View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11890_low_5 (Length: 543)

Name: NF11890_low_5
Description: NF11890
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11890_low_5
NF11890_low_5
[»] chr7 (215 HSPs)
chr7 (20-537)||(12465577-12466094)
chr7 (20-537)||(44374164-44374681)
chr7 (20-537)||(44383029-44383546)
chr7 (20-537)||(46386404-46386921)
chr7 (20-512)||(13147789-13148281)
chr7 (20-537)||(20585574-20586087)
chr7 (20-512)||(12371521-12372010)
chr7 (20-537)||(19282310-19282827)
chr7 (20-512)||(11066711-11067203)
chr7 (28-512)||(12127488-12127973)
chr7 (26-505)||(32433912-32434392)
chr7 (24-473)||(14928653-14929100)
chr7 (24-473)||(15352119-15352566)
chr7 (20-406)||(14258701-14259087)
chr7 (32-379)||(8851488-8851835)
chr7 (20-406)||(32301531-32301917)
chr7 (20-335)||(47094500-47094815)
chr7 (38-379)||(13745111-13745452)
chr7 (41-335)||(36685587-36685882)
chr7 (26-406)||(16580009-16580389)
chr7 (20-300)||(12323247-12323527)
chr7 (23-335)||(32160522-32160834)
chr7 (24-379)||(18875167-18875522)
chr7 (20-379)||(20619662-20620021)
chr7 (37-335)||(708889-709187)
chr7 (26-335)||(16462456-16462765)
chr7 (19-335)||(58734-59050)
chr7 (19-335)||(832339-832655)
chr7 (19-335)||(1197519-1197835)
chr7 (23-335)||(16550324-16550636)
chr7 (23-335)||(16615026-16615338)
chr7 (37-335)||(13647662-13647960)
chr7 (37-335)||(30820590-30820888)
chr7 (37-332)||(14415818-14416113)
chr7 (37-335)||(15213919-15214217)
chr7 (99-400)||(33001269-33001570)
chr7 (20-379)||(43277060-43277420)
chr7 (39-335)||(47975251-47975543)
chr7 (19-331)||(34957595-34957907)
chr7 (26-335)||(4325476-4325785)
chr7 (37-335)||(14188628-14188924)
chr7 (20-335)||(16998846-16999167)
chr7 (20-379)||(3287373-3287725)
chr7 (37-333)||(17070626-17070923)
chr7 (47-280)||(29052499-29052732)
chr7 (47-327)||(10896338-10896618)
chr7 (47-327)||(15167403-15167683)
chr7 (20-379)||(14161172-14161530)
chr7 (37-335)||(37727261-37727559)
chr7 (38-379)||(25941814-25942154)
chr7 (20-361)||(48213262-48213602)
chr7 (37-335)||(38828481-38828779)
chr7 (39-323)||(32771760-32772044)
chr7 (99-335)||(48812258-48812494)
chr7 (99-335)||(8756792-8757028)
chr7 (47-335)||(11661525-11661813)
chr7 (178-406)||(16460407-16460635)
chr7 (142-406)||(16585390-16585654)
chr7 (41-336)||(14153310-14153604)
chr7 (41-335)||(12755044-12755338)
chr7 (39-361)||(24270318-24270639)
chr7 (20-361)||(4691213-4691553)
chr7 (36-329)||(15119641-15119921)
chr7 (21-254)||(15720250-15720483)
chr7 (59-335)||(18456004-18456280)
chr7 (20-361)||(15576150-15576488)
chr7 (37-331)||(17505338-17505632)
chr7 (37-331)||(17547582-17547876)
chr7 (175-379)||(13745672-13745876)
chr7 (47-335)||(14422205-14422493)
chr7 (47-335)||(18872580-18872868)
chr7 (94-335)||(14191479-14191718)
chr7 (47-335)||(14566422-14566710)
chr7 (47-335)||(16008798-16009086)
chr7 (47-335)||(147838-148126)
chr7 (99-335)||(13699285-13699521)
chr7 (94-360)||(48743698-48743964)
chr7 (37-355)||(20252686-20252993)
chr7 (94-335)||(13408192-13408433)
chr7 (94-335)||(40555134-40555375)
chr7 (47-335)||(18607707-18607995)
chr7 (59-335)||(29004242-29004518)
chr7 (23-218)||(1856720-1856915)
chr7 (38-337)||(8514081-8514379)
chr7 (26-329)||(9743404-9743706)
chr7 (58-343)||(21538544-21538828)
chr7 (59-352)||(39292093-39292385)
chr7 (198-361)||(13894489-13894652)
chr7 (23-218)||(13917893-13918088)
chr7 (23-218)||(25926620-25926815)
chr7 (59-303)||(13864751-13864995)
chr7 (414-534)||(37785076-37785196)
chr7 (58-352)||(15978411-15978704)
chr7 (47-330)||(3192638-3192920)
chr7 (20-218)||(32125967-32126165)
chr7 (424-537)||(18875646-18875759)
chr7 (49-353)||(18080064-18080367)
chr7 (37-340)||(8563925-8564227)
chr7 (275-401)||(15720130-15720256)
chr7 (233-406)||(20487792-20487965)
chr7 (37-218)||(23664457-23664638)
chr7 (212-335)||(14273768-14273891)
chr7 (20-167)||(15376201-15376348)
chr7 (20-167)||(20384611-20384758)
chr7 (37-218)||(11303724-11303905)
chr7 (37-218)||(29800906-29801087)
chr7 (424-537)||(43277546-43277659)
chr7 (47-218)||(16108203-16108374)
chr7 (424-526)||(3287145-3287247)
chr7 (20-157)||(13869885-13870020)
chr7 (45-183)||(44190591-44190729)
chr7 (37-218)||(29797087-29797268)
chr7 (20-167)||(27217388-27217535)
chr7 (39-340)||(3136710-3137007)
chr7 (26-136)||(14317690-14317800)
chr7 (38-214)||(37538949-37539125)
chr7 (38-218)||(41523394-41523574)
chr7 (38-218)||(41525856-41526036)
chr7 (24-218)||(18431188-18431383)
chr7 (196-319)||(13918260-13918383)
chr7 (26-136)||(20487999-20488109)
chr7 (37-183)||(39431562-39431707)
chr7 (20-130)||(45847142-45847252)
chr7 (38-218)||(24702705-24702885)
chr7 (38-218)||(24705152-24705332)
chr7 (203-319)||(25926993-25927109)
chr7 (210-330)||(28719885-28720005)
chr7 (20-167)||(16410586-16410733)
chr7 (39-157)||(11392806-11392924)
chr7 (20-157)||(16233058-16233196)
chr7 (47-228)||(46473585-46473766)
chr7 (99-228)||(46580320-46580449)
chr7 (27-157)||(456859-456988)
chr7 (38-218)||(14948628-14948808)
chr7 (20-136)||(18640830-18640946)
chr7 (37-156)||(18985066-18985185)
chr7 (37-156)||(18999694-18999813)
chr7 (37-143)||(19194763-19194869)
chr7 (72-193)||(11309871-11309992)
chr7 (404-537)||(15281477-15281607)
chr7 (404-537)||(11053845-11053976)
chr7 (20-146)||(11287019-11287145)
chr7 (26-107)||(16460316-16460397)
chr7 (258-331)||(46580465-46580538)
chr7 (45-157)||(14105809-14105921)
chr7 (20-136)||(18628124-18628240)
chr7 (406-537)||(33001175-33001303)
chr7 (37-156)||(33556703-33556822)
chr7 (38-167)||(26355487-26355616)
chr7 (38-167)||(26357939-26358068)
chr7 (39-155)||(42566442-42566558)
chr7 (339-406)||(1489907-1489974)
chr7 (94-193)||(13897808-13897907)
chr7 (286-344)||(21675491-21675549)
chr7 (424-535)||(3289548-3289657)
chr7 (58-245)||(12191835-12192022)
chr7 (37-156)||(33059767-33059886)
chr7 (37-156)||(36301293-36301412)
chr7 (58-148)||(126006-126096)
chr7 (36-130)||(7822072-7822166)
chr7 (36-130)||(7829383-7829477)
chr7 (36-130)||(27102468-27102562)
chr7 (36-130)||(27109816-27109910)
chr7 (36-130)||(27175764-27175858)
chr7 (36-130)||(38784560-38784654)
chr7 (38-130)||(11310319-11310411)
chr7 (26-189)||(15760685-15760848)
chr7 (203-265)||(1857092-1857154)
chr7 (37-155)||(8931424-8931542)
chr7 (57-159)||(16383148-16383250)
chr7 (434-537)||(8757131-8757233)
chr7 (397-508)||(15096385-15096495)
chr7 (70-214)||(21660558-21660702)
chr7 (438-537)||(40555482-40555580)
chr7 (37-156)||(18570081-18570200)
chr7 (434-508)||(21735237-21735312)
chr7 (37-156)||(38294883-38295002)
chr7 (37-155)||(13316694-13316812)
chr7 (37-147)||(15852018-15852128)
chr7 (469-534)||(17130514-17130578)
chr7 (397-508)||(19558025-19558135)
chr7 (434-496)||(4325310-4325373)
chr7 (434-508)||(13408014-13408089)
chr7 (434-508)||(13865121-13865196)
chr7 (293-352)||(46473490-46473549)
chr7 (434-535)||(832758-832858)
chr7 (434-535)||(1197938-1198038)
chr7 (38-156)||(11309716-11309834)
chr7 (69-150)||(10000974-10001055)
chr7 (357-406)||(14219713-14219762)
chr7 (357-406)||(15096385-15096434)
chr7 (357-406)||(16077624-16077673)
chr7 (357-406)||(19558025-19558074)
chr7 (397-487)||(13133257-13133346)
chr7 (397-487)||(14219713-14219802)
chr7 (366-401)||(22000972-22001007)
chr7 (103-190)||(48623317-48623404)
chr7 (435-496)||(12755442-12755504)
chr7 (452-518)||(14161683-14161748)
chr7 (403-508)||(15139364-15139468)
chr7 (366-400)||(15139431-15139465)
chr7 (274-319)||(1858644-1858689)
chr7 (357-406)||(13133067-13133116)
chr7 (265-342)||(16065861-16065937)
chr7 (69-150)||(16418058-16418139)
chr7 (440-508)||(17071030-17071099)
chr7 (58-150)||(1937765-1937857)
chr7 (449-496)||(11309537-11309585)
chr7 (449-496)||(14191839-14191887)
chr7 (406-470)||(14258679-14258741)
chr7 (406-470)||(16460595-16460657)
chr7 (406-470)||(16579987-16580049)
chr7 (406-470)||(16585614-16585676)
chr7 (406-470)||(32301509-32301571)
chr7 (469-537)||(36705441-36705507)
[»] chr3 (210 HSPs)
chr3 (20-537)||(5205971-5206488)
chr3 (20-512)||(40807239-40807731)
chr3 (26-537)||(35064904-35065414)
chr3 (20-532)||(17693291-17693803)
chr3 (20-532)||(14508074-14508582)
chr3 (26-534)||(15931830-15932338)
chr3 (20-512)||(17538350-17538841)
chr3 (20-535)||(35353819-35354337)
chr3 (28-518)||(2841788-2842277)
chr3 (20-537)||(41172688-41173205)
chr3 (20-537)||(17519190-17519707)
chr3 (20-537)||(17534052-17534569)
chr3 (26-512)||(22306906-22307392)
chr3 (143-524)||(44273705-44274086)
chr3 (37-406)||(54875817-54876186)
chr3 (19-406)||(14441517-14441903)
chr3 (20-406)||(17685160-17685546)
chr3 (20-379)||(40812209-40812568)
chr3 (20-406)||(43889116-43889502)
chr3 (37-491)||(13519549-13520001)
chr3 (236-537)||(11258685-11258986)
chr3 (20-406)||(18699790-18700176)
chr3 (20-406)||(12470151-12470537)
chr3 (20-379)||(50348343-50348702)
chr3 (20-360)||(12511243-12511583)
chr3 (19-328)||(17670025-17670334)
chr3 (20-335)||(10563129-10563444)
chr3 (24-406)||(14671173-14671555)
chr3 (42-379)||(49900104-49900449)
chr3 (94-406)||(11192430-11192741)
chr3 (28-387)||(10541783-10542142)
chr3 (19-335)||(6158817-6159133)
chr3 (32-329)||(17044392-17044689)
chr3 (23-335)||(16979330-16979642)
chr3 (39-336)||(11913140-11913437)
chr3 (20-379)||(14152716-14153075)
chr3 (37-335)||(1988566-1988864)
chr3 (37-335)||(10989138-10989435)
chr3 (37-335)||(43550011-43550309)
chr3 (46-335)||(14641893-14642182)
chr3 (38-406)||(6156055-6156422)
chr3 (26-329)||(33564555-33564858)
chr3 (23-335)||(41947-42259)
chr3 (38-379)||(24546213-24546557)
chr3 (40-335)||(6805298-6805593)
chr3 (37-335)||(31224287-31224586)
chr3 (38-361)||(43928745-43929068)
chr3 (26-329)||(53646383-53646686)
chr3 (37-335)||(10833673-10833971)
chr3 (99-361)||(50351396-50351658)
chr3 (26-335)||(35961210-35961519)
chr3 (50-332)||(3803258-3803540)
chr3 (100-401)||(9511563-9511863)
chr3 (100-401)||(9519538-9519838)
chr3 (20-337)||(14519681-14519997)
chr3 (41-335)||(8928003-8928297)
chr3 (20-250)||(17046631-17046861)
chr3 (47-327)||(20248328-20248608)
chr3 (41-379)||(50755720-50756057)
chr3 (37-331)||(55291975-55292269)
chr3 (26-379)||(17207718-17208069)
chr3 (20-361)||(54330623-54330963)
chr3 (28-379)||(15565890-15566240)
chr3 (20-246)||(5215156-5215382)
chr3 (59-335)||(50243153-50243429)
chr3 (99-335)||(2248366-2248602)
chr3 (59-335)||(24152800-24153076)
chr3 (47-327)||(38311347-38311628)
chr3 (59-335)||(16643425-16643701)
chr3 (39-331)||(10554691-10554983)
chr3 (47-335)||(14763305-14763593)
chr3 (41-325)||(19443941-19444224)
chr3 (94-334)||(6819530-6819770)
chr3 (47-335)||(9533549-9533837)
chr3 (99-331)||(14966426-14966658)
chr3 (23-335)||(16324861-16325173)
chr3 (94-331)||(37038242-37038480)
chr3 (99-335)||(3394398-3394634)
chr3 (99-335)||(12275969-12276205)
chr3 (47-335)||(23371051-23371339)
chr3 (248-495)||(42353218-42353463)
chr3 (20-201)||(11258984-11259165)
chr3 (37-352)||(25104538-25104850)
chr3 (100-335)||(42324618-42324853)
chr3 (20-218)||(22763947-22764145)
chr3 (94-335)||(179098-179339)
chr3 (55-335)||(18889784-18890064)
chr3 (47-335)||(51300815-51301103)
chr3 (138-335)||(13029711-13029908)
chr3 (94-335)||(18367149-18367390)
chr3 (23-218)||(15465631-15465826)
chr3 (94-325)||(17513010-17513241)
chr3 (138-335)||(13026119-13026316)
chr3 (47-312)||(18893067-18893332)
chr3 (94-335)||(13522801-13523043)
chr3 (23-218)||(5223860-5224055)
chr3 (37-226)||(46722960-46723149)
chr3 (41-225)||(51602938-51603122)
chr3 (37-221)||(14647437-14647621)
chr3 (37-352)||(18739300-18739613)
chr3 (23-218)||(26054755-26054950)
chr3 (237-406)||(14682672-14682841)
chr3 (414-535)||(16728503-16728624)
chr3 (23-216)||(54521301-54521494)
chr3 (20-218)||(10247211-10247409)
chr3 (37-218)||(12305599-12305780)
chr3 (37-218)||(13436776-13436956)
chr3 (406-535)||(19884226-19884355)
chr3 (38-218)||(28848127-28848307)
chr3 (287-406)||(17046511-17046630)
chr3 (37-352)||(17937931-17938244)
chr3 (20-167)||(34159853-34160000)
chr3 (414-537)||(45531332-45531455)
chr3 (150-291)||(14567659-14567800)
chr3 (275-406)||(19568940-19569072)
chr3 (424-535)||(14153191-14153302)
chr3 (20-167)||(17463705-17463852)
chr3 (69-349)||(12952448-12952727)
chr3 (20-157)||(13151278-13151415)
chr3 (20-157)||(15412968-15413105)
chr3 (37-218)||(29544346-29544527)
chr3 (403-537)||(50348806-50348937)
chr3 (39-157)||(55477028-55477146)
chr3 (20-156)||(6468622-6468758)
chr3 (38-218)||(15978009-15978189)
chr3 (39-157)||(45606413-45606531)
chr3 (237-331)||(52989492-52989586)
chr3 (203-319)||(15465337-15465453)
chr3 (203-319)||(26055128-26055244)
chr3 (168-319)||(5223566-5223717)
chr3 (177-335)||(22652252-22652409)
chr3 (20-157)||(13153744-13153880)
chr3 (38-218)||(7780852-7781032)
chr3 (38-213)||(16453785-16453960)
chr3 (94-225)||(19568802-19568933)
chr3 (325-406)||(17691427-17691508)
chr3 (461-537)||(5215083-5215159)
chr3 (20-86)||(44274088-44274154)
chr3 (47-148)||(14528592-14528693)
chr3 (37-189)||(8276431-8276583)
chr3 (47-150)||(27840498-27840601)
chr3 (404-537)||(20417293-20417424)
chr3 (37-189)||(8269320-8269472)
chr3 (48-156)||(15025729-15025837)
chr3 (39-134)||(21846019-21846114)
chr3 (47-150)||(51158611-51158714)
chr3 (440-537)||(10562921-10563019)
chr3 (69-211)||(36528061-36528202)
chr3 (37-155)||(48630726-48630844)
chr3 (102-223)||(8631274-8631395)
chr3 (23-120)||(22652407-22652503)
chr3 (37-86)||(30123783-30123832)
chr3 (57-185)||(40039698-40039826)
chr3 (37-153)||(48044081-48044197)
chr3 (36-130)||(1468570-1468664)
chr3 (69-211)||(3264676-3264818)
chr3 (38-156)||(12917969-12918087)
chr3 (403-492)||(13179399-13179488)
chr3 (424-537)||(23395786-23395897)
chr3 (37-147)||(25058340-25058450)
chr3 (37-147)||(49231810-49231919)
chr3 (47-156)||(12151331-12151440)
chr3 (37-134)||(12155367-12155464)
chr3 (37-130)||(12808564-12808657)
chr3 (37-153)||(25201469-25201585)
chr3 (35-156)||(29907090-29907211)
chr3 (35-156)||(29948256-29948377)
chr3 (35-156)||(29997410-29997531)
chr3 (434-537)||(3394737-3394839)
chr3 (434-537)||(13523146-13523248)
chr3 (37-156)||(3161255-3161374)
chr3 (404-496)||(14818278-14818370)
chr3 (434-537)||(13520516-13520618)
chr3 (293-361)||(14568649-14568717)
chr3 (57-193)||(17759012-17759148)
chr3 (57-193)||(19060332-19060468)
chr3 (58-150)||(30152489-30152581)
chr3 (48-156)||(45803993-45804101)
chr3 (434-508)||(10550510-10550585)
chr3 (37-155)||(3527812-3527929)
chr3 (99-329)||(8023649-8023878)
chr3 (69-214)||(6002488-6002632)
chr3 (282-335)||(18893010-18893063)
chr3 (434-537)||(18367493-18367595)
chr3 (69-189)||(44228516-44228636)
chr3 (434-492)||(6819367-6819426)
chr3 (138-209)||(11986841-11986912)
chr3 (434-508)||(17548286-17548361)
chr3 (265-352)||(37917146-37917233)
chr3 (440-508)||(6158637-6158706)
chr3 (47-132)||(12540881-12540966)
chr3 (440-508)||(14642293-14642362)
chr3 (404-508)||(52338671-52338775)
chr3 (434-537)||(179442-179544)
chr3 (38-146)||(36527934-36528042)
chr3 (301-352)||(4813250-4813301)
chr3 (397-487)||(6155897-6155986)
chr3 (397-487)||(11192200-11192289)
chr3 (94-189)||(17956843-17956938)
chr3 (48-157)||(4656249-4656356)
chr3 (440-537)||(14250861-14250954)
chr3 (404-493)||(52213183-52213272)
chr3 (397-497)||(11562678-11562777)
chr3 (440-508)||(37038058-37038127)
chr3 (440-508)||(42324964-42325033)
chr3 (366-406)||(11192240-11192280)
chr3 (267-323)||(11833294-11833349)
chr3 (424-484)||(16050114-16050172)
chr3 (424-492)||(16059489-16059555)
chr3 (76-180)||(54039123-54039227)
[»] scaffold0737 (2 HSPs)
scaffold0737 (20-537)||(5030-5547)
scaffold0737 (103-335)||(6077-6310)
[»] chr1 (96 HSPs)
chr1 (20-537)||(42912268-42912785)
chr1 (20-534)||(21046366-21046880)
chr1 (20-534)||(16058631-16059145)
chr1 (20-537)||(4596162-4596679)
chr1 (26-537)||(20587896-20588407)
chr1 (26-537)||(20592434-20592945)
chr1 (24-537)||(20633955-20634469)
chr1 (26-512)||(41227031-41227513)
chr1 (20-393)||(19676073-19676446)
chr1 (28-535)||(14237937-14238441)
chr1 (26-477)||(51082496-51082945)
chr1 (38-537)||(7052390-7052886)
chr1 (26-361)||(41225778-41226109)
chr1 (25-432)||(38887409-38887816)
chr1 (94-406)||(21239686-21239998)
chr1 (41-361)||(12710282-12710602)
chr1 (100-402)||(51323628-51323930)
chr1 (41-335)||(21180663-21180957)
chr1 (47-335)||(46198069-46198357)
chr1 (37-335)||(50000893-50001192)
chr1 (37-374)||(45496326-45496664)
chr1 (37-335)||(2332544-2332842)
chr1 (48-335)||(29763979-29764270)
chr1 (20-361)||(50544246-50544586)
chr1 (37-335)||(22130399-22130697)
chr1 (28-361)||(18120999-18121331)
chr1 (20-361)||(24720011-24720351)
chr1 (33-379)||(1642972-1643315)
chr1 (48-335)||(8276337-8276624)
chr1 (37-335)||(28312768-28313066)
chr1 (71-335)||(44822490-44822754)
chr1 (37-335)||(296775-297073)
chr1 (47-379)||(22823750-22824082)
chr1 (37-335)||(38056985-38057283)
chr1 (69-335)||(13880982-13881248)
chr1 (38-337)||(14792897-14793195)
chr1 (37-325)||(23194885-23195173)
chr1 (59-320)||(22350023-22350284)
chr1 (94-335)||(20031281-20031522)
chr1 (94-335)||(24815243-24815484)
chr1 (37-335)||(45574386-45574673)
chr1 (56-335)||(20437580-20437859)
chr1 (94-336)||(7792243-7792485)
chr1 (99-379)||(39060472-39060752)
chr1 (41-337)||(17902100-17902395)
chr1 (80-331)||(16401092-16401343)
chr1 (26-337)||(44891867-44892176)
chr1 (37-361)||(6833609-6833932)
chr1 (41-327)||(16372178-16372465)
chr1 (406-537)||(19675969-19676100)
chr1 (20-218)||(16362395-16362593)
chr1 (20-167)||(13989393-13989540)
chr1 (37-218)||(13227340-13227521)
chr1 (37-218)||(29535528-29535709)
chr1 (38-218)||(21841243-21841423)
chr1 (38-218)||(21922797-21922977)
chr1 (357-537)||(38887781-38887958)
chr1 (37-223)||(9784677-9784863)
chr1 (20-157)||(21474574-21474711)
chr1 (38-218)||(41372948-41373128)
chr1 (176-335)||(294456-294624)
chr1 (440-537)||(42696935-42697031)
chr1 (38-208)||(23593239-23593409)
chr1 (94-211)||(10812760-10812877)
chr1 (94-210)||(21659689-21659805)
chr1 (99-330)||(16655793-16656023)
chr1 (424-537)||(18275130-18275241)
chr1 (37-152)||(21190002-21190117)
chr1 (440-537)||(1642655-1642750)
chr1 (37-150)||(18060532-18060645)
chr1 (404-508)||(52983387-52983491)
chr1 (404-534)||(51476194-51476322)
chr1 (36-130)||(17003968-17004062)
chr1 (37-155)||(35893528-35893646)
chr1 (308-372)||(48301315-48301379)
chr1 (36-118)||(38055908-38055990)
chr1 (47-156)||(21244371-21244480)
chr1 (319-379)||(11809199-11809259)
chr1 (58-189)||(22366527-22366658)
chr1 (424-537)||(18270476-18270587)
chr1 (319-379)||(23073262-23073322)
chr1 (309-361)||(28477374-28477426)
chr1 (434-508)||(7792587-7792662)
chr1 (434-508)||(13528529-13528604)
chr1 (447-537)||(21181073-21181162)
chr1 (434-496)||(44822856-44822919)
chr1 (440-537)||(38057394-38057490)
chr1 (449-508)||(10813273-10813333)
chr1 (401-492)||(13302045-13302135)
chr1 (434-496)||(24815587-24815647)
chr1 (404-537)||(18823821-18823952)
chr1 (440-537)||(19761968-19762064)
chr1 (76-185)||(20708696-20708805)
chr1 (69-189)||(7641549-7641669)
chr1 (69-189)||(15862030-15862150)
chr1 (58-150)||(44035797-44035889)
[»] chr8 (144 HSPs)
chr8 (20-537)||(20178838-20179355)
chr8 (20-512)||(19140008-19140500)
chr8 (20-512)||(39936328-39936819)
chr8 (27-534)||(42818231-42818738)
chr8 (20-489)||(6102070-6102536)
chr8 (20-406)||(5760882-5761268)
chr8 (20-537)||(20083955-20084467)
chr8 (20-379)||(5082529-5082888)
chr8 (20-379)||(18833847-18834206)
chr8 (20-379)||(17437635-17437993)
chr8 (20-329)||(6573374-6573682)
chr8 (27-332)||(18024019-18024324)
chr8 (23-333)||(26454133-26454443)
chr8 (26-335)||(41680457-41680766)
chr8 (26-406)||(23914273-23914652)
chr8 (19-333)||(38185402-38185716)
chr8 (26-329)||(22207693-22207996)
chr8 (37-379)||(22483123-22483464)
chr8 (48-333)||(21860965-21861250)
chr8 (37-335)||(44432281-44432580)
chr8 (37-335)||(364208-364506)
chr8 (37-335)||(19882388-19882686)
chr8 (20-361)||(4381110-4381450)
chr8 (37-335)||(42559862-42560159)
chr8 (23-335)||(11775142-11775454)
chr8 (23-335)||(23478500-23478812)
chr8 (48-335)||(15635526-15635812)
chr8 (23-333)||(19880250-19880560)
chr8 (45-335)||(25483816-25484106)
chr8 (94-335)||(39694919-39695160)
chr8 (59-335)||(20454659-20454935)
chr8 (59-335)||(20455416-20455692)
chr8 (59-335)||(20460394-20460670)
chr8 (48-379)||(36305035-36305365)
chr8 (37-335)||(17795652-17795950)
chr8 (20-337)||(22258621-22258937)
chr8 (47-327)||(44476851-44477132)
chr8 (47-327)||(44480113-44480394)
chr8 (39-357)||(36732860-36733167)
chr8 (99-331)||(19807993-19808225)
chr8 (99-331)||(22237650-22237882)
chr8 (36-335)||(21579540-21579839)
chr8 (26-361)||(22474146-22474480)
chr8 (19-256)||(21399209-21399446)
chr8 (19-256)||(21793702-21793939)
chr8 (58-327)||(8728292-8728561)
chr8 (26-335)||(29763192-29763501)
chr8 (59-320)||(42265951-42266209)
chr8 (26-361)||(17978740-17979074)
chr8 (59-335)||(17460644-17460919)
chr8 (20-361)||(21513715-21514054)
chr8 (94-335)||(44522817-44523058)
chr8 (169-361)||(361678-361870)
chr8 (169-361)||(32949995-32950187)
chr8 (59-379)||(20517474-20517793)
chr8 (94-324)||(39363955-39364185)
chr8 (47-335)||(27941233-27941521)
chr8 (26-337)||(36405383-36405693)
chr8 (94-379)||(22344418-22344702)
chr8 (94-379)||(22356078-22356362)
chr8 (61-337)||(38988884-38989159)
chr8 (61-337)||(39019981-39020256)
chr8 (59-282)||(23660688-23660911)
chr8 (23-218)||(16198371-16198566)
chr8 (129-361)||(18816886-18817119)
chr8 (98-334)||(21326333-21326569)
chr8 (37-352)||(24907180-24907492)
chr8 (39-352)||(25757556-25757868)
chr8 (99-334)||(21321736-21321971)
chr8 (103-337)||(23670067-23670300)
chr8 (39-352)||(25295536-25295848)
chr8 (161-361)||(18815281-18815480)
chr8 (20-167)||(1484929-1485076)
chr8 (20-218)||(4541861-4542059)
chr8 (249-406)||(21345945-21346102)
chr8 (38-218)||(18677570-18677750)
chr8 (20-167)||(5852780-5852927)
chr8 (20-167)||(14408932-14409079)
chr8 (99-330)||(17501350-17501581)
chr8 (47-352)||(19331921-19332223)
chr8 (440-537)||(22259106-22259203)
chr8 (20-137)||(4483837-4483954)
chr8 (23-218)||(14397230-14397426)
chr8 (38-218)||(24485549-24485729)
chr8 (20-167)||(20045683-20045830)
chr8 (47-352)||(45559520-45559817)
chr8 (20-156)||(14824313-14824449)
chr8 (26-190)||(45290041-45290205)
chr8 (23-193)||(8414069-8414239)
chr8 (233-335)||(8414240-8414342)
chr8 (203-319)||(14397604-14397720)
chr8 (38-218)||(22002229-22002409)
chr8 (417-537)||(17217802-17217920)
chr8 (424-537)||(17907695-17907807)
chr8 (57-352)||(22313234-22313529)
chr8 (47-189)||(223272-223414)
chr8 (47-189)||(688043-688185)
chr8 (47-189)||(736895-737037)
chr8 (47-189)||(860790-860932)
chr8 (37-150)||(18611991-18612104)
chr8 (20-85)||(18816796-18816861)
chr8 (169-352)||(18118630-18118813)
chr8 (418-537)||(23947414-23947531)
chr8 (56-328)||(24238843-24239114)
chr8 (69-352)||(18827627-18827909)
chr8 (424-537)||(22244617-22244729)
chr8 (37-150)||(15319946-15320059)
chr8 (37-150)||(15500315-15500428)
chr8 (37-150)||(22147016-22147129)
chr8 (35-152)||(23883457-23883574)
chr8 (59-352)||(24624072-24624364)
chr8 (466-535)||(24713388-24713457)
chr8 (23-112)||(25657836-25657925)
chr8 (286-361)||(5080403-5080478)
chr8 (404-534)||(23888942-23889070)
chr8 (36-130)||(272120-272214)
chr8 (36-130)||(643635-643729)
chr8 (36-130)||(829441-829535)
chr8 (58-148)||(29759470-29759560)
chr8 (424-537)||(22584461-22584572)
chr8 (293-352)||(18122329-18122388)
chr8 (47-189)||(18618830-18618971)
chr8 (47-156)||(20878940-20879050)
chr8 (47-156)||(12037800-12037909)
chr8 (37-150)||(22089330-22089443)
chr8 (397-497)||(36728025-36728124)
chr8 (397-508)||(22318655-22318765)
chr8 (58-144)||(17150594-17150680)
chr8 (94-156)||(22310230-22310292)
chr8 (449-537)||(20454454-20454541)
chr8 (397-497)||(31723309-31723408)
chr8 (59-152)||(32950188-32950280)
chr8 (449-508)||(19882207-19882267)
chr8 (449-508)||(20455238-20455298)
chr8 (449-508)||(20460216-20460276)
chr8 (469-537)||(42266365-42266432)
chr8 (434-496)||(15635915-15635978)
chr8 (367-406)||(20024993-20025032)
chr8 (397-487)||(31723499-31723588)
chr8 (367-406)||(45471168-45471207)
chr8 (479-537)||(19699280-19699337)
chr8 (440-537)||(39695271-39695367)
chr8 (406-470)||(21346062-21346124)
chr8 (366-406)||(36728034-36728074)
[»] chr2 (130 HSPs)
chr2 (26-537)||(9975146-9975658)
chr2 (20-512)||(24781157-24781649)
chr2 (20-537)||(36839392-36839906)
chr2 (20-537)||(17306705-17307221)
chr2 (20-495)||(5031447-5031922)
chr2 (30-537)||(28652829-28653336)
chr2 (20-537)||(24515404-24515921)
chr2 (43-535)||(27484810-27485302)
chr2 (38-537)||(23968958-23969457)
chr2 (20-401)||(23068767-23069148)
chr2 (28-379)||(19201525-19201877)
chr2 (26-379)||(21368483-21368836)
chr2 (23-331)||(18358289-18358597)
chr2 (23-335)||(21081291-21081603)
chr2 (26-406)||(9784931-9785310)
chr2 (23-335)||(25183607-25183919)
chr2 (39-335)||(41301309-41301605)
chr2 (39-323)||(10039470-10039754)
chr2 (37-335)||(21915042-21915340)
chr2 (94-379)||(43707676-43707960)
chr2 (58-361)||(24273614-24273917)
chr2 (103-331)||(27472677-27472905)
chr2 (37-335)||(23338734-23339032)
chr2 (20-361)||(21335770-21336110)
chr2 (59-335)||(31520537-31520813)
chr2 (94-335)||(24883806-24884047)
chr2 (47-327)||(6482946-6483227)
chr2 (47-327)||(6486413-6486694)
chr2 (20-361)||(21315979-21316319)
chr2 (36-337)||(22690099-22690399)
chr2 (36-337)||(22694695-22694995)
chr2 (59-321)||(18388653-18388915)
chr2 (37-331)||(20590656-20590950)
chr2 (32-335)||(2524076-2524361)
chr2 (94-335)||(26903578-26903819)
chr2 (37-361)||(1384020-1384343)
chr2 (47-335)||(19661999-19662287)
chr2 (99-331)||(34858781-34859013)
chr2 (99-331)||(34873843-34874075)
chr2 (20-374)||(22686221-22686574)
chr2 (58-335)||(22173383-22173660)
chr2 (47-335)||(6260722-6261010)
chr2 (47-335)||(21073071-21073359)
chr2 (57-379)||(25587041-25587362)
chr2 (47-335)||(9242180-9242468)
chr2 (99-329)||(20915531-20915761)
chr2 (37-374)||(28345410-28345746)
chr2 (20-361)||(23609871-23610211)
chr2 (29-215)||(40911863-40912050)
chr2 (47-352)||(22332121-22332424)
chr2 (48-218)||(31345656-31345826)
chr2 (94-336)||(28349327-28349578)
chr2 (414-534)||(19358152-19358272)
chr2 (26-218)||(38967956-38968148)
chr2 (37-218)||(10684267-10684448)
chr2 (37-218)||(20261696-20261877)
chr2 (38-218)||(23136056-23136236)
chr2 (20-167)||(18809470-18809617)
chr2 (20-218)||(24897683-24897881)
chr2 (20-218)||(24900166-24900364)
chr2 (20-218)||(24905120-24905318)
chr2 (20-218)||(24907595-24907793)
chr2 (20-167)||(23711501-23711648)
chr2 (20-167)||(26505906-26506053)
chr2 (20-167)||(27920252-27920399)
chr2 (138-353)||(29113764-29113978)
chr2 (20-218)||(24902643-24902841)
chr2 (20-137)||(34402010-34402127)
chr2 (37-256)||(23778629-23778849)
chr2 (20-167)||(26508384-26508531)
chr2 (20-137)||(23131419-23131536)
chr2 (20-137)||(23133886-23134003)
chr2 (38-214)||(36734820-36734996)
chr2 (20-167)||(28577626-28577773)
chr2 (20-157)||(571935-572072)
chr2 (20-157)||(39682851-39682988)
chr2 (20-167)||(32038986-32039133)
chr2 (47-199)||(22255768-22255920)
chr2 (203-319)||(31345379-31345495)
chr2 (48-189)||(19887243-19887384)
chr2 (37-115)||(149881-149959)
chr2 (249-335)||(22501288-22501374)
chr2 (59-180)||(22501375-22501496)
chr2 (249-335)||(22509222-22509308)
chr2 (59-180)||(22509309-22509430)
chr2 (69-179)||(7186942-7187052)
chr2 (37-156)||(19646507-19646626)
chr2 (232-335)||(30643810-30643913)
chr2 (37-156)||(45527828-45527947)
chr2 (39-156)||(14183728-14183845)
chr2 (37-150)||(24686555-24686668)
chr2 (20-148)||(27261373-27261501)
chr2 (415-537)||(10897503-10897625)
chr2 (57-147)||(24383119-24383209)
chr2 (37-156)||(14179988-14180107)
chr2 (434-505)||(14693456-14693527)
chr2 (99-330)||(22786694-22786924)
chr2 (36-130)||(11232169-11232263)
chr2 (37-155)||(19196409-19196527)
chr2 (94-260)||(20272851-20273017)
chr2 (36-130)||(22514016-22514110)
chr2 (36-130)||(28776618-28776712)
chr2 (47-132)||(23759980-23760065)
chr2 (440-500)||(5985336-5985396)
chr2 (403-537)||(44071706-44071837)
chr2 (20-70)||(24436333-24436383)
chr2 (286-352)||(24841356-24841422)
chr2 (37-90)||(29113976-29114029)
chr2 (37-89)||(21132987-21133039)
chr2 (37-156)||(20006629-20006747)
chr2 (397-508)||(3538981-3539091)
chr2 (69-189)||(21141427-21141547)
chr2 (180-328)||(24281099-24281246)
chr2 (414-492)||(18391046-18391124)
chr2 (434-496)||(31520371-31520434)
chr2 (357-406)||(3539042-3539091)
chr2 (57-150)||(16900854-16900947)
chr2 (57-150)||(16994245-16994338)
chr2 (69-189)||(5889244-5889364)
chr2 (405-492)||(27851836-27851922)
chr2 (434-508)||(6478035-6478110)
chr2 (94-153)||(19819678-19819737)
chr2 (404-537)||(27860499-27860629)
chr2 (99-228)||(17203817-17203946)
chr2 (55-116)||(24281309-24281370)
chr2 (403-487)||(25141349-25141432)
chr2 (406-470)||(9784909-9784971)
chr2 (366-398)||(27851889-27851921)
chr2 (307-335)||(34492096-34492124)
chr2 (366-398)||(44071802-44071834)
[»] chr4 (135 HSPs)
chr4 (20-534)||(25090874-25091388)
chr4 (20-537)||(10356753-10357270)
chr4 (20-535)||(42875019-42875532)
chr4 (37-535)||(14548846-14549344)
chr4 (20-537)||(16997745-16998260)
chr4 (20-512)||(19609567-19610059)
chr4 (20-537)||(11425172-11425680)
chr4 (20-406)||(53630790-53631176)
chr4 (20-361)||(37019063-37019404)
chr4 (41-535)||(3485134-3485622)
chr4 (35-404)||(14630177-14630546)
chr4 (20-379)||(15114599-15114957)
chr4 (39-361)||(35660240-35660562)
chr4 (36-401)||(33243629-33243994)
chr4 (51-379)||(19435045-19435374)
chr4 (20-287)||(15011830-15012097)
chr4 (23-333)||(15008388-15008698)
chr4 (23-335)||(10694567-10694879)
chr4 (23-335)||(10908333-10908645)
chr4 (37-335)||(630237-630535)
chr4 (47-335)||(9638427-9638715)
chr4 (36-329)||(9923622-9923915)
chr4 (36-329)||(11478944-11479237)
chr4 (47-335)||(28385663-28385951)
chr4 (23-335)||(40619950-40620262)
chr4 (37-335)||(33849162-33849460)
chr4 (20-379)||(26445261-26445619)
chr4 (37-335)||(56115170-56115468)
chr4 (102-361)||(3337493-3337752)
chr4 (26-361)||(19566242-19566576)
chr4 (59-335)||(12611271-12611547)
chr4 (69-331)||(15447782-15448044)
chr4 (28-361)||(2424946-2425278)
chr4 (20-379)||(25513119-25513477)
chr4 (20-361)||(16026246-16026585)
chr4 (36-336)||(46740618-46740917)
chr4 (37-335)||(24046868-24047166)
chr4 (36-335)||(33186321-33186620)
chr4 (37-331)||(53387271-53387565)
chr4 (59-331)||(23802820-23803092)
chr4 (103-331)||(10056896-10057124)
chr4 (69-379)||(15344253-15344561)
chr4 (26-337)||(44023927-44024237)
chr4 (41-335)||(18212986-18213280)
chr4 (94-335)||(15990459-15990700)
chr4 (59-335)||(51463423-51463699)
chr4 (101-335)||(10704918-10705152)
chr4 (101-335)||(10918688-10918922)
chr4 (37-331)||(16277661-16277955)
chr4 (26-337)||(40229721-40230033)
chr4 (37-374)||(55582585-55582909)
chr4 (49-352)||(10237844-10238146)
chr4 (258-405)||(13036332-13036479)
chr4 (94-361)||(45314728-45314994)
chr4 (37-218)||(14049054-14049235)
chr4 (424-537)||(37018816-37018929)
chr4 (47-218)||(49547288-49547459)
chr4 (205-335)||(15883917-15884047)
chr4 (26-242)||(18108200-18108417)
chr4 (424-537)||(19435498-19435611)
chr4 (100-330)||(15214442-15214672)
chr4 (38-352)||(19081676-19081989)
chr4 (37-218)||(15534658-15534839)
chr4 (396-537)||(33243949-33244089)
chr4 (20-167)||(15117840-15117987)
chr4 (20-157)||(7640674-7640811)
chr4 (37-218)||(30147392-30147573)
chr4 (37-218)||(36038347-36038528)
chr4 (38-218)||(12033279-12033459)
chr4 (20-136)||(18239100-18239216)
chr4 (38-218)||(44615765-44615945)
chr4 (38-218)||(50221845-50222025)
chr4 (26-157)||(44772577-44772708)
chr4 (354-535)||(19734514-19734687)
chr4 (69-329)||(20595797-20596056)
chr4 (39-157)||(1837026-1837144)
chr4 (26-136)||(12622931-12623041)
chr4 (38-218)||(19243177-19243357)
chr4 (26-136)||(14873579-14873690)
chr4 (195-361)||(14508156-14508321)
chr4 (38-218)||(29267830-29268010)
chr4 (79-226)||(22725464-22725608)
chr4 (263-335)||(9871126-9871198)
chr4 (99-211)||(14185426-14185538)
chr4 (37-189)||(18247739-18247891)
chr4 (37-156)||(14476938-14477057)
chr4 (286-361)||(26922254-26922329)
chr4 (404-537)||(4615772-4615903)
chr4 (47-189)||(47357183-47357325)
chr4 (47-148)||(16731717-16731818)
chr4 (37-150)||(19697930-19698043)
chr4 (37-150)||(19708515-19708628)
chr4 (26-189)||(19020009-19020172)
chr4 (26-180)||(15287805-15287959)
chr4 (57-310)||(13045999-13046251)
chr4 (434-534)||(21061743-21061843)
chr4 (37-189)||(10643746-10643898)
chr4 (195-337)||(12622790-12622931)
chr4 (38-180)||(15294927-15295069)
chr4 (37-130)||(14995703-14995796)
chr4 (26-86)||(12424617-12424677)
chr4 (37-189)||(17146237-17146389)
chr4 (38-130)||(22725231-22725323)
chr4 (58-330)||(54364045-54364316)
chr4 (47-134)||(13164714-13164801)
chr4 (261-335)||(43251120-43251195)
chr4 (58-148)||(55377164-55377254)
chr4 (48-153)||(10272956-10273061)
chr4 (424-535)||(2584937-2585046)
chr4 (37-189)||(8374040-8374192)
chr4 (37-156)||(9621789-9621908)
chr4 (424-535)||(6511791-6511900)
chr4 (434-537)||(15448146-15448248)
chr4 (69-189)||(22355049-22355169)
chr4 (434-537)||(27027950-27028052)
chr4 (397-487)||(9638080-9638169)
chr4 (434-508)||(14933176-14933251)
chr4 (58-148)||(14951311-14951401)
chr4 (57-150)||(5683333-5683426)
chr4 (265-330)||(12134421-12134486)
chr4 (424-535)||(13446669-13446778)
chr4 (434-537)||(14942382-14942484)
chr4 (434-529)||(18229880-18229974)
chr4 (57-192)||(19622870-19623005)
chr4 (404-534)||(20899466-20899594)
chr4 (397-537)||(16026788-16026924)
chr4 (440-508)||(9638247-9638316)
chr4 (57-185)||(17376020-17376148)
chr4 (397-487)||(14629945-14630034)
chr4 (38-81)||(14718219-14718262)
chr4 (24-69)||(18022737-18022783)
chr4 (76-150)||(25120031-25120105)
chr4 (357-406)||(9638120-9638169)
chr4 (366-406)||(14629985-14630025)
chr4 (366-406)||(16026797-16026837)
[»] chr6 (146 HSPs)
chr6 (21-537)||(17318440-17318956)
chr6 (20-537)||(15891028-15891537)
chr6 (26-535)||(27125799-27126309)
chr6 (36-537)||(31733926-31734425)
chr6 (20-512)||(18708743-18709234)
chr6 (20-493)||(7827234-7827707)
chr6 (20-512)||(23150584-23151075)
chr6 (20-430)||(18702889-18703299)
chr6 (26-406)||(19655552-19655932)
chr6 (35-462)||(27317885-27318314)
chr6 (20-406)||(19773026-19773412)
chr6 (26-406)||(15704934-15705314)
chr6 (94-406)||(28947693-28948005)
chr6 (26-406)||(23491494-23491874)
chr6 (26-406)||(23497092-23497472)
chr6 (23-335)||(15173775-15174087)
chr6 (37-346)||(25601611-25601920)
chr6 (37-335)||(15817092-15817390)
chr6 (37-335)||(19825823-19826121)
chr6 (26-290)||(23655804-23656068)
chr6 (23-335)||(23956282-23956594)
chr6 (20-379)||(22556625-22556984)
chr6 (36-329)||(18928149-18928442)
chr6 (20-361)||(32259242-32259581)
chr6 (47-335)||(13764773-13765054)
chr6 (41-325)||(8759855-8760138)
chr6 (37-325)||(8767597-8767885)
chr6 (99-335)||(27851423-27851659)
chr6 (37-297)||(1254215-1254475)
chr6 (59-335)||(25619313-25619589)
chr6 (30-337)||(20182982-20183288)
chr6 (30-337)||(22152703-22153009)
chr6 (39-335)||(34296604-34296901)
chr6 (99-335)||(20733843-20734078)
chr6 (20-361)||(25921124-25921466)
chr6 (20-361)||(18455389-18455728)
chr6 (59-335)||(20556449-20556725)
chr6 (59-337)||(5834091-5834368)
chr6 (59-335)||(14978978-14979254)
chr6 (59-335)||(611160-611435)
chr6 (46-335)||(4477078-4477367)
chr6 (94-335)||(18658626-18658867)
chr6 (20-337)||(20410989-20411305)
chr6 (20-229)||(22806275-22806484)
chr6 (37-288)||(755-1006)
chr6 (20-219)||(27330289-27330488)
chr6 (20-219)||(27391029-27391228)
chr6 (47-285)||(25807602-25807840)
chr6 (39-379)||(13285085-13285424)
chr6 (94-337)||(20177164-20177406)
chr6 (94-337)||(22158585-22158827)
chr6 (94-325)||(25347556-25347787)
chr6 (94-335)||(29847894-29848137)
chr6 (23-218)||(23415441-23415636)
chr6 (39-256)||(29044809-29045026)
chr6 (48-273)||(31022042-31022267)
chr6 (59-335)||(19443637-19443912)
chr6 (59-361)||(18585014-18585314)
chr6 (24-303)||(23838451-23838730)
chr6 (23-218)||(27557199-27557394)
chr6 (41-256)||(34140965-34141178)
chr6 (41-256)||(34153581-34153794)
chr6 (37-221)||(7430057-7430241)
chr6 (99-335)||(16133066-16133302)
chr6 (99-349)||(18398325-18398574)
chr6 (37-218)||(12942666-12942847)
chr6 (47-330)||(17857036-17857319)
chr6 (37-218)||(28288841-28289022)
chr6 (37-214)||(35057045-35057222)
chr6 (20-167)||(18334080-18334227)
chr6 (20-167)||(24423074-24423221)
chr6 (20-218)||(1540399-1540597)
chr6 (37-221)||(14593959-14594143)
chr6 (47-218)||(15891923-15892094)
chr6 (35-218)||(19858425-19858608)
chr6 (20-167)||(33864805-33864952)
chr6 (20-157)||(2290668-2290805)
chr6 (39-344)||(23221277-23221581)
chr6 (37-182)||(19234658-19234803)
chr6 (38-218)||(33862270-33862450)
chr6 (39-157)||(8055567-8055685)
chr6 (39-218)||(17883004-17883183)
chr6 (19-118)||(19008847-19008946)
chr6 (414-537)||(24441140-24441261)
chr6 (196-319)||(27556905-27557028)
chr6 (204-315)||(23415151-23415262)
chr6 (26-167)||(22782754-22782895)
chr6 (39-218)||(12742794-12742973)
chr6 (38-167)||(26923953-26924082)
chr6 (36-118)||(7219195-7219277)
chr6 (47-189)||(27654564-27654706)
chr6 (47-189)||(25175112-25175254)
chr6 (404-537)||(31735629-31735761)
chr6 (357-470)||(23655665-23655776)
chr6 (169-352)||(22523435-22523617)
chr6 (457-512)||(27322172-27322227)
chr6 (286-361)||(29044656-29044731)
chr6 (47-329)||(15938570-15938851)
chr6 (47-189)||(16826335-16826477)
chr6 (291-361)||(19234591-19234661)
chr6 (404-537)||(22212214-22212346)
chr6 (47-156)||(10445497-10445606)
chr6 (47-156)||(18452252-18452361)
chr6 (24-189)||(21776040-21776205)
chr6 (317-406)||(22806182-22806271)
chr6 (258-330)||(16135519-16135591)
chr6 (110-330)||(31161866-31162085)
chr6 (47-150)||(22226536-22226639)
chr6 (36-130)||(10488030-10488124)
chr6 (404-537)||(13751060-13751191)
chr6 (36-130)||(16377204-16377298)
chr6 (36-130)||(16384528-16384622)
chr6 (37-150)||(16556902-16557015)
chr6 (37-150)||(16633458-16633571)
chr6 (37-150)||(16650132-16650245)
chr6 (37-150)||(19609619-19609732)
chr6 (371-432)||(23655741-23655802)
chr6 (37-150)||(25904514-25904627)
chr6 (26-189)||(1555527-1555690)
chr6 (434-508)||(18658448-18658523)
chr6 (47-150)||(29665413-29665516)
chr6 (69-202)||(3007478-3007611)
chr6 (434-537)||(610955-611057)
chr6 (434-537)||(29848240-29848342)
chr6 (434-508)||(19444017-19444092)
chr6 (58-156)||(30674055-30674153)
chr6 (488-537)||(7825864-7825913)
chr6 (69-202)||(31163519-31163652)
chr6 (279-335)||(25752970-25753026)
chr6 (279-335)||(25755140-25755196)
chr6 (434-508)||(16133407-16133482)
chr6 (397-487)||(23497613-23497702)
chr6 (47-130)||(33315043-33315126)
chr6 (39-85)||(21686506-21686551)
chr6 (47-155)||(1818232-1818340)
chr6 (449-508)||(13764592-13764652)
chr6 (397-487)||(23492015-23492104)
chr6 (440-508)||(19829695-19829764)
chr6 (357-406)||(23497613-23497662)
chr6 (399-432)||(23655640-23655673)
chr6 (366-406)||(6083497-6083537)
chr6 (94-150)||(16240335-16240391)
chr6 (406-470)||(19773372-19773434)
chr6 (366-406)||(23492024-23492064)
chr6 (366-406)||(23500930-23500970)
chr6 (366-398)||(31735631-31735663)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (28-534)||(57969-58475)
scaffold0064 (47-218)||(68438-68609)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (20-537)||(12853-13368)
scaffold0111 (268-537)||(19368-19635)
[»] chr5 (109 HSPs)
chr5 (20-537)||(19920852-19921368)
chr5 (20-406)||(20565903-20566289)
chr5 (19-432)||(32607641-32608053)
chr5 (37-432)||(36509118-36509505)
chr5 (23-335)||(17011146-17011458)
chr5 (37-335)||(24276940-24277238)
chr5 (37-335)||(24384975-24385273)
chr5 (26-329)||(8833530-8833824)
chr5 (37-331)||(29448262-29448556)
chr5 (37-331)||(6766085-6766379)
chr5 (37-335)||(17812816-17813114)
chr5 (37-335)||(36460390-36460688)
chr5 (26-329)||(26761827-26762130)
chr5 (28-361)||(18744044-18744376)
chr5 (37-335)||(18418832-18419130)
chr5 (37-335)||(263277-263576)
chr5 (37-334)||(27868909-27869206)
chr5 (38-332)||(41875928-41876222)
chr5 (37-361)||(16604938-16605261)
chr5 (23-335)||(33472884-33473196)
chr5 (116-379)||(33895295-33895558)
chr5 (39-335)||(21557380-21557677)
chr5 (99-379)||(21399400-21399679)
chr5 (44-335)||(21554720-21555011)
chr5 (59-325)||(17875429-17875695)
chr5 (99-379)||(20197982-20198264)
chr5 (59-335)||(22412426-22412702)
chr5 (26-361)||(14026131-14026465)
chr5 (47-327)||(19511614-19511895)
chr5 (26-379)||(23199715-23200065)
chr5 (37-335)||(22758224-22758523)
chr5 (36-337)||(8504202-8504502)
chr5 (47-335)||(38145082-38145370)
chr5 (69-335)||(31456218-31456484)
chr5 (37-361)||(1627715-1628038)
chr5 (47-335)||(42960797-42961085)
chr5 (47-327)||(22750372-22750649)
chr5 (38-254)||(40917308-40917524)
chr5 (47-335)||(28370600-28370888)
chr5 (47-337)||(16062904-16063191)
chr5 (69-335)||(30138530-30138795)
chr5 (47-327)||(22336748-22337028)
chr5 (41-335)||(37598455-37598749)
chr5 (47-327)||(22340286-22340566)
chr5 (37-221)||(43242992-43243176)
chr5 (39-226)||(24617259-24617446)
chr5 (39-226)||(24713490-24713677)
chr5 (39-226)||(24746518-24746705)
chr5 (20-218)||(29346456-29346654)
chr5 (20-218)||(29348929-29349127)
chr5 (20-218)||(29351402-29351600)
chr5 (37-226)||(24751069-24751258)
chr5 (37-218)||(37804407-37804588)
chr5 (169-361)||(22110994-22111185)
chr5 (37-226)||(24668531-24668720)
chr5 (37-226)||(24738300-24738489)
chr5 (20-137)||(39363941-39364058)
chr5 (20-156)||(39245674-39245810)
chr5 (20-167)||(264256-264403)
chr5 (20-167)||(20909539-20909686)
chr5 (20-157)||(23065051-23065188)
chr5 (37-223)||(17908999-17909185)
chr5 (20-157)||(38619973-38620110)
chr5 (38-218)||(10732446-10732626)
chr5 (357-505)||(32608018-32608164)
chr5 (38-218)||(42244871-42245051)
chr5 (357-535)||(36509470-36509645)
chr5 (199-379)||(30611929-30612108)
chr5 (199-379)||(30613889-30614068)
chr5 (47-150)||(22367062-22367165)
chr5 (47-189)||(11903-12045)
chr5 (47-189)||(25426177-25426319)
chr5 (26-108)||(26749678-26749760)
chr5 (47-189)||(18778573-18778715)
chr5 (258-335)||(12122077-12122154)
chr5 (99-330)||(28901346-28901576)
chr5 (99-330)||(28937741-28937971)
chr5 (47-150)||(43443976-43444079)
chr5 (26-180)||(7424886-7425040)
chr5 (47-189)||(21074176-21074318)
chr5 (440-534)||(25250632-25250725)
chr5 (440-534)||(25314417-25314510)
chr5 (47-130)||(9776730-9776813)
chr5 (24-150)||(19499467-19499593)
chr5 (47-153)||(20312556-20312662)
chr5 (440-537)||(23200299-23200394)
chr5 (47-148)||(27183136-27183237)
chr5 (58-189)||(11342190-11342321)
chr5 (36-130)||(21933199-21933293)
chr5 (36-130)||(21939369-21939463)
chr5 (57-326)||(31478801-31479069)
chr5 (36-130)||(36990595-36990689)
chr5 (458-537)||(21406443-21406521)
chr5 (47-150)||(23506542-23506645)
chr5 (434-508)||(24277341-24277416)
chr5 (434-508)||(24384797-24384872)
chr5 (195-337)||(26749532-26749673)
chr5 (36-130)||(35581399-35581493)
chr5 (69-156)||(21403919-21404006)
chr5 (37-150)||(35791682-35791795)
chr5 (58-146)||(1168770-1168858)
chr5 (436-535)||(8952787-8952885)
chr5 (440-537)||(10953187-10953283)
chr5 (397-459)||(20565701-20565762)
chr5 (69-150)||(22883893-22883974)
chr5 (449-508)||(17812638-17812698)
chr5 (404-487)||(22357664-22357747)
chr5 (357-406)||(20565713-20565762)
chr5 (366-406)||(21618749-21618789)
[»] scaffold0632 (1 HSPs)
scaffold0632 (20-534)||(386-900)
[»] scaffold0026 (4 HSPs)
scaffold0026 (20-531)||(145960-146467)
scaffold0026 (45-335)||(21501-21791)
scaffold0026 (37-325)||(123894-124182)
scaffold0026 (47-335)||(110907-111195)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (120-512)||(7802-8195)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (20-497)||(78322-78799)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (20-406)||(784-1170)
[»] scaffold0077 (6 HSPs)
scaffold0077 (32-535)||(33573-34062)
scaffold0077 (37-335)||(22989-23286)
scaffold0077 (37-325)||(17591-17879)
scaffold0077 (41-288)||(22517-22765)
scaffold0077 (195-325)||(23382-23512)
scaffold0077 (20-115)||(40043-40138)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (28-535)||(431-932)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (37-406)||(14920-15289)
scaffold0061 (37-406)||(23978-24347)
[»] scaffold0546 (3 HSPs)
scaffold0546 (26-535)||(7198-7704)
scaffold0546 (283-535)||(11018-11267)
scaffold0546 (37-209)||(10251-10423)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (26-535)||(301-806)
scaffold0109 (26-535)||(5603-6109)
scaffold0109 (37-335)||(2759-3056)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (152-506)||(8752-9106)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (187-512)||(9711-10035)
scaffold0134 (20-167)||(38349-38496)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (20-406)||(6862-7248)
scaffold0292 (406-470)||(6840-6902)
[»] scaffold0452 (2 HSPs)
scaffold0452 (26-395)||(12988-13357)
scaffold0452 (99-330)||(8046-8277)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (26-405)||(39449-39828)
[»] scaffold0039 (3 HSPs)
scaffold0039 (26-459)||(10252-10684)
scaffold0039 (485-537)||(10695-10746)
scaffold0039 (94-147)||(19914-19967)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (24-395)||(120270-120641)
scaffold0034 (23-292)||(29517-29786)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (28-406)||(21001-21379)
scaffold0018 (406-470)||(20979-21041)
[»] scaffold0104 (6 HSPs)
scaffold0104 (37-432)||(7543-7937)
scaffold0104 (37-432)||(14174-14568)
scaffold0104 (37-323)||(26358-26644)
scaffold0104 (37-323)||(27740-28026)
scaffold0104 (378-420)||(16588-16630)
scaffold0104 (378-420)||(18608-18650)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (24-401)||(21422-21799)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (20-379)||(142989-143345)
scaffold0020 (20-297)||(169316-169591)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (35-404)||(186837-187206)
scaffold0005 (397-487)||(187349-187438)
scaffold0005 (366-406)||(187358-187398)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (28-379)||(6913-7265)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (20-344)||(22108-22432)
scaffold0080 (94-335)||(29152-29393)
scaffold0080 (94-335)||(34617-34858)
[»] scaffold0205 (2 HSPs)
scaffold0205 (24-473)||(29894-30343)
scaffold0205 (99-156)||(6331-6388)
[»] scaffold1186 (3 HSPs)
scaffold1186 (35-404)||(1062-1431)
scaffold1186 (397-487)||(830-919)
scaffold1186 (366-406)||(870-910)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (59-537)||(11381-11855)
scaffold0439 (26-406)||(3768-4149)
[»] scaffold0241 (4 HSPs)
scaffold0241 (20-361)||(1958-2299)
scaffold0241 (80-251)||(5413-5584)
scaffold0241 (243-361)||(5111-5229)
scaffold0241 (397-487)||(1654-1743)
[»] scaffold0146 (3 HSPs)
scaffold0146 (180-493)||(22322-22633)
scaffold0146 (21-156)||(22627-22762)
scaffold0146 (440-533)||(23618-23711)
[»] scaffold0108 (3 HSPs)
scaffold0108 (20-335)||(5837-6152)
scaffold0108 (20-361)||(7100-7439)
scaffold0108 (440-537)||(5630-5726)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (36-406)||(168786-169157)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (20-335)||(77107-77422)
scaffold0001 (37-333)||(152544-152840)
scaffold0001 (47-335)||(176212-176500)
scaffold0001 (47-335)||(168859-169147)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (20-361)||(126142-126483)
scaffold0011 (26-337)||(32872-33182)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (26-406)||(5649-6029)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (37-300)||(106537-106800)
scaffold0040 (20-112)||(13307-13399)
[»] scaffold1662 (1 HSPs)
scaffold1662 (283-537)||(1-255)
[»] scaffold0630 (2 HSPs)
scaffold0630 (30-335)||(8484-8789)
scaffold0630 (440-537)||(8277-8373)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (23-335)||(4450-4766)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (23-335)||(4450-4766)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (26-406)||(3619-3999)
[»] scaffold0019 (4 HSPs)
scaffold0019 (175-473)||(29442-29738)
scaffold0019 (47-335)||(133508-133796)
scaffold0019 (70-335)||(133170-133435)
scaffold0019 (47-190)||(33803-33946)
[»] scaffold0051 (3 HSPs)
scaffold0051 (27-328)||(64393-64694)
scaffold0051 (23-218)||(31680-31875)
scaffold0051 (203-319)||(31386-31502)
[»] scaffold0672 (1 HSPs)
scaffold0672 (37-333)||(7890-8186)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (37-361)||(1479-1803)
scaffold0334 (20-270)||(1-251)
[»] scaffold1766 (1 HSPs)
scaffold1766 (20-297)||(1013-1288)
[»] scaffold0008 (4 HSPs)
scaffold0008 (37-335)||(11841-12139)
scaffold0008 (403-497)||(136323-136416)
scaffold0008 (449-537)||(12260-12347)
scaffold0008 (368-400)||(136328-136360)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (39-336)||(416-713)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (37-361)||(7527-7851)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (37-333)||(21677-21973)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (23-335)||(5878-6190)
scaffold0058 (37-144)||(60301-60408)
[»] scaffold1817 (1 HSPs)
scaffold1817 (307-534)||(1-228)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (104-379)||(1283-1558)
[»] scaffold0371 (3 HSPs)
scaffold0371 (26-329)||(10770-11073)
scaffold0371 (196-291)||(17223-17318)
scaffold0371 (366-400)||(16913-16947)
[»] scaffold0607 (2 HSPs)
scaffold0607 (39-332)||(3129-3422)
scaffold0607 (434-537)||(2921-3023)
[»] scaffold0462 (3 HSPs)
scaffold0462 (23-335)||(10640-10953)
scaffold0462 (20-337)||(738-1054)
scaffold0462 (20-337)||(6244-6560)
[»] scaffold0338 (3 HSPs)
scaffold0338 (37-335)||(3276-3574)
scaffold0338 (47-148)||(8607-8708)
scaffold0338 (93-157)||(17-81)
[»] scaffold0083 (7 HSPs)
scaffold0083 (58-400)||(337-679)
scaffold0083 (58-400)||(5641-5983)
scaffold0083 (23-210)||(1480-1667)
scaffold0083 (406-537)||(645-773)
scaffold0083 (406-537)||(5949-6077)
scaffold0083 (440-537)||(11448-11544)
scaffold0083 (94-147)||(11396-11449)
[»] scaffold0635 (1 HSPs)
scaffold0635 (39-323)||(7316-7600)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (37-361)||(9449-9773)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (23-335)||(22089-22401)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (37-331)||(673-967)
[»] scaffold0328 (2 HSPs)
scaffold0328 (37-335)||(18978-19276)
scaffold0328 (440-508)||(19387-19456)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (41-335)||(105332-105625)
scaffold0023 (94-323)||(162716-162945)
scaffold0023 (20-167)||(94938-95085)
[»] scaffold0335 (2 HSPs)
scaffold0335 (37-329)||(1130-1422)
scaffold0335 (51-148)||(6167-6264)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (99-335)||(11117-11353)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (99-379)||(27676-27956)
scaffold0125 (59-335)||(1465-1741)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (59-361)||(28724-29026)
scaffold0180 (19-193)||(9997-10171)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (41-331)||(70166-70456)
scaffold0057 (59-225)||(71941-72107)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (37-374)||(66366-66703)
scaffold0004 (47-156)||(65473-65582)
scaffold0004 (424-530)||(59565-59669)
scaffold0004 (47-156)||(74940-75049)
scaffold0004 (26-54)||(328614-328642)
[»] scaffold0220 (4 HSPs)
scaffold0220 (47-335)||(13366-13654)
scaffold0220 (100-335)||(16184-16419)
scaffold0220 (121-303)||(8688-8870)
scaffold0220 (446-508)||(16004-16067)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (36-329)||(5000-5293)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (37-379)||(10087-10418)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (24-335)||(9277-9588)
[»] scaffold0070 (2 HSPs)
scaffold0070 (37-335)||(8477-8775)
scaffold0070 (434-496)||(8311-8374)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (20-337)||(65298-65614)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (69-320)||(35937-36188)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (94-406)||(25865-26176)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (99-361)||(21127-21389)
scaffold0106 (47-148)||(41298-41399)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (59-335)||(437-712)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (26-379)||(11670-12022)
[»] scaffold0394 (2 HSPs)
scaffold0394 (59-335)||(12389-12665)
scaffold0394 (47-156)||(7896-8005)
[»] scaffold0529 (3 HSPs)
scaffold0529 (150-361)||(7911-8122)
scaffold0529 (189-304)||(8152-8267)
scaffold0529 (397-518)||(7576-7695)
[»] scaffold1160 (1 HSPs)
scaffold1160 (36-337)||(104-404)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (59-335)||(413-689)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (28-361)||(18559-18891)
scaffold0213 (37-150)||(28508-28621)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (36-337)||(56395-56695)
[»] scaffold0032 (4 HSPs)
scaffold0032 (99-331)||(67518-67750)
scaffold0032 (137-379)||(62404-62646)
scaffold0032 (74-352)||(116776-117054)
scaffold0032 (20-80)||(62354-62414)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (59-298)||(23560-23799)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (59-335)||(15993-16269)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (26-337)||(8238-8549)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (339-512)||(9397-9567)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (59-335)||(82407-82682)
[»] scaffold0153 (2 HSPs)
scaffold0153 (99-284)||(4568-4753)
scaffold0153 (99-193)||(11679-11773)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (28-379)||(18451-18802)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (47-335)||(2071-2359)
[»] scaffold0117 (5 HSPs)
scaffold0117 (41-228)||(21288-21475)
scaffold0117 (23-177)||(42271-42425)
scaffold0117 (203-319)||(39515-39631)
scaffold0117 (172-218)||(39809-39855)
scaffold0117 (434-496)||(40960-41023)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (26-337)||(62137-62446)
scaffold0063 (26-166)||(39232-39372)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (94-320)||(159341-159567)
scaffold0007 (37-156)||(82724-82843)
[»] scaffold0126 (2 HSPs)
scaffold0126 (94-335)||(6219-6460)
scaffold0126 (434-496)||(6053-6116)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (59-320)||(12769-13029)
[»] scaffold0042 (4 HSPs)
scaffold0042 (101-335)||(51378-51612)
scaffold0042 (414-534)||(47280-47399)
scaffold0042 (108-236)||(67187-67315)
scaffold0042 (440-537)||(28493-28589)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (37-330)||(11552-11844)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (23-218)||(8495-8690)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (94-331)||(6449-6686)
scaffold0123 (169-361)||(16332-16523)
scaffold0123 (434-508)||(2013-2088)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (20-219)||(24380-24579)
scaffold0162 (286-337)||(24586-24637)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (38-240)||(2403-2604)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (111-335)||(138195-138419)
scaffold0003 (69-150)||(6770-6851)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (23-218)||(19579-19774)
scaffold0293 (196-319)||(19945-20068)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (37-218)||(3500-3681)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (20-256)||(7937-8173)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (94-359)||(34661-34921)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (59-361)||(7211-7511)
scaffold0230 (38-218)||(14424-14604)
[»] scaffold0200 (2 HSPs)
scaffold0200 (23-218)||(18130-18325)
scaffold0200 (203-319)||(17836-17952)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (60-256)||(1-197)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (47-218)||(33648-33819)
scaffold0138 (204-335)||(33338-33469)
[»] scaffold0231 (2 HSPs)
scaffold0231 (99-337)||(18050-18287)
scaffold0231 (26-78)||(17994-18046)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (45-379)||(35859-36192)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (346-535)||(15152-15338)
[»] scaffold0413 (3 HSPs)
scaffold0413 (143-299)||(11101-11257)
scaffold0413 (404-537)||(10891-11022)
scaffold0413 (41-90)||(11255-11304)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (75-329)||(13144-13402)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (196-335)||(21061-21200)
scaffold0149 (440-537)||(20862-20958)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (100-330)||(747-977)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (88-330)||(11592-11833)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (20-218)||(11766-11964)
[»] scaffold2015 (1 HSPs)
scaffold2015 (37-221)||(17-201)
[»] scaffold0256 (2 HSPs)
scaffold0256 (241-361)||(3059-3179)
scaffold0256 (59-243)||(2409-2593)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (20-178)||(13909-14067)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (26-218)||(6423-6615)
[»] scaffold0409 (4 HSPs)
scaffold0409 (94-330)||(2171-2406)
scaffold0409 (94-330)||(10426-10661)
scaffold0409 (415-534)||(444-562)
scaffold0409 (415-534)||(8699-8817)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (38-218)||(21225-21405)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (37-183)||(174482-174628)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (99-330)||(7931-8162)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (38-218)||(9718-9898)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (20-178)||(40916-41074)
scaffold0044 (41-148)||(37900-38007)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (246-379)||(2377-2510)
[»] scaffold0369 (2 HSPs)
scaffold0369 (39-208)||(16324-16493)
scaffold0369 (258-379)||(16525-16646)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (103-224)||(767-888)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (46-189)||(9606-9749)
[»] scaffold1278 (1 HSPs)
scaffold1278 (51-352)||(857-1157)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (38-218)||(53-233)
[»] scaffold0174 (4 HSPs)
scaffold0174 (20-352)||(20391-20723)
scaffold0174 (47-132)||(15588-15673)
scaffold0174 (47-132)||(4508-4593)
scaffold0174 (47-132)||(10629-10714)
[»] scaffold0825 (3 HSPs)
scaffold0825 (94-242)||(1025-1173)
scaffold0825 (261-335)||(1373-1447)
scaffold0825 (434-496)||(1550-1613)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (94-328)||(32671-32904)
[»] scaffold0577 (1 HSPs)
scaffold0577 (37-124)||(6078-6165)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (20-110)||(11591-11681)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (404-508)||(34097-34201)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (38-218)||(134687-134867)
scaffold0028 (38-218)||(137156-137336)
scaffold0028 (38-218)||(139625-139805)
scaffold0028 (38-218)||(142094-142274)
scaffold0028 (38-218)||(144563-144743)
scaffold0028 (366-401)||(3797-3832)
scaffold0028 (406-444)||(63835-63873)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (311-403)||(7115-7207)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (47-150)||(1414-1517)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (47-150)||(764-867)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (110-228)||(7784-7902)
scaffold0013 (286-352)||(7929-7995)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (37-156)||(31500-31619)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (36-90)||(9-63)
[»] scaffold0956 (1 HSPs)
scaffold0956 (94-183)||(2314-2403)
[»] scaffold0453 (1 HSPs)
scaffold0453 (405-537)||(3250-3380)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (37-150)||(30509-30622)
scaffold0107 (434-508)||(3120-3195)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (55-148)||(110040-110133)
scaffold0035 (55-148)||(118541-118634)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (273-333)||(2362-2422)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (37-156)||(28013-28132)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (404-537)||(6835-6966)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (424-537)||(127144-127254)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (26-86)||(5298-5358)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (47-147)||(18247-18347)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (434-537)||(6121-6223)
scaffold0309 (434-537)||(8273-8375)
[»] scaffold1354 (1 HSPs)
scaffold1354 (37-156)||(234-353)
[»] scaffold1102 (1 HSPs)
scaffold1102 (69-156)||(2532-2619)
[»] scaffold2046 (1 HSPs)
scaffold2046 (404-537)||(325-456)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (36-130)||(38434-38528)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (403-492)||(127500-127589)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (47-156)||(6992-7101)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (434-537)||(5039-5141)
[»] scaffold1815 (1 HSPs)
scaffold1815 (446-537)||(1237-1326)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (37-108)||(9165-9236)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (58-148)||(951-1041)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (58-147)||(1234-1323)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (37-189)||(8040-8192)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (47-157)||(40774-40884)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (37-156)||(9809-9927)
scaffold0100 (47-156)||(27259-27368)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (403-537)||(66226-66357)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (452-518)||(765-830)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (47-156)||(8367-8476)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (366-406)||(3984-4024)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (434-537)||(372-474)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (58-157)||(900-999)
[»] scaffold1695 (2 HSPs)
scaffold1695 (397-487)||(625-714)
scaffold1695 (357-406)||(665-714)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (434-508)||(2725-2800)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (39-150)||(1998-2109)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (446-534)||(1276-1363)
[»] scaffold1276 (1 HSPs)
scaffold1276 (357-401)||(390-434)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (417-492)||(2652-2727)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (440-508)||(53378-53446)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (103-190)||(2945-3032)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (49-148)||(53987-54086)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (469-535)||(775-839)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (486-535)||(1700-1749)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (368-400)||(20735-20767)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 434; Significance: 0; HSPs: 215)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 537
Target Start/End: Original strand, 12465577 - 12466094
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  12465577 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 12465676  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  12465677 agttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 12465776  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12465777 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgacttcaattaggatgtttaagagtat 12465876  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12465877 ttaacttatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 12465976  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  12465977 gagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagtaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgttaagttgttg 12466076  T
Q  520 tatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  12466077 tatgttgctgtctctgct 12466094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 44374681 - 44374164
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  44374681 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 44374582  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  44374581 agttagctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 44374482  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  44374481 attcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtat 44374382  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44374381 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 44374282  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  44374281 gagttacgtatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttg 44374182  T
Q  520 tatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  44374181 tatgttgttgtctttgct 44374164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 44383546 - 44383029
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  44383546 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 44383447  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  44383446 agttagctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 44383347  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  44383346 attcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtat 44383247  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383246 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 44383147  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  44383146 gagttacgtatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttg 44383047  T
Q  520 tatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  44383046 tatgttgttgtctttgct 44383029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 537
Target Start/End: Original strand, 46386404 - 46386921
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||    
T  46386404 gctctctgacagcacatcatgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtctaaacatgaaagttgtagatagttg 46386503  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  46386504 agttagctttccagtggctttggtttgaagtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 46386603  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  46386604 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactatggtgtttaagagtat 46386703  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46386704 ttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgttgttgaataattt 46386803  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46386804 gagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttg 46386903  T
Q  520 tatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  46386904 tatgttgctgtctctgct 46386921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 512
Target Start/End: Original strand, 13147789 - 13148281
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  13147789 gctctgtgatagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctattttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 13147888  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  13147889 agttagctttccattggatttggtttgacgtgaaaatcattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 13147988  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  13147989 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactacaagtattatgagatcaactagggtgtttaagagtat 13148088  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13148089 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 13148188  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 512  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13148189 gagttacatatatttatgcggaaaaggtatgatatagaaaataatatttttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 13148281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 20586087 - 20585574
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||    
T  20586087 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacttttctgttttgaattggccttaggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 20585988  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    ||||||| ||||||||    
T  20585987 agttagctttcccgtggctttggtttgacgtgaaaatgagttttggttcttgaggtatgatgaaaatactccaaggaggt----gtgaaatcttatgaaa 20585892  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  20585891 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaattagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtat 20585792  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20585791 ttaacttatgttgtgatggatctaatttggtttgatgtgaacatttttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 20585692  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  20585691 gagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgtcgtgaagttgttg 20585592  T
Q  520 tatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20585591 tatgttgttgtctctgct 20585574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 12372010 - 12371521
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  12372010 gctctctgacaacacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 12371911  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  12371910 agttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgcgatatggtaaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 12371811  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12371810 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtat 12371711  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  12371710 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt---gttgaataattt 12371614  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 512  Q
    |||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12371613 gagttatatatatttacgtggaaaaagtatgatatagaaaataaagtttttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 12371521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 19282827 - 19282310
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  19282827 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcatctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 19282728  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     |||||||||  ||||| ||||  ||||| |||||||| | |||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19282727 tgttagctttttagtggctttgagttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 19282628  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19282627 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaaatagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtat 19282528  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19282527 ttaacctatgttgtaatggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 19282428  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  19282427 gagttacatatatttatatggaaaagatataatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaacgatgctatgttgtgaagttgttg 19282328  T
Q  520 tatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19282327 tatgttgttgtctctgct 19282310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 11067203 - 11066711
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  11067203 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtatttttcacatgtttctgttttgatttggcttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 11067104  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  11067103 agttagctttccagtggctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccatggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 11067004  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  11067003 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattgcaaacctcaaaactagaagtactatgatttcaactagggtgtttaagagtat 11066904  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11066903 ttaacttatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaagtacatatattatgtgaatgttgtcgttgaataattt 11066804  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 512  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11066803 gagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatggaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 11066711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 512
Target Start/End: Original strand, 12127488 - 12127973
Alignment:
Q  28 acagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagct 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12127488 acagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagtagtagataattgagttagct 12127587  T
Q  128 ttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg-ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 226  Q
     ||  |||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  12127588 atcacgtggcttctgtttgacgtgaaaatgattttttggttcttgagatatgatgaaaatacttcagggaggtattagtgaaatcttatgaaaattcagc 12127687  T
Q  227 atgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacct 326  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  12127688 ataaccgtttctaagttaatccaaaagttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacgt 12127787  T
Q  327 atgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttac 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12127788 atgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacacatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttac 12127887  T
Q  427 atatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 512  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12127888 atatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatactatgttgtgaa 12127973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 505
Target Start/End: Original strand, 32433912 - 32434392
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  32433912 tgacagcacgtcctctttaatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagctag 32434011  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
      ||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32434012 tgttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 32434111  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  32434112 cataaccgtttctaaattaatccaaaacttaatgaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaatc 32434211  T
Q  326 tatgttgtg-atggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagtt 424  Q
    |||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32434212 tatgttatgaaaggatctaatttggtttgacgtgaatatatttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatattgttgttgaataatttgagtt 32434311  T
Q  425 acatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatg 505  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  32434312 acatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttgttattaatgatgttatg 32434392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 24 - 473
Target Start/End: Original strand, 14928653 - 14929100
Alignment:
Q  24 tttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagtt 123  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  14928653 tttgatagcatgttctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttgctgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 14928752  T
Q  124 agctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 223  Q
    ||||||||| |||  |  |||||||  ||||||| | |||||||   ||| ||||||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14928753 agctttccaatggcgtcagtttgactagaaaatgatttttggtttacgagttatgatgaaaataatacaaggagtacttagtgaaattttatgaaaattc 14928852  T
Q  224 agcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaa 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||   ||||||| ||||| |||    
T  14928853 agcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaaagtgtttaaaagtatctaa 14928952  T
Q  324 cctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagt 423  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14928953 cctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataacttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgaga 14929052  T
Q  424 tacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttata 473  Q
    ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14929053 tacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttata 14929100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 24 - 473
Target Start/End: Original strand, 15352119 - 15352566
Alignment:
Q  24 tttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagtt 123  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  15352119 tttgatagcatgttctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttgctgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 15352218  T
Q  124 agctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 223  Q
    ||||||||| |||  |  |||||||  ||||||| | |||||||   ||| ||||||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15352219 agctttccaatggcgtcagtttgactagaaaatgatttttggtttacgagttatgatgaaaataatacaaggagtacttagtgaaattttatgaaaattc 15352318  T
Q  224 agcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaa 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||   ||||||| ||||| |||    
T  15352319 agcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaatgtgtttaaaagtatctaa 15352418  T
Q  324 cctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagt 423  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15352419 cctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataacttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgaga 15352518  T
Q  424 tacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttata 473  Q
    ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15352519 tacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttata 15352566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 14259087 - 14258701
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||| |||||||||||||||||    
T  14259087 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtcttttacacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacattaaagttgtagataattg 14258988  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14258987 agttagctttccagtggctttgctttgacatgaaaatgaactttggttcttgagatatgatgaaaggactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 14258888  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  14258887 attcagcataaccgtttcaaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtat 14258788  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14258787 ttaacatttgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 14258701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 32 - 379
Target Start/End: Original strand, 8851488 - 8851835
Alignment:
Q  32 cacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttcc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8851488 cacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttaggtttcc 8851587  T
Q  132 agtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgac 231  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  8851588 agtggctttggtttgacgtgaaaatgagttttggttctggagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataac 8851687  T
Q  232 cgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||     
T  8851688 cgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagattatttaacctatgtg 8851787  T
Q  332 gtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||    
T  8851788 gtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatcgttgttggatgattt 8851835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 32301917 - 32301531
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  32301917 gctctctgacagcatgtcttgtttcatgttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 32301818  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  32301817 agttagttttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttaatgaaattttatgaaa 32301718  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  32301717 atacagcataaccgtttataagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtat 32301618  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  32301617 ttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatatttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 32301531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 47094815 - 47094500
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  47094815 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 47094716  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  47094715 agttagctttccagtggctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 47094616  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  47094615 attcagcataaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagtagtactatgatttcaattaaggtgtttaagagtat 47094516  T
Q  320 ttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||||||||    
T  47094515 ttaacctatgttgtga 47094500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 38 - 379
Target Start/End: Original strand, 13745111 - 13745452
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||     
T  13745111 ctgtttcatgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaactggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggc 13745210  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttc 237  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13745211 tttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttc 13745310  T
Q  238 taagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatg 337  Q
    |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13745311 taagtcgatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttcagagtatttaacctatgttgtgatg 13745410  T
Q  338 gatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
     |||||| ||||||||| |||||| || ||||||||| ||||    
T  13745411 aatctaacttggtttgatgtgaatatctttgttggatgattt 13745452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 41 - 335
Target Start/End: Original strand, 36685587 - 36685882
Alignment:
Q  41 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtttt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36685587 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggcttt 36685686  T
Q  141 ggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaa 240  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  36685687 ggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcgtaaccgtttctaa 36685786  T
Q  241 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatg-tttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  36685787 gttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgttttaagagtatttaacccatgttgtga 36685882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 26 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16580389 - 16580009
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16580389 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgtcttgaattagtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 16580290  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    |||| ||||||  || ||||||| |||||||| | |||||||   ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16580289 cttttcagtggcgttagtttgacatgaaaatggtttttggtttaggagttgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcag 16580190  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||| ||||||||||     
T  16580189 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaaca 16580090  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16580089 tgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 16580009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 12323247 - 12323527
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  12323247 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggtgtttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 12323346  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||    
T  12323347 agttagctttccgggggctttggtttgacgtgaaaatgatatttggttcttgagatatgatgaaaatacttgaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 12323446  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12323447 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactaaaagtactatgagttcaa 12323527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Original strand, 32160522 - 32160834
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||  |    
T  32160522 ctttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtct 32160621  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  32160622 tagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 32160721  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtattta 322  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32160722 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattta 32160821  T
Q  323 acctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||    
T  32160822 acctatgttgtga 32160834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 24 - 379
Target Start/End: Original strand, 18875167 - 18875522
Alignment:
Q  24 tttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagtt 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18875167 tttgacaacacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttaacacatttatgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagtt 18875266  T
Q  124 agctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 223  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18875267 agctttccagtggatttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggatgtcttagtgaaattttatgaaaattc 18875366  T
Q  224 agcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaa 323  Q
     |||| ||  |||||| || ||||||||||||  ||| |   |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||    
T  18875367 cgcataactatttctaggtcaatccaaaacttgtggattgtctccaaacctcaaaactagaagtaacaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaa 18875466  T
Q  324 cctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  18875467 cctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 18875522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 20620021 - 20619662
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  20620021 gctctctgacaacacgtcctatttcatgttcttgcgtatttttcacacgtttccgtttggaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 20619922  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||    
T  20619921 agttagctttccagtagcttcggtgtgacgtgaaaaagatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttaataaaattttatgaaa 20619822  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| || || || ||||| |  ||||||||||||    
T  20619821 attcagcataaccgtttctaagttaatccataacttatggaataattccaaaactcaaaattagaagtattaggattttaattaaggggtttaagagtat 20619722  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||    
T  20619721 ttaacctacgtggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgattt 20619662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Original strand, 708889 - 709187
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  708889 cctgttttatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttatgatttggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatgg 708988  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||    
T  708989 ctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcttaactgttt 709088  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  709089 ctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 709187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 26 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16462765 - 16462456
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||| | ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16462765 tgacagcatgccctattttatgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 16462666  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16462665 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 16462566  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| |||||||||||    
T  16462565 catagctgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgattaacagtatttaacc 16462466  T
Q  326 tatgttgtga 335  Q
    ||||||||||    
T  16462465 tatgttgtga 16462456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 58734 - 59050
Alignment:
Q  19 agctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataatt 118  Q
    |||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| || ||||||    
T  58734 agctctctgacagcatgccatgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtataaacatgaaagttttatataatt 58833  T
Q  119 gagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
      |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  58834 ttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 58933  T
Q  219 aattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagta 318  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  58934 aattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagta 59033  T
Q  319 tttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||    
T  59034 tttaacctatgttgtga 59050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 832339 - 832655
Alignment:
Q  19 agctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataatt 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  832339 agctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttcggttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatt 832438  T
Q  119 gagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
      |||||||||||| ||| |||||||||||   |||||| | |||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  832439 ttgttagctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaa 832538  T
Q  219 aattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagta 318  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  832539 aattcagcaaaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaagatgtttaagagta 832638  T
Q  319 tttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||| |||||||||    
T  832639 tttaacccatgttgtga 832655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 1197519 - 1197835
Alignment:
Q  19 agctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataatt 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  1197519 agctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttcggttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatt 1197618  T
Q  119 gagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
      |||||||||||| ||| |||||||||||   |||||| | |||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1197619 ttgttagctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaa 1197718  T
Q  219 aattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagta 318  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1197719 aattcagcaaaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaagatgtttaagagta 1197818  T
Q  319 tttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||| |||||||||    
T  1197819 tttaacccatgttgtga 1197835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Original strand, 16550324 - 16550636
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16550324 ctttgacagcatcccctgtttcacgttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 16550423  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16550424 tagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtatttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 16550523  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtattta 322  Q
     || || ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  16550524 gagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaagtgtttaagagtattta 16550623  T
Q  323 acctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||    
T  16550624 acctatgttgtga 16550636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16615338 - 16615026
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16615338 ctttgacagcatcccctgtttcacgttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 16615239  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16615238 tagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtatttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 16615139  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtattta 322  Q
     || || ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  16615138 gagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaagtgtttaagagtattta 16615039  T
Q  323 acctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||    
T  16615038 acctatgttgtga 16615026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13647960 - 13647662
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647960 cctgttttatgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttcaattggcctttggtctaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 13647861  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  13647860 ctttggtttgacgtgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgttt 13647761  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  13647760 ctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacccatgttgtga 13647662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Original strand, 30820590 - 30820888
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  30820590 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctagtgg 30820689  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
    | |||||||||| |||||||  | ||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  30820690 tattggtttgacttgaaaataatttttggtttttaagatatgataaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttt 30820789  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30820790 ctaagataatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 30820888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 37 - 332
Target Start/End: Original strand, 14415818 - 14416113
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  14415818 cctgttttatgttcttgcgtctttttcacacgtttctattttgaattggcctttggtgtgaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 14415917  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| ||||||||   ||| ||  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14415918 ctttggtttgacttgaaaatgacttttagtgtttgatttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttt 14416017  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttg 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14416018 ctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttg 14416113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15214217 - 15213919
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  15214217 cctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgagttgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 15214118  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||| || |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  15214117 ctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgttt 15214018  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  15214017 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaatttatgttgtga 15213919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 99 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33001570 - 33001269
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33001570 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttaacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 33001471  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33001470 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttc 33001371  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtg 398  Q
    ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33001370 aattaaggtgtttaagagaatttaacctatgttgtgatggacctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatatattatgtg 33001271  T
Q  399 aa 400  Q
    ||    
T  33001270 aa 33001269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 379
Target Start/End: Original strand, 43277060 - 43277420
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  43277060 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttaaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 43277159  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttat-gaa 218  Q
     |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||  ||    
T  43277160 tgttagctttcaagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatacttcaagaaggtcttagtgaaattttatcaaa 43277259  T
Q  219 aattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagta 318  Q
    ||||| |||| ||  |||||| || ||  ||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  43277260 aattccgcataactatttctaggtcaactcaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagta 43277359  T
Q  319 tttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| || ||||||||| ||||    
T  43277360 tttaacatatgttgtgatggatctaacttggtttagcgtgaatatctttgttggatgattt 43277420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 39 - 335
Target Start/End: Original strand, 47975251 - 47975543
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  47975251 tgttttatgttcttgtgtctttttcacacatttctgttttgaattgaccttt--ggta--catgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggct 47975346  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttct 238  Q
    |||||||||| |||||||| | |||| |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  47975347 ttggtttgacttgaaaatgatttttgatgtttgagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacagtttct 47975446  T
Q  239 aagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47975447 aagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacatcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 47975543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 34957907 - 34957595
Alignment:
Q  19 agctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataatt 118  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  34957907 agctctctgacagcacgttctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatt 34957808  T
Q  119 gagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
      |||||||||| | ||| |||||||||||   |||||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  34957807 ttgttagctttcaaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttagtttttgagatatgattaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaa 34957708  T
Q  219 aattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagta 318  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  34957707 aattcagcataaccatttctaaggtaatccaaaacttatgggataattccaaggatcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagta 34957608  T
Q  319 tttaacctatgtt 331  Q
    ||||||| |||||    
T  34957607 tttaacccatgtt 34957595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4325785 - 4325476
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  4325785 tgacagcatatcctgttttatgttcttgcatctttttaacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaatgttgtagataattgcgttag 4325686  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  4325685 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttaatgaaatcttatgaaaattcag 4325586  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  4325585 cacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgcgataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatc 4325486  T
Q  326 tatgttgtga 335  Q
     |||||||||    
T  4325485 catgttgtga 4325476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Original strand, 14188628 - 14188924
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||    
T  14188628 cctgtttcgcgtttttgcgtctttttcacacgtttcttttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgg 14188727  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| ||||||||  | || ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  14188728 ctttggtttgacttgaaaatg--acttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtctttgtgaaatattatgaaaattcagcataactgttt 14188825  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14188826 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 14188924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16999167 - 16998846
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| | ||||  |||||||| |||||||||||    
T  16999167 gctctctgacagcacgtcatgtttcatgttcttgcgtctttttcatacatttctgttttgaattagcctttggtgtaaatatgaaagtagtagataattg 16999068  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||    
T  16999067 agttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagagatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttaggaaa 16998968  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagt------actatgagttcaattaggatgtttaa 313  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||      || ||||||||||||| | |||||||    
T  16998967 attcagtataaccttttctatgttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtaccatcaccatgagttcaattaaggtgtttaa 16998868  T
Q  314 gagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  16998867 gagtatttaacccatgttgtga 16998846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3287725 - 3287373
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  3287725 gctctctgacaacacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgacagttgtagataattg 3287626  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | |||| || ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3287625 tgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaa 3287526  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||| |||| ||  |||||| || || |||||||||| ||| |   |||||||       ||||||||| || ||||| ||||| |  |||||||| |||    
T  3287525 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaac-------ctagaagtattaggagtttaattaaggggtttaagaatat 3287433  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  3287432 ttaacgtatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 3287373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 333
Target Start/End: Original strand, 17070626 - 17070923
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttt-tcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtg 135  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||    
T  17070626 cctgtttcgcgttcttgcgtcttttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatg 17070725  T
Q  136 gttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtt 235  Q
      |||| |||||| |||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  17070726 actttgttttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttattgaaatcttatgaaaattcagcataaccatt 17070825  T
Q  236 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgt 333  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17070826 tctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaattctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 17070923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 47 - 280
Target Start/End: Original strand, 29052499 - 29052732
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29052499 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtaattgtgttagctttccagtggttttggtttg 29052598  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  29052599 acttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaat 29052698  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 280  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  29052699 ccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 29052732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 47 - 327
Target Start/End: Original strand, 10896338 - 10896618
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  10896338 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 10896437  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || | |||||| | ||| |||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10896438 actttaaaatgatttttagtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaat 10896537  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaaccta 327  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10896538 ccaaaacttagggaataattccaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaagctgtttaagagtatttaaccta 10896618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 47 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15167683 - 15167403
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||    
T  15167683 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttg 15167584  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || ||||||||   ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15167583 acttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 15167484  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaaccta 327  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15167483 ccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 15167403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 379
Target Start/End: Original strand, 14161172 - 14161530
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  14161172 gctctctgacagcacgtcctgtttcacgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 14161271  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     ||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||  | ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14161272 tgttagatttccattggctttggtttgacttgaaaatcatttttggtttttgaggtttgataaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaa 14161371  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||| |||| ||  |||||| || || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  14161372 attctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagattat 14161470  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  14161471 ttaacctatgttttgatggatcttacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 14161530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Original strand, 37727261 - 37727559
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  37727261 cctgtttcgtgttcttgcatcttttacacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtatataattttgttagctttccagtgg 37727360  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||||||   |||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| || || ||| |||    
T  37727361 ctttggtttgactcaaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataacctttt 37727460  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37727461 ctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccatcaaaactagaagtactatgagttcaatcaaggtgtttaagagtttttaacctatgttgtga 37727559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 38 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25942154 - 25941814
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||     
T  25942154 ctgtttcatgtttttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttgctgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggc 25942055  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttc 237  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||    
T  25942054 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcatgataatttc 25941955  T
Q  238 taagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatg 337  Q
    || || || ||||| |||| ||| |   ||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25941954 taggtcaacccaaatcttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatg 25941856  T
Q  338 gatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    || |||| |||||||||||||||| || || |||||| ||||    
T  25941855 gaactaacttggtttgacgtgaatatctttattggatgattt 25941814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 48213262 - 48213602
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  48213262 gctctctgacaacacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctattttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 48213361  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     ||||| |||||| | | ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48213362 tgttagatttccattcgctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 48213461  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||| |||| ||  ||| ||||| || | |||||||| ||| |   ||||||| ||||| | |   |||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  48213462 attccgcataactatttttaagtcaacctaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc-atgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatat 48213560  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  48213561 ttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgcgaat 48213602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 38828779 - 38828481
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  38828779 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacatttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 38828680  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||  |||    
T  38828679 ctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaactattt 38828580  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||| |  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38828579 ctaagttaatccaaaacttatgagacaattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccacgttgtga 38828481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 39 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 32772044 - 32771760
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  32772044 tgtttcatgttcttgtgtctttttcatacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggct 32771945  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttct 238  Q
    ||||||||||  ||||||| | ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  32771944 ttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaataatccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttct 32771845  T
Q  239 aagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaa 323  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  32771844 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 32771760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 99 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 48812494 - 48812258
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  48812494 catgaaagttgtatataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactgcaaggagg 48812395  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  48812394 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagagaataattccaaacctcaaaactagaagtattaggagttt 48812295  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48812294 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 48812258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 99 - 335
Target Start/End: Original strand, 8756792 - 8757028
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  8756792 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccgaggagg 8756891  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8756892 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttttgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 8756991  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8756992 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 8757028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11661813 - 11661525
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  11661813 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 11661714  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || ||||||||   |||  || ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||    
T  11661713 acttgaaaatgacttttattttttgagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaacacaaccatttctaagttaat 11661614  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11661613 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 11661525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 178 - 406
Target Start/End: Original strand, 16460407 - 16460635
Alignment:
Q  178 gatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaa 277  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16460407 gatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaa 16460506  T
Q  278 aactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataat 377  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||    
T  16460507 aactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaatattatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataat 16460606  T
Q  378 ttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16460607 ttgagatacatatattatgtgaatattgt 16460635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 142 - 406
Target Start/End: Original strand, 16585390 - 16585654
Alignment:
Q  142 gtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaag 241  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||   ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16585390 gtttgacatgaaaatggtttttggtttaggagttgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 16585489  T
Q  242 ttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatc 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  16585490 ttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgtgatggatc 16585589  T
Q  342 taatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16585590 taatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 16585654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 41 - 336
Target Start/End: Original strand, 14153310 - 14153604
Alignment:
Q  41 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtttt 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| | |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||| || ||| |||    
T  14153310 tttcgtgttcttgcgtcttttacacacgtttctgttttgaattagtctttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttacaatggcttt 14153409  T
Q  141 ggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaa 240  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14153410 ggtttgacttgaaaataatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 14153509  T
Q  241 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
     ||||||||||||||| ||| |   ||||||| ||||| |  |  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14153510 tttaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcctg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgat 14153604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 41 - 335
Target Start/End: Original strand, 12755044 - 12755338
Alignment:
Q  41 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtttt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||| | |||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||    
T  12755044 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgtttttaactgtgttttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagatttccaatggcttt 12755143  T
Q  141 ggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaa 240  Q
    ||||||||  |||||||   ||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12755144 ggtttgactagaaaatgagttttagattttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 12755243  T
Q  241 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12755244 gttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttgacccatgttgtga 12755338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 39 - 361
Target Start/End: Original strand, 24270318 - 24270639
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||      
T  24270318 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttatgttttgaattggccttgggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttcaaatggaa 24270417  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttct 238  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |    
T  24270418 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactattttt 24270517  T
Q  239 aagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgg 338  Q
    |||| || | |||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  ||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24270518 aagtcaaccgaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatga 24270616  T
Q  339 atctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    || ||| ||||||||||||||||    
T  24270617 atttaacttggtttgacgtgaat 24270639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 4691213 - 4691553
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  4691213 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgtttttgcgtctttttcatacgtttctgttttgaattagcctttggtataaacatgaaagttgtagataattg 4691312  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     ||||| ||||||||||  | |||||||| |||||||  | ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4691313 tgttagatttccagtggagtcggtttgacttgaaaataatttttggtttttgatttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 4691412  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||| |||| ||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| |||||  | |  |||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  4691413 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtat 4691511  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  4691512 ttaaccaatgttgtgatgaatctaactaggtttgacgtgaat 4691553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 36 - 329
Target Start/End: Original strand, 15119641 - 15119921
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtg 135  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  15119641 tcctgttttatgttattgcgtctttttcacacgtttcgattttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagatttctagtg 15119740  T
Q  136 gttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtt 235  Q
    | ||||||||||| ||||| |             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||    
T  15119741 gctttggtttgacttgaaagt-------------tgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttataaatattcagcataactgtt 15119827  T
Q  236 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatg 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15119828 tctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 15119921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15720483 - 15720250
Alignment:
Q  21 ctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattga 120  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||      
T  15720483 ctctctgacagcatgccctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataatttt 15720384  T
Q  121 gttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaa 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  15720383 gttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgaggtatgataaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatgaaaa 15720284  T
Q  221 ttcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaact 254  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15720283 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 15720250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 59 - 335
Target Start/End: Original strand, 18456004 - 18456280
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  18456004 ttttcacccttttgtgttttgaatttg-ctttcggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatg 18456102  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||     
T  18456103 atttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccatttctaaattaatccaaaacttat 18456202  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18456203 gggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 18456280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 15576150 - 15576488
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| ||| ||||||||||||||||     
T  15576150 gctctctgacagcacatcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttcaattggcctttggtttaaacataaaagttgtagataatt- 15576248  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||| ||| || ||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  15576249 -gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaataatttttggtttttgagttatcataaaaatgctccaagaaggttttagtgaaattttatgaaa 15576347  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||| |||| ||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |   ||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  15576348 attctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tctactatgagttcaattaaggtgtttaagggtat 15576446  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    ||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  15576447 ttaacttatgttgtgattaatctaacttggtttgacgtgaat 15576488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 37 - 331
Target Start/End: Original strand, 17505338 - 17505632
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||     
T  17505338 cctgttttatgttcttgcgtctgtttcacgtgtttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatga 17505437  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  17505438 ctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagcataacccttt 17505537  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  17505538 ttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgtt 17505632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 37 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17547876 - 17547582
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||     
T  17547876 cctgttttatgttcttgcgtctgtttcacgtgtttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatga 17547777  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  17547776 ctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagcataacccttt 17547677  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  17547676 ttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgtt 17547582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 175 - 379
Target Start/End: Original strand, 13745672 - 13745876
Alignment:
Q  175 tatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 274  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13745672 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatagccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaataattccaaacct 13745771  T
Q  275 caaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||    
T  13745772 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttcacgtgaatatctttgttggat 13745871  T
Q  375 aattt 379  Q
     ||||    
T  13745872 gattt 13745876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14422493 - 14422205
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  14422493 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 14422394  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    ||   |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||    
T  14422393 actctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaat 14422294  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14422293 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagcatttaacccatgttgtga 14422205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18872868 - 18872580
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  18872868 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 18872769  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    ||   |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||    
T  18872768 actctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 18872669  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18872668 ccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 18872580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 335
Target Start/End: Original strand, 14191479 - 14191718
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||  | || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14191479 gtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatg--acttagtttttgagttatgatgaaaatactccaa 14191576  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  14191577 ggaggtcttagtgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactata 14191676  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14191677 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 14191718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14566710 - 14566422
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  14566710 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggctttggtttg 14566611  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    ||   |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||    
T  14566610 actctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 14566511  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||   || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14566510 ccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgtaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 14566422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16009086 - 16008798
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||| |||||||||    
T  16009086 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgctagctttccaatggctttggtttg 16008987  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    ||   |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||    
T  16008986 actctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 16008887  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16008886 ccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 16008798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 148126 - 147838
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| |||||||||    
T  148126 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtacacatgaaagttgtagataattctgttagctttacaatggctttggtttg 148027  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    ||   ||||||   |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||    
T  148026 actctaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 147927  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  147926 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 147838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 335
Target Start/End: Original strand, 13699285 - 13699521
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13699285 catgaaagctttagataattgtgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 13699384  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
     ||||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  13699385 ccttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccatttctaagttaatctgaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttt 13699484  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13699485 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 13699521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 48743964 - 48743698
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  48743964 gtaaacataaaagttttagataattttgttagcttttcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaa 48743865  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     |||  ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  48743864 ggagaacttagtgaaatcttataaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagatgtactatg 48743765  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaa 360  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  48743764 agttcaattaaggtgtttaggagtatttaacatatgttctgatgaatctaagttggtttgacgtgaa 48743698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 355
Target Start/End: Original strand, 20252686 - 20252993
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| | ||| | |||||          |||||||||||||||    
T  20252686 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacgtgataattgta----------ttagctttccagtgg 20252775  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||  |||    
T  20252776 ttttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtaaaattttacgaaaattccgcataactattt 20252875  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    |||||| || |||||| ||| ||| |   ||||||| ||||| ||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20252876 ctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 20252974  T
Q  337 ggatctaatttggtttgac 355  Q
    | |||||  ||||||||||    
T  20252975 gaatctatcttggtttgac 20252993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 94 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13408433 - 13408192
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  13408433 gtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaattctccaa 13408334  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  13408333 gtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaggctcaaaactagaagtactatg 13408234  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13408233 agttcaattaagttttttaagagtatttaacccatgttgtga 13408192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 94 - 335
Target Start/End: Original strand, 40555134 - 40555375
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||| | |||||| | |||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  40555134 gtaaacatgaaagttttagataattttgttaactttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttgatttttgagatatgatgtaaatactccaa 40555233  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40555234 ggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatg 40555333  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||| || ||||||    
T  40555334 agttcaattaaggtgtttaagtgtatttaacccatattgtga 40555375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18607995 - 18607707
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||| |||||| ||  || ||||||||| ||| |||||||||    
T  18607995 gttcttgtgtctttttcacacgtttttgttttgaattggactttggtgtaaacatggaagttttagatacttttgtcagctttccaatggctttggtttg 18607896  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || | |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||    
T  18607895 actttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttaaggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaat 18607796  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18607795 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 18607707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 59 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 29004518 - 29004242
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgt 158  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||   || | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||     
T  29004518 ttttcacccctttccgttttgaattgggtcttagtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatga 29004419  T
Q  159 tatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaag 258  Q
    | ||| ||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  29004418 tttttagtttttgagatatgatgaaaatactcaagggaggtcctagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccgtttccaagttaatcgaaaacttatg 29004319  T
Q  259 gaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    | |||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29004318 ggataattccaggactaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 29004242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 1856720 - 1856915
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  1856720 ctttgacagcattccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 1856819  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1856820 tagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 1856915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 38 - 337
Target Start/End: Original strand, 8514081 - 8514379
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |     
T  8514081 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacccgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagatttcgagttgc 8514180  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttc 237  Q
    ||||||||||| |||||| |   ||||| | ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||    
T  8514181 tttggtttgacttgaaaaagaattttgggttttgaattatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttgtgaaaattccgcataactatttc 8514280  T
Q  238 taagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatg 337  Q
    || || || |||||||||| ||| |   |  |||| ||||| || |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8514281 taggtcaacccaaaacttatggattgtcttaaaacttcaaatcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttatgatg 8514379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 329
Target Start/End: Original strand, 9743404 - 9743706
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  9743404 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgtatctttttcacacgtttctggtttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgttttag 9743503  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||| | ||   || || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9743504 cttttcagtggctttggtttgacttgaaaatgattttgtctttttaagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcgg 9743603  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| ||  |||||| || || |||||||||| ||| |   ||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||    
T  9743604 cataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaactttaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggcgtttaagcgtatttaacc 9743702  T
Q  326 tatg 329  Q
    ||||    
T  9743703 tatg 9743706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 343
Target Start/End: Original strand, 21538544 - 21538828
Alignment:
Q  58 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21538544 tttttctcacatttctattttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagttttccagtggctttggtttgacttgaaaatg 21538643  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | |||   | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||| || ||||||||||     
T  21538644 atttttaaattttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataatcatttctaagtcaacccaaaacttat 21538743  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatcta 343  Q
     || |  |||||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21538744 agattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatagatcta 21538828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 352
Target Start/End: Original strand, 39292093 - 39292385
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgt 158  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  | ||| | |||| ||||||| || |||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||     
T  39292093 ttttcacccttttctgttttgaatttacttttggtgtaaacatgaaaattttagataattttgttagctttccattgactttggtttgaattgaaaatga 39292192  T
Q  159 tatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaag 258  Q
    | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||| | ||  ||||||||| |    
T  39292193 tttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaaatcaactcaaaacttatg 39292292  T
Q  259 gaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggttt 352  Q
    || |  |||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39292293 gattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggttt 39292385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 198 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13894652 - 13894489
Alignment:
Q  198 gtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 297  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13894652 gtcttagtgaaatcttattaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaagctcaaaactagaagtactatgagtt 13894553  T
Q  298 caattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13894552 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggcttgacgtgaat 13894489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 13917893 - 13918088
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  13917893 ctttgacagcattccctgtttcgcggtcttgcttctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 13917992  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13917993 tagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgattattggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 13918088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 25926620 - 25926815
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  25926620 ctttgacagcattccctatttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 25926719  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25926720 tagctttctagtggctttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 25926815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 59 - 303
Target Start/End: Original strand, 13864751 - 13864995
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||    
T  13864751 ttttcacccttttttgttttgaatttg-ctttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttgggttgacttaaaaatg 13864849  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||     
T  13864850 atttttagtttttgagatatgaggaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttagaaaaattcagtacaaccttttctaagttaatccaaaacttat 13864949  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatta 303  Q
    || ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13864950 gggataattccaaggctcaaaagtagaagtactatgagttcaatta 13864995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 414 - 534
Target Start/End: Original strand, 37785076 - 37785196
Alignment:
Q  414 taatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 513  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37785076 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 37785175  T
Q  514 ttgttttatgttgttgtctct 534  Q
    ||||| ||||||| |||||||    
T  37785176 ttgttgtatgttgctgtctct 37785196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 58 - 352
Target Start/End: Original strand, 15978411 - 15978704
Alignment:
Q  58 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||    
T  15978411 tttttcacccgtttccgttttgaattggcttttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccactgactttggcttgacttgaaaatg 15978510  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | ||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  || ||| ||||||||||||  |||| ||  ||||||||| || ||||||||||     
T  15978511 atttttagattttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtctcggtaaaactttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttat 15978610  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggttt 352  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||  || ||||||||| |||||||    
T  15978611 ggaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggggtt-aattaagaggtttaagagcacttaacctatgtcttgttggatctaacttggttt 15978704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 330
Target Start/End: Original strand, 3192638 - 3192920
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |  | | ||||||| || |||||||||| ||||| ||| |||||  |||||||||    
T  3192638 gttcttgcgtctttttcacacatttgtgttttgaatttgcctttggcattaacatgaaattt-tagataattgtgttagttttgcagtgtctttggtttg 3192736  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || |||||||| | ||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||  ||||||||| ||     
T  3192737 acttgaaaatgatttttagattttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattgtgcataactatttctaagtcaac 3192836  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgt 330  Q
    |||||||||| |   |  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3192837 ccaaaacttatgatttgtttctaaacttcaaaactagaagtattatgagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 3192920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32126165 - 32125967
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||     
T  32126165 gctctctgacagcatgtcatgtttcatgttcttgcgtcttgttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattt 32126066  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     |||||||||||| ||| |||||| || ||| ||||||   |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32126065 tgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 32125967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 424 - 537
Target Start/End: Original strand, 18875646 - 18875759
Alignment:
Q  424 tacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatg 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18875646 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatacaattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 18875745  T
Q  524 ttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||||    
T  18875746 ttgttgtctctgct 18875759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 353
Target Start/End: Original strand, 18080064 - 18080367
Alignment:
Q  49 tcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgac 148  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||  | |||| ||| ||| || |||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  18080064 tcttgcatctttttcacgcatttctgttttgaattggccttcggtgtaaacattaaatttttagataattgtgttagctttacagtggctttgatttgac 18080163  T
Q  149 gtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatcc 248  Q
     |||||||| | ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||  |||||| || || ||    
T  18080164 ttgaaaatgatttttggtttttgacttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatttaatgaaaattccgcataactatttctatgtcaaccc 18080263  T
Q  249 aaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttg 348  Q
    |||||||| ||| |  |||||||| |  ||||| |  ||||||||| ||| |||| | ||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||     
T  18080264 aaaacttatggattgtttccaaacttagaaacttg-tgtactatgaattcgattaaggtgtttcagggtatttaagttatgttgtgttggatctaacttt 18080362  T
Q  349 gtttg 353  Q
    |||||    
T  18080363 gtttg 18080367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 8563925 - 8564227
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||  |||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||    
T  8563925 cctgtttcgggttctcgcgtctttttcacacgtttctattttgaattgacctttggtgtacacatgaaagttttagataattgtgttagcttttcaatgg 8564024  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
    |||| || ||| ||||| ||| | ||| | | || || |||||||||||||||||||   |||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  8564025 ttttcgtgtgatgtgaagatgatttttagattttaagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttggtaaaactttatgaaaattcagcataaccgttt 8564124  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    |||||| || ||||| || | ||  |  ||||||||  ||||| | |  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8564125 ctaagtcaacccaaagctaatggtttgtttccaaactccaaaaattg-tgtactatgatttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaat 8564223  T
Q  337 ggat 340  Q
    ||||    
T  8564224 ggat 8564227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 275 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 15720256 - 15720130
Alignment:
Q  275 caaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  15720256 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacttatgttgtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatctttgttggat 15720157  T
Q  375 aatttgaaatacatatattatgtgaat 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15720156 aatttgaaatacatatattaagtgaat 15720130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 233 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 20487965 - 20487792
Alignment:
Q  233 gtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttg 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| |  |||||| |||||||||| | |||||    
T  20487965 gtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactaggagtactaggtgtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttg 20487866  T
Q  333 tgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20487865 tgatggatctaatttgctcggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 20487792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 218
Target Start/End: Original strand, 23664457 - 23664638
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||    
T  23664457 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgg 23664556  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     ||| |||||||  ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23664557 ctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 23664638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14273891 - 14273768
Alignment:
Q  212 ttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgttt 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14273891 ttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgttt 14273792  T
Q  312 aagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  14273791 aagagtatttaacccatgttgtga 14273768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 15376201 - 15376348
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  15376201 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 15376300  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  15376301 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 15376348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 20384611 - 20384758
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  20384611 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 20384710  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  20384711 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 20384758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11303905 - 11303724
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  11303905 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 11303806  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     |||  ||||||  |||| || | |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11303805 ctttaatttgactcgaaattgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 11303724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29801087 - 29800906
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  29801087 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 29800988  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     |||  ||||||  ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  29800987 ctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29800906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 424 - 537
Target Start/End: Original strand, 43277546 - 43277659
Alignment:
Q  424 tacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatg 523  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43277546 tacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 43277645  T
Q  524 ttgttgtctctgct 537  Q
    ||  ||||||||||    
T  43277646 ttactgtctctgct 43277659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 218
Target Start/End: Original strand, 16108203 - 16108374
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||  | ||| |||||||||    
T  16108203 gttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttacctttttaatggatttggtttg 16108302  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     | |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16108303 gcttgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 16108374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 424 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 3287247 - 3287145
Alignment:
Q  424 tacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatg 523  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3287247 tacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 3287148  T
Q  524 ttg 526  Q
    |||    
T  3287147 ttg 3287145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13870020 - 13869885
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  13870020 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 13869921  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  13869920 tgttagctttccagtgg--tcggtttgacttgaaaatg 13869885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Original strand, 44190591 - 44190729
Alignment:
Q  45 atgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtt 144  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||    
T  44190591 atgttattgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgcgttagcttttcaatggctttggtt 44190690  T
Q  145 tgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaa 183  Q
    |||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  44190691 tgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaa 44190729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29797268 - 29797087
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  29797268 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 29797169  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     | |  ||||||  ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  29797168 ctctaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29797087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27217535 - 27217388
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  27217535 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcatacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 27217436  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  27217435 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 27217388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3137007 - 3136710
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| | |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| |    
T  3137007 tgtttcgtgttcttgcgtctttttcacacatttttcttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttttagataaatgatttagctttccaatggct 3136908  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttct 238  Q
    ||| ||||||   ||||||   |||   | ||||| || | ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||| ||||| || |||||     
T  3136907 ttgctttgacc--aaaatgagttttatattttgagttagg-tgaaaatactccaagtaggtcttggtaaaattttaagaaaattaagcataactgtttcc 3136811  T
Q  239 aagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgg 338  Q
    |||| || |||||||||| ||  |  |||||||| |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  3136810 aagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacatcaaaacttga-gtactaagagtttaattaggatgtttaagagtgtttaacctatgatatgatgg 3136712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14317800 - 14317690
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14317800 tgacagcatctcctatttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttag 14317701  T
Q  126 ctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||    
T  14317700 ctttccagtgg 14317690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37539125 - 37538949
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||      
T  37539125 ctgtttcatgttcttgggtctttttcacacgtttctgttttgaattggccttttgtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgtc 37539026  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaatttta 214  Q
    ||||||||||| | |||||||| | ||| | ||||| ||| ||||||| |||||||  ||||||| | |||||||||    
T  37539025 tttggtttgacttaaaaatgttttgtggattttgagttattatgaaaacactccaagtaggtcttggagaaatttta 37538949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41523574 - 41523394
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  41523574 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 41523475  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||| || ||| ||||||   |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  41523474 tttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 41523394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41526036 - 41525856
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  41526036 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 41525937  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||| || ||| ||||||   |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  41525936 tttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 41525856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18431383 - 18431188
Alignment:
Q  24 tttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgttt-ctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  18431383 tttgacagaatgtcatgtttcatgttcttgcgtctttttcacacattttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 18431284  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    || |||||||||||  | |||||||| |||||||| | || ||||   | | |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||    
T  18431283 tatctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttaggtgttatgatgaaaatactcaaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 18431188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 196 - 319
Target Start/End: Original strand, 13918260 - 13918383
Alignment:
Q  196 aggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgag 295  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13918260 aggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgag 13918359  T
Q  296 ttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||||||| | |||||||||||||    
T  13918360 ttcaattaaggtgtttaagagtat 13918383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20488109 - 20487999
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20488109 tgacagcatgtcttgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctcttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 20488010  T
Q  126 ctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||    
T  20488009 ctttccagtgg 20487999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 183
Target Start/End: Original strand, 39431562 - 39431707
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||     
T  39431562 cctgttttatgttcttgcgtctttttcacacgtttatgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttaacttttcagtga 39431661  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaa 183  Q
     ||||| ||||| || ||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  39431662 ctttggcttgacttggaaatgatttttggtt-ttgagatatgatgaa 39431707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 130
Target Start/End: Original strand, 45847142 - 45847252
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  45847142 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 45847241  T
Q  120 agttagctttc 130  Q
     |||| |||||    
T  45847242 tgttaactttc 45847252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24702885 - 24702705
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  24702885 ctgttccatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaatttgtagataattttgttagctttccaatggc 24702786  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||| || ||| ||||||   |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24702785 tttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24702705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24705332 - 24705152
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  24705332 ctgttccatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaatttgtagataattttgttagctttccaatggc 24705233  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||| || ||| ||||||   |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24705232 tttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24705152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 203 - 319
Target Start/End: Original strand, 25926993 - 25927109
Alignment:
Q  203 agtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 302  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25926993 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 25927092  T
Q  303 aggatgtttaagagtat 319  Q
    | | |||||||||||||    
T  25927093 aaggtgtttaagagtat 25927109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 210 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 28720005 - 28719885
Alignment:
Q  210 ttttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgt 309  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || ||    
T  28720005 ttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagggaatatttccaaacctcaaaactatgagtactaggagtttaattaagaggt 28719906  T
Q  310 ttaagagtatttaacctatgt 330  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  28719905 ttaaaagtatttaacctatgt 28719885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16410733 - 16410586
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||| |||||||||||||||||    
T  16410733 gctctctgacagcatgtcctgtttcacgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattg 16410634  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||| ||||||  | || ||||| |||||||| | |||||||    
T  16410633 tgttagctttacagtggcgtcggcttgacttgaaaatgatttttggtt 16410586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 157
Target Start/End: Original strand, 11392806 - 11392924
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       
T  11392806 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctattttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgtcg 11392905  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  11392906 tcggtttgacttgaaaatg 11392924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16233196 - 16233058
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttc-atgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataatt 118  Q
    ||||| |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||| |||||||||||||||    
T  16233196 gctctgtgacagcatgtcttttttccatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatggaagttgtagataatt 16233097  T
Q  119 gagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    | ||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  16233096 gtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatg 16233058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 46473766 - 46473585
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  46473766 gttcttgtgtctttttcacacatttttgttttaaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccaatagttttggtttg 46473667  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcat 228  Q
    ||  |||||||   |||   | | ||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  46473666 actagaaaatgaattttacatttggaggtatgatgaaaatactccaagcgggtcttagtaaaactttatgaaaattcagcat 46473585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 228
Target Start/End: Original strand, 46580320 - 46580449
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||  ||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  46580320 catgaaagttgtagataattttgttagttttccaatgactttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagt 46580419  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcat 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46580420 tcttactgaaattttatgaaaattcagcat 46580449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 456988 - 456859
Alignment:
Q  27 gacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagc 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  456988 gacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaatt-aactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagc 456890  T
Q  127 tttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    |||||| |||  | |||| ||| ||||||||    
T  456889 tttccaatggcgtcggttggacttgaaaatg 456859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Original strand, 14948628 - 14948808
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  || ||||||||||||||||  |||||| ||||| |||     
T  14948628 ctgtttcatgttcttgcgtcttttgcacacgtttccgttttgaactgggttttagtgtaaaaataaaagttgtagataattttgttagccttccaatggc 14948727  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||| || || ||| ||||||   |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14948728 tttagtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 14948808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18640946 - 18640830
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||| ||    
T  18640946 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttgtcatatgtttctgtttcgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataactg 18640847  T
Q  120 agttagctttccagtgg 136  Q
     ||||||||||||||||    
T  18640846 tgttagctttccagtgg 18640830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Original strand, 18985066 - 18985185
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| | |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  18985066 cctgttttgtgttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgatttgacctttggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttccagtgg 18985165  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    | |||||||||| |||||||    
T  18985166 tcttggtttgacatgaaaat 18985185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Original strand, 18999694 - 18999813
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| | |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  18999694 cctgttttgtgttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgatttgacctttggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttccagtgg 18999793  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    | |||||||||| |||||||    
T  18999794 tcttggtttgacatgaaaat 18999813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19194869 - 19194763
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||    
T  19194869 cctgttttatgttcttgcgtctttttcacacgtttcggttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccattgg 19194770  T
Q  137 ttttggt 143  Q
     ||||||    
T  19194769 atttggt 19194763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11309992 - 11309871
Alignment:
Q  72 ctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttg 171  Q
    |||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  |||    
T  11309992 ctgtttcgaattgtcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccattggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttg 11309893  T
Q  172 agatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  11309892 agatatgatgaaaataccccaa 11309871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 404 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 15281607 - 15281477
Alignment:
Q  404 tgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgcta 503  Q
    ||||||||  || ||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  15281607 tgttgttggttattttgaattacatatat-tatgtggaaagtgtatgatatagaaaataatgttgttatatcatccaagttgttatta-taatgttgcta 15281510  T
Q  504 tgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    |||||  ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15281509 tgttg-caagttgtttaatggtgttgtctctgct 15281477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 404 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 11053976 - 11053845
Alignment:
Q  404 tgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgct 502  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11053976 tgttgttggttaatttgagctacatatat-tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgct 11053878  T
Q  503 atgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    || |||  |||||  ||||||||||||||| ||||    
T  11053877 atattg-caagtt-ctttatgttgttgtctatgct 11053845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 11287145 - 11287019
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||||||||| ||  || | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||||||     
T  11287145 gctctttgacaacatttcttatttcacgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattagccttttgtgtaaacatgaaagttttagataatta 11287046  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
     |||||||||| | ||| |||||||||    
T  11287045 tgttagctttctaatggctttggtttg 11287019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 107
Target Start/End: Original strand, 16460316 - 16460397
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagt 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  16460316 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttcggttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagt 16460397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 258 - 331
Target Start/End: Original strand, 46580465 - 46580538
Alignment:
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  46580465 ggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 46580538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 157
Target Start/End: Original strand, 14105809 - 14105921
Alignment:
Q  45 atgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtt 144  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  14105809 atgttcttgcgtcagtttcacatgtttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtt 14105908  T
Q  145 tgacgtgaaaatg 157  Q
    |||||||||||||    
T  14105909 tgacgtgaaaatg 14105921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18628240 - 18628124
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||| | ||||||||||  |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||| ||    
T  18628240 gctctgtgacagcatgtcctgttttatgttcttgcatctttgtcatatgtttctgtttcaaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataactg 18628141  T
Q  120 agttagctttccagtgg 136  Q
     ||||||||||||||||    
T  18628140 tgttagctttccagtgg 18628124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 406 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 33001303 - 33001175
Alignment:
Q  406 ttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatg 505  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| || ||||||| | |||||||    
T  33001303 ttgttggataatttgagatacatatat-tatgtg-aaaatgtatgatatagaaaattatgttgttgtatcatccaagttattgttattaacgttgctatg 33001206  T
Q  506 ttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33001205 ttg-caagttgttttatgttgctgtctctgct 33001175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Original strand, 33556703 - 33556822
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||  ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| |    
T  33556703 cctgtttcgcgttcttgcgtctatttcacacgtttctgttttgagttggcctttagtgtaaatatgaaagttattgataattgtgttatctttccagtag 33556802  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
      |||||||||| |||||||    
T  33556803 ccttggtttgacatgaaaat 33556822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 167
Target Start/End: Original strand, 26355487 - 26355616
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||     
T  26355487 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacttttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattgtgtaagccttccagtggc 26355586  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     |  ||||||| |||||||| | |||||||    
T  26355587 gtctgtttgacttgaaaatgatttttggtt 26355616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 167
Target Start/End: Original strand, 26357939 - 26358068
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||     
T  26357939 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacttttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattgtgtaagccttccagtggc 26358038  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     |  ||||||| |||||||| | |||||||    
T  26358039 gtctgtttgacttgaaaatgatttttggtt 26358068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 155
Target Start/End: Original strand, 42566442 - 42566558
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| |      
T  42566442 tgtttcgtgttcttgcgtctgtttcacacgtttttgttttgagttggtctttggtgtaaacatgaaagttgttgataactgtgttatctttccagtagcc 42566541  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaa 155  Q
    |||||||||||| ||||    
T  42566542 ttggtttgacgtaaaaa 42566558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 339 - 406
Target Start/End: Original strand, 1489907 - 1489974
Alignment:
Q  339 atctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1489907 atctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgatatacatatattatgtgaatattgt 1489974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13897907 - 13897808
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13897907 gtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattattagtttttgagatatgatgaaaatactccaa 13897808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 286 - 344
Target Start/End: Original strand, 21675491 - 21675549
Alignment:
Q  286 gtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaa 344  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21675491 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaa 21675549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 424 - 535
Target Start/End: Original strand, 3289548 - 3289657
Alignment:
Q  424 tacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttat 522  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||||||  |||||| |||||    
T  3289548 tacatatat-tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattgacgttgctatgttg-caagttg-tttat 3289644  T
Q  523 gttgttgtctctg 535  Q
    |||||||||||||    
T  3289645 gttgttgtctctg 3289657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12192022 - 12191835
Alignment:
Q  58 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    |||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||     
T  12192022 tttttcacccttttatgttttgaactggcttttcgtgtaaacatgaaagttttagataattctgttaactttccattggctttggtttgacttgaaaata 12191923  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaa 245  Q
    || | ||| | ||||| ||| ||  ||| |||||||  ||||||| |   ||||||| ||||||||||||| |||  |||||| ||||    
T  12191922 ttttgtggattttgagttatcatataaacactccaagtaggtcttggaagaattttacgaaaattcagcataaccacttctaaattaa 12191835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 33059886 - 33059767
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||| || |||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||| |||||||||||| |||| ||| |||| |||| |||| |    
T  33059886 cctgtttcgcgttcctgtgtctgtttcacacgtttctgttctgagttggtctttggtgtaaacatgaaagttgttgatatttgtgttatcttttcagtag 33059787  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  33059786 tcttggtttgacgtgaaaat 33059767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Original strand, 36301293 - 36301412
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||| ||||| | ||||  ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| |    
T  36301293 cctgtttcgtgttcttgcgtgtgtttcgcacgtttctgttttgagttgacctttagtgtaaatatgaaagttattgataattgtgttatctttccagtag 36301392  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
      |||||||||| |||||||    
T  36301393 ccttggtttgacatgaaaat 36301412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 126096 - 126006
Alignment:
Q  58 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgac 148  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  126096 tttttcactcgtttccgttttgaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttgac 126006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 7822166 - 7822072
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  7822166 tcctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttc 7822072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 7829477 - 7829383
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  7829477 tcctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttc 7829383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 130
Target Start/End: Original strand, 27102468 - 27102562
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  27102468 tcctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttc 27102562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 130
Target Start/End: Original strand, 27109816 - 27109910
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  27109816 tcctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttc 27109910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 27175858 - 27175764
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  27175858 tcctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttc 27175764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 130
Target Start/End: Original strand, 38784560 - 38784654
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  38784560 tcctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttc 38784654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 11310411 - 11310319
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||  ||| | |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  11310411 ctgttacatgtttttgcgtctttttcacatgtttctgttttaaactgggttttggtgtaaacataaaagttgtagataattgacttagctttc 11310319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 189
Target Start/End: Original strand, 15760685 - 15760848
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||||  |||||||   |||||||| ||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| || ||||||  |||||    
T  15760685 tgacagcaccccctgttttgcgttcttgcatctttttcacctagttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttataaataattttgttag 15760784  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||  ||||| | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  15760785 ctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 15760848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 265
Target Start/End: Original strand, 1857092 - 1857154
Alignment:
Q  203 agtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataat 265  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1857092 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 1857154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Original strand, 8931424 - 8931542
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| | ||||  |||||| || | |||||||| |||| || |||||| |    
T  8931424 cctgtttcgtgttcctgcgtctgtttcgcacgtttctgttttgagttggcatttagtgtaaatatgaaaattattgataattgtgttatctctccagtag 8931523  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaa 155  Q
      |||||||||||||||||    
T  8931524 ccttggtttgacgtgaaaa 8931542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16383250 - 16383148
Alignment:
Q  57 ctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||| |    
T  16383250 ctttttcacccatttccgttttgaattggtctttggtgtaagcatgaaagttttagataattttgttagcttttcaatggattttgtttgacttgaaatt 16383151  T
Q  157 gtt 159  Q
    |||    
T  16383150 gtt 16383148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 537
Target Start/End: Original strand, 8757131 - 8757233
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtct 532  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||  |||||||| |||||    
T  8757131 tatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttg-cttatgttgctgtct 8757228  T
Q  533 ctgct 537  Q
    |||||    
T  8757229 ctgct 8757233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 508
Target Start/End: Original strand, 15096385 - 15096495
Alignment:
Q  397 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaa 495  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||    
T  15096385 tgaatgttgttgttggataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaa 15096482  T
Q  496 tgatgctatgttg 508  Q
    || || |||||||    
T  15096483 tgttgttatgttg 15096495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21660702 - 21660558
Alignment:
Q  70 ttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttct 169  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||| |||||| |||  | ||||||  |||| ||||||| |||  |||||||||| |||||||||| | ||| | |    
T  21660702 ttctgatttgaattggcctttggtgtaaacatgaaggtttcaaataattatgttatctttccaatggcgttggtttgacatgaaaatgttttgtggattt 21660603  T
Q  170 tgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaatttta 214  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||  ||||||| | |||||||||    
T  21660602 tgagttatgatgaaaacacttcaagtaggtcttggggaaatttta 21660558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 438 - 537
Target Start/End: Original strand, 40555482 - 40555580
Alignment:
Q  438 tggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgc 536  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||||    
T  40555482 tggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttg-cttatgttgctgtctctgc 40555579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18570200 - 18570081
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||| ||||    ||| |||||||||||| ||||  || |||| ||||||||| |    
T  18570200 cctgtttcgtgttcttgcgtctgtttcgtacgtttctgttttaaattggtctttgatataaacatgaaagttgttgatatctgtgttatctttccagtag 18570101  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
      ||||| ||||||||||||    
T  18570100 ccttggtatgacgtgaaaat 18570081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 21735237 - 21735312
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttat-accattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21735237 tatgtggaaaatgtatgagatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 21735312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 38295002 - 38294883
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||  || |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||| | ||||  ||||||||| | |||||||| ||||  |||||||| |    
T  38295002 cctgtttcacatttttgcgtctgtttcacatgtttctgttttgagttggcatttagtgtaaatatgaaagttattgataattgtgttatatttccagtag 38294903  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
      |||||||||| |||||||    
T  38294902 ccttggtttgacatgaaaat 38294883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Original strand, 13316694 - 13316812
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  || |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||| | |||||||||| |||||||| |||| ||||| ||| |    
T  13316694 cctgtttcgcgtacttgtgtctgtttcacacgtttctgttttgagttggtcttcggtgtaaacgtgaaagttgttgataattgtgttatctttctagtag 13316793  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaa 155  Q
      ||||||||| |||||||    
T  13316794 ccttggtttgatgtgaaaa 13316812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15852128 - 15852018
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||||||| ||||  |||| ||||| | |||    
T  15852128 cctgtttcgcgttcttgcatctttttcgcatatttctgttttgatttggactttttggtaaacatgaaagttgtagaaaattatgttatctttctaatgg 15852029  T
Q  137 ttttggtttga 147  Q
     ||||||||||    
T  15852028 ctttggtttga 15852018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 469 - 534
Target Start/End: Original strand, 17130514 - 17130578
Alignment:
Q  469 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctct 534  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17130514 ttatatcatccaagttgttagtattaatgtggctatgttgt-aagttgttttatgttgttgtctct 17130578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 508
Target Start/End: Original strand, 19558025 - 19558135
Alignment:
Q  397 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaa 495  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||  |||||| ||| ||||||||||||| ||||| |    
T  19558025 tgaatgttgttgttggataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaatatagttgttcatatcattcaagttgttgttattga 19558122  T
Q  496 tgatgctatgttg 508  Q
    || || |||||||    
T  19558123 tgttgttatgttg 19558135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 4325373 - 4325310
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaat 496  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4325373 tatgttgaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaat 4325310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 13408089 - 13408014
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttat-accattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13408089 tatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtaattatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 13408014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 13865121 - 13865196
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13865121 tatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgttattatcattgaagttgttattattaatattgctatgttg 13865196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 46473549 - 46473490
Alignment:
Q  293 gagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggttt 352  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  46473549 gagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgttttaatggatctaacttggttt 46473490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 535
Target Start/End: Original strand, 832758 - 832858
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtct 532  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  832758 tatgaggaaaatgtatgataaagaaaatatcgttttttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttg-cttatgttgttgtct 832855  T
Q  533 ctg 535  Q
    |||    
T  832856 ctg 832858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 535
Target Start/End: Original strand, 1197938 - 1198038
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtct 532  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  1197938 tatgaggaaaatgtatgataaagaaaatatcgttttttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttg-cttatgttgttgtct 1198035  T
Q  533 ctg 535  Q
    |||    
T  1198036 ctg 1198038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11309834 - 11309716
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||   |||| |  ||| |||||||  ||| |||||||| | || ||||||||| |     
T  11309834 ctgtttcatgttcttgcgtctatttcacatgtttttgttctgaattactctttggtataaacatgaaatatgttgataattgtgatatctttccagtaga 11309735  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  11309734 tttggtttggcatgaaaat 11309716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 150
Target Start/End: Original strand, 10000974 - 10001055
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgt 150  Q
    |||||||||||| || | |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||  |||||||||||||    
T  10000974 tttctgttttgattttgactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgt 10001055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 357 - 406
Target Start/End: Original strand, 14219713 - 14219762
Alignment:
Q  357 tgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14219713 tgaatgttgttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 14219762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 357 - 406
Target Start/End: Original strand, 15096385 - 15096434
Alignment:
Q  357 tgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15096385 tgaatgttgttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 15096434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 357 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16077673 - 16077624
Alignment:
Q  357 tgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16077673 tgaatgttgttgttggataatttgaaatacatgtattatgtgaatattgt 16077624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 357 - 406
Target Start/End: Original strand, 19558025 - 19558074
Alignment:
Q  357 tgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19558025 tgaatgttgttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 19558074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 487
Target Start/End: Original strand, 13133257 - 13133346
Alignment:
Q  397 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 487  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  13133257 tgaatattgttgctgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgtt 13133346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 487
Target Start/End: Original strand, 14219713 - 14219802
Alignment:
Q  397 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 487  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||||    
T  14219713 tgaatgttgttgttggataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aagtattgttgttcatatcattcaagttgtt 14219802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #196
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 401
Target Start/End: Original strand, 22000972 - 22001007
Alignment:
Q  366 ttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaat 401  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22000972 ttgttggataatttggaatacatatattatgtgaat 22001007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #197
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 190
Target Start/End: Original strand, 48623317 - 48623404
Alignment:
Q  103 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactc 190  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  ||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||    
T  48623317 aaagttgtagacaattgagttggtattcctttggctttggtttgacttgaaaatattattttgtttttgaattatgaagaaaatactc 48623404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #198
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 435 - 496
Target Start/End: Original strand, 12755442 - 12755504
Alignment:
Q  435 atgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaat 496  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||  |||||||||||||| ||||||    
T  12755442 atgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatataattcaagttgttatgattaat 12755504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #199
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 452 - 518
Target Start/End: Original strand, 14161683 - 14161748
Alignment:
Q  452 tatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgtt 518  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||  ||||||| ||||||||    
T  14161683 tatagaaaataatgttgttatatcatccaagatgttgttattaatgttgtcatgttgt-aagttgtt 14161748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #200
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 403 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 15139468 - 15139364
Alignment:
Q  403 ttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgc 501  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | |  |||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||||||||| | |||||| ||     
T  15139468 ttgttgttggataatttgagatacatatat-tatgtgaacattgtatgatatagaaa-tattgttgtttatatcaatcaagttgttagtgttaatgttgt 15139371  T
Q  502 tatgttg 508  Q
    |||||||    
T  15139370 tatgttg 15139364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #201
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 366 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15139465 - 15139431
Alignment:
Q  366 ttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaa 400  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15139465 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaa 15139431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #202
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 319
Target Start/End: Original strand, 1858644 - 1858689
Alignment:
Q  274 tcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  1858644 tcaaaactagaagttctacgagttcaattaaggtgtttaagagtat 1858689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #203
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 406
Target Start/End: Original strand, 13133067 - 13133116
Alignment:
Q  357 tgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    ||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13133067 tgaatatcgttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 13133116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #204
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16065937 - 16065861
Alignment:
Q  265 ttccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatct 342  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| ||||| ||| | | ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  16065937 ttccaaacctcaaaatttga-gtactaggagtttaatcatggtgtttaagagtgtttaacctatggcgtgatggatct 16065861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #205
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16418139 - 16418058
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgt 150  Q
    ||||| |||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  16418139 tttctattttgatttggactttttggtaaacatgaaagttgtagacaattatgttagctatcttttggttttggtttgacgt 16418058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #206
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 508
Target Start/End: Original strand, 17071030 - 17071099
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||| |||||||||| ||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17071030 gaaaatgtatgatataaaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 17071099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 150
Target Start/End: Original strand, 1937765 - 1937857
Alignment:
Q  58 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgt 150  Q
    |||||||| | |||| | ||||||||||  ||| | |||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||    
T  1937765 tttttcacccctttccgctttgaattggattttggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttatctttctaatggctttggtttgacgt 1937857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #208
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 449 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 11309585 - 11309537
Alignment:
Q  449 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 496  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  11309585 tgatatagaaaatattgttgtttatattattcaagttgttattattaat 11309537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #209
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 449 - 496
Target Start/End: Original strand, 14191839 - 14191887
Alignment:
Q  449 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 496  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14191839 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaat 14191887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #210
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 406 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 14258741 - 14258679
Alignment:
Q  406 ttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 470  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  14258741 ttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 14258679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #211
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 406 - 470
Target Start/End: Original strand, 16460595 - 16460657
Alignment:
Q  406 ttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 470  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  16460595 ttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 16460657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #212
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 406 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16580049 - 16579987
Alignment:
Q  406 ttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 470  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  16580049 ttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 16579987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #213
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 406 - 470
Target Start/End: Original strand, 16585614 - 16585676
Alignment:
Q  406 ttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 470  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  16585614 ttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 16585676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #214
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 406 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 32301571 - 32301509
Alignment:
Q  406 ttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 470  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  32301571 ttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 32301509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #215
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 469 - 537
Target Start/End: Original strand, 36705441 - 36705507
Alignment:
Q  469 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  36705441 ttatatcattcaagttgttattgttcatgttgctatgttg-caagatg-tttatgttgttgtctctgct 36705507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 426; Significance: 0; HSPs: 210)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 537
Target Start/End: Original strand, 5205971 - 5206488
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  5205971 gctctctgacaacacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 5206070  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5206071 agttagatttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 5206170  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  5206171 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattatggtgtttaagattat 5206270  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5206271 ttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 5206370  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  5206371 gagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaaattgttg 5206470  T
Q  520 tatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5206471 tatgttgttgtctctgct 5206488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 40807731 - 40807239
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  40807731 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 40807632  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40807631 agttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 40807532  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40807531 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtat 40807432  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40807431 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 40807332  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 512  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40807331 gagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattaaagttattattattaatgatgctatgttgtgaa 40807239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 537
Target Start/End: Original strand, 35064904 - 35065414
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35064904 tgacagcacatcctgtttcatgttcttacgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttag 35065003  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35065004 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactcccatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 35065103  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  35065104 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattc-aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacc 35065202  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagtta 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35065203 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaacaatttgagtta 35065302  T
Q  426 catatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgtt 525  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35065303 catatatttatgtggaaaaagtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgtt 35065402  T
Q  526 gttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||    
T  35065403 gttgtctctgct 35065414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 17693803 - 17693291
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  17693803 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 17693704  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||| |||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17693703 agttagttttccaatggctttggtttgatgtgaaagttatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 17693604  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17693603 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtat 17693504  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17693503 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 17693404  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17693403 gagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgatataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttg 17693304  T
Q  520 tatgttgttgtct 532  Q
    ||||||| |||||    
T  17693303 tatgttgatgtct 17693291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 14508582 - 14508074
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  14508582 gctctctgacagcacgtcatgttttatgttcttgcgtctttttcacacgtttatgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 14508483  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14508482 agttagctttcctatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 14508383  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  14508382 attcagcataaccgttt-taagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtat 14508284  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  14508283 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatttattatgtgaa---tgttgttgaataattt 14508187  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14508186 gagttacatatatttatgtggaaaaggtattatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttg 14508087  T
Q  520 tatgttgttgtct 532  Q
    |||||| ||||||    
T  14508086 tatgtttttgtct 14508074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 534
Target Start/End: Original strand, 15931830 - 15932338
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15931830 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgtgtctttttaacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttatagataattgagttag 15931929  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15931930 ctttccagtggccttggtttgatgtgcaaatgattttgggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 15932029  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |    
T  15932030 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagaaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttcatc 15932129  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagtta 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15932130 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagtta 15932229  T
Q  426 catatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgtt 525  Q
    ||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  15932230 catatgtttatgtggaaattgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgct 15932329  T
Q  526 gttgtctct 534  Q
    | |||||||    
T  15932330 gctgtctct 15932338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 17538841 - 17538350
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||    
T  17538841 gctctctgacaacacgtcctgtttcatgttattgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataaatg 17538742  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17538741 agttagctttccaattcttt-ggtttgacgtgcaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 17538643  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17538642 attcagcataaccttttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcgaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtat 17538543  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17538542 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 17538443  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 512  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17538442 gagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattaaagttgttattattaatgaagctatgttgtgaa 17538350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 35354337 - 35353819
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  35354337 gctctctgacagcacatcccgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 35354238  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgtta---tttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatg 216  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  35354237 agttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagatcttagtgaaatcttatg 35354138  T
Q  217 aaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagag 316  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||||    
T  35354137 aaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactgggagtttaattaaggggtttaagag 35354038  T
Q  317 tatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataa 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35354037 tatttaacctatgttgtgatggatctaatttagtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataa 35353938  T
Q  417 tttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttg 516  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35353937 ttttagttacatatatttatgtggaaaatgtatgttatagaaaataatgttgttataccttttaagttgttattattaattatgctatgttgtgaagttg 35353838  T
Q  517 ttttatgttgttgtctctg 535  Q
    || ||||||||||||||||    
T  35353837 ttgtatgttgttgtctctg 35353819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 518
Target Start/End: Original strand, 2841788 - 2842277
Alignment:
Q  28 acagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagct 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2841788 acagcacgtcctgtttcatgttcttgtgtctttttcacacacttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgagttagct 2841887  T
Q  128 ttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagca 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2841888 ttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagca 2841987  T
Q  228 tgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaaccta 327  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2841988 taaccgttcc-aagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaaccta 2842086  T
Q  328 tgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttaca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2842087 tgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatatgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgtgttaca 2842186  T
Q  428 tatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgtt 518  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2842187 catatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagtttttattattaatgatgctatgttgtgaagttgtt 2842277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 537
Target Start/End: Original strand, 41172688 - 41173205
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||    
T  41172688 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttt-cacacgtttctgttttgaattggcctttagtgtaaaaatgaaagttgtagataattg 41172786  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41172787 agttagctttccagcggctttcgtttgacgtgaaaacaattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 41172886  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatta-ggatgtttaagagta 318  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  41172887 attcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagta 41172986  T
Q  319 tttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatt 418  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41172987 tttaacctatgttgtgatggatgtaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaagaatt 41173086  T
Q  419 tgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgtt 518  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41173087 tgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgtt 41173186  T
Q  519 ttatgttgttgtctctgct 537  Q
     ||||||||||||||||||    
T  41173187 gtatgttgttgtctctgct 41173205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 537
Target Start/End: Original strand, 17519190 - 17519707
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||    
T  17519190 gctctctgacaacacgtcatgtttaatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtaattg 17519289  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17519290 acttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggatcttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 17519389  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  17519390 attcagcataaccgttactaagataatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaagagtat 17519489  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17519490 ttaacatatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 17519589  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  17519590 gagttacatatatttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaataatgtggtcataccattcaagttgttattattaatgatgttatattgtgaagttgttg 17519689  T
Q  520 tatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  17519690 tatgttgctgtctctgct 17519707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 537
Target Start/End: Original strand, 17534052 - 17534569
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||    
T  17534052 gctctctgacaacacgtcatgtttaatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtaattg 17534151  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17534152 acttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggatcttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 17534251  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  17534252 attcagcataaccgttactaagataatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaagagtat 17534351  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17534352 ttaacatatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 17534451  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  17534452 gagttacatatatttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaataatgtggtcataccattcaagttgttattattaatgatgttatattgtgaagttgttg 17534551  T
Q  520 tatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  17534552 tatgttgctgtctctgct 17534569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 512
Target Start/End: Original strand, 22306906 - 22307392
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  22306906 tgacagcacgtcttgtttcatgttcttgcatctttttcacccatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttagttat 22307005  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  22307006 ctttccagtgactttggtttgacgtgaaaatgatttttgattattgagatatgatgaaaatactcgaaggaggtcttactgaaatcctatgaaaattcag 22307105  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  22307106 cataaccgtttctaagttaatcccaaacttaaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaact 22307205  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagtta 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22307206 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagtta 22307305  T
Q  426 catatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 512  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22307306 catatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 22307392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 143 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 44274086 - 44273705
Alignment:
Q  143 tttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagt 242  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44274086 tttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagt 44273987  T
Q  243 taatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatct 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44273986 taatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtttttaagagtatttaacctatgttgtgatggatct 44273887  T
Q  343 aatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaa 442  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44273886 aatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaa 44273787  T
Q  443 aaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgt 524  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  44273786 aatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtggagttgttgtatgt 44273705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 37 - 406
Target Start/End: Original strand, 54875817 - 54876186
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54875817 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 54875916  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
      ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||    
T  54875917 agttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataactgttt 54876016  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54876017 ctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 54876116  T
Q  337 ggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  54876117 ggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 54876186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 19 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 14441903 - 14441517
Alignment:
Q  19 agctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataatt 118  Q
    |||||| | |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  14441903 agctctctaacagcatgccctgtttcatgt-cttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatt 14441805  T
Q  119 gagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14441804 gagttagttttccagtgactttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 14441705  T
Q  219 aattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagta 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14441704 aattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagta 14441605  T
Q  319 tttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14441604 tttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaattagtttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 14441517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 20 - 406
Target Start/End: Original strand, 17685160 - 17685546
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||    
T  17685160 gctctctgacagcatgccctgtttcaagttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaaattgtagataattg 17685259  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17685260 agttagctttccagtggcgttggtttgacgtgaaaatgaattttggtacttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 17685359  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  17685360 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgaattcaattagggtgtttaagagtat 17685459  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17685460 ttaatctatcttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattagaaatacatatattatgtgaatattgt 17685546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 40812568 - 40812209
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  40812568 gctctgtgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 40812469  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40812468 agttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtgcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 40812369  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  40812368 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtat 40812269  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||    
T  40812268 ttaacctatgtggtgatgtatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgattt 40812209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 20 - 406
Target Start/End: Original strand, 43889116 - 43889502
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  43889116 gctctctgacagcatgtcatgtttcatgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttgatgtaaacatgaaagttgtagataattg 43889215  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43889216 agttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 43889315  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |   |||||||||||    
T  43889316 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaatttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggttttaagagtat 43889415  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  43889416 ttaacatgtgttgtcatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 43889502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 37 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 13520001 - 13519549
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||  |||||||||  |||||||||| | ||     
T  13520001 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacacgaaagtcttagataattatgttagctttctattga 13519902  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||| ||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  13519901 ctttcgtttgacttgaaattgatttttggtttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttt 13519802  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt-aggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13519801 ctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttgattaagggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 13519702  T
Q  336 tggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatcta 435  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  13519701 tggatctaa-ttggtttgacgtgaatatctttgttggcgaatttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaataatttgaggtacatatat-ta 13519604  T
Q  436 tgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttatta 491  Q
    |||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13519603 tgtgaatatcgtatgatatag-aaataatgttgttataccatccaagtggttatta 13519549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 236 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 11258986 - 11258685
Alignment:
Q  236 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11258986 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 11258887  T
Q  336 tggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatcta 435  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11258886 tagatataatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatattta 11258787  T
Q  436 tgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctg 535  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  11258786 tgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgtagtatgttgatgtttctg 11258687  T
Q  536 ct 537  Q
    ||    
T  11258686 ct 11258685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 20 - 406
Target Start/End: Original strand, 18699790 - 18700176
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||  || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  18699790 gctctctgacagcatatcatgtttcatgttcttgagtcttgttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 18699889  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18699890 agttagatttccagtggctttaatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 18699989  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| |   |||||||||||    
T  18699990 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttttggaataattccaaacctcaaaactagaagtgctaggagtttagttaagggatttaagagtat 18700089  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18700090 ttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 18700176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 12470537 - 12470151
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  12470537 gctctctgatagcatgtcatgtttcatgttcttgcgtcttttgcacacgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 12470438  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |  |  ||||| ||||| |||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12470437 aaatttctttctagtggctttgatttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 12470338  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  12470337 attcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggggtttaagagtat 12470238  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12470237 ttaacatgtgttgtgattgatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 12470151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 379
Target Start/End: Original strand, 50348343 - 50348702
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||    
T  50348343 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgtattggcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattg 50348442  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  50348443 agttagctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttggtgaaatcttatgaaa 50348542  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| |  ||||||||||||    
T  50348543 attcagtataaccatttctaagttaatccaaaactcatgggataattccaaacctcaaaactataagtactaggggtttaattaaggggtttaagagtat 50348642  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  50348643 ttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 50348702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 12511583 - 12511243
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  12511583 gctctctgacaccatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaatttgtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 12511484  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12511483 agttagatttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 12511384  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  12511383 attcagcataactgtttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaaccttaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtat 12511284  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaa 360  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12511283 ttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaa 12511243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 328
Target Start/End: Original strand, 17670025 - 17670334
Alignment:
Q  19 agctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataatt 118  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  17670025 agctctctgacagcatgccctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatt 17670124  T
Q  119 gagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17670125 gagttagcttttcagtggcgttggtttgacgtgaaaatgaattttggtacttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 17670224  T
Q  219 aattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagta 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17670225 aattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttcaattagggtgtttaagagta 17670324  T
Q  319 tttaacctat 328  Q
    ||||| ||||    
T  17670325 tttaatctat 17670334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 20 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10563444 - 10563129
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||    
T  10563444 gctctttgacagcacgttccgtttcatgttcttgcgtcttttgcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgcagataattg 10563345  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  10563344 agttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggtgcttgagatatgatgaacatactcaaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 10563245  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||||| || | | ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10563244 attcagtataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 10563145  T
Q  320 ttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||||||||    
T  10563144 ttaacctatgttgtga 10563129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 24 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 14671555 - 14671173
Alignment:
Q  24 tttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagtt 123  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||| | ||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  14671555 tttgacagcatgtcctttttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctctcttgtattagcctttggtgtaaagatgaaagttgtagataattgtgtt 14671456  T
Q  124 agctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 223  Q
    |||||||||||||| | | |||||| | |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14671455 agctttccagtggtgtcgatttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 14671356  T
Q  224 agcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaa 323  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||| |||||||||    
T  14671355 agcataactgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaa 14671256  T
Q  324 cctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    | | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14671255 catgtgttgtgatggatctaatttggtcggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 14671173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 42 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 49900449 - 49900104
Alignment:
Q  42 ttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttg 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  49900449 ttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctattttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattaagttagcttttcagtggatttg 49900350  T
Q  142 gtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttcta-- 239  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||      
T  49900349 gtttgacgtgaaaatggtttttggttattgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 49900250  T
Q  240 ------agttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt-aggatgtttaagagtatttaacctatgttg 332  Q
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  49900249 tttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactagaagtttaattaaggat-tttaagagtatttaacctatgtgg 49900151  T
Q  333 tgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||| ||||    
T  49900150 tgatggatctaatttggtttgatgcgaatatccttgttggatgattt 49900104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 94 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 11192741 - 11192430
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | |||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  11192741 gtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattttttttt-ttgagatatgatgaaaatactccaa 11192643  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11192642 ggaggccttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 11192543  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatatt 393  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11192542 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggacctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatttatt 11192443  T
Q  394 atgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||| ||||    
T  11192442 atgtgaatattgt 11192430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 28 - 387
Target Start/End: Original strand, 10541783 - 10542142
Alignment:
Q  28 acagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagct 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  10541783 acagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacatgtttccgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttatct 10541882  T
Q  128 ttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagca 227  Q
    |||||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||   ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10541883 ttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatcatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagca 10541982  T
Q  228 tgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaaccta 327  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||| |||||||||| |     
T  10541983 taaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaacatg 10542082  T
Q  328 tgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaataca 387  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| |||||    
T  10542083 tgttgtgatggatctaacttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagataca 10542142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6159133 - 6158817
Alignment:
Q  19 agctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataatt 118  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||    
T  6159133 agctctctgacaacatgccctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacataaaagttgtagataatt 6159034  T
Q  119 gagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
      |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| | |||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6159033 ttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatgtttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaa 6158934  T
Q  219 aattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagta 318  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6158933 aattcaacataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 6158834  T
Q  319 tttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||    
T  6158833 tttaacctatgttgtga 6158817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 17044689 - 17044392
Alignment:
Q  32 cacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttcc 131  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  17044689 cacgtcctgtttcatgttcttctgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaatttatagataattgagttagatttcc 17044590  T
Q  132 agtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgac 231  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  17044589 agtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcaacataac 17044490  T
Q  232 cgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatg 329  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  17044489 tgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaattagaaatactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 17044392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16979642 - 16979330
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16979642 ctttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttatattttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 16979543  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16979542 tagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttataaaaatt 16979443  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtattta 322  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16979442 cagcatgaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtattta 16979343  T
Q  323 acctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||    
T  16979342 acctatgttgtga 16979330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 39 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 11913437 - 11913140
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  |    
T  11913437 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgagttgacctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgact 11913338  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttct 238  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||    
T  11913337 ttggtttcacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttct 11913238  T
Q  239 aagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  11913237 aagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttttgat 11913140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 20 - 379
Target Start/End: Original strand, 14152716 - 14153075
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  |||    
T  14152716 gctctctgacagcacgttctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagatttttg 14152815  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |   ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  14152816 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaaagaattttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaagaaggtcttagtgaacttttatgaaa 14152915  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||| |||| ||  |||||| || || |||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  14152916 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtat 14153015  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  14153016 ttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 14153075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Original strand, 1988566 - 1988864
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  1988566 cctgtttcgtgttcttgcgtcttttagacacgtttctgttttgaattggcgtttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 1988665  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||| ||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1988666 ctttagtttgacttgaaaatgatatttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgcaattttatgaaaattcagcataaccgttt 1988765  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1988766 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataactactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaaccaatgttgtga 1988864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Original strand, 10989138 - 10989435
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  10989138 cctgtttcatgttcttacgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtgaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 10989237  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||| |||| |||||||  | ||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10989238 ctttggtctgacatgaaaataat-tttggtttttaagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttt 10989336  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  10989337 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtga 10989435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Original strand, 43550011 - 43550309
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||||  |||||| |||    
T  43550011 cctgttttatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttaattttccaatgg 43550110  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  43550111 ctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgttt 43550210  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43550211 ctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 43550309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 46 - 335
Target Start/End: Original strand, 14641893 - 14642182
Alignment:
Q  46 tgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggttt 145  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||    
T  14641893 tgttcttgcgtctttttcacatgtttctgtttttaattgtcatttggtgtaaacatgaaagttttagataatttcgttagctttccaatggctttggttt 14641992  T
Q  146 gacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaa 245  Q
    ||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14641993 gacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaa 14642092  T
Q  246 tccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14642093 tccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 14642182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 38 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 6156422 - 6156055
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| || || |||||||||| ||||||||||||||||     
T  6156422 ctgtttcgtgttcttgcgtctgtttcgcacgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatggaaattttagataattgtgttagctttccagtggc 6156323  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttc 237  Q
     |||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  ||||    
T  6156322 gttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttc 6156223  T
Q  238 taagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatg 337  Q
    ||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6156222 taagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatg 6156124  T
Q  338 gatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  6156123 gatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatgttatgtgaatattgt 6156055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 33564858 - 33564555
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  33564858 tgacagcatctcttgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 33564759  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||||| ||  ||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33564758 ctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 33564659  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    | | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33564658 cctaacagtttctatgttaatccaaaacttatggaataattccaatcctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 33564559  T
Q  326 tatg 329  Q
    ||||    
T  33564558 tatg 33564555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 42259 - 41947
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  42259 ctttgacagcatcccctatttcgtgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgt 42160  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    |||||||||| ||  | ||||||| | |||||||  | ||| |||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42159 tagctttccaatgactctggtttggcatgaaaataatttttagtttaagagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 42060  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtattta 322  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  42059 cagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtattta 41960  T
Q  323 acctatgttgtga 335  Q
    ||||| |||||||    
T  41959 acctaagttgtga 41947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 38 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24546557 - 24546213
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  24546557 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggc 24546458  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatga----aaattcagcatgaccg 233  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    |||||| |||| ||      
T  24546457 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaattaaattccgcataacta 24546358  T
Q  234 tttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgt 333  Q
    ||||||||| || |||||||| | ||| |   ||||||| ||||| |  |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  24546357 tttctaagtcaacccaaaactcatggattgtctccaaacttcaaagcctg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 24546259  T
Q  334 gatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  24546258 gatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 24546213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 40 - 335
Target Start/End: Original strand, 6805298 - 6805593
Alignment:
Q  40 gtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttt 139  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||   ||||  ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||    
T  6805298 gttttatgttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattgacctttgatgtaaatatgaaagttgtggataattatgttagctttccagtggctt 6805397  T
Q  140 tggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttcta 239  Q
    |||| |||| |||||||| | | ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  6805398 tggtgtgacttgaaaatgatttctggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcctagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttcta 6805497  T
Q  240 agttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6805498 agttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtga 6805593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Original strand, 31224287 - 31224586
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  31224287 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctagtgg 31224386  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
    | ||||||| || |||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| || ||| |||    
T  31224387 tattggtttcacttgaaaatgatttttggtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaatttcagtataaccattt 31224486  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatg-tttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  31224487 ctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgttttaagagtatttaacccatgctgtga 31224586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 38 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 43929068 - 43928745
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||     
T  43929068 ctgttttatgttcttgcgtatttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggc 43928969  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttc 237  Q
    |||| |||||  |||||||  | |||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||    
T  43928968 tttgatttgatctgaaaataatttttaatttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttc 43928869  T
Q  238 taagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatg 337  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  43928868 taagttgatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacatatgttctgatg 43928769  T
Q  338 gatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
     |||| ||||||||||||||||||    
T  43928768 aatcttatttggtttgacgtgaat 43928745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 26 - 329
Target Start/End: Original strand, 53646383 - 53646686
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | |||| ||| ||||||||||||||||  |||||    
T  53646383 tgacagcatctcatgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttag 53646482  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
     |||||| || |||||||||||| |||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53646483 atttccaatgattttggtttgacttgaaaatgatttttgttttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattcag 53646582  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  53646583 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaaca 53646682  T
Q  326 tatg 329  Q
    ||||    
T  53646683 tatg 53646686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Original strand, 10833673 - 10833971
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||| ||||  |||||||||||| ||     
T  10833673 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagaaaattttgttagctttccaatga 10833772  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| ||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  10833773 ctttggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccattt 10833872  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10833873 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 10833971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 99 - 361
Target Start/End: Original strand, 50351396 - 50351658
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50351396 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 50351495  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  50351496 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccatttctaagtcgatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactatgagttt 50351595  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50351596 aattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgttatggatctaatttggtttgacgtgaat 50351658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 335
Target Start/End: Original strand, 35961210 - 35961519
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||   ||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  35961210 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgtttacattttgaactgagttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 35961309  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  35961310 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaaattag 35961409  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  35961410 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaaatagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 35961509  T
Q  326 tatgttgtga 335  Q
    ||||||||||    
T  35961510 tatgttgtga 35961519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 50 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3803540 - 3803258
Alignment:
Q  50 cttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacg 149  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  | | ||||| ||    
T  3803540 cttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctagtttggcg 3803441  T
Q  150 tgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatcca 249  Q
    |||||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  3803440 tgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatcaa 3803341  T
Q  250 aaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttg 332  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  3803340 aatcttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttg 3803258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 100 - 401
Target Start/End: Original strand, 9511563 - 9511863
Alignment:
Q  100 atgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggt 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9511563 atgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 9511662  T
Q  200 cttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| || |||||||||| |||     ||||||| |||||||| |  |||||||||| | |    
T  9511663 cttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagatta 9511761  T
Q  300 attaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtga 399  Q
    |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9511762 attaaggtgcttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 9511861  T
Q  400 at 401  Q
    ||    
T  9511862 at 9511863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 100 - 401
Target Start/End: Original strand, 9519538 - 9519838
Alignment:
Q  100 atgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggt 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9519538 atgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 9519637  T
Q  200 cttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| || |||||||||| |||     ||||||| |||||||| |  |||||||||| | |    
T  9519638 cttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagatta 9519736  T
Q  300 attaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtga 399  Q
    |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9519737 attaaggtgcttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 9519836  T
Q  400 at 401  Q
    ||    
T  9519837 at 9519838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14519997 - 14519681
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  14519997 gctctctgacagcatgccctgtttcatgttcttgcatctttgtcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 14519898  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14519897 tgttagctttccagtggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 14519798  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||| |||| ||  ||||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14519797 attctgcataactatttctaagtcaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 14519699  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatg 337  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14519698 ttaacctatgttgtgatg 14519681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 335
Target Start/End: Original strand, 8928003 - 8928297
Alignment:
Q  41 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtttt 140  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |  ||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||    
T  8928003 tttcgtgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtataaacataaaagttgtagataattttgttagatttccaatggcttt 8928102  T
Q  141 ggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaa 240  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  8928103 ggtttgacctgaaaatgatttttggtttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaa 8928202  T
Q  241 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8928203 gataatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 8928297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17046861 - 17046631
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||||||||||    
T  17046861 gctctttgacagcacgtcatgtttcatgtgcttgcatctttttcacacgtttatgttttgaattggcctttgctgtaaacatgaaagttatagataattg 17046762  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17046761 agttagatttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 17046662  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaa 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17046661 attcagcataaccgtttctaagttaatccaa 17046631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 47 - 327
Target Start/End: Original strand, 20248328 - 20248608
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||||    
T  20248328 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagttttccaatggctttggtttg 20248427  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || | |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20248428 actttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 20248527  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaaccta 327  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  20248528 ccaaaacttagggaatatttccaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaaccta 20248608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 41 - 379
Target Start/End: Original strand, 50755720 - 50756057
Alignment:
Q  41 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtttt 140  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||| |  ||| |||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||| |||    
T  50755720 tttcatgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattgagttttggtataaacatgaaagttttagataatcgtgttagctttctagtggcttt 50755819  T
Q  141 ggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaa 240  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||    
T  50755820 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggtggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaa 50755919  T
Q  241 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggat 340  Q
    || || |||||| ||| ||| |   ||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50755920 gtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggat 50756018  T
Q  341 ctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  50756019 ctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 50756057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 331
Target Start/End: Original strand, 55291975 - 55292269
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  55291975 cctgttttatgttcttgcgtctttttcacaggtttctattttgaattggcctttggtgtgaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 55292074  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  55292075 ctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagcataacccttt 55292174  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
     |||||||| |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||    
T  55292175 ttaagttaacccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacccatgtt 55292269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 17208069 - 17207718
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17208069 tgacagcatgccctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 17207970  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||||||||| |||||||| |  || |||||   ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  17207969 ctttccagtggctttggttttaattgcaaatgaattttggtt-ttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatgttatgaaaattccg 17207871  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| ||  ||||||||| || ||||||||||  || |   ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  17207870 cataactatttctaagtcaacccaaaacttattgattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaaataaggtgtttaagagtatttaacc 17207772  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  17207771 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 17207718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 54330623 - 54330963
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||  |||||||||||||||||||||    
T  54330623 gctctctgacagcacgtcatgtttcacgttcttgcgtctttttcacacgtttatgttttgaattgacctttggtgtagacatgaaagttgtagataattg 54330722  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54330723 tgttagctttccagtggctttggtttgatttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 54330822  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||| |||| ||  ||| || || || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  ||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  54330823 attccgcataactatttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 54330921  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  54330922 ttaacctatgttgtgatgaatctaacttgatttgacgtgaat 54330963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 28 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15566240 - 15565890
Alignment:
Q  28 acagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagct 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15566240 acagcatgtcctgtttcatgttcttgcatttttttcacacgtttctgttttgagttagcctttggcgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagct 15566141  T
Q  128 ttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagca 227  Q
    |||||||||  |  ||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  15566140 ttccagtggcatcagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcatagtgaaattttatgaaaatttcgca 15566041  T
Q  228 tgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaaccta 327  Q
    | ||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| |   |  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15566040 taactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc-ctatttactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 15565942  T
Q  328 tgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||| ||||    
T  15565941 tgttgtgttggatctaacttggtttgacgtaaatatctttgttggatgattt 15565890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5215382 - 5215156
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||    
T  5215382 gctctctgacagcacgtaatttttcacgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataaatg 5215283  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||    
T  5215282 agttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttgtgaaa 5215183  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5215182 attcagcataaccgtttctaagttaat 5215156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 59 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 50243429 - 50243153
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| || ||||||||    
T  50243429 ttttcacccttttctgttttgaatttgc-tttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttacatttccaatggctttggtttcacttgaaaatg 50243331  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  50243330 atttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttat 50243231  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50243230 gagataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 50243153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 99 - 335
Target Start/End: Original strand, 2248366 - 2248602
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2248366 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 2248465  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2248466 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttc 2248565  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2248566 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 2248602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 59 - 335
Target Start/End: Original strand, 24152800 - 24153076
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  24152800 ttttcacccttttctgttttgaatttg-ctttcggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatg 24152898  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  24152899 atttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttat 24152998  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  24152999 gggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtctaagagtacttaacccatgttgtga 24153076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 47 - 327
Target Start/End: Original strand, 38311347 - 38311628
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  38311347 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttgatgtacacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 38311446  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || | |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||    
T  38311447 actttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaat 38311546  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattcc-aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaaccta 327  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  38311547 ccaaaacttagggaataattccaaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 38311628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 59 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16643701 - 16643425
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16643701 ttttcacccttttctgttttgaatttgc-tttcggtgcaaacatgaaagttgtagacaattgagttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatg 16643603  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | | | ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||     
T  16643602 atttatagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttat 16643503  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16643502 ggaataattccaacactcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtga 16643425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 10554983 - 10554691
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  10554983 tgttttatgttcttgcgtctgtttcacatgtttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggct 10554884  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttct 238  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  10554883 ttggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacccttttt 10554784  T
Q  239 aagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  10554783 aagttaatccaaaacttatgggataattcaaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgtt 10554691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Original strand, 14763305 - 14763593
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  14763305 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 14763404  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    ||   |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||    
T  14763405 actctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 14763504  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14763505 ccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 14763593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19444224 - 19443941
Alignment:
Q  41 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtttt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || | ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||    
T  19444224 tttcatgttcttgcgtctttt-cacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtgaacatgaaagttgtagataattttgttagcttcccaatggcttt 19444126  T
Q  141 ggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaa 240  Q
    |||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19444125 ggtttgacatgaaagtgatttttggtttttgagatattatgaaaatactccaaggaggtcttattaaaattttatgaaaattcagcataaccatttctaa 19444026  T
Q  241 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    || ||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||    
T  19444025 gtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctccaaactagaagtgccatgagttcaattaaggtgtttgagaatatttaacc 19443941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 94 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6819770 - 6819530
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6819770 gtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacatgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaa 6819671  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6819670 ggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattaaggataaccgtttctaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaagctcaaaactataagtactatg 6819571  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtg 334  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6819570 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtg 6819530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9533837 - 9533549
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  9533837 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 9533738  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    ||   |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||    
T  9533737 actctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 9533638  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9533637 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 9533549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 99 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14966658 - 14966426
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| || ||   |||||||||| |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  14966658 catgaaagttgtagataatttttttagcttttcaatgacattggtttgacttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaag 14966559  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  14966558 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattctaaacctaaaaactagaagtactaggagttc 14966459  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  14966458 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14966426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Original strand, 16324861 - 16325173
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| || |||||||||||||||||  ||    
T  16324861 ctttgacagcatcccctgtttcgcattcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcatttggtgtaaacaggaaagttgtagataattttgt 16324960  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    || ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| | | |||||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16324961 tatctttccaatggatttggtttggcgtgaaaatgatttatggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 16325060  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtattta 322  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||  || |||||||||||||||| | ||||||||| | |||||| || ||||||    
T  16325061 tagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatcggataatttcaaggctaaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttatgaatattta 16325160  T
Q  323 acctatgttgtga 335  Q
     |||| |||||||    
T  16325161 tcctaagttgtga 16325173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 37038480 - 37038242
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaa-tactcca 192  Q
    |||| |||||||||| |||||||||   |||||||| || ||| ||||||||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  37038480 gtaaacatgaaagttttagataattttattagcttttcaatggctttggtttgatttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaaatactcca 37038381  T
Q  193 acgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactat 292  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37038380 gagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcaaaacctcaaaactagaagtactat 37038281  T
Q  293 gagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37038280 gagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 37038242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 99 - 335
Target Start/End: Original strand, 3394398 - 3394634
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3394398 catgaaagttttagataactttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 3394497  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  3394498 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtactatgaattc 3394597  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3394598 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 3394634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 99 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12276205 - 12275969
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    ||||||| || |||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12276205 catgaaaattttagataatttggttagctttccaatgactttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 12276106  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12276105 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaagccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 12276006  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  12276005 aattaaggtgtttaagagtgtttaacccatgttgtga 12275969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Original strand, 23371051 - 23371339
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  23371051 gttcttgtgtctttttcatacgtttctgtcttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 23371150  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    ||   |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||    
T  23371151 actataaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 23371250  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||   || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23371251 ccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 23371339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 248 - 495
Target Start/End: Original strand, 42353218 - 42353463
Alignment:
Q  248 caaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatta-ggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatt 346  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||| || ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  42353218 caaaacttagggaataattctaaacctcaaaacaaaaagtattaggagtttaattaagggagtttaagagtatttaacgtatgttgtgatggatctaatg 42353317  T
Q  347 tggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaagg 446  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  |    
T  42353318 -ggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattg 42353415  T
Q  447 tatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaa 495  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  42353416 tatgatatag-aaataatgttgttataccatccaagtggttattattaa 42353463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11259165 - 11258984
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  11259165 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgtgtttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 11259066  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtct 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11259065 agttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggctcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 11258984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 352
Target Start/End: Original strand, 25104538 - 25104850
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  25104538 cctgtttcacgttcttgcgtcttttccacgcatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagtt-tagataattgtgttagctttccagtgg 25104636  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||| |||||| ||||| || | |||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||  |||    
T  25104637 ctttgatttgacttgaaa-tgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttacgaaaattccgcataactattt 25104735  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    | |||| || |||||||||| ||| |  |||||||| |||||| | |  ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  25104736 ccaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaatttg-tgtactatcagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacttatgttgtggt 25104834  T
Q  337 ggatctaatttggttt 352  Q
    |||||||| |||||||    
T  25104835 ggatctaacttggttt 25104850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 100 - 335
Target Start/End: Original strand, 42324618 - 42324853
Alignment:
Q  100 atgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggt 199  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  42324618 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatataatcaaaatactccaaggaggt 42324717  T
Q  200 cttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttca 299  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42324718 cttagtgaaatcttagaaaaattcagtataaccatttctaagttagtcaaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttca 42324817  T
Q  300 attaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42324818 attaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 42324853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Original strand, 22763947 - 22764145
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| ||||||||||    
T  22763947 gctctctgacagcatgtcatgtttcatgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttatagataattg 22764046  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||    
T  22764047 agttagcttttcagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagatcttagtgaatttttatgaa 22764145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 335
Target Start/End: Original strand, 179098 - 179339
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | |||  || |||||||||||||||||||| ||||    
T  179098 gtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaataccccaa 179197  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  179198 gtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatg 179297  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||| ||||| | ||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  179298 agttgaattaaggtgtttaacagtatttaatccatgttgtga 179339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 55 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18890064 - 18889784
Alignment:
Q  55 gtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaa 154  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  18890064 gtctttttctcacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacacgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaa 18889965  T
Q  155 atgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaact 254  Q
    ||| | |||  |  ||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  18889964 atgatttttaatgtttgagttatgatggaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattccgcacaaccatttctaagttaatccaaaact 18889865  T
Q  255 taaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    || || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18889864 tatgggatagttccaaggctcaaatctagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 18889784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 51301103 - 51300815
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  51301103 gttcttgtgtctttttcatacgtttctgtcttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttg 51301004  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    ||   |||||| | |||||||   ||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||    
T  51301003 actctaaaatgatttttggtttaggatttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 51300904  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||   || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51300903 ccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgtaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 51300815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 138 - 335
Target Start/End: Original strand, 13029711 - 13029908
Alignment:
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttc 237  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||| ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||    
T  13029711 tttggtttgacttgaaaatgatttttagttttttaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttc 13029810  T
Q  238 taagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13029811 taagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13029908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 94 - 335
Target Start/End: Original strand, 18367149 - 18367390
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| | |||  || ||||||||||||||||||| | |||    
T  18367149 gtaaacatgaaagttttagataatttttttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatatttcaa 18367248  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     |||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18367249 ggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataacccgttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaagctagaagtactatg 18367348  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18367349 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 18367390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15465826 - 15465631
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  15465826 ctttgacagcattccctgtttcgcgttctttcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 15465727  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15465726 tagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 15465631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 94 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17513241 - 17513010
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||||||||| |||  |||||||||| | | |  |||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17513241 gtaaacatgaaagttgtagattattttgttagctttctaattgagttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaa 17513142  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     ||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17513141 ggaggtcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttattgaataattccaaacctccaaactagaagtgctatg 17513042  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  17513041 agttcaattaaggtgtttgagagtatttaacc 17513010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 138 - 335
Target Start/End: Original strand, 13026119 - 13026316
Alignment:
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttc 237  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||| ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||    
T  13026119 tttggtttgacttgaaaatgatttttagttttttaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttc 13026218  T
Q  238 taagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13026219 taagttaatccaaaaattatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13026316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 18893332 - 18893067
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| | |||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  18893332 gttcttgtgtctttttttcacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacacgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 18893233  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || ||||||||   ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  18893232 acttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcagaaccatttctaagttaat 18893133  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgttta 312  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  18893132 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactacaagtaatatgagtttaattaaggtgttta 18893067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 335
Target Start/End: Original strand, 13522801 - 13523043
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||  |||||||||||| ||| |||||||| || |||||||  | ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13522801 gtaaacatgaaagttttagagaattttgttagctttccaatggctttggtttaacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgagaatactccaa 13522900  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatcc-aaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactat 292  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13522901 gtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttaatccaaaaacttatgcgataattccaaggctcaaaactagaagtactat 13523000  T
Q  293 gagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13523001 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 13523043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5224055 - 5223860
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||| ||| ||    
T  5224055 ctttgacagcatttcctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgcaaacatgaaagttgtagatagttgtgt 5223956  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5223955 tagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgcgatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 5223860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 226
Target Start/End: Original strand, 46722960 - 46723149
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  46722960 cctgttttatgttcttgtgtcttttttacacgtttctattttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 46723059  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 226  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  46723060 ctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactaaaatcttatgaaaattcagc 46723149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Original strand, 51602938 - 51603122
Alignment:
Q  41 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtttt 140  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||    
T  51602938 tttcatgttcttgcgactttttcacacgtttctgttttgagttgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 51603037  T
Q  141 ggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||| || |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51603038 ggtttcacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 51603122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 221
Target Start/End: Original strand, 14647437 - 14647621
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||     
T  14647437 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtgaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatga 14647536  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaat 221  Q
     ||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  14647537 ctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaagtttattaaaat 14647621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18739613 - 18739300
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  18739613 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacttatttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccaatgg 18739514  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||| || | |||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  |||    
T  18739513 ctttggtttcactttaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactattt 18739414  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    |||||| || ||||| |||| ||| |  |||||||| | |||  | |   || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  18739413 ctaagtcaacccaaaccttatggattgtttccaaactttaaagtttg-tttattatgagttcaattaag-ggtttaagagtatttaacctagattgtgtt 18739316  T
Q  337 ggatctaatttggttt 352  Q
    |||||||| |||||||    
T  18739315 ggatctaacttggttt 18739300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 26054755 - 26054950
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   || |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  26054755 ctttgacagcattcccagtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttcagttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 26054854  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||||||||||| || ||||| || |||||||| | ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  26054855 tagctttccagtggcttcggttttacatgaaaatgatttttggtgtttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 26054950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 14682841 - 14682672
Alignment:
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  14682841 ctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgtgat 14682742  T
Q  337 ggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14682741 ggatctaatttggtcggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 14682672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 414 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 16728624 - 16728503
Alignment:
Q  414 taatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 513  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16728624 taatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaacaatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgatatgttgtgaag 16728525  T
Q  514 ttgttttatgttgttgtctctg 535  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  16728524 ttgttgtatgttgttgtctctg 16728503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 54521494 - 54521301
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  54521494 ctttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgt 54521395  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatg 216  Q
    |||||||||| ||| |||  ||| ||  ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  54521394 tagctttccaatggctttaattttactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg 54521301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Original strand, 10247211 - 10247409
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  10247211 gctctctgacagcatgtcttgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttcgtgtaaacatgaaagttgtagataattg 10247310  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     ||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||  || | |||| | ||| |||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  10247311 cgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgtgttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaa 10247409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12305780 - 12305599
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||     
T  12305780 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatga 12305681  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     ||| |||||||  ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12305680 ctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 12305599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13436956 - 13436776
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||    
T  13436956 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatgttgttagctttccaatgg 13436857  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     ||||||||| | |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||    
T  13436856 atttggtttggcttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa-gagatctcagtgaatttttatgaa 13436776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 406 - 535
Target Start/End: Original strand, 19884226 - 19884355
Alignment:
Q  406 ttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatg 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19884226 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgtttttataccattcaagttgttattattaatgatgttatg 19884325  T
Q  506 ttgtgaagttgttttatgttgttgtctctg 535  Q
    || || ||||||| ||||||| ||||||||    
T  19884326 ttatggagttgttgtatgttgatgtctctg 19884355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Original strand, 28848127 - 28848307
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  28848127 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 28848226  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||| || ||| ||||||   |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28848227 tttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 28848307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 17046630 - 17046511
Alignment:
Q  287 tactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatac 386  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  17046630 tactattagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatac 17046531  T
Q  387 atatattatgtgaatgttgt 406  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  17046530 atatattatgtgaatattgt 17046511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 17938244 - 17937931
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||| ||  ||| ||||| |||||||| ||    |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||    
T  17938244 cctgtttctcgttcttgcatctttttcgcatatttatgtttcgaattggctttggatgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgg 17938145  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  |||    
T  17938144 ctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgatttatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactattt 17938045  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    |||||| || ||||| |||| ||| |  |||||||| | |||  | |   || |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  17938044 ctaagtcaacccaaaccttatggattgtttccaaactttaaagtttg-tttattatgagttcaattaag-ggtttaagagtatttaacctaggttgtgtt 17937947  T
Q  337 ggatctaatttggttt 352  Q
    ||||||||||||||||    
T  17937946 ggatctaatttggttt 17937931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 34160000 - 34159853
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  34160000 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 34159901  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  34159900 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 34159853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 414 - 537
Target Start/End: Original strand, 45531332 - 45531455
Alignment:
Q  414 taatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 513  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45531332 taatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatataaaagataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaag 45531431  T
Q  514 ttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||| |||||| |||||||||||    
T  45531432 ttgttgtatgttattgtctctgct 45531455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 150 - 291
Target Start/End: Original strand, 14567659 - 14567800
Alignment:
Q  150 tgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatcca 249  Q
    ||||||||  |||| ||| ||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14567659 tgaaaatgacatttagtttttgatttatgatcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcca 14567758  T
Q  250 aaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtacta 291  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14567759 aaacttatgaaataattccaaacctcaaaactagaagtacta 14567800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 275 - 406
Target Start/End: Original strand, 19568940 - 19569072
Alignment:
Q  275 caaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatc-taatttggtttgacgtgaatgtcattgttgga 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  19568940 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggaccttaatttggtttgacgtgaatatctttgttgaa 19569039  T
Q  374 taatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19569040 taatttgagatacatatattatgtgaatattgt 19569072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 424 - 535
Target Start/End: Original strand, 14153191 - 14153302
Alignment:
Q  424 tacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatg 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14153191 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 14153290  T
Q  524 ttgttgtctctg 535  Q
    ||  ||||||||    
T  14153291 ttactgtctctg 14153302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17463852 - 17463705
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  17463852 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 17463753  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  17463752 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 17463705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 12952727 - 12952448
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttc 168  Q
    |||| ||||||||||  | ||| | |||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||||| ||| ||||||||||| ||||| || | |||||||     
T  12952727 tttccgttttgaattaacttttggtgtaaacatgaaagttttagataatagtgttaaatttccattggctttggtttgacttgaaactgatttttggttt 12952628  T
Q  169 ttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 268  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||  |||| |||| || ||||||||||  || |   |||    
T  12952627 ttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaatcccgcataactatttcaaagtcaacccaaaacttatagattgtgtcc 12952528  T
Q  269 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttgg 349  Q
    |||| ||||| || |  || ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12952527 aaacttcaaatcttg-tgttctatgagctcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatagatctaacttgg 12952448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Original strand, 13151278 - 13151415
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  13151278 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 13151377  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||    
T  13151378 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatg 13151415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15413105 - 15412968
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  15413105 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 15413006  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
     ||||||||||||||||  | | |||||| ||||||||    
T  15413005 tgttagctttccagtggcgtcgatttgacttgaaaatg 15412968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 218
Target Start/End: Original strand, 29544346 - 29544527
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||    
T  29544346 cctgtttcgcgttcttgcatctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttgtttagctttccaatgg 29544445  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     |||  ||||||  ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  29544446 ctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaatttttatgaa 29544527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 403 - 537
Target Start/End: Original strand, 50348806 - 50348937
Alignment:
Q  403 ttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgct 502  Q
    |||||||||  |||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50348806 ttgttgttggttaatgtgaaatacatgtatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatattgttataccattcaagttgttattattaatgatgct 50348905  T
Q  503 atgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  50348906 atgttgtgaagttg---tatgttgctgtctctgct 50348937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 55477146 - 55477028
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  55477146 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcg 55477047  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  55477046 tcggtttgacttgaaaatg 55477028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 156
Target Start/End: Original strand, 6468622 - 6468758
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  6468622 gctctctgacagcatgttctgtttcatgttcttacgtctttttcacacgtttctgttttgacttagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 6468721  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
     ||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||    
T  6468722 tgttagctttccagtggtgtccgtttgacttgaaaat 6468758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15978189 - 15978009
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  15978189 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 15978090  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||||||  | ||| ||||||   |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15978089 tttggtggggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 15978009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 157
Target Start/End: Original strand, 45606413 - 45606531
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  45606413 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcg 45606512  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    | | |||||| ||||||||    
T  45606513 tcgttttgacttgaaaatg 45606531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 237 - 331
Target Start/End: Original strand, 52989492 - 52989586
Alignment:
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  52989492 ctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 52989586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 203 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 15465453 - 15465337
Alignment:
Q  203 agtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 302  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15465453 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 15465354  T
Q  303 aggatgtttaagagtat 319  Q
    | | |||||||||||||    
T  15465353 aaggtgtttaagagtat 15465337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 203 - 319
Target Start/End: Original strand, 26055128 - 26055244
Alignment:
Q  203 agtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 302  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26055128 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 26055227  T
Q  303 aggatgtttaagagtat 319  Q
    | | |||||||||||||    
T  26055228 aaggtgtttaagagtat 26055244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 168 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 5223717 - 5223566
Alignment:
Q  168 cttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattc 267  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||   |||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  5223717 cttgagttatgatcaaattactccacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatcaaaaacttatgggataatac 5223618  T
Q  268 caaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  5223617 caaccctcaaaactagaagttctatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 5223566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 177 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22652409 - 22652252
Alignment:
Q  177 tgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctca 276  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||| || || |||||||||| ||| |   ||||||| |||    
T  22652409 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttca 22652310  T
Q  277 aaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    || || |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22652309 aagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 22652252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Original strand, 13153744 - 13153880
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||  |||||||||||||||| ||||    
T  13153744 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtacacatgaaagttgtagat-attg 13153842  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||    
T  13153843 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatg 13153880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Original strand, 7780852 - 7781032
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  7780852 ctgttccatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 7780951  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||| || ||| ||||||   | |||||   | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  7780952 tttggtgtggcgtaaaaatgagttctggtttaggcgttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 7781032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 213
Target Start/End: Original strand, 16453785 - 16453960
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||     
T  16453785 ctgttccatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttattagctttccaatggc 16453884  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaatttt 213  Q
    |||||| || ||| ||||||   |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  16453885 tttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaattttt 16453960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 225
Target Start/End: Original strand, 19568802 - 19568933
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19568802 gtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 19568901  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
      ||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  19568902 gcaggtcttagtgaaatcttagcaaaattcag 19568933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 325 - 406
Target Start/End: Original strand, 17691427 - 17691508
Alignment:
Q  325 ctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17691427 ctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgatatacatatattatgtgaatattgt 17691508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 461 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 5215159 - 5215083
Alignment:
Q  461 taatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5215159 taatgttgttataccattcaagttgttattatttatgatgctatgttgtgaaattgttgtatgttgttgtctctgct 5215083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 44274154 - 44274088
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggc 86  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44274154 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggc 44274088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Original strand, 14528592 - 14528693
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||    
T  14528592 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggatttggtttg 14528691  T
Q  147 ac 148  Q
    ||    
T  14528692 ac 14528693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 189
Target Start/End: Original strand, 8276431 - 8276583
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||    
T  8276431 cctgtttcgtgttcttgcatctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatgg 8276530  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
     |||||||||||||  ||||| | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  8276531 ctttggtttgacgtcgaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 8276583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 27840601 - 27840498
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||  |||||||||    
T  27840601 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggagtaaacatgaaagttgtagataattttgttagccttctaatgactttggtttg 27840502  T
Q  147 acgt 150  Q
    ||||    
T  27840501 acgt 27840498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 404 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 20417424 - 20417293
Alignment:
Q  404 tgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 502  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  || |    
T  20417424 tgttgttggttaatttgagctacatatat-tatgtggaaaatgtatgatataaaagatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgat 20417326  T
Q  503 atgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20417325 atgttg-caagttg-tttatgttgttgtctctgct 20417293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 189
Target Start/End: Original strand, 8269320 - 8269472
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||    
T  8269320 cctgtttcgtgttcttgcatctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatgg 8269419  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
     || ||||||||||  ||||| | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  8269420 cttgggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 8269472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 156
Target Start/End: Original strand, 15025729 - 15025837
Alignment:
Q  48 ttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttga 147  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |  ||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||     
T  15025729 ttcttgcgtctgtttcatacgtttctgttttgaattggtctttggtataaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttccagtagtcttggtttgg 15025828  T
Q  148 cgtgaaaat 156  Q
    | |||||||    
T  15025829 catgaaaat 15025837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 134
Target Start/End: Original strand, 21846019 - 21846114
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagt 134  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21846019 tgtttcacgttcttgcgtctgtttcacacgtttctgttttgagttggtcttcggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttccagt 21846114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 150
Target Start/End: Original strand, 51158611 - 51158714
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||| || |||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||    
T  51158611 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggattttggtgtaaacatgaaaattttagataattatgttagctttctaatggctttggtttg 51158710  T
Q  147 acgt 150  Q
    ||||    
T  51158711 acgt 51158714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 440 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 10563019 - 10562921
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||| |||||||||| ||| || | ||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10563019 gaaaatgtatgatataaaaattattattgtttatatcgttcaagttgttatttttaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttatctctgct 10562921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 36528202 - 36528061
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttc 168  Q
    ||||||||| |||||  ||||| | |||| || ||||||| |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||      
T  36528202 tttctgtttcgaattt-cctttggtgtaaacacgaaagttttagataattttgtcagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgattcttggtgt 36528104  T
Q  169 ttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaatt 211  Q
    ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  36528103 ttgatttatgatgaaaataccccaaggaggtcttagcgaaatt 36528061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 48630844 - 48630726
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| |||||||||| | |||||||| |||| |||| |||| |    
T  48630844 cctgtttcgcgttcttgcatctgtttcacacgtttctgttttgagttgacctttagtgtaaacatgaaagttattgataattgtgttatcttttcagtag 48630745  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaa 155  Q
      |||||||||||||||||    
T  48630744 ccttggtttgacgtgaaaa 48630726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8631395 - 8631274
Alignment:
Q  102 gaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtct 201  Q
    ||||||| ||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||    
T  8631395 gaaagttttagataatgatgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgttgaaaacactccaaggagatct 8631296  T
Q  202 tagtgaaattttatgaaaattc 223  Q
    || |||||||||| ||||||||    
T  8631295 tattgaaattttacgaaaattc 8631274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 22652503 - 22652407
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattga 120  Q
    |||||||||||   ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22652503 ctttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcga-tttttcacacgtttctattttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattga 22652407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 86
Target Start/End: Original strand, 30123783 - 30123832
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggc 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30123783 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggc 30123832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 185
Target Start/End: Original strand, 40039698 - 40039826
Alignment:
Q  57 ctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||| |||| || ||| ||||||||||| |||||||    
T  40039698 ctttttcacccatttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttatcttttcaatggatttggtttgacttgaaaat 40039797  T
Q  157 gttatttggttcttgagatatgatgaaaa 185  Q
     || | ||| | ||||| |||||||||||    
T  40039798 attttatggattttgagttatgatgaaaa 40039826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 153
Target Start/End: Original strand, 48044081 - 48044197
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||  | |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  |    
T  48044081 cctgtttcgcgttcttgcgtctgtttcacacgtttctgttttgagttgatcttcggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttccagcag 48044180  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaa 153  Q
    | ||||||||| |||||    
T  48044181 tcttggtttgatgtgaa 48044197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 130
Target Start/End: Original strand, 1468570 - 1468664
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  1468570 tcctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttc 1468664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 211
Target Start/End: Original strand, 3264676 - 3264818
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttc 168  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | |||| || ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||   |||||||||||||||||| | |||| |      
T  3264676 tttctgtttcgaattgtcctttggtgtaaacacgaaagttttagataattttgttagcttcccagtggccatggtttgacgtgaaaatgatttttgatgt 3264775  T
Q  169 ttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaatt 211  Q
    ||||  | |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  3264776 ttgatttgtgatgaaaataccccaaggaggtcttagcgaaatt 3264818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Original strand, 12917969 - 12918087
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||  ||||||||| | |||||||| |||| ||| | ||| |     
T  12917969 ctgtttcgcgttcttgcgtctgtttcacacgtttctgttttgagttggcctttagtgtaaatatgaaagttattgataattgtgttatcttgctagtagc 12918068  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaat 156  Q
     |||||||||| |||||||    
T  12918069 cttggtttgacatgaaaat 12918087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 403 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13179488 - 13179399
Alignment:
Q  403 ttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattat 492  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13179488 ttgttgttggttaatttgagctacatatat-tatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaagttgttattat 13179399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 424 - 537
Target Start/End: Original strand, 23395786 - 23395897
Alignment:
Q  424 tacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttat 522  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||| |||  |||||| |||||    
T  23395786 tacatatat-tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgttatattg-caagttg-tttat 23395882  T
Q  523 gttgttgtctctgct 537  Q
    |||||||||||||||    
T  23395883 gttgttgtctctgct 23395897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25058450 - 25058340
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| | |||    
T  25058450 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcatctatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatgg 25058351  T
Q  137 ttttggtttga 147  Q
      |||||||||    
T  25058350 cgttggtttga 25058340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 49231919 - 49231810
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| || | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| | |||    
T  49231919 cctgtttcgtgttcttgcgtctttttcac-ctattctgttttgaattggcccttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatgg 49231821  T
Q  137 ttttggtttga 147  Q
      |||||||||    
T  49231820 cgttggtttga 49231810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 156
Target Start/End: Original strand, 12151331 - 12151440
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||| | |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||| |  ||| ||||    
T  12151331 gttcttgtgtcattttcacacatttctgttttgatttgacctttggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttctagtagccttgctttg 12151430  T
Q  147 acgtgaaaat 156  Q
    ||||||||||    
T  12151431 acgtgaaaat 12151440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 134
Target Start/End: Original strand, 12155367 - 12155464
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagt 134  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||| | |||||||    
T  12155367 cctgttttaagttcttgcgtctttttcacatatttatgttttgatttgacctttggggtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatccttccagt 12155464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12808657 - 12808564
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  12808657 cctgtttcgtgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttc 12808564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 25201585 - 25201469
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtg 135  Q
    ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||     
T  25201585 cctgtttcgcgttcttgcgtcagtttcacacgtttctattttgagttggt-tttcggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttccagta 25201487  T
Q  136 gttttggtttgacgtgaa 153  Q
    || ||||||||| |||||    
T  25201486 gtcttggtttgatgtgaa 25201469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 29907211 - 29907090
Alignment:
Q  35 gtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagt 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| | |||| |  ||| |||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  29907211 gtcctgtttcgtgttcttgcgtctgtttcatacatttctattttgaattagtcttttgtataaacatgaaagttgctgataattgtgttatctttccagt 29907112  T
Q  135 ggttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
     | ||| ||||||| |||||||    
T  29907111 agcttttgtttgacctgaaaat 29907090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 29948377 - 29948256
Alignment:
Q  35 gtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagt 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| | |||| |  ||| |||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  29948377 gtcctgtttcgtgttcttgcgtctgtttcatacatttctattttgaattagtcttttgtataaacatgaaagttgctgataattgtgttatctttccagt 29948278  T
Q  135 ggttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
     | ||| ||||||| |||||||    
T  29948277 agcttttgtttgacctgaaaat 29948256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 29997531 - 29997410
Alignment:
Q  35 gtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagt 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| | |||| |  ||| |||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  29997531 gtcctgtttcgtgttcttgcgtctgtttcatacatttctattttgaattagtcttttgtataaacatgaaagttgctgataattgtgttatctttccagt 29997432  T
Q  135 ggttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
     | ||| ||||||| |||||||    
T  29997431 agcttttgtttgacctgaaaat 29997410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 434 - 537
Target Start/End: Original strand, 3394737 - 3394839
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtct 532  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  3394737 tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttg-cttatgttgttgttt 3394834  T
Q  533 ctgct 537  Q
    |||||    
T  3394835 ctgct 3394839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 434 - 537
Target Start/End: Original strand, 13523146 - 13523248
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtct 532  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||    
T  13523146 tatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttg-tttatgttgctgtct 13523243  T
Q  533 ctgct 537  Q
    |||||    
T  13523244 ctgct 13523248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Original strand, 3161255 - 3161374
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||| ||||||  |||| ||||| || |||  ||||||||| |    
T  3161255 cctgtttcgcgttcttgcgtctatttcacacgtttctgttttaagttggtctttagtgtaaacatgaatattgttgataactgtgttgtctttccagtag 3161354  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    | |||||||||| |||||||    
T  3161355 tcttggtttgacatgaaaat 3161374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 14818370 - 14818278
Alignment:
Q  404 tgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaat 496  Q
    ||||||||  |||||| || || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14818370 tgttgttggttaatttaagctatatatat-tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaat 14818278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 537
Target Start/End: Original strand, 13520516 - 13520618
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtct 532  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  13520516 tatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaaattgttattattaatattgctatgttg-caagttg-cttatgttgttgtct 13520613  T
Q  533 ctgct 537  Q
    |||||    
T  13520614 ctgct 13520618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Original strand, 14568649 - 14568717
Alignment:
Q  293 gagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  14568649 gagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtgatgaatctatcttggtttgacgtgaat 14568717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 193
Target Start/End: Original strand, 17759012 - 17759148
Alignment:
Q  57 ctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||    
T  17759012 ctttttcactcatttccgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagcttttcaatggatttggtttgacttaaaaat 17759111  T
Q  157 gttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
      | | ||| | ||||| |||||| |||| |||||||    
T  17759112 tgtttgtggattttgagttatgataaaaacactccaa 17759148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 193
Target Start/End: Original strand, 19060332 - 19060468
Alignment:
Q  57 ctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||    
T  19060332 ctttttcactcatttccgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagcttttcaatggatttggtttgacttaaaaat 19060431  T
Q  157 gttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
      | | ||| | ||||| |||||| |||| |||||||    
T  19060432 tgtttgtggattttgagttatgataaaaacactccaa 19060468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 30152581 - 30152489
Alignment:
Q  58 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgt 150  Q
    ||||||||  ||||| || |||||||||  ||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  30152581 tttttcacctgtttccgtgttgaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgt 30152489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 156
Target Start/End: Original strand, 45803993 - 45804101
Alignment:
Q  48 ttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttga 147  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||| | ||||  ||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||    
T  45803993 ttcttgcgtctgtttcgcacgtttctgttttgagttgacctttagtgtaaatatgaaagttatttataattgtgttatctttccagtagccttggtttga 45804092  T
Q  148 cgtgaaaat 156  Q
    | |||||||    
T  45804093 catgaaaat 45804101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 10550585 - 10550510
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10550585 tatgtggaaaatgtatgatatagaaattatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 10550510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Original strand, 3527812 - 3527929
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||  |||||| || | |||||||| |||| ||||||| | |    
T  3527812 cctgtttcgtgttcttgcgtgtgtttcacacgtttatgttttgagttggcc-ttggtgtaaatatgaaaattattgataattgtgttatctttccaatag 3527910  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaa 155  Q
      |||||||||||||||||    
T  3527911 ccttggtttgacgtgaaaa 3527929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 8023878 - 8023649
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||||||||| | ||| || |||||||| | |||||| | | | | | ||||| ||||||||||||||| |||  |||    
T  8023878 catgaaagttttagataaatatgttagctttctaatggcttgggtttgacttaaaaatgatttctagattttgagttatgatgaaaatactacaagtagg 8023779  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    | || ||| ||||| | ||||||| ||||| ||  ||| ||||| || |||||||||| ||  |  | |||||| |||||||| | | ||||| |||||     
T  8023778 ttttggtgcaatttaacgaaaatttagcataactatttttaagtcaacccaaaacttatggtttggtcccaaacttcaaaacttg-attactaggagttt 8023680  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatg 329  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  8023679 aattaggatgtgtaagagtcattaacctatg 8023649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6002632 - 6002488
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttc 168  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | |||| |||||| ||| |||||||||  |||| ||||||| |||  || ||||||| |||||||||| | ||| |     
T  6002632 tttctgatttgaattggc-tttggtgtaaacatgaaggttttagataattatgttatctttccaatggcgttagtttgacttgaaaatgttttgtggatt 6002534  T
Q  169 ttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaatttta 214  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||| | |||||||||    
T  6002533 ttgagttatgatgaaaacacttcaagtaggtcttggggaaatttta 6002488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18893063 - 18893010
Alignment:
Q  282 agaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18893063 agaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 18893010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 537
Target Start/End: Original strand, 18367493 - 18367595
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtct 532  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||  ||||||  |||||||| |||||    
T  18367493 tatgtggaaaatgtatgatattgaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgttatgttg-caagttg-cttatgttgctgtct 18367590  T
Q  533 ctgct 537  Q
    |||||    
T  18367591 ctgct 18367595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 44228636 - 44228516
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttc 168  Q
    |||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||| ||   |||||||||||||||||  ||||| | ||| |  |    
T  44228636 tttctgttttgatttggactttttggtaaacatgaaagttgtagacaattatgttagctatcttttggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaac 44228537  T
Q  169 ttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  44228536 ttgagatatgattaaattact 44228516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 6819426 - 6819367
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattat 492  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6819426 tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattat 6819367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 209
Target Start/End: Original strand, 11986841 - 11986912
Alignment:
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  11986841 tttggtttgacttgaaaatgatctttagtttttgagttatgatgaaaatactacaagggggtcttagtgaaa 11986912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 17548286 - 17548361
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  17548286 tatgtggaaaatgtatgatatagaaaaaatcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg 17548361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 352
Target Start/End: Original strand, 37917146 - 37917233
Alignment:
Q  265 ttccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggttt 352  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||  || || |||||| |||||||    
T  37917146 ttccaaacttcaaaactataagtattaggagtttaattaagaggtttaagagcatttaacctatgtcttgttgaatctaacttggttt 37917233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 6158706 - 6158637
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6158706 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 6158637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 12540966 - 12540881
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttcca 132  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| | |||| |  ||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||    
T  12540966 gttcttgcgtttgtttcatacgtttctgttttgaattagtcttttgtataaacatgaaagttattgataattgtgttatctttcca 12540881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 508
Target Start/End: Original strand, 14642293 - 14642362
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14642293 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 14642362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 508
Target Start/End: Original strand, 52338671 - 52338775
Alignment:
Q  404 tgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgtt-gttataccattcaagttgttattattaatgatgct 502  Q
    ||||||||  |||||| || || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  52338671 tgttgttggttaatttaagctatatatat-tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttatttatatcattcaagttgttgttattaatattgct 52338769  T
Q  503 atgttg 508  Q
    ||||||    
T  52338770 atgttg 52338775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 537
Target Start/End: Original strand, 179442 - 179544
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttat-accattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtct 532  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  179442 tatgtgcaaaatgtttgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttactattaatattgctatgttg-caagttg-cttatgttgttgttt 179539  T
Q  533 ctgct 537  Q
    |||||    
T  179540 ctgct 179544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 36528042 - 36527934
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||  |||| |||| |||||| | |||| |  ||| |||||||| ||| |||||||| | || ||||||||| |     
T  36528042 ctgtttcatgttcttgcgtctgcttcacgtgtttttgttctgaattagtctttggtataaacatgaaagatgttgataattgtgatatctttccagtagc 36527943  T
Q  138 tttggtttg 146  Q
    |||||||||    
T  36527942 tttggtttg 36527934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 4813301 - 4813250
Alignment:
Q  301 ttaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggttt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| |||||||    
T  4813301 ttaggatgtttaagagtatttaacctatgacatgatgaatctaacttggttt 4813250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 6155986 - 6155897
Alignment:
Q  397 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 487  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  6155986 tgaatattgttgttgaataatttgagatacatatgt-tatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgtt 6155897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 11192289 - 11192200
Alignment:
Q  397 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 487  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||||    
T  11192289 tgaatattgttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaatattattgttcatatcattcaagttgtt 11192200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 189
Target Start/End: Original strand, 17956843 - 17956938
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||| ||||| |  |||||| |||||| ||| ||||    
T  17956843 gtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacatctaaatgatatttagaacttgagttatgatcaaattact 17956938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 4656356 - 4656249
Alignment:
Q  48 ttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttga 147  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  |  ||| |||||||||| ||||||  || |||||||||||  ||  |||||||||     
T  4656356 ttcttgtgtctttttcacacatttatgttttgaattggctttaggtttaaacatgaaagttttagata--tgtgttagctttcccatgactttggtttgg 4656259  T
Q  148 cgtgaaaatg 157  Q
    | ||||||||    
T  4656258 cttgaaaatg 4656249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 440 - 537
Target Start/End: Original strand, 14250861 - 14250954
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| || ||||||||| ||||||||||    
T  14250861 gaaaatgtatgatatggaaattattattgttata--attcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatg-tttatgttgctgtctctgct 14250954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 493
Target Start/End: Original strand, 52213183 - 52213272
Alignment:
Q  404 tgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattatt 493  Q
    ||||||||  |||||| ||||  |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  52213183 tgttgttggttaatttaagttgtatatat-tatgtggaaaatgtattatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaaattgttattatt 52213272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 11562777 - 11562678
Alignment:
Q  397 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaa 495  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||    
T  11562777 tgaatattgttgttgaataattagagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaaattgttgttgttaa 11562680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 37038127 - 37038058
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  37038127 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaaattgttattattgatgttgctatgttg 37038058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 508
Target Start/End: Original strand, 42324964 - 42325033
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42324964 gaaaatgtatgatatggaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattcatgttgctatgttg 42325033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 366 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 11192280 - 11192240
Alignment:
Q  366 ttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  11192280 ttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 11192240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 267 - 323
Target Start/End: Original strand, 11833294 - 11833349
Alignment:
Q  267 ccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaa 323  Q
    ||||||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  11833294 ccaaacctcaaaacttga-gttctacgagtttaattaggatttttaagagtatttaa 11833349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 424 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 16050172 - 16050114
Alignment:
Q  424 tacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagtt 484  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  16050172 tacatatat-tatgtggaaagtgtatgatatagaaa-tgatgttgttatatcattcaagtt 16050114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 424 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16059555 - 16059489
Alignment:
Q  424 tacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattat 492  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  16059555 tacatatat-tatgtggaaagtgtatgatatag-aaatgatgttgttaaatcattcaagttattattat 16059489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 180
Target Start/End: Original strand, 54039123 - 54039227
Alignment:
Q  76 tttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagat 175  Q
    ||||||||||  ||| | |||| |||||| ||| |||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||||  ||||| | ||| |  ||||||||    
T  54039123 tttgaattggattttggtgtaaacatgaatgttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagat 54039222  T
Q  176 atgat 180  Q
    |||||    
T  54039223 atgat 54039227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 422; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 537
Target Start/End: Original strand, 5030 - 5547
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    ||| |||||||||||||||||||||    
T  5030 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcatttgatataaccatgaaagttgtagataattg 5129  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5130 agttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgtttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 5229  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5230 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtat 5329  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5330 ttaaactatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 5429  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  5430 gagttacatatatttatgtggaaaaagtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgttgctatgttgtgaagttgttg 5529  T
Q  520 tatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5530 tatgttgttgtctctgct 5547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 103 - 335
Target Start/End: Original strand, 6077 - 6310
Alignment:
Q  103 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtctt 202  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6077 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgaaatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 6176  T
Q  203 agtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 302  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6177 agtgaaatcttataaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagatcaaaactagaagtactatgagttcaatt 6276  T
Q  303 a-ggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    | || | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6277 agggttttttaagagtatttaacttatgttgtga 6310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 422; Significance: 0; HSPs: 96)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 42912785 - 42912268
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  42912785 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcatcgttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 42912686  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  42912685 agttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaa 42912586  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  42912585 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactataagttcaattagggtgtttaagagtat 42912486  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42912485 ttaatatatgttgtgattgatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 42912386  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42912385 gagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttg 42912286  T
Q  520 tatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||| ||||| ||||    
T  42912285 tatgttgctgtctttgct 42912268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 534
Target Start/End: Original strand, 21046366 - 21046880
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  21046366 gctctttgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattaacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 21046465  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21046466 agttaggtttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaataatccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaa 21046565  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  21046566 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgggttcaattagggtgtttaagtgtat 21046665  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21046666 ttaacctatgttgtgatggatataatttggtttgatgtgaatatctttgttagataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 21046765  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21046766 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttg 21046865  T
Q  520 tatgttgttgtctct 534  Q
    |||||||||||||||    
T  21046866 tatgttgttgtctct 21046880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 534
Target Start/End: Original strand, 16058631 - 16059145
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  16058631 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 16058730  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  16058731 agttagctttccagtggctttgatttgacgagaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttatgaaa 16058830  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  16058831 attcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagattat 16058930  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16058931 ttaagctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 16059030  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  16059031 gagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttggtg 16059130  T
Q  520 tatgttgttgtctct 534  Q
    |||||  ||||||||    
T  16059131 tatgtgtttgtctct 16059145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 537
Target Start/End: Original strand, 4596162 - 4596679
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  4596162 gctctctgacagcacgtcctctttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 4596261  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4596262 agttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 4596361  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||| || ||||||||||    
T  4596362 attcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtaatataggttcaactagggtgcttaagagtat 4596461  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4596462 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatattgttgttgaataattt 4596561  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  4596562 gagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaactaatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaaattgttg 4596661  T
Q  520 tatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4596662 tatgttgttgtctctgct 4596679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 20588407 - 20587896
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20588407 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtt-ctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttag 20588309  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20588308 ctttccagtggctttggtttggtgtgaaaatcatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaaattcag 20588209  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20588208 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacc 20588109  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaat-aatttgagtt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20588108 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaagacatatattatgtgaatgttgttgttgaataaatttgagtt 20588009  T
Q  425 acatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgt 524  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20588008 acatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatactatgttgtgaagttgttgtatgt 20587909  T
Q  525 tgttgtctctgct 537  Q
    || ||||||||||    
T  20587908 tgctgtctctgct 20587896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 20592945 - 20592434
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20592945 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtt-ctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttag 20592847  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20592846 ctttccagtggctttggtttggtgtgaaaatcatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaaattcag 20592747  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20592746 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacc 20592647  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaat-aatttgagtt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20592646 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaagacatatattatgtgaatgttgttgttgaataaatttgagtt 20592547  T
Q  425 acatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgt 524  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20592546 acatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatactatgttgtgaagttgttgtatgt 20592447  T
Q  525 tgttgtctctgct 537  Q
    || ||||||||||    
T  20592446 tgctgtctctgct 20592434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 537
Target Start/End: Original strand, 20633955 - 20634469
Alignment:
Q  24 tttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagtt 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20633955 tttgacatcacgtcctgtttcatgttcttgtgtcttttccacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagtt 20634054  T
Q  124 agctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 223  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20634055 agctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 20634154  T
Q  224 agcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagga-tgtttaagagtattta 322  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||||||    
T  20634155 agcataaccgtttctatgtcaatccaaaacttggagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagagggtttaagagtattta 20634254  T
Q  323 acctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgag 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20634255 acctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatgcatatattatgtgaatgttgttgttaaataatttgag 20634354  T
Q  423 ttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttat 522  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20634355 ttacatatatttatgtggaaaaggcatgatataaaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtat 20634454  T
Q  523 gttgttgtctctgct 537  Q
    |||| ||||||||||    
T  20634455 gttgctgtctctgct 20634469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 512
Target Start/End: Original strand, 41227031 - 41227513
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  41227031 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttatgttttgaattggccttt--ggta--cataaaagttgtagataattgagttag 41227126  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41227127 ctttccagtggctttggtttgacgcgaaaatgattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 41227226  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41227227 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtatttaacc 41227326  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagtta 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41227327 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgatggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagtta 41227426  T
Q  426 catatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 512  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41227427 catacaattatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaatttgttatcattaatgatgctatgttgtgaa 41227513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 20 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 19676446 - 19676073
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  19676446 gctctctgacaacacgtcctatttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 19676347  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19676346 agttagctttccagtggttttagttggacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 19676247  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19676246 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtat 19676147  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatatt 393  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19676146 ttaatatatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatatt 19676073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 28 - 535
Target Start/End: Original strand, 14237937 - 14238441
Alignment:
Q  28 acagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagct 127  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||| || ||||||||||||| |||||||    
T  14237937 acagcatgtcctgtttcatgtttttgcgtttttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgtaaattgtagataattgtgttagct 14238036  T
Q  128 ttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagca 227  Q
    || ||||||  | |||||||| |||||||| | ||| |||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14238037 tttcagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttagtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagca 14238136  T
Q  228 tgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaaccta 327  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  14238137 taactgtttctgagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaaccta 14238236  T
Q  328 tgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttaca 427  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14238237 tgttgtgatgaatctaattttgtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagataca 14238336  T
Q  428 tatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgt 527  Q
    ||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| | | |||||||| |||||||     
T  14238337 tatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgttatgat-tcaagttgttgtatgttgc 14238433  T
Q  528 tgtctctg 535  Q
    ||||||||    
T  14238434 tgtctctg 14238441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 26 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 51082945 - 51082496
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||| ||| |||||||||||||||||  |||     
T  51082945 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattagcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattgtattat 51082846  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51082845 ctttccagtggcgtaggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttaagaaaattcag 51082746  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||    
T  51082745 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacc 51082646  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagtta 425  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51082645 tatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagata 51082546  T
Q  426 catatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccat 477  Q
    ||||||| |||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51082545 catatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttataccat 51082496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 38 - 537
Target Start/End: Original strand, 7052390 - 7052886
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||     
T  7052390 ctgttttatgttcttgcgtctttttcacacgttgaatttttgaattggcctttagtgtaaacatgaaagttttagataattttgttaactttccaatggc 7052489  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttc 237  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7052490 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtattagtgaaattttatgaaaattctgcataaccgtttc 7052589  T
Q  238 taagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt-aggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7052590 taagtcagtccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaacctatgttgtgat 7052689  T
Q  337 ggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctat 436  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  7052690 ggatctaa-ttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagatacatatat-tag 7052787  T
Q  437 gtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgc 536  Q
    ||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||| ||||| |||    
T  7052788 gtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgctgtctgtgc 7052885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 41225778 - 41226109
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  41225778 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttatgttttgaattggccttt--ggta--cataaaagttgtagataattgagttag 41225873  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41225874 ctttccagtggctttggattgacgagaaaatgatttttagttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 41225973  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41225974 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtatttaacc 41226073  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41226074 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 41226109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 25 - 432
Target Start/End: Original strand, 38887409 - 38887816
Alignment:
Q  25 ttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagtta 124  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  38887409 ttgacagcatcttctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattggcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtta 38887508  T
Q  125 gctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattca 224  Q
    |||||| | ||| ||||||||||  |||||||| | |||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38887509 gctttcgaatggctttggtttgatttgaaaatgatttttgatttttgaggtatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattca 38887608  T
Q  225 gcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt-aggatgtttaagagtatttaa 323  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||||||    
T  38887609 gcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataattacaaaactcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaa 38887708  T
Q  324 cctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagt 423  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  38887709 cctatgttgtgatggatctaa-ttggtttgacgtggatatctttgttggataagttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaataatttgaaa 38887807  T
Q  424 tacatatat 432  Q
    |||||||||    
T  38887808 tacatatat 38887816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 94 - 406
Target Start/End: Original strand, 21239686 - 21239998
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21239686 gtaaacatgaaagttttagataatttggttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 21239785  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21239786 ggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 21239885  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatatt 393  Q
    |||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21239886 agttcaattaaggtgtttaagaatttttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatttttgttggataatttgaaatacatatatt 21239985  T
Q  394 atgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||||||||    
T  21239986 atgtgaatgttgt 21239998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 41 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12710602 - 12710282
Alignment:
Q  41 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtttt 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  12710602 tttcacgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtataaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggcgtt 12710503  T
Q  141 ggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaa 240  Q
    |||||||| |  ||||| | |||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12710502 ggtttgacttacaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaatttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 12710403  T
Q  241 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggat 340  Q
    || ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710402 gtcaatccgaaacttatggaataactccaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggat 12710303  T
Q  341 ctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12710302 ctaatttggtttgacgtgaat 12710282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 100 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 51323930 - 51323628
Alignment:
Q  100 atgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggt 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51323930 atgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 51323831  T
Q  200 cttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51323830 cttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaattcaaaacttatggaataactccaaaccttaaaactagaagtactatgagttca 51323731  T
Q  300 attaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtga 399  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51323730 attaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgtgatggatctaatttggtttgacatgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 51323631  T
Q  400 atg 402  Q
    |||    
T  51323630 atg 51323628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 41 - 335
Target Start/End: Original strand, 21180663 - 21180957
Alignment:
Q  41 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtttt 140  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||    
T  21180663 tttcgtgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggattt 21180762  T
Q  141 ggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaa 240  Q
    |||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21180763 ggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaatttcagcataaccgtttctaa 21180862  T
Q  241 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21180863 gttaatccaaaacttatgggataattccaattcttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 21180957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Original strand, 46198069 - 46198357
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||    
T  46198069 gttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtgactttggtttg 46198168  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  46198169 acttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttaatgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaat 46198268  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46198269 ccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatattgtga 46198357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 50001192 - 50000893
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  50001192 cctgtttcgcgttcttgcgtcttttgcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatgg 50001093  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||| ||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  50001092 ctttagtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccattt 50000993  T
Q  237 ctaagttaatcc-aaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50000992 ctaagttaatccaaaaacttatgagataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 50000893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 37 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 45496664 - 45496326
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| || |||||||||| |||||||||| | ||     
T  45496664 cctgtttcatgttcttgcgtgtttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaaattttagataattgtgttagctttctaatga 45496565  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||| |||| || |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  45496564 ctttagttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaactcagcataaccgttt 45496465  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt-aggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  45496464 ctaagtcaatccaaaacttagggaataatttcaaacctccaaactagaagtactctgagtttaattaaggggatttaagagtatttaacctatgttgtga 45496365  T
Q  336 tggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggat 374  Q
    |  |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||    
T  45496364 ttaatctaacttggtttgacatgaatatctttgttggat 45496326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Original strand, 2332544 - 2332842
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  2332544 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 2332643  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||| ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||    
T  2332644 ctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccattt 2332743  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2332744 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 2332842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 48 - 335
Target Start/End: Original strand, 29763979 - 29764270
Alignment:
Q  48 ttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttga 147  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  29763979 ttcttgcaactttttcacacgtttctattttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggatttggtttaa 29764078  T
Q  148 cgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatc 247  Q
    | |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  29764079 catgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatc 29764178  T
Q  248 caaaacttaaggaataattcca----aacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||| || |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29764179 caaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 29764270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 50544586 - 50544246
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  50544586 gctctctgacagcatgtcatatttcatgttcttgcgtctttttcacgcgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 50544487  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  50544486 tgttagctttcgggtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaattttatgaaa 50544387  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||| |||| ||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||  ||||| || |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  50544386 attcggcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaatttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 50544288  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50544287 ttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaat 50544246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Original strand, 22130399 - 22130697
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  22130399 cctgttttatgttcttacgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttgatgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 22130498  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
      |||||||||  |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | |||    
T  22130499 aattggtttgatttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataatctttt 22130598  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22130599 ctaatttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 22130697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18121331 - 18120999
Alignment:
Q  28 acagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagct 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18121331 acagcacgttctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacttttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagct 18121232  T
Q  128 ttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagca 227  Q
    ||| ||||| ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  18121231 ttctagtggatttggttggacttgaaaatgatttttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgca 18121132  T
Q  228 tgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaaccta 327  Q
    | |   |||||| || || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| |  |  | ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18121131 taattatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcctg-tgcactatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 18121033  T
Q  328 tgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  18121032 tgttgtgatgaatctatcttggtttgacgtgaat 18120999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 24720011 - 24720351
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  24720011 gctctctgacagcacgtcctctttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttttcttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 24720110  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| || || ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24720111 agttagccttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttttttagttatgatgaaaatacttcatggaggtcttagtgaaattttatgaaa 24720210  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||| |||| ||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  | |||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  24720211 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcactatgagttcagttaaggtgtttaagagtat 24720309  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||    
T  24720310 ttaacctatgttgcgatgaatctatcttggtttgacgtgaat 24720351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 33 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1643315 - 1642972
Alignment:
Q  33 acgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttcca 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  1643315 acgtcctgtttcatgttcttgcgtatttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttaactttcca 1643216  T
Q  133 gtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgacc 232  Q
     ||| ||| ||||||| ||  |||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  1643215 atggctttagtttgacttg--aatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataact 1643118  T
Q  233 gtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttg 332  Q
     |||||| || || |||||||||| ||| |   ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||     
T  1643117 atttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttt 1643019  T
Q  333 tgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  1643018 tgatggatctaacttgatttgacgtgaatatctttgttggatgattt 1642972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 48 - 335
Target Start/End: Original strand, 8276337 - 8276624
Alignment:
Q  48 ttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttga 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || | |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||     
T  8276337 ttcttgcgtctttttcacacgtttatgttttgaattggcctttggtgttaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgg 8276436  T
Q  148 cgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatc 247  Q
    | |||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8276437 cttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatc 8276536  T
Q  248 caaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8276537 caaaacttatgagataattccaaacctcaaaactagaagtactataggttcaattaaggcgtttaagagtatttaacctatgttgtga 8276624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28313066 - 28312768
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||    
T  28313066 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgggctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgg 28312967  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| ||||||||   ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||    
T  28312966 ctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccattt 28312867  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28312866 ctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 28312768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 71 - 335
Target Start/End: Original strand, 44822490 - 44822754
Alignment:
Q  71 tctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttct 169  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||| |    
T  44822490 tctgttttgaatttg-ctttcggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttt 44822588  T
Q  170 tgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcca 269  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  44822589 tgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccaagttaatccaaaacttacgggataattcca 44822688  T
Q  270 aacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44822689 aacctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 44822754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 297073 - 296775
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  297073 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcatttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 296974  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||| ||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |||    
T  296973 ctttggtttgactcgaaaatgatatttgatttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatgaaaattcagcacaaccattt 296874  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  296873 ctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtga 296775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 47 - 379
Target Start/End: Original strand, 22823750 - 22824082
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtcttttt-cacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtt 144  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22823750 gttcttgcgtcttttttcacacatttctgttttgaatttg-ctttcggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtt 22823848  T
Q  145 tgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagtta 244  Q
    |||| | |||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| |    
T  22823849 tgacttcaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtca 22823948  T
Q  245 atccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaa 344  Q
    | |||||||||| ||| |   ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22823949 acccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgatggatctaa 22824047  T
Q  345 tttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
     || ||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  22824048 cttagtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 22824082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Original strand, 38056985 - 38057283
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| || ||||||| |||||||||  |||||||||| |||||    
T  38056985 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattggcctttggtgtaaacaagaaagttttagataattttgttagctttctagtgg 38057084  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||| |||| || || ||||  | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||| || ||| |||    
T  38057085 ctttcgtttaacttgcaaattatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagggggtattagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccattt 38057184  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38057185 ctaagttaatacaaaacttatgggattattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtacaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 38057283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 335
Target Start/End: Original strand, 13880982 - 13881248
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||    
T  13880982 tttctgttttgaatttg-ctttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttacagtggttttggtttgacttggaaatgatttttagtt 13881080  T
Q  168 cttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattc 267  Q
     ||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13881081 tttgtgatatgatgaaattagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattc 13881180  T
Q  268 caaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13881181 caaccctcaaaactaaaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 13881248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 38 - 337
Target Start/End: Original strand, 14792897 - 14793195
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||      
T  14792897 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtacataattgtgttagctttccagtgac 14792996  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttc 237  Q
    ||||||| ||| |||||||| | ||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  ||||    
T  14792997 tttggttggacttgaaaatgatttttggttttagagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttc 14793096  T
Q  238 taagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatg 337  Q
    || || || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14793097 taggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgatg 14793195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 37 - 325
Target Start/End: Original strand, 23194885 - 23195173
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||     
T  23194885 cctgttttatgttcttgcgtctttttcacaagtttctattttgaattggcctttggtgtgaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatga 23194984  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||| || ||||||||   ||| ||  ||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  23194985 ctttggtttaacttgaaaatgacttttagtgtttgagttatgataaaaatactcctaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacccttt 23195084  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  23195085 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctccaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttgagagtatttaacc 23195173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 59 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22350284 - 22350023
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  22350284 ttttcacccttttctgttttgaatttgc-tttcggtgtaaacatgaaatttgtagataactgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatc 22350186  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | | | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||     
T  22350185 atttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttat 22350086  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatt 320  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22350085 ggaataattccaaccctcaaaactagaagtactacgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 22350023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 94 - 335
Target Start/End: Original strand, 20031281 - 20031522
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| |     
T  20031281 gtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgtttttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactcaat 20031380  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20031381 ggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatg 20031480  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20031481 agttcaattaaggtgtttaggagtatttaacccatgttgtga 20031522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 94 - 335
Target Start/End: Original strand, 24815243 - 24815484
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24815243 gtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgtctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaa 24815342  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||    
T  24815343 ggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattctaaggctcaaaactagaagtaatatg 24815442  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24815443 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 24815484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Original strand, 45574386 - 45574673
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||     
T  45574386 cctgttttatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcatttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatga 45574485  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||           ||||||||||| |||||||    
T  45574486 ctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtg-----------aaattcagcataaccgttt 45574574  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  45574575 ctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtgctatgagttcaattaaggtgtttaagcgtatttaacccatgttgtga 45574673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 56 - 335
Target Start/End: Original strand, 20437580 - 20437859
Alignment:
Q  56 tctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaa 155  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||   ||||    
T  20437580 tcttttttacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgactctaaaa 20437679  T
Q  156 tgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaactt 255  Q
    || | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  20437680 tgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaactt 20437779  T
Q  256 aaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    | || ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20437780 atgggataattccaaggcttaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 20437859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 336
Target Start/End: Original strand, 7792243 - 7792485
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7792243 gtaaacatgaaagttgtagataattttgttagatttccaatggctttggtttgaattgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaa 7792342  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| | ||    
T  7792343 ggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatgtg 7792442  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  7792443 agttcaattaaggtgtttaagagcatttaacccatgttgtgat 7792485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 99 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 39060752 - 39060472
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttcca-gtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgag 197  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  39060752 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggag 39060653  T
Q  198 gtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | || ||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   || ||||  |||| || |  ||||||||||||    
T  39060652 gtcttagtgaaattttatgaaaatttcgtataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaactccaaagcttg-tgtactatgagtt 39060554  T
Q  298 caattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  39060553 caattaagatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 39060472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 337
Target Start/End: Original strand, 17902100 - 17902395
Alignment:
Q  41 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtttt 140  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  17902100 tttcatgttcttgcgtttttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggcttt 17902199  T
Q  141 ggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaa 240  Q
    || ||||| |||||||| | ||||||| |  || ||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||    
T  17902200 ggcttgacttgaaaatgatttttggttttcaagttatgatgaaaatactccaaggtggtcttgatgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaa 17902299  T
Q  241 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatg 337  Q
    || || |||||||||| ||| |   ||||||  ||||| | |   |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17902300 gtcaacccaaaacttatggattgtctccaaaattcaaagc-atgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatg 17902395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 80 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16401343 - 16401092
Alignment:
Q  80 aattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatga 179  Q
    ||||||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||   ||||||   ||| ||  |||||||||||    
T  16401343 aattggcatttagtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgacttttagtgtttgagatatga 16401244  T
Q  180 tgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaa 279  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  16401243 tcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcaaaatcgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaa 16401144  T
Q  280 ctagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||    
T  16401143 ctagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacccatgtt 16401092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 44892176 - 44891867
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  44892176 tgacagcatttcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 44892077  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
     ||||| |||| ||||||||| | |||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  44892076 atttcccgtggctttggtttgccttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattccg 44891977  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| ||  |||||| || || |||||| ||| ||| |   ||||||| ||||| || | | |||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||    
T  44891976 cataactatttctaggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaatcttgta-tactatgagtacaattaaggtgtttaagagta-ttaacc 44891879  T
Q  326 tatgttgtgatg 337  Q
    |||||| |||||    
T  44891878 tatgttatgatg 44891867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 6833932 - 6833609
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||| |||||||||| ||||||| |  ||||| ||||  ||||    
T  6833932 cctgtttcatattcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacttttggtgtaaacatgaaagttttagataactctgttagatttctggtgg 6833833  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||| |  |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | || ||  |||    
T  6833832 atttggttttaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgaataactattt 6833733  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    |||||| || |||||||||| ||| |   ||||||  ||||| || |   |||| |||||||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6833732 ctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaatttcaaagcttg-tttactgtgagttcaattaaggagcttaagagtatataacctatgttgtgat 6833634  T
Q  337 ggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    | |||||| ||||||||| ||||||    
T  6833633 gaatctaacttggtttgatgtgaat 6833609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16372465 - 16372178
Alignment:
Q  41 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtttt 140  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||| |||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||    
T  16372465 tttcgtgttcttgtatctttttcacacgtttctgttttgaattggacttgggtgtaaacatggaagttttagataattttgttagctttccaatggcttt 16372366  T
Q  141 ggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaa 240  Q
    |||||||| | |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||    
T  16372365 ggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaa 16372266  T
Q  241 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct-caaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaaccta 327  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||| || ||||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16372265 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctacaaaaataaaagtaatatgagtgaaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 16372178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 406 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 19676100 - 19675969
Alignment:
Q  406 ttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatg 505  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19676100 ttgttggataatttgaaatacatatatttatgtgcaaaaggtatgatatagaaaataattttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatg 19676001  T
Q  506 ttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19676000 ttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgct 19675969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16362593 - 16362395
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||     
T  16362593 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttaaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattt 16362494  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16362493 cgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 16362395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13989540 - 13989393
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  13989540 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 13989441  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  13989440 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 13989393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13227521 - 13227340
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||     
T  13227521 cctgttttacgttcttgcgtctttttcacacgtttctgatttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatga 13227422  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     |||||||| || |||||||| | ||| | | ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  13227421 ctttggttttacttgaaaatgatttttagcttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 13227340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29535709 - 29535528
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||| || |||||||||  |||||||||||| |||    
T  29535709 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaaattttagataattttgttagctttccaatgg 29535610  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     |||||||| || |||||||| | ||| | | ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  29535609 ctttggttttacttgaaaatgatttttagcttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 29535528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21841423 - 21841243
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  21841423 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 21841324  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||||||||| ||| ||||||   |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21841323 tttggtttggcgtaaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 21841243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Original strand, 21922797 - 21922977
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  21922797 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 21922896  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||||||||| ||| ||||||   |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21922897 tttggtttggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 21922977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 357 - 537
Target Start/End: Original strand, 38887781 - 38887958
Alignment:
Q  357 tgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatag 456  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  |||||||||||    
T  38887781 tgaatgttgttgttgaataatttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaataatttgaggtacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag 38887879  T
Q  457 aaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  38887880 -aaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgctgtttctgct 38887958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 223
Target Start/End: Original strand, 9784677 - 9784863
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtg 135  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||    
T  9784677 cctgtttcgcgttcttgcgtcttttttgcatatttctgttttgaattgg-ctttcggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatg 9784775  T
Q  136 gttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 223  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  9784776 gttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagatcttggtgaaattttataaaaattc 9784863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Original strand, 21474574 - 21474711
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| |||    
T  21474574 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagatacttg 21474673  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
     |||||| |||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  21474674 tgttagccttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatg 21474711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41373128 - 41372948
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||     
T  41373128 ctgttccatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagatttccaatggc 41373029  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||||||||| ||| ||||||   |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  41373028 tttggtttggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 41372948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 176 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 294624 - 294456
Alignment:
Q  176 atgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatt--------- 266  Q
    |||||| |||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||             
T  294624 atgatggaaatactccaagtatgtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgggataatt 294525  T
Q  267 ccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  294524 ccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaatccatgttgtga 294456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 440 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 42697031 - 42696935
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  42697031 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcatccaagatgttgttattaatgttgctacgttg-caagttgttttatgttgttgtctctgct 42696935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 208
Target Start/End: Original strand, 23593239 - 23593409
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||     
T  23593239 ctgttccatgttctccggtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagtcgtagataatttagttatctttccaatggc 23593338  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaa 208  Q
    |||||||||  || |||||| | |||||||   ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23593339 tttggtttggagtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaattactccaaggaggtcttagtgaa 23593409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 211
Target Start/End: Original strand, 10812760 - 10812877
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||| | ||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  10812760 gtaaacatgaaagtcgtagataattgtgttagctttccagtgcctttggtttgacttagaaatgatttttggtctttgagttatgatgaaaatactccaa 10812859  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaatt 211  Q
     |||||||||| ||||||    
T  10812860 ggaggtcttagcgaaatt 10812877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21659805 - 21659689
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||| ||| || |||||| | |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21659805 gtaaacatgaaagtcttagataattttgttagctttccaatggcttcggtttggcatgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaa 21659706  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaat 210  Q
     ||||||||||||||||    
T  21659705 ggaggtcttagtgaaat 21659689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16656023 - 16655793
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||| | ||  ||||||||||| | |||||| | | | | | |||||||||| || || ||| ||||  | |    
T  16656023 catgaaagttttagataattttgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaag 16655924  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||| || || ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  16655923 tcttggtaaatttttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagttt 16655825  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgt 330  Q
    |||||  | |||  ||||||||||||||||||    
T  16655824 aattaaaaggttggagagtatttaacctatgt 16655793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 424 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 18275241 - 18275130
Alignment:
Q  424 tacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttat 522  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| |||||    
T  18275241 tacatatat-tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttg-tttat 18275145  T
Q  523 gttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||| |||||    
T  18275144 gttgttgtccctgct 18275130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 152
Target Start/End: Original strand, 21190002 - 21190117
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||   |||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| |    
T  21190002 cctgtttcgtgttcttgcgtctgtttcacacgtttctattttgagttggtctttattgtaaacatgaaagttgatgataattgtgttatctttccagtag 21190101  T
Q  137 ttttggtttgacgtga 152  Q
      ||||||||||||||    
T  21190102 ccttggtttgacgtga 21190117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 440 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 1642750 - 1642655
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  1642750 gaaaatgtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgctatgttgt-aagatg-tttatgttgttgtctctgct 1642655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 150
Target Start/End: Original strand, 18060532 - 18060645
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| ||| |||||  |||||||||| | |||    
T  18060532 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgttttgatttggcctttggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatgg 18060631  T
Q  137 ttttggtttgacgt 150  Q
     |||||||||||||    
T  18060632 ctttggtttgacgt 18060645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 404 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 52983491 - 52983387
Alignment:
Q  404 tgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 502  Q
    ||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  52983491 tgttgttggttaatttaagctacatatat-tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgtt 52983393  T
Q  503 atgttg 508  Q
    ||||||    
T  52983392 atgttg 52983387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 404 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 51476322 - 51476194
Alignment:
Q  404 tgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 502  Q
    ||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  51476322 tgttgttggttaatttaagctacatatat-tatgtggaaaatgtatgatatagataataccgttgtttatattattcaagttgttattattaatgttgct 51476224  T
Q  503 atgttgtgaagttgttttatgttgttgtctct 534  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  51476223 atgttg-caagttg-tttatgttgttctctct 51476194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 17004062 - 17003968
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  17004062 tcctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttc 17003968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 35893646 - 35893528
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||| |  |||  ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |    
T  35893646 cctgtttcgcgttcttgcgtctgtttcatacgtttctgttttaaattggtctttggtataaatatgaaagttgttgataattgtgttatctttccagtag 35893547  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaa 155  Q
      ||||||||| |||||||    
T  35893546 ccttggtttgatgtgaaaa 35893528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 308 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 48301379 - 48301315
Alignment:
Q  308 gtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttgg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  48301379 gtttaagagtatttaacctatgtggtgatagatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttgg 48301315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 118
Target Start/End: Original strand, 38055908 - 38055990
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataatt 118  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||    
T  38055908 tcctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataatt 38055990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 156
Target Start/End: Original strand, 21244371 - 21244480
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |   || |||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| |  ||||||||    
T  21244371 gttcttgcgtctgtttcatacgtttctattttgaattagccttttgtacaaacatgaaagttgttgataattatgttatctttccagtagccttggtttg 21244470  T
Q  147 acgtgaaaat 156  Q
    || |||||||    
T  21244471 acatgaaaat 21244480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 379
Target Start/End: Original strand, 11809199 - 11809259
Alignment:
Q  319 tttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11809199 tttaacctatgttgtgatgaatctaacttgggttgacgtgaatatcattgttggatgattt 11809259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22366658 - 22366527
Alignment:
Q  58 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||  ||||||||||| |  |||||    
T  22366658 tttttcacccgtttccgttttgaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttgtagaaaattttgttagctttctaatgactttggtttgacatcgaaatg 22366559  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
     | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  22366558 atttttagaacttgagatatgattaaattact 22366527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 424 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 18270587 - 18270476
Alignment:
Q  424 tacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatg-ttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttat 522  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| | | || |||||||  |||||| |||||    
T  18270587 tacatatat-tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttttttatatcattctagttgttattatttacgttgttatgttg-caagttg-tttat 18270491  T
Q  523 gttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||| |||||    
T  18270490 gttgttgtccctgct 18270476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23073322 - 23073262
Alignment:
Q  319 tttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23073322 tttaacttatgttgtgatgaatctaacttgggttgacgtgaatatcattgttggatgattt 23073262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 361
Target Start/End: Original strand, 28477374 - 28477426
Alignment:
Q  309 tttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28477374 tttaagaatattttacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacatgaat 28477426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 7792587 - 7792662
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| | || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7792587 tatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtaaatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 7792662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 13528529 - 13528604
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  13528529 tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg 13528604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 447 - 537
Target Start/End: Original strand, 21181073 - 21181162
Alignment:
Q  447 tatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  21181073 tatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttg-cttatgttgttgtccctgct 21181162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 496
Target Start/End: Original strand, 44822856 - 44822919
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 496  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  44822856 tatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaat 44822919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 537
Target Start/End: Original strand, 38057394 - 38057490
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||| ||||||    
T  38057394 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatg-tttatgttgttgtttctgct 38057490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 449 - 508
Target Start/End: Original strand, 10813273 - 10813333
Alignment:
Q  449 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10813273 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 10813333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 401 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13302135 - 13302045
Alignment:
Q  401 tgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattat 492  Q
    |||||||||||  ||||||||| |  |||||| ||||||||||  |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13302135 tgttgttgttgtttaatttgagatctatatat-tatgtggaaattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcattcaagttgttattat 13302045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 496
Target Start/End: Original strand, 24815587 - 24815647
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaat 496  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24815587 tatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgtt--tatatcattcaagttgttattattaat 24815647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 18823952 - 18823821
Alignment:
Q  404 tgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 502  Q
    ||||||||  |||||| || || |||||| |||||||||||  |||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  || |    
T  18823952 tgttgttggttaatttaagctatatatat-tatgtggaaaatatatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgtt 18823854  T
Q  503 atgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||  ||||||  |||||||| ||||||||||    
T  18823853 atgttg-caagttg-cttatgttgctgtctctgct 18823821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 440 - 537
Target Start/End: Original strand, 19761968 - 19762064
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| || ||||||||| ||||||||||    
T  19761968 gaaaatgtatgatatggaaattattattgattatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatg-tttatgttgatgtctctgct 19762064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 185
Target Start/End: Original strand, 20708696 - 20708805
Alignment:
Q  76 tttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagat 175  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||| | ||| |||||||||  | || ||||||| |||  |||||||||| | |||||||| | ||| | ||||| |    
T  20708696 tttgaattggcctttggtgtaaacatgcaggttttagataattttgctatctttccaatggcgttggtttgacttaaaaatgttttgtggattttgagtt 20708795  T
Q  176 atgatgaaaa 185  Q
    ||||||||||    
T  20708796 atgatgaaaa 20708805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 189
Target Start/End: Original strand, 7641549 - 7641669
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttc 168  Q
    ||||| |||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| | ||   |||||||||||||||||  ||||| | ||| |  |    
T  7641549 tttctattttgatttggactttttggtaaacatgaaagttgtagacaattatgttagatatcttttggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaac 7641648  T
Q  169 ttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  7641649 ttgagatatgattaaattact 7641669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 189
Target Start/End: Original strand, 15862030 - 15862150
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttc 168  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||  ||||| |||| | ||| || ||||||| ||  ||||| | ||| |  |    
T  15862030 tttccgttttgaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttgtagacaattttgttagttttctaatggcttgggtttgatgtccaaatgatttttagaac 15862129  T
Q  169 ttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  15862130 ttgagatatgattaaattact 15862150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 150
Target Start/End: Original strand, 44035797 - 44035889
Alignment:
Q  58 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgt 150  Q
    |||||||| | |||| | ||||||||||  ||| | |||| ||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  44035797 tttttcacccctttccgctttgaattggattttggtgtaaacatcaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttgacgt 44035889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 418; Significance: 0; HSPs: 144)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 537
Target Start/End: Original strand, 20178838 - 20179355
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  20178838 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 20178937  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  20178938 agttagctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 20179037  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  20179038 attcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtat 20179137  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20179138 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 20179237  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  20179238 gagttacgtatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttg 20179337  T
Q  520 tatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  20179338 tatgttgttgtctttgct 20179355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 19140500 - 19140008
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  19140500 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttacgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 19140401  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19140400 agttagctttccagtggctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgtgatatgatgcaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 19140301  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  19140300 attcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaacagtat 19140201  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19140200 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttcttgttgaataattt 19140101  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 512  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19140100 gagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 19140008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 512
Target Start/End: Original strand, 39936328 - 39936819
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  39936328 gctctctgacagcacatcctgtttcatgttcttgcatctttttaacacgtttctgttttgaattggcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattg 39936427  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  39936428 agttagctttccggtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggctcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 39936527  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  39936528 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagaaataattccaaatctcgaaactagaagtactatgagttcaactagg-tgtttaagagtat 39936626  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39936627 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 39936726  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 512  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39936727 gagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgtggttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 39936819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 534
Target Start/End: Original strand, 42818231 - 42818738
Alignment:
Q  27 gacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  42818231 gacagcacgtcctgtttcatgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggtctttgatgtaaacatgaaagttgtagataattgagttaga 42818330  T
Q  127 tttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 226  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  42818331 tttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttaagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttatgaaaattcagc 42818430  T
Q  227 atgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacct 326  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  42818431 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaatct 42818530  T
Q  327 atgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttac 426  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42818531 atggtgtgatggatctaatttgatttgacgtgaatttatttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttac 42818630  T
Q  427 atatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttg 526  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  42818631 atatatttatgaggaaaagatatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagtttttattattaacgatgatatgttgtgaagttgttgtatgttg 42818730  T
Q  527 ttgtctct 534  Q
    ||||||||    
T  42818731 ttgtctct 42818738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 489
Target Start/End: Original strand, 6102070 - 6102536
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||    
T  6102070 gctctctgacagaacgtcctattttatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacacaaaagttgtagataattg 6102169  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6102170 agttagctttccagtggctttggtttgacgtgcaaatggtttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 6102269  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6102270 attcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatatttaagagtat 6102369  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6102370 ttaacctatgttgtgatggatctaa-ttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttattgaataattt 6102468  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttat 489  Q
    ||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  6102469 gagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttataccatccaagtggttat 6102536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 20 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 5761268 - 5760882
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||    
T  5761268 gctctctgacagcacgtccggtttcatgttcttgcgtctttttaacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtcgataattg 5761169  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5761168 agttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 5761069  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5761068 attcagcataactgtttctaggttaatcaaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtaccatgagttcaattagggtgtttaagagtat 5760969  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5760968 ttaacctatgttgtgatggatctaaattggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 5760882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 20 - 537
Target Start/End: Original strand, 20083955 - 20084467
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||||||     
T  20083955 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgtattgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttttagataatta 20084054  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20084055 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaa 20084154  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt-aggatgtttaagagta 318  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||  | |||||| ||    
T  20084155 attcagcataaccgtttctaagtcagtccaaaacttagagaataattccaaacctc-aaactagaagtactaggagtttaattaagggggcttaagatta 20084253  T
Q  319 tttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatt 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  20084254 tttaacctatgttgtgatggatctaa-ttggtttgacgtgaatatctttgttgaataatttgaaatacatatactatatgaatgttcttgttgaataatt 20084352  T
Q  419 tgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgtt 518  Q
    |||| ||||||||| |||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||| | | ||||||||    
T  20084353 tgaggtacatatat-tatgtgaatattgtatgatata-aaaataatgttgttatacca-tcaagtggttattattaatgttgttatgat-tcaagttgtt 20084448  T
Q  519 ttatgttgttgtctctgct 537  Q
     ||||||||||||||||||    
T  20084449 gtatgttgttgtctctgct 20084467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 379
Target Start/End: Original strand, 5082529 - 5082888
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| ||||||||||    
T  5082529 gctctctgacagcacgtcatgtttcatgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataattg 5082628  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  5082629 agttagctttccagtggttttggtttaacatgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtctgagtgaaattttatgaaa 5082728  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  5082729 attcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtat 5082828  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||    
T  5082829 ttaacttatgcggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgattt 5082888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18834206 - 18833847
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  18834206 gctctctgacaacatgttctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 18834107  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     ||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18834106 tgttagcttttcagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 18834007  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  18834006 attcagcataatcgtttctaagttaatcaaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtat 18833907  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||    
T  18833906 ttaacctatatggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgattt 18833847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 20 - 379
Target Start/End: Original strand, 17437635 - 17437993
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||    ||| |||||||||||||||||||||    
T  17437635 gctctctgacagcacgttctgtttcatgttcttgcatctttttctctcgtttctgttttgaattggcattttctataaacatgaaagttgtagataattg 17437734  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17437735 agttagctttccagtggctttggtttgacgtaaaaatgattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaa 17437834  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || || || || ||||| |  ||||||||||||    
T  17437835 attcagcacaaccgtttctaatttaatccaaaacttatggaataattccaaatctcaaaactagaaataataggattttaattaaggagtttaagagtat 17437934  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||    
T  17437935 ttaacctatgtggtgatggatctaatttggtttgatgtgaat-tccttgttggatgattt 17437993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Original strand, 6573374 - 6573682
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  6573374 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattgccctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 6573473  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6573474 tgttagctttccggtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatt-ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 6573572  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | |||||||||||||    
T  6573573 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaggtactaggggttcaattaagttgtttaagagtat 6573672  T
Q  320 ttaacctatg 329  Q
     |||| ||||    
T  6573673 ctaacatatg 6573682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 27 - 332
Target Start/End: Original strand, 18024019 - 18024324
Alignment:
Q  27 gacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18024019 gacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagc 18024118  T
Q  127 tttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 226  Q
    |||||| | | |||| ||||||  ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18024119 tttccaatagctttgatttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 18024218  T
Q  227 atgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacct 326  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18024219 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggcatagttccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 18024318  T
Q  327 atgttg 332  Q
    ||||||    
T  18024319 atgttg 18024324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 23 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 26454443 - 26454133
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  26454443 ctttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggcttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 26454344  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26454343 tagctttccagtggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 26454244  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtattta 322  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26454243 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacatcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtattta 26454144  T
Q  323 acctatgttgt 333  Q
    |||||||||||    
T  26454143 acctatgttgt 26454133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 335
Target Start/End: Original strand, 41680457 - 41680766
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagtta 124  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||| |||| |||||||||| |||||||||  ||||    
T  41680457 tgacagcatatcctgtttcatgttattgcgtctttttcacacctttccgctttgaattggg-tttcggtgtaaacatgaaagttttagataattatgtta 41680555  T
Q  125 gctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattca 224  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41680556 gctttccaatggctttggattgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattca 41680655  T
Q  225 gcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaac 324  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41680656 gcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaac 41680755  T
Q  325 ctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||    
T  41680756 ctatgttgtga 41680766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 23914652 - 23914273
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23914652 tgacagcatatcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctattttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 23914553  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    |||||||||||  | |||||||| | |||||| | |||||||    || ||||||||||||||| |||  ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23914552 ctttccagtggcgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatgaaaatacttcaagtaggtcctattgaaattttatgaaaattcag 23914453  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| |  |||||| ||||||||||     
T  23914452 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaagtagaagtactaggagtt-tattaaggggtttaacagtatttaaca 23914354  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    | |||| ||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23914353 tgtgttatgatggatctaatttggtcggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatgttgt 23914273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 333
Target Start/End: Original strand, 38185402 - 38185716
Alignment:
Q  19 agctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataatt 118  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  38185402 agctctctgacagcacatcttgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatt 38185501  T
Q  119 gagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
      |||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  38185502 ttgttagctttccaatgactttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaa 38185601  T
Q  219 aattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagta 318  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  38185602 aattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagta 38185701  T
Q  319 tttaacctatgttgt 333  Q
    ||||| | |||||||    
T  38185702 tttaatccatgttgt 38185716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22207996 - 22207693
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22207996 tgacagcatctcctgttttatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtaaataattgtgttag 22207897  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||    ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22207896 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttgggttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattcag 22207797  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22207796 cataactgtttctaaattaatccaaaacttatggaataattccaaacctgaaaactagaagtatcaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 22207697  T
Q  326 tatg 329  Q
    ||||    
T  22207696 tatg 22207693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 37 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22483464 - 22483123
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||    
T  22483464 cctgtttcatgttcatgcgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgtaagctttccaatgg 22483365  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||    
T  22483364 ctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactattt 22483265  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    |||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22483264 ctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacttatgttgtgat 22483166  T
Q  337 ggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||| ||||    
T  22483165 ggatctaacttggtttgatgtgaatatctttgttggatgattt 22483123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 48 - 333
Target Start/End: Original strand, 21860965 - 21861250
Alignment:
Q  48 ttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttga 147  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |  || ||| ||||||    
T  21860965 ttcttgcatcttttacacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttggttagctttctaaaggcttttgtttga 21861064  T
Q  148 cgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatc 247  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  21861065 cttgaaaatgatatttggtttttgagatatgctgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtttatc 21861164  T
Q  248 caaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgt 333  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  21861165 caaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgt 21861250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 44432580 - 44432281
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  44432580 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccagtgg 44432481  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatg-ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtt 235  Q
     ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||    
T  44432480 ctttggtttgacttgaaaatgattttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatt 44432381  T
Q  236 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  44432380 tctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtga 44432281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 364506 - 364208
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||    
T  364506 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcgcacgtttctgttttgaattgaccttgggtgtaaacatgaaagttgtggataattttgttagctttccaatgg 364407  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||| ||||||| |||||||| | ||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  364406 ctttagtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttt 364307  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  364306 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaatccatgttgtga 364208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19882686 - 19882388
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||    
T  19882686 cctgtttcgcgttcttgcgtcttttgcacacgtttctgtttttaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgg 19882587  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| ||||||||   ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  19882586 ctttggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagttataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgttt 19882487  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19882486 ctaagttaatcccaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagggtatttaacctatgttgtga 19882388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 4381110 - 4381450
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  4381110 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 4381209  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     |||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4381210 tgttagctttctagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttacgataaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 4381309  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||| |||| ||  ||||||||| || |||||||||| | | |   ||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4381310 attctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgaattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 4381408  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4381409 ttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaat 4381450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Original strand, 42559862 - 42560159
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||    
T  42559862 cctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgagttgacttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagcttttcaatgg 42559961  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||| || |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  42559962 ctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgttt 42560061  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  42560062 ctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaagctc-aaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtga 42560159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11775454 - 11775142
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  11775454 ctttgacagcatcccctatttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgt 11775355  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    ||| |||||| ||  | | ||||| |||||||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11775354 tagatttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 11775255  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtattta 322  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  11775254 cagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggtttaattaaggtgtttaagagtattta 11775155  T
Q  323 acctatgttgtga 335  Q
    ||||| |||||||    
T  11775154 acctaagttgtga 11775142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23478812 - 23478500
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  23478812 ctttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgactttttgtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 23478713  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    || ||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  23478712 tacctttccagtggcttgggtttgacttgaaaatgatttttagtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatg 23478613  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtattta 322  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| | ||||||||    
T  23478612 cagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttcatagtattta 23478513  T
Q  323 acctatgttgtga 335  Q
    || ||||||||||    
T  23478512 acatatgttgtga 23478500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 48 - 335
Target Start/End: Original strand, 15635526 - 15635812
Alignment:
Q  48 ttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttga 147  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15635526 ttcttgcgtctttttcactcgtttatgttt-gaattggcccttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 15635624  T
Q  148 cgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatc 247  Q
    | |||||||| | ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15635625 cttgaaaatgatttttggcttttgagatataatgaagatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatc 15635724  T
Q  248 caaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15635725 caaaacttatgggataattccaatcctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 15635812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19880560 - 19880250
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  19880560 ctttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttatgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgt 19880461  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    ||||||| || ||| |||||||||  ||||||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19880460 tagcttttcaatggctttggtttggtgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 19880361  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtattta 322  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19880360 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttattggataattccaaatctcgaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattta 19880261  T
Q  323 acctatgttgt 333  Q
    |||||||||||    
T  19880260 acctatgttgt 19880250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 45 - 335
Target Start/End: Original strand, 25483816 - 25484106
Alignment:
Q  45 atgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||  |||||||    
T  25483816 atgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgcctttggtt 25483915  T
Q  145 tgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagtta 244  Q
    |||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  25483916 tgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaacgtttctaagtta 25484015  T
Q  245 atccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25484016 atccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 25484106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 94 - 335
Target Start/End: Original strand, 39694919 - 39695160
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| ||||||| || |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39694919 gtaaacatgaaaattttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacctgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 39695018  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39695019 ggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatg 39695118  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39695119 agttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtga 39695160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 59 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20454935 - 20454659
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgt 158  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||| ||||||||     
T  20454935 ttttcacccttttctgttttgaatttgcttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccattggctttcatttgacttgaaaatga 20454836  T
Q  159 tatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaag 258  Q
    | ||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20454835 tttttagtttttgagatatgatgaaaatactcgaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatg 20454736  T
Q  259 gaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    | ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20454735 ggataattcaaacccacaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 20454659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 59 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20455692 - 20455416
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgt 158  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||     
T  20455692 ttttcacccttttctgttttgaatttgcattccgtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggctttcgtttgacttgaaaatga 20455593  T
Q  159 tatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaag 258  Q
    | ||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20455592 tttttagtttttgagatatgatgaaaataccccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatg 20455493  T
Q  259 gaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
      |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20455492 agataattccatccctcaaaactagaagtactatgaggtcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 20455416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 59 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20460670 - 20460394
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgt 158  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||     
T  20460670 ttttcacccttttctgttttgaatttgcattccgtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggctttcgtttgacttgaaaatga 20460571  T
Q  159 tatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaag 258  Q
    | ||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20460570 tttttagtttttgagatatgatgaaaataccccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatg 20460471  T
Q  259 gaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
      |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20460470 agataattccatccctcaaaactagaagtactatgaggtcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 20460394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 48 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 36305365 - 36305035
Alignment:
Q  48 ttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttga 147  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  36305365 ttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgatttggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttagtttga 36305266  T
Q  148 cgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatc 247  Q
    | |||||||| | |||| || ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  ||||||||| || |    
T  36305265 cttgaaaatggtttttgctttttgagttatgataaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtaaacc 36305166  T
Q  248 caaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaattt 347  Q
    ||||||| | ||| |   ||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36305165 caaaactcatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagtccaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaactt 36305067  T
Q  348 ggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| ||||    
T  36305066 ggtttgacgtgaatacctttgttggatgattt 36305035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17795950 - 17795652
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  17795950 cctgtttcgcgttctagcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcatttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 17795851  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     || ||||||||  ||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||    
T  17795850 cttgggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccattt 17795751  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  17795750 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacaagtatttaatccatgttgtga 17795652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 337
Target Start/End: Original strand, 22258621 - 22258937
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  22258621 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacctttattttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 22258720  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22258721 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttttttagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 22258820  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||| |||| ||  |||||| || || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22258821 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 22258919  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatg 337  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  22258920 ttaaactatgttatgatg 22258937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 47 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 44477132 - 44476851
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  44477132 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 44477033  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || | |||||| | |||||||    || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44477032 actttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 44476933  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctc-aaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaaccta 327  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  44476932 ccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 44476851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 47 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 44480394 - 44480113
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  44480394 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 44480295  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || | |||||| | |||||||    || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44480294 actttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 44480195  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctc-aaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaaccta 327  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  44480194 ccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 44480113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 36732860 - 36733167
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36732860 tgttttatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggct 36732959  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttct 238  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||    
T  36732960 ttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaatgaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttct 36733059  T
Q  239 aagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgg 338  Q
    |||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  | |||||||||||||||| |          ||||||||||||||||||||||     
T  36733060 aagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcactatgagttcaattaag----------gtatttaacctatgttgtgatga 36733148  T
Q  339 atctaatttggtttgacgt 357  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  36733149 atctaacttggtttgacgt 36733167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 99 - 331
Target Start/End: Original strand, 19807993 - 19808225
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||| || | |||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  19807993 catgaaagttgtagataattttgtaagctttccaatgatattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatcctctaaggagg 19808092  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  19808093 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 19808192  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19808193 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19808225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 99 - 331
Target Start/End: Original strand, 22237650 - 22237882
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22237650 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgttgaaaatactccaaggagg 22237749  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22237750 tcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 22237849  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22237850 aattatgttgtttaagagtatttaacctatgtt 22237882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 36 - 335
Target Start/End: Original strand, 21579540 - 21579839
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtg 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  21579540 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttaacacgttttcgttttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagatttctagtg 21579639  T
Q  136 gttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtt 235  Q
    | |||||||||||  ||| ||| | ||| ||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| || || ||| ||    
T  21579640 gctttggtttgactcgaatatgatttttagtttttgatttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataaccttt 21579739  T
Q  236 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21579740 tctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaattagaaatactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtga 21579839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22474480 - 22474146
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22474480 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttagtgtaagcatgaaagttgtagataattgtgttag 22474381  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||||  ||| ||| ||||||| |||||| | | ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||      
T  22474380 ctttcccatggctttagtttgacttgaaaacgatttttggtttttgaattatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaactcca 22474281  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| |   |||||| || || |||||| ||| ||| |   ||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  22474280 cataattatttctaggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 22474182  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22474181 tatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaat 22474146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21399446 - 21399209
Alignment:
Q  19 agctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataatt 118  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  21399446 agctctctgacagcatgccctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgtcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatt 21399347  T
Q  119 gagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21399346 gagttagttttccaatggattcggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaa 21399247  T
Q  219 aattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaactta 256  Q
    ||||| |||| ||  |||||| || || ||||||||||    
T  21399246 aattctgcataactatttctaggtcaacccaaaactta 21399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21793939 - 21793702
Alignment:
Q  19 agctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataatt 118  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  21793939 agctctctgacagcatgccctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgtcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatt 21793840  T
Q  119 gagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21793839 gagttagttttccaatggattcggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaa 21793740  T
Q  219 aattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaactta 256  Q
    ||||| |||| ||  |||||| || || ||||||||||    
T  21793739 aattctgcataactatttctaggtcaacccaaaactta 21793702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 58 - 327
Target Start/End: Original strand, 8728292 - 8728561
Alignment:
Q  58 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||    
T  8728292 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatg 8728391  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
       ||| |||   ||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||     
T  8728392 aattttagtttaggagttatgatgaaaatactacaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcc-aaacttag 8728490  T
Q  258 ggaataattcc-aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaaccta 327  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  8728491 ggaataattccaaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 8728561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 335
Target Start/End: Original strand, 29763192 - 29763501
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  29763192 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag 29763291  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||| ||||  |||||||||||  |||||||   ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  29763292 ctttctagtgtctttggtttgactcgaaaatgaattttagtttttgagttataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaatttag 29763391  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
     || | | ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||   |||||| |||||||    
T  29763392 aataatcatttctaagttaatccgaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaagatgggaaagagtgtttaacc 29763491  T
Q  326 tatgttgtga 335  Q
    ||||||||||    
T  29763492 tatgttgtga 29763501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 59 - 320
Target Start/End: Original strand, 42265951 - 42266209
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  42265951 ttttcacccctttctgttttgaatttg-ctttcggtgtaaacacgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatg 42266049  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||     
T  42266050 atttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctt---aaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaagcttat 42266146  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatt 320  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  42266147 ggaataattccaaccctccaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 42266209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 17978740 - 17979074
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17978740 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacatatttatgtttttaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 17978839  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
      ||||||||| ||||||||||| |||||||    ||||||| ||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17978840 agttccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttggtttttgagttatgatgaaaatatttcaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 17978939  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
     || ||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| |||||  | |  |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  17978940 gataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacc 17979038  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  17979039 tatgttgtgatgaatctatcttggtttgacgtgaat 17979074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 59 - 335
Target Start/End: Original strand, 17460644 - 17460919
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || | |||| |||| ||||||| || |||||||||  ||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||    
T  17460644 ttttcacccttttctgttttgaatttgc-tctcggtgtaaacatgaaattt-tagataattttgttagtttttcaatggctttggtttgacttgaaaatg 17460741  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  17460742 atttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttat 17460841  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17460842 gggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 17460919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21514054 - 21513715
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  21514054 gctctctgacaacacgtcctgttttatgttcttccgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 21513955  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     |||||| ||| ||||| ||||||||| | |||||||| | ||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21513954 tgttagcattctagtggctttggtttggcttgaaaatgatttttgggttttgagatatgatcaaaatactccaa-gaggtcttagtgaaattttatgaaa 21513856  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||| |||| ||  |||||| || || |||||| ||| ||| |   ||||||| ||||| ||    | |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21513855 attctgcataactatttctaggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgcactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 21513757  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    ||||| ||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  21513756 ttaacatattttgtgatgaatttatcttggtttgacgtgaat 21513715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 94 - 335
Target Start/End: Original strand, 44522817 - 44523058
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| | |||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  44522817 gtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaa 44522916  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44522917 ggaggtcttagtgaaatctcatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatg 44523016  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  44523017 agttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtga 44523058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 169 - 361
Target Start/End: Original strand, 361678 - 361870
Alignment:
Q  169 ttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  361678 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcc 361777  T
Q  269 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  361778 aaagctcaaaactaggagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgatgtgaat 361870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 169 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 32950187 - 32949995
Alignment:
Q  169 ttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  32950187 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcc 32950088  T
Q  269 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  32950087 aaagctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgttgaatctaatttggtttgacgtgaat 32949995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 59 - 379
Target Start/End: Original strand, 20517474 - 20517793
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgt 158  Q
    ||||||| | |||||| |||||||| || ||| | |||| ||| ||| || ||||||| || ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  20517474 ttttcacccttttctgctttgaatttgcttttggtgtaaacattaaaattttagataactgtgttagttttccagtggctttggcttgacttgaaaatga 20517573  T
Q  159 tatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaag 258  Q
    | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| || |||||||||| |    
T  20517574 tttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactgtttctaagtcaacccaaaacttatg 20517673  T
Q  259 gaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtg 358  Q
    ||     ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20517674 gatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgcgatggatctaacttggtttgacgtg 20517772  T
Q  359 aatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||| || ||||||||| ||||    
T  20517773 aatatctttgttggatgattt 20517793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 94 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 39364185 - 39363955
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  39364185 gtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccaa 39364086  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     ||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  39364085 agaggtcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctccaaactagaagtgctatg 39363986  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaac 324  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  39363985 agttcaattaaggtgtttgagagtatttaac 39363955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Original strand, 27941233 - 27941521
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||| || ||| ||    
T  27941233 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatggaagttttagataattttgttagctttccaatggcttcggtgtg 27941332  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || | |||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||    
T  27941333 actttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaat 27941432  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27941433 ccaaaacttatgggataattccaatgctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaatagtatttaacccatgttgtga 27941521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 337
Target Start/End: Original strand, 36405383 - 36405693
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  36405383 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaaattgtagataattgtgttag 36405482  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    |||||| |||| ||||  ||||  |||||||| | |||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36405483 ctttcccgtggctttgaattgatttgaaaatgatttttgttttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 36405582  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| ||  |||||| || || |||||||||| | | |   ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  36405583 cataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaatgtgtttaatagtatttaacc 36405681  T
Q  326 tatgttgtgatg 337  Q
    || ||| |||||    
T  36405682 taagttatgatg 36405693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 94 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22344702 - 22344418
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| ||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| | ||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  22344702 gtaaacatgaaaattttagataattgtgttagctttctagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaa 22344603  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||||| ||    
T  22344602 ggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactgtg 22344504  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  22344503 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 22344418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 94 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22356362 - 22356078
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| ||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| | ||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  22356362 gtaaacatgaaaattttagataattgtgttagctttctagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaa 22356263  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||||| ||    
T  22356262 ggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactgtg 22356164  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  22356163 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 22356078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 61 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 38989159 - 38988884
Alignment:
Q  61 ttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgtta 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |     
T  38989159 ttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaaattgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatt 38989060  T
Q  161 tttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaagga 260  Q
    ||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||  | || ||| |||||| |||    
T  38989059 tttggtttttaggttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctagttcaacccagaacttatgga 38988960  T
Q  261 ataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatg 337  Q
     |   ||||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38988959 ttgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactataagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgatg 38988884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 61 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 39020256 - 39019981
Alignment:
Q  61 ttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgtta 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |     
T  39020256 ttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaaattgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatt 39020157  T
Q  161 tttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaagga 260  Q
    ||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||  | || ||| |||||| |||    
T  39020156 tttggtttttaggttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctagttcaacccagaacttatgga 39020057  T
Q  261 ataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatg 337  Q
     |   ||||||| ||||| || |  ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39020056 ttgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactataagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgatg 39019981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 59 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23660911 - 23660688
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgt 158  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || ||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||     
T  23660911 ttttcacccttttctgttttgaatttgctttcagtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttacagtggctttggtttgacttgaaaatga 23660812  T
Q  159 tatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaag 258  Q
    | ||| ||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  23660811 tttttagtttttgagatatgatgaaattagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatg 23660712  T
Q  259 gaataattccaaacctcaaaacta 282  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  23660711 gaataattccaaccctcaaaacta 23660688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16198566 - 16198371
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  16198566 ctttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtatataattgtgt 16198467  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16198466 tagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgattaaaatactccacggaggtcttagtgaaattttatgaa 16198371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 129 - 361
Target Start/End: Original strand, 18816886 - 18817119
Alignment:
Q  129 tccagtggttttggtttgacgtgaaaatg--ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 226  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18816886 tccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgc 18816985  T
Q  227 atgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacct 326  Q
    || |   ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18816986 ataattatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacatcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 18817084  T
Q  327 atgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  18817085 atgttgtgatgaatgtaacttggtttgacgtgaat 18817119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 98 - 334
Target Start/End: Original strand, 21326333 - 21326569
Alignment:
Q  98 gcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgag 197  Q
    ||||||||| | |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||   ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||   |    
T  21326333 gcatgaaagctttagataatttggttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatcaaaatactccaagatg 21326432  T
Q  198 gtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 297  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || |||| || |||||| |||||||    
T  21326433 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccagttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaattaaaagtacaatgagtt 21326532  T
Q  298 caattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtg 334  Q
    ||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  21326533 caattaaagagtttaagagtatttaacctatgttgtg 21326569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 24907492 - 24907180
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| | |||| |||||| ||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  24907492 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacatttatattttgaattgacctttggtgtaaacatgaatgttttatataattgtgttagctttctagtgg 24907393  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| | |||||| | |||| || ||||| ||||| |||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||   ||    
T  24907392 ctttggtttgactttaaaatgatttttgatttttgagttatgacgaaaatactctaaggaggtttgagtgaaattttatgaaaattccgcataactaatt 24907293  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    |||||| || |||||||||| ||| |  |||| ||| |||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||| |     
T  24907292 ctaagtcaacccaaaacttatggattgtttcc-aacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaagttgtttaagaatatttaacctatattgt-aa 24907196  T
Q  337 ggatctaatttggttt 352  Q
    |||||||| |||||||    
T  24907195 ggatctaacttggttt 24907180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 25757868 - 25757556
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||| | ||| || |||||    
T  25757868 tgtttcgtgttcttgtgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttatagataattgtgttggtttttcaatggtt 25757769  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttct 238  Q
    |||||||||| |||||||  | ||| | | | ||| |||||||||||||||||||   ||||||||  ||| |||||||||||||||||| |   || ||    
T  25757768 ttggtttgacttgaaaataatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttagcaaaactttatgaaaattcagcataattattcct 25757669  T
Q  239 aagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgg 338  Q
    ||||||| |||||  ||| ||  |  |||||||| |||||| | | |||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25757668 aagttaaaccaaactttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgttgtaatgg 25757570  T
Q  339 atctaatttggttt 352  Q
    || ||| |||||||    
T  25757569 atttaacttggttt 25757556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 334
Target Start/End: Original strand, 21321736 - 21321971
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    |||||||||| | |||||||  |||||||||||| ||| || | |||||| ||||||||   ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||   ||    
T  21321736 catgaaagtttttgataatttggttagctttccaatggcttagatttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatcaaaatactccaagatgg 21321835  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || |||| || |||||||||||||||    
T  21321836 tcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccagttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaattataagtactatgagttc 21321935  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtg 334  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21321936 aattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtg 21321971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 103 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23670300 - 23670067
Alignment:
Q  103 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtctt 202  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  23670300 aaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggtctt 23670201  T
Q  203 agtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 302  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||  |||||| || || |||||||||| | | |   ||||||| |||||  | |  |||||||||||||||||    
T  23670200 agtgaaattttattaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtatccaaacttcaaagattg-tgtactatgagttcaatt 23670102  T
Q  303 aggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatg 337  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23670101 aaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgatg 23670067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 39 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 25295848 - 25295536
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||| | ||| || |||||    
T  25295848 tgtttcgtgttcttgtgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttatagataattgtgttggtttttcaatggtt 25295749  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttct 238  Q
    |||||||||| |||||||  | ||| | | | ||| |||||||||||||||||||   ||||||||  ||| || ||||||||||||||| |   || ||    
T  25295748 ttggtttgacttgaaaataatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttagcaaaacttcatgaaaattcagcataattattcct 25295649  T
Q  239 aagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgg 338  Q
    ||||||| |||||  ||| ||  |  |||||||| |||||| | | |||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25295648 aagttaaaccaaactttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgttgtaatgg 25295550  T
Q  339 atctaatttggttt 352  Q
    || ||| |||||||    
T  25295549 atttaacttggttt 25295536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 161 - 361
Target Start/End: Original strand, 18815281 - 18815480
Alignment:
Q  161 tttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaagga 260  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| || |||||||||| |||    
T  18815281 tttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgga 18815380  T
Q  261 ataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaa 360  Q
     |   ||||||| |||||  | |  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  18815381 ttgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttcacgtgaa 18815479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1485076 - 1484929
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  1485076 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 1484977  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  1484976 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 1484929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Original strand, 4541861 - 4542059
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||     
T  4541861 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattt 4541960  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     |||||||||||| ||| |||||| || ||| ||||||   |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4541961 tgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 4542059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 249 - 406
Target Start/End: Original strand, 21345945 - 21346102
Alignment:
Q  249 aaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttg 348  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21345945 aaaacttagggaataattccaaatctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttg 21346044  T
Q  349 gtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    ||| ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21346045 gttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 21346102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Original strand, 18677570 - 18677750
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||     
T  18677570 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttacctttccaatggc 18677669  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18677670 tttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 18677750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 5852780 - 5852927
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  5852780 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 5852879  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  5852880 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 5852927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 14408932 - 14409079
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  14408932 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 14409031  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  14409032 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 14409079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 99 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 17501581 - 17501350
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    ||||||||||  ||||||||   ||||||||||| ||| || ||||| || | |||||| | ||| | | ||||||||||||| || ||| ||||  | |    
T  17501581 catgaaagtttgagataattttattagctttccaatggcttgggtttaacttaaaaatgatttttagattttgagatatgatggaattaccccaagcaag 17501482  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||| || || ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  17501481 tcttggtaaatttttatgaaaaattagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 17501382  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgt 330  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17501381 aattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 17501350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 352
Target Start/End: Original strand, 19331921 - 19332223
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||| |||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||    
T  19331921 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacaagaaagttttagataattgtgttagctttgcaatagtttttgtttg 19332020  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || |||||||| | ||| | | | ||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||  |||||||| ||||| |   || |||||||||     
T  19332021 acttgaaaatgatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttagtaaaactt--tgaaaatttagcataaatattcctaagttaaa 19332118  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatt 346  Q
    ||||| |||| ||  |  |||||||| |||||| |  ||||| |  || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  19332119 ccaaatcttatggtttgtttccaaacttcaaaa-tttaagtattcggattttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgttgtaatggatctaact 19332217  T
Q  347 tggttt 352  Q
    ||||||    
T  19332218 tggttt 19332223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 440 - 537
Target Start/End: Original strand, 22259106 - 22259203
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22259106 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgccatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgct 22259203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 4483954 - 4483837
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  4483954 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagtctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattg 4483855  T
Q  120 agttagctttccagtggt 137  Q
     |||||||||||||||||    
T  4483854 tgttagctttccagtggt 4483837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 14397230 - 14397426
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttt-tcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgag 121  Q
    |||||||||||   ||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||  |    
T  14397230 ctttgacagcattccctgtttcgcgttcttgcatcttttttcacacgcttctgttttgaattggcctttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttg 14397329  T
Q  122 ttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  14397330 ttagctttccaatggctttggtatggtgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaatttatgaa 14397426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Original strand, 24485549 - 24485729
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  24485549 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 24485648  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||||| ||| ||||||||||   |||||||   ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24485649 tttggcttggcgtgaaaatgacttttggtttaggagttatgattaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24485729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 20045683 - 20045830
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  20045683 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttctttcgtctttttcacacgtttatgttttgaattagcctttggtctaaacatgaaagttgtagataattg 20045782  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  20045783 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 20045830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 352
Target Start/End: Original strand, 45559520 - 45559817
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  45559520 gttcttgtgtctttttcacacatttatgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccaattgttttggtttg 45559619  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || |||||||  | ||| | | |||      ||||||||||||||||    |||||||| ||| |||||||||||||| ||| |   || |||||||||     
T  45559620 acttgaaaataatttttagat-ttg------gatgaaaatactccaaatgagtcttagtaaaactttatgaaaattcaacataattattcctaagttaaa 45559712  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatt 346  Q
    ||||| |||| ||  |  |||||||| |||||| | | |||| || || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  45559713 ccaaaccttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggattttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgttgtaatggatctaact 45559811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14824449 - 14824313
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  14824449 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtcttttttatacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 14824350  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
     ||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||    
T  14824349 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaat 14824313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 190
Target Start/End: Original strand, 45290041 - 45290205
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  45290041 tgacaacatgtcctgtttcatgttcttgcgtctctttgacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 45290140  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactc 190  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||||||   |||| ||   ||| ||||||||||||||||    
T  45290141 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttgttttaggagttatgatgaaaatactc 45290205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 193
Target Start/End: Original strand, 8414069 - 8414239
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  8414069 ctttgacagcatcccctatttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgt 8414168  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||||||||| ||  | | ||||| |||||||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||    
T  8414169 tagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaa 8414239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 233 - 335
Target Start/End: Original strand, 8414240 - 8414342
Alignment:
Q  233 gtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttg 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  8414240 gtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttg 8414339  T
Q  333 tga 335  Q
    |||    
T  8414340 tga 8414342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 203 - 319
Target Start/End: Original strand, 14397604 - 14397720
Alignment:
Q  203 agtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 302  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14397604 agtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 14397703  T
Q  303 aggatgtttaagagtat 319  Q
    | | |||||||||||||    
T  14397704 aaggtgtttaagagtat 14397720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22002409 - 22002229
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  22002409 ctgttccatgttcttgcttctttttcacacatttctgttttgaactgggtttttgtgtaaaaatgaaagttgtagataatttggttagctttccaatggc 22002310  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||||||||||||| |||||    |||||||   ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||    
T  22002309 tttggtttgacgtaaaaataagttttggtttaggagttatgatgaaaataccccaaggaggtcttagtgaatttgtatgaa 22002229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 417 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 17217920 - 17217802
Alignment:
Q  417 tttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttg 516  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  17217920 tttgaattacatatat-tatgtggaaagtgtatgatatagaaaataatgttgttatatcatctaagttgttattattaatgttgctatgttg-caagttg 17217823  T
Q  517 ttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  17217822 ttttatgttgctgtctctgct 17217802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 424 - 537
Target Start/End: Original strand, 17907695 - 17907807
Alignment:
Q  424 tacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttat 522  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  17907695 tacatatat-tatgtggaaaaagtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaagttgatattattaatgttgctatgttg-caagttgttttat 17907792  T
Q  523 gttgttgtctctgct 537  Q
    |||||||||||||||    
T  17907793 gttgttgtctctgct 17907807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22313529 - 22313234
Alignment:
Q  57 ctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||| |||||||    
T  22313529 ctttttcacccatttctgttttgaattggcctttggtgtaatcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggttccggtttgacttgaaaat 22313430  T
Q  157 gttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaactta 256  Q
    ||| | ||  | ||||| ||||||||||| ||| |||   |||||| | ||||||||| | ||| | ||||| ||  |||  |||| || ||||||| ||    
T  22313429 gttttgtgaattttgagttatgatgaaaacactgcaagtgggtcttggagaaattttaaggaaacttagcataactattttcaagtcaacccaaaaccta 22313330  T
Q  257 aggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggttt 352  Q
     ||  |  |||||||| ||||||     |||| || || || ||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22313329 tggtttgtttccaaacatcaaaatctttagtattaggatttaaattaaggtgtttaatggtatttgacctatgttgtgatggatctaacttggttt 22313234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Original strand, 223272 - 223414
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||  ||||||||    
T  223272 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttg 223371  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    ||||  ||||| | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  223372 acgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 223414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Original strand, 688043 - 688185
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||  ||||||||    
T  688043 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttg 688142  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    ||||  ||||| | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  688143 acgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 688185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Original strand, 736895 - 737037
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||  ||||||||    
T  736895 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttg 736994  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    ||||  ||||| | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  736995 acgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 737037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Original strand, 860790 - 860932
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||  ||||||||    
T  860790 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttg 860889  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    ||||  ||||| | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  860890 acgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 860932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 18612104 - 18611991
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||   |||    
T  18612104 cctgtttcgtgttcttgcgtctttttcacctatttctattttgaattggcctttcgtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagatttcttttgg 18612005  T
Q  137 ttttggtttgacgt 150  Q
     |||||||||||||    
T  18612004 ctttggtttgacgt 18611991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Original strand, 18816796 - 18816861
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgg 85  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18816796 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttcggttttgaattgg 18816861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 169 - 352
Target Start/End: Original strand, 18118630 - 18118813
Alignment:
Q  169 ttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 268  Q
    |||||||| |||| || ||| ||||  ||||||| || || ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||  |  | ||    
T  18118630 ttgagataagatggaattacaccaagtaggtcttggtaaatttttacgaaaattcagcctaaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggtttgttccc 18118729  T
Q  269 aaacctcaaaactagaagtactatg-agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggttt 352  Q
    |||| |||||||| || ||| || | |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18118730 aaacttcaaaacttga-gtattagggagttcaattaaggtgttttagagtatttaacctatgttgtgatggatttaacttggttt 18118813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 418 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 23947531 - 23947414
Alignment:
Q  418 ttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttg 516  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  23947531 ttgagctacatatat-tatgtggaaatg-tatgatatagaaaatattattgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgctatgttg-caagttg 23947435  T
Q  517 ttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  23947434 ttttatgttgctgtctctgct 23947414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24239114 - 24238843
Alignment:
Q  56 tctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaa 155  Q
    ||||||| || | |||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||| ||||||| | ||||    
T  24239114 tctttttaacccatttccgttttgaattggcctttagtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttagtttgacttaaaaa 24239015  T
Q  156 tgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaactt 255  Q
    |||| | ||| | ||||| ||| ||||||| |||||||   ||||||   ||||||||| | ||| | ||||| |   |||| |||| || |||||||||    
T  24239014 tgttttgtggattttgagttataatgaaaacactccaagagggtcttgaagaaattttaaggaaacttagcataattatttccaagtcaacccaaaactt 24238915  T
Q  256 aaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctat 328  Q
    |  |  |  |||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||    
T  24238914 atcgtttgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaatgtgtttaagattaattaacctat 24238843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18827909 - 18827627
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttc 168  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || | |||||||||| |||||||    ||||| |||||| ||| ||||||||| | | |||||| |  || |||     
T  18827909 tttctgttttgaattggcttttggtgtgaacatgaaagttttagataaagatgttagatttccaatggatttggtttggcttaaaaatgattgttagttt 18827810  T
Q  169 ttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 268  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||  || ||||  |||||||||| ||||||||| ||| |   ||| | ||  |||||||||  || ||  | |||||    
T  18827809 ttgagttatggtgaaaatactacaagtagatcttgctgaaattttacgaaaattcaacataattatttttgagcgaatccaaaagatatggtttgattcc 18827710  T
Q  269 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggttt 352  Q
    ||| ||||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||  |||||||    
T  18827709 aaaactcaaaacttga-gtactaggagtctaattaggatgtttaagagtatttaaactatggcatgatggatctagcttggttt 18827627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 424 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 22244729 - 22244617
Alignment:
Q  424 tacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttat 522  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||    
T  22244729 tacatatat-tatgttgaaaatgtatgatatagaaaatattattgtttatatctttcaagttgttattattaatgtttctatgttg-caagttgttttat 22244632  T
Q  523 gttgttgtctctgct 537  Q
    |||| ||||||||||    
T  22244631 gttgatgtctctgct 22244617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 150
Target Start/End: Original strand, 15319946 - 15320059
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||| |  |||||||||| | |||    
T  15319946 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatgg 15320045  T
Q  137 ttttggtttgacgt 150  Q
     |||||||||||||    
T  15320046 ctttggtttgacgt 15320059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 150
Target Start/End: Original strand, 15500315 - 15500428
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||| |  |||||||||| | |||    
T  15500315 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatgg 15500414  T
Q  137 ttttggtttgacgt 150  Q
     |||||||||||||    
T  15500415 ctttggtttgacgt 15500428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22147129 - 22147016
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |  ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||    
T  22147129 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtataaacatgaaagttttagataattgtgttagctttcttttgg 22147030  T
Q  137 ttttggtttgacgt 150  Q
     |||||||||||||    
T  22147029 ctttggtttgacgt 22147016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23883574 - 23883457
Alignment:
Q  35 gtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagt 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||| | ||||  |||||| || | |||||||||||||  ||||||||    
T  23883574 gtcctgtttcgtgttcttgcgtctgtttcgcacgtttctgttttgagttgccctttagtgtaaatatgaaaattattgataattgagttatttttccagt 23883475  T
Q  135 ggttttggtttgacgtga 152  Q
     |  ||||||||||||||    
T  23883474 agccttggtttgacgtga 23883457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 59 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 24624364 - 24624072
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgt 158  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||| |||   |||| |||||||||| || ||||    ||||  |||| | ||| ||||||||||| | |||||      
T  24624364 ttttcacccttttctgttttgaactggctttttctgtaaacatgaaagttttatataaagatgttatatttctaatggatttggtttgacttaaaaatta 24624265  T
Q  159 tatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaag 258  Q
    | ||| | | ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| || ||||||  || |    
T  24624264 tttttagattttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtctttgtgcaattttacgaaaattcaacataactatttctaagtgaacccaaaagctatg 24624165  T
Q  259 gaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggttt 352  Q
    |  |  | |||||||  |||||| ||  || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||| |||||||    
T  24624164 gtttggtcccaaaccctaaaacttgat-taataggagtttaattaggatgtttaagagtatttaacctatggaatgatagatctaacttggttt 24624072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 466 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 24713457 - 24713388
Alignment:
Q  466 ttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctg 535  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24713457 ttgttatatcattcaaattgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 24713388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 112
Target Start/End: Original strand, 25657836 - 25657925
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtag 112  Q
    |||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||    
T  25657836 ctttgacagcatcccctatttcgtgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtag 25657925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 286 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5080478 - 5080403
Alignment:
Q  286 gtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  5080478 gtactgtgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgttgtgatgaatcttacttggtttgacgtgaat 5080403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 404 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 23889070 - 23888942
Alignment:
Q  404 tgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgct 502  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||  |||    
T  23889070 tgttgttggttaatttgagctacatatat-tatgtggaaaatgtatgatatagaagatattgttgtttatatcgttcaagttgttattattaatgtagct 23888972  T
Q  503 atgttgtgaagttgttttatgttgttgtctct 534  Q
     |||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  23888971 gtgttg-caagttg-tttatgttgctgtctct 23888942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 130
Target Start/End: Original strand, 272120 - 272214
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  272120 tcctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttc 272214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 643729 - 643635
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  643729 tcctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttc 643635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 829535 - 829441
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  829535 tcctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttc 829441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 29759560 - 29759470
Alignment:
Q  58 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgac 148  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||| | |||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  29759560 tttttcactcgtttctgttttgaattggtttttcgtgtaaacatgaaaggtttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttgac 29759470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 424 - 537
Target Start/End: Original strand, 22584461 - 22584572
Alignment:
Q  424 tacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttat 522  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||    
T  22584461 tacatatat-tatgtgaaaaatgtatgatattgaaaatatcgttgtttatatcattcaagtggttattattaatgttgctatgttg-caagttg-tttat 22584557  T
Q  523 gttgttgtctctgct 537  Q
    |||| ||||||||||    
T  22584558 gttgctgtctctgct 22584572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 352
Target Start/End: Original strand, 18122329 - 18122388
Alignment:
Q  293 gagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggttt 352  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  18122329 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctagattgtgatggatctaacttggttt 18122388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18618971 - 18618830
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| | |||||||  |||||||||| | ||| |||||||||    
T  18618971 gttcttgcatctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagtt-ttgataattttgttagctttctaatggctttggtttg 18618873  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
     |||  ||||| | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  18618872 ccgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 18618830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20879050 - 20878940
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagct-ttccagtggttttggttt 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |  ||| ||| |||||| | |||||||  |||| || ||||||| |  |||||||    
T  20879050 gttcttgcgtctgtttcacacgtttctgttttgagctggcctttagtataaacataaaagttattgataattatgttatctcttccagtagccttggttt 20878951  T
Q  146 gacgtgaaaat 156  Q
    |||||||||||    
T  20878950 gacgtgaaaat 20878940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 156
Target Start/End: Original strand, 12037800 - 12037909
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |  ||| |||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||| || ||||||||    
T  12037800 gttcttgcgtctgtttcatacgtttctgctttgagttggtctttggtataaacatgaaagttgctgataattgtattatctttccagtagtcttggtttg 12037899  T
Q  147 acgtgaaaat 156  Q
     | |||||||    
T  12037900 gcatgaaaat 12037909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 150
Target Start/End: Original strand, 22089330 - 22089443
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||   | ||| ||| |||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| | |||    
T  22089330 cctgtttcgcgttcttgcatctttttcacctatgtctatttcgaattggcctttggtttaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatgg 22089429  T
Q  137 ttttggtttgacgt 150  Q
     |||||||||||||    
T  22089430 ctttggtttgacgt 22089443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 497
Target Start/End: Original strand, 36728025 - 36728124
Alignment:
Q  397 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaa 495  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||    
T  36728025 tgaatattgttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaa 36728122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 508
Target Start/End: Original strand, 22318655 - 22318765
Alignment:
Q  397 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaa 495  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |  |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||    
T  22318655 tgaatattgttgttggataatttgagatacatatat-tacgtggatattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaa 22318752  T
Q  496 tgatgctatgttg 508  Q
    || || |||||||    
T  22318753 tgttgttatgttg 22318765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 144
Target Start/End: Original strand, 17150594 - 17150680
Alignment:
Q  58 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtt 144  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| | ||| |||||||    
T  17150594 tttttcacctgtttccgttttgaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttgcagataattatgttagctttctaatggctttggtt 17150680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 156
Target Start/End: Original strand, 22310230 - 22310292
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  22310230 gtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttccagtagtcttggtttgacatgaaaat 22310292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 449 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 20454541 - 20454454
Alignment:
Q  449 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  20454541 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttg-cttatgttgttgtccctgct 20454454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 397 - 497
Target Start/End: Original strand, 31723309 - 31723408
Alignment:
Q  397 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaa 495  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||    
T  31723309 tgaatattgttgttaaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaa 31723406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 32950280 - 32950188
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtga 152  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||  ||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  32950280 ttttcaaaggtttctgttttgaactgggttttggtgtaa-catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttga 32950188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 449 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 19882267 - 19882207
Alignment:
Q  449 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19882267 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 19882207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 449 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 20455298 - 20455238
Alignment:
Q  449 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20455298 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 20455238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 449 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 20460276 - 20460216
Alignment:
Q  449 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20460276 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 20460216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 469 - 537
Target Start/End: Original strand, 42266365 - 42266432
Alignment:
Q  469 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  42266365 ttatatcattcaagttgttattatcgatgttgctatgttg-caagatgttttatgttgttgtttctgct 42266432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 496
Target Start/End: Original strand, 15635915 - 15635978
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 496  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15635915 tatgaggaaaatgtgtgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaat 15635978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 406
Target Start/End: Original strand, 20024993 - 20025032
Alignment:
Q  367 tgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20024993 tgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 20025032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 487
Target Start/End: Original strand, 31723499 - 31723588
Alignment:
Q  397 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 487  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  31723499 tgaatattgttgttgaataatttgagatacatatat-tatctgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgtt 31723588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 406
Target Start/End: Original strand, 45471168 - 45471207
Alignment:
Q  367 tgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  45471168 tgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 45471207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 479 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 19699337 - 19699280
Alignment:
Q  479 caagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19699337 caagttgttagtattaatgtggctatgatgt-aagttgctttatgttgttgtctctgct 19699280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 440 - 537
Target Start/End: Original strand, 39695271 - 39695367
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||| |||||||||| ||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||| ||||||    
T  39695271 gaaaatgtatgatataaaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatg-tttatgttgttgtttctgct 39695367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 406 - 470
Target Start/End: Original strand, 21346062 - 21346124
Alignment:
Q  406 ttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 470  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  21346062 ttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 21346124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 366 - 406
Target Start/End: Original strand, 36728034 - 36728074
Alignment:
Q  366 ttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  36728034 ttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 36728074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 417; Significance: 0; HSPs: 130)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 9975658 - 9975146
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9975658 tgacagcacgtcatgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttag 9975559  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9975558 ttttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 9975459  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9975458 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacc 9975359  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaa-tacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagtt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9975358 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaattacatatgttatgtgaatgttgttgttgaataatttgagtt 9975259  T
Q  425 acatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgt 524  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9975258 acatatatatatgtggaaaatgtatggtatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtaaagttgttgtatgt 9975159  T
Q  525 tgttgtctctgct 537  Q
    |||||||||||||    
T  9975158 tgttgtctctgct 9975146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 512
Target Start/End: Original strand, 24781157 - 24781649
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  24781157 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 24781256  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  24781257 agttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaa 24781356  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  24781357 attcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagaatat 24781456  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24781457 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttattgttgaataattt 24781556  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24781557 gagttacatatatttatgtggaaaagatatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 24781649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 36839906 - 36839392
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  36839906 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcatttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 36839807  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  36839806 agttagttttccagtggatttggttttacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 36839707  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36839706 attcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtat 36839607  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  36839606 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatttattatgtgaatgtt---gttgaataattt 36839510  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  36839509 gagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatagtgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgtcg 36839410  T
Q  520 tatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36839409 tatgttgttgtctctgct 36839392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 17307221 - 17306705
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  17307221 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcctgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaa-catgaaagttgtagataattg 17307123  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17307122 agttagctttctagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcctgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 17307023  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||  ||    
T  17307022 attcagcataaccgtttcttagttaatccaaaacttaaggaataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaagatcat 17306923  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17306922 ttaacatatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatttattatgtgaatgttgttgttgaataattt 17306823  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17306822 gagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatattgttataaaattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttg 17306723  T
Q  520 tatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17306722 tatgttgttgtctctgct 17306705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 495
Target Start/End: Original strand, 5031447 - 5031922
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  5031447 gctctctgacaacacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttgatgtaaacatgaaagttgtagataattg 5031546  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5031547 agttagctttccagtggatttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 5031646  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5031647 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttcaactaggctgtttaagagtat 5031746  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5031747 ttaacatatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 5031846  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaa 495  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5031847 gagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaa 5031922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 537
Target Start/End: Original strand, 28652829 - 28653336
Alignment:
Q  30 agcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagcttt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28652829 agcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcatacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagattt 28652928  T
Q  130 ccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatg 229  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  28652929 tcagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatggaaattcagcata 28653028  T
Q  230 accgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatg 329  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||     
T  28653029 accgtttttaggttaatccgaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacatatc 28653128  T
Q  330 ttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacata 429  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28653129 ttgtgatggatctaatttggtttcacgtgaatatctttgttggataatttgaaatgcatatattacgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacata 28653228  T
Q  430 tatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttg 529  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28653229 tatttatgtggaaaaggtatgatatagataataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttg 28653328  T
Q  530 tctctgct 537  Q
    ||||||||    
T  28653329 tctctgct 28653336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 24515921 - 24515404
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||| |||    
T  24515921 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacatgtttttgttttgaattggcatttggtgtaaacatgaaagttgtagatagttg 24515822  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  24515821 agttagctttccagtgtctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttctttagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 24515722  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24515721 attcagtataatcgtttctacgttaatccaaaacttaaggaataaattcaaatctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 24515622  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24515621 ttaatctatgttgtgatggatctaatttggtttgacatgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 24515522  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  24515521 cagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattgaagttgttatgattaatgatgctatgttgcgaagttgttg 24515422  T
Q  520 tatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24515421 tatgttgttgtctctgct 24515404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 43 - 535
Target Start/End: Original strand, 27484810 - 27485302
Alignment:
Q  43 tcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27484810 tcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacatttgatgtaaacatgaaagatgtagataattgagttagctttccagtggctttgg 27484909  T
Q  143 tttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagt 242  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27484910 tttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatataatgaaaatactccaagtaggtcttagtggaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagt 27485009  T
Q  243 taatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatct 342  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  27485010 taatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacatatgttttgatggatct 27485109  T
Q  343 aatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaa 442  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27485110 aatttggtttgacgtgaatatatttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaa 27485209  T
Q  443 aaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctg 535  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  27485210 aatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgtgatatgttgatgtctctg 27485302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 537
Target Start/End: Original strand, 23968958 - 23969457
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  23968958 ctgttttatgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggc 23969057  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttc 237  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23969058 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatacgatgaaaataattaatggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataacagtttc 23969157  T
Q  238 taagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatg 337  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23969158 taagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatt 23969257  T
Q  338 gatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatg 437  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23969258 gatctaatttggtttgacgtaaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatg 23969357  T
Q  438 tggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||    
T  23969358 tggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgatatgttgtgaagttgtagtatgttgatgtatctgct 23969457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 20 - 401
Target Start/End: Original strand, 23068767 - 23069148
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||    
T  23068767 gctctctgacaacatgccctgtttcatgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttagtgtaaacacgaaagttgtagataattg 23068866  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23068867 agtttgttttctagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttattgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 23068966  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  23068967 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactataagtactaagagtttaattaaggggtttaagagtat 23069066  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaat 401  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23069067 ttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaat 23069148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 28 - 379
Target Start/End: Original strand, 19201525 - 19201877
Alignment:
Q  28 acagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagct 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19201525 acagcacgtcctctttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcttttggtttaaacatgaaagttgtagataattgagttagct 19201624  T
Q  128 ttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaa-tactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19201625 ttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatatgtggttcttgagatatgatgaaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 19201724  T
Q  227 atgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacct 326  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  19201725 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttatttaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacct 19201824  T
Q  327 atgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||    
T  19201825 atgtggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgattt 19201877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 26 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 21368836 - 21368483
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  21368836 tgacagcatgccctgtttcatgttcttgcatctttatcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttag 21368737  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    |||||| |||| ||||||||| | ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21368736 ctttccggtggatttggtttggcttgaaaatgagttttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcaa 21368637  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  21368636 cataaccgtttctaagttaatccaaaaattatggaataattctaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaaataagaggtttaagagtatttaacc 21368537  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||    
T  21368536 tatgtggtaatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgattt 21368483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 23 - 331
Target Start/End: Original strand, 18358289 - 18358597
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  18358289 ctttgacagcatcccctatttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 18358388  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18358389 tagcttttcagtggctttggtttgacttgaaaatgttttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 18358488  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtattta 322  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18358489 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattta 18358588  T
Q  323 acctatgtt 331  Q
    |||||||||    
T  18358589 acctatgtt 18358597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Original strand, 21081291 - 21081603
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21081291 ctttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 21081390  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21081391 tagctttctagtggctttggtttgacttaaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 21081490  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtattta 322  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21081491 tagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtattta 21081590  T
Q  323 acctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||    
T  21081591 acctatgttgtga 21081603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 26 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 9785310 - 9784931
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| | |||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  9785310 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttt-cacacgtttctgttttgagttagcctttggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttag 9785212  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||| |||||  |||||||||| | |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9785211 ctttcaagtggcgttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 9785112  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |  |||||| ||||||||||     
T  9785111 cataattgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagaactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaaca 9785012  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    | |||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  9785011 tgtgttgtgatgaatctaatttggtcggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 9784931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25183919 - 25183607
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  25183919 ctttgacagcatcccttgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttatgttttgaattggcctttggtataaacatgaaagttgtagataattgtgt 25183820  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25183819 tagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 25183720  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtattta 322  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  25183719 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtattta 25183620  T
Q  323 acctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||    
T  25183619 acctatgttgtga 25183607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 39 - 335
Target Start/End: Original strand, 41301309 - 41301605
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  41301309 tgttttatgtttttgcgtcattttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggct 41301408  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttct 238  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41301409 ttggtttgacttgaaagtgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttct 41301508  T
Q  239 aagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41301509 aagttaatccaaaacttatgagataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 41301605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 39 - 323
Target Start/End: Original strand, 10039470 - 10039754
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||     
T  10039470 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttctgaattggcctttggtgtaaatatgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggta 10039569  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttct 238  Q
    |||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||    
T  10039570 ttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccagggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttct 10039669  T
Q  239 aagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaa 323  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10039670 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 10039754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21915340 - 21915042
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||   |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||    
T  21915340 cctgtttcgcgttcttgcatctttttcacatgtttctgttttgaattggaatttaatgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagatttccaatgg 21915241  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||| |||||||||    |||||||   ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21915240 ctttggtttggcgtgaaaataagttttggtttaggagttatgatgaaaataccccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgttt 21915141  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21915140 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 21915042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 94 - 379
Target Start/End: Original strand, 43707676 - 43707960
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43707676 gtaaacataaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 43707775  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  43707776 ggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtt-ctaagttaatctaaaacttatggaataattcgaaacctcaaaactagaagtaccatg 43707874  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  43707875 agttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 43707960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 58 - 361
Target Start/End: Original strand, 24273614 - 24273917
Alignment:
Q  58 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    |||||||| | |||||| |||||| |||  ||| | ||||  ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||    
T  24273614 tttttcacccctttctgctttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacctgaaaatg 24273713  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  24273714 atttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttat 24273813  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgt 357  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24273814 gggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgt 24273913  T
Q  358 gaat 361  Q
    ||||    
T  24273914 gaat 24273917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 103 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27472905 - 27472677
Alignment:
Q  103 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtctt 202  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||   |||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27472905 aaagttgtagataattttgttagctttccagtgaaattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 27472806  T
Q  203 agtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472805 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 27472706  T
Q  303 aggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||    
T  27472705 aaggtgtttaagagtatttaacttatgtt 27472677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Original strand, 23338734 - 23339032
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||    |||||||||| |||    
T  23338734 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcatttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttactagctttccaatgg 23338833  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||    
T  23338834 ctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccattt 23338933  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  23338934 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtga 23339032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 21335770 - 21336110
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||| | |||| || ||||||||||||||||||    
T  21335770 gctctttgacagcatgccctgtttcatgttcttgtgtcttttgcacatgtttatgttttgaattgacctttggtgtaaacaagaaagttgtagataattg 21335869  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21335870 tgttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaagttttatgaaa 21335969  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||| |||| ||  ||||||||| || ||||||  || ||| |   ||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21335970 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaagctatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtat 21336068  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||    
T  21336069 ttaacctatgttgggatgaatctatcttggtttgacgtgaat 21336110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 59 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 31520813 - 31520537
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgt 158  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  31520813 ttttcacccttttctgttttgaatttgcttttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatga 31520714  T
Q  159 tatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaag 258  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  31520713 tttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttata 31520614  T
Q  259 gaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31520613 gaataattccaaccctcaaaactgaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaactcatgttgtga 31520537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 94 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24884047 - 24883806
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24884047 gtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaa 24883948  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24883947 ggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccctttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaattactatg 24883848  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24883847 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtagtga 24883806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 47 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 6483227 - 6482946
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  6483227 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 6483128  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || | |||||| | |||||||    || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6483127 acttcaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 6483028  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctc-aaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaaccta 327  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6483027 ccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 6482946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 47 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 6486694 - 6486413
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  6486694 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 6486595  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || | |||||| | |||||||    || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6486594 actttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 6486495  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctc-aaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaaccta 327  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6486494 ccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 6486413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 21315979 - 21316319
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  21315979 gctctttgacagcatgccctgtttcacgttcttgcgtcttttgcacatgcttatgttttgaattggcatttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 21316078  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     |||||||||||||||   || |||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21316079 tgttagctttccagtgtccttcgtttgacgtgaaaataatatttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 21316178  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||| || | ||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21316179 attccgcttaactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 21316277  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  21316278 ttaacctatgttgtgatgaatctatcttgatttgacgtgaat 21316319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 36 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22690399 - 22690099
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtg 135  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  22690399 tcctgtttcatgtacttacgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttagtgtaagcatgaaagttggagataattgtgttagctttccagtg 22690300  T
Q  136 gttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtt 235  Q
    |  | |||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||    
T  22690299 gcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatt 22690200  T
Q  236 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| |||||   ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22690199 tctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtcag-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttatga 22690101  T
Q  336 tg 337  Q
    ||    
T  22690100 tg 22690099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 36 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22694995 - 22694695
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtg 135  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  22694995 tcctgtttcatgtacttacgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttagtgtaagcatgaaagttggagataattgtgttagctttccagtg 22694896  T
Q  136 gttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtt 235  Q
    |  |||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||    
T  22694895 gcgttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatt 22694796  T
Q  236 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||| || || |||||||||| ||| |   ||||||| |||||   ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22694795 tctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtcag-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttatga 22694697  T
Q  336 tg 337  Q
    ||    
T  22694696 tg 22694695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 59 - 321
Target Start/End: Original strand, 18388653 - 18388915
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||    
T  18388653 ttttcacccttttctgttttgaatttg-ctttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgggttagctttccagtgactttggtttgacttaaaaatg 18388751  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||     
T  18388752 atttatggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctttggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttat 18388851  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtattt 321  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18388852 ggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 18388915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 37 - 331
Target Start/End: Original strand, 20590656 - 20590950
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| |||  ||| | |||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||||| |||    
T  20590656 cctgttttatgttcttgcgtctgtttcacatgtttctactttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagctgtagataattttgttatctttccaatgg 20590755  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  20590756 ctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagcataacccttt 20590855  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  20590856 ttaagttaatccaaaacttaagggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgtt 20590950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 32 - 335
Target Start/End: Original strand, 2524076 - 2524361
Alignment:
Q  32 cacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttcc 131  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2524076 cacgtcatgtttcatgttcttgcgtctttttaacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagatttcc 2524175  T
Q  132 agtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgac 231  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |                ||||||||||||||||| ||    
T  2524176 agtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagg----------------ttatgaaaattcagcataac 2524259  T
Q  232 cgtttct-aagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgt 330  Q
    |   ||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||    
T  2524260 c---tctaaagttaatctaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttcaatcaaggtatttaagagtatttaacctatgt 2524356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 94 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26903819 - 26903578
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26903819 gtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaa 26903720  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  26903719 ggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactagg 26903620  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26903619 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatattgtga 26903578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 37 - 361
Target Start/End: Original strand, 1384020 - 1384343
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1384020 cctgtttcatgtttttgcgtctttttcaaacgtttctgttttgaattgaccatttgtgtaaacatgaaagttgtagataattgtattagctttccagtgg 1384119  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||| ||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||    
T  1384120 ctttggattgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactattt 1384219  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    |||||| ||  ||||||||| | | |   ||||||| ||||| || |  |||| |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1384220 ctaagtcaactcaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtaccatgagttctattaaggtgtttacgagtatttaacctatgctgtgat 1384318  T
Q  337 ggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    | |||||| ||||||||||||||||    
T  1384319 gaatctaacttggtttgacgtgaat 1384343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Original strand, 19661999 - 19662287
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  19661999 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 19662098  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    ||   |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||    
T  19662099 actctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 19662198  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19662199 ccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 19662287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 99 - 331
Target Start/End: Original strand, 34858781 - 34859013
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  ||||||| || |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  34858781 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcattggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaagg 34858880  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34858881 tcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 34858980  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  34858981 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 34859013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 99 - 331
Target Start/End: Original strand, 34873843 - 34874075
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  ||||||| || |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  34873843 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcattggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaagg 34873942  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34873943 tcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 34874042  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  34874043 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 34874075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22686574 - 22686221
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||| ||| |||||| ||     
T  22686574 gctctctgacagcatgccctgtttcatgtttttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaatcggcctttggtgtaaacatgaacgttttagatatttt 22686475  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
      ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22686474 tattagctttccaatggctttggtttgacttgaatatgatttttggtttttgaggtatgatgaaaacactctaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 22686375  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||| |||  ||  ||||||| | || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22686374 attccgcacaactatttctaattcaacccaaaacttatggattgtctcgaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 22686276  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||    
T  22686275 ttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaataactttgttggat 22686221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 58 - 335
Target Start/End: Original strand, 22173383 - 22173660
Alignment:
Q  58 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggt-aagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| || |||||  | || |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  22173383 tttttcacccttttctgttttgaatttgc-tttcgatttaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgggtttggtttgacttgaaaat 22173481  T
Q  157 gttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaactta 256  Q
    | | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22173482 gatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaactta 22173581  T
Q  257 aggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
     |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22173582 tggaataattcaaaccctcaaaactcaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 22173660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Original strand, 6260722 - 6261010
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||    
T  6260722 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttaactttccaatggctttggtttg 6260821  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || | |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||    
T  6260822 actttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 6260921  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||  || ||||||||||  ||||||||||||| || || ||||  ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6260922 ccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaaatattacgagtgaaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 6261010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Original strand, 21073071 - 21073359
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  21073071 gttcttgtgtctttttcacacgtttctattttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 21073170  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || ||||||||   ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  21073171 acttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaat 21073270  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
     ||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21073271 tcaaaacttatgggataattccaatactcaaaactagaagcaatatgagttcaattaaggtatttcagagtatttaacccatgttgtga 21073359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 57 - 379
Target Start/End: Original strand, 25587041 - 25587362
Alignment:
Q  57 ctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcggg-taagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaa 155  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||  |||  || ||  || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25587041 ctttttcacacatttctgttttgaatttgc-tttcggtataaaaataaattttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaa 25587139  T
Q  156 tgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaactt 255  Q
    || | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||| || || |||||||||    
T  25587140 tgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctaggtcaacccaaaactt 25587239  T
Q  256 aaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgac 355  Q
    | ||| |   ||||||| ||||| || |  ||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25587240 atggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaagatgtttaagaaaatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgac 25587338  T
Q  356 gtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    |||||| || ||||||||| ||||    
T  25587339 gtgaatatctttgttggatgattt 25587362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9242468 - 9242180
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||| |||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  9242468 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatggaagttttagataattttgttagcttcccaatggctttggtttg 9242369  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || | ||| || | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||    
T  9242368 actttaaagtgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagatcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaat 9242269  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9242268 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaactaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 9242180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20915761 - 20915531
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    |||||||| | |||||||||  ||||| |||||| | | ||||||||||| |||||||| |  ||  || ||||||||||||||||||||||||| ||      
T  20915761 catgaaagatttagataattttgttagttttccaattgctttggtttgacttgaaaatgattcttattttttgagatatgatgaaaatactccaatgata 20915662  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915661 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 20915562  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatg 329  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20915561 aattaagctgtttaagagtatttaacctatg 20915531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 374
Target Start/End: Original strand, 28345410 - 28345746
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtg 135  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  28345410 cctgattcatgttcttgtatctttttcacacgtttctgttttgaatttg-ctttcggtgtaaacatgaaaattttagataattgtgttagctttccagtg 28345508  T
Q  136 gttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtt 235  Q
    | |||| ||| || |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||  ||    
T  28345509 gctttgattttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttacgaaaattccgcataactatt 28345608  T
Q  236 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||  || | |||||||| |||     ||||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  28345609 tctaagccaaccaaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcatttaaggtgtttaatagtacttaatctatgttgtga 28345707  T
Q  336 tggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggat 374  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||    
T  28345708 tggatctaacttggtttgacatgaatatctttgttggat 28345746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23610211 - 23609871
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||  || ||| ||||||||||    
T  23610211 gctctctgacaggacatcctgtttcgtgttcttgcgtatttttcacacgtttctgttttgaattgccctttagtgtaaacagaaatgttttagataattg 23610112  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     | |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| | |  | || ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  23610111 tgctagctttccagtgtatttagtttgacttgaaaatgatttacgatttttgagttatgatgaaaatactcgaaggaggtcttagtgaaattttatgcaa 23610012  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||| |||| ||  ||||||||| || ||||||| || ||| |   ||||||| ||||| || |  ||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  23610011 attctgcataactatttctaagtcaacccaaaacctatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtat 23609913  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  23609912 ttaacctatgttgtggtaaatctaacttggtttgacgtgaat 23609871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40912050 - 40911863
Alignment:
Q  29 cagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaa-ttggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagct 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40912050 cagcacgtcatgtttcatgttcttgcgtctttttcatacgtttctgttttgaaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagct 40911951  T
Q  128 ttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttat 215  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  40911950 ttccagtagctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatataatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatcttat 40911863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22332424 - 22332121
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || | ||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  22332424 gttcttgtgtctttttcacacatttctgttttgaattggcttttggagtgaacataaatgttttagataattgtgttagctttccagtggctttgatttg 22332325  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || |||||||| | ||| | | ||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| ||     
T  22332324 acttgaaaatgatttttagattttgagttatggcgaaaacactccaatgaggtcttggtg-aattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaac 22332226  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatt 346  Q
    |||||||||| ||| |  |||||||| |||||| | |  |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  22332225 ccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaaattg-tgtactatgagttcaattaaggtgttcaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaact 22332127  T
Q  347 tggttt 352  Q
    ||||||    
T  22332126 tggttt 22332121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31345826 - 31345656
Alignment:
Q  48 ttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttga 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31345826 ttcttgcgtttttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggctttggtttga 31345727  T
Q  148 cgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    | |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  31345726 catgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaatttttatgaa 31345656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 94 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28349578 - 28349327
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||| | ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  28349578 gtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttgcaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatggaaatactccaa 28349479  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaactta---------aggaataattccaaacctcaaaactaga 284  Q
      ||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||          || ||||||||||| ||||||||||||    
T  28349478 gtaggtcttcgtgaaatcttatgaaaattcagctcaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgggataattccaaagctcaaaactaga 28349379  T
Q  285 agtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28349378 agtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgat 28349327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 414 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 19358272 - 19358152
Alignment:
Q  414 taatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19358272 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtaaag 19358173  T
Q  514 ttgttttatgttgttgtctct 534  Q
    ||||| ||||||| |||||||    
T  19358172 ttgttgtatgttgatgtctct 19358152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 38968148 - 38967956
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  38968148 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgcctttttcacacatttctgttttcaattagcctttgctgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 38968049  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||||| | ||| |||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  38968048 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttttgtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 38967956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 218
Target Start/End: Original strand, 10684267 - 10684448
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  10684267 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 10684366  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     ||| |||| ||  ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10684367 ctttagttttactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 10684448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20261877 - 20261696
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  20261877 cctgtttcgcgttcttccgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 20261778  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     ||| |||||||  ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20261777 ctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 20261696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23136236 - 23136056
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  23136236 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaagatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 23136137  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||| || ||| ||||||   |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23136136 tttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 23136056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18809617 - 18809470
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  18809617 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 18809518  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  18809517 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 18809470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Original strand, 24897683 - 24897881
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||     
T  24897683 gctctctgacagcatgttctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattt 24897782  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||   ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24897783 tgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24897881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Original strand, 24900166 - 24900364
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||     
T  24900166 gctctctgacagcatgttctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattt 24900265  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||   ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24900266 tgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24900364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Original strand, 24905120 - 24905318
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||     
T  24905120 gctctctgacagcatgttctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattt 24905219  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||   ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24905220 tgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24905318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Original strand, 24907595 - 24907793
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||     
T  24907595 gctctctgacagcatgttctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattt 24907694  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||   ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24907695 tgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24907793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 23711501 - 23711648
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  23711501 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 23711600  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  23711601 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 23711648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26506053 - 26505906
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  26506053 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 26505954  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  26505953 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 26505906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 27920252 - 27920399
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  27920252 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 27920351  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  27920352 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 27920399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 138 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 29113978 - 29113764
Alignment:
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttc 237  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  || |    
T  29113978 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactattcc 29113879  T
Q  238 taagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatg 337  Q
    ||||| || |||||||||| ||| |  |||||||| |||||| | |  ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29113878 taagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaatttg-tgtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatt 29113780  T
Q  338 gatctaatttggtttg 353  Q
    | ||||| || |||||    
T  29113779 ggtctaactttgtttg 29113764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Original strand, 24902643 - 24902841
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||| | ||||  |||||||||||||||||||     
T  24902643 gctctctgacagcatgttctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgagttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattt 24902742  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||   ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24902743 tgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24902841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 137
Target Start/End: Original strand, 34402010 - 34402127
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  34402010 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattg 34402109  T
Q  120 agttagctttccagtggt 137  Q
     |||||||||||||||||    
T  34402110 tgttagctttccagtggt 34402127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 256
Target Start/End: Original strand, 23778629 - 23778849
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  23778629 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccaatgg 23778728  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatg-aaaattcagcatgaccgtt 235  Q
     |||| |||||| |||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | ||||||| |||| ||  ||    
T  23778729 ctttgatttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggttttagtgaaattttacgaaaaattccgcataactatt 23778828  T
Q  236 tctaagttaatccaaaactta 256  Q
    ||||||| || ||||| ||||    
T  23778829 tctaagtcaacccaaacctta 23778849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26508531 - 26508384
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  26508531 gctctctgacagcatgtcttgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 26508432  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  26508431 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 26508384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23131536 - 23131419
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||  |||||||||||||||||||||    
T  23131536 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttagtgtacacatgaaagttgtagataattg 23131437  T
Q  120 agttagctttccagtggt 137  Q
     |||||||||||||||||    
T  23131436 tgttagctttccagtggt 23131419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23134003 - 23133886
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||  |||||||||||||||||||||    
T  23134003 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttagtgtacacatgaaagttgtagataattg 23133904  T
Q  120 agttagctttccagtggt 137  Q
     |||||||||||||||||    
T  23133903 tgttagctttccagtggt 23133886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 214
Target Start/End: Original strand, 36734820 - 36734996
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||   ||||| |||||| |||     
T  36734820 ctgttttatgttcttgcgtctttttcatacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataatgttgttagatttccaatggc 36734919  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaatttta 214  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||| | ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| | |||||||||    
T  36734920 tttggtttgacttgaaaatgttttgtgggttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttggagaaatttta 36734996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 28577773 - 28577626
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  28577773 gctctctgacagaatgttctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgtttttaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 28577674  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  28577673 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 28577626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 572072 - 571935
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  572072 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcatatgtttctgttttgaattagcctttgctgtaaacatgaaagttgtagataattg 571973  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  571972 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatg 571935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 39682988 - 39682851
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| ||||||    
T  39682988 gctctctgacagcatgtcatgtttcatgttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagctaattg 39682889  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  39682888 tgttagctttccagtggcatcggtttgacttgaaaatg 39682851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 32038986 - 32039133
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  32038986 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtcattttcatacgtttctgttttcaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 32039085  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  32039086 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 32039133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22255920 - 22255768
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  22255920 gttcttgcatctttttcacctatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccaatggatttggtttg 22255821  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggt 199  Q
    || |||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  22255820 acttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggt 22255768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 203 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 31345495 - 31345379
Alignment:
Q  203 agtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 302  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31345495 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttataggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 31345396  T
Q  303 aggatgtttaagagtat 319  Q
    | | |||||||||||||    
T  31345395 aaggtgtttaagagtat 31345379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 189
Target Start/End: Original strand, 19887243 - 19887384
Alignment:
Q  48 ttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttga 147  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||||    
T  19887243 ttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttga 19887342  T
Q  148 cgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    |||  ||||| | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  19887343 cgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 19887384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 115
Target Start/End: Original strand, 149881 - 149959
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagata 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||    
T  149881 cctgttttatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcatttagtgtaaacatgaaagttgtagata 149959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 249 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22501374 - 22501288
Alignment:
Q  249 aaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22501374 aaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtcgtga 22501288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22501496 - 22501375
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22501496 ttttcacccttttctgttttgaatttgt-tttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatg 22501398  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgat 180  Q
     | | | ||| ||||||||||||    
T  22501397 atttgtagtttttgagatatgat 22501375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 249 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22509308 - 22509222
Alignment:
Q  249 aaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22509308 aaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtcgtga 22509222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22509430 - 22509309
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22509430 ttttcacccttttctgttttgaatttgt-tttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatg 22509332  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgat 180  Q
     | | | ||| ||||||||||||    
T  22509331 atttgtagtttttgagatatgat 22509309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 7187052 - 7186942
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| | ||| |||    
T  7187052 tttctgttttgaatttgc-tttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtt 7186954  T
Q  168 cttgagatatga 179  Q
     |||||||||||    
T  7186953 tttgagatatga 7186942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 19646626 - 19646507
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||||||  |    
T  19646626 cctgtttcgcgttcttgtgtctgtttcacacgtttctgttttgagttggcctttagtgtaaacatgaaagttattgataattgtgttatctttccagcag 19646527  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
      ||||||||||||||||||    
T  19646526 ccttggtttgacgtgaaaat 19646507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 232 - 335
Target Start/End: Original strand, 30643810 - 30643913
Alignment:
Q  232 cgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
    |||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  30643810 cgtttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 30643909  T
Q  332 gtga 335  Q
    ||||    
T  30643910 gtga 30643913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 45527947 - 45527828
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||| || |||| |||| |  ||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |    
T  45527947 cctgtttcacgttcttgcatttgtttcacacgtttctgtttggagttggtctttggtataaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttccagtag 45527848  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  45527847 tcttggtttgacgtgaaaat 45527828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 156
Target Start/End: Original strand, 14183728 - 14183845
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |  ||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||     
T  14183728 tgtttcgtgttcttgcgtctatttcatacgtttctgctttgagttggtctttggtataaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttccagtagtc 14183827  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    |||||||||| |||||||    
T  14183828 ttggtttgacatgaaaat 14183845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 150
Target Start/End: Original strand, 24686555 - 24686668
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||    
T  24686555 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagctttctaatgg 24686654  T
Q  137 ttttggtttgacgt 150  Q
     |||||||||||||    
T  24686655 ctttggtttgacgt 24686668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 27261501 - 27261373
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||  || | ||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| || |||||||||     
T  27261501 gctctctgacagcatttcttatttcacgttcttgtgtctttttcacatatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaaattttagataatta 27261402  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgac 148  Q
     |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  27261401 tgttagctttctaatggctttggtttgac 27261373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 415 - 537
Target Start/End: Original strand, 10897503 - 10897625
Alignment:
Q  415 aatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 513  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |  || ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||    
T  10897503 aatttgagctacatatatttatgtggaaaagatatgttatacaaaatattcatgtttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaag 10897601  T
Q  514 ttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  10897602 ttgttgtatgttgttgtctctgct 10897625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24383209 - 24383119
Alignment:
Q  57 ctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttga 147  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24383209 ctttttcacccatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttggtttga 24383119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Original strand, 14179988 - 14180107
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||    ||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||| || |    
T  14179988 cctgtttcgtgttcttgcgtctgtttcatacgtttctgctttgagttggtctttgatataaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttccggtag 14180087  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    | |||||||||| |||||||    
T  14180088 tcttggtttgacatgaaaat 14180107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 434 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 14693527 - 14693456
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatg 505  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14693527 tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgatgttatatcattcaagttgttatgattaatgttgctatg 14693456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 330
Target Start/End: Original strand, 22786694 - 22786924
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    |||||||||| ||| |||||   ||||||||||| ||| ||| ||||||| | |||||||| ||| | | ||||||||||| | || ||| ||||  | |    
T  22786694 catgaaagttttagctaattttattagctttccaatggctttagtttgacttaaaaatgttttttagattttgagatatgagggaattaccccaagcaag 22786793  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||| || || |||| ||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  22786794 tcttggtaaatttttgtgaaaattt-gcataaccgtttctaactcaatccaaaacctatggaacgtttccaaacctcaaaactagaagtattaggagttt 22786892  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgt 330  Q
    |||   ||  ||  ||||||||||||||||||    
T  22786893 aatcgagagattggagagtatttaacctatgt 22786924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 130
Target Start/End: Original strand, 11232169 - 11232263
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  11232169 tcctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttc 11232263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Original strand, 19196409 - 19196527
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||  || ||| || | |||||||| |||| ||||||||| |    
T  19196409 cctgttttgtgttcttgcgtctgtttcgcacgtttctgttttgagttggcctttagtgtaaatataaaaattattgataattgtgttatctttccagtag 19196508  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaa 155  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  19196509 ctttggtttgacatgaaaa 19196527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20273017 - 20272851
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||  ||| | ||||  | |||||| | ||| | | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  20273017 gtaaacatgaaagttttagataatctcgttagctttccaatgaatttagattgatttaaaaatgatttttagattttgagttatgatggaaatactccaa 20272918  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaagga 260  Q
      ||||||| || || |||||  |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20272917 gtaggtcttggtaaatttttaccaaaattcagcataaccgtttctatgtcaatccaaaacttaagga 20272851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 130
Target Start/End: Original strand, 22514016 - 22514110
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  22514016 tcctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttc 22514110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 130
Target Start/End: Original strand, 28776618 - 28776712
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  28776618 tcctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttc 28776712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Original strand, 23759980 - 23760065
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttcca 132  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||| |||| ||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  23759980 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggacttgggtgtaaacatggaagttttagataattttgttagctttcca 23760065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 440 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 5985396 - 5985336
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatg 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||    
T  5985396 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcatccaagttgttgttattattgatg 5985336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 403 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 44071837 - 44071706
Alignment:
Q  403 ttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgc 501  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||||||||||||||| || ||     
T  44071837 ttgttgttggataatttgagatacatatat-tatgtggaaattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcgttcaagttgttattattagtgttgt 44071740  T
Q  502 tatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    |||||||  |||||| || |||||||||||| ||||    
T  44071739 tatgttg-caagttg-ttgatgttgttgtctttgct 44071706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 24436383 - 24436333
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtt 70  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24436383 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttaacacgtt 24436333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 24841422 - 24841356
Alignment:
Q  286 gtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggttt 352  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  24841422 gtactatgagttcaattaaggtatttaagagtatttaacctatgttgtaagggatctaacttggttt 24841356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 29114029 - 29113976
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggccttt 90  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29114029 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattggccttt 29113976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 89
Target Start/End: Original strand, 21132987 - 21133039
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctt 89  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21132987 cctgtttcatgttcgtgagtctttttcacacgtttctgttttgagttggcctt 21133039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Original strand, 20006629 - 20006747
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||||  |||||||  ||| ||||| ||| |    
T  20006629 cctgtttcgcgttcttgcgtctgcttcacacgtt-ctgttttgagttggtctttggtgtaaacatgaaagttgttaataattgtattatctttctagtag 20006727  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    | ||||||||||| ||||||    
T  20006728 tcttggtttgacgggaaaat 20006747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 3539091 - 3538981
Alignment:
Q  397 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaa 495  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || || |    
T  3539091 tgaatgttgttgttggataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttga 3538994  T
Q  496 tgatgctatgttg 508  Q
    || || |||||||    
T  3538993 tgttgttatgttg 3538981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21141547 - 21141427
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttc 168  Q
    ||||| |||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||| ||   |||||||||||||||||  ||||| | ||| |  |    
T  21141547 tttctattttgatttggactttttggtaaacatgaaagttgtagacaattatgttagctatcttttggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaac 21141448  T
Q  169 ttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  21141447 ttgagatatgattaaaatact 21141427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24281246 - 24281099
Alignment:
Q  180 tgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaa 279  Q
    |||||||||| |||  |||||||  || ||||||| ||||||| ||||| ||  ||| ||||| || ||||||  || ||  || | |||||||||||||    
T  24281246 tgaaaatactacaagtaggtcttgttgcaattttacgaaaatttagcataactatttttaagtgaacccaaaagctatggtttagtcccaaacctcaaaa 24281147  T
Q  280 ctagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctat 328  Q
    || || |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24281146 cttga-gtactaagagtttaattaggatgttttagagtattcaacctat 24281099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 492
Target Start/End: Original strand, 18391046 - 18391124
Alignment:
Q  414 taatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattat 492  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18391046 taatttgagctacatatat-tatgtggaaaatatatgatatcggaaatattgttgttcatatcattcaagttgttattat 18391124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 31520434 - 31520371
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaat 496  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  31520434 tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcattgttattatcattcaagttgttattattaat 31520371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 357 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 3539091 - 3539042
Alignment:
Q  357 tgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3539091 tgaatgttgttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 3539042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16900947 - 16900854
Alignment:
Q  57 ctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgt 150  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||| ||| | |||| ||||||| || |||||||||  |||||||||| | ||  |||||||||||||    
T  16900947 ctttttcacccatttccgttttgaattggcttttggtgtaaacatgaaaattttagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgt 16900854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16994338 - 16994245
Alignment:
Q  57 ctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgt 150  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||| ||| | |||| ||||||| || |||||||||  |||||||||| | ||  |||||||||||||    
T  16994338 ctttttcacccatttccgttttgaattggcttttggtgtaaacatgaaaattttagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgt 16994245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 189
Target Start/End: Original strand, 5889244 - 5889364
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttc 168  Q
    ||||| |||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||| ||   |||||||||||||||||  ||||| | ||| |  |    
T  5889244 tttctattttgatttggactttttggtaaacatgaaagttgtagacaattatgttagctatcttttggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaac 5889343  T
Q  169 ttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  5889344 ttgagatatgattaaattact 5889364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 27851922 - 27851836
Alignment:
Q  405 gttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattat 492  Q
    |||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27851922 gttgttggttaatttgaaatacatatat-tatgtggaaattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcattcaagttgttattat 27851836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 6478035 - 6478110
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  6478035 tatgtggaaaatggatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg 6478110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19819737 - 19819678
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaa 153  Q
    |||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  19819737 gtaaacatgaaagttgctgataattgtgttaactttccagtagtcttggtttgacgtgaa 19819678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 27860629 - 27860499
Alignment:
Q  404 tgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 502  Q
    ||||||||  ||| ||||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||| | || || |    
T  27860629 tgttgttggttaaattgagatagatatat-tatgtggaaattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcattcaagttgttattatcagtgttgtt 27860532  T
Q  503 atgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||  |||||| || |||||||||||| ||||    
T  27860531 atgttg-caagttg-ttgatgttgttgtctttgct 27860499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17203946 - 17203817
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    ||||||| || |||| ||||||||| || ||||| ||| ||||||||||| || ||||  | ||| ||||||||| ||||| ||||| | || || ||||    
T  17203946 catgaaaattttagacaattgagttggcattccattggctttggtttgacttggaaataatgttttgttcttgagttatgaagaaaacaatctaaagagg 17203847  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcat 228  Q
    | ||| | ||| |||| |||||||| ||||    
T  17203846 ttttaataaaactttacgaaaattccgcat 17203817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 24281370 - 24281309
Alignment:
Q  55 gtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataa 116  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||||||    
T  24281370 gtctttttcacccttttctattttgaattggctttttatgtaagcatgaaagttttagataa 24281309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 25141432 - 25141349
Alignment:
Q  403 ttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 487  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |   |||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  25141432 ttgttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattttatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgtt 25141349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 406 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 9784971 - 9784909
Alignment:
Q  406 ttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 470  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  9784971 ttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 9784909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 366 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 27851921 - 27851889
Alignment:
Q  366 ttgttggataatttgaaatacatatattatgtg 398  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27851921 ttgttggttaatttgaaatacatatattatgtg 27851889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 335
Target Start/End: Original strand, 34492096 - 34492124
Alignment:
Q  307 tgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34492096 tgtttaagagtatttaacctatgttgtga 34492124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 366 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 44071834 - 44071802
Alignment:
Q  366 ttgttggataatttgaaatacatatattatgtg 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44071834 ttgttggataatttgagatacatatattatgtg 44071802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 415; Significance: 0; HSPs: 135)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 25091388 - 25090874
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  25091388 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 25091289  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  25091288 agttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 25091189  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25091188 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcgaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtat 25091089  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25091088 ttaaccaatgttgtgatggatctaatttgctttgacgtgaatatctttgttagataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 25090989  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  25090988 gagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttg 25090889  T
Q  520 tatgttgttgtctct 534  Q
    | ||||||| |||||    
T  25090888 tgtgttgttttctct 25090874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 537
Target Start/End: Original strand, 10356753 - 10357270
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |    
T  10356753 gctctctgacagcacgtcatgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgtattgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatgg 10356852  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  10356853 agttagctttccagtggctttggtgtgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatacaccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 10356952  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  10356953 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaactagggtgtttaagagtat 10357052  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10357053 ttaacctatgttgtgatggatcttatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgatgaataattt 10357152  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  10357153 gagttacatatatttacgtagaaaagatatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttg 10357252  T
Q  520 tatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  10357253 tatgttgttgtctttgct 10357270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 42875532 - 42875019
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||     
T  42875532 gctctctgacagcacg-cctattttatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggc-tttggtgtaaacatgaaagttgtagataatta 42875435  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  42875434 agttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 42875335  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  42875334 attcagcgtaactgtttctaagttaatccaaaacttaatgaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaggagtat 42875235  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42875234 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacatgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 42875135  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42875134 gagttacatatatttatgtggaaaaagtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttg 42875035  T
Q  520 tatgttgttgtctctg 535  Q
    ||||||| ||||||||    
T  42875034 tatgttgctgtctctg 42875019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 14549344 - 14548846
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14549344 cctgttttatgttcttgcgtctttttcacatgcttctgttttgaattggcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 14549245  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14549244 ctttggtttgatgtgaaaatgagttttggttcttgagatatgatgaaagtactccatggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttt 14549145  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14549144 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaagactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttagcctatgttgtgat 14549045  T
Q  337 ggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctat 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14549044 ggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggagaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatgtat 14548945  T
Q  437 gtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctg 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14548944 gtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 14548846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 16998260 - 16997745
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  16998260 gctctttgacagaacgtactgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 16998161  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16998160 tgttagctttccagtggctttggtttgacttaaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 16998061  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  16998060 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaa-----aagtactatgagttgaactagggtgtttaagagtat 16997966  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaa---tgttgttgttgaataa 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  16997965 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgttgaataa 16997866  T
Q  417 tttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttg 516  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16997865 tttgagttacttatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttg 16997766  T
Q  517 ttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  16997765 ttgtatgttgttgtctctgct 16997745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 19610059 - 19609567
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||||    
T  19610059 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattgacctttggtgtaaacataaaagttgtagataattg 19609960  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19609959 agttacctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 19609860  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  19609859 attcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttaaggtataattccaaacctcaaaactagaagtactatcagttcaactagggtgtttaagagtat 19609760  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19609759 ttaacctatgttgtgatggacctaatttggtttgacgcgaatatttttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 19609660  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 512  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19609659 gagtgacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttaaaccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 19609567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 11425680 - 11425172
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||    
T  11425680 gctctctgacaacaggtcttgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttaaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagatgattg 11425581  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||              
T  11425580 agttagctttccagtagctttggttttacgtgcaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaaggaggtcttagtgaaa---------- 11425491  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11425490 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactattagttcaattagggtgtttaagagtat 11425391  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11425390 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgtatgttgttgttgaataattt 11425291  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatag-aaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgtt 518  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11425290 gagttacatatatttatgtggaataggtatgatatagaaaaataatattgttatatcattcatgttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgat 11425191  T
Q  519 ttatgttgttgtctctgct 537  Q
     ||||||||||||||||||    
T  11425190 gtatgttgttgtctctgct 11425172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 20 - 406
Target Start/End: Original strand, 53630790 - 53631176
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  53630790 gctctctgacagcacgtcatgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 53630889  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  53630890 agttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaa 53630989  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53630990 attcggcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtat 53631089  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  53631090 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 53631176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 37019404 - 37019063
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  37019404 gctctatgacagcacgtcttgttttatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 37019305  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  37019304 agttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 37019205  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||    
T  37019204 attcagcataatcgtttataagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgggttcaactaaggtgtttaagagtat 37019105  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37019104 ttaacctatgctgtgatggatctaacttggtttgacgtgaat 37019063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 41 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 3485622 - 3485134
Alignment:
Q  41 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtttt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  |     
T  3485622 tttcatgttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattaacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagttttctagtggcgtc 3485523  T
Q  141 ggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaa 240  Q
     ||||||| |||||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  3485522 agtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaattgtta--aaaattcagcataaccgtttctaa 3485425  T
Q  241 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggat 340  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||| || | |||||||||||| ||    
T  3485424 gttaatccaaaacttagggaataattccaaccc-caagactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctagcatatgttgtgatgaat 3485326  T
Q  341 ctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtgg 440  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  3485325 ctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtga 3485227  T
Q  441 aaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctg 535  Q
    | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||    
T  3485226 atattgtatgatatag-aaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgttgtctctg 3485134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 35 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 14630546 - 14630177
Alignment:
Q  35 gtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14630546 gtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgatttggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagttttccagt 14630447  T
Q  135 ggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgt 234  Q
    || ||||||||||| | |||||  | || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  |    
T  14630446 ggctttggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactat 14630347  T
Q  235 ttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtg 334  Q
    ||||| || || |||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14630346 ttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtg 14630247  T
Q  335 atggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14630246 atggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 14630177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15114957 - 15114599
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||     
T  15114957 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcttctttttcatacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattt 15114858  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  15114857 agttagatttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactcaaagtaggtcttagtgaaa-tttatgaaa 15114759  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  15114758 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaccttaaaactagaagtactaggagtttaattaaggagtttaagagtat 15114659  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| ||||    
T  15114658 ttaacctatgtgctgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttcttggatgattt 15114599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 39 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 35660562 - 35660240
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||| |    
T  35660562 tgttttatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtataaacatgaaagttttagatagttttgttagctttccaatggct 35660463  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttct 238  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35660462 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttct 35660363  T
Q  239 aagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgg 338  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35660362 aagtcaatccaaaacttatggaataatctcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatga 35660263  T
Q  339 atctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  35660262 atctaatttggtttgacgtgaat 35660240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 36 - 401
Target Start/End: Original strand, 33243629 - 33243994
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtg 135  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  33243629 tcctctttcatgttcttgcatctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 33243728  T
Q  136 gttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtt 235  Q
     ||||| |||||| |||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  33243729 attttgatttgacttgaaaataatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaaggggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatt 33243828  T
Q  236 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  | ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33243829 tctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattgaggtgtttaagagtagctaacctatgttgtga 33243928  T
Q  336 tggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaat 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33243929 tggatctaatttgatttgacgtgaatatttttgttgaataatttgagatacatatattgtgtgaat 33243994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 51 - 379
Target Start/End: Original strand, 19435045 - 19435374
Alignment:
Q  51 ttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgt 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  19435045 ttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttccaatggctttggtttgactt 19435144  T
Q  151 gaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaa 250  Q
    ||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||    
T  19435145 gaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattatatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcagtctaa 19435244  T
Q  251 aacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt-aggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttgg 349  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19435245 aatttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttgg 19435344  T
Q  350 tttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  19435345 tttgacgtgaatatctttgttggatgattt 19435374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Original strand, 15011830 - 15012097
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||     
T  15011830 gctctatgacaacatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacataaaagttgtagataatta 15011929  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15011930 agttagctttcccgtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttagttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 15012029  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagt 287  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15012030 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagt 15012097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 23 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15008698 - 15008388
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  15008698 ctttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttatgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 15008599  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15008598 tagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 15008499  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtattta 322  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15008498 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggcataattcgaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtattta 15008399  T
Q  323 acctatgttgt 333  Q
    |||||||||||    
T  15008398 acctatgttgt 15008388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Original strand, 10694567 - 10694879
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  10694567 ctttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcgtctttttgacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 10694666  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10694667 tagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 10694766  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtattta 322  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  10694767 cagcataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattattta 10694866  T
Q  323 acctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||    
T  10694867 acctatgttgtga 10694879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Original strand, 10908333 - 10908645
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  10908333 ctttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcgtctttttgacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 10908432  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10908433 tagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 10908532  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtattta 322  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  10908533 cagcataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattattta 10908632  T
Q  323 acctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||    
T  10908633 acctatgttgtga 10908645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Original strand, 630237 - 630535
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||     
T  630237 cctgttttatgttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatga 630336  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  630337 ctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgttt 630436  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  630437 ctaatttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 630535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9638715 - 9638427
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||| || ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  9638715 gttcttgcgtctttttcacacgtttatgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttatataattttgttagctttccaatggctttggtttg 9638616  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  9638615 acttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaat 9638516  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9638515 ccaaaacttatgggataattccaaatctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtga 9638427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 9923915 - 9923622
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtg 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  9923915 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccattttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtg 9923816  T
Q  136 gttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtt 235  Q
    | ||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  9923815 gctttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtt 9923716  T
Q  236 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatg 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||    
T  9923715 tctaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaatagtgtttaacctatg 9923622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 329
Target Start/End: Original strand, 11478944 - 11479237
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtg 135  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| | |||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11478944 tcctgtttcatgttcttgtgtctttttcacatgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaacatagaagttgtagataattgtgttagctttccagtg 11479043  T
Q  136 gttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtt 235  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  11479044 gctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtt 11479143  T
Q  236 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatg 329  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  11479144 tccaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatg 11479237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28385951 - 28385663
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  | |||||||    
T  28385951 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttg 28385852  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
     |||||||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28385851 gcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaat 28385752  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28385751 ccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccaagttgtga 28385663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 40620262 - 40619950
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| |     
T  40620262 ctttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcatctttttcacacgtttctattttaaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtaaataattgtgc 40620163  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  40620162 tagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 40620063  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtattta 322  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||      
T  40620062 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaatctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtattat 40619963  T
Q  323 acctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||    
T  40619962 acctatgttgtga 40619950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33849460 - 33849162
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  33849460 cctgtttcgtgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcatttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 33849361  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||   ||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||    
T  33849360 ctttggtttgaatcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccattt 33849261  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  33849260 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtga 33849162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 20 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26445619 - 26445261
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  26445619 gctctctgacagcatgttctgtttcacgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 26445520  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| | |||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  26445519 agttagctttccagtagctttggtttgaattgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaa 26445420  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||  | || ||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  26445419 atttcggataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgatttcaattaaggtgtttaagagtat 26445321  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || || |||||| ||||    
T  26445320 ttaacctatgttgtgatggatatatcttggtttgacgtgaatatctttattggatgattt 26445261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Original strand, 56115170 - 56115468
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  56115170 cctgtttcatgttcttgcatttttttcgcacgtttctgttttgaattgaccttgggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 56115269  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||| |||||| |||||||| | ||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  56115270 ctttgatttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttt 56115369  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  56115370 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaagcagaagtactatgagttctattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtga 56115468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 102 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 3337752 - 3337493
Alignment:
Q  102 gaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtct 201  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||| |  | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3337752 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagttttcaatatatgatgaaaatactccaaggaggtct 3337653  T
Q  202 tagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaat 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3337652 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaat 3337553  T
Q  302 taggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3337552 taaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaat 3337493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 19566242 - 19566576
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  19566242 tgacagcatctcttgtttcatgttcttgcatctttttcacatgtttctgttttgaattagccttttgtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttag 19566341  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  19566342 ctttccagtggctttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaattttgtgaaaattctg 19566441  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| ||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19566442 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 19566540  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  19566541 tatgttgtgataaatctaacttggtttgacgtgaat 19566576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 59 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12611547 - 12611271
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||    
T  12611547 ttttcacccttttctattttgaatttgc-tttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatg 12611449  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  12611448 atttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaacgaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttat 12611349  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12611348 gggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 12611271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 69 - 331
Target Start/End: Original strand, 15447782 - 15448044
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||| | ||| |||    
T  15447782 tttctgttttgaattgg-ctttcggtgtaaacatgaaagttgtaggtaattgagttagctttctattggctttggtctgacttgaaaatgatttttagtt 15447880  T
Q  168 cttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattc 267  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15447881 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattc 15447980  T
Q  268 caaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  15447981 caaccctcaaaactggaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 15448044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 361
Target Start/End: Original strand, 2424946 - 2425278
Alignment:
Q  28 acagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagct 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2424946 acagcacttcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagct 2425045  T
Q  128 ttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagca 227  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||| | |||| || ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  2425046 ttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttgctttttgagttatgatgaaactactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaatttccgca 2425145  T
Q  228 tgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaaccta 327  Q
    | ||  |||||| || || |||||||||| ||| |   ||||||  |||||  | |  | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  2425146 taactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaaattcaaaggttg-tgcactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 2425244  T
Q  328 tgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||| ||||||    
T  2425245 tgttgtgatgaatcaatcttggtttgatgtgaat 2425278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25513477 - 25513119
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||    
T  25513477 gctctctgacagcacgtcctctttcatgttcttgcgtttttttgacacgtttatgttttgaattggcctttggtgtaaatatgaaagttgtagataattg 25513378  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     |||||||||||| ||  ||||||| ||| |||||||| | |||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25513377 tgttagctttccattgactttggttcgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 25513278  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
     ||| |||| ||  ||||||||| || |||||||||| ||  |   | ||||||||||| || |  |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||    
T  25513277 gttccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgggttgtcttcaaacctcaaagcttg-tgtactacgagttcaattacggtgtttaagaatat 25513179  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||| ||||    
T  25513178 ttaacctatgttgtgatagatctaacttggtttgatgtgaatatctttgttggatgattt 25513119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 16026246 - 16026585
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||    
T  16026246 gctctgtgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttatgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattg 16026345  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     | |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| | |||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16026346 tgctagctttccagtggcttcagtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 16026445  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||| |||| |   |||||||||||| |||||||||| ||| |   | ||||| |||||  | |  |||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  16026446 attccgcataagtatttctaagttaacccaaaacttatggattgtctacaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta- 16026543  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  16026544 ttaacccatgttgtgatgaatctaacttggtatgacgtgaat 16026585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 36 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 46740917 - 46740618
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtg 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  46740917 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccagtg 46740818  T
Q  136 gttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtt 235  Q
      ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||    
T  46740817 actttggtttgacttgaaaatgatgtttggtttttgagttatgataaaaatactccaaagacgtcttagtgaaattttgtgaaaattccgcataactatt 46740718  T
Q  236 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||| || || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46740717 tctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttatga 46740619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Original strand, 24046868 - 24047166
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  24046868 cctgtttcgtgttcttgtgtcttttttacatgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 24046967  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| ||||||| |||||||| |   ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||    
T  24046968 ctttggtttgacttgaaaatgattcttggtttttgagttatgatggaaatactctaggtaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccattt 24047067  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24047068 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 24047166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 36 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33186620 - 33186321
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtg 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||   ||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33186620 tcctgtttcatgttcttgcgtctgtttcacacgtttccgttttgaactgagttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccagtg 33186521  T
Q  136 gttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtt 235  Q
    | |||||||||||  ||||||  | ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| || || ||  ||    
T  33186520 gctttggtttgactcgaaaataatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataacattt 33186421  T
Q  236 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33186420 tctaagttagtccaaaacttatggaataactccaaccctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtga 33186321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 37 - 331
Target Start/End: Original strand, 53387271 - 53387565
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  53387271 cctgttttatgttcttgcgtctgtttcacgtgtttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 53387370  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  53387371 atttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagcataacccttt 53387470  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  53387471 ttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaattagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgtt 53387565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 59 - 331
Target Start/End: Original strand, 23802820 - 23803092
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||    
T  23802820 ttttcacccttttctgttttgaatttgc-tttcgatgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatg 23802918  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  23802919 atttttagtttttgagatgtgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttat 23803018  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
    || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  23803019 gggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 23803092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 103 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 10057124 - 10056896
Alignment:
Q  103 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtctt 202  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  10057124 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtctt 10057025  T
Q  203 agtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  10057024 agtgaaattttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaatctagaagtaccaggagttcaatt 10056925  T
Q  303 aggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||    
T  10056924 aaggtgtttaagagtatttaacatatgtt 10056896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 69 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15344561 - 15344253
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  15344561 tttctgttttgaatttgc-tttcggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtt 15344463  T
Q  168 cttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattc 267  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| || || ||||||| ||| |   ||    
T  15344462 tttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaacttatggattgtctc 15344363  T
Q  268 caaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcatt 367  Q
    ||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  15344362 caaa-ttcaaagct-tatgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgatggatctaatttggtttgacgtgaatatcttt 15344265  T
Q  368 gttggataattt 379  Q
    ||||||| ||||    
T  15344264 gttggatgattt 15344253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 337
Target Start/End: Original strand, 44023927 - 44024237
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  44023927 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgccatttggtgtaaacaggaaagttgtagataattgtgttag 44024026  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
     ||||| |||| ||||||||||| |||||||  | |||||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44024027 atttcccgtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtttctgagttattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 44024126  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| || ||||||| || || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  44024127 cataactgtttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 44024225  T
Q  326 tatgttgtgatg 337  Q
    |||||| |||||    
T  44024226 tatgttatgatg 44024237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18213280 - 18212986
Alignment:
Q  41 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtttt 140  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||    
T  18213280 tttcacgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatggaagttttagataattttgttagctttccaatggcttt 18213181  T
Q  141 ggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaa 240  Q
    |||||||| | |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||    
T  18213180 ggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaa 18213081  T
Q  241 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18213080 gttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 18212986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 94 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15990700 - 15990459
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | |||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  15990700 gtaaacatgaaagttttagataatttagttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaa 15990601  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  15990600 ggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactagg 15990501  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15990500 agttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtga 15990459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 59 - 335
Target Start/End: Original strand, 51463423 - 51463699
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||    
T  51463423 ttttcacccttttctgttttgaatttg-ctttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatg 51463521  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | ||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  51463522 atttttagtttttgagatatgatgaaaatagtctaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaatttat 51463621  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  51463622 gcgataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggcgtttaagagtatttaacccatgttgtga 51463699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 101 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10705152 - 10704918
Alignment:
Q  101 tgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtc 200  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| | ||| ||||| |||||||  | ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  10705152 tgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctctggcttgacttgaaaataattttttgtttttgagatatgatgaaaatattgcaaggaggtc 10705053  T
Q  201 ttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 300  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10705052 ttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 10704953  T
Q  301 ttaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10704952 ttaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 10704918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 101 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10918922 - 10918688
Alignment:
Q  101 tgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtc 200  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| | ||| ||||| |||||||  | ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  10918922 tgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctctggcttgacttgaaaataattttttgtttttgagatatgatgaaaatattgcaaggaggtc 10918823  T
Q  201 ttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 300  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10918822 ttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 10918723  T
Q  301 ttaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10918722 ttaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 10918688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 331
Target Start/End: Original strand, 16277661 - 16277955
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||| |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||    
T  16277661 cctgttttatgttcttccgtctgtttcacatgtttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaacgg 16277760  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||||||  ||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  16277761 ctttggtttgactcgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggttttactgaaatcttatgaaaattcagcataacccttt 16277860  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  16277861 ttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgtt 16277955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 40230033 - 40229721
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaa-ttggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagtta 124  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  40230033 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgtgtctttttcacatgtttctattttgaaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtta 40229934  T
Q  125 gctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtctt-agtgaaattttatgaaaattc 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40229933 gctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaggaggtcttaagtgaaattttatgaaaattc 40229834  T
Q  224 agcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaa 323  Q
     |||| |   |||||| || || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  40229833 tgcataattatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtatttaagagtatttaa 40229735  T
Q  324 cctatgttgtgatg 337  Q
    |||||||| |||||    
T  40229734 cctatgttatgatg 40229721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 55582909 - 55582585
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  55582909 cctgtttcgtgttcttgcgtctgtttcgcacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataatcgtgttagctttccagtgg 55582810  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||    
T  55582809 ctttggtttgacttgaaaatgatgtttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactattt 55582710  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    |||||            ||  ||| |   ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55582709 ctaag------------ttgtggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaatctatgttgtgat 55582623  T
Q  337 ggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggat 374  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||||    
T  55582622 ggatctaacttgatttgatgtgaatatctttgttggat 55582585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 49 - 352
Target Start/End: Original strand, 10237844 - 10238146
Alignment:
Q  49 tcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgac 148  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| |  |||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10237844 tcttgcgtctttttcacatatttttgttttgaattggtctttggtataaatatgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggcgttggtttgac 10237943  T
Q  149 gtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatcc 248  Q
     |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| || ||    
T  10237944 ttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccc 10238043  T
Q  249 aaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttg 348  Q
    |||||||| ||| |  |||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||   ||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||| |||    
T  10238044 aaaacttatggattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttaaattaatgtgtttaagagtatttaagctacgttgtggtgaatttaacttg 10238142  T
Q  349 gttt 352  Q
    ||||    
T  10238143 gttt 10238146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 258 - 405
Target Start/End: Original strand, 13036332 - 13036479
Alignment:
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  13036332 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatattgtgatggatctaatttagtttgacgt 13036431  T
Q  358 gaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttg 405  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13036432 gaatatctttgttggataatttaaaatacatatattatgtgaatgttg 13036479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 361
Target Start/End: Original strand, 45314728 - 45314994
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||   || | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45314728 gtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgagtctggtttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaa 45314827  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| || |||||||||  ||| |   ||||||| ||||| || |  | | ||||    
T  45314828 ggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttgtggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcattatg 45314926  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  45314927 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttaagatgaatctaacttggtttgacgtgaat 45314994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14049235 - 14049054
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||    
T  14049235 cctgtttcatgttcttgcgtcgtttacacacgtttctgttttgaattggcatttggtgtaaacatgaaagttgtatataattttgttagctttccaatgg 14049136  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14049135 ctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatcataaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 14049054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 424 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 37018929 - 37018816
Alignment:
Q  424 tacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatg 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37018929 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 37018830  T
Q  524 ttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||||    
T  37018829 ttgttgtctctgct 37018816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 218
Target Start/End: Original strand, 49547288 - 49547459
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  | |||||||    
T  49547288 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttg 49547387  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     |||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  49547388 gcgtgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttaatgaatttttatgaa 49547459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 205 - 335
Target Start/End: Original strand, 15883917 - 15884047
Alignment:
Q  205 tgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattag 304  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15883917 tgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttgatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa 15884016  T
Q  305 gatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15884017 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 15884047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 242
Target Start/End: Original strand, 18108200 - 18108417
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttc-acacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagtta 124  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||| | ||| ||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18108200 tgacagcatgtcatgtttcatgttcttacatctttttctacacgtttctctcttgtattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtta 18108299  T
Q  125 gctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattca 224  Q
    | ||||||||||| | |||||||| | |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18108300 gatttccagtggtgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattca 18108399  T
Q  225 gcatgaccgtttctaagt 242  Q
    |||| || ||||||||||    
T  18108400 gcataactgtttctaagt 18108417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 424 - 537
Target Start/End: Original strand, 19435498 - 19435611
Alignment:
Q  424 tacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatg 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19435498 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaacaatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 19435597  T
Q  524 ttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||||    
T  19435598 ttgttgtctctgct 19435611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 100 - 330
Target Start/End: Original strand, 15214442 - 15214672
Alignment:
Q  100 atgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggt 199  Q
    ||||||||| ||  |||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| | ||||| | ||||||||||||| || ||| ||||  | ||    
T  15214442 atgaaagttttaattaattttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttggattttgagatatgatggaattaccccaagcaagt 15214541  T
Q  200 cttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttca 299  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |    
T  15214542 cttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaatatttccaaacctcgaaactggaagtactaggagttta 15214641  T
Q  300 attaggatgtttaagagtatttaacctatgt 330  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15214642 attaagaggtttaagagtatttaacctatgt 15214672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 352
Target Start/End: Original strand, 19081676 - 19081989
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||     
T  19081676 ctgtttcatgttcttgcatctttttcacacatttctgttttggattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataaatgagttatctttccactgga 19081775  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttc 237  Q
    ||| ||||||| | |||||| | |||   | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19081776 ttttgtttgacatcaaaatgatttttaaattttgagttatgatgaaaacacttcaaggagatcttggtaaaattttacgaaaattcagcataaccgtttc 19081875  T
Q  238 taagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatg 337  Q
     |||| || |||||||| ||||  |  || ||||| ||||||| |  |||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||| | |||||    
T  19081876 caagtcaacccaaaactcaaggcttgtttacaaacttcaaaac-atgagtattaggagtttaattaagatgtttaaaattatttgacctatgatatgatg 19081974  T
Q  338 gatctaatttggttt 352  Q
     |||||| |||||||    
T  19081975 aatctaacttggttt 19081989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15534839 - 15534658
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  15534839 cctgtttcgcgttcttccgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 15534740  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     ||| |||||||  ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15534739 ctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 15534658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 396 - 537
Target Start/End: Original strand, 33243949 - 33244089
Alignment:
Q  396 gtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaa 495  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33243949 gtgaatatttttgttgaataatttgagatacatatat-tgtgtgaataaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaa 33244047  T
Q  496 tgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  33244048 tgatgctatgttgtgaagttattgtatgttgatgtctctgct 33244089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 15117840 - 15117987
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  15117840 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 15117939  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  15117940 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 15117987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Original strand, 7640674 - 7640811
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  7640674 gctctttgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttcagttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 7640773  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  7640774 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatg 7640811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30147573 - 30147392
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||    
T  30147573 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgg 30147474  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     |||||||| || | |||||| | |||   | ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  30147473 ctttggttttacttaaaaatgatttttaacttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 30147392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36038528 - 36038347
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  36038528 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 36038429  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     |||  ||||||  ||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  36038428 ctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgataaaaatactcaaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 36038347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Original strand, 12033279 - 12033459
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  12033279 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcatacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 12033378  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12033379 tttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 12033459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 136
Target Start/End: Original strand, 18239100 - 18239216
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  18239100 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 18239199  T
Q  120 agttagctttccagtgg 136  Q
     ||||||||||||||||    
T  18239200 tgttagctttccagtgg 18239216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44615945 - 44615765
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  44615945 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacatgtttccgttttgaactgggttttagtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 44615846  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  44615845 tttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 44615765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Original strand, 50221845 - 50222025
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| | ||||  ||||||||||||||||| |  ||| |||||||| |||     
T  50221845 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataagtttgttggctttccaatggc 50221944  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  50221945 tttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 50222025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 157
Target Start/End: Original strand, 44772577 - 44772708
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||  |||     
T  44772577 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtattat 44772676  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  44772677 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatg 44772708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 354 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 19734687 - 19734514
Alignment:
Q  354 acgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgata 453  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  |||||||     
T  19734687 acgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgat- 19734590  T
Q  454 tagaaaataatgttgttataccattc-aagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctg 535  Q
          |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||    
T  19734589 ------ataatgttgttataccatccaaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgttgtctctg 19734514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 69 - 329
Target Start/End: Original strand, 20595797 - 20596056
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttc 168  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||  ||  ||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||  | ||| | |     
T  20595797 tttctgttttgaattggcctttggtataaacatgaaagttttagatacatgtattagctttctaatggctttggtttgacatgaaaataatttttagatt 20595896  T
Q  169 ttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 268  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |   ||| ||||| || || ||||||| ||  | || ||    
T  20595897 ttgagttatgatgaaaatacttcaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaattcagcataattatttgtaagtcaaccccaaacttatggtttgatgcc 20595996  T
Q  269 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatg 329  Q
    ||||||||||||| | |||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20595997 aaacctcaaaacttg-agttataggagttcaattatgatgtttaagagtatttaacctatg 20596056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 157
Target Start/End: Original strand, 1837026 - 1837144
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       
T  1837026 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgtcg 1837125  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  1837126 tcggtttgacttgaaaatg 1837144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12623041 - 12622931
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12623041 tgacagcatctcctgtttcatattcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 12622942  T
Q  126 ctttccagtgg 136  Q
    |||||| ||||    
T  12622941 ctttcctgtgg 12622931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19243357 - 19243177
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  19243357 ctgttccatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaactgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 19243258  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||||||  || || ||| | |||||||   | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19243257 tttggtttggagtaaatatgatttttggtttaggtgttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 19243177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 136
Target Start/End: Original strand, 14873579 - 14873690
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtcttttt-cacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagtta 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14873579 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcatcttttttcacatgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtta 14873678  T
Q  125 gctttccagtgg 136  Q
    ||||||||||||    
T  14873679 gctttccagtgg 14873690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14508321 - 14508156
Alignment:
Q  195 gaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatga 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||| || || |||||||||| ||| |   ||||||| | ||| || |  |||||||||    
T  14508321 gaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaactttaaagcttgt-gtactatga 14508223  T
Q  295 gttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  14508222 gttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctatcttggtttgacgtgaat 14508156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29268010 - 29267830
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||      
T  29268010 ctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgac 29267911  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||| || ||  || |||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  29267910 tttagtgtggagtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctcagtgaatttttatgaa 29267830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Original strand, 22725464 - 22725608
Alignment:
Q  79 gaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatg 178  Q
    ||||||| |||| | |||| |||||||||||   ||||||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||    
T  22725464 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttg---ataattttgttagctttccaaaggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatg 22725560  T
Q  179 atgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 226  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22725561 atgaaaatactccaaggaagtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 22725608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 335
Target Start/End: Original strand, 9871126 - 9871198
Alignment:
Q  263 aattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9871126 aattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 9871198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14185538 - 14185426
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  14185538 catgaaagttgtagataagtgtgttagctttccagtggctttggtgtgacttgaaaatgattcttggtttttgagttatgatgaaaatacgccaaggagg 14185439  T
Q  199 tcttagtgaaatt 211  Q
    |||||| ||||||    
T  14185438 tcttagcgaaatt 14185426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18247891 - 18247739
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||    
T  18247891 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgg 18247792  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
     |||||||||||||  ||||| | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  18247791 ctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 18247739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14477057 - 14476938
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||| | |||| |||||||||||| | |||||| |||| ||||||||| |    
T  14477057 cctgtttcgcgttcttgcgtctgtttcacacgtttctgtttcgagttggtctttggtgtaaacatgaaagttgttggtaattgtgttatctttccagtag 14476958  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  14476957 tcttggtttgacgtgaaaat 14476938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 286 - 361
Target Start/End: Original strand, 26922254 - 26922329
Alignment:
Q  286 gtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26922254 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaat 26922329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 404 - 537
Target Start/End: Original strand, 4615772 - 4615903
Alignment:
Q  404 tgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 502  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  4615772 tgttgttggttaatttgagttacatatat-tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgct 4615870  T
Q  503 atgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||  ||||||  |||||||| ||||||||||    
T  4615871 atgttg-caagttg-cttatgttgctgtctctgct 4615903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 47357325 - 47357183
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||  ||||||||    
T  47357325 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggccttggtttg 47357226  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    || |  ||||| | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  47357225 acatccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 47357183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16731818 - 16731717
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||| || | ||| |||||||||    
T  16731818 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctctctaatggctttggtttg 16731719  T
Q  147 ac 148  Q
    ||    
T  16731718 ac 16731717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 150
Target Start/End: Original strand, 19697930 - 19698043
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||   |||    
T  19697930 cctgtttcgtgttcttgcgtctttttcacctatttctattttgaattggcctttcgtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagatttcttttgg 19698029  T
Q  137 ttttggtttgacgt 150  Q
     |||||||||||||    
T  19698030 ctttggtttgacgt 19698043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 150
Target Start/End: Original strand, 19708515 - 19708628
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||   |||    
T  19708515 cctgtttcgtgttcttgcgtctttttcacctatttctattttgaattggcctttcgtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagatttcttttgg 19708614  T
Q  137 ttttggtttgacgt 150  Q
     |||||||||||||    
T  19708615 ctttggtttgacgt 19708628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19020172 - 19020009
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||||  ||||||||   ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||    
T  19020172 tgacagcaccccctgtttcgcattcttgcatctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttag 19020073  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    ||||| | |||||||||||||||||  ||||| | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  19020072 ctttctaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 19020009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 180
Target Start/End: Original strand, 15287805 - 15287959
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  15287805 tgacagcaccccctgtttcgcgttcttgcatctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattag 15287904  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgat 180  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||  ||||| | ||| |  |||||||||||||    
T  15287905 ctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgat 15287959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Original strand, 13045999 - 13046251
Alignment:
Q  57 ctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| ||  | |||| |||||||||| || |||| |  |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  13045999 ctttttcacccatttctgttttgaattggctttaggtgtaaacatgaaagttttatataaatttgttagctttccaatgcctttggtttgacttgaaaat 13046098  T
Q  157 gttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaactta 256  Q
    | | |||   | || |  |||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||| | || |||||| |||    
T  13046099 gatttttatatttttatttatgatgaaaatactccaagtaggtcttggtaaaattttacgaaaattcaacataaccatttctaaatcaacccaaaagtta 13046198  T
Q  257 aggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtt 310  Q
     ||  |  |||||| |||||||| | | ||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  13046199 tggtttgtttccaatcctcaaaaattg-agtactaggagtttaattagggtgtt 13046251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 434 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 21061843 - 21061743
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtct 532  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21061843 tatgtggaaaatgtttgatatagaaaatattgatgtttatatcattcaagttgttgttattaatgttgctatgttg-caagttgttttatgttgttgtct 21061745  T
Q  533 ct 534  Q
    ||    
T  21061744 ct 21061743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10643898 - 10643746
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | | || ||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||    
T  10643898 cctgtttcgcgttcttgcatctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgcaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatgg 10643799  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    |||||||||||| |  ||||| | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  10643798 ttttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 10643746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12622931 - 12622790
Alignment:
Q  195 gaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatga 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| || || || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  |||||||||    
T  12622931 gaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgt-gtactatga 12622833  T
Q  295 gttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatg 337  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12622832 gttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctattttatgatg 12622790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 180
Target Start/End: Original strand, 15294927 - 15295069
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||     
T  15294927 ctgtttcgcgttcttgcatctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggc 15295026  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgat 180  Q
    |||||||||||||  ||||| | ||| |  |||||||||||||    
T  15295027 tttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgat 15295069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 14995796 - 14995703
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  14995796 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctttttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttc 14995703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 86
Target Start/End: Original strand, 12424617 - 12424677
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggc 86  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12424617 tgacagcatctcctatttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggc 12424677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 189
Target Start/End: Original strand, 17146237 - 17146389
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||   |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||| | |||    
T  17146237 cctgtttcgcgttcttgcatctttttcgcatatttctgttttgaattggactttgatgtaaacattaaagttgtagataattttgttagctttctaatgg 17146336  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
     |||||||||||||  ||||| | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  17146337 ctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 17146389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 130
Target Start/End: Original strand, 22725231 - 22725323
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22725231 ctgtttcatgtttttgcgtcgttttcacatgtttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttc 22725323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 58 - 330
Target Start/End: Original strand, 54364045 - 54364316
Alignment:
Q  58 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    |||||||| | ||||  |||||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||  ||| ||||||| ||||||||    
T  54364045 tttttcacccatttccattttgaattgccctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagatttccaatgaatttagtttgacttgaaaatg 54364144  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
    || | ||| | ||||| ||||||||||| |||||||   |||||| | ||||||||| | ||| | ||||| ||  |||| |||| || ||||||||||     
T  54364145 ttttgtggattttgagttatgatgaaaacactccaagtgggtcttggagaaattttaagtaaacttagcataactatttccaagtcaacccaaaacttag 54364244  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgt 330  Q
     |     |||||||| |||||||| | |||| || |||| | |||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  54364245 agttcgtttccaaacttcaaaacttg-agtattaagagtcctattaggatattaaagagtaattaacctatgt 54364316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13164801 - 13164714
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagt 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||| | |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13164801 gttcttgcgtctttttcacacatttctgctttgatttgacctttggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttccagt 13164714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 261 - 335
Target Start/End: Original strand, 43251120 - 43251195
Alignment:
Q  261 ataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatg-tttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| | |||||||||    
T  43251120 ataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttttaagagtatttaatccatgttgtga 43251195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 148
Target Start/End: Original strand, 55377164 - 55377254
Alignment:
Q  58 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgac 148  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  55377164 tttttcacccgtttctgttttgaattggcttttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgac 55377254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10273061 - 10272956
Alignment:
Q  48 ttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttga 147  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||  | |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | || |||||||||    
T  10273061 ttcttgcgtctgtttaacacgtttctgttttgagttggtcttcagtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttccaatagtcttggtttga 10272962  T
Q  148 cgtgaa 153  Q
     |||||    
T  10272961 tgtgaa 10272956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 535
Target Start/End: Original strand, 2584937 - 2585046
Alignment:
Q  424 tacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttat 522  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||  |||||| |||||    
T  2584937 tacatatat-tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgttatgttg-caagttg-tttat 2585033  T
Q  523 gttgttgtctctg 535  Q
    |||| ||||||||    
T  2585034 gttgctgtctctg 2585046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8374192 - 8374040
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||    
T  8374192 cctgtttcgcgttcttgcatctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttaactttctaatgg 8374093  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
     |||| ||| ||||  ||||| | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  8374092 ctttgattttacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 8374040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9621908 - 9621789
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||  |||||||||| | |||||||| |||| |||||| ||      
T  9621908 cctgtttcgtgttcttgcgtctgtttcgcacgtttctattttgagttggcatttagtgtatacatgaaagttattgataattgtgttatctttcctgtat 9621809  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
      ||||||||||||||||||    
T  9621808 ccttggtttgacgtgaaaat 9621789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 6511900 - 6511791
Alignment:
Q  424 tacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttat 522  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| || | |||||| |||||    
T  6511900 tacatatat-tatgtagaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatatt-tcaagttg-tttat 6511804  T
Q  523 gttgttgtctctg 535  Q
    ||||||| |||||    
T  6511803 gttgttgcctctg 6511791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 537
Target Start/End: Original strand, 15448146 - 15448248
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtct 532  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||| |||||||||||  | ||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  15448146 tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagtttttattattaatatttctatgttg-caagttg-cttatgttgttgtct 15448243  T
Q  533 ctgct 537  Q
    |||||    
T  15448244 ctgct 15448248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 189
Target Start/End: Original strand, 22355049 - 22355169
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttc 168  Q
    |||||||||||| || | |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||||  ||||| | ||| |  |    
T  22355049 tttctgttttgattttgactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaac 22355148  T
Q  169 ttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  22355149 ttgagatatgattaaattact 22355169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 27028052 - 27027950
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtct 532  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  27028052 tatgtggaaaatgtatgatatagaaagtatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttg-cttatgttgttgttt 27027955  T
Q  533 ctgct 537  Q
    |||||    
T  27027954 ctgct 27027950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 9638169 - 9638080
Alignment:
Q  397 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  9638169 tgaatgttgttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgtt 9638080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 14933176 - 14933251
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14933176 tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttacatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 14933251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14951401 - 14951311
Alignment:
Q  58 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgac 148  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  14951401 tttttcacctgtttccattttgaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggctttggtttgac 14951311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 150
Target Start/End: Original strand, 5683333 - 5683426
Alignment:
Q  57 ctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgt 150  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||   ||| | |||| |||||||||| ||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5683333 ctttttcacccatttccgttttgaattgatttttggtgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttccaatggttttggtttgacgt 5683426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 330
Target Start/End: Original strand, 12134421 - 12134486
Alignment:
Q  265 ttccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgt 330  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12134421 ttccaaacttcaaaactaaaagtattaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 12134486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 13446778 - 13446669
Alignment:
Q  424 tacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttat 522  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||  ||||    
T  13446778 tacatatat-tatgtgaaaaatgtatgagatagaaaatatcgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttg-cttat 13446682  T
Q  523 gttgttgtctctg 535  Q
    |||||||||||||    
T  13446681 gttgttgtctctg 13446669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 537
Target Start/End: Original strand, 14942382 - 14942484
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtct 532  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||  |||||||||||| |    
T  14942382 tatgtggaaaatgtatgatctagaaaatatcgttgtttacatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttg-cttatgttgttgttt 14942479  T
Q  533 ctgct 537  Q
    |||||    
T  14942480 ctgct 14942484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 18229974 - 18229880
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttg 529  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  18229974 tatgtggaaaatgtatgagatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttaatattaatattgctatgttg-caagttg-tttatgttgttg 18229880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 192
Target Start/End: Original strand, 19622870 - 19623005
Alignment:
Q  57 ctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||  ||||||| || ||| |||||  | |||||||||| | | ||| ||||||  |||||||    
T  19622870 ctttttcacccatttctgttttaaattggcctttggtgtagacatgaaaattttaggtaattttgatagctttccaataggttttgtttgatttgaaaat 19622969  T
Q  157 gttatttggttcttgagatatgatgaaaatactcca 192  Q
    ||| | ||| | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  19622970 gttttgtggattttgagttatgatgaaaacactcca 19623005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 534
Target Start/End: Original strand, 20899466 - 20899594
Alignment:
Q  404 tgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgct 502  Q
    ||||||||  |||||| || || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  || |    
T  20899466 tgttgttggttaatttaagctatatatat-tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgtt 20899564  T
Q  503 atgttgtgaagttgttttatgttgttgtctct 534  Q
    ||||||  ||||||  ||||||||||||||||    
T  20899565 atgttg-caagttg-cttatgttgttgtctct 20899594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 537
Target Start/End: Original strand, 16026788 - 16026924
Alignment:
Q  397 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaa 495  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  || |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||    
T  16026788 tgaatattgttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtgtgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgctattgttaa 16026885  T
Q  496 tgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    || || |||| ||  ||||||  |||||||||||||| ||||    
T  16026886 tgttgttatgatg-caagttg--ttatgttgttgtctttgct 16026924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 9638316 - 9638247
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9638316 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 9638247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 185
Target Start/End: Original strand, 17376020 - 17376148
Alignment:
Q  57 ctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    ||||||||| | |||  |||||||||||| | |  | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||| | || || |||||||    
T  17376020 ctttttcacccattttcgttttgaattggtcatcggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttaggtttacttgaaaat 17376119  T
Q  157 gttatttggttcttgagatatgatgaaaa 185  Q
    ||| | ||| | ||||| |||||||||||    
T  17376120 gttttgtggattttgagttatgatgaaaa 17376148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 14630034 - 14629945
Alignment:
Q  397 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgtt 487  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  14630034 tgaatattgttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaatattattgtttatatcattcaagttgtt 14629945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 81
Target Start/End: Original strand, 14718219 - 14718262
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaa 81  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14718219 ctgttccatgttcctgcgtctttttcacacgtttccgttttgaa 14718262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 18022783 - 18022737
Alignment:
Q  24 tttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcg-tctttttcacacgt 69  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18022783 tttgacagcatgtcctttttcatgttcttgcgttctttttcacacgt 18022737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 150
Target Start/End: Original strand, 25120031 - 25120105
Alignment:
Q  76 tttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgt 150  Q
    ||||||||||  ||| | |||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  25120031 tttgaattggattttggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttgacgt 25120105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 9638169 - 9638120
Alignment:
Q  357 tgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  9638169 tgaatgttgttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 9638120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 366 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 14630025 - 14629985
Alignment:
Q  366 ttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14630025 ttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 14629985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 366 - 406
Target Start/End: Original strand, 16026797 - 16026837
Alignment:
Q  366 ttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16026797 ttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 16026837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 146)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 537
Target Start/End: Original strand, 17318440 - 17318956
Alignment:
Q  21 ctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattga 120  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17318440 ctctctgacagcacatcctgtttcatgttcttgcatcttgttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattga 17318539  T
Q  121 gttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaa 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17318540 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgagttttggttcttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 17318639  T
Q  221 ttcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatt 320  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17318640 ttcagcataaccgtttctaaggtaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 17318739  T
Q  321 taacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttg 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  17318740 taacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatattgttcttgaattatttg 17318839  T
Q  421 agttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgtttt 520  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17318840 agttatatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgt 17318939  T
Q  521 atgttgttgtctctgct 537  Q
    |||||||||||||||||    
T  17318940 atgttgttgtctctgct 17318956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 537
Target Start/End: Original strand, 15891028 - 15891537
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  15891028 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 15891127  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15891128 agttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaa 15891227  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  15891228 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctaaaaactagaagtactatgatttcaattagggtgtttaagagta- 15891326  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15891327 -----ctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatc--ttttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 15891419  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15891420 gagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataattttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttg 15891519  T
Q  520 tatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15891520 tatgttgttgtctctgct 15891537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 535
Target Start/End: Original strand, 27125799 - 27126309
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27125799 tgacaacacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttag 27125898  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg-ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattca 224  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27125899 ctttccagtggcttttgtttgaggtgaaaatgattttttggttcttgagatacgatgaaaatactttaaaaaggtcttagtgaaatcttatgaaaattca 27125998  T
Q  225 gcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaac 324  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27125999 gcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaagaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaac 27126098  T
Q  325 ctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagtt 424  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27126099 ctatgttgtgatggatttaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagtt 27126198  T
Q  425 acatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgt 524  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27126199 acataaatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgt 27126298  T
Q  525 tgttgtctctg 535  Q
    || ||||||||    
T  27126299 tgctgtctctg 27126309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 31734425 - 31733926
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtg 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31734425 tcctgtttcatgttcttgcgtctatttcacacgtttctgttttgaattggcatttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagttttccagtg 31734326  T
Q  136 gttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtt 235  Q
    | |||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  31734325 gctttggtttgacgtgaaaataatattagattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtt 31734226  T
Q  236 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31734225 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtact--gagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 31734128  T
Q  336 tggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatcta 435  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31734127 tagatctaatttggtttgacgtgaatatctttgtaggataattagaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatattta 31734028  T
Q  436 tgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctg 535  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31734027 tgtgaaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccatttaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctg 31733928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 18709234 - 18708743
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||| ||||    
T  18709234 gctctctgacaacacgtcctgtttcatgtttttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatcaaagttgtagatcattg 18709135  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| | ||||||    
T  18709134 agttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcatagtgaaatctaatgaaa 18709035  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18709034 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtat 18708935  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18708934 ttaacctatgttgtgatggatctaatttagtttgacatgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 18708835  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 512  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18708834 gagttacatatagttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagtt-ttattattaatgatgctatgttgtgaa 18708743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 7827707 - 7827234
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  7827707 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtataaacatgaaagttgtagataattg 7827608  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  7827607 agttagctttctagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaatcttatgaaa 7827508  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7827507 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtat 7827408  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7827407 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattggaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 7827308  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattatt 493  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7827307 gagttacatatatttatgtgaaaaaggtatgatatagaaaataattttgttataccattcaagttgttattatt 7827234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 512
Target Start/End: Original strand, 23150584 - 23151075
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  23150584 gctctctgacatcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttaacacgtttctgttttgagttgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 23150683  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  23150684 agttagcttttcaatggctttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 23150783  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23150784 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttcaactagg-tgtttaagagtat 23150882  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23150883 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 23150982  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 512  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23150983 gagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttgtaccattcaagttgttattattaattatgctatgttgtgaa 23151075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 20 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 18703299 - 18702889
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||| ||||    
T  18703299 gctctctgacaacacgtcctgtttcatgtttttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacattaaagttgtagattattg 18703200  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| | ||||||    
T  18703199 agttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcatagtgaaatctaatgaaa 18703100  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18703099 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtttttaagagtat 18703000  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18702999 ttaacctatgttgtgatggatctaatttagtttgacatgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 18702900  T
Q  420 gagttacatat 430  Q
    |||||||||||    
T  18702899 gagttacatat 18702889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 26 - 406
Target Start/End: Original strand, 19655552 - 19655932
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19655552 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttaacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttag 19655651  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19655652 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 19655751  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19655752 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacc 19655851  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  19655852 tatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattcgagatacatatattatgtgaatattgt 19655932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 35 - 462
Target Start/End: Original strand, 27317885 - 27318314
Alignment:
Q  35 gtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagcttt--cca 132  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  27317885 gtcctatttcatgttattgcgtcttttttacacgtttctgttttgaattagcctttggagtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctatatcca 27317984  T
Q  133 gtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgacc 232  Q
    |||| |||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27317985 gtggctttgatttgacgtgaaaaggatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacc 27318084  T
Q  233 gtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttg 332  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27318085 gtttctaagttaattcaaaactagaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatatggtgtttaagagtatttaacctacgttg 27318184  T
Q  333 tgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatat 432  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27318185 tgatggatctaatttagtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaataatttaagttacatatat 27318284  T
Q  433 ctatgtggaaaaggtatgatatagaaaata 462  Q
     ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27318285 ttatgtggaaaatgtatgatatataaaata 27318314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 20 - 406
Target Start/End: Original strand, 19773026 - 19773412
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  19773026 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtatttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 19773125  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19773126 agttagttttccagtggtttttgtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 19773225  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  19773226 atttagcataactgtttttaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtat 19773325  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19773326 ttaacatgtgttgtgatggatctaatttgattggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 19773412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 26 - 406
Target Start/End: Original strand, 15704934 - 15705314
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15704934 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgtttctggtttgaattggcctttggtgtaaacatgaaaattgtagataattgagttag 15705033  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15705034 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatacctcaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 15705133  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| || |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||     
T  15705134 cataactgtttcttagttaatccaaaatttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaaca 15705233  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15705234 tgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatttttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 15705314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 94 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 28948005 - 28947693
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||  |||| |||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28948005 gtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttgctttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 28947906  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28947905 ggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatg 28947806  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatatt 393  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28947805 agtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggacctaatttggtttgacgtgaatatttttgttggataatttgaaatacatatatt 28947706  T
Q  394 atgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||||||||    
T  28947705 atgtgaatgttgt 28947693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 26 - 406
Target Start/End: Original strand, 23491494 - 23491874
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | |||| |||| |||||||||||||||  |||||    
T  23491494 tgacagcatctcctgtttcatgttcttatgtctttttcacacgtttccgttttgaaatgggttttggtgtaaacatggaagttgtagataattttgttag 23491593  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||||| ||| |||||||||   |||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23491594 ctttccaatggctttggtttggattgaaaataatttttggtttttgagatatgatgacaatattccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 23491693  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||     
T  23491694 cataactgttactaagttaatccaaaacttaggtaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaaca 23491793  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23491794 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 23491874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 26 - 406
Target Start/End: Original strand, 23497092 - 23497472
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | |||| |||| |||||||||||||||  |||||    
T  23497092 tgacagcatctcctgtttcatgttcttatgtctttttcacacgtttccgttttgaaatgggttttggtgtaaacatggaagttgtagataattttgttag 23497191  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||||| ||| |||||||||   |||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23497192 ctttccaatggctttggtttggattgaaaataatttttggtttttgagatatgatgacaatattccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 23497291  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||     
T  23497292 cataactgttactaagttaatccaaaacttaggtaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaaca 23497391  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23497392 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 23497472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Original strand, 15173775 - 15174087
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15173775 ctttgacagcatcccctatttcgcgttcttgcgtgtttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaagcatgaaagttgtagataattgtgt 15173874  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15173875 tagctttccagtggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 15173974  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtattta 322  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||    
T  15173975 caacataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaattgtttaagggtattta 15174074  T
Q  323 acctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||    
T  15174075 acctatgttgtga 15174087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 37 - 346
Target Start/End: Original strand, 25601611 - 25601920
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  25601611 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacatgtttcttttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccagtgg 25601710  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| ||||||||   ||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25601711 ctttggtttgacttgaaaatgagttttggtttttgcgttatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgttt 25601810  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25601811 ctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtaataagagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgtggtgat 25601910  T
Q  337 ggatctaatt 346  Q
    ||||| ||||    
T  25601911 ggatcaaatt 25601920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Original strand, 15817092 - 15817390
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  15817092 cctgtttcgttttcttgcgtcttttacacacgtttctgttatgaattggcctttggtgtatgcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 15817191  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15817192 ctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgataatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgttt 15817291  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  15817292 ctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaccctcaaaactagaagtattatgaggtcaattaagttgtttaagattatttaacccatgttgtga 15817390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Original strand, 19825823 - 19826121
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||     
T  19825823 cctgtttcgtgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatga 19825922  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||| |||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  19825923 atttgttttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccattt 19826022  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19826023 ctaagttaatccaaaacttatcggataattccaaaccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaattatgttgtga 19826121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 26 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 23656068 - 23655804
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  23656068 tgacagcatctcctgtttcatgttattgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggccttttgtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttag 23655969  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23655968 ctttccagtggctttggtttgccttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaattcag 23655869  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtact 290  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23655868 cataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataattccaaacctcaaaactagaagtact 23655804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23956594 - 23956282
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  23956594 ctttgacagcatcccctatttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgt 23956495  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    |||||||||| ||  | | ||||| |||||||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23956494 tagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 23956395  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtattta 322  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  23956394 cagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggtttaattaaggtgtttaagagtattta 23956295  T
Q  323 acctatgttgtga 335  Q
    ||||| |||||||    
T  23956294 acctaagttgtga 23956282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22556984 - 22556625
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||    
T  22556984 gctctctgacagcatgtcatgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaacttgtagataattg 22556885  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     ||| | |||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22556884 tgtttgatttctagtggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagttatgatgaacatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaa 22556785  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||  |||| ||| |||||| || || |||||||||| ||| |   ||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |  ||||||||||||    
T  22556784 attttgcataaccatttctaggtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacatcaaaactagaagtactaggagtttcattaaggggtttaagagtat 22556685  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||| ||||    
T  22556684 ttaacctattttgtgatggatctaacttggtttaacgtgaatatctttgttggatgattt 22556625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 36 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18928442 - 18928149
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtg 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||  | |||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18928442 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggtttgggtgtatacatgaaagttgtagagaattgtgttagctttccagtg 18928343  T
Q  136 gttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtt 235  Q
    | ||||||||||| |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  18928342 gctttggtttgacttgaaaattatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtt 18928243  T
Q  236 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatg 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  18928242 tctaagttaatccaaaacttatggaatgattcaaaaactcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtattttacctatg 18928149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 32259581 - 32259242
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  32259581 gctctctgatagcatgttctgtttcatgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 32259482  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32259481 tgttagttttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgctttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 32259382  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||| |||| ||  |||||| || || |||||||||| ||| |   ||||||| || || || |  |||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  32259381 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttc-aagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgcttaagagtat 32259284  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  32259283 ttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaat 32259242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13765054 - 13764773
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  13765054 gttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 13764955  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || ||||||||  | ||     ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13764954 acttgaaaatg--actt-----ttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttaatgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaagttaat 13764862  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13764861 ccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgttttagagtatttaacctatgttgtga 13764773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 41 - 325
Target Start/End: Original strand, 8759855 - 8760138
Alignment:
Q  41 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtttt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |    
T  8759855 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtgaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctgt 8759954  T
Q  141 ggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaa 240  Q
    || ||||| |||||||  | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  8759955 ggattgacatgaaaataat-tttggtttttgagatattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaa 8760053  T
Q  241 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    || ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  8760054 gtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaacc 8760138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 37 - 325
Target Start/End: Original strand, 8767597 - 8767885
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||    
T  8767597 cctgttttatgttcttgggtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtgaacatgaaagttgtagatacttttgttagctttccaatgg 8767696  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| |||||||  | ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  8767697 ctttggtttgacatgaaaataatttttggtttttgagatattatgaaagtactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccattt 8767796  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  8767797 ctaagtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaacc 8767885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 99 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27851659 - 27851423
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27851659 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttggtttcacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 27851560  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27851559 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 27851460  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27851459 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 27851423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 37 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1254475 - 1254215
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  1254475 cctgtttcataatcttgcgtctttttcacacatttctgttttgagttgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 1254376  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||| || |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  1254375 ctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgttt 1254276  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 297  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1254275 ctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagtt 1254215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 59 - 335
Target Start/End: Original strand, 25619313 - 25619589
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25619313 ttttcacccttttctgttttgaatttg-ctttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatg 25619411  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | |||  || ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||     
T  25619412 atttttattttttgagatatgatggaaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttat 25619511  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25619512 ggaataattccaaccctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 25619589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20183288 - 20182982
Alignment:
Q  30 agcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagcttt 129  Q
    |||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20183288 agcatgtccggttccatgtttttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaattcgcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagcttt 20183189  T
Q  130 ccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatg 229  Q
    |||||||  | |||||||| | |||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  20183188 ccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgatttttcgtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcata 20183089  T
Q  230 accgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatg 329  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  20183088 accatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctc-aagctagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctttg 20182990  T
Q  330 ttgtgatg 337  Q
    || |||||    
T  20182989 ttatgatg 20182982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 22152703 - 22153009
Alignment:
Q  30 agcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagcttt 129  Q
    |||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22152703 agcatgtccggttccatgtttttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaattcgcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagcttt 22152802  T
Q  130 ccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatg 229  Q
    |||||||  | |||||||| | |||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  22152803 ccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgatttttcgtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcata 22152902  T
Q  230 accgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatg 329  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  22152903 accatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctc-aagctagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctttg 22153001  T
Q  330 ttgtgatg 337  Q
    || |||||    
T  22153002 ttatgatg 22153009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 39 - 335
Target Start/End: Original strand, 34296604 - 34296901
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagtt-agctttccagtggt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||   || ||||| |||  ||     
T  34296604 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgagttgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagatatttttttttagcttcccaaaggc 34296703  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttc 237  Q
    ||||| || || |||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  34296704 tttggcttcacttgaaaatgatttttggtttttgggatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttc 34296803  T
Q  238 taagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  34296804 taagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaaggactatgagtttaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtga 34296901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 99 - 335
Target Start/End: Original strand, 20733843 - 20734078
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||| |||| || |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20733843 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 20733942  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20733943 tcttagtgaaatct-atgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 20734041  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20734042 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 20734078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 25921466 - 25921124
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttc--acacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataat 117  Q
    ||||| |||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| ||||||||    
T  25921466 gctctctgacagcctgccctgtttcgcgttcttgcgtctttttttaacacgtttctgttttgaattgggctttggtgtaaacatgaaagttttagataat 25921367  T
Q  118 tgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatga 217  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25921366 tgtgttatctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 25921267  T
Q  218 aaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagt 317  Q
    |||||| |||| ||  ||||||||| || |||||||||| | | |   ||||||| |||||  | |  |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  25921266 aaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 25921168  T
Q  318 atttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  25921167 atttaacctatgttgtgatgaaactaacttggtttgacgtgaat 25921124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 18455389 - 18455728
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||| || | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||    
T  18455389 gctctctgacaacatgccctgtttcatgttcttacatctttttcacacgttttggttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtaattg 18455488  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18455489 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaggttttagtgaaattttatgaaa 18455588  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||| |||| ||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  18455589 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgta-tactatgagttcaattaaggtctttaagagtat 18455687  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||    
T  18455688 ttaacctatgttgtgatgaatataacttgg-ttgacgtgaat 18455728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 59 - 335
Target Start/End: Original strand, 20556449 - 20556725
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||    
T  20556449 ttttcacccttttctgttttgaatttg-ctttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatg 20556547  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  20556548 atttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttataagttaatccaaaacttat 20556647  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20556648 gggataattccaaccctcaaaactagaaatactatgagttaaattaaggtgttaaagagtatttaacccatgttgtga 20556725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 59 - 337
Target Start/End: Original strand, 5834091 - 5834368
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgt 158  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||     
T  5834091 ttttcacccgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatga 5834190  T
Q  159 tatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaag 258  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |    
T  5834191 tttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaag-taatccaaaacatagg 5834289  T
Q  259 gaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatg 337  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  5834290 gaataattctaaatctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgactaagagtatttaacctatgttatgatg 5834368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 59 - 335
Target Start/End: Original strand, 14978978 - 14979254
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14978978 ttttcacacttttatattttgaatttgc-tttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattaagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatg 14979076  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||     
T  14979077 atgtttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttggtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaatttaatccaaaacttat 14979176  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14979177 agaataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 14979254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 59 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 611435 - 611160
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||     
T  611435 ttttcacccttttctgttttgaatttgc--ttcggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaata 611338  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  611337 atttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttat 611238  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    || ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  611237 gggataattccaaagctcaaaactaaaattactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 611160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 46 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4477367 - 4477078
Alignment:
Q  46 tgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggttt 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||    
T  4477367 tgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttcgttagctttccaatggatttggttt 4477268  T
Q  146 gacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaa 245  Q
    |||   |||||| | |||||||  |||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||| |||||||    
T  4477267 gactctaaaatgatttttggtttatgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaa 4477168  T
Q  246 tccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    || ||||||   || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4477167 tcaaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 4477078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 94 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18658867 - 18658626
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| ||||||| |||||||||| |    
T  18658867 gtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgaaatatgataaaaatactccga 18658768  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18658767 ggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 18658668  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18658667 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 18658626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 337
Target Start/End: Original strand, 20410989 - 20411305
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  20410989 gctctctgacaacacgtccggtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacattaaagttgtagacaattg 20411088  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  20411089 tgttagcattccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttggtttttgaggtatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaa 20411188  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||| |||| ||  |||||| || || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  ||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  20411189 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttcaaagcttg-tgtaatatgagttcaattaagttgtttaagagtat 20411287  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatg 337  Q
    |||||||||||| |||||    
T  20411288 ttaacctatgttatgatg 20411305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22806484 - 22806275
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||    
T  22806484 gctctttgacagcatgtcctatttcatgttcttgcgtcttttccacacgttttagttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaatttgtagataattg 22806385  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22806384 agttagctttccagtggctttggtttgacctgaaaatgatttttggttcgtgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 22806285  T
Q  220 attcagcatg 229  Q
    ||||||||||    
T  22806284 attcagcatg 22806275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1006 - 755
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  1006 cctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgagttgacctttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 907  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||| || |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |  ||||    
T  906 ctttggttttacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataattgttt 807  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagta 288  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  806 ctaagttaatctaaaatttatggaataattccaaagctcaaaactagaagta 755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 27330289 - 27330488
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  27330289 gctctctgacagcatgtcctgttccatgttcttgtgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 27330388  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27330389 agttagttttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 27330488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 27391029 - 27391228
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  27391029 gctctctgacagcatgtcctgttccatgttcttgtgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 27391128  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27391129 agttagttttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 27391228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 47 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 25807840 - 25807602
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  | |||||||    
T  25807840 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttg 25807741  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
     |||||||||  | |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  25807740 tcgtgaaaattatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccatttctaagttaat 25807641  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaa 285  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||    
T  25807640 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaa 25807602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 39 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13285424 - 13285085
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||  | |||| ||||||| || |||||||||  |||||||||| ||||| |    
T  13285424 tgtttcatgttcttgcgtctgtttcacatgtttctgttttgaatttgctttcagtgtaaacatgaaaattttagataattatgttagctttctagtggct 13285325  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttct 238  Q
    || |||| || |||||||| | ||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||    
T  13285324 ttagttttacttgaaaatgatttttggtttttgatttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttct 13285225  T
Q  239 aagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgg 338  Q
    |||  || |||||||||| ||| |   ||||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13285224 aagccaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcatttaaggtgtttaagagtatttaacctatattgtgatgg 13285126  T
Q  339 atctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||    
T  13285125 atctaacttggtttgacgtgaatatctttgtttgatgattt 13285085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 94 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20177406 - 20177164
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||| ||| ||| |||| || |||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20177406 gtaagcatgaaagttttagacaattttgttagctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaa 20177307  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  20177306 ggaggtcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaag-caatccaaaacatagggaataattctaaacctcaaaactataagtactagg 20177208  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatg 337  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20177207 agttcaattaaggtgtctaagagtatttaacctatgttatgatg 20177164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 94 - 337
Target Start/End: Original strand, 22158585 - 22158827
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||| ||| ||| |||| || |||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22158585 gtaagcatgaaagttttagacaattttgttagctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaa 22158684  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  22158685 ggaggtcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaag-aaatccaaaacatagggaataattctaaacctcaaaactaaaagtactagg 22158783  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatg 337  Q
    |||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22158784 agttcaattaaggtgactaagagtatttaacctatgttatgatg 22158827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 94 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25347787 - 25347556
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  ||||||| || |||||||| | |||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  25347787 gtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttaacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaa 25347688  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     ||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||    
T  25347687 ggaggtcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctccaaactagaagtgccatg 25347588  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  25347587 agttcaattaaggtgtttgagagtatttaacc 25347556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 94 - 335
Target Start/End: Original strand, 29847894 - 29848137
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| | |||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  29847894 gtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgaatttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaa 29847993  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaa--ttcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtacta 291  Q
      |||||||| |||||| |||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29847994 gtaggtcttaatgaaatcttatgaaaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtacta 29848093  T
Q  292 tgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29848094 tgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtga 29848137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23415636 - 23415441
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  23415636 ctttgacagcattccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 23415537  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23415536 tagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttgttgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 23415441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 39 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 29045026 - 29044809
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  29045026 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacataaaagttttagataattgtgttagctttccagtggct 29044927  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttct 238  Q
    ||||||| || |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||  |||||    
T  29044926 ttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagatcttagtgaaatgttatgaaaattccgcataactatttct 29044827  T
Q  239 aagttaatccaaaactta 256  Q
    |||| || ||||||||||    
T  29044826 aagtcaacccaaaactta 29044809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 273
Target Start/End: Original strand, 31022042 - 31022267
Alignment:
Q  48 ttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  | |||||||     
T  31022042 ttcttgcgtctttttcacacgtttctggtttgaattggcctttggtgttaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttgg 31022141  T
Q  148 cgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatc 247  Q
    |||||||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  31022142 cgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattcactaaaaccgtttctaagttaatc 31022241  T
Q  248 caaaacttaaggaataattccaaacc 273  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  31022242 caaaacttagggaataattccaaacc 31022267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 59 - 335
Target Start/End: Original strand, 19443637 - 19443912
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgt 158  Q
    ||||||| | |||| |||||||| ||||  || | |||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||     
T  19443637 ttttcacccctttccgttttgaactggctcttggtgtaaacataaaagttgtagaaaattt-gttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatga 19443735  T
Q  159 tatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaag 258  Q
    | ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||| |    
T  19443736 tttttagtttttgagatatgaagaaaatactccacgtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttccaagttaatcgaaaacttatg 19443835  T
Q  259 gaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    | ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19443836 ggataattccagaactaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 19443912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 59 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18585314 - 18585014
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  18585314 ttttcacccttttttgttttgaatttgc-tttcggtgtaaacatgaatgttttagataattgtgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaatt 18585216  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| || || |||||||     
T  18585215 atttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaacttat 18585116  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgt 357  Q
    || ||  |  ||||| ||||| || |  ||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  18585115 gg-attgtctcaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctaagttgtgatgaatctaacttggtttgacgt 18585018  T
Q  358 gaat 361  Q
    ||||    
T  18585017 gaat 18585014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23838730 - 23838451
Alignment:
Q  24 tttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagtt 123  Q
    ||||||||||  || | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  23838730 tttgacagcatttcttatttcgtgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggccttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 23838631  T
Q  124 agctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 223  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||   |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  23838630 agctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtatgtcttagggaaatcttaagaaaattc 23838531  T
Q  224 agcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatta 303  Q
    ||||  ||| || | |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  23838530 agcacaaccattaccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtaatatgagtgcaatta 23838451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27557394 - 27557199
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  27557394 ctttgacagcattccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 27557295  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  27557294 tagctttccggtggatttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaatttttatgaa 27557199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 41 - 256
Target Start/End: Original strand, 34140965 - 34141178
Alignment:
Q  41 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtttt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||  ||    
T  34140965 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattg--ttagctttctagtggcgtt 34141062  T
Q  141 ggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaa 240  Q
    ||| |||| |||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||    
T  34141063 ggtatgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccaagaagatcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaa 34141162  T
Q  241 gttaatccaaaactta 256  Q
    || || ||||||||||    
T  34141163 gtcaacccaaaactta 34141178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 41 - 256
Target Start/End: Original strand, 34153581 - 34153794
Alignment:
Q  41 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtttt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||  ||    
T  34153581 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattg--ttagctttctagtggcgtt 34153678  T
Q  141 ggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaa 240  Q
    ||| |||| |||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||    
T  34153679 ggtatgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccaagaagatcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaa 34153778  T
Q  241 gttaatccaaaactta 256  Q
    || || ||||||||||    
T  34153779 gtcaacccaaaactta 34153794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7430241 - 7430057
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  7430241 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgacttgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 7430142  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaat 221  Q
     ||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  7430141 ctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaagtttattaaaat 7430057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 99 - 335
Target Start/End: Original strand, 16133066 - 16133302
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||   |||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16133066 catgaaagttgtagaaaattttgttagctttccaatgtcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 16133165  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||| || |||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  16133166 tcttagtgaattcataggaaaattcagcataaccatttccaagttaatcggaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtactatgagttc 16133265  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16133266 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 16133302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 99 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18398574 - 18398325
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  18398574 catgaaagttttagataattgtgttagctttctattggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccagggagg 18398475  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||| || ||||||||||  || |   ||||||| |||||||| |  || ||||||| ||    
T  18398474 tcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtgtccaaacttcaaaacttg-tgttctatgagctc 18398376  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttgg 349  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18398375 aattaaggtgtttaagagtatttaacttatgttgtgatggatctaacttgg 18398325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12942847 - 12942666
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  12942847 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 12942748  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     ||| |||||||  ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12942747 ctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 12942666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 330
Target Start/End: Original strand, 17857036 - 17857319
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| | |||| || ||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| ||    
T  17857036 gttcttgcatctttttcacacatttttgttttgaaattgcctttggtgtaaacaagaaagttttagataattgtgttagatttccaatggctttggtatg 17857135  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || |||||||| | ||| | | ||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | || ||  ||||||||| ||     
T  17857136 acttgaaaatgatttttagattttgggttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccggataactatttctaagtcaac 17857235  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgt 330  Q
    |||||||||| ||  |  |||||||| ||||||| ||||||| || || || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17857236 ccaaaacttatggtttgtttccaaacttcaaaacgagaagtattaggaatttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 17857319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 218
Target Start/End: Original strand, 28288841 - 28289022
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  28288841 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 28288940  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     ||||||| |||  |||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28288941 ctttggttggactcgaaaatgagttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 28289022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35057222 - 35057045
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||    
T  35057222 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgg 35057123  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaatttta 214  Q
     ||| ||||||| |||||||||| | ||| | ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| | |||||||||    
T  35057122 ctttagtttgacttgaaaatgttttatggattttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttggagaaatttta 35057045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 18334080 - 18334227
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  18334080 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 18334179  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  18334180 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 18334227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24423221 - 24423074
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  24423221 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 24423122  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  24423121 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 24423074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Original strand, 1540399 - 1540597
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||     
T  1540399 gctctctgacagcatgtcatgtttcatgttcttgcgtcttgttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattt 1540498  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     |||||||||||| ||| |||||| || | | ||||||   |||||||   | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1540499 tgttagctttccaatggctttggtgtggcataaaaatgagttttggtttaggcgttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 1540597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 221
Target Start/End: Original strand, 14593959 - 14594143
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||    
T  14593959 cctgtttcaagttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgacttgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccgatgg 14594058  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaat 221  Q
     ||||||||||  |||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  14594059 ctttggtttgatttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaagtttattaaaat 14594143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 218
Target Start/End: Original strand, 15891923 - 15892094
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||| ||||     
T  15891923 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacattaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttttgtttt 15892022  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
      || |||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15892023 gtgttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaa 15892094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 218
Target Start/End: Original strand, 19858425 - 19858608
Alignment:
Q  35 gtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19858425 gtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattagcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattgtgttagctttctagt 19858524  T
Q  135 ggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||  | |||||||| ||||||||   |||||||   ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||    
T  19858525 ggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactcaaaggagatcttagtgaatttttatgaa 19858608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 33864952 - 33864805
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  33864952 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 33864853  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  33864852 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 33864805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Original strand, 2290668 - 2290805
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  2290668 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 2290767  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
     ||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||    
T  2290768 tgttagcttttcagtggcatcggtttgacttgaaaatg 2290805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 23221581 - 23221277
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |  ||    
T  23221581 tgtttcacgttcttgtgtcctttacactcatttctgttttgaattggcctttagtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccaattttt 23221482  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttct 238  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| | | | ||| ||||||||||||||||||    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |   || ||    
T  23221481 ttggtttgacttgaaaatgatatttagatttggagttatgatgaaaatactccatgtgggtcttagtaaaactttatgaaaattcagcataatttttcct 23221382  T
Q  239 aagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgg 338  Q
    |||||||  |||| |||| ||  |  |||||||| |||||| | | |||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||| | |||     
T  23221381 aagttaaatcaaaccttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggagtttaattaagatgtttaagagtattaaacctaggttataatgc 23221283  T
Q  339 atctaa 344  Q
    ||||||    
T  23221282 atctaa 23221277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 19234803 - 19234658
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||| |||| ||||| ||||| ||| || |||    
T  19234803 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgatagttttagacaattgtgttagattttcattgg 19234704  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatga 182  Q
     ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  19234703 ctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatga 19234658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33862450 - 33862270
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  33862450 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 33862351  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||| || ||| ||||||   |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33862350 tttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 33862270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8055685 - 8055567
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  8055685 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcg 8055586  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  8055585 tcggtttgacttgaaaatg 8055567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Original strand, 17883004 - 17883183
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| |    
T  17883004 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataatttctttagctttccaatggct 17883103  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||||| ||| ||  || | |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17883104 ttggtttggcgttaatttgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 17883183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 19008946 - 19008847
Alignment:
Q  19 agctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataatt 118  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  19008946 agctctctgacagcacctcctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgtgtaaacatgaaagttgtagataatt 19008847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 414 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 24441261 - 24441140
Alignment:
Q  414 taatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 513  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||    
T  24441261 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatattgaagataatgttgttataccattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caag 24441163  T
Q  514 ttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    |||  |||||||||||||||||||    
T  24441162 ttg-cttatgttgttgtctctgct 24441140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 196 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 27557028 - 27556905
Alignment:
Q  196 aggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgag 295  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  27557028 aggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaattagaagttctatgag 27556929  T
Q  296 ttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||||||| | |||||||||||||    
T  27556928 ttcaattaaggtgtttaagagtat 27556905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 204 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23415262 - 23415151
Alignment:
Q  204 gtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatta 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23415262 gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatta 23415163  T
Q  304 ggatgtttaaga 315  Q
     | |||||||||    
T  23415162 aggtgtttaaga 23415151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22782895 - 22782754
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22782895 tgacagcatgtcctgtttcatatgcttgagtatttttcacacgtttctgttttgaattaccctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 22782796  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
    ||||||| |||  |  ||||||| |||||||| |||||||||    
T  22782795 ctttccactggcgtcagtttgacttgaaaatgatatttggtt 22782754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12742973 - 12742794
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| | ||||  ||  |||||||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  12742973 tgtttcctgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaactgggttttggtgtaaaaatataagttgtagataattttgttagctttccaatggct 12742874  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    || || ||  || ||| || | |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12742873 ttagtgtggagtaaaattgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 12742794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 167
Target Start/End: Original strand, 26923953 - 26924082
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  26923953 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaaatgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggc 26924052  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  26924053 gtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 26924082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 118
Target Start/End: Original strand, 7219195 - 7219277
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataatt 118  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  7219195 tcctgattcatgctcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatt 7219277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Original strand, 27654564 - 27654706
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||  ||||||||    
T  27654564 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttg 27654663  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    ||||  ||||| | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  27654664 acgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 27654706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25175254 - 25175112
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||| | |||  ||||||||    
T  25175254 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatcaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttg 25175155  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    ||||  ||||| | ||| | | |||||||||||| ||| ||||    
T  25175154 acgtccaaatgatttttagatattgagatatgattaaattact 25175112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 404 - 537
Target Start/End: Original strand, 31735629 - 31735761
Alignment:
Q  404 tgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 502  Q
    ||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  31735629 tgttgttggttaatttgaaatacatatat-tatgtggaaaatgtttgatatagaaaatattgttgtttatatcattcaaattgttattattaatgttgct 31735727  T
Q  503 atgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    |||||   |||||||||||||||| ||||||||||    
T  31735728 atgtt-acaagttgttttatgttgctgtctctgct 31735761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 357 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 23655776 - 23655665
Alignment:
Q  357 tgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatag 456  Q
    |||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| | |  |||||||||||    
T  23655776 tgaatgttgttgttgaataatttaaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaatattttgaggtacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag 23655678  T
Q  457 aaaataatgttgtt 470  Q
     |||||||||||||    
T  23655677 -aaataatgttgtt 23655665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 352
Target Start/End: Original strand, 22523435 - 22523617
Alignment:
Q  169 ttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 268  Q
    ||||| |||| ||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| ||||| || ||| || ||| ||  |  |  |    
T  22523435 ttgagttatggtgaaaatactaaaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaattcagcataactatttttaagtgaacccataagttatggtttggtcgc 22523534  T
Q  269 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggttt 352  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||    
T  22523535 aaacctcaaaacttga-gtactaggagtttaataaggatgtttaagagtatttaacctatggcatgatggatctaacttggttt 22523617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 457 - 512
Target Start/End: Original strand, 27322172 - 27322227
Alignment:
Q  457 aaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27322172 aaaataatgttgttataccattcaagttgttgttattaatgatgctatgttgtgaa 27322227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 286 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 29044731 - 29044656
Alignment:
Q  286 gtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  29044731 gtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatataacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaat 29044656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 329
Target Start/End: Original strand, 15938570 - 15938851
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| | ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||   |||| |||||||||| ||||| | |   || | |||||| ||| |||||||||    
T  15938570 gttcttgtgcctttttcacccatttctattttgaattggcttttgatgtaaacatgaaagttatagatgaattttttggttttccaatggctttggtttg 15938669  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || |||||||  | |||   | ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||     
T  15938670 acttgaaaattatttttatcttttgagttatgatgaaaatactctaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaatttagcataactatttttaagtcaac 15938769  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatg 329  Q
    |||||||||| ||  |  |||||||  |||||| | | |||  || ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  15938770 ccaaaacttatggtttgtttccaaaattcaaaaattg-agtgttaggagttcaattaaggtgtttaagggtatttaacctatg 15938851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Original strand, 16826335 - 16826477
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| |||||||||    
T  16826335 gttcttgagtctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagacaattttgttagctttctaatggctttggtttg 16826434  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    ||||  ||||| | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  16826435 acgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 16826477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 291 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19234661 - 19234591
Alignment:
Q  291 atgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19234661 atgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaat 19234591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 404 - 537
Target Start/End: Original strand, 22212214 - 22212346
Alignment:
Q  404 tgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgct 502  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| || |    
T  22212214 tgttgttggttaatttgagatacatatat-tatgtgaaaattgtatgatatagaaaataattttgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgtt 22212312  T
Q  503 atgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
     |||||  |||||||||||||||| || |||||||    
T  22212313 gtgttg-caagttgttttatgttgctgcctctgct 22212346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10445606 - 10445497
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||| | ||||  ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| | |||||||||    
T  10445606 gttcttgcgtctatttcacacgtttatgttttaagttggcctttggtgtaaatatgaaagttattgataattgtgttatctttccagtagctttggtttg 10445507  T
Q  147 acgtgaaaat 156  Q
    || |||||||    
T  10445506 acatgaaaat 10445497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18452361 - 18452252
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| | |||| |||||||||||    |||||| |||| ||||||||| || ||||||||    
T  18452361 gttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgatttgacctttggtgtaaacatgaaagttgctattaattgtgttatctttccagtagtcttggtttg 18452262  T
Q  147 acgtgaaaat 156  Q
    || |||||||    
T  18452261 acatgaaaat 18452252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 189
Target Start/End: Original strand, 21776040 - 21776205
Alignment:
Q  24 tttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagtt 123  Q
    ||||||||||  || ||||||  ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| | |||| | |||| |||||||||||||||||| |  |||    
T  21776040 tttgacagcatttcttgtttcgcgttcttgtgtctttttcacctatttctgttttgaattagactttggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgtt 21776139  T
Q  124 agctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||  |||||| | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  21776140 agctttctaatggctttggtttgacgccaaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21776205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 317 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 22806271 - 22806182
Alignment:
Q  317 tatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  22806271 tatttaacatgtgtggtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttaagatacatatattatgtgaatattgt 22806182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16135591 - 16135519
Alignment:
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgt 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16135591 ggaatatttccaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 16135519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 330
Target Start/End: Original strand, 31161866 - 31162085
Alignment:
Q  110 tagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaa 209  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||  |||| |||||| | |||||| | ||| | | ||||| |||| |||||| |||||||  ||||||| | ||||    
T  31161866 tagataattgaattagcattccaatgactttgatttgacatcaaaatgatttttagattttgagttatgttgaaaacactccaagtaggtcttggagaaa 31161965  T
Q  210 ttttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgt 309  Q
    ||||| | ||||| ||||||||  |||| |||| || |||||||||| ||  |  |||||||  |||||||| | |||| || ||||| ||||| |||||    
T  31161966 ttttaagtaaatttagcatgactatttccaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaatttcaaaacttg-agtattaagagtttaattatgatgt 31162064  T
Q  310 ttaagagtatttaacctatgt 330  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  31162065 ttaaaagtatttaacctatgt 31162085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 150
Target Start/End: Original strand, 22226536 - 22226639
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||    
T  22226536 gttcttgtgtctttttcacctatttctgttttgaattggcttttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttg 22226635  T
Q  147 acgt 150  Q
    ||||    
T  22226636 acgt 22226639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 10488124 - 10488030
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  10488124 tcctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttc 10488030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 404 - 537
Target Start/End: Original strand, 13751060 - 13751191
Alignment:
Q  404 tgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 502  Q
    ||||||||  |||||| || || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  13751060 tgttgttggttaatttaagctatatatat-tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatttcattcaagttgttattattaatattgct 13751158  T
Q  503 atgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  13751159 atgttg-caagttg-cttatgttgttgtctctgct 13751191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 130
Target Start/End: Original strand, 16377204 - 16377298
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  16377204 tcctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttc 16377298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 130
Target Start/End: Original strand, 16384528 - 16384622
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  16384528 tcctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttc 16384622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 150
Target Start/End: Original strand, 16556902 - 16557015
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| | |||    
T  16556902 cctgtttcgcgttcttgcatctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatgg 16557001  T
Q  137 ttttggtttgacgt 150  Q
     |||||||| ||||    
T  16557002 ctttggtttaacgt 16557015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 150
Target Start/End: Original strand, 16633458 - 16633571
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| | |||    
T  16633458 cctgtttcgcgttcttgcatctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatgg 16633557  T
Q  137 ttttggtttgacgt 150  Q
     |||||||| ||||    
T  16633558 ctttggtttaacgt 16633571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 150
Target Start/End: Original strand, 16650132 - 16650245
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  ||| |||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| | |||    
T  16650132 cctgtttcgcgtttttgcatctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatgg 16650231  T
Q  137 ttttggtttgacgt 150  Q
     |||||||||||||    
T  16650232 ctttggtttgacgt 16650245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19609732 - 19609619
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||    
T  19609732 cctgtttcgcgttcttgcatctttttctcctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatgg 19609633  T
Q  137 ttttggtttgacgt 150  Q
     |||||||||||||    
T  19609632 ctttggtttgacgt 19609619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 371 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23655802 - 23655741
Alignment:
Q  371 ggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatat 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  23655802 ggataatttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaataatttaaaatacatatat 23655741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 25904627 - 25904514
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  ||| |||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| | |||    
T  25904627 cctgtttcgcgtttttgcatctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatgg 25904528  T
Q  137 ttttggtttgacgt 150  Q
     |||||||||||||    
T  25904527 ctttggtttgacgt 25904514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1555690 - 1555527
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||||  |||||||   |||||||| ||||||||||    |||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| || ||||||  |||||    
T  1555690 tgacagcaccccctgttttgcgttcttgcatctttttcacctagttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttttaaataattttgttag 1555591  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||  ||||| | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  1555590 ctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 1555527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 18658523 - 18658448
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18658523 tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 18658448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 29665516 - 29665413
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||| || ||||| ||  |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| |||||||||    
T  29665516 gttcttgcatcattttctcatatttctgttttgatttggacttttgggtaaacatgaaagttgtagacaattatgttagctttctattggctttggtttg 29665417  T
Q  147 acgt 150  Q
    ||||    
T  29665416 acgt 29665413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 202
Target Start/End: Original strand, 3007478 - 3007611
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttc 168  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||| |||||| ||| |||||||||  |||| |||| || |||  |||||||||| |||||||||| | ||| |     
T  3007478 tttctgatttgaattggcctttggtgtaaacatgaaggttttagataattaggttatcttttcaatggcgttggtttgacttgaaaatgttttgtggatt 3007577  T
Q  169 ttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtctt 202  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||    
T  3007578 ttgagttatgatgaaaacacttcaagtaggtctt 3007611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 611057 - 610955
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtct 532  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||  |||||||||||||     
T  611057 tatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttg-cttatgttgttgtcc 610960  T
Q  533 ctgct 537  Q
    |||||    
T  610959 ctgct 610955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 537
Target Start/End: Original strand, 29848240 - 29848342
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtct 532  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||  |||||||||||||     
T  29848240 tatgaggaaaatgtgtgatatagaaaatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttg-cttatgttgttgtcc 29848337  T
Q  533 ctgct 537  Q
    |||||    
T  29848338 ctgct 29848342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 19444017 - 19444092
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  19444017 tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg 19444092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 156
Target Start/End: Original strand, 30674055 - 30674153
Alignment:
Q  58 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    ||| |||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||| |||||||    
T  30674055 tttttcacacatttctgttttgaattggtctttgctataaacatggaagttgttgataattgtgttatctttccagtagccttggtttgacatgaaaat 30674153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 488 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 7825913 - 7825864
Alignment:
Q  488 attattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  7825913 attattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgct 7825864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31163652 - 31163519
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttc 168  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | |||| |||||| ||| |||||||||  ||||  |||||| |||  |||||||||| |||||||||| | ||| |     
T  31163652 tttctgatttgaattgacctttggtgtaaacatgaaggttttagataattatgttatatttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgttttgtggatt 31163553  T
Q  169 ttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtctt 202  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||    
T  31163552 ttgagttatgatgaaaacacttcaagtaggtctt 31163519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25753026 - 25752970
Alignment:
Q  279 actagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  | |||||||||    
T  25753026 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtga 25752970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25755196 - 25755140
Alignment:
Q  279 actagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  | |||||||||    
T  25755196 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtga 25755140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 16133407 - 16133482
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  16133407 tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg 16133482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 487
Target Start/End: Original strand, 23497613 - 23497702
Alignment:
Q  397 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  |||||||||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  23497613 tgaatgttgttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatata-aaaagagtgttgttcatatcattcaagttgtt 23497702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 130
Target Start/End: Original strand, 33315043 - 33315126
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||||| ||||||||||   ||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  33315043 gttcttgcatctttttcacctatttatatttcgaattggcctttcgtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttc 33315126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 85
Target Start/End: Original strand, 21686506 - 21686551
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgg 85  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21686506 tgtttcatgtt-ttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattgg 21686551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1818340 - 1818232
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||| | ||||  |||||| || | |||||||| |||| ||||| ||| |  ||||||||    
T  1818340 gttctcgcgtctgtctcacacgtttctattttgagttggcatttagtgtaaatatgaaacttattgataattgtgttatctttctagtagccttggtttg 1818241  T
Q  147 acgtgaaaa 155  Q
    |||||||||    
T  1818240 acgtgaaaa 1818232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 449 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 13764652 - 13764592
Alignment:
Q  449 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13764652 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 13764592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 487
Target Start/End: Original strand, 23492015 - 23492104
Alignment:
Q  397 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 487  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  |||||||||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  23492015 tgaattttgttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatata-aaaagagtgttgttcatatcattcaagttgtt 23492104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 508
Target Start/End: Original strand, 19829695 - 19829764
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  19829695 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgatattattgatgttgctatgttg 19829764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 406
Target Start/End: Original strand, 23497613 - 23497662
Alignment:
Q  357 tgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23497613 tgaatgttgttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 23497662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23655673 - 23655640
Alignment:
Q  399 aatgttgttgttgaataatttgagttacatatat 432  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23655673 aatgttgttgttgaataatttgaggtacatatat 23655640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 366 - 406
Target Start/End: Original strand, 6083497 - 6083537
Alignment:
Q  366 ttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6083497 ttgttggataaattgaaatgcatatattatgtgaatattgt 6083537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16240391 - 16240335
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgt 150  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  16240391 gtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgt 16240335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 406 - 470
Target Start/End: Original strand, 19773372 - 19773434
Alignment:
Q  406 ttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 470  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  19773372 ttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 19773434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 366 - 406
Target Start/End: Original strand, 23492024 - 23492064
Alignment:
Q  366 ttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23492024 ttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 23492064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 366 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 23500970 - 23500930
Alignment:
Q  366 ttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  23500970 ttgttggataatttgagatacttatattatgtgaatattgt 23500930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 366 - 398
Target Start/End: Original strand, 31735631 - 31735663
Alignment:
Q  366 ttgttggataatttgaaatacatatattatgtg 398  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31735631 ttgttggttaatttgaaatacatatattatgtg 31735663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 58475 - 57969
Alignment:
Q  28 acagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagct 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  58475 acagcacgtcctgtttcatattcttgcgtgtttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaatatgaaagttgtagataattgagttagct 58376  T
Q  128 ttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagca 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  58375 ttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatctgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagca 58276  T
Q  228 tgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaaccta 327  Q
    | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  58275 taagcgtttctaagttaatccaaaacataaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctg 58176  T
Q  328 tgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttaca 427  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  58175 tgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaagaatttgagttaca 58076  T
Q  428 tatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgt 527  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  58075 tatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgtcgtgaagttgttgtatgttgt 57976  T
Q  528 tgtctct 534  Q
    |||||||    
T  57975 tgtctct 57969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 68609 - 68438
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||     
T  68609 gttcttgcatcttcttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttggtttt 68510  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    || |||||||| | |||   | ||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||| |||||||||    
T  68509 acttgaaaatgatttttatcttttgagatatgatggaaatactccaagttggtcttagtgaatttttatgaa 68438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 395; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 537
Target Start/End: Original strand, 12853 - 13368
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  12853 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgattctgtttttaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 12952  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12953 agttagatttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcctgagatatgttgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 13052  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13053 attcagcacaaccatttttaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactaaaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtat 13152  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13153 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaa--acatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 13250  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13251 gagttacatatatttatgtggaaaaggtataatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttg 13350  T
Q  520 tatgttgttgtctctgct 537  Q
    |||||| |||||||||||    
T  13351 tatgttattgtctctgct 13368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 268 - 537
Target Start/End: Original strand, 19368 - 19635
Alignment:
Q  268 caaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcatt 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  19368 caaacctcaaaactaaaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatcttt 19467  T
Q  368 gttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgtt 467  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19468 gttggataatttgaaa--catatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtataatatagaaaataatgtt 19565  T
Q  468 gttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19566 gttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttcttgtctctgct 19635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 390; Significance: 0; HSPs: 109)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 19921368 - 19920852
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||    
T  19921368 gctctctgacagcacgtcctgtttcattttcttgcgtcttttttacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagatgattg 19921269  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||    
T  19921268 agttagctttccagtggttt-ggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaaatcttagtgaaatcttatgaaa 19921170  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19921169 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaaccttaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtat 19921070  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19921069 ttaacatatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 19920970  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  19920969 gagttacatatatttatgtggaaaaactatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttattattattaatgatgatatgttgtgaagttgttg 19920870  T
Q  520 tatgttgttgtctctgct 537  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  19920869 tgtgttgctgtctctgct 19920852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 20 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 20566289 - 20565903
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  20566289 gctctctgacaggacgtcctgtttcatgttcttgtgtctttttcatacgtttctgttttgaattgtcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 20566190  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20566189 agttaaattttcagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 20566090  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20566089 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaattactatgagttcaattagggtgtttaagagtat 20565990  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20565989 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatctatgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 20565903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 432
Target Start/End: Original strand, 32607641 - 32608053
Alignment:
Q  19 agctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataatt 118  Q
    |||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||    
T  32607641 agctctctgacagcatgccatgtttcatgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataatt 32607740  T
Q  119 gagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
      |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  32607741 ttgttagctttccaatgtctttggtttgacttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 32607840  T
Q  219 aattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagta 318  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  32607841 aattcagcataaccgtttctaagctaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactataagttcaattagggtgtttaagagta 32607940  T
Q  319 tttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatt 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32607941 tttaacctatgttgtgatggatctaa-ttggcttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaataatt 32608039  T
Q  419 tgagttacatatat 432  Q
    |||  |||||||||    
T  32608040 tgaaatacatatat 32608053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 37 - 432
Target Start/End: Original strand, 36509118 - 36509505
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| |||| |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  36509118 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaactatgagagttttagatatttatgttagctttccagtgg 36509217  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| ||||||        |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36509218 ctttggtttgacttgaaaa--------ggtttttgagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgttt 36509309  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt-aggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36509310 ctaagtcaatccaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 36509409  T
Q  336 tggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatat 432  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36509410 tggatctaa-ttggtttgacgtgaatatttttgttggataatttgaagtacatatattatatgaatgttgttgttgaataatttgaaatacatatat 36509505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17011458 - 17011146
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  17011458 ctttgacagcatcccctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcattttgtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 17011359  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17011358 tagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttcagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 17011259  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtattta 322  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17011258 tagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacttcaaaactaaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattta 17011159  T
Q  323 acctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||    
T  17011158 acctatgttgtga 17011146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Original strand, 24276940 - 24277238
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  24276940 cctgtttcgtgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 24277039  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||| || |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  24277040 atttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgttt 24277139  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24277140 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 24277238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24385273 - 24384975
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  24385273 cctgtttcgtgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 24385174  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||| || |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  24385173 atttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgttt 24385074  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24385073 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 24384975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 26 - 329
Target Start/End: Original strand, 8833530 - 8833824
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  8833530 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 8833629  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8833630 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatg--attt------tgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 8833721  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  8833722 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc-attaagttgtttaagagtatttaacc 8833820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 37 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 29448556 - 29448262
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  29448556 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtgg 29448457  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||| ||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  29448456 ctttagtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccattt 29448357  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29448356 ctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtagtatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 29448262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 37 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6766379 - 6766085
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||     
T  6766379 cctgtttcgtgttcttgcgtcttttacacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatga 6766280  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6766279 cttttgtttgacttaaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttggtaaaattttatgaaaattcagcataaccgttt 6766180  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  6766179 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaaatagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 6766085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17813114 - 17812816
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| | |||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||    
T  17813114 cctgtttcgtgttcttgcgtcttttacacacgtttctgttttaaattgacatttggtgtaaacataaaagttgtagataatttttttagctttccaatgg 17813015  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17813014 ctttgatttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgttt 17812915  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17812914 ctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 17812816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 36460688 - 36460390
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  36460688 cctgtttcatgttcttccgtctttttcacacgtttctgttttgagttgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 36460589  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||| || |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  36460588 ctttggtttcacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgttt 36460489  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36460488 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtga 36460390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26762130 - 26761827
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  26762130 tgacagcatctcctgttttatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataaatgtgttag 26762031  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| || | |||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  26762030 ctttccagtggctttggttttacttgaaactgatttttgatttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaacattcaa 26761931  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26761930 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataactccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 26761831  T
Q  326 tatg 329  Q
    ||||    
T  26761830 tatg 26761827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18744376 - 18744044
Alignment:
Q  28 acagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagct 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18744376 acagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcatttgatgtaaacatgaaagttatagataattgagttagct 18744277  T
Q  128 ttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagca 227  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  18744276 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttataaaaattccgca 18744177  T
Q  228 tgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaaccta 327  Q
    | ||  |||||| || || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18744176 taactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 18744078  T
Q  328 tgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  18744077 tgttgtgatgaatctatcttggtttgacgtgaat 18744044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18419130 - 18418832
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  18419130 cctgttttatgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 18419031  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||    
T  18419030 ctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataatcgttt 18418931  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18418930 ctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 18418832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 263576 - 263277
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtcttttt-cacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtg 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||    
T  263576 cctgtttcgtgttcttgcgtcttttttcacacgtttttgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttatagataattgtgttagctttccgatg 263477  T
Q  136 gttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtt 235  Q
      ||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  263476 actttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatt 263377  T
Q  236 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  263376 tctaagttaatccaaaacttatgggataattgcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 263277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 37 - 334
Target Start/End: Original strand, 27868909 - 27869206
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || | ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  27868909 cctgtttcacgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcatttggtgtgaacatgaaagttgtagataattctgttagctttccaatgg 27869008  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | |||    
T  27869009 ctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaacattt 27869108  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtg 334  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27869109 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttgagagtatttaacctatgttgtg 27869206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 38 - 332
Target Start/End: Original strand, 41875928 - 41876222
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||      
T  41875928 ctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagatttccaatgac 41876027  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttc 237  Q
    | ||||||| | |||||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41876028 tctggtttggcatgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttc 41876127  T
Q  238 taagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttg 332  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  41876128 taagttaatccaaatcttagggaataattccaaacctcaaaactaaaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttg 41876222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 37 - 361
Target Start/End: Original strand, 16604938 - 16605261
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  16604938 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctagtgg 16605037  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||  |||    
T  16605038 ctttggtttgacttgaaaatggtttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaagtttatgaaaattccgcataactattt 16605137  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
     ||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16605138 ataagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 16605236  T
Q  337 ggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    | |||||| ||||||||||||||||    
T  16605237 gaatctaacttggtttgacgtgaat 16605261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Original strand, 33472884 - 33473196
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || ||||||||||||||||  ||    
T  33472884 ctttgacagcatcccctatttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaaaattaaagttgtagataattttgt 33472983  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    |||||||||| ||  | | ||||| |||||||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33472984 tagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 33473083  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtattta 322  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  33473084 cagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggtttaattaaggtgtttaagagtattta 33473183  T
Q  323 acctatgttgtga 335  Q
    ||||| |||||||    
T  33473184 acctaagttgtga 33473196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 116 - 379
Target Start/End: Original strand, 33895295 - 33895558
Alignment:
Q  116 attgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttat 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  33895295 attgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattgt 33895394  T
Q  216 gaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaaga 315  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |  ||||||||    
T  33895395 gaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttatagaataaatccaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaaggggtttaaga 33895494  T
Q  316 gtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||    
T  33895495 gtatttaacctatgcggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatctttgttggatgattt 33895558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 39 - 335
Target Start/End: Original strand, 21557380 - 21557677
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||     
T  21557380 tgtttcatgttcttgcatatttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggta 21557479  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttct 238  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| | || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| |||||    
T  21557480 ttggtttgacttgaaaatgatttttggcttttaagatatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaaatcttacgaaaattcagtataaccatttct 21557579  T
Q  239 aagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgttt-aagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21557580 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactataagttcaattaaggtgtttaaagagtatttaaactatgttgtga 21557677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 99 - 379
Target Start/End: Original strand, 21399400 - 21399679
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||| | ||  ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21399400 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgactt-aaaatgattttcagtttttgagatatgataaaaatactccaaggagg 21399498  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21399499 ttttagtgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 21399598  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||    
T  21399599 aattaaggtgtttaagagtatttaacctattttgtgatgaatctaatttggttagacgtgaatatctttgttggatgattt 21399679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 44 - 335
Target Start/End: Original strand, 21554720 - 21555011
Alignment:
Q  44 catgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  21554720 catgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggt 21554819  T
Q  144 ttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagtt 243  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  21554820 ttgacttgaaaatgat-tttggtttttaagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtctaaccatttctaagtt 21554918  T
Q  244 aatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgttt-aagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21554919 aatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactacgagttcaattaaggtgtttaaagagtatttaacccatgttgtga 21555011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 59 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17875695 - 17875429
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  17875695 ttttcacccttttctgttttgaatttgc-tttcgatgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatg 17875597  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     
T  17875596 atttttagtttttgagatatgataaaaatactccgaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccaagttaatccaaaacttat 17875497  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17875496 agaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 17875429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 99 - 379
Target Start/End: Original strand, 20197982 - 20198264
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg--ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacga 196  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||  || |||  || || |||||||||||||||||||||| ||    
T  20197982 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttttttttttttagatatgatgaaaatactccaagga 20198081  T
Q  197 ggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagt 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20198082 ggtcttagtgacattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactaggagt 20198181  T
Q  297 tcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    | ||||| |  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  20198182 ttaattaaggggtataagagtatttaacctatgttttgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 20198264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 59 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22412702 - 22412426
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |  |||||| |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||  |||  |||||| ||||||||    
T  22412702 ttttcacccttttctgttttgaatttgt-tttcggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttattttgacttgaaaatg 22412604  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  22412603 atttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaagttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttat 22412504  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22412503 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtga 22412426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 14026131 - 14026465
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||     
T  14026131 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttat 14026230  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  14026231 atttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatcccg 14026330  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    | | ||  ||||||||| || ||||||| || ||| |   ||||||| ||||| || |  |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  14026331 cctaactatttctaagtcaacccaaaacatatggattgtctccaaacttcaaatcttg-tgtactatgagttgaattaaggtgtttaagagtatttaacc 14026429  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  14026430 tatgttgtaatgaatctatcttggtttgacgtgaat 14026465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 47 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 19511895 - 19511614
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  19511895 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 19511796  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || | |||||| | |||||||    || ||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19511795 actttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtggaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 19511696  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctc-aaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaaccta 327  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  19511695 ccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagcattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 19511614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 379
Target Start/End: Original strand, 23199715 - 23200065
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23199715 tgacagcatgttctgtttcatgttcttgcatctttttcacatgtttctgttttgaattggccttttgtatacacatgaaagttgtagataattgtgttag 23199814  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||   |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23199815 ctttcccatggctttggtttgacttgaaaatttt---tggtttctgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 23199911  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgttt-aagagtatttaac 324  Q
    ||| ||  |||||| || || |||||||||| ||| |   ||||||  ||||| || |  ||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  23199912 cataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaaattcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaagtgtttgaagagtatttaac 23200010  T
Q  325 ctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  23200011 ctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtgaatatcgttgttggatgattt 23200065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Original strand, 22758224 - 22758523
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  22758224 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtgaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 22758323  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttg-agatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtt 235  Q
     ||| | ||||| |||||||| | ||||||| ||  || ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||    
T  22758324 ctttagcttgacttgaaaatgatttttggtttttttagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatt 22758423  T
Q  236 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  22758424 tctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagcactatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtga 22758523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 36 - 337
Target Start/End: Original strand, 8504202 - 8504502
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtg 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  8504202 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattatgttagctttcctgtg 8504301  T
Q  136 gttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtt 235  Q
    | ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||    
T  8504302 gctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatt 8504401  T
Q  236 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||| || || |||||||||| ||| |   | ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  8504402 tctaggtcaacccaaaacttatggattgtcttcaaacttcaaagcttg-tgtactatgaattcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttttga 8504500  T
Q  336 tg 337  Q
    ||    
T  8504501 tg 8504502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Original strand, 38145082 - 38145370
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  38145082 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 38145181  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    ||   |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||    
T  38145182 actctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 38145281  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||||| || |||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38145282 ccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatacgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 38145370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 69 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 31456484 - 31456218
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||    
T  31456484 tttctgttttgaatttgt-tttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttaactttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtt 31456386  T
Q  168 cttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattc 267  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  31456385 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgggaaaattaagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaaaaattc 31456286  T
Q  268 caaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  31456285 caaccctcaaaactagaaatactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacccatattgtga 31456218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 361
Target Start/End: Original strand, 1627715 - 1628038
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || | |||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||    
T  1627715 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtgaacatgaaagttttagataattgtgttatctttctagtgg 1627814  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| |||||||| | |||   | ||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  |||    
T  1627815 ctttggtttgacttgaaaatgatttttaacttttgagttatgatgaaaatactcgaaggaggtcttaatgaaattttatgaaaattccgcataactattt 1627914  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    ||| || || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1627915 ctaggtcaacccaaaacttatggattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaacgtgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 1628013  T
Q  337 ggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    | |||||| ||||||||||||||||    
T  1628014 gaatctaaattggtttgacgtgaat 1628038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 42961085 - 42960797
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  42961085 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 42960986  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    ||   |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||    
T  42960985 actctaaaatggtttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttcgggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 42960886  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||    
T  42960885 ccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgcttaagagtatttaacccatgttgtga 42960797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 47 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22750649 - 22750372
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| | |||  |    |||    
T  22750649 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcatg---ttg 22750553  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || |||||||    ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22750552 acttgaaaataacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 22750453  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaaccta 327  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22750452 ccaaaacttagggaataattccaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 22750372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 38 - 254
Target Start/End: Original strand, 40917308 - 40917524
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  40917308 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttaaactgggtttttgtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 40917407  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttc 237  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40917408 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactcaaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttc 40917507  T
Q  238 taagttaatccaaaact 254  Q
    |||||||||||||||||    
T  40917508 taagttaatccaaaact 40917524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Original strand, 28370600 - 28370888
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  28370600 gttcttgtgtcttttgcacacgtttctattttgaataggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccagtggctttggtttg 28370699  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    ||   |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||    
T  28370700 actctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 28370799  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||   || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28370800 ccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgtaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 28370888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16063191 - 16062904
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||  | ||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  16063191 gttcttgcgtctttttcacacattttttttt--atttgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggatttggtttg 16063094  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| ||     
T  16063093 acttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaac 16062994  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatg 337  Q
    ||||||||||  || |   || |||| ||||| || |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16062993 ccaaaacttatagattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatg 16062904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 335
Target Start/End: Original strand, 30138530 - 30138795
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||| ||| |||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | |||  ||    
T  30138530 tttctgttttgaatttgc-tttcggtgtaaacataaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattt 30138628  T
Q  168 cttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattc 267  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||     
T  30138629 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaacctt-atgaaaattcagcataaccgtttctaagttaacccaaaatttatgggataattt 30138727  T
Q  268 caaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30138728 caaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 30138795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 47 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22337028 - 22336748
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||| |||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  22337028 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggacttgggtgtaaacatggaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 22336929  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    ||   |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||    
T  22336928 actctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaat 22336829  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaaccta 327  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22336828 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtgaaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 22336748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 335
Target Start/End: Original strand, 37598455 - 37598749
Alignment:
Q  41 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtttt 140  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||| |||    
T  37598455 tttcacgttcttgtgtctttatcagacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtaaataattttgttagatttccaatggcttt 37598554  T
Q  141 ggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaa 240  Q
    ||||||||   |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||    
T  37598555 ggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaa 37598654  T
Q  241 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||  || | ||||||||  ||||||||||||| || ||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  37598655 gttaatccaaaacttgtgggacaattccaaggctcaaaactagaattaatatgagtgcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtga 37598749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 47 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22340566 - 22340286
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||| |||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  22340566 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggacttgggtgtaaacatggaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 22340467  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    ||   |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||    
T  22340466 actctaaaatgatttttggtttaagagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaat 22340367  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaaccta 327  Q
    ||||||||||  | ||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22340366 ccaaaacttataggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtgaaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 22340286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 221
Target Start/End: Original strand, 43242992 - 43243176
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||     
T  43242992 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtgaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatga 43243091  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaat 221  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  43243092 ttttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaagtttattaaaat 43243176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 226
Target Start/End: Original strand, 24617259 - 24617446
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  24617259 tgttttatgttcttgcgtctttttcacatgtttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggct 24617358  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 226  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24617359 ttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24617446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 226
Target Start/End: Original strand, 24713490 - 24713677
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  24713490 tgttttatgttcttgcgtctttttcacatgtttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggct 24713589  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 226  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24713590 ttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24713677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 226
Target Start/End: Original strand, 24746518 - 24746705
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  24746518 tgttttatgttcttgcgtctttttcacatgtttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggct 24746617  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 226  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24746618 ttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24746705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29346654 - 29346456
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  29346654 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtcttttccacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 29346555  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     ||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||  |||| |||| | ||| |||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  29346554 cgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29346456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29349127 - 29348929
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  29349127 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtcttttccacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 29349028  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     ||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||  |||| |||| | ||| |||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  29349027 cgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29348929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29351600 - 29351402
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  29351600 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtcttttccacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 29351501  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     ||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||  |||| |||| | ||| |||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  29351500 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29351402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 226
Target Start/End: Original strand, 24751069 - 24751258
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  24751069 cctgttttatgttcttgcgtctttttcacatgtttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 24751168  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 226  Q
     ||| | |||||||||||||| | ||||||| ||| | |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24751169 cttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24751258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 218
Target Start/End: Original strand, 37804407 - 37804588
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||    
T  37804407 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacatttttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatgttgttagctttccaatgg 37804506  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     ||| |||||||  ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  37804507 ctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 37804588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 169 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22111185 - 22110994
Alignment:
Q  169 ttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   |||    
T  22111185 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctcc 22111086  T
Q  269 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||| ||||| || |  ||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  22111085 aaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttctattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatataacttggtttgacgtgaat 22110994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 226
Target Start/End: Original strand, 24668531 - 24668720
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  24668531 cctgttttatgttcttgcgtctttttcccatgtttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 24668630  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 226  Q
     ||| | |||||||||||||| | ||||||| ||| | |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24668631 cttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24668720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 226
Target Start/End: Original strand, 24738300 - 24738489
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  24738300 cctgttttatgttcttgcgtctttttcacatatttctgctttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 24738399  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 226  Q
     ||| | |||||||||||||| | ||||||| ||| | |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24738400 cttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24738489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 39364058 - 39363941
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  39364058 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattg 39363959  T
Q  120 agttagctttccagtggt 137  Q
     |||||||||||||||||    
T  39363958 tgttagctttccagtggt 39363941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 39245810 - 39245674
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  39245810 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 39245711  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||| |||||||    
T  39245710 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaat 39245674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 264256 - 264403
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  264256 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 264355  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||| |||||   | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  264356 tgttagctttacagtgccgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 264403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20909686 - 20909539
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  20909686 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 20909587  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  20909586 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 20909539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23065188 - 23065051
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  23065188 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttatcttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 23065089  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  23065088 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatg 23065051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17909185 - 17908999
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||    
T  17909185 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttccaatgg 17909086  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 223  Q
     ||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  17909085 ctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggttttaataaaactttacgaaaattc 17908999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 38620110 - 38619973
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||  |||||||||||||||||||||    
T  38620110 gctctctgacagcatgtcatgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtatacatgaaagttgtagataattg 38620011  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
     ||||| ||| ||||||  | |||||||| ||||||||    
T  38620010 tgttagattttcagtggcgtcggtttgacttgaaaatg 38619973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Original strand, 10732446 - 10732626
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  10732446 ctgttccatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 10732545  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||| || ||| ||||||   |||||||   ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10732546 tttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 10732626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 357 - 505
Target Start/End: Original strand, 32608018 - 32608164
Alignment:
Q  357 tgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatag 456  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| | |  |||||||||||    
T  32608018 tgaatgttgttgttgaataatttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaataattttagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag 32608116  T
Q  457 aaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatg 505  Q
     |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  32608117 -aaataatgttgttatatcatccaagtggttattattaatgttgctatg 32608164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Original strand, 42244871 - 42245051
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||     
T  42244871 ctgttccatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttattagctttccaatggc 42244970  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||| || ||| ||||||   |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  42244971 tttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 42245051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 357 - 535
Target Start/End: Original strand, 36509470 - 36509645
Alignment:
Q  357 tgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatag 456  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  |||||||||||    
T  36509470 tgaatgttgttgttgaataatttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaataatttgaggtacatatat-tatgtgaatatcgtatgatatag 36509568  T
Q  457 aaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctg 535  Q
     |||||| ||| ||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||| | | |||||||| || |||| ||||||||    
T  36509569 -aaataacgttattataccatccaagtgattattattaatgttgccatgat-tcaagttgttgtacgttgctgtctctg 36509645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 199 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 30612108 - 30611929
Alignment:
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||  ||| ||||| || |||||| ||| ||| |   ||||||  |||||||| |  ||||||||||||     
T  30612108 tcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttgtaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaaattcaaaacttgt-gtactatgagttg 30612010  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| ||||    
T  30612009 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtgtgacgtgaatatctttgttggatgattt 30611929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 199 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 30614068 - 30613889
Alignment:
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   |  |||  ||||| || |  ||||||||||||     
T  30614068 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctttaaaattcaaagcttgt-gtactatgagttg 30613970  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| ||||    
T  30613969 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtgtgacgtgaatatctttgttggatgattt 30613889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 150
Target Start/End: Original strand, 22367062 - 22367165
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||    
T  22367062 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttg 22367161  T
Q  147 acgt 150  Q
    ||||    
T  22367162 acgt 22367165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12045 - 11903
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||  ||||||||    
T  12045 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttg 11946  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    ||||  ||||| | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  11945 acgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 11903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25426319 - 25426177
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||  ||||||||    
T  25426319 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttg 25426220  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    ||||  ||||| | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  25426219 acgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 25426177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 26749760 - 26749678
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagtt 108  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  26749760 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagtt 26749678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Original strand, 18778573 - 18778715
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||| ||||||||     
T  18778573 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagatttctaatggctttggtttt 18778672  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    ||||  ||||| | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  18778673 acgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 18778715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 258 - 335
Target Start/End: Original strand, 12122077 - 12122154
Alignment:
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12122077 ggaataattctaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtga 12122154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 28901576 - 28901346
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||| | ||  ||||||||||| | |||||| | | | | | |||||||||| || || ||| ||||  | |    
T  28901576 catgaaagttttagataattttgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaag 28901477  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||| || || ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  28901476 tcttggtaaatttttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagttt 28901378  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgt 330  Q
    |||||  | |||  ||||||||||||||||||    
T  28901377 aattaaaaggttggagagtatttaacctatgt 28901346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 28937971 - 28937741
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||| | ||  ||||||||||| | |||||| | | | | | |||||||||| || || ||| ||||  | |    
T  28937971 catgaaagttttagataattttgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaag 28937872  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||| || || ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  28937871 tcttggtaaatttttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagttt 28937773  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgt 330  Q
    |||||  | |||  ||||||||||||||||||    
T  28937772 aattaaaaggttggagagtatttaacctatgt 28937741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 150
Target Start/End: Original strand, 43443976 - 43444079
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| | ||| |||||||||    
T  43443976 gttcttgtgtctttttcatacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttg 43444075  T
Q  147 acgt 150  Q
    ||||    
T  43444076 acgt 43444079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 7425040 - 7424886
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  7425040 tgacagcaccccctgtttcgcgttcttgcatctttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattag 7424941  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgat 180  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||  ||||| | ||| |  |||||||||||||    
T  7424940 ctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgat 7424886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Original strand, 21074176 - 21074318
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||||||| |||||||||  |||||||||| | |||  ||||||||    
T  21074176 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaaaatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcattggtttg 21074275  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    ||||  ||||| | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  21074276 acgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21074318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 440 - 534
Target Start/End: Original strand, 25250632 - 25250725
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctct 534  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25250632 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgatatatcatccaatttgttgttattaatgttgctatgttg-caagttgttttatgttgttgtctct 25250725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 440 - 534
Target Start/End: Original strand, 25314417 - 25314510
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctct 534  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25314417 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgatatatcatccaatttgttgttattaatgttgctatgttg-caagttgttttatgttgttgtctct 25314510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 9776813 - 9776730
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9776813 gttcttccgtctttttcacatgtttctgttttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttc 9776730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19499593 - 19499467
Alignment:
Q  24 tttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagtt 123  Q
    ||||||||||  || ||||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  19499593 tttgacagcatttcttgtttcgcgttcttgtgtctttttcacatatttctgttttgaattagactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 19499494  T
Q  124 agctttccagtggttttggtttgacgt 150  Q
    ||||||| | | | |||||||||||||    
T  19499493 agctttctaatagctttggtttgacgt 19499467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20312662 - 20312556
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || |||||    
T  20312662 gttcgtgcgtctgtttcacacgtttctgttttgagttggtcttcggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttccagtggtcttagtttg 20312563  T
Q  147 acgtgaa 153  Q
    | |||||    
T  20312562 atgtgaa 20312556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 440 - 537
Target Start/End: Original strand, 23200299 - 23200394
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||    
T  23200299 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgctatgttgt-aagatg-tttatgttgttgtctatgct 23200394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Original strand, 27183136 - 27183237
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||    
T  27183136 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaattgacatttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttg 27183235  T
Q  147 ac 148  Q
    ||    
T  27183236 ac 27183237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11342321 - 11342190
Alignment:
Q  58 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||||  ||||| || |||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||  |||||    
T  11342321 tttttcacctgtttccgtgttgaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttgtagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatg 11342222  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
     | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  11342221 atttttagaacttgagatatgattaaattact 11342190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 130
Target Start/End: Original strand, 21933199 - 21933293
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  21933199 tcctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttc 21933293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 130
Target Start/End: Original strand, 21939369 - 21939463
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  21939369 tcctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttc 21939463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 31479069 - 31478801
Alignment:
Q  57 ctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaa 155  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| || |||| |||||||||| |||||||    |||||||||  | ||  ||||||||||| | ||||    
T  31479069 ctttttcacccttttttgttttgaattggacttttggtgtaaacatgaaagttttagataaagatgttagctttataatgactttggtttgacttaaaaa 31478970  T
Q  156 tgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaactt 255  Q
       | ||| | | ||||  ||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  |||||  |    
T  31478969 gaatttttagattttgatttatgatgaaaatactacagt-aggtcttggtgaaattttacgaaaattcagcataaccatttttaagtgaactcaaaagct 31478871  T
Q  256 aaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacct 326  Q
    | ||  |  ||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31478870 atggtttggttccaaaactcaaaacttga-gtactaggagtttaattatgatgtttaagagtatttaacct 31478801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 130
Target Start/End: Original strand, 36990595 - 36990689
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  36990595 tcctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttc 36990689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 458 - 537
Target Start/End: Original strand, 21406443 - 21406521
Alignment:
Q  458 aaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21406443 aaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgctgtctctgct 21406521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 23506645 - 23506542
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | |||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||| | ||  |||||||||    
T  23506645 gttcttgtgtctttttcacacatttctgttttgaatttgccttcggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagttttctaatgactttggtttg 23506546  T
Q  147 acgt 150  Q
    ||||    
T  23506545 acgt 23506542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 24277341 - 24277416
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24277341 tatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttataccattcaagttgttattattaatattgctatgttg 24277416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 24384872 - 24384797
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24384872 tatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttataccattcaagttgttattattaatattgctatgttg 24384797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 26749673 - 26749532
Alignment:
Q  195 gaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatga 294  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  ||| || || || |||||| ||| ||| |   ||||||| ||||| ||    |||||||||    
T  26749673 gaggtcttagcgaaattttatgaaaattccgcataactatttataggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagctttt-gtactatga 26749575  T
Q  295 gttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatg 337  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26749574 gttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgatg 26749532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 35581493 - 35581399
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  35581493 tcctgtttcgcgttcttgcatctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttc 35581399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 21404006 - 21403919
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | || ||| ||||||||||||||    
T  21404006 tttctgatttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttccaatagtcttgctttgacgtgaaaat 21403919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 150
Target Start/End: Original strand, 35791682 - 35791795
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||| | |||||| || ||||| ||  |||||||||||| || | |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||     
T  35791682 cctgtttcacgctcttgcatcgttttcgcatatttctgttttgattttgactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatga 35791781  T
Q  137 ttttggtttgacgt 150  Q
     |||||||||||||    
T  35791782 ctttggtttgacgt 35791795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 146
Target Start/End: Original strand, 1168770 - 1168858
Alignment:
Q  58 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||  |||   |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||    
T  1168770 tttttcacccgtttccgttttgaattgggtttttatgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttg 1168858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 535
Target Start/End: Original strand, 8952787 - 8952885
Alignment:
Q  436 tgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctct 534  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||    
T  8952787 tgtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg-caagttg-cttatgttgttgtctct 8952884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 10953283 - 10953187
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  10953283 gaaaatgtatgatatggaaattattattgtttataccattcaagttgttattgttgatgttgctatgttg-caagatg-tttatgttgttgtctctgct 10953187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 20565762 - 20565701
Alignment:
Q  397 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaa 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||||||    
T  20565762 tgaatgttgttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatagaaa 20565701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 150
Target Start/End: Original strand, 22883893 - 22883974
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgt 150  Q
    ||||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||| ||| |||||  |||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  22883893 tttctgtttcgaattggccttgggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgt 22883974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 449 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 17812698 - 17812638
Alignment:
Q  449 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17812698 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 17812638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 487
Target Start/End: Original strand, 22357664 - 22357747
Alignment:
Q  404 tgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgtt 487  Q
    ||||||||  |||||| || || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22357664 tgttgttggttaatttaagctatatatat-tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatgttgttgtttatatcattcaagttgtt 22357747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 20565762 - 20565713
Alignment:
Q  357 tgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20565762 tgaatgttgttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 20565713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 366 - 406
Target Start/End: Original strand, 21618749 - 21618789
Alignment:
Q  366 ttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  21618749 ttgttggataatttgagataaatatattatgtgaatattgt 21618789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0632 (Bit Score: 363; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0632
Description:

Target: scaffold0632; HSP #1
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 900 - 386
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  900 gctctctgacagcatgccttgtttcatgttcttgcgtctttttcacccgtttttgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 801  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     ||||||||| | |||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  800 tgttagcttttccgtggcttttgtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 701  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| || ||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  700 attcagcataactgtttctaaggtagtccaatatttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtccaactagggtgtttaagagtat 601  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  600 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 501  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  500 gagttacatatatttatatggaaaaggtatgatatagaaaataacgtttttataccattcaagttgttattattaatgatgatatgttgtgaagttgttg 401  T
Q  520 tatgttgttgtctct 534  Q
    || ||||||||||||    
T  400 tacgttgttgtctct 386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 146467 - 145960
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  146467 gctctttgacagcacatcctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgttcctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 146368  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  146367 agtttgctttccagtggctttggtttgacgtgaaaaggatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaa 146268  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146267 attcagaataacagtttctaagttaatccaaaacatatgtaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 146168  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  146167 ttaatctatgttgtgatggatctaa-ttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgattaattt 146069  T
Q  420 gagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttt 519  Q
    ||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| | | | ||||||||     
T  146068 gagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttatatcatccaagtggttattattaatgttgctacggt-tcaagttgttg 145972  T
Q  520 tatgttgttgtc 531  Q
    ||||||||||||    
T  145971 tatgttgttgtc 145960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 45 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21791 - 21501
Alignment:
Q  45 atgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21791 atgttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtt 21692  T
Q  145 tgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagtta 244  Q
    | || |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  21691 taacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatccagcataactgtttctaagtta 21592  T
Q  245 atccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21591 atccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttcacctatgttgtga 21501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 37 - 325
Target Start/End: Original strand, 123894 - 124182
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||    
T  123894 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtgaacatgaaagttgtagataattttgttagcattccaatgg 123993  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||  ||||| |||||||  | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  123994 ctttgaattgacatgaaaataatttttggtttttgagatattatgaaaatactccaatgaggtgttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccattt 124093  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  124094 ctaagtgaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaacc 124182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 111195 - 110907
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  111195 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 111096  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    ||   |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||    
T  111095 actctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 110996  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  110995 ccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 110907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 512
Target Start/End: Original strand, 7802 - 8195
Alignment:
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  7802 agttagctttctagtggctttggttttacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 7901  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7902 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacttcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtat 8001  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaacatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataattt 8101  T
Q  420 gagttacatatatctatgtgg-aaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 512  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8102 gagttacatatatttatgtggaaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 8195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 78799 - 78322
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  78799 gctctctgacagaacgtcctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 78700  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  78699 agttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaa 78600  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||    
T  78599 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgttaaagagtat 78500  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaa---tgttgttgttgaataa 416  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  78499 ttaacctatgttgtgatgaatctaa-ttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgttgaataa 78401  T
Q  417 tttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatg 497  Q
    |||||| ||||||||| |||||| | |  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  78400 tttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatggtatag-aaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatg 78322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 20 - 406
Target Start/End: Original strand, 784 - 1170
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  784 gctctctgacagcacgtcatgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 883  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  884 agttagatttccagtggctttggattgacgtgaaaatgatttttagttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaa 983  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  984 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtat 1083  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1084 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 6)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 32 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 34062 - 33573
Alignment:
Q  32 cacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttcc 131  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34062 cacgtcttgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagcattcc 33963  T
Q  132 agtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgac 231  Q
    ||| | || ||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  33962 agtagcttcggtttgacgtgaaaataaattttggttctcgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataac 33863  T
Q  232 cgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||   ||       ||||||| |||    
T  33862 cgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttcaactagggtg---aa-------taaccta-gtt 33774  T
Q  332 gtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatata 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33773 gtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatacattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagatacatata 33674  T
Q  432 tctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtc 531  Q
    | |||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||| ||||    
T  33673 t-tatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgatgtc 33577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23286 - 22989
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  23286 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcaca-gtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 23188  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||| ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||   || |||    
T  23187 ctttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacatccattt 23088  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23087 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaatgctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtga 22989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 37 - 325
Target Start/End: Original strand, 17591 - 17879
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  17591 cctgtttcgtgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttgatgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 17690  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||| ||||||| |||||||| |  || ||||||||||||  ||||||||||||||||   || |||    
T  17691 ctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatggaaatactctagggatgtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacagccattt 17790  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  17791 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaacc 17879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 288
Target Start/End: Original strand, 22517 - 22765
Alignment:
Q  41 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtttt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||  |||    
T  22517 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagcattccaatgacttt 22616  T
Q  141 ggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactcca-acgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttcta 239  Q
    |||||||| |||||||| | ||| ||| ||||| ||||||| |||||||| |   |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  22617 ggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatggaaatactctaggggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttcta 22716  T
Q  240 agttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagta 288  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22717 agttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagta 22765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 195 - 325
Target Start/End: Original strand, 23382 - 23512
Alignment:
Q  195 gaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatga 294  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  23382 gaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatga 23481  T
Q  295 gttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  23482 gttcaattaaggtgtttaagaatatttaacc 23512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 40138 - 40043
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagata 115  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  40138 gctctctgacagcatgttctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagata 40043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 28 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 932 - 431
Alignment:
Q  28 acagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagct 127  Q
    |||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  932 acagcacgtcctattccatgttcttacctctttttcacacgtttctgttttgagttggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagct 833  T
Q  128 ttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagca 227  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  832 tttcagttgctttggtttgacgtgaaaatgaattttggttctcgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcaaca 733  T
Q  228 tgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaaccta 327  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  732 taaccgtttctaagttaattcaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttcaactagggggtttaagagtatttaaccta 633  T
Q  328 tgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttaca 427  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  632 ttttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattttgtgaatgtt---gttgaataatttgagataca 536  T
Q  428 tatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgt 527  Q
    ||||| |||||| | |  ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||| | | |||||||| ||| |||     
T  535 tatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaataatattgttataccatccaagtggttattattaatgtttctatgat-tcaagttgttgtatattgg 439  T
Q  528 tgtctctg 535  Q
    ||||||||    
T  438 tgtctctg 431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 37 - 406
Target Start/End: Original strand, 14920 - 15289
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14920 cctgtttcaggttattgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 15019  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15020 ctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttt 15119  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15120 ctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 15219  T
Q  337 ggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15220 ggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 15289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 37 - 406
Target Start/End: Original strand, 23978 - 24347
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23978 cctgtttcaggttattgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 24077  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24078 ctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttt 24177  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24178 ctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 24277  T
Q  337 ggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24278 ggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 24347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 3)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 26 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 7704 - 7198
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||| |||||    
T  7704 tgacagcatgtcttgtttcatgttcttgcgtctttttcatacgtttctgttttgaattagcctttcgtgtaaacatcaaagatgtagataattgtgttag 7605  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
     ||| ||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7604 attttcagtggcatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 7505  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||  ||||    
T  7504 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatcaaacc 7405  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagtta 425  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7404 tatgctgtgatgaatctaatttggtctgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagata 7305  T
Q  426 catatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgtt 525  Q
    |||| || |||||| | |  ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||    
T  7304 cataaat-tatgtgaatattgtatgatat-ggaaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgtt 7208  T
Q  526 gttgtctctg 535  Q
    | ||||||||    
T  7207 gctgtctctg 7198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 283 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 11267 - 11018
Alignment:
Q  283 gaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaa 382  Q
    ||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  11267 gaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatagctttgttggataatttgaa 11168  T
Q  383 atacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaag 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  |||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  11167 atacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgacatag-aaataatgttgttataccatcgaag 11070  T
Q  483 ttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctg 535  Q
    | ||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||| | ||||||    
T  11069 tggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgctttctctg 11018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 209
Target Start/End: Original strand, 10251 - 10423
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  10251 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 10350  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaa 209  Q
     ||||||||||| |||||||| | ||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10351 atttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 10423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 26 - 535
Target Start/End: Original strand, 301 - 806
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  301 tgacatcatgtcttgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagccttt-gtataaacatgaaagttgtagataattgtgttag 399  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||| ||  |||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  400 ctttccagtggcatcggtttgacttgaaaaagtattttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 499  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||    
T  500 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactcgaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacc 599  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagtta 425  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  600 tatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatagctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagata 699  T
Q  426 catatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgtt 525  Q
    ||||||| |||||| | |  |||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||    
T  700 catatat-tatgtgaatattgtatgacatag-aaataatgttgttataccatcgaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgtt 796  T
Q  526 gttgtctctg 535  Q
    | | ||||||    
T  797 gctttctctg 806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 26 - 535
Target Start/End: Original strand, 5603 - 6109
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||| |||||    
T  5603 tgacagcatgtcttgtttcatgttcttgcgtctttttcatacgtttctgttttgaattagcctttcgtgtaaacatcaaagatgtagataattgtgttag 5702  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
     ||| ||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5703 attttcagtggcatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 5802  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||  ||||    
T  5803 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatcaaacc 5902  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagtta 425  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5903 tatgctgtgatgaatctaatttggtctgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagata 6002  T
Q  426 catatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgtt 525  Q
    |||| || |||||| | |  ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||    
T  6003 cataaat-tatgtgaatattgtatgatat-ggaaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgtt 6099  T
Q  526 gttgtctctg 535  Q
    | ||||||||    
T  6100 gctgtctctg 6109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3056 - 2759
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  3056 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 2957  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| |||||||| | ||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2956 atttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttt 2857  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||| || |||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  2856 ctaagttaatcc-aagcttatgggataattccaaagctcaaaactagaaatactacgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtga 2759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 152 - 506
Target Start/End: Original strand, 8752 - 9106
Alignment:
Q  152 aaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaa 251  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8752 aaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 8851  T
Q  252 acttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtt 351  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  8852 acttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaaactataatgtgatggatctaatttggtt 8951  T
Q  352 tgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatga 451  Q
    |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8952 tgacgtgaatatctttgttagatagtttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataaattgagttacatatatttatgtggaaaatgtatga 9051  T
Q  452 tatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgt 506  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9052 tatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgt 9106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 187 - 512
Target Start/End: Original strand, 9711 - 10035
Alignment:
Q  187 actccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaag 286  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9711 actccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaag 9810  T
Q  287 tactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatac 386  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9811 tactatgagttcaactagg-tgtttaagagtatttaacctatattgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatac 9909  T
Q  387 atatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgt 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9910 atatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttgtaccattcaagttgt 10009  T
Q  487 tattattaatgatgctatgttgtgaa 512  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  10010 tattattaattatgctatgttgtgaa 10035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 38496 - 38349
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  38496 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 38397  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  38396 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 38349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 20 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 7248 - 6862
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  7248 gctctctgacaacatgtcctttttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 7149  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7148 agttagctctccagtggctttggtttgacgtaaaaatgatttttggttcttgatatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 7049  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  7048 attcagcataactgtttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaagagtttaattaaggggtttaagagtat 6949  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  6948 ttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 6862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 406 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 6902 - 6840
Alignment:
Q  406 ttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 470  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  6902 ttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 6840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 26 - 395
Target Start/End: Original strand, 12988 - 13357
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12988 tgacagcatgtcctatttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttag 13087  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13088 ctttccagtggctttggtgtgacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 13187  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||     
T  13188 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaaca 13287  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattat 395  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13288 tgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattat 13357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 99 - 330
Target Start/End: Original strand, 8046 - 8277
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    ||||||| || |||||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||||| | |||||| | ||| | | | ||||||||||| || ||| ||||  | |    
T  8046 catgaaaattttagataattttgttagccttcctatggatttggtttgacttaaaaatgatgtttagatttagagatatgatggaattaccccaagcaag 8145  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||     
T  8146 tcttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaactcaatccaaaacttatggaatatttccaaaactcaaaactagaaatactaggagttt 8245  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgt 330  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  8246 aattaagaggtttaagagtatttaacgtatgt 8277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 26 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 39828 - 39449
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||   ||||    
T  39828 tgacagcatgccctgtttcatgttcttgcatttttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataatttttttag 39729  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||||| ||  ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39728 ctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagggcttagtgaaatcttatgaaaattcag 39629  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
     || | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39628 gataatcgtttctatgttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgatttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 39529  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttg 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39528 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatatgaatgttg 39449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 3)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 26 - 459
Target Start/End: Original strand, 10252 - 10684
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  | |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  10252 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacccgtttctgttttgaatttgctttaggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 10351  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||||||| | |||||||| || |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10352 ctttccagtagctttggtttaacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcag 10451  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt-aggatgtttaagagtatttaac 324  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||| |||||||||||    
T  10452 cataaacgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttatgagtatttaac 10551  T
Q  325 ctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagtt 424  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  10552 ctacgttgtgatggatctaa-ttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttattgaataatttgagat 10650  T
Q  425 acatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaa 459  Q
    |||||||| |||||| | |  ||||||||||||||    
T  10651 acatatat-tatgtgaatattgtatgatatagaaa 10684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 537
Target Start/End: Original strand, 10695 - 10746
Alignment:
Q  485 gttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10695 gttattattaatgttgctatgat-tgaagttgttgtatgttgttgtctctgct 10746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 147
Target Start/End: Original strand, 19914 - 19967
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttga 147  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19914 gtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctttggtttga 19967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 24 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 120641 - 120270
Alignment:
Q  24 tttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagtt 123  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  120641 tttgacaacatgtcttgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgcttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagtt 120542  T
Q  124 agctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 223  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  120541 agctttccagtggctttagtttgacgcgaaaatgatttttttttcttgagatatgatgaaaatacttcaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 120442  T
Q  224 agcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaa 323  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||    
T  120441 agcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggggtttaagagtatttaa 120342  T
Q  324 cctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattat 395  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  120341 catgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattat 120270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Original strand, 29517 - 29786
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  29517 ctttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgtgtctttgtcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 29616  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    ||| |||||||||| |||| |||||| |||||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29617 tagatttccagtggctttgatttgacttgaaaatcatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 29716  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactat 292  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29717 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactat 29786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 28 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21379 - 21001
Alignment:
Q  28 acagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagct 127  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  21379 acagcatgtcctgtttcttgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaaattgtaggtaattgagttagat 21280  T
Q  128 ttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagca 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21279 ttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcgtgagatatgatgaaaatactccaagtagatcttagtgaaattttatgaaaattcagca 21180  T
Q  228 tgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaaccta 327  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||| |||||||||| |     
T  21179 taaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaatagtatttaacatg 21080  T
Q  328 tgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21079 tgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 21001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 406 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 21041 - 20979
Alignment:
Q  406 ttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 470  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  21041 ttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 20979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 6)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 37 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7937 - 7543
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7937 cctgtttcatgatcttgcatctttttcacatgtttctgttttgaattggccttttgtgcaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgg 7838  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  7837 ctttggtttgatgtgaaaaagatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagaaggtctttgtgtaattttatgaaaattcagcataattgttt 7738  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7737 gtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttagttaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtgat 7638  T
Q  337 ggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatat 432  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  7637 ggatctaa-ttggtttgatgtgaatatctttgttggagaatttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaataatttgaggtacgtatat 7543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 37 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14568 - 14174
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14568 cctgtttcatgatcttgcatctttttcacatgtttctgttttgaattggccttttgtgcaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgg 14469  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  14468 ctttggtttgatgtgaaaaagatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagaaggtctttgtgtaattttatgaaaattcagcataattgttt 14369  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14368 gtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttagttaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtgat 14269  T
Q  337 ggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatat 432  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14268 ggatctaa-ttggtttgatgtgaatatctttgttggagaatttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaataatttgaggtacgtatat 14174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 26644 - 26358
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  26644 cctgttccatgttgttgcgtcttttttatacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 26545  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||||||  ||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  26544 ctttggtttgactagaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccattt 26445  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaa 323  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26444 ctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 26358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 28026 - 27740
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  28026 cctgttccatgttgttgcgtcttttttatacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 27927  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||||||  ||||||| | |||  || ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  27926 ctttggtttgactagaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccattt 27827  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaa 323  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  27826 ctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 27740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 378 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 16630 - 16588
Alignment:
Q  378 ttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttg 420  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16630 ttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaataatttg 16588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 378 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 18650 - 18608
Alignment:
Q  378 ttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttg 420  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18650 ttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaataatttg 18608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 24 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 21799 - 21422
Alignment:
Q  24 tttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagtt 123  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21799 tttgacagcatgttctgtttcatcttcttgcgtcttgttcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagtt 21700  T
Q  124 agctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 223  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21699 agatttccagtggatttggtttgacgtgaaaatgatttttggttattgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttggtgaaattttatgaaaattc 21600  T
Q  224 agcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaa 323  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||||||||    
T  21599 agcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtattaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaa 21500  T
Q  324 cctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaat 401  Q
    | | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21499 catgtgttgtaatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaat 21422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 143345 - 142989
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||    
T  143345 gctctttgacaacacgt---gtttcatgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaagatgaaagttgtagataattg 143249  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  143248 agttagctttccagtggttttagtttgacatgaaaagaatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 143149  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  143148 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtat 143049  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||    
T  143048 ttaacctatgtggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgattt 142989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 297
Target Start/End: Original strand, 169316 - 169591
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||  || |||    
T  169316 gctctctgacaacacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttaacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgta--tagttg 169413  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||    
T  169414 agttagctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaa 169513  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  169514 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 169591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 35 - 404
Target Start/End: Original strand, 186837 - 187206
Alignment:
Q  35 gtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  186837 gtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgatttggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagttttccagt 186936  T
Q  135 ggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgt 234  Q
    || ||||||||||| | |||||  | || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  |    
T  186937 ggctttggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactat 187036  T
Q  235 ttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtg 334  Q
    ||||| || || |||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  187037 ttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtg 187136  T
Q  335 atggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  187137 atggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 187206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 487
Target Start/End: Original strand, 187349 - 187438
Alignment:
Q  397 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgtt 487  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  187349 tgaatattgttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaatattattgtttatatcattcaagttgtt 187438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 366 - 406
Target Start/End: Original strand, 187358 - 187398
Alignment:
Q  366 ttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  187358 ttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 187398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 379
Target Start/End: Original strand, 6913 - 7265
Alignment:
Q  28 acagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagct 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6913 acagcacgtcatgtttcatgttcttgcatttttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagct 7012  T
Q  128 ttccagtgg-ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7013 ttccagtggcttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatattatgaaaatactccaagtagatcttagtgaaattttatgaaaattcagc 7112  T
Q  227 atgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacct 326  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  7113 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacct 7212  T
Q  327 atgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    | || ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||| ||||    
T  7213 acgtggtgatggatctaatttggtttcatgtgaatatccttgttggatgattt 7265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 344
Target Start/End: Original strand, 22108 - 22432
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||| |||||||||||||    
T  22108 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaaattgtagataattg 22207  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22208 agttagctttccagtggctttggtttcacgtgaaaattatttttggttattgagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 22307  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22308 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtat 22407  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaa 344  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  22408 ttaacctatgttgtgaaggatctaa 22432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 94 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 29393 - 29152
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||  || ||||||| | ||| ||| ||||||| | |||||| | ||| ||| || | |||||||||||||||||||     
T  29393 gtaaacataaaagttttagataattttgtaagctttcgaatggctttagtttgacttaaaaatgatttttagtttttaaaatatgatgaaaatactccac 29294  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||   || ||||||||||||| ||||    
T  29293 ggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccatgttaatcaaaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtattatg 29194  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29193 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaagccatgttgtga 29152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 94 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34858 - 34617
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||  || ||||||| | ||| ||| ||||||| | |||||| | ||| ||| || | |||||||||||||||||||     
T  34858 gtaaacataaaagttttagataattttgtaagctttcgaatggctttagtttgacttaaaaatgatttttagtttttaaaatatgatgaaaatactccac 34759  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||   || ||||||||||||| ||||    
T  34758 ggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccatgttaatcaaaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtattatg 34659  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  34658 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaagccatgttgtga 34617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 2)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 24 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 30343 - 29894
Alignment:
Q  24 tttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagtt 123  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  30343 tttgacagaatgttctatttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgtt 30244  T
Q  124 agctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 223  Q
    ||||||||||||   | ||||||||  ||||||| | |||| ||   ||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  30243 agctttccagtgtcgtaggtttgactagaaaatgatttttgatttaggagttatgatgaaaatactacaaggagtacttagtgaaattttatgaaaattc 30144  T
Q  224 agcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaa 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||| |||    
T  30143 agcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaggaaataattccaaacctcaagactagaagtaataggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaa 30044  T
Q  324 cctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaa---tgttgttgttgaataatttg 420  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  30043 cttatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataa-ttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgttgaataatttg 29945  T
Q  421 agttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttata 473  Q
    || ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29944 agatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttata 29894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 156
Target Start/End: Original strand, 6331 - 6388
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    |||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  6331 catgaaagttattgataattgtgttatctttccagtagccttggtttgacgtgaaaat 6388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 3)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 35 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 1431 - 1062
Alignment:
Q  35 gtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1431 gtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgattttgcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagttttccagt 1332  T
Q  135 ggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgt 234  Q
    || ||||||||||| | |||||  | || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  |    
T  1331 ggctttggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactat 1232  T
Q  235 ttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtg 334  Q
    ||||| || || |||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1231 ttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtg 1132  T
Q  335 atggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1131 atggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 1062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 919 - 830
Alignment:
Q  397 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgtt 487  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  919 tgaatattgttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaatattattgtttatatcattcaagttgtt 830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 366 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 910 - 870
Alignment:
Q  366 ttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  910 ttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 59 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 11855 - 11381
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgt 158  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||  | ||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||     
T  11855 ttttcacccttttccgttttgaattttctttttgtgtaagcataaaagttgtagataattaagttagctttccattggctttggtttgacttgaaaatga 11756  T
Q  159 tatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaag 258  Q
    | ||| ||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| || |    
T  11755 tttttagtttttgagttattatcaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatgaaaattcagcacagccgtttctaagttaatccaaaacctagg 11656  T
Q  259 gaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtg 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  11655 gaataattccaaacctcaaaactagaagtattaggagtttaattacggtgtttaagagtatttgacctatgttgtgatggatctaa-ttggtttgacgta 11557  T
Q  359 aatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaa 458  Q
    ||| || ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| |    
T  11556 aatatctttgctagataatttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaataatttgaggtacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-a 11459  T
Q  459 aataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11458 aataatgttgttataccatccaaatggttattattaatgttgctatggt-tcaagttgttgtatgttgttgtctgtgct 11381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 26 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 4149 - 3768
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4149 tgacagcatctcctgtttcatattcttgcatctttttcacacgtttctgttttgagttggcttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 4050  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  4049 ctttccagtggctctggtttgacttgaaaatgacttttggtatttgagatatgatgaaaatactccatggagatcttagtgaaattttatgaaaatttag 3950  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt-aggatgtttaagagtatttaac 324  Q
      | || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||  |||| ||||||||||||    
T  3949 tttaacagtttctaagtcaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactggaagtactaggagtttaattaagggggttttagagtatttaac 3850  T
Q  325 ctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3849 ctatgttgtgatggatctaatttcgtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatattgt 3768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 4)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 2299 - 1958
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| ||    
T  2299 gctctctgacagcacgtcctgcttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctcttttgaattggcctttggtataaacatgaaaattgtagataaatg 2200  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  2199 agttagctttccagtgactttagtttgacgtgaaaataatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 2100  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  2099 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcatacctcaaaactagaagtattatgagttctattagggtatttaagggtat 2000  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  1999 ttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtatgacgtgaat 1958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 80 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5584 - 5413
Alignment:
Q  80 aattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatga 179  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  5584 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattaagttagctttccactgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatga 5485  T
Q  180 tgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaa 251  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5484 tgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 5413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5229 - 5111
Alignment:
Q  243 taatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatct 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5229 taatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatct 5130  T
Q  343 aatttggtttgacgtgaat 361  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  5129 aacttggtatgacgtgaat 5111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 1743 - 1654
Alignment:
Q  397 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  1743 tgaatgttgttgttgaataatttgagatacatata-ctatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaaattgtt 1654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 180 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 22633 - 22322
Alignment:
Q  180 tgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaa 279  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22633 tgaaaatactccaaggaggtcgtagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaa 22534  T
Q  280 ctagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22533 ctagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 22434  T
Q  380 gaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattc 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  22433 gaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttataccatcc 22336  T
Q  480 aagttgttattatt 493  Q
    |||| |||||||||    
T  22335 aagtggttattatt 22322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22762 - 22627
Alignment:
Q  21 ctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattga 120  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||     
T  22762 ctctttgacagcatgtcttgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttgtgtttggaattagcctttggggtaaacatgaaaattgtagataattgt 22663  T
Q  121 gttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||| |||||||    
T  22662 gttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaat 22627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 440 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 23711 - 23618
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctc 533  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23711 gaaaaggtatgatgtagaaaataatgttgttataccatttaagttgttatcattaatgatgctatgttgtgaaattgttgtatgttgttgtctc 23618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 3)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6152 - 5837
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||    
T  6152 gctctctgacagcacgtcctatttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacattaaagttgtagataattg 6053  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | |||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6052 tgttagctttccattggatttggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaa 5953  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  5952 attcagcataaccgtttcaaagtcagtccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtat 5853  T
Q  320 ttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||||||||    
T  5852 ttaacctatgttgtga 5837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 7100 - 7439
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||| || |||||||    
T  7100 gctctctgacagcatgccctatttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttgatgtaaacatgaaagttttatataattg 7199  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||| ||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7200 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataattttttgtt-ttaagttatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 7298  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||| |||| ||  ||||||||| || |||||| ||| ||| |   ||||||  |||||  | |  |||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  7299 attctgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaaattcaaagtttg-tgtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtat 7397  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  7398 ttaacctatgttgtgatgaatataacttggtttgacgtgaat 7439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 440 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 5726 - 5630
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||| ||||||    
T  5726 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatataattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatg-tttatgttgttgtttctgct 5630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 36 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 169157 - 168786
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtg 135  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  169157 tcctatttcatgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgagttggcttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtg 169058  T
Q  136 gttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtt 235  Q
    | ||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| || || || |||    
T  169057 gctttggtttgacctgaaaatgacttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggagatcttagtgaaattttatgaaaatttagtataacagtt 168958  T
Q  236 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt-aggatgtttaagagtatttaacctatgttgtg 334  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||  |||| |||||||||||| |||||||||    
T  168957 tctaagtcaatccaaaacttagggaataattccaaacctctaaactggaagtactaggagtttaattaagggggttttagagtatttaacttatgttgtg 168858  T
Q  335 atggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  168857 atggttctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgttaatattgt 168786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 77422 - 77107
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  77422 gctctttgacagcacatcttgtttcatgttctttcgtctttttcacatgtttctgttttgcattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 77323  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  77322 agttagctttccagtggctttgatttgacgtggaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 77223  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  77222 attcagcataagcgtttctaagttaattcaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtacaatgagttcaattaaggtgtttaagattat 77123  T
Q  320 ttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||||||||    
T  77122 ttaacctatgttgtga 77107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 37 - 333
Target Start/End: Original strand, 152544 - 152840
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  152544 cctgtttcgtgttcttgcgtcttatccacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 152643  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  152644 ttttggtttgacttgaaaatgatatttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaactgttt 152743  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgt 333  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||    
T  152744 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgt 152840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 176500 - 176212
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  | |||||||    
T  176500 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgagttggcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttg 176401  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    ||||||||||  |||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  176400 acgtgaaaataatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaat 176301  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  176300 ccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtga 176212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 169147 - 168859
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  | |||||||    
T  169147 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgagttggcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttg 169048  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    ||||||||||  |||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  169047 acgtgaaaataatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaat 168948  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  168947 ccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggagtttaagagtatttaacctaagttgtga 168859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 126483 - 126142
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||    
T  126483 gctctctgatagcatgtcctgtttcatattcttgcatcttttccacacgtttctgttttgaattggcctttgatgtaaacataaaagttgtagataattg 126384  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  126383 agttagctttccagttgctttggtttaacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 126284  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  126283 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattctaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtat 126184  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  126183 ttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggatgtgaat 126142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 33182 - 32872
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  33182 tgacagcatttcctgttacatgttcttgtgtctttttcacacgtttctattttgaattggcctttggtggaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 33083  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
     ||||  |||| ||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33082 atttcttgtggatttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 32983  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| ||  ||| || || || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32982 cataactttttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 32884  T
Q  326 tatgttgtgatg 337  Q
    |||||| |||||    
T  32883 tatgttatgatg 32872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 26 - 406
Target Start/End: Original strand, 5649 - 6029
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || | | | |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  5649 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtcttttggacacgtttctgttttgaattagcatatggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 5748  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    |||||||||||  | |||||||| | |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5749 ctttccagtggcgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 5848  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||| ||||||||||     
T  5849 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaaca 5948  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5949 tgtgttgtgatggatctaatttggtcggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 6029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 37 - 300
Target Start/End: Original strand, 106537 - 106800
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  106537 cctgttttatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaataggcctttagtgtaaacattaaagttgtagataattgagttagctttccagtga 106636  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
      ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  106637 aattggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttt 106736  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  106737 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 106800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 112
Target Start/End: Original strand, 13307 - 13399
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtag 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||| || |||||||||||    
T  13307 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattagcctttagtgtaaacacgaaagttgtag 13399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 283 - 537
Target Start/End: Original strand, 1 - 255
Alignment:
Q  283 gaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaa 382  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  1 gaagtgctatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgttaatatctttgttggataatttgaa 100  T
Q  383 atacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaag 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  101 atacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatataattttgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaag 200  T
Q  483 ttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  201 ttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgct 255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 30 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8789 - 8484
Alignment:
Q  30 agcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagcttt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8789 agcacgtcctgtttcatgttcttgcgtatttttcacacgtttcggttttgaatttgcctttgttgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagcttt 8690  T
Q  130 ccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatg 229  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| | ||||||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  8689 ccagtggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtgtttgatatatgatgaaaatactccaaggaagtcttggtgaaatcttatgaaaattcagcata 8590  T
Q  230 accgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8589 accgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactacaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatg 8490  T
Q  330 ttgtga 335  Q
    ||||||    
T  8489 ttgtga 8484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 8373 - 8277
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||| ||||||    
T  8373 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatg-tttatgttgttgtttctgct 8277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4766 - 4450
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  4766 ctttgacagcatcccctgtttcacgttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 4667  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4666 tagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 4567  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcca----aacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagta 318  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4566 cagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 4467  T
Q  319 tttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||    
T  4466 tttaacctatgttgtga 4450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4766 - 4450
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  4766 ctttgacagcatcccctgtttcacgttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 4667  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4666 tagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 4567  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcca----aacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagta 318  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4566 cagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 4467  T
Q  319 tttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||    
T  4466 tttaacctatgttgtga 4450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 3999 - 3619
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  3999 tgacagcatatcctgtttcatgttcttgagtctttttcacacgtttctgttttgagttagtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 3900  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||||| | |  | |||||||| | |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3899 ctttccattagagtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 3800  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |  |||||| | ||||||||     
T  3799 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaggactaggagtttaattaaggggtttaacaatatttaaca 3700  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3699 tgtgttgtgatggatctaatttggtcggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 3619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 4)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 175 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 29738 - 29442
Alignment:
Q  175 tatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 274  Q
    ||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29738 tatgatgaaaatactacaaggaatacttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacct 29639  T
Q  275 caaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggat 374  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  29638 caagactagaagtactaagagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 29539  T
Q  375 aatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttata 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29538 aatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttata 29442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Original strand, 133508 - 133796
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||| || || |||||||||  |||||||||||| ||| ||| |||||    
T  133508 gttcttgtgtctttttcacacgtttatgttttgaattggactttggtgtaagcatggaaattttagataattttgttagctttccaatggctttagtttg 133607  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || | |||||| | ||| |||   ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||    
T  133608 actttaaaatgattttttgtttaggagttatgttgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaatttcagcacaaccatttccaagttaat 133707  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  133708 ccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 133796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 70 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 133435 - 133170
Alignment:
Q  70 ttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttct 169  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||| |  ||||| | |||||||      
T  133435 ttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagcttttcaatggctttggtttgacttttaaatgatttttggttta 133336  T
Q  170 tgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcca 269  Q
     ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  133335 ggagttatgatgaaaatactcaaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccattttcaagttaatccaaaacttatgggataattcca 133236  T
Q  270 aacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  133235 aggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaagaggtttaagtgtatttaactcatgttgtga 133170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33946 - 33803
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||| |||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||||    
T  33946 gttcttgtgtctttatcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatggaagttttagataattttgttagatttccaatggctttggtttg 33847  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactc 190  Q
    || | |||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  33846 actttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactc 33803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 3)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 27 - 328
Target Start/End: Original strand, 64393 - 64694
Alignment:
Q  27 gacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagc 126  Q
    |||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  64393 gacagcatctcctattttatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttaga 64492  T
Q  127 tttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 226  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64493 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 64592  T
Q  227 atgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacct 326  Q
    || || |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  64593 ataactgtttctaagttaatccaaaacttgtggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtagttaacct 64692  T
Q  327 at 328  Q
    ||    
T  64693 at 64694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31875 - 31680
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  31875 ctttgacagcattccctgtttcgcgttctttcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 31776  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||| ||||| |||| ||||| || || |||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31775 tagatttccggtggctttgggtttacatgaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 31680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 203 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 31502 - 31386
Alignment:
Q  203 agtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 302  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31502 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaatccttaaaactagaagttctatgagttcaatt 31403  T
Q  303 aggatgtttaagagtat 319  Q
    | | |||||||||||||    
T  31402 aaggtgtttaagagtat 31386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0672 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0672
Description:

Target: scaffold0672; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 37 - 333
Target Start/End: Original strand, 7890 - 8186
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  7890 cctgtttcgtgttcttgcgtcttttagacacgtttctgttttgaattgacctttcgtgtaaacattaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 7989  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7990 ctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgttt 8089  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgt 333  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||| |||||||    
T  8090 ctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttatgattatttaacccatgttgt 8186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 37 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1803 - 1479
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| || |||    
T  1803 cctgttttatgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttacaatgg 1704  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||| || |||||||| | ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||  ||    
T  1703 ctttggtttaacttgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataaccaatt 1604  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1603 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaacaagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 1504  T
Q  337 ggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  1503 gaatctaatttggtttgacgtgaat 1479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 251 - 1
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||     
T  251 gctctctgacagcacatcctgtttcatgttctggagtctttttcaaacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattt 152  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     |||| ||||||| ||| |||||||| ||  ||||||| | ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  151 tgttatctttccaatggctttggtttaactggaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 52  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaa 270  Q
    |||| |||| |||  ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  51 attcggcataaccaattctatgttaatccaaaacttatgggataattccaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1766 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold1766
Description:

Target: scaffold1766; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 297
Target Start/End: Original strand, 1013 - 1288
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||  || |||    
T  1013 gctctctgacaacacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttaacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgta--tagttg 1110  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||    
T  1111 agttagctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaa 1210  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1211 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 1288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 4)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Original strand, 11841 - 12139
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11841 cctgtttcatgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaaattgtagataattgtgttagctttccagtgg 11940  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||| || |||||||| | ||||||  ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  11941 ctttggttttacttgaaaatgatttttggtgtttgaattattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataactgttt 12040  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12041 caaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtaattaacctatgttgtga 12139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 403 - 497
Target Start/End: Original strand, 136323 - 136416
Alignment:
Q  403 ttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatg 497  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  136323 ttgtagttggataatttgagatacatatat-tatgtgaaaattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcattcaagttgttgttattaatg 136416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 537
Target Start/End: Original strand, 12260 - 12347
Alignment:
Q  449 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  12260 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaaattgttattattaatattgctatgttg-caagttg-cttatgttgttgtccctgct 12347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 368 - 400
Target Start/End: Original strand, 136328 - 136360
Alignment:
Q  368 gttggataatttgaaatacatatattatgtgaa 400  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  136328 gttggataatttgagatacatatattatgtgaa 136360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 39 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 713 - 416
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  |    
T  713 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgagttgacctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgact 614  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttct 238  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||    
T  613 ttggtttcacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttct 514  T
Q  239 aagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  513 aagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactttgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttttgat 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 37 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 7851 - 7527
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||| |||| || || |||||||||  |||||||||||| |||    
T  7851 cctgttttatgttcttgcgtctttttcacacgtttatgttatgaattggcctttggtgtaaacatggaaattatagataattttgttagctttccaatgg 7752  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
    ||||| |||||| |||||||  | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  7751 ttttgatttgacttgaaaattatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtcaaatcttatgaaaattcagcataaccattt 7652  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7651 ctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaagctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgtttattagtatttaacctatgttgtgat 7552  T
Q  337 ggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  7551 gaatctaatttggtttgacgtgaat 7527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 37 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21973 - 21677
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||    
T  21973 cctgttttgtgttcttacgtcttttacacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgttgataattttgttagctttccaatgg 21874  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21873 ctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgttt 21774  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgt 333  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||    
T  21773 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgt 21677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6190 - 5878
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  6190 ctttgacagcatcccctatttcgcgttcttgcgtccttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 6091  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6090 tagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 5991  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtattta 322  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5990 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtattta 5891  T
Q  323 acctatgttgtga 335  Q
    || ||||||||||    
T  5890 acatatgttgtga 5878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 144
Target Start/End: Original strand, 60301 - 60408
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  ||||||| || | ||||||||||||||||||| | |||| | || | |||| |||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| |    
T  60301 cctgtttcgcgttcttgtgtttgtttcacacgtttctgttttaagttggtccttggtgtaaacatgaaagttgttgataactgtgttatctttccagtag 60400  T
Q  137 ttttggtt 144  Q
    | ||||||    
T  60401 tcttggtt 60408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1817 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold1817
Description:

Target: scaffold1817; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 307 - 534
Target Start/End: Original strand, 1 - 228
Alignment:
Q  307 tgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 tgtttaagggtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgtaggatcatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 100  T
Q  407 tgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgt 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  101 tgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccatttaagttgttattattaatgatgctatgt 200  T
Q  507 tgtgaagttgttttatgttgttgtctct 534  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  201 tgtgaaattgttgtatgttgttgtctct 228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 104 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1558 - 1283
Alignment:
Q  104 aagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtctta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1558 aagttgtagataattgagttagctttccagtgactttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgggatatgatgaaaatactccaagtaggtctta 1459  T
Q  204 gtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatta 303  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1458 gtgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaatta 1359  T
Q  304 ggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
     |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||    
T  1358 aggggtttaagagtatttaacctatgtggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgattt 1283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 329
Target Start/End: Original strand, 10770 - 11073
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  10770 tgacagcatctcctgttttatgttcttgcgtcttttttacatgtttctgttttgaattgccctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttaa 10869  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10870 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattcag 10969  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
     || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10970 aataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcgaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 11069  T
Q  326 tatg 329  Q
    ||||    
T  11070 tatg 11073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 196 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 17318 - 17223
Alignment:
Q  196 aggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtacta 291  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  17318 aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattttaaatctcaaaactagaagtacta 17223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 366 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16947 - 16913
Alignment:
Q  366 ttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaa 400  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16947 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaa 16913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 39 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3422 - 3129
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||  |    
T  3422 tgtttcgtgttcttgcatcttttacacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgact 3323  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttct 238  Q
    || ||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3322 tttgtttgacttgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttct 3223  T
Q  239 aagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttg 332  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3222 aagttaatccaaaacttatgagataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgttg 3129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 3023 - 2921
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtct 532  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||  |||||||||||||     
T  3023 tatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattactatgttg-caagttg-cttatgttgttgtcc 2926  T
Q  533 ctgct 537  Q
    |||||    
T  2925 ctgct 2921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10953 - 10640
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||| ||||||  |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  10953 cttttacagcatctcctgtttcgcgttcttgcatctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 10854  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    ||||||| |||| | |||||||| || |||||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10853 tagcttttcagtagctttggtttcacttgaaaattatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaagaggacttagtgaaatcttatgaaaatt 10754  T
Q  223 cagcatgacc-gtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtattt 321  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  10753 cagcataaccattttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 10654  T
Q  322 aacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||||||    
T  10653 aacctatgttgtga 10640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 1054 - 738
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtcttttt-cacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataatt 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  1054 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgttttttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatt 955  T
Q  119 gagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||  |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  954 gtgttagctttctagtgggtttggtttgacttgaaaatgatttttggtttctgagttatgatgaaaatact-caatgaggtcttagtgaaattttatgaa 856  T
Q  219 aattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagta 318  Q
    ||||| |||  ||  |||||| || || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| ||    ||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  855 aattccgcagaactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgtactataaattcaattaaggtgtttaagagta 757  T
Q  319 tttaacctatgttgtgatg 337  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  756 tttaacctatgttatgatg 738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 6560 - 6244
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtcttttt-cacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataatt 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  6560 gctctctgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgttttttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatt 6461  T
Q  119 gagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||  |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6460 gtgttagctttctagtgggtttggtttgacttgaaaatgatttttggtttctgagttatgatgaaaatact-caatgaggtcttagtgaaattttatgaa 6362  T
Q  219 aattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagta 318  Q
    ||||| |||  ||  |||||| || || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| ||    ||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  6361 aattccgcagaactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgtactataaattcaattaaggtgtttaagagta 6263  T
Q  319 tttaacctatgttgtgatg 337  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  6262 tttaacctatgttatgatg 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Original strand, 3276 - 3574
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||    
T  3276 cctgtttcgtgttcttgcgtctttttcacacatttctgttttaaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtcaataattgtgttagctttccaatgg 3375  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| |||||||| | |||  |  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  3376 ctttggtttgacttgaaaatgattttttctgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgttt 3475  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3476 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtga 3574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8708 - 8607
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||    
T  8708 gttcttgtgtctttttcacaagtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttg 8609  T
Q  147 ac 148  Q
    ||    
T  8608 ac 8607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 81 - 17
Alignment:
Q  93 ggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  81 ggtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatg 17  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 7)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 58 - 400
Target Start/End: Original strand, 337 - 679
Alignment:
Q  58 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    |||||||| | |||| |||||||| |||  ||| | |||| |||||||||| |||||||||  | |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  337 tttttcacccctttccgttttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgatagctttccaatggttttgctttgacttgaaaatg 436  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||     
T  437 atttttggtttttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttctaagttaatccaaaacttat 536  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  537 ggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttaaattaaggtgtttaagagaatttaatctatgttgtgatggacctaatttggtttgacgt 636  T
Q  358 gaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaa 400  Q
    || | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  637 gagtatctttgttggataatttgagatacatatattatgtgaa 679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 58 - 400
Target Start/End: Original strand, 5641 - 5983
Alignment:
Q  58 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    |||||||| | |||| |||||||| |||  ||| | |||| |||||||||| |||||||||  | |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  5641 tttttcacccctttccgttttgaactgggttttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgatagctttccaatggttttgctttgacttgaaaatg 5740  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||     
T  5741 atttttggtttttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttctaagttaatccaaaacttat 5840  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5841 ggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttaaattaaggtgtttaagagaatttaatctatgttgtgatggacctaatttggtttgacgt 5940  T
Q  358 gaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaa 400  Q
    || | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5941 gagtatctttgttggataatttgagatacatatattatgtgaa 5983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1667 - 1480
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |     
T  1667 ctttgacagcatcccctgttttgcgttcttgcgtctttttcacacgtctctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgc 1568  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1567 tagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaat 1480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 406 - 537
Target Start/End: Original strand, 645 - 773
Alignment:
Q  406 ttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatg 505  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| | |||||||    
T  645 ttgttggataatttgagatacatatat-tatgtg-aaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcatccaagttgtagttattaacgttgctatg 742  T
Q  506 ttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  743 ttg-gaagttgttttatgttgctctctctgct 773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 406 - 537
Target Start/End: Original strand, 5949 - 6077
Alignment:
Q  406 ttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatg 505  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| | |||||||    
T  5949 ttgttggataatttgagatacatatat-tatgtg-aaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcatccaagttgtagttattaacgttgctatg 6046  T
Q  506 ttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  6047 ttg-gaagttgttttatgttgctctctctgct 6077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 440 - 537
Target Start/End: Original strand, 11448 - 11544
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| | || | ||||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  11448 gaaaaagtatgatatagaaaataattttgttgtatcatccaaggttttgtcattaacgttgctatgttg-caatttgttttatgttgttgtctctgct 11544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 147
Target Start/End: Original strand, 11396 - 11449
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttga 147  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11396 gtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttga 11449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0635
Description:

Target: scaffold0635; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 39 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 7600 - 7316
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||     
T  7600 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttctgaattggcctttggtgtaaatatgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggta 7501  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttct 238  Q
    |||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||    
T  7500 ttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccagggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttct 7401  T
Q  239 aagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaa 323  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7400 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 7316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 37 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 9773 - 9449
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  9773 cctgttttatgttcttgcgtcattttcacatgtttctgttttgaattgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 9674  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| ||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||    
T  9673 ctttggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattaagcataactattt 9574  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    |||||||||||||||||||| |  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9573 ctaagttaatccaaaacttatgagacaattccaaggctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgat 9474  T
Q  337 ggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  9473 gaatctaatttggtttgacgtgaat 9449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 335
Target Start/End: Original strand, 22089 - 22401
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   | ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22089 ctttgacagcatcccatgtttcgcgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 22188  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 222  Q
    || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  22189 taactttccagtggattttgtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgacatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaagatt 22288  T
Q  223 cagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtattta 322  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22289 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctaaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtattta 22388  T
Q  323 acctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||    
T  22389 acctatgttgtga 22401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 37 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 967 - 673
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||| | | ||     
T  967 cctgtttcgtgttcttgcgtcttttacacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagcttacgaatga 868  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| ||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  867 ctttggtttgacttgaaactgatatttcgtttttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgttt 768  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||    
T  767 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctccaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacccatgtt 673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Original strand, 18978 - 19276
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| || |||    
T  18978 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttctcacgtttctgttttgaattggcctgtggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttacaatgg 19077  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  19078 ctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactacaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccattt 19177  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19178 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 19276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 508
Target Start/End: Original strand, 19387 - 19456
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  19387 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgtttctatgttg 19456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 41 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 105625 - 105332
Alignment:
Q  41 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtttt 140  Q
    |||| ||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| |||    
T  105625 tttcgtgttcttgcatattttacacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaa-ttgtagataattttgttagctttccaatggcttt 105527  T
Q  141 ggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaa 240  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  105526 ggtttgacttgaaaatgatatttagtttttgagatatgatgaaaatacaccaaggaggtctaagtgaaattttatgaaaattcagcataacagtttctaa 105427  T
Q  241 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  105426 gttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 105332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 94 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 162945 - 162716
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  162945 gtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaa 162846  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  162845 gaaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacatatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatg 162746  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaa 323  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  162745 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 162716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 95085 - 94938
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  95085 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 94986  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggtt 167  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| | |||||||    
T  94985 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtt 94938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 37 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 1422 - 1130
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |    |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1422 cctgtttcgtgttcttgcgtctttttcatatttttctgttttgaattggccctggttgtaaacatgaaagttgtagataattgagtaagatttccagtgg 1323  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| |||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  1322 ctttggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggatatcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagttt 1223  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatg 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  1222 ctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaagatggttaagagtatttaacctatg 1130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 148
Target Start/End: Original strand, 6167 - 6264
Alignment:
Q  51 ttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgac 148  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  6167 ttgcgtcgttttcactcgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttatagataattatgttagctttctaatggctttggtttgac 6264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 173; Significance: 9e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 99 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11353 - 11117
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11353 catgaaagttgtagataattgtgttatctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgacttttggtttttgagatatgatgaaaatacgccaaggagg 11254  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11253 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 11154  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11153 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 11117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 173; Significance: 9e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 99 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27956 - 27676
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||| | | | ||||    
T  27956 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttagtttgaattgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaataattccaggagg 27857  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27856 tcttactgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtac 27757  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  27756 aattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtgatggatccaatttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 27676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 59 - 335
Target Start/End: Original strand, 1465 - 1741
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaa-t 156  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |  |||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  1465 ttttcacccttttctgttttgaatttgt-tttcggtgtaaaaatggaagttgtagataattgagttatctttccagtggctttggtttgacttgaaaaat 1563  T
Q  157 gttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaactta 256  Q
    | | |||  || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1564 gatttttattttttgagatatgatgaaaatactccatggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaactta 1663  T
Q  257 aggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
     ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  1664 tggaataattccaacccccaaaactagaagtactatgagttcaattaaggt-tttaagattatttaacccatgttgtga 1741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 172; Significance: 4e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 59 - 361
Target Start/End: Original strand, 28724 - 29026
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcggg-taagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||    
T  28724 ttttcacccttttatgttttgaatttgc-tttcggtctaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatg 28822  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||     
T  28823 atttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttat 28922  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgt 357  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28923 gggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgt 29022  T
Q  358 gaat 361  Q
    ||||    
T  29023 gaat 29026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10171 - 9997
Alignment:
Q  19 agctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataatt 118  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  10171 agctctctaacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttttgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatt 10072  T
Q  119 gagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
      |||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10071 ttgttagctttccaatgattttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaa 9997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 331
Target Start/End: Original strand, 70166 - 70456
Alignment:
Q  41 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtttt 140  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  70166 tttcatgttctttcgtattttgcacacgtttctgttttgaattggcctttgatgtaaacaagaaagttgtaggtaattgtgttagctttccagtggcttt 70265  T
Q  141 ggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaa 240  Q
     |||||||  ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  70266 agtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaa 70365  T
Q  241 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
    ||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  70366 gttaatcaaaaacttatgagataattccaaaactcaaaactagaagtactataagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 70456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 72107 - 71941
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| || ||||||||    
T  72107 ttttcacccttttctgttttgaatttgc-tttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccaattgctttggtttcacttgaaaatg 72009  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
     | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  72008 atttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcag 71941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 374
Target Start/End: Original strand, 66366 - 66703
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  66366 cctgtttcatgttcttacgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttgatgttaacataaaagttttagataattgtgttagctttccagtgg 66465  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||| |||||| |||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || | ||  |||    
T  66466 ctttgatttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactattt 66565  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    |||||| || |||||||||| ||| |   ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  66566 ctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaagcttcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgat 66665  T
Q  337 ggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggat 374  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  66666 ggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggat 66703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 65582 - 65473
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| | |||| |  ||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |  ||||||||    
T  65582 gttcttgcgtttgtttcatacgtttctgttttgaattagtcttttgtataaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttccagtagccttggtttg 65483  T
Q  147 acgtgaaaat 156  Q
    || |||||||    
T  65482 acatgaaaat 65473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 59669 - 59565
Alignment:
Q  424 tacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatg-ttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttat 522  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||  |||||| |||||    
T  59669 tacatatat-tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttttttatatcattcgagttgttattattaacgttgttatgttg-caagttg-tttat 59573  T
Q  523 gttgttgt 530  Q
    ||||||||    
T  59572 gttgttgt 59565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 75049 - 74940
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  | |||| |  ||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |   |||||||    
T  75049 gttcttgcgtctgtttcatacatttctgttttgaataagtcttttgtataaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttccagtagccgtggtttg 74950  T
Q  147 acgtgaaaat 156  Q
    || |||||||    
T  74949 acatgaaaat 74940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 54
Target Start/End: Original strand, 328614 - 328642
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgc 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  328614 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgc 328642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 4)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13654 - 13366
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  13654 gttcttgcgtctttttcagacgtttctattttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagatatttttgttagctttccaatggatttggtttg 13555  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    || |||||||| | ||   || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13554 acttgaaaatgattttaaatttttgaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaat 13455  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13454 ccaaaacatatgagataattcccaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16419 - 16184
Alignment:
Q  100 atgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggt 199  Q
    ||||||||| |||||| ||  | |||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||| |||||||||||||||||  || |||||    
T  16419 atgaaagttttagatacttttgctagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgcgatatgatgaaaatactttaaggaggt 16320  T
Q  200 cttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttca 299  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16319 cttagtgaaatcttatgaatattcagcataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataattctcaacctcaaaactagaagtactatgagttca 16220  T
Q  300 attaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    || | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16219 atgaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 16184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8870 - 8688
Alignment:
Q  121 gttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaa 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||   || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  8870 gttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgattttaaatttttgaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgtgaaaa 8771  T
Q  221 ttcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatta 303  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8770 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacatatgagataattcccaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatta 8688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 16067 - 16004
Alignment:
Q  446 gtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16067 gtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 16004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 36 - 329
Target Start/End: Original strand, 5000 - 5293
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtg 135  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||   ||| | |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5000 tcctgtttcatattcttgcgtctttttcacacgtttccattttgaactgagttttggtgtaaacatgaaagttgtagataactgtgttagctttccagtg 5099  T
Q  136 gttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtt 235  Q
    | ||||||||||| |||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  5100 gctttggtttgacttgaaaataatttttgatttttgagatatgatgaaaatacttcaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtt 5199  T
Q  236 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatg 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5200 tctaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagttctaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 5293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10418 - 10087
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||| ||||| ||||| |||| |||||    
T  10418 cctgtttcatgttcttgcatctgtttcacacttttctgttttgaattgtcctttggtgtaaacatgaaagttttagaaaattgtgttagatttcaagtgg 10319  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || ||              
T  10318 ttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtg-aattttatgaaaagtccgc---------- 10230  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 336  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  10229 ctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttgagagtatttaacctatgttgtggt 10130  T
Q  337 ggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| ||||    
T  10129 ggatctaacttggtttgacatgaatatctttgttggatgattt 10087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 24 - 335
Target Start/End: Original strand, 9277 - 9588
Alignment:
Q  24 tttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagtt 123  Q
    ||||||||||  || | |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  9277 tttgacagcatttcttatttcgtgttcttgtgtctttttcacacgtctctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgtt 9376  T
Q  124 agctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 223  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  9377 agctttccaatggctttggtttgactggaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgataattc 9476  T
Q  224 agcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaa 323  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  9477 agcacaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtacaattaaggtgtttaagagtatttaa 9576  T
Q  324 cctatgttgtga 335  Q
    || |||||||||    
T  9577 cccatgttgtga 9588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8775 - 8477
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  8775 cctgtttcatgttcttgcgtcttttacacccgtttccgtttcgaactgggttttggtgtaaatatgaaagttgtagataattgcgttagctttccagtgt 8676  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     ||||||||||| |||||||| | |||  || |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  8675 ctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtgttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccattt 8576  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  8575 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaatccatgttgtga 8477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 8374 - 8311
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaat 496  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  8374 tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaat 8311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 337
Target Start/End: Original strand, 65298 - 65614
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  65298 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttctttcgtctttttcacacgtttctgttttgaatttgcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattg 65397  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  65398 tgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaaggagttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 65497  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||| |||| ||  |||||| || || |||||||||| | | |   ||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  65498 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 65596  T
Q  320 ttaacctatgttgtgatg 337  Q
    |||||||||||| |||||    
T  65597 ttaacctatgttatgatg 65614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Original strand, 35937 - 36188
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttc 168  Q
    ||||||||||||||| || ||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | | |||||     
T  35937 tttctgttttgaatttgcttttggtgtaaacgtgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttctggttt 36036  T
Q  169 ttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36037 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 36136  T
Q  269 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatt 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  36137 aaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 36188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 94 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 26176 - 25865
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  26176 gtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaattatttttagtttttgagctatgatgaaaataccccaa 26077  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| || |||||||| | |||     | ||| | |||||||| |  ||||||||    
T  26076 ggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactgatggatcgtcttcaatcttcaaaacttgt-gtactatg 25978  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatatt 393  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25977 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggttttatgtaaatatctttgttggataatttgaaatacatatatt 25878  T
Q  394 atgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||||||||    
T  25877 atgtgaatgttgt 25865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 99 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21389 - 21127
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| | | | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21389 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttggaaatgatttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21290  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21289 tcttagtgaaatcttaagaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattttaattctcaaaactagaagtactatgagttc 21190  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21189 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgagtctaatttggtttgacgtgaat 21127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 41399 - 41298
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||  | |||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||| | ||| ||||| |||    
T  41399 gttcttgtgtctttttcacatgtttctgttttgaactagccttcggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagatttctaatggctttggcttg 41300  T
Q  147 ac 148  Q
    ||    
T  41299 ac 41298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 59 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 712 - 437
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||    
T  712 ttttcacccttttctgttttgaatttgc-tttcggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatg 614  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | ||| ||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  613 atttttagttttttagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttat 514  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||    
T  513 gggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtg-ttaagagtatttaacccatgttgtga 437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 379
Target Start/End: Original strand, 11670 - 12022
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11670 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttctcacgtttctgttttgaattggcctttgatgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 11769  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
     |||||||||| ||||||||    |||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||       
T  11770 atttccagtggctttggttttggttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaagggggtcttagtgaaattttatgaaaatttca 11869  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| ||  |||||| || || | |||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  ||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  11870 cataactatttctaggtcaaccgaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 11968  T
Q  326 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| ||||    
T  11969 tatgttttgatggatctaacttggtttgacatgaatatctttgttggatgattt 12022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 59 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12665 - 12389
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||    
T  12665 ttttcacccttttttgttttgaatttgc-tttcggtgtaatcatgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatg 12567  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | ||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  12566 atttttagtttttgagatatgaagaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttat 12467  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12466 gggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaacccattttgtga 12389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 156
Target Start/End: Original strand, 7896 - 8005
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||| | |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |  ||||||||    
T  7896 gttcttgcgtctttttcacacatttctgttttgattcgacatttggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttccagtagccttggtttg 7995  T
Q  147 acgtgaaaat 156  Q
    ||||||||||    
T  7996 acgtgaaaat 8005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 150 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8122 - 7911
Alignment:
Q  150 tgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatcca 249  Q
    |||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  8122 tgaaaatgatttttgactcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatcca 8023  T
Q  250 aaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttgg 349  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  8022 aaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttgg 7923  T
Q  350 tttgacgtgaat 361  Q
    | ||||||||||    
T  7922 tatgacgtgaat 7911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 189 - 304
Target Start/End: Original strand, 8152 - 8267
Alignment:
Q  189 tccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagta 288  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  8152 tccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtt 8251  T
Q  289 ctatgagttcaattag 304  Q
    ||||||||||||||||    
T  8252 ctatgagttcaattag 8267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 7695 - 7576
Alignment:
Q  397 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaa 495  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||    
T  7695 tgaatgttgttgttgaataattcgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaaattgttgttgttaa 7598  T
Q  496 tgatgctatgttgtgaagttgtt 518  Q
    || || |||| || |||||||||    
T  7597 tgttgttatgatg-gaagttgtt 7576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold1160
Description:

Target: scaffold1160; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 36 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 404 - 104
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtg 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  404 tcctgtttcatgttcttgcgtcttttacacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtacacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtg 305  T
Q  136 gttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtt 235  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||  ||    
T  304 gttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactgtaaggagatcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatt 205  T
Q  236 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||| || || | |||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  204 tctaggtcaacctaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 106  T
Q  336 tg 337  Q
    ||    
T  105 tg 104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 59 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 689 - 413
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || |||||  |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  689 ttttcacccttttctgttttgaatttgc-tttcgatgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggttttggtttgacttgaaaatg 591  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  590 atttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttat 491  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  490 gggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagcatttaacccgtgttgtga 413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18891 - 18559
Alignment:
Q  28 acagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagct 127  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18891 acagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcccacatttctgttttgaattggcctttgctgtaaacatgaaagttgtagatatttgtgttagct 18792  T
Q  128 ttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagca 227  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| |||| | |||| || | ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  18791 ttccagtgactttggtttgacttgataatggtttttgtttttcgagttatgatgaaaatactccaaggaagtcttagagaaatcttatgaaaattctgca 18692  T
Q  228 tgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaaccta 327  Q
    | ||  ||||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  18691 taactatttctaagtcaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacata 18593  T
Q  328 tgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  18592 tgttgtgatgaatctatctcggtttgacgtgaat 18559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 28621 - 28508
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||   |||| |||| | |||    
T  28621 cctgtttcgcgttcttgcgtccttttcacctatttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttttttagttttctaatgg 28522  T
Q  137 ttttggtttgacgt 150  Q
     |||||||||||||    
T  28521 ctttggtttgacgt 28508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 36 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 56695 - 56395
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtg 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  56695 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtataaacattaaagttgtagataattgtgttagctttccattg 56596  T
Q  136 gttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtt 235  Q
    |||||||||| || || ||||| | ||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  ||    
T  56595 gttttggtttaacttgcaaatgatttttggttttggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaattccgcataactatt 56496  T
Q  236 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||| || || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  56495 tctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 56397  T
Q  336 tg 337  Q
    ||    
T  56396 tg 56395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 4)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 99 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 67750 - 67518
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||||||| | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  67750 catgaaagttgtagataattttgttagctttcctatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 67651  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||    
T  67650 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagagaataattccaaatctgaaaactagaagtactaggatttc 67551  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  67550 aattaaggtgtttaagaatatttaacctatgtt 67518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 379
Target Start/End: Original strand, 62404 - 62646
Alignment:
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
    ||||| |||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||    
T  62404 ttttgttttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactattt 62503  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgttta-agagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||| || |||||||||  ||| |   ||||||| || || |  |  |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  62504 ctaagtcaaaccaaaacttgtggattgtctccaaacttctaagcctg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttagggagtatttaacctatgttgtga 62602  T
Q  336 tggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  62603 tggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 62646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 74 - 352
Target Start/End: Original strand, 116776 - 117054
Alignment:
Q  74 gttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgag 173  Q
    ||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| | ||| | | |||||    
T  116776 gttttgaattggcttttggtgtaaacatgaaagtttcagataattgtgttagctttgcagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagattttgag 116875  T
Q  174 atatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacc 273  Q
     ||||| ||||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||   || ||  ||||||||| || |||||||||| ||  |  ||||||||     
T  116876 ttatgaggaaaccattccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattctatataactatttctaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaact 116975  T
Q  274 tcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggttt 352  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||    
T  116976 tcaaaaccagaagtattaggagtttaagtaagaggtttaagagtattaaacctatgtcttgttggatctaacttggttt 117054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 80
Target Start/End: Original strand, 62354 - 62414
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttga 80  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  62354 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtcttttttacacgtttttgttttga 62414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 148; Significance: 7e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 59 - 298
Target Start/End: Original strand, 23560 - 23799
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgt 158  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||     
T  23560 ttttcacccttttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttaaaaatga 23659  T
Q  159 tatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaag 258  Q
    | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  23660 ttttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataagcgtttctaaattaatccaaaacttatg 23759  T
Q  259 gaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23760 ggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 23799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 59 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16269 - 15993
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || | |||| |||| |||||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  16269 ttttcacccttttctgttttgaatttgc-tctcggtgtaaacatgaaagttttagataactttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatg 16171  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | |||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  16170 atttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttat 16071  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16070 gggataattccaaccctcaaaactagaaatactataagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtga 15993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 8549 - 8238
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  8549 tgacagcatctcatgtttcttgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 8450  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttgg-ttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattca 224  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| |||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  8449 ctttccagtggctttgaattgacttgaaaatgatttttggttttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattct 8350  T
Q  225 gcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaac 324  Q
    |||| ||  |||||| || || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  8349 gcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaac 8251  T
Q  325 ctatgttgtgatg 337  Q
    ||||||| |||||    
T  8250 ctatgttatgatg 8238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 339 - 512
Target Start/End: Original strand, 9397 - 9567
Alignment:
Q  339 atctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgt 438  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9397 atctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt---gttgaataatttgagttacatatatttatgt 9493  T
Q  439 ggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9494 ggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatacctttcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 9567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 59 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 82682 - 82407
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||    
T  82682 ttttcacccttttctgttttgaatttgc-tttcggtgtaaagatgaaagttgtagataattaagttagctttccaattgttttggtttcacttgaaaatg 82584  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||     
T  82583 atttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaattcaaaacttat 82484  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    || ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||    
T  82483 gggataataccaaccctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtg-ttaagagtatttaacccatgttgtga 82407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 138; Significance: 7e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 99 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4753 - 4568
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4753 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 4654  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactaga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4653 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactaga 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11773 - 11679
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11773 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 11679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 379
Target Start/End: Original strand, 18451 - 18802
Alignment:
Q  28 acagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagct 127  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||  ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  18451 acagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacaataaagtcgtagacaattgtgttagct 18550  T
Q  128 ttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagca 227  Q
    || ||||||  | ||||||||  ||| ||  | ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18551 ttacagtggcgtcggtttgactcgaatataatttttggtttttgatttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcggca 18650  T
Q  228 tgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgttt-aagagtatttaacct 326  Q
    | ||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| || ||| |    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  18651 taactatttctaagtcaaaccaaaacttatggattgtctccaaacttc-aaagtctgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaaagagtatttaacct 18749  T
Q  327 atgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||||||||| ||||    
T  18750 atgttgtgatggatctaacttggtttaacgtaaatatctttgttggatgattt 18802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 133; Significance: 7e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 47 - 335
Target Start/End: Original strand, 2071 - 2359
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  2071 gttcttgtgtctttttcatacgtttctgtcttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttg 2170  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaat 246  Q
    ||   |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||    
T  2171 actataaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaat 2270  T
Q  247 ccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    | ||||||   || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2271 caaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtga 2359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 5)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21475 - 21288
Alignment:
Q  41 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtttt 140  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||    
T  21475 tttcgtgttcttgcgtcttttacacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggcttt 21376  T
Q  141 ggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcat 228  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21375 ggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcat 21288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 42425 - 42271
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  42425 ctttgacagcattccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcatacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaatatgaaagttgtagataattgtgt 42326  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatat 177  Q
    || || |||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||  |||||||||    
T  42325 tatctatccagtggctttggtttgacatgaaaataatttttggtgtttgagatat 42271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 203 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 39631 - 39515
Alignment:
Q  203 agtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 302  Q
    |||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  39631 agtgaaatcttaagaaaattcaggataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaatttctatgagttcaatt 39532  T
Q  303 aggatgtttaagagtat 319  Q
    | | |||||||||||||    
T  39531 aaggtgtttaagagtat 39515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39855 - 39809
Alignment:
Q  172 agatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  39855 agatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaacttttatgaa 39809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 496
Target Start/End: Original strand, 40960 - 41023
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 496  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  40960 tatgtggaaaatgtatgatatagaaagtatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaat 41023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 62446 - 62137
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||| || |||||    
T  62446 tgacagcatctcctgtttcatgtttttgcatcttcttcacacgtttctgttttgaattggccttt-gtgtagacatgaaagttgtagataactgtgttag 62348  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 225  Q
     ||||| |||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  62347 atttcccgtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 62248  T
Q  226 catgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 325  Q
    ||| ||   ||||| || || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  62247 cataactacttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 62149  T
Q  326 tatgttgtgatg 337  Q
    |||||| |||||    
T  62148 tatgttatgatg 62137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Original strand, 39232 - 39372
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  39232 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgtgtctttgtcatacgtttttgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttag 39331  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggt 166  Q
    ||||||| |||  | |||||||| |||||||| | ||||||    
T  39332 ctttccaatggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 39372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 320
Target Start/End: Original strand, 159341 - 159567
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  | ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  159341 gtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaa 159440  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  159441 ggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattcaaaagctcaaaactagaagtactatg 159540  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatt 320  Q
    |||||||||| | || |||||||||||    
T  159541 agttcaattaaggtgattaagagtatt 159567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Original strand, 82724 - 82843
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |  ||| |||||||||||| |||||||| |||| || |||||| |    
T  82724 cctgtttcgtgttcatgcgtctatttcacacgtttctgttttgagttggtctttggtataaacatgaaagttgttgataattgtgttatctctccagtag 82823  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  82824 ttttggtttgatgtgaaaat 82843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6460 - 6219
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  6460 gtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttgcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaaaactccaa 6361  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6360 gtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttttgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatg 6261  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  6260 agttcaattaaggtgtttaagagtttttaatccatgttgtga 6219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 6116 - 6053
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaat 496  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  6116 tatgtggaaaatgtgtgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaat 6053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 59 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13029 - 12769
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || |||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||||    
T  13029 ttttcacccttttctgttttgaatttgc-tttcggtgtaaacataaaagttgtagatagctgagttagctt-ctagtggctttggttttacttgaaaatg 12932  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | | | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||     
T  12931 atttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttat 12832  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatt 320  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  12831 ggaataattccaatccataaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 12769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 4)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 101 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 51612 - 51378
Alignment:
Q  101 tgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtc 200  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  51612 tgaaagttttagataattttgttagctttccagtggatttggtctgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatcaaaatactccaagtaggtc 51513  T
Q  201 ttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51512 ttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttaaa 51413  T
Q  301 ttaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
     || | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  51412 ataaggtgtttaagagtatttaatcaatgttgtga 51378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 414 - 534
Target Start/End: Original strand, 47280 - 47399
Alignment:
Q  414 taatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 513  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47280 taatttgggttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaa-aatgttgttataccattcaagttgttataattaatgatgctatgttgtgaag 47378  T
Q  514 ttgttttatgttgttgtctct 534  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  47379 ttgttgtatgttgttgtctct 47399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 67315 - 67187
Alignment:
Q  108 tgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtga 207  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  67315 tgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtga 67216  T
Q  208 aattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  67215 aattttatgaaaattcagcataaccgttt 67187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 440 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 28589 - 28493
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  28589 gaaaatgtatgatacagaaactaatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgtgactatgctg-caagttgttttatgttgctatctctgct 28493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 330
Target Start/End: Original strand, 11552 - 11844
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11552 cctgtttcgcgttcttgcgtctttgtcacacatttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagtttaagataattgtgttagctttccagtgg 11651  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgttt 236  Q
     |||||||| |  |||||||| | ||| | | ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||  |||| ||  |||    
T  11652 atttggtttaatttgaaaatgatttttagattttgagttatgatggaaatactccaaggcggtcttggtaaaattttatgaaaatttcgcataactattt 11751  T
Q  237 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgt 330  Q
    |||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  11752 ctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaga-ggttaagagtatttaacctatgt 11844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8690 - 8495
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  8690 ctttgacagcatcccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgt 8591  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8590 tagctttccagtggctttggtttgaattgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaataatccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 8495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6686 - 6449
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||  || |||||||  |||||||    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6686 gtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgacttcggtttgaattgaaaattagttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaa 6587  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     |||||||||||||||| ||| |||||||||| || | | ||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6586 ggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataatcatttataagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatg 6487  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 331  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6486 agttcaattagggtgtttaagagtgtttaacctatgtt 6449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 169 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16523 - 16332
Alignment:
Q  169 ttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 268  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   |||    
T  16523 ttgagttatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattttctcc 16424  T
Q  269 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||| |||||  |  | |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16423 aaacttcaaagatc-atgtactatgagttcaattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaat 16332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 2013 - 2088
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttat-accattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2013 tatgtggaaaatgtatgagatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 2088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 24380 - 24579
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  24380 gctctctgacagcatgctctgtttcatgttcttgcgtctttttcacccgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 24479  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24480 tgttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaa 24579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 337
Target Start/End: Original strand, 24586 - 24637
Alignment:
Q  286 gtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatg 337  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24586 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgatg 24637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2604 - 2403
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||     
T  2604 ctgttttatgttcttgcgtccttttcacacgtttctgttttgaattggcctttagtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttag-tttccaatggc 2506  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttc 237  Q
    ||||||| ||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2505 tttggttagacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactacaaagaggtcttagtgaagttttatgaaaattcagcataaccgtttc 2406  T
Q  238 taa 240  Q
    |||    
T  2405 taa 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 111 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 138419 - 138195
Alignment:
Q  111 agataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||     
T  138419 agataatttagttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttcgtgaaac 138320  T
Q  211 tttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtt 310  Q
     ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  138319 cttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgtgataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtt 138220  T
Q  311 taagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    || |||||||||| | |||||||||    
T  138219 tacgagtatttaatccatgttgtga 138195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 6851 - 6770
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgt 150  Q
    ||||| |||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  6851 tttctattttgatttggactttttggtaaacatgaaagttgtagacaattatgttagctatcttttggttttggtttgacgt 6770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 116; Significance: 9e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 19579 - 19774
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  19579 ctttgacagcattccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacgcgtttctgttttgaattggcctttggtgtaagcatgaaaattgtagataattgtgt 19678  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19679 tagctttccattggctttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 19774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 196 - 319
Target Start/End: Original strand, 19945 - 20068
Alignment:
Q  196 aggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgag 295  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19945 aggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgag 20044  T
Q  296 ttcaattaggatgtttaagagtat 319  Q
    |||||||| | |||||||||||||    
T  20045 ttcaattaaggtgtttaagagtat 20068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3681 - 3500
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  3681 cctgtttcacgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcatttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgg 3582  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3581 ctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatgacgaaaataatccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Original strand, 7937 - 8173
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||   |||| |||||||  ||||||||||||    
T  7937 gctctctgatagcatgtcctgtttcatgttcttgtttctttttcacacgtttttgttttaaattggcctttgatgtaaacatgaaaactgtagataattg 8036  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8037 tgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgaagaaaataccacaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 8136  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaactta 256  Q
    |||| |||| ||  ||||| ||| || ||||||||||    
T  8137 attccgcataactatttcttagtcaacccaaaactta 8173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34921 - 34661
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||  || || || |||||||||||||||||||    
T  34921 gtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttttttttttagttatgatgaaaatactccaa 34822  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||  ||||||    || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  ||||||||    
T  34821 ggaggtcttagtgaaattttatgaaaataccgcataactatttcta----aacccaaaacttatggattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatg 34727  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtga 359  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  34726 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctatcttggtttgacgtga 34661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 361
Target Start/End: Original strand, 7211 - 7511
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgg-gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||| | ||||||| |||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  7211 ttttcacccttttttgttttgaatttg-ctttcggtgtaaacatgaatgttttagataattgtgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaatt 7309  T
Q  158 ttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaa 257  Q
     | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||  ||||||||| || || |||||||     
T  7310 atttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaagtttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaacttat 7409  T
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgt 357  Q
    || ||  |  ||||| ||||| || |  ||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  7410 gg-attgtctcaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctaagttgtgatgaatctaacttggtttgacgt 7507  T
Q  358 gaat 361  Q
    ||||    
T  7508 gaat 7511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14604 - 14424
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  14604 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 14505  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||| || ||  || |||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14504 tttagtgtggagtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 14424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18325 - 18130
Alignment:
Q  23 ctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagt 122  Q
    |||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  18325 ctttgacagcattccctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcttttggtgtaaacgtgaaagttgtagataattgtgt 18226  T
Q  123 tagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18225 tagctttccagtggcttttgtttgacatgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 18130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 203 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 17952 - 17836
Alignment:
Q  203 agtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 302  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17952 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtttatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactataagttctatgagttcaatt 17853  T
Q  303 aggatgtttaagagtat 319  Q
    | |||||||||||||||    
T  17852 aagatgtttaagagtat 17836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 60 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 197 - 1
Alignment:
Q  60 tttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgtt 159  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |    
T  197 tttcacccttttctgttttgaatttgctttccgtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgat 98  T
Q  160 atttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaactta 256  Q
     ||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  97 ttttagtttttgagatatgatggaaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaactta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33819 - 33648
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  33819 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacaggaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgactttggtttg 33720  T
Q  147 acgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    || ||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  33719 acttgaaaatgagttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccgaggaggtcttagtgaatttttatgaa 33648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 204 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33469 - 33338
Alignment:
Q  204 gtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatta 303  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33469 gtgaaatcttatgaaaattcagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaacctcaaaactagaagcactatgagttcaatta 33370  T
Q  304 ggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33369 aggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 33338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 99 - 337
Target Start/End: Original strand, 18050 - 18287
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  18050 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaatcatgttttgtttttgagttatgatgaaaatactccaagcagg 18149  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||| || || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||| || |  ||| |||||||||    
T  18150 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttc 18248  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatg 337  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18249 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgatg 18287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 78
Target Start/End: Original strand, 17994 - 18046
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgtttt 78  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17994 tgacagcatctcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacatgtttccgtttt 18046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 379
Target Start/End: Original strand, 35859 - 36192
Alignment:
Q  45 atgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtt 144  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||| |||||||||  | |||||||||| ||  ||  |||    
T  35859 atgttcttgtgtcttttttacacgtttctgttttgaattggcctttgatgtaaacatgaaagttttagataattttgctagctttccaatgacttcagtt 35958  T
Q  145 tgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagtta 244  Q
    | || |||||||| | ||| | | || || |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||  ||||||||| |    
T  35959 ttacttgaaaatgattttttgctttttagttatgatgaaaatactcaaaggatgtcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttctaagtca 36058  T
Q  245 atccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaa 344  Q
    |  ||||||||| | | |   ||||||| ||||| || |  |||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36059 actcaaaacttatgtattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaa 36157  T
Q  345 tttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
     || ||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  36158 ctttgtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 36192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 106; Significance: 9e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 346 - 535
Target Start/End: Original strand, 15152 - 15338
Alignment:
Q  346 ttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaag 445  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |      
T  15152 ttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagatacatatat-tatgtgaatatt 15250  T
Q  446 gtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctg 535  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||    
T  15251 gtatgatatag-aaataatgtttttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgatgtctctg 15338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11257 - 11101
Alignment:
Q  143 tttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagt 242  Q
    |||||| |||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11257 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgatatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagt 11158  T
Q  243 taatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttca 299  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11157 taatctaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttca 11101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 404 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 11022 - 10891
Alignment:
Q  404 tgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 502  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |  ||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  11022 tgttgttggttaatttgagttacatatat-tatgtggaaaatgtatgatatatatgatattgttctttatatcattcaagttgttattattaatgtttct 10924  T
Q  503 atgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  10923 atgttg-caagttg-tctatgttgttgtctctgct 10891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 11304 - 11255
Alignment:
Q  41 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggccttt 90  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11304 tttcgtgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaactggccttt 11255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 75 - 329
Target Start/End: Original strand, 13144 - 13402
Alignment:
Q  75 ttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttattt-ggttct---t 170  Q
    |||||||||||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |   |    
T  13144 ttttgaattggcttttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatatttaggttgtgagt 13243  T
Q  171 gagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaa 270  Q
    ||| ||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| || |||||||||| ||| |  | ||||    
T  13244 gagttatgatgaaaacactcgaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgttcccaa 13343  T
Q  271 acctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatg 329  Q
    || ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  13344 acttcaaaactataagtattacgagtttaattaagaggtttaagagtatttaacatatg 13402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 196 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21200 - 21061
Alignment:
Q  196 aggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgag 295  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21200 aggtctcagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgag 21101  T
Q  296 ttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    |||||||| |   |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21100 ttcaattaagggttttaagagcatttaacctatgttgtga 21061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 20958 - 20862
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||| ||||||    
T  20958 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatg-tttatgttgttgtttctgct 20862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 100 - 330
Target Start/End: Original strand, 747 - 977
Alignment:
Q  100 atgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggt 199  Q
    ||||||||| ||  |||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| | ||||| | ||||||||||||| || ||| ||||  | ||    
T  747 atgaaagttttaattaattttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttggattttgagatatgatggaattaccccaagcaagt 846  T
Q  200 cttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttca 299  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  847 cttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatacaaaacttatagaatatttccaaacctcgaaactagaagtactaggagttta 946  T
Q  300 attaggatgtttaagagtatttaacctatgt 330  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  947 attaagaggtttaagagtatttaacctatgt 977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 88 - 330
Target Start/End: Original strand, 11592 - 11833
Alignment:
Q  88 tttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaata 187  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| | | | | | |||||||||| || || ||    
T  11592 tttcgtgtaaacatgaaagttctagataatttagttagctttccaatgggtttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaatta 11691  T
Q  188 ctccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagt 287  Q
      ||||  ||||||| || || ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11692 acccaagcaggtcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagt 11791  T
Q  288 actatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgt 330  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  11792 actaggagtttaattaagaggtttaagagt-tttaacctatgt 11833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11964 - 11766
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||     
T  11964 gctctctgacagcatgttctgtttcatgttcttgcgtctttttcacatgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattt 11865  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||   || || ||| | |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11864 tgttagctttccaatggctttggtttagagtaaacatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 11766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2015 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold2015
Description:

Target: scaffold2015; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 221
Target Start/End: Original strand, 17 - 201
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||     
T  17 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttgatgtgaacatgaaagtcgtagataattttgttagctttccaatga 116  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaat 221  Q
     ||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||| ||||| |||||    
T  117 ctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagaacttaatgaaaatttattaaaat 201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 241 - 361
Target Start/End: Original strand, 3059 - 3179
Alignment:
Q  241 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggat 340  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3059 gttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaat 3158  T
Q  341 ctaatttggtttgacgtgaat 361  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  3159 ctaacttggtttgacgtgaat 3179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 243
Target Start/End: Original strand, 2409 - 2593
Alignment:
Q  59 ttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgt 158  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||     
T  2409 ttttcacccttttctgttttgaatttgcttttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccagttgctttgatttgacttgaaaatga 2508  T
Q  159 tatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagtt 243  Q
    | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  2509 tttttggtttttgagttatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagtt 2593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14067 - 13909
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  14067 gctctctgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 13968  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatg 178  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||   ||||||| ||||| ||||    
T  13967 tgttagctttccagtggaatcggtttgacttgaaaatgagttttggtttttgagttatg 13909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6615 - 6423
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttag 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6615 tgacagcatgtcctgtttcatgttcttgcatctttttcatacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgcagataattgtgttag 6516  T
Q  126 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||||||||  | ||| |||| |||||||| | |||||||   ||| ||||||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||||||    
T  6515 ctttccagtggcgtcggtgtgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgcaaatactcaaaggaggtcttaatgaatttttatgaa 6423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 94 - 330
Target Start/End: Original strand, 2171 - 2406
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| | | |||||| | | | | | |||||||||| || || ||| ||||    
T  2171 gtaaacatgaaagttttagataatttagttagatttccaatggttttggtttgccttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaa 2270  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
      ||||||| || || ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  2271 gtaggtcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagaactagg 2370  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgt 330  Q
    |||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  2371 agtttaattaagaggtttaagagt-tttaacctatgt 2406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 330
Target Start/End: Original strand, 10426 - 10661
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| | | |||||| | | | | | |||||||||| || || ||| ||||    
T  10426 gtaaacatgaaagttttagataatttagttagatttccaatggttttggtttgccttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaa 10525  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
      ||||||| || || ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  10526 gtaggtcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagaactagg 10625  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgt 330  Q
    |||| ||||| || |||| ||||| ||||||||||||    
T  10626 agtttaattaagaggtttgagagt-tttaacctatgt 10661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 415 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 562 - 444
Alignment:
Q  415 aatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgt-tataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 513  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| |||  |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||    
T  562 aatttgagctacatatat-tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattattgtgtatatcatctaagttgttattattcatgttgctacgttgt-aag 465  T
Q  514 ttgttttatgttgttgtctct 534  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  464 ttgttttatgttgttgtctct 444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 415 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 8817 - 8699
Alignment:
Q  415 aatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgt-tataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 513  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| |||  |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||    
T  8817 aatttgagctacatatat-tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattattgtgtatatcatctaagttgttattattcatgttgctacgttgt-aag 8720  T
Q  514 ttgttttatgttgttgtctct 534  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8719 ttgttttatgttgttgtctct 8699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21405 - 21225
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  21405 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 21306  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21305 tttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 21225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 183
Target Start/End: Original strand, 174482 - 174628
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  174482 cctgttttatgttcttgcatttttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgcgttagccttccagtgg 174581  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaa 183  Q
     ||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| ||||||||||    
T  174582 ctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgatatatgatgaa 174628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8162 - 7931
Alignment:
Q  99 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagg 198  Q
    ||||||| || |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| | | | | | ||||||||||||| || ||| ||||  | |    
T  8162 catgaaaattttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttgtagattttgagatatgatggaattaccccaagaaag 8063  T
Q  199 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 298  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || | |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  8062 tcttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacatatgaaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 7963  T
Q  299 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgt 330  Q
    ||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  7962 aattaagaggtttgagaatatttaacctatgt 7931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9898 - 9718
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  9898 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccattttgaactgggttttggtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 9799  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    |||||||||  || |||||  |||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  9798 tttggtttggagtaaaaattatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 9718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 41074 - 40916
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  41074 gctctctgacagcatgtcctgtttcgtgttcttgcgtctttttcatacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattg 40975  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatg 178  Q
     ||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||| | || |||| ||||| ||||    
T  40974 tgttagctttacagtggcatcggtttgacttgaaaatgattttcggtttttgagttatg 40916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 38007 - 37900
Alignment:
Q  41 tttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtttt 140  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||| |||    
T  38007 tttcgtgttcttgtgtctttttcacacgtttctactttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggcttt 37908  T
Q  141 ggtttgac 148  Q
    ||||||||    
T  37907 ggtttgac 37900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 246 - 379
Target Start/End: Original strand, 2377 - 2510
Alignment:
Q  246 tccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaat 345  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  2377 tccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctaaatggtgatggatctaat 2476  T
Q  346 ttggtttgacgtgaatgtcattgttggataattt 379  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||| ||||    
T  2477 ttggtttgatgtgaatatccttgttggatgattt 2510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 208
Target Start/End: Original strand, 16324 - 16493
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||| | |||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||| |    
T  16324 tgtttcatgttcttgtgtttttttcacaggtttatcttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagatttccaatggct 16423  T
Q  139 ttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaa 208  Q
    |||||||||| | |||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16424 ttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaa 16493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 258 - 379
Target Start/End: Original strand, 16525 - 16646
Alignment:
Q  258 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgt 357  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| |   ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16525 ggaataattcaaaacctcaaaactataagtactaggaatttaattaagggttttaaaaatatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgt 16624  T
Q  358 gaatgtcattgttggataattt 379  Q
    |||| || ||||||||| ||||    
T  16625 gaatatctttgttggatgattt 16646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 103 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 888 - 767
Alignment:
Q  103 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtctt 202  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  888 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 789  T
Q  203 agtgaaattttatgaaaattca 224  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  788 agtgacattttatgaaaattca 767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 46 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9749 - 9606
Alignment:
Q  46 tgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggttt 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||    
T  9749 tgttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggttt 9650  T
Q  146 gacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
    |||   |||||| | |||||||   ||| |||||||||||||||    
T  9649 gactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatact 9606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1278 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1278
Description:

Target: scaffold1278; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 51 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 1157 - 857
Alignment:
Q  51 ttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgt 150  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||| |||||||||| || ||||||| ||||| |||  | || |||| ||||||| |    
T  1157 ttgcgtcttcttcacacatttctgctttgaattggcgtttggtgtaaacatgaaagttttatataattgtgttagatttataatgattttagtttgactt 1058  T
Q  151 gaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaa 250  Q
    ||||||| | |||   | || || |||||||||||||||||||   ||||||||  ||| ||||  |||||||||||| ||| ||||| ||| || ||||    
T  1057 gaaaatgatttttatattttaagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttaggaaaactttacaaaaattcagcataaccatttcttagtcaacccaa 958  T
Q  251 aacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggt 350  Q
    | |||| ||  |  ||||||||  |||||||  | ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  957 agcttatggtttgtttccaaactccaaaactt-atgtactttgagttcaattaaggtgtttaagggtatttaacctatgatatgatggatctaacttggt 859  T
Q  351 tt 352  Q
    ||    
T  858 tt 857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 233 - 53
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| | ||||  ||  |||||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  233 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttccgttttgaactggg-tttggtgtaaaaatagaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 135  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaa-tgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||||||||| ||| |||| || | |||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  134 tttggtttggcgtaaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 53  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 352
Target Start/End: Original strand, 20391 - 20723
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattg 119  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||| |||||||||| ||||||||||    
T  20391 gctctctgacagcataccctgtttcgcgttctcgcgtttttttcacacgtttctgttttgaattggattttggtgtaaacatgaaagttttagataattg 20490  T
Q  120 agttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaa 219  Q
     |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||| | | ||||| ||||| | |||||||||||  ||||||| | ||||||||| | ||    
T  20491 tgttagtgttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgacggaaatactccaagtaggtcttggagaaattttaaggaa 20590  T
Q  220 attcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtacta-tgagttcaattaggatgtttaagagta 318  Q
    | | ||||| ||  |||| |||| || || ||||||| ||  |  |||||||| ||||||||   |||| ||  | ||| ||||| | | || |||||||    
T  20591 acttagcataactatttccaagtcaacccgaaacttatggtttgtttccaaacttcaaaact-ttagtattacggggttaaattaaggttttaaagagta 20689  T
Q  319 tttaacctatgttgtgatggatctaatttggttt 352  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  20690 tttaaccaatgttgtgatggatctgacttggttt 20723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 15673 - 15588
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttcca 132  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||    ||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  15673 gttcttgcgtctgtttcatacgtttctgttttgaattagtcttttatataaacatgaaagttgtttataattgtgttatctttcca 15588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 4593 - 4508
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttcca 132  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| | |||| |  ||| ||| |||||| | |||||||| |||| |||||||    
T  4593 gttcttgcgtctgtttcatacgtttatgttttgaattagtcttttgtataaacataaaagttcttgataattgtgttatctttcca 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 10714 - 10629
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttcca 132  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| | |||| |  ||| ||| |||||| | |||||||| |||| |||||||    
T  10714 gttcttgcgtctgtttcatacgtttatgttttgaattagtcttttgtataaacataaaagttcttgataattgtgttatctttcca 10629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Original strand, 1025 - 1173
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||| |||||||||   ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1025 gtaaacatgaaagttttagataatttttttatctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaa 1124  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagt 242  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  1125 gtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagt 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 261 - 335
Target Start/End: Original strand, 1373 - 1447
Alignment:
Q  261 ataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1373 ataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtga 1447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 496
Target Start/End: Original strand, 1550 - 1613
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaat 496  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  1550 tatgtggaaaatgtttgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaat 1613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 32904 - 32671
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaa 193  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||| | |||||| | | | | | || |||||||||| || ||| ||||    
T  32904 gtaaccatgaaagttttagataattttgttatctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttctagatttttagatatgatggaattaccccaa 32805  T
Q  194 cgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatgaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatg 293  Q
      | |||||  | || ||||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32804 gcaagtcttgataaatttttatgaaaatt-agcataatcgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactagg 32706  T
Q  294 agttcaattaggatgtttaagagtatttaacctat 328  Q
    |||| ||||| || |||  ||||||||||||||||    
T  32705 agtttaattaagaagttggagagtatttaacctat 32671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0577
Description:

Target: scaffold0577; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 6165 - 6078
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagtta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  6165 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattgacctttggtgtaaacatgaaagttttagataattgtgtta 6078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 110
Target Start/End: Original strand, 11591 - 11681
Alignment:
Q  20 gctctttgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgt 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||| ||||||||    
T  11591 gctctctgacagcacgtcctgtttcacgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattagcctttggtgtaaacatcaaagttgt 11681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 404 - 508
Target Start/End: Original strand, 34097 - 34201
Alignment:
Q  404 tgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 502  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34097 tgttgttggttaatttgagttacatatat-tatgtggaaaatgtatgatatagaagatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgct 34195  T
Q  503 atgttg 508  Q
    ||||||    
T  34196 atgttg 34201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 134867 - 134687
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  134867 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacatgtttccgttttgaactgggttttagtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 134768  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatt-tggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||| ||||  ||| ||||| || || | |||   ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  134767 tttcgttttgcgt-aaaatatttttatagtttaggagttatgatgacaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 134687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 137336 - 137156
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  137336 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacatgtttccgttttgaactgggttttagtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 137237  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatt-tggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||| ||||  ||| ||||| || || | |||   ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  137236 tttcgttttgcgt-aaaatatttttatagtttaggagttatgatgacaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 137156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 139805 - 139625
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  139805 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacatgtttccgttttgaactgggttttagtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 139706  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatt-tggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||| ||||  ||| ||||| || || | |||   ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  139705 tttcgttttgcgt-aaaatatttttatagtttaggagttatgatgacaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 139625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 142274 - 142094
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  142274 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacatgtttccgttttgaactgggttttagtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 142175  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatt-tggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||| ||||  ||| ||||| || || | |||   ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  142174 tttcgttttgcgt-aaaatatttttatagtttaggagttatgatgacaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 142094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 144743 - 144563
Alignment:
Q  38 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  144743 ctgtttcatgttcttgcgtctttttcacatgtttccgttttgaactgggttttagtgtaaaaatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggc 144644  T
Q  138 tttggtttgacgtgaaaatgttatt-tggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaa 218  Q
    ||| ||||  ||| ||||| || || | |||   ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  144643 tttcgttttgcgt-aaaatatttttatagtttaggagttatgatgacaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 144563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 401
Target Start/End: Original strand, 3797 - 3832
Alignment:
Q  366 ttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaat 401  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3797 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaat 3832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 406 - 444
Target Start/End: Original strand, 63835 - 63873
Alignment:
Q  406 ttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  63835 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtgaaaaa 63873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 311 - 403
Target Start/End: Original strand, 7115 - 7207
Alignment:
Q  311 taagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7115 taagagtatttaacctatgttgtgataaatctcatttggattgacatgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatatgaatgt 7207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 1517 - 1414
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||    
T  1517 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggccttcggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttg 1418  T
Q  147 acgt 150  Q
    ||||    
T  1417 acgt 1414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 867 - 764
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||| ||    
T  867 gttcttgtgtctttttcacacgtttctgttttgaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattacgttagctttctaatggctttggtctg 768  T
Q  147 acgt 150  Q
    ||||    
T  767 acgt 764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 228
Target Start/End: Original strand, 7784 - 7902
Alignment:
Q  110 tagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaa 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||| | |||||||   ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7784 tagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgaattaaaaatgatttttggtttgagagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 7883  T
Q  210 ttttatgaaaattcagcat 228  Q
    ||||| |||||||| ||||    
T  7884 ttttacgaaaattccgcat 7902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 286 - 352
Target Start/End: Original strand, 7929 - 7995
Alignment:
Q  286 gtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggttt 352  Q
    |||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  7929 gtactatgagtttaattaaggtgcttaagagtatttaacctctgttgtggtggatctaacttggttt 7995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31619 - 31500
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| | |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |    
T  31619 cctgtttcgtgttcttgtgtctttctcacacatttctgttttgatttgacctttggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttatctttccagttg 31520  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    | || ||||||| |||||||    
T  31519 tctttgtttgacatgaaaat 31500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 63 - 9
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggccttt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggccttt 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0956 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0956
Description:

Target: scaffold0956; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 183
Target Start/End: Original strand, 2314 - 2403
Alignment:
Q  94 gtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaa 183  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||    
T  2314 gtaaacatgaaagttgtagataattgcgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaa 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0453
Description:

Target: scaffold0453; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 405 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 3380 - 3250
Alignment:
Q  405 gttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgcta 503  Q
    |||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||| |||||  |||||    
T  3380 gttgttggttaatttaagctacatatat-tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttataacattcaagttgttattgttaatattgcta 3282  T
Q  504 tgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3281 tgttg-caagttg-tttatgttgttgtctctgct 3250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 30622 - 30509
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| | |||    
T  30622 cctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatgg 30523  T
Q  137 ttttggtttgacgt 150  Q
     |||||||||||||    
T  30522 ctttggtttgacgt 30509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 3195 - 3120
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  3195 tatggggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg 3120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 148
Target Start/End: Original strand, 110040 - 110133
Alignment:
Q  55 gtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgac 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||| |||| ||||||    
T  110040 gtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgac 110133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 148
Target Start/End: Original strand, 118541 - 118634
Alignment:
Q  55 gtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgac 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||| |||| ||||||    
T  118541 gtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgac 118634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 273 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 2422 - 2362
Alignment:
Q  273 ctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2422 ctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgt 2362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28132 - 28013
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||| |  ||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| |    
T  28132 cctgtttcgcgttcctgcgtctgtttcacacgtttctattttgagttggtctttggtataaacatgaaagttgttgacaattgtgttatctttccagtag 28033  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  28032 tcttggtttgacgtgaaaat 28013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 404 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 6966 - 6835
Alignment:
Q  404 tgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgct 502  Q
    ||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  6966 tgttgttggttaatttaagctacatatat-tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcatttgagttgttattattaatgttgct 6868  T
Q  503 atgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||  ||||||  |||||||| ||||||||||    
T  6867 atgttg-caagttg-cttatgttgctgtctctgct 6835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 424 - 537
Target Start/End: Original strand, 127144 - 127254
Alignment:
Q  424 tacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatg 523  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||    
T  127144 tacatatat-tatgtggaaa-ggtatgatagggaaaataatgttattatatcatccaagttgttgttattaaagttgctatgttg-caagctgttttatg 127240  T
Q  524 ttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||||||||||    
T  127241 ttgttgtctctgct 127254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 5358 - 5298
Alignment:
Q  26 tgacagcacgtcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggc 86  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5358 tgacagcatctcctatttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggc 5298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18347 - 18247
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||    
T  18347 gttcttgcgtctttttcacctatttccgttttgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttg 18248  T
Q  147 a 147  Q
    |    
T  18247 a 18247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 434 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 6223 - 6121
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtct 532  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  6223 tatgtggaaaatgtatgatatagaaagtattgttgtttatatcattcaagttattattattaatattgctatgttg-caagttg-tttatgttgttgtct 6126  T
Q  533 ctgct 537  Q
    |||||    
T  6125 ctgct 6121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 434 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 8375 - 8273
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtct 532  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  8375 tatgtggaaaatgtatgatatagaaagtattgttgtttatatcattcaagttattattattaatattgctatgttg-caagttg-tttatgttgttgtct 8278  T
Q  533 ctgct 537  Q
    |||||    
T  8277 ctgct 8273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1354 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1354
Description:

Target: scaffold1354; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Original strand, 234 - 353
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||   |||||||| ||||  || |||||||    
T  234 cctgtttcgcgttcttgcgtctgtttcacacgttactgttttgagttggcctttagtgtagacatgaaagttagtgataattgggttattttcccagtgg 333  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    ||||| ||||||||| ||||    
T  334 ttttgatttgacgtggaaat 353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1102 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1102
Description:

Target: scaffold1102; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 156
Target Start/End: Original strand, 2532 - 2619
Alignment:
Q  69 tttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  2532 tttctgatttgaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgttgataattgtgttacctttccagtagtcttggtttgacgtgaaaat 2619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2046 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold2046
Description:

Target: scaffold2046; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 404 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 456 - 325
Alignment:
Q  404 tgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 502  Q
    ||||||||  |||||| || || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  456 tgttgttggttaatttaagctatatatat-tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatttcattcaagttgttattattaatattgct 358  T
Q  503 atgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  357 atgttg-caagttg-cttatgttgttgtctctgct 325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 38528 - 38434
Alignment:
Q  36 tcctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttc 130  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  38528 tcctgtttcgcgttcttgcgtctttttcacctatttctgtttcgaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttc 38434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 403 - 492
Target Start/End: Original strand, 127500 - 127589
Alignment:
Q  403 ttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattat 492  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  127500 ttgttgttggttaatttgagctacatatat-tatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaagttgttattat 127589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 156
Target Start/End: Original strand, 6992 - 7101
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||| | |||| |||| ||||| |||||||||| |||| ||||| ||| |  ||||||||    
T  6992 gttcttgtgtctgtttcacacgtttttgttttgagttgccctttagtgtaaacatgtaagttatagataattgtgttatctttctagtagccttggtttg 7091  T
Q  147 acgtgaaaat 156  Q
    ||||||||||    
T  7092 acgtgaaaat 7101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 434 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 5141 - 5039
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtct 532  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  5141 tatgtggaaaatgtatgatatagaaagtattgttgtttatatcattcaagttattattattaatattgctatgttg-caagttg-cttatgttgttgtct 5044  T
Q  533 ctgct 537  Q
    |||||    
T  5043 ctgct 5039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1815 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1815
Description:

Target: scaffold1815; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 446 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 1326 - 1237
Alignment:
Q  446 gtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  1326 gtatgatatagaaa-taatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgctgtctgtgct 1237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 108
Target Start/End: Original strand, 9165 - 9236
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagtt 108  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||    
T  9165 cctgttttatgttcttgtatctttttcacacgtttctgttttgaaatggcctttggtgtaaacatgaaagtt 9236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 1041 - 951
Alignment:
Q  58 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgac 148  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  1041 tttttcacccatttccgttttgaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttgac 951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 147
Target Start/End: Original strand, 1234 - 1323
Alignment:
Q  58 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttga 147  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| || ||| | |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  1234 tttttcacccgtttccgttttgaattagcttttggtgtaaacataaaagttttagataattgtgttagctttctaatggttttggtttga 1323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 189
Target Start/End: Original strand, 8040 - 8192
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||| ||  |||||||||||| |||| | ||  ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||| || | |||    
T  8040 cctgtttcgcgttcttgcatctttttcgcatatttctgttttgatttggacattttggtaaacatgaaagttgtagacaattatgttagctatctaatgg 8139  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatact 189  Q
     |||||||||||||  ||||| | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||    
T  8140 ctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 8192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 157
Target Start/End: Original strand, 40774 - 40884
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcg-ggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggttt 145  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||  |||| ||| ||| || |||||||||| |||||||||||| | | ||||||||    
T  40774 gttcttgcgtcttattcacacatttctgttttgaatttg-ctttcgatgtaaacattaaaattttagataattgtgttagctttccactagctttggttt 40872  T
Q  146 gacgtgaaaatg 157  Q
    ||  ||||||||    
T  40873 gaattgaaaatg 40884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Original strand, 9809 - 9927
Alignment:
Q  37 cctgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgg 136  Q
    ||||||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |  |||  ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| |    
T  9809 cctgtttcgcgttcttgcatctttt-cacacatttctgttttgaattggtctttggtataaatatggaagttgttgataattgtgttaactttccagtag 9907  T
Q  137 ttttggtttgacgtgaaaat 156  Q
      |||||||||| |||||||    
T  9908 ccttggtttgacatgaaaat 9927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 156
Target Start/End: Original strand, 27259 - 27368
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||||||||||| |||| |||  | |||||||||| |||| |  |||  ||| ||||||| |||||||| |||| |||| |||| |  ||||||||    
T  27259 gttcttgcgtcttttttacacattttcgctttgaattggtctttggtataaatatggaagttgttgataattgtgttatcttttcagtagccttggtttg 27358  T
Q  147 acgtgaaaat 156  Q
    || |||||||    
T  27359 acatgaaaat 27368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 66357 - 66226
Alignment:
Q  403 ttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgc 501  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||| || ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||     
T  66357 ttgttgttggttaatttgagatacatatatg-atgtggaaattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcattaaagttgttattattaatgttgt 66260  T
Q  502 tatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctgct 537  Q
    |||||||  |||||| || |||||||||||| ||||    
T  66259 tatgttg-caagttg-ttgatgttgttgtctttgct 66226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 452 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 830 - 765
Alignment:
Q  452 tatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgtt 518  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  830 tatagaaaataatgttgttatatcatccaagatgttgttattaatgctgctatgttgt-aagttgtt 765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8476 - 8367
Alignment:
Q  47 gttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttg 146  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| | ||| | |||| |||| ||||| | ||| |||| |||| ||||| ||| |  ||||||||    
T  8476 gttcttgcgtctgtttcacacgtttttgttttgagttgacatttagtgtaaacatgtaagttattgatcattgtgttatctttcaagtagccttggtttg 8377  T
Q  147 acgtgaaaat 156  Q
    ||||||||||    
T  8376 acgtgaaaat 8367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 4024 - 3984
Alignment:
Q  366 ttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4024 ttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatattgt 3984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 537
Target Start/End: Original strand, 372 - 474
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtct 532  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||  |||||||| |||||    
T  372 tatgtgaaaaatgtatgatatagaaagtatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttg-cttatgttgctgtct 469  T
Q  533 ctgct 537  Q
    |||||    
T  470 ctgct 474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 999 - 900
Alignment:
Q  58 tttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatg 157  Q
    |||||||| | |||| | ||||||||||  ||||| || | |||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||    
T  999 tttttcacccttttccgctttgaattggattttcgtgtgaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtgcaaatg 900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1695 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold1695
Description:

Target: scaffold1695; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 714 - 625
Alignment:
Q  397 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 487  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  714 tgaatgttgttgttggataatttgagatacatatat-tatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgtt 625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1695; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 357 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 714 - 665
Alignment:
Q  357 tgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 406  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  714 tgaatgttgttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 2725 - 2800
Alignment:
Q  434 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  2725 tatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcattgtttatatcattcaagttgttatttttaatattgctatgttg 2800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 2109 - 1998
Alignment:
Q  39 tgtttcatgttcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggtt 138  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||  |||||||||||| |||| | ||  ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||| ||   ||| |    
T  2109 tgtttcgtgttcttgcatctttttcgcatatttctgttttgatttggacattttggtaaacatgaaagttgtagacaattatgttagctatcttttggct 2010  T
Q  139 ttggtttgacgt 150  Q
    ||||||||||||    
T  2009 ttggtttgacgt 1998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 446 - 534
Target Start/End: Original strand, 1276 - 1363
Alignment:
Q  446 gtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctct 534  Q
    |||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||    
T  1276 gtatgatatataaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgt-aagttg-cttatgttgctgtctct 1363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1276
Description:

Target: scaffold1276; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 434 - 390
Alignment:
Q  357 tgaatgtcattgttggataatttgaaatacatatattatgtgaat 401  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  434 tgaatatctttgttggataatttgaaatacttatattatgtgaat 390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 417 - 492
Target Start/End: Original strand, 2652 - 2727
Alignment:
Q  417 tttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattat 492  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||||    
T  2652 tttgagatacatatat-tatgtggaaattgtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaaatcgttattat 2727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 440 - 508
Target Start/End: Original strand, 53378 - 53446
Alignment:
Q  440 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 508  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  53378 gaaaatgtatgatatggaaattattatttttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 53446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3032 - 2945
Alignment:
Q  103 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgttatttggttcttgagatatgatgaaaatactc 190  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  ||||  ||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  3032 aaagttgtagacaattgagttggtattcctttggctttggtttgacttgaaaatactattttgtttttgagttatgaagaaaatactc 2945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 54086 - 53987
Alignment:
Q  49 tcttgcgtctttttcacacgtttctgttttgaattggcctttcgggtaagcatgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgac 148  Q
    |||||| |||||||| ||  |||||||||||| || | |||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  54086 tcttgcatctttttcgcatatttctgttttgatttagactttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttaactttctaatggctttggtttgac 53987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 469 - 535
Target Start/End: Original strand, 775 - 839
Alignment:
Q  469 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctg 535  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||    
T  775 ttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatg-tttatgttgttgtctctg 839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 486 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 1749 - 1700
Alignment:
Q  486 ttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttttatgttgttgtctctg 535  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| | ||||||    
T  1749 ttattattaatgatgctatgttgttaagttgttgtattttgctatctctg 1700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 368 - 400
Target Start/End: Original strand, 20735 - 20767
Alignment:
Q  368 gttggataatttgaaatacatatattatgtgaa 400  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20735 gttggataatttgagatacatatattatgtgaa 20767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University