View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11907_high_2 (Length: 612)

Name: NF11907_high_2
Description: NF11907
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11907_high_2
NF11907_high_2
[»] chr4 (5 HSPs)
chr4 (20-603)||(30775074-30775655)
chr4 (224-555)||(35132476-35132807)
chr4 (226-554)||(9335701-9336029)
chr4 (355-554)||(23596395-23596594)
chr4 (43-126)||(35132304-35132387)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (21-603)||(8585471-8586051)
chr7 (272-594)||(8628608-8628926)
chr7 (22-554)||(8659187-8659721)
chr7 (55-555)||(8654309-8654809)
chr7 (55-555)||(13333265-13333765)
chr7 (55-555)||(10494183-10494683)
chr7 (226-555)||(8667449-8667778)
chr7 (259-555)||(8602037-8602333)
chr7 (24-554)||(27830685-27831217)
chr7 (23-555)||(6789337-6789871)
chr7 (224-555)||(8636152-8636483)
chr7 (54-548)||(17267797-17268291)
chr7 (26-279)||(8616509-8616764)
chr7 (54-551)||(17260099-17260596)
chr7 (224-555)||(1301488-1301823)
chr7 (224-551)||(3147292-3147627)
chr7 (235-551)||(8559372-8559688)
chr7 (347-554)||(8382686-8382893)
chr7 (223-555)||(8646904-8647236)
chr7 (352-551)||(8570467-8570666)
chr7 (352-551)||(8581856-8582055)
chr7 (163-551)||(8545600-8545987)
chr7 (352-555)||(8576482-8576685)
chr7 (273-555)||(8609994-8610276)
chr7 (358-551)||(8538198-8538391)
chr7 (260-394)||(29581811-29581945)
chr7 (225-391)||(7877706-7877872)
chr7 (273-394)||(8590715-8590836)
chr7 (55-139)||(3147123-3147207)
chr7 (426-554)||(8671440-8671568)
chr7 (224-554)||(29577479-29577812)
chr7 (426-555)||(7877542-7877671)
chr7 (52-126)||(1301316-1301390)
chr7 (445-551)||(8102916-8103022)
chr7 (43-113)||(8664907-8664977)
chr7 (433-548)||(8017229-8017344)
chr7 (163-198)||(8576293-8576328)
chr7 (22-102)||(8601798-8601880)
chr7 (61-126)||(8646742-8646807)
chr7 (517-554)||(29581651-29581688)
chr7 (428-513)||(39985878-39985963)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (43-594)||(16661766-16662313)
chr2 (55-555)||(16657326-16657826)
chr2 (43-573)||(7542073-7542599)
chr2 (264-554)||(12234757-12235047)
chr2 (259-554)||(14703471-14703766)
chr2 (235-551)||(12245219-12245535)
chr2 (235-406)||(12258539-12258710)
chr2 (224-554)||(43625440-43625770)
chr2 (280-548)||(11999478-11999746)
chr2 (439-511)||(17716546-17716618)
chr2 (22-139)||(14703232-14703351)
chr2 (22-113)||(43625236-43625329)
chr2 (21-139)||(12258806-12258926)
chr2 (22-139)||(12234513-12234632)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (22-555)||(4678367-4678901)
chr1 (260-594)||(34466567-34466897)
chr1 (223-554)||(15595061-15595399)
chr1 (60-102)||(34467047-34467089)
chr1 (43-84)||(52549292-52549333)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (358-555)||(43745011-43745206)
chr8 (165-317)||(43744785-43744937)
chr8 (224-554)||(12528532-12528862)
[»] chr5 (4 HSPs)
chr5 (223-316)||(28219945-28220038)
chr5 (438-555)||(28220193-28220310)
chr5 (55-139)||(28219777-28219861)
chr5 (358-404)||(28220113-28220159)
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (264-546)||(28910650-28910932)
chr6 (439-512)||(11276197-11276270)
chr6 (433-500)||(11156507-11156574)
chr6 (433-512)||(11170807-11170886)
chr6 (433-500)||(11196960-11197027)
chr6 (433-512)||(11200125-11200204)
chr6 (439-512)||(11209635-11209708)
[»] scaffold1207 (1 HSPs)
scaffold1207 (439-512)||(1128-1201)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 510; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 603
Target Start/End: Original strand, 30775074 - 30775655
Alignment:
Q  20 agtaagacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgcct 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30775074 agtaagacaactctcaacagtctgtatacactcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgagtgattgatgaagaaaagtcaatgtct 30775173  T
Q  118 tgaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30775174 tgaaataaattatctatctcaacaaatgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggat 30775273  T
Q  218 cgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccaga 317  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30775274 tcccggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtaattcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagc 30775373  T
Q  318 agttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatca 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30775374 agttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatca 30775473  T
Q  418 cacctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatag 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30775474 cacctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatag 30775573  T
Q  518 tggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcacatacagtgacaactgcatttttaactggggattccaaatacatctctgc 603  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30775574 tggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggc----acagtgataactgcatttttaactggggattccaaatacatctctgc 30775655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 224 - 555
Target Start/End: Original strand, 35132476 - 35132807
Alignment:
Q  224 taatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgc 323  Q
    ||||||| || ||||||||  |||| || || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||| ||    
T  35132476 taatgtctactttgttctttctcttgaactcttgtacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccaccgagatgagtgtttccggcagtggc 35132575  T
Q  324 tttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacaccta 423  Q
     |||||||  || |||| |||  |||| || || |  || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    ||  || ||||   |    
T  35132576 cttaacttggaagacattatccttaatagtaagtattgaaacatcaaaagtgccaccaccaagatcgaagacaaaaatattttgttctccagcacaatca 35132675  T
Q  424 cctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggctt 523  Q
      |||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35132676 gatctcttgtcaaggccatatgcaaccgctgcggcagtaggttcattcattactctcataacattgggaccagcaatagcaccagcatctatagtggctt 35132775  T
Q  524 ttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcaca 555  Q
    |||| || | |||| | |||||||||||||||    
T  35132776 ttcgttgagaatcactaaaataagcaggcaca 35132807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 226 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 9336029 - 9335701
Alignment:
Q  226 atgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgctt 325  Q
    |||||||| || |||||| | || || || || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || || | ||| |||||||| |  || ||||    
T  9336029 atgtccactttattcttcttttttaactcttccacaaaatagttaaccattctgttatcaaagtcctcgcctccaaggtgcgtgtttcctgcggtggctt 9335930  T
Q  326 taacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacc 425  Q
    | |||||||| | |||| |  |||| ||||| | ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |  | | |||||||   |      
T  9335929 ttacttcaaatagatcacccttaattgtgaggatagacacatcaaaagtaccgccacccagatcaaagacaaaaatatttcggttaccatcacagtcatt 9335830  T
Q  426 tctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggctttt 525  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |  || |||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| |||    
T  9335829 tctcttatcaaggccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgaatgacattaaggccagcaatagtaccagcatctatggtggccttt 9335730  T
Q  526 cgctgtgcatcattgaaataagcaggcac 554  Q
    ||||| | ||||||||| ||||| |||||    
T  9335729 cgctgagaatcattgaagtaagctggcac 9335701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 23596594 - 23596395
Alignment:
Q  355 agaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctg 454  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || | || ||  ||| ||||| ||  ||   || || |||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  23596594 agaagtgaaacatcaaaagttccaccaccaagatcgaaaataagaacgttcttctcaccagtacttgtagctttcttatcaagaccataagcaatagcgg 23596495  T
Q  455 ctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcac 554  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||| |||| ||||||||||| |||| ||||  || |||| ||| ||||| || ||||||||    
T  23596494 cagcagtgggctcgttaataattctcatcacattgagtccagaaatgacaccagcatccttagtagcttgacgttgtgaatcgttgaagtatgcaggcac 23596395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 126
Target Start/End: Original strand, 35132304 - 35132387
Alignment:
Q  43 atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaa 126  Q
    |||||||  |||||||||||   ||| ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35132304 atacactcattaaaaaggtctgcattcatttcctcaaacttggcgcgattgattgatgaagaaaaatcaatgccttgaaataaa 35132387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 21 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 8586051 - 8585471
Alignment:
Q  21 gtaagacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgcctt 118  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || || | ||| |    
T  8586051 gtaagacaactctcaacagtatttatacactcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgcgtgattgatgaagagaaatcgacgccct 8585952  T
Q  119 gaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatc 218  Q
     | |||||| ||| || |||| | | ||||  || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| |     
T  8585951 cacataaataatcaatttcaatagtagtgaccaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgccgttcttaaccgcctcaaagctcttgggtt 8585852  T
Q  219 gcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaa 318  Q
        ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||      
T  8585851 cttagtaatatccacattgttctttctcttaaattcctcaacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcccctcccccaaggtgagtatttccagcg 8585752  T
Q  319 gttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcac 418  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| ||||||    
T  8585751 gttgctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcac 8585652  T
Q  419 acctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagt 518  Q
    |  ||||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  8585651 agttacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggt 8585552  T
Q  519 ggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcacatacagtgacaactgcatttttaactggggattccaaatacatctctgc 603  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||| ||| || |||| ||||||  |||||||    
T  8585551 ggcttttcgctgagaatcattgaaataagcaggc----acagtcacaactgcattttgaacaggtgatttcaaatatgtctctgc 8585471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 272 - 594
Target Start/End: Original strand, 8628608 - 8628926
Alignment:
Q  272 acattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaa 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||    
T  8628608 acattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaa 8628707  T
Q  372 agtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcatta 471  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  8628708 agtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtggggtcattg 8628807  T
Q  472 attattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcacatacagtgacaactgca 571  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     ||||||||||||    
T  8628808 attatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcattcatggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagcaggcacg----gtgacaactgca 8628903  T
Q  572 tttttaactggggattccaaata 594  Q
    ||||| || || |||| ||||||    
T  8628904 ttttttacaggtgatttcaaata 8628926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 554
Target Start/End: Original strand, 8659187 - 8659721
Alignment:
Q  22 taagacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttg 119  Q
    |||||||||||| |||||| |  |||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| | ||||| || || ||    
T  8659187 taagacaactctcaacagttttcatacactcattaaaaagatccatattcatttcctcaaacctggcacgagtgattaatgaacagaagtctattccctg 8659286  T
Q  120 aaataaattatctatctcaacaattgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcg 219  Q
    |||||||  ||| | ||||||| | |||| |||    || ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||   || || | | |||| |      
T  8659287 aaataaagaatcgacctcaacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggtta 8659386  T
Q  220 cgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaag 319  Q
    |   |||||||||| || |||||| | || || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  8659387 ccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgctatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccagaag 8659486  T
Q  320 ttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcaca 419  Q
    | ||||| |||||||| |||||| |  | || || || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    | | |||||||    
T  8659487 tggcttttacttcaaagacatcacccttcattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaagaccaaaatattttgtttaccatcaca 8659586  T
Q  420 cctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtg 519  Q
       ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    || |||||||| |||||||||||||| | ||| || |||    
T  8659587 gtcacctctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattaattatctgaatgacattaaggccagcaatggcaccggaatctatggtg 8659686  T
Q  520 gcttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcac 554  Q
    ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||    
T  8659687 gcttttcgctgagaatcattgaactatgcaggcac 8659721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 555
Target Start/End: Original strand, 8654309 - 8654809
Alignment:
Q  55 aaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaact 154  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||| || ||   |||||||  ||||| ||||||| | |||| |||      
T  8654309 aaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaag 8654408  T
Q  155 tgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattc 254  Q
    | || |||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||   || || | | |||| |  | | |||| ||||| || |||||| | || || ||    
T  8654409 taaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatttccactttattcttctttttgaactc 8654508  T
Q  255 ctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtg 354  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||| |  |||| |||    
T  8654509 ctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcaaagacatcacccttaattgtg 8654608  T
Q  355 agaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctg 454  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  | | ||||| |  ||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8654609 agtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggccatatgcaatagctg 8654708  T
Q  455 ctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcac 554  Q
    | ||||| || ||||| | ||| |  || || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |  |||||||| || || |||||    
T  8654709 cggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattgaagtatgccggcac 8654808  T
Q  555 a 555  Q
    |    
T  8654809 a 8654809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 55 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 13333765 - 13333265
Alignment:
Q  55 aaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaact 154  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| || ||   |||||||  |||||  |||||| | |||| |||      
T  13333765 aaaaagtctatattaatttcctcaaatttggcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacttcaacagtggtgacaaaag 13333666  T
Q  155 tgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattc 254  Q
      ||||||||| |||||||| || | ||||| ||||||||||||   || || | | |||| |  |   | || || ||||| |||||| | || || ||    
T  13333665 aaaaggagagtatccttttttccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttcccactgatatcgacgttattcttctttttgaactc 13333566  T
Q  255 ctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtg 354  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||| |||||||| |||||| |  |||| ||     
T  13333565 ctcaacaaaatagttcaccattctgttatcgaagtcttctcccccaaggtgagtgtttcctgcggtggcttttacttcaaagacatcacccataattgta 13333466  T
Q  355 agaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctg 454  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | || | |||||||   || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13333465 aggatagacacatcaaaagtaccaccacccagatcaaagacaaaaatatttcgcttaccatcacaatcacgtctcttgtcaaggccatatgcaatagctg 13333366  T
Q  455 ctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcac 554  Q
    | ||||| || ||||| |||||||  || | |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||    
T  13333365 cagcagtaggttcattgattattcgaatgatattaaggccagcaatagcaccagcatctatggtggcctttcgctgagaatcattgaagtaagccggcac 13333266  T
Q  555 a 555  Q
    |    
T  13333265 a 13333265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 55 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 10494683 - 10494183
Alignment:
Q  55 aaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaact 154  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| || ||   |||||||  ||| | ||||||  | |||| |||      
T  10494683 aaaaagtctatattaatttcctcaaatttggcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatcgacctcaacggtggtgacaaaag 10494584  T
Q  155 tgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattc 254  Q
      || |||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||   || || | | ||||||  |   | ||||||||||| |||||| | || || ||    
T  10494583 aaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttggattcccactgatgtccacgttattcttctttttgaactc 10494484  T
Q  255 ctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtg 354  Q
    ||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || | ||| ||||| |||||||| |||||| |  |||| |||    
T  10494483 ctcaacaaaataattcaccattctgttatcgaagtcctctcccccaaggtgagtgttacctgcagtggcttttacttcaaagacatcacccttaattgtg 10494384  T
Q  355 agaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctg 454  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  | | | |||||   || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10494383 aggatagacacatcaaaagtaccaccacccagatcaaagacaaaaatatttcggttaccctcacaatcacttctcttgtcaaggccatatgcaatagctg 10494284  T
Q  455 ctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcac 554  Q
    | ||||| || ||||| ||||| |  || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || | ||| ||||| ||||| |||||    
T  10494283 cagcagtaggttcattgattatccgaatgacattaaggccagcaatagcaccagcatcaatagtagcctttcgttgagaatcgttgaagtaagccggcac 10494184  T
Q  555 a 555  Q
    |    
T  10494183 a 10494183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 226 - 555
Target Start/End: Original strand, 8667449 - 8667778
Alignment:
Q  226 atgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgctt 325  Q
    |||||||| || |||||| | || || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| | ||| ||||    
T  8667449 atgtccactttattcttcttttttaactcctcaacaaaatagttcaccattctgttatcgaagtcctcgcccccaaggtgagtgtttcctgcagtggctt 8667548  T
Q  326 taacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacc 425  Q
    | |||||||| |||||| |  |||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    | |||||||   |      
T  8667549 tcacttcaaagacatcacccttaattgtgaggatagacacatcaaaagtcccgccacccagatcaaagacaaaaatatttcggctaccatcacagtcatt 8667648  T
Q  426 tctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggctttt 525  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |  || |||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| |||    
T  8667649 tctcttgtcaaggccatatgcaatagctgccgcagtaggttcattgattatccgaatgacattaagtccagcaatagtaccagcatctatggtggccttt 8667748  T
Q  526 cgctgtgcatcattgaaataagcaggcaca 555  Q
    ||||| | ||||||||| ||||| ||||||    
T  8667749 cgctgagaatcattgaagtaagctggcaca 8667778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Original strand, 8602037 - 8602333
Alignment:
Q  259 acaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaa 358  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| || | ||| |||| ||| ||||| || || |||||||| | || ||   |||| |||||||    
T  8602037 acaaagtggttcaccattcggttatcaaagtcctctcctccaaggtgtgtgtctccggaagtggccttgacttcaaagagattattcttaattgtgagaa 8602136  T
Q  359 gagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgc 458  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||  || ||||  || ||||||| | ||| |||||||||| ||| |||||    
T  8602137 gagaaacatcaaaagttccaccaccaagatcaaatatgaaaatatttctctcttcaacacaattagctctcttttgaaggccatatgcaagagcagctgc 8602236  T
Q  459 agtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcaca 555  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||    
T  8602237 agttggctcattgattatccgcattacattgagaccagcaatggcaccagcatcttttgtggcttttcgctgagaatcattaaaataagccggcaca 8602333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 27831217 - 27830685
Alignment:
Q  24 agacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaa 121  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||   |||| | ||||||||||| | ||    
T  27831217 agacaactctcaacagtctccatacattcattgaaaaggtccatattgatttcctcaaactttgcacgagtgatcattgaaaagaagtcaatgccctcaa 27831118  T
Q  122 ataaattatctatctcaacaattgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcg 221  Q
    ||||   ||||||||||| | | |||  ||     || |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||| |   ||||| |||||||| |  |     
T  27831117 ataaggcatctatctcaatagtagtgtcaacagaaaaagagagtgtcctttttgccttctcacattaggttctcagcctcctcaaggctcttgggttccc 27831018  T
Q  222 ggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagtt 321  Q
      ||||||||||  | |||||| |||| ||  |||| ||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||    
T  27831017 actaatgtccactcttttcttcttcttgaacacctccacaaaatagttcaccatcctattatcaaagtcctctccaccaaggtgagtgtttccagcagtt 27830918  T
Q  322 gctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacc 421  Q
    || |||||||  || || | |||  |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||  ||  | |      
T  27830917 gccttaacttggaagaccttatccttaattgtaacaagagacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaacacaaaaatattccgttctccagtatatt 27830818  T
Q  422 tacctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggc 521  Q
    |   || | | ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||    
T  27830817 ttgttcccgtgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtaggctcgcttattatccgcataacattaaggccagcaatggcaccggaatctacagtggc 27830718  T
Q  522 ttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcac 554  Q
    |||||| || |  |||||||||||||| |||||    
T  27830717 ttttcgttgagagtcattgaaataagctggcac 27830685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 555
Target Start/End: Original strand, 6789337 - 6789871
Alignment:
Q  23 aagacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttga 120  Q
    ||||||||||| ||| ||||  |||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||   ||||| ||||| |||    
T  6789337 aagacaactctcaacggtcttcatacactcattaaaaatatccatattgatttcctcaaacttggcccgagtaagtgatgaaatgaagtcgatgccctga 6789436  T
Q  121 aataaattatctatctcaacaattgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgc 220  Q
    ||||||   |||| ||||| | | ||||  |     || ||||||  |||||| ||| ||||||| ||||||||||||  ||| || || ||||  |  |    
T  6789437 aataaagagtctacctcaatagtagtgacgacaacaaaagagagtacccttttggccctttcacacgcagttctcaaccttcttaaggcccttgagtttc 6789536  T
Q  221 gggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagt 320  Q
      ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| | || || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||    
T  6789537 cagtaatatccactttgttcttcctcttaaactcctctgcaaagtagtttaccaatcggttatcaaagtcctctcctccgaggtgagtgtttccaccggt 6789636  T
Q  321 tgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacac 420  Q
     || |||||||  || || | |||| | || || |  | ||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||  | ||  || |  |     
T  6789637 ggccttaacttggaagaccttatctttgattgttaagatagacacatcgaaagtgccaccaccaaggtcgaagacgaaaatatttttttctccaccgtaa 6789736  T
Q  421 ctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtgg 520  Q
     ||  |||||| ||||| |||||||||| ||| || || || || ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  6789737 ttagttctcttatcaaggccatatgcaagagcagcagctgttggttcattgattattcgtataacattaagaccagcaatggcaccagcatctaaagtgg 6789836  T
Q  521 cttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcaca 555  Q
    |||| || || | ||||||||||||||||||||||    
T  6789837 ctttccgttgagaatcattgaaataagcaggcaca 6789871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 224 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 8636483 - 8636152
Alignment:
Q  224 taatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgc 323  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| | |||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||| || | ||| |||| ||| | ||| ||    
T  8636483 taatgtctaccttgttcttcctcttgatttcctctacaaaatattccaccattctgttatcaaagtcctctcctccaaggtgtgtgtctccggcagtggc 8636384  T
Q  324 tttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacaccta 423  Q
    |||||||||||| || ||| || ||||  |||| | |||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||   | ||||  ||    
T  8636383 tttaacttcaaagacttcacctttaattttgagtatagacacgtcgaatgtaccaccaccaagatcaaatacgaaaatgtttctctctttaacacagtta 8636284  T
Q  424 cctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggctt 523  Q
    |||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||| ||||| |  || |||||||| || |||||||||||||||||  | |||| ||    
T  8636283 cctctcttttgaagtccatacgcaaaagctgcagcagttggttcattgattatccgaattacattaaggccggcaatggcaccagcatctttggtggatt 8636184  T
Q  524 ttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcaca 555  Q
    | ||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  8636183 tacgctgagaatcattgaaataagcgggcaca 8636152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 548
Target Start/End: Original strand, 17267797 - 17268291
Alignment:
Q  54 aaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaac 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||  || | |||||||   |||| ||||||| | || | | |     
T  17267797 aaaaaggtccatattgatttcctcaaacttggcacgagtgattgacgaagaaaaatcaacacccttaaataaagcgtctacctcaacattggtcacagag 17267896  T
Q  154 ttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaatt 253  Q
      ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||  ||| |||| |  |    ||| | ||  || || ||| | || | ||    
T  17267897 gcgaaagaaagtgtcctttttgctttttcacatgcagttctcaacctcctcatggcttttgggttcccaacaattttcaatttttttttccttttgattt 17267996  T
Q  254 cctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggt 353  Q
    |||| ||||| ||||  | |||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||   || || |||||||| || || | |||  |||| ||    
T  17267997 cctcaacaaaatagtataccattctattatcaaagtcctcacccccaagatgagtgtctccaccggtggccttaacttcgaagaccttatccttaattgt 17268096  T
Q  354 gagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaatagct 453  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||  || ||||  ||  ||||||  |||| |||||||||||||||    
T  17268097 aacgagagacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaagacaaaaatattccgttcttcaacacagttagttctcttgccaaggccatatgcaatagct 17268196  T
Q  454 gctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagc 548  Q
    || ||||| || ||||| ||||   |||  |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||| |||||    
T  17268197 gcagcagttggttcattgattaccttcaatacattaaggccagcaatgacaccagcatctatggtggcttttcgctgagaatcgttgaagtaagc 17268291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 279
Target Start/End: Original strand, 8616509 - 8616764
Alignment:
Q  26 acaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaat 123  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || || ||||| | | ||    
T  8616509 acaactctcaacagtctttatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttaacacgagtgattgatgaagagaaatcgatgccctcacat 8616608  T
Q  124 aaattatctatctcaacaattgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcggg 223  Q
    |||| ||| ||||||| | | ||||  || ||||| || ||  ||| ||| |||||||| ||||||||| ||||| | ||||| | |||||| |  |  |    
T  8616609 aaataatcaatctcaatagtagtgaccaatttgaatgaaagcatccgtttcgccttttcgcatgcagttttcaaccgcctcaacgatcttgggttcctag 8616708  T
Q  224 taatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctg 279  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8616709 taatatccacattgttcttcctcttaaaatcctcaacaaagtagttcaacattctg 8616764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 551
Target Start/End: Original strand, 17260099 - 17260596
Alignment:
Q  54 aaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaac 153  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||| | ||  || | |||||||   |||| ||||||| | || | | |     
T  17260099 aaaaaggtccatattgatttcttcaaacttggcacgagtgattgacgaagaaaaattaacacccttaaataaagcgtctacctcaacattggtcacagag 17260198  T
Q  154 ttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaatt 253  Q
       || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || || ||| |||| |  |   |||||||||  || ||| |  | || |  |    
T  17260199 gcaaaagaaagtgtcctttttgctttttcacatgcagttctcaacctccttaaggcttttgggttcccaataatgtccaattttttcgttcttttgatct 17260298  T
Q  254 cctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggt 353  Q
    |||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||   || || |||||||| || || | |||  |||| ||    
T  17260299 cctctacaaaatagtacaccattctattatcaaagtcctcacccccaagatgagtgtctccaccggtggccttaacttcgaagaccttatccttaattgt 17260398  T
Q  354 gagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaatagct 453  Q
     |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||   |   | ||||  ||  ||||||  |||| |||||||||||||||    
T  17260399 aacgagagacacatcaaaagtccccccaccaaggtcaaagacaaaaatattccgtacttaaacacaattagttctcttgacaaggccatatgcaatagct 17260498  T
Q  454 gctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcagg 551  Q
    || ||| | || ||||||||||   ||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17260499 gcagcaataggttcattaattaacttcaaaacataaaggccagcaataacaccagcatctatggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagcagg 17260596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 224 - 555
Target Start/End: Original strand, 1301488 - 1301823
Alignment:
Q  224 taatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgc 323  Q
    |||||||||| || |||||| |  | || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| || | |||||| ||||||  ||| ||    
T  1301488 taatgtccactttattcttctttctgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtatttccaccagtggc 1301587  T
Q  324 tttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacaccta 423  Q
    ||| |||||||| |||||  |  | ||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  | | |||||||   |    
T  1301588 ttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagaccaaaatattccgtttaccatcacagtca 1301687  T
Q  424 cctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcag----tgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtg 519  Q
    | |||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||    | || |||||||||||    || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||    
T  1301688 cttctcttgtcaaaaccatacgcaatagctgcagcagtagctaggttcattaattatctgaatgacattaaggccagcaattgcaccggcatctatggtg 1301787  T
Q  520 gcttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcaca 555  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  |||||||||    
T  1301788 gcttttcgctgagaatcattgaaatgtgcaggcaca 1301823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 224 - 551
Target Start/End: Original strand, 3147292 - 3147627
Alignment:
Q  224 taatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgc 323  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |   | ||    
T  3147292 taatgtctaccttgttcttcttcttaaactcccgtgcaaagtagttcaccatcctattatcaaagtcctctcccccaaggtgggtgtttcctgcgatggc 3147391  T
Q  324 tttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatt-----cctct-cagcatca 417  Q
     ||||||| ||| || | |||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||     ||||| ||  || |    
T  3147392 cttaacttgaaagaccttatccttaattgtaagaagagacacatcaaaagtcccaccacccaagtcaaagataaaaatattacgctcctctacacaatta 3147491  T
Q  418 cacc--tacctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccat 515  Q
    |||   ||  |||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | ||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||    
T  3147492 cacaattagttctcttgtccagtccatacgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgcataatattaaggccagcaataacaccagcatctat 3147591  T
Q  516 agtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcagg 551  Q
     || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3147592 tgtcgctttccgctgagcatcattgaaataagcagg 3147627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 235 - 551
Target Start/End: Original strand, 8559372 - 8559688
Alignment:
Q  235 ttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgctttaacttcaa 334  Q
    ||||||||| ||| ||| || | ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| ||||| || || |||||||    
T  8559372 ttgttcttcctctcaaactcttttacaaagtgtttcaccattctgttatcaaagtcctctcctccgaggtgtgtgtctccggaagtggccttgacttcaa 8559471  T
Q  335 acacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctc 434  Q
    | | || ||   |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||   | ||||  ||  |||||| |     
T  8559472 agagattattcttaattgtgagaagagaaacatcaaaagttccaccaccgagatcaaagatgaaaatatttctctctttaacacaattagatctcttttg 8559571  T
Q  435 aagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgca 534  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  |||| |||||  | |||||| |||  || | |    
T  8559572 aagtccatatgcaagagcagctgcagttggttcattgattatctgcattacattaagaccagcaatttcacctgcatctttggtggctcttctttgagaa 8559671  T
Q  535 tcattgaaataagcagg 551  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8559672 tcattaaaataagcagg 8559688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 347 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 8382893 - 8382686
Alignment:
Q  347 taatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgc 446  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||  ||  |||  || ||||||||| ||| ||||||||    
T  8382893 taattgtgaggagagacacatcaaaagttccaccaccaagatcaaagatgaaaatatttctctcttcaagacaattagctctcttctgaaggccatatgc 8382794  T
Q  447 aatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataa 546  Q
    || ||| || ||||| |||||||| ||||| | ||| ||||| || |||||||| |||||||||||  | |||||||| || || | ||||||||||||     
T  8382793 aagagcagcggcagttggctcattgattatccgcattacattgaggccagcaatcgcaccagcatcttttgtggctttccgttgagaatcattgaaatat 8382694  T
Q  547 gcaggcac 554  Q
    ||||||||    
T  8382693 gcaggcac 8382686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 223 - 555
Target Start/End: Original strand, 8646904 - 8647236
Alignment:
Q  223 gtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttg 322  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||| | | |||||| || || ||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  || |    
T  8646904 gtaatgtccaccttgttcttcttgttaaattcttgtgcaaagtggtccaccattctactatcaaagtcctctcctccgaggtgagtgtttccagcggtgg 8647003  T
Q  323 ctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacct 422  Q
    ||||||| | ||| || | |||  |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  || ||||| |  ||  || ||||  |    
T  8647004 ctttaacatgaaagaccttatccttaattgtaaggagagacacatcaaaagttccaccaccaaggtcgaagatgaatatatttcgttcttcagcacaatt 8647103  T
Q  423 acctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggct 522  Q
       |||||| ||||| |||||||| | ||| || || || || ||||| ||||| |  || | |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  8647104 tgttctcttgtcaaggccatatgcgagagcagcagctgttggttcattgattatccggatgatattaaggccagcaatggccccggcatctatagtggct 8647203  T
Q  523 tttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcaca 555  Q
    ||||||||   ||||||||| || |||||||||    
T  8647204 tttcgctgataatcattgaagtatgcaggcaca 8647236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 352 - 551
Target Start/End: Original strand, 8570467 - 8570666
Alignment:
Q  352 gtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaatag 451  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| | || || |  || ||||||| | ||| |||||||||| ||    
T  8570467 gtgagaatagacacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttctcttatcaacaaaattagctctcttttgaaggccatatgcaagag 8570566  T
Q  452 ctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcagg 551  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||  |||| |||||  |||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||    
T  8570567 ctgccgcagtcggttcattgattatccgcattacattgagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcgttgtgaatcattaaaataagcagg 8570666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 352 - 551
Target Start/End: Original strand, 8581856 - 8582055
Alignment:
Q  352 gtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaatag 451  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| | || ||||  || ||||||| | ||| |||||||||| ||    
T  8581856 gtgagaatagacacatcaaaagttccacctccaaggtcaaagataaaaatatttctcttatcaacacaattagctctcttttgaaggccatatgcaagag 8581955  T
Q  452 ctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcagg 551  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| | ||| ||||| ||||| |||||  |||| |||||  |||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||    
T  8581956 ctgccgcagtcggttcattgattatccgcattacattgagacctgcaatttcacctgcatctttagtggctcttcgttgtgaatcattaaaataagcagg 8582055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 551
Target Start/End: Original strand, 8545600 - 8545987
Alignment:
Q  163 agtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaa 262  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   ||||| |||  ||| |  ||  |||| ||| | ||||||||| |||| || ||||  ||||    
T  8545600 agtgtcctttttgccttctcacaggcagttctcaacctcctcaaggcttctgggttccgactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcacaa 8545699  T
Q  263 agtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagaga 362  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| || || || | || ||||| ||||| ||| || || || ||||| || | || | |||| || |||| |||    
T  8545700 agtaattcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtaagtgtctccagcagtggccttgacatcaaagaccttatttttaattgtaagaataga 8545799  T
Q  363 cacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtg 462  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| | || | ||  || ||||||| | ||| |||||||||| ||| || |||||     
T  8545800 cacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttctcttatcaac-caattagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgcagtc 8545898  T
Q  463 ggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcagg 551  Q
    || ||||| ||||| | ||| ||||| ||||| |||||  |||| |||||  | |||| | || | |||| |||||| |||||||||||    
T  8545899 ggttcattgattatccgcatgacatttagaccggcaatttcacctgcatcttttgtggatctttgttgtgaatcattaaaataagcagg 8545987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 352 - 555
Target Start/End: Original strand, 8576482 - 8576685
Alignment:
Q  352 gtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaatag 451  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| || | | || ||||  || ||||||| | ||| ||||| |||| ||    
T  8576482 gtgagaatagacacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttcttttatcaacacaattagctctcttttgaaggccatacgcaagag 8576581  T
Q  452 ctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcagg 551  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||   ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||| |||| || | |||||| |||||||||||    
T  8576582 ctgccgcagtcggttcattgattatctgcatgacattgagaccagcaattgcacctgcatctttagtggctcttcgttgggaatcattaaaataagcagg 8576681  T
Q  552 caca 555  Q
    ||||    
T  8576682 caca 8576685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 273 - 555
Target Start/End: Original strand, 8609994 - 8610276
Alignment:
Q  273 cattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaa 372  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | |||||| | ||||| ||| || || || || ||  |||  | | |||| ||||||| ||||||||| |||    
T  8609994 cattctgtgatcaaagtcctctcctccaaggtgagtatctccagcagtagccttgacatcgaaagcattgtttttaattgtgagaacagacacatcgaaa 8610093  T
Q  373 gtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaa 472  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |   |  ||||  || ||||||||| ||| |||||||||| ||| || || || || ||||| |    
T  8610094 gtcccaccaccaagatcaaagataaaaatatttctattttccacacaattagctctcttctgaagaccatatgcaagagccgcagccgttggttcattga 8610193  T
Q  473 ttattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcaca 555  Q
    | || |  || |||||||| |||| |||| ||||||||||  | |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  8610194 taatccggattacattaaggccagaaatgacaccagcatcttttgtggctttccgctgagaatcattaaaataagcaggcaca 8610276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 358 - 551
Target Start/End: Original strand, 8538198 - 8538391
Alignment:
Q  358 agagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctg 457  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  || |||||  || ||||  || ||||||| | ||| || ||||||| ||| || |    
T  8538198 agagatacatcaaaagttccaccaccaagatcaaagatgaaaacttttctctcttcaacacaattagctctcttttgaaggccgtatgcaagagcagcag 8538297  T
Q  458 cagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcagg 551  Q
    | || || ||||| ||||| | ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8538298 ctgtaggttcattgattatccgcattacattgaggccagcaatgacaccagcatctttggtggctcttcgctgtgaatcattgaaataagcagg 8538391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 29581945 - 29581811
Alignment:
Q  260 caaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaag 359  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |  |||| ||| || || |||||||||  ||||||  | |  ||||||||    
T  29581945 caaagtaattcaccattcggttatcaaagtcctctcctcctaggtgagtatcgccagcagtggccttcacttcaaacttatcatccttgagtgtgagaag 29581846  T
Q  360 agacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaaga 394  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29581845 agacacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaaga 29581811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 7877872 - 7877706
Alignment:
Q  225 aatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgct 324  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||| |||   || || | |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| | ||| | ||| |||    
T  7877872 aatgtccactttattcttcctcttaaactccatcactaaatggttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgagtatctccggcagtagct 7877773  T
Q  325 ttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaa 391  Q
     | || |||||   ||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7877772 attacatcaaagctatcatcttttagtgtgagaagagacacatcgaaagtgccaccaccaagatcaa 7877706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 273 - 394
Target Start/End: Original strand, 8590715 - 8590836
Alignment:
Q  273 cattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaa 372  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||| || | ||| ||||| ||||| || |||||   |||| || | |  |||||||||||||||||||||    
T  8590715 cattctgttatcaaagtcctctcctcctaggtgggtatctccggaagtggcttttacatcaaagctatcacctttgagtgtgagaagagacacatcaaaa 8590814  T
Q  373 gtcccaccaccaagatcaaaga 394  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  8590815 gtgccaccaccaagatcaaaga 8590836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Original strand, 3147123 - 3147207
Alignment:
Q  55 aaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaa 139  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||  || |||||||||  |||||||||||    
T  3147123 aaaagatccatattgatttcctcaaacttggcacgagtgattgatgaaaataagtcaaatccctgaaataaagaatctatctcaa 3147207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 426 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 8671568 - 8671440
Alignment:
Q  426 tctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggctttt 525  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |  || |||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||  ||    
T  8671568 tctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgaatgacattaagtccagcaatagtaccagcatcaatggtggccgtt 8671469  T
Q  526 cgctgtgcatcattgaaataagcaggcac 554  Q
    ||||| | ||||||||| ||||| |||||    
T  8671468 cgctgagaatcattgaagtaagctggcac 8671440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 29577812 - 29577479
Alignment:
Q  224 taatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgc 323  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| || || |  ||||||| | ||| |||| | ||||| ||||||||||| || | |||||| |  |||| ||| ||    
T  29577812 taatgtccacattgttcttcctcttcaactcattcacaaagtggctcaccattttattatcgaagtcctctcctcctaggtgagtatcaccagcagtggc 29577713  T
Q  324 tttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctct---cagcatcacac 420  Q
     || ||||||||   ||||||  |||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  || | ||| | ||   || || || |     
T  29577712 ctttacttcaaaactatcatccttaagtgtgagaagagacacatcaaaggtgccaccaccaagatcaaagatgaatacatttcgctttccaacaacaaaa 29577613  T
Q  421 ctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtgg 520  Q
     |||||||||| | || |||||||||||  || || ||||| || ||||| ||||| | ||| ||||| || ||||||||    || |||||  | ||||    
T  29577612 ttacctctcttttgaattccatatgcaagtgcagcagcagttggttcattgattatccgcattacattgaggccagcaataatgccggcatctttggtgg 29577513  T
Q  521 cttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcac 554  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  29577512 cttttcgctgagaatcattgaaataagctggcac 29577479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 426 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 7877671 - 7877542
Alignment:
Q  426 tctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggctttt 525  Q
    |||||| | ||| ||||||||||  || || ||||| || ||||||||||| | ||||||||| || || ||||  |||||||||||  | |||||||||    
T  7877671 tctcttttgaaggccatatgcaagggcagcagcagttggttcattaattatccgcataacattgaggccggcaactgcaccagcatcttttgtggctttt 7877572  T
Q  526 cgctgtgcatcattgaaataagcaggcaca 555  Q
    || || | ||||||||||||||| ||||||    
T  7877571 cgttgagaatcattgaaataagccggcaca 7877542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 126
Target Start/End: Original strand, 1301316 - 1301390
Alignment:
Q  52 ttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaa 126  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||| || || |||||||||    
T  1301316 ttaaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgaaataaa 1301390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 551
Target Start/End: Original strand, 8102916 - 8103022
Alignment:
Q  445 gcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaat 544  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||| ||  ||||||||||  |||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  8102916 gcaatagcagcagcagttggctcattaataattctcaaaacatttaaaccagcgataacaccagcatctttagttgcttgacgctgagaatcattgaagt 8103015  T
Q  545 aagcagg 551  Q
    |||||||    
T  8103016 aagcagg 8103022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 113
Target Start/End: Original strand, 8664907 - 8664977
Alignment:
Q  43 atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaat 113  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||| |||| |||||    
T  8664907 atacactttgtaaaaaggtccatattgatttcctcaaacctcgcacgagttattgatgaacaaaattcaat 8664977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 8017344 - 8017229
Alignment:
Q  433 tcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtg 532  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || ||||| || || ||||||| |||||| || || |||||| |||| |||||| | |||||||  ||||| |    
T  8017344 tcaagtccgtacgcaatagctgcagctgttggctcgttgataattctcaaaacattgagtcctgcaatgacaccggcatcctttgtggcttgacgctgcg 8017245  T
Q  533 catcattgaaataagc 548  Q
     ||||||||| |||||    
T  8017244 aatcattgaagtaagc 8017229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 198
Target Start/End: Original strand, 8576293 - 8576328
Alignment:
Q  163 agtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8576293 agtgtcctttttgccttttcacaagcagttctcaac 8576328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 102
Target Start/End: Original strand, 8601798 - 8601880
Alignment:
Q  22 taagacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaa 102  Q
    |||||||||| | ||||||||  |||||||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||| |  ||||||||||||||    
T  8601798 taagacaactttcaacagtctctatacacttcttaaagaggtccacattgagttgctcaaacttggcccgagtgattgatgaa 8601880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 126
Target Start/End: Original strand, 8646742 - 8646807
Alignment:
Q  61 tccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaa 126  Q
    |||||||||||| | ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  8646742 tccatattgattgcgtcaaatttggcacgagtgattgatgaaataaagtcaatgccattaaataaa 8646807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 517 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 29581688 - 29581651
Alignment:
Q  517 gtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcac 554  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  29581688 gtggcttttcgctgagaatcattgaaataagcaggcac 29581651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 428 - 513
Target Start/End: Original strand, 39985878 - 39985963
Alignment:
Q  428 tcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatcc 513  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||  | |||||||||    
T  39985878 tcttgtcaagaccataagcaatggcagcagcagtgggctcattgataattcgcatgacattaagaccggcaataactccagcatcc 39985963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 43 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 16662313 - 16661766
Alignment:
Q  43 atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaa 142  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| | |   |||||| ||| ||||||| |     
T  16662313 atacactcgttaaaaaggcccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatag 16662214  T
Q  143 ttgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttctt 242  Q
      ||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||   ||||| ||||||||||  |  || || ||||| ||||||||    
T  16662213 cggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttctt 16662114  T
Q  243 cgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgctttaacttcaaacacatca 342  Q
    | | |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16662113 cctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatca 16662014  T
Q  343 tctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccat 442  Q
     || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||| ||| || ||||| ||||    
T  16662013 cctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttctttcaccatcacaattacttcttttgtcaaggccat 16661914  T
Q  443 atgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaa 542  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| || ||    
T  16661913 atgcaatagctgctgcagtgggttcattgattatcctcacaacgttaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttcgctgagaatcgttaaa 16661814  T
Q  543 ataagcaggcacatacagtgacaactgcatttttaactggggattccaaata 594  Q
    |||||||||     ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16661813 ataagcagg----aacagtgacaactgcatttttaaccggtgattccaaata 16661766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 55 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 16657826 - 16657326
Alignment:
Q  55 aaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaact 154  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||| ||||||| | |||| |||      
T  16657826 aaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaag 16657727  T
Q  155 tgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattc 254  Q
      || ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||   ||||| |||||||  |  |   | |||||||| || |||||| | | ||| ||    
T  16657726 caaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttgagttcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactc 16657627  T
Q  255 ctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtg 354  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| ||||| || ||||| |||||| |  |||| ||     
T  16657626 ctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgta 16657527  T
Q  355 agaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctg 454  Q
    || | ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||   || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16657526 aggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattccgtttaccatcacaatcacttctcttgtcaagaccatatgcaatagctg 16657427  T
Q  455 ctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcac 554  Q
    | ||||| || ||||| || ||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||    
T  16657426 cagcagtaggttcattgataattcgaatgacattaaggccagcgatggcaccagcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcac 16657327  T
Q  555 a 555  Q
    |    
T  16657326 a 16657326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 573
Target Start/End: Original strand, 7542073 - 7542599
Alignment:
Q  43 atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaa 142  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||| |   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |     
T  7542073 atacactcgttaaaaagatccatattcatctcctcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaagaatctacctcaatag 7542172  T
Q  143 ttgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttctt 242  Q
    | |  | ||    ||| || ||||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||   ||||| ||| ||||||  |   |||||||||| ||||||||    
T  7542173 tggcaacaacaaggaaagaaagtgatctttttgccctctcacaagcagttctcaacctcctcaaggcttttggattcccactaatgtccactttgttctt 7542272  T
Q  243 cgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgctttaacttcaaacacatca 342  Q
      |||| || || | |||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||| |||| ||| || |||||||  ||    |      
T  7542273 tctcttgaactcttgtacaaagtagttcgccattctattatcaaagtcttctccaccaaggtgagtgttgccagcagtggccttaacttggaagttgttg 7542372  T
Q  343 tctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccat 442  Q
     |  |||| || || | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||  ||||| |   |  |||||| ||||| ||||    
T  7542373 cccttaatcgttagtaaagacacatcaaaagtgccaccgccaagatcaaaaacaaaaatatttcgctctccatcataatcagttctcttgtcaaggccat 7542472  T
Q  443 atgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaa 542  Q
    |||||| |||||| ||||| || ||||| |||   ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||| ||    
T  7542473 atgcaacagctgcggcagtaggttcattcattgccctcataacattgaggccagcaatggcacccgcatctatagtggcttttcgttgagaatcattaaa 7542572  T
Q  543 ataagcaggcacatacagtgacaactgcatt 573  Q
    |||||||||    |||||| |||||||||||    
T  7542573 ataagcagg----tacagtaacaactgcatt 7542599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 264 - 554
Target Start/End: Original strand, 12234757 - 12235047
Alignment:
Q  264 gtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagac 363  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||  || |||| | || | || || || ||||||    
T  12234757 gtagtttaccattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccggctgtggctttaacttggaagacattacctttgattgttaggagagac 12234856  T
Q  364 acatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgg 463  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||  || ||||   |  |||||| ||||| |||||||||| ||| |||||  |||    
T  12234857 acatcaaaagtgccaccgccgagatcaaaaacaaaaatatttcgttctccaacacaatcagttctcttgtcaagaccatatgcaacagcggctgccatgg 12234956  T
Q  464 gctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcac 554  Q
    | || || ||||  ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  12234957 gttcgttcattaccctcataacattgaggccagcaatgacaccagcatctatagttgcttttcgttgagaatcattgaaataagcaggcac 12235047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 259 - 554
Target Start/End: Original strand, 14703471 - 14703766
Alignment:
Q  259 acaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaa 358  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||| ||  || ||     |  |||| || || |    
T  14703471 acaaagtagttcaccattctgttatcgaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagcagtagccttaatttggaagacggtgcccttaattgttagga 14703570  T
Q  359 gagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgc 458  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||  || || |   |  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14703571 gagacacgtcaaaagtaccaccaccaagatcaaagacaaatatattacgttctccaccataatcagttctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagc 14703670  T
Q  459 agtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcac 554  Q
     || || ||||| ||||  ||||||||||| || || |||||  ||||||||||||||||||||||||  || | |||| | ||||||||||||||    
T  14703671 tgtaggttcattcattaccctcataacattgaggccggcaataacaccagcatccatagtggcttttctttgagaatcactaaaataagcaggcac 14703766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 235 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 12245535 - 12245219
Alignment:
Q  235 ttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgctttaacttcaa 334  Q
    ||||||||  |||| || |||| | |||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || | |||||||||||||| ||| || |||||||  |    
T  12245535 ttgttctttctcttgaactcctgtgcaaagtagtttaccattctattatcaaaatcctctcctccaaggtgagtgtttccagcagtggccttaacttgga 12245436  T
Q  335 acacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctc 434  Q
    | |  | |||  |||| || || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||  || ||||   | ||||||| ||    
T  12245435 agatgttatccttaatagttaggatagaaacgtcaaaagtgccaccaccaagatcaaacacaaaaatgtttctttctccaacacaatcagctctcttttc 12245336  T
Q  435 aagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgca 534  Q
    ||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| || || ||||||||||| | |    
T  12245335 aaggccatatgcaacagctgcagcagtgggttcattcattaccctcataacattgagaccagcaattgagccagcatctatcgttgcttttcgctgagaa 12245236  T
Q  535 tcattgaaataagcagg 551  Q
    ||| | |||||||||||    
T  12245235 tcactaaaataagcagg 12245219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 235 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 12258710 - 12258539
Alignment:
Q  235 ttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgctttaacttcaa 334  Q
    ||||||||  |||| || || |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||  || || ||||||| ||    
T  12258710 ttgttctttctcttgaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaa 12258611  T
Q  335 acacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcc 406  Q
    | |||| |||  ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12258610 agacattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcc 12258539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 224 - 554
Target Start/End: Original strand, 43625440 - 43625770
Alignment:
Q  224 taatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgc 323  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||    
T  43625440 taatatccacattgttcttcttctcaaattcttctgcaaagtagttcaccattctatcatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccagcagtggc 43625539  T
Q  324 tttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacaccta 423  Q
    ||||||    || || |  ||  |||| || || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||| |  ||  || ||||  ||    
T  43625540 tttaacacggaagaccttgtccttaattgtaagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagatgaaaatatttcgttctccaacacaatta 43625639  T
Q  424 cctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggctt 523  Q
      |||||| | ||| || ||||| | ||| || || || || ||||| |||| ||  | ||||||||| ||  ||||| ||||| |||| || |||||||    
T  43625640 attctcttgttaaggccgtatgctagagcagcagctgttggttcattgattactcgtaaaacattaaggccgacaatgacaccaacatctatggtggctt 43625739  T
Q  524 ttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcac 554  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  43625740 ttcgctgagaatcattgaagtaagcaggcac 43625770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 548
Target Start/End: Original strand, 11999478 - 11999746
Alignment:
Q  280 ttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccac 379  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||  || || |||||||  || ||||  ||  |||| || || | ||||| ||||||||| ||||    
T  11999478 ttatcaaaatcctctcctccgaagtgagtgtttccagctgtggccttaacttggaagacattgtccttaattgttagtatagacaaatcaaaagtgccac 11999577  T
Q  380 caccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattct 479  Q
    | |||||||||||||| ||||| || || ||  || ||||   | ||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||| ||||| ||||  ||    
T  11999578 cgccaagatcaaagactaaaatgtttctttctccaacacaatcagctctcttgtcaaggccatatgcaacagttgcagcagtgggttcattcattaccct 11999677  T
Q  480 cataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagc 548  Q
     |||||||| |  |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || | |||| | ||||||||    
T  11999678 tataacattgatgccagcaattgcaccggcatctatagtggcttttcgttgagaatcactaaaataagc 11999746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 439 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 17716618 - 17716546
Alignment:
Q  439 ccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcat 511  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17716618 ccataagcaatggctgcagcagtgggctcattaataattctcatgaaattaagaccagcaatagcaccagcat 17716546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 139
Target Start/End: Original strand, 14703232 - 14703351
Alignment:
Q  22 taagacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttg 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  | |||||  ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |   | |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  14703232 taagacaactctcaacaatcttcacacactcattaaaaaagtccatattcatttcttcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaagtcaatgcattg 14703331  T
Q  120 aaataaattatctatctcaa 139  Q
    |||||||  ||||| |||||    
T  14703332 aaataaagcatctacctcaa 14703351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 113
Target Start/End: Original strand, 43625236 - 43625329
Alignment:
Q  22 taagacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaat 113  Q
    ||||||||||||||||||| |  | ||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  43625236 taagacaactcttaacagttttcaaacactcgttgaaaagatccatatttatttcatcaaatttggcacgagtgattgatgaaaagaagtcaat 43625329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12258926 - 12258806
Alignment:
Q  21 gtaagacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgcctt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||  || || |  || ||||| |||| ||| ||||||||||||||| || || ||||||||| |||||| |||||||| |    
T  12258926 gtaagacaactctcaacagtcttcatgcattcattgaaaagttccaaatttatttcctcaaacttggcacgattgattgatgcagaaaaatcaatgccat 12258827  T
Q  119 gaaataaattatctatctcaa 139  Q
     | |||||  |||||||||||    
T  12258826 cacataaagaatctatctcaa 12258806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 139
Target Start/End: Original strand, 12234513 - 12234632
Alignment:
Q  22 taagacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttg 119  Q
    |||||||||||| |||| |||  |||||||   ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |   | |||| ||||||||||| ||||||||||     
T  12234513 taagacaactctcaacaatcttcatacactcaataagaagatccatattcatttcctcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaaatcaatgccttc 12234612  T
Q  120 aaataaattatctatctcaa 139  Q
    |||||||  ||||| |||||    
T  12234613 aaataaagaatctacctcaa 12234632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 4678901 - 4678367
Alignment:
Q  22 taagacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttg 119  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||| || || ||    
T  4678901 taagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaaagtctattccctg 4678802  T
Q  120 aaataaattatctatctcaacaattgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcg 219  Q
    |||||||  ||||| ||||||| | |||| |||   ||| ||||||||||| |||||| | || || ||||||||||||   || || | | |||  |      
T  4678801 aaataaagaatcta-ctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccttaagggttttgcgttc 4678703  T
Q  220 cgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaag 319  Q
        |||||||||| || |||||| | || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||    
T  4678702 ttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgagtgtttccagcag 4678603  T
Q  320 ttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcaca 419  Q
    | ||||| |||||||| ||| || |  | ||  | || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  | |  |||||     
T  4678602 tggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttcgtttacaatcact 4678503  T
Q  420 cctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtg 519  Q
       || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||| || || || ||||||   || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||     
T  4678502 ttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcaacagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcaccagcatctatggta 4678403  T
Q  520 gcttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcaca 555  Q
    |||||||| || | ||||||||| || |||||||||    
T  4678402 gcttttcgttgagaatcattgaagtatgcaggcaca 4678367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 260 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 34466897 - 34466567
Alignment:
Q  260 caaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaag 359  Q
    |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||  |||| || || ||    
T  34466897 caaagtggttcgccattctattatcaaagtcctctcgtccgaggtgagtgttaccagaagtggccttaacttcaaagacattatccttaattgtaaggag 34466798  T
Q  360 agacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgca 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||  |  || |   | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34466797 agacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaagacgaaaatatttccttcttccacaaagtcagctctcttgtcaagtccatatgcaatagctgcagca 34466698  T
Q  460 gtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcacataca 559  Q
    ||||| ||||| ||||||  || ||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||         
T  34466697 gtgggttcattgattatttgcaaaacattaaggccagcaatagtaccagcatccacagtagcttttcgctgagaatcattaaaataagcaggcacg---- 34466602  T
Q  560 gtgacaactgcatttttaactggggattccaaata 594  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  34466601 gtgataactgcattcttaattggtgattccaaata 34466567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 223 - 554
Target Start/End: Original strand, 15595061 - 15595399
Alignment:
Q  223 gtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttg 322  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    || |    
T  15595061 gtaatatccactttgttcttcgtcttgaattcctgcgcaaagtagttgaccattctgttatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccgcctgtgg 15595160  T
Q  323 ctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacct 422  Q
    | |||||||  || || |  ||  |||| || || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  || ||||  |    
T  15595161 ccttaacttggaagaccttgtccttaattgttaggatagacacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttctttctccaacacagtt 15595260  T
Q  423 acctctcttctcaagtccatatgcaatagctg-------ctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccat 515  Q
    |   ||||| ||||| ||||||||||||||||       | || || || ||||| ||||  |  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  15595261 aatcctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagctgtcagctgtcggttcattgattacccgtataacattaaggccagcaatggcacctgcatctat 15595360  T
Q  516 agtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcac 554  Q
    |||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||    
T  15595361 agtggcttttcgttgagaatcattgagataagcaggcac 15595399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 34467089 - 34467047
Alignment:
Q  60 gtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  34467089 gtccatattgatttcctcaaacttggcacgagtgattgacgaa 34467047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 52549333 - 52549292
Alignment:
Q  43 atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttg 84  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52549333 atacactccttaaaaaggtccatattcatttcctcaaacttg 52549292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 358 - 555
Target Start/End: Original strand, 43745011 - 43745206
Alignment:
Q  358 agagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcct--ctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctgc 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||  ||| ||| || |  ||  |||||| || || |||||||||||||||||    
T  43745011 agagacacatcaaaagtcccaccacccaggtcaaagatgaaaatatttcttcctc-gca-cagagttagttctcttttccagaccatatgcaatagctgc 43745108  T
Q  456 tgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcaca 555  Q
     |||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  43745109 agcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatc--tagtggctttccgctgataatcattgaaataagccggcaca 43745206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 317
Target Start/End: Original strand, 43744785 - 43744937
Alignment:
Q  165 tgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaag 264  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| |||||||||   || || |||||||| |  |  ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | |||    
T  43744785 tgtcctttttgctctttcgcatgctgttctcaacctccttaatgctcttgggtttccagtaatgtccaccttgttcttcttcttaaactcctctgcgaag 43744884  T
Q  265 tagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccaga 317  Q
    ||||||| ||| || |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  43744885 tagttcaccatcctattatcaaaatcctctcctccgaggtgagtgtttccaga 43744937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 554
Target Start/End: Original strand, 12528532 - 12528862
Alignment:
Q  224 taatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgc 323  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||| || |  |||||||  |||| |||||  ||||||||||||||||| || | |||||||| ||| | ||| ||    
T  12528532 taatgtcaactttgttcttcctcttaaactctttcacaaagtgattcaccattcgattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtctccggcagtggc 12528631  T
Q  324 tttaacttcaaacacatcat-ctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacct 422  Q
     || ||||| || |||| || || || || | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||  | |||||  ||  |||  |    
T  12528632 cttgacttcgaagacattattctttactg-taagaagagacacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaaaataaaaatccttctctcttcaagacaatt 12528730  T
Q  423 acctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggct 522  Q
    | ||||||| | ||  |||||||||| ||| |||||||| || || || ||||| |  || ||||| || ||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  12528731 agctctcttttgaatgccatatgcaagagcagctgcagttggttcgttgattatccgtattacattgaggccagcaatgacaccagcatccttggtggct 12528830  T
Q  523 tttcgctgtgcatcattgaaataagcaggcac 554  Q
      |||||| | |||||||||||| || |||||    
T  12528831 cgtcgctgcgaatcattgaaatacgctggcac 12528862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 316
Target Start/End: Original strand, 28219945 - 28220038
Alignment:
Q  223 gtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccag 316  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28219945 gtaatgtccaccttgttcttcttcttaaactcctctgcgaagtagttcaccatcctactatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccag 28220038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 438 - 555
Target Start/End: Original strand, 28220193 - 28220310
Alignment:
Q  438 tccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatca 537  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||| || | |||||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||   ||||    
T  28220193 tccatatgcaatagcagcagcagtgggttcattgactatccttagaacatttagaccagcaatggtacctgcatctatggtggctttccgctgataatca 28220292  T
Q  538 ttgaaataagcaggcaca 555  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28220293 ttgaaataagcaggcaca 28220310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Original strand, 28219777 - 28219861
Alignment:
Q  55 aaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaa 139  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| | || |||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  28219777 aaaagatccatattgatttcctcaaacttagcacgagtaattgatgaaaagaaatcaatgccttcaaataaagaatctacctcaa 28219861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 358 - 404
Target Start/End: Original strand, 28220113 - 28220159
Alignment:
Q  358 agagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||    
T  28220113 agagacacatcaaaagtcccaccacccaggtcaaagatgaaaatatt 28220159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 546
Target Start/End: Original strand, 28910650 - 28910932
Alignment:
Q  264 gtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaagttgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagac 363  Q
    |||||||| ||| || ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||  || || |||||||  || || | |||   ||| || || |||||     
T  28910650 gtagttcaccatcctattatcaatgtcctcgaccccgaggtgagtgtttccagcggtggccttaacttggaagaccttatcctgaattgtaaggagagaa 28910749  T
Q  364 acatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgg 463  Q
    |||||||||||||||| ||| || || ||||  ||| |||| |  ||  || |||||  | ||||||| || || ||||||| ||||||| | ||||||     
T  28910750 acatcaaaagtcccactacccaggtcgaagatgaaagtatttcgttctccagcacactcagctctcttgtcgaggccatatgaaatagctacagcagtga 28910849  T
Q  464 gctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataa 546  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||| |   |||||||||||||||| || |||||||| | ||  | |||||||||||||    
T  28910850 gctcattgattatccgcataacattaagcctgacaatggcaccagcatctatggtggctttcctctaagaatcattgaaataa 28910932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 439 - 512
Target Start/End: Original strand, 11276197 - 11276270
Alignment:
Q  439 ccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatc 512  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  11276197 ccatatgcaattgcagctgcagtaggctcatttattattcgcataacgtttaggccagcaatagcacccgcatc 11276270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 500
Target Start/End: Original strand, 11156507 - 11156574
Alignment:
Q  433 tcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaat 500  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  11156507 tcaagaccatatgcaattgcagctgcagaaggctcattgattattcgcataacattgaggccagcaat 11156574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 512
Target Start/End: Original strand, 11170807 - 11170886
Alignment:
Q  433 tcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatc 512  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| || |||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  11170807 tcaaggccatatgcaattgcagctgcagtaggctcattgagtattcgcaaaacattgaggccagcaatagcacccgcatc 11170886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 500
Target Start/End: Original strand, 11196960 - 11197027
Alignment:
Q  433 tcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaat 500  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  11196960 tcaagaccatatgcaattgcagctgcagaaggctcattgattattcgcataacattgaggccagcaat 11197027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 512
Target Start/End: Original strand, 11200125 - 11200204
Alignment:
Q  433 tcaagtccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatc 512  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||||| || |||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  11200125 tcaagaccatatgcaattgcagctgcagaaggctcattgattattcgcaaaacattgaggccagcaatagcacccgcatc 11200204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 512
Target Start/End: Original strand, 11209635 - 11209708
Alignment:
Q  439 ccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatc 512  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| || |||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  11209635 ccatatgcaattgcagctgcagtaggctcattgagtattcgcaaaacattgaggccagcaatagcacccgcatc 11209708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1207 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1207
Description:

Target: scaffold1207; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 512
Target Start/End: Original strand, 1128 - 1201
Alignment:
Q  439 ccatatgcaatagctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatc 512  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| || |||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  1128 ccatatgcaattgcagctgcagtaggctcattgagtattcccaaaacattgaggccagcaatagcacctgcatc 1201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University