View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11907_low_3 (Length: 574)

Name: NF11907_low_3
Description: NF11907
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11907_low_3
NF11907_low_3
[»] chr3 (239 HSPs)
chr3 (252-554)||(15996510-15996810)
chr3 (254-554)||(20621423-20621721)
chr3 (255-554)||(45513375-45513674)
chr3 (256-554)||(10015530-10015826)
chr3 (247-505)||(43158468-43158726)
chr3 (255-556)||(8321923-8322222)
chr3 (256-554)||(19897577-19897873)
chr3 (270-508)||(45323842-45324080)
chr3 (253-505)||(31186805-31187057)
chr3 (256-503)||(52291168-52291415)
chr3 (266-503)||(50726535-50726772)
chr3 (266-503)||(50786076-50786313)
chr3 (266-502)||(43978210-43978446)
chr3 (254-501)||(17698771-17699018)
chr3 (266-501)||(52044540-52044775)
chr3 (251-505)||(2993306-2993560)
chr3 (248-554)||(49383344-49383649)
chr3 (266-508)||(32978526-32978767)
chr3 (256-505)||(28673035-28673284)
chr3 (256-501)||(46049727-46049972)
chr3 (271-505)||(14758885-14759117)
chr3 (266-503)||(12050144-12050381)
chr3 (256-501)||(48213803-48214048)
chr3 (256-554)||(46845231-46845529)
chr3 (259-505)||(48909919-48910165)
chr3 (255-505)||(47066981-47067233)
chr3 (255-554)||(1450242-1450541)
chr3 (269-505)||(35711322-35711558)
chr3 (256-505)||(50433128-50433379)
chr3 (266-505)||(53361604-53361845)
chr3 (254-505)||(8546951-8547204)
chr3 (255-505)||(27688033-27688282)
chr3 (253-505)||(17753271-17753525)
chr3 (253-505)||(19054591-19054845)
chr3 (250-505)||(23776230-23776485)
chr3 (254-505)||(13809546-13809799)
chr3 (267-556)||(21458980-21459269)
chr3 (255-505)||(9499235-9499487)
chr3 (256-505)||(10656738-10656989)
chr3 (256-505)||(46862105-46862356)
chr3 (266-556)||(6784461-6784750)
chr3 (266-505)||(22103678-22103919)
chr3 (275-556)||(48887704-48887985)
chr3 (271-505)||(50730372-50730609)
chr3 (271-505)||(50782245-50782482)
chr3 (255-505)||(12906150-12906402)
chr3 (255-505)||(53686735-53686987)
chr3 (256-554)||(4759088-4759388)
chr3 (304-560)||(10220927-10221180)
chr3 (254-505)||(43686548-43686801)
chr3 (256-501)||(38071246-38071494)
chr3 (255-505)||(51489414-51489665)
chr3 (252-554)||(26221288-26221590)
chr3 (256-499)||(41992279-41992509)
chr3 (253-505)||(43868150-43868404)
chr3 (266-505)||(7181397-7181638)
chr3 (266-505)||(46703074-46703315)
chr3 (310-505)||(46861667-46861864)
chr3 (266-505)||(50517271-50517512)
chr3 (251-505)||(54782651-54782907)
chr3 (256-505)||(1084693-1084944)
chr3 (280-505)||(23700548-23700775)
chr3 (280-505)||(23719003-23719230)
chr3 (280-505)||(23737459-23737686)
chr3 (256-505)||(54107400-54107651)
chr3 (249-505)||(7051452-7051710)
chr3 (275-554)||(45745778-45746057)
chr3 (266-482)||(40919024-40919242)
chr3 (275-505)||(49126956-49127188)
chr3 (266-556)||(45252771-45253061)
chr3 (254-505)||(42801519-42801772)
chr3 (256-505)||(44543829-44544079)
chr3 (266-505)||(52673234-52673475)
chr3 (266-505)||(53164210-53164451)
chr3 (275-505)||(32467472-32467704)
chr3 (285-503)||(43557221-43557441)
chr3 (275-505)||(43701225-43701457)
chr3 (266-505)||(16434987-16435227)
chr3 (266-505)||(25148506-25148743)
chr3 (280-505)||(30040780-30041007)
chr3 (266-502)||(20656059-20656297)
chr3 (266-554)||(24087087-24087372)
chr3 (253-505)||(46878175-46878429)
chr3 (266-505)||(7251031-7251272)
chr3 (266-505)||(21756533-21756774)
chr3 (266-505)||(33212443-33212684)
chr3 (256-437)||(25879254-25879436)
chr3 (248-425)||(41750919-41751097)
chr3 (266-548)||(9779989-9780272)
chr3 (266-502)||(36005553-36005791)
chr3 (266-505)||(45048771-45049012)
chr3 (275-505)||(25148880-25149112)
chr3 (267-486)||(33976549-33976766)
chr3 (256-505)||(42390643-42390894)
chr3 (275-500)||(54604346-54604573)
chr3 (275-505)||(1641858-1642089)
chr3 (266-505)||(31531160-31531401)
chr3 (249-505)||(20862243-20862501)
chr3 (275-505)||(32569044-32569275)
chr3 (275-505)||(32962863-32963094)
chr3 (253-505)||(50647681-50647934)
chr3 (266-505)||(4024099-4024338)
chr3 (266-505)||(10044888-10045127)
chr3 (266-505)||(33868495-33868735)
chr3 (292-505)||(35165738-35165952)
chr3 (266-440)||(37144235-37144413)
chr3 (256-505)||(37728760-37729010)
chr3 (266-505)||(52058995-52059235)
chr3 (267-505)||(17591296-17591535)
chr3 (331-505)||(43408542-43408719)
chr3 (266-505)||(14428657-14428896)
chr3 (254-505)||(36099012-36099263)
chr3 (324-501)||(49383640-49383819)
chr3 (256-554)||(41824108-41824405)
chr3 (346-505)||(12683011-12683172)
chr3 (255-376)||(18658167-18658288)
chr3 (266-505)||(26593514-26593755)
chr3 (266-505)||(35572207-35572445)
chr3 (283-505)||(35867849-35868073)
chr3 (256-378)||(39625197-39625318)
chr3 (266-450)||(19350125-19350312)
chr3 (283-502)||(25916450-25916673)
chr3 (316-505)||(33361500-33361683)
chr3 (271-415)||(23308075-23308221)
chr3 (254-505)||(36317394-36317645)
chr3 (266-505)||(39952318-39952558)
chr3 (256-505)||(51283802-51284053)
chr3 (292-501)||(1572382-1572591)
chr3 (301-505)||(20877680-20877883)
chr3 (266-505)||(26058593-26058826)
chr3 (256-435)||(54866390-54866570)
chr3 (255-502)||(29383064-29383313)
chr3 (255-554)||(47008241-47008539)
chr3 (266-502)||(53271642-53271878)
chr3 (255-502)||(1111387-1111635)
chr3 (318-501)||(22832411-22832595)
chr3 (292-501)||(26806156-26806366)
chr3 (315-501)||(26306406-26306593)
chr3 (304-505)||(52177847-52178050)
chr3 (255-504)||(44561435-44561685)
chr3 (255-425)||(27646045-27646216)
chr3 (266-379)||(12675172-12675285)
chr3 (291-441)||(35938472-35938624)
chr3 (346-501)||(44542303-44542460)
chr3 (303-505)||(54849410-54849614)
chr3 (384-557)||(49543674-49543845)
chr3 (270-428)||(41392633-41392793)
chr3 (275-379)||(20849007-20849111)
chr3 (270-425)||(33290473-33290627)
chr3 (384-498)||(18658328-18658442)
chr3 (323-501)||(28810928-28811107)
chr3 (384-499)||(46557752-46557867)
chr3 (254-425)||(54927828-54928001)
chr3 (248-365)||(25130834-25130951)
chr3 (324-425)||(38341077-38341177)
chr3 (266-429)||(49543929-49544093)
chr3 (253-332)||(43408189-43408268)
chr3 (402-505)||(9582290-9582393)
chr3 (256-425)||(29719451-29719621)
chr3 (266-344)||(46557664-46557742)
chr3 (352-505)||(30819925-30820079)
chr3 (323-423)||(42526432-42526533)
chr3 (323-554)||(17589683-17589913)
chr3 (323-554)||(48904070-48904300)
chr3 (346-501)||(7886892-7887048)
chr3 (401-501)||(20848612-20848712)
chr3 (323-425)||(34021802-34021905)
chr3 (402-508)||(22527507-22527614)
chr3 (339-428)||(40215052-40215142)
chr3 (323-505)||(48902516-48902698)
chr3 (346-505)||(31533414-31533574)
chr3 (256-325)||(33360885-33360954)
chr3 (253-377)||(16776483-16776607)
chr3 (402-554)||(39625681-39625833)
chr3 (323-426)||(42044061-42044165)
chr3 (339-554)||(42755341-42755555)
chr3 (323-425)||(15095325-15095428)
chr3 (339-425)||(4836516-4836601)
chr3 (323-501)||(8379728-8379907)
chr3 (323-425)||(24813713-24813814)
chr3 (266-320)||(49543866-49543920)
chr3 (251-425)||(12918573-12918748)
chr3 (461-502)||(16776833-16776874)
chr3 (323-415)||(21497618-21497711)
chr3 (390-443)||(48136964-48137017)
chr3 (461-505)||(7462943-7462987)
chr3 (461-501)||(20919133-20919173)
chr3 (461-501)||(20928095-20928135)
chr3 (323-399)||(31397930-31398006)
chr3 (266-362)||(46879210-46879306)
chr3 (519-554)||(4564237-4564272)
chr3 (324-371)||(23650639-23650686)
chr3 (323-425)||(45404501-45404604)
chr3 (324-425)||(4564364-4564466)
chr3 (303-365)||(9582398-9582460)
chr3 (250-295)||(10015787-10015832)
chr3 (327-376)||(20084697-20084746)
chr3 (323-425)||(34265531-34265640)
chr3 (323-424)||(36584835-36584935)
chr3 (384-425)||(55287388-55287429)
chr3 (266-330)||(7462850-7462914)
chr3 (461-505)||(31541074-31541118)
chr3 (461-505)||(41392826-41392870)
chr3 (348-425)||(48655072-48655150)
chr3 (519-554)||(4759088-4759123)
chr3 (323-425)||(28875059-28875161)
chr3 (255-298)||(28875246-28875289)
chr3 (519-554)||(28875253-28875288)
chr3 (519-554)||(36584710-36584745)
chr3 (519-554)||(42801521-42801556)
chr3 (429-501)||(54690580-54690652)
chr3 (519-557)||(10656954-10656992)
chr3 (461-557)||(15095195-15095289)
chr3 (253-295)||(19897834-19897876)
chr3 (323-408)||(29447602-29447688)
chr3 (461-554)||(32969171-32969262)
chr3 (256-298)||(36584710-36584752)
chr3 (322-425)||(38364295-38364400)
chr3 (520-554)||(49383836-49383870)
chr3 (519-560)||(8547167-8547208)
chr3 (339-399)||(22494483-22494544)
chr3 (519-556)||(33360883-33360920)
chr3 (253-298)||(48904258-48904303)
chr3 (519-556)||(54866535-54866572)
chr3 (461-501)||(7886460-7886500)
chr3 (520-556)||(8503508-8503544)
chr3 (521-557)||(10045104-10045140)
chr3 (522-554)||(12906418-12906450)
chr3 (521-557)||(16434974-16435010)
chr3 (520-552)||(20918221-20918253)
chr3 (520-552)||(20927183-20927215)
chr3 (519-551)||(24087080-24087112)
chr3 (246-290)||(24087338-24087382)
chr3 (520-556)||(27646309-27646345)
chr3 (266-298)||(32969220-32969252)
chr3 (521-557)||(36005768-36005804)
chr3 (430-503)||(41751384-41751457)
chr3 (266-298)||(45404385-45404417)
chr3 (461-505)||(52693634-52693678)
[»] chr1 (213 HSPs)
chr1 (255-554)||(41317593-41317891)
chr1 (257-554)||(9413067-9413362)
chr1 (256-554)||(6089735-6090031)
chr1 (251-497)||(229142-229388)
chr1 (256-555)||(34931078-34931375)
chr1 (266-505)||(52602038-52602277)
chr1 (266-505)||(8923417-8923658)
chr1 (256-554)||(7763491-7763786)
chr1 (266-505)||(4102465-4102704)
chr1 (256-501)||(40614646-40614891)
chr1 (290-554)||(25509209-25509470)
chr1 (256-557)||(36694851-36695152)
chr1 (256-557)||(36710952-36711253)
chr1 (249-554)||(21630838-21631144)
chr1 (268-505)||(41855226-41855463)
chr1 (248-505)||(48853865-48854122)
chr1 (256-556)||(8472047-8472344)
chr1 (280-554)||(1767627-1767897)
chr1 (266-554)||(26549791-26550076)
chr1 (266-489)||(43395422-43395645)
chr1 (254-505)||(3549079-3549329)
chr1 (256-505)||(15100403-15100660)
chr1 (252-505)||(27530339-27530592)
chr1 (253-505)||(38530888-38531140)
chr1 (282-505)||(26544551-26544774)
chr1 (252-505)||(12814522-12814777)
chr1 (256-554)||(27037269-27037567)
chr1 (256-554)||(28052189-28052487)
chr1 (256-505)||(31238766-31239016)
chr1 (256-554)||(42275900-42276198)
chr1 (256-554)||(5765730-5766027)
chr1 (255-554)||(48067633-48067932)
chr1 (271-486)||(14090006-14090223)
chr1 (255-439)||(44529413-44529597)
chr1 (256-501)||(23530596-23530843)
chr1 (256-505)||(38613522-38613773)
chr1 (256-550)||(45285551-45285843)
chr1 (269-508)||(19792616-19792855)
chr1 (253-547)||(9202242-9202535)
chr1 (256-500)||(14347174-14347420)
chr1 (265-505)||(15111628-15111874)
chr1 (255-554)||(28885841-28886141)
chr1 (270-505)||(36674051-36674288)
chr1 (266-505)||(45794391-45794632)
chr1 (256-505)||(9715407-9715658)
chr1 (266-453)||(14171630-14171817)
chr1 (256-440)||(25283918-25284104)
chr1 (254-424)||(44454563-44454736)
chr1 (267-502)||(9378852-9379090)
chr1 (256-554)||(15892303-15892600)
chr1 (256-555)||(28888162-28888462)
chr1 (283-502)||(31086689-31086910)
chr1 (255-560)||(38261334-38261639)
chr1 (266-505)||(52430923-52431164)
chr1 (253-501)||(25271242-25271489)
chr1 (267-508)||(27575387-27575630)
chr1 (266-505)||(11741444-11741685)
chr1 (283-501)||(37585004-37585222)
chr1 (266-505)||(42872083-42872324)
chr1 (256-503)||(47300632-47300881)
chr1 (266-501)||(50246679-50246916)
chr1 (284-505)||(15763362-15763585)
chr1 (266-505)||(30290312-30290553)
chr1 (253-500)||(51422162-51422414)
chr1 (256-505)||(2489141-2489390)
chr1 (283-554)||(16575858-16576129)
chr1 (313-501)||(39324576-39324766)
chr1 (282-505)||(2280001-2280225)
chr1 (266-505)||(11906977-11907218)
chr1 (266-505)||(16456683-16456924)
chr1 (266-505)||(24855328-24855569)
chr1 (256-453)||(896792-896990)
chr1 (275-501)||(943395-943623)
chr1 (303-505)||(32169741-32169944)
chr1 (266-556)||(46075617-46075906)
chr1 (266-503)||(39750131-39750369)
chr1 (302-497)||(43668187-43668384)
chr1 (266-505)||(49907068-49907309)
chr1 (256-453)||(25228295-25228494)
chr1 (317-502)||(15289984-15290171)
chr1 (266-505)||(15810982-15811222)
chr1 (266-505)||(38174923-38175160)
chr1 (259-503)||(13343822-13344068)
chr1 (266-502)||(50008232-50008470)
chr1 (253-504)||(3934653-3934906)
chr1 (266-557)||(23541976-23542266)
chr1 (292-551)||(10383817-10384079)
chr1 (255-505)||(45038101-45038352)
chr1 (255-407)||(51561069-51561220)
chr1 (292-453)||(51810975-51811138)
chr1 (266-505)||(37951699-37951939)
chr1 (266-505)||(44646318-44646558)
chr1 (266-508)||(1048002-1048245)
chr1 (269-505)||(1039134-1039371)
chr1 (269-505)||(1046040-1046277)
chr1 (253-505)||(30289599-30289852)
chr1 (275-508)||(8104048-8104282)
chr1 (266-505)||(39362944-39363184)
chr1 (292-501)||(45335936-45336147)
chr1 (283-482)||(37589011-37589211)
chr1 (310-501)||(50937829-50938022)
chr1 (266-505)||(7784038-7784281)
chr1 (292-554)||(18237094-18237353)
chr1 (266-505)||(44649676-44649916)
chr1 (266-505)||(45039459-45039699)
chr1 (266-505)||(39497480-39497720)
chr1 (270-390)||(26544377-26544497)
chr1 (292-505)||(7212334-7212549)
chr1 (251-374)||(26547685-26547807)
chr1 (249-508)||(47068832-47069092)
chr1 (266-441)||(1837322-1837505)
chr1 (255-505)||(22567116-22567367)
chr1 (266-477)||(36880372-36880582)
chr1 (310-502)||(50008024-50008217)
chr1 (255-503)||(18172377-18172610)
chr1 (254-503)||(27974893-27975144)
chr1 (266-505)||(35984412-35984652)
chr1 (253-378)||(32906702-32906828)
chr1 (320-508)||(39873488-39873678)
chr1 (303-501)||(34503287-34503487)
chr1 (307-500)||(46506204-46506398)
chr1 (384-554)||(11352933-11353099)
chr1 (255-502)||(31635869-31636117)
chr1 (303-504)||(47296353-47296556)
chr1 (303-503)||(10433369-10433572)
chr1 (254-378)||(35693240-35693364)
chr1 (306-505)||(47429177-47429377)
chr1 (253-503)||(9700487-9700738)
chr1 (256-378)||(18114211-18114333)
chr1 (303-503)||(31465714-31465916)
chr1 (303-502)||(32149097-32149298)
chr1 (256-355)||(11351441-11351541)
chr1 (253-440)||(37850174-37850362)
chr1 (384-505)||(48022953-48023074)
chr1 (256-503)||(27479647-27479895)
chr1 (314-452)||(31154359-31154498)
chr1 (292-424)||(32153569-32153703)
chr1 (333-449)||(9424870-9424988)
chr1 (256-505)||(2636927-2637176)
chr1 (290-498)||(1427253-1427462)
chr1 (324-425)||(2606722-2606829)
chr1 (292-501)||(15616184-15616397)
chr1 (268-502)||(26768435-26768670)
chr1 (323-503)||(39425637-39425818)
chr1 (256-425)||(45810116-45810287)
chr1 (270-501)||(47263506-47263741)
chr1 (303-508)||(4592622-4592829)
chr1 (340-554)||(29437678-29437891)
chr1 (401-505)||(39867542-39867646)
chr1 (324-425)||(23893505-23893607)
chr1 (428-548)||(5858261-5858379)
chr1 (323-425)||(35945335-35945438)
chr1 (275-394)||(13698769-13698889)
chr1 (346-425)||(41619998-41620076)
chr1 (323-425)||(48363821-48363924)
chr1 (401-501)||(51561764-51561864)
chr1 (317-440)||(31338946-31339073)
chr1 (256-446)||(47754431-47754623)
chr1 (323-554)||(17483733-17483962)
chr1 (254-425)||(22940559-22940730)
chr1 (461-556)||(47754015-47754109)
chr1 (323-425)||(4389736-4389839)
chr1 (405-505)||(27530806-27530905)
chr1 (267-425)||(27669969-27670127)
chr1 (417-505)||(32908288-32908376)
chr1 (323-425)||(52429014-52429117)
chr1 (260-374)||(27255465-27255579)
chr1 (324-425)||(30996871-30996973)
chr1 (255-365)||(46084055-46084165)
chr1 (323-505)||(49549048-49549231)
chr1 (303-425)||(1197953-1198079)
chr1 (324-425)||(4371574-4371674)
chr1 (270-374)||(15624646-15624750)
chr1 (324-372)||(23932941-23932989)
chr1 (346-556)||(43456451-43456660)
chr1 (323-425)||(1867262-1867365)
chr1 (255-378)||(5966749-5966870)
chr1 (316-375)||(8946442-8946501)
chr1 (323-425)||(15302551-15302654)
chr1 (333-441)||(30761008-30761118)
chr1 (323-425)||(46271159-46271262)
chr1 (253-295)||(1767858-1767900)
chr1 (519-557)||(4280128-4280166)
chr1 (327-429)||(33336924-33337025)
chr1 (461-506)||(19349253-19349298)
chr1 (324-505)||(21290168-21290350)
chr1 (469-505)||(897154-897190)
chr1 (522-554)||(6129918-6129950)
chr1 (254-298)||(17483731-17483775)
chr1 (339-426)||(38920360-38920448)
chr1 (522-554)||(45943978-45944010)
chr1 (461-554)||(25227304-25227398)
chr1 (519-554)||(27037532-27037567)
chr1 (519-554)||(28885842-28885877)
chr1 (519-554)||(38613738-38613773)
chr1 (259-298)||(46271345-46271384)
chr1 (323-425)||(51467280-51467383)
chr1 (256-298)||(4280121-4280163)
chr1 (385-443)||(10758489-10758547)
chr1 (461-503)||(38505848-38505890)
chr1 (323-365)||(52001531-52001573)
chr1 (521-554)||(7784258-7784291)
chr1 (323-444)||(22177549-22177669)
chr1 (521-554)||(30289602-30289635)
chr1 (384-428)||(5854461-5854505)
chr1 (323-425)||(6402670-6402773)
chr1 (255-295)||(9413323-9413363)
chr1 (316-412)||(9413514-9413610)
chr1 (324-372)||(10332367-10332415)
chr1 (461-505)||(30996791-30996835)
chr1 (255-295)||(39425829-39425869)
chr1 (461-505)||(43789701-43789745)
chr1 (461-501)||(44530554-44530594)
[»] chr5 (172 HSPs)
chr5 (256-554)||(20142000-20142296)
chr5 (266-554)||(9020694-9020981)
chr5 (266-554)||(14913648-14913935)
chr5 (253-554)||(7940452-7940751)
chr5 (266-505)||(16440978-16441217)
chr5 (254-505)||(20987952-20988203)
chr5 (256-554)||(3028013-3028313)
chr5 (266-505)||(32964179-32964418)
chr5 (255-505)||(13759187-13759437)
chr5 (256-554)||(43060150-43060448)
chr5 (266-505)||(23285082-23285325)
chr5 (267-502)||(14649235-14649472)
chr5 (255-554)||(4976027-4976327)
chr5 (249-505)||(9064954-9065212)
chr5 (265-505)||(27873093-27873335)
chr5 (266-554)||(38371723-38372012)
chr5 (266-554)||(20186501-20186789)
chr5 (256-504)||(34332266-34332516)
chr5 (251-505)||(9268027-9268283)
chr5 (254-505)||(4194729-4194978)
chr5 (251-505)||(23285810-23286066)
chr5 (255-505)||(23092378-23092630)
chr5 (270-499)||(31507374-31507605)
chr5 (248-502)||(21239149-21239405)
chr5 (256-505)||(10511211-10511461)
chr5 (256-505)||(18615801-18616056)
chr5 (280-502)||(28140683-28140907)
chr5 (256-501)||(40643145-40643392)
chr5 (253-505)||(1265996-1266250)
chr5 (266-502)||(14619299-14619537)
chr5 (255-501)||(40951781-40952029)
chr5 (275-505)||(42561107-42561339)
chr5 (256-505)||(12743871-12744122)
chr5 (275-554)||(10734279-10734560)
chr5 (266-505)||(17674407-17674648)
chr5 (266-505)||(28041100-28041341)
chr5 (303-505)||(24307927-24308131)
chr5 (303-505)||(24365192-24365396)
chr5 (283-505)||(31888940-31889164)
chr5 (248-505)||(34662251-34662510)
chr5 (252-554)||(15190550-15190852)
chr5 (285-505)||(34889046-34889268)
chr5 (255-425)||(14435929-14436101)
chr5 (266-505)||(16153004-16153245)
chr5 (266-505)||(22527739-22527980)
chr5 (303-501)||(5528025-5528225)
chr5 (256-505)||(7734881-7735133)
chr5 (256-505)||(20517892-20518139)
chr5 (266-505)||(6672977-6673218)
chr5 (251-505)||(35547308-35547564)
chr5 (255-481)||(39758958-39759186)
chr5 (275-505)||(41641142-41641378)
chr5 (266-501)||(3686503-3686740)
chr5 (266-505)||(13862744-13862985)
chr5 (266-501)||(15521691-15521928)
chr5 (255-505)||(39121428-39121680)
chr5 (292-505)||(4984891-4985106)
chr5 (266-505)||(9828440-9828680)
chr5 (256-505)||(8283851-8284098)
chr5 (266-505)||(4752967-4753208)
chr5 (270-505)||(22657815-22658052)
chr5 (256-503)||(25600799-25601048)
chr5 (266-502)||(39984819-39985059)
chr5 (266-505)||(17714611-17714856)
chr5 (256-554)||(19571669-19571976)
chr5 (256-505)||(41418357-41418606)
chr5 (253-453)||(8144456-8144658)
chr5 (292-505)||(32478185-32478400)
chr5 (266-505)||(40004159-40004399)
chr5 (285-505)||(9264020-9264242)
chr5 (266-505)||(3497550-3497790)
chr5 (256-505)||(35039044-35039294)
chr5 (267-505)||(7951608-7951847)
chr5 (283-481)||(15774829-15775029)
chr5 (303-505)||(32617562-32617766)
chr5 (266-505)||(16127306-16127546)
chr5 (266-505)||(13660908-13661146)
chr5 (283-506)||(13703576-13703798)
chr5 (266-379)||(26889603-26889716)
chr5 (292-501)||(40738461-40738671)
chr5 (266-501)||(186149-186385)
chr5 (256-451)||(37034248-37034443)
chr5 (253-500)||(41383909-41384157)
chr5 (255-425)||(11780881-11781053)
chr5 (266-505)||(21749977-21750218)
chr5 (270-481)||(17592555-17592767)
chr5 (255-425)||(30182967-30183139)
chr5 (253-501)||(38161517-38161766)
chr5 (283-374)||(42030365-42030456)
chr5 (256-505)||(22581475-22581725)
chr5 (344-505)||(12806693-12806856)
chr5 (256-554)||(14570630-14570927)
chr5 (275-505)||(26605374-26605613)
chr5 (275-505)||(31158186-31158414)
chr5 (343-505)||(20987794-20987958)
chr5 (283-505)||(33639338-33639561)
chr5 (252-554)||(23286217-23286511)
chr5 (292-501)||(14789604-14789814)
chr5 (255-344)||(20988252-20988341)
chr5 (312-505)||(14571334-14571526)
chr5 (270-505)||(32147340-32147574)
chr5 (254-554)||(41686853-41687149)
chr5 (281-505)||(3160291-3160517)
chr5 (384-508)||(26894743-26894866)
chr5 (256-344)||(12807132-12807220)
chr5 (301-425)||(9438875-9439002)
chr5 (324-505)||(16284998-16285180)
chr5 (275-505)||(8100152-8100383)
chr5 (303-415)||(15674914-15675026)
chr5 (323-503)||(25837057-25837238)
chr5 (323-425)||(3629030-3629132)
chr5 (253-502)||(13335338-13335588)
chr5 (383-505)||(39180508-39180630)
chr5 (323-554)||(24857556-24857785)
chr5 (327-425)||(26699443-26699543)
chr5 (327-425)||(26969176-26969276)
chr5 (324-428)||(39692462-39692565)
chr5 (323-554)||(39971014-39971244)
chr5 (339-425)||(28414507-28414594)
chr5 (255-374)||(33818765-33818884)
chr5 (254-425)||(35784658-35784828)
chr5 (256-425)||(15559660-15559834)
chr5 (349-505)||(24170180-24170338)
chr5 (270-502)||(37700143-37700377)
chr5 (323-425)||(5283174-5283277)
chr5 (391-505)||(26674480-26674594)
chr5 (391-505)||(26946086-26946200)
chr5 (323-425)||(27834071-27834174)
chr5 (254-554)||(31657685-31657983)
chr5 (323-554)||(16926452-16926682)
chr5 (254-425)||(18251143-18251319)
chr5 (316-425)||(26076188-26076299)
chr5 (339-425)||(6328626-6328713)
chr5 (266-554)||(8949812-8950102)
chr5 (323-505)||(11432357-11432546)
chr5 (323-425)||(13236068-13236169)
chr5 (303-365)||(13958638-13958700)
chr5 (285-431)||(35495039-35495185)
chr5 (411-501)||(13735701-13735790)
chr5 (461-505)||(4902854-4902898)
chr5 (461-505)||(30182130-30182174)
chr5 (266-365)||(4902970-4903069)
chr5 (324-556)||(21069635-21069866)
chr5 (266-505)||(31642234-31642474)
chr5 (314-392)||(2328420-2328498)
chr5 (256-298)||(21069637-21069679)
chr5 (339-424)||(1303400-1303484)
chr5 (292-365)||(10561254-10561327)
chr5 (518-554)||(14435830-14435866)
chr5 (386-434)||(30117233-30117281)
chr5 (324-379)||(7408871-7408926)
chr5 (519-554)||(8144459-8144494)
chr5 (339-425)||(8356362-8356449)
chr5 (529-560)||(40738404-40738435)
chr5 (316-378)||(12098737-12098798)
chr5 (335-377)||(16099406-16099448)
chr5 (383-425)||(20187207-20187249)
chr5 (520-554)||(23260141-23260175)
chr5 (519-557)||(34332481-34332519)
chr5 (249-294)||(4976289-4976334)
chr5 (461-556)||(11780762-11780853)
chr5 (300-365)||(11937201-11937266)
chr5 (253-298)||(24857553-24857598)
chr5 (461-502)||(26076335-26076375)
chr5 (316-365)||(37331007-37331056)
chr5 (316-365)||(39181908-39181957)
chr5 (255-295)||(7940451-7940491)
chr5 (461-501)||(8145088-8145128)
chr5 (327-375)||(10116761-10116809)
chr5 (461-505)||(13235989-13236033)
chr5 (384-440)||(21252222-21252278)
chr5 (522-554)||(39121429-39121461)
[»] chr6 (108 HSPs)
chr6 (255-557)||(31091442-31091742)
chr6 (256-554)||(402362-402658)
chr6 (249-554)||(15498629-15498932)
chr6 (255-505)||(8670182-8670432)
chr6 (254-554)||(13866593-13866893)
chr6 (266-505)||(1729852-1730092)
chr6 (255-554)||(31149986-31150283)
chr6 (266-554)||(16272717-16273005)
chr6 (256-554)||(34915282-34915580)
chr6 (269-505)||(925687-925923)
chr6 (251-505)||(1147003-1147257)
chr6 (266-505)||(13647878-13648119)
chr6 (256-448)||(20373139-20373331)
chr6 (266-501)||(19097552-19097787)
chr6 (254-505)||(20449918-20450171)
chr6 (249-505)||(12143826-12144082)
chr6 (266-502)||(31711599-31711835)
chr6 (256-554)||(25045382-25045680)
chr6 (283-505)||(390370-390592)
chr6 (256-554)||(7772176-7772474)
chr6 (266-505)||(11847618-11847859)
chr6 (256-501)||(31487110-31487357)
chr6 (266-505)||(34126188-34126427)
chr6 (254-554)||(2090658-2090959)
chr6 (256-501)||(9341889-9342136)
chr6 (252-502)||(15355291-15355541)
chr6 (256-554)||(23604460-23604760)
chr6 (266-505)||(34301581-34301822)
chr6 (254-504)||(16122302-16122553)
chr6 (285-503)||(23578194-23578414)
chr6 (256-505)||(19418863-19419114)
chr6 (270-501)||(33773628-33773863)
chr6 (271-505)||(17227282-17227518)
chr6 (266-508)||(25197196-25197440)
chr6 (266-501)||(15966910-15967148)
chr6 (275-505)||(10195752-10195984)
chr6 (275-505)||(30248694-30248926)
chr6 (266-503)||(25024255-25024494)
chr6 (266-505)||(6147430-6147671)
chr6 (255-502)||(13010858-13011107)
chr6 (266-556)||(23397889-23398178)
chr6 (266-502)||(33487881-33488119)
chr6 (266-505)||(287163-287404)
chr6 (275-505)||(12105822-12106054)
chr6 (303-503)||(5457461-5457663)
chr6 (266-503)||(17175214-17175453)
chr6 (266-505)||(34741513-34741753)
chr6 (345-501)||(9660505-9660663)
chr6 (266-556)||(8743186-8743474)
chr6 (266-505)||(1779794-1780034)
chr6 (266-505)||(9388539-9388781)
chr6 (266-501)||(15287190-15287425)
chr6 (317-501)||(5576180-5576362)
chr6 (255-505)||(13690470-13690722)
chr6 (280-505)||(230870-231096)
chr6 (255-501)||(8175712-8175954)
chr6 (266-344)||(9660143-9660221)
chr6 (266-508)||(344908-345155)
chr6 (256-508)||(32615032-32615284)
chr6 (282-505)||(15126511-15126734)
chr6 (344-505)||(11656172-11656336)
chr6 (256-502)||(18105911-18106158)
chr6 (266-503)||(6417924-6418158)
chr6 (257-404)||(11104699-11104850)
chr6 (284-415)||(2746311-2746444)
chr6 (259-501)||(3177232-3177473)
chr6 (303-505)||(345533-345736)
chr6 (317-486)||(235825-235993)
chr6 (333-497)||(9299246-9299411)
chr6 (324-425)||(4823098-4823198)
chr6 (325-453)||(17952167-17952297)
chr6 (266-365)||(29036263-29036362)
chr6 (256-425)||(8217461-8217629)
chr6 (285-425)||(11161978-11162121)
chr6 (327-431)||(6840082-6840186)
chr6 (323-554)||(22998852-22999082)
chr6 (323-554)||(23789322-23789552)
chr6 (324-425)||(33012473-33012575)
chr6 (275-505)||(22852090-22852321)
chr6 (280-334)||(17950506-17950560)
chr6 (340-505)||(6418476-6418642)
chr6 (323-425)||(27581513-27581616)
chr6 (339-425)||(14630030-14630115)
chr6 (339-425)||(22710393-22710478)
chr6 (323-425)||(27310561-27310662)
chr6 (340-505)||(4175289-4175455)
chr6 (323-426)||(28236010-28236114)
chr6 (339-425)||(11200721-11200808)
chr6 (461-554)||(9038642-9038733)
chr6 (430-505)||(11104619-11104694)
chr6 (461-554)||(13321272-13321363)
chr6 (384-425)||(11840497-11840538)
chr6 (253-298)||(13321321-13321366)
chr6 (419-505)||(29036172-29036258)
chr6 (383-501)||(29293667-29293785)
chr6 (346-429)||(493510-493594)
chr6 (339-426)||(9038766-9038854)
chr6 (346-554)||(13901641-13901847)
chr6 (519-554)||(16122516-16122551)
chr6 (255-378)||(17992165-17992287)
chr6 (323-505)||(28980662-28980846)
chr6 (519-557)||(34915279-34915317)
chr6 (521-554)||(15355558-15355591)
chr6 (388-421)||(17545389-17545422)
chr6 (461-553)||(22710267-22710357)
chr6 (249-298)||(22999040-22999089)
chr6 (249-298)||(23789315-23789364)
chr6 (388-428)||(8637148-8637188)
[»] chr8 (181 HSPs)
chr8 (255-554)||(18111715-18112012)
chr8 (255-554)||(23487064-23487361)
chr8 (256-554)||(23687905-23688202)
chr8 (256-556)||(32522584-32522882)
chr8 (266-501)||(9035290-9035525)
chr8 (253-554)||(26016569-26016868)
chr8 (253-505)||(2944010-2944262)
chr8 (250-505)||(33865277-33865531)
chr8 (256-501)||(25058093-25058338)
chr8 (255-505)||(5783885-5784138)
chr8 (283-554)||(33980465-33980732)
chr8 (253-505)||(39406606-39406860)
chr8 (255-556)||(5162302-5162603)
chr8 (266-505)||(32474982-32475217)
chr8 (255-505)||(44580615-44580869)
chr8 (266-501)||(39029229-39029463)
chr8 (266-505)||(26980726-26980966)
chr8 (266-505)||(40784937-40785178)
chr8 (251-500)||(7682772-7683022)
chr8 (256-554)||(5774048-5774347)
chr8 (250-505)||(38780875-38781131)
chr8 (255-557)||(44888677-44888979)
chr8 (255-501)||(257276-257524)
chr8 (255-501)||(658396-658644)
chr8 (255-501)||(844132-844380)
chr8 (255-505)||(8072867-8073119)
chr8 (251-505)||(7683298-7683553)
chr8 (252-554)||(8566202-8566502)
chr8 (266-505)||(34490564-34490805)
chr8 (266-501)||(42985265-42985501)
chr8 (266-505)||(18455767-18456008)
chr8 (275-505)||(50853-51085)
chr8 (256-502)||(44747098-44747345)
chr8 (266-505)||(8251682-8251923)
chr8 (266-505)||(8948100-8948341)
chr8 (266-505)||(28191924-28192165)
chr8 (266-505)||(38878768-38879009)
chr8 (256-486)||(12825013-12825244)
chr8 (256-505)||(11482859-11483110)
chr8 (256-486)||(31886737-31886967)
chr8 (255-505)||(32675495-32675747)
chr8 (253-503)||(41014553-41014805)
chr8 (253-503)||(44021055-44021307)
chr8 (255-505)||(8797027-8797287)
chr8 (269-505)||(35143274-35143510)
chr8 (275-554)||(36176861-36177140)
chr8 (253-505)||(38967190-38967444)
chr8 (256-503)||(4778640-4778887)
chr8 (266-501)||(35504329-35504566)
chr8 (292-505)||(4076219-4076434)
chr8 (266-505)||(40741312-40741551)
chr8 (285-501)||(24992566-24992784)
chr8 (266-505)||(8951177-8951418)
chr8 (266-505)||(29598271-29598512)
chr8 (275-498)||(38183324-38183549)
chr8 (266-505)||(42598465-42598705)
chr8 (255-486)||(45260289-45260521)
chr8 (275-505)||(34568537-34568769)
chr8 (256-440)||(110182-110370)
chr8 (266-505)||(4631303-4631543)
chr8 (250-554)||(45283525-45283829)
chr8 (266-505)||(18754191-18754433)
chr8 (266-501)||(1774393-1774630)
chr8 (266-505)||(14699499-14699740)
chr8 (298-505)||(28579686-28579894)
chr8 (352-505)||(5951165-5951318)
chr8 (266-505)||(13153975-13154215)
chr8 (275-504)||(16999045-16999276)
chr8 (266-505)||(33745646-33745886)
chr8 (266-505)||(44502666-44502910)
chr8 (248-488)||(16125441-16125683)
chr8 (267-505)||(28864258-28864497)
chr8 (292-503)||(36661701-36661914)
chr8 (251-505)||(41615953-41616213)
chr8 (298-487)||(16117232-16117423)
chr8 (256-505)||(16448492-16448743)
chr8 (266-554)||(17856527-17856813)
chr8 (266-377)||(28965643-28965754)
chr8 (266-505)||(29279243-29279483)
chr8 (332-505)||(29806038-29806213)
chr8 (303-452)||(35202938-35203086)
chr8 (266-505)||(11798652-11798892)
chr8 (266-505)||(12255142-12255382)
chr8 (266-505)||(12260685-12260925)
chr8 (266-554)||(43653953-43654240)
chr8 (254-505)||(45425082-45425332)
chr8 (256-423)||(30140211-30140380)
chr8 (269-374)||(14625707-14625812)
chr8 (270-505)||(18641130-18641367)
chr8 (275-501)||(42218105-42218330)
chr8 (285-453)||(35203101-35203261)
chr8 (266-505)||(44250869-44251111)
chr8 (311-554)||(44748257-44748500)
chr8 (266-554)||(13568659-13568942)
chr8 (248-355)||(5952482-5952589)
chr8 (256-554)||(2151980-2152277)
chr8 (312-505)||(29321090-29321284)
chr8 (255-505)||(14583871-14584121)
chr8 (292-505)||(5268016-5268230)
chr8 (298-505)||(36245694-36245903)
chr8 (290-378)||(42747384-42747472)
chr8 (318-501)||(5593470-5593654)
chr8 (256-350)||(17851249-17851343)
chr8 (259-495)||(21652224-21652466)
chr8 (256-343)||(34070971-34071058)
chr8 (275-501)||(14548447-14548674)
chr8 (254-428)||(43292736-43292909)
chr8 (316-425)||(2767759-2767868)
chr8 (323-554)||(12802611-12802838)
chr8 (323-554)||(35179600-35179830)
chr8 (303-504)||(21136903-21137106)
chr8 (323-501)||(39463036-39463215)
chr8 (417-555)||(42885053-42885189)
chr8 (254-415)||(23497867-23498029)
chr8 (346-440)||(31089751-31089845)
chr8 (275-365)||(42885359-42885449)
chr8 (254-505)||(11293700-11293952)
chr8 (326-425)||(23894718-23894816)
chr8 (323-425)||(36786594-36786697)
chr8 (256-425)||(23424936-23425106)
chr8 (253-502)||(26990564-26990815)
chr8 (340-551)||(5244451-5244659)
chr8 (340-424)||(13141587-13141670)
chr8 (266-425)||(17336545-17336704)
chr8 (327-502)||(30512817-30512991)
chr8 (292-440)||(40855908-40856058)
chr8 (417-505)||(7758811-7758899)
chr8 (286-442)||(11113889-11114049)
chr8 (257-502)||(24260694-24260941)
chr8 (323-425)||(36409723-36409826)
chr8 (323-425)||(36941395-36941498)
chr8 (351-449)||(45145347-45145446)
chr8 (323-505)||(5109928-5110111)
chr8 (275-365)||(28741043-28741133)
chr8 (280-434)||(29738123-29738276)
chr8 (316-409)||(39112561-39112655)
chr8 (256-441)||(44056809-44056993)
chr8 (383-505)||(44580921-44581043)
chr8 (323-399)||(25056707-25056785)
chr8 (405-501)||(40529357-40529453)
chr8 (323-505)||(23995624-23995806)
chr8 (256-425)||(29073751-29073917)
chr8 (266-363)||(40530336-40530433)
chr8 (420-505)||(28965551-28965636)
chr8 (328-431)||(15021169-15021274)
chr8 (259-342)||(25635891-25635973)
chr8 (316-400)||(41388545-41388631)
chr8 (323-425)||(44165276-44165379)
chr8 (383-429)||(6142372-6142418)
chr8 (461-554)||(36408415-36408506)
chr8 (519-556)||(11482857-11482894)
chr8 (323-399)||(19176844-19176920)
chr8 (384-449)||(39970596-39970661)
chr8 (339-399)||(5449587-5449646)
chr8 (461-505)||(19176183-19176227)
chr8 (327-378)||(42486236-42486288)
chr8 (333-372)||(16894062-16894101)
chr8 (333-376)||(19700825-19700868)
chr8 (339-425)||(26625920-26626007)
chr8 (519-554)||(44888943-44888978)
chr8 (519-554)||(45260485-45260520)
chr8 (520-554)||(6050558-6050592)
chr8 (520-554)||(17069847-17069881)
chr8 (520-554)||(17578392-17578426)
chr8 (519-557)||(17851246-17851284)
chr8 (520-554)||(18641383-18641417)
chr8 (253-295)||(23688163-23688205)
chr8 (520-554)||(37023287-37023321)
chr8 (255-289)||(39463533-39463567)
chr8 (253-298)||(35179597-35179642)
chr8 (519-556)||(41898498-41898535)
chr8 (521-557)||(2151977-2152013)
chr8 (266-298)||(17336429-17336461)
chr8 (333-365)||(19715659-19715691)
chr8 (255-295)||(23487063-23487103)
chr8 (461-505)||(26625840-26625884)
chr8 (254-298)||(36408413-36408457)
chr8 (520-548)||(38798332-38798360)
chr8 (519-551)||(43292998-43293030)
chr8 (522-554)||(44580616-44580648)
chr8 (247-295)||(44888671-44888719)
[»] chr2 (192 HSPs)
chr2 (15-252)||(13500296-13500532)
chr2 (256-554)||(8912615-8912911)
chr2 (256-554)||(12889949-12890245)
chr2 (256-554)||(40680404-40680698)
chr2 (256-505)||(38214527-38214776)
chr2 (266-554)||(40788839-40789125)
chr2 (266-505)||(22182674-22182913)
chr2 (256-505)||(11385909-11386158)
chr2 (255-508)||(17665568-17665821)
chr2 (284-557)||(11851955-11852225)
chr2 (256-505)||(23465182-23465431)
chr2 (269-505)||(32712538-32712774)
chr2 (267-505)||(20643529-20643767)
chr2 (255-505)||(41003990-41004240)
chr2 (265-508)||(7531647-7531890)
chr2 (266-505)||(15227900-15228139)
chr2 (256-505)||(40607749-40608000)
chr2 (266-505)||(34113578-34113813)
chr2 (256-505)||(24345464-24345715)
chr2 (256-554)||(2060316-2060614)
chr2 (266-502)||(41834456-41834695)
chr2 (249-502)||(2200029-2200284)
chr2 (256-505)||(18375239-18375490)
chr2 (256-502)||(25523551-25523797)
chr2 (256-505)||(31751116-31751370)
chr2 (256-505)||(34944158-34944402)
chr2 (256-505)||(19318794-19319045)
chr2 (256-554)||(11865026-11865326)
chr2 (256-500)||(19034465-19034708)
chr2 (256-505)||(1142997-1143248)
chr2 (283-505)||(44573655-44573873)
chr2 (273-505)||(28840685-28840918)
chr2 (271-502)||(7933471-7933703)
chr2 (266-505)||(34883597-34883838)
chr2 (266-505)||(37229487-37229728)
chr2 (275-505)||(20727616-20727848)
chr2 (266-505)||(25624779-25625017)
chr2 (282-505)||(1859595-1859819)
chr2 (286-505)||(7666325-7666546)
chr2 (255-505)||(19353238-19353490)
chr2 (266-554)||(26322042-26322330)
chr2 (256-504)||(13336496-13336744)
chr2 (256-554)||(38121250-38121548)
chr2 (255-494)||(7418552-7418793)
chr2 (266-505)||(8716641-8716882)
chr2 (266-501)||(13197394-13197631)
chr2 (266-505)||(24973847-24974088)
chr2 (266-505)||(32120991-32121232)
chr2 (255-505)||(1748380-1748632)
chr2 (256-503)||(5255583-5255831)
chr2 (266-505)||(15404457-15404697)
chr2 (275-505)||(4711774-4712005)
chr2 (280-502)||(20252260-20252484)
chr2 (298-505)||(5664685-5664894)
chr2 (266-505)||(16108225-16108465)
chr2 (266-498)||(45474369-45474603)
chr2 (250-505)||(8990251-8990508)
chr2 (266-505)||(34062414-34062655)
chr2 (266-505)||(36130777-36131018)
chr2 (255-505)||(12619854-12620108)
chr2 (275-505)||(41450563-41450795)
chr2 (255-505)||(45628619-45628871)
chr2 (281-502)||(1943624-1943847)
chr2 (285-505)||(5070356-5070575)
chr2 (266-505)||(39833749-39833989)
chr2 (256-435)||(40173142-40173323)
chr2 (256-453)||(30779740-30779939)
chr2 (303-481)||(41967990-41968170)
chr2 (266-505)||(7491891-7492131)
chr2 (290-505)||(6007619-6007836)
chr2 (275-505)||(16669673-16669905)
chr2 (252-425)||(30466252-30466427)
chr2 (266-505)||(1359838-1360078)
chr2 (266-505)||(16805541-16805781)
chr2 (266-505)||(16844823-16845063)
chr2 (310-554)||(18374496-18374741)
chr2 (266-505)||(23789016-23789256)
chr2 (252-549)||(42629376-42629667)
chr2 (266-505)||(10399211-10399452)
chr2 (253-505)||(8841394-8841647)
chr2 (310-505)||(15435670-15435866)
chr2 (266-505)||(2438272-2438512)
chr2 (266-505)||(22897438-22897678)
chr2 (266-501)||(36020999-36021235)
chr2 (292-505)||(40680774-40680989)
chr2 (320-503)||(8782515-8782700)
chr2 (266-557)||(17408044-17408334)
chr2 (256-505)||(15917820-15918069)
chr2 (266-505)||(16456622-16456862)
chr2 (285-505)||(3060390-3060611)
chr2 (269-505)||(27560253-27560490)
chr2 (266-501)||(43701021-43701246)
chr2 (256-503)||(11201732-11201980)
chr2 (255-400)||(8295460-8295607)
chr2 (266-505)||(29239343-29239583)
chr2 (284-501)||(8030786-8030992)
chr2 (266-505)||(12360503-12360742)
chr2 (275-560)||(15571177-15571464)
chr2 (279-505)||(9697904-9698131)
chr2 (256-486)||(15353203-15353430)
chr2 (275-504)||(23083541-23083776)
chr2 (303-505)||(45151795-45152001)
chr2 (254-441)||(1422161-1422349)
chr2 (283-390)||(16636389-16636496)
chr2 (274-508)||(19630948-19631182)
chr2 (274-508)||(19827849-19828083)
chr2 (316-555)||(7116099-7116337)
chr2 (318-477)||(7461290-7461448)
chr2 (266-453)||(3670227-3670428)
chr2 (281-425)||(8867712-8867853)
chr2 (269-354)||(26334637-26334722)
chr2 (255-444)||(44436223-44436414)
chr2 (260-324)||(12873177-12873241)
chr2 (252-556)||(18970465-18970768)
chr2 (343-504)||(13215646-13215808)
chr2 (256-428)||(13598641-13598814)
chr2 (317-502)||(29830817-29831002)
chr2 (384-505)||(10757847-10757968)
chr2 (384-501)||(12873040-12873157)
chr2 (259-327)||(15435587-15435655)
chr2 (323-425)||(4408584-4408687)
chr2 (271-378)||(12296182-12296289)
chr2 (323-425)||(28566278-28566381)
chr2 (275-554)||(29830514-29830791)
chr2 (255-440)||(6028454-6028640)
chr2 (339-505)||(31633670-31633837)
chr2 (323-554)||(9701070-9701300)
chr2 (323-425)||(21838743-21838846)
chr2 (248-554)||(36750615-36750921)
chr2 (388-508)||(44017784-44017904)
chr2 (461-503)||(30466153-30466195)
chr2 (323-425)||(11944445-11944548)
chr2 (461-505)||(24300297-24300341)
chr2 (323-554)||(30857938-30858168)
chr2 (339-554)||(41494445-41494659)
chr2 (323-425)||(2788145-2788248)
chr2 (323-425)||(30830150-30830253)
chr2 (385-505)||(32511066-32511186)
chr2 (255-417)||(40544461-40544624)
chr2 (340-554)||(41422512-41422725)
chr2 (303-501)||(16809003-16809201)
chr2 (303-501)||(16848284-16848482)
chr2 (275-365)||(32511189-32511279)
chr2 (336-503)||(6650975-6651144)
chr2 (384-453)||(7446964-7447033)
chr2 (333-499)||(26273372-26273540)
chr2 (322-425)||(3095426-3095530)
chr2 (323-428)||(3904570-3904677)
chr2 (322-378)||(16807067-16807123)
chr2 (322-378)||(16846348-16846404)
chr2 (388-554)||(26334717-26334882)
chr2 (336-501)||(9040926-9041092)
chr2 (327-378)||(11083496-11083547)
chr2 (323-374)||(22302593-22302644)
chr2 (317-435)||(18223700-18223821)
chr2 (341-505)||(43700664-43700833)
chr2 (519-556)||(2200242-2200279)
chr2 (519-556)||(3095297-3095334)
chr2 (281-378)||(4897418-4897515)
chr2 (281-378)||(4944812-4944909)
chr2 (170-203)||(13488392-13488425)
chr2 (519-559)||(24345680-24345720)
chr2 (461-505)||(34432146-34432190)
chr2 (336-440)||(40348225-40348328)
chr2 (461-505)||(44436767-44436811)
chr2 (522-557)||(13215825-13215860)
chr2 (324-425)||(18294120-18294220)
chr2 (255-298)||(41422511-41422554)
chr2 (255-298)||(41494617-41494660)
chr2 (519-557)||(2060579-2060617)
chr2 (256-298)||(3095299-3095341)
chr2 (418-505)||(8295368-8295455)
chr2 (519-557)||(11865023-11865061)
chr2 (249-295)||(12890206-12890252)
chr2 (519-557)||(13598519-13598557)
chr2 (254-308)||(18374427-18374481)
chr2 (520-554)||(28566151-28566185)
chr2 (521-554)||(1360055-1360088)
chr2 (327-425)||(11121111-11121211)
chr2 (521-554)||(16805531-16805564)
chr2 (521-554)||(16844813-16844846)
chr2 (521-554)||(29239333-29239366)
chr2 (521-554)||(31751069-31751102)
chr2 (324-361)||(36556204-36556241)
chr2 (522-554)||(2199978-2200010)
chr2 (461-505)||(2788283-2788327)
chr2 (522-554)||(8841397-8841429)
chr2 (461-489)||(16636508-16636536)
chr2 (522-554)||(23083515-23083547)
chr2 (266-298)||(30857948-30857980)
chr2 (266-298)||(36750879-36750911)
chr2 (461-505)||(40544371-40544415)
[»] chr7 (170 HSPs)
chr7 (266-554)||(32759556-32759844)
chr7 (254-505)||(1574766-1575017)
chr7 (256-554)||(12930318-12930616)
chr7 (254-505)||(11647573-11647824)
chr7 (266-554)||(35569403-35569688)
chr7 (256-554)||(27529229-27529524)
chr7 (253-505)||(43279752-43280003)
chr7 (256-503)||(23919781-23920028)
chr7 (256-505)||(6799285-6799534)
chr7 (266-503)||(19920612-19920848)
chr7 (265-502)||(10475751-10475990)
chr7 (269-505)||(45907292-45907528)
chr7 (254-505)||(3024631-3024880)
chr7 (266-505)||(42298177-42298416)
chr7 (256-554)||(2289755-2290053)
chr7 (256-505)||(47323268-47323519)
chr7 (266-505)||(9998334-9998576)
chr7 (254-503)||(41803207-41803460)
chr7 (275-556)||(25247449-25247729)
chr7 (255-507)||(38736497-38736749)
chr7 (284-505)||(47657433-47657654)
chr7 (266-441)||(20950789-20950963)
chr7 (256-505)||(39871352-39871603)
chr7 (266-502)||(23364064-23364302)
chr7 (249-505)||(30895607-30895865)
chr7 (266-505)||(17491562-17491803)
chr7 (266-505)||(17561411-17561652)
chr7 (256-505)||(4856853-4857107)
chr7 (255-505)||(9140271-9140523)
chr7 (245-486)||(44780121-44780362)
chr7 (253-508)||(7703557-7703813)
chr7 (275-554)||(34978835-34979114)
chr7 (266-505)||(1275482-1275723)
chr7 (266-505)||(8612324-8612565)
chr7 (266-497)||(21870085-21870318)
chr7 (267-505)||(26736527-26736773)
chr7 (266-508)||(36697880-36698124)
chr7 (255-501)||(21119609-21119857)
chr7 (285-505)||(787980-788202)
chr7 (253-505)||(31458044-31458298)
chr7 (253-505)||(43081299-43081552)
chr7 (266-505)||(8290950-8291191)
chr7 (266-505)||(28016295-28016536)
chr7 (266-505)||(37913122-37913363)
chr7 (266-505)||(40300277-40300518)
chr7 (266-505)||(41025845-41026086)
chr7 (266-505)||(44547473-44547714)
chr7 (251-505)||(7607368-7607624)
chr7 (283-505)||(32872141-32872365)
chr7 (275-505)||(36711057-36711288)
chr7 (247-505)||(7400175-7400438)
chr7 (266-505)||(26255142-26255383)
chr7 (266-505)||(29285786-29286027)
chr7 (282-505)||(31200129-31200354)
chr7 (266-505)||(33858616-33858856)
chr7 (290-501)||(48008985-48009200)
chr7 (250-508)||(2006519-2006779)
chr7 (275-505)||(36646395-36646627)
chr7 (285-554)||(43093176-43093446)
chr7 (256-501)||(27881827-27882074)
chr7 (292-505)||(29064232-29064447)
chr7 (275-505)||(7449316-7449547)
chr7 (266-505)||(6387372-6387613)
chr7 (247-489)||(19619096-19619340)
chr7 (256-502)||(41444252-41444500)
chr7 (266-505)||(32814480-32814721)
chr7 (275-505)||(29642902-29643133)
chr7 (287-415)||(32117995-32118123)
chr7 (275-505)||(39197765-39197997)
chr7 (249-505)||(41252094-41252351)
chr7 (266-453)||(12130147-12130334)
chr7 (303-505)||(25950877-25951083)
chr7 (266-505)||(38858345-38858585)
chr7 (256-453)||(16957734-16957932)
chr7 (256-423)||(27325908-27326076)
chr7 (270-505)||(38361198-38361432)
chr7 (266-502)||(48521076-48521314)
chr7 (252-505)||(21295198-21295452)
chr7 (269-505)||(9036682-9036919)
chr7 (256-425)||(21870831-21871002)
chr7 (256-378)||(33381358-33381480)
chr7 (255-425)||(23109194-23109366)
chr7 (249-374)||(26842951-26843076)
chr7 (270-505)||(29177006-29177242)
chr7 (266-453)||(17326970-17327159)
chr7 (305-505)||(18112955-18113157)
chr7 (266-503)||(23320700-23320943)
chr7 (254-554)||(34012256-34012554)
chr7 (247-453)||(24299934-24300142)
chr7 (303-505)||(41002941-41003144)
chr7 (256-501)||(41787302-41787542)
chr7 (285-503)||(30737780-30738001)
chr7 (384-505)||(17317488-17317609)
chr7 (266-505)||(38428195-38428434)
chr7 (266-504)||(28060766-28061004)
chr7 (266-505)||(44719174-44719410)
chr7 (317-505)||(43440910-43441100)
chr7 (384-505)||(26299362-26299483)
chr7 (256-505)||(46266115-46266364)
chr7 (247-505)||(9299144-9299407)
chr7 (275-554)||(31581677-31581957)
chr7 (259-425)||(21587534-21587702)
chr7 (259-440)||(7400464-7400646)
chr7 (267-495)||(17878127-17878346)
chr7 (275-554)||(18751746-18752019)
chr7 (256-505)||(47534643-47534893)
chr7 (247-505)||(9303693-9303956)
chr7 (256-434)||(40120994-40121174)
chr7 (285-505)||(45777987-45778212)
chr7 (257-424)||(10538871-10539038)
chr7 (255-554)||(27813496-27813798)
chr7 (323-558)||(30534701-30534933)
chr7 (311-487)||(2470870-2471048)
chr7 (255-365)||(12616149-12616259)
chr7 (384-505)||(9233445-9233566)
chr7 (403-557)||(31769220-31769372)
chr7 (323-555)||(9682601-9682831)
chr7 (323-505)||(32699513-32699694)
chr7 (323-502)||(42887887-42888067)
chr7 (284-425)||(3775956-3776098)
chr7 (346-486)||(3796060-3796202)
chr7 (323-501)||(19845474-19845655)
chr7 (256-425)||(21135375-21135545)
chr7 (292-505)||(5524773-5524988)
chr7 (266-500)||(31802872-31803105)
chr7 (266-378)||(20075023-20075134)
chr7 (339-425)||(32964218-32964305)
chr7 (461-554)||(33381520-33381610)
chr7 (256-505)||(34895904-34896155)
chr7 (335-440)||(20182099-20182204)
chr7 (384-505)||(10071243-10071364)
chr7 (323-554)||(22991552-22991781)
chr7 (344-505)||(19292885-19293047)
chr7 (275-554)||(29629716-29629993)
chr7 (348-508)||(46414835-46414998)
chr7 (256-554)||(49044860-49045157)
chr7 (323-425)||(35888439-35888540)
chr7 (323-555)||(2345350-2345581)
chr7 (323-508)||(24504728-24504914)
chr7 (461-505)||(12129724-12129768)
chr7 (405-506)||(12616273-12616374)
chr7 (461-505)||(20074936-20074980)
chr7 (323-425)||(23801990-23802093)
chr7 (333-428)||(33342261-33342356)
chr7 (323-425)||(47648985-47649088)
chr7 (352-505)||(44510179-44510333)
chr7 (323-554)||(45722006-45722237)
chr7 (461-496)||(10539081-10539116)
chr7 (327-443)||(28409849-28409967)
chr7 (476-554)||(32118125-32118200)
chr7 (298-410)||(49110808-49110922)
chr7 (339-424)||(33683007-33683093)
chr7 (316-365)||(10071866-10071915)
chr7 (312-365)||(34900775-34900828)
chr7 (346-425)||(3881371-3881451)
chr7 (461-505)||(8782159-8782203)
chr7 (519-554)||(26843034-26843069)
chr7 (326-425)||(33682841-33682938)
chr7 (303-410)||(43008253-43008359)
chr7 (256-298)||(8782208-8782250)
chr7 (519-560)||(12930581-12930622)
chr7 (325-378)||(25270678-25270731)
chr7 (384-425)||(32811300-32811341)
chr7 (461-502)||(40121204-40121245)
chr7 (522-554)||(1574719-1574751)
chr7 (520-556)||(19920561-19920597)
chr7 (256-308)||(26299493-26299545)
chr7 (519-555)||(33381357-33381393)
chr7 (250-290)||(41444196-41444236)
chr7 (522-554)||(42541864-42541896)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (255-554)||(6350-6646)
[»] chr4 (227 HSPs)
chr4 (266-554)||(20454933-20455218)
chr4 (254-505)||(33988534-33988782)
chr4 (247-554)||(46949992-46950297)
chr4 (259-554)||(37518004-37518298)
chr4 (259-554)||(37522220-37522514)
chr4 (251-501)||(14793759-14794009)
chr4 (256-554)||(23777543-23777839)
chr4 (253-554)||(30049820-30050121)
chr4 (251-554)||(13620590-13620891)
chr4 (266-505)||(48030360-48030599)
chr4 (257-554)||(36900852-36901147)
chr4 (266-557)||(26625753-26626042)
chr4 (255-505)||(625707-625957)
chr4 (271-555)||(37776490-37776775)
chr4 (270-505)||(38899798-38900033)
chr4 (266-501)||(13389661-13389895)
chr4 (256-505)||(54623848-54624098)
chr4 (271-549)||(37842180-37842456)
chr4 (254-556)||(17339076-17339378)
chr4 (267-503)||(38027181-38027419)
chr4 (271-508)||(52850208-52850447)
chr4 (255-453)||(30523763-30523961)
chr4 (255-554)||(55562864-55563164)
chr4 (267-505)||(18003990-18004228)
chr4 (252-557)||(29519900-29520204)
chr4 (266-554)||(56432518-56432807)
chr4 (255-501)||(50450963-50451211)
chr4 (256-505)||(36990961-36991212)
chr4 (256-505)||(37173880-37174133)
chr4 (266-502)||(50602847-50603084)
chr4 (266-501)||(55876431-55876666)
chr4 (251-505)||(20788978-20789234)
chr4 (269-505)||(45096919-45097155)
chr4 (271-505)||(18706398-18706632)
chr4 (253-554)||(25123980-25124283)
chr4 (269-557)||(36129842-36130130)
chr4 (256-505)||(6462430-6462680)
chr4 (256-501)||(47683140-47683386)
chr4 (255-451)||(54535920-54536118)
chr4 (249-554)||(54877748-54878052)
chr4 (253-501)||(55014703-55014952)
chr4 (254-505)||(48241387-48241640)
chr4 (266-505)||(375471-375712)
chr4 (253-505)||(47806907-47807161)
chr4 (256-554)||(31937076-31937374)
chr4 (266-555)||(32032740-32033031)
chr4 (275-554)||(15241480-15241758)
chr4 (256-505)||(20767955-20768206)
chr4 (266-554)||(35675669-35675957)
chr4 (266-554)||(39114638-39114924)
chr4 (266-554)||(49228467-49228755)
chr4 (275-557)||(20391196-20391477)
chr4 (266-501)||(29427540-29427777)
chr4 (253-501)||(34963435-34963684)
chr4 (266-505)||(36391901-36392142)
chr4 (266-554)||(49373444-49373730)
chr4 (266-505)||(53276935-53277176)
chr4 (255-505)||(47298976-47299228)
chr4 (266-499)||(30771575-30771810)
chr4 (285-551)||(41620517-41620781)
chr4 (256-505)||(51717838-51718088)
chr4 (266-508)||(422678-422921)
chr4 (253-505)||(20285757-20286011)
chr4 (266-505)||(5375307-5375547)
chr4 (266-505)||(9327989-9328230)
chr4 (266-505)||(43387742-43387983)
chr4 (275-505)||(6753572-6753804)
chr4 (275-505)||(10588121-10588353)
chr4 (275-505)||(24754125-24754357)
chr4 (266-505)||(4035872-4036112)
chr4 (271-508)||(18882395-18882636)
chr4 (266-505)||(54676594-54676836)
chr4 (266-505)||(1028565-1028806)
chr4 (275-505)||(4455108-4455341)
chr4 (266-505)||(34272968-34273209)
chr4 (256-505)||(45921478-45921726)
chr4 (266-501)||(47228477-47228714)
chr4 (256-505)||(39670771-39671023)
chr4 (255-501)||(44294840-44295088)
chr4 (260-501)||(16545727-16545969)
chr4 (256-505)||(29460444-29460695)
chr4 (256-501)||(40809607-40809854)
chr4 (269-453)||(45850476-45850662)
chr4 (266-505)||(55632009-55632249)
chr4 (266-505)||(28298119-28298361)
chr4 (275-503)||(50533932-50534162)
chr4 (256-475)||(20761564-20761785)
chr4 (266-501)||(33413569-33413806)
chr4 (266-505)||(45742555-45742796)
chr4 (266-554)||(49793091-49793377)
chr4 (266-505)||(50424603-50424844)
chr4 (266-505)||(51536214-51536455)
chr4 (266-505)||(52978029-52978270)
chr4 (275-505)||(37352590-37352822)
chr4 (266-505)||(17609771-17610011)
chr4 (317-505)||(9808398-9808588)
chr4 (256-435)||(23623753-23623933)
chr4 (255-497)||(1173616-1173861)
chr4 (275-505)||(8343954-8344184)
chr4 (253-505)||(51335840-51336096)
chr4 (303-505)||(37357489-37357693)
chr4 (287-505)||(47311337-47311556)
chr4 (270-557)||(37639641-37639927)
chr4 (256-435)||(46480759-46480940)
chr4 (263-505)||(52870691-52870934)
chr4 (318-505)||(50352111-50352300)
chr4 (256-554)||(4415965-4416262)
chr4 (256-425)||(41191275-41191446)
chr4 (256-395)||(49489880-49490019)
chr4 (256-501)||(49329541-49329784)
chr4 (266-505)||(30745549-30745789)
chr4 (255-425)||(32898977-32899149)
chr4 (275-486)||(37364583-37364796)
chr4 (266-505)||(2615693-2615935)
chr4 (266-505)||(20747217-20747457)
chr4 (266-549)||(4549639-4549921)
chr4 (255-376)||(5734386-5734507)
chr4 (275-505)||(39184009-39184239)
chr4 (266-505)||(5743409-5743649)
chr4 (266-505)||(29014074-29014314)
chr4 (266-392)||(4143549-4143675)
chr4 (266-501)||(15500361-15500598)
chr4 (259-505)||(34948395-34948641)
chr4 (285-475)||(18018735-18018926)
chr4 (266-502)||(53629842-53630079)
chr4 (253-505)||(25474863-25475115)
chr4 (275-503)||(6083333-6083562)
chr4 (256-374)||(39879917-39880035)
chr4 (256-502)||(26866601-26866850)
chr4 (270-503)||(39144453-39144687)
chr4 (266-391)||(55777056-55777180)
chr4 (266-505)||(25708430-25708669)
chr4 (338-505)||(41191449-41191618)
chr4 (368-557)||(49490020-49490208)
chr4 (266-391)||(55841236-55841360)
chr4 (269-505)||(1859191-1859427)
chr4 (303-505)||(19281877-19282071)
chr4 (299-503)||(4094755-4094960)
chr4 (266-406)||(6807492-6807634)
chr4 (266-425)||(33501678-33501839)
chr4 (255-505)||(39184320-39184569)
chr4 (255-504)||(6656484-6656733)
chr4 (335-453)||(38405643-38405763)
chr4 (381-502)||(48149052-48149173)
chr4 (255-380)||(27009579-27009706)
chr4 (256-554)||(28501127-28501423)
chr4 (317-508)||(31071742-31071932)
chr4 (323-555)||(13548979-13549209)
chr4 (256-356)||(48148663-48148763)
chr4 (384-498)||(5734547-5734661)
chr4 (327-507)||(8418156-8418338)
chr4 (303-440)||(3168222-3168358)
chr4 (323-425)||(41333857-41333960)
chr4 (393-554)||(42528469-42528630)
chr4 (323-554)||(18872717-18872947)
chr4 (323-505)||(28495431-28495615)
chr4 (266-452)||(20180667-20180854)
chr4 (266-428)||(53564106-53564269)
chr4 (323-425)||(42598519-42598621)
chr4 (252-425)||(26889637-26889809)
chr4 (250-554)||(30868533-30868838)
chr4 (254-378)||(49613898-49614022)
chr4 (323-425)||(47109627-47109730)
chr4 (256-425)||(51329521-51329691)
chr4 (324-554)||(6629284-6629509)
chr4 (323-425)||(37780022-37780123)
chr4 (384-505)||(18879546-18879665)
chr4 (354-501)||(20286101-20286249)
chr4 (461-505)||(2738833-2738877)
chr4 (266-425)||(13498236-13498396)
chr4 (461-501)||(23621509-23621549)
chr4 (323-425)||(23390155-23390258)
chr4 (255-378)||(24072221-24072343)
chr4 (323-425)||(30010659-30010762)
chr4 (461-554)||(32899165-32899255)
chr4 (324-399)||(38615984-38616058)
chr4 (339-554)||(52181009-52181223)
chr4 (259-488)||(52966159-52966389)
chr4 (430-505)||(468420-468495)
chr4 (254-412)||(17468030-17468187)
chr4 (323-425)||(20783315-20783416)
chr4 (323-425)||(32684724-32684825)
chr4 (384-441)||(26186569-26186626)
chr4 (384-453)||(53906116-53906185)
chr4 (333-435)||(706662-706766)
chr4 (333-435)||(729851-729955)
chr4 (323-425)||(3085571-3085672)
chr4 (267-411)||(5840046-5840189)
chr4 (461-501)||(51329712-51329752)
chr4 (323-425)||(29508932-29509035)
chr4 (323-425)||(35909769-35909872)
chr4 (323-378)||(54158710-54158765)
chr4 (461-554)||(11469182-11469275)
chr4 (461-554)||(11522186-11522279)
chr4 (300-505)||(17678302-17678509)
chr4 (519-557)||(39670988-39671026)
chr4 (461-554)||(39797434-39797525)
chr4 (324-425)||(48801427-48801529)
chr4 (327-441)||(10497477-10497593)
chr4 (323-425)||(19596248-19596351)
chr4 (461-505)||(46481334-46481379)
chr4 (323-501)||(13138777-13138956)
chr4 (256-304)||(15452573-15452621)
chr4 (461-505)||(36040908-36040952)
chr4 (519-554)||(7698471-7698506)
chr4 (255-298)||(18872716-18872759)
chr4 (519-554)||(23623898-23623933)
chr4 (519-558)||(41191271-41191310)
chr4 (461-508)||(42598668-42598715)
chr4 (346-431)||(50649042-50649133)
chr4 (255-378)||(53910308-53910431)
chr4 (520-554)||(6462693-6462727)
chr4 (387-425)||(7326036-7326074)
chr4 (520-554)||(21161297-21161331)
chr4 (520-554)||(53564359-53564393)
chr4 (384-425)||(6595602-6595643)
chr4 (461-505)||(7698378-7698422)
chr4 (266-378)||(7776694-7776805)
chr4 (461-505)||(17467938-17467982)
chr4 (522-554)||(21265220-21265252)
chr4 (333-431)||(22130324-22130423)
chr4 (461-505)||(24073072-24073116)
chr4 (461-505)||(29508852-29508896)
chr4 (522-554)||(30523764-30523796)
chr4 (461-501)||(38319656-38319696)
chr4 (519-555)||(40809819-40809855)
chr4 (521-557)||(55631996-55632032)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (256-554)||(164214-164510)
scaffold0020 (254-295)||(164212-164253)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (251-501)||(45722-45972)
[»] scaffold0907 (1 HSPs)
scaffold0907 (251-505)||(4311-4565)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (248-554)||(48654-48959)
[»] scaffold0240 (2 HSPs)
scaffold0240 (256-554)||(18497-18793)
scaffold0240 (519-554)||(18758-18793)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (254-554)||(4402-4700)
[»] scaffold0604 (1 HSPs)
scaffold0604 (266-556)||(3535-3821)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (270-505)||(355056-355291)
scaffold0002 (316-423)||(92307-92416)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (256-554)||(5151-5446)
[»] scaffold0549 (1 HSPs)
scaffold0549 (256-554)||(9924-10219)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (256-554)||(3438-3735)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (255-560)||(9165-9469)
[»] scaffold0883 (1 HSPs)
scaffold0883 (287-505)||(1767-1987)
[»] scaffold0095 (2 HSPs)
scaffold0095 (287-505)||(45560-45780)
scaffold0095 (255-289)||(24935-24969)
[»] scaffold0576 (2 HSPs)
scaffold0576 (252-502)||(281-531)
scaffold0576 (521-554)||(548-581)
[»] scaffold0649 (1 HSPs)
scaffold0649 (266-505)||(4047-4288)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (275-505)||(31445-31677)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (253-505)||(93832-94086)
scaffold0039 (267-365)||(103814-103912)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (266-505)||(19708-19950)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (275-505)||(258880-259112)
[»] scaffold0368 (1 HSPs)
scaffold0368 (266-505)||(8265-8505)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (266-501)||(6889-7126)
[»] scaffold0308 (2 HSPs)
scaffold0308 (275-505)||(14107-14338)
scaffold0308 (298-505)||(5067-5276)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (266-505)||(47687-47927)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (253-505)||(51418-51672)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (266-505)||(4809-5047)
scaffold0443 (461-505)||(4727-4771)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (266-505)||(61602-61843)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (256-435)||(40606-40787)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (266-505)||(12111-12351)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (266-502)||(24381-24617)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (266-501)||(24270-24495)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (266-505)||(65388-65628)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (275-475)||(9512-9714)
[»] scaffold0280 (3 HSPs)
scaffold0280 (255-401)||(13302-13450)
scaffold0280 (343-554)||(8407-8619)
scaffold0280 (276-344)||(8066-8134)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (268-433)||(18473-18640)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (270-505)||(117893-118128)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (384-554)||(1316-1483)
[»] scaffold0311 (2 HSPs)
scaffold0311 (384-508)||(9535-9659)
scaffold0311 (303-380)||(9070-9146)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (254-501)||(34156-34402)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (323-505)||(17511-17694)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (253-425)||(11399-11569)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (292-378)||(13101-13186)
[»] scaffold2116 (1 HSPs)
scaffold2116 (461-505)||(7-51)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (323-554)||(246456-246685)
scaffold0009 (253-298)||(246453-246498)
[»] scaffold0086 (2 HSPs)
scaffold0086 (299-441)||(32946-33089)
scaffold0086 (324-377)||(22066-22119)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (303-503)||(156188-156391)
[»] scaffold0263 (1 HSPs)
scaffold0263 (316-423)||(13679-13788)
[»] scaffold0407 (2 HSPs)
scaffold0407 (324-424)||(633-733)
scaffold0407 (324-424)||(7097-7197)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (323-426)||(36172-36276)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (335-378)||(1953-1996)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (520-560)||(78778-78818)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 239)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 252 - 554
Target Start/End: Original strand, 15996510 - 15996810
Alignment:
Q  252 ttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgt 351  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15996510 ttaatactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgt 15996609  T
Q  352 ttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  15996610 ttttacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtat 15996709  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggta 551  Q
    ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15996710 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaattttttt--ttcaaaagggtcttataattagggacggaggta 15996807  T
Q  552 gta 554  Q
    |||    
T  15996808 gta 15996810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 254 - 554
Target Start/End: Original strand, 20621423 - 20621721
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20621423 aatactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 20621522  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  20621523 ttacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 20621622  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20621623 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttt--ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 20621720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 255 - 554
Target Start/End: Original strand, 45513375 - 45513674
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  45513375 atactacctccgtccttaattataggacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactatcgtttt 45513474  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||     
T  45513475 tacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 45513574  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45513575 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttctttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 45513674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 10015530 - 10015826
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10015530 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 10015629  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||      
T  10015630 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacgtgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 10015729  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10015730 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttt--ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 10015826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 247 - 505
Target Start/End: Original strand, 43158468 - 43158726
Alignment:
Q  247 aatatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagt 346  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||| | |  |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43158468 aatatttaatactacctccgtccttaattatagggcatttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagt 43158567  T
Q  347 attgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggca 446  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  43158568 attgtttttacaattttatcctttaagagagaaatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagggaca 43158667  T
Q  447 tgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43158668 tgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaaggga 43158726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 255 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 8322222 - 8321923
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  |||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8322222 atactacctccgtccttaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 8322123  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||     
T  8322122 tacagttttatcctttaagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgta 8322023  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8322022 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 8321925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 19897577 - 19897873
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19897577 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 19897676  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||      
T  19897677 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 19897776  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
         ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19897777 agaaataattaaagtagttggaaatagtaaaggagtcttataaaaagggacaatttttttt--ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 19897873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 270 - 508
Target Start/End: Original strand, 45323842 - 45324080
Alignment:
Q  270 ctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctt 369  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45323842 ctaattatagggcccttttgaaaaattaacggaaattaagatagaagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctt 45323941  T
Q  370 taagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatg 469  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||       |||||||||    
T  45323942 taagagagagatggtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatg 45324041  T
Q  470 tagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45324042 tagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 45324080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 253 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 31187057 - 31186805
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31187057 taatactatctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtt 31186958  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||  ||||||||||    
T  31186957 tttacaattttatcctttaagagaaagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatg 31186858  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31186857 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 31186805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 256 - 503
Target Start/End: Original strand, 52291168 - 52291415
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52291168 tactaccttcgtccttaattatagggcccttttgaaaaaataaagggaattaagatagtggatttttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 52291267  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||      
T  52291268 acaattttattctttaagagagagataatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaataggggcatgtatgtaa 52291367  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
         |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  52291368 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagg 52291415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 266 - 503
Target Start/End: Original strand, 50726535 - 50726772
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50726535 gtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 50726634  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||       |||||    
T  50726635 cctttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataatt 50726734  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50726735 aatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 50726772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 266 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 50786313 - 50786076
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50786313 gtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 50786214  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||       |||||    
T  50786213 cctttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataatt 50786114  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50786113 aatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 50786076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 266 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 43978446 - 43978210
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43978446 gtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 43978347  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||       |||||    
T  43978346 cctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataatt 43978247  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  43978246 aatgtagttggaaatagcaaataagtcttataaaaag 43978210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 254 - 501
Target Start/End: Original strand, 17698771 - 17699018
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||   ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17698771 aatactacctccatccttaattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 17698870  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||| ||| |||||||    
T  17698871 ttacaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacacgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtttaattaataggggcgtgtatgt 17698970  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17698971 aaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaa 17699018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 266 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 52044775 - 52044540
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52044775 gtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttttacaattttat 52044676  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| | ||| |||||       |||||    
T  52044675 cctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagggacatatatgtaaagaaataatt 52044576  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52044575 aatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaa 52044540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 251 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 2993560 - 2993306
Alignment:
Q  251 tttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 350  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||  |||||| |||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2993560 tttaatactacatctgtctctaattatatggtccttttaaaaaaataacgggaactaaggtagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 2993461  T
Q  351 tttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  2993460 tttttacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgta 2993361  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||       ||||||||||| ||| ||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  2993360 tgtaaagaaataattaatgtaattgaaaataacaaatgagtcttataaaaaggga 2993306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 248 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 49383649 - 49383344
Alignment:
Q  248 atatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagta 347  Q
    |||||||||| || ||  |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49383649 atatttaatattatctccgtcccttattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacta 49383550  T
Q  348 ttgtttttacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggc 445  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||    
T  49383549 ttgtttttacaattttatcctttaagaaagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggc 49383450  T
Q  446 atgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacg 545  Q
    ||||||||       |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||          |||||||||||||||||||||||||||    
T  49383449 atgtatgtaaagaaataattattgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaattttttt---ttcaaaagagtcttataattagggacg 49383353  T
Q  546 gaggtagta 554  Q
    |||||||||    
T  49383352 gaggtagta 49383344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 266 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 32978767 - 32978526
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32978767 gtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 32978668  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  || |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||       |||||    
T  32978667 cctttaagagagaattgatttatgttttcaatatgatatttattgttgattaaaaaaaattatatataataaataggggcatgcatgtaaagaaataatt 32978568  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  32978567 aatgtagttggaaataacaaa-gggtcttataaaaaaggataa 32978526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 28673035 - 28673284
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  28673035 tactacctccgtccctaattataaaacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactgttgttttt 28673134  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||      
T  28673135 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctggttgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaa 28673234  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
         |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  28673235 agaaataattaatgtagttggaaatagtaaagaggtcttataaaaaggga 28673284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 256 - 501
Target Start/End: Original strand, 46049727 - 46049972
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46049727 tactccctctgtccctaattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 46049826  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||  ||||      
T  46049827 acaattttatcctttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatacatgtaa 46049926  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46049927 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 46049972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 271 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 14759117 - 14758885
Alignment:
Q  271 taattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttt 370  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  14759117 taattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatctttt 14759018  T
Q  371 aagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgt 470  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||||||||   ||||       ||||||||||    
T  14759017 aagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtataattaatagaggca--aatgtaaagaaataattaatgt 14758920  T
Q  471 agttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14758919 agttggaaatagcaaatgggtcttataaaaaggga 14758885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 266 - 503
Target Start/End: Original strand, 12050144 - 12050381
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12050144 gtccctaattataggacctttttgaaaaaattacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 12050243  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     |||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||       |||||    
T  12050244 cctttgagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataatt 12050343  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12050344 aatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagg 12050381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 256 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 48214048 - 48213803
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48214048 tactacctccgtccctaattatagggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattattttt 48213949  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||  ||||| |||||      
T  48213948 acaagtttatcctttaagagagaaatggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataattaatatgggcatatatgtaa 48213849  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48213848 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcctataaaaa 48213803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 46845231 - 46845529
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46845231 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 46845330  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||  ||||   ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  46845331 acaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattatatctattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 46845430  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46845431 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagt 46845528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 259 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 48910165 - 48909919
Alignment:
Q  259 tacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 358  Q
    |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48910165 taccttcgtccctaattataggattcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 48910066  T
Q  359 attttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnn 458  Q
    |||||||  |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||         
T  48910065 attttattatttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaaga 48909966  T
Q  459 nntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
      ||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  48909965 aataattaatgtagttggaaataacaagtaggtcttataaaaaggga 48909919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 47067233 - 47066981
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47067233 atactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 47067134  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||||| ||||  ||||||||||    
T  47067133 tacaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaatgatgaataataaataagggcatgtatg 47067034  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47067033 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaaggga 47066981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 255 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 1450541 - 1450242
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1450541 atactacatctgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 1450442  T
Q  355 tacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  1450441 tacaattttagcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 1450342  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtag 552  Q
    |       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||           |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1450341 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagagtcttataattagggacgaaggtag 1450244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 269 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 35711558 - 35711322
Alignment:
Q  269 cctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgct 368  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  35711558 cctaattataggacccttttaaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 35711459  T
Q  369 ttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaat 468  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||       ||||||||    
T  35711458 ttaagagagaattcatttgtgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaat 35711359  T
Q  469 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35711358 gtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaaggga 35711322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 50433128 - 50433379
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50433128 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 50433227  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||  |||||  ||  ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  50433228 acaattttatcctttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 50433327  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  50433328 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaataggggtcttataaaaaggga 50433379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 53361604 - 53361845
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53361604 gtccctaattataagacccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 53361703  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||       |||    
T  53361704 cctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataa 53361803  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  53361804 ttaatgtagttagaaataacaaaagagtcttataaaaaggga 53361845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 254 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 8547204 - 8546951
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8547204 aatactacctccgtccctaagtataagacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgcgtatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 8547105  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    | |||||||||| |||||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| || |||| | ||||| | |||||||    
T  8547104 tgacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacctgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtatagtaaatagggacatgtat 8547005  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||       ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  8547004 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaaggga 8546951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 27688282 - 27688033
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27688282 atactacattcgtcgctaattatatggtccttttgaaaaaataacgggaattaagacagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 27688183  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    ||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||     
T  27688182 tacaattttatcctttaagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattactaattgaagaaaaatatgtataa-taataagggcatgtatgta 27688084  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
          |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27688083 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaaggga 27688033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 253 - 505
Target Start/End: Original strand, 17753271 - 17753525
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17753271 taatactatctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 17753370  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |    || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  17753371 tttacaattttatcctttaagagaaatggttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 17753470  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||       ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17753471 tgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaagggtcttataaaaaggga 17753525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 253 - 505
Target Start/End: Original strand, 19054591 - 19054845
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19054591 taatactatctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 19054690  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |    || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  19054691 tttacaattttatcctttaagagaaatggttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 19054790  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||       ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19054791 tgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaagggtcttataaaaaggga 19054845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 250 - 505
Target Start/End: Original strand, 23776230 - 23776485
Alignment:
Q  250 atttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtatt 349  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23776230 atttaatactaccttcgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgtgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactatt 23776329  T
Q  350 gtttttacaattttatgcttta--agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcat 447  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||   ||  |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  23776330 gtttttacaattttattctttaatagagagggttggattatgttttcaac--gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcat 23776427  T
Q  448 gtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||        |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  23776428 gtatgtaaagaaacaattaatgtagttgtaaataacaaaggagtcttataacaaggga 23776485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 254 - 505
Target Start/End: Original strand, 13809546 - 13809799
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||   ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  13809546 aatactacctccatccttaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgttt 13809645  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||    
T  13809646 ttacaattttattcttcaagagagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcat 13809745  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||       ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  13809746 gtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatgatcttataaaaaggga 13809799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 267 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 21459269 - 21458980
Alignment:
Q  267 tccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatg 366  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  21459269 tccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttgacaattttatc 21459170  T
Q  367 cttta--agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
    |||||  | | |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  21459169 ctttacgatatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 21459070  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagt 556  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||           |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21459069 taatgtagttggaaataacaaaggtgtcctataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaaggatcttataattagggacggaggtagtagt 21458980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Original strand, 9499235 - 9499487
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    ||||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||    
T  9499235 atactccctctgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt 9499334  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| |||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  9499335 tacaattttatcctttaagagagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 9499434  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9499435 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 9499487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 10656989 - 10656738
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10656989 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgtgaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 10656890  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  10656889 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 10656790  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10656789 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 10656738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 46862105 - 46862356
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  46862105 tactaccttcgtccctaattataagacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattattactgttttt 46862204  T
Q  356 acaattttatgctttaaga--gagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||  |||   ||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  46862205 acaattttatcctttaagaaggagggttgacttatgttttcaatattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgt 46862304  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46862305 aaagaaataattaatgtagttggaaataaaaaaggggtcttataaaaaggga 46862356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 266 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 6784750 - 6784461
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6784750 gtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtgttaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 6784651  T
Q  366 gctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||  |||||  ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||       |||    
T  6784650 cctttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataa 6784551  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagt 556  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6784550 ttaatgtagttgaaaatag-aaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattaaggacggaggtagtagt 6784461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 22103678 - 22103919
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  22103678 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 22103777  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||       |||    
T  22103778 cctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataa 22103877  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22103878 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 22103919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 275 - 556
Target Start/End: Original strand, 48887704 - 48887985
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48887704 tataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaagtattattgtttttacaattttatcctttaaga 48887803  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
    |||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || ||| || || || |||||||||||       ||||||||||||    
T  48887804 gagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtatgataaacaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 48887903  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagt 556  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||           |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48887904 ttgaaaatagcaaagcagtcttataaaaagggacaaaaaaatttc--tcaaaagaatcttataattatggacggaggtagtagt 48887985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 271 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 50730609 - 50730372
Alignment:
Q  271 taattatatgacccttttgaaaaaa-taacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctt 369  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  50730609 taattataagatccttttgaaaaaaataatgaaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatcctt 50730510  T
Q  370 taagagag--aaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaa 467  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||       |||||||    
T  50730509 taagagagatagatggtttatgttttcaacatgttatttgttgctgatcgaagaaaaatatgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaa 50730410  T
Q  468 tgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  50730409 tgtagttgaaaatagaaaaagagtcttataaaaaggga 50730372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 271 - 505
Target Start/End: Original strand, 50782245 - 50782482
Alignment:
Q  271 taattatatgacccttttgaaaaaa-taacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctt 369  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  50782245 taattataagatccttttgaaaaaaataatgaaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatcctt 50782344  T
Q  370 taagagag--aaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaa 467  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||       |||||||    
T  50782345 taagagagatagatggtttatgttttcaacatgttatttgttgctgatcgaagaaaaatatgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaa 50782444  T
Q  468 tgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  50782445 tgtagttgaaaatagaaaaagagtcttataaaaaggga 50782482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Original strand, 12906150 - 12906402
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12906150 atactacctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtagttactattgtttt 12906249  T
Q  355 tacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||   ||  ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  12906250 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatg 12906349  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  12906350 taaagaaataattaatgtagttggaaatggaaaaggggtcttataagaaggga 12906402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Original strand, 53686735 - 53686987
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53686735 atactacctctgtccctaattataaaacccttttgaaaaaacaacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 53686834  T
Q  355 tacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  53686835 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgcataataaatagaggcatgtatg 53686934  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  53686935 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaaggga 53686987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 4759088 - 4759388
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaa-aataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4759088 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaaataacgcgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 4759187  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagaga---aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    ||||||||||| |||||||| |||     ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||    
T  4759188 tacaattttatcctttaagaaagagggtttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 4759287  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggta 551  Q
    ||       |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||           ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4759288 gtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaaaggatcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggta 4759385  T
Q  552 gta 554  Q
    |||    
T  4759386 gta 4759388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 304 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 10221180 - 10220927
Alignment:
Q  304 attaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgtta 403  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  10221180 attaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaattggtttatgttttcaacatgata 10221081  T
Q  404 tttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| || |       |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10221080 tttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatataaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaagtcttataaaaagg 10220981  T
Q  504 gataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagttgat 560  Q
    || ||           ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10220980 gacaaaaaaattc---tcaaaagggtcttataattagggacggagggagtaattgat 10220927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 254 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 43686801 - 43686548
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43686801 aatactacctccgtccctaattataaggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 43686702  T
Q  354 ttacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| || ||||||    
T  43686701 ttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtat 43686602  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||       |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  43686601 gtaaataaataattaatgtagttggaaatagaaaaaaggtcttataaaaaggga 43686548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 256 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 38071494 - 38071246
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgaccctttt-gaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    ||||||||  || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  38071494 tactacctccgttcctaattataggatccttttagaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttt 38071395  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    |||||||||||  |||||||||||  | || |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  38071394 tacaattttatcttttaagagagaggattggtttatgctttcaacatgttatttattgatgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatg 38071295  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |       |||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  38071294 taaagaaataattaatatagttagaaatagcaaatgagtcttataaaaa 38071246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 51489665 - 51489414
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||| || |||||||||||||| | || |||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51489665 atactatctctgtccctaattatagggcc-ttttgaaaaaataatgggaattaagataggggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 51489567  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaa--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||| | |||||||||    
T  51489566 tacaattttatcctttaagagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgatggaagaaaaagatgtataataaataaatgcatgtatg 51489467  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  51489466 taaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaacaagtcttataaaaaggga 51489414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 252 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 26221590 - 26221288
Alignment:
Q  252 ttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgt 351  Q
    |||||||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  26221590 ttaatactccctctgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgt 26221491  T
Q  352 ttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgt 449  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||  |||||||    
T  26221490 ttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagagaaagatgtataataaataagggcatgt 26221391  T
Q  450 atgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggagg 549  Q
    ||||       ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26221390 atgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagagtcttataattagggacggagg 26221293  T
Q  550 tagta 554  Q
     ||||    
T  26221292 gagta 26221288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 256 - 499
Target Start/End: Original strand, 41992279 - 41992509
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41992279 tactacctccgtccctaattataaggccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 41992378  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| |             || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||      
T  41992379 acaattttatcc-------------tggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatatatgtaa 41992465  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaa 499  Q
         |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41992466 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaa 41992509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 253 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 43868404 - 43868150
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    ||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||    
T  43868404 taatactccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtt 43868305  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  43868304 tttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 43868205  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||       ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  43868204 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaaggga 43868150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 7181638 - 7181397
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  7181638 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagataggggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 7181539  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| || ||||||||       |||    
T  7181538 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataa 7181439  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7181438 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 7181397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 46703315 - 46703074
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  46703315 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 46703216  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| | |||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||       |||    
T  46703215 cctttaagaaaaaaagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaagcatgtatgtaaagaaataa 46703116  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46703115 ttaatgtagttagaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 46703074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 310 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 46861864 - 46861667
Alignment:
Q  310 atagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttattta 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||    
T  46861864 atagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttattatttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttattta 46861765  T
Q  408 ttgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||| |||| ||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46861764 ttgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 46861667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 50517271 - 50517512
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50517271 gtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttat 50517370  T
Q  366 gctttaa--gagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     ||||||  | |||   || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||  | |||||||||       |||    
T  50517371 cctttaagggggagggttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataaggacatgtatgtaaagaaataa 50517470  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  50517471 ttaatgtagttgaaaatagcaaagaggtattataaaaaggga 50517512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 251 - 505
Target Start/End: Original strand, 54782651 - 54782907
Alignment:
Q  251 tttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 350  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||    
T  54782651 tttaatactccctctgtccctatatataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattg 54782750  T
Q  351 tttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatg 448  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| | ||||    
T  54782751 tttttacaattttatcctttaagaaaaaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatg 54782850  T
Q  449 tatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54782851 tatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 54782907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 1084693 - 1084944
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  1084693 tactacctccgtccctaactatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttttattaaatatctttgtaattactattgttttt 1084792  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||    
T  1084793 acaattttaccctttaagagagagagatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgt 1084892  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           ||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||    
T  1084893 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagtaaaaggatcttataaaaaggga 1084944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 280 - 505
Target Start/End: Original strand, 23700548 - 23700775
Alignment:
Q  280 gacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaa 379  Q
    ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23700548 gacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaa 23700647  T
Q  380 a--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttgga 477  Q
       |  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||||||||||||||    
T  23700648 tgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgga 23700747  T
Q  478 aatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23700748 aataacaaaggggtcttataaaaaggga 23700775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 280 - 505
Target Start/End: Original strand, 23719003 - 23719230
Alignment:
Q  280 gacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaa 379  Q
    ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23719003 gacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaa 23719102  T
Q  380 a--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttgga 477  Q
       |  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||||||||||||||    
T  23719103 tgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgga 23719202  T
Q  478 aatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23719203 aataacaaaggggtcttataaaaaggga 23719230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 280 - 505
Target Start/End: Original strand, 23737459 - 23737686
Alignment:
Q  280 gacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaa 379  Q
    ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23737459 gacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaa 23737558  T
Q  380 a--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttgga 477  Q
       |  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||||||||||||||    
T  23737559 tgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgga 23737658  T
Q  478 aatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23737659 aataacaaaggggtcttataaaaaggga 23737686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 54107651 - 54107400
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  54107651 tactacctctgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 54107552  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||    
T  54107551 acaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgt 54107452  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  54107451 aaagaaataattaatgtagttgaaaataataaaggggtcttataaaaaggga 54107400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 249 - 505
Target Start/End: Original strand, 7051452 - 7051710
Alignment:
Q  249 tatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtat 348  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||| | |||    
T  7051452 tattttatactccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgggtatttgtattaaagttgtttgtaatcactat 7051551  T
Q  349 tgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggca 446  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||    
T  7051552 tgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggca 7051651  T
Q  447 tgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||       ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7051652 tgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 7051710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 275 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 45746057 - 45745778
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45746057 tataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 45745958  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||    
T  45745957 aagaaggttagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 45745858  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||          |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  45745857 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttt--ttcaaaagagtcttataatttgggacggagggagta 45745778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 266 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 40919242 - 40919024
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40919242 gtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 40919143  T
Q  366 gctttaagagaga-aatgat-ttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| |||   | || |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  40919142 cctttaagaaagagggttatcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataa 40919043  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatag 482  Q
    |||||||||||||||||||    
T  40919042 ttaatgtagttggaaatag 40919024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Original strand, 49126956 - 49127188
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  49126956 tataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaa 49127055  T
Q  375 gagaa-atga-tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||| |||||    
T  49127056 aagaagattagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattattgtag 49127155  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  49127156 ttggaaataacaaaggagtcttataaaaaggga 49127188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 266 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 45253061 - 45252771
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  45253061 gtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 45252962  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||       |||    
T  45252961 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataa 45252862  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagt 556  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45252861 ttaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggagggagtagt 45252771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 254 - 505
Target Start/End: Original strand, 42801519 - 42801772
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42801519 aatactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 42801618  T
Q  354 ttacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    ||| |||||||| |||||||  ||||   |   |||| ||||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||    
T  42801619 ttataattttatcctttaagaaagagggttagcttatattttcaatattctatttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 42801718  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||       |||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||    
T  42801719 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagttttataaaaaggga 42801772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 44544079 - 44543829
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||| |||| |||||| |||||| ||| ||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  44544079 tactcccttcgtcccttattataagactcttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 44543980  T
Q  356 acaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    |||||||||| ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||     
T  44543979 acaattttatccttaagagagagagttcgtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 44543880  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
          ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44543879 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 44543829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 52673475 - 52673234
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  52673475 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 52673376  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  52673375 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 52673276  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  52673275 ttaatgtaggtggaaataacaaatgggtcttataaaaaggga 52673234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 53164451 - 53164210
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||||||||    |||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53164451 gtccctaattataatgtccttttgaaaaaataatgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 53164352  T
Q  366 gctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| |||    ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||       |||    
T  53164351 cctttaagaaagatggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgcataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataa 53164252  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  53164251 ttaatgtagttggaaatagaaaagaagtcttataaaaaggga 53164210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 32467704 - 32467472
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  32467704 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttacga 32467605  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||    
T  32467604 aagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 32467505  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32467504 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 32467472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 285 - 503
Target Start/End: Original strand, 43557221 - 43557441
Alignment:
Q  285 ttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaa--atg 382  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||   ||    
T  43557221 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttattatttaagagagaaggttg 43557320  T
Q  383 atttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 482  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||       | ||||||||||||| ||||||    
T  43557321 gtttatgttttcaacatgttatttattggtaattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaatgattaatgtagttgaaaatag 43557420  T
Q  483 caaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    |||| || |||||||||||||    
T  43557421 caaatggatcttataaaaagg 43557441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 43701457 - 43701225
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43701457 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 43701358  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||    
T  43701357 aagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtacaataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtag 43701258  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  43701257 ttggaaataacaaaggagtcttataaaaaggga 43701225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 16434987 - 16435227
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16434987 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaaaaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 16435086  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  || ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  16435087 ccttaagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 16435186  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16435187 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 16435227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 25148743 - 25148506
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||| ||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25148743 gtccctagatataagactcttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 25148644  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||          |||    
T  25148643 cctttaagaaagaaaattagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta----aagaaataa 25148548  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25148547 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 25148506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 280 - 505
Target Start/End: Original strand, 30040780 - 30041007
Alignment:
Q  280 gacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaa 379  Q
    ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  30040780 gacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaa 30040879  T
Q  380 a--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttgga 477  Q
       |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||| |    
T  30040880 ggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttgaa 30040979  T
Q  478 aatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  30040980 aataacaaaatggtcttataaaaaggga 30041007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 266 - 502
Target Start/End: Original strand, 20656059 - 20656297
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  20656059 gtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaataactattgcttttacaattttat 20656158  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||| ||| | |||||||||||       |||    
T  20656159 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttatcgttgattgaagaaaaagatgtataataaattggggcatgtatgtaaagaaataa 20656258  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20656259 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 20656297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 266 - 554
Target Start/End: Original strand, 24087087 - 24087372
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24087087 gtccctaattataagactcctttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtgttaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 24087186  T
Q  366 gctttaagagagaa--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   ||   |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||   ||||| |||||||||||       |||    
T  24087187 cctttaagaaagaaggttggcctatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaatatgtata---aataggggcatgtatgtaaagaaataa 24087283  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24087284 ttaatatagttgaaaatagaaaacgggtcttataaaacgggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 24087372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 253 - 505
Target Start/End: Original strand, 46878175 - 46878429
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    ||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||    
T  46878175 taatactccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagataaaggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtt 46878274  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||   |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  46878275 tttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 46878374  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||       |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46878375 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaaaaggga 46878429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 7251031 - 7251272
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |  | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  7251031 gtccctatatataagacccttttgttaaaatcattggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 7251130  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  7251131 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 7251230  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  7251231 ttaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaaggga 7251272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 21756774 - 21756533
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21756774 gtccctatatataagacccttttgcgaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 21756675  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||       |||    
T  21756674 cctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataa 21756575  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  21756574 ttaatgtagttggaaataataaagaggtcttataaaaaggga 21756533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 33212684 - 33212443
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33212684 gtccctaattataagatccttttaaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 33212585  T
Q  366 gctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||       |||    
T  33212584 cctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataa 33212485  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||    
T  33212484 ttaatgtagatggaaatagaaaagaaatcttataaaaaggga 33212443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 256 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 25879436 - 25879254
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25879436 tactacctccgtccctaattatg-gacacttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgcattaaatatgtttgcaattactattgttttt 25879338  T
Q  356 acaattttatgctttaagag--agaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataatta 437  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  25879337 acaattttatcttttaagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaagatgtataatta 25879254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 248 - 425
Target Start/End: Original strand, 41750919 - 41751097
Alignment:
Q  248 atatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagta 347  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  41750919 atatgtaatactacctccgtccttaattatatgatccttttgaaaa-ataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattacta 41751017  T
Q  348 ttgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  41751018 ttgtttttacaattttatcctttgagagagaaagttggtttatgttttcaacatgttatttaatgttgattgaaaaaaaa 41751097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 266 - 548
Target Start/End: Original strand, 9779989 - 9780272
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9779989 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattattattgtttttacaatattat 9780088  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||  |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  9780089 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 9780188  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggag 548  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9780189 taatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaaatttttttttttcaaaagggtcttataattagggacggag 9780272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 266 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 36005791 - 36005553
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  36005791 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 36005692  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
      ||||||||||| |  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  36005691 cttttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 36005592  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  36005591 ttaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaag 36005553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 45048771 - 45049012
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||| ||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  45048771 gtccctatatataagactcttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttat 45048870  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||       |||    
T  45048871 cctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataa 45048970  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45048971 ttaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaaggga 45049012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Original strand, 25148880 - 25149112
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25148880 tataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgcaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 25148979  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||       |||||||| |||    
T  25148980 aagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatatag 25149079  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25149080 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 25149112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 267 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 33976766 - 33976549
Alignment:
Q  267 tccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatg 366  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||     
T  33976766 tcccgaattataggacccttttaaaaaaataacagaaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtagttactattgcttttataattttatc 33976667  T
Q  367 ctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatta 466  Q
    ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||       ||||||    
T  33976666 cttt--gagatggatgatttatgttttcaacatgttatttatggctgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataatta 33976569  T
Q  467 atgtagttggaaatagcaaa 486  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  33976568 atgtagttggaaataacaaa 33976549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 42390643 - 42390894
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || | ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42390643 tactacctccgtccctaattataggatcattttgaaaaaataacgagaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 42390742  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
     |||||||||  ||||||||||| |  |  |||||||||||||||||| ||||||||   || ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||    
T  42390743 gcaattttatcatttaagagagagagttagtttatgttttcaacatgtaatttattgcaaattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgt 42390842  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           ||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  42390843 aaataaataattaatgcagttggagataacaaagatgtcttataaaaaggga 42390894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 275 - 500
Target Start/End: Original strand, 54604346 - 54604573
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54604346 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 54604445  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
      |||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||       ||||||||||||    
T  54604446 atgaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatggatgtaaagaattaattaatgtag 54604545  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 500  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  54604546 ttggaaataacaaagggatcttataaaa 54604573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Original strand, 1641858 - 1642089
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1641858 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 1641957  T
Q  375 gagaaatga-tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagt 473  Q
     | |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||||||||||    
T  1641958 aaaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 1642057  T
Q  474 tggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    || ||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  1642058 tgaaaataacaaagaagtcttataaaaaggga 1642089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 31531160 - 31531401
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| |||||||||   ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31531160 gtccctatatataagacccttttaccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 31531259  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||       |||    
T  31531260 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataa 31531359  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  31531360 ttaatgtagttggaaataacaaaaatgtcttataaaaaggga 31531401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 249 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 20862501 - 20862243
Alignment:
Q  249 tatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtat 348  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | | |||||||||||||||||  |||||||||| | |||    
T  20862501 tatttaatactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactat 20862402  T
Q  349 tgtttttacaattttatgcttta---agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggc 445  Q
    || |||||||||||||| ||| |   |||||||  |  ||||||||||| | ||| |||| |||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  20862401 tgcttttacaattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctatt-attgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggc 20862303  T
Q  446 atgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20862302 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 20862243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 32569275 - 32569044
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||  |||||||    
T  32569275 tataagacccttttgtcaaaatcacggga-ttaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattatttttacaattttatcatttaaga 32569177  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||||||||     
T  32569176 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgtcgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaa 32569077  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32569076 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 32569044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Original strand, 32962863 - 32963094
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| || | |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  32962863 tataagacccttttgccaaaatcacaggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt-acaattttatcctttaaga 32962961  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||       ||||||||||||    
T  32962962 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtag 32963061  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32963062 ttgcaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 32963094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 253 - 505
Target Start/End: Original strand, 50647681 - 50647934
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |  ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||    
T  50647681 taatactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtt 50647780  T
Q  353 tttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||    
T  50647781 tttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 50647880  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50647881 gtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 50647934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 4024338 - 4024099
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||| | || || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4024338 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaataagaa-agcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 4024240  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | |||||| |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  4024239 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 4024140  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4024139 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 4024099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 10045127 - 10044888
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||| ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10045127 gtccctaattataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgcattaaagctgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 10045028  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||  | |||||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  10045027 cctgaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 10044928  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  10044927 taatgtagttggaaataacaaa-gggtcttataaaaaggga 10044888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 33868735 - 33868495
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33868735 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 33868636  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  33868635 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 33868536  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  33868535 taatgtagttggaaataactaaggggtcttataaaaaggga 33868495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 292 - 505
Target Start/End: Original strand, 35165738 - 35165952
Alignment:
Q  292 aaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatg 389  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |  ||||||    
T  35165738 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtagtcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 35165837  T
Q  390 ttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggg 489  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  35165838 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa-gg 35165936  T
Q  490 gtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||    
T  35165937 gtcttataaaaaggga 35165952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 266 - 440
Target Start/End: Original strand, 37144235 - 37144413
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatga-cccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaa-tatgtttgtaattagtattgtttttacaatttt 363  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37144235 gtccctaattataagaacccttttgaaaaattaacgggaattaagatagtggatatttttattaaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttt 37144334  T
Q  364 atgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaata 440  Q
    ||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||    
T  37144335 atcttttaagagagagagttgatttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 37144413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 37729010 - 37728760
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||| |||    
T  37729010 tactccctctgtccttaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtattt 37728911  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  37728910 acaattttat-ctttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 37728812  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37728811 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 37728760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 52058995 - 52059235
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |  ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  52058995 gtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 52059094  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  52059095 ccttaagagagagagtttgtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaagtaat 52059194  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52059195 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 52059235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 267 - 505
Target Start/End: Original strand, 17591296 - 17591535
Alignment:
Q  267 tccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatg 366  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |  ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  17591296 tccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat- 17591394  T
Q  367 ctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
    |||||||| ||| |  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  17591395 ctttaagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 17591494  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17591495 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 17591535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 331 - 505
Target Start/End: Original strand, 43408542 - 43408719
Alignment:
Q  331 tatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatat 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  43408542 tatgtttataattagtattgtttttacaattttat-ctttaagagaaagacgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgt 43408640  T
Q  431 ataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaat----gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||  |||||||||||       ||||||||    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  43408641 ataattaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtacgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaaggga 43408719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 14428896 - 14428657
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14428896 gtccctaattataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 14428797  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  14428796 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatag-ggcatgtatgtaaagaaataat 14428698  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14428697 taatgtagttggaaataagaaaggggtcttataaaaaggga 14428657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 254 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 36099263 - 36099012
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||||    
T  36099263 aatactccctctgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggataattgtattaaagttgtttgtaatcactattgttt 36099164  T
Q  354 ttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||| | |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  36099163 ttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttatcgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 36099064  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36099063 taaagaaataattaatgtaattggaaataacaaa-gggtcttataaaaaggga 36099012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 324 - 501
Target Start/End: Original strand, 49383640 - 49383819
Alignment:
Q  324 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    || |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  49383640 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaatagagagggttggtttatgtttttaacatgttatttattgctgattgaaga 49383739  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  49383740 aaaaaatatataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaatgcagttggaaatagcaaaaaggtcttataaaaa 49383819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 41824405 - 41824108
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  41824405 tactaccttcgtcccaatatataagacccttttgctaaaattacggaaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgttttt 41824306  T
Q  356 acaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    ||| |||||| ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||||||||  ||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||     
T  41824305 acagttttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattcaagaaaaaagtgtataataaataggggcatgtatgta 41824206  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
          |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  41824205 aagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagatgtcttataaaaagggataa-ttttttttcttcaaaag-gtcttataattaaggacggaggtagta 41824108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 346 - 505
Target Start/End: Original strand, 12683011 - 12683172
Alignment:
Q  346 tattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagag 443  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |    
T  12683011 tattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 12683110  T
Q  444 gcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12683111 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 12683172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 255 - 376
Target Start/End: Original strand, 18658167 - 18658288
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18658167 atactacctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 18658266  T
Q  355 tacaattttatgctttaagaga 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  18658267 tacaattttatcctttaagaga 18658288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 26593514 - 26593755
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| ||| | |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26593514 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagataatagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 26593613  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||   ||||||||||       |||    
T  26593614 cctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaatatgagcatgtatgtaaagaaataa 26593713  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  26593714 ttaatgtagttgaaaataacaaaagagtcttataaaaaggga 26593755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 35572207 - 35572445
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35572207 gtccctaattatagggcccttttgaaaaaataaagggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttataattactattgattttacaattttat 35572306  T
Q  366 gctttaagagagaaa----tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnnt 461  Q
     ||||||| |||| |    || |||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| || |||||| |||||       |||||       |    
T  35572307 cctttaagggagagagagttggtttatgttttcaacatgtcatttactgctgattgaagaaaaagatgtataataaatag-----gttatgtaaagaaat 35572401  T
Q  462 aattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  35572402 aattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaaggga 35572445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 283 - 505
Target Start/End: Original strand, 35867849 - 35868073
Alignment:
Q  283 ccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa-- 380  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||| |||| | |||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||       
T  35867849 ccttttgccaaaattacgggaattaagatagggcatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagaaagaaggt 35867948  T
Q  381 tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaat 480  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||  |||||||       ||||||||||||||| ||||    
T  35867949 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtgtgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaat 35868048  T
Q  481 agcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  35868049 aacaaaggggtcttataaaaaggga 35868073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 256 - 378
Target Start/End: Original strand, 39625197 - 39625318
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39625197 tactacctccgtccctaattatagg-cccttaagaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 39625295  T
Q  356 acaattttatgctttaagagaga 378  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  39625296 acaattttatcctttaagagaga 39625318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 266 - 450
Target Start/End: Original strand, 19350125 - 19350312
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaa-aataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  19350125 gtccctaattataggacccttttaaaaaaaataacgagaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttataaattta 19350224  T
Q  365 tgctt--taagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    | |||   ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||| |||| || ||||||    
T  19350225 tccttcaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataaagacatgta 19350312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 283 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 25916673 - 25916450
Alignment:
Q  283 ccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaat 381  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |    
T  25916673 ccttttgctaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttcagagagagaatt 25916574  T
Q  382 gatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatg---tatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaa 478  Q
     |||||| ||| | | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||   |||||       |||||||||||||| |||    
T  25916573 aatttatatttcccatatattatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaattgaggcatgcaatatgtaaagaaataattaatgtagttagaa 25916474  T
Q  479 atagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  25916473 atagcaaatgggtcttataaaaag 25916450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 316 - 505
Target Start/End: Original strand, 33361500 - 33361683
Alignment:
Q  316 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttg 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33361500 gatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctg 33361599  T
Q  414 atcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    || ||||||||| || |||||| | ||| ||        |       ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  33361600 attgaagaaaaagatgtataataagtagggg--------taaagaaataattaatgtagttggaaaaagcaaagaggtcttataaaaaggga 33361683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 271 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 23308221 - 23308075
Alignment:
Q  271 taattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttt 370  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  23308221 taattatagggcctttttgaaaaaataacgggaattaagacagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatccttt 23308122  T
Q  371 aagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgat 415  Q
    ||||||||    |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23308121 aagagagagggttagtttatgttttcaacatgttatttattgctgat 23308075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 254 - 505
Target Start/End: Original strand, 36317394 - 36317645
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    |||| |||||| ||||||   |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||    
T  36317394 aataataccttcgtccctttatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaaga-agtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttt 36317492  T
Q  354 ttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||  |  |||||||||||   ||| ||||||||  |||| ||||||||| || |||||| |||||  |||||||||    
T  36317493 ttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccttatgctatttattactgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatg 36317592  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  36317593 tgaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaaggga 36317645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 39952558 - 39952318
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| || |||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||||||| ||||    
T  39952558 gtccctaattataagatccttttgttaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaatattat 39952459  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||  | ||| ||||||||  |||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||       ||||    
T  39952458 ccttaagagagagagttagtttatgtttttcatatgctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataat 39952359  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  39952358 taatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataaaaaggga 39952318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 51283802 - 51284053
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| | || |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  51283802 tactccctctgtccctaattataagacccttttgctaaaatcatgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 51283901  T
Q  356 acaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataat-taatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| ||| | |||||||  |  |||| |||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || ||||||  ||||| |||||||||||    
T  51283902 acaattttatccttaagagagagagttagtttacgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaaataggggcatgtatgt 51284001  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           ||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||    
T  51284002 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatggattttataaaaaggga 51284053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 292 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 1572591 - 1572382
Alignment:
Q  292 aaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgtt 391  Q
    ||||| ||||||||||| | | | ||||||| |||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||  | |||||||||    
T  1572591 aaaatcacggaaattaagaaaattgatatttatattaaagttgtttgtaatcgttattgtttttacaattttat-ccttaagagagagttaatttatgtt 1572493  T
Q  392 ttcaacatgttatttattgttga-tcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaagggg 490  Q
    ||| | ||||||||||||||||| | ||| ||||| || |||||| ||||  ||||||||| |       ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1572492 ttccatatgttatttattgttgattggaaaaaaaaaatgtataatgaatatgggcatgtatctaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggg 1572393  T
Q  491 tcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||    
T  1572392 tcttataaaaa 1572382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 301 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 20877883 - 20877680
Alignment:
Q  301 gaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatg 400  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||  |||||||||||||| | ||||||||||  |  |||| |||||| | |||    
T  20877883 gaaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattacttttacaattttattc-ttaagagagagttagtttacgttttccatatg 20877785  T
Q  401 ttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 500  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||   ||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||    
T  20877784 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatatgagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaaagatcttataaaa 20877685  T
Q  501 aggga 505  Q
    |||||    
T  20877684 aggga 20877680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 26058826 - 26058593
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||  |||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26058826 gtccctatatataagacccttttgccaaaattacgagaattaagatattggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 26058727  T
Q  366 gctttaagagagaa--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |    |||| |       |||    
T  26058726 cctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatg----ttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggg----gtatataaagaaataa 26058635  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26058634 ttaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaaggga 26058593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 256 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 54866570 - 54866390
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  54866570 tactacctccgtccctaattataagatccttttgaaaaa-taatggaaattaagatagtgaatatttatattaattatgtttgtaattactattgttttt 54866472  T
Q  356 acaattttatgcttta--agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataat 435  Q
    ||||||||||  ||||  | ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || ||||||    
T  54866471 acaattttatcttttaataaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataat 54866390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 255 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 29383313 - 29383064
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||| | | | |||| | ||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  29383313 atactacctccgtccctaaatataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagaaaattgataatagtaataaatttgtttgtaattattattgtttt 29383214  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |  |  ||||||||||||| ||  |||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||  || ||||  |    
T  29383213 tacaattttatccttgaagagagagagttagtttatgttttcaatatagtatttaatattgattgaagaaaaagatataaaataaataagggtatgttgg 29383114  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |       ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  29383113 taaagaattaattaatgtacttgaaaatatcaaagggatcttataaaaag 29383064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 255 - 554
Target Start/End: Original strand, 47008241 - 47008539
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  47008241 atactacctccgtccctaaatataggacccttttgccaaaattacggagattaaaaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttt 47008340  T
Q  355 tacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||| ||  | ||| ||||  || ||||  ||    
T  47008341 tacaattttatccttaagggagagagttaatttatgttttcaacataatatttattcttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagt 47008440  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47008441 aaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttc--tcaaaagtgtcttataattagggacggaggtagt 47008538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 266 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 53271878 - 53271642
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  ||||| | || |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  53271878 gtccctaattataagacttttttgctaaaattatgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcac-attgtttttacaattttat 53271780  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||| ||  |  ||||||||||| | |||||| |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  53271779 ccttaagagagggagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 53271680  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  53271679 taatgtaattggaaataacaaagggatcttataaaaag 53271642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 255 - 502
Target Start/End: Original strand, 1111387 - 1111635
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| ||||| | ||| | |  | | ||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  1111387 atactacctccgtccctaattataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagcattaaatttgtatgtaattactattgtttt 1111486  T
Q  355 tacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||  || || |  ||    
T  1111487 tacaattttatccttaagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatcttggt 1111586  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
           ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1111587 aaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaag 1111635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 318 - 501
Target Start/End: Original strand, 22832411 - 22832595
Alignment:
Q  318 tatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatc 416  Q
    |||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||  ||||     
T  22832411 tatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattactgatt 22832510  T
Q  417 gaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22832511 gaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 22832595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 292 - 501
Target Start/End: Original strand, 26806156 - 26806366
Alignment:
Q  292 aaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatg 389  Q
    ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||||||||   |  ||||||    
T  26806156 aaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatcctt-aagagagaaggttagtttatg 26806254  T
Q  390 ttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggg 489  Q
    ||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||       ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  26806255 ttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggg 26806354  T
Q  490 gtcttataaaaa 501  Q
    ||||||||||||    
T  26806355 gtcttataaaaa 26806366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 315 - 501
Target Start/End: Original strand, 26306406 - 26306593
Alignment:
Q  315 ggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaa-gagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttg 413  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||  | |||||||||||| | ||| || |||||| ||    
T  26306406 ggatatttgtattaaagttgtttgcaatcactattgtttttacaattttatccttaagcgagagagttaatttatgttttccatatgctacttattgctg 26306505  T
Q  414 atcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    ||  |||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26306506 attaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaa 26306593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 304 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 52178050 - 52177847
Alignment:
Q  304 attaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacat-- 399  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||  | || |||||| |||||||||      
T  52178050 attaagatagtggatatttgtattaaatatctttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaagattggtttatg-tttcaacattc 52177952  T
Q  400 gttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaa 499  Q
      ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||       ||||||||||||||| || ||| |||| | | |||||||    
T  52177951 tctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaactag-aaagagatattataaa 52177853  T
Q  500 aaggga 505  Q
    ||||||    
T  52177852 aaggga 52177847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 255 - 504
Target Start/End: Original strand, 44561435 - 44561685
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  |||||||| ||||  | ||||||| |||||| ||||| ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  44561435 atactacctccgtccctaaatatagaagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttt 44561534  T
Q  355 tacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||  || ||||  ||    
T  44561535 tacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggt 44561634  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggg 504  Q
           ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44561635 aaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaaggg 44561685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 255 - 425
Target Start/End: Original strand, 27646045 - 27646216
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| || | ||||| |||||| ||||| ||||||| ||| | |  | | ||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  27646045 atactacctccgtccctaattataggagctttttgcaaaaattacggagattaaaaaagttggttgtagcattaaatttgtatgtaattactattgtttt 27646144  T
Q  355 tacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  27646145 tacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaa 27646216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 379
Target Start/End: Original strand, 12675172 - 12675285
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12675172 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttacaattttat 12675271  T
Q  366 gctttaagagagaa 379  Q
     |||||||| ||||    
T  12675272 cctttaagaaagaa 12675285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 291 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 35938624 - 35938472
Alignment:
Q  291 aaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttat 388  Q
    |||||||||||||||||| | | | || | ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |  | |||    
T  35938624 aaaaataacggaaattaagaaaattgaaagttgtaataaatttgtttgtaattgttattgtttttacaattttatcctttaagagagatagttagtgtat 35938525  T
Q  389 gttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatag 441  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  35938524 gttttcaacatgataattaatgttgatcgaagaaaaagatataaaataaatag 35938472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 346 - 501
Target Start/End: Original strand, 44542303 - 44542460
Alignment:
Q  346 tattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagag 443  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||       
T  44542303 tattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataaga 44542402  T
Q  444 gcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
     |||||||||       ||||||||||||||| |||||| |||   ||||||||||||    
T  44542403 acatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataggaaaaatgtcttataaaaa 44542460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 303 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 54849614 - 54849410
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatg 400  Q
    |||||| | |||||||||||  ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||    |  |||||||||||||||||    
T  54849614 aattaagaaagtggatatttacattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcatttaagagagatggttactttatgttttcaacatg 54849515  T
Q  401 ttatttattgttgatcgaag-aaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaa 499  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||||       || |||||||| ||| ||||| |||| || |||||||||    
T  54849514 ttatttattgctgattgaagaaaaaatatgtataataaat-ggggcatgtatgtaaagaaatagttaatgtacttgaaaataacaaatggatcttataaa 54849416  T
Q  500 aaggga 505  Q
    ||||||    
T  54849415 aaggga 54849410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 384 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 49543845 - 49543674
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||| || ||| || || || |||||||||||       |||||||||||||||||||||||    
T  49543845 tttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaaaaaaaagatgtatgataaacaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 49543746  T
Q  484 aaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49543745 aaaagagtcttataaaaagggacaacaaattttc--tcaaaagggtcttataattagggacggaagtagtagtt 49543674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 270 - 428
Target Start/End: Original strand, 41392633 - 41392793
Alignment:
Q  270 ctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctt 369  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| | |  |||||| | ||| |||  | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  41392633 ctaattataagagccttttgataaaatcatgagaattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtttgtaattactattgtttttacaattatatcctt 41392732  T
Q  370 taagag--agaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatat 428  Q
    ||||||  |||  || ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  41392733 taagagatagagttggtttatattttcaacatagtatttattgttgattgaagaaaaatat 41392793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 20849111 - 20849007
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20849111 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaggatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 20849012  T
Q  375 gagaa 379  Q
     ||||    
T  20849011 aagaa 20849007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 270 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 33290627 - 33290473
Alignment:
Q  270 ctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctt 369  Q
    |||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||| | ||| |||| | ||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| | |    
T  33290627 ctaattatatgaacctttagtcaaaatcacggaaattaagaaagttgataatagtattaaatttgtttataattactattatttttacaattgtattc-t 33290529  T
Q  370 taagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||||||  | ||||||||| |||||||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  33290528 taagagagagttaatttatgttctcaacataatatttattattgattgaagaaaaa 33290473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 384 - 498
Target Start/End: Original strand, 18658328 - 18658442
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt-nnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 482  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||        ||||||||||||||||||||||    
T  18658328 tttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaaaaaaataattaatgtagttggaaatag 18658427  T
Q  483 caaaggggtcttataa 498  Q
    |||| |||||||||||    
T  18658428 caaa-gggtcttataa 18658442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 323 - 501
Target Start/End: Original strand, 28810928 - 28811107
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  28810928 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 28811027  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||| ||  | ||| ||||  || ||||  ||       ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  28811028 aaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggagtcttataaaaa 28811107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Original strand, 46557752 - 46557867
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 483  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||       ||||||||||||||||||||||     
T  46557752 tttatgttttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataga 46557851  T
Q  484 aaaggggtcttataaa 499  Q
    |||||| |||||||||    
T  46557852 aaagggatcttataaa 46557867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 254 - 425
Target Start/End: Original strand, 54927828 - 54928001
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || | ||||| |||||| ||||| |||||   ||| | |  | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  54927828 aatactacctccgtccctaattataggagctttttgcaaaaattacggagattaagcaagttggttgtagtattaaatttgtatgtaattactattgttt 54927927  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    ||| ||||||||  ||||| ||||| |  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  54927928 ttataattttatcatttaaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaa 54928001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 248 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 25130951 - 25130834
Alignment:
Q  248 atatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagta 347  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||||  ||||| |||| |||||| | | |||||||||||||||||  |||||||||| | ||    
T  25130951 atattaaatactaccttcgtccctatatataagactcttttgctaaaatcacgggaattaagaaaatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcacta 25130852  T
Q  348 ttgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25130851 ttgtttttacaattttat 25130834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 324 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 38341177 - 38341077
Alignment:
Q  324 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaa 423  Q
    |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  38341177 tattaaatctgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaa 38341079  T
Q  424 aa 425  Q
    ||    
T  38341078 aa 38341077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 429
Target Start/End: Original strand, 49543929 - 49544093
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||| | | | |||| |  || ||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  49543929 gtccctaattatagggccctttagaaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtgataataaatttgttggtaattactattggttttacaattttat 49544028  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatata 429  Q
     ||| | |||||||  | ||||||||||| || ||  |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  49544029 ccttaagagagagagttaatttatgtttttaatatagtatttaatgttgattgaagaaaaatata 49544093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 332
Target Start/End: Original strand, 43408189 - 43408268
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaata 332  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  43408189 taatactacctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaata 43408268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 402 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 9582393 - 9582290
Alignment:
Q  402 tatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| || || ||| ||||| |||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9582393 tatttatttttgattgaagaaaaagatgtaaaataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatatagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaa 9582294  T
Q  502 ggga 505  Q
    ||||    
T  9582293 ggga 9582290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 425
Target Start/End: Original strand, 29719451 - 29719621
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||| ||| |||| || ||||||| |||||| ||||| ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  29719451 tactacctccgtccttaaatataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgttttt 29719550  T
Q  356 acaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||||||| ||| | |||||||  | ||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  29719551 acaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttgaacatactatttattgttgattgaagaaaaa 29719621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 344
Target Start/End: Original strand, 46557664 - 46557742
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatta 344  Q
    ||||||||||| | ||  |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46557664 gtccctaattacaagattcttttggaaaaataacgggaattaaaataatggatatatgtattaaatatgtttgtaatta 46557742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 352 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 30820079 - 30819925
Alignment:
Q  352 ttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||| | | |||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||| || || ||| ||||  || ||||     
T  30820079 ttttacaattttatccttaagagagaggattaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaagaaaaagatgtaaaataaataagggtatgtt 30819980  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
     ||       ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30819979 agtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaaggga 30819925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 323 - 423
Target Start/End: Original strand, 42526432 - 42526533
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||| | | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  42526432 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagaggattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 42526531  T
Q  422 aa 423  Q
    ||    
T  42526532 aa 42526533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 554
Target Start/End: Original strand, 17589683 - 17589913
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  17589683 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 17589782  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttc 521  Q
    |||| ||  | ||| ||||  ||  |||  ||       ||||||||||| ||| ||||| |||| | |||||||||||||||| ||          |||    
T  17589783 aaaaaatgcaaaataaataagggtgtgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgagtcttataaaaagggacaaattatttt--ttc 17589880  T
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17589881 aaaagtgtcttataattagggacggaggtagta 17589913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 554
Target Start/End: Original strand, 48904070 - 48904300
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  48904070 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 48904169  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttc 521  Q
    |||| ||  | ||| ||||  || ||||  ||       ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||          ||     
T  48904170 aaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaaattatttt--ttt 48904267  T
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48904268 aaaagggtcttataattagggacggaggtagta 48904300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 346 - 501
Target Start/End: Original strand, 7886892 - 7887048
Alignment:
Q  346 tattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagagg 444  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| | ||| |||  ||| |||||||||  | ||| ||||||||| | || ||||||||| || |||||| |||||||     
T  7886892 tattatttttacaattttattcttaagagaaagagttgacttatgtttttcatatgctatttattgctcattgaagaaaaagatgtataataaatagaga 7886991  T
Q  445 catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||       |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7886992 catgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaa 7887048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 401 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 20848712 - 20848612
Alignment:
Q  401 ttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 500  Q
    ||||||||||||||| || |||||| || |||||| ||| | |||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  20848712 ttatttattgttgattgatgaaaaagatgtataataaatcggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaa 20848613  T
Q  501 a 501  Q
    |    
T  20848612 a 20848612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Original strand, 34021802 - 34021905
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||| |||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  34021802 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatccttaagagatagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 34021901  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  34021902 aaaa 34021905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 508
Target Start/End: Original strand, 22527507 - 22527614
Alignment:
Q  402 tatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatag-aggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 500  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| || |||||||||       ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||    
T  22527507 tatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggagccatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgaatcttataaaa 22527606  T
Q  501 agggataa 508  Q
    ||||||||    
T  22527607 agggataa 22527614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 428
Target Start/End: Original strand, 40215052 - 40215142
Alignment:
Q  339 taattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatat 428  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||| | | |||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  40215052 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagaattaacttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaatat 40215142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 505
Target Start/End: Original strand, 48902516 - 48902698
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | ||| || |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  48902516 gtattaaatttgtatataactactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 48902615  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||| ||  | ||| |||| ||| ||||  ||       ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  48902616 aaaa-atgcaaaataaataaaggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaaggga 48902698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 31533574 - 31533414
Alignment:
Q  346 tattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagag 443  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||  |  ||||||||||| | ||| |||||||||  ||| ||||||||| || |||||| |||||||    
T  31533574 tattatttttacaattttatcctt-aggagagaaagttagtttatgttttctatatgctatttattgcagattgaagaaaaagatgtataataaatagag 31533476  T
Q  444 gcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
     |||||||||       |||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  31533475 acatgtatgtaaagaaataattaatatagttagaaatagcaattggatcttataaaaaggga 31533414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 325
Target Start/End: Original strand, 33360885 - 33360954
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgta 325  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  33360885 tactacctccgtccttaattataagacccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgta 33360954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 377
Target Start/End: Original strand, 16776483 - 16776607
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||| | ||||||||||| |||||| | | |  | | | ||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  16776483 taatactacctctgtccctaactatagggccctttaggaaaaataacgggaattaagaaaattaaaagtggtaataaatttgtttgtaattattattgtt 16776582  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagag 377  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||    
T  16776583 tttacaaatttgtcctttaagagag 16776607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 402 - 554
Target Start/End: Original strand, 39625681 - 39625833
Alignment:
Q  402 tatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    ||||||||| | || |||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||       ||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||    
T  39625681 tatttattgctaattgaagaaaaatatgtataataaatagagacatgcatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagttttataaaaa 39625780  T
Q  502 gggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||| ||         |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||    
T  39625781 gggacaatttttttttcttcaaaaaaatcttataattagagatggaggtagta 39625833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 426
Target Start/End: Original strand, 42044061 - 42044165
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||    |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  42044061 gtattaaatttgtgtataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 42044160  T
Q  422 aaaat 426  Q
    |||||    
T  42044161 aaaat 42044165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 339 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 42755555 - 42755341
Alignment:
Q  339 taattagtattgtttttacaattttatgctttaa-gagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataatta 437  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||| || ||||||  | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| |    
T  42755555 taattactattgtttttataattttatccttaaaagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataa 42755456  T
Q  438 atagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataat 537  Q
    ||| ||| ||||  ||       ||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||          ||||| |||||||||||||    
T  42755455 ataaaggtatgttggtaaagaaataattaatgtatttggaaataccaaaaaggtcttataaaaagagacaaattatttt--ttcaatagagtcttataat 42755358  T
Q  538 tagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||||    
T  42755357 tagggacggaggtagta 42755341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 15095428 - 15095325
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||    
T  15095428 gtattaaatttgtatatatttactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaaga 15095329  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  15095328 aaaa 15095325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 339 - 425
Target Start/End: Original strand, 4836516 - 4836601
Alignment:
Q  339 taattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  4836516 taattactattgtttttacgattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttatttttgattgaagaaaaa 4836601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 323 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 8379907 - 8379728
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| || ||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||| ||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  8379907 gtattaaatttgtatataattactactgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaacataatattgattgttgattgaaga 8379808  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||| ||  | ||| ||||  || ||||  ||       ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8379807 aaaaaattcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaatgggtcttataaaaa 8379728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 24813814 - 24813713
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaa 422  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |    |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  24813814 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagaaagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaa 24813716  T
Q  423 aaa 425  Q
    |||    
T  24813715 aaa 24813713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 266 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 49543920 - 49543866
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatat 320  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  49543920 gtccctaattataggccccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatat 49543866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 425
Target Start/End: Original strand, 12918573 - 12918748
Alignment:
Q  251 tttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 350  Q
    |||| ||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| |||||    
T  12918573 tttattactacctccgtccctaaatatatgagccttttgccaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattg 12918672  T
Q  351 tttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |  | |||||| ||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||    
T  12918673 tttttacaattttat-ccttaagagagatagttaatttatattttcaatataatatttattgttaattgaagaaaaa 12918748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 502
Target Start/End: Original strand, 16776833 - 16776874
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776833 taattaatgtacttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 16776874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 415
Target Start/End: Original strand, 21497618 - 21497711
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgat 415  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  21497618 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgtttttaacataatatttattgttgat 21497711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 443
Target Start/End: Original strand, 48136964 - 48137017
Alignment:
Q  390 ttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagag 443  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  48136964 ttttcaacatattatttattgttgatcgaagaaaaaaatgtataataaatagag 48137017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Original strand, 7462943 - 7462987
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7462943 taattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaaggga 7462987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 20919173 - 20919133
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20919173 taattaatgtagttggaaatagtaaaggggtcttataaaaa 20919133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 20928135 - 20928095
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20928135 taattaatgtagttggaaatagtaaaggggtcttataaaaa 20928095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 31398006 - 31397930
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacat 399  Q
    ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| | ||||||||    
T  31398006 gtattaaatttctttataattactattgtttttacaattatatcctttaagagagagttgatttatatcttcaacat 31397930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 46879306 - 46879210
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt 362  Q
    ||||||| ||||  |||| |||||  ||||| |||| | |||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46879306 gtccctatttatcagaccattttggcaaaatcacgggacttaagaaagttgatatttgtattaaattcgtttgtaattactattgtttttacaattt 46879210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 519 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 4564272 - 4564237
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4564272 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 4564237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 371
Target Start/End: Original strand, 23650639 - 23650686
Alignment:
Q  324 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta 371  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23650639 tattaaatttgtttgtaattagtaatgtttttacaattttatccttta 23650686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 45404604 - 45404501
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||    |||||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||    
T  45404604 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaaga 45404505  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  45404504 aaaa 45404501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 4564466 - 4564364
Alignment:
Q  324 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaa 422  Q
    |||||||| ||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| ||    
T  4564466 tattaaatttgtatattattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacacaatatttattgttgattgaataa 4564367  T
Q  423 aaa 425  Q
    |||    
T  4564366 aaa 4564364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 9582460 - 9582398
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9582460 aattaagaaagtggatatttgtatcaaagttgtttggaattactattgtttttacaattttat 9582398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10015832 - 10015787
Alignment:
Q  250 atttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaa 295  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10015832 atttaatactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaa 10015787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 327 - 376
Target Start/End: Original strand, 20084697 - 20084746
Alignment:
Q  327 taaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagaga 376  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20084697 taaatttgtttgtaattgttattgtttttacaattttatcctttaagaga 20084746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Original strand, 34265531 - 34265640
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatga--------tttatgttttcaacatgttatttattgttga 414  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||        ||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  34265531 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttattc-ttaagagagagatgaataattagtttatgttttcaacatagtatttattgtcga 34265629  T
Q  415 tcgaagaaaaa 425  Q
    | |||||||||    
T  34265630 ttgaagaaaaa 34265640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 323 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 36584935 - 36584835
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaa 422  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||    |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  36584935 gtattaaatttgtatataattactattgtttttataattttat-ccttaagagagagtaaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaa 36584837  T
Q  423 aa 424  Q
    ||    
T  36584836 aa 36584835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 384 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 55287429 - 55287388
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  55287429 tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagtaaaa 55287388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 330
Target Start/End: Original strand, 7462850 - 7462914
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaa 330  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  7462850 gtccctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaa 7462914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 31541118 - 31541074
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  31541118 taattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaaggga 31541074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Original strand, 41392826 - 41392870
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  41392826 taattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttacaaaaaggga 41392870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 425
Target Start/End: Original strand, 48655072 - 48655150
Alignment:
Q  348 ttgtttttacaattttatgctttaaga--gagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||  ||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  48655072 ttgtttttacaattttatactt-aagatggagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaa 48655150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 519 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 4759123 - 4759088
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4759123 ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 4759088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Original strand, 28875059 - 28875161
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||| |||| || ||  |||||||||||||| |||||    
T  28875059 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttat-cttaagagagagagttaatttatatttttaatataatatttattgttgattgaaga 28875157  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  28875158 aaaa 28875161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28875289 - 28875246
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataa 298  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28875289 atactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataa 28875246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 519 - 554
Target Start/End: Original strand, 28875253 - 28875288
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28875253 ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 28875288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 519 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 36584745 - 36584710
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36584745 ttcaaaagagtcttataattagggacagaggtagta 36584710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 519 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 42801556 - 42801521
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42801556 ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 42801521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 501
Target Start/End: Original strand, 54690580 - 54690652
Alignment:
Q  429 atataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||       ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  54690580 atataataaatagaggcatgcatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagcaaagaggtcttataaaaa 54690652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 519 - 557
Target Start/End: Original strand, 10656954 - 10656992
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10656954 ttcaaaagggccttataattagggacggaggtagtagtt 10656992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 461 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 15095289 - 15095195
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||           ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15095289 taattaatgtacttgaaaatatcaaagggatcttataaaaagggacaattttttttc--tcaaaagggttttataattagggacggaggtagtagtt 15095195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19897876 - 19897834
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaa 295  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19897876 taatactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaa 19897834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 408
Target Start/End: Original strand, 29447602 - 29447688
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttat 408  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||| ||| ||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||||||||  |||||||    
T  29447602 gtattaaatttgtatataattactattatttgtacaattttatccttaagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttat 29447688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 461 - 554
Target Start/End: Original strand, 32969171 - 32969262
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||          |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  32969171 taattaatgtacttggaaacaccaaagggatcttataaaaagggacaaattatttt--ttcaaaagggtcttataattagggacgggggtagta 32969262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 298
Target Start/End: Original strand, 36584710 - 36584752
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataa 298  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36584710 tactacctctgtccctaattataagactcttttgaaaaaataa 36584752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 38364400 - 38364295
Alignment:
Q  322 tgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaa 419  Q
    |||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||  || | ||||||||||| ||  |||| | ||||||| |||    
T  38364400 tgtaataaatttatttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagagttgttatatgttttcaaaatagtattcactgttgattgaa 38364301  T
Q  420 gaaaaa 425  Q
    ||||||    
T  38364300 gaaaaa 38364295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 520 - 554
Target Start/End: Original strand, 49383836 - 49383870
Alignment:
Q  520 tcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49383836 tcaaaagagtcttataattagagacggaggtagta 49383870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 519 - 560
Target Start/End: Original strand, 8547167 - 8547208
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagttgat 560  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  8547167 ttcaaaagggtcttatacttagggacggaggtagtatttgat 8547208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 399
Target Start/End: Original strand, 22494483 - 22494544
Alignment:
Q  339 taattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacat 399  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||| | |||||||  |||||||||||||||||||    
T  22494483 taattactattatttttacaattttatccttaagagagagagttgatttatgttttcaacat 22494544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 519 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 33360920 - 33360883
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagt 556  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33360920 ttcaaaagggtcttataattaaggacggaggtagtagt 33360883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 48904303 - 48904258
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataa 298  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  48904303 taatactacctccgtccctaattataagacccttttaaaaaaataa 48904258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 519 - 556
Target Start/End: Original strand, 54866535 - 54866572
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagt 556  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54866535 ttcaaaaggatcttataattagggacggaggtagtagt 54866572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 7886500 - 7886460
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  7886500 taattaatgtagttggaaataacaaaggaatcttataaaaa 7886460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 520 - 556
Target Start/End: Original strand, 8503508 - 8503544
Alignment:
Q  520 tcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagt 556  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8503508 tcaaaagggtcttatatttagggacggaggtagtagt 8503544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 521 - 557
Target Start/End: Original strand, 10045104 - 10045140
Alignment:
Q  521 caaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10045104 caaaagggtcttataattagggacggatgtagtagtt 10045140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 522 - 554
Target Start/End: Original strand, 12906418 - 12906450
Alignment:
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12906418 aaaagggtcttataattagggacggaggtagta 12906450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 521 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 16435010 - 16434974
Alignment:
Q  521 caaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16435010 caaaagggtcttataattagggacggagggagtagtt 16434974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 520 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 20918253 - 20918221
Alignment:
Q  520 tcaaaagagtcttataattagggacggaggtag 552  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20918253 tcaaaagggtcttataattagggacggaggtag 20918221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 520 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 20927215 - 20927183
Alignment:
Q  520 tcaaaagagtcttataattagggacggaggtag 552  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20927215 tcaaaagggtcttataattagggacggaggtag 20927183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 519 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 24087112 - 24087080
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggta 551  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24087112 ttcaaaggagtcttataattagggacggaggta 24087080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24087382 - 24087338
Alignment:
Q  246 caatatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttga 290  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  24087382 caatattaaatactacctccgtccctaattataagacccttttga 24087338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 520 - 556
Target Start/End: Original strand, 27646309 - 27646345
Alignment:
Q  520 tcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagt 556  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27646309 tcaaaaggatcttataattagggacggaggtagtagt 27646345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 266 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 32969252 - 32969220
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataa 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32969252 gtccctaattataagacccttttgaaaaaataa 32969220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 521 - 557
Target Start/End: Original strand, 36005768 - 36005804
Alignment:
Q  521 caaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36005768 caaaagggtcttataattagggacggagggagtagtt 36005804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #237
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 430 - 503
Target Start/End: Original strand, 41751384 - 41751457
Alignment:
Q  430 tataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    |||||| ||||||| |||||||||       ||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  41751384 tataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaacgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaagg 41751457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #238
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 266 - 298
Target Start/End: Original strand, 45404385 - 45404417
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataa 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45404385 gtccctaattataagacccttttgaaaaaataa 45404417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #239
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Original strand, 52693634 - 52693678
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  52693634 taattaatgtacttggaaataccaaaatggtcttataaaaaggga 52693678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 213)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 255 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 41317891 - 41317593
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41317891 atactacctccgtctctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 41317792  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||     
T  41317791 tacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtatgta 41317692  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||         ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41317691 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa-ttttttttcttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 41317593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 257 - 554
Target Start/End: Original strand, 9413067 - 9413362
Alignment:
Q  257 actacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 356  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9413067 actaccttcgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 9413166  T
Q  357 caattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnn 456  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||       
T  9413167 caattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaa 9413266  T
Q  457 nnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9413267 gaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttt--ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 9413362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 6090031 - 6089735
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6090031 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 6089932  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||      
T  6089931 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 6089832  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
         |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||          |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6089831 agaaataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttt--ttcaaaagggtcttataattagagacggaggtagta 6089735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 251 - 497
Target Start/End: Original strand, 229142 - 229388
Alignment:
Q  251 tttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 350  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  229142 tttattactacctctgtccttaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattg 229241  T
Q  351 tttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  229242 tttttacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgta 229341  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata 497  Q
    |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  229342 tgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata 229388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 256 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 34931375 - 34931078
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34931375 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 34931276  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| ||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||      
T  34931275 acaattttatcctttaagagagagttggttcatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 34931176  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtag 555  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  34931175 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttt--ttcaaaagggtcttataattaggaacggaggtagtag 34931078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 52602277 - 52602038
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52602277 gtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 52602178  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||       |||||    
T  52602177 cctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataatt 52602078  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52602077 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 52602038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 8923417 - 8923658
Alignment:
Q  266 gtccctaattatat--gacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttt 363  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8923417 gtccctaattatatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagtttt 8923516  T
Q  364 atgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
    || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||       |||    
T  8923517 atcctttaagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataa 8923616  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8923617 ttaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaaggga 8923658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 7763491 - 7763786
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7763491 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 7763590  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||      
T  7763591 acagttttatcctttaagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttaattgaagaaaaagat-tataattaataggggcatgtatgtaa 7763689  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7763690 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 7763786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 4102465 - 4102704
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4102465 gtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 4102564  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| || |||||||||||  |||||||||||       |||||    
T  4102565 cctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaagatgtataattaataagggcatgtatgtaaagaaataatt 4102664  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4102665 aatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 4102704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 256 - 501
Target Start/End: Original strand, 40614646 - 40614891
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40614646 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 40614745  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||      
T  40614746 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggagcatgtatgtaa 40614845  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40614846 agaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaa 40614891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 290 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 25509470 - 25509209
Alignment:
Q  290 aaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatg 389  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  25509470 aaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagttttatcctttaagagagagatgttttatg 25509371  T
Q  390 ttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggg 489  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25509370 ttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaaggg 25509271  T
Q  490 gtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25509270 gtcttataaaaagggacaaaaaaattc---tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 25509209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 256 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 36695152 - 36694851
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36695152 tactccctctgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 36695053  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  36695052 acaattttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 36694953  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  36694952 aaagaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggagggagt 36694855  T
Q  554 agtt 557  Q
    ||||    
T  36694854 agtt 36694851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 256 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 36711253 - 36710952
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36711253 tactccctctgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 36711154  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  36711153 acaattttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 36711054  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  36711053 aaagaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggagggagt 36710956  T
Q  554 agtt 557  Q
    ||||    
T  36710955 agtt 36710952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 249 - 554
Target Start/End: Original strand, 21630838 - 21631144
Alignment:
Q  249 tatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtat 348  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  21630838 tattcaatactacctccgtccctaattatatagcctttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactat 21630937  T
Q  349 tgtttttacaattttatgc-tttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggc 445  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||| ||||| |||    
T  21630938 tgtttttacaaatttatccttttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggc 21631037  T
Q  446 atgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacg 545  Q
    ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||         ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21631038 atgtatgtagagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaa--tttgtttcttcaaaagggtcttataattagggacg 21631135  T
Q  546 gaggtagta 554  Q
    |||||||||    
T  21631136 gaggtagta 21631144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 268 - 505
Target Start/End: Original strand, 41855226 - 41855463
Alignment:
Q  268 ccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgc 367  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  41855226 ccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcc 41855325  T
Q  368 tttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaa 467  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||       |||||||    
T  41855326 tttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaa 41855425  T
Q  468 tgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41855426 tgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 41855463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 248 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 48854122 - 48853865
Alignment:
Q  248 atatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagta 347  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48854122 atatttaatactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacaggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattaata 48854023  T
Q  348 ttgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcat 447  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  48854022 ttgtttttacaattttatcctttaagagagaaatggtttacgttttcaacatattatttattattgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcat 48853923  T
Q  448 gtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  48853922 gtatgtaaagaaagaattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaaggga 48853865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 256 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 8472344 - 8472047
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8472344 tactacctccgtccctaattatagggctcttttaaaaaaataacggaaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 8472245  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaag-aaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || |||| ||||||| |||||||||||     
T  8472244 acaattttatcctttaagagag--atgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaaatgtatagttaataggggcatgtatgta 8472147  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8472146 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttc--tcaaaagggtcttataattagggacggaagtagta 8472049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 280 - 554
Target Start/End: Original strand, 1767627 - 1767897
Alignment:
Q  280 gacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaa 379  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1767627 gacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgcattatatatgtttgtaattagcattgtttttacaattttatcatttaagagagaa 1767726  T
Q  380 atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaa 479  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||       ||||||||||||||| |||    
T  1767727 atggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaa 1767826  T
Q  480 tagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1767827 tagcaaaggggtcttataaaaagggacaatttttt----ttcaaaagggtcttataattagggacgaaggtagta 1767897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 266 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 26550076 - 26549791
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26550076 gtccttaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgta-ttagtattgtttttacaattttat 26549978  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||       |||||    
T  26549977 cctttaagagagaaattgtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataatt 26549878  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||         ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  26549877 aatatagttggaaatagcaaatgggtctta-aaaaagggacaa-ttttttttcttcaaaagggtcttataattaaggactgaggtagta 26549791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 266 - 489
Target Start/End: Original strand, 43395422 - 43395645
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43395422 gtccctaattatagaatcctttagagaaaataacggaaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 43395521  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |  ||||||||       |||||    
T  43395522 cctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaatagggatatgtatgtaaagaaataatt 43395621  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggg 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  43395622 aatgtagttggaaatagcaaaggg 43395645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 254 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 3549329 - 3549079
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3549329 aatactacctccgtctctaattatagagtcctttcgaaaaaataacgggaattaagatagtgtatatttatattaaatatgtttgtaattagtatt-ttt 3549231  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |    
T  3549230 ttacaattttatcctttaagagataaatgatttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatat 3549131  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3549130 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaaggga 3549079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 15100660 - 15100403
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15100660 tactacctctgtcccttattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 15100561  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--------tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcat 447  Q
    |||||||||| |||||||||||| |        || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||    
T  15100560 acaattttatcctttaagagagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcat 15100461  T
Q  448 gtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||       |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15100460 gtatgtaaagaaataattattgtagtttgaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 15100403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 252 - 505
Target Start/End: Original strand, 27530339 - 27530592
Alignment:
Q  252 ttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgt 351  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27530339 ttaatactacctccgtccctaattatagggcc-ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgc 27530437  T
Q  352 ttttacaattttatgctttaagag--agaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgt 449  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||| |||||||    
T  27530438 ttttacaattttatcctttaagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaagatgtataataaataggggcatgt 27530536  T
Q  450 atgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27530537 atgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaaggga 27530592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 253 - 505
Target Start/End: Original strand, 38530888 - 38531140
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38530888 taatactacctccgtccctaattatagggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattaatattgtt 38530987  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| || ||| |||    
T  38530988 tttataattttatcctttaagagggagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggtatgcatg 38531087  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  38531088 taaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagcgatcttataaaaaggga 38531140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 282 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 26544774 - 26544551
Alignment:
Q  282 cccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaat 381  Q
    |||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26544774 ccctttcgaaaaaataacaagaattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttatgagagaaat 26544675  T
Q  382 gatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaata 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||       ||||||||||| ||| |||||    
T  26544674 gatttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataatttataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtaattgaaaata 26544575  T
Q  482 gcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    | |||| |||||||||||||||||    
T  26544574 gaaaagaggtcttataaaaaggga 26544551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 252 - 505
Target Start/End: Original strand, 12814522 - 12814777
Alignment:
Q  252 ttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaa-aataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 350  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12814522 ttaatactacctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaaataacgggaattaagatactggatattagtattaaatatgtttgcaattactattg 12814621  T
Q  351 tttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatg 448  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  12814622 tttttacaattttatcctttaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttactgttgattgaagaaaaagatgtataa-taataggggcatg 12814720  T
Q  449 tatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||       |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12814721 tatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagtgtcttataaaaaggga 12814777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 27037567 - 27037269
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  27037567 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaataactattgttttt 27037468  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||  |||||  ||  ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  27037467 acaattttatcctttaagaaagagagctggcttatgctttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 27037368  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27037367 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagt 27037270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 28052487 - 28052189
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28052487 tactacctccgtccctaattacaggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 28052388  T
Q  356 acaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    | |||||||| ||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||    
T  28052387 ataattttatcctttaagagagatggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattggagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 28052288  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||          ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28052287 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaaat--ttcaaaagaatcttataattaaggacggaggtagt 28052190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 31239016 - 31238766
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaa-taacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31239016 tactacctccgtccctaattatagggcccctttgaaaaaaatagcgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 31238917  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| || |||||| || || |||||||||||     
T  31238916 tacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattactgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggcatgtatgta 31238817  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
          ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31238816 aagaaataattaaagtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 31238766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 42275900 - 42276198
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42275900 tactaccttcgtcc-taattataagactcttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 42275998  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||  | ||   ||  ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  42275999 acaattttatcctttaagaaatagggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 42276098  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||         | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42276099 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaatttttttc-tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagt 42276197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 5765730 - 5766027
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5765730 tactacctccgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 5765829  T
Q  356 acaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    |||||||| | ||| | ||||||   || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||     
T  5765830 acaattttctccttaagagagagtgttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 5765929  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
          ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| |||||            |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5765930 aagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataacaagagataaaaaaaattca--caaaagggtcttataattagggacggaggtagta 5766027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 255 - 554
Target Start/End: Original strand, 48067633 - 48067932
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  48067633 atactacctccgtccctaattacaaaacccttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttt 48067732  T
Q  355 tacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  48067733 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 48067832  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtag 552  Q
    |       |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||          |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  48067833 taaagaaataattaatttagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaattttttt--ttcaaaagggtcttataattagagacggaggtag 48067930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 271 - 486
Target Start/End: Original strand, 14090006 - 14090223
Alignment:
Q  271 taattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttt 370  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14090006 taattataagatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 14090105  T
Q  371 aagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaat 468  Q
    |||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||    
T  14090106 aagagagagaggtaatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 14090205  T
Q  469 gtagttggaaatagcaaa 486  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  14090206 gtagttggaaataacaaa 14090223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 255 - 439
Target Start/End: Original strand, 44529413 - 44529597
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44529413 atactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 44529512  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaat 439  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||||||||    
T  44529513 tacaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgatgattgaaaaaaaagatgtataattaat 44529597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 256 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 23530843 - 23530596
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23530843 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 23530744  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||  ||||   ||  |||| ||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  23530743 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatcttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 23530644  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
           |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23530643 aaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 23530596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 38613773 - 38613522
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  38613773 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaactaaaatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattattttt 38613674  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  38613673 acaattttatcctttaagaaagagggctggcttatgttttcaacattctatttattgatgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 38613574  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38613573 aaagaaataattaatgtagttagaaatataaaaggggtcttataaaaaggga 38613522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 256 - 550
Target Start/End: Original strand, 45285551 - 45285843
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |  |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45285551 tactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaa--taacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 45285648  T
Q  356 acaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||    
T  45285649 acaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgt 45285748  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggt 550  Q
           |||||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| ||           |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45285749 aaagaaataattaatgtagttggaaataggaaataagttttataaaaagggacaaaaaaatttc--tcaaaagagtcttataattagggacggaggt 45285843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 269 - 508
Target Start/End: Original strand, 19792616 - 19792855
Alignment:
Q  269 cctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgct 368  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  19792616 cctaattatagggcccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 19792715  T
Q  369 ttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaat 468  Q
    |||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |  ||||||||       ||||||||    
T  19792716 ttaagataaagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataattaat 19792815  T
Q  469 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
     |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19792816 atagttgaaaatagaaaaggagtcttataaaaagggataa 19792855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 253 - 547
Target Start/End: Original strand, 9202242 - 9202535
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||    
T  9202242 taatactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgtatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtt 9202341  T
Q  353 tttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  9202342 tttacaattttatccttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtat 9202441  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacgga 547  Q
    ||       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||           ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9202442 gtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaatggataaaaacaattc--tcaaaagagtcttataattagggacgga 9202535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 256 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 14347420 - 14347174
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||||| | ||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  14347420 tactacatctgtccctaattataaagctcttttgagaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 14347321  T
Q  356 acaattttatgctttaaga--gagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||  |||   || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  14347320 acaattttatcctttaagagggagggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 14347221  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 500  Q
           ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  14347220 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagaggttttataaaa 14347174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 265 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 15111874 - 15111628
Alignment:
Q  265 tgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 364  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  15111874 tgtcccttattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattaattttacaatttta 15111775  T
Q  365 tgctttaagagagaaa------tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnn 458  Q
    | |||||||||||| |      || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| || ||||  | |||||||||         
T  15111774 tcctttaagagagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatatggacatgtatgtaaaga 15111675  T
Q  459 nntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
      |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15111674 aataattattgtagtttgaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 15111628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 255 - 554
Target Start/End: Original strand, 28885841 - 28886141
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28885841 atactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 28885940  T
Q  355 tacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || | | || ||||| ||||||||||    
T  28885941 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtttcataaataggggcatgtatg 28886040  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtag 552  Q
    |       |||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||         ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28886041 taaataaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttacaaaaagggacaa-ttttttctcttcaaaatggtcttataattagggacggaggtag 28886139  T
Q  553 ta 554  Q
    ||    
T  28886140 ta 28886141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 270 - 505
Target Start/End: Original strand, 36674051 - 36674288
Alignment:
Q  270 ctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctt 369  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  36674051 ctaattataggacctttttgaaaaaataacgcgaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 36674150  T
Q  370 ta--agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaa 467  Q
    ||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||| ||||       |||||||    
T  36674151 taagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgcatgtaaaaaaataattaa 36674250  T
Q  468 tgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||  |||||||||| || |||||||||||||||    
T  36674251 tgtagttaaaaatagcaaaaggatcttataaaaaggga 36674288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 45794632 - 45794391
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  45794632 gtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 45794533  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||| |||       |||    
T  45794532 cctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtgtgtaaagaaataa 45794433  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45794432 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 45794391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 9715658 - 9715407
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9715658 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 9715559  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||| | |||||| ||||    
T  9715558 acaattttatcctttaagaaagagggttgccttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaattggggcatgcatgt 9715459  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  9715458 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggcgcttataaaaaggga 9715407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 266 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 14171817 - 14171630
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14171817 gtccctaattataggacccttttgaaaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaattttat 14171718  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
     |||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  14171717 cctttaaaagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgt 14171630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 256 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 25284104 - 25283918
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25284104 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttataattactattgttttt 25284005  T
Q  356 acaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaata 440  Q
    |||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  25284004 acaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaata 25283918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 254 - 424
Target Start/End: Original strand, 44454563 - 44454736
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaa-aataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  44454563 aatactacctttgtccctaattataggatccttttgaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgat 44454662  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaa 424  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  44454663 tttacaattttatcctttaagagagatggatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgatagaagaaaa 44454736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 267 - 502
Target Start/End: Original strand, 9378852 - 9379090
Alignment:
Q  267 tccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatg 366  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  9378852 tccctaattataagatc-ttttgaaaaaataacggaaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatc 9378950  T
Q  367 ctttaagagagaaa----tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnnta 462  Q
    |||||||||||| |     | |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| | ||| | |||||||||       ||    
T  9378951 ctttaagagagagagagtcggtttatgtttttaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataagtagggacatgtatgtaaagaaata 9379050  T
Q  463 attaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  9379051 attaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaag 9379090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 15892303 - 15892600
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15892303 tactatctctgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 15892402  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||| |||    || ||||||||||||||||  ||||||||  |||| ||| ||||| || |||||| |||||  |||| |||||    
T  15892403 acaattttatcctttaagaaagagtgttggtttatgttttcaacattctatttattactgattgaaaaaaaagatgtataataaataggagcatatatgt 15892502  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15892503 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaatt---ttcaaaagggtcttataattaggaacggaggtagt 15892599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 256 - 555
Target Start/End: Original strand, 28888162 - 28888462
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28888162 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 28888261  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||| | |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||    
T  28888262 acaattttttcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgt 28888361  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||         |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  28888362 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttacaaaaaaggacaa-ttttttttcttcaaaaggatcttataattagggatggaggtagt 28888460  T
Q  554 ag 555  Q
    ||    
T  28888461 ag 28888462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 283 - 502
Target Start/End: Original strand, 31086689 - 31086910
Alignment:
Q  283 ccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga--aa 380  Q
    |||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |     
T  31086689 ccttttgaaaaaataatgggagttaagatagtggatatttgtattaaatgtgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatgat 31086788  T
Q  381 tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaat 480  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| || || ||||| |||||       ||||||||||||||||||||    
T  31086789 tgatttatgtttttaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaagaggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 31086888  T
Q  481 agcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |||||| || | ||||||||||    
T  31086889 agcaaaaggattttataaaaag 31086910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 255 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 38261639 - 38261334
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38261639 atactacctccgtccctaattataaggttcttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttctattaaatatgtttgtaattactattgtttt 38261540  T
Q  355 tacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  38261539 tacaattttatcctttaagaaagagtgttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 38261440  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtag 552  Q
    |       ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  38261439 taaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaggagtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattaaggacggaggtag 38261342  T
Q  553 tagttgat 560  Q
    || |||||    
T  38261341 taattgat 38261334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 52430923 - 52431164
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| || |||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  52430923 gtccctatatataagatccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttacaattttat 52431022  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  52431023 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 52431122  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52431123 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 52431164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 253 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 25271489 - 25271242
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25271489 taatactagctccgtccctaattatatgatatttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtgaatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtt 25271390  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  25271389 tttacaattttat--tttaagagagaggaatggtttatgttatcaacatgtta-ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 25271293  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||        |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  25271292 tgtaaagaaacaattaatgtagttggaaatagcaaagagatcttaaaaaaa 25271242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 267 - 508
Target Start/End: Original strand, 27575387 - 27575630
Alignment:
Q  267 tccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatg 366  Q
    |||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||     
T  27575387 tccctaattataaggtctttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtctgaaattactattgtttttacaattttatc 27575486  T
Q  367 ctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
    |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  27575487 ctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 27575586  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  27575587 taatgtagttggaaatagaaaaaggatcttataaaaagggataa 27575630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 11741685 - 11741444
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  11741685 gtccctatatataagacccttttgtcaaaatcatgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 11741586  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  11741585 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatcttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 11741486  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11741485 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 11741444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 283 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 37585222 - 37585004
Alignment:
Q  283 ccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatg 382  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||    
T  37585222 ccttttgaaaaaataacaggaattaagataatagatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttg 37585123  T
Q  383 atttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 482  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||| |||||| |      
T  37585122 gtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtatttggaattta 37585023  T
Q  483 caaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37585022 caaaggggtcttataaaaa 37585004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 42872083 - 42872324
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42872083 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 42872182  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  42872183 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 42872282  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  42872283 ttaatgtagttggaaataacaatggggtcttataaaaaggga 42872324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 256 - 503
Target Start/End: Original strand, 47300632 - 47300881
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  47300632 tactccctctgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 47300731  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  47300732 acaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 47300831  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
           ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  47300832 aaataaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtctcataaaaagg 47300881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 266 - 501
Target Start/End: Original strand, 50246679 - 50246916
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  50246679 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 50246778  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  50246779 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 50246878  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50246879 ttaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaa 50246916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 284 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 15763585 - 15763362
Alignment:
Q  284 cttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--t 381  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||| |  |    
T  15763585 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaaaaatttatcctttaagagagagagtt 15763486  T
Q  382 gatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaata 481  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||  |||  ||||||||| || |||||| ||||   ||||||||||       |||||||||||||||||||||    
T  15763485 ggtttatgttttcaacatattatttattactgactgaagaaaaaaatgtataataaatatgagcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaata 15763386  T
Q  482 gcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||| | ||||||||||||||||    
T  15763385 gcaaaagagtcttataaaaaggga 15763362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 30290553 - 30290312
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  30290553 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 30290454  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||| ||| ||||   |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  30290453 ccttttagaaagaatgttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 30290354  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30290353 ttaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaaggga 30290312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 253 - 500
Target Start/End: Original strand, 51422162 - 51422414
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaa-taacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgt 351  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |  |||||| |||||| |||||  |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51422162 taatactacctccgtccctaattataaggtccttttaaaaaaaataacgcgaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgt 51422261  T
Q  352 ttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcat-- 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| || |||||| ||||| |||||      
T  51422262 ttttacaattttatgctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattgccgattgaaggaaaagatgtataataaataggggcatat 51422361  T
Q  448 gtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 500  Q
    ||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51422362 gtatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 51422414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 2489141 - 2489390
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||| ||| || | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2489141 tactacctccgtccctaattatagagccattttgaaaaaataacgggaattaagataatgaacatttgtattaaatatatttgtaattactattgttttt 2489240  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| || |||||| ||||   ||||||||||      
T  2489241 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgtaaaaaaagatgtataataaatatgagcatgtatgtaa 2489340  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
         ||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||    
T  2489341 agaaataattaatgtagttggaaataccaaaaagttcttataaaaaggga 2489390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 283 - 554
Target Start/End: Original strand, 16575858 - 16576129
Alignment:
Q  283 ccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa-- 380  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||       
T  16575858 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattcaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 16575957  T
Q  381 tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaat 480  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||       ||| ||||||||||||||||    
T  16575958 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataactaatgtagttggaaat 16576057  T
Q  481 agcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||           |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16576058 aacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaatta--tcaaaagagtcttataattagggacggagggagta 16576129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 313 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 39324766 - 39324576
Alignment:
Q  313 gtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattg 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  39324766 gtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattg 39324667  T
Q  411 ttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    ||||| ||||||||| ||  |||||  |||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  39324666 ttgattgaagaaaaagatgaataatagataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaa 39324576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 282 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 2280225 - 2280001
Alignment:
Q  282 cccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa- 380  Q
    ||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||      
T  2280225 cccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttctattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatg 2280126  T
Q  381 -tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaa 479  Q
     |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||||||||||||||||    
T  2280125 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaa 2280026  T
Q  480 tagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    || |||||||||| ||||||||||||    
T  2280025 taacaaaggggtc-tataaaaaggga 2280001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 11906977 - 11907218
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||| ||||||  ||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  11906977 gtccctatatataagactcttttgccaaaatcacgagaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 11907076  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  11907077 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 11907176  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11907177 ttaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 11907218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 16456924 - 16456683
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16456924 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 16456825  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||  ||||| ||||       |||    
T  16456824 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggagcatgcatgtaaagaaataa 16456725  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16456724 ttaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 16456683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 24855569 - 24855328
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24855569 gtccctaattataaggccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 24855470  T
Q  366 gctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||  ||||   ||  |||||||||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||       |||    
T  24855469 cctttaagaaagagggttggcttatgttttcaatattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataa 24855370  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  24855369 ttaatgtagttgaaaatagaaaatgagtcttataaaaaggga 24855328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 256 - 453
Target Start/End: Original strand, 896792 - 896990
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| |  |||||||||||| ||| | ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  896792 tactacctccgtctctaattataaggtccttttgaaaaa-taaggaaaattaagataattgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 896890  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  896891 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagaggcatgcatgt 896990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 275 - 501
Target Start/End: Original strand, 943395 - 943623
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  943395 tataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 943494  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||       ||||||||||||    
T  943495 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtag 943594  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  943595 ttggaaatgacaaaggagtcttataaaaa 943623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 303 - 505
Target Start/End: Original strand, 32169741 - 32169944
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaa-atgatttatgttttcaacatgt 401  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||    
T  32169741 aattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttattctttaagaaagaaggttatttatattttcaacatgt 32169840  T
Q  402 tatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||       ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  32169841 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggagtcttataaaaa 32169940  T
Q  502 ggga 505  Q
    ||||    
T  32169941 ggga 32169944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 266 - 556
Target Start/End: Original strand, 46075617 - 46075906
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| || |||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  46075617 gtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 46075716  T
Q  366 gctttaagagagaa--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||        |||    
T  46075717 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgat-taagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgcaaagaaataa 46075815  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagt 556  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46075816 ttaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaatattc--tcaaaagggtcttataattagggacggagggagtagt 46075906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 266 - 503
Target Start/End: Original strand, 39750131 - 39750369
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  39750131 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 39750230  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | |||||| |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  39750231 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 39750330  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39750331 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 39750369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 302 - 497
Target Start/End: Original strand, 43668187 - 43668384
Alignment:
Q  302 aaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacat 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |  | |||||||||||||||||||    
T  43668187 aaattaagatagtggatatttgtattaaatttgtttgtaattactattgtttttataattttatcctttaagagaaaagattgatttatgttttcaacat 43668286  T
Q  400 gttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata 497  Q
    ||||||||||| |||| || |||||| || |||||| |||||||||||||||||       ||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  43668287 gttatttattgctgattgatgaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattgaaaatagcaaagaagtcttata 43668384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 49907309 - 49907068
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  |||||  ||| |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  49907309 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcgcgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttaacaattttat 49907210  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  49907209 cctttaagaaagaaggttagtttattttttcaacatgatatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 49907110  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49907109 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 49907068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 256 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 25228494 - 25228295
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||| |||||| | | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25228494 tactacctccgtccttaattaaaaggccattttgaaaatataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 25228395  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||  ||||   ||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  25228394 acaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 25228295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 317 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 15290171 - 15289984
Alignment:
Q  317 atatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttga 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15290171 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatattatcctttaagagagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattgctga 15290072  T
Q  415 tcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    | ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||       ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  15290071 ttgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaag 15289984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 15810982 - 15811222
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15810982 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 15811081  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  15811082 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 15811181  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15811182 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 15811222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 38175160 - 38174923
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaa-atagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 364  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  38175160 gtccctaattataggactcttttgaaaaaataatggaaattaaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattgttattgtttttacaatttta 38175061  T
Q  365 tgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
    | ||||  |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| || |||||| ||||  ||| |||||||       ||||    
T  38175060 ttcttt--gagagtgttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaatgaaaagatgtataataaataagggcgtgtatgt-aaaaaataat 38174964  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  38174963 taatgtagttaaaaatagcaaaatagtcttataaaaaggga 38174923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 259 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 13344068 - 13343822
Alignment:
Q  259 tacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 358  Q
    ||||| |||||||||||||| |    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13344068 tacctctgtccctaattataaggttattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 13343969  T
Q  359 attttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnn 456  Q
    ||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || || ||| ||||| |||||||| ||       
T  13343968 attttatcctttaagaaagagtgttggcttatgttttcaacattctatttattgctgatagaagaaaaagatgtacaataaataggggcatgtacgtaaa 13343869  T
Q  457 nnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
        |||||||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||    
T  13343868 gaaataattaatgtagttagaaatagaaaataagtcttataaaaagg 13343822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 266 - 502
Target Start/End: Original strand, 50008232 - 50008470
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||| |||||||||    
T  50008232 gtccctatatataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttgcaattttat 50008331  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| || ||||||||       |||    
T  50008332 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttaattattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataa 50008431  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  50008432 ttaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaag 50008470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 253 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 3934906 - 3934653
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3934906 taatattaccttcgtccctcgttataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgagtatttatattaaatatgtttgtaattactattgtt 3934807  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||    ||  ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||||   ||||||    
T  3934806 tttacaattttatcctttaagaaagatggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggaacatgta 3934707  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggg 504  Q
    | |       ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||    
T  3934706 tctaaacaaataattaatgtagttgaaaatagaaaatgagtcttataaaaaggg 3934653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 266 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 23542266 - 23541976
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23542266 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaatttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 23542167  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||| ||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| || ||||||||       ||||    
T  23542166 ccttaagagagagagttagtttatattttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataat 23542067  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23542066 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggagggagtagtt 23541976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 292 - 551
Target Start/End: Original strand, 10383817 - 10384079
Alignment:
Q  292 aaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta---agagagaaatgatttat 388  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |   |||||||  |  |||||    
T  10383817 aaaatcacggaaattaagaaagtggatatttatattaaatttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttagtttat 10383916  T
Q  389 gttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaagg 488  Q
    |||||| | ||||||||||||  | || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10383917 gttttccatatgttatttattactaattgaagaaaaagatatataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagg 10384016  T
Q  489 ggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggta 551  Q
     |||||||||||||||| ||         ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10384017 agtcttataaaaagggacaattattttttcttcaaaagagtcttataattagagacggaggta 10384079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Original strand, 45038101 - 45038352
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    ||||||| || |||| ||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45038101 atactacattcgtccataattataatgcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 45038200  T
Q  355 tacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    |||||||||||  ||||||  |||||  ||  | |||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  45038201 tacaattttatcatttaagaaagagagttggctaatgttttcaacattctatttattgctgattgaa-aaaaaaatgtataataaataggggcatgtatg 45038299  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       |||||||| |||||| |||||| | |||||||||||| |||||||    
T  45038300 taaagaaataattaatatagttgaaaatagaataggggtcttatagaaaggga 45038352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 255 - 407
Target Start/End: Original strand, 51561069 - 51561220
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51561069 atactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 51561168  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttattta 407  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  51561169 tacaattttatcctttaagagaaagatggtttatgtttt-aacatattattta 51561220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 292 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 51811138 - 51810975
Alignment:
Q  292 aaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga--aatgatttatg 389  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  51811138 aaaataacgggaattaagatggtggatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaggaatgatttatg 51811039  T
Q  390 ttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| || |||| | |||||  ||||||||||    
T  51811038 ttttcaacatgttattgattgctgattgaagaaaaagatgtatagtaaataggagcatgtatgt 51810975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 37951699 - 37951939
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||||||| ||||    
T  37951699 gtccctaattatatgacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaatattat 37951798  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | | |||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||  |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  37951799 ccttaagaaagagagttagtttatgttttccatatgctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 37951898  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37951899 taatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 37951939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 44646558 - 44646318
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  44646558 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 44646459  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | | |||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  44646458 ccttaagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 44646359  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44646358 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 44646318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 266 - 508
Target Start/End: Original strand, 1048002 - 1048245
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1048002 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 1048101  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||  | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  1048102 ccttaagagagagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 1048201  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  1048202 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttttaaaaagggataa 1048245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 269 - 505
Target Start/End: Original strand, 1039134 - 1039371
Alignment:
Q  269 cctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgct 368  Q
    |||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  1039134 cctaattataagaccattttgctaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 1039233  T
Q  369 tta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaa 467  Q
    | | |||||||  || ||||||||||| | ||| || |||||  |||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||       |||||||    
T  1039234 taagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattactgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaa 1039333  T
Q  468 tgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1039334 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 1039371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 269 - 505
Target Start/End: Original strand, 1046040 - 1046277
Alignment:
Q  269 cctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgct 368  Q
    |||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  1046040 cctaattataagaccattttgctaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 1046139  T
Q  369 tta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaa 467  Q
    | | |||||||  || ||||||||||| | ||| || |||||  |||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||       |||||||    
T  1046140 taagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattactgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaa 1046239  T
Q  468 tgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1046240 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 1046277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 253 - 505
Target Start/End: Original strand, 30289599 - 30289852
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||    
T  30289599 taatactccctccgtccctaattataagactcttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtt 30289698  T
Q  353 tttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||    
T  30289699 tttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 30289798  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||       |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30289799 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaaaaggga 30289852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 275 - 508
Target Start/End: Original strand, 8104048 - 8104282
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| | || |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8104048 tataagacccttttgccaaaattatgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 8104147  T
Q  375 gagaa--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |       ||||||||||||    
T  8104148 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatataaagaaataattaatgtag 8104247  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||    
T  8104248 ttggaaataacaaa-cggtcttataaaaaaggataa 8104282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 39362944 - 39363184
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  39362944 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 39363043  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||  | |||||| |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||       ||||    
T  39363044 ccttaagagagagagttagtttatgtttttcatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtatgtaaagaaataat 39363143  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  39363144 taatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaaggga 39363184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 292 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 45336147 - 45335936
Alignment:
Q  292 aaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatg 389  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||  |  |||||     
T  45336147 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttcttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttata 45336048  T
Q  390 ttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggg 489  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| || |||||| ||| || ||||||||||       ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  45336047 ttttcaacatgttatttattgttaattgaaaaaaaaaatgtataataaatggaagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtaggaaataacaaaggg 45335948  T
Q  490 gtcttataaaaa 501  Q
    ||||||||||||    
T  45335947 gtcttataaaaa 45335936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 283 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 37589211 - 37589011
Alignment:
Q  283 ccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa-- 380  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||        
T  37589211 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggt 37589112  T
Q  381 tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaat 480  Q
    || ||||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  37589111 tggtttatgttttcaacattccatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatag-ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 37589013  T
Q  481 ag 482  Q
    ||    
T  37589012 ag 37589011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 310 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 50938022 - 50937829
Alignment:
Q  310 atagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttattta 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||   |||||    
T  50938022 atagtggatatttgtattaaatatctttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattcaattta 50937923  T
Q  408 ttgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    ||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  50937922 ttgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaa 50937829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 7784281 - 7784038
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaa-aatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 364  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||  ||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  7784281 gtccctaattataagactcttttgttaaaattacgggaattaagaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatttta 7784182  T
Q  365 tgcttta---agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnnt 461  Q
    | ||| |   |||||||  |  ||||| ||||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||       |    
T  7784181 tccttaagagagagagagttagtttatattttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaat 7784082  T
Q  462 aattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  7784081 aattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataataaggga 7784038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 292 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 18237353 - 18237094
Alignment:
Q  292 aaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgt 390  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||  |  ||||| |    
T  18237353 aaaattacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattctatccttaagagagagagttagtttatat 18237254  T
Q  391 tttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaagggg 490  Q
    |||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  18237253 tttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaagcatgtatgtaaagaaataagtaatgtagttggaaatagcaaatgag 18237154  T
Q  491 tcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||||||| ||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18237153 tcttataaaaagggacaaaaaattc----tcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 18237094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 44649916 - 44649676
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  44649916 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 44649817  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | | |||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  44649816 ccttaagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 44649717  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  44649716 taatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaaggga 44649676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 45039699 - 45039459
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||| ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  45039699 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatattagtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 45039600  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||  || ||||||||       ||||    
T  45039599 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggtatgtatgtaaagaaataat 45039500  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45039499 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 45039459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 39497720 - 39497480
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || | ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  39497720 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 39497621  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     ||| |||||||| |  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||   ||||||||||       |||    
T  39497620 cctt-aagagagatagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagagcatgtatgtaaagaaataa 39497522  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39497521 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 39497480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 270 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 26544497 - 26544377
Alignment:
Q  270 ctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctt 369  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  26544497 ctaattataggacccttttgaaaacataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatatttgtaattattattgtttttacaattttattctt 26544398  T
Q  370 taagagagaaatgatttatgt 390  Q
    ||||||||| ||| |||||||    
T  26544397 taagagagagatggtttatgt 26544377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 292 - 505
Target Start/End: Original strand, 7212334 - 7212549
Alignment:
Q  292 aaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatg 389  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || |||    |  ||||||    
T  7212334 aaaatcacggaaattaatatagtgaatatttgtataaaagttgtttgtaatcattattgtttttataattttatcctttatgaaagatggttagtttatg 7212433  T
Q  390 ttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggg 489  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7212434 ttttcaacatgatatttattgttcattcaagaaaaatatgtataataaataaaggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggg 7212533  T
Q  490 gtcttataaaaaggga 505  Q
    || ||||| |||||||    
T  7212534 gttttatagaaaggga 7212549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 251 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26547807 - 26547685
Alignment:
Q  251 tttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 350  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26547807 tttaatactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaa-taacggaaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattg 26547709  T
Q  351 tttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||||||||||||||  |||||||    
T  26547708 tttttacaattttatcatttaaga 26547685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 249 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 47069092 - 47068832
Alignment:
Q  249 tatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtat 348  Q
    ||||||||||| | |  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | |||    
T  47069092 tatttaatactccatccgtccctaattataagacccttttgttaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactat 47068993  T
Q  349 tgtttttacaattttatgctt-taagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcat 447  Q
    | ||||||||||||||| |||  ||||||||  |  ||||| ||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||    
T  47068992 tatttttacaattttatccttaaaagagagagttagtttatattttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcat 47068893  T
Q  448 gtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
    ||||||       ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  47068892 gtatgtaaagaaataattaatgcagttagaaataacaaagaggtcttataaaaagggataa 47068832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 266 - 441
Target Start/End: Original strand, 1837322 - 1837505
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  1837322 gtccctaattatatgactcttttataaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtcttaaatatgtttgtaattactattgcttttacaatattat 1837421  T
Q  366 gctttaagagagaaa--------tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatag 441  Q
     ||| |||||||| |        |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  1837422 ccttcaagagagagagagagagtttgtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatag 1837505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 22567367 - 22567116
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  |||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||    
T  22567367 atactacctccgtccctatatataagacccttttgttaaaattacggaaattaagaaagtggatatttgtattatttttgtttgtaatcactattgtttt 22567268  T
Q  355 tacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||||  || | |||||||  | |||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||||  | |||||||||    
T  22567267 tacaattttattattaagagagagagttaatttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtattataaatatggacatgtatgt 22567168  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           |||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  22567167 aaggaaataattaatatagttggaaatagcaaaagagtcttgtaaaaaggga 22567116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 266 - 477
Target Start/End: Original strand, 36880372 - 36880582
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| || |||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  36880372 gtccctatatataagatccttttgtcaaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtatttacaattttat 36880471  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     |||||||| |    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||       |||||    
T  36880472 cctttaaga-aatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataatt 36880570  T
Q  466 aatgtagttgga 477  Q
    ||||||||||||    
T  36880571 aatgtagttgga 36880582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 310 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 50008217 - 50008024
Alignment:
Q  310 atagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttattta 407  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| | ||||||||  ||||||| | ||   |  ||||||||||||||||||||||||    
T  50008217 atagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttcataattttatcatttaagaaaaaaggttagtttatgttttcaacatgttattta 50008118  T
Q  408 ttgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50008117 ttgttgattgaagaaaaa-atgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 50008024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 255 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 18172610 - 18172377
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaa-taacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaat-atgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||| |      ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  18172610 atactaccttcgtccttaattataggactcttttgaaaaaaataacgggag-----atagtggatatttatattaaattatgtttgtaattactgttgtt 18172516  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||| ||||| || |          
T  18172515 tttacaattttatcctttaagagttggatgatttatgtttttaacatgttatttatagttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggga------ 18172422  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
            ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18172421 ------aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 18172377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 254 - 503
Target Start/End: Original strand, 27974893 - 27975144
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||  |||||  | | |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  27974893 aatactacctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaattgcaggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgttt 27974992  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||  ||||   ||||||||    
T  27974993 ttacaattttattttttaagagagagagtatatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatatgtgcatgtat 27975092  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    ||       ||||||||| ||||| ||||| |||| | || |||||||||||    
T  27975093 gtaaataaataattaatgcagttgaaaataacaaaagagttttataaaaagg 27975144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 35984412 - 35984652
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   |||| |||| |||||||| ||   ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  35984412 gtccctaattataagacccttttgcttaaatcacgggaattaaaaaagcatatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 35984511  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  35984512 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 35984611  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  35984612 taatgtagttaaaaataacaaagggattttataaaaaggga 35984652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 253 - 378
Target Start/End: Original strand, 32906702 - 32906828
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaa-aataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgt 351  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  32906702 taatactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatttgtttgtaattactattgt 32906801  T
Q  352 ttttacaattttatgctttaagagaga 378  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||    
T  32906802 ttttacaattttatcctttaaaagaga 32906828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 320 - 508
Target Start/End: Original strand, 39873488 - 39873678
Alignment:
Q  320 tttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcg 417  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    || |||||||||| ||||| |||||||||| |||| |    
T  39873488 tttgtattaaatatgtatgtaattattattgtttttccaattttatcctttaagagagagggttggtttatgtttttaacatattatttattgctgattg 39873587  T
Q  418 aagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
    |||||||| || |||||| ||||| |  ||||||||       |||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  39873588 aagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatatgtcttataaaaagcgataa 39873678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 303 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 34503487 - 34503287
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatg 400  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||    || |||||||||||||||||    
T  34503487 aattaagatggtgaatatttgtattaaatatatttgtaattactattgcttttataattttatcttttaagagagagggttggtttatgttttcaacatg 34503388  T
Q  401 ttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 500  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||| || |||||| ||||  |||||||||||       ||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||    
T  34503387 ttatttattgctgattgaaaaaaaaaatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgcagttgaaaatagcaaatgaatcttataaaa 34503288  T
Q  501 a 501  Q
    |    
T  34503287 a 34503287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 307 - 500
Target Start/End: Original strand, 46506204 - 46506398
Alignment:
Q  307 aaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatt 405  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||| | | |||||  |||||||||||||| | ||| | ||    
T  46506204 aaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatccttaagaaagagagttgatttatgttttccatatgatgtt 46506303  T
Q  406 tattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 500  Q
    ||||| | || ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  46506304 tattgctcattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaagtaattaatatagttgaaaatagcaaaagggtcttataaaa 46506398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 384 - 554
Target Start/End: Original strand, 11352933 - 11353099
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 483  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||| ||||| || ||||||||       ||||||||||||||| ||||| |    
T  11352933 tttatattttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgtaaaataataattaatgtagttgaaaataac 11353032  T
Q  484 aaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11353033 aaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaat----ttcaaaagggtcttataattaggaacggaggtagta 11353099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 255 - 502
Target Start/End: Original strand, 31635869 - 31636117
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||  |||||  ||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||    
T  31635869 atactacctcggtccctaattataagacttttttgctaaaattacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttataatcactattgtttt 31635968  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttc--aacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| | |||| |||||  | ||||||||||||   | ||| ||||||| | | || ||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||    
T  31635969 tacaattttat-ccttaaaagagagttaatttatgttttccatatatgctatttatggctaattgaagaaaaagatgtagaataaataggggcatgtatg 31636067  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |       |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  31636068 taaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaag 31636117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 303 - 504
Target Start/End: Original strand, 47296353 - 47296556
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgtt 402  Q
    |||||| ||| | |||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||| |||||||  |  ||||||||||||||||| |    
T  47296353 aattaagataatcgatattggtattaaagatgtttgtaatcactattgttttcacaattttgtccttt-agagagaggtagtttatgttttcaacatgat 47296451  T
Q  403 atttattgttg---atcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaa 499  Q
    |||||||||||   || ||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||       |||||||||||||||||||||||||||   || ||||||    
T  47296452 atttattgttgattattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaacaaataattaatgtagttggaaatagcaaagatatcctataaa 47296551  T
Q  500 aaggg 504  Q
    |||||    
T  47296552 aaggg 47296556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 303 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 10433572 - 10433369
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta---agagagaaatgatttatgttttcaacat 399  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| |   |||||||| |  | ||| ||||||||||    
T  10433572 aattaagaaagtagatatttgtattaaatttgtttctaatcactattgtttttacaattttattcttaagagagagagaattagtatatattttcaacat 10433473  T
Q  400 gttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaa 499  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||| ||||  |||||||||||       ||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||    
T  10433472 gttatttattgctgattgaataaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataaataatgtagttggcaataacaaatgagtcttataaa 10433373  T
Q  500 aagg 503  Q
    ||||    
T  10433372 aagg 10433369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 254 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35693364 - 35693240
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | | | |||| | ||| ||||| ||||||||| || ||||||||    
T  35693364 aatactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagaaatttgataatggtaataaatttgtttgtaaatactattgttt 35693265  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagaga 378  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  35693264 ttacaattttatccttgaagagaga 35693240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 306 - 505
Target Start/End: Original strand, 47429177 - 47429377
Alignment:
Q  306 taaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttat 404  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||| | | |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  |  ||||| || |||| || ||||    
T  47429177 taaaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtagtcactattatttttacaattttattctttagagagagagttagtttatattctcaatatattat 47429276  T
Q  405 ttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggg 504  Q
    |||||||||||  |||||||| || |||||| ||| | | |||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  47429277 ttattgttgattaaagaaaaagatgtataataaatggggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagagatcttataaaaaggg 47429376  T
Q  505 a 505  Q
    |    
T  47429377 a 47429377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 253 - 503
Target Start/End: Original strand, 9700487 - 9700738
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    |||||||||||  |||||||  || | |||| |||||  ||||| || | |||||| | ||||  |||||||||||||  | |||||||| | ||||| |    
T  9700487 taatactacctccgtccctatatacaagacctttttgccaaaatcacaggaattaagaaagtgagtatttgtattaaagttatttgtaatcactattgat 9700586  T
Q  353 tttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| | ||| |||    
T  9700587 tttacaattttatcctttagaaagagagatagtttatattttcaacatgctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatatat 9700686  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    ||       |||||||| || ||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  9700687 gtaaagaaataattaatttaattggaaataacaaggaggtcttataaaaagg 9700738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 378
Target Start/End: Original strand, 18114211 - 18114333
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||||||| ||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| | ||| || | | ||| ||||  |||||||||||  ||||||||||    
T  18114211 tactacctctgtacctaattatagggcccttttggaaaaataacggaaattaagaaagttgaaaatggtaataaacttgtttgtaatttctattgttttt 18114310  T
Q  356 acaattttatgctttaagagaga 378  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  18114311 acaattttatcctttaagagaga 18114333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 303 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 31465916 - 31465714
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatg 400  Q
    |||||| | |||| ||||||| ||||||  | ||||| || | || ||||||||||||||||| |||||||||||| |  |  |||||||||||||||||    
T  31465916 aattaagaaagtgaatatttgcattaaacttatttgttatcactaatgtttttacaattttatcctttaagagagatagttagtttatgttttcaacatg 31465817  T
Q  401 ttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 500  Q
    |||||||||| | ||  |||||||| || |||||| ||||| || ||||||||       || |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  31465816 ttatttattgctaattaaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaaggaatagttaatgtacttggaaataacaaagggatcttgtaaaa 31465717  T
Q  501 agg 503  Q
    |||    
T  31465716 agg 31465714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 303 - 502
Target Start/End: Original strand, 32149097 - 32149298
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatg 400  Q
    |||||| | ||| |||||||  ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| | ||| |  |  |||||||||| ||||||    
T  32149097 aattaagaaagtagatattttcattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaaaatagagagttagtttatgttttgaacatg 32149196  T
Q  401 ttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 500  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||       |||| |||||  || |||||| |||| |||||||||||||    
T  32149197 ttatttattgctgattgaagaaaaagatgtgaaataaatagaggcatgtatgtaaataaataataaatgtgcttagaaataacaaaagggtcttataaaa 32149296  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  32149297 ag 32149298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 355
Target Start/End: Original strand, 11351441 - 11351541
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggata-tttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11351441 tactaccttcatccctaattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatattttatattaaatatgtttgtaattattattatttt 11351540  T
Q  355 t 355  Q
    |    
T  11351541 t 11351541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 440
Target Start/End: Original strand, 37850174 - 37850362
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| || ||||||| |||||| ||||| ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| |||||||    
T  37850174 taatactacctccgtccctaaatataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtgtataattactattgtt 37850273  T
Q  353 tttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaata 440  Q
    ||| ||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||    
T  37850274 tttgcaattttatccttaagagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaagaaaaagatataaaataaata 37850362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 384 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 48023074 - 48022953
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 483  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||        ||||||||||||||||||||| |    
T  48023074 tttatgttttccatatgctatttattgttgatttaagaaaaatatatataataaataggggcatgtatgcaaagaaataattaatgtagttggaaatacc 48022975  T
Q  484 aaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||  | |||||||||||||||    
T  48022974 aaaatgatcttataaaaaggga 48022953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 27479895 - 27479647
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||||||| |||| ||  ||||||  ||||| ||||| ||||| | ||| |||  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  27479895 tactacctccgtccctaaatataggagtcttttgtcaaaattacggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgttttt 27479796  T
Q  356 acaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    |||||||||| ||| | || ||| | | |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||  || ||||  ||     
T  27479795 acaattttatccttaagagggaggattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagta 27479696  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
          ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27479695 aaaaaataattaatgtacttggaaataccaaagggatcttataaaaagg 27479647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 314 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 31154498 - 31154359
Alignment:
Q  314 tggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaa-gagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgtt 412  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| || |||| || || ||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  31154498 tggatatttatattaaagttgtttttaatcactattgtttttacaattttatccttaaaagagataattggtttatgtttttcatatgctatttattgtt 31154399  T
Q  413 gatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||| |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  31154398 gattgaaggaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatg 31154359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 292 - 424
Target Start/End: Original strand, 32153569 - 32153703
Alignment:
Q  292 aaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga--gagaaatgatttatg 389  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| | ||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||  |  ||||||    
T  32153569 aaaatcacggaaattaagaaagtaggtatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagatggagagttagtttatg 32153668  T
Q  390 ttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaa 424  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32153669 ttttgaacatgttatttattgttgattgaagaaaa 32153703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 333 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 9424988 - 9424870
Alignment:
Q  333 tgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga-aatgattt-atgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatat 430  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  9424988 tgtttataattaatattgtttttacaattttatcttttaagagagagaattattttatgttttcaacataatatttaatgttgattgaagaaaaagatat 9424889  T
Q  431 ataattaatagaggcatgt 449  Q
    | ||| |||||||| ||||    
T  9424888 aaaataaatagaggtatgt 9424870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 2636927 - 2637176
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||| || |||| ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  2636927 tactacctctgtccctaaatatagtagccttttgaaaaatta-cggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgttttt 2637025  T
Q  356 acaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    | |||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||  || | ||  ||     
T  2637026 ataattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtacgttggta 2637125  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
          ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2637126 aagaaataattaatgtacttagaaataccaaaggggtcttataaaaaggga 2637176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 290 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 1427462 - 1427253
Alignment:
Q  290 aaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttat 388  Q
    ||||||||||||||||||| | | | |||| |  || ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||||  | ||||||    
T  1427462 aaaaaataacggaaattaagaaaattgatagtgataataaatttgttggtaattactattggttttacaattttatccttaagagagagagttaatttat 1427363  T
Q  389 gttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaagg 488  Q
    |||||||| ||  |||||| ||||||| ||||||||||||| | ||| ||||| || |||   ||       ||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  1427362 gttttcaatatagtatttaatgttgattgaagaaaaatatacaaaataaataggggtatgatggtgaaaaattaattaatgcacttggaaataacaaagg 1427263  T
Q  489 ggtcttataa 498  Q
    ||||||||||    
T  1427262 ggtcttataa 1427253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 324 - 425
Target Start/End: Original strand, 2606722 - 2606829
Alignment:
Q  324 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaa------atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcg 417  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||      ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| |    
T  2606722 tattaaatttgtttgtaattagtattgtttttacgattttatcctttaagagagaaagagatatgctttatattttcaacatagtatttattgttgattg 2606821  T
Q  418 aagaaaaa 425  Q
    || |||||    
T  2606822 aaaaaaaa 2606829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 15616397 - 15616184
Alignment:
Q  292 aaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa----tgattta 387  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||||| || |||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    |  ||||    
T  15616397 aaaatcacgggaattaagaaagtggataattatattaaagttgtttgtaatcatcattgtttttacaattttat-ctttaagagagagagagttagttta 15616299  T
Q  388 tgttttcaacatgttatttattgttgatcgaa-gaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaa 486  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||||  ||||| || ||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15616298 tgttttccatatgctatttattgttgattaaaggaaaaatatgtataaaaaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaa 15616199  T
Q  487 ggggtcttataaaaa 501  Q
      | |||||||||||    
T  15616198 ttgatcttataaaaa 15616184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 268 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 26768670 - 26768435
Alignment:
Q  268 ccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgc 367  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| | | |  | | |  || ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  |    
T  26768670 ccctaattacaggacctttttgaaaaaataacggaaattaagaaaattaaaaatgataataaatttgtttgtaattgttattgtttttacaattttaacc 26768571  T
Q  368 tttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
    |||||||||||||  |  | |||| |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||| || ||||  ||       |||||    
T  26768570 tttaagagagaaagttagtgtatg-tttcaacatagtatttaatgttgattgaagaaaaagatataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaatt 26768472  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |||||| || ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  26768471 aatgtacttagaaatacaaaagggatcttataaaaag 26768435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 323 - 503
Target Start/End: Original strand, 39425637 - 39425818
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  39425637 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 39425736  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    |||  ||  | ||| ||||  || ||||  ||       ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39425737 aaatgatgcaaaataaataagggtatgttggtaatgaaataatttatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaagg 39425818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 45810287 - 45810116
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| || ||||||| |||||| || || ||||| | ||| |||  | ||||||||| | | | |||||| |||| |||||    
T  45810287 tactatcttcgtccctaattataggagccttttgcaaaaattaccgagattaagaaagttgattgtagtattaaatttatatataattactattattttt 45810188  T
Q  356 acaattttatgctttaa--gagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  45810187 acaattttatcctttaaaggagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaaaaaaa 45810116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 270 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 47263741 - 47263506
Alignment:
Q  270 ctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctt 369  Q
    |||||| || ||||||||||  ||||| |||  |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| | |    
T  47263741 ctaattgtaggacccttttgctaaaatcacgagaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat-cct 47263643  T
Q  370 taaga--gagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa----tatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
    |||||  ||||  |  ||||||||||  | |||||| |||||| |||| |||||||||    ||| |||||| ||||| | |||||||||       |||    
T  47263642 taagattgagagttagtttatgtttttcatatgtta-ttattgctgattgaagaaaaagatgtatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataa 47263544  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  47263543 ttaatgtagttgaaaatagcaaatgaatcttataaaaa 47263506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 303 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 4592829 - 4592622
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatg 400  Q
    |||||| | ||| |||||||| |||||   |||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||||| | |  |  ||||||||||||||||     
T  4592829 aattaagaaagtagatatttgcattaatattgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctataagagatagagttagtttatgttttcaacata 4592730  T
Q  401 ttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 500  Q
    |||||||||| |  | ||||||||| || |||||| ||||  | |||||||||       || |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  4592729 ttatttattgctagttgaagaaaaagatgtataataaatatggacatgtatgtaaagtaatagttaatgtacttgaaaatatcaaaggtgtcttataaaa 4592630  T
Q  501 agggataa 508  Q
    ||||||||    
T  4592629 agggataa 4592622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 340 - 554
Target Start/End: Original strand, 29437678 - 29437891
Alignment:
Q  340 aattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaa 438  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| || ||  |||||||||||||  ||||||||| ||  | ||| ||    
T  29437678 aattactattgtttttacaattttatccttaatagagagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgaatgaagaaaaaaatgcaaaataaa 29437777  T
Q  439 tagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataatt 538  Q
    ||  || ||||  ||       ||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||          ||||||||||||||||||||    
T  29437778 taagggtatgttggtaaagaaataattgatgtacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaaattatttt--ttcaaaagagtcttataatt 29437875  T
Q  539 agggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||||||||    
T  29437876 agggacggaggtagta 29437891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 401 - 505
Target Start/End: Original strand, 39867542 - 39867646
Alignment:
Q  401 ttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 500  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||       ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  39867542 ttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaa 39867641  T
Q  501 aggga 505  Q
    |||||    
T  39867642 aggga 39867646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 324 - 425
Target Start/End: Original strand, 23893505 - 23893607
Alignment:
Q  324 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaa 422  Q
    |||||||| ||| | ||||||  ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  23893505 tattaaatttgtatataattaccattgtttttacaattttatccttaagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaa 23893604  T
Q  423 aaa 425  Q
    |||    
T  23893605 aaa 23893607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 428 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 5858379 - 5858261
Alignment:
Q  428 tatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaaga 527  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||    
T  5858379 tatataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaaga 5858282  T
Q  528 gtcttataattagggacggag 548  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5858281 gtcttataattagggacggag 5858261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 35945438 - 35945335
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaag 420  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  35945438 gtattaaatttgtatgtaattattattgtttttataattttatcctt-aagaaagaaaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 35945340  T
Q  421 aaaaa 425  Q
    |||||    
T  35945339 aaaaa 35945335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 13698889 - 13698769
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-ag 373  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||  |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  13698889 tataagacccttttgctaaaatcacgagaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttattcttaagag 13698790  T
Q  374 agagaaatgatttatgttttc 394  Q
    |||||  || |||||||||||    
T  13698789 agagagttggtttatgttttc 13698769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 346 - 425
Target Start/End: Original strand, 41619998 - 41620076
Alignment:
Q  346 tattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  41619998 tattgtttttacaattttat-ctttaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaagaaaaa 41620076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Original strand, 48363821 - 48363924
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||   |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  48363821 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 48363920  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  48363921 aaaa 48363924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 401 - 501
Target Start/End: Original strand, 51561764 - 51561864
Alignment:
Q  401 ttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 500  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||       |||||||| |||||| ||||| |||| | |||||||||||    
T  51561764 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttgaaaataacaaatgtgtcttataaaa 51561863  T
Q  501 a 501  Q
    |    
T  51561864 a 51561864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 440
Target Start/End: Original strand, 31338946 - 31339073
Alignment:
Q  317 atatttgtattaaatatgtttgtaatt--agtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgtt 412  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |  |  ||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  31338946 atatttgtattaaatttgtttgtaattgtattattgtttttacaatttcatcctttaaaagagagagtttgtttctgttttcaacatgctatttcttgtt 31339045  T
Q  413 gatcgaagaaaaatatatataattaata 440  Q
    |||  |||||||| || |||||| ||||    
T  31339046 gattaaagaaaaaaatttataataaata 31339073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 47754623 - 47754431
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||||||  |||| || |||||||  ||||| |||| ||||||  ||||| |||||| |||||||  ||||||||| ||   | ||||||    
T  47754623 tactacctccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaatttagtgaatatttatattaaagttgtttgtaaataccgtcgttttt 47754524  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggca 446  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| |  |  ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||    
T  47754523 acaaatttatcctttaagatagagagtttgtttatgttttcaacatactatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggca 47754431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 17483962 - 17483733
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||||    |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  17483962 gtattaaatttgtatataattactattgattttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 17483863  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttc 521  Q
    |||| ||  | ||| ||||  || ||||  ||       ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| || ||          |||    
T  17483862 aaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagagacaaattatttt--ttc 17483766  T
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17483765 aaaagggtcttataattagggacggaggtagta 17483733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 254 - 425
Target Start/End: Original strand, 22940559 - 22940730
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||  |||| || | |||||| | ||| |||| | ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||    
T  22940559 aatactacctccgtctctaattataggacccttttgatcaaatcacaggaattaagaaagttgatagtagtatt-aatttgtttgtaattactattgctt 22940657  T
Q  354 ttacaattttatgct-ttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    ||||| |||||| || || |||||| | |  ||||||||| ||||||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  22940658 ttacagttttattctcttcagagagtattagtttatgtttccaacataatatttattattgattgaagaaaaa 22940730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 47754109 - 47754015
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagt 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||           |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47754109 taattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaaggga-aattttttttttctcaaaagagttttataattagggacggaggtagtagt 47754015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 4389839 - 4389736
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||    
T  4389839 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgagga 4389740  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  4389739 aaaa 4389736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 27530905 - 27530806
Alignment:
Q  405 ttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggg 504  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||       ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  27530905 ttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc-aatgagtcttataaaaaggg 27530807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27670127 - 27669969
Alignment:
Q  267 tccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt-acaattttat 365  Q
    ||||||| |||| || | ||||| |||||| ||||| ||||| | ||| |||  | ||||||||| ||| | |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27670127 tccctaaatataggagctttttgcaaaaattacggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgttttttacaattttat 27670028  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
     ||| || |||||  | |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  27670027 ccttaaa-agagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa 27669969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 505
Target Start/End: Original strand, 32908288 - 32908376
Alignment:
Q  417 gaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  32908288 gaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaggaataattaatgtagttggaaatagcaaataagtcttataaaaaggga 32908376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 52429117 - 52429014
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  52429117 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 52429018  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  52429017 aaaa 52429014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 260 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 27255579 - 27255465
Alignment:
Q  260 acctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaa 359  Q
    |||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| | | | || | | ||| ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  27255579 acctctgtccctaattatatagtccttttgaaaaaataacgggaattaagaaaattgaaaatggtaataaatttgtttgcaatcactattgtttttacaa 27255480  T
Q  360 ttttatgctttaaga 374  Q
    ||||||  |||||||    
T  27255479 ttttatcatttaaga 27255465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 324 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 30996973 - 30996871
Alignment:
Q  324 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaa 422  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | | ||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  30996973 tattaaatttgtatataattactattgtttttataattttatccttaagagagaggattaatttacgttttcaacataatatttattgttgattgaagaa 30996874  T
Q  423 aaa 425  Q
    |||    
T  30996873 aaa 30996871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 255 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 46084165 - 46084055
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||  |||||| | | | || | |  || ||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  46084165 atactatctttgtccctaattataaggccgttttgaaaaaataacgagaattaagaaaattgaaagtgataataaatttgtttgtaattaatattgcttt 46084066  T
Q  355 tacaattttat 365  Q
    |||||||||||    
T  46084065 tacaattttat 46084055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 323 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 49549231 - 49549048
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||| |    
T  49549231 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaaa 49549132  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||| ||  | ||| ||||  ||  |||  ||       ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  49549131 aaaaaatgcaaaataaataagggtgtgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaaggga 49549048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 425
Target Start/End: Original strand, 1197953 - 1198079
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaa----gagagaaatgatttatgttttcaaca 398  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||  ||||| |||||  ||||||||||| ||||||||  |||||    ||||||  | ||||||||||| ||||    
T  1197953 aattaaaaaagttgatgtttgtattaaagctgtttataattgctattgtttttaaaattttatcttttaagagggagagagttaatttatgtttttaaca 1198052  T
Q  399 tgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||    
T  1198053 tgctatttattgttgattgaaaaaaaa 1198079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 425
Target Start/End: Original strand, 4371574 - 4371674
Alignment:
Q  324 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaa 423  Q
    |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||  | |||||| ||||||||||  || ||||||||||| || ||||    
T  4371574 tattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttat-ccttaagagagagttaatttatattttcaacataatacttattgttgattgaggaaa 4371672  T
Q  424 aa 425  Q
    ||    
T  4371673 aa 4371674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 374
Target Start/End: Original strand, 15624646 - 15624750
Alignment:
Q  270 ctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctt 369  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| | | | || | | ||| ||||| |||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||    
T  15624646 ctaattatagggctcttttgaaaaaataacggaaattaagaaaattgaaagtggtaataaatttgtttgtaattactattattttgataattttatcctt 15624745  T
Q  370 taaga 374  Q
    |||||    
T  15624746 taaga 15624750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 372
Target Start/End: Original strand, 23932941 - 23932989
Alignment:
Q  324 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaa 372  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23932941 tattaaatttgtttgtaattagtattgtttttataattttattctttaa 23932989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 556
Target Start/End: Original strand, 43456451 - 43456660
Alignment:
Q  346 tattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagagg 444  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | | |||||  |  ||||||||||| | |||  |||| ||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||    
T  43456451 tattgtttttacaattttatccttaagaaagagagttagtttatgttttccatatgcaattttttgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggg 43456550  T
Q  445 catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggac 544  Q
    || ||||||       ||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||  |           ||||||| |||||||||||||||||    
T  43456551 caggtatgtaaataaataactaatgtagttggaaatagcaaatgaatcttataaaacgggaccaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggac 43456648  T
Q  545 ggaggtagtagt 556  Q
    ||||||||||||    
T  43456649 ggaggtagtagt 43456660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Original strand, 1867262 - 1867365
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | ||| || ||||| |||||||||||||| ||| | | | |||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1867262 gtattaaatttgtatataagtactattggttttacaattttatccttaagaaatagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgatcgaaga 1867361  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  1867362 aaaa 1867365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5966870 - 5966749
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||  | | |||| | | | || | ||| | ||||  |||||||||||| ||||| |||    
T  5966870 atactacctctgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataatcggatttaagaaaattga-aattgaaataaagttgtttgtaatta-tattgcttt 5966773  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagaga 378  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  5966772 tacaattttatcctttaagagaga 5966749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 375
Target Start/End: Original strand, 8946442 - 8946501
Alignment:
Q  316 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagag 375  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8946442 gatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacatttttattctttaagag 8946501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Original strand, 15302551 - 15302654
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||| ||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  15302551 gtattaaatttgtatataattactattatttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 15302650  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  15302651 aaaa 15302654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 30761118 - 30761008
Alignment:
Q  333 tgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagag--agaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatat 430  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  |||  |  | ||||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||| ||||    
T  30761118 tgtttgtaattgctattgtttttacaattttattctttaagagaaagagttagtgtatgttttcaacatggtatttaatactgattgaagaaaaaaatat 30761019  T
Q  431 ataattaatag 441  Q
    | ||| |||||    
T  30761018 aaaataaatag 30761008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Original strand, 46271159 - 46271262
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||| ||||||| ||  |||||||| ||||| |||||    
T  46271159 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttattcttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattattgatagaaga 46271258  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  46271259 aaaa 46271262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1767900 - 1767858
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaa 295  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1767900 taatactaccttcgtccctaattataagacccttttgaaaaaa 1767858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 519 - 557
Target Start/End: Original strand, 4280128 - 4280166
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4280128 ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtagtt 4280166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 33337025 - 33336924
Alignment:
Q  327 taaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaat 426  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||  | |||||||||||||| ||  |||||  ||||||| ||| ||||||    
T  33337025 taaatttgttggtaattactattggttttacaattttat-ccttaagagagagttaatttatgttttcaatataatatttgatgttgattgaaaaaaaat 33336927  T
Q  427 ata 429  Q
    |||    
T  33336926 ata 33336924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 19349298 - 19349253
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggat 506  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  19349298 taattaatgtacttggaaataccaaatgggtcttataaaaagggat 19349253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 21290350 - 21290168
Alignment:
Q  324 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaa 422  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||| | | | |||| | |||||||||||||||||  || ||||||||||| || |||    
T  21290350 tattaaatttgtatataattactattgtttttataattttatccttaagacaaagaattaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaa 21290251  T
Q  423 aaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||| ||  | ||| ||||  || | ||  ||       |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21290250 aaagatgcaaaataaataagggtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaaggga 21290168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 469 - 505
Target Start/End: Original strand, 897154 - 897190
Alignment:
Q  469 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  897154 gtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaaggga 897190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 522 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 6129950 - 6129918
Alignment:
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6129950 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 6129918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 298
Target Start/End: Original strand, 17483731 - 17483775
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataa 298  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17483731 aatactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataa 17483775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #190
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 38920448 - 38920360
Alignment:
Q  339 taattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaat 426  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||    |||||||||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  38920448 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaagaaaaat 38920360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #191
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 522 - 554
Target Start/End: Original strand, 45943978 - 45944010
Alignment:
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45943978 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 45944010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #192
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 25227398 - 25227304
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnnct-tcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||          | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25227398 taattaatatagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaaggcacaaaaaaaaataatatcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 25227304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #193
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 519 - 554
Target Start/End: Original strand, 27037532 - 27037567
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27037532 ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 27037567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #194
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 519 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 28885877 - 28885842
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28885877 ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 28885842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #195
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 519 - 554
Target Start/End: Original strand, 38613738 - 38613773
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38613738 ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 38613773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #196
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 46271384 - 46271345
Alignment:
Q  259 tacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataa 298  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46271384 taccttcgtccctaattataagacccttttgaaaaaataa 46271345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #197
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Original strand, 51467280 - 51467383
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||   | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  51467280 gtattaaatttgtatataattactattgtttttataattttatccttaagagagagggttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 51467379  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  51467380 aaaa 51467383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #198
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4280163 - 4280121
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataa 298  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4280163 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataa 4280121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #199
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 385 - 443
Target Start/End: Original strand, 10758489 - 10758547
Alignment:
Q  385 ttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagag 443  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  10758489 ttatgttttcaacataatatttaatgtcgatcgaagaaaaagatataaaataaatagag 10758547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #200
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 461 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 38505890 - 38505848
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  38505890 taattaatgtatttggaaatatcaaaggagtcttataaaaagg 38505848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #201
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 52001573 - 52001531
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  52001573 gtattaaatttgtttgtaattattattgtttttataattttat 52001531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #202
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 521 - 554
Target Start/End: Original strand, 7784258 - 7784291
Alignment:
Q  521 caaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7784258 caaaagagtcttataattagggacggagggagta 7784291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #203
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22177669 - 22177549
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaa 422  Q
    ||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |  |||||||| ||   ||  |||||||||||||| | | ||    
T  22177669 gtattaaatttgttgataattgatattgtttttacaagtttatccttcaagagagaattagtttatgttctccttatagtatttattgttgattgcacaa 22177570  T
Q  423 aaatatatataattaatagagg 444  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  22177569 aaa-atataaaattaatagagg 22177549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #204
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 521 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 30289635 - 30289602
Alignment:
Q  521 caaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30289635 caaaagagtcttataattagggacggagggagta 30289602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 384 - 428
Target Start/End: Original strand, 5854461 - 5854505
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatat 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5854461 tttatgttttcaacataatatttatggttgattgaagaaaaatat 5854505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Original strand, 6402670 - 6402773
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaatta---gtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaa 419  Q
    |||||||||  |||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||  ||||||| |  ||||||||||||||||  | || ||||||||| | |    
T  6402670 gtattaaattcgtttgtaattaatagtattgtttttacaattttatcattt--gagagaactagtttatgttttcaacataatgttcattgttgattgga 6402767  T
Q  420 gaaaaa 425  Q
    ||||||    
T  6402768 gaaaaa 6402773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 255 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 9413363 - 9413323
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaa 295  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9413363 atactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaa 9413323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #208
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 316 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 9413610 - 9413514
Alignment:
Q  316 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgtt 412  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||| | |||  |||||||||||||||  || || ||||| ||  ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  9413610 gatatttgtattaaagttgtttgcaatcattatcatttttacaattttatctttgaaaagagatatagtttatattttcaacatactatttattgtt 9413514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #209
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 10332415 - 10332367
Alignment:
Q  324 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaa 372  Q
    |||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  10332415 tattaaatttatttgtaattattattatttttacaattttatcctttaa 10332367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #210
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 30996835 - 30996791
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  30996835 taattaatgtacttggaaataccaaatggatcttataaaaaggga 30996791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #211
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 255 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 39425869 - 39425829
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaa 295  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  39425869 atactacctttgtccctaattataagaccattttgagaaaa 39425829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #212
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 43789745 - 43789701
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  43789745 taattaatgtaattggaactaccaaaggggtcttttaaaaaggga 43789701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #213
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 501
Target Start/End: Original strand, 44530554 - 44530594
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  44530554 taattaatgtagttggaaatagcaaaatgatcttataaaaa 44530594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 172)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 20142000 - 20142296
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20142000 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 20142099  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||      
T  20142100 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtatgtaa 20142199  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||         |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20142200 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttttc--caaaagggtcttataattagggacggaggtagta 20142296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 266 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 9020981 - 9020694
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020981 gtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 9020882  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||       |||||    
T  9020881 cctttaagagagagatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataatt 9020782  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9020781 aatgtagatggaaatagcaaaggagtcttataaaaagggacaattttttttt-ttcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 9020694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 266 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 14913935 - 14913648
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14913935 gtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 14913836  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||       |||||    
T  14913835 cctttaagagatagatgatttatgttttcaacatgttatttattgatgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataatt 14913736  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||         | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14913735 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaaattc-tcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 14913648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 253 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 7940751 - 7940452
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7940751 taatactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 7940652  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| | ||||||||    
T  7940651 tttacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatg 7940552  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtag 552  Q
    |       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7940551 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttt--ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtag 7940454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 16441217 - 16440978
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16441217 gtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 16441118  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  16441117 cctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaaaatgtataattaatagaggcatgtatgtaaagaaataatt 16441018  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16441017 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaagaggga 16440978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 254 - 505
Target Start/End: Original strand, 20987952 - 20988203
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20987952 aatactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaatagcgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 20988051  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  20988052 ttacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgt 20988151  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20988152 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaaggtcttataaaaaggga 20988203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 3028313 - 3028013
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3028313 tactacctccgtcccttattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatttttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 3028214  T
Q  356 acaattttatgctttaaga----gagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    |||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  3028213 acaattttattctttaagagagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataattaataggggcatgtat 3028114  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggta 551  Q
    ||       |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||           ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3028113 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggacaaatttttttc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggta 3028016  T
Q  552 gta 554  Q
    |||    
T  3028015 gta 3028013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 32964418 - 32964179
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32964418 gtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 32964319  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| | |||||||||       |||||    
T  32964318 cctttaagagagtgatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgcataattaatagggacatgtatgtaaagaaataatt 32964219  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32964218 aatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaaggga 32964179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Original strand, 13759187 - 13759437
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13759187 atactacctccgtccttaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatggtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 13759286  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||     
T  13759287 tacagttttatcctttaagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgta 13759386  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
          |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13759387 aaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaagtcttataaaaaggga 13759437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 43060150 - 43060448
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43060150 tactaccttcgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 43060249  T
Q  356 acaattttatgcttt--aagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| ||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  43060250 acaattttatcctttaaaagagagggatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 43060349  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43060350 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagt 43060447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 23285325 - 23285082
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23285325 gtcccttattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 23285226  T
Q  366 gctttaagagagaaa----tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnnt 461  Q
     |||||||||||| |    || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |    
T  23285225 cctttaagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 23285126  T
Q  462 aattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23285125 aattattgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 23285082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 267 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 14649472 - 14649235
Alignment:
Q  267 tccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatg 366  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  14649472 tccctaattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaattttatc 14649373  T
Q  367 ctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
    ||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  14649372 ctttaagagagagtgttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaataaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 14649273  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14649272 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 14649235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 255 - 554
Target Start/End: Original strand, 4976027 - 4976327
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  4976027 atactacctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgcttt 4976126  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaa----tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  4976127 tacaattttatcctttaagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaagatgtataataaatagaggcatgta 4976225  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggt 550  Q
    |||       |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||          |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4976226 tgtaaagaaataattaatgtagctggaaatagcaaagagatcttataaaaggggacaaaaatattt--ttcaaaagggtcttataattagggacggaggt 4976323  T
Q  551 agta 554  Q
    ||||    
T  4976324 agta 4976327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 249 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 9065212 - 9064954
Alignment:
Q  249 tatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtat 348  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9065212 tatttagtactatctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactat 9065113  T
Q  349 tgtttttacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggca 446  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| | ||    
T  9065112 tgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggaca 9065013  T
Q  447 tgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9065012 tgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 9064954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 265 - 505
Target Start/End: Original strand, 27873093 - 27873335
Alignment:
Q  265 tgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 364  Q
    |||||||||||||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27873093 tgtccctaattatagggtcattttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 27873192  T
Q  365 tgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnnta 462  Q
    | ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||  |||||| ||||       ||    
T  27873193 tcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgcatgtaaagaaata 27873292  T
Q  463 attaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27873293 attaatgtagttggaaataggaaaagggtcttataaaaaggga 27873335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 266 - 554
Target Start/End: Original strand, 38371723 - 38372012
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  38371723 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataatggaaattaagattgtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattaatattatttttacaattttat 38371822  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||    
T  38371823 tctttaatagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatt 38371922  T
Q  466 aatgtagttggaaatagc-aaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||| ||          |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  38371923 aatgtagttggaaataacaaaaaggatcttataaaaagggacaattttttttctttcaaaagggtcttataattagagacggatgtagta 38372012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 266 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 20186789 - 20186501
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20186789 gtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 20186690  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||| || ||| || ||||| || ||||||||       |||    
T  20186689 cctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtatgataaataggggtatgtatgtaaagaaataa 20186590  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20186589 ttaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaaattttttt--ttcaaaagggtcttataattagggacggatgtagta 20186501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 256 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 34332516 - 34332266
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34332516 tactacctccgtccctaattataagaccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 34332417  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||| ||| ||| |||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||    
T  34332416 acaattatattcttgaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgt 34332317  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggg 504  Q
           ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  34332316 aaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaaggg 34332266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 251 - 505
Target Start/End: Original strand, 9268027 - 9268283
Alignment:
Q  251 tttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 350  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9268027 tttagtactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattg 9268126  T
Q  351 tttttacaattttatgcttt--aagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatg 448  Q
    ||||||||||||||| ||||  || | ||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  9268127 tttttacaattttatcctttaaaaaatagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgatcgaagaaaaagatgtataataaataggggcatg 9268226  T
Q  449 tatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9268227 tatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 9268283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 254 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 4194978 - 4194729
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||    
T  4194978 aatactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaat--gtttgtaattactattattt 4194881  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  4194880 ttacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacattttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 4194781  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  4194780 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttacaaaaaggga 4194729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 251 - 505
Target Start/End: Original strand, 23285810 - 23286066
Alignment:
Q  251 tttaatactacctttgtccctaattatatgaccctttt-gaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtatt 349  Q
    |||| ||||||||  ||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23285810 tttactactacctccgtctctaattatagggccctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattactatt 23285909  T
Q  350 gtttttacaattttatgctttaagagaga-aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatg 448  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  23285910 gtttttacaattttatcctttaagagagatgattgtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatg 23286009  T
Q  449 tatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||       ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||    
T  23286010 tatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagatgtcttataaataggga 23286066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Original strand, 23092378 - 23092630
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  23092378 atactacctccgtccctaatcatatgacctttttgaaaaaataacgaaaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgttgt 23092477  T
Q  355 tacaattttatgctttaagag--agaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| |||||||||  | || || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | |||||  ||||| |||||| |||    
T  23092478 tacaattttatcctttaagagacataattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagttgtataaaaaataggggcatgcatg 23092577  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  23092578 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtattataaaaaggga 23092630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 270 - 499
Target Start/End: Original strand, 31507374 - 31507605
Alignment:
Q  270 ctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctt 369  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  31507374 ctaattataaggtccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt 31507473  T
Q  370 ta--agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaa 467  Q
    ||  |||||||  || |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||       |||||||    
T  31507474 taatagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaa 31507573  T
Q  468 tgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaa 499  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31507574 tgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaa 31507605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 248 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 21239405 - 21239149
Alignment:
Q  248 atatttaat-actacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagt 346  Q
    ||||||||| |||||||  ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  21239405 atatttaattactacctccgtctctaattatagg-cccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgcattaaatatgttcgtaattact 21239307  T
Q  347 attgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagagg 444  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| || |||||| || || ||    
T  21239306 attgtttttacaattttatcttttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttgtttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaacagggg 21239207  T
Q  445 catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21239206 catgtatgtaaagaagtaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 21239149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 10511211 - 10511461
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | || |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10511211 tactacctccgtccctaattatagggccatttt-aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 10511309  T
Q  356 acaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||   ||||||||||    
T  10511310 acaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagagcatgtatgt 10511409  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  10511410 aaagaaataattaatgtagttgaaaataggaaatgagtcttataaaaaggga 10511461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 18615801 - 18616056
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  18615801 tactccctctgtcccttattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattaatttt 18615900  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa------tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgt 449  Q
    |||||||||| |||||||||||| |      || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| || ||||  | |||||    
T  18615901 acaattttatcctttaagagagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatatggacatgt 18616000  T
Q  450 atgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||       |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18616001 atgtaaagaaataattattgtagtttgaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 18616056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 280 - 502
Target Start/End: Original strand, 28140683 - 28140907
Alignment:
Q  280 gacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagaga 378  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||     
T  28140683 gacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttaagagagagt 28140782  T
Q  379 aatgatttatgttttcaacatgttatttat-tgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttgga 477  Q
      || |||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||||||||||||||    
T  28140783 gttggtttatgttttcaacatgttatttatccgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgga 28140882  T
Q  478 aatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  28140883 aatagcaaaggggtcttataaaaag 28140907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 256 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 40643392 - 40643145
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40643392 tactacctccgtccctaattatcagggccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 40643293  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||  |||||  ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  40643292 acaattttatcctttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 40643193  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
           |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40643192 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 40643145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 253 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 1266250 - 1265996
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    ||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||    
T  1266250 taatactccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtt 1266151  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  1266150 tttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 1266051  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1266050 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 1265996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 266 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 14619537 - 14619299
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14619537 gtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 14619438  T
Q  366 gctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
      ||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  14619437 cttttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 14619338  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14619337 ttaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaag 14619299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 255 - 501
Target Start/End: Original strand, 40951781 - 40952029
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  || |||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  40951781 atactacctccgttcctaattatacgatccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttt 40951880  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||    
T  40951881 tacaaatttatccttcaagagagagagttggtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatg 40951980  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40951981 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaa 40952029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Original strand, 42561107 - 42561339
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42561107 tatataacccttttgccaaaattacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 42561206  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||    
T  42561207 aagaaagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 42561306  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  42561307 ttggaaataacaaatgggtcttataaaaaggga 42561339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 12744122 - 12743871
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||| |  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12744122 tactacctctgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataatgagaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 12744023  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||| |||||    || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||  ||||| | |||||||||    
T  12744022 acaattttatcctttaaaagagagggttgttttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatagggacatgtatgt 12743923  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12743922 aaagaaataattaatgcagttggaaatagcaaacgagtcttataaaaaggga 12743871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 275 - 554
Target Start/End: Original strand, 10734279 - 10734560
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10734279 tataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaaacactattgtttttacaattttatcctttaaga 10734378  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||    
T  10734379 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 10734478  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10734479 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaataataattcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 10734560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 17674407 - 17674648
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17674407 gtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 17674506  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  17674507 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 17674606  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17674607 ttaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaaggga 17674648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 28041100 - 28041341
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  28041100 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattacagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 28041199  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  28041200 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 28041299  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28041300 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 28041341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 303 - 505
Target Start/End: Original strand, 24307927 - 24308131
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||||    
T  24307927 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttttaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaaatagttgatttatgttttcaacatg 24308026  T
Q  401 ttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 500  Q
    |||||||||  | || ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||        ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24308027 ttatttattacttattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaacaattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaa 24308126  T
Q  501 aggga 505  Q
    |||||    
T  24308127 aggga 24308131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 303 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 24365396 - 24365192
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||||    
T  24365396 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttttaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaaatagttgatttatgttttcaacatg 24365297  T
Q  401 ttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 500  Q
    |||||||||  | || ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||        ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24365296 ttatttattacttattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaacaattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaa 24365197  T
Q  501 aggga 505  Q
    |||||    
T  24365196 aggga 24365192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 283 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 31889164 - 31888940
Alignment:
Q  283 ccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa-- 380  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||       
T  31889164 ccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 31889065  T
Q  381 tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaat 480  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  31889064 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 31888965  T
Q  481 agcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  31888964 aacaaaggggtcttataaaaaggga 31888940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 248 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 34662510 - 34662251
Alignment:
Q  248 atatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagta 347  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||    
T  34662510 atatttagtactccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaaataagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcacta 34662411  T
Q  348 ttgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggc 445  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||  |||    
T  34662410 ttgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggc 34662311  T
Q  446 atgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34662310 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 34662251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 554
Target Start/End: Original strand, 15190550 - 15190852
Alignment:
Q  252 ttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgt 351  Q
    |||||||| |||  |||||||  |||| || |||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||    
T  15190550 ttaatactccctccgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttataatcactattgt 15190649  T
Q  352 ttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgt 449  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||    
T  15190650 ttttacaattttatcatttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgt 15190749  T
Q  450 atgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggagg 549  Q
    ||||       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15190750 atgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagagtcttataattagggacggagg 15190847  T
Q  550 tagta 554  Q
     ||||    
T  15190848 gagta 15190852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 285 - 505
Target Start/End: Original strand, 34889046 - 34889268
Alignment:
Q  285 ttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttt--aagagagaaatg 382  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||    
T  34889046 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttttattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagagttg 34889145  T
Q  383 atttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 482  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || | ||| ||||| || |||||| ||||  |||||||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  34889146 atttatgtattcaacatgttatttattgctggttgaaaaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 34889245  T
Q  483 caaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
     ||||  ||||||||||||||||    
T  34889246 gaaagatgtcttataaaaaggga 34889268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 255 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 14436101 - 14435929
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14436101 atactacctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 14436002  T
Q  355 tacaattttatgctttaaga--gagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||||||||  |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14436001 tacaattttatcttttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaa 14435929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 16153004 - 16153245
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||| ||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16153004 gtccctatatataagactcttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 16153103  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||       |||    
T  16153104 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataa 16153203  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16153204 ttaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaaggga 16153245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 22527980 - 22527739
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| |||| |||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  22527980 gtccctatatataagacctttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 22527881  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||| | ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  22527880 cctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 22527781  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22527780 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 22527739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 303 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 5528225 - 5528025
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||| ||||   | ||||||||||||||||||    
T  5528225 aattaaaatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactactgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttaatttatgttttcaacatg 5528126  T
Q  401 ttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 500  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5528125 ttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaa 5528026  T
Q  501 a 501  Q
    |    
T  5528025 a 5528025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 7735133 - 7734881
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaa-taacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7735133 tactacctccgtccctaattatatggcccttttgaaaaaagtaacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 7735034  T
Q  355 tacaattttatgcttt--aagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| ||||  || | ||   ||  |||| ||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  7735033 tacaattttatcctttaaaaaatagggttgggttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 7734934  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7734933 taaagaaataattaatgtagttgaaaataaaaaaggggtcttataaaaaggga 7734881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 20518139 - 20517892
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20518139 tactacctccgtccctaattatagggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 20518040  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    | |||||||| |||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||  || |||||| ||| | ||||| |||||      
T  20518039 ataattttatccttt-agagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaagaatgtataataaatgggggcatatatgtaa 20517941  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
         ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||    
T  20517940 agaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatggatc-tataaaaaggga 20517892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 6672977 - 6673218
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| || |||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  6672977 gtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 6673076  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  6673077 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 6673176  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6673177 ttaatgtagttgaaaataacaaagaggtcttataaaaaggga 6673218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 251 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 35547564 - 35547308
Alignment:
Q  251 tttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 350  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  35547564 tttagtactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaagtaacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatatttgtaattactatta 35547465  T
Q  351 tttttacaattttatgctttaaga--gagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatg 448  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||   ||  ||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||| || |||||| ||||| || |||    
T  35547464 tttttacaattttatcctttaagaatgagggttggcttatgttttcaacattttatttattgcttattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatg 35547365  T
Q  449 tatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||       ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  35547364 tatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagaggtcttataaaaaggga 35547308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 255 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 39759186 - 39758958
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  39759186 atactacctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatgtttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttt 39759087  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||    
T  39759086 tacaaatttatccttcaagagagaaagttggtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatg 39758987  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaata 481  Q
    |       |||||||||||||||||||||    
T  39758986 taaagaaataattaatgtagttggaaata 39758958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 41641378 - 41641142
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41641378 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttacaattttatcctttaaga 41641279  T
Q  375 gagaa--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt----nnnnnnntaattaat 468  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||           ||||||||    
T  41641278 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaattaat 41641179  T
Q  469 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41641178 gtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 41641142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 501
Target Start/End: Original strand, 3686503 - 3686740
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  3686503 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 3686602  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| | ||   |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  3686603 cctttaagaaataaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 3686702  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3686703 ttaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 3686740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 13862744 - 13862985
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| || |||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13862744 gtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 13862843  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  13862844 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgacagaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaattaa 13862943  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  13862944 ttaatgtagttggaaataacaaaggagttttataaaaaggga 13862985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 501
Target Start/End: Original strand, 15521691 - 15521928
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15521691 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcatgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 15521790  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  15521791 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaggaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataa 15521890  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15521891 ttaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaa 15521928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Original strand, 39121428 - 39121680
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  39121428 atactacctccgtccctaattataaggctcttttaaaaaaatagcgggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttataattactattgtttt 39121527  T
Q  355 tacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  39121528 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattatatttattgctgatttaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 39121627  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  39121628 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaaggga 39121680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 292 - 505
Target Start/End: Original strand, 4984891 - 4985106
Alignment:
Q  292 aaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatg 389  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |  ||||||    
T  4984891 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattatagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 4984990  T
Q  390 ttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggg 489  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  4984991 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatctataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagg 4985090  T
Q  490 gtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||    
T  4985091 gtcttataaaaaggga 4985106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 9828680 - 9828440
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9828680 gtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 9828581  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  9828580 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 9828481  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9828480 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 9828440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 8283851 - 8284098
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8283851 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaag----ataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 8283946  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||| |||    |   |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||| || |||||| ||||| || ||||||||    
T  8283947 acaattttatcctttaagaaagagggttagcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgt 8284046  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8284047 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 8284098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 4752967 - 4753208
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4752967 gtccctatatataagacccttttatcaaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 4753066  T
Q  366 gctttaagagagaa--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  4753067 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataa 4753166  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||| || || ||||   ||||||||||||||||    
T  4753167 ttaatgtagttgaaattaacaaaaatgtcttataaaaaggga 4753208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 270 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 22658052 - 22657815
Alignment:
Q  270 ctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctt 369  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| |  |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  22658052 ctaattataagatctttttgaaaaaattaaagaaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctt 22657953  T
Q  370 taagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaa 467  Q
    ||||| |||    ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||||    
T  22657952 taagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 22657853  T
Q  468 tgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22657852 tgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaaggga 22657815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 256 - 503
Target Start/End: Original strand, 25600799 - 25601048
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||| ||| ||||||||  |||| || |||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  25600799 tactccctctgtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 25600898  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||| ||||   |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  25600899 acaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaataaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 25600998  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
           |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25600999 aaagaaataattaatgtagttggaaataaaaaaggggtcttataaaaagg 25601048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 266 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 39985059 - 39984819
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39985059 gtccctaattataaggaccttttgaaaaaataacgagaattaagatagcggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 39984960  T
Q  366 gctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaat--agaggcatgtatgtnnnnnnnt 461  Q
     |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||  ||||| ||||||||       |    
T  39984959 cctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagagaggtatgtatgtaaagaaat 39984860  T
Q  462 aattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  39984859 aattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaag 39984819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 17714856 - 17714611
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||    
T  17714856 gtccctaattatagaacctttttgaaaaaattatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttctgattactattgttttgacaattttat 17714757  T
Q  366 gctttaagagagaaatga---tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcg---aagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnn 459  Q
      ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |   || ||||| || |||||| ||||| |||||||||||          
T  17714756 tttttaagagagagatgatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 17714657  T
Q  460 ntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
     ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||| ||||||    
T  17714656 ataattaatgtagttgaaaatagtaaatgagtcttataagaaggga 17714611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 19571669 - 19571976
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaa--------tagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagta 347  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  19571669 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaatttaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacca 19571768  T
Q  348 ttgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggc 445  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||    ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||    
T  19571769 ttgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggc 19571868  T
Q  446 atgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacg 545  Q
    |||| |||       |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||         | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19571869 atgtgtgtaaagaaataattaatatagttggaaatagtaaatgggtcttataaaaagggacaaaaaaaaaatc-tcaaaagggtcttataattagggacg 19571967  T
Q  546 gaggtagta 554  Q
    |||||||||    
T  19571968 gaggtagta 19571976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 41418606 - 41418357
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  41418606 tactacctccgtccctaattatgaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgttttt 41418507  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||  ||||   ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||  || |||||| |||  | | ||||||||    
T  41418506 acaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaatattctatttattgttgattgaagaaaatgatgtataataaat--atgtatgtatgt 41418409  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           ||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41418408 aaagaaataattaatgtatttagaaatagaaaaagggtcttataaaaaggga 41418357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 253 - 453
Target Start/End: Original strand, 8144456 - 8144658
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8144456 taatactacctccgtccctaattataaggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 8144555  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||    ||  ||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| | ||| ||||||||    
T  8144556 tttacaattttatcctttaagaaagatggttggcttatgtttttaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataattaggggcatgta 8144655  T
Q  451 tgt 453  Q
    |||    
T  8144656 tgt 8144658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 292 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 32478400 - 32478185
Alignment:
Q  292 aaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatg 389  Q
    ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| | ||||   |  |||||     
T  32478400 aaaatcacgggaattaatataatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttata 32478301  T
Q  390 ttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggg 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32478300 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 32478201  T
Q  490 gtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||    
T  32478200 gtcttataaaaaggga 32478185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 40004159 - 40004399
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||| |||| || |||||||  ||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  40004159 gtccctaaatataagatccttttgctaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 40004258  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  40004259 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 40004358  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40004359 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 40004399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 285 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 9264242 - 9264020
Alignment:
Q  285 ttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaag--agagaaatg 382  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||   ||    
T  9264242 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttg 9264143  T
Q  383 atttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 482  Q
      |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||   |||||||| |       ||||||||||||||||||||||    
T  9264142 gcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagagcatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaatag 9264043  T
Q  483 caaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
     ||| | ||||||||||| ||||    
T  9264042 aaaatgagtcttataaaacggga 9264020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 3497550 - 3497790
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  3497550 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatattat 3497649  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  3497650 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 3497749  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3497750 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 3497790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 35039294 - 35039044
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35039294 tactacctccgtcgctaattataaggccctttt-aaaaaataacgcgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 35039196  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||| |||||  || |||||||| |  || ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||| ||||  | ||| |||||    
T  35039195 acaaatttatcattcaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataaggacatatatgt 35039096  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  35039095 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaatatcttataaaaaggga 35039044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 267 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 7951847 - 7951608
Alignment:
Q  267 tccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatg 366  Q
    |||||||||||| || | |||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  7951847 tccctaattataagatcattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatc 7951748  T
Q  367 cttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
    ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||    
T  7951747 cttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatt 7951648  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7951647 aatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 7951608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 283 - 481
Target Start/End: Original strand, 15774829 - 15775029
Alignment:
Q  283 ccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaag--agagaaa 380  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||       
T  15774829 ccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggt 15774928  T
Q  381 tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaat 480  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| || || ||| ||||| ||||| |||||       ||||||||||||| ||||||    
T  15774929 tgacttatgttttcaacattctatttattgttgattaaagaaaaagatgtacaataaataggggcatatatgtaaaaaaataattaatgtagtcggaaat 15775028  T
Q  481 a 481  Q
    |    
T  15775029 a 15775029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 303 - 505
Target Start/End: Original strand, 32617562 - 32617766
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatg 400  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||  ||||   ||| |||||||||||||||     
T  32617562 aattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttgtcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacatt 32617661  T
Q  401 ttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 500  Q
     ||||||||| |||| ||||||||| || |||| | ||||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  32617662 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtatattaaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaa 32617761  T
Q  501 aggga 505  Q
    |||||    
T  32617762 aggga 32617766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 16127546 - 16127306
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16127546 gtccctaattataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 16127447  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||       ||||    
T  16127446 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataat 16127347  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16127346 taatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaaggga 16127306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 13661146 - 13660908
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||| ||||   ||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13661146 gtccctaattataagacctttttattaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 13661047  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     | ||||||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| || || |||||       |||||    
T  13661046 -ccttaagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatatatgtaaagaaataatt 13660948  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13660947 aatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 13660908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 283 - 506
Target Start/End: Original strand, 13703576 - 13703798
Alignment:
Q  283 ccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatg 382  Q
    |||||||||||||||   | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| |||||  ||    
T  13703576 ccttttgaaaaaatattaggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtatttacaattttattttttaaaagagagttg 13703675  T
Q  383 atttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 482  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||||| |||||  ||||||    
T  13703676 gtttat-ttttcaacatgttatttattgttgtttgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttaaaaatag 13703774  T
Q  483 caaaggggtcttataaaaagggat 506  Q
    |||| |  |||||||| |||||||    
T  13703775 caaaagaatcttataacaagggat 13703798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 266 - 379
Target Start/End: Original strand, 26889603 - 26889716
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26889603 gtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 26889702  T
Q  366 gctttaagagagaa 379  Q
     |||||| ||||||    
T  26889703 cctttaaaagagaa 26889716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 292 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 40738671 - 40738461
Alignment:
Q  292 aaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctt-taagagagaaatgatttatgt 390  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  |  |||||||    
T  40738671 aaaattacgggaattaaaaaagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttatgagagagagttagtttatgt 40738572  T
Q  391 tttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaagggg 490  Q
    |||| | ||||||||||||| | || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40738571 tttccatatgttatttattgctcattgaagaaaaagatgtataataaatagaggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagggg 40738472  T
Q  491 tcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||    
T  40738471 tcttataaaaa 40738461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 266 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 186385 - 186149
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  186385 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaatttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 186286  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  186285 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 186186  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  186185 taatgtagttggaaatgacaaaatggtcttataaaaa 186149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 256 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 37034443 - 37034248
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||    
T  37034443 tactacctccgtccctaattataaggaccttttgaaaaaataaccgaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtgtgtaa--actattgttttt 37034346  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    |||||||||| |||||||  ||||   ||  |||| ||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  37034345 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtat 37034248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 253 - 500
Target Start/End: Original strand, 41383909 - 41384157
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| || |||||||  ||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||    
T  41383909 taatactccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtt 41384008  T
Q  353 tttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    ||||||||||| | ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||    
T  41384009 tttacaattttgtccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 41384108  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 500  Q
    ||       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41384109 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 41384157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 255 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11781053 - 11780881
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11781053 atactacatctgttcctaattataaggcatttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatgtgtttgtaattactattgtttt 11780954  T
Q  355 tacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||  ||  |||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  11780953 tacaattttatcctttaagaaagagagttggcttatattttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaa 11780881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 21750218 - 21749977
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||| |||||||| || |||||| |||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21750218 gtccttaattataagatccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtaaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttat 21750119  T
Q  366 gcttt--aagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     ||||  || ||||   ||  ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||       |||    
T  21750118 cctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataa 21750019  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    | |||||||||| |||||| ||| |  ||| |||||||||||    
T  21750018 tcaatgtagttgaaaatagaaaatgaatctcataaaaaggga 21749977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 270 - 481
Target Start/End: Original strand, 17592555 - 17592767
Alignment:
Q  270 ctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctt 369  Q
    ||||||||| ||| ||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  17592555 ctaattataggacacttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat-ctt 17592653  T
Q  370 taagagaga-aatga-tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaa 467  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||       |||||||    
T  17592654 taagagagagaattagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaa 17592753  T
Q  468 tgtagttggaaata 481  Q
    ||||||||||||||    
T  17592754 tgtagttggaaata 17592767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 255 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 30183139 - 30182967
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30183139 atactacctccgtctctaattataagactcttctgaaaaaataacgggaattaagatagatgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 30183040  T
Q  355 tacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  30183039 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaa 30182967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 253 - 501
Target Start/End: Original strand, 38161517 - 38161766
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    |||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||||  ||||| |||| ||| || | |||||||||||||||||||  |||||| ||| |   ||| |    
T  38161517 taatactaccttcgtccctatatataagactcttttgccaaaattacgggaatcaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgcaatcaccgttgat 38161616  T
Q  353 tttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| | | ||| |||||||||    
T  38161617 tttacaattttatcctttagagatagagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtatagtaagtaggggcatgtat 38161716  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    ||       ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  38161717 gtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaa 38161766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 283 - 374
Target Start/End: Original strand, 42030365 - 42030456
Alignment:
Q  283 ccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42030365 ccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaga 42030456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 22581475 - 22581725
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | ||||||||||| ||||| |  ||||||||| || ||||||||||    
T  22581475 tactacctccgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaataaagtggatatttatattacagttgtttgtaagtactattgttttt 22581574  T
Q  356 acaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    ||| |||||| ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||||||||||||| ||||  || ||||| || |||||| |||||||||||||||||     
T  22581575 acagttttatccttaagagagagagttcgtttatgttttccatatgttatttattgctgattcaaaaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgta 22581674  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
          ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||    
T  22581675 aagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagaaatcttataaaaaggga 22581725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 344 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 12806856 - 12806693
Alignment:
Q  344 agtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatag 441  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||  |||||    
T  12806856 agtattgtttttacaattttatcctttaaaagagagggttgttttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatag 12806757  T
Q  442 aggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
     |||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12806756 gggcatgtatgtaaagaaataattaatgcagttggaaatagcaaacgagtcttataaaaaggga 12806693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 14570630 - 14570927
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||| || ||||  |||| |||| |||||  ||||| |||| |||||| |  ||||||||||||||||||  ||||| |||| |  ||| ||||     
T  14570630 tactaccttcgttcctatatataagaccattttgttaaaatcacgggaattaagaaggtggatatttgtattaaagttgtttataatcacaattatttta 14570729  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |  ||||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||||| |||||      
T  14570730 acaattttatcctt-aagagagagttagtttatgttttccatatgctattcattgttgattgaagaaaaatatgtataataagtaggggcatatatgtaa 14570828  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
         ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||         ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14570829 agaaataattaatgtaattgaaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaatttttttttcttcaaaaaggtcttataattagggacggaggtagta 14570927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Original strand, 26605374 - 26605613
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta--- 371  Q
    |||| |||||||||   ||||| |||| |||||| | ||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |       
T  26605374 tataagacccttttactaaaattacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatccttaagag 26605473  T
Q  372 ------agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
          |||||||  |  ||||||||||| | ||||||||||||| ||||  |||||||| || |||||| |||||||||||||||||       |||||    
T  26605474 agagagagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctgattcaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataatt 26605573  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26605574 aatgtagttggaaatatcaaaggggtcttataaaaaggga 26605613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Original strand, 31158186 - 31158414
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||| ||||||  ||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  31158186 tataagactcttttgttaaaattacgggaattaagaaagtg-atatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttataattttatcctt-aaga 31158283  T
Q  375 gagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagtt 474  Q
    ||||  || ||||||||||| | ||| ||||||||| | || |||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||       ||||||||||| ||    
T  31158284 gagagttggtttatgttttccatatgctatttattgcttattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtaatt 31158383  T
Q  475 ggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    | |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31158384 gaaaatagaaaagtggtcttataaaaaggga 31158414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 343 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 20987958 - 20987794
Alignment:
Q  343 tagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaata 440  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |    ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||    
T  20987958 tagtattgtttttacaattttatcctttaagaaatagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 20987859  T
Q  441 gaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    | |||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20987858 ggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 20987794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 283 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 33639561 - 33639338
Alignment:
Q  283 ccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa-- 380  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||      
T  33639561 ccttttgccaaaatcacgggaattaaaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttat-ccttaagagataaagt 33639463  T
Q  381 tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaat 480  Q
    |  ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| ||| ||||| || |||||| ||||| ||||| |||||       ||||||||||||||| ||||    
T  33639462 tagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtagaaaaataattaatgtagttgaaaat 33639363  T
Q  481 agcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    || ||| | ||||||||||| ||||    
T  33639362 agtaaatgagtcttataaaacggga 33639338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 252 - 554
Target Start/End: Original strand, 23286217 - 23286511
Alignment:
Q  252 ttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgt 351  Q
    |||||||| |||  || |||||||||| |||| |||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||    
T  23286217 ttaatacttcctccgttcctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgt 23286316  T
Q  352 ttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||  |  ||||| ||||| | ||| || | ||||       |||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  23286317 ttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatattttccatatgctactgattg-------aagaaaaagatgtataataaatagaggcatgta 23286409  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggt 550  Q
    |||       |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23286410 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataaaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggt 23286507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 292 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 14789814 - 14789604
Alignment:
Q  292 aaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgt 390  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||||  || |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||||||   | ||||||||    
T  14789814 aaaatcacgggaattaagaaagtggatcattatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagggttaatttatgt 14789715  T
Q  391 tttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaagggg 490  Q
    |||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||| ||| |||||||| || ||    
T  14789714 tttctatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtaattgaaaatagcagagagg 14789615  T
Q  491 tcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||    
T  14789614 tcttataaaaa 14789604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 255 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20988341 - 20988252
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatta 344  Q
    ||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20988341 atactacattcgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatta 20988252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 312 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 14571526 - 14571334
Alignment:
Q  312 agtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgt 411  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |  ||||||||||  | |||||||| |||||    
T  14571526 agtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcacaattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttagtttatgttttgcatatgttattcattgt 14571428  T
Q  412 tgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||| || ||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||    
T  14571427 tgattgaagaaaaatatgtataataagtaggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaagtcttatgaaaaggga 14571334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 270 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 32147574 - 32147340
Alignment:
Q  270 ctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctt 369  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | ||   ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||    
T  32147574 ctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagc--atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgcttttacaattttatcctt 32147477  T
Q  370 ta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaat 468  Q
     | || ||||  |  ||||||||||  | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||    
T  32147476 aagagtgagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 32147377  T
Q  469 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  32147376 gtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaaggga 32147340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 254 - 554
Target Start/End: Original strand, 41686853 - 41687149
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| || |||||||   |||| ||||| ||||| | | | | |  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||    
T  41686853 aatactacctctgtccctaaatataggagccttttgcccaaattacggagattaagaaaattggttgtagtattaaatttgtatataattactattgttt 41686952  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||  || ||||  ||    
T  41686953 ttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaataagggtatgttagt 41687051  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  41687052 aaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggagtcttataaaaagggacaattttttt---ttcaaaagggtcttataattatggacggaggtagt 41687148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 281 - 505
Target Start/End: Original strand, 3160291 - 3160517
Alignment:
Q  281 acccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa 380  Q
    |||||||||  ||||| |||  ||| || |||||| |||||||| |||||  | |||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||      
T  3160291 acccttttgccaaaatcacgagaatcaagatagtgaatatttgtgttaaagttttttgtaaacactattgtttttacaaatttatcctttaagagagatg 3160390  T
Q  381 --tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaa 478  Q
      |  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||        |||||||||| ||| ||    
T  3160391 gttagtttatgttttcaacatactatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaaaaattaatgtaattgaaa 3160490  T
Q  479 atagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||    
T  3160491 atagcaaaggaatcttataaaaaggga 3160517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 384 - 508
Target Start/End: Original strand, 26894743 - 26894866
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 483  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||       || ||||||||||||||||||||    
T  26894743 tttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaata-ttaatgtagttggaaatagc 26894841  T
Q  484 aaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  26894842 aaatgggtcttataaaaagggataa 26894866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12807220 - 12807132
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatta 344  Q
    ||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12807220 tactacctccgtccctaattatagagtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaatta 12807132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 301 - 425
Target Start/End: Original strand, 9438875 - 9439002
Alignment:
Q  301 gaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgc-tttaagagaga-aatga-tttatgttttcaac 397  Q
    |||||||| | ||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||| | ||| ||||||||||    
T  9438875 gaaattaagaaagttgatatttttattaaatttgtttgtaattattattgtttttacaatttttttcttttaagagagagaattagtttgtgttttcaac 9438974  T
Q  398 atgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  9438975 atgctatttattgctgatcaaagaaaaa 9439002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 324 - 505
Target Start/End: Original strand, 16284998 - 16285180
Alignment:
Q  324 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagaga--gaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||    
T  16284998 tattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatcctt-aagagattgaattaatttatgttttcaacataatatttattgtttattgaaga 16285096  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||| ||  | ||| ||||  || ||||  ||       ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16285097 aaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaaggga 16285180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Original strand, 8100152 - 8100383
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| |||| |||||  ||||| |||| |||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||||||||||||  |||| ||    
T  8100152 tataagaccattttgccaaaattacgggaattaagaaagttgatatttgtattaaatttgtttgtaatccctattggttttacaattttatcatttagga 8100251  T
Q  375 gaga-aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagt 473  Q
     | | ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||| || ||||   | ||||| ||       |||||||||| ||    
T  8100252 taaagaattagttatgttttcaacatgttatttattgatgattgaaaaaaaaaatgtatgataaataagagtatgtaagtaaagaagtaattaatgttgt 8100351  T
Q  474 tggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| |||  | |||||||||||||||    
T  8100352 tggaaatagaaaattgatcttataaaaaggga 8100383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 303 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 15675026 - 15674914
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgtt 402  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  ||||| |||||||||||||    
T  15675026 aattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgcttttacaattttatcttttaagagagagttagtttatattttcaacatgtt 15674927  T
Q  403 atttattgttgat 415  Q
    |||||||| ||||    
T  15674926 atttattgctgat 15674914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 323 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 25837238 - 25837057
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaa-gagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |    
T  25837238 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaaa 25837139  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    |||| ||  | ||| ||||  || ||||  ||       ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25837138 aaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaagggatcttataaaaagg 25837057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3629132 - 3629030
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaa 422  Q
    ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||  |||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3629132 gtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatgttatcctttaagctagagttagtttatgttttcaacatgatatttattgttgattgaagaa 3629033  T
Q  423 aaa 425  Q
    |||    
T  3629032 aaa 3629030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 253 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 13335588 - 13335338
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| ||| | | |||| | |  || ||||| |||||||||||| ||||| |    
T  13335588 taatactacatccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgaaaaataagaaaatggaaagtgataataaatttgtttgtaattaatattgct 13335489  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagaga-aatgatt-tatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||  || ||| |||| ||| |||||  |||||| || |||| ||||||||| ||||| ||| ||||| || ||||     
T  13335488 tttacaattttatcctttacgagagatgattattgtatgctttgaacatagtatttaatgctgattgaagaaaaagatataaaataaatagcggtatgt- 13335390  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    ||        |||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  13335389 tggtaaaaattaattaatatacttggaaataccaaatgggtcttataaaaag 13335338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 383 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 39180630 - 39180508
Alignment:
Q  383 atttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||||| | ||| | |||||||||       |||||||||||||||||||||     
T  39180630 atttatgttttcaacatgttatttattgatgatttaagaaaaagatgtataataattagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataa 39180531  T
Q  483 caaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||   || |||||||||||||    
T  39180530 caaaaatgttttataaaaaggga 39180508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 24857785 - 24857556
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||    |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  24857785 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 24857686  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttc 521  Q
    ||||  |  | ||| ||||  || | ||  ||       ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||          |||    
T  24857685 aaaa-gtgcaaaataaataagggtacgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacatcaaaggggtcttataaaaagggacaaattatttt--ttc 24857589  T
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24857588 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 24857556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 26699543 - 26699443
Alignment:
Q  327 taaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga-aatgatt-tatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaa 424  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  26699543 taaatttgtttgtaattaatattgtttttataattttatgctttaagagagatgattattgtatgttttgaacatagtatttaatgttgattgaagaaaa 26699444  T
Q  425 a 425  Q
    |    
T  26699443 a 26699443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 26969276 - 26969176
Alignment:
Q  327 taaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga-aatgatt-tatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaa 424  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  26969276 taaatttgtttgtaattaatattgtttttataattttatgctttaagagagatgattattgtatgttttgaacatagtatttaatgttgattgaagaaaa 26969177  T
Q  425 a 425  Q
    |    
T  26969176 a 26969176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 428
Target Start/End: Original strand, 39692462 - 39692565
Alignment:
Q  324 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaa 423  Q
    |||||||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||    
T  39692462 tattaaatttgtatataattattgttgtttttacaattttattctt-aagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaa 39692560  T
Q  424 aatat 428  Q
    |||||    
T  39692561 aatat 39692565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 39971244 - 39971014
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||    
T  39971244 gtattaaatttgtatacaattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaaga 39971145  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttc 521  Q
    |||| ||  | ||| | ||  || ||||  ||       ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||          |||    
T  39971144 aaaagatgcaaaataattaagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaagggatcttataaaaagggacaaattatttt--ttc 39971047  T
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39971046 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 39971014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 339 - 425
Target Start/End: Original strand, 28414507 - 28414594
Alignment:
Q  339 taattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  28414507 taattattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaa 28414594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 255 - 374
Target Start/End: Original strand, 33818765 - 33818884
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| | | | || | |  || ||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  33818765 atactacctctgcccctaattataggacctttttgaaaaaataaaggaaattaagaaaattgaaagtgataataaatttgtttgtaattactattgcttt 33818864  T
Q  355 tacaattttatgctttaaga 374  Q
    ||||||| ||| ||||||||    
T  33818865 tacaattctattctttaaga 33818884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 425
Target Start/End: Original strand, 35784658 - 35784828
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||  |||||  |||| ||||||| ||| | |  |  |||||||| ||| | |||||| ||||||||    
T  35784658 aatactaccttcgtccctaaatataggagtcttttgtcaaaattgcggagattaaaaaagttggttgtaatattaaatttgtatataattattattgttt 35784757  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||||||||| | ||||||||||  | |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  35784758 ttacaattttat-ccttaagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaaaaaaa 35784828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 15559834 - 15559660
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||||||| |||| || ||||||| |||||| ||||| ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||  | |||||| ||||||||||    
T  15559834 tactacctccgtccctaaatataagagccttttgtaaaaattacggagattaagaaagttggttctagtattaaatttgcatataattactattgttttt 15559735  T
Q  356 acaattttatgcttta-----agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||||||| ||| |     |||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  15559734 acaattttattcttaagagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaa 15559660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 24170338 - 24170180
Alignment:
Q  349 tgtttttacaattttatgctttaagagaga-aatga-tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggca 446  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||||  |||    
T  24170338 tgtttttacaattttat-cttaaagagagagaattagtttatgttttctatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggagca 24170240  T
Q  447 tgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaa-ggggtcttataaaaaggga 505  Q
    || ||||       ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||    
T  24170239 tgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagatcttataaaaaggga 24170180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 270 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 37700377 - 37700143
Alignment:
Q  270 ctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctt 369  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| | | | ||   |  || ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||    
T  37700377 ctaattatatggcacttttgaaaaaataacgggaattaagaaaattgaaggtgataataaatttgtttgtaatcaccattgtttttacaattttatcctt 37700278  T
Q  370 taagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaa 467  Q
    |||||||||||  |  | ||||||||||| ||  |||||| || |||| ||||||||  ||||| ||| ||||| |  ||||  ||       |||||||    
T  37700277 taagagagaaaattagtatatgttttcaatatagtatttaatgctgattgaagaaaatgatataaaataaatagggatatgttggtaaagaattaattaa 37700178  T
Q  468 tgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |||| | ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  37700177 tgtactcggaaatatcaaaggagtcttataaaaag 37700143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 5283277 - 5283174
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaag 420  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||| |  | || ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  5283277 gtattaaatttgtatgtaattactattgtttttacaattttat-ccttaagaaagatagttaatctatgttttcaacatagtatttattgttgattgaag 5283179  T
Q  421 aaaaa 425  Q
    |||||    
T  5283178 aaaaa 5283174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 505
Target Start/End: Original strand, 26674480 - 26674594
Alignment:
Q  391 tttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaagggg 490  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||  |||||||       |||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  26674480 tttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtctgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgag 26674579  T
Q  491 tcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||    
T  26674580 tcttataaaaaggga 26674594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 505
Target Start/End: Original strand, 26946086 - 26946200
Alignment:
Q  391 tttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaagggg 490  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||  |||||||       |||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  26946086 tttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtctgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgag 26946185  T
Q  491 tcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||    
T  26946186 tcttataaaaaggga 26946200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27834174 - 27834071
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaag 420  Q
    ||||||||| ||| | ||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||| |  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  27834174 gtattaaatttgtatataattatcattgtttttacaattttat-cattaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 27834076  T
Q  421 aaaaa 425  Q
    |||||    
T  27834075 aaaaa 27834071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 31657983 - 31657685
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||  ||||||  |||||  |||| ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||    
T  31657983 aatactacctccgtccctaaatatatgagtcttttgtcaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgttt 31657884  T
Q  354 ttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||  | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||  |  | ||| ||||  || ||||  |    
T  31657883 ttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaagtgcaaaataaataagggtatgttgg 31657784  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtag 552  Q
    |       ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31657783 taaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaaattattt---ttcaaaagggtcttataattagggacggatgtag 31657687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 16926682 - 16926452
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagaga-gaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||    
T  16926682 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagaagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgagga 16926584  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttc 521  Q
    |||| ||  | ||| ||||  || | ||  ||       |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||         | ||    
T  16926583 aaaagatgcaaaataaataagggtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaagagggacaatttttttttc-tc 16926485  T
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16926484 aaaagggtcttataattagggatggaggtagta 16926452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 254 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 18251319 - 18251143
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||  |||||||| ||| | || |  |||||||| ||| | |||||| ||||||||    
T  18251319 aatactacctccgtccctaaatatatgatccttttgtcaaaatcacgagaattaaaaaagttggtagtaatattaaatttgtatataattactattgttt 18251220  T
Q  354 ttacaattttatgctt-----taagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||||||||| |||      ||||||||  |  ||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  18251219 ttacaattttatccttaagagaaagagagagttagtttatgttttcaatatagtatttattgttgattgaagaaaaa 18251143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 425
Target Start/End: Original strand, 26076188 - 26076299
Alignment:
Q  316 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttg 413  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |  |  ||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  26076188 gatatctgtattaaatttgtttctaattattattatttttacaattttattctttaagaaagagagttagtttgtgttttcaacatattatttattgctg 26076287  T
Q  414 atcgaagaaaaa 425  Q
    || || ||||||    
T  26076288 attgaggaaaaa 26076299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 425
Target Start/End: Original strand, 6328626 - 6328713
Alignment:
Q  339 taattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  6328626 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaa 6328713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 266 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 8950102 - 8949812
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||| |||| || ||||||| ||||||  |||| ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8950102 gtccctaaatataggagccttttgcaaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttat 8950003  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | ||| |||  | |||||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||| ||  | ||| ||||  || | ||  ||       ||||    
T  8950002 ccttaagagaaagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataaataagggtaggttggtaaagaaataat 8949903  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnnct-tcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    || |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||          | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8949902 tagtgtacttggaaatatcaaaggagtcttataaaaagggacaattttttttcttctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 8949812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 323 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 11432546 - 11432357
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-------agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgat 415  Q
    ||||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||| ||| |       |||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11432546 gtattaaatttgtatatatttactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgat 11432447  T
Q  416 cgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
     ||||||||| ||  | ||| ||||  || ||||  ||       ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11432446 tgaagaaaaagatgcagaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaagggatcttataaaaaggga 11432357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 13236169 - 13236068
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaa 422  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  13236169 gtattaaatttgtatataattactattatttttacaattttatcctt-aagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaa 13236071  T
Q  423 aaa 425  Q
    |||    
T  13236070 aaa 13236068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 303 - 365
Target Start/End: Original strand, 13958638 - 13958700
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13958638 aattaaaaaagtgaatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 13958700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 285 - 431
Target Start/End: Original strand, 35495039 - 35495185
Alignment:
Q  285 ttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgat 384  Q
    |||| |||||||||| | |||||| | | | |||| | ||| ||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |  | ||    
T  35495039 ttttaaaaaaataacaggaattaagaaaattgataatggtaataaatttatttgtaattactattgattttacaattttatcctttaagagaaaggtaat 35495138  T
Q  385 ttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatata 431  Q
     ||| ||||||| ||  |||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  35495139 gtatattttcaaaatagtatttaatgttgattgaagaaaaagatata 35495185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 13735790 - 13735701
Alignment:
Q  411 ttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    ||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13735790 ttgattgaagaaaaa-atgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaa 13735701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 4902898 - 4902854
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4902898 taattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 4902854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 30182174 - 30182130
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  30182174 taattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaaggga 30182130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4903069 - 4902970
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| ||||||   ||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  4903069 gtccctatatataagacccttttgttaaaattacgggaattaaggaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttat 4902970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 21069866 - 21069635
Alignment:
Q  324 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    |||||||| ||| | |||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||  |  | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  21069866 tattaaatttgtatataattactattatttttacaattttatcctt-aagagaggtagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 21069768  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttc 521  Q
    |||| ||  | ||| ||||  || ||||  ||       ||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||          |||    
T  21069767 aaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaatggtcttataaaaagggacaaattatttt--ttc 21069670  T
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagtagt 556  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21069669 aaaagggtcttataattagggacagaggtagtagt 21069635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 31642474 - 31642234
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||| |||| || ||||||| ||||||  |||| ||||| | ||| | |  | ||||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31642474 gtccctaaatatacgagccttttgcaaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgataataattactattgtttttacaattttat 31642375  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | ||| |||  | |||||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||| ||  | ||| ||||  || | ||  ||       ||||    
T  31642374 ccttaagagaaagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataaataagggtaggttggtaaagaaataat 31642275  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31642274 tagtgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaaggga 31642234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Original strand, 2328420 - 2328498
Alignment:
Q  314 tggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttt 392  Q
    |||||||||| ||||||  |||| ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||    
T  2328420 tggatatttgcattaaagttgttagtaatcactattgattttacaattttatcctttaagagagagttaatttatgttt 2328498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 298
Target Start/End: Original strand, 21069637 - 21069679
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataa 298  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21069637 tactacctctgtccctaattataagacccttttgaaaaaataa 21069679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 339 - 424
Target Start/End: Original strand, 1303400 - 1303484
Alignment:
Q  339 taattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaa 424  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||  |  |||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  1303400 taattactattatttttacaattttatcctt-aagagagagttagtttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaagaaaa 1303484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10561327 - 10561254
Alignment:
Q  292 aaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||| |||||||||||| | | | ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10561327 aaaaaaacggaaattaagaaaattgatatttctaataaatttgtttgtaattattattgtttttataattttat 10561254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 518 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 14435866 - 14435830
Alignment:
Q  518 cttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14435866 cttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 14435830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 386 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 30117281 - 30117233
Alignment:
Q  386 tatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataa 434  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30117281 tatgttttcaacatagtatttaatgttgatcgaagaaaaagatatataa 30117233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 7408926 - 7408871
Alignment:
Q  324 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaa 379  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||||    
T  7408926 tattaaatttgtttgtaattactattgtttatacaattttatcttttaagtgagaa 7408871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 519 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 8144494 - 8144459
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8144494 ttcaaaagagccttataattagggacggaggtagta 8144459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 425
Target Start/End: Original strand, 8356362 - 8356449
Alignment:
Q  339 taattagtattgtttttacaattttatgctttaa-gagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||| || || |||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  8356362 taattactgttgtttttacaattttatacttaaaagatagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaaaaaaa 8356449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 40738435 - 40738404
Alignment:
Q  529 tcttataattagggacggaggtagtagttgat 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40738435 tcttataattagggacggaggtagtagttgat 40738404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12098798 - 12098737
Alignment:
Q  316 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga 378  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12098798 gatatttgtattaaagttgtttgta-tcacaattgtttttacaattttatcctttaagagaga 12098737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16099448 - 16099406
Alignment:
Q  335 tttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagag 377  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16099448 tttgtaattgttattgtttttacaattttatcctttaagagag 16099406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 20187249 - 20187207
Alignment:
Q  383 atttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  20187249 atttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaa 20187207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 520 - 554
Target Start/End: Original strand, 23260141 - 23260175
Alignment:
Q  520 tcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23260141 tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 23260175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 519 - 557
Target Start/End: Original strand, 34332481 - 34332519
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34332481 ttcaaaatggtcttataattagggacggaggtagtagtt 34332519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4976334 - 4976289
Alignment:
Q  249 tatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaa 294  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4976334 tatttagtactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaa 4976289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 11780853 - 11780762
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagt 556  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||           ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11780853 taattaatgtagttgaaaatagaaaaggg-tcttataaaaagggacaaaaaaattc---tcaaaagggtcttataactagggacggaggtagtagt 11780762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 365
Target Start/End: Original strand, 11937201 - 11937266
Alignment:
Q  300 ggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||||| | ||| |||| |  |||||||||||||||||||    
T  11937201 ggaaattaagaaagttgatatttgtattaaatttatttataatcacaattgtttttacaattttat 11937266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 298
Target Start/End: Original strand, 24857553 - 24857598
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataa 298  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24857553 taatactacctccgtccctaattataagactcttttgaaaaaataa 24857598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 502
Target Start/End: Original strand, 26076335 - 26076375
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26076335 taattaatttagttggaaatagcaaagggg-cttataaaaag 26076375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 365
Target Start/End: Original strand, 37331007 - 37331056
Alignment:
Q  316 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  37331007 gatatttgtcttaaatttgtttgtaattactgatgtttttacaattttat 37331056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 39181957 - 39181908
Alignment:
Q  316 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  39181957 gatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttat 39181908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 255 - 295
Target Start/End: Original strand, 7940451 - 7940491
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaa 295  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7940451 atactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaa 7940491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 501
Target Start/End: Original strand, 8145088 - 8145128
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  8145088 taattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaa 8145128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 327 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10116809 - 10116761
Alignment:
Q  327 taaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagag 375  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10116809 taaatttgtttgtaataactattgtttttacaattttatcatttaagag 10116761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 13236033 - 13235989
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  13236033 taattaatgtacttagaaacatcaaaggggtcttataaaaaggga 13235989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 384 - 440
Target Start/End: Original strand, 21252222 - 21252278
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaata 440  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| ||||    
T  21252222 tttatgttttcaacataatatttattgttaattgaagaaaaaaatataaaataaata 21252278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 522 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 39121461 - 39121429
Alignment:
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39121461 aaaagagccttataattagggacggaggtagta 39121429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 108)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 255 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 31091742 - 31091442
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31091742 atactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 31091643  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||     
T  31091642 tacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtatgta 31091543  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31091542 aaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaagggacaatttttttt--ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 31091445  T
Q  555 gtt 557  Q
    |||    
T  31091444 gtt 31091442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 402362 - 402658
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  402362 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 402461  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||      
T  402462 acagttttatcctttaagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 402561  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  402562 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 402658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 249 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 15498932 - 15498629
Alignment:
Q  249 tatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtat 348  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15498932 tatttaatactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtat 15498833  T
Q  349 tgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatg 448  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  15498832 tgtttttacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatg 15498733  T
Q  449 tatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggag 548  Q
    |||||       |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15498732 tatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgaatcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggag 15498635  T
Q  549 gtagta 554  Q
    ||||||    
T  15498634 gtagta 15498629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 8670432 - 8670182
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8670432 atactacctccgtccctaattatagtacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 8670333  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||     
T  8670332 tacaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgta 8670233  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
          ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8670232 aagaaataattaatgcagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 8670182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 254 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 13866893 - 13866593
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13866893 aatactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 13866794  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||    
T  13866793 ttacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacttgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgt 13866694  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||          | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13866693 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaagggacaattttttttcttccaaaagggtcttataattagggacggaggtagt 13866594  T
Q  554 a 554  Q
    |    
T  13866593 a 13866593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 1729852 - 1730092
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaa-aataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 364  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1729852 gtccctaattatagggcccttttgaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 1729951  T
Q  365 tgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||       ||||    
T  1729952 tcctttaagagagagatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataat 1730051  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1730052 taatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggga 1730092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 255 - 554
Target Start/End: Original strand, 31149986 - 31150283
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31149986 atactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtttatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 31150085  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||     
T  31150086 tacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 31150185  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31150186 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaattttttt--ttcaaaagggtcttataaatagggacggaggtagta 31150283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 266 - 554
Target Start/End: Original strand, 16272717 - 16273005
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16272717 gtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttttacaattttat 16272816  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     |||||| | |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||       |||||    
T  16272817 cctttaacaaagagttgatttttgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataatt 16272916  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||         ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16272917 gatgtagttggaaatagcaaaggggtcttttaaaaagggacaaaaattttttcttcaaaagggtcttataattagggacggaggaagta 16273005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 34915282 - 34915580
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34915282 tactaccttcgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattgagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 34915381  T
Q  356 acaattttatgcttta--agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||    
T  34915382 acaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgt 34915481  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34915482 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggacttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagt 34915579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 269 - 505
Target Start/End: Original strand, 925687 - 925923
Alignment:
Q  269 cctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgct 368  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  925687 cctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 925786  T
Q  369 ttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaat 468  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||       ||||||||    
T  925787 ttaagagagaattgttttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaat 925886  T
Q  469 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  925887 gtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaaggga 925923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 251 - 505
Target Start/End: Original strand, 1147003 - 1147257
Alignment:
Q  251 tttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 350  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1147003 tttaatactccctctgtccttaattataggacccttttgaaaaaacaacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattg 1147102  T
Q  351 tttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| |    
T  1147103 tttttacaattttatcctttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgca 1147202  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||       |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1147203 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaggga 1147257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 13647878 - 13648119
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13647878 gtcccttattataagacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 13647977  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  13647978 cctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatttataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 13648077  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  13648078 ttaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaaggga 13648119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 256 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 20373331 - 20373139
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20373331 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 20373232  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatg 448  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  20373231 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatg 20373139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 266 - 501
Target Start/End: Original strand, 19097552 - 19097787
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19097552 gtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaattttat 19097651  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| || |       |||||    
T  19097652 cctttaagagagaattggtttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatataaagaaataatt 19097751  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19097752 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 19097787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 254 - 505
Target Start/End: Original strand, 20449918 - 20450171
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20449918 aatactacctccgtccctaattaaaggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 20450017  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    | |||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||    
T  20450018 tgacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtat 20450117  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20450118 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 20450171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 249 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 12144082 - 12143826
Alignment:
Q  249 tatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtat 348  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  12144082 tatttaatactccctccgtccctaattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattgctat 12143983  T
Q  349 tgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatg 448  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||    
T  12143982 tgtttttacaattttatcctttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattaaagaaaattatgtataataaataggggcatg 12143883  T
Q  449 tatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
     ||||       |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12143882 catgtaaagaaataattaatatagttgaaaatagcaaaggggttttataaaaaggga 12143826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 266 - 502
Target Start/End: Original strand, 31711599 - 31711835
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||| | | | ||||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31711599 gtccctaattacagggctcttttaaaaaaataacaggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatatttgtaattagtattgtatttacaattttat 31711698  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||       |||||    
T  31711699 tctttaagagagagatgatttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatatataattaataggggcatgtatgtaaagaaataatt 31711798  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31711799 aatatagttggaaatagcaaagggatcttataaaaag 31711835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 25045382 - 25045680
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25045382 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 25045481  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||  ||||   ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  25045482 acaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattatatctattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 25045581  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25045582 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagt 25045679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 283 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 390592 - 390370
Alignment:
Q  283 ccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatg 382  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  390592 ccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat-ttttaagagagagatg 390494  T
Q  383 atttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaag-aaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaata 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||  |||||||||||       |||||||| ||||||||||||    
T  390493 atttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaaatgtataattaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaata 390394  T
Q  482 gcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||  ||||||||||||||||    
T  390393 gcaaagatgtcttataaaaaggga 390370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 7772474 - 7772176
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  7772474 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgtgaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 7772375  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  7772374 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 7772275  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7772274 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaatggacaaaaaaaattc--tcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 7772177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 11847859 - 11847618
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11847859 gtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 11847760  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |  ||||||||       |||    
T  11847759 cctttaagagagagaggtggtttatgttttcaatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataa 11847660  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11847659 ttaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 11847618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 256 - 501
Target Start/End: Original strand, 31487110 - 31487357
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31487110 tactacctccgtccctaattatagggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 31487209  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    ||||||| || |||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  31487210 acaatttaatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 31487309  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
           |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31487310 aaagaaataattaatgtagttggaaattgcaaaggggtcttataaaaa 31487357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 34126427 - 34126188
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34126427 gtccttaaatataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 34126328  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
      |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||| || ||| ||||       |||||    
T  34126327 cttttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggtatgcatgtaaagaaataatt 34126228  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  34126227 aatgtagttggaaatagcaaatgagccttataaaaaggga 34126188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 254 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 2090959 - 2090658
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2090959 aatactacctacgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 2090860  T
Q  354 ttacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| || ||||||    
T  2090859 ttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtat 2090760  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggta 551  Q
    ||       |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||         | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2090759 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttgtaaaaagggacaaaaaaaaattc-tcaaaagggtcttataattagggacggaggta 2090661  T
Q  552 gta 554  Q
    |||    
T  2090660 gta 2090658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 256 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 9342136 - 9341889
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9342136 tactacctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 9342037  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaa--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||| ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  9342036 acaattttatcctttaagaaagaaggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 9341937  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
           |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9341936 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 9341889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 252 - 502
Target Start/End: Original strand, 15355291 - 15355541
Alignment:
Q  252 ttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgt 351  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  15355291 ttaatactacctccgtccctaattatagggcc-ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattaccattgt 15355389  T
Q  352 ttttacaattttatgcttta--agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgt 449  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||| ||||  |||||||    
T  15355390 ttttacaattttatcctttaagagagagaattaaattatgttttcaacatgttatttattgttcattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgt 15355489  T
Q  450 atgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    ||||       ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15355490 atgt-aaagaataattaatgtagttgaaaatagcaatggggtcttataaaaag 15355541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 23604760 - 23604460
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||| |  |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23604760 tactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataatgagaattaagatagtgaatatttgtattagatatgtttgtaattactattgttttt 23604661  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||| ||||  ||||| |||||    
T  23604660 acaattttatcttttaagagagagagttggattatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtgtaataaataagggcatatatgt 23604561  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23604560 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagagacaaaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggaggtagt 23604461  T
Q  554 a 554  Q
    |    
T  23604460 a 23604460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 34301581 - 34301822
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| || |||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34301581 gtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 34301680  T
Q  366 gctttaagagagaa--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  34301681 cctttaagaaagaaggttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 34301780  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34301781 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 34301822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 254 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 16122553 - 16122302
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16122553 aatactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaa-taacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttttaattactattgttt 16122455  T
Q  354 ttacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||| |||||||    
T  16122454 ttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagagacatgtat 16122355  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggg 504  Q
    ||       |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  16122354 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaaggg 16122302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 285 - 503
Target Start/End: Original strand, 23578194 - 23578414
Alignment:
Q  285 ttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tg 382  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||    
T  23578194 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagagttg 23578293  T
Q  383 atttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 482  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||       |||||||| |||||| |||||     
T  23578294 gtttatgttttcaacatgttatttatttttgattaaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatatagttgaaaataa 23578393  T
Q  483 caaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    |||| |  |||||||||||||    
T  23578394 caaatgaatcttataaaaagg 23578414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 19418863 - 19419114
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19418863 tactacatctgtccctaattataagacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 19418962  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||| | || || ||| ||||| | |||||||||    
T  19418963 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaaaaagagatgtacaataaatagggacatgtatgt 19419062  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  19419063 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaaggga 19419114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 270 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 33773863 - 33773628
Alignment:
Q  270 ctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctt 369  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  33773863 ctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgtttttacaattttatcatt 33773764  T
Q  370 taagagagaaa----tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
    ||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||| || |||||| ||||| |  ||||||||       |||||    
T  33773763 taagagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttgttgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtagagaaataatt 33773664  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  33773663 aatgtagttggaaatagcaaaatggtattataaaaa 33773628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 271 - 505
Target Start/End: Original strand, 17227282 - 17227518
Alignment:
Q  271 taattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttt 370  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  17227282 taattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattgaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 17227381  T
Q  371 aagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaat 468  Q
    |||| |||    ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||    
T  17227382 aagaaagatggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 17227481  T
Q  469 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  17227482 gtagttagaaatagaaaataggtcttataaaaaggga 17227518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 266 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 25197440 - 25197196
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25197440 gtccctatatataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 25197341  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| || ||||||||       |||    
T  25197340 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttaattattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataa 25197241  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  25197240 ttaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaagggataa 25197196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 266 - 501
Target Start/End: Original strand, 15966910 - 15967148
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacg-gaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 364  Q
    ||||||||||||| |   ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15966910 gtccctaattataagtttcttttgaaaaaataacgagaatttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 15967009  T
Q  365 tgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnnta 462  Q
    | |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||       ||    
T  15967010 tcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaata 15967109  T
Q  463 attaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15967110 attaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 15967148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Original strand, 10195752 - 10195984
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10195752 tataagacccttttgtcaaaatcacgagaattaacatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 10195851  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||       ||||||||||||    
T  10195852 aagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaaaatatataataaataatggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 10195951  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10195952 ttggaaataacaaaggggtcttataaagaggga 10195984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 30248926 - 30248694
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30248926 tataagacccttttgccaaaatcccgggaattaaaatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 30248827  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||       ||||||||||||    
T  30248826 aagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggtgcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 30248727  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  30248726 ttggaaataacaaatgggtcttataaaaaggga 30248694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 266 - 503
Target Start/End: Original strand, 25024255 - 25024494
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  25024255 gtccctatatataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacatttttat 25024354  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  25024355 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 25024454  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  25024455 ttaatgtagttggaaataacaaaaggatcttataaaaagg 25024494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 6147671 - 6147430
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| |||| |||||  ||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  6147671 gtccctatatataagaccattttgccaaaatcaagggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 6147572  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  6147571 cctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 6147472  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6147471 ttaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 6147430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 255 - 502
Target Start/End: Original strand, 13010858 - 13011107
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  13010858 atactacctccgtccctaattacaaagcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatgactattgtttt 13010957  T
Q  355 tacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||   ||| |||||||||||||||  ||||||||| | || ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  13010958 tacaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgcttattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 13011057  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |       ||||||| |||||||||||||| ||| | || ||||||||||    
T  13011058 taaagaaataattaacgtagttggaaatagaaaatgagttttataaaaag 13011107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 266 - 556
Target Start/End: Original strand, 23397889 - 23398178
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  ||||| |||| |||||| | | || ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23397889 gtccctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaaatgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 23397988  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||       ||||    
T  23397989 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataat 23398088  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagt 556  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23398089 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggataa--aaaaaatcctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtagt 23398178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 266 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 33488119 - 33487881
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| |||| |||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33488119 gtccctatatataagacctttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 33488020  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||       |||    
T  33488019 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataa 33487920  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33487919 ttaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaag 33487881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 287163 - 287404
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  287163 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaatatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 287262  T
Q  366 gctttaagagagaa--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  287263 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 287362  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
     | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  287363 ctgatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaaggga 287404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Original strand, 12105822 - 12106054
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||| ||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  12105822 tataagactcttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttattctttaaga 12105921  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||       |||||||| |||    
T  12105922 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtatgtaaagaaataattaatttag 12106021  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12106022 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 12106054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 303 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 5457663 - 5457461
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatg 400  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||    
T  5457663 aattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatg 5457564  T
Q  401 ttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 500  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||  |||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5457563 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaaacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaa 5457464  T
Q  501 agg 503  Q
    |||    
T  5457463 agg 5457461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 266 - 503
Target Start/End: Original strand, 17175214 - 17175453
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17175214 gtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 17175313  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
      ||||||| |||||  || |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |       |||    
T  17175314 cttttaagaaagaaagttggtttatgttttgaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatataaagaaataa 17175413  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  17175414 ttaatgttgttggaaataacaaatggatcttataaaaagg 17175453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 34741753 - 34741513
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||  ||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  34741753 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtcaatatttgtattaaagttgtttttaatcactattgtttttacaattttat 34741654  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||       ||||    
T  34741653 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtaggtaaagaaataat 34741554  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  34741553 taatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaaggga 34741513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 345 - 501
Target Start/End: Original strand, 9660505 - 9660663
Alignment:
Q  345 gtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaataga 442  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||     
T  9660505 gtattgtttttacaattttatcctttaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaaaatgtataataaatagg 9660604  T
Q  443 ggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  9660605 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaa 9660663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 266 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 8743474 - 8743186
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||   ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  8743474 gtccctaattataagacccttttactaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 8743375  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||  | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  8743374 ccttaagagagagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 8743275  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagt 556  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8743274 taatgtacttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaattc---tcaaaagggtcttataattagggacggagggagtagt 8743186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 1779794 - 1780034
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| || |||||||  ||||| |||| |||||| | | |||||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||||||| ||||    
T  1779794 gtccctaattataagatccttttgctaaaattacgggaattaagaaaatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaatattat 1779893  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||  |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  1779894 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 1779993  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1779994 taatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaaggga 1780034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 9388539 - 9388781
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |  ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9388539 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 9388638  T
Q  366 gcttta---agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnnta 462  Q
     ||| |   |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||       ||    
T  9388639 ccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaata 9388738  T
Q  463 attaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9388739 attaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 9388781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 266 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 15287425 - 15287190
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  15287425 gtccctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatctctattgtttttacaattttat 15287326  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | | |||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||       ||||    
T  15287325 ccttaatatagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatatataataaatag-gacatgtatgtaaagaaataat 15287227  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  15287226 taatgtagttggaaataacaaatggatcttataaaaa 15287190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 317 - 501
Target Start/End: Original strand, 5576180 - 5576362
Alignment:
Q  317 atatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatc 416  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5576180 atatttgtattgaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagtgagagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgatt 5576279  T
Q  417 gaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||       ||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||    
T  5576280 gaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaatagcaa--gagtcttataaaaa 5576362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Original strand, 13690470 - 13690722
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |   ||||| |||||||||  | |||||| ||| || |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13690470 atactaccttcgtccctaattataaggttcttttaaaaaaataagaggaattaagataatgaatatttatattaaatgtgtttgtaattactattgtttt 13690569  T
Q  355 tacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    |||||||||||  ||||||  ||||   ||  ||||||||||| |||  ||||||||| ||||  |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  13690570 tacaattttatcttttaagaaagagggttggcttatgttttcatcattatatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 13690669  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       |||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||    
T  13690670 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaataagtcttataaaaaggga 13690722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 280 - 505
Target Start/End: Original strand, 230870 - 231096
Alignment:
Q  280 gacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaa 379  Q
    ||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| | ||    
T  230870 gacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaataa 230969  T
Q  380 a--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttgga 477  Q
       |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||  |||||||| ||       ||||||||||||||| |    
T  230970 ggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgactgaagaaaaagatgtataataaatacgggcatgtaggtaaagaaataattaatgtagttgaa 231069  T
Q  478 aatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  231070 aataacaaa-tggtcttataaaaaggga 231096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 255 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 8175954 - 8175712
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    ||||||||| |||||||   |||| ||||| ||||  |||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||    
T  8175954 atactacctctgtccctttatataagacccctttgctaaaattgcgggaattaaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt 8175855  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |  |  ||||||||||| | ||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  8175854 tacaattttatccttcaagagagagagttagtttatgttttccatatactatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatg 8175755  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |        | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8175754 taa------agttaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 8175712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 266 - 344
Target Start/End: Original strand, 9660143 - 9660221
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatta 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9660143 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatta 9660221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 266 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 345155 - 344908
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatta----gtattgtttttacaatt 361  Q
    ||||||||||||| || |||||||  ||||| || | |||||| | ||  ||||||| |||||||  |||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  345155 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacaggaattaagaaagcagatatttatattaaagttgtttgtaatcactacgtattgtttttacaatt 345056  T
Q  362 ttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnn 460  Q
    |||| ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||           
T  345055 ttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaa 344956  T
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  344955 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggataa 344908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 256 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 32615284 - 32615032
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| | | | |||| |  |||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  32615284 tactacctccgtctctaattatatgactcttttgtcaaaatcacggaaattaagaaaattgataataatattaaatttgtttataattactattgttttt 32615185  T
Q  356 acaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    |||||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||| || |||  |||     
T  32615184 acaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataggggtatggttgta 32615086  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
          ||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  32615085 aagaaataattaatgtaattggaaataacaaacgggacttataaaaagggataa 32615032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 282 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 15126734 - 15126511
Alignment:
Q  282 cccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaat 381  Q
    ||||||||  ||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||| || |||| |||||||| |    
T  15126734 cccttttgtcaaaattacgggaattaagaaagtg-atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatttcatccttt-agagagaatt 15126637  T
Q  382 gatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaag--aaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaa 479  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||  ||||| || |||||| ||||| |||||| ||||       |||||||| |||||| |||    
T  15126636 ggtttatgttttcaacatgctatttattgctgattgtagaaaaaaaaatctataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatatagttgaaaa 15126537  T
Q  480 tagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  15126536 tagcaaagaagtcttatcaaaaggga 15126511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 344 - 505
Target Start/End: Original strand, 11656172 - 11656336
Alignment:
Q  344 agtattgtttttacaattttatgctt-taagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaata 440  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |  || ||||||||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||| || |||||| ||||    
T  11656172 agtattgtttttacaattttatccttatgagagagagagttggtttatgttttccatatgctatttattgtttattgaagaaaaagatgtataataaata 11656271  T
Q  441 gaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
     | ||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11656272 aaagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 11656336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 256 - 502
Target Start/End: Original strand, 18105911 - 18106158
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||| |||||| |||||||  |||||||||| | | ||||||||    
T  18105911 tactacctttgtccctatatataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagtgaatatttatattaaaattgtttgtaatcactgttgttttt 18106010  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| | ||||||||||||  |  || || ||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||  ||||| | | || ||||    
T  18106011 acaattttat-ccttaagagagaaagttagttcatattttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatagggacgtgcatgt 18106109  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
           ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18106110 aaagaaataattaatgtacttggaaataacaaaagggtcttataaaaag 18106158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 6418158 - 6417924
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  ||||| |||| |||||| | |  ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  6418158 gtccctaattataagacctttttgttaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattggttttacaattttat 6418059  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||  | ||| || |||||| |||| ||||||||| || ||| || ||||||||||||||          ||||    
T  6418058 ccttaagagagagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatagaggcatgta----aagaaataat 6417963  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6417962 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 6417924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 257 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 11104850 - 11104699
Alignment:
Q  257 actacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgt---attaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    |||||||  ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11104850 actacctccgtccctaattatagggtcatttt-aaaaaataacggaaattaagatagtagatatttgttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 11104752  T
Q  354 ttacaattttatgctttaaga--gagaaatgatttatgttttcaacatgttat 404  Q
    ||||||||||||  |||||||  ||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  11104751 ttacaattttatcatttaagagagagaattggtttatgttttaaacatgttat 11104699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 284 - 415
Target Start/End: Original strand, 2746311 - 2746444
Alignment:
Q  284 cttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga-aatg 382  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||     
T  2746311 cttttgaaaaaataatggaaattaaaaaaattgatagttgtaataaatttgtttgtaattattattgtttttacaaatttatcctttaagagagagaatt 2746410  T
Q  383 at-ttatgttttcaacatgttatttattgttgat 415  Q
    |  |||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  2746411 agcttatgttttcaacatagtatttaatgttgat 2746444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 3177473 - 3177232
Alignment:
Q  259 tacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 358  Q
    ||||| ||||||||  ||||  || ||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||| ||||||  |||||||||  | |||| ||||||||    
T  3177473 tacctctgtccctatatataaaactcttttgctaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgcattaaagttgtttgtaaccactattttttttaca 3177374  T
Q  359 attttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnn 458  Q
    ||||||| | ||||||||||  |  || || ||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||| ||         
T  3177373 attttat-ccttaagagagagttagttcatattttccatatgatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtacgtaaaga 3177275  T
Q  459 nntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
      ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  3177274 aataattaatgtaattgaaaatagcaaagggatcttataaaaa 3177232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 303 - 505
Target Start/End: Original strand, 345533 - 345736
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgt 401  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  |  ||||||||||| | |||     
T  345533 aattaaaaaattcgatatttatattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgc 345632  T
Q  402 tatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    ||||||||| || | ||||||| | || |||||| |||||  ||||||||||       || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  345633 tatttattgctggttgaagaaagagatgtataataaataggcgcatgtatgtaaagaaatagttaatgtagttggaaatagcaaagaagtcttataagaa 345732  T
Q  502 ggga 505  Q
    ||||    
T  345733 ggga 345736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 317 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 235993 - 235825
Alignment:
Q  317 atatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatga-tttatgttttcaacatgttatttattgttgat 415  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||||||||||||| |  ||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  235993 atatttgtattaaaattgttcgtaatcactattgtttttacaattttgtcatttaagagaaatattagtttatgttttcaacatgttatttattgttgat 235894  T
Q  416 cgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaa 486  Q
     |  |||||| || |||||| ||||| || ||||| ||       ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  235893 tg--gaaaaaaatgtataataaataggggtatgtaggtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaa 235825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 333 - 497
Target Start/End: Original strand, 9299246 - 9299411
Alignment:
Q  333 tgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatat 430  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |  |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  9299246 tgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaacagagatagtttgtttatgttttaaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgt 9299345  T
Q  431 ataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata 497  Q
    ||||| ||||  || |||  ||        |||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  9299346 ataataaataagggtatgc-tggaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatggatcttata 9299411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 324 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 4823198 - 4823098
Alignment:
Q  324 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaa 423  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  4823198 tattaaatttgtatgtaattactattgtttttataattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaa 4823100  T
Q  424 aa 425  Q
    ||    
T  4823099 aa 4823098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 325 - 453
Target Start/End: Original strand, 17952167 - 17952297
Alignment:
Q  325 attaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaa 422  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||  ||||   ||  ||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||    
T  17952167 attaaatatgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacaatctatttattgctgattgaagaa 17952266  T
Q  423 aaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    ||| || |||||| ||||| | |||||||||    
T  17952267 aaaaatgtataataaatagggacatgtatgt 17952297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 266 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 29036362 - 29036263
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| || |||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  29036362 gtccctatatataagatccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 29036263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 425
Target Start/End: Original strand, 8217461 - 8217629
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  8217461 tactacctccgtccctaaatatatgaaccttttgccaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgttttt 8217560  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||||||| | ||||||||||  | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  8217561 acaattttat-ccttaagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa 8217629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11162121 - 11161978
Alignment:
Q  285 ttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta---agagagaaat 381  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| | ||| | |  | ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |   |||||||  |    
T  11162121 ttttgcaaaaattacggaaattaagaaagttggttgtagtattaaatttctatgtaattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagtt 11162022  T
Q  382 gatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  11162021 aatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaa 11161978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 431
Target Start/End: Original strand, 6840082 - 6840186
Alignment:
Q  327 taaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaat 426  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||   | || |||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||     
T  6840082 taaatttgtttgtaattgctattgtttttacaattttatcctataagagagtgttaatgtatgttttcaacatattatttaatgctgattgaagaaaaag 6840181  T
Q  427 atata 431  Q
    |||||    
T  6840182 atata 6840186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 554
Target Start/End: Original strand, 22998852 - 22999082
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  22998852 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 22998951  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttc 521  Q
    |||| ||  | ||| ||||  || ||||  ||       ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||          |||    
T  22998952 aaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaaattatttt--ttc 22999049  T
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22999050 aaaagggtcttataactagggacggaggtagta 22999082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 23789552 - 23789322
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  23789552 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 23789453  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttc 521  Q
    |||| ||  | ||| ||||  || ||||  ||       ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||          |||    
T  23789452 aaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaaattatttt--ttc 23789355  T
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  23789354 aaaagggtcttataactagggacggaggtagta 23789322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 425
Target Start/End: Original strand, 33012473 - 33012575
Alignment:
Q  324 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  33012473 tattaaatttgtttataattaatattgtttttacaattttgt-ctttaaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 33012571  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  33012572 aaaa 33012575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Original strand, 22852090 - 22852321
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-ag 373  Q
    |||| ||||||||||  ||||| | ||  ||||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  22852090 tataagacccttttgctaaaattatgggtattaagaaagtggatatttgtttaaaat-tgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagag 22852188  T
Q  374 agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaata-tatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
    |||||  |  ||||| ||||  | ||  ||||||||| |||| ||| ||||| | | |||||  ||||| | |||||||||       ||||||||||||    
T  22852189 agagagttagtttatatttttcatatactatttattgctgattgaaaaaaaaaaatgtataacaaatagggacatgtatgtaaataaataattaatgtag 22852288  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22852289 ttggaaatagcaaagagatcttataaaaaggga 22852321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 334
Target Start/End: Original strand, 17950506 - 17950560
Alignment:
Q  280 gacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatg 334  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17950506 gacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatg 17950560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 505
Target Start/End: Original strand, 6418476 - 6418642
Alignment:
Q  340 aattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaa 438  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||    
T  6418476 aattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaa 6418575  T
Q  439 tagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||  || ||||  ||       ||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6418576 taagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaagaggtcttataaaaaggga 6418642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27581616 - 27581513
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||| ||| | |||||||  | ||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  27581616 gtattaaatttgtatataattactgttgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaaga 27581517  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  27581516 aaaa 27581513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 339 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 14630115 - 14630030
Alignment:
Q  339 taattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||    
T  14630115 taattattattatttttacaattttatcctt-aagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaagaaaaa 14630030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 339 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 22710478 - 22710393
Alignment:
Q  339 taattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  22710478 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa 22710393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27310662 - 27310561
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaa 422  Q
    ||||||||| ||| | |||||| | ||||||||| |||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||    
T  27310662 gtattaaatttgtatataattactgttgtttttataattttatcctt-aagagagatttaatttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaagaa 27310564  T
Q  423 aaa 425  Q
    |||    
T  27310563 aaa 27310561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 4175455 - 4175289
Alignment:
Q  340 aattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaa 438  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||| | |||||||  | | |||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||    
T  4175455 aattactattatttttacaattttatccttaagagagagagttaacttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaa 4175356  T
Q  439 tagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||  || ||||  ||       ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4175355 taagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtatttggaaatatcaaagaggtcttataaaaaggga 4175289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 426
Target Start/End: Original strand, 28236010 - 28236114
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||||||   |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |    
T  28236010 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagaaagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaca 28236109  T
Q  422 aaaat 426  Q
    |||||    
T  28236110 aaaat 28236114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11200808 - 11200721
Alignment:
Q  339 taattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||| ||| | |||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  11200808 taattactattgattttacaattgtatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaa 11200721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 9038733 - 9038642
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9038733 taattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaaatgatttt--ttcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 9038642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 430 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 11104694 - 11104619
Alignment:
Q  430 tataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||| ||||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  11104694 tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtattataaaaaggga 11104619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 554
Target Start/End: Original strand, 13321272 - 13321363
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13321272 taattaatgtacttggaaacacgaaaggggtcttataaaaagggacaaattatttt--ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 13321363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 384 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11840538 - 11840497
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11840538 tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagtaaaa 11840497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13321366 - 13321321
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataa 298  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13321366 taatactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataa 13321321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 419 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 29036258 - 29036172
Alignment:
Q  419 agaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||| || |||||| ||||  |||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  29036258 agaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaagtcttataaaaaggga 29036172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 383 - 501
Target Start/End: Original strand, 29293667 - 29293785
Alignment:
Q  383 atttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 482  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||| || || ||| ||||  || ||||  ||       ||||||||||| |||||||||     
T  29293667 atttatgttttcaacataatatttattgttgattgatgaaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacttggaaatac 29293766  T
Q  483 caaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  29293767 caaaagggtcttataaaaa 29293785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Original strand, 493510 - 493594
Alignment:
Q  346 tattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatata 429  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  493510 tattgattttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttaatgttgattgaagaaaaatata 493594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 9038854 - 9038766
Alignment:
Q  339 taattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaat 426  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||    |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  9038854 taattactattgtttttataattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaat 9038766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 13901847 - 13901641
Alignment:
Q  346 tattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagag 443  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| | |  |  ||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||| ||||  |    
T  13901847 tattgtttttacatttttatcctttaagagaaagagttagtttatgttttcgaaatgatatttcttgttgattgaagaaaaatatgtaaaataaatatgg 13901748  T
Q  444 gcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattaggga 543  Q
    | ||||  ||       |||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| || |            ||||||| ||||||||||||||||    
T  13901747 gtatgttggtaaagaaataattaatataattggaaataccaaaggggtcttgtaaaaagagacacaaaattc----tcaaaagggtcttataattaggga 13901652  T
Q  544 cggaggtagta 554  Q
    |||||||||||    
T  13901651 cggaggtagta 13901641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 519 - 554
Target Start/End: Original strand, 16122516 - 16122551
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16122516 ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 16122551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17992287 - 17992165
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| | ||| |||  | ||||||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  17992287 atactacctccgtcactaaatatatgagccttttgctaaaattgcggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttt 17992188  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagaga 378  Q
    ||||||||||| | ||||||||||    
T  17992187 tacaattttattc-ttaagagaga 17992165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 505
Target Start/End: Original strand, 28980662 - 28980846
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta---agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaa 419  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| |   |||||||    |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||    
T  28980662 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttgagagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaa 28980761  T
Q  420 gaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||| ||  | ||| ||||   | ||||  ||       |||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28980762 gaaaaa-atgcaaaataaataagagtatgttggtaaagaaataattaatttacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaaggga 28980846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 519 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 34915317 - 34915279
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34915317 ttcaaaagggtcttataattagggacgaaggtagtagtt 34915279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 521 - 554
Target Start/End: Original strand, 15355558 - 15355591
Alignment:
Q  521 caaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15355558 caaaagagtcttataattaaggacggaggtagta 15355591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 17545422 - 17545389
Alignment:
Q  388 tgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17545422 tgttttcaacatgttatttattgttgattgaaga 17545389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 22710357 - 22710267
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||          |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22710357 taattaatgtacttgaaaataccaaaagggtcttataaaaagggacaaattatttt--ttcaaaagtgtcttataattagagacggaggtagt 22710267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22999089 - 22999040
Alignment:
Q  249 tatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataa 298  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22999089 tattttatactacctccgtccctagttataagacccttttgaaaaaataa 22999040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 298
Target Start/End: Original strand, 23789315 - 23789364
Alignment:
Q  249 tatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataa 298  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23789315 tattttatactacctccgtccctagttataagacccttttgaaaaaataa 23789364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 388 - 428
Target Start/End: Original strand, 8637148 - 8637188
Alignment:
Q  388 tgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatat 428  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  8637148 tgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaatat 8637188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 181)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 255 - 554
Target Start/End: Original strand, 18111715 - 18112012
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18111715 atactacctctgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 18111814  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||     
T  18111815 tacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgta 18111914  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||         |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18111915 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttttc--caaaagggtcttataattagggacggaggtagta 18112012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 255 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 23487361 - 23487064
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23487361 atactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 23487262  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||     
T  23487261 tacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgta 23487162  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23487161 aaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttt--ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 23487064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 23687905 - 23688202
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23687905 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgttttt 23688004  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||      
T  23688005 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 23688104  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23688105 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttt-ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 23688202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 256 - 556
Target Start/End: Original strand, 32522584 - 32522882
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32522584 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 32522683  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||      
T  32522684 acaattttatcctttaagagagagttggcttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 32522783  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtag 555  Q
         ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32522784 agaaataattaatgtaattggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttt--ttcaaaagggtcttataattagcgacggaggtagtag 32522881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 266 - 501
Target Start/End: Original strand, 9035290 - 9035525
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9035290 gtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 9035389  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||       |||||    
T  9035390 cctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataatt 9035489  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9035490 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 9035525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 253 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 26016868 - 26016569
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26016868 taatactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 26016769  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| |||    
T  26016768 tttacaattttatcctttaagagagaattgatttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatg 26016669  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtag 552  Q
    |       ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  26016668 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagcggtcttataaaaagggacaaattttttt--ttcaaaagggtcttataattagggacggagggag 26016571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 253 - 505
Target Start/End: Original strand, 2944010 - 2944262
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2944010 taatactccctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 2944109  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  2944110 tttacaattttatcctttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatatataataaataggggcatgcatg 2944209  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2944210 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 2944262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 250 - 505
Target Start/End: Original strand, 33865277 - 33865531
Alignment:
Q  250 atttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtatt 349  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33865277 attttatactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaa-ataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtatt 33865375  T
Q  350 gtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgt 449  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  33865376 gtttttacagttttatcctttaagagatagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgt 33865475  T
Q  450 atgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||       |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33865476 atgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaaggga 33865531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 256 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 25058338 - 25058093
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25058338 tactatctctgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 25058239  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||| |||||||||||||||||      
T  25058238 acaattttatcctttaagagatagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattaaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaa 25058139  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
         ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25058138 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggttttataaaaa 25058093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Original strand, 5783885 - 5784138
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5783885 atactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 5783984  T
Q  355 tacaattttatgcttt---aagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    ||||||||||| ||||    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||  |||||||||    
T  5783985 tacaattttatccttttaagagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtat 5784084  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||       |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5784085 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggatcttataaaaaggga 5784138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 283 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 33980732 - 33980465
Alignment:
Q  283 ccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatg 382  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  33980732 ccttttgaaaaaa-aacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtctgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagagatg 33980634  T
Q  383 atttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 482  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||  |||||||||||       ||||||||||||||| ||||||    
T  33980633 gtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatag 33980534  T
Q  483 caaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||           |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33980533 caaatgagtcttataaaaagggacaaaaaatttc---tcaaaaaagtcttataattagggacggaggtagta 33980465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 253 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 39406860 - 39406606
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39406860 taatactacctccgtccctaattatagaacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 39406761  T
Q  353 tttacaattttatgctttaaga--gagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||| || |||||||||||||||| || ||||||| ||||  |||||||| || |||||| ||||| |||||| |    
T  39406760 tttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatattttttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgca 39406661  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||       |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39406660 tgtaaagaaataattaatgtagctggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 39406606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 255 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 5162603 - 5162302
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5162603 atactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 5162504  T
Q  355 tacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  5162503 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 5162404  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtag 552  Q
    |       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5162403 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggtag 5162306  T
Q  553 tagt 556  Q
    ||||    
T  5162305 tagt 5162302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 32474982 - 32475217
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||||| || |||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32474982 gtccctaattctaggacctttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 32475081  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||          |||||    
T  32475082 cctttaagagagaattgatttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgta----aagaaataatt 32475177  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32475178 aatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaaggga 32475217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Original strand, 44580615 - 44580869
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  44580615 atactacctccgtccctaattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttt 44580714  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaag--aaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||  ||||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  44580715 tacaattttatcctttaagagagatgaatggtttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaaaatgtataataaataggggcatgta 44580814  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44580815 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 44580869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 266 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 39029463 - 39029229
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39029463 gtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 39029364  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||       | |||    
T  39029363 cctttaagagagaattagtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaat-att 39029265  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39029264 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 39029229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 26980726 - 26980966
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||| ||||||||  ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26980726 gtccttaattatagtacctttttgaaaaaatatcgggaattaagatagtggatattt-tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 26980824  T
Q  366 gctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     ||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  26980825 cctttaagagagatgattggtttatgttttcaacatgttatttattggtgatcgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 26980924  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26980925 ttaatgtagttggaaatagtaaaggggtcttataaaaaggga 26980966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 40785178 - 40784937
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40785178 gtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgcttttacaattttat 40785079  T
Q  366 gcttt--aagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     ||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  40785078 cctttaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttacttaatgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 40784979  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  40784978 ttaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaaggga 40784937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 251 - 500
Target Start/End: Original strand, 7682772 - 7683022
Alignment:
Q  251 tttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 350  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7682772 tttattactacctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattg 7682871  T
Q  351 tttttacaattttatgcttt-aagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgt 449  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||| ||||| | |||||    
T  7682872 tttttacaattttatcctttaaagagataattggtttatgttttcaacatgttatttatcgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgt 7682971  T
Q  450 atgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 500  Q
    ||||       ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  7682972 atgtaaagaaataattaatgtagtcgaaaatagcaaaggggtcttataaaa 7683022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 5774347 - 5774048
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5774347 tactacctccgtccctaattacaaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 5774248  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataat-taatagaggcatgtatg 452  Q
    |||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||    
T  5774247 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataatggaataggggcatgtatg 5774148  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtag 552  Q
    |       ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||           |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5774147 taaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagagtcttataattagggacggaggtag 5774050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 250 - 505
Target Start/End: Original strand, 38780875 - 38781131
Alignment:
Q  250 atttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtatt 349  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38780875 atttattactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattactatt 38780974  T
Q  350 gtttttacaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcat 447  Q
     |||||| || ||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||  |||||    
T  38780975 atttttataa-tttatcctttaagagagaggattgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcat 38781073  T
Q  448 gtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||       |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  38781074 gtatgtaaagaaataattattgtggttggaaataggaaaggggtcttataaagaggga 38781131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 255 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 44888979 - 44888677
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  44888979 atactacctccgtccctaattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattgctattatttt 44888880  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |  | | |||| ||||| | ||||||||    
T  44888879 tacaattttatcctttaagagagaaagttggtttatattttcaacatgttatttattgccgattgaagaaagagctgtgtaataaatagggtcatgtatg 44888780  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtag 552  Q
            ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44888779 aaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggagtcttataaaaagggacaatttttttt--ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtag 44888682  T
Q  553 tagtt 557  Q
    |||||    
T  44888681 tagtt 44888677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 255 - 501
Target Start/End: Original strand, 257276 - 257524
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  |||||||||||||  ||  |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  257276 atactacctccgtccctaattatagcacttttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttct 257375  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  257376 tacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatg 257475  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |       ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  257476 taaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 257524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 255 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 658644 - 658396
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  |||||||||||||  ||  |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  658644 atactacctccgtccctaattatagcacttttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttct 658545  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  658544 tacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatg 658445  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |       ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  658444 taaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 658396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 255 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 844380 - 844132
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  |||||||||||||  ||  |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  844380 atactacctccgtccctaattatagcacttttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttct 844281  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  844280 tacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatg 844181  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |       ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  844180 taaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 844132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Original strand, 8072867 - 8073119
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||| |||| |||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8072867 atactaccttcgtccttaattataaggcttttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgtttt 8072966  T
Q  355 tacaattttatgcttt--aagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| ||||  || |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  8072967 tacaattttatcctttaaaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatg 8073066  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       ||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  8073067 taaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaacagatcttataaaaaggga 8073119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 251 - 505
Target Start/End: Original strand, 7683298 - 7683553
Alignment:
Q  251 tttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 350  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||| |||| |||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7683298 tttaatactacctccgtccataattataggacctttttaaaaaaataacgagaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattg 7683397  T
Q  351 tttttacaattttatgcttt-aagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgt 449  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||| || |||||| ||||| | |||||    
T  7683398 tttttacaattttatcctttaaagagagaattggtttatgttttcaacatgttatatatcgctgattgaaaaaaaagatgtataataaatagggacatgt 7683497  T
Q  450 atgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||       |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7683498 atgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaaggga 7683553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 252 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 8566502 - 8566202
Alignment:
Q  252 ttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgt 351  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| | || ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  8566502 ttaatactacatccgtccctaattatagg-ccattttgaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatgtgtttgtaattactattgt 8566404  T
Q  352 ttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||  || |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||    
T  8566403 ttttacaattttatcctttatgagagagttggtttatgttttcaacatgtcatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 8566304  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggta 551  Q
     |       |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | ||         | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8566303 ataaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaagggaacaaaaaaaaattc-tcaaaagagtcttataattaggaacggaggta 8566205  T
Q  552 gta 554  Q
    |||    
T  8566204 gta 8566202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 34490805 - 34490564
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| |||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34490805 gtccctatatataagacccttttgcaaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 34490706  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  34490705 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 34490606  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34490605 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 34490564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 266 - 501
Target Start/End: Original strand, 42985265 - 42985501
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42985265 gtccctaaatataacacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 42985364  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||       |||    
T  42985365 cctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataa-taatatagacatgtatgtaaagaaataa 42985463  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  42985464 ttaatgtagttgaaaatagcaaaagagtcttataaaaa 42985501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 18456008 - 18455767
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18456008 gtccctatatataagacccttttgaaaaaaacacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 18455909  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||| |||       |||    
T  18455908 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtgtgtaaagaaataa 18455809  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18455808 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 18455767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Original strand, 50853 - 51085
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50853 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 50952  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||    
T  50953 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 51052  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51053 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 51085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 256 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 44747345 - 44747098
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44747345 tactacctccgtccttaattataaggtccttttaaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 44747246  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    ||||||||||  ||||||  |||||  ||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  44747245 acaattttatcttttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaatag-ggcatgtatgt 44747147  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44747146 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaag 44747098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 8251682 - 8251923
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  8251682 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 8251781  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  8251782 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataa 8251881  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  8251882 ttaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaaggga 8251923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 8948100 - 8948341
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  8948100 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 8948199  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  8948200 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 8948299  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8948300 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 8948341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 28191924 - 28192165
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  28191924 gtccctatatataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttatacaattttat 28192023  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  28192024 cctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 28192123  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28192124 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 28192165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 38879009 - 38878768
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  38879009 gtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 38878910  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  38878909 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaatgaaataa 38878810  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38878809 ttaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaaggga 38878768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 256 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 12825244 - 12825013
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  12825244 tactacctccgtccctaattatagagcccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtgaatatttgtattaaatatgtttttaattactattgttttt 12825145  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||    
T  12825144 acaattttatcctttaagagagatagttggtttatgttttcaacatgttgtttattgctgattgaagaaaaatatgtat-ataaataggggcatgtatgt 12825046  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaa 486  Q
           ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12825045 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaa 12825013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 11482859 - 11483110
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11482859 tactacctccgtccctaattataagacacttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 11482958  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| | || ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||    
T  11482959 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 11483058  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  11483059 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagtggtcttataaaaaggga 11483110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 256 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 31886967 - 31886737
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||| ||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31886967 tactacctccgtccttaattatagaacccttttaaaaaaataacgggaattaagataataaatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgttttt 31886868  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || ||| || |||||||||||||||||      
T  31886867 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtatgataaatagaggcatgtatgtaa 31886768  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaa 486  Q
         ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31886767 aaaaataattaatgtagttgaaaataacaaa 31886737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Original strand, 32675495 - 32675747
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    ||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||   ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||    
T  32675495 atactccctctgtccctatatataagacccttttaccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt 32675594  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||   |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  32675595 tacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 32675694  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32675695 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 32675747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 253 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 41014805 - 41014553
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    ||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||    
T  41014805 taatactccctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtt 41014706  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||   |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  41014705 tttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatattttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 41014606  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    |||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41014605 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 41014553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 253 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 44021307 - 44021055
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| | | | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  44021307 taatactacatccgtccctaattacaaggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatacgtttataattactattgtt 44021208  T
Q  353 tttacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  44021207 tttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatctataataaataggggcatgta 44021108  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    |||       |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  44021107 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagg 44021055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Original strand, 8797027 - 8797287
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgta--------attagt 346  Q
    |||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||        |||| |    
T  8797027 atactacctccgttcctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttatatgtttataattact 8797126  T
Q  347 attgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagagg 444  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    || ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||  ||    
T  8797127 attgtttttacaattatatcctttaagagagagggttggtttattttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatatcgg 8797226  T
Q  445 catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8797227 catgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 8797287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 269 - 505
Target Start/End: Original strand, 35143274 - 35143510
Alignment:
Q  269 cctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgct 368  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  35143274 cctagttatagggcccttttgaaaaaataaccggaattaagatagtatatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttgtcct 35143373  T
Q  369 ttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaat 468  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||       ||||||||    
T  35143374 ttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttttttattggtgattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaaaaaaataattaat 35143473  T
Q  469 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  35143474 gtagttggaaataacaaataagtcttataaaaaggga 35143510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 275 - 554
Target Start/End: Original strand, 36176861 - 36177140
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36176861 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttataatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 36176960  T
Q  375 gagaa--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||  ||||| |||||       ||||||||||||    
T  36176961 aagaaggttaatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatctatgtaaagaaataattaatgtag 36177060  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||           |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36177061 ttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagagtcttataattagggacggagggagta 36177140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 253 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 38967444 - 38967190
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    |||||||||||  || |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38967444 taatactacctccgttcctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattattattgtt 38967345  T
Q  353 tttacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||| |||||||  | ||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |  |||||    
T  38967344 tttacaattttatcctttaagaaaaagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgta 38967245  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||       ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  38967244 tgtaaagaaataattcatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaaggga 38967190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 256 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 4778887 - 4778640
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4778887 tactacctccgtccctaattatatgattattttaaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 4778788  T
Q  356 acaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    ||| |||||| | ||||||||||    || ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || ||||| |||||| ||||| |||||    
T  4778787 acagttttatccattaagagagagggttggtttat-ttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataa-taataggggcatatatgt 4778690  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
           |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  4778689 aaagaattaattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttatagaaagg 4778640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 266 - 501
Target Start/End: Original strand, 35504329 - 35504566
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||| ||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  35504329 gtccctatatataagactcttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 35504428  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  35504429 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 35504528  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35504529 ttaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaa 35504566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 292 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 4076434 - 4076219
Alignment:
Q  292 aaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatg 389  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |  ||||||    
T  4076434 aaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 4076335  T
Q  390 ttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggg 489  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4076334 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 4076235  T
Q  490 gtcttataaaaaggga 505  Q
    || |||||||||||||    
T  4076234 gtattataaaaaggga 4076219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 40741551 - 40741312
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  40741551 gtccctaattataagaccattttgctaaaatcacggaa-ttaaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 40741453  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  40741452 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 40741353  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40741352 taatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 40741312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 285 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 24992784 - 24992566
Alignment:
Q  285 ttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaag--agagaaatg 382  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||   ||    
T  24992784 ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttg 24992685  T
Q  383 atttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 482  Q
      |||||||||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||||  ||||| ||||       ||||||||||||||||||||||    
T  24992684 gcttatgttttcaatattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggagcatgaatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatag 24992585  T
Q  483 caaaggggtcttataaaaa 501  Q
     ||||||||||||||||||    
T  24992584 aaaaggggtcttataaaaa 24992566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 8951177 - 8951418
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  8951177 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgagaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttccaattttat 8951276  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  8951277 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 8951376  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  8951377 ttaatgtagttggaaataacaaaagagtcttataaaaaggga 8951418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 29598512 - 29598271
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| |||||||||   ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  29598512 gtccctatatataagacccttttaccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 29598413  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||       |||    
T  29598412 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataa 29598313  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  29598312 ttaatgtagttgaaaataacaaaaatgtcttataaaaaggga 29598271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 275 - 498
Target Start/End: Original strand, 38183324 - 38183549
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38183324 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 38183423  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||    
T  38183424 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 38183523  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataa 498  Q
    ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  38183524 ttgaaaataacaaaagggtcttataa 38183549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 42598465 - 42598705
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42598465 gtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 42598564  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  42598565 cctttaagaaagaacgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaggaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 42598664  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  42598665 ttaatgtagttggaaataacaaa-gggtctaataaaaaggga 42598705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 255 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 45260521 - 45260289
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  45260521 atactacctccgtccctaattatatgactcttttgaaaaa-taacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattgttattgtttt 45260423  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |  | |||||| ||||  | ||||||||    
T  45260422 tacaattttatcctttaagagataaagttggtttatgttttcaacatgttatttattgccgattgaagaaagagctgtataataaataaggtcatgtatg 45260323  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaa 486  Q
            ||||||||||||||| ||||||||||    
T  45260322 gaaataaataattaatgtagttgaaaatagcaaa 45260289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 34568769 - 34568537
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  34568769 tataagacccttttgccaaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaa 34568670  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| || |  |||||||||||       ||||||||||||    
T  34568669 aagaaggttattttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaacaagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 34568570  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  34568569 ttggaaataacaaaagggtcttataataaggga 34568537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 256 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 110370 - 110182
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  110370 tactacattcgtccctaattataggacccttttgaaaaaataatgggaattaagatcgtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 110271  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa----tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaata 440  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |    || |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||| ||||    
T  110270 acaatcttatcctttaagagagagagggttggtttatgtttttaacatgttatttattggtgattgaaaaaaaatatgtataataaata 110182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 4631303 - 4631543
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||  ||||| |||| |||||| | ||||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4631303 gtccctaattataagactcttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 4631402  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |       ||||    
T  4631403 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatataaagaaataat 4631502  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4631503 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 4631543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 250 - 554
Target Start/End: Original strand, 45283525 - 45283829
Alignment:
Q  250 atttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtatt 349  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||  | | |||||||||| ||||||| |||||| | | || |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  45283525 atttagtactaccttcgtccttaattatggg-ctcttttgaaaa-ataacgggaattaagacaatgaatatttatatcaaatatgtttgtaattattatt 45283622  T
Q  350 gtttttacaattttatgcttta--agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcat 447  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||    
T  45283623 gtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacat 45283722  T
Q  448 gtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacgga 547  Q
    ||||||       ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| | ||          | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45283723 gtatgtaaaaagataattaatgtagttggaaataacaaagatgtcttataaaaaggaacaatttttttttatccaaaagggtcttataattagggacgga 45283822  T
Q  548 ggtagta 554  Q
    |||||||    
T  45283823 ggtagta 45283829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 18754433 - 18754191
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| || |||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18754433 gtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 18754334  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||| | ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  18754333 cctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 18754234  T
Q  464 ttaatgtag-ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  18754233 ttaatgtagtttggaaataacaaaagggtcttataaaaaggga 18754191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 266 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 1774630 - 1774393
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1774630 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatatgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 1774531  T
Q  366 gctttaagagagaa--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       | |    
T  1774530 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaatca 1774431  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  1774430 ttaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaa 1774393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 14699740 - 14699499
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14699740 gtccctatatataagacccttttgtcaaaattacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 14699641  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
      ||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||  || ||||||||       |||    
T  14699640 cgtttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggtatgtatgtaaagaaataa 14699541  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14699540 ttaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 14699499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 298 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 28579894 - 28579686
Alignment:
Q  298 acggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttca 395  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||    
T  28579894 acgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgttt-taatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttaatttatgttttca 28579796  T
Q  396 acatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtctta 495  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  28579795 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagggatctta 28579696  T
Q  496 taaaaaggga 505  Q
    ||||||||||    
T  28579695 taaaaaggga 28579686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 352 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 5951318 - 5951165
Alignment:
Q  352 ttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    |||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  5951318 ttttacaattttatcctttaagaggtagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtat 5951219  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5951218 gtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 5951165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 13154215 - 13153975
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13154215 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 13154116  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  13154115 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 13154016  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13154015 taatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 13153975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 275 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 16999276 - 16999045
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16999276 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 16999177  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||||| |||    
T  16999176 aagaaggttagtttatcttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatatag 16999077  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggg 504  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  16999076 ttggaaataacaaaaggatcttataaaaaggg 16999045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 33745646 - 33745886
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| | || || ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33745646 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcaagggaaataagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 33745745  T
Q  366 gctttaagagagaaatga-tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     |||| ||| | |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  33745746 cctttgagaaaaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 33745845  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33745846 taatgtagttgaaaataacaaagggatcttataaaaaggga 33745886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 44502910 - 44502666
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  44502910 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaattttat 44502811  T
Q  366 gcttta-----agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnn 460  Q
     ||| |     |||||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||           
T  44502810 ccttaagagagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaa 44502711  T
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44502710 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 44502666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 248 - 488
Target Start/End: Original strand, 16125441 - 16125683
Alignment:
Q  248 atatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagta 347  Q
    |||||| ||||| |||  |||||||  |||| |||||||||   ||||  |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||    
T  16125441 atattttatactccctccgtccctatatataagacccttttatcaaaaacacgggaattaagatagtcgatatttgtattaaagttgtttgtaatcacta 16125540  T
Q  348 ttgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggc 445  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  16125541 ttgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggc 16125640  T
Q  446 atgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaagg 488  Q
    ||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16125641 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagg 16125683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 267 - 505
Target Start/End: Original strand, 28864258 - 28864497
Alignment:
Q  267 tccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatg 366  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||| |  | |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  28864258 tccctaattataagacccttttgttaaaatcagaggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatc 28864357  T
Q  367 cttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
    ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       |||||    
T  28864358 cttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatt 28864457  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28864458 aatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaaggga 28864497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 292 - 503
Target Start/End: Original strand, 36661701 - 36661914
Alignment:
Q  292 aaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaa--atgatttatg 389  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| | ||||   |  ||||||    
T  36661701 aaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatg 36661800  T
Q  390 ttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggg 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| || || ||||||||| |       ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36661801 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatataaagaattaattaatgtagttgaaaataacaaaggg 36661900  T
Q  490 gtcttataaaaagg 503  Q
    ||||||||||||||    
T  36661901 gtcttataaaaagg 36661914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 251 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 41616213 - 41615953
Alignment:
Q  251 tttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 350  Q
    |||| ||||||||  ||| ||||||||| | || ||||||||| |||||   |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41616213 tttattactacctccgtctctaattatagggccattttgaaaatataacatgaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgcaattagtattg 41616114  T
Q  351 tttttacaattttatgctttaagagaga------aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagagg 444  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||      | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||||| || || ||    
T  41616113 tttttacaattttatcctttaagagagatgtttgatttatttatgttttcaacatgttatttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaacagggg 41616014  T
Q  445 catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||       ||||||||||||||| ||||| |||||   | |||||||||||||    
T  41616013 catgtatgtaaagatataattaatgtagttgaaaataacaaagaaattttataaaaaggga 41615953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 298 - 487
Target Start/End: Original strand, 16117232 - 16117423
Alignment:
Q  298 acggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttca 395  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |  ||||||||||||    
T  16117232 acgggaattaagatagtcgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttca 16117331  T
Q  396 acatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaag 487  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16117332 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaag 16117423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 16448492 - 16448743
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |  |||| ||||||||||   |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16448492 tactaccttcgtccctaattataaggctattttaaaaaaataacttgaattaagatagtaaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 16448591  T
Q  356 acaattttatgcttt--aagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| ||||  || ||||   ||  |||||||||||| ||  ||||||||| |||| ||| ||||| || |||||| ||||| |||||| ||||    
T  16448592 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaatattctatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgt 16448691  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16448692 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 16448743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 266 - 554
Target Start/End: Original strand, 17856527 - 17856813
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17856527 gtccttaattataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 17856626  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     | |||||||||| |  || ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  17856627 -ccttaagagagatagttggtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 17856725  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17856726 ttaatgtagttggaagtaacaaaggggtcttataaaaagggacaattttttt---ttcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 17856813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 266 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 28965754 - 28965643
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28965754 gtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 28965655  T
Q  366 gctttaagagag 377  Q
     |||||||||||    
T  28965654 cctttaagagag 28965643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 29279483 - 29279243
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  29279483 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaaattttttgtaatcactattgtttttacaattttat 29279384  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | |||||| |||||||| || ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  29279383 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 29279284  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29279283 taatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaaggga 29279243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 332 - 505
Target Start/End: Original strand, 29806038 - 29806213
Alignment:
Q  332 atgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatata 429  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||     
T  29806038 atgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatg 29806137  T
Q  430 tataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29806138 tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 29806213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 303 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 35203086 - 35202938
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgtt 402  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  35203086 aattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatccttt-agagagagttggtttatgttttcaacatgtt 35202988  T
Q  403 atttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||  |||||||||    
T  35202987 atttattgttgattgaagaaaaagatctataataaataggagcatgtatg 35202938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 11798892 - 11798652
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| | || |||||| | |  ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  11798892 gtccctaattataagacccttttgttaaaatcatgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 11798793  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  11798792 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 11798693  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11798692 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 11798652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 12255382 - 12255142
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||||||||  |||||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  12255382 gtccctaattataaaacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatattat 12255283  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | | |||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  12255282 ccttaagaaagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 12255183  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12255182 taatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaaggga 12255142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 12260925 - 12260685
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||||||||  |||||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  12260925 gtccctaattataaaacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatattat 12260826  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | | |||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  12260825 ccttaagaaagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 12260726  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12260725 taatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaaggga 12260685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 266 - 554
Target Start/End: Original strand, 43653953 - 43654240
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  43653953 gtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 43654052  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| | || | |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  43654053 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctaattgtagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 43654152  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||           |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43654153 taatgtagttggaaataataaagatgtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagagtcttataattagggacggagggagta 43654240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 254 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 45425332 - 45425082
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  |||||||  |||| |||| |||||  |||||  |||||||||| | ||| ||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||    
T  45425332 aatactacctccgtccctatatataagaccattttgttaaaattgcggaaattaagaaagttgatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgttt 45425233  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||||| | ||||||||||  | |||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||  | |||||||||    
T  45425232 ttacaattttat-ccttaagagagagttaatttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataaggacatgtatgt 45425134  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45425133 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaaaggtcttataaaaaggga 45425082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 256 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 30140380 - 30140211
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30140380 tactacctccgtccctaattatagggtttttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 30140281  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaa 423  Q
    |||||||||| |||||||| |||    || ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  30140280 acaattttatcctttaagaaagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaa 30140211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 269 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14625812 - 14625707
Alignment:
Q  269 cctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgct 368  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  14625812 cctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcct 14625713  T
Q  369 ttaaga 374  Q
    ||||||    
T  14625712 ttaaga 14625707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 270 - 505
Target Start/End: Original strand, 18641130 - 18641367
Alignment:
Q  270 ctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctt 369  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  18641130 ctaattataagacctttttaaaaaaataataggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatcctt 18641229  T
Q  370 taag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaa 467  Q
    ||||  ||||   ||  ||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |  ||||||||       |||||||    
T  18641230 taagaaagagggttggcttatgttttaaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggttatgtatgtaaagaaataattaa 18641329  T
Q  468 tgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    | |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18641330 tttagttgaaaatagaaaaggagtcttataaaaaggga 18641367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 275 - 501
Target Start/End: Original strand, 42218105 - 42218330
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||| ||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  42218105 tataagactcttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagatgtttgcaatcactattgtttttacaattttat-cttttaga 42218203  T
Q  375 gagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagtt 474  Q
    ||||  |  ||||||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||       ||||||||||||||    
T  42218204 gagagttagtttatgtcttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcttgtatgtaaaaaaataattaatgtagtt 42218303  T
Q  475 ggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  42218304 gaaaataacaaagggatcttataaaaa 42218330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 285 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 35203261 - 35203101
Alignment:
Q  285 ttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgat 384  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||        ||||||   ||||    
T  35203261 ttttaaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataatttt--------agagagggttgat 35203170  T
Q  385 ttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||  | |||||||||    
T  35203169 ttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatacggacatgtatgt 35203101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 44250869 - 44251111
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  44250869 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcaatattatttttacaattttat 44250968  T
Q  366 gcttta---agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnnta 462  Q
     ||| |   |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| ||||  |||||||| || |||||| ||||| | |||||||||       ||    
T  44250969 ccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaata 44251068  T
Q  463 attaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44251069 attaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 44251111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 311 - 554
Target Start/End: Original strand, 44748257 - 44748500
Alignment:
Q  311 tagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttat 408  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    ||  |||||||||||||||  |||||||    
T  44748257 tagtggatatttatattaaatatgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttat 44748356  T
Q  409 tgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
    || |||| ||||||||| || |||||| ||||  | |||||||||       |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||    
T  44748357 tgctgattgaagaaaaagatgtataataaataaggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagagacaa 44748456  T
Q  509 nnnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
               |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44748457 aaaaaattc--tcaaaagaatcttataattagggacggaggtagta 44748500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 266 - 554
Target Start/End: Original strand, 13568659 - 13568942
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||  ||||| |||  |||||| | ||  ||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13568659 gtccttaattataagacacttttgttaaaattacgagaattaagaaagcagatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 13568758  T
Q  366 gctttaagagagaaa-tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| |||||| | | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||        |||    
T  13568759 cctt-aagagaaagagtgatttatgttttccatatgctatttattgttgatggaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag----aat 13568853  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||         | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13568854 taatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaattttttctc-tcaaaagggtcttataattaaggacggaggtagta 13568942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 248 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5952589 - 5952482
Alignment:
Q  248 atatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagta 347  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5952589 atatctaatactaccttcgtccctaattatatggccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaata 5952490  T
Q  348 ttgttttt 355  Q
    ||| ||||    
T  5952489 ttgatttt 5952482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 2151980 - 2152277
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||||||  |||| ||| ||||||  ||||| |||  |||||| | ||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  2151980 tactacctccgtccctatatataagactcttttgttaaaatcacgtgaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgttttt 2152079  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    ||| |||||| | |||||||||| |  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||  |||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  2152080 acagttttat-cgttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 2152178  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2152179 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaataggtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagt 2152276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 312 - 505
Target Start/End: Original strand, 29321090 - 29321284
Alignment:
Q  312 agtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattg 410  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  |  ||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  29321090 agtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatattttccatatgctatttattg 29321189  T
Q  411 ttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
     | || ||||||||| || ||| || ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29321190 ctaattgaagaaaaagatgtatgataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 29321284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Original strand, 14583871 - 14584121
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||   ||||| || |||||||| | |||| ||||||||||||||  | |||||||| |  ||||||||    
T  14583871 atactaactctgtccctaattataggacccttttactaaaatcacagaaattaagaaagtgaatatttgtattaaaattatttgtaatcacaattgtttt 14583970  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||  |  ||||||||||  | ||||||||||||| | || |||| |||| ||||||||| || || |||||||||     
T  14583971 tacaattttat-ccttaagagagaaaatttgtttatgtttttcatatgttatttattggtaattgaag-aaaagatatataataaacaggggcatgtata 14584068  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14584069 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttataaaaaggga 14584121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 292 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 5268230 - 5268016
Alignment:
Q  292 aaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta--agagagaaatgatttatg 389  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||  | |||| |||| |||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||    
T  5268230 aaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaaacattattatttt-acaaatttatcctttatgagagagaattaatttatg 5268132  T
Q  390 ttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggg 489  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||| || ||||||| |     
T  5268131 ttttcaacatattatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaagtagcaaaaga 5268032  T
Q  490 gtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||| ||||||||    
T  5268031 gtcttatgaaaaggga 5268016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 298 - 505
Target Start/End: Original strand, 36245694 - 36245903
Alignment:
Q  298 acggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaa 396  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| |||| |  ||||||||||||||||| | ||| | |||||||  |  ||||||||||| |    
T  36245694 acgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttctaatcacaattgtttttacaattttctccttaagagagagagttagtttatgttttcca 36245793  T
Q  397 catgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt-nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtctta 495  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||        ||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  36245794 tatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatggatctta 36245893  T
Q  496 taaaaaggga 505  Q
    ||||||||||    
T  36245894 taaaaaggga 36245903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 290 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 42747472 - 42747384
Alignment:
Q  290 aaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga 378  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42747472 aaaaaataacgaaaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattttttttacaattttattctttaagagaga 42747384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 318 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 5593654 - 5593470
Alignment:
Q  318 tatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatc 416  Q
    |||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||  ||||     
T  5593654 tatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattactgatt 5593555  T
Q  417 gaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5593554 gaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 5593470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 256 - 350
Target Start/End: Original strand, 17851249 - 17851343
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 350  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17851249 tactacctccgtccctaattatagggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattg 17851343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 259 - 495
Target Start/End: Original strand, 21652224 - 21652466
Alignment:
Q  259 tacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 358  Q
    ||||| ||||||||   ||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||     
T  21652224 tacctctgtccctatacataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatttttattgtttttacc 21652323  T
Q  359 attttatgcttt--aagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatat----aattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||| ||||  |||||||   |  ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||    ||| ||||||||||||||||    
T  21652324 attttatcctttaaaagagagggttagtttatgttttcaacataatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataaatagaggcatgtatg 21652423  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtctta 495  Q
    |       |||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||    
T  21652424 taaagaaataattaatgtggttgggaataacaaaagggtctta 21652466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 256 - 343
Target Start/End: Original strand, 34070971 - 34071058
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatt 343  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  34070971 tactacctctgtccctaattatagggccctcttgaaaaaataacggaaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaatt 34071058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 275 - 501
Target Start/End: Original strand, 14548447 - 14548674
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctt-taag 373  Q
    |||| |||| |||||  ||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||  ||||| |||| | |||||| ||||||||||||| |||  |||    
T  14548447 tataagaccattttgttaaaatcacgggaattaagaaagtgcatatttgtattaaagttgtttttaatcactattgtgtttacaattttatccttaaaag 14548546  T
Q  374 agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagt 473  Q
    ||| |  | ||||||| |||| | ||| ||||||||| |||| |||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||       |||||||| ||||    
T  14548547 agatagtttatttatggtttccatatgctatttattgctgattgaagaccaatatgtataataaatagaggcatgtatgtacataaataattaatatagt 14548646  T
Q  474 tggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||    
T  14548647 tgaaaatagcaaagagatcttataaaaa 14548674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 254 - 428
Target Start/End: Original strand, 43292736 - 43292909
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  |||||||| |||| || |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| | |  |  |||||||| ||| | |||||| ||||||||    
T  43292736 aatactacctccgtccctaaatataggagccttttgccaaaattacggagattaagatagttggttgtaatattaaatttgtatataattactattgttt 43292835  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatat 428  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  43292836 ttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaatat 43292909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 316 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 2767868 - 2767759
Alignment:
Q  316 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgat 415  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2767868 gatatttgtattaaagatctttgtaatcactattgtttttacaatattattatttaagagataattattttatgttttcaacatgttatttatttttgat 2767769  T
Q  416 cgaagaaaaa 425  Q
     |||||||||    
T  2767768 tgaagaaaaa 2767759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 323 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 12802838 - 12802611
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaa 422  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  12802838 gtattaaatttgtatttaattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaa 12802740  T
Q  423 aaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttca 522  Q
    ||| ||  | ||| ||||  || || |   |       ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||           |||    
T  12802739 aaaaatgcaaaataaataagggtatattaataaagaaataattaatgtacttggaaataccataggggtcttataaaaagggataaattttttc---tca 12802643  T
Q  523 aaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12802642 aaagggtcttataattagggacggaggtagta 12802611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 323 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 35179830 - 35179600
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | | |||||| | |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  35179830 gtattaaatttgtatataattaatattgtttttacaattttatccttaagaaagagaattaatttatgttttcaacataatatttattattgattgaaga 35179731  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttc 521  Q
    ||||  |  | ||| |||| ||| ||||  ||       ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||          |||    
T  35179730 aaaaggtgcaaaataaataaaggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaaaggacaaattatttt--ttc 35179633  T
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35179632 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 35179600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 303 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 21137106 - 21136903
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatg 400  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||| |||||||||  ||||||||| | |  | ||||||||||||||||||    
T  21137106 aattaagaaagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattatttttccaattttatcatttaagagatagagttaatttatgttttcaacatg 21137007  T
Q  401 ttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 500  Q
    ||||||||| || || ||||||||| || |||||| |||||  | ||||| ||       || || ||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  21137006 ttatttattattcattgaagaaaaaaatgtataataaataggagtatgtaagtaaagaaatagttgatgtaattggaaatagcaaatgagtcttataaaa 21136907  T
Q  501 aggg 504  Q
    ||||    
T  21136906 aggg 21136903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 323 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 39463215 - 39463036
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| | | |||||   | ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  39463215 gtattaaatttgtttgtaattactattgcttttacaattttatccttaagaaagagactaggtttatgttttcaacatagtatttattgttgattgaaga 39463116  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||| || || ||| ||||| || ||||  ||       ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39463115 aaaagatgtaaaataaataggggtatgttggtaaggaaataattaacgtagttggaaatgacaaaggggtcttataaaaa 39463036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 417 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 42885189 - 42885053
Alignment:
Q  417 gaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnn 516  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||            
T  42885189 gaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttt 42885090  T
Q  517 ncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtag 555  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  42885089 --ttcaaaagggtcttataattagggacggagggagtag 42885053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 254 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 23498029 - 23497867
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| ||| | | ||| | |  | ||||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  23498029 aatactaccttcgtccctaattataggagccttttgcaaaaattacggagattgagaaagttggttgtagtattaaatttgtatgcaattattattgttt 23497930  T
Q  354 ttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgat 415  Q
    || ||||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23497929 ttccaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgat 23497867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 346 - 440
Target Start/End: Original strand, 31089751 - 31089845
Alignment:
Q  346 tattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaata 440  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  31089751 tattgtttttacaattttatcctttaagagagagttagtttatgttttcaacatgctatttattactgattgaagaaaaatatgtataataaata 31089845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 275 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 42885449 - 42885359
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42885449 tataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 42885359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 254 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 11293952 - 11293700
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  ||| |||| |||| ||  |||||| |||||| ||||| ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||    
T  11293952 aatactacctccgtctctaaatataggagtcttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgttt 11293853  T
Q  354 ttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||  | |||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || || ||| | ||  || ||||  |    
T  11293852 ttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataagtaagggtatgttgg 11293753  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       ||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  11293752 taaagaaataattaatgtacttggaaataccgaaggagtcttataaaaaggga 11293700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 326 - 425
Target Start/End: Original strand, 23894718 - 23894816
Alignment:
Q  326 ttaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  23894718 ttaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaa 23894816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 36786697 - 36786594
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  36786697 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 36786598  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  36786597 aaaa 36786594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 23425106 - 23424936
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||||||| ||||||||| |||| || | |||||  ||||| ||||| ||||| | ||| | |  ||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  23425106 tactacctctgtccctaaatataggagcattttgtcaaaattacggagattaagaaagttggttgttgtattaaatttgtatataattactattgttttt 23425007  T
Q  356 acaattttatgctt-taagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||||||| |||  |||||| || | |||||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||    
T  23425006 acaattttatccttaaaagagataattaatttatgttttcaagataatatttatggttgattgaagaaaaa 23424936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 253 - 502
Target Start/End: Original strand, 26990564 - 26990815
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| |||| ||||   ||||| |||| |||||| | || | ||||||| ||||||  |||||||||| | |||| ||    
T  26990564 taatactccctccgtccctaattataagacctttttactaaaattacgggaattaagaaagcgaatatttgcattaaagttgtttgtaatcactattttt 26990663  T
Q  353 tttac-aattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    |||   |||||||| ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  26990664 ttttttaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 26990763  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |||       ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  26990764 tgtaaagaaataattaatgtatttggaaataacaaacgcgtcttataaaaag 26990815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 551
Target Start/End: Original strand, 5244451 - 5244659
Alignment:
Q  340 aattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaa 438  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||  | ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||  | ||| ||    
T  5244451 aattactattgtttttagaattttatccttaagagagagagttcatttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaa 5244550  T
Q  439 tagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataatt 538  Q
    ||  || ||||  ||       ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||           |||||||||||||||||||    
T  5244551 taagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaatttttta----tcaaaagagtcttataatt 5244646  T
Q  539 agggacggaggta 551  Q
    |||||||||||||    
T  5244647 agggacggaggta 5244659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 340 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 13141670 - 13141587
Alignment:
Q  340 aattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaa 424  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||    
T  13141670 aattactattgtttttacaattttat-ctttaagagagagataatttatgttttcaacataatatttatttttgattgaaaaaaa 13141587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 17336704 - 17336545
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| || | ||||| |||||| ||||| ||||| | | | | |  | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17336704 gtccctaattataggaacattttgcaaaaattacggagattaagaaaattggttgtagtattaaatttgtatgtaattactattgtttt-acaattttat 17336606  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
     ||| | |||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  17336605 ccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaa 17336545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 30512991 - 30512817
Alignment:
Q  327 taaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaat 426  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||  |  ||| ||||||||||||  |||||| |||| || |||||||||     
T  30512991 taaatttgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt--agagagagctagtttgtgttttcaacatagtatttaatgttcattgaagaaaaag 30512894  T
Q  427 atatataattaatagaggcatgtatgt-nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    ||||| ||| ||||| || ||||  ||        ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30512893 atataaaataaataggggtatgttggtaaaaaaattaattaatgtacttgaaaataccaaaggggtcttataaaaag 30512817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 40856058 - 40855908
Alignment:
Q  292 aaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatg 389  Q
    ||||| |||| |||||| | |||| |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  | |||  |  ||||||    
T  40856058 aaaatcacggtaattaagaaagtgaatatttatattaaaattgtttgtaattattattgtttttacaattttat-ctttaagataaagagttagtttatg 40855960  T
Q  390 ttttcaacatg-ttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaata 440  Q
    ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||    
T  40855959 ttttccatatgtttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaata 40855908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 417 - 505
Target Start/End: Original strand, 7758811 - 7758899
Alignment:
Q  417 gaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7758811 gaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaaggga 7758899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 11114049 - 11113889
Alignment:
Q  286 tttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaag----agagaaat 381  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||| |||  |||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||    |||||  |    
T  11114049 tttgacaaaatcacgtgaattaaaaaagttcatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttactattttatcctttaagagatagagagtt 11113950  T
Q  382 gatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaataga 442  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||| | |||| ||||||||| || |||||| ||||||    
T  11113949 gttttatgtttttaacatgatatttatcgctgattgaagaaaaagatgtataataaataga 11113889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 502
Target Start/End: Original strand, 24260694 - 24260941
Alignment:
Q  257 actacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 356  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| | | |  | | | ||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  24260694 actaacttcgtccctaattatatgattcttttgagaaaataacgggaattaagaaaattaaaaatggtaataaatttgtttgtaattactattgctttta 24260793  T
Q  357 caattttatgcttt--aagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    ||||| ||| ||||  ||||||||| |  | ||||||||||| ||  |||||| |  |||| ||||||||| ||||| ||| ||||  || ||||  ||     
T  24260794 caattctatcctttaaaagagagaattagtgtatgttttcaagatagtatttaatactgattgaagaaaaagatataaaataaataagggtatgttggta 24260893  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
          ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24260894 aaaaattaattaatgcacttggaaatatcaaagggatcttataaaaag 24260941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 36409826 - 36409723
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||| | ||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||    
T  36409826 gtattaaatttgtataaaattactattgtttttacaattttattcttaagagagagaattaatttatgtttttaatatgatatttattgttgattgaaga 36409727  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  36409726 aaaa 36409723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 36941498 - 36941395
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||   ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  36941498 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtagatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 36941399  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  36941398 aaaa 36941395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 351 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 45145446 - 45145347
Alignment:
Q  351 tttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgt 449  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||| ||| ||||    
T  45145446 tttttacaattttattcttaagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaatatgtacaataaataaaggtatgt 45145347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 5110111 - 5109928
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||| | | |||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| |    
T  5110111 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatccttaagagagaggattaatttatgttttcaacataatatttatagttgattgaaaa 5110012  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||| ||  | ||| ||||  || ||||  ||       ||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  5110011 aaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgggtcttataaaaaggga 5109928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 28741133 - 28741043
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||| ||||||||||  ||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28741133 tataagacccttttgttaaaattatgggaattaaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttacaattattattgtttttacaattttat 28741043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 434
Target Start/End: Original strand, 29738123 - 29738276
Alignment:
Q  280 gacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaa 379  Q
    ||||||||||  ||||| || | |||||| | | |||||||||||||||||  || | ||||| | |||| ||||||||||||| | ||| ||||||||     
T  29738123 gacccttttgctaaaattacaggaattaagaaattggatatttgtattaaagttgatggtaatcactattatttttacaattttgttctt-aagagagag 29738221  T
Q  380 atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataa 434  Q
     |||||||||||||| | ||||||||||| | |||| ||||||||| || |||||    
T  29738222 ttgatttatgttttccatatgttatttatcgctgattgaagaaaaagatgtataa 29738276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 409
Target Start/End: Original strand, 39112561 - 39112655
Alignment:
Q  316 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatga-tttatgttttcaacatgttatttatt 409  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  39112561 gatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcatctaagagagaaattagtttatgtattcaacatgctatttatt 39112655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 441
Target Start/End: Original strand, 44056809 - 44056993
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||||| || ||||||||||||  |||| |||||  ||||| ||   |||||| | | || ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  44056809 tactacattcgtccctaattattggaccattttgttaaaatcacaagaattaagaaaatgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 44056908  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatag 441  Q
    |||||||||| | ||||||||||  |  ||||||||||  | ||| ||||||||||||||  || ||||| || |||||| |||||    
T  44056909 acaattttat-ccttaagagagagttagtttatgtttttcatatgatatttattgttgatttaaaaaaaagatgtataataaatag 44056993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 505
Target Start/End: Original strand, 44580921 - 44581043
Alignment:
Q  383 atttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || |||||| ||||| || ||||||||       || |||||||| ||| |||||     
T  44580921 atttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaatagttaatgtacttgaaaataa 44581020  T
Q  483 caaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||| ||  |||||||||||||    
T  44581021 caaagaggcattataaaaaggga 44581043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 399
Target Start/End: Original strand, 25056707 - 25056785
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacat 399  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |  ||||||||||||||||    
T  25056707 gtattaaatttgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaaaagagagagtttgtttatgttttcaacat 25056785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 40529453 - 40529357
Alignment:
Q  405 ttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||| ||||  |||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  40529453 ttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaaaa 40529357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 323 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 23995806 - 23995624
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||| ||| | |||||||    |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  23995806 gtattaaatttgtatataattactgttgtttttacaattttatccttgagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 23995707  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||| ||  | ||| ||||  || ||||  ||       ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23995706 aaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaaggga 23995624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 29073917 - 29073751
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| | | | | |  | ||||||||| ||| | |||||| |||||||||     
T  29073917 tactacctccgtccctaaatatatgagccttttgcaaaaattacggagattaagaaaattggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttt- 29073819  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    | ||||| || | ||||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  29073818 ataattt-at-cattaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaa 29073751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 40530433 - 40530336
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttt 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |  ||||||||||||||||  |||||||||| |   ||||||||||||||||    
T  40530433 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcacggttgtttttacaatttt 40530336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 28965636 - 28965551
Alignment:
Q  420 gaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28965636 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaagaggtcttataaaaaggga 28965551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 328 - 431
Target Start/End: Original strand, 15021169 - 15021274
Alignment:
Q  328 aaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatt----tatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaa 423  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||    |||||||| |||||  | |||| ||||||| |||||||    
T  15021169 aaatttgtttgtaattgttattgtttttacaattttaacctttaagagaga--tgattagtgtatgttttgaacataatctttaatgttgattgaagaaa 15021266  T
Q  424 aatatata 431  Q
    ||||||||    
T  15021267 aatatata 15021274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 342
Target Start/End: Original strand, 25635891 - 25635973
Alignment:
Q  259 tacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaat 342  Q
    |||||| |||||||  |||| ||||||||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25635891 taccttcgtccctatatataagacccttttgttaaaata-cggaaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaat 25635973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 400
Target Start/End: Original strand, 41388545 - 41388631
Alignment:
Q  316 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatg 400  Q
    |||||||||||||||  ||||||| || | |||| ||||||||||||||| |||||||||| | |  | ||||||||||||||||||    
T  41388545 gatatttgtattaaaattgtttgtgatgactattatttttacaattttatcctttaagagatatagctaatttatgttttcaacatg 41388631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Original strand, 44165276 - 44165379
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||| |||  | |||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||    
T  44165276 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgagga 44165375  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  44165376 aaaa 44165379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 429
Target Start/End: Original strand, 6142372 - 6142418
Alignment:
Q  383 atttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatata 429  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6142372 atttatgttttcaacataatatttattgttgatcgaaaaaaaatata 6142418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 36408506 - 36408415
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||          |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  36408506 taattaatgtactagaaaatatcaaaggggtcttataaaaagggataaattatttt--ttcaaaaaggtcttataattagggacggaggtagta 36408415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 519 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 11482894 - 11482857
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagt 556  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11482894 ttcaaaagtgtcttataattagggacggaggtagtagt 11482857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 323 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 19176920 - 19176844
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga-aatgatttatgttttcaacat 399  Q
    ||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  19176920 gtattaaatttgtatgtaattaatactgtttttacaattttat-ccttaagagagagattaatttatgttttcaacat 19176844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 384 - 449
Target Start/End: Original strand, 39970596 - 39970661
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgt 449  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||  |||||||    
T  39970596 tttatgttttcaacatagtatttattgttgatggaagaaaaatatgtaaaataaataagggcatgt 39970661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 5449646 - 5449587
Alignment:
Q  339 taattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacat 399  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||| ||||||||||    
T  5449646 taattattattgtttttacaattttat-ctttaagagagagttaatttatattttcaacat 5449587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 19176227 - 19176183
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19176227 taattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaaggga 19176183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 327 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 42486288 - 42486236
Alignment:
Q  327 taaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgc-tttaagagaga 378  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42486288 taaatttgtttgtaattactattgtttttacaattttatacttttaagagaga 42486236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16894101 - 16894062
Alignment:
Q  333 tgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaa 372  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16894101 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 16894062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 376
Target Start/End: Original strand, 19700825 - 19700868
Alignment:
Q  333 tgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagaga 376  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19700825 tgtttgtaattattactgtttttacaattttatcctttaagaga 19700868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 26626007 - 26625920
Alignment:
Q  339 taattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||| |||  | |||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||||||    
T  26626007 taattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaa 26625920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 519 - 554
Target Start/End: Original strand, 44888943 - 44888978
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44888943 ttcaaaagagtcctataattagggacggaggtagta 44888978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 519 - 554
Target Start/End: Original strand, 45260485 - 45260520
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45260485 ttcaaaagagtcatataattagggacggaggtagta 45260520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 520 - 554
Target Start/End: Original strand, 6050558 - 6050592
Alignment:
Q  520 tcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6050558 tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 6050592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 520 - 554
Target Start/End: Original strand, 17069847 - 17069881
Alignment:
Q  520 tcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17069847 tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 17069881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 520 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 17578426 - 17578392
Alignment:
Q  520 tcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17578426 tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 17578392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 519 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 17851284 - 17851246
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17851284 ttcaaaagagccctataattagggacggaggtagtagtt 17851246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 520 - 554
Target Start/End: Original strand, 18641383 - 18641417
Alignment:
Q  520 tcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18641383 tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 18641417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23688205 - 23688163
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaa 295  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23688205 taatactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaa 23688163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 520 - 554
Target Start/End: Original strand, 37023287 - 37023321
Alignment:
Q  520 tcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37023287 tcaaaagagtcttataattagggacggaggcagta 37023321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 39463567 - 39463533
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39463567 atactacctttgtccctaattataggacccttttg 39463533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 298
Target Start/End: Original strand, 35179597 - 35179642
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataa 298  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  35179597 taatactacctccgtccctaattataagactcttttgaaaaaataa 35179642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 519 - 556
Target Start/End: Original strand, 41898498 - 41898535
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagt 556  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41898498 ttcaaaaggatcttataattagggacggaggtagtagt 41898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 521 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 2152013 - 2151977
Alignment:
Q  521 caaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2152013 caaaagagtcttatatatagggacggaggtagtagtt 2151977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 266 - 298
Target Start/End: Original strand, 17336429 - 17336461
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataa 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17336429 gtccctaattataagacccttttgaaaaaataa 17336461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 333 - 365
Target Start/End: Original strand, 19715659 - 19715691
Alignment:
Q  333 tgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19715659 tgtttgtaattattattgtttttacaattttat 19715691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 255 - 295
Target Start/End: Original strand, 23487063 - 23487103
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaa 295  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23487063 atactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaa 23487103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 26625884 - 26625840
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26625884 taattagtgtacttggaaatatcaaaggagtcttataaaaaggga 26625840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 254 - 298
Target Start/End: Original strand, 36408413 - 36408457
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataa 298  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  36408413 aatactacctccgtccctaattataagacctttttgaaaaaataa 36408457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 520 - 548
Target Start/End: Original strand, 38798332 - 38798360
Alignment:
Q  520 tcaaaagagtcttataattagggacggag 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38798332 tcaaaagagtcttataattagggacggag 38798360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 519 - 551
Target Start/End: Original strand, 43292998 - 43293030
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggta 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43292998 ttcaaaagagtcttataattagggacagaggta 43293030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 522 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 44580648 - 44580616
Alignment:
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44580648 aaaagggtcttataattagggacggaggtagta 44580616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 247 - 295
Target Start/End: Original strand, 44888671 - 44888719
Alignment:
Q  247 aatatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaa 295  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44888671 aatattaactactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaa 44888719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 180; Significance: 6e-97; HSPs: 192)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 252
Target Start/End: Original strand, 13500296 - 13500532
Alignment:
Q  15 atgaattcaaacccaaaattccgcataaaatatcatcacaatcaaaccacaatgctacaacaagcacatattttagattttaattattccagtggtatat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13500296 atgaattcaaacccaaaattccgcataaaatatcatcacaaccaaaccacaatgctacaacaaacacatattttagattttaattattccagtggtatat 13500395  T
Q  115 cnnnnnnntgtatatcaatgtcatcctattttcttattattttatggaacccttcttttatttatcaatttcaactttcaagttaataataaactacatg 214  Q
    |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13500396 caaaaaaatgtatatcaatgtcatcctattttcttattattttatggaacccttcttttatttatcaatttcaactttcaagttaataataaac-acatg 13500494  T
Q  215 caaataannnnnnnctataaaatttaaaaagcaatatt 252  Q
    |||||||       ||||||||||||||||||||||||    
T  13500495 caaataatttttttctataaaatttaaaaagcaatatt 13500532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 8912615 - 8912911
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8912615 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 8912714  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||      
T  8912715 acagttttatcctttaagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 8912814  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8912815 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 8912911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 12889949 - 12890245
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  12889949 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 12890048  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||      
T  12890049 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 12890148  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12890149 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaattttttt--ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 12890245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 40680404 - 40680698
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40680404 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataatgggaattaaaatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 40680503  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||      
T  40680504 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagaggcatgtatgtaa 40680603  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
         |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||         ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40680604 agaaataattaatataattggaaatagcaaa-gggtcttataaaaagggaaaa--aaaaattctt-aaaagagttttataattagggacggaggtagta 40680698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 38214776 - 38214527
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38214776 tactaccttcgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 38214677  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||| | |||||||||      
T  38214676 acaattttatcctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataattaatagggacatgtatgtaa 38214577  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
         |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  38214576 agaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaaggga 38214527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 266 - 554
Target Start/End: Original strand, 40788839 - 40789125
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  40788839 gtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttatattaaatatgtttataattactattgtttttacaattttat 40788938  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||    
T  40788939 cctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatt 40789038  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40789039 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttt--ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 40789125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 22182674 - 22182913
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22182674 gtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 22182773  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||       |||||    
T  22182774 cctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttagtgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataatt 22182873  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22182874 aatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 22182913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 11385909 - 11386158
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11385909 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 11386008  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||      
T  11386009 acaattttatcctttaagtgagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattaaagaaaaaaatatataattaatagggacatatatgtaa 11386108  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
         ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  11386109 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaattagtcttataaaaaggga 11386158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 255 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 17665821 - 17665568
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17665821 atactacattcgtccctaattatatgtcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttt 17665722  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||     
T  17665721 tacaattttatcttttaagagagagatgatatatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataattaataggggcatgcatgta 17665622  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
          ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17665621 aagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggagtcttataaaaagggataa 17665568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 284 - 557
Target Start/End: Original strand, 11851955 - 11852225
Alignment:
Q  284 cttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatga 383  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11851955 cttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttttacaattttatcctttaagagagagatga 11852054  T
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||| |||||| ||||       |||||||||||||||||||||||    
T  11852055 tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataattaataggggcatgcatgtaaataaataattaatgtagttggaaatagc 11852154  T
Q  484 aaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||           |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11852155 aaagggatcttataaaaagggacaaaaaaattc---tcaaaaggatcttataattagggacggaggtagtagtt 11852225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 23465431 - 23465182
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23465431 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 23465332  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||      
T  23465331 acaattttatcctttaagagagaattggttaatattttcaacatgatatttattgatgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaa 23465232  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
         ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23465231 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaaggga 23465182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 269 - 505
Target Start/End: Original strand, 32712538 - 32712774
Alignment:
Q  269 cctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgct 368  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  32712538 cctaattatatagcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtagttagtattgattttacaattttatcct 32712637  T
Q  369 ttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaat 468  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| | |||||||||       ||||||||    
T  32712638 ttaagagataaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaatagggacatgtatgtaaagaaataattaat 32712737  T
Q  469 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32712738 gtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaaggga 32712774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 267 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 20643767 - 20643529
Alignment:
Q  267 tccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatg 366  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  20643767 tccctaattatagggcccttttgaaaaaataacaggaattaagatagcgaatatttgtattatatatgtttgtaattagtattctttttacaattttatc 20643668  T
Q  367 ctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatta 466  Q
     ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  20643667 ttttaagagagagatgttttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagaggcatgtatgtaaagaaataatta 20643568  T
Q  467 atgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20643567 atgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 20643529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 41004240 - 41003990
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  41004240 atactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtgattaatattgtttt 41004141  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| || |||||||||||| |||||  ||||     
T  41004140 tataattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattaatgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatccatgta 41004041  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41004040 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 41003990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 265 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 7531890 - 7531647
Alignment:
Q  265 tgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 364  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7531890 tgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 7531791  T
Q  365 tgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
    | ||||||||||||  || |||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||       ||||    
T  7531790 tcctttaagagagatttgttttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaatgaaataat 7531691  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7531690 taatgtagttgaaaatagcaaagaggtcttataaaaagggataa 7531647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 15227900 - 15228139
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15227900 gtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 15227999  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     |||  |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||       |||||    
T  15228000 ccttcgagagagaattggtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataatt 15228099  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15228100 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 15228139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 40608000 - 40607749
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40608000 tacttcctctgtctctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 40607901  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  || |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| || ||||||||    
T  40607900 acaattttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttaaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgt 40607801  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40607800 aaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 40607749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 34113813 - 34113578
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34113813 gtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaatt----tagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 34113718  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||       |||||    
T  34113717 cctttaagagataattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataatt 34113618  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34113617 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 34113578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 24345715 - 24345464
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24345715 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaataactattgttttt 24345616  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||  |||||  ||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  24345615 acaattttatcctttaagaaagagagctgacttatgctttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 24345516  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  24345515 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaagggtcttataaaaaggga 24345464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 2060614 - 2060316
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2060614 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatatttgtaattactattgttttt 2060515  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||  || ||||||||    
T  2060514 acaattttatcctttaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagat-tataataaatatgggaatgtatgt 2060416  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           ||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||| ||         | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2060415 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtattataaaaagggacaaattttttttc-tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagt 2060317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 266 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 41834695 - 41834456
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41834695 gtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatactggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttttacaattttat 41834596  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt---nnnnnnnta 462  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| |||||||| |||||| ||||          ||    
T  41834595 cctttaagagagagatgatttatgttttctacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgattaataggggcatgcatgtatgtaaaaaata 41834496  T
Q  463 attaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41834495 attaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaag 41834456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 249 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 2200284 - 2200029
Alignment:
Q  249 tatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtat 348  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2200284 tatttactactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactat 2200185  T
Q  349 tgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggca 446  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||    || ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || | | ||||| | ||    
T  2200184 tatttttacaattttatcatttaagagagagtgttggtttctgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtacagtaaatagggtca 2200085  T
Q  447 tgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2200084 tgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 2200029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 18375490 - 18375239
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18375490 tactacctccgtccctaattatggagcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttt 18375391  T
Q  356 acaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  18375390 acaattttatcctttaagagagatgagtgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgt 18375291  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18375290 aaagaaataattaatatagttgtaaatagcaaatgagtcttataaaaaggga 18375239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 256 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 25523797 - 25523551
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25523797 tactacctctgttcctaattataggacccttttggaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 25523698  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    ||||||| || |||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||| |  ||||||||||      
T  25523697 acaatttaatcctttaagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaaaatgtataataaattggagcatgtatgtaa 25523598  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
         |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25523597 agaaataattaatgtagttggaaatagtaaatgggtcttataaaaag 25523551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 31751370 - 31751116
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31751370 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 31751271  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcg---aagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    |||||||||| |||||||  |||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |   || ||||| || |||||| ||||| || ||| |    
T  31751270 acaattttatcctttaagaaagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaaaaagatgtataataaataggggtatgca 31751171  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31751170 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 31751116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 34944158 - 34944402
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34944158 tactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgttttt 34944257  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| | |||||||||      
T  34944258 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttc-----gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagggacatgtatgtaa 34944352  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
         ||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||    
T  34944353 agaaataattaatgtagttggaaacagcaaaatgttcttataaaaaggga 34944402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 19318794 - 19319045
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19318794 tactacctctgtccctaattatagggtccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 19318893  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||| ||||| | | |||||||    
T  19318894 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatattttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacgtgtatgt 19318993  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19318994 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaaggga 19319045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 11865026 - 11865326
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11865026 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 11865125  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaag-aaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    |||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||||| || |||||| |||||  |||||||||    
T  11865126 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaagatgtataataaataggagcatgtatg 11865225  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtag 552  Q
    |       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||         | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11865226 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagagacaaaaaaaaattc-tcaaaagagtcttataattagggacggaggtag 11865324  T
Q  553 ta 554  Q
    ||    
T  11865325 ta 11865326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 256 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 19034708 - 19034465
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||    
T  19034708 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacta---ttttt 19034612  T
Q  356 acaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||| | ||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  19034611 acaattttgtcctttaagagagagtgttgatttatcttttcaacatgttatttattgttgaatgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 19034512  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 500  Q
           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19034511 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaa 19034465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 1142997 - 1143248
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1142997 tactacctccgtccctaattataagatccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 1143096  T
Q  356 acaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||| |||    || ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  1143097 acaattttatcctttaagaaagatggttggtttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgt 1143196  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  1143197 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaagagtcttataaaaaggga 1143248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 283 - 505
Target Start/End: Original strand, 44573655 - 44573873
Alignment:
Q  283 ccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatg 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||    
T  44573655 ccttttgaaaaaataacggaaattaagatactgaatatttgta---aatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagatggatg 44573751  T
Q  383 atttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 482  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  44573752 gtttatgtttt-aacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 44573850  T
Q  483 caaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  44573851 caaagaggtcttataaaaaggga 44573873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 273 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 28840918 - 28840685
Alignment:
Q  273 attatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaa 372  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  28840918 attataggaccattttaaaaaaataacgggaattaagat-gtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 28840820  T
Q  373 gagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgt 470  Q
    |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||||| ||||||| |||||||||       |||||| |||    
T  28840819 gagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattattgt 28840720  T
Q  471 agttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28840719 agttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 28840685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 271 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 7933703 - 7933471
Alignment:
Q  271 taattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttt 370  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  7933703 taattataggacccttttgaaaaaacaacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 7933604  T
Q  371 aagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaat 468  Q
    |||||||| |  || |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||       ||||||||    
T  7933603 aagagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaacatgtataataaatagaggcatgtatgtaaaacaataattaat 7933504  T
Q  469 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
      |||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  7933503 acagttggaaatagcaga-tggtcttataaaaag 7933471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 34883597 - 34883838
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34883597 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 34883696  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  34883697 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 34883796  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34883797 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 34883838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 37229728 - 37229487
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||| ||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  37229728 gtccctatatataagactcttttgtcaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 37229629  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  37229628 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatatataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 37229529  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37229528 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 37229487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Original strand, 20727616 - 20727848
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20727616 tataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaaga 20727715  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||       ||||||||||||    
T  20727716 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 20727815  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20727816 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 20727848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 25625017 - 25624779
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25625017 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 25624918  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     |||||||| ||    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||    
T  25624917 cctttaagaaaggttag-tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatt 25624819  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25624818 aatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 25624779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 282 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 1859819 - 1859595
Alignment:
Q  282 cccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta--agagagaa 379  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |  ||||||||    
T  1859819 cccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaaatttatccttcaagagagagaa 1859720  T
Q  380 atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaa 479  Q
     || ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||| ||       |||||||||||||||||||    
T  1859719 ttggtttatattttcaacatcttatttattgttgattgaagaaaaaaatgaataataaata-aggcatgtaggtaaagaaataattaatgtagttggaaa 1859621  T
Q  480 tagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||    
T  1859620 tagcaaatgagtcttataaaaaggga 1859595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 286 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 7666546 - 7666325
Alignment:
Q  286 tttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaa--atga 383  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||     
T  7666546 tttgaaaaaataacggaaattaagataatgaatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagtgaaggttgg 7666447  T
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 483  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||| | |||||||||       |||||||||||||||||||||||    
T  7666446 tatatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtacaataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 7666347  T
Q  484 aaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||| | ||||||||||||||||    
T  7666346 aaatgcgtcttataaaaaggga 7666325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 19353490 - 19353238
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | ||  ||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19353490 atactacctccgtccctaattataaggcctctttaaaaaaataaagggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttt 19353391  T
Q  355 tacaattttatgctttaaga--gagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||   ||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  19353390 tacaattttatcctttaagaatgagtgttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 19353291  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  19353290 taaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagggatcttataaaaaggga 19353238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 554
Target Start/End: Original strand, 26322042 - 26322330
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26322042 gtccttaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 26322141  T
Q  366 gctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||       |||    
T  26322142 cctttaagaaagagggctggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggtgcatgtatgtaaagaaataa 26322241  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26322242 ttaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 26322330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 256 - 504
Target Start/End: Original strand, 13336496 - 13336744
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13336496 tactacctccgtccctaattatagggttcttttgaaaaaataacgggaattaatatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 13336595  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    ||||||||||  ||||| |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||  || |||||| ||||| ||||| ||| |      
T  13336596 acaattttatcttttaaaagagagttggtttatgtttttaacatgttatttattgttgattgaataaaatgatgtataataaataggggcatatatataa 13336695  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggg 504  Q
         ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  13336696 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggaatcttataaaaaggg 13336744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 38121250 - 38121548
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||||||||||||    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38121250 tactacctccgtccctaattataaagtccttttaaaaaaataacggaatttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 38121349  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||    
T  38121350 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgt 38121449  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           |||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| ||           ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38121450 aaagaaataattaatgtagttggtaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagagtcttattattagggacggaggtagt 38121547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 255 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 7418793 - 7418552
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7418793 atactacctcagtccctaattataaagcccttttgaaaaaataacagaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 7418694  T
Q  355 tacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||  || |||||| ||||| ||||||||||    
T  7418693 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaatgatgtataataaataggggcatgtatg 7418594  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtctt 494  Q
    |       |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  7418593 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaagggtctt 7418552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 8716641 - 8716882
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  8716641 gtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 8716740  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  8716741 cctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaattaa 8716840  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  8716841 ttaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaaggga 8716882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 266 - 501
Target Start/End: Original strand, 13197394 - 13197631
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13197394 gtccctatatataagacccttttgccaaaatctcgggaattaagatagtggatatttgtattaaacttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 13197493  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  13197494 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 13197593  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13197594 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 13197631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 24974088 - 24973847
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24974088 gtccctaattacaagactcttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttat 24973989  T
Q  366 gctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||  | ||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  24973988 cctttaagaaaaagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgatagaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 24973889  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24973888 ttaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaaggga 24973847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 32121232 - 32120991
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  32121232 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 32121133  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  32121132 cctttaagaaagaaggttagtttatgtttttaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 32121033  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32121032 ttaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 32120991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Original strand, 1748380 - 1748632
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  1748380 atactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagattatggatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattatttt 1748479  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||| ||||  || |||||||    
T  1748480 tacaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggtatgtatg 1748579  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  1748580 taaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaagaggtcttataaaaaggga 1748632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 256 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 5255831 - 5255583
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5255831 tactaccttcgtccctaattataaggcttttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 5255732  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||    
T  5255731 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 5255632  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
           ||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  5255631 aaagaaataa-taatgtagttgaaaatagaaaagaggtcttataaaaagg 5255583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 15404457 - 15404697
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15404457 gtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 15404556  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||       |||    
T  15404557 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat-ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataa 15404655  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15404656 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 15404697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 4712005 - 4711774
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| | || |||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4712005 tataagacccttttgctaaaatcatgggaattaagatactggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat-ctttaaga 4711907  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||       ||||||||||||    
T  4711906 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 4711807  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4711806 ttggaaataacaaaggggccttataaaaaggga 4711774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 280 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 20252484 - 20252260
Alignment:
Q  280 gacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaa 379  Q
    ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  20252484 gacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagaaagaa 20252385  T
Q  380 a--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttgga 477  Q
       |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||| |||||    
T  20252384 ggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattgga 20252285  T
Q  478 aatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  20252284 aataacaaaggggtcttataaaaag 20252260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 298 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 5664894 - 5664685
Alignment:
Q  298 acggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgat---ttatgttttc 394  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |   |||||||||     
T  5664894 acgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaa-aaatgttagtttatgttttt 5664796  T
Q  395 aacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtctt 494  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5664795 aacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaatgaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtctt 5664696  T
Q  495 ataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||    
T  5664695 ataaaaaggga 5664685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 16108225 - 16108465
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16108225 gtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 16108324  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||| ||||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  16108325 ccttaagagagagagttagtttatattttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataat 16108424  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16108425 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 16108465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 266 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 45474603 - 45474369
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  45474603 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgtgaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 45474504  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  45474503 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 45474404  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataa 498  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  45474403 ttaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataa 45474369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 250 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 8990508 - 8990251
Alignment:
Q  250 atttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtatt 349  Q
    ||||| |||| | |||||| |||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||    
T  8990508 atttagtactccgtttgtctctatatataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactatt 8990409  T
Q  350 gtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcat 447  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| || ||    
T  8990408 gtttttacaatgttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtat 8990309  T
Q  448 gtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||       ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  8990308 gtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggttttataaaaaggga 8990251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 34062414 - 34062655
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| |||| |||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34062414 gtccctatatataagacctttttgctaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 34062513  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  34062514 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 34062613  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34062614 ctaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaaggga 34062655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 36130777 - 36131018
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  36130777 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 36130876  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||       |||    
T  36130877 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataa 36130976  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  36130977 ttaatgtagttgaaaataacaaaaaggtcttataaaaaggga 36131018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 12620108 - 12619854
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12620108 atactacctccgtccctaattatatgacatttttgaaaaaataatggtaattaagatagtgactatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttt 12620009  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaa----tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
     |||||||| | |||||||||||| |    || ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||   |||| ||    
T  12620008 cacaattttgtcctttaagagagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaatatatataataaatatgagcattta 12619909  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    | |       ||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  12619908 tataaagaaataattaatgtacttggaaatagcaaaagagttttataaaaaggga 12619854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 41450795 - 41450563
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  41450795 tataagacccttttgccaaaatcacaggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaaga 41450696  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||       ||||||||||||    
T  41450695 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtag 41450596  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41450595 ttggaaataacaaagggatcttataaaaaggga 41450563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Original strand, 45628619 - 45628871
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45628619 atactacctccgtccctaattataaagcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 45628718  T
Q  355 tacaattttatgcttt--aagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||  ||||  || ||||   ||  |||| ||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  45628719 tacaattttaccctttaaaaaagagggttggcttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 45628818  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       ||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  45628819 taaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaatgaatcttataaaaaggga 45628871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 281 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 1943847 - 1943624
Alignment:
Q  281 acccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa 380  Q
    |||||||||  ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||      
T  1943847 acccttttgtcaaaatcacgtgaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagatg 1943748  T
Q  381 --tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaa 478  Q
      |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||       ||||||||||||||||||    
T  1943747 gttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaa 1943648  T
Q  479 atagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  1943647 ataacaaaggggtcttataaaaag 1943624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 285 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 5070575 - 5070356
Alignment:
Q  285 ttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga--aatg 382  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    ||    
T  5070575 ttttaaaaaaataacgaaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaactactattgtttttataattttattctttaagagagatggttg 5070476  T
Q  383 atttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 482  Q
     |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||       |||||||||||||||| ||||     
T  5070475 gtttatgttttcaaca--ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatataggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttgg-aataa 5070379  T
Q  483 caaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||| |||| |||||||||||||    
T  5070378 caaaagggttttataaaaaggga 5070356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 39833749 - 39833989
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  39833749 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 39833848  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  39833849 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 39833948  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39833949 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 39833989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 256 - 435
Target Start/End: Original strand, 40173142 - 40173323
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  40173142 tactacctccgtcccttattatatgatccttttgaaaaaataacgggaattaagatcgtgaatatttatattaaatatgtttataattactattgttttt 40173241  T
Q  356 acaattttatgctttaagag--agaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataat 435  Q
    |||||||||| |||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  40173242 acaattttatcctttaagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataat 40173323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 256 - 453
Target Start/End: Original strand, 30779740 - 30779939
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  30779740 tactacctccgtccctaattataggatcattttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgttttt 30779839  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||| |||||  || |||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||| ||||  |||||||||||    
T  30779840 acaaatttatctttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgt 30779939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 303 - 481
Target Start/End: Original strand, 41967990 - 41968170
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatg 400  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || |||||||||||||||||    
T  41967990 aattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatg 41968089  T
Q  401 ttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaata 481  Q
    |||||||||| | || ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||    
T  41968090 ttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaata 41968170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 7492131 - 7491891
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| || | |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  7492131 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacaggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 7492032  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | ||| |||  |  ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  7492031 ccttaagagaaagagttagtttatgttttccatatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 7491932  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  7491931 taatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaaggga 7491891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 290 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 6007836 - 6007619
Alignment:
Q  290 aaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta--agagagaaatgattta 387  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||    
T  6007836 aaaaaataacgggaattaagataatatatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttcaagagagagaaatggttta 6007737  T
Q  388 tgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaag 487  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||| ||||| || ||||||||       |||||||||||||| |||||| ||||     
T  6007736 tgttttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaaaatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttagaaataacaaaa 6007637  T
Q  488 gggtcttataaaaaggga 505  Q
      || |||||||||||||    
T  6007636 atgttttataaaaaggga 6007619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 16669905 - 16669673
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16669905 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaaga 16669806  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||| | || ||||||||       ||||||||||||    
T  16669805 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatgggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtag 16669706  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16669705 ttgaaaataacaaaagggtcttataaaaaggga 16669673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 252 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 30466427 - 30466252
Alignment:
Q  252 ttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgt 351  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30466427 ttaatactacctccgtccctaattacagtgtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgt 30466328  T
Q  352 ttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  30466327 ttttacaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaa 30466252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 1360078 - 1359838
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1360078 gtccctaattataagactcttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 1359979  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  1359978 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 1359879  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1359878 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 1359838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 16805541 - 16805781
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16805541 gtccctaattataagactcttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 16805640  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  16805641 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 16805740  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16805741 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 16805781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 16844823 - 16845063
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16844823 gtccctaattataagactcttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 16844922  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  16844923 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 16845022  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16845023 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 16845063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 310 - 554
Target Start/End: Original strand, 18374496 - 18374741
Alignment:
Q  310 atagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttattta 407  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||    ||  |||||||||||||||  ||||||    
T  18374496 atagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt-atcttttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctattta 18374594  T
Q  408 ttgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggata 507  Q
    ||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  18374595 ttgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggagtcttataaaaagggaca 18374694  T
Q  508 annnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18374695 aaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 18374741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 23789256 - 23789016
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23789256 gtccctaattataagactattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 23789157  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  23789156 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 23789057  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23789056 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 23789016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 252 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 42629667 - 42629376
Alignment:
Q  252 ttaatactacctttgtccctaattatatgaccctttt-gaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 350  Q
    |||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||| |  ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||    
T  42629667 ttaatactccctccgtccctatatataagacccttttcgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattg 42629568  T
Q  351 tttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||      |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  |||  ||||||||    
T  42629567 tttttacaattttatcctttaagttag------tttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataatatataagggcatgta 42629474  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggagg 549  Q
    |||       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||          |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42629473 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaattttttt-ttcaaaagggtcttataattagggacggagg 42629376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 10399211 - 10399452
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||| |||||||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  10399211 gtccttaattataaggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacttttatttttacaattttat 10399310  T
Q  366 gctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||  | || ||||||||| || |||| | ||||| |||||||||||       |||    
T  10399311 cctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattactcattgaagaaaaagatgtatagtaaataggggcatgtatgtaaagaaataa 10399410  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  10399411 ttaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaacggga 10399452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 253 - 505
Target Start/End: Original strand, 8841394 - 8841647
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||   ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||    
T  8841394 taatactccctccgtccctaattataagactcttttactaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtt 8841493  T
Q  353 tttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||  |  ||||||||||| | |||||| |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||    
T  8841494 tttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtat 8841593  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8841594 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 8841647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 310 - 505
Target Start/End: Original strand, 15435670 - 15435866
Alignment:
Q  310 atagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttattta 407  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||||    
T  15435670 atagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattatatcatttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgtttttta 15435769  T
Q  408 ttgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||| | || ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15435770 ttgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt-aaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaaggga 15435866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 2438512 - 2438272
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  2438512 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttat 2438413  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | | |||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  2438412 ccttaagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 2438313  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2438312 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 2438272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 22897678 - 22897438
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  22897678 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatattat 22897579  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | | |||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  22897578 ccttaagaaagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 22897479  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22897478 taatgtagttggaaataacaaaggggttttataaaaaggga 22897438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 266 - 501
Target Start/End: Original strand, 36020999 - 36021235
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  36020999 gtccctatatataagacccttttgtcaaaatcatgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 36021098  T
Q  366 gctttaagagagaaatg---atttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnnta 462  Q
     |||||||| | |||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||    
T  36021099 cctttaaga-aaaaatgttagtttatgttttcgacatgttatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 36021196  T
Q  463 attaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  36021197 attaatatagttggaaataataaaggagtcttataaaaa 36021235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 292 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 40680989 - 40680774
Alignment:
Q  292 aaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatg 389  Q
    ||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||   |  ||||||    
T  40680989 aaaatcacgggaattaagatggtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgattttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 40680890  T
Q  390 ttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggg 489  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| || ||||||||       |||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  40680889 ttttcaacatgttatttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatatagttgaaaataacaaaggg 40680790  T
Q  490 gtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||    
T  40680789 gtcttataaaaaggga 40680774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 320 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 8782700 - 8782515
Alignment:
Q  320 tttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  8782700 tttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattg 8782601  T
Q  418 aagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    |||||||| || |||||| ||||    |||||||||       |||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||    
T  8782600 aagaaaaagatgtataataaatatgttcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataggaaaatagtcttataaaaagg 8782515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 266 - 557
Target Start/End: Original strand, 17408044 - 17408334
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17408044 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 17408143  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||  || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||       ||||    
T  17408144 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatactacttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataat 17408243  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17408244 taatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggagggagtagtt 17408334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 15917820 - 15918069
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||||||| |||||||||||||| |    |||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  15917820 tactacctctgtccctaattataaggtt-ttttaaaaaaataacgggaattaagatagtgaatattagtattaaatatgtttgtaattactatt-atttt 15917917  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    ||| |||||  |||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||| || |||||| ||||  | || ||||||    
T  15917918 acagttttaccctttaagagagagagttgatttacgttttgaacatgttatttattactgattgaagaaaaaaatgtataataaataaggacaagtatgt 15918017  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15918018 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaaggga 15918069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 16456622 - 16456862
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||   ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16456622 gtccctaattataagacccttttactaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 16456721  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | | |||||  |  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  16456722 ccttaagacagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 16456821  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  16456822 taatgtagttggaaatgacaaaagggtcttataaaaaggga 16456862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 285 - 505
Target Start/End: Original strand, 3060390 - 3060611
Alignment:
Q  285 ttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaag--agagaaatg 382  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||   ||    
T  3060390 ttttgaaaaaataacggaa-ttaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggttg 3060488  T
Q  383 atttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 482  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||       ||||||||||||||| ||| ||    
T  3060489 acttatgttttcaacattctatttattgctgattaaagaaaaagatatataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaacag 3060588  T
Q  483 caaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
     |||    |||||||||||||||    
T  3060589 aaaaaaaatcttataaaaaggga 3060611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 269 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 27560490 - 27560253
Alignment:
Q  269 cctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgct 368  Q
    |||||||||| |||| |||||  ||||| | || |||||| | ||| |||||||||||||||  ||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  27560490 cctaattataagaccattttgttaaaatcatgggaattaagaaagtagatatttgtattaaagttgtatgtaatcactattgtttttacaattttatcct 27560391  T
Q  369 tta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaa 467  Q
    | | | |||||  | |||||||||||  | |||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||       |||||||    
T  27560390 taagaaagagagttaatttatgtttttcatatgttacttattgatgattgaagaaaaatatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaa 27560291  T
Q  468 tgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27560290 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 27560253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 266 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 43701246 - 43701021
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||            ||| ||||||||||||||||||||    
T  43701246 gtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaa------------ttactattgtttttacaattttat 43701159  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| |||    ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||       |||    
T  43701158 cctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataa 43701059  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43701058 ttaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 43701021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 256 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 11201980 - 11201732
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||  |||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  11201980 tactccctctgtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgcgaattaaaaaagcagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 11201881  T
Q  356 acaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    |||||||||| ||| | || ||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||     
T  11201880 acaattttatccttaagagtgagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 11201781  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
          ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  11201780 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagtgtcttataaaaagg 11201732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 255 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 8295607 - 8295460
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  8295607 atactacctccgtccctaattataggacgtttttgaaaaaataacgggaattatgatagtggatatttgtatgaaatatgtatgtaattactattgtttt 8295508  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatg 400  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    || |||||||||||||||||    
T  8295507 tacaattttatcctttaagagagatggttggtttatgttttcaacatg 8295460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 29239343 - 29239583
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||| | || ||||||||||  ||||  |||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  29239343 gtccctaattataagactcttttgctaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgttataaagttgtttgtaatcactattgtttttagaattttat 29239442  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||       ||||    
T  29239443 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataat 29239542  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29239543 taatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 29239583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 284 - 501
Target Start/End: Original strand, 8030786 - 8030992
Alignment:
Q  284 cttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatga 383  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||||  ||     
T  8030786 cttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattgaatatgtttgtaatttctattatttttacaattttatcgtttaagagagagttgg 8030885  T
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 483  Q
    |||           ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||||    
T  8030886 ttt-----------atgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagc 8030974  T
Q  484 aaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||| | |||||||||||    
T  8030975 aaagtgatcttataaaaa 8030992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 12360742 - 12360503
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| | || |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12360742 gtccctatatataagacccttttgttaaaattaagggaattaagaaagtggatatttgtattaaagctgtttgtaatcattattgtttttacaattttat 12360643  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     ||| |||||| |||  |  ||| | ||||| | || |||||||||||||||  |||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  12360642 cctt-aagagacaaagttagtttctattttccatatattatttattgttgatttaagaaaaagatgtataat-aataggggcatgtatgtaaagaaataa 12360545  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12360544 ttaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttataaaaaggga 12360503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 15571464 - 15571177
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-ag 373  Q
    |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||| |||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||| | ||    
T  15571464 tataagacccttttgctaaaatcacggaaattaagaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttatagttttatccttaagag 15571365  T
Q  374 agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagt 473  Q
    |||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||  |||||||| || |||||| |||||   ||||||| |       |||||||||||||    
T  15571364 agagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggaacatgtatctaaagaaataattaatgtagt 15571265  T
Q  474 tggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga-taannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagttgat 560  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||  ||         |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15571264 tggaaatagcaaaaggatcttataaaaagggacaaaaaaaaaattcttcaaaagagtcttataattaaggacggaggtagtaattgat 15571177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 279 - 505
Target Start/End: Original strand, 9697904 - 9698131
Alignment:
Q  279 tgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagag 377  Q
    |||||||||||  ||||| |||| |||||| | |  ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  9697904 tgacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaatcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagag 9698003  T
Q  378 aaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttgga 477  Q
    |  |  ||||| ||||  | ||  || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||||||||||||||    
T  9698004 agttagtttatatttttcatatactacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgga 9698103  T
Q  478 aatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  9698104 aataacaaaggggtcttataaaaaggga 9698131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 256 - 486
Target Start/End: Original strand, 15353203 - 15353430
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||||||| ||||||||  |||| |||  |||||  ||||| |||  |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  15353203 tactacctctgtccctatatataagacatttttgtcaaaatcacgagaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 15353302  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    ||||||||||  ||||||||||   | |||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||      
T  15353303 acaattttatcgtttaagagag--ttaatttattttttcaacatactatttattgttgattgaag-aaaagatatataataaataggggcatgtttgtaa 15353399  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaa 486  Q
         ||||||||||||||||||||||||||    
T  15353400 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 15353430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 23083776 - 23083541
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt--tatgctttaa 372  Q
    |||| |||||||||   ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||| |  |||||||||| | |||||||||||||||||  ||| | ||||    
T  23083776 tataggaccctttttctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattagagttgtttgtaatcactattgtttttacaatttaatattccttaa 23083677  T
Q  373 gagagaaa----tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaat 468  Q
    |||||| |    || ||||||||||| | || |||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||       | ||||||    
T  23083676 gagagagagagttggtttatgttttccatatcttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgtaaaaaaattattaat 23083577  T
Q  469 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggg 504  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23083576 gtagttcgaaatagcaaatgggtcttataaaaaggg 23083541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 303 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 45152001 - 45151795
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagta----ttgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaaca 398  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||    || ||||||||||||||| | ||||||||||  |  ||||||||||| | |    
T  45152001 aattaaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactatagtttttttttacaattttat-ccttaagagagagttagtttatgttttccata 45151903  T
Q  399 tgttatttattgttgatcgaag-aaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata 497  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  45151902 tgttatttattgctgattgaagaaaaaagatatataataaataagggcatgtatgtaaaaatataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttata 45151803  T
Q  498 aaaaggga 505  Q
    ||||||||    
T  45151802 aaaaggga 45151795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 254 - 441
Target Start/End: Original strand, 1422161 - 1422349
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | ||| |||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||    
T  1422161 aatactacctccgtccctatatataagacccttttgttaaaattacgggaattaagaaagtagatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgttt 1422260  T
Q  354 ttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatag 441  Q
    |||||||||||||||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  1422261 ttacaattttatgcttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatag 1422349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 283 - 390
Target Start/End: Original strand, 16636389 - 16636496
Alignment:
Q  283 ccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatg 382  Q
    |||||||||||| ||| |  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  16636389 ccttttgaaaaattaatgagaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagagatg 16636488  T
Q  383 atttatgt 390  Q
     |||||||    
T  16636489 gtttatgt 16636496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 508
Target Start/End: Original strand, 19630948 - 19631182
Alignment:
Q  274 ttatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-a 372  Q
    ||||| |||||||||   ||||| |||  |||||| | |||| ||||||||||||||  | ||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| | |    
T  19630948 ttataagacccttttactaaaatcacgagaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttatttctaatcactattgtttttacaattttatccttaaga 19631047  T
Q  373 gagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
    ||||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||       ||||||||||||    
T  19631048 gagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtag 19631147  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  19631148 ttggaaataac-aaggggtcttatataaagggataa 19631182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 508
Target Start/End: Original strand, 19827849 - 19828083
Alignment:
Q  274 ttatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-a 372  Q
    ||||| |||||||||   ||||| |||  |||||| | |||| ||||||||||||||  | ||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| | |    
T  19827849 ttataagacccttttactaaaatcacgagaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttatttctaatcactattgtttttacaattttatccttaaga 19827948  T
Q  373 gagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
    ||||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||       ||||||||||||    
T  19827949 gagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtag 19828048  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  19828049 ttggaaataac-aaggggtcttatataaagggataa 19828083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 316 - 555
Target Start/End: Original strand, 7116099 - 7116337
Alignment:
Q  316 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttga 414  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| |||    
T  7116099 gatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctga 7116198  T
Q  415 tcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnn 514  Q
    |  |||||||| || |||||| ||||| | |||||||||       |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||          
T  7116199 ttcaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggatcttataaaaagggacaatttttt 7116298  T
Q  515 nnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtag 555  Q
         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7116299 ttc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtag 7116337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 318 - 477
Target Start/End: Original strand, 7461290 - 7461448
Alignment:
Q  318 tatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcg 417  Q
    |||||||||||||  |||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |    
T  7461290 tatttgtattaaagttgtttgaaatcactatcgtttttacaattttat-cttttagagagagttaatttatgttttcaatatactatttattgttgattg 7461388  T
Q  418 aagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttgga 477  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||||||||||       |||||||||||||||||    
T  7461389 aagaaaaatatatataataaatatgagcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgga 7461448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 453
Target Start/End: Original strand, 3670227 - 3670428
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgt------------tt 353  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||            ||    
T  3670227 gtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtaatcactattgttt 3670326  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||    
T  3670327 ttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 3670426  T
Q  452 gt 453  Q
    ||    
T  3670427 gt 3670428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 281 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 8867853 - 8867712
Alignment:
Q  281 acccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa 380  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| | || ||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  8867853 acccttttgacaaaatcacgggaataagaa-agttgatatttctattaaatttgtttgtaattactattatttttacgattttatcctttaagagagaga 8867755  T
Q  381 tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
       ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  8867754 --gtttatgttttcaacatgctatttattgttaattgaagaaaaa 8867712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 269 - 354
Target Start/End: Original strand, 26334637 - 26334722
Alignment:
Q  269 cctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26334637 cctaattataaagcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 26334722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 255 - 444
Target Start/End: Original strand, 44436223 - 44436414
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||  | |||||||||    
T  44436223 atactacctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgtatatttgtattaaagttgtttgtaaacactattgtttt 44436322  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagagg 444  Q
    ||||| |||||  ||||||| ||| |  |  ||||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||    
T  44436323 tacaaatttatcttttaagaaagagagttagtttatgttttcaagatactatatattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagagg 44436414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12873241 - 12873177
Alignment:
Q  260 acctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  12873241 acctttgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacagaaattaagatagtggatatttgt 12873177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 252 - 556
Target Start/End: Original strand, 18970465 - 18970768
Alignment:
Q  252 ttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgt 351  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||    
T  18970465 ttaatactacctccgtccctaaatatatgagccttttgcaaaaattgcggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgt 18970564  T
Q  352 ttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||| ||  | ||| ||||  || | ||     
T  18970565 ttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaaaatgcaaaataaataagggtaggtt 18970664  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggt 550  Q
     ||       ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||           ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18970665 ggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaagggatcttatgaaaagggacaattttttttc--tcaaaagggtcttataattagggacagaggt 18970762  T
Q  551 agtagt 556  Q
    ||||||    
T  18970763 agtagt 18970768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 343 - 504
Target Start/End: Original strand, 13215646 - 13215808
Alignment:
Q  343 tagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatag 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||     
T  13215646 tagtattatttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaataa 13215745  T
Q  442 aggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggg 504  Q
     || ||||  ||       ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  13215746 gggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaagggtcttataaaaaggg 13215808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 13598814 - 13598641
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||| | | | |||| |  || ||||| |||| ||||||| ||||| ||||    
T  13598814 tactacctccgtccctaattatagggccctttagaaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtgataataaatctgttggtaattactattggtttt 13598715  T
Q  356 acaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatat 428  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||  | |||||||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13598714 acaattttattcttaagagatagagttaatttatgttttcaatatagtatttaatgttgattgaagaaaaatat 13598641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 317 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 29831002 - 29830817
Alignment:
Q  317 atatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttga 414  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||  ||||||||| | |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29831002 atatttgtattaaatttgtttgtaattattatt--ttttacaattttatcatttaagagaaagagtttgtttatgttttcaacatgttatttattgttga 29830905  T
Q  415 tcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaa-aggggtcttataaaaag 502  Q
      | ||||||| || |||||| |||| ||| ||||| ||       ||||||||||||||  ||||| |||  ||||||||||||||||    
T  29830904 cggtagaaaaa-atgtataataaataaaggtatgtaagtaaaaaaataattaatgtagtttaaaataacaaggggggtcttataaaaag 29830817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 384 - 505
Target Start/End: Original strand, 10757847 - 10757968
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 483  Q
    ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||   ||||||||||       ||||||||||||||||||||| |    
T  10757847 tttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataagagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataac 10757946  T
Q  484 aaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10757947 aaaggggtcttataaaaaggga 10757968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 384 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 12873157 - 12873040
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |  ||||||  |||| |  ||||||||       ||||||||||||||||||||| |    
T  12873157 tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagacgtataatagatagtgatatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataac 12873058  T
Q  484 aaaggggtcttataaaaa 501  Q
    || |||||||||||||||    
T  12873057 aagggggtcttataaaaa 12873040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 327
Target Start/End: Original strand, 15435587 - 15435655
Alignment:
Q  259 tacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtatt 327  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  15435587 tacctctgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtatt 15435655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Original strand, 4408584 - 4408687
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  4408584 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatccttaagagagagaattaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaaga 4408683  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  4408684 aaaa 4408687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 271 - 378
Target Start/End: Original strand, 12296182 - 12296289
Alignment:
Q  271 taattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | | || | |  || ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||    
T  12296182 taattatatgacccttttgaaaaaataacgggaattaagaaaattgaaagtgataataaatttgtttgtaatcactattgtttttacaattttacccttt 12296281  T
Q  371 aagagaga 378  Q
    ||||||||    
T  12296282 aagagaga 12296289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 28566381 - 28566278
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | ||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||    
T  28566381 gtattaaatttgtatataattagtattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcagcataatatttattgttgattgaaga 28566282  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  28566281 aaaa 28566278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 554
Target Start/End: Original strand, 29830514 - 29830791
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-ag 373  Q
    |||| ||||||||||  ||||| ||| ||| ||| | | || ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  29830514 tataagacccttttgtcaaaatcacgaaaagtaagaaaatgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcatttagag 29830613  T
Q  374 agagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgta 471  Q
    ||||| |  |  |||||||||||||  || |||||  || | |||||||||||| || |||| | ||||| || |||| |||       |||||||||||    
T  29830614 agagatagttagtttatgttttcaatttgctatttgatgcttatcgaagaaaaagatgtatagtaaataggggtatgtgtgtaaagaaataattaatgta 29830713  T
Q  472 gttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||| ||          |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  29830714 gttggaaatagc-aatgagtcttataaaaagggacaacaaatt----ttcaaaaaggtcttataattagggacggaggtagta 29830791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 255 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 6028640 - 6028454
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  |||||||| |||| ||  |||||| |||||| ||||| ||||| | ||| |||  | ||||||||| ||| | ||| || |||||||||    
T  6028640 atactacctccgtccctaaatataagagtcttttgcaaaaattacggagattaagaaagttgattatagtattaaatttgtatataactactattgtttt 6028541  T
Q  355 tacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaata 440  Q
    || |||||||| ||| | |||||||  | |||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||    
T  6028540 tataattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatataaaataaata 6028454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 339 - 505
Target Start/End: Original strand, 31633670 - 31633837
Alignment:
Q  339 taattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataatta 437  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||| | |||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| |    
T  31633670 taattactattgtttttacaattttgtccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataa 31633769  T
Q  438 atagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||  || ||||  ||       ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31633770 ataagggtatgttagtaaataaataattaatgtacttggaaatacaaaaggggtcttataaaaaggga 31633837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 9701300 - 9701070
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  9701300 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagatagaattaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 9701201  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttc 521  Q
    ||||  |  | ||| ||||  || ||||  ||       ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||          |||    
T  9701200 aaaaattgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagggacaaattatttt--ttc 9701103  T
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9701102 aaaagggtcttataattaaggacggaggtagta 9701070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 21838846 - 21838743
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga-aatga-tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaag 420  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  21838846 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttat-ctttaagagagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 21838748  T
Q  421 aaaaa 425  Q
    |||||    
T  21838747 aaaaa 21838743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 554
Target Start/End: Original strand, 36750615 - 36750921
Alignment:
Q  248 atatttaa-tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagt 346  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||| |||| || |||||||  |||||  |||| ||||| | ||||| |  | ||||||||| ||| |  |||||      
T  36750615 atatttaagtactacctccgtccctaaatataggagccttttgccaaaattgcggagattaagaaagtgggttgtagtattaaatttgtataaaattaca 36750714  T
Q  347 attgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggc 445  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| | ||  ||     
T  36750715 attttttttacaattttatccttaagagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataattaagggt 36750814  T
Q  446 atgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacg 545  Q
    ||||  ||       ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||          |||||||| ||||||||||||||||||    
T  36750815 atgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaagaggtcttataaaaagggacaaattatttt--ttcaaaagggtcttataattagggacg 36750912  T
Q  546 gaggtagta 554  Q
    || ||||||    
T  36750913 gaagtagta 36750921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 388 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 44017904 - 44017784
Alignment:
Q  388 tgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaag 487  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  | || |||||| ||||| |||||| ||||| || ||||| ||       |||||||||||| ||||||||||||||    
T  44017904 tgttttcaagatgctatttattactaattgaagaagaatatgtataataaataggggtatgtaagtaaataaataattaatgtagctggaaatagcaaag 44017805  T
Q  488 gggtcttataaaaagggataa 508  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  44017804 gggtcttataaaaatggataa 44017784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 461 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 30466195 - 30466153
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30466195 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 30466153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Original strand, 11944445 - 11944548
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagag--agaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaag 420  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||| |||||||||||||  ||||||| |||||| ||||    
T  11944445 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttat-ctttaagagaaagaattaattcatgttttcaacataatatttatcgttgattgaag 11944543  T
Q  421 aaaaa 425  Q
    |||||    
T  11944544 aaaaa 11944548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Original strand, 24300297 - 24300341
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24300297 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 24300341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 30858168 - 30857938
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  30858168 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 30858069  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttc 521  Q
    |||| ||  | ||| ||||  || ||||  ||       |||||||||||  |||||||| |||| | |||||||||||||||| ||          |||    
T  30858068 aaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacatggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaaattatttt--ttc 30857971  T
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  30857970 aaaagggtcttataattagggacgggggtagta 30857938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 339 - 554
Target Start/End: Original strand, 41494445 - 41494659
Alignment:
Q  339 taattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataatta 437  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| |    
T  41494445 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagaattaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataa 41494544  T
Q  438 atagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataat 537  Q
    |||  || ||||  ||       ||||||||||| ||| ||||| |||| | || ||||||||||||| ||          |||||||| ||||||||||    
T  41494545 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagagttttataaaaagggacaaattatttt--ttcaaaagggtcttataat 41494642  T
Q  538 tagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||||    
T  41494643 tagggacggaggtagta 41494659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Original strand, 2788145 - 2788248
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||    
T  2788145 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgagga 2788244  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  2788245 aaaa 2788248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Original strand, 30830150 - 30830253
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||    |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  30830150 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 30830249  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  30830250 aaaa 30830253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 32511186 - 32511066
Alignment:
Q  385 ttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagca 484  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||    |||||||||       ||||||||||||||| ||||||||    
T  32511186 ttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatacgaacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagca 32511087  T
Q  485 aaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||  |||||||||||||||||    
T  32511086 aataggtcttataaaaaggga 32511066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 40544624 - 40544461
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||  |||||| |||||| | ||| ||||| | ||| | |  |  |||||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  40544624 atactacctccgtccctaattataggagtcttttgcaaaaatgatggagattaagaaagttggttgtaatattaaatttgtatataattactattgtttt 40544525  T
Q  355 tacaattttatgctttaa-gagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcg 417  Q
    || |||||||| ||| || ||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40544524 tataattttatccttaaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgatcg 40544461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 41422725 - 41422512
Alignment:
Q  340 aattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaa 438  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||    
T  41422725 aattactattgtttttacaattttatccttaagagagagaatttatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaa 41422626  T
Q  439 tagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataatt 538  Q
    ||  || ||||  ||       ||||||||||| ||| ||||| |||| | || ||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||    
T  41422625 taagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagagttttataaaaagggacaaattatttt--ttcaaaagggtcttataatt 41422528  T
Q  539 agggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||||||||    
T  41422527 agggacggaggtagta 41422512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 303 - 501
Target Start/End: Original strand, 16809003 - 16809201
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttt-aagagagaaatgatttatgttttcaacatgt 401  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |  ||||| ||||||| ||||    
T  16809003 aattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaaagagagagttagtttatattttcaaaatgt 16809102  T
Q  402 tatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
     ||||| ||  ||| ||| ||||| || |||| | ||||||| |||||||||       |||||||| |||||| |||||| |||  | |||||||||||    
T  16809103 aatttaatgccgattgaa-aaaaagatgtatattaaatagagacatgtatgtaaataaataattaatatagttgaaaataggaaaatgatcttataaaaa 16809201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 303 - 501
Target Start/End: Original strand, 16848284 - 16848482
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttt-aagagagaaatgatttatgttttcaacatgt 401  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |  ||||| ||||||| ||||    
T  16848284 aattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaaagagagagttagtttatattttcaaaatgt 16848383  T
Q  402 tatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
     ||||| ||  ||| ||| ||||| || |||| | ||||||| |||||||||       |||||||| |||||| |||||| |||  | |||||||||||    
T  16848384 aatttaatgccgattgaa-aaaaagatgtatattaaatagagacatgtatgtaaataaataattaatatagttgaaaataggaaaatgatcttataaaaa 16848482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 275 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 32511279 - 32511189
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||| ||| ||||||  ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  32511279 tataagactcttttgttaaaataacggaaattaagaaagtgaaaatttgtattaaaattgtttgtaattactgttgtttttacgattttat 32511189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 503
Target Start/End: Original strand, 6650975 - 6651144
Alignment:
Q  336 ttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaa--gagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatata 433  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||  || ||  ||||||| |    |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || ||||    
T  6650975 ttgtaatttttattgtttttacaattttatcattcaaaagagagaattagagtatgttttcaacgtgttatttattgttgattgaggaaaaaaatgtata 6651074  T
Q  434 attaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    || |||||||  || || ||       ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  6651075 ataaatagagatatatacgtaaaaaaataattaatgtaattgaaaatagcaaagagaccttataaaaagg 6651144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 384 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 7447033 - 7446964
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  7447033 tttatgttttcaacatattatttattgcagattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 7446964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 499
Target Start/End: Original strand, 26273372 - 26273540
Alignment:
Q  333 tgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatt----tatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatat 428  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||    |||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  26273372 tgtttgtaattgctattgttattacaattttatcctttaagagag--atgattagtgtatgtttctaacatcatatttaatgttgattgaagaaaaaaat 26273469  T
Q  429 atataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaa 499  Q
    ||| ||| |||||||   |||  ||       ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26273470 ataaaataaatagagatgtgttagtaaagaattaattaatgtacttgaaaatatcaaaggggtcttataaa 26273540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3095530 - 3095426
Alignment:
Q  322 tgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaag 420  Q
    |||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||| |||  | |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  3095530 tgtattaaatttgtatacaattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 3095431  T
Q  421 aaaaa 425  Q
    |||||    
T  3095430 aaaaa 3095426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 3904677 - 3904570
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaag 420  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||  ||||||||||| |  |||||||| |||| ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  3904677 gtattaaatttgtttgcaattactattgtttttataattatatcatttaagagagagagttgatttatatttttaacaaagtatttattgctgattgaag 3904578  T
Q  421 aaaaatat 428  Q
    ||||||||    
T  3904577 aaaaatat 3904570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 378
Target Start/End: Original strand, 16807067 - 16807123
Alignment:
Q  322 tgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga 378  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16807067 tgtaataaatttgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga 16807123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 378
Target Start/End: Original strand, 16846348 - 16846404
Alignment:
Q  322 tgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga 378  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16846348 tgtaataaatttgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagagaga 16846404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 554
Target Start/End: Original strand, 26334717 - 26334882
Alignment:
Q  388 tgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaag 487  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || ||| || ||||| | |||||||||       ||||||| | |||| ||||||  ||||    
T  26334717 tgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaacgaagttagaaataaaaaag 26334816  T
Q  488 gggtctta-taaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||| |||||||||| ||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26334817 gggtcttaataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 26334882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 501
Target Start/End: Original strand, 9040926 - 9041092
Alignment:
Q  336 ttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatata 433  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||| | |  |  ||||||||||  | ||||||||||||| ||||  |||||||| || ||||    
T  9040926 ttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagatatagttagtttatgtttttcatatgttatttattgctgattcaagaaaaaaatgtata 9041024  T
Q  434 attaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    || ||||| |||||||||||       | |||||| |||||| ||||| |||| | ||||||||||||    
T  9041025 ataaataggggcatgtatgtaaaaaaatcattaatatagttgaaaataacaaacgagtcttataaaaa 9041092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 378
Target Start/End: Original strand, 11083496 - 11083547
Alignment:
Q  327 taaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga 378  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11083496 taaatttgtttgtaattgctattgtttttacaattttatcctttaagagaga 11083547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 374
Target Start/End: Original strand, 22302593 - 22302644
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22302593 gtattaaatttgtttgtaattattattatttttacaattttatcctttaaga 22302644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 435
Target Start/End: Original strand, 18223700 - 18223821
Alignment:
Q  317 atatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagag--aaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttga 414  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || | ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |  |  |||||||||||||  || |||||||||||||    
T  18223700 atatttgtattaaagttgtttgtgatcactattgtttttacaattttatcatttaagagagttagttagtttatgttttcaaagtgatatttattgttga 18223799  T
Q  415 tcg-aagaaaaatatatataat 435  Q
    | | |||||||| || ||||||    
T  18223800 ttgaaagaaaaagatgtataat 18223821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 43700833 - 43700664
Alignment:
Q  341 attagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatg---atttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataatt 436  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| | |   |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || || |||     
T  43700833 attactattgtttttacaattttatccttaagagagagagaggttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaata 43700734  T
Q  437 aatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa-ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||  || ||||  ||        || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43700733 aataagggtatgttggtaaaaaaaaaaattaatgtacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaaggga 43700664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 519 - 556
Target Start/End: Original strand, 2200242 - 2200279
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagt 556  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2200242 ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtagt 2200279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 519 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 3095334 - 3095297
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagt 556  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3095334 ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtagt 3095297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 281 - 378
Target Start/End: Original strand, 4897418 - 4897515
Alignment:
Q  281 acccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga 378  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| | | | || | | ||| ||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  4897418 acccttttgaaaaaataatgggaattaagaaaattgaaaatagtaataaatttgtttgtaatcactattgtttttataattttgtcctttaagagaga 4897515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 281 - 378
Target Start/End: Original strand, 4944812 - 4944909
Alignment:
Q  281 acccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga 378  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| | | | || | | ||| ||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  4944812 acccttttgaaaaaataatgggaattaagaaaattgaaaatagtaataaatttgtttgtaatcactattgtttttataattttgtcctttaagagaga 4944909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 203
Target Start/End: Original strand, 13488392 - 13488425
Alignment:
Q  170 ttttatttatcaatttcaactttcaagttaataa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13488392 ttttatttatcaatttcaactttcaagttaataa 13488425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 519 - 559
Target Start/End: Original strand, 24345680 - 24345720
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagttga 559  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24345680 ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtaattga 24345720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Original strand, 34432146 - 34432190
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  34432146 taattaatgtacttggaaacatcaaaggggtcttataaaaaggga 34432190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 440
Target Start/End: Original strand, 40348225 - 40348328
Alignment:
Q  336 ttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataat 435  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||| |||| |  ||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| ||||| || ||||||    
T  40348225 ttgtaatcactattgtttttacaattttat-ccttaagaaagaattagtttatgtttttcatatgttatttattattgattgaaaaaaaagatgtataat 40348323  T
Q  436 taata 440  Q
     ||||    
T  40348324 aaata 40348328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Original strand, 44436767 - 44436811
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44436767 taattaatgtaattggaaatagcaaatgagtcttataaaaaggga 44436811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 522 - 557
Target Start/End: Original strand, 13215825 - 13215860
Alignment:
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13215825 aaaagggtcttataattagggacggaggtagtagtt 13215860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 18294220 - 18294120
Alignment:
Q  324 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaa 422  Q
    |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||| |||  ||||||||||||| |  ||  |||||||||||||| ||||||    
T  18294220 tattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttattcttaagagaaagagttgatttatgttttta--ataatatttattgttgattgaagaa 18294123  T
Q  423 aaa 425  Q
    |||    
T  18294122 aaa 18294120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 298
Target Start/End: Original strand, 41422511 - 41422554
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataa 298  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41422511 atactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataa 41422554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 41494660 - 41494617
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataa 298  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41494660 atactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataa 41494617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 519 - 557
Target Start/End: Original strand, 2060579 - 2060617
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2060579 ttcaaaagggtcctataattagggacggaggtagtagtt 2060617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 298
Target Start/End: Original strand, 3095299 - 3095341
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataa 298  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3095299 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataa 3095341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 418 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 8295455 - 8295368
Alignment:
Q  418 aagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| |||||| ||||  || ||||||||       |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||    
T  8295455 aagaaaaatatgtataataaatatgggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttgtaaagaggga 8295368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 519 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 11865061 - 11865023
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11865061 ttcaaaagggccttataattagggacggaggtagtagtt 11865023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12890252 - 12890206
Alignment:
Q  249 tatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaa 295  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12890252 tattaaatactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaa 12890206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 519 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 13598557 - 13598519
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13598557 ttcaaaagggtcttatatttagggacggaggtagtagtt 13598519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 308
Target Start/End: Original strand, 18374427 - 18374481
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaa 308  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18374427 aatactacctccgtccctaattataaggcccttttaaaaaaataacgggaattaa 18374481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 520 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 28566185 - 28566151
Alignment:
Q  520 tcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28566185 tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 28566151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 521 - 554
Target Start/End: Original strand, 1360055 - 1360088
Alignment:
Q  521 caaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1360055 caaaagagtcttataattagggacggagggagta 1360088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11121211 - 11121111
Alignment:
Q  327 taaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga--gagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaa 424  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||  ||||  || | ||||||||||||||   ||||| ||||||| ||| ||||    
T  11121211 taaatttgtttgtaattactactgtttttacaattttatcatttaagagggagagttggtgtatgttttcaacataacatttaatgttgattgaataaaa 11121112  T
Q  425 a 425  Q
    |    
T  11121111 a 11121111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 521 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 16805564 - 16805531
Alignment:
Q  521 caaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16805564 caaaagagtcttataattagggacggaggaagta 16805531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 521 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 16844846 - 16844813
Alignment:
Q  521 caaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16844846 caaaagagtcttataattagggacggaggaagta 16844813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 521 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 29239366 - 29239333
Alignment:
Q  521 caaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29239366 caaaagagtcttataattagggacggagggagta 29239333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 521 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 31751102 - 31751069
Alignment:
Q  521 caaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31751102 caaaagggtcttataattagggacggaggtagta 31751069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 361
Target Start/End: Original strand, 36556204 - 36556241
Alignment:
Q  324 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatt 361  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36556204 tattaaatttgtttgtaattactattgtttttacaatt 36556241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 522 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 2200010 - 2199978
Alignment:
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2200010 aaaagggtcttataattagggacggaggtagta 2199978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Original strand, 2788283 - 2788327
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2788283 taagtaatgtacttggaaataccaaagtggtcttataaaaaggga 2788327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 522 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 8841429 - 8841397
Alignment:
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8841429 aaaagagtcttataattagggacggagggagta 8841397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 489
Target Start/End: Original strand, 16636508 - 16636536
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggg 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16636508 taattaatgtagttggaaatagcaaaggg 16636536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 522 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 23083547 - 23083515
Alignment:
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23083547 aaaagggtcttataattagggacggaggtagta 23083515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 266 - 298
Target Start/End: Original strand, 30857948 - 30857980
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataa 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30857948 gtccctaattataagacccttttgaaaaaataa 30857980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 266 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 36750911 - 36750879
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataa 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36750911 gtccctaattataagacccttttgaaaaaataa 36750879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #192
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 40544415 - 40544371
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  40544415 taattaatgtacttggaaatatcaaatgagtcttataaaaaggga 40544371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 170)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 266 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 32759844 - 32759556
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32759844 gtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatggtggatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 32759745  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||       |||||    
T  32759744 cctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataatt 32759645  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||          |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  32759644 aatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttcttttcaaaaaggtcttataattagggacggaggtagta 32759556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 254 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 1575017 - 1574766
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1575017 aatactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 1574918  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  1574917 ttacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaataatatgtatatttaataggggcatgtatgt 1574818  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1574817 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaaggga 1574766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 12930616 - 12930318
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12930616 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 12930517  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||      
T  12930516 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 12930417  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttat-aaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||         | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12930416 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaagggacaatttttttttc-tcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 12930318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 254 - 505
Target Start/End: Original strand, 11647573 - 11647824
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||   ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11647573 aatactacctccctccttaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 11647672  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||  |||||||||||    
T  11647673 ttacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaataagggcatgtatgt 11647772  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11647773 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 11647824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 266 - 554
Target Start/End: Original strand, 35569403 - 35569688
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35569403 gtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 35569502  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||    
T  35569503 cctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatt 35569602  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||          |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35569603 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaggacaattttttt---ttcaaaagggtcttataattaaggacggaggtagta 35569688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 27529524 - 27529229
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27529524 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 27529425  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||      
T  27529424 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 27529325  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
         ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||          ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27529324 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggacaattttttt---ttcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 27529229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 253 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 43280003 - 43279752
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43280003 taatactacatccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 43279904  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  43279903 tttacaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatag-ggcatgtatg 43279805  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43279804 taaagaaataattaatgtagtaggaaatagtaaaggggtcttataaaaaggga 43279752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 256 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 23920028 - 23919781
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23920028 tactacctccgtccctaattatagggctcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 23919929  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||      
T  23919928 acaattttatcttttaagagaaagatggtttatgttttcaacatattatttattgttgatggaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 23919829  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
         ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  23919828 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaagagtcttataaaaagg 23919781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 6799285 - 6799534
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6799285 tactacctccgtcccaaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 6799384  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||      
T  6799385 acaattttatcctttaagagagagatagtttatgctttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatatatgtaa 6799484  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
         ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6799485 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagagatcttataaaaaggga 6799534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 266 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 19920848 - 19920612
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  19920848 gtccctaattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttac-attttat 19920750  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||       |||||    
T  19920749 cctttaagagagaattgatttatgttttcaacatgatatttattaatgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataatt 19920650  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19920649 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 19920612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 265 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 10475990 - 10475751
Alignment:
Q  265 tgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 364  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10475990 tgtccctaattataagacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttta 10475891  T
Q  365 tgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnnta 462  Q
    | ||||||||||||  | || |||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||| || ||||||  |||| | |||||||||       ||    
T  10475890 tcctttaagagagagtattggtttatgttttcaacatgtcatttattgctaattgaagaaaaagatgtataatatatagggtcatgtatgtaaataaata 10475791  T
Q  463 attaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10475790 attaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 10475751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 269 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 45907528 - 45907292
Alignment:
Q  269 cctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgct 368  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  45907528 cctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 45907429  T
Q  369 ttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaat 468  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||  ||||       ||||||||    
T  45907428 ttaagagagaattgatttatgtttccaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatacatgtaaaaaaataattaat 45907329  T
Q  469 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  45907328 gtagttggaaataataaaggggtcttataaaaaggga 45907292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 254 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 3024880 - 3024631
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3024880 aatactacctccgtccttaattatagggccctttt-aaaaaataacgggaattaagatagtgaatgtttgtattaaatatatttgtaattagtattgttt 3024782  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||    
T  3024781 t-acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaataggggcatatatgt 3024683  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3024682 aaagaaataattaatatagttggaaatagcaaagaagtcttataaaaaggga 3024631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 42298177 - 42298416
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  42298177 gtccctaattataggatccttttgaaaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattatttttacaattttat 42298276  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||       |||||    
T  42298277 cctttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataatt 42298376  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42298377 aatatagttggaaatagcaaaggggtcttatgaaaaggga 42298416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 2289755 - 2290053
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  2289755 tactacctccgtccgtaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatattt 2289854  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  2289855 acaattttatcttttaagagagagagttcgtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaataaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 2289954  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2289955 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttagaaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagt 2290052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 47323268 - 47323519
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47323268 tactacctccgtccctaattatagggtctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgttttt 47323367  T
Q  356 acaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  47323368 acaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataagggcatgtatgt 47323467  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           ||||||||||||||| |||||  |||| | | |||||||||||||    
T  47323468 aaagaaataattaatgtagttgaaaataagaaagagattttataaaaaggga 47323519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 9998576 - 9998334
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaa-taacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaatttta 364  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  9998576 gtccctaattatagggctcttttgaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaatttta 9998477  T
Q  365 tgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnnta 462  Q
    | ||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||    
T  9998476 tcctttaagagagagggatgaataatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 9998377  T
Q  463 attaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9998376 attaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttgtaaaaaggga 9998334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 254 - 503
Target Start/End: Original strand, 41803207 - 41803460
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    |||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41803207 aatactacctctgtcctttattataggaccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 41803306  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaa--atatatataattaatagaggcatgt 449  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  || |||||||| ||||| |||||||    
T  41803307 ttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatataataaataggggcatgt 41803406  T
Q  450 atgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    ||||       |||||| | |||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  41803407 atgtaaagaaataattattatagttgaaaataataaaggggtcttataaaaagg 41803460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 275 - 556
Target Start/End: Original strand, 25247449 - 25247729
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25247449 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 25247548  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||    
T  25247549 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 25247648  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagt 556  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||           |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25247649 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaattc---tcaaaagagtcttataattagggacggagggagtagt 25247729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 255 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 38736749 - 38736497
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaa-taacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  38736749 atactacctttgttcctaattataggatccttttgaaaaaaataacaggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattatcattgttt 38736650  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||    
T  38736649 ttacaattttattctttaagagaaggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgt 38736550  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggata 507  Q
           ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  38736549 aaagaaataattaatgtagttgaaaatag-aaaagagtcttataaaaagggata 38736497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 284 - 505
Target Start/End: Original strand, 47657433 - 47657654
Alignment:
Q  284 cttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatga 383  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||    
T  47657433 cttttgaaaaaattacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatatttataattactattgtttttacaattttatcttttaagacagaattga 47657532  T
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 483  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||       |||||||||||||||||||||||    
T  47657533 tttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 47657632  T
Q  484 aaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  47657633 aaagtggtcttataaaaaggga 47657654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 266 - 441
Target Start/End: Original strand, 20950789 - 20950963
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20950789 gtccctaattataggacccttttgaaaa-ataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttat 20950887  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatag 441  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || |||||| |||||    
T  20950888 cctttaagagagaattgatttatgttttcaacatgttatttattgcttattgaagaaaaagatgtataataaatag 20950963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 39871352 - 39871603
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  39871352 tactccctctgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 39871451  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  39871452 acaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 39871551  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39871552 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 39871603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 266 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 23364302 - 23364064
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  23364302 gtccctaattatagggccctttttaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatatttgtagttactattgtttttacaaatttat 23364203  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||   ||||||||||       |||    
T  23364202 cctttaagagagaaagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgatcgaagaaaaagatgaataataaataagagcatgtatgtaaagaaataa 23364103  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23364102 ttaatgtagttggaaatagcaaatggatcttataaaaag 23364064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 249 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 30895865 - 30895607
Alignment:
Q  249 tatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtat 348  Q
    |||||| || |||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  30895865 tatttattattacctccgtccctaattatagcgcccttttgaaaaaataacaggaattaagataatggatatttgtattaaatatgttcgtaattactat 30895766  T
Q  349 tgtttttacaattttatgctt--taagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggca 446  Q
    ||||||||||| ||||| |||   ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||  ||||    
T  30895765 tgtttttacaaatttatccttcaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgaataataaataagggca 30895666  T
Q  447 tgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30895665 tgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 30895607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 17491803 - 17491562
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  17491803 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttataatcactattgtttttacaattttat 17491704  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  17491703 cctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataa 17491604  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17491603 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 17491562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 17561411 - 17561652
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  17561411 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttataatcactattgtttttacaattttat 17561510  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  17561511 cctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataa 17561610  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17561611 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 17561652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 4857107 - 4856853
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaata---acggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||| ||||| |||||||   |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4857107 tactacctccgtccctaattataggaccattttggaaaaatattaacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtt 4857008  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    || |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| || |||||    
T  4857007 tttacaattttatcctttaagagagatggttggtttaggttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaataggggaatgta 4856908  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||       |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4856907 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagacgtcttataaaaaggga 4856853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Original strand, 9140271 - 9140523
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9140271 atactacctctgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttt 9140370  T
Q  355 tacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| || || ||||||||||    
T  9140371 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaagaggggcatgtatg 9140470  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  9140471 taaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaaggga 9140523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 245 - 486
Target Start/End: Original strand, 44780121 - 44780362
Alignment:
Q  245 gcaatatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatta 344  Q
    ||||| |||||||||||||  |||| |||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44780121 gcaatttttaatactacctccgtccttaattatatggctcttttaaaaaaataacgagaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatta 44780220  T
Q  345 gtattgtttttacaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaataga 442  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| || |||||| |||||     
T  44780221 ctattgtttttacaattttatcttttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattga--aaaaaaatctataataaatagg 44780318  T
Q  443 ggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaa 486  Q
    |||||| ||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  44780319 ggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 44780362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 253 - 508
Target Start/End: Original strand, 7703557 - 7703813
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    ||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||    
T  7703557 taatactccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtt 7703656  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagagaa-atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||    
T  7703657 tttacaattttatcctttaggaaagaaggttagttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 7703756  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
    ||       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7703757 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggataa 7703813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 275 - 554
Target Start/End: Original strand, 34978835 - 34979114
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34978835 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 34978934  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||||| |||    
T  34978935 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatttag 34979034  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||           |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34979035 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagagtcttataattagggacggagggagta 34979114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 1275482 - 1275723
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1275482 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 1275581  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  1275582 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 1275681  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1275682 ttaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 1275723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 8612324 - 8612565
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  8612324 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 8612423  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  8612424 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtcaagaaataa 8612523  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8612524 ttaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaaggga 8612565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 497
Target Start/End: Original strand, 21870085 - 21870318
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||| |||||||| | | |||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  21870085 gtccttaattatagggctcttttggaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttttacaaatttat 21870184  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||  ||||| ||||  |||||||||||       |||    
T  21870185 cctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttatcgttgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaagaaataa 21870284  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21870285 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata 21870318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 267 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 26736773 - 26736527
Alignment:
Q  267 tccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatg 366  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  26736773 tccctaattataagacccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattatatc 26736674  T
Q  367 ctttaagagagaaa--------tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnn 458  Q
    ||| |||||||| |        || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||         
T  26736673 cttgaagagagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaa 26736574  T
Q  459 nntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
      ||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  26736573 aataattaatgtagttgaaaataacaaatgagtcttataaaaaggga 26736527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 508
Target Start/End: Original strand, 36697880 - 36698124
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  36697880 gtccctatatataagacccttttgtcaaaaacacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 36697979  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  36697980 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 36698079  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36698080 ttaatgtagttggaaataacaaagtggtcttataaaaagggataa 36698124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 255 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 21119857 - 21119609
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21119857 atactacctccgtccctaattacaggatccttttgaaaaaataaaggaaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttt 21119758  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagaga-aatga-tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||  || |||||| ||||| |||||| |||    
T  21119757 tacaattttatcatttaagagagataattagtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaacaatgtataataaataggggcatgcatg 21119658  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |       ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  21119657 taaagaaataattaatgtaattggaaataacaaacgagtcttataaaaa 21119609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 285 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 788202 - 787980
Alignment:
Q  285 ttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta--agagagaaatg 382  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||   ||    
T  788202 ttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaggagagagggttg 788103  T
Q  383 atttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 482  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |  |||||| ||||  |||||||||||       |||||||| |||||||||||||    
T  788102 atttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagaagtataataaataagggcatgtatgtaaaaaaataattaatatagttggaaatag 788003  T
Q  483 caaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||| | ||||||||||||||||    
T  788002 caaatgagtcttataaaaaggga 787980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 253 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 31458298 - 31458044
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    ||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||| | |||||||||  |||||||||| | |||||||    
T  31458298 taatactccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatgtctgtattaaagttgtttgtaatcactattgtt 31458199  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  31458198 tttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 31458099  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31458098 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 31458044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 253 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 43081552 - 43081299
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43081552 taatactacctccgtccctaattataaggct-ttttgaaaaaataacgggaattaagatggtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 43081454  T
Q  353 tttacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||| |||||||  | ||   ||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  43081453 tttacaattttatcctttaagaaaaagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 43081354  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||       |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  43081353 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaaggga 43081299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 8291191 - 8290950
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  8291191 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 8291092  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  8291091 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 8290992  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  8290991 ttaatgtagttgaaaataacaaatgggtcttataaaaaggga 8290950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 28016295 - 28016536
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28016295 gtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 28016394  T
Q  366 gctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| | || |||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  28016395 cctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctaattgaagaaaaaggtgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 28016494  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  28016495 ttaatgtagttggaaatataaaaggaatcttataaaaaggga 28016536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 37913363 - 37913122
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||| |||||||| | | |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  37913363 gtccttaattataaggctcttttgaaaaaataacggtaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttat 37913264  T
Q  366 gctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||  ||||   ||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||       |||    
T  37913263 cctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataa 37913164  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37913163 ttaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaaggga 37913122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 40300518 - 40300277
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  40300518 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 40300419  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  40300418 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 40300319  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40300318 ttaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 40300277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 41025845 - 41026086
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  41025845 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 41025944  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  41025945 cctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 41026044  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  41026045 ttaatgtagttgaaaataacaaatgggtcttataaaaaggga 41026086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 44547714 - 44547473
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| |||| |||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  44547714 gtccctatatataagacctttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 44547615  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||       |||    
T  44547614 cctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataa 44547515  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  44547514 ttaatgtagttggaaataacaaagagatcttataaaaaggga 44547473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 251 - 505
Target Start/End: Original strand, 7607368 - 7607624
Alignment:
Q  251 tttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 350  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||| |  |||||| ||||||||| || |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7607368 tttattactacctccgtccctaattatagggtccttttaaaaaaataatgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattg 7607467  T
Q  351 tttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatg 448  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||    || |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  7607468 tttttacaattttatcatttaagagagagtgttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatg 7607567  T
Q  449 tatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||       ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7607568 tatgtaaagaaataattcatgcagttggaaatagcaaagaggtctcataaaaaggga 7607624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 283 - 505
Target Start/End: Original strand, 32872141 - 32872365
Alignment:
Q  283 ccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa-- 380  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||       
T  32872141 ccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggt 32872240  T
Q  381 tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaat 480  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  32872241 tagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 32872340  T
Q  481 agcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    | ||||||| |||||||||||||||    
T  32872341 aacaaagggatcttataaaaaggga 32872365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Original strand, 36711057 - 36711288
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36711057 tataagacccttttgctaaaatcacggtaattaaaatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 36711156  T
Q  375 gagaaa-tga-tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||    
T  36711157 aagaaggtcagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaa-atgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 36711255  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  36711256 ttggaaataacaaaggagtcttataaaaaggga 36711288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 247 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 7400438 - 7400175
Alignment:
Q  247 aatatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagt 346  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||  |||| |||| |||||  ||||  |||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||   |    
T  7400438 aatatttattactaccttcgtccctatatataagaccattttgccaaaaacacgggaattaagatagtggatatttgcattaaagttgtttgtaatcctt 7400339  T
Q  347 attgtttttacaattttatgcttta---agagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatag 441  Q
    ||||||||||||||||||| |||||   |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||    
T  7400338 attgtttttacaattttatcctttaattagagagaaagttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaatag 7400239  T
Q  442 aggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
     || ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7400238 gggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaaggga 7400175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 26255383 - 26255142
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  26255383 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactaatgtttttacaattttat 26255284  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||       |||    
T  26255283 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataa 26255184  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  26255183 ttaatgtagttggaaataacaaaatggtcttataaaaaggga 26255142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 29285786 - 29286027
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  29285786 gtccctatatataagacccttttgtcaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttagaattttat 29285885  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  29285886 cctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 29285985  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  29285986 ttaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaaggga 29286027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 282 - 505
Target Start/End: Original strand, 31200129 - 31200354
Alignment:
Q  282 cccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa- 380  Q
    ||||||||  ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||      
T  31200129 cccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaagg 31200228  T
Q  381 -tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaa 479  Q
     |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||       |||||||||||||||||||    
T  31200229 ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaa 31200328  T
Q  480 tagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  31200329 taacaaaggggtcttataaaaaggga 31200354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 33858616 - 33858856
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33858616 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 33858715  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  33858716 cctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 33858815  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  33858816 tcaatgtagttggaaataacaaa-gggtcttataaaaaggga 33858856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 290 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 48009200 - 48008985
Alignment:
Q  290 aaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagaga----gaaatgatt 385  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    ||  |||||    
T  48009200 aaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtatttaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagtgagttgatt 48009101  T
Q  386 tatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaa 485  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||       ||||||||||| ||||||||| |||    
T  48009100 tatgctttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtatttggaaataacaa 48009001  T
Q  486 aggggtcttataaaaa 501  Q
    |||| |||||||||||    
T  48009000 agggttcttataaaaa 48008985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 250 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 2006779 - 2006519
Alignment:
Q  250 atttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtatt 349  Q
    |||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||  ||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | | ||    
T  2006779 atttaatactccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaaccacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgtt 2006680  T
Q  350 gtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcat 447  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||    
T  2006679 gtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcat 2006580  T
Q  448 gtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
    ||||||       ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||    
T  2006579 gtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagccttataaaaagggataa 2006519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Original strand, 36646395 - 36646627
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| |||| |||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36646395 tataagacctttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 36646494  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||       ||||||||||||    
T  36646495 aagaaggttagtttatgtttttaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 36646594  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36646595 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 36646627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 285 - 554
Target Start/End: Original strand, 43093176 - 43093446
Alignment:
Q  285 ttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tg 382  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||    
T  43093176 ttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattataattgtttttacaaatttatccttcaagagagagagttg 43093275  T
Q  383 atttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 482  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||| ||||  |||||||||||       ||| ||||||||||||||||||    
T  43093276 gtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaagaaataactaatgtagttggaaatag 43093375  T
Q  483 caaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||| | || ||||||||||||| ||         | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  43093376 caaatgagttttataaaaagggacaaaaaatttttc-tcaaaagggtcttataattaggggcggaggtagta 43093446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 256 - 501
Target Start/End: Original strand, 27881827 - 27882074
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27881827 tactacctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgtgaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtagttactattgttttt 27881926  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27881927 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatatataataaatagagacatgtatgt 27882026  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
           |||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  27882027 aaaaaaataattaatgtagttagaaatataaaaggtgtcttataaaaa 27882074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 292 - 505
Target Start/End: Original strand, 29064232 - 29064447
Alignment:
Q  292 aaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatg 389  Q
    ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |  ||||||    
T  29064232 aaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgaaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 29064331  T
Q  390 ttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggg 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29064332 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 29064431  T
Q  490 gtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||    
T  29064432 gtcttataaaaaggga 29064447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 7449547 - 7449316
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  7449547 tataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgattttacaattttatcctttaaga 7449448  T
Q  375 gagaaatga-tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagt 473  Q
     | |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||||||||||    
T  7449447 aaaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 7449348  T
Q  474 tggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7449347 tgaaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 7449316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 6387613 - 6387372
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  6387613 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 6387514  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  6387513 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacattttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 6387414  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6387413 ttaatgtagttgaaaataacaaagaggtcttataaaaaggga 6387372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 247 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 19619340 - 19619096
Alignment:
Q  247 aatatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagt 346  Q
    ||||| || ||||||||  |||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  19619340 aatatgtactactacctccgtccctaattatagagctcttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaaatact 19619241  T
Q  347 attgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagagg 444  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    || ||||| ||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||| || |||||| ||||| ||    
T  19619240 attgtttttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatatttgcaacatgttatttgttgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggg 19619141  T
Q  445 catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggg 489  Q
     ||||||||       |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19619140 tatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaattgcaaaggg 19619096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 256 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 41444500 - 41444252
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41444500 tactacctccgtccctaattataagatccttttgaaaaaataacgggaattgagatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgttttt 41444401  T
Q  356 acaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||| |||||  || ||||||||    |  ||||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| ||  ||||| ||||  |||||||||||    
T  41444400 acaaatttattattcaagagagagtgttagtttatgttttcaacatgttatttattgctggtataataaaaagatgaataataaataagggcatgtatgt 41444301  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41444300 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 41444252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 32814721 - 32814480
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  32814721 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 32814622  T
Q  366 gctttaagagagaaatgat---ttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnnta 462  Q
     |||||||| | ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||       ||    
T  32814621 cctttaagaaa-aaatgttagtttatgttttcaacatattatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaatagggtcatgtatgtaaagaaata 32814523  T
Q  463 attaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  32814522 attaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaaggga 32814480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Original strand, 29642902 - 29643133
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29642902 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 29643001  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||    
T  29643002 aagaaggttagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 29643101  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  29643102 ttgaaaataac-aaggggtcttataaaaaggga 29643133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 415
Target Start/End: Original strand, 32117995 - 32118123
Alignment:
Q  287 ttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgattt 386  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || |||    
T  32117995 ttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttattacaattttatcctttaagagagagttggttt 32118094  T
Q  387 atgttttcaacatgttatttattgttgat 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32118095 atgttttcaacatgttatttattgttgat 32118123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 39197997 - 39197765
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| |||| |||||  ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39197997 tataagaccattttgtcaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 39197898  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||    
T  39197897 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 39197798  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||| ||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  39197797 ttgaaaataacaaaagagtcttataaaaaggga 39197765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 249 - 505
Target Start/End: Original strand, 41252094 - 41252351
Alignment:
Q  249 tatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtat 348  Q
    |||||| |||| |||  |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||    
T  41252094 tatttattactccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactat 41252193  T
Q  349 tgtttttacaattttatgctttaagagagaaatga-tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcat 447  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |  | | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||  ||||    
T  41252194 tgtttttacaattttatcctttaagaataaggttagtttatgttttcaagatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcat 41252293  T
Q  448 gtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||       ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41252294 gtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 41252351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 266 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 12130334 - 12130147
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||    
T  12130334 gtccctaattatagggccctattgagaaaataacgtgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaa--tgat 12130237  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
     |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  12130236 cctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 12130147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 303 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 25951083 - 25950877
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatg 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |  |||||||||||||||||    
T  25951083 aattaagatagtggatatttgtattaacgttatttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatgattagtttatgttttcaacatg 25950984  T
Q  401 ttatttattgttgatcgaagaaaaatatat--ataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataa 498  Q
    |||||||||| | || ||||||||| | ||  ||||| |||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25950983 ttatttattgctaattgaagaaaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggatatagcaaaggggtcttataa 25950884  T
Q  499 aaaggga 505  Q
    |||||||    
T  25950883 aaaggga 25950877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 38858585 - 38858345
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  ||||| | || |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  38858585 gtcccttattataagacccttttgctaaaatcaagggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 38858486  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  38858485 ccttaagagagagagttcgtttatgtttttcatatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 38858386  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38858385 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 38858345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 256 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 16957932 - 16957734
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16957932 tactaccttcgtccctaattatagagcccttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgttttt 16957833  T
Q  356 acaattttat-gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| | || ||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||   ||||||||||    
T  16957832 acaattttatcgtttaaagagatggttgatttatgttttcaatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatatgagcatgtatgt 16957734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 256 - 423
Target Start/End: Original strand, 27325908 - 27326076
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27325908 tactacctccgtcactaattatagggcccttttgaaaaaataacggaa-ttaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatttctattgttttt 27326006  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaa 423  Q
    | |||||||| |||||||  |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27326007 ataattttatcctttaagatagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaa 27326076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 270 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 38361432 - 38361198
Alignment:
Q  270 ctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctt 369  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||| || |||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  38361432 ctaattacatcactcttttaaaaaaataatgggaattaagacagtgaatatttgtgttaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat-cat 38361334  T
Q  370 taagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatg 469  Q
    | |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||       |||||||||    
T  38361333 tgagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttatagctgattgaagaaaaagatatataataaatattagcatgtatgtaaagaaataattaatg 38361234  T
Q  470 tagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  38361233 tagctcgaaatagcaaagaagtcttataaaaaggga 38361198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 266 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 48521314 - 48521076
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| || |||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||  | |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  48521314 gtccctatatataagatccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgcattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttat 48521215  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  48521214 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 48521115  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  48521114 ttaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaag 48521076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 252 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 21295452 - 21295198
Alignment:
Q  252 ttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgt 351  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||| || | |||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||    
T  21295452 ttaatactccctccgtccctaattataagaactttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgt 21295353  T
Q  352 ttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  21295352 ttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 21295253  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||       ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21295252 tgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 21295198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 269 - 505
Target Start/End: Original strand, 9036682 - 9036919
Alignment:
Q  269 cctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgct 368  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  9036682 cctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtgtatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 9036781  T
Q  369 tta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaa 467  Q
    | | |||||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| | || | |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       |||||||    
T  9036782 taagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctaattgtagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaacaaataattaa 9036881  T
Q  468 tgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9036882 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 9036919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 256 - 425
Target Start/End: Original strand, 21870831 - 21871002
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21870831 tactactttcgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgttttt 21870930  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||| ||||| ||| |||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21870931 acaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttatcgttgattgaagaaaaa 21871002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 256 - 378
Target Start/End: Original strand, 33381358 - 33381480
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33381358 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 33381457  T
Q  356 acaattttatgctttaagagaga 378  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  33381458 acaattttatcctttaagagaga 33381480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 255 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 23109366 - 23109194
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  23109366 atactacctccgtccctaattataggaccctattgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattttttt 23109267  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| |  || |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  23109266 tacaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaa 23109194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 249 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26843076 - 26842951
Alignment:
Q  249 tatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtat 348  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26843076 tatttattactacctccgtccctaattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactat 26842977  T
Q  349 tgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26842976 tgtttttacaattttatcctttaaga 26842951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 270 - 505
Target Start/End: Original strand, 29177006 - 29177242
Alignment:
Q  270 ctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctt 369  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  29177006 ctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt 29177105  T
Q  370 ta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaat 468  Q
     | |||||||  |  ||||||||||| | |||||| |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||       ||||||||    
T  29177106 aagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtatgtaaagaaataattaat 29177205  T
Q  469 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  29177206 gtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaaggga 29177242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 266 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 17327159 - 17326970
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| |||| |||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17327159 gtccctatatataagaccattttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaggttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 17327060  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
     |||||||| ||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  17327059 cctttaagaaagaaggttaatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 17326970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 305 - 505
Target Start/End: Original strand, 18112955 - 18113157
Alignment:
Q  305 ttaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgtt 402  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||    
T  18112955 ttaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgtt 18113054  T
Q  403 atttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||       ||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||    
T  18113055 atttaatgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggttttataaaaag 18113154  T
Q  503 gga 505  Q
    |||    
T  18113155 gga 18113157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 266 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 23320943 - 23320700
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23320943 gtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 23320844  T
Q  366 gctttaagagagaa--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcg----aagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnn 459  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    || ||||| || |||||| ||||  | |||||||||          
T  23320843 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaaaaaagatgtataataaataaggacatgtatgtaaagaa 23320744  T
Q  460 ntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
     ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23320743 ataattgatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 23320700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 254 - 554
Target Start/End: Original strand, 34012256 - 34012554
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    |||||||| || |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||    
T  34012256 aatactacattcgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcaatattgttt 34012355  T
Q  354 ttacaattttatgctt-taagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||  |  ||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||  ||||| ||| ||||||    
T  34012356 ttacaattttatccttaaaagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataacaaataggggcttgtatg 34012455  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtag 552  Q
    |       ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34012456 taaagaaataattaatgtacttggaaatagcaaaagagtcttataaaaagggacaaaaaaattc---tcaaaagggtcttataattagggacggaggtag 34012552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 247 - 453
Target Start/End: Original strand, 24299934 - 24300142
Alignment:
Q  247 aatatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagt 346  Q
    ||||| || ||||||||  ||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24299934 aatatgtactactacctccgtctctaattatagagcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattact 24300033  T
Q  347 attgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagagg 444  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||||    || ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||| || |||||| ||||  ||    
T  24300034 attgtttttataattttatcctttaaaagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttgttgctaattgaagaaaaagatgtataataaatatggg 24300133  T
Q  445 catgtatgt 453  Q
     ||||||||    
T  24300134 tatgtatgt 24300142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 303 - 505
Target Start/End: Original strand, 41002941 - 41003144
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgt 401  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||  ||||||||||| | |||     
T  41002941 aattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagatagtttatgttttccatatgc 41003040  T
Q  402 tatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  41003041 tacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatggatcttataaaaa 41003140  T
Q  502 ggga 505  Q
    ||||    
T  41003141 ggga 41003144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 256 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 41787542 - 41787302
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  || |||||||| | ||| ||||||||||||||| | |||     |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41787542 tactacctccgttcctaattacaggacacttttgaaaaaataatgaaaag----atagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttt 41787447  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| |||||||| |    || |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||      
T  41787446 acaattttatcctttaagaaaaggttggtttatgttttaaacatgttatttattgccgattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgt-a 41787348  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
         |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  41787347 aaaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgaatcttataaaaa 41787302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 285 - 503
Target Start/End: Original strand, 30737780 - 30738001
Alignment:
Q  285 ttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa---- 380  Q
    |||| |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||        
T  30737780 ttttaaaaaaataacgggaactaagatagtagatatttgtattaaatacgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaaaagag 30737879  T
Q  381 ---tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttgga 477  Q
       || ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |    ||||||       |||||||||||||||||    
T  30737880 ggttggtttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggg----gtatgtaaagaaataattaatgtagttgga 30737975  T
Q  478 aatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30737976 aatagaaaatgggtcttataaaaagg 30738001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 17317609 - 17317488
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| |    
T  17317609 tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataac 17317510  T
Q  484 aaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17317509 aaaggggtcttataaaaaggga 17317488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 38428434 - 38428195
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  38428434 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 38428335  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| || || |||||||||||       ||||    
T  38428334 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatgtaaagaaataat 38428235  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||    
T  38428234 taatgtagttagaaataacaaa-ggatcttgtaaaaaggga 38428195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 266 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 28061004 - 28060766
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| | || |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  28061004 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcatgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 28060905  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | | |||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||| ||       ||||    
T  28060904 ccttaagaaagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtaggtaaagaaataat 28060805  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggg 504  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  28060804 taatgtagttggaaataacaaa-gggtcttataaaaaggg 28060766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 44719410 - 44719174
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||| |||||||| || |||||||  ||||| || | ||| || | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  44719410 gtccataattataggatccttttgttaaaatcactggaatgaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttat 44719311  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     ||| |||||||   || ||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||  |||||||||||       |||||    
T  44719310 cctt-aagagagt--tggtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaagatttacaataaatatgggcatgtatgtaaagaaataatt 44719214  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  44719213 aatgtagttggaaatagcaaagacgtcttataaaaaggga 44719174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 317 - 505
Target Start/End: Original strand, 43440910 - 43441100
Alignment:
Q  317 atatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttt--aagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttga 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  43440910 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctga 43441009  T
Q  415 tcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    | ||||||||| || |||||| ||||  ||||||| |||       ||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||    
T  43441010 ttgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtttgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagataatgagtcttataaaaaggga 43441100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 26299483 - 26299362
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||       |||||||||||||| |||||||     
T  26299483 tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttagaaatagt 26299384  T
Q  484 aaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26299383 aaaggggtcttataaaaaggga 26299362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 46266115 - 46266364
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||||||||  ||||| | || |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||    
T  46266115 tactacctctgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcatgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagatgtttgcaatcactattgttttt 46266214  T
Q  356 acaattttatgcttta---agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||| || |||||   | |||||  |  ||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||| ||    |||||| ||||| ||| ||||||    
T  46266215 acaatttaatcctttatatatagagagttagtttatgttttcaacatgatatttatagctgattgaagaagaa---gtataataaataggggcttgtatg 46266311  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  46266312 taaaaaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaagaggga 46266364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 247 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 9299407 - 9299144
Alignment:
Q  247 aatatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagt 346  Q
    |||||||  ||||||||  |||||||  |||| ||||||||||  ||||| | || |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| || |    
T  9299407 aatatttgttactacctccgtccctatatataagacccttttgctaaaatcatgggaattaaaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtact 9299308  T
Q  347 attgtttttacaattttatgcttta-----agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatag 441  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |     | |||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||  |||||||| || |||||| |||||    
T  9299307 attgtttttacagttttatccttaagagaaatagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaatag 9299208  T
Q  442 aggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
     || ||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9299207 gggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggacttataaaaaggga 9299144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 31581957 - 31581677
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| |||| |||||  ||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  31581957 tataagacctttttgttaaaattacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttataattttat-ctttaaga 31581859  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
    |||| |  |  ||||| ||||| | | ||||||||||| | || ||||||||| || |||||| ||||| |  ||||||||       ||||||||||||    
T  31581858 gagagagttagtttatattttccatacgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataattaatgtag 31581759  T
Q  473 ttggaaatagc-aaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||         ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31581758 ttggaaatagcaaaaggggtcttataaaaaaggacaa-ttttttttcttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 31581677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 259 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 21587702 - 21587534
Alignment:
Q  259 tacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 358  Q
    |||||||||||||| ||||  ||| ||||||  ||||| |  |||||||| | | | ||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  21587702 tacctttgtccctatttattagactcttttggcaaaatcatagaaattaagaaaattgatatttatattaaatttgtttgcaattactattgtttttaca 21587603  T
Q  359 attttatgcttt--aagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||||  |||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21587602 attttattttttaaaagagagaatttgtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa 21587534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 440
Target Start/End: Original strand, 7400464 - 7400646
Alignment:
Q  259 tacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 358  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| | ||| || ||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||    
T  7400464 tacctttgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacggga-ttaagaaagttgaaatttgtattgaagatgtttgtaatcactattgtttttaca 7400562  T
Q  359 attttatgctttaagaga--gaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaata 440  Q
    | ||||| |||||| |||  ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||    
T  7400563 agtttatcctttaaaagaaagaattaatttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaata 7400646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 267 - 495
Target Start/End: Original strand, 17878127 - 17878346
Alignment:
Q  267 tccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatg 366  Q
    |||||||||||| |   |||||||||| ||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  17878127 tccctaattatagggttcttttgaaaatataacgggaattaagatggtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatc 17878226  T
Q  367 ctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
    ||||||||||||    || ||||||||||||          ||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  17878227 ctttaagagagagggttggtttatgttttca----------tattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatag-ggcatgtatgtaaaaatataat 17878315  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtctta 495  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  17878316 taatgtagttagaaataacaaagaggtctta 17878346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 275 - 554
Target Start/End: Original strand, 18751746 - 18752019
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||| ||||||  ||||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||||  ||| | |||| | |||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  18751746 tataagactcttttgctaaaatcacgtaaattaagaaagtagatatttgtattaaagttgtatttaatcactattatttttacaattttattctt-aaga 18751844  T
Q  375 gagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagtt 474  Q
    || |  || ||||||||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||       ||||||||||||||    
T  18751845 gatagttggtttatgttttccatatgctatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgt-aaaaaataattaatgtagtt 18751943  T
Q  475 ggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    | |||||||| || ||||||||||||| ||| ||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18751944 gaaaatagcagagtggtcttataaaaatggacaaaaaattc----tcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 18752019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 47534643 - 47534893
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||| |||||| |||||| |||||  ||||| |||  |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||    
T  47534643 tactacctcggtccataattacatgaccattttgctaaaatcacgagaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattgttgttttt 47534742  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt-- 453  Q
    |||||||||| | ||||||||||  |  ||||||||||| | ||||||||||||| | || ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||      
T  47534743 acaattttat-ccttaagagagagttattttatgttttccatatgttatttattgctaattgaagaaaaa-atgtataataaataggggcatgtatgtaa 47534840  T
Q  454 --nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
             ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  47534841 agaaataattaattaatgtagttgaaaatagcaaa-gggttttataaaaaggga 47534893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 247 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 9303956 - 9303693
Alignment:
Q  247 aatatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagt 346  Q
    ||||||| |||||||||  |||| ||  |||| ||| ||||||  ||||| |||| |||||| | ||||||||||| |||||||  ||||||||| || |    
T  9303956 aatatttgatactacctccgtccttatatataagactcttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtact 9303857  T
Q  347 attgtttttacaattttatgcttta-----agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatag 441  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |     | |||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||  |||||||| || |||||| |||||    
T  9303856 attgtttttacagttttatccttaagagaaatagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaatag 9303757  T
Q  442 aggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
     || ||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9303756 gggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgtaaatagcaaaggggacttataaaaaggga 9303693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 434
Target Start/End: Original strand, 40120994 - 40121174
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||| | | | |||| | ||| ||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  40120994 tactacctccgtctctaattatagggcccttttggaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtggtaataaatttgtttgtaattactattgtattt 40121093  T
Q  356 acaattttatgcttta--agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataa 434  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| | | ||| ||||||||| ||||||||    
T  40121094 acaattttatcctttaagagagagaaatagtttatgttttcaacatagtatttaatatcgattgaagaaaaagatatataa 40121174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 285 - 505
Target Start/End: Original strand, 45777987 - 45778212
Alignment:
Q  285 ttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagag--agaaatg 382  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||| ||||||||  ||||||||  |||| |     
T  45777987 ttttaaaaaaatcacgaaaattaagaaagttgaaatttgtattaaagatgtttgtaatcactattatttttataattttatcttttaagagaaagaatta 45778086  T
Q  383 atttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaataga----ggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaa 478  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| |    || ||| | ||       ||||||||||||||||||    
T  45778087 gtttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaag-aaaatatgtataataaataaataagggtatgcaagtaaagaaataattaatgtagttggaa 45778185  T
Q  479 atagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45778186 ataacaaagaggtcttataaaaaggga 45778212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 257 - 424
Target Start/End: Original strand, 10538871 - 10539038
Alignment:
Q  257 actacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 356  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||| ||||  ||||| ||  ||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||    
T  10538871 actaccttcgtccctatatataagacccatttgtcaaaatcaccaaaattaagaaagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgttttta 10538970  T
Q  357 caattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaa 424  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||    
T  10538971 caattttatcctttaatagagagttagtttatgttttcaacatgctatttattgctgattgaaaaaaa 10539038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 255 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 27813798 - 27813496
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  |||||||| |||| || ||||||| ||||||  |||| ||||| | |||||||  | ||||||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  27813798 atactacctccgtccctaaatataggagccttttgcaaaaattgcggagattaagaaagtggattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttt 27813699  T
Q  355 tacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||| || || ||| ||||  || | ||  ||    
T  27813698 tacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgtaaaataaataagggtaggttggt 27813599  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnnc--ttcaaaagagtcttataattagggacggaggta 551  Q
           |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||         |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27813598 aaagaaataattaatatacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttttcttttcaaaagggtcttataattagggacggaggta 27813499  T
Q  552 gta 554  Q
    |||    
T  27813498 gta 27813496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 323 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 30534933 - 30534701
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaa 422  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  30534933 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaa 30534835  T
Q  423 aaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttca 522  Q
    ||| ||  | ||| ||||  || ||||  ||       ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||          ||||    
T  30534834 aaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaaggagtcttataaaaagggacaaattatttt--ttca 30534737  T
Q  523 aaagagtcttataattagggacggaggtagtagttg 558  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30534736 aaagtgtcttataattagggacggaggtagtagttg 30534701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 311 - 487
Target Start/End: Original strand, 2470870 - 2471048
Alignment:
Q  311 tagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga--gagaaatgatttatgttttcaacatgttatttat 408  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||  |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2470870 tagtggatatttgtattaaatatatttataattactattgtttttataatattatcctttaagagtgagagttgatttctgttttcaacatgttacttat 2470969  T
Q  409 tgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaag 487  Q
    || | ||  |||||||| || |||||| |||| ||| || ||||        |||||||||||||||||||| ||||||    
T  2470970 tgctaattaaagaaaaagatgtataataaataaaggtatatatgaaaagaattaattaatgtagttggaaattgcaaag 2471048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 255 - 365
Target Start/End: Original strand, 12616149 - 12616259
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| | | |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12616149 atactaccttcatccttaattatagggcacttttgaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactaatgtttt 12616248  T
Q  355 tacaattttat 365  Q
    ||||| |||||    
T  12616249 tacaaatttat 12616259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 384 - 505
Target Start/End: Original strand, 9233445 - 9233566
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| | ||| || ||       |||||||||||||||||||||||    
T  9233445 tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatatacgtaaataaataattaatgtagttggaaatagc 9233544  T
Q  484 aaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||| | ||||||||||||||||    
T  9233545 aaatgagtcttataaaaaggga 9233566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 403 - 557
Target Start/End: Original strand, 31769220 - 31769372
Alignment:
Q  403 atttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  31769220 atttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaag 31769319  T
Q  503 ggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    ||||||           ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31769320 ggataaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggtaatagtt 31769372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 323 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 9682831 - 9682601
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||    |||||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||    
T  9682831 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaaga 9682732  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttc 521  Q
    |||| || || ||| ||||  || ||||  ||       ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||          |||    
T  9682731 aaaa-atgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaaattatttt--ttc 9682635  T
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagtag 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9682634 aaaagagtcttataattagggacggaggtagtag 9682601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 323 - 505
Target Start/End: Original strand, 32699513 - 32699694
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaa 422  Q
    ||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||| || ||  |||||||||||||| ||||||    
T  32699513 gtattaaatttgtataaaattattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaagaa 32699611  T
Q  423 aaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||| ||  | ||| ||||  || ||||  ||       ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32699612 aaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaaggga 32699694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 323 - 502
Target Start/End: Original strand, 42887887 - 42888067
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  42887887 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 42887986  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |||| ||  | ||| ||||  || ||||  ||       ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  42887987 aaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggtaataccaaaggggtcttataaaaag 42888067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 284 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3776098 - 3775956
Alignment:
Q  284 cttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatg 382  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||| ||| |||  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||| |||| ||| | |||||||  |     
T  3776098 cttttgcaaaaattacggagattaaaaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaatattatccttaagagagagagtta 3775999  T
Q  383 atttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  3775998 atttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaa 3775956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 346 - 486
Target Start/End: Original strand, 3796060 - 3796202
Alignment:
Q  346 tattgtttttacaattttatgctttaa--gagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagag 443  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| || || ||| |||||||    
T  3796060 tattgtttttacaattttatcttttaaaagagagaattaatttatgtttttaacatattatttattgctgatggaagaaaaagatgtaaaataaatagag 3796159  T
Q  444 gcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaa 486  Q
    | ||||||||       ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3796160 gtatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaa 3796202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 323 - 501
Target Start/End: Original strand, 19845474 - 19845655
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta---agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaa 419  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| |   |||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  19845474 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaa 19845573  T
Q  420 gaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||| ||  | ||| ||||  || ||||  ||       ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19845574 gaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaa 19845655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 21135545 - 21135375
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||| | |||   ||| |||  | ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||    
T  21135545 tactacctccgtccgtaattataagagccttttgcaaaaattacggagaataagcaagttgattgtagtattaaatttgtatgtaattaccattgttttt 21135446  T
Q  356 acaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  21135445 acaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaa 21135375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 505
Target Start/End: Original strand, 5524773 - 5524988
Alignment:
Q  292 aaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta---agagagaaatgatttat 388  Q
    ||||| |||| |||||| | |||| ||||||| ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |   |||||||  ||||||||    
T  5524773 aaaattacgggaattaagaaagtgaatatttgcattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttgatttat 5524872  T
Q  389 gttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaagg 488  Q
    |||||| | |||  |||||||| ||||  |||||||| ||||||||| |||   ||||| ||| |       ||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  5524873 gttttccatatg-catttattgctgattaaagaaaaagatatataataaatgagggcatatatataaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaatg 5524971  T
Q  489 ggtcttataaaaaggga 505  Q
     ||||||||||||||||    
T  5524972 agtcttataaaaaggga 5524988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 500
Target Start/End: Original strand, 31802872 - 31803105
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||| ||||| || | |||||  ||||| ||| ||||||||| |||  ||| | ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31802872 gtccctagttataggatctttttgccaaaatcacgaaaattaaaaaagttaataatagtattaaatttgtttataattactattgtttttacaattttat 31802971  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     | ||||||||||  |  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||| ||  | ||| ||||| || ||| | ||       |||||    
T  31802972 -ccttaagagagagttagtttatgttttcaacataatatttattgtttattaaagaaaaagatgcaaaataaataggggtatggaggtaaagaaataatt 31803070  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 500  Q
    ||| || |||||||||||||||  |||||||||||    
T  31803071 aatataattggaaatagcaaagcagtcttataaaa 31803105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20075134 - 20075023
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||| |||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20075134 gtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 20075035  T
Q  366 gctttaagagaga 378  Q
     | ||||||||||    
T  20075034 -ccttaagagaga 20075023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 339 - 425
Target Start/End: Original strand, 32964218 - 32964305
Alignment:
Q  339 taattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  32964218 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaa 32964305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 461 - 554
Target Start/End: Original strand, 33381520 - 33381610
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33381520 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaatc---tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 33381610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 34896155 - 34895904
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||  |||||  ||||| |||| |||||| | | |  ||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||    
T  34896155 tactacctccgtccttaattataggacttttttgctaaaatcacgggaattaagaaaataaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattattttt 34896056  T
Q  356 acaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaat-atatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| | || |||||||| | || |||||| ||||  |  ||||||||    
T  34896055 acaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctaattgaagaaaattgatgtataataaataaggatatgtatgt 34895956  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34895955 acagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagagatcttataaaaaggga 34895904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 335 - 440
Target Start/End: Original strand, 20182099 - 20182204
Alignment:
Q  335 tttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataa 434  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||||  |  | ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  20182099 tttgtaattactattgtttttacaatcttatccttacagagagatttagtgtatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaatatatagaa 20182198  T
Q  435 ttaata 440  Q
    | ||||    
T  20182199 taaata 20182204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 384 - 505
Target Start/End: Original strand, 10071243 - 10071364
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 483  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||  |||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||| |||||||    
T  10071243 tttatattttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttgaaaatagc 10071342  T
Q  484 aaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||  |||||||||||||||||    
T  10071343 aaataggtcttataaaaaggga 10071364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 554
Target Start/End: Original strand, 22991552 - 22991781
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||  | |||||||  |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22991552 gtattaaatttgtttataattactattgtttttaca-ttttatcctaaagagagagagttagtttatgttttcaacataatatttattgttgatcgaaga 22991650  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttc 521  Q
    |||| ||  | ||| ||||| || |||    |       ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||          |||    
T  22991651 aaaagatgcaaaataaataggggtatggtgataaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaatggatcttataaaaagggacaaaaaaaaaa--ttc 22991748  T
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22991749 aaaaggatcttataattagggacggaggtagta 22991781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 19293047 - 19292885
Alignment:
Q  344 agtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatag 441  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||     
T  19293047 agtattgtttttacaattttattctt-aagagagatagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataa 19292949  T
Q  442 aggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
     || ||||  ||       ||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19292948 gggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttagaaatactaaaggggtcttataaaaaggga 19292885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 29629993 - 29629716
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| |||| |||||  ||||| |||| |||||| | |||| || |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||| ||||||||| | |||| |    
T  29629993 tataagaccattttgctaaaattacgggaattaagaaagtgaatgtttgtattaaagttgtttgtaatcacaattgtttttgcaattttat-ccttaaaa 29629895  T
Q  375 gagaaatgatttatgttt----tcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgt 470  Q
    ||||  ||||||||||||    || | ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| | ||||||          |||||| |||    
T  29629894 gagagttgatttatgttttccatccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgta----aagaaataattattgt 29629799  T
Q  471 agttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||         |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  29629798 agttgaaaataacagagggatcttataaaaagggacaa-ttttttttcttcaaaaggttcttataattagggacggagatagta 29629716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 348 - 508
Target Start/End: Original strand, 46414835 - 46414998
Alignment:
Q  348 ttgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaat-atatataattaatagagg 444  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||    ||  |||||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||  || |||||| |||||  |    
T  46414835 ttgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctattttttgctgattgaagaaaaaagatgtataataaataggag 46414934  T
Q  445 catgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
    |||||||||       |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||    
T  46414935 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaaaggataa 46414998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 49044860 - 49045157
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||||||| |||| || |||||||  |||||  |||| ||||| | ||||| |  | ||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||    
T  49044860 tactacctccgtccctaaatataggagccttttgccaaaattgcggagattaagaaagtgggttgtagtattaaatttgtatacaattactattgttttt 49044959  T
Q  356 acaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    |||||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| | ||  || || |  ||     
T  49044960 acaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataattaagggtatattggta 49045059  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
          ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||          |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  49045060 aagaaataattaatgtacttggaaatatcaaagaggtcttataaaaagggacaaattatttt--ttcaaaagggtcttataattagagacggaggtagta 49045157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 35888540 - 35888439
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaa 422  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||  | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  35888540 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttat-ccttaagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaa 35888442  T
Q  423 aaa 425  Q
    |||    
T  35888441 aaa 35888439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 555
Target Start/End: Original strand, 2345350 - 2345581
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | | | |||| | |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  2345350 gtattaaatttgtatataattaatattgtttttacaattttatccttaagaaaaagaattaatttatgttttcaacataatatttattattgattgaaga 2345449  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttc 521  Q
    ||||  |  | ||| ||||  || |||| |||       ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||||| | ||          |||    
T  2345450 aaaaggtgcaaaataaataagggtatgtttgtaaataaataattaatgtatttggaaatatcaaatgagtcttttaaaaaggaacaaattatttt--ttc 2345547  T
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagtag 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2345548 aaaagagtcttataattagggacggatgtagtag 2345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 24504914 - 24504728
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||  | |||| | ||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  24504914 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagcgagagagttaatttctattttcaacataatatttattgttgattgaaga 24504815  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
    |||| ||  | ||| ||||  || ||||  ||       ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  24504814 aaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggataa 24504728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 12129768 - 12129724
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12129768 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaagaggga 12129724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 405 - 506
Target Start/End: Original strand, 12616273 - 12616374
Alignment:
Q  405 ttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggg 504  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||  ||||| ||||  |||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12616273 ttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaagggatcttataaaaaggg 12616372  T
Q  505 at 506  Q
    ||    
T  12616373 at 12616374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 20074980 - 20074936
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20074980 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 20074936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Original strand, 23801990 - 23802093
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||    |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  23801990 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 23802089  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  23802090 aaaa 23802093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 33342356 - 33342261
Alignment:
Q  333 tgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatat 428  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||  |||||||||||  |  ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  33342356 tgtttataattactattgtttttacaattaaatcatttaagagagagttagtttatattttcaacatagtatttattgttgattgaagaaaaatat 33342261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Original strand, 47648985 - 47649088
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  47648985 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttattcttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 47649084  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  47649085 aaaa 47649088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 505
Target Start/End: Original strand, 44510179 - 44510333
Alignment:
Q  352 ttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| | ||  || ||||     
T  44510179 ttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataagtaagggtatgtt 44510278  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
     ||       ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44510279 ggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaaggga 44510333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 45722237 - 45722006
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | ||||||  ||| ||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |    
T  45722237 gtattaaatttgtatataattaccattatttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaaa 45722138  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttc 521  Q
    |||| ||  | ||| ||||  ||  |||  ||       ||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||         | ||    
T  45722137 aaaagatgcaaaataaataagggtgtgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaagagatcttataaaaagggataattttttttcc-tc 45722039  T
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  45722038 aaaagagtcttataattaaggacgaaggtagta 45722006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 461 - 496
Target Start/End: Original strand, 10539081 - 10539116
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttat 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10539081 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttat 10539116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 443
Target Start/End: Original strand, 28409849 - 28409967
Alignment:
Q  327 taaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatg--atttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaa 424  Q
    ||||| |||||||||  | ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||   || ||| ||||||||||  ||||||  |||||| ||||||||    
T  28409849 taaatttgtttgtaaccaatattgcttttacaattttatcatttaagagagatatttaatctatattttcaacataatatttaacgttgattgaagaaaa 28409948  T
Q  425 atatatataattaatagag 443  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  28409949 aaatataaaattaatagag 28409967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 476 - 554
Target Start/End: Original strand, 32118125 - 32118200
Alignment:
Q  476 gaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32118125 gaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttt---ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 32118200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 410
Target Start/End: Original strand, 49110808 - 49110922
Alignment:
Q  298 acggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagaga--gaaatgatttatgttttca 395  Q
    ||||||||||| | | | |||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||||||   ||||||||  ||  |  |||||||||| |    
T  49110808 acggaaattaagaaaattgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgattttacaattttatcacttaagagagtgagctattttatgttttta 49110907  T
Q  396 acatgttatttattg 410  Q
    |||||||||||||||    
T  49110908 acatgttatttattg 49110922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 424
Target Start/End: Original strand, 33683007 - 33683093
Alignment:
Q  339 taattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaa 424  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||||  | ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||    
T  33683007 taattaatattgcttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacctaatatttattgttgattgaagaaaa 33683093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 316 - 365
Target Start/End: Original strand, 10071866 - 10071915
Alignment:
Q  316 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10071866 gatatttgtattaaagttgtttgtaattattatggtttttacaattttat 10071915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 312 - 365
Target Start/End: Original strand, 34900775 - 34900828
Alignment:
Q  312 agtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  34900775 agtggatatttgtattaaaattgtttgtaatcactgttgtttttacaattttat 34900828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 425
Target Start/End: Original strand, 3881371 - 3881451
Alignment:
Q  346 tattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  3881371 tattgtttttaaaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaataaaaa 3881451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Original strand, 8782159 - 8782203
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  8782159 taattaatgtatttggaaacaccaaaggggtcttataaaaaggga 8782203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 519 - 554
Target Start/End: Original strand, 26843034 - 26843069
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26843034 ttcaaaagagtcctataattagggacggaggtagta 26843069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 33682938 - 33682841
Alignment:
Q  326 ttaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    |||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||||||    
T  33682938 ttaaatttgtatataattactattgtttttacaattttat-ccttaagagagagtaaatttatgttttcaatataat-tttattgttgattgaagaaaaa 33682841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 43008359 - 43008253
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgtt 402  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||| || |||||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||| |  |  |||| |||||||||||| |    
T  43008359 aattaagaaagttgatatttgtattaaagatatttgtaatcactactgtttttacaa-tttatactttaagagaaagttagtttaagttttcaacatgat 43008261  T
Q  403 atttattg 410  Q
    | ||||||    
T  43008260 aattattg 43008253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8782250 - 8782208
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataa 298  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8782250 tactaccttcgttcctaattataagacccttttgaaaaaataa 8782208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 519 - 560
Target Start/End: Original strand, 12930581 - 12930622
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagttgat 560  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12930581 ttcaaaaggatcctataattagggacggaggtagtagttgat 12930622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25270731 - 25270678
Alignment:
Q  325 attaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga 378  Q
    ||||||| | |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25270731 attaaatttatttgtaatgattattgtatttacaattttattctttaagagaga 25270678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 425
Target Start/End: Original strand, 32811300 - 32811341
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  32811300 tttatgttttcaacatagtatttattgttgattgaagaaaaa 32811341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 502
Target Start/End: Original strand, 40121204 - 40121245
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  40121204 taattaatgtacttggaaatactaaaggggtcttataaaaag 40121245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 522 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 1574751 - 1574719
Alignment:
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1574751 aaaagggtcttataattagggacggaggtagta 1574719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 520 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 19920597 - 19920561
Alignment:
Q  520 tcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagt 556  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19920597 tcaaaagggtcttataattagggacggagggagtagt 19920561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26299545 - 26299493
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaa 308  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26299545 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaacaataacgggaattaa 26299493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 519 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 33381393 - 33381357
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtag 555  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33381393 ttcaaaagggtcctataattagggacggaggtagtag 33381357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Original strand, 41444196 - 41444236
Alignment:
Q  250 atttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttga 290  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  41444196 atttaatactaccttcgtctctaattataagacccttttga 41444236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 522 - 554
Target Start/End: Original strand, 42541864 - 42541896
Alignment:
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42541864 aaaagggtcttataattagggacggaggtagta 42541896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 172; Significance: 4e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 255 - 554
Target Start/End: Original strand, 6350 - 6646
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6350 atactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 6449  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||     
T  6450 tacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgta 6549  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6550 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttt---tccaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 6646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 170; Significance: 6e-91; HSPs: 227)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 266 - 554
Target Start/End: Original strand, 20454933 - 20455218
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454933 gtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 20455032  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||       |||||    
T  20455033 cctttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataatt 20455132  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20455133 aatgtagttggaaatggcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaattc---tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 20455218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 254 - 505
Target Start/End: Original strand, 33988534 - 33988782
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||   |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33988534 aatactacctccatccctaattatagg-cccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 33988632  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  33988633 ttacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgt 33988732  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33988733 --aaaaataattaatatagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaaggga 33988782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 247 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 46950297 - 46949992
Alignment:
Q  247 aatatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagt 346  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46950297 aatatataatactacctccgtccctaattatagggccctcttaaaaaaataacggaaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttctaattagt 46950198  T
Q  347 attgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggca 446  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  46950197 attgttttcacaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggca 46950098  T
Q  447 tgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacgg 546  Q
    |||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||           ||||||| |||||||||||||||||||    
T  46950097 tgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaatattc--tcaaaagggtcttataattagggacgg 46950000  T
Q  547 aggtagta 554  Q
    ||||||||    
T  46949999 aggtagta 46949992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 259 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 37518298 - 37518004
Alignment:
Q  259 tacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 358  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37518298 tacctctgtctctaattataagacctttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgaaattaatattgtttttaca 37518199  T
Q  359 attttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnn 458  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||         
T  37518198 attttatcctttaagagagagatgatttatgtcttcaacatattatttattattgatcgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgaatgtaaaga 37518099  T
Q  459 nntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||         | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  37518098 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagtgacaaaaaaaaaatc-tcaaaagggtcttataattaggaacggaggtagta 37518004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 259 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 37522514 - 37522220
Alignment:
Q  259 tacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 358  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37522514 tacctctgtctctaattataagacctttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgaaattaatattgtttttaca 37522415  T
Q  359 attttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnn 458  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||         
T  37522414 attttatcctttaagagagagatgatttatgtcttcaacatattatttattattgatcgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgaatgtaaaga 37522315  T
Q  459 nntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||         | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  37522314 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagtgacaaaaaaaaaatc-tcaaaagggtcttataattaggaacggaggtagta 37522220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 251 - 501
Target Start/End: Original strand, 14793759 - 14794009
Alignment:
Q  251 tttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 350  Q
    |||| ||||||||  || |||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14793759 tttattactacctccgttcctaattatagggcccttttcaaaaaacaacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 14793858  T
Q  351 tttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  14793859 tttttacaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgta 14793958  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14793959 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 14794009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 23777543 - 23777839
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23777543 tactacctctgtccctaattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgttataaatatgtttgtaattagtatt-ttttt 23777641  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |      
T  23777642 acaattttatcctttaagagagatatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatataa 23777741  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||         ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  23777742 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaagggacaa-ttttttttcttcaaaagggtcttataattaggaacggaggtagta 23777839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 253 - 554
Target Start/End: Original strand, 30049820 - 30050121
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30049820 taatactaccttcgtcccttattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 30049919  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  30049920 tttacaattttatcctttaagagagagagttgctttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 30050019  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggt 550  Q
    |||       |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |          ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30050020 tgtaaagaaataattattgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggaccaaatttttt--ttcaaaagagtcttataattagggacggaggt 30050117  T
Q  551 agta 554  Q
    ||||    
T  30050118 agta 30050121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 251 - 554
Target Start/End: Original strand, 13620590 - 13620891
Alignment:
Q  251 tttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 350  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13620590 tttaatactatctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattg 13620689  T
Q  351 tttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| | ||||||    
T  13620690 tttttacaattttatcctttaagagagagttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgta 13620789  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggt 550  Q
    |||       |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||          ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13620790 tgtaaaaaaataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttt--ttcaaaaggatcttataattagggacggaggt 13620887  T
Q  551 agta 554  Q
    ||||    
T  13620888 agta 13620891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 48030599 - 48030360
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48030599 gtccttaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 48030500  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||       |||||    
T  48030499 cctttaagagagaattggtttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataatt 48030400  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48030399 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 48030360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 257 - 554
Target Start/End: Original strand, 36900852 - 36901147
Alignment:
Q  257 actacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 356  Q
    |||||||  ||||||||||||| | || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36900852 actacctccgtccctaattatagggccattttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 36900951  T
Q  357 caattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnn 456  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||       
T  36900952 caattttat-ccttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaa 36901050  T
Q  457 nnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
        ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||         | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  36901051 gaaataattaatgtagttggaaatagcaagggagtcttacaaaaagggacaaaaaaaaaatc-tcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 36901147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 266 - 557
Target Start/End: Original strand, 26625753 - 26626042
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26625753 gtccctaattataggacccttttgaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttat 26625852  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||       |||||    
T  26625853 cctttaagagagaattgatttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataatt 26625952  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26625953 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaaatc--tcaaaagggtcttataattagggacggagggagtagtt 26626042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Original strand, 625707 - 625957
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| || | ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  625707 atactacctccgtccctaattataggatctttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttt 625806  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||     
T  625807 tacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 625906  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  625907 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 625957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 271 - 555
Target Start/End: Original strand, 37776490 - 37776775
Alignment:
Q  271 taattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttt 370  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  37776490 taattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaattttatccttt 37776589  T
Q  371 aagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgt 470  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||       ||||||||||    
T  37776590 aagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataattaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgt 37776689  T
Q  471 agttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnnctt-caaaagagtcttataattagggacggaggtagtag 555  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||          || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  37776690 agttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggacaattttttttcttttcaaaagggtcttataattaaggacggaggtagtag 37776775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 270 - 505
Target Start/End: Original strand, 38899798 - 38900033
Alignment:
Q  270 ctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctt 369  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  38899798 ctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatattggatatttgtattaaatatatttgtaattaatgttgtttttacaattttatcctt 38899897  T
Q  370 taagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatg 469  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |       |||||||||    
T  38899898 taagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatatataattaataggggcatgtatataaaggaataattaatg 38899997  T
Q  470 tagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  38899998 tagttggaaatagcaaagtgatcttataaaaaggga 38900033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 266 - 501
Target Start/End: Original strand, 13389661 - 13389895
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13389661 gtccttaattatatggccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtagttagtattgtttttacaattttat 13389760  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||       |||||    
T  13389761 cctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataatt 13389859  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13389860 aatgtagttgaaaatagcaaaggagtcttataaaaa 13389895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 54624098 - 54623848
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54624098 tactacctccgtccctaattatatggccattttgaaaaaaaaatggaaattaagatagtaaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 54623999  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaaca-tgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  54623998 acaattttatcctttaagagaaagatggtttatgttttcaacattgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataattaataggggcatgtatgta 54623899  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
          |||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  54623898 aataaataattaatgtaggtggaaatagcaagtgagtcttataaaaaggga 54623848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 271 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 37842456 - 37842180
Alignment:
Q  271 taattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttt 370  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  37842456 taattataggacctttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 37842357  T
Q  371 aagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgt 470  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||       ||||||||||    
T  37842356 aagagagaattggtttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgt 37842257  T
Q  471 agttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggagg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37842256 agttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaatta--tcaaaagagtcttataattagggacggagg 37842180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 254 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 17339378 - 17339076
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  17339378 aatactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattt 17339279  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |  || |||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||| || ||| || ||||| |||||||||    
T  17339278 ttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttgaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtatgataaataggggcatgtat 17339179  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggta 551  Q
    ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  17339178 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagagacggaggta 17339081  T
Q  552 gtagt 556  Q
    |||||    
T  17339080 gtagt 17339076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 267 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 38027419 - 38027181
Alignment:
Q  267 tccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  38027419 tccctaattatatgacccttttggaaaaataactggaattaagatagtggatatttatattaaatatttttgtaattactattgtttttacaattttatc 38027320  T
Q  367 ctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
    |||||||  |||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  38027319 ctttaagaaagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 38027220  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38027219 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 38027181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 271 - 508
Target Start/End: Original strand, 52850208 - 52850447
Alignment:
Q  271 taattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttt 370  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  52850208 taattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatccttt 52850307  T
Q  371 aagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaat 468  Q
    |||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||    
T  52850308 aagagagatagttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 52850407  T
Q  469 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  52850408 atagttggaaataacaaaggggtcttataattagggataa 52850447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 255 - 453
Target Start/End: Original strand, 30523763 - 30523961
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30523763 atactacctccgtccctaattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 30523862  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||  |||||||||||    
T  30523863 tacaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaatatgggcatgtatgt 30523961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 255 - 554
Target Start/End: Original strand, 55562864 - 55563164
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55562864 atactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 55562963  T
Q  355 tacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  55562964 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 55563063  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtag 552  Q
    |       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||         | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55563064 taaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaaaatc-tcaaaagggtcttataattagggacggaggtag 55563162  T
Q  553 ta 554  Q
    ||    
T  55563163 ta 55563164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 267 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 18004228 - 18003990
Alignment:
Q  267 tccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatg 366  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  18004228 tccctaattatagggcccttttgaaaaaataacaggaattaagatagcgaatatttgtattatatatgtttgtaattagtattctttttacaattttatc 18004129  T
Q  367 ctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatta 466  Q
     ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  18004128 ttttaagagagagatgttttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagaggcatgtatgtaaagaaataatta 18004029  T
Q  467 atgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    | ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||    
T  18004028 aggtagttgaaaataacaaaaggatcttataaaaaggga 18003990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 252 - 557
Target Start/End: Original strand, 29519900 - 29520204
Alignment:
Q  252 ttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgt 351  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29519900 ttaatactacatccgtccctaattataaaacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggataaa-gtattaaatatgtttgtaattactattgt 29519998  T
Q  352 ttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgt 449  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||  ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  29519999 ttttacaattttatcctttaagaaagaaagttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgt 29520098  T
Q  450 atgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggagg 549  Q
    ||||       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||           ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29520099 atgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttc--tcaaaagggtcttataattagggacggagg 29520196  T
Q  550 tagtagtt 557  Q
    ||||||||    
T  29520197 tagtagtt 29520204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 266 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 56432807 - 56432518
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  56432807 gtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 56432708  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaata-tatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnnta 462  Q
     |||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||| || ||||  |||||||||||       ||    
T  56432707 cctttaagagagagagttggattatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaaatgtattataaataagggcatgtatgtaaagaaata 56432608  T
Q  463 attaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  56432607 attaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagagacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 56432518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 255 - 501
Target Start/End: Original strand, 50450963 - 50451211
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50450963 atactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatctgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 50451062  T
Q  355 tacaattttatgctttaaga--gagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  50451063 tacaattttatcctttaagagtgaggaatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatatatg 50451162  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |       ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  50451163 taaagaaataattaatgtagttttaaatagtaaaggggtcttataaaaa 50451211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 36991212 - 36990961
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36991212 tactacctccgtccctaattataggacccttctgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 36991113  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  || |||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||| || ||| || ||||| |||||||||||    
T  36991112 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttgaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtatgataaataggggcatgtatgt 36991013  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36991012 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 36990961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 37174133 - 37173880
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaa--taacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | | ||||| ||||||  |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37174133 tactacctccgtccctaattataggcctcttttaaaaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 37174034  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  37174033 ttacagttttatcctttaagagagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtat 37173934  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37173933 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 37173880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 266 - 502
Target Start/End: Original strand, 50602847 - 50603084
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50602847 gtccctaattatataacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 50602946  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||       |||    
T  50602947 tctttaagagagatagttggattatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataa 50603045  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  50603046 ttaatgtagttggaaatagcaaaaaagtcttataaaaag 50603084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 266 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 55876666 - 55876431
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55876666 gtccttaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 55876567  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     |||||| |||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||  |||||| ||||       |||||    
T  55876566 cctttaaaagagaattggtttatgttttcatcatgatatttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataagggcatgcatgtaaaaaaataatt 55876467  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  55876466 aatgtagttggaaatagcaaaggaatcttataaaaa 55876431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 251 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 20789234 - 20788978
Alignment:
Q  251 tttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 350  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  20789234 tttaatactacctccgttcctaattatagaacccttttgaaaaaataatggaaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattgctattg 20789135  T
Q  351 tttttacaattttatgctttaagagag--aaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatg 448  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  20789134 tttttacaactttatcctttaagagagataattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatg 20789035  T
Q  449 tatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
     || |       ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20789034 catataaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaaggga 20788978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 269 - 505
Target Start/End: Original strand, 45096919 - 45097155
Alignment:
Q  269 cctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgct 368  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  45096919 cctaattataggacccttttataaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 45097018  T
Q  369 ttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaat 468  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||  || |||||| ||||  || ||| ||||       ||||||||    
T  45097019 ttaagagagaattggtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaatcatgtataataaataagggtatgcatgtaaagaaataattaat 45097118  T
Q  469 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45097119 gtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaaggga 45097155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 271 - 505
Target Start/End: Original strand, 18706398 - 18706632
Alignment:
Q  271 taattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttt 370  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||| ||||    
T  18706398 taattataagacccttttaaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttataattattattatatttacaattttatccttt 18706497  T
Q  371 aagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgt 470  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||  |||||||       ||||||||||    
T  18706498 aagagagagatcgtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtgtgtatgtaaagaaataattaatgt 18706597  T
Q  471 agttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18706598 agttggaaatagcaaaagagtcttataaaaaggga 18706632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 253 - 554
Target Start/End: Original strand, 25123980 - 25124283
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaa-aataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgt 351  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25123980 taatactacctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgt 25124079  T
Q  352 ttttacaattttatgcttta--agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgt 449  Q
    |||||||||||||| |||||  | ||||   ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||    
T  25124080 ttttacaattttatcctttaataaagagggttgacttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgt 25124179  T
Q  450 atgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggagg 549  Q
    ||||       ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||         | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25124180 atgtaaataaataattaatgaagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggtcaaaaaaaatttc-tcaaaagggtcttataattagggacggagg 25124278  T
Q  550 tagta 554  Q
    |||||    
T  25124279 tagta 25124283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 269 - 557
Target Start/End: Original strand, 36129842 - 36130130
Alignment:
Q  269 cctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgct 368  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  36129842 cctaattataggatccttttgaaaaaataatgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtctgtaattactattgtttttacaattttatcct 36129941  T
Q  369 ttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatta 466  Q
    |||||||||| |  || ||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||    
T  36129942 ttaagagagagagttggtttatgtttccaacatgttatctattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 36130041  T
Q  467 atgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36130042 atgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaaatc--tcaaaagggtcttataattaggaacggaggtagtagtt 36130130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 6462430 - 6462680
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6462430 tactacctccgtccataattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgttttt 6462529  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  6462530 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataa-taataggggcatgtatgt 6462628  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  6462629 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaaaggtcttataataaggga 6462680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 256 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 47683386 - 47683140
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  47683386 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatattagtattaaatatgtttgcaattactattattttt 47683287  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||||| |||||||||||    
T  47683286 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaggtgtataa-taataggggcatgtatgt 47683188  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
           ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  47683187 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaaagtcttataaaaa 47683140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 255 - 451
Target Start/End: Original strand, 54535920 - 54536118
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54535920 atactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 54536019  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  54536020 tacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtat 54536118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 249 - 554
Target Start/End: Original strand, 54877748 - 54878052
Alignment:
Q  249 tatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtat 348  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  54877748 tattgaatactacctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagagagtgaatatttttattaaatatgtttgtaattactat 54877847  T
Q  349 tgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatg 448  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| || |||||| ||||  ||||||    
T  54877848 tatttttacaattttatcttttaagagagtgttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattga--aaaaaaatgtataataaataagggcatg 54877945  T
Q  449 tatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnnc-ttcaaaagagtcttataattagggacgga 547  Q
    |||||       |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||         | |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  54877946 tatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaatttttttttctttcaaaacggtcttataattagggacgga 54878045  T
Q  548 ggtagta 554  Q
    |||||||    
T  54878046 ggtagta 54878052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 253 - 501
Target Start/End: Original strand, 55014703 - 55014952
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    |||||||||||   || ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55014703 taatactacctccatctctaattataggatccttttgaaaaaataacggaa-ttaaaataatgcatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtt 55014801  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    |||||||||||||  |||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  55014802 tttacaattttatcttttaagagagatggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgta 55014901  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||       |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  55014902 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatggatcttataaaaa 55014952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 254 - 505
Target Start/End: Original strand, 48241387 - 48241640
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48241387 aatactaccatcgtccttaattataggacccttttgaaaaaataacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 48241486  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||    || |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  48241487 ttacaattttatcctttatgagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttactggtgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtat 48241586  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||       |||||||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||    
T  48241587 gtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaaaagatcttataagaaggga 48241640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 375712 - 375471
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  375712 gtccataattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 375613  T
Q  366 gctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||  ||||   ||  ||||||||||| |||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  375612 cctttaagaaagagggttggcttatgttttcagcattctatttattgctgattgaagaaaaaaatatataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 375513  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  375512 ttaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaaggga 375471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 253 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 47807161 - 47806907
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    ||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| | |||||||    
T  47807161 taatactccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtt 47807062  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagagaa-atga-tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  47807061 tttacaattttatcctttaagaaagaagattagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 47806962  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47806961 tgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 47806907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 31937374 - 31937076
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31937374 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 31937275  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgat---ttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||  ||||||| || | || |   |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| || || ||||||||||    
T  31937274 acaattttatcatttaagaaag-agtgttagattatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatg 31937176  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtag 552  Q
    |       ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31937175 taaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggtag 31937078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 266 - 555
Target Start/End: Original strand, 32032740 - 32033031
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  32032740 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 32032839  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  32032840 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 32032939  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtag 555  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  32032940 ttaatgtagctggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagggagtag 32033031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 275 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 15241758 - 15241480
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15241758 tataagaccattttgtcaaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 15241659  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||    
T  15241658 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtag 15241559  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||           |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15241558 ttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaaaaaaattc---tcaaaagagtcttataattagggacggagggagta 15241480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 20767955 - 20768206
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20767955 tactacctccgtccctaattataagtcatttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 20768054  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  20768055 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 20768154  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           ||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||    
T  20768155 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagagatcttataaaaaggga 20768206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 266 - 554
Target Start/End: Original strand, 35675669 - 35675957
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  35675669 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 35675768  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  35675769 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 35675868  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  35675869 ttaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaaattttttt--ttcaaaagggtcttataattagggacggagggagta 35675957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 266 - 554
Target Start/End: Original strand, 39114638 - 39114924
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  39114638 gtccctaattataaggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtatttacaattttat 39114737  T
Q  366 gctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| |||    ||  |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||       |||    
T  39114738 cctttaagaaagatggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataagagcatgtatgtaaagaaataa 39114837  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||          ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39114838 ttaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaa----ttcaaaaggatcttataattagggacggaggtagta 39114924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 266 - 554
Target Start/End: Original strand, 49228467 - 49228755
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  49228467 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 49228566  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| | ||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||       |||    
T  49228567 cctttaagaaataaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataa 49228666  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||         ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  49228667 ttaatgtagtttgaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaa--attttttcttcaaaagggtcttataattagagacggagggagta 49228755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 275 - 557
Target Start/End: Original strand, 20391196 - 20391477
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20391196 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 20391295  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||    
T  20391296 aagaaggttagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 20391395  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20391396 ttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggacaaatttttt---ttcaaaagggtcttataattagggacggagggagtagtt 20391477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 29427777 - 29427540
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  29427777 gtccctatatatatgacccttttgttaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 29427678  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| | ||||| |||||||||||       |||    
T  29427677 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtatattaaataggggcatgtatgtaaagaaataa 29427578  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29427577 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 29427540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 253 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 34963684 - 34963435
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatga-cccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgt 351  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  34963684 taatattacctccgtccttaattataggatcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgcaattattattgg 34963585  T
Q  352 ttttacaattttatgctttaagagaga-aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  34963584 ttttacaattttatcctttaagagagagagttgtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataa-taatagaggcatgta 34963486  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||       ||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||    
T  34963485 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaatgatcttataaaaa 34963435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 36392142 - 36391901
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||| ||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  36392142 gtccctatatataagacacttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 36392043  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
      ||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  36392042 cttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 36391943  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36391942 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 36391901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 554
Target Start/End: Original strand, 49373444 - 49373730
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  49373444 gtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatctgtattaaatatgtttgcaattactattgtttttacaattttat 49373543  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||||| |    || |||||||| |||| ||||||||||| | |||| |||||||||| || |  || ||||| |||||||||||       |||    
T  49373544 cctttaagagatatggttggtttatgttatcaagatgttatttatagctgattgaagaaaaatgtaca--ataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 49373641  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49373642 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggccaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 49373730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 53276935 - 53277176
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  53276935 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 53277034  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  53277035 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 53277134  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53277135 ttaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 53277176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Original strand, 47298976 - 47299228
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    ||||| |||| |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||  |||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||    
T  47298976 atactcccttcgtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtaaatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttt 47299075  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  47299076 tacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatg 47299175  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47299176 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 47299228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 266 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 30771810 - 30771575
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  30771810 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 30771711  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  30771710 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 30771611  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaa 499  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30771610 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 30771575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 285 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 41620781 - 41620517
Alignment:
Q  285 ttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgat 384  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |  || |    
T  41620781 ttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgcttttacaattttatcctttaagagatagttggt 41620682  T
Q  385 ttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagca 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||  || |||||||||       ||||||||||||||||||||||||    
T  41620681 ttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatgaagacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagca 41620582  T
Q  485 aaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggta 551  Q
    ||   ||||||||||||| |||||           ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41620581 aaaatgtcttataaaaagagataaaaataattc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggta 41620517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 51717838 - 51718088
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  51717838 tactaactttatccctaattataggacctttttgaaaa-ataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtatgtaattactattgttttt 51717936  T
Q  356 acaattttatgcttt--aagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| ||||  || |||||  || |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| || |||||  ||||  | |||||||||    
T  51717937 acaattttatcctttaaaaaagagagttggtttatgttttcaacctgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatatggacatgtatgt 51718036  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51718037 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtattataaaaaggga 51718088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 266 - 508
Target Start/End: Original strand, 422678 - 422921
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  422678 gtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 422777  T
Q  366 gctttaagagagaaatga-tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     |||||||| | |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||       ||||    
T  422778 cctttaagaaaaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataat 422877  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  422878 taatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggataa 422921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 253 - 505
Target Start/End: Original strand, 20285757 - 20286011
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||   ||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||    
T  20285757 taatactccctccgtccctaattataaagcccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtt 20285856  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  20285857 tttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 20285956  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||       ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  20285957 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaagagggtcttataaaaaggga 20286011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 5375307 - 5375547
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5375307 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 5375406  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     | |||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||||       |||    
T  5375407 ccgttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggca-gtatgtaaagaaataa 5375505  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5375506 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 5375547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 9327989 - 9328230
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9327989 gtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 9328088  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  9328089 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 9328188  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9328189 ttaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaaggga 9328230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 43387742 - 43387983
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| |||||||||   ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  43387742 gtccctatatataagacccttttatcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 43387841  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  43387842 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 43387941  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  43387942 ttaatgtagttggaagtaacaaaggggtcttataaaaaggga 43387983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 6753804 - 6753572
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6753804 tataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 6753705  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||    
T  6753704 aagaatgttagtttatgtttttaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 6753605  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6753604 ttggaaataacaaagaggtcttataaaaaggga 6753572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 10588353 - 10588121
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10588353 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 10588254  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||    
T  10588253 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 10588154  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10588153 ttggaaataacaaaggagtcttataaaaaggga 10588121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 24754357 - 24754125
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24754357 tataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttattacaattttatcctttaaga 24754258  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||    
T  24754257 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 24754158  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24754157 ttggaaataacaaagaggtcttataaaaaggga 24754125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 4036112 - 4035872
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4036112 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 4036013  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  4036012 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 4035913  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4035912 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 4035872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 271 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 18882636 - 18882395
Alignment:
Q  271 taattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttt 370  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18882636 taattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 18882537  T
Q  371 aag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggc--atgtatgtnnnnnnntaatta 466  Q
    |||  |||||  ||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||  || |||||       ||||||    
T  18882536 aagaaagagagttggcttatgttttcaacattatatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatatgtaaagaaataatta 18882437  T
Q  467 atgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||||    
T  18882436 atgtagttggaaatagaaaagaggttttagaaaaaaggataa 18882395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 54676836 - 54676594
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54676836 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttat 54676737  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||| | ||||   |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  54676736 cctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 54676637  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagc-aaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  54676636 ttaatgtagttggaaataacaaaaggggtcttataaaaaggga 54676594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 1028806 - 1028565
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||| ||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  1028806 gtccctatatataagactcttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatttatttgtaatcactattatttttacaattttat 1028707  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  1028706 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 1028607  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1028606 ttaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaaaaggga 1028565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 4455341 - 4455108
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4455341 tataagacccttttgccaaaatcacggaaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 4455242  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaat-atatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgta 471  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || |||||| ||||  |||||||||||       |||||||||||    
T  4455241 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 4455142  T
Q  472 gttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4455141 gttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 4455108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 34272968 - 34273209
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34272968 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaactaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 34273067  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||||| |||||||||||       |||    
T  34273068 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtatgataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 34273167  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34273168 ttaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 34273209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 45921726 - 45921478
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  45921726 tactacctctgtccctaattataaggcttttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgctttt 45921627  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||    | |||||||||||||   |||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||| ||||  |||||||||||    
T  45921626 acaattttatcctttaagagagagggttaatttatgttttca---tgttatttattgctgattgaataaaaagatgtataataaataagggcatgtatgt 45921530  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  45921529 aaataaataattaatgtagttgcaaataggaaatgagtcttataaaaaggga 45921478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 266 - 501
Target Start/End: Original strand, 47228477 - 47228714
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47228477 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 47228576  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  47228577 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaattaa 47228676  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  47228677 ttaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaa 47228714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 39671023 - 39670771
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39671023 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttt 39670924  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcg-aagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    |||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| | || ||||| || |||||| ||||| || |||||      
T  39670923 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaaaaaaaagatgtataataaataggggtatgtaga 39670824  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  39670823 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaaggga 39670771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 255 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 44295088 - 44294840
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    ||||| |||| |||||||  |||| |||||||||   ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||    
T  44295088 atactcccttcgtccctatatataagacccttttaccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt 44294989  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  44294988 tacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 44294889  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |       ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44294888 taaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaaaa 44294840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 260 - 501
Target Start/End: Original strand, 16545727 - 16545969
Alignment:
Q  260 acctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaa 359  Q
    ||||| |||| ||||||||||| | |||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16545727 accttcgtccttaattatatgatcattttaaaaaaataacgagaattaaaatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaa 16545826  T
Q  360 ttttatgctttaagagagaa--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnn 457  Q
    ||||||  ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||        
T  16545827 ttttatcttttaagagagaaggttggtttatcttttcaacatgttatttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaatag-ggcatgtatgtaaag 16545925  T
Q  458 nnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
       ||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||    
T  16545926 aaataattaatgtaattggaaatatcaaatgattcttataaaaa 16545969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 256 - 505
Target Start/End: Original strand, 29460444 - 29460695
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  29460444 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattagatatgtttgtaattattattgttttt 29460543  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| | || ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||    
T  29460544 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 29460643  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
           ||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  29460644 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaatgaatcttataaaaaggga 29460695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 256 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 40809854 - 40809607
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40809854 tactacctccgtccataattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 40809755  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | ||| || ||||| | |||||||||    
T  40809754 acaattttatcttttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagttgtattataaatagggacatgtatgt 40809655  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
           ||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  40809654 aaataaataattaatgtagttaaaaatagcaaaagaatcttataaaaa 40809607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 269 - 453
Target Start/End: Original strand, 45850476 - 45850662
Alignment:
Q  269 cctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgct 368  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  45850476 cctaattataagacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaattttatcct 45850575  T
Q  369 ttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  45850576 ttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 45850662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 55632009 - 55632249
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  55632009 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaaaaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 55632108  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  || ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  55632109 ccttaagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 55632208  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55632209 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 55632249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 28298119 - 28298361
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28298119 gtccctaattataaggctcttttaaaaaaataacgagaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttat 28298218  T
Q  366 gctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcg-aagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnnta 462  Q
     |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  |||||||||| ||| | || ||||| || |||||| |||||||||||||||||       ||    
T  28298219 cctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgtcgattgaaaaaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaata 28298318  T
Q  463 attaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  28298319 attaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaaggga 28298361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 275 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 50534162 - 50533932
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50534162 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 50534063  T
Q  375 gagaaatga--tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     |||| |    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||       ||||||||||||    
T  50534062 aagaagtttagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 50533963  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50533962 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 50533932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 256 - 475
Target Start/End: Original strand, 20761564 - 20761785
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20761564 tactacctccgtccctaattataagtcatttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 20761663  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  20761664 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 20761763  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttg 475  Q
           |||||||||||||||    
T  20761764 aaagaaataattaatgtagttg 20761785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 33413806 - 33413569
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33413806 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcatgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 33413707  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
      ||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  33413706 cttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 33413607  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33413606 ttaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaa 33413569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 45742555 - 45742796
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45742555 gtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttat 45742654  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |  ||||||||       |||    
T  45742655 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgatggaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataa 45742754  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  45742755 ttaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataaaaaggga 45742796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 49793377 - 49793091
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  49793377 gtccctaattataggacctttttgaaaaaataacgagaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttctaattacaattgtttttacaaatttat 49793278  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     ||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||  ||||| ||||  |  ||||||||       |||||    
T  49793277 ccttcaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattcaagaaaaagatgaataataaataaggaaatgtatgtaaagaaataatt 49793178  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49793177 aatgtagttggaaatagcaaaaaggttttataaaaagggacaaaaaaaattc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 49793091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 50424603 - 50424844
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  50424603 gtccctatatataagacccttttgtcaaaatcatgggaattaagatagtggatatgtgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 50424702  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  50424703 cctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 50424802  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  50424803 ttaatgtagttgaaaataacaaaagagtcttataaaaaggga 50424844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 51536455 - 51536214
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  51536455 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacaggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 51536356  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  51536355 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataa 51536256  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  51536255 ttaatgtagttgaaaataataaagaggtcttataaaaaggga 51536214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 52978270 - 52978029
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  52978270 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttat 52978171  T
Q  366 gctttaagagagaa--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||| ||||| || ||||||||       |||    
T  52978170 cctttaagaaagaaggttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaggatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataa 52978071  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  52978070 ttaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaaggga 52978029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 37352822 - 37352590
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| |||||||||   ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||    
T  37352822 tataagacccttttaccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctctaaga 37352723  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||    
T  37352722 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 37352623  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  37352622 ttggaaataacaaaaaggtcttataaaaaggga 37352590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 17609771 - 17610011
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||  || ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17609771 gtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgcttgtaatcactattgtttttacaattttat 17609870  T
Q  366 gctttaagagagaaatga-tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     |||||||| | |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  17609871 tctttaagaaaaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 17609970  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17609971 taatgtagttgaaaataacaaaggagtcttataaaaaggga 17610011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 317 - 505
Target Start/End: Original strand, 9808398 - 9808588
Alignment:
Q  317 atatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttga 414  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9808398 atatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaaatttatccttcaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctga 9808497  T
Q  415 tcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    | ||||||||| ||  ||||| ||||  |||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9808498 ttgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 9808588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 256 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23623933 - 23623753
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23623933 tactacctccgtccctaattatatgactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattg-tttt 23623835  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataat 435  Q
    |||||||||| |||||||  ||| || || ||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||    
T  23623834 acaattttatcctttaagaaagataattggtttatatttttaacatgttatttattgctgattgaataaaaatatgtataat 23623753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 255 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 1173861 - 1173616
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaat-aacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    |||||||||  ||| ||||||||| | | ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  1173861 atactacctccgtctctaattataaggctcttttgaaaaaattaacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattt 1173762  T
Q  354 ttacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||   ||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||  || |||||| ||||| ||||| |||    
T  1173761 ttacaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaggatgtataataaataggggcatatat 1173662  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata 497  Q
    ||       ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1173661 gtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaggggtcttata 1173616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 8344184 - 8343954
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8344184 tataagacccttttgtcaaaattacggtaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 8344085  T
Q  375 gagaa--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||  |||||       ||||||||||||    
T  8344084 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggca--tatgtaaagaaataattaatgtag 8343987  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| |||| | || |||||||||||||    
T  8343986 ttggaaataacaaaagagttttataaaaaggga 8343954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 253 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 51336096 - 51335840
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacgga--aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 350  Q
    |||||||||||   ||||||||||||   ||||||| ||||||||| | |  |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  51336096 taatactacctccctccctaattatagagcccttttaaaaaaataaagaaggaattaagataatagatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattg 51335997  T
Q  351 tttttacaattttatgctttaagaga--gaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatg 448  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||    
T  51335996 tttttacaaatttatccttcaagagagggagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatg 51335897  T
Q  449 tatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51335896 tatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 51335840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 303 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 37357693 - 37357489
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatg 400  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||| ||||   |  |||||||||||||||||    
T  37357693 aattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctctaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatg 37357594  T
Q  401 ttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 500  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  37357593 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaaggtcttataaaa 37357494  T
Q  501 aggga 505  Q
    |||||    
T  37357493 aggga 37357489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 47311556 - 47311337
Alignment:
Q  287 ttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta--agagagaaatgat 384  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||||   ||      
T  47311556 ttgaaaaaataacgggaattaagata-tggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaggaaagagggttggc 47311458  T
Q  385 ttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagca 484  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| |    
T  47311457 ttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaa 47311358  T
Q  485 aaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||   || |||||||||||||    
T  47311357 aaaaagtgttataaaaaggga 47311337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 270 - 557
Target Start/End: Original strand, 37639641 - 37639927
Alignment:
Q  270 ctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctt 369  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  37639641 ctaattataagtcctttttgaaaaaataacgagaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttt 37639740  T
Q  370 t--aagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaa 467  Q
    |  || ||||   ||  |||||||||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||||       |||||||    
T  37639741 taaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgccgattgaacaaaaatatgtataataaatag-gacatgtatgtaaagaaataattaa 37639839  T
Q  468 tgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37639840 tgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaagaatc--tcaaaagagtcttataattagggacggagatagtagtt 37639927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 256 - 435
Target Start/End: Original strand, 46480759 - 46480940
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||   |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46480759 tactacatttgtccctaattataaaaccattttaaaaaaataacatgaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 46480858  T
Q  356 acaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataat 435  Q
    |||||||||| ||||||||||||    || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  46480859 acaattttatcctttaagagagatggttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattggagaaaaaaatatataat 46480940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 263 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 52870934 - 52870691
Alignment:
Q  263 tttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattt 362  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  52870934 tttgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 52870835  T
Q  363 tatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnnt 461  Q
    ||| ||| | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||| ||       |    
T  52870834 tatccttaagagagagaattagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtaggtaaagaaat 52870735  T
Q  462 aattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  52870734 aattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaaggga 52870691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 318 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 50352300 - 50352111
Alignment:
Q  318 tatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgat 415  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50352300 tatttgtaataaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgat 50352201  T
Q  416 cgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
     ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50352200 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 50352111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 4416262 - 4415965
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | ||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  4416262 tactacctccgtccctatatataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtattattgttttt 4416163  T
Q  356 acaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    ||| |||||| ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||  |||||||| || |||||| ||||| |||||||||||     
T  4416162 acagttttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 4416063  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4416062 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaacattc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 4415965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 256 - 425
Target Start/End: Original strand, 41191275 - 41191446
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41191275 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 41191374  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  41191375 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaa 41191446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 256 - 395
Target Start/End: Original strand, 49489880 - 49490019
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49489880 tactacctccgtccctaattataggacacttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 49489979  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttca 395  Q
    |||||||||| |||||||||||   |||||||| ||||||    
T  49489980 acaattttatcctttaagagagtgttgatttattttttca 49490019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 256 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 49329784 - 49329541
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||    |||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  49329784 tactaccttcgtccctaattataaagtccttttgaa----taacagaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacttttgttttt 49329689  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    ||||||||||  ||||||  || |   ||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  49329688 acaattttatcatttaagaaagtgggttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataaaggcatgtatgt 49329589  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
           ||||||||||||||| |||||  ||| | ||||||||||||    
T  49329588 aaaaaaataattaatgtagttgaaaataaaaaatgagtcttataaaaa 49329541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 30745549 - 30745789
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| |||||| |||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  30745549 gtccctatatataagaccctcttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcatt-ttgtttttacaattttat 30745647  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| | ||   |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| || ||||||||       |||    
T  30745648 cctttaagaaataatgttagtttatgttttcaacctgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataa 30745747  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30745748 ttaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 30745789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 255 - 425
Target Start/End: Original strand, 32898977 - 32899149
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32898977 atactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 32899076  T
Q  355 tacaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  32899077 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaa 32899149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 275 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 37364796 - 37364583
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| |||||||||   ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||    
T  37364796 tataagacccttttaccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctctaaga 37364697  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||    
T  37364696 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 37364597  T
Q  473 ttggaaatagcaaa 486  Q
    ||||||||| ||||    
T  37364596 ttggaaataacaaa 37364583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 2615693 - 2615935
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||| |||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  2615693 gtccctaattataaggcccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 2615792  T
Q  366 gcttta---agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnnta 462  Q
     ||| |   |||||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       ||    
T  2615793 ccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 2615892  T
Q  463 attaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  2615893 attaatgtagttggaaataacaaaaaggtcttataaaaaggga 2615935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 20747457 - 20747217
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| | || |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20747457 gtccctaattataagacccttttgctaaaattatgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 20747358  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  20747357 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 20747258  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20747257 taatgtagttgaaaataacaaagggatcttataaaaaggga 20747217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 266 - 549
Target Start/End: Original strand, 4549639 - 4549921
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4549639 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttat 4549738  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  4549739 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 4549838  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggagg 549  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| | ||           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4549839 taatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataaaaaggaacaaaaaaaattc--tcaaaagagtcttataattagggacggagg 4549921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 255 - 376
Target Start/End: Original strand, 5734386 - 5734507
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5734386 atactacctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 5734485  T
Q  355 tacaattttatgctttaagaga 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  5734486 tacaattttatcctttaagaga 5734507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Original strand, 39184009 - 39184239
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaag- 373  Q
    |||| |||| |||||  ||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||     
T  39184009 tataagaccattttgtcaaaattatggaaattaaaaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatcctttaaga 39184108  T
Q  374 -agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     |||||| |  ||||||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||       || |||||||||    
T  39184109 tagagaattagtttatgttttcaacataatatttactgtcgattgaagaaaaatatatataataaataggggcatgtatgtaaagaaatagttaatgtag 39184208  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  39184209 ttggaaatagcaa--gggtcttatacaaaggga 39184239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 5743409 - 5743649
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  ||||| |||| |||||| | ||| |||||||||||||||  ||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5743409 gtccctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtagatatttgtattaaagttgtctgtaatcactattgtttttacaattttat 5743508  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | | |||||  |  ||||||||||  | |||||| |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  5743509 ccttaagaaagagagttagtttatgtttttcatatgttacttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 5743608  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5743609 taatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 5743649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 29014074 - 29014314
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || | ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  29014074 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 29014173  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  29014174 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 29014273  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  29014274 taatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaaggga 29014314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4143675 - 4143549
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||||  |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4143675 gtccttaattataggatccttttgaaaaaataacgagaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaattttat 4143576  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttt 392  Q
     |||||||||||| |||||||||||||    
T  4143575 cctttaagagagagatgatttatgttt 4143549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 266 - 501
Target Start/End: Original strand, 15500361 - 15500598
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||  |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  15500361 gtccttaattataggacttttttgaaaaaataacgggaattaagatactagatattcatattaaatatgtttataattactattatttttacaattttat 15500460  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     ||||| ||||||    || ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||| || |||||| ||| |  |||||| |||       |||    
T  15500461 cctttatgagagaggggtggtttatgttttcaacatgttatttattactaattgaagaaaaagatgtataataaatcggagcatgtgtgtaaagaaataa 15500560  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15500561 ttaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttataaaaa 15500598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 259 - 505
Target Start/End: Original strand, 34948395 - 34948641
Alignment:
Q  259 tacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 358  Q
    |||||| |||||||  |||| ||| ||||||  ||||| |||| |||||| | | || ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  34948395 taccttcgtccctatatataagactcttttgctaaaattacgggaattaagaaaatgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcaatattgtttttaca 34948494  T
Q  359 attttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnn 458  Q
    |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||         
T  34948495 attttatcttttaagagagagttgatttatgttttccgtatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaaga 34948594  T
Q  459 nntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
      ||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||    
T  34948595 aataattaatgtagttgaaaatagtaaagtgatcttataaaaaggga 34948641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 285 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 18018926 - 18018735
Alignment:
Q  285 ttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaag--agagaaatg 382  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||   ||    
T  18018926 ttttgaaaaaataacggaa-ttaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggttg 18018828  T
Q  383 atttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttg 475  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||       |||||||||||||||    
T  18018827 acttatgttttcaacattctatttattgctgattaaagaaaaagatatataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttg 18018735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 266 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 53630079 - 53629842
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || | ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  53630079 gtccctaaatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 53629980  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  53629979 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 53629880  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  53629879 taatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaag 53629842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 253 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 25475115 - 25474863
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    |||||||||||  ||||||   |||| || |||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||   |||||  |||||||||| | |||||||    
T  25475115 taatactacctccgtccctgtatataagatccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttactttaaagttgtttgtaatcactattgtt 25475016  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||| |||||    |||||||    
T  25475015 tttacaattttatcctttaagagataattagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagacgtataataaataggattatgtatg 25474916  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |       ||||||||||| ||| ||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  25474915 taaagaaataattaatgtacttgaaaataacaaaagagtcttataaaaaggga 25474863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 275 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 6083562 - 6083333
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||| ||||||  ||||| |||| |||||| | ||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  6083562 tataagactcttttgttaaaattacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttat-ctttaaga 6083464  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
    |||| |  |  ||||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||| || |||||| |||||||  ||||||||       ||||||||||||    
T  6083463 gagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattcaagaaaaagatgtataataaatagagctatgtatgtaaagaaataattaatgtag 6083364  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6083363 ttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 6083333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 256 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 39880035 - 39879917
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  39880035 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatacttgtattaaatatgtttataattactattgttttt 39879936  T
Q  356 acaattttatgctttaaga 374  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  39879935 acaattttatcctttaaga 39879917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 256 - 502
Target Start/End: Original strand, 26866601 - 26866850
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||| ||| |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||| |||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  26866601 tactatcttcgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgttttt 26866700  T
Q  356 acaattttatgcttta-agagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||| |||||| ||| | ||||||| |  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  26866701 acagttttatccttaagagagagatagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgatacaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatg 26866800  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |       ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26866801 taaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaag 26866850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 270 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 39144687 - 39144453
Alignment:
Q  270 ctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctt 369  Q
    ||||||||| |||| |||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  39144687 ctaattataagacctttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt 39144588  T
Q  370 ta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaat 468  Q
     | |||||||  |  |||||||||||   ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||    
T  39144587 aagagagagagttagtttatgttttccgtatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 39144488  T
Q  469 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagg 503  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  39144487 gtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagg 39144453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 266 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 55777180 - 55777056
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55777180 gtccctaattataggacc-ttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 55777082  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgtt 391  Q
      ||||||||| || || ||||||||    
T  55777081 catttaagagataattggtttatgtt 55777056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 25708430 - 25708669
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25708430 gtccctaattataagacccttt-gctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 25708528  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||        |||    
T  25708529 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaacaaaaaat 25708628  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
     |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25708629 caatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 25708669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 338 - 505
Target Start/End: Original strand, 41191449 - 41191618
Alignment:
Q  338 gtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataat 435  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || ||||||    
T  41191449 gtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataat 41191548  T
Q  436 taatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
     ||||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41191549 aaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 41191618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 368 - 557
Target Start/End: Original strand, 49490020 - 49490208
Alignment:
Q  368 tttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaa 467  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| || |||||| ||||  |||||||||||       |||||||    
T  49490020 tttaagagagtgttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgtagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaa 49490119  T
Q  468 tgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||         | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49490120 tgtagttggaaataggaaaggggtcttataaaaagggacaaacaaaaaatc-tcaaaagaatcttataattagggacggatgtagtagtt 49490208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 266 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 55841360 - 55841236
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55841360 gtccctaattataggacc-ttttaaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 55841262  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgtt 391  Q
      ||||||||| || || ||||||||    
T  55841261 catttaagagataattggtttatgtt 55841236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 269 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 1859427 - 1859191
Alignment:
Q  269 cctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgct 368  Q
    |||||||||| ||| ||||||  ||||| || | |||||| | |  ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  1859427 cctaattataagactcttttgctaaaatcacaggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcct 1859328  T
Q  369 tta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaa 467  Q
    | | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| || | ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||||||    
T  1859327 taagagagagagttagtttatgttttccatatgatacttattgctgtt-gaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 1859229  T
Q  468 tgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1859228 tgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 1859191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 303 - 505
Target Start/End: Original strand, 19281877 - 19282071
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaa--atgatttatgttttcaacatg 400  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||    
T  19281877 aattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatg 19281976  T
Q  401 ttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 500  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||         |||||       ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19281977 ttatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataaat---------tatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaa 19282066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 299 - 503
Target Start/End: Original strand, 4094755 - 4094960
Alignment:
Q  299 cggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaac 397  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||||||   |  ||||||||||| |     
T  4094755 cggaaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagggttagtttatgttttccat 4094854  T
Q  398 atgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata 497  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||| |||||||  ||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||    
T  4094855 atgctatttattgttgattgaagagaaagatgtataataaatagagatatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaatggtcttata 4094954  T
Q  498 aaaagg 503  Q
    ||||||    
T  4094955 aaaagg 4094960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 266 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 6807634 - 6807492
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6807634 gtccctatatataagacccttttgtcaaaatcatgggaattaaaatagtggatatttgtattaaaaatgtttataattactattgtttttacaattttat 6807535  T
Q  366 gctttaagagagaa--atgatttatgttttcaacatgttattt 406  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||    
T  6807534 cctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttattt 6807492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 266 - 425
Target Start/End: Original strand, 33501678 - 33501839
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| |||| |||||  ||||| || | |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33501678 gtccctatatataagaccattttgccaaaatcacaggaattaagatagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 33501777  T
Q  366 gctttaagagagaa--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33501778 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa 33501839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 39184569 - 39184320
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||  |||||  |||||  ||| |||||| | ||||||||||| |||||||  ||||||| || | |||||||||    
T  39184569 atactacctccgtccttaattatatgacttttttgctaaaatcgcgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtgatcactattgtttt 39184470  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    ||||||||||| | |||| |||||  |  ||||||||||| | || |||||||||| |  | |||||||||||| |||||| ||||| | |||||| ||     
T  39184469 tacaattttat-ccttaaaagagagttagtttatgttttccatatattatttattgctagttgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtaggta 39184371  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
          ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  39184370 aagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagagatcttataaaaaggga 39184320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 255 - 504
Target Start/End: Original strand, 6656484 - 6656733
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  6656484 atactaccttcgtccctaattataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattaatattgtttt 6656583  T
Q  355 tacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| ||||  | ||| |   |    
T  6656584 tacaattttat-cttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataaggacatattgat 6656682  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggg 504  Q
           ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6656683 aaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaaggg 6656733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 335 - 453
Target Start/End: Original strand, 38405643 - 38405763
Alignment:
Q  335 tttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatat 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| || |||    
T  38405643 tttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattactgattgaagaaaaagatgtat 38405742  T
Q  433 aattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  38405743 aataaataggggcatgtatgt 38405763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 381 - 502
Target Start/End: Original strand, 48149052 - 48149173
Alignment:
Q  381 tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaat 480  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||    
T  48149052 tgatttatgctctcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataatatatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaat 48149151  T
Q  481 agcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  48149152 agcaaaagggtcttataaaaag 48149173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 255 - 380
Target Start/End: Original strand, 27009579 - 27009706
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaa-tatgtttgtaatt-agtattgtt 352  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  27009579 atactacttttctccttaattatagggcccttttgaaaaaataataagaattaagatagtggatatttatattaaaatatgtttgtaatttactattgtt 27009678  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagagaaa 380  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27009679 tttacaattttatcctttaagagagaaa 27009706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 28501127 - 28501423
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || ||||||| |||||| || || ||||| | ||| | |  | | ||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  28501127 tactacctccgtccctaattataggagccttttgcaaaaattacagagattaagaaagttggttgtagcattaaatttgtatgtaattactattgttttt 28501226  T
Q  356 acaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtn 454  Q
    |||||||||| ||| | |||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||  | ||| |||| ||| || |  ||     
T  28501227 acaattttatccttaagagagcgagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaata-aggtatcttggta 28501325  T
Q  455 nnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
          ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28501326 aagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaatttc--tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 28501423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 31071932 - 31071742
Alignment:
Q  317 atatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatc 416  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | | ||  ||||| |||||||| |||| ||||| || |  ||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  31071932 atatttgtattaaat-tgtttgtaatcactgttacttttataattttatcctttgagagataattagtttttgttttcagcatgttatttattgttgatt 31071834  T
Q  417 gaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
    ||||||||| || |||||| ||||  |  ||||||||       |||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  31071833 gaagaaaaagatgtataataaataaggatatgtatgtaaaaaaataattaatgtagctgaaaatagcaatggggtcttatgaaaatggataa 31071742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 323 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 13549209 - 13548979
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||    |||||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||    
T  13549209 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaaga 13549110  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttc 521  Q
    |||| || || ||| ||||  || ||||  ||       ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||          |||    
T  13549109 aaaa-atgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaaattatttt--ttc 13549013  T
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagtag 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13549012 aaaagagtcttataattagggacggaggtagtag 13548979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 356
Target Start/End: Original strand, 48148663 - 48148763
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||| ||||||||   |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  48148663 tactacctccgtccttaattatagtgcccttttgaaaaaataatataaattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 48148762  T
Q  356 a 356  Q
    |    
T  48148763 a 48148763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 384 - 498
Target Start/End: Original strand, 5734547 - 5734661
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt-nnnnnnntaattaatgtagttggaaatag 482  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||        ||||||||||||||||||||||    
T  5734547 tttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaaaaaaataattaatgtagttggaaatag 5734646  T
Q  483 caaaggggtcttataa 498  Q
    |||| |||||||||||    
T  5734647 caaa-gggtcttataa 5734661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 507
Target Start/End: Original strand, 8418156 - 8418338
Alignment:
Q  327 taaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaa 424  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||  |  ||||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  8418156 taaatctgttagtaattagtattgtttttacaattctatcctttaagagagtaagttagtttatattttcaacatactatttaatgttgattgaagaaaa 8418255  T
Q  425 atatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggata 507  Q
    | ||||| ||| ||||| || ||||  ||       ||||||||||| ||| ||||| |||| || |||||||||||| ||||    
T  8418256 aaatataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttgaaaataccaaatggatcttataaaaagagata 8418338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 303 - 440
Target Start/End: Original strand, 3168222 - 3168358
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgtt 402  Q
    |||||| | ||| ||||||| |||||||  |||| ||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||||  |    
T  3168222 aattaagaaagttgatatttatattaaaattgttcgtaatcactattgtttttacaattttatcatttaagagag-agttatttatgttttcaacatact 3168320  T
Q  403 atttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaata 440  Q
    |||||| |||||| ||||||||| || |||||| ||||    
T  3168321 atttatcgttgattgaagaaaaagatgtataataaata 3168358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Original strand, 41333857 - 41333960
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaag 420  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  41333857 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttat-ctttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 41333955  T
Q  421 aaaaa 425  Q
    |||||    
T  41333956 aaaaa 41333960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 393 - 554
Target Start/End: Original strand, 42528469 - 42528630
Alignment:
Q  393 tcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtc 492  Q
    |||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| | ||| |||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  42528469 tcaacatactatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataattaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtc 42528568  T
Q  493 ttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||||| ||         | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  42528569 ttataaaaagggacaatttttttttcctcaaaagggtcttataactagggacggaggtagta 42528630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 323 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 18872947 - 18872717
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | ||||||||||| || ||  |||||||||||||| |||||    
T  18872947 gtattaaatttgtataaaattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaaga 18872848  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttc 521  Q
    |||| ||| | ||| ||||  || ||||  ||       |||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||          |||    
T  18872847 aaaaaatacaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacctggaaatatcaaagggatcttataaaaagggacaaattatttt--ttc 18872750  T
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18872749 aaaagggtcttataattagggacggaggtagta 18872717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 323 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 28495615 - 28495431
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatga--tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaag 420  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    ||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||     
T  28495615 gtattaaatttgtttgtaattactattgcttttacaattttatcctttaagagagagatttagtttatattttcaacataatatttattgttgattgaat 28495516  T
Q  421 aaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||| || || ||| ||||| || ||||  ||       ||||||||| | ||||||||| || | || |||||||||||||||    
T  28495515 aaaaagatgtaaaataaataggggtatgttggtaaataaataattaatgaacttggaaataccagatggatcttataaaaaggga 28495431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 266 - 452
Target Start/End: Original strand, 20180667 - 20180854
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||  |||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20180667 gtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgagaattaaaaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaattaatattgtttttacaattttat 20180766  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
     ||| | |||||||  |   ||||| |||  ||||  ||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||| || |||||||    
T  20180767 ccttaagagagagagttagattatgcttttcacatactatttattgctgatcgaagaaaaaaaattataataaatagtggtatgtatg 20180854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 266 - 428
Target Start/End: Original strand, 53564106 - 53564269
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||| |||| || ||||||| |||||| ||||| ||||| | ||| | |  | ||||||||  ||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  53564106 gtccctaaatataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaagttgtgtataattactattgtttttacaattttat 53564205  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatat 428  Q
     ||| | |||||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  53564206 ccttaagagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaagaaaaatat 53564269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Original strand, 42598519 - 42598621
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaa 422  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  |||||| |||||| ||| || ||||||||||| ||| ||    
T  42598519 gtattaaatttgtttgtagttactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttagtttatggtttcaatatgctacttattgttgattgaaaaa 42598618  T
Q  423 aaa 425  Q
    |||    
T  42598619 aaa 42598621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 252 - 425
Target Start/End: Original strand, 26889637 - 26889809
Alignment:
Q  252 ttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgt 351  Q
    |||||| |||||  |||| |||||||| || ||||||| |||||| ||| | ||||| | ||| | |  | ||||||||| | | |||||||| ||||||    
T  26889637 ttaatattacctccgtccataattatacgagccttttgcaaaaattacgaagattaagaaagttggttgtagtattaaatttatatgtaattactattgt 26889736  T
Q  352 ttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||  | ||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  26889737 ttttacaattttat-ccttaagagggagttaatttatgtttttaacataatatttattgttgattgaagaaaaa 26889809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 250 - 554
Target Start/End: Original strand, 30868533 - 30868838
Alignment:
Q  250 atttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtatt 349  Q
    |||| |||||||||  || | |||||||| || ||||||| |||||| ||||| ||||| | ||| ||| || ||||||||| ||| | |||||| ||||    
T  30868533 atttgatactacctacgttcttaattataggagccttttgcaaaaattacggagattaagaaagttgat-ttagtattaaatttgtatataattactatt 30868631  T
Q  350 gtttttacaattttatgcttta---agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggca 446  Q
    |||||||||||||||| ||| |   |||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||| ||  | ||| ||||  || |    
T  30868632 gtttttacaattttatccttaagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaaaaaaaagatgcaaaataaataagggta 30868731  T
Q  447 tgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacgg 546  Q
     ||  ||       ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||         | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  30868732 cgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaggagtcttataaaaagggacaatttttttttc-tcaaaagggtcttataattagggacgg 30868830  T
Q  547 aggtagta 554  Q
    | ||||||    
T  30868831 atgtagta 30868838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 378
Target Start/End: Original strand, 49613898 - 49614022
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| | | |||| | ||| ||||| ||||   || || ||||||||    
T  49613898 aatactacctctgtctctaattatataaccctcttgaaaaaacaacgggaattaaaaaatttgataatggtaataaatttgttcaaaaatactattgttt 49613997  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagaga 378  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  49613998 ttacaattttatccttgaagagaga 49614022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Original strand, 47109627 - 47109730
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | ||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  47109627 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaattcatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 47109726  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  47109727 aaaa 47109730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 425
Target Start/End: Original strand, 51329521 - 51329691
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  |||||||  |||| |||| |||||  ||||| | || |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  51329521 tactacctccgtccctatatataagaccattttgctaaaattatgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 51329620  T
Q  356 acaattttatgctttaagagaga-aatga-tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||| | ||||| ||||  | ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  51329621 acaattttat-ccttaagagagataattagtttatatttttcatatgttatttattgctgattgaagaaaaa 51329691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 554
Target Start/End: Original strand, 6629284 - 6629509
Alignment:
Q  324 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaa 423  Q
    |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||  | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||||||    
T  6629284 tattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttat-ccttaagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaa 6629382  T
Q  424 aatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaa 523  Q
    || ||  | ||| ||||  || ||||  ||       ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||          |||||    
T  6629383 aa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagcgtcttataaaaagggacaaattatttt--ttcaa 6629479  T
Q  524 aagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6629480 aag-gtcttataattagggacggaggtagta 6629509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Original strand, 37780022 - 37780123
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaa 422  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  37780022 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttat-ccttaagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaa 37780120  T
Q  423 aaa 425  Q
    |||    
T  37780121 aaa 37780123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 18879665 - 18879546
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||| ||||   | ||||| ||       |||||||  ||||||||||||||    
T  18879665 tttatgttttcaacatgttatttattgatgatagaagaaagaaatgtataataaataagagtatgtaggtaaagaaataattaa--tagttggaaatagc 18879568  T
Q  484 aaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  18879567 aaaggggacttataaaaaggga 18879546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 20286249 - 20286101
Alignment:
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtat 451  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |  || |||    
T  20286249 ttacaattttatt-tttaagagagagagttgatttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatatat 20286151  T
Q  452 gtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    ||       |||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||    
T  20286150 gtaatgaaataattaatgtagttggaaatagtaaataagtcttataaaaa 20286101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 2738877 - 2738833
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2738877 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtattataaaaaggga 2738833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 425
Target Start/End: Original strand, 13498236 - 13498396
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| |  || | ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| |||||| |||||||||||||    
T  13498236 gtccctaaatatatgagccttttgcaaaaattacggagaaaaagaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtatttacaattttat 13498335  T
Q  366 gctttaaga-gagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
     ||| || | ||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  13498336 ccttaaaaaagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaa 13498396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 23621549 - 23621509
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23621549 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 23621509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Original strand, 23390155 - 23390258
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| || ||  |||||||||||||| |||||    
T  23390155 gtattaaatttgtataaaattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaaga 23390254  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  23390255 aaaa 23390258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 378
Target Start/End: Original strand, 24072221 - 24072343
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| ||| |||||    
T  24072221 atactacctccgtccctaaatatatgagccttttgaaaaaattacggagattaagaaagttggttgtggtattaaatttgtatataattactatggtttt 24072320  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagaga 378  Q
    ||||||||||| | ||||||||||    
T  24072321 tacaattttat-ccttaagagaga 24072343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Original strand, 30010659 - 30010762
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  30010659 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttgagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 30010758  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  30010759 aaaa 30010762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 554
Target Start/End: Original strand, 32899165 - 32899255
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32899165 taattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaaaatc---tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 32899255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 38616058 - 38615984
Alignment:
Q  324 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacat 399  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  38616058 tattaaatttgtttataattactattatttttacaattttat-ctttaagggagaattaatttatgttttcaacat 38615984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 554
Target Start/End: Original strand, 52181009 - 52181223
Alignment:
Q  339 taattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaa 438  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||  | |||||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||| ||  | ||| ||    
T  52181009 taattactattgtttttacaattttat-ccttgagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataaa 52181107  T
Q  439 tagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataatt 538  Q
    ||  || | ||  ||       ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||          |||||||  |||||||||||    
T  52181108 taagggtaggttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggagtcttataaaaagggacaaatttttttttttcaaaatggtcttataatt 52181207  T
Q  539 agggacggaggtagta 554  Q
    | ||||||||||||||    
T  52181208 atggacggaggtagta 52181223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 52966389 - 52966159
Alignment:
Q  259 tacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 358  Q
    ||||| ||||||||  |||| || | |||||  ||||| |||| || ||| | |||||||||||||||||||  | ||||||||   |||| ||||||||    
T  52966389 tacctctgtccctatatataagatcattttgctaaaatcacgggaaataagaaagtggatatttgtattaaagttatttgtaatccctattatttttaca 52966290  T
Q  359 attttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnn 456  Q
    ||||||| ||| || |||| ||  |  ||||||||||  | ||| ||||||||| | || ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||       
T  52966289 attttatccttaaa-agaggaagttagtttatgttttacatatgatatttattgctaattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaa 52966191  T
Q  457 nnnntaattaatgtagttggaaatagcaaagg 488  Q
        ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52966190 gaaataattaatgtagttggaaataacaaagg 52966159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 430 - 505
Target Start/End: Original strand, 468420 - 468495
Alignment:
Q  430 tataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||| ||||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  468420 tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttttaaaaaggga 468495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 254 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 17468187 - 17468030
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  |||||||| |||| || | ||||  |||||| ||||| ||||| | ||| | |  | ||||||||| | | | |||||| ||||||||    
T  17468187 aatactacctccgtccctaaatataggagcatttttcaaaaattacggagattaagaaagttggttgtagtattaaatttatatataattactattgttt 17468088  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgtt 412  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17468087 ttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgtt 17468030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 20783416 - 20783315
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaa 422  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||    
T  20783416 gtattaaatttgtatataattactattatttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttttttgaagaa 20783318  T
Q  423 aaa 425  Q
    |||    
T  20783317 aaa 20783315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 32684825 - 32684724
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaa 422  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||  | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  32684825 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttat-ccttaagaaagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaa 32684727  T
Q  423 aaa 425  Q
    |||    
T  32684726 aaa 32684724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 384 - 441
Target Start/End: Original strand, 26186569 - 26186626
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatag 441  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  26186569 tttatgttttcaacaagatatttattgttgatcgaagaaaataatatataataaatag 26186626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 384 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 53906185 - 53906116
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  || |||||| ||||  |||||||||||    
T  53906185 tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaatgatgtataataaataagggcatgtatgt 53906116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 706766 - 706662
Alignment:
Q  333 tgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga-aatga-tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatat 430  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| | |||||||||| |||||| |||||||| || ||  ||||||||||| |    
T  706766 tgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagatagataattagtttatgtttttaacatgctatttattatttattaaagaaaaatatgt 706667  T
Q  431 ataat 435  Q
    |||||    
T  706666 ataat 706662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 435
Target Start/End: Original strand, 729851 - 729955
Alignment:
Q  333 tgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga-aatga-tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatat 430  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| | |||||||||| |||||| |||||||| || ||  ||||||||||| |    
T  729851 tgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagatagataattagtttatgtttttaacatgctatttattatttattaaagaaaaatatgt 729950  T
Q  431 ataat 435  Q
    |||||    
T  729951 ataat 729955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3085672 - 3085571
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||  ||||||||||| || ||  |||||||||||||| |||||    
T  3085672 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttgagagagagtaa--atttatgtttttaatataatatttattgttgattgaaga 3085575  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  3085574 aaaa 3085571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 411
Target Start/End: Original strand, 5840046 - 5840189
Alignment:
Q  267 tccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatg 366  Q
    ||||||||||||||| ||| ||   ||||| |||| ||| || | ||| |||| |  |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||     
T  5840046 tccctaattatatgatcctcttaccaaaatcacgggaataaagaaagttgataataatattaaatttgtttataattattattatttttacaattttat- 5840144  T
Q  367 ctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgt 411  Q
    | ||||||||||  |  |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5840145 ccttaagagagagttagtttatgtttttaacatgatatttattgt 5840189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 501
Target Start/End: Original strand, 51329712 - 51329752
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51329712 taattaatgtaattggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 51329752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 29509035 - 29508932
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaa-gagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||  | |||||||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||    
T  29509035 gtattaaatttgtatatagttactattgtttttacaattttatccttaaaagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattattgattgaaga 29508936  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  29508935 aaaa 29508932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 35909872 - 35909769
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||| ||||||| ||  |||||||||||| | |||||    
T  35909872 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttggttgaaga 35909773  T
Q  422 aaaa 425  Q
    ||||    
T  35909772 aaaa 35909769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 378
Target Start/End: Original strand, 54158710 - 54158765
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga 378  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  54158710 gtattaaatttgtttgtaattactattatttttacaattttatccttttagagaga 54158765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 554
Target Start/End: Original strand, 11469182 - 11469275
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||         ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  11469182 taattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaaattctcaaaaagggttttataattagggacggaggtagta 11469275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 11522279 - 11522186
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||         ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  11522279 taattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaaattctcaaaaagggttttataattagggacggaggtagta 11522186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 505
Target Start/End: Original strand, 17678302 - 17678509
Alignment:
Q  300 ggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaaca 398  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||   |||||| ||| | |||| ||||||||||||||| ||| | ||||||   |  ||||||||||| | |    
T  17678302 ggaaattaagaaagtggatatttatattaatgttgtttgaaatcactattatttttacaattttatccttaagagagagtgttagtttatgttttccata 17678401  T
Q  399 tgttatttattgttgatcgaag-aaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata 497  Q
    |  ||||||||| |||| |||| ||||| || |||||| ||||| | ||| ||| |       ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||    
T  17678402 ttatatttattgctgattgaaggaaaaagatgtataataaatagggacatatatataaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaataagtcttata 17678501  T
Q  498 aaaaggga 505  Q
    ||||||||    
T  17678502 aaaaggga 17678509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 519 - 557
Target Start/End: Original strand, 39670988 - 39671026
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39670988 ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagtagtt 39671026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 39797525 - 39797434
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||          |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  39797525 taattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagggacaaatgatttt--ttcaaaaaggtcttataattagggacggaggtagta 39797434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 425
Target Start/End: Original strand, 48801427 - 48801529
Alignment:
Q  324 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaa 422  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||| |||||||||||||||| ||| | ||| |||  |  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  48801427 tattaaatttgtatataattattatagtttttacaattttatccttaagagaaagagttagtttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaa 48801526  T
Q  423 aaa 425  Q
    |||    
T  48801527 aaa 48801529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 327 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 10497593 - 10497477
Alignment:
Q  327 taaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaa 424  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  | |  | |||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  10497593 taaatttgtttataattactattatttttacaattttatcctttaagagagaagactagtgtatgtttttaacatagtatttaatgttgattgaagaaaa 10497494  T
Q  425 atatatataattaatag 441  Q
      ||||| ||| |||||    
T  10497493 ggatataaaataaatag 10497477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 323 - 425
Target Start/End: Original strand, 19596248 - 19596351
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaag 420  Q
    ||||||||| ||| | ||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |  | ||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  19596248 gtattaaatttgtatataactactattgcttttacaattttatcctt-aagagagatagttaattcatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 19596346  T
Q  421 aaaaa 425  Q
    |||||    
T  19596347 aaaaa 19596351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Original strand, 46481334 - 46481379
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagc-aaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  46481334 taattaatgtagttggaaataacaaaaggggtcttataaaaaggga 46481379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 13138956 - 13138777
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta--agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaag 420  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||  ||||  ||| |||  || ||||| |||| |||||  ||||||| ||| || ||||    
T  13138956 gtattaaatatgtttgtaattattattgttttttcaattatatcttttacgagatagagttggtttatatttt-aacataatatttatcgttaattgaag 13138858  T
Q  421 aaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||| || ||| ||||  || ||||  ||       ||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||    
T  13138857 aaaaatatgtaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaatgagtcttataaaaa 13138777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 304
Target Start/End: Original strand, 15452573 - 15452621
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaa 304  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15452573 tactacctccgtccctaattatatgacatttttgaaaaaataacggaaa 15452621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Original strand, 36040908 - 36040952
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36040908 taattaatgtagttgaaaatagcaaaggaatcttataaaaaggga 36040952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 519 - 554
Target Start/End: Original strand, 7698471 - 7698506
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7698471 ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 7698506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 298
Target Start/End: Original strand, 18872716 - 18872759
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataa 298  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18872716 atactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataa 18872759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 519 - 554
Target Start/End: Original strand, 23623898 - 23623933
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23623898 ttcaaaagagtcatataattagggacggaggtagta 23623933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 519 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 41191310 - 41191271
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagttg 558  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41191310 ttcaaaagggccttataattagggacggaggtagtagttg 41191271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #209
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 508
Target Start/End: Original strand, 42598668 - 42598715
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  42598668 taattaatgtagttgaaaatagcaaatggatcttataaaaaaggataa 42598715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #210
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 50649133 - 50649042
Alignment:
Q  346 tattgtttttacaattttatgctttaagagaga-----aatgatt-tatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatata 431  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||     ||| | | |||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50649133 tattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttaattagtgtatgtttttaacatagtatttaatgttgatcgaagaaaaatatata 50649042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #211
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 53910431 - 53910308
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||  |||||| | ||| |||||||| ||||||  |||||  | ||  |||||||||    
T  53910431 atactacctctgtccctatatataagacccttttgccaaaattacgagaattaagaaagttgatatttgcattaaagttgtttcaagtttttattgtttt 53910332  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagaga 378  Q
    ||||||||||| ||| || |||||    
T  53910331 tacaattttatccttcaatagaga 53910308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #212
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 520 - 554
Target Start/End: Original strand, 6462693 - 6462727
Alignment:
Q  520 tcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6462693 tcaaaagaatcttataattagggacggaggtagta 6462727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #213
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 425
Target Start/End: Original strand, 7326036 - 7326074
Alignment:
Q  387 atgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7326036 atgttatcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa 7326074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #214
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 520 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 21161331 - 21161297
Alignment:
Q  520 tcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21161331 tcaaaagagtcttataattaaggacggaggtagta 21161297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #215
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 520 - 554
Target Start/End: Original strand, 53564359 - 53564393
Alignment:
Q  520 tcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53564359 tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 53564393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #216
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 425
Target Start/End: Original strand, 6595602 - 6595643
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  6595602 tttatgttttcaacaatttatttatggttgatcgaagaaaaa 6595643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #217
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Original strand, 7698378 - 7698422
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  7698378 taattaatgtacttggaaacatcaaaggggtcttataaaatggga 7698422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #218
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 266 - 378
Target Start/End: Original strand, 7776694 - 7776805
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||| |||| || |||||||  |||||  |||| ||||||| ||| | |  | ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  7776694 gtccctaaatataggagccttttgccaaaattgcggagattaaaaaagttggttgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttat 7776793  T
Q  366 gctttaagagaga 378  Q
     | ||||||||||    
T  7776794 -ccttaagagaga 7776805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #219
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 17467982 - 17467938
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17467982 taattaatgtacttgaaaataccaaagggatcttataaaaaggga 17467938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #220
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 522 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 21265252 - 21265220
Alignment:
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21265252 aaaagggtcttataattagggacggaggtagta 21265220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #221
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 333 - 431
Target Start/End: Original strand, 22130324 - 22130423
Alignment:
Q  333 tgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaa-atgatt-tatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatat 430  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  || ||||||||  || ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  22130324 tgtttgtaattataattgtttt-acaattttatctttgaagagagaggattattgtatgttttcaacatagtatttaatgttgattgaagaaaaagatat 22130422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #222
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Original strand, 24073072 - 24073116
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24073072 taattaatataattggaaataccaaagggatcttataaaaaggga 24073116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #223
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 29508896 - 29508852
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  29508896 taattaatgtacttggaaatatcaaaatggtcttataaaaaggga 29508852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #224
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 522 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 30523796 - 30523764
Alignment:
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30523796 aaaagggtcttataattagggacggaggtagta 30523764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #225
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 38319696 - 38319656
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  38319696 taattaatgtagttgaaaatagcaaagagctcttataaaaa 38319656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #226
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 519 - 555
Target Start/End: Original strand, 40809819 - 40809855
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtag 555  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  40809819 ttcaaaagagtcctataattatggacggaggtagtag 40809855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #227
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 521 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 55632032 - 55631996
Alignment:
Q  521 caaaagagtcttataattagggacggaggtagtagtt 557  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55632032 caaaagggtcttataattagggacggagggagtagtt 55631996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 164510 - 164214
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  164510 tactacctccgtccctaattataggatcgttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 164411  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnn 455  Q
    |||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||      
T  164410 acaattttattctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 164311  T
Q  456 nnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
         ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  164310 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaagggacaatttttttt--ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 164214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 295
Target Start/End: Original strand, 164212 - 164253
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaa 295  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  164212 aatactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaa 164253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 158; Significance: 8e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 251 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 45972 - 45722
Alignment:
Q  251 tttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 350  Q
    |||| ||||||||  || |||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45972 tttattactacctccgttcctaattatagggcccttttcaaaaaacaacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 45873  T
Q  351 tttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  45872 tttttacaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgta 45773  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45772 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 45722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0907 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0907
Description:

Target: scaffold0907; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 251 - 505
Target Start/End: Original strand, 4311 - 4565
Alignment:
Q  251 tttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 350  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||| |  | |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4311 tttattactacctccgtccctaattatagggtctttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattg 4410  T
Q  351 tttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  4411 tttttacagttttatcctttaagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgta 4510  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4511 tgtaaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 4565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 248 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 48959 - 48654
Alignment:
Q  248 atatttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagta 347  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  48959 atattaaatactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagataatagatatttgtattaaatatgtttgtgattaata 48860  T
Q  348 ttgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcat 447  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| || ||||||||||||  ||||    
T  48859 ttgtttttacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattaatgtttgaagaaaaagatgtataattaataggagcat 48760  T
Q  448 gtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacgga 547  Q
     |||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||         | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48759 ctatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggtacaaaaaaaaattc-tcaaaagggtcttataattagggacgga 48661  T
Q  548 ggtagta 554  Q
    |||||||    
T  48660 ggtagta 48654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 18793 - 18497
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18793 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgttttt 18694  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||    
T  18693 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataa-taataggggcatgtatgt 18595  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18594 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttataaaaagggacaaaaaaattc---tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagt 18498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 519 - 554
Target Start/End: Original strand, 18758 - 18793
Alignment:
Q  519 ttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18758 ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 18793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 254 - 554
Target Start/End: Original strand, 4402 - 4700
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4402 aatactacctccgtccttaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattaatattgttt 4501  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  4502 ttacaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgt 4601  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||           |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4602 aaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaatggacaaaaaaaattc--tcaaaagaatcttataattagggacggaggtagt 4699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0604 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0604
Description:

Target: scaffold0604; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 266 - 556
Target Start/End: Original strand, 3535 - 3821
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  3535 gtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactactgtttttacaattttat 3634  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||       | |||    
T  3635 cctttaagagagaattgatttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaat-att 3733  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagt 556  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3734 aatatagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaattc---tcaaaagggtcttataattagggacggagggagtagt 3821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 143; Significance: 8e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 270 - 505
Target Start/End: Original strand, 355056 - 355291
Alignment:
Q  270 ctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctt 369  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  355056 ctaattataggaccattttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgttattactattgtttttacaattttatcctt 355155  T
Q  370 taagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatg 469  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||       |||||||||    
T  355156 taagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaggaaaattatgtataataaataggggcaagtatgtaaagaaataattaatg 355255  T
Q  470 tagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  355256 tagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 355291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 92416 - 92307
Alignment:
Q  316 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttg 413  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||  | ||| |||||||||||||  |||||||| ||     
T  92416 gatattagtattaaatttatttgtaattcatattctttttacaattttatcctttaagatcgaaagttaattaatgttttcaacataatatttatttttt 92317  T
Q  414 atcgaagaaa 423  Q
    ||||||||||    
T  92316 atcgaagaaa 92307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 5446 - 5151
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5446 tactacctccgtccctaat-ataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgttttt 5348  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||    
T  5347 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataa-taataggggcatgtatgt 5249  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5248 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttataaaaagggacaaaaaaattc---tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagt 5152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0549 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0549
Description:

Target: scaffold0549; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Original strand, 9924 - 10219
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9924 tactacctccgtccctaat-ataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgttttt 10022  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||    
T  10023 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataa-taataggggcatgtatgt 10121  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10122 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttataaaaagggacaaaaaaattc---tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagt 10218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 256 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 3735 - 3438
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3735 tactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 3636  T
Q  356 acaattttatgctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||| |||||||  ||||   ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||| ||| | |||||| ||||    
T  3635 acaattttatcctttaagaaagagggttggattatgtttttaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaatcggggcatgcatgt 3536  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagt 553  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3535 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaattc---tcaaaagggtcttataattagggacggaggtagt 3439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 255 - 560
Target Start/End: Original strand, 9165 - 9469
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9165 atactacctctgtccctaattataacacccttttgaaaaa-taacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 9263  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatg 452  Q
    ||||||||||| |||||||| |||    ||| |||| ||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  9264 tacaattttatcctttaagaaagagggttgacttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 9363  T
Q  453 tnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtag 552  Q
    |       |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||           |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9364 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagagacaaaaaaaattc--tcaaaaggatcttataattagggacggaggtag 9461  T
Q  553 tagttgat 560  Q
    || |||||    
T  9462 tatttgat 9469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0883 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0883
Description:

Target: scaffold0883; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 287 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 1987 - 1767
Alignment:
Q  287 ttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga--gagaaatgat 384  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| || |    
T  1987 ttgaaaaaataacggaaattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggt 1888  T
Q  385 ttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagca 484  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||  |||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||       |||||||||||| |||||||||||    
T  1887 ttatgttttcaacatattttttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagctggaaatagca 1788  T
Q  485 aaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1787 aaggggtcttataaaaaggga 1767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 287 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 45780 - 45560
Alignment:
Q  287 ttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga--gagaaatgat 384  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| || |    
T  45780 ttgaaaaaataacggaaattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggt 45681  T
Q  385 ttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagca 484  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||  |||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||       |||||||||||| |||||||||||    
T  45680 ttatgttttcaacatattttttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagctggaaatagca 45581  T
Q  485 aaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  45580 aaggggtcttataaaaaggga 45560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 289
Target Start/End: Original strand, 24935 - 24969
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24935 atactacctttgtccctaattataggacccttttg 24969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0576 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0576
Description:

Target: scaffold0576; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 252 - 502
Target Start/End: Original strand, 281 - 531
Alignment:
Q  252 ttaatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgt 351  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  281 ttaatactacctccgtccctaattatagggcc-ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattaccattgt 379  T
Q  352 ttttacaattttatgcttta--agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgt 449  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||| ||||  |||||||    
T  380 ttttacaattttatcctttaagagagagaattaaattatgttttcaacatgttatttattgttcattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgt 479  T
Q  450 atgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    ||||       ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  480 atgt-aaagaataattaatgtagttgaaaatagcaatggggtcttataaaaag 531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0576; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 521 - 554
Target Start/End: Original strand, 548 - 581
Alignment:
Q  521 caaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  548 caaaagagtcttataattaaggacggaggtagta 581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0649 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0649
Description:

Target: scaffold0649; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 4047 - 4288
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4047 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 4146  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  4147 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtcaagaaataa 4246  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4247 ttaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 4288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Original strand, 31445 - 31677
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  31445 tataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaaga 31544  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||       ||||||||||||    
T  31545 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 31644  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31645 ttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 31677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 253 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 94086 - 93832
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    |||||||||||   |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  94086 taatactacctccatccctaattataaggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaactactattgtt 93987  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||    || ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  93986 tttacaattttaacctttaagaaagagggttggtttatgttttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgta 93887  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||       ||||||||||||||| |||||  ||||| ||  ||||||||||||    
T  93886 tgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataaaaaaggagttctataaaaaggga 93832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 365
Target Start/End: Original strand, 103814 - 103912
Alignment:
Q  267 tccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||||||| |||| |||||  ||||| |||| |||||||| | | |||| | ||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  103814 tccctaattataggaccattttgccaaaattacgggaattaaaaaaattgataatagtattaaatttgtttataattgctattgtttttacaattttat 103912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 19708 - 19950
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19708 gtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagaggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 19807  T
Q  366 gctttaag--agagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||  ||||   ||  |||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  19808 cctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattcaatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 19907  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatag-caaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  19908 ttaatgtagttggaaatagaaaaagggatcttataaaaaggga 19950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Original strand, 258880 - 259112
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  258880 tataagacccttttgtcaaaatcacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 258979  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||    
T  258980 aagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 259079  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  259080 ttggaaataacaaagagatcttataaaaaggga 259112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0368 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0368
Description:

Target: scaffold0368; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 8505 - 8265
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  8505 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtntttacaattttat 8406  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  8405 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaatat-tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 8307  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8306 ttaatgtagttggaaataacaatggggtcttataaaaaggga 8265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 106; Significance: 9e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 266 - 501
Target Start/End: Original strand, 6889 - 7126
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  6889 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 6988  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  6989 cctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaattaa 7088  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  7089 ttaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaa 7126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 275 - 505
Target Start/End: Original strand, 14107 - 14338
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14107 tataagacccttttgccaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagatgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaaga 14206  T
Q  375 gagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||       |||||||||||     
T  14207 aagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgta- 14305  T
Q  473 ttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14306 taggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 14338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 298 - 505
Target Start/End: Original strand, 5067 - 5276
Alignment:
Q  298 acggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttca 395  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||   |  ||||||||||||    
T  5067 acgggaattaagatagtggatatttgtattaaagctgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttca 5166  T
Q  396 acatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtctta 495  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  5167 acatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtctta 5266  T
Q  496 taaaaaggga 505  Q
    ||||||||||    
T  5267 taaaaaggga 5276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 47927 - 47687
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| || |||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47927 gtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 47828  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||       ||||    
T  47827 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 47728  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  47727 taatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaaggga 47687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 253 - 505
Target Start/End: Original strand, 51418 - 51672
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    ||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||    
T  51418 taatactccctccgtccctatatataagacccttttgcgaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcaccattgtt 51517  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagagaa--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgta 450  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| || |||||    
T  51518 tttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgta 51617  T
Q  451 tgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    | |       ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  51618 tataaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaaggga 51672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 5047 - 4809
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  5047 gtccctaattataggatccttttaaaaaaataacgagagttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgcttttacaa-tttat 4949  T
Q  366 gctttaagagaga--aatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     ||||||||||||    || ||| || |||||||||||||||||||| | || ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||       |||    
T  4948 cctttaagagagagggttggtttttg-tttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataa-taataggggcatgtatgtaaagaaataa 4851  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4850 ttaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaaggga 4809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 4771 - 4727
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4771 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 4727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 61602 - 61843
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  61602 gtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 61701  T
Q  366 gctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||| |||||||||||       |||    
T  61702 cctttaagaaagaaggttagtttatattttcaatatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 61801  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  61802 ttaatgtagttggaaataacataggggtcttataaaaaggga 61843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 256 - 435
Target Start/End: Original strand, 40606 - 40787
Alignment:
Q  256 tactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 355  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  40606 tactacctccgtccctaattatagggcatttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttttattaaatatgtttgtaattactcttattttt 40705  T
Q  356 acaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataat 435  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  40706 acaattttattctttaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataat 40787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 12351 - 12111
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||||||||  |||||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12351 gtccctaattataaaacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 12252  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||  |  ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||       ||||    
T  12251 ccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataat 12152  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12151 taatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 12111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 266 - 502
Target Start/End: Original strand, 24381 - 24617
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24381 gtccctatatataagacccttttgtcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 24480  T
Q  366 gctttaagagagaa--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaa 463  Q
     |||||||| ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||  ||||||       |||    
T  24481 cctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggc--gtatgtaaagaaataa 24578  T
Q  464 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 502  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  24579 ttaatgtagttgaaaataacaaaggagtcttataaaaag 24617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 266 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 24495 - 24270
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| || | ||| |||||| ||| || ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24495 gtccctaattataggatcttttagaaaaa-taatgggaattaagttaatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 24397  T
Q  366 gctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaatt 465  Q
     |||||||       || ||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||       ||| |    
T  24396 cctttaag-----gttggtttatgttttcaacatgttatatattggcgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgt----aaataaat 24306  T
Q  466 aatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24305 aatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaa 24270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 266 - 505
Target Start/End: Original strand, 65388 - 65628
Alignment:
Q  266 gtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttat 365  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  65388 gtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat 65487  T
Q  366 gcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaat 464  Q
     ||| | |||||||| |  ||||||||||| | ||| || |||||| ||||  |||||||| || |||||| ||||  |||||||||||       ||||    
T  65488 ccttaagagagagaattagtttatgttttccatatgctacttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataat 65587  T
Q  465 taatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  65588 taatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaaggga 65628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 475
Target Start/End: Original strand, 9512 - 9714
Alignment:
Q  275 tatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaaga 374  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9512 tataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaga 9611  T
Q  375 gagaa--atgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtag 472  Q
     ||||   |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||||||    
T  9612 aagaaggttagtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtag 9711  T
Q  473 ttg 475  Q
    |||    
T  9712 ttg 9714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 255 - 401
Target Start/End: Original strand, 13302 - 13450
Alignment:
Q  255 atactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 354  Q
    |||||||||  |||||||||||||   || ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13302 atactacctccgtccctaattatagagccattttgaaaaaataacgtgaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 13401  T
Q  355 tacaattttatgctttaagagagaa--atgatttatgttttcaacatgt 401  Q
    |||||||||||  ||||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  13402 tacaattttatcatttaagagagaaggttggtttatgttttcaacatgt 13450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 343 - 554
Target Start/End: Original strand, 8407 - 8619
Alignment:
Q  343 tagtattgtttttacaattttatgcttt-aagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatag 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  || |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||     
T  8407 tagtattgtttttacaattttatccttttaagagagagttggtttatgttatcaacatgttacttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaataa 8506  T
Q  442 aggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagg 541  Q
     |||||| ||||       |||||||||||||||||||| | ||| | ||||| |||||| ||| ||         || ||||||||||||||||||| |    
T  8507 gggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaattgtaaatgagtcttctaaaaaaggacaatttttttttctccaaaagagtcttataattaag 8606  T
Q  542 gacggaggtagta 554  Q
    |||||||||||||    
T  8607 gacggaggtagta 8619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 276 - 344
Target Start/End: Original strand, 8066 - 8134
Alignment:
Q  276 atatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatta 344  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8066 atatgtcccttctgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatta 8134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 268 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 18640 - 18473
Alignment:
Q  268 ccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgc 367  Q
    ||||||||||| | |  ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  18640 ccctaattataggtctttttggaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcc 18541  T
Q  368 tttaagaga--gaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatata 433  Q
    |||||||||  |   |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  18540 tttaagagagggggtttgtttatgttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaaaatatata 18473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 270 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 118128 - 117893
Alignment:
Q  270 ctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctt 369  Q
    ||||||||| ||| ||||||  ||||| |||||| |||| | |  ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  118128 ctaattataagactcttttgttaaaatcacggaa-ttaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt 118030  T
Q  370 ta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaat 468  Q
     | |||||||  |  ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||       ||||||||    
T  118029 aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaat 117930  T
Q  469 gtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  117929 gtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 117893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 384 - 554
Target Start/End: Original strand, 1316 - 1483
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||| | |||||||||||       ||||||| |||||||||||||||    
T  1316 tttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaatcggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttggaaatagc 1415  T
Q  484 aaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttcaaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1416 aaaggagtctcataaaaagggacaaaaaaaat---ttcaaaagggtcttataattagggacggaggtagta 1483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 384 - 508
Target Start/End: Original strand, 9535 - 9659
Alignment:
Q  384 tttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagc 483  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||  ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||    
T  9535 tttatgttttccatatgctatttattgctgatataagaaaaatgtgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagc 9634  T
Q  484 aaaggggtcttataaaaagggataa 508  Q
    ||||  |||||||||||||||||||    
T  9635 aaagaagtcttataaaaagggataa 9659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 380
Target Start/End: Original strand, 9070 - 9146
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa 380  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  9070 aattaaaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttat-ccttaagagagaaa 9146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 254 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 34402 - 34156
Alignment:
Q  254 aatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 353  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||  |||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||| |||    
T  34402 aatactacctccgtccctatatataaaacccttttgataaaattacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattattt 34303  T
Q  354 ttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt 453  Q
    |||||||||||| | ||||| || | |   ||||||||||  | ||   |||||||  |||| |||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||    
T  34302 ttacaattttat-ccttaagggaaagagagtttatgtttttcatatcccatttattaatgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgt 34204  T
Q  454 nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 501  Q
           |||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||    
T  34203 aaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagaatcttataaaaa 34156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 323 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 17694 - 17511
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||  | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  17694 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 17595  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    |||| ||  | ||| ||||  || ||||  ||       ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17594 aaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaaggga 17511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 425
Target Start/End: Original strand, 11399 - 11569
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 352  Q
    |||||||||||  ||| |||| |||| || | |||||  ||||| ||||| ||||| | ||| |||  | ||||||||| ||| | |||||| |||||||    
T  11399 taatactacctccgtctctaaatataggagcattttgtcaaaattacggagattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtatataattactattgtt 11498  T
Q  353 tttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaa 425  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  11499 tttacaattttatac-ttaagagaggattaatttatgttttcaacataatatttattgtt-attgaagaaaaa 11569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 292 - 378
Target Start/End: Original strand, 13101 - 13186
Alignment:
Q  292 aaaataacggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga 378  Q
    ||||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13101 aaaatcacggaaattaagaaagtaaatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat-ctttaagagaga 13186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2116 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold2116
Description:

Target: scaffold2116; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 505
Target Start/End: Original strand, 7 - 51
Alignment:
Q  461 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 505  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 51  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 246685 - 246456
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaa-gagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||    |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  246685 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaaaagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 246586  T
Q  422 aaaatatatataattaatagaggcatgtatgtnnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggataannnnnnnnncttc 521  Q
    |||| |   | ||| ||||  || ||||  ||       ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||          |||    
T  246585 aaaa-aagcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaaattatttt--ttc 246489  T
Q  522 aaaagagtcttataattagggacggaggtagta 554  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  246488 aaaagggtcttataattaggaacggaggtagta 246456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 298
Target Start/End: Original strand, 246453 - 246498
Alignment:
Q  253 taatactacctttgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataa 298  Q
    |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  246453 taatactacctccgttcctaattataagacccttttgaaaaaataa 246498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 441
Target Start/End: Original strand, 32946 - 33089
Alignment:
Q  299 cggaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgct-ttaagagagaaatgatttatgttttcaac 397  Q
    |||||||||| | ||| | ||||| |||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||   |||||| |  |  ||||||||||||||    
T  32946 cggaaattaagaaagttggtatttctattaaagttctttgtaatcagtattgtttttacaattttatcctcaaaagagatagttagtttatgttttcaac 33045  T
Q  398 atgttatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatag 441  Q
    |   |||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||    
T  33046 aatatatttattgttgattgaagaaaaatatgtaaaataaatag 33089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22119 - 22066
Alignment:
Q  324 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagag 377  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| ||||    
T  22119 tattaaatttgtttgtaattattattatgtttacaattttatcctttaaaagag 22066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 503
Target Start/End: Original strand, 156188 - 156391
Alignment:
Q  303 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgt 401  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||||||||||| ||  | |||||||| |  ||||| ||||  | |||     
T  156188 aattaaaaaagtagatatttgtactaaagttttttgtaatcactattgtttttacaattttatcctgaagagagagaattagtttatatttttcatatgc 156287  T
Q  402 tatttattgttgatcgaagaaaaatatatataattaatagaggcatgtatgt--nnnnnnntaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaa 499  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||| |||||| ||||| | ||| |||||         |||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  156288 tatttattactgattgaagaaaaatatgtataatgaatagggtcatctatgtaaagaaatataattaatgtggttgaaaataacaaacgggtcttataaa 156387  T
Q  500 aagg 503  Q
    ||||    
T  156388 aagg 156391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0263 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0263
Description:

Target: scaffold0263; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 13788 - 13679
Alignment:
Q  316 gatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttg 413  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||  | ||| |||||||||||||  |||||||| ||     
T  13788 gatattagtattaaatttatttgtaattcatattctttttacaattttatcctttaagaccgaaagttaattaatgttttcaacataatatttatttttt 13689  T
Q  414 atcgaagaaa 423  Q
    ||||||||||    
T  13688 atcgaagaaa 13679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 733 - 633
Alignment:
Q  324 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaa 423  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||  |  ||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||    
T  733 tattaaatttgtttgtagttactattgattttacaattttatcctatatgagagagttagtttttgtttttaatatagtatttattgttgatcgaagaaa 634  T
Q  424 a 424  Q
    |    
T  633 a 633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 7197 - 7097
Alignment:
Q  324 tattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaa 423  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||  |  ||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||    
T  7197 tattaaatttgtttgtagttactattgattttacaattttatcctatatgagagagttagtttttgtttttaatatagtatttattgttgatcgaagaaa 7098  T
Q  424 a 424  Q
    |    
T  7097 a 7097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 426
Target Start/End: Original strand, 36172 - 36276
Alignment:
Q  323 gtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatgcttta-agagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaaga 421  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||||||   |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |    
T  36172 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagaaagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaca 36271  T
Q  422 aaaat 426  Q
    |||||    
T  36272 aaaat 36276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 378
Target Start/End: Original strand, 1953 - 1996
Alignment:
Q  335 tttgtaattagtattgtttttacaattttatgctttaagagaga 378  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1953 tttgtaattactattgtttttacaattttattctttaagagaga 1996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 520 - 560
Target Start/End: Original strand, 78778 - 78818
Alignment:
Q  520 tcaaaagagtcttataattagggacggaggtagtagttgat 560  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  78778 tcaaaagagtcttgcaattagagacggaggtagtagttgat 78818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University