View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11912_high_6 (Length: 338)

Name: NF11912_high_6
Description: NF11912
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11912_high_6
NF11912_high_6
[»] chr6 (37 HSPs)
chr6 (1-322)||(20748143-20748468)
chr6 (26-283)||(24589062-24589324)
chr6 (65-283)||(8747757-8747979)
chr6 (65-296)||(6407746-6407980)
chr6 (65-296)||(11570634-11570869)
chr6 (134-285)||(17964455-17964606)
chr6 (72-285)||(12688953-12689170)
chr6 (110-284)||(16836053-16836231)
chr6 (65-296)||(2699992-2700226)
chr6 (152-298)||(14509050-14509196)
chr6 (157-296)||(11534596-11534735)
chr6 (157-296)||(11560106-11560245)
chr6 (61-280)||(29892162-29892385)
chr6 (65-285)||(33687499-33687723)
chr6 (33-234)||(11614039-11614244)
chr6 (5-296)||(12406238-12406530)
chr6 (65-215)||(21309006-21309160)
chr6 (154-308)||(15991611-15991767)
chr6 (154-308)||(15999273-15999429)
chr6 (150-308)||(9751681-9751839)
chr6 (33-243)||(13736616-13736831)
chr6 (150-268)||(22609632-22609750)
chr6 (65-247)||(25316498-25316686)
chr6 (65-247)||(26203992-26204180)
chr6 (154-285)||(4157265-4157396)
chr6 (149-296)||(19995288-19995435)
chr6 (201-296)||(11428124-11428219)
chr6 (5-203)||(2760233-2760422)
chr6 (63-226)||(22695226-22695393)
chr6 (73-129)||(11534734-11534790)
chr6 (73-129)||(11560244-11560300)
chr6 (72-133)||(11428025-11428086)
chr6 (221-308)||(2863339-2863429)
chr6 (226-308)||(2882643-2882728)
chr6 (246-296)||(25314342-25314391)
chr6 (246-296)||(26201836-26201885)
chr6 (72-133)||(19674295-19674356)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (10-296)||(25543247-25543537)
chr7 (88-308)||(23866066-23866285)
chr7 (65-285)||(44510573-44510797)
chr7 (65-284)||(4930208-4930431)
chr7 (67-308)||(9650842-9651085)
chr7 (65-281)||(44423037-44423257)
chr7 (66-247)||(4579484-4579669)
chr7 (65-285)||(26341174-26341398)
chr7 (65-296)||(13314122-13314356)
chr7 (65-285)||(27238217-27238441)
chr7 (5-308)||(8075977-8076261)
chr7 (9-280)||(9008086-9008357)
chr7 (149-298)||(26287028-26287177)
chr7 (65-296)||(8268268-8268504)
chr7 (134-296)||(12799458-12799620)
chr7 (66-313)||(23246797-23247052)
chr7 (150-296)||(30258164-30258310)
chr7 (62-269)||(12254051-12254262)
chr7 (33-296)||(10388252-10388517)
chr7 (33-296)||(21671138-21671405)
chr7 (23-240)||(29150868-29151088)
chr7 (156-269)||(42626502-42626616)
chr7 (149-296)||(13142786-13142933)
chr7 (63-298)||(3357514-3357754)
chr7 (149-298)||(3880061-3880207)
chr7 (134-283)||(6590877-6591030)
chr7 (149-269)||(3284790-3284912)
chr7 (33-223)||(15642177-15642371)
chr7 (167-294)||(23318067-23318192)
chr7 (5-101)||(26287242-26287337)
chr7 (210-296)||(3045679-3045765)
chr7 (176-258)||(45748562-45748647)
chr7 (73-298)||(16372381-16372609)
chr7 (246-320)||(23616241-23616317)
chr7 (246-283)||(40865252-40865288)
chr7 (149-258)||(48064058-48064167)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (65-283)||(31449764-31449986)
chr8 (65-308)||(17025910-17026157)
chr8 (65-308)||(17556402-17556649)
chr8 (65-298)||(44925807-44926043)
chr8 (65-284)||(1807447-1807671)
chr8 (65-296)||(36683554-36683789)
chr8 (65-285)||(33416522-33416745)
chr8 (72-294)||(40125772-40125998)
chr8 (72-313)||(18876235-18876479)
chr8 (65-298)||(1910852-1911089)
chr8 (56-296)||(23548515-23548761)
chr8 (65-269)||(19166609-19166818)
chr8 (73-296)||(34118449-34118676)
chr8 (5-285)||(24090543-24090821)
chr8 (66-241)||(15875608-15875787)
chr8 (158-308)||(43302569-43302714)
chr8 (65-265)||(38182152-38182356)
chr8 (5-269)||(2965547-2965814)
chr8 (186-283)||(4238239-4238336)
chr8 (186-283)||(4242978-4243075)
chr8 (152-296)||(15951440-15951584)
chr8 (65-265)||(28559570-28559774)
chr8 (9-247)||(17953806-17954052)
chr8 (9-299)||(24673216-24673500)
chr8 (79-296)||(28564705-28564927)
chr8 (79-296)||(28572328-28572550)
chr8 (151-258)||(10933497-10933603)
chr8 (150-219)||(12820403-12820472)
chr8 (86-247)||(7902559-7902724)
chr8 (73-183)||(43302716-43302831)
chr8 (65-159)||(4243076-4243174)
chr8 (65-133)||(40130738-40130806)
chr8 (65-159)||(4238337-4238435)
chr8 (218-285)||(17020470-17020537)
chr8 (218-285)||(17550907-17550974)
chr8 (43-93)||(22714941-22714991)
chr8 (246-293)||(7001849-7001896)
chr8 (152-299)||(27415577-27415726)
chr8 (246-283)||(34818598-34818634)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (5-283)||(12045037-12045307)
chr5 (65-283)||(36942163-36942385)
chr5 (5-283)||(3665859-3666129)
chr5 (65-283)||(36937409-36937631)
chr5 (88-308)||(32461427-32461646)
chr5 (65-294)||(39523024-39523257)
chr5 (65-284)||(7451733-7451956)
chr5 (65-294)||(39518385-39518618)
chr5 (65-283)||(42001409-42001626)
chr5 (65-296)||(26667247-26667482)
chr5 (65-296)||(26938844-26939079)
chr5 (65-296)||(29167858-29168093)
chr5 (65-295)||(41587048-41587280)
chr5 (65-283)||(556670-556892)
chr5 (65-283)||(561442-561664)
chr5 (65-283)||(41996640-41996857)
chr5 (65-285)||(6155315-6155539)
chr5 (65-285)||(12103000-12103224)
chr5 (73-298)||(12501782-12502011)
chr5 (65-285)||(37248692-37248915)
chr5 (65-296)||(36428684-36428919)
chr5 (65-285)||(6514496-6514721)
chr5 (65-296)||(35679761-35679994)
chr5 (73-298)||(12041815-12042046)
chr5 (65-296)||(36423612-36423847)
chr5 (65-296)||(40147870-40148105)
chr5 (65-285)||(10759717-10759939)
chr5 (152-298)||(4871988-4872134)
chr5 (153-296)||(11981165-11981308)
chr5 (24-282)||(16116151-16116410)
chr5 (33-280)||(9911096-9911344)
chr5 (77-285)||(20180959-20181171)
chr5 (32-297)||(15414766-15415034)
chr5 (66-285)||(12102726-12102950)
chr5 (190-283)||(9726586-9726678)
chr5 (65-183)||(37652828-37652950)
chr5 (205-280)||(34707439-34707513)
chr5 (134-183)||(37550030-37550079)
chr5 (246-283)||(13301381-13301417)
chr5 (89-181)||(24435869-24435964)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (65-322)||(30658238-30658494)
chr2 (65-280)||(10160626-10160844)
chr2 (65-296)||(1934878-1935113)
chr2 (65-284)||(9180621-9180844)
chr2 (65-296)||(19892351-19892586)
chr2 (65-284)||(9189700-9189923)
chr2 (65-294)||(30650904-30651137)
chr2 (72-284)||(18344413-18344629)
chr2 (65-296)||(25478183-25478417)
chr2 (65-296)||(25497211-25497445)
chr2 (65-296)||(31326714-31326948)
chr2 (72-284)||(12796907-12797123)
chr2 (65-258)||(29677356-29677554)
chr2 (33-298)||(19578298-19578566)
chr2 (65-298)||(29677742-29677979)
chr2 (65-296)||(28603273-28603513)
chr2 (65-308)||(35601897-35602139)
chr2 (72-285)||(7737747-7737964)
chr2 (5-305)||(19094366-19094678)
chr2 (65-283)||(30631554-30631780)
chr2 (45-269)||(21523636-21523859)
chr2 (52-285)||(40847495-40847728)
chr2 (65-226)||(42926714-42926881)
chr2 (196-263)||(17453497-17453564)
chr2 (52-285)||(17545194-17545432)
chr2 (65-221)||(35638957-35639117)
chr2 (150-266)||(13291455-13291571)
chr2 (5-101)||(20711360-20711456)
chr2 (43-95)||(20572960-20573012)
chr2 (149-242)||(32079442-32079535)
chr2 (174-281)||(30618951-30619061)
chr2 (228-283)||(30629011-30629069)
[»] chr3 (44 HSPs)
chr3 (65-283)||(3672559-3672781)
chr3 (65-283)||(3692591-3692813)
chr3 (65-283)||(8069653-8069874)
chr3 (65-296)||(7571103-7571338)
chr3 (65-296)||(23666008-23666243)
chr3 (65-296)||(24038256-24038491)
chr3 (65-283)||(3033617-3033839)
chr3 (65-296)||(758253-758488)
chr3 (65-283)||(8883143-8883365)
chr3 (65-283)||(8887903-8888125)
chr3 (65-284)||(14438592-14438815)
chr3 (65-285)||(49971320-49971544)
chr3 (65-296)||(20520027-20520262)
chr3 (65-296)||(39775613-39775848)
chr3 (73-269)||(55431296-55431497)
chr3 (65-296)||(18467198-18467433)
chr3 (150-283)||(6596255-6596388)
chr3 (66-296)||(12965758-12965992)
chr3 (65-296)||(18471981-18472215)
chr3 (33-285)||(12112537-12112793)
chr3 (134-296)||(23661349-23661511)
chr3 (65-269)||(29350213-29350422)
chr3 (65-285)||(32474575-32474798)
chr3 (65-285)||(3418968-3419191)
chr3 (66-298)||(12971516-12971752)
chr3 (149-284)||(27708997-27709132)
chr3 (65-285)||(3657136-3657360)
chr3 (155-296)||(25726674-25726816)
chr3 (5-212)||(28125030-28125242)
chr3 (159-285)||(55325847-55325973)
chr3 (173-285)||(2207645-2207757)
chr3 (65-218)||(29715617-29715774)
chr3 (149-285)||(46964076-46964212)
chr3 (149-283)||(47567093-47567227)
chr3 (171-308)||(17025980-17026115)
chr3 (189-281)||(28125244-28125335)
chr3 (134-308)||(19276794-19276967)
chr3 (149-308)||(16013771-16013922)
chr3 (72-133)||(27708858-27708919)
chr3 (194-283)||(9113177-9113267)
chr3 (231-285)||(10708575-10708629)
chr3 (44-125)||(25726853-25726933)
chr3 (69-132)||(2207760-2207823)
chr3 (65-106)||(23661529-23661570)
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (65-296)||(31269009-31269244)
chr4 (65-296)||(37264449-37264684)
chr4 (65-296)||(31273496-31273731)
chr4 (65-296)||(37259762-37259997)
chr4 (5-297)||(12878155-12878449)
chr4 (67-308)||(13521867-13522110)
chr4 (65-299)||(33463238-33463476)
chr4 (65-285)||(16421004-16421228)
chr4 (65-296)||(47244223-47244458)
chr4 (67-296)||(8693688-8693921)
chr4 (150-298)||(48276532-48276680)
chr4 (65-296)||(55251695-55251929)
chr4 (65-296)||(51697892-51698126)
chr4 (65-284)||(5271316-5271539)
chr4 (91-284)||(31729284-31729481)
chr4 (65-296)||(5928104-5928339)
chr4 (65-296)||(13059385-13059619)
chr4 (65-296)||(19101952-19102187)
chr4 (73-299)||(33468855-33469085)
chr4 (67-285)||(12823797-12824013)
chr4 (42-293)||(12874491-12874746)
chr4 (65-298)||(8030359-8030596)
chr4 (134-285)||(19541057-19541208)
chr4 (168-283)||(8649528-8649643)
chr4 (168-283)||(8661335-8661450)
chr4 (65-296)||(19906226-19906460)
chr4 (65-308)||(47574600-47574837)
chr4 (23-299)||(4550932-4551206)
chr4 (70-247)||(42758689-42758870)
chr4 (65-265)||(2819819-2820024)
chr4 (72-245)||(32082027-32082203)
chr4 (65-198)||(31765861-31765998)
chr4 (65-296)||(19106594-19106818)
chr4 (225-283)||(55810176-55810234)
chr4 (149-283)||(32545158-32545293)
chr4 (149-242)||(16948064-16948157)
chr4 (171-296)||(40408284-40408411)
chr4 (175-306)||(40840417-40840548)
chr4 (9-95)||(23093112-23093197)
chr4 (245-308)||(47574816-47574874)
chr4 (56-171)||(13065778-13065897)
chr4 (217-266)||(55073389-55073438)
chr4 (226-269)||(1151211-1151254)
chr4 (171-313)||(9362416-9362562)
chr4 (211-250)||(55073320-55073359)
chr4 (134-188)||(16953133-16953187)
chr4 (246-283)||(7903005-7903041)
chr4 (221-285)||(13065712-13065776)
chr4 (164-308)||(29985570-29985715)
chr4 (218-313)||(39217257-39217356)
chr4 (231-263)||(55149765-55149797)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (65-298)||(23192701-23192937)
chr1 (65-285)||(33301076-33301300)
chr1 (65-296)||(19798898-19799133)
chr1 (67-281)||(18784457-18784666)
chr1 (65-284)||(16649510-16649732)
chr1 (148-284)||(25843818-25843954)
chr1 (65-296)||(26927607-26927842)
chr1 (65-285)||(40165955-40166179)
chr1 (5-263)||(16035530-16035784)
chr1 (65-266)||(10135431-10135637)
chr1 (143-298)||(8137996-8138151)
chr1 (65-294)||(51041350-51041581)
chr1 (65-284)||(10140064-10140294)
chr1 (150-296)||(16833548-16833694)
chr1 (149-298)||(28434457-28434606)
chr1 (80-296)||(47451111-47451330)
chr1 (186-283)||(3094188-3094285)
chr1 (72-296)||(39588252-39588480)
chr1 (134-296)||(38620740-38620902)
chr1 (63-269)||(11806332-11806543)
chr1 (40-281)||(12259946-12260184)
chr1 (72-214)||(47455353-47455499)
chr1 (39-223)||(5346615-5346800)
chr1 (61-191)||(8900225-8900359)
chr1 (65-133)||(25855146-25855214)
chr1 (212-295)||(46696734-46696817)
chr1 (65-159)||(3094089-3094187)
chr1 (74-133)||(16832085-16832144)
chr1 (246-283)||(41097851-41097887)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (65-284)||(7079-7302)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (65-296)||(9772-10007)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (5-283)||(82993-83260)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (65-294)||(4049-4282)
scaffold0002 (118-280)||(443847-444010)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (65-285)||(25374-25598)
scaffold0054 (150-258)||(29219-29327)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (5-270)||(165997-166254)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (73-234)||(35617-35782)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (43-247)||(255770-255978)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (143-255)||(1197-1309)
[»] scaffold2020 (1 HSPs)
scaffold2020 (150-269)||(435-561)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (150-269)||(164934-165060)
[»] scaffold0128 (1 HSPs)
scaffold0128 (110-265)||(13292-13451)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (69-242)||(2288-2464)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (5-101)||(15199-15295)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (155-213)||(155486-155544)
[»] scaffold0240 (3 HSPs)
scaffold0240 (5-101)||(3906-4002)
scaffold0240 (205-269)||(4092-4157)
scaffold0240 (153-183)||(4058-4088)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (149-242)||(8953-9046)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (88-181)||(2772-2868)
scaffold0132 (88-181)||(10732-10828)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (206-268)||(5410-5473)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (246-283)||(45944-45980)
[»] scaffold0060 (2 HSPs)
scaffold0060 (246-283)||(47756-47792)
scaffold0060 (246-283)||(52799-52835)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (246-283)||(1125-1161)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (246-283)||(152807-152843)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 37)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 20748468 - 20748143
Alignment:
Q  1 ctgtttgtttttggaattctaaattgttgtattttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20748468 ctgtttgtttttggatttctaaattgttgtattttggttttccaaattctattttaaaagataatatctatcaaagttgttactaggttgagtcacgacc 20748369  T
Q  101 aggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaact 196  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| ||  ||||    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  20748368 aggtcgccctctttaacatgtttcatggtactgtccaaaattgtgcaaggccgactatcaaccacgccgcctccagaataaaacaagtccatctacaact 20748269  T
Q  197 gtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20748268 gtgcggttaactactgcaccgtagaaaacggttcgagaattacaccttaaatatggtactaaaaccactcttttaatactaaaactactccaatatggta 20748169  T
Q  297 ctaagaccactcaaataagatgttac 322  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  20748168 ctaacaccactcaaataagatgttac 20748143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24589324 - 24589062
Alignment:
Q  26 gttgtattttggtttttcaaattctatttta-aaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttc 124  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||  |||||||| |||||||    
T  24589324 gttgtattttggttttcgaaattctattttctaaagagaacatctatcgaagttgttactaagttgagtcacgatcagatcgctctctttaaaacgtttc 24589225  T
Q  125 gtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtag 220  Q
    ||||||||     |||||||  |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24589224 gtgacactttccaaaattgtgcaagatagactatcaaccacgccgtctccaggataaaacaagtccaactacaactgtgcggttaactactgcattgtag 24589125  T
Q  221 aaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589124 aaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 24589062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 65 - 283
Target Start/End: Original strand, 8747757 - 8747979
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    |||||||  ||| | | |||||||| |    
T  8747757 tatctattgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgttccgtgacactgcccaaaattgtgcaagacaggctatcaacaa 8747856  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8747857 cgccgcctccaggataaaacaagctcagctgcaactatgtggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgaaaattacaccttcaatatggtactaaga 8747956  T
Q  261 ccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  8747957 ccactcttttattactgaaacca 8747979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 6407980 - 6407746
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||  ||||| || |||||||||| |||||    |||||||| || || ||||||||||||    
T  6407980 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgatcaggtcgctctcttgaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtacaaagcagactatcaacca 6407881  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6407880 cgccgcctccaggataaaacaagctcagctacaactgtgcggttaactact-cactgtagaaaaccgttcaagaattacacctccaaatatggtactaag 6407782  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6407781 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 6407746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 11570869 - 11570634
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| ||| ||||||||    
T  11570869 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacaaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagacaatcaacca 11570770  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  11570769 cgccgcctccaggataaaacaagctcagctacaactgtgcggtgaactactccgctgtagaaaaccgttccagaattataccctcaaatatggtactaag 11570670  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  11570669 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 11570634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 17964606 - 17964455
Alignment:
Q  134 aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgag 233  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17964606 aaattgtgcaaggcagactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagcccagctgcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgag 17964507  T
Q  234 aattacaccttc-aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17964506 aattacaccttcaaatatggtactaagaccactc-tttaatactgaaaccact 17964455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 285
Target Start/End: Original strand, 12688953 - 12689170
Alignment:
Q  72 cgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcc 167  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||   |||||||| |||||| |||| ||||    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |    
T  12688953 cgaagttgttactaggttgagtcatgaccaggtcactctctttaagacgttttgtgatactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaaccacgccgtc 12689052  T
Q  168 tccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaa-tatggtactaagaccactc 266  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||    
T  12689053 tccaggataaaacaagctcagctacaactgtgcggttaactactacactgtagaaaaccgttcgacaattacaccctcaattatggtattaagacgactc 12689152  T
Q  267 ttttaatactgaaaccact 285  Q
     ||||||| ||||||||||    
T  12689153 -tttaatattgaaaccact 12689170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 110 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16836231 - 16836053
Alignment:
Q  110 tctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggtta 205  Q
    ||||||| |||||||||| |||||    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16836231 tctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtacaaggcagactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagcccagctacaactgtgcggtta 16836132  T
Q  206 actactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttca-atatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccac 284  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16836131 gttactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcatatttggtactaagaccactc-tttaatactgaaaccac 16836053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 2700226 - 2699992
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| | ||||||||||||    
T  2700226 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccagatcgctctctttaagacgtttcgtggcactgttcaaaattgtgcaagacagactatcaacca 2700127  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||| ||||||||||||||||  || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  2700126 cgccgcttccaggataaaacaagcccaactacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaatcg-tcgagaattacacctccaaatatggtactaag 2700028  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  2700027 atcactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 2699992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 152 - 298
Target Start/End: Original strand, 14509050 - 14509196
Alignment:
Q  152 tatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatg 251  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  14509050 tatcaaccacgccgcttccaagataaaacaagctcatctacaactgttcgattaactactgcattgtagaaaatcgttcgagaattacacctccaatatg 14509149  T
Q  252 gtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtact 298  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14509150 gtaccaagaccattcttttaatactgaaaccactttaatatggtact 14509196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 157 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 11534735 - 11534596
Alignment:
Q  157 accacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtac 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  11534735 accacgccgcctccaggataaaacaagctcaactacaactgtgcggtgaactactgcattgtagaaaaccgttccagaattacaccctcaaatatggtac 11534636  T
Q  256 taagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  11534635 taagaccactc-tttaatattgaaaccactttaatatggta 11534596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 157 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 11560245 - 11560106
Alignment:
Q  157 accacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtac 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  11560245 accacgccgcctccaggataaaacaagctcaactacaactgtgcggtgaactactgcattgtagaaaaccgttccagaattacaccctcaaatatggtac 11560146  T
Q  256 taagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  11560145 taagaccactc-tttaatattgaaaccactttaatatggta 11560106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29892385 - 29892162
Alignment:
Q  61 agaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatca 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||  |||||||| | |||| ||| |||||    |||||||  ||| |  |||||||    
T  29892385 agaatatctatcgaagttgttactaggttgagtcacggtcaggtcgctctctttaagaagtttggtggcactgcccaaaattgtgcaagacaaactatca 29892286  T
Q  157 accacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtac 255  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | ||||||| || ||||||||||    
T  29892285 accacacctcctccaggataaaacaagtccagctacaactgtgtggttaactattgcattgtagaaaacctttcgatatttacaccctcaaatatggtac 29892186  T
Q  256 taagaccactcttttaatactgaaa 280  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||    
T  29892185 taagatcactc-tttaatactgaaa 29892162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33687723 - 33687499
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| |||| |||||| ||| |||||| |  |||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| | ||||||||||||    
T  33687723 tatctaccgaaattgttattaggttgagttaccaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactggccaaaattgtgcaagacagactatcaacca 33687624  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
     |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||| || |||||||||||||     
T  33687623 tgccgtctccaggataaaacaaactcaactacaactgtgcggttaactactgcattgtagaaaatccttcgagatttacaccctcaaatatggtactaaa 33687524  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33687523 accactc-tttaatattgaaaccact 33687499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11614244 - 11614039
Alignment:
Q  33 tttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacact 132  Q
    ||||| |||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| || |||||||| ||||||  || ||||    
T  11614244 tttggatttttaaattcttttttgaaaaagaatatctatcgaagttgttactaggttgagtcacgatgaggttgttctctttaaaacgttttatggcact 11614145  T
Q  133 g----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgt 228  Q
    |    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  11614144 gctcaaaattgtgcaaggcagactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagcacaattacaattgtgcggttaactaatgcactttagaaaactgt 11614045  T
Q  229 tcgaga 234  Q
    | ||||    
T  11614044 ttgaga 11614039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12406530 - 12406238
Alignment:
Q  5 ttgtttttggaattctaaattgttgtattttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggt 104  Q
    ||||||||||| ||  ||| |||||||||| || ||||||| || | |||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12406530 ttgtttttggattttcaaactgttgtattt-ggattttcaatttttttttttaaaga--atatataccgaagttgttactagattgagtcacgaccaggt 12406434  T
Q  105 cgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgc 200  Q
    ||  ||||| || |||||||||| || ||    || ||||  ||||  ||||||||| |||||||||| || ||||||||| | ||| |||||||||||     
T  12406433 cgctctcttaaagacgtttcgtggcagtgcctaaagttgtgcaaggaagactatcaatcacgccgccttcatgataaaacatgctcaactacaactgtgt 12406334  T
Q  201 ggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||| ||| || |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12406333 ggttaactactgcaccgtagaaaaccgtgagagatttataccctcaaatatgatactaaaatcact-ttttaatactgaaaccactttaatatggta 12406238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 65 - 215
Target Start/End: Original strand, 21309006 - 21309160
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||  |||  |||||||| ||||||| || |||||    |||||||  || || ||||||||||||    
T  21309006 tatctatcgaagttgttactaggttgagtcactaccatatcgctctctttaagacgtttcatggcactgcccaaaattgtgcaatgcagactatcaacca 21309105  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcac 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21309106 cgccgcctccaggataaaacaagctcagctacaactgtgcggttaactactgcac 21309160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 154 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15991767 - 15991611
Alignment:
Q  154 tcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatat-g 251  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  || ||||| |    
T  15991767 tcaaccaagccgcctctaggataaaacaagttcagctgcaattgtgcagttaactactgcactgtcgaaaaccgtttgagaattacacaatcaaatatgg 15991668  T
Q  252 gtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtactaagaccactc 308  Q
    ||| |||  |||||||||||| |||||||||| || | |||||||||| ||||||||    
T  15991667 gtattaatgccactcttttaaaactgaaaccaatcaattatggtactatgaccactc 15991611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 154 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15999429 - 15999273
Alignment:
Q  154 tcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatat-g 251  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  || ||||| |    
T  15999429 tcaaccaagccgcctctaggataaaacaagttcagctgcaattgtgcagttaactactgcactgtcgaaaaccgtttgagaattacacaatcaaatatgg 15999330  T
Q  252 gtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtactaagaccactc 308  Q
    ||| |||  |||||||||||| |||||||||| || | |||||||||| ||||||||    
T  15999329 gtattaatgccactcttttaaaactgaaaccaatcaattatggtactatgaccactc 15999273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 150 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9751839 - 9751681
Alignment:
Q  150 actatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaata 249  Q
    |||||||| |||| || ||  ||||||||| ||||  | |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  9751839 actatcaatcacgtcgtctgtaggataaaataagtctaactacaattgtgcgattaactactgcactgtagaacaccattcgagaattacacctccaata 9751740  T
Q  250 tggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtactaagaccactc 308  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| || | |||||||||| ||||||||    
T  9751739 tggcactaagaccactattttaatagcgaaaccaatcaattatggtactatgaccactc 9751681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13736831 - 13736616
Alignment:
Q  33 tttggtttttcaaattct-attttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacac 131  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||   ||||||||   |||||||  |||||||||| |||    
T  13736831 tttggatttccaaattcttattttgaaaaagaatatttaccgaagttgttactaggttgagtcgccaccaggtccctctctttacgacgtttcgtggcac 13736732  T
Q  132 tg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccg 227  Q
    ||    |||||||  ||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  13736731 tgcctaaaattgtgcaaggaagactaccaaccacactgcctccaggataaaacaagcacatctacaaatgtgcgaataactactgcactgtagaaaactg 13736632  T
Q  228 ttcgagaattacacct 243  Q
    ||||||| ||||||||    
T  13736631 ttcgagatttacacct 13736616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 268
Target Start/End: Original strand, 22609632 - 22609750
Alignment:
Q  150 actatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaata 249  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  22609632 actatcagtcacgccgcctccaggataaaacaagctcaactacaactgcgtgattaacaactgcacggtagaaaactattcgagaattacacctccaata 22609731  T
Q  250 tggtactaagaccactctt 268  Q
    ||||| || ||||||||||    
T  22609732 tggtaatatgaccactctt 22609750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25316686 - 25316498
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||  |  ||||| |||||| ||| |||||    |||||||  || ||  ||||| |||||    
T  25316686 tatctaccgaaattgttactagattgagtcgcgaccaggtcgctcaatttaagacgttttgtggcactgcccaaaattgtgcaaagcaaactatgaacca 25316587  T
Q  161 cgccgcc---tccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaa 247  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  25316586 cgccgccgtctccaggataaaacaagttcatctacaaccgtgcggttaacta-tgcactgtagaaaactgttcgagaattgcaccctcaa 25316498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26204180 - 26203992
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||  |  ||||| |||||| ||| |||||    |||||||  || ||  ||||| |||||    
T  26204180 tatctaccgaaattgttactagattgagtcgcgaccaggtcgctcaatttaagacgttttgtggcactgcccaaaattgtgcaaagcaaactatgaacca 26204081  T
Q  161 cgccgcc---tccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaa 247  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  26204080 cgccgccgtctccaggataaaacaagttcatctacaaccgtgcggttaacta-tgcactgtagaaaactgttcgagaattgcaccctcaa 26203992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 4157396 - 4157265
Alignment:
Q  154 tcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattaca-ccttcaatatgg 252  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| |||||||    
T  4157396 tcaaccacactgcctctaggataaaacaaactcagctacaacggtgcggttaactactgcactgtagaaaatcgttcgaaatttacacccttaaatatgg 4157297  T
Q  253 tactaagaccactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    | |||| | ||||| ||||||||||||| ||||    
T  4157296 tgctaatatcactc-tttaatactgaaatcact 4157265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 149 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19995435 - 19995288
Alignment:
Q  149 gactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aa 247  Q
    |||||||||||||| | ||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||| || ||    
T  19995435 gactatcaaccacggcaccttcgggataaaacaagcccagctacaactatgcggttaactactacaccgtagaaaacctttcgagatttacaccctcaaa 19995336  T
Q  248 tatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||| ||||||| | ||||  ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19995335 tatcgtactaaaaacact-atttaatactgaaaccactttaatatggta 19995288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 201 - 296
Target Start/End: Original strand, 11428124 - 11428219
Alignment:
Q  201 ggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  11428124 ggttaagtactgcactgtagaaaaccgttcgagatttacaccatcaaatatggtactaagactactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 11428219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 2760422 - 2760233
Alignment:
Q  5 ttgtttttggaattctaaattgttgtattttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggt 104  Q
    ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||| |||||| ||||||   |||||||| ||| ||||||||||||||| || ||| | ||||||||    
T  2760422 ttgtttttggatttccaaacagttgtattttggttttccaaattgtattttgttagagaataactagcgaagttgttactaggttaagttacgaccaggt 2760323  T
Q  105 cgtcctctttaatacgtttcgtgacactgaaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggt 203  Q
    ||| |||||||| |||||| ||| |      ||| |  ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||    
T  2760322 cgttctctttaaaacgttttgtggc------attatgcaaggcagactatcaacca---cgcctccaggataaaacaagctcaaatacaactttgcggt 2760233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22695393 - 22695226
Alignment:
Q  63 aatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaac 158  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||  | || |  |||||||| ||||||||||||| ||    |||||||  ||| |  || |||||     
T  22695393 aatatatatcgatgttgttactaggttgagacacgattatgttgctctctttaacacgtttcgtgacattgctcaaaattgtgcaagacatacaatcaat 22695294  T
Q  159 cacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaacc 226  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22695293 cacaccgcctccacgataaaacaagtacagctacaactgtgcggttaaccactgcattgtagaaaacc 22695226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 11534790 - 11534734
Alignment:
Q  73 gaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgac 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  11534790 gaagttgttactaggttgagtcaagaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtgac 11534734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 11560300 - 11560244
Alignment:
Q  73 gaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgac 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  11560300 gaagttgttactaggttgagtcaagaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtgac 11560244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 133
Target Start/End: Original strand, 11428025 - 11428086
Alignment:
Q  72 cgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg 133  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    
T  11428025 cgaagttgttattagattgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactg 11428086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 2863429 - 2863339
Alignment:
Q  221 aaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactc---ttttaatactgaaaccactccaatatggtactaagaccactc 308  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||   ||||| ||||||||||| || | |||||||||| ||||||||    
T  2863429 aaaaacgttcgaaaattacacctccaatatgatactaaggccactcatattttagtactgaaaccaatcaattatggtactatgaccactc 2863339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 2882728 - 2882643
Alignment:
Q  226 cgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactc---ttttaatactgaaaccactccaatatggtactaagaccactc 308  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||   ||||| ||||||||||| || | |||||| ||| ||||||||    
T  2882728 cgttcgaaaattacacctccaatatgatactaaggccactcatattttagtactgaaaccaatcaattatggtgctatgaccactc 2882643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25314391 - 25314342
Alignment:
Q  246 aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  25314391 aatatggtactaagaccactc-tttaatactgaaatcactttaatatggta 25314342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 26201885 - 26201836
Alignment:
Q  246 aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  26201885 aatatggtactaagaccactc-tttaatactgaaatcactttaatatggta 26201836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 133
Target Start/End: Original strand, 19674295 - 19674356
Alignment:
Q  72 cgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg 133  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||   |||||||| ||||||| || |||||    
T  19674295 cgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcactctctttaagacgtttcatggcactg 19674356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25543537 - 25543247
Alignment:
Q  10 tttggaattctaaattgttgtattttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcc 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||  |    
T  25543537 tttggaattctaaactgttgtattttggtttttcaaattctattttaaaagacaatatttatcgaagttgttactaggttgagtcacaatcaggtcgcac 25543438  T
Q  110 tctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggtta 205  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||    |||||||  |||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25543437 tctttaagacgtttcgtggtactgcctaaaattgtgcaagataaactatcaaccacatcgcctccaggataaaacaagtctagctacaactgtgcggtta 25543338  T
Q  206 actactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25543337 actactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactttaatatggta 25543247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 88 - 308
Target Start/End: Original strand, 23866066 - 23866285
Alignment:
Q  88 ttgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaag 183  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23866066 ttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaagacagactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaag 23866165  T
Q  184 ttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 283  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       
T  23866166 ctcagctgcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatgctgaaa--- 23866262  T
Q  284 ctccaatatggtactaagaccactc 308  Q
      |||||||||||||| ||||||||    
T  23866263 --ccaatatggtactatgaccactc 23866285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 44510797 - 44510573
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| | |  |||||||| |||||| ||| |||||    |||||||  ||| | ||||||||||||    
T  44510797 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccagattgctctctttaagacgttttgtggcactgtccaaaattgtgcaagacagactatcaacca 44510698  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44510697 cgccgcctccaggataaaacaagctcagctgcaactgtgcggttaacttctgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 44510598  T
Q  261 ccactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  44510597 ccacacttttaatactgaaaccact 44510573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 284
Target Start/End: Original strand, 4930208 - 4930431
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    ||||||| |||| |  |||||||||||    
T  4930208 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgtaagtcatactatcaacca 4930307  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttca-atatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4930308 cgccgcctccaggataaaacaagcccaactacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcatatatggtactaag 4930407  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccac 284  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  4930408 accactc-tttaatactgaaaccac 4930431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 67 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9651085 - 9650842
Alignment:
Q  67 tctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacg 162  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  9651085 tctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaagacagactatcaaccacg 9650986  T
Q  163 ccgcctccaggataaaacaagttcagctac---aactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9650985 ccgcctccaggataaaacaagtccagctgctgcaactgtacggttgactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacttttaatatggtactaag 9650886  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggtactaagaccactc 308  Q
    |||||||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||||||    
T  9650885 accactcttttaatactgaaa-----ccaatatggtactatgaccactc 9650842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 44423257 - 44423037
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactga----aattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||| || ||| |||  |||||||| |||||||||| ||||||    ||||||  ||||| |||||||||| |    
T  44423257 tatctaccaaagttgttactaggttgagtcacgatcagatcgctctctttaagacgtttcgtggcactgaccaaaattgttcaaggcagactatcaacta 44423158  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  44423157 cgccgcctccaggataaaacaagtccatctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaag 44423058  T
Q  260 accactcttttaatactgaaac 281  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  44423057 accactc-tttaatactgaaac 44423037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 66 - 247
Target Start/End: Original strand, 4579484 - 4579669
Alignment:
Q  66 atctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccac 161  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| |||||||||||||    
T  4579484 atctatcgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaaccac 4579583  T
Q  162 gccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaa 247  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4579584 gccgcctccaggataaaacaagtccagctacaactgtgcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcaagaattacaccctcaa 4579669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Original strand, 26341174 - 26341398
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  26341174 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacatttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 26341273  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  26341274 cgccgcctccaggataaaacaagtccagctacaactgttcgattaactactacactgtagaaaatcattcaagaattacacctccaaatatggtactaag 26341373  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26341374 accactc-tttaatactgaaaccact 26341398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13314356 - 13314122
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||  ||||    |||||||  ||||  |||||||| |||    
T  13314356 tatctaccgtagttgttactaggttgagtcacgaccagatcgctctctttaagacgtttcgtggtactgcccaaaattgtgcaaggtagactatcagcca 13314257  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13314256 cgtcgcctccaggataaaacaagctcagctacaactgttcaattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacctccaaatatggtactaag 13314157  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  |||||||||    
T  13314156 accactc--ttaatactgaaaccactttaatatggta 13314122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Original strand, 27238217 - 27238441
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||| ||| |||||    ||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  27238217 tatctatggaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgttttgtggcactgctcaaaattgtgtaaggcagactatcaatca 27238316  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||| |||||||    
T  27238317 cgccgcctgcaagataaaacaagtccagctacaactgcgtgcttaactactgcactgtagaaaatcgttcgagatttacaccctcaaatatgatactaag 27238416  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||    
T  27238417 accactc-tttaattctgaaaccact 27238441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 308
Target Start/End: Original strand, 8075977 - 8076261
Alignment:
Q  5 ttgtttttggaattctaaattgttgtattttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggt 104  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||            |||||  |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  8075977 ttgtttttggatttccaaactgttgtattttggttttccaaattctatt------------atctactgaagttgttactgggttgagtcacgaccaggt 8076064  T
Q  105 cgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgc 200  Q
    ||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8076065 cgctctctttaagacgtttcgtggcactgcctaaaattgtgcaagacagactatcaaccacgctgcctccaggataaaacaagctcagctgcaactgtgc 8076164  T
Q  201 ggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtactaa 300  Q
    | ||||||     |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     ||||||||||||||     
T  8076165 gattaact-----actgtagaaaactgttcgag-attacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatgttgaaa-----ccaatatggtactat 8076253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 280
Target Start/End: Original strand, 9008086 - 9008357
Alignment:
Q  9 ttttggaattctaaattgttgtattttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtc 108  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| || | |    |||||||||||| |||||||| ||||| |||       
T  9008086 ttttggatttccaaactgttgtattttggttttctaaattctattttgaaagagagtaccaa----agttgttactaggttgagtcacgaccatgtccct 9008181  T
Q  109 ctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggtt 204  Q
    |||||||| |||||| ||||||||     |||||||  ||||| | ||||||| || |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||    
T  9008182 ctctttaagacgtttagtgacactactcaaaattgtgcaaggcaggctatcaatcatgaagcctccaggataaaacaagtccaactacaactgtgtgatt 9008281  T
Q  205 aactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaa 280  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||    
T  9008282 aactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacaccttcaatatgatactaaaatcactcttttaataccgaaa 9008357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 149 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26287177 - 26287028
Alignment:
Q  149 gactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaat 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| ||||    
T  26287177 gactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaaatccagctacaactgtgcagttaactactgcactatagaaaatcgttcgagctttacacctccaat 26287078  T
Q  249 atggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtact 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26287077 atggtaccaagaccattcttttaatactgaaaccactttaatatggtact 26287028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Original strand, 8268268 - 8268504
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||| ||| |||||    |||||||  ||| | ||||||||||||    
T  8268268 tatctaccgaagttgttactatattgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgttttgtggcactgtccaaaattgtgcaagacagactatcaacca 8268367  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtag-aaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaa 258  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  8268368 cgccacctccatgataaaacaagtccagctacaactgttcgattaactactgcaccgtagaaaaaccgttcgataattacacctccaaatatggtactaa 8268467  T
Q  259 gaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    || ||||| |||| |||||||||||||  |||||||||    
T  8268468 gatcactc-tttagtactgaaaccactttaatatggta 8268504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 134 - 296
Target Start/End: Original strand, 12799458 - 12799620
Alignment:
Q  134 aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgag 233  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12799458 aaattgtgcaaggcagactatcaaccacgccacatccaggataaaataagtccagctacaactgtgcggttaactactgcattgcagaaaaccgttcgag 12799557  T
Q  234 aattacaccttc-aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  12799558 aattacaccctcaaatatggtactaagaccactc-tttaatactgaaatcactttaatatggta 12799620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 66 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23247052 - 23246797
Alignment:
Q  66 atctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccac 161  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | |||||||| |||||    |||||||  ||||| |||||||||||||    
T  23247052 atctaccgaagttgttactagattgagtcacgaccaggtcgctctctttaagatgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaaccac 23246953  T
Q  162 gccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatgg-tactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| ||  |||    
T  23246952 gccgcctccaggataaaacaagctcacctacaactgtgcgattaactactgttttatagaaaaccgttccaaaattacaccctcaaatatggctataaag 23246853  T
Q  260 accactc--ttttaatactgaaaccactccaatatggtactaagaccactcaaata 313  Q
     ||||||   ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  23246852 gccactcggatttaatattgaaaccactattatatggtactaagaccattcaaata 23246797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 30258164 - 30258310
Alignment:
Q  150 actatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aat 248  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||| |||    
T  30258164 actatcaatcacgccgcctccaggataaaacaagtccagctacaacagtgcggttaactactgcactgtagaaaattgttcgaaatttacaccttcaaat 30258263  T
Q  249 atggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  30258264 atggtactaagaccactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 30258310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 269
Target Start/End: Original strand, 12254051 - 12254262
Alignment:
Q  62 gaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaa 157  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||  |||||||| | |||| ||| |||||    || ||||  ||||| |||||||||    
T  12254051 gaatatctatcgaagttgttaccaggttgagtcgcgaccaggtcgctctctttaagatgttttgtggcactgcctaaagttgtgcaaggcagactatcaa 12254150  T
Q  158 ccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtacta 257  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  12254151 tcacgccgcctacaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactaatgctgtgtagaaaaccgtttgagatttacacctcaaatatggtacta 12254250  T
Q  258 agaccactcttt 269  Q
    || ||| |||||    
T  12254251 agtccagtcttt 12254262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 10388517 - 10388252
Alignment:
Q  33 tttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacact 132  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||| ||| || |    
T  10388517 tttggatttccaaattctattttgaaaaagaatatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgttttgtggcatt 10388418  T
Q  133 g---aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgtt 229  Q
    |   || ||||  | |   ||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  |||    
T  10388417 gcccaagttgtgcatgatagac-atcaacaacgccgcctccaggataaaacaaactcaactacaactgtgcgattaactactgcactctaaaaaattgtt 10388319  T
Q  230 cgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||| ||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  10388318 cgagatttacaccctcaaataaggtactaataccactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 10388252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 296
Target Start/End: Original strand, 21671138 - 21671405
Alignment:
Q  33 tttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacact 132  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||   |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |   |||||||| | |||| ||| ||||    
T  21671138 tttggatttccaaattctattttgaaatagaatatctgctgaagttgttactaggttgagtcacgactaggaccctctctttaagaagtttagtggcact 21671237  T
Q  133 g----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgt 228  Q
    |    || ||||  ||||| ||| |||||| ||  ||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  21671238 gcccaaagttgtgcaaggcagacaatcaacaacttcgcatccagaataaaacaagctcacctacaactgtgcggttaactactgcagtgtagaaaatcgt 21671337  T
Q  229 tcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    |||||| ||| |||| |||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  21671338 tcgagatttaaacctccaatatgggacaaagaccattcttttaataatgaaaccactttaatatggta 21671405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 240
Target Start/End: Original strand, 29150868 - 29151088
Alignment:
Q  23 attgttgtattttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtt 122  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||  || ||||| |||||    
T  29150868 attgttgt-ttttggattttcaaattctattttgaaaaagaatatataccgaagttgttactaggttgagtcacgaccagatcgctctttttaagacgtt 29150966  T
Q  123 tcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgt 218  Q
    |||||||||||    |||||||  |||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||  |||| | |    
T  29150967 tcgtgacactgctcaaaattgtgcaaggcaaactatcaaccacgtcgcctccaagataaaataagttcagctacaactacgcgcttaacttttgcattat 29151066  T
Q  219 agaaaaccgttcgagaattaca 240  Q
    |||| |||||| |||| |||||    
T  29151067 agaagaccgtttgagatttaca 29151088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 42626616 - 42626502
Alignment:
Q  156 aaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggta 254  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  42626616 aaccatgccgccgccaggataaaataagtccagctacaactgtgcggttaattactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacaccctcaaatatggta 42626517  T
Q  255 ctaagaccactcttt 269  Q
    |||||| ||||||||    
T  42626516 ctaagatcactcttt 42626502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 149 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13142933 - 13142786
Alignment:
Q  149 gactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacc-ttcaa 247  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||| || ||    
T  13142933 gactttcaacaacgccgccaccaggataaaacaagttcagctacaactgtaaggctaactattgcactatagaaaactgttcgagatttacaccgttaaa 13142834  T
Q  248 tatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  13142833 tatggtactaagatcactc-tttaatattgaaaccactttaatatggta 13142786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3357754 - 3357514
Alignment:
Q  63 aatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaac 158  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |  || |    || ||||  ||||| ||||||||||    
T  3357754 aatatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgcggtacagcccaaagttgtgcaaggcagactatcaac 3357655  T
Q  159 cacgccgcctccaggataaaa-caagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattaca-ccttcaatatggtact 256  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||   || |||||| |||| ||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||  |||||||||||    
T  3357654 cacgccgtctccatgataaaaacaaacacaactacaattgtgtggttaaccattgcactgtagaaaatcgttcaagatttacaccctaaaatatggtact 3357555  T
Q  257 aagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtact 298  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  3357554 aagatcactc-tttaataccgaaaccactttaatatggtact 3357514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 149 - 298
Target Start/End: Original strand, 3880061 - 3880207
Alignment:
Q  149 gactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacac-cttcaa 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |  |  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||    
T  3880061 gactatcaaccacgccgcctccaggataaaa---gccccactacaactatgtggttaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacactctcaaa 3880157  T
Q  248 tatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtact 298  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||| ||||    
T  3880158 tatgatactaagaccactc-tttaatattgaaaccactttaatatgatact 3880207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6591030 - 6590877
Alignment:
Q  134 aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgag 233  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||| || ||||||||| |||| |||    
T  6591030 aaattgtgcaaggcagactatcaaccacgccgccttcaggataaaacaagttcagttataactgtgtgattaactactacattgtagaaaatcgtttgag 6590931  T
Q  234 aattacaccttc-aatatgg-tactaagaccactc--ttttaatactgaaacca 283  Q
    ||||||||| || ||||||| || |||| ||||||   ||||||||||||||||    
T  6590930 aattacaccctcaaatatggctattaaggccactcgaatttaatactgaaacca 6590877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 149 - 269
Target Start/End: Original strand, 3284790 - 3284912
Alignment:
Q  149 gactatcaaccacgccgcctccaggataaaa-caagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-a 246  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  3284790 gactatcaaccacaccgtcttcatgataaaaacaaactcagctacaaccgtgcggttaactaccgcacaatagaaaaccgttcgagaattacaccctcaa 3284889  T
Q  247 atatggtactaagaccactcttt 269  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  3284890 atatggtactgagaccactcttt 3284912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Original strand, 15642177 - 15642371
Alignment:
Q  33 tttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacact 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||   |||| |||| || |||||||  || ||||| ||||||| |||||||    
T  15642177 tttggattttcaaattctattttgaaaaagaatatctaccgaagttgttacagaattgtgtcacgatcaggtcgctctttttaagacgtttcatgacact 15642276  T
Q  133 ----gaaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaa 223  Q
         |||||||  ||| |  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  15642277 atccaaaattgtggaagacaaactatcaactacgtcgcctccaggacaaaacaggctcagctacaacggcacggttaactactgcactatagaaa 15642371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 294
Target Start/End: Original strand, 23318067 - 23318192
Alignment:
Q  167 ctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactc 266  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| |||   ||| ||||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23318067 ctccaggataaaacaggt-cggctaaaactgtgcggttaactattgcttcgtacaaaaatggtcgagatttacacctccaatatggtactaagaccactc 23318165  T
Q  267 ttttaatactgaaaccactccaatatgg 294  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23318166 -tttaatactgaaaccactctaatatgg 23318192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 26287337 - 26287242
Alignment:
Q  5 ttgtttttggaattctaaattgttgtattttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagacca 101  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26287337 ttgtttttggatttcaaaactgttgtattt-ggatttccaaattctattttgaaaaataatctctaccgaagttgttactaggttgagtcacgacca 26287242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 296
Target Start/End: Original strand, 3045679 - 3045765
Alignment:
Q  210 ctgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |  |||||||||    
T  3045679 ctgcactgtagaaaatcgttcgagatttacaccctcaaatatggtactaagaccgctc-tttaatattgaaaccattttaatatggta 3045765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 45748647 - 45748562
Alignment:
Q  176 aaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaa---ccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaa 258  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || |  |||||||||||||    
T  45748647 aaaacaagttcaactacaactatgcgattaactactgcactgtagaaaatcgtcgttcgagaattatacttcaaatatggtactaa 45748562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 298
Target Start/End: Original strand, 16372381 - 16372609
Alignment:
Q  73 gaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg---aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctc 169  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| | |||||||| ||||    | || ||  ||| | ||||||||||   | ||||||    
T  16372381 gaagttgttactaggttgagtcacgaccaagtcgctctctttaagatgtttcgtggcactaccaagatcgtgcaagacagactatcaac---gtcgcctc 16372477  T
Q  170 caggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatgg-tactaagaccactc- 266  Q
    || |||||||||||| |  ||||| || |||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| || ||||||| || |||| ||||||     
T  16372478 caagataaaacaagtgcgactaca-ctatgcgattaactacttcactgtagaaaatcgtttgagaattaaaccatcaaatatggctattaaggccactcg 16372576  T
Q  267 -ttttaatactgaaaccactccaatatggtact 298  Q
      ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  16372577 aatttaatactgaaaccactattatatggtact 16372609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23616317 - 23616241
Alignment:
Q  246 aatatggtactaagaccactcttttaa--tactgaaaccactccaatatggtactaagaccactcaaataagatgtt 320  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||   |||||| ||||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  23616317 aatatggtgctaagaccactctattatggtactgagaccactataatatggtattatgaccactcaaatatgatgtt 23616241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 40865288 - 40865252
Alignment:
Q  246 aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40865288 aatatggtactaagaccactc-tttaatactgaaacca 40865252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 48064167 - 48064058
Alignment:
Q  149 gactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaat 248  Q
    ||||||||| || | || |||||  |||||||||||| | |||||||| | ||  ||||| |||||| ||||  || | |||||||||||||| ||| ||    
T  48064167 gactatcaatcatgtcgtctccacaataaaacaagtttatctacaactatacgactaacttctgcaccgtagctaatctttcgagaattacacattcgat 48064068  T
Q  249 atggtactaa 258  Q
    ||||||||||    
T  48064067 atggtactaa 48064058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 65 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31449986 - 31449764
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| | ||||||||||||    
T  31449986 tatctatcgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaagacagactatcaacca 31449887  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31449886 cgccgcctccaggataaaacaagtccagctgcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 31449787  T
Q  261 ccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  31449786 ccaatcttttaatactgaaacca 31449764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 65 - 308
Target Start/End: Original strand, 17025910 - 17026157
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    | |||||  ||| | ||||||||| ||    
T  17025910 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaacattgtgcaagacagactatcaatca 17026009  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 260  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17026010 cgtcgcctccaggataaaacaagtctagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacctccaatatggtaccaaga 17026109  T
Q  261 ccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtactaagaccactc 308  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  17026110 ccattcttttaatattgaaaccactttaatatggtactattaccactc 17026157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 65 - 308
Target Start/End: Original strand, 17556402 - 17556649
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    | |||||  ||| | ||||||||| ||    
T  17556402 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaacattgtgcaagacagactatcaatca 17556501  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 260  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17556502 cgtcgcctccaggataaaacaagtctagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacctccaatatggtaccaaga 17556601  T
Q  261 ccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtactaagaccactc 308  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  17556602 ccattcttttaatattgaaaccactttaatatggtactattaccactc 17556649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 44926043 - 44925807
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  44926043 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaaaacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 44925944  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  44925943 cgccgcctccaggataaaacaaggtcatctacaactatgcggttaacta-tgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaaa 44925845  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggtact 298  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  44925844 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatgatact 44925807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 284
Target Start/End: Original strand, 1807447 - 1807671
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  1807447 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgactaggtcgctctctttaagacgtttcgtgacactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 1807546  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaa-caagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaa 258  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1807547 cgccgcctctaggataaaaacaagtccagctacaactgtgcggttaactagtgcactgtagaaaaccgttcgagatttacaccttcaaatatggtactaa 1807646  T
Q  259 gaccactcttttaatactgaaaccac 284  Q
    || ||||| |||||||||||||||||    
T  1807647 gatcactc-tttaatactgaaaccac 1807671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Original strand, 36683554 - 36683789
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| ||| ||||||  |||||||| |||||||||| |||||    ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  36683554 tatctaccggagttgttactaggttgagtcatgactaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgtaaggcagactatcaacca 36683653  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  36683654 cgctgcctccaggataaaacaaggtcagctacatctgtgcgattaactactgcactgtagaaaatcgtttgagaattacaccctcaaatatggtactaag 36683753  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  36683754 accactc-tttaatactgaaatcactttaatatggta 36683789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Original strand, 33416522 - 33416745
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| | ||||||||||||    
T  33416522 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcggtctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaagacagactatcaacca 33416621  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  33416622 cgccgcctccaagataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaacta-tgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatacggtactaag 33416720  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  33416721 accgctc-tttaatactgaaaccact 33416745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40125998 - 40125772
Alignment:
Q  72 cgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcc 167  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  40125998 cgaagttgttactaggttgagtcacgaccagatcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaaccacgccgcc 40125899  T
Q  168 tccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactc 266  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  40125898 tccaagataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcaccgtagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtactaagaccactc 40125799  T
Q  267 ttttaatactgaaaccactccaatatgg 294  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||    
T  40125798 -tttaatactgaaaccactttaatatgg 40125772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18876479 - 18876235
Alignment:
Q  72 cgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcc 167  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  18876479 cgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctct-tttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaagacagactatcaaccacgccgcc 18876381  T
Q  168 tccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactc 266  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||    
T  18876380 tccaggataaaacaaactcatctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatgatactaataccactc 18876281  T
Q  267 ttttaatactgaaaccactccaatatggtactaagaccactcaaata 313  Q
     ||||||| |||||||||   ||||||||  | ||||||||||||||    
T  18876280 -tttaatattgaaaccaccttaatatggtgttgagaccactcaaata 18876235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 1911089 - 1910852
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||| ||||     |||||||  || || ||||||||||||    
T  1911089 tatctatcgaagttgttattaggttaagtcacgatcaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactagtcaaaattgtgcaaagcagactatcaacca 1910990  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    ||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||    
T  1910989 cgctgcctccagtataaaacaagctcaactacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccattcgagatttacacattcaaatatggtattaag 1910890  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggtact 298  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1910889 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatggtact 1910852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 56 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 23548761 - 23548515
Alignment:
Q  56 aaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgac 151  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||| ||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| |||    
T  23548761 aaaatagaatatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgacctggtcgctctctataagacgtttcgtggcactgtgtaaaattgtgcaaggcggac 23548662  T
Q  152 tatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattaca-ccttcaatat 250  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || || |||| |||||    
T  23548661 tatcaaccacgtcgcctctaggataaaacaagttcagctacaactgcgcggttaactactgcattgtagaaaaccgttcaagattttcacccttaaatat 23548562  T
Q  251 ggtactaagaccactcttt-taatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    | ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||||    
T  23548561 gatactaagaccactatttataatactgaaatcactttaatatggta 23548515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 65 - 269
Target Start/End: Original strand, 19166609 - 19166818
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  | ||| ||||||||||||    
T  19166609 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccatgtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcacggcagactatcaacca 19166708  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19166709 cgccgcctccaggataaaacaagctcaactacaactgtgctgttaactactgcactatagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaag 19166808  T
Q  260 accactcttt 269  Q
    | || |||||    
T  19166809 atcattcttt 19166818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 296
Target Start/End: Original strand, 34118449 - 34118676
Alignment:
Q  73 gaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcct 168  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| || |||||    |||||||  ||||| |||||||||||||| |||||    
T  34118449 gaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcatggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaaccacgtcgcct 34118548  T
Q  169 ccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactct 267  Q
      |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  34118549 ttaggataaaacaagcccagctacaactgtgctgttaactactgcaccgtagaaaactgttcgagatttacaccttcgaatatggtactaaggccactc- 34118647  T
Q  268 tttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  34118648 tttaataatgaaaccactttaatatggta 34118676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 285
Target Start/End: Original strand, 24090543 - 24090821
Alignment:
Q  5 ttgtttttggaattctaaattgttgtattttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggt 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||| ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24090543 ttgtttttggatttctaaattgttgtatttggactttt-aaattcttttttgaaaaagaatatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggt 24090641  T
Q  105 cgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgc 200  Q
    ||  |||||||| |||||||||| |||||    || ||||  ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||    
T  24090642 cgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaagttgtgcaaggcagaatatcaatcacgtcgcctccaagataaaacaagcttatctacaactgtgc 24090741  T
Q  201 ggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattaca-ccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    ||||||||     | ||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24090742 ggttaact-----attgtagaaaaccgttcgagatttacatcctcaaatattgtactaagaccactc-tttaatattgaaaccact 24090821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15875787 - 15875608
Alignment:
Q  66 atctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccac 161  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||  |||||||  |||||||||| |||||    |||||||  ||||| |||||||||||||    
T  15875787 atctatcgaagttgttactaaattgagttacgaccaggtcgctctctttaggacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaaccac 15875688  T
Q  162 gccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacac 241  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15875687 gccgcctccaggataaaacaagctcagctacaattgtacgattaactactgcactatagaaaaccgttcaagaattacac 15875608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 43302714 - 43302569
Alignment:
Q  158 ccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtacta 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43302714 ccacgccgcctccaggataaaacaagcccagctgcacctgtgcggttaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacaccttcaatgtggtacta 43302615  T
Q  258 agaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtactaagaccactc 308  Q
    |||| |||||||||||| |||||     |||||||||||||| ||||||||    
T  43302614 agactactcttttaatattgaaa-----ccaatatggtactatgaccactc 43302569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 38182356 - 38182152
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||     | |||||  ||||| || |||||||||    
T  38182356 tatctaccgaagttgttac-aggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaaaacgtttcgtggcacttcccaagattgtgcaaggcagattatcaacca 38182258  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  38182257 cgccgcctccaggataaaacaagcacagctacaactgtgctgttaactactgcactataaaaaaccgttcgagatttacaccttcaaatatggtactaaa 38182158  T
Q  260 accact 265  Q
    ||||||    
T  38182157 accact 38182152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 269
Target Start/End: Original strand, 2965547 - 2965814
Alignment:
Q  5 ttgtttttggaattctaaattgttgtattttggtttttcaaattctatttt-aaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccagg 103  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||| |  ||| ||||||||||||| |||||| |||||| | | || |||||||||| | |||||| |||||||    
T  2965547 ttgtttttggatttcgaaactgctgtattt-gaatttccaaattctattttgaaaaga-aatatccaccaaatttgttactaggt-gagtcacgaccagg 2965643  T
Q  104 tcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtg 199  Q
    |||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  2965644 tcgctctctttaaaacgtttcgtggcactgcctaaaattgtgcaagacacactatcaaccacaccgcctctaggataaaacaagtccagctacaactatg 2965743  T
Q  200 cggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactcttt 269  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  2965744 cagttaactactgcactgtagaaaaccatttgagatttacaccctcaaatatggtactaagaccactcttt 2965814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 186 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4238336 - 4238239
Alignment:
Q  186 cagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4238336 cagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccaatcttttaatactgaaacca 4238239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 186 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4243075 - 4242978
Alignment:
Q  186 cagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4243075 cagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccaatcttttaatactgaaacca 4242978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 152 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15951584 - 15951440
Alignment:
Q  152 tatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcact--gtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaata 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  15951584 tatcaaccacgccgcctccag-ataaaacaagcccagctacaactgtgcagttaactactgcactctgtagaaaaccgttcgagatttacacgttcgata 15951486  T
Q  250 tggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  15951485 tggtactaagaccactc-tttaatactgaaatcactttaatatggta 15951440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28559774 - 28559570
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||  |||| ||| |||||||||| |||||    |||||||  |||||  |||||||||||    
T  28559774 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgacaatgtcgctctctataagacgtttcgtggcactgtccaaaattgtgcaaggcaaactatcaacca 28559675  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 260  Q
    ||||| || |||||||||| |||  ||| || |||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28559674 cgccgtctgcaggataaaataagcccagttagaactgttcgattaactattgcactgtaaaaaaccgttcgagaattacaccttcaatacggtagtaaga 28559575  T
Q  261 ccact 265  Q
    |||||    
T  28559574 ccact 28559570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17954052 - 17953806
Alignment:
Q  9 ttttggaattctaaattgttgtattttggtttttcaaattctattttaaaagagaat----atctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggt 104  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |  ||    ||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||| ||    
T  17954052 ttttggatttccaaactgttgtattttggattttcaaat-ctattttgaaaaatgattttcatctaccgaagttgttactaggttgagtaacgaccatgt 17953954  T
Q  105 cgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaa-ctgtg 199  Q
    ||   ||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  17953953 cgctttctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaagacagaatatcaaccacgccgcctccaagataaaacaagctcacctacaaactgtg 17953854  T
Q  200 cggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaa 247  Q
     | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17953853 tgattaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacaccctcaa 17953806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24673500 - 24673216
Alignment:
Q  9 ttttggaattctaaattgttgtattttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtc 108  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || ||| |||      
T  24673500 ttttggatttttaaactgttgtatttaagtttt-caaattctattttaaaagagaatatttatcgaagttgttactaggttgagttacgatcagatcgct 24673402  T
Q  109 ctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggtt 204  Q
    || ||||| ||||||||||||||||    ||||| |  |||   |||||||| ||||  | | ||||  |||||||||| |      |||||||||||||    
T  24673401 ctttttaaaacgtttcgtgacactgttcaaaattatgcaagatagactatcacccacaacacttccaaaataaaacaagct------caactgtgcggtt 24673308  T
Q  205 aactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtacta 299  Q
    ||| ||| ||||||  ||||  |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  24673307 aaccactacactgt--aaaagagttcaagatttacacctccaatatggtactaagaccact-ttttaatgttgaaaccactctaatatggtacta 24673216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 28564927 - 28564705
Alignment:
Q  79 gttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccagga 174  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||  |||| ||| || |||| ||||||||    |||||||  ||| | |||||| |||||||||| || |||||    
T  28564927 gttactaggttgagtcacgatcaggtcgctctctataaaacatttcatgacactgctcaaaattgttcaagacagactattaaccacgccgtctgcagga 28564828  T
Q  175 ta--aaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaa 272  Q
    ||  |||||||  | | || |||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  28564827 tataaaacaagcccggttagaactgttcgattaactattgcagtgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatgatagtaagaccactc-tttaa 28564729  T
Q  273 tactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    |  ||||||||||  |||||||||    
T  28564728 tgttgaaaccactttaatatggta 28564705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 28572550 - 28572328
Alignment:
Q  79 gttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccagga 174  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||  |||| ||| || |||| ||||||||    |||||||  ||| | |||||| |||||||||| || |||||    
T  28572550 gttactaggttgagtcacgatcaggtcgctctctataaaacatttcatgacactgctcaaaattgttcaagacagactattaaccacgccgtctgcagga 28572451  T
Q  175 ta--aaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaa 272  Q
    ||  |||||||  | | || |||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  28572450 tataaaacaagcccggttagaactgttcgattaactattgcagtgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatgatagtaagaccactc-tttaa 28572352  T
Q  273 tactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    |  ||||||||||  |||||||||    
T  28572351 tgttgaaaccactttaatatggta 28572328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 151 - 258
Target Start/End: Original strand, 10933497 - 10933603
Alignment:
Q  151 ctatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatat 250  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10933497 ctatcaaccacgtcgcctccatgataaaacaaac-caactacaactgtgtgattaactactgcactgtagagaattgttcgagaattacaccttcaatat 10933595  T
Q  251 ggtactaa 258  Q
    | ||||||    
T  10933596 gatactaa 10933603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 219
Target Start/End: Original strand, 12820403 - 12820472
Alignment:
Q  150 actatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgta 219  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12820403 actatcaatcacaccgcctccaggataaaacaagttcaggtacaactgtgcgactaactactgcactgta 12820472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 247
Target Start/End: Original strand, 7902559 - 7902724
Alignment:
Q  86 gattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaaca 181  Q
    |||||||||| ||||| ||||  |||||||| | ||||||||||| |     |||||||||||| |  | |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  7902559 gattgagtcacgaccaagtcgctctctttaaaatgtttcgtgacattacccaaaattgtataagacatattatcaaccacgccgtctctaggataaaaca 7902658  T
Q  182 agttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaa 247  Q
    ||| || | |||| |||||| ||||||||| |||||||   |||  ||||||||||||| ||||||    
T  7902659 agtccatcaacaattgtgcgattaactactacactgtatctaactattcgagaattacaacttcaa 7902724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 43302831 - 43302716
Alignment:
Q  73 gaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg-----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcc 167  Q
    |||||||||| |||  ||||| | |||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||     |||||||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  43302831 gaagttgttattaggctgagttacgacccggtcgttctctttaagacgtttcgtggcactgtccaaaaattgtgcaaggtagactatcaaccacgccgcc 43302732  T
Q  168 tccaggataaaacaag 183  Q
    ||||||||||||||||    
T  43302731 tccaggataaaacaag 43302716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 4243174 - 4243076
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacc 159  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| || |||||    |||||||  ||||| |||||||||||    
T  4243174 tatctatcgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaacacgtttcatggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacc 4243076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 40130806 - 40130738
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg 133  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    
T  40130806 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactg 40130738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 4238435 - 4238337
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacc 159  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| || |||||    |||||||  ||||| |||||||||||    
T  4238435 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaacacgtttcatggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacc 4238337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 218 - 285
Target Start/End: Original strand, 17020470 - 17020537
Alignment:
Q  218 tagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17020470 tagaaaaccgtttgagatttacacattcgaatatggtactaagaccactc-tttaatattgaaaccact 17020537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 218 - 285
Target Start/End: Original strand, 17550907 - 17550974
Alignment:
Q  218 tagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17550907 tagaaaaccgtttgagatttacacattcgaatatggtactaagaccactc-tttaatattgaaaccact 17550974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 22714991 - 22714941
Alignment:
Q  43 caaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagt 93  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  22714991 caaattctatattaaaagagaatatctaccgaagttgttattaggttgagt 22714941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 246 - 293
Target Start/End: Original strand, 7001849 - 7001896
Alignment:
Q  246 aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatg 293  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7001849 aatatagtacaaagaccactcttttaatactgaaatcactctaatatg 7001896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 299
Target Start/End: Original strand, 27415577 - 27415726
Alignment:
Q  152 tatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatg 251  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||   | |||||| |||||| |||| || ||||  ||||  || ||||| | |||||||| | || ||||    
T  27415577 tatcaaccacgtcgccttcagaataaaacaagcataactacaattgtgcgattaaatattgcatcgtagctaatcgttcaaaaattacacatccactatg 27415676  T
Q  252 gtactaagaccactctt--ttaatactgaaaccactccaatatggtacta 299  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||  ||||||| || | ||||||||||    
T  27415677 gtactaagaccacacttaattaataacgaaaccaatcaattatggtacta 27415726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34818634 - 34818598
Alignment:
Q  246 aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34818634 aatatggtactaagaccactc-tttaatactgaaacca 34818598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12045307 - 12045037
Alignment:
Q  5 ttgtttttggaattctaaattgttgtattttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggt 104  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||            ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12045307 ttgtttttggatttccaaactgttgtattttggttttccaaattctatt------------atctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggt 12045220  T
Q  105 cgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgc 200  Q
    || ||||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  12045219 cgccctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaagacagactatcgaccacgccgcctccaggataaaacaagcatagctacaactgtgc 12045120  T
Q  201 ggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12045119 ggttaactactgcactgtagactaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 12045037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 36942385 - 36942163
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| || |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  36942385 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcatggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 36942286  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36942285 cgccgcctccaggataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 36942186  T
Q  261 ccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  36942185 ccaatcttttaatactgaaacca 36942163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Original strand, 3665859 - 3666129
Alignment:
Q  5 ttgtttttggaattctaaattgttgtattttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggt 104  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||            ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  3665859 ttgtttttggatttccaaactgttgtattttggtttttcaaattctatttt------------ctaccgaagttgttactaggttgagtcacgactaggt 3665946  T
Q  105 cgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgc 200  Q
    ||  ||||| || |||||||||| |||||    |||||||  ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3665947 cgctctcttcaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaaccacgccacctctaggataaaacaagtccaactacaactgtgc 3666046  T
Q  201 ggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3666047 ggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgggaattacaccttcaatatggtactaataccactcttttaatactgaaacca 3666129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 65 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 36937631 - 36937409
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| || |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  36937631 tatctaccgaagttgttattaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcatggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 36937532  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36937531 cgccgcctccaggataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 36937432  T
Q  261 ccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  36937431 ccaatcttttaatactgaaacca 36937409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 88 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 32461646 - 32461427
Alignment:
Q  88 ttgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaag 183  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||| ||| |||||    |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32461646 ttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgttttgtggcactgcccaaaattgtgcaagacagactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaag 32461547  T
Q  184 ttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       
T  32461546 ttcagctgcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatgctgaaa--- 32461450  T
Q  284 ctccaatatggtactaagaccactc 308  Q
      |||||||||||||| ||||||||    
T  32461449 --ccaatatggtactatgaccactc 32461427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 65 - 294
Target Start/End: Original strand, 39523024 - 39523257
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| ||| |    |||||||  ||| | ||||||||||||    
T  39523024 tatctatcgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcaccgcccaaaattgtgcaagacagactatcaacca 39523123  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  39523124 cgccgcctccaggataaaacaagtccagctgcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcaagaattacacctccaaatatggtactaag 39523223  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatgg 294  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  39523224 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatgg 39523257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 284
Target Start/End: Original strand, 7451733 - 7451956
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  7451733 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgtccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 7451832  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7451833 cgctgcctccaggataaaacaagctcagctgcaactgtgcggttaactactacactgtagaaaaccgttcgagaattacacctccaaatatggtactaag 7451932  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccac 284  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  7451933 accactc-tttaatactgaaaccac 7451956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 65 - 294
Target Start/End: Original strand, 39518385 - 39518618
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| ||| |    |||||||  | ||| ||||||||||||    
T  39518385 tatctatcgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcaccgcccaaaattgtgcatggcagactatcaacca 39518484  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  39518485 cgccgcctccaggataaaacaagtccagctgcaactgtgcggttaactactgcagtgtagaaaaccgttcaagaattacacctccaaatatggtactaag 39518584  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatgg 294  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  39518585 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatgg 39518618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 65 - 283
Target Start/End: Original strand, 42001409 - 42001626
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    ||||||| |||| | ||||||||||||    
T  42001409 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgtaagacagactatcaacca 42001508  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42001509 cgccgcctccaggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactg-----tagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 42001603  T
Q  261 ccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||| |||||||| ||||||||||    
T  42001604 ccaatcttttaacactgaaacca 42001626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Original strand, 26667247 - 26667482
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  26667247 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 26667346  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  26667347 cgccgcctccaggataaaacaagtccagctgcaactgttcgattaactactgcactctagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtactaag 26667446  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26667447 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 26667482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Original strand, 26938844 - 26939079
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  26938844 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 26938943  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  26938944 cgccgcctccaggataaaacaagtccagctgcaactgttcgattaactactgcactctagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtactaag 26939043  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26939044 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 26939079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 29168093 - 29167858
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  29168093 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 29167994  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  29167993 cgccgcctccaggataaaacaagcccaactacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtactaag 29167894  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29167893 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 29167858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 65 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 41587280 - 41587048
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||    |||||||  ||| | ||||||||||||    
T  41587280 tatctaccgaagttgttactagtttgagtcacgaccaggttgctctctttaagacgtttcgtgacactgttcaaaattgtgcaagacagactatcaacca 41587181  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||    
T  41587180 cgccgcctccaggataaaacaagctcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttc--gaattacaccctcaaatatggtactaag 41587083  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggt 295  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  41587082 accactc-tttaacactgaaaccactttaatatggt 41587048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 65 - 283
Target Start/End: Original strand, 556670 - 556892
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||| ||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  556670 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgttttgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 556769  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  556770 cgccgcctccaggataaaacaagctcagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacctccaaatatggtactaag 556869  T
Q  260 accactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||||||| | ||||||||||||||    
T  556870 accactc-tataatactgaaacca 556892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 65 - 283
Target Start/End: Original strand, 561442 - 561664
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||| ||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  561442 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgttttgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 561541  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  561542 cgccgcctccaggataaaacaagctcagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacctccaaatatggtactaag 561641  T
Q  260 accactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||||||| | ||||||||||||||    
T  561642 accactc-tataatactgaaacca 561664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 283
Target Start/End: Original strand, 41996640 - 41996857
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||||| |||||    ||||||| |||| | ||||||||||||    
T  41996640 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggttgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgtaagacagactatcaacca 41996739  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41996740 cgccgcctccaggataaaacaagcccaactacaactgtgcggttaactactg-----tagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 41996834  T
Q  261 ccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||| |||||||| ||||||||||    
T  41996835 ccaatcttttaacactgaaacca 41996857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 6155539 - 6155315
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| |||||||||| |||||    ||||| || ||| | ||||||||||||    
T  6155539 tatctaccgaaattgttactaggttgagtcacgatcaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgtccaaaattttacaagacagactatcaacca 6155440  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6155439 caccgcctccaggataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacctccaaatatggtactaag 6155340  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6155339 accactc-tttaatactgaaaccact 6155315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Original strand, 12103000 - 12103224
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  12103000 tatctaccgaagttgttactaggttgagttacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 12103099  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattaca-ccttcaatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12103100 cgccgcctccaggataaaacaagcccaactacaaatgtgcgattaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacacccttaaatatggtactaag 12103199  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||    
T  12103200 atcactc-tttaatactgaaaccact 12103224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12502011 - 12501782
Alignment:
Q  73 gaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcct 168  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||  | ||||||||||||||||||||    
T  12502011 gaagttgttactaggttgagtcatgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaaacagactatcaaccacgccgcct 12501912  T
Q  169 ccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactct 267  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||      
T  12501911 ccaggataaaacaagcccagctacaactgttcggttaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatgatactaagaccact-a 12501813  T
Q  268 tttaatactgaaaccactccaatatggtact 298  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  12501812 tttaataccgaaaccactttaatatggtact 12501782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 37248915 - 37248692
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||| ||||     |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  37248915 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacatttcgtggcactacctaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 37248816  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  37248815 cgccgcctccaggataaaacaagcccagctgcaactgtgcggttaa-tactgtactatagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaag 37248717  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  37248716 accactc-tttaatactgaaaccact 37248692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Original strand, 36428684 - 36428919
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||| | |  ||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  36428684 tatctaacgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgttttgcggaactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 36428783  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  36428784 cgccgcctccaggataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaatcgctcgagaattacacctccaaatatggttctaag 36428883  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36428884 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 36428919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 6514721 - 6514496
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||   |||||||| |||||||||| |||||    ||||| |  ||||| ||||||||||||    
T  6514721 tatctaccaaagttgttactaggttgagtcacgaccaagtcactctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattttgcaaggcagactatcaacca 6514622  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  6514621 cgccgcctccaggataaaacaagcttagctacaactgtgtggttaactactgcattgtagaaaatcattcgagatttacaccttcaaatatggtactaaa 6514522  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6514521 accactcttttaatattgaaaccact 6514496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 35679994 - 35679761
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||| | | ||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  35679994 tatctaccgaagctgttactaggttgagtcatggc-aggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgtcaaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 35679896  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  35679895 cgccgcctccaggataaaacaagctcaactacaactgtgcagttaacta-tgcattgtagaaaatcgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaag 35679797  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35679796 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 35679761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12042046 - 12041815
Alignment:
Q  73 gaagttgttactagat--tgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgc 166  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    ||| | |  |||||  |||||||||||||||||    
T  12042046 gaagttgttactaggtcatgagtcacgaccaggtcgttctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaaatatgcaaggcaaactatcaaccacgccgc 12041947  T
Q  167 ctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactc 266  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || ||    
T  12041946 ctccaggataaaacaagtccagctacaactgttcgattaactactgcactataaaaaactgttcgagaattacacctccaatatggtaccaagtacattc 12041847  T
Q  267 ttttaatactgaaaccactccaatatggtact 298  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  12041846 ttttaatactgaaaccacattaatatggtact 12041815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Original strand, 36423612 - 36423847
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  36423612 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcgcgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgcggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 36423711  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||  | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  36423712 cgccgcctccagaataaaacaagcccagctactactgtttgattaactaatgcactgtagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtgctaag 36423811  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36423812 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 36423847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Original strand, 40147870 - 40148105
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||  |||||||| | |||||||| |||||    |||||||  ||| | ||||||||||||    
T  40147870 tatctatcgaagttgttattaggttgagtcatgatcaggtcgctctctttaagatgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaagacagactatcaacca 40147969  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  40147970 cgccgcctccaggataaaataagctcagcttcaattgttcaattaactactacactgtagaaaaccgttcgagaattacacctccaaatatggtactacg 40148069  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40148070 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 40148105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 10759939 - 10759717
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||| |||||| ||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  10759939 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctct-tttaagacgttttgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 10759841  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  10759840 cgccgcctccaggataaaacaagcccatttacaactgtgcggttaacta-tgcacggtagaaaaccgttcgagaattataccctcaaatatggtactaag 10759742  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||    
T  10759741 accactc-tgtcatactgaaaccact 10759717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 152 - 298
Target Start/End: Original strand, 4871988 - 4872134
Alignment:
Q  152 tatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatg 251  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4871988 tatcaaccacgccgcctccatgataaaacaagctcaactacaactgttcgattaactactgtactgtagaaaaccgtttgagaattataccttcaatatg 4872087  T
Q  252 gtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtact 298  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  4872088 gtacaaagaccattcttttaataatgaaaccactttaatatggtact 4872134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 153 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 11981308 - 11981165
Alignment:
Q  153 atcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatgg 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11981308 atcaaccacgccgcctccagaataaaacaagcacatctacaactgttcgattaactattgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacctctaatatgg 11981209  T
Q  253 tactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  11981208 taccaagaccattcttttaataccgaaaccactttaatatggta 11981165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16116410 - 16116151
Alignment:
Q  24 ttgttgtattttggtttttcaaattctatttta-aaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtt 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||| || ||||| ||| |||| |  ||| |||| |||||    
T  16116410 ttgttgtattt-ggattttcaaattcttttttttaaagacaatatttatcgaagttgttgctaggttaagtcacgactaggttgctctccttaaaacgtt 16116312  T
Q  123 tcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgt 218  Q
    |||||||||||    |||||||  ||| |  ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| |    
T  16116311 tcgtgacactgcccaaaattgtgcaagacaaactatcaaccacgccacctcctagataaaacaagttcaactacaacagtactgttaactactgcactat 16116212  T
Q  219 agaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  16116211 agaaaaccgttcgagaattacacatccaatatgatacta--atcactc-tttaatactgaaacc 16116151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 280
Target Start/End: Original strand, 9911096 - 9911344
Alignment:
Q  33 tttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacact 132  Q
    ||||| || ||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||| | ||||| || ||||| || ||| ||| ||||    
T  9911096 tttggattctcaaattctcttttgatagagaatatctaccgaagttgttactaggttgagttaggacaatgtcgttctttttaagacattttgtggcact 9911195  T
Q  133 g----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgt 228  Q
    |    |||||||    ||| ||||| ||| |||||||| || | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9911196 gttcaaaattgtgcggggcagactaccaatcacgccgc-tctaagataaaacaagttcaactacaattgtgcggttaattactgcactgtagaaaaccgt 9911294  T
Q  229 tcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaa 280  Q
    ||   ||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9911295 tc--aaaagacacattaaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaa 9911344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 77 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20181171 - 20180959
Alignment:
Q  77 ttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccag 172  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||| || ||    ||||| |  ||| | |||||| ||||||||| ||||||     
T  20181171 ttgttattaggttgagtcacgaccaggtcactctctttaagacgtttcgtggcattgtccaaaattatgcaagacagactattaaccacgccacctccat 20181072  T
Q  173 gataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactctttta 271  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||| ||| |||||||||| ||||    
T  20181071 gataaaacaagctcaactacaattgtgcggttaactactgcactgtagaaaactgttcgagatttacaccctcaaatatgataccaagaccactc-ttta 20180973  T
Q  272 atactgaaaccact 285  Q
    ||| ||||||||||    
T  20180972 atattgaaaccact 20180959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15415034 - 15414766
Alignment:
Q  32 ttttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacac 131  Q
    |||||| ||| |||||| || ||| ||| ||||||| ||  |||||||||||| | |||||||| ||| ||  ||  ||||||||  ||||| ||| |||    
T  15415034 ttttggatttccaaattttactttgaaatagaatatatacggaagttgttacttggttgagtcacgactagaacgctctctttaagtcgttttgtggcac 15414935  T
Q  132 tg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccg 227  Q
    ||    ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |  || ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  15414934 tgcccaaaattgtgtgaggcagaatatcaaccacgccgcctccaggataatgcaagtccacatgtaaatgtgcggttaactactgcactatagaaaacct 15414835  T
Q  228 ttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtac 297  Q
    ||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||  || ||||| ||||||||||    
T  15414834 ttcgaaatttacacctccaatatgctactaagaccaatc-tttaatactagaatcactctaatatggtac 15414766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12102950 - 12102726
Alignment:
Q  66 atctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccac 161  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||  |||||||| || ||| ||| |||||    |||||||  ||||  |||||||||||||    
T  12102950 atctaccgaagttgttactaggttgagtcacgactaggtcgctctctttaagactttttgtggcactggccaaaattgtgcaaggaagactatcaaccac 12102851  T
Q  162 gccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatg----gtact 256  Q
     ||| | |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| | || || |||| || ||||||    |||||    
T  12102850 accgtcaccaggataaaacaagaccaactacaactgtgcggttaactactac---gtagaaaaccgtttgggattttcaccctcaaatatggtatgtact 12102754  T
Q  257 aagaccactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12102753 aagaccactc-tttaatactgaaaccact 12102726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9726678 - 9726586
Alignment:
Q  190 tacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| || ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  9726678 tacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcaaggtttacactttaaatatggtattaagaccattc-tttaatactgaaacca 9726586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 37652950 - 37652828
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||| ||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  37652950 tatctaccgaagttgttattaggttgagtcacgatcaggtcgctctctttaagacgtttcgtgacattgtccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 37652851  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaag 183  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  37652850 cgccacctccaggataaaacaag 37652828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 34707513 - 34707439
Alignment:
Q  205 aactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaa 280  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34707513 aactattgcaccatagaaaaccgttcgagatttacaccttaaatatggtactaagaccactc-tttaatactgaaa 34707439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 37550079 - 37550030
Alignment:
Q  134 aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaag 183  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37550079 aaattgtgcaaggcagactatcaaccacgccacctccaggataaaacaag 37550030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13301417 - 13301381
Alignment:
Q  246 aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13301417 aatatggtactaagaccactc-tttaatactgaaacca 13301381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 24435964 - 24435869
Alignment:
Q  89 tgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg---aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaaca 181  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||    || ||||  ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24435964 tgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgcggcactatccaagttgtgcaaggtagactatcaaccacgccgtctccaggataaaaca 24435869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 65 - 322
Target Start/End: Original strand, 30658238 - 30658494
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||     |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  30658238 tatctaccgaagttgttactatgttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactactcaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 30658337  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30658338 cgccgcctccaggataaaacaagcccagctgcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 30658437  T
Q  261 ccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtactaagaccactcaaataagatgttac 322  Q
    | ||| ||||||||||||||     |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  30658438 caacttttttaatactgaaa-----ccaatatggtactatgaccactcaaatatggtgttac 30658494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 65 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 10160844 - 10160626
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  10160844 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 10160745  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10160744 cgccgcctccaggataaaacaagctcagctgcaactgtgcggttaacta-tgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 10160646  T
Q  261 ccactcttttaatactgaaa 280  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  10160645 ccattcttttaatactgaaa 10160626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 1935113 - 1934878
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| | ||||||||||||    
T  1935113 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaagacagactatcaacca 1935014  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1935013 cgccgcctccaggataaaacaagcccagctgcaactgtgcggttaactaatgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaag 1934914  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1934913 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 1934878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9180844 - 9180621
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  9180844 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgtccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 9180745  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9180744 cgccgcctccaggataaaacaagcccagctacaactgtttgattaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaag 9180645  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccac 284  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  9180644 accactc-tttaatactgaaaccac 9180621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19892586 - 19892351
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| || |||||    |||||||  ||  | ||||||||||||    
T  19892586 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcctggcactgtccaaaattgtgcaacacagactatcaacca 19892487  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  19892486 cgccgcctccaggataaaacaagctcagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtactaag 19892387  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19892386 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 19892351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 65 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9189923 - 9189700
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  9189923 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggttgctctctttaagacgtttcgtggcactgtccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 9189824  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9189823 cgccgcctccaggataaaacaagcccagctacaactgtttgattaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaag 9189724  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccac 284  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  9189723 accactc-tttaatactgaaaccac 9189700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 65 - 294
Target Start/End: Original strand, 30650904 - 30651137
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  30650904 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccagatcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 30651003  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  30651004 cgccgcctccaagataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcaccgtagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtactaag 30651103  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatgg 294  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  30651104 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatgg 30651137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 284
Target Start/End: Original strand, 18344413 - 18344629
Alignment:
Q  72 cgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| |||||| |||||||||| |    
T  18344413 cgaagttgttactagattgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactattaaccacgccggc 18344512  T
Q  168 tccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactc 266  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  18344513 tccaggataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtactaagaccact- 18344611  T
Q  267 ttttaatactgaaaccac 284  Q
     |||||||||||||||||    
T  18344612 atttaatactgaaaccac 18344629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25478417 - 25478183
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  25478417 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacaaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtgacactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 25478318  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  25478317 cgccgcctccagaataaaacaagcccagctacaactgtgcgaataacta-tgcactgtagaaaaccgttcaagaattacaccctcaaatatagtactaag 25478219  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25478218 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 25478183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25497445 - 25497211
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||    || ||||  ||| | ||||||||||||    
T  25497445 tatctaccgaaattgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtaacactgcccaaatttgtgcaagtcagactatcaacca 25497346  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  25497345 cgccgcctccaggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaacta-tgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatgatactaag 25497247  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  25497246 accactc-tttaatattgaaaccactttaatatggta 25497211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Original strand, 31326714 - 31326948
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| || |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  31326714 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcatgccactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 31326813  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31326814 cgccacctccaggataaaacaagcccaactacaactgtgcgattaactactgcact-tagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaag 31326912  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31326913 accact-atttaatactgaaaccactttaatatggta 31326948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 284
Target Start/End: Original strand, 12796907 - 12797123
Alignment:
Q  72 cgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcc 167  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||  |||||||| |||||| ||| |||||    |||||||  ||| | ||||||||||||||||| |    
T  12796907 cgaagttgttattaggttgagtcacgaccagatcgctctctttaagacgttttgtggcactgcccaaaattgttcaagacagactatcaaccacgccgtc 12797006  T
Q  168 tccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactc 266  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12797007 tccaggataaaacaagtccggctacaactgtgcggttaactactgcaccgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactc 12797106  T
Q  267 ttttaatactgaaaccac 284  Q
     |||||||||||||||||    
T  12797107 -tttaatactgaaaccac 12797123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 65 - 258
Target Start/End: Original strand, 29677356 - 29677554
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  || || ||||||||||||    
T  29677356 tatctagcgaagttgttactaggttgagtcacgatcatgtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaagcagactatcaacca 29677455  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaa 258  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  29677456 cgccgcctccaggataaaataagtccagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaa 29677554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 33 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19578566 - 19578298
Alignment:
Q  33 tttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacact 132  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||  |||||||| |||||| ||| ||||    
T  19578566 tttggattttcaaattctactttgaaagagaatatctaccgaagttgttattaggttgagtcacgaccagatcgctctctttaagacgttttgtggcact 19578467  T
Q  133 g----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgt 228  Q
         |||||||  ||||  |||||||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  19578466 acctaaaattgtgcaaggaagactatcaaccatgctgcctccagggtaaaacaagtccaactacaattgggcggttaactattgcactgtagaaaatcgt 19578367  T
Q  229 tcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtact 298  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  19578366 tcgagatttacaccttcaatatggtattaaaatcactc-tttaatactaaaatcactctaatatggtact 19578298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Original strand, 29677742 - 29677979
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||| || ||| ||| |||||    |||||||  |||||  |||||||||||    
T  29677742 tatctagcgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctcattaagacatttagtggcactgccaaaaattgtgcaaggcaaactatcaacca 29677841  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
     ||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  29677842 agccgcctacaggataaaaaaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacccacaaatatggtactaag 29677941  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggtact 298  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||    
T  29677942 accactc-tttaatattgataccactttaatatggtact 29677979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Original strand, 28603273 - 28603513
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    |||||||  ||| | ||||||||||||    
T  28603273 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaaaacgtttcgtgacactgtccaaaattgtgcaagacagactatcaacca 28603372  T
Q  161 cgccgcct----ccaggataaaa-caagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggta 254  Q
    |||  |||    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  28603373 cgctacctacctccaggataaaaacaagttcagctacaactgttcgattaactactgcactgtaaaaaaccgttcaagaattacacctccaaatatggta 28603472  T
Q  255 ctaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  28603473 ctaagaccact-ttttaatattgaaaccactttaatatggta 28603513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 308
Target Start/End: Original strand, 35601897 - 35602139
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||  || ||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| | || |||||||||    
T  35601897 tatctaccgaagttgttactaggttgaatcacgaccaggtcgctctttttaagacgtttcgtggcactgtccaaaattgtgcaagacagagtatcaacca 35601996  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  35601997 cgccgcctccaggataaaacaaacccagctacaattgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacatccaaatatggtactaag 35602096  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggtactaagaccactc 308  Q
    ||||||| ||||||| |||||     |||||||||||||| ||||||||    
T  35602097 accactc-tttaatattgaaa-----ccaatatggtactatgaccactc 35602139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 7737964 - 7737747
Alignment:
Q  72 cgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcc 167  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| | |||| ||| |||||    |||||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  7737964 cgaagttgttactaggttgagtcacgaccatgtcgctctctttaagaagttttgtggcactgcccaaaattgtgcaagacagactatcaaccacgccgcc 7737865  T
Q  168 tccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactct 267  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||| |||    
T  7737864 tccaggataaaacaagcccaactacaattgttcgattaactattgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacctccaatatgataccaaaaccattct 7737765  T
Q  268 tttaatactgaaaccact 285  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  7737764 tttaatactgaaatcact 7737747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19094678 - 19094366
Alignment:
Q  5 ttgtttttggaattctaaattgttgtattttggtttttcaaattctattttaaaagagaat----atctatcgaagttgttactagattgagtcaagacc 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| | |||    ||||| ||||||||||| ||| |||||||| || |    
T  19094678 ttgtttttggatttctaaactgttgtattttggattttaaaat-ctattttaaaaaataattttcatctaccgaagttgttattaggttgagtcacgatc 19094580  T
Q  101 aggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaa-caagttcagctacaac 195  Q
    ||||||  ||| |||| ||||||  ||  ||||    |||||||  |||||  | |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19094579 aggtcgctctccttaaaacgttttttggtactgcccaaaattgtgcaaggcaaaatatcaaccacaccgcctccaggataaaaacaagctcagctacaac 19094480  T
Q  196 tgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatgg-tactaagaccactc--ttttaatactgaaaccactccaata 291  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||   |||||||||||||||| |   |||    
T  19094479 tgtgcgattaattactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggctattaaggccactccaatttaatactgaaaccattattata 19094380  T
Q  292 tggtactaagacca 305  Q
    |||||||| |||||    
T  19094379 tggtactatgacca 19094366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 283
Target Start/End: Original strand, 30631554 - 30631780
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||   |||||||| || ||||||| || ||    |||||||  |||   ||||||||||||    
T  30631554 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgattaggtcactctctttaaaacttttcgtggcattgccaaaaattgtgcaagaaagactatcaacca 30631653  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgt---gcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaatt-acaccttcaatatggtact 256  Q
    |||| ||||||||||||||||||  || || |||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30631654 cgccacctccaggataaaacaagcccaactgcaactgttgtgcggttatctactgcactgtagaaaaccgttcgagaatttacaccttcaatatggtact 30631753  T
Q  257 aagaccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  30631754 aagacaactcttttaatattgaaacca 30631780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21523859 - 21523636
Alignment:
Q  45 aattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgt 140  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||  | |||||||| ||| |||||||| |||||||| |   ||||||| |||||||||| |||||    |||||||    
T  21523859 aattctattttgaaaaagaatatctactggagttgttaataggttgagtcacgaccaggttgctatctttaa-acgtttcgtggcactgcccaaaattgt 21523761  T
Q  141 ataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattaca 240  Q
      ||||  |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21523760 gcaagggagactatcaaccacgccgcttctaggttaaaacaagttcagctacaactgtgcggttaact-----actgtagaaaatcgttcgagatttaca 21523666  T
Q  241 ccttc-aatatggtactaagaccactcttt 269  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||    
T  21523665 ccctcaaatatggtactaagaccactcttt 21523636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 40847728 - 40847495
Alignment:
Q  52 ttttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggc 147  Q
    |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||    || ||||  |||||    
T  40847728 ttttaaataagaataactaccgaagttgttactagattgagtcacgaccatgtcgttctctttaagacgttttgtggcactgttcaaagttgtgcaaggc 40847629  T
Q  148 cgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacac-cttca 246  Q
      ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||      ||||||||||||||||| |||||| ||  |    
T  40847628 aaactatcaaccacgccacctcctggataaaacaagtccaactacaactgtgtggttaactacta-----tagaaaaccgttcgagatttacactctcaa 40847534  T
Q  247 atatgg-tactaagaccactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  40847533 atatggttaccaagaccactc-tttaatattgaaaccact 40847495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42926881 - 42926714
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatac--gtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaac 158  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||| ||  |||||||| ||  |||||||| |||||    |||||||  ||||  ||||||||||    
T  42926881 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgatcaggccgctctctttaagacacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggtagactatcaac 42926782  T
Q  159 cacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaacc 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42926781 cacgccgcctccaggataatacaagctcaactacaactgtgcggttaactactgcaccgtagaaaacc 42926714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 196 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17453564 - 17453497
Alignment:
Q  196 tgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagacca 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17453564 tgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagacca 17453497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 17545432 - 17545194
Alignment:
Q  52 ttttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctct-ttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataagg 146  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | || ||||||||  | | |||| |||||||||||||||     || ||||  ||      
T  17545432 ttttaaaaaagaatatctaccgaagttgttactaggttgagttacgatcaggtcgttttttcttaagacgtttcgtgacacttttcaaagttgtgcaaaa 17545333  T
Q  147 ccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc- 245  Q
      |||||||||||||||| |||| |||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| | ||||||| ||||||| ||     
T  17545332 aagactatcaaccacgccacctcgaggataaaacaagcacatctacaacagtgcggttaactaacgcattgtagaaaatcattcgagatttacaccctca 17545233  T
Q  246 aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  17545232 aatatgatactaagaccactc-tttaatacggaaaccact 17545194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35639117 - 35638957
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||| ||| || |||||||  || ||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| | |  |||||||||    
T  35639117 tatctaccgaagttgttactaagttgaatcacgatcaggtcgctctttttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaagacagcgtatcaacca 35639018  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtaga 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  35639017 cgccgcctccaggataaaacaagctcagctacaactgttcgattaactactgcactgtaga 35638957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13291571 - 13291455
Alignment:
Q  150 actatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaata 249  Q
    |||||||||||||||||| | | |||| || |||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  13291571 actatcaaccacgccgccactatgatagaataagttcagctacaactatgcgattaactattgctcagtagaaaaccgttcgataattaaacctccaata 13291472  T
Q  250 tggtactaagaccactc 266  Q
    | ||||||| |||||||    
T  13291471 tcgtactaaaaccactc 13291455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 101
Target Start/End: Original strand, 20711360 - 20711456
Alignment:
Q  5 ttgtttttggaattctaaattgttgtattttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagacca 101  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20711360 ttgtttttggatttacaaactgttgtattttggttttccaaattctattttttaagaaaatatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgacca 20711456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 20573012 - 20572960
Alignment:
Q  43 caaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtca 95  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20573012 caaattctattttaaaagggaatatctatcgaaattgttactagattgagtca 20572960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 149 - 242
Target Start/End: Original strand, 32079442 - 32079535
Alignment:
Q  149 gactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacc 242  Q
    ||||||||| ||||  | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||  || |||||||||||||||||    
T  32079442 gactatcaatcacgttgtctccaggataaaaaaggttcagctacaactgtgcgattaactattgcattatagctaatcgttcgagaattacacc 32079535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 281
Target Start/End: Original strand, 30618951 - 30619061
Alignment:
Q  174 ataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactc---tttt 270  Q
    |||||||||| | | ||| |||| |||| |||  ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||   ||||    
T  30618951 ataaaacaagcttacctataactatgcgattagttactgcattgtagaaaatcattcgagaattacacctccaatacagtatcaagaccactcatatttt 30619050  T
Q  271 aatactgaaac 281  Q
    |||||||||||    
T  30619051 aatactgaaac 30619061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 283
Target Start/End: Original strand, 30629011 - 30629069
Alignment:
Q  228 ttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccac---tcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||   | |||||||||||||||||    
T  30629011 ttcgagaattacaccttcaatatagtatcaagaccacttatattttaatactgaaacca 30629069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 44)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 283
Target Start/End: Original strand, 3672559 - 3672781
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| || |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  3672559 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcatggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 3672658  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3672659 cgccgcctccaggataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 3672758  T
Q  261 ccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  3672759 ccaatcttttaatactgaaacca 3672781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 65 - 283
Target Start/End: Original strand, 3692591 - 3692813
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| || |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  3692591 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcatggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 3692690  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3692691 cgccgcctccaggataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 3692790  T
Q  261 ccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  3692791 ccaatcttttaatactgaaacca 3692813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 65 - 283
Target Start/End: Original strand, 8069653 - 8069874
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg---aaattgtataaggccgactatcaaccac 161  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||   |||||||  ||| | |||||||||||||    
T  8069653 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgtccaaattgtgcaagacagactatcaaccac 8069752  T
Q  162 gccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagac 261  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8069753 gccgcctccaggataaaacaagcccagctgcaactgtgcggttaactactgcactgtagataaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagac 8069852  T
Q  262 cactcttttaatactgaaacca 283  Q
    || |||||||| ||||||||||    
T  8069853 caatcttttaacactgaaacca 8069874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 7571338 - 7571103
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| | ||||||||| ||    
T  7571338 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaagacagactatcaatca 7571239  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7571238 cgccgcctccaggataaaacaagctcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacctccaaatatggtactaag 7571139  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7571138 accacgc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 7571103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 23666243 - 23666008
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  23666243 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 23666144  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23666143 cgccgcctccaggataaaacaagcccagctgcaactgtgcggttaactaatgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaag 23666044  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  23666043 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 23666008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24038491 - 24038256
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  24038491 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 24038392  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24038391 cgccgcctccaggataaaacaagcccagctgcaactgtgcggttaactaatgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaag 24038292  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24038291 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 24038256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 65 - 283
Target Start/End: Original strand, 3033617 - 3033839
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| || |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  3033617 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcatggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 3033716  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 260  Q
    | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3033717 caccgcctcaaggataaaacaagctcagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 3033816  T
Q  261 ccactcttttaatactgaaacca 283  Q
     || |||||||||||||||||||    
T  3033817 tcaatcttttaatactgaaacca 3033839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 758488 - 758253
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||  |||||||| |||||||||| ||||     |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  758488 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccagatcgctctctttaagacgtttcgtggcactacccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 758389  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  758388 cgccgcctccaggataaaacaagcccagctgcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaag 758289  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  758288 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 758253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 65 - 283
Target Start/End: Original strand, 8883143 - 8883365
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| | ||||||||||||    
T  8883143 tatctaccgaagttgttactaggtcgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaagacagactatcaacca 8883242  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 260  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8883243 cgctgcctccaggataaaacaagcccagctgcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtacaaaga 8883342  T
Q  261 ccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||| | |||||||||||||||||    
T  8883343 ccaatattttaatactgaaacca 8883365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 65 - 283
Target Start/End: Original strand, 8887903 - 8888125
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||| ||  |||||    |||||||  ||| | || |||||||||    
T  8887903 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgttttgttgcactgtccaaaattgtgcaagacagattatcaacca 8888002  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 260  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8888003 cgccgcctccaggataaaacaaatccagctgcaactgtgcggttaactactacactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 8888102  T
Q  261 ccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  8888103 ccaatcttttaatactgaaacca 8888125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 65 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14438815 - 14438592
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||     |||||||  ||||| ||| ||||||||    
T  14438815 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgccctctttaagacgtttcgtggcactacccaaaattgtgcaaggcagacaatcaacca 14438716  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14438715 cgccgcctccaggataaaacaagcccagctgcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaag 14438616  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccac 284  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||    
T  14438615 accactc-tttaatattgaaaccac 14438592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 49971544 - 49971320
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||     |||||||  ||||| ||||||||| ||    
T  49971544 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgatctctttaagacgtttcgtggcactatccaaaattgtgcaaggcagactatcaatca 49971445  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  49971444 cgccgcctccaggataaaacaagtccagctgcaactgtgcagttaactacttcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactgag 49971345  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  49971344 accactc-tttaatactgaaaccact 49971320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Original strand, 20520027 - 20520262
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||| |||||    | |||||  ||||  ||||||||||||    
T  20520027 tatctagcgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcactctctttaagacgtttcgtggcactgcccaagattgtgcaagggagactatcaacca 20520126  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  20520127 cgccgcctccaagataaaacaagtccagctacaactgtgcggttaactactgtactgtagaaaactgttcgagatttacaccttcaaatatagtactaag 20520226  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20520227 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 20520262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 39775848 - 39775613
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  39775848 tatctaccgaagttgctactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 39775749  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  39775748 cgccgcctccaggataaaacaagctcagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaatcgttcgaaaattacacctccaaatatggtactaag 39775649  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    || |||| |||| |||||||||||||  |||||||||    
T  39775648 acaactc-tttactactgaaaccactttaatatggta 39775613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 73 - 269
Target Start/End: Original strand, 55431296 - 55431497
Alignment:
Q  73 gaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcct 168  Q
    |||||||||| ||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||    ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  55431296 gaagttgttattaggttgagtcacgatcaggtcgctctctttaagacgtttcgtgacactgtcaaaaattatgcaaggcagactatcaaccacgccgcct 55431395  T
Q  169 ccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactct 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  55431396 ccaggataaaacaagtccagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaactgttcgagaattgcaccctcaaatatggtactaagaccactct 55431495  T
Q  268 tt 269  Q
    ||    
T  55431496 tt 55431497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Original strand, 18467198 - 18467433
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| |||||| |||||    
T  18467198 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactattaacca 18467297  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  18467298 cgccgcctccaggataaaacaagtccaactacaattgttcgattaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacacttccaaatatggtactaag 18467397  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||    
T  18467398 accactc-tttaatactgaaaccattttaatatggta 18467433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 150 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6596388 - 6596255
Alignment:
Q  150 actatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaata 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6596388 actatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagctcagctacaattatgtggttaactactgcattgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaata 6596289  T
Q  250 tggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6596288 tggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 6596255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12965992 - 12965758
Alignment:
Q  66 atctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccac 161  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||||  || |||||    |||||||  ||| | |||||||||||||    
T  12965992 atctaccgaagttgttactagattgagtcacaaccaggtcgctctctttaagacgttttatggcactgcccaaaattgtgcaagacagactatcaaccac 12965893  T
Q  162 gccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagac 261  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12965892 gccgcctccaggataaaacaagtccaactacaattgttcgattaactaatgcactgtagaaaactgttcaagaattacacctccaatatggtaccaagac 12965793  T
Q  262 cactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12965792 cattcttttaatactgaaaccactttaatatggta 12965758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Original strand, 18471981 - 18472215
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||  | ||| |||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  18471981 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttacgatgtt-cgtggcactgcctaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 18472079  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18472080 cgccgcctccaggataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcattgtagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtactaag 18472179  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18472180 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 18472215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12112793 - 12112537
Alignment:
Q  33 tttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacact 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  12112793 tttggattttcaaattctattttaaaaaggaatatctaccgaagttgttactaggttgaatcacgactaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcact 12112694  T
Q  133 g----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgt 228  Q
    |    || ||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||||| || |||||||||||||| |    
T  12112693 gtccaaagttgtgcaagacagactatcaaccacaccgcctccaggataaaacaagctcaactacaaatgggtggttaactgctacactgtagaaaaccat 12112594  T
Q  229 tcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | ||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  12112593 tcgagatttacacctccaatatggtgcaaagactattcttttaatacttaaaccact 12112537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 134 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 23661511 - 23661349
Alignment:
Q  134 aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgag 233  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23661511 aaattgtgcaaggcagactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagcccagctgcaactgtgcggttaactaatgcactgtagaaaaccgttcgag 23661412  T
Q  234 aattacaccttc-aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  23661411 aattacaccctcaaatatggtactaagaccactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 23661349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 269
Target Start/End: Original strand, 29350213 - 29350422
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||   ||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| ||| ||| ||||    
T  29350213 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccatgtcgctttctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagaccatctacca 29350312  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
     |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  29350313 tgccgcctccaggataaaacaagctcaactacaactgtgtggttaattactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaag 29350412  T
Q  260 accactcttt 269  Q
    ||||||||||    
T  29350413 accactcttt 29350422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 32474798 - 32474575
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||| ||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| | ||||||||||||    
T  32474798 tatctaccgaagttgttactagattgagccacgaccaggtcg--ctctctaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaagacagactatcaacca 32474701  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacct-tcaatatggtact-aa 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||    
T  32474700 cgccgtctccaggataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattatacctctaaatatggtactaaa 32474601  T
Q  259 gaccactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  32474600 gaccactc-tttaatactgaaaccact 32474575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Original strand, 3418968 - 3419191
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  3418968 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaagtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 3419067  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  3419068 cgccaccttcaggataaaacaagctcaactgcaactgtgcggttaactattgcatcgtagaaaaccgtttgagatttacaccctcaaatatggtactaag 3419167  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    |||||||  |||||||||||||||||    
T  3419168 accactc--ttaatactgaaaccact 3419191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12971752 - 12971516
Alignment:
Q  66 atctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccac 161  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||   |||||||| |||||||||| || ||    |||||||  ||| | || |||||| |||    
T  12971752 atctatcgaagttgttactaggttgactcacgaccaggtctctctctttaagacgtttcgtggcattgcccaaaattgtgcaagacagattatcaatcac 12971653  T
Q  162 gccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagac 261  Q
    |||||||| |||||||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12971652 gccgcctctaggataaaacaagcccaactacaactgttcaattaactactgcattgtagaaaaccgttcgagaattacacctccaatatggtaccaagac 12971553  T
Q  262 cactcttttaatactgaaaccactccaatatggtact 298  Q
     | |||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  12971552 taatcttttaatactaaaaccactttaatatggtact 12971516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 149 - 284
Target Start/End: Original strand, 27708997 - 27709132
Alignment:
Q  149 gactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aa 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  27708997 gactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagcccagcttcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaa 27709096  T
Q  248 tatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccac 284  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  27709097 tatggtactaagatcactc-ttcaatactgaaaccac 27709132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3657360 - 3657136
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||| ||  || |||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| | ||||||||||||    
T  3657360 tatctaccgaagttgttactatgttgagtcacgattagatcgctctctttaagacgtttcgtggcactgttcaaaattgtgcaagacagactatcaacca 3657261  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattaca-ccttcaatatggtactaag 259  Q
     ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3657260 tgccacctccaagataaaacaagtccagctacaactgttagattaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacacccttaaatatggtactaag 3657161  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||    
T  3657160 accactc-tttaatgctgaaaccact 3657136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 155 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25726816 - 25726674
Alignment:
Q  155 caaccacgccgcctccaggataa--aacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatgg 252  Q
    ||||||||||||||| ||||  |  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  25726816 caaccacgccgcctctaggaggataaacaagtgcagttacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagatttacacctccaatatgg 25726717  T
Q  253 tactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| || || |||||||||    
T  25726716 tactaagaccactc-ttaaatactgaaatcattctaatatggta 25726674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 28125030 - 28125242
Alignment:
Q  5 ttgtttttggaattctaaattgttgtattttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggt 104  Q
    |||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28125030 ttgtttttagatttccaaagtgttgtattttggttttctaaattctattttgaaagagaatatctatcgaaattgttactaggttgagtcacgaccaggt 28125129  T
Q  105 cgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggat--aaaacaagttcagctacaactgt 198  Q
     |  || ||||| || ||||||| |||||    |||||||  ||| | |||||| |||||| | |||||||||||  |||||||||||| |||||| |||    
T  28125130 tgctct-tttaagacatttcgtggcactgcttaaaattgtgcaagacagactattaaccacactgcctccaggattaaaaacaagttcaactacaattgt 28125228  T
Q  199 gcggttaactactg 212  Q
    ||||| ||||||||    
T  28125229 gcggtcaactactg 28125242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 159 - 285
Target Start/End: Original strand, 55325847 - 55325973
Alignment:
Q  159 cacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaa-ccgttcgagaattaca-ccttcaatatggtact 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  55325847 cacgccgcctccaggataaaacaagcccagttacaactgtgcggttaacta-tgcactgtagaaaacccgatcgagaattacacccttaaatacggtact 55325945  T
Q  257 aagaccactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55325946 aagaccactc-tttaatactgaaaccact 55325973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 173 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 2207757 - 2207645
Alignment:
Q  173 gataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactctttta 271  Q
    |||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2207757 gataaaacaagcccatctacaattgtgcggttaactactgtactgtagaaaacccttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactc-ttta 2207659  T
Q  272 atactgaaaccact 285  Q
    ||||||||||||||    
T  2207658 atactgaaaccact 2207645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Original strand, 29715617 - 29715774
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||  || ||||| ||||||||||||||||    |||||||   |||  ||||||||||||    
T  29715617 tatctaccgaagttgttattaggttgagtcacgaccagatcgctctttttaagacgtttcgtgacactgtccaaaattgtgctaggaagactatcaacca 29715716  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgt 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  29715717 cgccgcctctaggataaaacaagtccagctacagctgtgcggttaactattgcactgt 29715774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 149 - 285
Target Start/End: Original strand, 46964076 - 46964212
Alignment:
Q  149 gactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aa 247  Q
    |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||    
T  46964076 gactatcacccatgccacctctaggataaaacaaactcagatacaactatgtggttaactattgcactatagaaaaccgttcgagatttacaccctcaaa 46964175  T
Q  248 tatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46964176 tatggtattaagaccactc-tttaatactgaaaccact 46964212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 47567227 - 47567093
Alignment:
Q  149 gactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaat 248  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||   ||||| ||| |  |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||    
T  47567227 gactatcaaccataccgcctccgagataaaacaagttcattgacaacggtgtgaataactattgcactgtagaaaatccttcgagaattacatctccaat 47567128  T
Q  249 atggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  47567127 atgatactaagagcactattttaataccgaaacca 47567093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 17026115 - 17025980
Alignment:
Q  171 aggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactctttt 270  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  || || |  |||||||| |||||||| |||| ||||||| |||    
T  17026115 aggataaaacaagttcagctacaattgtgcgg-taactactgcacggtagaaaacaatttgacacatacacctttaatatggtcctaataccactc-ttt 17026018  T
Q  271 aatactgaaaccactccaatatggtactaagaccactc 308  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||    
T  17026017 aatattgaaatcactctaatatggtgctgtgaccactc 17025980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 189 - 281
Target Start/End: Original strand, 28125244 - 28125335
Alignment:
Q  189 ctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaac 281  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  28125244 ctacaattgtgcggtcaactactg-actgtagaaaacagttcgagtattacacctccaatatggtattaagacaactcttttaatattgaaac 28125335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19276967 - 19276794
Alignment:
Q  134 aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgag 233  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||  ||||| || |||||||||| |||  || |||| |||||||| |||||||| ||| |||||  |||||||    
T  19276967 aaattgtgtaagacagactatcaaccacgttgcctctagaataaaacaagctcaattaaaactatgcggttagctactgcaatgttgaaaattgttcgag 19276868  T
Q  234 aattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtactaagaccactc 308  Q
    | ||||||||  |||||| ||| |||||  ||||||| ||||| | |||| || |||||| ||||| ||| ||||    
T  19276867 atttacacctctaatatgatacgaagacatctctttt-atactaacaccagtctaatatgatactatgactactc 19276794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 149 - 308
Target Start/End: Original strand, 16013771 - 16013922
Alignment:
Q  149 gactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaat 248  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||  | |       ||||| | ||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  16013771 gactatccaccacgccgcctccaggataaaataagctcatctacaattgtgtagat-------gcactattgaaaatcattcgagaattacacctccaat 16013863  T
Q  249 atggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtactaagaccactc 308  Q
    |||||| ||| |||| | |||||||| |||||||| || | |||||||||| ||||||||    
T  16013864 atggtagtaacacca-tattttaatattgaaaccaatcaattatggtactatgaccactc 16013922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 133
Target Start/End: Original strand, 27708858 - 27708919
Alignment:
Q  72 cgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg 133  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  27708858 cgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgttctctttaagacgtttcgtggcactg 27708919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9113267 - 9113177
Alignment:
Q  194 actgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatgg-tactaagaccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||| | |||| |||||||||| | |||||| |||||| | || |||||||||||||||||||    
T  9113267 actgtgcgattaactactgcactgtagctaactgctcgacaattacacctcctatatggttactaaaatcagtcttttaatactgaaacca 9113177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 10708629 - 10708575
Alignment:
Q  231 gagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10708629 gagaattacactttctatatgggactaagaccattcttttaatactgaaaccact 10708575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 25726933 - 25726853
Alignment:
Q  44 aaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcg 125  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||| || | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  25726933 aaattttattttgaaaaagaatatataccaaagttgt-actagattgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcg 25726853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2207823 - 2207760
Alignment:
Q  69 tatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacact 132  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||| ||| ||||    
T  2207823 tatcgaagttgtcactagattgagtcacgaccaggtcgctctttttaagacgtttagtggcact 2207760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 23661570 - 23661529
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcg 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23661570 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcg 23661529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Original strand, 31269009 - 31269244
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  31269009 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcctaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 31269108  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31269109 cgccgcctccaggataaaacaagtccagctacaaccgtgtggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaag 31269208  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31269209 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 31269244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 37264684 - 37264449
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    ||||| |  ||||| ||||||||||||    
T  37264684 tatctatcgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattatgcaaggcagactatcaacca 37264585  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  37264584 cgccgcctccaggataaaacaagcccagctacaattgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaag 37264485  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  37264484 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 37264449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Original strand, 31273496 - 31273731
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| | ||||||||||||    
T  31273496 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaagacagactatcaacca 31273595  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31273596 cgccgcctccaggataaaacaagcccagctacaactgtgtggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaag 31273695  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31273696 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 31273731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 37259997 - 37259762
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||     |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  37259997 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctttctttaagacgtttcgtggcactactcaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 37259898  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  37259897 cgccgcctccaggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaag 37259798  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  37259797 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 37259762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Original strand, 12878155 - 12878449
Alignment:
Q  5 ttgtttttggaattctaaattgttgtattttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggt 104  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||   ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  12878155 ttgtttttggatttccaaattgttatatttgggttcc-caaattctattttgatagagaatatctacggaagttgttactaggttgagtcacgatcaggt 12878253  T
Q  105 cgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgc 200  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||||     |||||||  || || ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  12878254 cgctctctttaagacgtttcgtgacacttttcaaaattgtgcaaagcagactatcaatcacgccacctccagaataaaacaagttcagctacaactgtgt 12878353  T
Q  201 ggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtac 297  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||||||    
T  12878354 tgttaattactgcac-gtagaaaaccgttcgagaattacacctccaatatgatactaagaccactcttttaatgttgaaacgactctagtatggtac 12878449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 67 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13522110 - 13521867
Alignment:
Q  67 tctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacg 162  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  13522110 tctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaagacagactatcaaccacg 13522011  T
Q  163 ccgcctccaggataaaacaagttcagctac---aactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13522010 ccgcctccaggataaaacaagtccagctgctgcaactgtacggttgactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacttttaatatggtactaag 13521911  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggtactaagaccactc 308  Q
    |||||||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||||||    
T  13521910 accactcttttaatactgaaa-----ccaatatggtactatgaccactc 13521867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33463476 - 33463238
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    || ||||  ||||| || | ||||||     
T  33463476 tatctatcgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgtccaaagttgtgcaaggcagattgtcaaccc 33463377  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  33463376 cgccgcctccaggataaaacaagcacaactacaactgttcgattaactactgcattgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtaccaaaa 33463277  T
Q  261 ccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtacta 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  33463276 ccattcttttaatactgaaaccactttaatattgtacta 33463238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Original strand, 16421004 - 16421228
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||| || ||||||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  16421004 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctcattaagacatttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 16421103  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16421104 cgccgcctacaggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgtccgagatttacaccttcgaatatggtactaag 16421203  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16421204 accactc-tttaatattgaaaccact 16421228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Original strand, 47244223 - 47244458
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    ||||| |  |||   ||||||||||||    
T  47244223 tatctatcgaagttgttagtaggttgagtcacgatcaggtcgccctctttaagacgtttcgtggcactgttcaaaattattgaagaaagactatcaacca 47244322  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||    
T  47244323 cgccgcctccaggataaaacaagcacaactacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattaaacccccaaatatggtactaag 47244422  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  47244423 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 47244458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 67 - 296
Target Start/End: Original strand, 8693688 - 8693921
Alignment:
Q  67 tctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacg 162  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| | ||     |||||||  ||| |  |||||||||||||    
T  8693688 tctatcgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcgctacccaaaattgtgcaagacatactatcaaccacg 8693787  T
Q  163 ccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagac 261  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  8693788 ccgcctcaaggataaaacaagctcagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtactaagac 8693887  T
Q  262 cactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8693888 cactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 8693921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 150 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 48276680 - 48276532
Alignment:
Q  150 actatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaata 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  48276680 actatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccattcgagaattacacctccaata 48276581  T
Q  250 tggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtact 298  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  48276580 tggtaccaagaccattcttttaatactgaaaccactttaatatggtact 48276532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Original strand, 55251695 - 55251929
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| | ||||||||||||    
T  55251695 tatctattgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctct-tttaagacgtttcgtggcactgtccaaaattgtgcaagacagactatcaacca 55251793  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacc-ttcaatatggtactaag 259  Q
    |||| ||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  55251794 cgccacctccaggataaaacaagcccaactacaactgtacggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagatttacacctttgaatatggtactaag 55251893  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  55251894 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 55251929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Original strand, 51697892 - 51698126
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||  || ||||| ||||||| ||||||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  51697892 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccagatcgctctttttaagacgtttcatgacactgctcaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 51697991  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  51697992 cgccgcctccaggataaaacaagctcaactacaattgtgcggttaacta-tgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaag 51698090  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    | ||||| ||||||| |||||| |||  |||||||||    
T  51698091 atcactc-tttaatattgaaactactttaatatggta 51698126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 65 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5271539 - 5271316
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| | ||||||||||||    
T  5271539 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaagacagactatcaacca 5271440  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  5271439 cgccgcctccaggataaaacaagtccaactacaactgtttgattcactattgcactgtagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtgctaag 5271340  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccac 284  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  5271339 accactc-tttaatactgaaaccac 5271316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 91 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31729481 - 31729284
Alignment:
Q  91 agtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttc 186  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||| ||||     |||||||  ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  31729481 agtcatgatcaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactacccaaaattgtgcaaggcagacaatcaatcacgccgcctccaggataaaacaagtcc 31729382  T
Q  187 agctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccac 284  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31729381 agctgcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactc-tttaatactgaaaccac 31729284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5928339 - 5928104
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||| | |||| ||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  5928339 tatctaccgaagttgttaccaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagatgtttagtggcactgctcaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 5928240  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5928239 caccgcctccaggataaaacaagcccagctgcaactgttcgattaactactgcactgtagaaaatcgttcaagaattacacctccaaatatggtactaag 5928140  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  5928139 accactc-tttaatacttaaaccactttaatatggta 5928104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Original strand, 13059385 - 13059619
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| | ||||||||||||    
T  13059385 tatctaccgaagttattactaggttgagtcatgaccagatcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcataaaattgtgcaagacagactatcaacca 13059484  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    | ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  13059485 ctccgcctctagaataaaacaagctcagctacaactgtgtggttaactactgcattgtagaaaaccgttcgag-attacaccttcaaatatggttctaag 13059583  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  13059584 accactc-tttaatattgaaaccactttaatatggta 13059619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Original strand, 19101952 - 19102187
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||||   || ||||| |||||||||| ||||     |||||||  ||  | ||||||||||||    
T  19101952 tatctatcaaagttgttactaggttaagtcacgacgaggtcactctgtttaagacgtttcgtggcactactcaaaattgtgcaaaacagactatcaacca 19102051  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19102052 cgtcgcctccaggataaaacaagtccaactacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaag 19102151  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  19102152 accactc-tttaatactaaaaccattttaatatggta 19102187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33469085 - 33468855
Alignment:
Q  73 gaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcct 168  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| ||| |||||    || ||||  ||||| |||| ||||||||||| |||    
T  33469085 gaagttgttactaggttgagtcacgactaggtcgttctctttaagacgttttgtggcactgcccaaagttgtgcaaggcagactgtcaaccacgccacct 33468986  T
Q  169 ccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactctt 268  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  33468985 ccatgataaaacaagctcagctacaattgttcgattaactactgcactgttgaataaggtttgagaattacacctccaatatggtaccaagaccattctt 33468886  T
Q  269 ttaatactgaaaccactccaatatggtacta 299  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  33468885 ttaatactgaaaccactttaatatggtacta 33468855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12824013 - 12823797
Alignment:
Q  67 tctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacg 162  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||| |||||    |||||||  ||| |  |||||||||||||    
T  12824013 tctaccgaagttgttattaggttgagtcatgaccaggtcgctctctttaagacatttcgtggcactgcccaaaattgtgcaagacaaactatcaaccacg 12823914  T
Q  163 ccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagac 261  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12823913 ccgcctccaggataaaacaagtccatcta------tgcggctaactactgcactgtagaaaaccgttcgagatttacaccttcgaatatggtactaagac 12823820  T
Q  262 cactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  12823819 cactc-tttaatactgaaaccact 12823797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 42 - 293
Target Start/End: Original strand, 12874491 - 12874746
Alignment:
Q  42 tcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaat 137  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||  | ||| |||  |||||||| ||  |||||| |||||    ||||    
T  12874491 tcaaattttattttgatagagaatatctactgaagttgttattaggttgagtcacaatcagatcgctctctttaagacaattcgtggcactgtctaaaat 12874590  T
Q  138 tgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaatt 237  Q
    |||  || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||    
T  12874591 tgtgcaaagcagaccatcaatcacgccgcctccaggataaaacaagctcagctaaaattgtgcggttaactactacactgtagaaaaccgttaatgaatt 12874690  T
Q  238 acaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatg 293  Q
    |||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||    
T  12874691 acacttccaatatggtagtaagaccacccttttaatactgaaatcattctaatatg 12874746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8030596 - 8030359
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||  | |||||||  |||||||| |||||| ||| |||||    |||||||  |||   |||||||||| |    
T  8030596 tatctaccgaagttgttactaggttgaatcacaatcaggtcgctctctttaagacgttttgtggcactgcccaaaattgtgcaagatagactatcaacaa 8030497  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 260  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  8030496 cgctgcctccaggataaaacaagcccagctacaaatgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgaaaattacacctccaatatgataccaaga 8030397  T
Q  261 ccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtact 298  Q
     || |||||||||||| |||||| |  |||||||||||    
T  8030396 tcattcttttaatactaaaaccattttaatatggtact 8030359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19541208 - 19541057
Alignment:
Q  134 aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgag 233  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19541208 aaattgtacaagacagactatcaaccacgccgcctataggataaaacaagtccagctacaacagttcgattaactactgcattgtagaaaaccgttcgag 19541109  T
Q  234 aattacaccttc-aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19541108 aattacacctccaaatatggtactaagaccactc-tttaatattgaaaccact 19541057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 168 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8649643 - 8649528
Alignment:
Q  168 tccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactct 267  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8649643 tccaggataaaacaagcctaactacaactgtgcggttaactactacactgtagaaaactgttcgagaattacaccttcaatatggtactaacaccactct 8649544  T
Q  268 tttaatactgaaacca 283  Q
    ||||||||||||||||    
T  8649543 tttaatactgaaacca 8649528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 168 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8661450 - 8661335
Alignment:
Q  168 tccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactct 267  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8661450 tccaggataaaacaagcctaactacaactgtgcggttaactactacactgtagaaaactgttcgagaattacaccttcaatatggtactaacaccactct 8661351  T
Q  268 tttaatactgaaacca 283  Q
    ||||||||||||||||    
T  8661350 tttaatactgaaacca 8661335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Original strand, 19906226 - 19906460
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||| ||| ||| |||||||| || |||||||  || ||||| |||||  |||||||||    |||||||  ||| | ||||||||||      
T  19906226 tatctaccgaagttattattaggttgagtcacgatcaggtcgctctttttaagacgttcagtgacactgtctaaaattgtgcaagacagactatcaactc 19906325  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | | ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19906326 cgccgcctccaggataaaacaagctcaactacaactgtttgat-aactactgcgctttagaaaaccgttcgaaaattacacctccaatatggtaccaaga 19906424  T
Q  261 ccactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19906425 ccattcttttaatacttaaaccactctaatatggta 19906460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 308
Target Start/End: Original strand, 47574600 - 47574837
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| |||| |||||| ||| ||||||||  | |||||||  |||||||| ||||||| |||||||     |||||||  ||| |  | |||||| ||    
T  47574600 tatctaccgaatttgttattaggttgagtcacaatcaggtcgctctctttaagacgtttcttgacactacccaaaattgtgcaagacaaaatatcaatca 47574699  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 260  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||     |||||||||    
T  47574700 cgccgcatccaggataaaacaagtccagctacaactgtgcggttaactactgccatgtagaaaactgttcgagaattacaccttca-----gtactaaga 47574794  T
Q  261 ccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtactaagaccactc 308  Q
    | ||||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||||||    
T  47574795 caactcttttaatactgaaa-----ccaatatggtactatgaccactc 47574837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 299
Target Start/End: Original strand, 4550932 - 4551206
Alignment:
Q  23 attgttgtattttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtt 122  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  ||||| || ||    
T  4550932 attgttgtattt-ggattttcaaattctattttgaaaagtaatatctatcgaagttgttactaggttgagtcatgattaggtcgttca-tttaagacatt 4551029  T
Q  123 tcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgt 218  Q
    |  || |||||    || ||||  ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  4551030 ttatgccactgctcaaagttgtgcaagacagactatcaactacgccgcctccaggataaaacaaactcaattacaactctgcgattaactactgcactgt 4551129  T
Q  219 agaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtacta 299  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||     |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4551130 agaaaaccgtttaagatttacaccatcaaatatggtactaagaccattct-----tactgaaaccactctaatatggtacta 4551206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 42758870 - 42758689
Alignment:
Q  70 atcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccg 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| | |||||||| |||||    |||||||  ||| | |||||||||||||| ||    
T  42758870 atcgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagatgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaagacagactatcaaccacgtcg 42758771  T
Q  166 cctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaa 247  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42758770 cctccagaataaaactagtccaaaaacaactgtgcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaa 42758689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 2819819 - 2820024
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| | ||||||||  ||||    |||||||  ||||  ||||||| ||||    
T  2819819 tatctatcgaagttgttactagattgagtcacgaccaggtcgttttctttaagatgtttcgtggtactgtccaaaattgtgcaaggtagactatctacca 2819918  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||  ||||||    
T  2819919 tgccgcgtccaggataaaacaagtttagctacaactatgcaattaactgttgcactatagaaaatcgttcgagatttacaccctcaaatatgacactaag 2820018  T
Q  260 accact 265  Q
    ||||||    
T  2820019 accact 2820024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32082203 - 32082027
Alignment:
Q  72 cgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcc 167  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||   || ||||| || |||| || |||||    |||||||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  32082203 cgaagttgttactaggttgagtcacgaccagatcactctttttaagacatttcatggcactgtccaaaattgtgcaaggca-actatcaaccacgccgcc 32082105  T
Q  168 tccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc 245  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  32082104 tccaggataaaacaagctcagttacaattgtgcggttaactactgcagtgtagaaaaccattcgagatttacaccttc 32082027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 198
Target Start/End: Original strand, 31765861 - 31765998
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||   |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  31765861 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacaaccaggtcactctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 31765960  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31765961 cgccgcctccaggataaaacaagtccagctacaactgt 31765998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Original strand, 19106594 - 19106818
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||   ||||||| ||||||| |  |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  19106594 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacaagcagatcgctttctttaagacgtttcatagcactgcccaaaattgtgcaaggctgactatcaacca 19106693  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    || ||||||||| |||||||||            || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  19106694 cgtcgcctccagaataaaacaac-----------ctttgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtattaag 19106782  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    | ||||| |||||||| ||||||| |  |||||||||    
T  19106783 atcactc-tttaatacagaaaccattttaatatggta 19106818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 225 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 55810234 - 55810176
Alignment:
Q  225 ccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55810234 ccgttcgagaattacacgttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 55810176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 149 - 283
Target Start/End: Original strand, 32545158 - 32545293
Alignment:
Q  149 gactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaat 248  Q
    ||||||||||||||  |  |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||    
T  32545158 gactatcaaccacgttgtatccatgataaaacaagctcaactacaattgtgcgactaactactgcactgtaattaatcgttcgagaattacaactccaat 32545257  T
Q  249 atggtactaagaccactct-tttaatactgaaacca 283  Q
    ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  32545258 atgttactaagactgctctatttaatactgaaacca 32545293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 149 - 242
Target Start/End: Original strand, 16948064 - 16948157
Alignment:
Q  149 gactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacc 242  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| ||||||||  || | ||| |||||||||||    
T  16948064 gactatcaactacgccgcctccaggataaaacaagttcattgacaactgtgcgattaactactacactgtagctaatcattctagaattacacc 16948157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 296
Target Start/End: Original strand, 40408284 - 40408411
Alignment:
Q  171 aggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcg--agaattacac-cttcaatatggtactaagaccactct 267  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||   ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  40408284 aggataaaacaagttcaactacaattgtgtggttaattactgtactgtagaaaaccgttctcaagatttacattcttaaatatggtactaagaccact-t 40408382  T
Q  268 tttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||| ||||  |||||||||    
T  40408383 tttaatattgaaatcactttaatatggta 40408411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 306
Target Start/End: Original strand, 40840417 - 40840548
Alignment:
Q  175 taaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatg-gtactaagaccactcttttaat 273  Q
    |||||||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||  || |||   |||||||||||     
T  40840417 taaaacaaatttaactacaactgtgcgattaaccactgcacta-agaaaatcgttcgagaattacacctccaatatgactattaatgtcactcttttaaa 40840515  T
Q  274 actgaaaccactccaatatggtactaagaccac 306  Q
    |||||||||| || | |||||||||| ||||||    
T  40840516 actgaaaccaatcaattatggtactatgaccac 40840548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 95
Target Start/End: Original strand, 23093112 - 23093197
Alignment:
Q  9 ttttggaattctaaattgttgtattttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtca 95  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  23093112 ttttggatttcaaaactgttgtattt-ggatttccaaattctattttgaaaaagaatatatatcgaagttgttactaagttgagtca 23093197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 308
Target Start/End: Original strand, 47574816 - 47574874
Alignment:
Q  245 caatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtactaagaccactc 308  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||||||    
T  47574816 caatatggtactatgaccactcttttaatactgaaa-----ccaatatggtactatgaccactc 47574874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 13065897 - 13065778
Alignment:
Q  56 aaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgac 151  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||  |||||||| ||||||| || |||||    || ||||  ||||  |||    
T  13065897 aaaaaagaatatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgactatgtcgctctctttaagacgtttcatggcactgcccaaagttgtgaaagggagac 13065798  T
Q  152 tatcaaccacgccgcctcca 171  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  13065797 tatcaaccacgcagcctcca 13065778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 266
Target Start/End: Original strand, 55073389 - 55073438
Alignment:
Q  217 gtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactc 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||    
T  55073389 gtagaaaaccgttcgagaattacacatccaatatagtattaagaccactc 55073438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 1151254 - 1151211
Alignment:
Q  226 cgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttt 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  1151254 cgttcgagaattacaccttcagtatggtactaaaatcactcttt 1151211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 313
Target Start/End: Original strand, 9362416 - 9362562
Alignment:
Q  171 aggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacac-cttcaatatgg-tactaagaccactc-- 266  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||  |||| ||| ||| ||||||  || ||||||| || |||||||||||      
T  9362416 aggataaaataagtccagctaaaactgtgcgattaactactgcactatagctaaccattcaagacttacacatttaaatatggctattaagaccactcgg 9362515  T
Q  267 ttttaatactgaaaccactccaatatggtactaagaccactcaaata 313  Q
     ||||||| |  || ||||| ||||||||| | |||||||| |||||    
T  9362516 atttaatattataatcactctaatatggtattgagaccacttaaata 9362562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 211 - 250
Target Start/End: Original strand, 55073320 - 55073359
Alignment:
Q  211 tgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  55073320 tgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacatccaatat 55073359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 188
Target Start/End: Original strand, 16953133 - 16953187
Alignment:
Q  134 aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcag 188  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  16953133 aaattgtgcaaggcagactatcaaccacaacgcctccaggataaaacaagctcag 16953187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7903041 - 7903005
Alignment:
Q  246 aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7903041 aatatggtactaagaccactc-tttaatactgaaacca 7903005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 13065776 - 13065712
Alignment:
Q  221 aaaaccgttcgagaattacaccttcaa-tatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  13065776 aaaaccattcgagatttacaccctcaaatatggtactaaaaccactc-tttaataccgaaaccact 13065712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29985715 - 29985570
Alignment:
Q  164 cgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagacca 263  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || | |||||||||||| |||||  || ||||| ||||||||| ||  |||| |||||  ||||||    
T  29985715 cgcctccaggataaa-caagtccagctacaagtttgtgattaactactgcattgtagccaa-cgttcaagaattacaactctaatacggtacatagacca 29985618  T
Q  264 ctct---tttaatactgaaaccactccaatatggtactaagaccactc 308  Q
    ||||   ||||||| |||||||| || | | |||||||| || |||||    
T  29985617 ctcttaatttaatattgaaaccaatcaattttggtactatgatcactc 29985570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 39217356 - 39217257
Alignment:
Q  218 tagaaaaccgttcgagaattacaccttcaat-atgg-tactaagaccactct--tttaatactgaaaccactccaatatggtactaagaccactcaaata 313  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||    
T  39217356 tagaaaatcgttcgagacttacaccctcaaacatggctattaagaccactcgaatttaatactgaaaccactgttatatggtattgagaccactcaaata 39217257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 263
Target Start/End: Original strand, 55149765 - 55149797
Alignment:
Q  231 gagaattacaccttcaatatggtactaagacca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55149765 gagaattacaccttcaatatggtactgagacca 55149797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 65 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23192937 - 23192701
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23192937 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtacaaggcagactatcaacca 23192838  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaaga 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23192837 cgcctcctccaggataaaacaagc-cagctacaattgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacctccaatatggtaccaaga 23192739  T
Q  261 ccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtact 298  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  23192738 ccattcttttaatactgaaaccactttaatatgatact 23192701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33301300 - 33301076
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| | ||||||||||||    
T  33301300 tatctatcaaagttgttactagcttgaatcacgaccaggtcgttctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaagacagactatcaacca 33301201  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33301200 cgccgcctccaggataaaacaatttcatctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaactgttcgagaattacaccttcaaatatggtactaag 33301101  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||    
T  33301100 accactc-gttaatacttaaaccact 33301076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19799133 - 19798898
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||  |||||||| |||||||||| ||||     |||||||  ||| | ||||||||||||    
T  19799133 tatctatcgaagttgttactaggttgagtcacgatcagatcgctctctttaagacgtttcgtggcactatccaaaattgtgcaagacagactatcaacca 19799034  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  19799033 cgccgcctccaggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagatttacaccttcaaatatggcactaag 19798934  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  19798933 accactc-tttaatactaaaaccactttaatatggta 19798898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 67 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 18784666 - 18784457
Alignment:
Q  67 tctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacg 162  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||  || ||||| || ||||||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18784666 tctagcgaagttgttactaggttgagtcacgatcaggtcgctct-tttaagacatttcgtggcactgcctaaaattgtgcaaggcagactatcaaccacg 18784568  T
Q  163 ccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagacc 262  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18784567 ccgcctccagaataaaacaagtccagct--------gcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagacc 18784476  T
Q  263 actcttttaatactgaaac 281  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18784475 actcttttaatactgaaac 18784457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 65 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16649732 - 16649510
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||| ||| |||||    |||||||  |||   ||||||||||||    
T  16649732 tatctaccgaagttgttactaagttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgttt-gtggcactgtccaaaattgtgcaagatagactatcaacca 16649634  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  16649633 cgccgcctccgggataaaacaagtccagctacaactgtgtggttaactactgcactgtagaaaactgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaat 16649534  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccac 284  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  16649533 accactc-tttaatactgaaaccac 16649510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 148 - 284
Target Start/End: Original strand, 25843818 - 25843954
Alignment:
Q  148 cgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttca- 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  25843818 cgactatcaaccacgccgcctccagtataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccctcat 25843917  T
Q  247 atatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccac 284  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25843918 atatggtactaagaccactc-tttaatactgaaaccac 25843954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 26927842 - 26927607
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||  |||||||| |||||||||| || ||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  26927842 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgactaagtcgctctctttaagacgtttcgtggcattgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 26927743  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    ||||||||| |  ||||||||||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  26927742 cgccgcctctaaaataaaacaagcccagctacaactgtacacttaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtactaag 26927643  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26927642 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatggta 26927607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Original strand, 40165955 - 40166179
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| ||||| |||| |    
T  40165955 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccatgtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactaacaacaa 40166054  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    ||||||||| |||||||||||||  || |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||    
T  40166055 cgccgcctctaggataaaacaagcacaactacaactatacgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgaaatttacacattcgaatatggtactaag 40166154  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40166155 accactc-tttaatactgaaaccact 40166179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 263
Target Start/End: Original strand, 16035530 - 16035784
Alignment:
Q  5 ttgtttttggaattctaaattgttgtattttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggt 104  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||      ||  ||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16035530 ttgtttttggatttccaaactgttgtattt-ggattttcaaattcta------aaatgaatatctaccaaagttgttactaggttgagtcacgaccaggt 16035622  T
Q  105 cgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgc 200  Q
    || ||||||||| |||||||||| |||||    || ||||  ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||     
T  16035623 cgccctctttaacacgtttcgtggcactgtccaaagttgtgcaagacagattatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagctcatctacaaatgtgt 16035722  T
Q  201 ggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagacca 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16035723 ggttaactactgcactttagaaaaccattcgag-attacacctccaatatggtaccaagacca 16035784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 266
Target Start/End: Original strand, 10135431 - 10135637
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||     |||||||  ||||| ||| ||||||||    
T  10135431 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactacctaaaattgtgcaaggcagacaatcaacca 10135530  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||| |    
T  10135531 cgccgcctctaggataaaacaagcccagttgcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcaagaattacaccctcaaatatggcactacg 10135630  T
Q  260 accactc 266  Q
    |||||||    
T  10135631 accactc 10135637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 298
Target Start/End: Original strand, 8137996 - 8138151
Alignment:
Q  143 aaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacc 242  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8137996 aaggcagactatcaaccatatcgcctccaggataaaacaagctcagctacaactgtgcggttaactactgcaatgtagaaaaccgttcgagaattacacc 8138095  T
Q  243 ttc-aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtact 298  Q
     || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  8138096 ctcaaatatggtactaagaccac-cctttaatactgaaaccactttaatatgatact 8138151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 65 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 51041581 - 51041350
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg---aaattgtataaggccgactatcaaccac 161  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||| |||||   |||||||  ||||| |||||||||||||    
T  51041581 tatctaccgaagttgttactaagttgagtcacgaccaggtcgctct-tttaagacgtttcgtggcactgcccaaattgtgcaaggcagactatcaaccac 51041483  T
Q  162 gccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaaga 260  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  51041482 gccgcctccaagataaaacaagcccagctacaactgttcgattaattactgcactgtagaaaatcgttcgagaactatacctccaaatatggtactaaga 51041383  T
Q  261 ccactcttttaatactgaaaccactccaatatgg 294  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||    
T  51041382 tcactc-tttaatattgaaaccactttaatatgg 51041350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 284
Target Start/End: Original strand, 10140064 - 10140294
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| |||||||||| ||||     |||||||  ||||| ||| ||||||||    
T  10140064 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgatcaggtcgctctctttaacacgtttcgtggcactactcaaaattgtgcaaggcagacaatcaacca 10140163  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgta-------gaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatgg 252  Q
    |||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  10140164 cgccacctctaggataaaacaagcccagctgcaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatgg 10140263  T
Q  253 tactaagaccactcttttaatactgaaaccac 284  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  10140264 tactaagaccattc-tttaatattgaaaccac 10140294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 16833548 - 16833694
Alignment:
Q  150 actatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaata 249  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||   |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16833548 actatcaacctcgccacatccaggataaaacagcctcagctacaactgttcgattaactactgcattgtagaaaaccgttcgaaaattacacctccaata 16833647  T
Q  250 tggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16833648 tggtaccaagaccattcttttaatactgaaaccactttaatatggta 16833694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28434606 - 28434457
Alignment:
Q  149 gactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaat 248  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28434606 gactatcaaccttgccgtctccaggataaaacaagttcaactacaattgtgcagttaactactttactatagaaaaccgttcgagatttacacctccaat 28434507  T
Q  249 atggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggtact 298  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28434506 atggtacaaagatcattcttttaatactgaaaccactttaatatggtact 28434457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 80 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 47451330 - 47451111
Alignment:
Q  80 ttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggat 175  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| || |||||    |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  47451330 ttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcatggcactgccaaaaattgtgcaagacagactatcaaccacgccgcctccaagat 47451231  T
Q  176 aaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactcttttaata 274  Q
    |||||||| ||| |||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |   | ||||||||    
T  47451230 aaaacaagctcaactacaactgttcgattaactactgtactgcagaaaaccgttcgagaattacacctccaaatatggtactaattc--tttttttaata 47451133  T
Q  275 ctgaaaccactccaatatggta 296  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  47451132 ctgaaaccactttaatatggta 47451111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 186 - 283
Target Start/End: Original strand, 3094188 - 3094285
Alignment:
Q  186 cagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  3094188 cagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtattaagaccaatcttttaatactgaaacca 3094285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 39588480 - 39588252
Alignment:
Q  72 cgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcc 167  Q
    |||| |||||||||| || ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| | ||||||| ||||||||  |    
T  39588480 cgaaattgttactaggttaagtcacgatcaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgtccaaaattgtgcaagacagactatctaccacgcctac 39588381  T
Q  168 tccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactc 266  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||    
T  39588380 tccaggataaagcaagctcatctacaattgttcgattaactactgcagtgtagaaaaccgttcgagaattacacctccaaatatggtactgagaccaatc 39588281  T
Q  267 ttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
     ||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  39588280 -tttaatactaaaaccactttaatatggta 39588252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 134 - 296
Target Start/End: Original strand, 38620740 - 38620902
Alignment:
Q  134 aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgag 233  Q
    |||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  38620740 aaattgtgcaaggcagactatcaactacgccgcctccaagataaaacaagtccaactacaactgtgcggttaactactgcattgtagaaaactgtttgag 38620839  T
Q  234 aattaca-ccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    | ||||| |||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  38620840 atttacaccctaaaatatggtattaagaccactc-tttaatactgaaatcactttaatatggta 38620902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 269
Target Start/End: Original strand, 11806332 - 11806543
Alignment:
Q  63 aatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaac 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||  |||||||| | ||||||||||||||    || | ||| ||||| ||||||||||    
T  11806332 aatatctatcgaagttgttattaggttgagtcacaaccagatcgctctctttaagatgtttcgtgacactgcgcaaagtggtacaaggcagactatcaac 11806431  T
Q  159 cacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtacta 257  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| || |||||| |||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||    
T  11806432 cacgccgccttcagaataaaagaagttcaactacaattgtgcggttaaatactgcagtgcagaaaatcgtttgagatttacactttcaaatatggcacta 11806531  T
Q  258 agaccactcttt 269  Q
    ||| ||||||||    
T  11806532 agatcactcttt 11806543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 281
Target Start/End: Original strand, 12259946 - 12260184
Alignment:
Q  40 tttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aa 135  Q
    |||| ||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||| | ||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||    ||    
T  12259946 tttccaattctattttgaaaaataatatctactgaagttgttacttggttgagacacgaccatgtcgctctctttaagacgtttcgtgacactgcccaaa 12260045  T
Q  136 attgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaa 235  Q
    |||||  ||| | ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||   ||  ||||||| |||||||||||||||||   ||||||||  || || ||    
T  12260046 attgtgcaagacagactatcaaccacgccgtctttaggataaaacaaacacatgtacaactatgcggttaactactgcataatagaaaacaatttgaaaa 12260145  T
Q  236 ttacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaac 281  Q
    |||||||| |||     ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12260146 ttacacctccaa-----tactaagaccactc--ttaatactgaaac 12260184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 47455499 - 47455353
Alignment:
Q  72 cgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcc 167  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| || ||    |||||||  ||| | || ||||||||||||||||    
T  47455499 cgaagttgttattaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcaatgtccaaaattgtgcaagacagattatcaaccacgccgcc 47455400  T
Q  168 tccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgca 214  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||||    
T  47455399 tccaggataaaacaagcctagctacaactgttcgattaactactgca 47455353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 223
Target Start/End: Original strand, 5346615 - 5346800
Alignment:
Q  39 ttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttg-ttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg---- 133  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||| ||||||| |||||| |  | |||||||| |||||||| |||||| ||| |||||        
T  5346615 ttttcaaattttattttaaaagagaatatc----gaagttggttactaggttgagttacaatcaggtcgttctctttaaaacgttttgtggcactgtcca 5346710  T
Q  134 aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaa 223  Q
    || ||||| ||  | ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||  |||| |||| || ||||||||    
T  5346711 aatttgtacaatacagactatcaatcacgccgcctccaagatgaaacaagttcagctacaactatgcaattaaatactacaatgtagaaa 5346800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Original strand, 8900225 - 8900359
Alignment:
Q  61 agaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatca 156  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||  |||  |||||||| |||||| |||||||||    || ||||  ||  |  |||||||    
T  8900225 agaatatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccatatcgctctctttaaaacgttttgtgacactgtctaaagttgtgcaaaacatactatca 8900324  T
Q  157 accacgccgcctccaggataaaacaagttcagcta 191  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8900325 atcacaccgcctccaggataaaacaagttcagcta 8900359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 133
Target Start/End: Original strand, 25855146 - 25855214
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg 133  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    
T  25855146 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactg 25855214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 295
Target Start/End: Original strand, 46696734 - 46696817
Alignment:
Q  212 gcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaaccactccaatatggt 295  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| || |||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  46696734 gcaccgtagaaaaccgttcaagaattacacctccaatatgttaataagatcattcttttaatattgaaatcattctaatatggt 46696817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 159
Target Start/End: Original strand, 3094089 - 3094187
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacc 159  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| || |||||    |||||||  ||||| |||||||||||    
T  3094089 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcatggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacc 3094187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 133
Target Start/End: Original strand, 16832085 - 16832144
Alignment:
Q  74 aagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg 133  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  16832085 aagttgttactatattgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgttccgtgacactg 16832144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41097887 - 41097851
Alignment:
Q  246 aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41097887 aatatggtactaagaccactc-tttaatactgaaacca 41097851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 284
Target Start/End: Original strand, 7079 - 7302
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  7079 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 7178  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||| ||||    
T  7179 cgccgcctccaggataaaacaagctcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacgccctcaaatattgtattaag 7278  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccac 284  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  7279 accactc-tttaatactgaaaccac 7302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 10007 - 9772
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  10007 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacgtttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 9908  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9907 cgccgcctccaggataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacctccaaatatggtactaag 9808  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatggta 296  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||    
T  9807 accactc-tataatactgaaaccactttaatatggta 9772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Original strand, 82993 - 83260
Alignment:
Q  5 ttgtttttggaattctaaattgttgtattttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggt 104  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||            ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  82993 ttgtttttggatttctaaactgttgtattttggttttccaaattctgtttt------------ctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggt 83080  T
Q  105 cgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgc 200  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||||      ||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  83081 cgctctctttaagacgtttcgtgacaccacccaaaattatgcaaggcagactatcaaccatgccgcctccaggataaaacaagctcagctgcaactgtgc 83180  T
Q  201 ggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||    
T  83181 ggttaactactgcactgtagaaaacctttcgagaattacaccttcaatatggtactaagatcactctt---atactgaaacca 83260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 65 - 294
Target Start/End: Original strand, 4049 - 4282
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||| |||||    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  4049 tatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgaccaggtcgctctctttaagacatttcgtggcactgcccaaaattgtgcaaggcagactatcaacca 4148  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  4149 cgccgcctccaggataaaacaagcccagctacaactgttcgattaactactgcactgtagaaaatcgttcgagaattacacctccaaatatggtactaag 4248  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccactccaatatgg 294  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  4249 accactc-tttaatactgaaaccactttaatatgg 4282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 118 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 444010 - 443847
Alignment:
Q  118 acgtttcgtgacactg---aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgca 214  Q
    |||||||||| |||||   |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  444010 acgtttcgtggcactgccaaaattgtgcaaggcagactatcaaccacgccgtctc-aggataaaacaagcccagctacaactgtgcggttaacta-tgca 443913  T
Q  215 ctgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaa 280  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  443912 ctatagaaaaccgttcgagaattacaccctcaaatatggtactaagaccactc-tttaatactgaaa 443847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Original strand, 25374 - 25598
Alignment:
Q  65 tatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaacca 160  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||||   |||||||| ||||| ||||||||||    |||||||  ||| | ||||||||||||    
T  25374 tatctatcgaagttgttactaggttgagtcacaattaggtcactctctttaagacgttacgtgacactgcgtaaaattgtgcaagacagactatcaacca 25473  T
Q  161 cgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttc-aatatggtactaag 259  Q
    |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  25474 cgccgcgtccaggataaaacaagcccaactacaactgtgcggttaactactacactgtagaaaaccgttcgagacttacatcttcaaatatggtactaag 25573  T
Q  260 accactcttttaatactgaaaccact 285  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25574 accactc-tttaatattgaaaccact 25598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 150 - 258
Target Start/End: Original strand, 29219 - 29327
Alignment:
Q  150 actatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaata 249  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29219 actatcaaccacgccgtcttcaggataaaataagtctaactataactgtgcggttaactactgcattgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaata 29318  T
Q  250 tggtactaa 258  Q
    || ||||||    
T  29319 tgatactaa 29327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 166254 - 165997
Alignment:
Q  5 ttgtttttggaattctaaattgttgtattttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggt 104  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||            ||| |||| ||| |||||| ||||||||  |||||||    
T  166254 ttgtttttggatttccaaactgttgtattttggttttccaaattctgtttt------------ctaccgaaattgatactaggttgagtcacaaccaggt 166167  T
Q  105 cgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgc 200  Q
    ||  |||||||| |||||||||| |||||    |||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  166166 cgctctctttaagacgtttcgtggcactgccaaaaattgtgcaagacatactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagcccagctgcaactgtgc 166067  T
Q  201 ggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccactctttt 270  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  166066 ggttaattactgcactgtaaaaaaccgttcgagaattacacctttactatggtactaagaccaatctttt 165997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 234
Target Start/End: Original strand, 35617 - 35782
Alignment:
Q  73 gaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcct 168  Q
    |||||||||||||| || ||| | ||||| | ||  |||||||| ||||||||||||||||    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35617 gaagttgttactaggttaagttacgaccatgccgctctctttaagacgtttcgtgacactggccaaaattgtgcaaggcagactatcaaccacgccgcct 35716  T
Q  169 ccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgaga 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35717 ccaggataaaacaagtccagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaatcgttcgaga 35782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 247
Target Start/End: Original strand, 255770 - 255978
Alignment:
Q  43 caaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaatt 138  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| | || |||||||||  || || || |||||||||   |||||||| | |||||||| ||||     |||||    
T  255770 caaattctattgtgaaagagaatatctaccaaatttgttactatgttaagacacgaccaggtcactctctttaagaggtttcgtggcactacccaaaatt 255869  T
Q  139 gtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaatta 238  Q
    ||  ||| |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  255870 gtgcaagacatactatcaactatgccgcctccaggataaaacaagtccagctacaactgtgtggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgaggatta 255969  T
Q  239 caccttcaa 247  Q
    |||| ||||    
T  255970 caccctcaa 255978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 143 - 255
Target Start/End: Original strand, 1197 - 1309
Alignment:
Q  143 aaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacc 242  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  1197 aaggcggactataaaccacgctgcctccaggcaaaaacaagttcagctacgactgtgcggttaactactgcactatagaaaatcgttcgagatttacacc 1296  T
Q  243 ttcaatatggtac 255  Q
    |||||||||||||    
T  1297 ttcaatatggtac 1309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2020 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold2020
Description:

Target: scaffold2020; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 435 - 561
Alignment:
Q  150 actatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcg------gttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacct 243  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  435 actatcaaccacgtcgcctccaggataaaacaagctcagctacaactgtgcgcgcgcggttaactactgcactgtagaaaaccgtttgagatttacaccc 534  T
Q  244 tc-aatatggtactaagaccactcttt 269  Q
    || |||| |||||||||||||||||||    
T  535 tcaaatacggtactaagaccactcttt 561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 165060 - 164934
Alignment:
Q  150 actatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcg------gttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacct 243  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  165060 actatcaaccacgtcgcctccaggataaaacaagctcagctacaactgtgcgcgcgcggttaactactgcactgtagaaaaccgtttgagatttacaccc 164961  T
Q  244 tc-aatatggtactaagaccactcttt 269  Q
    || |||| |||||||||||||||||||    
T  164960 tcaaatacggtactaagaccactcttt 164934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0128
Description:

Target: scaffold0128; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 265
Target Start/End: Original strand, 13292 - 13451
Alignment:
Q  110 tctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggtta 205  Q
    ||||||| |||||| |||||||||    |||||||  ||||  |||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13292 tctttaagacgtttggtgacactgcccaaaattgttcaaggtagactatcaaccatggtgcctccaagatacaacaagttcaactacaactgtgcggtta 13391  T
Q  206 actactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaatatggtactaagaccact 265  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13392 actacttcactgtagaaaatggttcgcaatttacacctctaatatggtactaagaccact 13451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 242
Target Start/End: Original strand, 2288 - 2464
Alignment:
Q  69 tatcgaagttgttactagattgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacactg----aaattgtataaggccgactatcaaccacgcc 164  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||| || ||    |||||||  ||| | || |||||||||||||    
T  2288 tatcgaagttgttattaggttgagtcatgatcaggtcgttctctttaatacgttttgtgccattgtttaaaattgtgcaagacaga-tatcaaccacgcc 2386  T
Q  165 gcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacc 242  Q
    ||||| || |||||||||  |||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||    
T  2387 gcctctagtataaaacaaactcaggtacaactgtgagattaactactgcaccgtagaaaattgttggagaattacacc 2464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 101
Target Start/End: Original strand, 15199 - 15295
Alignment:
Q  5 ttgtttttggaattctaaattgttgtattttggtttttcaaattctattttaaaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagacca 101  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15199 ttgtttttggatttacaaactgttgtattttggttttccaaattctattttttaagaaaatatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgacca 15295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 155544 - 155486
Alignment:
Q  155 caaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgc 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  155544 caaccacgccgcctctaggataaaacaagttcagctacaactgtgcgattaactactgc 155486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 101
Target Start/End: Original strand, 3906 - 4002
Alignment:
Q  5 ttgtttttggaattctaaattgttgtattttggtttttcaaattctatttta-aaagagaatatctatcgaagttgttactagattgagtcaagacca 101  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3906 ttgtttttggattttaaaattgtcgtattt-gaattttcaaattctatttttgaaaaagaatatctaccgaagttgttactaggttgagtcacgacca 4002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 269
Target Start/End: Original strand, 4092 - 4157
Alignment:
Q  205 aactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacc-ttcaatatggtactaagaccactcttt 269  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  4092 aactactgcattgtagaaaaccattcgagatttatacccttaaatatggtactaagaccactcttt 4157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 183
Target Start/End: Original strand, 4058 - 4088
Alignment:
Q  153 atcaaccacgccgcctccaggataaaacaag 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4058 atcaaccacgccgcctccaggataaaacaag 4088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 242
Target Start/End: Original strand, 8953 - 9046
Alignment:
Q  149 gactatcaaccacgccgcctccaggataaaacaagttcagctacaactgtgcggttaactactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacacc 242  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||  ||||  |||| |||| |||||||||||| |||| |||| | ||| |||||||||||    
T  8953 gactatcaatcacgtcgccttcaggataaaacaagtctagctgtaactatgcgattaactactgcattgtacaaaatcattcaagaattacacc 9046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 2868 - 2772
Alignment:
Q  88 ttgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacact---gaaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaaca 181  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    || ||||  ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  2868 ttgagtcacgaccaggtcgcgctctttaagacgtttcgtgacactacccaagttgtgcaaggtagactaacaaccacgccgtctccaggataaaaca 2772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 10828 - 10732
Alignment:
Q  88 ttgagtcaagaccaggtcgtcctctttaatacgtttcgtgacact---gaaattgtataaggccgactatcaaccacgccgcctccaggataaaaca 181  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    || ||||  ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10828 ttgagtcacgaccaggtcgcgctctttaagacgtttcgtgacactacccaagttgtgcaaggtagactaacaaccacgccgtctccaggataaaaca 10732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 268
Target Start/End: Original strand, 5410 - 5473
Alignment:
Q  206 actactgcactgtagaaaaccgttcgagaattacaccttcaa-tatggtactaagaccactctt 268  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  5410 actattgcaccgtagaaaactgtttgagatttacaccctcaaatatggtactaagaccactctt 5473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 283
Target Start/End: Original strand, 45944 - 45980
Alignment:
Q  246 aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45944 aatatggtactaagaccactc-tttaatactgaaacca 45980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 47792 - 47756
Alignment:
Q  246 aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47792 aatatggtactaagaccactc-tttaatactgaaacca 47756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 52835 - 52799
Alignment:
Q  246 aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52835 aatatggtactaagaccactc-tttaatactgaaacca 52799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1161 - 1125
Alignment:
Q  246 aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1161 aatatggtactaagaccactc-tttaatactgaaacca 1125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 152843 - 152807
Alignment:
Q  246 aatatggtactaagaccactcttttaatactgaaacca 283  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  152843 aatatggtactaagaccactc-tttaatactgaaacca 152807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University