View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11921_high_14 (Length: 390)

Name: NF11921_high_14
Description: NF11921
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11921_high_14
NF11921_high_14
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (17-228)||(21732233-21732444)
chr7 (227-375)||(538755-538902)
chr7 (227-375)||(12567081-12567229)
chr7 (227-375)||(12548805-12548952)
chr7 (227-375)||(4312625-4312772)
chr7 (227-371)||(23515135-23515278)
chr7 (227-375)||(9582961-9583108)
chr7 (227-375)||(13657934-13658081)
chr7 (227-373)||(9004019-9004165)
chr7 (227-375)||(8717933-8718080)
chr7 (227-375)||(14551167-14551314)
chr7 (227-375)||(16119849-16119996)
chr7 (227-374)||(48801777-48801923)
chr7 (227-375)||(20108436-20108584)
chr7 (227-375)||(8780936-8781085)
chr7 (227-375)||(16532162-16532311)
chr7 (227-375)||(16633351-16633500)
chr7 (227-375)||(13673924-13674071)
chr7 (227-375)||(9264939-9265087)
chr7 (228-375)||(11921307-11921450)
chr7 (227-375)||(18593352-18593499)
chr7 (227-375)||(18618185-18618332)
chr7 (318-375)||(825782-825839)
chr7 (318-375)||(4461242-4461299)
chr7 (318-375)||(14221718-14221775)
chr7 (318-375)||(15916776-15916833)
chr7 (318-375)||(18287760-18287817)
chr7 (318-375)||(27291495-27291552)
chr7 (319-375)||(16465616-16465672)
chr7 (326-375)||(15065935-15065984)
chr7 (319-375)||(5397275-5397331)
chr7 (319-375)||(15206584-15206640)
chr7 (322-375)||(9194544-9194597)
chr7 (319-371)||(6713072-6713124)
chr7 (277-374)||(4791383-4791479)
chr7 (319-374)||(15348532-15348587)
chr7 (319-359)||(15522517-15522557)
chr7 (332-374)||(15940731-15940773)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (227-375)||(21843524-21843672)
chr8 (229-375)||(21098794-21098939)
chr8 (229-375)||(21104115-21104260)
chr8 (227-375)||(16418620-16418769)
chr8 (227-375)||(21939996-21940145)
chr8 (227-375)||(17620814-17620961)
chr8 (263-375)||(20712537-20712649)
chr8 (227-375)||(21538615-21538765)
chr8 (227-375)||(21382161-21382309)
chr8 (227-375)||(20038981-20039128)
chr8 (227-375)||(24034081-24034230)
chr8 (227-375)||(23911508-23911655)
chr8 (227-375)||(8314535-8314683)
chr8 (227-375)||(8322846-8322994)
chr8 (235-364)||(14352181-14352310)
chr8 (227-375)||(23455005-23455154)
chr8 (318-375)||(11346953-11347010)
chr8 (318-375)||(19767683-19767740)
chr8 (318-375)||(22370101-22370158)
chr8 (324-375)||(20002279-20002330)
chr8 (318-375)||(22033555-22033612)
chr8 (318-375)||(22099655-22099712)
chr8 (318-375)||(22102551-22102608)
chr8 (324-375)||(21831181-21831232)
chr8 (324-375)||(22817755-22817806)
chr8 (326-374)||(18572977-18573025)
chr8 (332-374)||(19902174-19902216)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (227-375)||(23600636-23600784)
chr5 (227-375)||(24219813-24219961)
chr5 (227-371)||(20444843-20444987)
chr5 (227-375)||(15735602-15735749)
chr5 (227-375)||(20595831-20595978)
chr5 (227-375)||(20602117-20602264)
chr5 (227-375)||(20608408-20608555)
chr5 (227-375)||(23748119-23748266)
chr5 (252-375)||(24940627-24940749)
chr5 (227-357)||(20622230-20622359)
chr5 (227-375)||(21387457-21387605)
chr5 (227-350)||(23710701-23710824)
chr5 (227-375)||(18072968-18073115)
chr5 (227-375)||(24953174-24953321)
chr5 (227-375)||(20790714-20790861)
chr5 (318-375)||(22317513-22317570)
chr5 (318-375)||(25006808-25006865)
chr5 (318-375)||(30759655-30759712)
chr5 (227-375)||(20916456-20916603)
chr5 (325-375)||(25116171-25116221)
chr5 (318-375)||(26847802-26847859)
chr5 (319-375)||(18484212-18484268)
chr5 (227-338)||(20575570-20575680)
chr5 (318-371)||(22855722-22855775)
chr5 (330-375)||(25175261-25175306)
chr5 (227-336)||(22948579-22948688)
chr5 (330-374)||(27270563-27270607)
chr5 (326-374)||(17412736-17412784)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (227-375)||(5500265-5500413)
chr2 (227-375)||(25144757-25144905)
chr2 (227-375)||(23644011-23644160)
chr2 (227-375)||(22665130-22665277)
chr2 (227-375)||(23798922-23799069)
chr2 (229-375)||(25804267-25804412)
chr2 (227-375)||(117611-117758)
chr2 (227-375)||(22044660-22044807)
chr2 (227-375)||(25357579-25357726)
chr2 (227-375)||(24178193-24178341)
chr2 (227-375)||(11615-11762)
chr2 (227-375)||(16775719-16775866)
chr2 (227-375)||(17590475-17590622)
chr2 (227-370)||(25370890-25371032)
chr2 (227-375)||(24795285-24795432)
chr2 (252-375)||(27627674-27627796)
chr2 (318-375)||(23159385-23159442)
chr2 (318-375)||(23570642-23570699)
chr2 (318-375)||(27631654-27631711)
chr2 (318-375)||(27768816-27768873)
chr2 (324-375)||(24171510-24171561)
chr2 (285-375)||(24506776-24506865)
chr2 (264-371)||(24321272-24321380)
chr2 (319-375)||(23257570-23257625)
chr2 (322-375)||(25337651-25337704)
chr2 (329-374)||(29955868-29955913)
chr2 (330-374)||(19805618-19805662)
chr2 (326-374)||(21512567-21512615)
chr2 (319-374)||(24019068-24019123)
chr2 (332-374)||(17334606-17334648)
chr2 (227-296)||(24502229-24502299)
chr2 (319-356)||(23648128-23648165)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (227-375)||(18448201-18448349)
chr6 (227-375)||(2181121-2181269)
chr6 (227-375)||(23023154-23023302)
chr6 (227-375)||(18854079-18854226)
chr6 (227-375)||(25625752-25625899)
chr6 (227-375)||(21560554-21560701)
chr6 (227-375)||(15699623-15699770)
chr6 (227-375)||(22165549-22165696)
chr6 (227-375)||(22243880-22244027)
chr6 (235-375)||(29595765-29595904)
chr6 (227-375)||(22061503-22061650)
chr6 (227-371)||(20107784-20107928)
chr6 (227-375)||(25631269-25631416)
chr6 (227-375)||(25963309-25963457)
chr6 (227-375)||(25967956-25968104)
chr6 (227-375)||(30671807-30671955)
chr6 (227-375)||(20170310-20170458)
chr6 (227-375)||(22767116-22767263)
chr6 (227-375)||(24855245-24855392)
chr6 (297-375)||(18184874-18184951)
chr6 (319-375)||(35270972-35271028)
chr6 (228-346)||(19585571-19585688)
chr6 (318-375)||(11204003-11204060)
chr6 (319-375)||(18731875-18731931)
chr6 (319-375)||(20218981-20219037)
chr6 (319-375)||(22113006-22113062)
chr6 (319-371)||(23517835-23517887)
chr6 (319-375)||(29686601-29686657)
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (227-375)||(10630818-10630965)
chr4 (227-375)||(3354707-3354855)
chr4 (229-375)||(18292007-18292153)
chr4 (227-375)||(17484910-17485058)
chr4 (227-375)||(18081459-18081608)
chr4 (227-375)||(56580539-56580688)
chr4 (227-375)||(42709731-42709878)
chr4 (227-375)||(45234232-45234380)
chr4 (227-375)||(38426805-38426938)
chr4 (227-375)||(11496614-11496761)
chr4 (227-375)||(13822981-13823128)
chr4 (227-375)||(15254416-15254563)
chr4 (319-375)||(14653998-14654054)
chr4 (319-373)||(15865647-15865701)
chr4 (318-375)||(10650546-10650603)
chr4 (318-375)||(15260109-15260166)
chr4 (318-375)||(16682912-16682969)
chr4 (324-375)||(15409534-15409585)
chr4 (227-375)||(8092427-8092576)
chr4 (319-375)||(9488878-9488934)
chr4 (326-374)||(17296250-17296298)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (227-375)||(164403-164551)
scaffold0011 (319-374)||(172261-172316)
scaffold0011 (319-375)||(162002-162058)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (227-375)||(11117-11264)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (227-375)||(121014-121162)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (227-375)||(251870-252018)
[»] scaffold0825 (1 HSPs)
scaffold0825 (227-375)||(2852-3000)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (227-375)||(281-428)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (256-375)||(10206-10325)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (227-375)||(14662-14809)
[»] chr3 (48 HSPs)
chr3 (229-375)||(16448760-16448905)
chr3 (227-375)||(13504881-13505028)
chr3 (227-374)||(3245589-3245735)
chr3 (227-375)||(13001425-13001574)
chr3 (227-375)||(11947475-11947622)
chr3 (229-375)||(9360971-9361116)
chr3 (227-375)||(4382812-4382961)
chr3 (227-375)||(13097772-13097919)
chr3 (227-375)||(10546936-10547085)
chr3 (227-375)||(10602472-10602619)
chr3 (227-375)||(13690669-13690816)
chr3 (227-375)||(17387897-17388045)
chr3 (227-375)||(22637760-22637908)
chr3 (227-375)||(14348588-14348736)
chr3 (227-375)||(1992864-1993011)
chr3 (227-375)||(2721365-2721511)
chr3 (227-375)||(7600423-7600570)
chr3 (230-375)||(20156515-20156658)
chr3 (262-375)||(12160207-12160320)
chr3 (227-375)||(15556942-15557089)
chr3 (230-367)||(17045766-17045902)
chr3 (230-367)||(17047926-17048062)
chr3 (227-375)||(3279251-3279399)
chr3 (227-375)||(12187076-12187223)
chr3 (227-375)||(16373565-16373712)
chr3 (227-375)||(37942446-37942593)
chr3 (227-375)||(11398276-11398424)
chr3 (227-374)||(12193491-12193637)
chr3 (227-375)||(15645069-15645216)
chr3 (319-375)||(27356728-27356784)
chr3 (318-375)||(3339226-3339283)
chr3 (227-375)||(10147079-10147226)
chr3 (318-375)||(12776534-12776591)
chr3 (318-375)||(13136210-13136267)
chr3 (318-375)||(20584261-20584318)
chr3 (319-375)||(10160173-10160229)
chr3 (227-374)||(13187418-13187564)
chr3 (319-375)||(13601221-13601277)
chr3 (324-375)||(15946773-15946824)
chr3 (227-371)||(6814936-6815079)
chr3 (318-375)||(15619283-15619340)
chr3 (319-375)||(14445768-14445824)
chr3 (230-375)||(20225754-20225898)
chr3 (318-375)||(13195458-13195515)
chr3 (320-375)||(8686387-8686442)
chr3 (324-375)||(13068306-13068357)
chr3 (344-375)||(2005499-2005530)
chr3 (319-375)||(16703307-16703363)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (227-375)||(2287-2435)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (227-375)||(15746-15893)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (227-375)||(52938621-52938769)
chr1 (227-371)||(8653184-8653327)
chr1 (227-375)||(19364097-19364244)
chr1 (227-375)||(27046942-27047089)
chr1 (227-375)||(3990005-3990154)
chr1 (227-375)||(20237524-20237671)
chr1 (227-375)||(17094601-17094748)
chr1 (227-375)||(21798662-21798810)
chr1 (60-123)||(21417459-21417522)
chr1 (230-371)||(19875648-19875792)
chr1 (319-375)||(14070664-14070720)
chr1 (319-375)||(21784472-21784528)
chr1 (319-372)||(16382578-16382631)
chr1 (319-375)||(4027839-4027895)
chr1 (319-375)||(8947515-8947571)
chr1 (332-374)||(18478234-18478276)
[»] scaffold0582 (1 HSPs)
scaffold0582 (227-375)||(8720-8869)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (227-375)||(892-1041)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (227-375)||(123437-123584)
scaffold0029 (332-374)||(77391-77433)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (273-375)||(38508-38610)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (227-375)||(58628-58777)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (227-375)||(97726-97875)
[»] scaffold0974 (1 HSPs)
scaffold0974 (227-375)||(1169-1318)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (227-375)||(8002-8149)
[»] scaffold0773 (1 HSPs)
scaffold0773 (227-375)||(540-687)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (227-375)||(510-657)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (227-375)||(615-762)
[»] scaffold0404 (2 HSPs)
scaffold0404 (227-375)||(1106-1253)
scaffold0404 (321-375)||(3470-3524)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (227-373)||(12464-12609)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (227-373)||(232789-232934)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (227-375)||(35104-35243)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (235-375)||(13002-13141)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (230-371)||(37782-37922)
[»] scaffold0566 (1 HSPs)
scaffold0566 (318-375)||(2761-2818)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (319-375)||(914-970)
[»] scaffold0512 (1 HSPs)
scaffold0512 (319-375)||(5239-5295)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (319-375)||(42244-42300)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (319-375)||(50506-50562)
scaffold0035 (332-374)||(88361-88403)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (324-375)||(12743-12794)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (318-375)||(10719-10776)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (318-375)||(54849-54906)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (319-371)||(22159-22211)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (319-374)||(1193-1248)
[»] scaffold1225 (1 HSPs)
scaffold1225 (322-375)||(1849-1902)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (319-375)||(37743-37799)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (331-375)||(22774-22818)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (318-375)||(18205-18263)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (325-375)||(72572-72622)
scaffold0037 (325-375)||(84762-84812)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (319-375)||(45228-45284)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (319-359)||(83174-83214)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (332-372)||(3251-3291)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 21732233 - 21732444
Alignment:
Q  17 attccattaaaagcatccatttgaagaatatcatattcaatagttaaaacaatatctcatgaatattcaaaacaaataatggttttagatgatttaaaac 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21732233 attccattaaaagcatccatttgaagaatatcatattcaatagttaaaccaatatctcatgaatattcaaaacaaataatggttttagatgatttaaaac 21732332  T
Q  117 caaatcataaactcttttggaatgtagaatgacgtttctctaattcacatgtatcactcttttgatatctactaaacagacatgtatcacttttctaatt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21732333 caaatcaaaaactcttttggaatgtaaaatcacgtttctctaattcacatgtatcaatcttttgatatctactaaacagacatgtatcaattttctaatt 21732432  T
Q  217 cctaaattctag 228  Q
    ||||| ||||||    
T  21732433 cctaacttctag 21732444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 538902 - 538755
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  538902 agtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaaacccttcaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgt-ttatgctaccatgtttat 538804  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  538803 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 538755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 12567081 - 12567229
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  12567081 agtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgaggagacatgagttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgttctaccatgtttat 12567180  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12567181 gcattttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtgtgggggagtttgatg 12567229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12548952 - 12548805
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  12548952 agtttgtgattagtggacgcttgaaattgaagcccttgaggagacatgtattt-aattaaattgtcatatgataatattattttgtgctaccatgtttat 12548854  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12548853 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgttggggagtttgatg 12548805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 4312625 - 4312772
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||    
T  4312625 agtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgaggagacataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgt-ttatgctactatgtttat 4312723  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4312724 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 4312772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 227 - 371
Target Start/End: Original strand, 23515135 - 23515278
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||||| |||||||| |||||||||    
T  23515135 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataattgt-ttgtgctaccatgtttat 23515233  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23515234 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 23515278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 9582961 - 9583108
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||  ||||||||    
T  9582961 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttat 9583059  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9583060 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 9583108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 13657934 - 13658081
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||| |||| ||  |||| |||||| ||    
T  13657934 agtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttgaggagatatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgt-ttacgctaccatgttgat 13658032  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13658033 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13658081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 227 - 373
Target Start/End: Original strand, 9004019 - 9004165
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||  ||||||||    
T  9004019 agtttgtaattagtgtatgcttgaaataaaagcctttgaggagacataagttttaattgaattgtcatatgataaacttgttttatgctactatgtttat 9004118  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 373  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9004119 gccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtgtgggggagtttga 9004165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 8717933 - 8718080
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | | | | ||||||  ||||||||    
T  8717933 agtttgtgattagtgtacacttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactat-tggtgctactatgtttat 8718031  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8718032 gcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 8718080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 14551167 - 14551314
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||  |  || ||||||||  ||||||||    
T  14551167 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggggacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgt-ttgtgctactatgtttat 14551265  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14551266 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14551314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16119996 - 16119849
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| ||||||||  |||| |||    
T  16119996 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-ttgtgctactatgtatat 16119898  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16119897 gtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 16119849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 227 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 48801923 - 48801777
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |  |||||  |||| |||    
T  48801923 agtttgtgattagtgtacgtttgaaattaaagcctttgaggagacatgagttttgattgaattgtcatat-ataatcttgtttattgctactatgtgtat 48801825  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48801824 gccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgat 48801777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 20108436 - 20108584
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||  |||| || |||||  ||||||||    
T  20108436 agtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttgaggagacatcagttttaattgaattctcatatgataaccttgttttatgctactatgtttat 20108535  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20108536 gtcttttgcttgaggacaataaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 20108584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8781085 - 8780936
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacat--gtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttt 324  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||  || |||||||| |||||||||||| |||| |||| || ||||   ||||||    
T  8781085 agtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagcctttgaggagacataagttttttaattgaattgtcatatgttaatcttgt-ttatgctgctatgttt 8780987  T
Q  325 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8780986 atgccttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 8780936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 16532162 - 16532311
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| || | || ||||| ||||||||    
T  16532162 agtttgtgattagtgtactctttgaaataaatgcctttgaggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgaaaatgttattttatgctaccatgttta 16532261  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16532262 tgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 16532311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16633500 - 16633351
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| || | || ||||| ||||||||    
T  16633500 agtttgtgattagtgtactctttgaaataaatgcctttgaggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgaaaatgttattttatgctaccatgttta 16633401  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16633400 tgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 16633351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 13673924 - 13674071
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   | ||| |  |||||  | ||||||    
T  13673924 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgt-tgatgctactacgtttat 13674022  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13674023 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 13674071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9265087 - 9264939
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgtttta-attaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||||   |||||||    
T  9265087 agtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagtctttgaggagacataagttttttattgaattgtcatatgttaatcttg-cttatgctgctatgttta 9264989  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9264988 tgccttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 9264939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 228 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11921450 - 11921307
Alignment:
Q  228 gtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||||| ||| ||| || |     |||| |||||||||    
T  11921450 gtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgaggagacgtgtgctttaatgtaattgtcatgtgaaaatgttat-----gctaccatgtttat 11921356  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11921355 gacttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 11921307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18593499 - 18593352
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||| ||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||   | ||| |  |||||  ||||||||    
T  18593499 agtttgtaattagtgtacattttggatttaagcccttgaggagacatgtactttaatttaattgtcatttgatttaactgt-tgatgctactatgtttat 18593401  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18593400 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 18593352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 18618185 - 18618332
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||| ||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||   | ||| |  |||||  ||||||||    
T  18618185 agtttgtaattagtgtacattttggatttaagcccttgaggagacatgtactttaatttaattgtcatttgatttaactgt-tgatgctactatgtttat 18618283  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18618284 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 18618332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Original strand, 825782 - 825839
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  825782 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 825839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4461299 - 4461242
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4461299 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 4461242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14221775 - 14221718
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14221775 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14221718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15916833 - 15916776
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15916833 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15916776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Original strand, 18287760 - 18287817
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18287760 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 18287817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Original strand, 27291495 - 27291552
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27291495 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27291552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16465672 - 16465616
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16465672 atgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 16465616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 326 - 375
Target Start/End: Original strand, 15065935 - 15065984
Alignment:
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15065935 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15065984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Original strand, 5397275 - 5397331
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5397275 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtaggggagtttgatg 5397331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15206640 - 15206584
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15206640 atgtctatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15206584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9194597 - 9194544
Alignment:
Q  322 tttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9194597 tttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatgggggagtttgatg 9194544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 319 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 6713124 - 6713072
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6713124 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtataggggagttt 6713072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 277 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4791479 - 4791383
Alignment:
Q  277 ttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 374  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || |  | ||||  ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4791479 ttttaattgaattgtcatatgttaatctttttat-tgctgccatgtctatgcattctgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgat 4791383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 374
Target Start/End: Original strand, 15348532 - 15348587
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 374  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15348532 atgtttatgccttttacttgaggacaaacaaagattcaagtttggggaagtttgat 15348587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 319 - 359
Target Start/End: Original strand, 15522517 - 15522557
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 359  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15522517 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagt 15522557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 374
Target Start/End: Original strand, 15940731 - 15940773
Alignment:
Q  332 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 374  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  15940731 ttgcttgaggacaagcaacggttcaagtgtaggggagtttgat 15940773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21843672 - 21843524
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21843672 agtttgtgattactgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttat 21843573  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21843572 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 21843524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 229 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21098939 - 21098794
Alignment:
Q  229 tttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttatgc 328  Q
    ||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21098939 tttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgt-ttgtgctaccatgtttatgc 21098841  T
Q  329 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21098840 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 21098794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 229 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21104260 - 21104115
Alignment:
Q  229 tttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttatgc 328  Q
    ||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21104260 tttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgt-ttgtgctaccatgtttatgc 21104162  T
Q  329 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21104161 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 21104115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16418769 - 16418620
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||    
T  16418769 agtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgttttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgttta 16418670  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16418669 tgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 16418620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21940145 - 21939996
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||    
T  21940145 agtttgtgattagtgtactctttgaaatgaaagcctttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgttta 21940046  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940045 tgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 21939996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 17620814 - 17620961
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||| |||||||||    
T  17620814 agtttatgattagggtacacttgaaattaaagcctttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgt-ttatgctaccatgtttat 17620912  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17620913 gccttttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtgtgggggagtttgatg 17620961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 263 - 375
Target Start/End: Original strand, 20712537 - 20712649
Alignment:
Q  263 tgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 362  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  20712537 tgaggagacatgtgctttgattaaattgtcatatgataatgttgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagatttaagtgta 20712636  T
Q  363 ggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||    
T  20712637 ggggagtttgatg 20712649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 21538615 - 21538765
Alignment:
Q  227 agtttgtgatta--gtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttt 324  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||    
T  21538615 agtttgtgattatagtgtacgattgaaattaaagtctttgaggagacataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgttttatgctaccatgttt 21538714  T
Q  325 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  21538715 atgccttttgcttgaggacaagcaaaaatttaagtgtgggggattttgatg 21538765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 21382161 - 21382309
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  | ||| | ||||||  |||||||    
T  21382161 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgt-tagtgctactatgttta 21382259  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21382260 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 21382309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20039128 - 20038981
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||| | ||| ||||| |||||| |||| || |||| || ||||| |||||||||    
T  20039128 agtttgtgattattgtacatttgaaattaaagcctttgaagagacatgtatcttagttaaaatgtcatgtgatgatcttgt-ttatgctaccatgtttat 20039030  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20039029 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 20038981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 24034081 - 24034230
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgtttt-aattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||  |||| | || |  |||||  |||||||    
T  24034081 agtttgtgatcagtgtacgcttgaaattaaagcctttgaggagacataagttttcaattgaattgtcatatattaatctcgtttattgctactatgttta 24034180  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24034181 tgccttttgcttgtggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24034230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 23911508 - 23911655
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||  | | | | ||||||  ||||||||    
T  23911508 agtttgtgattagtgtacatctgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgatataactat-tggtgctactatgtttat 23911606  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23911607 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 23911655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 8314535 - 8314683
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaa-ttaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||   | ||| |  |||||  |||||||    
T  8314535 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaaatttaattgtcatttgatttaaatgt-tgatgctactatgttta 8314633  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8314634 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 8314683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8322994 - 8322846
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    ||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||   | ||||   |||||  |||||||    
T  8322994 agtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattaatttgtcatttgatttaactgtcga-tgctactatgttta 8322896  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  8322895 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgagggagtttgatg 8322846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 235 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14352310 - 14352181
Alignment:
Q  235 attagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaatta-aattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttatgcctttt 333  Q
    |||||||||||||||||||  |||||   ||||||||||| |||||||||  ||||||||||| || || |||| || ||||| |||||||||| |||||    
T  14352310 attagtgtacgcttgaaataaaagcctcggaggagacatgagttttaattttaattgtcatataattatcttgt-ttatgctaccatgtttatgtctttt 14352212  T
Q  334 gcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14352211 gcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 14352181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 23455005 - 23455154
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgtttt-aattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||   |||| |||| ||||||||||||  | | |||| || |||||  |||||||    
T  23455005 agtttgtgattagtgtatgcttgaaatgaaagcctttgaggagacataaattttcaattgaattgtcatatgtgagtcttgt-ttatgctactatgttta 23455103  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgt-gggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23455104 tgccttttgctcgaggacaagcaaagattcaagtgtggggggagtttgatg 23455154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11347010 - 11346953
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11347010 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 11346953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Original strand, 19767683 - 19767740
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19767683 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 19767740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Original strand, 22370101 - 22370158
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22370101 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22370158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 324 - 375
Target Start/End: Original strand, 20002279 - 20002330
Alignment:
Q  324 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20002279 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 20002330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22033612 - 22033555
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22033612 catgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22033555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22099712 - 22099655
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22099712 catgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22099655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Original strand, 22102551 - 22102608
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22102551 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtaggggagtttgatg 22102608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 324 - 375
Target Start/End: Original strand, 21831181 - 21831232
Alignment:
Q  324 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21831181 tatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 21831232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 375
Target Start/End: Original strand, 22817755 - 22817806
Alignment:
Q  324 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22817755 tatgtcttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22817806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18573025 - 18572977
Alignment:
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 374  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18573025 tgccttttgcttaaggacaagaaaaaattcaagtatgggggagtttgat 18572977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19902216 - 19902174
Alignment:
Q  332 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 374  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  19902216 ttgcttgaggacaagcaacggttcaagtgtaggggagtttgat 19902174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23600784 - 23600636
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23600784 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttctaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttat 23600685  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23600684 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggaatttgatg 23600636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 24219813 - 24219961
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24219813 agtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttat 24219912  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24219913 gccttttgcttgaggacaagcaaagactcaagtgtgggggagtttgatg 24219961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 227 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20444987 - 20444843
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||    
T  20444987 agtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattattttgtgctaccatatttat 20444888  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 371  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20444887 gccttttgcttgaggacaatcaaagattcaagtgtgggggagttt 20444843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 15735602 - 15735749
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||  ||||||||    
T  15735602 agtttgtgattagtgtacacttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttat 15735700  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735701 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15735749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20595978 - 20595831
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  |  || ||||||||  ||||||||    
T  20595978 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgt-ttgtgctactatgtttat 20595880  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20595879 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 20595831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20602264 - 20602117
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  |  || ||||||||  ||||||||    
T  20602264 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgt-ttgtgctactatgtttat 20602166  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20602165 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 20602117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20608555 - 20608408
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  |  || ||||||||  ||||||||    
T  20608555 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgt-ttgtgctactatgtttat 20608457  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20608456 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 20608408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 23748119 - 23748266
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||   | ||| |  |||||  ||||||||    
T  23748119 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgt-tgatgctactatgtttat 23748217  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23748218 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 23748266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 252 - 375
Target Start/End: Original strand, 24940627 - 24940749
Alignment:
Q  252 atttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaag 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   | ||| |  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24940627 atttaagcccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgt-tgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaag 24940725  T
Q  352 attcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  24940726 attcaagtatgggggagtttgatg 24940749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 227 - 357
Target Start/End: Original strand, 20622230 - 20622359
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   ||||| |  |||||  ||||||||    
T  20622230 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaattgt-tgatgctactatgtttat 20622328  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622329 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 20622359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 21387457 - 21387605
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgtttt-aattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||| || | |||| | |||||   |||||||    
T  21387457 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatgaaagtctttgaggagacataagttttcaattgaattgtcatatgttagtcttgtgt-gtgctgctatgttta 21387555  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21387556 tgcatttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 21387605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23710824 - 23710701
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||  | ||| | ||||||  |||||||    
T  23710824 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgt-tagtgctactatgttta 23710726  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaa 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23710725 tgccttttgcttgaggacaagcaaa 23710701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 18072968 - 18073115
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    ||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||   | | | |  |||||  |||||||    
T  18072968 agtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattga-ttgtcatttgatttaactat-tgatgctactatgttta 18073065  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18073066 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 18073115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24953321 - 24953174
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    ||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||   | | | |  |||||  |||||||    
T  24953321 agtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattaa-ttgtcatttgatttaactat-tgatgctactatgttta 24953224  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24953223 taccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 24953174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20790861 - 20790714
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    ||||||||||||||||||  || |  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||   | | | |  |||||  |||||||    
T  20790861 agtttgtgattagtgtacattttgggattaaagcccttgaggagacatgtgctttaattaact-gtcatttgatttaactat-tgatgctactatgttta 20790764  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20790763 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 20790714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22317570 - 22317513
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22317570 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22317513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25006865 - 25006808
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25006865 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25006808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30759712 - 30759655
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759712 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 30759655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20916603 - 20916456
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| |||| || | || |||    |||| |||    
T  20916603 agttcgtgattagtgtacggttgaaataaaagcctttgaggagacatgagttttgatttaattgtcctatg-taatcttattttatgcagctatgtctat 20916505  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  20916504 gccttttgcttgaggacaaccaaaaattcatgtgtaggggagtttgatg 20916456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 325 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25116221 - 25116171
Alignment:
Q  325 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25116221 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25116171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Original strand, 26847802 - 26847859
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26847802 catgtctatgccttttggttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 26847859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18484268 - 18484212
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18484268 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgttggggagtttgatg 18484212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 338
Target Start/End: Original strand, 20575570 - 20575680
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| |||| |||| || ||||   |||| |||    
T  20575570 agtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgaggagacatgagttttgattgaattgccatatg-taatcttgttttatgctgctatgtctat 20575668  T
Q  327 gccttttgcttg 338  Q
    ||||||||||||    
T  20575669 gccttttgcttg 20575680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 318 - 371
Target Start/End: Original strand, 22855722 - 22855775
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 371  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22855722 catgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 22855775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25175306 - 25175261
Alignment:
Q  330 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175306 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25175261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 336
Target Start/End: Original strand, 22948579 - 22948688
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtg-ttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||  | |||||||| |||||||||||| ||||  ||| || ||||  ||||||||    
T  22948579 agtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcctttgagaaaacataagtttttaattgaattgtcatatgttaatcgtgt-ttatgctgccatgttta 22948677  T
Q  326 tgccttttgct 336  Q
    |||||||||||    
T  22948678 tgccttttgct 22948688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 374
Target Start/End: Original strand, 27270563 - 27270607
Alignment:
Q  330 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27270563 ttttgcttgaggacaagcaatgattcaagtgtgggggagtttgat 27270607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 374
Target Start/End: Original strand, 17412736 - 17412784
Alignment:
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 374  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17412736 tgccttttgcttgacgacaaacaatgattcaagtatgggggagtttgat 17412784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5500413 - 5500265
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  5500413 agtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttat 5500314  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5500313 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 5500265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25144905 - 25144757
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  25144905 agtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttat 25144806  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25144805 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25144757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 23644011 - 23644160
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgc-ttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||    
T  23644011 agtttgtgattagtgtactccttgaaataaaagcctttgaggagacacgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgttta 23644110  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23644111 tgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23644160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 22665130 - 22665277
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||  ||||||||    
T  22665130 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttat 22665228  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22665229 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22665277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23799069 - 23798922
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| |||| || |||||  ||||||||    
T  23799069 agtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgaggagacatgagttttgattgaattgtcatatg-taatcttgttttatgctactatgtttat 23798971  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23798970 gccttttgcttgaggataatcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23798922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 229 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25804412 - 25804267
Alignment:
Q  229 tttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttatgc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||   ||||||||||    
T  25804412 tttgtgattagtgtacgcttgaattaaaagcctttgaggatacataagttttaattgaattgtcatatgttaatcttgt-ttgtgctgctatgtttatgc 25804314  T
Q  329 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804313 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25804267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 117611 - 117758
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||| ||| ||||  | ||||||    
T  117611 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgt-ttgagctactacgtttat 117709  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  117710 gccttttgcttgaggacaagcaaatatgcaagtgtgggggagtttgatg 117758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22044807 - 22044660
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   | ||| |  |||||  ||||||||    
T  22044807 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgt-tgatgctactatgtttat 22044709  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22044708 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 22044660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 25357579 - 25357726
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   | ||| |  |||||  ||||||||    
T  25357579 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgt-tgatgctactatgtttat 25357677  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25357678 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 25357726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24178341 - 24178193
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgtttt-aattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||   |||||||    
T  24178341 agtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcttttgaggagacataagtttttaattaaattgtcatatgataatcttgt-ttatgctgctatgttta 24178243  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24178242 tgccttttgtttgaagacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24178193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11762 - 11615
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||| ||| ||||  | ||||||    
T  11762 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagatatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgt-ttgagctactacgtttat 11664  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  11663 gccttttgcttgaggacaagcaaagaggcaagtgtgggggagtttgatg 11615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 16775719 - 16775866
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||   | ||| |  |||||  ||||||||    
T  16775719 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgt-tgatgctactatgtttat 16775817  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16775818 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 16775866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 17590475 - 17590622
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||   | ||| |  |||||  ||||||||    
T  17590475 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgt-tgctgctactatgtttat 17590573  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17590574 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 17590622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25371032 - 25370890
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||  ||| |  || ||  ||||||||    
T  25371032 agtttgtaattagtgtacgcttgaaattaaagcctttgaggagacatgagttttgattgaattgtcatat-ataatcctgtttattgttactatgtttat 25370934  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtt 370  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25370933 gtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtt 25370890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24795432 - 24795285
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   | || ||  || ||  | ||||||    
T  24795432 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactg-ctgatggtactacgtttat 24795334  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24795333 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 24795285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 252 - 375
Target Start/End: Original strand, 27627674 - 27627796
Alignment:
Q  252 atttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaag 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||   | ||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27627674 atttaagcccttgaggagacatgtgctttaattaatttgtcatttgattcaactgtcga-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaag 27627772  T
Q  352 attcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  27627773 attcaagtatgggggagtttgatg 27627796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23159442 - 23159385
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23159442 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23159385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23570699 - 23570642
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23570699 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23570642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Original strand, 27631654 - 27631711
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27631654 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27631711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27768873 - 27768816
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27768873 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27768816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 324 - 375
Target Start/End: Original strand, 24171510 - 24171561
Alignment:
Q  324 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24171510 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24171561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 375
Target Start/End: Original strand, 24506776 - 24506865
Alignment:
Q  285 aaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||   ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24506776 aaattgtcatatgataatcttgt-ttatgctgctatgtttatgtcttttgcttgaggacaataaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24506865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 264 - 371
Target Start/End: Original strand, 24321272 - 24321380
Alignment:
Q  264 gaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataa-tattgtcttgtgcta-tcatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgt 361  Q
    |||||||||||  ||||||| || |||||||||| ||| | |||| || ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24321272 gaggagacatgaattttaataaagttgtcatatgttaaatcttgt-ttatgctactaatgtttacgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtat 24321370  T
Q  362 gggggagttt 371  Q
    ||||||||||    
T  24321371 gggggagttt 24321380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23257625 - 23257570
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23257625 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtat-ggggagtttgatg 23257570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 322 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25337704 - 25337651
Alignment:
Q  322 tttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25337704 tttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggaatttgatg 25337651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 329 - 374
Target Start/End: Original strand, 29955868 - 29955913
Alignment:
Q  329 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  29955868 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatcgggaagtttgat 29955913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19805662 - 19805618
Alignment:
Q  330 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 374  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  19805662 ttttgcttgaggacaagcaatggttctagtgtgggggagtttgat 19805618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21512615 - 21512567
Alignment:
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||    
T  21512615 tgccttttgcttgaggacaagcaaggattcaagcatgggggaatttgat 21512567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 319 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24019123 - 24019068
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 374  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24019123 atgtttatgtcttttgtttgaggacaaaaaaagattcaagtatgggggaatttgat 24019068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17334648 - 17334606
Alignment:
Q  332 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 374  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17334648 ttgcttgaggacaatcaatggttcaagtgtgggggagtttgat 17334606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 296
Target Start/End: Original strand, 24502229 - 24502299
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtg-ttttaattaaattgtcatat 296  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  24502229 agtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcatttgaggagacataagtttttaattgaattgtcatat 24502299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 356
Target Start/End: Original strand, 23648128 - 23648165
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattca 356  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23648128 atgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattca 23648165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 18448201 - 18448349
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  18448201 agtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccaagtttat 18448300  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18448301 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 18448349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 2181121 - 2181269
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  2181121 agtttgtgattaatgtgcgctcgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttat 2181220  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2181221 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 2181269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 23023154 - 23023302
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  23023154 agtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttatgctaccatgtttaa 23023253  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23023254 gacttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23023302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 18854079 - 18854226
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||    
T  18854079 agtttgtgattagtgtacgctggaaattaaagcccttgaggagacatgtgtattaattaaattgtcatatgataatattgt-ttatgctaccatatttat 18854177  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18854178 gccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtatgggggagtttgatg 18854226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 25625752 - 25625899
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||     
T  25625752 agtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttaaggagacatatgttttaattaaattgtcatatgataatattgt-ttatgctaccatgtttac 25625850  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  25625851 accttttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtatgggggagtttgatg 25625899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21560701 - 21560554
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||| |||| || ||||| |||||||||    
T  21560701 agtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttgaggagacatgtgttttaattaaattgacatgaagtaatcttgt-ttatgctaccatgtttat 21560603  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21560602 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 21560554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 15699623 - 15699770
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||  ||||||||    
T  15699623 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttat 15699721  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15699722 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15699770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22165696 - 22165549
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||  ||||||||    
T  22165696 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttat 22165598  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165597 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22165549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 22243880 - 22244027
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||  ||||||||    
T  22243880 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttat 22243978  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22243979 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22244027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 235 - 375
Target Start/End: Original strand, 29595765 - 29595904
Alignment:
Q  235 attagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttatgccttttg 334  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | || ||||| ||||||||||| |||||    
T  29595765 attagtgtacacttgaaattaaagcccttggggagacatgtgttttaattaaatcgtcatgtgataatcttat-ttatgctaccatgtttatgctttttg 29595863  T
Q  335 cttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29595864 cttgaggacaagcaaagattcaagtgtgagggagtttgatg 29595904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22061650 - 22061503
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||  ||||||||    
T  22061650 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttat 22061552  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22061551 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 22061503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 227 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20107928 - 20107784
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgtttt-aattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||| | || |||| || |||||  |||||||    
T  20107928 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatgaaagcctttgaggagacataagttttcaattgaattgtcatatgtttatcttgt-ttatgctactatgttta 20107830  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20107829 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 20107784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25631416 - 25631269
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |  ||||| |||||||||    
T  25631416 agtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcctttgaagagatataagttttaattgaattgtcatat-ataatcttgtttattgctaccatgtttat 25631318  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25631317 gcatttttcctgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25631269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 25963309 - 25963457
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataa-tattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||    |||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||| |||||  |||| ||    
T  25963309 agtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttgaggagacacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttg-cttatgctactatgtcta 25963407  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25963408 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25963457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 25967956 - 25968104
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataa-tattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||    |||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||| |||||  |||| ||    
T  25967956 agtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttgaggagacacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttg-cttatgctactatgtcta 25968054  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25968055 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25968104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30671955 - 30671807
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataa-tattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| |||    |||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||| |||||  |||| ||    
T  30671955 agtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttggggaaacacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttg-cttatgctactatgtcta 30671857  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30671856 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 30671807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 20170310 - 20170458
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttg-tgctatcatgttt 324  Q
    ||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  ||   | ||| |||||  ||||||    
T  20170310 agtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattaa-ttgtcatttgatt-taaactattgatgctactatgttt 20170407  T
Q  325 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20170408 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 20170458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22767263 - 22767116
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    ||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||   | ||| |  || ||  |||||||    
T  22767263 agtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattaa-ttgtcatttgatttaactgt-tgatgttactatgttta 22767166  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22767165 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 22767116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24855392 - 24855245
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    ||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||   | | | |  |||||  |||||||    
T  24855392 agtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattaa-ttgtcatttgatttaactat-tgatgctactatgttta 24855295  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24855294 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 24855245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 297 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18184951 - 18184874
Alignment:
Q  297 gataatattgtcttgtgctatcatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18184951 gataatattgt-ttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 18184874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Original strand, 35270972 - 35271028
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35270972 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggtgtttgatg 35271028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 228 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 19585688 - 19585571
Alignment:
Q  228 gtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttatg 327  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||| || |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||| ||||  | ||||   |||| ||||    
T  19585688 gtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagccttttaggagacatgagttttaattgtattgtcatatg-taatcttgttctatgctgctatgtatatg 19585590  T
Q  328 ccttttgcttgaggacaag 346  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19585589 ccttttgcttgaggacaag 19585571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Original strand, 11204003 - 11204060
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11204003 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaatatttaagtgtgggggagtttgatg 11204060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Original strand, 18731875 - 18731931
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18731875 atgtctatgccttttgcttgaggacaagctaagattcaagtgtggaggagtttgatg 18731931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20219037 - 20218981
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20219037 atgtttatgccttttgcttgaagagaagcaaagattcatgtgtgggggagtttgatg 20218981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22113062 - 22113006
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22113062 atgtttatgccttttgcttgaagagaagcaaagattcatgtgtgggggagtttgatg 22113006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 319 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 23517887 - 23517835
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 371  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23517887 atgtgtatgccttttgcttgaggataagcaaagattcaagtatgggggagttt 23517835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Original strand, 29686601 - 29686657
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29686601 atgtttatgcctcttgcttgaggacaagaaaagattcaagtatgggagagtttgatg 29686657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 10630818 - 10630965
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  10630818 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatatgataata-tgtcttgtgctaccatgtttat 10630916  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10630917 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 10630965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 3354707 - 3354855
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3354707 agtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttat 3354806  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3354807 gccttttgcttgaggacaagcaactattcaagtgtgggggagtttgatg 3354855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 229 - 375
Target Start/End: Original strand, 18292007 - 18292153
Alignment:
Q  229 tttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttatgc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18292007 tttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgc 18292106  T
Q  329 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18292107 ctttttcttgtggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 18292153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 17485058 - 17484910
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||| ||| |||||    
T  17485058 agtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcccctgaggagacataagttttaattaaattgtcatgtgataatcttgttttatgctaccatatttat 17484959  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17484958 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 17484910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18081608 - 18081459
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||    
T  18081608 agtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttctatgctaccatgttta 18081509  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18081508 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 18081459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 56580688 - 56580539
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| || | || ||||| ||||||||    
T  56580688 agtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcagatgataatgttattttatgctaccatgttta 56580589  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56580588 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 56580539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42709878 - 42709731
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||  ||||||||    
T  42709878 agtttgtgattagtgtacatttgagatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttat 42709780  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42709779 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 42709731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 45234380 - 45234232
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||| | |||||||||    
T  45234380 agtttgtgattactgtacgcttgaaataaaagcctttgaggagacattagttttaatttaattgtcatatgataatcttgttttatgccaccatgtttat 45234281  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45234280 gccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtctgggggagtttgatg 45234232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 38426805 - 38426938
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               | |||||    
T  38426805 agtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatat---------------tatttat 38426889  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38426890 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 38426938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11496761 - 11496614
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||  ||||||||    
T  11496761 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttat 11496663  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11496662 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 11496614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 13822981 - 13823128
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||  ||||||||    
T  13822981 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttat 13823079  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13823080 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13823128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 15254416 - 15254563
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  ||   |||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||| |||||| |  | || |||    
T  15254416 agtttgtgattagtgtacattttggatttaaacccttaaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgt-ttgtgcaactacgtctat 15254514  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15254515 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15254563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14654054 - 14653998
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14654054 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14653998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 319 - 373
Target Start/End: Original strand, 15865647 - 15865701
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 373  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15865647 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 15865701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Original strand, 10650546 - 10650603
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10650546 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 10650603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15260166 - 15260109
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15260166 catgtctatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15260109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Original strand, 16682912 - 16682969
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16682912 catgtctatgccttttgcttgatgacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 16682969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 324 - 375
Target Start/End: Original strand, 15409534 - 15409585
Alignment:
Q  324 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15409534 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattctagtgtgggggagtttgatg 15409585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8092576 - 8092427
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaa-ttaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | |||||||  ||||| | || ||||||| |||  |||| |||| |  || ||  |||||||    
T  8092576 agtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttaatgagacataagttttcagttgaattgtcgtatattaatcttgtttattgttactatgttta 8092477  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  8092476 tgtctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggaaagtttgatg 8092427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9488934 - 9488878
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9488934 atgttcatgccttttgcttgaggacaagcaaagattgaagtatgggggagtttgatg 9488878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 326 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17296298 - 17296250
Alignment:
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17296298 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagcatgggggagtttgat 17296250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 164551 - 164403
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  164551 agtttgtgattagtgtgcgctttaaattgaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttat 164452  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164451 gccttttgcttgaggataagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 164403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 319 - 374
Target Start/End: Original strand, 172261 - 172316
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172261 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 172316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Original strand, 162002 - 162058
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  162002 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 162058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 11117 - 11264
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  11117 agtttgtgattagtgtacgcttaaaattaaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgt-ttatgctaccatgtttat 11215  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11216 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 11264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 121014 - 121162
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| | |||||||| |||||||||    
T  121014 agtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgaggagacatgtgtttcaattaaattgtcatataaaaatattattttgtgctaccatgtttat 121113  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121114 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 121162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 252018 - 251870
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  252018 agtttgtgactagtgtacgcttgaaattaaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcaaatgataatattgttttgtgctaccatgtttat 251919  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  251918 gccatttgcttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 251870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3000 - 2852
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3000 agtttgtgattagtgtacacatgaaattaaagcccttaaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttat 2901  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2900 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgtgggagtttgatg 2852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 281 - 428
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  281 agtttgtgattagtgtacgctttaaattaaagcccttgaggagacatgtattttaattaaattgtcatacgataatattgt-ttatgctaccatgtttat 379  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  380 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 256 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10325 - 10206
Alignment:
Q  256 aagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10325 aagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattc 10226  T
Q  356 aagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  10225 aagtttgggggagtttgatg 10206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14809 - 14662
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  14809 agtttatgaataatgtacgcttgaaattaaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattttcatatgataatattgt-ttatgctaccatgtttat 14711  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14710 gcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 14662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 48)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 229 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16448905 - 16448760
Alignment:
Q  229 tttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttatgc 328  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16448905 tttgtgattagtgtacatttggaatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgt-ttgtgctaccatgtttatgc 16448807  T
Q  329 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16448806 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 16448760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13505028 - 13504881
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||||    
T  13505028 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgt-ttgtgctactatgtttat 13504930  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13504929 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13504881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 227 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3245735 - 3245589
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||    
T  3245735 agtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgaggagacataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgt-ttatgctactatgtttat 3245637  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3245636 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 3245589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13001574 - 13001425
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  13001574 agtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgttta 13001475  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13001474 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13001425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 11947475 - 11947622
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||||    
T  11947475 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgt-ttgtgctactatgtttat 11947573  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11947574 gccttttgcttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 11947622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 229 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9361116 - 9360971
Alignment:
Q  229 tttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttatgc 328  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  9361116 tttgtgattagtgtacatttggaatttaagcccttgaggagacatgtcctttaatcgaattgtcatttgataaaattgt-ttgtgctaccatgtttatgc 9361018  T
Q  329 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9361017 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 9360971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 4382812 - 4382961
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||    
T  4382812 agtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttctatgctaccatgttta 4382911  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4382912 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 4382961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 13097772 - 13097919
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||| |||||||||    
T  13097772 agtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgt-ttatgctaccatgtttat 13097870  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13097871 gccttttacttgaggacaagcaaagattcaaatgtgggggagtttgatg 13097919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10547085 - 10546936
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||  | | ||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  10547085 agtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgcttcgaattaattgtcatatgataatatcgttttatgctaccatgttta 10546986  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10546985 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 10546936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10602619 - 10602472
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||  ||||||||    
T  10602619 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttat 10602521  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10602520 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 10602472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 13690669 - 13690816
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| || ||||| |||||||||    
T  13690669 agtttgtgattagtggacacttgaaattaaagcctttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatgaaataatcttgt-ttatgctaccatgtttat 13690767  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13690768 gccttttgcttgatgacaactaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13690816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 17387897 - 17388045
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||| |||| || ||||| |||||| ||    
T  17387897 agtttgtgattagtgtgtgcttgaaataaaagcctttgaggagatataagttttaattgaattgtcacatgataatcttgttttatgctaccatgttgat 17387996  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17387997 gccttttgcttaaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 17388045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 22637760 - 22637908
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||    
T  22637760 agtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagtctttgaggaggcataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgttttatgctaccatgttgat 22637859  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22637860 gccttttgcttgagcacaagtaaagattcaagtgtaggggagtttgatg 22637908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14348736 - 14348588
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataa-tattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||| || || ||||| ||    
T  14348736 agtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgaggagacacaagttttaattgaattgtcatatgttaagtcttg-cttatgttaccatgtcta 14348638  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14348637 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14348588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 1992864 - 1993011
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||    
T  1992864 agtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgaggagacataagttttaatttaattgtcatatgataatcttgt-ttatgctactatgtttat 1992962  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  1992963 gccttttgcttgagcataagcaaagattcaagtgggagagagtttgatg 1993011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 2721365 - 2721511
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||| |||| || ||||   ||||||||    
T  2721365 agtttgtgattagtgtacgcttgaattaaaagcctttgaggagacataagttttaattgaattgtcatattataatcttgt-ttatgctgctatgtttat 2721463  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2721464 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgt-ggggagtttgatg 2721511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 7600423 - 7600570
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   | ||| |  |||||  ||||||||    
T  7600423 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgt-tgatgctactatgtttat 7600521  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7600522 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 7600570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 230 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20156658 - 20156515
Alignment:
Q  230 ttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttatgcc 329  Q
    ||||||||||||||   |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||| || ||||| |||||||||||     
T  20156658 ttgtgattagtgtaaaattgaaataaaagcctttgaggagacatgagttttaatttaattgtcatatgattatcttgt-ttatgctaccatgtttatgca 20156560  T
Q  330 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20156559 ttttgcttgaggacaagc-aagattcaagtgtgggggagtttgatg 20156515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 262 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12160320 - 12160207
Alignment:
Q  262 ttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgt 361  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12160320 ttgaggagacatgttctttaatttaattgtcatatgataatgttattttatgccaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgt 12160221  T
Q  362 gggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||    
T  12160220 gggggagtttgatg 12160207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15557089 - 15556942
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatga--taa-tattgtcttgtgctatcatgtt 323  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||  ||| |||||     |||||  |||||    
T  15557089 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgaattaactattga----tgctactatgtt 15556994  T
Q  324 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15556993 tatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15556942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 230 - 367
Target Start/End: Original strand, 17045766 - 17045902
Alignment:
Q  230 ttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgtttt-aattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttatgc 328  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||| |||| || |||||  || |||||||    
T  17045766 ttgtgattagtgtacacttgaaata-aagcctttgaggagacataagtttttaattgaattgtcatatgttaatcttgt-ttatgctactatttttatgc 17045863  T
Q  329 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045864 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 17045902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 230 - 367
Target Start/End: Original strand, 17047926 - 17048062
Alignment:
Q  230 ttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgtttt-aattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttatgc 328  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||| |||| || |||||  || |||||||    
T  17047926 ttgtgattagtgtacacttgaaata-aagcctttgaggagacataagtttttaattgaattgtcatatgttaatcttgt-ttatgctactatttttatgc 17048023  T
Q  329 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17048024 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 17048062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 3279251 - 3279399
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataa-tattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||   ||||||||| |||||||||||| ||| |||||| || || |   |||| ||    
T  3279251 agtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagtctttgaggagacacaagttttaatttaattgtcatatgttaagtattgt-ttatgttgctatgtcta 3279349  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3279350 tgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 3279399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12187223 - 12187076
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    ||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||   | ||| |  |||||  |||||||    
T  12187223 agtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattaa-ttgtcatttgatttaactgt-tgatgctactatgttta 12187126  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12187125 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 12187076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16373712 - 16373565
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    ||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||   | ||| |  |||||  |||||||    
T  16373712 agtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattaa-ttgtcatttgatttaactgt-tgatgctactatgttta 16373615  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16373614 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 16373565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 37942446 - 37942593
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    ||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||   | ||| |  |||||  |||||||    
T  37942446 agtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattaa-ttgtcatttgatttaactgt-tgatgctactatgttta 37942543  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37942544 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 37942593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 11398276 - 11398424
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgtttt-aattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||  ||||| |||| ||||||| |||| |||| |||| || ||||   || ||||    
T  11398276 agtttatgattagtgtacgctttaaataaaagcctttgaagagacataagttttcaattgaattgtcgtatgttaatcttgt-ttatgctgctatattta 11398374  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11398375 tgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagtgtgggggagtttgatg 11398424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 12193637 - 12193491
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    ||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||   | ||| |  |||||  |||||||    
T  12193637 agtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattaa-ttgtcatttgatttaactgt-tgatgctactatgttta 12193540  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  12193539 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaggtatgggggagtttgat 12193491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 15645069 - 15645216
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    ||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||   | | | |  |||||  |||||||    
T  15645069 agtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattga-ttgtcatttgatttaactat-tgatgctactatgttta 15645166  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15645167 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 15645216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27356784 - 27356728
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356784 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27356728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3339283 - 3339226
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3339283 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 3339226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 10147079 - 10147226
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    ||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||   | | | |  |||||  |||||||    
T  10147079 agtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattaact-gtcatttgatttaactat-tgatgctactatgttta 10147176  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10147177 tgccttttgcttgaggacaagcaaagactcaagtatgggggagtttgatg 10147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12776591 - 12776534
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12776591 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 12776534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13136267 - 13136210
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13136267 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13136210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Original strand, 20584261 - 20584318
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20584261 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 20584318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10160229 - 10160173
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10160229 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 10160173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13187564 - 13187418
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    ||||||||||||||||||  || |  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||   | | | |  |||||  |||||||    
T  13187564 agtttgtgattagtgtacattttgggattaaagcccttgaggagacatgtgctttaattaact-gtcatttgatttaactat-tgatgctactatgttta 13187467  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13187466 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgat 13187418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Original strand, 13601221 - 13601277
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13601221 atgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13601277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 324 - 375
Target Start/End: Original strand, 15946773 - 15946824
Alignment:
Q  324 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15946773 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15946824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 371
Target Start/End: Original strand, 6814936 - 6815079
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    ||||||||||||||||||  || |  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||   | ||| |  |||||  |||||||    
T  6814936 agtttgtgattagtgtacattttgggatttatgcccttgaggagacatgtgctttaattaact-gtcatttgatttaactgt-tgatgctactatgttta 6815033  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6815034 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgagggagttt 6815079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15619340 - 15619283
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15619340 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggcagtttgatg 15619283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14445824 - 14445768
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14445824 atgtctatgccttttgctttaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14445768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20225898 - 20225754
Alignment:
Q  230 ttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgtttt-aattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttatgc 328  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||| ||||   |||||||||| |||| || | || ||||   |||||||||     
T  20225898 ttgtgattagtgtacacttgaaata-aagcctttgaggagacataagtttttaattgttttgtcatatgttaatcttat-ttatgctgctatgtttatgt 20225801  T
Q  329 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  20225800 cttttgcttgaggacaaacaaagatttaagtatgggggagtttgatg 20225754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13195515 - 13195458
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13195515 catgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgtgggagtttgatg 13195458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8686442 - 8686387
Alignment:
Q  320 tgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8686442 tgtttatgctttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 8686387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 375
Target Start/End: Original strand, 13068306 - 13068357
Alignment:
Q  324 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13068306 tatgtcttttggttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13068357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 375
Target Start/End: Original strand, 2005499 - 2005530
Alignment:
Q  344 aagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2005499 aagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 2005530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Original strand, 16703307 - 16703363
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  16703307 atgtttataccttttgctttaggttaagcaaagattcaagcatggaggagtttgatg 16703363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2435 - 2287
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||    
T  2435 agtttgtgattagtgtactcttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttat 2336  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2335 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 2287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 15746 - 15893
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | ||| ||||||||  ||||||||    
T  15746 agtttgtgattagtgtacatttgagatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgt-ttgtgctactatgtttat 15844  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15845 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 52938769 - 52938621
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||    
T  52938769 agtttgtgattagtgtactcttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgatttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgattat 52938670  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52938669 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 52938621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 227 - 371
Target Start/End: Original strand, 8653184 - 8653327
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |  |||||  ||||||||    
T  8653184 agtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcctttgaggagacatgagttttgattgaattgtcatat-ataatcttgtttattgctactatgtttat 8653282  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8653283 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 8653327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 19364097 - 19364244
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| |||| || ||||   |||| |||    
T  19364097 agtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgaggagacatgagttttgattgaattgtcatatg-taatcttgttttatgctgctatgtctat 19364195  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19364196 gcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 19364244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 27046942 - 27047089
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| | | ||||  ||||||||    
T  27046942 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggagctactatgtttat 27047040  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27047041 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27047089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 3990005 - 3990154
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||  ||||| |||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  3990005 agtttgtgattagtgcactctttgaaataaaagcctttgacgagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgttta 3990104  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3990105 tgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatgggggagtttgatg 3990154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 20237524 - 20237671
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||| | ||||||||     |||||    
T  20237524 agtttgtggttagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattat-ttgtgctactgcatttat 20237622  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20237623 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 20237671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 17094748 - 17094601
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatga--taa-tattgtcttgtgctatcatgtt 323  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||  ||| |||||     |||||  |||||    
T  17094748 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgaattaactattga----tgctactatgtt 17094653  T
Q  324 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17094652 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 17094601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21798810 - 21798662
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaa-ttaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||   | ||| |  |||||  |||||||    
T  21798810 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaaatttaattgtcatttgatttaactgt-tgatgctactatgttta 21798712  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21798711 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 21798662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 21417522 - 21417459
Alignment:
Q  60 ttaaaacaatatctcatgaatattcaaaacaaataatggttttagatgatttaaaaccaaatca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21417522 ttaaaacaatatctcatgaatattcaaaacaaataatggttttagatgatttaaaaccaaatca 21417459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 230 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 19875792 - 19875648
Alignment:
Q  230 ttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgtttt-aattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatc--atgtttat 326  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||  |||| |||| ||  | | |   ||||||||    
T  19875792 ttgttattagtgtacacttgaaataaaagcctttgaggagacataagttttcaattgaattgtcatatattaatcttgtttttagttttgctatgtttat 19875693  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19875692 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 19875648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Original strand, 14070664 - 14070720
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14070664 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 14070720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21784528 - 21784472
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21784528 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagtgtgggggagtttgatg 21784472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 319 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16382631 - 16382578
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 372  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16382631 atgtttattccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttg 16382578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Original strand, 4027839 - 4027895
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4027839 atgtctatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagggtgggggagtttgatg 4027895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8947571 - 8947515
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8947571 atgtctatgtcttttccttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 8947515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18478276 - 18478234
Alignment:
Q  332 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 374  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  18478276 ttgcttgaggacaagcaatggttcaagtgtaggggagtttgat 18478234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0582 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 8720 - 8869
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  8720 agtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgttta 8819  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8820 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 8869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 892 - 1041
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||   || ||||| ||||||||    
T  892 agtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttaatttatgctaccatgttta 991  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  992 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 1041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 123437 - 123584
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||  ||||||||    
T  123437 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttat 123535  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123536 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 123584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 77433 - 77391
Alignment:
Q  332 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 374  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  77433 ttgcttgaggacaagcaatggttcaagtgtaggggagtttgat 77391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 273 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38610 - 38508
Alignment:
Q  273 tgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38610 tgtgttttaattaaattgtcatatgataatatttttttgtgctaccatgtttatgctttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 38511  T
Q  373 atg 375  Q
    |||    
T  38510 atg 38508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 58777 - 58628
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||    
T  58777 agtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcatttgaggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgttta 58678  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58677 tgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 58628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 97875 - 97726
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||    
T  97875 agtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcatttgaggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgttta 97776  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  97775 tgccttttgctttaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 97726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 1169 - 1318
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgctt-gaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgttta 325  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||  ||||| |||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||    
T  1169 agtttgtgattaatgtactctttgaaataaaagcctttgaggggacatgtgccttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgttta 1268  T
Q  326 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1269 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 1318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 8002 - 8149
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| | || || |||| || ||||| | |||||||    
T  8002 agtttgtgattagtgtacatttgaaattaaagcctttgaagagacatgtgttttagttaaaatgtcatgtaatgatcttgt-ttatgctaccgtgtttat 8100  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8101 gccttttgcttgaagacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 8149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0773 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0773
Description:

Target: scaffold0773; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 540 - 687
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||   ||||||||    
T  540 agtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagcttttgaggagacattaattttaattgaattgtcatatgataatcttgt-ttatgctgctatgtttat 638  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  639 acattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 657 - 510
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||  ||||| ||| |||||||||||| |||| |||| || |||||  || |||||    
T  657 agtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgaggagatataagttttgattgaattgtcatatg-taatcttgttttatgctactatatttat 559  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  558 gccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatgggggagtttgatg 510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 762 - 615
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||||| |||| ||||||  |||||| || |||||| ||||| |||||||| ||| |||||    
T  762 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaatcccttgaggagacttgtgctttaatcgaattgtgatttgataaaattgt-ttgtgctaccatatttat 664  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  663 gctttttgctttaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Original strand, 1106 - 1253
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   | || ||  |||||  | ||||||    
T  1106 agtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactg-ctgatgctactacgtttat 1204  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1205 gccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 1253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 321 - 375
Target Start/End: Original strand, 3470 - 3524
Alignment:
Q  321 gtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3470 gtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 3524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 227 - 373
Target Start/End: Original strand, 12464 - 12609
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||  |||| ||| ||||||||||| |||||  ||| |  |||||  ||||||||    
T  12464 agtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagtctttgaggagacatgaattttgattgaattgtcatat-ataatcctgtttattgctactatgtttat 12562  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 373  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12563 gcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 12609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 227 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 232934 - 232789
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||  |||| ||| ||||||||||| |||||  ||| |  |||||  ||||||||    
T  232934 agtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagtctttgaggagacatgaattttgattgaattgtcatat-ataatcctgtttattgctactatgtttat 232836  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 373  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  232835 gcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 232789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35243 - 35104
Alignment:
Q  227 agtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttat 326  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||| |        ||| || ||||| |||||||||    
T  35243 agtttgtgattactgtacacttgaaattaaagccttaaaggagacatgtgttttagttgaattgtcatct--------tgt-ttatgctaccatgtttat 35153  T
Q  327 gccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35152 gccttttgcttgaggacaaggaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 35104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 235 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13141 - 13002
Alignment:
Q  235 attagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttatgccttttg 334  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||  ||||||||| |||| | |||||||||| |||  || |||||  |||||||||||| ||     
T  13141 attagtgtacgcatgaaataaaagcctttgagaagacataagttttaattgaattattatatgataatcttgg-ttatgctactatgtttatgcctctta 13043  T
Q  335 cttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13042 cttgaggacaagcaaagattcaagtgtggcggagtttgatg 13002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 230 - 371
Target Start/End: Original strand, 37782 - 37922
Alignment:
Q  230 ttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgaggagacatgtg-ttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctatcatgtttatgc 328  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||  |||| |||| || || |   |||||||||     
T  37782 ttgtgattagtgtacacttgaaatt-aagcctttgaggagacataagattttaattgaattgtcatattttaattttgt-ttatgttgctatgtttatgg 37879  T
Q  329 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 371  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37880 cttttgcttgagggcaagaaaagattcaagtgtgggggagttt 37922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Original strand, 2761 - 2818
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2761 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 2818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Original strand, 914 - 970
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  914 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0512 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0512
Description:

Target: scaffold0512; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Original strand, 5239 - 5295
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5239 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 5295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Original strand, 42244 - 42300
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42244 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 42300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 50562 - 50506
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50562 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 50506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 88403 - 88361
Alignment:
Q  332 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 374  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  88403 ttgcttgaggacaagcaatggttcaagtgtaggggagtttgat 88361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 324 - 375
Target Start/End: Original strand, 12743 - 12794
Alignment:
Q  324 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12743 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 12794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Original strand, 10719 - 10776
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10719 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattaaagtgtgggggagtttgatg 10776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 54906 - 54849
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54906 catgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagcgtgggggagtttgatg 54849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 319 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22211 - 22159
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 371  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22211 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 22159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 319 - 374
Target Start/End: Original strand, 1193 - 1248
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1193 atgtttatgccttttgcttgtggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgat 1248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1225 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1225
Description:

Target: scaffold1225; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 375
Target Start/End: Original strand, 1849 - 1902
Alignment:
Q  322 tttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1849 tttatgccttttgcttgagaacaatcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 1902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37799 - 37743
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37799 atgtctattccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggaatttgatg 37743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 331 - 375
Target Start/End: Original strand, 22774 - 22818
Alignment:
Q  331 tttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22774 tttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Original strand, 18205 - 18263
Alignment:
Q  318 catgtttatgccttttg-cttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18205 catgtctatgccttttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 18263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 72622 - 72572
Alignment:
Q  325 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  72622 atgccttttgcttgaggaaaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 72572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 84812 - 84762
Alignment:
Q  325 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  84812 atgccttttgcttgaggaaaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 84762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 45284 - 45228
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 375  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45284 atgtctatgtcttttgcttgagaacaagcaaagattcaggtgtgggggagtttgatg 45228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 319 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 83214 - 83174
Alignment:
Q  319 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  83214 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagt 83174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 332 - 372
Target Start/End: Original strand, 3251 - 3291
Alignment:
Q  332 ttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 372  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  3251 ttgcttgaggacaagcaacggttcaagtgtaggggagtttg 3291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University