View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11921_low_16 (Length: 355)

Name: NF11921_low_16
Description: NF11921
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11921_low_16
NF11921_low_16
[»] chr3 (31 HSPs)
chr3 (7-342)||(55478208-55478543)
chr3 (7-342)||(25432427-25432762)
chr3 (7-342)||(20491622-20491957)
chr3 (16-342)||(4370954-4371280)
chr3 (16-342)||(4380673-4380999)
chr3 (7-342)||(4024557-4024892)
chr3 (7-342)||(12152-12487)
chr3 (7-342)||(6421869-6422205)
chr3 (7-342)||(16335606-16335942)
chr3 (16-342)||(8972423-8972749)
chr3 (16-342)||(8982978-8983304)
chr3 (16-342)||(9536712-9537038)
chr3 (16-342)||(9547038-9547364)
chr3 (7-342)||(10012392-10012727)
chr3 (16-342)||(1685416-1685742)
chr3 (20-342)||(5655791-5656113)
chr3 (7-336)||(6432309-6432639)
chr3 (7-197)||(10508468-10508656)
chr3 (80-317)||(12376170-12376405)
chr3 (98-239)||(4783255-4783395)
chr3 (98-239)||(19828518-19828658)
chr3 (98-239)||(2489846-2489986)
chr3 (263-345)||(24793273-24793355)
chr3 (98-239)||(13120245-13120385)
chr3 (263-345)||(17733934-17734016)
chr3 (263-345)||(19035203-19035285)
chr3 (98-239)||(20745350-20745490)
chr3 (98-214)||(13113140-13113256)
chr3 (223-325)||(21542463-21542565)
chr3 (172-217)||(20292867-20292912)
chr3 (98-217)||(18560623-18560742)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (7-342)||(15668755-15669090)
chr4 (7-342)||(16252980-16253315)
chr4 (7-342)||(26330793-26331128)
chr4 (16-342)||(16249023-16249349)
chr4 (16-342)||(3487788-3488114)
chr4 (16-342)||(3497111-3497437)
chr4 (10-343)||(17160809-17161142)
chr4 (16-342)||(18105581-18105908)
chr4 (16-342)||(21845680-21846006)
chr4 (16-342)||(21855272-21855598)
chr4 (16-342)||(21901543-21901869)
chr4 (16-342)||(21911135-21911461)
chr4 (16-342)||(40921420-40921746)
chr4 (16-341)||(5293255-5293580)
chr4 (16-341)||(5302914-5303239)
chr4 (16-341)||(27680918-27681243)
chr4 (16-341)||(27690573-27690898)
chr4 (16-342)||(6691795-6692121)
chr4 (16-342)||(6702201-6702527)
chr4 (10-342)||(13403202-13403533)
chr4 (11-342)||(17985030-17985362)
chr4 (73-342)||(16241695-16241964)
chr4 (7-325)||(52498698-52499017)
chr4 (11-336)||(9836231-9836556)
chr4 (7-342)||(6405989-6406322)
chr4 (173-336)||(13793231-13793394)
chr4 (171-342)||(11476653-11476824)
chr4 (11-342)||(14600868-14601199)
chr4 (7-342)||(1292925-1293259)
chr4 (98-239)||(17838171-17838311)
chr4 (253-325)||(19917979-19918051)
chr4 (98-239)||(17828780-17828920)
chr4 (82-317)||(53946492-53946724)
chr4 (98-217)||(7847058-7847176)
chr4 (161-317)||(16211376-16211530)
chr4 (98-217)||(16629168-16629287)
chr4 (263-325)||(26458170-26458232)
chr4 (254-340)||(41525672-41525757)
chr4 (82-313)||(2829181-2829410)
chr4 (263-325)||(17421506-17421568)
chr4 (101-295)||(16472311-16472503)
chr4 (270-325)||(30651390-30651445)
chr4 (263-323)||(16058066-16058126)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (7-342)||(42033759-42034098)
chr1 (7-342)||(8539818-8540154)
chr1 (7-342)||(21885881-21886216)
chr1 (7-342)||(8605057-8605393)
chr1 (7-342)||(13964463-13964798)
chr1 (7-342)||(2115568-2115903)
chr1 (7-342)||(30549763-30550098)
chr1 (7-342)||(25019035-25019371)
chr1 (16-342)||(21458205-21458531)
chr1 (7-342)||(16154450-16154786)
chr1 (7-342)||(2370565-2370900)
chr1 (7-342)||(18382930-18383264)
chr1 (7-276)||(1968905-1969174)
chr1 (7-342)||(1186578-1186911)
chr1 (7-342)||(18062378-18062712)
chr1 (7-241)||(41544399-41544634)
chr1 (16-325)||(34822603-34822911)
chr1 (7-336)||(22956125-22956452)
chr1 (224-342)||(41544268-41544386)
chr1 (7-121)||(22406646-22406761)
chr1 (98-217)||(21782349-21782468)
chr1 (98-239)||(26193724-26193864)
chr1 (68-217)||(21821739-21821889)
chr1 (98-239)||(20308505-20308645)
chr1 (98-239)||(25867917-25868057)
chr1 (98-317)||(18097139-18097356)
chr1 (266-325)||(1989673-1989732)
chr1 (263-325)||(52955473-52955535)
chr1 (266-325)||(1982255-1982314)
chr1 (98-217)||(20328673-20328792)
chr1 (98-239)||(20314189-20314329)
chr1 (153-239)||(20318328-20318412)
chr1 (98-239)||(27065724-27065864)
chr1 (223-325)||(50940948-50941049)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (7-342)||(4376-4711)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (7-342)||(29540025-29540360)
chr6 (7-342)||(14791170-14791506)
chr6 (16-342)||(12454630-12454956)
chr6 (7-342)||(24922158-24922494)
chr6 (16-342)||(16897523-16897849)
chr6 (16-342)||(16908176-16908502)
chr6 (7-342)||(20911849-20912185)
chr6 (7-342)||(24931194-24931530)
chr6 (16-342)||(31357137-31357463)
chr6 (16-342)||(31366865-31367191)
chr6 (16-342)||(18159638-18159964)
chr6 (16-342)||(18169450-18169776)
chr6 (13-342)||(3285418-3285748)
chr6 (98-342)||(18200876-18201119)
chr6 (80-342)||(14044956-14045217)
chr6 (68-342)||(27787726-27788000)
chr6 (98-239)||(16320945-16321085)
chr6 (98-239)||(26021389-26021529)
chr6 (223-323)||(9761632-9761732)
chr6 (98-317)||(1596091-1596309)
chr6 (254-323)||(28092398-28092467)
chr6 (160-239)||(16333155-16333233)
chr6 (161-239)||(791505-791582)
chr6 (263-345)||(8563405-8563487)
chr6 (263-325)||(22223775-22223837)
chr6 (263-325)||(22249610-22249672)
chr6 (91-313)||(16923219-16923439)
chr6 (98-217)||(18712578-18712697)
chr6 (98-238)||(24505686-24505825)
chr6 (172-317)||(26161616-26161760)
chr6 (82-317)||(30658341-30658573)
chr6 (272-325)||(24361878-24361931)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (7-336)||(7938-8267)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (7-342)||(15416-15751)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (7-342)||(93018-93353)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (7-342)||(14943875-14944210)
chr7 (7-342)||(15371468-15371803)
chr7 (7-342)||(42620747-42621082)
chr7 (7-342)||(9535399-9535735)
chr7 (7-342)||(9545682-9546018)
chr7 (18-342)||(26348308-26348632)
chr7 (16-342)||(5381974-5382300)
chr7 (16-342)||(5391612-5391938)
chr7 (16-342)||(5926712-5927038)
chr7 (16-342)||(8500626-8500952)
chr7 (16-342)||(8511096-8511422)
chr7 (16-342)||(46496691-46497017)
chr7 (16-342)||(46507303-46507629)
chr7 (16-341)||(6544382-6544707)
chr7 (16-342)||(43983054-43983380)
chr7 (16-341)||(6534083-6534408)
chr7 (18-325)||(26363360-26363667)
chr7 (16-342)||(44896894-44897220)
chr7 (16-342)||(44907297-44907623)
chr7 (7-342)||(32097947-32098283)
chr7 (7-342)||(32108384-32108720)
chr7 (16-342)||(11626523-11626848)
chr7 (16-342)||(16132073-16132399)
chr7 (16-342)||(16142622-16142948)
chr7 (7-323)||(14248719-14249034)
chr7 (7-342)||(2992074-2992409)
chr7 (7-343)||(9006474-9006808)
chr7 (7-102)||(22964652-22964747)
chr7 (223-325)||(33090976-33091078)
chr7 (223-325)||(40701709-40701811)
chr7 (265-345)||(41027368-41027448)
chr7 (263-345)||(15988833-15988915)
chr7 (98-239)||(24541107-24541247)
chr7 (98-217)||(45552832-45552951)
chr7 (268-342)||(7034912-7034986)
chr7 (263-325)||(12827543-12827605)
chr7 (263-325)||(13285969-13286031)
chr7 (263-345)||(42595179-42595261)
chr7 (98-317)||(27988150-27988368)
chr7 (98-215)||(19585411-19585528)
chr7 (263-325)||(31824544-31824606)
chr7 (298-342)||(12491146-12491190)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (11-342)||(24696661-24696992)
chr2 (16-342)||(2998773-2999099)
chr2 (16-342)||(18650795-18651121)
chr2 (16-342)||(18662913-18663239)
chr2 (9-342)||(45014301-45014635)
chr2 (16-341)||(4457772-4458097)
chr2 (16-341)||(4467397-4467722)
chr2 (7-342)||(38957894-38958230)
chr2 (16-342)||(9502837-9503163)
chr2 (16-342)||(9514203-9514529)
chr2 (16-341)||(5337212-5337537)
chr2 (16-341)||(5347065-5347390)
chr2 (9-342)||(45024378-45024712)
chr2 (7-342)||(38930558-38930895)
chr2 (7-336)||(17488257-17488587)
chr2 (7-341)||(72294-72626)
chr2 (173-342)||(44639102-44639270)
chr2 (7-139)||(44639277-44639409)
chr2 (195-342)||(29423126-29423268)
chr2 (7-241)||(24239418-24239639)
chr2 (98-311)||(12570221-12570433)
chr2 (263-345)||(19342105-19342187)
chr2 (263-345)||(23721735-23721817)
chr2 (223-325)||(40409216-40409318)
chr2 (98-239)||(22687952-22688092)
chr2 (263-345)||(22901908-22901990)
chr2 (98-239)||(45190472-45190612)
chr2 (263-336)||(22908957-22909030)
chr2 (98-239)||(573895-574035)
chr2 (98-239)||(16934571-16934711)
chr2 (98-239)||(17005231-17005371)
chr2 (154-217)||(15940399-15940462)
chr2 (114-217)||(24942578-24942681)
chr2 (263-313)||(16135335-16135385)
chr2 (248-313)||(16327821-16327886)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (7-343)||(791304-791640)
chr8 (11-342)||(7757335-7757666)
chr8 (16-342)||(9325192-9325518)
chr8 (16-342)||(21202970-21203296)
chr8 (16-342)||(21213386-21213712)
chr8 (16-342)||(21333875-21334201)
chr8 (7-342)||(17268409-17268744)
chr8 (16-342)||(21997630-21997956)
chr8 (16-342)||(21988096-21988422)
chr8 (7-342)||(2690448-2690781)
chr8 (68-321)||(5867569-5867821)
chr8 (7-185)||(20098382-20098559)
chr8 (264-325)||(37295701-37295762)
chr8 (249-325)||(37816670-37816746)
chr8 (98-239)||(13673889-13674029)
chr8 (98-239)||(14881971-14882111)
chr8 (98-239)||(14894321-14894461)
chr8 (254-323)||(18536406-18536475)
chr8 (169-325)||(14437096-14437259)
chr8 (98-317)||(20531525-20531742)
chr8 (98-239)||(31999524-31999664)
chr8 (98-239)||(33774415-33774555)
chr8 (266-325)||(26362544-26362603)
chr8 (95-217)||(31991744-31991866)
chr8 (295-325)||(12841689-12841719)
[»] chr5 (39 HSPs)
chr5 (10-341)||(22244285-22244616)
chr5 (16-342)||(18360854-18361180)
chr5 (16-342)||(21753020-21753346)
chr5 (16-342)||(21762307-21762633)
chr5 (16-342)||(33938894-33939220)
chr5 (16-342)||(33949294-33949620)
chr5 (7-342)||(27411715-27412051)
chr5 (16-342)||(18389811-18390137)
chr5 (16-342)||(26192159-26192485)
chr5 (16-342)||(26202763-26203089)
chr5 (7-342)||(32070007-32070343)
chr5 (16-342)||(8765523-8765849)
chr5 (16-342)||(11411267-11411592)
chr5 (7-342)||(31104981-31105315)
chr5 (11-342)||(23378741-23379071)
chr5 (15-342)||(21484192-21484518)
chr5 (98-239)||(30944266-30944406)
chr5 (98-239)||(30953688-30953828)
chr5 (98-239)||(37299295-37299435)
chr5 (98-239)||(37549085-37549225)
chr5 (98-317)||(31916447-31916665)
chr5 (98-217)||(20896588-20896707)
chr5 (104-317)||(4038382-4038594)
chr5 (98-215)||(13572183-13572300)
chr5 (263-325)||(19548653-19548715)
chr5 (98-239)||(27274661-27274801)
chr5 (98-239)||(37651883-37652023)
chr5 (104-239)||(22173730-22173864)
chr5 (249-325)||(36316170-36316246)
chr5 (104-217)||(18210313-18210426)
chr5 (104-217)||(18219651-18219764)
chr5 (98-239)||(19888834-19888974)
chr5 (104-217)||(21681284-21681397)
chr5 (98-317)||(34130892-34131111)
chr5 (98-217)||(20763995-20764113)
chr5 (116-217)||(20905033-20905134)
chr5 (269-317)||(205879-205926)
chr5 (98-239)||(37817233-37817375)
chr5 (161-241)||(42090995-42091074)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (7-342)||(310184-310520)
scaffold0005 (11-342)||(216179-216510)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (7-331)||(74894-75218)
[»] scaffold0014 (4 HSPs)
scaffold0014 (16-342)||(234154-234480)
scaffold0014 (98-317)||(146328-146546)
scaffold0014 (98-239)||(153795-153934)
scaffold0014 (98-239)||(114793-114932)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (16-342)||(8008-8334)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (53-342)||(21321-21610)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (7-342)||(19541-19877)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (69-342)||(55985-56262)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (136-342)||(17452-17658)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (11-342)||(13394-13724)
[»] scaffold1705 (1 HSPs)
scaffold1705 (5-197)||(415-607)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (7-332)||(198868-199191)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (11-258)||(29010-29254)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (7-336)||(65255-65583)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (7-192)||(1143-1327)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (104-342)||(15046-15284)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (223-325)||(241867-241969)
[»] scaffold0265 (1 HSPs)
scaffold0265 (68-217)||(10920-11070)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (98-239)||(112061-112201)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (98-217)||(23010-23129)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (223-347)||(40754-40878)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (104-317)||(18402-18614)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (98-239)||(1136-1276)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (109-217)||(4430-4538)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (98-214)||(24108-24224)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (160-239)||(13720-13798)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (269-317)||(54459-54506)
scaffold0018 (269-317)||(58411-58458)
scaffold0018 (269-317)||(59839-59886)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 31)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 55478543 - 55478208
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55478543 aagcatagatcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatgtccaggaaa 55478444  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  55478443 gtacttttgcatggatcaatcaagcaataaagacatatacaaagattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagactatgaatattgatatacta 55478344  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  55478343 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 55478244  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  55478243 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 55478208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 25432427 - 25432762
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25432427 aagcatagatcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaggtcatgcaatgcacatgtgacatggatatatgtccaggaaa 25432526  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25432527 gtacatttgcatggattaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaatgatatccaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 25432626  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  25432627 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattattgtttcactaataggatttgattacatcaaatgatagtcttaca 25432726  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  25432727 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 25432762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 20491622 - 20491957
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20491622 aagcatagattagaaggttgttcttatataagccaagaatctcaagaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatgtccaggaaa 20491721  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20491722 gtacatttgcatggatcaatctagcaataaaagcatatacaaggattatgtcaaaaaggatactcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 20491821  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20491822 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatataacttctcttcattgttgttttactatttggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 20491921  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  20491922 aatcatgctaagtgaaacagatggaacattctgatg 20491957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 4370954 - 4371280
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  4370954 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacacttg 4371053  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  4371054 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatatccaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 4371153  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  4371154 cacaagggaatatcatcctagatgttaatagcactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 4371253  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  4371254 aagtgaaacagatggaacattctgatg 4371280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 4380673 - 4380999
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  4380673 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacacttg 4380772  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  4380773 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatatccaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 4380872  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  4380873 cacaagggaatatcatcctagatgttaatagcactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 4380972  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  4380973 aagtgaaacagatggaacattctgatg 4380999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4024892 - 4024557
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  4024892 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaaaacaagaatctcaagaacattgatcaagttcatgcaaggcacatgtgacattgatatatgttcaggaaa 4024793  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4024792 gtagatttacatggatcaatcaagcaataaaggcatatgcaaggattatgtcaaaaaggatactcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 4024693  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  4024692 ggaatattccacaagggaatatcatcctagaggttaatatcactactcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatctaatggtagtcttaca 4024593  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  4024592 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 4024557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12487 - 12152
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12487 aagcagagatcagaatgttgttcttatacaagccgagagtctcaagaactttgatcaagatcatgcaagacacatgtgacatgggtatatgtccaggaaa 12388  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12387 gtacatttgcatggatcaatcaacaaataaaagcatatacaaggattatgtcaaagaaggtattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 12288  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12287 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatcattgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 12188  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  12187 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 12152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 6421869 - 6422205
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6421869 aagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaagacacatgtgacatgggtatatgtccaggaa 6421968  T
Q  106 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6421969 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 6422068  T
Q  206 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  6422069 aggaatatttcacaagggaatatcatcctagatgttattattactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 6422168  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6422169 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattttgatg 6422205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16335942 - 16335606
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  16335942 aagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtcctggaa 16335843  T
Q  106 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 205  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16335842 agtacatttgcatgaatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 16335743  T
Q  206 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16335742 aggaatattccacaaggggatatcatcctaggtgttaaaatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttac 16335643  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16335642 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 16335606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 8972423 - 8972749
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8972423 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 8972522  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  8972523 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 8972622  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  8972623 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 8972722  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  8972723 aagtgaaacagatggaacattctgatg 8972749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 8982978 - 8983304
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8982978 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 8983077  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  8983078 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 8983177  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  8983178 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 8983277  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  8983278 aagtgaaacagatggaacattctgatg 8983304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 9536712 - 9537038
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  9536712 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 9536811  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  9536812 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 9536911  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  9536912 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 9537011  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  9537012 aagtgaaacagatggaacattctgatg 9537038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 9547038 - 9547364
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  9547038 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 9547137  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  9547138 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 9547237  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  9547238 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 9547337  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  9547338 aagtgaaacagatggaacattctgatg 9547364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10012727 - 10012392
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   |||| |||||||||    
T  10012727 aagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaggtcatgcacgacacatgtgacatgtgaatatgtccaggaaa 10012628  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10012627 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatatcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 10012528  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10012527 ggaatattccacaagagaatatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcattattgtttcaccattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 10012428  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10012427 aatcgtcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 10012392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1685742 - 1685416
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  1685742 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatcgcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 1685643  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  1685642 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 1685543  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  1685542 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 1685443  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  1685442 aagtgaaacagatggaacattctgatg 1685416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 20 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5656113 - 5655791
Alignment:
Q  20 aaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgcatg 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5656113 aaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttgcatg 5656014  T
Q  120 gataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccaca 219  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5656013 gatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatatttcaca 5655914  T
Q  220 agggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagt 319  Q
    | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5655913 aaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaagt 5655814  T
Q  320 gaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||| |||||||||| |||||    
T  5655813 gaaacagatggaacattctgatg 5655791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Original strand, 6432309 - 6432639
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6432309 aagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaa 6432408  T
Q  106 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6432409 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 6432508  T
Q  206 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  6432509 aggaatatttcacaagggaatatcatcctagatgttattattactgcttttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 6432608  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacatt 336  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6432609 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacatt 6432639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10508656 - 10508468
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||| ||||| ||||| | |||| ||| || ||||||  ||| |||| |||| |||||||| ||| || ||||| |||    
T  10508656 aagcagagttcagaaggttgtctttacacaagccaagagtttcaagaacatt-atcaagagcattcaagtcacacgtgacatgaataaatgtccagaaaa 10508558  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacatt 197  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10508557 gtacattttcatggatcaatcaagcaatgaagacatttacaaggttaatgtcaaaaaggatattcaatgttca-ttaagactatgaacatt 10508468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 317
Target Start/End: Original strand, 12376170 - 12376405
Alignment:
Q  80 atgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttca 179  Q
    |||||||||  || ||| |||||||||| || |||| |||||| ||||||| | | ||||||| ||||||    ||||| ||| | || || ||||||||    
T  12376170 atgtgacataaatgtatgtccaggaaagcacctttgaatggatcaatcaagaagttaaggcatttacaagagaaatgtctaaatg-atctttaatgttca 12376268  T
Q  180 tttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttca-ttgttgtttcactattagga 278  Q
    | ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||    ||||||| ||||| ||||   || ||||||||||    
T  12376269 tctaagactatgaacattaaagtactaggaatattcca-atgagaatattatcctagatgttgcattcactgcacttcagttgtgtctttactattagga 12376367  T
Q  279 tttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaa 317  Q
     ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12376368 -ttgattacatcaaaagtaagtcttacaaatcatcctaa 12376405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4783395 - 4783255
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||  ||||| ||||||||    
T  4783395 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgt-aaaaaggatctttaatgttcatccaagatgatgaacat 4783297  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  4783296 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 4783255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19828658 - 19828518
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  19828658 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 19828560  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  19828559 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 19828518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2489986 - 2489846
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  2489986 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatgaacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 2489888  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  2489887 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 2489846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 345
Target Start/End: Original strand, 24793273 - 24793355
Alignment:
Q  263 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatgtcc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||    
T  24793273 tgtttcactattaggatttgattacatcaaataagagtcttgcaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgaagtcc 24793355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13120385 - 13120245
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  13120385 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatgaacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 13120287  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | |||||||||||||| || | | |||||| ||||||||||    
T  13120286 taaagtactaggaatatttca-atgagaatattatcctagatg 13120245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 345
Target Start/End: Original strand, 17733934 - 17734016
Alignment:
Q  263 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatgtcc 345  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||    
T  17733934 tgtttcactattatgatttgattacatcaaataagagtcttacaaattatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgaagtcc 17734016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 345
Target Start/End: Original strand, 19035203 - 19035285
Alignment:
Q  263 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatgtcc 345  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||    
T  19035203 tgtttcactattatgatttgattacatcaaataagagtcttacaaattatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgaagtcc 19035285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20745490 - 20745350
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  20745490 tccagaaaagttcatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 20745392  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  20745391 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 20745350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13113256 - 13113140
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  13113256 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatgaacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 13113158  T
Q  197 tgatgtactaggaatatt 214  Q
    | | ||||||||||||||    
T  13113157 taaagtactaggaatatt 13113140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21542565 - 21542463
Alignment:
Q  223 gaatatcatcctagatgtta-atatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtga 321  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||| |  ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| || ||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  21542565 gaatatcatcctagatgttacacat-actacatttcattgatgttacactactaggatttgattacattaaatgagagtcttacaaataatcctaagtga 21542467  T
Q  322 aaca 325  Q
    ||||    
T  21542466 aaca 21542463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 217
Target Start/End: Original strand, 20292867 - 20292912
Alignment:
Q  172 aatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattcca 217  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  20292867 aatgttcattcaagactatgaacattaaagtactaggaatattcca 20292912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 217
Target Start/End: Original strand, 18560623 - 18560742
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||  |||||  |||||||||||  |||| ||  ||||| |||||| || || |||||||||  |||| |||||||||    
T  18560623 tccagaaaagtacatctgcatagatctatcaacaaataaaggcatggacaaagaactatgtaaaaaag-atctttaatgttcatccaagactatgaacat 18560721  T
Q  197 tgatgtactaggaatattcca 217  Q
    | | |||||||||||||||||    
T  18560722 taaagtactaggaatattcca 18560742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 15668755 - 15669090
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15668755 aagcagatatcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaggttatgtaaggcacatgtgacatggatatatgtccaggaaa 15668854  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15668855 gtacatttgcatggatcaatcaagtaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 15668954  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15668955 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 15669054  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  15669055 aatcatccaaagtgaaacaaatggaacattctgatg 15669090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 16252980 - 16253315
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16252980 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaaa 16253079  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16253080 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaggctattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 16253179  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16253180 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaattactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 16253279  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16253280 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 16253315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 26330793 - 26331128
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26330793 aagcagagatcagaaggatgttcttatacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatgtacaggaaa 26330892  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26330893 gtacatctgcatggatcaattaagcaataaagacatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagaccatgaacattgatgtacta 26330992  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26330993 ggaatattctacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 26331092  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  26331093 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 26331128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 16249023 - 16249349
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  16249023 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacacttg 16249122  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  16249123 catggataaattaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 16249222  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  16249223 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 16249322  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  16249323 aagtgaaacagatggaacattctgatg 16249349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3488114 - 3487788
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  3488114 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacacttg 3488015  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  3488014 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatatccaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 3487915  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  3487914 cacaagggaatatcatcctagatgttaatagcactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 3487815  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  3487814 aagtgaaacagatggaacattctgatg 3487788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3497437 - 3497111
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  3497437 tcagaagattgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacacttg 3497338  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  3497337 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatatccaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 3497238  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  3497237 cacaagggaatatcatcctagatgttaatagcactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 3497138  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  3497137 aagtgaaacagatggaacattctgatg 3497111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Original strand, 17160809 - 17161142
Alignment:
Q  10 cagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagta 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17160809 cagagattagaaggttgttcttatacaagtcaagaatgtaaagaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacacggatatatatctaggaaagta 17160908  T
Q  110 catttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactagga 209  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17160909 catttgcatggatcaatcaatcaataaaggcatatacaataattatgtcaaaaaggatattcgatgttcatttaagactatgaacattgatgtactagga 17161008  T
Q  210 atattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaat 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  17161009 atattccacaagggaatatcatcttagatgttaatatcattgttcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttataaat 17161108  T
Q  310 catcctaagtgaaacatatggaacattttgatgt 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17161109 catcctaagtgaaacagatggaacattctgatgt 17161142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18105908 - 18105581
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18105908 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 18105809  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaagga-ttatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18105808 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatatt 18105709  T
Q  215 ccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcc 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  18105708 tcacaagggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcc 18105609  T
Q  315 taagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18105608 taagtgaaacagatggaacattctgatg 18105581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 21845680 - 21846006
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21845680 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 21845779  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21845780 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 21845879  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  21845880 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 21845979  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  21845980 aagtgaaacagatggaacattctgatg 21846006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 21855272 - 21855598
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21855272 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 21855371  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21855372 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 21855471  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  21855472 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 21855571  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  21855572 aagtgaaacagatggaacattctgatg 21855598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 21901543 - 21901869
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21901543 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 21901642  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21901643 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 21901742  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  21901743 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 21901842  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  21901843 aagtgaaacagatggaacattctgatg 21901869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 21911135 - 21911461
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21911135 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 21911234  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21911235 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 21911334  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  21911335 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 21911434  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  21911435 aagtgaaacagatggaacattctgatg 21911461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 40921420 - 40921746
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  40921420 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 40921519  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  40921520 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 40921619  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  40921620 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 40921719  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  40921720 aagtgaaacagatggaacattctgatg 40921746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5293580 - 5293255
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5293580 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtggtcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 5293481  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  5293480 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 5293381  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  5293380 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 5293281  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgat 341  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  5293280 aagtgaaacagatggaacattctgat 5293255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5303239 - 5302914
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5303239 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtggtcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 5303140  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  5303139 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 5303040  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  5303039 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 5302940  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgat 341  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  5302939 aagtgaaacagatggaacattctgat 5302914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27681243 - 27680918
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  27681243 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacataaatatatgtccaggaaagtacatttg 27681144  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  27681143 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 27681044  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  27681043 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 27680944  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgat 341  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  27680943 aagtgaaacagatggaacattctgat 27680918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27690898 - 27690573
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  27690898 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacataaatatatgtccaggaaagtacatttg 27690799  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  27690798 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 27690699  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  27690698 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 27690599  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgat 341  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  27690598 aagtgaaacagatggaacattctgat 27690573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 6691795 - 6692121
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6691795 tcagaaggttattcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 6691894  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  6691895 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 6691994  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  6691995 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 6692094  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  6692095 aagtgaaacagatggaacattctgatg 6692121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 6702201 - 6702527
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6702201 tcagaaggttattcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 6702300  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  6702301 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 6702400  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  6702401 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 6702500  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  6702501 aagtgaaacagatggaacattctgatg 6702527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13403533 - 13403202
Alignment:
Q  10 cagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagta 109  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||| ||||||||    
T  13403533 cagagatcaggaggttgttcttgcacaagccaagaatctcaagaacattgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgattaaatgtcctggaaagta 13403434  T
Q  110 catttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactagga 209  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13403433 catt-gcatggatcaatcaagcaataaagacatatataaggattatggcaaaaaggatattcaatgttcatttaagactatgaacattgaagtactagga 13403335  T
Q  210 atattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaat 309  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13403334 atattccaaaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgttcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaat 13403235  T
Q  310 catcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  13403234 catcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 13403202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17985362 - 17985030
Alignment:
Q  11 agagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagta 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||    
T  17985362 agagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccagaagagta 17985263  T
Q  110 catttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactagga 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  17985262 catttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagggttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactataaacattgatgtactagga 17985163  T
Q  210 atattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaat 309  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  17985162 atatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaat 17985063  T
Q  310 catcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  17985062 catcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 17985030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 73 - 342
Target Start/End: Original strand, 16241695 - 16241964
Alignment:
Q  73 aaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattca 172  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16241695 aaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaggttattca 16241794  T
Q  173 atgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcacta 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16241795 atgttcatttaagactatgaacattgatatactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcattattgtttcacta 16241894  T
Q  273 ttaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16241895 ttaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 16241964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 325
Target Start/End: Original strand, 52498698 - 52499017
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccagg-aa 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  52498698 aagcagagatcagaaggttgttcttatgcaagccaataatctcaagaacattggtcgaagtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatgtccagggaa 52498797  T
Q  106 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  52498798 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattaatgtact 52498897  T
Q  206 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  52498898 atgaatattccataagggaatatcatcctaaatattaatatcattgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttac 52498997  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  52498998 aaatcatcctaagtgaaaca 52499017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9836556 - 9836231
Alignment:
Q  11 agagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| || ||| |||||||| |||||||||| ||||  || |||| ||| || | ||||||| |||    
T  9836556 agagatcagaaggttgttcttatacaagcacataatcttaagaacattgatcaaagtcatgcaagacacacatgtcatgaataaatgttcaggaaaatac 9836457  T
Q  111 atttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaa 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9836456 atttgcatggatcaatcaagcaataaagacatatacaaggattatgtcaaaaaggatactcaatgttcatttaagactatgaacattgaagtactaggaa 9836357  T
Q  211 tattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatc 310  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9836356 tattccaaaagggaatatcatcctagatgttttaatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattatatcaaatggtagtcttacaaatc 9836257  T
Q  311 atcctaagtgaaacatatggaacatt 336  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||    
T  9836256 atcctaagtgaaacaaaaggaacatt 9836231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6406322 - 6405989
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| || || |||  | ||||||  |||||||||||||  ||||||| ||| || |||||||||    
T  6406322 aagcagagttcagaaggttgttcttatacaagcccagaaactaaagaacaat-atcaagaacatgcaaggcacacttgacatgaataaatgtccaggaaa 6406224  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
     ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  6406223 atacattttcatggatcaattaagcaattaagacatttacaaggttaatgtcaaaaatgatattcaatgttcattaaagactatgaacattgaagtacta 6406124  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | |||||||||    
T  6406123 ggaatattcca-aagagaatatcttcctagatgttacaatcattgatcttcattgttgtttcactattagaatttgattacatcaaatagaagtcttaca 6406025  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||    
T  6406024 aatcatcataagtgaaacaaaaggaacattctgatg 6405989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 173 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 13793394 - 13793231
Alignment:
Q  173 atgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcacta 272  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13793394 atgttcatttaagactatgaacattgaagtactaggattattttaaaagggaatatcatcctagatgttacaatcactgctcttcattgttgtttcacta 13793295  T
Q  273 ttaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacatt 336  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  13793294 ttaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaaatgaaacaaaaggaacatt 13793231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 171 - 342
Target Start/End: Original strand, 11476653 - 11476824
Alignment:
Q  171 caatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcac 270  Q
    |||||||||||||  | || ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  11476653 caatgttcatttataactacgaacattgaagtgctaggaatattccaaaagggaatatcatcctagatgtttcaatcactgctcttcattgttgtttcac 11476752  T
Q  271 tattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||| |||| |||| |||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  11476753 tattagaattttattacatcaaatggtattcttacagattatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgatg 11476824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14601199 - 14600868
Alignment:
Q  11 agagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtac 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||  |||||||| ||  ||||| ||| | | || ||||| |||||||    
T  14601199 agaggtcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaagaacatt-atcaagaacatgcaagtcatttgtgatatgaacaaatgtccagaaaagtac 14601101  T
Q  111 atttgcatggataaatc-aagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactagg 208  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| || || | |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||| |    
T  14601100 gtttgcatggatcaatcaaagcaataaagacatttataaagttaaatgtcaaaaaggatattcaatgttca-ttaagactataaacattgaagtactaag 14601002  T
Q  209 aatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttc-attgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaa 307  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||||||   || ||||| |||| ||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||     ||||||||||    
T  14601001 aatattcca-atgtgaatatcatcctagatgttgcaattactgcacttcaattatgttttcactattagga-ttgattacatcaagtacaagtcttacaa 14600904  T
Q  308 atcatcctaagt-gaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||    
T  14600903 atcatcctatgtaaaaacaaatggaacattctgatg 14600868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 1292925 - 1293259
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || ||||||  |||||||| ||| | ||||||| | | || ||||  |||    
T  1292925 aagcaaaggtcagaaagttgttcttatgcaagtcaataatctcaagaacatt-atcaagaacatgcaagtcacttatgacatgaacaaatgtccataaaa 1293023  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 205  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| | |  ||| ||||| |||||||||||| ||| | |||| |||||||||||| |||||    
T  1293024 gtacatttgcatggatcaatcaaacaataaagacatttacaaagttaaatgacaaaagggatattcaatgatca-tcaagactatgaacattgaagtact 1293122  T
Q  206 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttca-ttgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtctta 304  Q
    |||||||||||| |   |||||||||| ||||||||   || ||||| ||||| || |  |||||||||||||| ||||||| |||||     |||||||    
T  1293123 aggaatattcca-atttgaatatcatcttagatgttgcaattactgcacttcagttatgttttcactattagga-ttgattacatcaagtacaagtctta 1293220  T
Q  305 caaatcatcctaagtg-aaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||| || ||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  1293221 caaataatactaagtgaaaacaaatggaacattctgatg 1293259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17838311 - 17838171
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  17838311 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 17838213  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  17838212 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 17838171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 325
Target Start/End: Original strand, 19917979 - 19918051
Alignment:
Q  253 tcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 325  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19917979 tcttcattattgtttcactattaggaattgattacatcaaatggatgtcttgcaaatcatcctaagtgaaaca 19918051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17828920 - 17828780
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||  |||||||||    
T  17828920 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaaggctatgaacat 17828822  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  17828821 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 17828780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 53946724 - 53946492
Alignment:
Q  82 gtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggatta-tgtcaaaaaggatattcaatgttcat 180  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |  ||||| |  | ||||||||||| | ||||| ||||||    
T  53946724 gtgacataaatatatgtccaggaaagtacatttgcatggatgtatc-agcaataaaggcttggacaagcaaaagtgtcaaaaagg-tgttcaaggttcat 53946627  T
Q  181 ttaagattatgaaca-ttgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttc-actattagga 278  Q
    | |||| |||||||| |||| || |||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||| | | ||||| ||||| |  ||| || |||| |||||    
T  53946626 tcaagactatgaacacttgaagttctaggaatattcca-aagaggatattatcttagatgttact-ttactgcacttcagttgtgtctctactagtagga 53946529  T
Q  279 tttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaa 317  Q
     ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  53946528 -ttgattacatcaaaa-gtagtcctacaaatcatcctaa 53946492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7847176 - 7847058
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||| ||||  |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  7847176 tccagaaaagtacatttgcatggatctatcaacaaataaaggcatgaacaaggatctatgccaaa--ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 7847079  T
Q  197 tgatgtactaggaatattcca 217  Q
    | | |||||||||||||||||    
T  7847078 taaagtactaggaatattcca 7847058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16211530 - 16211376
Alignment:
Q  161 aaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcatt 260  Q
    ||||||| || ||||||||  ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||| | | ||||| ||||| |    
T  16211530 aaaggatctttaatgttcacctaagactatgaacattaaagtactaggaatattcca-atgagaatattatcctagatgttact-ttactgcacttcagt 16211433  T
Q  261 gttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggt-agtcttacaaatcatcctaa 317  Q
      ||||| ||||||| || ||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  16211432 tgtgttttactatta-gagttgattacatcaaaagttaagtcttacaaatcaacctaa 16211376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 217
Target Start/End: Original strand, 16629168 - 16629287
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  16629168 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 16629266  T
Q  197 tgatgtactaggaatattcca 217  Q
    | | |||||||||||||||||    
T  16629267 taaagtactaggaatattcca 16629287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 325
Target Start/End: Original strand, 26458170 - 26458232
Alignment:
Q  263 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 325  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26458170 tgtttcactattaggagttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 26458232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 340
Target Start/End: Original strand, 41525672 - 41525757
Alignment:
Q  254 cttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttga 340  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  41525672 cttcatttatgttttactattaggatttaattacatcaaatggatgtcttacaaatcatcctaagtaaaacaaat-gaacattttga 41525757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 313
Target Start/End: Original strand, 2829181 - 2829410
Alignment:
Q  82 gtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggatta-tgtcaaaaaggatattcaatgttcat 180  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||  |||| | ||||||||| |  ||||| |  | ||||||||||| | ||||| ||||||    
T  2829181 gtgacataaatatatatccaggaaagtacaattacatggatgtatca-gtaataaaggcttggacaagcaaaagtgtcaaaaagg-tcttcaaggttcat 2829278  T
Q  181 ttaagattatgaaca-ttgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttc-actattagga 278  Q
    | |||| |||||||| |||| || ||||||||||| || ||| | |||| || ||||| |||| | | ||||| ||||| |  ||| || ||||||||||    
T  2829279 tcaagactatgaacacttgaagttctaggaatatttca-aagaggatattattctagaggttacttt-actgcacttcagttatgtctctactattagga 2829376  T
Q  279 tttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatc 313  Q
    || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2829377 tt-gattacatcaaaaagtagtcttacaaatcatc 2829410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17421568 - 17421506
Alignment:
Q  263 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 325  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17421568 tgtttcactattaggaattgattacatcaattacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 17421506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 295
Target Start/End: Original strand, 16472311 - 16472503
Alignment:
Q  101 aggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggatta-tgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaaca-ttg 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||| |  | ||||||||||| | ||||| ||||||| |||| |||||||| |||    
T  16472311 aggaaagtacaattgcatggatggatc-agcaataaaggcttagacaagcaaaagtgtcaaaaagg-tcttcaaggttcattcaagactatgaacacttg 16472408  T
Q  199 atgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttc-actattaggatttgattagatcaaaag 295  Q
    | || |||||||||||||| ||| | |||| |||| ||| |||| | | ||||| ||||||| |||| || |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16472409 aagttctaggaatattcca-aagaggatattatcccagaggttact-ttactgcacttcatttttgtctctactattagga-ttgattacatcaaaag 16472503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 270 - 325
Target Start/End: Original strand, 30651390 - 30651445
Alignment:
Q  270 ctattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 325  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30651390 ctattagaatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 30651445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 323
Target Start/End: Original strand, 16058066 - 16058126
Alignment:
Q  263 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaa 323  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||    | |||||||||||||||||| |||||    
T  16058066 tgttccactattaggatttgattacatcaaataagaatcttacaaatcatcctaattgaaa 16058126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 42033759 - 42034098
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42033759 aagcagagatcagaaggttgttcttatgcaagccaagaatctcaagaactttgatcaagatcatgcaaggcacatgtgacatggatatatgtccaggaaa 42033858  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42033859 gtacatttgcatagatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 42033958  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatg----ttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  42033959 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaattaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcagatggtagtct 42034058  T
Q  303 tacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  42034059 tacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 42034098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 8539818 - 8540154
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8539818 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaataatctcaagaactttgatcaaggtcatgcaaggcatatgtgacatggatatatgtccaggaaa 8539917  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaa-aggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  8539918 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatataaggattatgtaaaaaaaggatattcaatgttaatttaagaccatgaacattgatgtact 8540017  T
Q  206 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8540018 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttac 8540117  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  8540118 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 8540154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 21885881 - 21886216
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21885881 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatcaagatcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaaa 21885980  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21885981 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggtattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 21886080  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21886081 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 21886180  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21886181 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 21886216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 8605057 - 8605393
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8605057 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaataatctcaagaactttgatcaaggtcatgcaaggcatatgtgacatggatatatgtccaggaaa 8605156  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaa-aggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  8605157 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatataaggattatgtaaaaaaaggatattcaatgttaatttaagaccatgaacattgatgtact 8605256  T
Q  206 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8605257 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttaagtattaggatttgattacatcaaatggtagtcttac 8605356  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  8605357 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 8605393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 13964463 - 13964798
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||    
T  13964463 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaaaacaagaatctcaagaacattgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacattgatatatgtttaggaaa 13964562  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13964563 gtagatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatgcaaggattatgtcaaaaaggatactcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 13964662  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  13964663 ggaatattccacaagggaatatcatcctagaggttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatctaatggtagtcttaca 13964762  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  13964763 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 13964798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 2115568 - 2115903
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  2115568 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatcaagatcatgcaaggcacatgtgacatgggaatatgtccaggaaa 2115667  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2115668 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatataaaaggattatgttaaagaaggtattcaatgttcatttaagactatcaacattgatgtacta 2115767  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2115768 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 2115867  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  2115868 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 2115903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30550098 - 30549763
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  30550098 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatcaagatcatgcaagtcacatgtgacatgtgtatatgtccaggaaa 30549999  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30549998 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggtattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 30549899  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30549898 ggaatattccacaagggaatatcatgctagatgttaaaatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 30549799  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  30549798 aatcatcttaagtgaaacagatggaacattctgatg 30549763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 25019035 - 25019371
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 105  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25019035 aagcagagattagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaa 25019134  T
Q  106 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  25019135 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgaagtact 25019234  T
Q  206 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  25019235 aggaatatttcacaagggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 25019334  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  25019335 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 25019371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 21458205 - 21458531
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21458205 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 21458304  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21458305 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 21458404  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  21458405 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 21458504  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  21458505 aagtgaaacagatggaacattctgatg 21458531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 16154450 - 16154786
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |     
T  16154450 aagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccagaag 16154549  T
Q  106 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 205  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16154550 agtatatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagggttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 16154649  T
Q  206 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  16154650 aggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 16154749  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16154750 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 16154786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2370900 - 2370565
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| || || ||||||    
T  2370900 aagcatagatcaaaaggttgttcttatacaagcccaaaatctcaagaacattgatcaaggtcatggaatgcacatgtgacatgaataaatgtcaaggaaa 2370801  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2370800 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataatggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatactcaatgttcatttaagactatgaacattgaagtacta 2370701  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  2370700 gaaatattccaaaagggaatatcatcctagatgttaaaatcattgctcttcattgttttttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttata 2370601  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  2370600 aatcatcataagtgaaacaaaaagaacattttgatg 2370565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 18382930 - 18383264
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  18382930 aagcagagatcagaaagttgttcttacacaagccaagaatctcaagaacattgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggttaaatgtccaggaaa 18383029  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
     |||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  18383030 atacatt-gcatagatcaatcaagcaataatggcatatacaaggattatgtcaaaaaagatattcaatgttcatttaagacaatgaacattgaagtacta 18383128  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||    
T  18383129 gaaatattccaaaagggaatatcatcctagatgttaaattcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttaattacatcaaatgatagtcttaca 18383228  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  18383229 aatcatcctaagtgaaacaaaaggaacgttctgatg 18383264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 276
Target Start/End: Original strand, 1968905 - 1969174
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  1968905 aagcagagatcagaaggttattcttatacaagccaagaatctcaagaacattgattaaggtcatgcaaggcacatgtgatatggatatatgtctaggaaa 1969004  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1969005 gtacaaattcatggatcaatcaagcaataaaggaatatacaaggattatgtcaaaaaagatacttaatgttcatttaagattatggacattgatgtacta 1969104  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattag 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1969105 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattag 1969174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1186911 - 1186578
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||| || ||||||  ||| |||||||||||| ||||| ||| || | ||| |||    
T  1186911 aagcagatttcataaggttgttcttatgcaagcccagaaactcaagaacatt-atcaagaacatacaaggcacatgtaacatgaataaatgttcagtaaa 1186813  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||||  |||| || |||||| |||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1186812 gtacattatcatgtatcaatcaaacaataaagacatttacaagaataatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagactatgaacattgaagtacta 1186713  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  1186712 gaaatattcca-aagagaatatcatcctagatgttacaatctctgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggaagtcttaca 1186614  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||    
T  1186613 aatcatcataagtgaaacaaaaggaacattctgatg 1186578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18062712 - 18062378
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||||||  ||||||||  | | |||||||| | | || |||||||||    
T  18062712 aagcagagttcaaaaggttgttcttatacaagcctagaatctcaagaacatt-atcaagaacatgcaagctatacgtgacatgaacaaatgtccaggaaa 18062614  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18062613 gtacatctccatggatcaatgaagcaataaagacatttataaggttaatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagactatgaacattgaagtacta 18062514  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
      ||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  18062513 taaatattccaaaagggaatatcatcttatatgttaaaatcactgctcttcattgttgttccactgttagaatttgattacatcaaatggtagtcttaca 18062414  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||    
T  18062413 aataatcctaagtgaaacaaaagaaacattctgatg 18062378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41544634 - 41544399
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  41544634 aagcaaagattagaaggttgttcttacacaaaccaagaatctcaagaacattgatcaaggtcatgcaagacacatgtgacatggatatatgtccacgaaa 41544535  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaa-gcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 205  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  41544534 gtacatttgcatggatctatcaaagcaacaaaggcatatacaaggactatgtcaaaaaggatgctcaatgttcatttaagactatgaacgttgatgtact 41544435  T
Q  206 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgtt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41544434 aggaatattccacaagggaatattatcctagatgtt 41544399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 325
Target Start/End: Original strand, 34822603 - 34822911
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| |||   ||  || ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |  | ||| ||||||||||      
T  34822603 tcagaaggttgttcttatacaagcccagaagctcgtgaatatt-atcaagaacatgcaaggcacatgtgacatgaataaaggttcagtaaagtacattgt 34822701  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacatt-gatgtactaggaatatt 214  Q
    | ||||| |||||||||||||||| || ||||||  | |||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  34822702 cttggatcaatcaagcaataaaggaatttacaagattaatgtcaaaaaagatcttcattgttcatttaagactatgaacatttgaagtactaggaatatt 34822801  T
Q  215 ccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcc 314  Q
    | | ||| ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  34822802 cta-aagagaatatcatactagatgttacaaacactgcacttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcc 34822900  T
Q  315 taagtgaaaca 325  Q
    |||||||||||    
T  34822901 taagtgaaaca 34822911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Original strand, 22956125 - 22956452
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| || || ||||||    
T  22956125 aagcagagttcagaagggttctcttatacaagccaagaatctcaagaacatt-atcaagatcatgcaagtcacacgtgacatgaataaatgtctaggaaa 22956223  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||||| |||| || |||||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22956224 gtacattttcatgaatcaatcaaacaatagaggcatttacaaggttaatgtcaaaaaggatatttaaggttcatttaagactatgaacattgaagtacta 22956323  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttca-ttgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
     |||||||||| |   |||||||||||||||||||   |||||||| ||||| || |  |||||||||||||| ||| ||| ||||||    ||||||||    
T  22956324 agaatattcca-ataagaatatcatcctagatgttgcaatcactgcacttcagttatgttttcactattagga-ttgtttacatcaaatacaagtcttac 22956421  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacatt 336  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22956422 aaatcatcctaagtgaaacaaatggaacatt 22956452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 224 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 41544386 - 41544268
Alignment:
Q  224 aatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41544386 aatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcagtgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaa 41544287  T
Q  324 catatggaacattttgatg 342  Q
    || |||||||||| |||||    
T  41544286 cagatggaacattctgatg 41544268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 22406761 - 22406646
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |     
T  22406761 aagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgaccaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatacgtccagaag 22406662  T
Q  106 agtacatttgcatgga 121  Q
    ||||||||||||||||    
T  22406661 agtacatttgcatgga 22406646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 217
Target Start/End: Original strand, 21782349 - 21782468
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaaca-t 196  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| | ||||| ||||||| |||| ||| |||| |    
T  21782349 tccagtaaagtacatctacatggatcaatcaagcaataaaggcatttacaagaataatgtcaaaaagg-tcttcaaggttcattcaagactataaacact 21782447  T
Q  197 tgatgtactaggaatattcca 217  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  21782448 tgaagtactaggaatattcca 21782468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 26193864 - 26193724
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  26193864 tccagtaaagtacatttgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 26193766  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  26193765 taaagtactaggaatattcca-atgagaatattatcctagatg 26193724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21821889 - 21821739
Alignment:
Q  68 catgcaaggcacatgtgacatggatata-tatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaagga 166  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||| | | ||||| ||||||||| | | || || ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |     
T  21821889 catgcaacgtacatgtgacatgaataaaatgtccagtaaagtacatctacttgaatcaatcaagcaataaaggcatttacaagaataatgtcaaaaaag- 21821791  T
Q  167 tattcaatgttcatttaagattatgaaca-ttgatgtactaggaatattcca 217  Q
    | ||||| ||||||| |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  21821790 tcttcaaagttcattcaagactatgaagacttgaagtactaggaatattcca 21821739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Original strand, 20308505 - 20308645
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  20308505 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 20308603  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  20308604 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 20308645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Original strand, 25867917 - 25868057
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  25867917 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 25868015  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  25868016 taaggtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 25868057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18097356 - 18097139
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacatt 197  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |  ||||||  ||||| |  ||||| ||| | || || ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18097356 tccaggaaagtacagttgcatggatcaatcaagaacttgaggcattcacaagaacaatgtctaaatg-atctttaatgttcatctaagactatgaacatt 18097258  T
Q  198 gatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgt---ttcactattaggatttgattagatcaaaa 294  Q
     | ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||    ||||||| |||  | |||||   |||||||||| || |||| || |||||||    
T  18097257 aaagtactaggaatattcca-atgagaatattatcctagatgttgcattcactgcactt--tggttgtatcttcactatta-gaattgactacatcaaaa 18097162  T
Q  295 ggtagtcttacaaatcatcctaa 317  Q
    |  ||||||||||||||||||||    
T  18097161 gtaagtcttacaaatcatcctaa 18097139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1989732 - 1989673
Alignment:
Q  266 ttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1989732 ttcactattaggatttgattacatcaaatacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 1989673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 52955535 - 52955473
Alignment:
Q  263 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52955535 tgtttcactattagaatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 52955473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1982314 - 1982255
Alignment:
Q  266 ttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1982314 ttcactattaggatttgattacatcaaatacaagtcttacaaatcattctaagtgaaaca 1982255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20328792 - 20328673
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||  |||||  |||||||||||  | |||||  |||||||||| |||| || |||||| || ||||| |||||||||    
T  20328792 tccagaaaagtacatatgcatgaatctatcaacaaataaaggcatggaaaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgtttatctaagactatgaacat 20328694  T
Q  197 tgatgtactaggaatattcca 217  Q
    | | |||||||||||||||||    
T  20328693 taaagtactaggaatattcca 20328673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Original strand, 20314189 - 20314329
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||| ||||| | |||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||| ||  |||| |||||||||    
T  20314189 tccagaaaattacatatacatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgtttatccaagactatgaacat 20314287  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  20314288 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 20314329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20318412 - 20318328
Alignment:
Q  153 tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    |||||||||||| || || |||||||||  |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  20318412 tatgtcaaaaag-atctttaatgttcatccaagactatgaacattaaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 20318328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Original strand, 27065724 - 27065864
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaagg-attatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||  |||||  |||||||||||  |||||| | |||||| |||||||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  27065724 tccagaaaagtacatctacatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtc-aaaaggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 27065822  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | | |||| |||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  27065823 taaagcactaagaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 27065864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 325
Target Start/End: Original strand, 50940948 - 50941049
Alignment:
Q  223 gaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||  |  | ||| |||| ||| ||||| |||||||  ||| | ||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  50940948 gaatatcatcctagatgttatgaaaattgcacttcgttgatgttttactattaaaattgg-ttacatcaaatggaagtcttacaaattatcctaagtgaa 50941046  T
Q  323 aca 325  Q
    |||    
T  50941047 aca 50941049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4711 - 4376
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4711 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagaatcacaagaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatgtccaggaaa 4612  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  4611 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgtgcatttgagactatgaacattgatgtacta 4512  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  4511 ggaatattccataagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcattgtagtttcactattaagatttgattacatcaaatggtagtcttaca 4412  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  4411 aatcatcctaagtgaaatagatggaacattctgatg 4376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 29540025 - 29540360
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29540025 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaggtcatgcaaagcacatgtgacatggatatatgtccaggaaa 29540124  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29540125 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaagacatatacaagaattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 29540224  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  29540225 ggaatatcccacaagggaatatcatcctagatgttaacatcattactcttcattcttgtttcactattagaatttgattacatcaaatggtagtcttaca 29540324  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  29540325 aatcatcctaagtgaaacaaatggaacattctgatg 29540360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 14791170 - 14791506
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14791170 aagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaa 14791269  T
Q  106 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14791270 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 14791369  T
Q  206 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14791370 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttac 14791469  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  14791470 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattatgatg 14791506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 12454630 - 12454956
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12454630 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 12454729  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  12454730 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 12454829  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  12454830 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 12454929  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  12454930 aagtgaaacagatggaacattctgatg 12454956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24922494 - 24922158
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24922494 aagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggacatgcaaggcacatgtgacatagatatatgtccaggaa 24922395  T
Q  106 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24922394 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 24922295  T
Q  206 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  24922294 aggaatatttcacaagggaatatcatcctagatgttattattactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 24922195  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24922194 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 24922158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 16897523 - 16897849
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16897523 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 16897622  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  16897623 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 16897722  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||    
T  16897723 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgttcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcattct 16897822  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  16897823 aagtgaaacagatggaacattctgatg 16897849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 16908176 - 16908502
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16908176 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 16908275  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  16908276 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 16908375  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||    
T  16908376 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgttcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcattct 16908475  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  16908476 aagtgaaacagatggaacattctgatg 16908502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 20911849 - 20912185
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |     
T  20911849 aagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccagaag 20911948  T
Q  106 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 205  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20911949 agtacatttgcatgaatcaatcaagcaataaaggcatatacaagggttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 20912048  T
Q  206 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  20912049 aggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 20912148  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  20912149 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 20912185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24931530 - 24931194
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24931530 aagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaatagtctcaagaactttgatcaaaggacatgcaaggcacatgtgacatagatatatgtccaggaa 24931431  T
Q  106 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24931430 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 24931331  T
Q  206 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  24931330 aggaatatttcacaagggaatatcatcctagatgttattattactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 24931231  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24931230 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 24931194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 31357137 - 31357463
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  31357137 tcagaaggtagttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacataaatatatgtccaggaaagtacatttg 31357236  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  31357237 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 31357336  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||    
T  31357337 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcagcct 31357436  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  31357437 aagtgaaacagatggaacattctgatg 31357463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 31366865 - 31367191
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  31366865 tcagaaggtagttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacataaatatatgtccaggaaagtacatttg 31366964  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  31366965 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 31367064  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||    
T  31367065 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcagcct 31367164  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  31367165 aagtgaaacagatggaacattctgatg 31367191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 18159638 - 18159964
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18159638 tcagaaggttattcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 18159737  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  18159738 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaatactatgaacattgatgtactaggaatattt 18159837  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||    
T  18159838 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcagcct 18159937  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  18159938 aagtgaaacagatggaacattctgatg 18159964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 18169450 - 18169776
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18169450 tcagaaggttattcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 18169549  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  18169550 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaatactatgaacattgatgtactaggaatattt 18169649  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||    
T  18169650 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcagcct 18169749  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  18169750 aagtgaaacagatggaacattctgatg 18169776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Original strand, 3285418 - 3285748
Alignment:
Q  13 agatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaag-gtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtaca 111  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3285418 agatcagaaggttgttcttaaaaaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaagtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaaagtaca 3285517  T
Q  112 tttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaa-aaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3285518 tttgcatggatcaatcaagaaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaagga-attcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaa 3285616  T
Q  211 tattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatc 310  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  3285617 tatttcacaaggaaatatcatcctagatgttagttttactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatc 3285716  T
Q  311 atcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  3285717 atcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 3285748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 98 - 342
Target Start/End: Original strand, 18200876 - 18201119
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  18200876 tccaggaaagtacatttgcatggatcaataaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatatccaatgttcatttaagactatgaagatt 18200975  T
Q  198 gatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18200976 gatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatc-aaaggt 18201074  T
Q  298 agtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  18201075 agtcttacaaatcatcctaagtgatacagatggaacattctgatg 18201119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 80 - 342
Target Start/End: Original strand, 14044956 - 14045217
Alignment:
Q  80 atgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttca 179  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044956 atgtgacatggatacttgtctaggaaag-atatttgcatcgatcaatcaagcaataaagacatatataagaattatgtcaaaaaggatattcaatgttca 14045054  T
Q  180 tttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggat 279  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  14045055 tttaagactatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgtttttcattgttgtttcactattaggat 14045154  T
Q  280 ttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  14045155 ttgattacatcaaaagatagtctcacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattatgatg 14045217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 68 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27788000 - 27787726
Alignment:
Q  68 catgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggat 167  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| || | |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  27788000 catgcaaggcacacatgacatgaataaatgttcaggaaagtacacttgtatggatcaatcaagcaataaaggcatttacaaggttaatgtcaaaaaggat 27787901  T
Q  168 attcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgttt 267  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27787900 attcaatgttcatttaagactatgaacattgaagtactaggaatattccaaaagggaatatcatcctagatgttacaatcactgctcttcattgttgttt 27787801  T
Q  268 cactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  27787800 cactattaggatatgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgatg 27787726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Original strand, 16320945 - 16321085
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || ||||||||| ||||| |||||||||    
T  16320945 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatgaacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatctaagactatgaacat 16321043  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  16321044 taaagtactaggaatattcca-atgagaatatcatcctagatg 16321085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 26021529 - 26021389
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  26021529 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 26021431  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  26021430 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 26021389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 9761732 - 9761632
Alignment:
Q  223 gaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| ||||||  | | |||||||||||||||||||||||    
T  9761732 gaatatcatcctagatgttatacacactgcacttcattgatgttttactgttaagatttgattacatcaaatagaaatcttacaaatcatcctaagtgaa 9761633  T
Q  323 a 323  Q
    |    
T  9761632 a 9761632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 317
Target Start/End: Original strand, 1596091 - 1596309
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  1596091 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatgaacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatacaagactatgaacat 1596189  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaagg 296  Q
    | | |||||||||||||| || | | |||||| |||||||||| |    ||||||| ||||| |  ||| | ||||||||| |||||||| || |||||     
T  1596190 taaagtactaggaatatttca-atgagaatattatcctagatgatgcattcactgcacttcagttgtgtcttactattagg-tttgattacattaaaagt 1596287  T
Q  297 t-agtcttacaaatcatcctaa 317  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  1596288 taagtcttacaaatcaacctaa 1596309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 254 - 323
Target Start/End: Original strand, 28092398 - 28092467
Alignment:
Q  254 cttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaa 323  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| || |||||||||||||    
T  28092398 cttcattgatgtttcactattaggatttgattacatcaaatgagagtcttacacataatcctaagtgaaa 28092467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 239
Target Start/End: Original strand, 16333155 - 16333233
Alignment:
Q  160 aaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  16333155 aaaaggatctttaatgttcatctaagactatgaacattaaagtactaggaatattcca-atgagaatatcatcctagatg 16333233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 791582 - 791505
Alignment:
Q  161 aaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    ||||||| || |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  791582 aaaggatctttaatgttcattcaagactatgaacattaaagtactaggaatattcca-atgagaatatcatcctagatg 791505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8563487 - 8563405
Alignment:
Q  263 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatgtcc 345  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||    
T  8563487 tgtttcaatattaggatttgattacatcaattaagagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgaagtcc 8563405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22223837 - 22223775
Alignment:
Q  263 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22223837 tgtttcactattaggatttgattacatcaattaaaagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 22223775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22249672 - 22249610
Alignment:
Q  263 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22249672 tgtttcactattaggatttgattacatcaattaaaagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 22249610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 313
Target Start/End: Original strand, 16923219 - 16923439
Alignment:
Q  91 atatatatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggatta-tgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagatta 189  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| |  ||||| |  | |||||||||| ||  |||| ||| ||| |||| ||    
T  16923219 atatatgtccaggaaagtacaattgcatggatgtatca-gcaataaaggcttggacaagcaaaagtgtcaaaaag-atcctcaaggttaattcaagacta 16923316  T
Q  190 tgaaca-ttgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttc-actattaggatttgattag 287  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||| ||| | |||| |||||||| |||| | | ||||| ||||| |  ||| || |||||||||||| |||||     
T  16923317 tgaacacttgaagttctaggaatattcca-aagaggatattatcctagaggttacttt-actgcacttcagttatgtctctactattaggatt-gattac 16923413  T
Q  288 atcaaaaggtagtcttacaaatcatc 313  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16923414 atcaaaaagtagtcttacaaatcatc 16923439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18712697 - 18712578
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaagg-attatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||| | |||||| |||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||    
T  18712697 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtc-aaaaggatctttaatgttcatctaagactatgaacat 18712599  T
Q  197 tgatgtactaggaatattcca 217  Q
    | |  ||||| ||||||||||    
T  18712598 taaactactatgaatattcca 18712578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24505825 - 24505686
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||  |||||  |||||| ||||  |||||||  ||||| ||||||||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  24505825 tccagaaaagtacatctgcatagatctatcaacaaataaaagcatggacaaggaactatgt-aaaaaggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 24505727  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagat 238  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||    
T  24505726 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagat 24505686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 317
Target Start/End: Original strand, 26161616 - 26161760
Alignment:
Q  172 aatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcact 271  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| |    ||||||| ||||| |  ||||| |||    
T  26161616 aatgttcaatcaagactatgaacattaaagtactaggaatattcca-atgagaatataatcctagatgatgcattcactgcacttcagttgtgttttact 26161714  T
Q  272 attaggatttgattagatcaaaaggt-agtcttacaaatcatcctaa 317  Q
    |||| || ||||||| || ||||| | |||||||||||||| |||||    
T  26161715 atta-gagttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaa 26161760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30658573 - 30658341
Alignment:
Q  82 gtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggatta-tgtcaaaaaggatattcaatgttcat 180  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| |   |||| |  | ||||||||||| | ||||| ||||||    
T  30658573 gtgacataaatatatgtccaggaaagtacaattgcatggatgtatca-gcaataaaggcttgggcaagcaaaagtgtcaaaaagg-tcttcaaggttcat 30658476  T
Q  181 ttaagattatgaaca-ttgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttc-actattagga 278  Q
    | |||| |||||||| |||| || ||||||||||| || |  ||| ||| |||||||| |||| | | || || ||||| |  ||| || ||||||||||    
T  30658475 tcaagactatgaacacttgaagttctaggaatatttcatagagga-tattatcctagaggttacttt-accgcacttcagttgtgtctctactattagga 30658378  T
Q  279 tttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaa 317  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30658377 tt-gattacatcaaaag-tagtcttacaaatcatcctaa 30658341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24361931 - 24361878
Alignment:
Q  272 attaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 325  Q
    ||||||||||||||| |||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24361931 attaggatttgattacatcaattaaaagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 24361878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Original strand, 7938 - 8267
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  7938 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaggtcatgcaagacacatgtgacatgggtatatgtccaggaaa 8037  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8038 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcataaacaaggattatgtcaaagaggttattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 8137  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  8138 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcataattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 8237  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacatt 336  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8238 aatcatcctaagtgaaacagatggaacatt 8267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 15416 - 15751
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15416 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaggtcatgcacggcatatgtgacatgggtatatgtccaggaaa 15515  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15516 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggaatatgtcaaagaggttattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgaacta 15615  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15616 ggaatattccacaagggaacatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 15715  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15716 aatcatcctaagtgaaacaaatggaacattctgatg 15751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 93353 - 93018
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  93353 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctaaagaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtctaggaaa 93254  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  93253 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacagggattatgtcaaagaggttattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 93154  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  93153 ggaatattccaaaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatagtagtcttaca 93054  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  93053 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 93018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 14943875 - 14944210
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14943875 aagcagagatcggaaggtttttcctatacaggccaagaatctcaagaacattgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatctgtccaggaaa 14943974  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14943975 gtacatttgcatggatcaattaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatactcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 14944074  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  14944075 ggaacattccacaagggaatatcatcctatatgttaatataactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 14944174  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  14944175 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 14944210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 15371468 - 15371803
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  15371468 aagcagagatcggaaggtttttcctatacaggccaagaatctcaagaacattgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgtatatttgtccaggaaa 15371567  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15371568 gtacatttgcatggatcaattaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatactcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 15371667  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15371668 ggaacattccacaagggaatatcatcctatatgttaatataactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 15371767  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15371768 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 15371803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 42620747 - 42621082
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||    
T  42620747 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatcaagatcatgcaaggcacatgtgacatgagaatatgtccaggaaa 42620846  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||    
T  42620847 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatataaaaggattatgtaaaaaaagaaattcaatgttcatataagaatataaacattaatgtacta 42620946  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  42620947 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 42621046  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  42621047 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 42621082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9535735 - 9535399
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9535735 aagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaatagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaa 9535636  T
Q  106 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9535635 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcattgttcatttaagactatgaacattgatgtact 9535536  T
Q  206 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  9535535 aggaatatttcacaagggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 9535436  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9535435 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 9535399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9546018 - 9545682
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9546018 aagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaa 9545919  T
Q  106 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9545918 agtacatttgcatggatcaatcaagaaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcattgttcatttaagactatgaacattgatgtact 9545819  T
Q  206 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  9545818 aggaatatttcacaagggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 9545719  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9545718 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 9545682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 18 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26348632 - 26348308
Alignment:
Q  18 agaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgca 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26348632 agaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttgca 26348533  T
Q  118 tggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattcca 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26348532 tggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatatttca 26348433  T
Q  218 caagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaa 317  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26348432 caaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaa 26348333  T
Q  318 gtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||| |||||||||| |||||    
T  26348332 gtgaaacagatggaacattctgatg 26348308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5382300 - 5381974
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5382300 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 5382201  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  5382200 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 5382101  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  5382100 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 5382001  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  5382000 aagtgaaacagatggaacattctgatg 5381974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5391938 - 5391612
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5391938 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 5391839  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  5391838 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 5391739  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  5391738 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 5391639  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  5391638 aagtgaaacagatggaacattctgatg 5391612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 5926712 - 5927038
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5926712 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 5926811  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  5926812 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 5926911  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  5926912 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 5927011  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  5927012 aagtgaaacagatggaacattctgatg 5927038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 8500626 - 8500952
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8500626 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 8500725  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  8500726 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 8500825  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  8500826 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 8500925  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  8500926 aagtgaaacagatggaacattctgatg 8500952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 8511096 - 8511422
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8511096 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 8511195  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  8511196 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 8511295  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  8511296 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 8511395  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  8511396 aagtgaaacagatggaacattctgatg 8511422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 46496691 - 46497017
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  46496691 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 46496790  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  46496791 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 46496890  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  46496891 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 46496990  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  46496991 aagtgaaacagatggaacattctgatg 46497017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 46507303 - 46507629
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  46507303 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 46507402  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  46507403 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 46507502  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  46507503 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 46507602  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  46507603 aagtgaaacagatggaacattctgatg 46507629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 341
Target Start/End: Original strand, 6544382 - 6544707
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6544382 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 6544481  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  6544482 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 6544581  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  6544582 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 6544681  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgat 341  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  6544682 aagtgaaacagatggaacattctgat 6544707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 43983054 - 43983380
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  43983054 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 43983153  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  43983154 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 43983253  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||    
T  43983254 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcagcct 43983353  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  43983354 aagtgaaacagatggaacattctgatg 43983380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 341
Target Start/End: Original strand, 6534083 - 6534408
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6534083 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 6534182  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  6534183 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactataaacattgatgtactaggaatattt 6534282  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  6534283 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 6534382  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgat 341  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  6534383 aagtgaaacagatggaacattctgat 6534408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 18 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26363667 - 26363360
Alignment:
Q  18 agaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgca 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26363667 agaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttgca 26363568  T
Q  118 tggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattcca 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26363567 tggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatatttca 26363468  T
Q  218 caagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaa 317  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26363467 caaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcctaa 26363368  T
Q  318 gtgaaaca 325  Q
    ||||||||    
T  26363367 gtgaaaca 26363360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 44896894 - 44897220
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  44896894 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtggtcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 44896993  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |     
T  44896994 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatactt 44897093  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  44897094 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 44897193  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  44897194 aagtgaaacagatggaacattctgatg 44897220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 44907297 - 44907623
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  44907297 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtggtcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 44907396  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |     
T  44907397 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatactt 44907496  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  44907497 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 44907596  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  44907597 aagtgaaacagatggaacattctgatg 44907623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 32097947 - 32098283
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |     
T  32097947 aagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatacgtccagaag 32098046  T
Q  106 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32098047 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagggttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 32098146  T
Q  206 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||    
T  32098147 aggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattgcatcaaatgatagtcttac 32098246  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32098247 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 32098283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 32108384 - 32108720
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |     
T  32108384 aagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatacgtccagaag 32108483  T
Q  106 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32108484 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagggttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 32108583  T
Q  206 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||    
T  32108584 aggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattgcatcaaatgatagtcttac 32108683  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32108684 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 32108720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11626848 - 11626523
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  11626848 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 11626749  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  11626748 catg-atcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 11626650  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||    
T  11626649 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattgcatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 11626550  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  11626549 aagtgaaacagatggaacattctgatg 11626523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16132399 - 16132073
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  16132399 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacataaatatatgtccaggaaagtacatttg 16132300  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  16132299 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgacgtactaggaatattt 16132200  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
      ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  16132199 ttcaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 16132100  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  16132099 aagtgaaacagatggaacattctgatg 16132073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16142948 - 16142622
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  16142948 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacataaatatatgtccaggaaagtacatttg 16142849  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  16142848 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgacgtactaggaatattt 16142749  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
      ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  16142748 ttcaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 16142649  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  16142648 aagtgaaacagatggaacattctgatg 16142622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 14249034 - 14248719
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||| ||| | |||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||| || |||| ||||    
T  14249034 aagcagagttcagaaggctattcttatataagcccagaaactcaagaacattgatcaagatcatgcaaggcacacgtgaaattaataaatgtccaagaaa 14248935  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  14248934 gtacatttgcatggatcaatcaagaaataaaggcatatacaagatttatgtcaaaaatgatactcaatgttcatttaagactatgaacattgaagtacta 14248835  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
      ||||||||| | | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  14248834 taaatattcca-aggagaatatcatcctagatgttacaatcactgctcttcattgttgtttcactataaggattcgattacatcaaatggtagtcttaca 14248736  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaa 323  Q
    |||||||| ||||||||    
T  14248735 aatcatcccaagtgaaa 14248719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2992409 - 2992074
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||| || ||||||   |||||||||||| |||||||| ||| ||   |||||||    
T  2992409 aagcagagttcagaatgttgttcttatacaagtccagaaactcaagaacatt-atcaagagtatgcaaggcacacgtgacatgaataaatgcgcaggaaa 2992311  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgt--caaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtac 204  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||    
T  2992310 gtaaacttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatttacaag-attaaattgcaaaaaggatattcaatgttcatttaagactatagacattgaagtac 2992212  T
Q  205 taggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtctta 304  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  2992211 taggaatatttcaaaagggaatatcatcctagatgttacaatcacttctcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtctta 2992112  T
Q  305 caaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
     |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||    
T  2992111 gaaatcatcctaaatgaaacaaaaggaacattctgatg 2992074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 9006474 - 9006808
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| ||| || ||||||  ||||||||| |||  ||||||| ||| || ||||  |||    
T  9006474 aagcagagttcagaagattgttcttataaaagcccagaatctcaagaacatt-atcaagaacatgcaaggtacacatgacatgaataaatgtccattaaa 9006572  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaaca-ttgatgtact 205  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||    
T  9006573 gtacattggcatggatcaatcaagcaataaaggtatttacaagattaatgtcaaaaaggatattcaatgttcattcaagactatgaacacttgaaatact 9006672  T
Q  206 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  9006673 agaaatattcca-aagagaatatcatcctagatgttgcaatcacttctcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttac 9006771  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatgt 343  Q
    ||||| | |||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  9006772 aaatccttctaagtgaaacagat-gaacattatgatgt 9006808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 22964747 - 22964652
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22964747 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatcaagatcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccag 22964652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 223 - 325
Target Start/End: Original strand, 33090976 - 33091078
Alignment:
Q  223 gaatatcatcctagatgtta-atatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtga 321  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  33090976 gaatatcatcctagatgttacatat-actgcacttcatcaatgtttcactattaggatttgattacatcaaatgagagtcttacaaatcatcctaagtga 33091074  T
Q  322 aaca 325  Q
    ||||    
T  33091075 aaca 33091078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 223 - 325
Target Start/End: Original strand, 40701709 - 40701811
Alignment:
Q  223 gaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaa 322  Q
    ||||||||| ||||||||||    |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40701709 gaatatcattctagatgttatacacactgcacttcaatgatgtttcattattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaattatcctaagtgaa 40701808  T
Q  323 aca 325  Q
    |||    
T  40701809 aca 40701811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 345
Target Start/End: Original strand, 41027368 - 41027448
Alignment:
Q  265 tttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatgtcc 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  41027368 tttcactattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaatggaacattctgaagtcc 41027448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 263 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15988915 - 15988833
Alignment:
Q  263 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatgtcc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||    
T  15988915 tgtttcactattaggatttgattacatcaaataacagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgaagtcc 15988833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24541247 - 24541107
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  24541247 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 24541149  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  24541148 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 24541107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 217
Target Start/End: Original strand, 45552832 - 45552951
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  45552832 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatcaaagactatgaacat 45552930  T
Q  197 tgatgtactaggaatattcca 217  Q
    | | |||||||||||||||||    
T  45552931 taaagtactaggaatattcca 45552951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7034986 - 7034912
Alignment:
Q  268 cactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  7034986 cactataaggatttgattacatcaaatggtagtctaacaaattatcctaagtgaaatagatggaacattctgatg 7034912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12827605 - 12827543
Alignment:
Q  263 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12827605 tgtttcactattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 12827543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13286031 - 13285969
Alignment:
Q  263 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13286031 tgtttcactattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 13285969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 345
Target Start/End: Original strand, 42595179 - 42595261
Alignment:
Q  263 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatgtcc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||    
T  42595179 tgtttcactattaggatttgattacatcaattaagagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgaagtcc 42595261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 317
Target Start/End: Original strand, 27988150 - 27988368
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  | |||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||  |||||||||    
T  27988150 tccaggaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggataaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagcctatgaacat 27988248  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaagg 296  Q
    | | ||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| |    ||||||| ||||| |  ||| | ||||||||| |||||||| || |||||     
T  27988249 taaagtactaggaatattcca-atgagaatattatcctagatgatgcattcactgcacttcagttgtgtcttactattagg-tttgattacattaaaagt 27988346  T
Q  297 t-agtcttacaaatcatcctaa 317  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  27988347 taagtcttacaaatcaacctaa 27988368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 215
Target Start/End: Original strand, 19585411 - 19585528
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||||| || || |||||||||  |||| |||||||||    
T  19585411 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatgaacaaggaactatgtcaaaaag-atctttaatgttcatccaagactatgaacat 19585509  T
Q  197 tgatgtactaggaatattc 215  Q
    | | |||||||||||||||    
T  19585510 taaagtactaggaatattc 19585528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 325
Target Start/End: Original strand, 31824544 - 31824606
Alignment:
Q  263 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31824544 tgtttcactattaggatttgattacatcaattacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 31824606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 298 - 342
Target Start/End: Original strand, 12491146 - 12491190
Alignment:
Q  298 agtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  12491146 agtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 12491190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24696992 - 24696661
Alignment:
Q  11 agagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  24696992 agagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaagatcatgcaaggcacatgtgacatgggaatatgtccaggaaagtac 24696893  T
Q  111 atttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaa 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24696892 atttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggtattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaa 24696793  T
Q  211 tattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24696792 tattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatc 24696693  T
Q  311 atcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  24696692 atcctaagtgaaacagaaggaacattctgatg 24696661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2999099 - 2998773
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  2999099 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 2999000  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  2998999 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 2998900  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  2998899 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 2998800  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  2998799 aagtgaaacagatggaacattctgatg 2998773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 18650795 - 18651121
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18650795 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 18650894  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  18650895 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 18650994  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  18650995 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 18651094  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  18651095 aagtgaaacagatggaacattctgatg 18651121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 18662913 - 18663239
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18662913 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 18663012  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  18663013 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 18663112  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  18663113 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 18663212  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  18663213 aagtgaaacagatggaacattctgatg 18663239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Original strand, 45014301 - 45014635
Alignment:
Q  9 gcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||    
T  45014301 gcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccagtagag 45014400  T
Q  108 tacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactag 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45014401 tacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactag 45014500  T
Q  208 gaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaa 307  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  45014501 gaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaa 45014600  T
Q  308 atcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  45014601 atcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 45014635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 341
Target Start/End: Original strand, 4457772 - 4458097
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  4457772 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacataaatatatgtccaggaaagtacatttg 4457871  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  4457872 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 4457971  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  4457972 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 4458071  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgat 341  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  4458072 aagtgaaacagatggaacattctgat 4458097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 341
Target Start/End: Original strand, 4467397 - 4467722
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  4467397 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacataaatatatgtccaggaaagtacatttg 4467496  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  4467497 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 4467596  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  4467597 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 4467696  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgat 341  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  4467697 aagtgaaacagatggaacattctgat 4467722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38958230 - 38957894
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  38958230 aagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgtaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaa 38958131  T
Q  106 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38958130 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatgtacgaggattatgtcaaagaagacattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 38958031  T
Q  206 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  38958030 agaaatattccacaagggaatatcattctagatgttaaaatcaccgctcttcattattgtttcactattaggatttgattatatcaaatggtagtcttac 38957931  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  38957930 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 38957894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9503163 - 9502837
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  9503163 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 9503064  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  9503063 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatattcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 9502964  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  9502963 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 9502864  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  9502863 aagtgaaacagatggaacattctgatg 9502837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9514529 - 9514203
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  9514529 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 9514430  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  9514429 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatattcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 9514330  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  9514329 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 9514230  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  9514229 aagtgaaacagatggaacattctgatg 9514203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5337537 - 5337212
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5337537 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 5337438  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  5337437 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 5337338  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||    
T  5337337 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcagcct 5337238  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgat 341  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  5337237 aagtgaaacagatggaacattctgat 5337212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5347390 - 5347065
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5347390 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 5347291  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  5347290 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 5347191  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||    
T  5347190 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcagcct 5347091  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgat 341  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  5347090 aagtgaaacagatggaacattctgat 5347065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Original strand, 45024378 - 45024712
Alignment:
Q  9 gcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||    
T  45024378 gcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaaatttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccagtagag 45024477  T
Q  108 tacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactag 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45024478 tacatttgcatggatcaatcaagcaataaagacatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactag 45024577  T
Q  208 gaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaa 307  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  45024578 gaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaa 45024677  T
Q  308 atcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  45024678 atcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 45024712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38930895 - 38930558
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaa-gaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccagga 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  38930895 aagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccagga 38930796  T
Q  105 aagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtac 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38930795 aagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatgtacaaggattttgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtac 38930696  T
Q  205 taggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtctta 304  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  38930695 taggaatatttcacaagagaatatcatcctagatgttaaaatcattgctcttcattattgcttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtctta 38930596  T
Q  305 caaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  38930595 caaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 38930558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Original strand, 17488257 - 17488587
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |     
T  17488257 aagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaattttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatacgtccagaag 17488356  T
Q  106 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17488357 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagggttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 17488456  T
Q  206 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  17488457 aggaatatttcacaaagaaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 17488556  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacatt 336  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17488557 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacatt 17488587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 72626 - 72294
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||  | ||||||  ||||||||| |||  ||||||| ||| || ||||| |||    
T  72626 aagcagagttcaaaaggttgttcttatacaagcccagaatctcaagaacaat-atcaagaacatgcaaggtacacatgacatgaataaatgtccagtaaa 72528  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggatta-tgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaaca-ttgatgtac 204  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  72527 gtacattggcatggatcaatcaagcaataaagacatttaca-ggattaatgtcaaagaaaatattcaatgttcatttaagattatgaacacttgaagtac 72429  T
Q  205 taggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtctta 304  Q
    |||| ||||| || ||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  72428 tagggatatttca-aagagaatatcatcttagatgttgcaatcactgctcttcgttgctgtttcactattaggatttaattacatcaaatggtagtctta 72330  T
Q  305 caaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgat 341  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  72329 caaatcattctaagtgaaacaaat-gaacattttgat 72294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 173 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 44639270 - 44639102
Alignment:
Q  173 atgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcacta 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  44639270 atgttcatttaagactatgaacattgatttaataggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctctatattgttgtttaacta 44639171  T
Q  273 ttaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
     ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||    
T  44639170 ctaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatcatcttaagtgaaaca-aaggaacattctgatg 44639102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 44639409 - 44639277
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44639409 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagattctcaagaacattgatcaaggtcatccaaggcacatgtgatatggatatatgtccaggaaa 44639310  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaagg 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44639309 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaagg 44639277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Original strand, 29423126 - 29423268
Alignment:
Q  195 attgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  29423126 attgatgtactaggaatattccacaaggaaatatcat-----atgttaatatcactcttctttattattgtttcactattaggatttgattacatcaaat 29423220  T
Q  295 ggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  29423221 ggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 29423268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24239639 - 24239418
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||             ||||||| ||  ||||||||| | | || ||||| |||    
T  24239639 aagcagaggtcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaac-------------atgcaagtcatttgtgacatgaaaaaatgtccagaaaa 24239553  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatc-aagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtac 204  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || || | |  |||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||| || |    
T  24239552 gaacatttgcatggatcaatcaaagcaataaaggcatttataaagttaaatgtaaaaaaggatattcaatgttca-tcaagactatgaaaattgaagtgc 24239454  T
Q  205 taggaatattccacaagggaatatcatcctagatgtt 241  Q
    | ||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  24239453 tgggaatattcca-atgagaatatcatcctagatgtt 24239418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 311
Target Start/End: Original strand, 12570221 - 12570433
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  ||||||| |||  |||||||  |||||||||| |||| || ||||||||| ||||| |||||||||    
T  12570221 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaagacatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatataagactatgaacat 12570319  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaagg 296  Q
    | | ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||    ||||||| ||||| |  ||||| ||||||| || ||||||| || |||||     
T  12570320 taaagtactaggaatattcca-atgagaatattatcctagatgttgcattcactgcacttcagttgtgttttactatta-gagttgattacattaaaagt 12570417  T
Q  297 t-agtcttacaaatca 311  Q
    | ||||||||||||||    
T  12570418 taagtcttacaaatca 12570433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 263 - 345
Target Start/End: Original strand, 19342105 - 19342187
Alignment:
Q  263 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatgtcc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||    
T  19342105 tgtttcactattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgaagtcc 19342187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 263 - 345
Target Start/End: Original strand, 23721735 - 23721817
Alignment:
Q  263 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatgtcc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||    
T  23721735 tgtttcactattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattatgaagtcc 23721817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40409318 - 40409216
Alignment:
Q  223 gaatatcatcctagatgtta-atatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtga 321  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  40409318 gaatatcatcctagatgttacacat-actacacttcattgatgtttcactattagagtttgattacatcaaatgagagtcttacaaatcttcctaagtga 40409220  T
Q  322 aaca 325  Q
    ||||    
T  40409219 aaca 40409216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22688092 - 22687952
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  22688092 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcataaaagactatgaacat 22687994  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  22687993 taaagtactaggaatattcca-atgagaatattatcctagatg 22687952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 345
Target Start/End: Original strand, 22901908 - 22901990
Alignment:
Q  263 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatgtcc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||| ||||    
T  22901908 tgtttcactattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaactgaaacaaaaggaacattctgaagtcc 22901990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Original strand, 45190472 - 45190612
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  45190472 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 45190570  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  45190571 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 45190612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 263 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 22909030 - 22908957
Alignment:
Q  263 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacatt 336  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22909030 tgtttcattattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaacaaaaggaacatt 22908957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Original strand, 573895 - 574035
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||| ||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  573895 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaagcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 573993  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  573994 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 574035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16934711 - 16934571
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  16934711 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatgaacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 16934613  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | |||||||||||||| || | | |||||| ||||||||||    
T  16934612 taaagtactaggaatatttca-atgagaatattatcctagatg 16934571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17005371 - 17005231
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  17005371 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatgaacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 17005273  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | |||||||||||||| || | | |||||| ||||||||||    
T  17005272 taaagtactaggaatatttca-atgagaatattatcctagatg 17005231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Original strand, 15940399 - 15940462
Alignment:
Q  154 atgtcaaaaagg-atattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattcca 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15940399 atgtcaaaaagggatattcaatgttcatc-aagactatgaacattgaagtgctaggaatattcca 15940462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 217
Target Start/End: Original strand, 24942578 - 24942681
Alignment:
Q  114 tgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaata 212  Q
    |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  24942578 tgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagattatgaacattaaagtactaggaaaa 24942676  T
Q  213 ttcca 217  Q
    |||||    
T  24942677 ttcca 24942681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16135385 - 16135335
Alignment:
Q  263 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatc 313  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  16135385 tgtttcactgttaggattcgattgcatcaaatggtagtcttacaaatcatc 16135335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 313
Target Start/End: Original strand, 16327821 - 16327886
Alignment:
Q  248 actgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatc 313  Q
    ||||| |||||| | ||||||||| || ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  16327821 actgcacttcatcgatgtttcactgttgggattcgattgcatcaaatggtagtcttacaaatcatc 16327886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 791304 - 791640
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||    
T  791304 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaatcatgcaaggcacatgtgatacgggaatatgtccaggaaa 791403  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  791404 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggtattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 791503  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  791504 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatctctgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 791603  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatgt 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  791604 aatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatgt 791640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 342
Target Start/End: Original strand, 7757335 - 7757666
Alignment:
Q  11 agagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  7757335 agagatcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaacattgatcaaggtcatgcaaggcacatgagacatggatatatgtctaggaaagtac 7757434  T
Q  111 atttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaa 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7757435 atttgcatggatcaatcaagcaataaagacatatacaagaattatgtcaaaaaggatactcaatgttcatttaagactatgaactttgatgtactaggaa 7757534  T
Q  211 tattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7757535 tattccacaagggaatatcatcctagatattaatatcattgctcttcattgtcgtttcactattagtatttgattacatcaaatggtagtcttacaaatc 7757634  T
Q  311 atcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  7757635 atcctaagtaaaacagatggaacattctgatg 7757666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9325518 - 9325192
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  9325518 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 9325419  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  9325418 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 9325319  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  9325318 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 9325219  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  9325218 aagtgaaacagatggaacattctgatg 9325192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21203296 - 21202970
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21203296 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 21203197  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21203196 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 21203097  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  21203096 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 21202997  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  21202996 aagtgaaacagatggaacattctgatg 21202970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21213712 - 21213386
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21213712 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 21213613  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21213612 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 21213513  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  21213512 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 21213413  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  21213412 aagtgaaacagatggaacattctgatg 21213386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 21333875 - 21334201
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21333875 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 21333974  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21333975 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 21334074  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  21334075 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 21334174  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  21334175 aagtgaaacagatggaacattctgatg 21334201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 17268409 - 17268744
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||     
T  17268409 aagcagagatcagaaaattgttcttatacaagtcaagaatctcaagaacattgatcaagatcatgcaaggcacatgtgatatggataaatttccaggaag 17268508  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  17268509 gtacatttgcatggatcaatcaagcaacaaaggcatatacaaagattatgtcaaaaaggatactcaatgttcatttaagactatgaacattgaagtactg 17268608  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17268609 ggaatattccaaaagggaatatcatcctagatgttgaagtcactgctcttcattgttgtttcattattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 17268708  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  17268709 aatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgatg 17268744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21997956 - 21997630
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21997956 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaagatcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 21997857  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21997856 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 21997757  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  21997756 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattactgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 21997657  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  21997656 aagtgaaacagatggaacattctgatg 21997630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21988422 - 21988096
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21988422 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaagatcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 21988323  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21988322 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 21988223  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  21988222 cacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattactgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 21988123  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||    
T  21988122 atgtgaaacagatggaacattctgatg 21988096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2690781 - 2690448
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||| || || ||   |||||||| |||| |||||||| |||  ||||||| |||    
T  2690781 aagcagagttcagaaggttggtcttatacaagccaagaaactcaagaacatt-ataaaaaacatgcaagtcacacgtgacatgaataagtatccagaaaa 2690683  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  2690682 gtacaattgcatggatcaatcaagcaatagaggtatttacaaagttaatgtcaaagaggatattcaatgttcattttagactatgaacattgaagtacta 2690583  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttca-ttgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| || |  |||||||||||||| ||||||| | ||||    ||||||||    
T  2690582 ggaatattcca-atgagaatatcatcctagatattacaatcactgcacttcagttatattttcactattagga-ttgattacaccaaatacaagtcttac 2690485  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  2690484 aaatcatcctaagtgaaacaaatgaaacattctgatg 2690448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 5867821 - 5867569
Alignment:
Q  68 catgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattat-gtcaaaaagga 166  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||| ||  |||| ||||||||||   | |||| ||||||| ||||||||||| |  | ||||||  |||||||||||    
T  5867821 catgcaaggcacacgtaacatgaataaatg-ccagtaaagtacattgagaaggatcaatcaaggaataaaggcattttta-ggattaaagtcaaaaagga 5867724  T
Q  167 tattcaatgttcatttaagattatgaacatt-gatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgt 265  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  | | |||||||||||||| ||||  | || ||| |||||| | |||    
T  5867723 tcttcaatgttcatttaagactatgaacatttgaagtactaggaatattccaataag-aatatcatcctagacgttacaaacattgcccttcatcgatgt 5867625  T
Q  266 ttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtga 321  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  5867624 ttcactattaggatttgattacattaaatgagagtcttacaaatcatcctaagtga 5867569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 185
Target Start/End: Original strand, 20098382 - 20098559
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| | | ||  |||| ||| |  ||||||  |||||||||||||  ||||||| ||| || |||||||||    
T  20098382 aagcagagttaagaaggttgttcttatacaagcccataaaatcaagaacatc-atcaagagcatgcaaggcacacatgacatgaataaatgtccaggaaa 20098480  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaag 185  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20098481 gtacacttgcatggatcaatcaagcaataaaagcatttacaagattaatgtcaaaaaagatattcaatgttcatttaag 20098559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 264 - 325
Target Start/End: Original strand, 37295701 - 37295762
Alignment:
Q  264 gtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37295701 gtttcactattaggatttgattatatcaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 37295762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 325
Target Start/End: Original strand, 37816670 - 37816746
Alignment:
Q  249 ctgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 325  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37816670 ctgcacttcattgatgtttcactattagaatttgattacatcaaatgagagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 37816746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Original strand, 13673889 - 13674029
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  13673889 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 13673987  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  13673988 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 13674029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14882111 - 14881971
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  14882111 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 14882013  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  14882012 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 14881971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14894461 - 14894321
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  14894461 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 14894363  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  14894362 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 14894321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 254 - 323
Target Start/End: Original strand, 18536406 - 18536475
Alignment:
Q  254 cttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaa 323  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18536406 cttcattgatgtttcactattagaatttgattacatcaaatgagagttttacaaatcatcctaagtgaaa 18536475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 325
Target Start/End: Original strand, 14437096 - 14437259
Alignment:
Q  169 ttcaatgttcatttaagattatgaaca-ttgatgtac-------taggaatattcca-caagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcat 259  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||       ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||  |    |||| ||||||    
T  14437096 ttcaatgttcatttaagactatgaacaattgaagtacaaaacattaggaatattccatcaag--aatatcatcctagatgtttttcatgctgcacttcat 14437193  T
Q  260 tgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 325  Q
       |||||||||||||||||||||||| |||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14437194 aaatgtttcactattaggatttgattacatcaattacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 14437259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20531742 - 20531525
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaagga-ttatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||| || ||||||||||   ||| || |||||||| | ||||||||||||||    
T  20531742 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatgaacaaagaattatgtcaaat--gatctttaatgttcaatcaagattatgaacat 20531645  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaagg 296  Q
    | | ||| ||||||||||| | | | |||||| |||||||||| |    ||||||| ||||| |  ||||| ||||||||| |||||||| || |||||     
T  20531644 taaagtattaggaatattcta-atgagaatattatcctagatgatgcattcactgcacttcagttgtgttttactattagg-tttgattacattaaaagt 20531547  T
Q  297 t-agtcttacaaatcatcctaa 317  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  20531546 taagtcttacaaatcaacctaa 20531525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 31999664 - 31999524
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaagg-attatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||| | |||||| |||||||| || |||||||||| |||| |||||||||    
T  31999664 tccagaaaagttcatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtc-aaaaggatctttaatgttcattcaagactatgaacat 31999566  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | |||||| |||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  31999565 taaagtactaagaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 31999524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 33774555 - 33774415
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  | |||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  33774555 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaagtaaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 33774457  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  33774456 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 33774415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26362603 - 26362544
Alignment:
Q  266 ttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26362603 ttcactattaggatttgattacatcaattacaagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 26362544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 31991866 - 31991744
Alignment:
Q  95 atatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaa 193  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||  |||||  |||||| ||||  | |||||  |||||||||| |||| || |||||||||| |||| ||||||    
T  31991866 atatccagaaaagttcatctgcatggatctatcaacaaataaatgcatggaaaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcattcaagactatgaa 31991768  T
Q  194 cattgatgtactaggaatattcca 217  Q
    |||| | |||||||||||||||||    
T  31991767 cattaaagtactaggaatattcca 31991744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12841719 - 12841689
Alignment:
Q  295 ggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12841719 ggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 12841689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 39)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 10 - 341
Target Start/End: Original strand, 22244285 - 22244616
Alignment:
Q  10 cagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||    
T  22244285 cagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaacactgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgatatgaatatatgtccaggaaatta 22244384  T
Q  110 catttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactagga 209  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22244385 catttgcatggatcaatcaatcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatactcaatgttcatttaagactatggacattgatgtactagga 22244484  T
Q  210 atattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaat 309  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22244485 atattccacaaggaaatatcatcctaaatgttaatatcactgctcttcgtttttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttacaaat 22244584  T
Q  310 catcctaagtgaaacatatggaacattttgat 341  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22244585 catcctaagtgaaacagatggaacattctgat 22244616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 18360854 - 18361180
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18360854 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 18360953  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  18360954 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 18361053  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  18361054 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 18361153  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  18361154 aagtgaaacagatggaacattctgatg 18361180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 21753020 - 21753346
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21753020 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 21753119  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21753120 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 21753219  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  21753220 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 21753319  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  21753320 aagtgaaacagatggaacattctgatg 21753346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 21762307 - 21762633
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21762307 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 21762406  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21762407 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 21762506  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  21762507 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 21762606  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  21762607 aagtgaaacagatggaacattctgatg 21762633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 33938894 - 33939220
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  33938894 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 33938993  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  33938994 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 33939093  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  33939094 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 33939193  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  33939194 aagtgaaacagatggaacattctgatg 33939220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 33949294 - 33949620
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  33949294 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 33949393  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  33949394 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 33949493  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  33949494 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 33949593  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  33949594 aagtgaaacagatggaacattctgatg 33949620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 27411715 - 27412051
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |     
T  27411715 aagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccagaag 27411814  T
Q  106 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27411815 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagggttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 27411914  T
Q  206 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  27411915 aggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 27412014  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  27412015 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 27412051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 18389811 - 18390137
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18389811 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 18389910  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  18389911 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 18390010  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||    
T  18390011 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttagaaatcatcct 18390110  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  18390111 aagtgaaacagatggaacattctgatg 18390137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26192485 - 26192159
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  26192485 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaaactcaagaactgtgatcaaggccatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 26192386  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  26192385 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 26192286  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  26192285 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 26192186  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  26192185 aagtgaaacagatggaacattctgatg 26192159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26203089 - 26202763
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  26203089 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaaactcaagaactgtgatcaaggccatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 26202990  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  26202989 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 26202890  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  26202889 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 26202790  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  26202789 aagtgaaacagatggaacattctgatg 26202763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 32070007 - 32070343
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |     
T  32070007 aagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccagaag 32070106  T
Q  106 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 205  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32070107 agtacatttgcatggaacaatcaaacaataaaggcatatacaagggttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 32070206  T
Q  206 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  32070207 aggaatatttcacaaaggaatatcatcctagatgttattatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 32070306  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32070307 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 32070343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8765849 - 8765523
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8765849 tcagaaggttgctcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 8765750  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  8765749 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttcagactatgaacattgatgtactaggaacattt 8765650  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  8765649 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 8765550  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  8765549 aagtgaaacagatggaacattctgatg 8765523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11411592 - 11411267
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||     
T  11411592 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccagaaaagtacattta 11411493  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||     
T  11411492 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgt-ctagtaatattt 11411394  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  11411393 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 11411294  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  11411293 aagtgaaacagatggaacattctgatg 11411267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 31104981 - 31105315
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||| | ||||||| || ||| || || |||  ||||||||| ||| |||||||| ||| || ||||| |||    
T  31104981 aagcagagttcataaggttgttcttatgcaagcctagaatctgaagaacatt-ataaagaacatgcaaggtacacgtgacatgaataaatgtccagtaaa 31105079  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  31105080 gtacattggtatggatcaatcaagcaataaagtcatttacaagattaatgccaaaaaggatattcaatgttcatttaagactatgaacattgaagtgcta 31105179  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  31105180 ggattattccaaaaaggaatatcatcctagatgtataaatcactactcttcattgttgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 31105279  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  31105280 aatcatcctaagtgaaacaaaaggaacattctgatg 31105315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23379071 - 23378741
Alignment:
Q  11 agagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtac 110  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||| ||| || ||||||  |||||||| ||||  |||| || ||| || ||  | |||||||    
T  23379071 agagctcagaaggttgtccttatacaagcctagaaactcaagaacatt-atcaagaacatgcaagacacacatgacttgaataaatttcaggtaaagtac 23378973  T
Q  111 atttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaa 210  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  23378972 atttgcatcgatcaatcaagcaataaagacaattacaaggttaatgtcaaaaaggatattcgatgttcatttaagactatgaacattaaagtactaggaa 23378873  T
Q  211 tattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatc 310  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  23378872 tattcaaaaagggaatatcatcctagatgttacattcactgctcttcattgttgtttcactattacgatttgattacatcaaatggaagtcttacaaatc 23378773  T
Q  311 atcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||| |||||| | ||| |||| |||||    
T  23378772 atcctaagagaaacaaaaggaccattctgatg 23378741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21484518 - 21484192
Alignment:
Q  15 atcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacattt 114  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||| || || |||  ||| |||  ||| ||||||||| ||| || || || ||||||| |||    
T  21484518 atcagaaggttgttcttaaataagccaagaatctcaagaacatt-ataaagaacatacaactcacttgtgacatgaataaatgtctagaaaagtacgttt 21484420  T
Q  115 gcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatatt 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21484419 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatttacaaggttaatgtaaaaaaggatatgcaatgttcatttaagactatgaacattgaagtactgggaatatt 21484320  T
Q  215 ccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttca-ttgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatc 313  Q
    ||| | | |||||||||| ||||||||   |||||| | ||||| || |  |||||||||||||| ||||||| ||||||    ||||||||||||||||    
T  21484319 cca-atgagaatatcatcttagatgttgcaatcactccacttcagttatgttttcactattagga-ttgattacatcaaatacaagtcttacaaatcatc 21484222  T
Q  314 ctaagtg-aaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||| |||||    
T  21484221 ctaggtgaaaacaaatggaacattctgatg 21484192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 30944406 - 30944266
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  30944406 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 30944308  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  30944307 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 30944266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 30953828 - 30953688
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  30953828 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 30953730  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  30953729 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 30953688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37299435 - 37299295
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  37299435 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 37299337  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  37299336 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 37299295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37549225 - 37549085
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  37549225 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 37549127  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  37549126 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 37549085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 317
Target Start/End: Original strand, 31916447 - 31916665
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  31916447 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 31916545  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaagg 296  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| |    ||||||| ||||| |  ||| | ||||||||| |||||||| || |||||     
T  31916546 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatgatgcattcactgcacttcagttgtgtcttactattagg-tttgattacattaaaagt 31916643  T
Q  297 t-agtcttacaaatcatcctaa 317  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  31916644 taagtcttacaaatcaacctaa 31916665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 217
Target Start/End: Original strand, 20896588 - 20896707
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaaca-t 196  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||| | | ||||| ||||||| |||| |||||||| |    
T  20896588 tccagtaaagtacatctacatggatcaatcaagcaataaagacatttacaagaataatgtcaaaaaag-tcttcaaggttcattcaagactatgaacact 20896686  T
Q  197 tgatgtactaggaatattcca 217  Q
    ||| |||||||||| ||||||    
T  20896687 tgaagtactaggaaaattcca 20896707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4038594 - 4038382
Alignment:
Q  104 aaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgt 202  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||| | ||    
T  4038594 aaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacattaaagt 4038496  T
Q  203 actaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggt-agtc 301  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| |    ||||||| ||||| |  | | ||||||||||| |||||||| || ||||| | ||||    
T  4038495 actaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatgatgcattcactgcacttcagttgtatctcactattagg-tttgattacattaaaagttaagtc 4038398  T
Q  302 ttacaaatcatcctaa 317  Q
    |||||||||| |||||    
T  4038397 ttacaaatcaacctaa 4038382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13572300 - 13572183
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  13572300 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 13572202  T
Q  197 tgatgtactaggaatattc 215  Q
    | | |||||||||||||||    
T  13572201 taaagtactaggaatattc 13572183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19548715 - 19548653
Alignment:
Q  263 tgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19548715 tgtttcactattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 19548653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27274801 - 27274661
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  27274801 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 27274703  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||    
T  27274702 taaagtactaggaatattcca-aagagaatactatcctagatg 27274661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37652023 - 37651883
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  37652023 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaatgcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 37651925  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  37651924 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 37651883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22173864 - 22173730
Alignment:
Q  104 aaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgt 202  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||| | ||    
T  22173864 aaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacattaaagt 22173766  T
Q  203 actaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  22173765 actaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 22173730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 325
Target Start/End: Original strand, 36316170 - 36316246
Alignment:
Q  249 ctgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 325  Q
    |||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36316170 ctgcacttcatcgatgttccactattaggatttgattacatcaaataagagtcttacaaatcatcctaagtgaaaca 36316246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18210426 - 18210313
Alignment:
Q  104 aaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgt 202  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||| | ||    
T  18210426 aaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacattaaagt 18210328  T
Q  203 actaggaatattcca 217  Q
    |||||||||||||||    
T  18210327 actaggaatattcca 18210313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18219764 - 18219651
Alignment:
Q  104 aaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgt 202  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||| | ||    
T  18219764 aaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacattaaagt 18219666  T
Q  203 actaggaatattcca 217  Q
    |||||||||||||||    
T  18219665 actaggaatattcca 18219651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19888974 - 19888834
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  19888974 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatgaacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 19888876  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | |||||||||||||| || | | |||||| ||||||||||    
T  19888875 taaagtactaggaatatttca-atgagaatattatcctagatg 19888834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 217
Target Start/End: Original strand, 21681284 - 21681397
Alignment:
Q  104 aaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgt 202  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||| | ||    
T  21681284 aaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacattaaagt 21681382  T
Q  203 actaggaatattcca 217  Q
    |||||||||||||||    
T  21681383 actaggaatattcca 21681397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34131111 - 34130892
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || ||| |||||  || | |||||||||    
T  34131111 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatattcatccaaaactatgaacat 34131013  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaagg 296  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| |    ||||||||||||| |  | | | ||||||||| ||| |||| || |||||     
T  34131012 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatgatgcattcactgctcttcagttgtatcttactattaggtttttattacattaaaagt 34130914  T
Q  297 t-agtcttacaaatcatcctaa 317  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  34130913 taagtcttacaaatcaacctaa 34130892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 217
Target Start/End: Original strand, 20763995 - 20764113
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaagg-attatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||| | |||||| |||||||| || ||||||||| |||||  ||||||||    
T  20763995 tccagaaaagtacatatgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtc-aaaaggatctttaatgttcatctaaga-catgaacat 20764092  T
Q  197 tgatgtactaggaatattcca 217  Q
    | | |||||||||||||||||    
T  20764093 taaagtactaggaatattcca 20764113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20905134 - 20905033
Alignment:
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaaca-ttgatgtactaggaatatt 214  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||| | | ||||| ||||||| |||| |||||| | |||| |||||| |||||||    
T  20905134 catggatcaataaagcaataaaggcatttacaagaataatgtcaaaaaag-tcttcaaggttcattcaagactatgaaaacttgaagtactaagaatatt 20905036  T
Q  215 cca 217  Q
    |||    
T  20905035 cca 20905033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 205926 - 205879
Alignment:
Q  269 actattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaa 317  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  205926 actattaggatt-gattacatcaaaaagtagtcttacaaatcatcctaa 205879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Original strand, 37817233 - 37817375
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaa-ggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgtt-catttaagattatgaac 194  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||| |||||  |||||||| |||||||||| |||| || |||||| |||  |||| |||||||    
T  37817233 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaaggcatggacaaggatctatgtcaaaa-ggatctttaatgtttcatccaagactatgaac 37817331  T
Q  195 attgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    ||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  37817332 attaaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 37817375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 42091074 - 42090995
Alignment:
Q  161 aaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgtt 241  Q
    ||||||| || |||||||||| || | ||||| |||| | ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||    
T  42091074 aaaggatctttaatgttcattcaatactatgatcattaaagtactaggaatattcca-atgagaatattatcctagatgtt 42090995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 310520 - 310184
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  310520 aagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaa 310421  T
Q  106 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  310420 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatgtaagactatgagcattgatgtact 310321  T
Q  206 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  310320 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttac 310221  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  310220 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 310184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 342
Target Start/End: Original strand, 216179 - 216510
Alignment:
Q  11 agagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtac 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||  |||||||| ||  ||||| ||| | | || ||||| |||||||    
T  216179 agaggtcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaagaacatt-atcaagaacatgcaagtcatttgtgatatgaacaaatgtccagaaaagtac 216277  T
Q  111 atttgcatggataaatc-aagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactagg 208  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| || || | |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||| |    
T  216278 gtttgcatggatcaatcaaagcaataaagacatttataaagttaaatgtcaaaaaggatattcaatgttca-ttaagactataaacattgaagtactaag 216376  T
Q  209 aatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttc-attgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaa 307  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||||||   || ||||| |||| ||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||     ||||||||||    
T  216377 aatattcca-atgtgaatatcatcctagatgttgcaattactgcacttcaattatgttttcactattagga-ttgattacatcaagtacaagtcttacaa 216474  T
Q  308 atcatcctaagt-gaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||    
T  216475 atcatcctatgtaaaaacaaatggaacattctgatg 216510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 7 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 75218 - 74894
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  75218 aagcacagatcataagcttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatcaagatcatgcaaggcacatgtgacatgggaatatgtccaggaaa 75119  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  75118 gtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggtattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtacta 75019  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttaca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  75018 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgatcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatggtagtcttaca 74919  T
Q  307 aatcatcctaagtgaaacatatgga 331  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  74918 aatcatcctaagtgaaacagatgga 74894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 4)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 234480 - 234154
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  234480 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 234381  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  234380 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 234281  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  234280 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 234181  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  234180 aagtgaaacagatggaacattctgatg 234154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 317
Target Start/End: Original strand, 146328 - 146546
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||  | |||||  |||||||||| |||| || ||||||||| ||||| |||||||||    
T  146328 tccagaaaagtacatttgaatggatctatcaacaaataaaggcatggaaaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatctaagactatgaacat 146426  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaagg 296  Q
    | | ||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| |    ||||||| || || |  ||||| ||||||||| |||||||| || |||||     
T  146427 taaagtactaggaatattcca-atgagaatattatcctagatgatgcattcactgcactccagttgtgttttactattagg-tttgattacattaaaagt 146524  T
Q  297 t-agtcttacaaatcatcctaa 317  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  146525 taagtcttacaaatcaacctaa 146546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 153934 - 153795
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcat-atacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |  ||| ||||||||  ||||||| || |||||||| | |||| || ||||||    
T  153934 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggtcaaagaattatgtc--aaaggatctttaatgttcaatcaagactacgaacat 153837  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  153836 taaagtactaggaatattcca-atgagaatatcatcctagatg 153795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 114932 - 114793
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcat-atacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |  ||| ||||||||  ||||||| || |||||||| | |||| || ||||||    
T  114932 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggtcaaagaattatgtc--aaaggatctttaatgttcaatcaagactaagaacat 114835  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||    
T  114834 taaagtactaggaatattcca-atgagaatatcatcttagatg 114793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8334 - 8008
Alignment:
Q  16 tcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttg 115  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8334 tcagaaggttattcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttg 8235  T
Q  116 catggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  8234 catggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattt 8135  T
Q  216 cacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcct 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  8134 cacaaaggaatatcatcctagatgttatcatcactgctcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttacaaatcatcct 8035  T
Q  316 aagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  8034 aagtgaaacagatggaacattctgatg 8008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 53 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21610 - 21321
Alignment:
Q  53 aactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat 152  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21610 aactttgatcaaggtcgtgcaaggcacatgtgacatggatatatgtctaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggat 21511  T
Q  153 tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21510 tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagaatatgaacattgttgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaaaatcactgc 21411  T
Q  253 tcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  21410 tcttcattattgtttcactattaggatttgattacatcaattggtattcttacaaatcatcccaaatgaaacagatggaacattctgatg 21321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19877 - 19541
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaa 105  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  19877 aagctgagatcagaaggttgtttttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccagaaa 19778  T
Q  106 agtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtact 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19777 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcacatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 19678  T
Q  206 aggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  19677 aggaatatttcacaagggaatatcatcctagatgttattattactgctcttcatcattgtttcactattaggatttgattacatcaaatgatagtcttac 19578  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19577 aaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 19541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 69 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 56262 - 55985
Alignment:
Q  69 atgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggata 168  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  56262 atgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaattaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaggtta 56163  T
Q  169 ttcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgt----taatatcactgctcttcattgttg 264  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  56162 ttcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaattaatatcactgctcttcattgttg 56063  T
Q  265 tttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  56062 tttcactattaggatttgattacatcagatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacattctgatg 55985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17658 - 17452
Alignment:
Q  136 aaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatccta 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17658 aaggcatatacaaggattatgtcaaaaatgatattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatccta 17559  T
Q  236 gatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacatatggaacat 335  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17558 gatgttaaaatcactgctctttattgttgtttcactattaggatttgattacattaaatggtagtcttacaaatcatcctaagtgaaacagatggaacat 17459  T
Q  336 tttgatg 342  Q
    | |||||    
T  17458 tctgatg 17452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 342
Target Start/End: Original strand, 13394 - 13724
Alignment:
Q  11 agagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtac 110  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||| ||| || ||||||  |||||||| ||||  |||| || ||| || ||  | |||||||    
T  13394 agagctcagaaggttgtccttatacaagcctagaaactcaagaacatt-atcaagaacatgcaagacacacatgacttgaataaatttcaggtaaagtac 13492  T
Q  111 atttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaa 210  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  13493 atttgcatcgatcaatcaagcaataaagacaattacaaggttaatgtcaaaaaggatattcgatgttcatttaagactatgaacattaaagtactaggaa 13592  T
Q  211 tattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatc 310  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  13593 tattcaaaaagggaatatcatcctagatgttacattcactgctcttcattgttgtttcactattacgatttgattacatcaaatggaagtcttacaaatc 13692  T
Q  311 atcctaagtgaaacatatggaacattttgatg 342  Q
    |||||||| |||||| | ||| |||| |||||    
T  13693 atcctaagagaaacaaaaggaccattctgatg 13724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1705 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold1705
Description:

Target: scaffold1705; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Original strand, 415 - 607
Alignment:
Q  5 agaagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccagga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  415 agaagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtaacatggatatatgtccagga 514  T
Q  105 aagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaagg-attatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacatt 197  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||| || |||||||||  |||| ||||||||||    
T  515 aagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatataaggaactatgtc-aaaaggatctttaatgttcatccaagactatgaacatt 607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 199191 - 198868
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| ||| || |||||| ||||||||| |||| |||||||| |||  |||||||||||    
T  199191 aagcagagttcagaaggtttctcttatataagccaagaatctcaagaacatt-atcaagatcatgcaagtcacacgtgacatgaataagtatccaggaaa 199093  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtacta 206  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  199092 gtacatttgcatgaatcaatcaaacaatagaggcatttacaaggttaatgtcaaaaaggatatttaaggttcatttaagactatgaacattgaagtacta 198993  T
Q  207 ggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttca-ttgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttac 305  Q
     |||||||||| |   |||||||||||||||||||   |||||||| ||||| || |  |||||||||||||| ||| ||| ||||||    ||||||||    
T  198992 tgaatattcca-ataagaatatcatcctagatgttgcaatcactgcacttcagttatgttttcactattagga-ttgtttacatcaaatacaagtcttac 198895  T
Q  306 aaatcatcctaagtgaaacatatggaa 332  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  198894 aaatcatcctaagtgaaacaaatggaa 198868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 29254 - 29010
Alignment:
Q  11 agagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaagtac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||| || ||||||  |||||||| ||| ||||||||  ||| || ||||  |||||||    
T  29254 agagatcagaaggttgttcttaaacaagcaaagaatctcaataacatt-atcaagaacatgcaagtcacttgtgacataaataaatttccataaaagtac 29156  T
Q  111 atttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaa 210  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||    
T  29155 atttgcatgg-tcaatcaagcaataaatgcatttacaaggttaatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagactatgaacattgaaatactagcaa 29057  T
Q  211 tattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttca 258  Q
    ||||||| | | |||||||||||||||||||   |||||||| |||||    
T  29056 tattcca-atgagaatatcatcctagatgttgcaatcactgcacttca 29010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Original strand, 65255 - 65583
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||  ||| || ||||||  ||||  ||||||| || |||||  || || ||||  |||    
T  65255 aagcagagttcagaaggttgttcttatacaagcccagaagctcatgaacatt-atcaagaacatgagaggcacacgtaacatgagtaaatgtccaataaa 65353  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacatt-gatgtact 205  Q
    |||||||  ||||||  ||||||||||||||  ||| ||||||  | |||||||||| ||| |||| |||||||| |||| |||||||||| || |||||    
T  65354 gtacattgacatggaacaatcaagcaataaatacatttacaagattaatgtcaaaaaagatcttcagtgttcattcaagactatgaacatttgaagtact 65453  T
Q  206 aggaatattcca-caagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtctta 304  Q
    |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||  | || | | |||| ||| |||||||||||||  ||||||||| || ||| || | |||||    
T  65454 aggaatattcgaacaag--aatatcatcctagatgttacaaacattccacttctttgatgtttcactattaatatttgattacatgaaatggaaatctta 65551  T
Q  305 caaatcatcctaagtgaaacatatggaacatt 336  Q
    || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  65552 catatcatcctaagtgaaacaaaaggaacatt 65583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 1327 - 1143
Alignment:
Q  7 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaaaaactttgatcaaggtcatgcaaggcacatgtgacatggatatatatccaggaaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||| ||| || ||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| |||    
T  1327 aagcagagttcagaaggttgttcttatagaagcccataatctcaagaacatt-atcaagaacatgcaaggtacatgtgacatgaataaatgtccagcaaa 1229  T
Q  107 gtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatga 192  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||  | || | |||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  1228 gtacattggaatggatcaatcaagcaataaaggcatttacaagattaatataaaaaaggatattcaattttcattcaagactatga 1143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 342
Target Start/End: Original strand, 15046 - 15284
Alignment:
Q  104 aaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaaca-ttgatgt 202  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| |||||||| |||| ||    
T  15046 aaagtacatctgcatggatcaatcaagaaataaagacatttacaagactaatgtcaaaaa-gatcttcaaggttcattcaagactatgaacacttgaagt 15144  T
Q  203 actaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttca-ttgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtc 301  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||||   ||||| | ||||| || |  ||| |||||||||| ||||||| |||||||   ||||    
T  15145 actaggaatattcca-aagagaatattatcatatatgttacattcactacacttcagttatgtttttactattagga-ttgattacatcaaaaacaagtc 15242  T
Q  302 ttacaaatcatcctaagtga-aacatatggaacattttgatg 342  Q
    ||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||    
T  15243 ttacaaatcattctaagtaagaacaaatggaacattctgatg 15284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 241969 - 241867
Alignment:
Q  223 gaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||    |||| | |||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  241969 gaatatcatcctagatgttatacacactacacttcattgatgtattactattaggatctgattacatcaaatagaagtcttacaaatcatcctaagtgaa 241870  T
Q  323 aca 325  Q
    |||    
T  241869 aca 241867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 217
Target Start/End: Original strand, 10920 - 11070
Alignment:
Q  68 catgcaaggcacatgtgacatggatata-tatccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaagga 166  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||| | | ||||| ||||||||| | | || || ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |     
T  10920 catgcaacgtacatgtgacatgaataaaatgtccagtaaagtacatctacttgaatcaatcaagcaataaaggcatttacaagaataatgtcaaaaaag- 11018  T
Q  167 tattcaatgttcatttaagattatgaaca-ttgatgtactaggaatattcca 217  Q
    | ||||| ||||||| |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  11019 tcttcaaagttcattcaagactatgaagacttgaagtactaggaatattcca 11070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 112201 - 112061
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  112201 tccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 112103  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  112102 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 112061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 217
Target Start/End: Original strand, 23010 - 23129
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  23010 tccagaaaagtacatctgcatagatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 23108  T
Q  197 tgatgtactaggaatattcca 217  Q
    | | |||||||||||||||||    
T  23109 taaagtactaggaatattcca 23129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40878 - 40754
Alignment:
Q  223 gaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaagtgaa 322  Q
    |||||||||||||||||||  |   | ||| |||||||| | ||||| ||| | |||||  ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  40878 gaatatcatcctagatgtttttcatattgcacttcattgatatttcattatgaagatttccttacatcaaatgggagtctcacaaatcatcctaagtgaa 40779  T
Q  323 acatatggaacattttgatgtccat 347  Q
    ||| | |||||||| ||| ||||||    
T  40778 acaaaaggaacattatgaagtccat 40754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 18402 - 18614
Alignment:
Q  104 aaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgt 202  Q
    ||||| ||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| ||  ||||||||  |||| |||||||||| | ||    
T  18402 aaagttcatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttgatgttcatccaagactatgaacattaaagt 18500  T
Q  203 actaggaatattccacaagggaatatcatcctagatgttaatatcactgctcttcattgttgtttcactattaggatttgattagatcaaaaggt-agtc 301  Q
    ||||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |    ||||||| ||||| |||||  | ||||||||| |||||||| || ||||| | ||||    
T  18501 actaggaatattcca-ataagaatattatcctagatgatgcattcactgcacttcagtgttggcttactattagg-tttgattacattaaaagttaagtc 18598  T
Q  302 ttacaaatcatcctaa 317  Q
    |||||||||| |||||    
T  18599 ttacaaatcaacctaa 18614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1276 - 1136
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| ||||| ||| ||||| |||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  1276 tccagaaaagttcatctgcatagatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 1178  T
Q  197 tgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  1177 taaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 1136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4538 - 4430
Alignment:
Q  109 acatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactag 207  Q
    |||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||| | |||||||    
T  4538 acatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacattaaagtactag 4440  T
Q  208 gaatattcca 217  Q
    ||||||||||    
T  4439 gaatattcca 4430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24224 - 24108
Alignment:
Q  98 tccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacat 196  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||    
T  24224 tccagaaaagcacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggaactatgtcaaaa-ggatctttaatgttcatccaagactatgaacat 24126  T
Q  197 tgatgtactaggaatatt 214  Q
    | | ||||||||||||||    
T  24125 taaagtactaggaatatt 24108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13798 - 13720
Alignment:
Q  160 aaaaggatattcaatgttcatttaagattatgaacattgatgtactaggaatattccacaagggaatatcatcctagatg 239  Q
    |||||||| || |||||||||  |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  13798 aaaaggatctttaatgttcatccaagactatgaacattaaagtactaggaatattcca-aagagaatattgtcctagatg 13720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 317
Target Start/End: Original strand, 54459 - 54506
Alignment:
Q  269 actattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaa 317  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  54459 actattaggatt-gattacatcaaaagtaagtcttacaaatcatcctaa 54506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 317
Target Start/End: Original strand, 58411 - 58458
Alignment:
Q  269 actattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaa 317  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  58411 actattaggatt-gattacatcaaaagtaagtcttacaaatcatcctaa 58458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 317
Target Start/End: Original strand, 59839 - 59886
Alignment:
Q  269 actattaggatttgattagatcaaaaggtagtcttacaaatcatcctaa 317  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  59839 actattaggatt-gattacatcaaaagtaagtcttacaaatcatcctaa 59886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University