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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF11928_low_16 (Length: 591)
Name: NF11928_low_16
Description: NF11928
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF11928_low_16 |
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Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 462; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 3446788 - 3446242
Alignment:
| Q |
11 |
tgagaagaacatttgatgaggaatttaatctgattcaacatggcttgaaaattcccttacgtaaaagattatatgaaatttaggacaaatattcactttt |
110 |
Q |
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| T |
3446788 |
tgagaagaacatttgatgaggaatttaatctgattcaacatggcttggagattcccttacgtaaaagattatatgaaatttaggacaaatattcactttt |
3446689 |
T |
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| Q |
111 |
gcaatccattaaaaatatatatatgtgatttcttttttagtgaactagggtacctcttgacgaacatttatgaagttatcgctctaaaaactctgagatt |
210 |
Q |
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| T |
3446688 |
gcaatccattaaaaagatatatatgtgatttcttttttagtaaactagggcacctcttgacgaacatt---------atcgctctaaaaactctgagatt |
3446598 |
T |
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| Q |
211 |
tatttaaaagatatgaaatcaaaatatgttgattttatatcatatttttagatttaggagaaatcaaatcaatctattaaatacatttatatatgttgca |
310 |
Q |
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| T |
3446597 |
tatttaaaagatatgaaatcaaaatatgttgatttcatatcatatttttagatttaggagaaatcaaatcaatctattaaatacatttatatatgttgca |
3446498 |
T |
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| Q |
311 |
tatttgaatctaatattgagagcctgtttattatatttaacaaaaataacatttacacatgcaccataattcctctaaagttaacgtcgatctaaacata |
410 |
Q |
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| T |
3446497 |
tatttgaatctaatattaagagcctgtttgttatatttaacaaaaataacatttacacatgcaccataattcctctaaagttaaggtcgatctaaacata |
3446398 |
T |
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| Q |
411 |
tatacattcaaatctaaaagtcgattaaaatcaacaaataaaaggaaaatccacaattactttgtttccactttgcatacattgatagctctcttttatc |
510 |
Q |
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| T |
3446397 |
tatacattcaaatctaaaagtcgattaaaatcaacaaataaaaggaaaatccacaattactttgtttccactttgcatacattgatagctctcttttat- |
3446299 |
T |
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| Q |
511 |
ccccaatatatatttgatgatgatttatggttactctcgtcaagtaaacatccacccatgagac |
574 |
Q |
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| T |
3446298 |
-cccaatatatatttgatgatgat------ttactctcgtcaagtaaacatccacccatgagac |
3446242 |
T |
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