View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11929_high_10 (Length: 342)

Name: NF11929_high_10
Description: NF11929
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11929_high_10
NF11929_high_10
[»] chr7 (69 HSPs)
chr7 (16-342)||(41765000-41765345)
chr7 (120-342)||(29173540-29173761)
chr7 (111-342)||(48928219-48928466)
chr7 (111-342)||(31520663-31520893)
chr7 (143-342)||(32593128-32593326)
chr7 (90-342)||(48928486-48928754)
chr7 (122-342)||(26980325-26980545)
chr7 (93-341)||(12390572-12390818)
chr7 (95-342)||(5657403-5657667)
chr7 (94-289)||(21991610-21991805)
chr7 (90-336)||(18797299-18797560)
chr7 (111-289)||(22687230-22687408)
chr7 (93-342)||(30055499-30055766)
chr7 (95-289)||(8861260-8861454)
chr7 (93-342)||(32820975-32821241)
chr7 (95-342)||(4582894-4583158)
chr7 (121-289)||(12165753-12165921)
chr7 (111-342)||(38258536-38258784)
chr7 (93-342)||(9355748-9356014)
chr7 (94-342)||(43686015-43686279)
chr7 (96-288)||(24211717-24211909)
chr7 (95-341)||(15612682-15612944)
chr7 (95-289)||(6546494-6546688)
chr7 (111-289)||(7334785-7334963)
chr7 (94-342)||(31578986-31579256)
chr7 (111-341)||(37347013-37347259)
chr7 (95-342)||(27283719-27283983)
chr7 (111-290)||(33688253-33688431)
chr7 (97-288)||(27421373-27421563)
chr7 (177-286)||(11071263-11071372)
chr7 (95-336)||(37109847-37110107)
chr7 (92-336)||(17842512-17842775)
chr7 (95-289)||(10359206-10359400)
chr7 (111-289)||(25691536-25691715)
chr7 (174-342)||(38053540-38053700)
chr7 (111-336)||(23111181-23111425)
chr7 (94-342)||(32432431-32432691)
chr7 (132-249)||(35353120-35353238)
chr7 (91-244)||(26524364-26524517)
chr7 (175-289)||(10481660-10481774)
chr7 (97-289)||(44413371-44413564)
chr7 (204-289)||(37704241-37704326)
chr7 (213-342)||(15672684-15672830)
chr7 (191-289)||(44598737-44598835)
chr7 (95-225)||(34362205-34362334)
chr7 (279-342)||(37703420-37703483)
chr7 (279-342)||(46481051-46481114)
chr7 (282-342)||(35353287-35353347)
chr7 (195-342)||(43925177-43925340)
chr7 (279-342)||(10359136-10359199)
chr7 (279-342)||(10481781-10481844)
chr7 (279-342)||(21991812-21991875)
chr7 (279-333)||(37704333-37704387)
chr7 (279-335)||(11071382-11071438)
chr7 (295-342)||(44411462-44411509)
chr7 (291-342)||(24211929-24211980)
chr7 (239-289)||(26588076-26588126)
chr7 (280-336)||(7334971-7335026)
chr7 (286-337)||(25691471-25691522)
chr7 (291-342)||(44598854-44598905)
chr7 (97-159)||(8299192-8299254)
chr7 (192-234)||(34362149-34362191)
chr7 (228-288)||(46481122-46481182)
chr7 (299-342)||(12165939-12165982)
chr7 (89-140)||(40381934-40381985)
chr7 (111-140)||(3953747-3953776)
chr7 (297-342)||(6546713-6546758)
chr7 (111-140)||(23402374-23402403)
chr7 (228-264)||(37703515-37703551)
[»] chr1 (67 HSPs)
chr1 (111-342)||(14758053-14758292)
chr1 (93-342)||(11742284-11742532)
chr1 (93-342)||(15168083-15168356)
chr1 (97-342)||(33725516-33725778)
chr1 (111-342)||(47279201-47279449)
chr1 (93-342)||(16415639-16415906)
chr1 (111-283)||(31621545-31621717)
chr1 (94-342)||(2959743-2960008)
chr1 (127-339)||(40884841-40885070)
chr1 (97-289)||(15752027-15752219)
chr1 (111-337)||(4330291-4330536)
chr1 (95-289)||(38823210-38823404)
chr1 (94-289)||(10181994-10182189)
chr1 (173-342)||(27227401-27227587)
chr1 (111-289)||(27532967-27533144)
chr1 (111-342)||(27267116-27267361)
chr1 (93-289)||(48620631-48620827)
chr1 (95-289)||(3309144-3309338)
chr1 (93-342)||(34012298-34012559)
chr1 (121-342)||(48620659-48620888)
chr1 (95-286)||(42721035-42721226)
chr1 (93-342)||(15382927-15383193)
chr1 (94-342)||(18422646-18422911)
chr1 (97-342)||(238429-238690)
chr1 (111-342)||(7078979-7079238)
chr1 (114-342)||(9902970-9903215)
chr1 (97-342)||(41926161-41926417)
chr1 (95-342)||(30326868-30327132)
chr1 (114-336)||(10922742-10922981)
chr1 (132-342)||(32216088-32216315)
chr1 (93-342)||(32267028-32267294)
chr1 (111-342)||(47682410-47682657)
chr1 (93-289)||(3534926-3535122)
chr1 (93-288)||(39393377-39393573)
chr1 (93-289)||(1547281-1547469)
chr1 (94-342)||(30254419-30254683)
chr1 (91-342)||(8222123-8222388)
chr1 (177-342)||(25160710-25160892)
chr1 (94-342)||(19899685-19899950)
chr1 (111-342)||(37451298-37451545)
chr1 (111-336)||(28564705-28564945)
chr1 (93-281)||(37618886-37619078)
chr1 (95-243)||(21289661-21289816)
chr1 (97-336)||(28769651-28769907)
chr1 (124-336)||(51128884-51129113)
chr1 (163-338)||(27563825-27564017)
chr1 (134-336)||(46931446-46931663)
chr1 (111-336)||(23999359-23999601)
chr1 (195-342)||(22170807-22170971)
chr1 (195-289)||(27763297-27763391)
chr1 (279-342)||(1359851-1359914)
chr1 (279-342)||(10181924-10181987)
chr1 (279-342)||(38823411-38823474)
chr1 (278-342)||(3309349-3309413)
chr1 (279-342)||(15752226-15752289)
chr1 (279-334)||(38759730-38759785)
chr1 (284-335)||(42721241-42721292)
chr1 (279-342)||(48353740-48353802)
chr1 (288-342)||(27763227-27763281)
chr1 (286-332)||(31621480-31621526)
chr1 (279-341)||(39393581-39393643)
chr1 (180-289)||(38759610-38759723)
chr1 (93-141)||(4150489-4150537)
chr1 (303-342)||(37618817-37618856)
chr1 (292-342)||(27532897-27532947)
chr1 (95-140)||(43579242-43579287)
chr1 (306-342)||(3535147-3535183)
[»] chr3 (84 HSPs)
chr3 (111-342)||(11357302-11357534)
chr3 (90-289)||(22450954-22451153)
chr3 (93-342)||(33378706-33378969)
chr3 (106-342)||(40935993-40936228)
chr3 (111-342)||(52040843-52041092)
chr3 (92-290)||(21193594-21193792)
chr3 (118-341)||(44186439-44186663)
chr3 (93-336)||(48354930-48355190)
chr3 (94-286)||(11466814-11467006)
chr3 (95-337)||(37203058-37203318)
chr3 (95-289)||(4015451-4015645)
chr3 (111-289)||(27480370-27480548)
chr3 (93-342)||(34132924-34133190)
chr3 (97-342)||(46297683-46297945)
chr3 (95-289)||(51212972-51213166)
chr3 (93-289)||(35844315-35844512)
chr3 (111-342)||(43975813-43976054)
chr3 (111-342)||(53229073-53229322)
chr3 (95-289)||(37157699-37157892)
chr3 (94-342)||(26941181-26941446)
chr3 (92-342)||(39282641-39282907)
chr3 (93-336)||(4761575-4761838)
chr3 (143-342)||(42505996-42506212)
chr3 (143-342)||(2007972-2008187)
chr3 (111-289)||(29099362-29099540)
chr3 (94-288)||(40552251-40552445)
chr3 (94-289)||(3655193-3655388)
chr3 (111-288)||(32373479-32373654)
chr3 (111-276)||(20373300-20373465)
chr3 (117-290)||(45174516-45174692)
chr3 (127-342)||(3362276-3362510)
chr3 (111-290)||(44891514-44891683)
chr3 (94-342)||(7327403-7327669)
chr3 (111-290)||(22446054-22446234)
chr3 (173-288)||(43348327-43348441)
chr3 (111-342)||(24488883-24489131)
chr3 (111-342)||(25579746-25579994)
chr3 (198-289)||(29163912-29164003)
chr3 (195-336)||(46994588-46994746)
chr3 (142-342)||(21009723-21009940)
chr3 (153-289)||(24708106-24708242)
chr3 (154-289)||(14586661-14586796)
chr3 (177-290)||(53176127-53176240)
chr3 (93-264)||(47481511-47481682)
chr3 (216-289)||(33698265-33698338)
chr3 (192-286)||(38591786-38591880)
chr3 (195-288)||(54828693-54828786)
chr3 (119-342)||(54505823-54506062)
chr3 (279-342)||(20373165-20373228)
chr3 (218-289)||(22622709-22622780)
chr3 (279-342)||(1089886-1089949)
chr3 (206-288)||(11835619-11835702)
chr3 (279-341)||(37157899-37157962)
chr3 (279-342)||(27480283-27480350)
chr3 (279-342)||(11467016-11467079)
chr3 (283-342)||(22622639-22622698)
chr3 (279-342)||(33698345-33698408)
chr3 (279-342)||(44891689-44891752)
chr3 (279-342)||(54828622-54828685)
chr3 (211-288)||(36012244-36012322)
chr3 (281-342)||(40552180-40552241)
chr3 (279-336)||(47481714-47481771)
chr3 (181-246)||(53811696-53811767)
chr3 (279-342)||(45174698-45174761)
chr3 (222-288)||(1089811-1089877)
chr3 (282-336)||(3655129-3655183)
chr3 (279-341)||(11357072-11357134)
chr3 (291-336)||(51212698-51212743)
chr3 (290-342)||(22451171-22451223)
chr3 (298-342)||(24708036-24708080)
chr3 (286-342)||(32373669-32373725)
chr3 (286-342)||(38591897-38591953)
chr3 (286-342)||(43348456-43348512)
chr3 (93-140)||(40640637-40640684)
chr3 (292-342)||(22445986-22446036)
chr3 (279-328)||(11835562-11835611)
chr3 (282-342)||(36012333-36012394)
chr3 (286-342)||(4015659-4015714)
chr3 (306-342)||(14586600-14586636)
chr3 (279-317)||(53176246-53176284)
chr3 (93-159)||(55343405-55343471)
chr3 (96-189)||(11835702-11835790)
chr3 (292-342)||(53811655-53811701)
chr3 (292-336)||(21193812-21193856)
[»] chr5 (73 HSPs)
chr5 (95-342)||(14409252-14409501)
chr5 (94-342)||(1429073-1429321)
chr5 (93-342)||(24886100-24886351)
chr5 (111-342)||(33908249-33908497)
chr5 (111-342)||(699166-699414)
chr5 (111-342)||(22980809-22981057)
chr5 (95-342)||(31786557-31786821)
chr5 (111-337)||(26268090-26268333)
chr5 (93-342)||(19119857-19120123)
chr5 (89-334)||(8466739-8466983)
chr5 (111-289)||(30969305-30969483)
chr5 (93-289)||(8741867-8742064)
chr5 (95-289)||(7693230-7693424)
chr5 (88-289)||(27330299-27330498)
chr5 (94-288)||(39572818-39573012)
chr5 (114-286)||(5837574-5837746)
chr5 (97-289)||(25500907-25501099)
chr5 (95-342)||(36866762-36867026)
chr5 (93-289)||(38528218-38528413)
chr5 (95-342)||(40133385-40133649)
chr5 (94-342)||(9200232-9200488)
chr5 (111-336)||(27318404-27318646)
chr5 (93-289)||(12910348-12910549)
chr5 (92-342)||(36860420-36860688)
chr5 (95-342)||(23116133-23116397)
chr5 (96-288)||(32563150-32563342)
chr5 (93-286)||(5112297-5112490)
chr5 (119-289)||(22019656-22019826)
chr5 (111-342)||(35511393-35511636)
chr5 (149-342)||(21088677-21088887)
chr5 (96-341)||(31705524-31705785)
chr5 (163-342)||(23954701-23954897)
chr5 (111-342)||(22255197-22255446)
chr5 (93-289)||(22974063-22974259)
chr5 (153-289)||(6824460-6824598)
chr5 (93-342)||(14919439-14919706)
chr5 (173-342)||(7208775-7208960)
chr5 (95-289)||(15724490-15724682)
chr5 (94-342)||(8436965-8437229)
chr5 (93-290)||(35826464-35826660)
chr5 (94-289)||(35933901-35934090)
chr5 (174-289)||(15992521-15992636)
chr5 (134-289)||(28416508-28416663)
chr5 (176-289)||(43308633-43308746)
chr5 (153-244)||(25668707-25668798)
chr5 (173-336)||(35504443-35504623)
chr5 (279-342)||(2888356-2888419)
chr5 (279-342)||(5830093-5830156)
chr5 (111-232)||(11898018-11898139)
chr5 (283-342)||(13956273-13956332)
chr5 (134-289)||(17158012-17158166)
chr5 (279-342)||(30969235-30969298)
chr5 (215-286)||(42342851-42342921)
chr5 (279-342)||(5837756-5837819)
chr5 (279-342)||(35934097-35934160)
chr5 (282-336)||(22973999-22974053)
chr5 (88-189)||(13956426-13956527)
chr5 (279-336)||(17157948-17158005)
chr5 (279-336)||(38528154-38528211)
chr5 (291-342)||(12910568-12910619)
chr5 (217-264)||(13956368-13956415)
chr5 (279-342)||(15992451-15992514)
chr5 (248-342)||(25669739-25669840)
chr5 (279-337)||(6824396-6824453)
chr5 (292-342)||(25889584-25889634)
chr5 (156-276)||(5829962-5830073)
chr5 (95-170)||(16004476-16004552)
chr5 (93-140)||(22616492-22616539)
chr5 (299-342)||(42342942-42342985)
chr5 (286-336)||(27330512-27330562)
chr5 (302-336)||(35826403-35826437)
chr5 (96-140)||(10237415-10237459)
chr5 (290-342)||(15724700-15724752)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (88-342)||(7234955-7235225)
chr6 (94-341)||(8513232-8513491)
chr6 (111-332)||(33618850-33619079)
chr6 (94-342)||(3879859-3880124)
chr6 (97-342)||(6088910-6089167)
chr6 (111-289)||(15491631-15491809)
chr6 (96-288)||(20768087-20768275)
chr6 (93-289)||(4318812-4319009)
chr6 (89-289)||(29182157-29182357)
chr6 (92-342)||(1945830-1946098)
chr6 (111-342)||(21017032-21017280)
chr6 (97-288)||(30353349-30353540)
chr6 (95-289)||(33892993-33893186)
chr6 (93-336)||(5627389-5627649)
chr6 (94-289)||(7055205-7055400)
chr6 (93-226)||(18498431-18498565)
chr6 (156-289)||(6091173-6091306)
chr6 (279-342)||(4318742-4318805)
chr6 (279-342)||(20768283-20768346)
chr6 (279-342)||(29182365-29182428)
chr6 (279-342)||(30353278-30353341)
chr6 (279-336)||(6091108-6091166)
chr6 (279-337)||(7055140-7055198)
chr6 (93-140)||(19631747-19631794)
[»] chr4 (74 HSPs)
chr4 (95-342)||(28002933-28003197)
chr4 (93-342)||(38011852-38012118)
chr4 (111-289)||(33816550-33816728)
chr4 (111-342)||(5047913-5048160)
chr4 (93-288)||(25701075-25701270)
chr4 (93-342)||(35020982-35021248)
chr4 (94-342)||(35025543-35025800)
chr4 (111-289)||(34948114-34948292)
chr4 (95-336)||(19089406-19089664)
chr4 (95-289)||(55241122-55241315)
chr4 (92-288)||(27396613-27396809)
chr4 (97-342)||(36493636-36493897)
chr4 (92-342)||(55477838-55478109)
chr4 (112-289)||(23761089-23761265)
chr4 (93-289)||(29584217-29584411)
chr4 (111-342)||(49375982-49376231)
chr4 (111-290)||(7703533-7703704)
chr4 (117-286)||(32579466-32579637)
chr4 (94-342)||(37663688-37663951)
chr4 (105-289)||(32592103-32592287)
chr4 (149-342)||(4934149-4934360)
chr4 (121-342)||(17173316-17173554)
chr4 (111-289)||(19440665-19440843)
chr4 (89-289)||(9139241-9139439)
chr4 (94-333)||(25184112-25184368)
chr4 (97-289)||(33341397-33341592)
chr4 (111-289)||(4598009-4598185)
chr4 (121-342)||(17167739-17167977)
chr4 (111-289)||(37775685-37775861)
chr4 (111-336)||(879501-879743)
chr4 (111-289)||(46888174-46888352)
chr4 (97-342)||(47253751-47254004)
chr4 (111-270)||(50764748-50764905)
chr4 (120-289)||(54499254-54499425)
chr4 (93-289)||(30002649-30002837)
chr4 (113-336)||(6864053-6864293)
chr4 (89-342)||(42199723-42199993)
chr4 (203-342)||(1815409-1815565)
chr4 (93-289)||(32912597-32912793)
chr4 (93-289)||(34361509-34361704)
chr4 (94-287)||(37287732-37287919)
chr4 (95-289)||(39397918-39398103)
chr4 (173-289)||(50697320-50697435)
chr4 (279-342)||(33816463-33816526)
chr4 (195-289)||(17272068-17272158)
chr4 (279-336)||(3042820-3042877)
chr4 (279-342)||(33341599-33341662)
chr4 (279-342)||(55241052-55241115)
chr4 (279-336)||(32912533-32912590)
chr4 (279-335)||(25701010-25701066)
chr4 (279-342)||(34361439-34361502)
chr4 (288-342)||(34948042-34948096)
chr4 (285-342)||(50697448-50697506)
chr4 (286-342)||(7703717-7703773)
chr4 (282-342)||(37287932-37287992)
chr4 (279-342)||(7152151-7152214)
chr4 (289-342)||(32579657-32579710)
chr4 (91-140)||(38812263-38812312)
chr4 (293-342)||(46888105-46888154)
chr4 (93-189)||(4205114-4205210)
chr4 (279-333)||(26896288-26896342)
chr4 (92-161)||(17272008-17272077)
chr4 (217-273)||(3042741-3042797)
chr4 (301-341)||(19440596-19440636)
chr4 (97-140)||(20097494-20097537)
chr4 (282-333)||(46884066-46884116)
chr4 (279-342)||(50764921-50764984)
chr4 (91-140)||(2704508-2704557)
chr4 (93-170)||(7152242-7152319)
chr4 (95-140)||(38811813-38811858)
chr4 (310-342)||(4205216-4205248)
chr4 (290-342)||(23761283-23761335)
chr4 (286-342)||(27396824-27396880)
chr4 (306-342)||(39400236-39400272)
[»] chr8 (57 HSPs)
chr8 (94-342)||(27082765-27083030)
chr8 (89-342)||(36694893-36695163)
chr8 (95-342)||(6098445-6098709)
chr8 (95-289)||(5299943-5300137)
chr8 (93-290)||(38643975-38644172)
chr8 (95-342)||(33906223-33906475)
chr8 (93-342)||(34894964-34895225)
chr8 (111-336)||(37970452-37970694)
chr8 (94-341)||(16446803-16447067)
chr8 (111-336)||(1204942-1205184)
chr8 (93-342)||(9864145-9864411)
chr8 (111-289)||(465857-466035)
chr8 (111-281)||(10555207-10555377)
chr8 (95-289)||(13307622-13307816)
chr8 (84-289)||(1150102-1150306)
chr8 (95-342)||(12876108-12876373)
chr8 (93-341)||(16222860-16223125)
chr8 (94-290)||(34952027-34952223)
chr8 (111-289)||(11727039-11727217)
chr8 (93-333)||(43643531-43643788)
chr8 (111-289)||(23854428-23854606)
chr8 (95-288)||(41362517-41362707)
chr8 (203-342)||(7998401-7998541)
chr8 (176-342)||(1149559-1149742)
chr8 (93-342)||(40862416-40862682)
chr8 (90-281)||(31933891-31934082)
chr8 (94-289)||(30654580-30654775)
chr8 (173-288)||(39099117-39099232)
chr8 (122-289)||(41910985-41911153)
chr8 (173-288)||(1953987-1954103)
chr8 (177-342)||(7890884-7891066)
chr8 (178-288)||(35459709-35459819)
chr8 (221-342)||(4132613-4132750)
chr8 (175-284)||(44869576-44869686)
chr8 (147-289)||(43025753-43025895)
chr8 (279-334)||(1953923-1953978)
chr8 (122-342)||(8803744-8803974)
chr8 (279-336)||(23854364-23854421)
chr8 (282-342)||(11727227-11727287)
chr8 (282-342)||(43025905-43025965)
chr8 (279-338)||(41910919-41910978)
chr8 (279-333)||(13307823-13307877)
chr8 (279-333)||(30654519-30654573)
chr8 (95-219)||(4133077-4133199)
chr8 (279-342)||(31933813-31933876)
chr8 (279-342)||(44869697-44869760)
chr8 (279-342)||(1149847-1149906)
chr8 (294-336)||(10555137-10555179)
chr8 (194-244)||(33197947-33197997)
chr8 (284-336)||(35459644-35459696)
chr8 (92-163)||(24823395-24823466)
chr8 (286-342)||(39099046-39099102)
chr8 (94-135)||(7998361-7998402)
chr8 (305-342)||(35859160-35859197)
chr8 (97-141)||(6446708-6446752)
chr8 (95-159)||(15009241-15009305)
chr8 (93-133)||(39099262-39099302)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (94-342)||(133-398)
scaffold0002 (116-289)||(94374-94547)
scaffold0002 (196-342)||(408350-408512)
[»] chr2 (62 HSPs)
chr2 (95-337)||(19313852-19314103)
chr2 (92-342)||(4166919-4167186)
chr2 (89-289)||(36641980-36642182)
chr2 (89-289)||(33550995-33551195)
chr2 (94-289)||(19424637-19424832)
chr2 (176-342)||(7006877-7007043)
chr2 (97-289)||(33660377-33660569)
chr2 (91-289)||(29242147-29242345)
chr2 (94-289)||(4264086-4264281)
chr2 (95-341)||(4478368-4478628)
chr2 (95-342)||(41465509-41465765)
chr2 (97-342)||(43770787-43771039)
chr2 (121-342)||(3176965-3177203)
chr2 (176-289)||(45327801-45327914)
chr2 (127-289)||(27349948-27350109)
chr2 (111-338)||(4763644-4763891)
chr2 (94-342)||(17071676-17071941)
chr2 (96-264)||(13711465-13711633)
chr2 (93-289)||(31570743-31570939)
chr2 (111-288)||(26357593-26357770)
chr2 (97-289)||(41463859-41464051)
chr2 (93-288)||(39167373-39167568)
chr2 (127-289)||(37905740-37905902)
chr2 (111-289)||(44285965-44286143)
chr2 (132-289)||(43648254-43648411)
chr2 (93-336)||(2325323-2325575)
chr2 (93-342)||(18494220-18494473)
chr2 (127-289)||(33709241-33709403)
chr2 (195-289)||(41960940-41961034)
chr2 (94-289)||(17054105-17054300)
chr2 (94-286)||(5881533-5881729)
chr2 (121-336)||(19289268-19289500)
chr2 (95-342)||(44913662-44913928)
chr2 (94-336)||(11366326-11366585)
chr2 (119-281)||(33902092-33902252)
chr2 (196-289)||(31861953-31862046)
chr2 (279-336)||(35959097-35959154)
chr2 (122-240)||(41051263-41051382)
chr2 (279-342)||(41961041-41961104)
chr2 (279-342)||(4264015-4264079)
chr2 (279-334)||(17054043-17054098)
chr2 (282-342)||(26357781-26357841)
chr2 (284-336)||(43648190-43648242)
chr2 (279-342)||(18258226-18258289)
chr2 (279-342)||(36642189-36642252)
chr2 (279-338)||(44286150-44286209)
chr2 (279-341)||(37905911-37905973)
chr2 (279-336)||(33550932-33550988)
chr2 (198-278)||(19501760-19501839)
chr2 (282-342)||(31570673-31570733)
chr2 (282-337)||(19500859-19500914)
chr2 (291-342)||(45327933-45327984)
chr2 (111-276)||(35958925-35959077)
chr2 (290-342)||(41463789-41463841)
chr2 (291-342)||(29242077-29242128)
chr2 (286-337)||(33709176-33709227)
chr2 (295-342)||(39167308-39167355)
chr2 (290-336)||(19424573-19424619)
chr2 (279-331)||(33902267-33902319)
chr2 (290-340)||(13711671-13711721)
chr2 (111-140)||(6177791-6177820)
chr2 (236-289)||(18258296-18258349)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (97-342)||(7889-8151)
[»] scaffold0318 (2 HSPs)
scaffold0318 (97-289)||(11908-12103)
scaffold0318 (286-342)||(12117-12173)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (97-336)||(43959-44214)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (97-336)||(154573-154828)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (143-342)||(267331-267549)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (111-342)||(145937-146185)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (239-342)||(100894-100991)
scaffold0009 (94-186)||(42347-42439)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 69)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 41765345 - 41765000
Alignment:
Q  16 aaattgtataccacagtgtaggtcacaacattttaaaaaagcgtttgtgtaacat---caatattgcaatgttaataattaaggaaaattccattgtcaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  41765345 aaattgtataccacaatgtaggtcacaacattttaaaaaagcttttgtgtaacatgtgcaatattgcaatgtta-taattaaggaaaattccatggtgaa 41765247  T
Q  113 gtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcct 212  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41765246 gtcatgagaatgacttttctgataaagtcaatactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagtccagtcct 41765147  T
Q  213 catagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgta-----------------acacttaaga 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||                 ||||||||||    
T  41765146 catagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttactctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacacttaaga 41765047  T
Q  296 ctatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41765046 ctatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 41765000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 120 - 342
Target Start/End: Original strand, 29173540 - 29173761
Alignment:
Q  120 gaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagta 219  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  29173540 gaatgacttttctggtgaagttaacactgtagtatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagta 29173639  T
Q  220 tcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactat 319  Q
    |||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29173640 tcatcaattcatcaaactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgttacacttaagactatcacataatatcatcaactct 29173739  T
Q  320 gtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  29173740 gtttgcatgttaaa-atgccaac 29173761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 48928466 - 48928219
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48928466 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactatttgtacggtgccatcaaaagttcagtc 48928367  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca-----------------cttaa 293  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||                 |||||    
T  48928366 c-catagtattatcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacctcagaaagtgtaatgcttaa 48928268  T
Q  294 gactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48928267 gactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaac 48928219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31520893 - 31520663
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||||| | ||||||||  ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31520893 aagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatatagtgagtaacactccattgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtc 31520794  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 310  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31520793 c-catagtatcatcaattcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 31520695  T
Q  311 atcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31520694 atcaactctatttgcatgttaaagatgccaac 31520663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32593326 - 32593128
Alignment:
Q  143 acactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaa 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  32593326 acactatagcattaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttatatggtggtatcaaaagttcagtc-tcacagtatcatcaattcatcagattatcaa 32593228  T
Q  243 gactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
     |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32593227 aactgcatttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaac 32593128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 90 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 48928754 - 48928486
Alignment:
Q  90 attaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtac 189  Q
    ||||| |||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  48928754 attaaagaaaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactatttgtac 48928655  T
Q  190 ggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca- 288  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||     
T  48928654 ggtgccatcaaaagttcagtcc-catagtattatcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattattttaagtgtaacac 48928556  T
Q  289 ----------------cttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
                    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48928555 ctcagaaagtgtaatgcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaac 48928486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 122 - 342
Target Start/End: Original strand, 26980325 - 26980545
Alignment:
Q  122 atgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatc 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26980325 atgacttttatggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacggtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccccataatatc 26980424  T
Q  222 atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgt 321  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |    
T  26980425 atcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctat 26980524  T
Q  322 ttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  26980525 ttgcatgttaaagatgtcaac 26980545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 93 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12390818 - 12390572
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| || || ||||||| |||  ||||||| |||||||||  ||||||||  |||||||||||| |||||  || |||||||||||| | ||    
T  12390818 aaggaaaattctatggtgaagtcatcagatcgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgtaatgagtaacatcccactgtttgtgcagt 12390719  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactta 292  Q
    | |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12390718 gacatcaaaagttatgtccccatagtattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttcttttaagtgtaacactta 12390619  T
Q  293 agactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaa 341  Q
    ||||  |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  12390618 agac--tcacataatatcatcaactcagcttgcatgttaaagatgccaa 12390572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 95 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5657667 - 5657403
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  5657667 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 5657568  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaac------- 287  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||           
T  5657567 catcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcatattaacaaaaatacacttaatttaattttatcctactttgttttaagtgtaacagcccac 5657468  T
Q  288 ----------acttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
              ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5657467 aaagtgtaatacttaagactatcgcatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 5657403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 94 - 289
Target Start/End: Original strand, 21991610 - 21991805
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| ||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||| |||    
T  21991610 aggaaaattctagggtgaagtcatgagaatgatttttatggtgaagttaacactatagcatcaaaattgttgcgagtaacaccccactgtttgtacagtg 21991709  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21991710 tcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 21991805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 90 - 336
Target Start/End: Original strand, 18797299 - 18797560
Alignment:
Q  90 attaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtac 189  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||   ||  |||| |||| |||||  |||||||||||||||||    
T  18797299 attaaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactaacata--aaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtac 18797396  T
Q  190 ggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt----------- 278  Q
      || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |               
T  18797397 aatgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacac 18797496  T
Q  279 ------aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18797497 ctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagat 18797560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 111 - 289
Target Start/End: Original strand, 22687230 - 22687408
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  22687230 aagtcatgagaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgcagtggtatcaaaagttcagtc 22687329  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22687330 cccatagtatcatcaattcatcagattaacaataatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 22687408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 93 - 342
Target Start/End: Original strand, 30055499 - 30055766
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctgg-tgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacgg 191  Q
    ||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| | | ||||||  |||||||| |||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||      
T  30055499 aaggaaaattctatggtgaagtcataagaatgactttttttgatgaagttaacactataatatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaa 30055598  T
Q  192 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt------------- 278  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |                 
T  30055599 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcattaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccc 30055698  T
Q  279 ----aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||    
T  30055699 tacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaac 30055766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 289
Target Start/End: Original strand, 8861260 - 8861454
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |  ||||||||||||||||| ||||    
T  8861260 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctcgcgaagttaacactatagcatcaaaagtgttatgaataacaccccactgtttgtacagtgg 8861359  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  8861360 catcaaaagttaagtccccatagtatcatcaattaatcagattaacaacaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacac 8861454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 93 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32821241 - 32820975
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||| ||||  ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||  |    
T  32821241 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgatttttttggtgaagttaacaatataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaat 32821142  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-------------- 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||                  
T  32821141 ggcatcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcaattcattagattaacaagactacagttaatttagttttatcctaccttgttttaagcgtaacacccc 32821042  T
Q  279 ---aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  32821041 ataaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaac 32820975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 95 - 342
Target Start/End: Original strand, 4582894 - 4583158
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || |||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||  ||     
T  4582894 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaatactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatga 4582993  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt---------------- 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||                    
T  4582994 catcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccac 4583093  T
Q  279 -aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4583094 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaac 4583158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 121 - 289
Target Start/End: Original strand, 12165753 - 12165921
Alignment:
Q  121 aatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtat 220  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    |||||    
T  12165753 aatgacttttctggtgaagttaacactatagcatccaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttaagtcccttaagtat 12165852  T
Q  221 catcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12165853 catcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacac 12165921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Original strand, 38258536 - 38258784
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||| | ||||| |||| |||||||||  ||||||||  || |||| |||| |||||  |||| ||| ||||||||  || ||||||||||||| ||    
T  38258536 aagtcataaaaatgatttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccacaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatc 38258635  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |                 |||||||||||||||    
T  38258636 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaa 38258735  T
Q  294 gactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  38258736 gactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaac 38258784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 93 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9356014 - 9355748
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||  || || ||||||||||||||||  || ||||||| |  ||||||||| || |||| |||||||||    |||||||||||||||| ||    
T  9356014 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaatgaccattttggtgaatttaacactatagcataaaaaatgtagtgagcaataccccactgtttgtacagt 9355915  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgta------- 285  Q
    | ||||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||           
T  9355914 gacatcaaaagtttagttctcatattatcgttaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttcatcctaccttgttttaagtgtaacacccc 9355815  T
Q  286 ----------acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
              |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9355814 acaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 9355748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Original strand, 43686015 - 43686279
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||| || || |||||| || ||||||||||  ||||||||  |||||||| |||||||| ||| ||||||  ||||| |||||||||||  ||    
T  43686015 aggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgactttttgggtgaagttaacactataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccc-actgtttgtacaatg 43686113  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt--------------- 278  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||                   
T  43686114 gcatcaaaagttcagtccctatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 43686213  T
Q  279 --aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  43686214 caaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaac 43686279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 288
Target Start/End: Original strand, 24211717 - 24211909
Alignment:
Q  96 gaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggc 195  Q
    |||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||| ||   ||||    
T  24211717 gaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccctactgtttatagaatggc 24211816  T
Q  196 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 288  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  24211817 atcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaaca 24211909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15612944 - 15612682
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||||||||  |||||| ||||  |||||  ||||||| ||||||||  ||||    
T  15612944 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaataacgtttcttgtgaagttaacactataacatcaaa-gtgttatgagtaacaccccagtgtttgtagagtgg 15612846  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgta--------- 285  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||             
T  15612845 catcaaaagttcagtccctataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 15612746  T
Q  286 --------acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaa 341  Q
            ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15612745 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaa 15612682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 95 - 289
Target Start/End: Original strand, 6546494 - 6546688
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || ||||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||  ||||||||| ||||||| ||      
T  6546494 ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgatttttctagtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacaccccactatttgtacagtaa 6546593  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6546594 catcaaaagtttactatccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 6546688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 111 - 289
Target Start/End: Original strand, 7334785 - 7334963
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||  ||||||||  || |||  |||| |||||  |||||||||||||||||  || |||||||||||||||     
T  7334785 aagtcgtgagaatgacttttttgatgaagttaacactataacataaaatatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtt 7334884  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  7334885 ctcatagtatcatcaactcatcagcttaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacac 7334963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31579256 - 31578986
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttg-----ta 188  Q
    |||||||||| || || ||||||| ||||| | |||| |||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  |||||||||||||      ||    
T  31579256 aggaaaattctatggtgaagtcataagaataatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttaatttata 31579157  T
Q  189 cggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt------------ 276  Q
    |  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||                
T  31579156 caatgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataaca 31579057  T
Q  277 -----ttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
         | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  31579056 ccctataaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttatttgcatgttaaagattccaac 31578986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 111 - 341
Target Start/End: Original strand, 37347013 - 37347259
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||  | ||||||  ||||||| | || |||||  ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  37347013 aagtcatgaaaatgatttttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatataatgagtaacaccccattgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtc 37347112  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt----------------aagtgtaacacttaag 294  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||                ||||||||||||||||    
T  37347113 ctcatagtatcatcaatttattaaattaacaggactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaaactccacaaagtgtaacacttaag 37347212  T
Q  295 actatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaa 341  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37347213 actaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaa 37347259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 342
Target Start/End: Original strand, 27283719 - 27283983
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || |||| || | ||||| |||| |||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  |||||||| ||||||||  ||     
T  27283719 ggaaaattctatggtgaagttataaaaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatga 27283818  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt---------------- 278  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |                    
T  27283819 aatcaaaagttcagtcctcatagtattatcaatttatcagattaacaagactatacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccac 27283918  T
Q  279 -aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27283919 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatattatcaactatgtttgcatgttaaagattccaac 27283983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 111 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 33688431 - 33688253
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||  |||||  || || ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33688431 aagttatgagaatgacttttctggt-aagttaacactataacatcaaaagtgttatgagtaacatcctactgtttgtccagtggcatcaaaagttcagtc 33688333  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacact 290  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  33688332 tctatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcatactttgttttaagtgtaacact 33688253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27421563 - 27421373
Alignment:
Q  97 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 196  Q
    ||||||| || || ||||| ||| ||||| |||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||  || ||    
T  27421563 aaaattctatggtgaagtcgtgataatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatgaca 27421464  T
Q  197 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 288  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27421463 tcaaaagttcagtcct-ataatatcataaatttatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaaca 27421373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 177 - 286
Target Start/End: Original strand, 11071263 - 11071372
Alignment:
Q  177 ccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 276  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  11071263 ccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcagattaacaacactacgcttaatctaattttatcctaccttgtt 11071362  T
Q  277 ttaagtgtaa 286  Q
    ||||||||||    
T  11071363 ttaagtgtaa 11071372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 95 - 336
Target Start/End: Original strand, 37109847 - 37110107
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || ||||||| | |||||||||| |||||||||  ||||||||  || |||| |||| |||||  |||||||| ||||||||  ||     
T  37109847 ggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatga 37109946  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccc--taccttgtttt-------------- 278  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||| |                  
T  37109947 catcaaaagttcagtcattataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaacacccc 37110046  T
Q  279 ---aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
       |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37110047 acaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagat 37110107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 92 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 17842775 - 17842512
Alignment:
Q  92 taaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacgg 191  Q
    |||||||||||| || || ||||||| | |||||||||| |||||||||  ||||||||  || |||| |||| |||||  |||||||| ||||||||      
T  17842775 taaggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaa 17842676  T
Q  192 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccc--taccttgtttt----------- 278  Q
    || ||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||| |               
T  17842675 tgacatcaaaagctcagtcattataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaacat 17842576  T
Q  279 ------aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17842575 cccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagat 17842512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 95 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10359400 - 10359206
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||| || |  |   ||||| ||||||||||||||||||  || || ||| ||| ||| |||     
T  10359400 ggaaaattctatggtgaagtcatgataatgacttttctggtaaaattaatcttatagcatcaaaagtgtagtgagtaacatcctactatttatacagtga 10359301  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcactt-aatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  10359300 catcaaaagttcagtc-tgatagtatcatcaattcatcagatcaacaagactacacttaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacac 10359206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 25691715 - 25691536
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggc-accccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||| | ||||||    ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25691715 aagtcatgagaatgacttttctcgtgaagttaacactataacatcaaaagtattgtgagtaattacctcactgtttgtacagtggcatcaacagttcagt 25691616  T
Q  210 cctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
     || ||||||| |||||||||||| |||||||| | | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  25691615 tcttatagtattatcaattcatcatattaacaaaaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacac 25691536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 174 - 342
Target Start/End: Original strand, 38053540 - 38053700
Alignment:
Q  174 accccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctacctt 273  Q
    |||| |||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||| |||||||        |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||    
T  38053540 accctactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagttctcatagtgtcatcaa--------attaacaagactacacttaatctaattttatcatacttt 38053631  T
Q  274 gttttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||    
T  38053632 gttataagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttggatgttaaagattccaac 38053700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 111 - 336
Target Start/End: Original strand, 23111181 - 23111425
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||| | | ||||||  ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||  |    
T  23111181 aagtcatgaaaatgatttttctggtgaagttaacactataacatcaaaaatattgtgagtaacacaccactatttgtacaatggcatcaaaagttcaacc 23111280  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattt--taccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacactt 291  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  || | ||| |||||||                 |||||||||||||    
T  23111281 atcgtagtatcatcaattcattagattaacaagactacacttaatctaattttatatcatactttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacactt 23111380  T
Q  292 aagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23111381 aagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagat 23111425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Original strand, 32432431 - 32432691
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||| || || |||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||     |||||||| ||| ||||||  ||||||| |||||||||  ||    
T  32432431 aggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgatttttctggtgaagttaacac-----tatcaaaaatgttgtgagtaacaccccattgtttgtacaatg 32432525  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag------------ 281  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||| |||||||| |||||||                
T  32432526 acatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacagttaatataattttatcctaccttattttaagtgtaacacccca 32432625  T
Q  282 -----tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  32432626 caaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacactgtttgcatattaaagatgccaac 32432691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 132 - 249
Target Start/End: Original strand, 35353120 - 35353238
Alignment:
Q  132 tggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaag-ttcagtcctcatagtatcatcaattca 230  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||    
T  35353120 tggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccattgtttgtacgatggaatcaaaagtttctgtccccatagtatcaccaattca 35353219  T
Q  231 tcagattaacaagactgca 249  Q
    |||||||||||||||||||    
T  35353220 tcagattaacaagactgca 35353238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26524517 - 26524364
Alignment:
Q  91 ttaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacg 190  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||| ||| |||| |  ||| ||| ||||||| |     
T  26524517 ttaaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgatgttaacactataacatcaaaaatgttgtgactaacactccattgtttgtgca 26524418  T
Q  191 gtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaaga 244  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26524417 gtggcatcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaatttatcatattaacaaga 26524364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 175 - 289
Target Start/End: Original strand, 10481660 - 10481774
Alignment:
Q  175 ccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttg 274  Q
    |||||||||||||||  || |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||    
T  10481660 ccccactgtttgtacaatgacatcaaaaattcagtctttatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacgcttaatctaattttatcttaccttg 10481759  T
Q  275 ttttaagtgtaacac 289  Q
    || ||||||||||||    
T  10481760 ttataagtgtaacac 10481774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 44413564 - 44413371
Alignment:
Q  97 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctgg-tgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggc 195  Q
    ||||||| || || ||||||||| |||||||||| |   ||||||  ||||||||  ||||||| | ||||||||  ||||||| |||||||||  ||      
T  44413564 aaaattctatggtaaagtcatgaaaatgactttttttaatgaagttaacactataacatcaaaaatatagtgagtaacaccccaatgtttgtacactgaa 44413465  T
Q  196 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  44413464 atcaaaagttcggtctccatagtatcttcaattcatcaaattaacaaggctacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacac 44413371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 204 - 289
Target Start/End: Original strand, 37704241 - 37704326
Alignment:
Q  204 ttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37704241 ttcagtccccatagtatcatcaatttatcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 37704326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15672830 - 15672684
Alignment:
Q  213 catagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaa-----------------cacttaaga 295  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||                 |||||||||    
T  15672830 catagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaaga 15672731  T
Q  296 ctatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  15672730 ctatcacataatatcatcaactctatttgaatgttaaagatgccaac 15672684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 191 - 289
Target Start/End: Original strand, 44598737 - 44598835
Alignment:
Q  191 gtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  44598737 gtggcatcaaaaattcaatccccatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacac 44598835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34362334 - 34362205
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || || | ||||||||||||||||| |  ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  34362334 ggaaaattctatggtgaaattatgagaatgacttttctaggaaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 34362235  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatca 225  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  34362234 catc-aaagttcagttctcatagtatcatca 34362205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 37703483 - 37703420
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37703483 aagtgtaccacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaac 37703420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 46481114 - 46481051
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  46481114 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcattaactttgtttgcatgttaaagatgtcaac 46481051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 282 - 342
Target Start/End: Original strand, 35353287 - 35353347
Alignment:
Q  282 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  35353287 tgtaacacttaagactatctcataatatcatcaactatatttgcatgttaaagatgtcaac 35353347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Original strand, 43925177 - 43925340
Alignment:
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtg----------- 283  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| |||||| | | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||               
T  43925177 catcaaaagttcagtctacatagtatcatcaact-atcagactaacaataatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgcaacacctcac 43925275  T
Q  284 ------taacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
          ||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43925276 aacgtttaatacttaatacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 43925340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10359199 - 10359136
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  10359199 aagtgtaacacttaagactatcacataacaacatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaac 10359136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Original strand, 10481781 - 10481844
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||    
T  10481781 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctctttgcatgtcaaagattccaac 10481844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Original strand, 21991812 - 21991875
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21991812 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaac 21991875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 279 - 333
Target Start/End: Original strand, 37704333 - 37704387
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaa 333  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37704333 aagtgtaacacttaagactatcatataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 335
Target Start/End: Original strand, 11071382 - 11071438
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaga 335  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11071382 aagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactttgttcgcatgttaaaga 11071438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 44411509 - 44411462
Alignment:
Q  295 actatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44411509 actatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaac 44411462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 342
Target Start/End: Original strand, 24211929 - 24211980
Alignment:
Q  291 taagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  24211929 taagactatcacataatatcatcaactttatttgcatgttaaagattccaac 24211980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 26588126 - 26588076
Alignment:
Q  239 acaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26588126 acaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 26588076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 280 - 336
Target Start/End: Original strand, 7334971 - 7335026
Alignment:
Q  280 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7334971 agtgtaacacttaagattatcagataatatcatcaacta-gtttgaatgttaaagat 7335026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 25691522 - 25691471
Alignment:
Q  286 acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatg 337  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  25691522 acacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagatg 25691471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 342
Target Start/End: Original strand, 44598854 - 44598905
Alignment:
Q  291 taagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  44598854 taagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgacaac 44598905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 159
Target Start/End: Original strand, 8299192 - 8299254
Alignment:
Q  97 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaa 159  Q
    ||||||| || || |||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8299192 aaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaacactatagtatcaaaa 8299254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34362191 - 34362149
Alignment:
Q  192 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcag 234  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  34362191 tggcatcaaaagttcagttcttatagtatcatcaattcatcag 34362149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 46481182 - 46481122
Alignment:
Q  228 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 288  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  46481182 tcatcagattaacaagactatacttgatgtaattttattctacattgttttaagtgtaaca 46481122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 299 - 342
Target Start/End: Original strand, 12165939 - 12165982
Alignment:
Q  299 tcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12165939 tcacataatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgacaac 12165982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 140
Target Start/End: Original strand, 40381934 - 40381985
Alignment:
Q  89 aattaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 140  Q
    ||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40381934 aattaaggaaaattctacggtgaagttatgagaatgacttttctggtgaagt 40381985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 140
Target Start/End: Original strand, 3953747 - 3953776
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3953747 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 3953776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 342
Target Start/End: Original strand, 6546713 - 6546758
Alignment:
Q  297 tatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  6546713 tatcacatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgccaac 6546758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 23402403 - 23402374
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23402403 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 23402374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 37703551 - 37703515
Alignment:
Q  228 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaatttta 264  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  37703551 tcatcagattaataagactacacttaatctaatttta 37703515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 67)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Original strand, 14758053 - 14758292
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14758053 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcacacaactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 14758152  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac--------ttaagactatcac 302  Q
    | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||| |    
T  14758153 cccatagtttcatcaattcattagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaattaagactatcgc 14758252  T
Q  303 ataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14758253 ataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 14758292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 93 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11742532 - 11742284
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||  || || |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || |||  ||||||||||||||||| ||    
T  11742532 aaggaaaattttatcgtgaagttatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatattatcaaaagtgttgtaagtaacaccccactgtttgtacagt 11742433  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactta 292  Q
    | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  11742432 gacatcaaaagttcagtcc-cataatatcatcaattcatcggattaacaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaatta 11742334  T
Q  293 agactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||||||||| ||||    
T  11742333 agactatcacatgatatcagcaactctctttgtatgttaaagatgtcaac 11742284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 93 - 342
Target Start/End: Original strand, 15168083 - 15168356
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgt----- 187  Q
    ||||||||||| || || |||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         
T  15168083 aaggaaaattctatcgtgaagtgatgagaatgctttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacgtt 15168182  T
Q  188 --acggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt------- 278  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||           
T  15168183 gtacggtggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcagttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgta 15168282  T
Q  279 ----------aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
              |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15168283 acacctcagaaagtgtaacacttaaggctatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaac 15168356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 97 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 33725778 - 33725516
Alignment:
Q  97 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 196  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||  |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| |  |||||||    
T  33725778 aaaattctatggtaaagtcaagagaatgacttttctagtgaagtcaacgctatatcatcaaaagtgtattgagtagcagcccactatttctttggtggca 33725679  T
Q  197 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac------- 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  33725678 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccccagaa 33725579  T
Q  290 ----------ttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
              ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33725578 agtgtaacatttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaac 33725516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Original strand, 47279201 - 47279449
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  47279201 aagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacattatactatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcgaaagttcagtc 47279300  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||                 |||||||||||||||    
T  47279301 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaattgtaacatcccataaagtgtaacacttaa 47279400  T
Q  294 gactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47279401 gactatcacatgatatcaacaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 47279449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 93 - 342
Target Start/End: Original strand, 16415639 - 16415906
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccac-tgtttgtacgg 191  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||| |    
T  16415639 aaggaaaattctaaggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacaccctaaatgtttgtacag 16415738  T
Q  192 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag---------- 281  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  16415739 tggcatcaaaagttcagccatcatagtatcatcaattcattagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccc 16415838  T
Q  282 -------tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
           ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16415839 cacatattgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 16415906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 111 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31621717 - 31621545
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  31621717 aagtcatgagaatgacttttctagtgaagtcaacactataacatcaaaggtgtattgagtagcaccccgctatttgtacggtggcatcaaaaattcagtc 31621618  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtg 283  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31621617 cccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtg 31621545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Original strand, 2959743 - 2960008
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||| |||||| |||  || |||||||||||||| |||    
T  2959743 aggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtaagtaacatcccactgtttgtacagtg 2959842  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag------------ 281  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||                
T  2959843 acatcaaaagttcagtcctcatagtgtcatcaattcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacatccca 2959942  T
Q  282 -----tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2959943 caaattgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatatgtttgcatgttaaagatgccaac 2960008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 127 - 339
Target Start/End: Original strand, 40884841 - 40885070
Alignment:
Q  127 ttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa 226  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  40884841 ttttctggtgaagtcaacaccataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtccctatagtatcttcaa 40884940  T
Q  227 ttcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaagactatcacataatat 309  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||                 |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40884941 ttcatcagattaacaagattgcacttaatctagttttatcctatcttgttttaagtgtaacattccgaaaagtgtaacacttaagactatcgcataatat 40885040  T
Q  310 catcaactatgtttgcatgttaaagatgcc 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40885041 catcaactatgtttgcatgttaaagatgcc 40885070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 97 - 289
Target Start/End: Original strand, 15752027 - 15752219
Alignment:
Q  97 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 196  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  || |||| | ||||||||  |||| ||||||||||||  |||||    
T  15752027 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatatagtgagtaacacctcactgtttgtacaatggca 15752126  T
Q  197 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15752127 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacac 15752219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 111 - 337
Target Start/End: Original strand, 4330291 - 4330536
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaag-tcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcacccc-actgtttgtacggtggcatcaaaagttcag 208  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4330291 aagttatgagaatgacttttctgatgaagataaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacacccccaatgtttgtacagtgggatcaaaagttcag 4330390  T
Q  209 tcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacactt 291  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||                 ||||||||||    
T  4330391 tcatcatagtatcatcaatttatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacactt 4330490  T
Q  292 aagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  4330491 aagactatcacataatatcatcaactctttttgcatgttaaagatg 4330536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 95 - 289
Target Start/End: Original strand, 38823210 - 38823404
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| ||| | ||||  ||||||||| ||||||| |||     
T  38823210 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggttaagttaacactatagcatcaaaattgttgcgagtaacaccccactatttgtacagtgt 38823309  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  38823310 catcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaagtgtaacac 38823404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 94 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10182189 - 10181994
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||| || || ||||||||| |||||||||| |||||||||  | ||| ||  || |||| | ||||| ||  ||| ||||||||||||| |||    
T  10182189 aggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaaaactgtaacataaaaaatatagtgcgtaacacgccactgtttgtacagtg 10182090  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10182089 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 10181994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 173 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27227587 - 27227401
Alignment:
Q  173 caccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctacct 272  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  27227587 cacctcactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctacct 27227488  T
Q  273 tgttttaagtgta-----------------acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||                 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27227487 tgttttaagtgtaacaccccacaaagtgcaacacttaagactatcacatgatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaac 27227401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 111 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27533144 - 27532967
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| | ||| ||  || |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  27533144 aagttatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtattgtgggtaacaacccactctttgtacagtggcatcaaaagttcaatc 27533045  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27533044 cccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatc-aattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 27532967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27267361 - 27267116
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||  | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27267361 aagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacacta--gcataaaaaatgtagtgagtgacaccccactgtttgtacagtggcattaaaagttcagtc 27267264  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaa 293  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||                 ||||| |||||||||    
T  27267263 tccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaa-tttaatctaccttgttttgagtgtaacaccccacaaagtgcaacacttaa 27267165  T
Q  294 gactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27267164 gactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaac 27267116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 93 - 289
Target Start/End: Original strand, 48620631 - 48620827
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| ||  | |||| || | |||||||||||| |||||||  ||| ||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  48620631 aaggaaaattctatgttgaagttattaaaatgacttttcttgtgaagttaacaatataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagt 48620730  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  48620731 gacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacac 48620827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 95 - 289
Target Start/End: Original strand, 3309144 - 3309338
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||||    
T  3309144 ggaaaattctatggtaaagtcatgagaatgacttttctggtaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccc-actgtttgtacagtgg 3309242  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaa-ttttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
     |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  3309243 tatcaaaagttcaatcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaaatgtaacac 3309338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 93 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 34012559 - 34012298
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| |||||| ||| || ||||||  ||||||||  ||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||  ||    
T  34012559 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacgtttatgatgaagttaacactataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaagt 34012460  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac--- 289  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||       
T  34012459 ggcatcaaaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacacccc 34012360  T
Q  290 -------tta--agactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
            ||  | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  34012359 acaaaatgtaacacactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaac 34012298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 121 - 342
Target Start/End: Original strand, 48620659 - 48620888
Alignment:
Q  121 aatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtat 220  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| ||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  48620659 aatgacttttcttgtgaagttaacaatataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtat 48620758  T
Q  221 catcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactt----aagacta----tcacataatatcat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      |||  ||    |||||| ||||||     
T  48620759 catcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcacatgatatcag 48620858  T
Q  313 caactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48620859 caactctgtttgcatgttaaagatgccaac 48620888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 95 - 286
Target Start/End: Original strand, 42721035 - 42721226
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || ||||||||| ||||| |||| |||||||||   | |||||  || |||| | ||||||||  ||||||||||||||||| ||      
T  42721035 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgatttttttggtgaagttagccctatatcataaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagtaa 42721134  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaa 286  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42721135 catcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaa 42721226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 342
Target Start/End: Original strand, 15382927 - 15383193
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| || || |||| || | |||||||||| ||||||| |  ||||||||  ||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||  |    
T  15382927 aaggaaaattctatggtgaagttataaaaatgacttttttggtgaaattaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacatcccaccgtttgtacaat 15383026  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-------------- 278  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |                  
T  15383027 gtcatcaaaagttcagtcatcgtagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacccc 15383126  T
Q  279 ---aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
       ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15383127 acaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtatgcatgttaaagattccaac 15383193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Original strand, 18422646 - 18422911
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||| || || ||||||| | |||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||| | ||  ||||  |||||||| ||||||||  ||    
T  18422646 aggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatataacgagtaacaccccaccgtttgtacaatg 18422745  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt--------------- 278  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |                   
T  18422746 acatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttatatgcgtaacacccca 18422845  T
Q  279 --aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  18422846 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcacctccgtttgcatgttaaagattccaac 18422911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 97 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 238690 - 238429
Alignment:
Q  97 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 196  Q
    ||||||| || || |||||| || ||| |||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||| ||||||  || || |||||||||||  || ||    
T  238690 aaaattctatagtgaagtcacgaaaataacttttttggtgaagttaacactatagtattaaaaatgttgtgagtaacatcc-actgtttgtacaatgaca 238592  T
Q  197 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgta----------- 285  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||               
T  238591 tcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattaatcagactaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 238492  T
Q  286 ------acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  238491 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgccaac 238429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7079238 - 7078979
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccact-----------gtttgtacggtggcatca 199  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||           ||||||||  || |||||    
T  7079238 aagtcatgataatgacttttttggtgaagttaacactataatatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactaacacctcactgtttgtacaatgacatca 7079139  T
Q  200 aaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaac------------ 287  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||                
T  7079138 aaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagt 7079039  T
Q  288 -----acttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
         ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7079038 ataagacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 7078979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9903215 - 9902970
Alignment:
Q  114 tcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctc 213  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |    
T  9903215 tcatgaaaatgacttttttgatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacaccccgctgtttgtacagtgacatcaaaagttcaatccac 9903116  T
Q  214 atagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgta-----------------acacttaagac 296  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||                 |||||||||||    
T  9903115 atactatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttacattgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagac 9903016  T
Q  297 tatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  9903015 tatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgacaac 9902970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 342
Target Start/End: Original strand, 41926161 - 41926417
Alignment:
Q  97 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 196  Q
    ||||||| || || |||| |||| ||||| |||| || ||||||  | ||||||  ||||||| | ||||||||   | |||||||||||||| ||||||    
T  41926161 aaaattctatggtgaagttatgaaaatgatttttttgatgaagttaatactataacatcaaaaatatagtgagtaatatcccactgtttgtacagtggca 41926260  T
Q  197 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacact------ 290  Q
    ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||          
T  41926261 tcacaagttcagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactccacaa 41926360  T
Q  291 ----taagac-tatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
        ||| || ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41926361 agtgtaacacttattaaataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 41926417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30327132 - 30326868
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || ||||||| | |||||||||| | ||||| |  ||||||||  ||||||| |||| |||||   |||| || ||||||||  | |    
T  30327132 ggaaaattctatagtgaagtcataaaaatgactttttttgtgaatttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaatacccaaccgtttgtacaatag 30327033  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt---------------- 278  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |                    
T  30327032 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccac 30326933  T
Q  279 -aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30326932 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagattccaac 30326868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 114 - 336
Target Start/End: Original strand, 10922742 - 10922981
Alignment:
Q  114 tcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctc 213  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||  || |||| |||| |||||   ||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||    
T  10922742 tcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaagaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatcctc 10922841  T
Q  214 atagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaagac 296  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| |                 ||||||||||||||||||    
T  10922842 atagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatcttattttatcataccttgttataagggtaacacctcacaaagtgtaacacttaagac 10922941  T
Q  297 tatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10922942 tgtcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagat 10922981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 132 - 342
Target Start/End: Original strand, 32216088 - 32216315
Alignment:
Q  132 tggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcat 231  Q
    |||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32216088 tggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaatggcgtcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcaattcat 32216187  T
Q  232 cagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatca 314  Q
     |||||||||| |||  |||||||| ||||||| |||||||||||||                 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32216188 tagattaacaaaactaaacttaatcaaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataa 32216287  T
Q  315 actatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  32216288 actctgtttgcatgttaaagattccaac 32216315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 93 - 342
Target Start/End: Original strand, 32267028 - 32267294
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||  || || ||||||| |||||||||||| | |||||||  ||| ||||  ||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||  |    
T  32267028 aaggaaaattttatggtgaagtcataagaatgactttttttgtgaagttaacaatataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaat 32267127  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-------------- 278  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |                  
T  32267128 gacatcaaaagttcactcctcatattatcatcaacccatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacactcc 32267227  T
Q  279 ---aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  32267228 acaaagtgtaacactcaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaatattccaac 32267294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 47682657 - 47682410
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcac-cccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagt 209  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||  | || |||| ||| ||||||  ||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||| |    
T  47682657 aagtcatgagagtgacttttttggtgaagttaacacta--gcataaaaaatgttgtgagtaacactcccactgcttgtacagtggtatcaaaagttcatt 47682560  T
Q  210 cctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgta-----------------acactta 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||  || ||||||||||||||||                 |||||||    
T  47682559 cctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacatttaaactaattttattctgccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacactta 47682460  T
Q  293 agactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47682459 agactatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaac 47682410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 289
Target Start/End: Original strand, 3534926 - 3535122
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| ||||| | |||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||  ||||||||| | ||    
T  3534926 aaggaaaattctattatgaagtcattagaattaattttctagtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccttactgtttgtgcagt 3535025  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    | ||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  3535026 gacatcaaaagttcagtccccttaatattatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctgccttgttttaagtgtaacac 3535122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 288
Target Start/End: Original strand, 39393377 - 39393573
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||   ||  || ||||||||| ||    
T  39393377 aaggaaaattctacggtgaagttatgagaatgacttttctaatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaatacttcattgtttgtacagt 39393476  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaa-ttttaccctaccttgttttaagtgtaaca 288  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39393477 ggcatcaaaagtttaatccccatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacacttcatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaaca 39393573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 289
Target Start/End: Original strand, 1547281 - 1547469
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  || |||| ||| ||||||  ||| ||||||||||| | ||    
T  1547281 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataacataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgcagt 1547380  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1547381 ggcatcaaaagttcagttctcatagta--------tcatcagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacac 1547469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Original strand, 30254419 - 30254683
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||| || || |||| || |||||||||||| || ||||||  ||| ||||  ||||||| |||| |||||   || | |||||||||||  ||    
T  30254419 aggaaaattctatggtgaagttataagaatgacttttttgttgaagttaacaatataacatcaaaaatgtaatgagtaatacac-actgtttgtacaatg 30254517  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt----------------- 276  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||                     
T  30254518 acatcaaaagttcagtcctcaaagtatcatcaattcatcagattaacaagactagacttaatctaattttatcctaccttgttataagcataacacccta 30254617  T
Q  277 ttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  30254618 taaagtgtaacacttaagactgtcacataataacatcaactctgtttgcatgttaaagattccaac 30254683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 8222123 - 8222388
Alignment:
Q  91 ttaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacg 190  Q
    ||||||||||||| |  || ||||||| | |||||| ||| | |||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  |||| ||| |||   ||     
T  8222123 ttaaggaaaattctacggtgaagtcataaaaatgacctttttagtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccacaccgtt---aca 8222219  T
Q  191 gtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt------------ 278  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |                
T  8222220 atggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacacc 8222319  T
Q  279 -----aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
         ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  8222320 ccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaac 8222388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 177 - 342
Target Start/End: Original strand, 25160710 - 25160892
Alignment:
Q  177 ccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 276  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  25160710 ccaccgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcattagattaataagactacacttaatctcattttatcctaccttgtt 25160809  T
Q  277 ttaagtg-----------------taacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
     ||||||                 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  25160810 ataagtgtaacaccccacaaagtataacacttaaaactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaac 25160892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19899950 - 19899685
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||| || || ||||||| | ||||| |||| |||||||||  ||||||||  ||||||| ||||  ||||  |||| |||||||||||   ||    
T  19899950 aggaaaattctatggtgaagtcataataatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacacctcactgtttgtagaatg 19899851  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt--------------- 278  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| |                   
T  19899850 gcatcaaaagttcaaccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcatacattgttctaagcgtaacacccta 19899751  T
Q  279 --aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  19899750 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcaccaactctatttgcatgttaaagattccaac 19899685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Original strand, 37451298 - 37451545
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| ||||  ||||||||  ||||||| |||| | |||  ||||| || ||||||||  || ||||||||||||||||    
T  37451298 aagtcataaaaatgacttttttggtaaagttaacactataacatcaaaaatgtaataagtaacaccctaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtc 37451397  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaa 293  Q
    ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |                 |||||||||||||||    
T  37451398 ctc-tagtatcatcaatttatcatattaacaagactacacttaatctaattttatctgaccttgttataagtgtaacacctcaaaaagtgtaacacttaa 37451496  T
Q  294 gactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  37451497 gactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaac 37451545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 111 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28564945 - 28564705
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    |||| |||| ||||| |||| || ||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  ||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  28564945 aagttatgaaaatgatttttttgatgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccttactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtc 28564846  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt-----------------ttaagtgtaacacttaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||                 | ||||||||||||||     
T  28564845 ctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcatgccttgttataagcataacaccccgtaaagtgtaacactta- 28564747  T
Q  294 gactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28564746 -actatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagat 28564705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 37619078 - 37618886
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtgg--caccccactgtttgtacg 190  Q
    ||||||||||| || || |||| || |||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||| | || |||||    ||||||||||||||||      
T  37619078 aaggaaaattctatggtgaagttataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatttaatgagtaaaacaccccactgtttgtaaa 37618979  T
Q  191 gtggcatcaaaagttcagtcctcatagtat--catcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag 281  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37618978 atgacatcaaaagttcagttctcatagtatatcatcaattcatcagattaacaatactacacttaatctaattttatcctaccttgttataag 37618886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 243
Target Start/End: Original strand, 21289661 - 21289816
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaa-------aagtgtagtgagtggcaccccactgtttgt 187  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  || ||       || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  21289661 ggaaaaatctattgtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatatcataaataataaaaaatgtagtgagtaacaccccactgtttgt 21289760  T
Q  188 acggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaag 243  Q
    || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21289761 acagtggcatcaaaagttcagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaag 21289816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 336
Target Start/End: Original strand, 28769651 - 28769907
Alignment:
Q  97 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 196  Q
    ||||||| || || ||||||| | ||| |||||| | |||||||  |||||||   ||||||| |||| |||||  ||||| || ||||||||  |||||    
T  28769651 aaaattctatggtgaagtcataaaaataactttttttgtgaagttaacactatgacatcaaaaatgtaatgagtaacaccc-accgtttgtacaatggca 28769749  T
Q  197 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt------------------ 278  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |                      
T  28769750 tcaaaggttcggtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataaacgtaacacccccaca 28769849  T
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  28769850 aagtgtaacgcttaagactatcacataatatcatcacctctgtttgcatgttaaagat 28769907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 336
Target Start/End: Original strand, 51128884 - 51129113
Alignment:
Q  124 gacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcat 223  Q
    ||||||| | |||||||  ||||||||  || |||| |||| |||||  ||| |||| ||||||||  || |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  51128884 gacttttttagtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcattatagtatcat 51128983  T
Q  224 caattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ttaagactatcacataa 306  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||                 |||| ||||||||||||    
T  51128984 caattcatcatattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacaattaaaactatcacataa 51129083  T
Q  307 tatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51129084 tatcatcaactctgtttgcatgttaaagat 51129113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 163 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27564017 - 27563825
Alignment:
Q  163 tagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattt 262  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27564017 tagtgagtaacactccactgtttgtatagtgacatcaaaagttcagttccgataatattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattt 27563918  T
Q  263 taccctaccttgttttaagt-----------------gtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgc 338  Q
    || |||||||||||||||||                 | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27563917 tatcctaccttgttttaagtataataccccacaaagaggaacacttaagactatcatataatttcatcaactctgtttgcatgttaaagatgc 27563825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 336
Target Start/End: Original strand, 46931446 - 46931663
Alignment:
Q  134 gtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatca 233  Q
    |||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||   |||||||||||||||    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  46931446 gtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaataccccactgtttgtagaacggcatcaaaaattcagccctcataatatcatcaattcatca 46931545  T
Q  234 gattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt---------------ttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacta 318  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46931546 ggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttcagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactc 46931645  T
Q  319 tgtttgcatgttaaagat 336  Q
    | ||||||||||||||||    
T  46931646 tatttgcatgttaaagat 46931663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 336
Target Start/End: Original strand, 23999359 - 23999601
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||||| |  || |||| | ||  ||||  ||||||||| ||||||   || |||||||||||||| |    
T  23999359 aagtcataagaatgatttttttggtgaagttaacactacaacataaaaaatataacgagtaacaccccactatttgtagaatgacatcaaaagttcagcc 23999458  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaa 293  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |                 |||||||||||||||    
T  23999459 ctcatagtattatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaa 23999558  T
Q  294 gactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23999559 gactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagat 23999601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Original strand, 22170807 - 22170971
Alignment:
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaa-------------- 280  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||                  
T  22170807 catcaaaagttcagtctacataatatcatcaattcattagattaataacactacacttaatctaatttcatcctaccttgtttcaaatgtaacaccccac 22170906  T
Q  281 ---gtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  22170907 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgtcaac 22170971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27763391 - 27763297
Alignment:
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||    
T  27763391 catcaaaagtccagccctcatagtatcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatctaattttatcatacctagttctaagcgtaacac 27763297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1359914 - 1359851
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1359914 aagtgtaacacttaagattatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagattccaac 1359851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10181987 - 10181924
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||    
T  10181987 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgacaac 10181924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Original strand, 38823411 - 38823474
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38823411 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttagagatgccaac 38823474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 342
Target Start/End: Original strand, 3309349 - 3309413
Alignment:
Q  278 taagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  3309349 taagtgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgccaac 3309413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Original strand, 15752226 - 15752289
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||    
T  15752226 aagtgtaacacttaagagtatcacataatatcattaactctgtttgcatgttaaaaattccaac 15752289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 334
Target Start/End: Original strand, 38759730 - 38759785
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaag 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38759730 aagtgtaacacttgagactatcagataatatcaccaactatgtttgcatgttaaag 38759785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 335
Target Start/End: Original strand, 42721241 - 42721292
Alignment:
Q  284 taacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaga 335  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42721241 taacacttaagattatcacgtaatatcatcaactttgtttgcatgttaaaga 42721292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Original strand, 48353740 - 48353802
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  48353740 aagtgtaacact-aagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaac 48353802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27763281 - 27763227
Alignment:
Q  288 acttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  27763281 acttaagactatcacataatataatcaactctatttgcatgttaaagattccaac 27763227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 286 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31621526 - 31621480
Alignment:
Q  286 acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaa 332  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31621526 acacttaagactatcgcataatatcaacaactatgtttgcatgttaa 31621480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 341
Target Start/End: Original strand, 39393581 - 39393643
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaa 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  39393581 aagtgtaacacttaagactatcatatgatattagcaactctgtttccatgttaaagatgccaa 39393643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 289
Target Start/End: Original strand, 38759610 - 38759723
Alignment:
Q  180 ctgtttgtacggtggcatcaaaagttcag----tcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgt 275  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||    || || || |||||||||||||||| ||||| || ||| || ||||| |||||||| | || ||| |    
T  38759610 ctgtttgtacagtgacatcaaaagttcagccagtcttcgtaatatcatcaattcatcatattaataaaactacatttaatttaattttatcatatcttat 38759709  T
Q  276 tttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||||||||    
T  38759710 tttaagtgtaacac 38759723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 4150537 - 4150489
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtc 141  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4150537 aaggaaaattctatggtgaagtcatgataatgacttttctggtgaagtc 4150489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 303 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 37618856 - 37618817
Alignment:
Q  303 ataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  37618856 ataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaac 37618817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27532947 - 27532897
Alignment:
Q  292 aagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  27532947 aagactatcacatgatatcagcaattctgtttgcaagttaaagatgccaac 27532897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 140
Target Start/End: Original strand, 43579242 - 43579287
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 140  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43579242 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagt 43579287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 342
Target Start/End: Original strand, 3535147 - 3535183
Alignment:
Q  306 atatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3535147 atatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 3535183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 84)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11357534 - 11357302
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcacccc-actgtttgtacggtggcatcaaaagttcagt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11357534 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtatagtgagtaacacccccactgtttgtacagttgcatcaaaagttcagt 11357435  T
Q  210 cctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacataatat 309  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357434 catcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacttaagactatcacataatat 11357335  T
Q  310 catcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  11357334 catcaactctgtttgcatgttaaagataccaac 11357302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 90 - 289
Target Start/End: Original strand, 22450954 - 22451153
Alignment:
Q  90 attaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtac 189  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  22450954 attaaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcacctcactgtttgtat 22451053  T
Q  190 ggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22451054 ggtggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccttaccttgttttaagtgtaacac 22451153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 93 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 33378969 - 33378706
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| || |  |||| |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  33378969 aaggaaaattctatggcaaagttatgagaatgactttt---gtgaagtcaacactatagtatcaaaagtgtagtgagtagtaccccaatatttgtacggt 33378873  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaac----- 287  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||         
T  33378872 gacatcaaaagttcagtccccatagtattatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc 33378773  T
Q  288 ------------acttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
                ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33378772 aagaagtgtaatacttaagactatcgcataatctcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaac 33378706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 106 - 342
Target Start/End: Original strand, 40935993 - 40936228
Alignment:
Q  106 ttgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagtt 205  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||  |||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  40935993 ttgtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacacctcattgtttatacagtgacatcaaaagtt 40936092  T
Q  206 cagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacacttaagactatcacata 305  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40936093 cagtcctcatagtatcatctattcatcagattaacaagaatacacttaatataattttatcc-aactttttttaagtgtaacacttaagactatcacatg 40936191  T
Q  306 atatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||| | |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  40936192 atattagcaactccgtttgcatgttaaagatgccaac 40936228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 52041092 - 52040843
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccac-tgtttgtacggtggcatcaaaagttcagt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||||||||||||  | |||||  ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  52041092 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaatactataacatcaaaagtgtagtgagtaactccccaaatgtttgtatagtggcatcaaaagttcagt 52040993  T
Q  210 cctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagt-----------------gtaacactta 292  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||                 ||||||||||    
T  52040992 catcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacatagtgtaacactta 52040893  T
Q  293 agactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  52040892 agactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaac 52040843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 92 - 290
Target Start/End: Original strand, 21193594 - 21193792
Alignment:
Q  92 taaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacgg 191  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  |    
T  21193594 taaggaaaattctatggtaaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactgttgaatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtagag 21193693  T
Q  192 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacact 290  Q
    || ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21193694 tgacatcaaaagttcagtccccatggtatcattaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacact 21193792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 44186663 - 44186439
Alignment:
Q  118 gagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatag 217  Q
    |||||||| |||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  44186663 gagaatgatttttttggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccgctgtttatacagtgacatcaaaagttcagtccccatag 44186564  T
Q  218 tatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca-cttaagactatcacataatatcatcaac 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  |  |||||||||| |||||| ||||    
T  44186563 tatcatcaattcatcaaattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacaccccacaactatcacatgatatcaacaac 44186464  T
Q  317 tatgtttgcatgttaaagatgccaa 341  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  44186463 tctgtttgcatgttaaagatgccaa 44186439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 93 - 336
Target Start/End: Original strand, 48354930 - 48355190
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| ||| |||| |||| |||||  ||||||| |||||||||  |    
T  48354930 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttatggtgaagttaacactataatattaaaaatgtaatgagtaacaccccattgtttgtacaat 48355029  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-------------- 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |                  
T  48355030 ggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttagtctaattttatcctaccttgttataaatgtaacatacc 48355129  T
Q  279 ---aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48355130 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagat 48355190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 94 - 286
Target Start/End: Original strand, 11466814 - 11467006
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||  | ||||||  |||  |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  11466814 aggaaaattctatggtgaagtcttgagaatgacttttctgatgaagttaagactataacatcgcaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtg 11466913  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaa 286  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11466914 gcatcaaaagtttagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaa 11467006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 95 - 337
Target Start/End: Original strand, 37203058 - 37203318
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || ||||||| | ||||| |||| || ||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  37203058 ggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgatttttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 37203157  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt---------------- 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||                    
T  37203158 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttttagtgtatcaccccac 37203257  T
Q  279 -aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacta-tgtttgcatgttaaagatg 337  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  37203258 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatattgtttgtatgttaaagatg 37203318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 95 - 289
Target Start/End: Original strand, 4015451 - 4015645
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||  |||     
T  4015451 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctgatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacacccaactgtttgtagagtga 4015550  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  | ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4015551 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatataattagtctaattttatcctacattgttttaagtgtaacac 4015645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 111 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27480548 - 27480370
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||  ||||||||| || ||||| ||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27480548 aagtcatgagaatgatatttttggtaaagtcaacactataacatcaaaagtataatgagtagcatccaattgtttgtacggtgacatcaaaagttcagtc 27480449  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27480448 cccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacac 27480370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 93 - 342
Target Start/End: Original strand, 34132924 - 34133190
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| ||  | |||||| || |||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||  |    
T  34132924 aaggaaaattctataatgaagtcacgaaaatgacttttttggtgaaattaacactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaat 34133023  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-------------- 278  Q
    | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||                  
T  34133024 gacatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc 34133123  T
Q  279 ---aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  34133124 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattttgtttgcatgttaaagatgccaac 34133190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 46297945 - 46297683
Alignment:
Q  97 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 196  Q
    ||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| | ||||||||  ||| |||||||||||||  ||||     
T  46297945 aaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaaatatagtgagtaacacaccactgtttgtacaatggcg 46297846  T
Q  197 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgta----------- 285  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||               
T  46297845 tcaaaagttcagtccccgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatcaaactttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 46297746  T
Q  286 ------acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  46297745 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaac 46297683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 51213166 - 51212972
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||  || |||| |||| ||||   |||||||||||||||||  |||    
T  51213166 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactgtaacataaaaaatgtaatgagcaacaccccactgtttgtacaatgg 51213067  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  51213066 catcaaaagttgagtcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagtgtaacac 51212972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 93 - 289
Target Start/End: Original strand, 35844315 - 35844512
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||| ||| ||||||  |||| |||||||||||| ||    
T  35844315 aaggaaaattctatggtgaagtcatgataatgacttttctggtgaagttaacactataacaacaaaaatgttgtgagtaacacctcactgtttgtacagt 35844414  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaa-ttttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  35844415 gacatcaaaagtttagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctacctagttttaagtgtaacac 35844512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 43976054 - 43975813
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||   ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||    
T  43976054 aagtcatgagaatgacttttttg---aagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcactccactatttgtacgatgacatcaaaagtttaatc 43975958  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac----------ttaagactatc 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||           ||| ||||||    
T  43975957 ctcataatatcatcaattcatcagattaacaaaattgcacttaatctaattttatcttatcttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacactatc 43975858  T
Q  301 acataatatcatcaacta---tgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
     |||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||    
T  43975857 gcataatatcatcaactatgttgtttacatgttaaagatgccaac 43975813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 53229322 - 53229073
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccc-cactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagt 209  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||   ||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  53229322 aagtcatgaaaattatttttctggtgaaattaacactatagcatcaaaagtgtagtgagcaacaccctcaatgtttgtacagttgcatcaaaagttcagt 53229223  T
Q  210 cctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtg-----------------taacactta 292  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||                 |||||||||    
T  53229222 catcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacagttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaactccccacaaagtgtaacactta 53229123  T
Q  293 agactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53229122 agactatcacatagtatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaac 53229073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 95 - 289
Target Start/End: Original strand, 37157699 - 37157892
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || ||||||||| |||| ||||| || ||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  37157699 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatggcttttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtt-gtacagtgg 37157797  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  37157798 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaatttataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttcaagtgtaacac 37157892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26941446 - 26941181
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||| || || ||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||||||||  ||||||| | || |||||  ||||||||||||||||   ||    
T  26941446 aggaaaattctatggtgaagtcataagaatgatttttttggtgaagttaacactataaaatcaaaattataatgagtaacaccccactgtttgtataatg 26941347  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt----------------- 276  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||                     
T  26941346 acatcaaaagttcagtcctcatggtatcattaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaatacctca 26941247  T
Q  277 ttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26941246 taaagtgtaacacttaaaactatcatataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaac 26941181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Original strand, 39282641 - 39282907
Alignment:
Q  92 taaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacgg 191  Q
    |||||||||||| || || ||||||||| ||||| ||||||| | || |  ||||||||  ||||||| ||| ||||||   |||||||||||| ||| |    
T  39282641 taaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgatttttctgataaaattaacactataacatcaaaactgt-gtgagtaataccccactgtttatacag 39282739  T
Q  192 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttt-------------- 277  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||                  
T  39282740 tggcatcaaaagttcagttctcatattatcatccattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccc 39282839  T
Q  278 ---taagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  39282840 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatatgtttgcctgttaaagatgtcaac 39282907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 4761838 - 4761575
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttct--ggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacg 190  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  | |||||| |||||||| |||| |||||  |||  ||||||||||||     
T  4761838 aaggaaaattctatggtgaattcatgagattgacttttttttggtgaagttaatactataatatcaaaaatgtaatgagtaacacttcactgtttgtaca 4761739  T
Q  191 gtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt------------ 278  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |                
T  4761738 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatctgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataacacc 4761639  T
Q  279 ------aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4761638 cccacaaagtataacacttaagactatcacataatatcatcaactatatttgcatgttaaagat 4761575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 42506212 - 42505996
Alignment:
Q  143 acactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaa 242  Q
    ||||||||  ||||||| |||| |||||   ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42506212 acactataacatcaaaattgtaatgagtaataccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaa 42506113  T
Q  243 gactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgc 325  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  42506112 gactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgc 42506013  T
Q  326 atgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||| |||||    
T  42506012 atgttaaagattccaac 42505996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Original strand, 2007972 - 2008187
Alignment:
Q  143 acactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaa 242  Q
    |||||||||  | |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2007972 acactatagcgttaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcaatccccatagcatcatcaattcatcagattaacaa 2008071  T
Q  243 gactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt----------------aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgca 326  Q
    || |  |||||||||||||||| ||||||| |||||                |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  2008072 gaatatacttaatctaattttatcctacctcgttttaagtgtacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgca 2008171  T
Q  327 tgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||| ||||    
T  2008172 tgttaaagatgacaac 2008187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 111 - 289
Target Start/End: Original strand, 29099362 - 29099540
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  || |||| ||| ||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  29099362 aagtcattagaatgacttttctggtgaagttaacactataacataaaaaatgtcgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatctaaagttcagtc 29099461  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    | | ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||| | | |||| |||||||||||||||    
T  29099462 cccttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatttaattttatcgtgccttattttaagtgtaacac 29099540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 40552445 - 40552251
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  ||| |||| ||||||||  ||    
T  40552445 aggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggagaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatg 40552346  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 288  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | || |||||| |||| ||||||    
T  40552345 acatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaacactacacttaatttaattttatcttagcttgttataagcgtaaca 40552251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3655388 - 3655193
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||  || || ||||||| | |||||||||| || | ||||  ||||||||  || |||| |||| |||||  |||||||| ||||||||  ||    
T  3655388 aggaaaattttatggtgaagtcataaaaatgacttttttgataaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatg 3655289  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||    
T  3655288 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttagaagcgtaacac 3655193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 288
Target Start/End: Original strand, 32373479 - 32373654
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    |||||||||||||||||||||   | ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||   || ||||||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  32373479 aagtcatgagaatgacttttccaataaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagta--actccactgtttgtacagtggcatcaaaagttccacc 32373576  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 288  Q
    |  || ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32373577 ccaatggtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca 32373654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 111 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20373465 - 20373300
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||  | ||||||  ||||||| ||||  ||||  |||||||||||||||||  || |||||||||||||||     
T  20373465 aagtcataagaatgatttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaacgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtt 20373366  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 276  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20373365 ctcatggtatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 20373300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 117 - 290
Target Start/End: Original strand, 45174516 - 45174692
Alignment:
Q  117 tgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtg--agtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctca 214  Q
    ||||||| |||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||  |||  |||  |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||    
T  45174516 tgagaataacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgtgagtaacacttcactgtttgtacagtagcatcaaaagttcagtcccca 45174615  T
Q  215 tagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaa-ttttaccctaccttgttttaagtgtaacact 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45174616 tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatttaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacact 45174692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 127 - 342
Target Start/End: Original strand, 3362276 - 3362510
Alignment:
Q  127 ttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa 226  Q
    |||| |||||||||  ||||||||| |||| || | ||||||||  || |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3362276 ttttttggtgaagttaacactatagcatcagaaatatagtgagtaacatcccactatttgtacagtggcatcaaaagttcactcctcatggtatcatcaa 3362375  T
Q  227 ttcatcagattaacaagactgcac--ttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaagactatcacataat 307  Q
    |||||||  ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| ||||                 ||||||||||||||||||||||||||||     
T  3362376 ttcatcatgttaacaagactacactattaatctaattttatcctaccttattttaagtgaaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataac 3362475  T
Q  308 atcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3362476 atcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaac 3362510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 290
Target Start/End: Original strand, 44891514 - 44891683
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  || ||||||||         ||||||||||||| ||||    
T  44891514 aagtcatgaaaatgactttt-tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgt---------ggcatcaaaagtttagtc 44891603  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacact 290  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44891604 cacatagtatcatcaattaatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacact 44891683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7327669 - 7327403
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcga-cactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    |||||||||| || || |||| ||||||||||||||| | |||||||  | |||||||  ||||||||||| ||||||  ||| ||| | ||||||| ||    
T  7327669 aggaaaattctatggtgaagttatgagaatgacttttttagtgaagttaaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccattatttgtacagt 7327570  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttt--------------- 277  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||||| |||                   
T  7327569 gacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcggattaacaagaatacacttaatttatttttatcctaccttctttctagtgtaacacccc 7327470  T
Q  278 --taagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
       |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7327469 acaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctatttgcatgttaaagatgccaac 7327403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 111 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22446234 - 22446054
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttct-ggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagt 209  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||  ||| ||||  ||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||      
T  22446234 aagtcatgaaaatgactttttttggtgaagttaacattatatcatcaaaaatatagtgagtaacaccccact-tttgtacagtggcatcaaaagttcaaa 22446136  T
Q  210 cc-tcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacact 290  Q
    || |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22446135 ccctcatagtatcatcaattcatcatataaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacact 22446054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 173 - 288
Target Start/End: Original strand, 43348327 - 43348441
Alignment:
Q  173 caccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctacct 272  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  43348327 caccccactgtttgtttagtggcatcaaaagttcagtcttt-tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctacct 43348425  T
Q  273 tgttttaagtgtaaca 288  Q
    ||||||||||||||||    
T  43348426 tgttttaagtgtaaca 43348441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24489131 - 24488883
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    |||||| || ||||| |||| | |||||||  | |||||||||| |||| ||| ||||||  ||  |||||||||| ||  || ||||||||||||||||    
T  24489131 aagtcacgaaaatgattttttttgtgaagttaagactatagtattaaaaatgttgtgagtaacattccactgtttgcacaatgacatcaaaagttcagtc 24489032  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgta-----------------acacttaa 293  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||                 ||||||||    
T  24489031 cccatattatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacacctcacaaggtgtaacacttaa 24488932  T
Q  294 gactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24488931 gactatcacacaatatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaac 24488883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Original strand, 25579746 - 25579994
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||| |  ||  | ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  25579746 aagttatgagaatgatttttctggtgaagttaatactatagcatcaaaagtgttgtgaataacattctactatttatacagtgacatcaaaagttcagtc 25579845  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaa 293  Q
    | |||| |||||||| || || |||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||                 |||||||||||||||    
T  25579846 cccatattatcatcagtttattagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgtttttagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaa 25579945  T
Q  294 gactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25579946 gactattacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 25579994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 289
Target Start/End: Original strand, 29163912 - 29164003
Alignment:
Q  198 caaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29163912 caaaagttcagtcctcttagtatcatcaattcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 29164003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 46994746 - 46994588
Alignment:
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag------------- 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||                 
T  46994746 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacgccccac 46994647  T
Q  282 ----tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  46994646 aaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattatgtttgcatgctaaagat 46994588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21009940 - 21009723
Alignment:
Q  142 gacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaaca 241  Q
    |||||||||  ||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||   || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21009940 gacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactatttgtagaatgacatcaaaagttcagccctcatattatcatcaattcatcaggttaaca 21009841  T
Q  242 agactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttg 324  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | || |||||| |                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  21009840 agactacacttaatataattttatcataacttgttctaagcataacactctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacaatatttg 21009741  T
Q  325 catgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||| |||||    
T  21009740 catgttaaagattccaac 21009723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 153 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24708242 - 24708106
Alignment:
Q  153 atcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcac-- 250  Q
    ||||||| || |||||||  |||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  24708242 atcaaaactgcagtgagtaacacctcactgt--gtacagtgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacactt 24708145  T
Q  251 ttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24708144 ttgatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacac 24708106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 154 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14586796 - 14586661
Alignment:
Q  154 tcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcactta 253  Q
    |||||||||| ||||||  |||| |||| ||| ||| |||  ||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14586796 tcaaaagtgttgtgagtaacacctcactatttatacagtgatatcaaaagttttgtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacactta 14586697  T
Q  254 atctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14586696 atctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacac 14586661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 177 - 290
Target Start/End: Original strand, 53176127 - 53176240
Alignment:
Q  177 ccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 276  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||  ||    
T  53176127 ccactgtttgtacaataacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatccaacctcatt 53176226  T
Q  277 ttaagtgtaacact 290  Q
    |||| | |||||||    
T  53176227 ttaaatataacact 53176240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 264
Target Start/End: Original strand, 47481511 - 47481682
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||  || || |||||||  ||||||  ||| |||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||   |    
T  47481511 aaggaaaattttatggtgaagtcataggaatgatgtttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtagaat 47481610  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaatttta 264  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  47481611 gacatcaaaagtttagccctcatagtatcatcaattcatcatgttaacaagactacacttaatataatttta 47481682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 216 - 289
Target Start/End: Original strand, 33698265 - 33698338
Alignment:
Q  216 agtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33698265 agtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 33698338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 192 - 286
Target Start/End: Original strand, 38591786 - 38591880
Alignment:
Q  192 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaa 286  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  38591786 tggcatcaaaagttaagtccacatattattatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgtttcaagtgtaa 38591880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 54828786 - 54828693
Alignment:
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 288  Q
    |||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  54828786 catcaaaaattcattcttcatagcatcatcaattcatcatatgaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaaca 54828693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 342
Target Start/End: Original strand, 54505823 - 54506062
Alignment:
Q  119 agaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagt 218  Q
    |||||||||||| || ||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  ||||||| | ||| ||   || |||||||| ||||| |||||||||    
T  54505823 agaatgacttttttgttgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccattatttatagaatgacatcaaaaattcag-cctcatagt 54505921  T
Q  219 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaagactatca 301  Q
    ||||| ||| |||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |                 |||||||||||||||||||||||    
T  54505922 atcataaatacatcgggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacactctacaaagtgtaacacttaagactatca 54506021  T
Q  302 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||    
T  54506022 cataatatcatctactttatttgcatgttaaagattccaac 54506062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20373228 - 20373165
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20373228 aagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaac 20373165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 218 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22622780 - 22622709
Alignment:
Q  218 tatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  22622780 tatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgtttcaagtgtaacac 22622709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Original strand, 1089886 - 1089949
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1089886 aagtgtaacacttaagactatcacataacatcaacaactctatttgcatgttaaagatgccaac 1089949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 206 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11835702 - 11835619
Alignment:
Q  206 cagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaat-tttaccctaccttgttttaagtgtaaca 288  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11835702 cagtccccatagtatcatcaatttatcatattaacaaaaatacacttaatctaatatttatcctaccttgttttaagtgtaaca 11835619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 279 - 341
Target Start/End: Original strand, 37157899 - 37157962
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacta-tgtttgcatgttaaagatgccaa 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  37157899 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatattgtttgtatgttaaagatgccaa 37157962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27480350 - 27480283
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac----tatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27480350 aagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatatatgtttgcatgttaaagatgccaac 27480283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Original strand, 11467016 - 11467079
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  11467016 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgtttaagataccaac 11467079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22622698 - 22622639
Alignment:
Q  283 gtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||    
T  22622698 gtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttggatgttaaagatgtcaac 22622639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Original strand, 33698345 - 33698408
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33698345 aagtgtaacacttaagactatcgcatgatatcggcaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 33698408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Original strand, 44891689 - 44891752
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  44891689 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgtcaac 44891752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 54828685 - 54828622
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  54828685 aagtgtaacacttaaaactatcaaataatatcatcaactatgtttgtatgttaaaaattccaac 54828622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 288
Target Start/End: Original strand, 36012244 - 36012322
Alignment:
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaa-ttttaccctaccttgttttaagtgtaaca 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  36012244 ctcataatatcatcaattcatcagatgaacaagaatacacctaatctaatttttatcctaccttgttttcagtgtaaca 36012322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 281 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 40552241 - 40552180
Alignment:
Q  281 gtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  40552241 gtgtaacacttaggattgtcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaac 40552180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 279 - 336
Target Start/End: Original strand, 47481714 - 47481771
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||    
T  47481714 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatattaaagat 47481771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 53811767 - 53811696
Alignment:
Q  181 tgtttgtacggtggcatcaaaagttcagt------cctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagact 246  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53811767 tgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtatataaccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagact 53811696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Original strand, 45174698 - 45174761
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  45174698 aagtgtaacacttaagactataatatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaac 45174761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 288
Target Start/End: Original strand, 1089811 - 1089877
Alignment:
Q  222 atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 288  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1089811 atcaatttatcagatcaacaggactacattaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca 1089877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 3655183 - 3655129
Alignment:
Q  282 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  3655183 tgtaacacttaaaactatcacatgatatcatcagctctgtttgcatgttaaagat 3655129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11357134 - 11357072
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaa 341  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||    
T  11357134 aagtgtaacactcaagactatcatataatatcatcaactctggttgtatgttaaatatgccaa 11357072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 51212743 - 51212698
Alignment:
Q  291 taagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51212743 taaggctatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagat 51212698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Original strand, 22451171 - 22451223
Alignment:
Q  290 ttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22451171 ttaacactatcgtataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaac 22451223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 298 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24708080 - 24708036
Alignment:
Q  298 atcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  24708080 atcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgccaac 24708036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 286 - 342
Target Start/End: Original strand, 32373669 - 32373725
Alignment:
Q  286 acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  32373669 acacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatattaaagatgtcaac 32373725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 286 - 342
Target Start/End: Original strand, 38591897 - 38591953
Alignment:
Q  286 acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||| ||||    
T  38591897 acacttaagactatcacataatatcatcaaatctatttgcatgtcaaagatgacaac 38591953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 286 - 342
Target Start/End: Original strand, 43348456 - 43348512
Alignment:
Q  286 acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  43348456 acacttaagactatcacatgatatcaacaactctatttgcatgttaaagatgtcaac 43348512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 40640684 - 40640637
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 140  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40640684 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 40640637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22446036 - 22445986
Alignment:
Q  292 aagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  22446036 aagactatcatataatatcatcaactatttttgcatattaaagataccaac 22445986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11835611 - 11835562
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatg 328  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  11835611 aagtgtaacaattaagactatcacatgatatcatcaactctatttgcatg 11835562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 342
Target Start/End: Original strand, 36012333 - 36012394
Alignment:
Q  282 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact-atgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  36012333 tgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactcttgtttccatgttaaagatgccaac 36012394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 342
Target Start/End: Original strand, 4015659 - 4015714
Alignment:
Q  286 acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4015659 acacttaagactatcgcattgtatcaacaact-tgtttgcatgttaaagatgccaac 4015714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14586636 - 14586600
Alignment:
Q  306 atatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14586636 atatcaacaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 14586600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 317
Target Start/End: Original strand, 53176246 - 53176284
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  53176246 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaact 53176284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 55343471 - 55343405
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaa 159  Q
    ||||||||||| || || |||||| || ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||    
T  55343471 aaggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataatatcaaaa 55343405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11835790 - 11835702
Alignment:
Q  96 gaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtac 189  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||     |||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||    
T  11835790 gaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacac-----tatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtac 11835702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 53811701 - 53811655
Alignment:
Q  292 aagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||    
T  53811701 aagactatcacataatatcatcaac----tttgcatgttaaagataccaac 53811655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 336
Target Start/End: Original strand, 21193812 - 21193856
Alignment:
Q  292 aagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    |||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21193812 aagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagat 21193856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 73)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 95 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14409501 - 14409252
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||  ||||||||    
T  14409501 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaaatgtagtgagtagcaccccactcttaatacggtgg 14409402  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgta---acactt 291  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   || |||    
T  14409401 catcaaaagttcagtc-tcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaactactctt 14409303  T
Q  292 aagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14409302 aagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaac 14409252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1429321 - 1429073
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    ||||||| || || || ||||||||| ||||||| || |||||||||  ||||||||| ||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||  ||    
T  1429321 aggaaaaatctatggtgaagtcatgaaaatgactcttttggtgaagttaacactatagcatcaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacactg 1429222  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacacttaa 293  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1429221 gcatcaaaaattcagtctccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacttaa 1429122  T
Q  294 gactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1429121 gactatcacataatatcataaactttatttgcatgttaaagatgccaac 1429073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 93 - 342
Target Start/End: Original strand, 24886100 - 24886351
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttct--ggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacg 190  Q
    ||||||||||  || || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  | ||||||  ||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||     
T  24886100 aaggaaaattttatggtgaaatcatgagaatgacttttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtaca 24886199  T
Q  191 gtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacact 290  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  24886200 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacact 24886299  T
Q  291 taagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  24886300 taagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaac 24886351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Original strand, 33908249 - 33908497
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33908249 aagtcatgagaatgaactttctggtgaagtcaacactatatcatcaaaagtgtagtgagtagcactccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 33908348  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaa 293  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||                 |||||||||||||||    
T  33908349 ctcatagtatcatcaattattcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaaatgtaacaccccagaaagtgtaacacttaa 33908448  T
Q  294 gactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33908449 gactatcgcataatatcgtcaactatgtttgtatgttaaagatgccaac 33908497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Original strand, 699166 - 699414
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| || |||| | ||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  699166 aagttatgagaatgacttttctgatgaagttaacactatagcataaaaaatctagtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtc 699265  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaac-----------------acttaa 293  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||                 ||||||    
T  699266 atcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttattttaagtgtaacactccacaaagtgtaatacttaa 699365  T
Q  294 gactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  699366 gactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 699414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Original strand, 22980809 - 22981057
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||||   |||||||||||||  |  || ||||||||||||||||    
T  22980809 aagttatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagtatcaaaaatacagtgagtaataccccactgtttgagcaatgacatcaaaagttcagtc 22980908  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaa 293  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||                 ||||||||||||    
T  22980909 cccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaaatgtaacacttaa 22981008  T
Q  294 gactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22981009 gactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 22981057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 95 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31786821 - 31786557
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || ||||  |||||||||||||| |||||||||  ||||||||| || |||| |||||||||     ||||||||||||||| ||||    
T  31786821 ggaaaattctatagtgaagtagtgagaatgacttttttggtgaagttaacactatagcatgaaaaatgtagtgagcactgccccactgtttgtacagtgg 31786722  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgta--------- 285  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||             
T  31786721 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccctac 31786622  T
Q  286 --------acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
            |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31786621 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgattgcatgttaaagatgccaac 31786557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 111 - 337
Target Start/End: Original strand, 26268090 - 26268333
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26268090 aagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttttgagtaacaccccactgtttgtacggtgacatcaaaagtttagtc 26268189  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaa 293  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||| | |||||||||||                 |||||||||||||||    
T  26268190 cacatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacaattaatcaaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccgcacaaagtgtaacacttaa 26268289  T
Q  294 gactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatg 337  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26268290 gactatcacatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagatg 26268333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 93 - 342
Target Start/End: Original strand, 19119857 - 19120123
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||| ||    
T  19119857 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttgtggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgctagtaacaccccactgtttgtacagt 19119956  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-------------- 278  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||||                  
T  19119957 gacatcaaaagttcagtccccatagtgtcatcaattcatcagattaacaagaataaacttactctaattttatcctaccttgttttaagtataacacccc 19120056  T
Q  279 ---aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
       |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19120057 acaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactccgtttgcatgttaaagatgccaac 19120123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 334
Target Start/End: Original strand, 8466739 - 8466983
Alignment:
Q  89 aattaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgta 188  Q
    ||||||||||||||| ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||| |||| |  |||||| || ||||||    
T  8466739 aattaaggaaaattctatgatgaggtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactgtaacatcaaaagtgttgtgaataacacccc-ctctttgta 8466837  T
Q  189 cggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 288  Q
    | |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  8466838 cagtggtatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaaatgtaaca 8466937  T
Q  289 cttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaag 334  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||| ||||| ||| ||||||    
T  8466938 cttaagactatcatatgatatcaccaactctgtttacatattaaag 8466983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 111 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 30969483 - 30969305
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||    
T  30969483 aagtcatgagaatgatttatctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttatacaatgacatcaaaagttcagtc 30969384  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  30969383 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacac 30969305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 93 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8742064 - 8741867
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcacccc-actgtttgtacgg 191  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||||      
T  8742064 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacacccccattgtttgtacaa 8741965  T
Q  192 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  8741964 tggcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacaattaatctaattttgtcataccttgttttaagtgtaacac 8741867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 289
Target Start/End: Original strand, 7693230 - 7693424
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || ||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||| ||||    
T  7693230 ggaaaattctatggtgaagtcattaaaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgtttgtacagtgg 7693329  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7693330 catcaaaagttcaatcctcttagtatcatcaattcattagattaacatgaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacac 7693424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 88 - 289
Target Start/End: Original strand, 27330299 - 27330498
Alignment:
Q  88 taattaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgt 187  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||  |||||  ||||  |||||||||    
T  27330299 taattaaggaaaattctatggtgaagtcgtgggaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgt--tgagtaacaccttactgtttgt 27330396  T
Q  188 acggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaac 287  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27330397 acaatggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaac 27330496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 94 - 288
Target Start/End: Original strand, 39572818 - 39573012
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||| || ||||  | |||||| ||| |||| ||| ||||||  ||| ||||||||||| | |||    
T  39572818 aggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagttaagttaatactataatataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgcagtg 39572917  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 288  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39572918 acatcaaaagttcagttctcatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca 39573012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 114 - 286
Target Start/End: Original strand, 5837574 - 5837746
Alignment:
Q  114 tcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |    
T  5837574 tcatgagaatgacttttctggtgaaggtaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaatttcagtctcc 5837673  T
Q  214 atagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaa 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  5837674 atagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaatttaatcctacattgttttaagtgtaa 5837746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 25501099 - 25500907
Alignment:
Q  97 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 196  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||| |||| |  |||| ||||||||||||  || ||    
T  25501099 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtaaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgaataacacctcactgtttgtacactgcca 25501000  T
Q  197 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25500999 tcaaaagttaagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaagaataaacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 25500907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 95 - 342
Target Start/End: Original strand, 36866762 - 36867026
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || |||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| | | ||||||  |||||||||||||||||  |||    
T  36866762 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgatttttctggtgaagttaacactataatatcaaaaatattgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgg 36866861  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt---------------- 278  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||                    
T  36866862 catcaaaagttcagtcccgatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 36866961  T
Q  279 -aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  36866962 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaac 36867026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 93 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 38528413 - 38528218
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| ||||  ||||||| ||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  ||||||| ||||| ||| ||    
T  38528413 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatggtttttctgatgaagttaacactataacatcaaaattgtaatgagtaacaccccattgtttatacagt 38528314  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  38528313 gacatcaaaagttcagtc-tcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcttaccttgtttcaagtgtaacac 38528218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 95 - 342
Target Start/End: Original strand, 40133385 - 40133649
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || |||||| || |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||  |||    
T  40133385 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttgtggtgaagttaacattatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatgg 40133484  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt---------------- 278  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||                    
T  40133485 catcaaaagttcagtccccataatatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 40133584  T
Q  279 -aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  40133585 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaac 40133649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Original strand, 9200232 - 9200488
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||  || || ||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||    
T  9200232 aggaaaattttatggtgaagtcattaaaataacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacagtttgtacagtg 9200331  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactt-- 291  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |       
T  9200332 acatcaaaagtttagtcctcttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacattcca 9200431  T
Q  292 --aagacta----tcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
      |||  ||    |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9200432 caaagtgtaacactcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 9200488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 111 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27318646 - 27318404
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |  || |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||  || ||||||||||| |||     
T  27318646 aagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactaaaacataaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaatgacatcaaaagtttagtt 27318547  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaa 293  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||                 |||||||||||||||    
T  27318546 ctcacagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaa 27318447  T
Q  294 gactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27318446 gactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagat 27318404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 289
Target Start/End: Original strand, 12910348 - 12910549
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||||| | ||||| ||  ||||||||||||||||| ||    
T  12910348 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaaaactataacatcaaaaatatagtgcgtaacaccccactgtttgtacagt 12910447  T
Q  193 -----ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaac 287  Q
         | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12910448 acagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacatgactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaac 12910547  T
Q  288 ac 289  Q
    ||    
T  12910548 ac 12910549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Original strand, 36860420 - 36860688
Alignment:
Q  92 taaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacgg 191  Q
    |||||||||||| || || |||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||||||||||      
T  36860420 taaggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgatttttctggtgaagttaacactatagtataaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaa 36860519  T
Q  192 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt------------- 278  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||                 
T  36860520 tgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcatactaacaagagtacatttaatctaattttatcctaccttttttttaagtgtaacacc 36860619  T
Q  279 -----aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  36860620 ccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaac 36860688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 95 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23116397 - 23116133
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || | ||||||| |||||||||| |  ||||||  ||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23116397 ggaaaattctatggtgacgtcatgaaaatgactttttttatgaagttaacattataacatcaaaactgtagtgagtagcaccccactgtttgtacagtgg 23116298  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgta--------- 285  Q
     ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||             
T  23116297 aatcaaaagttcagtttacatagtatcatcaattcatcagattaacaatattacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccac 23116198  T
Q  286 --------acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  23116197 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgtcaac 23116133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 288
Target Start/End: Original strand, 32563150 - 32563342
Alignment:
Q  96 gaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggc 195  Q
    |||||||| || || ||||||| | ||||| ||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||| ||| |    
T  32563150 gaaaattctatggtgaagtcattaaaatgatttttctgatgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtctgtacagtgac 32563249  T
Q  196 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 288  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32563250 atcaaaagttcagtccccttaatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca 32563342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 5112490 - 5112297
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||  || || ||||||||| |||||||||| |||||||||  | ||||||  || |||| | ||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  5112490 aaggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacataaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagt 5112391  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaa 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  5112390 ggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcattaaattaacaagactatacttaatctaattttatcataccatgttttaagtgtaa 5112297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 119 - 289
Target Start/End: Original strand, 22019656 - 22019826
Alignment:
Q  119 agaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||    
T  22019656 agaatgacttttctggtgaagttaaaactatagaatcaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttgtatagtgacatcaaaagttaagtccccttagt 22019755  T
Q  219 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22019756 atcatcacttcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacac 22019826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 35511636 - 35511393
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||  ||| ||||  ||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  35511636 aagtcatgaaaatgacgtttctgatgaagttaacattataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagtc 35511537  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac----------tta--agacta 298  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||           ||  | ||||    
T  35511536 atcatactatcaccaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacacta 35511437  T
Q  299 tcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  35511436 tcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaac 35511393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 149 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21088887 - 21088677
Alignment:
Q  149 tagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgc 248  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| | |    
T  21088887 tagtataaaaaatgttgtgagtgacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcatactaacaagaatac 21088788  T
Q  249 acttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgt-----------------aacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgtta 331  Q
    | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||                 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21088787 atttaatctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactatgtttgtatgtta 21088688  T
Q  332 aagatgccaac 342  Q
    |||||||||||    
T  21088687 aagatgccaac 21088677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31705785 - 31705524
Alignment:
Q  96 gaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggc 195  Q
    |||||||| || || ||||||| | ||||| |||| |||||||||  ||||||||  ||||||| ||||  ||||  ||||| || ||||||||  || |    
T  31705785 gaaaattctatggtgaagtcataaaaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacaccctaccgtttgtacaatgac 31705686  T
Q  196 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag-------------- 281  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||                  
T  31705685 atcaaaagtccagtcctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcgtaacatctcaca 31705587  T
Q  282 ---tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaa 341  Q
       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  31705586 aaatgtaacacttaagaccatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaa 31705524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 163 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23954897 - 23954701
Alignment:
Q  163 tagtgagtggcaccccactgtttgtacg-gtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaatt 261  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  23954897 tagtgagtaacaccccactgtttttactagtggcatcaaaagttcagtttccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaatt 23954798  T
Q  262 ttaccctaccttgttttaagtgta-----------------acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||| ||||||||||||||||||||                 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  23954797 ttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa-atgccaac 23954701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Original strand, 22255197 - 22255446
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaag-tgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagt 209  Q
    ||||||| | ||| |||||| |||||||||  ||| ||||  |||||||  |||| |||||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22255197 aagtcataaaaataacttttttggtgaagttaacattataacatcaaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatggcatcaaaagttcagt 22255296  T
Q  210 cctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacactta 292  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| |                 ||||||||||||||    
T  22255297 tctcatattatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttagcctattttgttataagcgtaacaccacacaaagtgtaacactta 22255396  T
Q  293 agactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22255397 aaactattacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaatattccaac 22255446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22974259 - 22974063
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| || || |||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||||||  |||||||  ||| |||||  || ||||||||||||||  |    
T  22974259 aaggaaaattctatggtgaagttatgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaaagtaatgagtaacatcccactgtttgtacaat 22974160  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
      ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||    
T  22974159 aacatcaaaagttcaattctcatattatcatcaactcatcagaataacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgttataagcgtaacac 22974063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 153 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6824598 - 6824460
Alignment:
Q  153 atcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagt--tcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcac 250  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  6824598 atcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtttgtacagtgacatcaaaagtgttcagtcttcatagtatcatcaatttatcagattaacaagaatacac 6824499  T
Q  251 ttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  6824498 ttaatctaattttatcataccttgttttaaatgtaacac 6824460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14919706 - 14919439
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctgg-tgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacgg 191  Q
    ||||||||||  || || ||||||||||||| | |||| | | ||||||  ||| ||||  ||||||| |||| |||||  |||| |||||||| ||       
T  14919706 aaggaaaattatatggtgaagtcatgagaattattttttttgatgaagttaacattataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcactgtttatataa 14919607  T
Q  192 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaac---- 287  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||        
T  14919606 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcatattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacacct 14919507  T
Q  288 -------------acttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
                 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  14919506 cacaaattgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaac 14919439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 173 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7208960 - 7208775
Alignment:
Q  173 caccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctacct 272  Q
    ||||| || ||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  7208960 caccctaccgtttgtacattgacatcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctacct 7208862  T
Q  273 tgtttt-----------------aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||| |                 |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  7208861 tgttataaacgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattttcaactctgtttgcatgttaaagattccaac 7208775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 289
Target Start/End: Original strand, 15724490 - 15724682
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||| | ||||||  ||||||||||||| |||  ||     
T  15724490 ggaaaattctatggtgaagttatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagttttgtgagtaacaccccactgtttatacaatga 15724589  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  15724590 catcaaa-gttcagtcc-cataatatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttattttaagtataacac 15724682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Original strand, 8436965 - 8437229
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||| ||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||  || ||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||    
T  8436965 aggacaattctaatgtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaaattaacactatagcttccaaagtgtagtgagtaacatcccattgtttgtacagtg 8437064  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaa------------- 280  Q
     |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| |||| |||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||                 
T  8437065 acatcaaaagttcagtcctcattatatcatcaa-ccatcagatttacaaaactatgcttaatctaattttatcctgccttgttttaagttatacacccca 8437163  T
Q  281 ----gtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
        ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8437164 caatgtgtaacacttaagattatcacataatatgatcaactctgtttgaatgttaaagatgccaac 8437229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 35826660 - 35826464
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||| | |||||||  | ||||||  ||||||| |||| |||||  |||  || ||||||||| ||    
T  35826660 aaggaaaattctatggtgaagtcatgataatgactttttttgtgaagttaatactataacatcaaaaatgtactgagtaacacttcattgtttgtacagt 35826561  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacact 290  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  || ||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||    
T  35826560 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcat-agattaacaataccacatttaatctaattttattctacattgttttaagcgtaacact 35826464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 289
Target Start/End: Original strand, 35933901 - 35934090
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||  || || ||||||||||||||| |||| || ||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||     ||  |||    
T  35933901 aggaaaattgtatggtgaagtcatgagaatgatttttttgatgaagttaacactatagaatcaaaagtgttgtgagtaacacctcact-----ta--gtg 35933993  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatcta-attttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35933994 gcatcaaaagtccagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctagtttttatcctaccttgttttaagtgtaacac 35934090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 174 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15992636 - 15992521
Alignment:
Q  174 accccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctacctt 273  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||    
T  15992636 accccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttgatctaattttattctacctt 15992537  T
Q  274 gttttaagtgtaacac 289  Q
    | ||| |||| |||||    
T  15992536 gatttgagtgcaacac 15992521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28416663 - 28416508
Alignment:
Q  134 gtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatca 233  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||| | ||||||  || |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||    
T  28416663 gtgaagttaacactataatatcaaaagtattgtgagtaacatcccactgtttgtacagtggaatcaaaagttcaatctccttaatatcatcaattcatca 28416564  T
Q  234 gattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||    
T  28416563 gattaacaagaatacacttaatctaattttattctgccttattttaagtgtaacac 28416508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 176 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 43308746 - 43308633
Alignment:
Q  176 cccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgt 275  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  43308746 cccactgttcgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcagcttaacaaaactatacttaatctaattttatcttaccttgt 43308647  T
Q  276 tttaagtgtaacac 289  Q
    | ||||||||||||    
T  43308646 tataagtgtaacac 43308633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 244
Target Start/End: Original strand, 25668707 - 25668798
Alignment:
Q  153 atcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaaga 244  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25668707 atcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgaacagtggcatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcattagattaacaaga 25668798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 336
Target Start/End: Original strand, 35504443 - 35504623
Alignment:
Q  173 caccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctacct 272  Q
    |||| ||| ||||||| | || ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||     
T  35504443 cacctcaccgtttgtatgatgacatcaaaagttcaatcattatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatataattttatcctacca 35504542  T
Q  273 tgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    | || ||||                 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  35504543 tattataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaaatctgtttgcatgttaaagat 35504623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2888419 - 2888356
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2888419 aagtgtaacacttaagactatcagataatatcatcaaatatgtttgcatgttaaagatgtcaac 2888356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Original strand, 5830093 - 5830156
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  5830093 aagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaac 5830156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 232
Target Start/End: Original strand, 11898018 - 11898139
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||  | | ||||| |||||||||| | |||||  ||||| |||  |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  11898018 aagtcatgataataacttttctggtaaagttaatattatagcatcaaaagtgcactgagtaacaccctactagttgtacagtgacatcaaaagtttagtc 11898117  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatc 232  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11898118 ctcatagtatcatcaattcatc 11898139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 283 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13956332 - 13956273
Alignment:
Q  283 gtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13956332 gtaacacttaagactatcatataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgccaac 13956273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17158166 - 17158012
Alignment:
Q  134 gtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatca 233  Q
    |||||||  ||||||||  || |||| |||| |||||  ||| |||| ||||||||  || |||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||    
T  17158166 gtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttc-gtcattatagtatcattaattcatca 17158068  T
Q  234 gattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| || | |||||| || ||||||||||||    
T  17158067 gattaacaagactacacttagtataattgtatcttaccttattataagtgtaacac 17158012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30969298 - 30969235
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  30969298 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaac 30969235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 286
Target Start/End: Original strand, 42342851 - 42342921
Alignment:
Q  215 tagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  42342851 tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatctta-cttgttttaagtgtaa 42342921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Original strand, 5837756 - 5837819
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  5837756 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctctttgcatgttaaagatgacaac 5837819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Original strand, 35934097 - 35934160
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  35934097 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttccatgttaaagatgtcaac 35934160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 22974053 - 22973999
Alignment:
Q  282 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22974053 tgtaacacttaagactattacataatattatcaactctgtttgcatgttaaagat 22973999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13956527 - 13956426
Alignment:
Q  88 taattaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgt 187  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||    
T  13956527 taattaaggaaaattctacggtgaagtcatgaaaatgacttttctcatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacacctcactgtttgt 13956428  T
Q  188 ac 189  Q
    ||    
T  13956427 ac 13956426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 279 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 17158005 - 17157948
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  17158005 aagtgtaacacttaagaccatcacataatattatcaactctgtttgcatgataaagat 17157948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 279 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 38528211 - 38528154
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||    
T  38528211 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctatttacatgttaaagat 38528154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 342
Target Start/End: Original strand, 12910568 - 12910619
Alignment:
Q  291 taagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  12910568 taagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgccaac 12910619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13956415 - 13956368
Alignment:
Q  217 gtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaatttta 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13956415 gtatcatcaattcatcagattaacaaaacttcacttaatctaatttta 13956368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15992514 - 15992451
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15992514 aagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcaggaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 15992451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 342
Target Start/End: Original strand, 25669739 - 25669840
Alignment:
Q  248 cacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacact---taag----actatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgcca 340  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    |||    ||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  25669739 cacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactccacaagtgtaacactcacatgatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtca 25669838  T
Q  341 ac 342  Q
    ||    
T  25669839 ac 25669840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 6824453 - 6824396
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  6824453 aagtgtaacacttaagactatcacaagatat-agcaactctgtttgcatgttaaagatg 6824396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 342
Target Start/End: Original strand, 25889584 - 25889634
Alignment:
Q  292 aagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  25889584 aagattatgacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataccaac 25889634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 276
Target Start/End: Original strand, 5829962 - 5830073
Alignment:
Q  156 aaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaat 255  Q
    |||| |||| |||||  ||||| || ||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||| ||||||||    
T  5829962 aaaaatgtaatgagtaacaccctaccgtttgtacaatgacatcaaaagtttagtcctcatagtatcatca---------attaacaagactacacttaat 5830052  T
Q  256 ctaattttaccctaccttgtt 276  Q
    || |||||| | |||||||||    
T  5830053 ctcattttatcttaccttgtt 5830073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16004552 - 16004476
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaat-gacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagt 170  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||| ||||||    
T  16004552 ggaaaattctatggtaaagtcatgagaattgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaaatgttgtgagt 16004476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 93 - 140
Target Start/End: Original strand, 22616492 - 22616539
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 140  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22616492 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagt 22616539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 299 - 342
Target Start/End: Original strand, 42342942 - 42342985
Alignment:
Q  299 tcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  42342942 tcacatgatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaac 42342985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 336
Target Start/End: Original strand, 27330512 - 27330562
Alignment:
Q  286 acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  27330512 acacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagat 27330562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 35826437 - 35826403
Alignment:
Q  302 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35826437 cataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagat 35826403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 10237415 - 10237459
Alignment:
Q  96 gaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 140  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10237415 gaaaattctattgtgaagtcatgaaaatgacttttctagtgaagt 10237459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Original strand, 15724700 - 15724752
Alignment:
Q  290 ttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  15724700 ttaagactatcatatgatatcaacaactttgtttacatgttaaagatgtcaac 15724752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 88 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7235225 - 7234955
Alignment:
Q  88 taattaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgt 187  Q
    |||||| ||||||||| || || |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7235225 taattatggaaaattctatggtgaagttatgagaatgacttttccggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgt 7235126  T
Q  188 acggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaac 287  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7235125 acggtgccatcaaaagttcagt-ctcatagtattatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaac 7235027  T
Q  288 a-----------------cttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |                 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7235026 accccagaaagtgtaacgcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaac 7234955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 94 - 341
Target Start/End: Original strand, 8513232 - 8513491
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  8513232 aggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataatatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtg 8513331  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaa-ttttaccctaccttgtttt-----------aag 281  Q
     ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||| ||||| |||||||||||||           |||    
T  8513332 acatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttgatctaatttttatcctaccttgttttaacaccctacaaag 8513431  T
Q  282 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaa 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8513432 tgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaa 8513491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 111 - 332
Target Start/End: Original strand, 33618850 - 33619079
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  33618850 aagtcatgggaaatacttttctggtgaagtcaacactatcgcatcaaaagtgtagtgagtagcaacccattatttgtacggtggcatcaaaagttcagtt 33618949  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctacc-ttgt-------tttaagtgtaacacttaagactatcac 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||       |  |||||| |||||||||| |||| |    
T  33618950 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccagtgtaacaccctagaagtgtgacacttaagagtatcgc 33619049  T
Q  303 ataatatcatcaactatgtttgcatgttaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33619050 ataatatcatcaactatgtttgcatgttaa 33619079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3880124 - 3879859
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||  ||    
T  3880124 aggaaaattctatggtgaagtcacgagaatgacttttctggtgaagttaacattatagtatcaaaagtgttgtgagtaacaccctactgtttgtacaatg 3880025  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt--------------- 278  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||||                   
T  3880024 acatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatatacttattctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacacccca 3879925  T
Q  279 --aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3879924 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaac 3879859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 97 - 342
Target Start/End: Original strand, 6088910 - 6089167
Alignment:
Q  97 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 196  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||  ||||||    
T  6088910 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactatagtatcaaaagtgttgtgagtaacgccccactgtttgtaaagtggca 6089009  T
Q  197 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaa-ttttaccctaccttgttttaa-----------gtgt 284  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||||| ||||| |||||||||||||||           || |    
T  6089010 tcaaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatatccttgatctaatttttatcctaccttgttttaacactctacaaggtat 6089109  T
Q  285 aacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6089110 aacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaac 6089167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 111 - 289
Target Start/End: Original strand, 15491631 - 15491809
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| | ||  ||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  15491631 aagttatgagaatgacttttctcgtgaagttaacattgtaacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttgtacagtggcatcaaaagttcagcc 15491730  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15491731 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatgcacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacac 15491809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 96 - 288
Target Start/End: Original strand, 20768087 - 20768275
Alignment:
Q  96 gaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggc 195  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||   |||||    
T  20768087 gaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagca-tccattgtttgt-tagtggc 20768184  T
Q  196 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20768185 atcaaaagttcagtcctcatagtatcattaattcatcagattaacaagatt--acttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaaca 20768275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 93 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 4319009 - 4318812
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  |||||||||||  |||||  ||||||||||||||||| ||    
T  4319009 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttatgagtaacaccccactgtttgtacagt 4318910  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaa-ttttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    | |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4318909 gacatcaaaagttcaacccccatagtatcatcaattcattagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacac 4318812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 289
Target Start/End: Original strand, 29182157 - 29182357
Alignment:
Q  89 aattaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgta 188  Q
    ||||||| ||||||  || || ||||||||||||||| |||  || ||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||    
T  29182157 aattaagaaaaattttatggtgaagtcatgagaatgattttattgatgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttata 29182256  T
Q  189 cggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 288  Q
    | ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  29182257 cagtgtcatcaaaagttcagtctccatattatcatcaattcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccatattttaagtgtaaca 29182356  T
Q  289 c 289  Q
    |    
T  29182357 c 29182357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Original strand, 1945830 - 1946098
Alignment:
Q  92 taaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttct-ggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacg 190  Q
    |||||||||||| |  || ||||||| |||||||||||| | ||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||      
T  1945830 taaggaaaattctacggtgaagtcataagaatgactttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtaga 1945929  T
Q  191 gtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt------------ 278  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |                
T  1945930 atgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatgaattcatcaagttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacacc 1946029  T
Q  279 -----aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  1946030 ctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaac 1946098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21017280 - 21017032
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||  ||| | |||||| |||| ||| ||||||  ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||    
T  21017280 aagtcacgaaaatgacttttttggtgaagttaacattgtagtataaaaaatgttgtgagtaacaccccattatttgtacaatggcatcaaaagttcagtc 21017181  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgta-----------------acacttaa 293  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||                 ||||||||    
T  21017180 cccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaataaacttaatctaattttatcctacgttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaa 21017081  T
Q  294 gactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  21017080 gactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaac 21017032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 30353540 - 30353349
Alignment:
Q  97 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 196  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||| | ||||   | | |||||||||||| ||||||    
T  30353540 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacattataacatcaaaagtgttgcgagtaatatctcactgtttgtacagtggca 30353441  T
Q  197 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 288  Q
    || | |||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  30353440 tcgatagttcagtctccatagtatcatcaattcatcatataaacaagaatacacttaatctaattttatcatgccttgttttaagtgtaaca 30353349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 95 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 33893186 - 33892993
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || ||||||| ||||| | |||| | |||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||  ||     
T  33893186 ggaaaattctatggtaaagtcattagaataatttttttagtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatga 33893087  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
     || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  33893086 tattaaaagttcagtcc-cttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttatgtataacac 33892993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 336
Target Start/End: Original strand, 5627389 - 5627649
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| |  || ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||  || |||| | || |||||  ||||||||| ||||||   |    
T  5627389 aaggaaaattctaaggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatataatgagtaacaccccactatttgtagaat 5627488  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-------------- 278  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |                  
T  5627489 gacatcaaaagttcagccctcatagtattatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccct 5627588  T
Q  279 ---aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5627589 acaaagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagat 5627649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 7055400 - 7055205
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||  || || ||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||||||||  || |||| | || | |||  |||| |||| ||||||   ||    
T  7055400 aggaaaattttatggtgaagtcataagaatgatttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatataattagtaacacctcactatttgtagaatg 7055301  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  7055300 acatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacac 7055205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 226
Target Start/End: Original strand, 18498431 - 18498565
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcacccc-actgtttgtacgg 191  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||   |||||| || |||||||| |    
T  18498431 aaggaaaaatctatagtgaagtcatgagaatgactttcctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgtagtgagcaacacccccacagtttgtacag 18498530  T
Q  192 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18498531 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa 18498565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6091306 - 6091173
Alignment:
Q  156 aaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaat 255  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  6091306 aaaaatgtagtgagtaacacaccattgtttgtacaatgccatcaaaagttcagtactcgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaat 6091207  T
Q  256 ctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  6091206 ctaattttatcataccttgttttaagcgtaacac 6091173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4318805 - 4318742
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  4318805 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgttttcatgttaaagatgtcaac 4318742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Original strand, 20768283 - 20768346
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20768283 aagtgtaacacttaagatcatcgcataatatcatcaattatgtttgcatgttaaagatgtcaac 20768346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Original strand, 29182365 - 29182428
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  29182365 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctatttgcaggttaaagatgccaac 29182428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30353341 - 30353278
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  30353341 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaaaatgtcaac 30353278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 6091166 - 6091108
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaa-gactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6091166 aagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatattaaagat 6091108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 7055198 - 7055140
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatg 337  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  7055198 aagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctatttggatgttaaagatg 7055140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 93 - 140
Target Start/End: Original strand, 19631747 - 19631794
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 140  Q
    ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19631747 aaggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttctggtgaagt 19631794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 74)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 95 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28003197 - 28002933
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | || ||||||||||||| |||     
T  28003197 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtcagtagtactccactgtttgtacagtga 28003098  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgta--------- 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||             
T  28003097 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcggattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccag 28002998  T
Q  286 --------acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
            |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28002997 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaac 28002933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 93 - 342
Target Start/End: Original strand, 38011852 - 38012118
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  38011852 aaggaaaattctatggtgaaatcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgaatagcaccccactgtttgtacggt 38011951  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca---- 288  Q
    | ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||        
T  38011952 gccatcaaaagttcagtccccataatattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatttaattttattataccttgttttaagtgtaacatccc 38012051  T
Q  289 -------------cttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  38012052 agaaagtgtaacgcttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcacgttaaaaatgccaac 38012118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 111 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 33816728 - 33816550
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33816728 aagtcatgagaatgatttttctggtgaagtcaacattgtagcatcaaaagtgtagtgagtagcacctcactatttatacggtggcatcaaaagttcagtc 33816629  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33816628 tccatagtatcatcaatttatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 33816550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5048160 - 5047913
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||     
T  5048160 aagttatgagaatgatttttctggtgaagtcaactctataacatcaaaagtgtagtgagtaggaccacactgtttgtacgatgatatcaaaagttcagtt 5048061  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagt----------------gtaacacttaag 294  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||                ||||||||||||    
T  5048060 cccatagtatcatcaattcatgagattaacaagactgcatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaatacccgcaaaatgtaacacttaag 5047961  T
Q  295 actatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5047960 actatcacatgatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 5047913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 93 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25701270 - 25701075
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||  || || ||||||||| |||||||||| |||| ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||    
T  25701270 aaggaaaattttatggtgaagtcatgataatgacttttttggtaaagttaacattataacatcaaaagtgtagtgagtaacaccctactgtttgtacagt 25701171  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 288  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25701170 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaggactacactaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca 25701075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 93 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 35021248 - 35020982
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||  |    
T  35021248 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaacattataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacatt 35021149  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-------------- 278  Q
    ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||                  
T  35021148 ggcgtcaaaagtttcgtcctcgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacacccc 35021049  T
Q  279 ---aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  35021048 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaac 35020982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 35025800 - 35025543
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  35025800 aggaaaattctatgctgaagtcatgaaaatgatttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttatacgttg 35025701  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt--------------- 278  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||                   
T  35025700 acatcaaaagttcagtcctcgtagtatc--------atcagattaacaagactgcatttaatataattttatcctatcttgttttaagtgtcacacccca 35025609  T
Q  279 --aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35025608 gaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 35025543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 111 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 34948292 - 34948114
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34948292 aagtcatgagaatgacttttctggcgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtaaagtggcatcaaaagttcagtc 34948193  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||    
T  34948192 ctcataatatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgtttaaagtgcaacac 34948114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 19089664 - 19089406
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || ||||||| ||||| |||||| || ||||||  |||||||| |||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||   ||     
T  19089664 ggaaaattctatggtgaagtcataagaataacttttttgatgaagttaacactataatatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtataatga 19089565  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt---------------- 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |                    
T  19089564 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctatatgcgtaacaccctac 19089465  T
Q  279 -aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  19089464 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagat 19089406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 55241315 - 55241122
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  55241315 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagttaatactatattatcaaaattgttgcgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 55241216  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  55241215 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaatttatcaga-taagaagaatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacac 55241122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 92 - 288
Target Start/End: Original strand, 27396613 - 27396809
Alignment:
Q  92 taaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacgg 191  Q
    |||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||  |||||  ||||| |||||||||||      
T  27396613 taagaaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacattatagcattaaaagtgttatgagtaacaccctactgtttgtacaa 27396712  T
Q  192 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 288  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27396713 tgacatcaaaagtttcgtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaagtgtaaca 27396809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 36493897 - 36493636
Alignment:
Q  97 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 196  Q
    ||||||| || || ||||||||| ||| |||||| |||||||||  | ||||||  ||||||| | ||||||||  ||||||| ||||||||| ||| ||    
T  36493897 aaaattctatggtgaagtcatgaaaataacttttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatatagtgagtaacaccccattgtttgtacagtgaca 36493798  T
Q  197 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagt-------------- 282  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||                  
T  36493797 tcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaaactccacaaa 36493698  T
Q  283 --gtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36493697 gtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 36493636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 55478109 - 55477838
Alignment:
Q  92 taaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgt---- 187  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||  ||||||| ||||  ||||  ||| |||||||||||        
T  55478109 taaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacactccactgtttgtttgt 55478010  T
Q  188 acggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgta-- 285  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||      
T  55478009 acaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgttataagtgtaac 55477910  T
Q  286 ---------------acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
                   ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  55477909 accccacaacgtgtaacactgaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaac 55477838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 112 - 289
Target Start/End: Original strand, 23761089 - 23761265
Alignment:
Q  112 agtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcc 211  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  23761089 agtcatgagaatgactattcttgtaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtatagtgacatcaaaagttcagtcc 23761188  T
Q  212 tcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23761189 ccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttta-tctaccttgttttaagtgtaacac 23761265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 29584411 - 29584217
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||  |||||  |||| ||||||||||||  |    
T  29584411 aaggaaaattctatggtgaagtcgtgggaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgt--tgagtaacacctcactgtttgtacaat 29584314  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  29584313 ggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgttacac 29584217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Original strand, 49375982 - 49376231
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgactttt-ctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagt 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  49375982 aagtcatgagaatgactttttctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgtcgtgagtaacaccccactgcttgtacagtggcatcaaaagttcagt 49376081  T
Q  210 cctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaa-----------------gtgtaacactta 292  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||  || ||||| |||||                 ||||||||||||    
T  49376082 cttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacgcttgatctaattttattctgccttgatttaagttatacaccccacaatgtgtaacactta 49376181  T
Q  293 agactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  49376182 agattatcacataatatcatcaactttgtttggatgttaaagatgtcaac 49376231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 111 - 290
Target Start/End: Original strand, 7703533 - 7703704
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7703533 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtcagtaacaccccactgtttgtacggtgacatcaaaagttcagtc 7703632  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacact 290  Q
    | |||||||        ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7703633 cccatagta--------tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacact 7703704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 117 - 286
Target Start/End: Original strand, 32579466 - 32579637
Alignment:
Q  117 tgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgt---acggtggcatcaaaagttcagtcctc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||   |||||| ||||||||||| |||| ||    
T  32579466 tgagaatgacttttctggtgaagtcaacattataacatcaaaagtgcagtgagtagcaccccagtgtttgttgtacggtgccatcaaaagtttagtc-tc 32579564  T
Q  214 atagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaa 286  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32579565 atagtattatcagttcatcagattaacatgactgtacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaa 32579637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 37663951 - 37663688
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||| || || ||||||| |||||||||||| || ||||||  ||||||    || |||| |||| |||||  |||||||||||||||||  ||    
T  37663951 aggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttgatgaagttaacactaac--attaaaactgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatg 37663854  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt--------------- 278  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |                   
T  37663853 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacacccca 37663754  T
Q  279 --aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||    
T  37663753 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaac 37663688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 289
Target Start/End: Original strand, 32592103 - 32592287
Alignment:
Q  105 attgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagt 204  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||| || ||||||  |||||| |||||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  32592103 attgtgaagtcattataatgacttttttgatgaagttaacactacagtatcaaaagtgttgagagtaacactccactgtttgtatagtgacatcaaaagt 32592202  T
Q  205 tcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32592203 tcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 32592287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 149 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4934360 - 4934149
Alignment:
Q  149 tagtatcaaaagtgtagtgagtggcacccc-actgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactg 247  Q
    |||||| |||| ||||||||||  |||||| | |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  4934360 tagtataaaaaatgtagtgagtaacacccccattgtttgtacactggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcatttcatcagattaacaagacta 4934261  T
Q  248 cacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgtt 330  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||                 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4934260 cacttaatctaattttattctaccttgttttaagtccaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcatataatatcatcaactatgtttgcatgtt 4934161  T
Q  331 aaagatgccaac 342  Q
    ||||||| ||||    
T  4934160 aaagatgacaac 4934149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 121 - 342
Target Start/End: Original strand, 17173316 - 17173554
Alignment:
Q  121 aatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtat 220  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  17173316 aatgacttttctgatgaagttaacattataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatctccatagtat 17173415  T
Q  221 catcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaagactatcaca 303  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||                 |||||||||||||||||||||||||    
T  17173416 cattaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 17173515  T
Q  304 taatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17173516 taatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 17173554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 111 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 19440843 - 19440665
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||  ||||||| |||| ||| |  ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19440843 aagtcatgagaatgacttttttggtgatgttaacactataacatcaaaaatgtaatgattaacactccaccgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtc 19440744  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||| |||| |||||||    
T  19440743 ctcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcttagcttgttataagcgtaacac 19440665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 289
Target Start/End: Original strand, 9139241 - 9139439
Alignment:
Q  89 aattaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgta 188  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| | |||||||| |||||||||  ||  ||||| || |||| |  |||||||  |||||||| |||||||    
T  9139241 aattaaggaaaattctatggtgaagtcatgaaattgacttttttggtgaagttaacgttatagcataaaaaat--agtgagtaacaccccaccgtttgta 9139338  T
Q  189 cggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 288  Q
    | ||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9139339 cagtgacataaaaagttcaatccccatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaactgtaaca 9139438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 94 - 333
Target Start/End: Original strand, 25184112 - 25184368
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  ||| | |||||||||||  ||    
T  25184112 aggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgactattttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactctactgtttgtacaatg 25184211  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt--------------- 278  Q
     |||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |                   
T  25184212 acatccaaagttcaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctca 25184311  T
Q  279 --aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaa 333  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25184312 caaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctgtttgcatgttaaa 25184368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 97 - 289
Target Start/End: Original strand, 33341397 - 33341592
Alignment:
Q  97 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtg----tagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||  ||||||| ||    | | |||   ||||||||||||||||| ||    
T  33341397 aaaattctatagtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaaattaacactatatcatcaaaattgattgttgcgaggaacaccccactgtttgtacagt 33341496  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33341497 ggcatcaaaagttcagtcc-catagtatcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 33341592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 111 - 289
Target Start/End: Original strand, 4598009 - 4598185
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4598009 aagtcattagaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaa-gtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtc 4598107  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    | | |||  |||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  4598108 cccttagactcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatttaattttatcct-gcttgttttaagtgtaacac 4598185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 342
Target Start/End: Original strand, 17167739 - 17167977
Alignment:
Q  121 aatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtat 220  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  17167739 aatgacttttctgatgaagttaacattataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcattctccatagtat 17167838  T
Q  221 catcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaagactatcaca 303  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||                 |||||||||||||||||||||||||    
T  17167839 cattaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 17167938  T
Q  304 taatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17167939 taatatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaac 17167977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 111 - 289
Target Start/End: Original strand, 37775685 - 37775861
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||| | ||||| |||| |||||||||   ||||||| ||| |||| ||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  37775685 aagtcattaaaatgatttttttggtgaagttagcactataatattaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttccccc 37775784  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  37775785 ct--tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacac 37775861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 879743 - 879501
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  |||| || |||||||||  || ||||||||||| | ||    
T  879743 aagtcatgagaataatttttttggtgaagtaaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcattgtttgtacaatgacatcaaaagtttaatc 879644  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaa 293  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |                 |||||||||| ||||    
T  879643 ttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacataatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacatttaa 879544  T
Q  294 gactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  879543 gactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagat 879501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 46888352 - 46888174
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    |||||| || ||| ||||||||| ||||||  | ||||||  ||||||| ||||||||||   |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  46888352 aagtcaagaaaataacttttctgatgaagttaatactataacatcaaaattgtagtgagtaataccccactatttgtacagcggcatcaaaagttcagtc 46888253  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    | |||| |||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  46888252 cccatactatcgttaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacac 46888174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 342
Target Start/End: Original strand, 47253751 - 47254004
Alignment:
Q  97 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 196  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  || |||| ||||| ||| ||| ||    
T  47253751 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactatatcatcaaaagtgttgtgagtaaca-cccattgtttatacagtgaca 47253849  T
Q  197 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------a 279  Q
    |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||                 |    
T  47253850 tcaaaagttcagtcctcatagta--------tcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 47253941  T
Q  280 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47253942 agtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 47254004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 111 - 270
Target Start/End: Original strand, 50764748 - 50764905
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||  ||||||    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  50764748 aagtcatgagaataacttttttgatgaagttaacactaac--atcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacggtgacatcaaaagttcaatc 50764845  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctac 270  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||    
T  50764846 ctcatagtatcatcaattcattagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctac 50764905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 54499425 - 54499254
Alignment:
Q  120 gaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtac-ggtggcatcaaaagttcagtcctcatagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||   || ||||||||||||||||   |||||    
T  54499425 gaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccaccgtttgtactaatgacatcaaaagttcagtctctatagt 54499326  T
Q  219 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaa-ttttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  54499325 atcatcaattcatcatattaacaagaatatacttaatctaatttttatcataccttgttttaagtgtaacac 54499254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 30002837 - 30002649
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    |||||||| || || || ||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||    
T  30002837 aaggaaaactctatggtgaagtcattaaaatgatttttctggtgaagttaacactgtagcatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtacagt 30002738  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||        ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  30002737 gacatcaaaagttcagtcttcttagtatc--------atcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacac 30002649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 336
Target Start/End: Original strand, 6864053 - 6864293
Alignment:
Q  113 gtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcct 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   |||||||  ||||||| | || ||| |  || || ||| |||||||  | ||||||||||| |||||||    
T  6864053 gtcatgagaatgacttttttggtgaagttatcactataacatcaaaaatttaatgaataacatccaactttttgtacaatagcatcaaaagtccagtcct 6864152  T
Q  213 catagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaaga 295  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | ||||||||| |                 |||||||| ||||||||    
T  6864153 catagtatcatcaatttatcagattaacaagactacatttaatttaattttatcataccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaatacttaaga 6864252  T
Q  296 ctatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6864253 ctatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagat 6864293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 89 - 342
Target Start/End: Original strand, 42199723 - 42199993
Alignment:
Q  89 aattaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgta 188  Q
    |||| ||||||| || || || || |||| ||||||| |||| |||||||||  | ||||||  ||||||| |||| |||||   |||||| | ||||||    
T  42199723 aatttaggaaaaatctatggtgaaatcataagaatgatttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaatgagtaataccccattatttgta 42199822  T
Q  189 cggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt---------- 278  Q
       || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |              
T  42199823 gaatgacataaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataaca 42199922  T
Q  279 -------aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||    
T  42199923 ccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatgttaaagattccaac 42199993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 203 - 342
Target Start/End: Original strand, 1815409 - 1815565
Alignment:
Q  203 gttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||                 |||||||    
T  1815409 gttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacatttactctaattttatcctaccttgttttaagggtaacaccccacaaagtgta 1815508  T
Q  286 acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  1815509 acacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaac 1815565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 32912793 - 32912597
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  ||||| | | ||||||   |    
T  32912793 aaggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccctagtatttgtagaat 32912694  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |  |||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  32912693 gatatcaaaagttcagcactcataatatcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacac 32912597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 34361704 - 34361509
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||  || |||| |||| |||||  ||||||||||||||||   |    
T  34361704 aaggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtagaat 34361605  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    | ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| | | |||||||| |||||||| | ||||||||| |||| |||||||    
T  34361604 gacattaaaagttcag-cctcataatatcatcaattcatccggttaacaaaattacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacac 34361509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 287
Target Start/End: Original strand, 37287732 - 37287919
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttct-ggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    |||||||||| || || |||| ||||||||||||||| | ||| ||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  37287732 aggaaaattctatggtgaagtaatgagaatgactttttttggtaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagt 37287831  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaa-ttttaccctaccttgttttaagtgtaac 287  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||        |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  37287832 ggcatcaaaagttcaatcctcataata--------tcataagattaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaagtgtaac 37287919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 95 - 289
Target Start/End: Original strand, 39397918 - 39398103
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||  || |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||     
T  39397918 ggaaaattctatggtgaagtcattagaatgacttttatggtgaagttaacactataacattaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttgtacagtga 39398017  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||         |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  39398018 catcaaaagttcagtcttctcagtatcatca---------attaacaagaatacacttaatctaattttatcctgccttattttaagtgtaacac 39398103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 173 - 289
Target Start/End: Original strand, 50697320 - 50697435
Alignment:
Q  173 caccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctacct 272  Q
    ||||| || ||||||||  || ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  50697320 caccctaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctacct 50697418  T
Q  273 tgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||| |||| |||||||    
T  50697419 tgttataagcgtaacac 50697435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 33816526 - 33816463
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33816526 aagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaac 33816463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 289
Target Start/End: Original strand, 17272068 - 17272158
Alignment:
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17272068 catcaaaagttcagtc----tagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacac 17272158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 279 - 336
Target Start/End: Original strand, 3042820 - 3042877
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3042820 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcttgttaaagat 3042877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Original strand, 33341599 - 33341662
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  33341599 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaac 33341662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 55241115 - 55241052
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55241115 aagtgtaacacttaagactatcacatgatgtcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 55241052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 279 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 32912590 - 32912533
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  32912590 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgtatgttaaagat 32912533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25701066 - 25701010
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaga 335  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  25701066 aagtgtaacacttaagattatcacataacatcatcaactttgtttgcatgttaaaga 25701010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 34361502 - 34361439
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  34361502 aagtgtaacacttaaagctatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaac 34361439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 34948096 - 34948042
Alignment:
Q  288 acttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34948096 acttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 34948042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 342
Target Start/End: Original strand, 50697448 - 50697506
Alignment:
Q  285 aacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgc-atgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  50697448 aacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcaatgttaaagattccaac 50697506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 342
Target Start/End: Original strand, 7703717 - 7703773
Alignment:
Q  286 acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  7703717 acacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagatgccaac 7703773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 342
Target Start/End: Original strand, 37287932 - 37287992
Alignment:
Q  282 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  37287932 tgtaacacttaagactagcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttgaagatgccaac 37287992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7152214 - 7152151
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  7152214 aagtataacacttaatactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaac 7152151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 342
Target Start/End: Original strand, 32579657 - 32579710
Alignment:
Q  289 cttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  32579657 cttaagactatcttataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaac 32579710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 38812312 - 38812263
Alignment:
Q  91 ttaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 140  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38812312 ttaaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 38812263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 46888154 - 46888105
Alignment:
Q  293 agactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  46888154 agactatcacataatatcatcaaatcggtttgcatgttaaagatgccaac 46888105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 93 - 189
Target Start/End: Original strand, 4205114 - 4205210
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtac 189  Q
    ||||||||||| || || |||||| || ||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||  ||| |  |||||||||||||||||    
T  4205114 aaggaaaattctatggtgaagtcaggaaaatgacttttctgatgaagttaacactataatatcaaaaatgttctgaataacaccccactgtttgtac 4205210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 333
Target Start/End: Original strand, 26896288 - 26896342
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaa 333  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | | |||||||||||||    
T  26896288 aagtgtaacacttaagactatcgcataatatgatcaagtctatttgcatgttaaa 26896342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 161
Target Start/End: Original strand, 17272008 - 17272077
Alignment:
Q  92 taaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagt 161  Q
    |||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||    
T  17272008 taaggaaaattctatggtgaagtcgtgggaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagt 17272077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 273
Target Start/End: Original strand, 3042741 - 3042797
Alignment:
Q  217 gtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctacctt 273  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||| | ||||||    
T  3042741 gtatcatcaattcatcatattaacaagattacacttaatataattttatcatacctt 3042797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19440636 - 19440596
Alignment:
Q  301 acataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaa 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  19440636 acataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaa 19440596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20097537 - 20097494
Alignment:
Q  97 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 140  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20097537 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 20097494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 46884116 - 46884066
Alignment:
Q  282 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaa 333  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  46884116 tgtaacacttaa-actatcacataatatcataaattttgtttgcatgttaaa 46884066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Original strand, 50764921 - 50764984
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||| |||||| || | |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  50764921 aagtgaaacactcaatattatcacatgatatcagcaactatgtttgcaagttaaagatgtcaac 50764984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 140
Target Start/End: Original strand, 2704508 - 2704557
Alignment:
Q  91 ttaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 140  Q
    ||||||||||||  || || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2704508 ttaaggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagt 2704557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 7152319 - 7152242
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagt 170  Q
    ||||||||||| || || ||||||||  ||||||||||||||| ||||  ||| ||||  ||||||||| ||||||||    
T  7152319 aaggaaaattctatggtgaagtcatgctaatgacttttctggtaaagttaacattataacatcaaaagtatagtgagt 7152242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 140
Target Start/End: Original strand, 38811813 - 38811858
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 140  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38811813 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagt 38811858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 310 - 342
Target Start/End: Original strand, 4205216 - 4205248
Alignment:
Q  310 catcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4205216 catcaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 4205248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Original strand, 23761283 - 23761335
Alignment:
Q  290 ttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  23761283 ttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagataccaac 23761335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 286 - 342
Target Start/End: Original strand, 27396824 - 27396880
Alignment:
Q  286 acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  27396824 acacttaagaccatcgcatgatatcagcaacgctgtttgcatgttaaagatgtcaac 27396880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 342
Target Start/End: Original strand, 39400236 - 39400272
Alignment:
Q  306 atatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39400236 atatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 39400272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27083030 - 27082765
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||    
T  27083030 aggaaaattctatggtgaagtcatcagactgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacaccccactgtttgtgcagtg 27082931  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt--------------- 278  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||                   
T  27082930 gcattaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttaccatgttttaagtctaacaccccg 27082831  T
Q  279 --aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27082830 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgtcaac 27082765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 89 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 36695163 - 36694893
Alignment:
Q  89 aattaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgta 188  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| || ||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  36695163 aattaaggaaaattctatggtgaagtcaggaaaatgacttttctgatgaagttaacactataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgta 36695064  T
Q  189 cggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgta--- 285  Q
    |  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||       
T  36695063 caatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 36694964  T
Q  286 --------------acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
                  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36694963 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 36694893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 95 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6098709 - 6098445
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || ||||||||| ||| |||||| |||||||||  | ||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| |||     
T  6098709 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaataacttttttggtgaagttaatactatagcatcaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 6098610  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgta--------- 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||             
T  6098609 catcaaaagttcagtccccatagtatcgtcaattcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccccac 6098510  T
Q  286 --------acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6098509 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 6098445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 95 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5300137 - 5299943
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||| |  ||||||  ||||||||| ||||||||||| || ||| |||| | ||||||||||| ||||    
T  5300137 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttaatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtaagtagcactctactgtttgtacagtgg 5300038  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  5300037 catcaaaagttcagtccttatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacac 5299943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 93 - 290
Target Start/End: Original strand, 38643975 - 38644172
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||   ||    
T  38643975 aaggaaaattctatggtgaaatcatgagaatgacttttttggtcaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtctagt 38644074  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacact 290  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38644075 ggcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacact 38644172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 95 - 342
Target Start/End: Original strand, 33906223 - 33906475
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||          
T  33906223 ggaaaattctatggtgaaattatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactatagtattaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttata------ 33906316  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt---------------- 278  Q
          |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||                    
T  33906317 ------aagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaagggtaacattccaa 33906410  T
Q  279 -aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33906411 aaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaac 33906475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 93 - 342
Target Start/End: Original strand, 34894964 - 34895225
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||  ||    
T  34894964 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaagt 34895063  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac--- 289  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||       
T  34895064 ggcatcaaaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacacccc 34895163  T
Q  290 -------tta--agactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
            ||  | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  34895164 acaaaatgtaacacactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaac 34895225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 111 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 37970694 - 37970452
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||  || |||||||||||||| |    
T  37970694 aagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgccatcaaaagttcagcc 37970595  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgta-----------------acacttaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||                 ||||||||    
T  37970594 ctcatagtatcatcaattcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaa 37970495  T
Q  294 gactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37970494 gactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagat 37970452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 94 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16447067 - 16446803
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||   ||    
T  16447067 aggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgataaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtataatg 16446968  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgta-------- 285  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||            
T  16446967 gcatcaaaagtttagtccccatactatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacacccca 16446868  T
Q  286 ---------acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaa 341  Q
             |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16446867 caaagcgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaa 16446803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 111 - 336
Target Start/End: Original strand, 1204942 - 1205184
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  || |||| ||||||||||  |||  ||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  1204942 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataacataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtc 1205041  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaa 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||                 |||||||||||||||    
T  1205042 ctcatagtatcatcagttcatcatattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaa 1205141  T
Q  294 gactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1205142 gactatcgcataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagat 1205184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 93 - 342
Target Start/End: Original strand, 9864145 - 9864411
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| ||  | |||||| || |||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||  |    
T  9864145 aaggaaaattctataatgaagtcacgaaaatgacttttttggtgaaattaacactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaat 9864244  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-------------- 278  Q
    | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||                  
T  9864245 gacatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc 9864344  T
Q  279 ---aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  9864345 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattttgtttgcatgttaaagatgccaac 9864411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 111 - 289
Target Start/End: Original strand, 465857 - 466035
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  465857 aagtcattaaaatgacttttgtggtgaagttaacacgataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaaattcagtc 465956  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  465957 cccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacac 466035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 111 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 10555377 - 10555207
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  || |||| |||| |||||  ||| |||||||||||||  || ||||||||||||| ||    
T  10555377 aagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatc 10555278  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10555277 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataag 10555207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 95 - 289
Target Start/End: Original strand, 13307622 - 13307816
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||| |||     
T  13307622 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactatttgtacagtga 13307721  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||    
T  13307722 catcaaaagttcagtccccatagtattatcaattcatcagattagcaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaaatgtaacac 13307816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1150306 - 1150102
Alignment:
Q  84 ttaataattaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgt 183  Q
    |||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||||||  || |||||  ||||||| |||| |||||  || ||||||||    
T  1150306 ttaataatta-ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacgctataacatcaaaaatgtaatgagtaacatcccactgt 1150208  T
Q  184 ttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtg 283  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  1150207 ttgtacaacgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcg 1150108  T
Q  284 taacac 289  Q
    ||||||    
T  1150107 taacac 1150102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 95 - 342
Target Start/End: Original strand, 12876108 - 12876373
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || |||||| || ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| |||| ||| ||||||  ||||| |||||||||||  ||     
T  12876108 ggaaaattctatggttaagtcacgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataatataaaaaatgttgtgagtaacacccaactgtttgtacaatga 12876207  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt---------------- 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||                    
T  12876208 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaagaaggatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccac 12876307  T
Q  279 -aagtgtaacactt-aagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12876308 aaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaac 12876373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 341
Target Start/End: Original strand, 16222860 - 16223125
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |||| | |||||||| |  |||||| ||||||||  |    
T  16222860 aaggaaaattctacggtgaaatcatgagaatgacttttctggtgaatttaacactataacataaaaaatatagtgagtagttccccacagtttgtacaat 16222959  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-------------- 278  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||                  
T  16222960 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatccttccttgttttaaacgtaacacccc 16223059  T
Q  279 ---aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaa 341  Q
       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  16223060 aaaaagtgtaacacttaagagtatcacataatatcatcaactttgtttgcattttaaagattccaa 16223125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 94 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 34952223 - 34952027
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||| || || ||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||| |||    
T  34952223 aggaaaattctatagtaaagtcattaaaatgacttttctggtcaagttaacactatatcatcaaaagtgttgtgagtaacagcccactgtttgtacagtg 34952124  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacact 290  Q
     |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  34952123 acatcaaaagttcagtccctttagtatcatcaattcatcaaattaataagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacact 34952027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 111 - 289
Target Start/End: Original strand, 11727039 - 11727217
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11727039 aagttatgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtaagtaacaccccactatttgtatagtggcatcaaaagttcagtc 11727138  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11727139 ctcataatatcatcaattcatcaaattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacac 11727217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 43643788 - 43643531
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  ||| | |||||||||||  |    
T  43643788 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgactattttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactctactgtttgtacaat 43643689  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-------------- 278  Q
    | |||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |                  
T  43643688 gacatccaaagttcaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctc 43643589  T
Q  279 ---aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaa 333  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  43643588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctgtttgcatgttaaa 43643531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 23854606 - 23854428
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  || |||| |||| |||||  ||||| ||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  23854606 aagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacacccaactgtttgtgcaatgacatcaaaagttcagtc 23854507  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| || |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  23854506 ctcatagtatcatcaactcattagattaacaatactacaattaatctaattttatcttacctagttataagtgtaacac 23854428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 288
Target Start/End: Original strand, 41362517 - 41362707
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || |||| |||| |||||||||| |||||||||  ||||||  | || |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||  |||     
T  41362517 ggaaaattctatggtgaagttatgaaaatgacttttttggtgaagttaacacta--gcataaaaa-tgtagtgagtaacaccccactatttgtatagtga 41362613  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  41362614 catcaaaagttcagacctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactaaacttgatataattttatcataccttgttttaagtgtaaca 41362707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 203 - 342
Target Start/End: Original strand, 7998401 - 7998541
Alignment:
Q  203 gttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaatttt-accctaccttgttttaagtgtaacacttaagactatca 301  Q
    |||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7998401 gttcggtccccataatatcatcaatacatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacacttaatactatca 7998500  T
Q  302 cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||| ||||| |||||  || ||||||||||||||    
T  7998501 cataatatcaacaactctgtttctatattaaagatgccaac 7998541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 176 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1149742 - 1149559
Alignment:
Q  176 cccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgt 275  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  1149742 cccactgtttgtacaatgacatcaaaagttctgtcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcttaccttgt 1149643  T
Q  276 ttt-----------------aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    | |                 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1149642 tataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactttgtttgcatgttaaagattccaac 1149559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 342
Target Start/End: Original strand, 40862416 - 40862682
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaag-tgtagtgagtggcaccccactgtttgtacgg 191  Q
    ||||||||||| || || |||||| || ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||||      
T  40862416 aaggaaaattctatagtgaagtcacgaaaataacttttctggtgaagttaacactataatatcaaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaa 40862515  T
Q  192 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt------------- 278  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | |||||| | | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |                 
T  40862516 tggcatcaaaagttcagtc-tcatggtatcatcaatttttcatactaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttctaagtgtaacactc 40862614  T
Q  279 ----aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  40862615 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaac 40862682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 90 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 31934082 - 31933891
Alignment:
Q  90 attaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtac 189  Q
    ||||| |||||||| |  || |||| |||||||||| |||| |||||||||  |||||||  |||||||| | || |||||  ||||||||| ||| |||    
T  31934082 attaaagaaaattctaacgtgaagttatgagaatgatttttttggtgaagttaacactatgatatcaaaaatataatgagtaacaccccactctttatac 31933983  T
Q  190 ggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag 281  Q
      || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  31933982 aatgacatcaaaagttcagtcattatagtatcatcaattcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataag 31933891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 30654775 - 30654580
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||  || || ||||||| ||| ||| |||| |||||||||  ||||||||  || |||| |||| |||||  |||||||||||||||    ||    
T  30654775 aggaaaattttatggtgaagtcataagagtgatttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgttgaatg 30654676  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  30654675 acatcaaaagttcagccttcatagtatcatcacttcatcaggttaacaagactacacttaatttaattttaccatacattgttttaagcgtaacac 30654580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 173 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 39099232 - 39099117
Alignment:
Q  173 caccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctacct 272  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| | ||||     
T  39099232 caccccactctttgtacactagcatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcttaccc 39099133  T
Q  273 tgttttaagtgtaaca 288  Q
    ||||||||||||||||    
T  39099132 tgttttaagtgtaaca 39099117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 41911153 - 41910985
Alignment:
Q  122 atgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcacccc-actgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtat 220  Q
    |||| |||| |||||||||  | ||||||  ||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||   || || ||||||||| |||||||  ||||||||    
T  41911153 atgatttttttggtgaagttaatactatatcatcaaaagtgtcgtgagtaacacccccactattataacagtagcatcaaaaattcagtcaacatagtat 41911054  T
Q  221 catcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41911053 catcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 41910985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1954103 - 1953987
Alignment:
Q  173 caccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatc-atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctacc 271  Q
    ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| | ||||    
T  1954103 caccctactatttggacagtggcatcaaaagttcagccctcatagtatctatcaattcatcagattaatatgactacactaaatctaattttatcatacc 1954004  T
Q  272 ttgttttaagtgtaaca 288  Q
    |||||||||||||||||    
T  1954003 ttgttttaagtgtaaca 1953987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7891066 - 7890884
Alignment:
Q  177 ccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 276  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | ||| |||||    
T  7891066 ccaccgtttgtacaatggcatcaaaagttcggtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacactcaatctagttttatcttactttgtt 7890967  T
Q  277 ttaa-----------------gtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
     |||                 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  7890966 ataagcgtaacaccccacaacgtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactctggttgcatgttaaagattccaac 7890884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 178 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 35459819 - 35459709
Alignment:
Q  178 cactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttt 277  Q
    ||||| ||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  35459819 cactgattgtacaatgacattaaaagttcagtcctcataatatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctactttgtta 35459720  T
Q  278 taagtgtaaca 288  Q
    ||| |||||||    
T  35459719 taaatgtaaca 35459709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4132750 - 4132613
Alignment:
Q  221 catcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttta----------------agtgtaacacttaagactatcacat 304  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |                |||||||||| ||||||||||||||    
T  4132750 catcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgtttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacataagactatcacat 4132651  T
Q  305 aatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4132650 aatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 4132613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 284
Target Start/End: Original strand, 44869576 - 44869686
Alignment:
Q  175 ccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaa-ttttaccctacctt 273  Q
    |||||||||||| ||  || ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  44869576 ccccactgtttgcacaatgacatcaaaagttcaatcgtcatagtatcatcaatttatcagattaacaataatacacttaatctaatttttatcctacctt 44869675  T
Q  274 gttttaagtgt 284  Q
    |||||||||||    
T  44869676 gttttaagtgt 44869686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 289
Target Start/End: Original strand, 43025753 - 43025895
Alignment:
Q  147 tatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagact 246  Q
    ||||||||||||||||| |||| |   |||||||| |||||||  ||| || ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  43025753 tatagtatcaaaagtgttgtgattaataccccactctttgtacaatggtattaaaagttcagttcatataatatcatcaattcatcagactaagaagaat 43025852  T
Q  247 gcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
     || |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  43025853 acatttaatctaattttatcctaccttattttaactgtaacac 43025895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 279 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1953978 - 1953923
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  1953978 aagtgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaag 1953923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8803974 - 8803744
Alignment:
Q  122 atgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatc 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  ||| ||||| ||||||   || |||||||||||||| |       ||||    
T  8803974 atgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactccactatttgtagaatgacatcaaaagttcagcc-------tatc 8803882  T
Q  222 atcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaagactatcacat 304  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |                 ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8803881 atcaatttatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctaaaaagtgtaacacttaatactatcacat 8803782  T
Q  305 aatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  8803781 aatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaac 8803744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 279 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 23854421 - 23854364
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23854421 aagtgtaacacttaagacaatcacataatatcatcaactctgcttgcatgttaaagat 23854364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 282 - 342
Target Start/End: Original strand, 11727227 - 11727287
Alignment:
Q  282 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  11727227 tgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactttgtttgaatgttaaagatgccaac 11727287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 282 - 342
Target Start/End: Original strand, 43025905 - 43025965
Alignment:
Q  282 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  43025905 tgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgattgcatgttaaagatgtcaac 43025965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 41910978 - 41910919
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgc 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  41910978 aagtgtaacacttaatactatcacatgatatcaccaactctgtttgcatgttaaagatgc 41910919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 333
Target Start/End: Original strand, 13307823 - 13307877
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaa 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  13307823 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaa 13307877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 30654573 - 30654519
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaa 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  30654573 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatgttaaa 30654519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4133199 - 4133077
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||  || |||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||  | || ||||   ||||||||   |||  ||||||||||| ||||    
T  4133199 ggaaaattttatggtcaagtcatcagaatgacttttttggtgaagttaacacta--gcataaaaaagatagtgagtaatacctgactgtttgtacagtgg 4133102  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagta 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4133101 catcaaaagttcagtcctcatagta 4133077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31933876 - 31933813
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||    
T  31933876 aagtgtaacacttaaaattatcacataatatcatcaagtctgtttgcatgttaaggattccaac 31933813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Original strand, 44869697 - 44869760
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  44869697 aagtgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactttgtttccatgttaaagatgtcaac 44869760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1149906 - 1149847
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1149906 aagtgtaacacttaagac----acataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaac 1149847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10555179 - 10555137
Alignment:
Q  294 gactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10555179 gactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagat 10555137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 244
Target Start/End: Original strand, 33197947 - 33197997
Alignment:
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaaga 244  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33197947 gcatcaaaagttcagtctccataatatcatcaattcatcagattaacaaga 33197997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 284 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 35459696 - 35459644
Alignment:
Q  284 taacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  35459696 taacacttaagactattacataatatcatcaattctgtttgtatgttaaagat 35459644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24823466 - 24823395
Alignment:
Q  92 taaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgt 163  Q
    |||||||||| | || || |||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  24823466 taaggaaaatactatggtaaagttatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataatatcaaaagtgt 24823395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 39099102 - 39099046
Alignment:
Q  286 acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  39099102 acacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaac 39099046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 135
Target Start/End: Original strand, 7998361 - 7998402
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggt 135  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  7998361 aggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggt 7998402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 342
Target Start/End: Original strand, 35859160 - 35859197
Alignment:
Q  305 aatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  35859160 aatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaac 35859197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 6446752 - 6446708
Alignment:
Q  97 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtc 141  Q
    ||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6446752 aaaattctatggtgaagtcatgataatgacttttctggtgaagtc 6446708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 159
Target Start/End: Original strand, 15009241 - 15009305
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaa 159  Q
    ||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||  |||||||    
T  15009241 ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaa 15009305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 39099302 - 39099262
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctg 133  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  39099302 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctg 39099262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Original strand, 133 - 398
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||| || || |||||| || ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||| ||||||  ||| |||||||||||||  ||    
T  133 aggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaacactgtagtataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatg 232  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt--------------- 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| |||| ||| ||||                   
T  233 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctatcttattttaagtgtaacacccca 332  T
Q  279 --aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  333 taaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 116 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 94547 - 94374
Alignment:
Q  116 atgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcat 215  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||    
T  94547 atgaaaatgacttttctgatgaagttaacattataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagtttggtccccat 94448  T
Q  216 agtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| ||||||| |||||||||||    
T  94447 actatcatcaattcatgagattaacaagactacacttaatttaattttattctagcttgtttcaagtgtaacac 94374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 408512 - 408350
Alignment:
Q  196 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt----------------- 278  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |                     
T  408512 atcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcaca 408414  T
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  408413 aagtggaacacttaagactatcacacaatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaac 408350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 62)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 95 - 337
Target Start/End: Original strand, 19313852 - 19314103
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||  ||||  ||| ||| ||| |||     
T  19313852 ggaaaattctatggtgaagtcattagaatgacttttctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccttactatttatacagtga 19313951  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac----- 289  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  19313952 catcaaaagttcagtcct-atagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatcgaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccccac 19314050  T
Q  290 -----ttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatg 337  Q
          ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19314051 aaagtgtaacactatcacatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagatg 19314103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Original strand, 4166919 - 4167186
Alignment:
Q  92 taaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacgg 191  Q
    |||||||||||| || || |||||| || ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | | ||||||  |||||||||||||||||      
T  4166919 taaggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaacattatagtatcaaaaatattgtgagtaacaccccactgtttgtacaa 4167018  T
Q  192 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt------------- 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||                 
T  4167019 tggcatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 4167118  T
Q  279 ----aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
        ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4167119 cacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaac 4167186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 289
Target Start/End: Original strand, 36641980 - 36642182
Alignment:
Q  89 aattaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgta 188  Q
    ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||    
T  36641980 aattaagaaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaaattaatactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacacctcactgtttgta 36642079  T
Q  189 cggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaa--ttttaccctaccttgttttaagtgtaa 286  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  36642080 cagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttttatcctaccttgttttaagtgtaa 36642179  T
Q  287 cac 289  Q
    |||    
T  36642180 cac 36642182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 33551195 - 33550995
Alignment:
Q  89 aattaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgta 188  Q
    ||||| ||||||||| |  || |||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33551195 aattatggaaaattctacggtgaagtcatgagaatgacttttttagtgaagttaacactataacatcaaaaatgtagtgagtaacaccccactgtttgta 33551096  T
Q  189 cggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 288  Q
    |  || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33551095 caatgacatcaaaagttcggtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctacgttgttttaagcgtaaca 33550996  T
Q  289 c 289  Q
    |    
T  33550995 c 33550995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 94 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 19424832 - 19424637
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||  || || |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||  |||    
T  19424832 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaatggcttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttatatagtg 19424733  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19424732 gcatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacac 19424637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 176 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7007043 - 7006877
Alignment:
Q  176 cccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgt 275  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  7007043 cccactgtttgtacagtagcatcaaaagtttagttcccatagtatcatcaatttataagattaacaagaatacacttaatctaattttatcataccttgt 7006944  T
Q  276 tttaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7006943 tttaagtgtaacacttaagaatatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 7006877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 97 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 33660569 - 33660377
Alignment:
Q  97 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 196  Q
    ||||||| || || ||||||| | |||||||||||| || ||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  33660569 aaaattctatggtgaagtcattaaaatgacttttctagttaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccaactgtttgtacagtggca 33660470  T
Q  197 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33660469 tcaaaagttcagtcctcttagtatcatcaattcattagattaacaggaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 33660377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 91 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 29242345 - 29242147
Alignment:
Q  91 ttaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacg 190  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| ||||  |||| |||||||||  | ||||||  || |||| | ||||| ||  |||||||||||||||||     
T  29242345 ttaaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatggtttttttggtgaagttaaaactataacataaaaaatatagtgcgtaacaccccactgtttgtaca 29242246  T
Q  191 gtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29242245 gtggtatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 29242147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 94 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 4264281 - 4264086
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||| || || ||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||| |||    
T  4264281 aggaaaattctatggtgaagtcatcataatgacttttctggtaaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgtttgtacagtg 4264182  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
     ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4264181 acatcaaaagttcagtctccatagtattatcaattcatcatattaagaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtttaacac 4264086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 95 - 341
Target Start/End: Original strand, 4478368 - 4478628
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcat-gagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    ||||||||| || || ||||||| || |||||  ||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||||||| |||    
T  4478368 ggaaaattctatagtgaagtcatagaaaatgatatttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccattgtttgtacagtg 4478467  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaa-ttttaccctaccttgtttt------------aa 280  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||            ||    
T  4478468 gcatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacacaaa 4478567  T
Q  281 gtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaa 341  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4478568 gtgtaacacttaagtctatcacatgatatcaccaactctgtttccatgttaaagatgccaa 4478628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 95 - 342
Target Start/End: Original strand, 41465509 - 41465765
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 194  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |        ||| |||    
T  41465509 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaggtgtagtgagtagcacccta--------acgctgg 41465600  T
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt---------------- 278  Q
     ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||                    
T  41465601 tatcaaaagttcagtccctataatatcatcaattcattagattcacaagactgaacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacacctcag 41465700  T
Q  279 -aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41465701 aaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaattatgtttgcatgttaaagatgccaac 41465765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 43771039 - 43770787
Alignment:
Q  97 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 196  Q
    ||||||| || || ||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  43771039 aaaattctatggtgaagtcattagaatgattttt-tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttatacagtggca 43770941  T
Q  197 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacactt----a 292  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |    |    
T  43770940 tcaaaagttcagtccccttaatatcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatttaattttatcctgccttgttttaagtgtaacacctcacaa 43770841  T
Q  293 ag----actatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||    ||  |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43770840 agtgtaacactcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 43770787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 121 - 342
Target Start/End: Original strand, 3176965 - 3177203
Alignment:
Q  121 aatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtat 220  Q
    ||||||||||||| ||||||  | |||||| |||||||| |||  |||||  ||| | |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3176965 aatgacttttctgatgaagttaatactataatatcaaaaatgttttgagtaacacgcaactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtat 3177064  T
Q  221 catcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaagactatcaca 303  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||                 |||||||||||||||||||||||||    
T  3177065 catcaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 3177164  T
Q  304 taatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3177165 taatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaac 3177203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 176 - 289
Target Start/End: Original strand, 45327801 - 45327914
Alignment:
Q  176 cccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgt 275  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45327801 cccattgtttatacggtgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgt 45327900  T
Q  276 tttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||||||||    
T  45327901 tttaagtgtaacac 45327914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 127 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27350109 - 27349948
Alignment:
Q  127 ttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa 226  Q
    |||| |||||||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  27350109 ttttttggtgaagttaacactatagcatcaaaaatgttgtgagtaacaccacactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcc-cttagtatcatcaa 27350011  T
Q  227 ttcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27350010 ttcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacac 27349948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 111 - 338
Target Start/End: Original strand, 4763644 - 4763891
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagt---cgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttca 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||   | ||||||||  | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4763644 aagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacaacactatatcaacaaaactgtagtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttca 4763743  T
Q  208 gtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttt-----------------taagtgtaacact 290  Q
    || | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||                  ||||||||||||    
T  4763744 gttcccatagtataatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttattctaccttgtttcaagtgtagcaccccacaaagtgtaacact 4763843  T
Q  291 taagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgc 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  4763844 taagactatcacataatatcatcaattctttttgcatgttaaagatgc 4763891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17071941 - 17071676
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||  | ||||| |||||| |||  || | || | |||||||  ||    
T  17071941 aggaaaattctatggtgaagtcatgcgaatgacttttttggtgaagttaacactataacaacaaaaatgtagtaagtaacatctcattatttgtacaatg 17071842  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt--------------- 278  Q
     |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||                   
T  17071841 acatcaaaagttcggtattcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacacccca 17071742  T
Q  279 --aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  17071741 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagattccaac 17071676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 96 - 264
Target Start/End: Original strand, 13711465 - 13711633
Alignment:
Q  96 gaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggc 195  Q
    |||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| ||| |    
T  13711465 gaaaattctatggtgaagtcatcagaatgacttttctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacagtttgtacagtgac 13711564  T
Q  196 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaatttta 264  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  13711565 atcaaaagtttagtccacatggtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaatttta 13711633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 31570939 - 31570743
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| || || |||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||  || |||||||| || |||  ||||||||| ||| ||  ||    
T  31570939 aaggaaaattctatggtgaagttatgagaataacttttctggtgaaattaacactataacattaaaagtgttgtaagtaacaccccactatttttatagt 31570840  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  31570839 gacatcaaaagttcagtccacatagtatcatgaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacac 31570743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 111 - 288
Target Start/End: Original strand, 26357593 - 26357770
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  26357593 aagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacatcccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtt 26357692  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 288  Q
    || ||||  | |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26357693 cttatagagttatcaattcatcatattaacaagatcacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaaca 26357770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 41464051 - 41463859
Alignment:
Q  97 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 196  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||||| ||| |||||||||  | ||||||  ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||    
T  41464051 aaaattctatggtgaagtcgtgagaatgacatttttggtgaagttaatactataaaatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtacagtggca 41463952  T
Q  197 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||| |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||    
T  41463951 tcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacttttaatataattttatcatactttgttttaattgtaacac 41463859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 39167568 - 39167373
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||  || || |||||| |||||||| |||| || ||||||  |||  |||||||||||||| | ||||||  |||| ||||||||||||  |    
T  39167568 aaggaaaattttatggtgaagtcacgagaatgatttttttgatgaagttaacagaatagtatcaaaagtattgtgagtaacacctcactgtttgtacaat 39167469  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca 288  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  39167468 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcattagagtaacaagaatacacttattctaattttattataccttgttttaagtgtaaca 39167373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 127 - 289
Target Start/End: Original strand, 37905740 - 37905902
Alignment:
Q  127 ttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa 226  Q
    |||| |||||||||  ||||||||  || |||| ||||  ||||  |||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37905740 ttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaacgagtaacaccccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa 37905839  T
Q  227 ttcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  37905840 ttcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacac 37905902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 289
Target Start/End: Original strand, 44285965 - 44286143
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| | |||    | | |||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  44285965 aagtcatgcgaatgatttttctgatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagcaatatctcactgtttgtatagtggcatcaaaagtttagtc 44286064  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  44286065 cacatagtatcataaattcatcagattaacaataatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacac 44286143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 43648411 - 43648254
Alignment:
Q  132 tggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcat 231  Q
    |||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||   || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  43648411 tggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcactgtttgtataatgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaactcat 43648312  T
Q  232 cagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  43648311 cagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagtgtaacac 43648254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 2325575 - 2325323
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    ||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||| |||||||  ||| ||||  |||| || |||| |||||  ||||||| |||||||||  |    
T  2325575 aaggaaaattctatggtgaagttatgtgaatgacttttctcgtgaagttaacaatataacatcataaatgtattgagtaacaccccattgtttgtacact 2325476  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-------------- 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||                  
T  2325475 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa--------attaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacacccc 2325384  T
Q  279 ---aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  2325383 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagat 2325323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18494473 - 18494220
Alignment:
Q  93 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 192  Q
    |||||||||||  | || ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||                
T  18494473 aaggaaaattctgtggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccac------------ 18494386  T
Q  193 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgta------- 285  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||           
T  18494385 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattcactagaatacacttgatctaattttatcctaccttgtattaagtgtaaacctca 18494286  T
Q  286 ---------acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
             ||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18494285 caaagagtcacacttaagactatcacatgatatcaacgactctgtttgcatgttaaagatgccaac 18494220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 127 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 33709403 - 33709241
Alignment:
Q  127 ttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa 226  Q
    |||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||| | ||||  ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33709403 ttttatggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgcgagtaacactccactgttagtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaa 33709304  T
Q  227 ttcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
     |  |||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33709303 atattcagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 33709241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 289
Target Start/End: Original strand, 41960940 - 41961034
Alignment:
Q  195 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  41960940 catcaaaagttcagtccacatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacac 41961034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17054300 - 17054105
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||||| |||||| |||  || | || |||||||||  ||    
T  17054300 aggaaaattctatggtgaagtcatgcgaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtagtaagtaacatctcattgtttgtacaatg 17054201  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
     |||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  17054200 acatcaaaagtncggtattcataatatcatcaattcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacac 17054105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 286
Target Start/End: Original strand, 5881533 - 5881729
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaa-----gtgtagtgagtggcaccccactgtttgta 188  Q
    |||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| || | ||||  |||||||     |||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  5881533 aggaaaattttattgtgaagtcattaaaatgacttttctggtgaagttgatattataacatcaaaacaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgta 5881632  T
Q  189 cggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaa 286  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  5881633 cagtgacatcaaaagttgagtccccttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacatttaatctaa-tttatcataccttgttttaagtgtaa 5881729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 121 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 19289500 - 19289268
Alignment:
Q  121 aatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtat 220  Q
    |||||||||| || ||||||  ||||||||  ||||||| | || |||||  ||||||| |||||||||  || ||||||||||| ||| |||| |||||    
T  19289500 aatgacttttttgatgaagttaacactataacatcaaaaatataatgagtaacaccccattgtttgtacaatgacatcaaaagttaagttctcacagtat 19289401  T
Q  221 catcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaagactatcaca 303  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |                 |||||||||||||||||||||||||    
T  19289400 catcaactcatcagattaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttataaatgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 19289301  T
Q  304 taatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19289300 taatatcatcaactctgtgtgcatgttaaagat 19289268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 95 - 342
Target Start/End: Original strand, 44913662 - 44913928
Alignment:
Q  95 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccact-gtttgtacggtg 193  Q
    ||||||||| || || |||||| || |||||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||  |||| |||| |||||||   ||    
T  44913662 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttatg-tgaagttaacactgtagtatcaaaaatgttgtgagtaacacctcacttgtttgtaaaatg 44913760  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctc-atagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-------------- 278  Q
     ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| | ||| |||||||                  
T  44913761 acataaaaagttcaatcccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaacacccc 44913860  T
Q  279 ----aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44913861 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 44913928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 11366585 - 11366326
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 193  Q
    |||||||||| || || || |||| |||||||||||| ||||||| |  ||||||||  ||||||| |||| |||||  || | |||| ||||||   ||    
T  11366585 aggaaaattctatggtgaaatcataagaatgacttttttggtgaaattaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacatctcactatttgtataatg 11366486  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt--------------- 278  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| | || |||||| |                   
T  11366485 acatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacatttaatataattttatcatatcttgttctaaacataacacccta 11366386  T
Q  279 --aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11366385 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagat 11366326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 281
Target Start/End: Original strand, 33902092 - 33902252
Alignment:
Q  119 agaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||   ||  |||| ||||||||||   |||||||||||||||   || |||||||||||||||||||| |||    
T  33902092 agaatgacttttctggtgaagttaacactaacata--aaaaatgtagtgagtaataccccactgtttgtaaaatgacatcaaaagttcagtcctcaaagt 33902189  T
Q  219 atcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaag 281  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  33902190 atcatcagttcatcagattaacaagactatatttaatcgaattttatcctaccttgttttaag 33902252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 196 - 289
Target Start/End: Original strand, 31861953 - 31862046
Alignment:
Q  196 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||||    
T  31861953 atcaaaatttcagtcattatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttaacatacattgttataagcgtaacac 31862046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 279 - 336
Target Start/End: Original strand, 35959097 - 35959154
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35959097 aagtgtaacagttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 35959154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 41051382 - 41051263
Alignment:
Q  122 atgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacg-gtggcatcaaaagttcagtcctcatagtat 220  Q
    |||||||||||| |||||   | ||||||| ||||||||||| |||  |  |||  |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41051382 atgacttttctgatgaagctaatactatagcatcaaaagtgttgtgtataacacttcactatttgtaccagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtat 41051283  T
Q  221 catcaattcatcagattaac 240  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  41051282 catcaattcatcagattaac 41051263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Original strand, 41961041 - 41961104
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  41961041 aagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaaatcggtttgcatgttaaagatgccaac 41961104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4264079 - 4264015
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatca-cataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4264079 aagtgtaacacttaagactatcaacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 4264015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17054098 - 17054043
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaag 334  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17054098 aagtgtaacacttaanactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaag 17054043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 282 - 342
Target Start/End: Original strand, 26357781 - 26357841
Alignment:
Q  282 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  26357781 tgtaacacttaaaactatcacataatattatcaaatgtgtttgcatgttaaagatgccaac 26357841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 284 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 43648242 - 43648190
Alignment:
Q  284 taacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43648242 taacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttccatgttaaagat 43648190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18258289 - 18258226
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  18258289 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctctttgcatgttaaagatcccaac 18258226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Original strand, 36642189 - 36642252
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  36642189 aagtgtaacacttaagactatcacatgataccagcaactctgtttccatgttaaagatgccaac 36642252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 338
Target Start/End: Original strand, 44286150 - 44286209
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgc 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  44286150 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactttgtttgcatgttaaatatgc 44286209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 341
Target Start/End: Original strand, 37905911 - 37905973
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaa 341  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  37905911 aagtgtaacacttaaaactatcgcataatatcattaactctgtttgcatgttaaagattccaa 37905973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 279 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 33550988 - 33550932
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33550988 aagtgtaacacttaagacta-cgtataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 33550932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19501839 - 19501760
Alignment:
Q  198 caaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt 278  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  19501839 caaaagttcagtctctatagtatcatcaattcatcagattaacaa-actacatttaatctaattttattctactttgtttt 19501760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31570733 - 31570673
Alignment:
Q  282 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31570733 tgtaacacttaagactgtcacatgatatcaacaactctgtttacatgttaaagatgccaac 31570673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19500914 - 19500859
Alignment:
Q  282 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||    
T  19500914 tgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctatttacatgttaaagatg 19500859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 342
Target Start/End: Original strand, 45327933 - 45327984
Alignment:
Q  291 taagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45327933 taagactatcgcataatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgtcaac 45327984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 276
Target Start/End: Original strand, 35958925 - 35959077
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||| | |||||||  || |||| |||| ||||   |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||      
T  35958925 aagtcataaaaatgacttttttggtgaagttgccactataacataaaaaatgtaatgagcaacaccccactgtttgtacaatgacattaaaagttcag-- 35959022  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtt 276  Q
              ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  35959023 ----------catcaattcatcatattaacaagactgcacttaatataa-tttatcctaccttgtt 35959077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 41463841 - 41463789
Alignment:
Q  290 ttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  41463841 ttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgtcaac 41463789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29242128 - 29242077
Alignment:
Q  291 taagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||    
T  29242128 taagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgtcaac 29242077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 33709227 - 33709176
Alignment:
Q  286 acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatg 337  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33709227 acacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatg 33709176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 39167355 - 39167308
Alignment:
Q  295 actatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  39167355 actatcacataatatcatcaactctgtttgtatgttaaagatgtcaac 39167308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 19424619 - 19424573
Alignment:
Q  290 ttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19424619 ttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagat 19424573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 331
Target Start/End: Original strand, 33902267 - 33902319
Alignment:
Q  279 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgtta 331  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  33902267 aagtgtaacacttaatagtatcacataatatcattaactctgtttccatgtta 33902319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 340
Target Start/End: Original strand, 13711671 - 13711721
Alignment:
Q  290 ttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgcca 340  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13711671 ttaagactatgacatgatatcagcaactctgtatgcatgttaaagatgcca 13711721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 140
Target Start/End: Original strand, 6177791 - 6177820
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6177791 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 6177820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18258349 - 18258296
Alignment:
Q  236 ttaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  18258349 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctacatttttttaagtgtaacac 18258296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 342
Target Start/End: Original strand, 7889 - 8151
Alignment:
Q  97 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 196  Q
    ||||||| || || |||| || |||||||||||| || ||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||  || ||    
T  7889 aaaattctatggtgaagttataagaatgacttttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgaca 7988  T
Q  197 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------a 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |                 |    
T  7989 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgctataagcgtaacaccccacaa 8088  T
Q  280 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||    
T  8089 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaac 8151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 97 - 289
Target Start/End: Original strand, 11908 - 12103
Alignment:
Q  97 aaaattccattgtcaagtcatgagaa-tgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcacccc-actgtttgta-cggtg 193  Q
    ||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||  || |||||||| ||||||  |||||| | |||||||| | |||    
T  11908 aaaattctatggtgaagtcatgagaaatgacttttctggtgaaattaacaccataacattaaaagtgttgtgagtaacacccccattgtttgtatcagtg 12007  T
Q  194 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacac 289  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  12008 gtatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacac 12103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 342
Target Start/End: Original strand, 12117 - 12173
Alignment:
Q  286 acacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12117 acacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaac 12173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 336
Target Start/End: Original strand, 43959 - 44214
Alignment:
Q  97 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 196  Q
    ||||||| || || ||||| | |||| ||||||| |||||||||  || ||||| |||||||| |||| |||||  ||||||  |||||||||  |||||    
T  43959 aaaattctatggtgaagtcgtaagaaagacttttttggtgaagttaacgctataatatcaaaaatgtaatgagtaacaccccgttgtttgtacaatggca 44058  T
Q  197 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------a 279  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| | || |||||| |                 |    
T  44059 taaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccccacaa 44158  T
Q  280 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44159 agtgtaacacttaag-ctatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagat 44214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 154828 - 154573
Alignment:
Q  97 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 196  Q
    ||||||| || || ||||| | |||| ||||||| |||||||||  || ||||| |||||||| |||| |||||  ||||||  |||||||||  |||||    
T  154828 aaaattctatggtgaagtcgtaagaaagacttttttggtgaagttaacgctataatatcaaaaatgtaatgagtaacaccccgttgtttgtacaatggca 154729  T
Q  197 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------a 279  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| | || |||||| |                 |    
T  154728 taaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccccacaa 154629  T
Q  280 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  154628 agtgtaacacttaag-ctatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagat 154573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Original strand, 267331 - 267549
Alignment:
Q  143 acactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgttt-gtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaaca 241  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||  || || ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  267331 acactatagcatcaaaaatatagtgagtaacatccaactgttttgtacagtgtcatcaaaagttcagtctctataatatcatcaattcattagattagca 267430  T
Q  242 agactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacactt-aagactatcacataatatcatcaactatgttt 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||                 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  267431 agactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacatcccacaaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactttgttt 267530  T
Q  324 gcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||    
T  267531 gcatgttaaagatgccaac 267549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 146185 - 145937
Alignment:
Q  111 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 210  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||| ||||  ||| ||||  || |||| |||| |||||  ||||||| | ||||||   || |||||||||||||| |    
T  146185 aagtcataagaatgatttttttggttaagttaacattataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccattatttgtagaatgacatcaaaagttcagcc 146086  T
Q  211 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaa 293  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |                 |||||||||||||||    
T  146085 ttcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaa 145986  T
Q  294 gactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  145985 gactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaac 145937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 239 - 342
Target Start/End: Original strand, 100894 - 100991
Alignment:
Q  239 acaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaa--gtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagat 336  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||        |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  100894 acaagactacacttaatttaattttatcctaccttgttttaactgtgtaacactt--------cacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagat 100985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 186
Target Start/End: Original strand, 42347 - 42439
Alignment:
Q  94 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttg 186  Q
    |||||||||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||    
T  42347 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaataatttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttg 42439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University