View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11930_low_10 (Length: 727)

Name: NF11930_low_10
Description: NF11930
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11930_low_10
NF11930_low_10
[»] chr3 (6 HSPs)
chr3 (1-713)||(51113605-51114317)
chr3 (3-350)||(13470558-13470905)
chr3 (7-350)||(51764270-51764613)
chr3 (100-437)||(514651-514988)
chr3 (176-437)||(51120892-51121153)
chr3 (96-355)||(1657172-1657427)
[»] chr4 (37 HSPs)
chr4 (13-465)||(546724-547179)
chr4 (96-444)||(1524405-1524750)
chr4 (171-465)||(640726-641020)
chr4 (139-461)||(55505070-55505389)
chr4 (2-455)||(570172-570622)
chr4 (95-452)||(1548344-1548699)
chr4 (96-355)||(55908647-55908906)
chr4 (97-356)||(53761692-53761948)
chr4 (111-465)||(553290-553644)
chr4 (48-349)||(8186959-8187263)
chr4 (177-430)||(1513407-1513657)
chr4 (178-437)||(12121458-12121717)
chr4 (167-430)||(1537757-1538020)
chr4 (37-355)||(8183887-8184208)
chr4 (167-452)||(1552757-1553045)
chr4 (96-251)||(1600444-1600599)
chr4 (111-364)||(644743-644995)
chr4 (177-430)||(1489361-1489614)
chr4 (107-455)||(3438496-3438841)
chr4 (103-437)||(7225809-7226143)
chr4 (250-392)||(370803-370946)
chr4 (166-392)||(566073-566299)
chr4 (2-221)||(21834203-21834422)
chr4 (178-259)||(1519143-1519224)
chr4 (107-248)||(12116505-12116646)
chr4 (214-446)||(1508040-1508272)
chr4 (96-286)||(659701-659889)
chr4 (310-437)||(1545612-1545739)
chr4 (179-293)||(7307843-7307957)
chr4 (232-288)||(558486-558542)
chr4 (310-461)||(6006142-6006293)
chr4 (95-185)||(12120060-12120150)
chr4 (166-279)||(532186-532299)
chr4 (244-340)||(1495986-1496082)
chr4 (244-340)||(1517563-1517659)
chr4 (30-75)||(570735-570780)
chr4 (96-145)||(1519062-1519111)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (96-435)||(45245004-45245343)
chr2 (96-355)||(1037583-1037842)
chr2 (178-291)||(32785773-32785886)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (27-370)||(6394770-6395113)
chr6 (96-350)||(6432087-6432341)
chr6 (39-350)||(7119083-7119394)
chr6 (39-350)||(7131561-7131872)
chr6 (90-383)||(6402753-6403046)
chr6 (27-362)||(6415880-6416215)
chr6 (90-355)||(6585150-6585415)
chr6 (37-351)||(6409931-6410245)
chr6 (96-350)||(11936194-11936448)
chr6 (96-350)||(11948174-11948428)
chr6 (7-356)||(6426431-6426780)
chr6 (90-350)||(6594519-6594779)
chr6 (26-349)||(7994031-7994354)
chr6 (101-348)||(19632367-19632611)
chr6 (90-370)||(14820599-14820879)
chr6 (27-350)||(6589173-6589496)
chr6 (30-365)||(10579589-10579925)
chr6 (205-348)||(6603230-6603373)
chr6 (9-292)||(6423201-6423484)
chr6 (204-350)||(14818308-14818454)
chr6 (96-277)||(6596847-6597028)
chr6 (173-281)||(14802331-14802439)
chr6 (176-465)||(9411166-9411455)
chr6 (321-437)||(28934888-28935004)
chr6 (26-145)||(8913834-8913952)
chr6 (1-73)||(6432364-6432436)
[»] chr7 (7 HSPs)
chr7 (37-292)||(10614577-10614832)
chr7 (37-370)||(15092011-15092344)
chr7 (26-187)||(10169979-10170140)
chr7 (26-187)||(10177504-10177665)
chr7 (241-335)||(10170145-10170239)
chr7 (241-335)||(10177670-10177764)
chr7 (96-251)||(7977603-7977758)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (7-281)||(19468329-19468603)
chr1 (214-349)||(7554415-7554550)
chr1 (2-350)||(9586565-9586913)
chr1 (1-437)||(9580908-9581346)
chr1 (156-275)||(52082582-52082701)
chr1 (90-277)||(52092776-52092960)
chr1 (214-337)||(29718960-29719083)
chr1 (407-461)||(43634012-43634066)
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (179-451)||(27922333-27922605)
chr8 (166-465)||(32151112-32151411)
chr8 (2-355)||(18315095-18315451)
chr8 (97-350)||(34936083-34936336)
chr8 (96-355)||(28246214-28246471)
chr8 (125-292)||(21235542-21235709)
chr8 (1-350)||(17636218-17636573)
chr8 (241-364)||(44736447-44736570)
chr8 (202-459)||(17628039-17628296)
chr8 (310-437)||(5767788-5767915)
chr8 (26-75)||(17627905-17627954)
[»] scaffold0295 (1 HSPs)
scaffold0295 (96-355)||(543-802)
[»] chr5 (9 HSPs)
chr5 (96-340)||(41889473-41889717)
chr5 (107-451)||(32267300-32267641)
chr5 (184-437)||(41901542-41901795)
chr5 (90-355)||(20477995-20478260)
chr5 (183-370)||(38267562-38267749)
chr5 (100-189)||(28525098-28525187)
chr5 (234-352)||(12845517-12845635)
chr5 (184-286)||(37937877-37937979)
chr5 (26-73)||(41889400-41889447)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (101-270)||(1388-1560)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (224-369)||(39091-39236)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 677; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 677; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 713
Target Start/End: Original strand, 51113605 - 51114317
Alignment:
Q  1 acaatccatggttaagagaggagagcatcataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaagg 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51113605 acaatccatggttaagagatgagagcatcataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaagg 51113704  T
Q  101 tatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51113705 tatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctcccaaa 51113804  T
Q  201 ctggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51113805 ctggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaatt 51113904  T
Q  301 gttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagggttgttttaaagtgcatgctaattt 400  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51113905 gttaccatgtcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaagagagattaatttaaagggttgttttaaagtgcatgctaattt 51114004  T
Q  401 tgttgcctcaatgatattttcaaggccatcattgagagaaataacagctccacctggttttgattcaaccgagaaaatgaaattctacttgagccacaac 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51114005 tgttgcctcaatgatattttcaaggccatcattgagagaaataacagctccacctggttttgattcaagcgagaaaatgaaattctacttgagccacaac 51114104  T
Q  501 tgctttgtttggtagctgtctgaaacatgaaacaactcttctgaagtataaactctgaaatgcaagttgtttgttgtttacggatttacttatatgagaa 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51114105 tgctttgtttggtagctgtctgaaacatgaaacaactctgctgaagtataaactctgaaatgcaagttgtttgttgattacggatttacttatatgagaa 51114204  T
Q  601 attaatttattttataaatgtcaacttacatatatgtatttagttacggatataacttatttatcccttttattatattatacgctagactagatgtttt 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51114205 attaatttattttataaatgtcaacttacatatatgtatttagttacggatttaacttatttatcccttttattatattatatgctagactagatgtttt 51114304  T
Q  701 tatttgtgtgtgt 713  Q
    |||||||||||||    
T  51114305 tatttgtgtgtgt 51114317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 350
Target Start/End: Original strand, 13470558 - 13470905
Alignment:
Q  3 aatccatggttaagagaggagagcatcataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaaggta 102  Q
    |||| ||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | |  |||| ||    ||||  ||||||    
T  13470558 aatcaatggttaagtgatgaaggcatcataatgtttgcttccaatttccccaatttgcagctgcttgatttgaattgttgcaatctcttatcaaaaggta 13470657  T
Q  103 tttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaact 202  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||  |||| ||||||||||||||||||||||||  | ||| || ||    
T  13470658 tttgtcaagttttaaggatatgttgtaagattaggcatttgaacttagcctattgtaaaaaagtgaagctacttggaatgaactttgttgttcccaatct 13470757  T
Q  203 ggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgt 302  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||  ||||    
T  13470758 ggaggtgttgaacttgtcaaatacaaaggttaatgataaaacactctatatgatctcaaagaattgttgtgggcttttgcaactattacttgaactttgt 13470857  T
Q  303 taccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcaca 350  Q
     |  || |||||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  13470858 cataatgtcacagaagagggagtgaaacatgtggtagagaactgcaca 13470905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 350
Target Start/End: Original strand, 51764270 - 51764613
Alignment:
Q  7 catggttaagagaggagagcatcataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaaggtatttg 106  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |  |||| ||   |||||  ||||| | ||    
T  51764270 catggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgattttaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctg 51764369  T
Q  107 tcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggag 206  Q
    | ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||  || |  | ||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||    
T  51764370 tgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggag 51764469  T
Q  207 gtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttacc 306  Q
    |||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| || ||||| |      
T  51764470 gtgttagacttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgata 51764569  T
Q  307 atttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcaca 350  Q
    || |||  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  51764570 atgtcaaggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcaca 51764613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 437
Target Start/End: Original strand, 514651 - 514988
Alignment:
Q  100 gtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaa 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||  |||| |||| | ||||| |    || |||||| ||  || ||  ||    
T  514651 gtatctgtcaagttttaaagagatggtctaagattaggcatttgaacttagcccactgctcaagagtgaagttgtacggtatgaacattagagttctcaa 514750  T
Q  200 actggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaat 299  Q
    ||| ||||||||   |||   | ||||||  || || |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  514751 acttgaggtgttgagcttaatagatacaagagtcgacgatgaagcacttcatgtgatctcgaagagttgctgtgggcttttgcaactattactgcaaaat 514850  T
Q  300 tgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagggttgttttaaagtgcatgctaatt 399  Q
    ||| |   | ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||  |||  ||||||| |||||||  ||||||  ||||||||||  ||||     
T  514851 tgtgaaggtatcacagagacgggagtgaagcatgtggtgaaaaactgcacacgactgagagagatcaatttaagaggttgtaataaagtgcattataatg 514950  T
Q  400 ttgttgcctcaatgatattttcaaggccatcattgaga 437  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  514951 ttgttgccccaatggtattttcaaggccatcattgaga 514988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 176 - 437
Target Start/End: Original strand, 51120892 - 51121153
Alignment:
Q  176 tggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtggg 275  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||  |||||||  ||||||  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  51120892 tggaatgaactttgaagttctcaaattggaggtgttgaacttgtcgcatacaagagttgatgatgaaaaactatatgtaatctcaaagagttgtcgtggg 51120991  T
Q  276 cttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagg 375  Q
    ||||||||| |||  ||  |||  ||||   || ||||| | || |||||||| |||||||||||||| |||||| || |  ||| ||| || || | |     
T  51120992 cttttgcaattgtctctagaaagctgtttgtatgtcacacaaaaaggagtgaaacatgtggtagaaaactgcacacaattgagagtgatcaacttgaggt 51121091  T
Q  376 gttgttttaaagtgcatgctaattttgttgcctcaatgatattttcaaggccatcattgaga 437  Q
     ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||||    
T  51121092 attgctataaagtccatgctgattttgttgcctcaatagtcttttcaaggtcatcgttgaga 51121153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 1657427 - 1657172
Alignment:
Q  96 gaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctc 195  Q
    |||||||||  ||| ||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||  ||    || ||||||||||| |  | |||||||||||| ||    
T  1657427 gaaggtattgttcatgttttaatgatatgttgtaacattagacatttgaatttaactcgct----aagactgaagctacgtacattgaactttgaagttc 1657332  T
Q  196 caaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaa 295  Q
    | |||||||||||||| |||||||||  |||||  |||||  ||  | ||||||||  |||||| ||||||||  | |||||||||||||||| ||| ||    
T  1657331 ccaaactggaggtgttggacttgtcatttacaagagttgacaatatatcactctattggatctcaaagagttgcagcgggcttttgcaactgtcacttaa 1657232  T
Q  296 aaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaact 355  Q
    |  |||| |   | |  |||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  1657231 attttgtgaaggtgttgcagacaaaggagtgacgcatgtggttgaaaaatgcacacaact 1657172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 142; Significance: 4e-74; HSPs: 37)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 547179 - 546724
Alignment:
Q  13 taagagaggagagcatcataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaag---gtatttgtca 109  Q
    ||||||| || ||||||| |||| || ||||||| ||||||||| |||| || |||||||||| | ||||   | | ||||| ||||   |||||||| |    
T  547179 taagagatgaaagcatcaaaatgtttccttccatgttccccaatttgcaactgcttgatttaagttattgtcgtaacatatctgaagacagtatttgtga 547080  T
Q  110 agttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtg 209  Q
     ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| |  | |||| |  | |||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  547079 tgttttaaggagatgttgtaagataaggcatttgaacttatccaattgtttagtagtgaacctatttggaatgaactttgaagttcctaaattggaggtg 546980  T
Q  210 ttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatt 309  Q
     |  ||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||  |||     
T  546979 gtgaacttgtcacgtacaattgtcaatgatgaaacactctatgtgatctcaaagagttgttgtgggcttttggaattgttactggaagaatgttttcatg 546880  T
Q  310 tcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagggttgttttaaagtgcatgctaattttgttgcctc 409  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||  ||||||| ||| ||||   ||||| ||    
T  546879 tcacagagaagggagtgaaacatgtgctagaaaactgcacaaaactaagagagatcaatttaagggcttgtaataaagtgaatgttaatgccgttgcttc 546780  T
Q  410 aatgatattttcaaggccatcattgagagaaataacagctccacctggttttgatt 465  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||||    
T  546779 aatgttatttttaaggccatcattgagaaagataatagctccatctggtttggatt 546724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 96 - 444
Target Start/End: Original strand, 1524405 - 1524750
Alignment:
Q  96 gaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctc 195  Q
    |||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| ||| |  | || | ||||||||||||||||| ||    
T  1524405 gaaggtattcttcaggttttaaggagatgttgtaaacttaggcatttgaacttagccaactgttctaaaatagaacttcatggaatgaactttgaagttc 1524504  T
Q  196 caaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaa 295  Q
    | ||  ||||||||||  | ||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||      
T  1524505 ccaatttggaggtgttgaatttgtcacgtacaagtgttgatgatgaaacactctatatgatctcacagagttgtcgtgggcttttgcaactgttattgcg 1524604  T
Q  296 aaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagggttgttttaaagtgcatgct 395  Q
     | |||||   || ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||  ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||    
T  1524605 tagttgtt---atgtcacagagaggggagtgaattatgtgatagaaaactgcacacaactgagagagattaatttgaggggttgttgtaaagttcatgct 1524701  T
Q  396 aattttgttgcctcaatgatattttcaaggccatcattgagagaaataa 444  Q
    |  ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  1524702 agctttgttgcctcaatgctattatcaagaccatcattgagagagataa 1524750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 171 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 641020 - 640726
Alignment:
Q  171 ctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgtt 270  Q
    |||||||||||||| ||||||   |||| | ||||||||||  |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||      
T  641020 ctacttggaatgaaatttgaactaccaatattggaggtgttgaacttgtcagatacaaacgttgatgatgaaacactctacgtgacctcaaagaattgcc 640921  T
Q  271 gtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaattt 370  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || ||||| |  || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| | || || ||||| | |||||    
T  640920 gtggtcttttgcatctgttactggaagattgtcattatgtaacaaagaagggagtgaatcatgtggtagaaaactgcaaagaattaagagaggtcaattt 640821  T
Q  371 aaagggttgttttaaagtgcatgctaattttgttgcctcaatgatattttcaaggccatcattgagagaaataacagctccacctggttttgatt 465  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||    
T  640820 aaagggttgtaataaagtgaatgctaatgtcgttgactcaatggtattttcaaggccatcattgagaaagatagtaactccacctggttttgatt 640726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 139 - 461
Target Start/End: Original strand, 55505070 - 55505389
Alignment:
Q  139 atttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatga 238  Q
    |||||||  |||| |||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||  ||  ||  |||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||| ||    
T  55505070 atttgaacctagcctactgttcaacagtgaacctaattggaatgaactttagagtcccccaactagaggtgttgaacttgtcatatacaaaggttgacga 55505169  T
Q  239 tgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggta 338  Q
    || |||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||  ||||| |||||||| |   | || ||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  55505170 tggaacactttatgtgacctcaaagaattgtcgtggacttttgcatttgttattgaaaaatag---cgatgtcacagagaagggagtgaaacacgtgtta 55505266  T
Q  339 gaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagggttgttttaaagtgcatgctaattttgttgcctcaatgatattttcaaggccatcattgagag 438  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||| || || || ||||||  |||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  55505267 gaaaactgcacacaactaagagagatcaacttgaacggttgtgataaagtgcatactagtgttgttgactcaatggtattttcaaggccatcattgagaa 55505366  T
Q  439 aaataacagctccacctggtttt 461  Q
    | |||||||| ||||||||||||    
T  55505367 agataacagcgccacctggtttt 55505389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 570622 - 570172
Alignment:
Q  2 caatccatggttaagagaggagagcatcataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaaggt 101  Q
    |||| |||||||||| || || | |||  ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||| | ||||| || ||||||||||  ||    
T  570622 caatacatggttaagtgatgaaaacattttaatgtttgcttctattttccccaatttgcagatacttgatttaagttattgcaatcagatatccgatagt 570523  T
Q  102 atttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaac 201  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| || | |||| |||||||||||| ||  ||||    
T  570522 atttgtcaagttttaa---gatgttgtaaacttaggcatttgaacttagctcactgctcaaaagtgaaactgcgtggattgaactttgaagttctcaaac 570426  T
Q  202 tggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattg 301  Q
    | ||||||||  |||||||| |||||   |||||| | |||  ||||||| |||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||  |  ||||    
T  570425 tcgaggtgttgaacttgtcatatacaggagttgataacgaagaactctatctgatttcaaagagttgtcgcgggcttttgcaactgttacttgagcattg 570326  T
Q  302 ttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagggttgttttaaagtgcatgctaatttt 401  Q
    |||  || | ||  | |  || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||  | ||||| ||||| |||   || | ||||||||||   ||| ||    
T  570325 ttattatgttactaaaagaggcgtgaatcatgtggtagaaaactgcacacaactgagggagatcaatttgaagaactgctataaagtgcataaaaatatt 570226  T
Q  402 gttgcctcaatgatattttcaaggccatcattgagagaaataacagctccacct 455  Q
    |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| | |||||||    
T  570225 gttgactcgatgatattatcaagaccatcattgagaaagataactgttccacct 570172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 95 - 452
Target Start/End: Original strand, 1548344 - 1548699
Alignment:
Q  95 cgaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctactt-ggaatgaactttgaagc 193  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||||| ||||| || ||||| ||||||    ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||      
T  1548344 cgaaggtatttgtgaagttttaa---gatgttgtaagattagacagttgaacttagctcgtagtttaaaagtgaagctactttggactgaactttgaaat 1548440  T
Q  194 tccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactg 293  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||      
T  1548441 tcccaaactggaggtgttgaacttgtcacatacaagtattgatgatgaaacactcaatgtgatctcaaagagttgttgtgggcttttgcacttgttacaa 1548540  T
Q  294 aaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagggttgttttaaagtgcatg 393  Q
    |||  |||| |  || ||||||||||||||||||| ||| | | |||||| ||| |  ||||  |||| ||||||||  | ||||||||| || ||||||    
T  1548541 aaacgttgtaaaaatatcacagagaagggagtgaaacatatagaagaaaactgctcgcaactgagagaaattaatttggaaggttgttttcaattgcatg 1548640  T
Q  394 ctaattttgttgcctcaatgatattttcaaggccatcattgagagaaataacagctcca 452  Q
     | || |||| || ||| || |||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||    
T  1548641 atgatgttgtcgcttcattggtattttcaagaccatcattgagaaagataacaactcca 1548699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 355
Target Start/End: Original strand, 55908647 - 55908906
Alignment:
Q  96 gaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctc 195  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||| | |||| |||||| |||| |||||| ||| ||    
T  55908647 gaaggtatttgtgaagttctaaggagatgttgtaaggttagacatttgaatttagcctactgttcaagagtgaaactacttagaataaactttaaagttc 55908746  T
Q  196 caaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaa 295  Q
    |  || | ||||||||  |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  55908747 ctgaattagaggtgtttaacttgtcacatacatgtgttgatgatgaaacactctatatgatctcaaagaattgttgtgggcttttacaactgtttctgga 55908846  T
Q  296 aaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaact 355  Q
    ||||||| |  |  |||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||| ||||    
T  55908847 aaattgtgatgaagtcacagagaatggtgtgaaacatgtagtcgaaaactgcacacaact 55908906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 356
Target Start/End: Original strand, 53761692 - 53761948
Alignment:
Q  97 aaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctcc 196  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||  | ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  53761692 aaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttagccgagtgttcaagagtgaagctaattggaatgaactttgtagttcc 53761791  T
Q  197 aaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaa 296  Q
     || || |||| |||  ||||||||  ||| |  ||| | ||| ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  53761792 caagctagaggcgttgaacttgtcatttacgaaagttaacgataaaacactc--tgtgatctcgaagaattgtcgtgggcttttgcaa-tattactgaaa 53761888  T
Q  297 aattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaacta 356  Q
     ||||| |  || |||| || ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  53761889 cattgtgataatgtcacggacaagggagtgaaacatgtggaagaaaactgcacacaacta 53761948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 553644 - 553290
Alignment:
Q  111 gttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgt 210  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||| |   |||||||| | ||||| ||| |  | |||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  553644 gttttaaggacatgttgtaacattagacatttgaacttaacccgctgttcaagagtgaagttacgtacattgaactttaaagttctcaaactggaggtgt 553545  T
Q  211 tagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccattt 310  Q
    |  ||||||||  |||||  |||||||||||| ||||  ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||  ||    |||||    || |    
T  553544 tgaacttgtcatttacaagagttgatgatgaagcacttaatgtgatttcaaagagttgttctgggcttttgcaactgttgttgttttattgtagtgatgt 553445  T
Q  311 cacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagggttgttttaaagtgcatgctaattttgttgcctca 410  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||  |||||||  ||||   |||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  553444 cacagataaaggagtgaatcatgtggtagaaaactgcacacaacttagagagatcgatttggggggttgtgataaagtgcatgcaaatgttgttgcctca 553345  T
Q  411 atgatattttcaaggccatcattgagagaaataacagctccacctggttttgatt 465  Q
    ||| ||  |||| || ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||    
T  553344 atggtacattcacggacatcattgagaaagataggagctccacctggttttgatt 553290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 349
Target Start/End: Original strand, 8186959 - 8187263
Alignment:
Q  48 ttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaag---gtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttga 144  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||    
T  8186959 ttccccaatttgcagttgcttgatttgagtcattgctatgacatatctgaagaaggtatttgtcaagttttgaagagatgttgtgagattagggatttga 8187058  T
Q  145 aattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaac 244  Q
    | ||||| |||||| ||| | |   |||    |||||||||||||||  | | ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||| ||||    
T  8187059 acttagcctactgtccaagagttgggctctccggaatgaactttgaaatttccaaactggaggtgttgaacttgtcacatacaagagttgatgataaaac 8187158  T
Q  245 actctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaa 344  Q
    ||| ||||  || || |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    |  |||||| ||||||||||| | |||||||| ||||     
T  8187159 actttatgcaatttcaaagagttgttgtgggcttttgcagttgttactggaaaattgtcgtaacgtcacagggaagggagtgatggatgtggtaaaaaac 8187258  T
Q  345 tgcac 349  Q
    |||||    
T  8187259 tgcac 8187263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 177 - 430
Target Start/End: Original strand, 1513407 - 1513657
Alignment:
Q  177 ggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggc 276  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||  ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| ||||||    
T  1513407 ggaatgaactttgaagttcccaaactagaagtgttgaacttgtcatttacaaatgttgatgatgaaacactctacgtaatctcaaagtgttgtcgtgggc 1513506  T
Q  277 ttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatt-tcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagg 375  Q
    ||||||||||  ||||||||  ||||    ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||      
T  1513507 ttttgcaactcatactgaaaggttgt----attgtcacagagatgggagtgaagcttgtgctagaaaaatgcacacaactgagagagatcaatttgaaat 1513602  T
Q  376 gttgttttaaagtgcatgctaattttgttgcctcaatgatattttcaaggccatc 430  Q
     ||||| ||||||| ||| | || || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1513603 attgttctaaagtgaatggtgatgttcttgcctcattgatattttcaaggccatc 1513657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 178 - 437
Target Start/End: Original strand, 12121458 - 12121717
Alignment:
Q  178 gaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggct 277  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| || |||||  |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  || ||||| ||| ||||  |||||||    
T  12121458 gaatgaactttgaagttcccaaactagaagtgttgaacttgtcatatacaaatgttgatgatgaaacactctccgtaatctcaaagtgttgccgtgggct 12121557  T
Q  278 tttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagggt 377  Q
    ||||||||| | |||| ||   || |    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||   |    
T  12121558 tttgcaactctcactggaatggtgcttttttgtcacagagatgggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacacaactaagagagatcgatttgaaatat 12121657  T
Q  378 tgttttaaagtgcatgctaattttgttgcctcaatgatattttcaaggccatcattgaga 437  Q
    ||| || ||||||||  | || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12121658 tgtcttcaagtgcattgtgatgttcttgcctcattgatattttcaaggccatcattgaga 12121717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 167 - 430
Target Start/End: Original strand, 1537757 - 1538020
Alignment:
Q  167 gaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagt 266  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||  |||||||| ||||||  ||| ||||  ||||||| | ||| ||||| ||| ||    
T  1537757 gaagctgcatggaatgaactttgaagttcccaaactagaagtgttgaacttgtcatatacaaatgttaatgacaaaacactgtgtgtaatctcaaagtgt 1537856  T
Q  267 tgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagatta 366  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||| | | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| |    
T  1537857 tgtcgtgggcttttgcaacttttactggaactttgttatcttgtcacacagaagggagtgaagtatgtgctagaaaaatgcactcaactaagagagatca 1537956  T
Q  367 atttaaagggttgttttaaagtgcatgctaattttgttgcctcaatgatattttcaaggccatc 430  Q
    |||| ||  | ||| || ||||| ||| | || || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  1537957 atttgaaaaggtgtgttcaagtggatgatgatgttcttacctcattgatattttcaaggccatc 1538020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 355
Target Start/End: Original strand, 8183887 - 8184208
Alignment:
Q  37 ttgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaa---ggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaat 133  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||| ||| || || |||   ||||||  |||| |||||| ||| |||||| | ||    
T  8183887 ttgcttccgtgttccccaatttgcagcggcttgatttgagtcattgctttgacatttctgaaaaaggtattactcaaattttaaggagttgttgtgagat 8183986  T
Q  134 taggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggtt 233  Q
    |||  ||||||| |||||||||  | ||||| ||| |||     ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||  |||    
T  8183987 tagagatttgaacttagcttacattccaaaaatgaggctgagcagaatgaactttgaagttccgaaactagaggtgttgaacttgtcacatacaagagtt 8184086  T
Q  234 gatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatg 333  Q
    ||||||  | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |     |||||||  |||||||||||||||    
T  8184087 gatgatatagcactctatgcaatctcaaagagttgttgtgggcttttggaactgttactggaaaattgtgaaatgatcacagatgagggagtgaagcatg 8184186  T
Q  334 tggtagaaaaatgcacaaaact 355  Q
    || ||||||| |||||| ||||    
T  8184187 tgctagaaaattgcacacaact 8184208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Original strand, 1552757 - 1553045
Alignment:
Q  167 gaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagt 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||| |||||  | |||||| ||||||   || |||||||||||||| ||||||| || |||| |    
T  1552757 gaagctacttggactgaactttgaaattcccaaactggaagtgttgaatttgtcacatacaaatattaatgatgaaacactcaatgtgatatcaaagaat 1552856  T
Q  267 tgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattg---ttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagaga 363  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||  || | ||   |||  || |||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||    ||||| ||||||    
T  1552857 tgtcgtgggcttttgcagctgttactagaacaatgtaattattatgtcaccgagaagggagtgaagcatgtcggagaaaattgcttgcaactaagagaga 1552956  T
Q  364 ttaatttaaagggttgttttaaagtgcatgctaattttgttgcctcaatgatattttcaaggccatcattgagagaaataacagctcca 452  Q
    | ||||| || |||||| |||||||| ||  | || ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  1552957 tcaatttgaaaggttgtcttaaagtggatcatgatgttgttgcttcattggtattttcaaggccatcattgagaaagataactgctcca 1553045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1600599 - 1600444
Alignment:
Q  96 gaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctc 195  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||| |||||  | ||||||| | ||||||| |  |||||||||||||||| ||    
T  1600599 gaaggtatttgtcaagttttaaggagattttctaaaattagacatttgaacttagcccagtgttcaataatgaagctgcgaggaatgaactttgaagttc 1600500  T
Q  196 caaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctat 251  Q
      ||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  1600499 ttaaactggaggtgttgaacttgtcatatacaagggttgacgatgaagcactctat 1600444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 644995 - 644743
Alignment:
Q  111 gttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgt 210  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||  |||||||| |||||||||||||  | |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  644995 gttttaatgatatgttgtaacattagacatttgaatttaactcgctgttcaagactgaagctacttacattgaactttgaagttcccaaactggaggtgt 644896  T
Q  211 tagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccattt 310  Q
    |||||||||||  |||||  ||| | ||| || || | ||| ||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||| ||| |||  |||| |   | |    
T  644895 tagacttgtcatttacaagagtttacgataaatca-tttatttgatctcaaagagttgcagcgggcttgtgcaactgtcacttaaattttgtgaaggtgt 644797  T
Q  311 cacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagat 364  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||    
T  644796 cacggagaaaggagtgaaacatgtggttgaaaaatgcacacaactgagagagat 644743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 177 - 430
Target Start/End: Original strand, 1489361 - 1489614
Alignment:
Q  177 ggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggc 276  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||  |||||||| ||||||  ||| |  | |||||||| | ||| ||||| | | ||||  ||||||    
T  1489361 ggaatgaactttgaagttcccaaactagaagtgttgaacttgtcatatacaaatgttaacaacgaaacactgtgtgtaatctcaatgtgttgccgtgggc 1489460  T
Q  277 ttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaaggg 376  Q
    |||||||||| |||||| ||   ||||   || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| ||       
T  1489461 ttttgcaactcttactggaagggtgttttaatgtcacagagaagggagtgaagcatgtgctagaaaaatgcgcacaactaagagagatcaatttgaaaat 1489560  T
Q  377 ttgttttaaagtgcatgctaattttgttgcctcaatgatattttcaaggccatc 430  Q
     |||  | ||||||||| | || || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1489561 gtgtggtcaagtgcatgatgatgttcttgcctcattgatattttcaaggccatc 1489614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 455
Target Start/End: Original strand, 3438496 - 3438841
Alignment:
Q  107 tcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggag 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   |||| |  | ||||  |   || |||||||||||| | | ||||| |||||    
T  3438496 tcaagttttaaggagatgttgtaagattagacatttgaacttagctggttgtttaggagtgaatttgtgtgcaatgaactttgatgtttcaaaattggag 3438595  T
Q  207 gtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttacc 306  Q
    || ||   ||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |      
T  3438596 gtattgagcttgtcacatacaagagttgatgat-aaatactccatgtaatctcaaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactggaattttgtaaag 3438694  T
Q  307 atttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagggttgttttaaagtgcatgctaattttgttgc 406  Q
     | |||||| ||||||||||||| ||||| |  |||| || || || | ||| ||| | ||||||| ||||||   | ||||| |||||||||||||||     
T  3438695 gtgtcacagtgaagggagtgaagtatgtgatgaaaaactgtac-aaccgagg-gaggtcaatttaaggggttgcgatcaagtgtatgctaattttgttga 3438792  T
Q  407 ctcaatgatattttcaaggccatcattgagagaaataacagctccacct 455  Q
    |   ||| ||||||||| ||||||||||||| |  |||| |||||||||    
T  3438793 cgagatggtattttcaaagccatcattgagaaaggtaactgctccacct 3438841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 103 - 437
Target Start/End: Original strand, 7225809 - 7226143
Alignment:
Q  103 tttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaact 202  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||| ||| | |||||||||     ||||||||||||| ||   || |    
T  7225809 tttgtcaagttttacggagatgttgtaagattagacatttgaacttatcctactgtccaagagtgaagctacgcaacatgaactttgaagttctcgaatt 7225908  T
Q  203 ggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgt 302  Q
    |||||| ||  |||||||| ||||||  ||||||||  ||  |||   |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  7225909 ggaggtcttgaacttgtcacatacaagagttgatgacaaaggacttcgtgtgatatcaaagagttgttgtggacttttgcaactattactggaaagttgt 7226008  T
Q  303 taccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagggttgttttaaagtgcatgctaattttg 402  Q
    |   |  |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   ||||  ||||||| ||||| |||   ||   |  |||||| | | || |||    
T  7226009 tttgaggtcaccgagaagggattgaagcacgtggtagaaaactgcaagcaactgagagagatcaatttgaagaactgccgtggagtgcaaggtgatattg 7226108  T
Q  403 ttgcctcaatgatattttcaaggccatcattgaga 437  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  7226109 ttgcctcaatggtttcttcaaggccatcattgaga 7226143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 370946 - 370803
Alignment:
Q  250 atgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcac 349  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |   | ||||| ||| ||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  370946 atgtgatctcaaagagttgttgtcggcttttgcaactattactgcaaaattgtgaaggtatcacaaagatgggagtgaagcatgtggtgaaaaactgcac 370847  T
Q  350 a-aaactaggagagattaatttaaagggttgttttaaagtgcat 392  Q
    | || ||  ||||||| |||||||  ||||||  ||||||||||    
T  370846 acaacctgagagagatcaatttaagcggttgtaataaagtgcat 370803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 566299 - 566073
Alignment:
Q  166 tgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagag 265  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||   ||| || || |||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  566299 tgaagctacgtggaatgaactttgaagttctaaaacttgaaacgttggatttatcatgttcaagcgttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagta 566200  T
Q  266 ttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagatt 365  Q
     ||| ||||||||||||| |||| |||| || ||  | |  || | ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||| ||||  |||| ||     
T  566199 ctgtcgtgggcttttgcagctgtcactgcaatataatcaaaatgttacagagaagggagtgaaacacctggtggaaaactgcacacaactgagagaaatc 566100  T
Q  366 aatttaaagggttgttttaaagtgcat 392  Q
    || ||  ||||||||| ||||||||||    
T  566099 aagttggagggttgttataaagtgcat 566073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 21834203 - 21834422
Alignment:
Q  2 caatccatggttaagagaggagagcatcataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaaggt 101  Q
    |||| |||||||||  || || || ||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||  || |    ||||||| ||||||    
T  21834203 caattcatggttaaatgatgaaagaatcataatgtttgcttcaattttccccaatttacagctgcttgatttgacttcttccacacagatatcagaaggt 21834302  T
Q  102 atttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaac 201  Q
    |||||  ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||| |    ||||  ||| ||||||||| | | || ||||||| || ||| || |    
T  21834303 atttgcgaagttttaaggaaatgttgtaagattaagcatttgaacttatcaggttgttataaagtgaagctacatagtatcaactttgtagttcccaagc 21834402  T
Q  202 tggaggtgttagacttgtca 221  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  21834403 tggaggtgttggacttgtca 21834422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 259
Target Start/End: Original strand, 1519143 - 1519224
Alignment:
Q  178 gaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctc 259  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  1519143 gaatgaactttgaagttcccaaactagaggtgttgaacttgtcacatacaagggttgatgaataagcactctatgtgatctc 1519224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 248
Target Start/End: Original strand, 12116505 - 12116646
Alignment:
Q  107 tcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggag 206  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| | |||||||  || ||||| |||||||||||| | || || | | ||||||||||||| | ||||||  | |||    
T  12116505 tcaaattttaaggagatgttgtaaactaaggcattaaaacttagcctactgttcaaaaataaaactgcgtagaatgaactttgatgttccaaatttagag 12116604  T
Q  207 gtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactc 248  Q
    |||||  |||||||| ||||||  |||||||||||| |||||    
T  12116605 gtgttgaacttgtcacatacaagtgttgatgatgaatcactc 12116646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 446
Target Start/End: Original strand, 1508040 - 1508272
Alignment:
Q  214 acttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcac 313  Q
    |||||||| |||| |  ||||||||||||||||| | ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||  | ||| |   ||||       ||||    
T  1508040 acttgtcacataccaatgttgatgatgaaacactgtgtgtaatctcaaagtgttgtcgtgggcttttgcaactcgtgctggatggttgtgctgcagtcac 1508139  T
Q  314 agagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagggttgttttaaagtgcatgctaattttgttgcctcaatg 413  Q
     |||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||   | ||  ||| || | || | || || |||||||| ||    
T  1508140 cgagatgggagtgaagcatgcgctagaaaaatgcacacaactaagagagatcaatttgaaatatggtcctaaggtacgtggtgatgttcttgcctcattg 1508239  T
Q  414 atattttcaaggccatcattgagagaaataaca 446  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1508240 atattttcaaggccatcgttgagaaaaataaca 1508272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 659889 - 659701
Alignment:
Q  96 gaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctc 195  Q
    |||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||  |||| || ||||| | |||||||| |  ||||||||  | ||| || ||||||| ||    
T  659889 gaagatattggtcaaattttaaggagatgttgtaacattagatatttaaacttagcctgctgttcaagagggaagctacgagtaataaattttgaagttc 659790  T
Q  196 caaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaact 286  Q
    | ||||| ||||||||  |||||||| ||||||  ||| || ||||||||  |||||||||||| | || ||||| |||| |||| |||||    
T  659789 ccaaactagaggtgttgaacttgtcacatacaagtgttaataatgaaaca--ctatgtgatctcaaggaattgttttggggttttacaact 659701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 1545739 - 1545612
Alignment:
Q  310 tcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagggttgttttaaagtgcatgctaattttgttgcctc 409  Q
    ||||| |||||||||||||  ||| |||| |||| |||||| ||||| ||| ||| ||||| | |||||||  |||||||||||||||| || |||| |     
T  1545739 tcacatagaagggagtgaaagatgcggtaaaaaactgcacacaactaagagtgatcaatttgaggggttgtgataaagtgcatgctaatgttattgcttt 1545640  T
Q  410 aatgatattttcaaggccatcattgaga 437  Q
    | |  |||| ||||||||||||||||||    
T  1545639 attagtattatcaaggccatcattgaga 1545612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7307957 - 7307843
Alignment:
Q  179 aatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggctt 278  Q
    |||||||||| ||| ||| ||| ||||||| ||  |||||||| |||||   |||||||||||| ||||   | ||||||| |||||||||||| |||||    
T  7307957 aatgaactttaaagttcccaaattggaggtattgaacttgtcatatacagaagttgatgatgaagcactacgtatgatctcaaagagttgttgtaggctt 7307858  T
Q  279 ttgcaactgttactg 293  Q
    ||||| |||||||||    
T  7307857 ttgcacctgttactg 7307843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 558542 - 558486
Alignment:
Q  232 ttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgt 288  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  558542 ttgatgatgaagcactccatgtgatctcaaagagttgtcgtgggcttttggaactgt 558486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 310 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 6006293 - 6006142
Alignment:
Q  310 tcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagggttgttttaaagtgcatgctaattttgttgcctc 409  Q
    ||||| |||||||||||| ||| || |||||||| |||| | || |  ||||||| |||||  ||| ||||  |||||||   ||| || |||||| ||     
T  6006293 tcacaaagaagggagtgatgcaagtcgtagaaaactgcaaacaattgagagagataaatttgcaggattgtcataaagtggtagctgatgttgttgactt 6006194  T
Q  410 aatgatattttcaaggccatcattgagagaaataacagctccacctggtttt 461  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  6006193 gatggtatttacaaggccatcattgagaaagataactgctccacctggtttt 6006142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 185
Target Start/End: Original strand, 12120060 - 12120150
Alignment:
Q  95 cgaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaac 185  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | || |||| ||||| |||||||| || ||  ||||||||| |||||||| ||||  |||||||    
T  12120060 cgaaggtattggtcaagttttaaagaaaagtagtaagattagacatttgaactttgcccactgttcaagactgaagcaacttataatgaac 12120150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 532299 - 532186
Alignment:
Q  166 tgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagag 265  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  || || || ||||||||  |||||||| ||||||   ||||||||||||  || ||||||| ||| ||||     
T  532299 tgaatctacttggaatgaactttgaagtccccaagctagaggtgttgaacttgtcatatacaaacattgatgatgaaaagctttatgtgacctcaaagaa 532200  T
Q  266 ttgttgtgggcttt 279  Q
    |||| ||| |||||    
T  532199 ttgtcgtgagcttt 532186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 340
Target Start/End: Original strand, 1495986 - 1496082
Alignment:
Q  244 cactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtaga 340  Q
    |||||| ||| ||||| |||| |||| ||||  |||||||||  |||||| |||||||| |  || |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1495986 cactctttgtaatctcaaagaattgtcgtggaattttgcaacaattactggaaaattgtcatgatatcacagagaagggagttaggcatgtggtaga 1496082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 340
Target Start/End: Original strand, 1517563 - 1517659
Alignment:
Q  244 cactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtaga 340  Q
    |||||| ||| ||||| |||| |||| ||||  ||||| |||| |||||| |||||||| |  || |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1517563 cactctttgtaatctcaaagaattgtcgtggaattttgaaactattactggaaaattgtcatgatgtcacagagaagggagttaggcatgtggtaga 1517659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 570780 - 570735
Alignment:
Q  30 ataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaa 75  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  570780 ataatgtttgcttccattttccccaatttgcaactacttgatttaa 570735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 145
Target Start/End: Original strand, 1519062 - 1519111
Alignment:
Q  96 gaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaa 145  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |  ||||||||||||||    
T  1519062 gaaggtatttgtcaagttttaagaagatgttgaaggattaggcatttgaa 1519111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 96 - 435
Target Start/End: Original strand, 45245004 - 45245343
Alignment:
Q  96 gaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctc 195  Q
    ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||| || |||||||| |||| |  ||| |||||| |||||||||| ||    
T  45245004 gaaggaatgtgtcatgttttaaggagatgttgtaacattaggcatttaaacttagtttgctgttcaagactggaattacgtggaataaactttgaagttc 45245103  T
Q  196 caaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaa 295  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  45245104 caaaacttgaggtgttgaatttgtcagagacaatggttgatgatgaaacactccatgtgatctcaaagagttgtcgtgggcttttgcaactattattgaa 45245203  T
Q  296 aaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagggttgttttaaagtgcatgct 395  Q
    ||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||   |||||| ||||| | |   || ||| |||||||||||    
T  45245204 aaaatgttatcatgtcacagataagggagtgaaacatgtggtagaaaattgcacacaacttacagagatcaatttgaggcactgctttcaagtgcatgct 45245303  T
Q  396 aattttgttgcctcaatgatattttcaaggccatcattga 435  Q
    ||| || ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  45245304 aatgttattgtctcgatggtattttcaaggccatcgttga 45245343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 355
Target Start/End: Original strand, 1037583 - 1037842
Alignment:
Q  96 gaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctc 195  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||| ||||| | |||| |||||| |||| |||||| ||| ||    
T  1037583 gaaggtatttgtgaagttttaaggagatgttgtaaggttagacatttgaatttagcctactattcaagagtgaaactacttagaataaactttaaagttc 1037682  T
Q  196 caaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaa 295  Q
    |  || | ||||||||  |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  1037683 ctgaattagaggtgtttaacttgtcacatacatgtgttgatgatgaaacactctatatgatctcaaagaattgttgtgggcttttacaactgtttctgga 1037782  T
Q  296 aaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaact 355  Q
    ||||||| |  |  |||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||| ||||    
T  1037783 aaattgtgatgaagtcacagagaatggtgtgaaacatgtagtcgaaaactgcacacaact 1037842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 291
Target Start/End: Original strand, 32785773 - 32785886
Alignment:
Q  178 gaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggct 277  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||| |  ||||||    
T  32785773 gaatgaactttaaagctcccaaactagaggtgttgaacttgtcacatacaagaattgatgatgaagcactttatgtgatctcaataagttttcatgggct 32785872  T
Q  278 tttgcaactgttac 291  Q
    |||| |||||||||    
T  32785873 tttgaaactgttac 32785886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 6395113 - 6394770
Alignment:
Q  27 atcataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaaggtatttgtcaagttttaaagagatgtt 126  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || | |||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6395113 atcataatgtttacttccattttccccaatttacagctacttgatttgacacgttgctcacaaatatctgaaggtatttgtcaagttttaaagaaatgtt 6395014  T
Q  127 gtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatac 226  Q
    ||||  |||  |||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||| || |||  | |||||||||||  |||||||||||||    
T  6395013 gtaagcttaaacatttgaacttagctttctgttcaaaagtgaaactacatggaatgaactttgcagttcccgagctggaggtgttgaacttgtcaaatac 6394914  T
Q  227 aatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtg 326  Q
    ||  |||||||||||||| || | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |   |||  | |||||| |  || ||||||| ||||| |||    
T  6394913 aagcgttgatgatgaaactctttctgtgatctcaaagaattgttgtgggcttttgcaattacaacttgataattgtaaaaatgtcacagaaaagggtgtg 6394814  T
Q  327 aagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaattt 370  Q
     | |||||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||    
T  6394813 gaacatgtggtagaaaactgcacacaattgagagagattaattt 6394770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 96 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6432341 - 6432087
Alignment:
Q  96 gaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctc 195  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||| ||||| || |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6432341 gaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaaacttaaacatttgaacttagcctattgtataaaagtgaagctacatggaatgaactttgaagttc 6432242  T
Q  196 caaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaa 295  Q
    | || ||| |||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| || ||| |    
T  6432241 ccaagctgaaggtgttgaacttgtcaaatacaagcgttgatgatgaaacactttatgtgatcttaaagaattgttgtgggcttctgcaactattcctgta 6432142  T
Q  296 aaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcaca 350  Q
     |||||| |  || ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  6432141 caattgtgataatgtcacacagaagggagtgaaacttgtggtagaaaaatgcaca 6432087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7119394 - 7119083
Alignment:
Q  39 gcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggc 138  Q
    |||||| ||||||||||| | || ||||||||||| | |  |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |    
T  7119394 gcttcctttttccccaatttacaacttcttgatttgaatacttgcaataacatatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttctaagattaaac 7119295  T
Q  139 atttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatga 238  Q
    ||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  | ||   | |||||||||||  |||||||| |||| | |||||||||    
T  7119294 atttgaacttagcccactgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgttgttcaccagctggaggtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatga 7119195  T
Q  239 tgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggta 338  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||  || ||||| | || | |||||| ||||||| |    
T  7119194 tgaaacactccatgtgatctcgaagaattgttgcgggcttttggaactattactgaaagattgttattatgtcacaaaaaaagaagtgaaacatgtggaa 7119095  T
Q  339 gaaaaatgcaca 350  Q
    ||||| ||||||    
T  7119094 gaaaactgcaca 7119083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7131872 - 7131561
Alignment:
Q  39 gcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggc 138  Q
    |||||| ||||||||||| | || ||||||||||| | |  |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |    
T  7131872 gcttcctttttccccaatttacaacttcttgatttgaatacttgcaataacatatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttctaagattaaac 7131773  T
Q  139 atttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatga 238  Q
    ||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  | ||   | |||||||||||  |||||||| |||| | |||||||||    
T  7131772 atttgaacttagcccactgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgttgttcgccagctggaggtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatga 7131673  T
Q  239 tgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggta 338  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||  || ||||| | || | |||||| ||||||| |    
T  7131672 tgaaacactccatgtgatctcgaagaattgttgcgggcttttggaactattactgaaagattgttattatgtcacaaacaaagcagtgaaacatgtggaa 7131573  T
Q  339 gaaaaatgcaca 350  Q
    ||||| ||||||    
T  7131572 gaaaactgcaca 7131561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 90 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 6403046 - 6402753
Alignment:
Q  90 atatccgaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttg 189  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||   ||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  6403046 atatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagtgaagctacttggaataaactttg 6402947  T
Q  190 aagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgtt 289  Q
     || |||  |||| || |||||  |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||| ||    
T  6402946 cagttccccaactagaagtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactatt 6402847  T
Q  290 actgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagggttgtttt 383  Q
    | ||| | |||||||  || ||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| || ||| ||||  |||||||| |||| | || |||||||    
T  6402846 attgagagattgttataatgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagagagatttatttgagggtttgtttt 6402753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 6416215 - 6415880
Alignment:
Q  27 atcataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaaggtatttgtcaagttttaaagagatgtt 126  Q
    ||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||||| |||||||| | || |||  ||    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6416215 atcataatgttttcttccaacttccccaatttgcagctgcttgatttgaatcgttgtaatctcttatctgaaggtatttgtcaagttttaaagatatgtt 6416116  T
Q  127 gtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatac 226  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||| |  |||  |||| ||||||||| ||||||| |||||| || ||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  6416115 gtaagattgggcatttgaacttagccttttgtaaaaaagtgaagctacatggaatggactttgtagttcccaacctggaggtgttgaacttgtcaaatac 6416016  T
Q  227 aatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtg 326  Q
    || |||| ||||| |||| |||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| |||||  ||  |||| |  || |||||||   |||||||    
T  6416015 aaaggttaatgataaaactctctatgtgatctcaaagaattgtagcgggcttttgcaactattacttgaattttgtgataatgtcacagaagtgggagtg 6415916  T
Q  327 aagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagag 362  Q
    || ||||||||||| || |||||| ||||| |||||    
T  6415915 aaacatgtggtagagaactgcacacaactaagagag 6415880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 355
Target Start/End: Original strand, 6585150 - 6585415
Alignment:
Q  90 atatccgaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttg 189  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||   ||||||| | |||||||||||||||| ||||||     
T  6585150 atatctgaaggtatttgtcatgttttaaggagatgttttaatattaggcatttgaactttactgggtgttcaagagtgaagctacttggaataaactttt 6585249  T
Q  190 aagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgtt 289  Q
     || | |  |  ||||||| ||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||| ||    
T  6585250 tagttacccagttggaggtattgaacttgtcagatacaaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagagttgttctgcgcttttggaactatt 6585349  T
Q  290 actgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaact 355  Q
    |||||||  |||| |  || |||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||| ||||    
T  6585350 actgaaaggttgtgaaaatgtcacagagaagggactgaaacatgtggtagaaatttgcacacaact 6585415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6410245 - 6409931
Alignment:
Q  37 ttgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattag 136  Q
    ||||||||||||| |||||| | || || |||||||| ||   |||| |  | ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||     
T  6410245 ttgcttccatttttcccaatttacaactacttgatttgacgggttgccagcaaatatctgaaggtatttgtcaagttttacagaaatgttgtaagcttaa 6410146  T
Q  137 gcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgat 236  Q
    ||||||| | ||||| || ||   |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||  ||| |||||||||||  ||||||    
T  6410145 gcatttggacttagcctattgcaaaaaagtgaagctacatggaatgaactttgaagttcccaagctgaaggtgttgaactagtcaaatacaagcgttgat 6410046  T
Q  237 gatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtgg 336  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||  || | || ||| |  || ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6410045 gatgaaactctttatgtgatctcaaagaattgttgtcggcttttgcaactatttttgtacaactgtgataatgtcacacagaagggagtgaaacatgtgg 6409946  T
Q  337 tagaaaaatgcacaa 351  Q
     | ||||||||||||    
T  6409945 caaaaaaatgcacaa 6409931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 350
Target Start/End: Original strand, 11936194 - 11936448
Alignment:
Q  96 gaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctc 195  Q
    |||||||||  ||| ||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||  |||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||| ||    
T  11936194 gaaggtattgttcatgttttaatgatatgttgtaacattagacatttgaatttaactcgctgttcaagactgaagctacgtacattgaactttgaagttc 11936293  T
Q  196 caaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaa 295  Q
    | |||||||||||||| |||||||||  |||||  ||||| ||| || ||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  11936294 ccaaactggaggtgttggacttgtcatttacaagagttgacgataaatcactctattggatctcaaagagttgtagtgggcttttgcaactgtcacttaa 11936393  T
Q  296 aaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcaca 350  Q
    |  |||| |   | ||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11936394 attttgtgaaggtgtcacagacaaaggagtgacgcatgtggttgaaaaatgcaca 11936448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 350
Target Start/End: Original strand, 11948174 - 11948428
Alignment:
Q  96 gaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctc 195  Q
    |||||||||  ||| ||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||  |||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||| ||    
T  11948174 gaaggtattgttcatgttttaatgatatgttgtaacattagacatttgaatttaactcgctgttcaagactgaagctacgtacattgaactttgaagttc 11948273  T
Q  196 caaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaa 295  Q
    | |||||||||||||| |||||||||  |||||  ||||| ||| || ||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  11948274 ccaaactggaggtgttggacttgtcatttacaagagttgacgataaatcactctattggatctcaaagagttgtagtgggcttttgcaactgtcacttaa 11948373  T
Q  296 aaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcaca 350  Q
    |  |||| |   | ||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11948374 attttgtgaaggtgtcacagacaaaggagtgacgcatgtggttgaaaaatgcaca 11948428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6426780 - 6426431
Alignment:
Q  7 catggttaagagaggagagcatcataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaaggtatttg 106  Q
    |||||||||| || || | ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |    ||||  ||| ||||| |||||||||||    
T  6426780 catggttaagtgatgaaatcatcataatgtatgcttccattttccccaatttacagctacttgatttgaaggtttgccgtgaaatatctgaaggtatttg 6426681  T
Q  107 tcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggag 206  Q
    | ||||||||| || |||||||||  |||  |||||||| ||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||||||| || |||  | ||||||    
T  6426680 tgaagttttaaggaaatgttgtaagcttaaacatttgaacttagctttctgttcaaacgtgaaactacatggaatgaactttgcagttcccgagctggag 6426581  T
Q  207 gtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttacc 306  Q
    |||||  | |||||||| ||||   |||||||||||||  | |||| |||||| |||| ||||||| || |||||||| | |||||  |||||||| |      
T  6426580 gtgttgaatttgtcaaacacaagcattgatgatgaaactttttatgcgatctcaaagaattgttgtcggattttgcaattattacttgaaaattgtaaag 6426481  T
Q  307 atttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaacta 356  Q
     | |||||  |||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||    
T  6426480 gtgtcacaatgaagggtgtgaaacaagtggtagaaaactgcacacaacta 6426431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 90 - 350
Target Start/End: Original strand, 6594519 - 6594779
Alignment:
Q  90 atatccgaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttg 189  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||||| | ||| |    ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||     
T  6594519 atatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttataagattacacatttgtacttatccgggtgttcaagagtgaagctacatggaataaactttt 6594618  T
Q  190 aagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgtt 289  Q
     || ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| |||||   ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||       
T  6594619 tagttcccaaactggaggtgttgtacttgtcaaatacagaggttgatgatgagacactacgtgtgatctcaaagaattgttgtgggcttttacaactaaa 6594718  T
Q  290 actgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcaca 350  Q
    |||  |||||||| | ||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  6594719 actagaaaattgtgatcatctcacagaggagggagccaaacatgtggtagaaaactgcaca 6594779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 349
Target Start/End: Original strand, 7994031 - 7994354
Alignment:
Q  26 catcataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaaggtatttgtcaagttttaaagagatgt 125  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||| | || ||||| | |  |||| |||  ||||| |||||||||||| | ||||||| || ||||    
T  7994031 catcatattgtttgctaccattttcccaaatttgcagatgctcgatttgaattcttgcaatggtatatctgaaggtatttgttacgttttaaggaaatgt 7994130  T
Q  126 tgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaata 225  Q
    ||||| || |||||||||||  ||||  | ||| ||| | |||||||||| ||||||||||||| || ||| || || ||||||||  || |||||||||    
T  7994131 tgtaagatcaggcatttgaacatagccgattgtacaagagtgaagctactaggaatgaactttgtagttccgaagctagaggtgttgaacatgtcaaata 7994230  T
Q  226 caatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagt 325  Q
    ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||  ||  |||| |  || | || ||| |||||||    
T  7994231 caagggttaatgacgaaacactatatgtgatctcaaagaattgttctggacttttgcaactattacttgaactttgtaatgatgttaccgaggagggagt 7994330  T
Q  326 gaagcatgtggtagaaaaatgcac 349  Q
    ||| |||||||||||||| |||||    
T  7994331 gaaacatgtggtagaaaactgcac 7994354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 101 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19632611 - 19632367
Alignment:
Q  101 tatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaa 200  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||| || | ||||||||| ||| ||   ||||||| | | || ||||||||||| ||||||  || ||| ||     
T  19632611 tatttgtcaagttttaa---gatgttgtaagataacgcatttgaacttaactcgatgttcaatagttaacctacttggaataaactttctagttcccaag 19632515  T
Q  201 ctggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaatt 300  Q
    || |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||   ||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19632514 ctagaggtgttggacttgtcgtatacaaaggttgatgatgagcaactttttgtgatctcaaagaattgttgtgggcttttgcaactcttactgaaaaatt 19632415  T
Q  301 gttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgca 348  Q
    ||    || ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  19632414 gtgctaatatcacagagaagggagtgaaacacgtggtagaaaactgca 19632367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14820879 - 14820599
Alignment:
Q  90 atatccgaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttg 189  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||  |||  |||||||| ||||  |  ||||||  | |||| |||| |||||| |||||||    
T  14820879 atatctgaaggtatttgtcaaggtttaaggaaatgttgtaagcttaaacatttgaacttagaattttgttcaggagtgaaactacatggaattaactttg 14820780  T
Q  190 aagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgtt 289  Q
     || ||| ||  | ||||||||  |||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||    
T  14820779 cagttcccaagttagaggtgttgaacttatcaaatacaaaggttgataatgaaacactttatatgatctccaagaattgttgtgggcttttgcgattatt 14820680  T
Q  290 actgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaattt 370  Q
    |||  |||| ||| |  || ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||| | ||  |||||||||||||    
T  14820679 acttgaaaaatgtaatgatgtcacagagaagggtgtgaaacatgtggtaaaaaactgcacacagctgagagagattaattt 14820599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 350
Target Start/End: Original strand, 6589173 - 6589496
Alignment:
Q  27 atcataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaaggtatttgtcaagttttaaagagatgtt 126  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  || | |||||||| | |  |||  || | |||||  |||||||||||||||| || |  |||||||    
T  6589173 atcataatgtttgcttccattttccccaatttagaggtgcttgatttcaattcttgtaataacatatctaaaggtatttgtcaagtattgagaagatgtt 6589272  T
Q  127 gtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatac 226  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| | ||||   ||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |  |||||||||||  |||||||||||||    
T  6589273 gtaagattaggcatttgaacttagccttctgtaagaaagtgaagctacttggaatgaactttgtagttcccatgctggaggtgttgaacttgtcaaatac 6589372  T
Q  227 aatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtg 326  Q
    ||  ||| ||||| ||||||| ||| ||||||| || | ||||   |||||| ||||| | | |||  ||  |||| |  || |||| ||| ||||||||    
T  6589373 aaatgttaatgataaaacactatatctgatctcaaaaaattgtatagggcttatgcaattatcacttcaactttgtaattatgtcacggaggagggagtg 6589472  T
Q  327 aagcatgtggtagaaaaatgcaca 350  Q
    || |||||||||||||| ||||||    
T  6589473 aaacatgtggtagaaaactgcaca 6589496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 10579589 - 10579925
Alignment:
Q  30 ataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgta 129  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| | |  |||| |  | ||||| |||||||||| |||||||| |   |||||| |||    
T  10579589 ataatgttagcttcctttttccccaatttgcagctgcttgatttgaatacttgcgaatacatatctgaaggtatttttcaagtttcaggaagatgtggta 10579688  T
Q  130 aaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaat 229  Q
    | |||| ||||||||| |||||  | ||| ||| | |||||| |||| |||| ||  ||| |  |||  | |||||||||||  |||||||| ||||||     
T  10579689 agattaagcatttgaacttagccaaatgtccaagagtgaagcgacttagaataaagattgtaattccccagctggaggtgttgaacttgtcatatacaaa 10579788  T
Q  230 ggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaact-gttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaa 328  Q
     ||||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| |     ||||| |||||||||| ||    
T  10579789 agttgatgataaaacactctattcgatctcaaagaattgttgtcggcttttggaactatttactgaaaaactgtaaaagggtcacaaagaagggagttaa 10579888  T
Q  329 gcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagatt 365  Q
     |||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||    
T  10579889 acatgtggtagaaaactgcacacaacttagagagatt 10579925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 205 - 348
Target Start/End: Original strand, 6603230 - 6603373
Alignment:
Q  205 aggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgtta 304  Q
    ||||||| |||||| || |||||   ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||  |||||||||| |||| ||| ||||| |||||||    
T  6603230 aggtgttggacttggcagatacaggtgttgatgatgaaacagtctatgcgatctcaaagagttgtcctgggcttttggaactattattgaaatattgtta 6603329  T
Q  305 ccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgca 348  Q
      || |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6603330 ttatgtcacagagaaaggagtgaaacatgtggtagaaaactgca 6603373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6423484 - 6423201
Alignment:
Q  9 tggttaagagaggagagcatcataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaaggtatttgtc 108  Q
    |||||||| || || | |||||||||| |||||||||||||||| ||| |  | || |||||||| |    |||| || | ||||  || ||||||||||    
T  6423484 tggttaagtgatgaaatcatcataatgtttgcttccattttccctaatttaaaactacttgatttgaagggttgccatcaaatatttgatggtatttgtc 6423385  T
Q  109 aagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggt 208  Q
    | ||||||  || |||| || |  |||  |||||||| ||||| || |||  | || ||||||||| || |||||||||| ||| ||| || ||||||||    
T  6423384 atgttttacggaaatgtcgtgagcttaaacatttgaacttagcctattgtgaacaagtgaagctacgtgcaatgaacttttaagttcccaagctggaggt 6423285  T
Q  209 gttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttact 292  Q
    |||  |||||||||||||||  |||   ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  6423284 gttgaacttgtcaaatacaagagttagcgataaaacactctatgcgatctcaaagagttgttgtgggattttgcaactattact 6423201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 204 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14818454 - 14818308
Alignment:
Q  204 gaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgtt 303  Q
    ||||||||  |||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||| | | |||||  ||||||||     
T  14818454 gaggtgttgaacttatcaaatacaaaggttgataatgaaacactttatatgatctccaagaattgttctgggcttttgcgattattacttgaaaattgta 14818355  T
Q  304 accatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcaca 350  Q
    |  || ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  14818354 ataatgtcacagagaagggtgtgaaacatgtagtagaaaactgcaca 14818308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 277
Target Start/End: Original strand, 6596847 - 6597028
Alignment:
Q  96 gaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctc 195  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||  ||| |||| ||||||||| | |||  | |||||||   |||||| ||||| ||| |||||||||  ||    
T  6596847 gaaggtatttgtcaagttttcaggagatgtgataagattaagcatttgaactgagccgaatgttcaagtgtgaagcgacttgaaataaactttgaaattc 6596946  T
Q  196 caaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggct 277  Q
    |  | |||||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |  ||||| |||| ||||| ||||||    
T  6596947 cccagctggaggtgttgaacttgtcaagtacaaatgttgatgatgaaacactctacgctatctcaaagaattgttctgggct 6597028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 14802439 - 14802331
Alignment:
Q  173 acttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgt 272  Q
    ||||||||  |||||||||| ||| ||  |||| |||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  14802439 acttggaactaactttgaagttcccaagatggaagtgttgaatttgtcaaatacaaaggttgatgatgaaacactctatgtgatttcaaagaattgttgt 14802340  T
Q  273 gggcttttg 281  Q
    || ||||||    
T  14802339 ggtcttttg 14802331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 9411455 - 9411166
Alignment:
Q  176 tggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtggg 275  Q
    |||| |||||||||| | ||| || |||||||||||  |||||||| |||||   |||   ||||||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||     
T  9411455 tggattgaactttgaggttcccaagctggaggtgttgaacttgtcatatacaggtgttttcgatgaaatactctatgagatctcaaagaattgtcgtgga 9411356  T
Q  276 cttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagg 375  Q
    |||||||||||||||||| ||   ||| |  || ||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||    ||||   |||||| |||||   |     
T  9411355 cttttgcaactgttactgcaatgctgtcataatgtcagagataagggagtgatgcatgtggtaggaaattgcctgcaactcaaagagatcaatttgcggc 9411256  T
Q  376 gttgttttaaagtgcatgctaattttgttgcctcaatgatattttcaaggccatcattgagagaaataacagctccacctggttttgatt 465  Q
    |||||  |  ||||||||||||| |||||| |   ||| ||||||||||||| ||||||||  | |||| | ||||||||||||||||||    
T  9411255 gttgtcatcgagtgcatgctaatattgttgacgatatggtattttcaaggccgtcattgagcaagataaaaactccacctggttttgatt 9411166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 28935004 - 28934888
Alignment:
Q  321 ggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagggttgttttaaagtgcatgctaattttgttgcctcaatgatatttt 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||  | | |||| ||||||||||| ||||||| || |||||| |  ||||      
T  28935004 ggagtgaagcatgtggtagaaaattgcacacaactaagagagatctatttggatgattgtgttaaagtgcatcctaatttggtagcctcactagtattac 28934905  T
Q  421 caaggccatcattgaga 437  Q
    ||||| |||||||||||    
T  28934904 caaggtcatcattgaga 28934888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 145
Target Start/End: Original strand, 8913834 - 8913952
Alignment:
Q  26 catcataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaaggtatttgtcaagttttaaagagatgt 125  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||  | |||||||||| | ||||  || | |||||  |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  8913834 catcataatgtttgcttccattttttccaatttgcatatgcttgatttaatt-attgagattatatatctaaaggtatttgtcaagttttaagaagatgt 8913932  T
Q  126 tgtaaaattaggcatttgaa 145  Q
    ||||| ||||  ||||||||    
T  8913933 tgtaagattaaacatttgaa 8913952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 6432436 - 6432364
Alignment:
Q  1 acaatccatggttaagagaggagagcatcataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgattt 73  Q
    ||||| ||||||||||  | || || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  6432436 acaattcatggttaaggaatgaaaggatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcaacatcttgattt 6432364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 7)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 10614832 - 10614577
Alignment:
Q  37 ttgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattag 136  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| | || |||| ||    |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  10614832 ttgcttccaatttccccaatttgcaactgcttgatttgaatcgttgcaatctcttatatgaaggtatttgtcaagttttaaggatatgttgtaagattag 10614733  T
Q  137 gcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgat 236  Q
    ||||||||| ||||| || |||  |||| |||||||||||||||||||| |||  | ||| || |||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||    
T  10614732 gcatttgaacttagcctattgtaaaaaagtgaagctacttggaatgaacgttgttgttcccaatctggaggtgttgaacttgtcaaatacgaaggttaat 10614633  T
Q  237 gatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttact 292  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||    
T  10614632 gataaaacactctatgtgatctcgaagaactgtagtgggcttttgcaactattact 10614577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 15092011 - 15092344
Alignment:
Q  37 ttgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattag 136  Q
    |||||||||||||||||||  |  |||| ||||||||   |||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||  |||     
T  15092011 ttgcttccattttccccaacttagagctacttgatttgggtcattgctataacatatctcaaggtatttctcaagttttaaggaaatgttataagcttaa 15092110  T
Q  137 gcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgat 236  Q
     |||||||| ||| ||   |||| ||   |||| |||| |||||||||||||| || |||  | |||||||||||  | |||||| | |||| |||| ||    
T  15092111 acatttgaacttaactggatgtttaagtgtgaaactacatggaatgaactttgcagttcccgagctggaggtgttgaatttgtcagaaacaaaggttaat 15092210  T
Q  237 gatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtgg 336  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||  ||||||  || |||||||   ||||||||| ||||||     
T  15092211 gataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgtgggcttttgcaactattacttgaattttgttataatgtcacagaagtgggagtgaaacatgtgc 15092310  T
Q  337 tagaaaaatgcacaaaactaggagagattaattt 370  Q
    ||||||| |||||| || |  |||||||||||||    
T  15092311 tagaaaactgcacacaattgagagagattaattt 15092344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Original strand, 10169979 - 10170140
Alignment:
Q  26 catcataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgattt-aactcattgctatgagatatccgaaggtatttgtcaagttttaaagagatg 124  Q
    |||||||||| || |||||||||| || ||| || ||||  ||||||| ||||| |||| || | ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  10169979 catcataatgttttcttccatttttcctaatttgaagctgtttgatttgaactc-ttgcaatcacatatcggaaggcatttgtcaagttttaaggaggtg 10170077  T
Q  125 ttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactt 187  Q
    || ||| ||||||||||| || |||||  ||||||||| | |||| ||||||| | |||||||    
T  10170078 ttctaatattaggcatttaaatttagcccactgttcaagagtgaatctacttgaagtgaactt 10170140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Original strand, 10177504 - 10177665
Alignment:
Q  26 catcataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgattt-aactcattgctatgagatatccgaaggtatttgtcaagttttaaagagatg 124  Q
    |||||||||| || |||||||||| || ||| || ||||  ||||||| ||||| |||| || | ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  10177504 catcataatgttttcttccatttttcctaatttgaagctgtttgatttgaactc-ttgcaatcacatatcggaaggcatttgtcaagttttaaggaggtg 10177602  T
Q  125 ttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactt 187  Q
    || ||| ||||||||||| || |||||  ||||||||| | |||| ||||||| | |||||||    
T  10177603 ttctaatattaggcatttaaatttagcccactgttcaagagtgaatctacttgaagtgaactt 10177665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 335
Target Start/End: Original strand, 10170145 - 10170239
Alignment:
Q  241 aaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtg 335  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| |||| ||  |||| |||||| |  || |||||||||| |||||||| ||||||    
T  10170145 aaacactctatgtgatctcaaagtattgttgtggacttttgaaactatttgtgaacaattgtaatgatgtcacagagaaaggagtgaaacatgtg 10170239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 335
Target Start/End: Original strand, 10177670 - 10177764
Alignment:
Q  241 aaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtg 335  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| |||| ||  |||| |||||| |  || |||||||||| |||||||| ||||||    
T  10177670 aaacactctatgtgatctcaaagtattgttgtggacttttgaaactatttgtgaacaattgtaatgatgtcacagagaaaggagtgaaacatgtg 10177764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7977758 - 7977603
Alignment:
Q  96 gaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctc 195  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||  |||| |  |||||||   |||| |||| ||||||||| || || | |     
T  7977758 gaaggtattggtcaagttttaaggagatgttgtaacattagacatttaaacctagcctgttgttcaagggtgaatctacgtggaatgaaattcgacgttt 7977659  T
Q  196 caaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctat 251  Q
      ||||| ||||  ||  |||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  7977658 gcaaactcgaggctttgaacttgtcacatacaacagttgatgataaaacactctat 7977603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 281
Target Start/End: Original strand, 19468329 - 19468603
Alignment:
Q  7 catggttaagagaggagagcatcataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgattt-aactcattgctatgagatatccgaaggtattt 105  Q
    |||||||||| || || | |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||| || |  | ||||| ||||| ||||    
T  19468329 catggttaagcgatgaaaacatcataatgtttgcttccatttttcccaatttgcagctgcttgatttgaactcat-gcaaccacatatcggaaggcattt 19468427  T
Q  106 gtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactgga 205  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||  ||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| || ||| || |||||    
T  19468428 gtcaagttttaaggaggtgttctaatattaggcatttaaacttagcccactgttcaagagtgaatctacttggagtgaactttgtagttcccaagctgga 19468527  T
Q  206 ggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttg 281  Q
    ||||||  | |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  19468528 ggtgttgaagttgtcagatacaaaggttgatgatgaaacactttatgtgatctcaaagaactgttgtggacttttg 19468603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 214 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 7554550 - 7554415
Alignment:
Q  214 acttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcac 313  Q
    |||| ||| ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||   ||| |  || ||||    
T  7554550 acttatcatatacaagtgttgatgatgaagcactctatatgatctcaaagagttgtggtggacttttacaactgttactgaaaggatgtgataatgtcac 7554451  T
Q  314 agagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcac 349  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7554450 agaaaagggagtgaagcatgtggtagaaaactgcac 7554415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9586913 - 9586565
Alignment:
Q  2 caatccatggttaagagaggagagcatcataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaa--- 98  Q
    ||||| ||||||||||||  | | |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |    ||||||| | | |||||  ||       
T  9586913 caatcaatggttaagagataaaaacatcataatgtttgcttcaattttccccaatttgcagctgcttgatctgtgccattgctgtaacatatctaaaaga 9586814  T
Q  99 ggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaa 198  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||||||  || |||   ||||     | || ||||||| ||| || |||||||  || |    
T  9586813 ggtatttgtcaagttttacaaagatgttgtcagattagacatttgaacatatctt---gttctcctgtaaacctacttgaaattaattttgaagtcccca 9586717  T
Q  199 aactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaa 298  Q
    | || ||||||||  |||||||| |||||   ||| ||||||||||||| ||||||| ||| | || |||| |||| |||||||| || |||| ||||||    
T  9586716 agctagaggtgttgaacttgtcatatacagatgttaatgatgaaacactttatgtgacctcaatgaattgtcgtggacttttgcatcttttacagaaaaa 9586617  T
Q  299 ttgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcaca 350  Q
    |||||| ||| |||||   || ||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  9586616 ttgttatcatgtcacaagcaatggattgaagcgtgtggtagaaaattgcaca 9586565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 9581346 - 9580908
Alignment:
Q  1 acaatccatggttaagagaggagagcatcataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaa-- 98  Q
    |||||| ||| ||||||||  | | |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |    ||||||| | | |||||  ||      
T  9581346 acaatcaatgtttaagagataaaaacatcataatgtttgcttcaattttccccaatttgcagctgcttgatctgcgccattgctgtaacatatctaaaag 9581247  T
Q  99 -ggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctcca 197  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||  || ||   |||||     | || ||||||| ||| || ||||||   ||     
T  9581246 aggtatttgtcaagttttaaaaagatgttgtcagattagacatttgaacatatct---tgttctcctgtaaaactacttgaaattaattttgaactcccc 9581150  T
Q  198 aaactggaggtgttagacttgtcaaatac--aatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaa 295  Q
    || || ||||||||  ||||||||  |||  ||  ||| |||||||||| || ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||   || ||||||||    
T  9581149 aagctagaggtgttgaacttgtcatgtacaaaaaagttaatgatgaaacgctttatgtgatctcaaagaattgtcgtggacttttgtgccttttactgaa 9581050  T
Q  296 aaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagggttgttttaaagtgcatgct 395  Q
    | || ||||   | ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||  |    
T  9581049 agatagttatggtgtcacaaacaatggagtgaagcgtgtggtagaaaattgcacacaactggaagagattgatttgaggggttgttataaagtgcatcgt 9580950  T
Q  396 aattttgttgcctcaatgatattttcaaggccatcattgaga 437  Q
    | | | ||| | |||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  9580949 agtgtggtttcgtcaatggtatcttcaaggccatcgttgaga 9580908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 52082701 - 52082582
Alignment:
Q  156 tgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtga 255  Q
    ||||||| |||||| ||||||  |||||||||| ||| | | ||| ||||||||||  |||||||||| ||||   |||||||||||||| | |||||||    
T  52082701 tgttcaacactgaatctactttcaatgaactttcaagtttccaaattggaggtgttgaacttgtcaaagacaaaaattgatgatgaaacattgtatgtga 52082602  T
Q  256 tctcgaagagttgttgtggg 275  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  52082601 tctcaaagagttgttgtggg 52082582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 52092960 - 52092776
Alignment:
Q  90 atatccgaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttg 189  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||  |||||||| ||    |  || |||| | |||| ||||||  ||||||||||     
T  52092960 atatccgaaggtattgttgaagttttaa---gatgttgtaaaattactcatttgaacttgagatcttggtcaacattgaatctactttcaatgaactttc 52092864  T
Q  190 aagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggct 277  Q
    ||| | | ||| ||||||||||  ||||| |||| ||||   |||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  52092863 aagtttccaaattggaggtgttgaacttggcaaagacaaaaattgatgatgacacattgtatgtgatctcaaagagtttttgtgggct 52092776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 337
Target Start/End: Original strand, 29718960 - 29719083
Alignment:
Q  214 acttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcac 313  Q
    |||||||| |||| |  ||||||||| || ||||| || | || || | |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||    || ||||    
T  29718960 acttgtcatataccaacgttgatgataaatcactccatatcatatcaacgagttgttgtggccttttgcaattgttactggaaagttgtatgaatgtcac 29719059  T
Q  314 agagaagggagtgaagcatgtggt 337  Q
    |||||| |||||||| ||||||||    
T  29719060 agagaatggagtgaaacatgtggt 29719083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 407 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 43634066 - 43634012
Alignment:
Q  407 ctcaatgatattttcaaggccatcattgagagaaataacagctccacctggtttt 461  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||| |||||    
T  43634066 ctcaatggtattttcaaggccatcattgagaaagataatagcgccacctcgtttt 43634012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 179 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 27922605 - 27922333
Alignment:
Q  179 aatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggctt 278  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||||  |||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27922605 aatgaactttgaagttcccaaattggaggtgttgaacttgtcatatacaaatgttgatgatgaagcactttatatgatctcaaagagttgttgtgggctt 27922506  T
Q  279 ttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagggtt 378  Q
    ||| || ||| |||  |||||||| |  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||  || |||||| |||  | ||||    
T  27922505 ttgaaattgtcacttgaaaattgtaatgatttcacaaagaagggagtgaaccatgtggtagaaaactgcactcaactgagaaagattagtttggatggtt 27922406  T
Q  379 gttttaaagtgcatgctaattttgttgcctcaatgatattttcaaggccatcattgagagaaataacagctcc 451  Q
    ||  |||||| ||||||||| ||||| | || ||| ||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  27922405 gtcataaagtacatgctaatattgtttcttcgatggtatcttcaaggccatcgttgagacagataacagctcc 27922333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 166 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 32151411 - 32151112
Alignment:
Q  166 tgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagag 265  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||| | | || |||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32151411 tgaagctgcgtggaatgaacttcgaagtttccaatctggaggtgttaaacttgtcatgtacaaggtttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagag 32151312  T
Q  266 ttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagatt 365  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||     |||| |  || ||||||||||||| ||||||||||||    |||| || | | ||||  | |||||     
T  32151311 ttgtagtgggcttttgcaactgttattggtgtcttgtaaatatgtcacagagaagggggtgaagcatgtgaggaaaaactgtatacaactgagggagatc 32151212  T
Q  366 aatttaaagggttgttttaaagtgcatgctaattttgttgcctcaatgatattttcaaggccatcattgagagaaataacagctccacctggttttgatt 465  Q
    ||||||| |||||||  | ||||||||||| || ||||||    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  32151211 aatttaaggggttgtgatcaagtgcatgctgatattgttgataaaatggtattttcaaggccatcattgagaaagataactgctccacctcgttatgatt 32151112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 355
Target Start/End: Original strand, 18315095 - 18315451
Alignment:
Q  2 caatccatggttaagagaggagagcatcataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaag-- 99  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||  || ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |   | ||| || | ||| | ||||      
T  18315095 caattcatggttaagagaggaaagcatcaaaatattttcttccattttccccaatttgcagttgcttgatttgagctactgcgataacatacctgaagaa 18315194  T
Q  100 -gtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaa 198  Q
     |||||||||||||||||   || |||| | | ||||| || ||||| ||||||     ||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |    
T  18315195 ggtatttgtcaagttttacgaagttgttctgagattagacagttgaacttagctcgtgattcaagaatgaagctacgtggaatgaactttaaagttccca 18315294  T
Q  199 aactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaa 298  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| || ||      
T  18315295 aactggaggtgttgaacttgtcacatacaaaagttgatgatgaagcactctatgtgatctcaaagagttgtcgtaggcttttgcaactgttattggaacg 18315394  T
Q  299 ttgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaact 355  Q
     ||||   || |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  18315395 ctgttgtgatgtcacagagaaaggagaaaagtatgtggtagaaaactgcacacaact 18315451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 350
Target Start/End: Original strand, 34936083 - 34936336
Alignment:
Q  97 aaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctcc 196  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| | ||||| |||||| | || ||  | ||||||||| |||| || |   |||||| |||||| | |||    
T  34936083 aaggtatttatcatgttttaaggagatgttgtgacattagacatttgtacttggccgattgttcaaaagtgaaccttcacagaatgatctttgatgttcc 34936182  T
Q  197 aaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaa 296  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||    
T  34936183 aaaactagaggtgttggacttgtcatatacaagagttgatgataaaacactctatgccatcgcaaagagttgtcgtgggcttttgcaactattacttcaa 34936282  T
Q  297 aattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcaca 350  Q
    |||||||   || |||| |||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||    
T  34936283 aattgttgtgatgtcacggagaagggagttgagcgtgtggttgaaaattgcaca 34936336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 355
Target Start/End: Original strand, 28246214 - 28246471
Alignment:
Q  96 gaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctc 195  Q
    |||||||||  ||| ||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||   ||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||| ||    
T  28246214 gaaggtattgttcatgttttaatgatatgttgtaacattagacatttgaatttaactcgttgttcaagactgaagctacatacattgaactttgaagttc 28246313  T
Q  196 caaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaa 295  Q
    | |||||||||||||| |||||||||  |||||  |||||  || || ||||||||  |||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||    
T  28246314 ccaaactggaggtgttggacttgtcatttacaagagttga--ataaatcactctattggatctcaaagagttgtagcgggcttttgcaactgtcacttaa 28246411  T
Q  296 aaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaact 355  Q
    |  |||| |   | ||||||| ||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28246412 attttgtgaaggtgtcacagacaaatgagtgacgcatgtggttgaaaaatgcacacaact 28246471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21235709 - 21235542
Alignment:
Q  125 ttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaat 224  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||   |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| ||    
T  21235709 ttgtaaacttaggcatttgaacttagctcactgctcaaaagtgaaactgtgtggagtgaactttgaagttcccaaactggaggtgttgaacttgtcatat 21235610  T
Q  225 acaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttact 292  Q
    |||   |||||| | |||  ||||||| |||| || ||||| ||| |  |||||||||||||||||||    
T  21235609 acaggagttgataacgaagaactctatttgatttcaaagagctgtcgcaggcttttgcaactgttact 21235542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 17636218 - 17636573
Alignment:
Q  1 acaatccatggttaagagaggagagcatcataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccga--- 97  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||| |||||| | | | | |||||||||||||| ||||||| |||||||||    ||||| || | ||||| ||       
T  17636218 acaattcatggttaagagatgaaagcctcataaagctcgataccattttccccaatttgcagctgcttgatttacgagattgcaataaaatatcagagaa 17636317  T
Q  98 aggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctac----ttggaatgaactttgaagc 193  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||| ||||     ||||||| | |||| ||||     | |||||||||||||||     
T  17636318 aggtatttgtcaagttttaaggggatgttctaatattaggcatttgaacttaggccgatgttcaagagtgaaactacatcgatcgaatgaactttgaagt 17636417  T
Q  194 tccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactg 293  Q
    ||| ||| ||||||||||  |||||||| | |||   ||||| |||||| || | ||||||||||| |||||||||  | | ||||||||| ||| |||     
T  17636418 tcccaaattggaggtgttgaacttgtcacaaacaggagttgacgatgaagcattgtatgtgatctcaaagagttgtcttagacttttgcaattgtcactt 17636517  T
Q  294 aaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcaca 350  Q
     || |||||    || |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  17636518 gaatattgtgttaatgtcac-gagaaaggagtgaggcatgtgctagaaaattgcaca 17636573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 44736570 - 44736447
Alignment:
Q  241 aaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtaga 340  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || |||||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  44736570 aaacactcattgtgatctcaaagagttgttgtgggcttttgtaactggtattgagctattgttataatgtcacaacgaagggagtgaaacatgttgtaga 44736471  T
Q  341 aaaatgcacaaaactaggagagat 364  Q
    ||| || ||| ||||| |||||||    
T  44736470 aaattgtacacaactaagagagat 44736447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 459
Target Start/End: Original strand, 17628039 - 17628296
Alignment:
Q  202 tggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattg 301  Q
    ||||||||||  |||||||| |||| |  ||||||||| || |||||  ||||||||| |||| ||||| |||||| ||| |||| |||||  ||  |||    
T  17628039 tggaggtgttgaacttgtcacatactagagttgatgataaagcactccgtgtgatctcaaagaattgttttgggctcttgaaactattactagaattttg 17628138  T
Q  302 ttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagggttgttttaaagtgcatgctaatttt 401  Q
    | |   | ||||||| |||||||||||||||||| |  |||| |||||| | ||  | ||||| | ||||| |||||||| | ||||| | |||||| ||    
T  17628139 taaaggtgtcacagacaagggagtgaagcatgtgttgaaaaactgcacacagctgagggagatcagtttaaggggttgttatgaagtgaaagctaatatt 17628238  T
Q  402 gttgcctcaatgatattttcaaggccatcattgagagaaataacagctccacctggtt 459  Q
    |||| |   ||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||  || ||||||||||    
T  17628239 gttgacatgatggtatttgcaaggccaacattgagaaagataattgccccacctggtt 17628296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 437
Target Start/End: Original strand, 5767788 - 5767915
Alignment:
Q  310 tcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagggttgttttaaagtgcatgctaattttgttgcctc 409  Q
    ||||||| |||||||| | ||| |||||| | || |||||| ||||  ||||||| |||||  | || |||  ||| ||||| |||||  ||||||||||    
T  5767788 tcacagacaagggagtcatgcacgtggtaaacaactgcacacaactcagagagataaatttggatggctgtcctaatgtgcaagctaaagttgttgcctc 5767887  T
Q  410 aatgatattttcaaggccatcattgaga 437  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||    
T  5767888 catggtagtttcaaggccatcattgaga 5767915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 75
Target Start/End: Original strand, 17627905 - 17627954
Alignment:
Q  26 catcataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaa 75  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  17627905 catcaaaatgtttgcttccattttccccaatttgcaactgcttgatttaa 17627954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0295 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0295
Description:

Target: scaffold0295; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 355
Target Start/End: Original strand, 543 - 802
Alignment:
Q  96 gaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctc 195  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||   ||| |||||||| ||||| |||||||||| | |||| |||||| |||| |||||| ||| ||    
T  543 gaaggtatttgtgaagttctaaggagatgttgtaaggctagacatttgaatttagcctactgttcaagagtgaaactacttagaataaactttaaagttc 642  T
Q  196 caaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaa 295  Q
    |  || | ||||||||  |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |    
T  643 ctgaattagaggtgtttaacttgtcacatacaagtgtcgatgatgaaacactctatatgatctcgaagaattgttgtgggctattacaactgttactgga 742  T
Q  296 aaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaact 355  Q
    ||||||| |  |  ||| |||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||    
T  743 aaattgtgatgaagtcatagagaatggtgtgaaacatgtagtagaaaactgcacacaact 802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 9)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 96 - 340
Target Start/End: Original strand, 41889473 - 41889717
Alignment:
Q  96 gaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctc 195  Q
    |||||||||  ||||||||||| || ||||||||| |||||  ||||||| ||| |    ||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  41889473 gaaggtattactcaagttttaaggatatgttgtaacattagatatttgaacttatccggatgttcaatagtgaagctacttgaaatgaactttaaagttc 41889572  T
Q  196 caaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaa 295  Q
    | ||| ||||||||||  |||| ||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||||| ||    
T  41889573 ccaaattggaggtgttgaacttatcatatacaaaagttgatgatgaaacactttataagatctcaaagagttgttgcgggctttcgaaattgttacttaa 41889672  T
Q  296 aaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtaga 340  Q
    |||||||||  || ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  41889673 aaattgttatgatgtcacaaagaagggagtgaatcatgtggtaga 41889717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 107 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 32267641 - 32267300
Alignment:
Q  107 tcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaactggag 206  Q
    |||| |||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||| |  | ||||||| | |||| |||   | |||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  32267641 tcaatttttaaggatatgttgtaacattagacatttgaacttatcccagtgttcaacagtgaaacta---gaaatgaactttgaagttcccaaattggag 32267545  T
Q  207 gtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttacc 306  Q
    || ||  |||||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||| |      
T  32267544 gtattgaacttgtcacaaacaatagttgatgatgaagcactttatatgatctcaaagagttgttgtgggcttttgaaattgtcacttaaaaattgtaatg 32267445  T
Q  307 atttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagggttgttttaaagtgcatgctaattttgttgc 406  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||  || ||||||||||  | ||||||   || || |||||| |||||||| |    
T  32267444 atatcacaaagaagggagtgaagcatgtagtagaaaactgcacgcaacttagaaagattaatttctatggttgtcagaaggtccatgctgattttgtttc 32267345  T
Q  407 ctcaatgatattttcaaggccatcattgagagaaataacagctcc 451  Q
     || ||| ||| ||||||||| || |||||| | ||||| |||||    
T  32267344 ttcgatggtatcttcaaggccgtcgttgagaaagataacggctcc 32267300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 184 - 437
Target Start/End: Original strand, 41901542 - 41901795
Alignment:
Q  184 actttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgca 283  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  41901542 actttgaagttcccaaactggaggtgttgaacttgtcatatacaaaagttgatgatgaagcactttatatgatctcaaagagttgttgtggacttttgaa 41901641  T
Q  284 actgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatttaaagggttgtttt 383  Q
    | ||| |||  || ||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||  || |  || |||||| ||| || |||||||||    
T  41901642 attgtcacttcaagattgtaatgatgtcacaaagaagggagtgaagcatgtggtagaaaactgtacgcaattgagaaagattagtttgaatggttgtttt 41901741  T
Q  384 aaagtgcatgctaattttgttgcctcaatgatattttcaaggccatcattgaga 437  Q
    ||||| ||||||||| ||||| | |  ||| |||||||||| || || ||||||    
T  41901742 aaagtacatgctaatgttgtttctttgatggtattttcaagaccgtcgttgaga 41901795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 90 - 355
Target Start/End: Original strand, 20477995 - 20478260
Alignment:
Q  90 atatccgaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttg 189  Q
    ||||| |||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||   |||  || |  ||||||||||||||| ||| |||    
T  20477995 atatctgaagatatttgtcaattcttaacgagatgttgtaagttaaggcatttgaacttagctggatgtcgaagagcgaagctacttggaataaacgttg 20478094  T
Q  190 aagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgtt 289  Q
     |  |||  | |||||||||||  |||||||| ||||||  |||||||| |||||| | | ||||||||| | || ||||||||||||||||||| |  |    
T  20478095 taattccccagctggaggtgttgaacttgtcatatacaaatgttgatgacgaaacattatctgtgatctcaaggaattgttgtgggcttttgcaaatact 20478194  T
Q  290 actgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaact 355  Q
    ||||||||||||  |  || |||||  ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||    
T  20478195 actgaaaaattgcgataatgtcacaatgaaaggagcgaaacatgtcgtagaaaactgcacacaact 20478260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 370
Target Start/End: Original strand, 38267562 - 38267749
Alignment:
Q  183 aactttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgc 282  Q
    |||||||||| ||| || || |||||||| |||||| || ||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  ||  |||||||||||     
T  38267562 aactttgaagttcccaaccttgaggtgttggacttgacacatacaagagttgatgatgacacactctatgtaatctcaaagacgtgccgtgggcttttga 38267661  T
Q  283 aactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaattt 370  Q
    ||||||  ||| ||  ||||    || |||| ||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||    
T  38267662 aactgtcgctgcaactttgtacgaatgtcaccgagaagggagtgatgcatgtggtcaaaaactgcacaaaactcagagagatcaattt 38267749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28525187 - 28525098
Alignment:
Q  100 gtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttg 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||    ||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||    
T  28525187 gtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaagatgagggatttgaaattaagcaactgttcaataatgaagccacttggaatcaactttg 28525098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12845635 - 12845517
Alignment:
Q  234 gatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaagggagtgaagcatg 333  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||| || |||||| ||   ||| |||||||| |  || | |||||||||||||||| ||| |    
T  12845635 gatgatgaagcactatatgcaatctcaaagagttgttgtggtctattgcaattggacctggaaaattgtaatgatgttacagagaagggagtgaggcaag 12845536  T
Q  334 tggtagaaaaatgcacaaa 352  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  12845535 tggtagcaaaatgcacaaa 12845517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 37937979 - 37937877
Alignment:
Q  184 actttgaagctccaaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgca 283  Q
    ||||||||| ||| || || |||||||| |||||| || ||||||   |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||    
T  37937979 actttgaagttcccaaccttgaggtgttggacttgacacatacaagaattgatgatcaaacactctatgtaatctcaaagatgtgtcgtgggcttttgca 37937880  T
Q  284 act 286  Q
    |||    
T  37937879 act 37937877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 73
Target Start/End: Original strand, 41889400 - 41889447
Alignment:
Q  26 catcataatgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgattt 73  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  41889400 catcataatgtttgcttccattttccctaatttgcagctacttgattt 41889447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 270
Target Start/End: Original strand, 1388 - 1560
Alignment:
Q  101 tatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaattaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctccaaaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||||    || | ||| ||| ||||||||||| || ||| ||     
T  1388 tatttgtcaagttttaaggagatgttataagattagacatttgaacttagcctggtgttcatctgtggacctatttgaaatgaactttgtagttcctaag 1487  T
Q  201 ctggaggtgttagacttgtcaaatacaa---tggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgtt 270  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1488 ctagaggtgttggacttgtcaaatacaaatgttgatgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtt 1560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 224 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 39236 - 39091
Alignment:
Q  224 tacaatggttgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatttcacagagaaggga 323  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||  | | |||||  |||||||    
T  39236 tacaaaggttaatgatgaaacactttatgtgatctcaaagagttgtagtgggcttttgcacctgatactggaaaaatgttctcgtgtcacaatgaaggga 39137  T
Q  324 gtgaagcatgtggtagaaaaatgcacaaaactaggagagattaatt 369  Q
    ||||| ||||||||| | || |||||  ||||  ||||||||||||    
T  39136 gtgaaacatgtggtaaacaactgcacgcaactgagagagattaatt 39091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University