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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11930_low_9 (Length: 749)

Name: NF11930_low_9
Description: NF11930
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11930_low_9
NF11930_low_9
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (12-733)||(3934140-3934862)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 607; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 607; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 733
Target Start/End: Original strand, 3934140 - 3934862
Alignment:
Q  12 atgaatatgaatctaggtgatttaattacctaaaatatttaaacaaatctcctgataataatgcatcgggcctaatcaattttgtagagaagtaaaggat 111  Q
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T  3934140 atgaatatgaatc-aggtgatttaattacctaaaatatttaaacaaatctcctgataataatgcatcgggcctaatcaattttgtagagaagtaaaggat 3934238  T
Q  112 cctctcacataggaaaaagaccacac-tggaatagtgatattccatcaatgatttatatattaaacaatataaggatgagtggctaaacaaaa-ttagtt 209  Q
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T  3934239 cctctcacataggaaaaagaccacacctggaatagtgatattccatcaatgatttatatattaaacaatataaggatgagtggctaaacaaaaattagtt 3934338  T
Q  210 atgattatattatttattttacaagaatgaaagtgatatttacttaaccatatgactaatttaacagcatnnnnnnngttgaactgtgacatctattgaa 309  Q
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T  3934339 atgattatattatttattttacaagaatgaaagtgatatttacttaaccatatgactaatttaacaacataaaaaaagttgaactgtggcatctattgaa 3934438  T
Q  310 aacaagaggatatttactgtttgtaatattttttagatagacgaaataacaaatcatttgaaattcacacacaaacggaggaattgaagtttaaacccag 409  Q
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T  3934439 aacaagaggatatttactgtttgtaatattttttagatagacgaaataacaaatcatttgaaatttacacacaaatggaggaattgaagtttgaatccag 3934538  T
Q  410 acgtccaacctaataatttcgacatttttatcaattaagcgaggatatctacacgtaaatgatatatttggcatcaacatacatggtgcatttggacaaa 509  Q
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T  3934539 gcgtccaacttaataatttcgacatttttatcaattaagctaggatatctacacgtaaatgatatatttggcatcaagatacatggtgcatttggacaaa 3934638  T
Q  510 ctgaaatggaataatgtttagggtgattacgctagaaattaagaaggtaatagatgaaatcaaaatgttatcttgatgatggtgtgtttaggcaaaaaca 609  Q
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T  3934639 ctgaaatggaataatgtttagggtgattacgctagaaattaagaaggtaatagatgaaatcaaaatgttatcctgatgatggtgtgtttaggctaaaaca 3934738  T
Q  610 caggctcttctgattaaaatttttcagattggcactacaatcatatatttagtatccgacgcgtctcaaattacataaaatacctaatggatagaaattt 709  Q
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T  3934739 caggtttttctgattataatttttcagattggcactgcaatcatatatttagtatccaacgcgcctcaaattacataaaatacctaatggatagaaattt 3934838  T
Q  710 taagaaagtgaccagacatgattg 733  Q
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T  3934839 taagaaagtgaccagacatgattg 3934862  T

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