View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11932_high_72 (Length: 247)

Name: NF11932_high_72
Description: NF11932
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11932_high_72
NF11932_high_72
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (1-247)||(7372401-7372644)
chr6 (1-247)||(20523826-20524069)
chr6 (1-246)||(6899934-6900176)
chr6 (11-247)||(32517338-32517572)
chr6 (1-247)||(32438522-32438758)
chr6 (1-246)||(7050207-7050449)
chr6 (78-244)||(18643855-18644018)
chr6 (1-246)||(10568849-10569091)
chr6 (5-163)||(11355676-11355834)
chr6 (120-187)||(21091709-21091776)
chr6 (29-119)||(25170896-25170986)
chr6 (205-247)||(11355850-11355892)
chr6 (8-133)||(30640454-30640579)
chr6 (29-119)||(31209725-31209815)
chr6 (49-129)||(29114039-29114119)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (1-247)||(3012893-3013136)
chr1 (1-244)||(45045926-45046166)
chr1 (1-247)||(46583021-46583265)
chr1 (1-247)||(51895606-51895849)
chr1 (1-247)||(4855409-4855643)
chr1 (1-247)||(2870039-2870282)
chr1 (1-247)||(33600592-33600835)
chr1 (11-247)||(25277798-25278032)
chr1 (11-247)||(37344803-37345037)
chr1 (1-247)||(34777580-34777813)
chr1 (1-246)||(15104894-15105136)
chr1 (1-247)||(26224994-26225227)
chr1 (1-247)||(27087732-27087966)
chr1 (1-246)||(52643067-52643310)
chr1 (5-163)||(31238005-31238164)
chr1 (50-183)||(20944295-20944428)
chr1 (12-163)||(50555606-50555757)
chr1 (50-187)||(8168759-8168896)
chr1 (35-163)||(6818215-6818343)
chr1 (8-129)||(35009289-35009411)
chr1 (12-135)||(42559444-42559567)
chr1 (183-247)||(6818157-6818218)
chr1 (31-166)||(43869650-43869792)
chr1 (183-247)||(31237947-31238008)
chr1 (201-247)||(50555548-50555594)
chr1 (3-119)||(23172482-23172598)
chr1 (49-131)||(47264866-47264948)
chr1 (103-135)||(35009452-35009484)
chr1 (1-113)||(35479087-35479199)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (1-247)||(42942234-42942477)
chr8 (1-247)||(5036899-5037142)
chr8 (1-247)||(22272721-22272964)
chr8 (1-247)||(33708251-33708494)
chr8 (1-247)||(27691614-27691857)
chr8 (1-247)||(38547675-38547909)
chr8 (1-247)||(40339121-40339364)
chr8 (1-247)||(41042025-41042268)
chr8 (1-247)||(8609248-8609482)
chr8 (1-247)||(13282845-13283079)
chr8 (35-247)||(13107815-13108015)
chr8 (1-247)||(13485549-13485785)
chr8 (1-246)||(26239853-26240091)
chr8 (1-246)||(9672611-9672853)
chr8 (1-244)||(7744567-7744807)
chr8 (5-244)||(41825113-41825330)
chr8 (50-187)||(601053-601190)
chr8 (50-172)||(29237754-29237876)
chr8 (50-187)||(35509975-35510112)
chr8 (50-172)||(33761923-33762045)
chr8 (50-177)||(15306825-15306952)
chr8 (50-177)||(15487194-15487321)
chr8 (2-145)||(11788754-11788897)
chr8 (8-135)||(17808043-17808170)
chr8 (12-119)||(11720922-11721029)
chr8 (1-135)||(10268815-10268949)
chr8 (29-135)||(15143590-15143696)
chr8 (29-135)||(11032085-11032191)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (1-247)||(35692791-35693034)
chr7 (1-245)||(23905695-23905936)
chr7 (1-247)||(30939850-30940093)
chr7 (1-247)||(37114961-37115204)
chr7 (1-247)||(46438951-46439194)
chr7 (1-247)||(29995935-29996178)
chr7 (1-247)||(27665486-27665729)
chr7 (50-247)||(66570-66764)
chr7 (1-246)||(48851769-48852010)
chr7 (1-247)||(38473564-38473802)
chr7 (1-246)||(47385645-47385887)
chr7 (5-163)||(6603991-6604149)
chr7 (8-190)||(24227893-24228076)
chr7 (12-163)||(39858741-39858892)
chr7 (12-163)||(13168557-13168708)
chr7 (12-163)||(45359796-45359947)
chr7 (50-187)||(35402810-35402947)
chr7 (100-246)||(37792476-37792618)
chr7 (13-90)||(37795437-37795514)
chr7 (13-90)||(37795765-37795842)
chr7 (20-101)||(34776499-34776580)
chr7 (1-135)||(367145-367278)
chr7 (183-247)||(6604146-6604207)
chr7 (8-135)||(7402324-7402451)
chr7 (201-247)||(13168720-13168766)
chr7 (29-166)||(25972289-25972433)
chr7 (201-247)||(34776402-34776448)
chr7 (201-247)||(39858683-39858729)
chr7 (201-247)||(45359959-45360005)
chr7 (18-135)||(13035143-13035260)
chr7 (1-119)||(23965410-23965528)
chr7 (31-119)||(6057813-6057901)
chr7 (29-119)||(17199951-17200040)
chr7 (29-119)||(31914422-31914512)
chr7 (125-163)||(34776460-34776498)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (1-247)||(41761168-41761410)
chr4 (8-247)||(49523581-49523815)
chr4 (8-247)||(42981067-42981303)
chr4 (1-247)||(43519878-43520121)
chr4 (1-244)||(11255376-11255616)
chr4 (1-247)||(52867600-52867843)
chr4 (1-244)||(41781962-41782202)
chr4 (1-247)||(35403109-35403344)
chr4 (5-244)||(51012379-51012606)
chr4 (2-246)||(54386590-54386831)
chr4 (12-246)||(48646179-48646410)
chr4 (20-246)||(11602137-11602359)
chr4 (54-192)||(43507791-43507929)
chr4 (50-172)||(320105-320227)
chr4 (50-172)||(4172945-4173067)
chr4 (50-172)||(33265144-33265266)
chr4 (58-187)||(834481-834610)
chr4 (58-187)||(5438331-5438460)
chr4 (1-190)||(2692747-2692927)
chr4 (8-135)||(27383072-27383199)
chr4 (29-135)||(44973441-44973547)
chr4 (29-166)||(50132443-50132587)
chr4 (8-135)||(9590877-9591004)
chr4 (29-135)||(4613973-4614079)
chr4 (49-131)||(10767218-10767300)
chr4 (18-114)||(7150015-7150111)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (1-244)||(17696666-17696906)
chr2 (9-247)||(42518675-42518910)
chr2 (1-247)||(2767394-2767636)
chr2 (5-247)||(39455623-39455862)
chr2 (1-247)||(40560683-40560927)
chr2 (1-247)||(44709197-44709441)
chr2 (1-247)||(14388535-14388777)
chr2 (1-244)||(6797967-6798207)
chr2 (12-163)||(19907778-19907929)
chr2 (12-163)||(39664281-39664432)
chr2 (50-187)||(6784718-6784855)
chr2 (27-163)||(37645962-37646098)
chr2 (8-135)||(40151295-40151422)
chr2 (174-247)||(16763573-16763643)
chr2 (20-134)||(26584356-26584470)
chr2 (33-122)||(14000839-14000928)
chr2 (201-247)||(19907720-19907766)
chr2 (201-247)||(39664223-39664269)
chr2 (1-45)||(16763525-16763569)
chr2 (84-135)||(4046813-4046864)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (1-247)||(2853750-2853993)
chr5 (1-247)||(24540632-24540875)
chr5 (1-247)||(7268292-7268526)
chr5 (1-246)||(18624442-18624684)
chr5 (21-247)||(21841470-21841684)
chr5 (63-247)||(8540172-8540353)
chr5 (1-247)||(28820834-28821063)
chr5 (12-163)||(12737579-12737730)
chr5 (12-163)||(12800402-12800553)
chr5 (1-228)||(17574767-17574981)
chr5 (8-163)||(30467790-30467946)
chr5 (20-163)||(2180257-2180400)
chr5 (50-187)||(42472909-42473046)
chr5 (141-247)||(32135275-32135378)
chr5 (18-166)||(19997580-19997729)
chr5 (201-247)||(12737742-12737788)
chr5 (201-247)||(12800565-12800611)
chr5 (29-134)||(15457980-15458085)
chr5 (149-228)||(17576937-17577012)
chr5 (154-228)||(17575631-17575701)
chr5 (201-247)||(2180412-2180458)
chr5 (18-119)||(9221238-9221339)
chr5 (3-48)||(34328064-34328109)
chr5 (8-135)||(27076244-27076371)
[»] chr3 (36 HSPs)
chr3 (1-247)||(17515770-17516013)
chr3 (1-247)||(44275657-44275900)
chr3 (6-247)||(43765585-43765823)
chr3 (8-247)||(21349161-21349397)
chr3 (1-247)||(46198180-46198424)
chr3 (1-247)||(23292610-23292854)
chr3 (1-247)||(2660673-2660916)
chr3 (1-247)||(44794667-44794910)
chr3 (1-246)||(51685060-51685302)
chr3 (1-247)||(7884334-7884568)
chr3 (1-247)||(41978197-41978431)
chr3 (1-247)||(54898886-54899120)
chr3 (1-247)||(35905173-35905407)
chr3 (1-247)||(2225614-2225848)
chr3 (1-246)||(48830258-48830500)
chr3 (8-247)||(53190305-53190532)
chr3 (1-246)||(42279956-42280198)
chr3 (1-246)||(610060-610302)
chr3 (12-163)||(27898613-27898764)
chr3 (12-163)||(2377490-2377641)
chr3 (93-246)||(30599641-30599791)
chr3 (50-187)||(53093464-53093601)
chr3 (50-172)||(46309570-46309692)
chr3 (50-172)||(38192716-38192838)
chr3 (1-198)||(46112936-46113133)
chr3 (8-168)||(24845367-24845523)
chr3 (31-166)||(5134038-5134180)
chr3 (179-247)||(27898555-27898620)
chr3 (31-166)||(5126783-5126925)
chr3 (29-135)||(41624696-41624802)
chr3 (8-135)||(54093512-54093639)
chr3 (201-247)||(2377653-2377699)
chr3 (1-135)||(22219661-22219795)
chr3 (58-107)||(28626932-28626981)
chr3 (1-119)||(7589868-7589986)
chr3 (45-115)||(35863049-35863119)
[»] scaffold0564 (1 HSPs)
scaffold0564 (1-247)||(8710-8953)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (2-247)||(3745-3987)
scaffold0058 (2-247)||(4917-5159)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (1-246)||(108019-108261)
[»] scaffold0345 (2 HSPs)
scaffold0345 (5-163)||(29-187)
scaffold0345 (205-247)||(203-245)
[»] scaffold1454 (1 HSPs)
scaffold1454 (1-68)||(1714-1781)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7372644 - 7372401
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7372644 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaat 7372545  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||       
T  7372544 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttatttaatgctttttggacttgttt--- 7372448  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372447 agtttatgcttttttgaatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 7372401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 20523826 - 20524069
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20523826 acaccactgaggtgtcctgctccacaaaatccaactgctccatgagttattagacttccaaatccaaattatgggtcatccgcttctactcaaccccaat 20523925  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||       
T  20523926 acatggagtttatcccaactcaaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttaactaatgctttttggacttgttt--- 20524022  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20524023 agtttatgcttttttggatatgtaatcccttaagaacgtcaaatgat 20524069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 6899934 - 6900176
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  6899934 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgcttttggagttattagagttccaaatccaaattgtgggccatctgcttctactcaaccccaat 6900033  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| | |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       
T  6900034 acatgaattttatcccaattccaggatttccaaagcagtgatgcttgcttaaattatgtttttggactagtttaattaatgttttttggacttgttt--- 6900130  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatga 246  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6900131 aatttatacttttttggatatgtaatgacttaagaacatcaaatga 6900176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 247
Target Start/End: Original strand, 32517338 - 32517572
Alignment:
Q  11 ggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaa-ccccaatacatggagt 109  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32517338 ggggtcctgcttcacaaaatccaactgcccctagagttattagagtttcaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaaccccaatacatggagt 32517437  T
Q  110 ttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtttatgc 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||   |||||||||    
T  32517438 ttatcccaacttcaggatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgattttggactagtttaattaaagctttttggacttgttt---agtttatgc 32517534  T
Q  210 ttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32517535 ttttttggatatgtaatcatttaagaacatcaaatgat 32517572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 32438758 - 32438522
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaa-ccccaa 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||    
T  32438758 acaccactgaggggtcctgctccacaaaattcaactgctcctggagttattagagtttcaaatccaaa---------atccgcttctactcaaaccccaa 32438668  T
Q  100 tacatggagtttatcccaactccaggattt-ccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgttta 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||     
T  32438667 tacatggagtttatcccaactccgggattttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggagttgttt- 32438569  T
Q  199 taagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32438568 --agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 32438522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 7050207 - 7050449
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  7050207 acaccattgaggggtcctgctccacaaaatccaactggtcctcgagttattagagtttcaaacccaaattgcgagtcatccgcttctactcaaccccaat 7050306  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||       
T  7050307 acatgaagtttatcccaattccaggatttccaaagcagtgatgcttgcttaaattatgtttttggactagtttaattaatgctttttggacttgttt--- 7050403  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatga 246  Q
    | |||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  7050404 aatttatgtttttttggatatataatgacttaagaacatcaaatga 7050449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 244
Target Start/End: Original strand, 18643855 - 18644018
Alignment:
Q  78 atccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaatt 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18643855 atccgcttctactcaacgccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaatt 18643954  T
Q  178 gatgttttttggacttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaat 244  Q
     |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18643955 aatgttttttggacttgttt---agtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaat 18644018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 10568849 - 10569091
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||| |||| ||||||  ||   |||||||||||||||||||||||     
T  10568849 acaccattgaggggtcctgctccacaaaatccaactgatactagagttattagagttacaaaaccaaatagcgaaacatccgcttctactcaaccccaaa 10568948  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||       
T  10568949 acataaagtttatcccaattccaggatttccaaagcagtgatgcttgcttaaattatgtttttggactagtttaattaatgctttttggacttgttt--- 10569045  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatga 246  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  10569046 aatttatgcttttttggatatgtaatgacttaagaacatcaaatga 10569091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Original strand, 11355676 - 11355834
Alignment:
Q  5 cactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacat 104  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355676 cactgagggatcctgctccacaaaaaccaaccgctcctagagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaatacat 11355775  T
Q  105 ggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||    
T  11355776 ggagtttatcccaactctaggatttccaaagcattgatgtttgtttgaattatgctttt 11355834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21091776 - 21091709
Alignment:
Q  120 tccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgtttttt 187  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  21091776 tccaggatttccaaagcattgatgcctgtttaaattatgcttttggacttgtttaatttatgtttttt 21091709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 25170986 - 25170896
Alignment:
Q  29 atccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaac 119  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||| ||||||||  | | ||| ||||||||||||||    
T  25170986 atccaactgctcctagcgttattagagttccatatcgaaattatggtccatccggttcaactcaacctaagttcattgagtttatcccaac 25170896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 247
Target Start/End: Original strand, 11355850 - 11355892
Alignment:
Q  205 tatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  11355850 tatgcttttttggatttgtaatcacttaagaacatcaaatgat 11355892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 30640579 - 30640454
Alignment:
Q  8 tgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgga 107  Q
    ||||||||| ||| ||| |  |||||||| |||||||  | ||||||||| || ||||||  || || ||||||| ||| | |||||| |||| ||||||    
T  30640579 tgaggggtcctgcaccaggtcatccaactcctcctggcataattagagtttcatatccaacctatggtccatccggttcgaatcaacctcaattcatgga 30640480  T
Q  108 gtttatcccaactccaggatttccaa 133  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||    
T  30640479 gtttataccaacccccggatttccaa 30640454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 119
Target Start/End: Original strand, 31209725 - 31209815
Alignment:
Q  29 atccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaac 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| || | || || ||| |||||||   ||| | ||||||||||||||||    
T  31209725 atccaactgctcctggcgttattagagtaccatatccaagttatggtctattcggttcgactcaacataaattcgtggagtttatcccaac 31209815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 129
Target Start/End: Original strand, 29114039 - 29114119
Alignment:
Q  49 attagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggattt 129  Q
    ||||| |||||| ||||||  || || ||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29114039 attagggttccatatccaacctatggtccacccggttcgactcaacctcaattcatggagtttataccaactcccggattt 29114119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3013136 - 3012893
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3013136 acaccactgaggggtcttgctccacaaaattcaattgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 3013037  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||       
T  3013036 acatggagtttatccctactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgctttttggacttgttt--- 3012940  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3012939 agtttatgcttttttgaatatgtaatcacttaagaatatcaaatgat 3012893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 45046166 - 45045926
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  45046166 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagtttcaaatctaaattacgggtcatccgcttctactcaactccaat 45046067  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||       
T  45046066 acacggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgattttggactagtttaattaatgctttttggacttgttt--- 45045970  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaat 244  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45045969 agtttatgcgtttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaat 45045926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 46583265 - 46583021
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  46583265 acaccactgaggggtcctgctccacaagatccaactgctcttggagttattagagttccaaatccaaattacgggtcatccgtttctactcaaccccaat 46583166  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccagga-tttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||      
T  46583165 acatggagtttatcccaactccaggattttcaaaagcattgatgcatgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgttttttggacttgttt-- 46583068  T
Q  200 aagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46583067 -agtttacgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 46583021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 51895849 - 51895606
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||    
T  51895849 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgtttctggagttattagagttcaaaatccaaattatgggtcatccgcttctactcaaccataat 51895750  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||       
T  51895749 acatggagtttatccctactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgcttattggacttgttt--- 51895653  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51895652 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 51895606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4855643 - 4855409
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||||    
T  4855643 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaa---------atccgcttctactcaacgccaat 4855553  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       
T  4855552 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgttttttggacttgttt--- 4855456  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4855455 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 4855409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 2870039 - 2870282
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||| ||||||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  2870039 acaccattgaggggttctgcttcacaagatccaactgctcctggagttattagagttcaaaatccaaattacgggtcatccggttctactcaaccccaat 2870138  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |  |||||||||||||||       
T  2870139 acatggagtttatcccgactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgtttttggactagtttaattactcctttttggacttgttt--- 2870235  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  2870236 agtttacgcttttttggatatgtaatcacataagaacatcaaatgat 2870282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33600835 - 33600592
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  33600835 acaccaataaggggtcctgctccacaaaatccaactgctccgggagttattagagttccaaatccaaattacaggtcatccacttctactcaaccccaat 33600736  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||       
T  33600735 acatgaagtttattccaactccaggatttccaaaacattgatgcatgtttaaattattctttttgactagtttaattaatgctttttgaacttgttt--- 33600639  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  33600638 agtttatgcttttttggatatgtaaacacttaagaacatcaaatgat 33600592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25278032 - 25277798
Alignment:
Q  11 ggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaa-ccccaatacatggagt 109  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25278032 ggggtcctgcttcacaaaatccaactgcccctagagttattagagtttcaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaaccccaatacatggagt 25277933  T
Q  110 ttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtttatgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||   |||||||||    
T  25277932 ttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgattttggactagtttaattaaagctttttggacttgttt---agtttatgc 25277836  T
Q  210 ttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25277835 ttttttggatatgtaatcatttaagaacatcaaatgat 25277798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 247
Target Start/End: Original strand, 37344803 - 37345037
Alignment:
Q  11 ggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaa-ccccaatacatggagt 109  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37344803 ggggtcctgctccacaaaatccaactgcccctagagttattagagtttcaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaaccccaatacatggagt 37344902  T
Q  110 ttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtttatgc 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||   |||||||||    
T  37344903 ttatcccaacttcaggatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgattttggactagtttaattaaagctttttggacttgttt---agtttatgc 37344999  T
Q  210 ttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37345000 ttttttggatatgtaatcatttaagaacatcaaatgat 37345037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34777813 - 34777580
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||         ||||||||||||||||| |||||    
T  34777813 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattaaagttgcaaatccaaa---------atccgcttctactcaacgccaat 34777723  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       
T  34777722 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgat-attgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggacttgttt--- 34777627  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34777626 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 34777580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 15104894 - 15105136
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||    
T  15104894 acaccactgaggggtcatgctccacaaaattcaactgctcctggagttattagagttctaaatccaaattacgggacatccacttctacacaactccaat 15104993  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||||       
T  15104994 agatggagtttatcccaactccaagatttccaaagcagtgatgcttgtttaaattatgtttttggactagtttcattaatgctttttgggcttgttt--- 15105090  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatga 246  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15105091 aatttatgcttttttggatatgtaatgacttaagaacatcaaatga 15105136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26225227 - 26224994
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||         ||||||||||||||||  |||||    
T  26225227 acaccactgatgggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagtttcaaatccaaa---------atccgcttctactcaaagccaat 26225137  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       
T  26225136 acatggagtttatcc-aactccaagatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggacttgttt--- 26225041  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225040 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 26224994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 27087732 - 27087966
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||         ||||||||||||||||| |||||    
T  27087732 acaccactgaagggtactgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagtttcaaatccaaa---------atccgcttctactcaacgccaat 27087822  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||       
T  27087823 acatgaagtttatcacaactccaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatattttttggacttgttt--- 27087919  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27087920 agtttacgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 27087966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 52643310 - 52643067
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||    
T  52643310 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatctaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattgttggtcatccgcttctactcaaccccaat 52643211  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatg-ttttttggacttgtttat 199  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | | |||| || |||||||||| || |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||      
T  52643210 acatggagtttatctcaattccaagatttccaaagtagtgatgcttgcttaaattatgtttctggactagtttaattaatgtttttttggacttgttt-- 52643113  T
Q  200 aagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatga 246  Q
     | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  52643112 -aatttatgcttttttggatatgtaatgacttaagaacgtcaaatga 52643067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 31238164 - 31238005
Alignment:
Q  5 cactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacat 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31238164 cactgaggggtcttgctccacaaaatccaactgcttctagagttattagacttccaaatctaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacat 31238065  T
Q  105 ggagtttat-cccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 163  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31238064 ggagtttatacccaactccaggatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgctttt 31238005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20944428 - 20944295
Alignment:
Q  50 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  20944428 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccacttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaaacagtgatgcatgtt 20944329  T
Q  150 taaattatgcttttggactagttcaattgatgtt 183  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20944328 ttaattatgcttttggactagtttaattaatgtt 20944295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 50555757 - 50555606
Alignment:
Q  12 gggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagttt 111  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  50555757 gggtcctgctccacaaaattcaactgctcctagagttattagagtttcaaatccaaattaagggtcatccgtttctactcaaccctaatgcatggagttt 50555658  T
Q  112 atcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  50555657 atcccaactccaggatttccaaagcatttatgcttgtttaaattatgctttt 50555606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8168896 - 8168759
Alignment:
Q  50 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||    
T  8168896 ttagagttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaactccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaaagagtgatgcatgtt 8168797  T
Q  150 taaattatgcttttggactagttcaattgatgtttttt 187  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  8168796 ttaattatgcttttggactagtttaattaatgcttttt 8168759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 6818343 - 6818215
Alignment:
Q  35 ctgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaa 134  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6818343 ctgctcctagagttattagagtttcaaacccaaattacgagtcatctgcttctacttaaccccaatacatggagtttatctcaactccaggatttccaaa 6818244  T
Q  135 gcattaatgcatgtttaaattatgctttt 163  Q
     |||| |||| |||||||||||| |||||    
T  6818243 acattgatgcttgtttaaattatactttt 6818215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Original strand, 35009289 - 35009411
Alignment:
Q  8 tgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccc-caatacatgg 106  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| || ||||||||||  ||| |||||    
T  35009289 tgagaggtcatgctccacaaaatccaactgcttttggagttgttagagtaccatatccaaattatgggaaatccggttttactcaacccagaattcatgg 35009388  T
Q  107 agtttatcccaactccaggattt 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  35009389 agtttatcccaactccgggattt 35009411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 42559567 - 42559444
Alignment:
Q  12 gggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagttt 111  Q
    ||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||  || || ||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  42559567 gggtcctgctccaccacatctaactgctcttggagttattcgagtaacatattcaagttatgggtcatccgattctactcaaccccaattcatgtagttt 42559468  T
Q  112 atcccaactccaggatttccaaag 135  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||    
T  42559467 atcccaaccccatgattttcaaag 42559444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6818218 - 6818157
Alignment:
Q  183 tttttggacttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6818218 tttttggacttgttta---gtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 6818157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 166
Target Start/End: Original strand, 43869650 - 43869792
Alignment:
Q  31 ccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttc 130  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |  ||| ||||||||  | | ||||||||||||||||||||  || ||||    
T  43869650 ccaactgctcctggcgttattagagtaccatatccaaattatggtccattctgttcaactcaacctaagttcatggagtttatcccaactctcggctttc 43869749  T
Q  131 caaagca-------ttaatgcatgtttaaattatgcttttgga 166  Q
    ||||| |       || ||||||||||||||||||||||||||    
T  43869750 caaagaagtgatacttgatgcatgtttaaattatgcttttgga 43869792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31238008 - 31237947
Alignment:
Q  183 tttttggacttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31238008 tttttggacttgttta---gtttatgcttttttggatatgtaatcatttaagaacatcaaatgat 31237947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 50555594 - 50555548
Alignment:
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50555594 agtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 50555548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 119
Target Start/End: Original strand, 23172482 - 23172598
Alignment:
Q  3 accactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatac 102  Q
    |||| ||||||||| ||| |||  | ||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||| | | ||||||||  | | |    
T  23172482 accagtgaggggtcctgcaccaacacatccaactgctccaggcgttattagagtaccatatccaaattatgatccatccggtccgactcaacctaagttc 23172581  T
Q  103 atggagtttatcccaac 119  Q
     ||||||||||||||||    
T  23172582 gtggagtttatcccaac 23172598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 47264948 - 47264866
Alignment:
Q  49 attagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttcc 131  Q
    ||||| |||||| ||||||  || || ||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  47264948 attagggttccatatccaacctatggtccacccggttcgactcaacctcaattcatggagtttataccaactcccggatttcc 47264866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 135
Target Start/End: Original strand, 35009452 - 35009484
Alignment:
Q  103 atggagtttatcccaactccaggatttccaaag 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35009452 atggagtttatcccaaccccaggatttccaaag 35009484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 35479199 - 35479087
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||| |  |||||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||  || || ||| ||| ||| | |||||| ||||    
T  35479199 acaccaatgaggggtcctgcaccaggtcatccaactcctcctggcataattagagttccatatccaacctatggtccacccggttcaaatcaacctcaat 35479100  T
Q  101 acatggagtttat 113  Q
     ||||||||||||    
T  35479099 tcatggagtttat 35479087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 42942234 - 42942477
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  42942234 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaattcaaattacgggccatccgcttctactcaatctcaat 42942333  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||       
T  42942334 acatggagtttatccctactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgctttttggacttgttt--- 42942430  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42942431 agtttatacttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 42942477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 5036899 - 5037142
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5036899 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgttcctggaattattagagttccaaatccaaattacgagtcatccgcttctactcaaccccaat 5036998  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||       
T  5036999 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgtttttttgacttgttt--- 5037095  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5037096 agtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 5037142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 22272721 - 22272964
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22272721 acaccaccgaggggtcctgctccacaaaatccaattgctcctagagttattagagttccaaatccaaattatgggtcatccgcttctactcaaccccaat 22272820  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||       
T  22272821 acatggagtttatccctactccaggatttccaaagcattgatgcatttttaaattatgcttttggactagtttaattaatgctttttggacttgttt--- 22272917  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22272918 aatttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 22272964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33708494 - 33708251
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33708494 acaccactgaggggtcctgctccactagatccaactgctcttggagttattagaattccaaatccaaattacggatcatccgcttctactcaaccccaat 33708395  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||       
T  33708394 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatttttttggactaatttaattaatgctttttggacttgttt--- 33708298  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33708297 agtttacgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 33708251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 27691614 - 27691857
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27691614 acactactgaggggtcatgctccacaagatccaactgctcttggggttattagaatttcaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaat 27691713  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||       
T  27691714 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgctttttggacttattt--- 27691810  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27691811 agtttacgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 27691857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 38547675 - 38547909
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||||    
T  38547675 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcttggagttattagagttccaaatccaaa---------atccgcttctactcaacgccaat 38547765  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       
T  38547766 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggacttgttt--- 38547862  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38547863 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 38547909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 40339364 - 40339121
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  40339364 acaccactgagggatcttgctccacaaaatccaactggtcctggagttattagagtttcaaatccaaattacgggtcatccgcttcaactcaaccccaat 40339265  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||   ||||| || |||||||     
T  40339264 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgtttttgaactagtttaattaatacgttttgaacctgtttat- 40339166  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
      |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  40339165 --tttatgcttttttggatatgtgatcacttaagaacatcaaatgat 40339121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 41042268 - 41042025
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||    
T  41042268 acaccactgaggggtcatgctccacaaaatccaactgcttccggagttattagagttccaaatccaaattataggtcatccgcttctactcaacctcaat 41042169  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  |||| |||||||||       
T  41042168 acatggagtttatcccaactccaggattttcaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttgaactagtttaattaatgccttttagacttgttt--- 41042072  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41042071 agtttatgctttttaggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 41042025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8609482 - 8609248
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||         ||||||||||||||||| |||||    
T  8609482 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaattgctccgggagttattagagtttcaaatccaaa---------atccgcttctactcaacgccaat 8609392  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       
T  8609391 acatggagtttatcccaactctaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggacttgttt--- 8609295  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8609294 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 8609248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 13282845 - 13283079
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||         || |||||||||||||  |||||    
T  13282845 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcgtggagttattagagttctaaatccaaa---------attcgcttctactcaatgccaat 13282935  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       
T  13282936 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcgtttggactagtttaattgatgttttttggacttgttt--- 13283032  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13283033 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 13283079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13108015 - 13107815
Alignment:
Q  35 ctgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13108015 ctgctcctggagttattagagttccaaatccaaa---------atccgcttctactcaacgccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaa 13107925  T
Q  135 gcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaag 234  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13107924 gcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggacttgttt---agtttatgctcttttggatatgtaatcacttaag 13107828  T
Q  235 aacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||    
T  13107827 aacatcaaatgat 13107815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13485785 - 13485549
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13485785 acaccactgagggatcctgctccacaaaatccaactgcttctggagttattagagtttcaaatccaaattacgggtcatccgcttctacttaaccccaat 13485686  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||       ||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||       
T  13485685 acatggagcttataccaactccaggatttccaaagcattgatgcat-------ttatgtttttagactagtttaattaatgctttttgtacttgttt--- 13485596  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13485595 agtttatgcttttctggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 13485549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26240091 - 26239853
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26240091 acaccactaagggttcctgcttcacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattgtgggccatccgcttctactcaaccccaat 26239992  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||| || |||||||||| ||||||||||||    || |||  ||||||||||||||       
T  26239991 acatggagtttatccaaattccaggatttccaaagcagtgatgcttgcttaaattatgtttttggactagt----ttaatgccttttggacttgttt--- 26239899  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatga 246  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  26239898 aatttatgcttttttggatatgtaatgacttaagaacatcaaatga 26239853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9672853 - 9672611
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  9672853 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaattgctcctagagttattagagttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctacacaacctcaat 9672754  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | |||| ||||||||||||| |||||||||||||   || ||| |||||||||||||||       
T  9672753 acatggagtttattccaacttcaggatttccaaagtagtgatgcttgtttaaattatgtttttggactagtttcgttaatgctttttggacttgttt--- 9672657  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatga 246  Q
    | |||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  9672656 aatttatgtttttttggatatgtaatgactcaagaacattaaatga 9672611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7744807 - 7744567
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||| |||| || |||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  7744807 acaccacttagggatcctgcttcacaaaatccaactgcttcttgagttattagagttccaaatccaaattgcgggccatccgcttctactccaccctaat 7744708  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||       
T  7744707 acatggagtttatcccaattccaggattttcaaagcagtgatgcttgcttaaattatgtttttggactagtttaattaatgctttttggacttgttt--- 7744611  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaat 244  Q
    | |||||| |||||| || ||| ||| |||||||||||||||||    
T  7744610 aatttatgtttttttagatatgcaatgacttaagaacatcaaat 7744567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 41825330 - 41825113
Alignment:
Q  5 cactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacat 104  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||       
T  41825330 cactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattgcggggcatccgcttctactcaaccccaata--- 41825234  T
Q  105 ggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtt 204  Q
                    ||||||||||||||||| | |||| || |||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||   | ||    
T  41825233 ----------------ccaggatttccaaagcagtgatgcttgcttaaattatgttttttgactagtttaattaatgttttttggacttgttt---aatt 41825153  T
Q  205 tatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaat 244  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  41825152 tatgcttttttggatatgtaatgacttaaaaacatcaaat 41825113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 601190 - 601053
Alignment:
Q  50 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||    
T  601190 ttagagttccaaatccaaattacgggacatccacttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaaaaagtgatgcatgtt 601091  T
Q  150 taaattatgcttttggactagttcaattgatgtttttt 187  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  601090 ttaattatgcttttggactagtttaattaatgcttttt 601053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 172
Target Start/End: Original strand, 29237754 - 29237876
Alignment:
Q  50 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || | |||||||||    
T  29237754 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactctaggatttctaaaacagtgatgcatgtt 29237853  T
Q  150 taaattatgcttttggactagtt 172  Q
    | ||||||||||||| |||||||    
T  29237854 ttaattatgcttttgaactagtt 29237876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 187
Target Start/End: Original strand, 35509975 - 35510112
Alignment:
Q  50 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 149  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  35509975 ttagagttccaaattcaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggattttatcccaactccaggatttccaaaacagtgatgcatgtt 35510074  T
Q  150 taaattatgcttttggactagttcaattgatgtttttt 187  Q
    | ||||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||    
T  35510075 ttaattatgtttttgaactagtttaattaatgcttttt 35510112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 33762045 - 33761923
Alignment:
Q  50 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||| |||    
T  33762045 ttagagttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaactccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaaagagtgatgcacgtt 33761946  T
Q  150 taaattatgcttttggactagtt 172  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  33761945 ttaattatgcttttggactagtt 33761923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 50 - 177
Target Start/End: Original strand, 15306825 - 15306952
Alignment:
Q  50 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 149  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || | |||||||||    
T  15306825 ttagagtttcaaatccaatttacgggccatccgcttctactcaaccgcagtacatggagtttatcccaactccagaatttcgaaaacagtgatgcatgtt 15306924  T
Q  150 taaattatgcttttggactagttcaatt 177  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15306925 ttaattatgcttttggactagtttaatt 15306952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 50 - 177
Target Start/End: Original strand, 15487194 - 15487321
Alignment:
Q  50 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 149  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || | |||||||||    
T  15487194 ttagagtttcaaatccaatttacgggccatccgcttctactcaaccgcagtacatggagtttatcccaactccagaatttcgaaaacagtgatgcatgtt 15487293  T
Q  150 taaattatgcttttggactagttcaatt 177  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15487294 ttaattatgcttttggactagtttaatt 15487321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Original strand, 11788754 - 11788897
Alignment:
Q  2 caccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaata 101  Q
    ||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||| |||| ||||| ||||| |||||||||||     
T  11788754 caccaatgaggggtcctgctccataaaatccaactgctcctggagttattagagtaccatatcaaagttatgggcaatccggttctattcaaccccaatt 11788853  T
Q  102 catggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgca 145  Q
     |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  11788854 gatggcgtttatcacaaccccaggatttccaaagaattgatgca 11788897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 17808170 - 17808043
Alignment:
Q  8 tgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgga 107  Q
    ||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| | ||| || ||| ||| || ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  17808170 tgaggggtcctgctccaccacttccaactgctcttggagttattagaatgccatattcaagttatggaccatccggttctactcaaccctaattcatgga 17808071  T
Q  108 gtttatcccaactccaggatttccaaag 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17808070 gtttatcccaaccccaggatttccaaag 17808043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 11721029 - 11720922
Alignment:
Q  12 gggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagttt 111  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||  || | ||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  11721029 gggtcctgctccacaaaatccaactgctcctgaagttattagagtaccatatccaagttttggacaatccggttctactaaacctaaattcatggagttt 11720930  T
Q  112 atcccaac 119  Q
    ||||||||    
T  11720929 atcccaac 11720922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 10268815 - 10268949
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||  | ||||||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  |||    
T  10268815 acaccagtgaggggtcatgcaccagcacatccaactgcttctgccgttattagagtaccatatccaagttatggtccatctggttcgactcaacctaaat 10268914  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaag 135  Q
     |||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  10268915 tcatggagtttatcccaaccctcggatttccaaag 10268949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 15143696 - 15143590
Alignment:
Q  29 atccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatt 128  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| || ||||||| ||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||| || || ||    
T  15143696 atccaactgctcctggcgttattcgagtgccatatccagattatggtccatccggttcaagtcaacctaagttcatagagtttatcccaacccccggctt 15143597  T
Q  129 tccaaag 135  Q
    |||||||    
T  15143596 tccaaag 15143590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 11032191 - 11032085
Alignment:
Q  29 atccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatt 128  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||| | | | ||||||||  ||| |||||||||||| ||||| |  |||||    
T  11032191 atccaactgcttctgccgttattagagtaccatatccaagttatggaccatctggtccgactcaacctaaattcatggagtttattccaaccctcggatt 11032092  T
Q  129 tccaaag 135  Q
    |||||||    
T  11032091 tccaaag 11032085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 35693034 - 35692791
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35693034 acaccactgaagggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagccctaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaat 35692935  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       
T  35692934 acatggagtttatctcaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggacttgttt--- 35692838  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  35692837 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcacatgat 35692791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23905936 - 23905695
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23905936 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcttggagttattagagttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaacctcaat 23905837  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||       
T  23905836 acatggagtttatcccaactcaaggatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgcttttcgactagtttaattaatgctttttggacttgttt--- 23905740  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatg 245  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23905739 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatg 23905695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 30940093 - 30939850
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30940093 acaccgctgaggggtcttgctccacaaaatccaactgctcctggagttattacagttccaaatccaaattatgggtcatccgcttctactcaaccccaat 30939994  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||  |||||| ||||||||       
T  30939993 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgtttttcgactagtttaattaatactttttgaacttgttt--- 30939897  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30939896 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 30939850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 37115204 - 37114961
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||    
T  37115204 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactactcctggagttattagagttccaaatccaaattacatgccatccgcttctactcaaccataat 37115105  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||       
T  37115104 acatggagtttatccctactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgcttattggacttgttt--- 37115008  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37115007 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 37114961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 46439194 - 46438951
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||| | ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46439194 acaccattaaggggtcctgctccacaaaatccaattgctcttggagttgttagagttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaat 46439095  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||       
T  46439094 acatggagtttatcccaactccagaatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgatttttggacttgttt--- 46438998  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46438997 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 46438951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 29996178 - 29995935
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29996178 acaccactgaggggtcctgctccacaggatccaactgctcttggagttattagaattccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaat 29996079  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||       
T  29996078 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatatttttgaactagtttaattaatgctttttggacttgttt--- 29995982  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29995981 agtttacgcttttttagatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 29995935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27665729 - 27665486
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27665729 acaccactgaggggttctgctccacaagatccaactgctcttggagttattagaattccaaatccaaattacgagtcatccgcttctactcaaccccaat 27665630  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||       
T  27665629 acattgagtttatcacaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgctttttggacttgttt--- 27665533  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665532 agtttacgcttttttgaatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 27665486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 50 - 247
Target Start/End: Original strand, 66570 - 66764
Alignment:
Q  50 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||    
T  66570 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactctaagatttccaaaacattgatacatgtt 66669  T
Q  150 taaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  66670 taaattatgcttttggactagtttaattaatgctttttgaacttgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 66764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 48852010 - 48851769
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48852010 acactactgaggggccctgctccacaaagtccaactgcttctggagttattagagttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaat 48851911  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       
T  48851910 acatggagtttatcccaacctcaggatttccaaagtagtgatgcttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggacttgttt--- 48851814  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatga 246  Q
    | |||||| |||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  48851813 aatttatg-ttttttagatatataatgacttaagaacatcaaatga 48851769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38473802 - 38473564
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  38473802 acaccattgaggggtcctgctccacaaaatacaactgctcatagagttattagagttctaaatcaaaattacgggtcatccgcttttactcaaccccaat 38473703  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||        ||     
T  38473702 acatggagtttatcccaactccagaatttccaaaacattgatgcatgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgctttttgg--------att 38473611  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473610 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 38473564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 47385887 - 47385645
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  47385887 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgttcttagagttaccagagttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctacccaactccaat 47385788  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||||||       
T  47385787 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaaacaatgatgcttgtttaaattatgcttttggagtagtttaattaatactttttggacttgttt--- 47385691  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatga 246  Q
    | || ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||    
T  47385690 aattaatgcttttttggatatgtaatgacttgagaacatcgaatga 47385645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Original strand, 6603991 - 6604149
Alignment:
Q  5 cactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacat 104  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6603991 cactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctagagttattagagttccaaatccaaattacgagtcatccgcttctactcaacctcaatacat 6604090  T
Q  105 ggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6604091 ggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgctttt 6604149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24228076 - 24227893
Alignment:
Q  8 tgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgga 107  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24228076 tgaggggttctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagatttccaaatccaaattatgggcaatcctcttccactcaaccccaatacatgga 24227977  T
Q  108 gtttatcccaactccagga-tttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttgga 190  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24227976 gtttatcccaactccaggattttccgaagcattgatgcatgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgttttttgga 24227893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 39858892 - 39858741
Alignment:
Q  12 gggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagttt 111  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39858892 gggtcctgctccacaaaattcaactgctcatagagttattagatttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaatacatggagttt 39858793  T
Q  112 atcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  39858792 atcccaactccaggatttccaaagcatttatgcttgtttaaattatgctttt 39858741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 13168557 - 13168708
Alignment:
Q  12 gggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagttt 111  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13168557 gggtcctgctccacaaaattcaactgcttctagagttattagatttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgaagttt 13168656  T
Q  112 atcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 163  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  13168657 atcccaactccaggatttccaaagaatttatgcttgtttaaattatgatttt 13168708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 45359796 - 45359947
Alignment:
Q  12 gggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagttt 111  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  45359796 gggtcctgctccacaaaattcaactgctcctagagttattagagttccaaatcgaaattacgggccatccgcttatactcaaccccaatacatgaagtgt 45359895  T
Q  112 atcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  45359896 atcccaactccaggatttccaaagcatttatgcttatttaaattatgctttt 45359947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 35402947 - 35402810
Alignment:
Q  50 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 149  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||    
T  35402947 ttagagttccaaattcaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttctaaaacagtgatgcatgtt 35402848  T
Q  150 taaattatgcttttggactagttcaattgatgtttttt 187  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  35402847 ttaattatgcttttggactagtttaattaatgcttttt 35402810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 37792618 - 37792476
Alignment:
Q  100 tacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttat 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||      
T  37792618 tacatggagtttatcccaaccccaggatttccaaagcagtgatgcttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgctttttggacttgttt-- 37792521  T
Q  200 aagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatga 246  Q
     | ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  37792520 -actttatgc-tttttggatatgtaatgacttaagaacatcaaatga 37792476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 37795514 - 37795437
Alignment:
Q  13 ggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctact 90  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37795514 ggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctact 37795437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 37795842 - 37795765
Alignment:
Q  13 ggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctact 90  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37795842 ggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctact 37795765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 34776580 - 34776499
Alignment:
Q  20 ctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaata 101  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  34776580 ctccacaaaattcaactgctcctagagttattagaattccaaatccaaattacggatcatccgcttctactcaaccccaata 34776499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 367145 - 367278
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||| ||| || | ||||| |||||||||| || |||    
T  367145 acaccagtgaggggtct-gctccaccacatccaactgctcctggagttattagaatgacacgtccaagttatggtctatccggttctactcaatcctaat 367243  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaag 135  Q
     ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  367244 tcatggagtttatctcaaccccaagatttccaaag 367278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 247
Target Start/End: Original strand, 6604146 - 6604207
Alignment:
Q  183 tttttggacttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6604146 tttttggacttgttta---gtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 6604207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 7402324 - 7402451
Alignment:
Q  8 tgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgga 107  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| | | | |||||||||||||||  || |||||| ||| | |||||  | ||||||||||||| ||| ||||||    
T  7402324 tgaggggtcttgctccaccacatccaatttcacttggagttattagagtatcatatccaagttatgagccatttggttctactcaaccctaattcatgga 7402423  T
Q  108 gtttatcccaactccaggatttccaaag 135  Q
     ||||||||||| |||| |||| |||||    
T  7402424 atttatcccaaccccagaattttcaaag 7402451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 247
Target Start/End: Original strand, 13168720 - 13168766
Alignment:
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13168720 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 13168766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 25972433 - 25972289
Alignment:
Q  29 atccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatt 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||  |||| | ||| ||||||||  | | |||||||||||||||||| || |  ||    
T  25972433 atccaactgctcctggcgttattagagtaccatatccaaattatggttcatctggttcaactcaacctaagttcatggagtttatcccaacccccgactt 25972334  T
Q  129 tccaaagca-------ttaatgcatgtttaaattatgcttttgga 166  Q
    ||||||| |       || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25972333 tccaaagaagtgatacttgatgcatgtttaaattatgcttttgga 25972289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34776448 - 34776402
Alignment:
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34776448 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 34776402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 39858729 - 39858683
Alignment:
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39858729 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 39858683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 247
Target Start/End: Original strand, 45359959 - 45360005
Alignment:
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45359959 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 45360005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 135
Target Start/End: Original strand, 13035143 - 13035260
Alignment:
Q  18 tgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatccca 117  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||| |||| | |  || |||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  13035143 tgctccaccacatccaactgcttctgaagtaattaaaatgtcatatccaagttatgggtcatccggttctaatcaaccataattcatggagtttatccca 13035242  T
Q  118 actccaggatttccaaag 135  Q
    || |||||||||||||||    
T  13035243 accccaggatttccaaag 13035260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 23965410 - 23965528
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| || ||||||  ||| | ||||||  | |    
T  23965410 acaccattgaggggtcttgcaccatcacatccaactgctcctggcgttattcgagtgccatatccagattatggtccatccaattcaagtcaacctaagt 23965509  T
Q  101 acatggagtttatcccaac 119  Q
     |||| |||||||||||||    
T  23965510 tcatgaagtttatcccaac 23965528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 119
Target Start/End: Original strand, 6057813 - 6057901
Alignment:
Q  31 ccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaac 119  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||| ||| ||||||||  | |  |||||||||||||||||    
T  6057813 ccaactcctcctggcgttattagagtaccatatccaaattatggtccacccggttcaactcaacctaagtttatggagtttatcccaac 6057901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 119
Target Start/End: Original strand, 17199951 - 17200040
Alignment:
Q  29 atccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaac 119  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||| || |||||   ||| ||||||||  | | ||||||||||||||||||    
T  17199951 atccaactgctcctgc-gttattagagtaccatatccaaattatggtccatctagttcaactcaacctaagttcatggagtttatcccaac 17200040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 119
Target Start/End: Original strand, 31914422 - 31914512
Alignment:
Q  29 atccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaac 119  Q
    |||||||||||| ||| ||| || |||| ||| |||||||||| || ||||||| ||| | ||||||  | | ||||||||||||||||||    
T  31914422 atccaactgctcttggcgttgttcgagtgccatatccaaattatggtccatccggttcaagtcaacctaagttcatggagtttatcccaac 31914512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 34776498 - 34776460
Alignment:
Q  125 gatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 163  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  34776498 gatttccaaagcatttatgcttgtttaaattatgctttt 34776460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 41761410 - 41761168
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41761410 acaccactgaggggtcctgctccac-aaatccaactgctcctgaagttattagagttccaaatccaaattacggaccatccgcttctactcaaccccaat 41761312  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       
T  41761311 acatggagtttatcccaactcctggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggacttgttt--- 41761215  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
     ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  41761214 tgtttatgcttttttgcatatgtaatcacttgagaacatcaaatgat 41761168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Original strand, 49523581 - 49523815
Alignment:
Q  8 tgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgga 107  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49523581 tgaggggtcctactccacaaaatccaactgctcttggagttattagagttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaatacatgga 49523680  T
Q  108 gtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtttat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||     |||||||    
T  49523681 gtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggacttgt-----agtttat 49523775  T
Q  208 gcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49523776 gcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 49523815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Original strand, 42981067 - 42981303
Alignment:
Q  8 tgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgga 107  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42981067 tgaggggttctgctccacaaaatccaactgcttctggagttattagagttccaaatccaaattacaggacatccgcttctactcaaccccaaaacatgga 42981166  T
Q  108 gtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtttat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||   |||||||    
T  42981167 gtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgctttttggacttgttt---agtttat 42981263  T
Q  208 gcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42981264 gcttttttggacatgtaattacttaagaacatcaaatgat 42981303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 43519878 - 43520121
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43519878 acaccacttaggggtcttgctccactagatccaactgctcttggagttattagaattccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaat 43519977  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||       
T  43519978 acatggagtttatcccaactccagaatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgtttttggactaatttaattaatgctttttggacttgttt--- 43520074  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43520075 agtttacgcttttttagatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 43520121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 11255616 - 11255376
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  11255616 acaccactcaggggtcctgctccacaaaatccaactgttcatggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatcagcttctactcaaccccaat 11255517  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||       
T  11255516 acatggagtttatcccaactccagaatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgctttttggacttgttt--- 11255420  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaat 244  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  11255419 agtttatactttttttgatatgtaatcacttaagaacatcaaat 11255376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 52867843 - 52867600
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52867843 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggaattattagagtttcaaatccaagttacgggccatccgcttctactcaaccccaat 52867744  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||       
T  52867743 acttggagtctatcccaacttcaggatttccaaagcatttatgcttgtttaaattatgattttggactagtttgattaatgctttttggacttgttt--- 52867647  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52867646 agtttatacttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 52867600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 41781962 - 41782202
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  41781962 acaccactgaggggtcctgctccacaaaattcaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggtcatccacttctactcaaccctaat 41782061  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| |||||||||       
T  41782062 acatggagtttatcctaactccaggatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgcttttggacaagtttaattattgctttttagacttgttt--- 41782158  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaat 244  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  41782159 agtttatgcttttttggatatgtaataacttaagaacatcaaat 41782202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 35403344 - 35403109
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  35403344 acaccactgaggggtcctgctccacaaaattcaactgctcctggagttattagagttccagatccaaattacgggccatccgcttctaatcaaccgcaat 35403245  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||||        |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       
T  35403244 acatggagt--------actccaggatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggacttgttt--- 35403156  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35403155 aatttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 35403109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 244
Target Start/End: Original strand, 51012379 - 51012606
Alignment:
Q  5 cactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacat 104  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||         ||||||||||||||||| |||||||||    
T  51012379 cactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagctattagagttccaaatcgaaa---------atccgcttctactcaacgccaatacat 51012469  T
Q  105 ggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   ||||    
T  51012470 ggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggacttgttt---agtt 51012566  T
Q  205 tatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51012567 tatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaat 51012606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Original strand, 54386590 - 54386831
Alignment:
Q  2 caccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaata 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  54386590 caccactgaggggtcctgctccacaaaattcaattgctcctggagttattagagtttcaaatccaaattgcgagtcatccgcttctactcaaccccaata 54386689  T
Q  102 catggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataa 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||   |    
T  54386690 catggagtttatcccaattccaggatttccaaagtagtgatgcttgcttaaattatgtttttggactagtttaattaatgctttttggacttgttt---a 54386786  T
Q  202 gtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatga 246  Q
     |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  54386787 atttatgtttttttggatatgtaatgacttaagaacatcaaatga 54386831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 48646410 - 48646179
Alignment:
Q  12 gggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagttt 111  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48646410 gggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagtttcaaatccaaattgtgggccatctgcttctactcaaccccaatacatggagttt 48646311  T
Q  112 atcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtttatgctt 211  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| | |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||   | |||||||||    
T  48646310 atcccaattccgggatttccaaagcagtgatgcctgcttaaattatgtttttggactagtttaattaatgctttttggacttgttt---aatttatgctt 48646214  T
Q  212 ttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatga 246  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  48646213 ttttggatatgtagtgacttaagaacatcaaatga 48646179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 246
Target Start/End: Original strand, 11602137 - 11602359
Alignment:
Q  20 ctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaac 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  11602137 ctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggtcatctccttctaatcaaccccaatacatggagtttatcccaat 11602236  T
Q  120 tccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtttatgcttttttggac 219  Q
     ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||   | ||||||| ||||||||     
T  11602237 cccaggatttccaaagcagtgatgcttgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgatttttgcacttgttt---actttatgc-tttttggat 11602332  T
Q  220 atgtaatcacttaagaacatcaaatga 246  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  11602333 atgtaatgacttaagaacatcaaatga 11602359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 54 - 192
Target Start/End: Original strand, 43507791 - 43507929
Alignment:
Q  54 agttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaa 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| ||    
T  43507791 agttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaaatagtgatgcatgttttaa 43507890  T
Q  154 ttatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  43507891 ttatgcttttggactagtttaattaatgtttttttgact 43507929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 320227 - 320105
Alignment:
Q  50 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||    
T  320227 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccacttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaagatttccaaaacagtgatgcatgtt 320128  T
Q  150 taaattatgcttttggactagtt 172  Q
    | ||||||| |||||||||||||    
T  320127 ttaattatgtttttggactagtt 320105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 4173067 - 4172945
Alignment:
Q  50 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||    
T  4173067 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccacttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaagatttccaaaacagtgatgcatgtt 4172968  T
Q  150 taaattatgcttttggactagtt 172  Q
    | ||||||| |||||||||||||    
T  4172967 ttaattatgtttttggactagtt 4172945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 172
Target Start/End: Original strand, 33265144 - 33265266
Alignment:
Q  50 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||    
T  33265144 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccacttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaagatttccaaaacagtgatgcatgtt 33265243  T
Q  150 taaattatgcttttggactagtt 172  Q
    | ||||||| |||||||||||||    
T  33265244 ttaattatgtttttggactagtt 33265266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 834610 - 834481
Alignment:
Q  58 ccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattat 157  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| ||||||    
T  834610 ccaaatccaatttacgggccatccgcttctactcaaccgcagtacatggagtttatcccaactccaggatttcgaaaacaatgatgcatgttttaattat 834511  T
Q  158 gcttttggactagttcaattgatgtttttt 187  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  834510 gcttttggactagtttaattaatgtttttt 834481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 58 - 187
Target Start/End: Original strand, 5438331 - 5438460
Alignment:
Q  58 ccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattat 157  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| |||||| ||||||    
T  5438331 ccaaatccaatttacgggccatccgcttctactcaaccgcagtacatggagtttatcccaactccaggatttcaaaaacaatgatgtatgttttaattat 5438430  T
Q  158 gcttttggactagttcaattgatgtttttt 187  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  5438431 gcttttggactagtttaattaatgtttttt 5438460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2692927 - 2692747
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  2692927 acaccactgaggggtcctgctccaaaaaatccaactactcctagagttatttgagttccaaattcaaattacgggccatctgcttctactcaacccca-- 2692830  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttgga 190  Q
           |||||||| ||||  |  |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  2692829 ------ggtttatcctaactgta-tatttccaaagcagtgatgcttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgctttttgga 2692747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 27383072 - 27383199
Alignment:
Q  8 tgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgga 107  Q
    ||||||||| ||| |||  | |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||  | | ||||||    
T  27383072 tgaggggtcctgcaccagcacatccaactgctcctgacgttattagagttccatatccaaattatggttcatccggttcaactcaacctaagttcatgga 27383171  T
Q  108 gtttatcccaactccaggatttccaaag 135  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||    
T  27383172 gtttatcccaacccccggattttcaaag 27383199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Original strand, 44973441 - 44973547
Alignment:
Q  29 atccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||| ||  ||||||||  | | ||||||||||||||||| ||| || ||    
T  44973441 atccaactgctcctggagttattaaagtaccatatccaaattatggtccatccggtttaactcaacctaagttcatggagtttatcccaaatcccggctt 44973540  T
Q  129 tccaaag 135  Q
    |||||||    
T  44973541 tccaaag 44973547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 166
Target Start/End: Original strand, 50132443 - 50132587
Alignment:
Q  29 atccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatt 128  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||||||  | | |||||||||||||| ||| || || ||    
T  50132443 atccaactgctcctgacgttattagagtaccatatccaaattatggtccatccggttcaactcaacctaagttcatggagtttatcctaacccctggctt 50132542  T
Q  129 tccaaagca-------ttaatgcatgtttaaattatgcttttgga 166  Q
    ||||||| |       || ||||||||||||||||||||||||||    
T  50132543 tccaaagaagtgatacttgatgcatgtttaaattatgcttttgga 50132587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 9591004 - 9590877
Alignment:
Q  8 tgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgga 107  Q
    ||||||||||||  |||  | |||||||||||||||  | ||||| ||| ||| |||||| ||| || ||||||| ||| |||||| |  ||| ||||||    
T  9591004 tgaggggtcttgtaccagcacatccaactgctcctgacgctattaaagtaccatatccaagttatggtccatccggttcgactcaatctaaattcatgga 9590905  T
Q  108 gtttatcccaactccaggatttccaaag 135  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||    
T  9590904 gtttatcccaacccccagatttccaaag 9590877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Original strand, 4613973 - 4614079
Alignment:
Q  29 atccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatt 128  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||| ||| ||||   ||| |||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| || ||||||||||  |||||||    
T  4613973 atccaattgctcctagacttattagagtaccatatcctggttatgggccatccggttcaactcaacctaaattcatgaagcttatcccaacctcaggatt 4614072  T
Q  129 tccaaag 135  Q
    |||||||    
T  4614073 tccaaag 4614079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 131
Target Start/End: Original strand, 10767218 - 10767300
Alignment:
Q  49 attagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttcc 131  Q
    ||||| |||||| ||||||  || || ||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  10767218 attagggttccatatccaacctatggtccacccggttcgactcaacctcaattcatggagtttataccaactcccggatttcc 10767300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 114
Target Start/End: Original strand, 7150015 - 7150111
Alignment:
Q  18 tgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatc 114  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| |  || |||||| ||| ||| ||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  7150015 tgctccaccacatccaactgctactgaagtcattagaatgtcatatccaagttatgggtcattcagttctactcaaccctaattcatggagtttatc 7150111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 17696666 - 17696906
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||    
T  17696666 acaccactgagggatcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttgttagagttccaaatccaaattacaggacatctgcttctactcaatcccaat 17696765  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||       
T  17696766 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgtttttgcactagtttaattaatgttttttggacttgttt--- 17696862  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaat 244  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17696863 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaat 17696906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 42518910 - 42518675
Alignment:
Q  9 gaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggag 108  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  42518910 gaggggtgctgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgagacatccacttcaactcaaccccaatacatggag 42518811  T
Q  109 tttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtttatg 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||   ||||||||    
T  42518810 tttatcccaactccagaatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttagttaatgttttttggacttgttt---agtttatg 42518714  T
Q  209 cttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42518713 tttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 42518675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 2767394 - 2767636
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  2767394 acaccactgaggggtcctactccgcaaaatccaactgctcctagagttattagagttccaattc-aaattacgggtcatatgcttctactcaaccccaat 2767492  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       
T  2767493 acatggagtttattccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggacttgttt--- 2767589  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2767590 agtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 2767636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Original strand, 39455623 - 39455862
Alignment:
Q  5 cactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacat 104  Q
    |||||||||||| | || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39455623 cactgaggggtcctacttcacaaaatccaattgctcttggagttattagagttccaaatccaaattaggggtcatccgcttctactctaccccaatacat 39455722  T
Q  105 ggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||   ||||    
T  39455723 ggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgctttttggacttgttt---agtt 39455819  T
Q  205 tatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39455820 tatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 39455862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 40560683 - 40560927
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaa-ccccaa 99  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  40560683 acaccattgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctagagttattagagttccaaatctaaattacgggtcatccgcttctactcaacccccaa 40560782  T
Q  100 tacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttat 199  Q
    ||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||      
T  40560783 tacatggagtttatccatactctagaatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttctggactagtttaattaatgttttttggacttgttt-- 40560880  T
Q  200 aagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  40560881 -agtttatgcttttttggatatgtaatcacctaagaacatcaaatgat 40560927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 44709441 - 44709197
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  44709441 acaccattgaggggtcctgctccacaaactccaactgctcttggagttattagagttctaaatctaaattacgggtcatccgcttttactcaaccccaat 44709342  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||       
T  44709341 acatggagtttatcccaactccatgatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgcttttagactagtttaattaatgctttttggacttgttt--- 44709245  T
Q  201 agtttatgc-ttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44709244 agtttatgctttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 44709197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14388777 - 14388535
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  14388777 acacaactgaggggtcg-gctccacaaaatccaactgctcctagagttattagagtttcaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaactccaat 14388679  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||       
T  14388678 acatgaagtttatcccaactctaggatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgcttttggactaatttaattaatgctttttggacttgttt--- 14388582  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14388581 agtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 14388535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 6797967 - 6798207
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    ||||| || |||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6797967 acaccgctaaggggtcccgctacacaaaatccaactgctcctgaagttattagagttccaaatccaaattttggatcatccgcttctactcaaccccaat 6798066  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| |||| ||| |||||||||||||||       
T  6798067 acatggagtttatcctaagtccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgttgttagactagtttaattaatgctttttggacttgttt--- 6798163  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaat 244  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6798164 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaat 6798207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19907929 - 19907778
Alignment:
Q  12 gggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagttt 111  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19907929 gggtcctgctccacaaaattcaactgctcatagagttattagatttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaatacatggagttt 19907830  T
Q  112 atcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19907829 atcccaactccaggatttccaaagcatttatgcttgtttaaattatgctttt 19907778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 39664432 - 39664281
Alignment:
Q  12 gggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagttt 111  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39664432 gggtcctgctccacaaaattcaactgctcctagagttattagagttccaaatccaaattacaggtcatccgcttctactcaacccctatacatggagttt 39664333  T
Q  112 atcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 163  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  39664332 atcccaactctaggatttccaaagcatttatgcttgtttaaattatgctttt 39664281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6784855 - 6784718
Alignment:
Q  50 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 149  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || | |||||||||    
T  6784855 ttagagttccaaatccaattttcgggccatccgcttctactcaaccgcagtacatggagtttatcccaactcaaggatttcgaaaacagtgatgcatgtt 6784756  T
Q  150 taaattatgcttttggactagttcaattgatgtttttt 187  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  6784755 ttaattatgcttttggactagtttaattaatgcttttt 6784718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 163
Target Start/End: Original strand, 37645962 - 37646098
Alignment:
Q  27 aaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccagga 126  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  37645962 aaatccaattgttcctggagttattagagtttcatatccaagttactggtcatccgcttctacttaaccccaatacatgaaatttatcccaactccagga 37646061  T
Q  127 tttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 163  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||    
T  37646062 tttccaaagcagtgttgcttgtttaaattatgctttt 37646098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 40151422 - 40151295
Alignment:
Q  8 tgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgga 107  Q
    ||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||   ||| |||||||  | |||||||||||| |||| ||||||    
T  40151422 tgaggggtcctgctccagcacatccaactgctcctggacttattagagtatcatatcctggttatgggccatatggttctactcaacctcaattcatgga 40151323  T
Q  108 gtttatcccaactccaggatttccaaag 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  40151322 gtttatcccaacaccaggatttccaaag 40151295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 174 - 247
Target Start/End: Original strand, 16763573 - 16763643
Alignment:
Q  174 aattgatgttttttggacttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16763573 aattaatgttttttggacttgttta---gtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 16763643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26584470 - 26584356
Alignment:
Q  20 ctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaac 119  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||    
T  26584470 ctccaccacatccaactgctcctagagttattagaatgacatatccaagttatggatcatccgattctactcaaccctaattcatcgagtatatcccaac 26584371  T
Q  120 tccaggatttccaaa 134  Q
     ||||||||| ||||    
T  26584370 cccaggattttcaaa 26584356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 122
Target Start/End: Original strand, 14000839 - 14000928
Alignment:
Q  33 aactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactcc 122  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||||||  | | |||||||||||||||||||||    
T  14000839 aactgctcatggcgttattagagtaccatatccaaattatggtccatccgattcaactcaacctaagttcatggagtttatcccaactcc 14000928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19907766 - 19907720
Alignment:
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19907766 agtttatgcttttttggatatgtgatcacttaagaacatcaaatgat 19907720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 39664269 - 39664223
Alignment:
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  39664269 agtttatgcttttttggatatataatcacttaagaacatcaaatgat 39664223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 16763525 - 16763569
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctgga 45  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16763525 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctgga 16763569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 135
Target Start/End: Original strand, 4046813 - 4046864
Alignment:
Q  84 ttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaag 135  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4046813 ttctactcaaccataattcatggagtttatcccaaccccaggatttccaaag 4046864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2853993 - 2853750
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  2853993 acaccattgaggggtcctgctccacaagatccaactgctcttggagttattagagttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccctaat 2853894  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       
T  2853893 acatggagtttatcccaactccaggatttctatagcattgatgcatgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgttttttggacttgttt--- 2853797  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2853796 agtttacgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 2853750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24540875 - 24540632
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24540875 acaccactgaggggtcctgctccacaagatccaacaactcttggagttattagaattccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaat 24540776  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||       
T  24540775 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatatttttggactagtttaattaatgctttttggacttgttt--- 24540679  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  24540678 agtttacgcttttttggatatgtgatcacttaataacatcaaatgat 24540632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 7268292 - 7268526
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||         || |||||||||||||| |||||    
T  7268292 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattaaagttccaaatacaaa---------attcgcttctactcaacgccaat 7268382  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||       
T  7268383 acatgaagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatattttttggacttgttt--- 7268479  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7268480 agtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 7268526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18624684 - 18624442
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  18624684 acacaactgaggggtcatgctccacaaaattcaactgctcctggagttattagagttctaaatccaaattacgggccatccatttctacacaaccccaat 18624585  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | || | ||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||       
T  18624584 agatggagtttatcccaactccaagatttccaaagtagtgatacttgtttaaattatgtttttggactagtttcattaatgctttttggacttgttt--- 18624488  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatga 246  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18624487 aatttatgcttttttggatatgtaatgacttaagaacatcaaatga 18624442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 247
Target Start/End: Original strand, 21841470 - 21841684
Alignment:
Q  21 tccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaact 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||         ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21841470 tccacaaaatccaactgctcctggagttattagagtttcaaatccaaa---------atccgcttctactcaacgccaatacatggagtttatcccaact 21841560  T
Q  121 ccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtttatgcttttttggaca 220  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |    
T  21841561 ccaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttctgggctagtttaattaatgttttttggacttgttt---agtttatgcttttttggata 21841657  T
Q  221 tgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  21841658 tgtaatcacttaagaacatcaaatgat 21841684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 63 - 247
Target Start/End: Original strand, 8540172 - 8540353
Alignment:
Q  63 tccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttt 162  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8540172 tccaaattacggaccatccgcttctactcaaccccaatacatgtagtttatccctactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttt 8540271  T
Q  163 tggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    ||||||| || |||| ||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8540272 tggactaatttaattaatgctttttggacttgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 8540353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 28820834 - 28821063
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||              |||||||||||    
T  28820834 acacgactgaagggtcctgctccacaaaatccaacttctcctggagttattaaagttccaaattcaaattacggg--------------tcaaccccaat 28820919  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       
T  28820920 acatgaagtttatcccaactccaagatttccaaagtattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggacttgttt--- 28821016  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  28821017 agtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacctcaaatgat 28821063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 12737579 - 12737730
Alignment:
Q  12 gggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagttt 111  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12737579 gggtcctgctccacaaaattcaactgctcctagagttattagatttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccgcaatacatggagttt 12737678  T
Q  112 atcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  12737679 atcccaactccaggatttccaaagcatttatgcttgtttaaattatgctttt 12737730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 12800402 - 12800553
Alignment:
Q  12 gggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagttt 111  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12800402 gggtcctgctccacaaaattcaactgctcctagagttattagatttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccgcaatacatggagttt 12800501  T
Q  112 atcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  12800502 atcccaactccaggatttccaaagcatttatgcttgtttaaattatgctttt 12800553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 17574767 - 17574981
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||||    
T  17574767 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaa---------atccgcttctactcaacgccaat 17574857  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||       
T  17574858 acatggagtttatcccaacttcagaatttccaaaacattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaat-ttttttggacttgttt--- 17574953  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatca 228  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||    
T  17574954 agtttatgctttttggtatatgtaatca 17574981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 30467946 - 30467790
Alignment:
Q  8 tgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgga 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30467946 tgaggggtcttgctccacaaaatctaactactcctagagttattagagttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaatacatgga 30467847  T
Q  108 gtttat-cccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 163  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  30467846 gtttatacccaacttcaggatttccaaagcattgatgcttgtttaaattatgctttt 30467790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 163
Target Start/End: Original strand, 2180257 - 2180400
Alignment:
Q  20 ctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaac 119  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2180257 ctccacaaaattcaactgctcctagagttattagagtttcaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaac 2180356  T
Q  120 tccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 163  Q
    || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2180357 tctaggatttccaaagcatttatgcttgtttaaattatgctttt 2180400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 42473046 - 42472909
Alignment:
Q  50 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||    
T  42473046 ttagagttccaaatccaatttacgggccatccgcttctactcaaccgcagtacatggagtttatcccaactccaggatttcgaaaacagtgatgcatgtt 42472947  T
Q  150 taaattatgcttttggactagttcaattgatgtttttt 187  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  42472946 ttaattatgcttttggactagtttaattaatgtttttt 42472909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 141 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 32135378 - 32135275
Alignment:
Q  141 atgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatc 240  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  32135378 atgcttgtttaaattatccttttagactagtttaattaatgctttttggacttgttta---gtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaatatc 32135282  T
Q  241 aaatgat 247  Q
    |||||||    
T  32135281 aaatgat 32135275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Original strand, 19997580 - 19997729
Alignment:
Q  18 tgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatccca 117  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||  ||||| | ||||| ||| |||||||||||| |||    
T  19997580 tgctccaccacatccaactgcttctgaagttattagaatgccatatccaagttatgggccatcctattctatttaaccctaattcatggagtttattcca 19997679  T
Q  118 actccagg-atttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttgga 166  Q
    || || || |||| ||||| | | |||| || ||||||||||||||||||    
T  19997680 acccccggaattttcaaagaagtgatgcttgattaaattatgcttttgga 19997729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 247
Target Start/End: Original strand, 12737742 - 12737788
Alignment:
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12737742 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 12737788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 247
Target Start/End: Original strand, 12800565 - 12800611
Alignment:
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12800565 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 12800611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15458085 - 15457980
Alignment:
Q  29 atccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatt 128  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||| |||  | ||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||  | |||||    
T  15458085 atccaactgctcctgacgttattagagtaccatatccaagttatagtccatccggttcgactcaacctaaattcatggagtttatcccaacctccggatt 15457986  T
Q  129 tccaaa 134  Q
    ||||||    
T  15457985 tccaaa 15457980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 228
Target Start/End: Original strand, 17576937 - 17577012
Alignment:
Q  149 ttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatca 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17576937 ttaatttatgcttttggactagtttaattaat-ttttttggacttgttta---gtttatgcttttttggatatgtaatca 17577012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 228
Target Start/End: Original strand, 17575631 - 17575701
Alignment:
Q  154 ttatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatca 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17575631 ttatgcttttggactagtttaattaat-ttttttggacttgttta---gtttatgcttttttggatatgtaatca 17575701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 247
Target Start/End: Original strand, 2180412 - 2180458
Alignment:
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2180412 agtttatgctttttttgatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 2180458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 9221339 - 9221238
Alignment:
Q  18 tgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatccca 117  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |  || |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||  | | ||||||||||||| ||    
T  9221339 tgctccaccacatccaactgctcctggagttgttagaatgacatatccaagttatgggccatccagttctactcaaccatagttcatggagtttatcaca 9221240  T
Q  118 ac 119  Q
    ||    
T  9221239 ac 9221238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 34328064 - 34328109
Alignment:
Q  3 accactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagtt 48  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34328064 accactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagtt 34328109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 27076244 - 27076371
Alignment:
Q  8 tgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgga 107  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||| ||||| ||| ||||| | |  || |||||| |||  |||||||   ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  27076244 tgaggggtcctgctccaccacatccaactactcctagagctattaaaatgtcatatccaagttataggccatctagttctactcatccctaattcatgga 27076343  T
Q  108 gtttatcccaactccaggatttccaaag 135  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  27076344 gtttatcccaaccccaagattttcaaag 27076371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 17515770 - 17516013
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17515770 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagtttcaaatccaaattccgggtcatccgcttctactcaaccccaat 17515869  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||       
T  17515870 acatggagtttatcccaactccaagatttccaaagtattgatgcatgtttaaattatgtttttgaactagtttaattaatgctttttggacttgttt--- 17515966  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17515967 agtttatgcttttctggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 17516013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 44275900 - 44275657
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  44275900 acaccactgaggggtcctgctccacaaaattcaactgctcatggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatccgcttctacttaaccccaat 44275801  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||| |||       
T  44275800 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttaatcaatgctttttagacttattt--- 44275704  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44275703 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 44275657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 247
Target Start/End: Original strand, 43765585 - 43765823
Alignment:
Q  6 actgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatg 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  43765585 actgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctgctggagttattagagttcaaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaagcccaatacgtg 43765684  T
Q  106 gagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagttt 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||   |||||    
T  43765685 gagtttatcccaactccagaatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgttttttggacttattt---agttt 43765781  T
Q  206 atgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43765782 atgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 43765823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Original strand, 21349161 - 21349397
Alignment:
Q  8 tgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgga 107  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21349161 tgaggggccctgctccacaaaatccaattgctcctggagttagtagagttccaaatccaaattacgggccatccacttctactcaaccccaatacatgga 21349260  T
Q  108 gtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtttat 207  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||   |||||||    
T  21349261 gtttatcccaacttcaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgctttttggacttgttt---agtttat 21349357  T
Q  208 gcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  21349358 gcttttttggatatgtattcacataagaacatcaaatgat 21349397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 46198180 - 46198424
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  46198180 acaccactgaggggtcatactccacaaaattcaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggtcatccacttctactcaaccccaat 46198279  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttcc-aaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||      
T  46198280 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaaagcattgatgcatgtttaaattatatttttggactagtttaattaatgctttttggacttgttt-- 46198377  T
Q  200 aagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46198378 -agtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 46198424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23292854 - 23292610
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  23292854 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttcaaaatccaaattacaggtcatccgcttctactcaaccccaat 23292755  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||       
T  23292754 acatggagtttatccctacttcaggatttacaaagcattgatgcatgttcaaattatgcttttgaactagtttaattaatgctttttggacttgttt--- 23292658  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaag-aacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23292657 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaaacatcaaatgat 23292610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 2660673 - 2660916
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2660673 acaccacttaggggtcctgctccacaagatccaactgctcttggagttattagaattctaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaat 2660772  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       
T  2660773 acatggagtttatctcaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatatttttggactagtttaattaatgttttttggacttgttt--- 2660869  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  2660870 agtttacgcttttttggataagtaatcacttaagaacatcaaatgat 2660916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 44794667 - 44794910
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44794667 acaccactgaggggtcctgctccacaagatccaactgctcttggagttattagaatttcaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaat 44794766  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||       
T  44794767 acatggagtttatcccagctccagaatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatgtttttggactagtttaattaatgctttttggacttgttt--- 44794863  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  44794864 agtttacgcttttttggatatataatcacttaagaacatcaaatgat 44794910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 51685060 - 51685302
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51685060 acaccactaaggggtcctgctccacaacatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 51685159  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||| || |||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||       
T  51685160 acatggagtttatcccaattccaagatttccaaagcagtgatgcttgcttaaattatgttttttgactagtttaattaatgttttttggacttgttt--- 51685256  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatga 246  Q
    | |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  51685257 aatttatgtttttttggatatgtaatgacttaagaacatcaaatga 51685302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7884568 - 7884334
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||||    
T  7884568 acaccactgaggggtcctgctccacaaaattcaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaa---------atccgcttctactcaacgccaat 7884478  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       
T  7884477 acatggagtttatcccaactcgaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggacttgttt--- 7884381  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7884380 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 7884334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 41978197 - 41978431
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         || |||||||||||||| |||||    
T  41978197 acaccactgaggggtcctgctccacaaaattcaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaa---------attcgcttctactcaacgccaat 41978287  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       
T  41978288 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgttttttggacttgttt--- 41978384  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41978385 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 41978431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 54898886 - 54899120
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||||    
T  54898886 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattaaagttccaaatccaaa---------atccgcttctactcaacgccaat 54898976  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||       
T  54898977 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaattttttttggacttgttt--- 54899073  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54899074 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 54899120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 35905407 - 35905173
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||||    
T  35905407 acaccactcaggggtcctgcaccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaa---------atccgcttctactcaacgccaat 35905317  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||       
T  35905316 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgattttggactagtttaattaatgttttttggacttgttt--- 35905220  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35905219 agtttatgattttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 35905173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2225848 - 2225614
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||  | |||    
T  2225848 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaa---------atccgcttctactcaatgcgaat 2225758  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||       
T  2225757 acatggagtttatcccaacttcaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgctttttgactagtttaattaatgttttttggacttgttt--- 2225661  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2225660 agtttatgattttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 2225614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 48830500 - 48830258
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  48830500 acaccattgaggggtcctgctccacaaaatccaactgcttctggagttattagagttccaaattcaaattgcggatcatccgcttctactcaaccccaat 48830401  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | | |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||       
T  48830400 acatggagtttatcccaattccaagatttccaaagtaatgatgcttgcttaaattatgtttttggactagtttaattaatgttttttgaacttgttt--- 48830304  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatga 246  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  48830303 aatttatgcttttttggatatgtaatgacttaagaacatcaaatga 48830258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 53190532 - 53190305
Alignment:
Q  8 tgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgga 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53190532 tgaggggtcctgctccacaaaatccaactgcttctgaagttattagagttccaaatccaaa---------atccgcttctactcaacgccaatacatgga 53190442  T
Q  108 gtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataagtttat 207  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||   |||||||    
T  53190441 gtttatcccaacttcaggatttccaaagcattgatacttgtttaaattatgctttttgactagtttaattaatgttttttggacttgttt---agtttat 53190345  T
Q  208 gcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53190344 gcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 53190305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 42279956 - 42280198
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||    
T  42279956 acaccaccgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattgcgagccatccacttccactcaaccccaat 42280055  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||       
T  42280056 acatggagtttatcccaattccaggatctccaaagcagtgatgcttgcttaaattatgtttttggactagtttaattaatgcttttttgacttgttt--- 42280152  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatga 246  Q
    | |||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  42280153 aatttatgctttttggaatatgtaatgacttaagaacatcaaatga 42280198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 610060 - 610302
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||||||||||    
T  610060 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccaaccacctctatacaaccccaat 610159  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||||| |||||       
T  610160 acatggagtttatcccaactctaagattttcaaagctgtgatgcttgtttaaattatgtttttggactagtttcattaatgctttttggacatgttt--- 610256  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatga 246  Q
    | ||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  610257 actttatgcttttttggatgtgtaatgacttatgaacatcaaatga 610302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 27898764 - 27898613
Alignment:
Q  12 gggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagttt 111  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27898764 gggtcctgctccacaaaattcaactgctcctagagttattagagttccaaatccaaattaggggtcatccgcttctactcaaccccaatacatggagttt 27898665  T
Q  112 atcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  27898664 atcccaactccaggatttccaaagcatttatgcttgtttaaattatgttttt 27898613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 2377490 - 2377641
Alignment:
Q  12 gggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagttt 111  Q
    ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377490 gggtcctgttccacaaaattcaactgctcctagagttattacagtttcaaatccaaattatgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagttt 2377589  T
Q  112 atcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 163  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  2377590 aacccaactccaggatttccaaagcatttatgcttgtttaaattatactttt 2377641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 93 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 30599791 - 30599641
Alignment:
Q  93 accccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggact 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  30599791 accccaatacatggagtttatcccaactctagaatttccaaagcattgatgcatgttaaaattatgcttttgaactagtttaattaatgctttttggact 30599692  T
Q  193 tgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatga 246  Q
    |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30599691 tgttt---agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatga 30599641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 53093601 - 53093464
Alignment:
Q  50 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  53093601 ttagagttccaaatccaaattacgggtcatccacttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaaacagtgatgcatgtt 53093502  T
Q  150 taaattatgcttttggactagttcaattgatgtttttt 187  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  53093501 ttaattatgcttttggactagtttaattaatgcttttt 53093464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 172
Target Start/End: Original strand, 46309570 - 46309692
Alignment:
Q  50 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||    
T  46309570 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccacttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaagatttccaaaacagtgatgcatgtt 46309669  T
Q  150 taaattatgcttttggactagtt 172  Q
    | ||||||| |||||||||||||    
T  46309670 ttaattatgtttttggactagtt 46309692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 38192838 - 38192716
Alignment:
Q  50 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtt 149  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  38192838 ttagagtttcaaattcaaattacgggccatctgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttccaaaacagtgatgcatgtt 38192739  T
Q  150 taaattatgcttttggactagtt 172  Q
    | | |||||||||||||||||||    
T  38192738 ttagttatgcttttggactagtt 38192716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 46112936 - 46113133
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    ||||||||||| |||| |  ||||| ||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||    
T  46112936 acaccactgagtggtcctcttccacaaaatcaaattgctactggaattattagagttccaaatccaaattacgggctatccacttctatacaaccccaat 46113035  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgttta 198  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||   | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||  ||||||| |||||||    
T  46113036 acatggagtttatcccaactctaagatttcgaaagttgtgatgcttgtttaaattatgtttttggactagtttcattaatgccttttggaattgttta 46113133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 168
Target Start/End: Original strand, 24845367 - 24845523
Alignment:
Q  8 tgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgga 107  Q
    |||| |||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    | ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  24845367 tgagtggtcctgctctacaaaattcaattgctcctggagttattagagttccata----agttacgggtcatctgcttctactcaaccccattacacgga 24845462  T
Q  108 gtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggact 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24845463 gtttatcccaactccaggatttccaaagcagtgatgcttgtttaaattatgcttttggact 24845523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 166
Target Start/End: Original strand, 5134038 - 5134180
Alignment:
Q  31 ccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttc 130  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||  ||| ||||||||  | | ||||||||||||||||||||  || ||||    
T  5134038 ccaactgctcctggcgttattagagtaccatatccaaattatggtccatccagttcaactcaacctaagttcatggagtttatcccaactctcggctttc 5134137  T
Q  131 caaagca-------ttaatgcatgtttaaattatgcttttgga 166  Q
    ||||| |       || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5134138 caaagaagtgatacttgatgcatgtttaaattatgcttttgga 5134180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27898620 - 27898555
Alignment:
Q  179 atgttttttggacttgtttataagtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27898620 atgttttttgaacttgttta---gtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 27898555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 166
Target Start/End: Original strand, 5126783 - 5126925
Alignment:
Q  31 ccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatttc 130  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||||| || ||||||| ||| ||||||||  | | ||||||||||||||||||||  || ||||    
T  5126783 ccaactgctcttggcgttattagagtatcatatccaaattatggtccatccggttcaactcaacctaagttcatggagtttatcccaactctcggctttc 5126882  T
Q  131 caaagca-------ttaatgcatgtttaaattatgcttttgga 166  Q
    ||||| |       || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5126883 caaagaagtgatacttgatgcatgtttaaattatgcttttgga 5126925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Original strand, 41624696 - 41624802
Alignment:
Q  29 atccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcccaactccaggatt 128  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||  ||| ||||||||  | | ||||||||||||||||||| | || ||    
T  41624696 atcctactgctcctggcgttattagagtaccatatccaaattatggtccatccagttcaactcaacctaagttcatggagtttatcccaactgccggctt 41624795  T
Q  129 tccaaag 135  Q
    |||||||    
T  41624796 tccaaag 41624802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 135
Target Start/End: Original strand, 54093512 - 54093639
Alignment:
Q  8 tgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgga 107  Q
    ||||||||| ||| |||  | |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||| ||| |||||| |  | | ||||||    
T  54093512 tgaggggtcctgcaccaacacatccaactgctcctagcgttattagaattccatatccaaattatggttcatccggttcaactcaatctaagttcatgga 54093611  T
Q  108 gtttatcccaactccaggatttccaaag 135  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||    
T  54093612 gtttatcccaacccccagatttccaaag 54093639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 247
Target Start/End: Original strand, 2377653 - 2377699
Alignment:
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377653 agtttatacttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 2377699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 22219795 - 22219661
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||| ||| || || |||||||| | |||||||||||  ||||||||||||| |  || ||  || ||| ||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  22219795 acaccagtgaaggttcctgctccaccacatccaactgcttatggagttattagaatgtcatattaaagttatgggtcatccggttctactcaaccctaat 22219696  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaag 135  Q
     ||||||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  22219695 tcatggagtttatctcaaccccgggattttcaaag 22219661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 107
Target Start/End: Original strand, 28626932 - 28626981
Alignment:
Q  58 ccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgga 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28626932 ccaaatccaatttacgggccatccgcttctactcaaccgcagtacatgga 28626981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 7589986 - 7589868
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||  | |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||   || || ||| ||||||||  |||    
T  7589986 acaccaatgaggggtcctgcaccagcatatccaactactcctggcgttattagagtaccatatccaagttatggtttattcggttcgactcaacctaaat 7589887  T
Q  101 acatggagtttatcccaac 119  Q
     |||| |||||||||||||    
T  7589886 tcatgaagtttatcccaac 7589868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 35863119 - 35863049
Alignment:
Q  45 agttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatggagtttatcc 115  Q
    |||||||||||| ||| || ||| ||| | | |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  35863119 agttattagagtaccatattcaagttatgtgtcatccggttctactcaatcccaattcatggagtttatcc 35863049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 8710 - 8953
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8710 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatacaactgctcatagagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaat 8809  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||       
T  8810 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaaacattgatacttgtttaaattatgcttttggactagtttaattaatgtttttcggacttgttt--- 8906  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8907 agtttatgcttttttggatatgtaatcacttacgaacatcaaatgat 8953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 247
Target Start/End: Original strand, 3745 - 3987
Alignment:
Q  2 caccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaata 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3745 caccactgaggggtcctgctccacaagatctaactgctcttggagttattagaattccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaata 3844  T
Q  102 catggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataa 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||   |    
T  3845 catggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatatttttggactaatttaattaatgctttttggacttgttt---a 3941  T
Q  202 gtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3942 gtttacgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 3987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 247
Target Start/End: Original strand, 4917 - 5159
Alignment:
Q  2 caccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaata 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4917 caccactgaggggtcctgctccacaagatctaactgctcttggagttattagaattccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaata 5016  T
Q  102 catggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttataa 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||   |    
T  5017 catggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattgatgcatgtttaaattatatttttggactaatttaattaatgctttttggacttgttt---a 5113  T
Q  202 gtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5114 gtttacgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 5159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 108261 - 108019
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| || ||||||||||    
T  108261 acaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggatttattagagttccaaatccaaatttcgggtcatccacttccacacaaccccaat 108162  T
Q  101 acatggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgcttttggactagttcaattgatgttttttggacttgtttata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||| |||||||||||||||       
T  108161 acatggagtttatcccaactccaagatttccaaagtagtgatgcttgtttaaattatgtttttggattagtttcattaatgctttttggacttgttt--- 108065  T
Q  201 agtttatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatga 246  Q
    | |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  108064 aatttatgtttttttggatatgtaatgacttaagaatatcaaatga 108019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0345
Description:

Target: scaffold0345; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Original strand, 29 - 187
Alignment:
Q  5 cactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacat 104  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29 cactgagggatcctgctccacaaaaaccaaccgctcctagagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaatacat 128  T
Q  105 ggagtttatcccaactccaggatttccaaagcattaatgcatgtttaaattatgctttt 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||    
T  129 ggagtttatcccaactctaggatttccaaagcattgatgtttgtttgaattatgctttt 187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 247
Target Start/End: Original strand, 203 - 245
Alignment:
Q  205 tatgcttttttggacatgtaatcacttaagaacatcaaatgat 247  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  203 tatgcttttttggatttgtaatcacttaagaacatcaaatgat 245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1454 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1454
Description:

Target: scaffold1454; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 1714 - 1781
Alignment:
Q  1 acaccactgaggggtcttgctccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaa 68  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  1714 acaccactgaggggtcatgcttcacaaaatccaactgctcctaaagttattagagtttcaaatccaaa 1781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University