View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11932_low_62 (Length: 279)

Name: NF11932_low_62
Description: NF11932
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11932_low_62
NF11932_low_62
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (25-239)||(20524126-20524340)
chr6 (26-239)||(7372155-7372367)
chr6 (25-239)||(7050498-7050712)
chr6 (25-239)||(32438251-32438465)
chr6 (25-220)||(18644031-18644226)
chr6 (63-239)||(11355948-11356124)
chr6 (25-239)||(10569141-10569353)
chr6 (25-177)||(32517672-32517824)
chr6 (123-239)||(6900225-6900341)
chr6 (25-129)||(6901999-6902103)
chr6 (56-138)||(33268073-33268155)
chr6 (25-128)||(32455022-32455125)
chr6 (85-169)||(24431587-24431671)
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (25-239)||(41760898-41761112)
chr4 (25-239)||(42981359-42981573)
chr4 (25-238)||(43520178-43520391)
chr4 (25-239)||(35402839-35403053)
chr4 (25-239)||(49523871-49524085)
chr4 (25-239)||(11255101-11255315)
chr4 (25-239)||(51012666-51012880)
chr4 (25-239)||(48645918-48646130)
chr4 (38-239)||(41782261-41782462)
chr4 (25-239)||(54386880-54387094)
chr4 (38-213)||(319846-320021)
chr4 (38-213)||(4172686-4172861)
chr4 (38-213)||(33265350-33265525)
chr4 (29-239)||(2692461-2692671)
chr4 (38-213)||(43507993-43508168)
chr4 (86-239)||(11602416-11602569)
chr4 (25-202)||(834226-834402)
chr4 (61-190)||(11640838-11640967)
chr4 (100-189)||(52867414-52867503)
chr4 (25-202)||(5438561-5438733)
chr4 (85-169)||(7150221-7150305)
[»] chr3 (31 HSPs)
chr3 (25-239)||(30599378-30599592)
chr3 (25-239)||(2377755-2377969)
chr3 (25-239)||(43765880-43766094)
chr3 (25-239)||(23292340-23292554)
chr3 (25-239)||(27898285-27898499)
chr3 (25-239)||(44275387-44275601)
chr3 (26-239)||(21349453-21349666)
chr3 (28-239)||(2660973-2661184)
chr3 (38-239)||(2225356-2225555)
chr3 (25-239)||(17516069-17516282)
chr3 (25-239)||(44794958-44795172)
chr3 (55-239)||(41978487-41978671)
chr3 (25-239)||(35904896-35905113)
chr3 (25-239)||(46198479-46198692)
chr3 (55-239)||(7884094-7884278)
chr3 (25-239)||(48829995-48830209)
chr3 (25-239)||(46113226-46113440)
chr3 (25-239)||(42280246-42280461)
chr3 (25-239)||(51685350-51685564)
chr3 (38-211)||(38192457-38192630)
chr3 (40-213)||(46609724-46609897)
chr3 (25-181)||(54899250-54899406)
chr3 (38-213)||(53093197-53093372)
chr3 (25-239)||(610353-610567)
chr3 (38-213)||(46309776-46309951)
chr3 (113-239)||(53190118-53190247)
chr3 (85-191)||(24845668-24845776)
chr3 (25-117)||(53188871-53188963)
chr3 (181-239)||(54899172-54899230)
chr3 (85-169)||(35862691-35862775)
chr3 (85-174)||(22219218-22219308)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (25-239)||(27691905-27692119)
chr8 (25-239)||(41041755-41041969)
chr8 (25-239)||(33707981-33708195)
chr8 (25-239)||(42942533-42942747)
chr8 (25-239)||(22272998-22273212)
chr8 (25-239)||(40338851-40339065)
chr8 (55-239)||(8609008-8609192)
chr8 (55-239)||(38547966-38548150)
chr8 (55-239)||(13107574-13107758)
chr8 (55-239)||(13283135-13283314)
chr8 (25-179)||(5037235-5037389)
chr8 (25-210)||(9672346-9672531)
chr8 (25-220)||(26239613-26239808)
chr8 (25-213)||(29237959-29238147)
chr8 (38-213)||(35510181-35510356)
chr8 (25-239)||(7744302-7744516)
chr8 (38-213)||(33761643-33761818)
chr8 (38-213)||(600809-600984)
chr8 (25-220)||(41824842-41825037)
chr8 (25-213)||(15307058-15307245)
chr8 (25-213)||(15487427-15487614)
chr8 (25-213)||(27405314-27405501)
chr8 (92-239)||(13485351-13485493)
chr8 (25-178)||(3152710-3152863)
chr8 (85-174)||(11720608-11720697)
chr8 (28-72)||(13485307-13485351)
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (25-243)||(32135005-32135223)
chr5 (26-239)||(28821119-28821332)
chr5 (25-239)||(8540410-8540624)
chr5 (25-239)||(30464808-30465022)
chr5 (25-239)||(2180514-2180727)
chr5 (25-239)||(2853439-2853653)
chr5 (25-239)||(21841740-21841954)
chr5 (25-239)||(12737844-12738058)
chr5 (25-239)||(12800667-12800881)
chr5 (55-239)||(7268584-7268768)
chr5 (88-239)||(24540425-24540576)
chr5 (25-213)||(42472654-42472841)
chr5 (25-138)||(40781430-40781543)
chr5 (29-153)||(41494617-41494741)
chr5 (26-138)||(29620912-29621024)
chr5 (85-169)||(27076733-27076817)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (25-239)||(14388273-14388487)
chr2 (25-244)||(40560978-40561197)
chr2 (25-239)||(6798264-6798478)
chr2 (25-220)||(2767691-2767886)
chr2 (25-239)||(19907450-19907664)
chr2 (25-239)||(16763704-16763918)
chr2 (25-239)||(17696965-17697179)
chr2 (67-239)||(39663994-39664166)
chr2 (25-239)||(39455918-39456131)
chr2 (93-239)||(44708996-44709142)
chr2 (25-213)||(24206710-24206900)
chr2 (25-213)||(6784459-6784648)
chr2 (145-239)||(42518524-42518618)
chr2 (25-138)||(37021388-37021501)
chr2 (130-175)||(37646238-37646283)
chr2 (85-169)||(161216-161300)
chr2 (25-65)||(34401354-34401394)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (25-239)||(37114699-37114913)
chr7 (25-239)||(6604264-6604478)
chr7 (25-239)||(38473295-38473508)
chr7 (28-239)||(23905426-23905637)
chr7 (28-239)||(27665220-27665431)
chr7 (25-239)||(22154639-22154853)
chr7 (25-239)||(22210554-22210768)
chr7 (25-239)||(45360076-45360290)
chr7 (25-239)||(29995687-29995901)
chr7 (25-239)||(35692521-35692735)
chr7 (25-239)||(39858413-39858627)
chr7 (25-239)||(13168822-13169036)
chr7 (25-239)||(46438681-46438895)
chr7 (28-239)||(34776135-34776346)
chr7 (25-239)||(24227592-24227806)
chr7 (25-234)||(38550441-38550650)
chr7 (56-239)||(37792236-37792419)
chr7 (38-213)||(35402545-35402719)
chr7 (59-239)||(48851529-48851708)
chr7 (25-220)||(47385386-47385576)
chr7 (45-147)||(69032-69134)
chr7 (25-138)||(20478921-20479034)
chr7 (143-213)||(66845-66915)
chr7 (76-191)||(48310750-48310867)
chr7 (85-169)||(13035621-13035705)
chr7 (193-239)||(30939748-30939794)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (25-239)||(3012624-3012838)
chr1 (25-239)||(31237677-31237891)
chr1 (25-239)||(26224724-26224938)
chr1 (25-239)||(2870338-2870552)
chr1 (25-239)||(6817887-6818101)
chr1 (25-239)||(46582759-46582973)
chr1 (25-239)||(51895336-51895550)
chr1 (25-239)||(27088026-27088241)
chr1 (55-239)||(34777338-34777522)
chr1 (55-239)||(4855167-4855351)
chr1 (25-239)||(50555273-50555488)
chr1 (25-213)||(33600323-33600511)
chr1 (25-177)||(25277546-25277698)
chr1 (25-239)||(15105185-15105399)
chr1 (25-177)||(37345137-37345289)
chr1 (38-213)||(8168515-8168690)
chr1 (25-177)||(45045674-45045826)
chr1 (56-201)||(52642838-52642981)
chr1 (25-138)||(9120813-9120926)
chr1 (25-138)||(1443400-1443513)
chr1 (25-138)||(47012213-47012326)
chr1 (85-169)||(3370338-3370422)
[»] scaffold0564 (1 HSPs)
scaffold0564 (25-239)||(9008-9222)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (25-239)||(4043-4257)
scaffold0058 (25-239)||(5215-5429)
[»] scaffold0345 (1 HSPs)
scaffold0345 (63-239)||(301-477)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (25-239)||(107756-107970)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (29-91)||(1690-1752)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20524340 - 20524126
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20524340 ttcaatcaaattggtccttgaattatatatgtatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 20524241  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  20524240 atcactatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataag 20524141  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  20524140 tcatatatttgatgt 20524126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 239
Target Start/End: Original strand, 7372155 - 7372367
Alignment:
Q  26 tcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagata 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  7372155 tcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaatcga-a 7372253  T
Q  126 tcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | ||    
T  7372254 tcactgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagt 7372353  T
Q  226 catatatttgatgt 239  Q
    ||||||||||||||    
T  7372354 catatatttgatgt 7372367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7050712 - 7050498
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  7050712 ttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtcattgaattttcacaacatat 7050613  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  7050612 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataag 7050513  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  7050512 tcatatatttgatgt 7050498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 32438251 - 32438465
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32438251 ttcaatcatattggtcctttaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaatagat 32438350  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | |    
T  32438351 atcactatgatccttggtccatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataag 32438450  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  32438451 tcatatatttgatgt 32438465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18644226 - 18644031
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18644226 ttcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccattatttcgatcatcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 18644127  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatca 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  18644126 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatca 18644031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 63 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11356124 - 11355948
Alignment:
Q  63 catatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaa 162  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11356124 catatcgatcctcaaattagtaaaaataccatcaaacaggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaa 11356025  T
Q  163 gtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  11356024 gtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcattagtcatatatttgatgt 11355948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10569353 - 10569141
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    ||||||||||||  |||||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||    
T  10569353 ttcaatcaaattgatccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttca--acatat 10569256  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| | |    
T  10569255 atcattgtgatccttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaaaacagacactttgattgtaaaaagatagacatttgcatatcatcataag 10569156  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  10569155 tcatatatttgatgt 10569141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 32517824 - 32517672
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  32517824 ttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcataccgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaatagttccttgaattttcacaacagac 32517725  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32517724 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 32517672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6900341 - 6900225
Alignment:
Q  123 atatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcaga 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| | |    
T  6900341 atatcactgtgatccttggttcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaggacagacatttgcataccattata 6900242  T
Q  223 ggtcatatatttgatgt 239  Q
     |||||| |||||||||    
T  6900241 agtcatacatttgatgt 6900225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 6902103 - 6901999
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  6902103 ttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcaatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttcacaacatat 6902004  T
Q  125 atcac 129  Q
    |||||    
T  6902003 atcac 6901999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 138
Target Start/End: Original strand, 33268073 - 33268155
Alignment:
Q  56 tatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 138  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  33268073 tatccatcatatcgatccctaaattattgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcaatgtgatcct 33268155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 32455022 - 32455125
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  32455022 ttcaattacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagag 32455121  T
Q  125 atca 128  Q
    ||||    
T  32455122 atca 32455125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 169
Target Start/End: Original strand, 24431587 - 24431671
Alignment:
Q  85 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 169  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |   |||| || |||  ||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||    
T  24431587 aaaataccatcaaataagtccttgaattatttaaacaaatgtcaacgtgatccttggtgcatatatgtgcagaattaagtaaaaa 24431671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 41760898 - 41761112
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  41760898 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcataccagat 41760997  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  41760998 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataag 41761097  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  41761098 tcatatatttgatgt 41761112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 42981573 - 42981359
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42981573 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatctatcatatcgatccttaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacaggt 42981474  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  42981473 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataag 42981374  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  42981373 tcatatatttgatgt 42981359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 43520391 - 43520178
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43520391 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaatagatccttgaattttcacaacagat 43520292  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | |    
T  43520291 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataag 43520192  T
Q  225 tcatatatttgatg 238  Q
    ||||||||||||||    
T  43520191 tcatatatttgatg 43520178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 35402839 - 35403053
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35402839 ttcaatcaaattggttcttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 35402938  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | |    
T  35402939 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaacgacagacactttgattataaaaagacaaacatttgcataccatcataag 35403038  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  35403039 tcatatatttgatgt 35403053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 49524085 - 49523871
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49524085 ttcaatcaaattggtcattgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacaaat 49523986  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| | |    
T  49523985 ataactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaacacagacatttgcataccatcataag 49523886  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  49523885 tcatatatttgatgt 49523871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 11255101 - 11255315
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11255101 ttcaatcaaattgatcgttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 11255200  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |    
T  11255201 atcactgtgatcattagtgcatacatttgctgagcaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagatatttgcataccatcataag 11255300  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  11255301 tcatatatttgatgt 11255315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 51012880 - 51012666
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51012880 ttcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcaatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttaaattttcacaacagat 51012781  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | |    
T  51012780 attactgcgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataag 51012681  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  51012680 tcatatatttgatgt 51012666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 48645918 - 48646130
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  48645918 ttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatat 48646017  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || |||||||||| ||||| | |    
T  48646018 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaataaagtaaaaagtaaaagacaaatactttgattgtaaaaag--agacatttgcataccatcataag 48646115  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  48646116 tcatatatttgatgt 48646130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 38 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41782462 - 41782261
Alignment:
Q  38 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 137  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41782462 gtccttgaattatatgcatatccatcatatcaatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaattggtccttgatttttcacaacagatatcaccgtgatcc 41782363  T
Q  138 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgat 237  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |  |||| | ||||||||||||||    
T  41782362 ttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatatgcacactatcataagtcatatatttgat 41782263  T
Q  238 gt 239  Q
    ||    
T  41782262 gt 41782261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 54387094 - 54386880
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  54387094 ttcaatcaaattggtccttcgattgtatgtctctccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatat 54386995  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  54386994 atcactgcaattcttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataag 54386895  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    ||||| |||||||||    
T  54386894 tcatacatttgatgt 54386880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 38 - 213
Target Start/End: Original strand, 319846 - 320021
Alignment:
Q  38 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 137  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  319846 gtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcc 319945  T
Q  138 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 213  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  319946 tttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 320021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 38 - 213
Target Start/End: Original strand, 4172686 - 4172861
Alignment:
Q  38 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 137  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  4172686 gtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcc 4172785  T
Q  138 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 213  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4172786 tttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 4172861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 38 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33265525 - 33265350
Alignment:
Q  38 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 137  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  33265525 gtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcc 33265426  T
Q  138 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 213  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33265425 tttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 33265350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 239
Target Start/End: Original strand, 2692461 - 2692671
Alignment:
Q  29 atcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatca 128  Q
    |||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  2692461 atcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatca 2692560  T
Q  129 ctgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcat 228  Q
     ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||    
T  2692561 ttgtgatccttggttcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcat 2692660  T
Q  229 atatttgatgt 239  Q
    | |||||||||    
T  2692661 acatttgatgt 2692671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43508168 - 43507993
Alignment:
Q  38 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 137  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||    
T  43508168 gtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaagataccatcaaattggtccttgaattatcataacaaatatcaatgtgatcc 43508069  T
Q  138 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 213  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43508068 tttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 43507993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 86 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11602569 - 11602416
Alignment:
Q  86 aaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacact 185  Q
    |||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11602569 aaatacaatcaaataagtcgttcaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatctgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacatacact 11602470  T
Q  186 ttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 239  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | |||| | |||||||||    
T  11602469 ttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcacacatttgatgt 11602416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 202
Target Start/End: Original strand, 834226 - 834402
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  834226 ttcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaacatcaaattggtccttgaattatcataacagaa 834325  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagaca 202  Q
    |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  834326 atcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaag-aaaaaataaaagacaaacactttgaatataaaaagaca 834402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11640967 - 11640838
Alignment:
Q  61 atcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaaca 160  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11640967 atcatatcgatctccaaattagtgaaaatacaatcaaataagtcgttcaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatctgctgaaca 11640868  T
Q  161 aagtaaaaagtaaaagacaaacactttgat 190  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11640867 aagtaaaaagtaaaaaacatacactttgat 11640838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 189
Target Start/End: Original strand, 52867414 - 52867503
Alignment:
Q  100 aggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttga 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  52867414 aggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtagaagacagacactttga 52867503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5438733 - 5438561
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||||||    |||||||||| ||| ||||||     
T  5438733 ttcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaacatcaaa----tccttgaattatcataacagaa 5438638  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagaca 202  Q
    |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5438637 atcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaag-aaaaaataaaagacaaacactttgaatataaaaagaca 5438561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 7150305 - 7150221
Alignment:
Q  85 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 169  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |   ||||||| ||| |||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||    
T  7150305 aaaataccatcaaataagtcctttaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggcgcatatatgtgtagaacaaagtaaaaa 7150221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 31)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 30599378 - 30599592
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30599378 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatattgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 30599477  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  30599478 atcactgtgatccttggtgcatacatttgcagaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataag 30599577  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  30599578 tcatatatttgatgt 30599592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2377969 - 2377755
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377969 ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcataacgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 2377870  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |      
T  2377869 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaatatttgcatatcatcataaa 2377770  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  2377769 tcatatatttgatgt 2377755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 43766094 - 43765880
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43766094 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcatcaaattagtgaaaatactatcaaatatgtccttgaattttcacaacagat 43765995  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |      
T  43765994 atcactatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataaa 43765895  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  43765894 tcatatatttgatgt 43765880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 23292340 - 23292554
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23292340 ttcaatcaaattgatccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 23292439  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  23292440 atcattgtgatccttggtgcataaatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataag 23292539  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  23292540 tcatatatttgatgt 23292554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 27898285 - 27898499
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27898285 ttcaatcaagttggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 27898384  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |      
T  27898385 atcactgtgatccctggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataaa 27898484  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  27898485 tcatatatttgatgt 27898499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 44275387 - 44275601
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  44275387 ttcaatcaaattggtccttgaattatacacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggttcttgaattttcacaatagat 44275486  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  44275487 atcattgtgatccttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaattaaaagacaaacactttgattataaaaagacagtcatttgcataccatcataag 44275586  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  44275587 tcatatatttgatgt 44275601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21349666 - 21349453
Alignment:
Q  26 tcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagata 125  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  21349666 tcaatcaaattggtcattgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacaatta 21349567  T
Q  126 tcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggt 225  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||| | ||    
T  21349566 tcactgtggtccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagatagacatttgcatactatcataagt 21349467  T
Q  226 catatatttgatgt 239  Q
    ||||||||||||||    
T  21349466 catatatttgatgt 21349453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2661184 - 2660973
Alignment:
Q  28 aatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatc 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2661184 aatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattggtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatc 2661085  T
Q  128 actgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtca 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | ||||    
T  2661084 actgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtca 2660985  T
Q  228 tatatttgatgt 239  Q
    ||||||||||||    
T  2660984 tatatttgatgt 2660973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 38 - 239
Target Start/End: Original strand, 2225356 - 2225555
Alignment:
Q  38 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2225356 gtccttgaattatatacatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 2225455  T
Q  138 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||  | ||||||||||||||    
T  2225456 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatc--aagtcatatatttgat 2225553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17516282 - 17516069
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516282 ttcaatcaaattggtccttgaattatatc-atatccatcatatcgatactcaaattagtaaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 17516184  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  17516183 atcattgtgatccttggtgcatacatttgcttaacaaagtaaaaagtaaaagacagatactttgattataaaaagacagacatttgcatatcatcataag 17516084  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  17516083 tcatatatttgatgt 17516069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 44795172 - 44794958
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44795172 ttcaatcaaattggttcttgaattatatccatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 44795073  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| | |    
T  44795072 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacggacattttcataccatcataag 44794973  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  44794972 tcatatatttgatgt 44794958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 55 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41978671 - 41978487
Alignment:
Q  55 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41978671 atatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 41978572  T
Q  155 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  41978571 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 41978487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 35904896 - 35905113
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35904896 ttcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcattgaattttcacaacagat 35904995  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatt---tgcatatcatcag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||   || ||| |||||     
T  35904996 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgatgaataccatcat 35905095  T
Q  222 aggtcatatatttgatgt 239  Q
    | ||||||||||||||||    
T  35905096 aagtcatatatttgatgt 35905113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 46198692 - 46198479
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  46198692 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatctatcatatcgatcctcaaattagtaaaaataccatcaaataggtcctggattttt-acaacagat 46198594  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| | |    
T  46198593 atcattgtgatctttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaaaacagacatttgcataccatcataag 46198494  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  46198493 tcatatatttgatgt 46198479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 55 - 239
Target Start/End: Original strand, 7884094 - 7884278
Alignment:
Q  55 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 154  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7884094 atatccatcatttcaatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 7884193  T
Q  155 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||    
T  7884194 tgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacactttgattataaaaagacacacatttgcctaccatcataagtcatatatttaatgt 7884278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 48829995 - 48830209
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  48829995 ttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatctccaaattagtgaaaataccatcaaacaagtccttgaattttcacaacatat 48830094  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| | |    
T  48830095 atcactgtgatccttagtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatatactttgattgtaaaaagacagacatttgtatatcatcataag 48830194  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  48830195 tcatatatttgatgt 48830209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 46113440 - 46113226
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||| | ||||||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |     
T  46113440 ttcaatcaaattggtccttctattgtatgtttatccatcacatcaatccctaaattagtgaagataccatcaaacaagtccttgaattttcacaacataa 46113341  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  46113340 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataag 46113241  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    ||||| |||||||||    
T  46113240 tcatacatttgatgt 46113226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 42280461 - 42280246
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  42280461 ttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcaatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttcacaacatat 42280362  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagta-aaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagag 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |     
T  42280361 atcattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataa 42280262  T
Q  224 gtcatatatttgatgt 239  Q
    |||||| |||||||||    
T  42280261 gtcatacatttgatgt 42280246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 51685564 - 51685350
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||| | |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  51685564 ttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatcgatcatatcaatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatat 51685465  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| | ||||| | |    
T  51685464 atcactgtgatcgttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacggacatttgcaaaccatcataag 51685365  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    ||||| |||||||||    
T  51685364 tcatacatttgatgt 51685350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 38 - 211
Target Start/End: Original strand, 38192457 - 38192630
Alignment:
Q  38 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 137  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  38192457 gtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcc 38192556  T
Q  138 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgc 211  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  38192557 tttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgc 38192630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 213
Target Start/End: Original strand, 46609724 - 46609897
Alignment:
Q  40 ccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcctt 139  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  46609724 ccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcctt 46609823  T
Q  140 ggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 213  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  46609824 tgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 46609897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 54899406 - 54899250
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  54899406 ttcaatcacatcggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatat 54899307  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaa 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54899306 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaa 54899250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 38 - 213
Target Start/End: Original strand, 53093197 - 53093372
Alignment:
Q  38 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 137  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  53093197 gtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcc 53093296  T
Q  138 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 213  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  53093297 tttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaatactttgattataaaaagacaaacatttgcat 53093372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 610567 - 610353
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||| | ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  610567 ttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcgcatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacataa 610468  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||| | |    
T  610467 atcactatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattgtaaaaaagcagacatttgcatataatcataag 610368  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    ||||| |||||||||    
T  610367 tcatacatttgatgt 610353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 46309951 - 46309776
Alignment:
Q  38 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 137  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||     
T  46309951 gtccatgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatca 46309852  T
Q  138 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 213  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  46309851 tttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 46309776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 113 - 239
Target Start/End: Original strand, 53190118 - 53190247
Alignment:
Q  113 ttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaa---agtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcattt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||    
T  53190118 ttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaattattaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacatattt 53190217  T
Q  210 gcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 239  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  53190218 gcataccatcataagtcatatatttgatgt 53190247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24845776 - 24845668
Alignment:
Q  85 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagt--aaaagacaaac 182  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  24845776 aaaataccatcaaataagtctttgaattatcacaacatatatcaatgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaaagacatac 24845677  T
Q  183 actttgatt 191  Q
    |||||||||    
T  24845676 actttgatt 24845668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Original strand, 53188871 - 53188963
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcac 117  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  53188871 ttcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatgtcatcaaataggtcattgaattttcac 53188963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 54899230 - 54899172
Alignment:
Q  181 acactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||    
T  54899230 acactttgattataaaaagacacacatttgcatactatcataagtcatatatttgatgt 54899172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 169
Target Start/End: Original strand, 35862691 - 35862775
Alignment:
Q  85 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 169  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||| |   ||||||| ||| ||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  35862691 aaaatacaatcagataagtccttgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttgttgcatatatgtgcagaacaaagtaaaaa 35862775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 174
Target Start/End: Original strand, 22219218 - 22219308
Alignment:
Q  85 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagta-aaaagtaaa 174  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||| |   ||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||    
T  22219218 aaaatatcatcaaataaatccttgaattatttaaacagatgtcaatgcgatccttggtgcatatatgtgcagaacaaagtacaaaagtaaa 22219308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27692119 - 27691905
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27692119 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 27692020  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | |    
T  27692019 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataag 27691920  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  27691919 tcatatatttgatgt 27691905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 41041755 - 41041969
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41041755 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 41041854  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  41041855 accattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataag 41041954  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||| ||||||    
T  41041955 tcatatatctgatgt 41041969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 33707981 - 33708195
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33707981 ttcaatcaaattggtcattgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 33708080  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |    
T  33708081 atcactgtgttccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacactttgattataaaaagacagacattttcatatcatcataag 33708180  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  33708181 tcatatatttgatgt 33708195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 42942747 - 42942533
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42942747 ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattattgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 42942648  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  42942647 atcattgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattatcaaaagacagacatttgcataccatcataag 42942548  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  42942547 tcatatatttgatgt 42942533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22273212 - 22272998
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22273212 ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcgtatcgatcatcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 22273113  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | |    
T  22273112 atcattgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaagagacaggcaattgcataccatcataag 22273013  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  22273012 tcatatatttgatgt 22272998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 40338851 - 40339065
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40338851 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcgtatcgatcctcaaattagtgaaaatacaatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 40338950  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |      
T  40338951 atcactgtgatccttgttgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacatacatttgcataccatcataac 40339050  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  40339051 tcatatatttgatgt 40339065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 55 - 239
Target Start/End: Original strand, 8609008 - 8609192
Alignment:
Q  55 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8609008 atatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 8609107  T
Q  155 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||    
T  8609108 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatctatttgatgt 8609192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 55 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 38548150 - 38547966
Alignment:
Q  55 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 154  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38548150 atatccatcattttgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 38548051  T
Q  155 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  38548050 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 38547966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 55 - 239
Target Start/End: Original strand, 13107574 - 13107758
Alignment:
Q  55 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 154  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13107574 atatccatcatttcgattctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 13107673  T
Q  155 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| | ||||||||||||||||    
T  13107674 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcctaccatcataagtcatatatttgatgt 13107758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 55 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13283314 - 13283135
Alignment:
Q  55 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13283314 atatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatacgatcaaataggtccttgaattttcaca-----tatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 13283220  T
Q  155 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 239  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13283219 tcaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 13283135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5037389 - 5037235
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5037389 ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 5037290  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 179  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5037289 atcattgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 5037235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 210
Target Start/End: Original strand, 9672346 - 9672531
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  9672346 ttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcgtatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatat 9672445  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9672446 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaactaaaaagtaaaagacagacactttgattgtaaaaagacagacatttg 9672531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 220
Target Start/End: Original strand, 26239613 - 26239808
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    ||||||| |||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  26239613 ttcaatccaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtcattgaattttcacaacatat 26239712  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatca 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||    
T  26239713 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctcaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagaaagacatttgcataccatca 26239808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29238147 - 29237959
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  29238147 ttcaatcacattggtccttgaattatattcatatccgtcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagaa 29238048  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 213  Q
    |||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29238047 atcaatttgatcatttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 29237959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35510356 - 35510181
Alignment:
Q  38 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 137  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||    
T  35510356 gtccttaaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtggtcc 35510257  T
Q  138 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 213  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35510256 tttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 35510181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 7744302 - 7744516
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| || |||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  7744302 ttcaatcaaattggttcttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaacaccatcaaataagtccttgaattttcacatcatat 7744401  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
     ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  7744402 ttcacttttattcttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataag 7744501  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    ||||| |||||||||    
T  7744502 tcatacatttgatgt 7744516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 213
Target Start/End: Original strand, 33761643 - 33761818
Alignment:
Q  38 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 137  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  33761643 gtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtcattgaattatcataacagatatcaatgtgatcc 33761742  T
Q  138 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 213  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  33761743 tttgtgcatacatttgctaaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaggacaaacatttgcat 33761818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 38 - 213
Target Start/End: Original strand, 600809 - 600984
Alignment:
Q  38 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 137  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||||    
T  600809 gtccttgaattatattcatatccgtcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcc 600908  T
Q  138 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 213  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  600909 tttgtgcatacatttgctgaataaagtaaaaagtaaaagagaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 600984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 220
Target Start/End: Original strand, 41824842 - 41825037
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| ||| ||  ||| ||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  41824842 ttcaatcaaattggtcattctattgtatgtctatccatcatattgatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttcacaacatat 41824941  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatca 220  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  41824942 atcaccgtgatgcttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatatacactgtgattgtaaaaagccagacatttgcataccatca 41825037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15307245 - 15307058
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  15307245 ttcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaccatcaaattggtccttgaattatcataacagaa 15307146  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 213  Q
    |||| | ||||| || || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15307145 atcaatttgatcatttgtacatatatttgctgaacaaagt-aaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 15307058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15487614 - 15487427
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  15487614 ttcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaccatcaaattggtccttgaattatcataacagaa 15487515  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 213  Q
    |||| | ||||| || || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15487514 atcaatttgatcatttgtacatatatttgctgaacaaagt-aaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 15487427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 213
Target Start/End: Original strand, 27405314 - 27405501
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  27405314 ttcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaacatcaaattggtccttgaattatcataacagaa 27405413  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 213  Q
    |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27405414 atcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaag-aaaaaataaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 27405501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 92 - 239
Target Start/End: Original strand, 13485351 - 13485493
Alignment:
Q  92 catcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgatt 191  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13485351 catcaaataggtccttcaattttcacaacagatatcactgtgatccttgaggcatacatttgctg----aagtaaaaagtagaagacaaacactttgatt 13485446  T
Q  192 ataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 239  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  13485447 ataaaaa-acagacatttgcataccatcataaatcatatatttgatgt 13485493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Original strand, 3152710 - 3152863
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| || |||  ||| ||| | ||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| |     
T  3152710 ttcaatcaaattggttcttctattgtatgtctatccatcacattcatccccaaattagtgaaattaccatcaaatcagttcttgaattttcacaacataa 3152809  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagac 178  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  3152810 atcaatgtgatccttggtgcatacatctactgaacaaagtaaaaagtaaaagac 3152863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 174
Target Start/End: Original strand, 11720608 - 11720697
Alignment:
Q  85 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaa 174  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||   || | ||  || |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  11720608 aaaatatcatcaaataagtccttgaagtttttaaaaatatgacaatgtgatccttggtgcatatatgtgttgaacaaagtaaaaagtaaa 11720697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 72
Target Start/End: Original strand, 13485307 - 13485351
Alignment:
Q  28 aatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatc 72  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13485307 aatcaaattggtccttgaattatgtacatatccatcatatcgatc 13485351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 243
Target Start/End: Original strand, 32135005 - 32135223
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  32135005 ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacggag 32135104  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  | |    
T  32135105 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcataacatcctaag 32135204  T
Q  225 tcatatatttgatgtccat 243  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32135205 tcatatatttgatgtccat 32135223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28821332 - 28821119
Alignment:
Q  26 tcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagata 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28821332 tcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataacatcaaataggtccttgaattttcacaacagata 28821233  T
Q  126 tcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggt 225  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  28821232 tcactgtgatctttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacattttgattataaaaagacagatatttgcatatcatcataagt 28821133  T
Q  226 catatatttgatgt 239  Q
    ||||||||||||||    
T  28821132 catatatttgatgt 28821119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8540624 - 8540410
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8540624 ttcaatcaaattgatccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 8540525  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  8540524 atcattgtgatccttggtgcataaatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataag 8540425  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  8540424 tcatatatttgatgt 8540410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 30464808 - 30465022
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30464808 ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctaaaattagtgataataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 30464907  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  30464908 atcactgtgatccttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatgcactttgactataaaaagacagacatttgcataccatcataag 30465007  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  30465008 tcatatatttgatgt 30465022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2180727 - 2180514
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2180727 ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 2180628  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |      
T  2180627 atcactgtgatccttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagac-tttgcataccatcataaa 2180529  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||| ||||||||    
T  2180528 tcatatctttgatgt 2180514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 2853439 - 2853653
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2853439 ttcaatgaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtctttgaattttcacaacagat 2853538  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | |    
T  2853539 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatgcactttgattataaaaagacagacattttcatattatcataag 2853638  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  2853639 tcatatatttgatgt 2853653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21841954 - 21841740
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21841954 ttcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaatagat 21841855  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |    
T  21841854 atcactgtgattcttagtgcatacatttgctgaagaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcatatcatcataag 21841755  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  21841754 tcatatatttgatgt 21841740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12738058 - 12737844
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12738058 ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcatcaaattagtgaaaataccaccaaataggtcattgaattttcacaacagat 12737959  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| | |      
T  12737958 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttaattataaaaagacagacatttgcataccattataaa 12737859  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  12737858 tcatatatttgatgt 12737844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12800881 - 12800667
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12800881 ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcatcaaattagtgaaaataccaccaaataggtcattgaattttcacaacagat 12800782  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| | |      
T  12800781 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttaattataaaaagacagacatttgcataccattataaa 12800682  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  12800681 tcatatatttgatgt 12800667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 55 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7268768 - 7268584
Alignment:
Q  55 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7268768 atatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataacatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 7268669  T
Q  155 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  7268668 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttacataccatcataagtcatatatttgatgt 7268584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 88 - 239
Target Start/End: Original strand, 24540425 - 24540576
Alignment:
Q  88 ataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacacttt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24540425 ataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacacttt 24540524  T
Q  188 gattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  24540525 gattataaaaagacatacattttcataccatcataagtcatatatttgatgt 24540576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 213
Target Start/End: Original strand, 42472654 - 42472841
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  42472654 ttcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaacatcaaattggtccttgaattatcataacagaa 42472753  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 213  Q
    |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  42472754 atcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaag-aaaaaataaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 42472841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 40781543 - 40781430
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  40781543 ttcaatcacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagag 40781444  T
Q  125 atcactgtgatcct 138  Q
    |||| |||||||||    
T  40781443 atcaatgtgatcct 40781430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 153
Target Start/End: Original strand, 41494617 - 41494741
Alignment:
Q  29 atcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatca 128  Q
    |||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41494617 atcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatattgatccccaaatttgtgaaaataccatcaaataattccttgaattttcacaacatatatca 41494716  T
Q  129 ctgtgatccttggtgcatacatttg 153  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||    
T  41494717 ctgtaatccttagtgcatatatttg 41494741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 138
Target Start/End: Original strand, 29620912 - 29621024
Alignment:
Q  26 tcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagata 125  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |   ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |    
T  29620912 tcaatcacattggtccttgaattacaatcatatccatcattttgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagaga 29621011  T
Q  126 tcactgtgatcct 138  Q
    ||| |||||||||    
T  29621012 tcaatgtgatcct 29621024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27076817 - 27076733
Alignment:
Q  85 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 169  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| |   ||||||| ||| |||||||||||||||| | || ||| ||| ||||||||||    
T  27076817 aaaataccatcaaataaatcattgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggtgcaaatatgtgcagaataaagtaaaaa 27076733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 14388273 - 14388487
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14388273 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 14388372  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| | |    
T  14388373 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacactttgattataaaaaaacagacatttgcataccatcataag 14388472  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  14388473 tcatatatttgatgt 14388487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 40561197 - 40560978
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40561197 ttcaattaaattggtccttaaattatatgcacatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 40561098  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |      
T  40561097 atcaatgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagccatacactttgattataaaaagacagacatttgcatatcatcataaa 40560998  T
Q  225 tcatatatttgatgtccatc 244  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  40560997 tcatatatttgatgttcatc 40560978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6798478 - 6798264
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6798478 ttcaatcaaattggtccttcaattgtatacatattcatcaaatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaatatgtccttgaattttcacaacagat 6798379  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  6798378 atcactgtgatccttggtgcatacatttgatgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcatatcatcataag 6798279  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    | |||||||||||||    
T  6798278 ttatatatttgatgt 6798264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2767886 - 2767691
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  2767886 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaatttagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattttcacaatagat 2767787  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatca 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  2767786 atcactgtgatccttggtgcatacattttctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaactctttgattataaaaagacagacatttgcataccatca 2767691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 19907450 - 19907664
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19907450 ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaatgagtgaaaataccatgaaataggtccttgaattttcacaacagat 19907549  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |      
T  19907550 atcactgtgatcattggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccattataaa 19907649  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  19907650 tcatatatttgatgt 19907664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16763918 - 16763704
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16763918 ttcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcattgaatttacacaacagat 16763819  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| | |    
T  16763818 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacagagtaaaaagtaaaagatagacactttgattataaaaagacacacatttgcatactatcataag 16763719  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  16763718 tcatatatttgatgt 16763704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17697179 - 17696965
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  17697179 ttcaatcaaactggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctaaaattggtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatac 17697080  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |    
T  17697079 atcactatgatccttggtggatacatttgttgaacaaagtaaaaagtagaagacagacactttgattataaaaagacagatatttgcataccatcataag 17696980  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  17696979 tcatatatttgatgt 17696965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 67 - 239
Target Start/End: Original strand, 39663994 - 39664166
Alignment:
Q  67 tcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaa 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39663994 tcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaa 39664093  T
Q  167 aaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 239  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  39664094 aaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatctgcataccatcataaatcatatatttgatgt 39664166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 39456131 - 39455918
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39456131 ttcaatcaaattggtcattgaattatatgcatattcatcatattgattctcaaatgagtgaaaatatcatcaaataggtccttaaattttcacaacagat 39456032  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| | |    
T  39456031 atcactatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaga-actttgattataaaaagacagacatttgtataccatcataag 39455933  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    ||||||| |||||||    
T  39455932 tcatatacttgatgt 39455918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 93 - 239
Target Start/End: Original strand, 44708996 - 44709142
Alignment:
Q  93 atcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgatta 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  44708996 atcaaattggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtcaaagacagacactttgatta 44709095  T
Q  193 taaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 239  Q
    ||||||  ||| |||||||||| ||||| | | ||||||||||||||    
T  44709096 taaaaatgcagacatttgcataccatcataagacatatatttgatgt 44709142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 213
Target Start/End: Original strand, 24206710 - 24206900
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatac--catcaaataggtccttgaattttcacaacag 122  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |   |||||||| |||||||||||| | | |||||    
T  24206710 ttcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaaatcatcaaattggtccttgaattattataacag 24206809  T
Q  123 atatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 213  Q
    | |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24206810 aaatcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacaatttgattataaaaagacaaacatttgcat 24206900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 213
Target Start/End: Original strand, 6784459 - 6784648
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatac-catcaaataggtccttgaattttcacaacaga 123  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  6784459 ttcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatctttaaattagtaaaaaaaaacatcaaattggtccttgaattatcataacaga 6784558  T
Q  124 tatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 213  Q
     |||| |  ||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6784559 aatcaattggatcctttggacatacatttgctgaacaaagtcaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 6784648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 239
Target Start/End: Original strand, 42518524 - 42518618
Alignment:
Q  145 atacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  42518524 atacatttgctgaacaaagtaaaaaataaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 42518618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 37021501 - 37021388
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  37021501 ttcaatcacattggtccttgaattataatcatatccatcattttgatcctcaaattaatgaaaaaaccatcaaattggtccttgaattatcataacagat 37021402  T
Q  125 atcactgtgatcct 138  Q
    |||| |||||||||    
T  37021401 atcaatgtgatcct 37021388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 37646283 - 37646238
Alignment:
Q  130 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa 175  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37646283 tgtgatctttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa 37646238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 161300 - 161216
Alignment:
Q  85 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 169  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||| |||  ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||    
T  161300 aaaataccatcaaataagtccttgaattatttaaacagatgtcaacgtgatccttggtgcatatatgtgcataacaaagtaaaaa 161216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 65
Target Start/End: Original strand, 34401354 - 34401394
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcat 65  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34401354 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcat 34401394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 37114699 - 37114913
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37114699 ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 37114798  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  37114799 atcattgtaatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaaatacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataag 37114898  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  37114899 tcatatatttgatgt 37114913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6604478 - 6604264
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  6604478 ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgacttttcacaacatat 6604379  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  6604378 atcactgtgatcattggtgcatacatttactgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataag 6604279  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  6604278 tcatatatttgatgt 6604264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 38473295 - 38473508
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473295 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatactcatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 38473394  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  38473395 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaa-acatacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataag 38473493  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  38473494 tcatatatttgatgt 38473508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 239
Target Start/End: Original strand, 23905426 - 23905637
Alignment:
Q  28 aatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatc 127  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23905426 aatcaaattggtcattgaattatatgcatatcaatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatc 23905525  T
Q  128 actgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtca 227  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||    
T  23905526 attgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaaaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtca 23905625  T
Q  228 tatatttgatgt 239  Q
    ||||||||||||    
T  23905626 tatatttgatgt 23905637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 239
Target Start/End: Original strand, 27665220 - 27665431
Alignment:
Q  28 aatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatc 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27665220 aatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaatatgtccttgaattttcacaacagatatc 27665319  T
Q  128 actgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtca 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||| | ||||    
T  27665320 actgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaaggcagacattttcataccatcataagtca 27665419  T
Q  228 tatatttgatgt 239  Q
    ||||||||||||    
T  27665420 tatatttgatgt 27665431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22154853 - 22154639
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22154853 ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 22154754  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | |    
T  22154753 atcactgtgatccatggtgcatatatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacagactctttgattataaaaagacaaacatttgcataccatcataag 22154654  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  22154653 tcatatatttgatgt 22154639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22210768 - 22210554
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22210768 ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 22210669  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | |    
T  22210668 atcactgtgatccatggtgcatatatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacagactctttgattataaaaagacaaacatttgcataccatcataag 22210569  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  22210568 tcatatatttgatgt 22210554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 45360290 - 45360076
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  45360290 ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctaaaattagtgaaaataccatcaaataggtctttgaattttcacaacatat 45360191  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |      
T  45360190 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagataaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataaa 45360091  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  45360090 tcatatatttgatgt 45360076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 29995687 - 29995901
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29995687 ttcaatcaaattgatccttaaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatgaaataggtccttgaattttcacaacaaat 29995786  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | |    
T  29995787 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataag 29995886  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  29995887 tcatatatttgatgt 29995901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 35692521 - 35692735
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35692521 ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcattgaattttcacaacagat 35692620  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | |    
T  35692621 atcactgtgatccttggtgcatatatttgccgaacgaagtaaaaagcaaaagacagacactttgattataaaaagacaaacatttgcataccatcataag 35692720  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  35692721 tcatatatttgatgt 35692735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 39858413 - 39858627
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39858413 ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaatgagtgaaaataccatgaaataggtccttgaattttcacaacagat 39858512  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |      
T  39858513 atcactgtgatcattggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccattataaa 39858612  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  39858613 tcatatatttgatgt 39858627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13169036 - 13168822
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13169036 ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaacataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 13168937  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |      
T  13168936 atcaatgtgatccttggtgcatacattcgctgaacaaaataaaaactaaaagacagacactttgattataaaaatacagacatttgcatatcattataaa 13168837  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  13168836 tcatatatttgatgt 13168822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 46438681 - 46438895
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46438681 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaataagtgaaaataccatcaaataggtcattgaattttcacaacagat 46438780  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| | |    
T  46438781 atcactttgatccttggtggatacatttgctgaatagagtaaaaagtagaagacaaacactttgattatagaaagacggacatttgcataccatcataag 46438880  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||| ||||    
T  46438881 tcatatatttaatgt 46438895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 28 - 239
Target Start/End: Original strand, 34776135 - 34776346
Alignment:
Q  28 aatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatc 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  34776135 aatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaatagatctttgaattttcacaacagatatc 34776234  T
Q  128 actgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtca 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  |||    
T  34776235 actgtgatccttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaactaaaagacagacactcagattataaaaagacaaacatttgcataccatcataaatca 34776334  T
Q  228 tatatttgatgt 239  Q
    ||||||||||||    
T  34776335 tatatttgatgt 34776346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 24227592 - 24227806
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  24227592 ttcaatcaaatatgtccttaaattatatacacatccatcatatcaatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggacatttaattttcacaacagat 24227691  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||| |      
T  24227692 atcactgtgatcattggtacatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattacaaaaagacagacatttgtataccatcataaa 24227791  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  24227792 tcatatatttgatgt 24227806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 234
Target Start/End: Original strand, 38550441 - 38550650
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  38550441 ttcaatcaaattagtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaatttttacaacatat 38550540  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  38550541 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaaataaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataag 38550640  T
Q  225 tcatatattt 234  Q
    ||||| ||||    
T  38550641 tcatacattt 38550650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 56 - 239
Target Start/End: Original strand, 37792236 - 37792419
Alignment:
Q  56 tatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 155  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  37792236 tatccatcatattgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaccatatatcactgtgatcattggtgcatacatttgtt 37792335  T
Q  156 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 239  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| | |||||| |||||||||    
T  37792336 gtacaaagtaaaaagtaaaagtcaaagactttgattgtaaaaagacagacatttgcttaccatcatatgtcatacatttgatgt 37792419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 213
Target Start/End: Original strand, 35402545 - 35402719
Alignment:
Q  38 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 137  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  35402545 gtccttgaattatattca-atccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcc 35402643  T
Q  138 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 213  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35402644 tttgagcatatatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagataaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 35402719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 239
Target Start/End: Original strand, 48851529 - 48851708
Alignment:
Q  59 ccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaa 158  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||     
T  48851529 ccatcatattgatcca-aaattagtgaaaatctcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcattgtgatccttggggcatacatttgctgac 48851627  T
Q  159 caaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||| || ||| |||||||||    
T  48851628 caaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattgtaaaaagacatacatttgcataccatcagaagttatacatttgatgt 48851708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 220
Target Start/End: Original strand, 47385386 - 47385576
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  47385386 ttcaatcaaattggtccttctattatatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaattaccatcaaataagtccttgaattttcacaacatac 47385485  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatca 220  Q
    |||| |||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  47385486 atca-tgtgatc----atgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacacattgattgtaaaaagacagacatttacataccatca 47385576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 69134 - 69032
Alignment:
Q  45 aattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgc 144  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  69134 aattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatccttggtgc 69035  T
Q  145 ata 147  Q
    |||    
T  69034 ata 69032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 20479034 - 20478921
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  20479034 ttcaatcacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagag 20478935  T
Q  125 atcactgtgatcct 138  Q
    |||| |||||||||    
T  20478934 atcaatgtgatcct 20478921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 143 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 66915 - 66845
Alignment:
Q  143 gcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  66915 gcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagaaaggcatttgcat 66845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 48310867 - 48310750
Alignment:
Q  76 aaattagtgaaaa-taccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagta-aaaagtaa 173  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||| | |||| ||||||||||||||||| ||||  ||    
T  48310867 aaattagtgaaaaatatcatcaaataagtcattgaattatcacaacatatatcaatatgatctttgctacatatatttgctgaacaaagtagaaaataaa 48310768  T
Q  174 aagacaaacactttgatt 191  Q
    |||||| |||||||||||    
T  48310767 aagacagacactttgatt 48310750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13035705 - 13035621
Alignment:
Q  85 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 169  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||    
T  13035705 aaaataccatcaaataagtccttgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggtgcatatatgtgcaaaacaaagtaaaaa 13035621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 239
Target Start/End: Original strand, 30939748 - 30939794
Alignment:
Q  193 taaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30939748 taaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 30939794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 3012624 - 3012838
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3012624 ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatattgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttggattttcacaacagat 3012723  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  3012724 atcattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataag 3012823  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  3012824 tcatatatttgatgt 3012838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 31237677 - 31237891
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31237677 ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccattatatcgatcctcaaattagtgataataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 31237776  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  31237777 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacattcactttgactataaaaagacagacatttgcatatcatcataag 31237876  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  31237877 tcatatatttgatgt 31237891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 26224724 - 26224938
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26224724 ttcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaagaccatcaaataggtccttgaattttcacaacaaat 26224823  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |    
T  26224824 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcatatcatcataag 26224923  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  26224924 tcatatatttgatgt 26224938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2870552 - 2870338
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2870552 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 2870453  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | |    
T  2870452 atcattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatgcactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataag 2870353  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  2870352 tcatatatttgatgt 2870338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 6817887 - 6818101
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  6817887 ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttggtttttcacaacatat 6817986  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | |    
T  6817987 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtgaaagacagacactttgattataaaaagacagacatgtgcataccatcataag 6818086  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  6818087 tcatatatttgatgt 6818101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 46582759 - 46582973
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46582759 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 46582858  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||| ||||| | |    
T  46582859 atcactgtgatccttggtgcatacatctgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagactgatattttcataccatcataag 46582958  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    | |||||||||||||    
T  46582959 taatatatttgatgt 46582973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 51895336 - 51895550
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51895336 ttcaatcaaattggcccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 51895435  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  51895436 atcattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaaatacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataag 51895535  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||| ||||    
T  51895536 tcatatattttatgt 51895550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27088241 - 27088026
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27088241 ttcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgacttttcacaacagat 27088142  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattata-aaaagacaggcatttgcatatcatcagag 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| |     
T  27088141 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaaagacacatatttgcatatcatcataa 27088042  T
Q  224 gtcatatatttgatgt 239  Q
    ||||||||||||||||    
T  27088041 gtcatatatttgatgt 27088026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 55 - 239
Target Start/End: Original strand, 34777338 - 34777522
Alignment:
Q  55 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34777338 atatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcataacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 34777437  T
Q  155 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  34777438 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 34777522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 55 - 239
Target Start/End: Original strand, 4855167 - 4855351
Alignment:
Q  55 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4855167 atatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtaatccttggtgcatacatttgc 4855266  T
Q  155 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  4855267 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacaatttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 4855351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 50555273 - 50555488
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50555273 ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 50555372  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagt-aaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagag 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |     
T  50555373 atcattgtgatccttggtgcatacatttactgaacaaggtaaaaaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcatgccatcataa 50555472  T
Q  224 gtcatatatttgatgt 239  Q
     |||||||||||||||    
T  50555473 atcatatatttgatgt 50555488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 213
Target Start/End: Original strand, 33600323 - 33600511
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33600323 ttcaatcaaatcggtccttgaattatatgcatatccatcctttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaatatgtccttgaattttcacaacagat 33600422  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  33600423 atcaatgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacaatttgattgtaaaaagacagacatttgcat 33600511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 177
Target Start/End: Original strand, 25277546 - 25277698
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25277546 ttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagac 25277645  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25277646 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 25277698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15105399 - 15105185
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  15105399 ttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacataa 15105300  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||| ||||| |||||   |    
T  15105299 atcattgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgcaaaaagacagacattcgcataccatcatgag 15105200  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  15105199 tcatatatttgatgt 15105185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37345289 - 37345137
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  37345289 ttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcataccgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaatagttccttgaattttcacaacagac 37345190  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37345189 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 37345137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 213
Target Start/End: Original strand, 8168515 - 8168690
Alignment:
Q  38 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 137  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  8168515 gtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtcattgaattatcataacagatatcaatgtgatcc 8168614  T
Q  138 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 213  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8168615 tttgtgcatacatttgctaaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 8168690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 177
Target Start/End: Original strand, 45045674 - 45045826
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45045674 ttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcttcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaatagat 45045773  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45045774 atcactgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaaga 45045826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 56 - 201
Target Start/End: Original strand, 52642838 - 52642981
Alignment:
Q  56 tatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 155  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52642838 tatccatcatatcgatccctaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatatatttgct 52642937  T
Q  156 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagac 201  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  52642938 gaacaaagtaaaaagtaaaagac--acactttgattgtaaaaagac 52642981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 138
Target Start/End: Original strand, 9120813 - 9120926
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  9120813 ttcaatcacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagag 9120912  T
Q  125 atcactgtgatcct 138  Q
    |||| |||||||||    
T  9120913 atcaatgtgatcct 9120926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 1443513 - 1443400
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  1443513 ttcaatcacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagag 1443414  T
Q  125 atcactgtgatcct 138  Q
    |||| ||| |||||    
T  1443413 atcaatgtaatcct 1443400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 138
Target Start/End: Original strand, 47012213 - 47012326
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  47012213 ttcaatcacattggtccttgaattataatcatatcaatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagag 47012312  T
Q  125 atcactgtgatcct 138  Q
    |||| |||||||||    
T  47012313 atcaatgtgatcct 47012326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 169
Target Start/End: Original strand, 3370338 - 3370422
Alignment:
Q  85 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 169  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |   ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||    
T  3370338 aaaataccatcaaataagtctttgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggtgcatatatgtgcataataaagtaaaaa 3370422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9222 - 9008
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9222 ttcaatcaaattagtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaatagat 9123  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | |    
T  9122 atcactgtgatccttggtgcatacatctgccgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcatactatcataag 9023  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  9022 tcatatatttgatgt 9008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4257 - 4043
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4257 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 4158  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||| | |    
T  4157 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattatcaaaagacagacatttttataccatcataag 4058  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  4057 tcatatatttgatgt 4043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 5429 - 5215
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5429 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 5330  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||| | |    
T  5329 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattatcaaaagacagacatttttataccatcataag 5230  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    |||||||||||||||    
T  5229 tcatatatttgatgt 5215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0345
Description:

Target: scaffold0345; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 63 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 477 - 301
Alignment:
Q  63 catatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaa 162  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  477 catatcgatcctcaaattagtaaaaataccatcaaacaggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgccgaacaaa 378  T
Q  163 gtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  377 gtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcaggagtcatatatttgatgt 301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 107756 - 107970
Alignment:
Q  25 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 124  Q
    |||||||||||| ||| ||  ||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |     
T  107756 ttcaatcaaattggtcattctattgtatgtctatccatcatatcgatccctaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttaaattttcacaatataa 107855  T
Q  125 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  107856 atcactgtgatcattggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataag 107955  T
Q  225 tcatatatttgatgt 239  Q
    ||||| |||||||||    
T  107956 tcatacatttgatgt 107970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 91
Target Start/End: Original strand, 1690 - 1752
Alignment:
Q  29 atcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatac 91  Q
    |||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1690 atcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatctccaaattagtgaaaatac 1752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University