View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11951_high_1 (Length: 911)

Name: NF11951_high_1
Description: NF11951
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11951_high_1
NF11951_high_1
[»] chr7 (58 HSPs)
chr7 (1-460)||(23862796-23863255)
chr7 (581-891)||(29327784-29328094)
chr7 (581-891)||(11535959-11536269)
chr7 (581-891)||(11542877-11543187)
chr7 (583-891)||(15152445-15152753)
chr7 (583-891)||(18561009-18561317)
chr7 (583-891)||(12750828-12751136)
chr7 (587-891)||(12738542-12738846)
chr7 (583-868)||(18257762-18258047)
chr7 (583-802)||(15148144-15148363)
chr7 (587-891)||(13392157-13392460)
chr7 (603-799)||(2364917-2365112)
chr7 (614-839)||(7396221-7396450)
chr7 (761-891)||(8464999-8465128)
chr7 (587-861)||(39111819-39112092)
chr7 (752-891)||(2204543-2204681)
chr7 (752-891)||(18400095-18400233)
chr7 (752-891)||(18407079-18407217)
chr7 (752-891)||(19230879-19231017)
chr7 (752-891)||(30254129-30254267)
chr7 (752-891)||(48808669-48808807)
chr7 (780-884)||(10235361-10235465)
chr7 (488-545)||(11543223-11543280)
chr7 (489-545)||(2653275-2653331)
chr7 (489-545)||(12738443-12738499)
chr7 (752-891)||(15729742-15729880)
chr7 (752-891)||(18139511-18139649)
chr7 (719-884)||(7662569-7662733)
chr7 (488-545)||(11536305-11536362)
chr7 (488-545)||(12750732-12750789)
chr7 (488-545)||(15152349-15152406)
chr7 (655-891)||(3132748-3132983)
chr7 (488-544)||(29327689-29327745)
chr7 (762-870)||(47833875-47833983)
chr7 (752-891)||(10669075-10669213)
chr7 (489-545)||(15148049-15148105)
chr7 (761-861)||(19859122-19859221)
chr7 (6-84)||(18473871-18473949)
chr7 (370-459)||(23872073-23872160)
chr7 (488-544)||(13392029-13392085)
chr7 (836-888)||(16011515-16011567)
chr7 (828-891)||(2365169-2365232)
chr7 (836-890)||(14591924-14591978)
chr7 (6-84)||(18478441-18478519)
chr7 (829-891)||(41681141-41681203)
chr7 (631-696)||(10234179-10234244)
chr7 (489-545)||(18258087-18258143)
chr7 (752-891)||(19393597-19393735)
chr7 (752-891)||(47167032-47167170)
chr7 (753-891)||(19388544-19388681)
chr7 (581-613)||(2653207-2653239)
chr7 (489-545)||(18560913-18560969)
chr7 (759-891)||(25845649-25845780)
chr7 (759-891)||(25846068-25846199)
chr7 (843-891)||(31190612-31190660)
chr7 (821-868)||(7396464-7396511)
chr7 (752-891)||(28130552-28130690)
chr7 (836-891)||(34128647-34128702)
[»] chr3 (67 HSPs)
chr3 (581-891)||(6110064-6110374)
chr3 (581-891)||(10572489-10572799)
chr3 (581-891)||(15600781-15601091)
chr3 (581-891)||(15607326-15607636)
chr3 (583-891)||(16482380-16482688)
chr3 (587-891)||(10579252-10579556)
chr3 (584-891)||(13211305-13211612)
chr3 (587-891)||(17781015-17781319)
chr3 (583-891)||(18522665-18522973)
chr3 (581-891)||(13248607-13248917)
chr3 (581-891)||(8490488-8490805)
chr3 (581-891)||(15357483-15357793)
chr3 (583-891)||(18519980-18520285)
chr3 (600-891)||(15342116-15342407)
chr3 (583-888)||(13516813-13517118)
chr3 (583-891)||(17200081-17200389)
chr3 (587-891)||(32056796-32057101)
chr3 (587-891)||(1647418-1647726)
chr3 (587-799)||(19089734-19089946)
chr3 (581-887)||(29924971-29925277)
chr3 (581-887)||(29974124-29974430)
chr3 (583-891)||(16200434-16200740)
chr3 (581-742)||(18640792-18640953)
chr3 (687-891)||(17136465-17136663)
chr3 (583-820)||(16200128-16200363)
chr3 (588-885)||(24253291-24253589)
chr3 (752-891)||(15846709-15846847)
chr3 (752-891)||(21034229-21034367)
chr3 (761-891)||(14890391-14890520)
chr3 (752-891)||(20147727-20147865)
chr3 (583-645)||(18534758-18534820)
chr3 (488-545)||(6109971-6110028)
chr3 (488-545)||(13248514-13248571)
chr3 (489-545)||(8490396-8490452)
chr3 (486-545)||(13211208-13211267)
chr3 (761-891)||(21398792-21398921)
chr3 (489-545)||(18640989-18641045)
chr3 (752-891)||(55427012-55427150)
chr3 (489-545)||(17136137-17136193)
chr3 (752-891)||(12299902-12300039)
chr3 (752-891)||(14147012-14147150)
chr3 (489-539)||(10579603-10579653)
chr3 (488-545)||(15607672-15607730)
chr3 (488-545)||(15351237-15351294)
chr3 (488-545)||(15357829-15357886)
chr3 (488-545)||(17200427-17200484)
chr3 (583-628)||(18510924-18510969)
chr3 (489-545)||(16482727-16482782)
chr3 (489-545)||(18519885-18519941)
chr3 (488-539)||(10572840-10572891)
chr3 (486-545)||(13516716-13516775)
chr3 (744-846)||(9504446-9504548)
chr3 (488-545)||(15601127-15601185)
chr3 (488-545)||(17781358-17781415)
chr3 (488-545)||(19089985-19090042)
chr3 (489-545)||(1647768-1647824)
chr3 (489-545)||(32057144-32057200)
chr3 (829-891)||(11787654-11787716)
chr3 (488-545)||(18510828-18510885)
chr3 (488-545)||(18522569-18522626)
chr3 (488-545)||(18534662-18534719)
chr3 (757-872)||(8251933-8252048)
chr3 (668-807)||(19345656-19345795)
chr3 (829-891)||(15317346-15317408)
chr3 (829-891)||(25978901-25978963)
chr3 (489-545)||(29924879-29924935)
chr3 (489-545)||(29974032-29974088)
[»] scaffold0234 (4 HSPs)
scaffold0234 (581-891)||(2218-2528)
scaffold0234 (581-891)||(11109-11419)
scaffold0234 (488-545)||(2564-2621)
scaffold0234 (488-545)||(11455-11512)
[»] chr1 (46 HSPs)
chr1 (581-891)||(18252030-18252340)
chr1 (581-891)||(18532411-18532721)
chr1 (581-891)||(27131306-27131616)
chr1 (583-891)||(21171130-21171438)
chr1 (583-891)||(27310474-27310782)
chr1 (583-891)||(16358932-16359240)
chr1 (587-891)||(36816530-36816834)
chr1 (581-891)||(3855816-3856126)
chr1 (581-891)||(22657118-22657429)
chr1 (587-885)||(27277460-27277756)
chr1 (615-884)||(12014188-12014457)
chr1 (593-870)||(9917837-9918106)
chr1 (615-866)||(12006461-12006712)
chr1 (737-890)||(23507056-23507209)
chr1 (752-891)||(19706612-19706750)
chr1 (752-891)||(28134896-28135034)
chr1 (752-891)||(43802538-43802676)
chr1 (752-891)||(9456107-9456245)
chr1 (752-891)||(20779818-20779956)
chr1 (752-891)||(22670430-22670568)
chr1 (752-891)||(42817162-42817300)
chr1 (489-545)||(18251936-18251992)
chr1 (489-545)||(18532757-18532813)
chr1 (752-891)||(20391412-20391550)
chr1 (752-891)||(22612483-22612621)
chr1 (752-870)||(47667668-47667785)
chr1 (489-545)||(27310821-27310877)
chr1 (752-891)||(35930573-35930711)
chr1 (787-883)||(22641778-22641871)
chr1 (489-545)||(16359280-16359336)
chr1 (761-891)||(633934-634063)
chr1 (488-545)||(21171479-21171536)
chr1 (836-889)||(51997353-51997406)
chr1 (836-891)||(8727741-8727796)
chr1 (488-542)||(36816881-36816935)
chr1 (488-545)||(3856164-3856221)
chr1 (488-541)||(22657469-22657522)
chr1 (587-656)||(30720625-30720694)
chr1 (489-545)||(27131652-27131704)
chr1 (769-891)||(26923557-26923678)
chr1 (611-688)||(3403248-3403325)
chr1 (611-688)||(3443494-3443571)
chr1 (7-84)||(9801529-9801606)
chr1 (489-545)||(27277800-27277856)
chr1 (829-891)||(29096789-29096851)
chr1 (306-367)||(5456400-5456461)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (581-891)||(18288-18598)
scaffold0220 (489-545)||(18196-18252)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (581-891)||(27381149-27381459)
chr6 (581-891)||(27471532-27471842)
chr6 (583-891)||(17684366-17684674)
chr6 (581-891)||(29308890-29309200)
chr6 (581-891)||(29315850-29316160)
chr6 (581-891)||(17691337-17691647)
chr6 (583-891)||(188874-189182)
chr6 (583-891)||(11651725-11652033)
chr6 (583-851)||(16566257-16566525)
chr6 (583-799)||(25537148-25537364)
chr6 (583-869)||(13359188-13359474)
chr6 (604-890)||(27925772-27926062)
chr6 (620-885)||(20553492-20553755)
chr6 (619-891)||(17850392-17850663)
chr6 (795-889)||(16394344-16394438)
chr6 (752-891)||(18020014-18020152)
chr6 (764-891)||(2669476-2669603)
chr6 (752-891)||(16789062-16789200)
chr6 (752-891)||(22860061-22860199)
chr6 (737-884)||(28172712-28172859)
chr6 (829-891)||(27296877-27296939)
chr6 (827-891)||(25537088-25537152)
chr6 (491-545)||(17691683-17691737)
chr6 (488-545)||(27381495-27381552)
chr6 (488-545)||(27471878-27471935)
chr6 (488-545)||(29308797-29308854)
chr6 (488-545)||(29315757-29315814)
chr6 (752-891)||(1586281-1586419)
chr6 (752-891)||(27508520-27508658)
chr6 (752-891)||(27528106-27528244)
chr6 (619-891)||(20736502-20736773)
chr6 (488-545)||(17684712-17684769)
chr6 (600-891)||(8509941-8510233)
chr6 (752-891)||(14074471-14074609)
chr6 (489-543)||(11651630-11651684)
chr6 (488-545)||(25537405-25537462)
chr6 (752-891)||(8612906-8613044)
chr6 (846-891)||(16559369-16559414)
chr6 (752-856)||(13995151-13995254)
chr6 (588-643)||(31258065-31258120)
chr6 (488-545)||(13359512-13359569)
chr6 (497-545)||(16566563-16566611)
chr6 (775-891)||(19347097-19347212)
chr6 (836-891)||(5758654-5758709)
chr6 (489-545)||(189221-189280)
chr6 (829-888)||(21994655-21994714)
chr6 (503-545)||(16394484-16394526)
chr6 (597-662)||(22259925-22259990)
[»] chr4 (75 HSPs)
chr4 (581-891)||(19926657-19926967)
chr4 (581-891)||(55612683-55612993)
chr4 (581-891)||(26970463-26970773)
chr4 (583-891)||(18262214-18262522)
chr4 (581-891)||(868597-868907)
chr4 (581-891)||(5707320-5707630)
chr4 (581-891)||(26963640-26963950)
chr4 (581-891)||(5713948-5714258)
chr4 (581-891)||(10621230-10621540)
chr4 (581-891)||(10628309-10628619)
chr4 (583-891)||(18269070-18269383)
chr4 (583-891)||(4426501-4426808)
chr4 (583-891)||(28393031-28393339)
chr4 (593-891)||(8858179-8858477)
chr4 (593-891)||(8845215-8845513)
chr4 (589-891)||(20311299-20311602)
chr4 (587-888)||(35223576-35223867)
chr4 (587-891)||(5668024-5668327)
chr4 (581-696)||(12357136-12357251)
chr4 (619-891)||(56516094-56516366)
chr4 (587-805)||(10677538-10677753)
chr4 (587-805)||(10891178-10891393)
chr4 (583-890)||(5616215-5616523)
chr4 (3-84)||(35268123-35268204)
chr4 (607-891)||(21454036-21454319)
chr4 (752-891)||(15461488-15461626)
chr4 (743-891)||(32646698-32646846)
chr4 (752-891)||(2677004-2677142)
chr4 (752-891)||(15815012-15815150)
chr4 (752-891)||(17300132-17300270)
chr4 (752-891)||(18111216-18111354)
chr4 (752-891)||(34975542-34975680)
chr4 (488-545)||(5713855-5713912)
chr4 (762-891)||(5870419-5870547)
chr4 (488-545)||(26963547-26963604)
chr4 (488-545)||(26970370-26970427)
chr4 (489-545)||(19927003-19927059)
chr4 (752-891)||(3369196-3369334)
chr4 (488-545)||(10621576-10621633)
chr4 (489-545)||(5707228-5707284)
chr4 (489-545)||(12357044-12357100)
chr4 (752-891)||(4676156-4676294)
chr4 (752-891)||(18163153-18163291)
chr4 (752-891)||(20243928-20244066)
chr4 (752-891)||(26531604-26531742)
chr4 (491-545)||(868507-868561)
chr4 (765-843)||(24700213-24700291)
chr4 (489-545)||(10628655-10628711)
chr4 (489-545)||(17142372-17142428)
chr4 (489-545)||(55612594-55612650)
chr4 (489-543)||(28393380-28393434)
chr4 (488-545)||(18268975-18269032)
chr4 (489-545)||(4426847-4426903)
chr4 (752-891)||(1941715-1941853)
chr4 (630-697)||(39074278-39074346)
chr4 (836-891)||(10677479-10677534)
chr4 (836-891)||(10891119-10891174)
chr4 (829-891)||(19365586-19365648)
chr4 (496-545)||(55992680-55992729)
chr4 (718-798)||(39074190-39074270)
chr4 (752-891)||(4546071-4546209)
chr4 (752-891)||(32636475-32636613)
chr4 (737-819)||(9937933-9938015)
chr4 (808-890)||(34777893-34777975)
chr4 (504-545)||(5668371-5668412)
chr4 (497-545)||(8845118-8845166)
chr4 (497-545)||(8858082-8858130)
chr4 (505-545)||(18262136-18262176)
chr4 (619-797)||(30040740-30040919)
chr4 (836-891)||(9487625-9487680)
chr4 (836-891)||(9538033-9538088)
chr4 (631-690)||(11161913-11161972)
chr4 (829-891)||(19362477-19362539)
chr4 (491-545)||(20311207-20311261)
chr4 (752-797)||(11421007-11421052)
[»] scaffold0390 (4 HSPs)
scaffold0390 (581-891)||(6831-7141)
scaffold0390 (581-891)||(13847-14157)
scaffold0390 (488-545)||(7177-7234)
scaffold0390 (489-545)||(14193-14249)
[»] chr8 (43 HSPs)
chr8 (581-891)||(21940665-21940975)
chr8 (587-888)||(6094129-6094430)
chr8 (583-891)||(22171491-22171797)
chr8 (587-891)||(24642655-24642959)
chr8 (583-782)||(28554885-28555084)
chr8 (593-891)||(38232274-38232570)
chr8 (587-714)||(24636860-24636987)
chr8 (677-891)||(14983818-14984030)
chr8 (805-891)||(15326422-15326508)
chr8 (805-891)||(15506791-15506877)
chr8 (611-888)||(32872741-32873019)
chr8 (752-891)||(21969324-21969462)
chr8 (752-891)||(12562114-12562252)
chr8 (602-891)||(2375027-2375321)
chr8 (752-891)||(8371426-8371564)
chr8 (752-891)||(22130782-22130920)
chr8 (752-891)||(25611186-25611324)
chr8 (752-891)||(27007690-27007828)
chr8 (752-891)||(27014833-27014971)
chr8 (752-891)||(27880660-27880798)
chr8 (752-891)||(28020841-28020979)
chr8 (752-891)||(21916667-21916805)
chr8 (489-545)||(21940573-21940629)
chr8 (489-545)||(22070108-22070164)
chr8 (752-891)||(18835341-18835479)
chr8 (756-891)||(24797285-24797419)
chr8 (752-891)||(45534446-45534584)
chr8 (488-545)||(22171395-22171452)
chr8 (488-541)||(24642555-24642608)
chr8 (489-545)||(6094031-6094087)
chr8 (752-891)||(26240475-26240613)
chr8 (488-545)||(28554790-28554847)
chr8 (762-891)||(22659667-22659795)
chr8 (764-858)||(29645537-29645631)
chr8 (619-682)||(10920234-10920297)
chr8 (829-891)||(6430953-6431015)
chr8 (837-891)||(8782048-8782102)
chr8 (829-868)||(36970332-36970371)
chr8 (488-542)||(2374946-2375000)
chr8 (829-867)||(2963133-2963171)
chr8 (737-835)||(24535471-24535569)
chr8 (489-526)||(24636605-24636642)
chr8 (835-888)||(34659059-34659112)
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (581-891)||(21330145-21330455)
chr2 (581-891)||(18796506-18796816)
chr2 (583-891)||(18619807-18620114)
chr2 (615-884)||(36270199-36270469)
chr2 (615-882)||(18822115-18822384)
chr2 (646-884)||(20977957-20978178)
chr2 (743-880)||(22183392-22183528)
chr2 (587-726)||(19692598-19692737)
chr2 (701-891)||(18851956-18852146)
chr2 (738-891)||(19279445-19279598)
chr2 (752-891)||(24250205-24250343)
chr2 (752-891)||(30174368-30174506)
chr2 (489-545)||(21330493-21330549)
chr2 (756-883)||(6992017-6992146)
chr2 (752-891)||(24229388-24229526)
chr2 (767-870)||(36801899-36802003)
chr2 (836-891)||(29800545-29800600)
chr2 (3-84)||(35571720-35571798)
chr2 (763-870)||(28741220-28741326)
chr2 (829-891)||(15342175-15342237)
chr2 (752-797)||(12098609-12098654)
chr2 (488-545)||(19692773-19692830)
chr2 (836-890)||(21626824-21626877)
chr2 (752-870)||(24763751-24763868)
chr2 (832-870)||(28718968-28719006)
[»] scaffold0433 (2 HSPs)
scaffold0433 (581-891)||(7107-7417)
scaffold0433 (488-545)||(7014-7071)
[»] chr5 (38 HSPs)
chr5 (581-891)||(24695363-24695673)
chr5 (583-891)||(19714395-19714703)
chr5 (581-891)||(18569758-18570070)
chr5 (587-891)||(19707115-19707419)
chr5 (587-891)||(22546913-22547217)
chr5 (694-891)||(39538701-39538898)
chr5 (586-841)||(27347425-27347679)
chr5 (647-884)||(18806938-18807175)
chr5 (585-891)||(17285645-17285935)
chr5 (585-889)||(17298798-17299088)
chr5 (581-690)||(39537962-39538071)
chr5 (752-891)||(20941018-20941156)
chr5 (752-891)||(25805558-25805696)
chr5 (752-891)||(31890-32028)
chr5 (752-891)||(23545913-23546051)
chr5 (488-545)||(24695709-24695766)
chr5 (752-891)||(12789836-12789974)
chr5 (752-891)||(22941241-22941379)
chr5 (587-690)||(31886537-31886640)
chr5 (489-545)||(19714742-19714798)
chr5 (752-891)||(24933479-24933617)
chr5 (488-545)||(19707462-19707519)
chr5 (489-545)||(27347722-27347778)
chr5 (752-891)||(12765167-12765305)
chr5 (752-891)||(31096807-31096945)
chr5 (752-891)||(5097642-5097780)
chr5 (752-891)||(7865607-7865745)
chr5 (752-891)||(9811910-9812048)
chr5 (752-891)||(12704051-12704189)
chr5 (607-697)||(33477389-33477479)
chr5 (488-545)||(18570108-18570165)
chr5 (752-873)||(26245093-26245213)
chr5 (489-544)||(39537870-39537925)
chr5 (830-884)||(18829465-18829519)
chr5 (763-891)||(20100416-20100543)
chr5 (631-699)||(11479420-11479489)
chr5 (843-884)||(18806578-18806619)
chr5 (843-884)||(18806758-18806799)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (581-891)||(25887-26197)
scaffold0186 (488-544)||(26231-26287)
[»] scaffold0657 (2 HSPs)
scaffold0657 (581-891)||(993-1303)
scaffold0657 (489-545)||(901-957)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (583-891)||(5531-5839)
scaffold0063 (488-545)||(5435-5492)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (583-764)||(230365-230545)
scaffold0008 (812-891)||(230288-230367)
scaffold0008 (489-545)||(230584-230640)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (738-884)||(90019-90166)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (752-891)||(8296-8434)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (752-891)||(174-312)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (581-645)||(8446-8510)
scaffold0176 (488-545)||(8546-8603)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (752-891)||(3848-3986)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (752-891)||(119721-119859)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (752-891)||(130397-130535)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (488-545)||(23769-23826)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (488-545)||(16522-16579)
scaffold0326 (581-614)||(16615-16648)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (752-891)||(67547-67685)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (761-891)||(40161-40290)
[»] scaffold0705 (1 HSPs)
scaffold0705 (488-545)||(41-98)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (489-545)||(8944-9000)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (752-891)||(13122-13260)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (829-888)||(26609-26668)
[»] scaffold0565 (2 HSPs)
scaffold0565 (491-545)||(10202-10256)
scaffold0565 (600-631)||(10127-10158)
[»] scaffold0767 (1 HSPs)
scaffold0767 (489-525)||(1-37)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (610-846)||(92194-92432)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (488-541)||(5877-5930)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (836-891)||(11703-11758)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (838-889)||(8807-8858)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (800-892)||(45956-46052)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (836-891)||(83188-83243)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (752-797)||(15089-15134)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 420; Significance: 0; HSPs: 58)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 460
Target Start/End: Original strand, 23862796 - 23863255
Alignment:
Q  1 gcaaatgtaactaactgataacttgtatatcaagttatctctatatctaggatttatcattagtaatgtcttcactatgcaataactttcatccattcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23862796 gcaaatgtaactaactgataacttgtatatcaagttatctctatatctaggatttatcatcactaatgtcttcactatgcaataactttcatccattcat 23862895  T
Q  101 ctactattaaaaacgtacaaatgattaatggtattaatgtcttcaaccatatattgatcatcatcacttcaacatgtctatattgtttttcgattgccat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23862896 ctactattaaaaacgtacaaatgattaatcgtattaatgtcttcaaccctatattgatcatcatcgcttcaacatgtctatattgtttttcgattgccat 23862995  T
Q  201 gttattggtacaaactttcgaccattgtttatcgatgactattcctcgtcaaagaatttgtgaggaacgcaaggtgggttttctcttctccatctaattt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23862996 gttattggtacaaactttccaccattgtttatcgatgactattcctcgtcaaagaatttgtgaggaacacaaggtgggttttctcttctccatctaattt 23863095  T
Q  301 tctccatacgcaaaaatcgaagatcgaacccctgtccacttacataaggggttcaagtctcttaccactaactaatttattgttgatatgattcaacatg 400  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23863096 tttccatacgcaaaaatcgaagatcgaacccctgtccacttacataagggattcaagtctcttaccactaactaatttattgttgatatgattcaacatg 23863195  T
Q  401 tccttaacactcttggatgtgtacaagatgtgtctaaaaatgtctaaggtgtttcgaaac 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23863196 tccttaacactcttggatgtgtacaagatgtctctaaaaatgtctaaggtgtttcgaaac 23863255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Original strand, 29327784 - 29328094
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327784 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcagtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 29327883  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327884 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 29327983  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327984 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 29328083  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  29328084 gaatactacat 29328094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 11536269 - 11535959
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11536269 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtacaacttaattgtgag 11536170  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11536169 accccattaaacataaggaacctattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 11536070  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11536069 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacaaagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 11535970  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  11535969 gaatactacat 11535959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 11543187 - 11542877
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11543187 acaatgcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtcag 11543088  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11543087 accccattaaacataaggaacctattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 11542988  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542987 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 11542888  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  11542887 gaatactacat 11542877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 583 - 891
Target Start/End: Original strand, 15152445 - 15152753
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152445 aaggcatttctttattgagtttgttttgtttcaaaataataaagttcctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 15152544  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152545 cccgttaaacatacggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 15152644  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152645 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 15152744  T
Q  883 atactacat 891  Q
    |||||||||    
T  15152745 atactacat 15152753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 583 - 891
Target Start/End: Original strand, 18561009 - 18561317
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18561009 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacattaagtataacttaactgtgagac 18561108  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18561109 cccgttaaacattaggaaactattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaggtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 18561208  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  18561209 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccctctatgaga 18561308  T
Q  883 atactacat 891  Q
    |||||||||    
T  18561309 atactacat 18561317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 583 - 891
Target Start/End: Original strand, 12750828 - 12751136
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12750828 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaagtaataaagtccctagaatagttagtccgtttaatgaaacattaagtataacttaattgtgagac 12750927  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    | | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12750928 ctcgttaaacataaagaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagttggatatcattaaagcatagagactattatgtggatagact 12751027  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751028 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaattcttctcatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 12751127  T
Q  883 atactacat 891  Q
    |||||||||    
T  12751128 atactacat 12751136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 587 - 891
Target Start/End: Original strand, 12738542 - 12738846
Alignment:
Q  587 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 686  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||       
T  12738542 catttctttattgattttattttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtttgtttaatgaaacattaattataacttaattgtgagaccttg 12738641  T
Q  687 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 786  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  12738642 ttaaacataaggaaactattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgaag 12738741  T
Q  787 atcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738742 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattactcataatatttatattggattgatccgccatgagaatac 12738841  T
Q  887 tacat 891  Q
    |||||    
T  12738842 tacat 12738846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 583 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 18258047 - 18257762
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18258047 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaataattagtctgtttaatggaacattaagtatgacttaattgtgagac 18257948  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| ||||| || ||| ||||| |||||||||||| | |||| |    
T  18257947 cccattaaacacaaggacattattcttaaagtatccgtagtcaagtttttttgttaagtaggataacaataatgcataaagactattatgtggatagatt 18257848  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 868  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257847 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 18257762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 583 - 802
Target Start/End: Original strand, 15148144 - 15148363
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148144 aaggcatttctttattgagtttgttttgtttcaaaataataaagttcctagaatagttagtccgtttgattgaacattaagtataacttaattgtgagac 15148243  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148244 cccgttaaacataaggaaactattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 15148343  T
Q  783 gatgatcacatctcacagat 802  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15148344 gatgatcacatctcacagat 15148363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 587 - 891
Target Start/End: Original strand, 13392157 - 13392460
Alignment:
Q  587 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 686  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | |||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| |    
T  13392157 catttctttgttgactttgttttgtttcaaaataataaagttcctagaacaattagtctgcttaatggagcattaagtgtgacttaatcgtgagaccc-a 13392255  T
Q  687 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 786  Q
    |||||   ||||| | |||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| |||  |||||| ||||||| ||||||||||||| | | ||||||  ||||    
T  13392256 ttaaatgaaaggacattattcttaaagtatcaatagtcaaactttattgtgaaaagggataacattaaaacatagagactattgtattggtagatcgatg 13392355  T
Q  787 atcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 886  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| |||||     
T  13392356 atcacatctcacggatcatagataaagagttatcctgtcttcacataggaataaatattaggagaaatatttatactggattgacccaccatgcgaatat 13392455  T
Q  887 tacat 891  Q
    |||||    
T  13392456 tacat 13392460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 603 - 799
Target Start/End: Original strand, 2364917 - 2365112
Alignment:
Q  603 ttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaac 702  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||||||  || || |     
T  2364917 ttgttatgtttcaaaataataaagtctctagaataattagtctttctaatggaacattaagtgtggcttaatcgtgagaacccattaaactaaatgacat 2365016  T
Q  703 tattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 799  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| | || ||| ||| || |||| ||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2365017 tattcttaaaatattcgtagtcaa-ccttattgtgaaatgagataacattaaaacatagagactatcatgtgggtcgactgatgatcacatctcaca 2365112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 614 - 839
Target Start/End: Original strand, 7396221 - 7396450
Alignment:
Q  614 caaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaa-tggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaa 712  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||    
T  7396221 caaaataaaaatgtcgctagaatagttagttcatttaaatggaacattaagtatgacttaatcttgagaccctattaaacataagaaaattattcttaaa 7396320  T
Q  713 gtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgt---aggtagactgatgatcacatctcacagatcatggat 809  Q
      ||  |||||||||| ||  || ||| |  |||   ||||||||||||||||||||||||    |||  |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  7396321 acatatgtagtcaagccttagtgtgaaatacgatgatattaaagcatagagactattatgtgcagggtgaactgatgatcacatctcacatatcatgaat 7396420  T
Q  810 aaagagttatccagtcttcacatagatata 839  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| |||||    
T  7396421 aaagaattatcaagtattcacataaatata 7396450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 761 - 891
Target Start/End: Original strand, 8464999 - 8465128
Alignment:
Q  761 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 860  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464999 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 8465097  T
Q  861 attggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||    
T  8465098 attggattgacccaccgtgagaatactacat 8465128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 587 - 861
Target Start/End: Original strand, 39111819 - 39112092
Alignment:
Q  587 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 686  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||||||    ||||  |     
T  39111819 catttctttattaattttgttttatttcaaaa-aataaagtccctagaatagcgagtccgtttaatgaaacattaagtacgacttaatcacaagacatct 39111917  T
Q  687 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 786  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||| ||| |  |||| |||||| ||| |||  |  ||| |||||||  ||||||||||||||   |||||||| |||    
T  39111918 ttaaacataaggacactatttcaaaaatattcacagtccagctttattgtgaaacgaaataacattaaaatatagagactattataagggtagactaatg 39112017  T
Q  787 atcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 861  Q
     | | ||| || || |||||||||||||||||     |||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  39112018 gtaatatcacataggtcatggataaagagttacaatttcttcatatatacataaatattaggagtattatttata 39112092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 2204543 - 2204681
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2204543 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 2204641  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  2204642 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 2204681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 18400095 - 18400233
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18400095 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 18400193  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  18400194 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 18400233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 18407079 - 18407217
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18407079 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 18407177  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  18407178 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 18407217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 19230879 - 19231017
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19230879 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 19230977  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  19230978 aatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacat 19231017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 30254129 - 30254267
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30254129 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 30254227  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  30254228 aatatttgtattggattgacccaccgtgagaatactacat 30254267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 48808807 - 48808669
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  48808807 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 48808709  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  48808708 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 48808669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 780 - 884
Target Start/End: Original strand, 10235361 - 10235465
Alignment:
Q  780 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatg 879  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||  | |||||    
T  10235361 actgatgatcacatctcacagatcattgataaagagttatcaggtgttcccatatgtataaatattaggaataatatttatatcggattgactcaccatg 10235460  T
Q  880 agaat 884  Q
    |||||    
T  10235461 agaat 10235465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 11543280 - 11543223
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11543280 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggttttggctttgtatcatg 11543223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 2653331 - 2653275
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2653331 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggattggctttgtatcatg 2653275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Original strand, 12738443 - 12738499
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738443 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 12738499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 15729742 - 15729880
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||  |||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  15729742 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 15729840  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  15729841 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 15729880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 18139649 - 18139511
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18139649 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaggtctatacatagatataaatattaggagt 18139551  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  18139550 aatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacat 18139511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 719 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 7662733 - 7662569
Alignment:
Q  719 gtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 818  Q
    ||||||||| |||  || ||||| ||||| |||||||| | |  || |||||||| | || ||||||||||| |||| ||  |||||| ||||| | |||    
T  7662733 gtagtcaagatttagtgtgaagtaggatagcattaaagtacattgattattatgtggatacactgatgatcatatcttacgaatcatgtataaaaactta 7662634  T
Q  819 tccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 884  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  7662633 tcaagtcttcacatagatataaa-attataagtaatatttttattagattgacccgccatgagaat 7662569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 11536362 - 11536305
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11536362 ttgttggaataagccctaatagccactctatattgattggttttggctttgtatcatg 11536305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Original strand, 12750732 - 12750789
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12750732 ttgttggagtaagccctaatagctaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 12750789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Original strand, 15152349 - 15152406
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15152349 ttgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggtttggttttgtatcatg 15152406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 655 - 891
Target Start/End: Original strand, 3132748 - 3132983
Alignment:
Q  655 aacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaa 754  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| | |||||||  ||| || || |||  |  ||| ||| | |  | |||    
T  3132748 aacattaagtgtaacttaattgtgagaccccattaaacataaggtcattattatgaaagtatttgtaatctagttttacttggaattggaaaaatagtaa 3132847  T
Q  755 agcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaat 854  Q
     ||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||| |||| |  ||  | ||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||| |  ||||    
T  3132848 tgcatagagactacaatgtgattagactgatgatcacatctcatagataaatgaatatgagatatcaagtcttcacatatgtataattattatg-ttaat 3132946  T
Q  855 atttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||    
T  3132947 atttatattggattgacctgtcataagaatactacat 3132983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 488 - 544
Target Start/End: Original strand, 29327689 - 29327745
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcat 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29327689 ttgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggtttggttttgtatcat 29327745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 762 - 870
Target Start/End: Complemental strand, 47833983 - 47833875
Alignment:
Q  762 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 861  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||    |||||||||||    
T  47833983 agactattacgtaggtaggctggtgatcagatctcaccgatcatgaataaagagttaccaagttttcacataggtataaatattactcataatatttata 47833884  T
Q  862 ttggattga 870  Q
    || ||||||    
T  47833883 tttgattga 47833875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 10669213 - 10669075
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||  |||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  10669213 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 10669115  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||| | |||||| || || ||||||||||||||    
T  10669114 aatatttatactagattgacccaccgtgagaatactacat 10669075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Original strand, 15148049 - 15148105
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15148049 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattaattgggtttggttttgtatcatg 15148105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 761 - 861
Target Start/End: Original strand, 19859122 - 19859221
Alignment:
Q  761 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 860  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859122 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 19859220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 18473949 - 18473871
Alignment:
Q  6 tgtaactaactgataacttgtatatcaagttatctctatatctaggatttatcattagtaatgtcttcactatgcaata 84  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| || | |||| ||||||||||||||||    
T  18473949 tgtaactaactgatcacttgtataacaagttatctctataactattatttattatcactaatctcttcactatgcaata 18473871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 370 - 459
Target Start/End: Original strand, 23872073 - 23872160
Alignment:
Q  370 aactaatttattgttgatatgattcaacatgtccttaacactcttggatgtgtacaagatgtgtctaaaaatgtctaaggtgtttcgaaa 459  Q
    ||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  23872073 aactaatttattgttgattc--tttaacatgtctttaacactcttagatgtgtacgagatgtgtttagaaatgtctaaggtgttttgaaa 23872160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 488 - 544
Target Start/End: Original strand, 13392029 - 13392085
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcat 544  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13392029 ttgttggagtaagccctaatatccaatctatattgattgtgtttgactttgtatcat 13392085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 836 - 888
Target Start/End: Original strand, 16011515 - 16011567
Alignment:
Q  836 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatacta 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  16011515 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccatgagaatacta 16011567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 828 - 891
Target Start/End: Original strand, 2365169 - 2365232
Alignment:
Q  828 cacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| ||||||    
T  2365169 cacatagatatcaatattaggagtaatatttacattggattgacccaccatgaaaatgctacat 2365232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 836 - 890
Target Start/End: Original strand, 14591924 - 14591978
Alignment:
Q  836 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactaca 890  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||    
T  14591924 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactaca 14591978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 18478519 - 18478441
Alignment:
Q  6 tgtaactaactgataacttgtatatcaagttatctctatatctaggatttatcattagtaatgtcttcactatgcaata 84  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||| ||||||| || | |||| | ||||||||||||||    
T  18478519 tgtaactaactgataacttgtattgcaagttatctttataactaagatttattatcactaatattttcactatgcaata 18478441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 829 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 41681203 - 41681141
Alignment:
Q  829 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  41681203 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacat 41681141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 631 - 696
Target Start/End: Original strand, 10234179 - 10234244
Alignment:
Q  631 tagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataa 696  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  |||||  |||||||||||||    
T  10234179 tagaatagttagtccgtttaatgaaccattaaatataacttaatcatgagattccattaaacataa 10234244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 18258143 - 18258087
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18258143 tgttggagtaagccctgatagccaatctagattgattggttttggccttgtatcatg 18258087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 19393735 - 19393597
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||  | ||||  |||  ||| |||  |||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  19393735 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactaatgaccacatttcatgggtcataaatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 19393637  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||| | |||||| |  || ||||||||||||||    
T  19393636 aatatttatactagattgaccgaccgtgagaatactacat 19393597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 47167170 - 47167032
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| |||  |||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  47167170 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattatgagt 47167072  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||| | ||| || || || ||||||||||||||    
T  47167071 aatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacat 47167032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 753 - 891
Target Start/End: Original strand, 19388544 - 19388681
Alignment:
Q  753 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagta 852  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||| |||||| || ||||||| | ||||| |||  ||| |||  ||| |  ||| || |||||||||||||||||    
T  19388544 aaagcatagagattattatgtatatagattgatgaccatatctcacgggtcatgaatat-gagatattaagtttgtacaaaggtataaatattaggagta 19388642  T
Q  853 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||| |||||||  |   ||||||||||||||||    
T  19388643 atatttatactggattgcccaatcatgagaatactacat 19388681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 581 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 2653239 - 2653207
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgttt 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653239 acaaggcatttctttattgattttgttttgttt 2653207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Original strand, 18560913 - 18560969
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18560913 tgttggagtaagcccttaaaggcaatctatgttgattgggcttggctttgtatcatg 18560969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 759 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 25845780 - 25845649
Alignment:
Q  759 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 858  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  | ||||| |||  ||| |||  |||||  || ||  | | |||||||||||||||||||    
T  25845780 tagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctcatgaatat-gagatattaagtctatacgtatgtgtcaatattaggagtaatattt 25845682  T
Q  859 atattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||| ||||||||  | || ||||||||||||||    
T  25845681 atactggattgacacaccgtgagaatactacat 25845649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 759 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 25846199 - 25846068
Alignment:
Q  759 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 858  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  | ||||| |||  ||| |||  |||||  || ||  | | |||||||||||||||||||    
T  25846199 tagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctcatgaatat-gagatattaagtctatacgtatgtgtcaatattaggagtaatattt 25846101  T
Q  859 atattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||| ||||||||  | || ||||||||||||||    
T  25846100 atactggattgacacaccgtgagaatactacat 25846068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 843 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 31190660 - 31190612
Alignment:
Q  843 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  31190660 attaggagcaatatttatactggattgacccaccatgagaatactacat 31190612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 821 - 868
Target Start/End: Original strand, 7396464 - 7396511
Alignment:
Q  821 cagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 868  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  7396464 cagtattcacataaatataaatattatgggtaatatttatattggatt 7396511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 28130552 - 28130690
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||||||||||| | |||||||  | ||||  |||  ||| |||  |||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  28130552 taaagcgtcgagactattatgcatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcataaatat-gagatattaagtctatacataggtataaatatcaggagt 28130650  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||| |||||||| || |  |||||||| |||||    
T  28130651 aatatttatactggattgacccactgtgagaatattacat 28130690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 836 - 891
Target Start/End: Original strand, 34128647 - 34128702
Alignment:
Q  836 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    ||||||||||||||    
T  34128647 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccattgtgagaatactacat 34128702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 307; Significance: 1e-172; HSPs: 67)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Original strand, 6110064 - 6110374
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110064 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 6110163  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110164 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 6110263  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110264 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 6110363  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  6110364 gaatactacat 6110374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 10572799 - 10572489
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572799 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 10572700  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572699 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 10572600  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572599 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 10572500  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  10572499 gaatactacat 10572489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 15601091 - 15600781
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15601091 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 15600992  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600991 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 15600892  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600891 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 15600792  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  15600791 gaatactacat 15600781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 15607636 - 15607326
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607636 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 15607537  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607536 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 15607437  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607436 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 15607337  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  15607336 gaatactacat 15607326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 583 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 16482688 - 16482380
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482688 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 16482589  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482588 cccattaaacataaggaaactactctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 16482489  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482488 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 16482389  T
Q  883 atactacat 891  Q
    |||||||||    
T  16482388 atactacat 16482380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 587 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 10579556 - 10579252
Alignment:
Q  587 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579556 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgttaaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 10579457  T
Q  687 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579456 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 10579357  T
Q  787 atcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579356 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 10579257  T
Q  887 tacat 891  Q
    |||||    
T  10579256 tacat 10579252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 584 - 891
Target Start/End: Original strand, 13211305 - 13211612
Alignment:
Q  584 aggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacc 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211305 aggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacc 13211404  T
Q  684 ccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactg 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211405 ccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactg 13211504  T
Q  784 atgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaa 883  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211505 atgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaa 13211604  T
Q  884 tactacat 891  Q
    || |||||    
T  13211605 tattacat 13211612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 587 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 17781319 - 17781015
Alignment:
Q  587 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 686  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781319 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 17781220  T
Q  687 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 786  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781219 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 17781120  T
Q  787 atcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 886  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781119 atcacatctcacaaatcatagataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 17781020  T
Q  887 tacat 891  Q
    |||||    
T  17781019 tacat 17781015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 583 - 891
Target Start/End: Original strand, 18522665 - 18522973
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522665 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 18522764  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522765 cccattaaacataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcatttaagcatagagactattatgtaggtagact 18522864  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18522865 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaaa 18522964  T
Q  883 atactacat 891  Q
    |||||||||    
T  18522965 atactacat 18522973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Original strand, 13248607 - 13248917
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248607 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 13248706  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248707 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtattcgtagtcaagctttgttgagaagtgggataacattaaagcatagagactattatgtaggtaga 13248806  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13248807 ctgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgattcgccatga 13248906  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    ||||| |||||    
T  13248907 gaatattacat 13248917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Original strand, 8490488 - 8490805
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490488 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 8490587  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagact-------attatgt 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  8490588 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatctgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactacagacgattatgt 8490687  T
Q  774 aggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcc 873  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490688 aggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcc 8490787  T
Q  874 gccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8490788 gccatgagaatactacat 8490805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 15357793 - 15357483
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357793 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagattagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 15357694  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15357693 accccattaaacataaggaacctattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaaacatagagactattatgtaggtaga 15357594  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15357593 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatatttatattgggttgatccgccatga 15357494  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  15357493 gaatactacat 15357483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 583 - 891
Target Start/End: Original strand, 18519980 - 18520285
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18519980 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 18520079  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520080 cccgttaaacataaggaaactattcttaaa---tccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 18520176  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18520177 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatttgattgatccgccatgaga 18520276  T
Q  883 atactacat 891  Q
    |||||||||    
T  18520277 atactacat 18520285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 600 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 15342407 - 15342116
Alignment:
Q  600 attttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataagga 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342407 attttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagtttgttcgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataagga 15342308  T
Q  700 aactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 799  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342307 acctattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaaacatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 15342208  T
Q  800 gatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15342207 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacat 15342116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 583 - 888
Target Start/End: Original strand, 13516813 - 13517118
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516813 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttcatggaacattaagtataacttaattgtgagac 13516912  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13516913 cccgttaaacataaggaaacgattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtaggatatcattaaagcacagagactattatgtgggtagact 13517012  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13517013 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctccatgaga 13517112  T
Q  883 atacta 888  Q
    ||||||    
T  13517113 atacta 13517118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 583 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 17200389 - 17200081
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17200389 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgatac 17200290  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17200289 ccctttaaacataatgaaactattcttaaagtatccgtagttaagctttattgagatgtgtgatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 17200190  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 882  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  17200189 gatgatcacatctcacagatcgtggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtagtatttgtattggattgacccgctatgaga 17200090  T
Q  883 atactacat 891  Q
    |||||||||    
T  17200089 atactacat 17200081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 587 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 32057101 - 32056796
Alignment:
Q  587 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||     
T  32057101 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacatcaagtataactttattgtaagaccccg 32057002  T
Q  687 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 786  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  32057001 ttaaacataaagaaactattcttaaagtgtccgtagtcaaactttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactaatg 32056902  T
Q  787 atcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatat-aaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaata 885  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056901 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaata 32056802  T
Q  886 ctacat 891  Q
    ||||||    
T  32056801 ctacat 32056796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 587 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 1647726 - 1647418
Alignment:
Q  587 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataa----cttaattgtgagac 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  1647726 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacattaagtataattaacttaattgtgagac 1647627  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1647626 cccgttaaacataaggaaactatttttaaagtatccgtaatcaagctttattgagaaaagggatataattaaagcatagagactattatgtggatagact 1647527  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||    
T  1647526 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagtaatgtttatatttgattgactcgccatgaga 1647427  T
Q  883 atactacat 891  Q
    |||||||||    
T  1647426 atactacat 1647418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 587 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 19089946 - 19089734
Alignment:
Q  587 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19089946 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagattagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccct 19089847  T
Q  687 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 786  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089846 ttaaacataatgaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaatcatagagactattatgtaggtagactgatg 19089747  T
Q  787 atcacatctcaca 799  Q
    |||||||||||||    
T  19089746 atcacatctcaca 19089734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 581 - 887
Target Start/End: Original strand, 29924971 - 29925277
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  29924971 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagcccctaaaatagttagtccgtttaatggattattaagtataatttaattgtgag 29925070  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||| ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||    
T  29925071 accccattaaatataaggacattattcttaaaatatatgtagtcaagctttattgtgaagtgagatatcattaaagcatggaggctattatgtggataga 29925170  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||    
T  29925171 tcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccacctaga 29925270  T
Q  881 gaatact 887  Q
    |||||||    
T  29925271 gaatact 29925277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 581 - 887
Target Start/End: Original strand, 29974124 - 29974430
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  29974124 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagcccctaaaatagttagtccgtttaatggattattaagtataatttaattgtgag 29974223  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||| ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||    
T  29974224 accccattaaatataaggacattattcttaaaatatatgtagtcaagctttattgtgaagtgagatatcattaaagcatggaggctattatgtggataga 29974323  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||    
T  29974324 tcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccacctaga 29974423  T
Q  881 gaatact 887  Q
    |||||||    
T  29974424 gaatact 29974430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 583 - 891
Target Start/End: Original strand, 16200434 - 16200740
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16200434 aaggcatttcttcgttg-ttttattttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccgtttaatggaacattatgtataacttaattgtgagac 16200532  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
     ||| |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| |  |||||    
T  16200533 tccaataaacataaggacattattcttaaagtattcgtagtcaagatttattgtgaagtgggatgtcattaaagcatgaagactatt-tgtggagagact 16200631  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 882  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  16200632 gatgatcatatcttacagatcatggataaagaattatcaagtattcatatagatacaaatattaggtgtaatattcatattggattgacccaccatgaga 16200731  T
Q  883 atactacat 891  Q
    |||||||||    
T  16200732 atactacat 16200740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 581 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 18640953 - 18640792
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640953 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 18640854  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtg 742  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18640853 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtg 18640792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 687 - 891
Target Start/End: Original strand, 17136465 - 17136663
Alignment:
Q  687 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 786  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17136465 ttaaacataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaaacatagagactattatgtgggtagactgatg 17136564  T
Q  787 atcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 886  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17136565 atcacatttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatag------atattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatac 17136658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 583 - 820
Target Start/End: Original strand, 16200128 - 16200363
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16200128 aaggcatttcttcgttg-ttttattttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagttcgtttaatggaacattatgtataacttaattgtgagac 16200226  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |  |||||    
T  16200227 cccattaaacataaggacattattcttaaagtattcgtagtcaagatttattgtgaagtgggatatcattaaagcatggagactatt-tgtggagagact 16200325  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatc 820  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16200326 gatgatcatatcttacagatcatggataaagagttatc 16200363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 588 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 24253589 - 24253291
Alignment:
Q  588 atttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgaga-cccca 686  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  24253589 atttctttattgattttgttttacttcaaaataataaagtccttagaatagctcgttcgtttgatggaacattaagtatgacttaatcgtgagatcccca 24253490  T
Q  687 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 786  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||  || |||||  ||| |||  ||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  24253489 tcaaacataaggacactattcttaaagtatatgtggtcaaaatttattgtaaagtgaggtaacattaaagcatagagactattatgtcggtagactaatg 24253390  T
Q  787 atcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaata 885  Q
    |||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  24253389 atcatatctcacgaattatggataaagagttatcaagttttcacatacttataaacattaagagttatatttatattggtttgaccctccatgagaata 24253291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 15846847 - 15846709
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15846847 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 15846749  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  15846748 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacat 15846709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 21034229 - 21034367
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21034229 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 21034327  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  21034328 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacat 21034367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 761 - 891
Target Start/End: Original strand, 14890391 - 14890520
Alignment:
Q  761 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 860  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14890391 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 14890489  T
Q  861 attggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||    
T  14890490 attggattgacccaccgtgagaatactacat 14890520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 20147865 - 20147727
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20147865 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 20147767  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  20147766 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 20147727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Original strand, 18534758 - 18534820
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcc 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18534758 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccatagaatagttagtcc 18534820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Original strand, 6109971 - 6110028
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6109971 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 6110028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Original strand, 13248514 - 13248571
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248514 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 13248571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Original strand, 8490396 - 8490452
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490396 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 8490452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 486 - 545
Target Start/End: Original strand, 13211208 - 13211267
Alignment:
Q  486 acttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13211208 acttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggttttgtatcatg 13211267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 761 - 891
Target Start/End: Original strand, 21398792 - 21398921
Alignment:
Q  761 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 860  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21398792 gagactattatgtatgtagacttatgacctcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 21398890  T
Q  861 attggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||    
T  21398891 attggattgacccaccgtgagaatactacat 21398921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 18641045 - 18640989
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18641045 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgtgtttggctttgtatcatg 18640989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 55427012 - 55427150
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||  |||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  55427012 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 55427110  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  55427111 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 55427150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Original strand, 17136137 - 17136193
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17136137 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggctttgtatcatg 17136193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 12299902 - 12300039
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  12299902 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctat-catagatataaatgttaggagt 12299999  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  12300000 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 12300039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 14147012 - 14147150
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||  | |||||||||  ||| |||  |||||  |||||  |||||||||||||||     
T  14147012 taaagcacagagactattatatatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagg 14147110  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||| |||||||| | ||| ||||||| ||||||    
T  14147111 aatatttatactggattgacctgccgtgagaatgctacat 14147150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 489 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 10579653 - 10579603
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgt 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10579653 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttgactttgt 10579603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 15607730 - 15607672
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctata-ttgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15607730 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattttattgggtttggctttgtatcatg 15607672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 15351294 - 15351237
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  15351294 ttgttggaataagccctaatagccaatctataatgattgattttggctttgtatcatg 15351237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 15357886 - 15357829
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  15357886 ttgttggaataagccctaatagccaatctataatgattgattttggctttgtatcatg 15357829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 17200484 - 17200427
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17200484 ttgttggagtaagccctaatagccaatctatgttgattgggtttggctttgtagcatg 17200427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 583 - 628
Target Start/End: Original strand, 18510924 - 18510969
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtc 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18510924 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtc 18510969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 16482782 - 16482727
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482782 tgttagaataagccctaata-ccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 16482727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Original strand, 18519885 - 18519941
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18519885 tgttggagtaagtcctaatagccaatctatattgattgggtttggttttgtatcatg 18519941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 488 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 10572891 - 10572840
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgt 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  10572891 ttgttggaataagccctaatagccaacctatattgattgggtttgactttgt 10572840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 486 - 545
Target Start/End: Original strand, 13516716 - 13516775
Alignment:
Q  486 acttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  13516716 acttgttggagtaagccctaatagccaatctatgttgattgagtttggctgtgtatcatg 13516775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 744 - 846
Target Start/End: Original strand, 9504446 - 9504548
Alignment:
Q  744 gatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaata 843  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| | |||||||||| |||||||| ||| || ||||| ||| |||||    
T  9504446 gatatctttaaaggatagaaactattatgtgggtagactgataatcttatctcacgggtcatggataaggagttatcaagtattaacatacataaaaata 9504545  T
Q  844 tta 846  Q
    |||    
T  9504546 tta 9504548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 15601185 - 15601127
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctata-ttgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  15601185 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattttattgggtttggatttgtatcatg 15601127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 17781415 - 17781358
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  17781415 ttgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggttttatatcatg 17781358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 19090042 - 19089985
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  19090042 ttgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggttttatatcatg 19089985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 1647824 - 1647768
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1647824 tgttggagtaagccctaatagctggtctatattgattgggtttggctttgtatcatg 1647768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 32057200 - 32057144
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  32057200 tgttggagtaagctctaatagccaatctatgttgattgggtttgactttgtatcatg 32057144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 829 - 891
Target Start/End: Original strand, 11787654 - 11787716
Alignment:
Q  829 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||    
T  11787654 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacat 11787716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Original strand, 18510828 - 18510885
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  18510828 ttgttggagtaagccctaatatccaatctatattgattgagtttgattttgtatcatg 18510885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Original strand, 18522569 - 18522626
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  18522569 ttgttggagtaagccctaatatccaatctatattgattgagtttgattttgtatcatg 18522626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Original strand, 18534662 - 18534719
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  18534662 ttgttgtagtaagccctaatagtcaatctatattgattgagtttggttttgtatcatg 18534719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 757 - 872
Target Start/End: Complemental strand, 8252048 - 8251933
Alignment:
Q  757 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 856  Q
    |||| ||||||| |||| | | |||||| |||||||||| || ||||||| |||||  |||||| | |||| ||||| || || |||||  |||||||||    
T  8252048 catatagactatcatgtggatggactgaagatcacatcttacggatcatgaataaaatgttatcaaatctttacataaatttacatatttcgagtaatat 8251949  T
Q  857 ttatattggattgatc 872  Q
    ||||||| ||||||||    
T  8251948 ttatatttgattgatc 8251933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 668 - 807
Target Start/End: Original strand, 19345656 - 19345795
Alignment:
Q  668 acttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagacta 767  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||| | |||||||| |||| ||||  | | ||| ||  ||| ||||||| ||| ||||||||| || |||  |    
T  19345656 acttaatcgtgagactccattaattataagaacactattcttaaagaatcctcaattaaggttcattgtgaagtggtataacattaaagcgtaaagatca 19345755  T
Q  768 ttatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatgg 807  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19345756 ttatgtgggtatactgatgatcacgtctcatagatcatgg 19345795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 829 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 15317408 - 15317346
Alignment:
Q  829 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || || || ||||||||||||||    
T  15317408 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacat 15317346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 829 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 25978963 - 25978901
Alignment:
Q  829 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||    
T  25978963 acataggtataattattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacat 25978901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Original strand, 29924879 - 29924935
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  29924879 tgttggagtaagccctaatagtcgatctatattgattgagtttgacattgtatcatg 29924935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Original strand, 29974032 - 29974088
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  29974032 tgttggagtaagccctaatagtcgatctatattgattgagtttgacattgtatcatg 29974088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 4)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 2528 - 2218
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2528 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 2429  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2428 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 2329  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2328 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 2229  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  2228 gaatactacat 2218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 11419 - 11109
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11419 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 11320  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11319 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 11220  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11219 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 11120  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  11119 gaatactacat 11109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 2621 - 2564
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2621 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 2564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 11512 - 11455
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11512 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 11455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Original strand, 18252030 - 18252340
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252030 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 18252129  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252130 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 18252229  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252230 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 18252329  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  18252330 gaatactacat 18252340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 18532721 - 18532411
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532721 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagttcgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 18532622  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18532621 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtagataga 18532522  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532521 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 18532422  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  18532421 gaatactacat 18532411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 27131616 - 27131306
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131616 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 27131517  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27131516 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatttgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtaggtaga 27131417  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131416 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 27131317  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  27131316 gaatactacat 27131306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 583 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 21171438 - 21171130
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21171438 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccgtttcatggaacattaaatataacttaattgtgagac 21171339  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21171338 cccgttgaacataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtgggtagact 21171239  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 882  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171238 gatgataacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 21171139  T
Q  883 atactacat 891  Q
    |||||||||    
T  21171138 atactacat 21171130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 583 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 27310782 - 27310474
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310782 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 27310683  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    | | || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27310682 cacgttgaacataaggaaactattcttaaagtatcagtagtcaagctttattgagaagtggaatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 27310583  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 882  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310582 gatgatcacatctcacagattatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 27310483  T
Q  883 atactacat 891  Q
    |||||||||    
T  27310482 atactacat 27310474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 583 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 16359240 - 16358932
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16359240 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacattaagaataacttaattgtgagac 16359141  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16359140 cccgttaaacataaggaaactattcttaaagtaaccctagtcaagctttattgagaaatggaatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 16359041  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 882  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359040 gatgatcacatctcacagataatggataaagagttatcaagccttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 16358941  T
Q  883 atactacat 891  Q
    |||||||||    
T  16358940 atactacat 16358932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 587 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 36816834 - 36816530
Alignment:
Q  587 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  36816834 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataatgaagtccctagaatagttcgtctgtttaatggaacattaagtataaattaattgtgagactccg 36816735  T
Q  687 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 786  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36816734 ttaaacataaggacattattcttaaagtatccatagtcaagctttattgagaagtgggataccattaaagcatagagactattatgtggatagactgatg 36816635  T
Q  787 atcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  36816634 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatac 36816535  T
Q  887 tacat 891  Q
    |||||    
T  36816534 tacat 36816530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 3856126 - 3855816
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3856126 acaaggcatttctttgtttattttgttttgtttcaaaataacaaagtccctagaatagttagcccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 3856027  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||  |||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  3856026 accccattaaacataaggacattattcttaaaatatttgtagtcaaactttattgtgaagtgggatattattaaagcatggagactattacgtgggtaga 3855927  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3855926 ctgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttataaagtcttcacataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccgcaatga 3855827  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  3855826 gaatactacat 3855816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 22657429 - 22657118
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgatttt-gttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtga 679  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22657429 acaagacatttctttattgatttttgttttgtttcaaaataataaagttcctagaatagttagtctgtttaatggaacattaaatataacttaattgtga 22657330  T
Q  680 gaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtag 779  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  22657329 gacccctttaaacataaggacacaattcttaaagtgtctctagtcaagctttattctgaaatgagatatcattaaagcatagagactatcatgtggatag 22657230  T
Q  780 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatg 879  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  22657229 actgatgatcacatctcatagctcatagataaagagttattaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattagattgacccaccatg 22657130  T
Q  880 agaatactacat 891  Q
     |||||||||||    
T  22657129 tgaatactacat 22657118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 587 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 27277756 - 27277460
Alignment:
Q  587 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 686  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||| || | ||||||| | ||||||       
T  27277756 catttctttgttgtttttgttttgtttcaaaataataacgtccctagaataattagtccatttaacggagcatta-gtgtgacttaatcgcgagacctt- 27277659  T
Q  687 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 786  Q
    |||| |  || || | |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27277658 ttaaccgaaatgacattattcttaaagtatccgtagtcaggctttattgtgaaaagggataacattaaagcatagagactattatgtgggtagaccgatg 27277559  T
Q  787 atcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaata 885  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||    
T  27277558 atcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgttttcacataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgacccaccataagaata 27277460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 615 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 12014457 - 12014188
Alignment:
Q  615 aaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagt 714  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||   |||||| |||      
T  12014457 aaaataataaagtcactagaatacatagtccgtttaatggaatattaagtgtaaattaatcgttagatcccattaaacataatgatgttattcttaaaac 12014358  T
Q  715 atccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaga 814  Q
    ||||||||| |||||||  || |||| ||||||  |||||||| || |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  12014357 atccgtagttaagctttagtgtgaagagggatacgattaaagcgtaaagaccattatgtgggtagaatgatgatcacatctcacggatcattgataagga 12014258  T
Q  815 gttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 884  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  12014257 gttatcaagtcttcacataaatataaatattaagagtaatattaatattggattgacccggcatgagaat 12014188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 593 - 870
Target Start/End: Complemental strand, 9918106 - 9917837
Alignment:
Q  593 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaac 692  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||       |||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||   ||||  ||||||||     
T  9918106 tttattgattttgttttgttacaaaataataaagtcactt------ttagtttgtttaatcgaacattaagtataacttgatcacgaga-tccattaaat 9918014  T
Q  693 ataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcaca 792  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||||  |||| ||||||| |||  |||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||    
T  9918013 ataaggacattattcttaaaatatctatagttaagctttattgttaagtgggatagcattgaagcatagagaatactatgtcggtaggttgatgatcaca 9917914  T
Q  793 tctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 870  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9917913 tctcgtggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt-tgagtaatatttatattggattga 9917837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 615 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 12006712 - 12006461
Alignment:
Q  615 aaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagt 714  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| | |||      
T  12006712 aaaataataaagtccctagaatagttagtctatttaatggaatattaagtgtgccttaatcgtgagaccccatgaaacataaggacattattattaaaac 12006613  T
Q  715 atccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaga 814  Q
    || ||||||||||| ||  || |||| |||||| ||||||| | |||||| | ||||||   |||||||||||||||| || ||  ||||| ||||| ||    
T  12006612 attcgtagtcaagccttagtgtgaagagggataacattaaaacttagagattgttatgtgcatagactgatgatcacaacttacgaatcattgataagga 12006513  T
Q  815 gttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgga 866  Q
    |||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12006512 gttatcaagtgttcgcacagatataaatattaagagtaatatttatactgga 12006461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 737 - 890
Target Start/End: Original strand, 23507056 - 23507209
Alignment:
Q  737 gaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagat 836  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| | || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  23507056 gaagtgggatagcattaaagtatatagaatataaggtggatagactgatgatcacatctcacggatcatggataaggagttatcaagttttcacatagat 23507155  T
Q  837 ataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactaca 890  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||| |||||    
T  23507156 ataaataataggagtaatatttatattggattaacccaccattagaatgctaca 23507209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 19706750 - 19706612
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19706750 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 19706652  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  19706651 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacat 19706612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 28135034 - 28134896
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28135034 taaagcgtcgagacaattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 28134936  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28134935 aatatttatattggattgatccaccgtgagaatactacat 28134896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 43802676 - 43802538
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  43802676 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 43802578  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  43802577 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacat 43802538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 9456107 - 9456245
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9456107 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 9456205  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  9456206 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 9456245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 20779956 - 20779818
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20779956 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 20779858  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  20779857 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 20779818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 22670568 - 22670430
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22670568 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 22670470  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  22670469 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 22670430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 42817300 - 42817162
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  42817300 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 42817202  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  42817201 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 42817162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Original strand, 18251936 - 18251992
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18251936 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 18251992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 18532813 - 18532757
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532813 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 18532757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 20391550 - 20391412
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  20391550 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatgttaggagt 20391452  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  20391451 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 20391412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 22612483 - 22612621
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||  |||| |||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  22612483 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gatatatcaagtctatacatagatataaatattgggagt 22612581  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  22612582 aatatttttattggattgacccaccgtgagaatactacat 22612621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 752 - 870
Target Start/End: Complemental strand, 47667785 - 47667668
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  47667785 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattatgagt 47667687  T
Q  852 aatatttatattggattga 870  Q
    |||||||||||||||||||    
T  47667686 aatatttatattggattga 47667668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 27310877 - 27310821
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27310877 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggctttgtatcatg 27310821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 35930573 - 35930711
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||  |||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  35930573 taaagcgtcgagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 35930671  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  35930672 aatatttatattggattgacctaccgtgagaatactacat 35930711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 787 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 22641871 - 22641778
Alignment:
Q  787 atcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaa 883  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  22641871 atcacatctcatagatcatggataaagagttattaagtgttcacatagatata---attaggaataatatttatactagattgacccaccatgagaa 22641778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 16359336 - 16359280
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16359336 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggttaggatttgtatcatg 16359280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 761 - 891
Target Start/End: Original strand, 633934 - 634063
Alignment:
Q  761 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 860  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| | ||  ||| |||  |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  633934 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagctat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 634032  T
Q  861 attggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    | |||||| | || || ||||||||||||||    
T  634033 actggattaacccaccgtgagaatactacat 634063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 21171536 - 21171479
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21171536 ttgttggagtaagctctaatagccaatctatatggattgagtttggctttgtatcatg 21171479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 836 - 889
Target Start/End: Original strand, 51997353 - 51997406
Alignment:
Q  836 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactac 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  51997353 tataaatattaggagtaatatttatattagattgacccaccatgagaatactac 51997406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 836 - 891
Target Start/End: Original strand, 8727741 - 8727796
Alignment:
Q  836 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8727741 tataaatattagaagtaatatttatactggattgatccaccgtgagaatactacat 8727796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 488 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 36816935 - 36816881
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatc 542  Q
    |||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816935 ttgtcggattaagccctaatattcaatctatattgattgggtttggctttgtatc 36816881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 3856221 - 3856164
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3856221 ttgttggagtaggccctaatagccaatccatcttgattgggtttgactttgtatcatg 3856164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 488 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 22657522 - 22657469
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtat 541  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22657522 ttgttggagtaagccttaatagccaatatatattgattgagtttggctttgtat 22657469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 587 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 30720694 - 30720625
Alignment:
Q  587 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaa 656  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  30720694 catttttttattggttttattttgttttaaaataataaagttcctggaataattagttcgtttaatggaa 30720625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 27131704 - 27131652
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  27131704 tgttggaataagccctaatagccaatctat----gttgggtttggctttgtatcatg 27131652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 769 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 26923678 - 26923557
Alignment:
Q  769 tatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 868  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  | |||| ||||  ||| |||  |||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  26923678 tatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacattggtatgaatattaggagtaatatttatactgaatt 26923580  T
Q  869 gatccgccatgagaatactacat 891  Q
    || || || ||||||||||||||    
T  26923579 gacccaccgtgagaatactacat 26923557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 611 - 688
Target Start/End: Original strand, 3403248 - 3403325
Alignment:
Q  611 tttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccatt 688  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||||||||||| | ||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  3403248 tttcaaagtaataaagtctataaaatagttagtctgattaatggaatattaagtgtgacttaaatgtgagaccacatt 3403325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 611 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 3443571 - 3443494
Alignment:
Q  611 tttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccatt 688  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||||||||||| | ||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  3443571 tttcaaagtaataaagtctataaaatagttagtctgattaatggaatattaagtgtgacttaaatgtgagaccacatt 3443494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Original strand, 9801529 - 9801606
Alignment:
Q  7 gtaactaactgataacttgtatatcaagttatctctatatctaggatttatcattagtaatgtcttcactatgcaata 84  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||| ||||| | || | | || ||||||||||||||||    
T  9801529 gtaactaactgataacttgcatagcaagttatctctatgactatgatttgttatcactgatctcttcactatgcaata 9801606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 27277856 - 27277800
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||    
T  27277856 tgttggagtaagccctaatagccaatctatgttaattatgtttgactttgtatcatg 27277800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 829 - 891
Target Start/End: Original strand, 29096789 - 29096851
Alignment:
Q  829 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || || |||||||||||    
T  29096789 acataggtatacatattaggaataatatttatactagattgatccaccgtgtgaatactacat 29096851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5456461 - 5456400
Alignment:
Q  306 atacgcaaaaatcgaagatcgaacccctgtccacttacataaggggttcaagtctcttacca 367  Q
    |||| ||| |||| |||||| ||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  5456461 atacacaagaatcaaagatcaaacccttggccacttatataaagggttcaagtctcttacca 5456400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 299; Significance: 1e-167; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Original strand, 18288 - 18598
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18288 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaattgaacattaagtataacttaattgtgag 18387  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 18487  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18488 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 18587  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  18588 gaatactacat 18598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Original strand, 18196 - 18252
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18196 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 18252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 299; Significance: 1e-167; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 27381459 - 27381149
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381459 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 27381360  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381359 accccattaaacatatggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 27381260  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381259 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 27381160  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  27381159 gaatactacat 27381149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 27471842 - 27471532
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471842 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 27471743  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471742 accccattaaacatatggaaactattctcaaagtatccatagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 27471643  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471642 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 27471543  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  27471542 gaatactacat 27471532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 583 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 17684674 - 17684366
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684674 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 17684575  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684574 cccgttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgatgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 17684475  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684474 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 17684375  T
Q  883 atactacat 891  Q
    |||||||||    
T  17684374 atactacat 17684366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Original strand, 29308890 - 29309200
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308890 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 29308989  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308990 agcccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 29309089  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309090 ctgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 29309189  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  29309190 gaatactacat 29309200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Original strand, 29315850 - 29316160
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315850 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 29315949  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315950 agcccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 29316049  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316050 ctgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 29316149  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  29316150 gaatactacat 29316160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 17691647 - 17691337
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691647 acaaggcatttctttattgattttgttttctttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 17691548  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17691547 accccattaaacataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttagtgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtaggtaga 17691448  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691447 ctgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 17691348  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  17691347 gaatactacat 17691337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 583 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 189182 - 188874
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189182 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 189083  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  189082 cccattaaacataaggaaactattcttaaagtatttgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 188983  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 882  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188982 gatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 188883  T
Q  883 atactacat 891  Q
    |||||||||    
T  188882 atactacat 188874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 583 - 891
Target Start/End: Original strand, 11651725 - 11652033
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11651725 aaggcatttctttattgattttgatttgtttcaaaataataaagtccctaaaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 11651824  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11651825 cccattaaaaataaggaaactattctaaaagtatcagtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 11651924  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11651925 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 11652024  T
Q  883 atactacat 891  Q
    |||||||||    
T  11652025 atactacat 11652033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 583 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 16566525 - 16566257
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566525 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 16566426  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566425 cccgttaaacataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 16566326  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566325 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 16566257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 583 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 25537364 - 25537148
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25537364 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaataattagtccgtttaatggaacattaagtataactttattgtgagac 25537265  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25537264 cccgttaaacataaggaaactattcttaaagtattcgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtaggtagact 25537165  T
Q  783 gatgatcacatctcaca 799  Q
    |||||||||||||||||    
T  25537164 gatgatcacatctcaca 25537148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 583 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 13359474 - 13359188
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  13359474 aaggcatttatttatttattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagttcgcttaatggagcattaagtataacttaatcgtgaaac 13359375  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
     |||||||||||||  | | |||| | ||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| | | ||||||    
T  13359374 tccattaaacataaaaacattatttttaaagtatccgtagtcaacctttattgtgaaatgggacaacattaaagcgtagagactattatatggatagact 13359275  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattg 869  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  13359274 gatgatcacatctcgcaaatcatggataaaaagttatcaaatcttcacttagatataagtattagaagtagtatttatattgaattg 13359188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 604 - 890
Target Start/End: Original strand, 27925772 - 27926062
Alignment:
Q  604 tgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacat---taagtata--acttaattgtgagaccccattaaacataagg 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  |||||| |||||||   ||||| |   ||||||| ||||||| |||||||||  |||     
T  27925772 tgttttgtttcaaaataataaagtccttagaataactagtatgtttaacggaacataattaagtgtgtgacttaatcgtgagactccattaaactaaaga 27925871  T
Q  699 aaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcac 798  Q
    ||| |||||| ||||||||  ||||||| |||| ||  ||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||| | || |||||||||| ||||||||    
T  27925872 aaattattcttaaagtatctctagtcaaactttatttggaagtggtatagcattgaagcacaaagactattatgtggataaactgatgatctcatctcac 27925971  T
Q  799 agatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactaca 890  Q
     ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  27925972 ggatcatggataaagatttatgaagttttcacatagatattaa-attaggaataatatttatattgaattgactcgccatgataatactaca 27926062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 620 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 20553755 - 20553492
Alignment:
Q  620 aataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccg 719  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||||| | | |||||| |||| |||||    
T  20553755 aataaagtctctaggatagctagtccgtttaatgaaatattaagtacgacttaatcgtgagatcccattaaatataagaatattattcttaaagcatccg 20553656  T
Q  720 tagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttat 819  Q
    |||| ||  ||| ||| |||||| ||||  ||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||    
T  20553655 tagtgaatttttattgtgaagtgagataaaattaaagcataaagatttttatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatcgataaagaaatat 20553556  T
Q  820 ccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaata 885  Q
    | |   ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||    
T  20553555 caaacattcacatagatat-aatattaagaataatatttatatt-gattgacccatcatgagaata 20553492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 619 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 17850663 - 17850392
Alignment:
Q  619 taataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatcc 718  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  ||||  |||||||||| |||  |||||||||||| | || |||||| | ||||| |||||||| ||| |||||    
T  17850663 taataaagtccctataatagctagtttgtttgttggaacattatgtaagacttaattgtgatatccaattaaaaacaaggacactattcttaaattatcc 17850564  T
Q  719 gtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 818  Q
     |||||||||||| ||| |||||   ||| |||| ||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||||| || || ||||||    
T  17850563 atagtcaagcttt-ttgtgaagtcaaataacattcaagtatatagactattatatgggtagactgatgatcatatcttatagatcattgacaacgagtta 17850465  T
Q  819 tccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || || | ||||||||||||    
T  17850464 tcgtgtattcacataggtataaatattatgagtaatatatatattggattgaccctccttaagaatactacat 17850392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 795 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 16394438 - 16394344
Alignment:
Q  795 tcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactac 889  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16394438 tcacatatcatggataaacagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactac 16394344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 18020152 - 18020014
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18020152 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 18020054  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  18020053 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacat 18020014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 764 - 891
Target Start/End: Original strand, 2669476 - 2669603
Alignment:
Q  764 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 863  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2669476 actattatatgggtagattgatgatcacatctcatgaatcattgattaagagttatcatgtattcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 2669575  T
Q  864 ggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
     ||||||  |  ||||| ||||||||||    
T  2669576 tgattgacacatcatgaaaatactacat 2669603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 16789062 - 16789200
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16789062 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 16789160  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  16789161 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 16789200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 22860199 - 22860061
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22860199 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 22860101  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  22860100 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 22860061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 737 - 884
Target Start/End: Original strand, 28172712 - 28172859
Alignment:
Q  737 gaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagat 836  Q
    ||||||||||| || | ||| ||||| | ||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  28172712 gaagtgggataacactgaagaatagaaattattatgtgaatggactgatgatcacatcttacagatcattgttaaaaagttatcaagtctttacatagat 28172811  T
Q  837 ataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 884  Q
    |||||||||| | ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28172812 ataaatattaagggtagtgtttatattggattgaccctccatgagaat 28172859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 829 - 891
Target Start/End: Original strand, 27296877 - 27296939
Alignment:
Q  829 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296877 acattgatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 27296939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 827 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 25537152 - 25537088
Alignment:
Q  827 tcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537152 tcacatagatataaatattaggtgtcatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 25537088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 491 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 17691737 - 17691683
Alignment:
Q  491 ttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691737 ttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 17691683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 27381552 - 27381495
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27381552 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtttcatg 27381495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 27471935 - 27471878
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27471935 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtttcatg 27471878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Original strand, 29308797 - 29308854
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29308797 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggttttggctttgtatcatg 29308854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Original strand, 29315757 - 29315814
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29315757 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggttttggctttgtatcatg 29315814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 1586419 - 1586281
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||  |||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  1586419 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 1586321  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  1586320 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 1586281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 27508658 - 27508520
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27508658 taaagcgtcgagactgttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 27508560  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  27508559 aatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacat 27508520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 27528244 - 27528106
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27528244 taaagcgtcgagactgttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 27528146  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  27528145 aatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacat 27528106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 619 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 20736773 - 20736502
Alignment:
Q  619 taataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaa-actattctcaaa-gtat 716  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||| | |||||||  |||||   |||||| ||||| ||| | |||||| ||| ||||    
T  20736773 taataaagttcctagaatagatagttcgtgtaatggtatattaagtttgacttaatcatgagattacattaa-cataaagaacattattcttaaatgtat 20736675  T
Q  717 ccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagt 816  Q
    | |||||||||||||  | |||| |||||||  | |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    | || ||||  |||     
T  20736674 ctgtagtcaagctttaataagaactgggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgtgttatagatat-gaga 20736576  T
Q  817 tatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||  ||| |  | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  20736575 tattaagtttata-ataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgatccatcgtgagaatactacat 20736502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 17684769 - 17684712
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  17684769 ttgttggaataagccctaatagccaatctatgttgaatgggtttggctttgtatcatg 17684712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 600 - 891
Target Start/End: Original strand, 8509941 - 8510233
Alignment:
Q  600 attttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgaga-ccccattaaacataagg 698  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||||| || |||    
T  8509941 attttattttgttttaaaataataaagtctatagaataattagtctatttgatggaacattatgtacgacttaattatgagacccccattaaatatgagg 8510040  T
Q  699 aaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg-atcacatctca 797  Q
    |   |||| | |||||||  ||||| ||||||| ||  ||| || |||| ||||||| |||| ||||||||||||  ||| |  |||| || |||||  |    
T  8510041 atgatattattaaagtatatgtagttaagctttattatgaaatgagatagcattaaaacataaagactattatgtgcgtaaa--gatgtataacatcgta 8510138  T
Q  798 cagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagat-ataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    || |||| || |||  |||||||   |||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||    
T  8510139 catatcacgggtaagtagttatcatttcttcatatagataaaaaatattagaagtaatatttatatttgattgacctacaatgataatactacat 8510233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 14074471 - 14074609
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||  |||||  |||||| |||||||||| |||||    
T  14074471 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattgggagt 14074569  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  14074570 aatatttataatggattgacccaccgtgagaatactacat 14074609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 489 - 543
Target Start/End: Original strand, 11651630 - 11651684
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatca 543  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11651630 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggctttgtatca 11651684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 25537462 - 25537405
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25537462 ttgttggattaagccctaatagccaatctatattgactgagtttggctttgtatcatg 25537405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 8612906 - 8613044
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| |||  |||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  8612906 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 8613004  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||    
T  8613005 aatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacat 8613044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 846 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 16559414 - 16559369
Alignment:
Q  846 aggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16559414 aggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacat 16559369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 752 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 13995254 - 13995151
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13995254 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 13995156  T
Q  852 aatat 856  Q
    |||||    
T  13995155 aatat 13995151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 588 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 31258120 - 31258065
Alignment:
Q  588 atttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagt 643  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  31258120 atttctttattgcttttgttttgtttcaaaataataaagtctctaaaataattagt 31258065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 13359569 - 13359512
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13359569 ttgtgggagtaagtcctaatagccaatctatattcattgggtttgactttgtatcatg 13359512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 497 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 16566611 - 16566563
Alignment:
Q  497 taagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16566611 taagccctaatagccaatctatgttgattgagtttgactttgtatcatg 16566563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 775 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 19347212 - 19347097
Alignment:
Q  775 ggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccg 874  Q
    |||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||  || ||||||||  |||||| |||| || |||||||| || |||||||| | |    
T  19347212 ggtagattgatgaccatatctcacatatcattgataaagagttgtcatgttttcacataagtataaacatta-gaataatatttgtaatggattgaactg 19347114  T
Q  875 ccatgagaatactacat 891  Q
    |||| ||||||||||||    
T  19347113 ccattagaatactacat 19347097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 836 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 5758709 - 5758654
Alignment:
Q  836 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  5758709 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccactgtgagaatactacat 5758654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 189280 - 189221
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatcta---tattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  189280 tgttggagtaagccctaataatcaatctagtatattgattgggtttggctttgtatcatg 189221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 829 - 888
Target Start/End: Original strand, 21994655 - 21994714
Alignment:
Q  829 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatacta 888  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||    
T  21994655 acatagctataaacattacgagtaatatttatactggaatgacccaccatgagaatacta 21994714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 503 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 16394526 - 16394484
Alignment:
Q  503 ctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16394526 ctaatagacaatctatattgattgagtttgactttgtatcatg 16394484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 597 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 22259990 - 22259925
Alignment:
Q  597 ttgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaa 662  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||  ||||||||    
T  22259990 ttgattttgttatgttgcaaaataataaactccctaaaataactagtccatttaatataacattaa 22259925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 299; Significance: 1e-167; HSPs: 75)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 19926967 - 19926657
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926967 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 19926868  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926867 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 19926768  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926767 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcaaatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 19926668  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  19926667 gaatactacat 19926657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Original strand, 55612683 - 55612993
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612683 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 55612782  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612783 accccattaaacataaggaaactactctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 55612882  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612883 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 55612982  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  55612983 gaatactacat 55612993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Original strand, 26970463 - 26970773
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970463 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 26970562  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970563 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagatttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 26970662  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970663 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagcagtaatatttatattggattgatccgccatga 26970762  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  26970763 gaatactacat 26970773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 583 - 891
Target Start/End: Original strand, 18262214 - 18262522
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262214 aaggcatttctttattgattttgtttcgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 18262313  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262314 cccgttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgatgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 18262413  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262414 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 18262513  T
Q  883 atactacat 891  Q
    |||||||||    
T  18262514 atactacat 18262522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Original strand, 868597 - 868907
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868597 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 868696  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868697 accccgttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 868796  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868797 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 868896  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  868897 gaatactacat 868907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Original strand, 5707320 - 5707630
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707320 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 5707419  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707420 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 5707519  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707520 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 5707619  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  5707620 gaatactacat 5707630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Original strand, 26963640 - 26963950
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26963640 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaaatataacttaattgtgag 26963739  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963740 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagatttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 26963839  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963840 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagcagtaatatttatattggattgatccgccatga 26963939  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  26963940 gaatactacat 26963950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Original strand, 5713948 - 5714258
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713948 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagcccatttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 5714047  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714048 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 5714147  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714148 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 5714247  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  5714248 gaatactacat 5714258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 10621540 - 10621230
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621540 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctggaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 10621441  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621440 agcccattaaacataaggaaactattctcaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 10621341  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621340 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaattttaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 10621241  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  10621240 gaatactacat 10621230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 10628619 - 10628309
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628619 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctggaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 10628520  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628519 agcccattaaacataaggaaactattctcaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatattattaaagcatagagactattatgtaggtaga 10628420  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628419 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 10628320  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  10628319 gaatactacat 10628309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 583 - 891
Target Start/End: Original strand, 18269070 - 18269383
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgatttt-----gttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgt 677  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269070 aaggcatttctttattgattttgttttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgt 18269169  T
Q  678 gagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggt 777  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269170 gagaccccgttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgatgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggt 18269269  T
Q  778 agactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgcca 877  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269270 agactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgcca 18269369  T
Q  878 tgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||    
T  18269370 tgagaatactacat 18269383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 583 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 4426808 - 4426501
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426808 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 4426709  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4426708 cccgttaaacataaggaa-ctattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 4426610  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426609 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 4426510  T
Q  883 atactacat 891  Q
    |||||||||    
T  4426509 atactacat 4426501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 583 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 28393339 - 28393031
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393339 aaggcatttctttattgattttgatttgtttcaaaataataaagtccctaaaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 28393240  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28393239 cccattaaacataaggaaactattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 28393140  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 882  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393139 gatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 28393040  T
Q  883 atactacat 891  Q
    |||||||||    
T  28393039 atactacat 28393031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 593 - 891
Target Start/End: Original strand, 8858179 - 8858477
Alignment:
Q  593 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaac 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8858179 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagatcccgttaaac 8858278  T
Q  693 ataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcaca 792  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8858279 ataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtcggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcaca 8858378  T
Q  793 tctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858379 tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcatatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 8858477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 593 - 891
Target Start/End: Original strand, 8845215 - 8845513
Alignment:
Q  593 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaac 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8845215 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagatcccgttaaac 8845314  T
Q  693 ataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcaca 792  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8845315 ataaggaaactattcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtcggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcaca 8845414  T
Q  793 tctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845415 tctcacagatcatggataaagagttatcaattctttatatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 8845513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 589 - 891
Target Start/End: Original strand, 20311299 - 20311602
Alignment:
Q  589 tttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaag-tataacttaattgtgagaccccat 687  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| |  ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20311299 tttctttattgattttgttttgttttaaaataataaagtacttataatagttaatatgttcaatggagcattaaggtataacttaattgtgagaccccat 20311398  T
Q  688 taaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatga 787  Q
    |||||||||||| ||| || | |||||||  || |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  20311399 taaacataaggacactgtttttaaagtatttgttgtcaagctttattgtgaagtgagatatcattaaagcatagagactattttgtgggtagattgatga 20311498  T
Q  788 tcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatact 887  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  20311499 tcacatatcatggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatgtaaatattaggagtaatttttatattggattgacctgtcatgagaatact 20311598  T
Q  888 acat 891  Q
    ||||    
T  20311599 acat 20311602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 587 - 888
Target Start/End: Original strand, 35223576 - 35223867
Alignment:
Q  587 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 686  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||| || |           
T  35223576 catttctttgttgattttgttttgttttaaaataataaagtccctagaataattagtctgtttaatggagcattaagtgtgacttaatcgtaa------- 35223668  T
Q  687 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 786  Q
       |||  ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||  ||   ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  35223669 ---aacgaaaggacattattcttaaagtattcgtagtcaagctttattgtaaaaaaggataacattaaagcatatagactattatgtgggtagacggatg 35223765  T
Q  787 atcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 886  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  35223766 atcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtctttacatatgtataaatattaggagtaatatttatactggattgaaccaccatgagaatac 35223865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 587 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 5668327 - 5668024
Alignment:
Q  587 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 686  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| |||||||| | | ||||| |||||| ||||    
T  5668327 catttctttgttgattttgttttgtttcaaaataataaagtctctagaataattagtctatttaatggagcattaagtgtgatttaatcgtgaga-ccca 5668229  T
Q  687 ttaaacataaggaaactattctcaaag--tatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactga 784  Q
    |||||   ||||| | |||||| ||||  |||  ||||||||||||| ||| |||  | |||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  5668228 ttaaatgaaaggacattattcttaaagtatatttgtagtcaagctttattgtgaaaagagataacattaaatcatagagactattatgtggatagaccga 5668129  T
Q  785 tgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 884  Q
    ||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  5668128 tgat--catctcacggatcatagataaagagttatcatatcttcacgtaggtataaatattaggagtaatatttatactggattgactcaccatgagaat 5668031  T
Q  885 actacat 891  Q
    |||||||    
T  5668030 actacat 5668024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 581 - 696
Target Start/End: Original strand, 12357136 - 12357251
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357136 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 12357235  T
Q  681 accccattaaacataa 696  Q
    ||||||||||||||||    
T  12357236 accccattaaacataa 12357251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 619 - 891
Target Start/End: Original strand, 56516094 - 56516366
Alignment:
Q  619 taataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaa-actattctcaaagtatc 717  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||  |  ||||| |||||||| | | |||||||||||||||  |||||| ||||  ||| | ||||||  |||||||    
T  56516094 taataaagtccttagaatagatggttagagtaatgaaacattaattgtgacttaattgtgagacttcattaa-catatagaacattattcttgaagtatc 56516192  T
Q  718 cgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtt 817  Q
      |||||||||||| ||| |||    ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  56516193 tatagtcaagctttattgtgaataacgatagtattaaaacatagagactattatgtaggtagattaatgatcaaatctcacagataatggataaagagtt 56516292  T
Q  818 atccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||    
T  56516293 atcaagtcttcacatacgtataaatatcatgagtaatatttatattggattgactcgctatgagaacactacat 56516366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 587 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 10677753 - 10677538
Alignment:
Q  587 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 686  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| |||| |||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| | |||| ||||    
T  10677753 catttttttattgattttcttttgtttcaataaaataaagcccctaaaataattagtctgtataatggagcattaagtatgacttaatcgcgaga-ccca 10677655  T
Q  687 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 786  Q
    ||||||  || || | |||||| |||||||||||||||||||||  | | ||| || |||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  10677654 ttaaacgaaatgatattattcttaaagtatccgtagtcaagctt--tagtgaaatgagataacattaaagtatatagactattatgtgggtagactgatg 10677557  T
Q  787 atcacatctcacagatcat 805  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  10677556 atcacatctcacggatcat 10677538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 587 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 10891393 - 10891178
Alignment:
Q  587 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 686  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| |||| |||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| | |||| ||||    
T  10891393 catttttttattgattttcttttgtttcaataaaataaagcccctaaaataattagtctgtataatggagcattaagtatgacttaatcgcgaga-ccca 10891295  T
Q  687 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 786  Q
    ||||||  || || | |||||| |||||||||||||||||||||  | | ||| || |||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  10891294 ttaaacgaaatgatattattcttaaagtatccgtagtcaagctt--tagtgaaatgagataacattaaagtatatagactattatgtgggtagactgatg 10891197  T
Q  787 atcacatctcacagatcat 805  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  10891196 atcacatctcacggatcat 10891178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 583 - 890
Target Start/End: Original strand, 5616215 - 5616523
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||  |||  ||||||||||||| | ||| |||  |||||     
T  5616215 aaggcatttctttattcattttgttttgtttcaaaataataaagttcctaaaataattagtctatttcttggaacattaagtctgactaaatcatgagat 5616314  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaa--gctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||| ||||||   |||| | |||||| ||||||||||| |||||  | ||| ||  ||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5616315 cccgttaaactagaggacattattcttaaagtatccgttgtcaaaggttttattatgaattgggatattaataaagcattgagactattatgtatgtaga 5616414  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
     |||||| |||||||||  | ||||  || | ||| | |  ||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  || |||    
T  5616415 ttgatgaccacatctcatgggtcataaat-atgagatgttaagtatatacgtaggtataaatattagaagtaatatttatactggattgaccaaccgtga 5616513  T
Q  881 gaatactaca 890  Q
    ||||||||||    
T  5616514 gaatactaca 5616523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 84
Target Start/End: Original strand, 35268123 - 35268204
Alignment:
Q  3 aaatgtaactaactgataacttgtatatcaagttatctctatatctaggatttatcattagtaatgtcttcactatgcaata 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  35268123 aaatgtaactaactgataacttgtatatcaagttatctctatatctaggatttatcatcactaatgtcttaactatgcaata 35268204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 607 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 21454319 - 21454036
Alignment:
Q  607 tttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaag-tataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactat 705  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||  | | |||||||  ||||||||||||||  |||| || | |||    
T  21454319 tttgtttcaaagtaataaagttcttagaatagttagtttgattaatggaacattaaaatgtgacttaatattgagaccccattaattataatgacattat 21454220  T
Q  706 tctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcat 805  Q
    | | ||| ||||  ||||||| |||| ||| ||| || |||| || ||| ||||| ||| ||||||||  ||||| |||||||||  ||||   ||| ||    
T  21454219 ttttaaaatatctatagtcaaactttattgtgaaatgagataacaataatgcataaagattattatgtgagtagattgatgatcatctctcgg-gataat 21454121  T
Q  806 ggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||    ||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  21454120 ggactt-gagatatcaagttttcacatacatataaatattaggagtaatatttatattgaattgacccaccatgagaatactacat 21454036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 15461488 - 15461626
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15461488 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 15461586  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  15461587 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacat 15461626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 743 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 32646846 - 32646698
Alignment:
Q  743 ggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaat 842  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||||||| | ||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  32646846 ggataacattaaagaatgaagactattatgtggatatgttgatgatcacatctcacggatcattgataaaggaatatcgagtcttcacatagatataaat 32646747  T
Q  843 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||| ||||| ||||||    
T  32646746 attaggaataatatttacattggattgacctaccataagaatgctacat 32646698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 2677004 - 2677142
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2677004 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 2677102  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  2677103 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 2677142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 15815012 - 15815150
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15815012 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 15815110  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  15815111 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 15815150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 17300270 - 17300132
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17300270 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 17300172  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  17300171 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 17300132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 18111354 - 18111216
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18111354 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 18111256  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  18111255 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 18111216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 34975542 - 34975680
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  34975542 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 34975640  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  34975641 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 34975680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Original strand, 5713855 - 5713912
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713855 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 5713912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 762 - 891
Target Start/End: Original strand, 5870419 - 5870547
Alignment:
Q  762 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 861  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5870419 agactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttata 5870517  T
Q  862 ttggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  5870518 ttggattgacccactgtgagaatactacat 5870547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Original strand, 26963547 - 26963604
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963547 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 26963604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Original strand, 26970370 - 26970427
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970370 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 26970427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 19927059 - 19927003
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19927059 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 19927003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 3369334 - 3369196
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3369334 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 3369236  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  3369235 aatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacat 3369196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 10621633 - 10621576
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10621633 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggttttggctttgtatcatg 10621576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Original strand, 5707228 - 5707284
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5707228 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgtgtttggctttgtatcatg 5707284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Original strand, 12357044 - 12357100
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12357044 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggatttggctttgtatcatg 12357100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 4676294 - 4676156
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||  |||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  4676294 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 4676196  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  4676195 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 4676156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 18163153 - 18163291
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  | |||| ||||  ||| |||  |||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  18163153 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgatcgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 18163251  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||| | || |  ||||||||||||||    
T  18163252 aatatttatattggattcacccactgtgagaatactacat 18163291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 20243928 - 20244066
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||  |||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  20243928 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 20244026  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  20244027 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 20244066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 26531604 - 26531742
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| || ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  26531604 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaaggctatacataaatataaatattaggagt 26531702  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  26531703 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 26531742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 491 - 545
Target Start/End: Original strand, 868507 - 868561
Alignment:
Q  491 ttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868507 ttggaataaaccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 868561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 765 - 843
Target Start/End: Original strand, 24700213 - 24700291
Alignment:
Q  765 ctattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaata 843  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  24700213 ctattatgtgggtagactgataatcacatcttacagatcttggataaagagatattaagtcttcacatagatataaata 24700291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 10628711 - 10628655
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10628711 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggttttgactttgtatcatg 10628655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 17142428 - 17142372
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17142428 tgttggaaaaagccctaatagccaatctatattgattgggtttgactttgtatcatg 17142372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Original strand, 55612594 - 55612650
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612594 tgttagaataagccctaataaccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 55612650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 489 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 28393434 - 28393380
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatca 543  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28393434 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggtttgactttgtatca 28393380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Original strand, 18268975 - 18269032
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18268975 ttgttggaataagcccaaatagccaatctatgttgaatgggtttggctttgtatcatg 18269032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 4426903 - 4426847
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4426903 tgttggagtaagtcctaatagccaatctatattgattgggtttggctctgtatcatg 4426847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 1941715 - 1941853
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| |||  |||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  1941715 taaagcgtcgagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 1941813  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||    
T  1941814 aatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacat 1941853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 630 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 39074346 - 39074278
Alignment:
Q  630 ctagaatagttagtccgtttaa-tggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataag 697  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  39074346 ctagaataattagtccgtttaaattgaacattaagtatgacttaatcatgagaccccattaaacataag 39074278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 836 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 10677534 - 10677479
Alignment:
Q  836 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||    
T  10677534 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacat 10677479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 836 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 10891174 - 10891119
Alignment:
Q  836 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||    
T  10891174 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacat 10891119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 829 - 891
Target Start/End: Original strand, 19365586 - 19365648
Alignment:
Q  829 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  19365586 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagagtactacat 19365648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 496 - 545
Target Start/End: Original strand, 55992680 - 55992729
Alignment:
Q  496 ataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55992680 ataagccctaatagccaatttgtattgattgggtttgactttgtatcatg 55992729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 718 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 39074270 - 39074190
Alignment:
Q  718 cgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcac 798  Q
    ||||||||  |||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||| || || ||||||||||||||    
T  39074270 cgtagtcatactttattgtgaagtgagatatcattaaagcatggagactattacgtgggttgattgttgatcacatctcac 39074190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 4546071 - 4546209
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||  | | || ||||  ||| |||  |||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  4546071 taaagcgtcgagactattatgtatgttgactgataatcgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 4546169  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||| ||||  || || || ||||||||||||||    
T  4546170 aatatttatactggacagacccaccgtgagaatactacat 4546209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 32636475 - 32636613
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | ||||| |||  ||| |||  ||||    ||||| ||||||||||| ||||    
T  32636475 taaagcgtggagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatgaatac-gagatattaagtccatgcataggtataaatattatgagt 32636573  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||    
T  32636574 aatatttatattggattgacccaatgtgagaatactacat 32636613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 737 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 9938015 - 9937933
Alignment:
Q  737 gaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttat 819  Q
    |||||| |||| |||  ||||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  9938015 gaagtgagatagcatcgaagcatatagactattgtgtgggtagagtcatgatcacatctcataaatcatgaataaagagttat 9937933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 808 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 34777975 - 34777893
Alignment:
Q  808 ataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactaca 890  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||  ||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  34777975 ataaaaagttatcaagtcttcaaatatgtataaatataatgagtaatttttgtattagattgaccctccatgagaatactaca 34777893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 504 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 5668412 - 5668371
Alignment:
Q  504 taatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  5668412 taatagccaatctatattgattgtgtttggttttgtatcatg 5668371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 497 - 545
Target Start/End: Original strand, 8845118 - 8845166
Alignment:
Q  497 taagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8845118 taagtcctaatagccaatctatgttgattgagtttgactttgtatcatg 8845166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 497 - 545
Target Start/End: Original strand, 8858082 - 8858130
Alignment:
Q  497 taagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8858082 taagtcctaatagccaatctatgttgattgagtttgactttgtatcatg 8858130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 505 - 545
Target Start/End: Original strand, 18262136 - 18262176
Alignment:
Q  505 aatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18262136 aatagccaatctatgttgaatgggtttggctttgtatcatg 18262176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 619 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 30040919 - 30040740
Alignment:
Q  619 taataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaa-actattctcaaa-gtat 716  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| | | ||||||| | |||||||  |||||   |||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  30040919 taataaagttcctagaatagatagttcgtgtaatagtatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaa-cataaagaacactattcttaaatgtat 30040821  T
Q  717 ccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 797  Q
    |  ||||||||| ||  |  ||| |||||||  | |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  30040820 ctatagtcaagcgttaatatgaattgggataataataaagcatcgagactattatgtatatagactgatgaccacatctca 30040740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 836 - 891
Target Start/End: Original strand, 9487625 - 9487680
Alignment:
Q  836 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | ||||||||||||||    
T  9487625 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccatcgtgagaatactacat 9487680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 836 - 891
Target Start/End: Original strand, 9538033 - 9538088
Alignment:
Q  836 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  9538033 tataaatgttaggagtaatatttatactggattgacccagcgtgagaatactacat 9538088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 631 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 11161972 - 11161913
Alignment:
Q  631 tagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaa 690  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  11161972 tagaatagttaatcagtttaatggaacacaaagtgtgacttaattgtgagactccattaa 11161913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 829 - 891
Target Start/End: Original strand, 19362477 - 19362539
Alignment:
Q  829 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||||||    
T  19362477 acataggtattaatattaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactacat 19362539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 491 - 545
Target Start/End: Original strand, 20311207 - 20311261
Alignment:
Q  491 ttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20311207 ttggagtaagctgtaatagccaatctgtattcattggatttggctttgtatcatg 20311261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 752 - 797
Target Start/End: Original strand, 11421007 - 11421052
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 797  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11421007 taaagcttcgagactattatgtatgtagactgatgaccacatctca 11421052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 4)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 7141 - 6831
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7141 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaactgtgag 7042  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7041 accctattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 6942  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6941 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 6842  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  6841 gaatactacat 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 14157 - 13847
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14157 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctacaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaactgtgag 14058  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14057 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtaggtaga 13958  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13957 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacaaagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 13858  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  13857 gaatactacat 13847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 7234 - 7177
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  7234 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgagtttggttttgtatcatg 7177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 14249 - 14193
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14249 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgagtttggttttgtatcatg 14193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 43)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Original strand, 21940665 - 21940975
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940665 acaatgcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagttcctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 21940764  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940765 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 21940864  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940865 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 21940964  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  21940965 gaatactacat 21940975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 587 - 888
Target Start/End: Original strand, 6094129 - 6094430
Alignment:
Q  587 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6094129 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccg 6094228  T
Q  687 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 786  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  6094229 ttaaacataaggaaactatttttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatatgggtagagtgatg 6094328  T
Q  787 atcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094329 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 6094428  T
Q  887 ta 888  Q
    ||    
T  6094429 ta 6094430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 583 - 891
Target Start/End: Original strand, 22171491 - 22171797
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171491 aaggcatttccttattgattttgttttatttcaaaataataaagtccctagaatagttagtctgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 22171590  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171591 cccattaaacata--gaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtggaatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 22171688  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 882  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171689 gatgatcacatctcatagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 22171788  T
Q  883 atactacat 891  Q
    |||||||||    
T  22171789 atactacat 22171797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 587 - 891
Target Start/End: Original strand, 24642655 - 24642959
Alignment:
Q  587 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 686  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24642655 catttctttattgattttgttttgtttcaaaatcataaagtccctagaattgttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccg 24642754  T
Q  687 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 786  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24642755 ttaaacataaggaaactattcttaaagtattcgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagtatagagactattatgtgggtagactgatg 24642854  T
Q  787 atcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24642855 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatac 24642954  T
Q  887 tacat 891  Q
    |||||    
T  24642955 tacat 24642959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 583 - 782
Target Start/End: Original strand, 28554885 - 28555084
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28554885 aaggcatttctttattgattttgtttagtttcaaaataataaaatacctaaaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 28554984  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28554985 cccattaaacataatgaaactattctaaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 28555084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 593 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 38232570 - 38232274
Alignment:
Q  593 tttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaac 692  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  |   ||| ||||||||||||  ||| || |||||||||    
T  38232570 tttattgattttgttttatttcaaaataataaa-tctctagaatagttagtctgtttaataaatttttaggtataacttaatcatgacactccattaaac 38232472  T
Q  693 ataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcaca 792  Q
     |||  | | |||||| |||||||  |||||||| |||| |||  ||||| ||||   |||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  38232471 gtaaa-atagtattcttaaagtatttgtagtcaaactttattgtaaagtgagatagtcttaaagcataaaaactattttgtgggtagactgataatcaca 38232373  T
Q  793 tctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  38232372 tctcacggatcatggataaagagtgatccagtcttgacatagatacacatattatgggtaatatttatattggattgatccgccgtgagaatgctacat 38232274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 587 - 714
Target Start/End: Original strand, 24636860 - 24636987
Alignment:
Q  587 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 686  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24636860 catttctttcttgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccttttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccg 24636959  T
Q  687 ttaaacataaggaaactattctcaaagt 714  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24636960 ttaaacataaggaaactattcttaaagt 24636987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 677 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 14984030 - 14983818
Alignment:
Q  677 tgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtagg 776  Q
    |||||||| |||||||   |||| | |||||| ||||||||  || ||||  ||| ||| ||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||| ||    
T  14984030 tgagacccaattaaactataggacattattcttaaagtatctataatcaaaatttattgtgaagtgggataacattaa-gaatagggactattatgtggg 14983932  T
Q  777 tagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgcc 876  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||    
T  14983931 tagactaatgatcatatctcacggatcatggaaaaagtgttatcaagtcttcacatagatgtagatattaggagtaata-ttatattagaatgacccgcc 14983833  T
Q  877 atgagaatactacat 891  Q
    |||||||||||||||    
T  14983832 atgagaatactacat 14983818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 805 - 891
Target Start/End: Original strand, 15326422 - 15326508
Alignment:
Q  805 tggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326422 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 15326508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 805 - 891
Target Start/End: Original strand, 15506791 - 15506877
Alignment:
Q  805 tggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506791 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 15506877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 611 - 888
Target Start/End: Complemental strand, 32873019 - 32872741
Alignment:
Q  611 tttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgttta-atggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctc 709  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||  ||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||| | |||| || | |  || | || | |     
T  32873019 tttcaaaataataaagtccttataatagttcatccatttatatagaacattaagtatgacttaattgtgagatctcattgaaaagagtgacaatactatt 32872920  T
Q  710 aaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggat 809  Q
    ||| |||  ||||| ||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  | | |||| | ||||  ||||||||||||||| ||    
T  32872919 aaaatatttgtagttaagatttattgtgaagtgggataacatcaaagcatagagactattatgcggctggactcacgatcttatctcacagatcatgaat 32872820  T
Q  810 aaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatacta 888  Q
    |||||| |||| |||||| |||| |  |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  32872819 aaagaggtatcaagtctttacatcggcataagtattagtaataatatttatattgaattgatctgtcatgagaatacta 32872741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 21969324 - 21969462
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  |||||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21969324 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggatcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 21969422  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  21969423 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacat 21969462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 12562114 - 12562252
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12562114 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 12562212  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  12562213 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacat 12562252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 602 - 891
Target Start/End: Original strand, 2375027 - 2375321
Alignment:
Q  602 tttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaa 701  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||| |  || |||||||  ||| |||| |||||||||| | | |    
T  2375027 tttgttttgtttcaaaataataaactccctataataattagtcaatttaatggaacatttatgatgacttaatcatgaaaccc-attaaacatacgaata 2375125  T
Q  702 ctattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgat-------gatcacatc 794  Q
     |||| | |||||||  ||||||| | ||| ||| || ||| |||| |||||||| |||   ||||||| || |||||| ||||       |||||||||    
T  2375126 ttatttttaaagtatatgtagtcacgatttattgcga-gtgagataacattaaagtatatgaactattaagtgggtagattgatcactcatgatcacatc 2375224  T
Q  795 tcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
     |||  ||||||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||| | ||| ||||||    
T  2375225 acacgtatcatggataatgagttatcaaattttcacataaatataaatattatgagtaatatgtatattggattgaccctccattataattctacat 2375321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 8371564 - 8371426
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  8371564 taaagcatcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaagagt 8371466  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  8371465 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacat 8371426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 22130920 - 22130782
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22130920 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 22130822  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  22130821 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 22130782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 25611186 - 25611324
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25611186 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgactgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 25611284  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  25611285 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacat 25611324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 27007828 - 27007690
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27007828 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 27007730  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  27007729 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 27007690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 27014971 - 27014833
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27014971 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 27014873  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  27014872 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 27014833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 27880798 - 27880660
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27880798 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 27880700  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  27880699 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 27880660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 28020979 - 28020841
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28020979 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 28020881  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  28020880 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 28020841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 21916667 - 21916805
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||   ||||||||||||||||||||||    
T  21916667 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatgcatagatataaatattaggagt 21916765  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  21916766 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 21916805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Original strand, 21940573 - 21940629
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21940573 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattggttttggctttgtatcatg 21940629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Original strand, 22070108 - 22070164
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22070108 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggttttgtatcatg 22070164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 18835341 - 18835479
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  | |||| ||||  ||| |||  |||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  18835341 taaagcatcgagactattatgtatgtagactgattaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattaggagt 18835439  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  18835440 aatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacat 18835479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 756 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 24797419 - 24797285
Alignment:
Q  756 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 855  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | ||||||  ||||||||  | ||||||||| || | ||||  |||||||| ||| ||||||||||| |||||| |    
T  24797419 gcatagagactattatgtgagtatattgatgactacatctcatgggtcatggatatag-gatatcatgtcttcacgtaggtataaatattatgagtaaaa 24797321  T
Q  856 tttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24797320 tttatactggattgacccgccatgagaatactacat 24797285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 45534584 - 45534446
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||  |||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  45534584 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 45534486  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  45534485 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 45534446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Original strand, 22171395 - 22171452
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22171395 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttgattttgtatcatg 22171452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 488 - 541
Target Start/End: Original strand, 24642555 - 24642608
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtat 541  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642555 ttgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtat 24642608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Original strand, 6094031 - 6094087
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6094031 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggctttgtatcatg 6094087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 26240475 - 26240613
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||  ||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  26240475 taaagcgtcgagactattatgtatgaagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtatatacataggtataaatattaggagt 26240573  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  26240574 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacat 26240613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Original strand, 28554790 - 28554847
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28554790 ttgttggagtaagccctaatagccaatctttgttgattgggtttggctttgtatcatg 28554847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 762 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 22659795 - 22659667
Alignment:
Q  762 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 861  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||  | |||| ||||  ||| |||  |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22659795 agactattatgtatgtagactgatgactgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatgtata 22659697  T
Q  862 ttggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
     |||||||| || || ||||||||||||||    
T  22659696 ctggattgacccaccgtgagaatactacat 22659667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 764 - 858
Target Start/End: Original strand, 29645537 - 29645631
Alignment:
Q  764 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 858  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||||||||  | ||||| ||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  29645537 actattacgtgggtaaactgatgaccacatctcatggttcatgcataaagatttatcaactcttcacatatatataaacattaagagtaatattt 29645631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 619 - 682
Target Start/End: Original strand, 10920234 - 10920297
Alignment:
Q  619 taataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  10920234 taataaaattcctagaataattagtctgtttaatggaacattaagtatgagttaatcgtgagac 10920297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 829 - 891
Target Start/End: Original strand, 6430953 - 6431015
Alignment:
Q  829 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || || || ||||||||||||||    
T  6430953 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacat 6431015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 837 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 8782102 - 8782048
Alignment:
Q  837 ataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||    
T  8782102 ataaatattaggactaatatttatacttgattgatccaccgtgagaatactacat 8782048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 829 - 868
Target Start/End: Original strand, 36970332 - 36970371
Alignment:
Q  829 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 868  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36970332 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatt 36970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 488 - 542
Target Start/End: Original strand, 2374946 - 2375000
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatc 542  Q
    |||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  2374946 ttgttggaataagccctaataataaatatgtattgattggatttggctttgtatc 2375000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 829 - 867
Target Start/End: Complemental strand, 2963171 - 2963133
Alignment:
Q  829 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggat 867  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2963171 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggat 2963133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 737 - 835
Target Start/End: Original strand, 24535471 - 24535569
Alignment:
Q  737 gaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacataga 835  Q
    |||||| |||| |||| || ||| |||| |||| |||  ||| ||||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  24535471 gaagtgagataacattgaaacatcgagattattttgtgagtacactgatgatcatatcttacggatcatgaataatgagttatcaagttttcacataga 24535569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 489 - 526
Target Start/End: Original strand, 24636605 - 24636642
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattg 526  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24636605 tgttggagtaagccataatagccaatctatattgattg 24636642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 835 - 888
Target Start/End: Original strand, 34659059 - 34659112
Alignment:
Q  835 atataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatacta 888  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||    
T  34659059 atatatatattaggactaatatttatattggatttatccaccatgcaaatacta 34659112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 21330455 - 21330145
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330455 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 21330356  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21330355 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtgga 21330256  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330255 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatga 21330156  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  21330155 gaatactacat 21330145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Original strand, 18796506 - 18796816
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    |||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796506 acaaggaatttatttgtttattttgttttgtttcaaaataacaaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 18796605  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||| | || |||||||||| | |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18796606 acctcttttaacataaggatattattcttaaattatctgtagtcaagctttattgtgaagtggtatatcattaaagcattgagactattatgtgggtaga 18796705  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  18796706 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctctatga 18796805  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  18796806 gaatactacat 18796816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 583 - 891
Target Start/End: Original strand, 18619807 - 18620114
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  18619807 aaggaatttctttgttgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctataataattagtctgtttaatggagcattaagtgtgacttaattatgagac 18619906  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    || |||||||| ||||| | |||||| |||||||| || ||||| |||| ||| |||  ||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| |     
T  18619907 cc-attaaacaaaaggatattattcttaaagtatctgtggtcaaactttattgtgaaaagggataatattaaagcatatagactattatgtgggtaggcc 18620005  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 882  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||    
T  18620006 gatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgacccaccatgaga 18620105  T
Q  883 atactacat 891  Q
    |||||||||    
T  18620106 atactacat 18620114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 615 - 884
Target Start/End: Original strand, 36270199 - 36270469
Alignment:
Q  615 aaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaa-tggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaag 713  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    |||| || ||  |||||| | ||||||| |||||||  ||||||||| || || |||||||| |||     
T  36270199 aaaataataaagtccctagaatagttagtttacttaaatgaaatgttaagtgtgacttaatcgtgagacatcattaaacacaatgacactattcttaaaa 36270298  T
Q  714 tatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaag 813  Q
     ||||||| |||||||||  || |||| |||||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||    
T  36270299 catccgtaatcaagctttagtgtgaagagggataacattaaagtataaagactattgtgtgggtagactgatgatcacatctcacgagtcatagagaaag 36270398  T
Q  814 agttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 884  Q
    ||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36270399 agttatcaagttttcacttcgatttaaatattaggagtaatatttatattggattgactcgccatgagaat 36270469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 615 - 882
Target Start/End: Original strand, 18822115 - 18822384
Alignment:
Q  615 aaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaa-tggaaca-ttaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaa 712  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||| | |||||| |  |||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  18822115 aaaataataaagtctatagaattgttagttcgtttaaatggaaaaattaagtgtggcttaatcgtgagacaccattaaacacaaggacactattcttaaa 18822214  T
Q  713 gtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaa 812  Q
      ||  ||| |||||||||  |  |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||     
T  18822215 acatatgtaatcaagctttagtttgaagtgggatatcattaaagcagatagattattatgtcaatagactgatgatcacatatcacggatcattgataag 18822314  T
Q  813 gagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 882  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18822315 gagttatcaacttttcacatagatataaatattaatggtaatatttatattggattgatctgccatgaga 18822384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 646 - 884
Target Start/End: Original strand, 20977957 - 20978178
Alignment:
Q  646 gtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtggga 745  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||  || |||||| ||    
T  20977957 gtttaatggaacattaagaataatttaatcatgagatcccattaaaaataaggaaattattcttaaaacatccgtagtcaagctttaatgtgaagtgaga 20978056  T
Q  746 tatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatatt 845  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||                 |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||    
T  20978057 tatcactaaagcatagagactattatgtggatag-----------------acagatcatggataaagagttatcaagtcttcaccgagatataattatt 20978139  T
Q  846 aggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 884  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20978140 atgagtaatatttatattggattgacccgccatgagaat 20978178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 743 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 22183528 - 22183392
Alignment:
Q  743 ggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaat 842  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22183528 ggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaat 22183429  T
Q  843 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22183428 attaagagtaata-ttatattggattgacccgccatga 22183392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 587 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 19692737 - 19692598
Alignment:
Q  587 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | |||||||  ||||| | ||    
T  19692737 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataatgaagtccctagaataattagtctgtttaatggaacattaagcctgacttaatcatgagatctca 19692638  T
Q  687 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaa 726  Q
    ||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  19692637 ttaaactaaaggaaattattcttaaagtatccttagtcaa 19692598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 701 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 18852146 - 18851956
Alignment:
Q  701 actattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacag 800  Q
    |||||||| |||||||  |||||| | |||| ||| ||||| ||||| |||||||   || |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |    
T  18852146 actattcttaaagtatatgtagtccaactttattgtgaagtaggataacattaaattgtatagactattatgtcggtagactaatgatcccatctcacgg 18852047  T
Q  801 atcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||    
T  18852046 atcatgaataaagagttatcaagtcttcaaatatgtataaatattaagagtaatatttatattggattgactcgctataagaatattacat 18851956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 738 - 891
Target Start/End: Original strand, 19279445 - 19279598
Alignment:
Q  738 aagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagata 837  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||   || |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||    
T  19279445 aagtgggataactttaaagcataaagactattatgcgagttgactaatgatcacatctcacgtatcatggataaaaagttatcaagttttcagatagata 19279544  T
Q  838 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||    
T  19279545 tagatatttggagtaatatttatattggattgacacgtcatgagaataccacat 19279598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 24250343 - 24250205
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24250343 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 24250245  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  24250244 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 24250205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 30174368 - 30174506
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30174368 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 30174466  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  30174467 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 30174506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 21330549 - 21330493
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330549 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 21330493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 756 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 6992146 - 6992017
Alignment:
Q  756 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagt--cttcacatagatataaatattaggagtaa 853  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||  |||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  6992146 gcataaagattattatatgggtagactaatgatcatatctcacagattataaataaagatttatcaagtatcttcacataggtataaatctcaggagtaa 6992047  T
Q  854 tatttatattggattgatccgccatgagaa 883  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  6992046 tatttatattggattgatcctccataagaa 6992017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 24229526 - 24229388
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||  |||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  24229526 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggttcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 24229428  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  24229427 aatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacat 24229388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 767 - 870
Target Start/End: Complemental strand, 36802003 - 36801899
Alignment:
Q  767 attatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacat-agatataaatattaggagtaatatttatattgg 865  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| | |||||||||||||||     
T  36802003 attatgtgagtagactgatgatcacacctcacaaatcattgataatgagttatcaagtcttcgcataaaatataaatattaagggtaatatttatattga 36801904  T
Q  866 attga 870  Q
    |||||    
T  36801903 attga 36801899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 836 - 891
Target Start/End: Original strand, 29800545 - 29800600
Alignment:
Q  836 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  29800545 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacat 29800600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 84
Target Start/End: Original strand, 35571720 - 35571798
Alignment:
Q  3 aaatgtaactaactgataacttgtatatcaagttatctctatatctaggatttatcattagtaatgtcttcactatgcaata 84  Q
    ||||||||||||||||||| |||||   || ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||    
T  35571720 aaatgtaactaactgataatttgta---caggttatctatatatctaggatttattatcactaatgtcttcattatgcaata 35571798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 763 - 870
Target Start/End: Complemental strand, 28741326 - 28741220
Alignment:
Q  763 gactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatat 862  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||| || | ||| |||  ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  28741326 gactattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgcgtcatgaat-atgagatattaagtatgtacataggtataaatattaggagtaatatttatac 28741228  T
Q  863 tggattga 870  Q
     |||||||    
T  28741227 cggattga 28741220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 829 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 15342237 - 15342175
Alignment:
Q  829 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || ||| ||||||||||    
T  15342237 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgaaaatactacat 15342175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 752 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 12098654 - 12098609
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 797  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12098654 taaaacatagagactattatgtatgtagactgatgatcagatctca 12098609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 19692830 - 19692773
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  19692830 ttgttggagtaagccttaatagccaatctgtatttattaggtttggttttgtatcatg 19692773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 836 - 890
Target Start/End: Original strand, 21626824 - 21626877
Alignment:
Q  836 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactaca 890  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  21626824 tataaataatatgagtaatatttatattgaattga-ccaccatgagaatactaca 21626877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 752 - 870
Target Start/End: Complemental strand, 24763868 - 24763751
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||  | |||| || |  ||| |||   ||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  24763868 taaagcatcgagactattatttatgtagactgatgaccacgtctcatgggtcatagacat-gagatattacgtctatacataggtataaatattatgagt 24763770  T
Q  852 aatatttatattggattga 870  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  24763769 aatatttatactggattga 24763751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 832 - 870
Target Start/End: Complemental strand, 28719006 - 28718968
Alignment:
Q  832 tagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 870  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28719006 tagatataaatattaggagtaatatttatacttgattga 28718968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 287; Significance: 1e-160; HSPs: 2)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Original strand, 7107 - 7417
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7107 acaaggtatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatagaacattaagtataacttaattgtgag 7206  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7207 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 7306  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7307 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 7406  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  7407 gaatactacat 7417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Original strand, 7014 - 7071
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7014 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgcatcatg 7071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 287; Significance: 1e-160; HSPs: 38)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 24695673 - 24695363
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695673 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 24695574  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695573 accccattaaacataatgaaactattctaaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcaataaagcatagagactattatgtaggtaga 24695474  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695473 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 24695374  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  24695373 gaatactacat 24695363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 583 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 19714703 - 19714395
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714703 aaggcatttctttattgattttgttttatttcaaagtaataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 19714604  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19714603 cccgttaaacataaggaatctattcttaaaatatccgaagtcaagctttattgagaagtaggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagact 19714504  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714503 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 19714404  T
Q  883 atactacat 891  Q
    |||||||||    
T  19714403 atactacat 19714395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 18570070 - 18569758
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18570070 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaattgaacattaagtataacttaattgtgag 18569971  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18569970 accccgttaaacataaggaaactactcttaaagtatccgtagtcaagctttattgagaagtggaatatcattaaagcataaagactattatgttggtaga 18569871  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatgg--ataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccat 878  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18569870 ctgatgatcacatctcacatatcatggatataaagagatatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccgccat 18569771  T
Q  879 gagaatactacat 891  Q
    |||||||||||||    
T  18569770 gagaatactacat 18569758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 587 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 19707419 - 19707115
Alignment:
Q  587 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 686  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19707419 catttctttattgattttgttttatttcaaagtaataaagtccctagaatagttagtcagtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccg 19707320  T
Q  687 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 786  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19707319 ttaaacataaggaatctattcttaaaatatccgaagtcaagctttattgagaagtaggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatg 19707220  T
Q  787 atcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19707219 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaaatcttcacatagatataaatactaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 19707120  T
Q  887 tacat 891  Q
    |||||    
T  19707119 tacat 19707115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 587 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 22547217 - 22546913
Alignment:
Q  587 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 686  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  22547217 catttatttattcattttgttttattttaaaataataaaaccgctataatagttagtcggtttaatggaacattaagtataacttaatcgtgagatctca 22547118  T
Q  687 ttaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatg 786  Q
    ||||| ||| ||| | |||| | ||||||| || |||||| |||| ||| |||||| |||| |||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  22547117 ttaaatatatggacattatttttaaagtattcgcagtcaaactttattgtgaagtgagataacattaaaatatagagactattatgtggatagaccgatg 22547018  T
Q  787 atcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 886  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22547017 atcacatctcacaaatcatggataaagagttatcaagttttcatatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgaccagccatgagaatac 22546918  T
Q  887 tacat 891  Q
    |||||    
T  22546917 tacat 22546913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 694 - 891
Target Start/End: Original strand, 39538701 - 39538898
Alignment:
Q  694 taaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacat 793  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  39538701 taaggacactattcttaaaatatccatagttaagctttattgtgaagtgggatatcattaaagcatgaagactattatgtgggtagactgatggtcatat 39538800  T
Q  794 ctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  39538801 ttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgaaaatactacat 39538898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 586 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 27347679 - 27347425
Alignment:
Q  586 gcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccc 685  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||     
T  27347679 gcatttctttgttgattttgttttgattcaaaataataaagtccttagaataattaatctgtttaatggagcattaagtgtgacttaatcgtgagaccc- 27347581  T
Q  686 attaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgat 785  Q
    |||||||  ||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||| | |||    
T  27347580 attaaacgaaaggacattattcttaaagtatatgtagtcaagctttattgtgaaaagggataacattaaagcatagagactattttgtggataggccgat 27347481  T
Q  786 gatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaa 841  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  27347480 gatcacatctcacagatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaa 27347425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 647 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 18807175 - 18806938
Alignment:
Q  647 tttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataa-ggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtggga 745  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| | |||||| ||||||||  ||||||||| || ||| |||||  ||    
T  18807175 tttaatggaacattaagtgtgacttaatcgtgagacaccattaaa-ataatggacattattcttaaagtatctatagtcaagcgttattgtgaagtaaga 18807077  T
Q  746 tatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatatt 845  Q
    || || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18807076 taacaataaagcatagagactattatgcgggtagactgatgatcacatttcatatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt 18806977  T
Q  846 aggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 884  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18806976 agaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaat 18806938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 585 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 17285935 - 17285645
Alignment:
Q  585 ggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccc 684  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  17285935 ggcatttatttattgattttgttatgtttcaaaataataatctccagagaatagttagtctgtttaatggaacattaagtgtgacttaatcgtgaaaccc 17285836  T
Q  685 cattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactga 784  Q
     | |||||  || || | |||||| ||||||| | ||||| | |||| ||| ||| |||||||  |||||||||||                ||||||||    
T  17285835 tagtaaactaaatgacattattcttaaagtattcatagtcgatctttattgtgaattgggatagtattaaagcata----------------tagactga 17285752  T
Q  785 tgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 884  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  17285751 tgatcacatatcacaggtcatggataaagagttatcaagtctttacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccacaatgagaat 17285652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 585 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 17299088 - 17298798
Alignment:
Q  585 ggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccc 684  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||    
T  17299088 ggcatttatttattgattttgttatgtttataaataataatatccagagaatagttagtccgattaatggaacattaagtgcgacttaatcgtgaaaccc 17298989  T
Q  685 cattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactga 784  Q
     | |||||  || || | |||||| ||||||| | ||||| | |||| |||  ||||||||||  |||||||||||                ||||||||    
T  17298988 tagtaaactaaatgacattattcttaaagtattcatagtcgatctttattgttaagtgggatagtattaaagcata----------------tagactga 17298905  T
Q  785 tgatcaca--tctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 882  Q
    ||||||||  | |||| | ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17298904 tgatcacacatatcacgggtcatggataaagagttattaaatcttcacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaccatgaga 17298805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 581 - 690
Target Start/End: Original strand, 39537962 - 39538071
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39537962 acaagccatttctttaatgattttgttttgtttcaaaatggttaagtccttagaatagttggttcgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 39538061  T
Q  681 accccattaa 690  Q
    ||| ||||||    
T  39538062 acctcattaa 39538071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 20941018 - 20941156
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20941018 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 20941116  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  20941117 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacat 20941156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 25805696 - 25805558
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25805696 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 25805598  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  25805597 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacat 25805558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 31890 - 32028
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31890 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 31988  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  31989 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 32028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 23545913 - 23546051
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23545913 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 23546011  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  23546012 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 23546051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 24695766 - 24695709
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695766 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 24695709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 12789974 - 12789836
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  12789974 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattagaagt 12789876  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  12789875 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 12789836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 22941241 - 22941379
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||  | |||| ||||  ||| |||| ||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  22941241 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgtatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtttatacatagatataaatattaggagt 22941339  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  22941340 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacat 22941379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 587 - 690
Target Start/End: Original strand, 31886537 - 31886640
Alignment:
Q  587 catttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagacccca 686  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||| |||    
T  31886537 catttctttagtgattttgttttgtttcaaattaataaagtccttagaataattagttcatttaattgaacatcaagtacgacttaatcgtgagactcca 31886636  T
Q  687 ttaa 690  Q
    ||||    
T  31886637 ttaa 31886640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 19714798 - 19714742
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714798 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 19714742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 24933617 - 24933479
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||  |||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  24933617 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagt 24933519  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  24933518 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 24933479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 19707519 - 19707462
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19707519 ttgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgagtttggctttgtatcatg 19707462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 27347778 - 27347722
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27347778 tgttggagtaagccctaatagccaatctatattgattgcgtttggctttgtatcatg 27347722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 12765305 - 12765167
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| |||  |||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  12765305 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagt 12765207  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||    
T  12765206 aatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacat 12765167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 31096807 - 31096945
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||  |||||  |||||| |||||||  |||||||    
T  31096807 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaattataggagt 31096905  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  31096906 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacat 31096945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 5097642 - 5097780
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||  ||| |||  |||||  |||||  ||||||||||| ||||    
T  5097642 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgactacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattatgagt 5097740  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||    
T  5097741 aatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacat 5097780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 7865745 - 7865607
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| |||  |||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  7865745 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 7865647  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||    
T  7865646 aatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacat 7865607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 9812048 - 9811910
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| |||  |||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  9812048 taaagcgtcgagactactatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagt 9811950  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||    
T  9811949 aatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacat 9811910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 12704189 - 12704051
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| |||  |||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  12704189 taaagcgtcgagactactatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagt 12704091  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||    
T  12704090 aatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacat 12704051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 33477479 - 33477389
Alignment:
Q  607 tttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataag 697  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||| |||||||| | |  |||| |||||||| |||||| ||||||    
T  33477479 tttgtttcaaaataataaagtccttacaatagttaggctgattaatggatcattaagtgtgatctaatcgtgagacctcattaatcataag 33477389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 18570165 - 18570108
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18570165 ttgttcgagtaagctctaatagctaatctatattaattgggtttggctttgtatcatg 18570108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 752 - 873
Target Start/End: Original strand, 26245093 - 26245213
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  | |||| ||||  ||| |||  ||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  26245093 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgattgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtttatacataggtataaatattaggagt 26245191  T
Q  852 aatatttatattggattgatcc 873  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  26245192 aatatttatacttgattgatcc 26245213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 489 - 544
Target Start/End: Original strand, 39537870 - 39537925
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcat 544  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  39537870 tgttggattaagccctaatagccaatctatgttgactgagtttagctttgtatcat 39537925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 830 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 18829519 - 18829465
Alignment:
Q  830 catagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 884  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  18829519 catatatataaatattaggaccaatatttatattggattgacccaccatgagaat 18829465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 763 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 20100543 - 20100416
Alignment:
Q  763 gactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatat 862  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| || | ||| |||  |||||  | |||| ||| |||||||||||||||| |||||     
T  20100543 gactattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgggtcatgaat-atgagatattaagtctatagataggtatcaatattaggagtaatacttatac 20100445  T
Q  863 tggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||| |||| ||  | |||||| |||||||    
T  20100444 tggcttgacccaacgtgagaaaactacat 20100416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 631 - 699
Target Start/End: Original strand, 11479420 - 11479489
Alignment:
Q  631 tagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagaccc-cattaaacataagga 699  Q
    ||||||| |||||  |||||||| || ||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  11479420 tagaataattagtgtgtttaatgaaatattaagtgtgacttgattgtgagaccctcattaaacataagga 11479489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 843 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 18806619 - 18806578
Alignment:
Q  843 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 884  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18806619 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaat 18806578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 843 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 18806799 - 18806758
Alignment:
Q  843 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 884  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18806799 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaat 18806758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 26197 - 25887
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26197 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccttagaatagttagtccatttaatggaacattaaatataacttaattgtgag 26098  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26097 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttattgaaaagtgggatatcattaaagcatagcgactattatgtaggtaga 25998  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25997 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagacttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 25898  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  25897 gaatactacat 25887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 488 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 26287 - 26231
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcat 544  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26287 ttgttggaataagccctaatagtcaatctatattgattgggtttggctttgtatcat 26231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 581 - 891
Target Start/End: Original strand, 993 - 1303
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgag 680  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  993 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctaaaatagttagtccgtttaatgaaacattaagtataacttaattgtgag 1092  T
Q  681 accccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 780  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1093 accccattaaacataaagaaactattctcaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtaga 1192  T
Q  781 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatga 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1193 ctgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttgccatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgatctgccatga 1292  T
Q  881 gaatactacat 891  Q
    |||||||||||    
T  1293 gaatactacat 1303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Original strand, 901 - 957
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  901 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 257; Significance: 1e-142; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 583 - 891
Target Start/End: Original strand, 5531 - 5839
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5531 aaggcatttctttattgatttatttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 5630  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 782  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5631 cccgttaaacataaggaaattattcttaaagtatatgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtgggtagact 5730  T
Q  783 gatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaga 882  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5731 gatgatcacatctcacaggtcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgtga 5830  T
Q  883 atactacat 891  Q
    |||||||||    
T  5831 atactacat 5839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Original strand, 5435 - 5492
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5435 ttgttgaagtaagccctaatagccaatctatattgtttgggtttggctttgtatcatg 5492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 583 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 230545 - 230365
Alignment:
Q  583 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230545 aaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagttcttataatagttagtccgtttaatggaacattaagtataacttaattgtgagac 230446  T
Q  683 cccattaaacataaggaaactattctcaaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcattaaagcatagaga 764  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230445 ccc-ttaaacataaggaaaccattcttaaagtatttgtagtcaagatttattgagaagtgggatatcattaaagcatagaga 230365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 812 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 230367 - 230288
Alignment:
Q  812 agagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  230367 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacat 230288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 230640 - 230584
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230640 tgttggagtaagcaataatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 230584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 68; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 738 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 90166 - 90019
Alignment:
Q  738 aagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggat-aaagagttatccagtcttcacatagat 836  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  90166 aagtgggataatattaaagcataaagactactatgtagatagactgataatcacatctcacggatcatgggtaaaagagttatcaacacttcacatagat 90067  T
Q  837 ataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 884  Q
    |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  90066 ataaatattacgtataacatttatattggattgacacgcgatgagaat 90019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 8296 - 8434
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8296 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 8394  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  8395 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacat 8434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 174 - 312
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  174 taaagcgtcgagactattatgtatgtcgactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 272  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  273 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacat 312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 61; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 581 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 8510 - 8446
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcc 645  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8510 acaagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtcc 8446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 8603 - 8546
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8603 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggttcggctttgtatcatg 8546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 3986 - 3848
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3986 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 3888  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  3887 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 3848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Original strand, 119721 - 119859
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  119721 taaagcgtcgagactattatgtacgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 119819  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  119820 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 119859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 130535 - 130397
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  130535 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 130437  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  130436 aatatttatattggattgacccactgtgagaatactacat 130397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 58; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 23826 - 23769
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23826 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 23769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 54; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Original strand, 16522 - 16579
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16522 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttatatcatg 16579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 581 - 614
Target Start/End: Original strand, 16615 - 16648
Alignment:
Q  581 acaaggcatttctttattgattttgttttgtttc 614  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16615 acaaggcatttctttattgattttgttttgnttc 16648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 67685 - 67547
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| |||  |||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  67685 taaagcgtcgagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 67587  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  67586 aatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacat 67547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 761 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 40290 - 40161
Alignment:
Q  761 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 860  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||  | |||||||||  ||| |||  |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40290 gagactattatgtatgtagactgatggccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 40192  T
Q  861 attggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |  ||||||| || |  ||||||||||||||    
T  40191 accggattgacccactgtgagaatactacat 40161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0705 (Bit Score: 46; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0705
Description:

Target: scaffold0705; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 488 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 98 - 41
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  98 ttgttggaataagccctaatagccaatctataatgattgattttggctttgtatcatg 41  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 45; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Original strand, 8944 - 9000
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  8944 tgttggaataagcccaaatagccaatctatgttgaatgggtttggctttgtatcatg 9000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 752 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 13260 - 13122
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatattaggagt 851  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||  | ||||  |||  ||| |||  |||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  13260 taaagcgtcgagactattatgtatgtagaccgatgaccacatctcatgggtcatatatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 13162  T
Q  852 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||    
T  13161 aatatttataccggattgacccaccgtgagaatactacat 13122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 829 - 888
Target Start/End: Original strand, 26609 - 26668
Alignment:
Q  829 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatacta 888  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  26609 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccttgagaatacta 26668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 10256 - 10202
Alignment:
Q  491 ttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtatcatg 545  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10256 ttggagtaagctctaatagccaatctatattgattgagtttgactttgtatcatg 10202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 600 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 10158 - 10127
Alignment:
Q  600 attttgttttgtttcaaaataataaagtccct 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10158 attttgttttgtttcaaaataataaagtccct 10127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 37 - 1
Alignment:
Q  489 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgatt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37 tgttggaataagccctaatagccaatctatattgatt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 610 - 846
Target Start/End: Original strand, 92194 - 92432
Alignment:
Q  610 gtttcaaaataataaagtccctagaatagttagtccgtttaa-tggaacattaagtataacttaattgtgagaccccattaaacataaggaaactattct 708  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||  | |  | ||||||    
T  92194 gttttaaagtaataaagtctctagaatatctagttattttaaatggaacattaagtataacttaatcgtgagacagcaataaacagcaaggcattattct 92293  T
Q  709 caaagtatccgtagtcaagctttgttgagaagtgggatatcatt-aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatgg 807  Q
     |||  || ||||||||||||||  || | || |||||| | || ||| | |||| |||||||| | | |||||||||||| |||| ||||   ||||||    
T  92294 taaaacattcgtagtcaagctttagtgtggagagggataactttaaaatcttagaaactattatatggctagactgatgattacatgtcacgagtcatgg 92393  T
Q  808 ataaagagttatccagtcttcacatagatataaatatta 846  Q
    |||| || ||||| |||| || || | ||||||||||||    
T  92394 ataaggaattatcaagtcatcgcacatatataaatatta 92432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 488 - 541
Target Start/End: Original strand, 5877 - 5930
Alignment:
Q  488 ttgttggaataagccctaatagccaatctatattgattgggtttggctttgtat 541  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5877 ttgttggagtaagtcataatagccaatctatattgattgagtttgactttgtat 5930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 836 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 11758 - 11703
Alignment:
Q  836 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||    
T  11758 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccactgtgagaatactacat 11703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 838 - 889
Target Start/End: Original strand, 8807 - 8858
Alignment:
Q  838 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactac 889  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||||    
T  8807 taaatattaggagtaatatttatactagattgacccccaatgagaatactac 8858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 800 - 892
Target Start/End: Original strand, 45956 - 46052
Alignment:
Q  800 gatcatggataaagagttatccagtcttcacatagatataaatat----taggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatg 892  Q
    ||||||||||||| |||| || | | |||| ||||||||||||||    || ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||| |||||||    
T  45956 gatcatggataaaaagttgtcaaatattcatatagatataaatatatattatgagtaatatttatattgaattgacccaccattagaatgctacatg 46052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 836 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 83243 - 83188
Alignment:
Q  836 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 891  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||    
T  83243 tataaatatcagaagtaatatttatactggattgacccacaatgagaatactacat 83188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 752 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 15134 - 15089
Alignment:
Q  752 taaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 797  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  15134 taaagcatcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctca 15089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University