View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11959_high_12 (Length: 470)

Name: NF11959_high_12
Description: NF11959
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11959_high_12
NF11959_high_12
[»] chr2 (99 HSPs)
chr2 (14-317)||(17796095-17796398)
chr2 (14-373)||(35491547-35491907)
chr2 (14-373)||(19471568-19471928)
chr2 (14-373)||(27130443-27130803)
chr2 (14-345)||(37312455-37312789)
chr2 (15-373)||(10364572-10364930)
chr2 (14-346)||(2919324-2919657)
chr2 (14-373)||(6976752-6977108)
chr2 (14-373)||(34521618-34521977)
chr2 (14-309)||(3937060-3937358)
chr2 (15-373)||(10360135-10360492)
chr2 (14-309)||(43982768-43983066)
chr2 (14-312)||(29111071-29111371)
chr2 (14-346)||(41499053-41499376)
chr2 (14-312)||(6901878-6902179)
chr2 (14-309)||(3941649-3941947)
chr2 (14-373)||(42241034-42241393)
chr2 (14-309)||(17424701-17424999)
chr2 (14-373)||(12968237-12968596)
chr2 (14-373)||(16581734-16582095)
chr2 (14-373)||(22493183-22493542)
chr2 (14-373)||(29067642-29067998)
chr2 (14-309)||(5420381-5420679)
chr2 (14-346)||(33403930-33404258)
chr2 (14-373)||(29906494-29906853)
chr2 (14-373)||(42119924-42120283)
chr2 (18-309)||(39393807-39394101)
chr2 (14-312)||(20148030-20148331)
chr2 (14-245)||(39799902-39800136)
chr2 (156-373)||(40677309-40677527)
chr2 (14-309)||(22001758-22002044)
chr2 (14-373)||(32734560-32734918)
chr2 (14-220)||(34638878-34639083)
chr2 (14-160)||(40678763-40678909)
chr2 (14-373)||(16253388-16253724)
chr2 (252-345)||(43491603-43491696)
chr2 (367-466)||(16582340-16582440)
chr2 (367-470)||(18393866-18393970)
chr2 (367-470)||(22493788-22493892)
chr2 (367-470)||(42120529-42120633)
chr2 (367-469)||(17425304-17425407)
chr2 (367-469)||(39799458-39799561)
chr2 (367-459)||(10359797-10359889)
chr2 (367-469)||(22002349-22002452)
chr2 (367-459)||(8557324-8557416)
chr2 (4-166)||(31770265-31770427)
chr2 (367-469)||(3936651-3936755)
chr2 (126-241)||(18392061-18392179)
chr2 (218-358)||(27650378-27650514)
chr2 (14-94)||(16706879-16706959)
chr2 (396-459)||(29073588-29073651)
chr2 (255-360)||(31991885-31991986)
chr2 (403-470)||(5420693-5420761)
chr2 (367-456)||(10364235-10364327)
chr2 (403-470)||(3941961-3942029)
chr2 (255-361)||(18036110-18036212)
chr2 (236-373)||(18393486-18393621)
chr2 (367-453)||(35492150-35492239)
chr2 (367-456)||(6977352-6977444)
chr2 (255-346)||(15891610-15891697)
chr2 (43-209)||(18878445-18878611)
chr2 (375-452)||(22493771-22493849)
chr2 (367-456)||(37312093-37312185)
chr2 (367-456)||(41498692-41498784)
chr2 (375-428)||(42120537-42120590)
chr2 (375-453)||(18393847-18393927)
chr2 (45-123)||(11718688-11718766)
chr2 (406-456)||(19471227-19471277)
chr2 (367-456)||(43491966-43492058)
chr2 (407-456)||(2918968-2919017)
chr2 (371-428)||(29111633-29111690)
chr2 (396-452)||(6977056-6977112)
chr2 (43-139)||(31992114-31992210)
chr2 (375-452)||(10359828-10359907)
chr2 (395-456)||(16253670-16253732)
chr2 (406-456)||(34521344-34521394)
chr2 (375-428)||(8557355-8557408)
chr2 (375-428)||(16582348-16582401)
chr2 (396-453)||(19471563-19471620)
chr2 (395-456)||(33404230-33404291)
chr2 (45-141)||(11679265-11679361)
chr2 (371-411)||(29111696-29111736)
chr2 (423-470)||(32735191-32735239)
chr2 (396-452)||(34521614-34521670)
chr2 (396-452)||(35491855-35491911)
chr2 (367-403)||(39394112-39394148)
chr2 (396-452)||(43491670-43491726)
chr2 (368-403)||(42241049-42241084)
chr2 (373-403)||(10360154-10360184)
chr2 (374-428)||(17425312-17425366)
chr2 (403-453)||(22002058-22002108)
chr2 (43-117)||(26617676-26617750)
chr2 (403-453)||(29067953-29068003)
chr2 (374-428)||(39799499-39799553)
chr2 (334-367)||(32735156-32735189)
chr2 (396-452)||(2919295-2919351)
chr2 (396-452)||(10364568-10364624)
chr2 (416-456)||(17538546-17538586)
chr2 (296-332)||(42240834-42240870)
[»] chr3 (184 HSPs)
chr3 (14-346)||(46414296-46414631)
chr3 (14-373)||(51013215-51013575)
chr3 (14-346)||(51015199-51015534)
chr3 (14-346)||(34647229-34647564)
chr3 (14-373)||(34472013-34472373)
chr3 (16-346)||(43569834-43570167)
chr3 (14-344)||(30192460-30192793)
chr3 (14-346)||(10053237-10053568)
chr3 (15-373)||(2428410-2428769)
chr3 (14-373)||(44927385-44927744)
chr3 (16-373)||(52569346-52569703)
chr3 (14-373)||(13895808-13896167)
chr3 (14-342)||(14631367-14631698)
chr3 (14-373)||(34693228-34693586)
chr3 (18-373)||(41803829-41804184)
chr3 (14-346)||(45100427-45100762)
chr3 (14-346)||(49273321-49273656)
chr3 (14-309)||(4004086-4004384)
chr3 (16-373)||(6754128-6754484)
chr3 (14-309)||(49140053-49140351)
chr3 (14-309)||(54390364-54390662)
chr3 (14-309)||(46402925-46403223)
chr3 (16-373)||(7246018-7246376)
chr3 (14-346)||(7954125-7954461)
chr3 (14-373)||(19453167-19453526)
chr3 (14-373)||(25576530-25576888)
chr3 (14-346)||(37281374-37281709)
chr3 (14-373)||(39416886-39417245)
chr3 (14-309)||(34049649-34049947)
chr3 (14-309)||(49610411-49610709)
chr3 (14-320)||(47759879-47760188)
chr3 (14-373)||(6464284-6464642)
chr3 (16-346)||(55206846-55207170)
chr3 (14-373)||(24702210-24702568)
chr3 (18-373)||(42382977-42383332)
chr3 (14-309)||(2268493-2268791)
chr3 (14-373)||(47065609-47065968)
chr3 (14-309)||(2646875-2647173)
chr3 (14-309)||(49218735-49219033)
chr3 (16-373)||(53826634-53826991)
chr3 (14-309)||(36134930-36135227)
chr3 (18-309)||(42382197-42382491)
chr3 (18-309)||(51695605-51695899)
chr3 (16-319)||(8633348-8633654)
chr3 (14-346)||(36721351-36721682)
chr3 (15-373)||(48087490-48087848)
chr3 (14-319)||(27186870-27187178)
chr3 (14-346)||(41577850-41578163)
chr3 (17-362)||(774288-774632)
chr3 (14-373)||(42949958-42950317)
chr3 (14-373)||(44835425-44835784)
chr3 (14-309)||(3495028-3495326)
chr3 (14-373)||(33449092-33449436)
chr3 (132-373)||(42323326-42323568)
chr3 (74-346)||(50458653-50458928)
chr3 (72-308)||(43477037-43477276)
chr3 (191-346)||(46346574-46346732)
chr3 (157-309)||(50997453-50997608)
chr3 (14-354)||(14265330-14265666)
chr3 (367-469)||(24701862-24701965)
chr3 (367-459)||(2268096-2268188)
chr3 (218-372)||(18440874-18441023)
chr3 (218-372)||(19485948-19486097)
chr3 (367-459)||(44927989-44928081)
chr3 (367-470)||(47066212-47066316)
chr3 (367-469)||(4003678-4003781)
chr3 (367-469)||(11378567-11378670)
chr3 (14-149)||(11378906-11379041)
chr3 (126-373)||(20375822-20376067)
chr3 (366-470)||(42383576-42383681)
chr3 (367-459)||(25576192-25576284)
chr3 (367-470)||(44835076-44835180)
chr3 (367-469)||(34050252-34050355)
chr3 (367-469)||(43477564-43477667)
chr3 (367-469)||(49139645-49139748)
chr3 (367-469)||(50997913-50998016)
chr3 (367-469)||(54390967-54391070)
chr3 (367-470)||(34692879-34692983)
chr3 (367-469)||(3494620-3494723)
chr3 (367-458)||(39416549-39416640)
chr3 (367-469)||(46403528-46403631)
chr3 (126-373)||(25887547-25887795)
chr3 (367-459)||(36135532-36135624)
chr3 (14-146)||(46346745-46346872)
chr3 (367-469)||(2646467-2646570)
chr3 (367-459)||(49218337-49218429)
chr3 (14-139)||(42328288-42328413)
chr3 (14-105)||(20378093-20378184)
chr3 (14-186)||(15636946-15637118)
chr3 (367-456)||(2429013-2429105)
chr3 (367-456)||(46346213-46346305)
chr3 (403-469)||(49610723-49610790)
chr3 (367-456)||(41578431-41578523)
chr3 (367-459)||(49273929-49274024)
chr3 (367-414)||(13895516-13895563)
chr3 (367-456)||(7246620-7246712)
chr3 (367-456)||(42322991-42323083)
chr3 (367-456)||(45100076-45100168)
chr3 (367-456)||(52569010-52569102)
chr3 (403-469)||(51695524-51695591)
chr3 (395-453)||(33449087-33449145)
chr3 (375-451)||(44835119-44835197)
chr3 (367-456)||(51012888-51012980)
chr3 (375-428)||(25576223-25576276)
chr3 (296-373)||(37282039-37282114)
chr3 (367-470)||(51015803-51015910)
chr3 (396-456)||(37282062-37282122)
chr3 (375-427)||(42383586-42383638)
chr3 (253-373)||(15637155-15637270)
chr3 (375-452)||(44927971-44928050)
chr3 (371-456)||(10052987-10053075)
chr3 (367-456)||(34471677-34471769)
chr3 (406-456)||(43570478-43570528)
chr3 (371-456)||(55206485-55206573)
chr3 (396-456)||(34646816-34646877)
chr3 (377-452)||(34692924-34693001)
chr3 (375-428)||(47066220-47066273)
chr3 (397-456)||(6754432-6754492)
chr3 (374-452)||(8632996-8633076)
chr3 (396-456)||(27187543-27187603)
chr3 (396-452)||(42323322-42323378)
chr3 (375-426)||(11378609-11378660)
chr3 (375-452)||(24701904-24701983)
chr3 (408-470)||(36720923-36720986)
chr3 (368-403)||(44835440-44835475)
chr3 (403-453)||(2268429-2268479)
chr3 (403-453)||(4004022-4004072)
chr3 (367-456)||(14631971-14632063)
chr3 (367-456)||(19452748-19452840)
chr3 (395-456)||(20375814-20375876)
chr3 (403-453)||(36135241-36135291)
chr3 (406-456)||(46413922-46413972)
chr3 (375-428)||(2268127-2268180)
chr3 (375-428)||(4003720-4003773)
chr3 (322-367)||(6464002-6464047)
chr3 (367-428)||(8632997-8633058)
chr3 (396-456)||(18440971-18441032)
chr3 (396-456)||(19486045-19486106)
chr3 (375-428)||(43477572-43477625)
chr3 (375-428)||(50997921-50997974)
chr3 (403-451)||(3494966-3495014)
chr3 (397-456)||(6464276-6464336)
chr3 (403-453)||(13895803-13895855)
chr3 (396-456)||(34647196-34647256)
chr3 (14-70)||(43476966-43477021)
chr3 (367-403)||(49218688-49218724)
chr3 (396-452)||(51013211-51013267)
chr3 (403-452)||(24702206-24702257)
chr3 (368-403)||(25576545-25576580)
chr3 (403-452)||(34693224-34693275)
chr3 (377-428)||(39416581-39416632)
chr3 (368-403)||(42949973-42950008)
chr3 (367-406)||(43477285-43477324)
chr3 (368-403)||(47065918-47065953)
chr3 (368-403)||(53826649-53826684)
chr3 (374-428)||(3494661-3494715)
chr3 (339-373)||(11378875-11378909)
chr3 (395-456)||(15637216-15637278)
chr3 (374-428)||(34050260-34050314)
chr3 (396-450)||(36721324-36721378)
chr3 (373-403)||(39416906-39416936)
chr3 (376-406)||(42382499-42382529)
chr3 (373-403)||(42383282-42383312)
chr3 (374-428)||(46403536-46403590)
chr3 (373-403)||(48087510-48087540)
chr3 (374-428)||(49139686-49139740)
chr3 (374-428)||(54390975-54391029)
chr3 (395-428)||(774299-774332)
chr3 (322-363)||(18441265-18441305)
chr3 (322-363)||(19486339-19486379)
chr3 (367-408)||(27187839-27187880)
chr3 (296-373)||(34646824-34646900)
chr3 (375-428)||(36135540-36135593)
chr3 (396-453)||(37281682-37281739)
chr3 (375-428)||(49218368-49218421)
chr3 (367-403)||(2268447-2268482)
chr3 (367-403)||(3494982-3495017)
chr3 (367-403)||(4004040-4004075)
chr3 (396-452)||(7954434-7954490)
chr3 (224-308)||(7954774-7954858)
chr3 (367-395)||(36721053-36721081)
chr3 (396-452)||(46346545-46346601)
chr3 (396-452)||(51015507-51015563)
chr3 (403-453)||(53826629-53826681)
[»] chr5 (127 HSPs)
chr5 (14-346)||(1400267-1400602)
chr5 (14-373)||(4724014-4724374)
chr5 (14-373)||(18308167-18308527)
chr5 (14-373)||(35565179-35565538)
chr5 (14-373)||(1971272-1971631)
chr5 (18-347)||(6793350-6793682)
chr5 (14-373)||(3601248-3601607)
chr5 (14-309)||(7231-7529)
chr5 (14-309)||(8537861-8538159)
chr5 (14-347)||(36350278-36350605)
chr5 (14-309)||(11346616-11346914)
chr5 (14-309)||(19036676-19036974)
chr5 (14-309)||(28880898-28881196)
chr5 (14-312)||(33370561-33370862)
chr5 (14-309)||(541637-541935)
chr5 (14-373)||(19400270-19400629)
chr5 (14-309)||(8576143-8576441)
chr5 (14-309)||(11027684-11027982)
chr5 (14-309)||(27661379-27661677)
chr5 (14-309)||(38854065-38854363)
chr5 (14-309)||(30709505-30709803)
chr5 (16-309)||(40009437-40009733)
chr5 (14-278)||(35927470-35927737)
chr5 (15-309)||(17366738-17367034)
chr5 (177-373)||(1694859-1695056)
chr5 (56-267)||(3169553-3169766)
chr5 (14-272)||(2599126-2599387)
chr5 (14-211)||(3458743-3458940)
chr5 (368-470)||(8538464-8538567)
chr5 (367-470)||(3459302-3459406)
chr5 (367-459)||(19400875-19400967)
chr5 (367-469)||(8575735-8575838)
chr5 (367-459)||(1971877-1971969)
chr5 (367-470)||(40012128-40012232)
chr5 (367-469)||(6823-6926)
chr5 (219-373)||(7082336-7082487)
chr5 (16-191)||(12742624-12742799)
chr5 (367-467)||(3601853-3601954)
chr5 (14-150)||(7082199-7082335)
chr5 (16-196)||(12805442-12805622)
chr5 (367-469)||(27660971-27661074)
chr5 (367-469)||(30710107-30710210)
chr5 (367-452)||(19036286-19036371)
chr5 (367-452)||(22284080-22284165)
chr5 (367-469)||(38854666-38854770)
chr5 (371-470)||(41202424-41202524)
chr5 (372-469)||(28881505-28881603)
chr5 (367-436)||(3170045-3170114)
chr5 (14-114)||(1691152-1691252)
chr5 (254-373)||(3458940-3459056)
chr5 (247-360)||(17195314-17195423)
chr5 (255-360)||(18920885-18920986)
chr5 (403-469)||(541556-541623)
chr5 (43-209)||(15798194-15798361)
chr5 (367-456)||(33371140-33371229)
chr5 (252-312)||(12742820-12742880)
chr5 (367-456)||(1695301-1695393)
chr5 (14-68)||(25498301-25498355)
chr5 (108-185)||(1693382-1693459)
chr5 (44-209)||(12067697-12067862)
chr5 (396-456)||(1171730-1171790)
chr5 (247-360)||(36311900-36312009)
chr5 (375-452)||(40012110-40012189)
chr5 (367-456)||(1399909-1400001)
chr5 (367-456)||(6793080-6793172)
chr5 (367-456)||(11347218-11347310)
chr5 (367-456)||(18308770-18308862)
chr5 (375-428)||(19400883-19400936)
chr5 (252-312)||(12805638-12805698)
chr5 (43-123)||(25360784-25360864)
chr5 (379-452)||(1971859-1971934)
chr5 (403-469)||(11027996-11028063)
chr5 (367-456)||(4723678-4723770)
chr5 (396-469)||(7082815-7082889)
chr5 (367-456)||(20196589-20196681)
chr5 (406-456)||(25498635-25498685)
chr5 (367-456)||(34683529-34683621)
chr5 (367-456)||(35565782-35565874)
chr5 (375-428)||(6865-6918)
chr5 (375-428)||(3459310-3459363)
chr5 (375-428)||(8538471-8538524)
chr5 (255-358)||(13131035-13131134)
chr5 (328-373)||(40011838-40011883)
chr5 (237-309)||(22283704-22283776)
chr5 (405-470)||(1972080-1972147)
chr5 (375-452)||(3170027-3170106)
chr5 (397-456)||(10398006-10398065)
chr5 (296-346)||(7082792-7082842)
chr5 (403-453)||(8576079-8576129)
chr5 (395-456)||(12805717-12805779)
chr5 (43-209)||(19747995-19748161)
chr5 (403-453)||(22283790-22283840)
chr5 (252-356)||(25360542-25360642)
chr5 (374-428)||(27661012-27661066)
chr5 (403-453)||(27661315-27661365)
chr5 (403-453)||(28881210-28881260)
chr5 (374-428)||(38854674-38854728)
chr5 (375-428)||(3601861-3601914)
chr5 (43-140)||(36312128-36312225)
chr5 (396-452)||(4724010-4724066)
chr5 (322-373)||(12806337-12806389)
chr5 (396-452)||(18308475-18308531)
chr5 (396-451)||(1695004-1695059)
chr5 (338-373)||(3169766-3169801)
chr5 (368-403)||(3459006-3459041)
chr5 (368-403)||(3601557-3601592)
chr5 (368-403)||(19400579-19400614)
chr5 (374-421)||(30710122-30710169)
chr5 (368-403)||(40011833-40011868)
chr5 (403-453)||(7167-7217)
chr5 (395-456)||(12742899-12742961)
chr5 (368-398)||(17195316-17195346)
chr5 (374-428)||(19036309-19036363)
chr5 (374-428)||(28881508-28881562)
chr5 (375-428)||(8575777-8575830)
chr5 (322-367)||(12743190-12743235)
chr5 (322-367)||(12806008-12806053)
chr5 (367-403)||(7185-7220)
chr5 (396-452)||(1400238-1400294)
chr5 (367-403)||(8538170-8538205)
chr5 (367-403)||(8576097-8576132)
chr5 (367-403)||(11346925-11346960)
chr5 (322-362)||(12743528-12743568)
chr5 (367-403)||(22283787-22283822)
chr5 (367-403)||(27661333-27661368)
chr5 (367-403)||(30709814-30709849)
chr5 (403-453)||(40011836-40011888)
[»] chr1 (166 HSPs)
chr1 (14-373)||(24270301-24270661)
chr1 (14-373)||(14173696-14174056)
chr1 (14-373)||(38046372-38046732)
chr1 (14-373)||(13972833-13973192)
chr1 (14-346)||(6435680-6436015)
chr1 (14-346)||(23342549-23342884)
chr1 (14-373)||(35586869-35587227)
chr1 (14-373)||(36909469-36909829)
chr1 (16-373)||(49396614-49396972)
chr1 (14-346)||(35184878-35185214)
chr1 (14-373)||(12791212-12791572)
chr1 (14-373)||(42571715-42572074)
chr1 (14-373)||(41780601-41780961)
chr1 (14-346)||(17686324-17686645)
chr1 (14-346)||(5765114-5765445)
chr1 (14-332)||(18169933-18170254)
chr1 (16-309)||(51269712-51270008)
chr1 (14-309)||(29435881-29436179)
chr1 (16-309)||(13635297-13635593)
chr1 (14-373)||(39224136-39224495)
chr1 (14-373)||(47487976-47488335)
chr1 (14-309)||(19160225-19160523)
chr1 (14-309)||(29762221-29762519)
chr1 (14-309)||(39856906-39857204)
chr1 (14-309)||(49427296-49427593)
chr1 (14-312)||(18842347-18842648)
chr1 (14-373)||(13283614-13283969)
chr1 (14-373)||(37778000-37778347)
chr1 (14-309)||(44337319-44337617)
chr1 (14-309)||(44597609-44597907)
chr1 (16-297)||(35526189-35526473)
chr1 (14-309)||(27486690-27486988)
chr1 (14-373)||(49926318-49926665)
chr1 (16-309)||(48215108-48215404)
chr1 (14-346)||(17696954-17697285)
chr1 (72-373)||(35576305-35576606)
chr1 (14-373)||(27035257-27035616)
chr1 (14-373)||(50068198-50068557)
chr1 (14-346)||(17372635-17372967)
chr1 (14-373)||(45689030-45689386)
chr1 (52-312)||(21484640-21484903)
chr1 (14-373)||(48568343-48568702)
chr1 (15-373)||(41874823-41875181)
chr1 (16-373)||(30309771-30310122)
chr1 (108-373)||(3658475-3658740)
chr1 (25-362)||(16532042-16532377)
chr1 (128-373)||(46180219-46180465)
chr1 (219-373)||(40533224-40533376)
chr1 (41-373)||(49262927-49263247)
chr1 (109-346)||(24363767-24364003)
chr1 (52-263)||(49598921-49599134)
chr1 (367-470)||(29436484-29436588)
chr1 (367-470)||(51270313-51270417)
chr1 (126-367)||(16081305-16081544)
chr1 (367-470)||(50067848-50067952)
chr1 (367-469)||(22528018-22528121)
chr1 (367-459)||(29707140-29707232)
chr1 (367-459)||(46179881-46179973)
chr1 (367-459)||(47487638-47487730)
chr1 (367-459)||(49427897-49427989)
chr1 (14-121)||(4209159-4209266)
chr1 (367-469)||(19160828-19160931)
chr1 (367-469)||(13634889-13634993)
chr1 (367-459)||(45689632-45689724)
chr1 (367-459)||(48227049-48227141)
chr1 (367-459)||(48568007-48568099)
chr1 (367-470)||(3658985-3659089)
chr1 (367-469)||(49262587-49262690)
chr1 (367-459)||(39223800-39223892)
chr1 (368-445)||(27034933-27035010)
chr1 (367-459)||(49598489-49598584)
chr1 (391-459)||(29761750-29761818)
chr1 (229-306)||(29707544-29707621)
chr1 (367-459)||(41874491-41874579)
chr1 (14-117)||(46181747-46181850)
chr1 (16-110)||(13148201-13148295)
chr1 (151-234)||(13148364-13148450)
chr1 (46-169)||(16098075-16098198)
chr1 (403-470)||(39856824-39856892)
chr1 (367-456)||(36910072-36910164)
chr1 (367-456)||(38044794-38044886)
chr1 (23-79)||(24364008-24364064)
chr1 (367-456)||(6436284-6436376)
chr1 (367-456)||(13973436-13973528)
chr1 (367-456)||(14173360-14173452)
chr1 (255-373)||(14772472-14772586)
chr1 (367-456)||(12790875-12790967)
chr1 (43-209)||(14772644-14772809)
chr1 (367-456)||(23343152-23343244)
chr1 (367-456)||(49397156-49397248)
chr1 (43-156)||(15471455-15471568)
chr1 (371-424)||(21484414-21484467)
chr1 (414-459)||(46924912-46924957)
chr1 (375-428)||(50067891-50067944)
chr1 (396-456)||(13283917-13283977)
chr1 (375-452)||(3658967-3659046)
chr1 (366-456)||(42571378-42571471)
chr1 (375-452)||(45689614-45689693)
chr1 (375-452)||(47487669-47487748)
chr1 (377-428)||(48568040-48568091)
chr1 (413-459)||(27486308-27486354)
chr1 (375-428)||(27034950-27035003)
chr1 (367-408)||(44336973-44337014)
chr1 (375-428)||(46179912-46179965)
chr1 (367-456)||(49925983-49926075)
chr1 (396-456)||(18170770-18170830)
chr1 (396-452)||(24270297-24270353)
chr1 (375-423)||(49598520-49598568)
chr1 (397-456)||(17372941-17373000)
chr1 (395-454)||(24363736-24363795)
chr1 (375-452)||(29707171-29707250)
chr1 (367-406)||(30309487-30309526)
chr1 (377-428)||(41874520-41874571)
chr1 (283-373)||(49598830-49598917)
chr1 (375-452)||(51270295-51270374)
chr1 (403-453)||(19160537-19160587)
chr1 (403-453)||(22527727-22527777)
chr1 (406-456)||(35586521-35586571)
chr1 (367-444)||(37778591-37778671)
chr1 (367-456)||(40532888-40532980)
chr1 (247-300)||(19262422-19262475)
chr1 (375-428)||(22528026-22528079)
chr1 (375-428)||(29436492-29436545)
chr1 (375-428)||(48227057-48227110)
chr1 (375-428)||(49427905-49427958)
chr1 (396-452)||(13973140-13973196)
chr1 (396-452)||(14173692-14173748)
chr1 (396-452)||(17686295-17686351)
chr1 (371-403)||(27486647-27486679)
chr1 (367-403)||(29762174-29762210)
chr1 (367-403)||(44597918-44597954)
chr1 (45-117)||(48707113-48707185)
chr1 (396-452)||(49396920-49396976)
chr1 (367-403)||(51270019-51270055)
chr1 (368-403)||(12791227-12791262)
chr1 (414-456)||(16098018-16098061)
chr1 (368-403)||(27035272-27035307)
chr1 (368-403)||(35576556-35576591)
chr1 (368-403)||(42571730-42571765)
chr1 (368-403)||(45689336-45689371)
chr1 (368-403)||(46180234-46180269)
chr1 (368-403)||(47487991-47488026)
chr1 (368-403)||(48568358-48568393)
chr1 (375-452)||(49262629-49262708)
chr1 (368-403)||(49262942-49262977)
chr1 (396-454)||(18170611-18170669)
chr1 (374-428)||(19160836-19160890)
chr1 (374-428)||(21484409-21484463)
chr1 (367-408)||(13284213-13284254)
chr1 (396-453)||(35185187-35185244)
chr1 (375-428)||(39223831-39223884)
chr1 (395-469)||(49397363-49397440)
chr1 (396-452)||(6435988-6436044)
chr1 (85-133)||(13148292-13148340)
chr1 (322-358)||(17686015-17686051)
chr1 (367-403)||(19160534-19160569)
chr1 (367-403)||(21484597-21484632)
chr1 (367-403)||(22527724-22527759)
chr1 (396-452)||(23342857-23342913)
chr1 (367-403)||(29436190-29436226)
chr1 (375-419)||(29761781-29761825)
chr1 (396-452)||(36909777-36909833)
chr1 (396-452)||(37778295-37778351)
chr1 (375-403)||(39856867-39856895)
chr1 (396-452)||(41780909-41780965)
chr1 (367-403)||(49427604-49427639)
[»] chr7 (114 HSPs)
chr7 (14-346)||(48315142-48315477)
chr7 (14-373)||(36393761-36394121)
chr7 (14-346)||(48270558-48270893)
chr7 (14-346)||(43351062-43351396)
chr7 (14-346)||(46862156-46862491)
chr7 (14-346)||(21614725-21615057)
chr7 (14-373)||(41048700-41049053)
chr7 (14-346)||(42735173-42735507)
chr7 (14-346)||(21187261-21187593)
chr7 (14-373)||(15337842-15338202)
chr7 (14-346)||(21650433-21650769)
chr7 (14-309)||(20564669-20564967)
chr7 (14-346)||(28114355-28114690)
chr7 (14-309)||(40588459-40588757)
chr7 (14-373)||(34140775-34141134)
chr7 (14-373)||(18237474-18237833)
chr7 (14-363)||(1642537-1642884)
chr7 (14-373)||(39477178-39477537)
chr7 (14-373)||(17183122-17183484)
chr7 (14-309)||(17839233-17839532)
chr7 (14-362)||(2356199-2356547)
chr7 (14-373)||(30360427-30360785)
chr7 (14-309)||(10522978-10523277)
chr7 (14-270)||(28979060-28979319)
chr7 (14-309)||(45363251-45363540)
chr7 (14-373)||(41217524-41217883)
chr7 (14-373)||(48220682-48221039)
chr7 (126-346)||(30354777-30355000)
chr7 (14-373)||(47268821-47269167)
chr7 (14-309)||(20378702-20379000)
chr7 (15-245)||(26603268-26603501)
chr7 (14-220)||(13916744-13916949)
chr7 (14-199)||(42682866-42683051)
chr7 (196-373)||(2205975-2206152)
chr7 (367-469)||(17183730-17183833)
chr7 (367-470)||(34157319-34157421)
chr7 (367-459)||(34141379-34141471)
chr7 (367-469)||(13920819-13920922)
chr7 (367-469)||(17839823-17839926)
chr7 (367-470)||(18238079-18238183)
chr7 (367-459)||(39476842-39476934)
chr7 (188-309)||(9367119-9367243)
chr7 (367-459)||(10523582-10523674)
chr7 (367-459)||(41218127-41218219)
chr7 (371-457)||(26601381-26601467)
chr7 (366-459)||(30361029-30361122)
chr7 (371-459)||(45362854-45362942)
chr7 (367-459)||(48220345-48220437)
chr7 (367-469)||(20565272-20565375)
chr7 (367-459)||(9366721-9366814)
chr7 (254-373)||(26601716-26601832)
chr7 (367-469)||(40589062-40589165)
chr7 (367-456)||(21614389-21614478)
chr7 (15-192)||(8726337-8726514)
chr7 (226-373)||(13920431-13920573)
chr7 (367-456)||(46861795-46861887)
chr7 (255-360)||(3380626-3380727)
chr7 (403-470)||(20378620-20378688)
chr7 (43-117)||(18146898-18146972)
chr7 (218-312)||(28066372-28066466)
chr7 (367-456)||(28113994-28114086)
chr7 (366-470)||(28978792-28978909)
chr7 (367-456)||(10224581-10224673)
chr7 (367-456)||(21186900-21186992)
chr7 (367-456)||(48271162-48271254)
chr7 (255-319)||(11824847-11824911)
chr7 (373-456)||(20877653-20877739)
chr7 (377-428)||(41218135-41218186)
chr7 (367-456)||(30354416-30354508)
chr7 (267-309)||(34139332-34139374)
chr7 (406-456)||(36393426-36393476)
chr7 (375-425)||(48220376-48220426)
chr7 (256-309)||(17320200-17320253)
chr7 (379-428)||(18238087-18238136)
chr7 (375-428)||(26601410-26601463)
chr7 (375-428)||(39476873-39476926)
chr7 (375-428)||(45362885-45362938)
chr7 (219-360)||(150206-150343)
chr7 (255-319)||(18149681-18149745)
chr7 (396-452)||(48270866-48270922)
chr7 (22-141)||(3380853-3380971)
chr7 (375-452)||(17183712-17183791)
chr7 (377-428)||(21614419-21614470)
chr7 (403-453)||(13920528-13920578)
chr7 (375-428)||(10523590-10523643)
chr7 (375-428)||(13920827-13920880)
chr7 (375-428)||(17839831-17839884)
chr7 (366-403)||(18237783-18237820)
chr7 (328-373)||(28978990-28979035)
chr7 (375-428)||(30361038-30361091)
chr7 (375-428)||(34141387-34141440)
chr7 (367-403)||(40588768-40588804)
chr7 (396-452)||(41049001-41049057)
chr7 (367-403)||(45363204-45363240)
chr7 (368-403)||(2205990-2206025)
chr7 (403-452)||(17183437-17183488)
chr7 (403-452)||(28978986-28979037)
chr7 (374-428)||(9366752-9366806)
chr7 (43-209)||(11824623-11824789)
chr7 (403-453)||(17320136-17320186)
chr7 (374-428)||(20565280-20565334)
chr7 (43-141)||(28066185-28066283)
chr7 (375-421)||(34157333-34157379)
chr7 (322-367)||(1642247-1642292)
chr7 (404-453)||(10523292-10523341)
chr7 (403-453)||(2205970-2206022)
chr7 (43-123)||(12082861-12082941)
chr7 (396-452)||(15337838-15337894)
chr7 (367-403)||(17839543-17839578)
chr7 (367-403)||(34139385-34139420)
chr7 (403-453)||(34141087-34141139)
chr7 (396-452)||(36393757-36393813)
chr7 (396-452)||(42735480-42735536)
chr7 (396-452)||(43351033-43351089)
[»] chr4 (160 HSPs)
chr4 (18-373)||(22436823-22437179)
chr4 (14-346)||(957419-957754)
chr4 (15-373)||(43889438-43889797)
chr4 (14-373)||(44560119-44560479)
chr4 (14-373)||(49423696-49424057)
chr4 (14-373)||(34529735-34530095)
chr4 (14-373)||(36776458-36776818)
chr4 (14-373)||(49791875-49792235)
chr4 (14-373)||(34153225-34153587)
chr4 (14-373)||(21169359-21169719)
chr4 (14-346)||(49817608-49817943)
chr4 (14-373)||(2772917-2773277)
chr4 (14-373)||(4785361-4785721)
chr4 (14-312)||(20778867-20779168)
chr4 (16-373)||(51428132-51428489)
chr4 (14-373)||(14330634-14330993)
chr4 (14-373)||(25762506-25762865)
chr4 (14-309)||(21017178-21017476)
chr4 (14-309)||(32937903-32938201)
chr4 (35-346)||(47657319-47657633)
chr4 (16-373)||(51027707-51028064)
chr4 (14-373)||(242356-242715)
chr4 (14-309)||(6177316-6177614)
chr4 (14-309)||(41794563-41794861)
chr4 (14-309)||(56138818-56139116)
chr4 (18-373)||(37866318-37866674)
chr4 (14-312)||(24606660-24606961)
chr4 (16-372)||(6282263-6282620)
chr4 (14-373)||(20901608-20901967)
chr4 (14-309)||(40353774-40354072)
chr4 (14-373)||(17211174-17211532)
chr4 (14-373)||(1226068-1226426)
chr4 (14-373)||(49063888-49064246)
chr4 (14-317)||(26591678-26591984)
chr4 (14-363)||(3393212-3393559)
chr4 (14-319)||(11288203-11288510)
chr4 (14-346)||(42886171-42886509)
chr4 (19-373)||(45939438-45939793)
chr4 (14-309)||(28082146-28082444)
chr4 (14-309)||(49094653-49094951)
chr4 (14-352)||(10312180-10312517)
chr4 (14-309)||(1042659-1042955)
chr4 (14-309)||(9489587-9489884)
chr4 (16-373)||(46816465-46816820)
chr4 (34-373)||(18412523-18412860)
chr4 (14-309)||(39588837-39589135)
chr4 (15-369)||(31824573-31824927)
chr4 (18-373)||(33163484-33163839)
chr4 (14-360)||(13866171-13866516)
chr4 (14-373)||(31324082-31324440)
chr4 (126-373)||(21711550-21711797)
chr4 (101-309)||(55796738-55796949)
chr4 (14-360)||(13850657-13851002)
chr4 (153-373)||(27759374-27759594)
chr4 (367-470)||(56139421-56139525)
chr4 (367-469)||(1043260-1043363)
chr4 (14-191)||(21412647-21412824)
chr4 (367-469)||(28082748-28082851)
chr4 (367-470)||(885319-885423)
chr4 (367-459)||(46816127-46816219)
chr4 (367-469)||(6176908-6177011)
chr4 (367-469)||(21016770-21016873)
chr4 (367-456)||(39589440-39589529)
chr4 (367-470)||(27759840-27759944)
chr4 (367-459)||(45940038-45940130)
chr4 (367-469)||(40353366-40353469)
chr4 (367-469)||(49095256-49095359)
chr4 (367-468)||(37866919-37867022)
chr4 (367-457)||(51027371-51027461)
chr4 (367-451)||(20901286-20901370)
chr4 (367-459)||(21712042-21712134)
chr4 (367-459)||(38132722-38132814)
chr4 (367-469)||(55797254-55797357)
chr4 (367-459)||(25763111-25763203)
chr4 (367-469)||(37867025-37867129)
chr4 (14-94)||(55794516-55794596)
chr4 (255-359)||(17292114-17292214)
chr4 (224-362)||(49817150-49817283)
chr4 (367-456)||(2773521-2773613)
chr4 (367-470)||(24607240-24607344)
chr4 (367-469)||(26591500-26591610)
chr4 (367-456)||(36776122-36776214)
chr4 (367-456)||(49423360-49423452)
chr4 (367-456)||(49791539-49791631)
chr4 (14-63)||(13181546-13181595)
chr4 (14-79)||(21711468-21711533)
chr4 (395-456)||(18412806-18412868)
chr4 (367-456)||(22437423-22437515)
chr4 (367-456)||(34529399-34529491)
chr4 (375-428)||(885327-885380)
chr4 (375-428)||(1043268-1043321)
chr4 (418-470)||(1226606-1226659)
chr4 (367-428)||(32937559-32937620)
chr4 (396-456)||(49064575-49064635)
chr4 (375-452)||(20901309-20901388)
chr4 (43-114)||(23124733-23124804)
chr4 (367-456)||(34152888-34152981)
chr4 (367-456)||(957058-957150)
chr4 (406-456)||(44559889-44559939)
chr4 (367-456)||(51427795-51427887)
chr4 (375-428)||(28082756-28082809)
chr4 (375-428)||(37867033-37867086)
chr4 (375-428)||(46816158-46816211)
chr4 (396-452)||(21169667-21169723)
chr4 (375-453)||(37866900-37866980)
chr4 (396-452)||(43889434-43889490)
chr4 (397-456)||(14330246-14330305)
chr4 (375-452)||(39589422-39589501)
chr4 (396-470)||(47657271-47657346)
chr4 (367-456)||(43889104-43889196)
chr4 (367-456)||(49571621-49571713)
chr4 (322-367)||(17211794-17211839)
chr4 (218-360)||(23124479-23124617)
chr4 (375-428)||(45940046-45940099)
chr4 (396-452)||(51027232-51027289)
chr4 (375-428)||(56139429-56139482)
chr4 (367-403)||(9489895-9489931)
chr4 (405-456)||(17211488-17211540)
chr4 (396-470)||(20901120-20901196)
chr4 (396-452)||(36776454-36776510)
chr4 (367-403)||(39589146-39589182)
chr4 (396-452)||(44560115-44560171)
chr4 (367-398)||(14330358-14330389)
chr4 (368-403)||(14330649-14330684)
chr4 (368-403)||(20901623-20901658)
chr4 (322-369)||(21411842-21411889)
chr4 (368-403)||(31824584-31824619)
chr4 (377-428)||(38132755-38132806)
chr4 (403-452)||(46816461-46816512)
chr4 (307-346)||(49064563-49064602)
chr4 (375-452)||(51027400-51027479)
chr4 (368-403)||(51428147-51428182)
chr4 (373-403)||(1226376-1226406)
chr4 (374-428)||(6176949-6177003)
chr4 (374-428)||(21016811-21016865)
chr4 (403-453)||(21017114-21017164)
chr4 (397-451)||(24606966-24607020)
chr4 (368-398)||(31324395-31324425)
chr4 (374-428)||(32937558-32937612)
chr4 (403-453)||(32937839-32937889)
chr4 (403-449)||(40353714-40353760)
chr4 (373-403)||(46816485-46816515)
chr4 (373-403)||(49064196-49064226)
chr4 (374-428)||(49095264-49095318)
chr4 (403-453)||(55796963-55797013)
chr4 (368-456)||(242040-242131)
chr4 (367-400)||(1042969-1043002)
chr4 (395-456)||(11288505-11288566)
chr4 (322-367)||(21411556-21411601)
chr4 (375-428)||(21712050-21712103)
chr4 (379-428)||(24607248-24607297)
chr4 (379-428)||(27759848-27759897)
chr4 (396-452)||(957390-957446)
chr4 (367-403)||(21017132-21017167)
chr4 (367-403)||(28082455-28082490)
chr4 (322-362)||(32937260-32937300)
chr4 (367-403)||(32937857-32937892)
chr4 (396-452)||(34153221-34153277)
chr4 (367-403)||(40353728-40353763)
chr4 (367-403)||(55796960-55796995)
[»] chr6 (65 HSPs)
chr6 (14-373)||(13402445-13402805)
chr6 (16-373)||(32027565-32027923)
chr6 (16-373)||(32037624-32037982)
chr6 (14-346)||(34802858-34803193)
chr6 (14-309)||(6205396-6205694)
chr6 (16-309)||(27640094-27640390)
chr6 (14-346)||(12396688-12397023)
chr6 (14-309)||(11692363-11692661)
chr6 (19-309)||(29108057-29108350)
chr6 (18-346)||(14114957-14115280)
chr6 (14-309)||(29066471-29066763)
chr6 (14-309)||(29075484-29075776)
chr6 (14-309)||(801078-801375)
chr6 (38-309)||(29110473-29110748)
chr6 (16-283)||(22305710-22305980)
chr6 (161-373)||(30257516-30257729)
chr6 (127-373)||(35058673-35058919)
chr6 (367-469)||(6205999-6206102)
chr6 (14-120)||(3765912-3766018)
chr6 (367-455)||(27640694-27640782)
chr6 (261-373)||(35021174-35021284)
chr6 (367-455)||(35058340-35058428)
chr6 (367-469)||(11692966-11693069)
chr6 (367-470)||(2192906-2193010)
chr6 (367-470)||(24020687-24020791)
chr6 (371-469)||(14123121-14123220)
chr6 (16-117)||(35060162-35060263)
chr6 (229-373)||(3765725-3765867)
chr6 (367-439)||(29067068-29067140)
chr6 (367-439)||(29108655-29108727)
chr6 (228-360)||(17465287-17465415)
chr6 (367-456)||(13403331-13403423)
chr6 (255-373)||(34134807-34134921)
chr6 (367-456)||(12397292-12397384)
chr6 (237-309)||(24021096-24021168)
chr6 (367-456)||(35020838-35020930)
chr6 (375-428)||(29067076-29067129)
chr6 (375-428)||(29108663-29108716)
chr6 (237-309)||(2192535-2192607)
chr6 (43-209)||(28051299-28051465)
chr6 (375-428)||(35058367-35058420)
chr6 (403-453)||(2192621-2192671)
chr6 (403-453)||(24021032-24021082)
chr6 (296-346)||(30257162-30257212)
chr6 (367-456)||(32027229-32027321)
chr6 (367-456)||(32037288-32037380)
chr6 (315-372)||(4495119-4495174)
chr6 (375-428)||(6206007-6206060)
chr6 (375-428)||(14123125-14123178)
chr6 (396-452)||(13402753-13402809)
chr6 (396-452)||(30257512-30257568)
chr6 (367-398)||(801679-801710)
chr6 (54-141)||(20242305-20242392)
chr6 (54-141)||(22136289-22136376)
chr6 (89-191)||(2402178-2402280)
chr6 (403-452)||(801389-801438)
chr6 (395-452)||(14115252-14115309)
chr6 (275-369)||(14482765-14482855)
chr6 (375-428)||(27640702-27640755)
chr6 (396-449)||(32027564-32027617)
chr6 (367-403)||(801386-801421)
chr6 (367-403)||(2192618-2192653)
chr6 (43-99)||(14483023-14483079)
chr6 (367-403)||(24021050-24021085)
chr6 (396-456)||(30257129-30257189)
[»] chr8 (81 HSPs)
chr8 (14-373)||(18440231-18440591)
chr8 (14-346)||(44943042-44943376)
chr8 (14-373)||(41856910-41857270)
chr8 (16-373)||(42603374-42603732)
chr8 (14-373)||(40702278-40702639)
chr8 (14-346)||(19242123-19242458)
chr8 (14-346)||(19315307-19315642)
chr8 (14-309)||(15032322-15032620)
chr8 (14-373)||(38033862-38034221)
chr8 (14-373)||(34614871-34615230)
chr8 (16-373)||(42168897-42169254)
chr8 (16-309)||(41363576-41363872)
chr8 (14-309)||(485256-485554)
chr8 (16-373)||(33799488-33799845)
chr8 (16-373)||(43693057-43693414)
chr8 (14-309)||(26452243-26452541)
chr8 (14-309)||(41275312-41275610)
chr8 (14-309)||(2416833-2417131)
chr8 (14-373)||(31171754-31172112)
chr8 (14-373)||(40415175-40415534)
chr8 (14-272)||(26484495-26484756)
chr8 (14-373)||(28706079-28706438)
chr8 (34-373)||(43638614-43638952)
chr8 (14-309)||(24861261-24861559)
chr8 (14-373)||(40414529-40414885)
chr8 (14-247)||(16575610-16575846)
chr8 (14-211)||(22548181-22548378)
chr8 (89-373)||(3589202-3589487)
chr8 (367-470)||(24861864-24861968)
chr8 (367-459)||(38033525-38033617)
chr8 (367-470)||(41017337-41017441)
chr8 (367-469)||(15031914-15032017)
chr8 (371-469)||(22549604-22549703)
chr8 (367-459)||(40415779-40415871)
chr8 (367-469)||(484848-484951)
chr8 (367-470)||(28705729-28705833)
chr8 (378-470)||(33799339-33799432)
chr8 (367-459)||(42168559-42168651)
chr8 (367-459)||(43637364-43637456)
chr8 (367-458)||(44050961-44051052)
chr8 (367-456)||(2417494-2417583)
chr8 (367-456)||(18439895-18439987)
chr8 (367-452)||(16576178-16576263)
chr8 (267-346)||(26486847-26486926)
chr8 (367-456)||(41856572-41856664)
chr8 (403-467)||(41275624-41275689)
chr8 (412-469)||(26452878-26452936)
chr8 (375-428)||(22549608-22549661)
chr8 (375-428)||(38033556-38033609)
chr8 (367-456)||(40702883-40702975)
chr8 (367-456)||(42603973-42604065)
chr8 (375-428)||(15031956-15032009)
chr8 (375-428)||(40415787-40415840)
chr8 (396-452)||(19242094-19242150)
chr8 (396-452)||(19315278-19315334)
chr8 (247-309)||(22549236-22549295)
chr8 (377-428)||(2417502-2417553)
chr8 (377-428)||(16576186-16576237)
chr8 (375-425)||(33799382-33799432)
chr8 (368-402)||(42168912-42168946)
chr8 (279-346)||(16575866-16575930)
chr8 (375-428)||(24861872-24861925)
chr8 (375-428)||(28705772-28705825)
chr8 (375-428)||(44050969-44051022)
chr8 (367-403)||(2417142-2417178)
chr8 (368-403)||(33799503-33799538)
chr8 (368-403)||(38033877-38033912)
chr8 (374-428)||(484889-484943)
chr8 (403-453)||(15032258-15032308)
chr8 (373-403)||(34615180-34615210)
chr8 (375-428)||(41017380-41017433)
chr8 (403-470)||(41363886-41363955)
chr8 (375-424)||(42168590-42168639)
chr8 (375-428)||(43637395-43637448)
chr8 (45-117)||(12504917-12504989)
chr8 (367-399)||(22549310-22549342)
chr8 (367-403)||(24861570-24861606)
chr8 (375-403)||(28706101-28706129)
chr8 (394-456)||(31171746-31171810)
chr8 (408-452)||(37780710-37780754)
chr8 (396-452)||(40702587-40702643)
[»] scaffold0589 (4 HSPs)
scaffold0589 (14-373)||(2177-2536)
scaffold0589 (367-470)||(4799-4903)
scaffold0589 (375-428)||(4807-4860)
scaffold0589 (368-403)||(2486-2521)
[»] scaffold0176 (4 HSPs)
scaffold0176 (14-373)||(1700-2059)
scaffold0176 (367-459)||(2304-2396)
scaffold0176 (375-428)||(2312-2365)
scaffold0176 (403-453)||(2012-2064)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (14-373)||(17855-18191)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (14-312)||(24815-25115)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (34-220)||(63906-64091)
scaffold0004 (252-312)||(64100-64160)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (368-469)||(11353-11455)
scaffold0199 (375-428)||(11395-11448)
[»] scaffold0861 (2 HSPs)
scaffold0861 (367-470)||(2468-2572)
scaffold0861 (375-452)||(2450-2529)
[»] scaffold0268 (4 HSPs)
scaffold0268 (367-416)||(14981-15030)
scaffold0268 (403-453)||(14690-14740)
scaffold0268 (256-309)||(14623-14676)
scaffold0268 (367-403)||(14687-14722)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (237-309)||(85462-85534)
scaffold0031 (403-453)||(85548-85598)
scaffold0031 (367-403)||(85545-85580)
[»] scaffold1700 (1 HSPs)
scaffold1700 (420-470)||(130-181)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (322-362)||(1169-1209)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 99)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 14 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17796398 - 17796095
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17796398 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 17796299  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17796298 ggaacacgttaagtataaacatccaacgctcgacgagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgg 17796199  T
Q  214 gagcacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtac 313  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||     
T  17796198 gagcacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttggttccgtcagaagctcgtcattaggtag 17796099  T
Q  314 ggaa 317  Q
    ||||    
T  17796098 ggaa 17796095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 35491547 - 35491907
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  35491547 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 35491646  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  35491647 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 35491746  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35491747 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 35491846  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  35491847 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 35491907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19471928 - 19471568
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19471928 agaggatgaaggttcggtgcctttgtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactaaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 19471829  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19471828 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 19471729  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||   |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19471728 gagcacagcatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 19471629  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||    
T  19471628 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctctg-aattgggtaattcaaa 19471568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27130803 - 27130443
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27130803 agaggttgaaggttcgatgccttggtgcaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaacctcggagacacaaggagggt 27130704  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||| || || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27130703 ggaacacattcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 27130604  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27130603 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatagtcattagg 27130504  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  27130503 taccgaatgaatgcaccttccagctaaaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 27130443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 14 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37312789 - 37312455
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  37312789 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaacccccgagacacaaggaggat 37312690  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  37312689 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagattatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 37312590  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37312589 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcattagg 37312490  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattg 345  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37312489 taccgaatgaatgcaccttacagctacaacaattg 37312455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 10364930 - 10364572
Alignment:
Q  15 gaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtg 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  10364930 gaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtg 10364831  T
Q  115 gaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagg 214  Q
    |||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  10364830 gaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggg 10364731  T
Q  215 agc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggt 311  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10364730 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattacgt 10364631  T
Q  312 acggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  10364630 a-ggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cct-ttaaatggggtaattcaaa 10364572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 2919657 - 2919324
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||| |||   |||||||| |||||||    
T  2919657 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactaactgaattcaaccaaggagtctacca--gagacacaaggagggt 2919560  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  2919559 ggaacacgttctgtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 2919460  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   |||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2919459 gagcacaacatgttacagtagatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcattaaaagtttgattccgccaaaagatcgtcattagg 2919360  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2919359 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 2919324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 6976752 - 6977108
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||| || |||||||| |||||||    
T  6976752 agaggttgaaggt--gatgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaacaaggagtcaactccagagacacaaggagggt 6976849  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||  ||  |||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  6976850 ggaacatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgag--gagtgtatcattcacttgggtgaaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 6976947  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6976948 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagg 6977047  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  6977048 taccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctctg-aatggggtaattcaaa 6977108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 34521977 - 34521618
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  34521977 agaggttgaaggttcggcgccttggtgtaacattaagaggtctcaaggatgaactaactgaattcaaccaaggagtcaacccag-agacacaaggagggt 34521879  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    | ||||| ||  |||||||| || ||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  34521878 gaaacacgttcggtataaacgtcaaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 34521779  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  34521778 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccctcataagatcgtcattagg 34521679  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  34521678 taccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 34521618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 3937358 - 3937060
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  3937358 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 3937259  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  3937258 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 3937159  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3937158 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 3937060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 10360492 - 10360135
Alignment:
Q  15 gaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtg 114  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10360492 gaggttgaaggttcgatgccttggtataacgttaagaggtctcaaagatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccggaaacacaaggagggtg 10360393  T
Q  115 gaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagg 214  Q
    |||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  10360392 gaacacgttctgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgtgacgagcatgttttggg 10360293  T
Q  215 agc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggt 311  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10360292 agcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaatgttgctgagatcaactgaagatttcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcattagtt 10360193  T
Q  312 acggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    | || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  10360192 agggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctc-aaaatggggtaattcaaa 10360135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 43982768 - 43983066
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  43982768 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccatggagtcaaccccagagacacaaggatggt 43982867  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  43982868 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 43982967  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43982968 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 43983066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 312
Target Start/End: Original strand, 29111071 - 29111371
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  29111071 agaggttgaag-ttcagtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaactcgaacagggagtcaaccccaaagacacaaggagggt 29111169  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  29111170 ggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 29111269  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  29111270 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaaccgaagatatcatcaaaaatttaattccgccagaataacgtcactagg 29111369  T
Q  311 ta 312  Q
    ||    
T  29111370 ta 29111371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 41499376 - 41499053
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||            ||| |||||| | |||||||    
T  41499376 agaggttgaaggttcggtgtcatggtgtgacgttaaaaggtctcaaggatgaactgactgaattcaac------------cccagagacagaaggagggt 41499289  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  41499288 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattaacctgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 41499189  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41499188 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgagggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 41499089  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  41499088 tacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgt 41499053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 312
Target Start/End: Original strand, 6901878 - 6902179
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  6901878 agaggttgaaggttcggtgccatggtgtaacgctaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactaggaagtcaaccccggagacacaaggagggt 6901977  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
     |||||||||  | |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  6901978 tgaacacattcggcataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 6902077  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| | ||||||    
T  6902078 gagcacaacatgttccagtgaatcgatatgcgagtaacgttgttgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcgagaagatcatgattagg 6902177  T
Q  311 ta 312  Q
    ||    
T  6902178 ta 6902179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 3941649 - 3941947
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||||| |||||||    
T  3941649 agaggttgaatgttcggtgccttggtttaacgttaagaggtctcaaggatcaactgactgaattcaaccaagaagtcaaccccagagacacaaggagggt 3941748  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  3941749 ggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 3941848  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3941849 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgatgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 3941947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 42241393 - 42241034
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  42241393 agaggttgaaggttcggtgccttagtgtaacgttaagaggtctaaaggataaactcactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 42241294  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    | ||||||||  |||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  42241293 gaaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 42241194  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  42241193 gagcacaacatgtttcagttgatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcaccaaaagtttgattctgccataagatcgtcattagt 42241094  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  42241093 tagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgaggtaattcaaa 42241034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 17424701 - 17424999
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||||  |||||||| ||| |||    
T  17424701 agaggtttaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccaaggagtcaaccctagagacacaaggatggt 17424800  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  17424801 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 17424900  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||   |||||||| ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17424901 gagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 17424999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12968596 - 12968237
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||| ||||||||  || |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12968596 agaggtggaaggttcaatgccttgatgtaacgttaagaggtcttaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 12968497  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  12968496 ggaatacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgttacgagcatgttttgg 12968397  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||     
T  12968396 gagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctccagaagatcgtcattagt 12968297  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  |||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12968296 tagggtaag-gtgcac--tccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 12968237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 16581734 - 16582095
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16581734 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacattaagaggtctgaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 16581833  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||| |    
T  16581834 ggaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaatgtgtcgagcatgttttgg 16581933  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatc--gatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 308  Q
    |||||   ||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  16581934 gagcacatcatgttccattggatcgagatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattccgctagaagatcttcatta 16582033  T
Q  309 ggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    | || || | |  ||||  ||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16582034 gttagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattggcttacctctgaaatggggtaattcaaa 16582095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 22493183 - 22493542
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||    
T  22493183 agagggtgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaagatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacgcaaggagggt 22493282  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  22493283 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacggcgaaaacgtgacgagcatgttttgg 22493382  T
Q  214 gagcac---atgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||| ||   |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||     
T  22493383 gagtacagaatgttccagtggattgatatgcgggtaacgttcctgagatcaactaaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagt 22493482  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | | |||||  ||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22493483 tagggtaag-atgca--ttccaactacaacaactgtcttacttctgaaatggggtaattcaaa 22493542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 29067642 - 29067998
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||  ||||||| ||| |||    
T  29067642 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaag-agtcaaccccaaagacacaaggatggt 29067740  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||| || |||||||| |    
T  29067741 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtgcaattaacgaatgacgaaaatgtgacgaccatgttttgg 29067840  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29067841 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagt 29067940  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  29067941 tagggtaag-gtgca--ttccagctacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 29067998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 5420381 - 5420679
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||| ||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5420381 agagattgaaggtttgatgccttggtgtatcgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaatgagtcaaccccggagacacaaggagggt 5420480  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||   ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||      
T  5420481 ggaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgt 5420580  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5420581 gagcacagcatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgatatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccacctgaagatcgtcattag 5420679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Original strand, 33403930 - 33404258
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |   ||||||||||| |||||||  ||||||    
T  33403930 agaggttgaaggttcggtgccttatagtaacgttaagaggtctcaaagatgaactgaatgaattcatcca---agtcaaccccgaagacacaaagagggt 33404026  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  33404027 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagggaatagtatcattcagttgtgtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 33404126  T
Q  214 gagcac---atgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||    
T  33404127 gagcacaagatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgatgtcgccagaagatcgtgattagg 33404226  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    || |    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  33404227 tagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgt 33404258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 29906494 - 29906853
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||  || |||||||    
T  29906494 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagatgcaaggagggt 29906593  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||  | |||||||| |    
T  29906594 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgtggggagagtatcattcacttgggtgaagttaaagaacgacgaaaacgtgacaaacatgttttgg 29906693  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||  ||||||     
T  29906694 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaaaatatcatcaacaacttgattctgccagaagatcagcattagt 29906793  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29906794 tagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaactgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 29906853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 42119924 - 42120283
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||| ||||  || |||||||    
T  42119924 agaggttgaaggtttgttgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactggatgagttcaaccaaggagtcaaccccagagatgcaaggagggt 42120023  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  42120024 ggaatacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggcggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgg 42120123  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||     
T  42120124 gagcacaacatgttccagtggattgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcattagt 42120223  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42120224 tagggtaag-gtgca--ttccaactacaacgattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 42120283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 39393807 - 39394101
Alignment:
Q  18 gttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaa 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||| | |||||||| |||||||| ||    
T  39393807 gttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaagtctcaaggatcaactgactgaattcaaccaaggagtcaacctcagagacacaaggagggtgtaa 39393906  T
Q  118 cacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagc 217  Q
    ||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  39393907 caccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaatcaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagc 39394006  T
Q  218 ---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
       |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  39394007 acaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcattaacaacttgattccgtcagaagatcgtcattag 39394101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 312
Target Start/End: Original strand, 20148030 - 20148331
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20148030 agaggttgaaggttcggtgccttggtataacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggt 20148129  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    | || |  ||  |||||||| |||||||||| || || ||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  20148130 gaaatatgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagaatatcatttagttggggggaattaaagaacgacgaaaacatgactagcatgttttag 20148229  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20148230 gagcacaacatgttccagtagatcgatatgcgggtaacgttgctgagattagctgaagatattttcaacagtctgattccgccagaagatcgtgattagg 20148329  T
Q  311 ta 312  Q
    ||    
T  20148330 ta 20148331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39800136 - 39799902
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||| |||    
T  39800136 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggatggt 39800037  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |    
T  39800036 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtcacgaccatgttttgg 39799937  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggt 245  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  39799936 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggt 39799902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 156 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40677527 - 40677309
Alignment:
Q  156 agtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagcac---atgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcg 252  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||   |||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  40677527 agtatcatccacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttctgggagcacgacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttg 40677428  T
Q  253 ctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacc 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||    
T  40677427 ctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttgcagctacaccaattgtatt-cc 40677329  T
Q  353 tctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    | || ||||||||||||||||    
T  40677328 tttg-aatggggtaattcaaa 40677309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 22001758 - 22002044
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||            ||| |||||||| ||| |||    
T  22001758 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgattgaattcaac------------cccagagacacaaggatggt 22001845  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
     |||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  22001846 agaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggaggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 22001945  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||    ||||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22001946 gagctcagcatgttccaatggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcattag 22002044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 32734560 - 32734918
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32734560 agaggttgaaggtccagtgcctta-tgtaacgttaagaggtctcaaagatcaactgaatgaattcaaccaatgagtcaaccccagagacacaaggagggt 32734658  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||| | ||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||  |||||||||| |    
T  32734659 ggaatacgtttggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaactacgaaaatgtgacaagcatgttttgg 32734758  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||     
T  32734759 gagcacaacatgttacagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgatatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccaaaagatagtcattagt 32734858  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| |||||||||  || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  32734859 taaggtaag-gtgca--ttccaactacaacaacagtcttacctctaaaatgggataattcaaa 32734918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Original strand, 34638878 - 34639083
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  34638878 agaggttgaaggttcggtgcattggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaacttactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaagga-ggt 34638976  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||||||||| || || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  34638977 ggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 34639076  T
Q  214 gagcaca 220  Q
    |||||||    
T  34639077 gagcaca 34639083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 40678909 - 40678763
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  40678909 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 40678810  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtat 160  Q
    ||||| | ||  |||||||| |||||| |||||| |  |||||||||    
T  40678809 ggaacgcgttcggtataaacgtccaacactcgacgaagggagagtat 40678763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 16253388 - 16253724
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||| | |||||| |||||||    
T  16253388 agaggttgaaggttcggcacgttggtgtcacgttaagaggtatcaaggatcaactgagtgaatttaaccaaggagtcaacccccgggacacaaggagggt 16253487  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  ||||||||  ||||| ||  || |  ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||| |    
T  16253488 ggaatacgttcggtataaacgcccaacacttaacgatgggagaatatcattaagttgggtggaattaaagaacgacgataacgtgagcagcatgttttgg 16253587  T
Q  214 gagcacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtac 313  Q
    |||||||  |||      ||          ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||     
T  16253588 gagcaca--ttc------at----------gtaacgttgctgagatcaactaaagatattatcgacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggtag 16253669  T
Q  314 ggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  16253670 g----gaatacaccttccaactacaacaattgtctta-ctctgaaatgaggtaattcaaa 16253724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 252 - 345
Target Start/End: Original strand, 43491603 - 43491696
Alignment:
Q  252 gctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattg 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  43491603 gctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaaagaatgcaccttccaactacaacaattg 43491696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 367 - 466
Target Start/End: Original strand, 16582340 - 16582440
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  16582340 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattatcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcagcaggac 16582439  T
Q  466 t 466  Q
    |    
T  16582440 t 16582440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Original strand, 18393866 - 18393970
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  18393866 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaattcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 18393965  T
Q  466 tccaa 470  Q
    |||||    
T  18393966 tccaa 18393970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Original strand, 22493788 - 22493892
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22493788 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctagatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 22493887  T
Q  466 tccaa 470  Q
    |||||    
T  22493888 tccaa 22493892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Original strand, 42120529 - 42120633
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa-tcgcaggac 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||    
T  42120529 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttattaattggcaggac 42120628  T
Q  466 tccaa 470  Q
    |||||    
T  42120629 tccaa 42120633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 17425304 - 17425407
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  17425304 attcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 17425403  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  17425404 tcca 17425407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 39799561 - 39799458
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  39799561 attcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 39799462  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  39799461 tcca 39799458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 10359889 - 10359797
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10359889 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcatattcgaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcg 10359797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 22002349 - 22002452
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22002349 attcaaaggtaacacaattgttgtgattggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatctgcaggac 22002448  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  22002449 tcca 22002452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 8557416 - 8557324
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8557416 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacatttcaagtacaacaattgtcttactctggatggggcaaatcaaacttgttaatcg 8557324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 166
Target Start/End: Original strand, 31770265 - 31770427
Alignment:
Q  4 gaagaagcagagaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagaca 103  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||  |||||    
T  31770265 gaagaagctcagacgttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaagaatgaaatgaatgaattcaaccaaggagccaaccccatagaca 31770364  T
Q  104 cagggagggtggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattca 166  Q
    || ||||| || || |  ||  |||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  31770365 caaggaggatgtaatatgttcggtataaacgtccaacgttcgacgaggggagagtatcattca 31770427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 3936755 - 3936651
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctg-gatggggtaattcaaacttgttaatc-gcagga 464  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  3936755 attcaaaggtaacagaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctgcgatggggcaattcaaacttgttaatcggcagga 3936656  T
Q  465 ctcca 469  Q
    |||||    
T  3936655 ctcca 3936651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 241
Target Start/End: Original strand, 18392061 - 18392179
Alignment:
Q  126 gtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagca---catg 222  Q
    |||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||   ||||    
T  18392061 gtataaacgtccaacgcttgacgaggggagagtatcatttacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatg 18392160  T
Q  223 ttccagtggatcgatatgc 241  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18392161 ttccagtggatcgatatgc 18392179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 218 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 27650514 - 27650378
Alignment:
Q  218 acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaa 317  Q
    ||||||| | |||||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |       
T  27650514 acatgttaccgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtgattaggtagg--- 27650418  T
Q  318 tgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaa 358  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  27650417 -gaatgcaccttccaactacaacaattgacttacctctgaa 27650378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Original strand, 16706879 - 16706959
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaacc 94  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  16706879 agaggttgaaggttcggtgccttggtataacgttaagaggtctcaaggatgaacttaatgaattcaaccaaggagtcaacc 16706959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 396 - 459
Target Start/End: Original strand, 29073588 - 29073651
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29073588 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcg 29073651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 255 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31991986 - 31991885
Alignment:
Q  255 gagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctc 354  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  31991986 gagatcaactgaagatattctcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctc 31991891  T
Q  355 tgaaat 360  Q
    ||||||    
T  31991890 tgaaat 31991885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 403 - 470
Target Start/End: Original strand, 5420693 - 5420761
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaat-cgcaggactccaa 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5420693 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaataggcaggactccaa 5420761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 10364327 - 10364235
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    || |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10364327 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtctaactgcaacaattgtctttctctaaatggggtaattcaaacttgttaa 10364235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 403 - 470
Target Start/End: Original strand, 3941961 - 3942029
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg-caggactccaa 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3941961 cattccaacttcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacatgttaatcgacaggactccaa 3942029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 255 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18036212 - 18036110
Alignment:
Q  255 gagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctc 354  Q
    |||||||||| || ||||  |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18036212 gagatcaactaaaaatattctcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattaggta-ggaa---atgcaccttccaactacaacaattgtcttacctc 18036117  T
Q  355 tgaaatg 361  Q
    |||||||    
T  18036116 tgaaatg 18036110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 236 - 373
Target Start/End: Original strand, 18393486 - 18393621
Alignment:
Q  236 atatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagct 335  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||  | || | |  ||||  ||||| ||    
T  18393486 atatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcataaacaacttgattctgccagaagatcgtcattagtgagggtaag-gtgca--ttccaact 18393582  T
Q  336 acaacaattgttttacctctgaaat-ggggtaattcaaa 373  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18393583 acaaaaattgtcttacctctgaaatnggggtaattcaaa 18393621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 367 - 453
Target Start/End: Original strand, 35492150 - 35492239
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  35492150 attcaaaggtaagacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctgaatttggtaattcaaacttgt 35492239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 6977352 - 6977444
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||| | |||    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  6977352 attcaaaggtaacacaattgtttgagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaa 6977444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15891697 - 15891610
Alignment:
Q  255 gagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15891697 gagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgctagaatatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgt 15891610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 209
Target Start/End: Original strand, 18878445 - 18878611
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaacatccaacgc 142  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||  ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||| ||| |||||||     
T  18878445 acgttaaaaggtcttaaggatcaactagatgaaatcaaccaaggactcaaccccggagacacaaggaggggggaatacatttggtatgaacgtccaacgt 18878544  T
Q  143 tcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgtt 209  Q
    | ||| |  ||||| || | |||||| |  | |||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  18878545 tggacgacaggagaataacgttcagtcgactagaattaacgaacgacgacgacgtgaggagcatgtt 18878611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 22493849 - 22493771
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || || |||||  ||||||||||||    
T  22493849 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatgggaaaattcaaacttg 22493771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 37312185 - 37312093
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||    |||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  37312185 attcaaaggtaacacaattgttatagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgttttcctctaaatggggtaattcaaacttgttaa 37312093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 41498784 - 41498692
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  41498784 attcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactacaacaattgtcttcctctgaatggggcaattcaaacttgttaa 41498692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 42120590 - 42120537
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  42120590 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 42120537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 375 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 18393927 - 18393847
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggt-aattcaaacttgt 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||    
T  18393927 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgaattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgt 18393847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 123
Target Start/End: Original strand, 11718688 - 11718766
Alignment:
Q  45 gttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacatt 123  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11718688 gttaaaaggtctcaatgatcaactgcatgaaatcaaccatggactcaaccccggagacacaaggagggtggaatacatt 11718766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 406 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 19471277 - 19471227
Alignment:
Q  406 tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19471277 tccaactgcaacaattgtcttcctctgaatggagtaattcaaacttgttaa 19471227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 43491966 - 43492058
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||| ||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  43491966 attcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaataattgtctttctttgaatgaggtaattcaaacttgttaa 43492058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 407 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 2919017 - 2918968
Alignment:
Q  407 ccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  2919017 ccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaa 2918968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 428
Target Start/End: Original strand, 29111633 - 29111690
Alignment:
Q  371 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  29111633 aaaggtaagataattgttgtagttggaatgcactttccaaccacatcaattgtcttac 29111690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Original strand, 6977056 - 6977112
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6977056 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttg 6977112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 31992210 - 31992114
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaacatccaa 139  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||  |||| ||| |||||    
T  31992210 acgttaaaaggtctcaaggatcaactagatgaaatcaaccaaggactcaaccccggagacacaaggagggtgaaatacatttggtatgaacgtccaa 31992114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 452
Target Start/End: Original strand, 10359828 - 10359907
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggt-aattcaaacttg 452  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  10359828 gtaagacaattgttgtagttcgaatatgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttg 10359907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 456
Target Start/End: Original strand, 16253670 - 16253732
Alignment:
Q  395 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctg-gatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  16253670 ggaatacaccttccaactacaacaattgtcttactctgaaatgaggtaattcaaacttgttaa 16253732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 34521394 - 34521344
Alignment:
Q  406 tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||    
T  34521394 tccaactgcaacaattgtcttcatttgaatggggtaattcaaacttgttaa 34521344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Original strand, 8557355 - 8557408
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  8557355 gtaagacaattgttgtacttgaaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 8557408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 16582401 - 16582348
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  16582401 gtaagataattgttgcagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 16582348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 19471620 - 19471563
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  19471620 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctctgaattgggtaattcaaacttgt 19471563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 456
Target Start/End: Original strand, 33404230 - 33404291
Alignment:
Q  395 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| ||||    
T  33404230 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaactttttaa 33404291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 11679361 - 11679265
Alignment:
Q  45 gttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaacatccaacg 141  Q
    ||||| || |||||| ||| ||||| ||||  ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||| |||||||    
T  11679361 gttaaaagatctcaatgatcaactgcatgagatcaaccatggactcaaccccggagacacaaggagggtggaatacatttggtatgaacgtccaacg 11679265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 29111736 - 29111696
Alignment:
Q  371 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaac 411  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29111736 aaaggtaagataattgttgtagttggaatgcactttccaac 29111696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 423 - 470
Target Start/End: Original strand, 32735191 - 32735239
Alignment:
Q  423 tcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggactccaa 470  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  32735191 tcttactctggatggggcaattcaagcttgttaatcggcaggactccaa 32735239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 34521670 - 34521614
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  34521670 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 34521614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Original strand, 35491855 - 35491911
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  35491855 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 35491911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 39394148 - 39394112
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39394148 attcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgcac 39394112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Original strand, 43491670 - 43491726
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  43491670 gaatgcaccttccaactacaacaattgccttcctttgaatggggtaattcaaacttg 43491726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Original strand, 42241049 - 42241084
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42241049 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 42241084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 403
Target Start/End: Original strand, 10360154 - 10360184
Alignment:
Q  373 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10360154 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 10360184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17425366 - 17425312
Alignment:
Q  374 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  17425366 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 17425312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Original strand, 22002058 - 22002108
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||    
T  22002058 cattccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgt 22002108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 26617750 - 26617676
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaa 117  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |  || ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  26617750 acgttaaaaggtctcaaggattaactaaatgaaatcaaccaatgactcaactccagagacacaaggagggtggaa 26617676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Original strand, 29067953 - 29068003
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  29067953 cattccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgt 29068003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Original strand, 39799499 - 39799553
Alignment:
Q  374 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  39799499 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 39799553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32735189 - 32735156
Alignment:
Q  334 ctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaa 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32735189 ctacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaa 32735156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 2919351 - 2919295
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  2919351 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatgtggtaattcaaacttg 2919295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 10364624 - 10364568
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||    
T  10364624 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttaaatggggtaattcaaacttg 10364568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 17538586 - 17538546
Alignment:
Q  416 acaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  17538586 acaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaa 17538546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 296 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 42240870 - 42240834
Alignment:
Q  296 aagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttcca 332  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  42240870 aagatcgtcagtaggtacagaatgaatgcaccttcca 42240834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 184)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 46414631 - 46414296
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  46414631 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 46414532  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  46414531 ggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgacgagtggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 46414432  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46414431 gagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 46414332  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46414331 tacggaatgaatgcaccttctagctacaacaattgt 46414296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 51013575 - 51013215
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  51013575 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaatgatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 51013476  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  51013475 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 51013376  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    || |   ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51013375 gaacacaacatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 51013276  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  51013275 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 51013215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Original strand, 51015199 - 51015534
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||  ||||||| |||||||    
T  51015199 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcgaccccaaagacacaaggagggt 51015298  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  51015299 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagtgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgg 51015398  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015399 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggaaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 51015498  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015499 taccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 51015534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 34647564 - 34647229
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  34647564 agaggttgaatgttcggtgtcttggtgtaacgttaagagatctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaacccccgagacacaaggagggt 34647465  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  34647464 ggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgtttcgg 34647365  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  34647364 gagcacaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattacgctagaagatcgtcattagg 34647265  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  34647264 taccgaatgaatgcaccttctagctgcaacaattgt 34647229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 34472373 - 34472013
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |  ||||||| |||||||    
T  34472373 agaggttgaagattcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaacctcaaagacacaaggagggt 34472274  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  34472273 ggaacacattcggtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 34472174  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34472173 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagttttattccgccagaagatcgtcattagg 34472074  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  34472073 taccgaatgaatgttccttccagctacaaaaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 34472013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 346
Target Start/End: Original strand, 43569834 - 43570167
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  43569834 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacagaaggagggtgg 43569933  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    ||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  43569934 aacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcatttacttgggtggaactaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 43570033  T
Q  216 gca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 312  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  43570034 gcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgatttcgccagaagatcgtctttatgta 43570133  T
Q  313 cggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43570134 cggaatgactgcaccttccagctacaacaattgt 43570167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 14 - 344
Target Start/End: Original strand, 30192460 - 30192793
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  30192460 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaattttaagaggtctcaagtatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 30192559  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |    
T  30192560 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgtctagcatgttttgg 30192659  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||| |   ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30192660 gagtacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 30192759  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaatt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30192760 tacggaatgaatgcaccttccaactacaacaatt 30192793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 10053568 - 10053237
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| |||    |||||||| |||||||    
T  10053568 agaggttgaaggtttagtgcattggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactggctgaattcaaccaaggagtaaacttgagagacacaaggagggt 10053469  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| |||||  |||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  10053468 ggaatacattcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgatgagcatgttttgg 10053369  T
Q  214 gagcacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtac 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10053368 gagcacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaa-atatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtac 10053270  T
Q  314 ggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10053269 tgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 10053237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 2428410 - 2428769
Alignment:
Q  15 gaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtg 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  2428410 gaggttgaaggttcggtgacttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacagaaggagggtg 2428509  T
Q  115 gaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagg 214  Q
    |||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  2428510 gaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggataatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttggg 2428609  T
Q  215 agc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggt 311  Q
    |||   |||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2428610 agcacaacattttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcattaggt 2428709  T
Q  312 acggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  2428710 acataatgaatgcacctttcagctacaacaattgtgtt-cctttg-aatggggtaattcaaa 2428769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 44927385 - 44927744
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44927385 agaggttgaaggttcgatgtcttggtttaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggt 44927484  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  44927485 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 44927584  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44927585 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagt 44927684  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| || |||||||||| ||||||   |||||||||||||||||    
T  44927685 tagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattgtcttacctaaaaaatggggtaattcaaa 44927744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 52569703 - 52569346
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||| |||| |||||| | ||| |||||    
T  52569703 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactaactgaattcaaccaaggagtcagccccagagacaaaaggatggtgg 52569604  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  52569603 aacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcgcttgggtggaattaacgaacgacgaaaa-gtgacgagcatgttttggga 52569505  T
Q  216 gc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 312  Q
    ||   ||||||||| ||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52569504 gcacaacatgttccggtgaatcgatatgcgggtgacattgctgagatcaactgaagatatcatcaagagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtg 52569405  T
Q  313 cggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  52569404 cggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 52569346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13896167 - 13895808
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||  |||||||| |||||||    
T  13896167 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacattaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaatgagtcaaccctagagacacaaggagggt 13896068  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13896067 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 13895968  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||     
T  13895967 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattccgctagaagatcgtcattagt 13895868  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13895867 taaggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 13895808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Original strand, 14631367 - 14631698
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| | |||||||| |||||||    
T  14631367 agaggttgaaggttcagtgccttgttgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaacctcagagacacaaggagggt 14631466  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  14631467 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagtaaagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 14631566  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14631567 gagcaaaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcattagg 14631666  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaa 342  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14631667 taccgaatgaatgcaccatccagctacaacaa 14631698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 34693586 - 34693228
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||  | ||||||| |||||||    
T  34693586 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaatttaaccaaggagttaaccttg-agacacaaggagggt 34693488  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  34693487 ggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgagggttgagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 34693388  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  34693387 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaactttgattccgccagaagatcgtcattagt 34693288  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34693287 tagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 34693228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 373
Target Start/End: Original strand, 41803829 - 41804184
Alignment:
Q  18 gttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaa 117  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  41803829 gttgaaagttcggtgccttggtgtgacgttaa-aggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacaaaaggagggtggaa 41803927  T
Q  118 cacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagc 217  Q
    ||| ||  |||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  41803928 cacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagc 41804027  T
Q  218 ---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacg 314  Q
       ||||||||||||||||||||||| | || |||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41804028 acaacatgttccagtggatcgatatgagagtgacgttgatgagatcaaatgaagatataatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacg 41804127  T
Q  315 gaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  41804128 gaatgaatgcactttttagctacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 41804184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 45100762 - 45100427
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| |||  ||||||| |||||||    
T  45100762 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtcttaaggatgaactgactgatttcaaccaaggagtcaatcccatagacacaaggagggt 45100663  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||| |    
T  45100662 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaagggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacaaaaatgtgacgagcatgttttgg 45100563  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  45100562 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccataatatcgtcattagg 45100463  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||| |||||||||||| ||  |||||| ||||||||    
T  45100462 tactgaatgaatgcactttttagctactacaattgt 45100427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Original strand, 49273321 - 49273656
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||  |||||||| |||||||    
T  49273321 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggaatcaaccctagagacacaaggagggt 49273420  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  49273421 ggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgagggcagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttctgg 49273520  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||| |||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  49273521 gagcacaacatgttccagttgatcaatatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattcttccagaatatcgtcattagg 49273620  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  49273621 tcctgaatgaacgcaccttccagctaccacaattgt 49273656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4004384 - 4004086
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  4004384 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 4004285  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  4004284 ggaacacgtttggtataaacattcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacgtgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgagcatgttttgg 4004185  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4004184 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcattag 4004086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 6754128 - 6754484
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6754128 aggttgaaggttcagtgccttggtgtaacgttaagaggtatcaaggatgaactgaatgaattcaactaaggagtcaaccccggagacacaaagagggtgg 6754227  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    || || ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  6754228 aatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattaagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgatcatgttttggga 6754327  T
Q  216 g---cacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 312  Q
    |    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| || |||||||||| |||| |||    
T  6754328 gtacaacatgttctagttgatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgctagaagatcgtgattatgta 6754427  T
Q  313 cggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
     |||   ||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6754428 ggga---aatgcaccttccaactacaacaactgtctta-ctctgaaatggggtaattcaaa 6754484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 49140351 - 49140053
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  49140351 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 49140252  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  49140251 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 49140152  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49140151 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 49140053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 54390364 - 54390662
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  54390364 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 54390463  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  54390464 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 54390563  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54390564 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 54390662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 46402925 - 46403223
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  46402925 agaggttaaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 46403024  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  46403025 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 46403124  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46403125 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 46403223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 7246018 - 7246376
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||| | ||| |||||| |  ||||||| | || ||||    
T  7246018 aggttgaaggttcagtgccttggtgtaacgttaagaggtttgaaggatgaactaactgaattcaaccaaggattcaacctcatagacacaagaagagtgg 7246117  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  7246118 aacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattgacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 7246217  T
Q  216 gca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 312  Q
      |   |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7246218 ttataacatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 7246317  T
Q  313 cggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  7246318 tggaataaatgcaccttccagctacaacgattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 7246376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Original strand, 7954125 - 7954461
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  7954125 agaggttgaaggtccgttgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggaagaactgaatgaattcaactaggtagtcaaccccggagacacaaggagggt 7954224  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtgg-agagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgtttta 212  Q
    |||| || ||  | |||||| |||||| |||||  || || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||     
T  7954225 ggaatacgttcggcataaacgtccaacactcgatgagggggagggtatcatttagttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttg 7954324  T
Q  213 ggagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  7954325 ggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaaagttgctaagatcaactgaagatattatcaacaatctgattccgctagaagatcgtcattag 7954424  T
Q  310 gtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  7954425 gtacggaatgaatgcaccttctaactacaacaattgt 7954461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19453526 - 19453167
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||| | | |||||||    
T  19453526 agaggttgaaggttaggtaacttagtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagatagaaggagggt 19453427  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||   ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  19453426 ggaacacgttcgatataaacgtccaatgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttatgg 19453327  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  19453326 gagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcatcattagt 19453227  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19453226 tagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattctcttacctctgaaatggggtaattcaaa 19453167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25576888 - 25576530
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || |||||||    
T  25576888 agaggttgaaggtttggtgtcttgatgtaacattaagaagtctcaaggatcaactgaatgaattcaactaaggattcaaccccagagacgcaaggagggt 25576789  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  25576788 ggaatacgttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagattatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 25576689  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||      
T  25576688 gagcacagcatgttcca-tggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgattccgtcagaagatcgtcattatt 25576590  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25576589 tagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 25576530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Original strand, 37281374 - 37281709
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||| | |    
T  37281374 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctaaaggatgaactcgctaaattcaaccaaggagtcaaccccatagacacaaggatgat 37281473  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||||| |||||| || | || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  37281474 ggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgagggtagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 37281573  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37281574 gagcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaacggaagatatcatcaaaagtttaattccgccagaagatcgtcattagg 37281673  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  37281674 taccgaatgaatgcaccttcaaactacaacaattgt 37281709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 39417245 - 39416886
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||| |||||||    
T  39417245 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaacctcaaagacacaaggagggt 39417146  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||    ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  39417145 ggaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgatgagcatgttttgg 39417046  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||     
T  39417045 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgatttcgccagaagatcgtcattagt 39416946  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  39416945 tagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctaaaatgggataattcaaa 39416886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 34049649 - 34049947
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  34049649 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacattaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 34049748  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||||||  |||||||| | |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  34049749 ggaacacatttggtataaacgttcaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 34049848  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34049849 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 34049947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 49610411 - 49610709
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  49610411 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 49610510  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||   ||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  49610511 ggaacaccttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 49610610  T
Q  214 gagcac---atgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  49610611 gagcacagtatgttccagtgggtcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 49610709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 47760188 - 47759879
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| | | |||||||||| |||||||| |||||||    
T  47760188 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaatgatgaactgattaaattcaaccaagaagtcaaccccagagacacaaggagggt 47760089  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |    
T  47760088 ggaacacgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacaaacatgttttgg 47759989  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    || ||   ||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47759988 gaacacagcatgttccagtggatcgatgtacgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 47759889  T
Q  311 tacggaatga 320  Q
    ||| ||||||    
T  47759888 taccgaatga 47759879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 6464642 - 6464284
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  6464642 agaggttgaaggttcagtgccttggtgtaacgttaagaggtatcaaagatgaactgaatgaattcaactaaggagtcaaccccggtgacacaaagagggt 6464543  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||| |    
T  6464542 ggaatacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacaatcatgttttgg 6464443  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| || |||||||||| ||||      
T  6464442 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgcaagaagatcgtgattata 6464343  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || |||   ||||||||||||| ||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6464342 taggga---aatgcaccttccaactacaacaactctctta-ctctgaaatggggtaattcaaa 6464284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 55207170 - 55206846
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||        |||||| | ||||| | ||||||||     
T  55207170 aggttgaaggttcggtgccttagtgtgacgttaaaaggtctcaaggatgaactgactgaattcaac--------caacccag-agacagaaggagggtga 55207080  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    ||||| ||  |||||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  55207079 aacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggtgagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttggga 55206980  T
Q  216 gcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 312  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55206979 gcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 55206880  T
Q  313 cggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  55206879 cggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgt 55206846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24702568 - 24702210
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  24702568 agaggttaaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaagatgaactgactgaattgaaccaaggagtcaaccccatagacacaaggagggt 24702469  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||| |    
T  24702468 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaatt-acgaacgacgaaaacgtgacggacatgttttgg 24702370  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  24702369 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattccgccagaagatcgtcattagt 24702270  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24702269 tagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 24702210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 373
Target Start/End: Original strand, 42382977 - 42383332
Alignment:
Q  18 gttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaa 117  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||  | ||||||||||     
T  42382977 gttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacgtaaggagggtggac 42383076  T
Q  118 cacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagc 217  Q
     || || ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  42383077 tacgttcagtataaacttccaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagc 42383176  T
Q  218 a---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacg 314  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  42383177 acatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaagttgattccgccagaagatcgtcatta-gttgg 42383275  T
Q  315 gaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||   || |  | ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  42383276 ga--caaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctaaaatggggtaattcaaa 42383332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 2268791 - 2268493
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||| |||    
T  2268791 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtcttaaggatgaactgattgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggatggt 2268692  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||  ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  2268691 ggaacaagtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgggcatgttttgg 2268592  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2268591 gagcacatcatgttccagtagatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 2268493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 47065609 - 47065968
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||||||    
T  47065609 agaggttgaaggtttggtgccttgatgtaacattaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaactccagagacacaaggagggt 47065708  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || || ||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| |    
T  47065709 ggaatacgttcagtataaacgtccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgaggaaaatgtgacgagcatgttttgg 47065808  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||     
T  47065809 gagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcattaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagt 47065908  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  47065909 tagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgaggtaattcaaa 47065968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 2647173 - 2646875
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  2647173 agagtttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagatgtctcaaggataaactgactgaattcaacgaaagagtcaaccccagagacacaaggatggt 2647074  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  2647073 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 2646974  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2646973 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcattag 2646875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 49219033 - 49218735
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||    
T  49219033 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccctagagacacaaggagggt 49218934  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  49218933 ggaacacctttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacaaacggcgaaaacgtgacgaacatgttttgg 49218834  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  49218833 gagcgcaacatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 49218735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 53826991 - 53826634
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  53826991 aggttgaaggttcggtgccttgatttaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacgcaaggagggtgg 53826892  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    || || ||  |||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  53826891 aatacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagagttaaagaacgacgaaaatgtgatgagcatgttttggga 53826792  T
Q  216 gc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 312  Q
    ||   |||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53826791 gcacaacatgttccaatggatcgatatgcatgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagtta 53826692  T
Q  313 cggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
     || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53826691 gggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 53826634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 36134930 - 36135227
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  ||||||||||  |||||||| ||| |||    
T  36134930 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactggattcaaccaatgagtcaaccctagagacacaaggatggt 36135029  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  36135030 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgagggga-agtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 36135128  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   |||||| |||| ||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36135129 gagcacatcatgtttcagtagatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcattag 36135227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 42382197 - 42382491
Alignment:
Q  18 gttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaa 117  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||  | ||||||||||     
T  42382197 gttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagtggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacgtaaggagggtggac 42382296  T
Q  118 cacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagc 217  Q
     || || ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  42382297 tacgttcagtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagc 42382396  T
Q  218 a---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  42382397 acatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaagttgattccgccagaagatcgtcattag 42382491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 51695899 - 51695605
Alignment:
Q  18 gttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaa 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  51695899 gttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaa 51695800  T
Q  118 cacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagc 217  Q
    ||| ||  |||||||| ||||||||||||| || | | ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  51695799 caccttcggtataaacgtccaacgctcgacgagggaaaagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaatacgtgacgagcatgttttgggagc 51695700  T
Q  218 a---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  51695699 acatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcatcattag 51695605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 8633654 - 8633348
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||| |||||||||    
T  8633654 aggttaaatgtttggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcatggatgaactgaatgaattcaaccaaggagttaacacaggagacacaaggagggtgg 8633555  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    || || ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||| |||    
T  8633554 aatacgtttggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaatattttttggga 8633455  T
Q  216 gcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 312  Q
      |||   |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8633454 tgacaacgtgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgcgatcatctgaagatattatcaacagtctgattccgccagaagatcgtcattaggta 8633355  T
Q  313 cggaatg 319  Q
    | |||||    
T  8633354 ccgaatg 8633348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 36721682 - 36721351
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| | | |||||||  | ||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  36721682 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtc----ggatgaactcactaaattcaatcatggagtcaaccccaaagacacaaggagggt 36721587  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||| |    
T  36721586 ggaacacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgagaggagagtatcattcacttgattggaataaacgaacgacgaaaacgtgacgagcaatgtttgg 36721487  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   ||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36721486 gagcacaacatgttctagtggatcgatatgctggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatttgg 36721387  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36721386 tatcgaatgaatgcaccttccacctacaacaattgt 36721351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 48087848 - 48087490
Alignment:
Q  15 gaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtg 114  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  48087848 gaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaaacgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggatggtg 48087749  T
Q  115 gaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagg 214  Q
    |||    ||  |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  48087748 gaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacctgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggg 48087649  T
Q  215 agcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggt 311  Q
    ||||||   | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  |    
T  48087648 agcacaacatattccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccaccagaagatcgtcattaatt 48087549  T
Q  312 acggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    | || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  48087548 agggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctaaaatggggtaattcaaa 48087490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 319
Target Start/End: Original strand, 27186870 - 27187178
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27186870 agaggttgaaggttcagtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 27186969  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || || ||||||||  ||||| |||||   || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |    
T  27186970 ggaatacgtttagtataaatgtccaatgctcgtagaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgaacatgttttgg 27187069  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  27187070 gagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatattatcaacaatctgattccgccataatatcgtgattagg 27187169  T
Q  311 tacggaatg 319  Q
    || ||||||    
T  27187170 tagggaatg 27187178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Original strand, 41577850 - 41578163
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||                      || |||||||    
T  41577850 agaggttgaaggtttggcgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactggctgaattcaac----------------------caaggagggt 41577927  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  41577928 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 41578027  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   |||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41578028 gagcacagcatgttccagtggatcaatatgcgagtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcatcattagg 41578127  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41578128 tacggaatgaatgcacctttcagctacaacaattgt 41578163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 774632 - 774288
Alignment:
Q  17 ggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgga 116  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| | | ||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  774632 ggttgaaggttcagtgccttggtgtaacgctaagaggtctcaatgatcaacttgatgaattcaaccaagtagtcaaccccggagacacgaggagagtgga 774533  T
Q  117 acacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggag 216  Q
    |    ||   ||||||| ||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  774532 atgtgtttgctataaacgtccaacgctcgacgacgggagaatatcattcagttggatggaattaacgaacgatgaaaacgtgaagaacatgttttcggag 774433  T
Q  217 cac---atgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtac 313  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||     
T  774432 cactgcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaagagtctgattccaccagaagatcgtgattaggtag 774333  T
Q  314 ggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatgg 362  Q
    |    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  774332 g----gaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatgg 774288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 42950317 - 42949958
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || | |||||    
T  42950317 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaatgatcaactgaatgaattcaaccaatgagtcaaccccagagacgcaagaagggt 42950218  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||  ||||||||||||| || | ||||||||||||| |||| |||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  42950217 ggaatacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgagggaagagtatcattcacttggatggagttaaagaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 42950118  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||     
T  42950117 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggtttacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagt 42950018  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  42950017 tagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgggataattcaaa 42949958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 44835784 - 44835425
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||  ||||| || |||||||    
T  44835784 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtcttaaggatcaactaaatgaattcaaccaaggagtcaaccctagagacgcaaggagggt 44835685  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||   ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  44835684 ggaatacgttcgatataaacattcaacgttcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 44835585  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||    |||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||     
T  44835584 gagcatagaatgttccagtggatggatatgcgggtaaggttgttgagatcaactgaaaatatcatcaacagcttgattccgtcagaagatcgtcattagt 44835485  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  44835484 tagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctttgaaatggggtaattcaaa 44835425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 3495326 - 3495028
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  3495326 agaggttgaaggttcggtaccttggtgtaacgttaaaaggtctcaaggataaactaactaaattcaaccaatgagtcaaccccagagacacaaggatggt 3495227  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||   ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  3495226 ggaacacgtttgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 3495127  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| | || | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3495126 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgtttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcattag 3495028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 33449436 - 33449092
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||  | ||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  33449436 agaggttgaacgtttggtgccttggtgtaacgttaaaaggtctcaaagatcaactgaatgaatccaatcaaggagtcaaccccaaagacacaaggagggt 33449337  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    | || || ||   ||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  33449336 gaaatacgttcgatataaacgtcaaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgg 33449237  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33449236 gagcacatcatgttccagtggatcgatat------------gctgagatcaactgaagatatcatccaaagtttgattccgccagaagatcgtaattagg 33449149  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || |    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  33449148 tagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtttt-cctctg-gatggggtaattcaaa 33449092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 132 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 42323568 - 42323326
Alignment:
Q  132 acatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagcaca---tgttccag 228  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||   |||| |||    
T  42323568 acatccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagctcaaaatgtttcag 42323469  T
Q  229 tggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcacct 328  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42323468 tggatcgatatgctggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccactggaagatcgtcattaggtactgaatgaatgcacct 42323369  T
Q  329 tccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  42323368 tccagctacaacaattgtctt-cctctg-aatggggtaattcaaa 42323326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 74 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 50458928 - 50458653
Alignment:
Q  74 aattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggt 173  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||  |   |||||   ||||||||||||| || |||||||||| || | ||||||    
T  50458928 aattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtgggacacggtcgatataagtgtccaacgctcgacgaggggagagtatcgtttaattgggt 50458829  T
Q  174 ggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagat 270  Q
    |||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||    
T  50458828 ggaatctacgaacgacgaaaacttgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatagatatgcgggtgacgttgttgagataaactgaagat 50458729  T
Q  271 atcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50458728 atcatcaaaagtttgattccgcctgaagatcgtcattaggtaccgaacgaatgcaccttccagctacaacaattgt 50458653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 72 - 308
Target Start/End: Original strand, 43477037 - 43477276
Alignment:
Q  72 tgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgg 171  Q
    |||||||||| | | |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||    
T  43477037 tgaattcaaccaagaagtcaaccccagagacacaaggagggtggaacacctttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgg 43477136  T
Q  172 gtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaag 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||| ||||    
T  43477137 gtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgatgagatcaaccgaag 43477236  T
Q  269 atatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 308  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  43477237 atatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcatta 43477276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 191 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 46346732 - 46346574
Alignment:
Q  191 aaaacgtgaagagcatgttttaggagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgat 287  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46346732 aaaacgtgacgagcatgttctgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgat 46346633  T
Q  288 tccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46346632 tccgccagaagattgtcattatgtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 46346574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 157 - 309
Target Start/End: Original strand, 50997453 - 50997608
Alignment:
Q  157 gtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgc 253  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| | || ||    
T  50997453 gtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagttgatcgatatgcgggtgaagttgc 50997552  T
Q  254 tgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50997553 ttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 50997608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 354
Target Start/End: Original strand, 14265330 - 14265666
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  14265330 agaggttgaaggttcggtaccttggtgtcatgttaagtggtcttaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggaaggt 14265429  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||||||||||| ||||| |  || || |||||||||||||| || |||||| ||||||||   |||||| || |||||||| |    
T  14265430 ggaatacgttcggtataaacatccaacgttcgacgatgggtgaatatcattcagttggatgaaattaaggaacgacg---acgtgacgaacatgttttgg 14265526  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    || |   ||||||| | |||||||||| || | |||||||  ||||||| |||| |||||||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  14265527 gaccacaacatgttaccgtggatcgatttgtgtgtaacgttactgagattaactaaagatattctccagagtttgattccgcctgaagatcgtgattagg 14265626  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctc 354  Q
    || |    || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  14265627 tagg----gattgcactttccaactacatcaattgtcttacctc 14265666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 24701965 - 24701862
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  24701965 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattatcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 24701866  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  24701865 tcca 24701862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 2268188 - 2268096
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2268188 attcaaaggtaagacaattgtcgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcg 2268096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 218 - 372
Target Start/End: Original strand, 18440874 - 18441023
Alignment:
Q  218 acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||     
T  18440874 acatgttccagtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggta--ga- 18440970  T
Q  318 tgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaa 372  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  18440971 -gaatgcaccttccaactacaacaattgtctta-ctctgaaattgggtaattcaa 18441023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 218 - 372
Target Start/End: Original strand, 19485948 - 19486097
Alignment:
Q  218 acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||     
T  19485948 acatgttccagtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggta--ga- 19486044  T
Q  318 tgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaa 372  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  19486045 -gaatgcaccttccaactacaacaattgtctta-ctctgaaattgggtaattcaa 19486097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Original strand, 44927989 - 44928081
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  44927989 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcagttcaaacttgttaatcg 44928081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Original strand, 47066212 - 47066316
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  47066212 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccgactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 47066311  T
Q  466 tccaa 470  Q
    |||||    
T  47066312 tccaa 47066316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 4003781 - 4003678
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  4003781 attcaaaggtaacacaattgttggagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 4003682  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  4003681 tcca 4003678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 11378670 - 11378567
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  11378670 attcaaaggcaagacaattgttggagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 11378571  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  11378570 tcca 11378567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 11379041 - 11378906
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11379041 agaggttgaaggtttgatgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattctaccaaggagtcaacaccggagacacaaggagggt 11378942  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaa 149  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||    
T  11378941 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaa 11378906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20376067 - 20375822
Alignment:
Q  126 gtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagc---acatg 222  Q
    |||||||| || || ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||   |||||    
T  20376067 gtataaacgtctaatgctcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaaagaacgacgataacgtgaggagtatgttttgagagcacaacatg 20375968  T
Q  223 ttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaat 322  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||  | |||  |||||||||||||| || ||||| |||||||| |    ||||    
T  20375967 ttcaagtagatcgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaatttaagataataacaactgtttgattccgccaaaatatcgtgattaggtagg----gaat 20375872  T
Q  323 gcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  20375871 gcaccttccaactacaaaaattgtctta-ctctgaaatgggttaattcaaa 20375822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 366 - 470
Target Start/End: Original strand, 42383576 - 42383681
Alignment:
Q  366 aattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa-tcgcagga 464  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  42383576 aattcaaagataagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcagga 42383675  T
Q  465 ctccaa 470  Q
    ||||||    
T  42383676 ctccaa 42383681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 25576284 - 25576192
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25576284 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggattgggcaattcaaacttgttaatcg 25576192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 44835180 - 44835076
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaat-cgcaggac 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  44835180 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctagatggggcaattcaaactcgttaatccgcaggac 44835081  T
Q  466 tccaa 470  Q
    |||||    
T  44835080 tccaa 44835076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 34050252 - 34050355
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  34050252 attcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 34050351  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  34050352 tcca 34050355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 43477564 - 43477667
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  43477564 attcaaaggtaagacaactgtggcagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 43477663  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  43477664 tcca 43477667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 49139748 - 49139645
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  49139748 attcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 49139649  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  49139648 tcca 49139645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 50997913 - 50998016
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  50997913 attcaaaggtaagacaattgttggagttggaatgcacattccaactgcagcaattgtcttactctagatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 50998012  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  50998013 tcca 50998016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 54390967 - 54391070
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  54390967 attcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 54391066  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  54391067 tcca 54391070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 34692983 - 34692879
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa-tcgcaggac 465  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  34692983 attcacaggtaagacaattgttggagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttcctctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggac 34692884  T
Q  466 tccaa 470  Q
    |||||    
T  34692883 tccaa 34692879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 3494723 - 3494620
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  3494723 attcaaaggtaacacaattgttgttgttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgctaatcggcaggac 3494624  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  3494623 tcca 3494620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 367 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 39416640 - 39416549
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc 458  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39416640 attcaaaggtaagataattgttgtagttggaatgcacatttcaactacaacaattgtcttgctctggatggggtaattcaaacttgttaatc 39416549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 46403528 - 46403631
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  46403528 attcaaaggtaacacaattgttgaggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 46403627  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  46403628 tcca 46403631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 126 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25887795 - 25887547
Alignment:
Q  126 gtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagc---acatg 222  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| || |||||||| |||||   |||||    
T  25887795 gtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatatcactcagttgggtggaattaacaaacgacgaggatgtgaggaccatgttttgggagcacaacatg 25887696  T
Q  223 ttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaat 322  Q
    |||  ||||||| ||||| | | ||||| | |||||||||||||||||||  || | ||||||||||||| |||| ||||| ||||  || | |  ||||    
T  25887695 ttctcgtggatc-atatgtgtggaacgttgttgagatcaactgaagatattctccacagtttgattccgctagaatatcgtgatta-ttaggtagggaat 25887598  T
Q  323 gcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  25887597 gcaccttccaactacaacaattgtcttacctatgaaatgggataattcaaa 25887547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Original strand, 36135532 - 36135624
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36135532 attcaaaggtaacacaattgttggagttggaatgcacatttcaactgcaacaattgtcttactctggatgaggcaattcaaacttgttaatcg 36135624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 46346872 - 46346745
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||     |||||||| |||||||    
T  46346872 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactggctgaattcaaccaaggagtcaa-----gagacacaaggagggt 46346778  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcga 146  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||    
T  46346777 ggaacacgttccgtataaacgtccaacgctcga 46346745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 2646570 - 2646467
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2646570 attcaaaggtaacacaattgttggggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttgccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 2646471  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  2646470 tcca 2646467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 49218429 - 49218337
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49218429 attcaaatgtaagataattgttggagttggaatgaacattccaagtgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcg 49218337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 42328413 - 42328288
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | | ||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  42328413 agaggttgaatgtttgatgccttggtgtaacgttaagaggtctaaaggatgaactgactgaattcagccaaggaatcaaccccagagacacaaggagggt 42328314  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaa 139  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||||    
T  42328313 ggaacacgttcggtataaacgtccaa 42328288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 20378184 - 20378093
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacaca 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20378184 agaggttgaaggttcggtgccttagtgtcacgttaagaggtctaaaggatcaactaaatgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacaca 20378093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Original strand, 15636946 - 15637118
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||    ||| |||| || || |||||| |||||||| ||||||||| ||||||  | | ||||||||||  ||||||| |||||||    
T  15636946 agaggttgaaggttcgacaccttcgtgtcacatttagaggtatcaaggatcaactgaatggattcaagaaagtagtcaaccccatagacacaaggagggt 15637045  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaac 186  Q
    |||| || ||  |||||||| |||||| |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15637046 ggaatacgttcggtataaacgtccaacactcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaac 15637118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 2429013 - 2429105
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2429013 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctgaatggggtaatttaaacttgttaa 2429105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 46346305 - 46346213
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46346305 attcaaaggtaagacaattgttggagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttgttaa 46346213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 403 - 469
Target Start/End: Original strand, 49610723 - 49610790
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggactcca 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49610723 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatgggacaattcaaacttgttaatcggcaggactcca 49610790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 41578431 - 41578523
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc---aactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||   ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41578431 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaaggtacaaacctcgaactgcaacaattgtgttcctctgaatggggtaattcaaacttgttaa 41578523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Original strand, 49273929 - 49274024
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  49273929 attcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggtacaaacatccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaatcg 49274024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 367 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 13895563 - 13895516
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgc 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13895563 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgc 13895516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 7246620 - 7246712
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    || ||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7246620 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtctaacagcaacaattgtcttccactgaatggggtaattcaaacttgttaa 7246712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 42323083 - 42322991
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  42323083 attcaaaggtaacacaattgttggagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctaaatggggtaattcaaacttgttaa 42322991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 45100168 - 45100076
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  45100168 attcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaa 45100076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 52569102 - 52569010
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  52569102 attcacaggtaagacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctgaatgaggtaattcaaacttgttaa 52569010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 403 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 51695591 - 51695524
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggactcca 469  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  51695591 cattccaactgcaataattgtcttactctcgatggggcaattcaaacttgttgatcggcaggactcca 51695524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 395 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 33449145 - 33449087
Alignment:
Q  395 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  33449145 ggaatgcaccttccaactacaacaattgttttcctctggatggggtaattcaaacttgt 33449087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 451
Target Start/End: Original strand, 44835119 - 44835197
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggt-aattcaaactt 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||    
T  44835119 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactt 44835197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 51012980 - 51012888
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  51012980 attcaaaggtaacacaattgttgtagttgggacgtacaaacgtccaagtgcaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaatttgttaa 51012888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Original strand, 25576223 - 25576276
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  25576223 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 25576276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 373
Target Start/End: Original strand, 37282039 - 37282114
Alignment:
Q  296 aagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  37282039 aagatcgttagtaggtacggaatgaatgcaccttccaactgcaacaattgtttt-cctttg-aatggggtaattcaaa 37282114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Original strand, 51015803 - 51015910
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcag 462  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| | | |||    |||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  51015803 attcaaaggtaacacaattgttggagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcatttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcag 51015902  T
Q  463 gactccaa 470  Q
    ||||||||    
T  51015903 gactccaa 51015910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 456
Target Start/End: Original strand, 37282062 - 37282122
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  37282062 gaatgcaccttccaactgcaacaattgttttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaa 37282122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 375 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 42383638 - 42383586
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  42383638 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtctta 42383586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 373
Target Start/End: Original strand, 15637155 - 15637270
Alignment:
Q  253 ctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacc 352  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||  ||  ||||||||| ||| |||| |||||     ||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  15637155 ctgagatcaactgaagatattatcaatattttgattttgctggaagatcgtaattcggtagggaatt----caccttccaactacaacaattgtctta-c 15637249  T
Q  353 tctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  15637250 tctgaaatgaggtaattcaaa 15637270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 44928050 - 44927971
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggt-aattcaaacttg 452  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  44928050 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttg 44927971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 371 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 10053075 - 10052987
Alignment:
Q  371 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| | |||    ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  10053075 aaaggtaacaaaattgttgtagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctttgaattgggtaattcaaacttgttaa 10052987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 34471769 - 34471677
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||    ||||| ||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||    
T  34471769 attcaaaggaaacacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtccaattgcaacaattgtcttcctttgaatggggtgattcaaacttgttaa 34471677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 406 - 456
Target Start/End: Original strand, 43570478 - 43570528
Alignment:
Q  406 tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  43570478 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaa 43570528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 371 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 55206573 - 55206485
Alignment:
Q  371 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  55206573 aaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtacaaacatccaactgcagcaattgtcttcctctgaatggggcaattcaaacttgttaa 55206485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 34646877 - 34646816
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggat-ggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  34646877 gaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttcctctaaatgggggtaattcaaacttgttaa 34646816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 377 - 452
Target Start/End: Original strand, 34692924 - 34693001
Alignment:
Q  377 aagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggt-aattcaaacttg 452  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  34692924 aagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactccaacaattgtcttacctgtgaatggggtcaattcaaacttg 34693001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 47066273 - 47066220
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  47066273 gtaagacaattgttgtagtcggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 47066220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 456
Target Start/End: Original strand, 6754432 - 6754492
Alignment:
Q  397 aatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctg-gatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6754432 aatgcaccttccaactacaacaactgtcttactctgaaatggggtaattcaaacttgttaa 6754492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 452
Target Start/End: Original strand, 8632996 - 8633076
Alignment:
Q  374 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggt-aattcaaacttg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||| ||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  8632996 ggtaagacaattgttgtagttggaagacaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttg 8633076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 456
Target Start/End: Original strand, 27187543 - 27187603
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  27187543 gaatgcacattgcaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaa 27187603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 42323378 - 42323322
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42323378 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttg 42323322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 426
Target Start/End: Original strand, 11378609 - 11378660
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctt 426  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  11378609 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactccaacaattgtctt 11378660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 452
Target Start/End: Original strand, 24701904 - 24701983
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggt-aattcaaacttg 452  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  24701904 gtaagataattgttgcagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttg 24701983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 408 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 36720986 - 36720923
Alignment:
Q  408 caactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggactccaa 470  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  36720986 caactgcaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaaacggcaggactccaa 36720923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Original strand, 44835440 - 44835475
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44835440 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 44835475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 2268479 - 2268429
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  2268479 cattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgt 2268429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 4004072 - 4004022
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  4004072 cattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgt 4004022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 14631971 - 14632063
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |    |||||   ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  14631971 attcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggtataaacgtccaaaaacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaa 14632063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 19452840 - 19452748
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    ||||  ||||||||||||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  19452840 attcaaaggtaagacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccatttgcaacaattgtcttcctctgaaagatgtaattcaaacttgttaa 19452748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 20375876 - 20375814
Alignment:
Q  395 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctg-gatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  20375876 ggaatgcaccttccaactacaaaaattgtcttactctgaaatgggttaattcaaacttgttaa 20375814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Original strand, 36135241 - 36135291
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  36135241 cattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgt 36135291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 46413972 - 46413922
Alignment:
Q  406 tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||    
T  46413972 tccaactgcaacaattgtcttcatttgaatggggtaattcaaacttgttaa 46413922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Original strand, 2268127 - 2268180
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  2268127 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactacgacaattgtcttac 2268180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Original strand, 4003720 - 4003773
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  4003720 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactccaacaattgtgttac 4003773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 367
Target Start/End: Original strand, 6464002 - 6464047
Alignment:
Q  322 tgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaa 367  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6464002 tgcaccttcaaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaa 6464047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8633058 - 8632997
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    |||||||| |||||||||||||||    
T  8633058 attcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggtgtcttccaactacaacaattgtcttac 8632997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 456
Target Start/End: Original strand, 18440971 - 18441032
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctg-gatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  18440971 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttactctgaaattgggtaattcaagcttgttaa 18441032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 456
Target Start/End: Original strand, 19486045 - 19486106
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctg-gatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  19486045 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttactctgaaattgggtaattcaagcttgttaa 19486106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 43477625 - 43477572
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  43477625 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactgccacagttgtcttac 43477572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 50997974 - 50997921
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  50997974 gtaagacaattgctgcagttggaatgtgcattccaactccaacaattgtcttac 50997921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 403 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 3495014 - 3494966
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaactt 451  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  3495014 cattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaactt 3494966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 6464336 - 6464276
Alignment:
Q  397 aatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctgga-tggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||| |||||||| |||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6464336 aatgcaccttccaactacaacaactctcttactctgaaatggggtaattcaaacttgttaa 6464276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 13895855 - 13895803
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtctta-ctctg-gatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  13895855 cattccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgt 13895803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 34647256 - 34647196
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  34647256 gaatgcaccttctagctgcaacaattgtcttcctctgaatgtggtaattcgaacttgttaa 34647196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 70
Target Start/End: Original strand, 43476966 - 43477021
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactga 70  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  43476966 agaggttgaaggttcagggccttggtgta-cgttaagaggtctcaaggatcaactga 43477021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Original strand, 49218688 - 49218724
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49218688 attcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgcac 49218724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 51013267 - 51013211
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  51013267 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 51013211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 24702257 - 24702206
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtctta-ctctg-gatggggtaattcaaacttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  24702257 cattccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttg 24702206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Original strand, 25576545 - 25576580
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25576545 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 25576580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 34693275 - 34693224
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtctta-ctctg-gatggggtaattcaaacttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  34693275 cattccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttg 34693224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 377 - 428
Target Start/End: Original strand, 39416581 - 39416632
Alignment:
Q  377 aagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||| ||||||    
T  39416581 aagacaattgttgtagttgaaatgtgcattccaactacaacaattatcttac 39416632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Original strand, 42949973 - 42950008
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42949973 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 42950008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 43477324 - 43477285
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacatt 406  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  43477324 attcaaaggtaagacagttgttgaagttggaatgcacatt 43477285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 47065953 - 47065918
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47065953 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 47065918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Original strand, 53826649 - 53826684
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53826649 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 53826684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Original strand, 3494661 - 3494715
Alignment:
Q  374 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  3494661 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaacaacaacaattgtgttac 3494715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 11378909 - 11378875
Alignment:
Q  339 acaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11378909 acaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 11378875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 395 - 456
Target Start/End: Original strand, 15637216 - 15637278
Alignment:
Q  395 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctg-gatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||    
T  15637216 ggaattcaccttccaactacaacaattgtcttactctgaaatgaggtaattcaaacttattaa 15637278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 34050314 - 34050260
Alignment:
Q  374 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  34050314 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 34050260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 396 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 36721378 - 36721324
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaact 450  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  36721378 gaatgcaccttccacctacaacaattgtgttcctctggatgaggtaattcaaact 36721324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 403
Target Start/End: Original strand, 39416906 - 39416936
Alignment:
Q  373 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39416906 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 39416936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 376 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 42382529 - 42382499
Alignment:
Q  376 taagacaattgttgtagttggaatgcacatt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42382529 taagacaattgttgtagttggaatgcacatt 42382499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 42383312 - 42383282
Alignment:
Q  373 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42383312 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 42383282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 46403590 - 46403536
Alignment:
Q  374 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  46403590 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaacctcaacaattgtgttac 46403536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 403
Target Start/End: Original strand, 48087510 - 48087540
Alignment:
Q  373 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48087510 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 48087540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Original strand, 49139686 - 49139740
Alignment:
Q  374 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  49139686 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 49139740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 54391029 - 54390975
Alignment:
Q  374 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  54391029 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 54390975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 774332 - 774299
Alignment:
Q  395 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  774332 ggaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttac 774299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18441305 - 18441265
Alignment:
Q  322 tgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggg 363  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18441305 tgcaccttccaactacaacaattg-tttacctctgaaatggg 18441265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19486379 - 19486339
Alignment:
Q  322 tgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggg 363  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19486379 tgcaccttccaactacaacaattg-tttacctctgaaatggg 19486339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 408
Target Start/End: Original strand, 27187839 - 27187880
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 408  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27187839 attcagaggtaagacaattgttgtagttggaaggtacattcc 27187880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 34646900 - 34646824
Alignment:
Q  296 aagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||    
T  34646900 aagatcctcagtaggtgcagaatgaatgcaccttccaactgcaacaattgtctt-cctctaaatgggggtaattcaaa 34646824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 36135593 - 36135540
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  36135593 gtaagacaattgttgcagttgaaatgtgcattccaactccaacaattgtgttac 36135540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 453
Target Start/End: Original strand, 37281682 - 37281739
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||    
T  37281682 gaatgcaccttcaaactacaacaattgtgttcctatggatgaggtaattcaaacttgt 37281739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Original strand, 49218368 - 49218421
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||    
T  49218368 gtaagacaattgttgcacttggaatgttcattccaactccaacaattatcttac 49218421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Original strand, 2268447 - 2268482
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2268447 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 2268482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Original strand, 3494982 - 3495017
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3494982 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 3495017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Original strand, 4004040 - 4004075
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4004040 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 4004075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Original strand, 7954434 - 7954490
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  7954434 gaatgcaccttctaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttg 7954490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 224 - 308
Target Start/End: Original strand, 7954774 - 7954858
Alignment:
Q  224 tccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 308  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| ||| | ||| |||||||||||||| ||||    
T  7954774 tccagttgatcgatatacgtgtaactttgatgagatcaactaaagattttatcaacagtcttatttcgccagaagatcgtgatta 7954858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 36721081 - 36721053
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttg 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36721081 attcaaaggtaagacaattgttgtagttg 36721053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 46346601 - 46346545
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| || || || ||||||||||||||||    
T  46346601 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaattgggtaattcaaacttg 46346545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Original strand, 51015507 - 51015563
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||    
T  51015507 gaatgcaccttccagctacaacaattgtctttctttgaatggggtaattcgaacttg 51015563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 53826681 - 53826629
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtctta-ctctg-gatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  53826681 cattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgt 53826629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 127)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1400602 - 1400267
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1400602 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaatgatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggt 1400503  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  1400502 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 1400403  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||   |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1400402 gagcacatcatgttccagtggatccatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 1400303  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1400302 tacggagtgaatgcaccttccagctacaacaattgt 1400267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4724374 - 4724014
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||  ||    
T  4724374 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggaaaaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggaaagt 4724275  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  4724274 ggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgagcatgttttgg 4724175  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724174 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 4724075  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  4724074 taccaaatgaatgcaccttgcagctacaacaattgtctt-cctctg-aatggggtaattcaaa 4724014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 18308167 - 18308527
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18308167 agaggttgaaggttcagtgccttggtgtaacgttaagaagtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 18308266  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  18308267 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgg 18308366  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  18308367 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccagtagattgacattagg 18308466  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  18308467 tatggaatgaatgcaccttccacctacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 18308527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 35565179 - 35565538
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  35565179 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggacgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacataaggagggt 35565278  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |    
T  35565279 ggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatg-aaacgtgacgagcatgttttgg 35565377  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35565378 gagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcagaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 35565477  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||| || ||||||||||||||||    
T  35565478 tgcggaatgaatgcacctttcagctacaacaattatctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 35565538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 1971272 - 1971631
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1971272 agaggttgaaggtttgatgccttggtataacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggt 1971371  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  1971372 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttcggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 1971471  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||     
T  1971472 gagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaaaatcatcattagt 1971571  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1971572 tatggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttgcctctgaaatggggtaattcaaa 1971631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6793682 - 6793350
Alignment:
Q  18 gttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaa 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  6793682 gttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggaggatggaa 6793583  T
Q  118 cacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagc 217  Q
    ||||||  ||||||||  | |||||||||| ||  | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  6793582 cacattcggtataaacgcctaacgctcgacgaggagtgagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagc 6793483  T
Q  218 ---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacg 314  Q
       |||||||| |||| |||||||||||| | | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  6793482 acaacatgttctagtgaatcgatatgcggatgaggttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattcagccagaagatcgtcattaggtact 6793383  T
Q  315 gaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6793382 gaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtt 6793350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 3601248 - 3601607
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3601248 agaggttcaaggtttggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaagatgaactgactgaattcaatcaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 3601347  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
     ||||| |||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  3601348 agaacatattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttaa 3601447  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  3601448 gagcacaacatgttccagtgtttcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgtcagaagatcgtcattagt 3601547  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||  || | || |  | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3601548 ta--gagt-aaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 3601607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 7529 - 7231
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  7529 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagagatctcaaggatgaactgactgaattgaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 7430  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  7429 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 7330  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7329 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 7231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 8537861 - 8538159
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  8537861 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 8537960  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  8537961 ggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgg 8538060  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8538061 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 8538159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 36350605 - 36350278
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  36350605 agaggttgaaggtttggtgccttggtgtaacgttaagaggtgtccaggatgaactgactgaattcaaccaaagagtcaaccccagagacacaaggagggt 36350506  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||      |    
T  36350505 ggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtgacgagcat------g 36350412  T
Q  214 gagcacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtac 313  Q
     |  |||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36350411 cacaacatgttccagtggatcgatatgtaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcgtcattaggtac 36350312  T
Q  314 ggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtt 347  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36350311 cgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtt 36350278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 11346616 - 11346914
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  11346616 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 11346715  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11346716 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgaaattaatgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 11346815  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||| || | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11346816 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 11346914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19036974 - 19036676
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  19036974 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaacaaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 19036875  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  19036874 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 19036775  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19036774 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 19036676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 28880898 - 28881196
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  28880898 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 28880997  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| |||||  ||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  28880998 ggaaaacatttggtacaaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 28881097  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28881098 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 28881196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 312
Target Start/End: Original strand, 33370561 - 33370862
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  33370561 agaggttgaatgttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaatttaactagggactcaaccccggagacacaaggagggt 33370660  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||   ||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  33370661 ggaatacgttcgatataaacgttcaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 33370760  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  33370761 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccagaagatcatgattagg 33370860  T
Q  311 ta 312  Q
    ||    
T  33370861 ta 33370862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 541935 - 541637
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  541935 agaggttgaaggttcgatgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 541836  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  541835 ggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgggacgagcatgttttgg 541736  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  541735 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactggagatatcatcaacaacttgatttcgccagaagatcgtcattag 541637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 19400270 - 19400629
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  19400270 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttgagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 19400369  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||| ||||||||||||  || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  19400370 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtgtcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgg 19400469  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||     
T  19400470 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttggtgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaatatcgtcattagt 19400569  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19400570 tagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 19400629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8576441 - 8576143
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  8576441 agaggttgaaggttcggtgctttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 8576342  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |    
T  8576341 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtgacgaccatgttttgg 8576242  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||   ||||||||| |||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8576241 gagcacaacatgttccggtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcattag 8576143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 11027684 - 11027982
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||| |||    
T  11027684 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggatggt 11027783  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |    
T  11027784 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtcacgaccatgttttgg 11027883  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11027884 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcgaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 11027982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27661677 - 27661379
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  27661677 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 27661578  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||  ||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  27661577 ggaacacgtttagtataaacttccattgctcgacgaggggagagtatcatttacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 27661478  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27661477 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcattag 27661379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 38854065 - 38854363
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||| |||    
T  38854065 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggatggt 38854164  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |    
T  38854165 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtcacgaccatgttttgg 38854264  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38854265 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagaccgtcattag 38854363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 30709505 - 30709803
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||| ||| ||| |||    
T  30709505 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagatacaaggatggt 30709604  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |    
T  30709605 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 30709704  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30709705 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccggaagatcgtcattag 30709803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 309
Target Start/End: Original strand, 40009437 - 40009733
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||  ||||| || |||||||||    
T  40009437 aggttgaaggttcggtgtcttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaaatgaatgaattcaaccaaggagtcaaccctagagacgcaaggagggtgg 40009536  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    || || ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  40009537 aatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 40009636  T
Q  216 gc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||    
T  40009637 gcacaacatgttacagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaactgaagacatcatcaacagcttgattccacaagaagatcgtcattag 40009733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 35927737 - 35927470
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||   |||||    
T  35927737 agaggttgaaatttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaaccaaggagtcaacctcggagacacaattagggt 35927638  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    | ||||| ||   ||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  35927637 gtaacacgttcgttataaacgtccaatgctcgacgagggaagagtatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgg 35927538  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaa 278  Q
    |||||   ||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  35927537 gagcacatcatctttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaa 35927470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 17367034 - 17366738
Alignment:
Q  15 gaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17367034 gaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattctaccaaggagtcaaccccgtagacacaaggagggtg 17366935  T
Q  115 gaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagg 214  Q
    ||| |  ||   ||||||| |||||| |||||  || | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||| ||    
T  17366934 gaata-gttcgatataaacgtccaaccctcgatgagggaagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacaaacatgttttggg 17366836  T
Q  215 agc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||   |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||||    
T  17366835 agcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtaccgttgttgagatcaactaaagatattatcaagagtctgattctgccagaatatcgtgattag 17366738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 177 - 373
Target Start/End: Original strand, 1694859 - 1695056
Alignment:
Q  177 attaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatc 273  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||| || |||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  1694859 attaacgaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgtttcactggaacgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatc 1694958  T
Q  274 atcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||    
T  1694959 atcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctctg-aattgggtaattcaaa 1695056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 56 - 267
Target Start/End: Original strand, 3169553 - 3169766
Alignment:
Q  56 tcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggag 155  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||  |||||||| || |||||||||| || ||||    
T  3169553 tcaaggatgaactcactgaactcaaccaaggagtcaaccccagagacataaagagggtggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcgacgag-ggag 3169651  T
Q  156 agtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcg 252  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  3169652 agtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatattttaagagcacaacatgttccagtggatcggtatgcgggtgacgttg 3169751  T
Q  253 ctgagatcaactgaa 267  Q
    ||||||||| |||||    
T  3169752 ctgagatcagctgaa 3169766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 2599126 - 2599387
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2599126 agaggttaaaggtttggtaccttggtgtcaccttaagagatctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggt 2599225  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||| ||||||  ||||| |   |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||   || ||||||||||||||| |    
T  2599226 ggaatacgttcggtataaacgtccaacattcgacgatgagagaatatcattcagttgggtggaattagcgaacaacggcgacatgaagagcatgttttgg 2599325  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatat 272  Q
    ||||   ||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  2599326 gagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagattaactgatgatat 2599387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 211
Target Start/End: Original strand, 3458743 - 3458940
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| || |||||||    
T  3458743 agaggttgaaggttcggcgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacgcaaggagggt 3458842  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgtttt 211  Q
    |||| || ||  |||||||  ||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  3458843 ggaatacgttcggtataaatgtccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggttgagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagtatgtttt 3458940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 368 - 470
Target Start/End: Original strand, 8538464 - 8538567
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggact 466  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  8538464 ttcaaaggtaagacaattgttggagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggact 8538563  T
Q  467 ccaa 470  Q
    ||||    
T  8538564 ccaa 8538567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Original strand, 3459302 - 3459406
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg-caggac 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  3459302 attcaaaggtaagacaattgttgtagttagaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcgacaggac 3459401  T
Q  466 tccaa 470  Q
    |||||    
T  3459402 tccaa 3459406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Original strand, 19400875 - 19400967
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19400875 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcg 19400967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 8575838 - 8575735
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  8575838 attcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 8575739  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  8575738 tcca 8575735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Original strand, 1971877 - 1971969
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1971877 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcatactctggatggggcaattcaaacttgttaatcg 1971969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Original strand, 40012128 - 40012232
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa-tcgcaggac 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  40012128 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactttggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggac 40012227  T
Q  466 tccaa 470  Q
    |||||    
T  40012228 tccaa 40012232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 6926 - 6823
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  6926 attcaaaggtaacacaattgttgcagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactttggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 6827  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  6826 tcca 6823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 219 - 373
Target Start/End: Original strand, 7082336 - 7082487
Alignment:
Q  219 catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || || |     
T  7082336 catgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagttatggtaa 7082435  T
Q  319 gaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |  ||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  7082436 g-gtgca--ttccaactacaacaattctcttacctctgaaaaggggtaattcaaa 7082487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Original strand, 12742624 - 12742799
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12742624 aggttgaaggttcggcaccttggtgtcacgttaagaggtatcaaggatcaactaaatgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaagaagggtgg 12742723  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacga 191  Q
    || || ||  |||||||| |||||||||| || |   || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12742724 aatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgatgagataatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacga 12742799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 367 - 467
Target Start/End: Original strand, 3601853 - 3601954
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  3601853 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttactctagatgggacaattcaaacttgttaatcggcaggac 3601952  T
Q  466 tc 467  Q
    ||    
T  3601953 tc 3601954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 150
Target Start/End: Original strand, 7082199 - 7082335
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7082199 agaggttgaaagttcggtgccttggcttaacgttaagaggtctaaaggatgaactcactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 7082298  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaag 150  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  7082299 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaag 7082335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 196
Target Start/End: Original strand, 12805442 - 12805622
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12805442 aggttgaaggttcggcaccttggtgtcacgttaagaggtatcaaggatcaactaaatgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaagaagggtgg 12805541  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 196  Q
    || || ||  |||||||| |||||||||| |  |   || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12805542 aatacgttcggtataaacgtccaacgctcaatgatgagataatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacgataacg 12805622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 27661074 - 27660971
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  27661074 attcaaaggtaacacaattgttgcggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 27660975  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  27660974 tcca 27660971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 30710107 - 30710210
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  30710107 attcaaaggtaacataattgttggagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgctaatcggcaggac 30710206  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  30710207 tcca 30710210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 367 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 19036371 - 19036286
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19036371 attcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttg 19036286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 367 - 452
Target Start/End: Original strand, 22284080 - 22284165
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22284080 attcaaaggtaacacaattgttgtggttgaaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 22284165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 38854666 - 38854770
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactc-tggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcagga 464  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  38854666 attcaaaggtaacacaattgttgcggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttacccttggatggggcaattcaaacttgttaatcggcagga 38854765  T
Q  465 ctcca 469  Q
    |||||    
T  38854766 ctcca 38854770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 371 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 41202524 - 41202424
Alignment:
Q  371 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggactcca 469  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41202524 aaaggtaagataattgttgtagttggaatgcatattccaactgcaacaattgttttattttggatagggtaattcaaacttgttaatcggcaggactcca 41202425  T
Q  470 a 470  Q
    |    
T  41202424 a 41202424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 372 - 469
Target Start/End: Original strand, 28881505 - 28881603
Alignment:
Q  372 aaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggactcca 469  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  28881505 aaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgccaatcggcaggactcca 28881603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 367 - 436
Target Start/End: Original strand, 3170045 - 3170114
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatg 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3170045 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacatttcaactgcaacaattgtcttactctggatg 3170114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Original strand, 1691152 - 1691252
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |  ||||||| |||||||    
T  1691152 agaggttgaaggttcagtgccttggtgtaaagttaagaagtttcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaacctcatagacacaaggagggt 1691251  T
Q  114 g 114  Q
    |    
T  1691252 g 1691252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 254 - 373
Target Start/End: Original strand, 3458940 - 3459056
Alignment:
Q  254 tgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacct 353  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| || || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3458940 tgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattccgctagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacct 3459036  T
Q  354 ctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  3459037 ctgaaatgaggtaattcaaa 3459056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 247 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 17195423 - 17195314
Alignment:
Q  247 acgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |    ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17195423 acgttgctgagatcaactaaagatattatcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcatcttccaactacaacaattgt 17195328  T
Q  347 tttacctctgaaat 360  Q
     |||||| ||||||    
T  17195327 cttacctttgaaat 17195314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 255 - 360
Target Start/End: Original strand, 18920885 - 18920986
Alignment:
Q  255 gagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctc 354  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |     
T  18920885 gagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacttg 18920980  T
Q  355 tgaaat 360  Q
    ||||||    
T  18920981 tgaaat 18920986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 403 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 541623 - 541556
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggactcca 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  541623 cattccaactgcaacaattgtcttactatggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactcca 541556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15798361 - 15798194
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaacatccaacgc 142  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||  |||| ||   ||||||     
T  15798361 acgttaaaaggtctcaaggatcaactgaatgaaatcaactaaggactcaaccccggagacacaaggagagtgaaatacatttggtatgaatgcccaacgt 15798262  T
Q  143 tcgacaagtgg-agagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgtt 209  Q
    | ||| || || ||| || ||||||||||| | |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||    
T  15798261 tggacgaggggcagaataacattcagttggctagaattaacgaacgatgacgacgtgaggagcatgtt 15798194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 33371140 - 33371229
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| || |  ||  |||||||||||||||||||    
T  33371140 attcaaaggtaagataattgttgtagttggaatgcacctttcaactacaacaattgtcttcctttaaattaggtaattcaaacttgttaa 33371229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 12742820 - 12742880
Alignment:
Q  252 gctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12742820 gctgagatcaactgaagatatcatcaacagtctgattccgccagaagatcgtgattaggta 12742880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 1695301 - 1695393
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||    
T  1695301 attcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctaaattgggtaattcaaacttgttaa 1695393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 68
Target Start/End: Original strand, 25498301 - 25498355
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaact 68  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25498301 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatgaact 25498355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 185
Target Start/End: Original strand, 1693382 - 1693459
Alignment:
Q  108 gagggtggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaa 185  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1693382 gagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtatcactcacttgggtggaattaacgaa 1693459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12067862 - 12067697
Alignment:
Q  44 cgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaacatccaacgct 143  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||| || ||||| || |    
T  12067862 cgttaaaaggtctcaaagatcaactgaatgaaatcaaccaaggactgaaccccggagacacaaggagagtggaatacatttggtatgaatatccatcgtt 12067763  T
Q  144 cgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgtt 209  Q
    |||| || ||||| || | |||||| ||  ||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||    
T  12067762 cgacgaggggagaataacgttcagtcggtcggagttaacgaacgacgacgatgtgaggagcatgtt 12067697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 396 - 456
Target Start/End: Original strand, 1171730 - 1171790
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  1171730 gaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaa 1171790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 247 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 36312009 - 36311900
Alignment:
Q  247 acgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    |||| |||||||||  |||||||| |  |||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    ||||||||| |||||||||||||    
T  36312009 acgttgctgagatcgcctgaagatcttctcaatagtttaattctgccagaagatcgtgattaggtagggaatg----caccttccaactacaacaattgt 36311914  T
Q  347 tttacctctgaaat 360  Q
     |||||||||||||    
T  36311913 cttacctctgaaat 36311900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 40012189 - 40012110
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggt-aattcaaacttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  40012189 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttg 40012110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 1400001 - 1399909
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1400001 attcaaagttaacacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattttcttcctctgaatggggtaattcaaacttgttaa 1399909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 6793172 - 6793080
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    ||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||||||||||||    
T  6793172 attcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgagataattcaaacttgttaa 6793080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 11347218 - 11347310
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11347218 attcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaaaaattgtcttcctctgaatggggcaattcaaacttgttaa 11347310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 18308770 - 18308862
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac---attccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   | || |||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  18308770 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaaggtacaaaagtctaactacaacaattgtcttcctcagaatgaggtaattcaaacttgttaa 18308862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19400936 - 19400883
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  19400936 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 19400883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 12805638 - 12805698
Alignment:
Q  252 gctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  12805638 gctgagatcaactgaagatatcatcaacagtctgattatgccagaagatcgtgattaggta 12805698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 25360864 - 25360784
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacatt 123  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  25360864 acgttaaaaggtctcaaggatcaactggatgaaatcaaccaaggactcaaccccgaagacacaaggagggtggaatacatt 25360784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 1971934 - 1971859
Alignment:
Q  379 gacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggt-aattcaaacttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  1971934 gacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttg 1971859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 469
Target Start/End: Original strand, 11027996 - 11028063
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa-tcgcaggactcca 469  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  11027996 cattccaaccacaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactcca 11028063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 4723770 - 4723678
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  | | |||    ||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  4723770 attcaaaggtaacacaattgttgtagttgcgaggtacaaacgtccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaa 4723678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 469
Target Start/End: Original strand, 7082815 - 7082889
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggactcca 469  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || | | ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  7082815 gaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttcctttgaacgtggtaattcaaacttgttaaacggcaggactcca 7082889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 20196589 - 20196681
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||| | |||    || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20196589 attcaaaggtaagacggtttttgtagttggaaggtacaaacgtctaactgcaacaattgtctttctctgaatggggtaattcaaatttgttaa 20196681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 406 - 456
Target Start/End: Original strand, 25498635 - 25498685
Alignment:
Q  406 tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  25498635 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaa 25498685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 34683621 - 34683529
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattc---caactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| | | |||  |   ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  34683621 attcaaaggtaacacaattggtgtagttgggaggtacaaacgttcaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaa 34683529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 35565782 - 35565874
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| | | |    ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  35565782 attcaaaggtaacacaattattgtagttggaaggtataaacgtccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaa 35565874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Original strand, 6865 - 6918
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6865 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactgcaacaattgtgttac 6918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 3459363 - 3459310
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||    
T  3459363 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattctaactacaacaattgtcttac 3459310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8538524 - 8538471
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  8538524 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactccaacaattgtcttac 8538471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13131134 - 13131035
Alignment:
Q  255 gagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctc 354  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | |||||||  || |||||||||| ||||| ||  ||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  13131134 gagatcaactgaagatattctcaacattttgattttgctagaagatcgtgattagcta--ga--gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctc 13131039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Original strand, 40011838 - 40011883
Alignment:
Q  328 ttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40011838 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 40011883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 309
Target Start/End: Original strand, 22283704 - 22283776
Alignment:
Q  237 tatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||||||| | || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||    
T  22283704 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccaccataaaatcgtccttag 22283776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 405 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 1972147 - 1972080
Alignment:
Q  405 ttccaactgcaacaattgtcttactctggatgggg-taattcaaacttgttaatc-gcaggactccaa 470  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  1972147 ttccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaa 1972080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 3170106 - 3170027
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggt-aattcaaacttg 452  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  3170106 gtaagacaattgttgcagttgaaatgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttg 3170027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 397 - 456
Target Start/End: Original strand, 10398006 - 10398065
Alignment:
Q  397 aatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||| |||||||| ||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10398006 aatgcaccttccaactacacaaattgtcttcctttggatggggtaattcaaacttgttaa 10398065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 346
Target Start/End: Original strand, 7082792 - 7082842
Alignment:
Q  296 aagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7082792 aagatcgtcagtaggtacagaatgaatgcaccttccaactgcaacaattgt 7082842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 8576129 - 8576079
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  8576129 cattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgt 8576079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 456
Target Start/End: Original strand, 12805717 - 12805779
Alignment:
Q  395 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  12805717 ggaatgcatcttccaactgcaacaattgtcttactacgaaatggggtaattcaaacttgttaa 12805779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 209
Target Start/End: Original strand, 19747995 - 19748161
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaacatccaacgc 142  Q
    ||||||| ||||||||||| | || || ||||| ||||| | ||| ||||||||  ||||||| | ||||||||| |||||   ||| ||| |||||||     
T  19747995 acgttaaaaggtctcaaggctcaattgcatgaaatcaaccaaggactcaaccccaaagacacaagaagggtggaatacatttgatatgaacgtccaacgt 19748094  T
Q  143 tcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgtt 209  Q
    | |||||  ||||| || | ||||||  | | |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  19748095 tggacaacgggagaataacgttcagtcagctagaattaacgaacgacgacgacgtgaagaacatgtt 19748161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Original strand, 22283790 - 22283840
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  22283790 cattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgt 22283840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25360642 - 25360542
Alignment:
Q  252 gctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttac 351  Q
    |||||||||  |||||||| |  |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  25360642 gctgagatcgcctgaagatgttttcaacagtttgattccgtcagaagatcgtgattaggta--ga--gaatgcacctttcaactacaacaattgtcttac 25360547  T
Q  352 ctctg 356  Q
     ||||    
T  25360546 atctg 25360542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Original strand, 27661012 - 27661066
Alignment:
Q  374 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27661012 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccgcaacaattgtgttac 27661066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 27661365 - 27661315
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  27661365 cattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgt 27661315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Original strand, 28881210 - 28881260
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  28881210 cattccaactacaacaattgtctttctttgaatggggtaattcaaacttgt 28881260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 38854728 - 38854674
Alignment:
Q  374 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38854728 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccgcaacaattgtgttac 38854674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 3601914 - 3601861
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  3601914 gtaagacaattgttgcagttggaaggtgcattccaactacaacaattgtcttac 3601861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 36312225 - 36312128
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaacatccaac 140  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||  ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||    
T  36312225 acgttaaaatgtctcaaggatcaacttgatgaaatcaaccaaggactcaaccccggagacacgaggagggtggaatacatttggtatgaacgtccaac 36312128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 4724066 - 4724010
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4724066 gaatgcaccttgcagctacaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttg 4724010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12806389 - 12806337
Alignment:
Q  322 tgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggt-aattcaaa 373  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12806389 tgcaccttcaaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtgaattcaaa 12806337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Original strand, 18308475 - 18308531
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  18308475 gaatgcaccttccacctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 18308531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 451
Target Start/End: Original strand, 1695004 - 1695059
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaactt 451  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  1695004 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctctgaattgggtaattcaaactt 1695059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 373
Target Start/End: Original strand, 3169766 - 3169801
Alignment:
Q  338 aacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3169766 aacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 3169801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 3459041 - 3459006
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3459041 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 3459006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 3601592 - 3601557
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3601592 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 3601557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 19400614 - 19400579
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19400614 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 19400579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 30710169 - 30710122
Alignment:
Q  374 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaatt 421  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  30710169 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactccaacaatt 30710122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 40011868 - 40011833
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40011868 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 40011833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 7217 - 7167
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||    
T  7217 cattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaatttgt 7167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 395 - 456
Target Start/End: Original strand, 12742899 - 12742961
Alignment:
Q  395 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  12742899 ggaatgcatcttccaactacaacaattgtcttactacgaaatggggtaattcaaacttgttaa 12742961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 368 - 398
Target Start/End: Original strand, 17195316 - 17195346
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17195316 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 17195346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Original strand, 19036309 - 19036363
Alignment:
Q  374 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  19036309 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 19036363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 28881562 - 28881508
Alignment:
Q  374 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  28881562 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 28881508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Original strand, 8575777 - 8575830
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  8575777 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 8575830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12743235 - 12743190
Alignment:
Q  322 tgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaa 367  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12743235 tgcaccttcaaactacaacaattgtcttacctctgaaatgtggtaa 12743190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12806053 - 12806008
Alignment:
Q  322 tgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaa 367  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12806053 tgcaccttcaaactacaacaattgtcttacctctgaaatgtggtaa 12806008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Original strand, 7185 - 7220
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7185 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 7220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 1400294 - 1400238
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||    
T  1400294 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttccttttaatggggtaattcaaacttg 1400238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 8538205 - 8538170
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8538205 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 8538170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Original strand, 8576097 - 8576132
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8576097 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 8576132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 11346960 - 11346925
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11346960 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 11346925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12743568 - 12743528
Alignment:
Q  322 tgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatgg 362  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12743568 tgcaccttcaaactacaacaattgtcttacctctgaaatgg 12743528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22283822 - 22283787
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22283822 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 22283787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Original strand, 27661333 - 27661368
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27661333 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 27661368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 30709849 - 30709814
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30709849 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 30709814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Original strand, 40011836 - 40011888
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtctta-ctctg-gatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  40011836 cattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgt 40011888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 166)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24270661 - 24270301
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24270661 agaggttggaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 24270562  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24270561 ggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttag 24270462  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24270461 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcatcaatagg 24270362  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  24270361 taccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctctg-aatggggtaattcaaa 24270301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14174056 - 14173696
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14174056 agaggttgaaggttcggtgctttggtgtaacgttaagagatctcaaggatgaactgacttaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 14173957  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgtttt-- 211  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  14173956 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 14173857  T
Q  212 -aggagcacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14173856 gaggacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 14173757  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  14173756 tacggtatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 14173696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 38046732 - 38046372
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  38046732 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 38046633  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  38046632 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacaagcatgttttgg 38046533  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38046532 gagcacaacatgttccagtcgatcaatatgccggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcgtcattagg 38046433  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  38046432 tacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 38046372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 13972833 - 13973192
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||    
T  13972833 agaggttgaaggttcggcgccttggtgtaactttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaacaagg-agtcaaccccagagacgcaaggagggt 13972931  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || || ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13972932 ggaatacgttcagtataaacgtccaacactcgactaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 13973031  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   |||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13973032 gagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtgacattgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccataagatcgtcattagg 13973131  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  13973132 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 13973192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Original strand, 6435680 - 6436015
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6435680 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacattaagagttctcaaggttgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 6435779  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  6435780 ggaaaacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcaagttttgg 6435879  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||| | || |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6435880 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgagtgacgttgttgagatcaagtgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 6435979  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6435980 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 6436015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Original strand, 23342549 - 23342884
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||| |||    
T  23342549 agagattgaaggttcggtgccttggtgtaacattaagaggtctcagggatgaactgattgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggaaggt 23342648  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    | ||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  23342649 gaaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgtttttg 23342748  T
Q  214 gagcac---atgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23342749 gagcacattatgttcgagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattcctccagaagatcgtcattagg 23342848  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23342849 taccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 23342884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 35587227 - 35586869
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  35587227 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaaaattaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 35587128  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |    
T  35587127 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgg 35587028  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35587027 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaccttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta-g 35586929  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  35586928 tacggaatgaatgcacctttcaactacaacagttgttt--cctttg-aatggggtaattcaaa 35586869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 36909469 - 36909829
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| | |||||||||||  |||||| | |||||||    
T  36909469 agaggttgaaggttcggtgccttagtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactcaattcaaccaaggagtcaaccctagagacataaggagggt 36909568  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  || ||||| ||||||||||||| || | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  36909569 ggaatacgttcggtgtaaacgtccaacgctcgacgagggaagagcatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 36909668  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36909669 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 36909768  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  36909769 tacagaatgaatgcaccttccagctacaacagttgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 36909829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 49396614 - 49396972
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||  ||||| | |||||||||    
T  49396614 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaacgagtcaaccccatagacataaggagggtgg 49396713  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    ||||| ||  |||||||| ||||||| |  || || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  49396714 aacacgttcggtataaacgtccaacgatttacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 49396813  T
Q  216 gc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 312  Q
    ||   |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49396814 gcacaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcaacaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 49396913  T
Q  313 cggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  49396914 tggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 49396972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Original strand, 35184878 - 35185214
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  ||||||| |||||||    
T  35184878 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtatcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcagccccaaagacacaaggagggt 35184977  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgtttt-a 212  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||      
T  35184978 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttgatggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgg 35185077  T
Q  213 ggagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35185078 ggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgaaatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 35185177  T
Q  310 gtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35185178 gtgcggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 35185214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12791572 - 12791212
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtctt-ggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggaggg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| | ||||    
T  12791572 agaggttgaaggttcggtgcctttggtgtaacattaagaggtctcaaggatgagctgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaagtaggg 12791473  T
Q  113 tggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgtttta 212  Q
    |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  12791472 tggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcattttttt 12791373  T
Q  213 ggagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12791372 ggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgtttttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 12791273  T
Q  310 gtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
     || |||   || |  | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12791272 tta-gga--taaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 12791212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 42572074 - 42571715
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||| | |||||||| |||||||    
T  42572074 agaggttgaaggttcgatgccttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaactcaaccaaggagtcaacctcagagacacaaggagggt 42571975  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42571974 ggaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgg 42571875  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||      
T  42571874 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattact 42571775  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42571774 taaggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 42571715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 41780601 - 41780961
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| | |||||    
T  41780601 agaggttgaaggtttggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaagaagggt 41780700  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||| |    
T  41780701 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggataatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaatatattttgg 41780800  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||   ||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  41780801 gagcacagcatgttccagtagatagatatgcaggtgacgttgctaagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgatttcgccagaagttcgtcattagg 41780900  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  41780901 tacggaatgaatgcaccttgcagctacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 41780961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 17686645 - 17686324
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||    |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  17686645 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaac----------caa----ggagtcaaccccagagacacaaggagggt 17686560  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
     |||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  17686559 agaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaatgacgaaaacgtgaagagcatgttttgg 17686460  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17686459 gagcacaacatcttccagtggatcgatatgcgggtgacgtagctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 17686360  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17686359 tatcgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 17686324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Original strand, 5765114 - 5765445
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  5765114 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccggagatacaaggagggt 5765213  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||| ||||||||||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |    
T  5765214 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatggaagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacaaaaacttgatgagcatgttttgg 5765313  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5765314 gagcagaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaaatgaagatattatcaaccgtctgattccgccagaagatcgtgattagg 5765413  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    || |    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5765414 tagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgt 5765445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 332
Target Start/End: Original strand, 18169933 - 18170254
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||| | ||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  18169933 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtttaaaggatgaactcactgaattcaaccaaggagttaaccccagagacacaaggagggt 18170032  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18170033 ggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 18170132  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||   ||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18170133 gagcacatcatgttccagtagatcgatatgcgggtgacattgctgagctcaactgaagatatcatcaaaggtttgattccgccagaagatcgtcattagg 18170232  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttcca 332  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  18170233 taccgaatgcatgcaccttcca 18170254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 309
Target Start/End: Original strand, 51269712 - 51270008
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  51269712 aggttgaaggtttgatgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtgg 51269811  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    ||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  51269812 aacaccttctgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcagttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 51269911  T
Q  216 gca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  51269912 gcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgggatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 51270008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 29435881 - 29436179
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  29435881 agaggttgaatgttcggtgtcttggtgtaacattaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 29435980  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  29435981 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 29436080  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  29436081 gagtacagcatgttccagtggatcgatacgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattaagccagaagatcgtcattag 29436179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13635593 - 13635297
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||| |||||    
T  13635593 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaagataaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggatggtgg 13635494  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    ||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||    
T  13635493 aacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtcacgaccatgttttggga 13635394  T
Q  216 gc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13635393 gcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 13635297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 39224495 - 39224136
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  39224495 agaggttgaaagtttggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctaaaggatgaactcactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 39224396  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| || ||||||| || || |||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  39224395 ggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcaacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 39224296  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||     
T  39224295 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaatatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagt 39224196  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  39224195 tagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattctcttacctctgaaatggggtaattcaaa 39224136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 47488335 - 47487976
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||  || |||||||    
T  47488335 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaatcaaggagtcaaccccagagatgcaaggagggt 47488236  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  47488235 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 47488136  T
Q  214 gagcac---atgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||||   || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||     
T  47488135 gagcacaatattttctagttgatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatgtcatcaacagcttgatttcgccagaagatcgtcattagt 47488036  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47488035 tatggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 47487976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 19160225 - 19160523
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||| |||    
T  19160225 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacgaggatggt 19160324  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |    
T  19160325 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgcttgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgactatgttttgg 19160424  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    || ||   ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19160425 gaacacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcattag 19160523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 29762519 - 29762221
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||    
T  29762519 agaggttgaaggttcgatgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccctagagacacaaggagggt 29762420  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  29762419 ggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 29762320  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  29762319 gagcacaacatgttccagtggatcgatatacgggtgacgttgatgagatcaactgaaaatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcatcattag 29762221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 39857204 - 39856906
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||  ||||||||| | |||||    
T  39857204 agaggttgaaggttcaattccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaacaaaggagtcaaccaaggagacacaagaagggt 39857105  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||  ||  |||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  39857104 ggaacatgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcatccacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgatcatgttttgg 39857005  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39857004 gagcacgacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcattag 39856906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 49427296 - 49427593
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||| ||| ||| |||    
T  49427296 agaggttgaaagttcggtg-cttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagatacaaggatggt 49427394  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |  |||| ||  |||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  49427395 gttacacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggcggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 49427494  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49427495 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 49427593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 312
Target Start/End: Original strand, 18842347 - 18842648
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18842347 agaggttgaaggttcggtgctttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaaccaaatagtcaaccccggagacacaaggagggt 18842446  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||| ||||||||||||  || | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18842447 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgagggaagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 18842546  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||    
T  18842547 gagcacggcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattgtcaagagtctgatcccgccagaagatcgggattagg 18842646  T
Q  311 ta 312  Q
    ||    
T  18842647 ta 18842648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 13283614 - 13283969
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  13283614 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacattaagaggtctcaaggatgaactgaatgaatttaaccaaggagtcaaccc-ggagacacgaggagggt 13283712  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |    
T  13283713 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcatttagttgggtgaaattaacgaacgatgaaaacatgacgagcatgttttgg 13283812  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13283813 gagcgcagcatgttctagtggatcgatatgcaggtaacgttgctgagatcaactgaatatattatcaacagtctgattccgccagaagatcgtgattagg 13283912  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||  ||  |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  13283913 ta--ga--gaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 13283969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 37778000 - 37778347
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||  |||||||| |||||||    
T  37778000 agaggttgaaggttcggtgcattggtgtaacgctaagatgtctcaaggatgaactgactgaattcaatcaaggagtcaaccctagagacacaaggagggt 37778099  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||             |||| |||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  37778100 ggaa-------------aacaaccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaaaggacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 37778186  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||| |||   ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37778187 gagaacaacatgttccagttgatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 37778286  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||    
T  37778287 taccgaatgaatgcaccttccgcctacaacaatt-ttcttcctctg-aatggggtaattcaaa 37778347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 44337617 - 44337319
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  44337617 agaggttgaaggttcggtgccttggtataacgttaagaggtctcaaggatcaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 44337518  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  44337517 ggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattcacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 44337418  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    | ||   ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  44337417 gtgcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaatatgattccgccagaagatcgtcattag 44337319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 44597609 - 44597907
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||||| |||||||    
T  44597609 agaggttgaaagttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgactgaattcaaccaagaagtcaaccccagagacacaaggagggt 44597708  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  44597709 ggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgatgagtatgttttgg 44597808  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  44597809 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgtgggtgacgttgatgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccggaagatcgtcattag 44597907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 35526473 - 35526189
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35526473 aggttaaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaccgactgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 35526374  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    ||| | ||  |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||    
T  35526373 aacgcgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggagagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgtcgaaaacgagacgaccatgttttggga 35526274  T
Q  216 gcac---atgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaa 297  Q
    ||||   ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35526273 gcacagaatgttgcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaa 35526189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27486988 - 27486690
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27486988 agaggttgaaggttcagtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattaaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 27486889  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
     || ||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27486888 agatcaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttaattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 27486789  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||   |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27486788 gagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgcctgaagatcgtcattag 27486690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 49926665 - 49926318
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||            ||| |||||| | || ||||    
T  49926665 agaggttgaaggttcagtgccttggtgtgacgttaaaaggtcttaaggatgaactgactgaattcaac------------cccagagacagaagg-gggt 49926579  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  49926578 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtgtcattcacttgtgcggaattaacgaacgacgaaaacgtgaggagcatgttttgg 49926479  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49926478 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 49926379  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  49926378 tacggaatgaatgcaccttttagctacaaccattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 49926318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 309
Target Start/End: Original strand, 48215108 - 48215404
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||| |  ||||||| ||| |||||    
T  48215108 aggttgaaagttcggtgccttggtgtaacattaagaggtctcaaggctgaactgactgaattcaaccaaggagtcaacctcacagacacaaggatggtgg 48215207  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    ||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||    
T  48215208 aacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatatttttgga 48215307  T
Q  216 gca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48215308 gcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatagtcattag 48215404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Original strand, 17696954 - 17697285
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  || |||||| | |||||||    
T  17696954 agaggttgaaggttcggtgccttcatataacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaatgccagagacataaggagggt 17697053  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  17697054 ggaacacgtttggtataaacgtccaatgctcgacaagggtagggtatcattcacttgggtggagttaaagtacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 17697153  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17697154 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatattatcaagagtctgattccgccagaagatcgtgattagg 17697253  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    |    || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  17697254 t----aaggaatgcaccttccaactacaacagttgt 17697285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 72 - 373
Target Start/End: Original strand, 35576305 - 35576606
Alignment:
Q  72 tgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgg 171  Q
    |||||||||| |  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||||| ||||    
T  35576305 tgaattcaaccaaagagtcaaccctggagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagaatatcattcacttgg 35576404  T
Q  172 gtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaag 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  35576405 gtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccggtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaag 35576504  T
Q  269 atatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaat 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35576505 atatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgaggtaat 35576601  T
Q  369 tcaaa 373  Q
    |||||    
T  35576602 tcaaa 35576606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27035616 - 27035257
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27035616 agaggttgaaggttaggtgtcttgatgtaacattaagaggtctcaaggatcaattgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 27035517  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || |   |||||||| ||||||||||||| || | || |||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  27035516 ggaatacgtccggtataaacgtccaacgctcgacgagggaagggtatcattcacttgggtggagttaaagaatgacgaaaacgtgacgagtatgttttgg 27035417  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||| |   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||     
T  27035416 gagaacaccatattccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaacttaagatatcatcaacaacttgattccaccagaagatcgtcattagt 27035317  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || |||   || |  | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27035316 ta-gga--taaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 27035257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 50068557 - 50068198
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  50068557 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaatgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaacgagtcaaccccagagacgcaaggagggt 50068458  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| |  ||  |||| ||  |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||| |||| || |||||||| |    
T  50068457 ggaatatgttcggtatgaaggtccaacactcgacgagtggagagtatcattcacttgggtggatttaaagaacgacaaaaatgtgacgaacatgttttgg 50068358  T
Q  214 gagcacat---gttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||     
T  50068357 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcgtcaacagcttgattccgccagaagatcgtcattagt 50068258  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||  || | || |  | ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  50068257 ta--gagt-aaggtgcattccaactacaacaattgtcttagctctgaaatggggtaatgcaaa 50068198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Original strand, 17372635 - 17372967
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||  ||||||    
T  17372635 agaggctgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaatacaaccaaggagtcaaccccagagacgcaaagagggt 17372734  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    | || |  ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||| || || || |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  17372735 gaaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatataatccacttaggtggaattagcgaacgacgaaaatgtgaagaacatgttttgg 17372834  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   | ||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17372835 gagcacaccatattccagtggatcgatatacgtgtaacgttgatgagatcaactgaagatatcatcgaaagtttaatttcgccagaagatcgtcattagg 17372934  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    || |||   ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17372935 tatgga---aatgcaccttccaactacaacaattgt 17372967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 45689030 - 45689386
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||  ||||||| |||||||    
T  45689030 agaggttgaag-ttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaactcaaccaaagagtcaaccccaaagacacaaggagggt 45689128  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| |  ||  ||   ||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  45689129 ggaatatgtttggtt--aacgtccaacgctcgacggggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 45689226  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||     
T  45689227 gagcacaacatgttccagtggatggatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccataagatcgtcattagt 45689326  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  45689327 tagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaattggataattcaaa 45689386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 52 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21484903 - 21484640
Alignment:
Q  52 ggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagt 151  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||   ||  |||||||| ||||||||||||| ||     
T  21484903 ggtctaaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggagggtgaaacttgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagg 21484804  T
Q  152 ggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaac 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| || ||    
T  21484803 ggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgtttttggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgagtgac 21484704  T
Q  249 gtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21484703 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcaccagaagatcgtcattaggta 21484640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 48568702 - 48568343
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  48568702 agaggttgaaggtttggtgccttgatgtaacgttaagagatatcaagaatcaactgaatgaactcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggagggt 48568603  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||    ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||||||| |    
T  48568602 ggaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaatgatgaaaacgtgacgagcatgttttgg 48568503  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||     
T  48568502 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgatttcgccagaagattgtcattagt 48568403  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  48568402 tagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaattgggtaactcaaa 48568343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 41875181 - 41874823
Alignment:
Q  15 gaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtg 114  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  41875181 gaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggagggtg 41875082  T
Q  115 gaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagg 214  Q
    |||    ||  |||| ||| ||||| ||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  41875081 gaattagttcggtatcaacgtccaatgctcgaagaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaataacgacgaaaatgtgacgagcatgttttggg 41874982  T
Q  215 agc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggt 311  Q
    |||   |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |  |  ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  41874981 agcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaatgttgctgagatcaactaaagatatcattagcaacttgattccgccagaagatcgttattagtt 41874882  T
Q  312 acggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    | || | |  ||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41874881 agggtaag-gtgca--ttcaaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 41874823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 30310122 - 30309771
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||  ||||| | |||||||||    
T  30310122 aggttgaaagttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctaaaggatgaactcgctgaattcaaccaaggagtcaaccccatagacataaggagggtgg 30310023  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    ||||| ||  |||||||| |||||| ||||||  | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  30310022 aacacgttcggtataaacgtccaacactcgacggggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 30309923  T
Q  216 gcac---atgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 312  Q
    ||||   | ||| |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30309922 gcacaggacgtttcagtggatcgatatgcgggtgac------gagatcaactgaatatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcattagtta 30309829  T
Q  313 cggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
     || | |  ||||  ||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  30309828 gggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattatcttacctccgaaatggggtaattcaaa 30309771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 108 - 373
Target Start/End: Original strand, 3658475 - 3658740
Alignment:
Q  108 gagggtggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatg 207  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||    
T  3658475 gagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggagagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgaacgtg 3658574  T
Q  208 ttttaggagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtc 304  Q
    |||| ||||||||   ||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3658575 ttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcaagtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtc 3658674  T
Q  305 attaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||| || | |  ||||  ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3658675 attaggtagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 3658740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16532377 - 16532042
Alignment:
Q  25 gttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacatta 124  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||     
T  16532377 gttcggtgccttggtgtaacgttaagagatctcaaggatcaattaaatgaattcaaccaaggagtcaactccggagacacaaggaggatggaatacgttc 16532278  T
Q  125 agtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagca---cat 221  Q
      ||||||| | ||||||||||  ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||||||   |||    
T  16532277 gatataaacgtacaacgctcgatgaggagagaatatcattaagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgatgagcatattatgggagcagagcat 16532178  T
Q  222 gttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaa 321  Q
    | || | ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| |    |||    
T  16532177 gctctaatggattgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaatagtctgatttcgctagaagatcgtgattaggtatg----gaa 16532082  T
Q  322 tgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatgg 362  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16532081 tgcatcttccaactacaacaattgtcttacc-ctgaaatgg 16532042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 128 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 46180465 - 46180219
Alignment:
Q  128 ataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagt-tgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagcaca---tgt 223  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    
T  46180465 ataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactctgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgt 46180366  T
Q  224 tccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatg 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| || || | |  ||    
T  46180365 tccagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattctgccagaagatcgtcattagttagggtaag-gtg 46180267  T
Q  324 caccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46180266 ca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 46180219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 219 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40533376 - 40533224
Alignment:
Q  219 catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40533376 catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgccgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttaattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaat 40533277  T
Q  319 gaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  40533276 gaatgcaccttccagctacaacaattgtttt-cctct-aactggggtaattcaaa 40533224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 49263247 - 49262927
Alignment:
Q  41 taacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaacatccaac 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |            |||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||| ||||||    
T  49263247 taacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaacaa------------cggagacacaagtagggtggaacacgttcggtataaacgtccaac 49263160  T
Q  141 gctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagc---acatgttccagtggatcgat 237  Q
    |||| || || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||||||||| ||    
T  49263159 gctcaacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacaaaagacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatctat 49263060  T
Q  238 atgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctac 337  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| | |||| ||| ||||||| || || | |  ||||  ||||| ||||    
T  49263059 atgctggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacatcttgattcctctagaatatcttcattagttatggtaag-gtgca--ttccaactac 49262963  T
Q  338 aacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  49262962 aacaattgtcttacctctgaaatggggtgattcaaa 49262927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 109 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24364003 - 24363767
Alignment:
Q  109 agggtggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgt 208  Q
    ||||||||| || ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  24364003 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcaatcacttgggtagaattaatgaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 24363904  T
Q  209 tttaggagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtca 305  Q
    ||| || |||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| |    
T  24363903 tttgggggcacagtatgttctagtggatcgatatgcggttaacgttgttgagagcaactgaagatattatcaagagtttgattccgttagaagatcgtga 24363804  T
Q  306 ttaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||||||| |    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  24363803 ttaggtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgt 24363767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 49599134 - 49598921
Alignment:
Q  52 ggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagt 151  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||  |||||||| | |||| |||||| ||     
T  49599134 ggtctcaaggatcaactaaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgttcaacactcgacgagg 49599035  T
Q  152 ggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaac 248  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||  |||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49599034 ggagagtatcattcacttgagtggagttaaagaatgacg-aaacgtgacaagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaac 49598936  T
Q  249 gtcgctgagatcaac 263  Q
    || ||||||||||||    
T  49598935 gttgctgagatcaac 49598921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Original strand, 29436484 - 29436588
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  29436484 attcaaaggtaaaacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 29436583  T
Q  466 tccaa 470  Q
    |||||    
T  29436584 tccaa 29436588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Original strand, 51270313 - 51270417
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  51270313 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacatttcaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 51270412  T
Q  466 tccaa 470  Q
    |||||    
T  51270413 tccaa 51270417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 367
Target Start/End: Original strand, 16081305 - 16081544
Alignment:
Q  126 gtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagc---acatg 222  Q
    |||||||| | ||||||||||| || ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||   |||||    
T  16081305 gtataaacgttcaacgctcgacgaggggaggatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacgataacatgaggagcatgtttttggagcacaacatg 16081404  T
Q  223 ttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaat 322  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||  ||||  | || ||||| |||| ||| ||||||||| |||||||| |    ||||    
T  16081405 ttctagttgatcgatatgcgtgtaacgttgctgcaatcaactgagaatatactgaagagtttaattctgccggaagatcgtgattaggtagg----gaat 16081500  T
Q  323 gcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaa 367  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  16081501 gcaccttccagctacaacaattgtctta-ctctaaaatggggtaa 16081544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 50067952 - 50067848
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  50067952 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaaccggcaggac 50067853  T
Q  466 tccaa 470  Q
    |||||    
T  50067852 tccaa 50067848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 22528018 - 22528121
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22528018 attcaaaggtaacacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctagatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 22528117  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  22528118 tcca 22528121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 29707232 - 29707140
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29707232 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactccaacaattatcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcg 29707140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 46179973 - 46179881
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46179973 attcaaaggtaagacaattgttgtagttgaaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcg 46179881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 47487730 - 47487638
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47487730 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacatttcaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcg 47487638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Original strand, 49427897 - 49427989
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49427897 attcaaaggtaagacaattgttggagttgtaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcg 49427989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 121
Target Start/End: Original strand, 4209159 - 4209266
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  4209159 agaggttgaagattcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 4209258  T
Q  114 ggaacaca 121  Q
    ||||||||    
T  4209259 ggaacaca 4209266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 19160828 - 19160931
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  19160828 attcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 19160927  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  19160928 tcca 19160931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 13634993 - 13634889
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaatt-gttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcagga 464  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  13634993 attcaaaggtaacacaatttgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcagga 13634894  T
Q  465 ctcca 469  Q
    |||||    
T  13634893 ctcca 13634889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Original strand, 45689632 - 45689724
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  45689632 attcaaaggtaagacaattgttgtagtaggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctagatggggcaattcaaacttgttaatcg 45689724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Original strand, 48227049 - 48227141
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48227049 attcaaaggtaagacaattgttggagtttgaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactatggatggggcaattcaaacttgttaatcg 48227141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 48568099 - 48568007
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  48568099 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttgctctagatggggcaattcaaacttgttaatcg 48568007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Original strand, 3658985 - 3659089
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  3658985 attcaaaggtaagacaattgttgtagttgtaatgtacattccaagtacaacaattgtcttactctggatgggacaattcaaacttgttaatcggcaggac 3659084  T
Q  466 tccaa 470  Q
    |||||    
T  3659085 tccaa 3659089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 49262690 - 49262587
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg-caggac 465  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  49262690 attcaaaggtaagacaattcttgtagttggaatgcacgtttcaactacaacaattgtcttactctggatgaggcaattcaaacttgttaatcgacaggac 49262591  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  49262590 tcca 49262587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 39223892 - 39223800
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39223892 attcaaatgtaagacaattgttgtagttggaatgcacatttccattacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcg 39223800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 368 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 27035010 - 27034933
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattc 445  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27035010 ttcaaaggtaagacaattattgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattc 27034933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 49598584 - 49598489
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaa---ttgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  49598584 attcaaaggtaagacaacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatgaggcaattcaaactcgttaatcg 49598489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 391 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 29761818 - 29761750
Alignment:
Q  391 agttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29761818 agttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcg 29761750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 229 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29707621 - 29707544
Alignment:
Q  229 tggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcat 306  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29707621 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcat 29707544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 41874579 - 41874491
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    ||||| |||||||||||||||||||    
T  41874579 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacatttcaactacaacaattgtcttgctc----tggggcaattcaaacttgttaatcg 41874491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 46181850 - 46181747
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||| |||    
T  46181850 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaatgttaagaggtctcaaggatcaattgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacgcaaggaaggt 46181751  T
Q  114 ggaa 117  Q
    ||||    
T  46181750 ggaa 46181747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 110
Target Start/End: Original strand, 13148201 - 13148295
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggag 110  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||    
T  13148201 aggttgaaggttcgatgccttgatgtaaccttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggag 13148295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 151 - 234
Target Start/End: Original strand, 13148364 - 13148450
Alignment:
Q  151 tggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagc---acatgttccagtggatc 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||   |||||||||||||||||    
T  13148364 tggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgagagcacaacatgttccagtggatc 13148450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16098198 - 16098075
Alignment:
Q  46 ttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaacatccaacgctcg 145  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||| |||||||||||    
T  16098198 ttaagaggtatcaaagatcaactgaatgaattcaaccaagtagtcaaccctggagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcg 16098099  T
Q  146 acaagtggagagtatcattcagtt 169  Q
    || |  ||||| ||||||||||||    
T  16098098 acgatgggagaatatcattcagtt 16098075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 403 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 39856892 - 39856824
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggactccaa 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39856892 cattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaa 39856824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 36910072 - 36910164
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36910072 attcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaatcgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttgttaa 36910164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 38044886 - 38044794
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38044886 attcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttgttaa 38044794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 24364064 - 24364008
Alignment:
Q  23 aggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattca 79  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24364064 aggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattca 24364008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 6436284 - 6436376
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  6436284 attcaaaggtaaaacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctgaatgtggtaattcaaacttgttaa 6436376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 13973436 - 13973528
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc---aactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||   |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13973436 attcaaaggtaaaacaattgttgtagttggaaggtacaaacctctaactacaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttgttaa 13973528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 14173452 - 14173360
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    ||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  14173452 attcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctaaatgcggtaattcaaacttgttaa 14173360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 255 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14772586 - 14772472
Alignment:
Q  255 gagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctc 354  Q
    |||||||| ||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  14772586 gagatcaattgaagatgttctcaacagtttgattctgccagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaactacaagaattgtgttacctc 14772491  T
Q  355 tgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    | ||||| | |||||||||    
T  14772490 taaaatgagataattcaaa 14772472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 12790967 - 12790875
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12790967 attcagaggtaacacaattgttggagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctaaatggggtaattcaaacttgttaa 12790875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14772809 - 14772644
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaacatccaacgc 142  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||  |||| ||| |||||||     
T  14772809 acgttaaaaggtctcaaggatcaactggaagaaatcaaccagg-actcaactccggagacacaaggagggtgaaatacatttggtatgaacgtccaacgt 14772711  T
Q  143 tcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgtt 209  Q
    | |||||  ||||| |||| |||||| || | ||||||| |||||||||  | |||| |||||||||    
T  14772710 tggacaacgggagaatatcgttcagtcggctagaattaaagaacgacgacgatgtgaggagcatgtt 14772644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 23343152 - 23343244
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  23343152 attcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgttttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaa 23343244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 49397156 - 49397248
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||   |||    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  49397156 attcaaaggtaacacaattgttggagttggaagatacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaa 49397248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 156
Target Start/End: Original strand, 15471455 - 15471568
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaacatccaacgc 142  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||| |||| |||||| || ||  |||| |||||||||||     
T  15471455 acgttaaaaggtgtcaaggatcaactgaatgaaatcaaccaaggtctcaaccccggagacacaaggagtgtggaatacgtttggtatgaacatccaacgt 15471554  T
Q  143 tcgacaagtggaga 156  Q
    ||||| || |||||    
T  15471555 tcgacgaggggaga 15471568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 21484467 - 21484414
Alignment:
Q  371 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  21484467 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttccaactacatcaattgtc 21484414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 46924957 - 46924912
Alignment:
Q  414 caacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46924957 caacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcg 46924912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Original strand, 50067891 - 50067944
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  50067891 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 50067944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 456
Target Start/End: Original strand, 13283917 - 13283977
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  13283917 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaa 13283977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 3659046 - 3658967
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggt-aattcaaacttg 452  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  3659046 gtaagacaattgttgtacttggaatgtacattacaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttg 3658967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 42571471 - 42571378
Alignment:
Q  366 aattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  | | |||    ||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||    
T  42571471 aattcaaaggtaacacaattgttgtagttgagaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctttgagtggggtaattcaaacttgttaa 42571378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 45689693 - 45689614
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggt-aattcaaacttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  45689693 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattcctactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttg 45689614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 452
Target Start/End: Original strand, 47487669 - 47487748
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggt-aattcaaacttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  47487669 gtaagacaattgttgtagttgaaatgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttg 47487748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 428
Target Start/End: Original strand, 48568040 - 48568091
Alignment:
Q  377 aagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  48568040 aagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 48568091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 413 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 27486354 - 27486308
Alignment:
Q  413 gcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27486354 gcaacaattgttttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcg 27486308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Original strand, 27034950 - 27035003
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||    
T  27034950 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaataattgtcttac 27035003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 44337014 - 44336973
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 408  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44337014 attcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgcacattcc 44336973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Original strand, 46179912 - 46179965
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  46179912 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcatttcaactacaacaattgtcttac 46179965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 49926075 - 49925983
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcacat-tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |  || |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  49926075 attcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtgcaaacgtcaaactgcaacaattgtcttcctctaaatggggcaattcaaacttgttaa 49925983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 456
Target Start/End: Original strand, 18170770 - 18170830
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  18170770 gaatgcaccttccaacagcaacaattgtctttctttgaatgaggtaattcaaacttgttaa 18170830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 24270353 - 24270297
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24270353 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttg 24270297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 423
Target Start/End: Original strand, 49598520 - 49598568
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  49598520 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgt 49598568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 397 - 456
Target Start/End: Original strand, 17372941 - 17373000
Alignment:
Q  397 aatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  17372941 aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaa 17373000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 395 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 24363795 - 24363736
Alignment:
Q  395 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgtt 454  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||    
T  24363795 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgtt 24363736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 452
Target Start/End: Original strand, 29707171 - 29707250
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggt-aattcaaacttg 452  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  29707171 gtaagataattgttggagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttg 29707250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 367 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 30309526 - 30309487
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacatt 406  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30309526 attcacaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacatt 30309487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 428
Target Start/End: Original strand, 41874520 - 41874571
Alignment:
Q  377 aagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  41874520 aagacaattgttgtagttgaaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 41874571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 49598917 - 49598830
Alignment:
Q  283 ttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || | |  ||||  ||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  49598917 ttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaagg-tgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctgaaatcgggtaattcaaa 49598830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 51270374 - 51270295
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggt-aattcaaacttg 452  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  51270374 gtaagacaattgttgcagttgaaatgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttg 51270295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Original strand, 19160537 - 19160587
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  19160537 cattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgt 19160587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Original strand, 22527727 - 22527777
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  22527727 cattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgt 22527777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 35586571 - 35586521
Alignment:
Q  406 tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  35586571 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaa 35586521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 444
Target Start/End: Original strand, 37778591 - 37778671
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaatt 444  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  37778591 attcagaggtaacacaattgttgtagttggaaggtacaaacttccaactgcaacaattgtcttcctctaaatggagtaatt 37778671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 40532980 - 40532888
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||| | |||    ||||||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  40532980 attcagaggtaacacgattgttgtagttggaaggtacaaacgtccaactacaacaattgtcttcctctaaatgaggtaattcaaacttgttaa 40532888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 247 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19262475 - 19262422
Alignment:
Q  247 acgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagat 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||    
T  19262475 acgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgcctgaagat 19262422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22528079 - 22528026
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  22528079 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtgttac 22528026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 29436545 - 29436492
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  29436545 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactacaacaattgttttac 29436492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 48227110 - 48227057
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||    
T  48227110 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattcaaactccaacaattgtcttac 48227057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 49427958 - 49427905
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  49427958 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattacaactccaacaattgtcttac 49427905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Original strand, 13973140 - 13973196
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  13973140 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 13973196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 14173748 - 14173692
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  14173748 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 14173692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 17686351 - 17686295
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  17686351 gaatgcaccttccagctacaacaattgtgttcctctggatagggtaattcaaacttg 17686295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 403
Target Start/End: Original strand, 27486647 - 27486679
Alignment:
Q  371 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27486647 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 27486679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Original strand, 29762174 - 29762210
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29762174 attcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 29762210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 44597954 - 44597918
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44597954 attcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 44597918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 48707185 - 48707113
Alignment:
Q  45 gttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaa 117  Q
    ||||| || ||| |||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  48707185 gttaaaagatctgaaggatcaactgaatgaaatcaaccaaggactcaaccctggagacacaaggagggtggaa 48707113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Original strand, 49396920 - 49396976
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  49396920 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 49396976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 51270055 - 51270019
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51270055 attcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 51270019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Original strand, 12791227 - 12791262
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12791227 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 12791262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 16098061 - 16098018
Alignment:
Q  414 caacaattgtcttactctgga-tggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16098061 caacaattgtcttactctgaaatggggtaattcaaacttgttaa 16098018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Original strand, 27035272 - 27035307
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27035272 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 27035307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 35576591 - 35576556
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35576591 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 35576556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Original strand, 42571730 - 42571765
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42571730 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 42571765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 45689371 - 45689336
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45689371 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 45689336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Original strand, 46180234 - 46180269
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46180234 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 46180269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Original strand, 47487991 - 47488026
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47487991 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 47488026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Original strand, 48568358 - 48568393
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48568358 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 48568393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 452
Target Start/End: Original strand, 49262629 - 49262708
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggt-aattcaaacttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||| |||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  49262629 gtaagacaattgttgtagttgaaacgtgcattccaactacaagaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttg 49262708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Original strand, 49262942 - 49262977
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49262942 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 49262977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 396 - 454
Target Start/End: Original strand, 18170611 - 18170669
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgtt 454  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||    
T  18170611 gaatgcaccttccaacaacaacaattgtctttctttgaatgaggtaattcaaacttgtt 18170669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19160890 - 19160836
Alignment:
Q  374 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  19160890 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 19160836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Original strand, 21484409 - 21484463
Alignment:
Q  374 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  21484409 ggtatgacaattgatgtagttggaaggtgcattccaactacaacaattgtcttac 21484463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 408
Target Start/End: Original strand, 13284213 - 13284254
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 408  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13284213 attcaagggtaagacaattgttgtagttggaaggtacattcc 13284254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 453
Target Start/End: Original strand, 35185187 - 35185244
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||    
T  35185187 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgt 35185244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Original strand, 39223831 - 39223884
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  39223831 gtaagacaattgttgtaatggaaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 39223884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 49397440 - 49397363
Alignment:
Q  395 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggt-aattcaaacttgttaatc-gcaggactcca 469  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||    
T  49397440 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttatctctgaatggggtaaattcaaacttgtcaaacagcaggactcca 49397363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Original strand, 6435988 - 6436044
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  6435988 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttg 6436044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 133
Target Start/End: Original strand, 13148292 - 13148340
Alignment:
Q  85 ggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaac 133  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  13148292 ggagtcaaccctagagacacaaggagggtggaacacattcattataaac 13148340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 358
Target Start/End: Original strand, 17686015 - 17686051
Alignment:
Q  322 tgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaa 358  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  17686015 tgcaccttccaactacaacaattgtgttacctctgaa 17686051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 19160569 - 19160534
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19160569 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 19160534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Original strand, 21484597 - 21484632
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21484597 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 21484632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22527759 - 22527724
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22527759 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 22527724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Original strand, 23342857 - 23342913
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| || || || ||||||||||||||||    
T  23342857 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaattgggtaattcaaacttg 23342913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 29436226 - 29436190
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29436226 attcaaaggtaagaaaattgttgcagttggaatgcac 29436190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 419
Target Start/End: Original strand, 29761781 - 29761825
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaa 419  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  29761781 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactgccacaa 29761825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Original strand, 36909777 - 36909833
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  36909777 gaatgcaccttccagctacaacagttgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 36909833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Original strand, 37778295 - 37778351
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||  || |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37778295 gaatgcaccttccgcctacaacaattttcttcctctgaatggggtaattcaaacttg 37778351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 403
Target Start/End: Original strand, 39856867 - 39856895
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856867 gtaagacaattgttgtagttggaatgcac 39856895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Original strand, 41780909 - 41780965
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  41780909 gaatgcaccttgcagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 41780965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 49427639 - 49427604
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49427639 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 49427604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 114)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 48315477 - 48315142
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||| | | |||||||    
T  48315477 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagatagaaggagggt 48315378  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||||||||| || || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  48315377 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcaacgagaggagagcatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 48315278  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48315277 gagcacaacatgttccagtagatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccataagatcgtcattagg 48315178  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48315177 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacgattgt 48315142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36394121 - 36393761
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  36394121 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggagggt 36394022  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  36394021 ggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagaatatcattcacttgtgtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 36393922  T
Q  214 gagcac---atgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  36393921 gagcacaatatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccataagatcttcattagg 36393822  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  36393821 tactgaatgaatgcaccttccagctacgacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 36393761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Original strand, 48270558 - 48270893
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  48270558 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaaaaagtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacaaaaggagggt 48270657  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  ||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  48270658 ggaacacgttcggtatagacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 48270757  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48270758 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcgttagg 48270857  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  48270858 tacggaatgaatgcacattccaactacaacaattgt 48270893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 43351396 - 43351062
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  43351396 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactaactgaattcaaccaaggagtctaccccagagacacaaggagggt 43351297  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  43351296 ggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgg 43351197  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  43351196 gagcacaacatgttccagtggatcgatatg-gggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaatgtctgattccaccagaagatcgtcattagg 43351098  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43351097 tacagaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 43351062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 46862491 - 46862156
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  46862491 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatgaactgattgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacagaaggagggt 46862392  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  46862391 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcttgttttgg 46862292  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46862291 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagattaactgaagatatgatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcataagg 46862192  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46862191 tacggaatgaatgcaccttccagatacaacaattgt 46862156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21615057 - 21614725
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21615057 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtatcgttaagaggtctcaatgatgaactgaatgaattcaactagggagtcaacctcggagacacaaggagggt 21614958  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||   ||||||| | ||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  21614957 ggaacacgttcgatataaacgttcaacgctcgacgagggaagagtatcattcatttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgcgacgagcatgttttgg 21614858  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21614857 gagcacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaattttgattccgccagaagttcgtgattagg 21614758  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    || |||   |||||||||| || |||||||||||||    
T  21614757 taggga---aatgcacctttcaactacaacaattgt 21614725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 41048700 - 41049053
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||       ||| |||||||||| | |||||||||||  |||||| | ||||| |    
T  41048700 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacattaagaggtctcaag-------tgactgaattcaaccaaggagtcaaccctagagacagaaggaggat 41048792  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  41048793 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggtgagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgcgacgagcatgttttgg 41048892  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41048893 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 41048992  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  41048993 tacgaaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 41049053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Original strand, 42735173 - 42735507
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  42735173 agaggttgaaggtttggtgcctcggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacagaaggagggt 42735272  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||   | | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  42735273 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatggg-gaagattatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 42735371  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   | ||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42735372 gagcacaacatattctagtgaatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcaagaagatcgtcattagg 42735471  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42735472 taccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 42735507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21187593 - 21187261
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21187593 agaggttgaaggttcagtgccttggtgtaacgtta---ggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 21187497  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    | ||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  21187496 gaaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagaattaacgattgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 21187397  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21187396 gagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgtcagaagatcgtcattagg 21187297  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21187296 tactgaatgaatgcacctttcagctacaataattgt 21187261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15338202 - 15337842
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  15338202 agaggttgaaggttttgtgccttggtgtgacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaaccaaggattcaaccccagagacacaaggagggt 15338103  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||  | |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15338102 ggaacacgttcggtataaatgttcaacgctcaacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgatgagcatgttttgg 15338003  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15338002 gagcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattataaacagtctgattccgccagaagatcgtcattagg 15337903  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || ||||||||||||||||| | ||| ||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  15337902 tatggaatgaatgcaccttctaactaaaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 15337842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Original strand, 21650433 - 21650769
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaacc-ccggagacacagggaggg 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| || |||||||| ||||||    
T  21650433 agaggttgaaggttcggtgccttggtataacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccacctgagacacaaggaggg 21650532  T
Q  113 tggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgtttta 212  Q
    |||||||| || | ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |     
T  21650533 tggaacacgttcattataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggaggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgttatg 21650632  T
Q  213 ggagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||| ||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  21650633 ggatcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccataagatcatcattag 21650732  T
Q  310 gtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
     ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  21650733 ttaccgaatgaatgaacctaccagctacaacaattgt 21650769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 20564669 - 20564967
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  20564669 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 20564768  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  20564769 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 20564868  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20564869 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 20564967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 28114690 - 28114355
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  28114690 agaggttgaaggttcagtcctttggtgtaacgttaagaggtccaaagggtgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagaaacaaggagggt 28114591  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  28114590 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgcccgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttag 28114491  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||| |||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||    
T  28114490 gagcacaacatgttccaatggatcgaaatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattctgtcaaaagattgtcattagg 28114391  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28114390 taccgaataaatgcaccttccagctacaacaattgt 28114355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 40588459 - 40588757
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||    
T  40588459 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgattgaattcaaccaaggagtcaaccctagagacacaaggagggt 40588558  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  40588559 ggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcgcttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgatgagcatgttttgg 40588658  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  40588659 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcggccagaagatcgtcattag 40588757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 34140775 - 34141134
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | | |||||||||  |||||||| |||||||    
T  34140775 agaggttgaaggttcgatgccttggtgtaacattaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcagccaagaagtcaaccctagagacacaaggagggt 34140874  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||  ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||| |    
T  34140875 ggaacaatttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacggacatgttttgg 34140974  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  34140975 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgccataagatcgtcattagt 34141074  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| || |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  34141075 tagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattctcttacctctgaattggggtaattcaaa 34141134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 18237474 - 18237833
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| || ||||| || ||| |||    
T  18237474 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttacgaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaagaagtcaactccagagacgcaaggatggt 18237573  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| |    
T  18237574 ggaatacgttcggtataaacgtctaacgctcgacaaggggagaggatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacatgacgagcatattttgg 18237673  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18237674 gagcacatcatgttccagtggatcggtatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtttgattccgccagaagatcgtcattagt 18237773  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  18237774 tagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaattggggtaactcaaa 18237833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 1642884 - 1642537
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1642884 agagattgaaggttcgatgccttggagtaatgttaagaggtctcaaggatcaattgaatgaattcaaccaaggagtcaatcccggagacacaaggagggt 1642785  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||   ||||||| | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  1642784 ggaatacgtttgatataaacgttcaacactcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgtgaggagcatgttttgg 1642685  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1642684 gagcacaacatgttcaagtggatcgatatgcgtgtaacgttgttgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccgccagaagatcgtgattagg 1642585  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggg 363  Q
    || |    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  1642584 tagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacct-tgaaatggg 1642537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 39477537 - 39477178
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||||    
T  39477537 agaggttgaaagtttggtggcttagtgtaacgttaagaggtctaaaggatgaactcactgaattcaaccaaggagtcaaccccagatacacaaggagggt 39477438  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  39477437 ggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggaggatatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgg 39477338  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||     
T  39477337 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcattaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagt 39477238  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39477237 tagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattatcttaccgctgaaatggggtaattcaaa 39477178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 17183122 - 17183484
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||   |||||||| |||||||    
T  17183122 agaggttgaaggtttgttgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccttagagacacaaggagggt 17183221  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    | ||||| ||  |||||||| |||||| |||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  17183222 gtaacacgtttggtataaacgtccaacactcgacgagggaagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgg 17183321  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaag---atcgtcatt 307  Q
     |||   |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||    
T  17183322 aagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcatcgtcatt 17183421  T
Q  308 aggtacggaatga-atgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || ||  |||  ||||  ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17183422 agttaggg--tgaggtgca--ttccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 17183484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 17839233 - 17839532
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  17839233 agaggttgaatattcggtaccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 17839332  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  | |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  17839333 ggaagacgtttggaataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 17839432  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcc-agaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  17839433 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccaaaaagatcgtcattag 17839532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Original strand, 2356199 - 2356547
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||    
T  2356199 agaggttgaaggtttgatgccttggtgtaatgctaagaggtctaaaggatgaactcaccgaattcaaccaaggagtcaaccctagagacacaaggagggt 2356298  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |    
T  2356299 ggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgaagaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacaaaaatgtgacgagcatgttttgg 2356398  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||| |   ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||| ||||||    
T  2356399 gagaacagcatgttccaatggatcgatatgcgagtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgctataagaccgtgattagg 2356498  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatgg 362  Q
    || |||   |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2356499 taggga---aatgcatcttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgg 2356547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 30360427 - 30360785
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  30360427 agaggttgaaggttcgatgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccatagacacaaggagggt 30360526  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||  | ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  30360527 ggaatacgttcggtataaatgtacaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaaaaaacgacgaaaacgtaacgagcatgttttgg 30360626  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30360627 gagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggt-gcgttgctgagatcaactgaagatatcataaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagt 30360725  T
Q  311 tacgg-aatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || ||||  ||||  ||||| ||| ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  30360726 tagggtaatg--tgca--ttccaactataactattgtcttacatctgaaattgggtaattcaaa 30360785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 10522978 - 10523277
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||  |||||||| ||| |||    
T  10522978 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccctagagacacaaggatggt 10523077  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  10523078 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttgttggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 10523177  T
Q  214 gagcac---atgttcca-gtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||||   ||||| |  |||||||||||||||||| | ||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  10523178 gagcaccacatgtttcttgtggatcgatatgcgggtgaagtttcttagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattccgcctgaaaatcgtcattag 10523277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28979319 - 28979060
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  28979319 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccatagacacaaggagggt 28979220  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  28979219 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtatcattcacttgggtgaaattaacgagcgacaaaaacgtgacgagcatgttttgg 28979120  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagat 270  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  28979119 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagat 28979060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 45363540 - 45363251
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||||| |||||||    
T  45363540 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgactgaattcaaccaagaagtcaaccccagagacacaaggagggt 45363441  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  45363440 ggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgagcagagagtttcattcacttgggtggaattaacaaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 45363341  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   |||||||||||||||||||         |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  45363340 gagcacatcatgttccagtggatcgat---------acgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 45363251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 41217524 - 41217883
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| | |||||||||| |  ||||||| |||||||    
T  41217524 agaggttgaaggttcggtgccttgatttaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaggttaaccaaggagtcaacctcaaagacacaaggagggt 41217623  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||    ||  ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  41217624 ggaattagttcggtataaaaattcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaaagtgaagaacatgttttgg 41217723  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||     
T  41217724 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccaccagaagatcgtcattagt 41217823  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  41217824 tagggtaag-gtgca--ttccaactacagcaattgtcttacctctgatatggggtaattcaaa 41217883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 48221039 - 48220682
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||  || |||||||    
T  48221039 agaggttgaaggttcggtaccttgatgtaacgttaagaggtctcaatgatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagatgcaaggagggt 48220940  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||  || |    
T  48220939 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatg--ttgg 48220842  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||   |||||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||     
T  48220841 gagcacagcatgttccagtggatcaatatgcaggtgacggtgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccaccataagatcgtcattagt 48220742  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||    
T  48220741 tagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattatcttagctctgaaatgggctaattcaaa 48220682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 126 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 30355000 - 30354777
Alignment:
Q  126 gtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagcaca---tg 222  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||    
T  30355000 gtataaacgtccaacgttcgacgaggggagcgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatg 30354901  T
Q  223 ttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaat 322  Q
    |||||||||||||||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30354900 ttccagtggatcgatatgtggatgacgttgctgagatcagctgaagatatcatcaaaagtttgattctgccaaaagatcgtcattaggtacggaatgaat 30354801  T
Q  323 gcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    |||||||  |||||||||||||||    
T  30354800 gcaccttttagctacaacaattgt 30354777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 47268821 - 47269167
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||            ||| ||||| || |||||||    
T  47268821 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaac------------cccagagacgcaaggagggt 47268908  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  47268909 ggaatacgttc-gtataaacgtccagcgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 47269007  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||      
T  47269008 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagattaactaaaaatatcatcaacaatttgattccgccaaaagatcgtcattaat 47269107  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | | |||||  ||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  47269108 tagggtaag-atgca--ttccaactacaacaattagcttacctgtgaaatggggtaattcaaa 47269167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 20379000 - 20378702
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20379000 agaggttgaaggttcgatgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaattgaataaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 20378901  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||| ||||| || | || || |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  20378900 ggaatacgttcggtataaacgtccaatgcacaacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgg 20378801  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||   |||||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20378800 gagcacaacatgttccagtggacagatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatataattaacaacttgattccgccagaagatcatcattag 20378702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26603501 - 26603268
Alignment:
Q  15 gaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtg 114  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| | |||||||| ||||||||    
T  26603501 gaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagttaacctcagagacacaaggagggtg 26603402  T
Q  115 gaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagg 214  Q
    ||| || ||  |||||||| ||||||||||||| |  |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  26603401 gaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaagggagggtatcattcacttgggtggaattaaagagcgacgaaaacgtgacgagcatgttttggg 26603302  T
Q  215 agc---acatgttccagtggatcgatatgcgggt 245  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26603301 agcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggt 26603268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Original strand, 13916744 - 13916949
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||||| ||| |||    
T  13916744 agaggttgaaggttcggtgccttggcgtaatgttaagaggtttcaaggatgaactgactgaattcaaccaag-agtcaaccccagagacacaaggatggt 13916842  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||| |||| || |||||||| |    
T  13916843 ggaacacatttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaatgacaaaaatgtgatgaccatgttttgg 13916942  T
Q  214 gagcaca 220  Q
    |||||||    
T  13916943 gagcaca 13916949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 199
Target Start/End: Original strand, 42682866 - 42683051
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  42682866 agaggttgaaggttcggtgacttagtgtaaaattaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 42682965  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtga 199  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||||||  |||| || ||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42682966 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgaacgacgaggggagaatatcattcactttggtggaattaacgaacaacgaaaacgtga 42683051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 196 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2206152 - 2205975
Alignment:
Q  196 gtgaagagcatgttttaggagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 292  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2206152 gtgacgagcatgttttgggagcacaatatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgc 2206053  T
Q  293 cagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||||||||||||||||| || |||   || |  | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2206052 cagaagatcgtcattagtta-gga--taaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 2205975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 17183730 - 17183833
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  17183730 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattctaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 17183829  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  17183830 tcca 17183833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Original strand, 34157319 - 34157421
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcgcaggact 466  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34157319 attcaaaggtaaca-aattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcgcaggact 34157417  T
Q  467 ccaa 470  Q
    ||||    
T  34157418 ccaa 34157421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Original strand, 34141379 - 34141471
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34141379 attcaaaggtaagacaattgttgtagttgaaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcg 34141471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 13920819 - 13920922
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  13920819 attcaaaggtaacacaattgttggagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 13920918  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  13920919 tcca 13920922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 17839823 - 17839926
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  17839823 attcaaaggtaacacaattgttggagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 17839922  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  17839923 tcca 17839926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Original strand, 18238079 - 18238183
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  18238079 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcctactctggattgggcaattcaaacttgttaatcagcaggac 18238178  T
Q  466 tccaa 470  Q
    |||||    
T  18238179 tccaa 18238183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 39476934 - 39476842
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39476934 attcaaaggtaagacaattgttatagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcg 39476842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 188 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9367243 - 9367119
Alignment:
Q  188 acgaaaacgtgaagagcatgttttaggagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagttt 284  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9367243 acgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagttt 9367144  T
Q  285 gattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  9367143 gattccgccacaagatcgtcattag 9367119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Original strand, 10523582 - 10523674
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  10523582 attcaaaggtaacacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaatttaaacttggtaatcg 10523674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Original strand, 41218127 - 41218219
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  41218127 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttgctctggatggggcaatttaaacttgttaatcg 41218219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 371 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 26601467 - 26601381
Alignment:
Q  371 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaat 457  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26601467 aaaggtaagacaattgttgtacttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaat 26601381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 366 - 459
Target Start/End: Original strand, 30361029 - 30361122
Alignment:
Q  366 aattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30361029 aattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcccattccaagaacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcg 30361122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 45362942 - 45362854
Alignment:
Q  371 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  45362942 aaaggtaagacaattgttgcagttagaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggattgggcaattcaaacttgttaatcg 45362854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 48220437 - 48220345
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  48220437 attcaaaggtgagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactttggatggagcaattcaaacttgttaatcg 48220345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 20565272 - 20565375
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||    
T  20565272 attcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgccaatctgcaggac 20565371  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  20565372 tcca 20565375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 9366814 - 9366721
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctgg-atggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  9366814 attcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggtatggggcaattcaaacttgttaatcg 9366721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 254 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26601832 - 26601716
Alignment:
Q  254 tgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacct 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || | |  ||||  ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  26601832 tgagatcaactgaagatatcatcaatagtttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattatcttacct 26601736  T
Q  354 ctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26601735 ctgaaatggggtaattcaaa 26601716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 40589062 - 40589165
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa-tcgcaggac 465  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||    
T  40589062 attcaaaggtaagacaaaatttgaagttggaatgcacattccaactgcaacaactgtcttactctggatgaggcaattcaaacttgttaattggcaggac 40589161  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  40589162 tcca 40589165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 21614478 - 21614389
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21614478 attcaaaggtaagataattgttgtagttggaaggtgccttccaactacaacaattgtcttcctctagatggggtaattcaaacttgttaa 21614389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8726514 - 8726337
Alignment:
Q  15 gaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtg 114  Q
    |||| ||||| ||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  8726514 gaggatgaagattcggtaccttggtgtcacgttacgaggtctcaaggatcaacttgatgaattcaaccaaggagtcaaccctgtagacacaaggagggtg 8726415  T
Q  115 gaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaa 192  Q
    ||| |  ||  |||||||| |||| || ||||||    |||| ||  |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  8726414 gaataagttcggtataaacgtccatcgttcgacactgagagaatactattcagttaggtggaattaacaaacgacgaa 8726337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 373
Target Start/End: Original strand, 13920431 - 13920573
Alignment:
Q  226 cagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgca 325  Q
    |||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || || | | |||||    
T  13920431 cagtggatcgatatgcaggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgatttcgccataagatcgtcattagttagggtaag-atgca 13920529  T
Q  326 ccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
      ||||| ||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  13920530 --ttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 13920573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 46861887 - 46861795
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46861887 attcaaaggtaagacaattgttgcagttggaaggtacaagcatctaactgcaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttgttaa 46861795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 255 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 3380727 - 3380626
Alignment:
Q  255 gagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctc 354  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||| |    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  3380727 gagatcaactgaagatattctcaacaatttgattctgccagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttccaacgacaacaattgtcttacctc 3380632  T
Q  355 tgaaat 360  Q
    ||||||    
T  3380631 tgaaat 3380626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 403 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20378688 - 20378620
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggactccaa 470  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20378688 cattccaactacaacaattgtcttcctctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaa 20378620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 117
Target Start/End: Original strand, 18146898 - 18146972
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaa 117  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18146898 acgttaaaaggtctcaaggatcaactgaatgaaatcaaccaaggactcaaccccggagacacaaggagggtggaa 18146972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 218 - 312
Target Start/End: Original strand, 28066372 - 28066466
Alignment:
Q  218 acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||   || |||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28066372 acatgttcctgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgtctgaagatattctcaaaagtttgattccgccagaacatcgtgattaggta 28066466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 28114086 - 28113994
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28114086 attcaaaggtaacacaattgttggagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctaaatggggtaattcaaacttgttaa 28113994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 366 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28978909 - 28978792
Alignment:
Q  366 aattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattc------------caactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||            ||||| |||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  28978909 aattcaaaggtaagacaattgttggagttggaatgcacattccaacgtgcattccaactccaacaattatcttactctgaatgggacaattcaaacttgt 28978810  T
Q  454 taatc-gcaggactccaa 470  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  28978809 taatcggcaggactccaa 28978792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 10224581 - 10224673
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| |||||||    
T  10224581 attcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctttaaatggggtaattcaaatttgttaa 10224673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 21186992 - 21186900
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    || ||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  21186992 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaagttacaaacgtctaactgcaacaattatcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaa 21186900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 48271162 - 48271254
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    || | |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  48271162 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtctagctgcaacaattgtcttcctctgaatggggtgattcaaatttgttaa 48271254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 319
Target Start/End: Original strand, 11824847 - 11824911
Alignment:
Q  255 gagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatg 319  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  11824847 gagatcaactgaagatattttcaacagtttgattccgctagaagatcgtgattaggtagggaatg 11824911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 373 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 20877739 - 20877653
Alignment:
Q  373 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||    ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||    
T  20877739 aggtaacacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctaaattgggtaattcaaacttgttaa 20877653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 41218186 - 41218135
Alignment:
Q  377 aagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  41218186 aagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 41218135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 30354508 - 30354416
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  30354508 attcaaaggtaacacagttgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtctttctctgaatggggcaattcaaacttattaa 30354416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 267 - 309
Target Start/End: Original strand, 34139332 - 34139374
Alignment:
Q  267 agatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34139332 agatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcattag 34139374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 406 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 36393476 - 36393426
Alignment:
Q  406 tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  36393476 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaa 36393426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 425
Target Start/End: Original strand, 48220376 - 48220426
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtct 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  48220376 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtct 48220426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 17320253 - 17320200
Alignment:
Q  256 agatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  17320253 agatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattctgccataaaatcgtcattag 17320200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 379 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 18238136 - 18238087
Alignment:
Q  379 gacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  18238136 gacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 18238087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Original strand, 26601410 - 26601463
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  26601410 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaagtacaacaattgtcttac 26601463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Original strand, 39476873 - 39476926
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||    
T  39476873 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactataacaattgtcttac 39476926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Original strand, 45362885 - 45362938
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45362885 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattctaactgcaacaattgtcttac 45362938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 360
Target Start/End: Original strand, 150206 - 150343
Alignment:
Q  219 catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaat 318  Q
    |||||||| ||||||||||||    || |||| | |||||||  ||||||||||  |||| | |||||||| || |||||||||| |||||||| |||||    
T  150206 catgttcccgtggatcgatatatttgtcacgttgttgagatcgcctgaagatattctcaacaatttgattctgctagaagatcgtgattaggtagggaat 150305  T
Q  319 gaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaat 360  Q
        |||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||    
T  150306 ----gcaccttccaactacaacaattggcttacctctaaaat 150343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 319
Target Start/End: Original strand, 18149681 - 18149745
Alignment:
Q  255 gagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatg 319  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  18149681 gagatcaactgaagatattctcaacagtttgattgcgccagaagatcgtatttaggtagggaatg 18149745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Original strand, 48270866 - 48270922
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||    
T  48270866 gaatgcacattccaactacaacaattgtctttcttttaatggggtaattcaaacttg 48270922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 3380971 - 3380853
Alignment:
Q  22 aaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacaca 121  Q
    |||||||||||  ||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||| ||| || |||    
T  3380971 aaggttcggtgcattaatgtgacgttaaaaggtctcaaggatcaactggatgaaatcaac-aaggactcaaccccggagacacaaggagagtgaaataca 3380873  T
Q  122 ttaagtataaacatccaacg 141  Q
    ||  |||| ||| |||||||    
T  3380872 tttggtatgaacgtccaacg 3380853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 17183791 - 17183712
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggt-aattcaaacttg 452  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  17183791 gtaagacaattgttgcagttagaatgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttg 17183712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 428
Target Start/End: Original strand, 21614419 - 21614470
Alignment:
Q  377 aagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  21614419 aagacaattgttgtagttggaaggcaccttccaactacaacaattatcttac 21614470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Original strand, 13920528 - 13920578
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  13920528 cattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgt 13920578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 10523643 - 10523590
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  10523643 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtgttac 10523590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 13920880 - 13920827
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  13920880 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactccaacaattgtgttac 13920827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17839884 - 17839831
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  17839884 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactccaacaattgtgttac 17839831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 366 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 18237820 - 18237783
Alignment:
Q  366 aattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18237820 aattcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 18237783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28979035 - 28978990
Alignment:
Q  328 ttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28979035 ttccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 28978990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 30361091 - 30361038
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  30361091 gtaagacaattgttgttcttggaatgggcattccaactacaacaattgtcttac 30361038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 34141440 - 34141387
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  34141440 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcatttcaactacaacaattgtcttac 34141387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 40588804 - 40588768
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40588804 attcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgcac 40588768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Original strand, 41049001 - 41049057
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  41049001 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 41049057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Original strand, 45363204 - 45363240
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45363204 attcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgcac 45363240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Original strand, 2205990 - 2206025
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2205990 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 2206025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 452
Target Start/End: Original strand, 17183437 - 17183488
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtctta-ctctg-gatggggtaattcaaacttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  17183437 cattccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttg 17183488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 28979037 - 28978986
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtctta-ctctg-gatggggtaattcaaacttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  28979037 cattccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttg 28978986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Original strand, 9366752 - 9366806
Alignment:
Q  374 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  9366752 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 9366806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 209
Target Start/End: Original strand, 11824623 - 11824789
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaacatccaacgc 142  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||| | | | |||||||| |||| ||| |||| ||| || | |||  ||||||||||||||||     
T  11824623 acgttaaaaggtctcaaggatcaacgggatgaaatcaaccaagcactcaacccctgagaaacaaggagagtgaaataaatttggtataaacatccaacgt 11824722  T
Q  143 tcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgtt 209  Q
    | ||| |  ||||| ||   |||||| || | ||||||| |||||||||  |||||| |||||||||    
T  11824723 tggacgacgggagaataatgttcagtgggttagaattaaagaacgacgacgacgtgaggagcatgtt 11824789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 17320186 - 17320136
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||    
T  17320186 cattccaactacaacaattgtcttcctttaaatggggtaattcaaacttgt 17320136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 20565334 - 20565280
Alignment:
Q  374 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  20565334 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 20565280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 141
Target Start/End: Original strand, 28066185 - 28066283
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaacatccaacg 141  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||  ||||| ||||| | ||  |||||||||| |||||| |||||||| || |||||  |||| |||||||||||    
T  28066185 acgttaaaaggtcttaaggatcaactagatgaaatcaaccaaggtctcaaccccggcgacacaaggagggtgtaatacatttggtatgaacatccaacg 28066283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 34157379 - 34157333
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaatt 421  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  34157379 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactacaacaatt 34157333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 367
Target Start/End: Original strand, 1642247 - 1642292
Alignment:
Q  322 tgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaa 367  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  1642247 tgcaccttcaaactacaacaattgtcttacctatgaaatggggtaa 1642292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 453
Target Start/End: Original strand, 10523292 - 10523341
Alignment:
Q  404 attccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||    
T  10523292 attccaactacaacaattgtcttcctttgaatgtggtaattcaaacttgt 10523341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 2206022 - 2205970
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtctta-ctctg-gatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  2206022 cattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgt 2205970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 123
Target Start/End: Original strand, 12082861 - 12082941
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacatt 123  Q
    ||||||| | |||| |||||| | ||| ||||| ||||| |  || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12082861 acgttaaaatgtcttaaggatcagctggatgaaatcaaccaacgactcaaccccggagacacaaggagggtggaatacatt 12082941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 15337894 - 15337838
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||| ||||  |||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  15337894 gaatgcaccttctaactaaaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 15337838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 17839578 - 17839543
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17839578 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 17839543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 34139420 - 34139385
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34139420 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 34139385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Original strand, 34141087 - 34141139
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtctta-ctctgga-tggggtaattcaaacttgt 453  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  34141087 cattccaactgcaacaattctcttacctctgaattggggtaattcaaacttgt 34141139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 36393813 - 36393757
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  36393813 gaatgcaccttccagctacgacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 36393757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Original strand, 42735480 - 42735536
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  42735480 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatgtggtaattcaaacttg 42735536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 43351089 - 43351033
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  43351089 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttg 43351033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 160)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 373
Target Start/End: Original strand, 22436823 - 22437179
Alignment:
Q  18 gttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaa 117  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22436823 gttgaaggttcgatgccttggtataacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaa 22436922  T
Q  118 cacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagc 217  Q
    ||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22436923 cacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgtgacgagcatgttttgggagc 22437022  T
Q  218 ---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacg 314  Q
       |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22437023 acaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccggaagatcgtcattaggtacg 22437122  T
Q  315 gaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || | ||  |||||||||||||||||    
T  22437123 gaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtcttccttc--aaatggggtaattcaaa 22437179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 957754 - 957419
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  957754 agaggttaaaggtttggtgccttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacataaggagggt 957655  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| |  ||  |||||||  ||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  957654 ggaatatgttctgtataaatgtccaacgctcgacgaggggagcgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttag 957555  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  957554 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 957455  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  957454 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 957419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 43889797 - 43889438
Alignment:
Q  15 gaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtg 114  Q
    |||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  43889797 gaggttaaaggtttggtgcctgggtgtaacgttaagaggtctcaatgatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtg 43889698  T
Q  115 gaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagg 214  Q
    |||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  43889697 gaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttggg 43889598  T
Q  215 agca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggt 311  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43889597 agcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatataatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggt 43889498  T
Q  312 acggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  43889497 accgaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctct-aaatggggtaattcaaa 43889438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 44560479 - 44560119
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  44560479 agaggttgaaggttcggtaccttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 44560380  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  44560379 ggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtgacaagcatgttttgg 44560280  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||   |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||    
T  44560279 gagcaaagcatgttccagtgtattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttctccttaagatcgtcattagg 44560180  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  44560179 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 44560119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 49424057 - 49423696
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  49424057 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccatagacacaaggagggt 49423958  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||  ||  |||||||  |||| |||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  49423957 ggaacatgttcggtataaatgtccagcgctcgacgaggggagattatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttctgg 49423858  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||   ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  49423857 gagcacggcatgttcaagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagaaatcatcaaaagtttgattctgccataagatcgtcattagg 49423758  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  49423757 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtgttacctttg-aatggggtaattcaaa 49423696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 34530095 - 34529735
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| | |||||    
T  34530095 agaggttgaaggttcgatgccttggtgtaacgttaagagatctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaagaagggt 34529996  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||| |    
T  34529995 ggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtgacgagcattttttgg 34529896  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34529895 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 34529796  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  34529795 tacggaatgaatgcacattaaagctacaacaattgtatt-cctttg-aatggggtaattcaaa 34529735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36776818 - 36776458
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  36776818 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtcgcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccatagacacaaggagggt 36776719  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  36776718 ggaacacgttaggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtattattcacttgggtagaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatggtttgg 36776619  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  36776618 gagcacggcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctgaaagatcgtcattagg 36776519  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  36776518 taccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 36776458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 49792235 - 49791875
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  49792235 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgattgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 49792136  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  49792135 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtattattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 49792036  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  49792035 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccaaaagatcatcattagg 49791936  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  49791935 tacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt-cct-ttaaatggggtaattcaaa 49791875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 34153587 - 34153225
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaa--ttcaactagggagtcaaccccggagacacagggagg 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||| | |||||||||||| |||||||| |||||    
T  34153587 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactggagattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagg 34153488  T
Q  112 gtggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgtttt 211  Q
    ||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  34153487 gtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgatcatgtttt 34153388  T
Q  212 aggagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 308  Q
     ||||||||   |||||||||||||| |||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34153387 gggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcggatgacgttggtgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcatta 34153288  T
Q  309 ggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  34153287 tgtacggaatgaatgcaccttccagctacaacagttgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 34153225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 21169359 - 21169719
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21169359 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatgaattgactgaattcaaccacggagtcaaccccagagacacaaggagggt 21169458  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||| ||| || ||||||||||| |    
T  21169459 ggaacacgttcgatataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtcgaattaacggacgatgaatacgcgacgagcatgttttgg 21169558  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||   ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21169559 gagcacagcatgtaccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccagaagatcgtcattagg 21169658  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  21169659 tacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 21169719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 49817943 - 49817608
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || || || | ||||||||  |||||||| |||||||    
T  49817943 agaggttgaaggtttggtgccttggtgtaacattaagatgtctcaaggatgaactgaatgaaatctaccagcgtgtcaaccctagagacacaaggagggt 49817844  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  49817843 ggaacacgttcagtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtaacattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgttacgagcatgttttgg 49817744  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49817743 gagcacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccagaagatcgtcattagg 49817644  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  49817643 tacggaatgaatgtacctttcaactacaacaattgt 49817608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 2772917 - 2773277
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||  |||||||| ||| |||    
T  2772917 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagagatctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaacccgagagacacaaggatggt 2773016  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||   ||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  2773017 ggaacacgttcgttataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgg 2773116  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  2773117 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttattgagatcaactgaagataccatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcatcagg 2773216  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  2773217 tacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 2773277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4785721 - 4785361
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  4785721 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaaccttaagaggtctcaaggattaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 4785622  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||||||  |||||||| || ||| || ||| || |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  4785621 ggaacacattcggtataaacgtcaaacccttgacgaggggagagcatcattcactttggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgaagaacatgttttgg 4785522  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4785521 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggggaacgttgctgatatcaactgaagatattatcaacagtttgattccgccacaagatcgtcattagg 4785422  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  4785421 taccgaatgaatgcatctttcagctacaacaattgtgtt-cctct-agatggggtaattcaaa 4785361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20779168 - 20778867
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  20779168 agaggttgaaggttcagtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaagatgaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccggacacacaagaagggt 20779069  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  20779068 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 20778969  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20778968 gagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtttcgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccaaaagatcgtcattagg 20778869  T
Q  311 ta 312  Q
    ||    
T  20778868 ta 20778867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 51428489 - 51428132
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  51428489 aggttgaaggtttggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtgg 51428390  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    ||||| ||  |||||||| | |||||||| || || ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  51428389 aacacgttcggtataaacgttcaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgtgtggagttaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 51428290  T
Q  216 gc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 312  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  51428289 gcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgcaagaagatcgtcattagtta 51428190  T
Q  313 cggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
     || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51428189 gggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 51428132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14330993 - 14330634
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| | ||||||||| |  |||||||| |||||||    
T  14330993 agaggttgatggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctaaaggatgaaatcactgaattcaaccaaggagtcaacgctagagacacaaggagggt 14330894  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||||| |||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  14330893 ggaacactttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 14330794  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14330793 gagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagt 14330694  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14330693 taaggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 14330634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 25762506 - 25762865
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25762506 agaggttgaaggttcgatgttttggtgtaacgttaagaggtcttaatgatgaactggctgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggt 25762605  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  25762606 ggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgg 25762705  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||     
T  25762706 gagcacaacatgttctggtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagt 25762805  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25762806 tagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattgtcttacctctaaaatggggtaattcaaa 25762865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21017476 - 21017178
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  21017476 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 21017377  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  21017376 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 21017277  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21017276 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 21017178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 32938201 - 32937903
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||| |||||||    
T  32938201 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccacatagacacaaggagggt 32938102  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||||| |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  32938101 ggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaagggagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgtttcgg 32938002  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32938001 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccagaagatcgtcattag 32937903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 35 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 47657633 - 47657319
Alignment:
Q  35 ttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaaca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||    
T  47657633 ttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactggctgaattcaaccaaggaatcaaccccagagacacaaggtgggtggaacacgttcggtataaaca 47657534  T
Q  135 tccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagc---acatgttccagtgg 231  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||   ||||||||||||||    
T  47657533 tccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgaccaaaacgtgacgagcatattttgggagcacaacatgttccagtgg 47657434  T
Q  232 atcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttcc 331  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  47657433 atcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcgtcattaggtatcgaatgaatgcacattcc 47657334  T
Q  332 agctacaacaattgt 346  Q
    |||||||||||||||    
T  47657333 agctacaacaattgt 47657319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 51028064 - 51027707
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||| |||||||| |||| ||||    
T  51028064 aggttgaaggttcgatgcgttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggactcaaccccagagacacaaggagagtgg 51027965  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    ||||| ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  51027964 aacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 51027865  T
Q  216 gc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 312  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  51027864 gcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccaccataagatcgtcattagtta 51027765  T
Q  313 cggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
     || | |  |||||  |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  51027764 gggtaag-gtgcac--tccaactacaacaattgtcgtacctctgaaatggggtaattcaaa 51027707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 242715 - 242356
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  242715 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 242616  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||||| |||||| || |||||| |||||||| || |||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  242615 ggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagcatcattcacttaggtggagttaaagaacgatgaaaacgtgacgagcatgttttgg 242516  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||     
T  242515 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcattagt 242416  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||   ||  || |  | ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  242415 ta---aagtaaggtgcattccaactataacaattgtcttacctctgaaatagggtaattcaaa 242356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 6177614 - 6177316
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  6177614 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 6177515  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  6177514 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 6177415  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6177414 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 6177316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 41794861 - 41794563
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  41794861 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 41794762  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  41794761 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 41794662  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41794661 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 41794563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 56138818 - 56139116
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  56138818 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 56138917  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  56138918 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 56139017  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  56139018 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 56139116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 18 - 373
Target Start/End: Original strand, 37866318 - 37866674
Alignment:
Q  18 gttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaa 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  37866318 gttgaaggttcggtggcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaacctcagagacacaagaagggtggaa 37866417  T
Q  118 cacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgtttt-aggag 216  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  37866418 cacattcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaacgtgatgagcatgttttcgggag 37866517  T
Q  217 c---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtac 313  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  37866518 cacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatatcttgattccgctagaagatcgtcattagttag 37866617  T
Q  314 ggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || | |  ||||  ||||| || ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  37866618 ggtaag-gtgca--ttccaactgcaacagtcgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 37866674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 312
Target Start/End: Original strand, 24606660 - 24606961
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  24606660 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagacttctcaaggatgaactgaatgaattcaactaggtagtcaaccccggagacacaaggagggt 24606759  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||   ||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  24606760 ggaacacgttcgatataaatgtccaacgctcgacaagcggagagtattattcagttgggtagaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgtattgg 24606859  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||   |||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24606860 gagcacatcatgttcccgtggattgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaagagtctgattccgccagaagatcgtgattagg 24606959  T
Q  311 ta 312  Q
    ||    
T  24606960 ta 24606961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6282620 - 6282263
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | || |||||||||||||||||||||| || | |||||||| | ||||||||||||  ||||| | |||||||||    
T  6282620 aggttgaaggttcgatgctttggtatgacattaagaggtctcaaggatgaaccgactaaattcaacaaaggagtcaaccccatagacagaaggagggtgg 6282521  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    ||||| ||  |||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  6282520 aacacgttcggtataaacgtccaacactcgacaaggagagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 6282421  T
Q  216 gc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 312  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  6282420 gcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcattagtta 6282321  T
Q  313 cggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaa 372  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||    
T  6282320 cggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaa 6282263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20901967 - 20901608
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  20901967 agaggttgaaggttcgatgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgattgaattcaaccaaggagtcaaccctgaagacacaaggagggt 20901868  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
     |||||| ||  |||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  20901867 agaacacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgagtggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 20901768  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||     
T  20901767 gagcacagcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacactgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccacctgaagatcgtcattagt 20901668  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20901667 tagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgaggtaattcaaa 20901608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 40354072 - 40353774
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  40354072 agaggttgaaggtttggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaattcaaccaaagagtcaaccccagagacacaaggatggt 40353973  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  40353972 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 40353873  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40353872 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcattag 40353774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 17211174 - 17211532
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||    
T  17211174 agaggttgaaggttatgtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactaaatgaattcaaccaaggagtcaacccatgagacacaaggagggt 17211273  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||| ||||||| ||||| || | ||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  17211274 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgagggaagaatatcattcatttgagtcgaattaacgaacgataaaaacgtgacgagcatgttttgg 17211373  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17211374 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatattatcaacagtctgattccgccagaagatcgtgattagg 17211473  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || |||   |||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  17211474 taggga---aatgcatcttccaactacaacaattgtctta-ctctgaaatgaggtaattcaaa 17211532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 1226068 - 1226426
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  1226068 agaggttgaaggtttggtgccttgatgtaacgttaagaagtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagttaaccccagagacacagg-agggt 1226166  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||   ||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  1226167 ggaatacgtttgctataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgtgtggaattaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgg 1226266  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1226267 gagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagt 1226366  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  1226367 tagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctcataaatggggtaattcaaa 1226426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 49063888 - 49064246
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  49063888 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaa-aggtctaaaggatgaactcactgaattcaacaaaggagtcaaccccagagacacaaggagagt 49063986  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||||| |||||| || |||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  49063987 ggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagggtgtcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgtttttg 49064086  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  49064087 gagcacaacatgtttccgtggatcgatatgcgggtgacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagt 49064186  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  49064187 tagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctcttaaatggggtaattcaaa 49064246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26591984 - 26591678
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26591984 agaggttgaagattcggtaccttggtgtaacgttaagaggtctcaagaatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 26591885  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||   ||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||| |    
T  26591884 ggaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgaacatattttgg 26591785  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26591784 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagg 26591685  T
Q  311 tacggaa 317  Q
    |||||||    
T  26591684 tacggaa 26591678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 363
Target Start/End: Original strand, 3393212 - 3393559
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3393212 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactaaatgaattcaaccaatgagtcaaccccggagacacaaggagggt 3393311  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||   ||||||| ||||||||||||  |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  3393312 ggaatacgttcgatataaacgtccaacgctcgaggatgggagattatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaggagcatgttttgg 3393411  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  3393412 gagcacaacatgttctagtggatcgatatgcatgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccagaagatcatgattagg 3393511  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggg 363  Q
    || |    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  3393512 tagg----gaatgcaccttccaactacaacatttgtattacc-ctgaaatggg 3393559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 319
Target Start/End: Original strand, 11288203 - 11288510
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  11288203 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgaatgaattcaaccagggaatcaaccccgaagacacaaggagggt 11288302  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11288303 ggaatacgttccgtataaacgtccaacggtcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 11288402  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| |||| |    
T  11288403 gagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcacaa-tttgattctgttagaagatcgtgattaag 11288501  T
Q  311 tacggaatg 319  Q
    || ||||||    
T  11288502 tagggaatg 11288510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Original strand, 42886171 - 42886509
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  42886171 agaggttgaaggttcggtgctttggtgtaacgttaagaggtctcaagaatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaacccgggagacacaaggagggt 42886270  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagag---tatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttt 210  Q
    ||||||| ||   ||||||| ||||||||||||| || ||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  42886271 ggaacacgttcgttataaacttccaacgctcgacgaggggagagtactatcattcacttgggtggaattaaccaacgacgaaaacatgacgagcatgctt 42886370  T
Q  211 taggagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatt 307  Q
    |  ||||   |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  42886371 tgagagcacaacattttctagtggatcgatacgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccagaagatcatcatt 42886470  T
Q  308 aggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    |||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  42886471 aggtaccgatttaatgtaccttccagctacaacaattgt 42886509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 373
Target Start/End: Original strand, 45939438 - 45939793
Alignment:
Q  19 ttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaac 118  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  45939438 ttgaaggttcgatgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccgaagacacaaggagggtggaac 45939537  T
Q  119 acattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagc- 217  Q
    || ||   ||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||     
T  45939538 acgttcgatataaacgttcaacgctcgacgagaggagattatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgataatgtgacgagcatgttttgggagca 45939637  T
Q  218 --acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacgg 315  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  ||| |||||||||||||| || ||    
T  45939638 caacatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcttccataagatcgtcattagttaggg 45939737  T
Q  316 aatgaatgcaccttccagctacaac-aattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
     | |  ||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45939738 taag-gtgca--ttccaactacaactaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 45939793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 28082146 - 28082444
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  28082146 agaggttgaaggtttggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 28082245  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  28082246 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgg 28082345  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28082346 gagcacatcatgtttcagtggatcaatatgcaggtgaagttacttagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccagaagatcgtcattag 28082444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 49094653 - 49094951
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||||| ||| |||    
T  49094653 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacattaagagatctcaaggatacactgactgaattcaaccaagtagtcaaccccagagacacaaggatggt 49094752  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |    
T  49094753 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgaccatgttttgg 49094852  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49094853 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcgtcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 49094951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 352
Target Start/End: Original strand, 10312180 - 10312517
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  10312180 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctgaaggatgaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagtgt 10312279  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| |  ||  |||||||||| |||| |||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  10312280 ggaatatgttcggtataaacatacaacactcgacgatgggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 10312379  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||| | | | |||||||  ||||||||| ||||||    
T  10312380 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttaagatcaactgaagatattatcaacaatctaattccgctggaagatcgtgattagg 10312479  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacc 352  Q
    || |||||     ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  10312480 tagggaatt----caccttccaactacaacaattgtcttacc 10312517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 1042659 - 1042955
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||||||||||  ||||||| |||||||    
T  1042659 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgactgaattcaaccaagaagtcaaccccaaagacacaaggagggt 1042758  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||| | ||  |||||||| ||||||||| ||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  1042759 ggaacgcctt--gtataaacgtccaacgctagacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgg 1042856  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1042857 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatataatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 1042955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 9489587 - 9489884
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9489587 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaatgttaagaggtctcaaggatcaactaactgaattcaacaaaggaatcaaccccggagacacaaggagggt 9489686  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  9489687 ggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtgacgagcatgtttt-g 9489785  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9489786 gagcacagcatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttattgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 9489884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 46816820 - 46816465
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  46816820 aggttgaaggttcggtgccttgatgtaacattaagagatctcaaggatcaactgaatgaattcaactacggagtcaaccccagagacgcaaggagggtgg 46816721  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    || || || |||||| || ||||| ||||||| || |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  46816720 aatacgttcagtatacacgtccaatgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacaaaaacgtgacgagcatgttttggga 46816621  T
Q  216 gc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 312  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46816620 gcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtaacgttgttgagatca--tgaagatatcatcaatagcttgattccgccagaagatcgtcattagtta 46816523  T
Q  313 cggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
     || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  46816522 gggcaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgagatggggtaattcaaa 46816465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 34 - 373
Target Start/End: Original strand, 18412523 - 18412860
Alignment:
Q  34 cttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaac 133  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||  ||||||||    
T  18412523 cttggtgtcacgttaagaggtatcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaagaagggtggaatacgttcggtataaac 18412622  T
Q  134 atccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagca---catgttccagtg 230  Q
     ||||||||||||| |  | ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||||| |||||    
T  18412623 gtccaacgctcgacgatggaagaatatcattcagttcggtggaattaatgaacgacgataacgtgaggagcatgttttgggagcacaccatgtttcagtg 18412722  T
Q  231 gatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttc 330  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||| |    ||||||||||||    
T  18412723 gatcgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaatatattatcaacaatttgattctgccagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttc 18412818  T
Q  331 cagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18412819 caactacaacaattgtctta-ctctgaaatggggtaattcaaa 18412860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 39588837 - 39589135
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  39588837 agaggttgaaggttcgatgccttggtataacgttaagaggtctcaatgatgaactaactgaattcaaccaaggagtcaaccccatagacacaaggagggt 39588936  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  39588937 ggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacggggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgg 39589036  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  39589037 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcggatgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgctagaagatcgtcattag 39589135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31824927 - 31824573
Alignment:
Q  15 gaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtg 114  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  31824927 gaggttgaaggttcggtgccttgatgtaaagttaagagctctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaactccagagatgcaaggagggtg 31824828  T
Q  115 gaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagg 214  Q
    ||| || ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  31824827 gaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggg 31824728  T
Q  215 agc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggt 311  Q
    |||   |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  31824727 agcacaacatgttctagtggatcaatatgcgggtaacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgctagaagatcgtcattagtt 31824628  T
Q  312 acggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaatt 369  Q
    | || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||    
T  31824627 agggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacatttgaaatagggtaatt 31824573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 33163839 - 33163484
Alignment:
Q  18 gttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaa 117  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||  | | ||||| ||  ||||||||||    
T  33163839 gttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggtgtcagtctcagagacgcaatgagggtggaa 33163740  T
Q  118 cacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagc 217  Q
     || ||  |||||||| |||||||||| || || |||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  33163739 tacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtaacattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagc 33163640  T
Q  218 aca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacg 314  Q
    |||   |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  33163639 acaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcattagttagg 33163540  T
Q  315 gaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    | | |  ||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||    
T  33163539 gtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttgcctcttaaatggggtatttcaaa 33163484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 13866171 - 13866516
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13866171 agaggttgaaggttcggtaccttggtgtcacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaactaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 13866270  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||  | ||  |||||||| ||||||  | ||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||| || |||||||| |    
T  13866271 ggaatgcgtttggtataaacgtccaacatttgacgatgggagaatatcattcagttggatggaattaacaaacgacgacgacgtgacgaacatgttttgg 13866370  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||| | |||||| ||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13866371 gagcacaacatgttaccgtggattgatatgtatgtaacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagaccgtgattagg 13866470  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaat 360  Q
    || |    ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||    
T  13866471 tagg----gaatgcacctttcaactacaacaattgtcatacctctgaaat 13866516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 31324082 - 31324440
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | | ||||||||||| |||||||  |||| |    
T  31324082 agaggttgaaggttcggtaccttggtgtcacgttaagaggtctcaaggatcaattgcatgaattcaaccaagtagtcaaccccgaagacacaatgaggat 31324181  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| |  || ||||||||| ||||||| ||||| |  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |    
T  31324182 ggaataggttcagtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatattattcagttgggtggaattaacgaacgacaatgacgtgacgagcatgtttttg 31324281  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||| | ||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  31324282 gagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtgtgtaaagttgctgagatcaactgaagacattctcaacagtttgattccgctagaagatcatgattagg 31324381  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || |    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  31324382 tagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaaatgagataattcaaa 31324440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 126 - 373
Target Start/End: Original strand, 21711550 - 21711797
Alignment:
Q  126 gtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagcaca---tg 222  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||    
T  21711550 gtataaacatctaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatg 21711649  T
Q  223 ttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || || | |  |    
T  21711650 ttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaag-gt 21711748  T
Q  323 gcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21711749 gca--ttccaactacaacaattctcttacctctgaaatggggtaattcaaa 21711797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 101 - 309
Target Start/End: Original strand, 55796738 - 55796949
Alignment:
Q  101 acacagggagggtggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaa 200  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  55796738 acacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgac 55796837  T
Q  201 gagcatgttttaggagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaa 297  Q
    || |||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  55796838 gaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaa 55796937  T
Q  298 gatcgtcattag 309  Q
    ||||||||||||    
T  55796938 gatcgtcattag 55796949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 13850657 - 13851002
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13850657 agaggttgaaggtttggtaccttggtgtcacattaagaggtcttacggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 13850756  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||| ||||||| | ||| |  ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||  |||||| || |||||||| |    
T  13850757 ggaatacgtttggtataaacgtccaacgtttgacgatgggagaatatcattcagttggatgaaattaacaaacgacgacgacgtgacgaacatgttttgg 13850856  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||| | |||||||||||||   ||||| | ||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13850857 gagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtatgtaacattgctgagatcaactaaagatattctcaacagtttgattccgccagaagaccgtgattagg 13850956  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaat 360  Q
    || |    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||    
T  13850957 tagg----gaatgcaccttccaactacaacaattatcttacctctaaaat 13851002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 153 - 373
Target Start/End: Original strand, 27759374 - 27759594
Alignment:
Q  153 gagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacg 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27759374 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacg 27759473  T
Q  250 tcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtttt 349  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || || | |  ||||  || || ||||||||||||| ||    
T  27759474 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--tttcaactacaacaattgtctt 27759570  T
Q  350 acctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  27759571 acctctgaaatggggtaattcaaa 27759594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Original strand, 56139421 - 56139525
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  56139421 attcaaaggtaacacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 56139520  T
Q  466 tccaa 470  Q
    |||||    
T  56139521 tccaa 56139525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 1043260 - 1043363
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  1043260 attcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 1043359  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  1043360 tcca 1043363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21412824 - 21412647
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21412824 agaggttgaaggttcggggccttagtgtaacattaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaaccacggagacacaaggagggt 21412725  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacga 191  Q
    |||| || |   |||||||| ||||| | || || || ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  21412724 ggaatacgtccggtataaacgtccaatgttcaacgaggggagaatatcatttagttggatggaattaacgaacgacga 21412647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 28082748 - 28082851
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  28082748 attcaaaggtaagacaattgttggagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactgtggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 28082847  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  28082848 tcca 28082851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Original strand, 885319 - 885423
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa-tcgcaggac 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||    
T  885319 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggagcaattcaaacttgttaattggcaggac 885418  T
Q  466 tccaa 470  Q
    |||||    
T  885419 tccaa 885423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 46816219 - 46816127
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46816219 attcaaaggtaagacaattgttgtagttagaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcg 46816127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 6177011 - 6176908
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  6177011 attcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 6176912  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  6176911 tcca 6176908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21016873 - 21016770
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  21016873 attcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 21016774  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  21016773 tcca 21016770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 39589440 - 39589529
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39589440 attcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcacatttcaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaa 39589529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Original strand, 27759840 - 27759944
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  27759840 attcaaaggtaagacaattgctgtagttggaatgcacatttcaactacaacaattgtcctactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 27759939  T
Q  466 tccaa 470  Q
    |||||    
T  27759940 tccaa 27759944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Original strand, 45940038 - 45940130
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  45940038 attcgaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacatcccaactgcaacaattgtcttactctggatggagcaattcaaacttgttaatcg 45940130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 40353469 - 40353366
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  40353469 attcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaaaaattgtcttaccctggatggggaaattcaaacttgttaatcggcaggac 40353370  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  40353369 tcca 40353366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 49095256 - 49095359
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  49095256 attcaaaggtaacacaattgttggggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 49095355  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  49095356 tcca 49095359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 367 - 468
Target Start/End: Original strand, 37866919 - 37867022
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggt-aattcaaacttgttaatc-gcagga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  37866919 attcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgcacattccaactgcaataattctcttactcttgatggggtcaattcaaacttgttaatcggcagga 37867018  T
Q  465 ctcc 468  Q
    ||||    
T  37867019 ctcc 37867022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 367 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 51027461 - 51027371
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaat 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51027461 attcaaaggtaagacaattgttgtaattagagtgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaat 51027371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 367 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 20901370 - 20901286
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaactt 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20901370 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcagattccaactacaacaattgtcttactctggatgaggcaattcaaactt 20901286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Original strand, 21712042 - 21712134
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21712042 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacatttcaagtacaacaattatcttactctggatagggcaattcaaacttgttaatcg 21712134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 38132814 - 38132722
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38132814 attcaaaggtaagacaattgttgtagttgaaatgcacattccaactacaacagttgtcttgctatggatggggcaattcaaacttgttaatcg 38132722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 55797254 - 55797357
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||    
T  55797254 attcaaaggtaacacaattgttgtggttggaattcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttactaatcggcaggac 55797353  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  55797354 tcca 55797357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Original strand, 25763111 - 25763203
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25763111 attcgaaggtaagacaattgttggagttggaatgcacatcccaactgcaacaattatcctactctggattgggcaattcaaacttgttaatcg 25763203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 37867025 - 37867129
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggt-aattcaaacttgttaatc-gcagga 464  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  37867025 attcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgtacattccaactgcaataattctcttactcttgatggggtcaattcaaacttgctaaccagcagga 37867124  T
Q  465 ctcca 469  Q
    |||||    
T  37867125 ctcca 37867129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Original strand, 55794516 - 55794596
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaacc 94  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  55794516 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgactgaattcaaccaaggagtcaacc 55794596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 255 - 359
Target Start/End: Original strand, 17292114 - 17292214
Alignment:
Q  255 gagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctc 354  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17292114 gagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtgattatgtagg----gaatgcaccttccaactacaacaattgttttacctc 17292209  T
Q  355 tgaaa 359  Q
    |||||    
T  17292210 tgaaa 17292214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 224 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 49817283 - 49817150
Alignment:
Q  224 tccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatg 323  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||||||| |||||||| |    |||||    
T  49817283 tccagtggatcgatatgcgtgtaacgttgatgagatcaaatgaagatattatcaacagtctgattctgccaaaagatcgtgattaggtagg----gaatg 49817188  T
Q  324 caccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatgg 362  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  49817187 caccttccaactacaataattgtcttacc-ctgaaatgg 49817150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 2773521 - 2773613
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2773521 attcaaaggtaagacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttgttaa 2773613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Original strand, 24607240 - 24607344
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  | |||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  24607240 attcaaaggtaagataattgttttagttggaaggtgccttccaactacaacaattgtcctcctctggatggagtaattcaaacttgttaaacggcaggac 24607339  T
Q  466 tccaa 470  Q
    |||||    
T  24607340 tccaa 24607344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 26591610 - 26591500
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat-------tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc- 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||        || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  26591610 attcaaaggtaagacaattgttgtagttgggaggtacaaacaaacgtctaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcg 26591511  T
Q  459 gcaggactcca 469  Q
    |||||||||||    
T  26591510 gcaggactcca 26591500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 36776214 - 36776122
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  36776214 attcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggtacaaatgtccaactgaaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaa 36776122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 49423452 - 49423360
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||    ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49423452 attcaaaggtaacacaattgttgtagtttgaaggtacaaacgtccaactacaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttgttaa 49423360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 49791631 - 49791539
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  49791631 attcaaaggtaagccaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaa 49791539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 13181595 - 13181546
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggat 63  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13181595 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggat 13181546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Original strand, 21711468 - 21711533
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattca 79  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  21711468 agaggttgaaagttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctaaaggatgaactcactgaattca 21711533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 395 - 456
Target Start/End: Original strand, 18412806 - 18412868
Alignment:
Q  395 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctg-gatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18412806 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttactctgaaatggggtaattcaaacttgttaa 18412868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 22437423 - 22437515
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  22437423 attcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcatctgaattgggtaattcaaacttgttaa 22437515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 34529491 - 34529399
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||    ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  34529491 attcaaaggtaacacaattgttggagttggaaggtacaaacgtccaactacaacaattgtcttcctctgaatggggcaattcaaacttgttaa 34529399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 885380 - 885327
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  885380 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 885327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 1043321 - 1043268
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1043321 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactgcaacaattgtcttac 1043268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 418 - 470
Target Start/End: Original strand, 1226606 - 1226659
Alignment:
Q  418 aattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggactccaa 470  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1226606 aattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaa 1226659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 32937620 - 32937559
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32937620 attcaacggtaagataattgttgtagttggagtgcaccttccaactacaacaattgtcttac 32937559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 456
Target Start/End: Original strand, 49064575 - 49064635
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  49064575 gaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaa 49064635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 452
Target Start/End: Original strand, 20901309 - 20901388
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggt-aattcaaacttg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  20901309 gtaagacaattgttgtagttggaatctgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttg 20901388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 23124804 - 23124733
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23124804 acgttaaaaggtctcaaggatcaactggatgaaatcaaccaaggactcaaccccggagacacaaggagggtg 23124733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 34152981 - 34152888
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattg-tcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||    ||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  34152981 attcaaaggtaagacaattgttgttgttggaagatacaaacgtccaactgcaacaattgatcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaa 34152888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 957150 - 957058
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||    
T  957150 attcaaaggtaacacaatttttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcatcctttgaatggggtaattcaaacttgttaa 957058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 406 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 44559939 - 44559889
Alignment:
Q  406 tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  44559939 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaa 44559889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 51427887 - 51427795
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| |||||||    
T  51427887 attcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttccttttaatggggtaattcaaatttgttaa 51427795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 28082809 - 28082756
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  28082809 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactccaacaattgtcttac 28082756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 37867086 - 37867033
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37867086 gtaagagaattattgcagttggaatgtacattccaactgcaacaattgtcttac 37867033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Original strand, 46816158 - 46816211
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||    
T  46816158 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattctaactacaacaattgtcttac 46816211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Original strand, 21169667 - 21169723
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  21169667 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 21169723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 37866980 - 37866900
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggt-aattcaaacttgt 453  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||    
T  37866980 gtaagagaattattgcagttggaatgtgcattccaactgcaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgt 37866900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 43889490 - 43889434
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  43889490 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctctaaatggggtaattcaaacttg 43889434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 397 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 14330305 - 14330246
Alignment:
Q  397 aatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  14330305 aatgcaccttccaactgtaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaa 14330246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 39589501 - 39589422
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggt-aattcaaacttg 452  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  39589501 gtaagacaattgttgcagttgaaatgtgcattccaacttcaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttg 39589422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 396 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 47657346 - 47657271
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggactccaa 470  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  47657346 gaatgcacattccagctacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggcaggactccaa 47657271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 43889196 - 43889104
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattc---caactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||| | |||  |   |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  43889196 attcaaaggtaacacgattgttggagttggaaggtacaaacgttcaactgcaacaattttcttcctctgaatggggtaattcaaacatgttaa 43889104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 49571621 - 49571713
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||    ||  ||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  49571621 attcaaaggtaagacaattgttgcagttgggaggtacaaacgtcacactgcaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaa 49571713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17211839 - 17211794
Alignment:
Q  322 tgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaa 367  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17211839 tgcaccttcaaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaa 17211794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23124617 - 23124479
Alignment:
Q  218 acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaa 317  Q
    ||||||||  |||||||||||||   || |||| |||||||||   | |||||||  |||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  23124617 acatgttctcgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgcttaaagatattctcaacaatttgatttcgccagaagattgtgattaggtagggaa 23124518  T
Q  318 tgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaat 360  Q
    ||    |||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23124517 tg----cacctttcaactacaacaattgtcttacctcttaaat 23124479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 45940099 - 45940046
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  45940099 gtaagacaattgttgcagttgggatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 45940046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Original strand, 51027232 - 51027289
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatgggg-taattcaaacttg 452  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  51027232 gaatgtaccttccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaaattcaaacttg 51027289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 56139482 - 56139429
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  56139482 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtgttac 56139429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 9489931 - 9489895
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9489931 attcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgcac 9489895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 456
Target Start/End: Original strand, 17211488 - 17211540
Alignment:
Q  405 ttccaactgcaacaattgtcttactctg-gatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  17211488 ttccaactacaacaattgtcttactctgaaatgaggtaattcaaacttgttaa 17211540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 470
Target Start/End: Original strand, 20901120 - 20901196
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatgggg-taattcaaacttgttaatc-gcaggactccaa 470  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  20901120 gaatgtaccttccaactacaacaattgtcttactctagatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaa 20901196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 36776510 - 36776454
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  36776510 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 36776454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 39589182 - 39589146
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39589182 attcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 39589146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 44560171 - 44560115
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  44560171 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 44560115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 14330389 - 14330358
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14330389 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 14330358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Original strand, 14330649 - 14330684
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14330649 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 14330684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Original strand, 20901623 - 20901658
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901623 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 20901658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21411889 - 21411842
Alignment:
Q  322 tgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaatt 369  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21411889 tgcaccttcgaactacaacaattatcttacctctgaaatggggtaatt 21411842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Original strand, 31824584 - 31824619
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31824584 ttcaaatgtaagacaattgttgtagttggaatgcac 31824619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 377 - 428
Target Start/End: Original strand, 38132755 - 38132806
Alignment:
Q  377 aagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  38132755 aagacaactgttgtagttggaatgtgcatttcaactacaacaattgtcttac 38132806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 46816512 - 46816461
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtctta-ctctg-gatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  46816512 cattccaactacaacaattgtcttacctctgagatggggtaattcaaacttg 46816461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 346
Target Start/End: Original strand, 49064563 - 49064602
Alignment:
Q  307 taggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  49064563 taggtacggaatgaatgcaccttccaactgcaacaattgt 49064602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 452
Target Start/End: Original strand, 51027400 - 51027479
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggt-aattcaaacttg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || || || | |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  51027400 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcactctaattacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttg 51027479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Original strand, 51428147 - 51428182
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51428147 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 51428182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 1226406 - 1226376
Alignment:
Q  373 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1226406 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 1226376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Original strand, 6176949 - 6177003
Alignment:
Q  374 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  6176949 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 6177003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Original strand, 21016811 - 21016865
Alignment:
Q  374 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  21016811 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 21016865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 21017164 - 21017114
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||    
T  21017164 cattccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgt 21017114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 397 - 451
Target Start/End: Original strand, 24606966 - 24607020
Alignment:
Q  397 aatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaactt 451  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  24606966 aatgtacattccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaactt 24607020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 368 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 31324425 - 31324395
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31324425 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 31324395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Original strand, 32937558 - 32937612
Alignment:
Q  374 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||| |||||||| ||||||    
T  32937558 ggtaagacaattgttgtagttggaaggtgcactccaactacaacaattatcttac 32937612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 32937889 - 32937839
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||    
T  32937889 cattccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgt 32937839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 403 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 40353760 - 40353714
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaac 449  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  40353760 cattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaac 40353714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 403
Target Start/End: Original strand, 46816485 - 46816515
Alignment:
Q  373 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46816485 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 46816515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 49064226 - 49064196
Alignment:
Q  373 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49064226 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 49064196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 49095318 - 49095264
Alignment:
Q  374 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  49095318 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccccaacaattgtgttac 49095264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Original strand, 55796963 - 55797013
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  55796963 cattccaactacaacaattgtcttcctttgaatgggctaattcaaacttgt 55797013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 242131 - 242040
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattc---caactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | | | |||  |   |||||||||||| |||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  242131 ttcaaaggtaacacaattgttgtagttcggaggtacaaacgttcaactgcaacaactgtcttcctttgaattgggtaattcaaacttgttaa 242040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 1043002 - 1042969
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1043002 attcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatg 1042969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 456
Target Start/End: Original strand, 11288505 - 11288566
Alignment:
Q  395 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||||| |||||||| | | ||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  11288505 ggaatgcaccttccaactaccataattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaa 11288566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 367
Target Start/End: Original strand, 21411556 - 21411601
Alignment:
Q  322 tgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaa 367  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21411556 tgcaccttcgaactacaacaattatcttacctctgaaatggggtaa 21411601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 21712103 - 21712050
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  21712103 gtaagataattgttgtacttgaaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 21712050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 24607297 - 24607248
Alignment:
Q  379 gacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||||    
T  24607297 gacaattgttgtagttggaaggcaccttccaactaaaacaattatcttac 24607248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 27759897 - 27759848
Alignment:
Q  379 gacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| || ||||||||||||    
T  27759897 gacaattgttgtagttgaaatgtgcattccaactacagcaattgtcttac 27759848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 957446 - 957390
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  957446 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattgaaacttg 957390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Original strand, 21017132 - 21017167
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21017132 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 21017167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 28082490 - 28082455
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28082490 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 28082455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 362
Target Start/End: Original strand, 32937260 - 32937300
Alignment:
Q  322 tgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatgg 362  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  32937260 tgcaccttcaagctacaacaattatcttacctctgaaatgg 32937300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Original strand, 32937857 - 32937892
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32937857 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 32937892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 34153277 - 34153221
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  34153277 gaatgcaccttccagctacaacagttgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 34153221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Original strand, 40353728 - 40353763
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40353728 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 40353763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 55796995 - 55796960
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55796995 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 55796960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 65)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 13402445 - 13402805
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13402445 agaggttgaaggttaggtaccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaagagtcaaccccagagacacaaggagggt 13402544  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13402545 ggaacacgttctgtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 13402644  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13402645 gagcccaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccagaagatcgtcattagg 13402744  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  13402745 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 13402805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 32027923 - 32027565
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  32027923 aggttgaaggttcggtgactttttgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggttg 32027824  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    ||||| ||  |||||||| ||||||  ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  32027823 aacacgttcggtataaacgtccaacattcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 32027724  T
Q  216 gc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 312  Q
    ||   |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027723 gcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 32027624  T
Q  313 cggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  32027623 cggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 32027565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 32037982 - 32037624
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  32037982 aggttgaaggttcggtgactttttgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggttg 32037883  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    ||||| ||  |||||||| ||||||  ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  32037882 aacacgttcggtataaacgtccaacattcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 32037783  T
Q  216 gc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 312  Q
    ||   |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32037782 gcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 32037683  T
Q  313 cggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
     ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  32037682 aggaataaatgcacattaaagctacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 32037624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 34803193 - 34802858
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  34803193 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtcttaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaatcccagagacacaaggagggt 34803094  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |    
T  34803093 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattgacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgatgagcatgttcagg 34802994  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  34802993 gagcacaacatgttccagtaaatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgccaaaagatcgtcattagg 34802894  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    || ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  34802893 taaggaatgaatgcgctttcgagctacaaaaattgt 34802858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 6205396 - 6205694
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  6205396 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggt 6205495  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  6205496 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 6205595  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6205596 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 6205694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 309
Target Start/End: Original strand, 27640094 - 27640390
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  27640094 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactcactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatggtgg 27640193  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |    
T  27640194 aacacatttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttggaa 27640293  T
Q  216 gca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27640294 gcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 27640390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Original strand, 12396688 - 12397023
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  12396688 agaggttgaaggtttggtgccttggtataacgttaagcggtctcaatgatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacataaggagggt 12396787  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||| ||| ||  |||||||| || ||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  12396788 ggagcacgttcggtataaacgtctaacactcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgg 12396887  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12396888 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatctactgaagatatcatcaacaacttgattccgccaaaagatcgtcattagg 12396987  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12396988 tacagaatgaatgcaccttttagctacaacaattgt 12397023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 11692363 - 11692661
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||| | |||||||||||  |||||||| ||| |||    
T  11692363 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactaaattcaaccaaggagtcaacccgagagacacaaggatggt 11692462  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  11692463 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacaaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgg 11692562  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
     |||   |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11692563 aagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 11692661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 309
Target Start/End: Original strand, 29108057 - 29108350
Alignment:
Q  19 ttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaac 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29108057 ttgaaggttcggtgccttggtgtaacgctaagaggtctcaaggatgaactgactgaatttaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggaac 29108156  T
Q  119 acattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagca 218  Q
    || |   |||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29108157 acctgtggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgggagca 29108256  T
Q  219 ---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
       ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  29108257 cagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 29108350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 346
Target Start/End: Original strand, 14114957 - 14115280
Alignment:
Q  18 gttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaa 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  14114957 gttgaaggttcggtgccttggt----cgttaagaggtctcaaggatgaactggatgaattcaaccaaggagtcaacctcggagacacaaggagggtgcaa 14115052  T
Q  118 cacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagc 217  Q
     || || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  14115053 aacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaagtaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttctgggagc 14115152  T
Q  218 ---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacg 314  Q
       ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||| |    
T  14115153 acaacatgttccagtggatcaatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaagagtctgattctgccagaagatagtgattaggtagg 14115252  T
Q  315 gaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
        |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14115253 ----gaatgcaccttccaactacaacaattgt 14115280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 29066471 - 29066763
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  29066471 agaggttgaaggttcggtgt------gtaacgctaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 29066564  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29066565 ggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgg 29066664  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29066665 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgccagtagatcgtcattag 29066763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 29075484 - 29075776
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  29075484 agaggttgaaggttcggtgt------gtaacgctaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 29075577  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29075578 ggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgg 29075677  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29075678 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgccagcagatcgtcattag 29075776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 801078 - 801375
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   | |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  801078 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgagtgaattcaaccgagaagtcgaccccagagacacaaggagggt 801177  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||| ||||| ||||||| || |||| || ||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  801178 ggaatacgtttggtataaacgtccaaagctcgacgaggggag-gtgtcattcacttgggtagagttaaagaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 801276  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  801277 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 801375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 38 - 309
Target Start/End: Original strand, 29110473 - 29110748
Alignment:
Q  38 gtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacaggga-gggtggaacacattaagtataaacatc 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||  |||||||| ||    
T  29110473 gtgtaacgctaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggatgggtggaacaccttcggtataaacgtc 29110572  T
Q  137 caacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagca---catgttccagtggat 233  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||    
T  29110573 caacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggat 29110672  T
Q  234 cgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29110673 cgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgccagcagatcgtcattag 29110748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Original strand, 22305710 - 22305980
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||| |||||    
T  22305710 aggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaagataaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggatggtgg 22305809  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    ||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||    
T  22305810 aacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtcacgaccatgttttggga 22305909  T
Q  216 gc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtt 283  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22305910 gcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtt 22305980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 161 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 30257729 - 30257516
Alignment:
Q  161 cattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagcacat---gttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgag 257  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||   |||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  30257729 cattcagttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgag 30257630  T
Q  258 atcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctga 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  30257629 atcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctct-a 30257532  T
Q  358 aatggggtaattcaaa 373  Q
    ||||||||||||||||    
T  30257531 aatggggtaattcaaa 30257516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 127 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 35058919 - 35058673
Alignment:
Q  127 tataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagcaca---tgt 223  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||   |||    
T  35058919 tataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgttacgagcatgttttgggagcacaacatgt 35058820  T
Q  224 tccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |  || ||||| | |||||||||||||||| || ||    || |    
T  35058819 tccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaacatcttaattccacaagaagatcgtcattagttaggg---taagg 35058723  T
Q  324 caccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
     || ||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  35058722 tacattccaactacaacaattgtcttacctctcaaattgggtaattcaaa 35058673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 6205999 - 6206102
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  6205999 attcaaaggtaacacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 6206098  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  6206099 tcca 6206102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 3766018 - 3765912
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3766018 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 3765919  T
Q  114 ggaacac 120  Q
    |||||||    
T  3765918 ggaacac 3765912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 367 - 455
Target Start/End: Original strand, 27640694 - 27640782
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgtta 455  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27640694 attcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgtta 27640782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 261 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 35021284 - 35021174
Alignment:
Q  261 aactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaat 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||| || |||    
T  35021284 aactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaagtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt-cctttg-aat 35021187  T
Q  361 ggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||||||||    
T  35021186 ggggtaattcaaa 35021174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 367 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 35058428 - 35058340
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgtta 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35058428 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaaatgtcttactctggatgaggcaattcaaacttgtta 35058340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 11692966 - 11693069
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  11692966 attcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgacttacaatggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 11693065  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  11693066 tcca 11693069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Original strand, 2192906 - 2193010
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  2192906 attcaaaggtaacacaattgttgtggttgaaatgcacattccaactgcaaaaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgctaatcagcaggac 2193005  T
Q  466 tccaa 470  Q
     ||||    
T  2193006 cccaa 2193010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24020791 - 24020687
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  24020791 attcaaaggtaacacaattgttgtggttgaaatgcacattccaactgcaacaattgtcttacgctggatggggcaattcaaacttgctaatcagcaggac 24020692  T
Q  466 tccaa 470  Q
     ||||    
T  24020691 cccaa 24020687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 469
Target Start/End: Original strand, 14123121 - 14123220
Alignment:
Q  371 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggactcca 469  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  14123121 aaaggtaagacaatttttgtagttggaatgcacatttcaactacaacaattgtcttactatggatggggcaatttaaacttgttaatcggcaggactcca 14123220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 35060263 - 35060162
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||| || |||||||||    
T  35060263 aggttgaaggttcggtgtcttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaacgagttaaccccagagacgcaaggagggtgg 35060164  T
Q  116 aa 117  Q
    ||    
T  35060163 aa 35060162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 229 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3765867 - 3765725
Alignment:
Q  229 tggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagttt-gattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcacc 327  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| || || | |  ||||      
T  3765867 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttaaattccaccagaagatcatcattagttagggtaag-gtgca-- 3765771  T
Q  328 ttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  3765770 ttccaactgcaacaattgtcttacctctcaaatggggtaattcaaa 3765725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 367 - 439
Target Start/End: Original strand, 29067068 - 29067140
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatgggg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29067068 attcaaatgtaagacaattgttgcagttggaatgcacattccaacttcaacaattgtcttactctggatgggg 29067140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 367 - 439
Target Start/End: Original strand, 29108655 - 29108727
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatgggg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29108655 attcaaatgtaagacaattgttgcagttggaatgcacattccaacttcaacaattgtcttactctggatgggg 29108727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 17465415 - 17465287
Alignment:
Q  228 gtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcacc 327  Q
    |||||||||||||   || |||| || ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||  |||| ||||    
T  17465415 gtggatcgatatgtttgtcacgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccaaaagatcgtgattaggta--ga--gaatacacc 17465320  T
Q  328 ttccagctacaacaattgttttacctctgaaat 360  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17465319 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaat 17465287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 13403331 - 13403423
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    ||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13403331 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaaggtacaaatgtccaattgcaacaatcgtctttctctgaatggggtaattcaaacttgttaa 13403423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 255 - 373
Target Start/End: Original strand, 34134807 - 34134921
Alignment:
Q  255 gagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctc 354  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||    ||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  34134807 gagatcaactgaagaaattctcaacagtttgattccgctaaaagatcgtgattaggtagggaat----gcacctttcaactacaacaattgtcttacctc 34134902  T
Q  355 tgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||||||||  |||||||||    
T  34134903 tgaaatggaataattcaaa 34134921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 12397292 - 12397384
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12397292 attcaaaggtaagacaattgttgtagttgggaggtacaaacatccaactgcaacaattatcttcctctaaatggggtaattcaaacttgttaa 12397384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24021168 - 24021096
Alignment:
Q  237 tatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||||||| | || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24021168 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgccataaaatcgtcattag 24021096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 35020930 - 35020838
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  35020930 attcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctcagaatggggcaattcaaacttgttaa 35020838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 29067129 - 29067076
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29067129 gtaagacaattgttgaagttggaatgtgcattccaactgcaacaattgtcttac 29067076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 29108716 - 29108663
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29108716 gtaagacaattgttgaagttggaatgtgcattccaactgcaacaattgtcttac 29108663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 309
Target Start/End: Original strand, 2192535 - 2192607
Alignment:
Q  237 tatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||||||| | || ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  2192535 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaattttgattccgccataaaatcgtcattag 2192607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 209
Target Start/End: Original strand, 28051299 - 28051465
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaacatccaacgc 142  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||  ||||| ||||| | | | ||||||||||||||||| |||||||| || |||||  |||| ||| |||||||     
T  28051299 acgttaaaaggtcttaaggatcaacttgatgaaatcaaccatgaactcaaccccggagacacaaggagggtgaaatacatttggtatgaacgtccaacgt 28051398  T
Q  143 tcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgtt 209  Q
    | ||| |  ||||| || | |||||| || | ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  28051399 tggacgacgggagaataacgttcagtcggctagaattaaagaacgacgacaacgtcaggagcatgtt 28051465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Original strand, 35058367 - 35058420
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  35058367 gtaagacatttgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 35058420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Original strand, 2192621 - 2192671
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  2192621 cattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgt 2192671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 24021082 - 24021032
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  24021082 cattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgt 24021032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 30257212 - 30257162
Alignment:
Q  296 aagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  30257212 aagatcgtcggtaggtacggaatgaatgcaccttcaaactacaacaattgt 30257162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 32027321 - 32027229
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattc---caactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||  |   ||| |||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  32027321 attcaaaggtaacataattgttgtagttggaaggtacaaacgttcaagtgcaacaactgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaa 32027229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 32037380 - 32037288
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattc---caactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||  |   ||| |||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  32037380 attcaaaggtaacataattgttgtagttggaaggtacaaacgttcaagtgcaacaactgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaa 32037288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Original strand, 4495119 - 4495174
Alignment:
Q  315 gaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaa 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||    
T  4495119 gaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaa 4495174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 6206060 - 6206007
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  6206060 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtgttac 6206007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 14123178 - 14123125
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| |||||||||||    
T  14123178 gtaagacaattgttgtagttgaaatgtgcattccaactacaaaaattgtcttac 14123125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Original strand, 13402753 - 13402809
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  13402753 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 13402809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 30257568 - 30257512
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  30257568 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctctaaatggggtaattcaaacttg 30257512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 398
Target Start/End: Original strand, 801679 - 801710
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  801679 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 801710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 20242392 - 20242305
Alignment:
Q  54 tctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaacatccaacg 141  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||  |||| ||| |||||||    
T  20242392 tctcaaggatcaactggatgaaatcaaccaaggactcaaccccggagacacaaggagagtgaaatacatttggtatgaacgtccaacg 20242305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22136376 - 22136289
Alignment:
Q  54 tctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaacatccaacg 141  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||  |||| ||| |||||||    
T  22136376 tctcaaggatcaactggatgaaatcaaccaaggactcaaccccggagacacaaggagagtgaaatacatttggtatgaacgtccaacg 22136289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 191
Target Start/End: Original strand, 2402178 - 2402280
Alignment:
Q  89 tcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacga 188  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||| | ||| |  ||||| || | |||||| |  | ||||||||||||||    
T  2402178 tcaaccccggagacacacggagggtggaatacatttggtatgaacgtccaacgttggacgacgggagaataacgttcagtcgactagaattaacgaacga 2402277  T
Q  189 cga 191  Q
    |||    
T  2402278 cga 2402280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 452
Target Start/End: Original strand, 801389 - 801438
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  801389 cattccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttg 801438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 452
Target Start/End: Original strand, 14115252 - 14115309
Alignment:
Q  395 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||    
T  14115252 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttaaatagggtaattcaaacttg 14115309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14482855 - 14482765
Alignment:
Q  275 tcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaatt 369  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||  | |||||||| ||||||    ||||||||  ||||||||||||| || |||||||| | ||||||||    
T  14482855 tcaacagtttgattccgctagaagataatgattaggtagggaatg----caccttcccactacaacaattgtcttgcctctgaatttgggtaatt 14482765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 27640755 - 27640702
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  27640755 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 27640702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 32027617 - 32027564
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaac 449  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  32027617 gaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaac 32027564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 801421 - 801386
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  801421 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 801386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 2192653 - 2192618
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2192653 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 2192618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 14483079 - 14483023
Alignment:
Q  43 acgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccgga 99  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||    
T  14483079 acgttaaaaggtctcaaggatcaactggatgaaatcaaccaggaaatcaaccccgga 14483023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Original strand, 24021050 - 24021085
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24021050 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 24021085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 30257189 - 30257129
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||||    
T  30257189 gaatgcaccttcaaactacaacaattgtctttctttaaatgaggtaattcaaacttgttaa 30257129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 81)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18440591 - 18440231
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18440591 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagatgtctcaaggatgaactgactgaattcaatcaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 18440492  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  18440491 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagaattaacgaacgatgaaaacgtgacgagcatgttttag 18440392  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18440391 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgagggtgacgttgctgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattacgcgagaagatcgtcattagg 18440292  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| || ||||||||||||||||    
T  18440291 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattatctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 18440231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 44943376 - 44943042
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||| |||    
T  44943376 agaggttgaaggttcggcgccttggtgtaacgttaa-aggtctcaaggatgaattgactgaattcaaccaaggagttaaccccagagacacaaggatggt 44943278  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    | ||||| ||   ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  44943277 gtaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 44943178  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44943177 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcattagg 44943078  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44943077 tacggaatgtatgcaccttccagctacaacaattgt 44943042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 41857270 - 41856910
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  41857270 agaggttgaaggttcgttgccttggtgtgacgttaagaggtcttaaggatgaactgactgaattcaatcaaggagtcaaccccagagacagaaggagggt 41857171  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |    
T  41857170 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattaacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatattttgg 41857071  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41857070 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 41856971  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  41856970 tacgaaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 41856910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 42603374 - 42603732
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||| ||    
T  42603374 aggttgaaggttcggtgccttggtgtgacgttaaaaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacagaaggagggcgg 42603473  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    ||||| ||  |||||||| ||||| ||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  42603474 aacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 42603573  T
Q  216 gca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 312  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42603574 gcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgaaatcaaccgaatatatcatcaaaagtttgattccgccaaaagatcgtcattaggta 42603673  T
Q  313 cggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  42603674 cggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 42603732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 40702278 - 40702639
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||| ||    
T  40702278 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtgacgttaaaaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacagaaggagagt 40702377  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  40702378 ggaacacgttcagtataaacgtccaacgttcgacgaagggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 40702477  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatc-gtcattag 309  Q
    || |   |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  40702478 gaacaaaacatgttccagtggatcgatatgcggatgacgttgctgagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattccgccaaaagatcggtcattag 40702577  T
Q  310 gtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  40702578 gtacggaatgaatgcacattttagctacaacaattgtctt-cctttg-aatggggtaattcaaa 40702639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 19242458 - 19242123
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||    
T  19242458 agaggttgaaggttcgttgcctttgtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaacccgagagacacaaggagggt 19242359  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  19242358 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgtaattaaggaacgacaaaaacgtgacgagcatgttttgg 19242259  T
Q  214 g---agcacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |   |  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||    
T  19242258 gaatacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctacgagaagattgtcattagg 19242159  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19242158 taccgaatgaatgcaccttccaactacaacaattgt 19242123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 19315642 - 19315307
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||    
T  19315642 agaggttgaaggttcgttgcctttgtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaacccgagagacacaaggagggt 19315543  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  19315542 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgtaattaaggaacgacaaaaacgtgacgagcatgttttgg 19315443  T
Q  214 g---agcacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |   |  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||    
T  19315442 gaatacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctacgagaagattgtcattagg 19315343  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19315342 taccgaatgaatgcaccttccaactacaacaattgt 19315307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15032620 - 15032322
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| | | |||    
T  15032620 agaggttgaaggtttggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggataaactgattgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaagtatggt 15032521  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15032520 ggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 15032421  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15032420 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 15032322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 38034221 - 38033862
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  38034221 agaggttgaaagttcgatgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaaatcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggagggt 38034122  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| | |||||||| || || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  38034121 ggaacacgttcggtataaacgttcaacgctctacgaggggagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 38034022  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||     
T  38034021 gagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgattccgccggaagatcgtcattagt 38033922  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  38033921 tagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaattgggtaattcaaa 38033862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 34614871 - 34615230
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34614871 agaggttgaagtttcgatgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggt 34614970  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  34614971 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggaaagtatcattcacttgggtgaaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgg 34615070  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| || |||||     
T  34615071 gagcacaacatgatccagtggattgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccaccagaagatagtaattagt 34615170  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  34615171 tagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctcttaaatggggtaattcaaa 34615230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 42169254 - 42168897
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  42169254 aggttgaaggtttgatgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaccaactgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacgaggagggtgg 42169155  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    ||| | ||  |||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  42169154 aacgcgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggaaagtatcattcccttgggtggaattaacgaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 42169055  T
Q  216 gc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 312  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42169054 gcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgcagagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcattagtta 42168955  T
Q  313 cggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
     |||    |||||  ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  42168954 -ggataagatgca--ttccaactacaacaattgtcttacctttgaaatggggtaattcaaa 42168897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 309
Target Start/End: Original strand, 41363576 - 41363872
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41363576 aggttgaaggttcgatgccttggagtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggtgg 41363675  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    ||||| ||  ||||| || || |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  41363676 aacacgttcggtatacacgtctaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttggga 41363775  T
Q  216 gc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  41363776 gcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggttacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctccagaagatcgtcattag 41363872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 485554 - 485256
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||| ||||||| |||||||| ||| |||    
T  485554 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatacactgactgaattcaaccaaggagccaaccccagagacacaaggatggt 485455  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  485454 ggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgg 485355  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||||   ||||||| ||||||||||||||||| | | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  485354 gagcacagcatgttctagtggatcgatatgcggatgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaagatcgtcattag 485256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 33799845 - 33799488
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||  |||  || |||||||||    
T  33799845 aggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggagtcaatcccatagatgcaaggagggtgg 33799746  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    || |  ||   ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  33799745 aatatgttcgttataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 33799646  T
Q  216 gcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 312  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33799645 gcacaacatgttccagtggatcgatatgcggataacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagtta 33799546  T
Q  313 cggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
     || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33799545 gggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 33799488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 43693057 - 43693414
Alignment:
Q  16 aggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtgg 115  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  43693057 aggttgaaagttcggtgccttggtgtaacattaagaggtctaaaggatgaactcactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtgg 43693156  T
Q  116 aacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttagga 215  Q
    ||||| ||  |||||||| ||||||||||| | || ||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  43693157 aacacgttcggtataaacgtccaacgctcggcgaggggaggatatcattcatttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 43693256  T
Q  216 gc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 312  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  43693257 gcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctccagaagatcgtcattagtta 43693356  T
Q  313 cggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
     || | |  ||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  43693357 gggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattttcttacctctgaaatggggtaattcaaa 43693414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 26452243 - 26452541
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| | | | |||||||| |||||||| |||||||    
T  26452243 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagagatctcaaggatcaactgactgaattcaaccaagaattcaaccccagagacacaaggagggt 26452342  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26452343 ggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 26452442  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26452443 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgctagaagatcgtcattag 26452541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 41275312 - 41275610
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41275312 agaggttgaaggtttggtgccttggtgtaaagttaagaggtcttaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 41275411  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| || |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||      
T  41275412 ggaacaccttcggtataaacgtcaaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttga 41275511  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||   |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  41275512 gagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattag 41275610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 2416833 - 2417131
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | | |||||||||| || ||||| |||||||    
T  2416833 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgactgaattcaaccaagaagtcaaccccagaaacacaaggagggt 2416932  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  2416933 ggaacaccttcggtataaacgtccaacattcgacaaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 2417032  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||   |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  2417033 gagcacaacatgttccagttgatcgatatgcaggtgacgttgatgagatcaaccgaagatatcatcaacaacttgattccaccagaagatcgtcattag 2417131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31172112 - 31171754
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31172112 agaggttgaaggttcggtaccttggtgtcacattaaaaggtctcaaggatcaacttaatgaattcaactaaggagtcaaccccggagacacaaggagggt 31172013  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||| ||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||  | ||| ||| ||    
T  31172012 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgacgacatgacaaacatttttcag 31171913  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
     ||||   |||||| | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31171912 aagcacagcatgttaccgtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaaaatattatcaacagtttgattccgccagaagatcgtgattagg 31171813  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || |    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  31171812 tatg----gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgagataattcaaa 31171754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 40415175 - 40415534
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| | ||||||| | || |||||||| |||||||    
T  40415175 agaggttgaaagttcggtgccttgatgtaacgttaagaggtctaaaggatgaactcgctgaattcaaccaaggagtcagcaccagagacacaaggagggt 40415274  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  40415275 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 40415374  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||||| |||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||     
T  40415375 gagcacaacatgttcccgtggatcgatatgcaggtgacgttgttgagatcaacttaagatatcatcaacagcttgattccgtcagaagatcgtcattagt 40415474  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  || || ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  40415475 tagggtaag-gtgca--tttcaactacaacaattctcttacctatgaaatggggtaattcaaa 40415534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 26484495 - 26484756
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| | ||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  26484495 agaggttgaaagttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaattaactgaattcaaccaaggagtcaaccccaaagacacaaggagggt 26484594  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26484595 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 26484694  T
Q  214 gagca---catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatat 272  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||    
T  26484695 gagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgcataacattgctgagatcaactgaagatat 26484756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28706438 - 28706079
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||    
T  28706438 agaggttgaaggttcggtgccttgatgtaacgttaaaaggtcccaaggatcaactaaatgaattcaaccaaggagtcaaccccagagacgcaaggagggt 28706339  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  28706338 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgagtggagttaaagaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 28706239  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||  |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||     
T  28706238 gagcacaacatgttttagtggatcgatatgcgtgtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaccgcttgattccgccagaagattgtcattagt 28706139  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  28706138 tagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacttgtgaaatggggtaattcaaa 28706079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 43638952 - 43638614
Alignment:
Q  34 cttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaac 133  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| | || ||||||||||| || ||  ||||||||    
T  43638952 cttgatgtaacgttaagaggtctcaaggatcaactgaatgaattcaaccaaggactcaaccccagag-cgcaaggagggtggaatacgttcggtataaac 43638854  T
Q  134 atccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagcaca---tgttccagtg 230  Q
     ||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||    
T  43638853 gtccaacgctcgacgaggggagagtatccttcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtg 43638754  T
Q  231 gatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttc 330  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||| || || | |  ||||  |||    
T  43638753 catcgatatgcgcgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgatttcgccagaagatcgtcattagttagggtaag-gtgca--ttc 43638657  T
Q  331 cagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43638656 caactacaataattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 43638614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 24861261 - 24861559
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||    
T  24861261 agaggttaaaggttcggtgcctggatgtaacgttaagaggtatcaaggatgaactgactgaattcaaccaaggagtcaaccctagagacacaaggagggt 24861360  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  24861361 ggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacggggggagagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtgacgagcatgttttgg 24861460  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||   |||||||| | ||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24861461 gagcacaacatgttcaattggattgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattctgccagaagatcgtcattag 24861559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 40414529 - 40414885
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||||| |  |||||||||| | ||||||| ||| |||    
T  40414529 agaggttgaaagttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctaaaggatgaagtcgctgaattcaaccaaagagtcaacccag-agacacaaggaaggt 40414627  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| || ||| |||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  40414628 ggaacacgttcggtataaacgtctaacactcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 40414727  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||     
T  40414728 gagcacaacatgtttcagttgattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccaccagaagatcgtcattag- 40414826  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
     | || | |  ||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  40414827 -agggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattctcttacctctgaaatggggtaattcaaa 40414885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 16575610 - 16575846
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  16575610 agaggttgaaggttcggtaccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggacgaactgaatgaattcaaccagggagtcaacctcgaagacacaaggagggt 16575709  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |    
T  16575710 ggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtttcattcagttgggtggaattaacgaacaacgaaaacgggatgagcatgttttgg 16575809  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaa 247  Q
    || |   ||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  16575810 gaccacaacatgttccagtgcatcgatacgcgcgtaa 16575846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 211
Target Start/End: Original strand, 22548181 - 22548378
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22548181 agaggttgaaggtttgatgccttggtgtaacgttaagatgtctcaaggatgaactgactgaattcaactaaggagtcaaccccagagacacaaggagggt 22548280  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgtttt 211  Q
    ||||||||||   ||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  22548281 ggaacacattcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaatgacgaaaacgtgacgagcatgtttt 22548378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3589487 - 3589202
Alignment:
Q  89 tcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacga 188  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||| || |||| | | | |  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3589487 tcaacctcggagacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtcaaacgattgtctatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacga 3589388  T
Q  189 cgaaaacgtgaagagcatgttttaggagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttg 285  Q
    ||| ||||||| | ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  3589387 cgataacgtgatgggcatgttttgggagcacaggatgttccagtggatcgatatgcgtgtaacattgttgagatcaactgaagacattatcaacagtttg 3589288  T
Q  286 attccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttac--ctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||  |||||||||| | |||||||||    
T  3589287 attccgccagaagatcgtgattaggtagg----gaatgcaccttcaaactacaacaattgtcttacctctctgaaatgagataattcaaa 3589202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Original strand, 24861864 - 24861968
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  24861864 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattttcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 24861963  T
Q  466 tccaa 470  Q
    |||||    
T  24861964 tccaa 24861968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 38033617 - 38033525
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38033617 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcg 38033525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 41017441 - 41017337
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  41017441 attcaaaggtaagacaattgttgtagttgaaatgcacattcaaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 41017342  T
Q  466 tccaa 470  Q
    |||||    
T  41017341 tccaa 41017337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 15032017 - 15031914
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15032017 attcaaaggtaacacaattgttgcagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 15031918  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  15031917 tcca 15031914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 371 - 469
Target Start/End: Original strand, 22549604 - 22549703
Alignment:
Q  371 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggactcca 469  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22549604 aaaggtaagacaattgttgcagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactcca 22549703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Original strand, 40415779 - 40415871
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40415779 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaagtacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcg 40415871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 484951 - 484848
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  484951 attcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 484852  T
Q  466 tcca 469  Q
    ||||    
T  484851 tcca 484848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28705833 - 28705729
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  28705833 attcaaaggtaagacaattgttgtagttgaaaagcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgtaaatcggcaggac 28705734  T
Q  466 tccaa 470  Q
    |||||    
T  28705733 tccaa 28705729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 378 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 33799432 - 33799339
Alignment:
Q  378 agacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggactccaa 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33799432 agacaattgttgtagttggaatgcacatttcaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaa 33799339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 42168651 - 42168559
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  42168651 attcgaaggtaggacaattgttgtagttggaatgcacatcccaactgcaacaattgtcttactctagatggggcaattcaaacttgttaatcg 42168559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 43637456 - 43637364
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43637456 attcaaaggtaaggcaattgttatagttgaaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcg 43637364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 367 - 458
Target Start/End: Original strand, 44050961 - 44051052
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc 458  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  44050961 attcaaaggtaagacaattgtggcagttggaatgcacatttcaactgcaacaattgtcttactctggattgggcaattcaaacttgttaatc 44051052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 2417494 - 2417583
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2417494 attcaaaggtaagacaattgtggcagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttcctctgaatggggcaattcaaacttgttaa 2417583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 18439987 - 18439895
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18439987 attcaaagataagacaattgttgtagttggaaggcacaaacgtctaactgcaacaattgtctttctctgaatggggtaattcaaacttgttaa 18439895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 367 - 452
Target Start/End: Original strand, 16576178 - 16576263
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16576178 attcaaaggtaagataattgttgtagttggaaggtgccttccaactacaacaattgtcttcctctggatggggtaatccaaacttg 16576263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 267 - 346
Target Start/End: Original strand, 26486847 - 26486926
Alignment:
Q  267 agatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||    
T  26486847 agatatcatcaacagcttgattccgtcagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcatctcttagctacaacaattgt 26486926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 41856664 - 41856572
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  41856664 attcaaaggtaagacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctatgaatggggtaattcaaacttgttaa 41856572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 403 - 467
Target Start/End: Original strand, 41275624 - 41275689
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggactc 467  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  41275624 cattccaactgcaataattgtcttactctggatgaggcaattcaaacttgttaatcagcaggactc 41275689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 412 - 469
Target Start/End: Original strand, 26452878 - 26452936
Alignment:
Q  412 tgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggactcca 469  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26452878 tgcaacaactgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactcca 26452936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22549661 - 22549608
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22549661 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactgcaacaattgtcttac 22549608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Original strand, 38033556 - 38033609
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  38033556 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 38033609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 40702883 - 40702975
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    ||||| | ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  40702883 attcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaatttcaacaattgtcttcctctgaatggggcaattcaaacttgttaa 40702975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 456
Target Start/End: Original strand, 42603973 - 42604065
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||||||||||    
T  42603973 attcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgggacaattcaaacttgttaa 42604065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Original strand, 15031956 - 15032009
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15031956 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactgcaacaattgtgttac 15032009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 40415840 - 40415787
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  40415840 gtaagacaattgttgtacttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 40415787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 19242150 - 19242094
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  19242150 gaatgcaccttccaactacaacaattgtctttctctgaatggggtagttcaaacttg 19242094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 19315334 - 19315278
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  19315334 gaatgcaccttccaactacaacaattgtctttctctgaatggggtagttcaaacttg 19315278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 309
Target Start/End: Original strand, 22549236 - 22549295
Alignment:
Q  247 acgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  22549236 acgttgctgacatcaactgaagatatcatcaac---ttgattccgccagaagatcgtcattag 22549295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 2417553 - 2417502
Alignment:
Q  377 aagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  2417553 aagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactgccacaattgtcttac 2417502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 16576237 - 16576186
Alignment:
Q  377 aagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  16576237 aagacaattgttgtagttggaaggcaccttccaactacaacaattatcttac 16576186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 425
Target Start/End: Original strand, 33799382 - 33799432
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtct 425  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  33799382 gtaagacaattgttgtagttgaaatgtgcattccaactacaacaattgtct 33799432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 402
Target Start/End: Original strand, 42168912 - 42168946
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgca 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42168912 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgca 42168946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 279 - 346
Target Start/End: Original strand, 16575866 - 16575930
Alignment:
Q  279 aagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgt 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||   ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16575866 aagtttgattccgccagaagttcgtgattaggcaggga---aatgcaccttccaactacaacaattgt 16575930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 24861925 - 24861872
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  24861925 gtaagaaaattgttgcagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 24861872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Original strand, 28705772 - 28705825
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||||||    
T  28705772 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcttttcaactacaacaattgtcttac 28705825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 44051022 - 44050969
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  44051022 gtaagacaattgttgcagttgaaatgtgcattccaactgccacaattgtcttac 44050969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 2417178 - 2417142
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2417178 attcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 2417142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Original strand, 33799503 - 33799538
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33799503 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 33799538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Original strand, 38033877 - 38033912
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38033877 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 38033912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
Target Start/End: Original strand, 484889 - 484943
Alignment:
Q  374 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  484889 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 484943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 15032308 - 15032258
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  15032308 cattccaactacaacatttgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgt 15032258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 34615210 - 34615180
Alignment:
Q  373 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34615210 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 34615180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Original strand, 41017380 - 41017433
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  41017380 gtaagacaattgttgcagtttgaatgtgcatttcaactacaacaattgtcttac 41017433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 470
Target Start/End: Original strand, 41363886 - 41363955
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatg-gggtaattcaaacttgttaatc-gcaggactccaa 470  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  41363886 cattccaactacaacaattgtctttctctggatgaggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaa 41363955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 424
Target Start/End: Original strand, 42168590 - 42168639
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtc 424  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||||||    
T  42168590 gtaagacaattgttgcagttgggatgtgcattccaactacaacaattgtc 42168639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Original strand, 43637395 - 43637448
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||||| |||||    
T  43637395 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcatttcaactataacaattgccttac 43637448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12504989 - 12504917
Alignment:
Q  45 gttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaa 117  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | | | |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12504989 gttaaaaggtctcaatgatcaactaaatgaaatcaacgaagaactcaaccccagagacacaaggagggtggaa 12504917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22549342 - 22549310
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaat 399  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22549342 attcaaaggtaagacaattgttgaagttggaat 22549310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24861606 - 24861570
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24861606 attcaaaggtaagacaattgttgcagatggaatgcac 24861570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 403
Target Start/End: Original strand, 28706101 - 28706129
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28706101 gtaagacaattgttgtagttggaatgcac 28706129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 394 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 31171810 - 31171746
Alignment:
Q  394 tggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctg-gatggggtaattcaaacttgttaa 456  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  31171810 tggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgagataattcaaacttgttaa 31171746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 408 - 452
Target Start/End: Original strand, 37780710 - 37780754
Alignment:
Q  408 caactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||    
T  37780710 caactgcaacaattgtcttcctctgaattgggcaattcaaacttg 37780754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 452
Target Start/End: Original strand, 40702587 - 40702643
Alignment:
Q  396 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttg 452  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  40702587 gaatgcacattttagctacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttg 40702643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 4)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 2177 - 2536
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2177 agaggttgaaggttcgatgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaaatgactgaattcaaccaaggagtcaaccccggagacacaaggagggt 2276  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  2277 ggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgg 2376  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||     
T  2377 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgatgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattccgccaaaagatcgtcattagt 2476  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2477 tagggtaag-gtgca--ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaa 2536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Original strand, 4799 - 4903
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  4799 attctaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacatcccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 4898  T
Q  466 tccaa 470  Q
    |||||    
T  4899 tccaa 4903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 4860 - 4807
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  4860 gtaagacaattgttgcagttgggatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 4807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 2521 - 2486
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2521 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 2486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 4)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 1700 - 2059
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | | |||||||||  |||||||| |||||||    
T  1700 agaggttgaaggttcgatgccttggtgtaacattaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcagccaagaagtcaaccctagagacacaaggagggt 1799  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||  ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||| |    
T  1800 ggaacaatttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacggacatgttttgg 1899  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  1900 gagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgccataagatcgtcattagt 1999  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  ||||| || |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2000 tagggtaag-gtgca--ttccaactgcaacaattctcttacctctgaattggggtaattcaaa 2059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 367 - 459
Target Start/End: Original strand, 2304 - 2396
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatcg 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2304 attcaaaggtaagacaattgttgtagttgaaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcg 2396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 2365 - 2312
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  2365 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcatttcaactacaacaattgtcttac 2312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Original strand, 2012 - 2064
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtctta-ctctgga-tggggtaattcaaacttgt 453  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  2012 cattccaactgcaacaattctcttacctctgaattggggtaattcaaacttgt 2064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18191 - 17855
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                      || |||||||    
T  18191 agaggttgaaggttcggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgactgaattcaac----------------------caaggagggt 18114  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18113 ggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgag-ggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgatgagcatgttttgg 18015  T
Q  214 gagcaca---tgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    |||||||   ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||     
T  18014 gagcacaacatgttatagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcattagt 17915  T
Q  311 tacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatggggtaattcaaa 373  Q
    || || | |  ||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17914 tagggtaag-gtgca--tttcaactacaacaattgtcttacctctgaaatgggataattcaaa 17855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 312
Target Start/End: Original strand, 24815 - 25115
Alignment:
Q  14 agaggttgaaggttcggtgtcttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24815 agaggttgaaggtttggtgccttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactggctaaattcaaccagggagtcaaccccggagacacaaggagggt 24914  T
Q  114 ggaacacattaagtataaacatccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttag 213  Q
    |||| || ||  ||||| || | ||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |    
T  24915 ggaatacgttcggtatagacgtacaacgctcgaggaggggagagtagcattcagttgggtggaattaacgaacaacgaaaatgtgacgagcatgttttgg 25014  T
Q  214 gagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagg 310  Q
    ||||   |||||||| |||||||| || ||||| |||| | ||| ||||||||||||||||| | ||| ||| ||||| |||||  ||||||| ||||||    
T  25015 gagcacaacatgttctagtggatctatttgcggataacattgctaagatcaactgaagatatta-caagagtctgattgcgccaatagatcgtgattagg 25113  T
Q  311 ta 312  Q
    ||    
T  25114 ta 25115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 220
Target Start/End: Original strand, 63906 - 64091
Alignment:
Q  34 cttggtgtaacgttaagaggtctcaaggatgaactgaatgaattcaactagggagtcaaccccggagacacagggagggtggaacacattaagtataaac 133  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||  |||||||     
T  63906 cttggtgtaaggttaagaggcctcaaggatgaactgaatgaattcaacaaaggagtcaaccccagagacacaaggagggtggagcacgttcggtataaat 64005  T
Q  134 atccaacgctcgacaagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttaggagcaca 220  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  64006 gtccaacgctcgacaag-ggagagtatcattcagttgagtggaatcaatgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcaca 64091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Original strand, 64100 - 64160
Alignment:
Q  252 gctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggta 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  64100 gctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcgtcattaggta 64160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 368 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 11455 - 11353
Alignment:
Q  368 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggact 466  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  11455 ttcaaaggtaagacaattgttggagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggact 11356  T
Q  467 cca 469  Q
    |||    
T  11355 cca 11353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 428
Target Start/End: Original strand, 11395 - 11448
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 428  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  11395 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactccaacaattgtcttac 11448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Original strand, 2468 - 2572
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggac 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2468 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaagtacaacaattgtcttactcttgatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggac 2567  T
Q  466 tccaa 470  Q
    |||||    
T  2568 tccaa 2572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 2529 - 2450
Alignment:
Q  375 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggt-aattcaaacttg 452  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  2529 gtaagacaattgttgtacttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttg 2450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 416
Target Start/End: Original strand, 14981 - 15030
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaa 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14981 attcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaa 15030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Original strand, 14690 - 14740
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  14690 cattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgt 14740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 309
Target Start/End: Original strand, 14623 - 14676
Alignment:
Q  256 agatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||    
T  14623 agatcaacttaagatttcatcaaaagtatgataccgccataagatcgtcgttag 14676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14722 - 14687
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14722 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 14687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 309
Target Start/End: Original strand, 85462 - 85534
Alignment:
Q  237 tatgcgggtaacgtcgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 309  Q
    ||||||||| | || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  85462 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattcagccataaaatcgtcattag 85534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 453
Target Start/End: Original strand, 85548 - 85598
Alignment:
Q  403 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggtaattcaaacttgt 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  85548 cattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgt 85598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 85580 - 85545
Alignment:
Q  367 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  85580 attcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 85545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1700 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1700
Description:

Target: scaffold1700; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 470
Target Start/End: Original strand, 130 - 181
Alignment:
Q  420 ttgtcttactctggatggggtaattcaaacttgttaatc-gcaggactccaa 470  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  130 ttgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaa 181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1209 - 1169
Alignment:
Q  322 tgcaccttccagctacaacaattgttttacctctgaaatgg 362  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1209 tgcaccttcaaactacaacaattgtcttacctctgaaatgg 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University