View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11967_low_28 (Length: 350)

Name: NF11967_low_28
Description: NF11967
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11967_low_28
NF11967_low_28
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (22-338)||(69256-69576)
scaffold0025 (22-123)||(73203-73308)
scaffold0025 (80-130)||(73160-73210)
[»] chr7 (138 HSPs)
chr7 (22-338)||(38393990-38394311)
chr7 (22-327)||(40836718-40837027)
chr7 (22-340)||(7469984-7470307)
chr7 (22-338)||(48457657-48457978)
chr7 (22-338)||(3878581-3878902)
chr7 (26-338)||(18345549-18345866)
chr7 (22-317)||(20626042-20626342)
chr7 (22-317)||(20629933-20630233)
chr7 (22-317)||(20642352-20642652)
chr7 (22-329)||(1849985-1850297)
chr7 (22-317)||(44724583-44724883)
chr7 (22-340)||(7471942-7472265)
chr7 (22-329)||(1049268-1049580)
chr7 (22-338)||(20299462-20299785)
chr7 (22-338)||(1046888-1047209)
chr7 (22-338)||(40946332-40946653)
chr7 (22-338)||(35633-35954)
chr7 (22-338)||(44568-44889)
chr7 (18-338)||(43253481-43253805)
chr7 (22-338)||(3035725-3036049)
chr7 (22-340)||(25542534-25542855)
chr7 (22-338)||(20297366-20297687)
chr7 (22-327)||(31435022-31435332)
chr7 (22-308)||(27306224-27306514)
chr7 (22-321)||(31155892-31156196)
chr7 (22-338)||(7351615-7351937)
chr7 (22-327)||(20137085-20137394)
chr7 (22-317)||(21990154-21990454)
chr7 (22-329)||(28487557-28487869)
chr7 (26-317)||(13099459-13099757)
chr7 (92-338)||(38396713-38396959)
chr7 (22-327)||(21592119-21592428)
chr7 (84-338)||(7092177-7092431)
chr7 (22-317)||(11355262-11355562)
chr7 (22-327)||(4295910-4296220)
chr7 (22-328)||(7349250-7349558)
chr7 (22-317)||(42330982-42331284)
chr7 (22-317)||(24748598-24748899)
chr7 (26-329)||(28485574-28485881)
chr7 (22-317)||(37412110-37412413)
chr7 (28-317)||(443605-443900)
chr7 (26-317)||(9680827-9681124)
chr7 (84-338)||(7094424-7094678)
chr7 (22-327)||(21680031-21680343)
chr7 (26-327)||(42223165-42223471)
chr7 (22-317)||(39145971-39146272)
chr7 (22-315)||(9679063-9679361)
chr7 (22-327)||(24258467-24258781)
chr7 (22-248)||(11757232-11757465)
chr7 (22-308)||(21678070-21678361)
chr7 (24-308)||(27832631-27832916)
chr7 (121-320)||(2935375-2935575)
chr7 (121-320)||(22108174-22108373)
chr7 (121-320)||(40549934-40550133)
chr7 (121-320)||(22137185-22137384)
chr7 (121-320)||(40552212-40552411)
chr7 (121-320)||(9027176-9027375)
chr7 (22-207)||(26804573-26804765)
chr7 (121-320)||(1606487-1606686)
chr7 (37-317)||(25276160-25276434)
chr7 (22-292)||(24817362-24817634)
chr7 (56-305)||(24813494-24813742)
chr7 (22-262)||(22828672-22828918)
chr7 (23-245)||(22251602-22251826)
chr7 (103-269)||(20091580-20091745)
chr7 (22-305)||(7188547-7188833)
chr7 (168-317)||(22393876-22394027)
chr7 (165-308)||(26295598-26295743)
chr7 (106-308)||(25351336-25351539)
chr7 (22-132)||(18567617-18567731)
chr7 (106-305)||(6332311-6332514)
chr7 (105-308)||(2120881-2121087)
chr7 (22-305)||(24465553-24465829)
chr7 (106-308)||(25357030-25357233)
chr7 (106-308)||(25410113-25410318)
chr7 (250-338)||(11759364-11759452)
chr7 (106-305)||(16297018-16297222)
chr7 (106-304)||(3320049-3320249)
chr7 (106-304)||(3324797-3324997)
chr7 (106-304)||(25405376-25405576)
chr7 (106-318)||(7069763-7069976)
chr7 (106-278)||(7074770-7074943)
chr7 (106-304)||(8378502-8378703)
chr7 (106-304)||(15540994-15541194)
chr7 (144-237)||(6348912-6349006)
chr7 (106-305)||(11081598-11081803)
chr7 (106-308)||(44512520-44512724)
chr7 (165-290)||(6046644-6046772)
chr7 (84-237)||(6048941-6049094)
chr7 (106-327)||(6067173-6067399)
chr7 (106-183)||(42006646-42006724)
chr7 (106-278)||(30246953-30247127)
chr7 (266-327)||(26804763-26804823)
chr7 (84-159)||(22392534-22392606)
chr7 (106-172)||(44143997-44144065)
chr7 (109-305)||(40281379-40281572)
chr7 (239-302)||(9190038-9190101)
chr7 (239-302)||(20284093-20284156)
chr7 (106-302)||(21369625-21369824)
chr7 (106-320)||(7464503-7464717)
chr7 (238-302)||(21983288-21983352)
chr7 (106-183)||(34546984-34547062)
chr7 (238-302)||(46516339-46516403)
chr7 (239-302)||(2580394-2580457)
chr7 (121-305)||(13290470-13290657)
chr7 (106-159)||(12310160-12310214)
chr7 (119-278)||(44010775-44010934)
chr7 (238-299)||(55955-56015)
chr7 (237-320)||(34546864-34546946)
chr7 (22-76)||(38396320-38396378)
chr7 (238-302)||(2647725-2647789)
chr7 (238-302)||(4796696-4796760)
chr7 (238-302)||(29159807-29159871)
chr7 (239-302)||(9185195-9185258)
chr7 (282-317)||(22251570-22251605)
chr7 (239-302)||(28617255-28617318)
chr7 (239-302)||(33332480-33332543)
chr7 (106-159)||(11084467-11084520)
chr7 (237-308)||(2075231-2075303)
chr7 (258-302)||(27347941-27347985)
chr7 (238-302)||(35960820-35960884)
chr7 (258-302)||(41317434-41317478)
chr7 (238-302)||(44848713-44848777)
chr7 (106-183)||(26210631-26210710)
chr7 (22-56)||(7094673-7094707)
chr7 (106-172)||(44016792-44016860)
chr7 (258-302)||(8153466-8153510)
chr7 (108-159)||(8260570-8260622)
chr7 (258-302)||(12097867-12097911)
chr7 (258-302)||(14069833-14069877)
chr7 (258-302)||(14379861-14379905)
chr7 (258-302)||(18126768-18126812)
chr7 (258-302)||(20344021-20344065)
chr7 (258-302)||(30814560-30814604)
chr7 (258-302)||(31732969-31733013)
chr7 (258-302)||(41649011-41649055)
chr7 (266-302)||(43864376-43864412)
chr7 (258-302)||(48489555-48489599)
[»] chr6 (106 HSPs)
chr6 (22-338)||(4816195-4816516)
chr6 (22-327)||(11983005-11983314)
chr6 (22-338)||(14507140-14507460)
chr6 (22-329)||(28241294-28241606)
chr6 (22-338)||(30967230-30967551)
chr6 (19-338)||(1230213-1230537)
chr6 (22-338)||(14458731-14459050)
chr6 (22-338)||(2628850-2629170)
chr6 (22-338)||(19704531-19704854)
chr6 (28-338)||(30034567-30034882)
chr6 (22-338)||(20915321-20915641)
chr6 (22-317)||(26065015-26065310)
chr6 (22-317)||(26084984-26085279)
chr6 (22-317)||(9019955-9020255)
chr6 (23-317)||(13039784-13040084)
chr6 (22-317)||(13057223-13057524)
chr6 (22-338)||(12195478-12195800)
chr6 (26-320)||(26932543-26932843)
chr6 (22-313)||(3390408-3390705)
chr6 (22-327)||(3629841-3630149)
chr6 (22-315)||(30728811-30729113)
chr6 (22-310)||(15532674-15532966)
chr6 (22-317)||(32280025-32280326)
chr6 (26-315)||(3631926-3632219)
chr6 (22-317)||(15541125-15541425)
chr6 (22-317)||(25477303-25477611)
chr6 (22-317)||(3233710-3234016)
chr6 (88-305)||(5273213-5273431)
chr6 (22-259)||(15530166-15530407)
chr6 (121-320)||(26066106-26066306)
chr6 (121-320)||(29754691-29754891)
chr6 (121-320)||(33308989-33309188)
chr6 (121-320)||(26068377-26068577)
chr6 (121-320)||(33311258-33311457)
chr6 (22-315)||(24338435-24338733)
chr6 (109-327)||(1069694-1069913)
chr6 (22-317)||(12161543-12161840)
chr6 (22-197)||(19227514-19227693)
chr6 (22-305)||(15719683-15719961)
chr6 (105-317)||(12186056-12186271)
chr6 (66-317)||(14466399-14466653)
chr6 (22-237)||(22490668-22490889)
chr6 (56-305)||(3027848-3028098)
chr6 (84-305)||(15367129-15367349)
chr6 (104-305)||(16455421-16455625)
chr6 (165-305)||(15346523-15346664)
chr6 (106-305)||(22857949-22858152)
chr6 (104-305)||(26945258-26945463)
chr6 (56-235)||(17012110-17012287)
chr6 (20-305)||(19696470-19696759)
chr6 (106-304)||(13878710-13878910)
chr6 (106-304)||(16785902-16786102)
chr6 (106-263)||(20526922-20527081)
chr6 (220-317)||(10584227-10584325)
chr6 (106-304)||(13883458-13883658)
chr6 (22-116)||(32447502-32447601)
chr6 (106-308)||(17694846-17695050)
chr6 (184-305)||(25465587-25465710)
chr6 (106-304)||(35201325-35201525)
chr6 (24-113)||(1072067-1072160)
chr6 (120-305)||(12911442-12911630)
chr6 (120-305)||(12937190-12937377)
chr6 (106-304)||(26887225-26887423)
chr6 (107-305)||(28037722-28037927)
chr6 (106-327)||(25078534-25078755)
chr6 (106-183)||(31248835-31248913)
chr6 (22-117)||(13870608-13870707)
chr6 (106-181)||(19701985-19702061)
chr6 (119-278)||(22351877-22352036)
chr6 (164-294)||(30445698-30445832)
chr6 (106-183)||(3577636-3577713)
chr6 (106-183)||(17036038-17036116)
chr6 (22-88)||(8995508-8995578)
chr6 (106-183)||(13467585-13467662)
chr6 (119-308)||(22342795-22342985)
chr6 (106-308)||(33215810-33216015)
chr6 (106-305)||(25465896-25466098)
chr6 (22-96)||(17852571-17852649)
chr6 (106-183)||(25941627-25941704)
chr6 (238-302)||(5757507-5757571)
chr6 (238-302)||(10077194-10077258)
chr6 (119-183)||(12166267-12166330)
chr6 (238-302)||(21356040-21356104)
chr6 (239-302)||(31979517-31979580)
chr6 (121-233)||(7542452-7542566)
chr6 (119-204)||(26643174-26643259)
chr6 (119-204)||(26749140-26749225)
chr6 (237-320)||(25941785-25941867)
chr6 (238-302)||(5572270-5572334)
chr6 (106-181)||(11138423-11138499)
chr6 (129-305)||(11262596-11262777)
chr6 (239-302)||(31936591-31936654)
chr6 (237-320)||(3577474-3577555)
chr6 (239-296)||(24436001-24436058)
chr6 (258-302)||(16569146-16569190)
chr6 (238-302)||(22963704-22963767)
chr6 (238-302)||(23824626-23824689)
chr6 (188-305)||(28078191-28078310)
chr6 (258-302)||(33211185-33211229)
chr6 (237-315)||(30443537-30443616)
chr6 (129-183)||(5165936-5165989)
chr6 (258-302)||(603088-603132)
chr6 (238-302)||(5017498-5017562)
chr6 (258-302)||(9183031-9183075)
chr6 (237-304)||(17038350-17038418)
chr6 (238-302)||(22709022-22709086)
[»] chr4 (165 HSPs)
chr4 (22-338)||(8631383-8631704)
chr4 (22-338)||(37089336-37089656)
chr4 (22-327)||(22046661-22046970)
chr4 (19-340)||(47868446-47868772)
chr4 (22-327)||(22044366-22044675)
chr4 (22-338)||(31849563-31849884)
chr4 (22-338)||(51015294-51015614)
chr4 (22-338)||(2484837-2485157)
chr4 (22-338)||(11435003-11435323)
chr4 (22-321)||(9148301-9148604)
chr4 (22-327)||(40637122-40637431)
chr4 (22-327)||(38409253-38409562)
chr4 (22-321)||(24348266-24348570)
chr4 (22-326)||(6764887-6765201)
chr4 (22-327)||(22800838-22801147)
chr4 (22-321)||(11006218-11006522)
chr4 (22-338)||(11008532-11008851)
chr4 (21-338)||(14633366-14633687)
chr4 (22-338)||(22132355-22132675)
chr4 (22-338)||(7941369-7941692)
chr4 (22-315)||(24888844-24889142)
chr4 (22-327)||(17662221-17662519)
chr4 (26-338)||(18847205-18847521)
chr4 (22-321)||(5198468-5198772)
chr4 (56-329)||(26085950-26086223)
chr4 (22-338)||(22134582-22134900)
chr4 (22-317)||(22802719-22803019)
chr4 (22-323)||(47274775-47275079)
chr4 (26-327)||(36921469-36921775)
chr4 (22-327)||(16934118-16934428)
chr4 (22-327)||(40091391-40091700)
chr4 (22-338)||(9176438-9176759)
chr4 (28-317)||(24880505-24880800)
chr4 (22-327)||(16931764-16932074)
chr4 (22-338)||(9174110-9174431)
chr4 (22-338)||(18709127-18709448)
chr4 (22-317)||(24879037-24879338)
chr4 (22-327)||(38928153-38928463)
chr4 (22-324)||(48486367-48486673)
chr4 (22-317)||(36919569-36919870)
chr4 (22-320)||(44599820-44600123)
chr4 (22-338)||(22780336-22780658)
chr4 (22-338)||(22782701-22783023)
chr4 (22-327)||(33415464-33415772)
chr4 (22-317)||(12395830-12396130)
chr4 (22-327)||(36378340-36378650)
chr4 (22-317)||(19095930-19096231)
chr4 (22-317)||(12400792-12401092)
chr4 (22-329)||(53405178-53405493)
chr4 (22-327)||(14787406-14787716)
chr4 (22-243)||(5637524-5637750)
chr4 (22-327)||(16453357-16453667)
chr4 (22-317)||(37313050-37313351)
chr4 (22-298)||(47210756-47211025)
chr4 (22-245)||(3824627-3824853)
chr4 (56-327)||(36380435-36380707)
chr4 (22-317)||(619433-619732)
chr4 (165-338)||(5635440-5635614)
chr4 (165-338)||(11437558-11437731)
chr4 (22-305)||(41997540-41997828)
chr4 (22-298)||(56030492-56030770)
chr4 (83-308)||(16455354-16455581)
chr4 (26-317)||(19322749-19323043)
chr4 (22-282)||(13544007-13544272)
chr4 (147-317)||(4215483-4215654)
chr4 (23-305)||(18409344-18409631)
chr4 (121-317)||(13547305-13547502)
chr4 (56-317)||(27499131-27499390)
chr4 (112-317)||(2891433-2891640)
chr4 (28-305)||(18537470-18537749)
chr4 (56-305)||(18534828-18535077)
chr4 (22-220)||(52942542-52942731)
chr4 (24-198)||(3937314-3937492)
chr4 (56-305)||(38890221-38890470)
chr4 (60-305)||(8756247-8756493)
chr4 (29-188)||(6132927-6133090)
chr4 (106-305)||(16185831-16186035)
chr4 (171-317)||(5101130-5101276)
chr4 (58-317)||(30136640-30136898)
chr4 (105-305)||(12102221-12102425)
chr4 (106-305)||(28453818-28454020)
chr4 (106-305)||(9863842-9864049)
chr4 (121-292)||(15032557-15032731)
chr4 (22-131)||(24446756-24446864)
chr4 (106-304)||(11853532-11853732)
chr4 (23-131)||(38270158-38270270)
chr4 (218-317)||(47563010-47563109)
chr4 (105-264)||(31983565-31983727)
chr4 (106-327)||(25357772-25358000)
chr4 (106-304)||(55822248-55822447)
chr4 (106-305)||(31300407-31300608)
chr4 (106-308)||(8529250-8529455)
chr4 (106-308)||(18586949-18587154)
chr4 (109-291)||(3982186-3982374)
chr4 (106-278)||(7050282-7050456)
chr4 (237-327)||(14789405-14789495)
chr4 (106-308)||(4884857-4885062)
chr4 (106-308)||(36769462-36769667)
chr4 (106-305)||(47150889-47151092)
chr4 (237-327)||(6133105-6133194)
chr4 (106-261)||(40998990-40999148)
chr4 (119-308)||(15316956-15317145)
chr4 (106-308)||(16688934-16689139)
chr4 (108-308)||(4556054-4556256)
chr4 (106-264)||(9022438-9022601)
chr4 (106-296)||(10113003-10113198)
chr4 (106-320)||(4570077-4570291)
chr4 (106-278)||(15831124-15831298)
chr4 (190-327)||(24446630-24446754)
chr4 (120-317)||(5336765-5336965)
chr4 (106-308)||(36771379-36771584)
chr4 (266-327)||(52942464-52942524)
chr4 (22-87)||(2891365-2891434)
chr4 (106-307)||(15312299-15312503)
chr4 (119-306)||(4558309-4558496)
chr4 (106-278)||(16489332-16489505)
chr4 (192-309)||(49088791-49088911)
chr4 (25-106)||(5101048-5101133)
chr4 (238-302)||(10047383-10047447)
chr4 (106-183)||(25699732-25699810)
chr4 (238-302)||(39245998-39246062)
chr4 (208-305)||(26557823-26557922)
chr4 (267-317)||(3937259-3937309)
chr4 (238-302)||(5269220-5269284)
chr4 (238-302)||(5396700-5396764)
chr4 (106-183)||(13072102-13072180)
chr4 (188-305)||(3578668-3578786)
chr4 (238-301)||(36315258-36315321)
chr4 (238-301)||(36329467-36329530)
chr4 (121-233)||(54906738-54906852)
chr4 (238-302)||(16623322-16623386)
chr4 (119-304)||(16638825-16639011)
chr4 (238-302)||(31985663-31985726)
chr4 (238-302)||(38152468-38152532)
chr4 (119-183)||(47566491-47566554)
chr4 (250-302)||(54867188-54867239)
chr4 (282-317)||(3824595-3824630)
chr4 (238-301)||(6743444-6743507)
chr4 (106-159)||(4874623-4874678)
chr4 (238-302)||(5143263-5143327)
chr4 (258-302)||(12739550-12739594)
chr4 (258-302)||(26175636-26175680)
chr4 (258-302)||(36463389-36463433)
chr4 (258-302)||(48893638-48893682)
chr4 (162-193)||(38270120-38270151)
chr4 (248-302)||(48053087-48053142)
chr4 (121-183)||(29609591-29609653)
chr4 (258-308)||(54883144-54883194)
chr4 (214-305)||(10114561-10114654)
chr4 (239-292)||(34495853-34495906)
chr4 (127-182)||(3760105-3760161)
chr4 (238-302)||(3777553-3777617)
chr4 (258-302)||(5429803-5429847)
chr4 (258-302)||(5871944-5871988)
chr4 (258-302)||(9927458-9927502)
chr4 (258-302)||(12743925-12743969)
chr4 (258-302)||(12745314-12745358)
chr4 (238-302)||(16630709-16630773)
chr4 (238-302)||(24333813-24333877)
chr4 (238-302)||(25862051-25862115)
chr4 (258-302)||(27416965-27417009)
chr4 (238-302)||(28468558-28468621)
chr4 (258-302)||(46147391-46147435)
chr4 (258-302)||(47038411-47038455)
chr4 (258-302)||(52467354-52467398)
[»] chr1 (132 HSPs)
chr1 (22-338)||(51750033-51750354)
chr1 (26-338)||(28840678-28840994)
chr1 (19-338)||(15294800-15295124)
chr1 (19-338)||(13761828-13762151)
chr1 (22-327)||(46431683-46431994)
chr1 (22-338)||(51752359-51752678)
chr1 (22-338)||(10399794-10400115)
chr1 (22-338)||(31735487-31735808)
chr1 (22-338)||(28842489-28842809)
chr1 (22-338)||(39932067-39932389)
chr1 (23-329)||(2617511-2617822)
chr1 (22-321)||(20302453-20302756)
chr1 (22-317)||(27336927-27337225)
chr1 (22-327)||(15823540-15823849)
chr1 (22-327)||(47906264-47906573)
chr1 (26-338)||(20291455-20291771)
chr1 (22-317)||(27339118-27339417)
chr1 (22-340)||(24325658-24325980)
chr1 (22-317)||(17324623-17324923)
chr1 (22-321)||(9463227-9463531)
chr1 (22-327)||(38925459-38925765)
chr1 (22-315)||(6823009-6823306)
chr1 (22-321)||(2510308-2510611)
chr1 (22-321)||(9459400-9459704)
chr1 (22-327)||(12302483-12302792)
chr1 (28-338)||(16226167-16226483)
chr1 (22-317)||(41646914-41647214)
chr1 (22-312)||(13215075-13215375)
chr1 (22-310)||(50307540-50307834)
chr1 (23-327)||(39462514-39462822)
chr1 (22-327)||(16428647-16428957)
chr1 (22-338)||(47179707-47180028)
chr1 (22-327)||(18839581-18839891)
chr1 (22-317)||(6995687-6995987)
chr1 (22-264)||(21948228-21948474)
chr1 (22-327)||(31424993-31425306)
chr1 (22-317)||(4131362-4131666)
chr1 (21-327)||(50076650-50076960)
chr1 (25-317)||(14097956-14098254)
chr1 (25-317)||(25127869-25128167)
chr1 (22-338)||(47177356-47177677)
chr1 (121-338)||(51757628-51757845)
chr1 (22-317)||(18307103-18307403)
chr1 (22-327)||(50078798-50079108)
chr1 (22-327)||(11457453-11457762)
chr1 (22-317)||(9241072-9241372)
chr1 (22-317)||(17186114-17186415)
chr1 (22-317)||(2949219-2949518)
chr1 (23-317)||(28998240-28998539)
chr1 (23-317)||(29003956-29004255)
chr1 (26-245)||(48665175-48665400)
chr1 (22-327)||(28207046-28207353)
chr1 (22-315)||(3579606-3579903)
chr1 (26-317)||(31489913-31490206)
chr1 (25-327)||(6756524-6756831)
chr1 (22-317)||(25251261-25251562)
chr1 (91-338)||(16231630-16231878)
chr1 (121-320)||(23785936-23786136)
chr1 (22-317)||(40133938-40134239)
chr1 (24-317)||(50248557-50248857)
chr1 (22-327)||(17318887-17319190)
chr1 (22-313)||(31422851-31423161)
chr1 (13-327)||(16432390-16432699)
chr1 (19-308)||(17324056-17324349)
chr1 (91-315)||(25248540-25248766)
chr1 (121-327)||(16429054-16429261)
chr1 (104-327)||(6115080-6115304)
chr1 (165-317)||(23816027-23816180)
chr1 (19-313)||(14183581-14183876)
chr1 (22-300)||(47451642-47451919)
chr1 (56-317)||(15669379-15669640)
chr1 (56-305)||(42922265-42922514)
chr1 (22-220)||(6823879-6824088)
chr1 (102-291)||(8347284-8347476)
chr1 (228-338)||(13358778-13358888)
chr1 (105-308)||(49495206-49495411)
chr1 (106-308)||(21353342-21353545)
chr1 (19-305)||(8349049-8349338)
chr1 (103-305)||(18800570-18800775)
chr1 (106-305)||(27916576-27916780)
chr1 (106-305)||(30738625-30738830)
chr1 (106-280)||(155788-155963)
chr1 (106-305)||(26613237-26613440)
chr1 (104-303)||(30790401-30790602)
chr1 (103-305)||(16561545-16561751)
chr1 (104-305)||(13125455-13125660)
chr1 (106-304)||(2232580-2232774)
chr1 (196-305)||(15916562-15916674)
chr1 (106-320)||(2401205-2401420)
chr1 (106-304)||(9526449-9526650)
chr1 (276-329)||(13447248-13447301)
chr1 (106-308)||(4144677-4144882)
chr1 (106-183)||(25134054-25134132)
chr1 (106-320)||(2393267-2393481)
chr1 (106-183)||(9521698-9521776)
chr1 (104-212)||(26520206-26520321)
chr1 (110-261)||(43104245-43104400)
chr1 (106-245)||(14353047-14353187)
chr1 (109-183)||(14997026-14997101)
chr1 (121-317)||(28279362-28279563)
chr1 (238-302)||(13598402-13598466)
chr1 (238-302)||(16124545-16124609)
chr1 (238-302)||(37069774-37069838)
chr1 (238-302)||(47703965-47704029)
chr1 (239-302)||(19072932-19072995)
chr1 (239-302)||(19120822-19120885)
chr1 (106-181)||(26332613-26332688)
chr1 (239-302)||(47098854-47098917)
chr1 (106-305)||(46783126-46783331)
chr1 (218-305)||(13127685-13127774)
chr1 (237-302)||(21536597-21536662)
chr1 (238-299)||(29651818-29651879)
chr1 (238-302)||(9476265-9476329)
chr1 (242-302)||(26644930-26644990)
chr1 (239-302)||(47102871-47102934)
chr1 (241-299)||(3281715-3281773)
chr1 (22-56)||(25248767-25248801)
chr1 (258-302)||(834167-834211)
chr1 (238-302)||(27104401-27104465)
chr1 (258-302)||(28220226-28220270)
chr1 (258-302)||(28265554-28265598)
chr1 (239-302)||(775676-775739)
chr1 (239-302)||(32889443-32889506)
chr1 (260-302)||(45644354-45644396)
chr1 (84-148)||(26332719-26332781)
chr1 (106-221)||(49959129-49959246)
chr1 (258-302)||(3156989-3157033)
chr1 (258-302)||(4552637-4552681)
chr1 (238-302)||(13604652-13604716)
chr1 (258-302)||(13659336-13659380)
chr1 (258-302)||(28223421-28223465)
chr1 (258-302)||(31659362-31659406)
[»] chr8 (109 HSPs)
chr8 (22-338)||(27829347-27829667)
chr8 (22-338)||(27827036-27827356)
chr8 (22-329)||(608784-609097)
chr8 (22-338)||(15809269-15809589)
chr8 (22-338)||(32339359-32339680)
chr8 (22-321)||(3874060-3874364)
chr8 (23-338)||(22684617-22684940)
chr8 (22-338)||(18810758-18811078)
chr8 (26-327)||(28251543-28251848)
chr8 (22-338)||(28283185-28283504)
chr8 (22-327)||(14807801-14808120)
chr8 (22-338)||(44720893-44721214)
chr8 (22-329)||(43530178-43530477)
chr8 (22-316)||(15068031-15068330)
chr8 (23-338)||(18812944-18813252)
chr8 (22-327)||(15072760-15073070)
chr8 (22-338)||(4424068-4424389)
chr8 (26-327)||(30480479-30480784)
chr8 (22-318)||(43079652-43079953)
chr8 (22-315)||(27106884-27107182)
chr8 (22-320)||(43082023-43082326)
chr8 (22-327)||(1225216-1225526)
chr8 (22-313)||(27911065-27911359)
chr8 (22-313)||(27957484-27957778)
chr8 (22-327)||(14419166-14419476)
chr8 (22-321)||(24873164-24873466)
chr8 (22-317)||(25952571-25952871)
chr8 (22-317)||(41384794-41385094)
chr8 (22-317)||(36865588-36865887)
chr8 (26-309)||(13858477-13858765)
chr8 (22-318)||(5372160-5372463)
chr8 (22-317)||(41382723-41383012)
chr8 (25-317)||(15185699-15185992)
chr8 (26-212)||(14477330-14477520)
chr8 (58-327)||(15956051-15956317)
chr8 (22-317)||(33541395-33541673)
chr8 (22-296)||(21480564-21480832)
chr8 (56-305)||(21482402-21482649)
chr8 (106-308)||(3005624-3005829)
chr8 (102-305)||(31162343-31162551)
chr8 (103-305)||(31035252-31035459)
chr8 (22-145)||(26775251-26775378)
chr8 (91-238)||(181622-181772)
chr8 (22-159)||(5622882-5623023)
chr8 (106-308)||(9021101-9021306)
chr8 (106-305)||(31578273-31578476)
chr8 (22-131)||(35872555-35872663)
chr8 (106-304)||(16757266-16757466)
chr8 (106-304)||(28327891-28328091)
chr8 (56-186)||(37214317-37214438)
chr8 (174-305)||(2468126-2468259)
chr8 (106-305)||(6376124-6376328)
chr8 (106-304)||(28895485-28895686)
chr8 (106-304)||(4812486-4812686)
chr8 (106-304)||(16752522-16752721)
chr8 (106-304)||(28332614-28332814)
chr8 (106-308)||(17799418-17799623)
chr8 (247-324)||(37214243-37214319)
chr8 (106-320)||(23179545-23179760)
chr8 (106-278)||(29554810-29554984)
chr8 (106-234)||(31573794-31573924)
chr8 (106-295)||(17847661-17847848)
chr8 (106-304)||(25684626-25684826)
chr8 (190-327)||(35872429-35872553)
chr8 (106-308)||(590777-590982)
chr8 (106-183)||(33032637-33032715)
chr8 (236-327)||(14477519-14477610)
chr8 (106-206)||(13985176-13985278)
chr8 (119-183)||(3276342-3276405)
chr8 (238-302)||(4696625-4696689)
chr8 (238-302)||(9765848-9765912)
chr8 (22-75)||(12517252-12517309)
chr8 (238-302)||(23799606-23799670)
chr8 (238-302)||(26403259-26403323)
chr8 (106-308)||(21033853-21034057)
chr8 (238-302)||(7412345-7412409)
chr8 (237-304)||(28890881-28890949)
chr8 (106-183)||(30423195-30423274)
chr8 (238-302)||(31071258-31071322)
chr8 (239-302)||(19752424-19752487)
chr8 (22-56)||(3886169-3886203)
chr8 (258-308)||(10930193-10930243)
chr8 (22-56)||(37214461-37214495)
chr8 (286-327)||(181798-181838)
chr8 (103-148)||(2468261-2468306)
chr8 (106-326)||(33838896-33839120)
chr8 (238-302)||(5702512-5702576)
chr8 (258-302)||(15212910-15212954)
chr8 (238-302)||(19175783-19175847)
chr8 (258-302)||(27811402-27811446)
chr8 (258-302)||(33352274-33352318)
chr8 (258-302)||(40321204-40321248)
chr8 (258-302)||(43036547-43036591)
chr8 (258-301)||(4733830-4733873)
chr8 (108-159)||(15949519-15949572)
chr8 (106-158)||(11701102-11701155)
chr8 (188-303)||(16833769-16833886)
chr8 (272-320)||(28228668-28228717)
chr8 (239-296)||(28307571-28307628)
chr8 (56-140)||(31035157-31035238)
chr8 (258-299)||(40221869-40221910)
chr8 (238-298)||(4456036-4456096)
chr8 (258-302)||(4743214-4743258)
chr8 (258-302)||(5689395-5689439)
chr8 (238-302)||(6127225-6127289)
chr8 (258-302)||(6599096-6599140)
chr8 (258-302)||(6674549-6674593)
chr8 (258-302)||(12702634-12702678)
chr8 (106-182)||(26268354-26268429)
[»] chr3 (183 HSPs)
chr3 (22-338)||(4103858-4104178)
chr3 (22-321)||(25533416-25533720)
chr3 (22-338)||(10955989-10956310)
chr3 (22-338)||(5191627-5191946)
chr3 (22-321)||(3859502-3859805)
chr3 (22-327)||(4308255-4308564)
chr3 (22-338)||(38890014-38890335)
chr3 (22-338)||(51726969-51727289)
chr3 (22-317)||(42990278-42990578)
chr3 (22-338)||(10084351-10084672)
chr3 (22-338)||(10958285-10958606)
chr3 (22-317)||(18099153-18099453)
chr3 (22-317)||(43228265-43228565)
chr3 (57-338)||(1321492-1321774)
chr3 (22-327)||(30005815-30006124)
chr3 (22-326)||(9604582-9604889)
chr3 (19-327)||(25388877-25389189)
chr3 (22-308)||(43226060-43226350)
chr3 (22-317)||(11170378-11170678)
chr3 (22-338)||(5522589-5522898)
chr3 (66-321)||(7606567-7606822)
chr3 (22-327)||(18096874-18097183)
chr3 (22-338)||(22114267-22114588)
chr3 (22-317)||(45882913-45883214)
chr3 (23-317)||(27101164-27101463)
chr3 (22-338)||(746731-747053)
chr3 (22-338)||(458258-458580)
chr3 (22-327)||(1313384-1313692)
chr3 (22-317)||(1626666-1626966)
chr3 (24-338)||(10621491-10621811)
chr3 (22-338)||(455881-456203)
chr3 (22-338)||(6063407-6063729)
chr3 (22-338)||(10191274-10191592)
chr3 (22-327)||(43423437-43423746)
chr3 (22-327)||(53917638-53917947)
chr3 (22-338)||(26720522-26720842)
chr3 (22-338)||(6065757-6066079)
chr3 (22-338)||(38210344-38210666)
chr3 (22-320)||(50493973-50494276)
chr3 (22-317)||(28101985-28102285)
chr3 (19-327)||(18162634-18162946)
chr3 (26-327)||(43421389-43421694)
chr3 (22-317)||(3314658-3314959)
chr3 (22-327)||(24979681-24979991)
chr3 (38-338)||(28412992-28413299)
chr3 (22-317)||(32264021-32264322)
chr3 (22-327)||(53915470-53915779)
chr3 (24-317)||(51943347-51943644)
chr3 (19-309)||(5926755-5927050)
chr3 (22-264)||(29956660-29956907)
chr3 (22-327)||(36011801-36012110)
chr3 (22-317)||(53468436-53468738)
chr3 (22-317)||(47148878-47149178)
chr3 (25-327)||(880425-880732)
chr3 (105-317)||(5886261-5886472)
chr3 (105-317)||(5899734-5899945)
chr3 (24-327)||(12267949-12268247)
chr3 (108-327)||(11168165-11168385)
chr3 (98-317)||(25688143-25688364)
chr3 (22-300)||(35917944-35918232)
chr3 (22-317)||(42992260-42992544)
chr3 (51-317)||(6484366-6484634)
chr3 (22-327)||(51674740-51675038)
chr3 (59-327)||(15780886-15781162)
chr3 (22-259)||(6561784-6562028)
chr3 (22-317)||(48361654-48361953)
chr3 (26-317)||(28761410-28761707)
chr3 (22-327)||(32219069-32219368)
chr3 (22-317)||(39715443-39715739)
chr3 (24-294)||(889779-890052)
chr3 (84-327)||(4666554-4666797)
chr3 (92-327)||(6231849-6232083)
chr3 (28-324)||(54691551-54691851)
chr3 (23-302)||(53591170-53591442)
chr3 (121-317)||(23633531-23633727)
chr3 (22-209)||(35777395-35777587)
chr3 (22-199)||(28100143-28100324)
chr3 (62-317)||(17795280-17795533)
chr3 (62-317)||(19103720-19103973)
chr3 (167-317)||(27635641-27635792)
chr3 (56-296)||(13420189-13420427)
chr3 (56-327)||(31151360-31151628)
chr3 (171-317)||(47701654-47701801)
chr3 (29-255)||(54884138-54884367)
chr3 (56-305)||(561769-562019)
chr3 (35-204)||(28181009-28181182)
chr3 (22-305)||(36871295-36871581)
chr3 (56-305)||(25635396-25635644)
chr3 (122-317)||(3306839-3307034)
chr3 (22-192)||(28137415-28137578)
chr3 (56-220)||(23637038-23637199)
chr3 (236-321)||(35919094-35919179)
chr3 (106-303)||(1620457-1620657)
chr3 (227-327)||(41849243-41849342)
chr3 (56-296)||(53597251-53597491)
chr3 (106-308)||(29913949-29914152)
chr3 (59-305)||(1673990-1674227)
chr3 (165-305)||(24181501-24181644)
chr3 (236-338)||(53894018-53894121)
chr3 (106-308)||(47878165-47878370)
chr3 (106-304)||(10094073-10094273)
chr3 (106-320)||(10896988-10897203)
chr3 (22-136)||(41849126-41849244)
chr3 (106-304)||(10100090-10100290)
chr3 (106-304)||(10200953-10201153)
chr3 (22-112)||(11163124-11163218)
chr3 (106-304)||(54193209-54193410)
chr3 (187-305)||(25634030-25634150)
chr3 (106-304)||(10207999-10208199)
chr3 (106-304)||(22625982-22626183)
chr3 (106-304)||(54188492-54188692)
chr3 (88-184)||(4560401-4560497)
chr3 (106-278)||(6303293-6303466)
chr3 (106-305)||(14634435-14634638)
chr3 (119-308)||(10595028-10595218)
chr3 (106-308)||(10612772-10612977)
chr3 (106-183)||(16462186-16462264)
chr3 (106-183)||(47883003-47883081)
chr3 (106-278)||(5858529-5858701)
chr3 (106-304)||(27544256-27544456)
chr3 (22-92)||(47701804-47701878)
chr3 (119-278)||(11079515-11079674)
chr3 (22-96)||(6231423-6231501)
chr3 (56-148)||(24177291-24177380)
chr3 (238-302)||(1736324-1736388)
chr3 (238-302)||(18552902-18552966)
chr3 (106-183)||(20031439-20031517)
chr3 (238-302)||(30709809-30709873)
chr3 (119-308)||(4535612-4535803)
chr3 (106-278)||(10949285-10949459)
chr3 (119-320)||(27761970-27762170)
chr3 (106-181)||(38002852-38002928)
chr3 (22-96)||(27635832-27635910)
chr3 (238-302)||(8370505-8370569)
chr3 (238-302)||(27974971-27975035)
chr3 (238-302)||(27986465-27986529)
chr3 (239-302)||(1417510-1417573)
chr3 (266-317)||(42992609-42992660)
chr3 (165-320)||(46966630-46966787)
chr3 (238-299)||(48438221-48438282)
chr3 (106-146)||(7768632-7768672)
chr3 (238-302)||(16264354-16264418)
chr3 (238-302)||(21711227-21711291)
chr3 (238-302)||(32143325-32143389)
chr3 (238-302)||(33386685-33386749)
chr3 (133-278)||(11007545-11007683)
chr3 (239-302)||(37466295-37466358)
chr3 (188-308)||(15823641-15823763)
chr3 (88-133)||(7606828-7606873)
chr3 (237-325)||(16996993-16997082)
chr3 (22-87)||(3306773-3306842)
chr3 (106-183)||(3329876-3329954)
chr3 (238-302)||(26298992-26299056)
chr3 (238-302)||(27452962-27453026)
chr3 (238-302)||(36029097-36029161)
chr3 (258-302)||(40913417-40913461)
chr3 (258-302)||(44331669-44331713)
chr3 (237-308)||(48390296-48390368)
chr3 (106-183)||(11066652-11066731)
chr3 (239-302)||(25795785-25795848)
chr3 (106-180)||(13419941-13420015)
chr3 (22-56)||(15780834-15780868)
chr3 (258-308)||(30236249-30236299)
chr3 (280-317)||(8183117-8183154)
chr3 (106-183)||(26763021-26763101)
chr3 (106-146)||(31021300-31021341)
chr3 (238-302)||(3716021-3716085)
chr3 (266-302)||(5236457-5236493)
chr3 (238-302)||(6794732-6794796)
chr3 (258-302)||(9666466-9666510)
chr3 (106-183)||(13893445-13893523)
chr3 (258-302)||(16499153-16499197)
chr3 (258-302)||(23391909-23391953)
chr3 (258-302)||(29196386-29196430)
chr3 (266-302)||(32744436-32744472)
chr3 (258-302)||(34491336-34491380)
chr3 (258-302)||(39153361-39153405)
chr3 (238-302)||(40592801-40592865)
chr3 (258-302)||(40734622-40734666)
chr3 (258-298)||(40735507-40735547)
chr3 (238-302)||(40844656-40844719)
chr3 (250-302)||(47923937-47923989)
chr3 (258-302)||(51398938-51398982)
[»] chr5 (118 HSPs)
chr5 (22-321)||(2174913-2175216)
chr5 (22-321)||(38882100-38882403)
chr5 (22-340)||(4236623-4236945)
chr5 (22-338)||(25921437-25921758)
chr5 (24-338)||(27912532-27912851)
chr5 (22-338)||(18466678-18466999)
chr5 (22-338)||(34479382-34479704)
chr5 (22-317)||(6745063-6745362)
chr5 (22-317)||(39854477-39854777)
chr5 (26-338)||(10529062-10529380)
chr5 (22-338)||(34477017-34477339)
chr5 (22-321)||(27910445-27910748)
chr5 (22-338)||(18469005-18469324)
chr5 (22-338)||(25804019-25804339)
chr5 (22-317)||(21948020-21948320)
chr5 (22-317)||(16776152-16776451)
chr5 (22-327)||(6747300-6747608)
chr5 (22-338)||(21684416-21684736)
chr5 (22-320)||(31545074-31545377)
chr5 (24-338)||(31179337-31179654)
chr5 (22-327)||(2818311-2818621)
chr5 (22-327)||(18511188-18511497)
chr5 (22-313)||(40221516-40221813)
chr5 (22-318)||(31542729-31543029)
chr5 (56-327)||(658332-658600)
chr5 (25-338)||(15552242-15552561)
chr5 (26-327)||(16092175-16092481)
chr5 (22-317)||(1189592-1189894)
chr5 (22-321)||(10586836-10587130)
chr5 (22-317)||(26097727-26098025)
chr5 (91-329)||(4410090-4410328)
chr5 (26-327)||(2954414-2954719)
chr5 (22-327)||(18509294-18509603)
chr5 (22-317)||(25904097-25904397)
chr5 (26-317)||(695887-696172)
chr5 (22-317)||(10474308-10474608)
chr5 (22-327)||(18596641-18596950)
chr5 (22-317)||(17818477-17818775)
chr5 (22-317)||(24126850-24127150)
chr5 (22-311)||(17072877-17073172)
chr5 (24-327)||(6756490-6756795)
chr5 (22-326)||(31472589-31472898)
chr5 (22-317)||(39397978-39398278)
chr5 (102-317)||(20505828-20506042)
chr5 (22-327)||(36402304-36402613)
chr5 (103-321)||(39798126-39798345)
chr5 (121-320)||(10749797-10749996)
chr5 (22-308)||(37705774-37706065)
chr5 (121-320)||(15354557-15354756)
chr5 (121-320)||(23665141-23665340)
chr5 (121-320)||(23793247-23793446)
chr5 (121-320)||(38960114-38960313)
chr5 (91-317)||(41585729-41585956)
chr5 (121-320)||(3373119-3373319)
chr5 (121-320)||(10757274-10757472)
chr5 (121-320)||(15356833-15357032)
chr5 (26-317)||(21288762-21289055)
chr5 (22-327)||(31465965-31466263)
chr5 (86-317)||(2723964-2724187)
chr5 (127-320)||(23741841-23742034)
chr5 (22-317)||(12555908-12556208)
chr5 (22-245)||(34530722-34530951)
chr5 (22-182)||(20043044-20043208)
chr5 (105-327)||(9020299-9020525)
chr5 (19-305)||(6661181-6661470)
chr5 (105-312)||(36208656-36208865)
chr5 (22-186)||(20045004-20045172)
chr5 (22-159)||(26098395-26098536)
chr5 (104-317)||(20053923-20054131)
chr5 (121-306)||(23667416-23667601)
chr5 (106-291)||(17413176-17413365)
chr5 (106-308)||(22672817-22673022)
chr5 (106-304)||(1170794-1170994)
chr5 (106-304)||(35385450-35385651)
chr5 (218-317)||(26098273-26098373)
chr5 (106-305)||(15143547-15143750)
chr5 (109-316)||(4897811-4898023)
chr5 (106-278)||(2298026-2298200)
chr5 (126-308)||(25445501-25445684)
chr5 (106-308)||(25452478-25452683)
chr5 (150-238)||(42770936-42771025)
chr5 (106-264)||(2144600-2144763)
chr5 (119-305)||(15445263-15445455)
chr5 (106-305)||(17841246-17841448)
chr5 (255-317)||(20043222-20043284)
chr5 (106-308)||(28786387-28786592)
chr5 (22-106)||(20507659-20507747)
chr5 (106-278)||(1240411-1240585)
chr5 (106-248)||(4754235-4754380)
chr5 (119-183)||(11962554-11962617)
chr5 (125-192)||(42770867-42770934)
chr5 (238-302)||(9353361-9353425)
chr5 (106-183)||(10627347-10627425)
chr5 (238-302)||(36932379-36932443)
chr5 (239-302)||(28832263-28832326)
chr5 (106-318)||(35430259-35430477)
chr5 (237-302)||(11917000-11917065)
chr5 (106-182)||(16093413-16093489)
chr5 (238-302)||(10281755-10281819)
chr5 (238-302)||(15464536-15464600)
chr5 (238-302)||(17003989-17004053)
chr5 (106-159)||(31782601-31782656)
chr5 (237-308)||(42238376-42238448)
chr5 (22-56)||(4410055-4410089)
chr5 (238-302)||(19588750-19588814)
chr5 (258-302)||(19806487-19806531)
chr5 (106-183)||(26406594-26406672)
chr5 (258-302)||(32636948-32636992)
chr5 (239-302)||(31300626-31300689)
chr5 (121-183)||(32520534-32520597)
chr5 (239-302)||(42127440-42127503)
chr5 (121-159)||(34033714-34033752)
chr5 (127-181)||(40222769-40222822)
chr5 (258-302)||(533893-533937)
chr5 (238-302)||(12084204-12084268)
chr5 (238-302)||(14520234-14520298)
chr5 (258-302)||(28278440-28278484)
chr5 (258-302)||(42428430-42428474)
[»] chr2 (120 HSPs)
chr2 (22-338)||(23452201-23452522)
chr2 (22-329)||(19501984-19502296)
chr2 (22-338)||(27104769-27105088)
chr2 (24-320)||(42064487-42064788)
chr2 (22-321)||(45279965-45280270)
chr2 (22-338)||(13910009-13910329)
chr2 (22-329)||(19504319-19504630)
chr2 (22-321)||(42452753-42453054)
chr2 (22-317)||(21520678-21520978)
chr2 (22-317)||(19007610-19007910)
chr2 (22-329)||(24162196-24162497)
chr2 (22-317)||(6264133-6264430)
chr2 (23-327)||(42923485-42923793)
chr2 (22-317)||(22287321-22287621)
chr2 (22-320)||(35215568-35215871)
chr2 (26-327)||(43623556-43623849)
chr2 (22-317)||(40032038-40032343)
chr2 (22-320)||(35217945-35218248)
chr2 (22-327)||(28196607-28196914)
chr2 (96-327)||(5375322-5375552)
chr2 (22-327)||(11739535-11739845)
chr2 (26-317)||(6258802-6259096)
chr2 (22-327)||(17848413-17848719)
chr2 (121-321)||(36558845-36559046)
chr2 (22-317)||(17849087-17849387)
chr2 (121-320)||(36561123-36561323)
chr2 (22-317)||(34979562-34979864)
chr2 (23-317)||(3022134-3022442)
chr2 (24-317)||(14837245-14837538)
chr2 (28-317)||(44289052-44289347)
chr2 (121-338)||(45332144-45332363)
chr2 (22-306)||(31732772-31733050)
chr2 (22-279)||(45239000-45239261)
chr2 (26-212)||(15539566-15539756)
chr2 (58-317)||(28459175-28459435)
chr2 (22-317)||(22874112-22874401)
chr2 (22-327)||(18800289-18800587)
chr2 (165-317)||(22407439-22407592)
chr2 (22-305)||(11578104-11578389)
chr2 (56-305)||(17897242-17897489)
chr2 (106-305)||(20146604-20146806)
chr2 (174-299)||(7462950-7463077)
chr2 (184-317)||(22707736-22707872)
chr2 (22-205)||(38020172-38020349)
chr2 (22-145)||(22163106-22163232)
chr2 (218-327)||(22162998-22163106)
chr2 (104-305)||(40699429-40699634)
chr2 (106-320)||(20054749-20054964)
chr2 (24-118)||(22407594-22407692)
chr2 (106-308)||(17943520-17943723)
chr2 (183-317)||(23870951-23871086)
chr2 (105-305)||(37962938-37963137)
chr2 (119-237)||(20589761-20589881)
chr2 (119-304)||(2736203-2736388)
chr2 (106-304)||(17462419-17462619)
chr2 (106-304)||(39686966-39687166)
chr2 (106-320)||(27517623-27517838)
chr2 (106-317)||(35107351-35107566)
chr2 (106-304)||(39680028-39680228)
chr2 (25-103)||(5377629-5377711)
chr2 (106-237)||(43139432-43139564)
chr2 (103-232)||(27136195-27136326)
chr2 (106-308)||(30478977-30479182)
chr2 (119-278)||(2740939-2741097)
chr2 (106-183)||(22712637-22712715)
chr2 (106-183)||(22717346-22717424)
chr2 (106-183)||(45567392-45567470)
chr2 (106-320)||(20050005-20050221)
chr2 (106-248)||(17932617-17932759)
chr2 (91-190)||(38414194-38414291)
chr2 (119-278)||(12781246-12781405)
chr2 (238-302)||(14699036-14699100)
chr2 (106-278)||(17921754-17921927)
chr2 (107-159)||(27583483-27583535)
chr2 (106-183)||(28458949-28459028)
chr2 (106-264)||(33603977-33604139)
chr2 (119-278)||(37170778-37170936)
chr2 (106-169)||(38190980-38191045)
chr2 (105-181)||(26345661-26345738)
chr2 (240-308)||(1345572-1345640)
chr2 (238-302)||(8390179-8390243)
chr2 (238-302)||(13569332-13569396)
chr2 (238-302)||(20522224-20522288)
chr2 (278-317)||(15539514-15539553)
chr2 (237-302)||(34682362-34682427)
chr2 (238-302)||(8040064-8040128)
chr2 (238-302)||(10445473-10445537)
chr2 (105-237)||(15693958-15694094)
chr2 (258-302)||(17057369-17057413)
chr2 (258-302)||(17085352-17085396)
chr2 (238-302)||(28259206-28259270)
chr2 (237-304)||(45679838-45679906)
chr2 (106-181)||(35028632-35028707)
chr2 (106-157)||(33674551-33674604)
chr2 (255-308)||(2838076-2838129)
chr2 (121-181)||(7502991-7503052)
chr2 (144-305)||(13828338-13828503)
chr2 (237-278)||(33670992-33671033)
chr2 (258-302)||(723744-723788)
chr2 (121-315)||(10942497-10942695)
chr2 (121-315)||(10948366-10948564)
chr2 (238-302)||(17865207-17865271)
chr2 (238-302)||(21629948-21630011)
chr2 (238-302)||(33118140-33118204)
chr2 (258-302)||(34139770-34139814)
chr2 (238-302)||(34388862-34388926)
chr2 (258-302)||(39284960-39285004)
chr2 (238-302)||(39482935-39482999)
chr2 (259-302)||(11151591-11151634)
chr2 (238-302)||(10707281-10707345)
chr2 (258-302)||(11067429-11067473)
chr2 (258-302)||(14633825-14633869)
chr2 (238-302)||(16940238-16940302)
chr2 (238-302)||(17010903-17010967)
chr2 (238-302)||(25398500-25398563)
chr2 (238-302)||(33528650-33528714)
chr2 (257-301)||(35446885-35446929)
chr2 (258-302)||(36773686-36773730)
chr2 (237-308)||(38191128-38191200)
chr2 (258-302)||(38312364-38312408)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (22-329)||(41456-41768)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (22-327)||(79188-79497)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (22-338)||(2883-3203)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (21-338)||(183605-183926)
scaffold0005 (22-327)||(52014-52324)
scaffold0005 (237-327)||(50235-50325)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (82-329)||(1426-1673)
[»] scaffold0131 (3 HSPs)
scaffold0131 (26-308)||(14376-14663)
scaffold0131 (22-308)||(15022-15313)
scaffold0131 (106-148)||(31124-31168)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (22-323)||(4000-4304)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (22-338)||(29174-29494)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (22-321)||(44-348)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (22-320)||(6202-6505)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (22-327)||(11449-11758)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (22-313)||(79862-80158)
scaffold0004 (106-183)||(188363-188441)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (22-264)||(2045-2291)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (27-327)||(85238-85543)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (121-320)||(22222-22421)
scaffold0140 (121-320)||(24497-24696)
scaffold0140 (238-302)||(8448-8512)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (24-195)||(35644-35819)
scaffold0011 (237-327)||(35817-35906)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (56-305)||(15817-16066)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (104-305)||(1638-1842)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (56-305)||(16646-16895)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (121-296)||(4916-5095)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (22-136)||(993-1116)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (248-320)||(4661-4733)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (268-338)||(1415-1485)
[»] scaffold0006 (5 HSPs)
scaffold0006 (106-264)||(224802-224961)
scaffold0006 (238-302)||(5687-5751)
scaffold0006 (238-302)||(2496-2560)
scaffold0006 (238-302)||(133309-133373)
scaffold0006 (258-302)||(149097-149141)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (106-304)||(16308-16509)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (119-308)||(16980-17170)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (120-278)||(57452-57614)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (237-304)||(3068-3136)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (238-302)||(43990-44054)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (239-299)||(10736-10796)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (238-302)||(45257-45321)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (258-302)||(20415-20459)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (241-302)||(85687-85748)


Alignment Details
Target: scaffold0025 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 69576 - 69256
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  69576 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 69477  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69476 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 69377  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69376 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 69277  T
Q  318 tctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  69276 tctcttctttgtgttcttctc 69256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 73308 - 73203
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  73308 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 73209  T
Q  118 gcaaaa 123  Q
    | ||||    
T  73208 ggaaaa 73203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 73210 - 73160
Alignment:
Q  80 ttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactatt 130  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  73210 ttggaaaaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 138)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 38393990 - 38394311
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  38393990 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 38394089  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394090 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 38394189  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394190 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 38394289  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  38394290 ttctcttctttgtgttcttctc 38394311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 40837027 - 40836718
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  40837027 gggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 40836928  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836927 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 40836828  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836827 tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 40836728  T
Q  318 tctcttcttt 327  Q
    ||||||||||    
T  40836727 tctcttcttt 40836718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7470307 - 7469984
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  7470307 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 7470208  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470207 gtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 7470108  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470107 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctccctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 7470008  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctcac 340  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  7470007 ttctcttatttgtgttcttctcac 7469984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 48457657 - 48457978
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  48457657 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcaccta 48457756  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457757 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 48457856  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457857 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 48457956  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  48457957 ttctcttctttgtgttcttctc 48457978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 3878581 - 3878902
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||    
T  3878581 gggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcacctt 3878680  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878681 ggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 3878780  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878781 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactatgttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 3878880  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  3878881 ttctcttctttgtgttcttctc 3878902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 26 - 338
Target Start/End: Original strand, 18345549 - 18345866
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  18345549 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttggga 18345648  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18345649 aacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttt 18345748  T
Q  221 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345749 gtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 18345848  T
Q  321 cttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  18345849 cttctttgtgttcttctc 18345866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 20626042 - 20626342
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626042 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 20626141  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626142 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctc 20626241  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626242 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 20626341  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  20626342 t 20626342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 20629933 - 20630233
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629933 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 20630032  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630033 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctc 20630132  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630133 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 20630232  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  20630233 t 20630233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 20642352 - 20642652
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642352 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 20642451  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642452 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctc 20642551  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642552 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 20642651  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  20642652 t 20642652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Original strand, 1849985 - 1850297
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1849985 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 1850084  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850085 ggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 1850184  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850185 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 1850284  T
Q  317 ttctcttctttgt 329  Q
    |||||||||||||    
T  1850285 ttctcttctttgt 1850297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 44724583 - 44724883
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44724583 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 44724682  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44724683 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 44724782  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724783 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 44724882  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  44724883 t 44724883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 22 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7472265 - 7471942
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  7472265 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 7472166  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472165 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctc 7472066  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472065 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 7471966  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctcac 340  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  7471965 ttctcttatttgtgttcttctcac 7471942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 1049580 - 1049268
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1049580 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcacctt 1049481  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049480 gggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 1049381  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg-ttc 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  1049380 tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtttt 1049281  T
Q  317 ttctcttctttgt 329  Q
    |||||||||||||    
T  1049280 ttctcttctttgt 1049268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 20299462 - 20299785
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaaggg-tttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactagg-ttttgagggttgattcacc 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20299462 gggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcacc 20299561  T
Q  116 ttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 215  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299562 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 20299661  T
Q  216 tc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 314  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299662 tcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 20299761  T
Q  315 tcttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||    
T  20299762 tcttctctcctttgtgttcttctc 20299785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1047209 - 1046888
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1047209 gggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 1047110  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047109 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 1047010  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg-ttc 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  1047009 tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtttt 1046910  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  1046909 ttctcttctttgtgttcttctc 1046888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 40946332 - 40946653
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| ||||||||| || ||    
T  40946332 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttacttt 40946431  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40946432 ggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctc 40946531  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40946532 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 40946631  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||| |||||||| ||| ||||    
T  40946632 ttcttttctttgtgttcttctc 40946653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 35633 - 35954
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35633 gggctgaaacaagggttcagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 35732  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35733 gggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 35832  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  35833 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctttctcccctagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatttttttgtgttc 35932  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  35933 ttctcttctttgtgttcttctc 35954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 44568 - 44889
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44568 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 44667  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
       ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44668 aggaaacactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 44767  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44768 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatagctgctttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 44867  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  44868 ttctcttctttgtgttcttctc 44889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 43253805 - 43253481
Alignment:
Q  18 aagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattca 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43253805 aagagggctgaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttt-gagggttgattca 43253707  T
Q  114 ccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 213  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43253706 ccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatt 43253607  T
Q  214 tctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 312  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43253606 tctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccctcagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaataaattcttttgt 43253507  T
Q  313 gttcttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  43253506 gttcttctcttctttgtgttcttctc 43253481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 3035725 - 3036049
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3035725 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 3035824  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga---ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 214  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035825 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgattt 3035924  T
Q  215 ctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 313  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035925 ctcttttgcaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 3036024  T
Q  314 ttcttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||| |||||||||||| ||| ||||    
T  3036025 ttcctctcttctttgtgttcttctc 3036049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 22 - 340
Target Start/End: Original strand, 25542534 - 25542855
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  25542534 gggctgaaacaaaggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 25542633  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542634 ggaaag-actattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 25542732  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25542733 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtttt 25542832  T
Q  318 tctcttctttgtattcatctcac 340  Q
    |||||||||||| ||| ||||||    
T  25542833 tctcttctttgtgttcttctcac 25542855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 20297366 - 20297687
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  20297366 gggctgaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcacctt 20297465  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297466 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 20297565  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20297566 ttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttc 20297665  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||    
T  20297666 ttctcctctttgtgttcttctc 20297687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 31435332 - 31435022
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31435332 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcacctt 31435233  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31435232 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctc 31435133  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435132 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 31435033  T
Q  316 cttctcttcttt 327  Q
    | ||||||||||    
T  31435032 c-tctcttcttt 31435022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27306514 - 27306224
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27306514 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-tatagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacctt 27306416  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27306415 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctc 27306316  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27306315 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 27306224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 31156196 - 31155892
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  31156196 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcacctt 31156097  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31156096 gggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 31155997  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31155996 ctttgtaacggtactcatcctatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 31155897  T
Q  317 ttctc 321  Q
    |||||    
T  31155896 ttctc 31155892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7351937 - 7351615
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  7351937 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 7351838  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7351837 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 7351738  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7351737 ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 7351638  T
Q  317 ttc-tcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||    
T  7351637 ttcttcttctttgtgttcttctc 7351615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20137394 - 20137085
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20137394 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 20137295  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20137294 gggaaacactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 20137195  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137194 ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 20137096  T
Q  316 cttctcttcttt 327  Q
    | ||||||||||    
T  20137095 c-tctcttcttt 20137085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 21990154 - 21990454
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag----ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||     | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21990154 gggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 21990253  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  21990254 gagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctc 21990353  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21990354 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 21990453  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  21990454 t 21990454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Original strand, 28487557 - 28487869
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    | ||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| || | |||||||||||||||    
T  28487557 gggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctt 28487656  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487657 tggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 28487756  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28487757 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcagagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttc 28487856  T
Q  317 ttctcttctttgt 329  Q
    |||| ||||||||    
T  28487857 ttcttttctttgt 28487869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13099757 - 13099459
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |    
T  13099757 tgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggga 13099658  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tt 219  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  13099657 aacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttt 13099558  T
Q  220 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099557 tgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13099459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 92 - 338
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396959
Alignment:
Q  92 ctaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagac 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 38396812  T
Q  192 ttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaac 291  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  38396813 ttatttttgtaacccattgatttctctttgtaactttactcatcatatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaac 38396912  T
Q  292 tgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  38396913 tgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 38396959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21592428 - 21592119
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21592428 gggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 21592329  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  21592328 ggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgacatctc 21592229  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21592228 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 21592129  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  21592128 -tctcttcttt 21592119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 84 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7092431 - 7092177
Alignment:
Q  84 aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  7092431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7092332  T
Q  184 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaattt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7092331 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaattt 7092233  T
Q  283 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7092232 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 7092177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 11355262 - 11355562
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11355262 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcacctt 11355361  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-t 216  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  11355362 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctt 11355461  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11355462 ttttgtaacgtttctcatcatatagtggaacagagagctgctctctcccctagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttc 11355561  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  11355562 t 11355562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4296220 - 4295910
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcacct 116  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4296220 gggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcacct 4296121  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  4296120 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatct 4296021  T
Q  217 c-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4296020 cttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctatctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaattcttttgtgtt 4295921  T
Q  316 cttctcttcttt 327  Q
    | ||||||||||    
T  4295920 c-tctcttcttt 4295910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 7349558 - 7349250
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  7349558 gggctgaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 7349459  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349458 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 7349359  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    |||||||||||  |||||||||    
T  7349358 ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa----gtcaacaaatttctttgtgttc 7349263  T
Q  317 ttc-tcttctttg 328  Q
    ||| |||||||||    
T  7349262 ttcttcttctttg 7349250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 42331284 - 42330982
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag----ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||     |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42331284 gggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 42331185  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggtt--acgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 215  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42331184 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 42331085  T
Q  216 tc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 314  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331084 tcttttgtaaagttactcattatatagtgaaacggagggctattctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 42330985  T
Q  315 tct 317  Q
    |||    
T  42330984 tct 42330982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 24748598 - 24748899
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  24748598 gggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccct 24748697  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24748698 gggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctc 24748797  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24748798 ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagattaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgtt 24748897  T
Q  316 ct 317  Q
    ||    
T  24748898 ct 24748899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 329
Target Start/End: Original strand, 28485574 - 28485881
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |    
T  28485574 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttgga 28485673  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  28485674 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctctttt 28485773  T
Q  221 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28485774 gtaacgttactcatcatataatgaatcagagggttgctctctcc-tcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttattct 28485872  T
Q  321 cttctttgt 329  Q
    |||||||||    
T  28485873 cttctttgt 28485881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37412413 - 37412110
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcacct 116  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37412413 gggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 37412314  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  37412313 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatct 37412214  T
Q  217 c--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 313  Q
    |  ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  37412213 ctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccctagactgggtcaatttggaccgaactggatcaataaattcttttgtg 37412114  T
Q  314 ttct 317  Q
    ||||    
T  37412113 ttct 37412110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 317
Target Start/End: Original strand, 443605 - 443900
Alignment:
Q  28 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaa 123  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  443605 aaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 443704  T
Q  124 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |    
T  443705 cactattaggattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttat 443804  T
Q  223 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443805 aacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctcccccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 443900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 317
Target Start/End: Original strand, 9680827 - 9681124
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag----ggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgca 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||     |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |      
T  9680827 tgaaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcggg 9680926  T
Q  121 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | || ||    
T  9680927 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttt 9681026  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  9681027 tgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttct 9681124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 84 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7094678 - 7094424
Alignment:
Q  84 aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  7094678 aacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7094580  T
Q  184 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaattt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7094579 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaattt 7094480  T
Q  283 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7094479 ggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 7094424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 21680031 - 21680343
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  21680031 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatctt 21680130  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  21680131 gggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgggactttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctc 21680230  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaa---ctgggtcaacaaattcttttgtg 313  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||    
T  21680231 ttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagagctgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgctgggtcaacaaatacttttttg 21680330  T
Q  314 ttcttctcttcttt 327  Q
    ||| ||||||||||    
T  21680331 ttc-tctcttcttt 21680343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 327
Target Start/End: Original strand, 42223165 - 42223471
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgca 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  42223165 tgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga 42223264  T
Q  121 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| |||| ||    
T  42223265 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttt 42223364  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  42223365 tgtaacgttactcatcatatagtgaaatggatggctgctctctcccccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaattcttttgttttc-tc 42223463  T
Q  320 tcttcttt 327  Q
    ||||||||    
T  42223464 tcttcttt 42223471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 39146272 - 39145971
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  39146272 gggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcacctt 39146173  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  39146172 ggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctc 39146073  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||| | | | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39146072 ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctcttttccctaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 39145973  T
Q  316 ct 317  Q
    ||    
T  39145972 ct 39145971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 315
Target Start/End: Original strand, 9679063 - 9679361
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcacct 116  Q
    |||||||||||||| | ||||| | ||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  9679063 gggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactaggttt-gaggattgattcacct 9679161  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9679162 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatct 9679261  T
Q  217 c-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9679262 cttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctctttcccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaattcttttgtgtt 9679361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 24258467 - 24258781
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24258467 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcacctt 24258566  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24258567 ggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatctc 24258666  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca----tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac-aaattcttttg 311  Q
     ||||||| |||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |||||||||||    
T  24258667 ttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctctttcagactaggtcaatttggaccgaattagatgaacaaaattcttttg 24258766  T
Q  312 tgttcttctcttcttt 327  Q
    ||||| ||||||||||    
T  24258767 tgttc-tctcttcttt 24258781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 22 - 248
Target Start/End: Original strand, 11757232 - 11757465
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaaggg-tttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactagg-ttttgagggttgattcacc 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11757232 gggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcacc 11757331  T
Q  116 ttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 215  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757332 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 11757431  T
Q  216 tc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcg 248  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757432 tcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcg 11757465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 21678070 - 21678361
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21678070 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 21678169  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  21678170 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggactttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatc 21678269  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
     ||||||| |||||| ||||||||||| | | | |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21678270 ttttgtaaggttacttatcatatagtgaaacagtgggctgctctctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggacaacaaattctt 21678361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 24 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27832916 - 27832631
Alignment:
Q  24 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag----ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgc 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |     |||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||     
T  27832916 gctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtatagagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgg 27832817  T
Q  120 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27832816 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 27832717  T
Q  220 -tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||    
T  27832716 ctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctcccccagactaggtcaattt-----gaactgggtaaacaaattctt 27832631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 2935375 - 2935575
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2935375 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 2935474  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  2935475 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttccttgtgttcttc 2935574  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  2935575 t 2935575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 22108174 - 22108373
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22108174 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 22108272  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22108273 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttc 22108372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 40549934 - 40550133
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40549934 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 40550032  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40550033 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttc 40550132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 22137185 - 22137384
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22137185 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 22137283  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22137284 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttc 22137383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 40552212 - 40552411
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40552212 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 40552310  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40552311 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttc 40552410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 9027375 - 9027176
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9027375 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctctt 9027277  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  9027276 tgtaacgttactcatcaaatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctatgtgttcttc 9027177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 207
Target Start/End: Original strand, 26804573 - 26804765
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactag---gttttgagggttgattcac 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  26804573 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcac 26804672  T
Q  115 cttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 207  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804673 cttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 1606487 - 1606686
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1606487 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctctt 1606585  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  1606586 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaatttccttgtgttcttc 1606685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 317
Target Start/End: Original strand, 25276160 - 25276434
Alignment:
Q  37 tttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattag 132  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  25276160 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattag 25276259  T
Q  133 gattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttact 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  25276260 gattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttact 25276359  T
Q  232 catca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||| ||||||||| |||           |||| |||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25276360 catcattatagtggaacgg-----------ctcc-ccagactaagtcaatatggaccgaactggttaaacaaattcttttgtgttct 25276434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24817634 - 24817362
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| | |    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||    
T  24817634 gggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagagaactagggtttgtatagagtttgct-ctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcacctt 24817540  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    | ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24817539 ggaaagcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctc 24817440  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaact 292  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||    
T  24817439 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaact 24817362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 56 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24813742 - 24813494
Alignment:
Q  56 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 155  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | || |||||||||| ||   ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24813742 agggtttgtatagagtttgct-cttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtctcttggtgacggga 24813647  T
Q  156 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggg 253  Q
    || |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  24813646 agtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattatagtggagcggatgg 24813547  T
Q  254 ctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24813546 ctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 24813494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22828918 - 22828672
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag----ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||     |||||||||||||||| | ||||   ||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||    
T  22828918 gggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagatt 22828819  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22828818 agaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 22828719  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 262  Q
     |||||||  |||||||| | ||||||| | | ||||||||||||||    
T  22828718 ttttgtaaaattactcattattatagtgaaacagagggctgctctct 22828672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22251826 - 22251602
Alignment:
Q  23 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttg 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22251826 ggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttg 22251727  T
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga----ttt 214  Q
      |        ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||    
T  22251726 gga--------taggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcttt 22251635  T
Q  215 ctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtgga 245  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22251634 ctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 22251602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 103 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 20091745 - 20091580
Alignment:
Q  103 gggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 202  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20091745 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 20091646  T
Q  203 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccag 269  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20091645 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtggaacggagggctgctctctcccccag 20091580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 305
Target Start/End: Original strand, 7188547 - 7188833
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||    |||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  7188547 gggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaataaaaatagggtttgtatagggtttgct-cttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcacctt 7188642  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  7188643 ggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttc 7188742  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
     ||||||| |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||| ||||  ||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  7188743 ttttgtaaagttattcatcattatagtggaacggaaggctgctctcttccccagtctatgtcagttttggactgaactaggtaaacaaatt 7188833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 168 - 317
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22394027
Alignment:
Q  168 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcca 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| || |||||||     
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctccc 22393975  T
Q  266 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22393976 ctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttct 22394027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 165 - 308
Target Start/End: Original strand, 26295598 - 26295743
Alignment:
Q  165 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 262  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | || | |||||||||    
T  26295598 gactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctct 26295697  T
Q  263 ccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  26295698 cctccagactaggtcaatttggactgaactggataaacaaattctt 26295743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Original strand, 25351336 - 25351539
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  25351336 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 25351434  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 300  Q
    || ||   || ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |||    
T  25351435 actca---atatctctttgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaac 25351531  T
Q  301 aaattctt 308  Q
    ||||||||    
T  25351532 aaattctt 25351539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 132
Target Start/End: Original strand, 18567617 - 18567731
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18567617 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcacctt 18567716  T
Q  118 gcaaaacactattag 132  Q
    |  ||||||||||||    
T  18567717 gggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 305
Target Start/End: Original strand, 6332311 - 6332514
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaac 204  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  6332311 ttgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaac 6332410  T
Q  205 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 301  Q
    || || || |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||| ||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  6332411 cctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctctcccctagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 6332510  T
Q  302 aatt 305  Q
    ||||    
T  6332511 aatt 6332514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 308
Target Start/End: Original strand, 2120881 - 2121087
Alignment:
Q  105 gttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 201  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||    
T  2120881 gttgattcaccttggacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgt 2120979  T
Q  202 aacccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtc 297  Q
    ||| ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||| |||||     
T  2120980 aactca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaattgggta 2121076  T
Q  298 aacaaattctt 308  Q
    |||||||||||    
T  2121077 aacaaattctt 2121087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 305
Target Start/End: Original strand, 24465553 - 24465829
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaagggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| |    |||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||||| ||  |   |||||||||||||  |    
T  24465553 gggctgaaacaagggtttagaaatcaaacta----gggtttgtatagcgtttgct-cttggcaacaaacactagggttgaa---ttgattcaccttggga 24465644  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| | || |||    
T  24465645 aacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtctttt 24465744  T
Q  221 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    |||| | ||||||||| |||| || | |||  | ||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  24465745 gtaaag-tactcatcattataatgaaacgggtgactgctctctcccccagactagatcaatatgaaccgaactgagtaaacaaatt 24465829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Original strand, 25357030 - 25357233
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  25357030 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 25357128  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 300  Q
    || ||   || ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||| || | || ||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |||    
T  25357129 actca---atatctctttgtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagatgatctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaac 25357225  T
Q  301 aaattctt 308  Q
    ||||||||    
T  25357226 aaattctt 25357233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Original strand, 25410113 - 25410318
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  25410113 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 25410211  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  25410212 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 25410308  T
Q  299 acaaattctt 308  Q
    ||||||||||    
T  25410309 acaaattctt 25410318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 250 - 338
Target Start/End: Original strand, 11759364 - 11759452
Alignment:
Q  250 agggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  11759364 agggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctctcctttgtgttcttctc 11759452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297018
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag-gcgggagacttattcttgtaac 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    | ||| | |||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaac 16297123  T
Q  205 cc-attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaac 300  Q
    ||  || || |||| |||| || ||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||| || |||    
T  16297122 ccttttaatatctcttttgcaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtcagtattggaccgaactgtgtaaac 16297023  T
Q  301 aaatt 305  Q
    |||||    
T  16297022 aaatt 16297018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3320249 - 3320049
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  3320249 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 3320151  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  3320150 actcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 3320054  T
Q  300 caaat 304  Q
    |||||    
T  3320053 caaat 3320049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3324997 - 3324797
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  3324997 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 3324899  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  3324898 actcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 3324802  T
Q  300 caaat 304  Q
    |||||    
T  3324801 caaat 3324797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Original strand, 25405376 - 25405576
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  25405376 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 25405474  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  25405475 actcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 25405571  T
Q  300 caaat 304  Q
    |||||    
T  25405572 caaat 25405576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 318
Target Start/End: Original strand, 7069763 - 7069976
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  7069763 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 7069861  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  7069862 actcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 7069958  T
Q  300 caaattcttttgtgttctt 318  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  7069959 caaa-tattttgtgttctt 7069976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 278
Target Start/End: Original strand, 7074770 - 7074943
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  7074770 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 7074868  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca 278  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  7074869 actcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgcactctcccccagactaggtca 7074943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 8378703 - 8378502
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  8378703 ttgattcaccttgaacaaaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 8378605  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  8378604 actcat---tatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagttgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 8378508  T
Q  299 acaaat 304  Q
    ||||||    
T  8378507 acaaat 8378502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15541194 - 15540994
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||   | ||||| ||||||| |    
T  15541194 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtataattaggtttgaagactgattcttgaa 15541096  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  15541095 actcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtgtatcgtagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 15540999  T
Q  300 caaat 304  Q
    |||||    
T  15540998 caaat 15540994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 237
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6349006
Alignment:
Q  144 ttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 237  Q
    ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcat 6349006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 305
Target Start/End: Original strand, 11081598 - 11081803
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaac 204  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |  || |||| ||| |||||||   || |||| |||||||||||    
T  11081598 ttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaac 11081697  T
Q  205 ccatt--gatttctctt-tgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || ||  ||| |||||| ||||| |||||||||| | | | |||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  11081698 cctttttgatatctcttgtgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaa 11081797  T
Q  300 caaatt 305  Q
    ||||||    
T  11081798 caaatt 11081803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 44512724 - 44512520
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  44512724 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 44512626  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||| ||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  44512625 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattataggggaacggagagctgctctctcc-ctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 44512530  T
Q  299 acaaattctt 308  Q
    ||||||||||    
T  44512529 acaaattctt 44512520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 290
Target Start/End: Original strand, 6046644 - 6046772
Alignment:
Q  165 gactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 262  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  | || ||||||||||    
T  6046644 gactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgctctct 6046743  T
Q  263 ccaccagactaggtcaat-ttggaccgaa 290  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||||    
T  6046744 cccccagactaggtcagtattggaccgaa 6046772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 237
Target Start/End: Original strand, 6048941 - 6049094
Alignment:
Q  84 aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgca-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 182  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||   ||||||||||| |||||||||    
T  6048941 aacaaacactaggtttgg--gattgattcaccttgaagaaacactattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattag 6049038  T
Q  183 g-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcat 237  Q
    |   | |||| ||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  6049039 gtttgaagacgtattcttataaccctttgatatccctttgtaaagttactcatcat 6049094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 6067399 - 6067173
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  ||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  ||||||||||   || |||| |||||||||    
T  6067399 ttgattcaccttgaacaaaacattgataggatttagtctcttggtcacgggaagagattgagactttga-tagaattaggtttgaagactaattcttgta 6067301  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaac-gttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    | ||  |||| |||||||||||  |  |||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||||||| ||    
T  6067300 atcctctgatatctctttgtaaaaggaactcgtcattatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccggactgggtaaa 6067201  T
Q  300 caaattcttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||    
T  6067200 caaattctctcgtgttcttcttttcttt 6067173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Original strand, 42006646 - 42006724
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  42006646 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 42006724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 278
Target Start/End: Original strand, 30246953 - 30247127
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||  |||||||||    
T  30246953 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagaccgattcttgta 30247051  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca 278  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  30247052 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctatctcccccagactaggtca 30247127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 327
Target Start/End: Original strand, 26804763 - 26804823
Alignment:
Q  266 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26804763 ccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcttcttt 26804823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 159
Target Start/End: Original strand, 22392534 - 22392606
Alignment:
Q  84 aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 159  Q
    ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22392534 aacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22392606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 44144065 - 44143997
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgg 172  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  44144065 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg 44143997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281379
Alignment:
Q  109 attcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccca 207  Q
    ||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||   | |||||||||||||||||||     
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccct 40281473  T
Q  208 ttgatttctctttgtaacgttactcatc-atatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    ||||      ||||||| ||||||||||  | | ||||| || |||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||||| || ||||||||    
T  40281472 ttga------tttgtaaagttactcatcgttgttgtggaacgaagggatgctctctcccccagactagttcagtattggacagaactgtgtaaacaaatt 40281379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 239 - 302
Target Start/End: Original strand, 9190038 - 9190101
Alignment:
Q  239 tagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9190038 tagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9190101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 239 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20284156 - 20284093
Alignment:
Q  239 tagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20284156 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20284093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 302
Target Start/End: Original strand, 21369625 - 21369824
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||| |||||||   | ||||| |||| ||||    
T  21369625 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcatgta 21369723  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||   |||||||||||||||| |    
T  21369724 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccgccatagtaggtcatcattggaccgaactgggtaa 21369820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 7464717 - 7464503
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||   | ||| | |||||||||    
T  7464717 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctctttgtcacggggagaggctgggac-ttgggta-aattaggtttgaagagtgattcttgta 7464620  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  7464619 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctcttccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 7464523  T
Q  299 acaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    ||||||||  ||||||||||||    
T  7464522 acaaattc--ttgtgttcttct 7464503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21983352 - 21983288
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21983352 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21983288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 34547062 - 34546984
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  34547062 ttgattcaccttgaacagagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 34546984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 46516339 - 46516403
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46516339 atagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 46516403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 2580457 - 2580394
Alignment:
Q  239 tagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  2580457 tagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 2580394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13290657 - 13290470
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||   |   ||| ||||||||||||||   || || | ||||||||||||  ||||| ||||||    
T  13290657 aaacactattagaatttagtctcttggtcacaggaagatattagaactctgggtagaattaggtttgaagaataattcttgtaaccttttgatatctctt 13290558  T
Q  220 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||| ||| | ||||||  |||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  13290557 tgtaaagttactcatcattatagcggaacagagagctacactctccctcagacttggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 13290470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12310214 - 12310160
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgca-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 159  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12310214 ttgattcaccttgaacaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 12310160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 44010934 - 44010775
Alignment:
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || | | |||||||||| ||||| | ||| |||||||   ||||||| ||||||||||| ||   || ||||    
T  44010934 caaagcactattaggattgagtctcttagtcatgagaagaggctgggactt-gtgtaaaattaggtttggagactgattcttgtaactca---atatctc 44010839  T
Q  218 tttgtaacgttactcat--cat-atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca 278  Q
    ||||||| |  ||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  44010838 tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 44010775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 56015 - 55955
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  56015 atagtggattggagggctgctctctcc-ccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 55955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 34546946 - 34546864
Alignment:
Q  237 tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  34546946 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttcttct 34546864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 76
Target Start/End: Original strand, 38396320 - 38396378
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaa----agggtttgtatagagtttgtt 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||    
T  38396320 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtt 38396378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 2647725 - 2647789
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||| |||||||||||    
T  2647725 atagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaa 2647789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 4796696 - 4796760
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4796696 atagtggatttgagggctgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaa 4796760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 29159871 - 29159807
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29159871 atagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 29159807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 302
Target Start/End: Original strand, 9185195 - 9185258
Alignment:
Q  239 tagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  9185195 tagtggattggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaa 9185258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22251605 - 22251570
Alignment:
Q  282 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251605 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22251570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 302
Target Start/End: Original strand, 28617255 - 28617318
Alignment:
Q  239 tagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  28617255 tagtggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaa 28617318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 302
Target Start/End: Original strand, 33332480 - 33332543
Alignment:
Q  239 tagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  || || ||||||||||||||||    
T  33332480 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaa 33332543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 159
Target Start/End: Original strand, 11084467 - 11084520
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 159  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  11084467 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagag 11084520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 308
Target Start/End: Original strand, 2075231 - 2075303
Alignment:
Q  237 tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  2075231 tatagtggaacggaaagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 2075303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 27347941 - 27347985
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27347941 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27347985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 35960884 - 35960820
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  35960884 atagtggtttggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaa 35960820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 41317478 - 41317434
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41317478 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 41317434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 44848713 - 44848777
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  44848713 atagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 44848777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Original strand, 26210631 - 26210710
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgca-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gagactttgggtagaattagg 183  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  | | |||||| ||||||||||||    
T  26210631 ttgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagattcgggactttcggtagaattagg 26210710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 7094707 - 7094673
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 56  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7094707 gggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaa 7094673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 44016860 - 44016792
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgg 172  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| || | | |||||||||| || |||||    
T  44016860 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttagtcatgagaagaggctgggaatttgg 44016792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 8153466 - 8153510
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8153466 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaa 8153510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Original strand, 8260570 - 8260622
Alignment:
Q  108 gattcaccttgca-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 159  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8260570 gattcaccttgtataaaccctattaggattgagtgtcttggtcacgggaagag 8260622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12097911 - 12097867
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12097911 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 12097867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 14069877 - 14069833
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14069877 tctctccccaagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 14069833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 14379905 - 14379861
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14379905 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 14379861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 18126768 - 18126812
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  18126768 tctctcccccagactaggtcaagtttgaccgacctgggtcaacaa 18126812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 20344021 - 20344065
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  20344021 tctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacaa 20344065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 30814560 - 30814604
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30814560 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 30814604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 31733013 - 31732969
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31733013 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 31732969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 41649055 - 41649011
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41649055 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 41649011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 302
Target Start/End: Original strand, 43864376 - 43864412
Alignment:
Q  266 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43864376 ccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 43864412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 48489555 - 48489599
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  48489555 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtaaacaa 48489599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 106)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4816516 - 4816195
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  4816516 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 4816417  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816416 ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 4816317  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816316 ttttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 4816217  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  4816216 ttctcttctttgtgttcttctc 4816195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11983314 - 11983005
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983314 gggctgaaacaaaggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 11983215  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983214 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 11983115  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983114 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 11983015  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  11983014 -tctcttcttt 11983005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14507460 - 14507140
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  14507460 gggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 14507361  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507360 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc 14507261  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507260 tttgtaacgatacttatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14507161  T
Q  318 tctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  14507160 tctcttctttgtgttcttctc 14507140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28241606 - 28241294
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  28241606 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 28241507  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241506 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 28241407  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241406 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 28241307  T
Q  317 ttctcttctttgt 329  Q
    |||||||||||||    
T  28241306 ttctcttctttgt 28241294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 30967230 - 30967551
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag----ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  30967230 gggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 30967329  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967330 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 30967429  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967430 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 30967529  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  30967530 ttctcttctttgtgttcttctc 30967551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 19 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1230537 - 1230213
Alignment:
Q  19 agagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1230537 agagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 1230438  T
Q  115 cttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 214  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230437 cttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 1230338  T
Q  215 ctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 313  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230337 ctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 1230238  T
Q  314 ttcttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||    
T  1230237 ttcttctcttcattgtgttcttctc 1230213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14459050 - 14458731
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||    
T  14459050 gggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgattc--ctt 14458953  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458952 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 14458853  T
Q  218 ttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458852 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 14458753  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  14458752 ttctcttctttgtgttcttctc 14458731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2629170 - 2628850
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2629170 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcacctt 2629071  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||    
T  2629070 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaacccattgatttctc 2628971  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2628970 tttgtaacggtactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 2628871  T
Q  318 tctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  2628870 tctcttctttgtgttcttctc 2628850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19704854 - 19704531
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  19704854 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcacctt 19704755  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704754 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 19704655  T
Q  217 ct--ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 314  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19704654 ctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgt 19704555  T
Q  315 tcttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||    
T  19704554 tcttctcttctttgtgttcttctc 19704531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 28 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 30034882 - 30034567
Alignment:
Q  28 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaa 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||    
T  30034882 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 30034783  T
Q  124 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 222  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30034782 cactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 30034683  T
Q  223 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctct 322  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  30034682 aacgttactcatcatatagcggatcggagggctgctctctcccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttattatct 30034583  T
Q  323 tctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||| ||| ||||    
T  30034582 tctttgtgttcttctc 30034567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20915641 - 20915321
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  20915641 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 20915542  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915541 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 20915442  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20915441 ctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc-tctgtgttc 20915343  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  20915342 ttctcttctttgtgttcttctc 20915321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 26065015 - 26065310
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26065015 gggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcacctt 26065111  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26065112 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctc 26065211  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26065212 tttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 26065310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 26084984 - 26085279
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26084984 gggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcacctt 26085080  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26085081 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctc 26085180  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26085181 tttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 26085279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 9019955 - 9020255
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9019955 gggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcacctt 9020054  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9020055 gggaaacactattaggattgagtctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 9020154  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020155 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 9020254  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  9020255 t 9020255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 317
Target Start/End: Original strand, 13039784 - 13040084
Alignment:
Q  23 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13039784 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 13039883  T
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 217  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  13039884 gaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctct 13039983  T
Q  218 tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13039984 tttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 13040083  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  13040084 t 13040084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 13057223 - 13057524
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13057223 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 13057322  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13057323 gggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 13057422  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13057423 ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaattcttttgtgtt 13057522  T
Q  316 ct 317  Q
    ||    
T  13057523 ct 13057524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12195800 - 12195478
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12195800 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 12195701  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195700 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 12195601  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  12195600 ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaagtttctttgtgttc 12195501  T
Q  317 ttc-tcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||    
T  12195500 ttcttcttctttgtgttcttctc 12195478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26932843 - 26932543
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||    ||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |    
T  26932843 tgaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgaga 26932744  T
Q  122 aacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26932743 aacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 26932644  T
Q  221 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttcttttgtgttcttc 319  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26932643 gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttcttttgtgttcttc 26932544  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  26932543 t 26932543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 3390408 - 3390705
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3390408 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 3390507  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3390508 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 3390607  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 313  Q
     ||||||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  3390608 ttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccaaattgggtcaacaaattcttttgtg 3390705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 3630149 - 3629841
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3630149 gggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 3630050  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3630049 gggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctc 3629950  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||| |||||| || |||||||| | | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3629949 ttttgtaaagttactaataatatagtgaaactgagggctgctctctcc-ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 3629851  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  3629850 -tctcttcttt 3629841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30729113 - 30728811
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30729113 gggctgaaacaagggtatcgaaagacaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcacctt 30729014  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga----tt 213  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    ||    
T  30729013 gggaaacactattaggattgactctcttggttacgggaagaggctggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctt 30728914  T
Q  214 tctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 312  Q
    |||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30728913 tctcttttgtaaagttactcatattatagtggaacggaaggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgt 30728814  T
Q  313 gtt 315  Q
    |||    
T  30728813 gtt 30728811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15532966 - 15532674
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  15532966 gggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcacctt 15532867  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15532866 ggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctc 15532767  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 310  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15532766 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctatcc-ctagactaggtcaattttgactgaactaggtcaacaaattctttt 15532674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 32280025 - 32280326
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  32280025 gggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 32280124  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32280125 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 32280224  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatc-atatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||||| ||||||||||  ||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  32280225 ttttgtaaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaaaaattctcttgtgtt 32280324  T
Q  316 ct 317  Q
    ||    
T  32280325 ct 32280326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3632219 - 3631926
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||  |    
T  3632219 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttggga 3632120  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  3632119 aacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 3632020  T
Q  221 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3632019 gtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctgtc--ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 3631926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15541425 - 15541125
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15541425 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcacctt 15541326  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15541325 gggaaacactattagaattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctc 15541226  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||| | | ||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15541225 ttttgtaaagttattcatcatatagtgaaacagaaagctgctctctcctccagactaggttaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 15541126  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  15541125 t 15541125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 25477303 - 25477611
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25477303 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 25477402  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25477403 gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 25477502  T
Q  218 -tttgtaa-------cgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
     |||||||       |||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25477503 ttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaaatgggtcaacaaattctt 25477602  T
Q  309 ttgtgttct 317  Q
    |||| ||||    
T  25477603 ttgtattct 25477611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3234016 - 3233710
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag----ggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcacct 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||     |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3234016 gggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtatatagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 3233917  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  3233916 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatct 3233817  T
Q  217 c-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggacc-----gaactgggtcaacaaattctttt 310  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||     |||||||||||||||||||||||    
T  3233816 cttttgtaacgttactcaccgtatagtgaaacggagggctgctctctcccccacactaggtcaattttgaccgaactgaactgggtcaacaaattctttt 3233717  T
Q  311 gtgttct 317  Q
    |||||||    
T  3233716 gtgttct 3233710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 88 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273213
Alignment:
Q  88 aacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgg 186  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  187 gagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggac 5273232  T
Q  287 cgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5273231 cgaactgggtcaacaaatt 5273213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15530407 - 15530166
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15530407 gggctgaagcaagggcttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 15530308  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15530307 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctc 15530209  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 259  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15530208 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26066306 - 26066106
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066306 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 26066207  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26066206 tgtaacgttacttatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttc 26066107  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  26066106 t 26066106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 29754891 - 29754691
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29754891 aaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctt 29754792  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29754791 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttc 29754692  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  29754691 t 29754691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 33308989 - 33309188
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33308989 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctctt 33309087  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  33309088 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttc 33309187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26068577 - 26068377
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068577 aaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 26068478  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26068477 tgtaacgttgctcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttc 26068378  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  26068377 t 26068377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 33311258 - 33311457
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33311258 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctctt 33311356  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  33311357 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttc 33311456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24338733 - 24338435
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggt-tttgagggttgattcacct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  24338733 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcataaagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttacct 24338634  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    || |||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||  | ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24338633 tggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaagactttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatct 24338534  T
Q  217 c-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 314  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||    
T  24338533 cttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactatgtcaatttggaccgaactaggtaaacaaatatttttgtgt 24338436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 109 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069694
Alignment:
Q  109 attcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 208  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  209 tgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 306  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1069813 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaattc 1069714  T
Q  307 ttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  1069713 ttttatgttc-tctcttcttt 1069694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12161840 - 12161543
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  12161840 gggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct--ggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgtt 12161743  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12161742 gggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagactttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctc 12161643  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||| |||||||||||||||||  |  ||| ||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  12161642 ttttgtaaggttactcatcatatagtaaaatggatggctgttctctcc-ctaaactaggttaatttggaccgaactgaatcaacaaattattttgtgttc 12161544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19227693 - 19227514
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19227693 gggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 19227594  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 197  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227593 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 305
Target Start/End: Original strand, 15719683 - 15719961
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaagggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| |    |||||||||||||||||| || || | ||||||||||||| ||   | |||||||||||||| ||    
T  15719683 gggctgaaacaagggtttagaaatcaaacta----gggtttgtatagagtttgctt-ttggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttggaa 15719774  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  15719775 aacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 15719874  T
Q  221 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | | ||| | |||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15719875 gtaaagttactcatcattatagtgaaacagagagttgctctttccccccatactaggtcaatttggaccgaacttggtaaacaaatt 15719961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 105 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186056
Alignment:
Q  105 gttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 203  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  204 cccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 301  Q
    | ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaaca 12186072  T
Q  302 aattcttttgtgttct 317  Q
    |||| |||||||||||    
T  12186071 aattattttgtgttct 12186056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 317
Target Start/End: Original strand, 14466399 - 14466653
Alignment:
Q  66 tagagtttgtttctttggaacaaacactagg-ttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 164  Q
    |||||||||| | || | ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||     
T  14466399 tagagtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgg 14466498  T
Q  165 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 262  Q
    || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | |||| | ||||| | |    
T  14466499 gagtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgttt 14466598  T
Q  263 ccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14466599 cccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaattctcttgtgttct 14466653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Original strand, 22490668 - 22490889
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggttta-gaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacct 116  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    || |||||    
T  22490668 gggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacacct 22490767  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22490768 tgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatct 22490867  T
Q  217 c-tttgtaacgttactcatcat 237  Q
    | |||||||  |||||||||||    
T  22490868 cttttgtaagattactcatcat 22490889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 56 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 3028098 - 3027848
Alignment:
Q  56 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 155  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| || |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  3028098 agggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtga 3028002  T
Q  156 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggg 253  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3028001 agagattgagactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggg 3027902  T
Q  254 ctgctctct-ccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    ||||||| | || |||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  3027901 ctgctctttccccccagactaggtcagtttttgaccgaactggataaacaaatt 3027848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 84 - 305
Target Start/End: Original strand, 15367129 - 15367349
Alignment:
Q  84 aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||| |||||||||| |||||      
T  15367129 aacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcgggaagagattgaaactttgggtaaaattaat 15367225  T
Q  184 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc-caccagactaggtcaatt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15367226 cgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctctccccagactaggtcaatt 15367325  T
Q  282 tggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  15367326 tggaccgaactgggtaaacaaatt 15367349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16455625 - 16455421
Alignment:
Q  104 ggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 203  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| | |||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16455625 ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattaagtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaa 16455526  T
Q  204 cccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaac 300  Q
    ||| ||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||| || |||    
T  16455525 ccctttgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgagtaaac 16455426  T
Q  301 aaatt 305  Q
    |||||    
T  16455425 aaatt 16455421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 165 - 305
Target Start/End: Original strand, 15346523 - 15346664
Alignment:
Q  165 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 263  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| | ||||  |||||||||||    
T  15346523 gactttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaagctgctctctc 15346622  T
Q  264 caccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15346623 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 15346664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22858152 - 22857949
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 204  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||| |||||| |||||   | ||||| |||||||||||    
T  22858152 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaac 22858053  T
Q  205 cc-attgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 301  Q
    ||  ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||    
T  22858052 ccttttgatatatctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaaaca 22857953  T
Q  302 aatt 305  Q
    ||||    
T  22857952 aatt 22857949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 305
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945463
Alignment:
Q  104 ggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  203 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||| || || ||||| |||||| || ||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||    
T  26945358 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaaa 26945457  T
Q  300 caaatt 305  Q
    ||||||    
T  26945458 caaatt 26945463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 235
Target Start/End: Original strand, 17012110 - 17012287
Alignment:
Q  56 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 155  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||| || |||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  17012110 agggtttgtataaagtttgct-cttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgaga 17012206  T
Q  156 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 235  Q
    ||||  |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  17012207 agagattgatgcttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatc 17012287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 305
Target Start/End: Original strand, 19696470 - 19696759
Alignment:
Q  20 gagggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaa---gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacc 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||   |||||||||||||||||| | ||| | ||||| ||||||| ||  |   ||||||||||    
T  19696470 gagggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaattagggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaatcactagggttcaaa--ttgattcacc 19696565  T
Q  116 ttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgattt 214  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||| || || | |||||  ||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||| || ||||| |    
T  19696566 ttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatat 19696665  T
Q  215 ctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| | ||  |||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  19696666 ctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctctctctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 19696759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Original strand, 13878710 - 13878910
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  13878710 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 13878808  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  13878809 actcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 13878905  T
Q  300 caaat 304  Q
    |||||    
T  13878906 caaat 13878910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Original strand, 16785902 - 16786102
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  16785902 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 16786000  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  16786001 actcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 16786097  T
Q  300 caaat 304  Q
    |||||    
T  16786098 caaat 16786102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 263
Target Start/End: Original strand, 20526922 - 20527081
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  | ||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  20526922 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 20527021  T
Q  205 ccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctc 263  Q
    |  ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20527022 cttttgatatctctttgtaaagttattcatcattatagtggaacggagagctgctctctc 20527081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 317
Target Start/End: Original strand, 10584227 - 10584325
Alignment:
Q  220 tgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10584227 tgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttct 10584325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Original strand, 13883458 - 13883658
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  13883458 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 13883556  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    |  |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  13883557 attcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 13883653  T
Q  300 caaat 304  Q
    |||||    
T  13883654 caaat 13883658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 32447601 - 32447502
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaa----agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactag-gttttgagggttgattcacct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32447601 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 17695050 - 17694846
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  17695050 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 17694952  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttact-catca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || ||   || ||||||||||| |  |||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  17694951 actca---atatctctttgtaaagaaactatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 17694855  T
Q  300 caaattctt 308  Q
    |||||||||    
T  17694854 caaattctt 17694846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465587
Alignment:
Q  184 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-t 281  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  ||| |||| |||| | |    
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagtat 25465611  T
Q  282 tggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  25465610 tggaccgaactgggtaaacaaatt 25465587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 35201525 - 35201325
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  35201525 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 35201427  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || |||   | |||||||| || |  ||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  35201426 actcat---tatctctttgaaaagaaactaattcattatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcattattagaccgaactgggtaaa 35201330  T
Q  300 caaat 304  Q
    |||||    
T  35201329 caaat 35201325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 1072160 - 1072067
Alignment:
Q  24 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  1072160 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12911630 - 12911442
Alignment:
Q  120 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||  || ||  ||||||||| |||||| |||||   || | || ||||||||||||  || || |||||    
T  12911630 aaaacactattaagattgagtctcttagtcacgataatagattgagacttttggtagagttaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctct 12911531  T
Q  219 ttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtc-aatttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12911530 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaatt 12911442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12937377 - 12937190
Alignment:
Q  120 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| ||  ||| ||||| ||||||||||||   || | || ||||||||||||  || || |||||    
T  12937377 aaaacactattaagattgagtctcttagtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctct 12937278  T
Q  219 ttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtc-aatttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12937277 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc-ccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaatt 12937190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26887423 - 26887225
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  26887423 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 26887325  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  26887324 actcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctg--ctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 26887230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037722
Alignment:
Q  107 tgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaacc 205  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||| | |||| || ||  ||||||||||||||||||||||    | | |||||||||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  206 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat-atagtgga---tcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    | ||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    || | ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||    
T  28037827 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggacggacgaaaggctgctctctcccccagtctaggtcagttttggaccgagctgggtaaa 28037728  T
Q  300 caaatt 305  Q
    ||||||    
T  28037727 caaatt 28037722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 25078755 - 25078534
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 204  Q
    |||||||||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||  ||||| |||  |||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  25078755 ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgaga-tttaagtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 25078657  T
Q  205 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 301  Q
    || ||||| |||| ||||||| ||||||| ||| || |||||| |||||| ||||| ||| | |||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  25078656 cctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgctttcttc-ccagtctaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 25078558  T
Q  302 aattcttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
    |||| || ||||||| ||||||||||    
T  25078557 aatt-ttgtgtgttc-tctcttcttt 25078534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 31248913 - 31248835
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31248913 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31248835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 13870707 - 13870608
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||| |||| ||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13870707 gggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19702061 - 19701985
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta 181  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19702061 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaatta 19701985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22352036 - 22351877
Alignment:
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||| |||| |||||| ||   || ||||    
T  22352036 caaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-tttgggtagaattaggtttgaagactgattcatgtaactca---atatctc 22351941  T
Q  218 tttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca 278  Q
    ||||||| |  ||||  |||| ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  22351940 tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagaactgctctctcccccagactaggtca 22351877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 294
Target Start/End: Original strand, 30445698 - 30445832
Alignment:
Q  164 agactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctct 260  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||    
T  30445698 agactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctct 30445797  T
Q  261 ctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgg 294  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||    
T  30445798 ctccaccatactaggtcagtattggactgaactgg 30445832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3577713 - 3577636
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  3577713 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 3577636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Original strand, 17036038 - 17036116
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17036038 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17036116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 88
Target Start/End: Original strand, 8995508 - 8995578
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaa----agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaa 88  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8995508 gggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 8995578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 13467662 - 13467585
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  13467662 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgtgactt--ggtagaattagg 13467585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22342985 - 22342795
Alignment:
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||    
T  22342985 caaagcactattaggattgcgtctcttggtcacgggaagaggctggga-tttgggtagtattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc 22342890  T
Q  218 tttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
    ||||||| |  ||||  |||| ||||||||| | ||| |||||||||||| | |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  22342889 tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 22342795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Original strand, 33215810 - 33216015
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  33215810 ttgattcaccttgaataaagcactattaggattgagtctcttggtcacggcaagaggctgggac-ttggatagaattaggtttgaagactgattcttgta 33215908  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||   || ||||||||||||| |    
T  33215909 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctatcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 33216005  T
Q  299 acaaattctt 308  Q
    ||||||||||    
T  33216006 acaaattctt 33216015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25466098 - 25465896
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  25466098 ttgattcaccttgaacaaagcattattaggattgagtctcttaatcacggaaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 25466000  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||   || ||||||||||||| |    
T  25465999 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggccatcattagaccgaactgggtaa 25465903  T
Q  299 acaaatt 305  Q
    |||||||    
T  25465902 acaaatt 25465896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 96
Target Start/End: Original strand, 17852571 - 17852649
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactagg 96  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17852571 gggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactagg 17852649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Original strand, 25941627 - 25941704
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  25941627 ttgattcaccttgaacaaagcattattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 25941704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 5757507 - 5757571
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5757507 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5757571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 10077194 - 10077258
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  10077194 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 10077258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 12166330 - 12166267
Alignment:
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12166330 caaagcaccattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12166267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21356104 - 21356040
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21356104 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21356040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 31979580 - 31979517
Alignment:
Q  239 tagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31979580 tagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31979517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7542566 - 7542452
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-gctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||   || || ||||| ||||||||||   | ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||    
T  7542566 aaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaaccctttgatatctct 7542467  T
Q  219 ttgtaacgttactca 233  Q
    |||||| ||||||||    
T  7542466 ttgtaaagttactca 7542452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 204
Target Start/End: Original strand, 26643174 - 26643259
Alignment:
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||    
T  26643174 caaatcactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaac 26643259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 204
Target Start/End: Original strand, 26749140 - 26749225
Alignment:
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||    
T  26749140 caaatcactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaac 26749225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 320
Target Start/End: Original strand, 25941785 - 25941867
Alignment:
Q  237 tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  25941785 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttcttct 25941867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 5572270 - 5572334
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  5572270 atagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 5572334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 181
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138499
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgca-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta 181  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   | |||||| ||||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 305
Target Start/End: Original strand, 11262596 - 11262777
Alignment:
Q  129 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaccca---ttgatttctctttgtaa 224  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||| ||||||||||||   || |||| |||||| |||||     ||||| |||||||||||    
T  11262596 ttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgaga-tttaggtagaattaggtttgaagactaattcttataacctccttttgatatctctttgtaa 11262694  T
Q  225 cgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
     |  ||||||||| ||| || | |||||  ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  11262695 agaaactcatcattatattgtaacggagaactgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaacggggtaaacaaatt 11262777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 31936654 - 31936591
Alignment:
Q  239 tagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  31936654 tagtggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 31936591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3577555 - 3577474
Alignment:
Q  237 tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  3577555 tatagtggaacggagagctgctctctcc-ccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttcttct 3577474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 296
Target Start/End: Original strand, 24436001 - 24436058
Alignment:
Q  239 tagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||  ||||| ||||||||||    
T  24436001 tagtggatcggagggctgctctctcccctagagtaggtcatattggatcgaactgggt 24436058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 16569146 - 16569190
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16569146 tctctcctccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 16569190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22963767 - 22963704
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  22963767 atagtggattggagggctgctctctcc-ccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaa 22963704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 23824626 - 23824689
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  23824626 atagtggattggagggctgctctctcc-ccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaa 23824689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 28078310 - 28078191
Alignment:
Q  188 agacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaa-tttgg 284  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||   | | |||||||||||  || |||||||||| ||| |    
T  28078310 agacttattcttgtaa-cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggattataagactgctctctccctcatactaggtcaattttag 28078212  T
Q  285 accgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    ||||||| |||| ||||||||    
T  28078211 accgaacagggtaaacaaatt 28078191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 33211229 - 33211185
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33211229 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33211185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 237 - 315
Target Start/End: Original strand, 30443537 - 30443616
Alignment:
Q  237 tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  30443537 tatagtgtaacggagagctgctctctccccgagactaggtaagtattggaccgaactgggtaaacaaatttttgtgtgtt 30443616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 5165989 - 5165936
Alignment:
Q  129 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  5165989 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattagg 5165936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 603132 - 603088
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  603132 tctctccccaagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 603088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 5017498 - 5017562
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||| | ||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  5017498 atagtagattggagggttgctctctcccctagattaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaa 5017562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 9183075 - 9183031
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9183075 tctctcctccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 9183031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 304
Target Start/End: Original strand, 17038350 - 17038418
Alignment:
Q  237 tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 304  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  17038350 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagacttggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 17038418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22709086 - 22709022
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| |||  ||| |||||||| |||||||||    
T  22709086 atagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattgaaccgaactaggtcaacaa 22709022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 165)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8631704 - 8631383
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  8631704 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 8631605  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631604 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 8631505  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631504 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 8631405  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  8631404 ttctcttctttgtgttcttctc 8631383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 37089656 - 37089336
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37089656 gggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 37089557  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089556 gggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 37089457  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089456 tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 37089357  T
Q  318 tctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  37089356 tctcttctttgtgttcttctc 37089336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22046970 - 22046661
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22046970 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 22046871  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046870 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 22046771  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046770 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22046671  T
Q  318 tctcttcttt 327  Q
    ||||||||||    
T  22046670 tctcttcttt 22046661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 47868446 - 47868772
Alignment:
Q  19 agagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcac 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47868446 agagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcac 47868545  T
Q  115 cttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 214  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47868546 cttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 47868645  T
Q  215 ctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 313  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47868646 ctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtg 47868745  T
Q  314 ttcttctcttctttgtattcatctcac 340  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||    
T  47868746 ttattctcttctttgtgttcttctcac 47868772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22044675 - 22044366
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  22044675 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcccctt 22044576  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22044575 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc 22044476  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044475 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22044376  T
Q  318 tctcttcttt 327  Q
    ||||||||||    
T  22044375 tctcttcttt 22044366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 31849884 - 31849563
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacacta-ggttttgagggttgattcacct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31849884 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcacct 31849785  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849784 tgggaaacactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 31849685  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849684 ctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 31849585  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  31849584 ttctcttctttgtgttcttctc 31849563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 51015294 - 51015614
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  51015294 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 51015393  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015394 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 51015493  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015494 tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggaggtctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51015593  T
Q  318 tctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  51015594 tctcttctttgtgttcttctc 51015614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2485157 - 2484837
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  2485157 gggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcacctt 2485058  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2485057 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 2484958  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2484957 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgttct 2484858  T
Q  318 tctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  2484857 tctcttctttgtgttcttctc 2484837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 11435003 - 11435323
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11435003 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 11435102  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435103 gggaaacactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtctaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 11435202  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435203 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11435302  T
Q  318 tctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||| |||| ||| ||||    
T  11435303 tctcttccttgtgttcttctc 11435323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Original strand, 9148301 - 9148604
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9148301 gggctgaagcaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 9148400  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148401 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 9148500  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148501 tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 9148600  T
Q  318 tctc 321  Q
    ||||    
T  9148601 tctc 9148604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 40637122 - 40637431
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40637122 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 40637221  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637222 gggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 40637321  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637322 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 40637421  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  40637422 -tctcttcttt 40637431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 38409253 - 38409562
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  38409253 gggctgaaacaatggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 38409352  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409353 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctc 38409452  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38409453 tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgagttct 38409552  T
Q  318 tctcttcttt 327  Q
    ||||||||||    
T  38409553 tctcttcttt 38409562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Original strand, 24348266 - 24348570
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag----ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24348266 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 24348365  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348366 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctc 24348465  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348466 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 24348565  T
Q  317 ttctc 321  Q
    |||||    
T  24348566 ttctc 24348570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 22 - 326
Target Start/End: Original strand, 6764887 - 6765201
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaa----agggtttgtatagagtttgtttc-----tttggaacaaacactaggttttgagggttgattc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6764887 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattc 6764986  T
Q  113 accttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 212  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6764987 accttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgat 6765086  T
Q  213 ttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765087 ttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 6765186  T
Q  312 tgttcttctcttctt 326  Q
    |||||||||||||||    
T  6765187 tgttcttctcttctt 6765201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22801147 - 22800838
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22801147 gggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 22801048  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22801047 ggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 22800948  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22800947 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 22800848  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  22800847 -tctcttcttt 22800838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 11006522 - 11006218
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11006522 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 11006423  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006422 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 11006323  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11006322 ctttgtaatggtactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttc 11006223  T
Q  317 ttctc 321  Q
    |||||    
T  11006222 ttctc 11006218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 11008851 - 11008532
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11008851 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 11008752  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008751 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 11008652  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
      |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11008651 --ttgtaatggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttc 11008554  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  11008553 ttctcttctttgtgttcttctc 11008532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 338
Target Start/End: Original strand, 14633366 - 14633687
Alignment:
Q  21 agggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacct 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14633366 agggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 14633465  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633466 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 14633564  T
Q  217 cttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633565 cttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 14633664  T
Q  316 cttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||||||| ||| ||||    
T  14633665 cttctcttctttgtgttcttctc 14633687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22132675 - 22132355
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22132675 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 22132577  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132576 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 22132477  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttcttttgtgttc 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  22132476 tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttggtcttc 22132377  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  22132376 ttctcttctttgtgttcttctc 22132355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 7941369 - 7941692
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaa--cactaggttttgagggttgattcacc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||  || ||||  ||||||| |||| |||||||||||||    
T  7941369 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcacc 7941468  T
Q  116 ttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 215  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941469 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 7941568  T
Q  216 tc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 314  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941569 tcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 7941668  T
Q  315 tcttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||    
T  7941669 tcttttcttctttgtgttcttctc 7941692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 22 - 315
Target Start/End: Original strand, 24888844 - 24889142
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24888844 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcacctt 24888943  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24888944 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctc 24889043  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24889044 ttttgtaacgttacttatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 24889142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 17662519 - 17662221
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaagggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  17662519 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaac-------tagggtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggga 17662427  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17662426 aacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttt 17662327  T
Q  221 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17662326 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tct 17662228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 26 - 338
Target Start/End: Original strand, 18847205 - 18847521
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  |    
T  18847205 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttggga 18847304  T
Q  122 aacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 220  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847305 aacactattagcattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 18847404  T
Q  221 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847405 gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 18847503  T
Q  321 cttctttgtattcatctc 338  Q
     |||||||| ||| ||||    
T  18847504 gttctttgtgttcttctc 18847521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Original strand, 5198468 - 5198772
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5198468 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacttt 5198567  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5198568 gggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 5198667  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5198668 ttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttc 5198767  T
Q  317 ttctc 321  Q
    |||||    
T  5198768 ttctc 5198772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 56 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26086223 - 26085950
Alignment:
Q  56 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 155  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086223 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 26086124  T
Q  156 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggct 255  Q
    ||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26086123 agagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggaaggct 26086024  T
Q  256 gctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgt 329  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086023 gctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgt 26085950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22134900 - 22134582
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22134900 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 22134802  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134801 gggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 22134702  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  22134701 tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtcttct 22134603  T
Q  318 tctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  22134602 tctcttctttgtgttcttctc 22134582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22803019 - 22802719
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22803019 gggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcacctt 22802920  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22802919 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 22802820  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22802819 ttttgtaatgttactcatcatatagtggaacggagggtttctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttc 22802720  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  22802719 t 22802719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 47274775 - 47275079
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  47274775 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatctt 47274873  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47274874 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 47274973  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47274974 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttc 47275072  T
Q  317 ttctctt 323  Q
    |||||||    
T  47275073 ttctctt 47275079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 26 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 36921775 - 36921469
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgca 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  36921775 tgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg 36921676  T
Q  121 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  36921675 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttt 36921576  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36921575 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagactagttaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tc 36921477  T
Q  320 tcttcttt 327  Q
    ||||||||    
T  36921476 tcttcttt 36921469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16934428 - 16934118
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  16934428 gggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 16934329  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934328 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 16934229  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16934228 ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 16934129  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
    |||||||||||    
T  16934128 ttctcttcttt 16934118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 40091700 - 40091391
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  40091700 gggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtttagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcacctt 40091601  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40091600 gggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 40091501  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40091500 ttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 40091401  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  40091400 -tctcttcttt 40091391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9176759 - 9176438
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9176759 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcacctt 9176660  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176659 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 9176560  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||     
T  9176559 ctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagagtcaacaaatttctttgtgtta 9176460  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  9176459 ttctcttctttgtgttcttctc 9176438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 28 - 317
Target Start/End: Original strand, 24880505 - 24880800
Alignment:
Q  28 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaa 123  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||    
T  24880505 aaactagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaa 24880604  T
Q  124 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24880605 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 24880704  T
Q  223 -aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
     |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24880705 aaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttct 24880800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16932074 - 16931764
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  16932074 gggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 16931975  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16931974 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 16931875  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16931874 ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 16931775  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
    |||||||||||    
T  16931774 ttctcttcttt 16931764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9174431 - 9174110
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || | | |||||||||||||    
T  9174431 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcacctt 9174332  T
Q  118 gcaaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9174331 gggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttct 9174232  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9174231 ctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgttctctgccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 9174132  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  9174131 ttctcttctttgtgttcttctc 9174110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18709448 - 18709127
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  18709448 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgattcacctt 18709349  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18709348 gggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 18709249  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18709248 tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 18709149  T
Q  318 tc-tcttctttgtattcatctc 338  Q
    || |||||||||| ||| ||||    
T  18709148 tcttcttctttgtgttcttctc 18709127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 24879037 - 24879338
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24879037 gggctgaaactagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcacctt 24879136  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24879137 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 24879236  T
Q  218 -tttgt-aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24879237 ttttgtaaacgatacacatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgtt 24879336  T
Q  316 ct 317  Q
    ||    
T  24879337 ct 24879338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 38928463 - 38928153
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcacct 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38928463 gggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 38928364  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  38928363 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatct 38928264  T
Q  217 c-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928263 cttttgtaacgttactcatcatatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 38928164  T
Q  316 cttctcttcttt 327  Q
    | ||||||||||    
T  38928163 c-tctcttcttt 38928153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 22 - 324
Target Start/End: Original strand, 48486367 - 48486673
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48486367 gggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 48486466  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  48486467 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctc 48486566  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  48486567 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattattttgtgtt- 48486665  T
Q  317 ttctcttc 324  Q
    ||||||||    
T  48486666 ttctcttc 48486673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 36919870 - 36919569
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcacct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36919870 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 36919771  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  36919770 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatct 36919671  T
Q  217 c-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919670 cttttgtaacgttattcatcatatagtggaatagatggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 36919571  T
Q  316 ct 317  Q
    ||    
T  36919570 ct 36919569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 44600123 - 44599820
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  44600123 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 44600024  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44600023 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttct 44599924  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  44599923 ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttc 44599824  T
Q  317 ttct 320  Q
    ||||    
T  44599823 ttct 44599820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22780658 - 22780336
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22780658 gggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 22780559  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780558 gggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 22780459  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  22780458 ctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttc 22780359  T
Q  317 ttc-tcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||    
T  22780358 ttcttcttctttgtgttcttctc 22780336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22783023 - 22782701
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22783023 gggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 22782924  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782923 gggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 22782824  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||   |||||||||    
T  22782823 ctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaaatatctttgtgttc 22782724  T
Q  317 ttc-tcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||    
T  22782723 ttcttcttctttgtgttcttctc 22782701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 33415772 - 33415464
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33415772 gggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt-ggaacaaacactaaggtttgagggttgattcacctt 33415674  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33415673 gggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 33415574  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33415573 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctcaggctaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttc 33415474  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  33415473 -tctcttcttt 33415464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12396130 - 12395830
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12396130 gggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 12396031  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12396030 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctc 12395931  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12395930 ttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttc 12395831  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  12395830 t 12395830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 36378340 - 36378650
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36378340 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcacctt 36378439  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  36378440 ggaaaacactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctc 36378539  T
Q  218 t-ttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    | |||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  36378540 tcttgtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattattttgtgtt 36378639  T
Q  316 cttctcttcttt 327  Q
    | ||||||||||    
T  36378640 c-tctcttcttt 36378650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 19095930 - 19096231
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcacct 116  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19095930 gggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 19096029  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga-ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 215  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  19096030 tgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-agagctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatc 19096128  T
Q  216 tcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 314  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19096129 tcttttgtaacgttacttatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgt 19096228  T
Q  315 tct 317  Q
    |||    
T  19096229 tct 19096231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12401092 - 12400792
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12401092 gggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 12400993  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12400992 gggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctc 12400893  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12400892 ttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttc 12400793  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  12400792 t 12400792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Original strand, 53405178 - 53405493
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53405178 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcacctt 53405276  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga------cttattcttgtaacccattga 211  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||      |||||||||||||||||||||    
T  53405277 gagaaacactattaagattgagtctcttggttacggaaagaggctgagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattga 53405376  T
Q  212 tttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 310  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||||||| | ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53405377 tttctcttttgaaacgatactcatcatatagtggaacagagagctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattctttt 53405474  T
Q  311 gtgttcttctcttctttgt 329  Q
     ||||||||||||||||||    
T  53405475 ttgttcttctcttctttgt 53405493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 14787716 - 14787406
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  14787716 gggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcacctt 14787617  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  14787616 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctc 14787517  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg--ctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  14787516 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattc--ttgtgt 14787419  T
Q  315 tcttctcttcttt 327  Q
    |||||||||||||    
T  14787418 tcttctcttcttt 14787406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 5637750 - 5637524
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637750 gggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 5637651  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637650 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc 5637551  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtg 243  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  5637550 ttttgtaacgttactcatcatatagtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 16453357 - 16453667
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    | ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16453357 gggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtacaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 16453456  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16453457 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggactttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 16453556  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||| | | || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  16453557 ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgccaaaaaattcttttgtgtt 16453656  T
Q  316 cttctcttcttt 327  Q
    | ||||||||||    
T  16453657 c-tctcttcttt 16453667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37313351 - 37313050
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  37313351 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcacctt 37313252  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  37313251 gagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctc 37313152  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||    
T  37313151 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttcccccagactatgtcaatttggaccaaattggatcaacaaattcttttgtttt 37313052  T
Q  316 ct 317  Q
    ||    
T  37313051 ct 37313050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 47211025 - 47210756
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |            ||    
T  47211025 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg------------tt 47210938  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47210937 gggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 47210838  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 298  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  47210837 ttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgagtca 47210756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3824853 - 3824627
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3824853 gggctgaaaca--ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcacctt 3824756  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824755 gggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 3824656  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtgga 245  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824655 ttttgtaacgttactcatcatatagtgga 3824627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 327
Target Start/End: Original strand, 36380435 - 36380707
Alignment:
Q  56 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 155  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | || || || |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  36380435 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttaccgga 36380534  T
Q  156 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggg 253  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  36380535 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtggaactgagtg 36380634  T
Q  254 ctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36380635 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaattcttttgtgttc-tctcttcttt 36380707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 619732 - 619433
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  619732 gggctgaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttacctt 619633  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  || | |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  619632 gggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctc 619533  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  619532 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctcc-cctaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttc 619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 165 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635440
Alignment:
Q  165 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 5635515  T
Q  264 caccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  5635514 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 5635440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 165 - 338
Target Start/End: Original strand, 11437558 - 11437731
Alignment:
Q  165 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437558 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 11437657  T
Q  265 accagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtattcatctc 338  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  11437658 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttccttgtgttcttctc 11437731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 305
Target Start/End: Original strand, 41997540 - 41997828
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    | ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41997540 gggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 41997639  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  41997640 ggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctc 41997739  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
     ||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41997740 ttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctctcc-ccagactaggttaatttggaccgaactggataaacaaatt 41997828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 298
Target Start/End: Original strand, 56030492 - 56030770
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  56030492 gggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 56030591  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttc 215  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||    
T  56030592 gggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatttc 56030691  T
Q  216 tctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 298  Q
    | |||||||||||| ||||||||   || | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030692 t-tttgtaacgttattcatcata---tgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 56030770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 83 - 308
Target Start/End: Original strand, 16455354 - 16455581
Alignment:
Q  83 gaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 182  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16455354 gaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattag 16455453  T
Q  183 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| | |||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16455454 gcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaat 16455553  T
Q  281 ttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16455554 ttggaccgaactgggtcaacaaattctt 16455581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 317
Target Start/End: Original strand, 19322749 - 19323043
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||    |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |    
T  19322749 tgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttggga 19322844  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  19322845 aacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctttt 19322944  T
Q  221 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  19322945 gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaattctttagtgttct 19323043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Original strand, 13544007 - 13544272
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcacct 116  Q
    |||||||||||||| | ||||| | ||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  13544007 gggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactaggttt-gaggattgattcacct 13544105  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13544106 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatct 13544205  T
Q  217 c-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaattt 282  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||||||||   |||||||||||||||||    
T  13544206 cttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctctttcccagactaggtcaattt 13544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 147 - 317
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215654
Alignment:
Q  147 gttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtgga 245  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 4215582  T
Q  246 tcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
     |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4215583 acggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4215654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18409631 - 18409344
Alignment:
Q  23 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  18409631 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttc 18409532  T
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 217  Q
       |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  18409531 gggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctct 18409432  T
Q  218 tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||| | | ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  18409431 tttgtaa-gttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctccctcagactaggtcaatttggattgaactgggtaaacaaatt 18409344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 121 - 317
Target Start/End: Original strand, 13547305 - 13547502
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | || ||    
T  13547305 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttt 13547404  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  13547405 tgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttct 13547502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 56 - 317
Target Start/End: Original strand, 27499131 - 27499390
Alignment:
Q  56 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 155  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  27499131 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacgata 27499230  T
Q  156 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggc 254  Q
    ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | || ||| ||||||| ||||||||||| |||| || | || |||||    
T  27499231 agagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacctaat-atctct-tttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaagggc 27499328  T
Q  255 tgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27499329 tgctctttcc-ccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27499390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 112 - 317
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891640
Alignment:
Q  112 caccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 211  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  212 tttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 309  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891533 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 2891632  T
Q  310 tgtgttct 317  Q
    ||||||||    
T  2891633 tgtgttct 2891640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18537749 - 18537470
Alignment:
Q  28 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaa---agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaac 124  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||   |||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||||||| ||   |||||||||||||||   ||||    
T  18537749 aaacaagggtttagaaa-caaacaacaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaccactagggtt--ggggttgattcaccttaggaaac 18537654  T
Q  125 actattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgta 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18537653 actattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgta 18537554  T
Q  224 acgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18537553 aagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccataataggtcattttttgaccgaactgggtaaacaaatt 18537470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 56 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18535077 - 18534828
Alignment:
Q  56 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 155  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| || |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  18535077 agggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgaga 18534981  T
Q  156 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggg 253  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||| | ||||||||| |||||||    
T  18534980 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacggaggg 18534881  T
Q  254 ctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
     ||||||| || ||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  18534880 gtgctctcccccccagactaggtaagttttggaccgaacagggtaaacaaatt 18534828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 52942731 - 52942542
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  52942731 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcacctt 52942632  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52942631 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg-------------tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 52942545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3937492 - 3937314
Alignment:
Q  24 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  3937492 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtatagagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 3937393  T
Q  120 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattct 198  Q
     |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3937392 gaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 56 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 38890470 - 38890221
Alignment:
Q  56 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 155  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||| |||| || |  ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  38890470 agggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacggga 38890374  T
Q  156 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggg 253  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  38890373 agagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagaggg 38890274  T
Q  254 ctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  38890273 ctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 38890221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 60 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 8756493 - 8756247
Alignment:
Q  60 tttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctctt-ggttacgggaaga 158  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| || |  |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  8756493 tttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaaga 8756397  T
Q  159 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctg 256  Q
    |  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| |||| || ||    
T  8756396 gattgagactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttg 8756297  T
Q  257 ctctctccaccagactaggtc-aatttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||    
T  8756296 ctctctcctccagactaggtcggttttggagcgaactgggtaaacaaatt 8756247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 188
Target Start/End: Original strand, 6132927 - 6133090
Alignment:
Q  29 aacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaac 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||| | || | ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  6132927 aacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaac 6133026  T
Q  125 actattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  6133027 actattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 106 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16186035 - 16185831
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||   | ||||||||||||| |    
T  16186035 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgca 16185936  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 300  Q
    |||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  16185935 accctttgatatatctttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaac 16185836  T
Q  301 aaatt 305  Q
    |||||    
T  16185835 aaatt 16185831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 171 - 317
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101276
Alignment:
Q  171 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccag 269  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagtaaaacggagggctgctatctcc-ccag 5101228  T
Q  270 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5101229 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5101276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 58 - 317
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30136898
Alignment:
Q  58 ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 157  Q
    ||||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||| || |  |||||||||||||||  |||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  30136640 ggtttgtatagagtttact-cttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaag 30136736  T
Q  158 aggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggct 255  Q
    |   || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | | || ||||    
T  30136737 aaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggct 30136836  T
Q  256 gctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  30136837 gctctctcctcaatactaggtcaatttggaccgaattggataaacaaattcttttgtgttct 30136898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 105 - 305
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102425
Alignment:
Q  105 gttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 203  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||  ||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T
Q  204 cccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 300  Q
    |||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||    
T  12102321 cccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaac 12102420  T
Q  301 aaatt 305  Q
    |||||    
T  12102421 aaatt 12102425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 305
Target Start/End: Original strand, 28453818 - 28454020
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 205  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||| |    
T  28453818 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggaccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaac 28453917  T
Q  206 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
      ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  || |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  28453918 ttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctcccccagactaggttagtattggaccgaactgggtaaacaa 28454017  T
Q  303 att 305  Q
    |||    
T  28454018 att 28454020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 305
Target Start/End: Original strand, 9863842 - 9864049
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaac 204  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||   | ||||| |||||||||||    
T  9863842 ttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaac 9863941  T
Q  205 ccattgatttctctttgtaacgttactcatca----tatagtggatcggagggctgctctct--ccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtc 297  Q
    |  ||||| ||||||||||| |||||||||||    ||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||| |||| | ||||||||||||||||     
T  9863942 cttttgatatctctttgtaaagttactcatcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccccagactaagtcagtattggaccgaactgggta 9864041  T
Q  298 aacaaatt 305  Q
    ||||||||    
T  9864042 aacaaatt 9864049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15032731 - 15032557
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||  |  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  15032731 aaacactattaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttt 15032632  T
Q  220 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaact 292  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  15032631 tgtaaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctcccccaaactaggtcagtattggaccgaact 15032557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 24446864 - 24446756
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaagggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  24446864 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacta-gggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 24446766  T
Q  122 aacactatta 131  Q
    ||||||||||    
T  24446765 aacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Original strand, 11853532 - 11853732
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  11853532 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 11853630  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  11853631 actcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 11853727  T
Q  300 caaat 304  Q
    |||||    
T  11853728 caaat 11853732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38270270 - 38270158
Alignment:
Q  23 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||| | || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38270270 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 38270171  T
Q  119 caaaacactatta 131  Q
     ||||||||||||    
T  38270170 gaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 218 - 317
Target Start/End: Original strand, 47563010 - 47563109
Alignment:
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47563010 tttgtaaggttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 47563109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983565
Alignment:
Q  105 gttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 203  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  204 cccattgatttc-tctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcc 264  Q
    ||| ||||| || | |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc 31983565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 327
Target Start/End: Original strand, 25357772 - 25358000
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggta----gaattaggcggga-gacttattcttg 200  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || |||||||| ||    |||||| |   || ||||||||||||    
T  25357772 ttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttg 25357871  T
Q  201 taacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtc 297  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||  |||||||||||| | ||||||||||| | ||||||| ||||||||     
T  25357872 taaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggta 25357971  T
Q  298 aacaaattcttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  25357972 aacaaatttttgtgtgttc-tctcttcttt 25358000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Original strand, 55822248 - 55822447
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  55822248 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 55822346  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  55822347 actcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcc-ccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 55822442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 305
Target Start/End: Original strand, 31300407 - 31300608
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  31300407 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 31300505  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  31300506 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagggctgctctctcc-ccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 31300601  T
Q  299 acaaatt 305  Q
    |||||||    
T  31300602 acaaatt 31300608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Original strand, 8529250 - 8529455
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  8529250 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 8529348  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  8529349 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 8529445  T
Q  299 acaaattctt 308  Q
    ||||||||||    
T  8529446 acaaattctt 8529455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Original strand, 18586949 - 18587154
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | |||||  |||||||     
T  18586949 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactggttcttgtt 18587047  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  18587048 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 18587144  T
Q  299 acaaattctt 308  Q
    ||||||||||    
T  18587145 acaaattctt 18587154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 3982374 - 3982186
Alignment:
Q  109 attcaccttgca-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacc 205  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||||||| |   || |||| |||||||||||     
T  3982374 attcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaaca 3982275  T
Q  206 cattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaac 291  Q
    | ||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||| | |||||||||||    
T  3982274 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcatactaggtcactattggaccgaac 3982186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 7050456 - 7050282
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  7050456 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 7050358  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca 278  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  7050357 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 7050282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 237 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 14789495 - 14789405
Alignment:
Q  237 tatagtggatcggagggctgctctctc--caccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14789495 tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtgttcttctcttcttt 14789405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Original strand, 4884857 - 4885062
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||   | ||||| |||||||||    
T  4884857 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtataatcaggtttgaagactgattcttgta 4884955  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || |||||||||||    ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  4884956 actca---atatctctttgtaaaaaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 4885052  T
Q  299 acaaattctt 308  Q
    ||||||||||    
T  4885053 acaaattctt 4885062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Original strand, 36769462 - 36769667
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   | ||||| |||||||||    
T  36769462 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggatcgagtttcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgta 36769560  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||| | |    
T  36769561 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactggataa 36769657  T
Q  299 acaaattctt 308  Q
    ||||||||||    
T  36769658 acaaattctt 36769667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47150889
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 204  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  47151092 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 47150993  T
Q  205 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 301  Q
    || ||||| |||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||||| | ||  | || | ||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||     
T  47150992 cctttgatatctcttttctaaagttgctcatcattatagtggaacagatagatgttatctcccctagactaggtcaatattggaccgaattgggtaaact 47150893  T
Q  302 aatt 305  Q
    ||||    
T  47150892 aatt 47150889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 327
Target Start/End: Original strand, 6133105 - 6133194
Alignment:
Q  237 tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6133105 tatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcttcttt 6133194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 40999148 - 40998990
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 204  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||   |||||||   | |||||||    
T  40999148 ttgattcacctaggaaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaac 40999049  T
Q  205 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc-atatagtggatcggagggctgctctc 261  Q
    || ||||| |||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| | ||||| |||||||    
T  40999048 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtggaacagagggatgctctc 40998990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 308
Target Start/End: Original strand, 15316956 - 15317145
Alignment:
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||    
T  15316956 caaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctc 15317051  T
Q  218 tttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
    ||||||| |  ||||  |||| ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  15317052 tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcc-ccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 15317145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16689139 - 16688934
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  16689139 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 16689041  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  || |||||||||   || ||||||||||||| |    
T  16689040 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccacaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 16688944  T
Q  299 acaaattctt 308  Q
    ||||||||||    
T  16688943 acaaattctt 16688934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4556256 - 4556054
Alignment:
Q  108 gattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 204  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  4556256 gattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 4556158  T
Q  205 ccattgatttctctttgtaacgttactcat---catatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 300  Q
     ||   || ||||||||||| |  ||||||     ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||   ||  |||||||||||| |||    
T  4556157 tca---atatctctttgtaaag-aactcatatgattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaac 4556062  T
Q  301 aaattctt 308  Q
    ||||||||    
T  4556061 aaattctt 4556054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 264
Target Start/End: Original strand, 9022438 - 9022601
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgca-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 203  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||| || | ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  9022438 ttgattcaccttggagaaacagtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaa 9022537  T
Q  204 c--ccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcc 264  Q
    |  | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||    
T  9022538 cctctattgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacaaagggctgctctctcc 9022601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 296
Target Start/End: Original strand, 10113003 - 10113198
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacggg-aagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa 203  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||  |  ||||||||||||||||||    || |||| ||||||||||    
T  10113003 ttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttgggtagaattagatttgaagactaattcttgtaa 10113102  T
Q  204 cccatt-gatttctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggt 296  Q
    ||  || ||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||||| | ||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  10113103 cctttttgatatctctttgtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctctctccccaagactaggttagtattggaccgaactgggt 10113198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 320
Target Start/End: Original strand, 4570077 - 4570291
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  4570077 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 4570175  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||   || |||||||||| || |    
T  4570176 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagact-ggtcatcattagaccgaactgtgtaa 4570271  T
Q  299 acaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    ||||||||  ||||||||||||    
T  4570272 acaaattc--ttgtgttcttct 4570291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 278
Target Start/End: Original strand, 15831124 - 15831298
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  15831124 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgcgtagaattaggtttgaagactgattcttgga 15831222  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca 278  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15831223 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 15831298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446630
Alignment:
Q  190 acttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccg 288  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||             | ||||||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc-------------ccatttggaccg 24446668  T
Q  289 aactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24446667 aactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcttcttt 24446630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5336965 - 5336765
Alignment:
Q  120 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||  | || |||||    
T  5336965 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctcttatatctct 5336867  T
Q  219 ttgt-aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    |||| || |  | |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| | | | ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||    
T  5336866 ttgtaaaagaaattcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctatagtaggtcaatattggactgaactgattaaacaaattcttttgtgtt 5336767  T
Q  316 ct 317  Q
    ||    
T  5336766 ct 5336765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Original strand, 36771379 - 36771584
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  36771379 ttgattcaccttgaacaaaacactattatgattgagtctcttggtcatgggaagaggctgtgac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 36771477  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| | ||| |||||||||| | |||||||||||||   || ||||||||| ||| |    
T  36771478 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctacgccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaa 36771574  T
Q  299 acaaattctt 308  Q
    ||||||||||    
T  36771575 acaaattctt 36771584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 52942524 - 52942464
Alignment:
Q  266 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52942524 ccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttc-tctcttcttt 52942464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 87
Target Start/End: Original strand, 2891365 - 2891434
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaa----agggtttgtatagagtttgtttctttggaaca 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2891365 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 2891434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 307
Target Start/End: Original strand, 15312299 - 15312503
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  15312299 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtcgcttggtcacgggaagatgctgtgac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 15312397  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||   || ||||||||| ||| |    
T  15312398 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctggtctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaa 15312494  T
Q  299 acaaattct 307  Q
    |||||||||    
T  15312495 acaaattct 15312503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Original strand, 4558309 - 4558496
Alignment:
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||    
T  4558309 caaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc 4558404  T
Q  218 tttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattc 306  Q
    ||||||| |  ||||  |||| ||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| |||||   || ||||||||||||| |||||||||    
T  4558405 tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagaactgctctctcccccagact-ggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc 4558496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 278
Target Start/End: Original strand, 16489332 - 16489505
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  16489332 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 16489430  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactcat---catatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca 278  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||||    |||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  16489431 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcaatatagtggaacggagagctgctctctcc-ctagactaggtca 16489505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 309
Target Start/End: Original strand, 49088791 - 49088911
Alignment:
Q  192 ttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccacc-agactaggtcaatttggaccg 288  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||   ||||||| |||| ||||||||||||| | | |||  || |||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  49088791 ttattcttgtaactcattgacatcttcttttgtaatgttagtcatcatatagtgaaacagagaactactctctccccccagactaggtcaatttgggccg 49088890  T
Q  289 aactgggtcaacaaattcttt 309  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  49088891 aactgggtcaacaaattcttt 49088911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 106
Target Start/End: Original strand, 5101048 - 5101133
Alignment:
Q  25 ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggt 106  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5101048 ctgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 10047447 - 10047383
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10047447 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10047383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Original strand, 25699732 - 25699810
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  25699732 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattagg 25699810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 39246062 - 39245998
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39246062 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 39245998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 305
Target Start/End: Original strand, 26557823 - 26557922
Alignment:
Q  208 ttgatttctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  26557823 ttgatatctctttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaactaggtaaacaaatt 26557922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3937309 - 3937259
Alignment:
Q  267 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3937309 cagactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcatttgtgttct 3937259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 5269220 - 5269284
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  5269220 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5269284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 5396700 - 5396764
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5396700 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5396764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 13072180 - 13072102
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13072180 ttgattcaccttgaacaaatcactattatgattgagtctcttggtcactggaagaggctgtga-tttgggtagaattagg 13072102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 3578786 - 3578668
Alignment:
Q  188 agacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttgga 285  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||| || | || ||    
T  3578786 agactaattcttgtaacattttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagagctg-tctctcccccagactaggccagtattaga 3578688  T
Q  286 ccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  3578687 ccgaactgggtaaacaaatt 3578668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 301
Target Start/End: Original strand, 36315258 - 36315321
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 301  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36315258 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36315321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 301
Target Start/End: Original strand, 36329467 - 36329530
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 301  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36329467 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36329530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 54906738 - 54906852
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  |  ||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||| | ||||| |||||    
T  54906738 aaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagagattcaagactttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactctttgatatctct 54906837  T
Q  219 ttgtaacgttactca 233  Q
    |||||| ||||||||    
T  54906838 ttgtaaagttactca 54906852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 16623322 - 16623386
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  16623322 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 16623386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 304
Target Start/End: Original strand, 16638825 - 16639011
Alignment:
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| ||||||||||| |||   | ||||| ||||||||||||| |  || ||||    
T  16638825 caaaacactgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagac-ttgggtagaatgaggtttgaagactgattcttgtaaccc-tcaatatctc 16638922  T
Q  218 tttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 304  Q
    ||||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| ||||||| | || ||| ||||||||| |||||||    
T  16638923 tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctc--ccagagtaggtcataattagactgaactgggtaaacaaat 16639011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 31985663 - 31985726
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31985663 atagtggattggagagctgctctctcc-ccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31985726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 38152468 - 38152532
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38152468 atagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 38152532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 183
Target Start/End: Original strand, 47566491 - 47566554
Alignment:
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  47566491 caaagcactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagactg-gaatttgggtagaattagg 47566554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 54867239 - 54867188
Alignment:
Q  250 agggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  54867239 agggctgctctctcc-ccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 54867188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3824630 - 3824595
Alignment:
Q  282 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824630 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3824595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 301
Target Start/End: Original strand, 6743444 - 6743507
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6743444 atagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 4874678 - 4874623
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 159  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4874678 ttgattcaccttgatcaaaacactattaagatagagtctcttggtcacgggaagag 4874623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 5143327 - 5143263
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  5143327 atagtgggttggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5143263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12739594 - 12739550
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12739594 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12739550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26175680 - 26175636
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26175680 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 26175636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 36463433 - 36463389
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36463433 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36463389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 48893682 - 48893638
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48893682 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 48893638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 162 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38270151 - 38270120
Alignment:
Q  162 tgagactttgggtagaattaggcgggagactt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270151 tgagactttgggtagaattaggcgggagactt 38270120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 48053142 - 48053087
Alignment:
Q  248 ggagggctgctctctccaccagac-taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  48053142 ggagagctgctctctcctccagacgtaggtcaatttggacagaactgggtaaacaa 48053087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29609653 - 29609591
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||  |||||||| | |||||||||||    
T  29609653 aaacactattagaattgagtctcttgatcacggcaagagattgagacttcgagtagaattagg 29609591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 308
Target Start/End: Original strand, 54883144 - 54883194
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  54883144 tctctcctccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatttctt 54883194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 305
Target Start/End: Original strand, 10114561 - 10114654
Alignment:
Q  214 tctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    |||||||||||  | ||||||||| ||||| || || || |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| | ||| ||||||||    
T  10114561 tctctttgtaaattaactcatcattatagttgaacgaagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattaggtaaacaaatt 10114654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 292
Target Start/End: Original strand, 34495853 - 34495906
Alignment:
Q  239 tagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaact 292  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||    
T  34495853 tagtggattggagggctgctctctcccccagagtaagtcatgttggaccgaact 34495906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 182
Target Start/End: Original strand, 3760105 - 3760161
Alignment:
Q  127 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag-actttgggtagaattag 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||  | || |||||||||||||||||    
T  3760105 tattaggattgagtctcttggtcacggaaagagatttagcactttgggtagaattag 3760161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 3777617 - 3777553
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||| | ||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  3777617 atagtggattggagagctactctctcctctagattaggttatattggaccgaactgggtcaacaa 3777553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 5429803 - 5429847
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5429803 tctctcccccagattaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 5429847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 5871944 - 5871988
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5871944 tctctcccccagattaggtcaagtttgaccgaactgggtcaacaa 5871988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 9927502 - 9927458
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9927502 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaa 9927458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12743969 - 12743925
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12743969 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12743925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12745358 - 12745314
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12745358 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12745314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 16630709 - 16630773
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  16630709 atagtggattggagagctgttctctcctccagattatgtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16630773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24333877 - 24333813
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  24333877 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagttaacaa 24333813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 25862051 - 25862115
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| | ||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  25862051 atagtggattggagggccgctctcttccccatattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 25862115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 27417009 - 27416965
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27417009 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaa 27416965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 28468558 - 28468621
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||| | |||||||||||||||    
T  28468558 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgg-ctgaactgggtcaacaa 28468621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 46147435 - 46147391
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46147435 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 46147391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 47038455 - 47038411
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47038455 tctctcccccagagtaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 47038411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 52467398 - 52467354
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52467398 tctctccccgagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 52467354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 132)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 51750033 - 51750354
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  51750033 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 51750132  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750133 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 51750232  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750233 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 51750332  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  51750333 ttctcttctttgtgttcttctc 51750354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 26 - 338
Target Start/End: Original strand, 28840678 - 28840994
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |    
T  28840678 tgaaacaagggtttagaaaggaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 28840777  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840778 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 28840877  T
Q  222 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840878 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 28840977  T
Q  322 ttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  28840978 ttctttgtgttcttctc 28840994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 19 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15295124 - 15294800
Alignment:
Q  19 agagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295124 agagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcac 15295025  T
Q  115 cttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 214  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15295024 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaacccattgattt 15294925  T
Q  215 ctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 313  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294924 ctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 15294825  T
Q  314 ttcttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||    
T  15294824 ttcttctcttctttgtgttcttctc 15294800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 338
Target Start/End: Original strand, 13761828 - 13762151
Alignment:
Q  19 agagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaca----aagggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  13761828 agagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacataactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaa 13761927  T
Q  115 cttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 214  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13761928 cttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 13762027  T
Q  215 ctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13762028 ctctttgtaacgttactcatcatatagtggaccggagggcttctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 13762127  T
Q  315 tcttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||    
T  13762128 tcttctcttctttgtgttcttctc 13762151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 46431994 - 46431683
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  46431994 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 46431895  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431894 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 46431795  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct--ccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431794 tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 46431695  T
Q  316 cttctcttcttt 327  Q
    ||||||||||||    
T  46431694 cttctcttcttt 46431683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 51752359 - 51752678
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752359 gggctgaaacaagagtttagaaaggtaacaacaaaattagggcttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 51752458  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752459 gtgaaacactattag-attgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 51752557  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752558 tttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51752657  T
Q  318 tctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  51752658 tctcttctttgtgttcttctc 51752678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10400115 - 10399794
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10400115 gggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcacctt 10400016  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10400015 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 10399916  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399915 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 10399816  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  10399815 ttctcttctttgtgttcttctc 10399794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 31735808 - 31735487
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  31735808 gggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 31735709  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31735708 gggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctc 31735609  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735608 ttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 31735509  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  31735508 ttctcttctttgtgttcttctc 31735487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 28842489 - 28842809
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  28842489 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacatt 28842588  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28842589 gggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 28842688  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28842689 tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctaatctctcccccagactaggtcaatttggacagaactaggtcaacaaattctattgtgttct 28842788  T
Q  318 tctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  28842789 tctcttctttgtgttcttctc 28842809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 39932067 - 39932389
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39932067 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaacctt 39932166  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39932167 gggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctc 39932266  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc-tccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39932267 ttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggagggctgctctcttcccccatactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgtt 39932366  T
Q  316 cttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||||||| ||| ||||    
T  39932367 cttctcttctttgtgttcttctc 39932389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 23 - 329
Target Start/End: Original strand, 2617511 - 2617822
Alignment:
Q  23 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2617511 ggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttg 2617610  T
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 217  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2617611 ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctct 2617710  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |    
T  2617711 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttgtgtttt 2617810  T
Q  318 tctcttctttgt 329  Q
    ||||||| ||||    
T  2617811 tctcttcattgt 2617822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Original strand, 20302453 - 20302756
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302453 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 20302552  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302553 gggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 20302652  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20302653 tttgtaacgatactcatcagatagtggatcggaggactactctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 20302752  T
Q  318 tctc 321  Q
    ||||    
T  20302753 tctc 20302756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 27337225 - 27336927
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27337225 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 27337127  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337126 gggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 27337027  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337026 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27336927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 15823540 - 15823849
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15823540 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 15823639  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15823640 gggaaacactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 15823739  T
Q  218 t-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15823740 tattgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 15823839  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  15823840 -tctcttcttt 15823849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 47906264 - 47906573
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag----ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906264 gggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 47906363  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906364 gagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 47906463  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906464 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 47906563  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  47906564 -tctcttcttt 47906573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 26 - 338
Target Start/End: Original strand, 20291455 - 20291771
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  20291455 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttggga 20291554  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291555 aacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 20291654  T
Q  222 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 321  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20291655 taacgattctcatcatatagtggatcggagggttgttctctcccccacactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttcttctc 20291754  T
Q  322 ttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  20291755 ttctttgtgttcttctc 20291771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 27339417 - 27339118
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27339417 gggctgaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 27339318  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339317 gggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctc 27339218  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27339217 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgatctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 27339118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 22 - 340
Target Start/End: Original strand, 24325658 - 24325980
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24325658 gggctgaaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 24325756  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325757 aggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 24325856  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24325857 ttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcgaatggctgctctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtcc 24325956  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctcac 340  Q
    || |||||||||| ||| ||||||    
T  24325957 ttttcttctttgtgttcttctcac 24325980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17324923 - 17324623
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17324923 gggctaaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtatagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 17324824  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  17324823 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctc 17324724  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324723 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 17324624  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  17324623 t 17324623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9463531 - 9463227
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9463531 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 9463432  T
Q  118 gcaaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9463431 gggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttct 9463332  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9463331 ctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 9463232  T
Q  317 ttctc 321  Q
    |||||    
T  9463231 ttctc 9463227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 38925765 - 38925459
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38925765 gggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 38925666  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38925665 ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctc 38925566  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||  |||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38925565 ttttgtaacgttactcatc--atagtaaaacggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttc 38925469  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  38925468 -tctcttcttt 38925459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 315
Target Start/End: Original strand, 6823009 - 6823306
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  6823009 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcacctt 6823107  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6823108 gggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc 6823207  T
Q  218 ttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823208 ttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 6823306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 2510611 - 2510308
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510611 gggctgaaacaagggtttataaaggcaaccacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 2510512  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510511 tggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctc 2510413  T
Q  218 t-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510412 tcttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 2510313  T
Q  317 ttctc 321  Q
    |||||    
T  2510312 ttctc 2510308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9459704 - 9459400
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9459704 gggctgaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 9459605  T
Q  118 gcaaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9459604 gggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttct 9459505  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9459504 ctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 9459405  T
Q  317 ttctc 321  Q
    |||||    
T  9459404 ttctc 9459400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12302792 - 12302483
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12302792 gggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 12302693  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||    
T  12302692 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctc 12302593  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302592 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 12302493  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  12302492 -tctcttcttt 12302483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 28 - 338
Target Start/End: Original strand, 16226167 - 16226483
Alignment:
Q  28 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaa 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||    
T  16226167 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 16226266  T
Q  124 cactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16226267 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 16226366  T
Q  223 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tc 321  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||    
T  16226367 aacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttc 16226466  T
Q  322 ttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  16226467 ttctttgtgttcttctc 16226483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 41646914 - 41647214
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  41646914 gggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcacctt 41647013  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  41647014 gggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctc 41647113  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41647114 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccatcagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttc 41647213  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  41647214 t 41647214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 312
Target Start/End: Original strand, 13215075 - 13215375
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13215075 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 13215174  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga----tt 213  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  13215175 gggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttt 13215274  T
Q  214 tctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 311  Q
    |||| |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13215275 tctcttttgtaaatttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgtcaacaaattcttttg 13215374  T
Q  312 t 312  Q
    |    
T  13215375 t 13215375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 50307834 - 50307540
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcacct 116  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50307834 gggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 50307735  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  50307734 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatct 50307635  T
Q  217 c-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50307634 cttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 50307540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 327
Target Start/End: Original strand, 39462514 - 39462822
Alignment:
Q  23 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttg 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39462514 ggctgaaacaaaggtttagaaatgcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttg 39462613  T
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 217  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||     
T  39462614 ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctct 39462713  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||| || |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39462714 tttgaaaagttattcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc- 39462812  T
Q  318 tctcttcttt 327  Q
    ||||||||||    
T  39462813 tctcttcttt 39462822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 16428647 - 16428957
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16428647 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcacctt 16428746  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16428747 ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 16428846  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||||| ||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16428847 ttttgtaaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgtt 16428946  T
Q  316 cttctcttcttt 327  Q
    | ||||||||||    
T  16428947 c-tctcttcttt 16428957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 47179707 - 47180028
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  47179707 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcacctt 47179806  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47179807 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 47179906  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  47179907 ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc-ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttc 47180005  T
Q  317 ttc-tcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||    
T  47180006 ttcttcttctttgtgttcttctc 47180028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 18839581 - 18839891
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  18839581 gggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcacctt 18839680  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18839681 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 18839780  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18839781 ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttcgtgtt 18839880  T
Q  316 cttctcttcttt 327  Q
    | ||||||||||    
T  18839881 c-tctcttcttt 18839891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6995987 - 6995687
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  6995987 gggccgaaacaacggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcacctt 6995888  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  6995887 gggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctc 6995788  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6995787 ttttataacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttc 6995688  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  6995687 t 6995687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21948474 - 21948228
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  21948474 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 21948375  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948374 ggaaa-cactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 21948276  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 264  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21948275 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 21948228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 31425306 - 31424993
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcacct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31425306 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 31425207  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagt---ctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 213  Q
    || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  31425206 tggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaggcttattcttgtaactcattgata 31425107  T
Q  214 tctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 311  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31425106 tctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctctcc-ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 31425008  T
Q  312 tgttcttctcttcttt 327  Q
    ||||| ||||||||||    
T  31425007 tgttc-tctcttcttt 31424993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4131666 - 4131362
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4131666 gggctgaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttacctt 4131567  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga----tt 213  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    ||    
T  4131566 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaacccattgatatctt 4131468  T
Q  214 tctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 311  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  4131467 tctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactatgtcaacaaattcttttg 4131368  T
Q  312 tgttct 317  Q
    ||||||    
T  4131367 tgttct 4131362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 50076960 - 50076650
Alignment:
Q  21 agggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacct 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50076960 agggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 50076861  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  50076860 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatct 50076761  T
Q  217 c-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 314  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076760 cttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc-ccagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 50076662  T
Q  315 tcttctcttcttt 327  Q
    || ||||||||||    
T  50076661 tc-tctcttcttt 50076650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14098254 - 14097956
Alignment:
Q  25 ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgca 120  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |||||    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  14098254 ctgaaacaatggtttaaaaaggcaactacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgga 14098155  T
Q  121 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga-ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14098154 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-agagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 14098056  T
Q  220 t-gtaa-cgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    | |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098055 ttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccacaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14097956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Original strand, 25127869 - 25128167
Alignment:
Q  25 ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  25127869 ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtg 25127968  T
Q  121 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tt 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||    
T  25127969 aaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattcattgatatctcttt 25128068  T
Q  220 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||| ||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25128069 tgtaaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25128167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 47177356 - 47177677
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  47177356 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcacctt 47177455  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47177456 gggaaacactattaggatgggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttct 47177555  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||    
T  47177556 ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc-ccagactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaaatatctttgtgttc 47177654  T
Q  317 ttc-tcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||    
T  47177655 ttcttcttctttgtgttcttctc 47177677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 121 - 338
Target Start/End: Original strand, 51757628 - 51757845
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  51757628 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttctcttt 51757727  T
Q  221 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51757728 gtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttct 51757827  T
Q  321 cttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  51757828 cttctttgtgttcttctc 51757845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 18307103 - 18307403
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  18307103 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctc 18307202  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  18307203 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctc 18307302  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18307303 ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaattcttttgtgtt 18307401  T
Q  316 ct 317  Q
    ||    
T  18307402 ct 18307403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 50079108 - 50078798
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50079108 gggctgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 50079009  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50079008 ggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctc 50078909  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||||| |||| |||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  50078908 ttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaatttggtaaacaaattcttttgtgtt 50078809  T
Q  316 cttctcttcttt 327  Q
    | ||||||||||    
T  50078808 c-tctcttcttt 50078798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11457762 - 11457453
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||| ||||| | |||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11457762 gggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcacctt 11457663  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11457662 gggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattgggggtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 11457563  T
Q  218 ttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11457562 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatgtctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttc 11457463  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  11457462 -tctcttcttt 11457453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 9241372 - 9241072
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9241372 gggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 9241274  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9241273 ggaaaacattattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctc 9241174  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  9241173 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggggaaacaaattcttttttgtt 9241074  T
Q  316 ct 317  Q
    ||    
T  9241073 ct 9241072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17186415 - 17186114
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17186415 gggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 17186316  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  17186315 gggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctc 17186216  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17186215 ttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattcttttgtgtt 17186116  T
Q  316 ct 317  Q
    ||    
T  17186115 ct 17186114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 2949518 - 2949219
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  2949518 gggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcacctt 2949419  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  2949418 gggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc 2949319  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949318 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc-cccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 2949220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28998539 - 28998240
Alignment:
Q  23 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttg 118  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    ||||||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28998539 ggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttg 28998440  T
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 217  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||     
T  28998439 ggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctct 28998340  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998339 tttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28998240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 29004255 - 29003956
Alignment:
Q  23 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttg 118  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    ||||||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29004255 ggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttg 29004156  T
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 217  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||     
T  29004155 ggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctct 29004056  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004055 tttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 29003956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 245
Target Start/End: Original strand, 48665175 - 48665400
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  48665175 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgaga 48665274  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggtta-cgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  48665275 aacactattaggattgagtctcttggttaccgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 48665374  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtgga 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  48665375 tgtaacgttactcatcatatagtgga 48665400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28207353 - 28207046
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  28207353 gggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcacctt 28207254  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  || | |||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  28207253 gggaaacactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagattggggctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc 28207154  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28207153 ttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 28207056  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  28207055 -tctcttcttt 28207046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3579903 - 3579606
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3579903 gggctgaaacaagggttcagaaaggcagcaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 3579804  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
       |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3579803 aggaaacacaattaggattgagtctcttgattacggaaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 3579704  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||| | |||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3579703 ttttgtaaagttactcatcat-tagtgaaacggatgattgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 3579606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 317
Target Start/End: Original strand, 31489913 - 31490206
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |    
T  31489913 tgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag--tttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttggga 31490010  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  31490011 aacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctctttt 31490110  T
Q  221 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31490111 gtaaggttattcatcatatggtgaaacggagggctgctctc-cccccagactaggtcaatttggactgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 31490206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 327
Target Start/End: Original strand, 6756524 - 6756831
Alignment:
Q  25 ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgc 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  6756524 ctgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 6756623  T
Q  120 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 218  Q
     ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  6756624 gaaacactattaggattgagtct--tgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctt 6756721  T
Q  219 ttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6756722 ttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctctctccccccagactaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaattcttttctgttc 6756821  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  6756822 -tctcttcttt 6756831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25251562 - 25251261
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    |||||||||||  |||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25251562 gggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataacgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 25251463  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  25251462 aggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatc 25251363  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||||| |||||| |||| ||||||| | | ||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25251362 ttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctccccaatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 25251263  T
Q  316 ct 317  Q
    ||    
T  25251262 ct 25251261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231878
Alignment:
Q  91 actaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggag 189  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  190 acttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccga 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 16231829  T
Q  290 actgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||| |||||||||||   |||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  16231830 act-ggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 16231878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 23785936 - 23786136
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23785936 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 23786035  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  23786036 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttccttgtgttcttc 23786135  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  23786136 t 23786136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 40133938 - 40134239
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag----ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||     |||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40133938 gggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 40134037  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  40134038 gggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctc 40134137  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  40134138 ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaattcttttgtgtt 40134237  T
Q  316 ct 317  Q
    ||    
T  40134238 ct 40134239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 24 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 50248857 - 50248557
Alignment:
Q  24 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag----ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgc 119  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||     | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  50248857 gctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgg 50248758  T
Q  120 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 218  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  50248757 gaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctctt 50248658  T
Q  219 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg--ctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | | || || ||  |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50248657 ttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagatggttgttctctctcccctagactaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttc 50248558  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  50248557 t 50248557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 17318887 - 17319190
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  17318887 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcacctt 17318986  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||      ||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  17318987 gggaaaca------ggattgagtctcttggttacgggaacagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctc 17319080  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||| | ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17319081 ttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctcc-ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 17319179  T
Q  316 cttctcttcttt 327  Q
    | ||||||||||    
T  17319180 c-tctcttcttt 17319190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31423161 - 31422851
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaac-aaacactaggttttgagggttgattcacct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||| ||||||| |  |||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  31423161 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcacct 31423062  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  31423061 tgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatct 31422962  T
Q  217 c-tttgtaacgttactcatca-tata------------gtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||            ||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31422961 cttttgtaaggttactcatcattatagtgaaagagagggtgaaacagagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgagctgggtgaacaa 31422862  T
Q  303 attcttttgtg 313  Q
    |||||||||||    
T  31422861 attcttttgtg 31422851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 327
Target Start/End: Original strand, 16432390 - 16432699
Alignment:
Q  13 tcatcaagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaagggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattc 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||         ||| |||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16432390 tcatcaagggggcagaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaac-------tagggtttgtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattc 16432482  T
Q  113 accttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 212  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16432483 accttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgat 16432582  T
Q  213 ttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccacc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 309  Q
     |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16432583 atctcttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttt 16432682  T
Q  310 tgtgttcttctcttcttt 327  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  16432683 tgtgttc-tctcttcttt 16432699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 17324056 - 17324349
Alignment:
Q  19 agagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag--ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacct 116  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||   | ||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17324056 agagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaactgatttttatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 17324155  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17324156 tgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatct 17324255  T
Q  217 c-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
    | ||||||| |||| |||||| ||||||| | |||| ||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17324256 cttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctccccatgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 17324349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 91 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248540
Alignment:
Q  91 actaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga 190  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggaga 25248667  T
Q  191 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccg 288  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| | ||||||| | |||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  25248666 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggaccg 25248567  T
Q  289 aactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  25248566 aactgggtcaacaaattcttttgtgtt 25248540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 121 - 327
Target Start/End: Original strand, 16429054 - 16429261
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tt 219  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  16429054 aaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 16429153  T
Q  220 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctt 318  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  16429154 tgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttc-t 16429252  T
Q  319 ctcttcttt 327  Q
    |||||||||    
T  16429253 ctcttcttt 16429261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 104 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115080
Alignment:
Q  104 ggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaa 6115205  T
Q  204 cccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 301  Q
    || |||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||| | ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6115204 ccaattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 6115105  T
Q  302 aattcttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||    
T  6115104 aattattttgtgttc-tctcttcttt 6115080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 165 - 317
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816180
Alignment:
Q  165 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggatcggagggatgctctctc 23816126  T
Q  264 caccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23816127 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 23816180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14183876 - 14183581
Alignment:
Q  19 agagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaa--agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||  ||||||||||||||| ||| | ||| | ||||||||||||| || |  |||||||||||||    
T  14183876 agagggctgaaacaagggtttagaatg-caacacaaactagggtttgtatagaggttgct-cttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcacct 14183781  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |   | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  14183780 tggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaattttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatct 14183681  T
Q  217 c-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 313  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14183680 cttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttttttgtg 14183581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 300
Target Start/End: Original strand, 47451642 - 47451919
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  47451642 gggcttaaacaagggtttggaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacatt 47451741  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
         |   | |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  47451742 -----agtgt-ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctc 47451835  T
Q  218 ttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| | || | | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47451836 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaatgactgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 47451919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 56 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15669640 - 15669379
Alignment:
Q  56 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 155  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||| || |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15669640 agggtttgtataaagtttgct-cttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggga 15669544  T
Q  156 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggg 253  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  15669543 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtggaacggatgg 15669444  T
Q  254 ctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  ||| ||| |||||| || |||||||| | |||||||||    
T  15669443 ctgctctctccccgagactaggtcagttttagactgaactgtgtaaacaaattttgttgtgttct 15669379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 56 - 305
Target Start/End: Original strand, 42922265 - 42922514
Alignment:
Q  56 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 155  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  | ||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42922265 agggtttgtatagagtttgctccta-gcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggga 42922361  T
Q  156 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggg 253  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||     
T  42922362 agagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggagga 42922461  T
Q  254 ctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    ||||||||| | || |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  42922462 ctgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaatt 42922514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 6823879 - 6824088
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6823879 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 6823978  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctctt-------ggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 210  Q
    |  ||||||||||| |||||| ||||||       ||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6823979 gggaaacactattacgattgaatctcttggttacgggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattg 6824078  T
Q  211 atttctcttt 220  Q
    ||||||||||    
T  6824079 atttctcttt 6824088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8347476 - 8347284
Alignment:
Q  102 agggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 201  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8347476 agggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgt 8347377  T
Q  202 aacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaac 291  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||||    
T  8347376 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtggaacggagggatgctctttcccctagactaggtcagttttggaccgaac 8347284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 228 - 338
Target Start/End: Original strand, 13358778 - 13358888
Alignment:
Q  228 tactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13358778 tactcttcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttt 13358877  T
Q  328 gtattcatctc 338  Q
    || ||| ||||    
T  13358878 gtgttcttctc 13358888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 49495411 - 49495206
Alignment:
Q  105 gttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 204  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||  ||||||||| ||||| |||| |||||  || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49495411 gttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcacggtaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaac 49495312  T
Q  205 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||||  ||||||| | |||||| |||||||| ||||||||| ||| || ||    
T  49495311 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaagggcttatctctccccaagactatgtcaatttagaccgaactaggtaaagaa 49495212  T
Q  303 attctt 308  Q
    ||||||    
T  49495211 attctt 49495206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21353545 - 21353342
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaac--actattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    ||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  21353545 ttgattcaccttgaacaacgcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 21353447  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 300  Q
    || ||   || ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||    
T  21353446 actca---atatctctttgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatctttagaccgaactgggtaaac 21353350  T
Q  301 aaattctt 308  Q
    ||||||||    
T  21353349 aaattctt 21353342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 8349338 - 8349049
Alignment:
Q  19 agagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag----ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||     ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| || |  |||| ||||||    
T  8349338 agagggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattaaggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacactagggttgg--ggtttattcac 8349243  T
Q  115 cttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 214  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||  |  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |    
T  8349242 cttgggaaacactattaggattgagtttgatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtat 8349143  T
Q  215 ctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| |||||||||   ||||| || ||||||| | |||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  8349142 ctcttttgttaagttactcatcattatagtggaatagagggttgttctctccccaagactatgtcagttttagaccgaactgggtaaacaaatt 8349049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 103 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18800775 - 18800570
Alignment:
Q  103 gggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 202  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18800775 gggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctctaggtcacgggtagagatttgaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgta 18800676  T
Q  203 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
     ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||  ||||||||||| ||| ||||||| |  |||||||| ||| |||| ||    
T  18800675 tcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaagcggagaactgctctctcccccaaactaggttagttttggaccaaacagggtaaa 18800576  T
Q  300 caaatt 305  Q
    ||||||    
T  18800575 caaatt 18800570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 305
Target Start/End: Original strand, 27916576 - 27916780
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaac 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||  || |||||||||| ||||||||   || |||| |||||| ||||    
T  27916576 ttgattcaccttggaaaacactattagaattgagtctcttggtcacatgaagagattgtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaac 27916675  T
Q  205 c--cattgatttctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaac 300  Q
    |  | ||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||    
T  27916676 cttctttgatatctctttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaac 27916775  T
Q  301 aaatt 305  Q
    |||||    
T  27916776 aaatt 27916780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738625
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  || || ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 30738731  T
Q  205 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca---tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || ||||| |||| ||||||| |||||||||||   ||||||| | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||| | ||||||| |||| ||| ||    
T  30738730 cctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggtcagtattggaccaaacttggtaaa 30738631  T
Q  300 caaatt 305  Q
    ||||||    
T  30738630 caaatt 30738625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 280
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155963
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 204  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  || |||||||| ||||||||||   | ||| | |||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaac 155887  T
Q  205 ccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat 280  Q
    |  ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  155888 cttttgttatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcc-ccaaactaggtcaat 155963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613237
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 204  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||  |||| |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 26613341  T
Q  205 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 301  Q
    || ||||| |||| |||| || |||||| |||| ||||||||| | ||| ||| |||||||| ||||| ||||||| | || ||||||||||||| ||||    
T  26613340 cctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaaca 26613241  T
Q  302 aatt 305  Q
    ||||    
T  26613240 aatt 26613237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 30790602 - 30790401
Alignment:
Q  104 ggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  30790602 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 30790504  T
Q  203 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  30790503 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttc-ccagactaggtcagttttggaccgaactggataaa 30790405  T
Q  300 caaa 303  Q
    ||||    
T  30790404 caaa 30790401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 103 - 305
Target Start/End: Original strand, 16561545 - 16561751
Alignment:
Q  103 gggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 201  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||  ||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||    
T  16561545 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgt 16561644  T
Q  202 aacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtca 298  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||| |  |||| ||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||||| || |    
T  16561645 aaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaa 16561744  T
Q  299 acaaatt 305  Q
    |||||||    
T  16561745 acaaatt 16561751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13125660 - 13125455
Alignment:
Q  104 ggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    ||||||||||| |||  |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  13125660 ggttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgta 13125561  T
Q  203 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    |||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| || ||  ||||||||| | | |||||||||| ||| ||    
T  13125560 accctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctctcccccccttactaggtcagtataggaccgaactaggtaaa 13125461  T
Q  300 caaatt 305  Q
    ||||||    
T  13125460 caaatt 13125455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Original strand, 2232580 - 2232774
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  2232580 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 2232678  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaaca 301  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||||    | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| ||||    
T  2232679 actcat---tatctctttgtaaagaaactcat----tcgtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaaca 2232771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 196 - 305
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916674
Alignment:
Q  196 tcttgtaacccattgatttctctttg-taacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaa-tttggaccgaact 292  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaact 15916661  T
Q  293 gggtcaacaaatt 305  Q
    |||| ||||||||    
T  15916662 gggtaaacaaatt 15916674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 2401420 - 2401205
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  2401420 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 2401322  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| | ||| ||| |||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  2401321 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 2401225  T
Q  299 acaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    ||||||||  ||||||||||||    
T  2401224 acaaattc--ttgtgttcttct 2401205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Original strand, 9526449 - 9526650
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  9526449 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 9526547  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttact--catca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  |||   |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  9526548 actca---atatctctttgtaaagaaacttatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 9526644  T
Q  299 acaaat 304  Q
    ||||||    
T  9526645 acaaat 9526650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 276 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 13447301 - 13447248
Alignment:
Q  276 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13447301 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgt 13447248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4144882 - 4144677
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||   | ||| | |||||||||    
T  4144882 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattaggtttgaagattgattcttgta 4144784  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || | ||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||||| |    
T  4144783 actca---atatatctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagagtaggtcatcattagaccgaactgggtaa 4144687  T
Q  299 acaaattctt 308  Q
    ||||||||||    
T  4144686 acaaattctt 4144677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Original strand, 25134054 - 25134132
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25134054 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25134132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 2393481 - 2393267
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag-gcgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||    | ||||| |||||||||    
T  2393481 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagtctgggac-ttgggtagaattagatttgaagactgattcttgta 2393383  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||| | |    
T  2393382 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcc-ccagactaggtcatcattagaccgaactggataa 2393287  T
Q  299 acaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    ||||||||  ||||||||||||    
T  2393286 acaaattc--ttgtgttcttct 2393267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Original strand, 9521698 - 9521776
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9521698 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9521776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26520321 - 26520206
Alignment:
Q  104 ggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttg------gttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttatt 196  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||      || ||||||||||  || |||||||||||||||||||   ||| |||||||    
T  26520321 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggaaacttatt 26520222  T
Q  197 cttgtaacccattgat 212  Q
    ||||||||||||||||    
T  26520221 cttgtaacccattgat 26520206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 261
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104400
Alignment:
Q  110 ttcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggaga-cttattcttgtaaccca 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||   ||| ||||||||||||||||||   | |||  || ||||||||||||     
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgtaaccct 43104344  T
Q  208 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 261  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||    
T  43104345 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagatgctctc 43104400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 245
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353187
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgca-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 203  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  | |||||||||||||||||||||   || || |||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaggtttgaaac-tattcttgtaa 14353145  T
Q  204 cccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtgga 245  Q
    ||| ||||  ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  14353146 ccctttgaaatct-tttgtaaagttattcatcattatagtgga 14353187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 183
Target Start/End: Original strand, 14997026 - 14997101
Alignment:
Q  109 attcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  14997026 attcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagattgagac-ttgggtagaattagg 14997101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 317
Target Start/End: Original strand, 28279362 - 28279563
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 218  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||| |||||   |||| |    
T  28279362 aaacactattaggattgagcttcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctctt 28279461  T
Q  219 ttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccacc-agactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||   ||| | || ||| ||| || ||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| || ||||||    
T  28279462 ttgtaaagttactcatcattatagtggaattgagagttgttctttccccctagactaggtcagtattagatcgaactgggtaaacaaatttttgtgtgtt 28279561  T
Q  316 ct 317  Q
    ||    
T  28279562 ct 28279563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13598466 - 13598402
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13598466 atagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13598402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 16124545 - 16124609
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  16124545 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 16124609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 37069838 - 37069774
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  37069838 atagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 37069774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 47703965 - 47704029
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47703965 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47704029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19072995 - 19072932
Alignment:
Q  239 tagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19072995 tagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19072932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19120885 - 19120822
Alignment:
Q  239 tagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19120885 tagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19120822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta 181  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  |||||||||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 302
Target Start/End: Original strand, 47098854 - 47098917
Alignment:
Q  239 tagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47098854 tagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47098917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 305
Target Start/End: Original strand, 46783126 - 46783331
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga-ctttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgt 201  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||| |||||||| ||  ||||||  | ||| |||||||||||||||||   || |||| ||||||||    
T  46783126 ttgattcaccttgaacaaagcactgttaggatagagactcttggtcacatgaagagattcagaactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 46783225  T
Q  202 aacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||| |  |||||||| ||||||||| | ||| |||| | ||||| ||||| || |||||| ||||| |||||||| | ||    
T  46783226 aaccctttgatatctttttgtaaagaaactcatcattatagtggaacagagagctgttatctcctccagagtaagtcaatattggatcgaactggataaa 46783325  T
Q  300 caaatt 305  Q
    ||||||    
T  46783326 caaatt 46783331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13127774 - 13127685
Alignment:
Q  218 tttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  13127774 tttgtaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcctccagactaggttagtattggaccgaaccgggtaaacaaatt 13127685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Original strand, 21536597 - 21536662
Alignment:
Q  237 tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  21536597 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaacaa 21536662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29651879 - 29651818
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  29651879 atagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 29651818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 9476329 - 9476265
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9476329 atagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9476265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 242 - 302
Target Start/End: Original strand, 26644930 - 26644990
Alignment:
Q  242 tggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26644930 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26644990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 302
Target Start/End: Original strand, 47102871 - 47102934
Alignment:
Q  239 tagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47102871 tagtggattggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47102934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3281773 - 3281715
Alignment:
Q  241 gtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  3281773 gtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 3281715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 25248801 - 25248767
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248801 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 25248767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 834211 - 834167
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  834211 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 834167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 27104401 - 27104465
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||    
T  27104401 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaa 27104465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28220270 - 28220226
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28220270 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28220226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28265598 - 28265554
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28265598 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28265554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 239 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 775739 - 775676
Alignment:
Q  239 tagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  775739 tagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 775676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 239 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 32889506 - 32889443
Alignment:
Q  239 tagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  32889506 tagtggattggagagctgctctatcccccagactaggtcatattggaccgaactagatcaacaa 32889443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 45644396 - 45644354
Alignment:
Q  260 tctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45644396 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 45644354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 26332781 - 26332719
Alignment:
Q  84 aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggt 148  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26332781 aacaaacactaggtttgg--gtttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggt 26332719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 221
Target Start/End: Original strand, 49959129 - 49959246
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgca-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 203  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||  | |||||||||| || |||||||   || ||| |||||| |||    
T  49959129 ttgattcaccttggagaaacactattaggaatgagtctcttggtcatgagaagagattcgagactttggataaaattaggtttgaaactgattcttttaa 49959228  T
Q  204 cccattgatttctctttg 221  Q
    ||| ||||| ||| ||||    
T  49959229 ccctttgatatctttttg 49959246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 3156989 - 3157033
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3156989 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 3157033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 4552681 - 4552637
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4552681 tctctccctcagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 4552637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 13604652 - 13604716
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  13604652 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaa 13604716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13659380 - 13659336
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13659380 tctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 13659336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28223465 - 28223421
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28223465 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28223421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 31659362 - 31659406
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31659362 tctctccctcagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 31659406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 109)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 27829347 - 27829667
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27829347 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 27829446  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829447 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 27829546  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829547 tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27829646  T
Q  318 tctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  27829647 tctcttctttgtgttcttctc 27829667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 27827036 - 27827356
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27827036 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 27827135  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827136 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 27827235  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827236 tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27827335  T
Q  318 tctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  27827336 tctcttctttgtgttcttctc 27827356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Original strand, 608784 - 609097
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  608784 gggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 608883  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608884 aggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 608983  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc-ttttgtgtt 315  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  608984 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgtt 609083  T
Q  316 cttctcttctttgt 329  Q
    ||||||||||||||    
T  609084 cttctcttctttgt 609097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 15809269 - 15809589
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15809269 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct-tttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 15809367  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809368 ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 15809467  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809468 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctcttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 15809567  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  15809568 ttctcttctttgtgttcttctc 15809589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 32339359 - 32339680
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  32339359 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 32339458  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32339459 ggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 32339558  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32339559 ttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaattcttttgtgttc 32339658  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  32339659 ttctcttctttgtgttcttctc 32339680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Original strand, 3874060 - 3874364
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaagg----gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3874060 gggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 3874159  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874160 gggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 3874259  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874260 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 3874359  T
Q  317 ttctc 321  Q
    |||||    
T  3874360 ttctc 3874364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22684940 - 22684617
Alignment:
Q  23 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22684940 ggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttg 22684841  T
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc---attgatttc 215  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  22684840 ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaatattgatttc 22684741  T
Q  216 tct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 314  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22684740 tctattgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 22684641  T
Q  315 tcttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||    
T  22684640 tcttctcttctttgtgttcttctc 22684617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 18810758 - 18811078
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18810758 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 18810857  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810858 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaataggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 18810957  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810958 tttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18811057  T
Q  318 tctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  18811058 tctcttctttgtgttcttctc 18811078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 26 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28251848 - 28251543
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  28251848 tgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttggga 28251749  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  28251748 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctctttt 28251649  T
Q  221 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28251648 gtaatgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tct 28251550  T
Q  321 cttcttt 327  Q
    |||||||    
T  28251549 cttcttt 28251543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28283504 - 28283185
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  28283504 gggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacatt 28283405  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28283404 gggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctc 28283305  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283304 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28283206  T
Q  318 tctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  28283205 tctcttctttgtgttcttctc 28283185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 14807801 - 14808120
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14807801 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 14807900  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807901 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 14808000  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg----------ctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14808001 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 14808100  T
Q  307 ttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  14808101 ttttgtgttc-tctcttcttt 14808120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 44720893 - 44721214
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag----ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||     | |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  44720893 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatgttttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 44720992  T
Q  118 gc-aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44720993 gggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 44721092  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  44721093 ctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 44721192  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  44721193 ttctcttctttgtgttcttctc 44721214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Original strand, 43530178 - 43530477
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaagggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||         || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  43530178 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaac---------gtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttggga 43530268  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  43530269 aacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctctttt 43530368  T
Q  221 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43530369 gtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctgtctctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 43530468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 22 - 316
Target Start/End: Original strand, 15068031 - 15068330
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15068031 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctt 15068130  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15068131 gggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 15068230  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15068231 ttttgtaacgttactcatcatataatggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggccaacaaattcttttgtgttc 15068330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 23 - 338
Target Start/End: Original strand, 18812944 - 18813252
Alignment:
Q  23 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaagggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||    
T  18812944 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaac-------tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 18813036  T
Q  123 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813037 acactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 18813136  T
Q  223 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctct 322  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813137 aacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttctct 18813236  T
Q  323 tctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||| ||| ||||    
T  18813237 tctttgtgttcttctc 18813252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 15072760 - 15073070
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag----ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15072760 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcacctt 15072859  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga-ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  15072860 ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagggttgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatct 15072959  T
Q  217 c-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15072960 cttttgtaacgttactcatcatacagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattattttgtgtt 15073059  T
Q  316 cttctcttcttt 327  Q
    | ||||||||||    
T  15073060 c-tctcttcttt 15073070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 4424068 - 4424389
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  4424068 gggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgt 4424167  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4424168 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatc 4424267  T
Q  218 ttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4424268 ttttgtaacattactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 4424367  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  4424368 ttctcttctttgtgttcttctc 4424389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 26 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 30480784 - 30480479
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaagg----gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  30480784 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 30480685  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  30480684 aacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 30480585  T
Q  221 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30480584 gtaacgttagtcatcatatagtgaaatggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tct 30480486  T
Q  321 cttcttt 327  Q
    |||||||    
T  30480485 cttcttt 30480479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 318
Target Start/End: Original strand, 43079652 - 43079953
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  43079652 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 43079751  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079752 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 43079851  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43079852 ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 43079951  T
Q  317 tt 318  Q
    ||    
T  43079952 tt 43079953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27107182 - 27106884
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27107182 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcacctt 27107083  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  27107082 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctc 27106983  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27106982 ttttgtagggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctatctcctccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgtt 27106884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Original strand, 43082023 - 43082326
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag----ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  43082023 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 43082122  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082123 gggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttct 43082222  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43082223 ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 43082322  T
Q  317 ttct 320  Q
    ||||    
T  43082323 ttct 43082326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 1225216 - 1225526
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1225216 gggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcacctt 1225315  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttc 215  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||    
T  1225316 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctc 1225415  T
Q  216 tctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1225416 tttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggccgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgtt 1225515  T
Q  316 cttctcttcttt 327  Q
    | ||||||||||    
T  1225516 c-tctcttcttt 1225526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 27911065 - 27911359
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27911065 gggctgaaacaagggtttagaa-ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 27911163  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27911164 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctc 27911263  T
Q  218 t-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 313  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27911264 tattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcc-ccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtg 27911359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 27957484 - 27957778
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27957484 gggctgaaacaagggtttagaa-ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 27957582  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27957583 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctc 27957682  T
Q  218 t-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 313  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27957683 tattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcc-ccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtg 27957778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 14419476 - 14419166
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  14419476 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcacctt 14419377  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||    
T  14419376 gggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtc 14419277  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419276 ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 14419177  T
Q  316 cttctcttcttt 327  Q
    | ||||||||||    
T  14419176 c-tctcttcttt 14419166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 24873466 - 24873164
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24873466 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 24873367  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
       ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24873366 tggaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttct 24873267  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||| || ||||||||||  || |||||||    
T  24873266 ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaaat--ttctgtgttc 24873169  T
Q  317 ttctc 321  Q
    |||||    
T  24873168 ttctc 24873164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 25952571 - 25952871
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag---ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    || ||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25952571 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattagggttgtatatagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 25952670  T
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 217  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  25952671 gaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagacattgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctct 25952770  T
Q  218 tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25952771 tttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttc 25952870  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  25952871 t 25952871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 41384794 - 41385094
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41384794 gggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcacctt 41384893  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||  ||||    
T  41384894 gggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctc 41384993  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41384994 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttctgttc 41385093  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  41385094 t 41385094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 36865588 - 36865887
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  36865588 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcacctt 36865687  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  36865688 gggaaacactattaggattgagtctct---tcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctc 36865784  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccacc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 314  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  36865785 ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattctcttgtgt 36865884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13858765 - 13858477
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  13858765 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 13858666  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| || |||| |||    
T  13858665 aacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctctttt 13858567  T
Q  221 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 309  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13858566 gtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggacagaactgggtaaacaaattcttt 13858477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 5372463 - 5372160
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  5372463 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcacctt 5372364  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-t 216  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  5372363 gggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggactttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatctt 5372264  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 314  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||    
T  5372263 ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctccccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttctgt 5372164  T
Q  315 tctt 318  Q
    ||||    
T  5372163 tctt 5372160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 41382723 - 41383012
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  41382723 gggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacct- 41382821  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
              |||| |||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  41382822 ----------attatgattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc 41382911  T
Q  218 ttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41382912 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttc 41383011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15185992 - 15185699
Alignment:
Q  25 ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag----ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgca 120  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||     ||||| |||| ||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  15185992 ctgaaacaagggtttagaaagaaaataacaaaactatggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgta 15185893  T
Q  121 aaacactattaggattgagtctct--tggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 218  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  15185892 aaacactattagaattgagtctctcttggttacgggaagaga-------tttgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctct 15185800  T
Q  219 ttgt-aacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    || | || |||||||||||| |||||| | |||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15185799 tttttaaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttc 15185700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 212
Target Start/End: Original strand, 14477330 - 14477520
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  14477330 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 14477429  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14477430 aacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgat 14477520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 327
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956317
Alignment:
Q  58 ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 157  Q
    ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaag 15956146  T
Q  158 aggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggct 255  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |    
T  15956147 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggtt 15956246  T
Q  256 gctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
     ||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15956247 tctctctccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtattc-tctcttcttt 15956317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 33541673 - 33541395
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  33541673 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacatt 33541574  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||                      ||||||| ||||    
T  33541573 gggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattagg----------------------cattgatatctc 33541496  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  33541495 ttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaaaaatttcttttgtgttc 33541396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 296
Target Start/End: Original strand, 21480564 - 21480832
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaagggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| |    |||||||||| ||||||| | ||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||  |    
T  21480564 gggctgaaacaagggtttagaaatcaaacta----gggtttgtatggagtttgct-cttggcaacaaacactaggttt---gggttgattcaccttggga 21480655  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 220  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  21480656 aacactattagaattgagtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaacccattgatatctctttt 21480755  T
Q  221 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 296  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21480756 gtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaacgaactgggt 21480832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 56 - 305
Target Start/End: Original strand, 21482402 - 21482649
Alignment:
Q  56 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 155  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21482402 agggtttgtataaagtttgct-cttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatggga 21482497  T
Q  156 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggg 253  Q
    ||||  || | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||  | | |||||||    
T  21482498 agagattggggctttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggaggg 21482597  T
Q  254 ctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21482598 ctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 21482649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3005829 - 3005624
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 205  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3005829 ttgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatc 3005730  T
Q  206 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  3005729 cattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaa 3005630  T
Q  303 attctt 308  Q
    ||||||    
T  3005629 attctt 3005624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 305
Target Start/End: Original strand, 31162343 - 31162551
Alignment:
Q  102 agggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 201  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31162343 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaagagattgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgt 31162442  T
Q  202 aacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct--ccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggt 296  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31162443 aactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccccagactaggtcagtattggaccgaactgggt 31162542  T
Q  297 caacaaatt 305  Q
     ||||||||    
T  31162543 aaacaaatt 31162551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 103 - 305
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035459
Alignment:
Q  103 gggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 201  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  202 aacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagac--taggtcaat-ttggaccgaactgggtc 297  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||||||||||||||     
T  31035352 aaccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaactgggta 31035451  T
Q  298 aacaaatt 305  Q
    ||||||||    
T  31035452 aacaaatt 31035459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 145
Target Start/End: Original strand, 26775251 - 26775378
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaa----agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  26775251 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgtatatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctt 26775350  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctctt 145  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26775351 ggaaaacactattagaattgagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 91 - 238
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181772
Alignment:
Q  91 actaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactatt-aggattgagtctcttggttacg--ggaagaggctgagactttgggtagaattaggcggg 187  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| ||||||  |||||||  || ||||||||||||||||||||||     
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgga 181721  T
Q  188 agacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  181722 agacttattcttgtaacccattgatatctctttgtaaagttactcatcata 181772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 5623023 - 5622882
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  5623023 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctt 5622924  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 159  Q
       ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5622923 tggaaacattatttggattgagtctcttgattacgggaagag 5622882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9021306 - 9021101
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  9021306 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 9021208  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  9021207 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 9021111  T
Q  299 acaaattctt 308  Q
    ||||||||||    
T  9021110 acaaattctt 9021101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578273
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 204  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  205 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 301  Q
    |  ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| | ||||||||||| | | |||||||||||||| ||||    
T  31578376 cttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtcagtataggaccgaactgggtaaaca 31578277  T
Q  302 aatt 305  Q
    ||||    
T  31578276 aatt 31578273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 35872663 - 35872555
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaagggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  35872663 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacta-gggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 35872565  T
Q  122 aacactatta 131  Q
    ||||||||||    
T  35872564 aacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 16757466 - 16757266
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  16757466 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 16757368  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  16757367 actcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 16757271  T
Q  300 caaat 304  Q
    |||||    
T  16757270 caaat 16757266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Original strand, 28327891 - 28328091
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  28327891 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 28327989  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  28327990 actcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 28328086  T
Q  300 caaat 304  Q
    |||||    
T  28328087 caaat 28328091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 37214438 - 37214317
Alignment:
Q  56 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 155  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||         ||||||||||||||||||||||    
T  37214438 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac---------attgagtctcttggttacggga 37214348  T
Q  156 agaggctgagactttgggtagaattaggcgg 186  Q
    || |  ||  |||||||||||||||||||||    
T  37214347 agcgattggaactttgggtagaattaggcgg 37214317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 174 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468126
Alignment:
Q  174 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagac 271  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||  |||||     
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagat 2468160  T
Q  272 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  2468159 taggtcaatttggacagaactaggtaaacaaatt 2468126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 305
Target Start/End: Original strand, 6376124 - 6376328
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||  |||||||||||   | ||||| ||||||||     
T  6376124 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgtt 6376223  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaac 300  Q
    |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||  || |||    
T  6376224 accttttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaacttagtaaac 6376323  T
Q  301 aaatt 305  Q
    |||||    
T  6376324 aaatt 6376328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Original strand, 28895485 - 28895686
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||     
T  28895485 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtt 28895583  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  28895584 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcctctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 28895680  T
Q  299 acaaat 304  Q
    ||||||    
T  28895681 acaaat 28895686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4812686 - 4812486
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  4812686 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 4812588  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || |||   | ||||||||||| |  | ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  4812587 actcat---tatctctttgtaaagaaaatcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcataattagaccgaactgggtaaa 4812491  T
Q  300 caaat 304  Q
    |||||    
T  4812490 caaat 4812486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 16752721 - 16752522
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  16752721 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 16752623  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  16752622 actcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctactctctcc-ccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 16752527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Original strand, 28332614 - 28332814
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  28332614 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 28332712  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  28332713 actcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 28332809  T
Q  300 caaat 304  Q
    |||||    
T  28332810 caaat 28332814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 17799623 - 17799418
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||   | ||||| |||||| ||    
T  17799623 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgagtataattaggtttgaagactgattcttata 17799525  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  17799524 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 17799428  T
Q  299 acaaattctt 308  Q
    ||||||||||    
T  17799427 acaaattctt 17799418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 247 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 37214319 - 37214243
Alignment:
Q  247 cggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttc 324  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37214319 cggatggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt-ttctcttc 37214243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23179760 - 23179545
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||   | ||||| |||||||||    
T  23179760 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcaccggaagaggctgtgacttt-ggtaaaattaggtttgaagactgattcttgta 23179662  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  23179661 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggatagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 23179565  T
Q  299 acaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    ||||||||  ||||||||||||    
T  23179564 acaaattc--ttgtgttcttct 23179545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 29554984 - 29554810
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta-ggcgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |   | | ||||||||||| |    
T  29554984 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattatgtttgaatacttattcttgga 29554886  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca 278  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  29554885 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 29554810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31573924 - 31573794
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 204  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  31573924 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 31573825  T
Q  205 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcat 234  Q
     | ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  31573824 tctttgatatctcttttgtaaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 295
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847848
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgca--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 17847760  T
Q  203 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactggg 295  Q
    | || ||||| |||| |||||||    | ||||  |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  17847761 a-cctttgatatctcttttgtaa----aatcat--tatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccaaactggg 17847848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Original strand, 25684626 - 25684826
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | | ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  25684626 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagacagggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 25684724  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  25684725 actcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 25684821  T
Q  300 caaat 304  Q
    |||||    
T  25684822 caaat 25684826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872429
Alignment:
Q  190 acttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccg 288  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||             | ||||||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc-------------ccatttggaccg 35872467  T
Q  289 aactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35872466 aactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcttcttt 35872429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Original strand, 590777 - 590982
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  590777 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 590875  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| ||   || ||||||||||||| |    
T  590876 actcat---tatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgttctctcccccagactaggacatcattagaccgaactgggtaa 590972  T
Q  299 acaaattctt 308  Q
    | ||||||||    
T  590973 ataaattctt 590982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Original strand, 33032637 - 33032715
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  33032637 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 33032715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 236 - 327
Target Start/End: Original strand, 14477519 - 14477610
Alignment:
Q  236 atatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactg-ggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
    |||||||| | |||| |||| |||| | | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14477519 atatagtgaaacggatggctactctttaccccagactaggtcaatttggatcgaactgcggtcaacaaattcttttgtgttctt-tcttcttt 14477610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13985278 - 13985176
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaa-cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 203  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||  | | |||||||||||||||||||   || ||| ||||||||||    
T  13985278 ttgattcaccttgaaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaa 13985179  T
Q  204 ccc 206  Q
    |||    
T  13985178 ccc 13985176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 183
Target Start/End: Original strand, 3276342 - 3276405
Alignment:
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3276342 caaagcactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3276405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 4696625 - 4696689
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  4696625 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 4696689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 9765848 - 9765912
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9765848 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9765912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 12517309 - 12517252
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaa----agggtttgtatagagtttgt 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  12517309 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 12517252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 23799606 - 23799670
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23799606 atagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 23799670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 26403259 - 26403323
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26403259 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26403323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Original strand, 21033853 - 21034057
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||   | ||||| |||||||||    
T  21033853 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaag-ggctgggac-ttgggtagaaataggtttgaagactaattcttgta 21033950  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| |||||  ||||||| | | ||| |||||||||   || ||||||||||||| |    
T  21033951 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagatctgctcttttccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 21034047  T
Q  299 acaaattctt 308  Q
    ||||||||||    
T  21034048 acaaattctt 21034057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 7412409 - 7412345
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7412409 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 7412345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 237 - 304
Target Start/End: Original strand, 28890881 - 28890949
Alignment:
Q  237 tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  28890881 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28890949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Original strand, 30423195 - 30423274
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||  ||||||| ||||||||||    
T  30423195 ttgattcaccttgaacaaaacacttttaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattagg 30423274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 31071258 - 31071322
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  31071258 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaa 31071322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 302
Target Start/End: Original strand, 19752424 - 19752487
Alignment:
Q  239 tagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  19752424 tagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19752487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 3886203 - 3886169
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3886203 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 3886169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 10930243 - 10930193
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  10930243 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatttctt 10930193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 37214495 - 37214461
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37214495 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 37214461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 286 - 327
Target Start/End: Original strand, 181798 - 181838
Alignment:
Q  286 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  181798 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcttcttt 181838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 2468306 - 2468261
Alignment:
Q  103 gggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggt 148  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2468306 gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33839120 - 33838896
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgca-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  |  ||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  33839120 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggt--caggaagagattcaagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 33839023  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactcatca--tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    |||| |||   ||| ||||||| |||||| |  |  ||||||||| |||||  ||||||||||| ||| | || |||| | || ||||||| ||||| ||    
T  33839022 accctttggaatct-tttgtaaagttacttaaaagttatagtggaacggagaactgctctctcccccataatatgtcagtattcgaccgaattgggtaaa 33838924  T
Q  300 caaattcttttgtgttct-tctcttctt 326  Q
    |||||| |  |||||||| |||||||||    
T  33838923 caaattttcgtgtgttctctctcttctt 33838896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 5702512 - 5702576
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5702512 ataggggattggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5702576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 15212910 - 15212954
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15212910 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 15212954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 19175783 - 19175847
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  19175783 atagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19175847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 27811402 - 27811446
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27811402 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27811446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 33352274 - 33352318
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33352274 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33352318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 40321204 - 40321248
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40321204 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40321248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 43036547 - 43036591
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43036547 tctctcctccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 43036591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 301
Target Start/End: Original strand, 4733830 - 4733873
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 301  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4733830 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 4733873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Original strand, 15949519 - 15949572
Alignment:
Q  108 gattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 159  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  15949519 gattcaccttgaacaaaacactattaggatatagtctcttggtcacgggaagag 15949572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 11701155 - 11701102
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgca-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 158  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11701155 ttgattcaccttgaagaaacattattagaattgagtctcttggtcacgggaaga 11701102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 303
Target Start/End: Original strand, 16833769 - 16833886
Alignment:
Q  188 agacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttgga 285  Q
    ||||||| |||||||| |  ||||| ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| || | |||||||||||||  ||||||| |||| ||| |     
T  16833769 agacttactcttgtaatcatttgatatctcttttgtaaagttactcaacattatagtggaacgaaaggctgctctctcccacagactaagtcacttttgg 16833868  T
Q  286 ccgaactgggtcaacaaa 303  Q
     |||||||||| ||||||    
T  16833869 acgaactgggtaaacaaa 16833886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 320
Target Start/End: Original strand, 28228668 - 28228717
Alignment:
Q  272 taggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  28228668 taggtcaatattggaccgaactaggtaaacacattcttttgtgttcttct 28228717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 28307628 - 28307571
Alignment:
Q  239 tagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 296  Q
    |||||||| |||| |||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  28307628 tagtggattggagagctgctctcatccccagagtaggtcattttggaccgaactgggt 28307571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 140
Target Start/End: Original strand, 31035157 - 31035238
Alignment:
Q  56 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagt 140  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| || |  | |||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  31035157 agggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacaccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 299
Target Start/End: Original strand, 40221869 - 40221910
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  40221869 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaa 40221910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4456096 - 4456036
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 298  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||    
T  4456096 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggaccgaaccgggtca 4456036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 4743258 - 4743214
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4743258 tctctcccccaaagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 4743214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 5689395 - 5689439
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5689395 tctctcccccagatttggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 5689439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 6127289 - 6127225
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| | ||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  6127289 atagtggattggagagctgctctcttccccaaattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 6127225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 6599096 - 6599140
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6599096 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 6599140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 6674549 - 6674593
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6674549 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 6674593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12702678 - 12702634
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12702678 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12702634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 26268429 - 26268354
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 182  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  26268429 ttgattcaccttgaacaaaacactattaagattga--ctcttggtcacggaaagaggatgggac-ttgggtagaattag 26268354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 183)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4104178 - 4103858
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  4104178 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 4104079  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104078 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 4103979  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4103978 tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4103879  T
Q  318 tctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  4103878 tctcttctttgtgttcttctc 4103858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Original strand, 25533416 - 25533720
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533416 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 25533515  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533516 gggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 25533615  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533616 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 25533715  T
Q  317 ttctc 321  Q
    |||||    
T  25533716 ttctc 25533720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10956310 - 10955989
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10956310 gggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcacctt 10956211  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10956210 gggaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc 10956111  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956110 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 10956011  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  10956010 ttctcttctttgtgttcttctc 10955989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 5191627 - 5191946
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  5191627 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 5191726  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5191727 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctc 5191826  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191827 tttgtaacgatactcatcatatagtggatcagagggctgttctctcc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5191925  T
Q  318 tctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  5191926 tctcttctttgtgttcttctc 5191946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Original strand, 3859502 - 3859805
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3859502 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 3859601  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3859602 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctc 3859701  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859702 tttgtaacaatactcatcatatagtggatcgtagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3859801  T
Q  318 tctc 321  Q
    ||||    
T  3859802 tctc 3859805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4308564 - 4308255
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4308564 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 4308465  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308464 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 4308365  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308364 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 4308265  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  4308264 -tctcttcttt 4308255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 38890014 - 38890335
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  38890014 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 38890113  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890114 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 38890213  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890214 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 38890313  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  38890314 ttctcttctttgtgttcttctc 38890335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 51727289 - 51726969
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  51727289 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgtatagagtttgtctctttggaacaaacactgggttt-gagggttgattcacctt 51727191  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51727190 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 51727091  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51727090 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttc 51726991  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  51726990 ttctcttctttgtgttcttctc 51726969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 42990278 - 42990578
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42990278 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcacctt 42990377  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42990378 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc 42990477  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990478 ttttgtaacgttactcatcatatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 42990577  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  42990578 t 42990578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10084672 - 10084351
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10084672 gggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 10084573  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10084572 gggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctc 10084473  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10084472 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttc 10084373  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  10084372 ttctcttctttgtgttcttctc 10084351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10958606 - 10958285
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10958606 gggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcacctt 10958507  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10958506 gggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgacactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc 10958407  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10958406 ttttgtaacgttactcttcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttc 10958307  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  10958306 ttctcttctttgtgttcttctc 10958285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18099453 - 18099153
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18099453 gggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 18099354  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099353 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 18099254  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099253 ttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatatggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 18099154  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  18099153 t 18099153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 43228265 - 43228565
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  43228265 gggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 43228364  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43228365 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc 43228464  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43228465 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttc 43228564  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  43228565 t 43228565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 57 - 338
Target Start/End: Original strand, 1321492 - 1321774
Alignment:
Q  57 gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 156  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1321492 gggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaa 1321591  T
Q  157 gaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggct 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321592 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggct 1321691  T
Q  256 gctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1321692 gctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 1321774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 30005815 - 30006124
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30005815 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 30005914  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30005915 gggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc 30006014  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30006015 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 30006114  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  30006115 -tctcttcttt 30006124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 22 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 9604889 - 9604582
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604889 gggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgattcacctt 9604791  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604790 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 9604691  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9604690 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttc 9604591  T
Q  317 ttctcttctt 326  Q
     |||||||||    
T  9604590 -tctcttctt 9604582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 327
Target Start/End: Original strand, 25388877 - 25389189
Alignment:
Q  19 agagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcac 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25388877 agagagctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 25388976  T
Q  115 cttgcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 213  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25388977 cttggaaa-cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatt 25389075  T
Q  214 tctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  25389076 tctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtg 25389175  T
Q  314 ttcttctcttcttt 327  Q
    ||||||||||||||    
T  25389176 ttcttctcttcttt 25389189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 43226060 - 43226350
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaagg---gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43226060 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacgtttgtatagagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttg 43226159  T
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 217  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43226160 ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 43226259  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226260 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 43226350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 11170378 - 11170678
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  11170378 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcacctt 11170477  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170478 gggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 11170577  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11170578 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaattcttttgttttc 11170677  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  11170678 t 11170678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5522898 - 5522589
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaagggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| |||||| |||| |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||  |    
T  5522898 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaac-------tagggtttgtctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttggga 5522806  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522805 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 5522706  T
Q  222 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 321  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522705 taacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 5522606  T
Q  322 ttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  5522605 ttctttgtgttcttctc 5522589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 66 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606567
Alignment:
Q  66 tagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 165  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 7606723  T
Q  166 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcca 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7606722 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctatttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctccc 7606623  T
Q  266 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606622 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 7606567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18097183 - 18096874
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18097183 gggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 18097084  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  18097083 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttccc 18096984  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18096983 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacgaattcttttgtgttc 18096884  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  18096883 -tctcttcttt 18096874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22114588 - 22114267
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22114588 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcacctt 22114489  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114488 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 22114389  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||| ||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114388 ttttgtaacgttactcatcatataatgaatcggagggatgatctctcccccaaacaaagtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 22114289  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||    
T  22114288 ttctcttttttgtgttcttctc 22114267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 45882913 - 45883214
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  45882913 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcacctt 45883012  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  45883013 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctc 45883112  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccacc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45883113 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 45883212  T
Q  316 ct 317  Q
    ||    
T  45883213 ct 45883214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 23 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 27101463 - 27101164
Alignment:
Q  23 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101463 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttg 27101364  T
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 217  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  27101363 ggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaatgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 27101264  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27101263 tttgcaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 27101164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 746731 - 747053
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  746731 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 746830  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746831 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 746930  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  746931 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 747030  T
Q  317 ttc-tcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||    
T  747031 ttcttcttctttgtgttcttctc 747053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 458258 - 458580
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  458258 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 458357  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458358 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 458457  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  458458 ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttc 458557  T
Q  317 ttc-tcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||    
T  458558 ttcttcttctttgtgttcttctc 458580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 1313384 - 1313692
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1313384 gggctgaaacaagg-tttacaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 1313482  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1313483 gggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctc 1313582  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313583 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 1313682  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  1313683 -tctcttcttt 1313692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 1626966 - 1626666
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1626966 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcacctt 1626867  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1626866 ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 1626767  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1626766 ttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcgcccagactaggtcgatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttc 1626667  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  1626666 t 1626666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 24 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10621811 - 10621491
Alignment:
Q  24 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgc 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||     
T  10621811 gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 10621712  T
Q  120 aaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 218  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621711 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 10621612  T
Q  219 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctt 318  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10621611 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 10621512  T
Q  319 c-tcttctttgtattcatctc 338  Q
    | |||||||||| ||| ||||    
T  10621511 cttcttctttgtgttcttctc 10621491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 455881 - 456203
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  455881 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 455980  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455981 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 456080  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  456081 ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttc 456180  T
Q  317 ttc-tcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||    
T  456181 ttcttcttctttgtgttcttctc 456203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6063729 - 6063407
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6063729 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 6063630  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6063629 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 6063530  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  6063529 ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaaatttctttgtgttc 6063430  T
Q  317 ttct-cttctttgtattcatctc 338  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||    
T  6063429 ttctccttctttgtgttcttctc 6063407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10191592 - 10191274
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10191592 gggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 10191493  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  10191492 gggaaacactattaggatcgagtctcttggttacaggaagaggctg-gactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctc 10191394  T
Q  218 ttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  10191393 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat--tattgtgttc 10191296  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  10191295 ttctcttctttgtgttcttctc 10191274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 43423746 - 43423437
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43423746 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 43423647  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43423646 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctc 43423547  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423546 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaactgagagctgctctctccctgagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 43423447  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  43423446 -tctcttcttt 43423437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 53917947 - 53917638
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53917947 gggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 53917848  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53917847 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 53917748  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917747 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 53917648  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  53917647 -tctcttcttt 53917638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 26720522 - 26720842
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26720522 gggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 26720621  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26720622 gggtta-actattaggattgagtttcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctc 26720720  T
Q  218 ttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26720721 ttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatgactgctctctcccctagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaccaaattcttttgtgttc 26720820  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  26720821 ttctcttctttgtgttcttctc 26720842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6066079 - 6065757
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6066079 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 6065980  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6065979 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 6065880  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6065879 ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggatggctgctctctcccctagactaggtcagattggacagaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 6065780  T
Q  317 ttct-cttctttgtattcatctc 338  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||    
T  6065779 ttctccttctttgtgttcttctc 6065757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 38210344 - 38210666
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  38210344 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 38210443  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38210444 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttct 38210543  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  38210544 ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttc 38210643  T
Q  317 tt-ctcttctttgtattcatctc 338  Q
    || ||||||||||| ||| ||||    
T  38210644 ttcctcttctttgtgttcttctc 38210666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Original strand, 50493973 - 50494276
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  50493973 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 50494072  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50494073 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttct 50494172  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  50494173 ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttc 50494272  T
Q  317 ttct 320  Q
    ||||    
T  50494273 ttct 50494276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28102285 - 28101985
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28102285 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 28102186  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28102185 gggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 28102086  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28102085 ttttgtaaagttacttatcatatagtggaacggatggctgctctctccccaaagctaggtcaatttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttc 28101986  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  28101985 t 28101985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 327
Target Start/End: Original strand, 18162634 - 18162946
Alignment:
Q  19 agagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  18162634 agagggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcac 18162733  T
Q  115 cttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat-t 213  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18162734 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatat 18162833  T
Q  214 tctctttgt-aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 312  Q
    |   ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18162834 ttattttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga-cgaactgtgtcaacaaatttttttgt 18162932  T
Q  313 gttcttctcttcttt 327  Q
    |||| ||||||||||    
T  18162933 gttc-tctcttcttt 18162946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 43421694 - 43421389
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  43421694 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 43421595  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt- 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  || |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  43421594 aacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggatttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 43421495  T
Q  221 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43421494 gtaacgttactcatcatatagtgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tct 43421396  T
Q  321 cttcttt 327  Q
    |||||||    
T  43421395 cttcttt 43421389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 3314658 - 3314959
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3314658 gggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 3314757  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3314758 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 3314857  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     |||||||  ||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314858 ttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 3314957  T
Q  316 ct 317  Q
    ||    
T  3314958 ct 3314959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 24979681 - 24979991
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24979681 gggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 24979780  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-t 216  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || || |    
T  24979781 gggaaatactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatctt 24979880  T
Q  217 ctttgt-aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24979881 ttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 24979980  T
Q  316 cttctcttcttt 327  Q
    | ||||||||||    
T  24979981 c-tctcttcttt 24979991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 38 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28413299 - 28412992
Alignment:
Q  38 ttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattagg 133  Q
    ||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  28413299 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 28413200  T
Q  134 attga-gtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactc 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  28413199 attgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactc 28413100  T
Q  233 atcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttcttttgtgttcttc-tcttctttgta 330  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  28413099 atcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaatttcttttgtgttcttcttcttctttgtg 28413000  T
Q  331 ttcatctc 338  Q
    ||| ||||    
T  28412999 ttcttctc 28412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32264322 - 32264021
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaagg----gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32264322 gggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 32264223  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32264222 gggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 32264123  T
Q  218 --tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 314  Q
      ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  32264122 tttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctatttggaccaaactggatcaac-aattcttttgtgt 32264024  T
Q  315 tct 317  Q
    |||    
T  32264023 tct 32264021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 53915779 - 53915470
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||||||    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  53915779 gggctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttacctt 53915680  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53915679 gtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 53915580  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53915579 ttttgtaatgttactcatcatttagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttgactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 53915480  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  53915479 -tctcttcttt 53915470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 24 - 317
Target Start/End: Original strand, 51943347 - 51943644
Alignment:
Q  24 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgc 119  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  51943347 gctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 51943446  T
Q  120 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 218  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |    
T  51943447 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctctt 51943545  T
Q  219 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51943546 ttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttct 51943644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 5927050 - 5926755
Alignment:
Q  19 agagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcac 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  5927050 agagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgc 5926951  T
Q  115 cttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 214  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  5926950 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatat 5926851  T
Q  215 ctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 309  Q
     || ||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5926850 atcttttgtaaggttactcatcatataatgaaacggatgactgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 5926755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 264
Target Start/End: Original strand, 29956660 - 29956907
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29956660 gggctgaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcacctt 29956759  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29956760 gggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc 29956859  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 264  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29956860 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 29956907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 36011801 - 36012110
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag----ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||     |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  36011801 gggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgtt 36011900  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36011901 gggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 36012000  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36012001 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctcttcttcagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttc 36012100  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  36012101 -tctcttcttt 36012110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 53468738 - 53468436
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag---ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  53468738 gggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaaccaggtttgtatagagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttg 53468639  T
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 217  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  53468638 ggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 53468539  T
Q  218 tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccag--actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 314  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53468538 tttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctaccccccagacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 53468439  T
Q  315 tct 317  Q
    |||    
T  53468438 tct 53468436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 47149178 - 47148878
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaa-caaacactaggttttgagggttgattcacct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  47149178 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcacct 47149079  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47149078 tggaaa-cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatct 47148980  T
Q  217 c-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  47148979 cttttgtatcgttactcatcatatagtgaaacagaggactgctctctcccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaattattctgtgtt 47148880  T
Q  316 ct 317  Q
    ||    
T  47148879 ct 47148878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 880732 - 880425
Alignment:
Q  25 ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgc 119  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  880732 ctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 880633  T
Q  120 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 218  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  || | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  880632 gaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattggggctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctctt 880533  T
Q  219 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctt 318  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  880532 ttgtaaagttactcatcatatagtaaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttc-t 880434  T
Q  319 ctcttcttt 327  Q
    |||||||||    
T  880433 ctcttcttt 880425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 105 - 317
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886472
Alignment:
Q  105 gttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 204  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttggaaa-cactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  205 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 304  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886360 ccattgatttgtctttgaaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 5886459  T
Q  305 tcttttgtgttct 317  Q
    |||||||||||||    
T  5886460 tcttttgtgttct 5886472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 105 - 317
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899945
Alignment:
Q  105 gttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 204  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttggaaa-cactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5899832  T
Q  205 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899833 ccattgatttctctttgcaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 5899932  T
Q  305 tcttttgtgttct 317  Q
    |||||||||||||    
T  5899933 tcttttgtgttct 5899945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 24 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12268247 - 12267949
Alignment:
Q  24 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa-----gggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12268247 gctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 12268148  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||     
T  12268147 cggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac---------tct- 12268058  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12268057 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc- 12267959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 108 - 327
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168385
Alignment:
Q  108 gattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 207  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  208 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatcatatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaattc 11168364  T
Q  307 ttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11168365 ttttgtgttcttctcttcttt 11168385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 98 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25688364 - 25688143
Alignment:
Q  98 tttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 197  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688364 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 25688265  T
Q  198 ttgtaacccattgatttctc-tttgt-aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactggg 295  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688264 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggg 25688165  T
Q  296 tcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  25688164 tcaaaaagttcttttgtgttct 25688143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35918232 - 35917944
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacac------taggttttgagggttgatt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      |||  ||||||||||||||    
T  35918232 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgatt 35918133  T
Q  112 caccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 211  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35918132 caccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagagactgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattga 35918033  T
Q  212 tttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  35918032 tttctcttttgtaacgttactcattatatagtggaacggagagctgctctctccctcagact-ggtcaatttagaccgaactggatcaac 35917944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 42992260 - 42992544
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42992260 gggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 42992359  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||               ||||||||||||| ||||||||||||    
T  42992360 gagaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagagtg-gactttgggtag---------------ttattcttgtaactcattgatttctc 42992443  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42992444 ttttgtaacgttagtcatcatatagtgaatcggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttttttgtgttc 42992543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 51 - 317
Target Start/End: Original strand, 6484366 - 6484634
Alignment:
Q  51 aacaaagggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggtt 149  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||| || |||||| ||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6484366 aacaaggggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggtt 6484465  T
Q  150 acgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcg 248  Q
    ||||||||||  || |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||| | ||    
T  6484466 acgggaagagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacg 6484565  T
Q  249 gagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6484566 gagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6484634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 51675038 - 51674740
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaagggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||         ||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  51675038 gggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaac-------taaggtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaa 51674946  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  51674945 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggattttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttt 51674846  T
Q  221 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    |||| ||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  51674845 gtaatgttactcatcatatactgaaatggagggctgctctctcccccataccaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttc-tct 51674747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 59 - 327
Target Start/End: Original strand, 15780886 - 15781162
Alignment:
Q  59 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 158  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15780886 gtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaga 15780985  T
Q  159 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat----ttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcggagg 252  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||| |||| | ||||| |||||||| || |||    
T  15780986 ggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttctcttttgtaaagttatttatcattatagtggaacgaagg 15781085  T
Q  253 gc---tgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
    ||   |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15781086 gcgcctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttc-tctcttcttt 15781162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 259
Target Start/End: Original strand, 6561784 - 6562028
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6561784 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcacctt 6561883  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6561884 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctc 6561983  T
Q  218 --tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 259  Q
      ||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6561984 tttttgtaaggtaactcatcattatagtggagcggagggctgctc 6562028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 48361953 - 48361654
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  48361953 gggctgaaacaagg-tttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacatt 48361855  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || | |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  48361854 gggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctc 48361755  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||| |||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48361754 ttttgcaacgttactcataatatagtaaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 48361655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28761707 - 28761410
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||| |||||| | ||| | ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  28761707 tgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgct-cttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaa 28761609  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  28761608 aacactattaggattgagtctcttggttacaggaagatattgagactttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctctttt 28761509  T
Q  221 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaa-tttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28761508 gtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaacaaattcttttgttttct 28761410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 32219069 - 32219368
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaagggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||         |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |    
T  32219069 gggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaac-------tagagtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggga 32219161  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tcttt 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || | |||    
T  32219162 aacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattgggactttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatctttttt 32219261  T
Q  221 gt-aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    || ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32219262 gtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctctcccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tc 32219360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 39715443 - 39715739
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39715443 gggctgaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 39715542  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  39715543 gagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctc 39715642  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||| ||||||||||  |||||| | | || || ||  |||||| ||| ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  39715643 ttttgtaaagttactcatc--atagtgaaacagatggttg--ctctcccccatactagatcattttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttc 39715738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 24 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 890052 - 889779
Alignment:
Q  24 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaa--agggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgca 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||      
T  890052 gctgaaacaagggtttagaatggcaacaaaacctagggtttgtatagagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttggg 889953  T
Q  121 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  889952 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga-gttggggctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctcttt 889854  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgg 294  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  889853 tgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgatttctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgg 889779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 84 - 327
Target Start/End: Original strand, 4666554 - 4666797
Alignment:
Q  84 aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4666554 aacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 4666653  T
Q  184 cgggaga--cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaa 279  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  4666654 cgggagatccttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct---ccccagactaggtcaa 4666750  T
Q  280 tttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4666751 tttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttc-tctcttcttt 4666797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 92 - 327
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6232083
Alignment:
Q  92 ctaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagac 191  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggagac 6231947  T
Q  192 ttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccga 289  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||| | |||| | |||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  6231948 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagtgaa-cggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccga 6232046  T
Q  290 actgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6232047 actgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcttcttt 6232083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 54691851 - 54691551
Alignment:
Q  28 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaa 123  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  54691851 aaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 54691752  T
Q  124 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 222  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  |  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||| |||||    
T  54691751 cactattaggattgaattttttggttatgggaagagattagggctttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgt 54691652  T
Q  223 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctct 322  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  54691651 aacgttacccatcatatagttaaacggagggctgctctctcccctagactatgtcaatttgaactgaactaggtcgacaaattcttttatgtt-ttctct 54691553  T
Q  323 tc 324  Q
    ||    
T  54691552 tc 54691551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 302
Target Start/End: Original strand, 53591170 - 53591442
Alignment:
Q  23 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaagggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaa 122  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||         ||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  53591170 ggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaac-------tagggtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 53591262  T
Q  123 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 221  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||  |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  53591263 acactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttg 53591362  T
Q  222 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  53591363 taacgttactcatcatatagtgaaacgaagggatgctctctcc-ccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaacaa 53591442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 121 - 317
Target Start/End: Original strand, 23633531 - 23633727
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  23633531 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctcttt 23633630  T
Q  221 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23633631 gtaaagttactcatcattatagtgaaaaggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttagaccgaaatgggtaaacaaattcttttgtgttct 23633727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 209
Target Start/End: Original strand, 35777395 - 35777587
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  35777395 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 35777494  T
Q  118 gcaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 209  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35777495 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 28100324 - 28100143
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28100324 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 28100225  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 199  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100224 ggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 317
Target Start/End: Original strand, 17795280 - 17795533
Alignment:
Q  62 tgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 161  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||| ||   |||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||      
T  17795280 tgtatagagtttgctt-ttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagat 17795375  T
Q  162 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  17795376 tgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctc 17795475  T
Q  260 tctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||| | |||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| |||||||||    
T  17795476 tctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttct 17795533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 317
Target Start/End: Original strand, 19103720 - 19103973
Alignment:
Q  62 tgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 161  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||| ||   |||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||      
T  19103720 tgtatagagtttgctt-ttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagat 19103815  T
Q  162 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| || | |||| ||||||||    
T  19103816 tgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctc 19103915  T
Q  260 tctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||| | |||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| |||||||||    
T  19103916 tctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttct 19103973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 167 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 27635792 - 27635641
Alignment:
Q  167 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcca 265  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  27635792 ctttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 27635693  T
Q  266 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27635692 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27635641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 56 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13420427 - 13420189
Alignment:
Q  56 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 155  Q
    |||||||||||||||||| | |||  | ||||||||||||| ||   | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13420427 agggtttgtatagagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggga 13420332  T
Q  156 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggg 253  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||| | |||| |||| ||||| |    
T  13420331 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaacggagag 13420232  T
Q  254 ctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggt 296  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  13420231 ctgctctct-caccagactaggtcagttttggaccgaaatgggt 13420189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 56 - 327
Target Start/End: Original strand, 31151360 - 31151628
Alignment:
Q  56 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 155  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||| ||| || |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31151360 agggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggga 31151456  T
Q  156 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactca-tcatatagtggatcggaggg 253  Q
    | ||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  31151457 aaagattgggactttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggaggg 31151554  T
Q  254 ctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  31151555 ctgctctctcccccagactaggtcagttttgggctgaactgggtaaacaaattctcatgtgttc-tctcttcttt 31151628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 171 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701654
Alignment:
Q  171 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccag 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 47701702  T
Q  270 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  47701701 attaggtcaatttggatcgaactggatcaacaaattcttttgcgttct 47701654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 255
Target Start/End: Original strand, 54884138 - 54884367
Alignment:
Q  29 aacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  54884138 aacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttgta--gagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaac 54884235  T
Q  125 actattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgta 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||| ||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||    
T  54884236 actattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaactttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctcttttgta 54884334  T
Q  224 acgttactcatca-tatagtggatcggagggct 255  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  54884335 aagttactcatcattatagtggaacggatggct 54884367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 56 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 562019 - 561769
Alignment:
Q  56 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 155  Q
    |||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||| ||    ||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  562019 agggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggtt--caggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgtga 561923  T
Q  156 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggg 253  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  561922 agagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaaggg 561823  T
Q  254 ctgctctct-ccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  561822 ctgctctctccctccagactaggtcagttttggaccgaaccgggtaaacaaatt 561769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 204
Target Start/End: Original strand, 28181009 - 28181182
Alignment:
Q  35 ggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactatt 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||  |||||| |||    
T  28181009 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccatt 28181108  T
Q  131 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28181109 aggattgagtctattggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacgtattcttataac 28181182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 36871581 - 36871295
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||| |||    ||| |||||||||||||| | ||| | ||||||||| ||| ||  ||| ||||||||||||    
T  36871581 gggctgaaacaagggtttacaa-gccaacaagaaaactagggcttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacaccagggtt--aggattgattcacctt 36871486  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    | |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||| | |||    
T  36871485 ggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatct 36871386  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||    
T  36871385 ctttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatt 36871295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 56 - 305
Target Start/End: Original strand, 25635396 - 25635644
Alignment:
Q  56 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 155  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||| || |  | ||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25635396 agggtttgtatatagtttgct-cttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacggga 25635492  T
Q  156 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggg 253  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||| ||| | | |||||    
T  25635493 agagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcattatggtgaaacagaggg 25635592  T
Q  254 ctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
     |||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  25635593 ttgctctctcccctcggctaggccaatttggaccaaactgcgtaaacaaatt 25635644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 122 - 317
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307034
Alignment:
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||   ||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  221 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |  ||| || |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  3306939 gtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctctc--ctagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttct 3307034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 28137578 - 28137415
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaagggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |    
T  28137578 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaac-------tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttggga 28137486  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagact 192  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||| |||||    
T  28137485 aacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 56 - 220
Target Start/End: Original strand, 23637038 - 23637199
Alignment:
Q  56 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 155  Q
    |||||||||||||||| || | ||| | ||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  23637038 agggtttgtatagagtctgct-cttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgttcatggga 23637134  T
Q  156 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 220  Q
    |||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23637135 agatattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 23637199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 35919179 - 35919094
Alignment:
Q  236 atatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 321  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35919179 atatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 35919094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620457
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaac 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||   || | ||  ||||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaac 1620558  T
Q  205 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||| |||| ||| |||||    
T  1620557 cctttgatatctctttgtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcagtattggaccaaactaggtgaacaa 1620458  T
Q  303 a 303  Q
    |    
T  1620457 a 1620457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 327
Target Start/End: Original strand, 41849243 - 41849342
Alignment:
Q  227 ttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctt 326  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41849243 ttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcttctt 41849341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 296
Target Start/End: Original strand, 53597251 - 53597491
Alignment:
Q  56 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 155  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  53597251 aggggttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgaga 53597347  T
Q  156 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggg 253  Q
    | ||  ||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  53597348 atagattgagattttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggaggg 53597447  T
Q  254 ctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggt 296  Q
     ||||||||||  || ||||||||| | |||||||||| |||||    
T  53597448 ttgctctctcccacaaactaggtcagtattggaccgaattgggt 53597491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29914152 - 29913949
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  29914152 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 29914054  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 300  Q
    || ||   || ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |||    
T  29914053 actca---atatctctttgtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaac 29913957  T
Q  301 aaattctt 308  Q
    ||||||||    
T  29913956 aaattctt 29913949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 59 - 305
Target Start/End: Original strand, 1673990 - 1674227
Alignment:
Q  59 gtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 158  Q
    ||||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1673990 gtttgtatatagtttgct-cttggcaacaaacactagggtt--aggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaaga 1674086  T
Q  159 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 257  Q
    |  || |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||| |||||        |  |||| |||| ||||||    
T  1674087 gattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgtaaagttac--------ttttggaacggatggctgc 1674178  T
Q  258 tctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  1674179 tctctccaccagactaggtcagtattagaccgaactgggtaaacaaatt 1674227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 165 - 305
Target Start/End: Original strand, 24181501 - 24181644
Alignment:
Q  165 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 262  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  24181501 gactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctct 24181600  T
Q  263 ccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    || ||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24181601 cctccaaactaggtcagttttggaccgaattgggtaaacaaatt 24181644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 236 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 53894121 - 53894018
Alignment:
Q  236 atatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtattca 334  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||     
T  53894121 atatattggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttctttgtgttct 53894022  T
Q  335 tctc 338  Q
    ||||    
T  53894021 tctc 53894018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 47878370 - 47878165
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  47878370 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 47878272  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||| |    
T  47878271 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcattattagaccgaactgggtaa 47878175  T
Q  299 acaaattctt 308  Q
    ||||||||||    
T  47878174 acaaattctt 47878165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 10094273 - 10094073
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  10094273 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 10094175  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  10094174 actcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 10094078  T
Q  300 caaat 304  Q
    |||||    
T  10094077 caaat 10094073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 320
Target Start/End: Original strand, 10896988 - 10897203
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  10896988 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 10897086  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  10897087 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 10897183  T
Q  299 acaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    ||||||||  ||||||||||||    
T  10897184 acaaattc--ttgtgttcttct 10897203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 136
Target Start/End: Original strand, 41849126 - 41849244
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41849126 gggctgaaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 41849225  T
Q  118 gcaaaacactattaggatt 136  Q
    |  |||| |||||||||||    
T  41849226 gggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 10100290 - 10100090
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||   | ||||| ||||||| |    
T  10100290 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgaa 10100192  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  10100191 actcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 10100095  T
Q  300 caaat 304  Q
    |||||    
T  10100094 caaat 10100090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 10201153 - 10200953
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  10201153 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 10201055  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || |||   | |||||||| || |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  10201054 actcat---tatctctttggaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 10200958  T
Q  300 caaat 304  Q
    |||||    
T  10200957 caaat 10200953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 112
Target Start/End: Original strand, 11163124 - 11163218
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  11163124 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Original strand, 54193209 - 54193410
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  54193209 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 54193307  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  || |  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  54193308 actca---atatctctttgtaaagaaacccatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 54193404  T
Q  299 acaaat 304  Q
    ||||||    
T  54193405 acaaat 54193410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 305
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634150
Alignment:
Q  187 gagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttgg 284  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||| | || | |||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatttgc 25634129  T
Q  285 accgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    |||||||| ||| ||||||||    
T  25634130 accgaactaggtaaacaaatt 25634150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 10208199 - 10207999
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  10208199 ttgattcaccttgaacaaaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 10208101  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  10208100 actcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccgcagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 10208004  T
Q  300 caaat 304  Q
    |||||    
T  10208003 caaat 10207999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 22626183 - 22625982
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | | ||| ||||||| |    
T  22626183 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaaaactgattcttgaa 22626085  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  22626084 actcat---tatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 22625988  T
Q  299 acaaat 304  Q
    ||||||    
T  22625987 acaaat 22625982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Original strand, 54188492 - 54188692
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  54188492 ttgattcaccttgaacaaagcactattagaattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 54188590  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  54188591 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcc-ccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 54188686  T
Q  299 acaaat 304  Q
    ||||||    
T  54188687 acaaat 54188692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 88 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 4560497 - 4560401
Alignment:
Q  88 aacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggc 184  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||   ||||||||||||||||||    
T  4560497 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggc 4560401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 278
Target Start/End: Original strand, 6303293 - 6303466
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | |||||   | ||||| ||||||| |    
T  6303293 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtatagttaggtttgaagactgattcttgaa 6303391  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca 278  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  6303392 actcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 6303466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634435
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 204  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||   | ||||| ||||||||||     
T  14634638 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaaa 14634539  T
Q  205 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 301  Q
    || ||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||  ||||  || |||||||||| | | || ||||||||| ||| ||||    
T  14634538 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggaacggatggctaatctcatcagcagactaggttagtattagaccgaactaggtaaaca 14634439  T
Q  302 aatt 305  Q
    ||||    
T  14634438 aatt 14634435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 10595218 - 10595028
Alignment:
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||| |||| ||   || ||||    
T  10595218 caaagcactattaggattaagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctc 10595123  T
Q  218 tttgtaacgttactca--tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
    ||||||| |  |||||  ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  10595122 tttgtaaagaaactcatgtcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 10595028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 10612977 - 10612772
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||| ||    
T  10612977 ttgattcaccttgaacaaagcactattaagattgagtttcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttata 10612879  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  10612878 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 10612782  T
Q  299 acaaattctt 308  Q
    ||||||||||    
T  10612781 acaaattctt 10612772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Original strand, 16462186 - 16462264
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16462186 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16462264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 47883081 - 47883003
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  47883081 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47883003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 278
Target Start/End: Original strand, 5858529 - 5858701
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  5858529 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgag--tcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 5858625  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca 278  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  5858626 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtca 5858701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Original strand, 27544256 - 27544456
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||  |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  27544256 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagcgtg-gaacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 27544354  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  27544355 actcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccctcagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 27544451  T
Q  300 caaat 304  Q
    |||||    
T  27544452 caaat 27544456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 47701878 - 47701804
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaa----agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacac 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  47701878 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacac 47701804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 278
Target Start/End: Original strand, 11079515 - 11079674
Alignment:
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| || ||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||    
T  11079515 caaaacactatcaggattgagtctcttggtcacgggaaaaggctgggac-ttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc 11079610  T
Q  218 tttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca 278  Q
    ||||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11079611 tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 11079674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 96
Target Start/End: Original strand, 6231423 - 6231501
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaa----agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactagg 96  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  6231423 gggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagg 6231501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 148
Target Start/End: Original strand, 24177291 - 24177380
Alignment:
Q  56 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggt 148  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24177291 agggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacactaaggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 1736324 - 1736388
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1736324 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 18552902 - 18552966
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18552902 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 18552966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20031517 - 20031439
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  20031517 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 20031439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 30709809 - 30709873
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30709809 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 30709873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 308
Target Start/End: Original strand, 4535612 - 4535803
Alignment:
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||    
T  4535612 caaaacaccgttaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggga-attgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc 4535707  T
Q  218 tttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctcc-accagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
    ||||||| |  ||||  |||| ||||||||| | ||| ||||||||||||  |||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  4535708 tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 4535803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10949459 - 10949285
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||||||   | ||||| |||||||||    
T  10949459 ttgattcaccttgaacaaagtactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctg-gaacttgggttgaattaggtttgaagactgattcttgta 10949361  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca 278  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| |||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  10949360 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 10949285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 27762170 - 27761970
Alignment:
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||    
T  27762170 caaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc 27762075  T
Q  218 tttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 313  Q
    ||||||| |  ||||  |||| ||||||||| |||||  | ||||| ||| ||| |||||||||   || ||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  27762074 tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagaaccgctctatcccccaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtg 27761977  T
Q  314 ttcttct 320  Q
    |||||||    
T  27761976 ttcttct 27761970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 181
Target Start/End: Original strand, 38002852 - 38002928
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta 181  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  38002852 ttgattcaccttgaacaaaacaccattaggtttgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaatta 38002928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 27635910 - 27635832
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactagg 96  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27635910 gggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagg 27635832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 8370505 - 8370569
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8370505 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8370569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 27974971 - 27975035
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27974971 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27975035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 27986465 - 27986529
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27986465 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27986529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 302
Target Start/End: Original strand, 1417510 - 1417573
Alignment:
Q  239 tagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1417510 tagtggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1417573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Original strand, 42992609 - 42992660
Alignment:
Q  266 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  42992609 ccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaaaaaattcttttgtattct 42992660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 46966787 - 46966630
Alignment:
Q  165 gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 262  Q
    |||||||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  46966787 gactttgggtagaattaggtttgaagactaattattgtaaccatttgatatctctttgtaaagaaactcatcattatagtggaacagagagctgccctct 46966688  T
Q  263 ccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    || ||||| ||||||||| |||||| ||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||    
T  46966687 cc-ccagagtaggtcaatattggactgaattggataaacaaattattttgcgttcttct 46966630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 48438282 - 48438221
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  48438282 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaa 48438221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 146
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768672
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttg 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 7768672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16264418 - 16264354
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  16264418 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16264354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21711291 - 21711227
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21711291 atagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21711227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 32143389 - 32143325
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  32143389 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 32143325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 33386685 - 33386749
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  33386685 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 33386749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 11007683 - 11007545
Alignment:
Q  133 gattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttact 231  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||         | |||||||||| | ||||  |||| ||||||| ||||||    
T  11007683 gattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg---------ttttcttgtaactctttgacatctcttttgtaaagttact 11007593  T
Q  232 catca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca 278  Q
    ||||| |||||||||  || ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  11007592 catcattatagtggaatggggggctcctctctcccctagactaggtca 11007545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 37466358 - 37466295
Alignment:
Q  239 tagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  37466358 tagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaa 37466295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15823763 - 15823641
Alignment:
Q  188 agacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttgga 285  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| |  |||| ||| ||||||||| || || |||||||||||  | ||| || |||||| |||||    
T  15823763 agactaattcttgtaaccctttgacatctctttgtaaagaaactcttcattatagtggaacgtagagctgctctctctccaagagtaagtcaatattgga 15823664  T
Q  286 ccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
    ||||| ||||| |||||||||||    
T  15823663 ccgaattgggtaaacaaattctt 15823641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606828
Alignment:
Q  88 aacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattagg 133  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 7606828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 325
Target Start/End: Original strand, 16996993 - 16997082
Alignment:
Q  237 tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttgg-accgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttct 325  Q
    ||||||||| |||||  |||||| |||| ||||||||||| | | ||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16996993 tatagtggaacggagaactgctcactcccccagactaggtaagtatgggactgaactgggtaaacaaattctcttgtgttcttcttttct 16997082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 87
Target Start/End: Original strand, 3306773 - 3306842
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaa----agggtttgtatagagtttgtttctttggaaca 87  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||    ||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3306773 gggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatagagtttgtctctttggaaca 3306842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Original strand, 3329876 - 3329954
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3329876 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattcagttagttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3329954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26299056 - 26298992
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  26299056 atagtagattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 26298992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 27453026 - 27452962
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || || |||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  27453026 atagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 27452962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 36029161 - 36029097
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  36029161 atagtggattggagagctgctttctcccccagattaggtcatattggacagaactgggtcaacaa 36029097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 40913417 - 40913461
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40913417 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40913461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 44331669 - 44331713
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44331669 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 44331713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 48390368 - 48390296
Alignment:
Q  237 tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||   ||  |||||||||||| |||||||||||    
T  48390368 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaacaaattctt 48390296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066731
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgca-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gagactttgggtagaattagg 183  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||  | | |||||||||||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattagg 11066731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 239 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 25795848 - 25795785
Alignment:
Q  239 tagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  25795848 tagtagattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 25795785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 180
Target Start/End: Original strand, 13419941 - 13420015
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatt 180  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||  | | | |||||||||||||    
T  13419941 ttgattcaccttgggaaacactattaggatcaagtctcttggtcacggaaagagattcaaattttgggtagaatt 13420015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 56
Target Start/End: Original strand, 15780834 - 15780868
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 56  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15780834 gggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaa 15780868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 308
Target Start/End: Original strand, 30236249 - 30236299
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  30236249 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaatttctt 30236299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8183154 - 8183117
Alignment:
Q  280 tttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8183154 tttgggccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 8183117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Original strand, 26763021 - 26763101
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||   | ||||||| |||||||||||||    
T  26763021 ttgattcaccttggacaaaacattattaggataaagtctcttggttatgggaagaaattcgagacttcgggtagaattagg 26763101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 31021341 - 31021300
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgca-aaacactattaggattgagtctcttg 146  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  31021341 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttg 31021300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 3716021 - 3716085
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||  | ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3716021 atagtagattggagagctgctctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 3716085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 5236493 - 5236457
Alignment:
Q  266 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5236493 ccagattaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaa 5236457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 6794732 - 6794796
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  6794732 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggacctaaccgggtcaacaa 6794796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 9666510 - 9666466
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9666510 tctctcccccagattaggtaaagttggaccgaactgggtcaacaa 9666466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Original strand, 13893445 - 13893523
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  ||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  13893445 ttgattcaccttgaacaaaataccgttagaattgagtctcttggtcacgggaagagattgagac-ttgggtaaaattagg 13893523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 16499153 - 16499197
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16499153 tctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 16499197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 23391953 - 23391909
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23391953 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 23391909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 29196430 - 29196386
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29196430 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 29196386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 32744472 - 32744436
Alignment:
Q  266 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32744472 ccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 32744436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 34491336 - 34491380
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  34491336 tctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacaa 34491380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 39153405 - 39153361
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  39153405 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaa 39153361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 40592801 - 40592865
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||| ||| |||| ||| ||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40592801 atagtcgattggagagcttctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 40592865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 40734622 - 40734666
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40734622 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40734666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 298
Target Start/End: Original strand, 40735507 - 40735547
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 298  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  40735507 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtca 40735547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 40844719 - 40844656
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  40844719 atagtggatttgagggctgctctctcc-ccagattaggtcatattggaccgaactgaatcaacaa 40844656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 47923937 - 47923989
Alignment:
Q  250 agggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  47923937 agggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 47923989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 51398938 - 51398982
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  51398938 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaa 51398982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 118)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Original strand, 2174913 - 2175216
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  2174913 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 2175012  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175013 gggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 2175112  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175113 tttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2175212  T
Q  318 tctc 321  Q
    ||||    
T  2175213 tctc 2175216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Original strand, 38882100 - 38882403
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  38882100 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 38882199  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882200 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc 38882299  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882300 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38882399  T
Q  318 tctc 321  Q
    ||||    
T  38882400 tctc 38882403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 340
Target Start/End: Original strand, 4236623 - 4236945
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  4236623 gggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 4236722  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4236723 ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 4236822  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4236823 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaact-ggtcaataaattcttttgtgttc 4236921  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctcac 340  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  4236922 ttctcttatttgtgttcttctcac 4236945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 25921758 - 25921437
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  25921758 gggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 25921659  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921658 gtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc 25921559  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921558 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 25921459  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  25921458 ttctcttctttgtgttcttctc 25921437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 24 - 338
Target Start/End: Original strand, 27912532 - 27912851
Alignment:
Q  24 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||     
T  27912532 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgg 27912631  T
Q  120 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 218  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27912632 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 27912731  T
Q  219 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctt 318  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912732 ttgtaacgatactcatcatatagtggaacagagaactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctt 27912831  T
Q  319 ctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||| ||| ||||    
T  27912832 ctcttctttgtgttcttctc 27912851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 18466678 - 18466999
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466678 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 18466777  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466778 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 18466877  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18466878 ttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttc 18466977  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  18466978 ttctcttctttgtgttcttctc 18466999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34479704 - 34479382
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  34479704 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 34479605  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttc 215  Q
    |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479604 gggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttc 34479505  T
Q  216 tctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479504 tctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 34479405  T
Q  316 cttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||||||| ||| ||||    
T  34479404 cttctcttctttgtgttcttctc 34479382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 6745063 - 6745362
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6745063 gggctgaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactaggttt-gagggttgattcacctt 6745161  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745162 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 6745261  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745262 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 6745361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 39854477 - 39854777
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854477 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 39854576  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39854577 gggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 39854676  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39854677 ttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttc 39854776  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  39854777 t 39854777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 26 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10529380 - 10529062
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  10529380 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 10529281  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10529280 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttt 10529181  T
Q  221 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc-ttttgtgttcttc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10529180 gtaacgttactcatcatatagtgaatcggaaggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttcttc 10529081  T
Q  320 tcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||| ||| ||||    
T  10529080 tcttctttgtgttcttctc 10529062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34477339 - 34477017
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  34477339 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 34477240  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttc 215  Q
    |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477239 gggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttc 34477140  T
Q  216 tctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34477139 tctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgtt 34477040  T
Q  316 cttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||||||| ||| ||||    
T  34477039 cttctcttctttgtgttcttctc 34477017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Original strand, 27910445 - 27910748
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910445 gggctgaaacaagg-tttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 27910543  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910544 gggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 27910643  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910644 ttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 27910743  T
Q  317 ttctc 321  Q
    |||||    
T  27910744 ttctc 27910748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 18469005 - 18469324
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18469005 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 18469104  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18469105 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctc 18469204  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||| || || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  18469205 ttttgtaacgatactcatcatctagtggaacgaagagctgctctctc--ccagactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaattcttttgcgttc 18469302  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  18469303 ttctcttctttgtgttcttctc 18469324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 25804019 - 25804339
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25804019 gggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 25804118  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804119 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 25804218  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25804219 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttc 25804317  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    || |||||||||| ||| ||||    
T  25804318 ttgtcttctttgtgttcttctc 25804339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 21948020 - 21948320
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21948020 gggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 21948119  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21948120 gggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctc 21948219  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948220 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 21948319  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  21948320 t 21948320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 16776152 - 16776451
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  16776152 gggctgaaacaagggtttacaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcacctt 16776251  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16776252 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatttctc 16776350  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776351 ttttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctatctcccccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 16776450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 6747300 - 6747608
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    | ||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6747300 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgtataaaatttgtctctttgaaacaaacactaggttt-gagggttgattcacctt 6747398  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  6747399 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctt 6747498  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747499 tttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctctctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6747598  T
Q  318 tctcttcttt 327  Q
      ||||||||    
T  6747599 cttcttcttt 6747608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21684736 - 21684416
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  21684736 gggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgcctt 21684637  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21684636 gggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctc 21684537  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21684536 tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttct 21684437  T
Q  318 tctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||| ||||| ||| ||||    
T  21684436 tctcttttttgtgttcttctc 21684416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Original strand, 31545074 - 31545377
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  31545074 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 31545173  T
Q  118 gcaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31545174 gggaaacactattaggattagagtctcttggttacgggaagaaattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 31545273  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31545274 ctttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 31545373  T
Q  317 ttct 320  Q
    ||||    
T  31545374 ttct 31545377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 24 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 31179654 - 31179337
Alignment:
Q  24 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||     
T  31179654 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 31179555  T
Q  120 aaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 218  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31179554 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctct 31179455  T
Q  219 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctt 318  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  31179454 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat--ttctgtgttctt 31179357  T
Q  319 ctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||| ||| ||||    
T  31179356 ctcttctttgtgttcttctc 31179337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 2818621 - 2818311
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag----ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggtt-gattcacct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  2818621 gggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcacct 2818522  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||    
T  2818521 tggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatct 2818422  T
Q  217 c-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2818421 cttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgtt 2818322  T
Q  316 cttctcttcttt 327  Q
    | ||||||||||    
T  2818321 c-tctcttcttt 2818311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18511497 - 18511188
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18511497 gggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 18511398  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18511397 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctc 18511298  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18511297 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttc 18511198  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  18511197 -tctcttcttt 18511188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 40221516 - 40221813
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40221516 gggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcacctt 40221615  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40221616 ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgggacttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctc 40221715  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 313  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40221716 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtg 40221813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 318
Target Start/End: Original strand, 31542729 - 31543029
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  31542729 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 31542828  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  31542829 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttct 31542927  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31542928 ctttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 31543027  T
Q  317 tt 318  Q
    ||    
T  31543028 tt 31543029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 56 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 658600 - 658332
Alignment:
Q  56 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  658600 agggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctcttggttacggga 658501  T
Q  156 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 254  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  658500 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggc 658401  T
Q  255 tgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
    ||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  658400 tgctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcttcttt 658332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 25 - 338
Target Start/End: Original strand, 15552242 - 15552561
Alignment:
Q  25 ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgca 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||      
T  15552242 ctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg 15552341  T
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552342 aaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 15552441  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15552442 tgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttc 15552541  T
Q  320 -tcttctttgtattcatctc 338  Q
     |||||||||| ||| ||||    
T  15552542 ttcttctttgtgttcttctc 15552561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16092481 - 16092175
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  16092481 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 16092382  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  16092381 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgagatctctttt 16092282  T
Q  221 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16092281 gtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcctctagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaaattcttttgtgttc-tc 16092183  T
Q  320 tcttcttt 327  Q
    ||||||||    
T  16092182 tcttcttt 16092175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 1189894 - 1189592
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag----ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  1189894 gggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacttt 1189795  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1189794 gggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctc 1189695  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcc-accagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 314  Q
     ||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1189694 ttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgctctctcctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 1189595  T
Q  315 tct 317  Q
    |||    
T  1189594 tct 1189592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Original strand, 10586836 - 10587130
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaagggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgca 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||         |||||||||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||      
T  10586836 gggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaac-------tagagtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttggg 10586928  T
Q  121 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10586929 aaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctcttt 10587028  T
Q  221 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10587029 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttc 10587128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 26097727 - 26098025
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26097727 gggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcacctt 26097826  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  26097827 ggaaa-cactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctc 26097925  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26097926 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacaga-ggctgctctctcctccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 26098024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 91 - 329
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410328
Alignment:
Q  91 actaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga 190  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4410189  T
Q  191 cttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaa 290  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  4410190 cttattcttgtaacctattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 4410289  T
Q  291 ctgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgt 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4410290 ctgggtcaacaaattcttttgtgttcttctctactttgt 4410328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 26 - 327
Target Start/End: Original strand, 2954414 - 2954719
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgca 120  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||    |||||||| || | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  2954414 tgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgga 2954513  T
Q  121 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2954514 aaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttt 2954613  T
Q  221 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2954614 gtaaagttactcatcatatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaactaggtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tct 2954712  T
Q  321 cttcttt 327  Q
    |||||||    
T  2954713 cttcttt 2954719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18509603 - 18509294
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18509603 gggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 18509504  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct- 216  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||     
T  18509503 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatcta 18509404  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18509403 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggtgggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttc 18509304  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  18509303 -tctcttcttt 18509294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 25904097 - 25904397
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25904097 gggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 25904196  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25904197 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagggctttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctc 25904296  T
Q  218 t-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25904297 tattgtaacgttacttatcatatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattattttgtgttc 25904396  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  25904397 t 25904397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 26 - 317
Target Start/End: Original strand, 695887 - 696172
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaagggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaaca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||         ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  695887 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaac-------tagggtttgtatctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa-ca 695978  T
Q  126 ctattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  695979 ctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 696078  T
Q  225 cgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
     |||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  696079 agttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 696172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10474608 - 10474308
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  10474608 gggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacacctt 10474509  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10474508 gggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctc 10474409  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||| ||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10474408 ttttctaaggttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttc 10474309  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  10474308 t 10474308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 18596641 - 18596950
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  18596641 gggctgaaacaagggtata--aagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcacctt 18596738  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  18596739 ggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctc 18596838  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18596839 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacagattcttttgtgtt 18596938  T
Q  316 cttctcttcttt 327  Q
    |  |||||||||    
T  18596939 cgactcttcttt 18596950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17818775 - 17818477
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  17818775 gggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttacctt 17818676  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17818675 gggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 17818576  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17818575 ttttgtaaagttactcatcatacagtggaacagagggct--tctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 17818478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 24126850 - 24127150
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||   |||||| |||||| ||||| | |||||| |||||    
T  24126850 gggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgacctt 24126949  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24126950 gggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctc 24127049  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24127050 ttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 24127149  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  24127150 t 24127150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Original strand, 17072877 - 17073172
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17072877 gggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 17072976  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || | |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  17072977 gggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattggggctttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctc 17073076  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 311  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17073077 ttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 17073172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 24 - 327
Target Start/End: Original strand, 6756490 - 6756795
Alignment:
Q  24 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag----ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgc 119  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  6756490 gctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgg 6756589  T
Q  120 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tct 218  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || | |    
T  6756590 gaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa--cattgatatctttt 6756687  T
Q  219 ttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||| | | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  6756688 ttgtaaggttacacatcattatagtgaaac-gagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatcttttgtgttc- 6756785  T
Q  318 tctcttcttt 327  Q
    ||||||||||    
T  6756786 tctcttcttt 6756795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 31472898 - 31472589
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31472898 gggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcacctt 31472799  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||||||| ||||    
T  31472798 gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctc 31472699  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31472698 ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgtt 31472599  T
Q  316 cttctcttctt 326  Q
    | |||||||||    
T  31472598 c-tctcttctt 31472589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 39398278 - 39397978
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcacct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39398278 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactaggttt-gagggttgattcacct 39398180  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39398179 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaactttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatct 39398080  T
Q  217 c-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    | ||||| |||||||  || |||||||  | |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  39398079 cttttgtgacgttaccaattatatagtaaaacggatggctgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaaacattcttttgtgtt 39397980  T
Q  316 ct 317  Q
    ||    
T  39397979 ct 39397978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 102 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20506042 - 20505828
Alignment:
Q  102 agggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 201  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20506042 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  202 aacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 300  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20505942 aacacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 20505845  T
Q  301 aaattcttttgtgttct 317  Q
    |||||||||||||||||    
T  20505844 aaattcttttgtgttct 20505828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 36402613 - 36402304
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||  || ||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36402613 gggctgaaacaagggtttagaatgacaatcacgaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 36402514  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  36402513 ggaaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggagattggaactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctc 36402414  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | | || | ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36402413 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatgtctgctctctcccccagactaggtcaatttagatcgaactaggtcaacaaattcttttgtgttc 36402314  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  36402313 -tctcttcttt 36402304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 103 - 321
Target Start/End: Original strand, 39798126 - 39798345
Alignment:
Q  103 gggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 202  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798126 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 39798225  T
Q  203 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 301  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39798226 acccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtcaaca 39798325  T
Q  302 aattcttttgtgttcttctc 321  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39798326 aattcttttgtgttcttctc 39798345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 10749797 - 10749996
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749797 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 10749896  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10749897 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc-tttgtgttcttc 10749995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 37706065 - 37705774
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||    ||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37706065 gggctgaaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtatagactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 37705966  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37705965 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 37705866  T
Q  218 ttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| | || | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37705865 ttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatggctattctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 37705774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15354756 - 15354557
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15354756 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 15354658  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15354657 tgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttc 15354558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 23665141 - 23665340
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23665141 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 23665239  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23665240 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttc 23665339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23793446 - 23793247
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23793446 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 23793348  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23793347 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttc 23793248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 38960313 - 38960114
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38960313 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagact-attcttgtaacccattgatttctctt 38960215  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  38960214 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttc 38960115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 91 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585729
Alignment:
Q  91 actaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  || | |||||||||||||||||| |||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggaga 41585857  T
Q  191 cttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccga 289  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  41585856 cttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccga 41585757  T
Q  290 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41585756 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 41585729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3373319 - 3373119
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373319 aaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 3373220  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3373219 tgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttc 3373120  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  3373119 t 3373119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 10757274 - 10757472
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10757274 aaacactattaggattggagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttctt 10757372  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10757373 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaattc-tttgtgttcttc 10757471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15357032 - 15356833
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15357032 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 15356934  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15356933 tgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttc 15356834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 317
Target Start/End: Original strand, 21288762 - 21289055
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttt------tgagggttgattcacc 115  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||| |||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||    
T  21288762 tgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcacc 21288861  T
Q  116 ttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||      |    
T  21288862 ttg-aaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggactttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaactcat------c 21288954  T
Q  216 tctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21288955 t-tttgtaacgttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtttt 21289053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 31466263 - 31465965
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||| |||||| ||| | ||| |||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  31466263 gggctgaaacaaaggtttaaaaaagtaacgacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcacctt 31466164  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct- 216  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  31466163 gagaaacagtattaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatcta 31466065  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||| ||||||||||||||          |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  31466064 ttttgtaaagttactcatcatat----------agggctgctctcacccccagactagttcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtattc 31465975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 86 - 317
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724187
Alignment:
Q  86 caaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcg 185  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||         |||||||||||||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg---------gtagaattaggcg 2724054  T
Q  186 ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttgg 284  Q
    || || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2724055 ggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgg 2724154  T
Q  285 accgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2724155 accgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2724187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 127 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741841
Alignment:
Q  127 tattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaac 225  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctttgtaac 23741936  T
Q  226 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23741935 gttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttct 23741841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12556208 - 12555908
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12556208 gggctgaaataagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcacctt 12556109  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttc 215  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  || || ||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||  || ||    
T  12556108 gggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaagagattg-gagttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctc 12556010  T
Q  216 tctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    | |||||||||||||||||| || || | | |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12556009 tttttgtaacgttactcatcttaaagcgaaacggagggctgctatctcccccatactagttcaatttggactgaactgggtcaataaattcttttgtgtt 12555910  T
Q  316 ct 317  Q
    ||    
T  12555909 ct 12555908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34530951 - 34530722
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34530951 gggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcacctt 34530852  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  34530851 gggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggactttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctc 34530752  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtgga 245  Q
     ||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  34530751 ttttgtaaagttgctcatcattatagtgga 34530722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 182
Target Start/End: Original strand, 20043044 - 20043208
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20043044 gggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 20043143  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 182  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  20043144 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 105 - 327
Target Start/End: Original strand, 9020299 - 9020525
Alignment:
Q  105 gttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 204  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9020299 gttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaac 9020398  T
Q  205 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtc-aatttggaccgaactgggtcaaca 301  Q
    |||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||   ||||||||||||||| | |||     
T  9020399 ccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggatcggatggctgctctctcctccaaattaggtctgttttggaccgaactggataaacc 9020498  T
Q  302 aattcttttgtgttct-tctcttcttt 327  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9020499 aattcttttgtgttctctctcttcttt 9020525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6661470 - 6661181
Alignment:
Q  19 agagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||    |||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  ||   ||||||||||||    
T  6661470 agagggttgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattagggtatgtatagagtttg-ttcttggcaacaaacactagagtt--ggggttgattcac 6661375  T
Q  115 cttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 214  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6661374 catgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttgggtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatat 6661275  T
Q  215 ctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    ||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||| | |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  6661274 ctcttttgtaaagttgctcataattatagtggaacggatgactgctctctccctcagactaggtcagatttggaccgaactggataaacaaatt 6661181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 105 - 312
Target Start/End: Original strand, 36208656 - 36208865
Alignment:
Q  105 gttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 203  Q
    ||||||||||||||  ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  36208656 gttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaa 36208755  T
Q  204 cccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 301  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36208756 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctctttcc-ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 36208854  T
Q  302 aattcttttgt 312  Q
    |||||||||||    
T  36208855 aattcttttgt 36208865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 186
Target Start/End: Original strand, 20045004 - 20045172
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20045004 gggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 20045103  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgg 186  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  20045104 gggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 26098536 - 26098395
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaa----agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26098536 gggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 26098437  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 159  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26098436 gacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaaagag 26098395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 20053923 - 20054131
Alignment:
Q  104 ggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 203  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  | ||      || ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20053923 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtttggagat-----tgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaa 20054017  T
Q  204 cccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 300  Q
    |||   ||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||| || |||    
T  20054018 ccc---gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaac 20054114  T
Q  301 aaattcttttgtgttct 317  Q
    |||||||||||||||||    
T  20054115 aaattcttttgtgttct 20054131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 306
Target Start/End: Original strand, 23667416 - 23667601
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||| |||| | |||||  || ||||||||  |||||||||||  | ||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  23667416 aaacactataaggattggactctcttgcttacagaaagagattgggactttggaaagaattaggcgaaaaact-atgcttgcaacccattgatttctctt 23667514  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 306  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23667515 tgtaacgtcactcatcaaataatggatcggagggctgctctcttccccagactaggacagattggaccgaactgggccaacaaattc 23667601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 17413365 - 17413176
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 204  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||||||   | | |||||||||||||||    
T  17413365 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaac 17413266  T
Q  205 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaac 291  Q
    || ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| | ||||| | |||||||||||    
T  17413265 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctcccccagagttggtcagtgttggaccgaac 17413176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Original strand, 22672817 - 22673022
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  22672817 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 22672915  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  22672916 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 22673012  T
Q  299 acaaattctt 308  Q
    ||||||||||    
T  22673013 acaaattctt 22673022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Original strand, 1170794 - 1170994
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  1170794 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 1170892  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  1170893 actcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 1170989  T
Q  300 caaat 304  Q
    |||||    
T  1170990 caaat 1170994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 35385651 - 35385450
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  35385651 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 35385553  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  35385552 actcat---tatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 35385456  T
Q  299 acaaat 304  Q
    ||||||    
T  35385455 acaaat 35385450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 218 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26098373 - 26098273
Alignment:
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccacc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  26098373 tttgtaacgttactcatcatatggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttatgttc 26098274  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  26098273 t 26098273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 305
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143750
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 204  Q
    ||||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |  || ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 15143646  T
Q  205 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 301  Q
    || ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | || ||||||| ||||| ||||    
T  15143647 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtcagtatttgaccgaaatgggtaaaca 15143746  T
Q  302 aatt 305  Q
    ||||    
T  15143747 aatt 15143750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 109 - 316
Target Start/End: Original strand, 4897811 - 4898023
Alignment:
Q  109 attcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaacc 205  Q
    ||||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  4897811 attcaccttgaacaaatcactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaacc 4897910  T
Q  206 cattgatttctct-ttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
      ||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| | | |||||||| ||||| ||| ||||||||| | || ||| ||||||||| |||||    
T  4897911 atttgatatctctattgtaaagttactcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtcagtattcgactgaactgggtaaacaa 4898010  T
Q  303 attcttttgtgttc 316  Q
    ||| ||||||||||    
T  4898011 att-ttttgtgttc 4898023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2298200 - 2298026
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  2298200 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 2298102  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca 278  Q
    || |||   | ||||||| ||| |  ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  2298101 actcat---tatctctttataaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctcccccccagactaggtca 2298026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 308
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445684
Alignment:
Q  126 ctattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||| || ||   || |||||||||||    
T  25445501 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctctttgtaa 25445596  T
Q  225 cgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
     |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  25445597 agaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25445684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Original strand, 25452478 - 25452683
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||     
T  25452478 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtt 25452576  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||||| |    
T  25452577 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagaataggtcatcattagaccgaactgggtaa 25452673  T
Q  299 acaaattctt 308  Q
    ||||||||||    
T  25452674 acaaattctt 25452683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 238
Target Start/End: Original strand, 42770936 - 42771025
Alignment:
Q  150 acgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcata 238  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  42770936 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 42771025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2144763 - 2144600
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgca-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag-actttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgta 202  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  | || ||||||||| ||||||||   || |||| |||||||||    
T  2144763 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgta 2144664  T
Q  203 acccattg-atttctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcc 264  Q
    |||  ||  || ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  2144663 accttttttatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc 2144600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15445455 - 15445263
Alignment:
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggtt---acgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgattt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||     ||  ||||||  |||||||||| |||||||||||   || || | ||||||||||||| ||||| |    
T  15445455 caaaacactgttaggattgagtctcttggcggccacatgaagagattgagactttgagtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccctttgatat 15445356  T
Q  215 ctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||    
T  15445355 ctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctcttc-ccagactaggtcagtattggactgaactgggtaaacaaatt 15445263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17841448 - 17841246
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  17841448 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctctaggtcacgggaagaggctg-gaacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 17841350  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  17841349 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 17841253  T
Q  299 acaaatt 305  Q
    |||||||    
T  17841252 acaaatt 17841246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 255 - 317
Target Start/End: Original strand, 20043222 - 20043284
Alignment:
Q  255 tgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20043222 tgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgtgttct 20043284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Original strand, 28786387 - 28786592
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||   | ||| | |||||||||    
T  28786387 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggcagaattaggtttgaagattgattcttgta 28786485  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| |||| |||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  28786486 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattataatggaacggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 28786582  T
Q  299 acaaattctt 308  Q
    ||||||||||    
T  28786583 acaaattctt 28786592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 20507747 - 20507659
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag----ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  20507747 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaagggtttaagggt 20507659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 278
Target Start/End: Original strand, 1240411 - 1240585
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  1240411 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttaggcacgggaagaggctggga-tttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 1240509  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca 278  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||    
T  1240510 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctctcccaaactaggtca 1240585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 248
Target Start/End: Original strand, 4754235 - 4754380
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||  || |||||||| ||||||||||   | || || |||||||||||    
T  4754235 ttgattcaccttgaaaaacactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtgactttggatagaattaggtttgaaggctaattcttgtaac 4754334  T
Q  205 c-cattgatttctctttgtaacgttactcatc-atatagtggatcg 248  Q
    |   || || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4754335 cttttttatatctctttgtaaagttactcatcaatatagtggatcg 4754380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 11962617 - 11962554
Alignment:
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11962617 caaagcactattaggattgtgtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 11962554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 192
Target Start/End: Original strand, 42770867 - 42770934
Alignment:
Q  125 actattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagact 192  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  42770867 actattaggactgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 9353361 - 9353425
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9353361 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9353425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Original strand, 10627347 - 10627425
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  10627347 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagac-tagggtagaattagg 10627425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 36932379 - 36932443
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36932379 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 36932443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28832326 - 28832263
Alignment:
Q  239 tagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  28832326 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaa 28832263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 318
Target Start/End: Original strand, 35430259 - 35430477
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgca-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgta 202  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||  | | | |||||||||||||||||   || |||| |||||||||    
T  35430259 ttgattcaccttggagaaacactattacaattgagtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 35430358  T
Q  203 acccatt-gatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    |  | || ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||  ||| || |||||   ||| ||||||| | |||||| ||||||| | ||    
T  35430359 attcttttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaaagctcctatctcctttagagtaggtcagtattggactgaactggataaa 35430458  T
Q  300 caaattcttttgtgttctt 318  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  35430459 caaattctcttgtgttctt 35430477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Original strand, 11917000 - 11917065
Alignment:
Q  237 tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11917000 tatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 11917065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 16093489 - 16093413
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaa-cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 182  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||| || |||||||||||    
T  16093489 ttgattcaccttgaaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagtctgggac-ttaggtagaattag 16093413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 10281819 - 10281755
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10281819 atagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10281755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 15464600 - 15464536
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  15464600 atagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 15464536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 17003989 - 17004053
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17003989 atagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 17004053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 31782656 - 31782601
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 159  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31782656 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagag 31782601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 237 - 308
Target Start/End: Original strand, 42238376 - 42238448
Alignment:
Q  237 tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  42238376 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 42238448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 56
Target Start/End: Original strand, 4410055 - 4410089
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410055 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 4410089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19588814 - 19588750
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  19588814 atagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaa 19588750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 19806487 - 19806531
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19806487 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 19806531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 26406672 - 26406594
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  26406672 ttgattcaccttgaacaaaacattgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagac-ttgagtagaattagg 26406594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 32636948 - 32636992
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32636948 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 32636992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 239 - 302
Target Start/End: Original strand, 31300626 - 31300689
Alignment:
Q  239 tagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||| |||| | | ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31300626 tagtggattggagagtttctctctccctcagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31300689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 183
Target Start/End: Original strand, 32520534 - 32520597
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga-gactttgggtagaattagg 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||    
T  32520534 aaacactattaagattgagtctctcgattacgggaagagattcatgactttgggtagaattagg 32520597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 239 - 302
Target Start/End: Original strand, 42127440 - 42127503
Alignment:
Q  239 tagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||  || || ||||||||||||||||    
T  42127440 tagtggattggggggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaa 42127503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 34033752 - 34033714
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  34033752 aaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagag 34033714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 181
Target Start/End: Original strand, 40222769 - 40222822
Alignment:
Q  127 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta 181  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  40222769 tattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctg-gaacttgggtagaatta 40222822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 533893 - 533937
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  533893 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 533937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 12084204 - 12084268
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| | ||| | |||||||   |||||||||||||||||||||    
T  12084204 atagtggattggagagctgctctctgccccatattaggtcatagtggaccgaactgggtcaacaa 12084268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 14520298 - 14520234
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| | || ||||||||| || | ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14520298 atagtggattgaagagctgctctcccccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14520234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 28278440 - 28278484
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  28278440 tctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacaa 28278484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 42428474 - 42428430
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42428474 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 42428430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 120)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23452522 - 23452201
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  23452522 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 23452423  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452422 gagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 23452323  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452322 ttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 23452223  T
Q  317 ttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  23452222 ttctcttctttgtgttcttctc 23452201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19502296 - 19501984
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19502296 gggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 19502197  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502196 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 19502097  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502096 ttttgtaacgatactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 19501997  T
Q  317 ttctcttctttgt 329  Q
    |||||||||||||    
T  19501996 ttctcttctttgt 19501984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 27104769 - 27105088
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  27104769 gggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcacctt 27104867  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104868 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 27104967  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104968 tttgtaacattactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27105067  T
Q  318 tctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  27105068 tctcttctttgtgttcttctc 27105088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 24 - 320
Target Start/End: Original strand, 42064487 - 42064788
Alignment:
Q  24 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||     
T  42064487 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 42064586  T
Q  120 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064587 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 42064686  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtc-aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctt 318  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064687 tgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctt 42064786  T
Q  319 ct 320  Q
    ||    
T  42064787 ct 42064788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 45280270 - 45279965
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaag-gcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45280270 gggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcacct 45280171  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45280170 tgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 45280071  T
Q  217 c-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45280070 cttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 45279971  T
Q  316 cttctc 321  Q
    ||||||    
T  45279970 cttctc 45279965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13910329 - 13910009
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  13910329 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcacctt 13910230  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910229 gggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 13910130  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910129 tttgtaacaatactcatcatatagtggatcagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13910030  T
Q  318 tctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  13910029 tctcttctttgtgttcttctc 13910009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19504630 - 19504319
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  19504630 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcacctt 19504531  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504530 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg-aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 19504432  T
Q  218 ttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504431 ttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 19504332  T
Q  317 ttctcttctttgt 329  Q
    |||||||||||||    
T  19504331 ttctcttctttgt 19504319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Original strand, 42452753 - 42453054
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  42452753 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtataaagtttgtctctgt--aacaaacactagagtttgtgggttgattcacctt 42452850  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452851 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 42452950  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452951 ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 42453049  T
Q  317 ttctc 321  Q
    |||||    
T  42453050 ttctc 42453054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21520978 - 21520678
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21520978 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 21520879  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21520878 aggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctaggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctc 21520779  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21520778 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactttgtcaacaaattcttttgtgttc 21520679  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  21520678 t 21520678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 19007610 - 19007910
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag----ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  19007610 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcacctt 19007709  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19007710 gggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 19007809  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19007810 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttc 19007909  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  19007910 t 19007910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 24162497 - 24162196
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24162497 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 24162398  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24162397 gggaaacactattaagattgagtctcttggtt----------gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 24162308  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24162307 tttgtaatgctactcatcatatagtggattggatggctgctctctcccccggactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 24162208  T
Q  318 tctcttctttgt 329  Q
    ||||||||||||    
T  24162207 tctcttctttgt 24162196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6264430 - 6264133
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaagggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  6264430 gggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaagggtttgtatagagtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 6264331  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||  || | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  6264330 aacactattaggattaagtctcttggttacgataaaagattggggctttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 6264231  T
Q  221 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6264230 gtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6264133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 42923793 - 42923485
Alignment:
Q  23 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttg 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42923793 ggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 42923694  T
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  42923693 gaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctct 42923594  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42923593 tttgtaaagttactcgtcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc- 42923495  T
Q  318 tctcttcttt 327  Q
    ||||||||||    
T  42923494 tctcttcttt 42923485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22287621 - 22287321
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22287621 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcacctt 22287522  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22287521 gggaaacggtattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgacacttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctc 22287422  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22287421 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 22287322  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  22287321 t 22287321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 35215871 - 35215568
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  35215871 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 35215772  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35215771 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttct 35215672  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  35215671 ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttc 35215572  T
Q  317 ttct 320  Q
    ||||    
T  35215571 ttct 35215568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 43623849 - 43623556
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||            ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  43623849 tgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc------------actaggttttgagggttgattcaccttggga 43623762  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  43623761 aacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 43623662  T
Q  221 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  43623661 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttc-tct 43623563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 40032343 - 40032038
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40032343 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 40032244  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga----tt 213  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||    
T  40032243 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggttaggactttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctt 40032144  T
Q  214 tctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 311  Q
    |||| |||| || ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032143 tctcttttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggagggccgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 40032044  T
Q  312 tgttct 317  Q
    | ||||    
T  40032043 tattct 40032038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 35218248 - 35217945
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  35218248 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 35218149  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35218148 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccgttgatttct 35218049  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  35218048 ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttc 35217949  T
Q  317 ttct 320  Q
    ||||    
T  35217948 ttct 35217945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 28196607 - 28196914
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  28196607 gggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcacctt 28196706  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28196707 gggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctc 28196806  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| | || | ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28196807 ttttgtaacattactcatcatatagtgaaacgaatggctgctctctcccccagactaggtcaatt--gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 28196904  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  28196905 -tctcttcttt 28196914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 5375552 - 5375322
Alignment:
Q  96 gttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 195  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5375552 gttttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg-agacttat 5375454  T
Q  196 tcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgg 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5375453 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgg 5375354  T
Q  295 gtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5375353 gtcaacaaattcttttgtgttc-tctcttcttt 5375322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11739845 - 11739535
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11739845 gggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatggagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcacctt 11739746  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  11739745 gggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctc 11739646  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     |||| || ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11739645 ttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 11739546  T
Q  316 cttctcttcttt 327  Q
    | ||||||||||    
T  11739545 c-tctcttcttt 11739535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6259096 - 6258802
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  6259096 tgaaacaagagtttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 6258997  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  6258996 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga--ttggggctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 6258899  T
Q  221 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6258898 gtaaagttactcattattatagtgaaacggagggctgctctctcc-ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6258802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 17848413 - 17848719
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcacct 116  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  17848413 gggctcaaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactt 17848512  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  17848513 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaa---ggcgggagacttattcttgtaacc-attgatatct 17848608  T
Q  217 cttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17848609 cttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctcccccatactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 17848708  T
Q  316 cttctcttcttt 327  Q
    | ||||||||||    
T  17848709 c-tctcttcttt 17848719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 121 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 36559046 - 36558845
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36559046 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 36558947  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36558946 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttc 36558847  T
Q  320 tc 321  Q
    ||    
T  36558846 tc 36558845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 17849087 - 17849387
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    | ||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17849087 gggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtatagagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcacctt 17849186  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  17849187 gagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctc 17849286  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  17849287 ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacgg-gggctgctctctcccacatactaggtcaatttggacaagactgggtcaacaaattcttttgtgtt 17849385  T
Q  316 ct 317  Q
    ||    
T  17849386 ct 17849387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 36561323 - 36561123
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561323 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 36561224  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36561223 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttc 36561124  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  36561123 t 36561123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34979864 - 34979562
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34979864 gggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 34979765  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  34979764 gggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctc 34979665  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctct-ctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 314  Q
     ||||||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||| |||| | || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34979664 ttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactctccccccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 34979565  T
Q  315 tct 317  Q
    |||    
T  34979564 tct 34979562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 317
Target Start/End: Original strand, 3022134 - 3022442
Alignment:
Q  23 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttg 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    | ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  3022134 ggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcacctta 3022233  T
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 218  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  3022234 ggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggttttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctct 3022333  T
Q  219 ttgtaacgttactcatca----------tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
    || ||| |||||||||||          |||| || | | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3022334 ttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 3022433  T
Q  309 ttgtgttct 317  Q
    |||||||||    
T  3022434 ttgtgttct 3022442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 317
Target Start/End: Original strand, 14837245 - 14837538
Alignment:
Q  24 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgc 119  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  14837245 gctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtacatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 14837344  T
Q  120 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
     |||||||||||||||||||||||||||      ||||||  |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14837345 gaaacactattaggattgagtctcttgg------gaagagattgagactttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctctt 14837438  T
Q  220 t-gtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    | |||| |||||||||||| |||||| | |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14837439 ttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttct 14837538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 44289347 - 44289052
Alignment:
Q  28 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaa 123  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||    | ||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  44289347 aaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 44289248  T
Q  124 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| | || | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  44289247 cactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggacttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgt 44289148  T
Q  223 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||  |||||||||| ||||||| | | || || |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44289147 aagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 44289052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 121 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 45332363 - 45332144
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45332363 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctctt 45332264  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    ||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  45332263 tgtaaaggtactcatcatatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttc 45332164  T
Q  320 -tcttctttgtattcatctc 338  Q
     |||||||||| ||| ||||    
T  45332163 ttcttctttgtgttcttctc 45332144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31733050 - 31732772
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  31733050 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgtt 31732951  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||||||            || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31732950 gggaaacactgttaggattgagtctcttggtt------------tgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 31732863  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 306  Q
     ||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31732862 ttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtaaacaaattc 31732772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 45239261 - 45239000
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcacct 116  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||    ||||||||||||| ||| |  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45239261 gggctgaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagactttct--ctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 45239164  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  45239163 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaacccattgatatct 45239064  T
Q  217 c-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaa 279  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45239063 cttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaa 45239000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15539756 - 15539566
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  15539756 tgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 15539657  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539656 aacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 15539566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459175
Alignment:
Q  58 ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 157  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 28459336  T
Q  158 aggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggct 255  Q
    ||  || | |||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  28459335 agtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggct 28459236  T
Q  256 gctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
     |||||| | | |||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  28459235 tctctctac-ctagactaggtcaatttggatcgaactagataaacaaattcttttgtgttct 28459175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Original strand, 22874112 - 22874401
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaagggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| |    |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| | ||   |||||||||||||||| ||    
T  22874112 gggctgaaacaagggtttagaaatcaaacta----gggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaa 22874203  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  22874204 aacagtattaggattgagtctcttagtcacgggaagagattgaggctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctctttt 22874303  T
Q  221 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | | ||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  22874304 gtaaagttactcatcattatagtgaaactgagagctgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattctcttgtgttct 22874401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18800587 - 18800289
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaagggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||     |||   ||||||||||||||| ||| | ||| | ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||  |    
T  18800587 gggctgaaacaagggtttagaaat----caagctagggtttgtatagaggttgct-cttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggga 18800496  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  18800495 aacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 18800396  T
Q  221 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctt 318  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18800395 gtaaagttactcgtcattatagtgaaacggagggctactctctcc-ccagaccaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttc-t 18800298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 165 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22407592 - 22407439
Alignment:
Q  165 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 263  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22407592 gacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 22407493  T
Q  264 caccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22407492 ccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 22407439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11578389 - 11578104
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||    ||||||||||||| ||| | |||| | |||||||  |||| || |  |||||||||||||     
T  11578389 gggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaaaaaaactagggtttgtatagaatttttctcttggcaacaaac--tagggttgg--ggttgattcacctc 11578295  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  11578294 gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctc 11578195  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||| |||  ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  11578194 ttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttcccccagactagatcagttttagaccgaactaggtaaacaaatt 11578104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 56 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17897489 - 17897242
Alignment:
Q  56 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 155  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||  ||   |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  17897489 agggtttgtatagagtttgct-cttcgcaacaaacactaggttgaga---ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgaga 17897394  T
Q  156 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggg 253  Q
    | ||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||||||||||| |||||| || |||| ||    
T  17897393 aaagattgagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatgg 17897294  T
Q  254 ctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||    
T  17897293 ctgctctctcc-ccagactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaaatt 17897242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 106 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20146806 - 20146604
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 205  Q
    |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20146806 ttgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaact 20146707  T
Q  206 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    | ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| | |||||||||||||||| ||| |    
T  20146706 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacga 20146607  T
Q  303 att 305  Q
    |||    
T  20146606 att 20146604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 174 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462950
Alignment:
Q  174 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagact 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 7462978  T
Q  273 aggtcaa-tttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7462977 aggtcaattttggaccgaactgggtcaa 7462950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 184 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707736
Alignment:
Q  184 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc--caccagactaggtcaat 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaat 22707773  T
Q  281 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22707772 ttggactgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 22707736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 205
Target Start/End: Original strand, 38020172 - 38020349
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  38020172 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccat 38020271  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 205  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||   |||          | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38020272 ggtaaacactattaggattgagtctcttggtattggg----------ggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 38020349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22163232 - 22163106
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaa----agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22163232 gggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 22163133  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctctt 145  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||    
T  22163132 ggaaaacactattagg-ttgagtctctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 218 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22163106 - 22162998
Alignment:
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22163106 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc- 22163008  T
Q  318 tctcttcttt 327  Q
    ||||||||||    
T  22163007 tctcttcttt 22162998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 305
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699634
Alignment:
Q  104 ggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || |||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  203 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    | || ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||| ||| ||||||||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  40699529 atcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaactaggtaaa 40699628  T
Q  300 caaatt 305  Q
    ||||||    
T  40699629 caaatt 40699634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20054964 - 20054749
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  20054964 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 20054866  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  20054865 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 20054769  T
Q  299 acaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    ||||||||  ||||||||||||    
T  20054768 acaaattc--ttgtgttcttct 20054749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 22407692 - 22407594
Alignment:
Q  24 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22407692 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 22407594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Original strand, 17943520 - 17943723
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  17943520 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 17943618  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 300  Q
    || ||   || ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||| ||| |||    
T  17943619 actca---atatctctttgtaaagaaactcatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaac 17943715  T
Q  301 aaattctt 308  Q
    ||||||||    
T  17943716 aaattctt 17943723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 183 - 317
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23871086
Alignment:
Q  183 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatt 281  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||   ||| ||||||||||    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaatt 23871050  T
Q  282 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23871051 tggatcaaactaggtcaacaaattcttttgagttct 23871086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 37963137 - 37962938
Alignment:
Q  105 gttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 204  Q
    |||||||| ||||  |||||| ||||  |||||||||||||||| ||  ||||||  |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  37963137 gttgattccccttagaaaacattattgagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaat 37963038  T
Q  205 ccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 303  Q
    |||||||||  | ||||||| |||| |||||| ||||||| | | | || ||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  37963037 ccattgatt--tttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacagtggactgatctctctcccacactaggttaatttggaccgaactgggtaaacaaa 37962940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 237
Target Start/End: Original strand, 20589761 - 20589881
Alignment:
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20589761 caaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctc 20589860  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcat 237  Q
     ||||| | ||||||||||||    
T  20589861 ttttgtgaagttactcatcat 20589881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 304
Target Start/End: Original strand, 2736203 - 2736388
Alignment:
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||    
T  2736203 caaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc 2736298  T
Q  218 tttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 304  Q
    ||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  2736299 tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 2736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Original strand, 17462419 - 17462619
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  17462419 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 17462517  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || | |   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  17462518 actcct---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 17462614  T
Q  300 caaat 304  Q
    |||||    
T  17462615 caaat 17462619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Original strand, 39686966 - 39687166
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  39686966 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 39687064  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  39687065 actcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 39687161  T
Q  300 caaat 304  Q
    |||||    
T  39687162 caaat 39687166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 27517838 - 27517623
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  27517838 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 27517740  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||| ||| |    
T  27517739 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaacttggtaa 27517643  T
Q  299 acaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    ||||||||  ||||||||||||    
T  27517642 acaaattc--ttgtgttcttct 27517623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 317
Target Start/End: Original strand, 35107351 - 35107566
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag--gcgggagacttattcttgtaa 203  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||     | ||||||||||||||||    
T  35107351 ttgattcaccttgagaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaa 35107450  T
Q  204 cccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaac 300  Q
     || ||| | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| || || |||||   ||||||||||||| | |||||||||| | ||| |||    
T  35107451 -cctttgttatctcttttgtaatgttactcatcattatagtggaacggatggttgttctctttcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaac 35107549  T
Q  301 aaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||  |||||||||||    
T  35107550 aaatatttttgtgttct 35107566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Original strand, 39680028 - 39680228
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||   | ||| | ||||||| |    
T  39680028 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagattgattcttgaa 39680126  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| ||    
T  39680127 actcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaa 39680223  T
Q  300 caaat 304  Q
    |||||    
T  39680224 caaat 39680228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 5377711 - 5377629
Alignment:
Q  25 ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaag----ggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5377711 ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgag 5377629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 237
Target Start/End: Original strand, 43139432 - 43139564
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 204  Q
    |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| |||||||||||| |   ||||| ||| |||||||    
T  43139432 ttgattcatcttgggaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaac 43139531  T
Q  205 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcat 237  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43139532 cttttgatttctctttgtaaagttactcatcat 43139564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27136326 - 27136195
Alignment:
Q  103 gggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 201  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||   || ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  27136326 gggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaagaaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgt 27136227  T
Q  202 aacccattgatttctc-tttgtaacgttactc 232  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  27136226 aactcattgatatctcttttgtaaagttactc 27136195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 308
Target Start/End: Original strand, 30478977 - 30479182
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  30478977 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 30479075  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  30479076 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 30479172  T
Q  299 acaaattctt 308  Q
    ||||||||||    
T  30479173 acaaattctt 30479182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 278
Target Start/End: Original strand, 2740939 - 2741097
Alignment:
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||     ||||| ||||||| ||| |||   | ||||    
T  2740939 caaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttaaagactgattcttgaaactcat---tatctc 2741034  T
Q  218 tttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca 278  Q
    ||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  2741035 tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 2741097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22712715 - 22712637
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22712715 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22712637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22717424 - 22717346
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22717424 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22717346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Original strand, 45567392 - 45567470
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  45567392 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 45567470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20050221 - 20050005
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||| |||| || |||||||   | ||||| |||||||||    
T  20050221 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagaggctaggac-ttggatataattaggtttgaagactgattcttgta 20050123  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtc 297  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||   || |||||||||||||     
T  20050122 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctccccccagactaggtcatcattagaccgaactgggta 20050026  T
Q  298 aacaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    |||||||||  ||||||||||||    
T  20050025 aacaaattc--ttgtgttcttct 20050005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 248
Target Start/End: Original strand, 17932617 - 17932759
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  17932617 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 17932715  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 248  Q
    || ||   || ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||    
T  17932716 actca---atatctctttgtaaagaaactcatcattatagtggatcg 17932759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  91 actaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga 190  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  || |||||| |||||||||||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggaga 38414194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12781405 - 12781246
Alignment:
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | | ||| ||||||| ||| ||   || ||||    
T  12781405 caaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaaaactgattcttggaactca---atatctc 12781310  T
Q  218 tttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca 278  Q
    ||||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  12781309 tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 12781246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 14699036 - 14699100
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14699036 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14699100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 278
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921927
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgca-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | | |||||||||||||||||||     | ||| ||||||| |    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggttttaaaactgattcttgca 17921853  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca 278  Q
    |||| |||| |||| ||  ||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  17921854 accctttga-ttct-ttcataaagttagtcatcattatagtggaacggagggctgctctctac-ccagactaggtca 17921927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583483
Alignment:
Q  107 tgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 159  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 27583483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 28459028 - 28458949
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   || |||||||||||||||||||    
T  28459028 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 264
Target Start/End: Original strand, 33603977 - 33604139
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||| |  ||||||||| || |||||||||   | ||||| |||||| ||    
T  33603977 ttgattcaccttgaacaaaacactattataattgagtcttttggtcatgggaagtgattgagactttaggaagaattaggtttgaagactaattcttcta 33604076  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcc 264  Q
    |||  ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||    
T  33604077 accttttgatatatctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc 33604139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37170936 - 37170778
Alignment:
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||| ||   || ||||    
T  37170936 caaagcactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgatttttgtaactca---atatctc 37170841  T
Q  218 tttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca 278  Q
    ||||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  37170840 tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcc-ccagactaggtca 37170778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 169
Target Start/End: Original strand, 38190980 - 38191045
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactt 169  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  38190980 ttgattcaccttgaacaaaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 38191045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 181
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345738
Alignment:
Q  105 gttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gagactttgggtagaatta 181  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  | |||||||||||||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 308
Target Start/End: Original strand, 1345572 - 1345640
Alignment:
Q  240 agtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1345572 agtggatcggagaggtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatttctt 1345640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 8390179 - 8390243
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8390179 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaa 8390243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13569396 - 13569332
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13569396 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13569332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20522288 - 20522224
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20522288 atagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20522224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15539553 - 15539514
Alignment:
Q  278 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539553 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15539514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 302
Target Start/End: Original strand, 34682362 - 34682427
Alignment:
Q  237 tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  34682362 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 34682427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8040128 - 8040064
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  8040128 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 8040064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 10445473 - 10445537
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  10445473 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 10445537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 237
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694094
Alignment:
Q  105 gttgattcaccttgca-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-gctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 201  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||   || |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 15694057  T
Q  202 aacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 237  Q
    ||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  15694058 aaccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15694094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 17057413 - 17057369
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17057413 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 17085396 - 17085352
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17085396 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17085352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 28259206 - 28259270
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28259206 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 28259270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 237 - 304
Target Start/End: Original strand, 45679838 - 45679906
Alignment:
Q  237 tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  45679838 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 45679906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 181
Target Start/End: Original strand, 35028632 - 35028707
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta 181  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  35028632 ttgattcgcattggaaaacactattatgattgagtctcttgatcacgagaagagattgacactttgggtagaatta 35028707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 33674604 - 33674551
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 157  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33674604 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 33674551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 308
Target Start/End: Original strand, 2838076 - 2838129
Alignment:
Q  255 tgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
    |||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  2838076 tgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatttctt 2838129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 181
Target Start/End: Original strand, 7502991 - 7503052
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-gctgagactttgggtagaatta 181  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  7502991 aaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaatta 7503052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13828503 - 13828338
Alignment:
Q  144 ttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tata 240  Q
    ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| |   || |||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||  |||||||| | ||||    
T  13828503 ttggtcacgggaagagattcagactttgggtagaattatgtttgaagacttattcttgtagccctttgatatctcttttgtaaaattactcataattata 13828404  T
Q  241 gtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatt-tggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    ||||| | |   ||| |||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||    
T  13828403 gtggaacagttagctactctctcccctagactaggtcagttctggaccgaactggataaacaaatt 13828338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 33671033 - 33670992
Alignment:
Q  237 tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca 278  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  33671033 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 33670992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 723788 - 723744
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  723788 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 723744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10942695 - 10942497
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   | | ||||||||||||||||| |   || || | ||||||||||||| ||    || ||    
T  10942695 aaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaattatgtttgaggattgattcttgtaacccttttgaatc-ct 10942597  T
Q  219 ttgtaacgttactcatca--tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    ||||||  ||||||||||  ||||||||| || || |||| | ||||| | ||| ||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  10942596 ttgtaaaattactcatcaattatagtggaacgaagagctggtgtctcccctagagtaggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaattctcttgtgtt 10942497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10948564 - 10948366
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   | | ||||||||||||||||| |   || || | ||||||||||||| ||    || ||    
T  10948564 aaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaattatgtttgaggattgattcttgtaacccttttgaatc-ct 10948466  T
Q  219 ttgtaacgttactcatca--tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    ||||||  ||||||||||  ||||||||| || || |||| | ||||| | ||| ||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  10948465 ttgtaaaattactcatcaattatagtggaacgaagagctggtgtctcccctagagtaggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaattctcttgtgtt 10948366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 17865271 - 17865207
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  17865271 atagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaa 17865207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21630011 - 21629948
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  21630011 atagtggattggagagctgctctctcc-ccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 21629948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 33118204 - 33118140
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  33118204 atagtggattggagggctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagccaacaa 33118140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 34139814 - 34139770
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34139814 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 34139770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 34388926 - 34388862
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  34388926 atagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 34388862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 39284960 - 39285004
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39284960 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 39285004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 39482999 - 39482935
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  39482999 atagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 39482935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 11151634 - 11151591
Alignment:
Q  259 ctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11151634 ctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 11151591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 10707281 - 10707345
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| | || ||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10707281 atagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10707345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 11067429 - 11067473
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11067429 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactcggtcaacaa 11067473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 14633869 - 14633825
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14633869 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaa 14633825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 16940238 - 16940302
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| || ||||  |||||||||| |||||||||||    
T  16940238 atagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaa 16940302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 17010903 - 17010967
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| || ||||  |||||||||| |||||||||||    
T  17010903 atagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaa 17010967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 25398563 - 25398500
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||| | |||||||||||||||    
T  25398563 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgg-ctgaactgggtcaacaa 25398500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 33528650 - 33528714
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||   ||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33528650 atagtggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 33528714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 35446929 - 35446885
Alignment:
Q  257 ctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 301  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  35446929 ctctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 35446885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 36773686 - 36773730
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36773686 tctctcccccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36773730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 308
Target Start/End: Original strand, 38191128 - 38191200
Alignment:
Q  237 tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
    ||||||||| || || |||||||||||| | |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  38191128 tatagtggaacgaagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 38191200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 38312364 - 38312408
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38312364 tctctcccccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 38312408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 22 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 41768 - 41456
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  41768 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 41669  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41668 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 41569  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41568 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 41469  T
Q  317 ttctcttctttgt 329  Q
    |||||||||||||    
T  41468 ttctcttctttgt 41456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 79188 - 79497
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  79188 gggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcacctt 79287  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79288 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 79387  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  79388 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgttc 79487  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  79488 -tctcttcttt 79497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 2883 - 3203
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  2883 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 2982  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2983 ggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggcttggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 3082  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  3083 tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctatctccccgagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatattttgtgttct 3182  T
Q  318 tctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||||| ||| ||||    
T  3183 tctcttctttgtgttcttctc 3203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 183926 - 183605
Alignment:
Q  21 agggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacct 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  183926 agggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 183827  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183826 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 183728  T
Q  217 cttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 315  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183727 cttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 183628  T
Q  316 cttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||||||||||| ||| ||||    
T  183627 cttctcttctttgtgttcttctc 183605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Original strand, 52014 - 52324
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  52014 gggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcacctt 52113  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  52114 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctc 52213  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg--ctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 314  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  52214 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattc--ttgtgt 52311  T
Q  315 tcttctcttcttt 327  Q
    |||||||||||||    
T  52312 tcttctcttcttt 52324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 327
Target Start/End: Original strand, 50235 - 50325
Alignment:
Q  237 tatagtggatcggagggctgctctctc--caccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  50235 tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaacaaattc--ttgtgttcttctcttcttt 50325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 82 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1426
Alignment:
Q  82 ggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta 181  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 1574  T
Q  182 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1573 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatt 1474  T
Q  282 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1473 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgt 1426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 3)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 26 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 14663 - 14376
Alignment:
Q  26 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaa 121  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  14663 tgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 14564  T
Q  122 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  14563 aacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 14464  T
Q  221 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14463 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 14376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 308
Target Start/End: Original strand, 15022 - 15313
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15022 gggctgaaacaatgatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcacctt 15121  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15122 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattcagactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 15221  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15222 ttttgtaaagttactcatcatatagtggaacggaaggctgctgtctcccccatgctaggtcaatttggaccgaactgactcaacaaattctt 15313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 148
Target Start/End: Original strand, 31124 - 31168
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggt 148  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31124 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggt 31168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 4000 - 4304
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  4000 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatctt 4098  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4099 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 4198  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4199 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttc 4297  T
Q  317 ttctctt 323  Q
    |||||||    
T  4298 ttctctt 4304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 29174 - 29494
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  29174 gggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgcctt 29273  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29274 gggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctc 29373  T
Q  218 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 317  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29374 tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttct 29473  T
Q  318 tctcttctttgtattcatctc 338  Q
    |||||| ||||| ||| ||||    
T  29474 tctcttttttgtgttcttctc 29494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Original strand, 44 - 348
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  44 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 143  T
Q  118 gcaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  144 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatttct 243  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  244 ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 343  T
Q  317 ttctc 321  Q
    |||||    
T  344 ttctc 348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Original strand, 6202 - 6505
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6202 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 6301  T
Q  118 gcaaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6302 gggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttct 6401  T
Q  217 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  6402 ctttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgagtcaacaaatttctttgtgttc 6501  T
Q  317 ttct 320  Q
    ||||    
T  6502 ttct 6505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11758 - 11449
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  11758 gggctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttcctt 11659  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11658 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctc 11559  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11558 ttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttc 11459  T
Q  317 ttctcttcttt 327  Q
     ||||||||||    
T  11458 -tctcttcttt 11449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 79862 - 80158
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttgg-aacaaacactaggttttgagggttgattcacct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  79862 gggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcacct 79961  T
Q  117 tgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 216  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||    
T  79962 tgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaga-ttaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatct 80060  T
Q  217 cttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 313  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  80061 cttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaaattcttttgtg 80158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 188441 - 188363
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 183  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  188441 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 188363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 264
Target Start/End: Original strand, 2045 - 2291
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  2045 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcacctt 2143  T
Q  118 gcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2144 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttctc 2243  T
Q  218 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 264  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2244 ttttgtaacgttcctcatcatatagtgaatcggagggctactctctcc 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 327
Target Start/End: Original strand, 85238 - 85543
Alignment:
Q  27 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaa 122  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  85238 gaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaa 85337  T
Q  123 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-g 221  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  85338 acactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtgactttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcg 85437  T
Q  222 taacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  85438 taaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttgaactgaaccaggtaaacaaattcttttgtgttc-tct 85536  T
Q  321 cttcttt 327  Q
    |||||||    
T  85537 cttcttt 85543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 22222 - 22421
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22222 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctctt 22320  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22321 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttc 22420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 24497 - 24696
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24497 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctctt 24595  T
Q  220 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24596 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttc 24695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 8448 - 8512
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8448 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 195
Target Start/End: Original strand, 35644 - 35819
Alignment:
Q  24 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |     
T  35644 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagg 35743  T
Q  120 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 195  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35744 gaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 327
Target Start/End: Original strand, 35817 - 35906
Alignment:
Q  237 tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttt 327  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  35817 tatagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattattttgtgttc-tctcttcttt 35906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 56 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16066 - 15817
Alignment:
Q  56 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 155  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  | ||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16066 agggtttgtatagagtttgctccta-gcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggga 15970  T
Q  156 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggg 253  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||     
T  15969 agagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggagga 15870  T
Q  254 ctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
    ||||||||| | || |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  15869 ctgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaatt 15817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 104 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1842 - 1638
Alignment:
Q  104 ggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 203  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1842 ggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaa 1743  T
Q  204 cccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 300  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||||| |||    
T  1742 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatactaggtcagtttttgaccgaactgggtaaac 1643  T
Q  301 aaatt 305  Q
    |||||    
T  1642 aaatt 1638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 56 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16895 - 16646
Alignment:
Q  56 agggtttgtatagagtttgtttctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgcaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 155  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| || |  | ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16895 agggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacggga 16799  T
Q  156 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggg 253  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  |  ||||    
T  16798 agagattgagactttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgggacaaaggg 16699  T
Q  254 ctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 305  Q
     |  ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16698 tttatctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 16646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 296
Target Start/End: Original strand, 4916 - 5095
Alignment:
Q  121 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--t 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  |||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |    
T  4916 aaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttt 5015  T
Q  219 ttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggt 296  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||| |  ||  ||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  5016 ttgtaaagatactcatcattatagtggaacatagaactgctctctgccccagactaggtcagtattggaccgaattgggt 5095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1116 - 993
Alignment:
Q  22 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaa----agggtttgtatagagtttgtttc-----tttggaacaaacactaggttttgagggttgattc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||     |||||||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  1116 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagtttggaacaaacactacgtttggagggttgatcc 1017  T
Q  113 accttgcaaaacactattaggatt 136  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||    
T  1016 accttgcgaaatacttttaggatt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 4733 - 4661
Alignment:
Q  248 ggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  4733 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgttgttct 4661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 268 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1415
Alignment:
Q  268 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtattcatctc 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||    
T  1485 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtccttttcttctttgtgttcttctc 1415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 5)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 264
Target Start/End: Original strand, 224802 - 224961
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  224802 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 224900  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctcc 264  Q
    || |||   | ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  224901 actcat---tatctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcc 224961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 5751 - 5687
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5751 atagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 2560 - 2496
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  2560 atagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaa 2496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 133309 - 133373
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  133309 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaa 133373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 149141 - 149097
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  149141 tctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 149097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Original strand, 16308 - 16509
Alignment:
Q  106 ttgattcaccttg--caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 202  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  16308 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgga 16406  T
Q  203 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 298  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |    
T  16407 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaa 16503  T
Q  299 acaaat 304  Q
    ||||||    
T  16504 acaaat 16509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 17170 - 16980
Alignment:
Q  119 caaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| |||  |||    ||||    
T  17170 caaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaagctaggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaacttatta---tctc 17075  T
Q  218 tttgtaacgttactcat--cat-atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 308  Q
    ||||||| |  ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  17074 tttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 16980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 57614 - 57452
Alignment:
Q  120 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctc 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||  | | |||||||||| ||||||||   || ||  |||||||||||||| ||||| |||     
T  57614 aaaacactattaggattgaatctcttggtcattggaagagattcgggactttgggtggaattaggtttgaagatctattcttgtaaccctttgatatcta 57515  T
Q  218 ttt-gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca 278  Q
    ||| |||| ||||||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  57514 ttttgtaaagttactcattaatataatggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 57452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 237 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3136 - 3068
Alignment:
Q  237 tatagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  3136 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 3068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 43990 - 44054
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  43990 atagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 44054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10796 - 10736
Alignment:
Q  239 tagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 299  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||  |||||||||||||||||||    
T  10796 tagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 10736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 45321 - 45257
Alignment:
Q  238 atagtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  45321 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactgagtcaacaa 45257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20459 - 20415
Alignment:
Q  258 tctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20459 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 20415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 85748 - 85687
Alignment:
Q  241 gtggatcggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 302  Q
    |||||| |||| || ||||||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  85748 gtggattggagagccgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 85687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University