View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11980_low_12 (Length: 603)

Name: NF11980_low_12
Description: NF11980
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11980_low_12
NF11980_low_12
[»] chr8 (153 HSPs)
chr8 (17-537)||(36777983-36778503)
chr8 (17-537)||(9473626-9474146)
chr8 (17-534)||(7390824-7391345)
chr8 (17-537)||(40586461-40586980)
chr8 (17-537)||(41158149-41158667)
chr8 (17-537)||(25345498-25346019)
chr8 (21-525)||(8762531-8763032)
chr8 (21-534)||(4464376-4464889)
chr8 (21-537)||(44380735-44381251)
chr8 (59-537)||(25618560-25619037)
chr8 (21-525)||(1944706-1945207)
chr8 (21-525)||(25834020-25834521)
chr8 (22-537)||(41531793-41532300)
chr8 (17-537)||(41978348-41978882)
chr8 (21-525)||(8160442-8160941)
chr8 (19-414)||(42244356-42244751)
chr8 (17-416)||(24055464-24055864)
chr8 (21-525)||(32846727-32847216)
chr8 (17-360)||(18375576-18375919)
chr8 (17-380)||(25361175-25361538)
chr8 (202-537)||(4465288-4465637)
chr8 (202-537)||(12760993-12761342)
chr8 (202-537)||(36777344-36777693)
chr8 (202-537)||(7390073-7390422)
chr8 (202-537)||(8162078-8162427)
chr8 (202-537)||(8761137-8761486)
chr8 (202-537)||(25835566-25835915)
chr8 (195-537)||(32845965-32846321)
chr8 (202-537)||(1943202-1943551)
chr8 (202-533)||(8161335-8161680)
chr8 (202-537)||(41532650-41532999)
chr8 (202-537)||(32844587-32844937)
chr8 (202-533)||(1943949-1944294)
chr8 (202-533)||(8761773-8762118)
chr8 (202-537)||(9472989-9473337)
chr8 (202-533)||(25834934-25835279)
chr8 (202-525)||(44381603-44381938)
chr8 (202-533)||(32845336-32845681)
chr8 (202-537)||(41157416-41157754)
chr8 (208-537)||(25619604-25619946)
chr8 (315-537)||(25346445-25346667)
chr8 (371-537)||(25345387-25345553)
chr8 (371-537)||(34893746-34893912)
chr8 (371-534)||(44381196-44381359)
chr8 (371-537)||(36777233-36777399)
chr8 (371-537)||(25618982-25619146)
chr8 (371-537)||(7390710-7390876)
chr8 (371-537)||(34893635-34893801)
chr8 (371-528)||(9473525-9473681)
chr8 (371-537)||(4464837-4465003)
chr8 (371-537)||(8161629-8161795)
chr8 (371-537)||(25615507-25615673)
chr8 (371-537)||(1943834-1944000)
chr8 (371-528)||(8762301-8762457)
chr8 (371-528)||(25834595-25834751)
chr8 (371-528)||(32846497-32846653)
chr8 (371-537)||(24250601-24250767)
chr8 (371-537)||(32845221-32845387)
chr8 (371-528)||(1944477-1944633)
chr8 (371-528)||(8161015-8161171)
chr8 (371-528)||(36777881-36778038)
chr8 (371-537)||(41158038-41158204)
chr8 (371-528)||(24254641-24254798)
chr8 (374-537)||(8762402-8762571)
chr8 (374-537)||(25834481-25834650)
chr8 (371-528)||(8161740-8161895)
chr8 (371-528)||(4465582-4465738)
chr8 (371-528)||(25615618-25615774)
chr8 (371-528)||(41157315-41157471)
chr8 (374-537)||(8160901-8161070)
chr8 (371-528)||(1943734-1943889)
chr8 (188-370)||(34894080-34894262)
chr8 (371-528)||(12760892-12761048)
chr8 (374-537)||(1944578-1944746)
chr8 (374-537)||(32846598-32846767)
chr8 (371-537)||(34893857-34894028)
chr8 (371-528)||(32845121-32845276)
chr8 (374-511)||(7389989-7390125)
chr8 (371-528)||(12761525-12761681)
chr8 (371-528)||(25619254-25619410)
chr8 (371-528)||(41532944-41533100)
chr8 (372-515)||(25345299-25345441)
chr8 (371-501)||(24250712-24250842)
chr8 (371-528)||(1943101-1943257)
chr8 (371-528)||(8162372-8162528)
chr8 (371-528)||(8761036-8761192)
chr8 (371-528)||(25835860-25836016)
chr8 (377-528)||(4464954-4465104)
chr8 (414-537)||(24254573-24254696)
chr8 (371-528)||(32844486-32844642)
chr8 (371-528)||(41157937-41158093)
chr8 (371-528)||(41978247-41978403)
chr8 (398-537)||(25615423-25615562)
chr8 (371-528)||(8761669-8761824)
chr8 (371-528)||(25835228-25835383)
chr8 (371-537)||(34893527-34893690)
chr8 (371-513)||(7390624-7390765)
chr8 (371-528)||(32845864-32846020)
chr8 (380-528)||(41532320-41532467)
chr8 (371-528)||(25619891-25620047)
chr8 (371-499)||(25619091-25619218)
chr8 (371-461)||(40586925-40587015)
chr8 (422-539)||(24250541-24250658)
chr8 (188-300)||(37588310-37588422)
chr8 (369-515)||(44381893-44382028)
chr8 (193-359)||(38295306-38295465)
chr8 (371-461)||(9472954-9473044)
chr8 (451-537)||(25619223-25619309)
chr8 (188-291)||(34894564-34894667)
chr8 (371-457)||(44381307-44381393)
chr8 (277-370)||(34894267-34894359)
chr8 (452-537)||(12761626-12761713)
chr8 (371-467)||(25346404-25346500)
chr8 (406-525)||(24250885-24251003)
chr8 (371-461)||(36777198-36777288)
chr8 (371-500)||(34893454-34893582)
chr8 (375-447)||(41532249-41532321)
chr8 (197-285)||(34894843-34894931)
chr8 (193-285)||(37588144-37588236)
chr8 (454-523)||(34893987-34894056)
chr8 (195-285)||(44428425-44428513)
chr8 (193-295)||(37588040-37588142)
chr8 (482-527)||(24055464-24055509)
chr8 (317-370)||(44428529-44428582)
chr8 (482-537)||(1944056-1944111)
chr8 (482-537)||(8161518-8161573)
chr8 (482-537)||(8761880-8761935)
chr8 (482-537)||(25835117-25835172)
chr8 (482-537)||(32845443-32845498)
chr8 (482-525)||(42244708-42244751)
chr8 (372-417)||(24250409-24250454)
chr8 (483-528)||(24250409-24250454)
chr8 (482-537)||(4464727-4464782)
chr8 (552-599)||(19959414-19959461)
chr8 (17-70)||(2680363-2680416)
chr8 (439-500)||(24250824-24250885)
chr8 (193-266)||(37587961-37588034)
chr8 (193-286)||(44428771-44428864)
chr8 (552-588)||(408842-408878)
chr8 (552-584)||(22731440-22731472)
chr8 (405-457)||(24250375-24250427)
chr8 (293-349)||(34894680-34894736)
chr8 (188-232)||(37588478-37588522)
chr8 (373-417)||(44381376-44381420)
chr8 (484-528)||(44381376-44381420)
chr8 (482-537)||(7390932-7390987)
chr8 (552-599)||(18488686-18488733)
chr8 (302-349)||(34894771-34894818)
chr8 (371-417)||(4465058-4465104)
chr8 (302-356)||(37588260-37588313)
chr8 (371-417)||(41532421-41532467)
chr8 (371-405)||(44381995-44382029)
chr8 (318-360)||(44428940-44428982)
[»] chr1 (138 HSPs)
chr1 (21-537)||(19320443-19320959)
chr1 (17-537)||(47137361-47137882)
chr1 (17-537)||(38896318-38896838)
chr1 (17-537)||(46623395-46623922)
chr1 (37-537)||(50562975-50563475)
chr1 (17-498)||(4893508-4893991)
chr1 (21-528)||(1375497-1376001)
chr1 (17-498)||(29184496-29184979)
chr1 (18-534)||(5427822-5428341)
chr1 (21-528)||(33074254-33074758)
chr1 (17-498)||(33363111-33363595)
chr1 (67-537)||(51964532-51965001)
chr1 (22-533)||(1827950-1828456)
chr1 (21-525)||(28572664-28573179)
chr1 (164-537)||(52311729-52312099)
chr1 (202-537)||(5427086-5427421)
chr1 (202-537)||(38895578-38895913)
chr1 (21-457)||(16301711-16302166)
chr1 (202-537)||(19321243-19321592)
chr1 (21-356)||(22194490-22194824)
chr1 (202-537)||(50562158-50562507)
chr1 (202-533)||(28571906-28572251)
chr1 (202-537)||(4892194-4892543)
chr1 (202-537)||(28571159-28571508)
chr1 (202-537)||(29185944-29186293)
chr1 (221-537)||(49586666-49586979)
chr1 (202-537)||(33361797-33362146)
chr1 (202-528)||(16301052-16301391)
chr1 (202-505)||(46624310-46624603)
chr1 (202-537)||(33074940-33075289)
chr1 (202-537)||(52310944-52311287)
chr1 (202-537)||(22198189-22198538)
chr1 (21-305)||(24289223-24289522)
chr1 (371-537)||(47137250-47137416)
chr1 (202-360)||(47136809-47136967)
chr1 (371-537)||(28571791-28571957)
chr1 (371-537)||(38896207-38896373)
chr1 (371-537)||(50562864-50563030)
chr1 (371-528)||(19320904-19321060)
chr1 (371-537)||(5427708-5427874)
chr1 (371-537)||(46623867-46624032)
chr1 (387-537)||(52311571-52311721)
chr1 (371-528)||(28572434-28572590)
chr1 (386-537)||(46625850-46626001)
chr1 (371-528)||(38896106-38896262)
chr1 (21-178)||(49586978-49587135)
chr1 (202-403)||(1827338-1827553)
chr1 (371-528)||(47137149-47137305)
chr1 (371-537)||(32575725-32575892)
chr1 (374-528)||(4892093-4892246)
chr1 (374-528)||(29186241-29186394)
chr1 (371-528)||(33075234-33075390)
chr1 (374-537)||(28572535-28572704)
chr1 (371-528)||(28571691-28571846)
chr1 (374-528)||(33361696-33361849)
chr1 (371-528)||(5426985-5427141)
chr1 (371-528)||(50562057-50562213)
chr1 (373-528)||(45914377-45914532)
chr1 (378-528)||(4892726-4892875)
chr1 (378-528)||(29185612-29185761)
chr1 (370-528)||(1827736-1827895)
chr1 (371-537)||(1827839-1828000)
chr1 (371-528)||(22198483-22198639)
chr1 (371-528)||(49586565-49586721)
chr1 (371-528)||(52311470-52311626)
chr1 (378-528)||(33362329-33362478)
chr1 (371-529)||(32575620-32575780)
chr1 (372-528)||(16301574-16301729)
chr1 (371-502)||(50562789-50562919)
chr1 (193-370)||(21056084-21056254)
chr1 (371-528)||(28571058-28571214)
chr1 (371-528)||(51964946-51965101)
chr1 (193-370)||(20130618-20130788)
chr1 (371-515)||(52310857-52310999)
chr1 (372-528)||(5427607-5427762)
chr1 (409-537)||(45914479-45914607)
chr1 (399-528)||(28947319-28947446)
chr1 (244-370)||(33373539-33373665)
chr1 (371-528)||(46623977-46624122)
chr1 (17-109)||(10763519-10763611)
chr1 (17-109)||(29840708-29840800)
chr1 (371-461)||(38895543-38895633)
chr1 (411-527)||(28949391-28949505)
chr1 (371-461)||(19321537-19321627)
chr1 (269-370)||(28950633-28950734)
chr1 (17-109)||(42682522-42682615)
chr1 (371-461)||(46625946-46626036)
chr1 (193-370)||(8256444-8256628)
chr1 (451-528)||(43991428-43991504)
chr1 (372-432)||(52311723-52311783)
chr1 (190-266)||(35593623-35593699)
chr1 (482-537)||(4893581-4893636)
chr1 (482-537)||(33363184-33363239)
chr1 (455-521)||(50278094-50278160)
chr1 (455-521)||(50289762-50289828)
chr1 (440-528)||(1827110-1827197)
chr1 (430-502)||(28948107-28948178)
chr1 (208-300)||(35599340-35599432)
chr1 (482-537)||(29184851-29184906)
chr1 (208-337)||(35598749-35598872)
chr1 (318-367)||(33375357-33375406)
chr1 (489-537)||(4892827-4892875)
chr1 (369-417)||(28947319-28947367)
chr1 (489-537)||(29185612-29185660)
chr1 (489-537)||(33362430-33362478)
chr1 (482-537)||(28572013-28572068)
chr1 (371-417)||(16301574-16301620)
chr1 (483-537)||(16301675-16301729)
chr1 (455-527)||(32575847-32575920)
chr1 (552-588)||(48959686-48959722)
chr1 (202-242)||(50278385-50278425)
chr1 (482-537)||(5427929-5427984)
chr1 (552-599)||(13927866-13927913)
chr1 (482-537)||(16301153-16301208)
chr1 (552-599)||(23694406-23694453)
chr1 (303-370)||(35593536-35593602)
chr1 (371-417)||(4892093-4892139)
chr1 (371-417)||(4892726-4892772)
chr1 (371-417)||(29185715-29185761)
chr1 (371-417)||(29186348-29186394)
chr1 (371-417)||(33361696-33361742)
chr1 (371-417)||(33362329-33362375)
chr1 (371-417)||(43991458-43991504)
chr1 (371-417)||(45914377-45914423)
chr1 (371-416)||(28949391-28949436)
chr1 (552-588)||(2050522-2050558)
chr1 (552-588)||(7477467-7477503)
chr1 (552-588)||(36869781-36869817)
chr1 (552-588)||(45505626-45505662)
chr1 (552-588)||(49790295-49790331)
chr1 (371-411)||(52310850-52310890)
chr1 (482-537)||(16301742-16301797)
chr1 (371-417)||(5427607-5427653)
chr1 (376-417)||(22197966-22198007)
chr1 (487-528)||(22197966-22198007)
chr1 (17-50)||(29693378-29693411)
chr1 (482-514)||(1827338-1827370)
chr1 (334-370)||(35598892-35598928)
[»] chr7 (139 HSPs)
chr7 (28-537)||(35155518-35156027)
chr7 (17-528)||(9150932-9151442)
chr7 (17-537)||(44806082-44806601)
chr7 (17-537)||(27732971-27733492)
chr7 (18-537)||(48527431-48527950)
chr7 (31-525)||(34873335-34873829)
chr7 (17-537)||(31896832-31897348)
chr7 (17-525)||(7854984-7855490)
chr7 (17-537)||(39648000-39648507)
chr7 (21-528)||(29468733-29469237)
chr7 (17-498)||(17172434-17172917)
chr7 (17-537)||(690782-691312)
chr7 (48-537)||(4849952-4850440)
chr7 (21-537)||(49144055-49144572)
chr7 (21-525)||(24682300-24682815)
chr7 (17-414)||(21669250-21669647)
chr7 (202-537)||(34872581-34872916)
chr7 (17-414)||(39277876-39278261)
chr7 (202-537)||(49145096-49145448)
chr7 (202-537)||(39648791-39649140)
chr7 (195-537)||(44805333-44805689)
chr7 (202-537)||(4849207-4849556)
chr7 (202-537)||(7855908-7856257)
chr7 (17-490)||(11834975-11835473)
chr7 (202-537)||(17171120-17171469)
chr7 (202-537)||(31897632-31897981)
chr7 (219-537)||(35156333-35156665)
chr7 (202-537)||(24683957-24684306)
chr7 (202-537)||(27733887-27734208)
chr7 (202-537)||(29468202-29468551)
chr7 (202-528)||(33637591-33637931)
chr7 (269-533)||(24683295-24683559)
chr7 (371-537)||(49144517-49144683)
chr7 (371-537)||(4849841-4850007)
chr7 (371-537)||(27733437-27733603)
chr7 (371-537)||(33637142-33637308)
chr7 (371-528)||(36158310-36158467)
chr7 (49-337)||(21598003-21598306)
chr7 (371-537)||(24683508-24683674)
chr7 (371-537)||(44805971-44806137)
chr7 (371-528)||(34873104-34873260)
chr7 (371-537)||(34873205-34873378)
chr7 (371-533)||(40106992-40107154)
chr7 (371-528)||(7855565-7855721)
chr7 (371-528)||(33637253-33637409)
chr7 (371-537)||(690674-690837)
chr7 (371-528)||(21670280-21670437)
chr7 (371-528)||(24682888-24683044)
chr7 (373-528)||(39277044-39277199)
chr7 (371-537)||(20073757-20073928)
chr7 (371-528)||(27733548-27733704)
chr7 (371-528)||(35155972-35156128)
chr7 (371-520)||(44805878-44806026)
chr7 (371-515)||(39649085-39649228)
chr7 (372-528)||(40107324-40107478)
chr7 (371-537)||(7855447-7855620)
chr7 (371-528)||(690572-690729)
chr7 (374-528)||(17171019-17171172)
chr7 (371-528)||(24683619-24683774)
chr7 (374-528)||(31897929-31898082)
chr7 (371-528)||(39648452-39648608)
chr7 (371-528)||(48527895-48528051)
chr7 (371-515)||(9150344-9150487)
chr7 (375-537)||(40107217-40107377)
chr7 (371-528)||(31897293-31897449)
chr7 (374-537)||(24682775-24682943)
chr7 (378-528)||(17171652-17171801)
chr7 (412-537)||(21670210-21670335)
chr7 (371-528)||(29468101-29468257)
chr7 (371-528)||(49144628-49144784)
chr7 (399-533)||(9150436-9150570)
chr7 (371-528)||(4849106-4849262)
chr7 (371-528)||(4849740-4849896)
chr7 (371-528)||(27734153-27734308)
chr7 (371-515)||(36158165-36158310)
chr7 (371-537)||(40107103-40107268)
chr7 (371-528)||(49145393-49145549)
chr7 (202-370)||(9150567-9150748)
chr7 (406-537)||(33637066-33637197)
chr7 (371-537)||(40106886-40107047)
chr7 (371-496)||(20073873-20073998)
chr7 (371-528)||(24684251-24684407)
chr7 (40-199)||(33636917-33637075)
chr7 (406-523)||(20073681-20073798)
chr7 (406-528)||(24396809-24396930)
chr7 (371-461)||(35156610-35156700)
chr7 (371-486)||(32200481-32200596)
chr7 (371-461)||(34872546-34872636)
chr7 (371-461)||(44805298-44805388)
chr7 (21-109)||(3795643-3795731)
chr7 (371-461)||(7856202-7856292)
chr7 (446-537)||(32200445-32200536)
chr7 (371-486)||(32200671-32200786)
chr7 (202-285)||(49144968-49145051)
chr7 (451-532)||(32200640-32200721)
chr7 (452-537)||(32200831-32200916)
chr7 (371-486)||(32200257-32200372)
chr7 (371-486)||(32200861-32200976)
chr7 (451-537)||(32200226-32200312)
chr7 (441-515)||(36158124-36158198)
chr7 (446-528)||(32201027-32201109)
chr7 (216-370)||(34989411-34989555)
chr7 (436-505)||(29322206-29322275)
chr7 (482-537)||(9151033-9151088)
chr7 (482-537)||(17172507-17172562)
chr7 (482-537)||(36158310-36158365)
chr7 (484-537)||(39277146-39277199)
chr7 (482-537)||(34873434-34873489)
chr7 (489-537)||(17171753-17171801)
chr7 (369-417)||(31897401-31897449)
chr7 (475-535)||(40106879-40106939)
chr7 (482-537)||(7855336-7855391)
chr7 (482-525)||(11835347-11835390)
chr7 (482-537)||(24683397-24683452)
chr7 (552-599)||(45114026-45114073)
chr7 (371-417)||(24396809-24396855)
chr7 (552-588)||(5092529-5092565)
chr7 (193-241)||(32200990-32201038)
chr7 (552-588)||(32658283-32658319)
chr7 (482-537)||(33637774-33637829)
chr7 (371-417)||(17171019-17171065)
chr7 (371-417)||(17171652-17171698)
chr7 (553-599)||(26163255-26163301)
chr7 (371-417)||(31898036-31898082)
chr7 (316-370)||(35100994-35101048)
chr7 (371-417)||(40107432-40107478)
chr7 (193-242)||(32200184-32200233)
chr7 (193-242)||(32200408-32200457)
chr7 (552-588)||(3065795-3065831)
chr7 (552-588)||(7885821-7885857)
chr7 (552-588)||(17694133-17694169)
chr7 (485-525)||(21669607-21669647)
chr7 (202-242)||(32200797-32200837)
chr7 (485-525)||(39277876-39277916)
chr7 (371-411)||(39649195-39649235)
chr7 (371-406)||(9150342-9150377)
chr7 (202-285)||(19327248-19327330)
chr7 (375-417)||(32201067-32201109)
chr7 (385-417)||(20077411-20077443)
[»] chr4 (220 HSPs)
chr4 (29-537)||(13172452-13172960)
chr4 (19-537)||(36741820-36742337)
chr4 (21-537)||(37356504-37357019)
chr4 (17-537)||(39713514-39714035)
chr4 (17-525)||(24548938-24549446)
chr4 (18-537)||(17741166-17741685)
chr4 (17-537)||(3758776-3759303)
chr4 (17-525)||(12680648-12681161)
chr4 (28-537)||(47555456-47555962)
chr4 (21-525)||(8988719-8989220)
chr4 (17-534)||(2117699-2118214)
chr4 (21-525)||(37351619-37352120)
chr4 (17-537)||(46105926-46106449)
chr4 (22-498)||(52802474-52802952)
chr4 (17-537)||(39404610-39405141)
chr4 (21-533)||(9887293-9887818)
chr4 (21-528)||(29713340-29713843)
chr4 (85-536)||(50118154-50118605)
chr4 (17-534)||(8531712-8532247)
chr4 (18-537)||(43023525-43024052)
chr4 (33-528)||(24944166-24944674)
chr4 (17-390)||(20590653-20591027)
chr4 (31-395)||(50042983-50043346)
chr4 (202-537)||(39405538-39405873)
chr4 (202-537)||(20589822-20590171)
chr4 (21-365)||(8964510-8964853)
chr4 (184-537)||(5755092-5755454)
chr4 (202-537)||(24548173-24548522)
chr4 (202-537)||(46105025-46105374)
chr4 (202-537)||(2116950-2117299)
chr4 (202-537)||(50118895-50119244)
chr4 (202-537)||(8987325-8987674)
chr4 (202-537)||(24947573-24947922)
chr4 (202-537)||(9888216-9888565)
chr4 (202-537)||(37350225-37350574)
chr4 (202-537)||(52801118-52801467)
chr4 (202-537)||(29712823-29713158)
chr4 (202-537)||(47556246-47556593)
chr4 (202-537)||(3758138-3758487)
chr4 (202-533)||(8987961-8988306)
chr4 (202-533)||(37350861-37351206)
chr4 (202-537)||(39714364-39714712)
chr4 (202-528)||(43022796-43023128)
chr4 (17-264)||(30527606-30527853)
chr4 (21-247)||(16652988-16653214)
chr4 (371-537)||(5754981-5755147)
chr4 (371-537)||(37356393-37356559)
chr4 (371-537)||(36742282-36742448)
chr4 (371-537)||(39405086-39405252)
chr4 (371-537)||(46105815-46105981)
chr4 (202-390)||(43022423-43022612)
chr4 (385-537)||(48808767-48808919)
chr4 (193-370)||(37061526-37061703)
chr4 (369-540)||(42350109-42350280)
chr4 (371-537)||(9887767-9887933)
chr4 (371-537)||(12681118-12681286)
chr4 (371-528)||(8988489-8988645)
chr4 (371-537)||(2117584-2117751)
chr4 (371-537)||(20590455-20590628)
chr4 (371-528)||(5754879-5755036)
chr4 (371-537)||(9060878-9061044)
chr4 (190-360)||(37061735-37061905)
chr4 (371-528)||(37351389-37351545)
chr4 (188-364)||(42349529-42349705)
chr4 (374-537)||(42350003-42350166)
chr4 (371-537)||(43023414-43023579)
chr4 (374-528)||(52801017-52801170)
chr4 (371-528)||(2116849-2117005)
chr4 (371-528)||(17741065-17741221)
chr4 (371-528)||(20590354-20590510)
chr4 (371-528)||(50118551-50118707)
chr4 (374-537)||(8988590-8988759)
chr4 (371-537)||(49751972-49752138)
chr4 (371-537)||(49752083-49752249)
chr4 (371-528)||(24548708-24548863)
chr4 (371-528)||(39405197-39405353)
chr4 (371-528)||(43023313-43023469)
chr4 (371-528)||(46105714-46105870)
chr4 (371-528)||(48808864-48809020)
chr4 (374-537)||(37351490-37351659)
chr4 (373-537)||(49356133-49356297)
chr4 (371-537)||(9060989-9061149)
chr4 (371-537)||(24548809-24548981)
chr4 (371-537)||(42350465-42350636)
chr4 (193-370)||(26602642-26602813)
chr4 (374-528)||(39714660-39714813)
chr4 (371-536)||(49355914-49356077)
chr4 (371-528)||(3758675-3758831)
chr4 (371-515)||(39405818-39405960)
chr4 (371-528)||(39713980-39714136)
chr4 (371-528)||(47555907-47556063)
chr4 (17-188)||(5759194-5759365)
chr4 (371-506)||(23980036-23980171)
chr4 (371-506)||(49356242-49356377)
chr4 (371-528)||(9887878-9888033)
chr4 (371-528)||(8531608-8531764)
chr4 (371-528)||(37350124-37350280)
chr4 (371-528)||(47556538-47556694)
chr4 (202-359)||(24944857-24945028)
chr4 (377-528)||(2117483-2117633)
chr4 (371-537)||(42350581-42350747)
chr4 (378-528)||(52801650-52801799)
chr4 (371-528)||(8987224-8987380)
chr4 (371-512)||(22454015-22454156)
chr4 (371-528)||(29712722-29712878)
chr4 (371-528)||(42350692-42350849)
chr4 (193-368)||(46419557-46419745)
chr4 (371-534)||(49356023-49356183)
chr4 (371-514)||(9888510-9888652)
chr4 (418-537)||(12681852-12681971)
chr4 (406-537)||(42349924-42350055)
chr4 (406-537)||(48808677-48808808)
chr4 (371-513)||(12681231-12681372)
chr4 (371-481)||(37356338-37356448)
chr4 (371-528)||(49751020-49751178)
chr4 (371-528)||(24947867-24948023)
chr4 (18-143)||(51347964-51348089)
chr4 (371-511)||(12681916-12682055)
chr4 (409-537)||(23979963-23980091)
chr4 (371-525)||(42349770-42349925)
chr4 (389-528)||(50033979-50034117)
chr4 (371-528)||(8987857-8988012)
chr4 (371-528)||(37350757-37350912)
chr4 (371-537)||(49751861-49752027)
chr4 (193-370)||(54866762-54866933)
chr4 (371-528)||(43022242-43022398)
chr4 (371-528)||(46104924-46105080)
chr4 (193-370)||(26603397-26603582)
chr4 (406-536)||(49355840-49355968)
chr4 (390-537)||(49751534-49751681)
chr4 (371-537)||(49751314-49751478)
chr4 (371-537)||(49751751-49751916)
chr4 (371-484)||(2526685-2526798)
chr4 (409-526)||(2526799-2526916)
chr4 (392-528)||(9061115-9061249)
chr4 (406-533)||(9060801-9060929)
chr4 (439-537)||(43022343-43022441)
chr4 (371-537)||(49751424-49751589)
chr4 (371-537)||(49751645-49751806)
chr4 (371-523)||(42350351-42350506)
chr4 (17-109)||(35707676-35707769)
chr4 (371-486)||(49751253-49751369)
chr4 (21-109)||(53991300-53991388)
chr4 (439-537)||(20590566-20590671)
chr4 (269-372)||(42348269-42348372)
chr4 (371-461)||(3758103-3758193)
chr4 (371-461)||(13172417-13172507)
chr4 (371-461)||(20589787-20589877)
chr4 (371-461)||(24548138-24548228)
chr4 (371-461)||(36742393-36742483)
chr4 (17-109)||(574195-574288)
chr4 (269-370)||(42348549-42348652)
chr4 (193-370)||(49355253-49355443)
chr4 (407-534)||(23980321-23980447)
chr4 (418-528)||(46420258-46420367)
chr4 (428-537)||(49356378-49356494)
chr4 (451-537)||(49751123-49751209)
chr4 (371-461)||(50119189-50119279)
chr4 (371-501)||(49356432-49356572)
chr4 (196-291)||(42348106-42348201)
chr4 (202-345)||(16904665-16904822)
chr4 (193-291)||(42348387-42348485)
chr4 (405-512)||(9060686-9060789)
chr4 (409-523)||(42350278-42350392)
chr4 (452-525)||(49752447-49752520)
chr4 (371-525)||(49752329-49752490)
chr4 (406-501)||(46420155-46420249)
chr4 (193-284)||(48808234-48808325)
chr4 (385-486)||(49752565-49752666)
chr4 (441-513)||(22453941-22454013)
chr4 (454-537)||(42349742-42349826)
chr4 (466-537)||(2526669-2526740)
chr4 (193-266)||(8120421-8120494)
chr4 (472-537)||(49752194-49752259)
chr4 (451-532)||(49752630-49752711)
chr4 (482-537)||(43022897-43022952)
chr4 (482-537)||(52802547-52802602)
chr4 (482-537)||(22454015-22454070)
chr4 (482-537)||(24549037-24549092)
chr4 (371-417)||(9061203-9061249)
chr4 (193-285)||(48808351-48808443)
chr4 (482-537)||(8988068-8988123)
chr4 (482-537)||(9887656-9887711)
chr4 (552-599)||(16907178-16907225)
chr4 (552-599)||(21380847-21380894)
chr4 (552-599)||(29362198-29362245)
chr4 (482-537)||(37350968-37351023)
chr4 (376-442)||(23980400-23980466)
chr4 (371-417)||(39714767-39714813)
chr4 (17-70)||(5482895-5482948)
chr4 (552-588)||(28381754-28381790)
chr4 (552-588)||(30390037-30390073)
chr4 (552-588)||(42346731-42346767)
chr4 (369-417)||(49751020-49751068)
chr4 (489-537)||(52801751-52801799)
chr4 (482-537)||(2117804-2117859)
chr4 (193-279)||(1325554-1325640)
chr4 (202-272)||(8120225-8120295)
chr4 (483-537)||(50118441-50118495)
chr4 (371-417)||(52801017-52801063)
chr4 (371-417)||(52801650-52801696)
chr4 (371-415)||(2526872-2526916)
chr4 (552-584)||(8959859-8959891)
chr4 (552-588)||(14147168-14147204)
chr4 (552-588)||(21584462-21584498)
chr4 (193-273)||(23980173-23980253)
chr4 (191-273)||(24527565-24527648)
chr4 (17-116)||(36678856-36678954)
chr4 (371-417)||(2117483-2117529)
chr4 (202-272)||(8120129-8120199)
chr4 (193-279)||(24527973-24528059)
chr4 (379-417)||(49357544-49357582)
chr4 (490-528)||(49357544-49357582)
chr4 (17-106)||(1694717-1694805)
chr4 (202-247)||(24390058-24390103)
chr4 (193-242)||(49752396-49752445)
chr4 (409-445)||(2526625-2526661)
chr4 (219-279)||(24527911-24527971)
chr4 (492-528)||(24947354-24947390)
chr4 (385-417)||(46420335-46420367)
[»] chr5 (165 HSPs)
chr5 (28-537)||(33704785-33705294)
chr5 (17-537)||(25695557-25696077)
chr5 (21-525)||(17636708-17637212)
chr5 (17-525)||(36884799-36885305)
chr5 (17-498)||(34718998-34719481)
chr5 (28-537)||(42975419-42975935)
chr5 (17-534)||(34725277-34725795)
chr5 (18-537)||(30180927-30181433)
chr5 (17-498)||(41692682-41693165)
chr5 (21-525)||(43136296-43136798)
chr5 (17-537)||(3086451-3086961)
chr5 (21-537)||(752078-752612)
chr5 (38-537)||(2182344-2182857)
chr5 (202-537)||(42976224-42976559)
chr5 (202-537)||(30180183-30180532)
chr5 (202-533)||(12419383-12419727)
chr5 (202-537)||(6304743-6305092)
chr5 (202-533)||(753006-753351)
chr5 (202-537)||(3087359-3087708)
chr5 (202-537)||(753749-754098)
chr5 (202-537)||(25696358-25696707)
chr5 (202-537)||(34726200-34726549)
chr5 (202-537)||(43137843-43138192)
chr5 (202-537)||(33705578-33705925)
chr5 (202-537)||(34717684-34718033)
chr5 (202-533)||(43137211-43137556)
chr5 (202-537)||(41691370-41691717)
chr5 (292-537)||(30755243-30755488)
chr5 (269-533)||(6304080-6304344)
chr5 (202-523)||(2181618-2181952)
chr5 (338-537)||(36886005-36886204)
chr5 (202-458)||(42976846-42977116)
chr5 (202-537)||(26601488-26601841)
chr5 (202-461)||(17637631-17637903)
chr5 (371-537)||(12419067-12419233)
chr5 (371-537)||(30180816-30180982)
chr5 (374-537)||(2182233-2182396)
chr5 (221-461)||(36885738-36885992)
chr5 (371-527)||(6304293-6304449)
chr5 (371-537)||(753300-753466)
chr5 (371-537)||(34725743-34725909)
chr5 (371-528)||(18241901-18242058)
chr5 (371-537)||(17637169-17637342)
chr5 (371-528)||(17637287-17637443)
chr5 (375-528)||(42976508-42976660)
chr5 (371-537)||(18242003-18242169)
chr5 (371-537)||(42692464-42692629)
chr5 (371-528)||(752667-752823)
chr5 (376-525)||(26601036-26601185)
chr5 (371-528)||(43136872-43137028)
chr5 (371-537)||(3086899-3087072)
chr5 (371-522)||(3087017-3087167)
chr5 (371-528)||(25696022-25696178)
chr5 (371-528)||(36885380-36885536)
chr5 (371-515)||(30180095-30180238)
chr5 (374-528)||(34717583-34717736)
chr5 (371-528)||(30180715-30180871)
chr5 (371-528)||(33705239-33705395)
chr5 (371-528)||(34726494-34726650)
chr5 (371-528)||(42975880-42976036)
chr5 (374-537)||(752553-752722)
chr5 (371-523)||(19123714-19123865)
chr5 (374-537)||(43136758-43136927)
chr5 (371-522)||(25480933-25481084)
chr5 (374-528)||(25696655-25696809)
chr5 (374-513)||(41691284-41691422)
chr5 (371-528)||(753411-753566)
chr5 (371-537)||(18242114-18242279)
chr5 (193-370)||(38937343-38937514)
chr5 (371-528)||(6304404-6304560)
chr5 (371-528)||(33705870-33706026)
chr5 (371-528)||(42692363-42692519)
chr5 (378-528)||(34718216-34718365)
chr5 (378-528)||(41691900-41692049)
chr5 (371-528)||(26601786-26601942)
chr5 (371-528)||(35393173-35393330)
chr5 (371-528)||(35393799-35393955)
chr5 (371-532)||(19123589-19123755)
chr5 (406-537)||(36885304-36885435)
chr5 (369-537)||(18242224-18242396)
chr5 (375-528)||(34725858-34726010)
chr5 (371-528)||(43138137-43138293)
chr5 (371-528)||(754043-754199)
chr5 (371-528)||(6305037-6305193)
chr5 (371-528)||(12419676-12419832)
chr5 (371-528)||(2182134-2182288)
chr5 (371-528)||(26601142-26601305)
chr5 (407-528)||(39914600-39914721)
chr5 (227-370)||(39915362-39915505)
chr5 (188-356)||(16679639-16679801)
chr5 (371-528)||(43137505-43137660)
chr5 (371-528)||(12418961-12419122)
chr5 (188-358)||(16679796-16679960)
chr5 (406-515)||(35393955-35394064)
chr5 (396-528)||(3890454-3890586)
chr5 (371-537)||(25481029-25481202)
chr5 (385-523)||(25481161-25481297)
chr5 (409-515)||(35393330-35393436)
chr5 (405-520)||(18242356-18242471)
chr5 (371-461)||(3087653-3087743)
chr5 (268-370)||(27440850-27440952)
chr5 (371-461)||(36886149-36886239)
chr5 (188-300)||(16683415-16683527)
chr5 (411-537)||(19123810-19123936)
chr5 (371-461)||(30755208-30755298)
chr5 (437-537)||(42692574-42692673)
chr5 (445-528)||(41290217-41290300)
chr5 (470-537)||(12419178-12419245)
chr5 (406-507)||(39914723-39914822)
chr5 (193-285)||(41289948-41290040)
chr5 (451-526)||(42692753-42692828)
chr5 (193-285)||(3890201-3890293)
chr5 (440-504)||(42692692-42692756)
chr5 (188-285)||(16679546-16679642)
chr5 (482-537)||(34719071-34719126)
chr5 (193-285)||(3890316-3890408)
chr5 (482-537)||(12419565-12419620)
chr5 (482-537)||(41692755-41692810)
chr5 (482-537)||(42977029-42977084)
chr5 (437-515)||(25481278-25481355)
chr5 (40-109)||(12588336-12588405)
chr5 (482-537)||(17637058-17637113)
chr5 (482-537)||(36885902-36885957)
chr5 (371-417)||(41290254-41290300)
chr5 (193-266)||(41289838-41289910)
chr5 (369-417)||(18241901-18241949)
chr5 (489-537)||(34718317-34718365)
chr5 (489-537)||(41692001-41692049)
chr5 (482-537)||(753189-753244)
chr5 (482-537)||(6304182-6304237)
chr5 (482-537)||(17637813-17637868)
chr5 (482-537)||(36885153-36885208)
chr5 (482-537)||(43137394-43137449)
chr5 (212-266)||(16685461-16685515)
chr5 (487-537)||(26601036-26601086)
chr5 (482-532)||(35393280-35393330)
chr5 (371-417)||(39914600-39914646)
chr5 (371-417)||(42976614-42976660)
chr5 (369-417)||(6304512-6304560)
chr5 (371-417)||(3890540-3890586)
chr5 (371-417)||(25696763-25696809)
chr5 (371-417)||(34717583-34717629)
chr5 (371-417)||(34718216-34718262)
chr5 (371-417)||(41691900-41691946)
chr5 (38-87)||(5620689-5620738)
chr5 (552-588)||(10039325-10039361)
chr5 (552-588)||(12652174-12652210)
chr5 (314-350)||(16683529-16683565)
chr5 (552-588)||(23180959-23180995)
chr5 (552-588)||(23185226-23185262)
chr5 (371-411)||(30180088-30180128)
chr5 (552-588)||(34758220-34758256)
chr5 (552-588)||(39875054-39875090)
chr5 (371-415)||(42692753-42692797)
chr5 (482-537)||(2181714-2181769)
chr5 (17-78)||(14387914-14387978)
chr5 (552-590)||(20108147-20108185)
chr5 (371-417)||(34725964-34726010)
chr5 (202-272)||(38939151-38939221)
chr5 (371-417)||(41691269-41691315)
chr5 (17-50)||(13596909-13596942)
chr5 (371-404)||(35393330-35393363)
chr5 (371-404)||(35393955-35393988)
chr5 (552-588)||(3610811-3610847)
chr5 (552-588)||(30093391-30093427)
[»] scaffold0484 (5 HSPs)
scaffold0484 (17-537)||(8194-8714)
scaffold0484 (202-482)||(8993-9286)
scaffold0484 (371-529)||(8659-8816)
scaffold0484 (482-537)||(9180-9235)
scaffold0484 (369-418)||(8767-8816)
[»] chr3 (126 HSPs)
chr3 (17-537)||(52842689-52843208)
chr3 (21-537)||(29528774-29529289)
chr3 (21-537)||(48519678-48520192)
chr3 (21-537)||(39094054-39094570)
chr3 (17-537)||(55290415-55290933)
chr3 (17-537)||(19360753-19361273)
chr3 (23-522)||(19893204-19893697)
chr3 (17-535)||(26776452-26776971)
chr3 (17-537)||(26100796-26101318)
chr3 (17-537)||(4137418-4137939)
chr3 (17-537)||(8396259-8396789)
chr3 (24-534)||(53801870-53802381)
chr3 (31-362)||(28979640-28979970)
chr3 (202-537)||(19361563-19361898)
chr3 (17-356)||(35860688-35861025)
chr3 (195-537)||(35855653-35856009)
chr3 (202-537)||(26101607-26101938)
chr3 (202-537)||(8527003-8527352)
chr3 (17-414)||(22521879-22522294)
chr3 (269-537)||(4138636-4138901)
chr3 (202-537)||(19368269-19368617)
chr3 (202-537)||(55293598-55293933)
chr3 (269-537)||(39093428-39093696)
chr3 (303-537)||(19367744-19367978)
chr3 (195-461)||(29529681-29529961)
chr3 (371-537)||(8396148-8396314)
chr3 (371-537)||(26776918-26777084)
chr3 (371-537)||(55290878-55291044)
chr3 (196-410)||(40821913-40822141)
chr3 (371-533)||(29529234-29529396)
chr3 (371-537)||(53801756-53801922)
chr3 (232-426)||(53801456-53801664)
chr3 (371-537)||(39093943-39094109)
chr3 (369-528)||(26101261-26101419)
chr3 (371-537)||(8526542-8526715)
chr3 (371-528)||(19361218-19361374)
chr3 (371-528)||(26777029-26777185)
chr3 (371-522)||(8526660-8526810)
chr3 (371-528)||(8396046-8396203)
chr3 (371-537)||(46488620-46488785)
chr3 (371-528)||(29529345-29529501)
chr3 (369-520)||(19361841-19361990)
chr3 (369-520)||(19367921-19368070)
chr3 (371-522)||(39093848-39093998)
chr3 (371-537)||(46487972-46488137)
chr3 (193-370)||(51656384-51656555)
chr3 (371-528)||(55293878-55294034)
chr3 (17-188)||(18688526-18688697)
chr3 (371-507)||(46488539-46488675)
chr3 (193-370)||(9373953-9374123)
chr3 (371-528)||(55290989-55291144)
chr3 (371-515)||(40823768-40823911)
chr3 (371-507)||(46487890-46488027)
chr3 (371-528)||(48520137-48520293)
chr3 (371-528)||(52842588-52842744)
chr3 (377-513)||(53801670-53801805)
chr3 (193-370)||(9373449-9373620)
chr3 (371-522)||(26101883-26102034)
chr3 (371-515)||(35855565-35855708)
chr3 (385-528)||(51656670-51656820)
chr3 (39-198)||(40817218-40817377)
chr3 (371-513)||(5557461-5557601)
chr3 (371-514)||(39093341-39093483)
chr3 (371-528)||(4137884-4138040)
chr3 (437-537)||(40823723-40823823)
chr3 (193-357)||(9373136-9373308)
chr3 (193-370)||(9373757-9373929)
chr3 (439-525)||(8526499-8526585)
chr3 (193-370)||(36006479-36006663)
chr3 (17-109)||(22477836-22477929)
chr3 (407-520)||(46487775-46487888)
chr3 (437-537)||(5557416-5557516)
chr3 (17-109)||(11951009-11951101)
chr3 (251-370)||(46489283-46489403)
chr3 (236-370)||(53521729-53521857)
chr3 (371-458)||(19368562-19368649)
chr3 (371-461)||(8527297-8527387)
chr3 (405-497)||(9392966-9393058)
chr3 (451-528)||(18684942-18685019)
chr3 (462-527)||(46488092-46488157)
chr3 (407-520)||(46488424-46488537)
chr3 (462-527)||(46488740-46488805)
chr3 (371-467)||(4138846-4138942)
chr3 (202-285)||(14555615-14555698)
chr3 (482-535)||(19893551-19893604)
chr3 (204-288)||(16040631-16040715)
chr3 (17-139)||(12001445-12001566)
chr3 (482-525)||(22521879-22521922)
chr3 (482-537)||(29529871-29529926)
chr3 (552-599)||(31485107-31485154)
chr3 (482-537)||(53801456-53801511)
chr3 (552-588)||(11825450-11825486)
chr3 (552-588)||(33004987-33005023)
chr3 (552-588)||(35714623-35714659)
chr3 (552-588)||(49564559-49564595)
chr3 (482-521)||(40822102-40822141)
chr3 (482-537)||(53801977-53802032)
chr3 (202-288)||(16046985-16047070)
chr3 (553-599)||(38661427-38661473)
chr3 (231-288)||(16036429-16036486)
chr3 (38-87)||(21165976-21166025)
chr3 (252-285)||(39093694-39093727)
chr3 (552-588)||(12258700-12258736)
chr3 (552-588)||(26944818-26944854)
chr3 (552-588)||(36089562-36089598)
chr3 (195-247)||(40793630-40793682)
chr3 (466-525)||(51656642-51656699)
chr3 (552-599)||(858268-858315)
chr3 (482-537)||(26776808-26776863)
chr3 (193-279)||(38362057-38362143)
chr3 (193-279)||(38362157-38362243)
chr3 (371-409)||(46487775-46487813)
chr3 (193-279)||(49453788-49453874)
chr3 (371-417)||(51656774-51656820)
chr3 (202-272)||(53522324-53522394)
chr3 (193-242)||(16062531-16062580)
chr3 (193-266)||(38362457-38362530)
chr3 (26-111)||(42614373-42614457)
chr3 (552-588)||(4586304-4586340)
chr3 (473-501)||(8526489-8526517)
chr3 (198-258)||(9374197-9374257)
chr3 (552-588)||(13457592-13457628)
chr3 (552-588)||(16648459-16648495)
chr3 (18-50)||(17228577-17228609)
chr3 (385-417)||(35856185-35856217)
chr3 (193-285)||(40822145-40822237)
[»] chr2 (125 HSPs)
chr2 (17-525)||(42782190-42782697)
chr2 (18-537)||(18090631-18091151)
chr2 (17-525)||(10874417-10874925)
chr2 (18-537)||(19487773-19488298)
chr2 (17-498)||(4289046-4289529)
chr2 (17-537)||(9542648-9543174)
chr2 (21-528)||(17837989-17838493)
chr2 (34-528)||(6931420-6931912)
chr2 (21-537)||(28609434-28609972)
chr2 (31-528)||(32675776-32676284)
chr2 (202-537)||(10875345-10875681)
chr2 (202-537)||(6930888-6931237)
chr2 (202-537)||(18091537-18091887)
chr2 (202-537)||(4290492-4290841)
chr2 (202-537)||(9543459-9543808)
chr2 (202-537)||(32676470-32676818)
chr2 (202-537)||(42781428-42781779)
chr2 (202-537)||(28608703-28609053)
chr2 (195-533)||(19487028-19487380)
chr2 (202-504)||(1513696-1514012)
chr2 (279-525)||(1513139-1513393)
chr2 (371-537)||(10875737-10875903)
chr2 (371-537)||(28609323-28609489)
chr2 (202-458)||(19485124-19485394)
chr2 (371-537)||(10875848-10876014)
chr2 (340-528)||(19484744-19484936)
chr2 (371-537)||(10875626-10875792)
chr2 (371-537)||(10876071-10876244)
chr2 (371-537)||(10048017-10048183)
chr2 (371-525)||(10875959-10876114)
chr2 (371-531)||(10875001-10875159)
chr2 (371-537)||(19487662-19487835)
chr2 (371-528)||(19487561-19487717)
chr2 (371-520)||(28609230-28609378)
chr2 (371-537)||(42782060-42782233)
chr2 (374-528)||(9543756-9543908)
chr2 (374-515)||(4290789-4290929)
chr2 (371-537)||(10874882-10875056)
chr2 (371-515)||(18091832-18091976)
chr2 (373-528)||(1513352-1513513)
chr2 (371-522)||(37994851-37995002)
chr2 (405-528)||(37995022-37995145)
chr2 (371-528)||(1514078-1514241)
chr2 (378-528)||(4290160-4290309)
chr2 (371-528)||(6930787-6930943)
chr2 (371-528)||(9543119-9543275)
chr2 (371-528)||(10048128-10048284)
chr2 (371-528)||(32676763-32676919)
chr2 (372-528)||(28608603-28608757)
chr2 (193-370)||(25235107-25235298)
chr2 (406-537)||(692641-692772)
chr2 (393-528)||(18091220-18091354)
chr2 (371-497)||(42781991-42782115)
chr2 (411-537)||(692454-692580)
chr2 (419-525)||(1514015-1514121)
chr2 (371-494)||(18091096-18091219)
chr2 (188-285)||(1501622-1501719)
chr2 (173-284)||(1501514-1501625)
chr2 (17-127)||(19484635-19484746)
chr2 (374-484)||(692396-692506)
chr2 (28-183)||(1501298-1501448)
chr2 (205-370)||(15783430-15783589)
chr2 (17-109)||(9916725-9916817)
chr2 (371-506)||(25235788-25235920)
chr2 (428-528)||(25235921-25236021)
chr2 (193-370)||(44940665-44940852)
chr2 (374-480)||(692587-692693)
chr2 (371-461)||(10876189-10876279)
chr2 (379-461)||(42781393-42781475)
chr2 (406-539)||(25235715-25235843)
chr2 (452-537)||(24128610-24128695)
chr2 (193-285)||(25234787-25234879)
chr2 (445-533)||(37994814-37994902)
chr2 (371-461)||(19486989-19487079)
chr2 (193-285)||(25234472-25234564)
chr2 (188-285)||(8909802-8909899)
chr2 (371-428)||(24128640-24128697)
chr2 (482-537)||(4289401-4289456)
chr2 (482-537)||(19484775-19484830)
chr2 (407-485)||(37995161-37995240)
chr2 (195-285)||(25234684-25234774)
chr2 (193-285)||(25234570-25234662)
chr2 (482-537)||(6931521-6931576)
chr2 (482-537)||(10874771-10874826)
chr2 (482-537)||(19487135-19487190)
chr2 (193-299)||(692907-693013)
chr2 (195-285)||(25234901-25234991)
chr2 (193-262)||(25234997-25235065)
chr2 (489-537)||(4290160-4290208)
chr2 (318-370)||(25235403-25235455)
chr2 (482-537)||(1513879-1513934)
chr2 (552-599)||(4999915-4999962)
chr2 (552-599)||(5011583-5011630)
chr2 (482-537)||(19485307-19485362)
chr2 (482-537)||(42782288-42782343)
chr2 (371-417)||(1513467-1513513)
chr2 (371-417)||(4290263-4290309)
chr2 (371-417)||(18091308-18091354)
chr2 (17-70)||(45003789-45003842)
chr2 (552-588)||(205804-205840)
chr2 (552-588)||(19820867-19820903)
chr2 (552-588)||(19841088-19841124)
chr2 (193-241)||(37994778-37994826)
chr2 (552-588)||(42110601-42110637)
chr2 (552-599)||(1917984-1918031)
chr2 (553-599)||(1502908-1502954)
chr2 (371-417)||(9543862-9543908)
chr2 (375-417)||(25235979-25236021)
chr2 (371-417)||(37995099-37995145)
chr2 (195-272)||(2194189-2194266)
chr2 (552-588)||(181088-181124)
chr2 (552-588)||(979192-979228)
chr2 (552-588)||(2445190-2445226)
chr2 (552-588)||(2445797-2445833)
chr2 (552-588)||(2446404-2446440)
chr2 (552-588)||(6121654-6121690)
chr2 (552-588)||(28089517-28089553)
chr2 (552-588)||(36438744-36438780)
chr2 (371-406)||(4290896-4290931)
chr2 (371-406)||(18091943-18091978)
chr2 (17-50)||(16884238-16884271)
chr2 (17-50)||(17041928-17041961)
chr2 (552-588)||(13902416-13902452)
chr2 (552-588)||(21589740-21589776)
chr2 (193-229)||(23456495-23456531)
[»] chr6 (74 HSPs)
chr6 (17-537)||(9978726-9979254)
chr6 (17-537)||(4109560-4110084)
chr6 (17-498)||(24447335-24447818)
chr6 (17-537)||(35159622-35160146)
chr6 (21-515)||(4895984-4896475)
chr6 (17-498)||(1221924-1222408)
chr6 (17-515)||(6966255-6966763)
chr6 (53-427)||(9735751-9736125)
chr6 (17-414)||(15043846-15044243)
chr6 (17-537)||(33319584-33320089)
chr6 (27-535)||(14832529-14833065)
chr6 (16-337)||(18320430-18320751)
chr6 (202-537)||(4108812-4109162)
chr6 (202-537)||(24446021-24446370)
chr6 (202-528)||(33320369-33320708)
chr6 (202-537)||(4896779-4897128)
chr6 (202-528)||(35158956-35159295)
chr6 (202-537)||(1220614-1220963)
chr6 (287-537)||(21059122-21059368)
chr6 (316-537)||(21055349-21055567)
chr6 (371-537)||(4109445-4109615)
chr6 (287-515)||(21078375-21078609)
chr6 (371-528)||(9979199-9979355)
chr6 (369-528)||(21078251-21078410)
chr6 (374-528)||(24445920-24446073)
chr6 (371-527)||(4109345-4109500)
chr6 (369-537)||(21055239-21055406)
chr6 (374-528)||(1220513-1220666)
chr6 (371-528)||(4896442-4896597)
chr6 (378-528)||(1221146-1221295)
chr6 (378-528)||(24446553-24446702)
chr6 (369-518)||(21059031-21059179)
chr6 (371-528)||(15045021-15045179)
chr6 (371-537)||(19989689-19989855)
chr6 (371-528)||(4108711-4108867)
chr6 (371-528)||(4897073-4897229)
chr6 (371-528)||(21055138-21055294)
chr6 (412-537)||(15044951-15045076)
chr6 (371-528)||(35159523-35159677)
chr6 (371-528)||(21058909-21059067)
chr6 (371-528)||(33320034-33320186)
chr6 (369-457)||(14832496-14832584)
chr6 (413-537)||(19989800-19989923)
chr6 (193-370)||(4621320-4621504)
chr6 (371-468)||(19989647-19989744)
chr6 (482-537)||(24447408-24447463)
chr6 (189-285)||(31426227-31426324)
chr6 (482-537)||(1221997-1222052)
chr6 (482-537)||(9736069-9736124)
chr6 (489-537)||(1221247-1221295)
chr6 (489-537)||(24446654-24446702)
chr6 (482-537)||(33320552-33320607)
chr6 (482-537)||(35159057-35159112)
chr6 (446-504)||(19989920-19989978)
chr6 (552-588)||(24457621-24457657)
chr6 (552-588)||(29373170-29373206)
chr6 (552-588)||(33005871-33005907)
chr6 (552-599)||(2278544-2278591)
chr6 (482-525)||(6966610-6966653)
chr6 (371-417)||(1220513-1220559)
chr6 (371-417)||(1221146-1221192)
chr6 (371-417)||(24445920-24445966)
chr6 (371-417)||(24446553-24446599)
chr6 (483-528)||(14832469-14832514)
chr6 (372-417)||(14832469-14832514)
chr6 (193-242)||(19989966-19990015)
chr6 (371-407)||(6966730-6966766)
chr6 (485-525)||(15044203-15044243)
chr6 (552-588)||(33048889-33048925)
chr6 (193-246)||(28079092-28079145)
chr6 (202-275)||(28079257-28079330)
chr6 (256-289)||(31490983-31491016)
chr6 (17-102)||(34218655-34218739)
chr6 (552-588)||(29370615-29370651)
[»] scaffold0057 (5 HSPs)
scaffold0057 (17-537)||(17419-17941)
scaffold0057 (202-537)||(18224-18573)
scaffold0057 (374-528)||(18521-18674)
scaffold0057 (371-528)||(17886-18041)
scaffold0057 (371-417)||(18628-18674)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (17-537)||(55063-55583)
scaffold0051 (371-528)||(54961-55118)
[»] scaffold0230 (5 HSPs)
scaffold0230 (16-498)||(26044-26528)
scaffold0230 (378-528)||(27161-27310)
scaffold0230 (482-537)||(26400-26455)
scaffold0230 (489-537)||(27161-27209)
scaffold0230 (371-417)||(27264-27310)
[»] scaffold0115 (11 HSPs)
scaffold0115 (36-537)||(14516-15016)
scaffold0115 (202-533)||(3519-3849)
scaffold0115 (202-511)||(11281-11589)
scaffold0115 (369-527)||(14415-14573)
scaffold0115 (371-528)||(3414-3570)
scaffold0115 (418-528)||(4036-4145)
scaffold0115 (418-528)||(11776-11885)
scaffold0115 (482-537)||(3626-3681)
scaffold0115 (482-537)||(11366-11421)
scaffold0115 (371-417)||(4036-4082)
scaffold0115 (371-417)||(11776-11822)
[»] scaffold0381 (6 HSPs)
scaffold0381 (21-533)||(10726-11251)
scaffold0381 (202-537)||(9979-10328)
scaffold0381 (371-537)||(10611-10777)
scaffold0381 (371-528)||(10511-10666)
scaffold0381 (371-514)||(9892-10034)
scaffold0381 (482-537)||(10833-10888)
[»] scaffold0032 (9 HSPs)
scaffold0032 (40-537)||(2886-3380)
scaffold0032 (203-533)||(3773-4117)
scaffold0032 (302-533)||(10335-10566)
scaffold0032 (371-528)||(3436-3592)
scaffold0032 (371-537)||(3325-3491)
scaffold0032 (371-528)||(4066-4222)
scaffold0032 (371-528)||(10515-10671)
scaffold0032 (482-537)||(3955-4010)
scaffold0032 (482-537)||(10404-10459)
[»] scaffold0009 (7 HSPs)
scaffold0009 (18-471)||(139159-139597)
scaffold0009 (48-537)||(232700-233216)
scaffold0009 (202-537)||(232067-232416)
scaffold0009 (371-528)||(232599-232755)
scaffold0009 (376-528)||(231966-232117)
scaffold0009 (482-537)||(139204-139258)
scaffold0009 (371-417)||(231966-232012)
[»] scaffold0069 (3 HSPs)
scaffold0069 (17-360)||(14328-14671)
scaffold0069 (431-528)||(13726-13822)
scaffold0069 (371-417)||(13726-13772)
[»] scaffold0079 (8 HSPs)
scaffold0079 (227-515)||(8819-9118)
scaffold0079 (202-537)||(9531-9886)
scaffold0079 (375-528)||(9835-9988)
scaffold0079 (371-537)||(9085-9244)
scaffold0079 (371-528)||(9189-9348)
scaffold0079 (79-123)||(8778-8822)
scaffold0079 (482-526)||(8963-9007)
scaffold0079 (371-417)||(9942-9988)
[»] scaffold0759 (1 HSPs)
scaffold0759 (21-191)||(3446-3617)
[»] scaffold0044 (8 HSPs)
scaffold0044 (369-537)||(86518-86684)
scaffold0044 (372-528)||(87036-87192)
scaffold0044 (401-537)||(86954-87090)
scaffold0044 (369-528)||(86736-86894)
scaffold0044 (371-524)||(86629-86780)
scaffold0044 (451-537)||(86489-86573)
scaffold0044 (371-417)||(87146-87192)
scaffold0044 (195-242)||(86893-86940)
[»] scaffold2127 (3 HSPs)
scaffold2127 (202-360)||(637-809)
scaffold2127 (462-528)||(991-1057)
scaffold2127 (371-417)||(991-1037)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (21-109)||(4207-4295)
[»] scaffold0368 (1 HSPs)
scaffold0368 (233-359)||(670-790)
[»] scaffold0432 (2 HSPs)
scaffold0432 (193-285)||(5518-5610)
scaffold0432 (193-241)||(5621-5669)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (205-300)||(200914-201011)
[»] scaffold0180 (8 HSPs)
scaffold0180 (202-279)||(105-182)
scaffold0180 (190-279)||(213-302)
scaffold0180 (202-279)||(4425-4502)
scaffold0180 (190-279)||(4533-4622)
scaffold0180 (193-279)||(4217-4303)
scaffold0180 (190-279)||(4317-4407)
scaffold0180 (193-274)||(4014-4095)
scaffold0180 (190-273)||(3-87)
[»] scaffold0089 (10 HSPs)
scaffold0089 (202-279)||(141-218)
scaffold0089 (190-279)||(249-338)
scaffold0089 (202-279)||(21938-22015)
scaffold0089 (202-273)||(20675-20746)
scaffold0089 (202-279)||(21522-21599)
scaffold0089 (190-279)||(33-123)
scaffold0089 (202-275)||(22450-22523)
scaffold0089 (209-273)||(21103-21167)
scaffold0089 (202-262)||(21314-21374)
scaffold0089 (190-273)||(22141-22225)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 417; Significance: 0; HSPs: 153)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 36778503 - 36777983
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  36778503 cttcgcacgggttgaataacgtatttttttaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgttctttataaatgtgaaaatta 36778404  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36778403 aagctgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccga 36778304  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  36778303 acgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 36778204  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 416  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36778203 aatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactatacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 36778104  T
Q  417 ttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtt 516  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36778103 ataaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtc 36778004  T
Q  517 atctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  36778003 atctcttatttctaaatgtta 36777983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 9474146 - 9473626
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9474146 cttcgcacgggttgaataacgtattttttttaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 9474047  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||  ||| ||| |||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9474046 aagctgcgtaatccaaaattttacaacacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccga 9473947  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9473946 acacaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 9473847  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 416  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9473846 aatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 9473747  T
Q  417 ttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtt 516  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9473746 ataaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtc 9473647  T
Q  517 atctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  9473646 atctcttatttctaaatgtta 9473626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 7391345 - 7390824
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtatttttta----aaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7391345 cttcgcacgggttgaataacgtttttttttttttaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattatggaaaattattgtcctttataaatgtgaaa 7391246  T
Q  113 atcaaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaac 212  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  7391245 atcaaagttgcgtaaaccaaaattttgtaacacagagcctagagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattccttaaagttaat 7391146  T
Q  213 ccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgttt 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  7391145 ccgaacgcaaaattttgccatagatttaacttaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattatta 7391046  T
Q  313 gggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctctt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7391045 gggaaatcaaaataaacaaatcgcacataatttttctccttaattttactaaacaaattatattaactctatatttaatttatgcaaaatgtcatatctt 7390946  T
Q  413 atttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaa 512  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7390945 atttataaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaa 7390846  T
Q  513 tgttatctcttatttttaaatg 534  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  7390845 tgtcatctcttatttttaaatg 7390824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Original strand, 40586461 - 40586980
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40586461 cttcgcacgggttgaataacgtatttttttaaaatttagttttgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttatcatttataaatgtgaaaatca 40586560  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  40586561 aagctgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaaa-actacatgaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaactcga 40586659  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  40586660 acgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 40586759  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 416  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40586760 aatcaaaatgaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 40586859  T
Q  417 ttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtt 516  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  40586860 ataaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtc 40586959  T
Q  517 atctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  40586960 atctcttatttctaaatgtta 40586980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 41158667 - 41158149
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41158667 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttaactttgaaggagaaatcttataaattacgaaaaattattgtcctttataaatgtgaaaatca 41158568  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  41158567 aagctgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaagcactacataaaaaacaacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccga 41158468  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||| || ||||    
T  41158467 acgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgcattaaccctatttaatttaatcaaaatg--aacgttaatt-ttaggga 41158371  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 416  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41158370 aatcaaaataaacaaatcgctcataatttttctccttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 41158271  T
Q  417 ttaaatgttaacccgtgatgcaatatt-aaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
     |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  41158270 ataaacgttaacccgtgacgcaatattaaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttattcaaaatgg 41158171  T
Q  516 tatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  41158170 catctcttatttttaaatgtta 41158149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 25346019 - 25345498
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaa--tttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaat 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25346019 cttcgcacggattgaataacgtattttttaaaaaaatttagctccgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaat 25345920  T
Q  115 caaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaaccc 214  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |     
T  25345919 caaagttgcgtaaaccaaaattttacaacacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcatattccttgaagttaatct 25345820  T
Q  215 gaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgg 314  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  25345819 gaacacaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaacactatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagg 25345720  T
Q  315 gaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat 414  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25345719 gaaatcaaaataaacaaatcgcaaataaattttctccttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatgtatgcaaaatgtcatatcttat 25345620  T
Q  415 ttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 514  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25345619 ttataaatgttaacccgtgacgcaata-taaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 25345521  T
Q  515 ttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  25345520 tcatctcttatttttaaatgtta 25345498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 8763032 - 8762531
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  8763032 gcacgggttgaataacgtattttttttaaatttagttttgaaggagaaatcttataaattacagaaaattgttgtcatttataaatgtgaaaatcaaagc 8762933  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8762932 tgcgtaaaccaaaaatttgcaacacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgc 8762833  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatc 320  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8762832 aaaatttttccctagatttaacctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatc 8762733  T
Q  321 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaa 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||    
T  8762732 aaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc--atttataa 8762636  T
Q  421 atgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  8762635 acgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaccctaattttttcgtgtgactttactaaattaaccctagatttaatttctgcaaaatgtcatct 8762536  T
Q  521 cttat 525  Q
    |||||    
T  8762535 cttat 8762531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 534
Target Start/End: Original strand, 4464376 - 4464889
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaa--aaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4464376 gcacgggttgaataacgtattttttttttaaatttagtttcgaaggtgaaatcttataaat-acgaaaaattattgtcctttataaatgtgaaaatcaaa 4464474  T
Q  119 attgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaac 218  Q
      ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  4464475 gctgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaagcactgcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattccttaaagttaattcgaac 4464574  T
Q  219 gcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaa 318  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  4464575 gtaaaattttgccatagatttaacataacttctctgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattggtagggaaa 4464674  T
Q  319 tcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattttt 418  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  4464675 tcaaaataaacaaatcgcacataatttttctccttaattttactaatcaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttat 4464774  T
Q  419 aaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttat 518  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4464775 aaacgttaacccgtgatgcaatattaaccatagatttaacctaa-tttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtaat 4464873  T
Q  519 ctcttatttttaaatg 534  Q
    ||||||||||||||||    
T  4464874 ctcttatttttaaatg 4464889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 537
Target Start/End: Original strand, 44380735 - 44381251
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  44380735 gcacaggttaaataacgtattttttaaaaatttagctccgaaggagaaatcttataaattacgaaaaattattgtcctttataaatgtgaaaatcaaagc 44380834  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  44380835 tgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgc 44380934  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatc 320  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  44380935 aaaattttgctctagatttaacctaacttttttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttacggaaatc 44381034  T
Q  321 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaa 420  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  44381035 aaactaaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaagcaaattatattaaccctagatttaatttattcaaaatgtcatctcttatttataa 44381134  T
Q  421 atgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
    | |||||||| ||| | ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  44381135 acgttaacccatgacgtaatatcaaccctatatttaacctaattttttcgtatgactttactatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatat 44381234  T
Q  521 cttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||    
T  44381235 cttatttttaaatgtta 44381251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 59 - 537
Target Start/End: Original strand, 25618560 - 25619037
Alignment:
Q  59 cgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagca 158  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  25618560 cgaaggagaaattttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaagctgggtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaaaca 25618659  T
Q  159 cttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgctta 258  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25618660 ctacataaaaaataatataacaactattgtaatatcatattccttaaagttaattcaaatgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgctta 25618759  T
Q  259 attttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattt 358  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  25618760 attttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgtaaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcacataatttttctccttaattt 25618859  T
Q  359 tactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaac 458  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  25618860 tactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttataaacgttaacccgtgacgcaata-taaccctagatttaac 25618958  T
Q  459 ctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25618959 ctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgtta 25619037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 1945207 - 1944706
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  1945207 gcacgggttgaataacgtattttttttaaatttagttttgaaggagaaatcttataaattacagaaaattgttgtcatttataaatgtgaaaatcaaagc 1945108  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  1945107 tgcgtaaaccaaaaatttgcaacacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagc 1945008  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatc 320  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1945007 aaaatttttccctagatttaacctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatc 1944908  T
Q  321 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaa 420  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||    
T  1944907 aaaataaa-aaatcgttcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc--atttataa 1944811  T
Q  421 atgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  1944810 acattaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaccctaattttttcgtgtgactttactaaattaaccctagatttaatttctgcaaaatgtcatct 1944711  T
Q  521 cttat 525  Q
    |||||    
T  1944710 cttat 1944706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 25834020 - 25834521
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  25834020 gcacggattgaataacgtattttttttaaatttagttttgaatgagaaatcttataaattacagaaaattgttgtcatttataaatgtgaaaatcaaagc 25834119  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  25834120 tgcgtaaatcaaaaatttgcaacacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagc 25834219  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatc 320  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25834220 aaaatttttccctagatttaacctaacttatttgcttaattttactgcattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatc 25834319  T
Q  321 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaa 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||    
T  25834320 aaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc--atttataa 25834416  T
Q  421 atgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25834417 acgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaccctaattttttcgtgtgactttactaaattaaccctagatttaatttctgcaaaatgtcatct 25834516  T
Q  521 cttat 525  Q
    |||||    
T  25834517 cttat 25834521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 537
Target Start/End: Original strand, 41531793 - 41532300
Alignment:
Q  22 cacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaatt 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||    
T  41531793 cacgggttgaataacgtattttataaaaatttaacttcgaaagagaaatcttataaattacggaaagttgttgtcatttataaatggaaaaatcaaagtt 41531892  T
Q  122 gcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgca 221  Q
    || | ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41531893 gcgttaaccaaaattttgcaatacagagtctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaatccgaacgca 41531992  T
Q  222 aaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatca 321  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  41531993 aaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttattgtattaaccttatttaatttaattaaaatgtaaacgttaattgttagggaaatca 41532092  T
Q  322 aaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaa 421  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41532093 acataaa-aaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataaa 41532191  T
Q  422 tgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctc 521  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  41532192 cgttaacccgtgacgcaatattaaccctaaatttaacctaattttttcgtgtgactt-------ttaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatc 41532284  T
Q  522 ttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||    
T  41532285 ttatttttaaatgtta 41532300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 41978882 - 41978348
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  41978882 cttcgcacgggttgaataacgtatttttttaaaatttagctccaaaggagagatcttataaattacggaaaattgatgtcttttagaaatgtgaaaatca 41978783  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  41978782 aagctgcgtaaaccaaaattttgcaacacaaagcctaaagcactacataaaaaattacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccga 41978683  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------taatcgaaatgttaacg 302  Q
    || || ||||||||||||  |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||              ||||| |||||||||||    
T  41978682 acacagaattttgccctaattttaacctaacttcttcgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaacg 41978583  T
Q  303 ttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaat 402  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41978582 ttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcataatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 41978483  T
Q  403 gtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaat 502  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41978482 ggcatctcttatttccaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaat 41978383  T
Q  503 ttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41978382 ttattcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 41978348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 8160442 - 8160941
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  8160442 gcacgggttgaataacgtatttttttttaatttaattttgaaggagaaatcttataaattacagaaaattgttgtcatttataaatgtgaaaatcaaagc 8160541  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  8160542 tgcgtaaaccaaaaatttgcaacacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagc 8160641  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatc 320  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8160642 aaaatttttccctagatttaacctaacttatttgcttaatttta--gcattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttagttgttagggaaatc 8160739  T
Q  321 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaa 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||    
T  8160740 aaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc--atttataa 8160836  T
Q  421 atgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  8160837 acgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaccctaattttttcgtgtgactttactaaattaaccctagatttaatttctgcaaaatgtcatct 8160936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 19 - 414
Target Start/End: Original strand, 42244356 - 42244751
Alignment:
Q  19 tcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42244356 tcgcacgggttgaataacgtatttttttaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaa 42244455  T
Q  119 attgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaac 218  Q
     |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  42244456 gttgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagtctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaaccggaac 42244555  T
Q  219 gcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaa 318  Q
    | |||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  42244556 gtaaaattttacccaagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgtcaacgttaattgttagggaaa 42244655  T
Q  319 tcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat 414  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42244656 tcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat 42244751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 17 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 24055864 - 24055464
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtatttttt-aaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatc 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24055864 cttcgcacaggttgaataacgtatttttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcttttataaatgtgaaaatc 24055765  T
Q  116 aaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccg 215  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  24055764 aaagttgcgtaaaccaaaattttgcaacactgagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaactcg 24055665  T
Q  216 aacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggg 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  24055664 aacgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaattaaaatgttaacgttaattgttaggg 24055565  T
Q  316 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 415  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24055564 aaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 24055465  T
Q  416 t 416  Q
    |    
T  24055464 t 24055464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 32847216 - 32846727
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaa-aaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  32847216 gcacgggttgaataacgtatttttttttaaatttaattttgaaggagaaatcttataaattataaaaaattgttgtcatttataaatgtgaaaatcaaag 32847117  T
Q  120 ttgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacg 219  Q
     ||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||| |    
T  32847116 ctgcgtaaagcaaaaatttgcaacacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaactcgaaag 32847017  T
Q  220 caaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaat 319  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||             |||||||    
T  32847016 caaaaattttccctagatttaacctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgtta-------------gggaaat 32846930  T
Q  320 caaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattttta 419  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  32846929 caaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc--atttata 32846833  T
Q  420 aatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatc 519  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  32846832 aacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaccctaattttttcgtgtgactttactaaattaatcctagatttaatttctgcaaaatgtcatc 32846733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 360
Target Start/End: Original strand, 18375576 - 18375919
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18375576 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcatttatcaatgtgaaaatca 18375675  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||| || || ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18375676 aaactgcgtaaaccaaaattttacaacacatagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccga 18375775  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18375776 acgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 18375875  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaatttta 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18375876 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatttta 18375919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 25361538 - 25361175
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25361538 cttcacacgggatgaataacatatttttttaaaatttagtttcgaaagagaaattttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 25361439  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||| || || ||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25361438 aagctgcgtaaaccaaaattttgcaacacatagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactgttctaatatcttattccttaaagttaacccga 25361339  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    | |||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  25361338 aggcaaaattttgcccaaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 25361239  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaacc 380  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25361238 aatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaacc 25361175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 4465288 - 4465637
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||              |||||    
T  4465288 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtttaattta 4465387  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4465388 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcataatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 4465487  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4465488 taatttatgcaaaatggcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctaaatttaacctaaatttttcgtgtgactttactatatt 4465587  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  4465588 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgtta 4465637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 12761342 - 12760993
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  12761342 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttgtttgtttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 12761243  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12761242 attaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 12761143  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12761142 taatttatgcaaaatggcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 12761043  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12761042 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 12760993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 36777693 - 36777344
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta-------------- 287  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |                  
T  36777693 ttaaagttaactcggacgcaaaattttgccctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtttaatttg 36777594  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36777593 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 36777494  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36777493 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatggtaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 36777394  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36777393 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 36777344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 7390422 - 7390073
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  7390422 ttaaagttaacccgaatgaaaagttttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 7390323  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7390322 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcataatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 7390223  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7390222 taatttatgcaaaatagcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctaaatttaacctaattttttcgtgtgactttactacatt 7390123  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  7390122 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgtta 7390073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 8162078 - 8162427
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||              |||||    
T  8162078 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtttaattta 8162177  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8162178 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 8162277  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8162278 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacctatgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatact 8162377  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8162378 aaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 8162427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 8761486 - 8761137
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||              ||    
T  8761486 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtttaattta 8761387  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8761386 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 8761287  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8761286 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacctatgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatact 8761187  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8761186 aaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 8761137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 25835566 - 25835915
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||              |||||    
T  25835566 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtttaattta 25835665  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25835666 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 25835765  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25835766 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacctatgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatact 25835865  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25835866 aaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 25835915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 195 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 32846321 - 32845965
Alignment:
Q  195 ttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------- 285  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||             
T  32846321 ttattttttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtt 32846222  T
Q  286 -----taatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaacc 380  Q
         ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32846221 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttttctttaattttactaaacaaattatattaacc 32846122  T
Q  381 ctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgacttta 480  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32846121 ctagatttaatttatgcaaaatgacatctcttatttttaaatgttaacctatgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgacttta 32846022  T
Q  481 ctatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  32846021 ctatactaaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatatcttatttctaaatgtta 32845965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 1943551 - 1943202
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||              ||    
T  1943551 ttaaagttaacccgaacgtaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtttaattta 1943452  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1943451 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 1943352  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1943351 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacctatgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatact 1943252  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1943251 aaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 1943202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 202 - 533
Target Start/End: Original strand, 8161335 - 8161680
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||              |||||    
T  8161335 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 8161434  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  8161435 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacatattatattaaccctagatt 8161534  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8161535 taatttatgcaaaatgacatatcttatttctaaatgttaacctgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 8161634  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaat 533  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  8161635 aacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaat 8161680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 41532650 - 41532999
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||              |||||    
T  41532650 ttaaaattaacccgaacgcaaaattttgtcatagatttaacctaacttttttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtttaattta 41532749  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41532750 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgtttctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccttatatt 41532849  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41532850 taatttatgcaaaatggcatctcttatttctaaatgttaacccatgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 41532949  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41532950 aactctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 41532999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 32844937 - 32844587
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||              ||    
T  32844937 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtttaattta 32844838  T
Q  288 atcgaaa-tgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatat 386  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32844837 atcaaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagat 32844738  T
Q  387 ttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatat 486  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32844737 ttaatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacctatgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatac 32844638  T
Q  487 taaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  32844637 taaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 32844587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 202 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 1944294 - 1943949
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  1944294 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctatttaattta 1944195  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  1944194 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcttaatttttctctttaattttattaaacatattatattaaccctagatt 1944095  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1944094 taatttatgcaaaatggcatatcttatttctaaatgttaacatgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 1943995  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaat 533  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  1943994 aacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaat 1943949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 202 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 8762118 - 8761773
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  8762118 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 8762019  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  8762018 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacatattatattaaccctagatt 8761919  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8761918 taatttatgcaaaatggcatatcttatttctaaatgttaacatgtgacgcaatattaaccttagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 8761819  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaat 533  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  8761818 aacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaat 8761773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 9473337 - 9472989
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta-------------- 287  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |                  
T  9473337 ttaaagttaacccggacgcaaaattttgccctagaattaacttaacttctttgcttaattttattgtattaaccctatttaattaaccatgtttaatttg 9473238  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9473237 atcaaaatgttaacgttaattgttcgggaaatcaaaataaacaaatcgttcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 9473138  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9473137 taagttatgcaaaatgacat-tcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatactagccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 9473039  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  9473038 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 9472989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 202 - 533
Target Start/End: Original strand, 25834934 - 25835279
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||              |||||    
T  25834934 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 25835033  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  25835034 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacatattatattaaccctagatt 25835133  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25835134 taatttatgcaaaatggcatatcttatttctaaatgttaacatgtgacgcaatattaaccttagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 25835233  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaat 533  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25835234 aacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaat 25835279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 202 - 525
Target Start/End: Original strand, 44381603 - 44381938
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||              |||||    
T  44381603 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccttagatttaacctaatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaacctgtttaattta 44381702  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44381703 atcaaaatgttaacgttaattgttagggatatcaaaataaacaaatcggtcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 44381802  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44381803 taatttatgtaaaatggcatctc--atttctaaaggttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttattatatt 44381900  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttat 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  44381901 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctattat 44381938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 202 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 32845681 - 32845336
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||              ||    
T  32845681 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtagtaaccctatttaattaaccctgtttaattta 32845582  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  32845581 atcaaaatgttaacgttaattgttagagaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacatattatattaaccctagatt 32845482  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32845481 taatttatgcaaaatggcatatcttatttctaaatgttaacatgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 32845382  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaat 533  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32845381 aacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaat 32845336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 41157754 - 41157416
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgc-----ttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatg 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||       |||| | || |  ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  41157754 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttaccctaaatttaacctaacttcttttactgtattaactctatttaattaaccctatttaatttaatcaaaatg 41157655  T
Q  297 ttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatg 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  41157654 ttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccttagatttaatttatg 41157555  T
Q  397 caaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctaga 496  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  41157554 caaaatgacatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaactcaattttttc--gtgactttactatattaaccctagt 41157457  T
Q  497 tttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  41157456 tttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttcaaaatgtta 41157416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 208 - 537
Target Start/End: Original strand, 25619604 - 25619946
Alignment:
Q  208 ttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------taatcgaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||              ||||||||    
T  25619604 ttaacccgaacgcaaaattttgccttagatttaacctaacttatttgcttaagtttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaatttaatcgaa 25619703  T
Q  294 atgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaattt 393  Q
     |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  25619704 -tgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaatagattatattaaccctatatttaattt 25619802  T
Q  394 atgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccct 493  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25619803 atgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaactctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaacct 25619902  T
Q  494 agatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||| || | || ||| |||||||||    
T  25619903 agatttaatttatgcaaaatgtcatattttctttctaaatgtta 25619946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 315 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 25346667 - 25346445
Alignment:
Q  315 gaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat 414  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25346667 gaaatcaaaataaacaaatatctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgacatctcttat 25346568  T
Q  415 ttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 514  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  25346567 ttctaaatgttaacccgtgacgcaatattagccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgaaaaata 25346468  T
Q  515 ttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    | ||||||||||| |||||||||    
T  25346467 tcatctcttatttctaaatgtta 25346445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 25345553 - 25345387
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25345553 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 25345454  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25345453 tgtgactttacaatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttttaaatgtta 25345387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 34893912 - 34893746
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34893912 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 34893813  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34893812 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 34893746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 371 - 534
Target Start/End: Original strand, 44381196 - 44381359
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  44381196 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttttaaatgttaacccgtaacgcaatattaaacctaaatttaacctaattttttcg 44381295  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatg 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44381296 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatg 44381359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 36777399 - 36777233
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  36777399 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaaccgatgatgcaatattagccctagatttaacctaattttttcg 36777300  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36777299 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 36777233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 25618982 - 25619146
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  25618982 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacctaattttt--g 25619079  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25619080 tgtgactttactatattaaccttagatttaatttaagcaaaatgtcatatcttatttttaaatgtta 25619146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 7390876 - 7390710
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  7390876 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgctaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttca 7390777  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  7390776 tgtgactttactatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgtta 7390710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 34893801 - 34893635
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  34893801 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaatctaattttttcg 34893702  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  34893701 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaaagtcatctcttatttctaaatgtta 34893635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 9473681 - 9473525
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  9473681 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 9473583  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9473582 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctctaatttt 9473525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 4464837 - 4465003
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4464837 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtaatctcttatttttaaatgctaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 4464936  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  4464937 tgtgactttactataacaaccctagatttaatttatgcaaaatgtaatatcttatttctaaatgtta 4465003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 8161629 - 8161795
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8161629 tatattaacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaattttaacccctgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 8161728  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  8161729 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataactgtta 8161795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 25615507 - 25615673
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25615507 tatattaactctatatttaatttatgcaaaatggcatctcttatttttaaatgttaacccgcgacgcaatattaaccctaaatttaacctaattttttcg 25615606  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  25615607 tgtgactttactatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgtta 25615673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 1944000 - 1943834
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1944000 tatattaacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaattttaacccttgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 1943901  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||    
T  1943900 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctgttatttctaactgtta 1943834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 8762457 - 8762301
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8762457 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 8762359  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8762358 ggtgactttactatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 8762301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 25834595 - 25834751
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25834595 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 25834693  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25834694 ggtgactttactatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 25834751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 32846653 - 32846497
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  32846653 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 32846555  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32846554 ggtgactttactatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 32846497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 24250601 - 24250767
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  24250601 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatataatctcttatttctaaatgttatcccgtgacgcaatattacccctagatttaatctaattttttcg 24250700  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24250701 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 24250767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 32845387 - 32845221
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  32845387 tatattaacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaattttaacccctgacgcaatattaacccaagatttaacctaattttttcg 32845288  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  32845287 tgtgacattactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatttcttatttctaactgtta 32845221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 1944633 - 1944477
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1944633 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 1944535  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  1944534 ggtgactttactatattaatcctagatttaatttatgcaaaatatcatctctaatttt 1944477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 8161015 - 8161171
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8161015 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctatatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 8161113  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8161114 ggtgactttactatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 8161171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 36778038 - 36777881
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaa-cccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttc 469  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  36778038 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaaccccgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttc 36777940  T
Q  470 gtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  36777939 gcgtgactttactatattaaccctagatttaattaatgcaaaatgtcatctctaatttt 36777881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 41158204 - 41158038
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  41158204 tatattaaccctagatttaatttattcaaaatggcatctcttatttttaaatgttaacccgtgacacaatattaaccttaaatttaacctaattttttcg 41158105  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41158104 tgtgactttactatattattcctagatttaatttgtgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 41158038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 24254641 - 24254798
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24254641 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacttaattttttcg 24254740  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24254741 cgtgactttactatattaaccttgaatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 24254798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 374 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 8762571 - 8762402
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat-------ttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttt 466  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8762571 attaaccctagatttaatttctgcaaaatgtcatctcttatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaatttt 8762472  T
Q  467 ttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8762471 tt-gtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 8762402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 374 - 537
Target Start/End: Original strand, 25834481 - 25834650
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat-------ttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttt 466  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25834481 attaaccctagatttaatttctgcaaaatgtcatctcttatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaatttt 25834580  T
Q  467 ttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25834581 tt-gtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 25834650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 8161740 - 8161895
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  8161740 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataactgttaacccgtgatgcaatatgaaccctagatttaaccta--tttttcg 8161837  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  8161838 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaaagtcatctctaatttt 8161895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 4465582 - 4465738
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4465582 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgttaatccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 4465680  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  4465681 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 4465738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 25615618 - 25615774
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25615618 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgttaatccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 25615716  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  25615717 cgtgattttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 25615774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 41157471 - 41157315
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41157471 tatattaaccctagttttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttcaaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 41157373  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  41157372 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtaaactctaatttt 41157315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 374 - 537
Target Start/End: Original strand, 8160901 - 8161070
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat-------ttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttt 466  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8160901 attaaccctagatttaatttctgcaaaatgtcatctcttatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaatttt 8161000  T
Q  467 ttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  8161001 tt-gtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctatatgtta 8161070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 1943889 - 1943734
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  1943889 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctgttatttctaactgttaacccgtgatgcaatatgaaccctagatttaaccta--tttttcg 1943792  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  1943791 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaaagtcatctctaatttt 1943734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 188 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 34894262 - 34894080
Alignment:
Q  188 taatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta 287  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||  || |||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||    
T  34894262 taatctcttattccttaaagttaaaccgaacgcaaaattttgccttaaatttaacctaatttccttgcttaaatttactatattaacactatttaattta 34894163  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    ||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34894162 atcaaaatcttaatgttaattgttagggaaatcaaaatgaacaaatcgctcataatttttctccttaattttactaaacaaat 34894080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 12761048 - 12760892
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12761048 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacctgtgacgcaatgttaaccctagatttaacct-attttttcg 12760950  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  12760949 cgtgactttactatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 12760892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 374 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 1944746 - 1944578
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat-------ttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttt 466  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1944746 attaaccctagatttaatttctgcaaaatgtcatctcttatctcttatttttaaatgt-aacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaatttt 1944648  T
Q  467 ttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1944647 tt-gtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 1944578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 374 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 32846767 - 32846598
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat-------ttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttt 466  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32846767 attaatcctagatttaatttctgcaaaatgtcatctcttatctcatatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaatttt 32846668  T
Q  467 ttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  32846667 ttt-tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 32846598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 34894028 - 34893857
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctctt-----atttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattt 465  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||     |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  34894028 tatattgatcctaaatttaatttatgcaaaatgtcatctcttctcttatttctaaatgttaatccgtgacgcaatattaaccctaaatttaatctaattt 34893929  T
Q  466 tttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34893928 tttcgcgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 34893857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 32845276 - 32845121
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  32845276 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatttcttatttctaactgttaacccgtgatgcaatatgaaccctagatttaaccta--tttttcg 32845179  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  32845178 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaaagtcatctctaatttt 32845121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 374 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 7390125 - 7389989
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgt 473  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  7390125 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgttaatccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcgcgt 7390027  T
Q  474 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaa 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7390026 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaa 7389989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 12761681 - 12761525
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |    
T  12761681 tataataacactagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaactcgtgacgcaatattaaccctatatttaacct-atttttttg 12761583  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12761582 cgtgactttactatattaaccctagatttcatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 12761525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 25619254 - 25619410
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  25619254 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttttaaatgttaatccgtgacgcaatattaaccatagatttaacct-attttttcg 25619352  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||    
T  25619353 cgtgactttactatattaactctagatttaatttatgaaaaatctcatctctaatttt 25619410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 41532944 - 41533100
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41532944 tatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatctgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 41533042  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  41533043 cgtgactttacgatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 41533100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 372 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 25345441 - 25345299
Alignment:
Q  372 atattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgt 471  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||     
T  25345441 atattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttttaaatgttaatctgtgacgcaatattaaccctagatttaacat-attttttcgc 25345343  T
Q  472 gtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25345342 gtgactttactatattaaccctagacttaatttatgcaaaatgt 25345299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 501
Target Start/End: Original strand, 24250712 - 24250842
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24250712 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacacaatattaaccctagatttaatctaattttttcg 24250811  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaa 501  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24250812 cgtgactttactatattaatcctagatttaa 24250842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 1943257 - 1943101
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1943257 tatactaaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 1943159  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  1943158 cgtgactttactatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 1943101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 8162372 - 8162528
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8162372 tatactaaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 8162470  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  8162471 cgtgactttactatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 8162528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 8761192 - 8761036
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8761192 tatactaaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 8761094  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  8761093 cgtgactttactatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 8761036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 25835860 - 25836016
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25835860 tatactaaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 25835958  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  25835959 cgtgactttactatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 25836016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 377 - 528
Target Start/End: Original strand, 4464954 - 4465104
Alignment:
Q  377 aaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgac 476  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  4464954 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtaatatcttatttctaaatgttaatccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcgcgtgac 4465052  T
Q  477 tttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  4465053 tttactatattaactctagatttaatttatgcaaaatctcatctctaatttt 4465104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 414 - 537
Target Start/End: Original strand, 24254573 - 24254696
Alignment:
Q  414 tttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 513  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24254573 tttttaaatgttaactcgtgactcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgcgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 24254672  T
Q  514 gttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    || ||||||||||| |||||||||    
T  24254673 gtcatctcttatttctaaatgtta 24254696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 32844642 - 32844486
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  32844642 tatactaaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgtaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 32844544  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  32844543 cgtgactttactatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 32844486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 41158093 - 41157937
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  41158093 tatattattcctagatttaatttgtgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatctgcgatgcaatattaaccctagatttaa-cttattttttcg 41157995  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  41157994 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatatcatctctaatttt 41157937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 41978403 - 41978247
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  41978403 tatattaaccctagatttaatttattcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccatgacgcaatattaaccctaaatttaacct-gttttttcg 41978305  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  41978304 cgtgactttactatattaaccctaaacttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 41978247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 398 - 537
Target Start/End: Original strand, 25615423 - 25615562
Alignment:
Q  398 aaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagat 497  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  25615423 aaaatggcatctcctatttctaaatgttaacccgtgagacattattaaccctaaatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaactctatat 25615522  T
Q  498 ttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  25615523 ttaatttatgcaaaatggcatctcttatttttaaatgtta 25615562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 8761824 - 8761669
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  8761824 tatattaacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaattttaacctctgacgcaatattaaccctagatttaaccta--tttttcg 8761727  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||    
T  8761726 cgtgactttaccatattaaccctagatttaatttattcaaaaagtcatctctaatttt 8761669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 25835228 - 25835383
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  25835228 tatattaacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaattttaacctctgacgcaatattaaccctagatttaaccta--tttttcg 25835325  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||    
T  25835326 cgtgactttaccatattaaccctagatttaatttattcaaaaagtcatctctaatttt 25835383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 34893690 - 34893527
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |   |||| || || |||||||||||||||||||     
T  34893690 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaaagtcatctcttatttctaaatgttaacccgttacg---tatttacgctagatttaacctaattttttca 34893594  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| |||||    
T  34893593 ggtgactttactatattaaccatagatttaatttacgcaaaatgtcatcttttatttctaattgtta 34893527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 371 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 7390765 - 7390624
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  7390765 tatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgttaatctgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttca 7390667  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 513  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  7390666 cgtgactttactatattaactctagatctaatttatgcaaaat 7390624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 32846020 - 32845864
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  32846020 tatactaaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatatcttatttctaaatgttaacccgtgtcgtaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 32845922  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  32845921 cgtgactttactatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 32845864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 380 - 528
Target Start/End: Original strand, 41532320 - 41532467
Alignment:
Q  380 cctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgacttt 479  Q
    |||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  41532320 cctagatttaatttatacataatgccatctcttatttctaaatgttaatccatgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcgcgtgacttt 41532418  T
Q  480 actatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||    
T  41532419 actatattaaccctagatttaatttatgtaaaatttcatctctaatttt 41532467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 25619891 - 25620047
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||     
T  25619891 tatattaaacctagatttaatttatgcaaaatgtcatattttctttctaaatgttaatctgtgacgcaatattaaccctagatttaacat-attttttca 25619989  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||    
T  25619990 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttctgcaaaatgtcagctctaatttt 25620047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 371 - 499
Target Start/End: Original strand, 25619091 - 25619218
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25619091 tatattaaccttagatttaatttaagcaaaatgtcatatcttatttttaaatgttaatccgcgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 25619189  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagattt 499  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25619190 cgtgactttactatattaactctagattt 25619218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 371 - 461
Target Start/End: Original strand, 40586925 - 40587015
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40586925 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaaccggtgatgcaatattaaccctagatttaaccta 40587015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 422 - 539
Target Start/End: Original strand, 24250541 - 24250658
Alignment:
Q  422 tgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctc 521  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  24250541 tgttaatccgtgacacaatattaaccctagatctaacctaattttttcacgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatataatctc 24250640  T
Q  522 ttatttttaaatgttatc 539  Q
    |||||| |||||||||||    
T  24250641 ttatttctaaatgttatc 24250658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 188 - 300
Target Start/End: Original strand, 37588310 - 37588422
Alignment:
Q  188 taatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta 287  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  37588310 taatctcttattccttaaagttaacccgaacgccaaattttgccctagatttaacctaactcctttgcttaattttactatattaaccctatttaattta 37588409  T
Q  288 atcgaaatgttaa 300  Q
    ||| |||||||||    
T  37588410 atcaaaatgttaa 37588422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 369 - 515
Target Start/End: Original strand, 44381893 - 44382028
Alignment:
Q  369 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttttt 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||           |||| ||||||    
T  44381893 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctattatgtctaaatattaacccgtgacgcaatattaac-----------cctattttttt 44381981  T
Q  469 cgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44381982 tgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 44382028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 38295465 - 38295306
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcga 292  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | |||||| || | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  38295465 tcttattccttaaa-ttaacccgaaagtaaaattgtgtcttagatttaacctaacttctttgctgaattttactatattaaccctatttaatttaatcaa 38295367  T
Q  293 aatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaatttt 359  Q
    |||      ||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38295366 aat------gttaattgttatggaaatcaaagtaaacaattcgctcctaatttttctccttaatttt 38295306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 371 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 9473044 - 9472954
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  9473044 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaaccggtgatgcaatattagccctagatttaaccta 9472954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 451 - 537
Target Start/End: Original strand, 25619223 - 25619309
Alignment:
Q  451 gatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25619223 gatttaaccttattttttcgtgttactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttttaaatgtta 25619309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 34894667 - 34894564
Alignment:
Q  188 taatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta 287  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  34894667 taatctcttattccttaaagttaacctgaacgtaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaaatttactatattaaccctatttaattta 34894568  T
Q  288 atcg 291  Q
    ||||    
T  34894567 atcg 34894564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 371 - 457
Target Start/End: Original strand, 44381307 - 44381393
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaa 457  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  44381307 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgctaacccgtgacgcagtattaaccctagatttaa 44381393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 277 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 34894359 - 34894267
Alignment:
Q  277 tatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34894359 tatttaatttaatcaaaattttaatgttaattgttagggaaatcaaaatgaacaa-tcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 34894267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 452 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 12761713 - 12761626
Alignment:
Q  452 atttaacctaattttttcgtgtgactttactatat--taaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12761713 atttgacctaattttttcgtgtgactttactatataataacactagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgtta 12761626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 25346500 - 25346404
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttt 467  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  25346500 tatattaaccctagatttaatttatgaaaaatatcatctcttatttctaaatgttaaccggtgatgcaatattaaccctatatttaacctatttttt 25346404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 406 - 525
Target Start/End: Original strand, 24250885 - 24251003
Alignment:
Q  406 atctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaattta 505  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24250885 atctcttatttctaaatgttcacccgtgacgca-tattaaccctagatttcatctaattttttcgcgtgactttactatattaatcctagattcaattta 24250983  T
Q  506 tgcaaaatgttatctcttat 525  Q
    || ||||| | |||||||||    
T  24250984 tgaaaaatctcatctcttat 24251003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 371 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 36777288 - 36777198
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| || | |||||||||||    
T  36777288 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaaccgatgatgcaatattagccatagatttaaccta 36777198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 34893582 - 34893454
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | | ||||||||||||  ||||||| | ||||||| |    
T  34893582 tatattaaccatagatttaatttacgcaaaatgtcatcttttatttctaattgttaacccgttacgtaatattaaccctatatttaacat-atttttttg 34893484  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagattta 500  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34893483 cgtgactttactatattaaccatagattta 34893454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 375 - 447
Target Start/End: Original strand, 41532249 - 41532321
Alignment:
Q  375 ttaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaacc 447  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41532249 ttaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttttaaatgttaacccgtgacgaaatattaacc 41532321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 197 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 34894931 - 34894843
Alignment:
Q  197 attctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt 285  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  34894931 attctttaaagttaacccgaaagtaaaattttgccatagatttaacctaacttctttgtttaaatttactatattaaccctatttaatt 34894843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 285
Target Start/End: Original strand, 37588144 - 37588236
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt 285  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| |||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  37588144 tcttattcattaaagttaatccgaacgcaaaattttaccctagatttaacctaactcattttcttaattttactatattaaccatatttaatt 37588236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 454 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 34894056 - 34893987
Alignment:
Q  454 ttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctctt 523  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  34894056 ttaatctaattttttcgcgtgactttactatattgatcctaaatttaatttatgcaaaatgtcatctctt 34893987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 285
Target Start/End: Original strand, 44428425 - 44428513
Alignment:
Q  195 ttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt 285  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||  || |||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  44428425 ttattctttaaagtcaacccgaatgcaagattttgtcctagatt--acctaacttctttgcttaattttactatattaaccatatttaatt 44428513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 295
Target Start/End: Original strand, 37588040 - 37588142
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcga 292  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||   ||| |||||||||| | |||||| | |||||||||||||| |    
T  37588040 tcttattcattaaagttaatccgaacgtaaaattttgtcatagatttaacctaactctttttcttaattttattatattaaccttatttaatttaatcaa 37588139  T
Q  293 aat 295  Q
    |||    
T  37588140 aat 37588142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 24055509 - 24055464
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttattt 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24055509 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 24055464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 370
Target Start/End: Original strand, 44428529 - 44428582
Alignment:
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44428529 aatcaaaataaataaattgttcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 44428582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 1944111 - 1944056
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||    
T  1944111 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatggcatatcttatttctaaatgtta 1944056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 8161518 - 8161573
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||    
T  8161518 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgacatatcttatttctaaatgtta 8161573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 8761935 - 8761880
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||    
T  8761935 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatggcatatcttatttctaaatgtta 8761880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 25835117 - 25835172
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||    
T  25835117 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatggcatatcttatttctaaatgtta 25835172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 32845498 - 32845443
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||    
T  32845498 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatggcatatcttatttctaaatgtta 32845443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 525
Target Start/End: Original strand, 42244708 - 42244751
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttat 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42244708 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat 42244751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 372 - 417
Target Start/End: Original strand, 24250409 - 24250454
Alignment:
Q  372 atattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24250409 atattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 24250454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 483 - 528
Target Start/End: Original strand, 24250409 - 24250454
Alignment:
Q  483 atattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24250409 atattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 24250454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 4464727 - 4464782
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  4464727 tatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttataaacgtta 4464782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 552 - 599
Target Start/End: Original strand, 19959414 - 19959461
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgtctctgctgctc 599  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  19959414 ccttgcttgctttgatttttgatttatatatttgtgtttgtgctgctc 19959461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Original strand, 2680363 - 2680416
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaat 70  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  |||||||||||    
T  2680363 cttcgcacgggttgaataatgtatttttcaaaaatttaattgtgaaggagaaat 2680416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 439 - 500
Target Start/End: Original strand, 24250824 - 24250885
Alignment:
Q  439 atattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagattta 500  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24250824 atattaatcctagatttaacctatattttttgcgtgactttactatattaaccctggattta 24250885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 266
Target Start/End: Original strand, 37587961 - 37588034
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttact 266  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||   ||| ||||||||||||    
T  37587961 tcttattcattaaagttaacccgaacgtaaaattttaccttagatgtaacctaactctttttcttaattttact 37588034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 286
Target Start/End: Original strand, 44428771 - 44428864
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattt 286  Q
    |||||||  |||||||||||||| | | || |||||| | |||||||| | |||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44428771 tcttattacttaaagttaacccgtaagtaatattttgtcttagatttaccttaatttctctgcttaattttactatattaattctatttaattt 44428864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 408878 - 408842
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  408878 ccttgcttgctttgctttttgatttatatatttgtgt 408842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 22731472 - 22731440
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatattt 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22731472 ccttgcttgctttggtttttgatttatatattt 22731440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 457
Target Start/End: Original strand, 24250375 - 24250427
Alignment:
Q  405 catctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaa 457  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24250375 catctcatatttctaaatgttaactcgtgacgcaatattaaccctagatttaa 24250427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 34894736 - 34894680
Alignment:
Q  293 aatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttct 349  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  34894736 aatgttaatgttaattgttatggaaatcaaaatgaacaaattgctcctcatttttct 34894680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 232
Target Start/End: Original strand, 37588478 - 37588522
Alignment:
Q  188 taatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccc 232  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37588478 taatctcttattccttgaagttaacccgaacgcaaaattttgccc 37588522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Original strand, 44381376 - 44381420
Alignment:
Q  373 tattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  44381376 tattaaccctagatttaatttatgcaaaatatcatctctaatttt 44381420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 484 - 528
Target Start/End: Original strand, 44381376 - 44381420
Alignment:
Q  484 tattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  44381376 tattaaccctagatttaatttatgcaaaatatcatctctaatttt 44381420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 7390987 - 7390932
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  7390987 tatattaactctatatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttataaacgtta 7390932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 18488733 - 18488686
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgtctctgctgctc 599  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18488733 ccttccttgctttgctttttgatttatatatttgtgtttgtgctgctc 18488686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 34894818 - 34894771
Alignment:
Q  302 gttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttct 349  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34894818 gttaattgttatggaaatcaaaatgaacaaattgctcctaatttttct 34894771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Original strand, 4465058 - 4465104
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  4465058 tatattaactctagatttaatttatgcaaaatctcatctctaatttt 4465104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 356
Target Start/End: Original strand, 37588260 - 37588313
Alignment:
Q  302 gttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaat 356  Q
    |||||||| |  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37588260 gttaattggtgtggaaatcaaaatgaacaaatcgc-cctaatttttctccttaat 37588313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Original strand, 41532421 - 41532467
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  41532421 tatattaaccctagatttaatttatgtaaaatttcatctctaatttt 41532467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 405
Target Start/End: Original strand, 44381995 - 44382029
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtc 405  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44381995 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtc 44382029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 360
Target Start/End: Original strand, 44428940 - 44428982
Alignment:
Q  318 atcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaatttta 360  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  44428940 atcaaaataaataaatcactcctaatttttctacttaatttta 44428982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 417; Significance: 0; HSPs: 138)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 537
Target Start/End: Original strand, 19320443 - 19320959
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  19320443 gcacgggttgaataacgtatttttttaaaatttagtttcgaatgagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttttaaatgtgaaaatcaaagt 19320542  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19320543 tgcgtaaaccaaaattttgtaacacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgc 19320642  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatc 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19320643 aaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatc 19320742  T
Q  321 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19320743 aaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaattttactaaaaaaactatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaa 19320842  T
Q  421 atgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19320843 atgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatct 19320942  T
Q  521 cttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||| |||||||||    
T  19320943 cttatttctaaatgtta 19320959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 47137882 - 47137361
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtat-tttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  47137882 cttcgcacgggttgaataacgtaactttttaaaaatttcgcttcgaaggagaaatattataaattacggaaaaatgttgtcctttataaatgtaaaaatc 47137783  T
Q  116 aaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccg 215  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  47137782 aaagctgcataaaccaaaattttgcaacacagagcctaaagcactacataaaaaataacataataactattgtaatctcttattccttaaagttaacccg 47137683  T
Q  216 aacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  47137682 aacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcctaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggg 47137583  T
Q  316 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47137582 aaatcaaaataaacaaatagctcctaatttttctccttaattttactaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 47137483  T
Q  416 tttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47137482 tataaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaatttttttgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 47137383  T
Q  516 tatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  47137382 catctcttatttttaaatgtta 47137361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 38896838 - 38896318
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaa-tcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38896838 cttcgcacgggttgaataacgtatttttttaaaatttagtttcgaaggaaaaaatcttataaattacagaaaattgttgtcatttataaatgtgaaaatc 38896739  T
Q  116 aaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccg 215  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||||  |||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  38896738 aaagctgcgtaaaccaaaattttgcaacatagagcctaaaa-actacatgaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaaattaactcg 38896640  T
Q  216 aacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggg 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  38896639 aacgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggg 38896540  T
Q  316 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 415  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38896539 aaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 38896440  T
Q  416 tttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38896439 tataaacgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaaactaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 38896340  T
Q  516 tatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     || ||||| ||||||||||||    
T  38896339 catatcttaattttaaatgtta 38896318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Original strand, 46623395 - 46623922
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||||| |    
T  46623395 cttcgcacgagttgaataacgtatttttttaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacgaaaaattattgtaatttataaatatgaaaataa 46623494  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46623495 aaaatgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccga 46623594  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  46623595 acgcaaaattttgctcaagatttaacctaacttctttgcttaattttattgtattaatcctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 46623694  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtc-------atct 409  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||       ||||    
T  46623695 gatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaacgtcatctcttatct 46623794  T
Q  410 cttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgca 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46623795 cttatttttaaatgttaacccgtgacacaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaactctagatttaatttatgca 46623894  T
Q  510 aaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  46623895 aaatgtcatctcttatttctaaatgtta 46623922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 50563475 - 50562975
Alignment:
Q  37 gtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcataaaccaaaatt 136  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  50563475 gtatttttttaaaatttagcttcgaaggagaaatcttataaattatggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaagttgcgtaaaccaaaatt 50563376  T
Q  137 ttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctaga 236  Q
    || |||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  50563375 ttacaacacagagcctaaaacactacataaaaactaacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgtaaaattttgacctaga 50563276  T
Q  237 tttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgc 336  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  50563275 tttaacctaacttctttgtttaattttactgtattaaccatatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatttc 50563176  T
Q  337 tcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatg 436  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |    
T  50563175 tcttaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataaactttaacccgtgacg 50563076  T
Q  437 caatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtt 536  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50563075 caatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctaaatttaatttatgcaaaatgtaatctcttatttttaaatgtt 50562976  T
Q  537 a 537  Q
    |    
T  50562975 a 50562975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 4893991 - 4893508
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4893991 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagttccgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttatcattgtgaaaatca 4893892  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4893891 aaactgcgtaaactaaaattttacaacacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccga 4893792  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  4893791 acgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 4893692  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttact-aaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4893691 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaattttactaaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatattatctcttatt 4893592  T
Q  416 tttaaatgttaacccgtgatgcaata-ttaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatt 498  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4893591 tttaaatgttaacccgtgacgcaatatttaaccctagatttaacctaattttttcatgtgactttactatattaaccctagatt 4893508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 1376001 - 1375497
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |    
T  1376001 gcacgggttgaataacgtatttttttaaaatttagttctgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttaccctttataaatatgaaaatcaaagt 1375902  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  1375901 tgcgtaaaccgaaaatttgcaacacagagtctaaagcactacataaaaaataacataacaattattgcaatctcttattccttaaagttaacccaaacac 1375802  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatc 320  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1375801 aaaattttaccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattacccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatc 1375702  T
Q  321 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaa 420  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||    
T  1375701 aaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttattaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc--atttataa 1375605  T
Q  421 atgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  1375604 acgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaaagtcatct 1375505  T
Q  521 cttatttt 528  Q
    || |||||    
T  1375504 ctaatttt 1375497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 498
Target Start/End: Original strand, 29184496 - 29184979
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29184496 cttcgcacggattgaataacgtattttttaaaaatttagttccgaatgagaaatcttataaattatggaaaattgttgtcctttatcaatgtgaaaatca 29184595  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29184596 aaactgcgtaaactaaaattttacaacacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccga 29184695  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  29184696 acgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 29184795  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttact-aaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  29184796 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaattttactaaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatattatcttttatt 29184895  T
Q  416 tttaaatgttaacccgtgatgcaata-ttaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29184896 tttaaatgttaacccgtgatgcaatatttaaccctagatttaacctaattttttcatgtgactttactatattaaccctagatt 29184979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 5428341 - 5427822
Alignment:
Q  18 ttcgcacgggttgaataacgtat-----tttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||     |||||  |||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5428341 ttcgcacgggttgaataacatatatatatttttttaaatttagctccgaaagagaaatcttataaat-acggaaaattgttgtcttttataaatgtgaaa 5428243  T
Q  113 atcaaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaac 212  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  5428242 atcaaagctgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattccttaaagttaat 5428143  T
Q  213 ccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgttt 312  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  5428142 tcgaacgtaaaattttgccatagatttaacataatttctctgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgtta 5428043  T
Q  313 gggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctctt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5428042 gggaaatcaaaataaacaaatcgcacataatttttctccttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatatctt 5427943  T
Q  413 atttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaa 512  Q
    |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5427942 atttataaacgttaactcgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaat-ttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaa 5427844  T
Q  513 tgttatctcttatttttaaatg 534  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  5427843 tgtcatctcttatttttaaatg 5427822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 528
Target Start/End: Original strand, 33074254 - 33074758
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  33074254 gcacgggttgaataacgtatttttttaaaatttagttctgaaggagaaatcttataaattatggaaaattgttaccctttataaatgtgaaaatcaaagt 33074353  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  33074354 tgcgtaaaccaaaaatttgcaacacagagtctaaagcactacataaaaaataacataacaattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacac 33074453  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatc 320  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  33074454 aaaattttaccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattacccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatc 33074553  T
Q  321 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaa 420  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||    
T  33074554 aaaat-aacaaatcgctccaaatttttctccttaattttattaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc--atttataa 33074650  T
Q  421 atgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  33074651 acgttaatccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagattttatttatgcaaaaagtcatct 33074750  T
Q  521 cttatttt 528  Q
    || |||||    
T  33074751 ctaatttt 33074758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 33363595 - 33363111
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33363595 cttcgcacggattgaataacgtattttttaaaaatttagttccgaatgagaaatcttataaattatggaaaattgttgtcctttatcaatgtgaaaatca 33363496  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33363495 aaattgcgtaaactaaaattttacaacacagagcctaaaatactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccga 33363396  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  33363395 acgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 33363296  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttact--aaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat 414  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  33363295 aatcaaaataaacaaatagctcctaatttatctccttaattttattaaaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatattatctcttat 33363196  T
Q  415 ttttaaatgttaacccgtgatgcaata-ttaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatt 498  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33363195 ttttaaatgttaacctgtgacgcaatatttaaccctagatttaacctaattttttcatgtgactttactatattaaccctagatt 33363111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 67 - 537
Target Start/End: Original strand, 51964532 - 51965001
Alignment:
Q  67 aaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataa 166  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| | ||    ||| |||| |||||    
T  51964532 aaatcttataaattacggaaagttgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaggtgcggaaaccaaaattttgcaacactgaactaaaaacactacataa 51964631  T
Q  167 aaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttact 266  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  51964632 aaaataacataacaattattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaaggcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttatt 51964731  T
Q  267 gtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaac 366  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  51964732 gtattaaccctatttaatttaatcaaaatattaacgttaattgttagg-aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaac 51964830  T
Q  367 aaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttt 466  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  51964831 aaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatggcatatcttatttttaaatgttaacccgtgacacaatattaaccctaaatttaacctaatttt 51964930  T
Q  467 ttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  51964931 ttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 51965001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 22 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 1828456 - 1827950
Alignment:
Q  22 cacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaatt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  1828456 cacgggttgaataacgtattttttttaaatttagttgtgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcgtttataaatgtgaaaatcaaagct 1828357  T
Q  122 gcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgca 221  Q
    |  |||||||| | |||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1828356 gtgtaaaccaagaatttgtaacacaaagtctaaagcactgcataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgca 1828257  T
Q  222 aaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatca 321  Q
    ||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1828256 aaaattttccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatca 1828157  T
Q  322 aaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaa 421  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  1828156 aaat-aacaaatcgctcctaatttttatccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc--atttataaa 1828060  T
Q  422 tgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctc 521  Q
     ||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  1828059 cgttaacctgtgacgcaatgttaaccctagatttaacctaa-tttttcgtgtgactttactatattaa-cctagatttaattaatgcaaaatgtcatcta 1827962  T
Q  522 ttatttttaaat 533  Q
    |||||| |||||    
T  1827961 ttatttctaaat 1827950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 28573179 - 28572664
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  28573179 gcacgggttgaataacgtattttttttaaatttagttttgaaggagaaatcttataaattacagaaaattgttgtcatttataaatgtgaaaatcaaagc 28573080  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  28573079 tgcgtaaaccaaaaatttgcaacacagagtctaaaacactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagc 28572980  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatcttt--------------gcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaa 306  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| | |||              |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  28572979 aaaatttttccctagatttaacctaacttatttaacctaacttatttgcttaattttactgcattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttag 28572880  T
Q  307 ttgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtca 406  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  28572879 ttgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgcca 28572781  T
Q  407 tctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttat 506  Q
     |||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  28572780 gctc--atttataaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaccctaattttttcgtgtgactttactaaattaactctagatttaatttct 28572683  T
Q  507 gcaaaatgttatctcttat 525  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  28572682 gcaaaatgtcatctcttat 28572664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 164 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 52312099 - 52311729
Alignment:
Q  164 taaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaatttt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  52312099 taaaaaataacataacaactattgtaatttcttattctttaaagttaacccaaatgcaaaattttgccctagatttaaactaacttctttgcttaatttt 52312000  T
Q  264 actgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttacta 363  Q
     ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52311999 cctgtattaaccttatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaaggaaatcaaaataaacaaatcgcacctaatttttctccttaattttacta 52311900  T
Q  364 aacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaat 463  Q
    || ||||||||   ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  52311899 aataaattata---actgtagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataaacgttaacccgtgacgcaatattaactctagatttaacctaat 52311803  T
Q  464 tttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52311802 tttttcgtgtgactttacaatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 52311729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 5427421 - 5427086
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaac 301  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5427421 ttaaagttaacccggacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttattgtattaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaac 5427322  T
Q  302 gttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaa 401  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5427321 gttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaa 5427222  T
Q  402 tgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaa 501  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5427221 tggcatctcttatttgtaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctaaatttaacctaattttttcgtatgactttactatattaatcctagatttaa 5427122  T
Q  502 tttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  5427121 tttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgtta 5427086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 38895913 - 38895578
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaac 301  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  38895913 ttaaagttaacccagacgcaaaattttgccctagaattaacctaacttctttacttaattttattgtattaacactatttaatttaatcaaaatgttaac 38895814  T
Q  302 gttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaa 401  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38895813 gttaattgttagggaaatcaaaatgaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaa 38895714  T
Q  402 tgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaa 501  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38895713 tgtcatctcttatttataaaagttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctatatttaa 38895614  T
Q  502 tttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38895613 tttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 38895578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 21 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 16302166 - 16301711
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtat-----tttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||     |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16302166 gcacgggttgaataacgtatatttttttttataaatttagcttcaaaggataaatcttataaattacgtaaaattgttgtcttttataaatgtgaaaatc 16302067  T
Q  116 aaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccg 215  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  16302066 aaatctgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaaacactacataaaaaacaacataacaactattgtaatatcttgttccttaaagttaatccg 16301967  T
Q  216 aacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattt--------------aatttaatcgaaatgttaac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||              ||||||||| ||||||||||    
T  16301966 aacgcaaaattttgccctagatttaatcaaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatatttaatttaatcaaaatgttaac 16301867  T
Q  302 gttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaa 401  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  16301866 gttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgccccaaatttttctttttaattttactaaacaaattatatcaaccctatatttaatttatgcataa 16301767  T
Q  402 tgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaa 457  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16301766 tgacatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaa 16301711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 19321243 - 19321592
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta-------------- 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |                  
T  19321243 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaatttg 19321342  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19321343 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 19321442  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19321443 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattagccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 19321542  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19321543 aaccctaaatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 19321592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Original strand, 22194490 - 22194824
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |    
T  22194490 gcacgggttgaataacgtatttttttaaaatttaattccgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttaccctttataaatatgaaaatcaaagt 22194589  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  22194590 tgcgtaaaccgaaaatttgcaacacagagtctaaagcactacataaaaaataacataacaattattgcaatctcttattccttaaagttaacccaaacac 22194689  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatc 320  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22194690 aaaattttaccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattacccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatc 22194789  T
Q  321 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaat 356  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22194790 aaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaat 22194824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 50562507 - 50562158
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  50562507 ttaaagttaacccgaacacaaaattttgccctatatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccttgtttaattta 50562408  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50562407 atcaaaatgttaacgttaattgtttggtaaattaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 50562308  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  50562307 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtggcgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgacttctctatatt 50562208  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  50562207 aaccctagatttaatttatgtaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 50562158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 202 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 28572251 - 28571906
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  28572251 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 28572152  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  28572151 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacatattatattaaccctagatt 28572052  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28572051 taatttatgcaaaatgacatatcttatttctaaatgttaacctgtgatgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 28571952  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaat 533  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28571951 aacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaat 28571906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 4892543 - 4892194
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  4892543 ttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtttaattta 4892444  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  4892443 aataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaaccttagatt 4892344  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4892343 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacccgagacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactacatt 4892244  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4892243 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 4892194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 28571508 - 28571159
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||              ||    
T  28571508 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtttaattta 28571409  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28571408 atcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 28571309  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28571308 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacctatgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatact 28571209  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28571208 aaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 28571159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 29185944 - 29186293
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  29185944 ttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtttaattta 29186043  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  29186044 aataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaaccttagatt 29186143  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29186144 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacccgagacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactacatt 29186243  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29186244 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 29186293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 221 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 49586979 - 49586666
Alignment:
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatc 320  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| | ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  49586979 aaaattttgccctaaatttaacctaactt-tttac--aattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagagaaatc 49586883  T
Q  321 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaa 420  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  49586882 aaaataaacaaatcgttcctagtttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgacatctcttatttctaa 49586783  T
Q  421 atgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  49586782 atattaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagattttatttattcaaaatgtcatct 49586683  T
Q  521 cttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||| |||||||||    
T  49586682 cttatttctaaatgtta 49586666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 33362146 - 33361797
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||              |||||    
T  33362146 ttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttagttaatcctgtttaattta 33362047  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    |   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  33362046 aataaaatgttaacgttaattgttagggaaattaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaaccttagatt 33361947  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33361946 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacccgagacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactacatt 33361847  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  33361846 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaattgtta 33361797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 202 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 16301391 - 16301052
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  16301391 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccttagatttaacctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 16301292  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16301291 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctttttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 16301192  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16301191 taatttatgcaaaatgacatctcttacttctaaatgttaatccgtgacgcaatattaatcctagatttaacct-attttttcgcgtgactttactatatt 16301093  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  16301092 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 16301052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 202 - 505
Target Start/End: Original strand, 46624310 - 46624603
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaac 301  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  46624310 ttaaagttaacccggacgcaaaattttgccctagaattaatctaacttctttgcttaattttaccgtgttaaccctatttaatttaatcaaaatgttaac 46624409  T
Q  302 gttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaa 401  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||          ||||||||||    
T  46624410 gttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaaaaaattatattaaccc----------ttatgcaaaa 46624499  T
Q  402 tgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaa 501  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46624500 tgtcatctcttatttataaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttaatatattaaccctagatttaa 46624599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 33074940 - 33075289
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||              |||||    
T  33074940 ttaaagttaacatgaatgcaaaattttgccctagatgtaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 33075039  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  33075040 atcaaaatgttaacattaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttcactttaattttactaaacaaattttattaaccctagatt 33075139  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33075140 taatttatgtcaaatggcatctcttatttctaaatgttaacctgtgacgcaatattaaccctatatttaaccttattttttcgtgtgactttactatatt 33075239  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  33075240 aaccctagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 33075289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 52311287 - 52310944
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||              ||    
T  52311287 ttaaagttaacccgaacgtaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 52311188  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| | || |||||||| |      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  52311187 atcaatatattaacgttta------gggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatctttctctttaattttactaaacaaattatattaaccttgcatt 52311094  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52311093 taatttatgcaaaatggcatctcttatttctaaatgttagcccgtgacccaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 52310994  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  52310993 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 52310944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 22198189 - 22198538
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||              |||||    
T  22198189 ttaaagttaacctgaacgcaaaattttaccctagatgtaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 22198288  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  22198289 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaaaaaatcgctcctaatttttcactttaattttactaaaaaaattttattaaccctagatt 22198388  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22198389 taatttatgccaaatggtatctcttatttctaaatgttaatctgtgacgcaatattaaccctatatttaaccttattttttcgtgtgactttactatatt 22198488  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22198489 aaccctagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 22198538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 305
Target Start/End: Original strand, 24289223 - 24289522
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaa-aaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  24289223 gcacgggttgaataacgtatttttttttaaatttagttttgaatgagaaatcttataaattacagaaaattgttgtcatttataaatgtgaaaatcaaag 24289322  T
Q  120 ttgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacg 219  Q
     ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  24289323 ctgcgtaaaccaaaaatttgcaacacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaag 24289422  T
Q  220 caaaattttgccctag--------------atttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgtta 305  Q
    ||||||||| ||||||              ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24289423 caaaatttttccctagatttaacctaacttatttaacctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgtta 24289522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 47137416 - 47137250
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47137416 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 47137317  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  47137316 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 47137250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 47136967 - 47136809
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaac 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  47136967 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaac 47136868  T
Q  302 gttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaatttta 360  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47136867 gttaattgttagggaaatcaatataaacaaatcgctcctaatttttctctttaatttta 47136809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 28571957 - 28571791
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28571957 tatattaacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaattttaacccctgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 28571858  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  28571857 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataactgtta 28571791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 38896373 - 38896207
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  38896373 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttaattttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaatttttttg 38896274  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38896273 tgtgactttactatattaaccctatatttaatttatgtaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 38896207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 50563030 - 50562864
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| ||||||||     
T  50563030 tatattaaccctaaatttaatttatgcaaaatgtaatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattgaccttagatttaaccttattttttca 50562931  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  50562930 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 50562864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 19320904 - 19321060
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19320904 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 19321002  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19321003 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 19321060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 5427874 - 5427708
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5427874 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgctaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 5427775  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||    
T  5427774 tgtgactttaccatatcaaccatagatttaatttatacaaaatgtcatatcttatttctaaatgtta 5427708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 46623867 - 46624032
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  46623867 tatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 46623965  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  46623966 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgtta 46624032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 387 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 52311721 - 52311571
Alignment:
Q  387 ttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatat 486  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52311721 ttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatat 52311622  T
Q  487 taaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  52311621 taaatctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 52311571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 28572590 - 28572434
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  28572590 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 28572492  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  28572491 ggtgactttactatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 28572434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 386 - 537
Target Start/End: Original strand, 46625850 - 46626001
Alignment:
Q  386 tttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactata 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46625850 tttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattagccatagatttaacctaattttttcgtgtgactttactata 46625949  T
Q  486 ttaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  46625950 ttaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatcttttatttctaaatgtta 46626001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 38896262 - 38896106
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  38896262 tatattaaccctatatttaatttatgtaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatccgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 38896164  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  38896163 tgcgactttactatattaaccctaggtttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 38896106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 49587135 - 49586978
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  49587135 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattattatcctttataaatgtaaaaatcaaaat 49587036  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataa 178  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  49587035 tgtgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaaacactatataaaaaataacataa 49586978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 202 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 1827553 - 1827338
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||  |||||  || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  1827553 ttaaagttaacccgaatccaaaaaatttccctagatttaacctaacttctttgtttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 1827454  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1827453 atcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 1827354  T
Q  388 taatttatgcaaaatg 403  Q
    ||||||||||||||||    
T  1827353 taatttatgcaaaatg 1827338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 47137305 - 47137149
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  47137305 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatctgtgacgcaatattaaccctagagttaacct-attttttcg 47137207  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  47137206 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 47137149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 32575892 - 32575725
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt-taaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttc 469  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||   |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32575892 tatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcacctcttatttcctaaatgttaaattgtgacgcaatattaaccctggatttaacctaattttttc 32575793  T
Q  470 gtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  32575792 gcgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 32575725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 374 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 4892246 - 4892093
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgt 473  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||    
T  4892246 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacgt-attttttcgcgt 4892148  T
Q  474 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  4892147 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 4892093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 374 - 528
Target Start/End: Original strand, 29186241 - 29186394
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgt 473  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||    
T  29186241 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacgt-attttttcgcgt 29186339  T
Q  474 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  29186340 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 29186394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 33075234 - 33075390
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33075234 tatattaaccctagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 33075332  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  33075333 tgtgactttacaatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 33075390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 374 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 28572704 - 28572535
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat-------ttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttt 466  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28572704 attaactctagatttaatttctgcaaaatgtcatctcttatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaatttt 28572605  T
Q  467 ttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28572604 tt-gtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 28572535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 28571846 - 28571691
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  28571846 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataactgttaacccgtgatgcaatatgaaccctagatttaaccta--tttttcg 28571749  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  28571748 cgtgactttactttattaaccctagatttaatttatgcaaaaagtcatctctaatttt 28571691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 374 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 33361849 - 33361696
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgt 473  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||    
T  33361849 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaattgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacgt-attttttcgcgt 33361751  T
Q  474 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  33361750 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 33361696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 5427141 - 5426985
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  5427141 tatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgttaatccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 5427043  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  5427042 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 5426985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 50562213 - 50562057
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  50562213 tatattaaccctagatttaatttatgtaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaactcgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 50562115  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  50562114 cttgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 50562057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 373 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 45914532 - 45914377
Alignment:
Q  373 tattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtg 472  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  45914532 tattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttttaaatgttaactcgtgacgcaatattaaccctagatttaacctattttttccgcg 45914433  T
Q  473 tgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  45914432 agactttactatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 45914377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 378 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 4892875 - 4892726
Alignment:
Q  378 accctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgact 477  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  4892875 accctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatccttgatgcaatattaaccctagatttaacat-attttttcgcgtgact 4892777  T
Q  478 ttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4892776 ttactatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 4892726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 378 - 528
Target Start/End: Original strand, 29185612 - 29185761
Alignment:
Q  378 accctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgact 477  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  29185612 accctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatccttgatgcaatattaaccctagatttaacat-attttttcgcgtgact 29185710  T
Q  478 ttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  29185711 ttactatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 29185761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 370 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 1827895 - 1827736
Alignment:
Q  370 ttatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttc 469  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1827895 ttatattaaacatagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttc 1827797  T
Q  470 gtgtgactttac--tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  1827796 gcatgactttactatatattaaccctagatttaatttatgcaaaaagtcatctctaatttt 1827736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 1828000 - 1827839
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1828000 tatattaacc-tagatttaattaatgcaaaatgtcatctattatttctaaatattaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 1827902  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1827901 tgtgact----tatattaaacatagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 1827839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 22198483 - 22198639
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  22198483 tatattaaccctagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgaagcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 22198581  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  22198582 agtgactttacaatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 22198639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 49586721 - 49586565
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  49586721 tatattaaccctagattttatttattcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccatgacgcaatattaaccctagatttaatct-attttttcg 49586623  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  49586622 tgtgactttactatattaaccatagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 49586565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 52311626 - 52311470
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  52311626 tatattaaatctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 52311528  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  52311527 agtgactttactatattaaaactagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 52311470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 378 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 33362478 - 33362329
Alignment:
Q  378 accctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgact 477  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  33362478 accctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatccttgatgcaatattaaccttagatttaacat-attttttcgcgtgact 33362380  T
Q  478 ttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33362379 ttactatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 33362329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 32575780 - 32575620
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgt--gatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttttt 468  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||  || ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32575780 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatctgtatgacgcaatattaaccctaaatttaacctaatttttt 32575681  T
Q  469 cgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttattttt 529  Q
    || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  32575680 cgcgtgactttacgatattaactctagatttaatttatgcaaaatatcatctctaattttt 32575620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 372 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 16301729 - 16301574
Alignment:
Q  372 atattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgt 471  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  16301729 atattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttattactaaatgttaatccgtgacacaatattaaccctagacttaatcta-ttttttcgt 16301631  T
Q  472 gtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16301630 gtgactttactatattaaccctaaatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 16301574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 371 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 50562919 - 50562789
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  50562919 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacctgtgacgcaatattaatcctagatttaacct-attttttcg 50562821  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaat 502  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50562820 cgtgactttactatattaaccctagatttaat 50562789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 193 - 370
Target Start/End: Original strand, 21056084 - 21056254
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcga 292  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |    
T  21056084 tcttattccttacaattaacccgaacgcaaaattttaccatagatttaacctagcttctttgcttaattttactatattac-cctatttaatttaatcaa 21056182  T
Q  293 aatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    ||||||||      |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21056183 aatgttaa------ttgttatggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 21056254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 28571214 - 28571058
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  28571214 tatactaaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgtaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 28571116  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  28571115 cgtgactttactatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 28571058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 51964946 - 51965101
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  51964946 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacttg-gacgcattattaaccctagatttaaacta-ttttttcg 51965043  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  51965044 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 51965101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 193 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 20130788 - 20130618
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcga 292  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20130788 tcttatgccttaaagttaacccaaacgcaaaattttgcgttggatttaacctaacttctttgcttaattttactatattaatcctatttaatttaatcaa 20130689  T
Q  293 aatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    |||      ||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20130688 aat------gttaattgtat-ggaaatcaaaataaacaaaactctcctaatttttctccttagttttactaaacaaat 20130618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 52310999 - 52310857
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||  ||||||||||  ||||||     
T  52310999 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaactcgtggcacaatattaaccctatatttaaccta--tttttca 52310902  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52310901 cgtgactttactatattaaccctaaatttaatttatgcaaaatgt 52310857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 372 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 5427762 - 5427607
Alignment:
Q  372 atattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgt 471  Q
    |||| |||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  5427762 atatcaaccatagatttaatttatacaaaatgtcatatcttatttctaaatgttaatccgcgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcgc 5427664  T
Q  472 gtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  5427663 gtgactttactatattaactctagatttaatttatgcaaaatctcatctctaatttt 5427607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 409 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 45914607 - 45914479
Alignment:
Q  409 tcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgc 508  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  45914607 tcttattttttaatgttaatccgtgatgcaatattaaccctaaatttaacctaattttttcgcgtgattttactgtattaactctagatttaatttatgc 45914508  T
Q  509 aaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  45914507 aaaatgtcatatcttatttttaaatgtta 45914479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 399 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 28947446 - 28947319
Alignment:
Q  399 aaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatt 498  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28947446 aaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacacaatattaaccctatatttaacctaatttt--cgtgtgactttattatattaaccctagatt 28947349  T
Q  499 taatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  28947348 taatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 28947319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 244 - 370
Target Start/End: Original strand, 33373539 - 33373665
Alignment:
Q  244 taacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaat 343  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  33373539 taacttctttgcttaattttactatattaaccctacttaatttaatgaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgttcttaat 33373638  T
Q  344 ttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  33373639 ttttctccttaattttactaaacaaat 33373665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 46623977 - 46624122
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||    
T  46623977 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccct------------attttttcg 46624064  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  46624065 catgactttactatattaaccctagatttaatttatgtaaaatgtcatctctaatttt 46624122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 10763611 - 10763519
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10763611 cttcgcacgggttgaataacgtatttttttaaaatttagttttgaaggagaaatcttataaattacggaaaactgttgtcctttataaatgtg 10763519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Original strand, 29840708 - 29840800
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29840708 cttcgcacgggttgaataacgtatttttttaaaatttagttttgaaggagaaatcttataaattacgaaaaattgttgtcctttataaatgtg 29840800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 371 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 38895633 - 38895543
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38895633 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaaccggtgatgcaatattaaccctagatttaaccta 38895543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 411 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 28949505 - 28949391
Alignment:
Q  411 ttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaa 510  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28949505 ttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagattttacctaattttt--gtgtgactttactatattaaccctcgatttaatttaggcaa 28949408  T
Q  511 aatgttatctcttattt 527  Q
    ||||| |||||||||||    
T  28949407 aatgtcatctcttattt 28949391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 371 - 461
Target Start/End: Original strand, 19321537 - 19321627
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19321537 tatattaaccctaaatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaaccggtgatgcaatattaaccctagatttaaccta 19321627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 269 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28950734 - 28950633
Alignment:
Q  269 attaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaa 368  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  28950734 attaaccctacttaatttaatcaaaatgttaaagttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaattgttttccttaattttactaaacaa 28950635  T
Q  369 at 370  Q
    ||    
T  28950634 at 28950633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 42682615 - 42682522
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtatttttta-aaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42682615 cttcgcacgggttgaataacgtattttttttaaaatttagttctgaaggaaaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtg 42682522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 371 - 461
Target Start/End: Original strand, 46625946 - 46626036
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46625946 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatcttttatttctaaatgttaatcggtgatgcaatattaaccctagatttaaccta 46626036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 370
Target Start/End: Original strand, 8256444 - 8256628
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtatta-------------atcctat 279  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| || | |||||||||||||||||| |||||             | |||||    
T  8256444 tcttatttcttaaagttaatccgaacgcaaaattttgccatatatttaacctagcttctttgcttaattttactatattaccctatttaattaaccctat 8256543  T
Q  280 ttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    ||||||||||| |||||||||      |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  8256544 ttaatttaatcaaaatgttaa------ttgttatggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttccctttaattttactaaataaat 8256628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 451 - 528
Target Start/End: Original strand, 43991428 - 43991504
Alignment:
Q  451 gatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  43991428 gatttaacctaatttt-tcgtgtgactttactatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 43991504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 372 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 52311783 - 52311723
Alignment:
Q  372 atattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgt 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52311783 atattaaccctatatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgttaacccgt 52311723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 266
Target Start/End: Original strand, 35593623 - 35593699
Alignment:
Q  190 atatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttact 266  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  35593623 atatcttattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttaccctagatttaacctaacttctttccttaattttact 35593699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 4893636 - 4893581
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4893636 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatattatctcttatttttaaatgtta 4893581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 33363239 - 33363184
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33363239 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatattatctcttatttttaaatgtta 33363184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 455 - 521
Target Start/End: Original strand, 50278094 - 50278160
Alignment:
Q  455 taacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctc 521  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  50278094 taacctaattttttcgcgtgactttactatattaaccatagatttaatttattcaaaatgtcatctc 50278160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 455 - 521
Target Start/End: Original strand, 50289762 - 50289828
Alignment:
Q  455 taacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctc 521  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  50289762 taacctaattttttcgcgtgactttactatattaaccatagatttaatttattcaaaatgtcatctc 50289828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 440 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 1827197 - 1827110
Alignment:
Q  440 tattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  1827197 tattaaccctagatttaaccta-ttttttcgcgtgactttactatagtaactctaaatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 1827110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 430 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 28948178 - 28948107
Alignment:
Q  430 cgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaat 502  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28948178 cgtgacgcaattttaaccctagatttaacctaattttt-cgtgtgactttactatattaaccctggatttaat 28948107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 208 - 300
Target Start/End: Original strand, 35599340 - 35599432
Alignment:
Q  208 ttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaa 300  Q
    |||| |||||||||||||||| |  |||||||||| |||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  35599340 ttaatccgaacgcaaaattttacattagatttaacctaatttctttgcttaattttattatattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaa 35599432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 29184851 - 29184906
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  29184851 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatattatcttttatttttaaatgtta 29184906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 208 - 337
Target Start/End: Original strand, 35598749 - 35598872
Alignment:
Q  208 ttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaat 307  Q
    |||| |||||| |||||||||| | |||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| | ||      ||||||    
T  35598749 ttaatccgaacacaaaattttgtcttagatttaacctaacttatttgcttaattttactatattaaccctatttaattgaatcaagat------gttaat 35598842  T
Q  308 tgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgct 337  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  35598843 tgttatggaaatcaaaataaactaatcgct 35598872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 367
Target Start/End: Original strand, 33375357 - 33375406
Alignment:
Q  318 atcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaaca 367  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33375357 atcaaaataaacaaatcactcctaatttttctgcttaattttactaaaca 33375406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 489 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 4892875 - 4892827
Alignment:
Q  489 accctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4892875 accctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 4892827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 369 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 28947367 - 28947319
Alignment:
Q  369 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28947367 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 28947319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 489 - 537
Target Start/End: Original strand, 29185612 - 29185660
Alignment:
Q  489 accctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29185612 accctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 29185660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 489 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 33362478 - 33362430
Alignment:
Q  489 accctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  33362478 accctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 33362430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 28572068 - 28572013
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||    
T  28572068 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgacatatcttatttctaaatgtta 28572013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 16301620 - 16301574
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16301620 tatattaaccctaaatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 16301574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 483 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 16301729 - 16301675
Alignment:
Q  483 atattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  16301729 atattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttattactaaatgtta 16301675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 455 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 32575920 - 32575847
Alignment:
Q  455 taacctaattttttcgt-gtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttattt 527  Q
    |||||||||||||||   || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  32575920 taacctaattttttcaccgtcactatactatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcacctcttattt 32575847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 48959686 - 48959722
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48959686 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 48959722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 242
Target Start/End: Original strand, 50278385 - 50278425
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 242  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50278385 ttaaagttaacccgaacgcaaaatgttgccctagatttaac 50278425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 5427984 - 5427929
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  5427984 tatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttataaacgtta 5427929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 552 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 13927913 - 13927866
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgtctctgctgctc 599  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13927913 ccttacttgctttggtttttgatttatatatttgtgtttgtgctgctc 13927866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 16301208 - 16301153
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||    
T  16301208 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgacatctcttacttctaaatgtta 16301153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 552 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 23694453 - 23694406
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgtctctgctgctc 599  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23694453 ccttgcttgctttgcttttttatttatatatttgtgtctgtgctgctc 23694406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 303 - 370
Target Start/End: Original strand, 35593536 - 35593602
Alignment:
Q  303 ttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    |||||||||  |||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  35593536 ttaattgttatggaaattaaaataaataaatagctcctaa-ttttctccttaattttactaagcaaat 35593602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 4892139 - 4892093
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  4892139 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 4892093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 4892772 - 4892726
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4892772 tatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 4892726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Original strand, 29185715 - 29185761
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29185715 tatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 29185761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Original strand, 29186348 - 29186394
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  29186348 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 29186394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 33361742 - 33361696
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  33361742 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 33361696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 33362375 - 33362329
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33362375 tatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 33362329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Original strand, 43991458 - 43991504
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43991458 tatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 43991504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 45914423 - 45914377
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45914423 tatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 45914377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 371 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 28949436 - 28949391
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 416  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28949436 tatattaaccctcgatttaatttaggcaaaatgtcatctcttattt 28949391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 2050558 - 2050522
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2050558 ccttgcttgctttgctttttgatttatatatttgtgt 2050522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 7477467 - 7477503
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7477467 ccttgcttgctttgctttttgatttatatatttgtgt 7477503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 36869817 - 36869781
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36869817 ccttgcttgctttgctttttgatttatatatttgtgt 36869781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 45505662 - 45505626
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45505662 ccttgcttactttggtttttgatttatatatttgtgt 45505626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 49790331 - 49790295
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49790331 ccttgcttgctttgctttttgatttatatatttgtgt 49790295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 52310890 - 52310850
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctct 411  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  52310890 tatattaaccctaaatttaatttatgcaaaatgtcagctct 52310850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 16301797 - 16301742
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||    
T  16301797 tatatcaaccctatatttaatttatgcataatgacatctcttatttctaaatgtta 16301742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 5427653 - 5427607
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5427653 tatattaactctagatttaatttatgcaaaatctcatctctaatttt 5427607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 417
Target Start/End: Original strand, 22197966 - 22198007
Alignment:
Q  376 taaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22197966 taaccctagatttaatttatgcaaaaagtcatctctaatttt 22198007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 528
Target Start/End: Original strand, 22197966 - 22198007
Alignment:
Q  487 taaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  22197966 taaccctagatttaatttatgcaaaaagtcatctctaatttt 22198007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 29693411 - 29693378
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaa 50  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29693411 cttcgcacgggttgaattacgtattttttaaaaa 29693378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 482 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 1827370 - 1827338
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 514  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1827370 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatg 1827338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 370
Target Start/End: Original strand, 35598892 - 35598928
Alignment:
Q  334 cgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35598892 cgctcataatttttctccttaattttactaaataaat 35598928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 406; Significance: 0; HSPs: 139)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 537
Target Start/End: Original strand, 35155518 - 35156027
Alignment:
Q  28 ttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcataa 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  35155518 ttgaataacgtatttttttaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaagctgcgtaa 35155617  T
Q  128 accaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattt 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35155618 accaaaattttgcaacacagagtctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattt 35155717  T
Q  228 tgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataa 327  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35155718 tgcccaagatttaacctaacttctttggttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataa 35155817  T
Q  328 acaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaa 427  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  35155818 acaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataaacgttaa 35155917  T
Q  428 cccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttattt 527  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  35155918 cccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttggtgtgactttactatattaaccctagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttattt 35156017  T
Q  528 ttaaatgtta 537  Q
     |||||||||    
T  35156018 ctaaatgtta 35156027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 9151442 - 9150932
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9151442 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagctccgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 9151343  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  9151342 aagctgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttaatacttaaagttaacccga 9151243  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  9151242 acgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaactctatttaatttaatcaaaatgttaacgtttattgttaggga 9151143  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9151142 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 9151043  T
Q  417 ttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtt 516  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9151042 ttaaatgttaatccgtgatgcaatattaactgtagatttaacct-attttttcgtgtgactttgctatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtc 9150944  T
Q  517 atctcttatttt 528  Q
    |||||| |||||    
T  9150943 atctctaatttt 9150932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 44806601 - 44806082
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44806601 cttcgcactggttgaattacgtatttttttaaaatttagtttcgaatgagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 44806502  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  44806501 aagctgcgtaaaccaaaattttgcaatacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttatttcttaaagttaacccga 44806402  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  44806401 acgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgcttaattttaatgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacattaattgttaggga 44806302  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 416  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44806301 aatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg-catctcttattt 44806203  T
Q  417 ttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtt 516  Q
     |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44806202 ataaacgttaacccgtgacacaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtctgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtc 44806103  T
Q  517 atctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  44806102 atctcttatttttaaatgtta 44806082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Original strand, 27732971 - 27733492
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtatttt-ttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatc 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  27732971 cttcgcactggttgaataacgtatttttttaaaaatttagcttcggatgggaaattttataaattacggaaaattgttgtcttttataaatgtgaaaata 27733070  T
Q  116 aaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccg 215  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  27733071 aaagttgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattgtaatcttttattccttaaagttaacccg 27733170  T
Q  216 aacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  27733171 aacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggg 27733270  T
Q  316 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 415  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27733271 aaattaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 27733370  T
Q  416 tttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27733371 tataaacgttaacccgtgacgcaatatttaccttagatttaacctaattttttcgtgtgattttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 27733470  T
Q  516 tatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  27733471 catatcttatttttaaatgtta 27733492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 537
Target Start/End: Original strand, 48527431 - 48527950
Alignment:
Q  18 ttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48527431 ttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaattttagctatgaaggagaaatcttataaattacgaaaaattgttgtcctttatcaatgtgaaaatcaa 48527530  T
Q  118 aattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaa 217  Q
    || ||| |||||||||||||| |||  ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  48527531 aactgcgtaaaccaaaattttacaatacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaatccgaa 48527630  T
Q  218 cgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  48527631 cgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacattaattgttagggaa 48527730  T
Q  318 atcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48527731 atcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaattttactaaa-aatttatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 48527829  T
Q  418 taaatgttaacccgtgatgcaata-ttaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtt 516  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48527830 taaatgttaacccgttacgcaatatttaaccctagatttaacctaattttttcatgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtc 48527929  T
Q  517 atctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  48527930 atctcttatttctaaatgtta 48527950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 34873829 - 34873335
Alignment:
Q  31 aataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcataaacc 130  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||    
T  34873829 aataacatatttttttaaaatttagtttcgaatgagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatatgaaaatcaaagctgcgtaaacc 34873730  T
Q  131 aaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgc 230  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34873729 aaaattttgcaacacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgc 34873630  T
Q  231 cctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaaca 330  Q
     | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  34873629 tcaagatttaacctaacttctttgcttaattttattgtattaaccatatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaacaaaca 34873530  T
Q  331 aatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaaccc 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  34873529 aatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataaacgttaaccc 34873430  T
Q  431 gtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttat 525  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34873429 gtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat 34873335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Original strand, 31896832 - 31897348
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31896832 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagttccgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttatcaatgtgaaaatca 31896931  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31896932 aaactgcgtaaaccaaaattttacaacacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccga 31897031  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31897032 acgcaaaattttgccctagatttaacctaacttttttgcttaattttacagtagtaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 31897131  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31897132 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaattttactaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttattt 31897231  T
Q  417 ttaaatgttaacccgtgatgcaata-ttaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
    ||||||     ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31897232 ttaaat-----cccgtgacgcaatatttaaccctagatctaacctaattttttcatgtgactttgctatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 31897326  T
Q  516 tatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  31897327 catctcttatttctaaatgtta 31897348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 525
Target Start/End: Original strand, 7854984 - 7855490
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtatttttta-aaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7854984 cttcgcacgggttgaataacgtattttttttaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacgaaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatt 7855083  T
Q  116 aaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccg 215  Q
    |||  |||||   ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7855084 aaagctgcat---ccaaaattttgcaacacagagcctaaaacactacataacaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccg 7855180  T
Q  216 aacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggg 315  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  7855181 aacgcaaaattttgctcaagatttaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggg 7855280  T
Q  316 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 415  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7855281 aaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 7855380  T
Q  416 tttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
    | |||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7855381 tataaacgttaacccgtgacgcaatactaaccctagatttaacctaattttttcgcgtgactttactatattaaccttagatttcatttatgcaaaatgt 7855480  T
Q  516 tatctcttat 525  Q
     |||||||||    
T  7855481 catctcttat 7855490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Original strand, 39648000 - 39648507
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39648000 cttcgcacgggttgaataacgtatttttaaaaaatttaactccgaagaagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttatcaatgtgaaaatca 39648099  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  39648100 aagctgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagtctaaaacactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccga 39648199  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  39648200 acgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaaagttaattgttaggga 39648299  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 416  Q
    ||||||| |||||||||||||||             ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39648300 aatcaaattaaacaaatcgctcc-------------taattttactacaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttattt 39648386  T
Q  417 ttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtt 516  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39648387 ttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcatgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtt 39648486  T
Q  517 atctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  39648487 atctcttatttctaaatgtta 39648507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 29469237 - 29468733
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |    
T  29469237 gcacgggttgaataacgtatttttttaaaatttagttctgaagtagaaatcttataaattacggaaaattgttaccctttataaatatgaaaatcaaagt 29469138  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  29469137 tgtgtaaaccgaaaatttgcaacacagagtctaaagcactacataaaaaataacataacaattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacac 29469038  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatc 320  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29469037 aaaattttaccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattacccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatc 29468938  T
Q  321 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaa 420  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||    
T  29468937 aaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttattaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc--atttataa 29468841  T
Q  421 atgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  29468840 acgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaaagtcatct 29468741  T
Q  521 cttatttt 528  Q
    || |||||    
T  29468740 ctaatttt 29468733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 17172917 - 17172434
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17172917 cttcgcacggattgaataacgtattttttaaaaatttagttccgaatgagaaatcttataaattatggaaaattgttgtcctttatcaatgtgaaaatca 17172818  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17172817 aaactgcgtaaactaaaattttacaacacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccga 17172718  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  17172717 acgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 17172618  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttact-aaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  17172617 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaattttactaaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatattatcttttatt 17172518  T
Q  416 tttaaatgttaacccgtgatgcaata-ttaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17172517 tttaaatgttaacccgtgatgcaatatttaaccctagatttaacctaattttttcatgtgactttactatattaaccctagatt 17172434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 691312 - 690782
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtatttttt-aaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||||| ||||||||     
T  691312 cttcgcacgggttgaataacgtatttttttaaaaatttagttctgaaggagaaatcttataaattataaaaaattggtgttctttataaacgtgaaaatt 691213  T
Q  116 aaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccg 215  Q
    |||  ||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |    
T  691212 aaagctgcgtaaaccaaaattttgtaacccagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacttg 691113  T
Q  216 aacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggg 315  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  691112 aacgcaaaattttgccttagatttaacctaacttctttacttaattttactgtattaacccaatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggg 691013  T
Q  316 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctct---- 411  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        
T  691012 aaatcaaaataaacaaattgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatc 690913  T
Q  412 -----tatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttat 506  Q
         ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  690912 tcttatatttataaacgttaacccgtgacgcaatattaaccgtagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttat 690813  T
Q  507 gcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  690812 gcaagatgtcatcttttatttttaaatgtta 690782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 4850440 - 4849952
Alignment:
Q  48 aaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcag 147  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  4850440 aaatttggcttcgaaggataaatcttataaattatggaaaattgttgttttttataaatatgaaaatcaaagctgcgtaaaccaaaattttgcaacacag 4850341  T
Q  148 agtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataac 247  Q
    || |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4850340 agcctaaagtactacataaaaaataacataataactattgtaatatcatattccctaaagttaatccgaacgcaaaattttgccctatatttaacctaac 4850241  T
Q  248 atctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaattttt 347  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  4850240 ttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcacataaatttt 4850141  T
Q  348 ctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaacc 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  4850140 ctccttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttataaacgttaacccgtgacgcaata-taacc 4850042  T
Q  448 ctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4850041 ctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgtta 4849952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 537
Target Start/End: Original strand, 49144055 - 49144572
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaa--aaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaa 118  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49144055 gcacgagttgaataatgtattttttttttaaatttagttctgaaggagaaatcttttaaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgataatcaaa 49144154  T
Q  119 attgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaac 218  Q
      |||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  49144155 gctgcataagtcaaaattttgcaacacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcatattccttaaagttaatccgaac 49144254  T
Q  219 gcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaa 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  49144255 gcaaaattttaccctagatttaacctaatttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaa 49144354  T
Q  319 tcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattttt 418  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  49144355 tcaaaataaacaaatcacacataatttttctccttagttttactaaacaaattatattaactctagttttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttat 49144454  T
Q  419 aaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttat 518  Q
    ||| ||||||||||||  ||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49144455 aaacgttaacccgtgacccaata-taaccttagttttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcat 49144553  T
Q  519 ctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||    
T  49144554 ctcttatttttaaatgtta 49144572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 24682300 - 24682815
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  24682300 gcacgggttgaataacgtattttttttaaatttagttttgaaggagaaattttataaattacagaaaattgttgtcatttataaatgtgaaaatcaaaac 24682399  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  24682400 tgcgtaagccaaaaatttgcaacacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagc 24682499  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatcttt--------------gcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaa 306  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| | |||              |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24682500 aaaatttttccctagatttaacctaacttatttaacctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaa 24682599  T
Q  307 ttgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtca 406  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24682600 ttgttagggaaatcaaaataaa-aaatcgttcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 24682698  T
Q  407 tctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttat 506  Q
     |||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  24682699 gctc--atttataaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaccctaattttttcgtgtgactttactaaattaaccctagatttaatttct 24682796  T
Q  507 gcaaaatgttatctcttat 525  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  24682797 gcaaaatgtcatctcttat 24682815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 17 - 414
Target Start/End: Original strand, 21669250 - 21669647
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21669250 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagctccaaaggagaaatcttataaattacgaaaaattgttgttctttataaatgtgaaaatca 21669349  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21669350 aagctgcataaaccaaaattttgcaacacagatcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccga 21669449  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  21669450 acgcaaaattttgccctggatttaacctaacttcttttcttaattttattgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 21669549  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat 414  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21669550 aatcaaaataaacaaatagctcctgatttttctccttaattttaccaaacaaatttcattaaccctagatttaatttatgtaaaatgtcatctcttat 21669647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 34872916 - 34872581
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaac 301  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34872916 ttaaagttaacccggacgcaaaattttgccctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaagttaatcaaaatgttaac 34872817  T
Q  302 gttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaa 401  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34872816 gttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaa 34872717  T
Q  402 tgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaa 501  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  34872716 tgacatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattagccctagacttaacctaattttttcgtgtaactttactatattaaccctaaatttaa 34872617  T
Q  502 tttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34872616 tttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 34872581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 39278261 - 39277876
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39278261 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagctccgaaggagaaatcttataaattacgaaaaattgttgttctttataaatgtgaaaatca 39278162  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||            |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  39278161 aagctgcgtaaaccaaaattttgcaacacagatcctaaaacactacataaaaa------------ctattgtaatctcttattccttaaagttaacccga 39278074  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  39278073 acgcaaaattttgccctggatttaacctaacttcttttcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagaga 39277974  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat 414  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39277973 aatcaaaataaacaaatagctcctgatttttctccttaattttaccaaacaaatttcattaaccctagatttaatttatgtaaaatgtcatctcttat 39277876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 49145096 - 49145448
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta-----------------at 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||                 ||    
T  49145096 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaattaccctgtttaat 49145195  T
Q  285 ttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctat 384  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49145196 ttaatcaaaatgttaatgttaattgttacggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctat 49145295  T
Q  385 atttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactat 484  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49145296 atttaatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactat 49145395  T
Q  485 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||    
T  49145396 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcaaatcttatttctaaatgtta 49145448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 39648791 - 39649140
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  39648791 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcatgtttaactta 39648890  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    | | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  39648891 aacaaaatgttaacgttaattattagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaaccttagatt 39648990  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39648991 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatggtaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 39649090  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  39649091 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 39649140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 195 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 44805689 - 44805333
Alignment:
Q  195 ttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta------- 287  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |           
T  44805689 ttattttttaaagttaacccggacgcaaaattttgccctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 44805590  T
Q  288 -------atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaacc 380  Q
           ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44805589 taatttgatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaacc 44805490  T
Q  381 ctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgacttta 480  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44805489 ctagatttaatttatgcaaaatggcatctcttatttctaaatgttagcccgtgacgcaatattagccctagatttaacctaattttttcgtgtgacttta 44805390  T
Q  481 ctatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44805389 ctatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 44805333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 4849556 - 4849207
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||              ||    
T  4849556 ttaaagttaacccaaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttttagtattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 4849457  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4849456 atcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 4849357  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4849356 taatttatgcaaaatggcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 4849257  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||    
T  4849256 aaccctagatttaatttatacaaaatgtcatatcttatttctaaatgtta 4849207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 7855908 - 7856257
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta-------------- 287  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |                  
T  7855908 ttaaagttaacctggacgcaaaattttgccctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattaacattgtttaatttg 7856007  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7856008 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 7856107  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7856108 taatttatgcaaaatggcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattagccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 7856207  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7856208 aaccctaaatttaatttatacaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 7856257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 490
Target Start/End: Original strand, 11834975 - 11835473
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattt---tttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |   |||   |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11834975 cttcgcacgggttgaataacatatatatattttttaatttaattccgaaggagaaatcttataaattacagaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaa 11835074  T
Q  114 tcaaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaa----tatcttattctt---taaa 206  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||| ||   |||     
T  11835075 tcaatgttgcttaaaccaaaattttgcaacacagagtctaaaatactacataaaaaataacataacaactattatatatcttatcttattattccttaac 11835174  T
Q  207 gttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatt--------------taatttaatcga 292  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||      || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||              |||||||||  |    
T  11835175 gataacccgaacgcaaaattttgtccta------acctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctattaaatcatccatatttaatttaattaa 11835268  T
Q  293 aatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatt 392  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11835269 aatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccataattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatt 11835368  T
Q  393 tatgcaaaatgtc-------atctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactata 485  Q
    |||||||||||||       ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11835369 tatgcaaaatgtcatctcttatctcttatttataaacattaacccgtgacgcaatattaaccctaaatttaacctaatttttttgtgtgactttactata 11835468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 17171469 - 17171120
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  17171469 ttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtttaattta 17171370  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  17171369 aataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaaccttagatt 17171270  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17171269 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacccgagacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactacatt 17171170  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17171169 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 17171120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 31897632 - 31897981
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  31897632 ttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcatgtttaattta 31897731  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  31897732 aataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctcttaaaatttactaaacaaattatattaaccttagatt 31897831  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31897832 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactacatt 31897931  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  31897932 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 31897981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 219 - 537
Target Start/End: Original strand, 35156333 - 35156665
Alignment:
Q  219 gcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta--------------atcgaaatgttaacgtt 304  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |              ||| |||||||||||||    
T  35156333 gcaaaattttgccctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaatttgatcaaaatgttaacgtt 35156432  T
Q  305 aattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgt 404  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  35156433 aattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgatcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatga 35156532  T
Q  405 catctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaattt 504  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35156533 catctcttatttctaaatgttagcccgtgacgcaatattagccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaattt 35156632  T
Q  505 atgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35156633 atgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgtta 35156665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 24683957 - 24684306
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||              |||||    
T  24683957 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtttaattta 24684056  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24684057 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttagttttactaaacaaattatattaaccctagatt 24684156  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24684157 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacctatgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatact 24684256  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24684257 aaccctagattgattttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 24684306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 27733887 - 27734208
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaac 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||    
T  27733887 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccatatatttaacctaacttttttgcttaattttactgtattaaccctgtttaatttattcaaaatgttaac 27733986  T
Q  302 gttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaa 401  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||              ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27733987 gttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatctctcctaatttttctctttaatt--------------atattaaccttagatttaatttatgcaaaa 27734072  T
Q  402 tgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaa 501  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27734073 tggcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaa 27734172  T
Q  502 tttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27734173 tttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 27734208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 29468551 - 29468202
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||              ||    
T  29468551 ttaaagttaacctgaacgcaaaattttaccctagatgtaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 29468452  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  29468451 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaaaaaatcgctcctaatttttcactttaattttactaaacaaattttattaaccctagatt 29468352  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29468351 taatttatgccaaatggtatctcttatttctaaatgttaatctgtgacgcaatattaaccctatatttaaccttattttttcgtgtgactttactatatt 29468252  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29468251 aaccctagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 29468202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 202 - 528
Target Start/End: Original strand, 33637591 - 33637931
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  33637591 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaatttctttgtttaattttactgtattaaccctatttaattaactctgtttaattta 33637690  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaa-taaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatat 386  Q
    ||| |||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  33637691 atcaaaatattaacgttaatttttagggaaatcaaaaataaacaaat-gctcctaatttttctctttaattttattaaacaaattatattaaccctagat 33637789  T
Q  387 ttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatat 486  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33637790 ttaatttatgcagaatgacatctcttatttctaaaagttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatat 33637889  T
Q  487 taaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  33637890 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 33637931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 269 - 533
Target Start/End: Original strand, 24683295 - 24683559
Alignment:
Q  269 attaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaa 368  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  24683295 attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcttaatttttctctttaattttattaaacat 24683394  T
Q  369 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttttt 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24683395 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatggcatatcttatttctaaatgttaacatgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaatttttt 24683494  T
Q  469 cgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaat 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24683495 cgtgtgactttactatattaacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaat 24683559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 49144517 - 49144683
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49144517 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacctgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 49144616  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  49144617 tgtgactttactatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttttaaatgtta 49144683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 4850007 - 4849841
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  4850007 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttcacctaatattttcg 4849908  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  4849907 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatattatttttaaatgtta 4849841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 27733437 - 27733603
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27733437 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttttaaatgttaacccgtgacgtaatattaaccctaaatttaacctaattttttcg 27733536  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27733537 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 27733603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 33637142 - 33637308
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  33637142 tatattaactctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttca 33637241  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  33637242 tgcgactttactatattaaccctaaatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 33637308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 36158310 - 36158467
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36158310 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgttatgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 36158409  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  36158410 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 36158467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 49 - 337
Target Start/End: Original strand, 21598003 - 21598306
Alignment:
Q  49 aatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcaga 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21598003 aatttaatttcgaaggagaaatcttataaattacagaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaatgttgcttaaaccaaaattttgcaacacaga 21598102  T
Q  149 gtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgta----atatc---ttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaa 241  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||     ||||   |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||      |||    
T  21598103 gtctaaaacactacataaaaaataacataacaactattatatatcttatcttattattccttaacgataacccgaacgcaaaattttgtcc------taa 21598196  T
Q  242 cataacatctttgcttaattttactgtattaatcc--------------tatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataa 327  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||              |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21598197 cctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctattaaatcatccatatttaatttaattaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataa 21598296  T
Q  328 acaaatcgct 337  Q
    ||||||||||    
T  21598297 acaaatcgct 21598306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 24683508 - 24683674
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24683508 tatattaacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaattttaacccttgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 24683607  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  24683608 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaactgtta 24683674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 44806137 - 44805971
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||     
T  44806137 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtaacgcaatattaacgctagatttaacataattttttca 44806038  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44806037 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 44805971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 34873260 - 34873104
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34873260 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacc-aattttttcg 34873162  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34873161 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 34873104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 34873378 - 34873205
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat-------ttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaat 463  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  34873378 tatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaat 34873279  T
Q  464 tttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34873278 tttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 34873205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 371 - 533
Target Start/End: Original strand, 40106992 - 40107154
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40106992 tatattaaccttagatttaatttatgcaaaacgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 40107091  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaat 533  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  40107092 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaat 40107154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 7855565 - 7855721
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  7855565 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaatcctagatttaacct-attttttcg 7855663  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7855664 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 7855721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 33637253 - 33637409
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33637253 tatattaaccctaaatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 33637351  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33637352 tgtgattttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 33637409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 690837 - 690674
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  690837 tatattaaccctagatttaatttatgcaagatgtcatcttttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctaaatttaacctaatttttttg 690738  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  690737 tgtgact---ctatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttctaaatgtta 690674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 21670280 - 21670437
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21670280 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 21670378  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgc-aaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21670379 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaaatgttatctctaatttt 21670437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 24682888 - 24683044
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  24682888 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 24682986  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  24682987 ggtgactttactatattaatcctagatttaatttatgcaaaatatcatctctaatttt 24683044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 373 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 39277199 - 39277044
Alignment:
Q  373 tattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtg 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  39277199 tattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcgtg 39277101  T
Q  473 tgactttactatattaaccctagatttaatttatgc-aaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  39277100 tgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaaatgttatctctaatttt 39277044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 20073757 - 20073928
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt-----taaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattt 465  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20073757 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttctcttgtttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacctaattt 20073856  T
Q  466 tttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20073857 tttcgcgtgactttactatattaaccttagatttaatttgtgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 20073928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 27733548 - 27733704
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  27733548 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatccgtgacgcaatattaaccctagatataacc-aattttttcg 27733646  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27733647 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 27733704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 35155972 - 35156128
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  35155972 tatattaaccctagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-atttttccg 35156070  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  35156071 cgtgaatttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 35156128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 371 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 44806026 - 44805878
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  44806026 tatattaaccctagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctatatttaacct-attttttcg 44805928  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44805927 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatct 44805878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Original strand, 39649085 - 39649228
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  39649085 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacgt-attttttcg 39649183  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39649184 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 39649228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 372 - 528
Target Start/End: Original strand, 40107324 - 40107478
Alignment:
Q  372 atattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgt 471  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  40107324 atattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca-ctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaa-tttttcgc 40107421  T
Q  472 gtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  40107422 gtgactttactatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 40107478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 7855447 - 7855620
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatct-------cttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaat 463  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7855447 tatattaaccttagatttcatttatgcaaaatgtcatctcttatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctatatttaacctaat 7855546  T
Q  464 tttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7855547 tttttcatgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 7855620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 690729 - 690572
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  690729 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttctaaatgttaatccgtgacgtaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 690631  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgc-aaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  690630 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaaatgttatctctaatttt 690572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 374 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 17171172 - 17171019
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgt 473  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||    
T  17171172 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacgt-attttttcgcgt 17171074  T
Q  474 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  17171073 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 17171019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 24683619 - 24683774
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  24683619 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaactgttaacccgtgatgcaatatgaaccctagatttaaccta--tttttcg 24683716  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  24683717 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaaagtcatctctaatttt 24683774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 374 - 528
Target Start/End: Original strand, 31897929 - 31898082
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgt 473  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||    
T  31897929 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacgt-attttttcgcgt 31898027  T
Q  474 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  31898028 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 31898082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 39648452 - 39648608
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  39648452 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttctaaatgttaatccttgatgcaatattaaccctagatttaacat-attttttcg 39648550  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  39648551 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgctatctctaatttt 39648608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 48527895 - 48528051
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  48527895 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatccttgatgcaatattaaccctagatttaacat-attttttcg 48527993  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  48527994 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 48528051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 9150487 - 9150344
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  9150487 tatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatattaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 9150389  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9150388 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 9150344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 375 - 537
Target Start/End: Original strand, 40107217 - 40107377
Alignment:
Q  375 ttaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtg 474  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  40107217 ttaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacc-gtgacgcaatatcaaccctagatttaaccttattttttcgcgtg 40107315  T
Q  475 actttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  40107316 actttacgatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca-ctcttatttttaaatgtta 40107377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 31897293 - 31897449
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||    
T  31897293 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatccttgatgcaatattaactctagatttaacat-attttttcg 31897391  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31897392 cgtgactttattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 31897449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 374 - 537
Target Start/End: Original strand, 24682775 - 24682943
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat-------ttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttt 466  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24682775 attaaccctagatttaatttctgcaaaatgtcatctcttatctcttatttttaaatgt-aacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaatttt 24682873  T
Q  467 ttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24682874 tt-gtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 24682943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 378 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 17171801 - 17171652
Alignment:
Q  378 accctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgact 477  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  17171801 accctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatccttgatgcaatattaaccctagatttaacat-attttttcgcgtgact 17171703  T
Q  478 ttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17171702 ttactatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 17171652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 537
Target Start/End: Original strand, 21670210 - 21670335
Alignment:
Q  412 tatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaa 511  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21670210 tatttataaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaa 21670309  T
Q  512 atgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||    
T  21670310 atgtcatctcttatttctaaatgtta 21670335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 29468257 - 29468101
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29468257 tatattaaccctagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 29468159  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  29468158 cgtgactttacaatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 29468101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 49144628 - 49144784
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  49144628 tatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttttaaatgttaatctgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 49144726  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  49144727 cgtgactttactatattaactctagatttaatttatgcaaaatctcatctctaatttt 49144784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 399 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 9150570 - 9150436
Alignment:
Q  399 aaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatt 498  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9150570 aaatgacatctcttatttctaaatgttaactcgtgacgcaatattaaccctagattgaacctaattttttcgtgtgactttactatattaactctagatt 9150471  T
Q  499 taatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaat 533  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  9150470 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaat 9150436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 4849262 - 4849106
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  4849262 tatattaaccctagatttaatttatacaaaatgtcatatcttatttctaaatgttaatctgtgacgcaatattaaccctagatttaacat-attttttcg 4849164  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  4849163 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 4849106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 4849896 - 4849740
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4849896 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatattatttttaaatgttaatccatgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 4849798  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  4849797 cgtgactttactatattaattctagatttaatttatgcaaaatctcatctctaatttt 4849740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 27734153 - 27734308
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  27734153 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacctgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-atttttctg 27734251  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  27734252 cgtgactttactatattaa-cctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 27734308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Original strand, 36158165 - 36158310
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctctt-atttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttc 469  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36158165 tatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatttctttatttctaaaagttaacccgtgacgcagtattaaccctagatttaacctaattttttc 36158264  T
Q  470 gtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36158265 gtgtgattttactatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgt 36158310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 40107103 - 40107268
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||| | |||||||    
T  40107103 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatattaacccgtgacacaatattaaccttaaatttaacctca-tttttcg 40107201  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  40107202 tgtgactttagtgttttaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 40107268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 49145393 - 49145549
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||   |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  49145393 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcaaatcttatttctaaatgttaatttgtgacgcaatattaaccctagatttaacat-attttttcg 49145491  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  49145492 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 49145549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 202 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9150748 - 9150567
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||              ||    
T  9150748 ttaaagttaacccaaacgcaaaattttaccctagatttaa-ataacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 9150650  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9150649 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcactcctaatttttctctttaattttactaaacaaat 9150567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 406 - 537
Target Start/End: Original strand, 33637066 - 33637197
Alignment:
Q  406 atctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaattta 505  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  33637066 atctcttatttataaacgttgacctgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtatgactttactatattaactctatatttaattta 33637165  T
Q  506 tgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33637166 tgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgtta 33637197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 40106886 - 40107047
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  40106886 tatattaatcttagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtgaacc-----tgcaatattaaacctagattaaacctaattttttcg 40106980  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  40106981 cgtgactttactatattaaccttagatttaatttatgcaaaacgtcatctcttatttctaaatgtta 40107047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 371 - 496
Target Start/End: Original strand, 20073873 - 20073998
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20073873 tatattaaccttagatttaatttgtgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacctgtgacgcagtattaaccctagatttaacctaattttttcg 20073972  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctaga 496  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  20073973 tgtggctttactatattaaccctaga 20073998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 24684251 - 24684407
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||| |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  24684251 tatactaaccctagattgattttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattatccctagatttaacct-attttttcg 24684349  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  24684350 cgtgactttactatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 24684407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 199
Target Start/End: Original strand, 33636917 - 33637075
Alignment:
Q  40 ttttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcataaaccaaaattttg 139  Q
    |||||| ||||||||  | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||    
T  33636917 tttttttaaaatttaactccgaaggaaagatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaattaaagttgcgtaaaccaaaa-tttg 33637015  T
Q  140 caacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatt 199  Q
    ||||  | ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33637016 caacataaagcttaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttatt 33637075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 406 - 523
Target Start/End: Original strand, 20073681 - 20073798
Alignment:
Q  406 atctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaattta 505  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20073681 atctcttatttctaaatgttaacctgtgacgcaatattaacactagatttaacctaatttttttgcgtgactttactatattaaccctagatttaattta 20073780  T
Q  506 tgcaaaatgttatctctt 523  Q
    |||||||||| |||||||    
T  20073781 tgcaaaatgtcatctctt 20073798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 406 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 24396930 - 24396809
Alignment:
Q  406 atctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaattta 505  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24396930 atctcttatttctaaatattaacccgtgatgcaaaattaaccctaaatttaaccta-ttttttcgcatgactttactatattaaccctagatttaattta 24396832  T
Q  506 tgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||| |||||| |||||    
T  24396831 tgcaaaatgtcatctctaatttt 24396809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 371 - 461
Target Start/End: Original strand, 35156610 - 35156700
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35156610 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaaccggtgatgcaatattaaccctagatttaaccta 35156700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 371 - 486
Target Start/End: Original strand, 32200481 - 32200596
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  32200481 tatattaaccctagatttaatttatgtaaaatgtcatctcttatttctaaaagttaacctgtgacgcaatattaaccctagatttgacctaattttttcg 32200580  T
Q  471 tgtgactttactatat 486  Q
     |||||||||| ||||    
T  32200581 cgtgactttacgatat 32200596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 371 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 34872636 - 34872546
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34872636 tatattaaccctaaatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaaccggtgatgcaatattaaccctagatttaaccta 34872546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 371 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 44805388 - 44805298
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44805388 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaaccggtgatgcaatattaaccctagatttaaccta 44805298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 3795731 - 3795643
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3795731 gcacgggttgaataacgtatttttttaaaatttagttctgaaggagaaatcttataaattacgaaaaattgttgtcctttataaatgtg 3795643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 371 - 461
Target Start/End: Original strand, 7856202 - 7856292
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7856202 tatattaaccctaaatttaatttatacaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaaccggtgatgcaatattaaccctagatttaaccta 7856292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 446 - 537
Target Start/End: Original strand, 32200445 - 32200536
Alignment:
Q  446 ccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  32200445 ccctagatttaacctaattttttcgcgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgtaaaatgtcatctcttatttctaaaagtta 32200536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 486
Target Start/End: Original strand, 32200671 - 32200786
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  32200671 tatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaaatttaacttgtgatgcagtattaaccctagatttgacctaatttttttg 32200770  T
Q  471 tgtgactttactatat 486  Q
     |||||||||||||||    
T  32200771 cgtgactttactatat 32200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 202 - 285
Target Start/End: Original strand, 49144968 - 49145051
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49144968 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccttagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 49145051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 451 - 532
Target Start/End: Original strand, 32200640 - 32200721
Alignment:
Q  451 gatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaa 532  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32200640 gatttaacctaattttttcgcgtgactttactatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaa 32200721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 452 - 537
Target Start/End: Original strand, 32200831 - 32200916
Alignment:
Q  452 atttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  32200831 atttaacctaattttttcgcgtgactttactatatcaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaaagtta 32200916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 371 - 486
Target Start/End: Original strand, 32200257 - 32200372
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  32200257 tatattaaccctggatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaaagttaacttgtgacgcagtattaaccctagatttgacctaatattttcg 32200356  T
Q  471 tgtgactttactatat 486  Q
     | |||||||||||||    
T  32200357 cgcgactttactatat 32200372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 371 - 486
Target Start/End: Original strand, 32200861 - 32200976
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  || |||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  32200861 tatatcaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaaagttaacttgtgactcagtattaaccctagatttgacctaatttttttg 32200960  T
Q  471 tgtgactttactatat 486  Q
     |||||||||||||||    
T  32200961 cgtgactttactatat 32200976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 451 - 537
Target Start/End: Original strand, 32200226 - 32200312
Alignment:
Q  451 gatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  32200226 gatttaacctaattttttcgcgtgactttaatatattaaccctggatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaaagtta 32200312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 441 - 515
Target Start/End: Original strand, 36158124 - 36158198
Alignment:
Q  441 attaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36158124 attaaccatagatttaacctaattttttcgtgtgattttactatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgt 36158198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 446 - 528
Target Start/End: Original strand, 32201027 - 32201109
Alignment:
Q  446 ccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32201027 ccctagatttaatctaattttttcgcgtgactttactatgttaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 32201109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 34989555 - 34989411
Alignment:
Q  216 aacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggg 315  Q
    ||||||||||||||| || |||||||    || ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||| |||||||||      | |||  ||    
T  34989555 aacgcaaaattttgctcttgatttaa----acttctttgcttaatttttctatattcaccctatttaatttaatcaaaatgttaa------tagttacgg 34989466  T
Q  316 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34989465 aaattaaaataaacaaattgctcttaatttttctccttaattttactaaagaaat 34989411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 436 - 505
Target Start/End: Original strand, 29322206 - 29322275
Alignment:
Q  436 gcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaattta 505  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29322206 gcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgcgtgactttactatattaactgtagatttaattta 29322275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 9151088 - 9151033
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9151088 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgtta 9151033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 17172562 - 17172507
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17172562 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatattatcttttatttttaaatgtta 17172507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 36158310 - 36158365
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36158310 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 36158365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 484 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 39277199 - 39277146
Alignment:
Q  484 tattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  39277199 tattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 39277146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 34873489 - 34873434
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  34873489 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataaacgtta 34873434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 489 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 17171801 - 17171753
Alignment:
Q  489 accctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17171801 accctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 17171753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 369 - 417
Target Start/End: Original strand, 31897401 - 31897449
Alignment:
Q  369 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31897401 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 31897449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 475 - 535
Target Start/End: Original strand, 40106879 - 40106939
Alignment:
Q  475 actttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgt 535  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  40106879 actttactatattaatcttagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgt 40106939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 7855336 - 7855391
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  7855336 tatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataaacgtta 7855391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 525
Target Start/End: Original strand, 11835347 - 11835390
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttat 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11835347 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat 11835390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 24683397 - 24683452
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||    
T  24683397 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatggcatatcttatttctaaatgtta 24683452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 552 - 599
Target Start/End: Original strand, 45114026 - 45114073
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgtctctgctgctc 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  45114026 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgtttgtgctgctc 45114073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 24396855 - 24396809
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24396855 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 24396809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 5092529 - 5092565
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5092529 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 5092565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 241
Target Start/End: Original strand, 32200990 - 32201038
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaa 241  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32200990 tcttatttattaaagttaacccgaacgcaaaatgttgccctagatttaa 32201038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 32658283 - 32658319
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32658283 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 32658319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 33637774 - 33637829
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  33637774 tatattaaccctagatttaatttatgcagaatgacatctcttatttctaaaagtta 33637829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 17171065 - 17171019
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17171065 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 17171019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 17171698 - 17171652
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17171698 tatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 17171652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 553 - 599
Target Start/End: Original strand, 26163255 - 26163301
Alignment:
Q  553 cttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgtctctgctgctc 599  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26163255 cttgcttgctttagtttttgatttatatatttgtgtttgtgctgctc 26163301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Original strand, 31898036 - 31898082
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  31898036 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 31898082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 370
Target Start/End: Original strand, 35100994 - 35101048
Alignment:
Q  316 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    |||||||||||||  ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35100994 aaatcaaaataaatcaatggctcataatttttctgcttaattttactaaacaaat 35101048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Original strand, 40107432 - 40107478
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40107432 tatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 40107478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Original strand, 32200184 - 32200233
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 242  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  32200184 tcttatttattaaagttaacccgaacgcaaaatgttgcgctagatttaac 32200233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Original strand, 32200408 - 32200457
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 242  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32200408 tcttatttattaaagttaacccgaatgcaaaatgttgccctagatttaac 32200457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 3065831 - 3065795
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3065831 ccttgcttgctttgctttttgatttatatatttgtgt 3065795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 7885821 - 7885857
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7885821 ccttgcttgctttgctttttgatttatatatttgtgt 7885857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 17694133 - 17694169
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17694133 ccttgcttgctttgttttttgatttatatatttgtgt 17694169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 525
Target Start/End: Original strand, 21669607 - 21669647
Alignment:
Q  485 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttat 525  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21669607 attaaccctagatttaatttatgtaaaatgtcatctcttat 21669647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 242
Target Start/End: Original strand, 32200797 - 32200837
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 242  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32200797 ttaaagttaacccgaacgcaaaatgttgccctatatttaac 32200837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 39277916 - 39277876
Alignment:
Q  485 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttat 525  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  39277916 attaaccctagatttaatttatgtaaaatgtcatctcttat 39277876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Original strand, 39649195 - 39649235
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctct 411  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  39649195 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctct 39649235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 9150377 - 9150342
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtca 406  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9150377 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 9150342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 285
Target Start/End: Original strand, 19327248 - 19327330
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt 285  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||  |||  | |||||||||||||| | | |||| |||||||||||    
T  19327248 ttaaagttaacc-gaacgcaaaattttgccataaatttaagctaatttttttgcttaattttagtattttaaccctatttaatt 19327330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 375 - 417
Target Start/End: Original strand, 32201067 - 32201109
Alignment:
Q  375 ttaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32201067 ttaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 32201109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 385 - 417
Target Start/End: Original strand, 20077411 - 20077443
Alignment:
Q  385 atttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20077411 atttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 20077443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 405; Significance: 0; HSPs: 220)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 13172960 - 13172452
Alignment:
Q  29 tgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcataaa 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13172960 tgaataacgtatttttttaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcatttataaatttgaaaatcaaaattgcgtaaa 13172861  T
Q  129 ccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaatttt 228  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13172860 ccaaaattttgcaacacagagcctaaaacattacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaatttt 13172761  T
Q  229 gccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaa 328  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13172760 gcccaagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaa 13172661  T
Q  329 caaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaac 428  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13172660 caaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaac 13172561  T
Q  429 ccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  13172560 ccgtgacgcaatattagccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttc 13172461  T
Q  529 taaatgtta 537  Q
    |||||||||    
T  13172460 taaatgtta 13172452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 537
Target Start/End: Original strand, 36741820 - 36742337
Alignment:
Q  19 tcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaa 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36741820 tcgcacgggttgaattacgtatttttttaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacgaaaaattattgtcctttataaatgtgaaaatcaaa 36741919  T
Q  119 attgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaac 218  Q
      ||| |||||||||||||||||||  | || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36741920 gctgcgtaaaccaaaattttgcaacataaagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaac 36742019  T
Q  219 gcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaa 318  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  36742020 gcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaa 36742119  T
Q  319 tcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattttt 418  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  36742120 tcaaaataaacaaatcacttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg-catctcttatttat 36742218  T
Q  419 aaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttat 518  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36742219 aaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgcgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcat 36742318  T
Q  519 ctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||    
T  36742319 ctcttatttttaaatgtta 36742337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 37357019 - 37356504
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  37357019 gcacaggttgaataacgtattttttttaaatttagttttgaatgagaaatcttataaattacagaaaattgttgtcatttataaatgtgaaaatcaaagc 37356920  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  37356919 tgcgtaaaccaaaaatttgcaacacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagc 37356820  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatc 320  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37356819 aaaatttttccctagatttaacctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatc 37356720  T
Q  321 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaa 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37356719 aaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaa 37356621  T
Q  421 atgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37356620 atgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatct 37356521  T
Q  521 cttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||| |||||||||    
T  37356520 cttatttctaaatgtta 37356504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Original strand, 39713514 - 39714035
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39713514 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttaattccgaaggagaaatcttataaattatggaaaattgttgtcttttatcaatgtgaaaatca 39713613  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  39713614 aaactgcgtaaaccaaaattttacaacacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccga 39713713  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  39713714 acgcaaaatttggccctagatttaacctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 39713813  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39713814 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaattttactaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttattt 39713913  T
Q  417 ttaaatgttaacccgtgatgcaata-ttaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39713914 ttaaatgttaacccgtgacgcaatatttaatcctagatttaacctaattttttcatgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 39714013  T
Q  516 tatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     ||| ||||||| |||||||||    
T  39714014 catcacttatttctaaatgtta 39714035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 24549446 - 24548938
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24549446 cttcgcacgggttgaataacgtatttttttaaaatttagtttcgaaggagaaatgttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatga 24549347  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24549346 aagctgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaaacactacataacaaatgacataacaactattataatatcttattccttaaatttaacccga 24549247  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24549246 atgcaaaatttttcccaagatttaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 24549147  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 416  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24549146 aatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactgaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 24549047  T
Q  417 ttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtt 516  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24549046 ataaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtc 24548947  T
Q  517 atctcttat 525  Q
    |||||||||    
T  24548946 atctcttat 24548938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 17741685 - 17741166
Alignment:
Q  18 ttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaa 117  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17741685 ttcgcatgagttgaataacgtatctttttaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaa 17741586  T
Q  118 aattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaa 217  Q
    |  ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  17741585 agctgtgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaaccggaa 17741486  T
Q  218 cgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaa 317  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  17741485 cgcaaaatttttccctaaatttaacctaacttctttgattaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaa 17741386  T
Q  318 atcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  17741385 atcaaaataaacaaatcgctcctaatttttcttcttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgaaaattgtcatctcttattta 17741286  T
Q  418 taaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtta 517  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  17741285 taaacgttaactcgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccatatatttaatttatgcaaaatgtca 17741186  T
Q  518 tctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17741185 tctcttatttttaaatgtta 17741166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 3759303 - 3758776
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3759303 cttcgcacgggttgaataacgtatttttttaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattatggaaaattgttgtcatttataaatgtgaaaatca 3759204  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3759203 aagctgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcgtaaaacactaaataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccga 3759104  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3759103 acgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 3759004  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctctt---- 412  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        
T  3759003 aatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 3758904  T
Q  413 ---atttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgca 509  Q
       ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3758903 attatttttaaatgttaacccgtgacacaatattaaccttaaatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattgaccctagatttaatttatgca 3758804  T
Q  510 aaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  3758803 aaatgtcatctcttgtttctaaatgtta 3758776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 525
Target Start/End: Original strand, 12680648 - 12681161
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtatttttt-----aaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12680648 cttcgcacgggttgaataacgtatttttttttaaaaaaatttagcccagaaggagaaatcttataaattacggaaaattattgtcctttataaatgtgaa 12680747  T
Q  112 aatcaaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaa 211  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12680748 aatcaaagttgcgtaaaccaaaattttgcaacatagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattccttaaagttaa 12680847  T
Q  212 cccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtt 311  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12680848 tccgaacgcaaaattttgccatagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattatt 12680947  T
Q  312 tgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctct 411  Q
     |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  12680948 agggaaatcaaaataaacaaatcgcacgtaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaactctatatttaatttatgcaaaatgccatatct 12681047  T
Q  412 tatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaa 511  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12681048 tatttataaacgttaacccgtgacgcaatattaacgctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaa 12681147  T
Q  512 atgttatctcttat 525  Q
    |||| |||||||||    
T  12681148 atgtcatctcttat 12681161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 537
Target Start/End: Original strand, 47555456 - 47555962
Alignment:
Q  28 ttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcataa 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  47555456 ttgaataacgtatttttttaaaatttagtttcgaatgagaaatcttataaattacagaaaattat-gtcatttataaatgtgaaaatcaaaactgcgtaa 47555554  T
Q  128 accaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattt 227  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47555555 accaaaattttgcaacacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatcttttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattt 47555654  T
Q  228 tgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataa 327  Q
    || | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  47555655 tgtcatagatttaacctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatattaacgttaattgtaagggaaat-aaaataa 47555753  T
Q  328 acaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaa 427  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47555754 acaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaa 47555853  T
Q  428 cccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttattt 527  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47555854 cccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-atttttttgcgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 47555952  T
Q  528 ttaaatgtta 537  Q
     |||||||||    
T  47555953 ctaaatgtta 47555962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 8989220 - 8988719
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  8989220 gcacgggttgaataacatattttttttaaatttagttttgaaggagaaatcttataaattacagaaaattgttgtcatttataaatgtgaaaatcaaagc 8989121  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  8989120 tgcgtaaaccaaaaatttgcaacacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagc 8989021  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatc 320  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8989020 aaaatttttccctagatttaacctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatc 8988921  T
Q  321 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaa 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||    
T  8988920 aaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc--atttataa 8988824  T
Q  421 atgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  8988823 acgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaccctaattttttcgtgtgactttactaaattaaccctagatttaatttctgcaaaatgtcatct 8988724  T
Q  521 cttat 525  Q
    |||||    
T  8988723 cttat 8988719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 2118214 - 2117699
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtatttttt--aaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2118214 cttcgcacgggttgaataacgtattttttttaaaaatttagttccgaaaaagaaatattataaat-acggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaat 2118116  T
Q  115 caaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaaccc 214  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |    
T  2118115 caaagttgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaagcactgcataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaattc 2118016  T
Q  215 gaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgg 314  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  2118015 gaacgcaaaattttgtcatagatttaacataacttctctgcttaatattactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattggtagg 2117916  T
Q  315 gaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat 414  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2117915 gaaatcaaaataaacaaatcgcacataatttttcttcttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttat 2117816  T
Q  415 ttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 514  Q
    || |||| |||||   |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2117815 ttataaacgttaa--tgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaa-tttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 2117719  T
Q  515 ttatctcttatttttaaatg 534  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  2117718 tcatctcttatttttaaatg 2117699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 37352120 - 37351619
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  37352120 gcacaggttgaataacgtattttttttaaatttagttttgaatgagaaatcttataaattacagaaaattgttgtcatttataaatgtgaaaatcaaagc 37352021  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  37352020 tgcgtaaaccaaaaatttgcaacacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagc 37351921  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatc 320  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37351920 aaaatttttccctagatttaacctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatc 37351821  T
Q  321 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaa 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||    
T  37351820 aaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc--atttataa 37351724  T
Q  421 atgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  37351723 acgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaccctaattttttcgtgtgactttactaaattaaccctagatttaatttctgcaaaatgtcatct 37351624  T
Q  521 cttat 525  Q
    |||||    
T  37351623 cttat 37351619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 46106449 - 46105926
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaa----aatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46106449 cttcgcacgggttgaataacgtatttttttttttttaatttagctccgaacgagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcatttataaatgtgaaa 46106350  T
Q  113 atcaaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaac 212  Q
    |||||   ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  46106349 atcaaggctgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcatattccttaaagttaat 46106250  T
Q  213 ccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgttt 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  46106249 ccgaacacaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattatta 46106150  T
Q  313 gggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctctt 412  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  46106149 gggaaatcaaaataaacaaatcacacataatttttctccttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatggaaaatgtcatatctt 46106050  T
Q  413 atttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaa 512  Q
    |||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  46106049 atttataaacgttaacccgtgacacaata-taaccctagatttaacctaaatttttcgtgtgactttactatattaaccttatatttaatttatgcaaaa 46105951  T
Q  513 tgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  46105950 tgtcatctcttatttttaaatgtta 46105926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 52802952 - 52802474
Alignment:
Q  22 cacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaatt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  52802952 cacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagttccgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttatcattgtgaaaatcaaaact 52802853  T
Q  122 gcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgca 221  Q
    || ||||| ||||||||  ||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||     
T  52802852 gcgtaaactaaaattttataacacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccaaacgct 52802753  T
Q  222 aaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatca 321  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52802752 aaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttacggtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatca 52802653  T
Q  322 aaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttact-aaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaa 420  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  52802652 aaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaattttactaaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatattatctcttgtttttaa 52802553  T
Q  421 atgttaacccgtgatgcaata-ttaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatt 498  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52802552 atgttaacccgtgacgcaatatttaaccctagatttaacctaattttttcatgtgactttactatattaaccctagatt 52802474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Original strand, 39404610 - 39405141
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39404610 cttcgcacgggttgaataacatatttttttaaaatttagtttcaaaggcgaaatcttataaattacggaaaattgttgtcatttataaatgtgaaaatca 39404709  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||  ||| ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||| ||    
T  39404710 aagctgcgtaaactaaaaatttgcaacacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgcaatcttttattccttaaagttaacctga 39404809  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtatta--------------atcctatttaatttaatcgaaatgttaacg 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||              | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  39404810 acgcaaaattttaccctagatttaacctaatttctttgcttaattttactgtattacctctatttaattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacg 39404909  T
Q  303 ttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaat 402  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39404910 ttaattgttagggaaatcaaaataat-aaattgttcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctaaatttaatttatgcaaaat 39405008  T
Q  403 gtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaat 502  Q
    |||| |||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39405009 gtcagctc--atttataaacgttaacccgtgacgcaatattaaccttagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaat 39405106  T
Q  503 ttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39405107 ttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgtta 39405141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 533
Target Start/End: Original strand, 9887293 - 9887818
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  9887293 gcacgggttgaataacgtatttttttaaaatttagttttgaaggagaaatcttataaattacagaaaattgttgtcatttataaatgtgaaaatcaaagc 9887392  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  9887393 tgcgtaaaccaaaaatttgcaacacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagc 9887492  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatcttt--------------gcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaa 306  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| | |||              |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  9887493 aaaatttttccctagatttaacctaacttatttaacctaacttatttgcttaattttactgcattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttag 9887592  T
Q  307 ttgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtca 406  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  9887593 ttgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacatattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgaca 9887691  T
Q  407 tctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttat 506  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9887692 tatcttatttctaaatgttaacctgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaacccttgatttaatttat 9887791  T
Q  507 gcaaaatgttatctcttatttttaaat 533  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  9887792 gcaaaatgtcatctcttatttctaaat 9887818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 29713843 - 29713340
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  29713843 gcacgggttgaataacgtatttttttaaaatttagttctgaaggagaaatcttataaattatggaaaattgttaccctttataaatgtgaaaatcaaagt 29713744  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    | | |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  29713743 t-cgtaaaccaaaaatttgcatcacagagtctaaaacactacataaaaaataaaataacaattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacac 29713645  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatc 320  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29713644 aaaattttaccctagatttaacgtaacttctttgcttaattttattgtattacccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatc 29713545  T
Q  321 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaa 420  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||    
T  29713544 aaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttattaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc--atttataa 29713448  T
Q  421 atgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
    | |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  29713447 acgttaactcatgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtaactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaaagtcatct 29713348  T
Q  521 cttatttt 528  Q
    || |||||    
T  29713347 ctaatttt 29713340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 85 - 536
Target Start/End: Original strand, 50118154 - 50118605
Alignment:
Q  85 aaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaacta 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| |||||||||||||  |||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  50118154 aaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatgaaagctgcgtaaactaaaattttgcaacatagagcctaaaacactatataaaaaataacataacaacta 50118253  T
Q  185 ttgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 284  Q
    || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  50118254 ttataatatcttattccttaaatttaacccgaacgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttacttaattttactgtattaaccctttttaat 50118353  T
Q  285 ttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctat 384  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50118354 ttaatgaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaatgatattaaccctat 50118453  T
Q  385 atttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactat 484  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50118454 atttaatttatgcaaaatatcatctcttatttataaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagttttaacctaattttttcgtgtgactttactat 50118553  T
Q  485 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtt 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  50118554 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtt 50118605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 17 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 8532247 - 8531712
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8532247 cttcgcacgggttgaataacgtatttc---aaaatttagctcagaaggagaaattttataaattacggaaaattattgtcctttataaatgtgaaaatca 8532151  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||    
T  8532150 aagctgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaagtactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccctaaagttaactcga 8532051  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattt--------------aatttaatcgaaatgttaacg 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||| |||||||| |||||||              ||||||||| |||||||||||    
T  8532050 acgcaaaattttgccctagatttaacctaacttatttgtttaattttattgtattaaccctatttaattaacactatttaatttaatcaaaatgttaacg 8531951  T
Q  303 ttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaat 402  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8531950 ttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcataatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 8531851  T
Q  403 gtc-------atctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctag 495  Q
    |||       ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  8531850 gtcatctcttatctcttatttataaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaatttttttgtgtgactttactatattaactctag 8531751  T
Q  496 atttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatg 534  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8531750 atttagtttatgcaaaatgtcatctcttatttataaatg 8531712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 18 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 43024052 - 43023525
Alignment:
Q  18 ttcgcacgggttgaataacgtattttttaa---aaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaat 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||     ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43024052 ttcgcacgggttgaataatgtatttttttttttaaatttagttctaaaggagaaatcttataaattacggaaaattattgtcctttataaatgtgaaaat 43023953  T
Q  115 caaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaa--taacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaac 212  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  43023952 caaagttgcgtaaaccaaaaatttgcaacacagagcctaaaacactacataaaaaaaataacataacaactattgcaatctcttattccttaaagttaac 43023853  T
Q  213 ccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta----atcgaa---atgttaacgtta 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |     |  ||   ||||||| ||||    
T  43023852 ccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatattactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaatttatgttaatgtta 43023753  T
Q  306 attgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtc 405  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43023752 attgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattattttaaccctagatttaatttatgcaaaatgtc 43023654  T
Q  406 atctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaattta 505  Q
    |   || |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43023653 a--gctaatttataaacgttaacccgtgacgaaatattaaccctagatttaacctaatttagtcgtgtgactttactatattaaccctaga-ttaattta 43023557  T
Q  506 tgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43023556 tgtaaaatgtcatctcttatttttaaatgtta 43023525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 33 - 528
Target Start/End: Original strand, 24944166 - 24944674
Alignment:
Q  33 taacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcataaaccaa 132  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  24944166 taacatattttttaaaaatttagttatgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaagctgcgtaaaccaa 24944265  T
Q  133 aattttgcaacgcagagt--ctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgc 230  Q
    || |||| ||| |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24944266 aaatttgtaacacagagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatctttaattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttac 24944365  T
Q  231 cctagatttaacataacatctttgcttaattttactgta--------------ttaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||              |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24944366 cctagatttaacctaacttctttgcttaattttacagtactaaccctatttaattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 24944465  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 416  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  24944466 aatcaaaataagcaaatcgctcctaatttttatccttaattttactaaaaaaattatattaaccctacatttaatttatgcaaaatgtcagctc--attt 24944563  T
Q  417 ttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtt 516  Q
      ||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||     
T  24944564 acaaacgttaactcgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcgggtgattttactatattaatcctagatttaatttatgccaaatgtc 24944662  T
Q  517 atctcttatttt 528  Q
    |||||| |||||    
T  24944663 atctctaatttt 24944674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 17 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 20591027 - 20590653
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20591027 cttcgcatgggttgaataacatatttttttaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatatgaaaatca 20590928  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaa-taacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccg 215  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20590927 aagctgcataaaccaaaattttgcaacactgagcctaaaacactacataaaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaaattaacccg 20590828  T
Q  216 aacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggg 315  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  20590827 aacgtaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaactctatttaatttaatcaaaatgttaaagttaattgttaggg 20590728  T
Q  316 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaa 390  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20590727 aaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaa 20590653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 31 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 50043346 - 50042983
Alignment:
Q  31 aataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcataaacc 130  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  50043346 aataacgtattttttttaaatttaattttgaaggagaaatcttataaattacagaaaattgttgtcatttataaatgtgaaaatcaaagctgcgtaaacc 50043247  T
Q  131 aaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgc 230  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |    
T  50043246 aaaaatttgcaacacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttc 50043147  T
Q  231 cctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaaca 330  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  50043146 cctagatttaacctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaat-aata 50043048  T
Q  331 aatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50043047 aatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttat 50042983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 39405538 - 39405873
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaac 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  39405538 ttaaagttaacccgaatgcaaaatcttgccctagatttaacctaaattctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaac 39405637  T
Q  302 gttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaa 401  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39405638 gttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaa 39405737  T
Q  402 tgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaa 501  Q
    || |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39405738 tggcatctcttatttctaaatgttaatctgtgacgcaatattaaccctatatttaacctaattttttcttgtgactttactatattaaccctagatttaa 39405837  T
Q  502 tttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  39405838 tttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 39405873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 20590171 - 20589822
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  20590171 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 20590072  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20590071 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 20589972  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20589971 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattagccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 20589872  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20589871 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 20589822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 21 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 8964853 - 8964510
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  8964853 gcacgggttgaataacgtattttttttaaatttagttttgaatgagaaatcttataaattacagaaaattgttgtcatttataaatgtgaaaatcaaagc 8964754  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  8964753 tgcgtaaaccaaaaatttgcaacacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagc 8964654  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatc 320  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8964653 aaaatttttccctagatttaacctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatc 8964554  T
Q  321 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaa 365  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8964553 aaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaa 8964510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 184 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 5755454 - 5755092
Alignment:
Q  184 attgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaa 283  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  5755454 attgtaatctcttattccttaaagttaacttgaacgcaaattttttccctagatttaacctaacttctttgcttaactttactgtattaaccttatttaa 5755355  T
Q  284 tttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaacccta 383  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5755354 tttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaacccta 5755255  T
Q  384 tatttaatttatgcaaaatgtcatctct---------tatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtg 474  Q
      ||||||||||||||||||||||||||         |||||  ||| |||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  5755254 ggtttaatttatgcaaaatgtcatctcttatctcttatatttaaaaacgttaacccgtgacgtaatattaactctagatttaacctaattttttcgtgtg 5755155  T
Q  475 actttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5755154 actttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgtta 5755092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 24548522 - 24548173
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta-------------- 287  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |                  
T  24548522 ttaaagttaacccggacgcaaaattttgccctagaattaatctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattaaccctgtttaatttg 24548423  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24548422 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 24548323  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24548322 taatttatgcaaaatggcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattagccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 24548223  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24548222 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 24548173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 46105374 - 46105025
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  46105374 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 46105275  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46105274 atcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaaaaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 46105175  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46105174 taatttatgcaaaatggcatctcttatttccaaatgttaaaccatgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 46105075  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  46105074 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgtta 46105025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 2117299 - 2116950
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  2117299 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttaccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtttaattta 2117200  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2117199 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcataatttttctctttaattgtactaaacaaattatattaaccctatatt 2117100  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  2117099 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctaaatttaacctaaatttttcgtgtgactttgctatatt 2117000  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  2116999 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgtta 2116950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 50118895 - 50119244
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||              ||    
T  50118895 ttaaagttaacccggacgccaaattttgccctagaattaacataacttctttgcttaattttaccgtatcaaccctatttaattaaccatgtgtaattta 50118994  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50118995 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 50119094  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50119095 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatattaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgcgactttactatatt 50119194  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  50119195 aaccctaaatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 50119244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 8987674 - 8987325
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||              ||    
T  8987674 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtttaattta 8987575  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8987574 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 8987475  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8987474 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacctatgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatact 8987375  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8987374 aaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 8987325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 24947573 - 24947922
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||              |||||    
T  24947573 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttaccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctctttaattta 24947672  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24947673 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgttcctaatttttctctttaattttactaaataaattatattaaccctatatt 24947772  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24947773 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaattttaacttgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 24947872  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  24947873 aaccctagatttaatttaagcaaaatgtcatatcttatttctaaatgtta 24947922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 9888216 - 9888565
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||              |||||    
T  9888216 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacattgtttaattta 9888315  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9888316 atcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 9888415  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9888416 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacctatgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatact 9888515  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  9888516 aaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 9888565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 37350574 - 37350225
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||              ||    
T  37350574 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtttaattta 37350475  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37350474 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 37350375  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37350374 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacctatgacgcaatattaaccatagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatact 37350275  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37350274 aaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 37350225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 52801467 - 52801118
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||    
T  52801467 ttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattaatcctgtttaattta 52801368  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    |   ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  52801367 aataaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaaccttagatt 52801268  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52801267 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacccgagacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactacatt 52801168  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  52801167 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 52801118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 29713158 - 29712823
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaac 301  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29713158 ttaaagttaacctgaacgcaaaattttgccatagatgtaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaac 29713059  T
Q  302 gttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaa 401  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||    
T  29713058 gttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttcactttaatgttactaaacaaattttattaaccctagatttaatttaagccaaa 29712959  T
Q  402 tgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaa 501  Q
    || |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29712958 tgacatctcttatttctaaatgttaacctgtgacgcaatattaaccttatatttaaccttattttttcttgtgactttactatattaaccctaaatttaa 29712859  T
Q  502 tttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29712858 tttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 29712823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 47556246 - 47556593
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||              |||||    
T  47556246 ttaaagttaacccgaacgtaaattttttccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaaataaccatgtttaattta 47556345  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47556346 atcaaaatattaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccttatatt 47556445  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  47556446 taatttatgcaaaatggcatctcttatttctaaatattaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttc--gtgactttactatatt 47556543  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||    
T  47556544 aaccctagatttaatttatgcaaaatgacatctcttaattctaaatgtta 47556593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 3758487 - 3758138
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta-------------- 287  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |                  
T  3758487 ttaaagttaacccggacgtaaaattttgccctagaattaacctaaattttttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtttaatttg 3758388  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  3758387 atcaaaatgttaacgttaattgttaaggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattagccctagatt 3758288  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3758287 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattagccctagatttaacctaattttttcatgtgactttactatatt 3758188  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3758187 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 3758138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 202 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 8988306 - 8987961
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  8988306 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 8988207  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  8988206 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacatattatattaaccctagatt 8988107  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8988106 taatttatgcaaaatggcatatcttatttctaaatgttaacatgtgacgcaatattaaccttagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 8988007  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaat 533  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  8988006 aacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaat 8987961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 202 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 37351206 - 37350861
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  37351206 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 37351107  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  37351106 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacatattatattaaccctagatt 37351007  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37351006 taatttatgcaaaatggcatatcttatttctaaatgttaacatgtgacgcaatattaaccttagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 37350907  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaat 533  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  37350906 aacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaat 37350861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 39714364 - 39714712
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  39714364 ttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtttaattta 39714463  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  39714464 aataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaa-tcgctcctaatttttctcttaaaatttactaaacaaattatattaaccttagatt 39714562  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39714563 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaaccagtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactacatt 39714662  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  39714663 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 39714712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 202 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 43023128 - 43022796
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcg----aa---a 294  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |  |     ||   |    
T  43023128 ttaaagttaactcgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatattactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 43023029  T
Q  295 tgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaattta 394  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  43023028 tgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacatattatattaaccctagatttaattta 43022929  T
Q  395 tgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaacccta 494  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  43022928 tgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcgcgtgactatgctatattaacccta 43022830  T
Q  495 gatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  43022829 aatttaatttatgaaaaaagtcatctctaatttt 43022796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 264
Target Start/End: Original strand, 30527606 - 30527853
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30527606 cttcgtacgggttgaataacgtattttttttaaatttagttttgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatatgaaaatca 30527705  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30527706 aagctgcgtaaaccaaaattttgcaatacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccga 30527805  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaatttta 264  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  30527806 acgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgcttaatttta 30527853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16653214 - 16652988
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  16653214 gcacgggttgaataacgtattttttttaaatttagttttgaaggagaaatcttataaattacagaaaattgttgtcatttataaatgtgaaaatcaaagc 16653115  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  16653114 tgcgtaaactaaaaatttgcaacacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagc 16653015  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataac 247  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16653014 aaaatttttccctagatttaacctaac 16652988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 5755147 - 5754981
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5755147 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctaaatttaacctaattttttcg 5755048  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5755047 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 5754981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 37356559 - 37356393
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37356559 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 37356460  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37356459 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 37356393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 36742282 - 36742448
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36742282 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtaacacaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 36742381  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36742382 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 36742448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 39405086 - 39405252
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39405086 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtaacacaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 39405185  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  39405186 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 39405252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 46105981 - 46105815
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  46105981 tatattaaccttatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctataattaacctaattttttcg 46105882  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  46105881 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttttaaatgtta 46105815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 202 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 43022612 - 43022423
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaac 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  43022612 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatgtaacctaacttctttgtttaattttactgtattaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaac 43022513  T
Q  302 gttaattgtttgggaaatcaaaataaac-aaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaa 390  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43022512 gttaattgttagggaaatcaaaataaacaaaatcgctcctaatttttcactttaattatactaaacaaattatattaaccctagatttaa 43022423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 385 - 537
Target Start/End: Original strand, 48808767 - 48808919
Alignment:
Q  385 atttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactat 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808767 atttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaactcgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactat 48808866  T
Q  485 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  48808867 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 48808919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 193 - 370
Target Start/End: Original strand, 37061526 - 37061703
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcga 292  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  37061526 tcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccttagatttaacctaacttatttgcttaattttactatattaatcatatttaatttaatcaa 37061625  T
Q  293 aatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37061626 aatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactagacaaat 37061703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 369 - 540
Target Start/End: Original strand, 42350109 - 42350280
Alignment:
Q  369 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttttt 468  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  42350109 attatatcaaccttatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccttagatttaacctaatttttt 42350208  T
Q  469 cgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgttatct 540  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  42350209 tgcgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaagtgtcatctcttatttctaaatgttatct 42350280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 9887767 - 9887933
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9887767 tatattaacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaattttaacccctgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 9887866  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  9887867 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataactgtta 9887933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 12681118 - 12681286
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat--ttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttttt 468  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12681118 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatatttttaaatgctaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaatttttt 12681217  T
Q  469 cgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||    
T  12681218 cgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatttcatatcttatttctaaatgtta 12681286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 8988645 - 8988489
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8988645 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 8988547  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8988546 ggtgactttactatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 8988489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 2117751 - 2117584
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgattt-aacctaattttttc 469  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2117751 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgctaacctgtgacgcaatattaaccctagattttaacctaattttttc 2117652  T
Q  470 gtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  2117651 gtgtgactttactataacaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgtta 2117584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 20590628 - 20590455
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcat-------ctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaat 463  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20590628 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatctcttatttttaaatgttaacccgtgacacaatattaaccctagatttaacctaat 20590529  T
Q  464 tttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20590528 tttttcgtgtgagtttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 20590455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 5755036 - 5754879
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  5755036 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 5754938  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgc-aaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5754937 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaaatgttatctctaatttt 5754879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 9060878 - 9061044
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  9060878 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttgtaaattttaacccttgacgcaatattaacagtagatttaacctaattttttcg 9060977  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  9060978 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttaattctaaatgtta 9061044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 190 - 360
Target Start/End: Original strand, 37061735 - 37061905
Alignment:
Q  190 atatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaat 289  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37061735 atatcttattcctaaaagttaacctgaacgcaaaattttactctagatttaacctaaattctttgcttaattttactatattaatcctatttaatttaat 37061834  T
Q  290 cgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaatttta 360  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37061835 caaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaataaatcgctcctaatttttctccttaatttta 37061905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 37351545 - 37351389
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  37351545 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 37351447  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  37351446 ggtgactttactatattaatcctatatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 37351389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 188 - 364
Target Start/End: Original strand, 42349529 - 42349705
Alignment:
Q  188 taatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta 287  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  42349529 taatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccatagatttaacctaacttctttgcttaaatttactatattaaccctatttaattta 42349628  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaa 364  Q
    ||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  42349629 atcaaaatcttaatgttaattgttagggaaatcaaaatgaacaaatcactcataatttttctccttagttttactaa 42349705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 374 - 537
Target Start/End: Original strand, 42350003 - 42350166
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgt 473  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  42350003 attaaccatatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgcgt 42350102  T
Q  474 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    || |||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42350103 gaatttattatatcaaccttatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 42350166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 43023579 - 43023414
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||||    
T  43023579 tatattaaccctagatt-aatttatgtaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaatcatatatttaacctaattttttcg 43023481  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43023480 tgtgactttactatattagccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 43023414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 374 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 52801170 - 52801017
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgt 473  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||    
T  52801170 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacgt-attttttcgcgt 52801072  T
Q  474 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  52801071 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 52801017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 2117005 - 2116849
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  2117005 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgttaatccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 2116907  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  2116906 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 2116849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 17741221 - 17741065
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17741221 tatattaaccatatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgacacaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 17741123  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  17741122 cgtgtctttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 17741065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 20590510 - 20590354
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| || ||||||    
T  20590510 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatacaatattaaccttagatttaacct-atgttttcg 20590412  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20590411 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 20590354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 50118551 - 50118707
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  50118551 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtttacctgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-agtttttcg 50118649  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  50118650 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 50118707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 374 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 8988759 - 8988590
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat-------ttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttt 466  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8988759 attaaccctagatttaatttctgcaaaatgtcatctcttatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaatttt 8988660  T
Q  467 ttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8988659 tt-gtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 8988590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 49752138 - 49751972
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  49752138 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacctgtgatgcagtattaaccctagatttgaaataattttttcg 49752039  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||||||    
T  49752038 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatacaaaatgtcatcacttttttctaaatgtta 49751972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 49752249 - 49752083
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  49752249 tatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaaagttaacctgtgacgcagtattaaccctagatttgaccaaattttttcg 49752150  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  49752149 cgtgactttcctatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 49752083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 24548863 - 24548708
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  24548863 tatattaacc-tatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacctgtgatgcaatattaatcctagatttaacct-attttttcg 24548766  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24548765 cgtgactttactatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 24548708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 39405197 - 39405353
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||    
T  39405197 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattagccctagatttaacgt-attttttcg 39405295  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  39405296 agtgactttactatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcatatctaatttt 39405353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 43023469 - 43023313
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  43023469 tatattagccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 43023371  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  43023370 ggtgattttactatattaatcctaggtttaatttacgcaaaatgtcatctctaatttt 43023313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 46105870 - 46105714
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  46105870 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttttaaatgttaatccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 46105772  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  46105771 cgtgactttactatattaactctagatttaatttatgcaaaatttcatctctaatttt 46105714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 48808864 - 48809020
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||| | |||||||||    
T  48808864 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgtaatattagccctagatttaacat-attttttcg 48808962  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  48808963 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 48809020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 374 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 37351659 - 37351490
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat-------ttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttt 466  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  37351659 attaaccctagatttaatttctgcaaaatgtcatctcttatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccgtagatttaacctaatttt 37351560  T
Q  467 ttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37351559 tt-gtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 37351490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 373 - 537
Target Start/End: Original strand, 49356133 - 49356297
Alignment:
Q  373 tattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtg 472  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  49356133 tattaactctagatttaatttatgcaaaatgtaatctcttatttctaaatgcttacccgtgacgcaatagtaaccctagatttaacctaattttttcgcg 49356232  T
Q  473 tgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  49356233 tgactttactatattaaccctagatttaatttatacaaaatgtcatcttttatttctaaatgtta 49356297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 9060989 - 9061149
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9060989 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttaattctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 9061088  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     |||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  9061089 cgtgactttactatattaaccctaga------ttatgcaaaatgtcatgtcttatttctaaatgtta 9061149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 24548981 - 24548809
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat-------ttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaat 463  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  24548981 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatctcttatttttaaatgttaacccgtgaagcaatattaaccctagatttaacctaat 24548882  T
Q  464 tttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24548881 tttttcatgtaactttactatattaa-cctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 24548809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 42350465 - 42350636
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctctt-----atttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattt 465  Q
    |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||     |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  42350465 tatattaaccttgaatttaatttattcaaaatgtcatctcttctcttatttctaaatgttgacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacataattt 42350564  T
Q  466 tttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42350565 tttcgcgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 42350636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 26602813 - 26602642
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcga 292  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |    
T  26602813 tcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccttagatttaacctaacttctttgcttaattttattatattaaccctatttaatttaatcaa 26602714  T
Q  293 aatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    |||      | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26602713 aat------ggtaattgttatggaaatcaaaataaacaaatcgctccaaatttttctccttaattttactaaacaaat 26602642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 374 - 528
Target Start/End: Original strand, 39714660 - 39714813
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgt 473  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||    
T  39714660 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacgt-attttttcgcgt 39714758  T
Q  474 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  39714759 gactttactatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 39714813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 371 - 536
Target Start/End: Original strand, 49355914 - 49356077
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||  |    
T  49355914 tatattaaccctagatttaatttaggcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtttacccgtgacgcagtattaactctagatttaacctaattttt--g 49356011  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtt 536  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  49356012 tttgactttactatattaaccctagatttaatttaggcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtt 49356077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 3758831 - 3758675
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  3758831 tatattgaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttgtttctaaatgttaacctgtgatgtaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 3758733  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3758732 cgtgactttactatattaaccatagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 3758675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Original strand, 39405818 - 39405960
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  39405818 tatattaaccctagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaaccta--tttttcg 39405915  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39405916 tgtgactttactatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgt 39405960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 39713980 - 39714136
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |    
T  39713980 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatcacttatttctaaatgttaatccttgatgcaatattaaccctagatttaacat-atttttttg 39714078  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  39714079 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 39714136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 47555907 - 47556063
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |    
T  47555907 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatccttgacgcaatattaaccctatatttaacct-atttttttg 47556005  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  47556006 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 47556063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5759365 - 5759194
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaa-tttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5759365 cttcgcacgggttgaataacgtattatttaaaaaatttaactccgaaggaaaaa-cttataaattacgaaaaattgttgttctttataaatgtgaaaatc 5759267  T
Q  116 aaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgt 188  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5759266 aaagctgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgt 5759194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 371 - 506
Target Start/End: Original strand, 23980036 - 23980171
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  23980036 tatattaaccctatatttagttaatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccttaaatttaacctaattttttcg 23980135  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttat 506  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23980136 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttat 23980171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 371 - 506
Target Start/End: Original strand, 49356242 - 49356377
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49356242 tatattaaccctagatttaatttatacaaaatgtcatcttttatttctaaatgttaacctgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 49356341  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttat 506  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49356342 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttat 49356377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 9887878 - 9888033
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |    
T  9887878 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataactgttaacccgtgatgcaatataaaccctagatttaaccta--ttttttg 9887975  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  9887976 cgtgactttactttattaaccctagatttaatttatgcaaaaagtcatctctaatttt 9888033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 8531764 - 8531608
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  8531764 tatattaactctagatttagtttatgcaaaatgtcatctcttatttataaatgataacccgtgaagcaatattaaccctagatttaacct-atttttttg 8531666  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  8531665 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttgtgcaaaatgtcatctctaatttt 8531608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 37350280 - 37350124
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  37350280 tatactaaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 37350182  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  37350181 cgtgactttactatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 37350124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 47556538 - 47556694
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  47556538 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgacatctcttaattctaaatgttaacctgtgacacaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 47556636  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  47556637 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtaagctctaatttt 47556694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 202 - 359
Target Start/End: Original strand, 24944857 - 24945028
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatccta--------------tttaattta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||              |||||||||    
T  24944857 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 24944956  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaatttt 359  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24944957 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaatttt 24945028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 377 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 2117633 - 2117483
Alignment:
Q  377 aaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgac 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  2117633 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgttaatccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcgcgtgac 2117535  T
Q  477 tttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  2117534 tttactatattaactctagatttaatttatgcaaaatctcatctctaatttt 2117483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 42350581 - 42350747
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||     
T  42350581 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacatgtgacgcaatatttatgctagatttaacctaattttttca 42350680  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  42350681 ggtgactttactatattaaccctacatttaatttacccaaaatgtcatctcttatttctaattgtta 42350747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 378 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 52801799 - 52801650
Alignment:
Q  378 accctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgact 477  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  52801799 accctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgttaatccttgatgcaatattaaccctagatttaacat-attttttcgcgtgact 52801701  T
Q  478 ttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  52801700 ttactatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 52801650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 8987380 - 8987224
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8987380 tatactaaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 8987282  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  8987281 cgtgactttactatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 8987224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 512
Target Start/End: Original strand, 22454015 - 22454156
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  22454015 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctattatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctaaatttaacctaatcttttcg 22454114  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaa 512  Q
     || || |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22454115 cgtaacgttactatattaaccctaggttcaatttatgcaaaa 22454156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 29712878 - 29712722
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  29712878 tatattaaccctaaatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttca 29712780  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  29712779 cgtgactttacaatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 29712722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 42350692 - 42350849
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| |||||| |    
T  42350692 tatattaaccctacatttaatttacccaaaatgtcatctcttatttctaattgttaacccgttacgcaatattaaccgtagatttaacctattttttttg 42350791  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  42350792 cgtgactttactatattaaccatagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 42350849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 193 - 368
Target Start/End: Original strand, 46419557 - 46419745
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatccta-------------t 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||             |    
T  46419557 tcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaagttttccctagatttaacctaacttctttgcttaaatttactatattaatcctattcaattaacctat 46419656  T
Q  280 ttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaa 368  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46419657 ttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaatcaacaaatcgctcctaatctttctccttaattttactaaacaa 46419745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 371 - 534
Target Start/End: Original strand, 49356023 - 49356183
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  49356023 tatattaaccctagatttaatttaggcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtttatccgtgacgc--tattaactctagatttaacctaatttt-tcg 49356119  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatg 534  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  49356120 tgtgactttactgtattaactctagatttaatttatgcaaaatgtaatctcttatttctaaatg 49356183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 371 - 514
Target Start/End: Original strand, 9888510 - 9888652
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  9888510 tatactaaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 9888608  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 514  Q
     |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  9888609 cgtgactttactatagtaactctagatttaatttatgcaaaatg 9888652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 418 - 537
Target Start/End: Original strand, 12681852 - 12681971
Alignment:
Q  418 taaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtta 517  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12681852 taaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctaaatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 12681951  T
Q  518 tctcttatttttaaatgtta 537  Q
    | |||||||| |||||||||    
T  12681952 tatcttatttctaaatgtta 12681971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 406 - 537
Target Start/End: Original strand, 42349924 - 42350055
Alignment:
Q  406 atctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaattta 505  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  42349924 atctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgcgtgactttactacattaaccatatatttaattta 42350023  T
Q  506 tgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42350024 tgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 42350055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 406 - 537
Target Start/End: Original strand, 48808677 - 48808808
Alignment:
Q  406 atctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaattta 505  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | |||||||||||||    
T  48808677 atctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgcgtgactttactatacgaatcttagatttaattta 48808776  T
Q  506 tgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48808777 tgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgtta 48808808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 371 - 513
Target Start/End: Original strand, 12681231 - 12681372
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12681231 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatttcatatcttatttctaaatgttaatctgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 12681329  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 513  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12681330 cgtgactttactatattaactctagatttaatttatgcaaaat 12681372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 371 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 37356448 - 37356338
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37356448 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 37356349  T
Q  471 tgtgactttac 481  Q
    |||||||||||    
T  37356348 tgtgactttac 37356338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 49751178 - 49751020
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacct-aattttttc 469  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  49751178 tatattaaccatagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgaaacgcaatattaaccctagatttaacctaaattttttt 49751079  T
Q  470 gtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    | |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  49751078 gcgtgattttattatattaaccatagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 49751020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 24947867 - 24948023
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  24947867 tatattaaccctagatttaatttaagcaaaatgtcatatcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccttagatttaacct-attttttcg 24947965  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  24947966 cgtgagtttactatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 24948023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 51348089 - 51347964
Alignment:
Q  18 ttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaa 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51348089 ttcgcacgggttgaataatgtatttttttaaaatatagtttcgaaggagaaatcttataaattacagaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaa 51347990  T
Q  118 aattgcataaaccaaaattttgcaac 143  Q
    |  |||  ||||||||||||||||||    
T  51347989 agctgcgcaaaccaaaattttgcaac 51347964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 371 - 511
Target Start/End: Original strand, 12681916 - 12682055
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  12681916 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgttaatccgtgacgtaatattaaccctagatttaacct-atttttttg 12682014  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaa 511  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12682015 catgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaa 12682055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 409 - 537
Target Start/End: Original strand, 23979963 - 23980091
Alignment:
Q  409 tcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgc 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  23979963 tcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaatcctagatttaacctaattttttcatgtgactttactatattaaccctatatttagttaatgc 23980062  T
Q  509 aaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23980063 aaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 23980091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 371 - 525
Target Start/End: Original strand, 42349770 - 42349925
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt-tttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttc 469  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||||||    
T  42349770 tatattgatcctaaatttaatttatgcaaaatgtcatcccttattatttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccttaaatttaacataattttttc 42349869  T
Q  470 gtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttat 525  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||    
T  42349870 gcgtgactttactatattaaccctagatctaatttatacaaaatataatctcttat 42349925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 389 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 50034117 - 50033979
Alignment:
Q  389 aatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatta 488  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  50034117 aatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcgcgtgactttactatagta 50034019  T
Q  489 accctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  50034018 actctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 50033979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 8988012 - 8987857
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  8988012 tatattaacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaattttaacctctgacgcaatattaaccctagatttaaccta--tttttcg 8987915  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||    
T  8987914 cgtgactttaccatattaaccctagatttaatttattcaaaaagtcatctctaatttt 8987857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 37350912 - 37350757
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  37350912 tatattaacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaattttaacctctgacgcaatattaaccctagatttaaccta--tttttcg 37350815  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||    
T  37350814 cgtgactttaccatattaaccctagatttaatttattcaaaaagtcatctctaatttt 37350757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 49752027 - 49751861
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  49752027 tatattaaccctagatttaatttatacaaaatgtcatcacttttttctaaatgttaacctgtgacgcagtattaaccctagatttgaaataattttttcg 49751928  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||    
T  49751927 catgactttactatattatccctagatttaatttatgcaaaatgtcatcacttttttctaaatgtta 49751861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 193 - 370
Target Start/End: Original strand, 54866762 - 54866933
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcga 292  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  54866762 tcttattccttaaagctaatccgaacgcaaaattttggcttagatttaacctaatttctttgcttaattttactatattaatcctatttaatttaatcaa 54866861  T
Q  293 aatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    |||      ||||||||||  | |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54866862 aat------gttaattgttatgaaaatcaaaatgaacaaatcactcataatttttctccttaattttactaaacaaat 54866933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 43022398 - 43022242
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||     
T  43022398 tatattaaccctagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccatatatttaacct-attttttca 43022300  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||    
T  43022299 cgtgactttactatagtaactctagatttaatttatgaaaaatgtcagctctaatttt 43022242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 46105080 - 46104924
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  46105080 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgttaatatgtgacgcaatattaaccctacatttaacat-attttttcg 46104982  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||    
T  46104981 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatacaaaatgtcagctctaatttt 46104924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 193 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 26603582 - 26603397
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta----a 288  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    |    
T  26603582 tcttattccttaaagttaacctgaacgcaaaattttgccatagatttaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattaacccta 26603483  T
Q  289 tcga----aatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    || |    |||   || ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26603482 tctaatttaatcaaaatgttaattgttatggaaatcgaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 26603397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 406 - 536
Target Start/End: Original strand, 49355840 - 49355968
Alignment:
Q  406 atctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaattta 505  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49355840 atctcttatttctaaatgttaacctgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttt--gtttgactttactatattaaccctagatttaattta 49355937  T
Q  506 tgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtt 536  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  49355938 ggcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtt 49355968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 390 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 49751681 - 49751534
Alignment:
Q  390 atttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaa 489  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49751681 atttatgcaaaatgtcatcccttatttctaaatgttaacctgtgatgcagtattaaccctagatttgaaataattttttcgcgtgactttactatattaa 49751582  T
Q  490 ccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||||||    
T  49751581 tcctagatttaatttatacaaaatgtcatcacttttttctaaatgtta 49751534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 49751478 - 49751314
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||  |||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  49751478 tatattatccctagatttaatttatgcaaa-tgtcatcacttttttctaaatgttaacatgtgacgcagtattaaccctagatt-aacctaattttttcg 49751381  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  49751380 cgtgactttactatattaaccctatatttaatctatgcaaaatgtcatcttttatttctaaatgtta 49751314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 49751916 - 49751751
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||  |||| ||| |||||||||| |||| |||||| |||||||     
T  49751916 tatattatccctagatttaatttatgcaaaatgtcatcacttttttctaaatgttaacatgtgacgcagtattaaccctagatt-aacctagttttttca 49751818  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  49751817 cgtgactttactatattaactctagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaaagtta 49751751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 371 - 484
Target Start/End: Original strand, 2526685 - 2526798
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  2526685 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgttaagccgtgattcaatattaaccctagatttaacctaattttttca 2526784  T
Q  471 tgtgactttactat 484  Q
    ||||||||||||||    
T  2526785 tgtgactttactat 2526798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 409 - 526
Target Start/End: Original strand, 2526799 - 2526916
Alignment:
Q  409 tcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgc 508  Q
    |||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2526799 tcttatttctaaatgttaatctgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgt 2526898  T
Q  509 aaaatgttatctcttatt 526  Q
    ||||||| || |||||||    
T  2526899 aaaatgtcatatcttatt 2526916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 392 - 528
Target Start/End: Original strand, 9061115 - 9061249
Alignment:
Q  392 ttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaacc 491  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9061115 ttatgcaaaatgtcatgtcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaatcctagatttaaccta--tttttggcgtgactttactatattaacc 9061212  T
Q  492 ctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  9061213 ctatatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 9061249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 406 - 533
Target Start/End: Original strand, 9060801 - 9060929
Alignment:
Q  406 atctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgattt-aacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaattt 504  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9060801 atctcttatttctaaatattaacccgtgacgcaatattaaccttagattttaacctaattttttcgcgtgactctactatattaaccctagatttaattt 9060900  T
Q  505 atgcaaaatgttatctcttatttttaaat 533  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  9060901 atgcaaaatgtcatctcttatttgtaaat 9060929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 439 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 43022441 - 43022343
Alignment:
Q  439 atattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43022441 atattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 43022343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 49751589 - 49751424
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  49751589 tatattaatcctagatttaatttatacaaaatgtcatcacttttttctaaatgttaacctgtgacgcagtattaaccctagatttgaaataattttttcg 49751490  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||| |||||||||    
T  49751489 cgtgactttactatattatccctagatttaatttatgc-aaatgtcatcacttttttctaaatgtta 49751424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 49751806 - 49751645
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  49751806 tatattaactctagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaaagttaacctgtgacgcagtattaaccctagatttgaccaaattttttcg 49751707  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     |||||||| ||||||||||||||||     |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  49751706 cgtgactttcctatattaaccctaga-----tttatgcaaaatgtcatcccttatttctaaatgtta 49751645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 371 - 523
Target Start/End: Original strand, 42350351 - 42350506
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctctt-----atttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattt 465  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||     |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  42350351 tatattaaccctgagtttaatttatgcaaaatgtcatctcttctcttatttctaaatgttgacccgtgatgcaatattaaccatagatttaacctaattt 42350450  T
Q  466 tttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctctt 523  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  42350451 tt--gtgtgactttactatattaaccttgaatttaatttattcaaaatgtcatctctt 42350506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Original strand, 35707676 - 35707769
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtatttt-ttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35707676 cttcgcacgggttgaataacgtatttttttaaaaatttagttctgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtg 35707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 371 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 49751369 - 49751253
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatt-ttttc 469  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  49751369 tatattaaccctatatttaatctatgcaaaatgtcatcttttatttctaaatgttaatctgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaatttttttc 49751270  T
Q  470 gtgtgactttactatat 486  Q
    | |||||||||||||||    
T  49751269 gcgtgactttactatat 49751253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 109
Target Start/End: Original strand, 53991300 - 53991388
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53991300 gcacgggttgaataacgtatttttttaaaatttagttctgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtg 53991388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 439 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 20590671 - 20590566
Alignment:
Q  439 atattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg-------ttatctcttatttttaa 531  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||    
T  20590671 atattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatctcttatttttaa 20590572  T
Q  532 atgtta 537  Q
    ||||||    
T  20590571 atgtta 20590566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 269 - 372
Target Start/End: Original strand, 42348269 - 42348372
Alignment:
Q  269 attaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaa 368  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42348269 attaatcatatttaatttaatcaaaatgttaatgttaagtgttagggaaatcaaaatgaacaaatagctcctaatttttctccttaattttactaaacaa 42348368  T
Q  369 atta 372  Q
    ||||    
T  42348369 atta 42348372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 371 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 3758193 - 3758103
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3758193 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaaccggtgatgcaatattaaccctagatttaaccta 3758103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 371 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 13172507 - 13172417
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13172507 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaaccggtgatgcaatattaaccctagatttaaccta 13172417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 371 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 20589877 - 20589787
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20589877 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaaccggtgatgcaatattaaccctagatttaaccta 20589787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 371 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 24548228 - 24548138
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24548228 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaaccggtgatgcaatattaaccctagatttaaccta 24548138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 371 - 461
Target Start/End: Original strand, 36742393 - 36742483
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36742393 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaaccggtgatgcaatattaaccctagatttaaccta 36742483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Original strand, 574195 - 574288
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtatttttta-aaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  574195 cttcgcacgggttgaataacgtattttttttaaaatttagttctgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtg 574288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 269 - 370
Target Start/End: Original strand, 42348549 - 42348652
Alignment:
Q  269 attaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaa--atcgctcctaatttttctccttaattttactaaac 366  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42348549 attaatcatatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaatgaacaaatatcgctcctaatttttctccttaattttactaaac 42348648  T
Q  367 aaat 370  Q
    ||||    
T  42348649 aaat 42348652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 193 - 370
Target Start/End: Original strand, 49355253 - 49355443
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt------- 285  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||           
T  49355253 tcttgttccttaatgttaacccgaacacaaaattttgccatagatttaacctaacttctttgcttaatttgactatattaaccctaattaattaagccaa 49355352  T
Q  286 -------taatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
           ||||| ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49355353 cttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttatg-aaatcaaaataaacagatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 49355443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 407 - 534
Target Start/End: Original strand, 23980321 - 23980447
Alignment:
Q  407 tctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttat 506  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||   || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23980321 tctcttatttctaaatgttaacctgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaatttttttacgtaactttactata-taaccatagatttaatttat 23980419  T
Q  507 gcaaaatgttatctcttatttttaaatg 534  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23980420 acaaaatgtcatctcttatttctaaatg 23980447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 418 - 528
Target Start/End: Original strand, 46420258 - 46420367
Alignment:
Q  418 taaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtta 517  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  46420258 taaaagttaacccgtgacacaatattaaccctagatttaacctaattttttcgcgtgactttactatatt-accgtagatttaatttatgcaaaatgtca 46420356  T
Q  518 tctcttatttt 528  Q
    ||||| |||||    
T  46420357 tctctaatttt 46420367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 428 - 537
Target Start/End: Original strand, 49356378 - 49356494
Alignment:
Q  428 cccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg-------ttatct 520  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||    
T  49356378 cccgtgacgcaatactaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatataaattatgcaaaatgtcattttttatct 49356477  T
Q  521 cttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||    
T  49356478 cttatttttaaatgtta 49356494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 451 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 49751209 - 49751123
Alignment:
Q  451 gatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  49751209 gatttaacctaattttttcgcgtgactttactatattaaccatagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 49751123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 371 - 461
Target Start/End: Original strand, 50119189 - 50119279
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  50119189 tatattaaccctaaatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaaccggtgatgcaatattagccctagatttaaccta 50119279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 501
Target Start/End: Original strand, 49356432 - 49356572
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcat-------ctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaat 463  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||  |||||||||||||    
T  49356432 tatattaaccctagatataaattatgcaaaatgtcattttttatctcttatttttaaatgttaacctgtgacgcaatattaatcccagatttaacctaat 49356531  T
Q  464 tttttcgtgtgactttactatat---taaccctagatttaa 501  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  49356532 tttttcgtgtgactttactatattaataaccctagatttaa 49356572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 196 - 291
Target Start/End: Original strand, 42348106 - 42348201
Alignment:
Q  196 tattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcg 291  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  42348106 tattctttaaagttaatccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttacttaaatttactatattaaccctatttaatttaatcg 42348201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 202 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16904822 - 16904665
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattt--------------aattta 287  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||              ||||||    
T  16904822 ttaaagttaacccaaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttttttgcttaattttaatgtattaaccctatttaattaaccttgtttaattta 16904723  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaattt 345  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16904722 atcaaaatattaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcattcctaattt 16904665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 193 - 291
Target Start/End: Original strand, 42348387 - 42348485
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcg 291  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  42348387 tcttattccttaaagttaacctgaacgcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaaatttactatattaaccctatttaatttaatcg 42348485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 405 - 512
Target Start/End: Original strand, 9060686 - 9060789
Alignment:
Q  405 catctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaattt 504  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  9060686 catctcttatttctaaatgttaaccact----caatattaaccctagatttaacctaattttttcgcgtgacattactatattaatcctagatttagttt 9060781  T
Q  505 atgcaaaa 512  Q
    ||||||||    
T  9060782 atgcaaaa 9060789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 409 - 523
Target Start/End: Original strand, 42350278 - 42350392
Alignment:
Q  409 tcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgc 508  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  42350278 tcttatttctaaatattgacccgtgacgcaatattaaccttagatttaaccttgttttttcgcgcgactttactatattaaccctgagtttaatttatgc 42350377  T
Q  509 aaaatgttatctctt 523  Q
    ||||||| |||||||    
T  42350378 aaaatgtcatctctt 42350392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 452 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 49752520 - 49752447
Alignment:
Q  452 atttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttat 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  49752520 atttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctaaattttatttatgcaaaatgtcatcttttat 49752447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 371 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 49752490 - 49752329
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatct-------cttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatat-taaccctcgatttaacctaa 462  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||       ||||||| | || |||||||||  ||| || || |  |||| ||||||||||||    
T  49752490 tatattaaccctaaattttatttatgcaaaatgtcatcttttatctcttatttattaaagttaacccga-atgtaaaatgttgccctagatttaacctaa 49752392  T
Q  463 ttttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttat 525  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  49752391 ttttttcgcatgactttactatattaaccctagatttaatttatgtaaaatttcatctcttat 49752329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 406 - 501
Target Start/End: Original strand, 46420155 - 46420249
Alignment:
Q  406 atctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaa 501  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46420155 atctcttatttctaaaatttaacc-gtgacgcaatattaacactagatttaacctaagtttttcgcgtgactttactatattaaccctagatttaa 46420249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 193 - 284
Target Start/End: Original strand, 48808234 - 48808325
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 284  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| | | |||| ||||||||||    
T  48808234 tcttattttttaaagttaatccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttagttttattattttaaccctatttaat 48808325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 385 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 49752666 - 49752565
Alignment:
Q  385 atttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactat 484  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  49752666 atttaatttatgtaaaatgtcatctcttatttctaaaatttaacctgtgacgcagtattaacgctaaatttgacctaattttttcgcgtgactttactat 49752567  T
Q  485 at 486  Q
    ||    
T  49752566 at 49752565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 441 - 513
Target Start/End: Original strand, 22453941 - 22454013
Alignment:
Q  441 attaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 513  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22453941 attaaccctagatttaacctaattttttaatatgattttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 22454013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 454 - 537
Target Start/End: Original strand, 42349742 - 42349826
Alignment:
Q  454 ttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatt-tttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  42349742 ttaacctaattttttcgcgtgactttactatattgatcctaaatttaatttatgcaaaatgtcatcccttattatttaaatgtta 42349826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 466 - 537
Target Start/End: Original strand, 2526669 - 2526740
Alignment:
Q  466 tttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  2526669 tttcgcgtggctttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgtta 2526740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 266
Target Start/End: Original strand, 8120421 - 8120494
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttact 266  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  8120421 tcttattccttaaagttaacccgaacgcaagattttgacatagatttaacctaacttctttgcttaattttact 8120494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 472 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 49752259 - 49752194
Alignment:
Q  472 gtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  49752259 gtgactttactatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaaagtta 49752194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 451 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 49752711 - 49752630
Alignment:
Q  451 gatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaa 532  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  49752711 gatttaacttaatttttttgtgtgactttactacattaatcttagatttaatttatgtaaaatgtcatctcttatttctaaa 49752630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 43022952 - 43022897
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43022952 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 43022897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 52802602 - 52802547
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  52802602 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatattatctcttgtttttaaatgtta 52802547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 22454015 - 22454070
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  22454015 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctattatttctaaatgtta 22454070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 24549092 - 24549037
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  24549092 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataaacgtta 24549037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Original strand, 9061203 - 9061249
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9061203 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 9061249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 285
Target Start/End: Original strand, 48808351 - 48808443
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||| |   || |||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  48808351 tcttattccttaaagttaacccgaatgcaaaatgttgccctaaatttaacctaactttaatgattaattatactgtattagccctatttaatt 48808443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 8988123 - 8988068
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||    
T  8988123 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatggcatatcttatttctaaatgtta 8988068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 9887656 - 9887711
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||    
T  9887656 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgacatatcttatttctaaatgtta 9887711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 552 - 599
Target Start/End: Original strand, 16907178 - 16907225
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgtctctgctgctc 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16907178 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgtttgtgctgctc 16907225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 552 - 599
Target Start/End: Original strand, 21380847 - 21380894
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgtctctgctgctc 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21380847 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgtttgtgctgctc 21380894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 552 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 29362245 - 29362198
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgtctctgctgctc 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29362245 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtatttctgctgctc 29362198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 37351023 - 37350968
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||    
T  37351023 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatggcatatcttatttctaaatgtta 37350968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 376 - 442
Target Start/End: Original strand, 23980400 - 23980466
Alignment:
Q  376 taaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatat 442  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||    
T  23980400 taaccatagatttaatttatacaaaatgtcatctcttatttctaaatgctaatccgtgacgcaatat 23980466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Original strand, 39714767 - 39714813
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  39714767 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 39714813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 5482948 - 5482895
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaat 70  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  5482948 cttcgcacgggttgaataatgtatttttcaaaaatttagttgtgaaggagaaat 5482895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 28381754 - 28381790
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28381754 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 28381790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 30390073 - 30390037
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30390073 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 30390037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 42346731 - 42346767
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42346731 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 42346767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 49751068 - 49751020
Alignment:
Q  369 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49751068 attatattaaccatagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 49751020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 489 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 52801799 - 52801751
Alignment:
Q  489 accctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  52801799 accctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgtta 52801751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 2117859 - 2117804
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  2117859 tatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttataaacgtta 2117804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 279
Target Start/End: Original strand, 1325554 - 1325640
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctat 279  Q
    |||||||  |||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  1325554 tcttattacttaaagttaacccgcaaacaatattttgccctagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 1325640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 272
Target Start/End: Original strand, 8120225 - 8120295
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtatta 272  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||    
T  8120225 ttaaagttaacccgaacgctaattgttgccctagatttaacctaaccctaatgcttaattttactgtatta 8120295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 483 - 537
Target Start/End: Original strand, 50118441 - 50118495
Alignment:
Q  483 atattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||    
T  50118441 atattaaccctatatttaatttatgcaaaatatcatctcttatttataaacgtta 50118495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 52801063 - 52801017
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  52801063 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 52801017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 52801696 - 52801650
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52801696 tatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 52801650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 415
Target Start/End: Original strand, 2526872 - 2526916
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 415  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  2526872 tatattaaccctagatttaatttatgtaaaatgtcatatcttatt 2526916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 8959891 - 8959859
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatattt 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8959891 ccttgcttgctttggtttttgatttatatattt 8959859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 14147204 - 14147168
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14147204 ccttgcttgctttgctttttgatttatatatttgtgt 14147168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 21584498 - 21584462
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21584498 ccttgcttgctttgttttttgatttatatatttgtgt 21584462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 273
Target Start/End: Original strand, 23980173 - 23980253
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaa 273  Q
    |||||||  |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| | |||  ||| | |||||||||||| ||||||    
T  23980173 tcttattagttaaagttaacccgtaagcaatattttgccctagatttaccctaatttctctacttaattttactatattaa 23980253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 273
Target Start/End: Original strand, 24527565 - 24527648
Alignment:
Q  191 tatcttatt-ctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaa 273  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| | |||  | | |||||||||||||| ||||||    
T  24527565 tatcttattacttaaaagttaacccgtaagcaatattttgccctagatttaccctaatttttctgcttaattttactatattaa 24527648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Original strand, 36678856 - 36678954
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||  || | ||||| | ||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  36678856 cttcgcattggtttaataatgtattttttaaaaatttggttgtgaaggagaaat-gtacacattacagtaaattgttgtcattcataaatgtgaatatca 36678954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #209
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 2117529 - 2117483
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2117529 tatattaactctagatttaatttatgcaaaatctcatctctaatttt 2117483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #210
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 272
Target Start/End: Original strand, 8120129 - 8120199
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtatta 272  Q
    |||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||    
T  8120129 ttaaagttaaccagaacgctaattgttgccctagatttaacctaaccctaatgcttaattttactgtatta 8120199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #211
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 279
Target Start/End: Original strand, 24527973 - 24528059
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctat 279  Q
    |||||||  |||| |||||| || | |||| |||||||| |||||||||| |||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  24527973 tcttattacttaatgttaacacgtaagcaatattttgccttagatttaacctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 24528059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #212
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Original strand, 49357544 - 49357582
Alignment:
Q  379 ccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49357544 ccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 49357582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #213
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 490 - 528
Target Start/End: Original strand, 49357544 - 49357582
Alignment:
Q  490 ccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  49357544 ccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 49357582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #214
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 1694805 - 1694717
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaat 106  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||| | || ||||||||||| ||  |||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  1694805 cttcacactggttgaataatgtatttttcaaaaatttggctttgaaggagaaat-ttgaaaattatggtaaattattgtccttcataaat 1694717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #215
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24390103 - 24390058
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataac 247  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||    
T  24390103 ttaaagttaacccgaacgctaattgttgccctagaattaacataac 24390058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #216
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 49752445 - 49752396
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 242  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  49752445 tcttatttattaaagttaacccgaatgtaaaatgttgccctagatttaac 49752396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #217
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 409 - 445
Target Start/End: Original strand, 2526625 - 2526661
Alignment:
Q  409 tcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaa 445  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2526625 tcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaa 2526661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #218
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 219 - 279
Target Start/End: Original strand, 24527911 - 24527971
Alignment:
Q  219 gcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctat 279  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  24527911 gcaatattttgccctagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 24527971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #219
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 492 - 528
Target Start/End: Original strand, 24947354 - 24947390
Alignment:
Q  492 ctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24947354 ctagatttaatttatgcaaaatattatctctaatttt 24947390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #220
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 385 - 417
Target Start/End: Original strand, 46420335 - 46420367
Alignment:
Q  385 atttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46420335 atttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 46420367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 398; Significance: 0; HSPs: 165)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 537
Target Start/End: Original strand, 33704785 - 33705294
Alignment:
Q  28 ttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcataa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||| | || |||||||||||| ||| |||||  ||| |||    
T  33704785 ttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaatgaaaaatcttataaattatagaaaattatcgttctttataaatgtaaaagtcaaagctgcgtaa 33704884  T
Q  128 accaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattt 227  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33704885 accaaaattttgcaacagagagtctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattt 33704984  T
Q  228 tgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataa 327  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33704985 tgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataa 33705084  T
Q  328 acaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaa 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33705085 acaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaa 33705184  T
Q  428 cccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttattt 527  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33705185 ctcgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 33705284  T
Q  528 ttaaatgtta 537  Q
     |||||||||    
T  33705285 ctaaatgtta 33705294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Original strand, 25695557 - 25696077
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  25695557 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgttatttatcaatgtgaaaatca 25695656  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||| ||| |||||||||||||| || | || || ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  25695657 aaactgcgtaaaccaaaattttaca-cacatagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccga 25695755  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  25695756 acgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 25695855  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25695856 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaattttactaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttattt 25695955  T
Q  417 ttaaatgttaacccgtgatgcaata-ttaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25695956 ttaaatgttaacccgtgacgcaatatttaaccctagatttaacctaattttttcatgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 25696055  T
Q  516 tatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  25696056 catctcttatttctaaatgtta 25696077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 17636708 - 17637212
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  17636708 gcacgggttgaataacgtatttttttaaaatatagtttcgaatgagaaatcttataaattacagaaaattattgtcctttataaatgtgaaaatcaaagc 17636807  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  17636808 tgcgtaaaccaaaattttgcaacatagagcctaaaacactacataaaaaataacatgacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaatgc 17636907  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatc 320  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17636908 aaaattttgcccaagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttcgggaaatc 17637007  T
Q  321 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaa 420  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17637008 aaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaagttatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataa 17637107  T
Q  421 atgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17637108 acgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctatttttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatct 17637207  T
Q  521 cttat 525  Q
    |||||    
T  17637208 cttat 17637212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 525
Target Start/End: Original strand, 36884799 - 36885305
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36884799 cttcacacgggttgaataacgtatttttttaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 36884898  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||  | | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36884899 aagctacgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccga 36884998  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  36884999 acgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaaggttaattgttaggga 36885098  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 416  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36885099 aatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 36885198  T
Q  417 ttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtt 516  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||     
T  36885199 ataaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttc--gtgactttactatattcaatctagatttaattcatgcaaaatgtc 36885296  T
Q  517 atctcttat 525  Q
    |||| ||||    
T  36885297 atctattat 36885305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 34719481 - 34718998
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  34719481 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttatcattgtgaaaatca 34719382  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  34719381 aaactgcgtaaactaaaattttacaacacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccga 34719282  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  34719281 acgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 34719182  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttact-aaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  34719181 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaattttactaaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatattatctcttatt 34719082  T
Q  416 tttaaatgttaacccgtgatgcaata-ttaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatt 498  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34719081 tttaaatgttaacccgtgacgcaatatttaaccctagatttaacctaattttttcatgtgactttactatattaaccctagatt 34718998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 537
Target Start/End: Original strand, 42975419 - 42975935
Alignment:
Q  28 ttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcataa 127  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  42975419 ttgaataacatatttttttaaaatttagttttgaaggagaaatcttataaattacaaaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaagctgcgtaa 42975518  T
Q  128 accaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattt 227  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42975519 accaaaattttgcaacacagagcctaaaatactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattt 42975618  T
Q  228 tgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataa 327  Q
    ||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42975619 tgcccaaaatttaacctaacttctttgcttaattttattgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataa 42975718  T
Q  328 acaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtc-------atctcttatttttaa 420  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  42975719 acaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatctcttatttttaa 42975818  T
Q  421 atgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  42975819 atgttaacccatgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtaactttactatattaaccctagaattaatttatgcaaaatgacatct 42975918  T
Q  521 cttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||| |||||||||    
T  42975919 cttatttctaaatgtta 42975935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 534
Target Start/End: Original strand, 34725277 - 34725795
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtatt--ttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaat 114  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34725277 cttcgcacgggttaaataacatattcttttttaaaatttagttccgaaggagaaatcttataaattacgaaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaat 34725376  T
Q  115 caaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaaccc 214  Q
    ||||  ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  34725377 caaagctgcgtcaaccaaaattttgcaacacagagcctaaagcactgcataaaa-ataacataacaactattgtaatatcttattccttaaagttaatcc 34725475  T
Q  215 gaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgg 314  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  34725476 gaacacaaaattttgtcatagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagg 34725575  T
Q  315 gaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat 414  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  34725576 gaaatcaaaataaacaaatcgcacataatttttctccttaattttactaagcaaattatattaactctggatctaatttatgcaaaatgccatatcttat 34725675  T
Q  415 ttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 514  Q
    || |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34725676 ttataaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaatttttttgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 34725775  T
Q  515 ttatctcttatttttaaatg 534  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  34725776 tcatctcttatttttaaatg 34725795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 30181433 - 30180927
Alignment:
Q  18 ttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30181433 ttcgcacgggttgaataacgtatttttaaaaaatttaactccgaagaagaaatcttataaattacggaaaattattgtcctttatcaatgtgaaaatcaa 30181334  T
Q  118 aattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaa 217  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  30181333 aactgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaaacactgcataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaa 30181234  T
Q  218 cgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  30181233 cgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaa 30181134  T
Q  318 atcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||| ||||||||||||||||||             |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30181133 atcaaattaaacaaatcgctcctaa-------------ttttactacaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 30181047  T
Q  418 taaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtta 517  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30181046 taaatgttaacccctgacgcaatattaaccttagatttaacctaattttttcatgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtta 30180947  T
Q  518 tctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30180946 tctcttatttttaaatgtta 30180927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 41693165 - 41692682
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  41693165 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagttccgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttatcattgtgaaaatca 41693066  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41693065 aaactgcgtaaactaaaattttacaacacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatatcttattccttaaagttaacccga 41692966  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  41692965 acgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 41692866  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttact-aaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41692865 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaattttactaaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatattatctcttatt 41692766  T
Q  416 tttaaatgttaacccgtgatgcaata-ttaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatt 498  Q
     |||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41692765 attaaatgttaacccgtgacgtaatatttaaccctagatttaacctaattttttcatgtgactttactatattaaccctagatt 41692682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 43136296 - 43136798
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaa-aaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  43136296 gcacgggttgaataacgtatttttttttaaatttagttttgaatgagaaatcttataaattacagaaaattgttgtcatttataaatgtgaaaatcaaag 43136395  T
Q  120 ttgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacg 219  Q
     ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  43136396 ctgcgtaaaccaaaaatttgcaacacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaag 43136495  T
Q  220 caaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaat 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  43136496 caaaatttttccctagatttaacctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaat 43136595  T
Q  320 caaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattttta 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||    
T  43136596 caaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc--atttata 43136692  T
Q  420 aatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatc 519  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  43136693 aacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaccctaattttttcgtgtgactttactaaattaaccctagatttaatttctgcaaaatgtcatc 43136792  T
Q  520 tcttat 525  Q
    ||||||    
T  43136793 tcttat 43136798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Original strand, 3086451 - 3086961
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtatttttta-aaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3086451 cttcgcacgggttgaataacgtattttttttaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgttctttataaatatgaaaatc 3086550  T
Q  116 aaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccg 215  Q
    |||  ||| |||| |||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3086551 aaagctgcgtaaatcaaaattttgcatcacagagtctaaaacactacataacaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccg 3086650  T
Q  216 aacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggg 315  Q
    ||||||||||||            ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||      ||||| |||    
T  3086651 aacgcaaaattt------------aacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaa------ttgttaggg 3086732  T
Q  316 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 415  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3086733 aaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 3086832  T
Q  416 tttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg- 514  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3086833 tataaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 3086932  T
Q  515 ------ttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
          |||||||||||||||||||||||    
T  3086933 catatcttatctcttatttttaaatgtta 3086961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 21 - 537
Target Start/End: Original strand, 752078 - 752612
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  752078 gcacgggttgaataacgtattttttttaaatttagttttgaaggagaaatcttataaattacagaaaattgttgtcatttataaatgtgaaaatcaaagc 752177  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  752178 tgcgtaaaccaaaaatttgcaacacagagtctaaaacactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagc 752277  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatcttt--------------gcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaa 306  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| | |||              |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  752278 aaaatttttccctagatttaacctaacttatttaacctaacttatttgcttaattttactgcattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttag 752377  T
Q  307 ttgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtca 406  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  752378 ttgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgcca 752476  T
Q  407 tctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttat 506  Q
     |||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  752477 gctc--atttataaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaccctaattttttcgtgtgactttactaaattaaccctagatttaatttct 752574  T
Q  507 gcaaaatg-------ttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||       |||||||||||||||||||||||    
T  752575 gcaaaatgtcgtctcttatctcttatttttaaatgtta 752612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 38 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 2182857 - 2182344
Alignment:
Q  38 tattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcataaaccaaaattt 137  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || | ||||| |||||||    
T  2182857 tatttttttaaaatttagctccgaaggagaaatattataaattacggaaaattgttgtcctttataattgtgaaaattaaagttacgtaaactaaaattt 2182758  T
Q  138 tgcaacgca-gagtctaaagcacttcataaaaaa-taacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctag 235  Q
    |||||| || ||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  2182757 tgcaacacaagagcctaaagcactacagaaaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaatatgaacgcaaaattttgccctag 2182658  T
Q  236 atttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------taatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatca 321  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||              ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2182657 atttaacctaacttctttgcttaattttcctgtattaaccctatttaattaactctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatca 2182558  T
Q  322 aaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaa 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  2182557 aaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaatc-tagatttaatt-atgtaaaatgtcatctcttatttgtaaa 2182460  T
Q  422 tgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctc 521  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2182459 cgttaacccgtgacacaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactacattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctc 2182360  T
Q  522 ttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||    
T  2182359 ttatttttaaatgtta 2182344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 42976224 - 42976559
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaac 301  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  42976224 ttaaagttaacccggacgcaaaattttgccctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaac 42976323  T
Q  302 gttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaa 401  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42976324 gttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaa 42976423  T
Q  402 tgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaa 501  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42976424 tgtcatatcttatttataaacgttaacccgtgacgtaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactattttaaccctagatttaa 42976523  T
Q  502 tttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42976524 tttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 42976559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 30180532 - 30180183
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  30180532 ttaaagttaaccccaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcatgtttaactta 30180433  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  30180432 aacaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaaccttagatt 30180333  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30180332 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatggtaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 30180233  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30180232 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 30180183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 202 - 533
Target Start/End: Original strand, 12419383 - 12419727
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattt-------------aatttaa 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||             |||||||    
T  12419383 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttaccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaacccatttaatttaa 12419482  T
Q  289 tcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatattt 388  Q
    || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12419483 tcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagattt 12419582  T
Q  389 aatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatta 488  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12419583 aatttatgcaaaatggtatctcttatttctaaatgttaactcgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaatttttttgtgtgactttactatatta 12419682  T
Q  489 accctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaat 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  12419683 accctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttaattctaaat 12419727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 6304743 - 6305092
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||              |||||    
T  6304743 ttaaagttaatccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccatatttaattaacattgtttaattta 6304842  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6304843 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 6304942  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6304943 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacctatgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatact 6305042  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6305043 aaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 6305092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 202 - 533
Target Start/End: Original strand, 753006 - 753351
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||              |||||    
T  753006 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 753105  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  753106 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacatattatattaaccctagatt 753205  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  753206 taatttatgcaaaatgacatatcttatttctaaatgttaacctgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 753305  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaat 533  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  753306 aacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaat 753351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 3087359 - 3087708
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta-------------- 287  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |                  
T  3087359 ttaaagttaacccggacgcaaaattttgccctggaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattaaccatgtttaatttg 3087458  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3087459 atcaaaatgttaacgttaattgttggggaaatcaaaataaacaaatcactcttaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 3087558  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3087559 taatttatgcaaaatggcatctcttatttctaaatgttaacctgtgacgcaatattagcccgagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 3087658  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3087659 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 3087708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 753749 - 754098
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||              |||||    
T  753749 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtttaattta 753848  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  753849 atcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 753948  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  753949 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacctatgacgcaatattaaccctagatttaacataattttttcgtgtgactttactatact 754048  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  754049 aaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 754098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 25696358 - 25696707
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  25696358 ttaaagttaacccgaactcaaaaatttgtcctagatttaacctaatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcatgtttaattta 25696457  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  25696458 aataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctcttaaaatttactaaacaaattatattaaccttagatt 25696557  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25696558 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactacatt 25696657  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25696658 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 25696707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 34726200 - 34726549
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||              |||||    
T  34726200 ttaaagttaaaccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgctaaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 34726299  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34726300 atcaaaattttaacgttaattattagggaaatcaaaataaacaaatcacttctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccttatatt 34726399  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34726400 taatttatgcaaaatggcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctaaatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 34726499  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  34726500 aaccctagatttaatttatgcataatgtcatatcttatttctaaatgtta 34726549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 43137843 - 43138192
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||              |||||    
T  43137843 ttaaagttaacccgaacgcaaaactttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtttaattta 43137942  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43137943 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 43138042  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  43138043 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacctatgacgcaatattaaccctagatttaacataattttttcgtgtgactttactatact 43138142  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43138143 aaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 43138192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 33705578 - 33705925
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||              |||||    
T  33705578 ttaaagttaacccgaacgtaaaatttttccatagattaaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaaataaccatgtttaattta 33705677  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33705678 atcaaaatgtaaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccttatatt 33705777  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33705778 taatttatgcaaaatggcatctcttatttctaaatattaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttc--gtgactttactatatt 33705875  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  33705876 aaccctagatttaatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgtta 33705925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 34718033 - 34717684
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  34718033 ttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtttaattta 34717934  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  34717933 aataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaataaattatattaaccttagatt 34717834  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34717833 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacccgagacgcaatattaaccctatatttaacctaattttttcgtgtgactttactacatt 34717734  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34717733 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 34717684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 202 - 533
Target Start/End: Original strand, 43137211 - 43137556
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||              |||||    
T  43137211 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 43137310  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  43137311 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacatattatattaaccctagatt 43137410  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137411 taatttatgcaaaatggcatatcttatttctaaatgttaacatgtgacgcaatattaaccttagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 43137510  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaat 533  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43137511 aacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaat 43137556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 41691717 - 41691370
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  41691717 ttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttgacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcatgtttaattta 41691618  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  41691617 aataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaaccttagatt 41691518  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  41691517 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacccgagacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttc--gtgactttactacatt 41691420  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41691419 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 41691370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 292 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 30755488 - 30755243
Alignment:
Q  292 aaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaat 391  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30755488 aaatgttaacgttaattgttatggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaat 30755389  T
Q  392 ttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaacc 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30755388 ttatgcaaaatgtcatctcttatttataaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaact 30755289  T
Q  492 ctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30755288 ctaaatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 30755243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 269 - 533
Target Start/End: Original strand, 6304080 - 6304344
Alignment:
Q  269 attaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaa 368  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  6304080 attaatcctgtttaatttaatcaaaatattaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaataaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacat 6304179  T
Q  369 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttttt 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6304180 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgacatatcttatttctaaatgttaacctgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaatttttt 6304279  T
Q  469 cgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaat 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6304280 cgtgtgactttactatattaacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaat 6304344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 202 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 2181952 - 2181618
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||              ||    
T  2181952 ttaaagttaacccgaacgtaaaattttgccctagatttaacctaacttatttgcttaattttaatgtattaatcctatttaattaatcctgtttaattta 2181853  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||  |||    
T  2181852 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcactcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattagtcctggatt 2181753  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| | ||||||    
T  2181752 taatttatacaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacctgtgacccaatattaaccctagatttaacat-attttttcgcgtgacttgagtatatt 2181654  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctctt 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2181653 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctt 2181618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 338 - 537
Target Start/End: Original strand, 36886005 - 36886204
Alignment:
Q  338 cctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgc 437  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36886005 cctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgc 36886104  T
Q  438 aatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36886105 aatattagccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 36886204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 202 - 458
Target Start/End: Original strand, 42976846 - 42977116
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta-------------- 287  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |                  
T  42976846 ttaaagttataccggacgcaaaattttgccctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtttaatttg 42976945  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42976946 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 42977045  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaac 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42977046 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaaccggtgatgcaatattaaccctagatttaac 42977116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 26601488 - 26601841
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  26601488 ttaaagttaacccgaacgtaaa-ttttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtttaattta 26601586  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  | ||     
T  26601587 atcaaaatgttaacgttaattgttaaggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattatgcaaa-atg 26601685  T
Q  388 taat---ttatg-caaaatgt--catctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttac 481  Q
      ||   ||||  | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26601686 acatctcttatttctaaatgtggcatctcttatttctaaatgttaacctccgacgcaatattaaccctagatttaacccaattttttcgtgtgactttac 26601785  T
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26601786 tatattaaccctagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 26601841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 202 - 461
Target Start/End: Original strand, 17637631 - 17637903
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta-------------- 287  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |                  
T  17637631 ttaaagttaacccggacgcaaaattttgccattgaattaacctaacttctttgcttaattttact-tattaaccctatttaattaaccctgtttaatttg 17637729  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17637730 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 17637829  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17637830 taatttgtgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaatcggtgatgcaatattaaccctagatttaaccta 17637903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 12419233 - 12419067
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12419233 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtggcgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 12419134  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12419133 tgtgactttactatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 12419067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 30180982 - 30180816
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  30180982 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgttaacccctgacgcaatattaaccttagatttaacctaattttttca 30180883  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30180882 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttctaaatgtta 30180816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 374 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 2182396 - 2182233
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgt 473  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2182396 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgt 2182297  T
Q  474 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2182296 gactttactatattaaccttatatttaatttatacaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 2182233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 221 - 461
Target Start/End: Original strand, 36885738 - 36885992
Alignment:
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta--------------atcgaaatgttaacgttaa 306  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |              ||| ||||||||| |||||    
T  36885738 aaaattttgccctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtttaatttgatcaaaatgttaatgttaa 36885837  T
Q  307 ttgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtca 406  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  36885838 ttgttagggaaatcaaaataaataaatcgctcctaatttttctctttaattttactcaataaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgaca 36885937  T
Q  407 tctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  36885938 tctcttatttctaaatgttaacccatgacgcaatattagccctagatttaaccta 36885992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 371 - 527
Target Start/End: Original strand, 6304293 - 6304449
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6304293 tatattaacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaattttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 6304392  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttattt 527  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6304393 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 6304449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 753300 - 753466
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  753300 tatattaacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaattttaacccctgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 753399  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  753400 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataactgtta 753466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 34725743 - 34725909
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34725743 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgctaacccgtaactcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 34725842  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  34725843 tgtgactttactatgttaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgtta 34725909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 18242058 - 18241901
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18242058 tatattaatcctagatttaattgatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 18241959  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18241958 cgtgactttattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 18241901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 17637169 - 17637342
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatct-------cttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaat 463  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17637169 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaat 17637268  T
Q  464 tttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17637269 tttttcgtgtgactttactatattaaccctagacttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 17637342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 17637287 - 17637443
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17637287 tatattaaccctagacttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaaaattaaccctagatttaacct-attttttcg 17637385  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17637386 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 17637443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 375 - 528
Target Start/End: Original strand, 42976508 - 42976660
Alignment:
Q  375 ttaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtg 474  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  42976508 ttaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaacgctagatttaacct-attttttcgtgtg 42976606  T
Q  475 actttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  42976607 actttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 42976660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 18242169 - 18242003
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||     
T  18242169 tatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccttatatttaacctaattttttca 18242070  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18242069 tgtgactttgctatattaatcctagatttaattgatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgtta 18242003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 42692629 - 42692464
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  42692629 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgccatctcttgtttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaat-ttttcg 42692531  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42692530 tgtgactttactatattaaccatagacttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 42692464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 752667 - 752823
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  752667 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctagatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 752765  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  752766 ggtgactttactatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 752823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 376 - 525
Target Start/End: Original strand, 26601036 - 26601185
Alignment:
Q  376 taaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtga 475  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26601036 taaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaactcgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtga 26601135  T
Q  476 ctttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttat 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26601136 ctttactatattaaccctagatttaatttatgtaaaatgtcatctcttat 26601185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 43136872 - 43137028
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  43136872 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 43136970  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  43136971 ggtgactttactatattaattctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 43137028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 3086899 - 3087072
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcat-------ctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaat 463  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||    
T  3086899 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccttagatttaacttaat 3086998  T
Q  464 tttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3086999 tttttcatgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 3087072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 371 - 522
Target Start/End: Original strand, 3087017 - 3087167
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  3087017 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacctgtgatgcaatattaatcctagatttaacct-attttttcg 3087115  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctct 522  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3087116 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctct 3087167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 25696022 - 25696178
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  25696022 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatccttgatgcaatattaaccctggatttaacat-attttttcg 25696120  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25696121 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 25696178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 36885380 - 36885536
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  36885380 tatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtgatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 36885478  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  36885479 cgtgactttactatattaaccctagatttaatatatgcaaaatgtcatctctaatttt 36885536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 30180238 - 30180095
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  30180238 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacgt-attttttcg 30180140  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30180139 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 30180095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 374 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 34717736 - 34717583
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgt 473  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||    
T  34717736 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacgt-attttttcgcgt 34717638  T
Q  474 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  34717637 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 34717583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 30180871 - 30180715
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  30180871 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttctaaatgttaatccttgatgcaatattaaccctagatttaacat-attttttcg 30180773  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30180772 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 30180715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 33705239 - 33705395
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33705239 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatccttgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 33705337  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  33705338 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatatcatctctaatttt 33705395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 34726494 - 34726650
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  34726494 tatattaaccctagatttaatttatgcataatgtcatatcttatttctaaatgttaatccgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 34726592  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  34726593 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 34726650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 42975880 - 42976036
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  42975880 tatattaaccctagaattaatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaaaccgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 42975978  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  42975979 cgagactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtaatctctaatttt 42976036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 374 - 537
Target Start/End: Original strand, 752553 - 752722
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtc-------atctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttt 466  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  752553 attaaccctagatttaatttctgcaaaatgtcgtctcttatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaatttt 752652  T
Q  467 ttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  752653 tt-gtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctagatgtta 752722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 371 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 19123865 - 19123714
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  19123865 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatcaattatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccca-gatttaacctaattttttag 19123767  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctctt 523  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19123766 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctt 19123714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 374 - 537
Target Start/End: Original strand, 43136758 - 43136927
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat-------ttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttt 466  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  43136758 attaaccctagatttaatttctgcaaaatgtcatctcttatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccgtagatttaacctaatttt 43136857  T
Q  467 ttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43136858 tt-gtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 43136927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 371 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 25481084 - 25480933
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25481084 tatattaatcctagatttaatttatgcaaaatatcatctcttatttctaaatgttaaccagtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 25480985  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctct 522  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25480984 cttgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatatcatctct 25480933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 374 - 528
Target Start/End: Original strand, 25696655 - 25696809
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgt-g 472  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |    
T  25696655 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacgt-attttttcgtcg 25696753  T
Q  473 tgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  25696754 tgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 25696809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 374 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 41691422 - 41691284
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgt 473  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||    
T  41691422 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacgt-attttttcgcgt 41691324  T
Q  474 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41691323 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 41691284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 753411 - 753566
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  753411 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataactgttaacccgtgatgcaatatgaaccctagatttaaccta--tttttcg 753508  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  753509 cgtgactttactttattaaccctagatttaatttatgcaaaaagtcatctctaatttt 753566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 18242279 - 18242114
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  | ||||    
T  18242279 tatattaaccctagatttaatatatccaaaatgtcatttcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaa-gtattcg 18242181  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18242180 cgtgactttactatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 18242114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 38937514 - 38937343
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcga 292  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  38937514 tcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccatagatttaacctaacttctttacttaattttactatattaaccctatttaatttaatcaa 38937415  T
Q  293 aatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    |||      ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38937414 aat------gttaattgttatggaaatcgaaataaacaaatcgcccctaatttttctccttaattttactaaacaaat 38937343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 6304404 - 6304560
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  6304404 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaactattaacccgtgatgcaatatgaaccctagatttaacct-attttttcg 6304502  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  6304503 cgtgactttattatattaaccctagatttaatttatgcaaaaagtcatctctaatttt 6304560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 33705870 - 33706026
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33705870 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacctgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 33705968  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  33705969 cgtgactttactatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 33706026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 42692519 - 42692363
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  42692519 tatattaaccatagacttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccatggtgcaatattaaccctagatttaacctaat-ttttcg 42692421  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  42692420 cgtggctttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 42692363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 378 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 34718365 - 34718216
Alignment:
Q  378 accctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgact 477  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  34718365 accctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatccttgatgcaatattaaccctagatttaacat-attttttcgcgtgact 34718267  T
Q  478 ttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34718266 ttactatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 34718216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 378 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 41692049 - 41691900
Alignment:
Q  378 accctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgact 477  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  41692049 accctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatccttgatgcaatattaaccctagatttaacat-attttttcgcgtgact 41691951  T
Q  478 ttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  41691950 ttactatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 41691900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 26601786 - 26601942
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  26601786 tatattaaccctagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 26601884  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  26601885 cgtgactttactatagtaactctaaatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 26601942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 35393330 - 35393173
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  35393330 tatattaaccctagatttaagttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaaatttaacccgtgacgcagtattaaccatagatttaacctaattttttcg 35393231  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  35393230 cgtgactttactatattaaccctatatttaatttacgcaaaatgtcatctctaatttt 35393173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 35393955 - 35393799
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35393955 tatattaaccctatatttaagttatgcaaaatgtcatctcttattctaaaa-gttaacccgtgacgcagtattaaccctagatttaacctaattttttcg 35393857  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||    
T  35393856 cgtgactttactatattaaccatagatttaattttcgcaaaatgtcatctctaatttt 35393799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 371 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 19123755 - 19123589
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctctt------atttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatt 464  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19123755 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttctatttatttctaaatgttaacccatga-gcaatattaaccctagatttaacctaatt 19123657  T
Q  465 ttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaa 532  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  19123656 ttttcgtgtgtctttactatattaaccctagatttaatttacgcaaaatgtcatatcttatttctaaa 19123589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 406 - 537
Target Start/End: Original strand, 36885304 - 36885435
Alignment:
Q  406 atctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaattta 505  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36885304 atctcttattttaaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctatatttcacctaattttttcgtgtgactttactatattaatcctagatttaattta 36885403  T
Q  506 tgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36885404 tgcaaaatgtgatctcttatttctaaatgtta 36885435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 369 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 18242396 - 18242224
Alignment:
Q  369 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatct-----cttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaat 463  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18242396 attatattaaccttagatttcatttatgcaaaatgtcatctattctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatctaacctaat 18242297  T
Q  464 tttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||||||    
T  18242296 tttt-cgcgtgactttactatattaaccctagatttaatatatccaaaatgtcatttcttatttctaaatgtta 18242224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 375 - 528
Target Start/End: Original strand, 34725858 - 34726010
Alignment:
Q  375 ttaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtg 474  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  34725858 ttaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgttaatccgtgaagtaatattaaccctagatttaacct-attttttcgcgtg 34725956  T
Q  475 actttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  34725957 actttactatattaactctagatttaatttatgcaaaatctcatctctaatttt 34726010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 43138137 - 43138293
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  43138137 tatactaaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 43138235  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  43138236 cgtgactttactatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 43138293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 754043 - 754199
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  754043 tatactaaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgtaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 754141  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  754142 cgtgactttactatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 754199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 6305037 - 6305193
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  6305037 tatactaaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccttagatttaacct-attttttcg 6305135  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  6305136 cgtgactttactatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 6305193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 12419676 - 12419832
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  12419676 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttaattctaaatattaacccgtgagacaatattaaccttagatttaacct-attttttcg 12419774  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  12419775 cttgactttactatattaaccttagatttaatttatgcaaaatctcatctctaatttt 12419832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 2182288 - 2182134
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||  |||||||    
T  2182288 tatattaaccttatatttaatttatacaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccatatatttaactta--tttttcg 2182191  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2182190 cgtgactttactatatt-accctaaatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 2182134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 26601142 - 26601305
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat-------ttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaat 463  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  26601142 tatattaaccctagatttaatttatgtaaaatgtcatctcttatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaatcctagatttaaccta-t 26601240  T
Q  464 tttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  26601241 tttttcgggtgactttactatattaatcctagatttaatttatgcaaaaagtcatctctaatttt 26601305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 407 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 39914721 - 39914600
Alignment:
Q  407 tctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttat 506  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39914721 tctcttatttttaaatgttaatccgtgacgcaatattatccctagatttaacctaattttttcgcatgactttactatattaaccctagatttaatttat 39914622  T
Q  507 gcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
T  39914621 gcaaaatgtcatctctaatttt 39914600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 227 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 39915505 - 39915362
Alignment:
Q  227 ttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaata 326  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||||||||     
T  39915505 ttgccctagatttaacataacttatttgcttaaatttactatattaaccctatttaatttaatcaaaatgctaatgttaattggtagggaaatcaaaatg 39915406  T
Q  327 aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  39915405 aacaaatcgctcctaattttttttcttaattttactaaccaaat 39915362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 188 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16679801 - 16679639
Alignment:
Q  188 taatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatc-tttgcttaattttactgtattaatcctatttaattt 286  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16679801 taatttcttattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttgccctagattttacctaa-atcgtttgcttaattttactatattaaccctatttaattt 16679703  T
Q  287 aatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaat 356  Q
    |||| ||||      |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16679702 aatcaaaat------gttaattgatgtggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaat 16679639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 43137505 - 43137660
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||   |||||||    
T  43137505 tatattaacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaattttaacctctgacgcaatattaaccctagatttaacct--gtttttcg 43137602  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||    
T  43137603 cgtgactttaccatattaaccctagatttaatttattcaaaaagtcatctctaatttt 43137660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 12419122 - 12418961
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||  |||||||    
T  12419122 tatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccttaaatttaaccta--tttttcg 12419025  T
Q  471 tgtgactttactata------ttaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||      |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12419024 cgtgactttactatattacatttaaccttagatttaatttaagcaaaatgttatctctaatttt 12418961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 188 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16679960 - 16679796
Alignment:
Q  188 taatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta 287  Q
    |||| |||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16679960 taatctcttattccttaaagttaatatgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaactcctttgcttaattttactatattaaccctatttaattta 16679861  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattt 358  Q
    ||  ||||      |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16679860 attaaaat------gttaattgatgtggaaatcaaaataaacaaattgctcctaatttttctccttaattt 16679796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 406 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 35394064 - 35393955
Alignment:
Q  406 atctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaattta 505  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35394064 atctcttatttctaaaagttaacccgtgacgcagtattaacccttgatttaaactaattttttcgtgtgattttactatattaaccctagatttaattta 35393965  T
Q  506 tgcaaaatgt 515  Q
    ||||||||||    
T  35393964 tgcaaaatgt 35393955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 396 - 528
Target Start/End: Original strand, 3890454 - 3890586
Alignment:
Q  396 gcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctag 495  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||      
T  3890454 gcaaaatgccatctcttatttctaaatgttaacccgtgaagcaacattaaccctgaatttaacctaattttttcgcgtgactttagtatattaaccctgt 3890553  T
Q  496 atttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  3890554 atttaatttatgcgaaatgtcatctctaatttt 3890586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 25481202 - 25481029
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctctt-------atttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaat 463  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||   | ||||||| |||||    
T  25481202 tatattaacactagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttttctcttatttctaaatgttaacccatgacgcaatattaattttagatttaatctaat 25481103  T
Q  464 tttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  25481102 tttttagcgtgactttgctatattaatcctagatttaatttatgcaaaatatcatctcttatttctaaatgtta 25481029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 385 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 25481297 - 25481161
Alignment:
Q  385 atttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactat 484  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  25481297 atttaatttatgcaaaatgt-atcttttatttctcaatgctaacccgtgacgcaacattaaccctagatttaacctaattttt-cgcgtgattttactat 25481200  T
Q  485 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctctt 523  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25481199 attaacactagatttaatttatgcaaaatgtcatctctt 25481161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 409 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 35393436 - 35393330
Alignment:
Q  409 tcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgc 508  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35393436 tcttatttctaaaagttaacccgtgacgcagtattaacccttgatttaacctaattttttcatgtgattttactatattaaccctagatttaatttatgc 35393337  T
Q  509 aaaatgt 515  Q
    |||||||    
T  35393336 aaaatgt 35393330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 405 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 18242471 - 18242356
Alignment:
Q  405 catctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaattt 504  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  18242471 catctcttatttctaaatgttaacacgtgacgcaatattaatcctagatttaacctaattttttcgcgtgactttattatattaaccttagatttcattt 18242372  T
Q  505 atgcaaaatgttatct 520  Q
    ||||||||||| ||||    
T  18242371 atgcaaaatgtcatct 18242356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 371 - 461
Target Start/End: Original strand, 3087653 - 3087743
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3087653 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaaccggtgatgcaatattaaccctagatttaaccta 3087743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 268 - 370
Target Start/End: Original strand, 27440850 - 27440952
Alignment:
Q  268 tattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaaca 367  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27440850 tattaaccctatttaatttaatcaaaatattaatgttaattgttagggaaatcaaaatgaacaaatcgctcttaatttttctccttaattttactaaaca 27440949  T
Q  368 aat 370  Q
    |||    
T  27440950 aat 27440952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 371 - 461
Target Start/End: Original strand, 36886149 - 36886239
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  36886149 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaaccagtgatgcaatattagccctagatttaaccta 36886239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 188 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16683527 - 16683415
Alignment:
Q  188 taatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta 287  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  16683527 taatctcttattccttaaagttaacccgaacgcataattttgccctagatttaacctaactcctttgcttaattttactatattaaccctatttaagtta 16683428  T
Q  288 atcgaaatgttaa 300  Q
    ||| |||||||||    
T  16683427 atcaaaatgttaa 16683415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 411 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 19123936 - 19123810
Alignment:
Q  411 ttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaa 510  Q
    |||||| |||||||||| |||| |   ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19123936 ttatttctaaatgttaatccgtaacaaaatattaactctggatttaatctaattttttcgcgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaa 19123837  T
Q  511 aatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||| |||  |||||| |||||||||    
T  19123836 aatgtcatcaattatttctaaatgtta 19123810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 371 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 30755298 - 30755208
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30755298 tatattaactctaaatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaaccggtgatgcaatattaaccctagatttaaccta 30755208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 437 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 42692673 - 42692574
Alignment:
Q  437 caatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtt 536  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||    
T  42692673 caatattaaccctagatttaacctaattttt-cgcgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgccatctcttgtttctaaatgtt 42692575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 445 - 528
Target Start/End: Original strand, 41290217 - 41290300
Alignment:
Q  445 accctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41290217 accctagatttaacctatttttttcgcgtgcctttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 41290300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 470 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 12419245 - 12419178
Alignment:
Q  470 gtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12419245 gtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 12419178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 406 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 39914822 - 39914723
Alignment:
Q  406 atctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaattta 505  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39914822 atctcttatttctaaaagttaacctgtgacgcaatattaaccca--atttaacctaaatttttcgcgtgactttactatattaaccgtagatttaattta 39914725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 193 - 285
Target Start/End: Original strand, 41289948 - 41290040
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  41289948 tcttattctttaaagttaacccgaatgcaaatttttgccctatatttaacctaatttctttgcttaattttactattttaaccctatttaatt 41290040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 451 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 42692828 - 42692753
Alignment:
Q  451 gatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatt 526  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  42692828 gatttaaccaaattttttcgcgtgactttactatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcatcttttatt 42692753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 285
Target Start/End: Original strand, 3890201 - 3890293
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt 285  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||  |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  3890201 tcttattccttaatgttaacccgaacgcaaaattttgctctagatttaacccaaattctttgcttaattttactattttaaccctatttaatt 3890293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 440 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 42692756 - 42692692
Alignment:
Q  440 tattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaattt 504  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42692756 tattaaccttagatttaacctaattttttcgcgtgactttactatattaaccctagatttaattt 42692692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 16679642 - 16679546
Alignment:
Q  188 taatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaa-cataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt 285  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16679642 taatctcttattccttaaagttaacccaaacgcaaaattttgccctagatttaaacttatcat--ttgcttaattttactatattaaccctatttaatt 16679546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 34719126 - 34719071
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34719126 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatattatctcttatttttaaatgtta 34719071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 285
Target Start/End: Original strand, 3890316 - 3890408
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt 285  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| | | |||| | |||||||||    
T  3890316 tcttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgtcatagatttaacctaacttctttgcttaattttattattttaaccttatttaatt 3890408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 12419565 - 12419620
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12419565 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatggtatctcttatttctaaatgtta 12419620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 41692810 - 41692755
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41692810 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatattatctcttattattaaatgtta 41692755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 42977029 - 42977084
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42977029 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 42977084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 437 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 25481355 - 25481278
Alignment:
Q  437 caatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  25481355 caatattaaccctagatttaacctaattttttc-cgtgactttattatattaattccagatttaatttatgcaaaatgt 25481278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 109
Target Start/End: Original strand, 12588336 - 12588405
Alignment:
Q  40 ttttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtg 109  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12588336 tttttttaaaatttagttttgaaggaaattttttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtg 12588405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 17637058 - 17637113
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  17637058 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataaacgtta 17637113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 36885902 - 36885957
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  36885902 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgtta 36885957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Original strand, 41290254 - 41290300
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41290254 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 41290300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 266
Target Start/End: Original strand, 41289838 - 41289910
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttact 266  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  41289838 tcttatttcttaaagttaacc-gaacgtaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttact 41289910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 369 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 18241949 - 18241901
Alignment:
Q  369 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18241949 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 18241901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 489 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 34718365 - 34718317
Alignment:
Q  489 accctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34718365 accctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 34718317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 489 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 41692049 - 41692001
Alignment:
Q  489 accctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41692049 accctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 41692001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 753189 - 753244
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||    
T  753189 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgacatatcttatttctaaatgtta 753244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 6304182 - 6304237
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||    
T  6304182 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgacatatcttatttctaaatgtta 6304237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 17637813 - 17637868
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  17637813 tatattaaccctagatttaatttgtgcaaaatgacatctcttatttctaaatgtta 17637868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 36885153 - 36885208
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  36885153 tatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataaacgtta 36885208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 43137394 - 43137449
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||    
T  43137394 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatggcatatcttatttctaaatgtta 43137449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16685515 - 16685461
Alignment:
Q  212 cccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttact 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  16685515 cccgaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaactcctttgcttaattttact 16685461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 487 - 537
Target Start/End: Original strand, 26601036 - 26601086
Alignment:
Q  487 taaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26601036 taaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 26601086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 482 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 35393330 - 35393280
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaa 532  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  35393330 tatattaaccctagatttaagttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaa 35393280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 39914646 - 39914600
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39914646 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 39914600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Original strand, 42976614 - 42976660
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42976614 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 42976660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 417
Target Start/End: Original strand, 6304512 - 6304560
Alignment:
Q  369 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6304512 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaaagtcatctctaatttt 6304560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Original strand, 3890540 - 3890586
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  3890540 tatattaaccctgtatttaatttatgcgaaatgtcatctctaatttt 3890586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Original strand, 25696763 - 25696809
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  25696763 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 25696809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 34717629 - 34717583
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  34717629 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 34717583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 34718262 - 34718216
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34718262 tatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 34718216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 41691946 - 41691900
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41691946 tatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 41691900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 87
Target Start/End: Original strand, 5620689 - 5620738
Alignment:
Q  38 tattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaa 87  Q
    ||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5620689 tattttttttaaatttagctccgaaggagaaatcttataaattacggaaa 5620738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 10039325 - 10039361
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10039325 ccttgcttgctttagtttttgatttatatatttgtgt 10039361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 12652174 - 12652210
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12652174 ccttgcttgctttgctttttgatttatatatttgtgt 12652210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16683565 - 16683529
Alignment:
Q  314 ggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctc 350  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16683565 ggaaatcaaaataaaaaaatcgctcctaatttttctc 16683529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 23180959 - 23180995
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23180959 ccttgcttgctttgctttttgatttatatatttgtgt 23180995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 23185226 - 23185262
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23185226 ccttgcttgctttgctttttgatttatatatttgtgt 23185262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 30180128 - 30180088
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctct 411  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30180128 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctct 30180088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 34758220 - 34758256
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34758220 ccttgcttgctttgctttttgatttatatatttgtgt 34758256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 39875054 - 39875090
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39875054 ccttgcttgctttgctttttgatttatatatttgtgt 39875090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 42692797 - 42692753
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 415  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42692797 tatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcatcttttatt 42692753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 2181769 - 2181714
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2181769 tatattagtcctggatttaatttatacaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 2181714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 14387914 - 14387978
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaa---aaatttagtttcgaaggagaaatcttataaa 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  14387914 cttcgcacgggttgaataacgtatttttttttttaaatttagctccgaaggagaaattttataaa 14387978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 552 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 20108185 - 20108147
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgtct 590  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  20108185 ccttgcttgctttgcttttttatttatatatttgtgtct 20108147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Original strand, 34725964 - 34726010
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  34725964 tatattaactctagatttaatttatgcaaaatctcatctctaatttt 34726010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 38939221 - 38939151
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtatta 272  Q
    ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||    
T  38939221 ttaaagttaacccgaacggtaattgttgccctagatttaacctaaccctaatgcttaattttactgtatta 38939151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 41691315 - 41691269
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  41691315 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatatcaactctaatttt 41691269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 13596942 - 13596909
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaa 50  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13596942 cttcgcacgggttgaattacgtattttttaaaaa 13596909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 35393363 - 35393330
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgt 404  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35393363 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 35393330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 35393988 - 35393955
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgt 404  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35393988 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 35393955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 3610847 - 3610811
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3610847 ccttgcttgctttgcttttttatttatatatttgtgt 3610811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 30093427 - 30093391
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30093427 ccttgcttgctttgcttttttatttatatatttgtgt 30093391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Original strand, 8194 - 8714
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8194 cttcgcacgggttgaataacatatttttttaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 8293  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||| || || ||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8294 aagctgcgtaaaccaaaattttgcaacacatagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactgttataatatcttatttcttaaagttaacccga 8393  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    | |||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  8394 aggcaaaattttgcccaaaatttaacctaacttctttgcttaattttattgtattaaccctattaaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 8493  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 416  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8494 aatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 8593  T
Q  417 ttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtt 516  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  8594 ataaacgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgcc 8693  T
Q  517 atctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  8694 atctcttatttctaaatgtta 8714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 202 - 482
Target Start/End: Original strand, 8993 - 9286
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta-------------- 287  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |                  
T  8993 ttaaagttaacccggacgcaaaattttgccttagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattaattaaccatgtttaa 9092  T
Q  288 ----atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaacccta 383  Q
        ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9093 tttgatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatatctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacccta 9192  T
Q  384 tatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttact 482  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||     |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9193 gatttaatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacc-----tgcaatattatccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttact 9286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 371 - 529
Target Start/End: Original strand, 8659 - 8816
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8659 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgccatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 8757  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttattttt 529  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  8758 tgtgactttattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatttctaattttt 8816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 9180 - 9235
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  9180 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgtta 9235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 418
Target Start/End: Original strand, 8767 - 8816
Alignment:
Q  369 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattttt 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8767 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatttctaattttt 8816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 126)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 52843208 - 52842689
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  52843208 cttcgcacgagttgaataatgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacgaaaaattgtcgtcctttataaatatgaaaatca 52843109  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||  ||| ||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52843108 aagctgcgtaaaccaaaatttggcaacacagtgactaaaacactacataaaaa-taatataacaactattgtaatatcttattccttaaagttaacccga 52843010  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  52843009 acgcaaaattttgccctagatttaacttaacttctttgcttaattttactgtattaatcttatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 52842910  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52842909 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccatagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 52842810  T
Q  417 ttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtt 516  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  52842809 ttaaatgttaacctgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtc 52842710  T
Q  517 atctcttatttttaaatgtta 537  Q
    || |||||||| |||||||||    
T  52842709 atatcttatttctaaatgtta 52842689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 537
Target Start/End: Original strand, 29528774 - 29529289
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  29528774 gcacgagttgaattacgtatttttttaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaaatatggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaagc 29528873  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29528874 tgcgtaaatcaaaattttgcaacacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgc 29528973  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatc 320  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29528974 aaaattttgcccaaaatttaacctaacttcttttcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatc 29529073  T
Q  321 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaa 420  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  29529074 aaaataaacaaatcgcttctaaattttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg-catctcttatttataa 29529172  T
Q  421 atgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29529173 acgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatct 29529272  T
Q  521 cttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||    
T  29529273 cttatttttaaatgtta 29529289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 537
Target Start/End: Original strand, 48519678 - 48520192
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48519678 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagctccgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaagt 48519777  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||      
T  48519778 tgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacat 48519877  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatc 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  48519878 aaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaagtc 48519977  T
Q  321 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaa 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  48519978 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacctta-atttaa-ttatgcaaaatggcatctcttatttctaa 48520075  T
Q  421 atgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48520076 atgttaacccgtgacgcaatattaaccttatatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaacctagatttaatttatgcaaaatgtcatct 48520175  T
Q  521 cttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  48520176 cttatttctaattgtta 48520192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 39094570 - 39094054
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  39094570 gcacggattgaataacgtatttttttaaaatttaattttgaaagagaaatcttataaattacggaaaattattgtcctttataaatgtaaaaatcaaagt 39094471  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| |||||||||||||| |||| |||||  |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39094470 tgcgtaaaccaaaattttacaacacagagcttaaaacattgcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattccttaaagttaacccgaacgc 39094371  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatc 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39094370 aaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatc 39094271  T
Q  321 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaa 420  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39094270 aaaataaacaaatcgctcataatttttctccttaattgtactaaacaaattatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataa 39094171  T
Q  421 atgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  39094170 acgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaatttttttgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatgt 39094071  T
Q  521 cttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||    
T  39094070 cttatttttaaatgtta 39094054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Original strand, 55290415 - 55290933
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55290415 cttcgtacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagctccgaaggggaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaataa 55290514  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  55290515 aatctgcgtaaaccaaaattttgcaacacaaagcctaaaacactacataaaaaataacataacagctattgtaatctcttattccttaaagttaacccga 55290614  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  55290615 acgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttact--attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaaggttaattgttaggga 55290712  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 416  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55290713 aattaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatactaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 55290812  T
Q  417 ttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtt 516  Q
     |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  55290813 ataaacgttaacccgtgacgcaatatttaccctggatttaaccttattttttcgtgtaactttactatattaaccctaggtttaatttatgcaaaatgtc 55290912  T
Q  517 atctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  55290913 atctcttatttttaaatgtta 55290933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Original strand, 19360753 - 19361273
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  19360753 cttcgcatgagttgaataacgtatttttttaaaatttagtttcgaagaagaaatcttataaattacaaaaaattgttgtcatttataaatgtggaaatca 19360852  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  19360853 aagctgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactcttataatatcttattccttaaagttaacctga 19360952  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19360953 acgcaaaattttgccaaagatttaacctaacttctttgcttaattttattgtattaatcttatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 19361052  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 416  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19361053 aatcaaaataaacaaatcacttctaatttttctccttagttttattaaagaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 19361152  T
Q  417 ttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtt 516  Q
     |||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19361153 ataaacgttaacctgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtc 19361252  T
Q  517 atctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  19361253 atctcttatttctaaatgtta 19361273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 522
Target Start/End: Original strand, 19893204 - 19893697
Alignment:
Q  23 acgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattg 122  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  19893204 acgggttgaataat-tattttttaaaaatttagctccgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcatagttg 19893302  T
Q  123 cataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaa 222  Q
      ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19893303 tgtaaaccaaaattttggaacacagagtttaaagcactacataaaaaataacataacaattattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaatgcaa 19893402  T
Q  223 aattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaa 322  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19893403 aattttgacctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaa 19893502  T
Q  323 aataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaat 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19893503 aataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaatttatattaaccctaaatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaat 19893602  T
Q  423 gttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctct 522  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19893603 gtaaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacctaattt-----tgtgactttattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctct 19893697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 535
Target Start/End: Original strand, 26776452 - 26776971
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtatttttt---aaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26776452 cttcgcacgggttgaataacatatttttttaaaaaaatttaactccgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaa 26776551  T
Q  114 tcaaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacc 213  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  26776552 tcaaagctgcataa-ccaaaattttgcaacacagagcctaaaacactgcataaaaaataacataacaactattgtaatatcatattccttaaagttaatc 26776650  T
Q  214 cgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttg 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  26776651 cgaacgcaaaatttttccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttag 26776750  T
Q  314 ggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctctta 413  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26776751 gaaaatcaaaataaacaaatcgcacataatttttctccttaattttactaaacaaattatatcaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatatctta 26776850  T
Q  414 tttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 513  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26776851 tttataaacgttaacccgtgacgcaata-taaccatagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 26776949  T
Q  514 gttatctcttatttttaaatgt 535  Q
     | |||||||||||||||||||    
T  26776950 atcatctcttatttttaaatgt 26776971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Original strand, 26100796 - 26101318
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaa-atttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatc 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26100796 cttcgcacgggttgaataatgtattttttaaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatc 26100895  T
Q  116 aaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccg 215  Q
    ||| |||| |||| |||||||||||||| |||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26100896 aaagttgcgtaaatcaaaattttgcaacacagagcttaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccg 26100995  T
Q  216 aacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggg 315  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  26100996 aacgtaaaattttgcccaagatttaacttaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttaggg 26101095  T
Q  316 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 415  Q
    |||||||||||||||| | | | | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26101096 aaatcaaaataaacaactggtttc-atattttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatcttttatt 26101194  T
Q  416 tttaa--atgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 513  Q
    | |||  | ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26101195 tataaacacgttaacccgtgacacaatattaaccctagatttaaactaattttttcgtgtgactttattatattaaccctatatttaatttatgcaaaat 26101294  T
Q  514 gttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    || ||||||||||| |||||||||    
T  26101295 gtcatctcttatttctaaatgtta 26101318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Original strand, 4137418 - 4137939
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaa---aaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4137418 cttcgcacgggttgaataacgtatttttttttttaaatttagcttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaa 4137517  T
Q  114 tcaaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacc 213  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  4137518 tcaaatctgcgtaaaccaaaattttgcaacacagtgcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcatattccttaaagttaatc 4137617  T
Q  214 cgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttg 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  4137618 cgaacgcaaaattttgcccttgatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccatatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaa 4137717  T
Q  314 ggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctctta 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4137718 ggaaatcaaaataaacaaatcgcacataatttttctccttaattttactaaaaaaattatattaactctaaatttaatttatgcaaaatgtcatatctta 4137817  T
Q  414 tttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 513  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4137818 tttataaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaactttttc--gtgactttactatattaaccgtagatttaatttatgcaaaat 4137915  T
Q  514 gttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     | || |||||||| |||||||||    
T  4137916 atcatatcttatttctaaatgtta 4137939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 8396789 - 8396259
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaa-tttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| ||||||||     
T  8396789 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaaatttagttctgaaggagaaatcttataaattatgaaaaattggtgttctttataaacgtgaaaatt 8396690  T
Q  116 aaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccg 215  Q
    |||  ||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||       
T  8396689 aaagctgcgtaaaccaaaattttgtaacacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaactta 8396590  T
Q  216 aacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggg 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8396589 aacgcaaaattttgctctagatttaacctaacttctttacttaattttactgtattaacccaatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggg 8396490  T
Q  316 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctct---- 411  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||        
T  8396489 aaatcaaaataaacaaattgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatttcatctcttatc 8396390  T
Q  412 -----tatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttat 506  Q
         ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8396389 tcttatatttataaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttat 8396290  T
Q  507 gcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8396289 gcaaaatgtcatctcttatttttaaatgtta 8396259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 53802381 - 53801870
Alignment:
Q  24 cgggttgaataacgtatttttt---aaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | ||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53802381 cgggttgaataacgtatttttttaaaaaaatttagttccaaaaaagaaatattataaat-acggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaagt 53802283  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  53802282 tgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaagcactgcataaaaaataacataacaactattttaatatcttattccttaaagttaattcgaacgc 53802183  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatc 320  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  53802182 aaaattttgtcatagatttaacataacttctctgcttaatattactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattggtagggaaatc 53802083  T
Q  321 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaa 420  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  53802082 aaaataaacaaatcgcacataatttttcttcttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttataa 53801983  T
Q  421 atgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
    | |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53801982 acgttaactcgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaat-ttttcgtgtgactttactatattaacactagatttaatttatgcaaaatgtcatct 53801884  T
Q  521 cttatttttaaatg 534  Q
    ||||||||||||||    
T  53801883 cttatttttaaatg 53801870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 31 - 362
Target Start/End: Original strand, 28979640 - 28979970
Alignment:
Q  31 aataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcataaacc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||    
T  28979640 aataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattaaggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaagctag-taaacc 28979738  T
Q  131 aaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgc 230  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28979739 aaaattttgcaacacagagcttaaagcattacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgc 28979838  T
Q  231 cctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaaca 330  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28979839 cctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaaca 28979938  T
Q  331 aatcgctcctaatttttctccttaattttact 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28979939 aatcgctcctaatttttctccttaatcttact 28979970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 19361563 - 19361898
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaac 301  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  ||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19361563 ttaaagttaacccggacgcaaaattttgccatagaattaaccaaacttctttgcttaattttaccatattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaac 19361662  T
Q  302 gttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaa 401  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19361663 attaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccatagatttaatttatgcaaaa 19361762  T
Q  402 tgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaa 501  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  19361763 tgtcatctcttatttataaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttattatattaaccctagatctaa 19361862  T
Q  502 tttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  19361863 tttatgcaaaatgtcttctcttatttctaaatgtta 19361898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 35861025 - 35860688
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35861025 cttcgcacgggttgaataacgtatttttttaaaatttagttatgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaa-tca 35860927  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||  ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||    
T  35860926 aagctgcgtaaaccaaaaatttgcaacacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgcaatctcttattccttcaagttaacccga 35860827  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  35860826 acgcaaaattttgccatagatttaacttaacttttttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaaagttaattgttaggga 35860727  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaat 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35860726 aatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaat 35860688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 195 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 35856009 - 35855653
Alignment:
Q  195 ttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------- 285  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||             
T  35856009 ttatttttgaaagttaacccgaacgcaaaattttgcactagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 35855910  T
Q  286 -----taatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaacc 380  Q
         ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35855909 taatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacc 35855810  T
Q  381 ctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgacttta 480  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35855809 ctagatttaatttatgcaaaatggcatctcttatttctaaatgttaacttgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgacttta 35855710  T
Q  481 ctatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  35855709 ctatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 35855653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 26101607 - 26101938
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaac 301  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26101607 ttaaagttaacccggacgcaaaattttgctctaaaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaac 26101706  T
Q  302 gttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaa 401  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  26101707 gttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttttaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaa 26101806  T
Q  402 tgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaa 501  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26101807 tgtcatctcttatttataaacgttaacccgtgacgcaatattaactctagatt----ctaattttttcatgtgactttactatattaaacctagatttaa 26101902  T
Q  502 tttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  26101903 tttatgcaaaatctcatctcttatttctaaatgtta 26101938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 8527003 - 8527352
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta-------------- 287  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |                  
T  8527003 ttaaagttaacgcggacgcaaaattttgccctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattaaccctgtttaatttg 8527102  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8527103 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatagctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 8527202  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8527203 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaccccgtgacgcaatattagccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 8527302  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  8527303 aacgctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatatctaaatgtta 8527352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 22522294 - 22521879
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtat---tttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||   |||||   |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22522294 cttcgcacgggttgaataacatatatattttttttaatttaattccgaaggagaaatcttataaattacagaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaa 22522195  T
Q  114 tcaaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaa----tatcttattctt---taaa 206  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||| ||   ||||    
T  22522194 tcaatgttgcttaaaccaaaattttgcaacacagagtctaaaatactacataaaaaataacataacaactattatatatcttatcttattattccttaaa 22522095  T
Q  207 gttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatt--------------taatttaatcga 292  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||      || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||              |||||||||| |    
T  22522094 gataacccgaacgcaaaattttgtccta------acctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctattaaatcatccatatttaatttaatcaa 22522001  T
Q  293 aatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatt 392  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22522000 aatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccataattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatt 22521901  T
Q  393 tatgcaaaatgtcatctcttat 414  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22521900 tatgcaaaatgtcatctcttat 22521879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 269 - 537
Target Start/End: Original strand, 4138636 - 4138901
Alignment:
Q  269 attaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaa 368  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  4138636 attaatcctgtttaatttaatcaaaatgttaatgttaatcgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaa-aa 4138734  T
Q  369 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttttt 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4138735 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatggcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaatttttt 4138834  T
Q  469 cgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  4138835 c--gtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgtta 4138901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 19368269 - 19368617
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta-------------- 287  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |                  
T  19368269 ttaaagttaacccagacgcaaaattttaccctagaattaacctaacttctttacttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatatttaatttt 19368368  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  19368369 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaataaattatattaaccctagatt 19368468  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19368469 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacccatgacgaaatattagccatagatttaacctaa-tttttcgcgtgactttactatatt 19368567  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19368568 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 19368617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 55293598 - 55293933
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  55293598 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctatatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaagcctatttaattaaccctgtttaattta 55293697  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||              ||||||||| || |||    
T  55293698 atcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaatt--------------atattaaccttagatt 55293783  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55293784 taatttatgcaaaatggcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 55293883  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  55293884 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 55293933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 269 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 39093696 - 39093428
Alignment:
Q  269 attaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaa 368  Q
    ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39093696 attaaccctgtttaatttaattaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaaaaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaa 39093597  T
Q  369 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttttt 468  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39093596 attatattaaccctagatttaatttatggagaatgacatctcttatttctaaatgttaatccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaatttttt 39093497  T
Q  469 cgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39093496 tgtgtgactttaatatattatccctatattttatttatgcaaaatgttatctcttatttctaaatgtta 39093428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 303 - 537
Target Start/End: Original strand, 19367744 - 19367978
Alignment:
Q  303 ttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaat 402  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19367744 ttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccatagatttaatttatgcaaaat 19367843  T
Q  403 gtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaat 502  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19367844 gtcatctcttatttataaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttattatattaaccctagatctaat 19367943  T
Q  503 ttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  19367944 ttatgcaaaatgtcttctcttatttctaaatgtta 19367978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 195 - 461
Target Start/End: Original strand, 29529681 - 29529961
Alignment:
Q  195 ttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta------- 287  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |           
T  29529681 ttattttttaaagttaacccggacgcaaaattttgccctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 29529780  T
Q  288 -------atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaacc 380  Q
           ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29529781 taatttgatcaaaatgttaacattaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaacc 29529880  T
Q  381 ctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  29529881 ctaaatttaatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttagctcgtgacgcaatattagccctagatttaaccta 29529961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 8396314 - 8396148
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  8396314 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctaaatttaacctaatttttttg 8396215  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8396214 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttctaaatgtta 8396148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 26776918 - 26777084
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26776918 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatatcatctcttatttttaaatgtcaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 26777017  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26777018 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttttaaatgtta 26777084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 55290878 - 55291044
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  55290878 tatattaaccctaggtttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgacacaatattaaccctaaatttaacctaattttttcg 55290977  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55290978 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttctaaatgtta 55291044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 196 - 410
Target Start/End: Original strand, 40821913 - 40822141
Alignment:
Q  196 tattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatccta--------------ttt 281  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||              |||    
T  40821913 tattccttaaagctaacccgaacgcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattaaccctattt 40822012  T
Q  282 aatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccc 381  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40822013 aatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttcaccttaattttactaaacaaattatattaaccc 40822112  T
Q  382 tatatttaatttatgcaaaatgtcatctc 410  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  40822113 tagatttaatttatgcaaaatgtcatctc 40822141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 371 - 533
Target Start/End: Original strand, 29529234 - 29529396
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  29529234 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtaacgcaatattaaccttagatttaacctaattttttcg 29529333  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaat 533  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  29529334 tatgactttactatattaaccctagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaat 29529396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 53801922 - 53801756
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53801922 tatattaacactagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgctaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 53801823  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  53801822 tgtgactttactataacaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgtta 53801756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 232 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 53801664 - 53801456
Alignment:
Q  232 ctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------taatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaa 317  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  53801664 ctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccttgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaa 53801565  T
Q  318 atcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  53801564 atcaaaataaacaaatcgctcataatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgacatctcttatttc 53801465  T
Q  418 taaatgtta 426  Q
    |||||||||    
T  53801464 taaatgtta 53801456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 39094109 - 39093943
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  39094109 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatgtcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacataattttttcg 39094010  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  39094009 agtgattttactatattaaccatagatttaatttatgcaaaatgtcatcttttatttctaaatgtta 39093943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 369 - 528
Target Start/End: Original strand, 26101261 - 26101419
Alignment:
Q  369 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttttt 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  26101261 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccatagatttaacct-atttttt 26101359  T
Q  469 cgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  26101360 cgcgtgactttactatattaactttagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 26101419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 8526542 - 8526715
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatct-------cttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaat 463  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  8526542 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaaccaaat 8526641  T
Q  464 tttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  8526642 tttttcatgtgactttactatatttaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctgttatttctaaatgtta 8526715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 19361218 - 19361374
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  19361218 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaaccagtgatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttca 19361316  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19361317 cgtgactttactatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 19361374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 26777029 - 26777185
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  26777029 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttttaaatgttaatccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 26777127  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  26777128 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 26777185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 371 - 522
Target Start/End: Original strand, 8526660 - 8526810
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  8526660 tatatttaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctgttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaatcctagatttaacct-attttttcg 8526758  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctct 522  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8526759 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctct 8526810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 8396203 - 8396046
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8396203 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttctaaatgttaatccgtgacgtaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 8396105  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgc-aaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8396104 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaaatgttatctctaatttt 8396046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 46488785 - 46488620
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  46488785 tatattaaccgtagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctgaatattaacctgtgacgcaatattaactctagatttaacctaatttttt-g 46488687  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  46488686 tgtgactttactatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 46488620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 29529345 - 29529501
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  29529345 tatattaaccctagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaattttaacctgtgatgcaatattaaccctatatttaacct-attttttcg 29529443  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  29529444 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 29529501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 369 - 520
Target Start/End: Original strand, 19361841 - 19361990
Alignment:
Q  369 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttttt 468  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||    
T  19361841 attatattaaccctagatctaatttatgcaaaatgtcttctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctatatttaaccta--ttttt 19361938  T
Q  469 cgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19361939 cgcgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatct 19361990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 369 - 520
Target Start/End: Original strand, 19367921 - 19368070
Alignment:
Q  369 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttttt 468  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||    
T  19367921 attatattaaccctagatctaatttatgcaaaatgtcttctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctatatttaaccta--ttttt 19368018  T
Q  469 cgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19368019 cgcgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatct 19368070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 371 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 39093998 - 39093848
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  39093998 tatattaaccatagatttaatttatgcaaaatgtcatcttttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 39093900  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctct 522  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39093899 cgtgactttactattttaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctct 39093848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 46488137 - 46487972
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  46488137 tatattaaccgtagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctgaatattaacctgtgacgcaatattaactctagatttaacctaatttttt-g 46488039  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  46488038 cgtgactttactatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 46487972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 370
Target Start/End: Original strand, 51656384 - 51656555
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcga 292  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  51656384 tcttattcgttaaagttaatccgaacacaaaattttgccctagatttaacctaaattctttgcttaattttactatattaaccctatttaatttaatcaa 51656483  T
Q  293 aatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    |||      ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51656484 aat------gttaattgttatggaaatcaaaataaacaaatcgctcttaatttttctccttaattttactaaacaaat 51656555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 55293878 - 55294034
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  55293878 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-atttttctg 55293976  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  55293977 catgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 55294034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18688697 - 18688526
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaa-tttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18688697 cttcgcacgggttgaataacgtattatttaaaaaatttaactccgaaggaaaaa-cttataaattacgaaaaattgttgttctttataaatgtgaaaatc 18688599  T
Q  116 aaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgt 188  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18688598 aaagctgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgt 18688526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 371 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 46488675 - 46488539
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  46488675 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatccgtgatgtaatattaactttagatttaacctaattttttcg 46488576  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatg 507  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46488575 cgtgactttactatattaaccttagatttaatttatg 46488539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 193 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9374123 - 9373953
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcga 292  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |    
T  9374123 tcttattccttaaagttaatc-gaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttattatattaaccctatttaatttaatcaa 9374025  T
Q  293 aatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    |||      ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9374024 aat------gttaattgttatggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 9373953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 55290989 - 55291144
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  55290989 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttctaaatgttaatccgtgacgcaatattaaccctagatataacct-attttttcg 55291087  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  55291088 cgtgactttactat-ttaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 55291144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Original strand, 40823768 - 40823911
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  40823768 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtgatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaacccttgatttaacct-attttttcg 40823866  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
     || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  40823867 cgtaactttactatattaattctagatttaatttatgcaaaatgt 40823911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 46488027 - 46487890
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatt-ttttc 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  46488027 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgtaatattaactttagatttaacctaatttttttc 46487928  T
Q  470 gtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatg 507  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46487927 gcgtgactttactatattaaccttagatttaatttatg 46487890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 48520137 - 48520293
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| || ||||||||     
T  48520137 tatattaaacctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaattgttaacccgtgacgcaatattaaccatagatttaaact-attttttca 48520235  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  48520236 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 48520293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 52842744 - 52842588
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  52842744 tatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgttaatccttgacgcaatattaaccatagatttaacct-attttttcg 52842646  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  52842645 tgtgactttagtatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 52842588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 377 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 53801805 - 53801670
Alignment:
Q  377 aaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgac 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  53801805 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgttaatccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcgcgtgac 53801707  T
Q  477 tttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 513  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53801706 tttactatattaactctagatttaatttatgcaaaat 53801670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 193 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9373620 - 9373449
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcga 292  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |    
T  9373620 tcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaaaatttcactagatttaacctaacttctttgcttaattttactatattaatccggtttaatttaatcaa 9373521  T
Q  293 aatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    |||      ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9373520 aat------gttaattgttatagaaatcaaaataaacaaatcactcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 9373449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 371 - 522
Target Start/End: Original strand, 26101883 - 26102034
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  26101883 tatattaaacctagatttaatttatgcaaaatctcatctcttatttctaaatgttaacccgttatgcaatattaaccctagatttaacct-atttttttg 26101981  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctaga-tttaatttatgcaaaatgttatctct 522  Q
     ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||    
T  26101982 cgtgactttactatattaaccctaaattttattttatgcaaaatgtcatctct 26102034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 35855708 - 35855565
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||  || |||||||||| |||||||||    
T  35855708 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatccgtgacgcaatattaaatctagatttaacct-attttttcg 35855610  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
     |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  35855609 cgtgactttactatagtagctctagatttaatttatgcaaaatgt 35855565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 385 - 528
Target Start/End: Original strand, 51656670 - 51656820
Alignment:
Q  385 atttaatttatgcaaaatgtcatct-------cttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgact 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||       ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||    
T  51656670 atttaatttatgcaaaatgtcatctcttatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatataacctaattttttcgcgtaact 51656769  T
Q  478 ttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  51656770 ttactatattaaccctagatttaatatatgcaaaatgttatctctaatttt 51656820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 198
Target Start/End: Original strand, 40817218 - 40817377
Alignment:
Q  39 attttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcataaaccaaaatttt 138  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| | ||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  40817218 attttttaaaaatttagctctgaaagggaaatcttacaaattacgaaaaattattgttctttataaatgtgaaaatcaaagctgcgtaaaccaaaatttt 40817317  T
Q  139 gcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttat 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  40817318 gcaacacagagcctaaagcactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttat 40817377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 371 - 513
Target Start/End: Original strand, 5557461 - 5557601
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  5557461 tatattaacattatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataaatgttaacccatgatgcaatattaaccctagatttaaccta--tttttcg 5557558  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaat 513  Q
     ||||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||    
T  5557559 cgtgacttgactatattaactgtagaattaatttacgcaaaat 5557601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 371 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 39093483 - 39093341
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||    
T  39093483 tatattatccctatattttatttatgcaaaatgttatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccttagatttaacct-ttttttccg 39093385  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 514  Q
      |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  39093384 catgactttactatatcaacgctagatttaatttatgcaaaatg 39093341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 4137884 - 4138040
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||   |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  4137884 tatattaaccgtagatttaatttatgcaaaatatcatatcttatttctaaatgttaatttgtgacgcaatattaaccctagatttaacat-attttttcg 4137982  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  4137983 cgggactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 4138040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 437 - 537
Target Start/End: Original strand, 40823723 - 40823823
Alignment:
Q  437 caatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtt 536  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  40823723 caatattaaccctagatttaacctaatttttttgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtgatctcttatttctaaatgtt 40823822  T
Q  537 a 537  Q
    |    
T  40823823 a 40823823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 193 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9373308 - 9373136
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcga 292  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |  | |    
T  9373308 tctttttccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctaaatttaacttaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattaacccta 9373209  T
Q  293 --------aatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaatt 357  Q
            |||   || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9373208 tttaatttaatcaaaatgttaattgtttaggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaatt 9373136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 193 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9373929 - 9373757
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaaccc-gaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcg 291  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||      
T  9373929 tcttattccttaaagttaaccccgaatgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattatactatattaatccgatttagtttaataa 9373830  T
Q  292 aaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    ||||      ||||| ||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9373829 aaat------gttaagtgttatgaaaatcaaaataaacaaatcactcctaatttttctccttaatttttgtaaacaaat 9373757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 439 - 525
Target Start/End: Original strand, 8526499 - 8526585
Alignment:
Q  439 atattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttat 525  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8526499 atattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat 8526585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 193 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 36006663 - 36006479
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta----a 288  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |    |    
T  36006663 tcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaaatttgtcatagatttaacctagcatctttgcttaattttactatattac-cctatttaattaacccta 36006565  T
Q  289 tcgaa----atgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    || ||    ||   || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36006564 tctaatttaatcaaaatgttaattgttatgaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 36006479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 22477929 - 22477836
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtatttttta-aaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22477929 cttcgcacgggttgaataacgtattttttttaaaatttagttctgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtg 22477836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 407 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 46487888 - 46487775
Alignment:
Q  407 tctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttat 506  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  46487888 tctcttatttctaaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagattgaacctaattttttcgcatgactttactatattaaccctaaatttaagttat 46487789  T
Q  507 gcaaaatgttatct 520  Q
    ||||||||| ||||    
T  46487788 gcaaaatgtcatct 46487775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 437 - 537
Target Start/End: Original strand, 5557416 - 5557516
Alignment:
Q  437 caatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtt 536  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5557416 caatattaaccctagatttaacctaattttttcgcgtgactttactatattaacattatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataaatgtt 5557515  T
Q  537 a 537  Q
    |    
T  5557516 a 5557516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Original strand, 11951009 - 11951101
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11951009 cttcgcacgggttgaataacgtatttttttaaaatttagttctgaaggagaaatcttataaattacagaaaattattgtcctttataaatgtg 11951101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 251 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 46489403 - 46489283
Alignment:
Q  251 tttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaac-aaatcgctcctaatttttct 349  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| || | |||||||||||||||    
T  46489403 tttgcttaaatttactatattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaattaaaatgaactaagtagctcctaatttttct 46489304  T
Q  350 ccttaattttactaaacaaat 370  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  46489303 ccttaattttactaaacaaat 46489283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 236 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 53521857 - 53521729
Alignment:
Q  236 atttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcg 335  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||      |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  53521857 atttaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaa------ttgttatggaaatcgaaataaacaaatcg 53521764  T
Q  336 ctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  53521763 ctcctaatttttttccttaattttactaaataaat 53521729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 458
Target Start/End: Original strand, 19368562 - 19368649
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaac 458  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  19368562 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaaccggtgatgcaatattaacactagatttaac 19368649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 371 - 461
Target Start/End: Original strand, 8527297 - 8527387
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8527297 tatattaacgctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatatctaaatgttaaccggtgatgcaatattaaccctagatttaaccta 8527387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 405 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 9393058 - 9392966
Alignment:
Q  405 catctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagat 497  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9393058 catctcttatttctgaaagttaacccgtgacgcagtattaatcctagatttaacctaattttttcgtgtgattttactatattaaccctagat 9392966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 451 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 18685019 - 18684942
Alignment:
Q  451 gatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgc-aaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18685019 gatttaaccta-ttttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaaatgttatctctaatttt 18684942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 462 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 46488157 - 46488092
Alignment:
Q  462 attttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttattt 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46488157 attttttcgtgtgactttactatattaaccgtagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 46488092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 407 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 46488537 - 46488424
Alignment:
Q  407 tctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttat 506  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || || ||| ||||    
T  46488537 tctcttatttctaaacattaacccgtgacgcgatattaaccctagattgaacctaattttttcgcctgactttactatattaatcataaatataagttat 46488438  T
Q  507 gcaaaatgttatct 520  Q
    ||||||||||||||    
T  46488437 gcaaaatgttatct 46488424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 462 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 46488805 - 46488740
Alignment:
Q  462 attttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttattt 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46488805 attttttcgtgtgactttactatattaaccgtagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 46488740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 371 - 467
Target Start/End: Original strand, 4138846 - 4138942
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttt 467  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  4138846 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgttaatttgtgacgcaatattaacactagatttaacatatttttt 4138942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 285
Target Start/End: Original strand, 14555615 - 14555698
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14555615 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttattctagatttaacctaacttttttgtttaattttactatattaaccctatttaatt 14555698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 482 - 535
Target Start/End: Original strand, 19893551 - 19893604
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgt 535  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19893551 tatattaaccctaaatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgt 19893604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 288
Target Start/End: Original strand, 16040631 - 16040715
Alignment:
Q  204 aaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaa 288  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||| |||  ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16040631 aaagttaacccgtaagcaaaattttgctctaaatttaacctaatttctctacttaattttactatattaatcctatttaatttaa 16040715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 139
Target Start/End: Original strand, 12001445 - 12001566
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |   ||||| |||| |   |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  12001445 cttcgcacgggttgaataacgtatttttctaaaattttgctctaaaggataaatgtgc-aaattacggaaaattgttgtccttcataagcgtgaaaatca 12001543  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttg 139  Q
    || | |||||||||  |||||||    
T  12001544 aagtcgcataaaccgcaattttg 12001566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 22521922 - 22521879
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttat 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22521922 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat 22521879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 29529871 - 29529926
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  29529871 tatattaaccctaaatttaatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgtta 29529926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 552 - 599
Target Start/End: Original strand, 31485107 - 31485154
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgtctctgctgctc 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  31485107 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgtttgtgctgctc 31485154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 53801511 - 53801456
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  53801511 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgtta 53801456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 11825450 - 11825486
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11825450 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 11825486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 33005023 - 33004987
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33005023 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 33004987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 35714623 - 35714659
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35714623 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 35714659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 49564595 - 49564559
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49564595 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 49564559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 482 - 521
Target Start/End: Original strand, 40822102 - 40822141
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctc 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40822102 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctc 40822141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 53802032 - 53801977
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  53802032 tatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttataaacgtta 53801977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 288
Target Start/End: Original strand, 16046985 - 16047070
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaa 288  Q
    |||||||||||| | | |||||||||| || || ||||||| |||  ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16046985 ttaaagttaacctgtaagcaaaatttttcc-tatatttaacttaatttctctgcttaattttactatattaaccctatttaatttaa 16047070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 553 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 38661473 - 38661427
Alignment:
Q  553 cttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgtctctgctgctc 599  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  38661473 cttgcttgctttagtttttgatttatatatttgtgtttgtgctgctc 38661427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 231 - 288
Target Start/End: Original strand, 16036429 - 16036486
Alignment:
Q  231 cctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaa 288  Q
    |||||||||||| |||  ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16036429 cctagatttaacttaatttctctgcttaattttactatattaaccctatttaatttaa 16036486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 87
Target Start/End: Original strand, 21165976 - 21166025
Alignment:
Q  38 tattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaa 87  Q
    ||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21165976 tattttttttaaatttagctccgaaggagaaatcttataaattacggaaa 21166025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 252 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 39093727 - 39093694
Alignment:
Q  252 ttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39093727 ttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt 39093694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 12258700 - 12258736
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12258700 ccttgcttgctttgctttttgatttatatatttgtgt 12258736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 26944818 - 26944854
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26944818 ccttgcttgctttgctttttgatttatatatttgtgt 26944854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 36089598 - 36089562
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36089598 ccttgcttactttggtttttgatttatatatttgtgt 36089562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 40793682 - 40793630
Alignment:
Q  195 ttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataac 247  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||    
T  40793682 ttattcattaaagttaacccgaacgctaattgttgccctagatttaacctaac 40793630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 466 - 525
Target Start/End: Original strand, 51656642 - 51656699
Alignment:
Q  466 tttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttat 525  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51656642 tttcgtgtgactttattata--aaatctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat 51656699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 599
Target Start/End: Original strand, 858268 - 858315
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgtctctgctgctc 599  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  858268 ccttacttgctttgatttttgatttatatatttgtgtttgtgctgctc 858315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 26776808 - 26776863
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  26776808 tatatcaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttataaacgtta 26776863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 279
Target Start/End: Original strand, 38362057 - 38362143
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctat 279  Q
    |||||||  |||||||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||| | |||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  38362057 tcttattacttaaagttaatccgtaagcaatattttgccctatatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 38362143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 279
Target Start/End: Original strand, 38362157 - 38362243
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctat 279  Q
    |||||||  ||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||| | |||||| |||||    
T  38362157 tcttattacttaaagttaacacgtaagcaatattttgccctagatttaccctaatttctctgcttaattttattatattaaccctat 38362243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 46487813 - 46487775
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatct 409  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  46487813 tatattaaccctaaatttaagttatgcaaaatgtcatct 46487775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 49453874 - 49453788
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctat 279  Q
    |||||||  |||||||||||||| | |||| |||||  |||||||||| | |||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  49453874 tcttattacttaaagttaacccgtaagcaatattttttcctagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 49453788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Original strand, 51656774 - 51656820
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  51656774 tatattaaccctagatttaatatatgcaaaatgttatctctaatttt 51656820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 53522394 - 53522324
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtatta 272  Q
    ||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||    
T  53522394 ttaaagttaacccgaacgctaattgttaccctagatttaacctaaccctaatgcttaattttactgtatta 53522324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Original strand, 16062531 - 16062580
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 242  Q
    |||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  16062531 tcttattacttaaagttaacccgtaagcaaaattttgccctaaatttaac 16062580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 266
Target Start/End: Original strand, 38362457 - 38362530
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttact 266  Q
    |||||||  |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||| ||||    
T  38362457 tcttattacttaaagttaacccgtaagcaatattttgccctagatttaccctaatttctctgcttaattctact 38362530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 111
Target Start/End: Original strand, 42614373 - 42614457
Alignment:
Q  26 ggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaa 111  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| | |  |||| |||||| ||  ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  42614373 ggttgaataatgtatttttcaaaaatttggctgtgaagcagaaatgttc-aaattacagtaaattgttgtccttcataaatgtgaa 42614457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 4586304 - 4586340
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4586304 ccttgcttgctttactttttgatttatatatttgtgt 4586340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 473 - 501
Target Start/End: Original strand, 8526489 - 8526517
Alignment:
Q  473 tgactttactatattaaccctagatttaa 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8526489 tgactttactatattaaccctagatttaa 8526517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 198 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9374257 - 9374197
Alignment:
Q  198 ttctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgctta 258  Q
    ||||| |||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  9374257 ttcttaaaagttaaccggaatttaaaattttaccctagatttaacctaacttctttgctta 9374197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 13457628 - 13457592
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13457628 ccttgcttgctttgcttttttatttatatatttgtgt 13457592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 16648459 - 16648495
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16648459 ccttgcttgctttgcttttttatttatatatttgtgt 16648495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 17228609 - 17228577
Alignment:
Q  18 ttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaa 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17228609 ttcgcacgggttgaataacgtattttataaaaa 17228577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 385 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 35856217 - 35856185
Alignment:
Q  385 atttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35856217 atttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 35856185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 285
Target Start/End: Original strand, 40822145 - 40822237
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt 285  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||| || | ||||||||  |||||| |||  ||| |||||| ||||||||||||| || | |||||||    
T  40822145 tcttatttattaaagttaacccggacgctaactgttgccctaattttaacctaaattctatgcttacttttactgtattactcttgtttaatt 40822237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 125)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 42782697 - 42782190
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42782697 cttcacacgggttgaataacgtatttttttaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 42782598  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42782597 aagttgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaaacactacataacaaataacataacaactattataatatcttattccataaagttaacccga 42782498  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  42782497 acgcaaaattttacccaagatttaacctaacttctttgcttaattttattgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 42782398  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 416  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42782397 aatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 42782298  T
Q  417 ttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtt 516  Q
     |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42782297 ataaacgttaatccgtgatgcaatattaaccctagatttaacctaatttttt-gtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtc 42782199  T
Q  517 atctcttat 525  Q
    |||||||||    
T  42782198 atctcttat 42782190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 537
Target Start/End: Original strand, 18090631 - 18091151
Alignment:
Q  18 ttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18090631 ttcgcacgggttgaataacgtatttttcaaaaatttagttccgaaggagaaatcttataaattacggaaaactattgtcctttataaatgtgaaaatcaa 18090730  T
Q  118 aattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaa 217  Q
    |  |||  |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18090731 agctgcgcaaaccaaaattttgcaatacagagcctaaagtactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaa 18090830  T
Q  218 cgcaaaattttgccc-tagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18090831 cgcaaaattttgcccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 18090930  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 416  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18090931 aatcaaaataaacaaatctcttttaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 18091030  T
Q  417 ttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtt 516  Q
     |||| ||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  18091031 ataaacgttaacctgtgacgcaatattaacactagatttaacctaattttttcgtgtgattttactatattaaccctaaatttaatttatgcaaaatgcc 18091130  T
Q  517 atctcttatttttaaatgtta 537  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  18091131 gtctcttatttttaaatgtta 18091151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 525
Target Start/End: Original strand, 10874417 - 10874925
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10874417 cttcgcacgagttgaataacatatttttttaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacagaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 10874516  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  10874517 aagttgcgtaaaccaaaattttgcaacacagaacctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccaa 10874616  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    || |||| |||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  10874617 acacaaatttttgctcaagatttaacctaacttctttgcttaattttattgtattaagcctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 10874716  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 416  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10874717 gatcaaaataaacaaatcgtttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 10874816  T
Q  417 ttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtt 516  Q
     |||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  10874817 ataaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctaaatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccttagatttaatttatgcaaaatatc 10874916  T
Q  517 atctcttat 525  Q
    |||||||||    
T  10874917 atctcttat 10874925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 19488298 - 19487773
Alignment:
Q  18 ttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19488298 ttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaatttt-gttttgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaa 19488200  T
Q  118 aattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaa 217  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  19488199 agctgcataaaccaaaattttgcaacacagagcctaaaacaatacataaaaaataacataacaactattataatagcttattccttaaagttaacccaaa 19488100  T
Q  218 cgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaa 317  Q
    || |||||||||||| | ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19488099 cgtaaaattttgcccaaaatttaacctaacttcttttcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaa 19488000  T
Q  318 atcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19487999 atcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattta 19487900  T
Q  418 taaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg--- 514  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||       
T  19487899 taaacgttaacccctgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcatgtgactttactatattaaccttagatttattttatgcaaaatgtca 19487800  T
Q  515 ----ttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
        |||||||||||||||||||||||    
T  19487799 tttcttatctcttatttttaaatgtta 19487773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 498
Target Start/End: Original strand, 4289046 - 4289529
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4289046 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattatggaaaattgttgtcctttatcaatgtgaaaatca 4289145  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4289146 aaactgcgtaaactaaaattttacaacacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccga 4289245  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  4289246 acgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 4289345  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttact-aaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  4289346 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaattttactaaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatattatcttttatt 4289445  T
Q  416 tttaaatgttaacccgtgatgcaata-ttaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4289446 tttaaatgttaacccgtgatgcaatatttaaccctagatttaacctaattttttcatgtgactttactatattaaccctagatt 4289529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Original strand, 9542648 - 9543174
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  9542648 cttcgcacgggttgaataacatattttttaaaaatttagctctgaagaagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttatcaatgtgaaaatta 9542747  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  9542748 aaactgcgtaaaccaaaattttacaacacagagtctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccga 9542847  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||| || ||||    
T  9542848 acgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttacggtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttcacattaatttttaggga 9542947  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaat-----ttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctct 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||     ||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9542948 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatataagttaactccttaattttactaaaaaatttatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgttatctct 9543047  T
Q  412 tatttttaaatgttaacccgtgatgcaata-ttaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaa 510  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9543048 tatttttaaatgttaacccgtgacgcaatatttaaccctagatttaacctaattttttcatgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaa 9543147  T
Q  511 aatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||    
T  9543148 aatgtcatatcttatttctaaatgtta 9543174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 17838493 - 17837989
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  17838493 gcacaggttgaataacgtatttttttaaaatttagttatgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttaccctttataaatgtgaaaatcaaagt 17838394  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  17838393 tgcgtaaacaaaaaatttgcaacacagagtctaaagcactacataaaaaataacataacaattattgcagtctcttattcgttaaagttaacccgaacac 17838294  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatc 320  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17838293 aaaattttacgctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattacccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatc 17838194  T
Q  321 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaa 420  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||    
T  17838193 aaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttattaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctc--atttataa 17838097  T
Q  421 atgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  17838096 acgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaaagtcatct 17837997  T
Q  521 cttatttt 528  Q
    || |||||    
T  17837996 ctaatttt 17837989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 34 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 6931912 - 6931420
Alignment:
Q  34 aacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcataaaccaaa 133  Q
    ||||||||||||||| |||||| |   |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  6931912 aacgtattttttaaatatttagctctcaaggagaattcttatagattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaagctgcgtaaaccaaa 6931813  T
Q  134 attttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccct 233  Q
    |||||||||| || ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | |    
T  6931812 attttgcaacacatagtataaagtactacataaaaaataacataacaattatt-taatctcttattccttaaagttaacccgaatgcaaaatttagtcat 6931714  T
Q  234 agatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaat 333  Q
     |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6931713 tgatttaacctaacttctttgcttaatttgactgtattaaccatatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataaacaaat 6931614  T
Q  334 cgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||    
T  6931613 cgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtaatctcttatttctaaatgttaacttgtg 6931514  T
Q  434 atgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6931513 acgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcgcgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 6931420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 21 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 28609972 - 28609434
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  28609972 gcacgggttgaataacgtattttttttaaatttagttccgaaggagaaatcttataaattacagaaaattgatgtcctttataaatgtgaaaatcaaagc 28609873  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaa----tatcttattctt---taaagttaacc 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||     ||||||||| ||   |||||||||||    
T  28609872 tgcttaaaccaaaattttgcaacacaaagcctaaagcactacataaaaaataacataaccactattatatatcttatcttattattccttaaagttaacc 28609773  T
Q  214 cgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------taatcgaaatgtta 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||              ||||| ||||||||    
T  28609772 cgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattatccctgtttaatttaatcaaaatgtta 28609673  T
Q  300 acgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaa 399  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28609672 acgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaattgcttctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaa 28609573  T
Q  400 aatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatt-ttttcgtgtgactttactatattaaccctagatt 498  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  28609572 aatgtcatctcttatttataaatattaacccatgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttttgtgtgactttactatattaaccatatatt 28609473  T
Q  499 taatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  28609472 taatttatgcaaaatgtcatatcttatttttaaatgtta 28609434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 31 - 528
Target Start/End: Original strand, 32675776 - 32676284
Alignment:
Q  31 aataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcataaacc 130  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  32675776 aataacgtatttttttaaaatttagttttgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctctataagtgtgaaaatcaaagttgcgtaaacc 32675875  T
Q  131 aaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgc 230  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  32675876 aaaaatttgcaacacagagtctaaagcactacataaaaaataacataacaattattgcaatatcttattccttaaagttaacccgaacacaaaattttac 32675975  T
Q  231 cctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtatt--------------aatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    | || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||              || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  32675976 cttacatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattacccctatttaataaaccctatttaatttaatcaaaatattaacgttaattgttaggga 32676075  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattt 416  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||  ||||    
T  32676076 aattaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttattaaacaaattatattaaccttagatttaatttatacaaaatgtcagctc--attt 32676172  T
Q  417 ttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtt 516  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||     
T  32676173 ataaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctaaatttaatttatgaaaaaagtc 32676272  T
Q  517 atctcttatttt 528  Q
    |||||| |||||    
T  32676273 atctctaatttt 32676284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 10875345 - 10875681
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaac 301  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10875345 ttaaagttaatccggacgcaaaattttgccctagaattcacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaac 10875444  T
Q  302 gttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaa 401  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10875445 gttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaa 10875544  T
Q  402 tgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatatt-aaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagattta 500  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10875545 tgtcatctcttatttataaacgttaacccgtgacgcaatattaaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccttagattta 10875644  T
Q  501 atttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10875645 atttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 10875681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 6931237 - 6930888
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||              ||    
T  6931237 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttttttgcttaattttaatgtattaactctatttaattaactttgtttaattta 6931138  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6931137 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 6931038  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6931037 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccttagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 6930938  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6930937 aaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 6930888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 18091537 - 18091887
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||              |||||    
T  18091537 ttaaagttaacccgaatgcaaaattttgccctagatttaacataacttcttttcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 18091636  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  18091637 atcaaaatattaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccttagatt 18091736  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaa-ttttttcgtgtgactttactatat 486  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18091737 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacccgtggcgcaatattaaccctagatttaacctaatttttttcgtgtgactttactatat 18091836  T
Q  487 taaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18091837 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 18091887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 4290492 - 4290841
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  4290492 ttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtttaattta 4290591  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  4290592 aataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaaccttagatt 4290691  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4290692 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacccgagacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactacatt 4290791  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  4290792 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaattgtta 4290841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 9543459 - 9543808
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||              ||    
T  9543459 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttaatgtattaaccctatttaattaatcctgtttaattta 9543558  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    |   |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  9543559 aataaaatgttaacgttaattgttagtgaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctttttaaatttactaaacaaattatattaaccttagatt 9543658  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9543659 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaactcgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactacatt 9543758  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  9543759 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 9543808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 32676470 - 32676818
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||              |||||    
T  32676470 ttaaagttaacctgaacgcaaaattttgccctagatgtaacctaacttctttgtttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 32676569  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32676570 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttcactttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 32676669  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32676670 taatttatgccaaatggcatctcttatttctaaatgttaacctgtgacgcaatattaaccatagatttaacctaa-tttttcgtgtgactttactatatt 32676768  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  32676769 aaccctagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 32676818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 42781779 - 42781428
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta-------------- 287  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |                  
T  42781779 ttaaagttaacccggacgcaaaattttgccctataattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattaaccctgtttaatttg 42781680  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  42781679 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccataaatt 42781580  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  42781579 taatttatgcaaaatggcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattagccctagatttaaccttattttttcctgtgactttactatatt 42781480  T
Q  488 aa--ccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42781479 aaccccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 42781428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 28609053 - 28608703
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  28609053 ttaaagtaaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 28608954  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  28608953 atcaaaatgttaacgttaattattaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaaccttagatt 28608854  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatt-ttttcgtgtgactttactatat 486  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28608853 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatataaactctagatttaacctaatttttttcgtgtgactttacaatat 28608754  T
Q  487 taaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  28608753 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaattgtta 28608703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 195 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 19487380 - 19487028
Alignment:
Q  195 ttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat---------- 284  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||              
T  19487380 ttattttttaaagttaacccggacgcaaaattttgccctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatcaaccctgtt 19487281  T
Q  285 ----ttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaacc 380  Q
        || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19487280 taatttgatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaataaatcgctcctaatttttatctttaattttactaaacaaattatattaacc 19487181  T
Q  381 ctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgacttta 480  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19487180 ctagatttaatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttagcccgtgacgcaatattagacctagatttaacctaattttttcgtgtgacttta 19487081  T
Q  481 ctatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaat 533  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  19487080 ctatattaaccctaaatttaatttatgcaaaatgtcatctcatatttctaaat 19487028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 202 - 504
Target Start/End: Original strand, 1513696 - 1514012
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||              |||||    
T  1513696 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtttaattta 1513795  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1513796 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcggtcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 1513895  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1513896 taatttatgcaaaatgacatctcttatttccaaatgttaacccgtgacgaaatattaaccctagatttaacctaatttttttgtgtgactttactatatt 1513995  T
Q  488 aaccctagatttaattt 504  Q
    |||||||||||||||||    
T  1513996 aaccctagatttaattt 1514012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 279 - 525
Target Start/End: Original strand, 1513139 - 1513393
Alignment:
Q  279 tttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgttt-gggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatatta 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1513139 tttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatatta 1513238  T
Q  378 accctatatttaatttatgcaaaatgtc-------atctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1513239 accctagatttaatttatgcaaaatgtcgtcacttatctcttatttataaacgttaagttgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 1513338  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttat 525  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1513339 tgtgactttactgtattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat 1513393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 10875737 - 10875903
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10875737 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 10875836  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10875837 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 10875903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 28609489 - 28609323
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  28609489 tatattaaccatatatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaatttttacg 28609390  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28609389 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttctaaatgtta 28609323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 202 - 458
Target Start/End: Original strand, 19485124 - 19485394
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta-------------- 287  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |                  
T  19485124 ttaaagttataccggacgcaaaatttttccctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtttaatttg 19485223  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  19485224 atcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctgctaatttttctctttaattttactaaacaaattatatcaaccctagatt 19485323  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaac 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19485324 taatttatgcaaaatgtcatctcttattcctaaatgttaaccggtgatgaaatattaaccctagatttaac 19485394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 10875848 - 10876014
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10875848 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 10875947  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  10875948 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataaacgtta 10876014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 340 - 528
Target Start/End: Original strand, 19484744 - 19484936
Alignment:
Q  340 taatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaa 439  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19484744 taatttttatctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaa 19484843  T
Q  440 tattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgt-----gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  19484844 tattaaccctagatttaacct-attttttcgtgtgactcgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatatcatctctaatttt 19484936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 10875626 - 10875792
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  10875626 tatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattagccctatatttaacctaattttttcg 10875725  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10875726 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 10875792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 10876071 - 10876244
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatct-------cttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaat 463  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10876071 tatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaat 10876170  T
Q  464 tttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10876171 tttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttgtaaatgtta 10876244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 10048017 - 10048183
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  10048017 tatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgacatcttttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccgtagattttacctaattttttcg 10048116  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10048117 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 10048183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 371 - 525
Target Start/End: Original strand, 10875959 - 10876114
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaa-ccctcgatttaacctaattttttc 469  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  10875959 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataaacgttaacccgtgacgcaatattaaaccctagatttaacctaattttttc 10876058  T
Q  470 gtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttat 525  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10876059 gtgtgactttactatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat 10876114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 371 - 531
Target Start/End: Original strand, 10875001 - 10875159
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  10875001 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgttaacccgagatgcaatattaaccctatatttaacct-attttttcg 10875099  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaa 531  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10875100 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctc-tatttttaa 10875159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 19487835 - 19487662
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcat-------ctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaat 463  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19487835 tatattaaccttagatttattttatgcaaaatgtcatttcttatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccatagatttaacctaat 19487736  T
Q  464 tttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19487735 tttttcgtgtgactttactatattaaccttagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 19487662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 19487717 - 19487561
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19487717 tatattaaccttagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtaatgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 19487619  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19487618 cgtgactttactatattaaccctaaatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 19487561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 28609378 - 28609230
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  28609378 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctatatttaacct-attttttcg 28609280  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28609279 cgtgactttactatattaaccctaaatttaatttatgcaaaatgtcatct 28609230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 42782233 - 42782060
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat-------ttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaat 463  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  42782233 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaatcctagatttaacctaat 42782134  T
Q  464 tttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42782133 ttttttatgtgactttactatattaaccctatatttaattaatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 42782060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 374 - 528
Target Start/End: Original strand, 9543756 - 9543908
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgt 473  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||    
T  9543756 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtga-gcaatattaaccctagatttaacgt-attttttcgggt 9543853  T
Q  474 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  9543854 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 9543908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 374 - 515
Target Start/End: Original strand, 4290789 - 4290929
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgt 473  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||    
T  4290789 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaattgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacgt-attttttcgcgt 4290887  T
Q  474 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4290888 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 4290929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 10874882 - 10875056
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat-------ttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaat 463  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10874882 tatattaaccttagatttaatttatgcaaaatatcatctcttatctcttacttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaat 10874981  T
Q  464 ttt-ttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  10874982 ttttttcgtgtaactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgtta 10875056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 371 - 515
Target Start/End: Original strand, 18091832 - 18091976
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||  |||||| |    
T  18091832 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaactttagatttaaccttttttttttg 18091931  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18091932 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 18091976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 373 - 528
Target Start/End: Original strand, 1513352 - 1513513
Alignment:
Q  373 tattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat-------ttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattt 465  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  1513352 tattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaaccta-ttt 1513450  T
Q  466 tttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1513451 tttcgcgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 1513513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 371 - 522
Target Start/End: Original strand, 37994851 - 37995002
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  37994851 tatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttctaaatctaaacccgtgacgcaatattagccctagatttaacctaattttttcg 37994950  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctct 522  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  37994951 cgtgactttactatattaaccctagatttaacttatgtaaaatgtcatctct 37995002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 405 - 528
Target Start/End: Original strand, 37995022 - 37995145
Alignment:
Q  405 catctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaattt 504  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37995022 catctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaattt 37995121  T
Q  505 atgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||  ||||| |||||    
T  37995122 atgcaaaatgtcgtctctaatttt 37995145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 1514078 - 1514241
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat-------ttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaat 463  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       || |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  1514078 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatctcttatttctaaatgttaacctgtgacgcaatattaaccctagatttaaccta-t 1514176  T
Q  464 tttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  1514177 tttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 1514241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 378 - 528
Target Start/End: Original strand, 4290160 - 4290309
Alignment:
Q  378 accctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgact 477  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  4290160 accctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatccttgatgcaatattaaccctagatttaacat-attttttcgcgtgact 4290258  T
Q  478 ttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4290259 ttactatattaaccttatatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 4290309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 6930943 - 6930787
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  6930943 tatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-atttttttg 6930845  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  6930844 cacgactttactatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 6930787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 9543119 - 9543275
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  9543119 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgttaatccttaatgcaatattaaccctagatttaacat-attttttcg 9543217  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  9543218 cgtgactttactatattaactctagatttaatttatacaaaatgtcatctctaatttt 9543275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 10048128 - 10048284
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| | |||||||      
T  10048128 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaacattaaccctagatttaacgt-attttttta 10048226  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  10048227 cgtgactttactatattaaccctagacttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 10048284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 32676763 - 32676919
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  32676763 tatattaaccctagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttca 32676861  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  32676862 cgtgactttacaatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 32676919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 372 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 28608757 - 28608603
Alignment:
Q  372 atattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgt 471  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||     
T  28608757 atattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaattgttaacctgtgacgcaatattaaccctagatttaacgt-attttttcgc 28608659  T
Q  472 gtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  28608658 gtgactttactatattaaccctaga-ttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 28608603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 193 - 370
Target Start/End: Original strand, 25235107 - 25235298
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaa--------- 283  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||             
T  25235107 tcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgtcctagatttaacttaacttctttgtttaattttactatattaaccctatttaattaacccta 25235206  T
Q  284 -----tttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
         ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25235207 cttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaataaaaataaaaaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaat 25235298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 406 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 692772 - 692641
Alignment:
Q  406 atctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaattta 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  692772 atctcttatttttaaatgttaacccgtgaagcaatattaaccttaaatttaacctaattttttcgcgtgactttactaaattaaccctagatttaattta 692673  T
Q  506 tgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||| |  |||||||| |||||||||    
T  692672 tgcaaaatgtcaaatcttatttctaaatgtta 692641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 393 - 528
Target Start/End: Original strand, 18091220 - 18091354
Alignment:
Q  393 tatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccc 492  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18091220 tatgcaaaatgtcatcttttatttctaaatgttaatccgtgacgcaatattaaccctatatttaaccta-ttttttcgcgtgactttactatattaaccc 18091318  T
Q  493 tagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18091319 tagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 18091354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 371 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 42782115 - 42781991
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||    
T  42782115 tatattaaccctatatttaattaatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccctgatgcaatattaatcctagatttaaccta--tttttcg 42782018  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagat 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  42782017 cgtgactttactatattaaccctagat 42781991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 411 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 692580 - 692454
Alignment:
Q  411 ttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaa 510  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  692580 ttatttctaaatgttaacccgtgacacaatattaaccctaaatttaacctaattttttcgcgtgactttactaaattaaccctagatttaatttatgcaa 692481  T
Q  511 aatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||    
T  692480 aatgtcatatcttatttctaaatgtta 692454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 419 - 525
Target Start/End: Original strand, 1514015 - 1514121
Alignment:
Q  419 aaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttat 518  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1514015 aaatgttaacccgtgacgaaatattaaccctagatttaacctaatttttttgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcat 1514114  T
Q  519 ctcttat 525  Q
    |||||||    
T  1514115 ctcttat 1514121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 371 - 494
Target Start/End: Original strand, 18091096 - 18091219
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  18091096 tatattaaccctaaatttaatttatgcaaaatgccgtctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaactttttcc 18091195  T
Q  471 tgtgactttactatattaacccta 494  Q
    |||||||||  |||||||| ||||    
T  18091196 tgtgactttcttatattaatccta 18091219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 188 - 285
Target Start/End: Original strand, 1501622 - 1501719
Alignment:
Q  188 taatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt 285  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1501622 taatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatt 1501719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 173 - 284
Target Start/End: Original strand, 1501514 - 1501625
Alignment:
Q  173 acataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtatta 272  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1501514 acataacaactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaatgcaaaattttgccctagatttaacttaacttttttgcttaattttactgtatta 1501613  T
Q  273 atcctatttaat 284  Q
    | ||||||||||    
T  1501614 accctatttaat 1501625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 127
Target Start/End: Original strand, 19484635 - 19484746
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtatttttta-aaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatc 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19484635 cttcgcacgggttgaataacatattttttttaaaatttagttttgaaggagaaatcttataaattatggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatc 19484734  T
Q  116 aaaattgcataa 127  Q
    |||  |||||||    
T  19484735 aaagctgcataa 19484746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 374 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 692506 - 692396
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgt 473  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||    
T  692506 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaactctagatttaacctaattttttcacgt 692407  T
Q  474 gactttactat 484  Q
    |||||||||||    
T  692406 gactttactat 692396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 183
Target Start/End: Original strand, 1501298 - 1501448
Alignment:
Q  28 ttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcataa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |  | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  1501298 ttgaataacgtattttttaaaaatttagttatgaaggaaattttttataaattatggaaa-ttattgtcctttataaatgtgaaaatcaaagctgcgtaa 1501396  T
Q  128 accaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaact 183  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  1501397 actaaaattttgcaacacagagtctaaagc----cataaaaaataacataacaact 1501448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15783589 - 15783430
Alignment:
Q  205 aagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgtt 304  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||| || |      |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  15783589 aagttaattcgaacccaaaattttgccctagttttaacctatc------gcttaaatttactatattaatcctatttaatttaatcaaaatattaatgtt 15783496  T
Q  305 aattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15783495 aattattagggaaatcaaaatgaacaaattgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaat 15783430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Original strand, 9916725 - 9916817
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtg 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9916725 cttcgcacaggttgaataacgtatttttttaaaatttagttatgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtg 9916817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 371 - 506
Target Start/End: Original strand, 25235788 - 25235920
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  25235788 tatattaaccttagatttaatttaggcaaaatgtcatct--tatttctaaatgttatcc-gtgacgcaatattaaccttatatttaacctaattttttag 25235884  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttat 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25235885 tgtgactttactatattaaccctagattaaatttat 25235920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 428 - 528
Target Start/End: Original strand, 25235921 - 25236021
Alignment:
Q  428 cccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttattt 527  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25235921 cccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgcgtgagtttacaatgttaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaattt 25236020  T
Q  528 t 528  Q
    |    
T  25236021 t 25236021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 193 - 370
Target Start/End: Original strand, 44940665 - 44940852
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatt------------ 280  Q
    |||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||                
T  44940665 tcttattccttaaagttaacccg----caaaattttgccatagatttaacctaacttctttgcttaattttacgatattaaccctatttaattaacctta 44940760  T
Q  281 --taatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
      |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||    
T  44940761 tttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgttcctaacttttctctttaattttgctgaacaaat 44940852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 374 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 692693 - 692587
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgt 473  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||    
T  692693 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcaaatcttatttctaaatgttaacctgtgacgcaatattaactctagatttaacctaattttttcacgt 692594  T
Q  474 gacttta 480  Q
    |||||||    
T  692593 gacttta 692587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 371 - 461
Target Start/End: Original strand, 10876189 - 10876279
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10876189 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttgtaaatgttaatcggtgatgcaatattaaccctatatttaaccta 10876279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 379 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 42781475 - 42781393
Alignment:
Q  379 ccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42781475 ccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaaccggtgatgcaatattaaccctagatttaaccta 42781393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 406 - 539
Target Start/End: Original strand, 25235715 - 25235843
Alignment:
Q  406 atctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaattta 505  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25235715 atctcttatttctaaatgttaaaccgtgacgcaatatta-ccctatatttaacctaatttt--catgtgactttactatattaaccttagatttaattta 25235811  T
Q  506 tgcaaaatgttatctcttatttttaaatgttatc 539  Q
     ||||||||| |  |||||||| |||||||||||    
T  25235812 ggcaaaatgtca--tcttatttctaaatgttatc 25235843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 452 - 537
Target Start/End: Original strand, 24128610 - 24128695
Alignment:
Q  452 atttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  24128610 atttaatctaattttttcgcgtgactttactatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgtta 24128695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 193 - 285
Target Start/End: Original strand, 25234787 - 25234879
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| | |||| | |||||||||    
T  25234787 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttcttttcttcattttactattttaaccatatttaatt 25234879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 445 - 533
Target Start/End: Original strand, 37994814 - 37994902
Alignment:
Q  445 accctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaat 533  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37994814 accctagatttaatttaattttttcgcatgactttactatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttctaaat 37994902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 371 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 19487079 - 19486989
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaaccta 461  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19487079 tatattaaccctaaatttaatttatgcaaaatgtcatctcatatttctaaatattaactggtgatgcaatattaaccctacatttaaccta 19486989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 285
Target Start/End: Original strand, 25234472 - 25234564
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt 285  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||  | |||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  25234472 tcttattccttaaagttaacctgaacgcaaaattttgtcctagatttaacgtaatttatttgcttaattttactattttaaccctatttaatt 25234564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8909899 - 8909802
Alignment:
Q  188 taatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt 285  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |   || ||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  8909899 taatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaatgttgctctagatttaacctaactttaatgattaattttattgtattacccctatttaatt 8909802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 371 - 428
Target Start/End: Original strand, 24128640 - 24128697
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaac 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24128640 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgttaac 24128697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 4289401 - 4289456
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4289401 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatattatcttttatttttaaatgtta 4289456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 19484775 - 19484830
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19484775 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 19484830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 407 - 485
Target Start/End: Original strand, 37995161 - 37995240
Alignment:
Q  407 tctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaa-ttttttcgtgtgactttactata 485  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  37995161 tctcttatttctaaatgttaactagtgacgcaatattaaccctagatttaacctaatttttttcgcgtgactttactata 37995240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 285
Target Start/End: Original strand, 25234684 - 25234774
Alignment:
Q  195 ttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt 285  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| || ||||||||| | |||| |||||||||||    
T  25234684 ttattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttgtcatagatttaacctaacttctttcctgaattttactattttaaccctatttaatt 25234774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 285
Target Start/End: Original strand, 25234570 - 25234662
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt 285  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||| ||| |||||||| | |||| | |||||||||    
T  25234570 tcttattctttaaagttaacctgaatgcaaaattttgtcctaaatttaacctaacttcttttcttcattttactattttaaccatatttaatt 25234662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 6931576 - 6931521
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6931576 tatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtaatctcttatttctaaatgtta 6931521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 10874771 - 10874826
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  10874771 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataaacgtta 10874826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 19487190 - 19487135
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  19487190 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgtta 19487135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 693013 - 692907
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcga 292  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||| |||  |   || |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  693013 tcttattccttaaagttaatctgaacgttaaatgttgccctagatttaacctaattttaatgattaattttactgtattacccctatttaatttaatcaa 692914  T
Q  293 aatgtta 299  Q
    |||||||    
T  692913 aatgtta 692907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 285
Target Start/End: Original strand, 25234901 - 25234991
Alignment:
Q  195 ttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt 285  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| |||| |||||| | ||||||||| | |||| |||||||||||    
T  25234901 ttattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttatcatagatttaacctaacttctttgttgaattttactattttaaccctatttaatt 25234991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 262
Target Start/End: Original strand, 25234997 - 25235065
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattt 262  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25234997 tcttattccttaaagttaacc-gaacgcaaaattttgctatagatttaacctaacttctttgcttaattt 25235065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 489 - 537
Target Start/End: Original strand, 4290160 - 4290208
Alignment:
Q  489 accctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4290160 accctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 4290208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 318 - 370
Target Start/End: Original strand, 25235403 - 25235455
Alignment:
Q  318 atcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25235403 atcaaattaaacaaatcactcctaatttttctgcttaattttactaaacaaat 25235455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 1513879 - 1513934
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  1513879 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgacatctcttatttccaaatgtta 1513934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 552 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 4999962 - 4999915
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgtctctgctgctc 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4999962 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgtttgtgctgctc 4999915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 552 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 5011630 - 5011583
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgtctctgctgctc 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  5011630 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgtttgtgctgctc 5011583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 19485307 - 19485362
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  19485307 tatatcaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattcctaaatgtta 19485362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 42782343 - 42782288
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  42782343 tatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataaacgtta 42782288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Original strand, 1513467 - 1513513
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1513467 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 1513513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Original strand, 4290263 - 4290309
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4290263 tatattaaccttatatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 4290309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Original strand, 18091308 - 18091354
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18091308 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 18091354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Original strand, 45003789 - 45003842
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaat 70  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  45003789 cttcgcacgggttgaataatgtatttttcaaaaatttagttgtgaaggagaaat 45003842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 205804 - 205840
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  205804 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 205840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 19820867 - 19820903
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19820867 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 19820903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 19841088 - 19841124
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19841088 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 19841124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 241
Target Start/End: Original strand, 37994778 - 37994826
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaa 241  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  37994778 tcttattcttaaaagttaacctgaacgcaaaattttaccctagatttaa 37994826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 42110637 - 42110601
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42110637 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 42110601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 552 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 1918031 - 1917984
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgtctctgctgctc 599  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  1918031 ccttgcttgctttgctttttgatttatatatttgtgtttgtgctgctc 1917984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 553 - 599
Target Start/End: Original strand, 1502908 - 1502954
Alignment:
Q  553 cttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgtctctgctgctc 599  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  1502908 cttgcttgctttagtttttgatttatatatttgtgtttgtgctgctc 1502954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Original strand, 9543862 - 9543908
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9543862 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 9543908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 417
Target Start/End: Original strand, 25235979 - 25236021
Alignment:
Q  375 ttaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25235979 ttaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 25236021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Original strand, 37995099 - 37995145
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37995099 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcgtctctaatttt 37995145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 2194266 - 2194189
Alignment:
Q  195 ttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtatta 272  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||  |  |||||||||||||| |||||    
T  2194266 ttattcattacagttaacccgaacgctaattgttgccctagatttaccataaccacgatgcttaattttactatatta 2194189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 181088 - 181124
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  181088 ccttgcttgctttgctttttgatttatatatttgtgt 181124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 979228 - 979192
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  979228 ccttgcttgctttgctttttgatttatatatttgtgt 979192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 2445190 - 2445226
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2445190 ccttgcttgctttgctttttgatttatatatttgtgt 2445226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 2445797 - 2445833
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2445797 ccttgcttgctttgctttttgatttatatatttgtgt 2445833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 2446404 - 2446440
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2446404 ccttgcttgctttgctttttgatttatatatttgtgt 2446440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 6121654 - 6121690
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6121654 ccttgcttgctttgctttttgatttatatatttgtgt 6121690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 28089553 - 28089517
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28089553 ccttgcttgctttgctttttgatttatatatttgtgt 28089517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 36438780 - 36438744
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36438780 ccttgcttgctttggtttttgatttctatatttgtgt 36438744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 406
Target Start/End: Original strand, 4290896 - 4290931
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtca 406  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4290896 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 4290931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 406
Target Start/End: Original strand, 18091943 - 18091978
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtca 406  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18091943 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtca 18091978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 16884271 - 16884238
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaa 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16884271 cttcgcacgggttgaataacgtattttgtaaaaa 16884238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 17041961 - 17041928
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaa 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17041961 cttcgcacgggttgaataacgtattttgtaaaaa 17041928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 13902416 - 13902452
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13902416 ccttgcttgctttgcttttttatttatatatttgtgt 13902452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 21589776 - 21589740
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21589776 ccttgcttgctttgttttttaatttatatatttgtgt 21589740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23456531 - 23456495
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttg 229  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23456531 tcttattccttaaagttaactcgaacgcaaaattttg 23456495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 383; Significance: 0; HSPs: 74)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Original strand, 9978726 - 9979254
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9978726 cttcgcacgggttgaataacatattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 9978825  T
Q  117 aaattgca-taaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccg 215  Q
    ||    |  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  9978826 aagcctctgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattgtaatcttttattccttaaagttaacccg 9978925  T
Q  216 aacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggg 315  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  9978926 aacgaaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggg 9979025  T
Q  316 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtc-------atc 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       |||    
T  9979026 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatc 9979125  T
Q  409 tcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgc 508  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9979126 tcttatttataaacgttaacccgtgacacaatattaatcctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgc 9979225  T
Q  509 aaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  9979226 aaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 9979254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 4110084 - 4109560
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttt-----taaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     |   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4110084 cttcgcacgggttgaataacgtatttttattttttttaatttagcttcgaaggagaaatcttataaattacagaaaattgttgtcctttataaatgtgaa 4109985  T
Q  112 aatcaaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaa 211  Q
    |||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4109984 aatcaaagctgtgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcatattccttaaagttaa 4109885  T
Q  212 cccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtt 311  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4109884 tccgaacgcaaaattttgtcctagatttaacctaacttcattgcttaactttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgtt 4109785  T
Q  312 tgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctct 411  Q
     |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  4109784 agggaaatcaaaataaacaaatcacacataatttttctccttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatatct 4109685  T
Q  412 tatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaa 511  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4109684 tatttataaacgttaacccgtgacgcaata-taacactagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaa 4109586  T
Q  512 atgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  4109585 atgtcatctcttatttttaaatgtta 4109560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 24447818 - 24447335
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  24447818 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttaattccgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttatcattgtgaaaatca 24447719  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24447718 aaactgcgtaaactaaaattttacaacacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccga 24447619  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  24447618 acgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttacttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacattaattgttaggga 24447519  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttact-aaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24447518 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaattttactaaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatattatctcttatt 24447419  T
Q  416 tttaaatgttaacccgtgatgcaata-ttaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatt 498  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24447418 tttaaatgttaacccgtgacgcaatatttaaccctagatttaacctaattttttcatgtgactttactatattaaccctagatt 24447335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 35160146 - 35159622
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  35160146 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaagaagaaatcttataaattacggaaaatgattgtcatttataaatgtgaaaatca 35160047  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttat--tctttaaagttaaccc 214  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |    
T  35160046 aagctgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaaacacaacataaaaaataacatatcaactattgtaatctcttatattccttaaagttaactc 35159947  T
Q  215 gaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgg 314  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  35159946 aatcgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttacttagttttactgtatcaaccctatttaatttaatgaaaatgttaacgttaattgttagg 35159847  T
Q  315 gaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat 414  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35159846 gaaatcaaaataaaaaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccataaatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat 35159747  T
Q  415 ttttaaatgttaacc--cgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaa 512  Q
    || |||| |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35159746 ttataaacgttaacccgcgtgacgcaatattaaccctagatttaactaatttttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatatatgcaaaa 35159647  T
Q  513 tgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||    
T  35159646 tgtcatctcttatttctaaatgtta 35159622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 515
Target Start/End: Original strand, 4895984 - 4896475
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  4895984 gcacgagttgaataacgtatttttttaaaatttagttctgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttaccctttataaatgtgaaaatcaaagt 4896083  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  4896084 tgcgtaaaccaaaaatttgcaacacagagtctaaagcaccacataaaaaataacataacaattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacac 4896183  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatc 320  Q
    |||||||| || |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4896184 aaaattttaccttagatttaacctaacttctttacttaattttactgtattacccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatc 4896283  T
Q  321 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaa 420  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||    
T  4896284 aaaat-aacagatcgctcctaatttttctccttaattttattaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgtaaaatgtcagctc--atttataa 4896380  T
Q  421 atgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4896381 acgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgtaaaatgt 4896475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 1222408 - 1221924
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtatttttt-aaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatc 115  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1222408 cttcgcatggattgaataacgtatttttttaaaaatttagttccgaatgagaaatcttataaattatggaaaattgttgtcctttatcaatgtgaaaatc 1222309  T
Q  116 aaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccg 215  Q
    |||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1222308 aaaactgcgtaaactaaaattttacaacacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccg 1222209  T
Q  216 aacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  1222208 aacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggg 1222109  T
Q  316 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttact-aaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1222108 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaattttattaaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatattatctcttat 1222009  T
Q  415 ttttaaatgttaacccgtgatgcaata-ttaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatt 498  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1222008 ttttaactgttaacccgtgacgcaatatttaaccttagatttaacctaattttttcatgtgactttactatattaaccctagatt 1221924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 17 - 515
Target Start/End: Original strand, 6966255 - 6966763
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaa-tttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||| |    | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6966255 cttcgcacgggttgaataacgtattatttaaaaaatttaactccgaagaattttttttataaattacgaaaaattgttgttctttataaatgtgaaaatc 6966354  T
Q  116 aaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccg 215  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |    
T  6966355 aaagctgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacttg 6966454  T
Q  216 aacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  6966455 aacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttttttgcttaattgtactgtattaaccccatttaatttaatcaaaatgttaaagttaattgttaggg 6966554  T
Q  316 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctct---- 411  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||        
T  6966555 aaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctaggtttaatttatgcaaaatgtcatctcttatc 6966654  T
Q  412 -----tatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttat 506  Q
         ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6966655 tattatatttataaacgttaacccgtgacgcaatattaactctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttat 6966754  T
Q  507 gcaaaatgt 515  Q
    |||||||||    
T  6966755 gcaaaatgt 6966763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 53 - 427
Target Start/End: Original strand, 9735751 - 9736125
Alignment:
Q  53 tagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtct 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  9735751 tagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcttttataaatgtgaaaatgaaagctgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcct 9735850  T
Q  153 aaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctt 252  Q
    ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  9735851 aaaacactacataacaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaaccctaacgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctt 9735950  T
Q  253 tgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctcct 352  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9735951 tgcttaattttactatattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctcct 9736050  T
Q  353 taattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaa 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9736051 taattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataaacgttaa 9736125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 414
Target Start/End: Original strand, 15043846 - 15044243
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15043846 cttcgcacggattgaataacgtattttttaaaaatttagctccgaaggagaaatcttataaattacgaaaaattgttgttctttataaatgtgaaaatca 15043945  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  15043946 aagctgcgtaaaccaaaattttgcaacacagatcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacctga 15044045  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  15044046 acgcaaaattttgccctggatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagaga 15044145  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat 414  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15044146 aatcaaaataaacaaatagctcctgatttttctccttaattttaccaaacaaatttcattaaccctagatttaatttatgtaaaatgtcatctcttat 15044243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Original strand, 33319584 - 33320089
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaa-tttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatc 115  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  33319584 cttcgcacgagttgaataacatattttttaaaaaatttaatttcgaagaagaaatcttataaattacggaaaattattgtcatttataaatgtgaaaatt 33319683  T
Q  116 aaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccg 215  Q
    ||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |     
T  33319684 aaagttgcgtaaatcaaaattttgcaacacagagcctaaaacacaacataaaaaataacatatcaattattgtaatctcttattccttaaagttaactca 33319783  T
Q  216 aacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggg 315  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||  |          || ||   ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  33319784 atcgcaaaattttgccctatatttaacctaacttctttgcttagttttggt----------tagtt---ttaat-gaaatgttaacgttaattgttaggg 33319869  T
Q  316 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 415  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33319870 aaatcaaaataaataaatcgctcataatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 33319969  T
Q  416 tttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
    | |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33319970 tataaacgttaacccgcg-tgaaatattaaccctagatttaa-ctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaattgatgcaaaatgt 33320067  T
Q  516 tatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     ||||||||||| | |||||||    
T  33320068 catctcttatttcttaatgtta 33320089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 27 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 14833065 - 14832529
Alignment:
Q  27 gttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcata 126  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||| |   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | | ||    
T  14833065 gttgaataatgtattttttttaaatttagctcttaaggaaaaatcttataaattacggaaaattgttgtcttttataaatgtgaaaatcaaagctacgta 14832966  T
Q  127 aaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaatt 226  Q
    ||| |||||||| ||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14832965 aactaaaattttacaacatagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaatt 14832866  T
Q  227 ttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattt--------------aatttaatcgaaatgttaacgttaattgttt 312  Q
    ||| | |||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||              ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14832865 ttgacatagatttaacctaacttttttgcttaattttactatattaaccctatttaattaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttt 14832766  T
Q  313 gggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatc---- 408  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||        
T  14832765 gggaaattaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccttaga-ttaatttatgcaaaatgacatctctt 14832667  T
Q  409 -----------tcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagat 497  Q
               |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14832666 atttctaaatgtcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttattatattaaccctagat 14832567  T
Q  498 ttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgt 535  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  14832566 ttaatttatgcaaaatatcatctcttatttctaaatgt 14832529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18320751 - 18320430
Alignment:
Q  16 acttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatc 115  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18320751 acttcgcacggattaaataacgtattttttaaaaatttagttccgaatgagaaatcttataaattatggaaaattgttgtcttttatcaatgtgaaaatc 18320652  T
Q  116 aaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccg 215  Q
    |||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18320651 aaaactgcgtaaactaaaattttacaacacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatttcttattccttaaagttaacccg 18320552  T
Q  216 aacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18320551 aacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggg 18320452  T
Q  316 aaatcaaaataaacaaatcgct 337  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18320451 aaatcaaaataaacaaatcgct 18320430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 4109162 - 4108812
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  4109162 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 4109063  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4109062 atcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatatttatcctatatt 4108963  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatt-ttttcgtgtgactttactatat 486  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4108962 taatttatgcaaaatggcatctcttatatctaaatgttaacccgtgacacaatattaaccttagatttaacctaatttttttcgtgtgactttactatat 4108863  T
Q  487 taaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  4108862 taaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgtta 4108812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 24446370 - 24446021
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  24446370 ttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtttaattta 24446271  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  24446270 aataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaaccttagatt 24446171  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24446170 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacccgagacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactacatt 24446071  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24446070 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 24446021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 202 - 528
Target Start/End: Original strand, 33320369 - 33320708
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||              |||||    
T  33320369 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattgaccctatttaattaactctgtttaattta 33320468  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33320469 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcactcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 33320568  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33320569 taatttatgtaaaatgacatctcttatttgtaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcgtgtgactttactatatt 33320667  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  33320668 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 33320708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 4896779 - 4897128
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||              |||||    
T  4896779 ttaaagttaacctgaacgcaaaattttgccctagatgtaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 4896878  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  4896879 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttcactttaattttactaaacaaattttattaaccctagatt 4896978  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4896979 taatttatgccaaatgacatctcttatttctaaatgttaacctgtgatgcaatattaaccctatatttaaccttattttttcgtgtgactttactatatt 4897078  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4897079 aaccctagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 4897128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 202 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 35159295 - 35158956
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattta-------------- 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||                  
T  35159295 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgacctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttactctgtttaattta 35159196  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35159195 atcaaaatgttaacgttaatttttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 35159096  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35159095 taatttatgtaaaatgacatctcttatttgtaaatgttaacccgtgacgcaatataaaccctagatttaacct-attttttcgtgtgactttactatatt 35158997  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  35158996 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 35158956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 1220963 - 1220614
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  1220963 ttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtttaattta 1220864  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    |   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  1220863 aataaaatgttaacgttaattgttagggaaattaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaaccttagatt 1220764  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1220763 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacccgagacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactacatt 1220664  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  1220663 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaattgtta 1220614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 287 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 21059368 - 21059122
Alignment:
Q  287 aatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatat 386  Q
    |||| ||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21059368 aatcaaaatgttaatgtaaactgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagat 21059269  T
Q  387 ttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatat 486  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21059268 ttaatttatgcaaaatgtcataacttatttctaagcgttaacccgtgacgcaatattaacc----atttaacctaattttttcatgtgactttattatat 21059173  T
Q  487 taaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21059172 taaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 21059122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 316 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 21055567 - 21055349
Alignment:
Q  316 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  21055567 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcataacttatt 21055468  T
Q  416 tttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaa-ttttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 514  Q
    | |||| |||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21055467 tctaaacgttaacccgtgacgcaatattaacc----atttaacctaatttttttcatgtgactttattatattaaccttagatttaatttatgcaaaatg 21055372  T
Q  515 ttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    | ||||||||||| |||||||||    
T  21055371 tcatctcttatttctaaatgtta 21055349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 4109615 - 4109445
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacct----aatttt 466  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||    
T  4109615 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacctaattaatttt 4109516  T
Q  467 ttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  4109515 ttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttttaaatgtta 4109445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 287 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 21078609 - 21078375
Alignment:
Q  287 aatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatat 386  Q
    |||| ||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| ||    
T  21078609 aatcaaaatgttaatgtaaattgttaaggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaactttaccaaacaaattatattatctctagat 21078510  T
Q  387 ttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt------tttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgacttta 480  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||      ||  || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21078509 ttaatttaagcaaaatgtcattacttattacttatttctaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgacttta 21078410  T
Q  481 ctatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21078409 ttataataaccctagatttaatttatgcaaaatgt 21078375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 9979199 - 9979355
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  9979199 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacgt-attttttcg 9979297  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  9979298 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 9979355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 369 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 21078410 - 21078251
Alignment:
Q  369 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctctt-atttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttt 467  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21078410 attataataaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatttttttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaaccta-ttttt 21078312  T
Q  468 tcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21078311 tcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 21078251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 374 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 24446073 - 24445920
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgt 473  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||    
T  24446073 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacgt-attttttcgcgt 24445975  T
Q  474 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  24445974 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 24445920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 371 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 4109500 - 4109345
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4109500 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttttaaatgttaatccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 4109402  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttattt 527  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  4109401 cgtgactttactatattaactctagatttaatttatgcaaaatctcatctctaattt 4109345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 369 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 21055406 - 21055239
Alignment:
Q  369 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttttt 468  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21055406 attatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacgcgtga-gcaatattaacccttgatttaacctgatttttt 21055308  T
Q  469 cgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | || | |||||| |||||||||    
T  21055307 cgtgtgactttactatattaactctagatataatttatgcaaaatatcattttttatttctaaatgtta 21055239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 374 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 1220666 - 1220513
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgt 473  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||    
T  1220666 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaattgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacgt-attttttcgcgt 1220568  T
Q  474 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  1220567 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 1220513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 4896442 - 4896597
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4896442 tatattaaccctagatttaatttatgtaaaatgtcagctc--atttataaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 4896539  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  4896540 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaaagtcatctctaatttt 4896597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 378 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 1221295 - 1221146
Alignment:
Q  378 accctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgact 477  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  1221295 accctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatccttgatgcaatattaaccctagatttaacat-attttttcgcgtgact 1221197  T
Q  478 ttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1221196 ttactatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 1221146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 378 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 24446702 - 24446553
Alignment:
Q  378 accctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgact 477  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  24446702 accctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatccttgatgcaatattaaccctagatttaacat-attttttcgcgtgact 24446604  T
Q  478 ttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24446603 ttactatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 24446553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 369 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 21059179 - 21059031
Alignment:
Q  369 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttttt 468  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  21059179 attatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacgcgtga-gcaatattaacccttgatttaatctgatttttt 21059081  T
Q  469 cgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttat 518  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21059080 cgtgtgactttactatattaactctagatataatttatgcaaaatattat 21059031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 15045021 - 15045179
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15045021 tatattaaaactagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaaacagtgaagcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 15045119  T
Q  471 tgtgactttactata-ttaaccctagatttaatttatgc-aaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15045120 tgtgactttactatatttaaccctagatttaatttatgcaaaaatgttatctctaatttt 15045179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 19989855 - 19989689
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19989855 tatattaatcatagatttaatttatgcaaaacatcatctcttatttctaaatgttaacccgtgactcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 19989756  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||    
T  19989755 ctagactttactatattaactctagatttaatttatgcaaaatatcatctcttatttcaaaatgtta 19989689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 4108867 - 4108711
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| || | |||||||||    
T  4108867 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatttctaaatgttaatctgtgacgcaatattaaccctagattttacat-attttttcg 4108769  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  4108768 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 4108711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 4897073 - 4897229
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  4897073 tatattaaccctagatttaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtggcgcaatattaaccctagatttaa-cttattttttcg 4897171  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  4897172 cgtgactttacaatagtaactctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 4897229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 21055294 - 21055138
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  21055294 tatattaactctagatataatttatgcaaaatatcattttttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctaaatttaacct-attttttcg 21055196  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21055195 tgtgactttactatattaactctatatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 21055138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 412 - 537
Target Start/End: Original strand, 15044951 - 15045076
Alignment:
Q  412 tatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaa 511  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15044951 tatttataaacgttaacccgtgacgcaatattaaccatagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaaactagatttaatttatgcaaa 15045050  T
Q  512 atgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||    
T  15045051 atgtcatctcttatttctaaatgtta 15045076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 35159677 - 35159523
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || |||||||   |||| |    
T  35159677 tatattaaccctagatttaatatatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaactcgtgacgcaatattaaccctaaatgtaaccta---tttttg 35159581  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| |||||    
T  35159580 cgtgactttactatattaaccctagattcaatttatgtaaaatgtcatatctaatttt 35159523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 21059067 - 21058909
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctctt--atttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttttt 468  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||||| | || | ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  21059067 tatattaactctagatataatttatgcaaaatattattttttttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctaaatttaaccta-tttttt 21058969  T
Q  469 cgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21058968 cgtgtgactttactatattaactctatatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 21058909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 33320034 - 33320186
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  | |||||   |||| |    
T  33320034 tatattaaccctagatttaattgatgcaaaatgtcatctcttatttcttaatgttaactcgtgacgcaatattaaccctaga--tgaccta---tttttg 33320128  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  33320129 cgtgactttactatattaaccctaggtttaatttatgcaaaatgtcatatctaatttt 33320186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 369 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 14832584 - 14832496
Alignment:
Q  369 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaa 457  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14832584 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatatcatctcttatttctaaatgtcaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaa 14832496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 413 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 19989923 - 19989800
Alignment:
Q  413 atttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaa 512  Q
    |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19989923 atttctaaaagttaacccgtgacacaatattaaccctagatttaacctaattttt-catgtgactttactatattaatcatagatttaatttatgcaaaa 19989825  T
Q  513 tgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
      | ||||||||||| |||||||||    
T  19989824 catcatctcttatttctaaatgtta 19989800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 193 - 370
Target Start/End: Original strand, 4621320 - 4621504
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtatta-------------atcctat 279  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||             | |||||    
T  4621320 tcttattccttaaagttaacccgaacgcaaatttttgtcatagatttaacctagcttctttgcttaattttactatattaccctatttaattaaccctat 4621419  T
Q  280 ttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaat 370  Q
    ||||||||||| |||| ||||      |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4621420 ttaatttaatcaaaatattaa------ttgttatggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaat 4621504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 371 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 19989744 - 19989647
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttttt 468  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19989744 tatattaactctagatttaatttatgcaaaatatcatctcttatttcaaaatgttaacccgttacgcaatattaacccttgatttaacctaatttttt 19989647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 24447463 - 24447408
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24447463 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatattatctcttatttttaaatgtta 24447408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 31426324 - 31426227
Alignment:
Q  189 aatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgc-cctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt 285  Q
    |||||||  ||||||||| |||| | |||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  31426324 aatatctctttctttaaaattaatctgaacgcaaaattttgatcctaaatttaacataacttctttgcttaattttactatattaatcatatttaatt 31426227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 1222052 - 1221997
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1222052 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatattatctcttatttttaactgtta 1221997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 9736069 - 9736124
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  9736069 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataaacgtta 9736124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 489 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 1221295 - 1221247
Alignment:
Q  489 accctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1221295 accctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 1221247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 489 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 24446702 - 24446654
Alignment:
Q  489 accctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24446702 accctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 24446654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 33320552 - 33320607
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  33320552 tatattaaccctagatttaatttatgtaaaatgacatctcttatttgtaaatgtta 33320607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 35159112 - 35159057
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  35159112 tatattaaccctagatttaatttatgtaaaatgacatctcttatttgtaaatgtta 35159057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 446 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 19989978 - 19989920
Alignment:
Q  446 ccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaattt 504  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19989978 cccttgatttaacctaattttttcgcatgactttactattttaaccctaaatttaattt 19989920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 24457621 - 24457657
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24457621 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 24457657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 29373206 - 29373170
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29373206 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 29373170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 33005907 - 33005871
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33005907 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 33005871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 552 - 599
Target Start/End: Original strand, 2278544 - 2278591
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgtctctgctgctc 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  2278544 ccttgcttgctttggtttttgatttatatttttgtgtttgtgctgctc 2278591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 482 - 525
Target Start/End: Original strand, 6966610 - 6966653
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttat 525  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6966610 tatattaaccctaggtttaatttatgcaaaatgtcatctcttat 6966653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 1220559 - 1220513
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1220559 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 1220513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 1221192 - 1221146
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1221192 tatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 1221146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 24445966 - 24445920
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24445966 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 24445920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 24446599 - 24446553
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24446599 tatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 24446553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 483 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 14832514 - 14832469
Alignment:
Q  483 atattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  14832514 atattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 14832469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 372 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 14832514 - 14832469
Alignment:
Q  372 atattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  14832514 atattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 14832469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19990015 - 19989966
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 242  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19990015 tcttattccttaaagttaatctgaacgcaaaattttgcccttgatttaac 19989966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 407
Target Start/End: Original strand, 6966730 - 6966766
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcat 407  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6966730 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcat 6966766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 525
Target Start/End: Original strand, 15044203 - 15044243
Alignment:
Q  485 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttat 525  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15044203 attaaccctagatttaatttatgtaaaatgtcatctcttat 15044243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 33048925 - 33048889
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33048925 ccttgcttgctttgctttttgatttatatatttgtgt 33048889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28079145 - 28079092
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataa 246  Q
    |||||||  |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28079145 tcttattacttaaagttaacccgtaagcaatattttgccctagatttaccataa 28079092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 28079330 - 28079257
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatc 275  Q
    |||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||| | |||  ||| | |||||||||||| ||||||||    
T  28079330 ttaaagttaacccgtaagcaataatttgccctagatttatcttaatttctctacttaattttactatattaatc 28079257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 289
Target Start/End: Original strand, 31490983 - 31491016
Alignment:
Q  256 ttaattttactgtattaatcctatttaatttaat 289  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31490983 ttaattttactgtattactcctatttaatttaat 31491016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 34218739 - 34218655
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttat 102  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| |  |||||||||||  | ||||||  || |||||||||||||||||    
T  34218739 cttcgcacaggttgaataaggtatttttcaaaattttagctgtgaaggagaaat-gtgtaaattttggtaaattgttgtcctttat 34218655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 29370651 - 29370615
Alignment:
Q  552 ccttgcttgctttggtttttgatttatatatttgtgt 588  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  29370651 ccttgcttgcattgatttttgatttatatatttgtgt 29370615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 367; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Original strand, 17419 - 17941
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17419 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttaatttcgaaggagaaattttataaattacggaaaattgttgtcctttatcaatatgaaaatca 17518  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaa-taacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccg 215  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17519 aaactgcgtaaaccaaaattttacaacacagagcctaaaacactacataaaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccg 17618  T
Q  216 aacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggg 315  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17619 aacgcaaaattttgccatagatttaatctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggg 17718  T
Q  316 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 415  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17719 aaatcaaaatagacaaatcgctcctaatttatctccttaattttactaaaataattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatt 17818  T
Q  416 tttaaatgttaacccgtgatgcaata-ttaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 514  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17819 tttaaatgttaacccgtgacataatatttaaccctagatttaacctaattttttcatgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 17918  T
Q  515 ttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    | ||||||||||| |||||||||    
T  17919 tcatctcttatttctaaatgtta 17941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 18224 - 18573
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||    
T  18224 ttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtttaattta 18323  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  18324 aataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaaccttagatt 18423  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18424 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacccgagacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactacatt 18523  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18524 aaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 18573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 374 - 528
Target Start/End: Original strand, 18521 - 18674
Alignment:
Q  374 attaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgt 473  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||    
T  18521 attaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacgt-attttttcgcgt 18619  T
Q  474 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  18620 gactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 18674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 17886 - 18041
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||    
T  17886 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatccttgatgcaatattaaccctagatttaacata--tttttcg 17983  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  17984 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgaaaaatgtcatctctaatttt 18041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Original strand, 18628 - 18674
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18628 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 18674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 55583 - 55063
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtatttttta-aaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatc 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55583 cttcgcacgagttgaataacgtattttttttaaaattcagctccgaaggaaaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtaaaaatc 55484  T
Q  116 aaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccg 215  Q
    |||  ||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||    
T  55483 aaagctgcgtaaaccaaaattttacaacacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaatataatattccttaaagttaatccg 55384  T
Q  216 aacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggg 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  55383 aacgcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggg 55284  T
Q  316 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 415  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55283 aaatcaaaataaacaaatcacacataatttttctccttaattttactaaacaaattatattaactctagatttaatttatgcaaaatgtcatatcttatt 55184  T
Q  416 tttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
    | |||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55183 tataaacgttaacccgtgacgcaata-taaccctagatttaacctaattttttcttgtgactttactatattaaccctagattgaatttatgcaaaatgt 55085  T
Q  516 tatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  55084 catctcttatttttaaatgtta 55063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 55118 - 54961
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55118 tatattaaccctagattgaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 55019  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  55018 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 54961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 498
Target Start/End: Original strand, 26044 - 26528
Alignment:
Q  16 acttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatc 115  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26044 acttcgcacggattaaataacgtattttttaaaaatttagttccgaatgagaaatcttataaattatggaaaattgttgtcttttatcaatgtgaaaatc 26143  T
Q  116 aaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccg 215  Q
    |||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26144 aaaactgcgtaaactaaaattttacaacacagagcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccg 26243  T
Q  216 aacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  26244 aacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggg 26343  T
Q  316 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttact-aaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttat 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  26344 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaattttattaaaaaaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatattatctcttat 26443  T
Q  415 ttttaaatgttaacccgtgatgcaata-ttaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatt 498  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26444 ttttaaatgttaacccgtgacgcaatatttaaccctagatttaacctaattttttcatgtgactttactatattaaccctagatt 26528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 378 - 528
Target Start/End: Original strand, 27161 - 27310
Alignment:
Q  378 accctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgact 477  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  27161 accctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatccttgatgcaatattaaccctagatttaacat-attttttcgcgtgact 27259  T
Q  478 ttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27260 ttactatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 27310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 26400 - 26455
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26400 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatattatctcttatttttaaatgtta 26455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 489 - 537
Target Start/End: Original strand, 27161 - 27209
Alignment:
Q  489 accctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27161 accctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 27209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Original strand, 27264 - 27310
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27264 tatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 27310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 15016 - 14516
Alignment:
Q  36 cgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcataaaccaaaat 135  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15016 cgtacttttttaaaatttagcttcgaagaagaaatcttataaattacgaaaaattatttacctttataaatgtgaaaatcaaagttgcgtaaaccaaaat 14917  T
Q  136 tttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctag 235  Q
    ||  |||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||    
T  14916 ttcacaacacatagcctatagcactacataaaaaataacataacaactattgttatctcttattccttaaagttaacccaaacgtaaaaattttccctag 14817  T
Q  236 atttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcg 335  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14816 atttaagctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcg 14717  T
Q  336 ctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgat 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  14716 ctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattacccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataaacgttaacccgtgac 14617  T
Q  436 gcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgt 535  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14616 gcaatattaaccctatatttaacct-tttttttcgtgtgactttattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgt 14518  T
Q  536 ta 537  Q
    ||    
T  14517 ta 14516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 202 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 3849 - 3519
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaac 301  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||    
T  3849 ttaaggttaacccgaacgcaaaatttttccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctgtttaatttaaacaaaatgttaac 3750  T
Q  302 gttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaa 401  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3749 gttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctgtttaattttactaaacaa-ttatattaaccctagatttaatttatgcaaaa 3651  T
Q  402 tgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaa 501  Q
    || |||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  3650 tggcatctcttatttctaaatgttaacatgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaatccttgatttaa 3551  T
Q  502 tttatgcaaaatgttatctcttatttttaaat 533  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3550 tttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaat 3519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 202 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 11589 - 11281
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaac 301  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||    
T  11589 ttaaggttaacccgaacgcaaaatttttccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctgtttaatttaaacaaaatgttaac 11490  T
Q  302 gttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaa 401  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11489 gttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctgtttaattttactaaac-aattatattaaccctagatttaatttatgcaaaa 11391  T
Q  402 tgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaa 501  Q
    || |||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11390 tggcatctcttatttctaaatgttaacatgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaa 11291  T
Q  502 tttatgcaaa 511  Q
    ||||||||||    
T  11290 tttatgcaaa 11281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 369 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 14573 - 14415
Alignment:
Q  369 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttttt 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14573 attatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacgtgtgacgcaatattaaccctatatttaacctaatttttt 14474  T
Q  469 cgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttattt 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  14473 cgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcgaactgtcatctcttattt 14415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 3570 - 3414
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| | |||| ||||    
T  3570 tatattaatccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatattaacccatgacgcaatattaactctagatttaacat-atttcttcg 3472  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  3471 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 3414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 418 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 4145 - 4036
Alignment:
Q  418 taaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtta 517  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4145 taaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaaccta-ttttttcgaatgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtta 4047  T
Q  518 tctcttatttt 528  Q
    || || |||||    
T  4046 tcgctaatttt 4036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 418 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 11885 - 11776
Alignment:
Q  418 taaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtta 517  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11885 taaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaaccta-ttttttcgaatgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtta 11787  T
Q  518 tctcttatttt 528  Q
    || || |||||    
T  11786 tcgctaatttt 11776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 3681 - 3626
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  3681 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatggcatctcttatttctaaatgtta 3626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 11421 - 11366
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  11421 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatggcatctcttatttctaaatgtta 11366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 4082 - 4036
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  4082 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatcgctaatttt 4036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 11822 - 11776
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  11822 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatcgctaatttt 11776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 11251 - 10726
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  11251 gcacgggttgaataacgtatttttttaaaatttagttttgaaggagaaatcttataaattacagaaaattgttgtcatttataaatgtgaaaatcaaagc 11152  T
Q  121 tgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgc 220  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  11151 tgcgtaaaccaaaaatttgcaacacagagtctaaagcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagc 11052  T
Q  221 aaaattttgccctagatttaacataacatcttt--------------gcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaa 306  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| | |||              |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  11051 aaaatttttccctagatttaacctaacttatttaacctaacttatttgcttaattttactgcattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttag 10952  T
Q  307 ttgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtca 406  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  10951 ttgttagggaaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctctttaattttattaaacatattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgaca 10853  T
Q  407 tctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttat 506  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10852 tatcttatttctaaatgttaacctgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaacccttgatttaatttat 10753  T
Q  507 gcaaaatgttatctcttatttttaaat 533  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  10752 gcaaaatgtcatctcttatttctaaat 10726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 10328 - 9979
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||              ||    
T  10328 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacattgtttaattta 10229  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10228 atcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatt 10129  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10128 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacctatgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatact 10029  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10028 aaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 9979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 10777 - 10611
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10777 tatattaacccttgatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaattttaacccctgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcg 10678  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  10677 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataactgtta 10611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 10666 - 10511
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |    
T  10666 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataactgttaacccgtgatgcaatataaaccctagatttaaccta--ttttttg 10569  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  10568 cgtgactttactttattaaccctagatttaatttatgcaaaaagtcatctctaatttt 10511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 371 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 10034 - 9892
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10034 tatactaaccctagattgaatttaagcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-attttttcg 9936  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg 514  Q
     |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  9935 cgtgactttactatagtaactctagatttaatttatgcaaaatg 9892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 10888 - 10833
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||    
T  10888 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgacatatcttatttctaaatgtta 10833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 9)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 40 - 537
Target Start/End: Original strand, 2886 - 3380
Alignment:
Q  40 ttttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcataaaccaaaattttg 139  Q
    |||||| ||||||||| |  ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  2886 tttttttaaaatttagctctgaaagaaaaatcttataaattacagaaaattgttgtcttttataaatgtgaaaatcaaagctgcgtaaatcaaaattttg 2985  T
Q  140 caacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagattt 239  Q
    |||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2986 caacacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctaaattt 3085  T
Q  240 aacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcc 339  Q
    ||| |||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3086 aacctaatttctatgcttaattttattgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgctacggaaatcaaaataaacaaatcgctcc 3185  T
Q  340 taatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt-tttaaatgttaacccgtgatgca 438  Q
    |||||||| |||    |||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||  ||||||||||| |||    
T  3186 taatttttatcc----ttttactaaaaaaattatattattcctagatttaatttatacaaaatgtcatctcttattaataaaacattaacccgtgacgca 3281  T
Q  439 atattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  3282 atattaaccctagatttaacctaatttttttgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatttcatctcctatttttaaatgtta 3380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 203 - 533
Target Start/End: Original strand, 3773 - 4117
Alignment:
Q  203 taaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------atttaa 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||              ||||||    
T  3773 taaagttaacccgaacgcaaaattttgtgctagatttaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattaaccctgtttaatttaa 3872  T
Q  289 tcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatattt 388  Q
    || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3873 tcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctttttatttttattaaacaaattatattaaccctagattt 3972  T
Q  389 aatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatta 488  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3973 aatttatgcaaaatggcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattagccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatta 4072  T
Q  489 accctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaat 533  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  4073 accctagatttaatttatgaaaaatgtcatctcttatttctaaat 4117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 302 - 533
Target Start/End: Original strand, 10335 - 10566
Alignment:
Q  302 gttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaa 401  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10335 gttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaa 10434  T
Q  402 tgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaa 501  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10435 tggcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaa 10534  T
Q  502 tttatgcaaaatgttatctcttatttttaaat 533  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  10535 tttatgaaaaatgtcatctcttatttctaaat 10566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 3436 - 3592
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  3436 tatattaaccatagatttaatttatgcaaactgtcatctcttacttctaaatgttaacccgtgacgcaatattatccctagatttaacct-attttttcg 3534  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3535 cgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 3592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 3325 - 3491
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||| | || | ||||||||||||||||||    
T  3325 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatttcatctcctatttttaaatgttaaccagtgacggaatattatctctaggtttaacctaattttttcg 3424  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||    
T  3425 tgtgacttttctatattaaccatagatttaatttatgcaaactgtcatctcttacttctaaatgtta 3491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 4066 - 4222
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||     
T  4066 tatattaaccctagatttaatttatgaaaaatgtcatctcttatttctaaatattaacccgtgacgcaatattaactctagatttaacct-attttttca 4164  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  4165 cgtgactttactatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 4222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 10515 - 10671
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||     
T  10515 tatattaaccctagatttaatttatgaaaaatgtcatctcttatttctaaatattaacccgtgacgcaatattaactctagatttaacct-attttttca 10613  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  10614 cgtgactttactatattaatcctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 10671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 3955 - 4010
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  3955 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatggcatctcttatttctaaatgtta 4010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Original strand, 10404 - 10459
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  10404 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatggcatctcttatttctaaatgtta 10459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 7)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 18 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 139597 - 139159
Alignment:
Q  18 ttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaa 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139597 ttcgcacgggttgaattacgtatttttttaaaatttaattttgaaggagaaatcttataaattacagaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaa 139498  T
Q  118 aattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccgaa 217  Q
    |  ||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  139497 agctgcgtaaaccaaaattttgtaacacagagcctaaaacactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaa 139398  T
Q  218 cgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaa 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||              ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  139397 cgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgcttaattttac--------------ttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaa 139312  T
Q  318 atcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  139311 atcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg-catctcttattta 139213  T
Q  418 taaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgt 471  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  139212 taaacgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgt 139159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 48 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 233216 - 232700
Alignment:
Q  48 aaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgcataaaccaaaattttgcaacgcag 147  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  233216 aaatttagtttcgaagaagacatcttataaattttagaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaagctgcttaaaccaaaattttgcaacacag 233117  T
Q  148 agtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaa---------tatcttattctt---taaagttaacccgaacgcaaaattttgccctag 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||          ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  233116 agtctaaagcactacataaaaaataacataacaactattatatatcttatcttatcttattattccttaaagttaacccgaacgcaaaaattttctctag 233017  T
Q  236 atttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatt--------------taatttaatcgaaa-tgttaacgttaattgtttgggaaatc 320  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||              |||||||||| ||| |||||| |||||||||| | ||||||    
T  233016 atttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctattaaattatccctatttaatttaatcaaaaatgttaatgttaattgttagagaaatc 232917  T
Q  321 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  232916 aaaataaacaaatcgctcctaatttttctccataattctactaaacaaattaaattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttataa 232817  T
Q  421 atgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatct 520  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  232816 acattaacccgtgacgcaatattaacactagatttaacctaattttttcatgtgactttactatattaaacctagatttaatttatgcaaaatgtcatct 232717  T
Q  521 cttatttttaaatgtta 537  Q
    ||||||| |||||||||    
T  232716 cttatttctaaatgtta 232700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 232416 - 232067
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt--------------ta 287  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||              ||    
T  232416 ttaaagtaaacctgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttccttgcttaatttgactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 232317  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  232316 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaaatttactaaacaaattatattaacctttgatt 232217  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  232216 taatttatgcaaaatgacatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcatgtgactttacaatagt 232117  T
Q  488 aaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  232116 aaccctagatttaatttatgcaaaatatcatctcttatttctaaatgtta 232067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 232755 - 232599
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  232755 tatattaaacctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctggatttaacct-attttttcg 232657  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  232656 cgtgactttactatattaaccataaatttaatttatgcaaaatctcatctctaatttt 232599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 376 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 232117 - 231966
Alignment:
Q  376 taaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtga 475  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||| | ||||||| | ||||    
T  232117 taaccctagatttaatttatgcaaaatatcatctcttatttctaaatgttaaccctttatgcaatattaaccatagatttaacgt-attttttagcgtga 232019  T
Q  476 ctttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  232018 ctttactatattaaccatagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 231966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 482 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 139258 - 139204
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  139258 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatg-catctcttatttataaacgtta 139204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 232012 - 231966
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  232012 tatattaaccatagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 231966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 3)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14671 - 14328
Alignment:
Q  17 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14671 cttcgcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagttccgaaggagaaatcttataaattacgaaaaattgttgtcctttatgaatgtgaaaatca 14572  T
Q  117 aaattgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattctttaaagttaacccga 216  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||| ||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14571 aaactgcgtaaaccaaaattttacaacacagtgcctaaaacactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccga 14472  T
Q  217 acgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttggga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14471 acgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttacagtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggga 14372  T
Q  317 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaatttta 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14371 aatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatttta 14328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 431 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 13822 - 13726
Alignment:
Q  431 gtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  13822 gtgacgcaatattaaccctagatttaacgta-ttttttcgcgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 13726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 13772 - 13726
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13772 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 13726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 8)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 227 - 515
Target Start/End: Original strand, 8819 - 9118
Alignment:
Q  227 ttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaata 326  Q
    ||||||||||||| || |||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  8819 ttgccctagatttgacctaatttctttgcataattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagagaaatcaaaata 8918  T
Q  327 aacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtc-----------atctcttatt 415  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||    
T  8919 aacaaatcactcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttattaatctcttatt 9018  T
Q  416 tttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 515  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9019 tataaatgttaacccgtgacccaatattaaccctagatttaacctaatttttttgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgt 9118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 202 - 537
Target Start/End: Original strand, 9531 - 9886
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattta--------------attta 287  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| |||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||              |||||    
T  9531 ttaaagttaacctgaatgcaaaaattttcccaggatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattatccatgtttaattta 9630  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttactaaacaaattatattaaccctatatt 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||    
T  9631 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaaaataaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttactaaacaaattataatagccttagatt 9730  T
Q  388 taatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactata-- 485  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  9731 taatttatgcaaaatggcatctcttatttctaaatgttaacaagtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttactatatt 9830  T
Q  486 ----ttaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  9831 aaccttaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 9886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 375 - 528
Target Start/End: Original strand, 9835 - 9988
Alignment:
Q  375 ttaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtg 474  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  9835 ttaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttttcgcgtg 9934  T
Q  475 actttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  9935 actttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 9988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 371 - 537
Target Start/End: Original strand, 9085 - 9244
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9085 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcat-------ttttaaatgttagctcgtgacgcaatataaaccctagatttaacctaattttttcg 9177  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  9178 tgtgacattactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 9244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 371 - 528
Target Start/End: Original strand, 9189 - 9348
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  9189 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttaatctgtgacgcaatattaaccctagatttaacct-atttttttg 9287  T
Q  471 tgtgactttacta---tattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  9288 cgtgactttactatattattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 9348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 123
Target Start/End: Original strand, 8778 - 8822
Alignment:
Q  79 ttacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaattgc 123  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8778 ttacagaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaagttgc 8822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 482 - 526
Target Start/End: Original strand, 8963 - 9007
Alignment:
Q  482 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatt 526  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8963 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatt 9007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Original strand, 9942 - 9988
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9942 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcagctctaatttt 9988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0759 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0759
Description:

Target: scaffold0759; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Original strand, 3446 - 3617
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaa-tttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtgaaaatcaaaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  3446 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaaatttagctccgaaggagaaatcttataaattacgaaaaattgttgttctttataaatgtgaaaatcaaag 3545  T
Q  120 ttgcataaaccaaaattttgcaacgcagagtctaaagcacttcataaaaaataacataacaactattgtaat 191  Q
     ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3546 ctgcgtaaaccaaaattttgcaacacagagcctaaagcactacataaaaaataacataacaactattgtaat 3617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 106; Significance: 9e-53; HSPs: 8)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 369 - 537
Target Start/End: Original strand, 86518 - 86684
Alignment:
Q  369 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttttt 468  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  86518 attatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtcatct--tatttctaaatgttaactcgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattttgt 86615  T
Q  469 cgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  86616 tgcgtgactttactatattaaccctagatttaatttatacaaaatgacatctcttatttctaaatgtta 86684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 372 - 528
Target Start/End: Original strand, 87036 - 87192
Alignment:
Q  372 atattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgt 471  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||      
T  87036 atattaaccttagatttactttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgttagcccgtgacgcaatattaaccctagatttaacctaattctttcac 87135  T
Q  472 gtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  87136 gtgactttactatattaaccatagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 87192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 401 - 537
Target Start/End: Original strand, 86954 - 87090
Alignment:
Q  401 atgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagattta 500  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  86954 atgtcatttcttatttctaaatgttaacccgtgacgcaatactaaccctagatttaacctaattttttcgtgtgactttacgatattaaccttagattta 87053  T
Q  501 atttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  87054 ctttatgcaaaatgtcatctcttatttctaaatgtta 87090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 369 - 528
Target Start/End: Original strand, 86736 - 86894
Alignment:
Q  369 attatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaatttttt 468  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  86736 attatattaaccatagatttaatttatgcaaagtgtcatctcttaattctaa-tgttaacccatgacgcaatattaactctagatttaacctaatttttt 86834  T
Q  469 cgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  86835 tgcgtgactttactatattaaccctagatttaatctatgcaaaatgtcatctcttctttt 86894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 371 - 524
Target Start/End: Original strand, 86629 - 86780
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttttaaatgttaacccgtgatgcaatattaaccctcgatttaacctaattttttcg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||     
T  86629 tatattaaccctagatttaatttatacaaaatgacatctcttatttctaaatgttaa-ccgtgacgcaatattaactctagatttaacctaa-tttttct 86726  T
Q  471 tgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctctta 524  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  86727 cgtgactttattatattaaccatagatttaatttatgcaaagtgtcatctctta 86780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 451 - 537
Target Start/End: Original strand, 86489 - 86573
Alignment:
Q  451 gatttaacctaattttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttttaaatgtta 537  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||    
T  86489 gatttaacctaattttttcgcgtgactttattatattaaccttagatttaatttatgcaaaatgtca--tcttatttctaaatgtta 86573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Original strand, 87146 - 87192
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  87146 tatattaaccatagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 87192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 242
Target Start/End: Original strand, 86893 - 86940
Alignment:
Q  195 ttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaac 242  Q
    |||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  86893 ttattccttaaaggttacccgaacacaaaattttgccctagatttaac 86940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2127 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold2127
Description:

Target: scaffold2127; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 202 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 809 - 637
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctattt--------------aattta 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||              ||||||    
T  809 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtttaattta 710  T
Q  288 atcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaatttta 360  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  709 atcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaatataaacaaatcgctcctaatttttctctttaatttta 637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2127; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 462 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 1057 - 991
Alignment:
Q  462 attttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgttatctcttatttt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1057 attttttcgtgtgactttactatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2127; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 371 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 1037 - 991
Alignment:
Q  371 tatattaaccctatatttaatttatgcaaaatgtcatctcttatttt 417  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1037 tatattaaccctagatttaatttatgcaaaatgtcatctctaatttt 991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 109
Target Start/End: Original strand, 4207 - 4295
Alignment:
Q  21 gcacgggttgaataacgtattttttaaaaatttagtttcgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtg 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4207 gcacgggttgtataacgtatttttttaaaatttaattctgaaggagaaatcttataaattacggaaaattgttgtcctttataaatgtg 4295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0368 (Bit Score: 61; Significance: 7e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0368
Description:

Target: scaffold0368; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 233 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 790 - 670
Alignment:
Q  233 tagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaacgttaattgtttgggaaatcaaaataaacaaa 332  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||      |||||  |||||||||| |||||||     
T  790 tagatttaacttaacttctttgctgaattttactatattaaccntatttaatttaatcaaaatgttaa------ttgttatggaaatcaaagtaaacaat 697  T
Q  333 tcgctcctaatttttctccttaatttt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  696 tcgctcctaatttttctccttaatttt 670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0432 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0432
Description:

Target: scaffold0432; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 5610 - 5518
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatt 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |   || |||||||||||||||||  | |||||||||    
T  5610 tcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaatattgccctagatttaacctaactttaatgattaattttactgtattacccatatttaatt 5518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0432; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5669 - 5621
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaa 241  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5669 tcttattccttaaagttaactcgaacgcaaaatgttgccctagatttaa 5621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 201011 - 200914
Alignment:
Q  205 aagttaacccgaacgcaaaattttgccctagattt--aacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatttaatcgaaatgttaa 300  Q
    ||||||||||| | |||| ||||| ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  201011 aagttaacccgtaagcaatattttaccctaaatttttaacttaatttctttgcttaattttactatattaaccctatttaatttattcaaaatgttaa 200914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 8)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 182 - 105
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctat 279  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  182 ttaaagttaacccgtcagcaatattttgccctagatttaccataatttctctgcttaattttactatattaaccctat 105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 302 - 213
Alignment:
Q  190 atatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctat 279  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||| | |||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  302 atatcttattacttaaaattaacccgtacgcaatattttgccatagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4502 - 4425
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctat 279  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  4502 ttaaagttaacccgtcagcaatattttgccctagatttaccataatttctctgcttaattttactatattaaccctat 4425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4622 - 4533
Alignment:
Q  190 atatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctat 279  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||| | |||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  4622 atatcttattacttaaaattaacccgtacgcaatattttgccatagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 4533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4303 - 4217
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctat 279  Q
    |||||||  ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||| | |||  ||| || ||||||||||| |||||| |||||    
T  4303 tcttattacttaaaattaacccgtacgcaatattttgccatagatttaccctaatttctctgtttaattttactatattaaccctat 4217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4407 - 4317
Alignment:
Q  190 atatcttattct-ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctat 279  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  4407 atatcttattatcttaaagttaacccgtaaccaatatttttccctagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 4317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4095 - 4014
Alignment:
Q  193 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaat 274  Q
    |||||||  |||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||| ||| |||||||    
T  4095 tcttattacttaaagttaacctgtaagcaatattttgccctagatttaccttaatttctctgcttaatttaactatattaat 4014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 190 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 87 - 3
Alignment:
Q  190 atatcttattct-ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaa 273  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||| ||||||    
T  87 atatcttattatcttaaagttaacccgtaaccaatatttttccctagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaa 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 10)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 218 - 141
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctat 279  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  218 ttaaagttaacccgtcagcaatattttgccctagatttaccataatttctctgcttaattttactatattaaccctat 141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 338 - 249
Alignment:
Q  190 atatcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctat 279  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||| | |||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  338 atatcttattacttaaaattaacccgtacgcaatattttgccatagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 279
Target Start/End: Original strand, 21938 - 22015
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctat 279  Q
    |||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  21938 ttaaagttaacctgtaagcaatattttgccctagatttaccataatttctctgcttaattttactatattaaccctat 22015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 273
Target Start/End: Original strand, 20675 - 20746
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaa 273  Q
    |||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||| ||||||    
T  20675 ttaaagttaacctgtaagcaatattttgccctagatttaccataatttctctgcttaattttactatattaa 20746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 279
Target Start/End: Original strand, 21522 - 21599
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctat 279  Q
    |||||||||||  | | |||| ||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  21522 ttaaagttaacatgtaagcaatattttgccctagatttaccataatttctctgcttaattttactatattaaccctat 21599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 123 - 33
Alignment:
Q  190 atatcttattct-ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatcctat 279  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  123 atatcttattatcttaaagttaacccgtaaccaatatttttccctagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 33  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 275
Target Start/End: Original strand, 22450 - 22523
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaatc 275  Q
    |||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22450 ttaaagttaacctgttagcaatattttgccctagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaatc 22523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 209 - 273
Target Start/End: Original strand, 21103 - 21167
Alignment:
Q  209 taacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaa 273  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||   |||  ||| |||||||||||||| ||||||    
T  21103 taacccgtacgcaatattttgccctagatttactctaatttctctgcttaattttactatattaa 21167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 202 - 262
Target Start/End: Original strand, 21314 - 21374
Alignment:
Q  202 ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattt 262  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  21314 ttaaagttaacccgtaagcaatattttgccctagatttaccttaatttctctgcttaattt 21374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 190 - 273
Target Start/End: Original strand, 22141 - 22225
Alignment:
Q  190 atatcttattct-ttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacatctttgcttaattttactgtattaa 273  Q
    |||||||||| | |||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||| |||  | | ||||||||| |||| ||||||    
T  22141 atatcttattatcttaaagttaacctgtaagcaatattttgccctagatttaacctaatttatctgcttaattatactatattaa 22225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University