View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1199_high_140 (Length: 284)

Name: NF1199_high_140
Description: NF1199
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1199_high_140
NF1199_high_140
[»] chr4 (83 HSPs)
chr4 (13-284)||(6405034-6405305)
chr4 (17-280)||(13792245-13792504)
chr4 (15-280)||(8841771-8842037)
chr4 (17-265)||(10422387-10422634)
chr4 (17-265)||(16630137-16630384)
chr4 (17-265)||(15670684-15670931)
chr4 (17-280)||(17420512-17420776)
chr4 (17-280)||(521406-521672)
chr4 (17-238)||(13401997-13402219)
chr4 (17-238)||(4837210-4837432)
chr4 (17-256)||(16250059-16250297)
chr4 (17-256)||(17827208-17827447)
chr4 (17-256)||(17836599-17836838)
chr4 (22-238)||(16397879-16398095)
chr4 (17-234)||(2830620-2830837)
chr4 (17-234)||(5292121-5292338)
chr4 (17-234)||(5301780-5301997)
chr4 (17-238)||(16059000-16059222)
chr4 (17-234)||(17144363-17144581)
chr4 (17-234)||(21846920-21847137)
chr4 (17-234)||(21856512-21856729)
chr4 (17-234)||(21902783-21903000)
chr4 (17-234)||(21912375-21912592)
chr4 (17-234)||(27679786-27680003)
chr4 (17-234)||(27689441-27689658)
chr4 (17-264)||(16253841-16254087)
chr4 (17-256)||(17984082-17984320)
chr4 (17-256)||(18104632-18104870)
chr4 (17-256)||(40922456-40922694)
chr4 (17-234)||(3486660-3486877)
chr4 (17-234)||(3495983-3496200)
chr4 (17-234)||(17162223-17162441)
chr4 (17-256)||(6692831-6693069)
chr4 (17-256)||(6703237-6703475)
chr4 (22-244)||(30652296-30652513)
chr4 (22-234)||(44889653-44889865)
chr4 (17-280)||(26459006-26459271)
chr4 (22-238)||(41526930-41527145)
chr4 (17-250)||(7845950-7846184)
chr4 (17-217)||(518900-519101)
chr4 (17-238)||(53945322-53945543)
chr4 (12-265)||(14599862-14600117)
chr4 (17-238)||(16210183-16210404)
chr4 (88-280)||(11477491-11477684)
chr4 (156-262)||(44889538-44889643)
chr4 (156-280)||(2830226-2830346)
chr4 (156-238)||(2830528-2830610)
chr4 (156-234)||(4837438-4837516)
chr4 (156-280)||(41526804-41526924)
chr4 (156-238)||(16058912-16058994)
chr4 (156-238)||(30652214-30652296)
chr4 (156-234)||(2830444-2830522)
chr4 (203-280)||(15622214-15622292)
chr4 (156-234)||(17162135-17162213)
chr4 (156-256)||(3486983-3487083)
chr4 (156-256)||(3496306-3496406)
chr4 (156-256)||(5292444-5292544)
chr4 (156-256)||(5302103-5302203)
chr4 (156-256)||(21846714-21846814)
chr4 (156-256)||(21856306-21856406)
chr4 (156-256)||(21902577-21902677)
chr4 (156-256)||(21912169-21912269)
chr4 (156-256)||(27680109-27680209)
chr4 (156-256)||(27689764-27689864)
chr4 (156-242)||(3486890-3486977)
chr4 (156-242)||(3496213-3496300)
chr4 (156-280)||(13402225-13402345)
chr4 (156-280)||(16210410-16210530)
chr4 (156-280)||(53945549-53945669)
chr4 (156-238)||(2830352-2830434)
chr4 (156-238)||(4837526-4837608)
chr4 (156-234)||(17144275-17144353)
chr4 (17-74)||(7843070-7843127)
chr4 (156-242)||(5292351-5292438)
chr4 (156-242)||(5302010-5302097)
chr4 (156-280)||(16397677-16397797)
chr4 (156-242)||(21846820-21846907)
chr4 (156-242)||(21856412-21856499)
chr4 (156-242)||(21902683-21902770)
chr4 (156-242)||(21912275-21912362)
chr4 (156-242)||(27680016-27680103)
chr4 (156-242)||(27689671-27689758)
chr4 (17-81)||(16081490-16081554)
[»] chr7 (67 HSPs)
chr7 (20-280)||(15987878-15988139)
chr7 (17-280)||(9007533-9007796)
chr7 (17-265)||(9534449-9534695)
chr7 (17-265)||(9544732-9544978)
chr7 (17-280)||(14247712-14247976)
chr7 (17-280)||(5614663-5614930)
chr7 (17-234)||(24539675-24539893)
chr7 (17-265)||(19586351-19586598)
chr7 (22-234)||(27989727-27989940)
chr7 (17-280)||(13284917-13285180)
chr7 (16-280)||(12770675-12770935)
chr7 (17-251)||(15374321-15374556)
chr7 (20-265)||(42621696-42621940)
chr7 (17-267)||(41028199-41028451)
chr7 (17-256)||(11625575-11625813)
chr7 (17-234)||(43984294-43984511)
chr7 (17-256)||(5381023-5381261)
chr7 (17-256)||(5390661-5390899)
chr7 (17-256)||(5927748-5927986)
chr7 (17-256)||(8501662-8501900)
chr7 (17-256)||(8512132-8512370)
chr7 (17-256)||(16131125-16131363)
chr7 (17-256)||(16141674-16141912)
chr7 (17-256)||(26304168-26304406)
chr7 (17-256)||(26362412-26362650)
chr7 (17-256)||(46497727-46497965)
chr7 (17-256)||(46508339-46508577)
chr7 (17-251)||(6535102-6535335)
chr7 (17-251)||(6545423-6545656)
chr7 (17-232)||(10416620-10416835)
chr7 (17-256)||(26307728-26307966)
chr7 (17-256)||(32098993-32099231)
chr7 (17-256)||(32109430-32109668)
chr7 (17-256)||(44897911-44898149)
chr7 (17-256)||(44908336-44908574)
chr7 (17-251)||(14946728-14946962)
chr7 (23-280)||(42595970-42596228)
chr7 (22-234)||(45554191-45554403)
chr7 (17-280)||(2991099-2991361)
chr7 (17-280)||(31825306-31825570)
chr7 (17-251)||(7018615-7018849)
chr7 (17-251)||(7033977-7034211)
chr7 (34-265)||(8340812-8341042)
chr7 (17-211)||(12826588-12826783)
chr7 (17-189)||(19800779-19800951)
chr7 (25-172)||(12574879-12575026)
chr7 (17-138)||(12088056-12088177)
chr7 (156-265)||(27989609-27989717)
chr7 (125-238)||(12515865-12515978)
chr7 (126-238)||(12492060-12492172)
chr7 (156-280)||(12515739-12515859)
chr7 (17-101)||(13130604-13130688)
chr7 (156-280)||(45553973-45554093)
chr7 (156-238)||(24539903-24539985)
chr7 (156-238)||(45554099-45554181)
chr7 (156-280)||(24539991-24540111)
chr7 (156-238)||(10416526-10416608)
chr7 (156-256)||(43984088-43984188)
chr7 (156-280)||(12491934-12492054)
chr7 (25-120)||(12516011-12516106)
chr7 (156-242)||(43984194-43984281)
chr7 (25-120)||(12492206-12492301)
chr7 (26-81)||(40703344-40703399)
chr7 (157-238)||(10416438-10416519)
chr7 (26-81)||(40703188-40703246)
chr7 (234-284)||(12826779-12826829)
chr7 (26-81)||(40703588-40703643)
[»] chr2 (62 HSPs)
chr2 (19-284)||(69303-69568)
chr2 (17-265)||(45191441-45191688)
chr2 (17-267)||(22908003-22908254)
chr2 (17-280)||(27159132-27159396)
chr2 (17-280)||(27169480-27169744)
chr2 (17-265)||(29423957-29424204)
chr2 (17-257)||(38929636-38929875)
chr2 (17-265)||(45015317-45015564)
chr2 (21-280)||(21109802-21110062)
chr2 (17-280)||(32935915-32936177)
chr2 (17-251)||(38956978-38957211)
chr2 (17-280)||(19342902-19343167)
chr2 (17-261)||(41026033-41026277)
chr2 (17-265)||(24695713-24695957)
chr2 (17-234)||(4459012-4459229)
chr2 (17-234)||(16901348-16901566)
chr2 (17-234)||(16994739-16994957)
chr2 (17-265)||(28450931-28451178)
chr2 (17-265)||(37862242-37862489)
chr2 (17-234)||(4468637-4468854)
chr2 (17-234)||(5345842-5346059)
chr2 (17-265)||(12571201-12571448)
chr2 (17-280)||(15474687-15474948)
chr2 (17-256)||(2997825-2998063)
chr2 (17-256)||(18651831-18652069)
chr2 (17-256)||(18663949-18664187)
chr2 (17-234)||(5335990-5336207)
chr2 (17-256)||(9501888-9502126)
chr2 (17-256)||(9513254-9513492)
chr2 (17-234)||(3604774-3604991)
chr2 (17-234)||(22678878-22679095)
chr2 (17-280)||(22902727-22902991)
chr2 (17-256)||(17489303-17489541)
chr2 (17-238)||(44637784-44638005)
chr2 (17-218)||(22671738-22671939)
chr2 (156-280)||(3605089-3605209)
chr2 (156-238)||(16901576-16901658)
chr2 (156-238)||(16994967-16995049)
chr2 (156-280)||(16901664-16901784)
chr2 (156-280)||(16995055-16995175)
chr2 (156-238)||(3605001-3605083)
chr2 (156-238)||(22679105-22679187)
chr2 (156-234)||(33432473-33432551)
chr2 (156-234)||(33432564-33432642)
chr2 (156-238)||(44638011-44638093)
chr2 (156-234)||(5336220-5336298)
chr2 (156-234)||(5346072-5346150)
chr2 (156-256)||(4458806-4458906)
chr2 (156-256)||(4468431-4468531)
chr2 (156-256)||(5336403-5336503)
chr2 (156-256)||(5346256-5346356)
chr2 (21-139)||(40408151-40408268)
chr2 (156-242)||(4458912-4458999)
chr2 (156-242)||(4468537-4468624)
chr2 (156-242)||(5346163-5346250)
chr2 (156-280)||(44638100-44638218)
chr2 (25-81)||(22146566-22146622)
chr2 (220-280)||(23730380-23730440)
chr2 (156-242)||(5336311-5336397)
chr2 (25-97)||(38461270-38461341)
chr2 (156-185)||(22679193-22679222)
chr2 (42-86)||(37488795-37488839)
[»] chr8 (32 HSPs)
chr8 (17-280)||(2689491-2689755)
chr8 (17-265)||(14893245-14893493)
chr8 (17-280)||(21986959-21987221)
chr8 (17-280)||(21996493-21996755)
chr8 (17-265)||(14880895-14881143)
chr8 (17-265)||(31998451-31998698)
chr8 (17-265)||(33773338-33773583)
chr8 (17-265)||(31990862-31991109)
chr8 (17-256)||(13675373-13675611)
chr8 (17-280)||(26361549-26361814)
chr8 (17-280)||(14438009-14438275)
chr8 (17-256)||(9324244-9324482)
chr8 (17-256)||(21202044-21202282)
chr8 (17-256)||(21212460-21212698)
chr8 (17-256)||(21334911-21335149)
chr8 (17-238)||(11429679-11429900)
chr8 (17-232)||(20530081-20530296)
chr8 (17-265)||(23014241-23014488)
chr8 (128-251)||(17269440-17269563)
chr8 (100-277)||(20852078-20852253)
chr8 (156-280)||(11429906-11430026)
chr8 (17-81)||(12900518-12900582)
chr8 (17-83)||(3988297-3988363)
chr8 (17-81)||(21461892-21461956)
chr8 (156-234)||(20530308-20530386)
chr8 (156-238)||(20530396-20530478)
chr8 (160-280)||(20530488-20530604)
chr8 (17-83)||(6760603-6760669)
chr8 (25-105)||(12840672-12840752)
chr8 (25-81)||(18537438-18537494)
chr8 (184-238)||(12840828-12840883)
chr8 (18-74)||(37817846-37817901)
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (13-280)||(27786713-27786979)
chr6 (22-244)||(22222697-22222920)
chr6 (22-244)||(22248532-22248755)
chr6 (17-267)||(8562512-8562763)
chr6 (17-280)||(34765943-34766209)
chr6 (12-280)||(15504029-15504292)
chr6 (17-257)||(20968454-20968693)
chr6 (17-234)||(1597792-1598010)
chr6 (17-265)||(17826456-17826703)
chr6 (17-265)||(29541050-29541297)
chr6 (17-256)||(18170486-18170724)
chr6 (22-244)||(9034041-9034262)
chr6 (17-234)||(18202181-18202398)
chr6 (17-234)||(26019620-26019837)
chr6 (17-256)||(3286459-3286697)
chr6 (17-256)||(12455666-12455904)
chr6 (17-256)||(16898559-16898797)
chr6 (17-256)||(18160674-18160912)
chr6 (17-256)||(20912895-20913133)
chr6 (17-256)||(24921208-24921446)
chr6 (17-256)||(24930244-24930482)
chr6 (17-280)||(24692400-24692662)
chr6 (17-234)||(30657090-30657307)
chr6 (17-256)||(14792215-14792453)
chr6 (17-256)||(16909212-16909450)
chr6 (17-256)||(31358174-31358412)
chr6 (17-256)||(31367904-31368142)
chr6 (17-238)||(790234-790455)
chr6 (17-237)||(16321953-16322173)
chr6 (17-237)||(16334101-16334321)
chr6 (17-250)||(26169034-26169266)
chr6 (17-251)||(18705535-18705768)
chr6 (17-251)||(18711470-18711703)
chr6 (121-266)||(18333317-18333463)
chr6 (17-172)||(19363764-19363920)
chr6 (16-266)||(28093230-28093475)
chr6 (168-280)||(19361485-19361598)
chr6 (126-234)||(7754043-7754151)
chr6 (156-280)||(26019935-26020055)
chr6 (156-280)||(30657317-30657437)
chr6 (156-238)||(1597700-1597782)
chr6 (156-238)||(18202089-18202171)
chr6 (156-280)||(9033833-9033953)
chr6 (156-280)||(18201962-18202083)
chr6 (156-238)||(22222920-22223002)
chr6 (156-238)||(22248755-22248837)
chr6 (155-238)||(790460-790543)
chr6 (156-280)||(1597574-1597694)
chr6 (17-96)||(12989069-12989148)
chr6 (156-244)||(9033953-9034041)
chr6 (17-124)||(18335659-18335765)
chr6 (156-238)||(26019847-26019929)
chr6 (28-238)||(6314708-6314917)
chr6 (17-83)||(7753934-7754000)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (17-244)||(36317070-36317298)
chr5 (17-265)||(4037384-4037631)
chr5 (17-280)||(20948439-20948703)
chr5 (17-280)||(20958808-20959072)
chr5 (17-265)||(22172657-22172904)
chr5 (13-280)||(23376165-23376432)
chr5 (17-265)||(27273586-27273833)
chr5 (17-265)||(37818202-37818450)
chr5 (17-280)||(18208667-18208929)
chr5 (17-280)||(18218005-18218267)
chr5 (17-265)||(13571084-13571332)
chr5 (17-265)||(31917416-31917663)
chr5 (17-267)||(19547653-19547904)
chr5 (17-234)||(37537625-37537843)
chr5 (17-265)||(34129894-34130141)
chr5 (17-280)||(21682776-21683038)
chr5 (17-256)||(30942694-30942933)
chr5 (17-256)||(30952116-30952355)
chr5 (17-265)||(37298219-37298466)
chr5 (17-277)||(20897548-20897808)
chr5 (17-234)||(19887093-19887310)
chr5 (17-234)||(21754169-21754386)
chr5 (17-234)||(21763456-21763673)
chr5 (17-234)||(37646736-37646954)
chr5 (12-256)||(27412761-27413004)
chr5 (17-241)||(32071067-32071291)
chr5 (13-256)||(8764571-8764813)
chr5 (17-256)||(18390847-18391085)
chr5 (17-256)||(26191233-26191471)
chr5 (17-256)||(33939933-33940171)
chr5 (17-256)||(33950333-33950571)
chr5 (17-265)||(11410319-11410566)
chr5 (17-256)||(18361890-18362128)
chr5 (17-256)||(26201815-26202053)
chr5 (17-265)||(204871-205118)
chr5 (17-265)||(19781207-19781454)
chr5 (17-223)||(27578561-27578766)
chr5 (17-265)||(20807841-20808088)
chr5 (27-265)||(42089922-42090158)
chr5 (30-234)||(22245245-22245449)
chr5 (156-265)||(36316965-36317070)
chr5 (156-280)||(37537941-37538061)
chr5 (156-280)||(37647052-37647172)
chr5 (156-238)||(37537853-37537935)
chr5 (156-238)||(37646964-37647046)
chr5 (156-280)||(19887408-19887528)
chr5 (156-234)||(22245157-22245235)
chr5 (156-238)||(19887320-19887402)
chr5 (17-98)||(20904028-20904109)
chr5 (156-256)||(21754056-21754156)
chr5 (156-256)||(21763343-21763443)
chr5 (203-280)||(20904114-20904188)
[»] chr3 (56 HSPs)
chr3 (17-280)||(11459727-11459990)
chr3 (17-238)||(25433739-25433961)
chr3 (17-234)||(2488085-2488303)
chr3 (17-265)||(19827443-19827691)
chr3 (17-280)||(24872435-24872699)
chr3 (17-265)||(11201-11448)
chr3 (17-280)||(49386591-49386858)
chr3 (17-265)||(10507882-10508130)
chr3 (17-256)||(1684465-1684703)
chr3 (17-251)||(12386850-12387085)
chr3 (17-234)||(13118654-13118872)
chr3 (17-251)||(20492648-20492882)
chr3 (17-234)||(4372174-4372391)
chr3 (17-234)||(4381915-4382132)
chr3 (17-234)||(4781659-4781876)
chr3 (17-256)||(5654840-5655078)
chr3 (17-256)||(8973459-8973697)
chr3 (17-256)||(8984014-8984252)
chr3 (17-256)||(9537748-9537986)
chr3 (17-256)||(9548074-9548312)
chr3 (17-256)||(16334630-16334868)
chr3 (17-234)||(20743921-20744138)
chr3 (17-265)||(20293650-20293897)
chr3 (17-251)||(4023341-4023574)
chr3 (17-268)||(14801638-14801891)
chr3 (19-256)||(6433347-6433583)
chr3 (17-256)||(6422920-6423158)
chr3 (17-238)||(51977698-51977919)
chr3 (70-280)||(24794025-24794236)
chr3 (52-280)||(17734725-17734955)
chr3 (52-280)||(19035994-19036224)
chr3 (17-238)||(23503078-23503295)
chr3 (17-170)||(10002639-10002792)
chr3 (17-142)||(10507068-10507193)
chr3 (156-238)||(51977925-51978007)
chr3 (156-280)||(4781974-4782094)
chr3 (156-238)||(2488313-2488395)
chr3 (156-238)||(13118882-13118964)
chr3 (156-238)||(20744148-20744230)
chr3 (156-280)||(2488401-2488521)
chr3 (156-280)||(20744236-20744356)
chr3 (17-121)||(38817174-38817279)
chr3 (172-251)||(10011576-10011654)
chr3 (156-280)||(25433613-25433733)
chr3 (156-256)||(4371968-4372068)
chr3 (156-256)||(4381709-4381809)
chr3 (156-280)||(51978013-51978133)
chr3 (156-238)||(4781886-4781968)
chr3 (17-83)||(24773550-24773616)
chr3 (156-242)||(4372074-4372161)
chr3 (156-242)||(4381815-4381902)
chr3 (156-280)||(13118970-13119090)
chr3 (17-81)||(683023-683087)
chr3 (13-81)||(11043918-11043986)
chr3 (17-83)||(13430732-13430798)
chr3 (17-63)||(24814638-24814684)
[»] scaffold0811 (3 HSPs)
scaffold0811 (17-238)||(2522-2743)
scaffold0811 (156-280)||(2837-2958)
scaffold0811 (156-238)||(2749-2831)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (17-265)||(57-304)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (17-265)||(27066684-27066931)
chr1 (17-267)||(52948908-52949159)
chr1 (17-280)||(1973895-1974159)
chr1 (17-280)||(1988682-1988946)
chr1 (17-265)||(20315035-20315282)
chr1 (18-265)||(2117459-2117705)
chr1 (17-280)||(34823557-34823819)
chr1 (12-259)||(2369627-2369874)
chr1 (17-232)||(26192298-26192514)
chr1 (17-265)||(18096129-18096377)
chr1 (17-238)||(37012982-37013203)
chr1 (17-265)||(42034818-42035065)
chr1 (17-257)||(30548835-30549074)
chr1 (17-234)||(20327383-20327600)
chr1 (17-256)||(16155496-16155734)
chr1 (17-256)||(21459241-21459479)
chr1 (12-237)||(4951061-4951286)
chr1 (17-251)||(8540878-8541112)
chr1 (17-251)||(8606117-8606351)
chr1 (17-256)||(25020081-25020319)
chr1 (22-265)||(25043823-25044065)
chr1 (17-234)||(20316901-20317118)
chr1 (17-238)||(25822374-25822595)
chr1 (17-234)||(41543039-41543256)
chr1 (17-237)||(22961535-22961755)
chr1 (22-265)||(25038611-25038853)
chr1 (17-238)||(49336379-49336600)
chr1 (17-234)||(19747449-19747666)
chr1 (17-278)||(21820671-21820931)
chr1 (22-280)||(21793339-21793598)
chr1 (17-201)||(18384011-18384195)
chr1 (17-166)||(13965749-13965897)
chr1 (156-238)||(41543266-41543348)
chr1 (156-280)||(26192614-26192734)
chr1 (17-266)||(22957057-22957308)
chr1 (17-98)||(12420179-12420260)
chr1 (156-280)||(37012770-37012888)
chr1 (156-280)||(41543354-41543475)
chr1 (156-280)||(19747831-19747950)
chr1 (156-280)||(20317216-20317336)
chr1 (156-280)||(20327698-20327818)
chr1 (156-238)||(20317128-20317210)
chr1 (156-238)||(26192526-26192608)
chr1 (156-265)||(25822601-25822709)
chr1 (156-280)||(49336253-49336373)
chr1 (17-83)||(25868131-25868197)
chr1 (156-238)||(37012894-37012976)
chr1 (156-238)||(20327610-20327692)
chr1 (172-251)||(13965486-13965565)
chr1 (26-81)||(22892366-22892421)
chr1 (156-235)||(19747676-19747752)
chr1 (17-60)||(21904538-21904581)
chr1 (26-81)||(22892213-22892268)
chr1 (31-81)||(22892624-22892674)
chr1 (249-280)||(18058427-18058458)
chr1 (13-45)||(22959167-22959199)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (13-280)||(16033-16300)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (17-234)||(20271-20489)
scaffold0234 (156-262)||(20499-20603)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (17-265)||(55061-55308)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (17-280)||(6225-6486)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (17-265)||(73944-74191)
[»] scaffold0313 (3 HSPs)
scaffold0313 (17-280)||(6355-6621)
scaffold0313 (29-280)||(20512-20766)
scaffold0313 (17-184)||(10235-10403)
[»] scaffold0591 (2 HSPs)
scaffold0591 (17-280)||(1536-1801)
scaffold0591 (17-81)||(1-65)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (17-228)||(1-212)
[»] scaffold0764 (1 HSPs)
scaffold0764 (30-280)||(1-254)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (17-256)||(233206-233444)
scaffold0014 (22-265)||(147311-147553)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (17-265)||(19374-19622)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (20-265)||(92098-92342)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (17-241)||(110985-111209)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (17-256)||(7060-7298)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (17-256)||(18580-18819)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (21-264)||(8716-8958)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (17-280)||(27992-28255)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (17-256)||(309237-309475)
scaffold0005 (12-265)||(217261-217516)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (17-280)||(55231-55490)
scaffold0018 (17-280)||(59180-59439)
scaffold0018 (17-280)||(60608-60867)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (17-265)||(1174-1421)
[»] scaffold0118 (4 HSPs)
scaffold0118 (17-234)||(8771-8988)
scaffold0118 (156-238)||(8679-8761)
scaffold0118 (156-238)||(8591-8673)
scaffold0118 (156-231)||(8510-8585)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (17-273)||(39785-40039)
[»] scaffold0265 (1 HSPs)
scaffold0265 (17-278)||(11878-12138)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (17-234)||(223-440)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (17-234)||(28230-28447)
scaffold0058 (17-231)||(49434-49647)
scaffold0058 (156-262)||(49660-49765)
scaffold0058 (156-251)||(28457-28551)
[»] scaffold0360 (1 HSPs)
scaffold0360 (19-238)||(898-1118)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (17-266)||(196607-196860)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (17-249)||(8057-8273)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (17-111)||(19725-19819)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (17-122)||(395076-395182)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (68-238)||(66175-66346)
scaffold0057 (17-74)||(67013-67070)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (17-71)||(30872-30926)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 83)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 13 - 284
Target Start/End: Original strand, 6405034 - 6405305
Alignment:
Q  13 aatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6405034 aatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaa 6405133  T
Q  113 aaattacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacacttta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6405134 aaattacaacaattgtattctctaagcctcagcaatcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacacttta 6405233  T
Q  213 gtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaaaaga 284  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6405234 atacccctaaagctagatgagactttgtttacaacttgtttagagtttgaatgattaaaatcagacaaaaga 6405305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 13792245 - 13792504
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13792245 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcatgcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 13792344  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13792345 tacaaaaaatgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttctttctaagttacccacttagacttttataacttctgctcaaactaacactttagtac 13792444  T
Q  217 ccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    |||||||| ||||||||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13792445 ccctaaagttagatgagac----tttacaatatgtttggagattgaatgattaaaatcagacaa 13792504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8842037 - 8841771
Alignment:
Q  15 tatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaa 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  8842037 tatgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagttttcactatgatgcttgagataacctctcaaattctgcactttacaatcttgttcacctgaaca 8841938  T
Q  115 attacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttag 213  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8841937 attacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagacttttacaccttctgctcaaactaacactttag 8841838  T
Q  214 tacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg-gagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  8841837 tacccct-aagctagatgagactttctttacaatttgtttgaaagtttgaatgattgaaatcagacaa 8841771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10422634 - 10422387
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  10422634 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccattatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 10422535  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||    
T  10422534 ttacaactct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttataacctttgctcaaactaacactttagta 10422436  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  10422435 cccctagagctagatgagactttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 10422387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16630384 - 16630137
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16630384 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 16630285  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  16630284 ttacaattct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 16630186  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  16630185 cccctaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 16630137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15670931 - 15670684
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15670931 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 15670832  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  15670831 ttacaactct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgcttagttaaccacttagacttttacaacatttgctcaaactaacactttagta 15670733  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  15670732 cccctaaagctatatgagactttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 15670684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 17420512 - 17420776
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  17420512 tgggttagtccactcctcacagttttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaat 17420611  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||| ||||||||||||    
T  17420612 tacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctactcaaactaacactttagt 17420710  T
Q  215 acccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||    
T  17420711 acccctaaagctagatgagactttctttacaatttgtatggagtttgaatgatatagatcagacaa 17420776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 521406 - 521672
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  521406 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaat 521505  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  521506 tacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagt 521604  T
Q  215 acccctaaagctagatgagac-tttgtttacaatttgtttgga-gtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||  | |||||||||    
T  521605 acccctaaagctagatgagacttttctttacaatttgtatggaggtttgaatgatatagatcagacaa 521672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Original strand, 13401997 - 13402219
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  13401997 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactacgatgcttgagataacctctcaaattccgcaccttacaatctttgttcaactgaacaa 13402096  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  13402097 ttacaccaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 13402196  T
Q  216 cccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  13402197 cccttaaagctagatgggacttt 13402219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Original strand, 4837210 - 4837432
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  4837210 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttctattatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaa 4837309  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  4837310 ttacaacaactgtattctctaagcaacagcaggcttgcaccttgtttctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 4837409  T
Q  216 cccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4837410 cccctaaagctagatgagacttt 4837432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16250297 - 16250059
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16250297 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 16250198  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  16250197 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 16250099  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16250098 ctctaaaagttagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 16250059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 17827208 - 17827447
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaat-cttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  17827208 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaa 17827307  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| |    
T  17827308 ttacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttagga 17827406  T
Q  216 cccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17827407 cctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 17827447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 17836599 - 17836838
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaat-cttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  17836599 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaa 17836698  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| |    
T  17836699 ttacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttagga 17836797  T
Q  216 cccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17836798 cctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 17836838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16398095 - 16397879
Alignment:
Q  22 tagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaattacaa 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16398095 tagtccactcctcacgatcttgtgagagttttcactatgatgtttgaggtaacctctcaaatcctgcactttacaatcttgttcacctgaacaattacat 16397996  T
Q  122 caattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtaccccta 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||||||||||||    
T  16397995 caattgtattctctaagcctcagcaggcttacacctttttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgttcaaactaatactttagtaccccta 16397896  T
Q  222 aagctagatgagacttt 238  Q
    ||||||| |||||||||    
T  16397895 aagctagttgagacttt 16397879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2830837 - 2830620
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||||||| |     
T  2830837 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcacctgaacac 2830738  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  2830737 ttacaactct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagta 2830639  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2830638 cccctaaagctagatgaga 2830620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 5292121 - 5292338
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  5292121 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaa 5292220  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  5292221 ttacaatcct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaacactttagta 5292319  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5292320 cccctaaagctagatgaga 5292338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 5301780 - 5301997
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  5301780 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaa 5301879  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  5301880 ttacaatcct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaacactttagta 5301978  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5301979 cccctaaagctagatgaga 5301997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16059222 - 16059000
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16059222 tgggttagtccactcctcacaatcttgtaagaatttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 16059123  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16059122 ttacgccaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttctttctaagttacctatttagacttttacaacttctgctcaaactatcactttagta 16059023  T
Q  216 cccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    || |||||| |||||||||||||    
T  16059022 cctctaaagttagatgagacttt 16059000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17144581 - 17144363
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  17144581 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttttcactacgatgcttgagataacctctcaaatcctacaccttacaatccttgttcaccggaacaa 17144482  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||     
T  17144481 ttacaacaactgtattctctaaacctcagcaggcttgcaccttattgctaaggtaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtt 17144382  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17144381 cccctaaagctagatgaga 17144363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21847137 - 21846920
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  21847137 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaa 21847038  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  21847037 ttacaatcct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaacactttagta 21846939  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21846938 cccctaaagctagatgaga 21846920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21856729 - 21856512
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  21856729 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaa 21856630  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  21856629 ttacaatcct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaacactttagta 21856531  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21856530 cccctaaagctagatgaga 21856512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21903000 - 21902783
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  21903000 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaa 21902901  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  21902900 ttacaatcct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaacactttagta 21902802  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21902801 cccctaaagctagatgaga 21902783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21912592 - 21912375
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  21912592 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaa 21912493  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  21912492 ttacaatcct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaacactttagta 21912394  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21912393 cccctaaagctagatgaga 21912375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 27679786 - 27680003
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  27679786 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaa 27679885  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  27679886 ttacaatcct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaacactttagta 27679984  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27679985 cccctaaagctagatgaga 27680003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 27689441 - 27689658
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  27689441 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaa 27689540  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  27689541 ttacaatcct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaacactttagta 27689639  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27689640 cccctaaagctagatgaga 27689658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16254087 - 16253841
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |  | ||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  16254087 tgggctagtctactcctcacaattttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcacctcacaatctttgttcacctgaacaa 16253988  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||    
T  16253987 ttacaactct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaactacttagacttttacaacctttgctcaaactaatactttagta 16253889  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaat 264  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  16253888 cccctcaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatggaggttgaat 16253841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 17984082 - 17984320
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17984082 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 17984181  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  17984182 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 17984280  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17984281 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 17984320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 18104632 - 18104870
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18104632 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 18104731  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  18104732 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 18104830  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18104831 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 18104870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 40922694 - 40922456
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40922694 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 40922595  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  40922594 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 40922496  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  40922495 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 40922456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 3486660 - 3486877
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  3486660 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttctactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaa 3486759  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  3486760 ttacaatcct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaacactttagta 3486858  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3486859 cccctaaagctagatgaga 3486877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 3495983 - 3496200
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  3495983 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttctactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaa 3496082  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  3496083 ttacaatcct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaacactttagta 3496181  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3496182 cccctaaagctagatgaga 3496200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17162441 - 17162223
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  17162441 tgggatagtccactcctcataatcttctgagagtttccactatgatgcttgagataacctatcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 17162342  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  17162341 ttacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgaaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagta 17162242  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||| ||| ||||||    
T  17162241 cccctaaaactatatgaga 17162223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6693069 - 6692831
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  6693069 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttctcctgaacaat 6692970  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  6692969 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 6692871  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6692870 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 6692831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6703475 - 6703237
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  6703475 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttctcctgaacaat 6703376  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  6703375 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 6703277  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6703276 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 6703237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30652513 - 30652296
Alignment:
Q  22 tagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaattaca 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||      |||| ||||||| ||||||||||| ||||||     
T  30652513 tagtcaactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaat------ccttgcaatctttgttcacctgaacaattacg 30652420  T
Q  121 acaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct 220  Q
     ||| |||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  30652419 ccaactgtattctctaagcatcagcaggcttgtaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaatttctgctcaaactaacactttaatacccct 30652320  T
Q  221 aaagctagatgagactttgtttac 244  Q
    |||||||||||||| ||| |||||    
T  30652319 aaagctagatgagattttctttac 30652296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44889865 - 44889653
Alignment:
Q  22 tagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaattaca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||| ||||| | |||||    
T  44889865 tagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcaactgaacacttaca 44889766  T
Q  121 acaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct 220  Q
    ||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  44889765 actct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacccct 44889667  T
Q  221 aaagctagatgaga 234  Q
    ||||||| ||||||    
T  44889666 aaagctaaatgaga 44889653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 26459271 - 26459006
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  26459271 tgggttagtccactcctcacagttttgtgagattttccactatgatgtttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaat 26459172  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttct-tgctaagttacccacttagacttttacaactt-ctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||  | | ||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||||||||||    
T  26459171 tacaacaacagtattctcttagcctcatcgggcttacacctttaatgctaagttacccacttagacttt-acacctttctactcaaactaacactttagt 26459073  T
Q  215 acccc-taaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||    
T  26459072 accccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtatggagtttgaatgatatagatcagacaa 26459006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 41527145 - 41526930
Alignment:
Q  22 tagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaattaca 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||    
T  41527145 tagtccacttctcacaatcttg--agagtttccactatgatgctaaagataacctctcaaatcttgcaccttacaatctttgttcacctgaacagttaca 41527048  T
Q  121 acaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct 220  Q
      |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  41527047 caacctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaatctttgctcaaactaacactttagtacccct 41526948  T
Q  221 aaagctagatgagacttt 238  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  41526947 aaagttagatgaaacttt 41526930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 7845950 - 7846184
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| | |||||||||||| |     
T  7845950 tgggctagtccactcctcacaatcttatgagagtttcccctatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatttatgttcacctgaatac 7846049  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||    |||||| |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  7846050 ttacaa-ttctgtattttctaagcctcagcaggattgcaccttgttgctaagttaaccacttaaacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 7846148  T
Q  216 cccctaaagctagatgagac-tttgtttacaatttg 250  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  7846149 cccctaaagctagatgagacttttggttacaatttg 7846184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 217
Target Start/End: Original strand, 518900 - 519101
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  518900 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaat 518999  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  519000 tacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagt 519098  T
Q  215 acc 217  Q
    |||    
T  519099 acc 519101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Original strand, 53945322 - 53945543
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaat-cttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | || |||||| || |     
T  53945322 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaattcgtgctcacctaaacac 53945421  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||| |  || ||||||||||||||| |||| |||||| | | || |||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||    
T  53945422 ttacacctctt-tattctctaagcctcagcagacttgcatcatgtttctaagttgaccacttagacttttacaatctttgctcaaactaacactttagta 53945520  T
Q  216 cccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  53945521 cccctaaagctagatgagacttt 53945543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 265
Target Start/End: Original strand, 14599862 - 14600117
Alignment:
Q  12 taatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctg 110  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||  | || ||||||| ||| |||||||||    
T  14599862 taatgtgggctggtccactcctcacaatcctatgagagtttcaactatgatacttgagataacctcttaaatcctgcatcttacaacctttgttcacctg 14599961  T
Q  111 aaaaattacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagactttt--acaacttctgctcaaaataacac 208  Q
    || ||||| ||| || |||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||||| ||||||    
T  14599962 aacaattataaccat-gtattctctaagccacaactggcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttttacaacctttactcaaactaacac 14600060  T
Q  209 tttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  14600061 tttagtacctctaaagctagatgggacttaaattacaatttgtatggagtttgaatg 14600117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Original strand, 16210183 - 16210404
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |||||||||||| |     
T  16210183 tgggttagtccactcctctaaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgtaccttacaatctgtgttcacctgaacac 16210282  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||| |  | |||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||  | | |||| | |||||||||||||    
T  16210283 ttacacctct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccatgttgctaagttaaccacttatacttttacaatctttactcagactaacactttagta 16210381  T
Q  216 cccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  16210382 cccctaaagctagatgatacttt 16210404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 88 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11477684 - 11477491
Alignment:
Q  88 caccttacaatctt-gttcacctgaaaaattacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagactttta 186  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||   |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  11477684 caccttacgatctttgttcacttgaacaattacaactcatgtattctataagccttggcagacttgcaccttcttgctaagttacctacttacactttta 11477585  T
Q  187 caacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||| || |||||||| ||| ||| |||||| ||| ||  || || |||| | | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11477584 caagttttgctcaaactaaaactctagtacacctcaatatatattagacctagattacaatttgtatggagtttgaatgattgaaatcagacaa 11477491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 44889643 - 44889538
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  44889643 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagttagatgagactttg-ttacaatttgtatgg 44889545  T
Q  256 agtttga 262  Q
    || ||||    
T  44889544 aggttga 44889538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2830346 - 2830226
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||||     
T  2830346 cttcttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagac----tttacaagatgtttga 2830251  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  2830250 agcttgaatgattgaaatcagacaa 2830226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2830610 - 2830528
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2830610 cttcttgctaagttacccacttagacttttgctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 2830528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 234
Target Start/End: Original strand, 4837438 - 4837516
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgaga 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4837438 cttcttgctaagttacccacttagacttttactccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 4837516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41526924 - 41526804
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||    ||  |||||||    
T  41526924 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaccttctgctcaaactaaacctttagcaaccctaaagctagatgagactttgt----aagatgtttgg 41526829  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    |  |||||||||| |||||||||||    
T  41526828 aacttgaatgattgaaatcagacaa 41526804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16058994 - 16058912
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16058994 cttcttgctaagttactcacttagacttttacaccttcagctcagactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 16058912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 30652296 - 30652214
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30652296 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaccttcagctcagactaacactttagtacccctaaagctagatgaaacttt 30652214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2830522 - 2830444
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2830522 cttcttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 2830444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Original strand, 15622214 - 15622292
Alignment:
Q  203 taacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg-agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15622214 taacactttagtacccctaaagctagatgagactttctttacaaattgtttggaagtttgaatgattgaaatcagacaa 15622292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17162213 - 17162135
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgaga 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17162213 cttcttgctaagttatccacttagacttttacaaactcggctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 17162135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 256
Target Start/End: Original strand, 3486983 - 3487083
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  3486983 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtgtg 3487081  T
Q  255 ga 256  Q
    ||    
T  3487082 ga 3487083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 256
Target Start/End: Original strand, 3496306 - 3496406
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  3496306 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtgtg 3496404  T
Q  255 ga 256  Q
    ||    
T  3496405 ga 3496406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 256
Target Start/End: Original strand, 5292444 - 5292544
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  5292444 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtgtg 5292542  T
Q  255 ga 256  Q
    ||    
T  5292543 ga 5292544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 256
Target Start/End: Original strand, 5302103 - 5302203
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  5302103 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtgtg 5302201  T
Q  255 ga 256  Q
    ||    
T  5302202 ga 5302203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21846814 - 21846714
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21846814 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtgtg 21846716  T
Q  255 ga 256  Q
    ||    
T  21846715 ga 21846714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21856406 - 21856306
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21856406 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtgtg 21856308  T
Q  255 ga 256  Q
    ||    
T  21856307 ga 21856306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21902677 - 21902577
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21902677 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtgtg 21902579  T
Q  255 ga 256  Q
    ||    
T  21902578 ga 21902577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21912269 - 21912169
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21912269 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtgtg 21912171  T
Q  255 ga 256  Q
    ||    
T  21912170 ga 21912169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 256
Target Start/End: Original strand, 27680109 - 27680209
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  27680109 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtgtg 27680207  T
Q  255 ga 256  Q
    ||    
T  27680208 ga 27680209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 256
Target Start/End: Original strand, 27689764 - 27689864
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  27689764 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtgtg 27689862  T
Q  255 ga 256  Q
    ||    
T  27689863 ga 27689864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 242
Target Start/End: Original strand, 3486890 - 3486977
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgttt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  3486890 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttt 3486977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 242
Target Start/End: Original strand, 3496213 - 3496300
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgttt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  3496213 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttt 3496300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 13402225 - 13402345
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||  ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||  |||||||    
T  13402225 cttcttgctaagttatccacttagacttttgcacctttagctcaaattaacaatttagtacccctagagctggatgagac----tttacaagatgtttgg 13402320  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  13402321 agcttgaatgattgaaatcagacaa 13402345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 16210410 - 16210530
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||  | |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||||     
T  16210410 cttcttgctaagttacctacttaaacttttgtacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagac----tttacaagatgtttga 16210505  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  16210506 agattgaatgattgaaatcagacaa 16210530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 53945549 - 53945669
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    |||||||  ||||||     
T  53945549 cttcttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttaatacccctaaagatagatgagac----tttacaagatgtttga 53945644  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| | |||||||||    
T  53945645 agcttgaatgattgagatcagacaa 53945669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2830434 - 2830352
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2830434 cttcttgctaagttatccacttaaacttttgctccttttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 2830352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 4837526 - 4837608
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4837526 cttcttgctaagtttcccacttagacttttgctccttctgctcaaactaacactttagcacctctaaagctagatgagacttt 4837608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17144353 - 17144275
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgaga 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17144353 cttcttgctaagttacctacttagacttttacaaactcagctcaaactaacattttagtacccctaaagctagatgaga 17144275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Original strand, 7843070 - 7843127
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataac 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7843070 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataac 7843127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 242
Target Start/End: Original strand, 5292351 - 5292438
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgttt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||    
T  5292351 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactatgttt 5292438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 242
Target Start/End: Original strand, 5302010 - 5302097
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgttt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||    
T  5302010 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactatgttt 5302097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16397797 - 16397677
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    |||||||  |||||||    
T  16397797 cttcttgctaaattacccacttagaatttttcacctttaactcaaactaacactttagtactcctaaagctagatgacac----tttacaagatgtttgg 16397702  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  16397701 agcttgaatgattgaaatcagacaa 16397677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21846907 - 21846820
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgttt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||    
T  21846907 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactatgttt 21846820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21856499 - 21856412
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgttt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||    
T  21856499 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactatgttt 21856412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21902770 - 21902683
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgttt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||    
T  21902770 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactatgttt 21902683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21912362 - 21912275
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgttt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||    
T  21912362 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactatgttt 21912275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 242
Target Start/End: Original strand, 27680016 - 27680103
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgttt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||    
T  27680016 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactatgttt 27680103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 242
Target Start/End: Original strand, 27689671 - 27689758
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgttt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||    
T  27689671 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactatgttt 27689758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Original strand, 16081490 - 16081554
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaa 81  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16081490 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaa 16081554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 67)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 280
Target Start/End: Original strand, 15987878 - 15988139
Alignment:
Q  20 gctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaattac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15987878 gctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttctactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatgttgttcacctgaacaattac 15987977  T
Q  120 aacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccc 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15987978 aacaactgtattctctaagcctaagcaggcttgcaccttcttgctaagttacccacttagaattttacaacttctgctcaaactaacactttagtacccc 15988077  T
Q  220 taaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg-agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15988078 taaagctagatgagactttctttacaatttgtttggaagtttgaatgattgaaatcagacaa 15988139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9007796 - 9007533
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||| | |||| ||||||||  |||| |||    
T  9007796 tgggccagtccactcctcacaatcttgagagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcatgcacatgacaaccttgttcagttgaacaat 9007697  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  9007696 tacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgttaagttacccacttagacttctacacctactgctcaaactaacactttagtac 9007597  T
Q  217 ccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9007596 ctctaaagctagatgagaatttgtttacaatttgtatggagtttgaatgattaaaatcagacaa 9007533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 9534449 - 9534695
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9534449 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 9534548  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  9534549 tacaactct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtac 9534647  T
Q  217 ccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  9534648 ccctaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 9534695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 9544732 - 9544978
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9544732 tgggctagtctactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 9544831  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  9544832 tacaactct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtac 9544930  T
Q  217 ccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  9544931 ccctaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgaaggttgaatg 9544978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 14247712 - 14247976
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  14247712 tgggctagtccactcctcacaatcttttgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacttgaacaa 14247811  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||||  || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||    
T  14247812 ttacaacacctgaattctctaagcatcagcaggcttgcaccttcttgctaagatacccacttagacttttacaatctttgctcaaactaacactttagta 14247911  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||| ||||||||| |||| ||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  14247912 ccactaaagttagatgagattttgattacaatttttatggagtctgaatgattgaaatcagacaa 14247976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 5614663 - 5614930
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  5614663 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaat 5614762  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| | || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  5614763 tacaacaactgtattctcttagcctcagtaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagacttttacacctttctgctcaaactaacactttagt 5614862  T
Q  215 acccctaaagctagatgagac-tttgtttacaatttgtttgga-gtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||  | |||||||||    
T  5614863 acccctaaagctagatgagacttttctttacaatttgtatggaggtttgaatgatatagatcagacaa 5614930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 24539675 - 24539893
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  24539675 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaa 24539774  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  24539775 ttacaacatctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagta 24539874  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24539875 cccctaaagctagatgaga 24539893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19586598 - 19586351
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19586598 tgggttagtccactcctcacattcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataatctctcaaatcatgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 19586499  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  19586498 ttacaattct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 19586400  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  19586399 cccctaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 19586351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27989940 - 27989727
Alignment:
Q  22 tagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaattaca 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27989940 tagtccactcctcacaatctcgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaattaca 27989841  T
Q  121 acaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct 220  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27989840 acaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacccct 27989741  T
Q  221 aaagctagatgaga 234  Q
    ||||||| ||||||    
T  27989740 aaagctatatgaga 27989727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 13284917 - 13285180
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  13284917 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaat 13285016  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| | || |||||||  ||||||||||||    
T  13285017 tacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgatcagttacccacttagac-tttacacctttatgctcaaggtaacactttagt 13285115  T
Q  215 acccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | |||||||||    
T  13285116 acccctaaagctagataagactttgtttac-atttgtatggagtttgaatgatatagatcagacaa 13285180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12770935 - 12770675
Alignment:
Q  16 atgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |     
T  12770935 atgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcttgcaccttacaaccttgttcacctgaacag 12770836  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcac-cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||  ||  ||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  12770835 ttacaacacctatattctctaagcctcaaca-acttacacttttcttgctaagttacccacttaaacttttacaccttttgctcaaactaacactttagt 12770737  T
Q  215 acccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||||||| |||||||||||||    |||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  12770736 acccctatagctagatgagac----tttacaattgtttatgagtttgaatgattgaaatcagacaa 12770675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15374556 - 15374321
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  15374556 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacttgaacaa 15374457  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | | |||| |||||||||||||    
T  15374456 ttacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacattgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttacacaaactaacactttagta 15374357  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgt 251  Q
     ||||||| |||||||||| | || |||||||||||    
T  15374356 tccctaaatctagatgagattctgcttacaatttgt 15374321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 42621940 - 42621696
Alignment:
Q  20 gctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaatta 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |    
T  42621940 gctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcatctgaacaataa 42621841  T
Q  119 caacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtaccc 218  Q
    ||||  | |||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  42621840 caactct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcactttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtaccc 42621742  T
Q  219 ctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  42621741 ctaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatagaggttgaatg 42621696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 41028451 - 41028199
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  41028451 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaat 41028352  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttaca-acttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||  ||||| ||||||||||||    
T  41028351 tacaacaacagtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacatttcttttcaaactaacactttagt 41028253  T
Q  215 a-cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgat 267  Q
    | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41028252 accccctatagctatatgagactttgtttacaatttgtatggagtttgaatgat 41028199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 11625575 - 11625813
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11625575 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 11625674  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||    
T  11625675 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacttttgctcaacctaacactttaggac 11625773  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11625774 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 11625813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43984511 - 43984294
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  43984511 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatcttcgttcacctgaacaa 43984412  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  43984411 ttacaatcct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaacactttagta 43984313  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  43984312 cccctaaagctagatgaga 43984294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 5381023 - 5381261
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5381023 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 5381122  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  5381123 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 5381221  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5381222 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 5381261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 5390661 - 5390899
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5390661 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 5390760  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  5390761 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 5390859  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5390860 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 5390899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 5927986 - 5927748
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5927986 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 5927887  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  5927886 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 5927788  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5927787 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 5927748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 8501900 - 8501662
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8501900 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 8501801  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  8501800 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 8501702  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8501701 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 8501662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 8512370 - 8512132
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8512370 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 8512271  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  8512270 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 8512172  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8512171 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 8512132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 16131125 - 16131363
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16131125 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 16131224  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  16131225 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 16131323  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16131324 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 16131363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 16141674 - 16141912
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16141674 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 16141773  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  16141774 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 16141872  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16141873 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 16141912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26304406 - 26304168
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26304406 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 26304307  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  26304306 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 26304208  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26304207 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 26304168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 26362412 - 26362650
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26362412 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 26362511  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  26362512 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 26362610  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26362611 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 26362650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 46497965 - 46497727
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46497965 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 46497866  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  46497865 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 46497767  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  46497766 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 46497727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 46508577 - 46508339
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46508577 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 46508478  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  46508477 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 46508379  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  46508378 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 46508339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6535335 - 6535102
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6535335 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 6535236  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  6535235 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 6535137  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgt 251  Q
    | || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6535136 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgt 6535102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6545656 - 6545423
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6545656 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 6545557  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  6545556 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 6545458  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgt 251  Q
    | || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6545457 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgt 6545423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10416835 - 10416620
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||||||| |     
T  10416835 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcatgcaccttacaatatgtgttcacctgaacac 10416736  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| ||||| |||||||    
T  10416735 ttacaactcta-tattctctaagcctcagcagtcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacattttagta 10416637  T
Q  216 cccctaaagctagatga 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  10416636 cccctaaagctagatga 10416620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26307966 - 26307728
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| || |||    
T  26307966 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctaaacaat 26307867  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  26307866 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 26307768  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26307767 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 26307728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 32099231 - 32098993
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32099231 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaaaatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 32099132  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  32099131 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 32099033  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32099032 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 32098993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 32109668 - 32109430
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32109668 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 32109569  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  32109568 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagatttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 32109470  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32109469 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 32109430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 44898149 - 44897911
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44898149 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 44898050  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||||| ||    
T  44898049 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgctcaacctaacactttaggac 44897951  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  44897950 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 44897911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 44908574 - 44908336
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44908574 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 44908475  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||||| ||    
T  44908474 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgctcaacctaacactttaggac 44908376  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  44908375 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 44908336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14946962 - 14946728
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttg-ttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||  |||||||||| ||    
T  14946962 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaaactttattcacctgaacaa 14946863  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | | |||| |||||||||||||    
T  14946862 ttacaacc-ttgtattctctaagcctcagcaggcttgcactttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttacacaaactaacactttagta 14946764  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgt 251  Q
     ||||||| |||||||||| | || |||||||||||    
T  14946763 tccctaaatctagatgagattctgcttacaatttgt 14946728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 42596228 - 42595970
Alignment:
Q  23 agtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaattacaac 122  Q
    |||| |||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  42596228 agtctactcctcacagttttgtgagatttttcactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacgtgaacaattacaac 42596129  T
Q  123 aattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacctt-cttgctaagttacccacttagacttttacaactt-ctgctcaaaataacactttagtacccct 220  Q
    || |||||||||| |||||  | || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  42596128 aactgtattctcttagccttagtaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagacttt-acacctttctgctcaaactaacattttaatacccct 42596030  T
Q  221 aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||    
T  42596029 aaagctagatgagactttgtttacaatttgtatggagtttgaatgatatagatcagacaa 42595970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45554403 - 45554191
Alignment:
Q  22 tagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaattaca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||||||| | |||||    
T  45554403 tagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcacctgaacacttaca 45554304  T
Q  121 acaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct 220  Q
    ||  | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || || |||| ||||||||||||||||||    
T  45554303 actct-gtattctctaagtctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagcccaaactaacactttagtacccct 45554205  T
Q  221 aaagctagatgaga 234  Q
    ||||||||||||||    
T  45554204 aaagctagatgaga 45554191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 2991099 - 2991361
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||  | ||| |||||| ||| |||||| |||| ||    
T  2991099 tgggttagtccactactcacaatattgtgagaatttccactatgattcttgagataacctctcaaatcctacactttacaacctttgttcacttgaacaa 2991198  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||| ||||  ||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | | |||||| |||||||||||||    
T  2991199 ttataacacctgtattct--aagcctcagcaggcttgcacattcttgctaagttacccacttagaattttagaatatttactcaaactaacactttagta 2991296  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||    
T  2991297 cccctaaagctagatgagactctctttacaatttgagtagagtttgaatgattgaaatcagacaa 2991361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31825570 - 31825306
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  31825570 tgggttagtccactcctcacaattttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaat 31825471  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    ||||| || |||||||||| |||| | |||  ||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||||    
T  31825470 tacaataactgtattctcttagccacagcaagcttacacctttcttgctaagttaaccacttagac-tttacacctttctgctc-aaataacattttagt 31825373  T
Q  215 acccctaaagctagatgagac-tttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||||||||  | |||||||||    
T  31825372 acccctaaagctagatgagacttttctttacaatttgtatggaagttgaatgatatagatcagacaa 31825306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Original strand, 7018615 - 7018849
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  7018615 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgaaggtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctcaacaa 7018714  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | | ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||| | | |||||| ||||| |||||||    
T  7018715 ttacaactct-gcattctctaagcctcaacagtcttgcaccttattgctaagttaactatttagacttttacaaccttttctcaaactaacattttagta 7018813  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgt 251  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  7018814 cccctaaagctagatgtgattctgtttacaatttgt 7018849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Original strand, 7033977 - 7034211
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  7033977 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgaaggtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctcaacaa 7034076  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | | ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||| | | |||||| ||||| |||||||    
T  7034077 ttacaactct-gcattctctaagcctcaacagtcttgcaccttattgctaagttaactatttagacttttacaaccttttctcaaactaacattttagta 7034175  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgt 251  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  7034176 cccctaaagctagatgtgattctgtttacaatttgt 7034211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8341042 - 8340812
Alignment:
Q  34 cacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaattacaacaattgtattc 132  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    |||||||    
T  8341042 cacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattc 8340944  T
Q  133 tctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatga 232  Q
    |||||  || ||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  8340943 tctaaatcttggcaggcttgcaccttgttgataagttaaccacttagacttttacaatttttgctcaaactaacactttagtacccctaaaattagatga 8340844  T
Q  233 gactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    ||||||  |||||||||||  | ||||||||||    
T  8340843 gacttt-attacaatttgtgggaagtttgaatg 8340812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Original strand, 12826588 - 12826783
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  12826588 tgggttagtccactactcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcttgcaccttacaaccttgttcacctgaacaat 12826687  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacacttt 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  12826688 tacaacaattgtattctcttagcctcagcaggattacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacacttt 12826783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19800951 - 19800779
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  19800951 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcatcttacaatctttgttcacctgaacaa 19800852  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaa 189  Q
    ||||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19800851 ttacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaa 19800779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 12575026 - 12574879
Alignment:
Q  25 tccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaattacaacaa 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  12575026 tccactcctcacgatcttgtgagagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcactttacaatcttgttcacctgaacaattacatcaa 12574927  T
Q  125 ttgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacc 172  Q
     ||||||||| ||||||||  || |||||||||||||  |||||||||    
T  12574926 ctgtattctccaagcctcgatagacttgcaccttctttttaagttacc 12574879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 12088177 - 12088056
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  12088177 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccaataagatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaat 12088078  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaag 138  Q
    |||||||| |||||||| ||||    
T  12088077 tacaacaactgtattctataag 12088056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27989717 - 27989609
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  27989717 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacctctaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgg 27989619  T
Q  256 agtttgaatg 265  Q
    || |||||||    
T  27989618 aggttgaatg 27989609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 125 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12515978 - 12515865
Alignment:
Q  125 ttgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaag 224  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12515978 ttgtattctctaagcctcggcatgcttgcagcttctttctaagttacccacttagtcttttacaatctttgctcaaactaacactttagtacccctaaag 12515879  T
Q  225 ctagatgagacttt 238  Q
    |||| |||||||||    
T  12515878 ctagttgagacttt 12515865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12492172 - 12492060
Alignment:
Q  126 tgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagc 225  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  12492172 tgtattctctaagcctcggcatgcttgcagcttctttctaagttacccacttagtcttttacaatctttgctcaaactaacactttaatacccctaaagc 12492073  T
Q  226 tagatgagacttt 238  Q
    ||| |||||||||    
T  12492072 tagttgagacttt 12492060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12515859 - 12515739
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||| |    
T  12515859 cttcttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagac----tttacaagatgtttcg 12515764  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||| ||||    
T  12515763 agcttgaatgattgaaatcaaacaa 12515739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 13130688 - 13130604
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  13130688 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttgcactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctt 13130604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 45554093 - 45553973
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||   ||||||     
T  45554093 cttcttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagac----tttacaggatgtttga 45553998  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  45553997 agcttgaatgattgaaatcagacaa 45553973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 24539903 - 24539985
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24539903 cttcttgctaagttacccacttagacttttgctccttctgctcaaactaacactttagtacccataaagctagatgagacttt 24539985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 45554181 - 45554099
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45554181 cttcttgctaagttgcccacttagacttttgctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 45554099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 24539991 - 24540111
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||||     
T  24539991 cttcttgctaagttaccctcttagacttttgcacatttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagac----tttacaagatgtttga 24540086  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  24540087 agcttgaatgattgaaatcagacaa 24540111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10416608 - 10416526
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10416608 cttcttgctaagttacccacttatattttttctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 10416526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 43984188 - 43984088
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  43984188 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtgtg 43984090  T
Q  255 ga 256  Q
    ||    
T  43984089 ga 43984088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12492054 - 12491934
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     ||||||   ||||| |    
T  12492054 cttcttactaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaaataacactttagtacccctaaagttagatgaga----atttacaggatgttttg 12491959  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  12491958 agcttgaatgattgaaatcagacaa 12491934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 12516106 - 12516011
Alignment:
Q  25 tccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaattaca 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12516106 tccactcctcacgatcttgtgagagttcccactatgatgtttaagataacctctcaaatcccgcactttacaatcttgttcacctgaacaattaca 12516011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 43984281 - 43984194
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgttt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||    
T  43984281 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactatgttt 43984194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 12492301 - 12492206
Alignment:
Q  25 tccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaattaca 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  12492301 tccactcctcacgatcttgtgagagttcctactatgatgtttgagataacctttcaaattctgcactttacaatcttgttcacctaaacaattaca 12492206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 40703399 - 40703344
Alignment:
Q  26 ccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaa 81  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40703399 ccactcctcacaatcttgtgagaatttccactatgatgcttgagataacctctcaa 40703344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10416519 - 10416438
Alignment:
Q  157 ttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  10416519 ttcttgttaatttaccctcttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttattacctctaaagttagatgagacttt 10416438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 40703246 - 40703188
Alignment:
Q  26 ccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatga---tgcttgagataacctctcaa 81  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||||||||||||||    
T  40703246 ccactcctcacaatcttgtgagaatttccactatgatgttgcttgagataacctctcaa 40703188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 284
Target Start/End: Original strand, 12826779 - 12826829
Alignment:
Q  234 actttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaaaaga 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  12826779 actttgtttacaatttgtatggagtttgaatgatatagatcagacaaaaga 12826829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 40703643 - 40703588
Alignment:
Q  26 ccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaa 81  Q
    |||| |||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  40703643 ccacccctcacaatcctgtaagaatttccactatgatgcttgagataacttctcaa 40703588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 62)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 284
Target Start/End: Original strand, 69303 - 69568
Alignment:
Q  19 ggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaatta 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| ||| || |||||||||| |||||    
T  69303 ggctagtccactcctcacaatcttgtgagaatttcaactatgatgtttgagataacctctcaaatcatgcaccttaaaatattattcacctgaacaatta 69402  T
Q  119 caacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtaccc 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||    
T  69403 caacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttactaagttacccacttagaattttacaccctttgctcaaactaacactttagtaccc 69502  T
Q  219 ctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaaaaga 284  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  69503 ctaaagctagatgagactttgattacaatttgtatggagtttgaatgtttgaaatcaaacaaaaga 69568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 45191688 - 45191441
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  45191688 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 45191589  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  45191588 ttacaattct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 45191490  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  45191489 cccctaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 45191441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Original strand, 22908003 - 22908254
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||  |||    
T  22908003 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccattatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgattaat 22908102  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  22908103 tacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttttgctcaaactaacactttagt 22908201  T
Q  215 acccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgat 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22908202 acccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtatggagtttgattgat 22908254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 27159132 - 27159396
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  27159132 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaat 27159231  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||| ||||||||||||    
T  27159232 tacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttcttctcaaactaacactttagt 27159330  T
Q  215 acccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||    
T  27159331 acccctaaagctagatgagactttctttacaatttgtatggaggttgaatgatatagatcagacaa 27159396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 27169480 - 27169744
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  27169480 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaat 27169579  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||| ||||||||||||    
T  27169580 tacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttcttctcaaactaacactttagt 27169678  T
Q  215 acccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||    
T  27169679 acccctaaagctagatgagactttctttacaatttgtatggaggttgaatgatatagatcagacaa 27169744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29424204 - 29423957
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  29424204 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcatgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 29424105  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | ||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  29424104 ttacaactct-gtactctctaagcctcaacaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacatttgctcaaactaacactttagta 29424006  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  29424005 cccctaaagttagatgagactttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 29423957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Original strand, 38929636 - 38929875
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  38929636 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 38929735  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  38929736 ttacaact-ttgtattctctaagcctcaacaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 38929834  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggag 257  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  38929835 cccctaaaggtagatgagactttg-ttacaatttgtatggag 38929875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 45015564 - 45015317
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  45015564 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 45015465  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  45015464 ttacaactct-gtattctctaagcttcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 45015366  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  45015365 cccctaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 45015317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21110062 - 21109802
Alignment:
Q  21 ctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaattac 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  21110062 ctagtccactcctcgcaatcttgtgagagtttcaactatgatgcttgagataacctctcaaatcctacaccttacaatctttgttcaactgaacaattac 21109963  T
Q  120 aacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccc 219  Q
    ||||  | ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  21109962 aacacatatattctctaagtctcagcaggcttgcaccttcttgttaagttacccacttagacttttacaaactttgctcaaactaacactttagtacccc 21109863  T
Q  220 taaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||    
T  21109862 taaagctatatgagattttgattacaatttgtatgaagtttcaatgattgaaatcagacaa 21109802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 32935915 - 32936177
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32935915 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgaaagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 32936014  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  32936015 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 32936113  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    | || |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  32936114 ctctaaaagttagatgagactttg-ttacaatttgtatggagcttgaatgaatgaaatcagacaa 32936177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Original strand, 38956978 - 38957211
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  38956978 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 38957077  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  38957078 ttacaactct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttaaacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 38957176  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgt 251  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  38957177 cccctaaaggtagatgagactttg-ttacaatttgt 38957211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19343167 - 19342902
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| || ||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  19343167 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagatttttgactatgatgatttagataacttctcaaatcctacaccttacaaccttgttcacctgaacaat 19343068  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| |    
T  19343067 tacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttaat 19342969  T
Q  215 acccctaaagctagatgagac-tttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||    
T  19342968 acccctaaagctagatgagacttttgtttacaatttgtatggagtttgaatgatatagatcagacaa 19342902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 261
Target Start/End: Original strand, 41026033 - 41026277
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  41026033 tgggttagtccactcttcacaatcttgcgagagtttccatcatgatgcttgagacaacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctaaacaa 41026132  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||    
T  41026133 ttatatcaattgtattctctaagcctcatcaggcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaatctttgctcaaactaacactttagta 41026232  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttg 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||    
T  41026233 cccctaaagctagatgagac-ttgattacaatttgtatgaagtttg 41026277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 24695713 - 24695957
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  24695713 tgggctagtccactc---acaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 24695809  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||    
T  24695810 ttacaactct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactttgctcaaactaacactttagta 24695908  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  24695909 cccctaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 24695957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4459229 - 4459012
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  4459229 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaa 4459130  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||  || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  4459129 ttacaatcat-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaacactttagta 4459031  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4459030 cccctaaagctagatgaga 4459012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 16901348 - 16901566
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  | ||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  16901348 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatggttgagataacctctcaaatcctgcactttacaatccttgttcacctgaacaa 16901447  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||   | ||||||| |||||||||||||    
T  16901448 ttacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagaattttacaaacgcagctcaaactaacactttagta 16901547  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16901548 cccctaaagctagatgaga 16901566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 16994739 - 16994957
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  | ||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  16994739 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatggttgagataacctctcaaatcctgcactttacaatccttgttcacctgaacaa 16994838  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||   | ||||||| |||||||||||||    
T  16994839 ttacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagaattttacaaacgcagctcaaactaacactttagta 16994938  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16994939 cccctaaagctagatgaga 16994957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28451178 - 28450931
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||| |||| |     
T  28451178 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacatgaacac 28451079  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||| |||    
T  28451078 ttacaactct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttggta 28450980  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  28450979 cccttaaagctagatgaga-tttgtttacaatttgtgagaagtttgaatg 28450931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 37862242 - 37862489
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  37862242 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagatgacctctcaagtcctgcaccttacaatcattgttcacctgaacaa 37862341  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | ||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  37862342 ttacaattct-gtattctctaagcctcaacaggcttgcacctttttgctaagttaaccactaaaacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 37862440  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  37862441 cccctaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 37862489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4468854 - 4468637
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  4468854 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaa 4468755  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  4468754 ttacaatcct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaacactttagta 4468656  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4468655 cccctaaagctagatgaga 4468637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 5345842 - 5346059
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  5345842 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatcttcgttcacctgaacaa 5345941  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  5345942 ttacaatcct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaacactttagta 5346040  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5346041 cccctaaagctagatgaga 5346059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12571448 - 12571201
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||| || |     
T  12571448 tgggttagtccactactcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctacaccttacaatctatgttcacctaaacac 12571349  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||  || |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||  |||||||||||||    
T  12571348 ttacaattat-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgctcaagctaacactttagta 12571250  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||    
T  12571249 cccctaaagctagatgagac-ttgattacaatttgtgagaagtttgaatg 12571201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 15474687 - 15474948
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15474687 tgggttagtccactccttacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcatgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 15474786  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcac-cttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||  || |||  |||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || |||||||||    
T  15474787 tacaacaattgtattctctaagccttagcaggattacacttttcttgctaatttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactatcactttagt 15474885  T
Q  215 acccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg-gagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    |||  ||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15474886 acctgtaaagctagatgagac----tttacaatttgtttgtgagtttgaatgattgaaatcagacaa 15474948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 2997825 - 2998063
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2997825 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 2997924  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  2997925 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 2998023  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2998024 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 2998063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18652069 - 18651831
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18652069 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 18651970  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  18651969 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 18651871  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18651870 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 18651831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18664187 - 18663949
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18664187 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 18664088  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  18664087 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 18663989  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18663988 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 18663949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 5335990 - 5336207
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  5335990 tgggctagtctactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatcttcgttcacctgaacaa 5336089  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  5336090 ttacaatcct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaacactttagta 5336188  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5336189 cccctaaagctagatgaga 5336207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 9501888 - 9502126
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9501888 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 9501987  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  9501988 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaatcacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 9502086  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9502087 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 9502126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 9513254 - 9513492
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9513254 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 9513353  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  9513354 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaatcacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 9513452  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9513453 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 9513492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 3604774 - 3604991
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |  ||||||||||| |     
T  3604774 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcccgcaccttacaatatgcgttcacctgaacac 3604873  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  3604874 ttacaact-ttgtattctctaagcctcagcaagcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaattcagctcaaactaacattttagta 3604972  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3604973 cccctaaagctagatgaga 3604991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 22678878 - 22679095
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||||||| |     
T  22678878 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactataatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcacctgaacac 22678977  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  22678978 ttacaactct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagta 22679076  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  22679077 cccttaaagctagatgaga 22679095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22902991 - 22902727
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  22902991 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcatacacattacaaccttgttcacctgaacaat 22902892  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||  |||  || |||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||| | |||| |||||| ||||||||||||    
T  22902891 tacaacaactatattctcttagcctcaacaggtttacacctttcttactaagttacctacttagac-tttacacctttcttctcaaactaacactttagt 22902793  T
Q  215 acccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||    
T  22902792 acctcttaagctagatgagactttgtttacaatttgtatggagtttaaatgatatagatcagacaa 22902727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 17489541 - 17489303
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17489541 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 17489442  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||   |  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||  ||||||||||| ||    
T  17489441 tacaatccta-tattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaccttttctcaacctaacactttaggac 17489343  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17489342 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 17489303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Original strand, 44637784 - 44638005
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||  | |||||||| |||| || ||||||||| |     
T  44637784 tgggttagcccactcctcacaatcttgtgagagtttccactttgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttaccatctgtgatcacctgaacac 44637883  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  |    
T  44637884 ttacaacact-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttaaca 44637982  T
Q  216 cccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  44637983 cccctaaagctagatgagacttt 44638005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Original strand, 22671738 - 22671939
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||||||| |     
T  22671738 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactataatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcacctgaacac 22671837  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  22671838 ttacaactct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagta 22671936  T
Q  216 ccc 218  Q
    |||    
T  22671937 ccc 22671939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 3605089 - 3605209
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||||     
T  3605089 cttcttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagac----tttacaagatgtttga 3605184  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  3605185 agcttgaatgattgaaatcagacaa 3605209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 16901576 - 16901658
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16901576 cttcttgctaagttacccacttagacttttgctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 16901658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 16994967 - 16995049
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16994967 cttcttgctaagttacccacttagacttttgctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 16995049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 16901664 - 16901784
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||||     
T  16901664 cttcttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagac----tttacaagatgtttga 16901759  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||  |||||||||||    
T  16901760 agcttgaatgatggaaatcagacaa 16901784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 16995055 - 16995175
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||||     
T  16995055 cttcttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagac----tttacaagatgtttga 16995150  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||  |||||||||||    
T  16995151 agcttgaatgatggaaatcagacaa 16995175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 3605001 - 3605083
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3605001 cttcttgctaagttatctacttagacttttactccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 3605083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 22679105 - 22679187
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22679105 cttcttgctaagttacccacttagacttttgctccttttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 22679187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 234
Target Start/End: Original strand, 33432473 - 33432551
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgaga 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33432473 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 33432551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 234
Target Start/End: Original strand, 33432564 - 33432642
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgaga 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33432564 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 33432642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 44638011 - 44638093
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44638011 cttcttgctaagctacccacttagacttttactccttctgctcaaactaacattttagtacccctaaagctagatgagacttt 44638093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 234
Target Start/End: Original strand, 5336220 - 5336298
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgaga 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5336220 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaaactcatctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 5336298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 234
Target Start/End: Original strand, 5346072 - 5346150
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgaga 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5346072 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaaactcatctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 5346150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4458906 - 4458806
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4458906 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtgtg 4458808  T
Q  255 ga 256  Q
    ||    
T  4458807 ga 4458806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4468531 - 4468431
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4468531 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtgtg 4468433  T
Q  255 ga 256  Q
    ||    
T  4468432 ga 4468431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 256
Target Start/End: Original strand, 5336403 - 5336503
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  5336403 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtgtg 5336501  T
Q  255 ga 256  Q
    ||    
T  5336502 ga 5336503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 256
Target Start/End: Original strand, 5346256 - 5346356
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  5346256 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtgtg 5346354  T
Q  255 ga 256  Q
    ||    
T  5346355 ga 5346356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 139
Target Start/End: Original strand, 40408151 - 40408268
Alignment:
Q  21 ctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacct-gaaaaattac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||||||  |||||| | | ||| ||||||    
T  40408151 ctagtccactcctcacaatcttgtgagattttccattatgatgtttgagataacctctcaactcctgcaccttacaactttgttcccttggaataattac 40408250  T
Q  120 aacaattgtattctctaagc 139  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  40408251 aaca--tgtattctctaagc 40408268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4458999 - 4458912
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgttt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||    
T  4458999 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactatgttt 4458912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4468624 - 4468537
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgttt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||    
T  4468624 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactatgttt 4468537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 242
Target Start/End: Original strand, 5346163 - 5346250
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgttt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||    
T  5346163 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactatgttt 5346250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 44638100 - 44638218
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||  ||||||  | ||||| |||||||||||||||||    |||||||  ||||||     
T  44638100 cttcttgctaagttacccacttagacttttgtacattcagctcaagctaacac--tcgtacctctaaagctagatgagac----tttacaagatgtttga 44638193  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  44638194 agcttgaatgattgaaatcagacaa 44638218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22146622 - 22146566
Alignment:
Q  25 tccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaa 81  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22146622 tccacttctcacaatcttgtaagaatttccactatgatgcttgagataatctctcaa 22146566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23730440 - 23730380
Alignment:
Q  220 taaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||  | |||||||||    
T  23730440 taaagctagataagactttgtttacaatttgtatggaaattgaatgatgtagatcagacaa 23730380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 242
Target Start/End: Original strand, 5336311 - 5336397
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgttt 242  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||   |||| |||||| ||| || |||||||||||||||| |||||    
T  5336311 cttctagctaagttacccacttagacttttacaccctttgctcaccctaac-ctttaggacctctaaaagctagatgagactatgttt 5336397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 38461341 - 38461270
Alignment:
Q  25 tccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacc-tctcaaatatttcaccttacaa 97  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| | || ||||||||||    
T  38461341 tccactcctcacaac--tgtgagagtttccactatgatgcttgagacaaccttctcaactcttgcaccttacaa 38461270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 185
Target Start/End: Original strand, 22679193 - 22679222
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagactttt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22679193 cttcttgctaagttacccacttagactttt 22679222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 37488839 - 37488795
Alignment:
Q  42 tgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatt 86  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  37488839 tgtgagattttccaatatgatgcttgagagatcttctcaaatatt 37488795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 32)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 2689491 - 2689755
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  2689491 tgggctagtccacttctcacaatcttgtgaaagtttccactattatgcttgagataacctctcaaatcttgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 2689590  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||    
T  2689591 ttacaacacatgtattctctaatcctcagcatacttgcaccttcttgctcagttacccacttagacttttacaaactttgctcaaactaacactttagta 2689690  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2689691 cccctaaagctagatgagattttgattacaatttgtatggagtttgaatgattgaaatgagacaa 2689755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 14893245 - 14893493
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14893245 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctacaccttacaatctttgttcacctgaacaa 14893344  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||| | | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  14893345 ttacaatact-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 14893443  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtt-tggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  14893444 cccctaaagctagatgagactttg-ttataatttgttatggaggttgaatg 14893493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 21986959 - 21987221
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21986959 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 21987058  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  21987059 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 21987157  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    | || |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  21987158 ctctaaaagttagatgagactttg-ttacaatttgtatggagcttgaatgaatgaaatcagacaa 21987221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 21996493 - 21996755
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21996493 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 21996592  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  21996593 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 21996691  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    | || |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  21996692 ctctaaaagttagatgagactttg-ttacaatttgtatggagcttgaatgaatgaaatcagacaa 21996755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 14880895 - 14881143
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14880895 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaattctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 14880994  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||  || |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  14880995 ttacaattat-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttaaacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 14881093  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtt-tggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  14881094 cccctaaagctagatgagactttg-ttataatttgttatggaggttgaatg 14881143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 31998451 - 31998698
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||| |||||| |||| ||    
T  31998451 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagaatttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcatcttacaatctttgttcacatgaacaa 31998550  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  31998551 ttacaattct-gtattctctaagcctcggcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 31998649  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  31998650 cccctaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 31998698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 33773338 - 33773583
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  33773338 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 33773437  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  33773438 ttacaattct-gtattctctaagcctcagc--tcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 33773534  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  33773535 cccctaaagctagatgggactttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 33773583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 31990862 - 31991109
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||| ||    
T  31990862 tgggttagtctactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcatcttacaatctctgttcacctgaacaa 31990961  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  31990962 ttacaattct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 31991060  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||    
T  31991061 cccctaaagctagatgagactttg-taacaatttgtatggaggttgaatg 31991109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13675611 - 13675373
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13675611 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 13675512  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  13675511 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 13675413  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13675412 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 13675373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 26361549 - 26361814
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||  |||    
T  26361549 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttaagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgagcaat 26361648  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  26361649 tacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagt 26361747  T
Q  215 a-cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||    
T  26361748 accccctaaagctagatgagactttctttacaatttgtatggaggttgaatgatatagatcagacaa 26361814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14438275 - 14438009
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  14438275 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgctttagatatcttctcaaatccttcaccttacaaccttgttcacctgatcaat 14438176  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  14438175 tacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttatgctcaaactaacactttagt 14438077  T
Q  215 acccctaaagctagatgagac-tttgtttacaatttgtttgga-gtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||  | |||||||||    
T  14438076 acccctaaagctagatgagacttttctttacaatttgtatggaggtttgaatgatatagatcagacaa 14438009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 9324244 - 9324482
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9324244 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 9324343  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  9324344 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 9324442  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9324443 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 9324482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 21202044 - 21202282
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21202044 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 21202143  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  21202144 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 21202242  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21202243 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 21202282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 21212460 - 21212698
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21212460 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 21212559  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  21212560 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 21212658  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21212659 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 21212698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21335149 - 21334911
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21335149 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 21335050  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  21335049 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 21334951  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21334950 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 21334911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Original strand, 11429679 - 11429900
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| | || ||||||||| |     
T  11429679 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataaccactcaaatcctgcaccttacaatttgtgctcacctgaacag 11429778  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    || || ||  ||||||||||||||||| |||  |||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  11429779 ttgca-catctgtattctctaagcctcagcaagcttgcaccatgttgctaagttgaccacttagacttttacaatttttgctcaaactaacactttagta 11429877  T
Q  216 cccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11429878 cccctaaagctagatgagacttt 11429900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 232
Target Start/End: Original strand, 20530081 - 20530296
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  20530081 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacctatcaaatcctgcaccttacaatctttgttctcctgaacaa 20530180  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | ||||||||||||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| ||||| |||||||    
T  20530181 ttacaattct-gtattctctaagcctcaacaggcttacaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacattttagta 20530279  T
Q  216 cccctaaagctagatga 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  20530280 cccctaaagctagatga 20530296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 23014241 - 23014488
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||| |     
T  23014241 tgggttagtcaactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacac 23014340  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||    |||||||| ||||||||  ||| ||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||  || || |||| |||||||||||||    
T  23014341 ttacaa-ttctgtattctttaagcctcaacaggcttgcaccttgctgttaagttaaccacttagacttttacaaactcagcacaaactaacactttagta 23014439  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |  |||||||||||||| | |||| |||||||||||  | ||||||||||    
T  23014440 cttctaaagctagatga-aatttgattacaatttgtgagaagtttgaatg 23014488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 128 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17269563 - 17269440
Alignment:
Q  128 tattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagcta 227  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17269563 tattctctaatcctcagcaggtttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactaagctcaaactaacactttagtacccctaaagcta 17269464  T
Q  228 gatgagactttgtttacaatttgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  17269463 gatgagactttgtttacaatttgt 17269440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20852253 - 20852078
Alignment:
Q  100 ttgttcacctgaaaaattacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacctt-cttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  20852253 ttgttcacctgaaaaattacaacacctatattctccaagcctcagcaggcttacacttttcttgctaagttacccacttagactttgacaccttttgctc 20852154  T
Q  199 aaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg-gagtttgaatgattaaaatcaga 277  Q
    ||| || ||||| |||  ||||||||||||||||||||||    || ||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  20852153 aaactagcacttaagtgtccctaaagctagatgagacttt----accatttgtttatgagtttgaatgattgaaatcaga 20852078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 11429906 - 11430026
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||||     
T  11429906 cttcttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagac----tttacaagatgtttga 11430001  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| | |||||||||    
T  11430002 agcttgaatgattgagatcagacaa 11430026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Original strand, 12900518 - 12900582
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaa 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12900518 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaa 12900582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 3988363 - 3988297
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaat 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3988363 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaat 3988297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 21461956 - 21461892
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaa 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21461956 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaa 21461892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 234
Target Start/End: Original strand, 20530308 - 20530386
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgaga 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20530308 cttcttgctaagttacccacttaaatttttgctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 20530386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 20530396 - 20530478
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  20530396 cttcttgctaagttacccacttagaattttgctccttctgctcaaactaacactttagtatccctaaagctagatgatacttt 20530478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 280
Target Start/End: Original strand, 20530488 - 20530604
Alignment:
Q  160 ttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtt 259  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||  |||||| || |    
T  20530488 ttgctaagctacccacttagacttttgcacctttaactcaaactaacacttcagtacccctaaagctagatgagac----tttacaagatgtttgaagct 20530583  T
Q  260 tgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  20530584 tgaatgattgaaatcagacaa 20530604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 6760669 - 6760603
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaat 83  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6760669 tgggttagtccactccttacaatcttgtgagagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaat 6760603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 105
Target Start/End: Original strand, 12840672 - 12840752
Alignment:
Q  25 tccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||| |||||||    
T  12840672 tccactcctcacaatcttgtgagaatttccattatgatgcttgagataccctctcaaatcctgtaccttacaaccttgttc 12840752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 18537494 - 18537438
Alignment:
Q  25 tccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaa 81  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  18537494 tccactcctcacaatcttgtgagaatttccactataatgcttgaaataacctctcaa 18537438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 238
Target Start/End: Original strand, 12840828 - 12840883
Alignment:
Q  184 ttacaactt-ctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12840828 ttacaactttctgctcaacctaacactttaatacccttaaagctagatgagacttt 12840883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 37817901 - 37817846
Alignment:
Q  18 gggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataac 74  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  37817901 gggctaattcactcctcacaatcttctgaga-ttttcactatgatgcttgagataac 37817846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 280
Target Start/End: Original strand, 27786713 - 27786979
Alignment:
Q  13 aatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||    
T  27786713 aatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatacttgagataacctctcaactcttgcaccttacaatattgttcacctgaa 27786812  T
Q  113 aaattacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacacttta 212  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||| ||||    
T  27786813 cacttacaacgattgtattctctaagcctcagcaggcttgcacctt-ttgctaagttacccacttagactttcacaacatttgctcaaactaacaattta 27786911  T
Q  213 gtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  27786912 gtacccctaaagctatatgagattttgattacaatttgtatggagttgtaatgattgaaaccagacaa 27786979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 22222697 - 22222920
Alignment:
Q  22 tagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaattaca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  22222697 tagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacg 22222796  T
Q  121 acaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct 220  Q
     ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22222797 ccaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcactttcttgctaagttacccacatagacttttacaacttctgctcaaactaacactttagtacccct 22222896  T
Q  221 aaagctagatgagactttgtttac 244  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  22222897 aaagctagatgagactttctttac 22222920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 22248532 - 22248755
Alignment:
Q  22 tagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaattaca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  22248532 tagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacg 22248631  T
Q  121 acaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct 220  Q
     ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22248632 ccaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcactttcttgctaagttacccacatagacttttacaacttctgctcaaactaacactttagtacccct 22248731  T
Q  221 aaagctagatgagactttgtttac 244  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  22248732 aaagctagatgagactttctttac 22248755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Original strand, 8562512 - 8562763
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  8562512 tgggttagtccactcctcacagttttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaat 8562611  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  8562612 tacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttatacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagt 8562710  T
Q  215 acccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgat 267  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8562711 acccctaaagctatatgagactttgtttacaatttgtatggagtttgaatgat 8562763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 34766209 - 34765943
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  34766209 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaat 34766110  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  34766109 tacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagt 34766011  T
Q  215 acccctaaagctagatgagac-tttgtttacaatttgtttgga-gtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||  | |||||||||    
T  34766010 acccctaaagctagatgagacttttctttacaatttgtatggaggtttgaatgatatagatcagacaa 34765943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15504292 - 15504029
Alignment:
Q  12 taatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctg 110  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  15504292 taatatgggctagtccacttcccacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataaccactcaaatcttgcaccttacaatctttgttcagctg 15504193  T
Q  111 aaaaattacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactt 210  Q
    || ||||||||||  | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | || ||| ||||||||    
T  15504192 aacaattacaacacatatattctctaagcctcagcaggcttccaccttcttgctaagttatccacttagacttttacaaactttccttaaactaacactt 15504093  T
Q  211 tagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    |||||||| |||||||||||||||     |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15504092 tagtacccttaaagctagatgaga-----tttacaatttgtatgga-tttgaatgattaaaatcagacaa 15504029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20968693 - 20968454
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  20968693 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 20968594  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  20968593 ttacaactct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgtttctaagttaaccatttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 20968495  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggag 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20968494 cccctaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatggag 20968454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1598010 - 1597792
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  1598010 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaaccctgcaccttacaatccttgttcacatgaacaa 1597911  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  1597910 ttacaacatctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagta 1597811  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1597810 cccctaaagctagatgaga 1597792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17826703 - 17826456
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  17826703 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 17826604  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||| |||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||    
T  17826603 ttataactct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaaatgaaccacttagaattttacaaccttcgctcaaactaacactttagta 17826505  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  17826504 cccataaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 17826456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29541297 - 29541050
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  29541297 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttttcactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 29541198  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||||||||    
T  29541197 ttacaattct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttagaacctttgcttaaactaacactttagta 29541099  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  29541098 cccctaaagttagataagactttg-ttacaatctgtatggaggttgaatg 29541050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18170724 - 18170486
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18170724 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 18170625  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||   |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  18170624 tacaa-tcttgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 18170526  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18170525 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 18170486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9034262 - 9034041
Alignment:
Q  22 tagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaattacaa 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  9034262 tagtccactccacacaatcttgtgggagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaatttacaatcttgttcgcccgaacaattacaa 9034163  T
Q  122 caattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtaccccta 221  Q
    |  | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  9034162 ctct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacctcta 9034064  T
Q  222 aagctagatgagactttgtttac 244  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  9034063 aagctagatgagactttctttac 9034041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18202398 - 18202181
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  18202398 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcttgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 18202299  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||   |||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  18202298 ttacaac-tctgtattttctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaatttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagta 18202200  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  18202199 cccctaaagttagatgaga 18202181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 26019620 - 26019837
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| |     
T  26019620 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacag 26019719  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  26019720 ttacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagta 26019818  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26019819 cccctaaagctagatgaga 26019837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3286697 - 3286459
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3286697 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 3286598  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  3286597 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 3286499  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3286498 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 3286459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12455904 - 12455666
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12455904 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 12455805  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  12455804 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 12455706  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12455705 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 12455666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16898797 - 16898559
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16898797 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 16898698  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  16898697 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 16898599  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16898598 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 16898559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18160912 - 18160674
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18160912 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 18160813  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  18160812 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 18160714  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18160713 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 18160674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20913133 - 20912895
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20913133 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 20913034  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  20913033 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 20912935  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20912934 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 20912895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 24921208 - 24921446
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24921208 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 24921307  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  24921308 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttagccacttagacttttacaacatttgctcaacctaacactttaggac 24921406  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24921407 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 24921446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 24930244 - 24930482
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24930244 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 24930343  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  24930344 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttagccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 24930442  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24930443 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 24930482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24692662 - 24692400
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  24692662 tgggttagtcaactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcatgcaccttacaaccttgttcacctgaacaat 24692563  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  24692562 tacaacaactgtactctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacctacttaga-atttacacctttctgctcaaactaacactttagt 24692464  T
Q  215 acccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||| |||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||    
T  24692463 acctctaaagctagatgagac--tgattacaatttgtgtggagtttgaatgatatagatcagacaa 24692400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 30657090 - 30657307
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||||||| |     
T  30657090 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcacctgaacac 30657189  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  30657190 ttacaaccct-gtattctctaagcctcagcacgcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagta 30657288  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  30657289 cccctaaagctagatgaga 30657307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14792453 - 14792215
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14792453 tgggatagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 14792354  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  14792353 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 14792255  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14792254 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 14792215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16909450 - 16909212
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16909450 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgtttacctgaacaat 16909351  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  16909350 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 16909252  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16909251 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 16909212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31358412 - 31358174
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31358412 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 31358313  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  31358312 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 31358214  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31358213 ctctaaaaggtagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 31358174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31368142 - 31367904
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31368142 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 31368043  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  31368042 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 31367944  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31367943 ctctaaaaggtagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 31367904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Original strand, 790234 - 790455
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | || ||||||||| |     
T  790234 tgggttagtccactcctcacaattttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatttgtgctcacctgaacac 790333  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||    
T  790334 ttacaactct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaacttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgctcaaactaacactttagta 790432  T
Q  216 cccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  790433 cccctaaagctagatgagacttt 790455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16322173 - 16321953
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16322173 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcatgtaccttacaatctttgttcacctgaacaa 16322074  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||  |||||||||||||    
T  16322073 ttacaattat-gtattctctaagcctcaacaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatatttgctcaagctaacactttagta 16321975  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactt 237  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  16321974 ctcctaaagctagatgtgactt 16321953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16334321 - 16334101
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16334321 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcatgtaccttacaatctttgttcacctgaacaa 16334222  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||  |||||||||||||    
T  16334221 ttacaattat-gtattctctaagcctcaacaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatatttgctcaagctaacactttagta 16334123  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactt 237  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  16334122 ctcctaaagctagatgtgactt 16334101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26169266 - 26169034
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||  ||||| |||||| |     
T  26169266 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtctccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccgtgttctcctgaacac 26169167  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||  |||||||||||||    
T  26169166 ttacaattct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgctcaagctaacactttagta 26169068  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttg 250  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26169067 cccctaaagctagatgagac-ttgattacaatttg 26169034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Original strand, 18705535 - 18705768
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |     
T  18705535 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcaactatgatgcttgagataacctctcaaatcttgcaccttacaatctgtgttcacctgaacac 18705634  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||    ||||||||||||||||| ||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |  ||||||  |||||||||||||    
T  18705635 ttacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggattacaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatcttagctcaagctaacactttagta 18705733  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgt 251  Q
    |||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  18705734 ccccaaaagttagatgagac-ttgattacaatttgt 18705768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Original strand, 18711470 - 18711703
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |     
T  18711470 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcaactatgatgcttgagataacctctcaaatcttgcaccttacaatctgtgttcacctgaacac 18711569  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||    ||||||||||||||||| ||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |  ||||||  |||||||||||||    
T  18711570 ttacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggtttacaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatcttagctcaagctaacactttagta 18711668  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgt 251  Q
    |||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  18711669 ccccaaaagttagatgagac-ttgattacaatttgt 18711703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 121 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18333463 - 18333317
Alignment:
Q  121 acaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacctt-cttgctaagttacccacttagacttttacaactt-ctgctcaaaataacactttagtaccc 218  Q
    |||| |||||| ||| |||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18333463 acaactgtattatcttagcctcagcagacttacacctttcttgctaagttacccacttagacttt-acacctttctgctcaaactaacactttagtaccc 18333365  T
Q  219 ctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatga 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18333364 ctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtatggagtttgaatga 18333317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 19363920 - 19363764
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  19363920 tgggttagtccacttctcacaatattgtgagagttttcactatgatgcttgagataacctctcaaatcatgcaccttacaatcttgttcgcctgaacaat 19363821  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacc 172  Q
    | |||||| |||||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||||||||||||||    
T  19363820 ttcaacaaatgtattctcttagcctcagcagacttatacctttcttgctaagttacc 19363764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28093475 - 28093230
Alignment:
Q  16 atgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||    ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28093475 atgggctaatccactcctcacaatcttgtgagaattttcactgtgatgcttgagat----tctcaaatcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaa 28093380  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgc-acctt-cttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacacttta 212  Q
     ||||||   ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||| ||||||  | |||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  28093379 ctacaac--ctgtattctctaagtctcggcaggcttacaaccttcctttctaagt--cacacttaga-ttttacaactttctgcttaaactaacatttta 28093285  T
Q  213 gtacccctaaagctagatgagac-tttgtttacaatttgtttggagtttgaatga 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || | |||||||||||    
T  28093284 gtacccctaaagctagatgagacttttatttacaattgattggaagtttgaatga 28093230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 168 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19361598 - 19361485
Alignment:
Q  168 ttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg-gagtttgaatga 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19361598 ttacccacttagacttttacaccttatgttcaaactaacactttagtacccataaagctagatgagactttctttacaatttgtttgtgagtttgaatga 19361499  T
Q  267 ttaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||||    
T  19361498 ttgaaatcagacaa 19361485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 126 - 234
Target Start/End: Original strand, 7754043 - 7754151
Alignment:
Q  126 tgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagc 225  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7754043 tgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttactaactcagctcaaactaacactttagtacccctaaagc 7754142  T
Q  226 tagatgaga 234  Q
    |||||||||    
T  7754143 tagatgaga 7754151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 26019935 - 26020055
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||||     
T  26019935 cttcttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagac----tttacaacatgtttga 26020030  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  26020031 agcttgaatgattgaaatcagacaa 26020055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 30657317 - 30657437
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||||     
T  30657317 cttcttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagac----tttacaagatgtttga 30657412  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  30657413 agcttgaatgattgaaatcagacaa 30657437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1597782 - 1597700
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1597782 cttcttgctaagttacccacttagacttttgctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 1597700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18202171 - 18202089
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18202171 cttcttgctaagttacccacttagacttttacttcttcttctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 18202089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9033953 - 9033833
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||  ||||||     
T  9033953 cttcttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagttagatgagac----tttacaagatgtttgt 9033858  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  9033857 agcttgaatgattgaaatcagacaa 9033833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18202083 - 18201962
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||    
T  18202083 cttcttgctaagttacccacttagtcttttgcacctttagcccaaactaacactttagtatccctaaagctagatgagact---tttacaagatgtttgg 18201987  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  18201986 agcttgaatgattgaaatcagacaa 18201962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 22222920 - 22223002
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22222920 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaccttaagctcaaattaacactttagtactcctaaagctagatgagacttt 22223002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 22248755 - 22248837
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22248755 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaccttaagctcaaattaacactttagtactcctaaagctagatgagacttt 22248837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 155 - 238
Target Start/End: Original strand, 790460 - 790543
Alignment:
Q  155 ccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  790460 ccttcttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaaacttt 790543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1597694 - 1597574
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||||     
T  1597694 cttcttgctaagttaccctcttagacttttgcacctttatctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagac----tttacaagatgtttga 1597599  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  1597598 agcttgaatgattgaaatcagacaa 1597574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 96
Target Start/End: Original strand, 12989069 - 12989148
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttaca 96  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  12989069 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttaca 12989148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9034041 - 9033953
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttac 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  9034041 cttcttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagattaaactttctttac 9033953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 18335765 - 18335659
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||||||  | |||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  18335765 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttaagataatttctcaaatcctacaccttacaacctt-ttcacctgaacaat 18335667  T
Q  117 tacaacaa 124  Q
    ||||||||    
T  18335666 tacaacaa 18335659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 26019847 - 26019929
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  26019847 cttcttgctaagtttcccacttagacttttgctccttctgctcaaactaacactttagcacctctaaagctagatgagacttt 26019929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 238
Target Start/End: Original strand, 6314708 - 6314917
Alignment:
Q  28 actcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacct-gaaaaattacaacaatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||  ||||| |||||| | | ||| |||||||| || |    
T  6314708 actcctcacaatcttgtgagaaattccattatgatgcttgagataccctctcaaatcctgcaccaaacaattttgttcccttggaacaattacaa-aact 6314806  T
Q  127 gtattctctaagcctcggcagtcttgc-acctt-cttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagtacccctaaa 223  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||| | |||||  ||||||||| || |   ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||| ||||    
T  6314807 gtattctcgaagcctcagcaggcttacaaccttgtttgctaagtcacac---tagac-tttacaactttctgctcaacctaacactttaatacccttaaa 6314902  T
Q  224 gctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||||    
T  6314903 gctagatgagacttt 6314917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Original strand, 7753934 - 7754000
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaat 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  7753934 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgtgagtttcctctatgatgttttagataacctctcaaat 7754000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 36317298 - 36317070
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  36317298 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 36317199  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  36317198 ttacgccaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcatcttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaactatcactttagta 36317099  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36317098 cccctaaagctagatgagactttctttac 36317070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 4037384 - 4037631
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4037384 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 4037483  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  4037484 ttacaattct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 4037582  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  4037583 cccctaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 4037631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20948703 - 20948439
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  20948703 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctacaccttacaaccttgttcacctgaacaat 20948604  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  20948603 tacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagt 20948505  T
Q  215 acccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||    
T  20948504 acccctaaagctagatgagactttctttacaatttgtatggaggttgaatgatatagatcagacaa 20948439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20959072 - 20958808
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  20959072 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctacaccttacaaccttgttcacctgaacaat 20958973  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  20958972 tacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagt 20958874  T
Q  215 acccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||    
T  20958873 acccctaaagctagatgagactttctttacaatttgtatggaggttgaatgatatagatcagacaa 20958808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 22172657 - 22172904
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22172657 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 22172756  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  22172757 ttacaattct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 22172855  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  22172856 cccctaaagctagatgaggctttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 22172904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 280
Target Start/End: Original strand, 23376165 - 23376432
Alignment:
Q  13 aatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||| |||||    
T  23376165 aatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcccctatgatgcttgagataacctctcaattcctgcaccttacaatcttgttcagctgaa 23376264  T
Q  113 aaattacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagt----tacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacac 208  Q
     || |||||||| |||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||    
T  23376265 caagtacaacaactgtattctctaagcgtcaacaggcttgctccttcttgctaagttacgtacccacttagacttttacaacctttactcaaactaacac 23376364  T
Q  209 tttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23376365 tttggtactcctaaatctagatgagac----tttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 23376432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 27273586 - 27273833
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  27273586 tgggttagtccactcctcataatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaattctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 27273685  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  27273686 ttacaatt-ttgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 27273784  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  27273785 tccctaaagctagatgagacttt-tttacaatttgtatggaggttgaatg 27273833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37818450 - 37818202
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  37818450 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagagaacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 37818351  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||    
T  37818350 ttacaattct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttactcaaactaacactttagta 37818252  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  37818251 cgcctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtatggaggttgaatg 37818202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 18208667 - 18208929
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18208667 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 18208766  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  18208767 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 18208865  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    | || |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  18208866 ctctaaaagttagatgagactttg-ttacaatttgtatggagcttgaatgaatgaaatcagacaa 18208929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 18218005 - 18218267
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18218005 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 18218104  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  18218105 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 18218203  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    | || |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  18218204 ctctaaaagttagatgagactttg-ttacaatttgtatggagcttgaatgaatgaaatcagacaa 18218267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 13571084 - 13571332
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  13571084 tgggttagtccactccttacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagagaacctctcaaatcctgcaccttataatctttgttcacctgaacaa 13571183  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||    
T  13571184 ttacaattct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttactcaaactaacactttagta 13571282  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13571283 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtatggaggttgaatg 13571332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31917663 - 31917416
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  31917663 tgggctagtccaatcctcacaatcttgtgagagttgccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaaactttgttcacctgaacaa 31917564  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||    
T  31917563 ttacaattct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttagta 31917465  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  31917464 cccctaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 31917416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Original strand, 19547653 - 19547904
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  19547653 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctacactttacaaccttgttcacctgaacaat 19547752  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    |||||||| | |||||||| || ||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  19547753 tacaacaactatattctcttagtctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagt 19547851  T
Q  215 acccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgat 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  19547852 acccctaaagctagatgagactttgtttacaattaatatggagtttgaatgat 19547904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 37537625 - 37537843
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  37537625 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccattatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacattccttgttcacctgaacaa 37537724  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  37537725 ttacaacatctgtattctctaagcctcagcagacttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagta 37537824  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    || ||||||||||||||||    
T  37537825 cctctaaagctagatgaga 37537843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 34129894 - 34130141
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  34129894 tgggttagtccactcgtcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatttttgttcacctgaacaa 34129993  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
     |||||  || |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  34129994 ctacaattat-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 34130092  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  34130093 ctcctaaagctagaggagactttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 34130141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21683038 - 21682776
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21683038 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 21682939  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| |     
T  21682938 tacaa-tcctgtattctctaagcctcaacaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggat 21682840  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
      || |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  21682839 ttctaaaagttagatgagactttg-ttacaatttgtatggagcttgaatgaatgaaatcagacaa 21682776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 30942694 - 30942933
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaat-cttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  30942694 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaa 30942793  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| |    
T  30942794 ttacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttagga 30942892  T
Q  216 cccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30942893 cctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 30942933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 30952116 - 30952355
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaat-cttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  30952116 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaa 30952215  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| |    
T  30952216 ttacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttagga 30952314  T
Q  216 cccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30952315 cctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 30952355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 37298219 - 37298466
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||| |     
T  37298219 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataaactctcaaatcatgcaccttacaaactttgttcacctgaacag 37298318  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||| ||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  37298319 ttataattct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttattgataagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 37298417  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  37298418 cccctaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 37298466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20897808 - 20897548
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaa-aa 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  20897808 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgctttagataacctctcaaatcttgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 20897709  T
Q  115 attacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcac-cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttag 213  Q
     |||||| |  ||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  20897708 tttacaaaacctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacttttcttactaagttacacacttagacttttacaccttttgctcaaactaacactttag 20897609  T
Q  214 tacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg-gagtttgaatgattaaaatcaga 277  Q
    |||||||| || ||||||||||    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  20897608 tacccctataggtagatgagac----tttacaatttgtttgagaatttgaatgattgaaatcaga 20897548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 19887093 - 19887310
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19887093 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcctctatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 19887192  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  19887193 ttacaattct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagta 19887291  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19887292 cccctaaagctagatgaga 19887310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21754386 - 21754169
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  21754386 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaa 21754287  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  21754286 ttacaatcct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaacactttagta 21754188  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21754187 cccctaaagctagatgaga 21754169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21763673 - 21763456
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  21763673 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaa 21763574  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  21763573 ttacaatcct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaacactttagta 21763475  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21763474 cccctaaagctagatgaga 21763456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 37646736 - 37646954
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  37646736 tgggttagtccactcctcacaatcttttgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacattccttgttcacctgaacaa 37646835  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||| |||||||||||||    
T  37646836 ttacaacatctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagcttaaactaacactttagta 37646935  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    || ||||||||||||||||    
T  37646936 cctctaaagctagatgaga 37646954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27413004 - 27412761
Alignment:
Q  12 taatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctga 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||||||||||||    
T  27413004 taatgtgggctagtccactcctcacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctatcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctga 27412905  T
Q  112 aaaattacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacacttt 211  Q
    | ||||||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||    
T  27412904 acaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacacttt 27412806  T
Q  212 agtacccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27412805 aggacctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 27412761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32071291 - 32071067
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32071291 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 32071192  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||  | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  32071191 tacaatca-tgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 32071093  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtt 241  Q
    | || |||||||||||||||||||||    
T  32071092 ctctaaaagctagatgagactttgtt 32071067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 256
Target Start/End: Original strand, 8764571 - 8764813
Alignment:
Q  13 aatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||    
T  8764571 aatatgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaa 8764670  T
Q  113 aaattacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacacttta 212  Q
     |||||| ||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  8764671 caattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaatcacttagacttttacaacctttgctcaacctaacacttta 8764769  T
Q  213 gtacccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8764770 gaacctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 8764813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18391085 - 18390847
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18391085 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 18390986  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  18390985 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 18390887  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18390886 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 18390847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 26191233 - 26191471
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26191233 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 26191332  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  26191333 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 26191431  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26191432 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 26191471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 33940171 - 33939933
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33940171 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 33940072  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  33940071 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 33939973  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33939972 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 33939933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 33950571 - 33950333
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33950571 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 33950472  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  33950471 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 33950373  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33950372 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 33950333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 11410319 - 11410566
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11410319 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagatgacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 11410418  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  11410419 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 11410517  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||    
T  11410518 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatggaagttgaatg 11410566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18362128 - 18361890
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| || |||    
T  18362128 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctaaacaat 18362029  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  18362028 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 18361930  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18361929 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 18361890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 26201815 - 26202053
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26201815 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 26201914  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  26201915 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 26202013  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  26202014 ctctaaaagctagatgagactatg-ttacaatttgtatgga 26202053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 204871 - 205118
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| || | || |||||||||||||| |||| ||| || |     
T  204871 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgttgcttgagataatctcttaattcttgcaccttacaatctttgttctccttaacat 204970  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||  |||||||||||||    
T  204971 ttacaatt-ttgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagaattttacaatctttgctcaagctaacactttagta 205069  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||    
T  205070 cccctaaagctagatgagac-ttgattacaatttgtgagaagtttgaatg 205118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19781454 - 19781207
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||| |     
T  19781454 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcatcttacaatctgtgttcacctgaacac 19781355  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||  | |||| ||  |||||||||||||    
T  19781354 ttacaa-ttttgtgttctctaagcctcggcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagactttcacaatctttgcttaagctaacactttagta 19781256  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    | | ||||| |||||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||    
T  19781255 ctcataaagttagatgagac-ttgattacaatttgtgagaagtttgaatg 19781207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 27578561 - 27578766
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  27578561 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctcttaaatcttgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 27578660  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| || | | |||||| |||||||||||||    
T  27578661 ttacaac-cctgtattctctaagcctcagcagacttgcaccttgttactaagttatccacttagacttttac-acatttactcaaactaacactttagta 27578758  T
Q  216 cccctaaa 223  Q
    ||||||||    
T  27578759 cccctaaa 27578766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20808088 - 20807841
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||| | |||||||||| |     
T  20808088 tgggttagtccactcctcacactcttgtgagagtttccaccatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttagaatctgtattcacctgaacac 20807989  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   |  ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  | || ||||  |||||||||||||    
T  20807988 ttacaattcta-tattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgttcaagctaacactttagta 20807890  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||    
T  20807889 cccctaaagctagatgagac-ttgattacaatttgtgagaagtttgaatg 20807841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 27 - 265
Target Start/End: Original strand, 42089922 - 42090158
Alignment:
Q  27 cactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaattacaacaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||||| | ||||||  ||    
T  42089922 cactcctcacaatcttgtgagagtttccact-tgatgcttgagataacctcttaaatcctgcactttacagtctttgttcacctgaacacttacaattat 42090020  T
Q  126 tgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagc 225  Q
     |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  42090021 -gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgctcaagctaacactttagtaccccaaaagc 42090119  T
Q  226 tagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||    
T  42090120 tagatgagac-ttgattacaatttgtgagaagtttgaatg 42090158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22245449 - 22245245
Alignment:
Q  30 tcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaattacaacaattgt 128  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | || ||||||||| | |||| ||   |||    
T  22245449 tcctcacaatcttatgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcatgcaccttacaatatgtgctcacctgaacacttac-acctctgt 22245351  T
Q  129 attctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctag 228  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||     
T  22245350 attctctaagcctcagcaggcttgcaccatgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcgactcaaaccaacactttagtacctctaaagctac 22245251  T
Q  229 atgaga 234  Q
    ||||||    
T  22245250 atgaga 22245245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36317070 - 36316965
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||  |||||||    
T  36317070 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaccttcagctcagactaacactttagtacccctaaagctagatgagac----tttacaagatgtttgg 36316975  T
Q  256 agtttgaatg 265  Q
    ||||||||||    
T  36316974 agtttgaatg 36316965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 37537941 - 37538061
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||||     
T  37537941 cttcttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagac----tttacaagatgtttga 37538036  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  37538037 agcttgaatgattgaaatcagacaa 37538061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 37647052 - 37647172
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||||     
T  37647052 cttcttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagac----tttacaagatgtttga 37647147  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  37647148 agcttgaatgattgaaatcagacaa 37647172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 37537853 - 37537935
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37537853 cttcttgctaagttacccacttagactttttctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 37537935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 37646964 - 37647046
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37646964 cttcttgctaagttacccacttagactttttctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 37647046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 19887408 - 19887528
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||  ||||||     
T  19887408 cttcttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacctctaaagctagatgagac----tttacaagatgtttga 19887503  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  19887504 agcttgaatgattgaaatcagacaa 19887528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22245235 - 22245157
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgaga 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22245235 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacccctaaagctatatgaga 22245157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 19887320 - 19887402
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19887320 cttcttgctaagttgcccacttagacttttgctccttctgctcaaactaacactttagcacctctaaagctagatgagacttt 19887402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 98
Target Start/End: Original strand, 20904028 - 20904109
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaat 98  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20904028 tgggttagtccactcctcccaatcttgtgaaagtttcaactatgatgcttgagataacctctcaaatccttcaccttacaat 20904109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21754156 - 21754056
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  21754156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactatg-ttacaatttgtgtg 21754058  T
Q  255 ga 256  Q
    ||    
T  21754057 ga 21754056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21763443 - 21763343
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  21763443 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactatg-ttacaatttgtgtg 21763345  T
Q  255 ga 256  Q
    ||    
T  21763344 ga 21763343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Original strand, 20904114 - 20904188
Alignment:
Q  203 taacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg-gagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  20904114 taacactttagtacccctaatgctagatgagac----tttacaatttgtttgtgagtttaaatgattgaaatcagacaa 20904188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11459990 - 11459727
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  | || | |||||| |||||||||| || |||    
T  11459990 tgggttagtccacttctcacaatcttatgagagttttcactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcatcctacaatattgttcacctaaacaat 11459891  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||    
T  11459890 tacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttacccgcttacacttttacactttttgctcaaactaacactttagtac 11459791  T
Q  217 ccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11459790 ccctaaagctatatgagactttctttacaatttgtttggagtttgaatgattgaaatcagacaa 11459727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25433961 - 25433739
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  25433961 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaa 25433862  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  25433861 ttacaacaattgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccctgttgctaagttacccacttaaacttttacaaactcagctcaaactaacactttagta 25433762  T
Q  216 cccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  25433761 cccctaaagctagatgagacttt 25433739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 2488085 - 2488303
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  2488085 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcttgcaccttacaatccttgttcacctgaacaa 2488184  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  2488185 ttacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagta 2488284  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2488285 cccctaaagctagatgaga 2488303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 19827443 - 19827691
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19827443 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagagaacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 19827542  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  19827543 ttacaattct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 19827641  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19827642 cccctaaagttagatgagactttgtttacaatttgtatggaggttgaatg 19827691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 24872435 - 24872699
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  24872435 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaat 24872534  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  24872535 tacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagt 24872633  T
Q  215 acccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||    
T  24872634 acccctaaagctagatgagactttctttacaatttgtatggaggttgaatgatatagatcagacaa 24872699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 11201 - 11448
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  11201 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 11300  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||    
T  11301 ttacaactct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagatttttacaacctttgctcaagctaacactttagta 11399  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  11400 cccctaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 11448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 49386591 - 49386858
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  49386591 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgtttgagataacttctcaaatcatgcaccttacaaccttgttcacctgaacaat 49386690  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  49386691 tacaacaactgtattctcttagcctcagcaagcttacacctttcttgctaagttacccacttagacttttacacctttatgctcaaactaacactttagt 49386790  T
Q  215 acccctaaagctagatgagac-tttgtttacaatttgtttgga-gtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||  | |||||||||    
T  49386791 acccctaaagctagatgagacttttctttacaatttgtatggaggtttgaatgatatagatcagacaa 49386858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 10507882 - 10508130
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  10507882 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagtgtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgaaccttacaatctttgttcacctgaacaa 10507981  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||  |||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  10507982 ttacaaccct-gtattctctaagcctcaacaggtctgcaccttcttactaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaaattaacactttagta 10508080  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
      ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  10508081 agcctaaagttagatgagactttgattacaatttgtatgaagtttgaatg 10508130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 1684465 - 1684703
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1684465 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 1684564  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  1684565 tacaa-tcttgtattctctaagcctcggcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 1684663  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1684664 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 1684703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12387085 - 12386850
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||| || ||||||||||| |     
T  12387085 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctttcaaatcctacaccttacaatttttgttcacctgaacag 12386986  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||  |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||   |||||||||||||    
T  12386985 ttacacaacctgtattctctaagccttagcagtcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctcggctcaggctaacactttagta 12386886  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12386885 cccctaaagctagatgagactttgattacaatttgt 12386850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 13118654 - 13118872
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  13118654 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacgttacaatccttgttcacctgaacaa 13118753  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  13118754 ttacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacccggttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagta 13118853  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  13118854 cccctaaaactagatgaga 13118872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 20492882 - 20492648
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttg-ttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||| |||  |||||||||| ||    
T  20492882 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagaaaacctctcaaatcctgcaccttacaaactttattcacctgaacaa 20492783  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  20492782 ttacaacc-ttgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttactcaaactaacactttagta 20492684  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgt 251  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  20492683 cccctaaagttagatgagattctgtttacaatttgt 20492648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4372391 - 4372174
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  4372391 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatcttcgttcacctgaacaa 4372292  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  4372291 ttacaatcct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaacactttagta 4372193  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4372192 cccctaaagctagatgaga 4372174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4382132 - 4381915
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  4382132 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatcttcgttcacctgaacaa 4382033  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  4382032 ttacaatcct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaacactttagta 4381934  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4381933 cccctaaagctagatgaga 4381915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 4781659 - 4781876
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| |     
T  4781659 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacag 4781758  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  4781759 ttacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagta 4781857  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4781858 cccctaaagctagatgaga 4781876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 5654840 - 5655078
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5654840 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 5654939  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  5654940 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 5655038  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5655039 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 5655078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 8973697 - 8973459
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8973697 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 8973598  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  8973597 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 8973499  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8973498 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 8973459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 8984252 - 8984014
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8984252 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 8984153  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  8984152 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 8984054  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8984053 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 8984014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 9537986 - 9537748
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9537986 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 9537887  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  9537886 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 9537788  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9537787 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 9537748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 9548312 - 9548074
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9548312 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 9548213  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  9548212 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 9548114  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9548113 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 9548074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 16334630 - 16334868
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16334630 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 16334729  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  16334730 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 16334828  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16334829 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 16334868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 20743921 - 20744138
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||||||| |     
T  20743921 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagttttcactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcacctgaacac 20744020  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  20744021 ttacaactct-gtattttctaagcctcagcagtcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagta 20744119  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20744120 cccctaaagctagatgaga 20744138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20293897 - 20293650
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||| |     
T  20293897 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacac 20293798  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||    ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| |||||  ||| |||||||||    
T  20293797 ttacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggcttacaccttgttgctaagttaaccacttagatttttacaatctcttctcaagttaatactttagta 20293699  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  20293698 cccctgaagctagatgagac-ttgattacaatttgtgaggagtttgaatg 20293650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Original strand, 4023341 - 4023574
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4023341 tgggttagtccactcc-cacaatcttgagagagtttccactatgatatttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaataa 4023439  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||    
T  4023440 ttacaaccct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttactcaaactaacactttagta 4023538  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgt 251  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  4023539 cccctaaagttagatgagattatgtttacaatttgt 4023574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 268
Target Start/End: Original strand, 14801638 - 14801891
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||| |     
T  14801638 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacac 14801737  T
Q  116 ttacaacaat--tgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttag 213  Q
    |||||| |||  |||||| | ||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||  |||||||||||    
T  14801738 ttacaataattatgtattgtgtaagcctcaacaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgctcaagctaacactttag 14801837  T
Q  214 tacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgatt 268  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||  | |||||||||||||    
T  14801838 tacccctaaagctagatgaga-gttgattataatttgtgagaagtttgaatgatt 14801891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6433583 - 6433347
Alignment:
Q  19 ggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaatta 118  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6433583 ggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaatta 6433484  T
Q  119 caacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtaccc 218  Q
    | ||   ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| |||     
T  6433483 c-actcctgtattctctaagcctcagcaggattgcaccttcttgctaagttagccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacct 6433385  T
Q  219 ct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6433384 ctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 6433347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6423158 - 6422920
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | || |||||||||||||||||| ||| |||    
T  6423158 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcagcttacaatcttgttcaccagaacaat 6423059  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||| |   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  6423058 taca-ctcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttagccacttagacttttacaacatttgctcaacctaacactttaggac 6422960  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6422959 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 6422920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Original strand, 51977698 - 51977919
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||| |     
T  51977698 tgggttagttcactcctcacaatctagtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcttgcaccttacaatttgtgttcacctgaacac 51977797  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
     ||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  51977798 ctacaactct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgcggagttaaccatttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 51977896  T
Q  216 cccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  51977897 cccctaaagctagatgagacttt 51977919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 70 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24794236 - 24794025
Alignment:
Q  70 ataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaattacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacctt-cttgctaagt 168  Q
    ||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||    
T  24794236 ataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattatcttagcctcatcaggcttacacctttcttgctaagt 24794137  T
Q  169 tacccacttagacttttacaactt-ctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgat 267  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24794136 tacccacttagacttt-acacctttcagctcaaactaacactttagtacctctaaagctagatgatactttgtttacaatttgtatggagtttgaatgat 24794038  T
Q  268 taaaatcagacaa 280  Q
      | |||||||||    
T  24794037 atagatcagacaa 24794025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17734955 - 17734725
Alignment:
Q  52 tccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaattacaacaattgtattctctaagcctcggcagtctt 151  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| |||    
T  17734955 tccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctacaccttacaaccttgttcgcctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcaccaggctt 17734856  T
Q  152 gca-ccttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagac-tttgtttacaatt 248  Q
     ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||    
T  17734855 acatatttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctatatgagacttttgattacagtt 17734757  T
Q  249 tgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||| |||||| ||||||||| | |||||||||    
T  17734756 tgtatggagtatgaatgatttagatcagacaa 17734725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19036224 - 19035994
Alignment:
Q  52 tccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaattacaacaattgtattctctaagcctcggcagtctt 151  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| |||    
T  19036224 tccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctacaccttacaaccttgttcgcctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcatcaggctt 19036125  T
Q  152 gca-ccttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagac-tttgtttacaatt 248  Q
     ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||    
T  19036124 acatttttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctatatgagacttttgattacagtt 19036026  T
Q  249 tgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||| |||||| ||||||||| | |||||||||    
T  19036025 tgtatggagtatgaatgatttagatcagacaa 19035994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Original strand, 23503078 - 23503295
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  23503078 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagttttcactatgatgcttaagataccctatcaaattttgcaccttacaatcttgttcatctgaacaat 23503177  T
Q  117 tac-aacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgc-accttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||  ||| ||| | ||||||     ||||||||| ||||||| ||||||  |||| |||||| ||| ||||||||    
T  23503178 tacaaacaactgtattctctaagcctcaacagacttacaaccttc-----aagttacccgcttagac-tttacactttcttctcaaactaatactttagt 23503271  T
Q  215 acccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  23503272 acccctaaagatagatgagacttt 23503295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Original strand, 10002639 - 10002792
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  10002639 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtacttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 10002738  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagtta 170  Q
    |||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  10002739 ttacaac-tctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagtta 10002792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 142
Target Start/End: Original strand, 10507068 - 10507193
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  10507068 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagtgtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgaaccttacaatctttgttcacctgaacaa 10507167  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctc 142  Q
    |||||||   |||||||||||||||||    
T  10507168 ttacaac-cctgtattctctaagcctc 10507193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 51977925 - 51978007
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51977925 cttcttgctaagttacccacttagacttttactccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 51978007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 4781974 - 4782094
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||||     
T  4781974 cttcttgctaagttgcccacttagacttttgctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagac----tttacaagatgtttga 4782069  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  4782070 agcttgaatgattgaaatcagacaa 4782094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 2488313 - 2488395
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2488313 cttcttgctaagttacccacttagacttttgctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 2488395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 13118882 - 13118964
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13118882 cttcttgctaagttacccacttagactttttcttcttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 13118964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 20744148 - 20744230
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20744148 cttcttgctaagttacccacttagactttttctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 20744230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 2488401 - 2488521
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||||     
T  2488401 cttcttgctaagttaccctcttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagac----tttacaagatgtttga 2488496  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  2488497 agcttgaatgattgaaatcagacaa 2488521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 20744236 - 20744356
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||||     
T  20744236 cttcttgctaatttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagac----tttacaagatgtttga 20744331  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  20744332 agcttgaatgattgaaatcagacaa 20744356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 121
Target Start/End: Original strand, 38817174 - 38817279
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  38817174 tgggttagtccacttctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgtttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 38817273  T
Q  116 ttacaa 121  Q
    ||||||    
T  38817274 ttacaa 38817279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 251
Target Start/End: Original strand, 10011576 - 10011654
Alignment:
Q  172 ccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10011576 ccacttagacttttacaactcttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagactttg-ttacaatttgt 10011654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25433733 - 25433613
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||||     
T  25433733 cttcttgctaagttacccacttagagttttgcacctttacctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagac----tttacaagatgtttga 25433638  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  25433637 agcttgaatgattgaaatcagacaa 25433613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4372068 - 4371968
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4372068 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtgtg 4371970  T
Q  255 ga 256  Q
    ||    
T  4371969 ga 4371968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4381809 - 4381709
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4381809 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtgtg 4381711  T
Q  255 ga 256  Q
    ||    
T  4381710 ga 4381709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 51978013 - 51978133
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||||     
T  51978013 cttcttaccaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagac----tttacaagatgtttga 51978108  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||| ||||    
T  51978109 agcttgaatgattgaaatcaaacaa 51978133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 4781886 - 4781968
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4781886 cttcttgctaagttgcccacttagacttttgctccttctgctcaaactaacactttagcacctctaaagctagatgagacttt 4781968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 24773616 - 24773550
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaat 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24773616 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctttcaaat 24773550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4372161 - 4372074
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgttt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||    
T  4372161 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactatgttt 4372074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4381902 - 4381815
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct-aaagctagatgagactttgttt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||    
T  4381902 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactatgttt 4381815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 13118970 - 13119090
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||||     
T  13118970 cttctttctaagttacgcatttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagac----tttacaagatgtttga 13119065  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||| ||||    
T  13119066 agcttgaatgattgaaatcatacaa 13119090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Original strand, 683023 - 683087
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaa 81  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  683023 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaa 683087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 11043918 - 11043986
Alignment:
Q  13 aatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaa 81  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  11043918 aatatgggctaatccactcctcacaatcttatgagaattttcactataatgcttgagataacctctcaa 11043986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Original strand, 13430732 - 13430798
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaat 83  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| | | ||||||||    
T  13430732 tgggctaatctactcttcacaatcttgtgagaattttcaatctgatgcttgagacaccatctcaaat 13430798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 24814684 - 24814638
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatg 63  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24814684 tgggttagtccactactcacaatcttgtgagattttccactatgatg 24814638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Original strand, 2522 - 2743
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  2522 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatgttgttcaactgaacaat 2621  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  2622 tacatcaactgtattctctaagcctcagcaggattgcaccttcttgctaagtgacccacttagacttttacatcttctgctcaaactaacactttagtac 2721  T
Q  217 ccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  2722 ccctaaagctagacgagacttt 2743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 2837 - 2958
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg- 254  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    ||||  ||||||     
T  2837 cttcttgctgagttacccacttagacttttacaccttcagctcaaactaccactttagtacccgtaaagctagatgagacttt----acaagatgtttgt 2932  T
Q  255 gagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  2933 gagtttgaatgattgaaatcagacaa 2958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 2749 - 2831
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2749 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaccttcaactcaaactaccactttagtacacctaaagctagatgagacttt 2831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 57 - 304
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  57 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcttgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 156  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  157 ttacaatt-ttgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagtcttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 255  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  256 cccctaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27066931 - 27066684
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  27066931 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 27066832  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||  || |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  27066831 ttacaattat-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 27066733  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  27066732 cccctaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 27066684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Original strand, 52948908 - 52949159
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  52948908 tgggttagtccactcctcacagttttgtgagattttccattatgatgcttgagataacttctcaaattctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaat 52949007  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  52949008 tacaacaattgtattctcttagcctcagcagacttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagt 52949106  T
Q  215 acccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgat 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52949107 acccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtatggagtttgaatgat 52949159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 1973895 - 1974159
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  1973895 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaat 1973994  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  1973995 tacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagt 1974093  T
Q  215 acccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||    
T  1974094 acccctaaagctagatgagactttctttacaatttgtatggaggttgaatgatatagatcagacaa 1974159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 1988682 - 1988946
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  1988682 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaat 1988781  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  1988782 tacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagt 1988880  T
Q  215 acccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||  | |||||||||    
T  1988881 acccctaaagctagatgagactttctttacaatttgtatgaaggttgaatgatatagatcagacaa 1988946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20315282 - 20315035
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  20315282 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 20315183  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  20315182 ttacaattct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 20315084  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  20315083 cccctaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 20315035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 2117705 - 2117459
Alignment:
Q  18 gggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaat 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |  | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2117705 gggctagtccacttctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcacctttcaatccttgttcacctgaaaaat 2117606  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||    
T  2117605 tacaactct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttactcaaactaacactttagtac 2117507  T
Q  217 ccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  2117506 ccctaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 2117459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 34823819 - 34823557
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34823819 tgggttagtccatttctcacaatcttatgagagtttctactatgatgtttgagataaccgctcaaatcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 34823720  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
     ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||    
T  34823719 gacaacaactgtattctctaagcctcaacaggcttacaccttcttgctaagttatccacttagacttttacacattatgctcaaactaacactttagtac 34823620  T
Q  217 ccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34823619 ccctaaagctagatgagactttctttacaatgag-ttggagtttgagtgattgaaatcagacaa 34823557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 259
Target Start/End: Original strand, 2369627 - 2369874
Alignment:
Q  12 taatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctg 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  | ||||||||||| || |||||| ||    
T  2369627 taatgtggactagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgctttagataacctctaaaatcatgcaccttacaatttttgttcacgtg 2369726  T
Q  111 aaaaattacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactt 210  Q
    || ||||||||  || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||    
T  2369727 aacaattacaaatat-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaacaaacactt 2369825  T
Q  211 tagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtt 259  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  2369826 tagtacccctaaagttagatgagactttgattacaatttgtatggagtt 2369874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 232
Target Start/End: Original strand, 26192298 - 26192514
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  26192298 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaa 26192397  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| ||||| |||||||    
T  26192398 ttacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccctgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacattttagta 26192497  T
Q  216 cccctaaagctagatga 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  26192498 cccctaaagctagatga 26192514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 18096129 - 18096377
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  18096129 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttgcactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttagaatctttgttcacctgaacaa 18096228  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||  | |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||| |||||    
T  18096229 ttacacaacttgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactatagta 18096328  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  18096329 cccctaaagctagatgaga-tttgtttacaatttgtgagaagtttgaatg 18096377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37013203 - 37012982
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  37013203 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactacgatgttatagataacctctcaaatcctgcactttacaatcttgttcacttgaacaat 37013104  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  37013103 tacatcaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgttaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtac 37013004  T
Q  217 ccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  37013003 ccctaaagctagttgagacttt 37012982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 42035065 - 42034818
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  42035065 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctttcaagtcctgcaccttacaatctttgttcaccagaacaa 42034966  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||    
T  42034965 ttacaattct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttgcaaccttcgctcaaactaacactttagta 42034867  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  42034866 cccctaaagctagatgagactttg-ttgcaatttgtatggaggttgaatg 42034818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Original strand, 30548835 - 30549074
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |  | ||| | |||||||| ||||||||||| ||    
T  30548835 tgggctagtccactcctcacaatcttgtaagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcacataacaatctttgttcacctgaacaa 30548934  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  30548935 ttacaactct-gtattctctaagcctaagcagacttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 30549033  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggag 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  30549034 cccctaaagctagatgagactttgttt-caatttgtatggag 30549074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 20327383 - 20327600
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  20327383 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagttcccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 20327482  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||  || |||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  20327483 ttacaattat-gtattctctatgcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagta 20327581  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20327582 cccctaaagctagatgaga 20327600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16155734 - 16155496
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16155734 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 16155635  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||  | ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  16155634 tacaatca-tgtattctctaagcctcagcaagcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 16155536  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16155535 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 16155496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21459479 - 21459241
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21459479 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 21459380  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  21459379 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 21459281  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21459280 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 21459241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4951286 - 4951061
Alignment:
Q  12 taatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctg 110  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||||||||    
T  4951286 taatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgaaagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcatgcaccttacaatctgagttcacctg 4951187  T
Q  111 aaaaattacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactt 210  Q
    || | ||||||   |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||    
T  4951186 aacacttacaatt-ttgtattctctaagcctcagcagacttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgctcaagctaacactt 4951088  T
Q  211 tagtacccctaaagctagatgagactt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4951087 tagtacccctaaagctagatgagactt 4951061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8541112 - 8540878
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  8541112 tgggttagtccactcctcacaagattgtgagagtttccactacgatgcttgagataacatctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 8541013  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||| | | |||||| |||||||||||||    
T  8541012 ttacaactct-gtattctctaagcatcagcagacttgcaccttgttgctaagttaactacttagacgtttacaaccttttctcaaactaacactttagta 8540914  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgt 251  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8540913 cccctaaagctagatgagattttgtttacaatttgt 8540878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8606351 - 8606117
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  8606351 tgggttagtccactcctcacaagattgtgagagtttccactacgatgcttgagataacatctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 8606252  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||| | | |||||| |||||||||||||    
T  8606251 ttacaactct-gtattctctaagcatcagcagacttgcaccttgttgctaagttaactacttagacgtttacaaccttttctcaaactaacactttagta 8606153  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgt 251  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8606152 cccctaaagctagatgagattttgtttacaatttgt 8606117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25020319 - 25020081
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25020319 tgggctagtccactcctcacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 25020220  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  25020219 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaacctcttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 25020121  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
      || ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25020120 ttctaaaagctatatgagactttg-ttacaatttgtatgga 25020081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Original strand, 25043823 - 25044065
Alignment:
Q  22 tagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaattaca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  25043823 tagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcatcttacaatctgtgttcacctgaacacttaca 25043922  T
Q  121 acaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct 220  Q
    |   |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||  |   |||||| ||||||| |||||||| |    
T  25043923 a-ttttgtgttctctaagcctcggcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagatttttacaaacttaactcaaactaacactatagtacccgt 25044021  T
Q  221 aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  25044022 aaagctagatgaga-tttgtttacaatttgtaagaagtttgaatg 25044065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 20316901 - 20317118
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  20316901 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagttcccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctaaacaa 20317000  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  20317001 ttacaattct-gtattctctatgcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagta 20317099  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  20317100 cccctaaaactagatgaga 20317118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Original strand, 25822374 - 25822595
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| | || ||||||||| |     
T  25822374 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctctaatcttgcaccttacaatatgtgctcacctgaacac 25822473  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    || || |  | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  25822474 ttgcacctct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgataagttaaccacttagactcttacaatttttgctcaaactaacactttagta 25822572  T
Q  216 cccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  25822573 cccctaaagctagatgagacttt 25822595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 41543039 - 41543256
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||| ||||||| |||| |     
T  41543039 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgtttgagataacccctcaaatcctgcaccttacaatctatgttcacatgaacac 41543138  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||| || || |||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  41543139 ttactactat-gtattctctaagcctcagtaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagta 41543237  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  41543238 cccctaaagctagatgaga 41543256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22961755 - 22961535
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||| || |     
T  22961755 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctaaacac 22961656  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||| ||  |  ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||    
T  22961655 ttaccactcta-tattctctaagcctcagcaggcttgcacctagttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttactcaaactaacactttagta 22961557  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22961556 cccctaaagctagatgagactt 22961535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Original strand, 25038611 - 25038853
Alignment:
Q  22 tagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaattaca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  25038611 tagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttaca 25038710  T
Q  121 acaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct 220  Q
    |    |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||  |   |||||| ||||||| |||||||| |    
T  25038711 a-ttctgtattctctaagcctcaacaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagatttttacaaacttaactcaaactaacactatagtacccgt 25038809  T
Q  221 aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  25038810 aaagctagatgaga-tttgtttacaatttgtaagaagtttgaatg 25038853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 49336600 - 49336379
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||| || ||||||||| |     
T  49336600 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgtaccttacaatctgtgctcacctgaacac 49336501  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||| |  | |||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||    
T  49336500 ttacacctct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccatgttgctaagttgaccacttagacttttacaatatttgctcaaactaacactttagta 49336402  T
Q  216 cccctaaagctagatgagacttt 238  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  49336401 tccctaaagctagatgagacttt 49336379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 19747449 - 19747666
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  | ||| ||||||| | |||||||||||| |     
T  19747449 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataatctctcaaatcctgcactttacaatttgtgttcacctgaacac 19747548  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  19747549 ttacaactct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaggttaaccacttagacttttacaaactcaactcaaactaacactttagta 19747647  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
     | ||||||||||||||||    
T  19747648 tctctaaagctagatgaga 19747666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 278
Target Start/End: Original strand, 21820671 - 21820931
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaa-aa 114  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  21820671 tgggttagtccactcctcccaatcttgtgaaagtttccactatgatacttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 21820770  T
Q  115 attacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcac-cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttag 213  Q
     |||||  |  |||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||| || ||||| |||||||||||    
T  21820771 tttacacaacctgtattctctaagcctcaccaggcttgcacttttcttgctaagttacacacttctacttttacaccttttg-tcaaactaacactttag 21820869  T
Q  214 tacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg-gagtttgaatgattaaaatcagac 278  Q
    ||||||||| | ||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21820870 tacccctaatgttagatgagac----tttacaatttgtttgtgagtttgaatgattgaaatcagac 21820931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21793598 - 21793339
Alignment:
Q  22 tagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaa-aaattac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  21793598 tagtccactcctcacaatcttgtgggagtttccactatgatgctttagataacctctcaaatcctacaccttacaatctttgttcacctgaacaatttac 21793499  T
Q  120 aacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcac-cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta-cc 217  Q
    || |  ||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||  |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  21793498 aaaacctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacttttcttattaagttacacacttagacttttacaccttttgctcaaactaacactttagtaccc 21793399  T
Q  218 cctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg-gagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    |||| || ||||||||||     ||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||    
T  21793398 cctataggtagatgagac----cttaaaatttgtttgtgagtctgaatgattgaaattagacaa 21793339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18384195 - 18384011
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||| | || ||    
T  18384195 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttctactatgatgcttgagataacctctcaaatcctacaccttacaatctttgttcacataaacaa 18384096  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaa 201  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18384095 ttacaac-tttgtattctctaagcctgagcaggcttgcaccatgttgctaagttaaccacttagacttttacaacatttgctcaaa 18384011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 13965897 - 13965749
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  13965897 tgggttagtccactcc-cacaatcttgagagagtttccactatgataattgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 13965799  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaa 166  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||    
T  13965798 ttacaacca-tgtattctctaagcctcagcaggtttgcaccttgttgctaa 13965749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 41543266 - 41543348
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41543266 cttcttgctaagttacccacttagacttttactccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 41543348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 26192614 - 26192734
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||||     
T  26192614 cttcttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagac----tttacaagatgtttga 26192709  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  26192710 agcttgaatgattgaaatcagacaa 26192734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22957308 - 22957057
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |  |||||||| | ||||| ||  | ||| ||||||   |||| | ||||| |      
T  22957308 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttgcactatggtatttgagataccttctcagatcctgcactttacaaaaatgttaatctgaacata 22957209  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgca-ccttcttg-ctaagttacccacttagacttttacaacttc--tgctcaaaataacacttta 212  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||   |||||||| ||||| ||||    
T  22957208 taca-caattgtattctctaaacctcagcaggcttacaaccttcttggctaagttacccacttagacttt-acatttttcttgctcaaactaacatttta 22957111  T
Q  213 gtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatga 266  Q
    |||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  22957110 gtactcttaaagctaaatgaaactttgtttacaatttgagaggagtttgaatga 22957057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 12420260 - 12420179
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaat 98  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  12420260 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaat 12420179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 37012888 - 37012770
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||  |||||||    
T  37012888 cttcttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatga------ctttacaagatgtttgg 37012795  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  37012794 agcttgaatgattgaaatcagacaa 37012770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 41543354 - 41543475
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccc-taaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||  ||||||    
T  41543354 cttcttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagcccaaactaacactttagtaccccttaaagctagatgagac----tttacaagatgtttg 41543449  T
Q  255 gagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||    
T  41543450 gagcttgaatgattgaaatcagacaa 41543475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 19747831 - 19747950
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||  |||||||    
T  19747831 cttcttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagcccaac-taacactttagtacccctaaagttagatgagac----tttacaagatgtttgg 19747925  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  19747926 agcttgaatgattaaaatcagacaa 19747950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 20317216 - 20317336
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||  ||||||     
T  20317216 cttcttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaaggtagatgagac----tttacaagatgtttga 20317311  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||| ||||    
T  20317312 agcttgaatgattgaaatcaaacaa 20317336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 20327698 - 20327818
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||  ||||||     
T  20327698 cttcttgctaagttacccactaagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaaggtagatgagac----tttacaagatgtttga 20327793  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  20327794 agcttgaatgattgaaatcagacaa 20327818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 20317128 - 20317210
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20317128 cttcttgctaagttgcccacttagactttagctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 20317210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 26192526 - 26192608
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26192526 cttcttgctaagttacccacttaaatttttgctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 26192608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 265
Target Start/End: Original strand, 25822601 - 25822709
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |     
T  25822601 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaaactcagttcaaactaacactttagtatctctaaagctagatgaga-tttgtttaccatttgtgaga 25822699  T
Q  256 agtttgaatg 265  Q
    ||||||||||    
T  25822700 agtttgaatg 25822709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 49336373 - 49336253
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    |||||||| ||||||     
T  49336373 cttcttgctaagttacccatttagacttttgcacctttagctcaaactaacattttagtacccctaaaactagatgagac----tttacaatatgtttga 49336278  T
Q  256 agtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    || |||||||||| | |||||||||    
T  49336277 agcttgaatgattgagatcagacaa 49336253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 25868197 - 25868131
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaat 83  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25868197 tgggttagtccactcctcacaatcttgtaagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaat 25868131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37012976 - 37012894
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  37012976 cttcttgctaagttacctacttagacttttgctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaaggtagacgagacttt 37012894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 20327610 - 20327692
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||  |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20327610 cttcttgctaagttgcgcagttagactttagctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 20327692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13965565 - 13965486
Alignment:
Q  172 ccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgt 251  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  13965565 ccacttagacttttacaacctttactcaaactaacactttagaacccctaaagttagatgagattatgtttacaatttgt 13965486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22892421 - 22892366
Alignment:
Q  26 ccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaa 81  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22892421 ccactcctcacaatcttgtgagaatttccactatgatgcttgagataacctctcaa 22892366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 235
Target Start/End: Original strand, 19747676 - 19747752
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagac 235  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||   |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19747676 cttctcgctaagttacccacttagacttttactccttct---caaactaacactttagtacccctacagctagatgagac 19747752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 21904538 - 21904581
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatg 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21904538 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatg 21904581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22892268 - 22892213
Alignment:
Q  26 ccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaa 81  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||| ||||||    
T  22892268 ccactcctcacaatcttgtgagaatttccaccatgatgcttaagataacttctcaa 22892213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22892674 - 22892624
Alignment:
Q  31 cctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaa 81  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22892674 cctcacaatcttgtaagaatttccactatgatgcttgagataacttctcaa 22892624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 249 - 280
Target Start/End: Original strand, 18058427 - 18058458
Alignment:
Q  249 tgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18058427 tgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 18058458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 22959199 - 22959167
Alignment:
Q  13 aatatgggctagtccactcctcacaatcttgtg 45  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22959199 aatatgggttagtccactcctcacaatcttgtg 22959167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16300 - 16033
Alignment:
Q  13 aatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||| |||||    
T  16300 aatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcccctatgatgcttgagataacctctcaattcctgcaccttacaatcttgttcagctgaa 16201  T
Q  113 aaattacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagt----tacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacac 208  Q
     || |||||||| |||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||    
T  16200 caagtacaacaactgtattctctaagcgtcaacaggcttgctccttcttgctaagttacgtacccacttagacttttacaacctttactcaaactaacac 16101  T
Q  209 tttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16100 tttggtactcctaaatctagatgagac----tttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 16033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 20271 - 20489
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  20271 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaa 20370  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  20371 ttacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagta 20470  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  20471 cccctaaagctatatgaga 20489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 262
Target Start/End: Original strand, 20499 - 20603
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  20499 cttcttgctaagttacccacttatacttttacaacctttgctcaaactaacac-ttaatacccctaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgg 20596  T
Q  256 agtttga 262  Q
    || ||||    
T  20597 aggttga 20603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 55061 - 55308
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  55061 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 55160  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||    
T  55161 ttacaactct-gtattctctaagcctcagcagacttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaatactttaata 55259  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  55260 cccctaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 55308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 6225 - 6486
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  6225 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactataatgcttgagataacctctcaaatcctacaccttacaaccttgttcacctgaacaat 6324  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcac-cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  ||||||||| || |||| |||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||    
T  6325 tacaacacctgtattctcaaaacctcagcaggcttacacttttcttgctaagttacccacttagacttttacaccttttgctcagactaacactttagta 6424  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgttt-ggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    |||||||||||| |||||||    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  6425 cccctaaagctaaatgagac----tttacaatttgtttatgagtttgaatgattgaaatcagacaa 6486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 73944 - 74191
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |  |  ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  73944 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataatctctcaagtcctgaaccttacaatctttgttcacctgaacaa 74043  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  74044 ttacaactct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 74142  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  74143 cccctaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 74191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0313
Description:

Target: scaffold0313; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 6621 - 6355
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  6621 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaat 6522  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttt-tacaacttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  6521 tacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagactttatac-ctttctgctcaaactaacactttagt 6423  T
Q  215 acccctaaagctagatgagac-tttgtttacaatttgtttgga-gtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||  | |||||||||    
T  6422 acccctaaagctagatgagacttttctttacaatttgtatggaggtttgaatgatatagatcagacaa 6355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20766 - 20512
Alignment:
Q  29 ctcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaattacaacaattgt 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  20766 ctcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactgt 20667  T
Q  129 attctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttt-tacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagct 226  Q
    ||||||| |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20666 attctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagactttatac-ctttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagct 20568  T
Q  227 agatgagac-tttgtttacaatttgtttgga-gtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||  | |||||||||    
T  20567 agatgagacttttctttacaatttgtatggaggtttgaatgatatagatcagacaa 20512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 10403 - 10235
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  10403 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaat 10304  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttt 184  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10303 tacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagacttt 10235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0591 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0591
Description:

Target: scaffold0591; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1801 - 1536
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  1801 tgggctagtcaactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttgcaatctttgttcacttgaacaa 1702  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagac-ttttacaacttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    ||||| ||  |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | | |||||| ||||||||||||    
T  1701 ttacagcacatgtattctctaagcttcagcaggcttgcaccttcttgctaagttacccgcgtagactttttacaacctttactcaaactaacactttagt 1602  T
Q  215 acccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1601 acccctaaagctaaatgagattttgattacaaattgtatggagtttgaatgattgaaatcaaacaa 1536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0591; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 65 - 1
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaa 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  65 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 212 - 1
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  212 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 113  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  112 ttacaactct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagta 14  T
Q  216 cccctaaagctag 228  Q
    |||||||||||||    
T  13 cccctaaagctag 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0764 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0764
Description:

Target: scaffold0764; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 280
Target Start/End: Original strand, 1 - 254
Alignment:
Q  30 tcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaattacaacaattgta 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1 tcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactgta 100  T
Q  130 ttctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttt-tacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagcta 227  Q
    |||||| |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  101 ttctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagactttatac-ctttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagcta 199  T
Q  228 gatgagac-tttgtttacaatttgtttgga-gtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||  | |||||||||    
T  200 gatgagacttttctttacaatttgtatggaggtttgaatgatatagatcagacaa 254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 233206 - 233444
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  233206 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 233305  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  233306 tacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 233404  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  233405 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 233444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 147553 - 147311
Alignment:
Q  22 tagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaattaca 120  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  147553 tagtccactcctcacaatcttctgagagttattactatgatgtttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcaactgaacaattaca 147454  T
Q  121 acaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccct 220  Q
    |  || |||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  147453 attat-gtattctctaagcctcagcatgcttgcaccttcctgctaagttaactacttagacttttacaacctttgcttaaactaacactttagtacccct 147355  T
Q  221 aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| |||||||    
T  147354 aaagctagatgagacattg-ttactatttgtatggaggttgaatg 147311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19622 - 19374
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  19622 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcctgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 19523  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||  |||||||||||||    
T  19522 ttacaatta-tgtattctctaagcctcagtaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgctcaagctaacactttagta 19424  T
Q  216 ccc-ctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||    
T  19423 cccgctaaagctagatgagac-ttgattacaatttgtgagaagtttgaatg 19374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 265
Target Start/End: Original strand, 92098 - 92342
Alignment:
Q  20 gctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaatta 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  92098 gctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctatcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaatta 92197  T
Q  119 caacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtaccc 218  Q
    |||   | |||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||     
T  92198 caattct-gtattctctaagcctcagtaggcttgcaccttgttgctaagttaactacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacct 92296  T
Q  219 ctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  92297 ctaaatctagatgagactttg-ttacaatttgtatggaggttgaatg 92342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 110985 - 111209
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  110985 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagatttttcactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaa 111084  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||| |||||    
T  111085 ttacaattct-gtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttataacctttgctcaaactaacactatagta 111183  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  111184 cccctaaagctagatgagactttgtt 111209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 7060 - 7298
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  7060 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttctcctgaacaat 7159  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||    
T  7160 tac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggac 7258  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7259 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 7298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 18580 - 18819
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |    |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  18580 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcccgcaccttacaatccttgttcacctgaacaa 18679  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    ||||||   |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| |    
T  18680 ttacaatc-ttgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttagga 18778  T
Q  216 cccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18779 cctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 18819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8958 - 8716
Alignment:
Q  21 ctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaattac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |  | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8958 ctagtccactcctcacaatcttgtgagagttttcactatggtgtttgagataacctctcaagtcctgcacctcacaatctttgttcacctgaacaattac 8859  T
Q  120 aacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccc 219  Q
    |||  | |||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  8858 aactct-gtattctctaagcctcagaagacttgcaccttgttgctaagttaactacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccc 8760  T
Q  220 taaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaat 264  Q
    | ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  8759 tcaagctagatgagattttg-ttacaatttgtatggaggttgaat 8716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 27992 - 28255
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||  | || ||||||||||| ||||||||||  ||    
T  27992 tgggctagtccactcctcgcaatcttgtcagagtttccactatgatgcttgacataacccttcaaatcctgcatcttacaatctttgttcacctgagtaa 28091  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | ||||||| |||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| || ||||||| ||    
T  28092 ttacaaccct-gtattctttaagcctcagtaggctcgcaccttcttgctaagttacccacttagaattttacaagctttgctcaaactagcactttacta 28190  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28191 cgcctaaagctagatgagattttgattacaatttgtatggagtttgaatcattcaaatcagacaa 28255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 309237 - 309475
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  309237 tgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 309336  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtac 216  Q
    |||||    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||| ||    
T  309337 tacaa-tcctgtattctctaagcctcaacaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacattttaggac 309435  T
Q  217 ccct-aaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgga 256  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  309436 ctctaaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatgga 309475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 217516 - 217261
Alignment:
Q  12 taatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctg 110  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||  | || ||||||| ||| |||||||||    
T  217516 taatgtgggctggtccactcctcacaatcctatgagagtttcaactatgatacttgagataacctcttaaatcctgcatcttacaacctttgttcacctg 217417  T
Q  111 aaaaattacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagactttt--acaacttctgctcaaaataacac 208  Q
    || ||||| ||| || |||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||||| ||||||    
T  217416 aacaattataaccat-gtattctctaagccacaactggcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttttacaacctttactcaaactaacac 217318  T
Q  209 tttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  217317 tttagtacctctaaagctagatgggacttaaattacaatttgtatggagtttgaatg 217261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 55490 - 55231
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  55490 tgggttagtccactcctcacaat---gtgagagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctacgttcacctgaacaa 55394  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacctt-cttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    |||||  |  ||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  55393 ttacacaacctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacttttcttgctaagttacccacttagacttttacacattttgctcaaactaacactttagt 55294  T
Q  215 acccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg-gagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    ||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  55293 acccctaaaactagatgagacttt----acagtttgtttatgagtttgaatgattgaaatcagacaa 55231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 59439 - 59180
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  59439 tgggttagtccactcctcacaat---gtgagagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctacgttcacctgaacaa 59343  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacctt-cttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    |||||  |  ||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  59342 ttacacaacctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacttttcttgctaagttacccacttagacttttacacattttgctcaaactaacactttagt 59243  T
Q  215 acccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg-gagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    ||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  59242 acccctaaaactagatgagacttt----acagtttgtttatgagtttgaatgattgaaatcagacaa 59180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 60867 - 60608
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  60867 tgggttagtccactcctcacaat---gtgagagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctacgttcacctgaacaa 60771  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacctt-cttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    |||||  |  ||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  60770 ttacacaacctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacttttcttgctaagttacccacttagacttttacacattttgctcaaactaacactttagt 60671  T
Q  215 acccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg-gagtttgaatgattaaaatcagacaa 280  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    ||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  60670 acccctaaaactagatgagacttt----acagtttgtttatgagtttgaatgattgaaatcagacaa 60608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Original strand, 1174 - 1421
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatctt-gttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  | || ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  1174 tgggatagtccactcctaacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctgaagtcctgcatcttacaatctttgttcacctgaacaa 1273  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||  | ||||| | ||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||    
T  1274 ttacaactct-gtattatataagcctcaacagccttgcaccttgttgctacgttaaccacttagacttttacaaccttttctcaaactaacactttagta 1372  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  1373 cccctaaagctagatgagactttg-ttacaatttgtatagaggttgaatg 1421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8988 - 8771
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||||||| |     
T  8988 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcatgcaccttacaatatgtgttcacctgaacac 8889  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||   ||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  8888 ttacaac-tctgtattctctaagcctcagcaagcttgcaccttattgctaagttaaccatttagtcttttacaaactcatctcaaactaacactttagta 8790  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  8789 cccctaaagctatatgaga 8771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8761 - 8679
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8761 cttcttgctaagttacccacttagacttttgctccttctgctcaaactaacactttagtacccataaagctagatgagacttt 8679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8673 - 8591
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8673 cttcttgctaagttaccctcttagacttttgcacatttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 8591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8585 - 8510
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8585 cttcttgctaagttacccactcagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagttagatg 8510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 39785 - 40039
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39785 tgggttagtccccttctcacaatcttgtgagtttttccacgatgatgcttgagataacttctcaaatcacgcaccttacaatcttgttcacctgaacaat 39884  T
Q  117 tacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttttacaac-ttctgctcaaaataacactttagt 214  Q
    ||||| || | |||||||||||||||  ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||  ||||||||| |    
T  39885 tacaataactatattctctaagcctcaacatgcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaaccaacactttaat 39983  T
Q  215 acccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg-gagtttgaatgattaaaat 273  Q
    |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39984 acccctaaagctagatgagac----tttacaatttgtttgtgagtttgaatgattgaaat 40039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12138 - 11878
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatc-ttgttcacctgaa-aa 114  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  12138 tgggttagtccactcctcccaatcttgtgaaagtttccactatgatacttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaa 12039  T
Q  115 attacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcac-cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttag 213  Q
     |||||  |  |||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||| || ||||| |||||||||||    
T  12038 tttacacaacctgtattctctaagcctcaccaggcttgcacttttcttgctaagttacacacttctacttttacaccttttg-tcaaactaacactttag 11940  T
Q  214 tacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttg-gagtttgaatgattaaaatcagac 278  Q
    ||||||||| | ||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11939 tacccctaatgttagatgagac----tttacaatttgtttgtgagtttgaatgattgaaatcagac 11878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 223 - 440
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaat-cttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | || ||||||||  |||||||||| || ||    
T  223 tgggctagtcaactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcatcttacaatatttgttcacctaaacaa 322  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||   |||||||||||||  || || | |||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  323 ttacaac-tctgtattctctaaggttcagctggcttgcaccttgtttctaagttaaccacttagacatttacaacctttgctcaaactaacactttagta 421  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  422 cccctaaagctagaagaga 440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 28230 - 28447
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||||||| |     
T  28230 tgggttagtccactcctcacagtcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcacctgaacac 28329  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||||   |||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||| | ||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  28330 ttacaac-tctgtattttctaagcctcagcaggcttgcaccttgttggttagttaactacttagacttttacaaactcaactcaaactaacactttagta 28428  T
Q  216 cccctaaagctagatgaga 234  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  28429 ccccgaaagctagatgaga 28447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 231
Target Start/End: Original strand, 49434 - 49647
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||||||| |     
T  49434 tgggttagtccacaccttacagtcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcacctgaacac 49533  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
     ||||||   | |||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| ||||| |||||||    
T  49534 atacaac-tctatattttctaagcctcagcagacttgcaccttgttgctaa-ttaaccacttagacttttacaaactcaactcaaactaacaatttagta 49631  T
Q  216 cccctaaagctagatg 231  Q
    ||||||||||||||||    
T  49632 cccctaaagctagatg 49647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 262
Target Start/End: Original strand, 49660 - 49765
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttgg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  49660 cttcttgctaagttacccacttagacttttgctccttctgcttaaactaacactttagtacccctaaagatagatgagactttg-ttacaatttgtatgg 49758  T
Q  256 agtttga 262  Q
    || ||||    
T  49759 aggttga 49765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 156 - 251
Target Start/End: Original strand, 28457 - 28551
Alignment:
Q  156 cttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgt 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28457 cttcttgctaagttacacacttagacttttgctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctatatgagactttg-ttacaatttgt 28551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1118 - 898
Alignment:
Q  19 ggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaatta 118  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |  | | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1118 ggctaatccattcctcacaatcttgtgagaatttccactatgatgcttgagataccctctcaactcctgcgccttacaatcttgttcacctgaacaatta 1019  T
Q  119 caacaattgtattctctaagcctcggcagtctt-gcaccttcttgctaagttacccacttagacttttaca-acttctgctcaaaataacactttagta- 215  Q
    |||||| | |||||| ||||||||  ||| ||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||     
T  1018 caacaactatattctgtaagcctcaacaggcttagcactttcttgctaaat--cccacttagacttttacacttttctgctcaaactaacactttagtac 921  T
Q  216 cccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  920 cccctaaagttagatgagacttt 898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 266
Target Start/End: Original strand, 196607 - 196860
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |  |||||||| | ||||| ||  ||||| ||||||   |||| | ||||| |      
T  196607 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttacactatggtatttgagataccttctcagatccttcactttacaaaaatgttaatctgaacata 196706  T
Q  117 taca-acaattgtattctctaagcctcggcagtcttgca-ccttcttg-ctaagttacccacttagacttttacaac-ttct-gctcaaaataacacttt 211  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||||||    
T  196707 tacacacaattgtattctctaagcctcggcaggcttgcaaccttcttggctaagttacccacttagacttt-acatcgttcttgctcaaactaacacttt 196805  T
Q  212 agtacccctaaagctagatgagactttgtttacaatttgtttggagtttgaatga 266  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  196806 agtacccttaaagctaaatgagactttgtttacaatttaagaggagtttgaatga 196860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8273 - 8057
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaat-cttgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  8273 tgggttagtccactcctcacaatcttatgagagtttccattatgatgtttgagataacctctcaaatctggcaccttacaatccttgttcacttgaacaa 8174  T
Q  116 ttacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttagta 215  Q
    |||||  |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||                 |||||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  8173 ttacacaacatgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgtt-----------------gacttttacaacctcagctcaagctaacactttagta 8091  T
Q  216 cccctaaagctagatgagactttgtttacaattt 249  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8090 gccctaaagctagatgagactttgattacaattt 8057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 19819 - 19725
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctga 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||    
T  19819 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctga 19725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 122
Target Start/End: Original strand, 395076 - 395182
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| | |||||||||||| |     
T  395076 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctggaccttacaatatgtgttcacctgaacac 395175  T
Q  116 ttacaac 122  Q
    |||||||    
T  395176 ttacaac 395182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 66346 - 66175
Alignment:
Q  68 agataacctctcaaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaattacaacaattgtattctctaagcctcggcagtcttgc-accttcttgctaa 166  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||| |||  ||| ||| | ||| | |||||||    
T  66346 agataacctctcaaattctgcaccttacaatcttgttcacttaaacaattacaataattgtattctctaagactcatcaggcttacaaccattttgctaa 66247  T
Q  167 gttacccacttagacttttacaacttc-tgctcaaaataacactttagtacccctaaagctagatgagacttt 238  Q
    ||||||||||||||| |||| |  ||| | |||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  66246 gttacccacttagac-tttatattttcttcctcaaactaacactttagtacccctgaagttatatgagacttt 66175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 67070 - 67013
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataac 74  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||    
T  67070 tgggttagtacactcctcacaatcttgtgagaattttcactatgatgcttcagataac 67013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 71
Target Start/End: Original strand, 30872 - 30926
Alignment:
Q  17 tgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagat 71  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30872 tgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagat 30926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University