View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12003_high_2 (Length: 996)

Name: NF12003_high_2
Description: NF12003
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12003_high_2
NF12003_high_2
[»] chr3 (25 HSPs)
chr3 (53-976)||(18200483-18201407)
chr3 (53-909)||(26950254-26951113)
chr3 (53-909)||(36091934-36092793)
chr3 (540-973)||(36091495-36091931)
chr3 (540-973)||(26951116-26951552)
chr3 (802-973)||(18256107-18256278)
chr3 (803-967)||(49562482-49562646)
chr3 (803-973)||(35716184-35716354)
chr3 (817-973)||(31487113-31487269)
chr3 (817-973)||(36087657-36087813)
chr3 (821-973)||(36947224-36947375)
chr3 (821-967)||(38655996-38656142)
chr3 (817-973)||(18198592-18198748)
chr3 (817-973)||(52418862-52419017)
chr3 (899-973)||(12825171-12825245)
chr3 (899-976)||(13454947-13455024)
chr3 (899-976)||(16651391-16651468)
chr3 (865-976)||(16066870-16066981)
chr3 (900-973)||(4594084-4594157)
chr3 (907-973)||(854554-854620)
chr3 (899-973)||(12260798-12260872)
chr3 (191-277)||(12807577-12807663)
chr3 (899-973)||(26947819-26947893)
chr3 (828-964)||(16725940-16726076)
chr3 (197-284)||(14458470-14458557)
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (53-976)||(3590335-3591259)
chr6 (802-973)||(25971107-25971278)
chr6 (819-973)||(25975547-25975701)
chr6 (817-973)||(2280821-2280977)
chr6 (842-976)||(34265224-34265358)
chr6 (899-973)||(33045848-33045922)
chr6 (820-889)||(17905868-17905937)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (53-973)||(41859940-41860863)
chr4 (53-909)||(52681467-52682326)
chr4 (540-973)||(52682329-52682765)
chr4 (802-976)||(36895718-36895891)
chr4 (817-973)||(30388097-30388253)
chr4 (819-973)||(21382528-21382682)
chr4 (817-973)||(16908941-16909097)
chr4 (817-973)||(28389279-28389435)
chr4 (890-976)||(41944072-41944158)
chr4 (817-932)||(29359311-29359426)
chr4 (186-427)||(30576448-30576688)
chr4 (899-973)||(19515295-19515369)
chr4 (899-973)||(21581685-21581759)
chr4 (673-769)||(23004567-23004660)
chr4 (56-210)||(15056967-15057124)
chr4 (926-976)||(37062400-37062452)
chr4 (828-964)||(4882107-4882243)
chr4 (217-313)||(14991327-14991423)
chr4 (189-235)||(47964110-47964156)
[»] chr5 (14 HSPs)
chr5 (53-973)||(32674006-32674929)
chr5 (53-249)||(22636691-22636891)
chr5 (802-976)||(16678829-16679002)
chr5 (819-976)||(38095575-38095732)
chr5 (589-773)||(8795897-8796082)
chr5 (899-973)||(20105161-20105235)
chr5 (899-976)||(3608003-3608080)
chr5 (899-976)||(30090418-30090495)
chr5 (899-973)||(12655177-12655251)
chr5 (899-973)||(23183962-23184036)
chr5 (899-973)||(23188229-23188303)
chr5 (899-973)||(34761223-34761297)
chr5 (899-973)||(39878057-39878131)
chr5 (191-284)||(21122329-21122422)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (53-973)||(2045316-2046239)
chr1 (53-698)||(35595295-35595940)
chr1 (690-976)||(35593930-35594216)
chr1 (802-976)||(23086259-23086433)
chr1 (819-973)||(37891602-37891756)
chr1 (817-973)||(39513323-39513479)
chr1 (817-973)||(29245330-29245486)
chr1 (818-973)||(45503600-45503755)
chr1 (817-973)||(38211061-38211217)
chr1 (817-973)||(50708751-50708907)
chr1 (817-973)||(48650894-48651050)
chr1 (818-973)||(13926369-13926520)
chr1 (899-973)||(49787424-49787498)
chr1 (899-973)||(2047567-2047641)
chr1 (899-973)||(36866978-36867052)
chr1 (899-973)||(7480470-7480544)
chr1 (899-973)||(9533846-9533920)
chr1 (899-973)||(42496554-42496628)
chr1 (917-976)||(26211630-26211689)
chr1 (825-976)||(23480959-23481110)
chr1 (251-318)||(52589715-52589782)
chr1 (820-922)||(5429244-5429346)
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (53-973)||(14994547-14995470)
chr8 (802-976)||(37589444-37589618)
chr8 (817-973)||(22729954-22730110)
chr8 (817-973)||(23827644-23827800)
chr8 (817-973)||(19961504-19961660)
chr8 (899-973)||(406231-406305)
chr8 (899-973)||(18266066-18266140)
chr8 (900-973)||(41376488-41376561)
chr8 (721-773)||(36238570-36238622)
chr8 (899-973)||(18275079-18275153)
chr8 (828-961)||(9885678-9885811)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (53-973)||(40604478-40605401)
chr2 (53-909)||(13906996-13907855)
chr2 (53-909)||(26454641-26455500)
chr2 (540-973)||(26455503-26455939)
chr2 (540-973)||(13907858-13908293)
chr2 (817-973)||(35432242-35432398)
chr2 (817-973)||(207623-207779)
chr2 (817-973)||(5013634-5013791)
chr2 (821-967)||(1512653-1512799)
chr2 (899-973)||(13905287-13905361)
chr2 (899-973)||(2300779-2300853)
chr2 (899-973)||(6123670-6123744)
chr2 (899-973)||(184091-184165)
chr2 (899-973)||(976151-976225)
chr2 (899-973)||(2449325-2449399)
chr2 (938-976)||(23455759-23455797)
chr2 (23-59)||(32287325-32287361)
[»] chr7 (20 HSPs)
chr7 (53-909)||(22005714-22006573)
chr7 (53-909)||(7892490-7893349)
chr7 (540-973)||(7893352-7893788)
chr7 (540-973)||(22006576-22007011)
chr7 (52-444)||(3598843-3599241)
chr7 (438-707)||(3595667-3595936)
chr7 (772-976)||(3595461-3595666)
chr7 (817-973)||(45115705-45115861)
chr7 (817-973)||(32660102-32660258)
chr7 (802-967)||(26168704-26168869)
chr7 (827-976)||(35102862-35103010)
chr7 (899-973)||(17696872-17696946)
chr7 (899-973)||(27715901-27715975)
chr7 (899-973)||(16719857-16719931)
chr7 (899-973)||(31100097-31100171)
chr7 (899-973)||(7888824-7888898)
chr7 (900-973)||(29956435-29956508)
chr7 (191-310)||(13604144-13604262)
chr7 (915-973)||(32038416-32038474)
chr7 (734-773)||(16805970-16806009)
[»] scaffold0097 (2 HSPs)
scaffold0097 (819-967)||(51990-52138)
scaffold0097 (899-973)||(40512-40586)
[»] scaffold0642 (1 HSPs)
scaffold0642 (899-973)||(3356-3430)
[»] scaffold0345 (1 HSPs)
scaffold0345 (899-973)||(13268-13342)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (899-973)||(25639-25713)
[»] scaffold0121 (2 HSPs)
scaffold0121 (915-973)||(45550-45608)
scaffold0121 (23-59)||(41422-41458)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (820-889)||(104606-104675)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 817; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 817; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 976
Target Start/End: Original strand, 18200483 - 18201407
Alignment:
Q  53 tcctcctcttctttgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttcttac 152  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18200483 tcctcctcttttatgtgactaaggttaaccacacatctttctctccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttagacttcttac 18200582  T
Q  153 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcat 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18200583 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaatttggggttggaataagaataggagcat 18200682  T
Q  253 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttcggtttgttatattctag 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18200683 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttttgtttgttatattctag 18200782  T
Q  353 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattaaactgatgtgactgtgtcttagatgtc 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18200783 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattaaactgatgtgactgtgtcttagatgtc 18200882  T
Q  453 ccatgaactatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgattcatatcattgttttaataaggattgtcccaatgctttatgtgagattctattggctg 552  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18200883 ccctgagctatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgattcatatcattgttttaataaggattggcccaatgcttcatgtgatattctattggctg 18200982  T
Q  553 aataaggatttatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 652  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18200983 aataaggatctatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 18201082  T
Q  653 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcattatt 752  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18201083 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcatcatt 18201182  T
Q  753 gacccgtgtgatagcac-gggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttatgttatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagt 851  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18201183 gacccgtgtgatagcacggggttaacaaattatgaggttttgcttgacatgaaagcaatttctgttatctgtctcatttgcaataactattaacaagagt 18201282  T
Q  852 cggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatg 951  Q
    | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18201283 cagggtcagtcgttgaaacatgttggtgtttatctaccgtctcctgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaatataaagggttacttcaaaggatg 18201382  T
Q  952 gtttaaagatattgatcaatgatga 976  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18201383 gtttaaagatattgatcaatgatga 18201407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 746; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 909
Target Start/End: Original strand, 26950254 - 26951113
Alignment:
Q  53 tcctcctcttctttgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttcttac 152  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26950254 tcctcctcttttctgtgactaaggttaaccacacatctttctttgcattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttcttac 26950353  T
Q  153 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26950354 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcat 26950453  T
Q  253 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttcggtttgttatattctag 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26950454 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgttatctaatttattatcatctctttttttgtttgttatattctag 26950553  T
Q  353 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattaaactgatgtgactgtgtcttagatgtc 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  26950554 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattatactgatgtgactatgtcttagatatc 26950653  T
Q  453 ccatgaactatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgattcatatcattgttttaataaggattgtcccaatgctttatgtgagattctattggctg 552  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  26950654 ccctgagctatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgattcatatcattgttttaataaggattggcccaatgcttcatgtgatattctattggctg 26950753  T
Q  553 aataaggatttatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 652  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26950754 aataaggatctatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgtttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 26950853  T
Q  653 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcattatt 752  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26950854 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttatggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcatcatt 26950953  T
Q  753 gacccgtgtgatagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttatgttatct---gtctcatttgcaatgactattaacaaga 849  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26950954 gacccgtgtggtagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttccgttatctgtcgtctcatttgcaatgactattaacaaga 26951053  T
Q  850 gtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatg 909  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26951054 gtcagggtcagtcgttgaaacatgttggtgtttatctaccgtctcctgttttttcacatg 26951113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 730; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 909
Target Start/End: Complemental strand, 36092793 - 36091934
Alignment:
Q  53 tcctcctcttctttgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttcttac 152  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36092793 tcctcctcttttctgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttcttac 36092694  T
Q  153 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcat 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36092693 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcatgaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcat 36092594  T
Q  253 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttcggtttgttatattctag 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36092593 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatctgatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttttgtttgttatattctag 36092494  T
Q  353 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattaaactgatgtgactgtgtcttagatgtc 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||    
T  36092493 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacagtggtggttgattatactaatgtgattgtgtcttagatatc 36092394  T
Q  453 ccatgaactatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgattcatatcattgttttaataaggattgtcccaatgctttatgtgagattctattggctg 552  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  36092393 ccctgagctatgcaaactacaaattaagctgtaaaccatgattcatatcattgttttaataaggattggcccaatgcttcatgtgatattctattggctg 36092294  T
Q  553 aataaggatttatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 652  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36092293 aataaggatctatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 36092194  T
Q  653 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcattatt 752  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36092193 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcatcatt 36092094  T
Q  753 gacccgtgtgatagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttatgttatct---gtctcatttgcaatgactattaacaaga 849  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36092093 gacccgtgtggtagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttccattatctgtcgtctcatttgcaatgactattaacaaga 36091994  T
Q  850 gtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatg 909  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  36091993 gtcagggtcagtcgttgaaacatgttggtgtttatctatcttctcctgttttttcacatg 36091934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 540 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 36091931 - 36091495
Alignment:
Q  540 attctattggctgaataaggatttatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacatta 639  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36091931 attctattggctgaataaggatctatctaagcatatgactgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacatta 36091832  T
Q  640 attgtaaatcataccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatat 739  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36091831 attgtaaatcataccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatat 36091732  T
Q  740 tgtgctcattattgacccgtgtgatagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttatgttatct---gtctcatttgcaatg 836  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||    
T  36091731 tgtgctcatcattgacccgtgtggtagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttccgttatctgtcgtctcatttgcaatg 36091632  T
Q  837 actattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaaggg 936  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  36091631 actattaacaagagtcagggtcagtcgttgaaacatgttggtgtttatctaccgtctcctgttttttcacatggacagttgtacgtcgcaatatcacggg 36091532  T
Q  937 ttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||| || | || |||||| |||||||| |||||    
T  36091531 ttacttcgagaggtgttttaaaaatattgattaatga 36091495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 540 - 973
Target Start/End: Original strand, 26951116 - 26951552
Alignment:
Q  540 attctattggctgaataaggatttatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacatta 639  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26951116 attctattggctgaataaggatctatctaaccatatgactgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacatta 26951215  T
Q  640 attgtaaatcataccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatat 739  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26951216 attgtaaatcataccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatat 26951315  T
Q  740 tgtgctcattattgacccgtgtgatagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttatgttatct---gtctcatttgcaatg 836  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||| ||    
T  26951316 tgtgctcatcattgacccgtgtggtagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttccgttatctgtcgtctcatttgcagtg 26951415  T
Q  837 actattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaaggg 936  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  26951416 actattaacaagagttagggtcagtcgttgaaacatgttggtgtttatctaccgtctcctgttttttcacatggacagttgtacgtcacaatatcacggg 26951515  T
Q  937 ttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||    
T  26951516 ttacttcgagaggtggtttaaaaatattgattaatga 26951552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 802 - 973
Target Start/End: Original strand, 18256107 - 18256278
Alignment:
Q  802 gaaggcaatttatgttatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgtttt 901  Q
    ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18256107 gaaggcagtttccgttgtctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcagtctttgaaaaatgttggtgtctatctaccgtctcctgtttt 18256206  T
Q  902 ttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18256207 ttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcgagggttacttcaagggatggtttaaagatgttgatcaatga 18256278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 803 - 967
Target Start/End: Complemental strand, 49562646 - 49562482
Alignment:
Q  803 aaggcaatttatgttatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttt 902  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||    
T  49562646 aaggcaattttcgatatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcagtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttt 49562547  T
Q  903 tcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgat 967  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  49562546 tcacatggacaattgtacgtcgcaatatcacgggttacttcaaggggtggtttaaaaatattgat 49562482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 803 - 973
Target Start/End: Original strand, 35716184 - 35716354
Alignment:
Q  803 aaggcaatttatgttatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttt 902  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||    
T  35716184 aaggcaatttccgatatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcagtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttt 35716283  T
Q  903 tcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  35716284 tcacatggacaattgtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 35716354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 817 - 973
Target Start/End: Original strand, 31487113 - 31487269
Alignment:
Q  817 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaatt 916  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  31487113 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcagtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttttcacatggacagtt 31487212  T
Q  917 gtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  31487213 gtacgtcgcaatatcacaggttacttcgagggctggtttaaaaatattgattaatga 31487269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 817 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 36087813 - 36087657
Alignment:
Q  817 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaatt 916  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36087813 tatctgtctcatttgcaatcactattaacaagagtccgggtcagtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttttcacatggacaatt 36087714  T
Q  917 gtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  36087713 ttacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 36087657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 821 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 36947375 - 36947224
Alignment:
Q  821 tgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgtac 920  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  36947375 tgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcagtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctgttttt-cacatggacagttgtac 36947277  T
Q  921 gtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  36947276 gtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 36947224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 821 - 967
Target Start/End: Complemental strand, 38656142 - 38655996
Alignment:
Q  821 tgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgtac 920  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  38656142 tgtctcatttgcaatgactattaacaagagttagggttagtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttttcacatggacagttgtac 38656043  T
Q  921 gtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgat 967  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  38656042 gtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgat 38655996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 817 - 973
Target Start/End: Original strand, 18198592 - 18198748
Alignment:
Q  817 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaatt 916  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  18198592 tatctttctcatttgcaatgactattaacaagagtcaaggtcagtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttttcacatggacagtt 18198691  T
Q  917 gtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  18198692 gtacgtcgcactatcacgggctacttcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 18198748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 817 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 52419017 - 52418862
Alignment:
Q  817 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaatt 916  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || || |||||||||| || ||||||| || | ||||| ||||| |||| ||    
T  52419017 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagggtcagggtcagtcgctagaatatgttggtgtctacctaccgtttcctattttt-cacattgacagtt 52418919  T
Q  917 gtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||    
T  52418918 gtacgtcacaatatcacgggttacttcgaggggtgttttaaagatattgattaatga 52418862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Original strand, 12825171 - 12825245
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  12825171 tttttcacatggacagttgtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 12825245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 899 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 13455024 - 13454947
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatgatga 976  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  13455024 tttttcacatggacagttgtacgtcgcaatatcacgggttactttgaggggtggtttaaagatattgattaatgatga 13454947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 899 - 976
Target Start/End: Original strand, 16651391 - 16651468
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatgatga 976  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16651391 tttttcacatggacagttgtacgtcgcaatatcacgggttactttgaggggtggtttaaagatattgattaatgatga 16651468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 865 - 976
Target Start/End: Original strand, 16066870 - 16066981
Alignment:
Q  865 taaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatatt 964  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| ||    
T  16066870 taaaaaatgttggtgtctatttaccttctcctgttttttcacatggacaattgtatgttgtaatatcaagggttattttaagagatggtttgaagatctt 16066969  T
Q  965 gatcaatgatga 976  Q
    ||| ||| ||||    
T  16066970 gataaattatga 16066981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 900 - 973
Target Start/End: Original strand, 4594084 - 4594157
Alignment:
Q  900 ttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  4594084 ttttcacatagacagttgtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 4594157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 907 - 973
Target Start/End: Original strand, 854554 - 854620
Alignment:
Q  907 atggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  854554 atggacaattgtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 854620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Original strand, 12260798 - 12260872
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  12260798 tttttcacatggacagttgtacgttgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 12260872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12807663 - 12807577
Alignment:
Q  191 ggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcatttgtttagtttgatttttggttatt 277  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||   |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  12807663 ggtttgttgattttacagtttatgaattttcaaattaggggttaagataagagtaataacatttgtttaatttgatttttggttatt 12807577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Original strand, 26947819 - 26947893
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26947819 tttttcacatggacagttgtacattgcaatatcacaggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 26947893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 828 - 964
Target Start/End: Complemental strand, 16726076 - 16725940
Alignment:
Q  828 tttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaa 927  Q
    |||||||||||||| || || ||||  |||||||| || ||||||||||| || ||| | || || | | | ||||| ||||| |||||||| || ||      
T  16726076 tttgcaatgactataaagaaaagtcaaggtcaatctttgaaacatgttggcgtatatttgccatcgcctatcttttctcatggtcaattgtatgtggctt 16725977  T
Q  928 tatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatatt 964  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  16725976 tgtcaagggttacttcaagagaaggtttgaagatatt 16725940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14458557 - 14458470
Alignment:
Q  197 ttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcatttgtttagtttgatttttggttatttgtaatc 284  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||| || |||   |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||    
T  14458557 ttgattttacagtttatgaattttcaaattaggagttaagataagagtaatagcatttgtttaattttatttttggtaattcgtaatc 14458470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 813; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 813; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 976
Target Start/End: Original strand, 3590335 - 3591259
Alignment:
Q  53 tcctcctcttctttgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttcttac 152  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3590335 tcctcctcttttatgtgactaaggttaaccacacatctttctctctattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttagacttcttac 3590434  T
Q  153 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3590435 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcagcaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcat 3590534  T
Q  253 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttcggtttgttatattctag 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3590535 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttttgtttgttatattctag 3590634  T
Q  353 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattaaactgatgtgactgtgtcttagatgtc 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3590635 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattaaactgatgtgactgtgtcttagatgtc 3590734  T
Q  453 ccatgaactatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgattcatatcattgttttaataaggattgtcccaatgctttatgtgagattctattggctg 552  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  3590735 ccctgagctatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgattcatatcattgttttaataaggattggcccaatgcttcatgtgatattctattggctg 3590834  T
Q  553 aataaggatttatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 652  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3590835 aataaggatctatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagtatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 3590934  T
Q  653 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcattatt 752  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3590935 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcatcatt 3591034  T
Q  753 gacccgtgtgatagcac-gggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttatgttatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagt 851  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3591035 gacccgtgtgatagcacggggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaagcaatttccgttatctgtctcatttgcaataactattaacaagagt 3591134  T
Q  852 cggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatg 951  Q
    | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3591135 cagggtcagtcgttgaaacatgttggtgtttatctaccatctcctgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaaaggatg 3591234  T
Q  952 gtttaaagatattgatcaatgatga 976  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3591235 gtttaaagatattgatcaatgatga 3591259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 802 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 25971278 - 25971107
Alignment:
Q  802 gaaggcaatttatgttatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgtttt 901  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  25971278 gaaggcagtttctgttgtctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcagtctttgaaaaatgttggtgtctatctaccatctcctgtttt 25971179  T
Q  902 ttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25971178 ttcacatgaacaattgtacatcgcaatatcgagggttacttcaagggatggtttaaagatgttgatcaatga 25971107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 819 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 25975701 - 25975547
Alignment:
Q  819 tctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgt 918  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||| |||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||    
T  25975701 tctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcagtctttgaaaaatgttggtgtctatctaccatctactgttttttcacatgaacaattgt 25975602  T
Q  919 acgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25975601 acatcgcaatatcgagggttacttcaagggatggtttaaagatgttgatcaatga 25975547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 817 - 973
Target Start/End: Original strand, 2280821 - 2280977
Alignment:
Q  817 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaatt 916  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  2280821 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcggtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttttcacatggacagtt 2280920  T
Q  917 gtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  2280921 gtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 2280977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 842 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 34265358 - 34265224
Alignment:
Q  842 taacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttact 941  Q
    ||||||||||| |||||| || ||  || |||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  34265358 taacaagagtcagggtcagtctttgtaaaatgttggtgtctatctaacgtctcctgttttttgacatggacaattgtacgtcgcaatattgagggttact 34265259  T
Q  942 tcaagggatggtttaaagatattgatcaatgatga 976  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34265258 tcaagggatggtttaaagatgttgatcaatgatga 34265224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 33045922 - 33045848
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  33045922 tttttcacatggacagttgtacattgcaatatcacaggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 33045848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 820 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 17905937 - 17905868
Alignment:
Q  820 ctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctacc 889  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || || ||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  17905937 ctgtatcatttgcaatgacaattaacaaaagtcaagggcagtcgcttaaacatgttggtgtatatctacc 17905868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 794; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 794; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 41860863 - 41859940
Alignment:
Q  53 tcctcctcttctttgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttcttac 152  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41860863 tcctcctcttttctgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttcttac 41860764  T
Q  153 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41860763 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcat 41860664  T
Q  253 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttcggtttgttatattctag 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41860663 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttttgtttgttatattctag 41860564  T
Q  353 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattaaactgatgtgactgtgtcttagatgtc 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  41860563 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattatactgatgtgactgtgtcttagatatc 41860464  T
Q  453 ccatgaactatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgattcatatcattgttttaataaggattgtcccaatgctttatgtgagattctattggctg 552  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  41860463 ccctgagctatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgattcatatcattgttttaataaggattggcccaatgcttcatgtgatattctattggctg 41860364  T
Q  553 aataaggatttatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 652  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41860363 aataaggatctatctaagcatatgactgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 41860264  T
Q  653 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcattatt 752  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41860263 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcatcatt 41860164  T
Q  753 gacccgtgtgatagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttatgttatct---gtctcatttgcaatgactattaacaaga 849  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41860163 gacccgtgtggtagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttccgttatctgtcgtctcatttgcaatgactattaacaaga 41860064  T
Q  850 gtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaaggga 949  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| || |     
T  41860063 gtcagggtcagtcgttgaaacatgttggtgtttatctaccgtctcctgttttttcacatggacagttgtacgtcgtaatatcacgggttacttcgagagg 41859964  T
Q  950 tggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  41859963 tggtttaaaaatattgattaatga 41859940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 730; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 909
Target Start/End: Original strand, 52681467 - 52682326
Alignment:
Q  53 tcctcctcttctttgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttcttac 152  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52681467 tcctcctcttttctgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaacagctttttaggcttcttac 52681566  T
Q  153 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcat 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  52681567 aaaatcaaagtaattgttatataattggtgtggggtttagtttgttgattttgcaattcaggaattttcaaattcggggttgaaataagagtatgagcat 52681666  T
Q  253 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttcggtttgttatattctag 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  52681667 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattggattgctatctaatttattatcatctctttttttgtttgttatattctag 52681766  T
Q  353 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattaaactgatgtgactgtgtcttagatgtc 452  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  52681767 aaggagatttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattatactgatgtgactgtgtcttagatatc 52681866  T
Q  453 ccatgaactatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgattcatatcattgttttaataaggattgtcccaatgctttatgtgagattctattggctg 552  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  52681867 ccctgagctatgcaaactacaaattaagttgtaaactatgattcatatcattgttttaataaggattggcccaatgcttcatgtgatattctattggctg 52681966  T
Q  553 aataaggatttatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 652  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52681967 aataaggatctatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 52682066  T
Q  653 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcattatt 752  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52682067 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcatcatt 52682166  T
Q  753 gacccgtgtgatagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttatgttatct---gtctcatttgcaatgactattaacaaga 849  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52682167 gacccgtgtggtagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttccgttatctgtcgtctcatttgcaatgactattaacaaga 52682266  T
Q  850 gtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatg 909  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52682267 gtcagggtcagtcgttgaaacatgttggtgtttatctaccgtctcctgttttttcacatg 52682326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 540 - 973
Target Start/End: Original strand, 52682329 - 52682765
Alignment:
Q  540 attctattggctgaataaggatttatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacatta 639  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52682329 attctattggatgaataaggatctatctaagcatatgactgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacatta 52682428  T
Q  640 attgtaaatcataccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatat 739  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52682429 attgtaaatcataccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatat 52682528  T
Q  740 tgtgctcattattgacccgtgtgatagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttatgttatct---gtctcatttgcaatg 836  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||| ||||    
T  52682529 tgtgctcatcattgacccgtgtggtagcacgagttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttccgttatctgtcgtctcatttgtaatg 52682628  T
Q  837 actattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaaggg 936  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  52682629 actattaacaagagtcagggtcagtcgttgaaacatgttcgtgtttatctaccgtctcctgttttttcacatggacagttgtacgtcgcaatatcacggg 52682728  T
Q  937 ttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||    
T  52682729 ttacttcgagaggtggtttaaaaatattgattaatga 52682765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 802 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 36895891 - 36895718
Alignment:
Q  802 gaaggcaatttatgttatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgtttt 901  Q
    ||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  36895891 gaaggcagtttccgttgtctgtctcatttgcaatgactattaacaagattcagggtcaatctttgaaaaatgttggtgtctatctaccgtctcctgtttt 36895792  T
Q  902 ttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatgatga 976  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36895791 t-cacatggccaattgtacgtcgcaatatcgagggtaacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatgatga 36895718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 817 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 30388253 - 30388097
Alignment:
Q  817 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaatt 916  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  30388253 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcatggtcagtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttttcacatggacaatt 30388154  T
Q  917 gtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  30388153 gtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 30388097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 819 - 973
Target Start/End: Original strand, 21382528 - 21382682
Alignment:
Q  819 tctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgt 918  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  21382528 tctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcagtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttttcacatggacagttgt 21382627  T
Q  919 acgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  21382628 acgtcgcaatatcacaggttacttcgagggctggtttaaaaatattgattaatga 21382682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 817 - 973
Target Start/End: Original strand, 16908941 - 16909097
Alignment:
Q  817 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaatt 916  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  16908941 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcaaggtcggtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttttcacatggacagtt 16909040  T
Q  917 gtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  16909041 gtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 16909097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 817 - 973
Target Start/End: Original strand, 28389279 - 28389435
Alignment:
Q  817 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaatt 916  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  28389279 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcggtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttttcacatggacagtt 28389378  T
Q  917 gtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| || |||||||| |||||    
T  28389379 gtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggttttaaaatattgattaatga 28389435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 890 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 41944158 - 41944072
Alignment:
Q  890 gtctcatgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatgatga 976  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41944158 gtctcctgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatgatga 41944072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 817 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 29359426 - 29359311
Alignment:
Q  817 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaatt 916  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||| ||||||| ||    
T  29359426 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtgagggtcagtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttttcatatggacagtt 29359327  T
Q  917 gtacgtcgcaatatca 932  Q
    ||||||||||||||||    
T  29359326 gtacgtcgcaatatca 29359311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 186 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 30576688 - 30576448
Alignment:
Q  186 ggtttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcatttgtttagtttgatttttggttatttgtaatcc 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||| | | |||||||||||||| | |||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| |    
T  30576688 ggtttggtttgttcattttgcagtagagaaatttccaaaatggcggttggaataagagcaagagcttttgtttaattggattttttgttatttgtaattc 30576589  T
Q  286 gatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttcggtttgttatattctagaaggaggtttatgcggtggtggtt-------gt 378  Q
    || || |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||         ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||        |    
T  30576588 gacgagtttttgaatttcattgttatctaatttattaccatctctttt--------atattttctagaacgaggtttatgcggcggtggttttcgtaact 30576497  T
Q  379 tgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattaaa 427  Q
    |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  30576496 tgcaagaaggcccctgcgctgatgatttatatggtggtggttgaataaa 30576448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 19515369 - 19515295
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  19515369 tttttcacatggacagttgtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 19515295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 21581759 - 21581685
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  21581759 tttttcacatggacagttgtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 21581685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 673 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 23004660 - 23004567
Alignment:
Q  673 tatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcattattgacccgtgtgatagcac 769  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||   |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  23004660 tatatatttcacgttgttttagttta---ttttcatgtgatgttgtagtcctaaattgctaatatattgtgcttaatattgacccgtgcgatagcac 23004567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 210
Target Start/End: Original strand, 15056967 - 15057124
Alignment:
Q  56 tcctcttctttgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttcttacaaa 155  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||| ||  | |||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||  |||    
T  15056967 tcctcttcttcgtgaccaagtttaaccacgtatctttattctctttcaattcctttgttgttcaaaatagattgcaatagcttcttagatttcttttaaa 15057066  T
Q  156 atcaaagtaattgtt----atatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagtt 210  Q
    ||||| |||||||||    ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  15057067 atcaacgtaattgttgttcatatgattgttgt-aggtttggtatgttgattttggagtt 15057124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 926 - 976
Target Start/End: Original strand, 37062400 - 37062452
Alignment:
Q  926 aatatcaagggttacttcaaggg--atggtttaaagatattgatcaatgatga 976  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  37062400 aatatcaagggttacttcaagggatatagtttaaagatattgatcaatgatga 37062452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 828 - 964
Target Start/End: Complemental strand, 4882243 - 4882107
Alignment:
Q  828 tttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaa 927  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| || |||||||||||||| ||| | || || | | | || || ||||| |||||||| || ||      
T  4882243 tttgcaatgactataaacaaaagtcaaggtcaatctttgaaacatgttggtgtatatttgccatcgcctatcttctctcatggtcaattgtatgtggctt 4882144  T
Q  928 tatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatatt 964  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  4882143 tgtcaagggttacttcaagagaaggtttgaagatatt 4882107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 313
Target Start/End: Original strand, 14991327 - 14991423
Alignment:
Q  217 ttttcaaattcggggttggaataagagtaggagcatttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgctatct 313  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||   |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| |  |||||  || ||||||||||||||||||    
T  14991327 ttttctaattgggggttgtaataagagtgaaaatatttgtttaatttgatctttggttatttgtattatgatgagattctgaattgcattgctatct 14991423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 189 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 47964156 - 47964110
Alignment:
Q  189 ttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttgg 235  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  47964156 ttggtttgttgattttacagtttatgaattttcaaattaggggttgg 47964110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 778; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 778; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 973
Target Start/End: Original strand, 32674006 - 32674929
Alignment:
Q  53 tcctcctcttctttgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttcttac 152  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32674006 tcctcctcttttctgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaataacttgcaatagctttttaggcttcttac 32674105  T
Q  153 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32674106 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcaattcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcat 32674205  T
Q  253 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttcggtttgttatattctag 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  32674206 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttttgtttgttatattctag 32674305  T
Q  353 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattaaactgatgtgactgtgtcttagatgtc 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  32674306 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattatactgatgtgactgtgtcttagatatc 32674405  T
Q  453 ccatgaactatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgattcatatcattgttttaataaggattgtcccaatgctttatgtgagattctattggctg 552  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||    
T  32674406 ccctgagctatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgattcatatcattgttttaataaggattggcccaatgcttcttgtgatattctattggttg 32674505  T
Q  553 aataaggatttatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 652  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32674506 aataaagatctatctaatcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 32674605  T
Q  653 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcattatt 752  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32674606 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcatcatt 32674705  T
Q  753 gacccgtgtgatagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttatgttatct---gtctcatttgcaatgactattaacaaga 849  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32674706 gactcgtgtggtagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttccgttatctgtcgtctcatttgcaatgactattaacaaga 32674805  T
Q  850 gtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaaggga 949  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  32674806 gtcagggtcagtcgttgaaacatgttggtgtttatctaccgtctcctgttttttcacatggacagttgtacgtcgcaatatcaagggttacttcgagagg 32674905  T
Q  950 tggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  32674906 tggtttaaaaatattgattaatga 32674929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 53 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22636891 - 22636691
Alignment:
Q  53 tcctcctcttctttgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttcttac 152  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636891 tcctcctcttctccgtgactaaggttaaccgcatatctttctttccgttcaattcctcttttgttcaaaatagcttgcaatagctttttaggcttcttac 22636792  T
Q  153 aaaatcaaagtaattgtt----atatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtagga 248  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  22636791 aaaatcaaagtaattgttgttcatatgattggtgtggggttttgtttgttgattttgcagtttatgagttttcaaattggtggttggaaaaagagtagga 22636692  T
Q  249 g 249  Q
    |    
T  22636691 g 22636691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 802 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 16679002 - 16678829
Alignment:
Q  802 gaaggcaatttatgttatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgtttt 901  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16679002 gaaggcagttttcgttatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcagtctttgaaaaatgttggtgtctatctaccgtctcctgtttt 16678903  T
Q  902 ttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatgatga 976  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16678902 tttacatggacaattgtacgttgcaatatcga-ggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatgatga 16678829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 819 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 38095732 - 38095575
Alignment:
Q  819 tctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgt 918  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38095732 tctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcagtctttgaaaaatattggtgtctatctaccgtctcttgttttttcacatggacaattgt 38095633  T
Q  919 acgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatgatga 976  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38095632 atgtcgcaatatcgagggttacttcaagggatggtttaaagatgttgatcaatgatga 38095575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 589 - 773
Target Start/End: Original strand, 8795897 - 8796082
Alignment:
Q  589 aaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcataccttacctacataatatagctata-tatttcatgtt 687  Q
    ||||||| |||  ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||| ||||| |  ||    
T  8795897 aaatatggttagtttatcattatctacaagcatgatcattgcaaaacataaattataaaccatacttatcctagataatatagctatagtattttacatt 8795996  T
Q  688 attttaattta-cggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcattattgacccgtgtgatagcacgggt 773  Q
     |||||||||| ||  ||| ||||||||||| |||||||||||  |||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  8795997 gttttaatttatcgtctttcatgtgatgttggactcctaaatttttaatttgttgagctca-tattgacccgtgcgatagcacgggt 8796082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 20105235 - 20105161
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20105235 tttttcacatggacagttgtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 20105161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 899 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 3608080 - 3608003
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatgatga 976  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  3608080 tttttcacatggacagttgtacgtcgcaatatcacgggttactttgaggggtggtttaaagatattgattaatgatga 3608003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 899 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 30090495 - 30090418
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatgatga 976  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30090495 tttttcacatggacagttgtacgtcgcaatatcgcgggttactttgaggggtggtttaaagatattgattaatgatga 30090418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Original strand, 12655177 - 12655251
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  12655177 tttttcacatggacagttgtacattgcaatatcacaggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 12655251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Original strand, 23183962 - 23184036
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23183962 tttttcacatggacagttgtacattgcaatatcacaggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 23184036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Original strand, 23188229 - 23188303
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23188229 tttttcacatggacagttgtacattgcaatatcacaggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 23188303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Original strand, 34761223 - 34761297
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  34761223 tttttcacatggacagttgtacattgcaatatcacaggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 34761297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Original strand, 39878057 - 39878131
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  39878057 tttttcacatggacagttgtacattgcaatatcacaggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 39878131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 284
Target Start/End: Original strand, 21122329 - 21122422
Alignment:
Q  191 ggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcatttgtttagtttgatttttggttatttgtaatc 284  Q
    |||||||||||||| | ||  | ||||||| ||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  21122329 ggtttgttgattttacggtctatgaatttttaaattaggggttaagataagagtaatagcatttgtttaattttatttttggttattcgtaatc 21122422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 774; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 774; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 2046239 - 2045316
Alignment:
Q  53 tcctcctcttctttgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttcttac 152  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2046239 tcctcctcttttctgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaacagctttttaggcttcttac 2046140  T
Q  153 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcat 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2046139 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgtttattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttgaaataagagtatgagcat 2046040  T
Q  253 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttcggtttgttatattctag 352  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2046039 ttatttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattggattgctatctaatttattatcatctctttttttgtttgttatattctag 2045940  T
Q  353 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattaaactgatgtgactgtgtcttagatgtc 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  2045939 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattatactgatgtgactgtgtcttagatatc 2045840  T
Q  453 ccatgaactatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgattcatatcattgttttaataaggattgtcccaatgctttatgtgagattctattggctg 552  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2045839 ccctgagctatgcaaactacaaattaagttgtaaactatgattcatatcattgttttaataaggattggcccaatgcttcatgtgatattctattggctg 2045740  T
Q  553 aataaggatttatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 652  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2045739 aataaggatctatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 2045640  T
Q  653 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcattatt 752  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2045639 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcatcatt 2045540  T
Q  753 gacccgtgtgatagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttatgttatct---gtctcatttgcaatgactattaacaaga 849  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2045539 gacccgtgtggtagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttccgttatctgtcgtctcatttgcaatgactattaacaaga 2045440  T
Q  850 gtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaaggga 949  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |     
T  2045439 gtcagggtcagtcgttgaaacatgttggtgtttatctaccgtctcctgttttttcacatggacagttgtacgtcgcaatatcacgggttacttcgagagg 2045340  T
Q  950 tggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  2045339 tggtttaaaaatattgattaatga 2045316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 35595940 - 35595295
Alignment:
Q  53 tcctcctcttctttgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttcttac 152  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35595940 tcctcctcttttctgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttcttac 35595841  T
Q  153 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcat 252  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35595840 aaaatcaaaataattgttatatgattggtgtgggatttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtgggagcat 35595741  T
Q  253 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttcggtttgttatattctag 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  35595740 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgttgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctccttttttgtttgttatattctag 35595641  T
Q  353 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattaaactgatgtgactgtgtcttagatgtc 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35595640 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattaaactgatgtgactgtgtcttagatgtc 35595541  T
Q  453 ccatgaactatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgattcatatcattgttttaataaggattgtcccaatgctttatgtgagattctattggctg 552  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  35595540 ccctgagctatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgatttatatcattgttttaataaggattggcccaatgcttcatgtgatattctattggctg 35595441  T
Q  553 aataaggatttatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 652  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35595440 aataaggatctatctaagcatatgattttgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 35595341  T
Q  653 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaattta 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35595340 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaattta 35595295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 690 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 35594216 - 35593930
Alignment:
Q  690 tttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcattattgacccgtgtgatagcacgggttagcaaattatgaggt 789  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35594216 tttaatttacgatttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcatcattgacccgtgtgatagcacaggttagcaaattatgaggt 35594117  T
Q  790 tttgcttgacatgaaggcaatttatgttatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctacc 889  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35594116 tttgcttgacatgaaggcaatttccgttatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagagtcagtcgttgaaacatgttggtgtttatctacc 35594017  T
Q  890 gtctcatgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatgatga 976  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35594016 gtctcctgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatgatga 35593930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 802 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 23086433 - 23086259
Alignment:
Q  802 gaaggcaatttatgttatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgtttt 901  Q
    ||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  23086433 gaaggcagtttccgttgtctgtctcatttgcaatgactattaacaagagttggggtcaatctttgaaaaatgttggtgtctatctaccgtctcctgtttt 23086334  T
Q  902 ttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatgatga 976  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23086333 ttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcgatggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatgatga 23086259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 819 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 37891756 - 37891602
Alignment:
Q  819 tctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgt 918  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  37891756 tctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcagtctttgaaaaatgttggtgtctatctaccgtcttctgttttttcacatggacaattgt 37891657  T
Q  919 acgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37891656 acgtcgcaatatcgagggttacttcaagggatggtttaaagatgttgatcaatga 37891602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 817 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 39513479 - 39513323
Alignment:
Q  817 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaatt 916  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  39513479 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcagtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttttcacatggacaatt 39513380  T
Q  917 gtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  39513379 gtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 39513323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 817 - 973
Target Start/End: Original strand, 29245330 - 29245486
Alignment:
Q  817 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaatt 916  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  29245330 tatctgcctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcagtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttttcacatggacaatt 29245429  T
Q  917 gtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  29245430 gtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 29245486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 818 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 45503755 - 45503600
Alignment:
Q  818 atctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattg 917  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  45503755 atctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcagtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttttcacatggacaattg 45503656  T
Q  918 tacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  45503655 tacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 45503600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 817 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 38211217 - 38211061
Alignment:
Q  817 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaatt 916  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||| ||||| | |||||||||||||||| ||    
T  38211217 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcaatcgctagaacatgttggtgtctacctactgtctcctattttttcacatggacagtt 38211118  T
Q  917 gtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  38211117 gtacgtcgcaatatcacgagttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 38211061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 817 - 973
Target Start/End: Original strand, 50708751 - 50708907
Alignment:
Q  817 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaatt 916  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  50708751 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcagtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttttcacatggacagtt 50708850  T
Q  917 gtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  50708851 gtacgtcgcaatatcacgtgttacatcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 50708907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 817 - 973
Target Start/End: Original strand, 48650894 - 48651050
Alignment:
Q  817 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaatt 916  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| || |||| ||||| | |||||||||||||||| ||    
T  48650894 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcagtcgctagaacatgttggtgtctacctactgtctcctattttttcacatggacagtt 48650993  T
Q  917 gtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  48650994 gtacgtcgcaatatcacaggttactttgagggctggtttaaaaatattgattaatga 48651050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 818 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 13926520 - 13926369
Alignment:
Q  818 atctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattg 917  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||   |||| ||||||||||||| | ||||| |||||| ||| |||    
T  13926520 atctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcagtcgctagaacatg---gtgtctatctaccgtctcctattttt-cacatgcacagttg 13926425  T
Q  918 tacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  13926424 tacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 13926369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 49787498 - 49787424
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  49787498 tttttcacatggacagttgtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 49787424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 2047641 - 2047567
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  2047641 tttttcacatggacagttgtacgtcacaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 2047567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 36867052 - 36866978
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  36867052 tttttcacatggacagttgtacgtcacaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 36866978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Original strand, 7480470 - 7480544
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  7480470 tttttcacatggacagttgtacattgcaatatcacaggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 7480544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Original strand, 9533846 - 9533920
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  9533846 tttttcacatggacagttgtacattgcaatatcacaggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 9533920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Original strand, 42496554 - 42496628
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  42496554 tttttcacatggacagttgtacattgcaatatcacaggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 42496628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 917 - 976
Target Start/End: Original strand, 26211630 - 26211689
Alignment:
Q  917 gtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatgatga 976  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26211630 gtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggttaaaagatattgattaatgatga 26211689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 825 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 23481110 - 23480959
Alignment:
Q  825 tcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgtacgtcg 924  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||  || || ||| | |||||||||||||| ||||||||  | | ||| ||||| || ||||| ||||| || |    
T  23481110 tcatttgcaatgacaattaacaaaagtcaagggcagtcgcttaaacatgttggtgtatatctaccaacacctgtattttctcaaggacagttgtatgttg 23481011  T
Q  925 caatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatgatga 976  Q
    | || ||||| ||||| || || || ||  ||||||||||||||| ||||||    
T  23481010 ctatttcaagagttacatccagagaaggactaaagatattgatcactgatga 23480959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 251 - 318
Target Start/End: Original strand, 52589715 - 52589782
Alignment:
Q  251 atttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgctatctaattt 318  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  52589715 atttgtttgatttgattttttgttatttgtaatgtaacgagtttttgaattgcattgctatctaattt 52589782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 820 - 922
Target Start/End: Original strand, 5429244 - 5429346
Alignment:
Q  820 ctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgta 919  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || || ||| | |||||||||||||| ||||||||  | | ||| ||||| ||| |||| |||||    
T  5429244 ctgtatcatttgcaatgacaattaacaaaagtcaagggcagtcgcttaaacatgttggtgtatatctaccaacacctgtattttctcatagacagttgta 5429343  T
Q  920 cgt 922  Q
    |||    
T  5429344 cgt 5429346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 766; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 766; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 14995470 - 14994547
Alignment:
Q  53 tcctcctcttctttgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttcttac 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14995470 tcctcctcttttttgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttcttac 14995371  T
Q  153 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14995370 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcat 14995271  T
Q  253 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttcggtttgttatattctag 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14995270 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactgtttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttttgtttgttatattctag 14995171  T
Q  353 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattaaactgatgtgactgtgtcttagatgtc 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  14995170 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgtggtgataatttatacggtggtggttgattaaactgatgtgactgtgtctttgatatc 14995071  T
Q  453 ccatgaactatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgattcatatcattgttttaataaggattgtcccaatgctttatgtgagattctattggctg 552  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14995070 ccctgagctatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgattcatatcattgttttaataaggattggcccaatgcttcatgtgatattctattggctg 14994971  T
Q  553 aataaggatttatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 652  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14994970 aataaggatctatctaagcatatgattatgtcttcaaaatatgtttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 14994871  T
Q  653 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcattatt 752  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14994870 ccttacctacataatatagctatatatttcctgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcatcatt 14994771  T
Q  753 gacccgtgtgatagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttatgttatct---gtctcatttgcaatgactattaacaaga 849  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14994770 gacccgtgtggtagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttccgttatctgtcgtctcatttgcaatgattattaacaaga 14994671  T
Q  850 gtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaaggga 949  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||||||| |||||||||| || |     
T  14994670 gtcagggtcagtcgttgaaacatgttggtgtttatctaccgtctcctgttttttcacatggacagtcgtacgtgacaatatcacgggttacttcgagagg 14994571  T
Q  950 tggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    |||||| || |||||||| |||||    
T  14994570 tggttttaaaatattgattaatga 14994547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 802 - 976
Target Start/End: Original strand, 37589444 - 37589618
Alignment:
Q  802 gaaggcaatttatgttatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgtttt 901  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | ||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  37589444 gaagacaatttccgttatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcagtctatgaaaaatgttggtatctatctaccgtctcctgtttt 37589543  T
Q  902 ttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatgatga 976  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37589544 ttcacatggacaattgtatgttgcaatatcgatggttacttcaagggatgatttaaagatattgatcaatgatga 37589618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 817 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 22730110 - 22729954
Alignment:
Q  817 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaatt 916  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  22730110 tatctgtctcatttgcaatgactactaacaagagtcagggtcagtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttttcaaatggacaatt 22730011  T
Q  917 gtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  22730010 gtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 22729954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 817 - 973
Target Start/End: Original strand, 23827644 - 23827800
Alignment:
Q  817 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaatt 916  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  23827644 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcggtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttttcacatggacagtt 23827743  T
Q  917 gtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  23827744 gtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 23827800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 817 - 973
Target Start/End: Original strand, 19961504 - 19961660
Alignment:
Q  817 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaatt 916  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  19961504 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcagtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttttcacatggacagtt 19961603  T
Q  917 gtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  19961604 gtacgtcgcaatatcacgagttacatcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 19961660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 406305 - 406231
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  406305 tttttcacatggacagttgtacgtcgcaatatcacgggttacttcgagggatggtttaaagatattgattaatga 406231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 18266140 - 18266066
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18266140 tttttcacatggacagttgtacatcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 18266066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 900 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 41376561 - 41376488
Alignment:
Q  900 ttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  41376561 tttttacatgggcagttgtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 41376488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 721 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 36238622 - 36238570
Alignment:
Q  721 tcctaaattactaatatattgtgctcattattgacccgtgtgatagcacgggt 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  36238622 tcctaaattactaatatattgtgctcaatattgacccgtgcgatagcacgggt 36238570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 18275153 - 18275079
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18275153 tttttcacatggacagttgtacataacaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 18275079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 828 - 961
Target Start/End: Complemental strand, 9885811 - 9885678
Alignment:
Q  828 tttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaa 927  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||  || || ||  | |||||||| || |||||| | || || | ||||||||| ||||| |||||||| || |||     
T  9885811 tttgcagtgactattaacaaaagtcaaggccagtctcttaaacatgtgggagtttatttgccatcgcctgttttttctcatggtcaattgtatgtggcat 9885712  T
Q  928 tatcaagggttacttcaagggatggtttaaagat 961  Q
    | ||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  9885711 tgtcaagagttacttcaagagaaggtttgaagat 9885678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 762; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 762; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 973
Target Start/End: Original strand, 40604478 - 40605401
Alignment:
Q  53 tcctcctcttctttgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttcttac 152  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  40604478 tcctcctcttttctgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaacaactttttaggcttcttac 40604577  T
Q  153 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  40604578 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcagaaattttcaaattcggggttgaaataagagtatgagcat 40604677  T
Q  253 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttcggtttgttatattctag 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40604678 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattggattgctatctaatttattatcatctctttttttgtttgttatattctag 40604777  T
Q  353 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattaaactgatgtgactgtgtcttagatgtc 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  40604778 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattatactgatgtgactgtgtcttagatatc 40604877  T
Q  453 ccatgaactatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgattcatatcattgttttaataaggattgtcccaatgctttatgtgagattctattggctg 552  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  40604878 ccctgagctatgcaaactacaaattaagttgtaaactatgattcatatcattgttttaataaggattggcccaatgcttcatttgatattctattggttg 40604977  T
Q  553 aataaggatttatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 652  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40604978 aataaggatctatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 40605077  T
Q  653 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcattatt 752  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40605078 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcatcatt 40605177  T
Q  753 gacccgtgtgatagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttatgttatct---gtctcatttgcaatgactattaacaaga 849  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40605178 gacccgtgtggtagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttccgttatctgtcgtctcatttgcaatgactattaacaaga 40605277  T
Q  850 gtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaaggga 949  Q
    ||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |     
T  40605278 gttagggtcagtcgttgaaacatgttggtgtttatctaccgtctcctgttttttcacatggacagttgtacgtcgcaatatcacgggttacttcgagagg 40605377  T
Q  950 tggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  40605378 tggtttaaaaatattgattaatga 40605401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 750; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 909
Target Start/End: Original strand, 13906996 - 13907855
Alignment:
Q  53 tcctcctcttctttgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttcttac 152  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13906996 tcctcctcttttctgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttcttac 13907095  T
Q  153 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13907096 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggttttttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttgaaataagagtaggagcat 13907195  T
Q  253 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttcggtttgttatattctag 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13907196 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttttgtttgttatattctag 13907295  T
Q  353 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattaaactgatgtgactgtgtcttagatgtc 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  13907296 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattatactgatgtgaatgtgtcttagatatc 13907395  T
Q  453 ccatgaactatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgattcatatcattgttttaataaggattgtcccaatgctttatgtgagattctattggctg 552  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  13907396 ccctgagctatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgattcatatcattgttttaataaggattggcccaatgcttcatgtgatattctattggctg 13907495  T
Q  553 aataaggatttatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 652  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13907496 aataaggatctatctaagcatatgattgtgccttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 13907595  T
Q  653 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcattatt 752  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13907596 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcatcatt 13907695  T
Q  753 gacccgtgtgatagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttatgttatct---gtctcatttgcaatgactattaacaaga 849  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13907696 gacccgtgtggtagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttccgttatctgtcgtctcatttgcaatgactattaacaaga 13907795  T
Q  850 gtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatg 909  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13907796 gtcagggtcagtcgttgaaacatgttggtgtttatctaccgtctcctgttttttcacatg 13907855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 738; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 909
Target Start/End: Original strand, 26454641 - 26455500
Alignment:
Q  53 tcctcctcttctttgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttcttac 152  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26454641 tcctcctcttttctgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaacagctttttaggcttcttac 26454740  T
Q  153 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcat 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26454741 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttgaaataagagtatgagcat 26454840  T
Q  253 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttcggtttgttatattctag 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26454841 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttttgtttgttatattctag 26454940  T
Q  353 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattaaactgatgtgactgtgtcttagatgtc 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  26454941 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattatactgatgtgactgtgtcttagatatc 26455040  T
Q  453 ccatgaactatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgattcatatcattgttttaataaggattgtcccaatgctttatgtgagattctattggctg 552  Q
    || ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  26455041 ccctgagctatgcaaactaaaaattaagttgtaaactatgattcatatcattgttttaataaggattggcccaatgcttcatgtgatattctattggctg 26455140  T
Q  553 aataaggatttatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 652  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455141 aataaggatctatctaagcatatgattgtgtcttcaagatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 26455240  T
Q  653 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcattatt 752  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26455241 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcatcatt 26455340  T
Q  753 gacccgtgtgatagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttatgttatct---gtctcatttgcaatgactattaacaaga 849  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455341 gacccgtgtggtagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttccgttatctgtcgtctcatttgcaatgactattaacaaga 26455440  T
Q  850 gtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatg 909  Q
    ||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26455441 gtcagggtcggtcgttgaaacatgttggtgtttatctaccgtctcctgttttttcacatg 26455500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 540 - 973
Target Start/End: Original strand, 26455503 - 26455939
Alignment:
Q  540 attctattggctgaataaggatttatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacatta 639  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455503 attctattggctgaataaggatctatctaagcatattactgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacatta 26455602  T
Q  640 attgtaaatcataccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatat 739  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455603 attgtaaatcataccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatat 26455702  T
Q  740 tgtgctcattattgacccgtgtgatagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttatgttatct---gtctcatttgcaatg 836  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||    
T  26455703 tgtgctcatcattgacccgtgtggtagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttccgttatctgtcgtctcatttgcaatg 26455802  T
Q  837 actattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaaggg 936  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  26455803 actattaacaagagtcagggtcggtcgttgaaacatgttggtgtttatctaccgtctcctgttttttcacatggacagttgtacgtcgcaatatcacggg 26455902  T
Q  937 ttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||    
T  26455903 ttacttcgagaggtggtttaaaaatattgattaatga 26455939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 540 - 973
Target Start/End: Original strand, 13907858 - 13908293
Alignment:
Q  540 attctattggctgaataaggatttatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacatta 639  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13907858 attctattggctgaataaggatctatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccgttaactataagcatgatcattgcaaaacatta 13907957  T
Q  640 attgtaaatcataccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatat 739  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13907958 attgtaaatcataccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacgatttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatat 13908057  T
Q  740 tgtgctcattattgacccgtgtgatagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttatgttatct---gtctcatttgcaatg 836  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||    
T  13908058 tgtgctcatcattaacccgtgtggtagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttccgttatctgtcgtctcatttgcaatg 13908157  T
Q  837 actattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaaggg 936  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  13908158 actattaacaagagtcagggtc-atcgttgaaacatgttggtgtttatctaccgtctcctgttttttcacatggacagttgtacgtcgcaatatcacggg 13908256  T
Q  937 ttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||    
T  13908257 ttacttcgagaggtggtttaaaaatattgattaatga 13908293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 817 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 35432398 - 35432242
Alignment:
Q  817 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaatt 916  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  35432398 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcagtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttttcacatggacaatt 35432299  T
Q  917 gtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  35432298 gtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 35432242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 817 - 973
Target Start/End: Original strand, 207623 - 207779
Alignment:
Q  817 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaatt 916  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  207623 tatctgtctcatttgcaatgattattaacaagagtcagggtcagtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttttcacatggacaatt 207722  T
Q  917 gtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  207723 gtacgtcgcaatatcacaggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 207779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 817 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 5013791 - 5013634
Alignment:
Q  817 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttc-acatggacaat 915  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  5013791 tatctgtctcattttcaatgactattaacaagagtcagggtcagtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttttctacatggacaat 5013692  T
Q  916 tgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  5013691 tgtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 5013634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 821 - 967
Target Start/End: Original strand, 1512653 - 1512799
Alignment:
Q  821 tgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgtac 920  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  1512653 tgtctcatttgcaatgactattaacaagagttagggtcagtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttttcacatggacagttgtac 1512752  T
Q  921 gtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgat 967  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  1512753 gtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgat 1512799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Original strand, 13905287 - 13905361
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13905287 tttttcacatggacagttgtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 13905361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Original strand, 2300779 - 2300853
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  2300779 tttttcacatggacagttgtacatggcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 2300853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Original strand, 6123670 - 6123744
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  6123670 tttttcacatggacagttgtacgttgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 6123744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Original strand, 184091 - 184165
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  184091 tttttcacatggacagttgtacattgcaatatcacaggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 184165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 976225 - 976151
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  976225 tttttcacatggacagttgtacattgcaatatcacaggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 976151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Original strand, 2449325 - 2449399
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  2449325 tttttcacatggacagttgtacattgcaatatcacaggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 2449399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 938 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 23455797 - 23455759
Alignment:
Q  938 tacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatgatga 976  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23455797 tacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatgatga 23455759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 59
Target Start/End: Original strand, 32287325 - 32287361
Alignment:
Q  23 caaaccctaaccatgatttcctaatttctatcctcct 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32287325 caaaccctaaccatgatttcctaatttccatcctcct 32287361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 750; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 750; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 909
Target Start/End: Original strand, 22005714 - 22006573
Alignment:
Q  53 tcctcctcttctttgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttcttac 152  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22005714 tcctcctcttttctgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttcttac 22005813  T
Q  153 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22005814 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggttttttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttgaaataagagtaggagcat 22005913  T
Q  253 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttcggtttgttatattctag 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22005914 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttttgtttgttatattctag 22006013  T
Q  353 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattaaactgatgtgactgtgtcttagatgtc 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22006014 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattatactgatgtgactgtgtcttagatatc 22006113  T
Q  453 ccatgaactatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgattcatatcattgttttaataaggattgtcccaatgctttatgtgagattctattggctg 552  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22006114 ccctgagctatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgattcatatcattgttttaataagcattggcccaatgcttcatgtgatattctattggctg 22006213  T
Q  553 aataaggatttatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 652  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006214 aataaggatctatctaagcatatgattgtgccttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 22006313  T
Q  653 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcattatt 752  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22006314 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcatcatt 22006413  T
Q  753 gacccgtgtgatagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttatgttatct---gtctcatttgcaatgactattaacaaga 849  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006414 gacccgtgtggtagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttccgttatctgtcgtctcatttgcaatgactattaacaaga 22006513  T
Q  850 gtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatg 909  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22006514 gtcagggtcagtcgttgaaacatgttggtgtttatctaccgtctcctgttttttcacatg 22006573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 742; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 909
Target Start/End: Original strand, 7892490 - 7893349
Alignment:
Q  53 tcctcctcttctttgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttcttac 152  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7892490 tcctcctcttttctgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaacagctttttaggcttcttac 7892589  T
Q  153 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcat 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7892590 aaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttgaaataagagtatgagcat 7892689  T
Q  253 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttcggtttgttatattctag 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7892690 ttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattggattgctatctaatttattatcatctctttttttgtttgttatattctag 7892789  T
Q  353 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattaaactgatgtgactgtgtcttagatgtc 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  7892790 aaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattatactgatgtgactgtgtcttagatatc 7892889  T
Q  453 ccatgaactatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgattcatatcattgttttaataaggattgtcccaatgctttatgtgagattctattggctg 552  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7892890 ccctgagctatgcaaactacaaattaagttgtaaactatgattcatatcattgatttaataaggattggcccaatgcttcatgtgatattctattggctg 7892989  T
Q  553 aataaggatttatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 652  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7892990 aataaggatctatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacattaattgtaaatcata 7893089  T
Q  653 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcattatt 752  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7893090 ccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatattgtgctcatcatt 7893189  T
Q  753 gacccgtgtgatagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttatgttatct---gtctcatttgcaatgactattaacaaga 849  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893190 gacccgtgtggtagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttccgttatctgtcgtctcatttgcaatgactattaacaaga 7893289  T
Q  850 gtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatg 909  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7893290 gtcagggtcagtcgttgaaacatgttggtgtttatctaccgtctcctgttttttcacatg 7893349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 540 - 973
Target Start/End: Original strand, 7893352 - 7893788
Alignment:
Q  540 attctattggctgaataaggatttatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacatta 639  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893352 attctattggctgaataaggatctatctaagcatatgactgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacatta 7893451  T
Q  640 attgtaaatcataccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatat 739  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893452 attgtaaatcataccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatat 7893551  T
Q  740 tgtgctcattattgacccgtgtgatagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttatgttatct---gtctcatttgcaatg 836  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||    
T  7893552 tgtgctcatcattgacccgtgtggtagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttccgttatctgtcgtctcatttgcaatg 7893651  T
Q  837 actattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaaggg 936  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  7893652 actattaacaagagtcagggtcagtcgttgaaacatgttggtgtttatctaccgtctcctgttttttcacatggacagttgtacgtcgcaatatcacggg 7893751  T
Q  937 ttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||    
T  7893752 ttacttcgagaggtggtttaaaaatattgattaatga 7893788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 540 - 973
Target Start/End: Original strand, 22006576 - 22007011
Alignment:
Q  540 attctattggctgaataaggatttatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacatta 639  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006576 attctattggctgaataaggatctatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccgttaactataagcatgatcattgcaaaacatta 22006675  T
Q  640 attgtaaatcataccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggtttttatgtgatgttgaactcctaaattactaatatat 739  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22006676 attgtaaatcataccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacgatttttatgtgacgttgaactcctaaattactaatatat 22006775  T
Q  740 tgtgctcattattgacccgtgtgatagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttatgttatct---gtctcatttgcaatg 836  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||    
T  22006776 tgtgctcatcattgacccgtgtggtagcacgggttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttccgttatctgtcgtctcatttgcaatg 22006875  T
Q  837 actattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaaggg 936  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22006876 actattaacaagagtcagggtc-atcgttgaaacatgttggtgtttatctaccgtctcctgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcacggg 22006974  T
Q  937 ttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||    
T  22006975 ttacttcgagaggtggtttaaaaatattgattaatga 22007011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 52 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 3599241 - 3598843
Alignment:
Q  52 atcctcctcttctttgtgactaaggttaaccacacatctttctttccattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttctta 151  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3599241 atcctcctcttatctgtgactaaggttaaccacacatctttctttacattcaattcctctattgtacaaaatagcttgcaatagctttttaggcttctta 3599142  T
Q  152 caaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3599141 caaaatcaaagtaattgttatatgattggtgtggggtttggtttgttgattttgtagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtgggagca 3599042  T
Q  252 tttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttcggtttgttatattc-- 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||      
T  3599041 tttgtttagtttgatttttggttatttgtatttcgatgactttttgaattgcattgctatctaatttattatcatctctttttttgtttgttatattcta 3598942  T
Q  350 ----tagaaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcggtgataatttatacggtggtggttgattaaactgatgtgactgtgtct 444  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3598941 gatctagaaggaggtttatgcggtggtggttgttgcaagaaggccctcgcgatgataatttatacggtggtggttgattaaactgatgtgactgtgtct 3598843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 438 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 3595936 - 3595667
Alignment:
Q  438 tgtgtcttagatgtcccatgaactatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgattcatatcattgttttaataaggattgtcccaatgctttatgtg 537  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||    
T  3595936 tgtgtcttagatgtcctctgagctatgcaaactacaaattaagttgtaaaccatgattcatatcattgtttcaataaggattggcccaatgcttcaggtg 3595837  T
Q  538 agattctattggctgaataaggatttatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacat 637  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3595836 atattctattggctgaataaggatctatctaagcatatgattgtgtcttcaaaatatgcttaacttaccattaactataagcatgatcattgcaaaacat 3595737  T
Q  638 taattgtaaatcataccttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggttttta 707  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3595736 taattgtaaatcatatcttacctacataatatagctatatatttcatgttattttaatttacggttttta 3595667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 772 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 3595666 - 3595461
Alignment:
Q  772 gttagcaaattatgaggttttgcttgacatgaaggcaatttatgttatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaaca 871  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  3595666 gttagcaaattatgaggtttttcttgacatcaaggcaatttccgttatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcagtcgttgaaaca 3595567  T
Q  872 tgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaag-atattgatcaa 970  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3595566 tgttggtatctatctactgtctcctgttttttcacatggacaattgtacatcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagtatattgatcaa 3595467  T
Q  971 tgatga 976  Q
    ||||||    
T  3595466 tgatga 3595461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 817 - 973
Target Start/End: Original strand, 45115705 - 45115861
Alignment:
Q  817 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaatt 916  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  45115705 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcagtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttttcacatggacagtt 45115804  T
Q  917 gtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  45115805 gtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 45115861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 817 - 973
Target Start/End: Original strand, 32660102 - 32660258
Alignment:
Q  817 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaatt 916  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32660102 tatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcatggtcagtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttttcacatggacaatt 32660201  T
Q  917 gtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||| |||||    
T  32660202 gtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtagtttaaaaatattgattaatga 32660258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 802 - 967
Target Start/End: Original strand, 26168704 - 26168869
Alignment:
Q  802 gaaggcaatttatgttatctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgtttt 901  Q
    ||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  26168704 gaaggcagtttctgatatttgtctcatttgcaatgactattaacaagagttagggtcagtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctatttt 26168803  T
Q  902 ttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgat 967  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  26168804 ttcacatggacagttgtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgat 26168869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 827 - 976
Target Start/End: Original strand, 35102862 - 35103010
Alignment:
Q  827 atttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgtacgtcgca 926  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| | |  || ||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35102862 atttgcaatgactattaacaagagtcaaggttagtttttgaaaaatgttggtgtttatctact-tctcctgttttttcacatggacaattgtacgtcgca 35102960  T
Q  927 atatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatgatga 976  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35102961 atatcgagggttacttcaagggatgatttaaagatattgatcaatgatga 35103010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Original strand, 17696872 - 17696946
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  17696872 tttttcacatggacagttgtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 17696946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Original strand, 27715901 - 27715975
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  27715901 tttttcacatggacagttgtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaatatattgattaatga 27715975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Original strand, 16719857 - 16719931
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  16719857 tttttcacatggacagttgtacgttgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 16719931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Original strand, 31100097 - 31100171
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  31100097 tttttcacatggagagttgtacgtcgcaatatcatgggttactttgaggggtggtttaaagatattgattaatga 31100171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Original strand, 7888824 - 7888898
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  7888824 tttttcacatggacagttgtacattgcaatatcacaggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 7888898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 900 - 973
Target Start/End: Original strand, 29956435 - 29956508
Alignment:
Q  900 ttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| || |||||    
T  29956435 ttttcacatggatagttgtacgtcgcaatatcacgggttactttgaggggtggtttaaagatattaattaatga 29956508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13604262 - 13604144
Alignment:
Q  191 ggtttgttgattttgcagttcaggaattttcaaattcggggttggaataagagtaggagcatttgtttagtttgatttttggttatttgtaatccgatga 290  Q
    |||||||||||||| || || | ||||||||||||| ||||||   |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  13604262 ggtttgttgattttacattt-atgaattttcaaattaggggttaagataagagtaataacatttgtttaatttgatttttggttattcgtaatctggtga 13604164  T
Q  291 ctttttgaattgcattgcta 310  Q
     | ||| ||||| |||||||    
T  13604163 gtgtttaaattgtattgcta 13604144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 915 - 973
Target Start/End: Original strand, 32038416 - 32038474
Alignment:
Q  915 ttgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  32038416 ttgtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 32038474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 734 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 16806009 - 16805970
Alignment:
Q  734 atatattgtgctcattattgacccgtgtgatagcacgggt 773  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16806009 atatattgtgctcaatattgacccgtgcgatagcacgggt 16805970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 93; Significance: 9e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 819 - 967
Target Start/End: Complemental strand, 52138 - 51990
Alignment:
Q  819 tctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctaccgtctcatgttttttcacatggacaattgt 918  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  52138 tctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcagggtcagtcgctagaacatgttggtgtctacctaccgtctcctattttttcacatggacagttgt 52039  T
Q  919 acgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgat 967  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  52038 acgtcgcaatatcacaggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgat 51990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 40586 - 40512
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  40586 tttttcacatggacagttgtacattgcaatatcacaggttacttcgaggggtggtttaaagatattgattaatga 40512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0642 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0642
Description:

Target: scaffold0642; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Original strand, 3356 - 3430
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  3356 tttttcacatggacagttgtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 3430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0345
Description:

Target: scaffold0345; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Original strand, 13268 - 13342
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  13268 tttttcacatggacagttgtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 13342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 899 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 25713 - 25639
Alignment:
Q  899 tttttcacatggacaattgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  25713 tttttcacatggacagttgtacgtcgcaatatcacgggttacttcgaggggtggtttaaaaatattgattaatga 25639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 915 - 973
Target Start/End: Original strand, 45550 - 45608
Alignment:
Q  915 ttgtacgtcgcaatatcaagggttacttcaagggatggtttaaagatattgatcaatga 973  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||    
T  45550 ttgtacgtcgcaatatcacgggttacttcgagaggtggtttaaaaatattgattaatga 45608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 59
Target Start/End: Original strand, 41422 - 41458
Alignment:
Q  23 caaaccctaaccatgatttcctaatttctatcctcct 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41422 caaaccctaaccatgatttcctaatttccatcctcct 41458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 820 - 889
Target Start/End: Original strand, 104606 - 104675
Alignment:
Q  820 ctgtctcatttgcaatgactattaacaagagtcggggtcaatcgttaaaacatgttggtgtttatctacc 889  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || || ||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  104606 ctgtatcatttgcaatgacaattaacaaaagtcaagggcagtcgcttaaacatgttggtgtatatctacc 104675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University