View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1200_low_14 (Length: 370)

Name: NF1200_low_14
Description: NF1200
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1200_low_14
NF1200_low_14
[»] chr7 (94 HSPs)
chr7 (191-341)||(35752048-35752198)
chr7 (191-341)||(36816859-36817009)
chr7 (191-341)||(48085866-48086016)
chr7 (1-179)||(45442874-45443053)
chr7 (191-341)||(43489226-43489376)
chr7 (192-341)||(37127946-37128095)
chr7 (191-341)||(24228549-24228699)
chr7 (191-341)||(46817435-46817585)
chr7 (192-341)||(26941546-26941695)
chr7 (191-341)||(24923038-24923188)
chr7 (192-338)||(498205-498351)
chr7 (191-341)||(7876342-7876492)
chr7 (191-341)||(29610643-29610793)
chr7 (192-341)||(26371058-26371207)
chr7 (191-341)||(21718125-21718274)
chr7 (191-341)||(44659852-44660001)
chr7 (191-320)||(32556641-32556770)
chr7 (191-338)||(47906775-47906923)
chr7 (191-341)||(25037522-25037672)
chr7 (191-341)||(45237547-45237697)
chr7 (191-341)||(46103129-46103278)
chr7 (191-341)||(35484644-35484795)
chr7 (191-338)||(46898033-46898180)
chr7 (191-341)||(2332027-2332177)
chr7 (191-338)||(29098759-29098902)
chr7 (191-341)||(39453496-39453639)
chr7 (191-341)||(5712176-5712337)
chr7 (195-341)||(23393065-23393222)
chr7 (191-341)||(25893931-25894092)
chr7 (195-341)||(33839729-33839886)
chr7 (191-341)||(45690111-45690272)
chr7 (191-337)||(39323624-39323761)
chr7 (191-341)||(35328083-35328244)
chr7 (191-338)||(41855067-41855214)
chr7 (195-338)||(47740348-47740502)
chr7 (195-341)||(22979661-22979818)
chr7 (195-341)||(33423289-33423446)
chr7 (195-341)||(47066991-47067148)
chr7 (191-341)||(33455104-33455245)
chr7 (195-339)||(2341678-2341833)
chr7 (195-342)||(35355900-35356058)
chr7 (195-341)||(17855440-17855597)
chr7 (195-341)||(40670575-40670732)
chr7 (195-341)||(46913121-46913280)
chr7 (195-332)||(31586860-31587008)
chr7 (195-341)||(33332801-33332957)
chr7 (191-284)||(39866673-39866766)
chr7 (195-342)||(27018128-27018286)
chr7 (195-338)||(33695838-33695992)
chr7 (195-341)||(48609691-48609848)
chr7 (195-337)||(49171380-49171533)
chr7 (195-332)||(33411272-33411420)
chr7 (204-341)||(36389377-36389525)
chr7 (195-342)||(10028500-10028658)
chr7 (195-341)||(15877562-15877719)
chr7 (195-341)||(19563459-19563616)
chr7 (195-341)||(20165828-20165985)
chr7 (200-337)||(5183843-5183991)
chr7 (198-331)||(33870260-33870404)
chr7 (191-338)||(26579734-26579892)
chr7 (195-341)||(45063371-45063526)
chr7 (195-337)||(45482670-45482823)
chr7 (195-341)||(37846030-37846187)
chr7 (195-341)||(41990872-41991029)
chr7 (195-341)||(35757034-35757191)
chr7 (195-342)||(31625716-31625873)
chr7 (195-341)||(33393340-33393486)
chr7 (195-276)||(43499497-43499578)
chr7 (195-341)||(31429489-31429646)
chr7 (195-320)||(33720071-33720207)
chr7 (201-331)||(44564356-44564497)
chr7 (212-341)||(29446867-29447006)
chr7 (195-281)||(38448522-38448608)
chr7 (191-341)||(44003384-44003534)
chr7 (195-280)||(7257393-7257478)
chr7 (195-268)||(16482870-16482943)
chr7 (195-341)||(10618310-10618460)
chr7 (195-338)||(45502833-45502976)
chr7 (195-276)||(29863027-29863108)
chr7 (197-252)||(35557744-35557799)
chr7 (228-338)||(35767519-35767640)
chr7 (195-341)||(15643960-15644106)
chr7 (229-341)||(28233950-28234073)
chr7 (195-272)||(47460855-47460932)
chr7 (235-338)||(30076544-30076658)
chr7 (280-332)||(41904313-41904365)
chr7 (191-246)||(35823298-35823353)
chr7 (231-280)||(26456157-26456206)
chr7 (195-248)||(30077043-30077096)
chr7 (297-341)||(39866762-39866806)
chr7 (280-342)||(44405456-44405518)
chr7 (195-276)||(7720582-7720663)
chr7 (223-272)||(37443685-37443734)
chr7 (285-338)||(43499598-43499651)
[»] chr4 (126 HSPs)
chr4 (191-341)||(37239104-37239254)
chr4 (192-341)||(45633793-45633942)
chr4 (191-338)||(5117455-5117602)
chr4 (191-341)||(31881328-31881478)
chr4 (191-341)||(15060303-15060453)
chr4 (191-341)||(20351856-20352006)
chr4 (191-341)||(54216320-54216470)
chr4 (191-341)||(22620600-22620750)
chr4 (191-341)||(34552326-34552476)
chr4 (191-336)||(4486600-4486745)
chr4 (191-336)||(46708760-46708905)
chr4 (191-341)||(52688356-52688506)
chr4 (191-333)||(27873570-27873712)
chr4 (191-341)||(33289710-33289860)
chr4 (192-341)||(49014106-49014255)
chr4 (191-338)||(52461373-52461517)
chr4 (191-341)||(9997945-9998095)
chr4 (191-338)||(43890935-43891082)
chr4 (191-341)||(54715042-54715192)
chr4 (191-337)||(33557960-33558106)
chr4 (191-332)||(47811913-47812054)
chr4 (191-338)||(54216753-54216900)
chr4 (221-341)||(51981493-51981613)
chr4 (195-341)||(21366623-21366780)
chr4 (191-341)||(34276554-34276715)
chr4 (195-341)||(56023012-56023169)
chr4 (191-294)||(3293084-3293187)
chr4 (191-341)||(53461830-53461991)
chr4 (195-341)||(407765-407920)
chr4 (195-338)||(54607973-54608127)
chr4 (195-341)||(237488-237645)
chr4 (195-341)||(9798476-9798633)
chr4 (195-341)||(31972350-31972507)
chr4 (195-341)||(38591679-38591832)
chr4 (191-341)||(44984768-44984929)
chr4 (195-341)||(55056273-55056430)
chr4 (195-341)||(42765856-42766012)
chr4 (191-287)||(11972197-11972293)
chr4 (195-338)||(53854446-53854600)
chr4 (195-341)||(1932774-1932931)
chr4 (195-341)||(6019939-6020096)
chr4 (195-341)||(6285318-6285475)
chr4 (195-341)||(23437603-23437760)
chr4 (195-341)||(31532149-31532306)
chr4 (195-341)||(42085218-42085375)
chr4 (199-338)||(2826698-2826848)
chr4 (195-338)||(3170637-3170791)
chr4 (195-338)||(27373087-27373241)
chr4 (195-338)||(43471712-43471866)
chr4 (195-338)||(51363018-51363172)
chr4 (195-341)||(18462027-18462184)
chr4 (191-341)||(26091272-26091433)
chr4 (195-341)||(31914209-31914365)
chr4 (195-341)||(32366674-32366831)
chr4 (195-341)||(39077556-39077713)
chr4 (195-341)||(42222302-42222459)
chr4 (195-341)||(47344667-47344824)
chr4 (195-341)||(50534642-50534799)
chr4 (195-332)||(146452-146600)
chr4 (192-341)||(41560336-41560496)
chr4 (195-341)||(41949393-41949552)
chr4 (195-336)||(55776056-55776207)
chr4 (195-336)||(55840234-55840385)
chr4 (195-338)||(397413-397567)
chr4 (195-338)||(29777274-29777428)
chr4 (195-342)||(41632020-41632177)
chr4 (195-338)||(41702476-41702630)
chr4 (195-341)||(54574954-54575111)
chr4 (195-341)||(14017390-14017545)
chr4 (195-341)||(23609098-23609255)
chr4 (195-341)||(29478371-29478528)
chr4 (195-341)||(35446517-35446673)
chr4 (195-341)||(50457824-50457981)
chr4 (195-341)||(31070088-31070244)
chr4 (195-276)||(33897585-33897666)
chr4 (195-342)||(55519838-55519996)
chr4 (195-341)||(19387702-19387859)
chr4 (195-341)||(22618528-22618683)
chr4 (195-341)||(45797490-45797647)
chr4 (195-338)||(48259528-48259681)
chr4 (195-312)||(49881106-49881234)
chr4 (195-341)||(48657835-48657986)
chr4 (195-342)||(27580130-27580277)
chr4 (195-341)||(50536638-50536795)
chr4 (195-341)||(34835188-34835334)
chr4 (195-332)||(50234011-50234159)
chr4 (200-341)||(54086425-54086576)
chr4 (195-276)||(2243469-2243550)
chr4 (195-276)||(48313568-48313648)
chr4 (195-275)||(14335181-14335261)
chr4 (195-275)||(22468861-22468941)
chr4 (203-338)||(54425001-54425147)
chr4 (195-341)||(3692224-3692381)
chr4 (195-341)||(42033186-42033343)
chr4 (195-341)||(47662116-47662273)
chr4 (195-269)||(6371335-6371409)
chr4 (195-272)||(38547684-38547761)
chr4 (195-276)||(39587869-39587950)
chr4 (224-338)||(52728323-52728448)
chr4 (195-272)||(1662342-1662419)
chr4 (272-341)||(33048980-33049049)
chr4 (195-268)||(42557593-42557666)
chr4 (195-272)||(48654825-48654902)
chr4 (195-276)||(53834144-53834225)
chr4 (200-272)||(43231518-43231590)
chr4 (195-275)||(54805709-54805789)
chr4 (195-272)||(27398686-27398763)
chr4 (195-272)||(46720036-46720113)
chr4 (195-272)||(573814-573891)
chr4 (280-341)||(35595794-35595855)
chr4 (287-338)||(3291822-3291873)
chr4 (240-342)||(36532843-36532956)
chr4 (212-341)||(27872607-27872736)
chr4 (195-275)||(49057948-49058028)
chr4 (195-338)||(51951693-51951846)
chr4 (275-342)||(35344890-35344956)
chr4 (195-269)||(18206608-18206682)
chr4 (288-342)||(42558300-42558354)
chr4 (280-338)||(48259720-48259778)
chr4 (195-235)||(17555617-17555657)
chr4 (234-333)||(47105045-47105148)
chr4 (286-341)||(54805628-54805683)
chr4 (280-337)||(42509403-42509460)
chr4 (286-329)||(22468796-22468839)
chr4 (213-272)||(43478089-43478147)
chr4 (283-311)||(52396837-52396865)
[»] chr3 (106 HSPs)
chr3 (191-341)||(42589837-42589987)
chr3 (192-341)||(54401195-54401344)
chr3 (191-338)||(34279738-34279885)
chr3 (191-341)||(25641653-25641803)
chr3 (191-341)||(54707234-54707384)
chr3 (191-341)||(38156646-38156796)
chr3 (191-341)||(41635814-41635964)
chr3 (191-341)||(51415976-51416126)
chr3 (191-341)||(55000192-55000342)
chr3 (191-341)||(24688121-24688271)
chr3 (191-337)||(31286811-31286957)
chr3 (191-341)||(47510954-47511104)
chr3 (192-341)||(37028731-37028880)
chr3 (192-339)||(45058891-45059038)
chr3 (191-338)||(39141141-39141290)
chr3 (191-341)||(40022081-40022231)
chr3 (191-330)||(17665549-17665688)
chr3 (191-341)||(51224052-51224201)
chr3 (191-341)||(49130585-49130735)
chr3 (192-337)||(44945953-44946092)
chr3 (209-341)||(52756081-52756217)
chr3 (195-341)||(47257804-47257961)
chr3 (240-341)||(48534021-48534122)
chr3 (195-341)||(22399108-22399264)
chr3 (195-338)||(27066995-27067149)
chr3 (195-341)||(40130973-40131130)
chr3 (195-341)||(49330048-49330205)
chr3 (195-341)||(24100294-24100450)
chr3 (191-341)||(47809610-47809772)
chr3 (195-338)||(52628965-52629119)
chr3 (195-341)||(2666011-2666168)
chr3 (191-341)||(28048406-28048567)
chr3 (195-341)||(37313410-37313567)
chr3 (191-341)||(40643807-40643968)
chr3 (195-341)||(41464363-41464520)
chr3 (191-341)||(44222836-44222997)
chr3 (195-341)||(51170047-51170204)
chr3 (195-341)||(7755321-7755477)
chr3 (195-341)||(32234412-32234568)
chr3 (195-338)||(35748328-35748482)
chr3 (195-338)||(46134367-46134521)
chr3 (195-341)||(29625841-29625998)
chr3 (195-341)||(38416738-38416895)
chr3 (195-341)||(40419846-40420003)
chr3 (195-341)||(42291853-42292010)
chr3 (195-333)||(43125842-43125991)
chr3 (195-341)||(43612061-43612218)
chr3 (196-341)||(55453258-55453414)
chr3 (195-341)||(41293333-41293489)
chr3 (195-338)||(39053405-39053559)
chr3 (195-341)||(43021725-43021883)
chr3 (195-338)||(51452767-51452921)
chr3 (195-341)||(7855128-7855285)
chr3 (195-341)||(44806695-44806852)
chr3 (191-341)||(37324548-37324709)
chr3 (195-341)||(48609734-48609891)
chr3 (195-332)||(51102401-51102549)
chr3 (207-338)||(46126010-46126152)
chr3 (191-329)||(20754419-20754568)
chr3 (195-341)||(39634586-39634742)
chr3 (195-341)||(48739247-48739404)
chr3 (195-337)||(53832502-53832655)
chr3 (195-320)||(52215087-52215223)
chr3 (195-330)||(24376584-24376730)
chr3 (195-338)||(53943604-53943758)
chr3 (195-275)||(54159079-54159159)
chr3 (195-341)||(18946914-18947071)
chr3 (195-341)||(35594132-35594289)
chr3 (195-341)||(40804524-40804681)
chr3 (195-341)||(51146229-51146386)
chr3 (195-320)||(53637852-53637988)
chr3 (195-338)||(41732539-41732693)
chr3 (195-337)||(5560043-5560203)
chr3 (195-341)||(43183923-43184080)
chr3 (195-320)||(36368950-36369086)
chr3 (195-341)||(55379996-55380142)
chr3 (195-272)||(41882074-41882151)
chr3 (195-272)||(53115458-53115535)
chr3 (195-341)||(47894834-47894991)
chr3 (195-341)||(25353565-25353711)
chr3 (195-341)||(51143828-51143974)
chr3 (191-276)||(48726077-48726162)
chr3 (197-272)||(30251584-30251659)
chr3 (195-329)||(52638853-52638998)
chr3 (195-277)||(47402827-47402909)
chr3 (195-272)||(21597231-21597308)
chr3 (195-272)||(28576195-28576272)
chr3 (195-272)||(42998872-42998948)
chr3 (195-275)||(2228015-2228095)
chr3 (195-338)||(48546857-48547000)
chr3 (195-272)||(50731997-50732074)
chr3 (195-272)||(50780782-50780859)
chr3 (192-280)||(8847733-8847821)
chr3 (195-341)||(41216466-41216623)
chr3 (191-341)||(40165659-40165808)
chr3 (280-337)||(33550485-33550542)
chr3 (195-260)||(48752096-48752161)
chr3 (195-338)||(46949386-46949538)
chr3 (201-319)||(37758946-37759075)
chr3 (303-341)||(40688431-40688469)
chr3 (195-260)||(52434150-52434216)
chr3 (215-276)||(41609098-41609159)
chr3 (195-272)||(43176821-43176898)
chr3 (195-269)||(177172-177246)
chr3 (195-236)||(37741446-37741487)
chr3 (233-272)||(47182049-47182088)
[»] chr1 (104 HSPs)
chr1 (191-341)||(6626038-6626188)
chr1 (191-341)||(41467646-41467796)
chr1 (192-341)||(2657311-2657460)
chr1 (191-341)||(26472193-26472343)
chr1 (191-341)||(29770677-29770827)
chr1 (191-341)||(42234847-42234996)
chr1 (191-338)||(4953059-4953206)
chr1 (191-341)||(4243504-4243654)
chr1 (191-341)||(13281576-13281726)
chr1 (191-341)||(34752328-34752478)
chr1 (191-341)||(41895178-41895328)
chr1 (191-337)||(10928074-10928220)
chr1 (191-341)||(33073218-33073368)
chr1 (192-338)||(35991616-35991762)
chr1 (191-341)||(44544060-44544210)
chr1 (193-338)||(44293472-44293617)
chr1 (191-337)||(30289928-30290074)
chr1 (191-341)||(32448655-32448796)
chr1 (191-341)||(3611143-3611304)
chr1 (191-330)||(46428278-46428417)
chr1 (195-341)||(31308012-31308169)
chr1 (195-341)||(45538164-45538321)
chr1 (191-338)||(51155606-51155753)
chr1 (195-341)||(4068697-4068854)
chr1 (195-341)||(5981181-5981338)
chr1 (195-341)||(17994965-17995122)
chr1 (195-341)||(24245039-24245196)
chr1 (195-341)||(25678273-25678430)
chr1 (195-341)||(44661981-44662138)
chr1 (195-341)||(46616560-46616717)
chr1 (202-341)||(26085412-26085562)
chr1 (195-338)||(33112834-33112988)
chr1 (195-341)||(21139426-21139583)
chr1 (195-341)||(43251722-43251879)
chr1 (227-333)||(24215806-24215912)
chr1 (197-337)||(42863878-42864029)
chr1 (195-341)||(23932523-23932680)
chr1 (195-341)||(25058699-25058856)
chr1 (195-341)||(38331873-38332030)
chr1 (199-341)||(39646583-39646736)
chr1 (195-341)||(46967055-46967212)
chr1 (195-341)||(47317326-47317483)
chr1 (195-341)||(47671597-47671754)
chr1 (192-341)||(26794312-26794472)
chr1 (195-341)||(6327562-6327718)
chr1 (195-341)||(23984766-23984923)
chr1 (195-341)||(26277188-26277345)
chr1 (195-341)||(31040720-31040877)
chr1 (195-341)||(33884099-33884256)
chr1 (195-341)||(33959996-33960153)
chr1 (195-341)||(36566341-36566498)
chr1 (195-337)||(37620210-37620363)
chr1 (195-341)||(38790211-38790368)
chr1 (195-341)||(47383746-47383903)
chr1 (191-341)||(51057078-51057239)
chr1 (195-312)||(23220972-23221100)
chr1 (195-341)||(27983617-27983758)
chr1 (191-332)||(36003137-36003289)
chr1 (195-341)||(3285413-3285569)
chr1 (195-338)||(49253992-49254146)
chr1 (195-341)||(41999826-41999983)
chr1 (195-341)||(47187116-47187273)
chr1 (191-341)||(50774224-50774385)
chr1 (195-320)||(31844387-31844523)
chr1 (195-338)||(48373515-48373660)
chr1 (191-338)||(7561545-7561706)
chr1 (195-338)||(35692680-35692835)
chr1 (195-276)||(51403097-51403178)
chr1 (195-329)||(5980079-5980224)
chr1 (195-337)||(24885512-24885665)
chr1 (191-341)||(35273603-35273764)
chr1 (195-341)||(46784434-46784591)
chr1 (195-311)||(25518825-25518952)
chr1 (195-276)||(31980025-31980106)
chr1 (195-338)||(26524906-26525060)
chr1 (195-337)||(28888592-28888745)
chr1 (217-337)||(42313379-42313510)
chr1 (197-281)||(13313248-13313332)
chr1 (219-338)||(38718183-38718309)
chr1 (219-342)||(2450529-2450663)
chr1 (195-275)||(24649802-24649882)
chr1 (195-342)||(49399001-49399159)
chr1 (221-334)||(45475864-45475987)
chr1 (195-280)||(2556932-2557017)
chr1 (195-272)||(26685867-26685944)
chr1 (195-280)||(52323949-52324034)
chr1 (195-272)||(2954866-2954943)
chr1 (195-272)||(27924741-27924818)
chr1 (195-272)||(52367894-52367971)
chr1 (225-332)||(51045619-51045737)
chr1 (195-269)||(38716333-38716407)
chr1 (195-272)||(1388484-1388561)
chr1 (195-272)||(10920211-10920288)
chr1 (195-272)||(33187351-33187428)
chr1 (191-272)||(48683413-48683494)
chr1 (195-243)||(4156188-4156236)
chr1 (277-341)||(13312545-13312609)
chr1 (286-341)||(4156507-4156562)
chr1 (197-272)||(39475866-39475940)
chr1 (280-338)||(4808752-4808810)
chr1 (195-341)||(5961281-5961427)
chr1 (195-274)||(39637911-39637986)
chr1 (195-236)||(10919313-10919354)
chr1 (296-341)||(33187446-33187491)
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (191-341)||(117343-117493)
chr8 (191-341)||(31940322-31940471)
chr8 (191-341)||(41843260-41843410)
chr8 (192-341)||(4975421-4975570)
chr8 (191-341)||(9713696-9713843)
chr8 (194-341)||(40458786-40458933)
chr8 (191-338)||(2379147-2379294)
chr8 (191-341)||(4447309-4447459)
chr8 (191-342)||(10378316-10378467)
chr8 (191-341)||(9509414-9509564)
chr8 (196-341)||(40649845-40649990)
chr8 (191-341)||(3211213-3211362)
chr8 (191-338)||(32373744-32373890)
chr8 (192-338)||(33622483-33622628)
chr8 (191-300)||(27243194-27243303)
chr8 (191-300)||(27254769-27254878)
chr8 (195-341)||(5946058-5946215)
chr8 (195-342)||(45236578-45236736)
chr8 (195-341)||(24079915-24080072)
chr8 (191-332)||(38631659-38631800)
chr8 (195-341)||(32984091-32984248)
chr8 (195-338)||(2714560-2714714)
chr8 (195-338)||(6365997-6366151)
chr8 (195-342)||(41862231-41862389)
chr8 (195-341)||(10646134-10646291)
chr8 (195-341)||(13356134-13356291)
chr8 (195-341)||(2275924-2276080)
chr8 (195-338)||(37956432-37956586)
chr8 (195-341)||(17718736-17718893)
chr8 (195-341)||(43328718-43328875)
chr8 (195-341)||(9734266-9734421)
chr8 (195-341)||(9303588-9303745)
chr8 (195-341)||(31830969-31831126)
chr8 (195-341)||(37301339-37301496)
chr8 (195-337)||(40435171-40435324)
chr8 (195-341)||(41653906-41654063)
chr8 (195-342)||(32114260-32114418)
chr8 (195-338)||(33730658-33730812)
chr8 (195-341)||(25185910-25186067)
chr8 (195-341)||(33981677-33981834)
chr8 (195-340)||(13760663-13760819)
chr8 (195-332)||(29048426-29048574)
chr8 (195-332)||(35628788-35628936)
chr8 (195-341)||(37419951-37420108)
chr8 (195-341)||(45066606-45066763)
chr8 (191-276)||(39915902-39915987)
chr8 (256-341)||(41425443-41425527)
chr8 (195-341)||(22878402-22878559)
chr8 (195-320)||(41231957-41232093)
chr8 (195-341)||(42701303-42701461)
chr8 (195-341)||(9013695-9013851)
chr8 (195-275)||(41639925-41640005)
chr8 (195-338)||(44088460-44088614)
chr8 (195-338)||(45258521-45258675)
chr8 (191-269)||(3490485-3490563)
chr8 (195-338)||(25248050-25248198)
chr8 (205-276)||(41981454-41981525)
chr8 (195-272)||(33896926-33897002)
chr8 (233-341)||(3904126-3904244)
chr8 (280-341)||(12033037-12033098)
chr8 (195-277)||(31148968-31149050)
chr8 (280-338)||(41981575-41981633)
chr8 (195-272)||(26196400-26196476)
chr8 (286-341)||(31336207-31336262)
chr8 (195-251)||(164733-164789)
chr8 (290-332)||(39901674-39901716)
chr8 (286-332)||(41640027-41640073)
[»] chr5 (69 HSPs)
chr5 (191-341)||(38015528-38015678)
chr5 (193-341)||(42658676-42658824)
chr5 (191-341)||(27503386-27503536)
chr5 (191-338)||(36365462-36365609)
chr5 (191-341)||(6973070-6973220)
chr5 (191-341)||(9424606-9424756)
chr5 (191-341)||(19295737-19295887)
chr5 (191-341)||(23195262-23195412)
chr5 (191-341)||(5497280-5497430)
chr5 (191-341)||(9374516-9374666)
chr5 (191-341)||(13957677-13957827)
chr5 (192-336)||(6206892-6207036)
chr5 (212-341)||(3656582-3656711)
chr5 (192-341)||(14971986-14972135)
chr5 (191-337)||(33617592-33617738)
chr5 (218-338)||(38492647-38492767)
chr5 (191-338)||(42247808-42247946)
chr5 (191-329)||(33623965-33624103)
chr5 (195-341)||(24253393-24253550)
chr5 (191-341)||(35626045-35626206)
chr5 (195-341)||(40886042-40886198)
chr5 (195-342)||(5184983-5185141)
chr5 (195-341)||(6901810-6901967)
chr5 (195-341)||(15398496-15398653)
chr5 (195-341)||(43326393-43326550)
chr5 (195-317)||(40632510-40632634)
chr5 (195-341)||(3466695-3466852)
chr5 (195-341)||(25831532-25831688)
chr5 (195-341)||(39932590-39932747)
chr5 (195-341)||(43262197-43262354)
chr5 (195-332)||(18479691-18479839)
chr5 (201-340)||(27938914-27939064)
chr5 (199-341)||(7722064-7722217)
chr5 (195-341)||(27501069-27501226)
chr5 (195-332)||(15683802-15683950)
chr5 (212-337)||(36948508-36948631)
chr5 (195-341)||(31938908-31939065)
chr5 (195-338)||(28424812-28424964)
chr5 (195-342)||(2484305-2484463)
chr5 (195-338)||(12648808-12648962)
chr5 (194-337)||(40278876-40279030)
chr5 (195-341)||(739718-739875)
chr5 (195-320)||(4149705-4149831)
chr5 (195-338)||(13504759-13504913)
chr5 (195-332)||(5137726-5137874)
chr5 (191-269)||(9171111-9171189)
chr5 (195-342)||(890917-891074)
chr5 (195-277)||(5120036-5120118)
chr5 (195-277)||(12558107-12558189)
chr5 (195-341)||(27278487-27278648)
chr5 (221-341)||(29789309-29789440)
chr5 (212-342)||(612770-612898)
chr5 (195-272)||(2585473-2585550)
chr5 (226-338)||(34451292-34451415)
chr5 (195-276)||(38756578-38756659)
chr5 (195-342)||(40110245-40110402)
chr5 (201-338)||(763740-763888)
chr5 (195-272)||(36472367-36472444)
chr5 (195-254)||(9527121-9527180)
chr5 (195-337)||(27390608-27390750)
chr5 (195-272)||(38637993-38638070)
chr5 (195-280)||(40686910-40686995)
chr5 (212-275)||(3940411-3940474)
chr5 (195-272)||(1402588-1402665)
chr5 (195-272)||(24167867-24167944)
chr5 (195-280)||(31294075-31294160)
chr5 (195-341)||(18327187-18327333)
chr5 (195-266)||(15300962-15301033)
chr5 (296-341)||(5120136-5120181)
[»] chr2 (78 HSPs)
chr2 (191-341)||(35158064-35158214)
chr2 (191-338)||(39301214-39301361)
chr2 (191-341)||(145288-145438)
chr2 (191-341)||(28641306-28641456)
chr2 (191-341)||(29687047-29687197)
chr2 (191-341)||(19428440-19428591)
chr2 (191-341)||(27764877-27765026)
chr2 (192-341)||(13543638-13543787)
chr2 (191-338)||(12333513-12333659)
chr2 (191-341)||(4258496-4258645)
chr2 (191-341)||(43898985-43899134)
chr2 (191-341)||(27331304-27331458)
chr2 (191-338)||(12730067-12730214)
chr2 (191-341)||(28566712-28566862)
chr2 (191-341)||(39103053-39103203)
chr2 (192-341)||(34249272-34249421)
chr2 (191-338)||(2688746-2688893)
chr2 (216-341)||(3711664-3711789)
chr2 (191-338)||(43356105-43356249)
chr2 (191-337)||(21734918-21735064)
chr2 (191-338)||(8056632-8056779)
chr2 (191-338)||(2000355-2000501)
chr2 (191-341)||(3266302-3266443)
chr2 (195-341)||(23901789-23901946)
chr2 (191-341)||(40635224-40635385)
chr2 (191-341)||(40544099-40544240)
chr2 (195-341)||(746476-746633)
chr2 (195-341)||(13815232-13815389)
chr2 (195-341)||(26710355-26710512)
chr2 (195-338)||(38997111-38997265)
chr2 (195-337)||(2324907-2325060)
chr2 (195-341)||(4034602-4034759)
chr2 (195-341)||(6430483-6430640)
chr2 (195-341)||(6594472-6594629)
chr2 (195-341)||(17600846-17601003)
chr2 (195-341)||(27400413-27400570)
chr2 (195-341)||(32327371-32327528)
chr2 (195-341)||(34518377-34518534)
chr2 (195-341)||(45371000-45371157)
chr2 (195-341)||(4609636-4609793)
chr2 (195-341)||(10244596-10244753)
chr2 (195-341)||(10424605-10424762)
chr2 (195-341)||(11184982-11185139)
chr2 (199-337)||(14660460-14660609)
chr2 (195-341)||(27024425-27024582)
chr2 (195-341)||(27651048-27651205)
chr2 (195-341)||(40037153-40037309)
chr2 (195-336)||(15925090-15925242)
chr2 (195-341)||(33427661-33427818)
chr2 (195-320)||(32608390-32608526)
chr2 (195-338)||(5726139-5726293)
chr2 (195-341)||(1091965-1092122)
chr2 (195-341)||(32948456-32948612)
chr2 (192-320)||(41172465-41172604)
chr2 (195-338)||(2914155-2914309)
chr2 (195-337)||(37620885-37621041)
chr2 (199-341)||(32856450-32856603)
chr2 (195-337)||(40735474-40735627)
chr2 (195-332)||(7892711-7892859)
chr2 (195-341)||(14697551-14697708)
chr2 (195-320)||(12842113-12842249)
chr2 (195-276)||(42899925-42900006)
chr2 (195-341)||(11159632-11159788)
chr2 (221-329)||(9444726-9444845)
chr2 (195-264)||(12814624-12814693)
chr2 (195-272)||(44481838-44481915)
chr2 (195-329)||(8432942-8433087)
chr2 (195-272)||(35126790-35126867)
chr2 (218-341)||(37255351-37255485)
chr2 (236-337)||(25294886-25294998)
chr2 (201-273)||(30545837-30545909)
chr2 (280-341)||(447647-447708)
chr2 (280-329)||(12827168-12827217)
chr2 (280-317)||(28014856-28014893)
chr2 (216-254)||(38985378-38985416)
chr2 (280-340)||(1229733-1229793)
chr2 (195-252)||(10176569-10176626)
chr2 (195-228)||(28019959-28019992)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (191-341)||(28948859-28949009)
chr6 (191-341)||(13329388-13329538)
chr6 (191-341)||(15965440-15965590)
chr6 (192-341)||(4487535-4487684)
chr6 (191-341)||(3786756-3786906)
chr6 (191-338)||(3291015-3291162)
chr6 (191-341)||(1398560-1398710)
chr6 (195-342)||(18101508-18101666)
chr6 (195-341)||(2892199-2892356)
chr6 (195-341)||(5882517-5882674)
chr6 (191-341)||(26377218-26377379)
chr6 (195-337)||(7345130-7345283)
chr6 (199-341)||(14891393-14891546)
chr6 (195-341)||(22551075-22551232)
chr6 (195-342)||(16703377-16703535)
chr6 (195-341)||(1970722-1970879)
chr6 (195-341)||(19281069-19281226)
chr6 (195-341)||(24168102-24168259)
chr6 (197-341)||(11988988-11989143)
chr6 (195-341)||(599903-600060)
chr6 (195-341)||(959918-960075)
chr6 (195-341)||(2593866-2594023)
chr6 (195-341)||(7393600-7393757)
chr6 (195-341)||(8615251-8615408)
chr6 (254-341)||(18661804-18661891)
chr6 (195-341)||(19415547-19415704)
chr6 (195-341)||(34527876-34528033)
chr6 (197-341)||(22341802-22341959)
chr6 (195-341)||(28947098-28947255)
chr6 (196-342)||(24224083-24224240)
chr6 (237-337)||(24913114-24913216)
chr6 (191-305)||(1939554-1939668)
chr6 (195-338)||(30743465-30743619)
chr6 (195-332)||(10507931-10508079)
chr6 (195-276)||(30467693-30467774)
chr6 (195-342)||(33452585-33452743)
chr6 (195-276)||(5294891-5294972)
chr6 (195-276)||(5299443-5299524)
chr6 (195-341)||(7167593-7167739)
chr6 (216-341)||(23261943-23262079)
chr6 (195-266)||(929670-929741)
chr6 (195-280)||(375799-375884)
chr6 (194-280)||(13844846-13844932)
chr6 (296-341)||(375741-375786)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (191-341)||(7097-7248)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (195-341)||(39570-39727)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (195-341)||(11147-11303)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (191-320)||(17913-18042)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (195-341)||(13776-13933)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (195-341)||(75258-75415)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (195-341)||(1880-2037)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (195-341)||(2446-2603)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (196-342)||(176666-176823)
scaffold0007 (195-341)||(278017-278176)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (195-320)||(32572-32708)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (195-341)||(18868-19025)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (195-280)||(14755-14840)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (195-280)||(113-198)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (195-269)||(20563-20637)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (195-276)||(4633-4715)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (195-276)||(3403-3485)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (280-341)||(4610-4671)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (280-320)||(3186-3226)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (195-269)||(19228-19302)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 94)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 35752198 - 35752048
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35752198 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 35752099  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35752098 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 35752048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 36817009 - 36816859
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36817009 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 36816910  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816909 tggctaatatgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 36816859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 48085866 - 48086016
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48085866 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 48085965  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48085966 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 48086016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 45443053 - 45442874
Alignment:
Q  1 aataaaagtcgtaggaaattcaaagaccctagaactagaattcaaatttaatcgatatttagttagtttatag-caacttgattgacttctcgatatacg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||      
T  45443053 aataaaagtcgtaggaaattcaaagaccctagaactagaactcaaatttaatccatatttagttagtttatatacaacttaattgacttctcgatatata 45442954  T
Q  100 tggatccatgtaatgggtcccgaatcatcatagatattacaaatatcctccaaaagagtcgtgtgagaatgagggaaaga 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45442953 tggatccatgtaatgggtcccgaatcatcatagatattacaaatatcctctaaaagagtcgtgtgagaatgaggaaaaga 45442874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 43489226 - 43489376
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43489226 ctaaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 43489325  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43489326 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 43489376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 192 - 341
Target Start/End: Original strand, 37127946 - 37128095
Alignment:
Q  192 taaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 291  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37127946 taaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcataaatatgtgcttatgt 37128045  T
Q  292 ggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37128046 agctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 37128095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 24228549 - 24228699
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24228549 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatatgcttatg 24228648  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24228649 tggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggta 24228699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 46817585 - 46817435
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46817585 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 46817486  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46817485 tggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggta 46817435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 192 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26941695 - 26941546
Alignment:
Q  192 taaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 291  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26941695 taaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 26941596  T
Q  292 ggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26941595 ggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggta 26941546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24923188 - 24923038
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24923188 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatgaatatgtgcttatg 24923089  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24923088 tggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccatccttctttcatgggta 24923038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 192 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 498351 - 498205
Alignment:
Q  192 taaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 291  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  498351 taaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 498252  T
Q  292 ggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  498251 ggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatgg 498205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7876492 - 7876342
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7876492 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtacttatg 7876393  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  7876392 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcattggta 7876342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 29610643 - 29610793
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29610643 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgaatatgtgcttatg 29610742  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  29610743 tggctaatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggta 29610793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 192 - 341
Target Start/End: Original strand, 26371058 - 26371207
Alignment:
Q  192 taaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 291  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26371058 taaattatctttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaatatgtgcttatgt 26371157  T
Q  292 ggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26371158 gactaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggta 26371207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 21718125 - 21718274
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21718125 ctaaattacctttgaataacggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 21718224  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  21718225 tggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccattatt-tttcatgggta 21718274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 44659852 - 44660001
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44659852 ctaaattacctttgaagaatggtgg-taatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaatatatgcttatg 44659950  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44659951 tggctaatgtgtatcggttggagtaaattatccatcattcttttatgggta 44660001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 191 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 32556770 - 32556641
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32556770 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggacaagatagttcatgaatatgtgcttatg 32556671  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaatta 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  32556670 tgactaatgtgtattggttggggtaaatta 32556641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 47906923 - 47906775
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906923 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 47906824  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggt-aaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  47906823 tggctaatgtgtattgattagggtaaaattacccatcattttttcatgg 47906775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25037672 - 25037522
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25037672 ctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaattaaaatgatcaatttattggtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 25037573  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25037572 tggctgatgtgtattgattggggtaaattactcatcattctttcatgggta 25037522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 45237697 - 45237547
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45237697 ctaaattacctttgaagaatgataggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagataattcatgaatatgtgcttatg 45237598  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  45237597 tggttaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttttatgggta 45237547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 46103129 - 46103278
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46103129 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacc-accaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaatatgtgcttatg 46103227  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  46103228 tggctaatgtgtattagttggagtaaattactcatcattctttcatgggta 46103278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 35484644 - 35484795
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaa-tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttat 289  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35484644 ctaaattatctttgaagaatggtgggtaaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttat 35484743  T
Q  290 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||| ||||||||||||  ||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35484744 gtgactaatgtgtattatttgaggtaaattactcatcattctttcatgggta 35484795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 46898180 - 46898033
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46898180 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaataaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaatatgtgcttatg 46898081  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  46898080 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 46898033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 2332027 - 2332177
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2332027 ctaaattatctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 2332126  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  2332127 tggttactgtgtattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggta 2332177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 29098759 - 29098902
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||    
T  29098759 ctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttc----atatatgcttatg 29098854  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  29098855 tggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattttttcatgg 29098902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 39453639 - 39453496
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||| |||||    
T  39453639 ctaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagt-------tatgtgtttatg 39453547  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39453546 tgactaatgtgtaatggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 39453496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 5712176 - 5712337
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||           ||     
T  5712176 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 5712275  T
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5712276 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggta 5712337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23393222 - 23393065
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  23393222 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 23393123  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23393122 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggta 23393065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25894092 - 25893931
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aat 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           ||     
T  25894092 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 25893993  T
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  25893992 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 25893931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 33839886 - 33839729
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  33839886 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 33839787  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33839786 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggta 33839729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 45690272 - 45690111
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aat 279  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           ||     
T  45690272 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 45690173  T
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  45690172 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggta 45690111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 191 - 337
Target Start/End: Original strand, 39323624 - 39323761
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||    
T  39323624 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaa--------tatg 39323715  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  39323716 tggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcatg 39323761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 35328244 - 35328083
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aat 279  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           ||     
T  35328244 ctaaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 35328145  T
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35328144 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggta 35328083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 41855067 - 41855214
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41855067 ctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaatgtgagcaatttattggtggagtcaagatagttcataaatatatgcttatg 41855166  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||| |||||    
T  41855167 tggctaatgtgtattagtttggataaattacccatcattcttccatgg 41855214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 47740502 - 47740348
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||           ||||    
T  47740502 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgt 47740403  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  47740402 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 47740348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22979818 - 22979661
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || || |    
T  22979818 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 22979719  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22979718 gcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggta 22979661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 33423446 - 33423289
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  33423446 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 33423347  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  33423346 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 33423289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 47067148 - 47066991
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  47067148 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 47067049  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  47067048 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggta 47066991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 33455104 - 33455245
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  33455104 ctaaattacctatgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt--- 33455200  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
          ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  33455201 ------atgtgtattggtttgggtaaattgtccatcattctttcataggta 33455245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 195 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2341833 - 2341678
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  2341833 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaacttaaaaatgt 2341734  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatggg 339  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  2341733 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggg 2341678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Original strand, 35355900 - 35356058
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------tgaatatgt 283  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||           | || ||||    
T  35355900 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 35355999  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  35356000 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtat 35356058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 17855440 - 17855597
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  17855440 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgt 17855539  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  17855540 gcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggta 17855597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 40670575 - 40670732
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  40670575 attacctttgaagaatggtggataatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 40670674  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  40670675 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 40670732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 46913121 - 46913280
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------------aatat 281  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||             ||| |    
T  46913121 attacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 46913220  T
Q  282 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  46913221 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 46913280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 195 - 332
Target Start/End: Original strand, 31586860 - 31587008
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  31586860 attacctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31586959  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  31586960 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 31587008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 33332801 - 33332957
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------aatatgtg 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||          || || ||    
T  33332801 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgataccacttaaaaatatg 33332900  T
Q  285 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33332901 cttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggta 33332957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 284
Target Start/End: Original strand, 39866673 - 39866766
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtg 284  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39866673 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtg 39866766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Original strand, 27018128 - 27018286
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||           || ||||    
T  27018128 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 27018227  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  27018228 gcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtat 27018286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33695992 - 33695838
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  33695992 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 33695893  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  33695892 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 33695838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 48609848 - 48609691
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||           || ||||    
T  48609848 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccacttaaaaatgt 48609749  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  48609748 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatacaccattcttccatgggta 48609691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 49171533 - 49171380
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || || |    
T  49171533 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 49171434  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  49171433 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatg 49171380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 332
Target Start/End: Original strand, 33411272 - 33411420
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  33411272 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 33411371  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 332  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  33411372 gtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctt 33411420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 204 - 341
Target Start/End: Original strand, 36389377 - 36389525
Alignment:
Q  204 gaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------tgaatatgtgcttatgtg 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||           | || |||||||||||||    
T  36389377 gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtg 36389476  T
Q  293 gctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  36389477 gctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 36389525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Original strand, 10028500 - 10028658
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||           || ||||    
T  10028500 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgt 10028599  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  10028600 gtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtat 10028658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 15877562 - 15877719
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  15877562 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaacaaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 15877661  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  15877662 gcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 15877719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 19563459 - 19563616
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||           ||||    
T  19563459 attacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgt 19563558  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  19563559 gcttatgtggctaatgtgtattggttaaggtaaattacccaccattcttccatgggta 19563616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20165985 - 20165828
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  20165985 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 20165886  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  20165885 acttatgtggctaatgtgtataggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggta 20165828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 200 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 5183991 - 5183843
Alignment:
Q  200 ctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgctta 288  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || |||||||||    
T  5183991 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgctta 5183892  T
Q  289 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  5183891 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatg 5183843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 331
Target Start/End: Original strand, 33870260 - 33870404
Alignment:
Q  198 acctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgct 286  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||           |||||||    
T  33870260 acctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccatttaaaaatgtgct 33870359  T
Q  287 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattct 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  33870360 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattct 33870404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26579892 - 26579734
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aat 279  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           ||     
T  26579892 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgtataccacttaaaa 26579793  T
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  26579792 atgtgtttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgg 26579734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 45063526 - 45063371
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||           || ||||    
T  45063526 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 45063427  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  45063426 gcttatgtggctaatgtgtat--gttgaggtaaattatccaccattctttcattggta 45063371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 337
Target Start/End: Original strand, 45482670 - 45482823
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || || |    
T  45482670 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatat 45482769  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  45482770 gcttatgtgactgatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatg 45482823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 37846187 - 37846030
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| || |||           || ||||    
T  37846187 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataatttatggataccacttaaaaatgt 37846088  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  37846087 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 37846030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41991029 - 41990872
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------tgaatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||           | || ||||    
T  41991029 attacctttgaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 41990930  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||||| ||||||||    
T  41990929 gcttatgtggctaatgtgtattggtttggataaattactcaccattcttccatgggta 41990872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 35757191 - 35757034
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------aatatgtg 284  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||          || |||||    
T  35757191 attaactttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgataccacttaaaaatgtg 35757092  T
Q  285 cttatgtggctaatgtgtattggtt-ggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  35757091 cttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattactcaccattcttccatgggta 35757034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Original strand, 31625716 - 31625873
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           || ||||    
T  31625716 attaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31625815  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  31625816 gcttatgtgactaatgtatattggttggagtaaatta-ccaccattcttccatgggtat 31625873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 33393340 - 33393486
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggc 294  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    || |   ||     
T  33393340 attacctttaaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggt 33393439  T
Q  295 taatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  33393440 taatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 33393486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 276
Target Start/End: Original strand, 43499497 - 43499578
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 276  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  43499497 attacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 43499578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31429646 - 31429489
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||           || ||||    
T  31429646 attatctttgaagaatggtgggtgatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagtacatggataccacttaaaaatgt 31429547  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31429546 gtttatgtgactaatgtgtattggttgaagtaaattactcatcattctttcatgggta 31429489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 33720207 - 33720071
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||           || ||||    
T  33720207 attacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 33720108  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 320  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33720107 acttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatta 33720071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 201 - 331
Target Start/End: Original strand, 44564356 - 44564497
Alignment:
Q  201 tttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------tgaatatgtgcttat 289  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||           | || || |||||||    
T  44564356 tttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaataaaaataagcaatttattagtggtgtcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgcttat 44564455  T
Q  290 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattct 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44564456 gtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattct 44564497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 341
Target Start/End: Original strand, 29446867 - 29447006
Alignment:
Q  212 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggctaatgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           || || |||||||||| |||||||    
T  29446867 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgactaatgt 29446966  T
Q  301 gtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  29446967 gtattggttggagt-aattacccaccattcttccatgggta 29447006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 38448608 - 38448522
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat 281  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  38448608 attacctttgaaaaattgtggataatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatat 38448522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 44003534 - 44003384
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||    || |      
T  44003534 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaactaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaa 44003435  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
     ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||    
T  44003434 aggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggta 44003384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 280
Target Start/End: Original strand, 7257393 - 7257478
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 280  Q
    |||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  7257393 attaccttcgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaata 7257478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16482943 - 16482870
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 268  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16482943 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgataatgagcaatttattggtggggtcaagat 16482870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 10618310 - 10618460
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgg---ggtcaag-atagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||   | ||| | |||   | | || || || |||||    
T  10618310 attacatttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggatagttcatgaataccacttaaaaatatgtttatg 10618409  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  10618410 tggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 10618460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 45502976 - 45502833
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggc 294  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||     | || || ||||||||| ||    
T  45502976 attaactttgaagaatggtgagtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttagttgggtcaagataccatttaaaaatatgcttatgtagc 45502877  T
Q  295 taatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||| | ||||| |||||    
T  45502876 taatgtatattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatgg 45502833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 276
Target Start/End: Original strand, 29863027 - 29863108
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 276  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||  |||| ||||||||||    
T  29863027 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattggtggaatcaaaatagttcatg 29863108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 252
Target Start/End: Original strand, 35557744 - 35557799
Alignment:
Q  197 tacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattta 252  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35557744 tacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattta 35557799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 338
Target Start/End: Original strand, 35767519 - 35767640
Alignment:
Q  228 ccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaa 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35767519 ccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttggggtaa 35767618  T
Q  317 attatccatcattctttcatgg 338  Q
    |||| ||| ||||||| |||||    
T  35767619 attacccaccattcttccatgg 35767640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15644106 - 15643960
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggc 294  Q
    |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||    || |   ||     
T  15644106 attatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaaaatagtttatggataccacctaaaaaggt 15644007  T
Q  295 taatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  15644006 gaatgtttattgattggggtaaattacccaccattttttcatgggta 15643960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28234073 - 28233950
Alignment:
Q  229 caaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 317  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||           |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28234073 caactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaa 28233974  T
Q  318 ttatccatcattctttcatgggta 341  Q
     || ||| | ||||||||||||||    
T  28233973 ctacccacctttctttcatgggta 28233950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 47460932 - 47460855
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    ||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47460932 attacttttaaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtt 47460855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 235 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 30076658 - 30076544
Alignment:
Q  235 atgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcc 323  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||           ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  30076658 atgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggcgtaaattaccc 30076559  T
Q  324 atcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||| |||||    
T  30076558 atcattcttccatgg 30076544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Original strand, 41904313 - 41904365
Alignment:
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41904313 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattctt 41904365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 246
Target Start/End: Original strand, 35823298 - 35823353
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagc 246  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35823298 ctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagc 35823353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 231 - 280
Target Start/End: Original strand, 26456157 - 26456206
Alignment:
Q  231 accaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26456157 accaatgaaaatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaata 26456206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30077096 - 30077043
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaa 248  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30077096 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgggcaa 30077043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 341
Target Start/End: Original strand, 39866762 - 39866806
Alignment:
Q  297 atgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39866762 atgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcatgggta 39866806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 342
Target Start/End: Original strand, 44405456 - 44405518
Alignment:
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||    
T  44405456 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctaccattcttccatgggtat 44405518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 7720663 - 7720582
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 276  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||   | |||| |||||||||||||    
T  7720663 attacctttgaaaaatggtgggtaatttatccactaaccaataaaaataagcaatttatagattgggttaagatagttcatg 7720582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 37443734 - 37443685
Alignment:
Q  223 acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37443734 acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtt 37443685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 338
Target Start/End: Original strand, 43499598 - 43499651
Alignment:
Q  285 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  43499598 cttatgtggccaatgtatattagttggggtaaattacccaccattcttccatgg 43499651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 126)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 37239254 - 37239104
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37239254 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 37239155  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37239154 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 37239104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 192 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 45633942 - 45633793
Alignment:
Q  192 taaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 291  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45633942 taaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 45633843  T
Q  292 ggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45633842 ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 45633793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5117602 - 5117455
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5117602 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 5117503  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  5117502 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttaatgg 5117455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31881478 - 31881328
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31881478 ctaaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 31881379  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31881378 tggctaatgtgtattggttagggtaaattattcatcattctttcatgggta 31881328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15060453 - 15060303
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15060453 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 15060354  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15060353 tggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggta 15060303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20352006 - 20351856
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20352006 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 20351907  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20351906 tggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggta 20351856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 54216320 - 54216470
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54216320 ctaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 54216419  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54216420 ttgctaatgtgtattggttggggtaaattatcgatcattctttcatgggta 54216470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 22620600 - 22620750
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22620600 ctaaattatctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 22620699  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  22620700 tggctaatgtatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggta 22620750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 34552326 - 34552476
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34552326 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggtgtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 34552425  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34552426 cggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggta 34552476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 191 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 4486745 - 4486600
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4486745 ctaaattatctttgaagaacggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatgaatatgtgcttatg 4486646  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcat 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4486645 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcat 4486600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 191 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 46708905 - 46708760
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46708905 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 46708806  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcat 336  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  46708805 tgactaatgtgtattggttggggtaaatcacccatcattctttcat 46708760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 52688356 - 52688506
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  52688356 ctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcatgaatatatgcttatg 52688455  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52688456 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 52688506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 191 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27873712 - 27873570
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27873712 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagtaatttatttgtggggttaagatagttcatgaatatgtgcttatg 27873613  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27873612 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttt 27873570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 33289710 - 33289860
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33289710 ctaaattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaatacgtgcttatg 33289809  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33289810 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 33289860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 192 - 341
Target Start/End: Original strand, 49014106 - 49014255
Alignment:
Q  192 taaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 291  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49014106 taaatcacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtacttatgt 49014205  T
Q  292 ggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  49014206 ggctaatgtgtattgattgaggtaaattactcatcattctttcatgggta 49014255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 52461373 - 52461517
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    ||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52461373 ctaaattacctttgaa---tggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 52461469  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52461470 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgg 52461517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9998095 - 9997945
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9998095 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagtaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 9997996  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  9997995 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 9997945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 43890935 - 43891082
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43890935 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggagtcaatatagttcatgaatatgtgcttatg 43891034  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  43891035 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 43891082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 54715042 - 54715192
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54715042 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaacatagttcatgaatatgtgcttatg 54715141  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  54715142 tggctaatgtgtattagttgaggtaaattacccaccattcttccatgggta 54715192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 191 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 33558106 - 33557960
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  33558106 ctaaattatctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaggaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaatatgtatttatg 33558007  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33558006 tggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatg 33557960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 332
Target Start/End: Original strand, 47811913 - 47812054
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47811913 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattgattgagtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 47812012  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  47812013 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 47812054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 54216900 - 54216753
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54216900 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 54216801  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| |||||    
T  54216800 tgattaatgtgtattggttgggataaattaccctccattcttccatgg 54216753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 221 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 51981613 - 51981493
Alignment:
Q  221 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 320  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51981613 ttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtgggattaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 51981514  T
Q  321 tccatcattctttcatgggta 341  Q
      |||||||||||||| ||||    
T  51981513 ctcatcattctttcattggta 51981493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21366780 - 21366623
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  21366780 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 21366681  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21366680 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggta 21366623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 34276554 - 34276715
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aat 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           ||     
T  34276554 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 34276653  T
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  34276654 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 34276715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 56023169 - 56023012
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  56023169 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 56023070  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  56023069 gcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattttttcatgggta 56023012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 191 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3293187 - 3293084
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3293187 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 3293088  T
Q  291 tggc 294  Q
    ||||    
T  3293087 tggc 3293084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 53461991 - 53461830
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aat 279  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           ||     
T  53461991 ctaaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 53461892  T
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  53461891 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggta 53461830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 407765 - 407920
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------aatatgtg 284  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||          || |||||    
T  407765 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacacttaaaaatgtg 407864  T
Q  285 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  407865 cttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattatccaccattctttcatgggta 407920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Original strand, 54607973 - 54608127
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || || |    
T  54607973 attacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatat 54608072  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54608073 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatgg 54608127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 237488 - 237645
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  237488 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgt 237587  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  237588 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 237645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 9798476 - 9798633
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  9798476 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 9798575  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  9798576 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggta 9798633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31972507 - 31972350
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgt 283  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||           ||||    
T  31972507 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgt 31972408  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31972407 gcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattctttcatgggta 31972350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 38591679 - 38591832
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-------atgtgctt 287  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||       ||||||||    
T  38591679 attacatttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccattaatgtgctt 38591778  T
Q  288 atgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  38591779 atgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggta 38591832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 44984768 - 44984929
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aat 279  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           ||     
T  44984768 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 44984867  T
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  44984868 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 44984929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 55056430 - 55056273
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  55056430 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaacttaaaaatgt 55056331  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  55056330 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggta 55056273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 42766012 - 42765856
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------aatatgtg 284  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||          || |||||    
T  42766012 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgataccacttaaaaatgtg 42765913  T
Q  285 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  42765912 ctaatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 42765856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 191 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11972293 - 11972197
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972293 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt 11972197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 53854600 - 53854446
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  53854600 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 53854501  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  53854500 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgg 53854446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 1932774 - 1932931
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------tgaatatgt 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||           | || ||||    
T  1932774 attacctttgaagaatagtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 1932873  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1932874 gcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattatccatcattttttcatgggta 1932931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 6019939 - 6020096
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           || ||||    
T  6019939 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgt 6020038  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  6020039 gcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 6020096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 6285318 - 6285475
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||           || ||||    
T  6285318 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgt 6285417  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  6285418 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 6285475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 23437603 - 23437760
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  23437603 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 23437702  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  23437703 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggta 23437760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31532306 - 31532149
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  31532306 attacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31532207  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31532206 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccatgggta 31532149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 42085218 - 42085375
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  42085218 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 42085317  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  42085318 gcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggta 42085375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 199 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2826848 - 2826698
Alignment:
Q  199 cctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgctt 287  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || || |||||    
T  2826848 cctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgctt 2826749  T
Q  288 atgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  2826748 atgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 2826698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Original strand, 3170637 - 3170791
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||           ||||    
T  3170637 attacctttgaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgt 3170736  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  3170737 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 3170791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Original strand, 27373087 - 27373241
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------tgaatatgt 283  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||           | || ||||    
T  27373087 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 27373186  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  27373187 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 27373241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 43471866 - 43471712
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||           || ||||    
T  43471866 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 43471767  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  43471766 gattatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 43471712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Original strand, 51363018 - 51363172
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||           || ||||    
T  51363018 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 51363117  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||    
T  51363118 gcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgg 51363172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18462184 - 18462027
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  18462184 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 18462085  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||  |||||||    
T  18462084 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatcacccaccattcttctatgggta 18462027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26091433 - 26091272
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aat 279  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           ||     
T  26091433 ctaaattatcttggaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 26091334  T
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  26091333 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggta 26091272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 31914209 - 31914365
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  31914209 attacctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaactgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31914308  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31914309 gcttatg-ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggta 31914365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 32366831 - 32366674
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  32366831 attatctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 32366732  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  32366731 gcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggta 32366674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 39077556 - 39077713
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||           || ||||    
T  39077556 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 39077655  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  39077656 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaacattcttccatgggta 39077713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 42222302 - 42222459
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------tgaatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||           | || ||||    
T  42222302 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcattgataccacttaaaaatgt 42222401  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||| |||||||    
T  42222402 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacacaccattcttttatgggta 42222459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 47344667 - 47344824
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           || || |    
T  47344667 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 47344766  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  47344767 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccatgggta 47344824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 50534642 - 50534799
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  50534642 attacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 50534741  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  50534742 gcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 50534799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 146600 - 146452
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  146600 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 146501  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  146500 gcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattctt 146452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 341
Target Start/End: Original strand, 41560336 - 41560496
Alignment:
Q  192 taaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aata 280  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           || |    
T  41560336 taaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 41560435  T
Q  281 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  41560436 tgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 41560496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 41949393 - 41949552
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  41949393 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 41949492  T
Q  284 gct--tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  41949493 gcttatatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggta 41949552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 336
Target Start/End: Original strand, 55776056 - 55776207
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||           || ||||    
T  55776056 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 55776154  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcat 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  55776155 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcat 55776207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 336
Target Start/End: Original strand, 55840234 - 55840385
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||           || ||||    
T  55840234 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 55840332  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcat 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  55840333 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcat 55840385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Original strand, 397413 - 397567
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  397413 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 397512  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  397513 gtttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 397567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 29777428 - 29777274
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt-----------catgaatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||           | | || ||||    
T  29777428 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcgagatagtttacggataccacttaaaaatgt 29777329  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  29777328 gcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 29777274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 41632177 - 41632020
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||           || ||||    
T  41632177 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggatatcgcttaaaaatgt 41632079  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41632078 acttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtat 41632020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 41702630 - 41702476
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||           || ||||    
T  41702630 attacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 41702531  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  41702530 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 41702476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 54575111 - 54574954
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  54575111 attatcttagaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttggtggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 54575012  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  54575011 gcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 54574954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14017545 - 14017390
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata---------tgtgc 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||         ||||     
T  14017545 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaagtgtgt 14017446  T
Q  286 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||| ||||||||    
T  14017445 ttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctgccattcttccatgggta 14017390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 23609098 - 23609255
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------tgaatatgt 283  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||           | || ||||    
T  23609098 attatctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaatcaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcacggataccacttaaaaatgt 23609197  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  23609198 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggta 23609255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 29478371 - 29478528
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  29478371 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 29478470  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||    
T  29478471 gcttatatggctaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttccataggta 29478528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 35446517 - 35446673
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||           || ||||    
T  35446517 attaccttttaagaatggtgggtaatttacc-accgaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 35446615  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35446616 gcttatttggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggta 35446673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 50457981 - 50457824
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           || ||||    
T  50457981 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 50457882  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  50457881 gcttatgttgctaatgtgtattggttgaggtaaattatacaccattcttccatgggta 50457824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31070244 - 31070088
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------aatatgtg 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||          || |||||    
T  31070244 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggagtcaagatagttcatgataccacttaaaaatgtg 31070145  T
Q  285 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  31070144 ctcatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggta 31070088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 33897666 - 33897585
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 276  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  33897666 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 33897585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Original strand, 55519838 - 55519996
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           || ||||    
T  55519838 attacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaattttttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 55519937  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  55519938 gcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtat 55519996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19387859 - 19387702
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||           || ||||    
T  19387859 attacgtttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaaatgt 19387760  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  19387759 gcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 19387702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22618683 - 22618528
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||           || ||||    
T  22618683 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 22618585  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  22618584 gcttatgtggctaatatgtattggtt-aggtaaattacccaccattcttccatgggta 22618528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 45797490 - 45797647
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  45797490 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 45797589  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||| ||||    
T  45797590 acttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacctaccattcttccataggta 45797647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 48259681 - 48259528
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----------atgtg 284  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||          |||||    
T  48259681 attacccttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaattagttggtggagtcaagatagttcatgaataccacttaaaatgtg 48259582  T
Q  285 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  48259581 cttatgtggctaatatgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgg 48259528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 49881234 - 49881106
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||           || ||||    
T  49881234 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 49881135  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggg 312  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  49881134 gtttatgtggctaatgtgtattggttggg 49881106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 48657835 - 48657986
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||      ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||    
T  48657835 attacctttgaagaatggtgggt------cccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 48657928  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  48657929 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggta 48657986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Original strand, 27580130 - 27580277
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggc 294  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    || |   |      
T  27580130 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaagat 27580229  T
Q  295 taatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27580230 gaatgtttattggttggggtaaattatccatcatttttccatgggtat 27580277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 50536795 - 50536638
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||           || || |    
T  50536795 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccgatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaaatat 50536696  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  50536695 gtttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttctatgggta 50536638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 34835188 - 34835334
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggc 294  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    || |   ||     
T  34835188 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccatctaaaaaggt 34835287  T
Q  295 taatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||    
T  34835288 gaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggta 34835334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 332
Target Start/End: Original strand, 50234011 - 50234159
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||           || ||||    
T  50234011 attacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtgggatcaagatagttaatggataccacttaaaaatgt 50234110  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 332  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  50234111 gcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 50234159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 341
Target Start/End: Original strand, 54086425 - 54086576
Alignment:
Q  200 ctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgctta 288  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||           ||||||||    
T  54086425 ctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccgcttaaaaatgtgctta 54086523  T
Q  289 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  54086524 tgtggctaatgtgcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 54086576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 276
Target Start/End: Original strand, 2243469 - 2243550
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 276  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  2243469 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtcgggtcaagatagttcatg 2243550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 276
Target Start/End: Original strand, 48313568 - 48313648
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 276  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  48313568 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatg 48313648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14335261 - 14335181
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 275  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14335261 attacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggtcaagatagttcat 14335181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22468941 - 22468861
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 275  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  22468941 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcat 22468861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 203 - 338
Target Start/End: Original strand, 54425001 - 54425147
Alignment:
Q  203 tgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------tgaatatgtgcttatgt 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||           | || ||||||||||||    
T  54425001 tgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgt 54425100  T
Q  292 ggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  54425101 gactaatgtctattggttggggtaaattacccacgattcttccatgg 54425147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3692381 - 3692224
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt-----------catgaatatgt 283  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | |||||||||           | | || ||||    
T  3692381 attacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgggattaagatagtttattgataccacttaaaaatgt 3692282  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  3692281 gtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggta 3692224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 42033186 - 42033343
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||           || ||||    
T  42033186 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaattaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 42033285  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  42033286 gtttatgtagctaatgtatattggttgagataaattacccaccattcttccatgggta 42033343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 47662273 - 47662116
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||| |||||| |||           || || |    
T  47662273 attacctttgaataatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggtgtcaatatagttaatggataccacttaaaaatat 47662174  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  47662173 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggta 47662116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 6371409 - 6371335
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagata 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6371409 attacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagata 6371335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 38547761 - 38547684
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38547761 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtt 38547684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 195 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 39587950 - 39587869
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 276  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39587950 attacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 39587869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 224 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 52728448 - 52728323
Alignment:
Q  224 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  52728448 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgcgtattggttgag 52728349  T
Q  313 gtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||    
T  52728348 gtaaattacccaccattcttccatgg 52728323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1662419 - 1662342
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1662419 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtt 1662342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 272 - 341
Target Start/End: Original strand, 33048980 - 33049049
Alignment:
Q  272 tcatgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  33048980 tcatgaatacgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 33049049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 268
Target Start/End: Original strand, 42557593 - 42557666
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 268  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  42557593 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagat 42557666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Original strand, 48654825 - 48654902
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  48654825 attacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagtt 48654902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 53834225 - 53834144
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 276  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  53834225 attacttttgaagaatggtgggtaatttacccaacaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatg 53834144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Original strand, 43231518 - 43231590
Alignment:
Q  200 ctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43231518 ctttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagtt 43231590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 54805789 - 54805709
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 275  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||| | ||||||||||||    
T  54805789 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtgggattaagatagttcat 54805709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27398763 - 27398686
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27398763 attacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtt 27398686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Original strand, 46720036 - 46720113
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  46720036 attaactttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattgatggggtcaagatagtt 46720113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Original strand, 573814 - 573891
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  573814 attacctttaaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagatagtt 573891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Original strand, 35595794 - 35595855
Alignment:
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||    
T  35595794 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggta 35595855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 287 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3291873 - 3291822
Alignment:
Q  287 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3291873 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgg 3291822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 36532956 - 36532843
Alignment:
Q  240 aatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcat 328  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||    
T  36532956 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccaccat 36532857  T
Q  329 tctttcatgggtat 342  Q
    |||| |||||||||    
T  36532856 tcttccatgggtat 36532843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 341
Target Start/End: Original strand, 27872607 - 27872736
Alignment:
Q  212 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 311  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||    || |   ||  ||||| ||||||||||    
T  27872607 gtggataatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtgaatgtttattggttgg 27872706  T
Q  312 ggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||| ||| |||| || ||||||||    
T  27872707 ggtaaattacccaccatttttccatgggta 27872736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 49058028 - 49057948
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 275  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  || ||| || |||||||||    
T  49058028 attacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattgatgaggttaaaatagttcat 49057948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Original strand, 51951693 - 51951846
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||| ||||||||||  || |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||           || ||||    
T  51951693 attacttttgaagaatgatgagtaatttatccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttaatggagtcaagatagttcatggatatcagttaaaaatgt 51951792  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| ||||||| |||||    
T  51951793 gcttatgtggctaatgtatattggtt-gtgtaaattacccaccattcttccatgg 51951846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 342
Target Start/End: Original strand, 35344890 - 35344956
Alignment:
Q  275 tgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  35344890 tgaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-tggtaaattatccaccattcttccataggtat 35344956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18206682 - 18206608
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagata 269  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18206682 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagata 18206608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 342
Target Start/End: Original strand, 42558300 - 42558354
Alignment:
Q  288 atgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  42558300 atgtggctaatgtgtattgattagggtaaattatccaccattcttccatgggtat 42558354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 48259778 - 48259720
Alignment:
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  48259778 atgtgcttatgtggctaatatgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgg 48259720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17555657 - 17555617
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaa 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17555657 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaa 17555617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 47105148 - 47105045
Alignment:
Q  234 aatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-tgaatatgtgcttatg----tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcat 328  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    |||||||||| || |||||| ||||||||| ||| | |    
T  47105148 aatgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttcagtgaa-atgtgcttatgtgcatggctaatgtttaatggttgaggtaaattacccacctt 47105050  T
Q  329 tcttt 333  Q
    |||||    
T  47105049 tcttt 47105045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 54805683 - 54805628
Alignment:
Q  286 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| || ||||||||    
T  54805683 ttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattactcatcattgttccatgggta 54805628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 337
Target Start/End: Original strand, 42509403 - 42509460
Alignment:
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||    
T  42509403 atgtgtttatgtgactaatgtgtattggttaggataaattatccaccattcttccatg 42509460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 286 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22468839 - 22468796
Alignment:
Q  286 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  22468839 ttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccatt 22468796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 213 - 272
Target Start/End: Original strand, 43478089 - 43478147
Alignment:
Q  213 tgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  43478089 tgggtaatttatcgatcaaccaatgaaa-tgagcaatttattagtgtggtcaagatagtt 43478147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 283 - 311
Target Start/End: Original strand, 52396837 - 52396865
Alignment:
Q  283 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52396837 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 52396865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 106)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 42589837 - 42589987
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42589837 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 42589936  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42589937 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 42589987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 192 - 341
Target Start/End: Original strand, 54401195 - 54401344
Alignment:
Q  192 taaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 291  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54401195 taaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 54401294  T
Q  292 ggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54401295 ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 54401344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34279885 - 34279738
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279885 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 34279786  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34279785 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgg 34279738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 25641653 - 25641803
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25641653 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcataaatatgtgcttatg 25641752  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25641753 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 25641803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 54707384 - 54707234
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54707384 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 54707285  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54707284 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 54707234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 38156796 - 38156646
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38156796 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 38156697  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38156696 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 38156646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41635964 - 41635814
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41635964 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 41635865  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41635864 tggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggta 41635814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 51415976 - 51416126
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51415976 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtatatgtgcttatg 51416075  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  51416076 tggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggta 51416126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 55000342 - 55000192
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55000342 ctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 55000243  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55000242 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 55000192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 24688121 - 24688271
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  24688121 ctaaattacctttgaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaatatgtgtttatg 24688220  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24688221 tggctaatgtctactggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 24688271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 191 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 31286957 - 31286811
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31286957 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 31286858  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  31286857 tggctaatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatg 31286811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 47511104 - 47510954
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47511104 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 47511005  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  47511004 tggctaatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggta 47510954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 192 - 341
Target Start/End: Original strand, 37028731 - 37028880
Alignment:
Q  192 taaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 291  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37028731 taaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggagtcaagatagttcatgaatatgtgtttatgt 37028830  T
Q  292 ggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37028831 ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 37028880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 192 - 339
Target Start/End: Original strand, 45058891 - 45059038
Alignment:
Q  192 taaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 291  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45058891 taaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 45058990  T
Q  292 ggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatggg 339  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45058991 tgctaatgtatattgattggggtaaattacccatcattctttcatggg 45059038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 39141290 - 39141141
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatga--atatgtgctta 288  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  39141290 ctaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatatgtgctta 39141191  T
Q  289 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39141190 tgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccatcattctttcatgg 39141141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 40022081 - 40022231
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40022081 ctaaattacctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 40022180  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  40022181 tggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggta 40022231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 191 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 17665688 - 17665549
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17665688 ctaaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatatgcttatg 17665589  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattc 330  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17665588 tggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattc 17665549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 51224201 - 51224052
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51224201 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaac-aataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 51224103  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  51224102 tgactaatatatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggta 51224052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 49130585 - 49130735
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49130585 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatgaggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 49130684  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  49130685 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggta 49130735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 192 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 44946092 - 44945953
Alignment:
Q  192 taaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 291  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||    
T  44946092 taaattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagata------gaatatgtgcttatgt 44945999  T
Q  292 ggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  44945998 ggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcatcattctttcatg 44945953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 209 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 52756217 - 52756081
Alignment:
Q  209 atagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggc----taatgtgtat 304  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  52756217 atagtgggttatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggctaattaatgtgtat 52756118  T
Q  305 tggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52756117 tggtttgggtaaattacccatcattctttcatgggta 52756081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 47257804 - 47257961
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||           ||||    
T  47257804 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgt 47257903  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  47257904 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 47257961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 240 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 48534122 - 48534021
Alignment:
Q  240 aatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatggg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48534122 aatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattacccatcattctttcatggg 48534023  T
Q  340 ta 341  Q
    ||    
T  48534022 ta 48534021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 22399108 - 22399264
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------aatatgtg 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||          || |||||    
T  22399108 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggaaaccacttaaaatgtg 22399207  T
Q  285 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  22399208 cttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 22399264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27067149 - 27066995
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||           ||||    
T  27067149 attacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgt 27067050  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  27067049 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatgg 27066995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 40131130 - 40130973
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||           || ||||    
T  40131130 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgtctgtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 40131031  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||    
T  40131030 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggta 40130973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 49330048 - 49330205
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  49330048 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 49330147  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  49330148 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggta 49330205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 24100294 - 24100450
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------aatatgtg 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||          || || ||    
T  24100294 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgataccacttaaaaatatg 24100393  T
Q  285 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  24100394 cttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggta 24100450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 47809772 - 47809610
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aat 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           ||     
T  47809772 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 47809673  T
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-ggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  47809672 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattacccaccattcttccatgggta 47809610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Original strand, 52628965 - 52629119
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           || || |    
T  52628965 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 52629064  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  52629065 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgg 52629119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 2666011 - 2666168
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||    
T  2666011 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaactgt 2666110  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  2666111 gcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccactattctttcatgggta 2666168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28048567 - 28048406
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aat 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           ||     
T  28048567 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 28048468  T
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  28048467 atgtgcttatgtggctaatgtgtattaatttgggtaaattacccaccattcttccatgggta 28048406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 37313410 - 37313567
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||           ||||    
T  37313410 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgt 37313509  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  37313510 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 37313567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 40643807 - 40643968
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aat 279  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||           ||     
T  40643807 ctaaattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatatcatttaaaa 40643906  T
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  40643907 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 40643968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 41464363 - 41464520
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||           || ||||    
T  41464363 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 41464462  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  41464463 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccagcattcttccatgggta 41464520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 44222836 - 44222997
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----------- 279  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||               
T  44222836 ctaaattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatgaataccacttaaaa 44222935  T
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  44222936 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 44222997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 51170204 - 51170047
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  51170204 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 51170105  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  51170104 gcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggta 51170047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7755477 - 7755321
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------aatatgtg 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||          || |||||    
T  7755477 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagattatggataccacttaaaatgtg 7755378  T
Q  285 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  7755377 cttatgtggctaatgtgtattgcttggggtaaataacccatcattcttccatgggta 7755321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 32234568 - 32234412
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------aatatgtg 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||          || || ||    
T  32234568 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaatatg 32234469  T
Q  285 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| ||||||||    
T  32234468 cttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggta 32234412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 35748482 - 35748328
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || || |    
T  35748482 attagctttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 35748383  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  35748382 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatgg 35748328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Original strand, 46134367 - 46134521
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  46134367 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 46134466  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  46134467 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcaccattctttcatgg 46134521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 29625998 - 29625841
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || || |    
T  29625998 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 29625899  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  29625898 gcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggta 29625841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 38416895 - 38416738
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  38416895 attacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 38416796  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  38416795 gcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 38416738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 40419846 - 40420003
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  40419846 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 40419945  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  40419946 gcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattctttcatgggta 40420003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 42291853 - 42292010
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------tgaatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||           |||| ||||    
T  42291853 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttgaaaatgt 42291952  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||    
T  42291953 acttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggta 42292010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 333
Target Start/End: Original strand, 43125842 - 43125991
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  43125842 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 43125941  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttt 333  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  43125942 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttt 43125991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 43612218 - 43612061
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||           || ||||    
T  43612218 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 43612119  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  43612118 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggta 43612061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 196 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 55453414 - 55453258
Alignment:
Q  196 ttacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtg 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           || |||||    
T  55453414 ttacctttgaagaatggtgggtaatttactcatcaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 55453315  T
Q  285 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||    
T  55453314 cttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggta 55453258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41293489 - 41293333
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----------atgtg 284  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |||||||||          |||||    
T  41293489 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataattcatgaataccacttaaaatgtg 41293390  T
Q  285 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  41293389 cttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttctatgggta 41293333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Original strand, 39053405 - 39053559
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||           || ||||    
T  39053405 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 39053504  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  39053505 gcttatgtggctaatgtgtattcgttggggtaaattacccatcatttttttatgg 39053559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 43021725 - 43021883
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgt-ggggtcaagatagttcatgaat-----------atg 282  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||           |||    
T  43021725 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatg 43021824  T
Q  283 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  43021825 tgcttatgtagctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggta 43021883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 51452921 - 51452767
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||           || ||||    
T  51452921 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgt 51452822  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  51452821 gcttatgtagctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccatgg 51452767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7855285 - 7855128
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------tgaatatgt 283  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||           | || ||||    
T  7855285 attacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaaggataccacttaaaaatgt 7855186  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  7855185 gcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 7855128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 44806695 - 44806852
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||           || ||||    
T  44806695 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 44806794  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  44806795 gcttatgtggctaatatgtattggttgaagtaaattatccacaattctttcatgggta 44806852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 37324548 - 37324709
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aat 279  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           ||     
T  37324548 ctaaattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaa 37324647  T
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  37324648 atatatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 37324709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 48609734 - 48609891
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||           || ||||    
T  48609734 attaccttcgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 48609833  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  48609834 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggta 48609891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 51102549 - 51102401
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  51102549 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 51102450  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 332  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  51102449 atttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 51102401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 207 - 338
Target Start/End: Original strand, 46126010 - 46126152
Alignment:
Q  207 gaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggct 295  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||||||||||||||    
T  46126010 gaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtggct 46126109  T
Q  296 aatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  46126110 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 46126152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 191 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20754568 - 20754419
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aat 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||           ||     
T  20754568 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagagtcaagatagttcatggatatcacttaaaa 20754469  T
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcatt 329  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  20754468 atatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccatt 20754419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 39634742 - 39634586
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||           || ||||    
T  39634742 attacttttgaagaatggtgggtattttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccacttaaaaatgt 39634644  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||    
T  39634643 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattcttccatgggta 39634586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 48739404 - 48739247
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||           || ||||    
T  48739404 attacttttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaaatgt 48739305  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  48739304 gcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 48739247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 53832655 - 53832502
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||           || | |     
T  53832655 attacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagtttatggataccaattaaaaaggg 53832556  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  53832555 gcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatg 53832502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 320
Target Start/End: Original strand, 52215087 - 52215223
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||           || ||||    
T  52215087 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaactaatgaacatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 52215186  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52215187 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 52215223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 330
Target Start/End: Original strand, 24376584 - 24376730
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           || ||||    
T  24376584 attacctttgaagaatgatgggtaatttacgcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 24376683  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattc 330  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  24376684 gcttatgtggcttatgtgtatttgttggggtaaattacccaccattc 24376730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 53943758 - 53943604
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           || || |    
T  53943758 attacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 53943659  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  53943658 acttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 53943604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 54159159 - 54159079
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 275  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  54159159 attacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcat 54159079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 18946914 - 18947071
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||           || ||||    
T  18946914 attatctttgaagaatggtgcgtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccagttaaaaatgt 18947013  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  18947014 gcttatgtgactaatgtgtattggttgagacaaattacccaccattcttccatgggta 18947071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 35594132 - 35594289
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||           || || |    
T  35594132 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatat 35594231  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  35594232 gcttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatgggta 35594289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 40804681 - 40804524
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||           || ||||    
T  40804681 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtaggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 40804582  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||| || ||||||||    
T  40804581 gtttatgtggctaatgtgtattagttagggtaaattacccaccatttttccatgggta 40804524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 51146386 - 51146229
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||           || || |    
T  51146386 attatctttgaagaatggtaggtaatttacacatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaattt 51146287  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  51146286 gcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggta 51146229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 320
Target Start/End: Original strand, 53637852 - 53637988
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||           || ||||    
T  53637852 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaggataattcatggataccacttaaaaatgt 53637951  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 320  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  53637952 gcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaatta 53637988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Original strand, 41732539 - 41732693
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  41732539 attacctttgaaaaatggtggataatttatccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 41732638  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  41732639 gcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccatccttccatgg 41732693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 5560203 - 5560043
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatga-----aaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aa 278  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||           ||    
T  5560203 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaattaaatgagcaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccacttaaa 5560104  T
Q  279 tatgtgcttatgtggc--taatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
     || |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  5560103 aatatgcttatgtgactataatgtctattggttggggtaaattatccaccattcttccatg 5560043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 43183923 - 43184080
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||           || ||||    
T  43183923 attacctttgaagaatggtgagtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 43184022  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||| ||||    
T  43184023 gcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccataggta 43184080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 320
Target Start/End: Original strand, 36368950 - 36369086
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  36368950 attacctttgaagaatggtcgataatttacccaccaactaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 36369049  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  36369050 gcttatgtggctaatgtatattggttagggtaaatta 36369086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 55379996 - 55380142
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggc 294  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    || |   ||     
T  55379996 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggt 55380095  T
Q  295 taatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||    
T  55380096 gaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggta 55380142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 41882151 - 41882074
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41882151 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtt 41882074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Original strand, 53115458 - 53115535
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53115458 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtt 53115535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 47894991 - 47894834
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  47894991 attacctttaaagaatggtggataatttacctaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 47894892  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  47894891 gcttatgtgactaatgtatattagttgaggtaaatcatccaccattcttccatgggta 47894834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 25353565 - 25353711
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggc 294  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    || |   ||     
T  25353565 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataataagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggt 25353664  T
Q  295 taatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
     |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  25353665 gaatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 25353711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 51143828 - 51143974
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggc 294  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||    || |   ||     
T  51143828 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaatatagtttatggataccacctaaaaaggt 51143927  T
Q  295 taatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
     ||||| |||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  51143928 gaatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggta 51143974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 48726162 - 48726077
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 276  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||||||| ||||||||    
T  48726162 ctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaataagcaatttattggtagagtcaagacagttcatg 48726077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 197 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30251659 - 30251584
Alignment:
Q  197 tacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30251659 tacctttgaaaaatggtgggtaatttactcaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtt 30251584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Original strand, 52638853 - 52638998
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||           || ||||    
T  52638853 attacctttaaagaatggtgggtaatttaccaacgaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagataattcatggataccacttaaaaatgt 52638952  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcatt 329  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||    
T  52638953 gcttctgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccatt 52638998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 47402909 - 47402827
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatga 277  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  47402909 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtagggtcaagatagttcatga 47402827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21597308 - 21597231
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21597308 attacctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtt 21597231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28576272 - 28576195
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  28576272 attacctttgaagtatgatgggtaatttacccatcaaccgatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtt 28576195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 42998948 - 42998872
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  42998948 attacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgatcaatttattggtggggtcaagatagtt 42998872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2228095 - 2228015
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 275  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2228095 attacctttgaaaaatggtgggaaatttaccgatcaaccaatgaaaataagcaatttattggtgaggtcaagatagttcat 2228015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 48547000 - 48546857
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----atg 290  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||| |||    |||    |||    
T  48547000 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaa-atagttcatggata-ccacttaaaaatg 48546904  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    | ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  48546903 t-gcttatgtgtattgattggggtaaattatccaccattcttccatgg 48546857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 50732074 - 50731997
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  50732074 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtt 50731997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Original strand, 50780782 - 50780859
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  50780782 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtt 50780859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8847821 - 8847733
Alignment:
Q  192 taaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 280  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||    
T  8847821 taaattacctttgaagaatagtgtataatttacataccaactaataaaaatgaacaatttattggtgggatcaaaatagttcacgaata 8847733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 41216466 - 41216623
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||| || ||||||||||           || ||||    
T  41216466 attacctttaaaggatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggttaatatagttcatggataccacttaaaaatgt 41216565  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||  |||||| ||| ||||    
T  41216566 gcttatgtggctaatgtgtattaattgggataaattacccactattcttccataggta 41216623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 40165659 - 40165808
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||| |||    || |      
T  40165659 ctaaattatctttgaaaaataatgg-taatttacccaccaagcaatcataatgagtaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaa 40165757  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
     ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  40165758 aggtgaatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggta 40165808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 280 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 33550542 - 33550485
Alignment:
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  33550542 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatg 33550485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 48752096 - 48752161
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggg 260  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||    
T  48752096 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgtgcaatttattggtggg 48752161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Original strand, 46949386 - 46949538
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||||||           || ||||    
T  46949386 attatctttgaaga-tggtgtgtaatttacccaccgaccaatgaaaatgaacaatttgttggcgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 46949484  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  46949485 gtttatgtggctaatgtgtattggtt-ggataaattacccaccattcttccatgg 46949538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 319
Target Start/End: Original strand, 37758946 - 37759075
Alignment:
Q  201 tttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttat 289  Q
    |||||||||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||||  |||           ||| |||||    
T  37758946 tttgaagaatggtgaataatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatgaagtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtacttat 37759045  T
Q  290 gtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37759046 gtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 37759075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 341
Target Start/End: Original strand, 40688431 - 40688469
Alignment:
Q  303 attggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40688431 attggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 40688469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 52434150 - 52434216
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggg 260  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  52434150 attacctttgaaaaatggtgggtaattttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggg 52434216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 276
Target Start/End: Original strand, 41609098 - 41609159
Alignment:
Q  215 ggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 276  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  41609098 ggtaatttacctaccaactaatgaaaatgagcaatttattagtggagttaaaatagttcatg 41609159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 43176898 - 43176821
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||| |||  ||||||||||||    
T  43176898 attacctttgaaaaatggtggataatttatccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtgatgtcaagatagtt 43176821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 269
Target Start/End: Original strand, 177172 - 177246
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagata 269  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| | || ||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  177172 attacctttgaaaaatggtgggtaatttagtcaccaaccaatcataacgagtaatttattggtgggatcaagata 177246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 236
Target Start/End: Original strand, 37741446 - 37741487
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaat 236  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37741446 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 37741487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 233 - 272
Target Start/End: Original strand, 47182049 - 47182088
Alignment:
Q  233 caatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  47182049 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtt 47182088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 104)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6626188 - 6626038
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6626188 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 6626089  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6626088 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 6626038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41467796 - 41467646
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41467796 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 41467697  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41467696 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 41467646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 192 - 341
Target Start/End: Original strand, 2657311 - 2657460
Alignment:
Q  192 taaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 291  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2657311 taaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 2657410  T
Q  292 ggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2657411 ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 2657460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26472343 - 26472193
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26472343 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 26472244  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26472243 tggctaatgtgtcttggttggggtaaattactcatcattctttcatgggta 26472193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 29770677 - 29770827
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29770677 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 29770776  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29770777 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggta 29770827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 42234847 - 42234996
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42234847 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 42234946  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42234947 tggttaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattctttcatgggta 42234996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 4953059 - 4953206
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4953059 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 4953158  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4953159 tggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgg 4953206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4243654 - 4243504
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4243654 ctaaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaatatgtgcttatg 4243555  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  4243554 tggctaatgtgtattggatggggtaaattacccataattctttcatgggta 4243504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13281726 - 13281576
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13281726 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgacaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaatatgtgcttatg 13281627  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  13281626 tggctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcattattttatgggta 13281576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 34752478 - 34752328
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34752478 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaaataaaatgagcaatttatttgtgggcttaagatagttcatgaatatgtgcttatg 34752379  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34752378 tggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggta 34752328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41895328 - 41895178
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41895328 ctaaattacctttaaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaataacaattagcaatttatttgtgaggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 41895229  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41895228 tggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccatcattctttcatgggta 41895178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 337
Target Start/End: Original strand, 10928074 - 10928220
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10928074 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 10928173  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  10928174 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatg 10928220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 33073218 - 33073368
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33073218 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 33073317  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  33073318 tggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 33073368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 192 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 35991762 - 35991616
Alignment:
Q  192 taaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 291  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35991762 taaattacctttgaagaattgtgggtaatttatccaccaacaattgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatatgcttatgt 35991663  T
Q  292 ggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  35991662 ggctaatatgtattggttggggtaaattagctatcattctttcatgg 35991616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 44544210 - 44544060
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44544210 ctaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtacttatg 44544111  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |  ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44544110 taactaatgtatattagttagggtaaattatccatcattctttcatgggta 44544060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 44293617 - 44293472
Alignment:
Q  193 aaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtg 292  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44293617 aaattacctttgaagaatagtaggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtacttatgtg 44293518  T
Q  293 gctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  44293517 gctaatatatattagttggggtaaattactcatcattctttcatgg 44293472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 191 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 30290074 - 30289928
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30290074 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccagtgaatatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 30289975  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  30289974 tggttaatgtgtattggttgaggtaaattatccaccattcttccatg 30289928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 32448655 - 32448796
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  32448655 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt--- 32448751  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
          | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32448752 ------aagtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 32448796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 3611143 - 3611304
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aat 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           ||     
T  3611143 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 3611242  T
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  3611243 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 3611304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 191 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 46428417 - 46428278
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  46428417 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccagcaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaagatagttcatgaatatgtgtttata 46428318  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattc 330  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  46428317 tggctaatgtgtattggttagagtaaattatccaccattc 46428278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 31308012 - 31308169
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  31308012 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31308111  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  31308112 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 31308169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 45538164 - 45538321
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  45538164 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 45538263  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  45538264 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 45538321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 51155753 - 51155606
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51155753 ctaaattacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggagtcaagatagttcatgaatatgtgtttatg 51155654  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    || ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  51155653 tgactaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgg 51155606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4068854 - 4068697
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  4068854 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 4068755  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  4068754 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 4068697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 5981181 - 5981338
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  5981181 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 5981280  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5981281 gcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattatccaccattcttccatgggta 5981338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17995122 - 17994965
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||           || ||||    
T  17995122 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgt 17995023  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  17995022 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 17994965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24245196 - 24245039
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  24245196 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 24245097  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24245096 gcttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattatccaccattcttccatgggta 24245039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25678430 - 25678273
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  25678430 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 25678331  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  25678330 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 25678273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 44661981 - 44662138
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------tgaatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||           | || ||||    
T  44661981 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 44662080  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  44662081 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 44662138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 46616560 - 46616717
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||           ||||    
T  46616560 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgt 46616659  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  46616660 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggta 46616717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 202 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26085562 - 26085412
Alignment:
Q  202 ttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgcttatg 290  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||           |||||||||||    
T  26085562 ttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatg 26085463  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  26085462 tggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 26085412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33112988 - 33112834
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  33112988 attacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 33112889  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  33112888 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgg 33112834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21139583 - 21139426
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  21139583 attacctttgaagtatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 21139484  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||    
T  21139483 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggta 21139426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 43251722 - 43251879
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||           || ||||    
T  43251722 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 43251821  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  43251822 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 43251879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 227 - 333
Target Start/End: Original strand, 24215806 - 24215912
Alignment:
Q  227 accaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24215806 accaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaatatatgtttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatc 24215905  T
Q  327 attcttt 333  Q
    |||||||    
T  24215906 attcttt 24215912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 42863878 - 42864029
Alignment:
Q  197 tacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgc 285  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||           || ||||||    
T  42863878 tacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgtgc 42863977  T
Q  286 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  42863978 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatg 42864029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23932680 - 23932523
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  23932680 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggacaccacttaaaaatgt 23932581  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  23932580 gcttatgtggctaatgtgtattgatcagggtaaattacccaccattcttccatgggta 23932523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 25058699 - 25058856
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||           || ||||    
T  25058699 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgt 25058798  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  25058799 gcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggta 25058856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 38332030 - 38331873
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||           || |    
T  38332030 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatat 38331931  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  38331930 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 38331873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 199 - 341
Target Start/End: Original strand, 39646583 - 39646736
Alignment:
Q  199 cctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgctt 287  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||           || ||||||||    
T  39646583 cctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataggtcatggataccacttaaaaatgtgctt 39646682  T
Q  288 atgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  39646683 atgtaactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggta 39646736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 46967212 - 46967055
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  46967212 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 46967113  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46967112 gcttatgtggctaatatgtatttgttaggataaattacccatcattctttcatgggta 46967055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 47317326 - 47317483
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  47317326 attacctttgaagaatggtgggtaatttattcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgt 47317425  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||    
T  47317426 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttctatgggta 47317483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 47671597 - 47671754
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||           || ||||    
T  47671597 attacctttgaagaatggtggataatttaccgaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 47671696  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  47671697 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggta 47671754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 341
Target Start/End: Original strand, 26794312 - 26794472
Alignment:
Q  192 taaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aata 280  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           || |    
T  26794312 taaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaa 26794411  T
Q  281 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  26794412 tgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggta 26794472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6327718 - 6327562
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  6327718 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 6327619  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||    
T  6327618 gcttat-tgactaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggta 6327562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 23984766 - 23984923
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  23984766 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 23984865  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  23984866 gcttatgtagctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggta 23984923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 26277188 - 26277345
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           || || |    
T  26277188 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaattt 26277287  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  26277288 gtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 26277345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 31040720 - 31040877
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || || |    
T  31040720 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 31040819  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| || ||||||||    
T  31040820 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattattccatgggta 31040877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 33884099 - 33884256
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------tgaatatgt 283  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||           | || ||||    
T  33884099 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccatttaaaaatgt 33884198  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||    
T  33884199 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggta 33884256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 33960153 - 33959996
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------tgaatatgt 283  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||           | || ||||    
T  33960153 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccatttaaaaatgt 33960054  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||    
T  33960053 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggta 33959996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 36566341 - 36566498
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  36566341 attacctttgaagaatagtgggtaatatattcaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 36566440  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  36566441 gcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattacccaccattcttccatgggta 36566498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 37620363 - 37620210
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  37620363 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 37620264  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  37620263 ccttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatg 37620210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 38790368 - 38790211
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||           || || |    
T  38790368 attacctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatat 38790269  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  38790268 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 38790211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 47383903 - 47383746
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  47383903 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 47383804  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  47383803 gcttatgtagctaatgtgtattgattgggataaattacccaccattctttcattggta 47383746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 51057078 - 51057239
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aat 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||           ||     
T  51057078 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagatcatggataccacttaaaa 51057177  T
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  51057178 atgtgcttatgtggttaatgtgtattagttgaggtaaattatccaccattcttccatgggta 51057239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23221100 - 23220972
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  23221100 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 23221001  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23221000 gcttatgtggctaatgtgtattggttggg 23220972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27983758 - 27983617
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggc 294  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||     ||||     | || |||||||||||||||    
T  27983758 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-----gataccatttaaaaatgtgcttatgtggc 27983664  T
Q  295 taatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  27983663 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 27983617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 191 - 332
Target Start/End: Original strand, 36003137 - 36003289
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aat 279  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||           ||     
T  36003137 ctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttactggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 36003236  T
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||    
T  36003237 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcggataaattacccaccattctt 36003289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 3285413 - 3285569
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------aatatgtg 284  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||          || |||||    
T  3285413 attacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaatgtg 3285512  T
Q  285 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  3285513 cttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggta 3285569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 49254146 - 49253992
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||           || ||||    
T  49254146 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgt 49254047  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  49254046 gcttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 49253992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 41999826 - 41999983
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||           || ||||    
T  41999826 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaaatgt 41999925  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  41999926 gcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 41999983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 47187116 - 47187273
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||           || ||||    
T  47187116 attacctttgaagattgatgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgt 47187215  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47187216 gcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattatccaccattctttcatgggta 47187273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 50774224 - 50774385
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aat 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           ||     
T  50774224 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 50774323  T
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  50774324 atatgcttatgtgaccaatgtgtattggttgggataaattacccacctttcttccatgggta 50774385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 320
Target Start/End: Original strand, 31844387 - 31844523
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||           || ||||    
T  31844387 attacctttgaggaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31844486  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31844487 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 31844523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Original strand, 48373515 - 48373660
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----atg 290  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||    |||    |||    
T  48373515 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcagtttattggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaatg 48373613  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  48373614 t-gcttatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 48373660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7561706 - 7561545
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaa------------gatagttcatgaa 278  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||             ||||||||||||    
T  7561706 ctaaattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaattacccataatttatagttcatgaa 7561607  T
Q  279 tatgtgctta--tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  7561606 tatgtgcttacgtggggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatgg 7561545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 35692835 - 35692680
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaattta-cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatg 282  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || |||    
T  35692835 attacctttgaagaatggtgggtaatttatcccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccgcttaaaaatg 35692736  T
Q  283 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||| |||||    
T  35692735 tgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatgg 35692680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 51403178 - 51403097
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 276  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  51403178 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 51403097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Original strand, 5980079 - 5980224
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||           || ||      
T  5980079 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaaatta 5980178  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcatt 329  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  5980179 gcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatt 5980224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 337
Target Start/End: Original strand, 24885512 - 24885665
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           || || |    
T  24885512 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 24885611  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  24885612 gtttatgtggataatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatg 24885665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 35273603 - 35273764
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aat 279  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           ||     
T  35273603 ctaaattatctttgaagaatggtggataatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 35273702  T
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  35273703 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacacaccattcttccatgggta 35273764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 46784434 - 46784591
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |  || |||||||||||||           || ||||    
T  46784434 attacctttgaggaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggagaagtaaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 46784533  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  46784534 gcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggta 46784591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 311
Target Start/End: Original strand, 25518825 - 25518952
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgt 283  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           | |    
T  25518825 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 25518924  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttgg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25518925 gcttatgtggctaatgtgtattggttgg 25518952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 31980106 - 31980025
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 276  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  31980106 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgttagggtcaagatagttcatg 31980025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26525060 - 26524906
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt-----------catgaatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||           | | || || |    
T  26525060 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatagataccacttaaaaatat 26524961  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  26524960 gcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccactattcttccatgg 26524906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 337
Target Start/End: Original strand, 28888592 - 28888745
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||           || ||||    
T  28888592 attaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 28888691  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  28888692 gtttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattatccaccattcttccatg 28888745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 217 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 42313510 - 42313379
Alignment:
Q  217 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgcttatgtggctaatgtgtatt 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||    
T  42313510 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagaaatttattggtggagtcaagatagttcattaataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtatt 42313411  T
Q  306 ggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  42313410 ggttggggtaaattacccaccattcttccatg 42313379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 197 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 13313332 - 13313248
Alignment:
Q  197 tacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat 281  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13313332 tacctttgaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggatat 13313248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 38718309 - 38718183
Alignment:
Q  219 atttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat------gaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 312  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  38718309 atttatccaccgaccaataaaaatgaacaatttatttgtggcatcaagatagttcataaatatgaatatgtgcttatgtggctaatgtatatcggttggg 38718210  T
Q  313 -gtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
     |||||||| |||||||||||||||||    
T  38718209 agtaaattacccatcattctttcatgg 38718183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 342
Target Start/End: Original strand, 2450529 - 2450663
Alignment:
Q  219 atttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattgg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||| |||           |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2450529 atttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgg 2450628  T
Q  308 ttggggtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  2450629 ttggggtaaattacctatcattcttccatgggtat 2450663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24649882 - 24649802
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 275  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24649882 attacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagttatttattggtggggtcaagatagttcat 24649802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 49399159 - 49399001
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||| |||           || ||||    
T  49399159 attacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggagttaagatagtttatggataccacttaaaaatgt 49399060  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  49399059 gtttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtat 49399001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 221 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 45475987 - 45475864
Alignment:
Q  221 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||           ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45475987 ttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttgatggataccacttacaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 45475888  T
Q  310 ggggtaaattatccatcattctttc 334  Q
     |||||||||| ||| |||||||||    
T  45475887 -gggtaaattacccaccattctttc 45475864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2557017 - 2556932
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 280  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  2557017 attacctttgaagaatggtggataatttatccactaactaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaagatagttcatgaata 2556932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Original strand, 26685867 - 26685944
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26685867 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtt 26685944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 280
Target Start/End: Original strand, 52323949 - 52324034
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 280  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  52323949 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagataatttatgaata 52324034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Original strand, 2954866 - 2954943
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2954866 attacctttgacaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtt 2954943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27924818 - 27924741
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27924818 attacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtt 27924741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Original strand, 52367894 - 52367971
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  52367894 attacctttaaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtt 52367971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 51045737 - 51045619
Alignment:
Q  225 ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggg 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||           ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  51045737 ccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagtttatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattaggg 51045638  T
Q  314 taaattatccatcattctt 332  Q
    ||||||| ||| |||||||    
T  51045637 taaattacccaccattctt 51045619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 195 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 38716407 - 38716333
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagata 269  Q
    |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38716407 attatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagata 38716333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Original strand, 1388484 - 1388561
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1388484 attacatttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcatgatgagcaatttattggtagggtcaagatagtt 1388561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Original strand, 10920211 - 10920288
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10920211 attatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcacaatttattggtggggtcaagatagtt 10920288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Original strand, 33187351 - 33187428
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||| |||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  33187351 attatctttaaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggttggatcaagatagtt 33187428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 48683494 - 48683413
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  48683494 ctaatttacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggagtcaagatagtt 48683413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4156236 - 4156188
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 243  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4156236 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 4156188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13312609 - 13312545
Alignment:
Q  277 aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  13312609 aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggta 13312545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 341
Target Start/End: Original strand, 4156507 - 4156562
Alignment:
Q  286 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  4156507 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcatttttccatgggta 4156562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 39475940 - 39475866
Alignment:
Q  197 tacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  39475940 tacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggt-gggtcaagatagtt 39475866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 338
Target Start/End: Original strand, 4808752 - 4808810
Alignment:
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  4808752 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 4808810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5961427 - 5961281
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggc 294  Q
    ||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||    || |   ||     
T  5961427 attacttttgaaaaatggtggataatttacccaccaacaaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaaggt 5961328  T
Q  295 taatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  5961327 gaatgtttattggttgaggtaaattacccatcatttttccatgggta 5961281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 274
Target Start/End: Original strand, 39637911 - 39637986
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca 274  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39637911 attacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaa----taaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttca 39637986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10919354 - 10919313
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaat 236  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10919354 attatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 10919313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 341
Target Start/End: Original strand, 33187446 - 33187491
Alignment:
Q  296 aatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  33187446 aatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 33187491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 117493 - 117343
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117493 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 117394  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  117393 tggctaatgtgtattggttcgggtaaattattcatcattctttcatgggta 117343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 31940322 - 31940471
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31940322 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 31940421  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31940422 tggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcatgggta 31940471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 41843260 - 41843410
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41843260 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtccagatagttcatgaatatgtgcttatg 41843359  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41843360 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 41843410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 192 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4975570 - 4975421
Alignment:
Q  192 taaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 291  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4975570 taaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatat 4975471  T
Q  292 ggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4975470 ggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggta 4975421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 9713696 - 9713843
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9713696 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccca---accaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 9713792  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9713793 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 9713843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 194 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 40458933 - 40458786
Alignment:
Q  194 aattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtgg 293  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  40458933 aattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgtttttgtgg 40458834  T
Q  294 ctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40458833 ctaatatgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggta 40458786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 2379147 - 2379294
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2379147 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaaaatagttcatgaatatgtgcttatg 2379246  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2379247 tgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgg 2379294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4447459 - 4447309
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4447459 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 4447360  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  4447359 tggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 4447309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 191 - 342
Target Start/End: Original strand, 10378316 - 10378467
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10378316 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 10378415  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  10378416 tggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtat 10378467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9509564 - 9509414
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9509564 ctaaattacctttaaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgaatatgtgtttatg 9509465  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9509464 tggcaaatttttattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 9509414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 196 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 40649990 - 40649845
Alignment:
Q  196 ttacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggct 295  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40649990 ttacctttaaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgaatatgtgcttatgtggct 40649891  T
Q  296 aatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  40649890 aatgtgtattggttggggtaaactacccatcattctttcatgggta 40649845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 3211213 - 3211362
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3211213 ctaaattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatgaatatgtgcttatg 3211311  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  3211312 tggctaatgtgtattcgttggagtaaattacccaccattcttccatgggta 3211362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 32373890 - 32373744
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32373890 ctaaattacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 32373791  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  32373790 tgattaatgtgtattggttggggtaaatta-ccaccattcttccatgg 32373744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 192 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33622628 - 33622483
Alignment:
Q  192 taaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 291  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  33622628 taaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatatatttat-gggtcaaaatagttcatgaatatgtggttatgt 33622530  T
Q  292 ggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  33622529 gactaatgtgtattggttgggataaattacccatcattttttcatgg 33622483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27243303 - 27243194
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27243303 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatgaatatgtgcttatg 27243204  T
Q  291 tggctaatgt 300  Q
    ||||||||||    
T  27243203 tggctaatgt 27243194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27254878 - 27254769
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27254878 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatgaatatgtgcttatg 27254779  T
Q  291 tggctaatgt 300  Q
    ||||||||||    
T  27254778 tggctaatgt 27254769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 5946058 - 5946215
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  5946058 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 5946157  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5946158 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcataggta 5946215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 45236736 - 45236578
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  45236736 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 45236637  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  45236636 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttttatgggtat 45236578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24080072 - 24079915
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  24080072 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 24079973  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24079972 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggta 24079915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 191 - 332
Target Start/End: Original strand, 38631659 - 38631800
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38631659 ctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattggtgtggtcaagatagttcatgaatatatgcttatg 38631758  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 332  Q
    ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  38631759 tggttaatatgtattggttgggataaattatccaccattctt 38631800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 32984248 - 32984091
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  32984248 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 32984149  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  32984148 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 32984091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Original strand, 2714560 - 2714714
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||           || ||||    
T  2714560 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 2714659  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  2714660 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgg 2714714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Original strand, 6365997 - 6366151
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||           || ||||    
T  6365997 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgt 6366096  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  6366097 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctttcatgg 6366151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Original strand, 41862231 - 41862389
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  41862231 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 41862330  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  41862331 gcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtat 41862389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 10646134 - 10646291
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  10646134 attacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 10646233  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  10646234 tcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 10646291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13356291 - 13356134
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  13356291 attacatttgaagaaaggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 13356192  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13356191 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatgggta 13356134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 2275924 - 2276080
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------aatatgtg 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||          || || ||    
T  2275924 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaatatg 2276023  T
Q  285 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2276024 cttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccatcattcttccatgggta 2276080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Original strand, 37956432 - 37956586
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  37956432 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 37956531  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  37956532 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattatttcatgg 37956586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17718893 - 17718736
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||           || ||||    
T  17718893 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 17718794  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  17718793 gcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggta 17718736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 43328718 - 43328875
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  43328718 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 43328817  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  43328818 gcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggta 43328875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 9734266 - 9734421
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------aatatgtg 284  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||          || |||||    
T  9734266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacacttaaaaatgtg 9734365  T
Q  285 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  9734366 cttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattacccaccattcttccatgggta 9734421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9303745 - 9303588
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  9303745 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 9303646  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  9303645 gtttatgtggctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttccatgggta 9303588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31831126 - 31830969
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  31831126 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31831027  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  31831026 gcttatgtggctaatgtgtattgatttgggtaaattacctaccattcttccatgggta 31830969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 37301496 - 37301339
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||           || ||||    
T  37301496 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggccaaaatagttcatggataccacttaaaaatgt 37301397  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  37301396 gtttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggta 37301339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 40435324 - 40435171
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||           || ||||    
T  40435324 attacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 40435225  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  40435224 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatg 40435171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 41653906 - 41654063
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||           || ||||    
T  41653906 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaaaataattcatggataccacttaaaaatgt 41654005  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41654006 gcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggta 41654063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Original strand, 32114260 - 32114418
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||           || ||||    
T  32114260 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgt 32114359  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  32114360 gcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtat 32114418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33730812 - 33730658
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  33730812 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 33730713  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  33730712 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 33730658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 25185910 - 25186067
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||           || ||||    
T  25185910 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgt 25186009  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||    
T  25186010 gcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggta 25186067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 33981834 - 33981677
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  33981834 attatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 33981735  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||    
T  33981734 gcttatgcggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggta 33981677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13760819 - 13760663
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  13760819 attacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgt 13760720  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggt 340  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  13760719 gcttctgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggt 13760663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29048574 - 29048426
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  29048574 attatctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 29048475  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  29048474 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 29048426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 332
Target Start/End: Original strand, 35628788 - 35628936
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgt 283  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||           ||||    
T  35628788 attaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaagaataccacttaaaaatgt 35628887  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 332  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  35628888 gcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattctt 35628936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 37419951 - 37420108
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  37419951 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgt 37420050  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||    
T  37420051 gcttatgtgactaatgtgtattgattaaggtaaattacccaccattcttccataggta 37420108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 45066763 - 45066606
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  45066763 attacctttgaagaataatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 45066664  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||    ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  45066663 gcttatgtggctaatgtgtattgattataataaattacccatcattcttccatgggta 45066606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 39915987 - 39915902
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 276  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39915987 ctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg 39915902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 256 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41425527 - 41425443
Alignment:
Q  256 gtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  41425527 gtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattatccataattcttttatgggta 41425443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 22878402 - 22878559
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||           || ||||    
T  22878402 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccttccaatgaaaatgatcaattttttgttggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 22878501  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||    
T  22878502 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccacaattcttctatgggta 22878559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 320
Target Start/End: Original strand, 41231957 - 41232093
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  41231957 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 41232056  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 320  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  41232057 gcttatgtgaccaatgtgtattggttggggtaaatta 41232093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 42701461 - 42701303
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat--------------a 280  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||              |    
T  42701461 attacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaaaaa 42701362  T
Q  281 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  42701361 tgtgct--tgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccatccttccatgggta 42701303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 9013695 - 9013851
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||           || ||||    
T  9013695 attacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 9013794  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
     |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  9013795 acttatgtggctaatgtgtattggtt-aggtaaattacccaccattcttccatgggta 9013851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 275
Target Start/End: Original strand, 41639925 - 41640005
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 275  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41639925 attacctttgaagaatgatgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcat 41640005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 44088614 - 44088460
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           || ||||    
T  44088614 attacctttgaagaatgatgaataatttactcaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 44088515  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  44088514 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 44088460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Original strand, 45258521 - 45258675
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||           || ||||    
T  45258521 attacttttgaagaatggtcggtaatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgt 45258620  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  45258621 gtttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 45258675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 3490563 - 3490485
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagata 269  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3490563 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagata 3490485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Original strand, 25248050 - 25248198
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||      |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||    
T  25248050 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaa------aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactttaaaatgt 25248143  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  25248144 gcttatgttgctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgg 25248198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 276
Target Start/End: Original strand, 41981454 - 41981525
Alignment:
Q  205 aagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 276  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  41981454 aagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 41981525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 33897002 - 33896926
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33897002 attacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtt 33896926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 341
Target Start/End: Original strand, 3904126 - 3904244
Alignment:
Q  233 caatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatga----------atatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatc 322  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||          | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  3904126 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgataccacttaaaaatgtgcttatgtggctattgtgtattggttagggtaaattacc 3904225  T
Q  323 catcattctttcatgggta 341  Q
    || ||||||| ||||||||    
T  3904226 caccattcttccatgggta 3904244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Original strand, 12033037 - 12033098
Alignment:
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  12033037 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 12033098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 195 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31149050 - 31148968
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatga 277  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  31149050 attacctttgaaaaatggtgggtaatttattcactaaccaatgaaaatgagctatttattgatggggttaagatagttcatga 31148968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 280 - 338
Target Start/End: Original strand, 41981575 - 41981633
Alignment:
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  41981575 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 41981633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26196476 - 26196400
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26196476 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataat-aacaatttattggtggggtcaaaatagtt 26196400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 341
Target Start/End: Original strand, 31336207 - 31336262
Alignment:
Q  286 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  31336207 ttatatggctaatgtgtattggttggggcaaattacccaccattcttccatgggta 31336262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 251
Target Start/End: Original strand, 164733 - 164789
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 251  Q
    ||||||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  164733 attacctttaaggaatgatgggtaatttatccaccaaccaataaaaatgagcaattt 164789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 332
Target Start/End: Original strand, 39901674 - 39901716
Alignment:
Q  290 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 332  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  39901674 gtggctaatgtttattggttgaggtaaattatccaccattctt 39901716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 332
Target Start/End: Original strand, 41640027 - 41640073
Alignment:
Q  286 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||    
T  41640027 ttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattctt 41640073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 69)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 38015678 - 38015528
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38015678 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 38015579  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38015578 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 38015528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 193 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 42658824 - 42658676
Alignment:
Q  193 aaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtg 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42658824 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatatgcttatgtg 42658725  T
Q  293 gctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42658724 gctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 42658676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 27503386 - 27503536
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27503386 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 27503485  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27503486 tggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggta 27503536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36365609 - 36365462
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36365609 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 36365510  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  36365509 tggctaatgtgtattggttgaggtaaattagccatcattctttcatgg 36365462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 6973070 - 6973220
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6973070 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 6973169  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6973170 tgactaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 6973220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9424756 - 9424606
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9424756 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatatgcttatg 9424657  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9424656 tggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggta 9424606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 19295737 - 19295887
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19295737 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgtatatgtgcttatg 19295836  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19295837 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 19295887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23195412 - 23195262
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23195412 ctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 23195313  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  23195312 tggctaatgtgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcatgggta 23195262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 5497280 - 5497430
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5497280 ctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaatatgtgcttatg 5497379  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5497380 tggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggta 5497430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9374666 - 9374516
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9374666 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaatatgtgtttagg 9374567  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9374566 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 9374516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 13957677 - 13957827
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13957677 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgcgcttatg 13957776  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13957777 tgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggta 13957827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 192 - 336
Target Start/End: Original strand, 6206892 - 6207036
Alignment:
Q  192 taaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6206892 taaattacttttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgagcaatttatttggggggtcaaaatagttcatgaatatgtgcttatgt 6206991  T
Q  292 ggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcat 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6206992 ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcat 6207036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 212 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3656711 - 3656582
Alignment:
Q  212 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3656711 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttttggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 3656612  T
Q  312 ggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3656611 ggtaaattactcatcattctttcatgggta 3656582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 192 - 341
Target Start/End: Original strand, 14971986 - 14972135
Alignment:
Q  192 taaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 291  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14971986 taaattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaatatgtgcttatgt 14972085  T
Q  292 ggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14972086 gactaatgtgtattgattaggataaattacccatcattctttcatgggta 14972135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 337
Target Start/End: Original strand, 33617592 - 33617738
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33617592 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 33617691  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||    
T  33617692 tggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatg 33617738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 218 - 338
Target Start/End: Original strand, 38492647 - 38492767
Alignment:
Q  218 aatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 317  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38492647 aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaa 38492746  T
Q  318 ttatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  38492747 ttacccatcattctttcatgg 38492767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 42247946 - 42247808
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  42247946 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaatatgtgctta-- 42247849  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
           ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42247848 -------tgtgtattgattggggtaaattacccatcattctttcatgg 42247808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 191 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 33624103 - 33623965
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||  ||||||||||||    
T  33624103 ctaaattacctttgaataatggtagataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgggtatgtgcttatg 33624004  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcatt 329  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  33624003 tggctaatgtgtatcggttggggtaaattatccaccatt 33623965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 24253393 - 24253550
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  24253393 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 24253492  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  24253493 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 24253550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 35626045 - 35626206
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aat 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           ||     
T  35626045 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 35626144  T
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  35626145 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 35626206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 40886198 - 40886042
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------aatatgtg 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||          || |||||    
T  40886198 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaatgtg 40886099  T
Q  285 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  40886098 cttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggta 40886042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Original strand, 5184983 - 5185141
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||           ||||    
T  5184983 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgt 5185082  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||| |||||||||    
T  5185083 gcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattcttccatgggtat 5185141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 6901810 - 6901967
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgt 283  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||           ||||    
T  6901810 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgt 6901909  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  6901910 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggta 6901967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15398653 - 15398496
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  15398653 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 15398554  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||    
T  15398553 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggta 15398496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 43326550 - 43326393
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  43326550 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 43326451  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  43326450 gcctatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 43326393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 195 - 317
Target Start/End: Original strand, 40632510 - 40632634
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata--tgtgcttatgtg 292  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||   |||||||||||    
T  40632510 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccggtgcttatgtg 40632609  T
Q  293 gctaatgtgtattggttggggtaaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  40632610 gctaatgtgtattggttggggtaaa 40632634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3466852 - 3466695
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || || |    
T  3466852 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 3466753  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  3466752 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttatgggta 3466695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 25831532 - 25831688
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||           || ||||    
T  25831532 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccaattaaaaatgt 25831630  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25831631 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggta 25831688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 39932590 - 39932747
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  39932590 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 39932689  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  39932690 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccaaccattcttccatgggta 39932747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 43262354 - 43262197
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  43262354 attacctttgaagaatggtgggtaattaacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 43262255  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  43262254 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggta 43262197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 195 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18479839 - 18479691
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           || ||||    
T  18479839 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgt 18479740  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18479739 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 18479691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 201 - 340
Target Start/End: Original strand, 27938914 - 27939064
Alignment:
Q  201 tttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttat 289  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||||||||    
T  27938914 tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttat 27939013  T
Q  290 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggt 340  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  27939014 gtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggt 27939064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 199 - 341
Target Start/End: Original strand, 7722064 - 7722217
Alignment:
Q  199 cctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgctt 287  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||||||    
T  7722064 cctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctt 7722163  T
Q  288 atgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  7722164 atgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatgggta 7722217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27501226 - 27501069
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  27501226 attacctttgaagaatggtggataatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 27501127  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27501126 gcttatgtggctaatgtgtattgtttggggtaaattacccatcattcttccatgggta 27501069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 332
Target Start/End: Original strand, 15683802 - 15683950
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  15683802 attacctttgaagaatgatgtgtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 15683901  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 332  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15683902 gcttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattctt 15683950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 212 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 36948631 - 36948508
Alignment:
Q  212 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 311  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  36948631 gtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggt-aagatagttcatggatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgg-tag 36948534  T
Q  312 ggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  36948533 ggtaaattacccaccattcttgcatg 36948508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 31938908 - 31939065
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  31938908 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31939007  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  31939008 gtttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 31939065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28424964 - 28424812
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgt 283  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||           ||||    
T  28424964 attacctttgaaggatagtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaat--gcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgt 28424867  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  28424866 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 28424812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2484463 - 2484305
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||           || ||||    
T  2484463 attatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgt 2484364  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  2484363 gtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtat 2484305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Original strand, 12648808 - 12648962
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||           || ||||    
T  12648808 attatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 12648907  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  12648908 gcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgg 12648962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 194 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 40279030 - 40278876
Alignment:
Q  194 aattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatg 282  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||           || |||    
T  40279030 aattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaacataattcatggataccacttaaaaatg 40278931  T
Q  283 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  40278930 tgcttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattacccatcattcttccatg 40278876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 739875 - 739718
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  739875 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 739776  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  739775 gcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggta 739718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 320
Target Start/End: Original strand, 4149705 - 4149831
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtca-agatagttcatgaatatgtgcttatgtgg 293  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |  ||||   | | || ||||||||||||||    
T  4149705 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgg 4149804  T
Q  294 ctaatgtgtattggttggggtaaatta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4149805 ctaatgtgtattggttggggtaaatta 4149831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13504913 - 13504759
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  13504913 attaccatcgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 13504814  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  13504813 gcttatgtgactaatatgtattagttgggataaattatccaccattcttccatgg 13504759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 332
Target Start/End: Original strand, 5137726 - 5137874
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  5137726 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 5137825  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 332  Q
    | ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||| |||||||    
T  5137826 gtttatgtggctaatatgtattgatttgagtaaattatccaccattctt 5137874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 9171189 - 9171111
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagata 269  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9171189 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaacaaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagata 9171111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Original strand, 890917 - 891074
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------aatatgtg 284  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||          || |||||    
T  890917 attacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtcgagtcaagatagttcatggataccacttaaaatgtg 891016  T
Q  285 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||| |||||||||    
T  891017 cttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacctaccattcttccatgggtat 891074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 277
Target Start/End: Original strand, 5120036 - 5120118
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatga 277  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5120036 attacctttgatgaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattggtagggtcaagatagttcatga 5120118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12558189 - 12558107
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatga 277  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  12558189 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgatgtggtcaagatagttcatga 12558107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27278648 - 27278487
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatag----ttcatg-----------aat 279  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    ||||||           ||     
T  27278648 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagataattcatggataccacttaaaa 27278549  T
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||    
T  27278548 atgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggta 27278487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 29789440 - 29789309
Alignment:
Q  221 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29789440 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt 29789341  T
Q  310 ggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  29789340 gggataaattacccaccattcttccatgggta 29789309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 612898 - 612770
Alignment:
Q  212 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 311  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  612898 gtgggtaatttaaccaccaacca-tgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttattgatatg--cttatgtggctaatgtgtattggttgg 612802  T
Q  312 g-gtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
    | ||||||||  ||  |||||| |||||||||    
T  612801 gagtaaattactcagtattcttccatgggtat 612770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Original strand, 2585473 - 2585550
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2585473 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtt 2585550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 226 - 338
Target Start/End: Original strand, 34451292 - 34451415
Alignment:
Q  226 caccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||           || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34451292 caccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggt 34451391  T
Q  315 aaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||    
T  34451392 aaattacccaccattcttccatgg 34451415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 195 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 38756659 - 38756578
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 276  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  38756659 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaataaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 38756578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Original strand, 40110245 - 40110402
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgt 283  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||           |||    
T  40110245 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 40110343  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  40110344 gcttatgtggttaatgtatattagttagggtaaattatctaccattcttccatgagtat 40110402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 201 - 338
Target Start/End: Original strand, 763740 - 763888
Alignment:
Q  201 tttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttat 289  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||| || |||||||||||||           || |||| |||||    
T  763740 tttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggagttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtacttat 763839  T
Q  290 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  763840 gtggctaatatgtattagttggggtaaattacccatcattctttgatgg 763888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36472444 - 36472367
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36472444 attacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtt 36472367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9527180 - 9527121
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatt 254  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9527180 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatt 9527121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 337
Target Start/End: Original strand, 27390608 - 27390750
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggc 294  Q
    |||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    || |   ||     
T  27390608 attacctttgaaaaatggtggatagtttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggt 27390707  T
Q  295 taatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27390708 gaatgttcattggttggggtaaattatccaccattcttccatg 27390750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 38638070 - 38637993
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  38638070 attacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtt 38637993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 280
Target Start/End: Original strand, 40686910 - 40686995
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 280  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  40686910 attacctttgagaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatgaata 40686995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3940474 - 3940411
Alignment:
Q  212 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 275  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  3940474 gtgggtaatttacccaccaacaaatgaaaatgagcaatttattggtgcggtcaagataattcat 3940411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1402665 - 1402588
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  1402665 attacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtgggatcaagatagtt 1402588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24167944 - 24167867
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24167944 attacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataataaacaatttattggtggggtcaagatagtt 24167867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31294160 - 31294075
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 280  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  | |||| ||||||||    
T  31294160 attacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaaattattggtagggtccgggtagtccatgaata 31294075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18327333 - 18327187
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggc 294  Q
    |||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||    || |   ||     
T  18327333 attatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgcgcaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggt 18327234  T
Q  295 taatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||    
T  18327233 gaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggta 18327187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15301033 - 15300962
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaag 266  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  15301033 attacctttgaagaatgattggtaatttacacatcaaccaatgaaaatgagcaatttatcggtggagtcaag 15300962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 341
Target Start/End: Original strand, 5120136 - 5120181
Alignment:
Q  296 aatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5120136 aatgtttattggttgaggtaaattatccaccattctttcatgggta 5120181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 78)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 35158214 - 35158064
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35158214 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 35158115  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35158114 tgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 35158064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 39301361 - 39301214
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39301361 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttata 39301262  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39301261 tgactaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattctttcatgg 39301214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 145288 - 145438
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  145288 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatacgtgcttatg 145387  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  145388 tggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggta 145438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28641456 - 28641306
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  28641456 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatatgtttatg 28641357  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  28641356 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccattattctttcatgggta 28641306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 29687047 - 29687197
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29687047 ctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 29687146  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29687147 tggctaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatgggta 29687197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19428591 - 19428440
Alignment:
Q  191 ctaaattacc-tttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttat 289  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19428591 ctaaattaccctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttacttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttat 19428492  T
Q  290 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19428491 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 19428440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27765026 - 27764877
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27765026 ctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaatatgtgcttatg 27764927  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27764926 tggctaatgtgtattggttggggtaaattaaccatca-tctttcatgggta 27764877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 192 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13543787 - 13543638
Alignment:
Q  192 taaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 291  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13543787 taaattacttttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 13543688  T
Q  292 ggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13543687 ggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattctttcatgggta 13543638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12333659 - 12333513
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12333659 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtatatgtgcttatg 12333560  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  12333559 tggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcatgg 12333513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 4258496 - 4258645
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4258496 ctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggg-tcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 4258594  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4258595 tggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcgttcatgggta 4258645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 43899134 - 43898985
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43899134 ctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 43899035  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43899034 tggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcatgggta 43898985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 27331304 - 27331458
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatga----atatgtgct 286  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||    
T  27331304 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaatatatatgtgct 27331403  T
Q  287 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27331404 tatgtggctaatatgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 27331458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 12730067 - 12730214
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12730067 ctaaattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcataaatatgtgcttatg 12730166  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12730167 tgactaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatgg 12730214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28566862 - 28566712
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28566862 ctaaattacttttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttctggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 28566763  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  28566762 tgactaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattctttcatgggta 28566712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 39103053 - 39103203
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39103053 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaatatgtgcttatg 39103152  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  39103153 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 39103203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 192 - 341
Target Start/End: Original strand, 34249272 - 34249421
Alignment:
Q  192 taaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 291  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34249272 taaattatctttgaagaatggtgagtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaatatgtgcttatgt 34249371  T
Q  292 ggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34249372 gactaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggta 34249421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2688893 - 2688746
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2688893 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccgattaatgaaaattagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 2688794  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2688793 tggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgg 2688746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 216 - 341
Target Start/End: Original strand, 3711664 - 3711789
Alignment:
Q  216 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggta 315  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3711664 gtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggggta 3711763  T
Q  316 aattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3711764 aattacccatcattctttcatgggta 3711789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 43356105 - 43356249
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43356105 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaa---acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 43356201  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||    
T  43356202 tggctaatttgtattggtttgagtaaattacccatgattctttcatgg 43356249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 191 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21735064 - 21734918
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21735064 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgggggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 21734965  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  21734964 tggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccatg 21734918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 8056632 - 8056779
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  8056632 ctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaactatttatttgtggagtgaagatagttcatgaatatgcgcttatg 8056731  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  8056732 tagctaatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatgg 8056779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2000501 - 2000355
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  2000501 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcataaatatgtgcttacg 2000402  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2000401 tggctcatatgtatt-gttggggtaaattactcatcattctttcatgg 2000355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 3266302 - 3266443
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       
T  3266302 ctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt--- 3266398  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
          |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3266399 ------atgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggta 3266443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 23901789 - 23901946
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  23901789 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 23901888  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23901889 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggta 23901946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 40635224 - 40635385
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aat 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           ||     
T  40635224 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 40635323  T
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  40635324 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggta 40635385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 40544240 - 40544099
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       
T  40544240 ctaaattacctttgaagaatggtggatagtttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatatgctt--- 40544144  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
          |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  40544143 ------atgtgtattggttgaggtaaattacacatcattctttcatgggta 40544099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 746476 - 746633
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------tgaatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||           | || ||||    
T  746476 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 746575  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  746576 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 746633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13815389 - 13815232
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  13815389 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 13815290  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  13815289 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacctttctttcatgggta 13815232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 26710355 - 26710512
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  26710355 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcattttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 26710454  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  26710455 gcttatgtggctgatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggta 26710512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Original strand, 38997111 - 38997265
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  38997111 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 38997210  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  38997211 gcttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 38997265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 2325060 - 2324907
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  2325060 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 2324961  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||    
T  2324960 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatg 2324907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 4034602 - 4034759
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||           || ||||    
T  4034602 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 4034701  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  4034702 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 4034759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 6430483 - 6430640
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  6430483 attaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 6430582  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  6430583 gcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 6430640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6594629 - 6594472
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  6594629 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 6594530  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||    
T  6594529 gcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggta 6594472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 17600846 - 17601003
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  17600846 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 17600945  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  17600946 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 17601003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 27400413 - 27400570
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  27400413 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 27400512  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27400513 acttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggta 27400570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 32327371 - 32327528
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------tgaatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||           | || ||||    
T  32327371 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccagccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 32327470  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  32327471 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattcttccataggta 32327528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 34518377 - 34518534
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           || ||||    
T  34518377 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 34518476  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||    
T  34518477 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggta 34518534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 45371000 - 45371157
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||           || ||||    
T  45371000 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 45371099  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  45371100 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 45371157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 4609636 - 4609793
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  4609636 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaataagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 4609735  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  4609736 gcttatgtgcctaatgtgtattggttggggtaaattatccaacattcttccatgggta 4609793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10244753 - 10244596
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  10244753 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 10244654  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||    
T  10244653 gcttatgtagctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggta 10244596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 10424605 - 10424762
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  10424605 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 10424704  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  10424705 gcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggta 10424762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 11184982 - 11185139
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  11184982 attacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 11185081  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  11185082 gcttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 11185139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 199 - 337
Target Start/End: Original strand, 14660460 - 14660609
Alignment:
Q  199 cctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgctt 287  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||||||    
T  14660460 cctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctt 14660559  T
Q  288 atgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||    
T  14660560 atgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccaccattcttccatg 14660609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 27024425 - 27024582
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           || || |    
T  27024425 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 27024524  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  27024525 gattatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccattattcttccatgggta 27024582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27651205 - 27651048
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  27651205 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgcccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 27651106  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  27651105 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggta 27651048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 40037153 - 40037309
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------tgaatatgt 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||           | || ||||    
T  40037153 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 40037252  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  40037253 gcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcatt-tttcatgggta 40037309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 336
Target Start/End: Original strand, 15925090 - 15925242
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||           || || |    
T  15925090 attacctttcaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagtaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 15925189  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcat 336  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15925190 gcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcattctttcat 15925242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 33427818 - 33427661
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------tgaatatgt 283  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||           | || ||||    
T  33427818 attacctttgaataatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 33427719  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  33427718 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacacaccattctttcatgggta 33427661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 320
Target Start/End: Original strand, 32608390 - 32608526
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||           || ||||    
T  32608390 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgt 32608489  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32608490 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 32608526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Original strand, 5726139 - 5726293
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  5726139 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggttaccacttaaaaatgt 5726238  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  5726239 gtttatatggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgg 5726293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1092122 - 1091965
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  1092122 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 1092023  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||    
T  1092022 gtttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggta 1091965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 32948456 - 32948612
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||           || ||||    
T  32948456 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-agttcatggataccacttaaaaatgt 32948554  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  32948555 gcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattcttctatgggta 32948612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 320
Target Start/End: Original strand, 41172465 - 41172604
Alignment:
Q  192 taaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------tgaata 280  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||           | || |    
T  41172465 taaattacatttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcaaaggtaccacttaaaaa 41172564  T
Q  281 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41172565 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 41172604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2914309 - 2914155
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||           || ||||    
T  2914309 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 2914210  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  2914209 gcttatgtggctgatgtgtatcggttgaggtaaattacccaccattcttccatgg 2914155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 37621041 - 37620885
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggg---tcaagatagttcatg-----------aata 280  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||||||||||           || |    
T  37621041 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtactcaagatagttcatggataccacttaaaaa 37620942  T
Q  281 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||    
T  37620941 tgtgcttatgtggcttatgtgtattggtttggataaattatccaccattcttccatg 37620885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 199 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 32856603 - 32856450
Alignment:
Q  199 cctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctt 287  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||           ||||||||    
T  32856603 cctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtgggatcaagatagttcatggataccacttacaaatgtgctt 32856504  T
Q  288 atgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||    
T  32856503 atgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggta 32856450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 337
Target Start/End: Original strand, 40735474 - 40735627
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||           || ||||    
T  40735474 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgt 40735573  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
     |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  40735574 acttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattcttccatg 40735627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7892859 - 7892711
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||           || ||||    
T  7892859 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgt 7892760  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 332  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  7892759 gtttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattctt 7892711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14697708 - 14697551
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||           || ||||    
T  14697708 attacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgtgatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 14697609  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  14697608 gcttatgtagctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttctatgggta 14697551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 320
Target Start/End: Original strand, 12842113 - 12842249
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||| ||           || ||||    
T  12842113 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggagtcaagatagttcttggataccaattaaaaatgt 12842212  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 320  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12842213 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 12842249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 276
Target Start/End: Original strand, 42899925 - 42900006
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 276  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  42899925 attaccttcgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 42900006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 11159632 - 11159788
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  11159632 attacctttgaaaaatggtgg-taatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatgccacttaaaaatgt 11159730  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  11159731 gtttatgtggctattgtgtattggatggggtaaattacccaccattcttctatgggta 11159788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 329
Target Start/End: Original strand, 9444726 - 9444845
Alignment:
Q  221 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||           || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9444726 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 9444825  T
Q  310 ggggtaaattatccatcatt 329  Q
    ||||||||||| ||| ||||    
T  9444826 ggggtaaattacccaccatt 9444845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 195 - 264
Target Start/End: Original strand, 12814624 - 12814693
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtca 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12814624 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtca 12814693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Original strand, 44481838 - 44481915
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44481838 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtt 44481915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 8433087 - 8432942
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||           || || |    
T  8433087 attatctttgaagaatggtggataatttacctgccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccactttaaaatat 8432988  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcatt 329  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8432987 acttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 8432942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Original strand, 35126790 - 35126867
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 272  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35126790 attacctttgaaaaacggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtt 35126867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 218 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 37255485 - 37255351
Alignment:
Q  218 aatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattg 306  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  37255485 aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattg 37255386  T
Q  307 gttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  37255385 gttgggataaattacccaccattcttctatgggta 37255351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 236 - 337
Target Start/End: Original strand, 25294886 - 25294998
Alignment:
Q  236 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 324  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25294886 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25294985  T
Q  325 tcattctttcatg 337  Q
    |||||||| ||||    
T  25294986 tcattcttccatg 25294998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 273
Target Start/End: Original strand, 30545837 - 30545909
Alignment:
Q  201 tttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttc 273  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  30545837 tttgaagaatggtggataatttacctaccaaacaataaaaatgagcaacttattggtggggtcaagatagttc 30545909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 447708 - 447647
Alignment:
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||    
T  447708 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcatccatgggta 447647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 280 - 329
Target Start/End: Original strand, 12827168 - 12827217
Alignment:
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12827168 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 12827217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28014893 - 28014856
Alignment:
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28014893 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 28014856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 38985416 - 38985378
Alignment:
Q  216 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatt 254  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38985416 gtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttatt 38985378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 340
Target Start/End: Original strand, 1229733 - 1229793
Alignment:
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggt 340  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  1229733 atgtgcttatctggctaatatatattggttgggataaattacccaccattcttccatgggt 1229793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 252
Target Start/End: Original strand, 10176569 - 10176626
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattta 252  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  10176569 attacctttaaagaatggtgggtaacttattcaccaattaatgaaaatgagcaattta 10176626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28019992 - 28019959
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccac 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28019992 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccac 28019959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28949009 - 28948859
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28949009 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatgaatatatgcttatg 28948910  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28948909 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 28948859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 13329388 - 13329538
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13329388 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttcataaatatgtgcttatg 13329487  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13329488 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 13329538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 15965440 - 15965590
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  15965440 ctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatacttcatgaatatgtgtttatg 15965539  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15965540 tggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 15965590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 192 - 341
Target Start/End: Original strand, 4487535 - 4487684
Alignment:
Q  192 taaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgt 291  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  4487535 taaatttcctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtactcatgt 4487634  T
Q  292 ggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4487635 ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 4487684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 3786756 - 3786906
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3786756 ctaaattacttttgaagaatggtggataatttacctaccaatcaatgaaaatgaagaatttatttgtggggtcaatatagttcatgaatatgtgcttatg 3786855  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3786856 tggctaatgtgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 3786906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 3291015 - 3291162
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3291015 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttcataaatatgtgcttatg 3291114  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3291115 tggctaatatgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgg 3291162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 1398560 - 1398710
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1398560 ctaaattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagatagttgatgaatatgtgcttatg 1398659  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||    
T  1398660 tggctaatatgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcataggta 1398710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18101666 - 18101508
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           || ||||    
T  18101666 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgt 18101567  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18101566 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtat 18101508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 2892199 - 2892356
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  2892199 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 2892298  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  2892299 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttctatgggta 2892356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 5882517 - 5882674
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  5882517 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 5882616  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  5882617 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 5882674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26377379 - 26377218
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aat 279  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           ||     
T  26377379 ctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 26377280  T
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  26377279 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 26377218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 7345283 - 7345130
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           || ||||    
T  7345283 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgt 7345184  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  7345183 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatg 7345130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 199 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14891546 - 14891393
Alignment:
Q  199 cctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgctt 287  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||||||    
T  14891546 cctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctt 14891447  T
Q  288 atgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  14891446 atgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 14891393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22551232 - 22551075
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           || ||||    
T  22551232 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacctaaaaatgt 22551133  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  22551132 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 22551075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Original strand, 16703377 - 16703535
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||           || ||||    
T  16703377 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgt 16703476  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  16703477 gcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacgcatcattcttccatgggtat 16703535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 1970722 - 1970879
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||           ||||    
T  1970722 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgt 1970821  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  1970822 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 1970879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19281226 - 19281069
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||           || |    
T  19281226 attacctttgaagaatggtgggtaatttgcccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatat 19281127  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  19281126 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggta 19281069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 24168102 - 24168259
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  24168102 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 24168201  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  24168202 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 24168259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 197 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11989143 - 11988988
Alignment:
Q  197 tacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgc 285  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || || |||    
T  11989143 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgc 11989044  T
Q  286 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  11989043 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 11988988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 599903 - 600060
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  599903 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 600002  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  600003 gtttatgtgactaatttgtattggttgggataaattatccaccattctttcatgggta 600060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 960075 - 959918
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------tgaatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||           | || ||||    
T  960075 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatggaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatagataccacttaaaaatgt 959976  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  959975 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggta 959918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2594023 - 2593866
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  2594023 attatctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 2593924  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  2593923 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattatccaccattcttccataggta 2593866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7393757 - 7393600
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  7393757 attacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 7393658  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  7393657 gcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 7393600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 8615251 - 8615408
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  8615251 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 8615350  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| ||||||||    
T  8615351 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggta 8615408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 254 - 341
Target Start/End: Original strand, 18661804 - 18661891
Alignment:
Q  254 ttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18661804 ttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatgggta 18661891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19415704 - 19415547
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||           || ||||    
T  19415704 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagctcatggataccacttaaaaatgt 19415605  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19415604 gcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggta 19415547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 34528033 - 34527876
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||           || ||||    
T  34528033 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgt 34527934  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  34527933 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 34527876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 197 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22341959 - 22341802
Alignment:
Q  197 tacctttgaagaatagtgggtaatttacccacca--accaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  22341959 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccaacacaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 22341860  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  22341859 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 22341802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 28947098 - 28947255
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||           || ||||    
T  28947098 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccacttaaaaatgt 28947197  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  28947198 gtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggta 28947255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24224240 - 24224083
Alignment:
Q  196 ttacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtg 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||           || |||||    
T  24224240 ttacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 24224141  T
Q  285 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||| ||||    
T  24224140 cttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacctactattctttcatgagtat 24224083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 237 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24913216 - 24913114
Alignment:
Q  237 gaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat--gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24913216 gaaaatgagcaatttatttgtggagtcaaaatagttcatgaatatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattactcatcattctttc 24913117  T
Q  335 atg 337  Q
    |||    
T  24913116 atg 24913114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 191 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1939668 - 1939554
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |    
T  1939668 ctaaattatctttgaagaatggtggataatttacctataaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatggatatgtgtttacg 1939569  T
Q  291 tggctaatgtgtatt 305  Q
    |||||||| ||||||    
T  1939568 tggctaatatgtatt 1939554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 30743619 - 30743465
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||           || ||||    
T  30743619 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagtttatggataccacttaaaaatgt 30743520  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgg 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||    
T  30743519 gcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacctaccattctttcatgg 30743465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10508079 - 10507931
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  10508079 attatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgataatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 10507980  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctt 332  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  10507979 gcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccaccattctt 10507931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 30467774 - 30467693
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 276  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  30467774 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaacaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 30467693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 33452743 - 33452585
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||||||||           || ||||    
T  33452743 attatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaataatttgttgttggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 33452644  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||    
T  33452643 acttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtat 33452585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 5294972 - 5294891
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  5294972 attacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 5294891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 5299524 - 5299443
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 276  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  5299524 attacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 5299443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 7167593 - 7167739
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggc 294  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    || |   ||     
T  7167593 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggt 7167692  T
Q  295 taatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||    
T  7167693 gaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggta 7167739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23262079 - 23261943
Alignment:
Q  216 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||           || ||||||||||| || |||| |||||    
T  23262079 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgaggttaatatgtat 23261980  T
Q  305 tggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  23261979 tggttggggtaaattatccaccgttctttcataggta 23261943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 266
Target Start/End: Original strand, 929670 - 929741
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaag 266  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  929670 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaag 929741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 375884 - 375799
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 280  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  375884 attacttttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaactaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaata 375799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 280
Target Start/End: Original strand, 13844846 - 13844932
Alignment:
Q  194 aattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 280  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||| ||||    
T  13844846 aattacctttgaaaaatggtggttaacttaaccactaacaaatgaaaatgaacaatttattgatggagtcaaaatagttcataaata 13844932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 375786 - 375741
Alignment:
Q  296 aatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  375786 aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggta 375741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 191 - 341
Target Start/End: Original strand, 7097 - 7248
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaa-tgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttat 289  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7097 ctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttat 7196  T
Q  290 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7197 gtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggta 7248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 39727 - 39570
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  39727 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 39628  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  39627 gcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggta 39570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11303 - 11147
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  11303 attaccttt-aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 11205  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11204 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggta 11147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 320
Target Start/End: Original strand, 17913 - 18042
Alignment:
Q  191 ctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatg 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||| ||| || ||||||| |||||||||    
T  17913 ctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgatcaatttattgatggagtcaaaatattttatgaatacgtgcttatg 18012  T
Q  291 tggctaatgtgtattggttggggtaaatta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18013 tggctaatgtgtattggttggggtaaatta 18042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13933 - 13776
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  13933 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 13834  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  13833 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggta 13776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 75415 - 75258
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  75415 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgcataccacttaaaaatgt 75316  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||    
T  75315 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccattggta 75258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 1880 - 2037
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || || |    
T  1880 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 1979  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  1980 gcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggta 2037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2603 - 2446
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||           || ||||    
T  2603 attacctttgaagaatggtgggtaaattatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 2504  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  2503 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggta 2446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Original strand, 176666 - 176823
Alignment:
Q  196 ttacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------tgaatatgtg 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||           |||| ||||     
T  176666 ttacctttgaagaatggtgggtaatttaccgaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttgaaaatgta 176765  T
Q  285 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||    
T  176766 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtat 176823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 278017 - 278176
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------------aatat 281  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||             || ||    
T  278017 attacctttgaagaatggtgggtaaattactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccccacttaaaaat 278116  T
Q  282 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  278117 gtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 278176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 320
Target Start/End: Original strand, 32572 - 32708
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           || ||||    
T  32572 attacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccatttaaaaatgt 32671  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 320  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32672 gtttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaatta 32708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19025 - 18868
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 283  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||           || ||||    
T  19025 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgt 18926  T
Q  284 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||| ||||||||    
T  18925 gcttatgtgactaatgtgtattagttggaataaattatccacaattcttccatgggta 18868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 280
Target Start/End: Original strand, 14755 - 14840
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 280  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14755 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaata 14840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 195 - 280
Target Start/End: Original strand, 113 - 198
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 280  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  113 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatgaata 198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 20637 - 20563
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagata 269  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20637 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagata 20563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 195 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4715 - 4633
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 276  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4715 attacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatg 4633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 195 - 276
Target Start/End: Original strand, 3403 - 3485
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 276  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3403 attacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatg 3485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 280 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4671 - 4610
Alignment:
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggta 341  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  4671 atgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggta 4610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 320
Target Start/End: Original strand, 3186 - 3226
Alignment:
Q  280 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3186 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 3226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 269
Target Start/End: Original strand, 19228 - 19302
Alignment:
Q  195 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagata 269  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19228 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagata 19302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University